Date: 2019-12-26 00:39:04 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 10169 459
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | ||
|---|---|---|---|---|---|
| MAD:mclust | 2 | 1.000 | 0.989 | 0.995 | ** |
| ATC:hclust | 2 | 1.000 | 0.979 | 0.990 | ** |
| ATC:mclust | 2 | 1.000 | 0.989 | 0.995 | ** |
| SD:hclust | 2 | 0.995 | 0.961 | 0.983 | ** |
| SD:mclust | 2 | 0.988 | 0.953 | 0.965 | ** |
| MAD:hclust | 2 | 0.951 | 0.945 | 0.974 | ** |
| MAD:skmeans | 2 | 0.895 | 0.929 | 0.969 | |
| MAD:kmeans | 3 | 0.876 | 0.901 | 0.964 | |
| SD:kmeans | 3 | 0.864 | 0.901 | 0.960 | |
| ATC:NMF | 2 | 0.839 | 0.903 | 0.958 | |
| ATC:kmeans | 3 | 0.838 | 0.898 | 0.959 | |
| SD:skmeans | 2 | 0.835 | 0.907 | 0.960 | |
| CV:kmeans | 2 | 0.827 | 0.916 | 0.962 | |
| CV:skmeans | 2 | 0.813 | 0.908 | 0.959 | |
| ATC:skmeans | 2 | 0.805 | 0.894 | 0.955 | |
| ATC:pam | 2 | 0.519 | 0.798 | 0.906 | |
| MAD:NMF | 3 | 0.489 | 0.714 | 0.856 | |
| CV:NMF | 2 | 0.313 | 0.740 | 0.863 | |
| SD:NMF | 2 | 0.229 | 0.637 | 0.815 | |
| SD:pam | 3 | 0.197 | 0.643 | 0.814 | |
| MAD:pam | 3 | 0.131 | 0.629 | 0.795 | |
| CV:pam | 3 | 0.121 | 0.441 | 0.687 | |
| CV:mclust | 3 | 0.081 | 0.461 | 0.665 | |
| CV:hclust | 5 | 0.022 | 0.487 | 0.550 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.22931 0.637 0.815 0.4380 0.558 0.558
#> CV:NMF 2 0.31309 0.740 0.863 0.4741 0.515 0.515
#> MAD:NMF 2 0.20335 0.645 0.818 0.4020 0.639 0.639
#> ATC:NMF 2 0.83946 0.903 0.958 0.4881 0.508 0.508
#> SD:skmeans 2 0.83485 0.907 0.960 0.4928 0.506 0.506
#> CV:skmeans 2 0.81339 0.908 0.959 0.5010 0.499 0.499
#> MAD:skmeans 2 0.89522 0.929 0.969 0.4963 0.505 0.505
#> ATC:skmeans 2 0.80531 0.894 0.955 0.5001 0.500 0.500
#> SD:mclust 2 0.98816 0.953 0.965 0.1550 0.878 0.878
#> CV:mclust 2 0.07202 0.477 0.693 0.3367 0.881 0.881
#> MAD:mclust 2 1.00000 0.989 0.995 0.1155 0.889 0.889
#> ATC:mclust 2 1.00000 0.989 0.995 0.1510 0.851 0.851
#> SD:kmeans 2 0.70097 0.871 0.939 0.2772 0.712 0.712
#> CV:kmeans 2 0.82673 0.916 0.962 0.4983 0.501 0.501
#> MAD:kmeans 2 0.63422 0.916 0.943 0.3760 0.586 0.586
#> ATC:kmeans 2 0.43236 0.744 0.854 0.2530 0.909 0.909
#> SD:pam 2 0.16987 0.663 0.764 0.2770 0.916 0.916
#> CV:pam 2 0.15911 0.546 0.751 0.3731 0.540 0.540
#> MAD:pam 2 0.12254 0.616 0.728 0.3914 0.511 0.511
#> ATC:pam 2 0.51913 0.798 0.906 0.4753 0.517 0.517
#> SD:hclust 2 0.99502 0.961 0.983 0.0966 0.912 0.912
#> CV:hclust 2 0.00102 0.449 0.732 0.3312 0.941 0.941
#> MAD:hclust 2 0.95148 0.945 0.974 0.1029 0.916 0.916
#> ATC:hclust 2 1.00000 0.979 0.990 0.0715 0.924 0.924
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.373510 0.660 0.796 0.3864 0.713 0.542
#> CV:NMF 3 0.242191 0.477 0.705 0.3441 0.730 0.538
#> MAD:NMF 3 0.489149 0.714 0.856 0.4978 0.641 0.491
#> ATC:NMF 3 0.506970 0.682 0.839 0.3045 0.784 0.605
#> SD:skmeans 3 0.576727 0.752 0.871 0.3432 0.740 0.527
#> CV:skmeans 3 0.423684 0.595 0.766 0.2956 0.838 0.686
#> MAD:skmeans 3 0.655352 0.778 0.890 0.3353 0.764 0.562
#> ATC:skmeans 3 0.666150 0.680 0.834 0.3055 0.763 0.564
#> SD:mclust 3 0.279954 0.607 0.783 2.5506 0.564 0.503
#> CV:mclust 3 0.081282 0.461 0.665 0.6909 0.541 0.487
#> MAD:mclust 3 0.296056 0.590 0.776 3.6685 0.566 0.513
#> ATC:mclust 3 0.404682 0.728 0.862 2.5512 0.570 0.497
#> SD:kmeans 3 0.863545 0.901 0.960 0.9767 0.599 0.487
#> CV:kmeans 3 0.492682 0.743 0.831 0.2565 0.723 0.518
#> MAD:kmeans 3 0.875693 0.901 0.964 0.4503 0.697 0.549
#> ATC:kmeans 3 0.837657 0.898 0.959 1.1560 0.546 0.500
#> SD:pam 3 0.197195 0.643 0.814 0.8737 0.536 0.500
#> CV:pam 3 0.120763 0.441 0.687 0.4416 0.562 0.396
#> MAD:pam 3 0.130855 0.629 0.795 0.3121 0.798 0.658
#> ATC:pam 3 0.446409 0.730 0.878 0.0499 0.952 0.910
#> SD:hclust 3 0.918275 0.882 0.956 0.4949 0.983 0.982
#> CV:hclust 3 0.000316 0.424 0.593 0.4321 0.642 0.625
#> MAD:hclust 3 0.756976 0.861 0.934 0.6633 0.971 0.968
#> ATC:hclust 3 0.920605 0.937 0.949 1.0232 0.978 0.977
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.35514 0.307 0.609 0.1837 0.679 0.370
#> CV:NMF 4 0.36929 0.440 0.678 0.1474 0.775 0.490
#> MAD:NMF 4 0.35965 0.404 0.641 0.1927 0.809 0.566
#> ATC:NMF 4 0.45926 0.604 0.783 0.0997 0.746 0.448
#> SD:skmeans 4 0.64956 0.729 0.853 0.1211 0.869 0.636
#> CV:skmeans 4 0.41281 0.472 0.695 0.1307 0.854 0.635
#> MAD:skmeans 4 0.63518 0.714 0.845 0.1174 0.872 0.647
#> ATC:skmeans 4 0.68975 0.743 0.849 0.1132 0.826 0.563
#> SD:mclust 4 0.33784 0.575 0.746 0.2163 0.780 0.549
#> CV:mclust 4 0.25526 0.364 0.643 0.2068 0.719 0.459
#> MAD:mclust 4 0.37671 0.547 0.769 0.2621 0.703 0.438
#> ATC:mclust 4 0.34683 0.499 0.722 0.1622 0.834 0.656
#> SD:kmeans 4 0.61000 0.776 0.873 0.2317 0.811 0.609
#> CV:kmeans 4 0.47902 0.498 0.707 0.1428 0.807 0.547
#> MAD:kmeans 4 0.56396 0.678 0.827 0.2326 0.809 0.607
#> ATC:kmeans 4 0.62705 0.783 0.867 0.2549 0.762 0.525
#> SD:pam 4 0.18111 0.510 0.716 0.2139 0.886 0.768
#> CV:pam 4 0.17054 0.376 0.651 0.1203 0.801 0.615
#> MAD:pam 4 0.16119 0.494 0.696 0.2098 0.908 0.810
#> ATC:pam 4 0.43343 0.637 0.810 0.3291 0.743 0.525
#> SD:hclust 4 0.84935 0.878 0.939 0.2014 0.979 0.977
#> CV:hclust 4 0.00285 0.485 0.580 0.1710 0.724 0.594
#> MAD:hclust 4 0.64492 0.850 0.915 0.1968 0.992 0.991
#> ATC:hclust 4 0.21051 0.464 0.800 1.1981 0.979 0.977
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.4926 0.586 0.723 0.0848 0.788 0.415
#> CV:NMF 5 0.4412 0.417 0.628 0.0761 0.845 0.521
#> MAD:NMF 5 0.4750 0.559 0.703 0.0884 0.824 0.477
#> ATC:NMF 5 0.4679 0.367 0.584 0.0910 0.800 0.446
#> SD:skmeans 5 0.6002 0.590 0.770 0.0584 0.962 0.856
#> CV:skmeans 5 0.4163 0.361 0.610 0.0688 0.945 0.814
#> MAD:skmeans 5 0.5920 0.595 0.768 0.0595 0.959 0.846
#> ATC:skmeans 5 0.6982 0.709 0.844 0.0756 0.840 0.508
#> SD:mclust 5 0.3708 0.414 0.639 0.1009 0.855 0.600
#> CV:mclust 5 0.3242 0.370 0.639 0.0804 0.807 0.495
#> MAD:mclust 5 0.3769 0.506 0.627 0.0743 0.868 0.603
#> ATC:mclust 5 0.4327 0.437 0.672 0.1187 0.844 0.629
#> SD:kmeans 5 0.6411 0.557 0.752 0.0879 0.869 0.645
#> CV:kmeans 5 0.5422 0.580 0.725 0.0872 0.818 0.467
#> MAD:kmeans 5 0.5652 0.654 0.735 0.1008 0.836 0.545
#> ATC:kmeans 5 0.6172 0.579 0.736 0.0927 0.911 0.731
#> SD:pam 5 0.2776 0.445 0.686 0.1204 0.875 0.696
#> CV:pam 5 0.1953 0.365 0.637 0.0543 0.973 0.929
#> MAD:pam 5 0.2332 0.406 0.679 0.0976 0.861 0.675
#> ATC:pam 5 0.4799 0.550 0.770 0.0671 0.954 0.861
#> SD:hclust 5 0.7992 0.870 0.932 0.1049 0.991 0.990
#> CV:hclust 5 0.0218 0.487 0.550 0.1050 0.952 0.902
#> MAD:hclust 5 0.5437 0.817 0.900 0.1129 0.991 0.990
#> ATC:hclust 5 0.1912 0.442 0.775 0.0870 0.975 0.972
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.5321 0.467 0.662 0.0424 0.965 0.853
#> CV:NMF 6 0.5197 0.474 0.636 0.0441 0.876 0.525
#> MAD:NMF 6 0.5314 0.449 0.657 0.0437 0.969 0.864
#> ATC:NMF 6 0.4944 0.443 0.647 0.0514 0.823 0.400
#> SD:skmeans 6 0.5892 0.452 0.695 0.0380 0.970 0.873
#> CV:skmeans 6 0.4281 0.258 0.533 0.0432 0.937 0.774
#> MAD:skmeans 6 0.5861 0.466 0.692 0.0382 0.981 0.922
#> ATC:skmeans 6 0.7001 0.605 0.781 0.0534 0.886 0.551
#> SD:mclust 6 0.4653 0.409 0.642 0.0638 0.858 0.530
#> CV:mclust 6 0.3817 0.328 0.563 0.0498 0.902 0.665
#> MAD:mclust 6 0.4102 0.293 0.586 0.0491 0.812 0.429
#> ATC:mclust 6 0.5195 0.639 0.743 0.0971 0.780 0.412
#> SD:kmeans 6 0.6567 0.657 0.783 0.0512 0.838 0.500
#> CV:kmeans 6 0.6255 0.565 0.728 0.0514 0.941 0.743
#> MAD:kmeans 6 0.6378 0.643 0.770 0.0542 0.930 0.725
#> ATC:kmeans 6 0.6531 0.619 0.746 0.0581 0.837 0.472
#> SD:pam 6 0.3105 0.352 0.666 0.0394 0.964 0.887
#> CV:pam 6 0.2080 0.333 0.629 0.0242 0.976 0.934
#> MAD:pam 6 0.2519 0.400 0.662 0.0236 0.987 0.960
#> ATC:pam 6 0.5151 0.565 0.737 0.0766 0.930 0.774
#> SD:hclust 6 0.7295 0.862 0.922 0.1240 0.992 0.990
#> CV:hclust 6 0.0454 0.456 0.543 0.0721 0.949 0.894
#> MAD:hclust 6 0.4458 0.806 0.886 0.1205 0.995 0.995
#> ATC:hclust 6 0.1560 0.403 0.736 0.1356 0.924 0.912
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.995 0.961 0.983 0.0966 0.912 0.912
#> 3 3 0.918 0.882 0.956 0.4949 0.983 0.982
#> 4 4 0.849 0.878 0.939 0.2014 0.979 0.977
#> 5 5 0.799 0.870 0.932 0.1049 0.991 0.990
#> 6 6 0.729 0.862 0.922 0.1240 0.992 0.990
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699881 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699893 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.1184 0.9732 0.016 0.984
#> SRR1699900 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.0672 0.9805 0.008 0.992
#> SRR1699901 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699905 2 0.0938 0.9764 0.012 0.988
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699915 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699924 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699933 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0672 0.9806 0.008 0.992
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.2948 0.9336 0.052 0.948
#> SRR1699946 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.4298 0.8874 0.088 0.912
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0672 0.9802 0.008 0.992
#> SRR1699971 2 0.0672 0.9805 0.008 0.992
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.2778 0.9380 0.048 0.952
#> SRR1699975 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699978 2 0.3584 0.9150 0.068 0.932
#> SRR1699979 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.1843 0.8633 0.972 0.028
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.0938 0.9769 0.012 0.988
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.0672 0.9806 0.008 0.992
#> SRR1699993 2 0.2043 0.9557 0.032 0.968
#> SRR1699994 2 0.1414 0.9682 0.020 0.980
#> SRR1699995 1 0.9833 0.4457 0.576 0.424
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1699999 2 0.8608 0.5321 0.284 0.716
#> SRR1700000 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700003 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700005 1 0.0672 0.8624 0.992 0.008
#> SRR1700006 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.0938 0.9771 0.012 0.988
#> SRR1700009 1 0.6623 0.8123 0.828 0.172
#> SRR1700010 2 0.4690 0.8711 0.100 0.900
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700016 1 0.9522 0.5751 0.628 0.372
#> SRR1700018 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700017 2 0.1184 0.9730 0.016 0.984
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.6623 0.7626 0.172 0.828
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.0672 0.9805 0.008 0.992
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700027 2 0.0672 0.9806 0.008 0.992
#> SRR1700028 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.1184 0.9729 0.016 0.984
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.3733 0.9088 0.072 0.928
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700034 2 0.9833 0.0778 0.424 0.576
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700039 2 0.5408 0.8390 0.124 0.876
#> SRR1700040 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700041 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700042 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700043 2 0.0672 0.9805 0.008 0.992
#> SRR1700045 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700044 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700047 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700048 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700049 2 0.7602 0.6736 0.220 0.780
#> SRR1700050 2 0.4431 0.8834 0.092 0.908
#> SRR1700051 2 0.3879 0.9048 0.076 0.924
#> SRR1700052 2 0.2948 0.9345 0.052 0.948
#> SRR1700053 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700055 1 0.8327 0.7425 0.736 0.264
#> SRR1700056 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700057 2 0.1414 0.9689 0.020 0.980
#> SRR1700058 2 0.0672 0.9804 0.008 0.992
#> SRR1700059 2 0.0938 0.9771 0.012 0.988
#> SRR1700060 2 0.0672 0.9806 0.008 0.992
#> SRR1700061 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700062 2 0.1414 0.9694 0.020 0.980
#> SRR1700063 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700064 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700065 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700066 2 0.1184 0.9727 0.016 0.984
#> SRR1700067 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700068 2 0.0672 0.9807 0.008 0.992
#> SRR1700069 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700072 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700073 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700074 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700076 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700078 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700080 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.2423 0.9472 0.040 0.960
#> SRR1700081 2 0.0938 0.9770 0.012 0.988
#> SRR1700082 2 0.1184 0.9733 0.016 0.984
#> SRR1700083 2 0.3431 0.9198 0.064 0.936
#> SRR1700084 2 0.2603 0.9426 0.044 0.956
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700091 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700096 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700097 2 0.1843 0.9604 0.028 0.972
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700105 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700107 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700119 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700127 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700124 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700128 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700133 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700136 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700137 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700143 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700144 2 0.0672 0.9807 0.008 0.992
#> SRR1700145 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700149 2 0.0938 0.9770 0.012 0.988
#> SRR1700148 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700153 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700154 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.0938 0.9765 0.012 0.988
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700160 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700163 2 0.0672 0.9805 0.008 0.992
#> SRR1700165 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700166 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700170 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700171 2 0.0938 0.9766 0.012 0.988
#> SRR1700172 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.7528 0.7878 0.784 0.216
#> SRR1700185 1 0.1184 0.8633 0.984 0.016
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700192 2 0.9000 0.4463 0.316 0.684
#> SRR1700190 2 0.9815 0.0923 0.420 0.580
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.9833 0.0733 0.424 0.576
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700197 2 0.9323 0.3540 0.348 0.652
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.7950 0.6329 0.240 0.760
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0376 0.8616 0.996 0.004
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8603 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.8144 0.7593 0.748 0.252
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700230 2 0.9209 0.3881 0.336 0.664
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.9491 0.5831 0.632 0.368
#> SRR1700240 1 0.2423 0.8614 0.960 0.040
#> SRR1700241 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700242 2 0.6531 0.7637 0.168 0.832
#> SRR1700246 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.8555 0.7273 0.720 0.280
#> SRR1700249 1 0.2043 0.8630 0.968 0.032
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.8267 0.7510 0.740 0.260
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.6438 0.7745 0.164 0.836
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.2236 0.9523 0.036 0.964
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.0672 0.9804 0.008 0.992
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0376 0.9838 0.004 0.996
#> SRR1700330 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9868 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699875 2 0.0592 0.9522 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699876 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699877 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699879 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699878 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699880 2 0.1989 0.9206 0.004 0.948 0.048
#> SRR1699881 2 0.0592 0.9509 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699882 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699883 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699884 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699885 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699886 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699888 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699889 2 0.0424 0.9517 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699890 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699887 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699891 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699892 2 0.0237 0.9524 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699893 2 0.0592 0.9515 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699894 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699895 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699896 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699897 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699898 2 0.2796 0.8723 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699900 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699902 2 0.1643 0.9265 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699901 2 0.1031 0.9474 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699904 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699905 2 0.1711 0.9340 0.008 0.960 0.032
#> SRR1699906 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699907 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699908 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699909 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699910 2 0.0592 0.9505 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699912 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699913 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699914 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699915 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699916 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699917 2 0.0424 0.9505 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699918 2 0.0424 0.9517 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699919 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699920 2 0.0424 0.9519 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699921 2 0.0424 0.9507 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699922 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699923 2 0.0892 0.9485 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699924 2 0.1289 0.9402 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699925 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0237 0.9522 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699927 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699929 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699928 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699930 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699931 2 0.0892 0.9509 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699933 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699932 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699934 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699936 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699937 2 0.1031 0.9481 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699938 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699940 2 0.2625 0.8819 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699939 2 0.0592 0.9517 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699941 2 0.1411 0.9392 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699942 2 0.0592 0.9512 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699943 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699944 2 0.0592 0.9515 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699945 2 0.6473 -0.0507 0.016 0.652 0.332
#> SRR1699946 2 0.0592 0.9514 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699947 2 0.0747 0.9518 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699948 2 0.0747 0.9512 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699949 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699950 2 0.0592 0.9517 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699951 2 0.0592 0.9509 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699952 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699953 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699954 2 0.1529 0.9351 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699955 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699956 2 0.6518 -0.6535 0.004 0.512 0.484
#> SRR1699957 2 0.0592 0.9511 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699959 2 0.1529 0.9343 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699958 2 0.0892 0.9488 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699960 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699961 2 0.0892 0.9471 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699962 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699963 2 0.0747 0.9506 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699964 2 0.0892 0.9494 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699965 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699966 2 0.0747 0.9506 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699967 2 0.0592 0.9511 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699968 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699969 2 0.3340 0.8164 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699971 2 0.1753 0.9212 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699970 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699972 2 0.1411 0.9357 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699973 2 0.0892 0.9493 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699974 2 0.3481 0.8547 0.044 0.904 0.052
#> SRR1699975 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699976 2 0.0747 0.9509 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699977 2 0.0424 0.9519 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699978 2 0.4526 0.7650 0.040 0.856 0.104
#> SRR1699979 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699980 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699981 2 0.1964 0.9188 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699982 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699983 2 0.0424 0.9507 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699984 1 0.1491 0.7475 0.968 0.016 0.016
#> SRR1699985 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699986 2 0.3030 0.8645 0.004 0.904 0.092
#> SRR1699988 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699987 2 0.1529 0.9364 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699989 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699990 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699992 2 0.1031 0.9472 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699991 2 0.2165 0.9059 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699993 2 0.4994 0.6763 0.024 0.816 0.160
#> SRR1699994 2 0.2636 0.9022 0.020 0.932 0.048
#> SRR1699995 1 0.9695 -0.2352 0.452 0.304 0.244
#> SRR1699996 2 0.0237 0.9522 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699997 2 0.0747 0.9497 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699998 2 0.0892 0.9483 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699999 2 0.8666 -0.3520 0.264 0.584 0.152
#> SRR1700000 2 0.0747 0.9508 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700002 2 0.0747 0.9519 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700001 2 0.2796 0.8694 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700003 2 0.1031 0.9476 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700004 2 0.2625 0.8846 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700005 1 0.0424 0.7490 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700006 2 0.1411 0.9381 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700007 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700008 2 0.2711 0.8792 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700009 1 0.5656 0.5966 0.804 0.128 0.068
#> SRR1700010 3 0.6669 0.6462 0.008 0.468 0.524
#> SRR1700011 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700013 2 0.0892 0.9493 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700012 2 0.0892 0.9482 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700014 2 0.0892 0.9490 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700015 2 0.0747 0.9487 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700016 1 0.8378 -0.0140 0.596 0.284 0.120
#> SRR1700018 2 0.2356 0.8973 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700017 2 0.2860 0.8724 0.004 0.912 0.084
#> SRR1700019 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700020 2 0.7622 -0.0560 0.080 0.648 0.272
#> SRR1700021 2 0.0237 0.9511 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700023 2 0.1529 0.9361 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700022 2 0.2066 0.9100 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700024 2 0.0424 0.9519 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700025 2 0.1031 0.9463 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700026 2 0.1411 0.9383 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700027 2 0.1529 0.9306 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700028 2 0.0747 0.9502 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700029 2 0.2584 0.8985 0.008 0.928 0.064
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700031 2 0.5159 0.6683 0.040 0.820 0.140
#> SRR1700032 2 0.0592 0.9519 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700034 2 0.9252 -0.6504 0.372 0.468 0.160
#> SRR1700035 2 0.0424 0.9507 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700033 2 0.1753 0.9284 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700036 2 0.0592 0.9512 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700037 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700038 2 0.1411 0.9388 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700039 2 0.7091 0.1141 0.056 0.676 0.268
#> SRR1700040 2 0.1753 0.9282 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700041 2 0.1643 0.9313 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700042 2 0.1643 0.9273 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700043 2 0.1643 0.9296 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700045 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700044 2 0.0892 0.9488 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700046 2 0.0892 0.9469 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700047 2 0.2261 0.9057 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700048 2 0.0747 0.9505 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700049 2 0.8291 -0.2663 0.116 0.604 0.280
#> SRR1700050 2 0.5330 0.6507 0.044 0.812 0.144
#> SRR1700051 2 0.5222 0.6547 0.040 0.816 0.144
#> SRR1700052 2 0.3889 0.8258 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700053 2 0.0592 0.9507 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700054 2 0.1289 0.9409 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700055 1 0.8282 0.4626 0.632 0.160 0.208
#> SRR1700056 2 0.1753 0.9283 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700057 2 0.2772 0.8818 0.004 0.916 0.080
#> SRR1700058 2 0.2590 0.8939 0.004 0.924 0.072
#> SRR1700059 2 0.2796 0.8699 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700060 2 0.2261 0.9035 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700061 2 0.0747 0.9491 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700062 2 0.2945 0.8693 0.004 0.908 0.088
#> SRR1700063 2 0.2400 0.8994 0.004 0.932 0.064
#> SRR1700064 2 0.1031 0.9479 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700065 2 0.1964 0.9180 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700066 2 0.3120 0.8715 0.012 0.908 0.080
#> SRR1700067 2 0.0424 0.9521 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700068 2 0.2356 0.9042 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700069 2 0.1031 0.9469 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700070 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700071 2 0.1643 0.9330 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700072 2 0.1964 0.9175 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700073 2 0.0237 0.9518 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700075 2 0.2165 0.9121 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700074 2 0.1643 0.9309 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700076 2 0.0892 0.9496 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700077 2 0.1860 0.9236 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700078 2 0.1289 0.9416 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700080 2 0.1643 0.9326 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700079 2 0.3213 0.8538 0.008 0.900 0.092
#> SRR1700081 2 0.1964 0.9176 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700082 2 0.3482 0.7890 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700083 2 0.4217 0.7788 0.032 0.868 0.100
#> SRR1700084 2 0.4137 0.7939 0.032 0.872 0.096
#> SRR1700085 2 0.0592 0.9517 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700086 2 0.1163 0.9447 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700087 2 0.1411 0.9396 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700088 2 0.0592 0.9512 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700089 2 0.1031 0.9470 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700091 2 0.1031 0.9475 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700090 2 0.0892 0.9482 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700092 2 0.0747 0.9513 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700094 2 0.0424 0.9519 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700093 2 0.0747 0.9502 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700095 2 0.2448 0.8952 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700096 2 0.0747 0.9506 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700097 2 0.3769 0.8233 0.016 0.880 0.104
#> SRR1700098 2 0.0892 0.9487 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700099 2 0.0747 0.9490 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700100 2 0.0592 0.9510 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700101 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700102 2 0.0892 0.9494 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700104 2 0.0892 0.9491 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700103 2 0.1643 0.9343 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700105 2 0.0892 0.9491 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700106 2 0.1529 0.9371 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700107 2 0.0892 0.9492 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700108 2 0.0592 0.9510 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700109 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700110 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700112 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700111 2 0.1289 0.9423 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700113 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700114 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700115 2 0.0747 0.9500 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700116 2 0.0747 0.9504 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700117 2 0.2537 0.8891 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700119 2 0.0592 0.9507 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700118 2 0.0592 0.9510 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700120 2 0.1753 0.9306 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700121 2 0.0592 0.9505 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700122 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700123 2 0.2356 0.9036 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700125 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700126 2 0.1529 0.9370 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700127 2 0.1289 0.9428 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700124 2 0.1643 0.9336 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700128 2 0.1411 0.9403 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700129 2 0.0424 0.9517 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700130 2 0.1031 0.9473 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700132 2 0.0892 0.9491 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700131 2 0.1031 0.9470 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700133 2 0.0892 0.9482 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700134 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700135 2 0.1289 0.9429 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700136 2 0.1163 0.9451 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700137 2 0.1411 0.9404 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700138 2 0.0747 0.9506 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700140 2 0.1289 0.9432 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700139 2 0.0747 0.9496 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700141 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700142 2 0.1411 0.9385 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700143 2 0.1529 0.9373 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700144 2 0.1964 0.9217 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700145 2 0.1163 0.9452 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700146 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700147 2 0.1411 0.9410 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700149 2 0.2625 0.8819 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700148 2 0.1411 0.9404 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700150 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700152 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700151 2 0.1643 0.9338 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700153 2 0.1860 0.9247 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700154 2 0.1289 0.9431 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700155 2 0.0424 0.9510 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700156 2 0.1753 0.9306 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700158 2 0.2845 0.8895 0.012 0.920 0.068
#> SRR1700159 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700157 2 0.1031 0.9472 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700160 2 0.0892 0.9495 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700161 2 0.1031 0.9475 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700162 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700164 2 0.0892 0.9489 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700163 2 0.2356 0.9047 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700165 2 0.1031 0.9477 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700166 2 0.0747 0.9493 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700168 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700167 2 0.1031 0.9470 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700170 2 0.1031 0.9470 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700169 2 0.0592 0.9512 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700171 2 0.3532 0.8267 0.008 0.884 0.108
#> SRR1700172 2 0.1031 0.9470 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700174 2 0.1031 0.9472 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700173 2 0.0892 0.9481 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700175 2 0.0747 0.9490 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700176 2 0.1964 0.9219 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700178 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700177 2 0.0892 0.9487 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700180 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700179 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700181 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700184 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700186 2 0.0424 0.9514 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700187 1 0.6324 0.5412 0.764 0.160 0.076
#> SRR1700185 1 0.0983 0.7484 0.980 0.016 0.004
#> SRR1700188 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700192 2 0.9198 -0.5234 0.280 0.528 0.192
#> SRR1700190 3 0.8670 -0.2758 0.240 0.168 0.592
#> SRR1700191 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.8652 -0.5892 0.404 0.492 0.104
#> SRR1700193 2 0.0592 0.9516 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700195 2 0.0424 0.9514 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700194 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700197 2 0.9865 -0.7550 0.292 0.416 0.292
#> SRR1700198 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700199 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700200 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700201 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700202 2 0.0892 0.9495 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700203 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700204 2 0.0237 0.9522 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700206 2 0.1031 0.9497 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700207 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700208 3 0.8561 0.5922 0.104 0.368 0.528
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700210 2 0.0592 0.9515 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700211 2 0.1289 0.9391 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700212 2 0.0424 0.9520 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700213 2 0.1411 0.9436 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700214 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700215 1 0.0237 0.7464 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700217 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700216 1 0.0000 0.7468 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700219 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700222 1 0.6986 0.4787 0.724 0.180 0.096
#> SRR1700220 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700221 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700223 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700224 2 0.0592 0.9522 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700226 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700229 2 0.0424 0.9514 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700225 2 0.1289 0.9410 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700227 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700230 2 0.8503 -0.3924 0.304 0.576 0.120
#> SRR1700231 2 0.0592 0.9520 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700228 2 0.0747 0.9518 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700232 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700233 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700234 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700235 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700237 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700236 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700238 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 1 0.8345 -0.0515 0.596 0.288 0.116
#> SRR1700240 1 0.1905 0.7407 0.956 0.028 0.016
#> SRR1700241 2 0.0892 0.9493 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700243 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700244 2 0.0592 0.9519 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700242 2 0.6546 0.4386 0.148 0.756 0.096
#> SRR1700246 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700245 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700247 1 0.7330 0.3441 0.692 0.216 0.092
#> SRR1700249 1 0.1636 0.7474 0.964 0.016 0.020
#> SRR1700250 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700248 2 0.0424 0.9514 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700251 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700252 2 0.1289 0.9455 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700253 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700256 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700254 1 0.7205 0.4402 0.708 0.192 0.100
#> SRR1700255 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700257 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700258 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700259 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700260 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700261 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700262 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700263 2 0.0592 0.9516 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700264 2 0.0747 0.9508 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700265 2 0.0747 0.9509 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700266 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700268 2 0.2096 0.9155 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700270 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700267 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700271 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700272 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700273 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700274 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700277 3 0.7575 0.6636 0.040 0.456 0.504
#> SRR1700275 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700276 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700278 2 0.0424 0.9518 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700279 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700280 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700281 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700283 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700282 2 0.1411 0.9402 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700284 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700285 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700286 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700287 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700290 2 0.5053 0.6537 0.024 0.812 0.164
#> SRR1700289 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700288 2 0.0592 0.9521 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700292 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700291 2 0.0592 0.9503 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700293 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700294 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700295 2 0.3816 0.7604 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700297 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700296 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700298 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700299 2 0.0237 0.9523 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700300 2 0.1289 0.9427 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700302 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700301 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700303 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700305 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700306 2 0.2448 0.8946 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700308 2 0.0237 0.9518 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700307 2 0.0592 0.9510 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700309 2 0.1753 0.9286 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700310 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700311 2 0.1163 0.9459 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700312 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700313 2 0.0747 0.9499 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700314 2 0.0424 0.9518 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700315 2 0.0424 0.9519 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700316 2 0.0424 0.9517 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700317 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700318 2 0.0892 0.9490 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700319 2 0.1529 0.9348 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700320 2 0.0424 0.9513 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9511 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700321 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700323 2 0.0237 0.9504 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700324 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700325 2 0.0424 0.9518 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700326 2 0.1525 0.9371 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700327 2 0.0592 0.9517 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700329 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700328 2 0.1163 0.9453 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700330 2 0.0592 0.9509 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700331 2 0.0237 0.9514 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700332 2 0.0424 0.9515 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700333 2 0.0424 0.9516 0.000 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699875 3 0.0592 0.95091 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699876 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699877 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699879 3 0.0336 0.95029 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699878 3 0.0779 0.95060 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699880 3 0.2255 0.90284 0.000 0.068 0.920 0.012
#> SRR1699881 3 0.0707 0.94955 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699882 3 0.0657 0.95023 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699883 3 0.0657 0.95019 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699884 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699885 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699886 3 0.0469 0.94940 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699888 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699889 3 0.0469 0.95018 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699890 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699887 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699891 3 0.0469 0.94940 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699892 3 0.0524 0.95113 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699893 3 0.0592 0.95070 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699894 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699895 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699896 3 0.0895 0.95041 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699897 3 0.0817 0.95062 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699898 3 0.2987 0.85566 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1699900 3 0.1151 0.94806 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1699899 3 0.0188 0.94932 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699902 3 0.1888 0.92295 0.000 0.044 0.940 0.016
#> SRR1699901 3 0.1118 0.94497 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1699903 3 0.0188 0.94932 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699904 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699905 3 0.1786 0.93387 0.008 0.036 0.948 0.008
#> SRR1699906 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699907 3 0.0592 0.95071 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699908 3 0.0657 0.94986 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699909 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699910 3 0.0817 0.94971 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699911 3 0.0336 0.95015 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699912 3 0.0707 0.95074 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699913 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699914 3 0.0817 0.95002 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699915 3 0.0592 0.94975 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699916 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699917 3 0.0817 0.94998 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699918 3 0.0592 0.95149 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699919 3 0.0707 0.95074 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699920 3 0.0707 0.95113 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699921 3 0.0895 0.95043 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699922 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699923 3 0.1256 0.94704 0.000 0.028 0.964 0.008
#> SRR1699924 3 0.1489 0.93488 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1699925 1 0.0188 0.82920 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699926 3 0.0524 0.95115 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699927 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699929 3 0.0524 0.95070 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699928 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699930 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699931 3 0.1452 0.94653 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1699933 3 0.0779 0.95092 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699932 3 0.0592 0.95093 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699934 1 0.0188 0.82920 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699935 3 0.0817 0.94950 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699936 3 0.0657 0.94986 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699937 3 0.1042 0.94919 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1699938 3 0.0469 0.94940 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699940 3 0.2861 0.87069 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1699939 3 0.0895 0.95110 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699941 3 0.1824 0.92712 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1699942 3 0.0779 0.95034 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699943 3 0.0469 0.95092 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699944 3 0.1004 0.95042 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699945 3 0.6989 -0.36850 0.004 0.348 0.536 0.112
#> SRR1699946 3 0.0895 0.95010 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699947 3 0.0817 0.95113 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699948 3 0.0707 0.95086 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699949 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699950 3 0.0895 0.95110 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699951 3 0.0707 0.95019 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699952 3 0.0469 0.94940 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699953 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699954 3 0.1557 0.92998 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699955 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699956 2 0.6262 0.14590 0.000 0.540 0.400 0.060
#> SRR1699957 3 0.1004 0.94930 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699959 3 0.1635 0.93529 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1699958 3 0.1022 0.94770 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699960 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699961 3 0.1109 0.94653 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1699962 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699963 3 0.1004 0.94873 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699964 3 0.1109 0.94826 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1699965 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699966 3 0.0921 0.94919 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699967 3 0.0657 0.95027 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699968 3 0.0524 0.95054 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699969 3 0.3377 0.80187 0.000 0.140 0.848 0.012
#> SRR1699971 3 0.1975 0.91802 0.000 0.048 0.936 0.016
#> SRR1699970 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699972 3 0.1356 0.93928 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1699973 3 0.0817 0.94948 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699974 3 0.3633 0.83686 0.032 0.076 0.872 0.020
#> SRR1699975 3 0.0817 0.95119 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699976 3 0.1004 0.94970 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699977 3 0.0895 0.95044 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699978 3 0.5103 0.67016 0.020 0.096 0.792 0.092
#> SRR1699979 3 0.0895 0.94867 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699980 3 0.0469 0.94956 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699981 3 0.1867 0.91550 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699982 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699983 3 0.0592 0.94988 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699984 1 0.1474 0.82311 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699985 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699986 3 0.3450 0.83471 0.004 0.108 0.864 0.024
#> SRR1699988 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699987 3 0.1557 0.93305 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699989 3 0.0469 0.95113 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699990 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699992 3 0.1109 0.94711 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1699991 3 0.2174 0.91128 0.000 0.052 0.928 0.020
#> SRR1699993 3 0.5393 0.58033 0.016 0.176 0.752 0.056
#> SRR1699994 3 0.3540 0.84183 0.012 0.084 0.872 0.032
#> SRR1699995 4 0.7447 -0.37204 0.356 0.016 0.120 0.508
#> SRR1699996 3 0.0779 0.95096 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699997 3 0.0817 0.94948 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699998 3 0.1004 0.94776 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699999 3 0.9198 -0.59901 0.228 0.136 0.456 0.180
#> SRR1700000 3 0.0895 0.95036 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700002 3 0.0895 0.95152 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700001 3 0.3224 0.82985 0.000 0.120 0.864 0.016
#> SRR1700003 3 0.1004 0.94862 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700004 3 0.2654 0.87099 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR1700005 1 0.0469 0.82915 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700006 3 0.1452 0.93865 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1700007 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700008 3 0.3245 0.83785 0.000 0.100 0.872 0.028
#> SRR1700009 1 0.5120 0.72296 0.752 0.008 0.044 0.196
#> SRR1700010 2 0.6234 0.23594 0.000 0.584 0.348 0.068
#> SRR1700011 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700013 3 0.0921 0.94879 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700012 3 0.1022 0.94565 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700014 3 0.0921 0.94861 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700015 3 0.0937 0.94880 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1700016 1 0.7407 0.22781 0.556 0.012 0.160 0.272
#> SRR1700018 3 0.2563 0.88660 0.000 0.072 0.908 0.020
#> SRR1700017 3 0.3333 0.83965 0.004 0.088 0.876 0.032
#> SRR1700019 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700020 4 0.7569 -0.00421 0.020 0.132 0.324 0.524
#> SRR1700021 3 0.0524 0.95027 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700023 3 0.1824 0.92630 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700022 3 0.2179 0.90571 0.000 0.064 0.924 0.012
#> SRR1700024 3 0.0779 0.95128 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700025 3 0.1174 0.94850 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1700026 3 0.1398 0.94006 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700027 3 0.1706 0.93189 0.000 0.036 0.948 0.016
#> SRR1700028 3 0.1004 0.94834 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700029 3 0.2708 0.88230 0.004 0.076 0.904 0.016
#> SRR1700030 3 0.0524 0.94993 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700031 3 0.5998 0.37742 0.004 0.108 0.696 0.192
#> SRR1700032 3 0.0469 0.95080 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700034 4 0.9368 0.04476 0.308 0.088 0.284 0.320
#> SRR1700035 3 0.0657 0.95021 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700033 3 0.1890 0.92193 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700036 3 0.0895 0.94990 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700037 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700038 3 0.1256 0.94353 0.000 0.028 0.964 0.008
#> SRR1700039 3 0.7462 -0.43562 0.008 0.156 0.516 0.320
#> SRR1700040 3 0.2060 0.91716 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR1700041 3 0.1635 0.93300 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700042 3 0.1635 0.93141 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700043 3 0.1820 0.92767 0.000 0.036 0.944 0.020
#> SRR1700045 3 0.1151 0.94742 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1700044 3 0.1004 0.94954 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700046 3 0.1209 0.94500 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700047 3 0.2402 0.90163 0.000 0.076 0.912 0.012
#> SRR1700048 3 0.0921 0.94902 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700049 4 0.7787 -0.10876 0.048 0.088 0.384 0.480
#> SRR1700050 3 0.5612 0.53952 0.008 0.100 0.740 0.152
#> SRR1700051 3 0.6680 0.24960 0.024 0.108 0.664 0.204
#> SRR1700052 3 0.4226 0.78240 0.016 0.092 0.840 0.052
#> SRR1700053 3 0.0895 0.94958 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700054 3 0.1635 0.93587 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700055 1 0.5990 0.61760 0.524 0.012 0.020 0.444
#> SRR1700056 3 0.1940 0.91262 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1700057 3 0.2871 0.87125 0.000 0.072 0.896 0.032
#> SRR1700058 3 0.2843 0.87535 0.000 0.088 0.892 0.020
#> SRR1700059 3 0.2730 0.86991 0.000 0.088 0.896 0.016
#> SRR1700060 3 0.2662 0.88463 0.000 0.084 0.900 0.016
#> SRR1700061 3 0.1151 0.94519 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1700062 3 0.3399 0.83120 0.000 0.092 0.868 0.040
#> SRR1700063 3 0.2450 0.89559 0.000 0.072 0.912 0.016
#> SRR1700064 3 0.1109 0.94785 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700065 3 0.1938 0.91955 0.000 0.052 0.936 0.012
#> SRR1700066 3 0.3135 0.86242 0.012 0.092 0.884 0.012
#> SRR1700067 3 0.0779 0.95129 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700068 3 0.2342 0.90081 0.000 0.080 0.912 0.008
#> SRR1700069 3 0.1452 0.94428 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1700070 3 0.0336 0.94944 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700071 3 0.1743 0.92730 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700072 3 0.1970 0.91742 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700073 3 0.0336 0.95084 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700075 3 0.2198 0.91043 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1700074 3 0.1722 0.92965 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700076 3 0.1004 0.94889 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700077 3 0.1938 0.92468 0.000 0.052 0.936 0.012
#> SRR1700078 3 0.1398 0.93934 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700080 3 0.1576 0.93441 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700079 3 0.3870 0.79925 0.004 0.080 0.852 0.064
#> SRR1700081 3 0.2706 0.88269 0.000 0.080 0.900 0.020
#> SRR1700082 3 0.3743 0.74473 0.000 0.160 0.824 0.016
#> SRR1700083 3 0.5341 0.62905 0.020 0.096 0.776 0.108
#> SRR1700084 3 0.5013 0.69501 0.028 0.108 0.800 0.064
#> SRR1700085 3 0.0779 0.95060 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700086 3 0.1305 0.94394 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1700087 3 0.1716 0.92754 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1700088 3 0.0592 0.95018 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700089 3 0.1398 0.94040 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700091 3 0.1022 0.94666 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700090 3 0.1022 0.94617 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700092 3 0.0817 0.95093 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700094 3 0.0524 0.95169 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700093 3 0.0817 0.94932 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700095 3 0.2334 0.89148 0.000 0.088 0.908 0.004
#> SRR1700096 3 0.0921 0.94845 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700097 3 0.3820 0.82187 0.016 0.100 0.856 0.028
#> SRR1700098 3 0.0921 0.94758 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700099 3 0.0817 0.94834 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700100 3 0.0469 0.95046 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700101 3 0.0921 0.94804 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700102 3 0.0921 0.94878 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700104 3 0.1118 0.94595 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700103 3 0.1474 0.93607 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700105 3 0.0921 0.94837 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700106 3 0.1807 0.92953 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700107 3 0.0817 0.94944 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700108 3 0.0592 0.95003 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700109 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700110 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700112 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700111 3 0.1211 0.94359 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700113 3 0.1022 0.94761 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700114 3 0.0921 0.94804 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700115 3 0.0921 0.94890 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700116 3 0.0707 0.95027 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700117 3 0.3037 0.86203 0.000 0.100 0.880 0.020
#> SRR1700119 3 0.0592 0.95017 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700118 3 0.0707 0.95002 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700120 3 0.1743 0.93026 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700121 3 0.0707 0.94936 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700122 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700123 3 0.2149 0.89916 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1700125 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700126 3 0.1489 0.93720 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700127 3 0.1118 0.94450 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700124 3 0.1902 0.92430 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700128 3 0.1474 0.93562 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700129 3 0.0524 0.95032 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700130 3 0.1118 0.94603 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700132 3 0.0817 0.94931 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700131 3 0.1211 0.94340 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700133 3 0.0921 0.94758 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700134 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700135 3 0.1211 0.94301 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700136 3 0.1389 0.93791 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700137 3 0.1211 0.94297 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700138 3 0.1118 0.94531 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700140 3 0.1211 0.94316 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700139 3 0.0817 0.94827 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700141 3 0.0779 0.95054 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700142 3 0.1722 0.93121 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700143 3 0.1824 0.92619 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700144 3 0.1970 0.92385 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700145 3 0.1302 0.94080 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700146 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700147 3 0.1576 0.93692 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700149 3 0.3117 0.85831 0.000 0.092 0.880 0.028
#> SRR1700148 3 0.1474 0.93558 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700150 3 0.0592 0.95024 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700152 3 0.0817 0.94943 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700151 3 0.1661 0.93211 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1700153 3 0.1902 0.92161 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700154 3 0.1474 0.93736 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700155 3 0.0469 0.94999 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700156 3 0.1824 0.92461 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700158 3 0.2727 0.88800 0.012 0.084 0.900 0.004
#> SRR1700159 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700157 3 0.1022 0.94622 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700160 3 0.1209 0.94639 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700161 3 0.1211 0.94310 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700162 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700164 3 0.0921 0.94826 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700163 3 0.2843 0.87637 0.000 0.088 0.892 0.020
#> SRR1700165 3 0.1398 0.94088 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700166 3 0.0895 0.94979 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700168 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700167 3 0.1209 0.94451 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700170 3 0.1211 0.94341 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700169 3 0.0657 0.95149 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700171 3 0.3389 0.82867 0.004 0.104 0.868 0.024
#> SRR1700172 3 0.1022 0.94680 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700174 3 0.1211 0.94378 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700173 3 0.1022 0.94601 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700175 3 0.0707 0.94861 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700176 3 0.2048 0.92251 0.000 0.064 0.928 0.008
#> SRR1700178 3 0.0524 0.94965 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700177 3 0.1118 0.94598 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700180 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700179 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700181 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700183 1 0.0188 0.82920 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700182 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700184 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700186 3 0.0336 0.95037 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700187 1 0.5784 0.67234 0.728 0.016 0.076 0.180
#> SRR1700185 1 0.0817 0.82723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700188 3 0.0524 0.94989 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700192 3 0.9535 -0.71119 0.224 0.144 0.396 0.236
#> SRR1700190 2 0.6077 -0.29580 0.136 0.736 0.084 0.044
#> SRR1700191 1 0.0000 0.82922 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.9031 -0.73745 0.364 0.080 0.368 0.188
#> SRR1700193 3 0.0657 0.95051 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700195 3 0.0657 0.95024 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700194 1 0.0000 0.82922 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700197 2 0.9745 -0.10870 0.240 0.328 0.280 0.152
#> SRR1700198 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700199 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700200 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700201 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700202 3 0.1004 0.94891 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700203 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700204 3 0.0779 0.95031 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700206 3 0.1042 0.95057 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1700207 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700208 2 0.6826 0.14572 0.076 0.632 0.260 0.032
#> SRR1700205 3 0.0376 0.95013 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700209 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700210 3 0.0592 0.95118 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700211 3 0.1388 0.94080 0.000 0.028 0.960 0.012
#> SRR1700212 3 0.0657 0.95136 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700213 3 0.1545 0.94381 0.000 0.040 0.952 0.008
#> SRR1700214 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700215 1 0.0336 0.82934 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700216 1 0.0188 0.82920 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700218 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700219 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700222 1 0.6625 0.58513 0.684 0.036 0.100 0.180
#> SRR1700220 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700221 3 0.0524 0.94975 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700223 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700224 3 0.0895 0.95099 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700226 3 0.0524 0.94965 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700229 3 0.0657 0.95050 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700225 3 0.1489 0.93796 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700227 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700230 3 0.8691 -0.51988 0.288 0.116 0.484 0.112
#> SRR1700231 3 0.0592 0.95080 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700228 3 0.0779 0.95117 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700232 3 0.0469 0.95030 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700233 3 0.0376 0.94962 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700234 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700235 3 0.0336 0.95029 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700237 3 0.0524 0.94996 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700236 3 0.0469 0.95030 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700238 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700239 1 0.8025 0.15601 0.544 0.044 0.168 0.244
#> SRR1700240 1 0.1545 0.82369 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1700241 3 0.0921 0.94842 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700243 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700244 3 0.0657 0.95076 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700242 3 0.7067 0.19251 0.116 0.056 0.664 0.164
#> SRR1700246 3 0.0469 0.95063 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700245 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700247 1 0.6905 0.46981 0.652 0.028 0.124 0.196
#> SRR1700249 1 0.1452 0.82450 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1700250 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700248 3 0.0524 0.94999 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700251 3 0.0469 0.95062 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700252 3 0.1398 0.94463 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700253 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700256 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700254 1 0.6734 0.57943 0.660 0.028 0.100 0.212
#> SRR1700255 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700257 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700258 3 0.0336 0.95029 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700259 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700260 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700261 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700262 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700263 3 0.0657 0.95065 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700264 3 0.1004 0.94950 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700265 3 0.0921 0.94877 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700266 3 0.0657 0.95023 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700268 3 0.2234 0.90694 0.004 0.064 0.924 0.008
#> SRR1700270 3 0.0657 0.95019 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700267 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700271 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700272 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700273 3 0.0336 0.94992 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700274 3 0.0336 0.95003 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700277 2 0.5847 0.24113 0.024 0.612 0.352 0.012
#> SRR1700275 3 0.0524 0.94989 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700276 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700278 3 0.0336 0.95072 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700279 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700280 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700281 3 0.0524 0.94989 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700283 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700282 3 0.1398 0.94401 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700284 3 0.0336 0.95003 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700285 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700286 3 0.0657 0.94986 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700287 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700290 3 0.6090 0.43841 0.016 0.180 0.708 0.096
#> SRR1700289 3 0.0469 0.94940 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700288 3 0.0707 0.95083 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700292 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700291 3 0.0779 0.95048 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700293 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700294 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700295 3 0.4379 0.68563 0.000 0.172 0.792 0.036
#> SRR1700297 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700296 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700298 3 0.0336 0.95034 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700299 3 0.0336 0.95153 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700300 3 0.1209 0.94542 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700302 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700301 3 0.0524 0.94936 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700303 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700304 3 0.0188 0.95136 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700305 3 0.0336 0.95003 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700306 3 0.2563 0.89615 0.000 0.072 0.908 0.020
#> SRR1700308 3 0.0524 0.95084 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700307 3 0.0779 0.95075 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1700309 3 0.1970 0.92167 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700310 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700311 3 0.1305 0.94415 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1700312 3 0.0524 0.95010 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700313 3 0.1109 0.94929 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700314 3 0.0817 0.95012 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700315 3 0.0672 0.95126 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700316 3 0.0895 0.95103 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700317 3 0.0336 0.94921 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700318 3 0.1004 0.94832 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700319 3 0.1743 0.92798 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700320 3 0.0592 0.95013 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700322 3 0.0188 0.94932 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700321 3 0.0188 0.94911 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700323 3 0.0188 0.94892 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700324 3 0.0376 0.94909 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700325 3 0.0469 0.95084 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700326 3 0.1639 0.93604 0.004 0.036 0.952 0.008
#> SRR1700327 3 0.0469 0.95025 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700329 3 0.0336 0.95003 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700328 3 0.1356 0.94555 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1700330 3 0.0592 0.95064 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700331 3 0.0524 0.95057 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700332 3 0.0336 0.95003 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700333 3 0.0657 0.95049 0.000 0.012 0.984 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0671 0.9511 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699876 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699877 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0324 0.9499 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1699878 2 0.0771 0.9507 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1699880 2 0.2666 0.8866 0.000 0.892 0.076 0.020 0.012
#> SRR1699881 2 0.0955 0.9489 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1699882 2 0.0566 0.9499 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1699883 2 0.0671 0.9504 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699884 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0451 0.9495 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699888 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.0404 0.9498 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699890 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699887 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699891 2 0.0451 0.9495 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699892 2 0.0671 0.9510 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699893 2 0.0798 0.9503 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1699894 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699895 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699896 2 0.1041 0.9497 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1699897 2 0.0771 0.9508 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1699898 2 0.3448 0.8435 0.000 0.856 0.080 0.028 0.036
#> SRR1699900 2 0.1280 0.9479 0.000 0.960 0.024 0.008 0.008
#> SRR1699899 2 0.0162 0.9489 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699902 2 0.2321 0.9106 0.000 0.916 0.044 0.024 0.016
#> SRR1699901 2 0.1525 0.9385 0.000 0.948 0.036 0.004 0.012
#> SRR1699903 2 0.0162 0.9489 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699904 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699905 2 0.1996 0.9253 0.008 0.932 0.040 0.004 0.016
#> SRR1699906 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699907 2 0.0510 0.9503 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1699908 2 0.0510 0.9497 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1699909 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699910 2 0.0794 0.9498 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1699911 2 0.0290 0.9498 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699912 2 0.0671 0.9508 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699913 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699914 2 0.0794 0.9499 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1699915 2 0.0671 0.9499 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699916 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699917 2 0.0865 0.9500 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1699918 2 0.0609 0.9514 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699919 2 0.0671 0.9508 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1699920 2 0.0771 0.9510 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699921 2 0.0865 0.9504 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1699922 2 0.0510 0.9502 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1699923 2 0.1357 0.9434 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1699924 2 0.1673 0.9358 0.000 0.944 0.032 0.016 0.008
#> SRR1699925 1 0.0162 0.7200 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699926 2 0.0404 0.9509 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699927 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699929 2 0.0451 0.9505 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699928 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699930 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699931 2 0.1364 0.9462 0.000 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1699933 2 0.0771 0.9508 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699932 2 0.0566 0.9506 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1699934 1 0.0162 0.7200 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699935 2 0.0955 0.9489 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1699936 2 0.0566 0.9498 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1699937 2 0.1082 0.9499 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1699938 2 0.0451 0.9495 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699940 2 0.2914 0.8677 0.000 0.872 0.100 0.016 0.012
#> SRR1699939 2 0.0798 0.9509 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1699941 2 0.2006 0.9167 0.000 0.916 0.072 0.012 0.000
#> SRR1699942 2 0.0865 0.9499 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1699943 2 0.0451 0.9506 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699944 2 0.1041 0.9501 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1699945 2 0.7369 -0.5223 0.004 0.440 0.368 0.064 0.124
#> SRR1699946 2 0.1041 0.9489 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1699947 2 0.0771 0.9512 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1699948 2 0.0771 0.9510 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1699949 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.0898 0.9511 0.000 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR1699951 2 0.0880 0.9496 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.0404 0.9495 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.1956 0.9224 0.000 0.928 0.052 0.008 0.012
#> SRR1699955 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.6402 0.3705 0.000 0.300 0.572 0.076 0.052
#> SRR1699957 2 0.0955 0.9498 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1699959 2 0.1731 0.9368 0.000 0.940 0.040 0.012 0.008
#> SRR1699958 2 0.0880 0.9492 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1699960 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699961 2 0.1281 0.9441 0.000 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR1699962 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.1116 0.9484 0.000 0.964 0.028 0.004 0.004
#> SRR1699964 2 0.0992 0.9496 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1699965 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.1043 0.9474 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1699967 2 0.0609 0.9506 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.0404 0.9502 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699969 2 0.3403 0.7853 0.000 0.820 0.160 0.008 0.012
#> SRR1699971 2 0.2011 0.9214 0.000 0.928 0.044 0.020 0.008
#> SRR1699970 2 0.0404 0.9493 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699972 2 0.1525 0.9384 0.000 0.948 0.036 0.012 0.004
#> SRR1699973 2 0.0794 0.9498 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1699974 2 0.3920 0.8165 0.028 0.840 0.084 0.016 0.032
#> SRR1699975 2 0.0771 0.9512 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699976 2 0.1124 0.9468 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1699977 2 0.0865 0.9505 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1699978 2 0.5120 0.6496 0.008 0.760 0.044 0.116 0.072
#> SRR1699979 2 0.0798 0.9500 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1699980 2 0.0566 0.9500 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1699981 2 0.1892 0.9143 0.000 0.916 0.080 0.004 0.000
#> SRR1699982 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699983 2 0.0566 0.9504 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1699984 1 0.1502 0.7062 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1699985 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699986 2 0.3793 0.8127 0.004 0.832 0.108 0.016 0.040
#> SRR1699988 2 0.0609 0.9506 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699987 2 0.1502 0.9363 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1699989 2 0.0451 0.9510 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1699990 2 0.0404 0.9496 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699992 2 0.1243 0.9459 0.000 0.960 0.028 0.008 0.004
#> SRR1699991 2 0.2270 0.9110 0.000 0.916 0.052 0.020 0.012
#> SRR1699993 2 0.5896 0.4986 0.016 0.696 0.168 0.040 0.080
#> SRR1699994 2 0.3875 0.8196 0.012 0.840 0.088 0.028 0.032
#> SRR1699995 5 0.6996 -0.4187 0.280 0.068 0.016 0.076 0.560
#> SRR1699996 2 0.0703 0.9511 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1699997 2 0.0963 0.9477 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1699998 2 0.0992 0.9487 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1699999 2 0.8981 -0.6001 0.188 0.404 0.128 0.060 0.220
#> SRR1700000 2 0.0865 0.9504 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1700002 2 0.0932 0.9515 0.000 0.972 0.020 0.004 0.004
#> SRR1700001 2 0.3368 0.8273 0.000 0.844 0.120 0.016 0.020
#> SRR1700003 2 0.0992 0.9491 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700004 2 0.2741 0.8533 0.000 0.860 0.132 0.004 0.004
#> SRR1700005 1 0.0771 0.7194 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700006 2 0.1883 0.9285 0.000 0.932 0.048 0.012 0.008
#> SRR1700007 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700008 2 0.3531 0.8329 0.000 0.852 0.080 0.036 0.032
#> SRR1700009 1 0.4512 0.5079 0.688 0.004 0.004 0.016 0.288
#> SRR1700010 3 0.6251 0.4387 0.000 0.248 0.616 0.084 0.052
#> SRR1700011 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700013 2 0.0963 0.9482 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700012 2 0.1251 0.9433 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700014 2 0.1195 0.9472 0.000 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1700015 2 0.1173 0.9461 0.000 0.964 0.020 0.012 0.004
#> SRR1700016 1 0.6916 0.1899 0.516 0.100 0.004 0.052 0.328
#> SRR1700018 2 0.3046 0.8617 0.000 0.876 0.076 0.020 0.028
#> SRR1700017 2 0.3671 0.8175 0.000 0.844 0.060 0.072 0.024
#> SRR1700019 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700020 4 0.4948 0.0000 0.008 0.092 0.028 0.768 0.104
#> SRR1700021 2 0.0510 0.9501 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700023 2 0.2006 0.9164 0.000 0.916 0.072 0.012 0.000
#> SRR1700022 2 0.2390 0.9004 0.000 0.908 0.060 0.024 0.008
#> SRR1700024 2 0.0865 0.9512 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1700025 2 0.1331 0.9450 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700026 2 0.1695 0.9362 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1700027 2 0.1646 0.9359 0.000 0.944 0.032 0.020 0.004
#> SRR1700028 2 0.1116 0.9484 0.000 0.964 0.028 0.004 0.004
#> SRR1700029 2 0.2846 0.8754 0.000 0.888 0.052 0.048 0.012
#> SRR1700030 2 0.0510 0.9505 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700031 2 0.6883 0.0855 0.004 0.588 0.100 0.084 0.224
#> SRR1700032 2 0.0566 0.9509 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700034 5 0.8806 -0.1514 0.260 0.176 0.092 0.064 0.408
#> SRR1700035 2 0.0510 0.9504 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700033 2 0.2378 0.9056 0.000 0.908 0.064 0.016 0.012
#> SRR1700036 2 0.0865 0.9501 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700037 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700038 2 0.1356 0.9431 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700039 2 0.7885 -0.5948 0.004 0.408 0.156 0.096 0.336
#> SRR1700040 2 0.2416 0.9058 0.000 0.908 0.060 0.016 0.016
#> SRR1700041 2 0.1670 0.9301 0.000 0.936 0.052 0.012 0.000
#> SRR1700042 2 0.2100 0.9204 0.000 0.924 0.048 0.016 0.012
#> SRR1700043 2 0.2032 0.9209 0.000 0.924 0.052 0.004 0.020
#> SRR1700045 2 0.1124 0.9465 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700044 2 0.0794 0.9506 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700046 2 0.1329 0.9449 0.000 0.956 0.032 0.008 0.004
#> SRR1700047 2 0.2420 0.8998 0.000 0.896 0.088 0.008 0.008
#> SRR1700048 2 0.1153 0.9485 0.000 0.964 0.024 0.008 0.004
#> SRR1700049 5 0.7975 -0.3286 0.016 0.272 0.120 0.120 0.472
#> SRR1700050 2 0.6050 0.4431 0.008 0.676 0.100 0.044 0.172
#> SRR1700051 2 0.7016 0.0293 0.004 0.576 0.064 0.164 0.192
#> SRR1700052 2 0.4723 0.7313 0.016 0.792 0.100 0.032 0.060
#> SRR1700053 2 0.0771 0.9502 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700054 2 0.1591 0.9359 0.000 0.940 0.052 0.004 0.004
#> SRR1700055 5 0.5551 -0.4514 0.432 0.004 0.008 0.040 0.516
#> SRR1700056 2 0.2474 0.8963 0.000 0.896 0.084 0.008 0.012
#> SRR1700057 2 0.3213 0.8616 0.000 0.872 0.060 0.040 0.028
#> SRR1700058 2 0.2859 0.8707 0.000 0.876 0.096 0.012 0.016
#> SRR1700059 2 0.3191 0.8547 0.000 0.868 0.076 0.040 0.016
#> SRR1700060 2 0.2758 0.8879 0.000 0.888 0.076 0.024 0.012
#> SRR1700061 2 0.1356 0.9424 0.000 0.956 0.028 0.004 0.012
#> SRR1700062 2 0.3893 0.8047 0.000 0.832 0.084 0.048 0.036
#> SRR1700063 2 0.2367 0.8992 0.000 0.904 0.072 0.020 0.004
#> SRR1700064 2 0.1369 0.9452 0.000 0.956 0.028 0.008 0.008
#> SRR1700065 2 0.2266 0.9093 0.000 0.912 0.064 0.016 0.008
#> SRR1700066 2 0.3183 0.8580 0.008 0.868 0.092 0.012 0.020
#> SRR1700067 2 0.0794 0.9508 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700068 2 0.2490 0.8966 0.000 0.896 0.080 0.020 0.004
#> SRR1700069 2 0.1251 0.9466 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700070 2 0.0290 0.9495 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700071 2 0.2060 0.9226 0.000 0.924 0.052 0.016 0.008
#> SRR1700072 2 0.1934 0.9237 0.000 0.928 0.052 0.016 0.004
#> SRR1700073 2 0.0404 0.9503 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700075 2 0.2228 0.9086 0.000 0.908 0.076 0.004 0.012
#> SRR1700074 2 0.1808 0.9299 0.000 0.936 0.044 0.012 0.008
#> SRR1700076 2 0.1026 0.9491 0.000 0.968 0.024 0.004 0.004
#> SRR1700077 2 0.2199 0.9143 0.000 0.916 0.060 0.016 0.008
#> SRR1700078 2 0.1644 0.9349 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1700080 2 0.1662 0.9319 0.000 0.936 0.056 0.004 0.004
#> SRR1700079 2 0.3892 0.8030 0.000 0.836 0.052 0.056 0.056
#> SRR1700081 2 0.3113 0.8702 0.000 0.876 0.064 0.036 0.024
#> SRR1700082 2 0.4206 0.7300 0.000 0.796 0.136 0.048 0.020
#> SRR1700083 2 0.5344 0.6085 0.004 0.740 0.048 0.116 0.092
#> SRR1700084 2 0.5641 0.6189 0.028 0.740 0.104 0.052 0.076
#> SRR1700085 2 0.0609 0.9505 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700086 2 0.1412 0.9432 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1700087 2 0.1662 0.9339 0.000 0.936 0.056 0.004 0.004
#> SRR1700088 2 0.0671 0.9504 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1700089 2 0.1569 0.9392 0.000 0.944 0.044 0.008 0.004
#> SRR1700091 2 0.1124 0.9464 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700090 2 0.1124 0.9458 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700092 2 0.0794 0.9510 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700094 2 0.0833 0.9507 0.000 0.976 0.016 0.004 0.004
#> SRR1700093 2 0.1012 0.9488 0.000 0.968 0.020 0.012 0.000
#> SRR1700095 2 0.2474 0.8910 0.000 0.896 0.084 0.008 0.012
#> SRR1700096 2 0.1285 0.9449 0.000 0.956 0.036 0.004 0.004
#> SRR1700097 2 0.3835 0.8179 0.012 0.836 0.104 0.024 0.024
#> SRR1700098 2 0.0955 0.9481 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700099 2 0.0992 0.9482 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700100 2 0.0609 0.9501 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700101 2 0.0955 0.9485 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700102 2 0.1251 0.9458 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700104 2 0.1043 0.9472 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700103 2 0.1569 0.9377 0.000 0.944 0.044 0.008 0.004
#> SRR1700105 2 0.1195 0.9465 0.000 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1700106 2 0.1913 0.9303 0.000 0.932 0.044 0.016 0.008
#> SRR1700107 2 0.0963 0.9481 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700108 2 0.0794 0.9496 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700109 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700110 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700112 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700111 2 0.1202 0.9461 0.000 0.960 0.032 0.004 0.004
#> SRR1700113 2 0.1168 0.9472 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700114 2 0.1041 0.9475 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1700115 2 0.1082 0.9484 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1700116 2 0.0771 0.9502 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700117 2 0.3166 0.8539 0.000 0.860 0.104 0.016 0.020
#> SRR1700119 2 0.0671 0.9507 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1700118 2 0.0798 0.9501 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700120 2 0.1830 0.9257 0.000 0.924 0.068 0.008 0.000
#> SRR1700121 2 0.0992 0.9484 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700122 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700123 2 0.2295 0.8998 0.000 0.900 0.088 0.008 0.004
#> SRR1700125 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700126 2 0.1443 0.9387 0.000 0.948 0.044 0.004 0.004
#> SRR1700127 2 0.1043 0.9459 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700124 2 0.1857 0.9291 0.000 0.928 0.060 0.004 0.008
#> SRR1700128 2 0.1341 0.9387 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.0510 0.9505 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700130 2 0.1251 0.9460 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700132 2 0.0794 0.9496 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700131 2 0.1331 0.9426 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700133 2 0.1041 0.9471 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1700134 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700135 2 0.1121 0.9447 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1700136 2 0.1788 0.9294 0.000 0.932 0.056 0.004 0.008
#> SRR1700137 2 0.1630 0.9385 0.000 0.944 0.036 0.016 0.004
#> SRR1700138 2 0.1412 0.9438 0.000 0.952 0.036 0.004 0.008
#> SRR1700140 2 0.1522 0.9389 0.000 0.944 0.044 0.012 0.000
#> SRR1700139 2 0.1168 0.9459 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700141 2 0.0771 0.9508 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700142 2 0.2060 0.9211 0.000 0.924 0.052 0.016 0.008
#> SRR1700143 2 0.2131 0.9207 0.000 0.920 0.056 0.016 0.008
#> SRR1700144 2 0.1990 0.9291 0.000 0.928 0.040 0.028 0.004
#> SRR1700145 2 0.1695 0.9366 0.000 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1700146 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700147 2 0.1934 0.9298 0.000 0.928 0.052 0.016 0.004
#> SRR1700149 2 0.3237 0.8496 0.000 0.860 0.096 0.016 0.028
#> SRR1700148 2 0.1410 0.9363 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700150 2 0.0703 0.9497 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700152 2 0.0865 0.9496 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700151 2 0.1798 0.9267 0.000 0.928 0.064 0.004 0.004
#> SRR1700153 2 0.2166 0.9110 0.000 0.912 0.072 0.004 0.012
#> SRR1700154 2 0.1644 0.9374 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1700155 2 0.0609 0.9492 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700156 2 0.1877 0.9243 0.000 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR1700158 2 0.3113 0.8765 0.008 0.876 0.080 0.020 0.016
#> SRR1700159 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700157 2 0.1106 0.9468 0.000 0.964 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700160 2 0.1205 0.9462 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1700161 2 0.1644 0.9364 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1700162 2 0.0290 0.9492 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700164 2 0.1043 0.9470 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700163 2 0.2833 0.8873 0.000 0.888 0.068 0.024 0.020
#> SRR1700165 2 0.1430 0.9379 0.000 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR1700166 2 0.1041 0.9489 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1700168 2 0.0404 0.9494 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700167 2 0.1243 0.9457 0.000 0.960 0.028 0.008 0.004
#> SRR1700170 2 0.1412 0.9436 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1700169 2 0.0771 0.9509 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700171 2 0.3837 0.7999 0.004 0.832 0.104 0.020 0.040
#> SRR1700172 2 0.1124 0.9463 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700174 2 0.1357 0.9417 0.000 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR1700173 2 0.1331 0.9426 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700175 2 0.0955 0.9482 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700176 2 0.2374 0.9147 0.000 0.912 0.052 0.016 0.020
#> SRR1700178 2 0.0404 0.9493 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700177 2 0.1168 0.9470 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700180 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0290 0.9494 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0290 0.9494 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0162 0.7200 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700182 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0451 0.9497 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1700186 2 0.0290 0.9499 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.4946 0.5425 0.688 0.048 0.004 0.004 0.256
#> SRR1700185 1 0.0880 0.7177 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700188 2 0.0404 0.9495 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700192 5 0.8710 -0.2936 0.168 0.320 0.160 0.020 0.332
#> SRR1700190 3 0.5964 -0.5170 0.080 0.056 0.728 0.072 0.064
#> SRR1700191 1 0.0000 0.7204 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.8189 -0.4596 0.328 0.312 0.088 0.004 0.268
#> SRR1700193 2 0.0510 0.9503 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0510 0.9500 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.7204 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.9181 0.1093 0.200 0.184 0.352 0.048 0.216
#> SRR1700198 2 0.0290 0.9494 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0290 0.9494 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0566 0.9502 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.1041 0.9484 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1700203 2 0.0290 0.9492 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0703 0.9505 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0955 0.9505 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700207 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.6088 0.3579 0.056 0.204 0.672 0.044 0.024
#> SRR1700205 2 0.0404 0.9500 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0566 0.9510 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700211 2 0.1538 0.9376 0.000 0.948 0.036 0.008 0.008
#> SRR1700212 2 0.0510 0.9513 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.1357 0.9451 0.000 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR1700214 2 0.0404 0.9499 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0290 0.7209 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0290 0.7208 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700218 2 0.0566 0.9502 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700219 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.5913 0.4781 0.632 0.060 0.028 0.008 0.272
#> SRR1700220 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0566 0.9502 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700223 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0794 0.9510 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0404 0.9493 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0671 0.9506 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1700225 2 0.1644 0.9359 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1700227 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700230 2 0.8375 -0.5015 0.264 0.440 0.112 0.028 0.156
#> SRR1700231 2 0.0579 0.9509 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1700228 2 0.0865 0.9513 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1700232 2 0.0404 0.9498 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0290 0.9498 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.0324 0.9499 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700237 2 0.0451 0.9496 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1700236 2 0.0404 0.9498 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.7501 0.1550 0.492 0.112 0.040 0.036 0.320
#> SRR1700240 1 0.1430 0.7123 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700241 2 0.0880 0.9489 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0566 0.9505 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700242 2 0.6242 0.1778 0.080 0.628 0.048 0.004 0.240
#> SRR1700246 2 0.0451 0.9503 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1700245 2 0.0290 0.9492 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.6129 0.3693 0.604 0.088 0.024 0.004 0.280
#> SRR1700249 1 0.1357 0.7139 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700250 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0404 0.9497 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0404 0.9502 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.1443 0.9438 0.000 0.948 0.044 0.004 0.004
#> SRR1700253 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.5919 0.4404 0.608 0.068 0.012 0.012 0.300
#> SRR1700255 2 0.0404 0.9494 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0324 0.9499 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700259 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700262 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0510 0.9503 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0955 0.9500 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700265 2 0.0880 0.9490 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700266 2 0.0510 0.9499 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.2276 0.9033 0.004 0.908 0.076 0.004 0.008
#> SRR1700270 2 0.0510 0.9499 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0404 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0290 0.9494 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0290 0.9496 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700277 3 0.5249 0.4086 0.012 0.292 0.656 0.024 0.016
#> SRR1700275 2 0.0404 0.9495 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700276 2 0.0404 0.9494 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700278 2 0.0290 0.9503 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700279 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700280 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700281 2 0.0510 0.9502 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700282 2 0.1502 0.9383 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1700284 2 0.0290 0.9496 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700285 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700286 2 0.0510 0.9497 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700287 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700290 2 0.6485 0.3249 0.016 0.644 0.184 0.044 0.112
#> SRR1700289 2 0.0404 0.9495 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700288 2 0.0609 0.9508 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700291 2 0.0703 0.9504 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700293 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700294 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700295 2 0.4681 0.6304 0.000 0.744 0.184 0.012 0.060
#> SRR1700297 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700296 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700298 2 0.0404 0.9500 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700299 2 0.0404 0.9512 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700300 2 0.1412 0.9424 0.000 0.952 0.036 0.004 0.008
#> SRR1700302 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700301 2 0.0510 0.9496 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700303 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700304 2 0.0324 0.9511 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700305 2 0.0290 0.9496 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700306 2 0.2689 0.8871 0.000 0.888 0.084 0.012 0.016
#> SRR1700308 2 0.0404 0.9505 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700307 2 0.0609 0.9510 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700309 2 0.2050 0.9219 0.000 0.920 0.064 0.008 0.008
#> SRR1700310 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700311 2 0.1205 0.9456 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1700312 2 0.0404 0.9497 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700313 2 0.0963 0.9496 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700314 2 0.0703 0.9508 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700315 2 0.0771 0.9508 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700316 2 0.0703 0.9510 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700317 2 0.0290 0.9487 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700318 2 0.0865 0.9494 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700319 2 0.1770 0.9325 0.000 0.936 0.048 0.008 0.008
#> SRR1700320 2 0.0510 0.9502 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700322 2 0.0290 0.9490 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700321 2 0.0162 0.9486 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700323 2 0.0290 0.9492 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700324 2 0.0290 0.9486 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700325 2 0.0510 0.9508 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700326 2 0.1721 0.9337 0.004 0.944 0.028 0.004 0.020
#> SRR1700327 2 0.0404 0.9502 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700329 2 0.0290 0.9496 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700328 2 0.1408 0.9425 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1700330 2 0.0609 0.9505 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700331 2 0.0404 0.9502 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700332 2 0.0290 0.9496 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700333 2 0.0510 0.9502 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699875 2 0.0777 0.9439 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1699876 2 0.0363 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699877 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699879 2 0.0260 0.9416 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699878 2 0.0790 0.9424 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699880 2 0.3214 0.8186 0.000 0.832 0.008 0.008 0.132 0.020
#> SRR1699881 2 0.1152 0.9402 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1699882 2 0.0458 0.9417 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699883 2 0.0713 0.9427 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699884 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699885 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699886 2 0.0405 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1699888 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699889 2 0.0363 0.9418 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699890 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699887 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699891 2 0.0405 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1699892 2 0.0692 0.9432 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699893 2 0.0922 0.9422 0.000 0.968 0.000 0.004 0.024 0.004
#> SRR1699894 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699895 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699896 2 0.1007 0.9413 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1699897 2 0.0713 0.9431 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699898 2 0.3353 0.8111 0.000 0.824 0.020 0.008 0.136 0.012
#> SRR1699900 2 0.1196 0.9405 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699899 2 0.0260 0.9415 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699902 2 0.2466 0.8703 0.000 0.872 0.008 0.008 0.112 0.000
#> SRR1699901 2 0.1644 0.9159 0.000 0.920 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1699903 2 0.0363 0.9408 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699904 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699905 2 0.2169 0.8958 0.008 0.900 0.000 0.000 0.080 0.012
#> SRR1699906 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699907 2 0.0547 0.9427 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699908 2 0.0458 0.9415 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699909 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699910 2 0.0865 0.9418 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699911 2 0.0260 0.9419 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699912 2 0.0692 0.9430 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699913 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699914 2 0.1007 0.9417 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1699915 2 0.0692 0.9419 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699916 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699917 2 0.0858 0.9429 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1699918 2 0.0632 0.9437 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699919 2 0.0603 0.9429 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1699920 2 0.0837 0.9434 0.000 0.972 0.004 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699921 2 0.0790 0.9427 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699922 2 0.0458 0.9420 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699923 2 0.1644 0.9255 0.000 0.920 0.004 0.000 0.076 0.000
#> SRR1699924 2 0.1674 0.9242 0.000 0.924 0.004 0.004 0.068 0.000
#> SRR1699925 1 0.0146 0.8090 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0603 0.9431 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1699927 2 0.0363 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699929 2 0.0547 0.9429 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699928 2 0.0458 0.9412 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699930 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699931 2 0.1219 0.9389 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048 0.000
#> SRR1699933 2 0.1082 0.9421 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699932 2 0.0458 0.9426 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699934 1 0.0146 0.8090 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.1049 0.9412 0.000 0.960 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1699936 2 0.0508 0.9415 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1699937 2 0.0937 0.9431 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699938 2 0.0405 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1699940 2 0.2971 0.8573 0.000 0.860 0.016 0.012 0.100 0.012
#> SRR1699939 2 0.0692 0.9430 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699941 2 0.2102 0.9082 0.000 0.908 0.000 0.012 0.068 0.012
#> SRR1699942 2 0.0935 0.9422 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1699943 2 0.0458 0.9427 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699944 2 0.0937 0.9433 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699945 2 0.7910 -0.7453 0.004 0.324 0.092 0.028 0.284 0.268
#> SRR1699946 2 0.1082 0.9401 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699947 2 0.0692 0.9437 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699948 2 0.0713 0.9435 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699949 2 0.0260 0.9405 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699950 2 0.0777 0.9434 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1699951 2 0.0865 0.9423 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699952 2 0.0632 0.9422 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699953 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699954 2 0.2202 0.9066 0.000 0.904 0.008 0.012 0.072 0.004
#> SRR1699955 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699956 6 0.7378 0.4097 0.000 0.148 0.100 0.028 0.264 0.460
#> SRR1699957 2 0.0937 0.9424 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699959 2 0.1901 0.9250 0.000 0.924 0.004 0.008 0.052 0.012
#> SRR1699958 2 0.1007 0.9404 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1699960 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699961 2 0.1296 0.9369 0.000 0.948 0.004 0.000 0.044 0.004
#> SRR1699962 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699963 2 0.1080 0.9416 0.000 0.960 0.004 0.000 0.032 0.004
#> SRR1699964 2 0.1007 0.9419 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1699965 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699966 2 0.1007 0.9403 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1699967 2 0.0547 0.9427 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699968 2 0.0458 0.9424 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699969 2 0.3934 0.7516 0.000 0.792 0.016 0.004 0.128 0.060
#> SRR1699971 2 0.2312 0.8916 0.000 0.896 0.004 0.008 0.080 0.012
#> SRR1699970 2 0.0547 0.9414 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699972 2 0.1267 0.9296 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1699973 2 0.0865 0.9422 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699974 2 0.4062 0.7721 0.020 0.808 0.024 0.012 0.112 0.024
#> SRR1699975 2 0.0777 0.9434 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699976 2 0.1226 0.9377 0.000 0.952 0.004 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699977 2 0.0865 0.9430 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699978 2 0.5496 0.4948 0.004 0.692 0.036 0.128 0.124 0.016
#> SRR1699979 2 0.1010 0.9406 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1699980 2 0.0603 0.9424 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1699981 2 0.2182 0.9070 0.000 0.904 0.000 0.008 0.068 0.020
#> SRR1699982 2 0.0458 0.9413 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699983 2 0.0508 0.9428 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1699984 1 0.1976 0.7922 0.924 0.000 0.032 0.004 0.032 0.008
#> SRR1699985 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699986 2 0.3686 0.7648 0.004 0.800 0.020 0.008 0.156 0.012
#> SRR1699988 2 0.0547 0.9426 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699987 2 0.1946 0.9175 0.000 0.912 0.004 0.000 0.072 0.012
#> SRR1699989 2 0.0405 0.9432 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699990 2 0.0363 0.9415 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699992 2 0.1141 0.9382 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1699991 2 0.2308 0.8808 0.000 0.880 0.008 0.004 0.108 0.000
#> SRR1699993 2 0.6471 0.2162 0.016 0.600 0.044 0.032 0.228 0.080
#> SRR1699994 2 0.3958 0.7707 0.008 0.804 0.024 0.024 0.128 0.012
#> SRR1699995 3 0.5921 -0.2501 0.196 0.040 0.640 0.012 0.104 0.008
#> SRR1699996 2 0.0865 0.9432 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699997 2 0.1204 0.9367 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1699998 2 0.0865 0.9416 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699999 5 0.8646 0.3631 0.160 0.292 0.088 0.056 0.352 0.052
#> SRR1700000 2 0.0935 0.9427 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700002 2 0.1003 0.9439 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700001 2 0.3632 0.7657 0.000 0.800 0.004 0.008 0.148 0.040
#> SRR1700003 2 0.0937 0.9412 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700004 2 0.2933 0.8431 0.000 0.848 0.004 0.008 0.124 0.016
#> SRR1700005 1 0.0922 0.8094 0.968 0.000 0.004 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700006 2 0.1901 0.9127 0.000 0.912 0.008 0.004 0.076 0.000
#> SRR1700007 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700008 2 0.3602 0.7916 0.000 0.820 0.024 0.028 0.120 0.008
#> SRR1700009 1 0.5086 0.5006 0.616 0.000 0.276 0.004 0.104 0.000
#> SRR1700010 6 0.6931 0.3681 0.000 0.096 0.104 0.028 0.244 0.528
#> SRR1700011 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700013 2 0.1010 0.9418 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700012 2 0.1204 0.9346 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1700014 2 0.1364 0.9384 0.000 0.944 0.000 0.004 0.048 0.004
#> SRR1700015 2 0.1010 0.9386 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700016 1 0.7092 0.4228 0.492 0.036 0.112 0.040 0.304 0.016
#> SRR1700018 2 0.3247 0.8127 0.000 0.840 0.012 0.016 0.116 0.016
#> SRR1700017 2 0.3997 0.7485 0.000 0.800 0.008 0.052 0.112 0.028
#> SRR1700019 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700020 4 0.2632 0.0000 0.000 0.028 0.020 0.896 0.040 0.016
#> SRR1700021 2 0.0713 0.9433 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700023 2 0.2151 0.9041 0.000 0.904 0.000 0.008 0.072 0.016
#> SRR1700022 2 0.2538 0.8785 0.000 0.888 0.004 0.012 0.076 0.020
#> SRR1700024 2 0.0935 0.9434 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700025 2 0.1267 0.9376 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1700026 2 0.1606 0.9278 0.000 0.932 0.008 0.004 0.056 0.000
#> SRR1700027 2 0.1643 0.9232 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068 0.000
#> SRR1700028 2 0.1349 0.9352 0.000 0.940 0.004 0.000 0.056 0.000
#> SRR1700029 2 0.2818 0.8592 0.000 0.872 0.008 0.028 0.084 0.008
#> SRR1700030 2 0.0713 0.9425 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700031 2 0.7473 -0.3577 0.004 0.484 0.188 0.060 0.212 0.052
#> SRR1700032 2 0.0508 0.9430 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700034 3 0.8518 -0.0737 0.184 0.088 0.404 0.048 0.224 0.052
#> SRR1700035 2 0.0713 0.9429 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700033 2 0.2377 0.8865 0.000 0.892 0.008 0.008 0.084 0.008
#> SRR1700036 2 0.1010 0.9412 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700037 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700038 2 0.1411 0.9286 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060 0.000
#> SRR1700039 3 0.8041 -0.4160 0.004 0.280 0.364 0.044 0.208 0.100
#> SRR1700040 2 0.2763 0.8723 0.000 0.876 0.016 0.008 0.084 0.016
#> SRR1700041 2 0.1686 0.9257 0.000 0.932 0.004 0.004 0.052 0.008
#> SRR1700042 2 0.2164 0.9066 0.000 0.908 0.020 0.012 0.060 0.000
#> SRR1700043 2 0.2122 0.8979 0.000 0.900 0.008 0.000 0.084 0.008
#> SRR1700045 2 0.1411 0.9335 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1700044 2 0.0937 0.9421 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700046 2 0.1364 0.9358 0.000 0.944 0.004 0.004 0.048 0.000
#> SRR1700047 2 0.2368 0.8927 0.000 0.888 0.008 0.004 0.092 0.008
#> SRR1700048 2 0.1371 0.9392 0.000 0.948 0.004 0.004 0.040 0.004
#> SRR1700049 3 0.6019 -0.1736 0.000 0.128 0.612 0.012 0.204 0.044
#> SRR1700050 2 0.6222 0.2708 0.000 0.620 0.172 0.040 0.132 0.036
#> SRR1700051 2 0.7304 -0.3781 0.000 0.476 0.164 0.196 0.152 0.012
#> SRR1700052 2 0.4742 0.6570 0.016 0.748 0.040 0.020 0.160 0.016
#> SRR1700053 2 0.0790 0.9422 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700054 2 0.1956 0.9075 0.000 0.908 0.008 0.000 0.080 0.004
#> SRR1700055 3 0.4952 -0.3137 0.320 0.000 0.608 0.004 0.064 0.004
#> SRR1700056 2 0.2586 0.8807 0.000 0.880 0.008 0.000 0.080 0.032
#> SRR1700057 2 0.3352 0.8337 0.000 0.848 0.032 0.024 0.084 0.012
#> SRR1700058 2 0.3182 0.8093 0.000 0.828 0.012 0.000 0.136 0.024
#> SRR1700059 2 0.3756 0.7700 0.000 0.808 0.028 0.036 0.124 0.004
#> SRR1700060 2 0.2952 0.8545 0.000 0.864 0.020 0.016 0.092 0.008
#> SRR1700061 2 0.1536 0.9304 0.000 0.940 0.016 0.004 0.040 0.000
#> SRR1700062 2 0.4123 0.7259 0.000 0.784 0.056 0.016 0.132 0.012
#> SRR1700063 2 0.2753 0.8644 0.000 0.872 0.016 0.016 0.092 0.004
#> SRR1700064 2 0.1440 0.9359 0.000 0.944 0.004 0.004 0.044 0.004
#> SRR1700065 2 0.2261 0.8774 0.000 0.884 0.008 0.004 0.104 0.000
#> SRR1700066 2 0.3277 0.8049 0.004 0.832 0.012 0.008 0.132 0.012
#> SRR1700067 2 0.0865 0.9434 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700068 2 0.2529 0.8881 0.000 0.884 0.008 0.012 0.088 0.008
#> SRR1700069 2 0.1333 0.9375 0.000 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1700070 2 0.0260 0.9412 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700071 2 0.2056 0.9065 0.000 0.904 0.004 0.000 0.080 0.012
#> SRR1700072 2 0.2062 0.8963 0.000 0.900 0.004 0.008 0.088 0.000
#> SRR1700073 2 0.0547 0.9425 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700075 2 0.2326 0.8938 0.000 0.888 0.008 0.000 0.092 0.012
#> SRR1700074 2 0.2044 0.9061 0.000 0.908 0.004 0.008 0.076 0.004
#> SRR1700076 2 0.1010 0.9414 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700077 2 0.2313 0.8766 0.000 0.884 0.012 0.004 0.100 0.000
#> SRR1700078 2 0.1945 0.9194 0.000 0.920 0.004 0.016 0.056 0.004
#> SRR1700080 2 0.1700 0.9193 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR1700079 2 0.3916 0.7763 0.000 0.816 0.056 0.028 0.084 0.016
#> SRR1700081 2 0.3247 0.8194 0.000 0.840 0.016 0.016 0.116 0.012
#> SRR1700082 2 0.4838 0.6188 0.000 0.736 0.024 0.024 0.152 0.064
#> SRR1700083 2 0.5887 0.3568 0.000 0.652 0.072 0.144 0.120 0.012
#> SRR1700084 2 0.5993 0.4513 0.024 0.668 0.052 0.060 0.172 0.024
#> SRR1700085 2 0.0790 0.9435 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700086 2 0.1578 0.9314 0.000 0.936 0.000 0.012 0.048 0.004
#> SRR1700087 2 0.1956 0.9150 0.000 0.908 0.004 0.000 0.080 0.008
#> SRR1700088 2 0.0858 0.9421 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700089 2 0.1493 0.9331 0.000 0.936 0.004 0.000 0.056 0.004
#> SRR1700091 2 0.1152 0.9390 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700090 2 0.1219 0.9370 0.000 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1700092 2 0.0937 0.9432 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700094 2 0.0777 0.9432 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700093 2 0.1082 0.9409 0.000 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1700095 2 0.2745 0.8534 0.000 0.860 0.008 0.000 0.112 0.020
#> SRR1700096 2 0.1327 0.9317 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1700097 2 0.3872 0.7774 0.012 0.800 0.016 0.020 0.144 0.008
#> SRR1700098 2 0.1152 0.9387 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700099 2 0.1082 0.9388 0.000 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1700100 2 0.0790 0.9417 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700101 2 0.1152 0.9392 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700102 2 0.1285 0.9370 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700104 2 0.1141 0.9383 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700103 2 0.1411 0.9301 0.000 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700105 2 0.1219 0.9377 0.000 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1700106 2 0.1988 0.9158 0.000 0.912 0.008 0.004 0.072 0.004
#> SRR1700107 2 0.1141 0.9387 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700108 2 0.0937 0.9418 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700109 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700110 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700112 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700111 2 0.1265 0.9380 0.000 0.948 0.008 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700113 2 0.1265 0.9375 0.000 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1700114 2 0.1152 0.9385 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700115 2 0.1152 0.9395 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700116 2 0.0972 0.9421 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1700117 2 0.3583 0.7946 0.000 0.816 0.024 0.012 0.132 0.016
#> SRR1700119 2 0.0935 0.9412 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700118 2 0.1010 0.9412 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700120 2 0.2095 0.9113 0.000 0.904 0.000 0.004 0.076 0.016
#> SRR1700121 2 0.0935 0.9410 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700122 2 0.0260 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700123 2 0.2357 0.8904 0.000 0.888 0.004 0.004 0.092 0.012
#> SRR1700125 2 0.0260 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700126 2 0.1555 0.9260 0.000 0.932 0.004 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700127 2 0.1349 0.9329 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1700124 2 0.1897 0.9147 0.000 0.908 0.004 0.000 0.084 0.004
#> SRR1700128 2 0.1531 0.9275 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700129 2 0.0547 0.9428 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700130 2 0.1398 0.9366 0.000 0.940 0.000 0.000 0.052 0.008
#> SRR1700132 2 0.1007 0.9397 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700131 2 0.1411 0.9300 0.000 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700133 2 0.1152 0.9386 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700134 2 0.0260 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700135 2 0.1411 0.9317 0.000 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700136 2 0.1753 0.9127 0.000 0.912 0.004 0.000 0.084 0.000
#> SRR1700137 2 0.1728 0.9244 0.000 0.924 0.004 0.000 0.064 0.008
#> SRR1700138 2 0.1411 0.9329 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060 0.000
#> SRR1700140 2 0.1588 0.9249 0.000 0.924 0.000 0.000 0.072 0.004
#> SRR1700139 2 0.1285 0.9351 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700141 2 0.0777 0.9430 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700142 2 0.2077 0.9143 0.000 0.916 0.008 0.008 0.056 0.012
#> SRR1700143 2 0.1987 0.9109 0.000 0.908 0.004 0.004 0.080 0.004
#> SRR1700144 2 0.1918 0.9134 0.000 0.904 0.000 0.008 0.088 0.000
#> SRR1700145 2 0.1674 0.9236 0.000 0.924 0.000 0.004 0.068 0.004
#> SRR1700146 2 0.0260 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700147 2 0.1897 0.9155 0.000 0.908 0.000 0.004 0.084 0.004
#> SRR1700149 2 0.3561 0.8102 0.000 0.828 0.032 0.012 0.108 0.020
#> SRR1700148 2 0.1644 0.9220 0.000 0.920 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1700150 2 0.0858 0.9423 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700152 2 0.1155 0.9396 0.000 0.956 0.004 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700151 2 0.1932 0.9134 0.000 0.912 0.004 0.004 0.076 0.004
#> SRR1700153 2 0.2203 0.8976 0.000 0.896 0.000 0.004 0.084 0.016
#> SRR1700154 2 0.1556 0.9235 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1700155 2 0.0790 0.9410 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700156 2 0.2044 0.9106 0.000 0.908 0.004 0.004 0.076 0.008
#> SRR1700158 2 0.3100 0.8568 0.004 0.856 0.008 0.012 0.100 0.020
#> SRR1700159 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700157 2 0.1333 0.9341 0.000 0.944 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1700160 2 0.1411 0.9337 0.000 0.936 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700161 2 0.1644 0.9223 0.000 0.920 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1700162 2 0.0363 0.9417 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700164 2 0.1349 0.9356 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1700163 2 0.3041 0.8620 0.000 0.864 0.016 0.020 0.084 0.016
#> SRR1700165 2 0.1471 0.9282 0.000 0.932 0.004 0.000 0.064 0.000
#> SRR1700166 2 0.1204 0.9382 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1700168 2 0.0363 0.9410 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700167 2 0.1364 0.9333 0.000 0.944 0.004 0.000 0.048 0.004
#> SRR1700170 2 0.1542 0.9324 0.000 0.936 0.004 0.000 0.052 0.008
#> SRR1700169 2 0.0935 0.9426 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700171 2 0.4112 0.6902 0.004 0.764 0.020 0.004 0.180 0.028
#> SRR1700172 2 0.1333 0.9359 0.000 0.944 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1700174 2 0.1531 0.9297 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700173 2 0.1471 0.9292 0.000 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1700175 2 0.1007 0.9390 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700176 2 0.2122 0.9045 0.000 0.900 0.008 0.008 0.084 0.000
#> SRR1700178 2 0.0547 0.9420 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700177 2 0.1265 0.9381 0.000 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1700180 2 0.0260 0.9404 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700179 2 0.0363 0.9415 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700181 2 0.0363 0.9415 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700183 1 0.0146 0.8090 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700184 2 0.0603 0.9421 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700186 2 0.0458 0.9423 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700187 1 0.4363 0.6583 0.660 0.008 0.012 0.012 0.308 0.000
#> SRR1700185 1 0.1080 0.8088 0.960 0.000 0.004 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700188 2 0.0547 0.9421 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700192 5 0.7696 0.3777 0.136 0.224 0.028 0.040 0.496 0.076
#> SRR1700190 6 0.4073 -0.3629 0.060 0.020 0.036 0.016 0.044 0.824
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 5 0.6826 0.4270 0.300 0.240 0.008 0.008 0.424 0.020
#> SRR1700193 2 0.0632 0.9429 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700195 2 0.0632 0.9428 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700197 5 0.9120 -0.4807 0.140 0.080 0.144 0.056 0.312 0.268
#> SRR1700198 2 0.0363 0.9415 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700199 2 0.0458 0.9418 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700200 2 0.0603 0.9423 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700201 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700202 2 0.1010 0.9415 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700203 2 0.0458 0.9413 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700204 2 0.0713 0.9433 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700206 2 0.1010 0.9429 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700207 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700208 6 0.6504 0.4102 0.052 0.108 0.016 0.036 0.160 0.628
#> SRR1700205 2 0.0458 0.9423 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700209 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700210 2 0.0547 0.9432 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700211 2 0.1429 0.9316 0.000 0.940 0.004 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700212 2 0.0692 0.9437 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700213 2 0.1493 0.9371 0.000 0.936 0.004 0.004 0.056 0.000
#> SRR1700214 2 0.0458 0.9420 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700215 1 0.0260 0.8107 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700217 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700216 1 0.0405 0.8100 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700218 2 0.0508 0.9419 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700219 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700222 1 0.5042 0.6029 0.592 0.012 0.016 0.012 0.356 0.012
#> SRR1700220 2 0.0260 0.9404 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700221 2 0.0603 0.9422 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700223 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700224 2 0.0777 0.9435 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700226 2 0.0458 0.9414 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700229 2 0.0547 0.9429 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700225 2 0.1728 0.9268 0.000 0.924 0.008 0.004 0.064 0.000
#> SRR1700227 2 0.0363 0.9409 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700230 2 0.8071 -0.7205 0.244 0.356 0.012 0.032 0.264 0.092
#> SRR1700231 2 0.0603 0.9433 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700228 2 0.0777 0.9436 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700232 2 0.0458 0.9419 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700233 2 0.0363 0.9421 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700234 2 0.0458 0.9411 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700235 2 0.0363 0.9418 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700237 2 0.0547 0.9424 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700236 2 0.0458 0.9419 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700238 2 0.0363 0.9409 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700239 1 0.6243 0.3986 0.460 0.044 0.020 0.040 0.424 0.012
#> SRR1700240 1 0.1484 0.8049 0.944 0.004 0.004 0.008 0.040 0.000
#> SRR1700241 2 0.1010 0.9411 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700243 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700244 2 0.0603 0.9428 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700242 2 0.5318 -0.0815 0.060 0.572 0.004 0.004 0.348 0.012
#> SRR1700246 2 0.0363 0.9423 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700245 2 0.0260 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700247 1 0.5282 0.5500 0.576 0.036 0.016 0.012 0.356 0.004
#> SRR1700249 1 0.1340 0.8059 0.948 0.004 0.008 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700250 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700248 2 0.0458 0.9417 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700251 2 0.0458 0.9423 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700252 2 0.1542 0.9347 0.000 0.936 0.004 0.000 0.052 0.008
#> SRR1700253 2 0.0363 0.9404 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700256 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700254 1 0.5395 0.5927 0.584 0.016 0.016 0.028 0.344 0.012
#> SRR1700255 2 0.0547 0.9417 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700257 2 0.0260 0.9404 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700258 2 0.0260 0.9416 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700259 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700260 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700261 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700262 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700263 2 0.0547 0.9425 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700264 2 0.0790 0.9428 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700265 2 0.1007 0.9405 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700266 2 0.0458 0.9416 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700268 2 0.2174 0.8951 0.000 0.896 0.008 0.000 0.088 0.008
#> SRR1700270 2 0.0547 0.9420 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700267 2 0.0260 0.9404 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700271 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700272 2 0.0363 0.9405 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700273 2 0.0363 0.9415 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700274 2 0.0260 0.9413 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700277 6 0.5904 0.1343 0.008 0.196 0.012 0.012 0.160 0.612
#> SRR1700275 2 0.0363 0.9411 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700276 2 0.0363 0.9410 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700278 2 0.0260 0.9419 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700279 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700280 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700281 2 0.0547 0.9423 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700283 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700282 2 0.1759 0.9291 0.000 0.924 0.004 0.004 0.064 0.004
#> SRR1700284 2 0.0363 0.9416 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700285 2 0.0363 0.9407 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700286 2 0.0547 0.9420 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700287 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700290 2 0.7010 -0.0280 0.016 0.556 0.104 0.032 0.224 0.068
#> SRR1700289 2 0.0363 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700288 2 0.0692 0.9430 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700292 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700291 2 0.0865 0.9424 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700293 2 0.0260 0.9404 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700294 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700295 2 0.5318 0.4905 0.000 0.680 0.048 0.008 0.192 0.072
#> SRR1700297 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700296 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700298 2 0.0458 0.9424 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700299 2 0.0458 0.9435 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700300 2 0.1542 0.9299 0.000 0.936 0.008 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700302 2 0.0260 0.9407 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700301 2 0.0547 0.9420 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700303 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700304 2 0.0260 0.9432 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700305 2 0.0363 0.9416 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700306 2 0.2567 0.8798 0.000 0.876 0.012 0.004 0.100 0.008
#> SRR1700308 2 0.0363 0.9425 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700307 2 0.0777 0.9431 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700309 2 0.1931 0.9189 0.000 0.916 0.008 0.004 0.068 0.004
#> SRR1700310 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700311 2 0.1219 0.9387 0.000 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1700312 2 0.0458 0.9417 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700313 2 0.0937 0.9421 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700314 2 0.0858 0.9431 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700315 2 0.0713 0.9432 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700316 2 0.0713 0.9433 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700317 2 0.0260 0.9405 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700318 2 0.1080 0.9415 0.000 0.960 0.004 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700319 2 0.1836 0.9255 0.000 0.928 0.008 0.004 0.048 0.012
#> SRR1700320 2 0.0458 0.9423 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700322 2 0.0363 0.9413 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700321 2 0.0146 0.9401 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700323 2 0.0458 0.9415 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700324 2 0.0260 0.9401 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700325 2 0.0547 0.9429 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700326 2 0.1555 0.9230 0.004 0.932 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700327 2 0.0363 0.9421 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700329 2 0.0260 0.9413 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700328 2 0.1615 0.9310 0.000 0.928 0.004 0.004 0.064 0.000
#> SRR1700330 2 0.0777 0.9422 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700331 2 0.0363 0.9422 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700332 2 0.0363 0.9416 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700333 2 0.0692 0.9426 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.701 0.871 0.939 0.2772 0.712 0.712
#> 3 3 0.864 0.901 0.960 0.9767 0.599 0.487
#> 4 4 0.610 0.776 0.873 0.2317 0.811 0.609
#> 5 5 0.641 0.557 0.752 0.0879 0.869 0.645
#> 6 6 0.657 0.657 0.783 0.0512 0.838 0.500
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.8909 0.756 0.692 0.308
#> SRR1699881 2 0.6247 0.768 0.156 0.844
#> SRR1699882 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.9170 0.721 0.668 0.332
#> SRR1699900 2 0.2603 0.913 0.044 0.956
#> SRR1699899 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699902 1 0.9963 0.420 0.536 0.464
#> SRR1699901 1 0.8955 0.751 0.688 0.312
#> SRR1699903 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.8713 0.775 0.708 0.292
#> SRR1699906 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.6973 0.715 0.188 0.812
#> SRR1699915 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.9661 0.159 0.392 0.608
#> SRR1699924 2 0.5408 0.814 0.124 0.876
#> SRR1699925 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.4431 0.854 0.092 0.908
#> SRR1699939 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.9000 0.429 0.316 0.684
#> SRR1699942 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.6712 0.804 0.824 0.176
#> SRR1699946 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.8813 0.463 0.300 0.700
#> SRR1699955 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.8555 0.786 0.720 0.280
#> SRR1699957 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.1843 0.928 0.028 0.972
#> SRR1699958 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.9460 0.271 0.364 0.636
#> SRR1699971 2 0.6973 0.715 0.188 0.812
#> SRR1699970 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.3733 0.881 0.072 0.928
#> SRR1699973 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699974 1 0.8016 0.803 0.756 0.244
#> SRR1699975 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699978 1 0.8016 0.803 0.756 0.244
#> SRR1699979 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.4815 0.841 0.104 0.896
#> SRR1699982 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.7950 0.803 0.760 0.240
#> SRR1699988 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.2043 0.925 0.032 0.968
#> SRR1699991 2 0.9358 0.313 0.352 0.648
#> SRR1699993 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1699994 1 0.8386 0.795 0.732 0.268
#> SRR1699995 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700000 2 0.5629 0.805 0.132 0.868
#> SRR1700002 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.9460 0.271 0.364 0.636
#> SRR1700003 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.9896 -0.050 0.440 0.560
#> SRR1700005 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.9358 0.687 0.648 0.352
#> SRR1700009 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.8327 0.797 0.736 0.264
#> SRR1700011 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700012 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0672 0.947 0.008 0.992
#> SRR1700016 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700018 2 0.8909 0.454 0.308 0.692
#> SRR1700017 2 0.9977 -0.193 0.472 0.528
#> SRR1700019 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.1184 0.940 0.016 0.984
#> SRR1700022 1 0.9881 0.502 0.564 0.436
#> SRR1700024 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.3274 0.895 0.060 0.940
#> SRR1700027 2 0.1843 0.929 0.028 0.972
#> SRR1700028 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.7674 0.652 0.224 0.776
#> SRR1700030 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700031 1 0.8016 0.803 0.756 0.244
#> SRR1700032 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.8661 0.779 0.712 0.288
#> SRR1700036 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.2236 0.921 0.036 0.964
#> SRR1700039 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700040 2 0.9944 -0.129 0.456 0.544
#> SRR1700041 2 0.5178 0.825 0.116 0.884
#> SRR1700042 1 0.9427 0.673 0.640 0.360
#> SRR1700043 2 0.9944 -0.127 0.456 0.544
#> SRR1700045 2 0.4690 0.846 0.100 0.900
#> SRR1700044 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.2948 0.903 0.052 0.948
#> SRR1700047 2 0.9209 0.369 0.336 0.664
#> SRR1700048 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700049 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.7950 0.804 0.760 0.240
#> SRR1700051 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.8207 0.800 0.744 0.256
#> SRR1700053 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.7219 0.695 0.200 0.800
#> SRR1700055 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700056 2 0.9970 -0.181 0.468 0.532
#> SRR1700057 1 0.9044 0.739 0.680 0.320
#> SRR1700058 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700059 2 0.7950 0.616 0.240 0.760
#> SRR1700060 1 0.8763 0.770 0.704 0.296
#> SRR1700061 2 0.7528 0.664 0.216 0.784
#> SRR1700062 1 0.8861 0.761 0.696 0.304
#> SRR1700063 1 0.9686 0.598 0.604 0.396
#> SRR1700064 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700065 1 0.8661 0.779 0.712 0.288
#> SRR1700066 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700067 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.6247 0.768 0.156 0.844
#> SRR1700069 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.6247 0.767 0.156 0.844
#> SRR1700072 1 0.8661 0.779 0.712 0.288
#> SRR1700073 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.5519 0.808 0.128 0.872
#> SRR1700074 2 0.8763 0.487 0.296 0.704
#> SRR1700076 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.8713 0.497 0.292 0.708
#> SRR1700078 2 0.9248 0.359 0.340 0.660
#> SRR1700080 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700079 1 0.9286 0.701 0.656 0.344
#> SRR1700081 1 0.9170 0.722 0.668 0.332
#> SRR1700082 2 0.9248 0.354 0.340 0.660
#> SRR1700083 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700084 1 0.1414 0.799 0.980 0.020
#> SRR1700085 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700087 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700091 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.9732 0.118 0.404 0.596
#> SRR1700096 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700097 1 0.8386 0.795 0.732 0.268
#> SRR1700098 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.1414 0.936 0.020 0.980
#> SRR1700105 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.1414 0.936 0.020 0.980
#> SRR1700107 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700117 1 0.8386 0.795 0.732 0.268
#> SRR1700119 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700120 1 0.8763 0.771 0.704 0.296
#> SRR1700121 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.2778 0.908 0.048 0.952
#> SRR1700125 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.8909 0.756 0.692 0.308
#> SRR1700127 2 0.4939 0.836 0.108 0.892
#> SRR1700124 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700128 2 0.4161 0.867 0.084 0.916
#> SRR1700129 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.6438 0.755 0.164 0.836
#> SRR1700131 2 0.9710 0.131 0.400 0.600
#> SRR1700133 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.3584 0.885 0.068 0.932
#> SRR1700136 2 0.9393 0.300 0.356 0.644
#> SRR1700137 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.9775 0.562 0.588 0.412
#> SRR1700143 2 0.9635 0.178 0.388 0.612
#> SRR1700144 2 0.8081 0.598 0.248 0.752
#> SRR1700145 2 0.8861 0.465 0.304 0.696
#> SRR1700146 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.6247 0.768 0.156 0.844
#> SRR1700149 1 0.8608 0.782 0.716 0.284
#> SRR1700148 2 0.7883 0.626 0.236 0.764
#> SRR1700150 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.6247 0.768 0.156 0.844
#> SRR1700153 2 0.7453 0.674 0.212 0.788
#> SRR1700154 2 0.3733 0.880 0.072 0.928
#> SRR1700155 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.8499 0.535 0.276 0.724
#> SRR1700158 1 0.8386 0.795 0.732 0.268
#> SRR1700159 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.8207 0.582 0.256 0.744
#> SRR1700160 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.2236 0.920 0.036 0.964
#> SRR1700162 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.8713 0.775 0.708 0.292
#> SRR1700163 1 0.8499 0.789 0.724 0.276
#> SRR1700165 2 0.6247 0.769 0.156 0.844
#> SRR1700166 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.9922 0.467 0.552 0.448
#> SRR1700170 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700169 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700171 1 0.8207 0.800 0.744 0.256
#> SRR1700172 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700176 1 0.9170 0.722 0.668 0.332
#> SRR1700178 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.7528 0.804 0.784 0.216
#> SRR1700190 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700205 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.8267 0.799 0.740 0.260
#> SRR1700246 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700245 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.797 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.1184 0.940 0.016 0.984
#> SRR1700270 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.9775 0.561 0.588 0.412
#> SRR1700275 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0376 0.798 0.996 0.004
#> SRR1700289 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.7219 0.696 0.200 0.800
#> SRR1700297 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.3274 0.896 0.060 0.940
#> SRR1700308 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.1414 0.936 0.020 0.980
#> SRR1700310 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.6973 0.712 0.188 0.812
#> SRR1700327 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0376 0.950 0.004 0.996
#> SRR1700330 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.954 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699881 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699887 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699891 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699892 2 0.0424 0.9559 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699893 3 0.6225 0.2829 0.000 0.432 0.568
#> SRR1699894 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699895 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699896 2 0.6008 0.4129 0.000 0.628 0.372
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699898 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699900 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699899 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699902 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699901 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699903 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699904 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699905 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699906 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699907 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699908 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699910 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699912 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699913 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699914 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699915 3 0.2261 0.8751 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699917 2 0.0892 0.9524 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699919 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699920 3 0.4235 0.7360 0.000 0.176 0.824
#> SRR1699921 2 0.2625 0.8884 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699923 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699924 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6280 0.1663 0.000 0.460 0.540
#> SRR1699927 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699929 2 0.4504 0.7300 0.000 0.804 0.196
#> SRR1699928 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699930 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699931 2 0.3192 0.8455 0.000 0.888 0.112
#> SRR1699933 3 0.0892 0.9242 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699932 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.2066 0.9141 0.000 0.940 0.060
#> SRR1699936 2 0.0237 0.9602 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699941 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699942 2 0.5016 0.6640 0.000 0.760 0.240
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699946 2 0.1643 0.9226 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699947 2 0.1964 0.9103 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699950 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699951 2 0.0747 0.9555 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699954 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699959 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699960 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699961 3 0.2537 0.8678 0.000 0.080 0.920
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.6274 0.1570 0.000 0.544 0.456
#> SRR1699964 2 0.2711 0.8734 0.000 0.912 0.088
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 3 0.5948 0.4369 0.000 0.360 0.640
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.2448 0.8971 0.000 0.924 0.076
#> SRR1699969 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699971 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699973 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699974 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699975 2 0.0892 0.9519 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699976 3 0.6309 0.0833 0.000 0.496 0.504
#> SRR1699977 3 0.3267 0.8281 0.000 0.116 0.884
#> SRR1699978 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699979 3 0.2261 0.8747 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699980 2 0.1753 0.9265 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699981 3 0.2165 0.8789 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699982 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699983 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699986 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699988 2 0.0237 0.9584 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699987 3 0.0237 0.9298 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699989 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699990 2 0.5988 0.4061 0.000 0.632 0.368
#> SRR1699992 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699991 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699993 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699994 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699997 3 0.5591 0.5330 0.000 0.304 0.696
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699999 1 0.0892 0.9468 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700000 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700002 3 0.4555 0.7121 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700001 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700003 3 0.0747 0.9273 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700004 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.0892 0.9246 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700007 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700008 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700011 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700013 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700012 3 0.2959 0.8444 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700014 3 0.2356 0.8705 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700015 3 0.0592 0.9293 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700017 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700019 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700020 3 0.0747 0.9262 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700021 2 0.0892 0.9525 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700023 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700022 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700024 2 0.1964 0.9174 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700025 2 0.4504 0.7305 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700026 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700027 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700028 3 0.2537 0.8601 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700029 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700031 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700032 2 0.0592 0.9524 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700033 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700036 2 0.2878 0.8700 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700037 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700038 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700039 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700040 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700041 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700042 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700043 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700045 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700044 3 0.6235 0.2838 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700046 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700047 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700048 3 0.0424 0.9277 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700049 3 0.0747 0.9259 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700050 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700051 3 0.0592 0.9281 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700052 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700053 3 0.4121 0.7514 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700054 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700057 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700058 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700059 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700060 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700061 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700062 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700063 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700064 3 0.2066 0.8829 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700065 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700066 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700067 2 0.6215 0.2344 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700068 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700069 3 0.2711 0.8523 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700071 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700072 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700073 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700075 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700074 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700076 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700077 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700078 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700080 3 0.2356 0.8701 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700079 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700081 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700082 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700083 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700084 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700085 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700086 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700087 3 0.0237 0.9299 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700088 3 0.4887 0.6467 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700089 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.3482 0.8292 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700090 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.2959 0.8699 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700094 3 0.3192 0.8258 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700093 3 0.5529 0.5393 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700095 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700096 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700097 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700098 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700099 2 0.1289 0.9408 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700100 3 0.6305 0.1043 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700101 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700102 2 0.0592 0.9580 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700104 3 0.4291 0.7315 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700103 3 0.0747 0.9221 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700105 3 0.3267 0.8177 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700106 3 0.0237 0.9298 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700107 2 0.3816 0.8032 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700108 2 0.2066 0.9141 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700109 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700110 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700112 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700111 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700114 2 0.6008 0.3973 0.000 0.628 0.372
#> SRR1700115 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700116 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700117 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700119 3 0.3752 0.7812 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700118 3 0.1411 0.9058 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700120 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.5138 0.6567 0.000 0.748 0.252
#> SRR1700122 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700123 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700126 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700127 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700124 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700128 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700130 3 0.6095 0.3771 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700132 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700131 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700133 3 0.4605 0.6944 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700134 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700135 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700136 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700137 3 0.3752 0.7812 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700138 3 0.2066 0.8829 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700140 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700139 3 0.0592 0.9250 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700141 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700142 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700143 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700144 3 0.0237 0.9311 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700145 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700147 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700149 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700148 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.1031 0.9487 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700152 3 0.0747 0.9220 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700151 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700153 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700154 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700155 3 0.4235 0.7364 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700156 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700158 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700159 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700157 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700160 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700161 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700164 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700163 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700165 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700166 3 0.0424 0.9276 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700168 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700167 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700170 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700169 3 0.2261 0.8747 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700171 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700172 2 0.4702 0.7109 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700174 3 0.0237 0.9299 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700173 3 0.0237 0.9297 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700175 2 0.4235 0.7663 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700176 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.5178 0.6131 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0237 0.9584 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.3267 0.8371 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700190 1 0.6260 0.1867 0.552 0.000 0.448
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.3038 0.8636 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.1529 0.9295 0.960 0.000 0.040
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.6079 0.3677 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.1031 0.9212 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.4504 0.7298 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.3482 0.8257 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.4842 0.6872 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.5905 0.4624 0.648 0.000 0.352
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.0592 0.9292 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700246 2 0.6307 0.0363 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 3 0.2537 0.8662 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9614 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700260 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700261 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700262 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.4887 0.6828 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700266 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700268 3 0.3412 0.8087 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700272 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700277 3 0.0475 0.9303 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700275 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700276 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700279 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700280 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700282 3 0.5178 0.5913 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700284 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700285 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700286 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700287 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700290 3 0.0424 0.9295 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700289 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700291 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700294 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700295 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700296 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700298 2 0.0592 0.9528 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700299 3 0.5560 0.5380 0.000 0.300 0.700
#> SRR1700300 3 0.4654 0.6858 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700302 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700301 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700303 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700306 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700307 3 0.0424 0.9302 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700309 3 0.1529 0.9090 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700310 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700311 2 0.4399 0.7488 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700313 3 0.3267 0.8298 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700314 3 0.1163 0.9128 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700315 2 0.6126 0.3040 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700316 2 0.4654 0.7259 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700318 2 0.1411 0.9375 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700319 3 0.1289 0.9096 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700320 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700321 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700323 2 0.0592 0.9580 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700324 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700325 2 0.0237 0.9602 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700326 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700327 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700329 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700328 3 0.2625 0.8607 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700330 3 0.6111 0.3730 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700331 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700332 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9604 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.0707 0.8809 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699875 2 0.1109 0.8672 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1699876 2 0.3311 0.8469 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1699877 2 0.0376 0.8783 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699879 2 0.0469 0.8810 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699878 2 0.0657 0.8750 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1699880 3 0.0592 0.8713 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699881 3 0.2408 0.8472 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1699882 2 0.0592 0.8809 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699883 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699884 2 0.0804 0.8743 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1699885 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699886 2 0.2973 0.8581 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1699888 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699889 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699890 2 0.1940 0.8778 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1699887 2 0.2589 0.8669 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1699891 2 0.3610 0.8322 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1699892 2 0.2546 0.8652 0.000 0.912 0.028 0.060
#> SRR1699893 4 0.0657 0.7714 0.000 0.012 0.004 0.984
#> SRR1699894 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1699895 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1699896 2 0.6363 0.6616 0.000 0.656 0.172 0.172
#> SRR1699897 2 0.0376 0.8807 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699898 3 0.2589 0.8363 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699900 3 0.1389 0.8745 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699899 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1699902 3 0.1302 0.8761 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699901 3 0.1211 0.8745 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699903 2 0.3873 0.8123 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1699904 2 0.3726 0.8238 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1699905 3 0.1118 0.8744 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699906 2 0.3528 0.8369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1699907 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699908 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699909 2 0.4088 0.7849 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1699910 4 0.1305 0.7777 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1699911 2 0.3668 0.8323 0.000 0.808 0.004 0.188
#> SRR1699912 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699913 2 0.3610 0.8322 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1699914 3 0.2149 0.8584 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1699915 4 0.1256 0.7751 0.000 0.008 0.028 0.964
#> SRR1699916 2 0.2281 0.8709 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1699917 4 0.4053 0.5914 0.000 0.228 0.004 0.768
#> SRR1699918 2 0.4304 0.7225 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1699919 2 0.4585 0.6722 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1699920 4 0.2861 0.7315 0.000 0.096 0.016 0.888
#> SRR1699921 4 0.5558 -0.0379 0.000 0.432 0.020 0.548
#> SRR1699922 2 0.3024 0.8531 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1699923 3 0.1576 0.8753 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1699924 3 0.4103 0.6768 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 4 0.5109 0.6065 0.000 0.212 0.052 0.736
#> SRR1699927 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699929 2 0.5700 0.7433 0.000 0.716 0.120 0.164
#> SRR1699928 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699930 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1699931 2 0.5011 0.7960 0.000 0.764 0.076 0.160
#> SRR1699933 3 0.4852 0.7466 0.000 0.072 0.776 0.152
#> SRR1699932 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.1792 0.7505 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1699936 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699937 2 0.1610 0.8595 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1699938 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.1474 0.8746 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699939 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699941 3 0.1022 0.8746 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699942 2 0.5610 0.6041 0.000 0.720 0.104 0.176
#> SRR1699943 2 0.0779 0.8736 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1699944 2 0.0336 0.8785 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1699945 3 0.0592 0.8654 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699946 2 0.2413 0.8333 0.000 0.916 0.064 0.020
#> SRR1699947 2 0.3271 0.7686 0.000 0.856 0.132 0.012
#> SRR1699948 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699949 2 0.2011 0.8737 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1699950 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699951 2 0.3725 0.7907 0.000 0.812 0.008 0.180
#> SRR1699952 2 0.1256 0.8657 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1699953 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699954 3 0.0817 0.8743 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699955 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.0592 0.8654 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699957 2 0.1109 0.8672 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1699959 3 0.3837 0.7326 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1699958 4 0.3636 0.7093 0.000 0.172 0.008 0.820
#> SRR1699960 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699961 3 0.4285 0.7062 0.000 0.156 0.804 0.040
#> SRR1699962 2 0.0336 0.8810 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699963 2 0.7338 -0.2247 0.000 0.440 0.156 0.404
#> SRR1699964 2 0.2489 0.8292 0.000 0.912 0.068 0.020
#> SRR1699965 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699966 4 0.4022 0.7513 0.000 0.096 0.068 0.836
#> SRR1699967 2 0.0376 0.8786 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699968 2 0.5170 0.7852 0.000 0.724 0.048 0.228
#> SRR1699969 3 0.2469 0.8485 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699971 3 0.2722 0.8519 0.000 0.032 0.904 0.064
#> SRR1699970 2 0.0779 0.8736 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1699972 3 0.2174 0.8624 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1699973 4 0.5263 0.1012 0.000 0.448 0.008 0.544
#> SRR1699974 3 0.0469 0.8656 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699975 2 0.4319 0.8090 0.000 0.760 0.012 0.228
#> SRR1699976 3 0.5915 0.3264 0.000 0.400 0.560 0.040
#> SRR1699977 3 0.6548 0.4376 0.000 0.104 0.592 0.304
#> SRR1699978 3 0.1211 0.8695 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699979 4 0.3751 0.7305 0.000 0.004 0.196 0.800
#> SRR1699980 2 0.5277 0.7074 0.000 0.668 0.028 0.304
#> SRR1699981 3 0.5814 0.5756 0.000 0.056 0.644 0.300
#> SRR1699982 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699983 2 0.3942 0.8054 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.2149 0.8715 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1699986 3 0.0817 0.8661 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699988 2 0.3377 0.8604 0.000 0.848 0.012 0.140
#> SRR1699987 4 0.3444 0.7321 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699989 2 0.3764 0.8231 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1699990 2 0.5708 0.4462 0.000 0.556 0.028 0.416
#> SRR1699992 3 0.1584 0.8714 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1699991 3 0.1716 0.8717 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699993 3 0.1474 0.8697 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699994 3 0.0469 0.8686 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699995 1 0.2408 0.8766 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1699996 2 0.0937 0.8781 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1699997 4 0.1174 0.7761 0.000 0.020 0.012 0.968
#> SRR1699998 2 0.1042 0.8708 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1699999 1 0.4761 0.4960 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1700000 3 0.1807 0.8742 0.000 0.008 0.940 0.052
#> SRR1700002 3 0.6439 0.5881 0.000 0.180 0.648 0.172
#> SRR1700001 3 0.1118 0.8764 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700003 4 0.6071 0.4983 0.000 0.064 0.324 0.612
#> SRR1700004 3 0.1474 0.8753 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.3245 0.8234 0.000 0.064 0.880 0.056
#> SRR1700007 2 0.3311 0.8471 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1700008 4 0.4994 0.1252 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700009 1 0.0336 0.9381 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700010 3 0.0707 0.8652 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700011 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700013 4 0.5256 0.3700 0.000 0.012 0.392 0.596
#> SRR1700012 3 0.5272 0.7036 0.000 0.136 0.752 0.112
#> SRR1700014 3 0.5596 0.4970 0.000 0.036 0.632 0.332
#> SRR1700015 3 0.3245 0.8224 0.000 0.064 0.880 0.056
#> SRR1700016 1 0.1940 0.9000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1700018 3 0.0817 0.8738 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700017 3 0.0817 0.8740 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700019 2 0.3486 0.8392 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700020 3 0.1109 0.8640 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1700021 2 0.4916 0.4773 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1700023 3 0.1716 0.8737 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700022 3 0.0817 0.8737 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700024 4 0.4212 0.6047 0.000 0.216 0.012 0.772
#> SRR1700025 2 0.4927 0.5496 0.000 0.712 0.264 0.024
#> SRR1700026 3 0.1743 0.8712 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700027 3 0.1389 0.8721 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700028 4 0.1211 0.7822 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700029 3 0.2921 0.8273 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700030 2 0.4088 0.8061 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1700031 3 0.0336 0.8645 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700032 2 0.1635 0.8554 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1700034 1 0.1474 0.9160 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700035 2 0.4103 0.7802 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1700033 3 0.0707 0.8713 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700036 2 0.5025 0.7620 0.000 0.716 0.032 0.252
#> SRR1700037 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700038 3 0.1389 0.8739 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700039 3 0.0817 0.8661 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700040 3 0.0921 0.8743 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700041 3 0.2300 0.8667 0.000 0.016 0.920 0.064
#> SRR1700042 3 0.0921 0.8736 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700043 3 0.1118 0.8754 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700045 3 0.4011 0.7397 0.000 0.008 0.784 0.208
#> SRR1700044 3 0.7426 0.2751 0.000 0.324 0.488 0.188
#> SRR1700046 3 0.1557 0.8733 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700047 3 0.1389 0.8748 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700048 4 0.3306 0.7473 0.000 0.004 0.156 0.840
#> SRR1700049 3 0.0921 0.8656 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700050 3 0.1118 0.8690 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700051 3 0.0921 0.8656 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700052 3 0.0707 0.8700 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700053 3 0.6627 0.4263 0.000 0.112 0.588 0.300
#> SRR1700054 3 0.1661 0.8739 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700055 1 0.0336 0.9381 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700056 3 0.2704 0.8312 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700057 3 0.3726 0.7318 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700058 3 0.0707 0.8710 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700059 4 0.3610 0.7011 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700060 3 0.1022 0.8729 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700061 3 0.1474 0.8744 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700062 3 0.2216 0.8501 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700063 3 0.1389 0.8745 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700064 4 0.5546 0.5009 0.000 0.044 0.292 0.664
#> SRR1700065 3 0.0817 0.8724 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700066 3 0.0817 0.8715 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700067 4 0.1118 0.7657 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700068 3 0.4356 0.6293 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700069 3 0.5906 0.5363 0.000 0.064 0.644 0.292
#> SRR1700070 2 0.1118 0.8817 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700071 3 0.1557 0.8737 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700072 3 0.0921 0.8717 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700073 4 0.4967 -0.0537 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1700075 3 0.2021 0.8709 0.000 0.012 0.932 0.056
#> SRR1700074 3 0.1022 0.8756 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700076 3 0.2623 0.8565 0.000 0.028 0.908 0.064
#> SRR1700077 3 0.1118 0.8751 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700078 3 0.1302 0.8750 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700080 3 0.4008 0.7637 0.000 0.032 0.820 0.148
#> SRR1700079 3 0.1302 0.8733 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700081 3 0.1389 0.8765 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700082 3 0.1302 0.8751 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700083 3 0.1211 0.8700 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700084 3 0.0336 0.8645 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700085 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700086 3 0.3219 0.7646 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1700087 4 0.4244 0.7249 0.000 0.032 0.168 0.800
#> SRR1700088 4 0.6770 0.5321 0.000 0.160 0.236 0.604
#> SRR1700089 4 0.3791 0.7094 0.000 0.004 0.200 0.796
#> SRR1700091 4 0.3032 0.7444 0.000 0.124 0.008 0.868
#> SRR1700090 4 0.2868 0.7575 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700092 4 0.3591 0.7166 0.000 0.168 0.008 0.824
#> SRR1700094 4 0.3734 0.7614 0.000 0.044 0.108 0.848
#> SRR1700093 4 0.0804 0.7797 0.000 0.008 0.012 0.980
#> SRR1700095 4 0.3688 0.6917 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700096 4 0.3356 0.7321 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700097 3 0.2281 0.8424 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700098 2 0.3569 0.7704 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1700099 4 0.2868 0.7335 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1700100 4 0.1411 0.7802 0.000 0.020 0.020 0.960
#> SRR1700101 4 0.2976 0.7421 0.000 0.120 0.008 0.872
#> SRR1700102 4 0.3300 0.7305 0.000 0.144 0.008 0.848
#> SRR1700104 4 0.3435 0.7766 0.000 0.036 0.100 0.864
#> SRR1700103 4 0.3257 0.7461 0.000 0.004 0.152 0.844
#> SRR1700105 4 0.0779 0.7799 0.000 0.004 0.016 0.980
#> SRR1700106 4 0.2281 0.7772 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700107 4 0.1635 0.7703 0.000 0.044 0.008 0.948
#> SRR1700108 4 0.2814 0.7387 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700109 2 0.1867 0.8746 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700110 2 0.2011 0.8736 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700112 2 0.4713 0.6053 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1700111 4 0.2760 0.7625 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700113 4 0.2589 0.7150 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700114 4 0.2021 0.7725 0.000 0.056 0.012 0.932
#> SRR1700115 4 0.3528 0.6415 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700116 4 0.2814 0.7585 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700117 3 0.4994 -0.0261 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700119 4 0.1022 0.7835 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700118 4 0.2345 0.7746 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700120 3 0.5000 -0.0126 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1700121 4 0.0336 0.7721 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700122 4 0.3837 0.6053 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700123 4 0.3266 0.7333 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700125 2 0.4730 0.6119 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1700126 3 0.4356 0.6050 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700127 4 0.3569 0.7059 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1700124 4 0.3172 0.7396 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700128 4 0.2647 0.7662 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700129 4 0.2011 0.7408 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1700130 4 0.0657 0.7787 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1700132 4 0.3486 0.7143 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700131 4 0.3764 0.6860 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700133 4 0.0817 0.7684 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700134 4 0.3400 0.6544 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700135 4 0.1211 0.7831 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700136 4 0.3726 0.6869 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700137 4 0.0000 0.7733 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700138 4 0.0657 0.7775 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1700140 4 0.0921 0.7815 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700139 4 0.1474 0.7839 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700141 4 0.2973 0.6892 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700142 3 0.3266 0.8005 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700143 4 0.3801 0.6789 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700144 3 0.1474 0.8736 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700145 4 0.3726 0.6932 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700146 4 0.2081 0.7361 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700147 4 0.3400 0.7225 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700149 4 0.4222 0.6299 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700148 4 0.3649 0.6969 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700150 4 0.1022 0.7646 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700152 4 0.1209 0.7832 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR1700151 4 0.3444 0.7183 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700153 4 0.3569 0.7054 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1700154 4 0.2647 0.7661 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700155 4 0.0336 0.7721 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700156 4 0.3649 0.6969 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700158 4 0.4193 0.6389 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700159 4 0.4999 -0.2238 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1700157 4 0.3837 0.6758 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700160 4 0.2149 0.7795 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700161 4 0.2921 0.7547 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700162 4 0.3400 0.6539 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700164 4 0.3801 0.6865 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700163 4 0.3873 0.6776 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700165 4 0.3610 0.7012 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700166 4 0.0921 0.7824 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700168 4 0.4907 0.0598 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1700167 4 0.4817 0.3714 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700170 4 0.1637 0.7805 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700169 4 0.0921 0.7824 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700171 4 0.4679 0.5024 0.000 0.000 0.352 0.648
#> SRR1700172 4 0.0336 0.7719 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700174 4 0.1637 0.7830 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700173 4 0.1118 0.7837 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700175 4 0.0817 0.7681 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700176 3 0.4250 0.6349 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1700178 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.0469 0.7715 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700180 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700179 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700184 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700186 2 0.0895 0.8720 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1700187 1 0.0592 0.9364 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700192 3 0.1722 0.8389 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR1700190 3 0.3870 0.6524 0.208 0.000 0.788 0.004
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.5138 0.4160 0.600 0.000 0.392 0.008
#> SRR1700193 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700195 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700197 1 0.5088 0.3484 0.572 0.000 0.424 0.004
#> SRR1700198 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700199 2 0.0524 0.8769 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700200 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 4 0.6393 0.2458 0.000 0.456 0.064 0.480
#> SRR1700203 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700204 2 0.0524 0.8779 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700206 2 0.0672 0.8764 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.1004 0.8642 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR1700205 2 0.0592 0.8818 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700209 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0672 0.8761 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1700211 2 0.3978 0.7589 0.000 0.836 0.108 0.056
#> SRR1700212 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.2670 0.8319 0.000 0.908 0.040 0.052
#> SRR1700214 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0592 0.9364 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700223 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.1635 0.8812 0.000 0.948 0.008 0.044
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700225 2 0.4332 0.7449 0.000 0.816 0.072 0.112
#> SRR1700227 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700230 3 0.4468 0.6161 0.232 0.000 0.752 0.016
#> SRR1700231 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700228 2 0.0524 0.8769 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700232 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700234 2 0.0336 0.8807 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700235 2 0.0376 0.8785 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700237 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700236 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700239 1 0.0817 0.9339 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 4 0.4285 0.7269 0.000 0.040 0.156 0.804
#> SRR1700243 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.0921 0.8656 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700246 2 0.6796 0.3581 0.000 0.596 0.152 0.252
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0817 0.9339 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9388 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700251 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700252 3 0.7164 0.4018 0.000 0.204 0.556 0.240
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0336 0.9381 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700255 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0188 0.8806 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700259 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700260 2 0.2216 0.8715 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700261 2 0.2868 0.8610 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1700262 2 0.2647 0.8657 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1700263 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0895 0.8714 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1700265 2 0.4933 0.5265 0.000 0.688 0.296 0.016
#> SRR1700266 2 0.1302 0.8781 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700268 3 0.5771 0.6243 0.000 0.144 0.712 0.144
#> SRR1700270 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700267 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.1389 0.8774 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700272 2 0.1637 0.8762 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700273 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.1474 0.8771 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1700277 3 0.0921 0.8724 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700275 2 0.3569 0.8346 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1700276 2 0.3219 0.8512 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1700278 2 0.2647 0.8635 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1700279 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700280 2 0.3528 0.8369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8800 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.3219 0.8510 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1700282 4 0.3471 0.7643 0.000 0.072 0.060 0.868
#> SRR1700284 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700285 2 0.3649 0.8299 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700286 2 0.2408 0.8704 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700287 2 0.3486 0.8391 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700290 3 0.0921 0.8656 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700289 2 0.3528 0.8369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1700288 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700292 2 0.3528 0.8369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1700291 2 0.4877 0.5149 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1700293 2 0.1557 0.8782 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700294 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700295 4 0.2469 0.7758 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700297 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700296 2 0.3528 0.8369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1700298 4 0.4730 0.3191 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700299 4 0.2610 0.7417 0.000 0.088 0.012 0.900
#> SRR1700300 4 0.4775 0.7133 0.000 0.076 0.140 0.784
#> SRR1700302 2 0.3764 0.8207 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1700301 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700303 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700304 2 0.3172 0.8456 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700305 2 0.3311 0.8433 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1700306 4 0.4164 0.6336 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1700308 2 0.3172 0.8456 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700307 4 0.5600 0.0775 0.000 0.020 0.468 0.512
#> SRR1700309 4 0.6133 0.5314 0.000 0.088 0.268 0.644
#> SRR1700310 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700311 4 0.3074 0.6882 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1700312 2 0.3172 0.8466 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700313 4 0.6102 0.6014 0.000 0.116 0.212 0.672
#> SRR1700314 4 0.2256 0.7831 0.000 0.020 0.056 0.924
#> SRR1700315 4 0.5026 0.4932 0.000 0.312 0.016 0.672
#> SRR1700316 4 0.4175 0.6577 0.000 0.200 0.016 0.784
#> SRR1700317 2 0.1716 0.8784 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700318 2 0.4730 0.6171 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1700319 4 0.1151 0.7791 0.000 0.008 0.024 0.968
#> SRR1700320 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700322 2 0.4999 0.1658 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1700321 2 0.3649 0.8296 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700323 4 0.4431 0.4321 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1700324 2 0.3610 0.8323 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1700325 2 0.2081 0.8765 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1700326 4 0.3649 0.7118 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700327 2 0.3610 0.8327 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1700329 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700328 3 0.7293 0.1086 0.000 0.156 0.476 0.368
#> SRR1700330 4 0.3978 0.7400 0.000 0.108 0.056 0.836
#> SRR1700331 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700332 2 0.3688 0.8269 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700333 2 0.3528 0.8325 0.000 0.808 0.000 0.192
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.3932 0.72606 0.000 0.672 0.328 0.000 0.000
#> SRR1699875 3 0.4135 -0.28270 0.000 0.340 0.656 0.000 0.004
#> SRR1699876 2 0.0451 0.70203 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1699877 2 0.4101 0.71674 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.3895 0.72648 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.4300 0.61916 0.000 0.524 0.476 0.000 0.000
#> SRR1699880 5 0.5211 0.22769 0.000 0.000 0.432 0.044 0.524
#> SRR1699881 3 0.5480 0.30013 0.000 0.000 0.616 0.096 0.288
#> SRR1699882 2 0.3999 0.72495 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.4219 0.68420 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.4278 0.65094 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0703 0.70742 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1699888 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.1012 0.68966 0.000 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1699890 2 0.1851 0.72178 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1699887 2 0.1410 0.71524 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1699891 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699892 3 0.4853 -0.13423 0.000 0.312 0.652 0.028 0.008
#> SRR1699893 4 0.3455 0.69204 0.000 0.208 0.008 0.784 0.000
#> SRR1699894 2 0.0566 0.69789 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1699895 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699896 3 0.5701 0.30118 0.000 0.324 0.600 0.028 0.048
#> SRR1699897 2 0.4138 0.68823 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1699898 5 0.5983 0.54662 0.000 0.000 0.252 0.168 0.580
#> SRR1699900 3 0.4957 0.29605 0.000 0.000 0.624 0.044 0.332
#> SRR1699899 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699902 3 0.4934 0.24963 0.000 0.000 0.600 0.036 0.364
#> SRR1699901 5 0.5052 0.49131 0.000 0.000 0.340 0.048 0.612
#> SRR1699903 2 0.1018 0.68974 0.000 0.968 0.016 0.016 0.000
#> SRR1699904 2 0.0771 0.69380 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699905 5 0.4908 0.52292 0.000 0.000 0.320 0.044 0.636
#> SRR1699906 2 0.0451 0.69947 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1699907 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699908 2 0.0771 0.69380 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699909 2 0.3359 0.66438 0.000 0.840 0.108 0.052 0.000
#> SRR1699910 4 0.6244 0.45208 0.000 0.364 0.120 0.508 0.008
#> SRR1699911 2 0.3264 0.66524 0.000 0.836 0.140 0.020 0.004
#> SRR1699912 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699913 2 0.0566 0.69789 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1699914 3 0.5099 0.29163 0.000 0.004 0.608 0.040 0.348
#> SRR1699915 4 0.5966 0.48097 0.000 0.364 0.092 0.536 0.008
#> SRR1699916 2 0.3231 0.72590 0.000 0.800 0.196 0.004 0.000
#> SRR1699917 4 0.4907 0.33778 0.000 0.484 0.024 0.492 0.000
#> SRR1699918 2 0.4197 0.63739 0.000 0.776 0.148 0.076 0.000
#> SRR1699919 2 0.3064 0.58875 0.000 0.856 0.036 0.108 0.000
#> SRR1699920 2 0.6688 -0.35717 0.000 0.404 0.240 0.356 0.000
#> SRR1699921 2 0.5253 0.32246 0.000 0.684 0.088 0.220 0.008
#> SRR1699922 2 0.1408 0.70680 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1699923 3 0.4946 0.26479 0.000 0.000 0.596 0.036 0.368
#> SRR1699924 3 0.5962 0.22294 0.000 0.000 0.584 0.168 0.248
#> SRR1699925 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.6987 -0.16655 0.000 0.460 0.248 0.276 0.016
#> SRR1699927 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699929 3 0.5225 0.26699 0.000 0.424 0.540 0.016 0.020
#> SRR1699928 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699930 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699931 3 0.5114 0.21731 0.000 0.412 0.556 0.020 0.012
#> SRR1699933 3 0.5661 0.33818 0.000 0.028 0.644 0.064 0.264
#> SRR1699932 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.4329 0.59483 0.000 0.312 0.016 0.672 0.000
#> SRR1699936 2 0.3837 0.72635 0.000 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR1699937 3 0.4497 -0.29772 0.000 0.352 0.632 0.016 0.000
#> SRR1699938 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.5396 -0.00913 0.000 0.000 0.500 0.056 0.444
#> SRR1699939 2 0.3730 0.72868 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR1699941 3 0.5272 0.18634 0.000 0.000 0.552 0.052 0.396
#> SRR1699942 3 0.4513 0.28968 0.000 0.128 0.764 0.104 0.004
#> SRR1699943 2 0.4171 0.70181 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.4150 0.71092 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1699945 5 0.2054 0.69883 0.000 0.000 0.052 0.028 0.920
#> SRR1699946 3 0.4003 0.00276 0.000 0.244 0.740 0.008 0.008
#> SRR1699947 3 0.4275 -0.11784 0.000 0.284 0.696 0.000 0.020
#> SRR1699948 2 0.4126 0.71286 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.3366 0.72807 0.000 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.3586 0.72862 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000
#> SRR1699951 2 0.5882 0.62090 0.000 0.588 0.264 0.148 0.000
#> SRR1699952 3 0.3837 -0.19799 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699954 3 0.5236 0.21764 0.000 0.000 0.568 0.052 0.380
#> SRR1699955 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699956 5 0.3289 0.71008 0.000 0.000 0.108 0.048 0.844
#> SRR1699957 3 0.4449 -0.57418 0.000 0.484 0.512 0.000 0.004
#> SRR1699959 3 0.6517 0.05880 0.000 0.000 0.480 0.292 0.228
#> SRR1699958 4 0.2067 0.78701 0.000 0.048 0.032 0.920 0.000
#> SRR1699960 2 0.3990 0.72587 0.000 0.688 0.308 0.004 0.000
#> SRR1699961 3 0.4689 0.32913 0.000 0.000 0.688 0.048 0.264
#> SRR1699962 2 0.4045 0.72306 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1699963 3 0.4892 0.25888 0.000 0.044 0.724 0.208 0.024
#> SRR1699964 3 0.4576 -0.51776 0.000 0.456 0.536 0.004 0.004
#> SRR1699965 2 0.4030 0.72338 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR1699966 4 0.5370 0.60236 0.000 0.136 0.180 0.680 0.004
#> SRR1699967 2 0.4192 0.69599 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.4402 0.13633 0.000 0.636 0.352 0.012 0.000
#> SRR1699969 5 0.6191 0.16337 0.000 0.000 0.428 0.136 0.436
#> SRR1699971 3 0.4901 0.33223 0.000 0.000 0.672 0.060 0.268
#> SRR1699970 2 0.4273 0.65437 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.5156 0.30549 0.000 0.000 0.620 0.060 0.320
#> SRR1699973 4 0.6124 0.20434 0.000 0.336 0.144 0.520 0.000
#> SRR1699974 5 0.2625 0.71496 0.000 0.000 0.108 0.016 0.876
#> SRR1699975 2 0.3495 0.53214 0.000 0.812 0.160 0.028 0.000
#> SRR1699976 3 0.4118 0.33002 0.000 0.012 0.788 0.040 0.160
#> SRR1699977 3 0.5271 0.31185 0.000 0.000 0.680 0.152 0.168
#> SRR1699978 5 0.3752 0.70501 0.000 0.000 0.148 0.048 0.804
#> SRR1699979 3 0.4882 0.12606 0.000 0.012 0.540 0.440 0.008
#> SRR1699980 2 0.4671 0.17663 0.000 0.640 0.332 0.028 0.000
#> SRR1699981 3 0.8059 0.11416 0.000 0.156 0.440 0.196 0.208
#> SRR1699982 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699983 2 0.1493 0.67494 0.000 0.948 0.024 0.028 0.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.2848 0.72326 0.000 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR1699986 5 0.2300 0.71603 0.000 0.000 0.072 0.024 0.904
#> SRR1699988 2 0.4089 0.55190 0.000 0.736 0.244 0.016 0.004
#> SRR1699987 4 0.2956 0.69909 0.000 0.004 0.140 0.848 0.008
#> SRR1699989 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699990 2 0.5808 0.00422 0.000 0.568 0.340 0.084 0.008
#> SRR1699992 3 0.5129 0.30186 0.000 0.000 0.616 0.056 0.328
#> SRR1699991 3 0.5252 0.22073 0.000 0.000 0.580 0.056 0.364
#> SRR1699993 5 0.2359 0.71153 0.000 0.000 0.060 0.036 0.904
#> SRR1699994 5 0.4551 0.44568 0.000 0.000 0.368 0.016 0.616
#> SRR1699995 5 0.4114 -0.25546 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1699996 3 0.4306 -0.58321 0.000 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1699997 4 0.1571 0.79906 0.000 0.060 0.004 0.936 0.000
#> SRR1699998 3 0.4655 -0.38277 0.000 0.384 0.600 0.012 0.004
#> SRR1699999 5 0.3010 0.38890 0.172 0.000 0.000 0.004 0.824
#> SRR1700000 3 0.5203 0.29266 0.000 0.000 0.608 0.060 0.332
#> SRR1700002 3 0.4577 0.33506 0.000 0.000 0.740 0.084 0.176
#> SRR1700001 5 0.5215 0.39434 0.000 0.000 0.372 0.052 0.576
#> SRR1700003 3 0.5004 0.25102 0.000 0.000 0.672 0.256 0.072
#> SRR1700004 3 0.5399 -0.01652 0.000 0.000 0.496 0.056 0.448
#> SRR1700005 1 0.0609 0.92260 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700006 3 0.4817 0.33472 0.000 0.000 0.680 0.056 0.264
#> SRR1700007 2 0.0290 0.70056 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700008 4 0.4380 0.37926 0.000 0.000 0.008 0.616 0.376
#> SRR1700009 1 0.1544 0.91331 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700010 5 0.2927 0.70995 0.000 0.000 0.092 0.040 0.868
#> SRR1700011 2 0.3796 0.72718 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000
#> SRR1700013 4 0.4920 0.20022 0.000 0.000 0.384 0.584 0.032
#> SRR1700012 3 0.5115 0.34536 0.000 0.012 0.700 0.072 0.216
#> SRR1700014 3 0.6363 0.31983 0.000 0.124 0.636 0.060 0.180
#> SRR1700015 3 0.4754 0.33264 0.000 0.000 0.684 0.052 0.264
#> SRR1700016 1 0.4304 0.49602 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1700018 3 0.5236 0.19145 0.000 0.000 0.568 0.052 0.380
#> SRR1700017 3 0.5329 0.03387 0.000 0.000 0.516 0.052 0.432
#> SRR1700019 2 0.0451 0.69947 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700020 5 0.2189 0.71334 0.000 0.000 0.084 0.012 0.904
#> SRR1700021 2 0.3438 0.52488 0.000 0.808 0.020 0.172 0.000
#> SRR1700023 3 0.5617 0.20155 0.000 0.004 0.560 0.072 0.364
#> SRR1700022 3 0.5341 -0.01807 0.000 0.000 0.504 0.052 0.444
#> SRR1700024 2 0.6394 -0.19175 0.000 0.476 0.180 0.344 0.000
#> SRR1700025 3 0.2165 0.30581 0.000 0.036 0.924 0.024 0.016
#> SRR1700026 3 0.5080 0.30539 0.000 0.000 0.628 0.056 0.316
#> SRR1700027 3 0.5122 0.30606 0.000 0.000 0.628 0.060 0.312
#> SRR1700028 4 0.0703 0.80999 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1700029 3 0.6269 0.06998 0.000 0.000 0.508 0.168 0.324
#> SRR1700030 2 0.2964 0.58190 0.000 0.856 0.120 0.024 0.000
#> SRR1700031 5 0.2909 0.70994 0.000 0.000 0.140 0.012 0.848
#> SRR1700032 3 0.4483 -0.16896 0.000 0.308 0.672 0.012 0.008
#> SRR1700034 1 0.4242 0.59836 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1700035 2 0.1907 0.65862 0.000 0.928 0.028 0.044 0.000
#> SRR1700033 5 0.4380 0.58060 0.000 0.000 0.304 0.020 0.676
#> SRR1700036 2 0.4249 0.25865 0.000 0.688 0.296 0.016 0.000
#> SRR1700037 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700038 3 0.4957 0.29517 0.000 0.000 0.624 0.044 0.332
#> SRR1700039 5 0.2077 0.71484 0.000 0.000 0.084 0.008 0.908
#> SRR1700040 3 0.4855 0.10390 0.000 0.000 0.552 0.024 0.424
#> SRR1700041 3 0.4905 0.29266 0.000 0.000 0.624 0.040 0.336
#> SRR1700042 3 0.5047 -0.08274 0.000 0.000 0.496 0.032 0.472
#> SRR1700043 3 0.4898 0.24417 0.000 0.000 0.592 0.032 0.376
#> SRR1700045 3 0.5618 0.27852 0.000 0.000 0.608 0.112 0.280
#> SRR1700044 3 0.5390 0.35057 0.000 0.096 0.724 0.044 0.136
#> SRR1700046 3 0.4905 0.29266 0.000 0.000 0.624 0.040 0.336
#> SRR1700047 3 0.4969 0.23540 0.000 0.000 0.588 0.036 0.376
#> SRR1700048 3 0.7086 0.18309 0.000 0.168 0.488 0.304 0.040
#> SRR1700049 5 0.2270 0.71505 0.000 0.000 0.076 0.020 0.904
#> SRR1700050 5 0.2969 0.71320 0.000 0.000 0.128 0.020 0.852
#> SRR1700051 5 0.2305 0.71555 0.000 0.000 0.092 0.012 0.896
#> SRR1700052 5 0.4184 0.60554 0.000 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR1700053 3 0.5466 0.25799 0.000 0.312 0.620 0.016 0.052
#> SRR1700054 3 0.4950 0.27675 0.000 0.000 0.612 0.040 0.348
#> SRR1700055 1 0.1121 0.91948 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700056 5 0.6195 0.50479 0.000 0.000 0.240 0.208 0.552
#> SRR1700057 5 0.6022 0.44956 0.000 0.000 0.136 0.324 0.540
#> SRR1700058 5 0.4418 0.53222 0.000 0.000 0.332 0.016 0.652
#> SRR1700059 4 0.1281 0.80329 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700060 5 0.4404 0.58971 0.000 0.000 0.292 0.024 0.684
#> SRR1700061 3 0.4977 0.27142 0.000 0.000 0.604 0.040 0.356
#> SRR1700062 5 0.5039 0.64630 0.000 0.000 0.184 0.116 0.700
#> SRR1700063 3 0.5118 0.13061 0.000 0.000 0.548 0.040 0.412
#> SRR1700064 3 0.5692 0.22490 0.000 0.352 0.572 0.064 0.012
#> SRR1700065 5 0.4974 0.34891 0.000 0.000 0.408 0.032 0.560
#> SRR1700066 5 0.3849 0.64767 0.000 0.000 0.232 0.016 0.752
#> SRR1700067 4 0.4630 0.51014 0.000 0.396 0.016 0.588 0.000
#> SRR1700068 4 0.6590 -0.20195 0.000 0.000 0.320 0.452 0.228
#> SRR1700069 3 0.5809 0.26875 0.000 0.276 0.624 0.024 0.076
#> SRR1700070 2 0.4410 0.54002 0.000 0.556 0.440 0.004 0.000
#> SRR1700071 3 0.4950 0.27651 0.000 0.000 0.612 0.040 0.348
#> SRR1700072 5 0.4747 0.53418 0.000 0.000 0.332 0.032 0.636
#> SRR1700073 2 0.4161 0.42867 0.000 0.752 0.040 0.208 0.000
#> SRR1700075 3 0.4950 0.28789 0.000 0.000 0.612 0.040 0.348
#> SRR1700074 3 0.5176 0.19880 0.000 0.000 0.572 0.048 0.380
#> SRR1700076 3 0.5019 0.30823 0.000 0.000 0.632 0.052 0.316
#> SRR1700077 3 0.4874 0.24560 0.000 0.000 0.600 0.032 0.368
#> SRR1700078 3 0.5293 -0.05856 0.000 0.000 0.492 0.048 0.460
#> SRR1700080 3 0.6511 0.28470 0.000 0.164 0.608 0.044 0.184
#> SRR1700079 5 0.4716 0.56662 0.000 0.000 0.308 0.036 0.656
#> SRR1700081 5 0.4697 0.54471 0.000 0.000 0.320 0.032 0.648
#> SRR1700082 3 0.5080 0.27219 0.000 0.000 0.604 0.048 0.348
#> SRR1700083 5 0.3197 0.71059 0.000 0.000 0.140 0.024 0.836
#> SRR1700084 5 0.2843 0.70983 0.000 0.000 0.144 0.008 0.848
#> SRR1700085 2 0.0798 0.69369 0.000 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR1700086 3 0.6225 0.30893 0.000 0.124 0.632 0.040 0.204
#> SRR1700087 4 0.0771 0.79968 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700088 4 0.4992 0.10770 0.000 0.008 0.460 0.516 0.016
#> SRR1700089 4 0.0963 0.79534 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700091 4 0.1626 0.79901 0.000 0.044 0.016 0.940 0.000
#> SRR1700090 4 0.0486 0.80946 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR1700092 4 0.2450 0.75568 0.000 0.028 0.076 0.896 0.000
#> SRR1700094 4 0.0703 0.80008 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700093 4 0.0671 0.81037 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1700095 4 0.0671 0.80289 0.000 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700096 4 0.0566 0.80282 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700097 5 0.3812 0.68976 0.000 0.000 0.096 0.092 0.812
#> SRR1700098 2 0.5983 0.62910 0.000 0.580 0.252 0.168 0.000
#> SRR1700099 4 0.2362 0.77157 0.000 0.076 0.024 0.900 0.000
#> SRR1700100 4 0.0510 0.81038 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1700101 4 0.1211 0.80349 0.000 0.024 0.016 0.960 0.000
#> SRR1700102 4 0.2505 0.77082 0.000 0.092 0.020 0.888 0.000
#> SRR1700104 4 0.0671 0.81058 0.000 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR1700103 4 0.0671 0.80463 0.000 0.004 0.016 0.980 0.000
#> SRR1700105 4 0.0963 0.80817 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1700106 4 0.1124 0.80841 0.000 0.036 0.004 0.960 0.000
#> SRR1700107 4 0.1041 0.80779 0.000 0.032 0.004 0.964 0.000
#> SRR1700108 4 0.1568 0.79856 0.000 0.020 0.036 0.944 0.000
#> SRR1700109 2 0.3949 0.72680 0.000 0.696 0.300 0.004 0.000
#> SRR1700110 2 0.4138 0.72727 0.000 0.708 0.276 0.016 0.000
#> SRR1700112 2 0.4355 0.61680 0.000 0.760 0.076 0.164 0.000
#> SRR1700111 4 0.0290 0.80913 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700113 4 0.4196 0.56183 0.000 0.356 0.004 0.640 0.000
#> SRR1700114 4 0.0807 0.80822 0.000 0.012 0.012 0.976 0.000
#> SRR1700115 4 0.3838 0.61417 0.000 0.280 0.004 0.716 0.000
#> SRR1700116 4 0.0162 0.80912 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1700117 5 0.4455 0.17877 0.000 0.000 0.008 0.404 0.588
#> SRR1700119 4 0.0771 0.81088 0.000 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR1700118 4 0.1393 0.81062 0.000 0.012 0.008 0.956 0.024
#> SRR1700120 4 0.3970 0.60812 0.000 0.000 0.024 0.752 0.224
#> SRR1700121 4 0.1270 0.80419 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1700122 4 0.4452 0.36887 0.000 0.496 0.004 0.500 0.000
#> SRR1700123 4 0.0771 0.80986 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1700125 2 0.2230 0.61519 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1700126 4 0.5885 0.21447 0.000 0.000 0.132 0.572 0.296
#> SRR1700127 4 0.0992 0.80436 0.000 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700124 4 0.0992 0.80707 0.000 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700128 4 0.1059 0.81057 0.000 0.008 0.004 0.968 0.020
#> SRR1700129 4 0.3048 0.72671 0.000 0.176 0.004 0.820 0.000
#> SRR1700130 4 0.1197 0.80505 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1700132 4 0.0992 0.80548 0.000 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700131 4 0.1251 0.80108 0.000 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700133 4 0.1792 0.79145 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1700134 4 0.4273 0.46097 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1700135 4 0.1173 0.81135 0.000 0.012 0.004 0.964 0.020
#> SRR1700136 4 0.1331 0.79868 0.000 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700137 4 0.1270 0.80435 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1700138 4 0.1074 0.81207 0.000 0.016 0.004 0.968 0.012
#> SRR1700140 4 0.1012 0.81193 0.000 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR1700139 4 0.0898 0.81065 0.000 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1700141 4 0.4235 0.48808 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1700142 5 0.6808 0.28603 0.000 0.000 0.300 0.340 0.360
#> SRR1700143 4 0.1522 0.79560 0.000 0.000 0.012 0.944 0.044
#> SRR1700144 3 0.5026 0.23636 0.000 0.000 0.588 0.040 0.372
#> SRR1700145 4 0.1251 0.80091 0.000 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700146 4 0.3949 0.58873 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1700147 4 0.1082 0.80365 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700149 4 0.3579 0.61233 0.000 0.000 0.004 0.756 0.240
#> SRR1700148 4 0.1251 0.80196 0.000 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700150 4 0.2011 0.78794 0.000 0.088 0.004 0.908 0.000
#> SRR1700152 4 0.1278 0.81200 0.000 0.016 0.004 0.960 0.020
#> SRR1700151 4 0.1082 0.80365 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700153 4 0.1082 0.80365 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700154 4 0.0771 0.80981 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1700155 4 0.1341 0.80345 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1700156 4 0.1082 0.80365 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700158 4 0.3231 0.68061 0.000 0.000 0.004 0.800 0.196
#> SRR1700159 2 0.3582 0.44740 0.000 0.768 0.008 0.224 0.000
#> SRR1700157 4 0.1845 0.79275 0.000 0.000 0.016 0.928 0.056
#> SRR1700160 4 0.1074 0.81209 0.000 0.016 0.004 0.968 0.012
#> SRR1700161 4 0.0771 0.80839 0.000 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700162 4 0.4307 0.38280 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1700164 4 0.1430 0.79637 0.000 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700163 4 0.2763 0.72074 0.000 0.000 0.004 0.848 0.148
#> SRR1700165 4 0.1168 0.80320 0.000 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700166 4 0.1043 0.80741 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1700168 2 0.4101 0.21636 0.000 0.664 0.004 0.332 0.000
#> SRR1700167 4 0.3574 0.67410 0.000 0.000 0.028 0.804 0.168
#> SRR1700170 4 0.1153 0.81107 0.000 0.024 0.004 0.964 0.008
#> SRR1700169 4 0.0992 0.81097 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1700171 4 0.4420 0.23822 0.000 0.000 0.004 0.548 0.448
#> SRR1700172 4 0.1478 0.80052 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1700174 4 0.0566 0.81102 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1700173 4 0.0290 0.80969 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1700175 4 0.1544 0.79805 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1700176 4 0.5921 0.19521 0.000 0.000 0.136 0.568 0.296
#> SRR1700178 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.1341 0.80351 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1700180 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.4278 0.64778 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.2377 0.89390 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1700185 1 0.0609 0.92260 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700188 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700192 5 0.1082 0.66088 0.008 0.000 0.000 0.028 0.964
#> SRR1700190 5 0.1934 0.61683 0.052 0.000 0.004 0.016 0.928
#> SRR1700191 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 5 0.2966 0.36591 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1700193 2 0.4088 0.71940 0.000 0.632 0.368 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.4192 0.69508 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0162 0.92229 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700197 5 0.3160 0.35169 0.188 0.000 0.000 0.004 0.808
#> SRR1700198 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.4249 0.66772 0.000 0.568 0.432 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700202 3 0.6892 -0.13787 0.000 0.228 0.408 0.356 0.008
#> SRR1700203 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.4219 0.68404 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.4273 0.65236 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700208 5 0.1753 0.68937 0.000 0.000 0.032 0.032 0.936
#> SRR1700205 2 0.3857 0.72973 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.4256 0.66368 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000
#> SRR1700211 3 0.4751 -0.45348 0.000 0.420 0.564 0.008 0.008
#> SRR1700212 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700213 3 0.4146 -0.06678 0.000 0.268 0.716 0.012 0.004
#> SRR1700214 2 0.4101 0.71679 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.92202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.2424 0.89212 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1700220 2 0.4060 0.72210 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.4047 0.70399 0.000 0.676 0.320 0.000 0.004
#> SRR1700226 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.4201 0.69048 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1700225 3 0.4332 0.05402 0.000 0.236 0.732 0.024 0.008
#> SRR1700227 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700230 5 0.1768 0.58087 0.072 0.000 0.000 0.004 0.924
#> SRR1700231 2 0.4171 0.70108 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.4249 0.66870 0.000 0.568 0.432 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.4138 0.70926 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.4264 0.71653 0.000 0.620 0.376 0.004 0.000
#> SRR1700235 2 0.4182 0.69775 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.4088 0.71902 0.000 0.632 0.368 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.3274 0.83389 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1700240 1 0.0609 0.92260 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700241 4 0.2068 0.76995 0.000 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1700243 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700242 5 0.0807 0.68657 0.000 0.000 0.012 0.012 0.976
#> SRR1700246 3 0.6703 -0.17164 0.000 0.312 0.520 0.140 0.028
#> SRR1700245 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.3857 0.74563 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1700249 1 0.0510 0.92270 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700250 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.4088 0.71902 0.000 0.632 0.368 0.000 0.000
#> SRR1700252 3 0.6663 0.26680 0.000 0.060 0.604 0.160 0.176
#> SRR1700253 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.2377 0.89380 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1700255 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.3983 0.72568 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.3752 0.72734 0.000 0.708 0.292 0.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.2605 0.72467 0.000 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0671 0.70439 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1700262 2 0.0794 0.71041 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.4060 0.72210 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.4304 0.60943 0.000 0.516 0.484 0.000 0.000
#> SRR1700265 3 0.5426 0.29893 0.000 0.144 0.716 0.036 0.104
#> SRR1700266 2 0.3508 0.72860 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1700268 3 0.7825 0.13837 0.000 0.152 0.404 0.108 0.336
#> SRR1700270 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.3684 0.72802 0.000 0.720 0.280 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.3636 0.72840 0.000 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.4060 0.72210 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.3636 0.72954 0.000 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1700277 5 0.4681 0.58493 0.000 0.000 0.252 0.052 0.696
#> SRR1700275 2 0.0510 0.69744 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700276 2 0.1956 0.71411 0.000 0.916 0.076 0.008 0.000
#> SRR1700278 2 0.1557 0.70663 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700279 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700280 2 0.0290 0.70056 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700281 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0693 0.70461 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1700282 4 0.5020 0.57080 0.000 0.316 0.036 0.640 0.008
#> SRR1700284 2 0.0510 0.69744 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700285 2 0.0798 0.69770 0.000 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR1700286 2 0.1124 0.71065 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700287 2 0.0290 0.70056 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700290 5 0.0898 0.68711 0.000 0.000 0.020 0.008 0.972
#> SRR1700289 2 0.0566 0.69789 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700288 2 0.4074 0.72123 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700291 2 0.3745 0.47809 0.000 0.780 0.024 0.196 0.000
#> SRR1700293 2 0.3662 0.72976 0.000 0.744 0.252 0.004 0.000
#> SRR1700294 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700295 4 0.4690 0.71383 0.000 0.120 0.020 0.768 0.092
#> SRR1700297 2 0.0510 0.69744 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700296 2 0.0451 0.69947 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700298 2 0.5099 0.06936 0.000 0.612 0.052 0.336 0.000
#> SRR1700299 4 0.5811 0.45534 0.000 0.404 0.064 0.520 0.012
#> SRR1700300 4 0.7159 0.41583 0.000 0.308 0.144 0.492 0.056
#> SRR1700302 2 0.0771 0.69393 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700301 2 0.0566 0.69789 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700303 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700304 2 0.1701 0.70547 0.000 0.936 0.048 0.016 0.000
#> SRR1700305 2 0.1211 0.70390 0.000 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR1700306 4 0.6836 0.51432 0.000 0.256 0.052 0.556 0.136
#> SRR1700308 2 0.2189 0.69458 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1700307 3 0.7751 0.20453 0.000 0.156 0.484 0.224 0.136
#> SRR1700309 3 0.7857 0.15756 0.000 0.240 0.408 0.272 0.080
#> SRR1700310 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700311 2 0.5557 -0.37829 0.000 0.468 0.068 0.464 0.000
#> SRR1700312 2 0.1281 0.70597 0.000 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR1700313 3 0.7395 0.20281 0.000 0.272 0.460 0.220 0.048
#> SRR1700314 4 0.5793 0.54248 0.000 0.308 0.084 0.596 0.012
#> SRR1700315 2 0.6841 -0.14993 0.000 0.456 0.204 0.328 0.012
#> SRR1700316 4 0.5824 0.44207 0.000 0.392 0.084 0.520 0.004
#> SRR1700317 2 0.2011 0.72072 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000
#> SRR1700318 2 0.3090 0.59447 0.000 0.860 0.052 0.088 0.000
#> SRR1700319 4 0.5379 0.54952 0.000 0.324 0.056 0.612 0.008
#> SRR1700320 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700322 2 0.5124 0.33340 0.000 0.644 0.068 0.288 0.000
#> SRR1700321 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700323 2 0.4718 -0.21110 0.000 0.540 0.016 0.444 0.000
#> SRR1700324 2 0.0404 0.69913 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700325 2 0.2011 0.72137 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000
#> SRR1700326 4 0.2585 0.79041 0.000 0.072 0.008 0.896 0.024
#> SRR1700327 2 0.0566 0.69820 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700329 2 0.0510 0.69744 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700328 3 0.7689 0.23687 0.000 0.252 0.480 0.144 0.124
#> SRR1700330 4 0.6768 0.46446 0.000 0.276 0.176 0.524 0.024
#> SRR1700331 2 0.0671 0.69615 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700332 2 0.0510 0.69744 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700333 2 0.1661 0.69749 0.000 0.940 0.036 0.024 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.1610 0.768481 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1699875 2 0.3740 0.617517 0.000 0.740 0.228 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699876 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699877 2 0.0820 0.823023 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699879 2 0.1814 0.742474 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1699878 2 0.1951 0.788616 0.000 0.908 0.076 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699880 3 0.4482 0.569024 0.000 0.000 0.688 0.008 0.056 0.248
#> SRR1699881 3 0.2851 0.708689 0.000 0.000 0.876 0.044 0.040 0.040
#> SRR1699882 2 0.1501 0.772623 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1699883 2 0.1461 0.808050 0.000 0.940 0.044 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699884 2 0.2006 0.782293 0.000 0.904 0.080 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 5 0.3872 0.740387 0.000 0.392 0.000 0.000 0.604 0.004
#> SRR1699888 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699889 5 0.4150 0.746188 0.000 0.372 0.012 0.000 0.612 0.004
#> SRR1699890 2 0.3975 -0.408493 0.000 0.544 0.000 0.000 0.452 0.004
#> SRR1699887 5 0.3950 0.682594 0.000 0.432 0.000 0.000 0.564 0.004
#> SRR1699891 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699892 2 0.4906 0.311616 0.000 0.568 0.376 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699893 4 0.3833 0.564698 0.000 0.000 0.016 0.708 0.272 0.004
#> SRR1699894 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699895 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699896 3 0.3765 0.611655 0.000 0.048 0.780 0.000 0.164 0.008
#> SRR1699897 2 0.3785 0.693788 0.000 0.780 0.064 0.000 0.152 0.004
#> SRR1699898 3 0.6917 -0.128090 0.000 0.000 0.384 0.144 0.096 0.376
#> SRR1699900 3 0.0993 0.721002 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1699899 5 0.3852 0.746929 0.000 0.384 0.000 0.000 0.612 0.004
#> SRR1699902 3 0.2009 0.712470 0.000 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1699901 3 0.4739 0.470458 0.000 0.000 0.636 0.008 0.056 0.300
#> SRR1699903 5 0.4273 0.746875 0.000 0.368 0.012 0.004 0.612 0.004
#> SRR1699904 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699905 3 0.4765 0.351781 0.000 0.000 0.592 0.004 0.052 0.352
#> SRR1699906 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699907 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699908 5 0.4100 0.748233 0.000 0.376 0.004 0.004 0.612 0.004
#> SRR1699909 5 0.5295 0.620344 0.000 0.412 0.052 0.016 0.516 0.004
#> SRR1699910 5 0.4837 0.418854 0.000 0.000 0.068 0.312 0.616 0.004
#> SRR1699911 5 0.5217 0.591289 0.000 0.412 0.080 0.000 0.504 0.004
#> SRR1699912 5 0.3852 0.746929 0.000 0.384 0.000 0.000 0.612 0.004
#> SRR1699913 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699914 3 0.1515 0.724666 0.000 0.000 0.944 0.008 0.020 0.028
#> SRR1699915 5 0.4628 0.428479 0.000 0.000 0.052 0.312 0.632 0.004
#> SRR1699916 2 0.3240 0.356731 0.000 0.752 0.000 0.000 0.244 0.004
#> SRR1699917 5 0.5735 0.402369 0.000 0.084 0.024 0.368 0.520 0.004
#> SRR1699918 2 0.5902 -0.461613 0.000 0.452 0.060 0.048 0.436 0.004
#> SRR1699919 5 0.5341 0.726259 0.000 0.284 0.036 0.056 0.620 0.004
#> SRR1699920 5 0.5874 0.461261 0.000 0.024 0.200 0.180 0.592 0.004
#> SRR1699921 5 0.5886 0.687176 0.000 0.200 0.064 0.108 0.624 0.004
#> SRR1699922 5 0.4195 0.665243 0.000 0.440 0.008 0.000 0.548 0.004
#> SRR1699923 3 0.1320 0.723974 0.000 0.000 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR1699924 3 0.2842 0.704554 0.000 0.000 0.872 0.068 0.020 0.040
#> SRR1699925 1 0.0363 0.885388 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699926 5 0.6066 0.481206 0.000 0.044 0.212 0.152 0.588 0.004
#> SRR1699927 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699929 3 0.5252 0.430193 0.000 0.132 0.624 0.000 0.236 0.008
#> SRR1699928 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699930 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699931 3 0.5604 0.346443 0.000 0.172 0.556 0.000 0.268 0.004
#> SRR1699933 3 0.2583 0.710715 0.000 0.020 0.896 0.032 0.044 0.008
#> SRR1699932 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699934 1 0.0363 0.885388 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699935 4 0.4729 0.093539 0.000 0.040 0.000 0.544 0.412 0.004
#> SRR1699936 2 0.2003 0.722913 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1699937 2 0.3839 0.613590 0.000 0.748 0.212 0.004 0.036 0.000
#> SRR1699938 2 0.0146 0.829574 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699940 3 0.3944 0.643796 0.000 0.000 0.768 0.008 0.060 0.164
#> SRR1699939 2 0.2416 0.673317 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1699941 3 0.3579 0.679708 0.000 0.000 0.808 0.008 0.064 0.120
#> SRR1699942 3 0.5202 0.248497 0.000 0.400 0.532 0.036 0.032 0.000
#> SRR1699943 2 0.1480 0.805783 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699944 2 0.0993 0.820374 0.000 0.964 0.012 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699945 6 0.3261 0.702314 0.000 0.000 0.072 0.000 0.104 0.824
#> SRR1699946 2 0.4384 0.478757 0.000 0.660 0.296 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699947 2 0.4433 0.415936 0.000 0.616 0.344 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699948 2 0.0547 0.824720 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699949 2 0.3351 0.331847 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1699950 2 0.2664 0.623249 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1699951 2 0.4772 0.559810 0.000 0.700 0.016 0.096 0.188 0.000
#> SRR1699952 2 0.3808 0.602125 0.000 0.736 0.228 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699953 2 0.0458 0.826100 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699954 3 0.2009 0.719749 0.000 0.000 0.916 0.004 0.040 0.040
#> SRR1699955 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699956 6 0.4224 0.686902 0.000 0.000 0.156 0.004 0.096 0.744
#> SRR1699957 2 0.3041 0.725619 0.000 0.832 0.128 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699959 3 0.4809 0.489852 0.000 0.000 0.668 0.256 0.052 0.024
#> SRR1699958 4 0.1562 0.857041 0.000 0.024 0.004 0.940 0.032 0.000
#> SRR1699960 2 0.1910 0.738316 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1699961 3 0.1931 0.712932 0.000 0.028 0.924 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699962 2 0.0790 0.810782 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699963 3 0.5491 0.403670 0.000 0.276 0.604 0.088 0.032 0.000
#> SRR1699964 2 0.3210 0.699556 0.000 0.812 0.152 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699965 2 0.0632 0.815948 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699966 4 0.6306 0.375573 0.000 0.036 0.212 0.540 0.208 0.004
#> SRR1699967 2 0.1341 0.811768 0.000 0.948 0.024 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699968 5 0.5543 0.502508 0.000 0.148 0.296 0.000 0.552 0.004
#> SRR1699969 3 0.5683 0.427565 0.000 0.000 0.592 0.040 0.096 0.272
#> SRR1699971 3 0.1911 0.717015 0.000 0.020 0.928 0.004 0.036 0.012
#> SRR1699970 2 0.2201 0.774420 0.000 0.896 0.076 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699972 3 0.1299 0.716213 0.000 0.004 0.952 0.004 0.036 0.004
#> SRR1699973 4 0.5579 0.251387 0.000 0.336 0.008 0.532 0.124 0.000
#> SRR1699974 6 0.2706 0.711613 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1699975 5 0.5224 0.659401 0.000 0.244 0.136 0.000 0.616 0.004
#> SRR1699976 3 0.3106 0.662654 0.000 0.108 0.844 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699977 3 0.2857 0.695412 0.000 0.064 0.876 0.020 0.036 0.004
#> SRR1699978 6 0.5791 0.507474 0.000 0.000 0.280 0.048 0.092 0.580
#> SRR1699979 3 0.4172 0.549259 0.000 0.004 0.720 0.224 0.052 0.000
#> SRR1699980 5 0.5365 0.596985 0.000 0.132 0.216 0.012 0.636 0.004
#> SRR1699981 3 0.5699 0.492494 0.000 0.008 0.628 0.088 0.232 0.044
#> SRR1699982 5 0.3862 0.746462 0.000 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699983 5 0.4578 0.744603 0.000 0.348 0.016 0.016 0.616 0.004
#> SRR1699984 1 0.0363 0.885388 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699985 2 0.3446 0.112435 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1699986 6 0.2923 0.714731 0.000 0.000 0.100 0.000 0.052 0.848
#> SRR1699988 5 0.5757 0.489933 0.000 0.352 0.180 0.000 0.468 0.000
#> SRR1699987 4 0.2963 0.734624 0.000 0.000 0.152 0.828 0.016 0.004
#> SRR1699989 5 0.3986 0.747418 0.000 0.384 0.004 0.000 0.608 0.004
#> SRR1699990 5 0.5707 0.127969 0.000 0.108 0.420 0.008 0.460 0.004
#> SRR1699992 3 0.1484 0.714887 0.000 0.008 0.944 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699991 3 0.2491 0.683908 0.000 0.000 0.868 0.000 0.020 0.112
#> SRR1699993 6 0.3668 0.704309 0.000 0.000 0.088 0.016 0.084 0.812
#> SRR1699994 3 0.4034 0.465360 0.000 0.000 0.652 0.000 0.020 0.328
#> SRR1699995 6 0.4253 0.546178 0.108 0.000 0.000 0.000 0.160 0.732
#> SRR1699996 2 0.2531 0.742768 0.000 0.856 0.132 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699997 4 0.1007 0.859516 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1699998 2 0.4216 0.531894 0.000 0.676 0.288 0.004 0.032 0.000
#> SRR1699999 6 0.3504 0.596017 0.024 0.000 0.004 0.000 0.196 0.776
#> SRR1700000 3 0.2613 0.715437 0.000 0.012 0.892 0.008 0.040 0.048
#> SRR1700002 3 0.3101 0.667187 0.000 0.104 0.848 0.008 0.036 0.004
#> SRR1700001 3 0.5014 0.256027 0.000 0.000 0.544 0.008 0.056 0.392
#> SRR1700003 3 0.3821 0.663211 0.000 0.068 0.808 0.092 0.032 0.000
#> SRR1700004 3 0.4227 0.579457 0.000 0.000 0.724 0.012 0.044 0.220
#> SRR1700005 1 0.1088 0.886331 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1700006 3 0.2153 0.706822 0.000 0.040 0.912 0.004 0.040 0.004
#> SRR1700007 5 0.3737 0.743034 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1700008 4 0.5267 0.191420 0.000 0.000 0.020 0.528 0.056 0.396
#> SRR1700009 1 0.2794 0.852478 0.860 0.000 0.000 0.000 0.080 0.060
#> SRR1700010 6 0.3698 0.698224 0.000 0.000 0.116 0.000 0.096 0.788
#> SRR1700011 2 0.2135 0.712678 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1700013 4 0.4760 -0.025551 0.000 0.000 0.464 0.496 0.032 0.008
#> SRR1700012 3 0.1570 0.717698 0.000 0.016 0.944 0.008 0.028 0.004
#> SRR1700014 3 0.0935 0.723427 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700015 3 0.1629 0.716955 0.000 0.024 0.940 0.004 0.028 0.004
#> SRR1700016 6 0.5602 0.180383 0.276 0.000 0.000 0.000 0.188 0.536
#> SRR1700018 3 0.2272 0.715753 0.000 0.000 0.900 0.004 0.056 0.040
#> SRR1700017 3 0.2905 0.691043 0.000 0.000 0.856 0.004 0.048 0.092
#> SRR1700019 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700020 6 0.3466 0.703208 0.000 0.000 0.084 0.004 0.096 0.816
#> SRR1700021 5 0.5291 0.710392 0.000 0.252 0.020 0.100 0.628 0.000
#> SRR1700023 3 0.3296 0.698238 0.000 0.000 0.840 0.016 0.064 0.080
#> SRR1700022 3 0.3031 0.675575 0.000 0.000 0.844 0.004 0.044 0.108
#> SRR1700024 5 0.6836 0.470922 0.000 0.096 0.208 0.204 0.492 0.000
#> SRR1700025 3 0.4066 0.476629 0.000 0.272 0.696 0.004 0.028 0.000
#> SRR1700026 3 0.0748 0.722048 0.000 0.000 0.976 0.004 0.004 0.016
#> SRR1700027 3 0.0862 0.722195 0.000 0.000 0.972 0.004 0.016 0.008
#> SRR1700028 4 0.0363 0.876767 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700029 3 0.4316 0.635170 0.000 0.000 0.776 0.096 0.060 0.068
#> SRR1700030 5 0.4937 0.711295 0.000 0.280 0.088 0.004 0.628 0.000
#> SRR1700031 6 0.4762 0.584899 0.000 0.000 0.272 0.004 0.076 0.648
#> SRR1700032 2 0.4319 0.417108 0.000 0.620 0.348 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700034 6 0.5554 0.159914 0.276 0.000 0.000 0.000 0.180 0.544
#> SRR1700035 5 0.4596 0.741143 0.000 0.332 0.012 0.032 0.624 0.000
#> SRR1700033 3 0.4834 0.315975 0.000 0.000 0.596 0.004 0.060 0.340
#> SRR1700036 5 0.5506 0.614743 0.000 0.172 0.220 0.004 0.600 0.004
#> SRR1700037 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700038 3 0.0622 0.722530 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700039 6 0.3068 0.709829 0.000 0.000 0.088 0.000 0.072 0.840
#> SRR1700040 3 0.2526 0.697300 0.000 0.000 0.876 0.004 0.024 0.096
#> SRR1700041 3 0.0972 0.723938 0.000 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1700042 3 0.3800 0.613035 0.000 0.000 0.776 0.004 0.060 0.160
#> SRR1700043 3 0.1391 0.722182 0.000 0.000 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1700045 3 0.1321 0.725455 0.000 0.000 0.952 0.020 0.024 0.004
#> SRR1700044 3 0.1807 0.707387 0.000 0.060 0.920 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700046 3 0.0653 0.722659 0.000 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1700047 3 0.2854 0.691638 0.000 0.000 0.860 0.004 0.048 0.088
#> SRR1700048 3 0.3272 0.655023 0.000 0.000 0.824 0.124 0.048 0.004
#> SRR1700049 6 0.3210 0.705027 0.000 0.000 0.088 0.004 0.072 0.836
#> SRR1700050 6 0.4486 0.645855 0.000 0.000 0.208 0.004 0.084 0.704
#> SRR1700051 6 0.3975 0.697675 0.000 0.000 0.112 0.004 0.112 0.772
#> SRR1700052 3 0.4802 0.183329 0.000 0.000 0.540 0.000 0.056 0.404
#> SRR1700053 3 0.3410 0.574131 0.000 0.008 0.768 0.000 0.216 0.008
#> SRR1700054 3 0.1408 0.717937 0.000 0.000 0.944 0.000 0.020 0.036
#> SRR1700055 1 0.2263 0.873082 0.896 0.000 0.000 0.000 0.056 0.048
#> SRR1700056 3 0.6892 -0.065333 0.000 0.000 0.404 0.176 0.076 0.344
#> SRR1700057 6 0.6938 0.390035 0.000 0.000 0.168 0.304 0.092 0.436
#> SRR1700058 3 0.4049 0.438702 0.000 0.000 0.648 0.000 0.020 0.332
#> SRR1700059 4 0.2240 0.836082 0.000 0.000 0.016 0.908 0.032 0.044
#> SRR1700060 3 0.4834 0.346772 0.000 0.000 0.596 0.004 0.060 0.340
#> SRR1700061 3 0.1088 0.721825 0.000 0.000 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1700062 6 0.6003 0.445190 0.000 0.000 0.304 0.064 0.084 0.548
#> SRR1700063 3 0.3083 0.658049 0.000 0.000 0.828 0.000 0.040 0.132
#> SRR1700064 3 0.5007 0.183271 0.000 0.000 0.504 0.044 0.440 0.012
#> SRR1700065 3 0.3587 0.605101 0.000 0.000 0.772 0.000 0.040 0.188
#> SRR1700066 6 0.4473 -0.047673 0.000 0.000 0.484 0.000 0.028 0.488
#> SRR1700067 5 0.4267 0.259780 0.000 0.008 0.008 0.420 0.564 0.000
#> SRR1700068 3 0.6157 0.360017 0.000 0.000 0.576 0.228 0.072 0.124
#> SRR1700069 3 0.3357 0.569481 0.000 0.004 0.764 0.000 0.224 0.008
#> SRR1700070 2 0.5150 0.402780 0.000 0.608 0.256 0.000 0.136 0.000
#> SRR1700071 3 0.1616 0.714169 0.000 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1700072 3 0.4599 0.443010 0.000 0.000 0.648 0.004 0.056 0.292
#> SRR1700073 5 0.5608 0.699398 0.000 0.248 0.028 0.120 0.604 0.000
#> SRR1700075 3 0.0914 0.722904 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700074 3 0.2179 0.704000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.036 0.064
#> SRR1700076 3 0.0810 0.722745 0.000 0.004 0.976 0.004 0.008 0.008
#> SRR1700077 3 0.1616 0.715198 0.000 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1700078 3 0.3976 0.595521 0.000 0.000 0.748 0.004 0.052 0.196
#> SRR1700080 3 0.3250 0.617045 0.000 0.004 0.788 0.000 0.196 0.012
#> SRR1700079 3 0.5842 0.099608 0.000 0.000 0.504 0.036 0.088 0.372
#> SRR1700081 3 0.4603 0.391009 0.000 0.000 0.628 0.008 0.040 0.324
#> SRR1700082 3 0.0858 0.720646 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700083 6 0.4314 0.631719 0.000 0.000 0.220 0.004 0.064 0.712
#> SRR1700084 6 0.4252 0.528792 0.000 0.000 0.312 0.000 0.036 0.652
#> SRR1700085 5 0.3852 0.747624 0.000 0.384 0.004 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700086 3 0.1918 0.708592 0.000 0.000 0.904 0.000 0.088 0.008
#> SRR1700087 4 0.1313 0.864737 0.000 0.000 0.016 0.952 0.028 0.004
#> SRR1700088 4 0.5281 0.000690 0.000 0.048 0.436 0.492 0.024 0.000
#> SRR1700089 4 0.1341 0.857685 0.000 0.000 0.028 0.948 0.024 0.000
#> SRR1700091 4 0.0767 0.874931 0.000 0.008 0.000 0.976 0.012 0.004
#> SRR1700090 4 0.0146 0.876652 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700092 4 0.1829 0.827798 0.000 0.064 0.004 0.920 0.012 0.000
#> SRR1700094 4 0.1151 0.863607 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032 0.000
#> SRR1700093 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700095 4 0.0909 0.871256 0.000 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR1700096 4 0.0622 0.875024 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1700097 6 0.4434 0.660659 0.000 0.000 0.072 0.092 0.068 0.768
#> SRR1700098 2 0.4704 0.436578 0.000 0.664 0.000 0.236 0.100 0.000
#> SRR1700099 4 0.1151 0.859804 0.000 0.032 0.000 0.956 0.012 0.000
#> SRR1700100 4 0.0551 0.876139 0.000 0.000 0.004 0.984 0.008 0.004
#> SRR1700101 4 0.0508 0.875583 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1700102 4 0.2581 0.769385 0.000 0.016 0.000 0.856 0.128 0.000
#> SRR1700104 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700103 4 0.0622 0.875923 0.000 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1700105 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700106 4 0.0508 0.877045 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1700107 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700108 4 0.0665 0.875005 0.000 0.008 0.004 0.980 0.008 0.000
#> SRR1700109 2 0.2489 0.710960 0.000 0.860 0.000 0.012 0.128 0.000
#> SRR1700110 2 0.3071 0.623938 0.000 0.804 0.000 0.016 0.180 0.000
#> SRR1700112 5 0.5696 0.528632 0.000 0.396 0.000 0.160 0.444 0.000
#> SRR1700111 4 0.0436 0.876732 0.000 0.000 0.004 0.988 0.004 0.004
#> SRR1700113 5 0.4463 0.177685 0.000 0.028 0.000 0.456 0.516 0.000
#> SRR1700114 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700115 4 0.3837 0.633240 0.000 0.052 0.000 0.752 0.196 0.000
#> SRR1700116 4 0.0291 0.876380 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1700117 6 0.5032 0.397226 0.000 0.000 0.016 0.316 0.060 0.608
#> SRR1700119 4 0.0405 0.876939 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700118 4 0.0806 0.874957 0.000 0.000 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR1700120 4 0.3912 0.655603 0.000 0.000 0.004 0.748 0.044 0.204
#> SRR1700121 4 0.0458 0.875357 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700122 5 0.4779 0.404313 0.000 0.060 0.000 0.368 0.572 0.000
#> SRR1700123 4 0.0405 0.875175 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700125 5 0.4904 0.722046 0.000 0.316 0.000 0.084 0.600 0.000
#> SRR1700126 4 0.5564 0.448922 0.000 0.000 0.100 0.628 0.044 0.228
#> SRR1700127 4 0.0551 0.876805 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1700124 4 0.0260 0.876657 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700128 4 0.0508 0.876044 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1700129 4 0.2704 0.750400 0.000 0.016 0.000 0.844 0.140 0.000
#> SRR1700130 4 0.0508 0.876078 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1700132 4 0.0767 0.875531 0.000 0.000 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR1700131 4 0.1065 0.871449 0.000 0.000 0.008 0.964 0.008 0.020
#> SRR1700133 4 0.0713 0.871667 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700134 5 0.4774 0.285472 0.000 0.052 0.000 0.420 0.528 0.000
#> SRR1700135 4 0.0508 0.876307 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1700136 4 0.1857 0.840738 0.000 0.000 0.004 0.924 0.028 0.044
#> SRR1700137 4 0.0363 0.876103 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700138 4 0.0405 0.876189 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR1700140 4 0.0520 0.876721 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1700139 4 0.0520 0.876721 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1700141 5 0.4591 0.160921 0.000 0.036 0.000 0.464 0.500 0.000
#> SRR1700142 3 0.7051 -0.000672 0.000 0.000 0.416 0.276 0.084 0.224
#> SRR1700143 4 0.2036 0.832624 0.000 0.000 0.008 0.916 0.028 0.048
#> SRR1700144 3 0.3141 0.671746 0.000 0.000 0.836 0.004 0.048 0.112
#> SRR1700145 4 0.1003 0.869345 0.000 0.000 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR1700146 4 0.4183 -0.017720 0.000 0.012 0.000 0.508 0.480 0.000
#> SRR1700147 4 0.0767 0.873045 0.000 0.000 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR1700149 4 0.4064 0.608681 0.000 0.000 0.004 0.720 0.040 0.236
#> SRR1700148 4 0.0976 0.871420 0.000 0.000 0.008 0.968 0.016 0.008
#> SRR1700150 4 0.1327 0.843892 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1700152 4 0.0508 0.876848 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR1700151 4 0.0837 0.873132 0.000 0.000 0.004 0.972 0.020 0.004
#> SRR1700153 4 0.0665 0.874149 0.000 0.000 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR1700154 4 0.0405 0.876189 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR1700155 4 0.0458 0.875406 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700156 4 0.1138 0.866500 0.000 0.000 0.004 0.960 0.024 0.012
#> SRR1700158 4 0.3424 0.727416 0.000 0.000 0.004 0.800 0.036 0.160
#> SRR1700159 5 0.5186 0.685382 0.000 0.232 0.000 0.156 0.612 0.000
#> SRR1700157 4 0.1700 0.851943 0.000 0.000 0.012 0.936 0.028 0.024
#> SRR1700160 4 0.0725 0.875571 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR1700161 4 0.0767 0.874944 0.000 0.000 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR1700162 5 0.4724 0.438350 0.000 0.060 0.000 0.348 0.592 0.000
#> SRR1700164 4 0.1232 0.865253 0.000 0.000 0.004 0.956 0.016 0.024
#> SRR1700163 4 0.3275 0.736254 0.000 0.000 0.004 0.816 0.036 0.144
#> SRR1700165 4 0.0767 0.874060 0.000 0.000 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR1700166 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700168 5 0.5644 0.594538 0.000 0.188 0.000 0.288 0.524 0.000
#> SRR1700167 4 0.3595 0.690491 0.000 0.000 0.004 0.780 0.036 0.180
#> SRR1700170 4 0.0146 0.876899 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700169 4 0.0520 0.876372 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1700171 4 0.5259 0.227052 0.000 0.000 0.000 0.536 0.108 0.356
#> SRR1700172 4 0.0713 0.870288 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700174 4 0.0405 0.876791 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700173 4 0.0405 0.875886 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700175 4 0.0458 0.875406 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700176 4 0.5381 0.436971 0.000 0.000 0.064 0.628 0.048 0.260
#> SRR1700178 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.0458 0.875406 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700180 2 0.0146 0.829574 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0260 0.885816 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0146 0.829574 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700186 2 0.2046 0.782429 0.000 0.908 0.060 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700187 1 0.4273 0.775009 0.732 0.000 0.000 0.000 0.148 0.120
#> SRR1700185 1 0.1088 0.886497 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1700188 2 0.0508 0.827259 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700192 6 0.3361 0.628672 0.004 0.000 0.020 0.000 0.188 0.788
#> SRR1700190 6 0.3568 0.625040 0.012 0.000 0.020 0.000 0.188 0.780
#> SRR1700191 1 0.0363 0.885388 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700189 6 0.4117 0.555937 0.064 0.000 0.004 0.000 0.192 0.740
#> SRR1700193 2 0.0260 0.828703 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700195 2 0.1049 0.816862 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700194 1 0.0260 0.886825 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700196 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 6 0.3661 0.597069 0.020 0.000 0.012 0.000 0.200 0.768
#> SRR1700198 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.1196 0.812540 0.000 0.952 0.040 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.5143 0.450191 0.000 0.640 0.108 0.240 0.012 0.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0891 0.820523 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700206 2 0.2019 0.774400 0.000 0.900 0.088 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 6 0.3717 0.663526 0.000 0.000 0.072 0.000 0.148 0.780
#> SRR1700205 2 0.2118 0.735120 0.000 0.888 0.008 0.000 0.104 0.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.1225 0.812438 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700211 2 0.3017 0.700934 0.000 0.816 0.164 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.4269 0.455023 0.000 0.648 0.316 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700214 2 0.0717 0.824554 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700215 1 0.0260 0.885816 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0363 0.885388 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700218 2 0.0260 0.828703 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.4736 0.731608 0.680 0.000 0.000 0.000 0.164 0.156
#> SRR1700220 2 0.0547 0.818947 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700221 2 0.0146 0.829374 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.3455 0.672145 0.000 0.800 0.056 0.000 0.144 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0972 0.818650 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700225 2 0.4808 0.285246 0.000 0.568 0.384 0.012 0.036 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 6 0.3401 0.613020 0.004 0.000 0.016 0.000 0.204 0.776
#> SRR1700231 2 0.0891 0.820737 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700228 2 0.1584 0.795734 0.000 0.928 0.064 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0891 0.820523 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700234 2 0.0717 0.824802 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700235 2 0.1225 0.813275 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0260 0.829150 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700238 2 0.0520 0.826566 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700239 1 0.5464 0.577769 0.564 0.000 0.000 0.000 0.176 0.260
#> SRR1700240 1 0.1492 0.882866 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR1700241 4 0.4064 0.672442 0.000 0.044 0.168 0.768 0.016 0.004
#> SRR1700243 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 6 0.3453 0.660133 0.000 0.000 0.044 0.000 0.164 0.792
#> SRR1700246 2 0.4980 0.520477 0.000 0.648 0.268 0.060 0.024 0.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.5759 0.286493 0.436 0.000 0.000 0.000 0.172 0.392
#> SRR1700249 1 0.0914 0.886847 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700250 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700252 3 0.6334 0.345951 0.000 0.296 0.552 0.072 0.044 0.036
#> SRR1700253 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.4589 0.747244 0.696 0.000 0.000 0.000 0.172 0.132
#> SRR1700255 2 0.0146 0.829374 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0632 0.815737 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700259 2 0.2135 0.706241 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1700260 2 0.3843 -0.382585 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1700261 5 0.3737 0.742837 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1700262 5 0.3747 0.738334 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1700263 2 0.0146 0.828218 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700264 2 0.2163 0.778595 0.000 0.892 0.092 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700265 3 0.4088 0.502855 0.000 0.240 0.716 0.000 0.040 0.004
#> SRR1700266 2 0.2912 0.543711 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1700268 3 0.7481 0.202144 0.000 0.080 0.444 0.032 0.232 0.212
#> SRR1700270 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0146 0.828232 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700271 2 0.2300 0.682836 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1700272 2 0.2454 0.656430 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1700273 2 0.0260 0.826332 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700274 2 0.2883 0.553386 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1700277 6 0.5289 0.378548 0.000 0.000 0.360 0.004 0.096 0.540
#> SRR1700275 5 0.3727 0.744464 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700276 2 0.3854 -0.497107 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1700278 5 0.3993 0.603845 0.000 0.476 0.004 0.000 0.520 0.000
#> SRR1700279 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700280 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.829996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 5 0.3804 0.704291 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1700282 4 0.5956 0.190916 0.000 0.040 0.052 0.524 0.364 0.020
#> SRR1700284 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700285 5 0.3986 0.739141 0.000 0.384 0.004 0.004 0.608 0.000
#> SRR1700286 5 0.3823 0.676787 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1700287 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700290 6 0.2145 0.687108 0.000 0.000 0.028 0.000 0.072 0.900
#> SRR1700289 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700288 2 0.0260 0.829026 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700292 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700291 5 0.5483 0.710053 0.000 0.276 0.020 0.108 0.596 0.000
#> SRR1700293 2 0.2883 0.485311 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1700294 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700295 4 0.5439 0.527445 0.000 0.000 0.024 0.636 0.200 0.140
#> SRR1700297 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700296 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700298 5 0.5729 0.662063 0.000 0.180 0.036 0.168 0.616 0.000
#> SRR1700299 5 0.5157 0.412504 0.000 0.032 0.044 0.332 0.592 0.000
#> SRR1700300 5 0.6987 0.361685 0.000 0.052 0.176 0.264 0.484 0.024
#> SRR1700302 5 0.3852 0.747744 0.000 0.384 0.000 0.004 0.612 0.000
#> SRR1700301 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700303 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700304 5 0.3991 0.625607 0.000 0.472 0.000 0.004 0.524 0.000
#> SRR1700305 5 0.3789 0.718490 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1700306 5 0.6676 0.105937 0.000 0.000 0.056 0.336 0.432 0.176
#> SRR1700308 5 0.4385 0.652445 0.000 0.444 0.024 0.000 0.532 0.000
#> SRR1700307 3 0.4981 0.578934 0.000 0.024 0.720 0.124 0.120 0.012
#> SRR1700309 3 0.6191 0.275602 0.000 0.020 0.496 0.128 0.344 0.012
#> SRR1700310 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700311 5 0.5415 0.519036 0.000 0.064 0.044 0.280 0.612 0.000
#> SRR1700312 5 0.3833 0.679864 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1700313 3 0.6142 0.324711 0.000 0.044 0.536 0.136 0.284 0.000
#> SRR1700314 5 0.5253 0.170478 0.000 0.004 0.084 0.408 0.504 0.000
#> SRR1700315 5 0.6751 0.546620 0.000 0.152 0.152 0.168 0.528 0.000
#> SRR1700316 5 0.6118 0.283349 0.000 0.048 0.100 0.372 0.480 0.000
#> SRR1700317 2 0.3862 -0.489594 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1700318 5 0.5454 0.720542 0.000 0.272 0.040 0.064 0.620 0.004
#> SRR1700319 5 0.4873 0.180331 0.000 0.000 0.060 0.420 0.520 0.000
#> SRR1700320 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700322 5 0.5941 0.579472 0.000 0.340 0.008 0.176 0.476 0.000
#> SRR1700321 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700323 5 0.5641 0.556733 0.000 0.120 0.020 0.288 0.572 0.000
#> SRR1700324 5 0.3737 0.744050 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1700325 2 0.3817 -0.372418 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1700326 4 0.3671 0.737201 0.000 0.000 0.028 0.800 0.144 0.028
#> SRR1700327 5 0.3841 0.747625 0.000 0.380 0.004 0.000 0.616 0.000
#> SRR1700329 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700328 3 0.5601 0.371349 0.000 0.024 0.592 0.072 0.300 0.012
#> SRR1700330 5 0.6807 0.217647 0.000 0.060 0.168 0.336 0.432 0.004
#> SRR1700331 5 0.4079 0.747518 0.000 0.380 0.008 0.000 0.608 0.004
#> SRR1700332 5 0.3727 0.746700 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1700333 5 0.4268 0.689959 0.000 0.428 0.004 0.012 0.556 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.835 0.907 0.960 0.4928 0.506 0.506
#> 3 3 0.577 0.752 0.871 0.3432 0.740 0.527
#> 4 4 0.650 0.729 0.853 0.1211 0.869 0.636
#> 5 5 0.600 0.590 0.770 0.0584 0.962 0.856
#> 6 6 0.589 0.452 0.695 0.0380 0.970 0.873
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699881 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.4939 0.8637 0.108 0.892
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.8555 0.6119 0.280 0.720
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699900 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699902 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699901 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699910 1 0.0938 0.9392 0.988 0.012
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699914 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699915 1 0.9795 0.3316 0.584 0.416
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699920 1 0.7674 0.7292 0.776 0.224
#> SRR1699921 2 0.1414 0.9517 0.020 0.980
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699923 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699924 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.8763 0.5754 0.296 0.704
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.6048 0.8178 0.148 0.852
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.1184 0.9549 0.016 0.984
#> SRR1699933 1 0.4022 0.8899 0.920 0.080
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699940 1 0.0672 0.9415 0.992 0.008
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699941 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.4431 0.8823 0.092 0.908
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.3274 0.9149 0.060 0.940
#> SRR1699947 2 0.3114 0.9186 0.056 0.944
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699954 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699959 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699961 1 0.7139 0.7653 0.804 0.196
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.7602 0.7131 0.220 0.780
#> SRR1699964 2 0.1184 0.9547 0.016 0.984
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.8144 0.6574 0.252 0.748
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1699969 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699971 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699972 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699974 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.8813 0.5598 0.300 0.700
#> SRR1699977 1 0.8207 0.6828 0.744 0.256
#> SRR1699978 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699979 1 0.9209 0.5349 0.664 0.336
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699981 1 0.4022 0.8890 0.920 0.080
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699987 1 0.1184 0.9367 0.984 0.016
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.4022 0.8938 0.080 0.920
#> SRR1699992 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699991 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699993 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699994 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.4939 0.8627 0.108 0.892
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700002 1 0.9850 0.3054 0.572 0.428
#> SRR1700001 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700003 1 0.9833 0.3055 0.576 0.424
#> SRR1700004 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.1633 0.9318 0.976 0.024
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700013 1 0.2778 0.9140 0.952 0.048
#> SRR1700012 1 0.9850 0.2971 0.572 0.428
#> SRR1700014 2 0.9970 0.0752 0.468 0.532
#> SRR1700015 1 0.1633 0.9319 0.976 0.024
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700017 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700023 1 0.0376 0.9438 0.996 0.004
#> SRR1700022 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.1633 0.9485 0.024 0.976
#> SRR1700026 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700027 1 0.0376 0.9438 0.996 0.004
#> SRR1700028 2 0.9754 0.2986 0.408 0.592
#> SRR1700029 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700031 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700036 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700038 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700039 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.0376 0.9438 0.996 0.004
#> SRR1700042 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700043 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700044 2 0.8909 0.5441 0.308 0.692
#> SRR1700046 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700047 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700048 1 0.7299 0.7580 0.796 0.204
#> SRR1700049 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.9896 0.2672 0.560 0.440
#> SRR1700054 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700059 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700060 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700061 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700062 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700063 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700064 1 0.8608 0.6360 0.716 0.284
#> SRR1700065 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700066 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700067 2 0.3879 0.8991 0.076 0.924
#> SRR1700068 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700069 1 0.7376 0.7520 0.792 0.208
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700071 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700072 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700073 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700075 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700074 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700076 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700077 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700078 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700080 1 0.7528 0.7410 0.784 0.216
#> SRR1700079 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700081 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700082 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700083 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700084 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700086 1 0.4562 0.8750 0.904 0.096
#> SRR1700087 1 0.4431 0.8788 0.908 0.092
#> SRR1700088 2 0.9393 0.4428 0.356 0.644
#> SRR1700089 1 0.0938 0.9392 0.988 0.012
#> SRR1700091 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700090 1 0.1184 0.9369 0.984 0.016
#> SRR1700092 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1700094 1 0.9988 0.1216 0.520 0.480
#> SRR1700093 2 0.6531 0.7905 0.168 0.832
#> SRR1700095 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700096 1 0.5178 0.8575 0.884 0.116
#> SRR1700097 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.3114 0.9185 0.056 0.944
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.9732 0.2965 0.404 0.596
#> SRR1700103 1 0.4161 0.8859 0.916 0.084
#> SRR1700105 2 0.9866 0.2150 0.432 0.568
#> SRR1700106 1 0.4815 0.8660 0.896 0.104
#> SRR1700107 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700111 1 0.0376 0.9437 0.996 0.004
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.1184 0.9546 0.016 0.984
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700116 1 0.0376 0.9438 0.996 0.004
#> SRR1700117 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700119 1 0.7219 0.7611 0.800 0.200
#> SRR1700118 1 0.5842 0.8322 0.860 0.140
#> SRR1700120 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700121 2 0.4022 0.8945 0.080 0.920
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700123 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700127 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700124 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700128 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.5737 0.8317 0.136 0.864
#> SRR1700132 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700131 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700133 2 0.9686 0.3179 0.396 0.604
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700135 1 0.0938 0.9392 0.988 0.012
#> SRR1700136 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700137 1 0.9866 0.2916 0.568 0.432
#> SRR1700138 1 0.7674 0.7301 0.776 0.224
#> SRR1700140 1 0.6247 0.8158 0.844 0.156
#> SRR1700139 1 0.3431 0.9031 0.936 0.064
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700144 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700145 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700147 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700152 1 0.5059 0.8605 0.888 0.112
#> SRR1700151 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700153 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700154 1 0.0672 0.9415 0.992 0.008
#> SRR1700155 2 0.9522 0.3848 0.372 0.628
#> SRR1700156 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700157 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.1414 0.9344 0.980 0.020
#> SRR1700161 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700166 1 0.7674 0.7309 0.776 0.224
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.3879 0.8929 0.924 0.076
#> SRR1700169 1 0.9087 0.5602 0.676 0.324
#> SRR1700171 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700172 2 0.0938 0.9579 0.012 0.988
#> SRR1700174 1 0.8144 0.6847 0.748 0.252
#> SRR1700173 1 0.5737 0.8379 0.864 0.136
#> SRR1700175 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700176 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.7453 0.7215 0.212 0.788
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.9996 0.0223 0.488 0.512
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.8661 0.5947 0.288 0.712
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.5059 0.8603 0.112 0.888
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.6148 0.8098 0.152 0.848
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700241 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.9661 0.3809 0.608 0.392
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700252 1 0.5629 0.8400 0.868 0.132
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.8861 0.5631 0.304 0.696
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700268 1 0.6048 0.8193 0.852 0.148
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700282 1 0.8144 0.6778 0.748 0.252
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700295 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.9323 0.4575 0.348 0.652
#> SRR1700300 1 0.9580 0.4240 0.620 0.380
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700306 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700307 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700309 1 0.2043 0.9260 0.968 0.032
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.2603 0.9301 0.044 0.956
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700313 1 0.7815 0.7194 0.768 0.232
#> SRR1700314 1 0.9129 0.5502 0.672 0.328
#> SRR1700315 2 0.4431 0.8817 0.092 0.908
#> SRR1700316 2 0.1184 0.9547 0.016 0.984
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1700319 1 0.8207 0.6815 0.744 0.256
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700326 1 0.0000 0.9459 1.000 0.000
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700328 1 0.4298 0.8816 0.912 0.088
#> SRR1700330 1 0.9983 0.1234 0.524 0.476
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9674 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.1163 0.8522 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 1 0.5016 0.7354 0.760 0.240 0.000
#> SRR1699877 2 0.0237 0.8625 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699879 2 0.2448 0.8167 0.076 0.924 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699881 3 0.0592 0.9185 0.000 0.012 0.988
#> SRR1699882 2 0.2356 0.8229 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 1 0.6126 0.4876 0.600 0.400 0.000
#> SRR1699888 2 0.1643 0.8407 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699889 1 0.4062 0.7840 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699890 1 0.6309 0.2169 0.504 0.496 0.000
#> SRR1699887 1 0.6180 0.4484 0.584 0.416 0.000
#> SRR1699891 1 0.4121 0.7824 0.832 0.168 0.000
#> SRR1699892 2 0.0983 0.8571 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699893 1 0.0237 0.7554 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699894 1 0.4062 0.7837 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699895 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699896 2 0.8340 0.4271 0.236 0.620 0.144
#> SRR1699897 2 0.1289 0.8500 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699898 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699900 3 0.0237 0.9218 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699899 1 0.4062 0.7843 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699902 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699901 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699903 1 0.3879 0.7867 0.848 0.152 0.000
#> SRR1699904 1 0.3879 0.7867 0.848 0.152 0.000
#> SRR1699905 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699906 1 0.4121 0.7827 0.832 0.168 0.000
#> SRR1699907 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699908 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699909 1 0.5733 0.6316 0.676 0.324 0.000
#> SRR1699910 1 0.2165 0.7520 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699911 1 0.5591 0.6614 0.696 0.304 0.000
#> SRR1699912 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699913 1 0.4002 0.7855 0.840 0.160 0.000
#> SRR1699914 3 0.1163 0.9141 0.028 0.000 0.972
#> SRR1699915 1 0.0829 0.7624 0.984 0.012 0.004
#> SRR1699916 2 0.5706 0.3952 0.320 0.680 0.000
#> SRR1699917 1 0.2165 0.7799 0.936 0.064 0.000
#> SRR1699918 1 0.6291 0.3179 0.532 0.468 0.000
#> SRR1699919 1 0.3412 0.7889 0.876 0.124 0.000
#> SRR1699920 1 0.2703 0.7640 0.928 0.016 0.056
#> SRR1699921 1 0.3340 0.7890 0.880 0.120 0.000
#> SRR1699922 1 0.6126 0.5123 0.600 0.400 0.000
#> SRR1699923 3 0.0237 0.9218 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699924 3 0.2448 0.8909 0.076 0.000 0.924
#> SRR1699925 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699926 1 0.3921 0.7853 0.884 0.080 0.036
#> SRR1699927 1 0.3879 0.7867 0.848 0.152 0.000
#> SRR1699929 2 0.7948 0.4111 0.268 0.632 0.100
#> SRR1699928 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699930 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699931 2 0.5269 0.6551 0.200 0.784 0.016
#> SRR1699933 3 0.6601 0.5424 0.028 0.296 0.676
#> SRR1699932 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699934 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699935 1 0.2959 0.7703 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699936 2 0.3686 0.7526 0.140 0.860 0.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.4291 0.7618 0.000 0.180 0.820
#> SRR1699939 2 0.4178 0.7169 0.172 0.828 0.000
#> SRR1699941 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.2446 0.8271 0.052 0.936 0.012
#> SRR1699943 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0592 0.8569 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699947 2 0.1129 0.8523 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699948 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.5968 0.3281 0.364 0.636 0.000
#> SRR1699950 2 0.4796 0.6499 0.220 0.780 0.000
#> SRR1699951 2 0.5178 0.6101 0.256 0.744 0.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.1031 0.8535 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699954 3 0.1163 0.9092 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699955 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0237 0.8622 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699959 3 0.1482 0.9145 0.020 0.012 0.968
#> SRR1699958 2 0.5810 0.5472 0.336 0.664 0.000
#> SRR1699960 2 0.3752 0.7497 0.144 0.856 0.000
#> SRR1699961 2 0.5098 0.6205 0.000 0.752 0.248
#> SRR1699962 2 0.0892 0.8559 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699963 2 0.4206 0.7741 0.088 0.872 0.040
#> SRR1699964 2 0.0424 0.8593 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699965 2 0.0592 0.8596 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699966 1 0.8220 0.1879 0.516 0.408 0.076
#> SRR1699967 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 1 0.6247 0.5372 0.620 0.376 0.004
#> SRR1699969 3 0.0424 0.9203 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699971 3 0.2537 0.8720 0.000 0.080 0.920
#> SRR1699970 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.2878 0.8589 0.000 0.096 0.904
#> SRR1699973 2 0.5968 0.4619 0.364 0.636 0.000
#> SRR1699974 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699975 1 0.5397 0.6941 0.720 0.280 0.000
#> SRR1699976 2 0.2625 0.7966 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699977 2 0.8972 0.0667 0.128 0.460 0.412
#> SRR1699978 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699979 1 0.9924 0.0839 0.392 0.320 0.288
#> SRR1699980 1 0.3941 0.7879 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699981 3 0.4589 0.7643 0.172 0.008 0.820
#> SRR1699982 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699983 1 0.3941 0.7868 0.844 0.156 0.000
#> SRR1699984 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699985 2 0.5016 0.5877 0.240 0.760 0.000
#> SRR1699986 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.5591 0.4844 0.304 0.696 0.000
#> SRR1699987 3 0.5656 0.6677 0.284 0.004 0.712
#> SRR1699989 1 0.4399 0.7738 0.812 0.188 0.000
#> SRR1699990 1 0.7533 0.4387 0.564 0.392 0.044
#> SRR1699992 3 0.1163 0.9099 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699991 3 0.0237 0.9221 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699993 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699994 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699995 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699996 2 0.0747 0.8574 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699997 1 0.2339 0.7520 0.940 0.048 0.012
#> SRR1699998 2 0.0747 0.8573 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699999 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700000 3 0.0424 0.9203 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700002 2 0.5466 0.6887 0.040 0.800 0.160
#> SRR1700001 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700003 2 0.6644 0.6592 0.108 0.752 0.140
#> SRR1700004 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700005 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700006 3 0.6169 0.4503 0.004 0.360 0.636
#> SRR1700007 1 0.4605 0.7640 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700008 3 0.0747 0.9189 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700009 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700010 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.4121 0.7183 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700013 3 0.6927 0.6359 0.060 0.240 0.700
#> SRR1700012 2 0.7037 0.4563 0.036 0.636 0.328
#> SRR1700014 1 0.8568 0.5510 0.604 0.168 0.228
#> SRR1700015 3 0.6386 0.2971 0.004 0.412 0.584
#> SRR1700016 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700018 3 0.0237 0.9218 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700017 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700019 1 0.5560 0.6679 0.700 0.300 0.000
#> SRR1700020 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700021 1 0.3267 0.7888 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700023 3 0.5060 0.8071 0.064 0.100 0.836
#> SRR1700022 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700024 1 0.4605 0.7257 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700025 2 0.1129 0.8493 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700026 3 0.1031 0.9122 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700027 3 0.2796 0.8595 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700028 1 0.4399 0.7156 0.864 0.044 0.092
#> SRR1700029 3 0.1289 0.9131 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700030 1 0.4452 0.7727 0.808 0.192 0.000
#> SRR1700031 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0237 0.8626 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700034 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700035 1 0.3752 0.7878 0.856 0.144 0.000
#> SRR1700033 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700036 1 0.3879 0.7882 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700037 1 0.3879 0.7867 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700038 3 0.0424 0.9203 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700039 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700040 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700041 3 0.3780 0.8670 0.044 0.064 0.892
#> SRR1700042 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700043 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700045 3 0.1399 0.9140 0.028 0.004 0.968
#> SRR1700044 2 0.8212 0.4845 0.192 0.640 0.168
#> SRR1700046 3 0.0848 0.9194 0.008 0.008 0.984
#> SRR1700047 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700048 1 0.6262 0.5412 0.696 0.020 0.284
#> SRR1700049 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700052 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700053 1 0.5852 0.7332 0.788 0.060 0.152
#> SRR1700054 3 0.0592 0.9187 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700055 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700056 3 0.0424 0.9212 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700057 3 0.1411 0.9110 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700058 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700059 3 0.3752 0.8445 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700060 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700061 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700062 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700063 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700064 1 0.4676 0.7561 0.848 0.040 0.112
#> SRR1700065 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700066 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700067 1 0.0424 0.7598 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700068 3 0.2066 0.8994 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700069 1 0.6193 0.5903 0.692 0.016 0.292
#> SRR1700070 2 0.3340 0.7679 0.120 0.880 0.000
#> SRR1700071 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700072 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700073 1 0.3752 0.7883 0.856 0.144 0.000
#> SRR1700075 3 0.1289 0.9074 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700074 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700076 3 0.3896 0.8249 0.008 0.128 0.864
#> SRR1700077 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700078 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700080 1 0.7292 0.1576 0.500 0.028 0.472
#> SRR1700079 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700081 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700082 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700083 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700084 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700085 1 0.4062 0.7838 0.836 0.164 0.000
#> SRR1700086 3 0.6973 0.1857 0.416 0.020 0.564
#> SRR1700087 3 0.9151 0.0429 0.144 0.420 0.436
#> SRR1700088 2 0.7160 0.6348 0.132 0.720 0.148
#> SRR1700089 3 0.7413 0.6385 0.092 0.224 0.684
#> SRR1700091 2 0.6225 0.3529 0.432 0.568 0.000
#> SRR1700090 3 0.7504 0.5721 0.312 0.060 0.628
#> SRR1700092 2 0.5244 0.6753 0.240 0.756 0.004
#> SRR1700094 2 0.8659 0.4717 0.228 0.596 0.176
#> SRR1700093 1 0.7065 0.3928 0.644 0.316 0.040
#> SRR1700095 3 0.2796 0.8811 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700096 3 0.9547 0.2524 0.212 0.320 0.468
#> SRR1700097 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.4974 0.6799 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700099 2 0.6267 0.2972 0.452 0.548 0.000
#> SRR1700100 1 0.6879 0.0825 0.556 0.428 0.016
#> SRR1700101 2 0.6180 0.3948 0.416 0.584 0.000
#> SRR1700102 1 0.6302 -0.0302 0.520 0.480 0.000
#> SRR1700104 1 0.9428 -0.0341 0.428 0.396 0.176
#> SRR1700103 3 0.5845 0.6225 0.308 0.004 0.688
#> SRR1700105 1 0.6653 0.6312 0.752 0.112 0.136
#> SRR1700106 1 0.6299 -0.1142 0.524 0.000 0.476
#> SRR1700107 1 0.6026 0.2808 0.624 0.376 0.000
#> SRR1700108 2 0.6180 0.3979 0.416 0.584 0.000
#> SRR1700109 2 0.5591 0.5158 0.304 0.696 0.000
#> SRR1700110 2 0.5905 0.3986 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700112 1 0.5706 0.6011 0.680 0.320 0.000
#> SRR1700111 3 0.6192 0.4127 0.420 0.000 0.580
#> SRR1700113 1 0.1964 0.7748 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700114 2 0.6244 0.3433 0.440 0.560 0.000
#> SRR1700115 1 0.4178 0.6983 0.828 0.172 0.000
#> SRR1700116 3 0.5497 0.6828 0.292 0.000 0.708
#> SRR1700117 3 0.0592 0.9202 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700119 1 0.6209 0.2812 0.628 0.004 0.368
#> SRR1700118 1 0.6661 0.1790 0.588 0.012 0.400
#> SRR1700120 3 0.0892 0.9176 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700121 1 0.1964 0.7548 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700122 1 0.1031 0.7654 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700123 3 0.4235 0.8185 0.176 0.000 0.824
#> SRR1700125 1 0.2537 0.7842 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700126 3 0.0424 0.9212 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700127 3 0.4062 0.8278 0.164 0.000 0.836
#> SRR1700124 3 0.4974 0.7571 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700128 3 0.5810 0.5971 0.336 0.000 0.664
#> SRR1700129 1 0.0237 0.7554 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700130 1 0.2636 0.7530 0.932 0.048 0.020
#> SRR1700132 3 0.3482 0.8583 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700131 3 0.3192 0.8681 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700133 1 0.0592 0.7542 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700134 1 0.0424 0.7595 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700135 1 0.5968 0.2976 0.636 0.000 0.364
#> SRR1700136 3 0.3340 0.8624 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700137 1 0.0983 0.7534 0.980 0.004 0.016
#> SRR1700138 1 0.3551 0.6960 0.868 0.000 0.132
#> SRR1700140 1 0.3482 0.7000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1700139 1 0.5810 0.3756 0.664 0.000 0.336
#> SRR1700141 1 0.0592 0.7598 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700142 3 0.1031 0.9160 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700143 3 0.2959 0.8762 0.100 0.000 0.900
#> SRR1700144 3 0.0237 0.9222 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700145 3 0.3752 0.8439 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700146 1 0.0237 0.7554 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700147 3 0.4178 0.8214 0.172 0.000 0.828
#> SRR1700149 3 0.2356 0.8928 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700148 3 0.3816 0.8407 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700150 1 0.0237 0.7554 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700152 1 0.5529 0.4638 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700151 3 0.4931 0.7596 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700153 3 0.4002 0.8314 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700154 3 0.5859 0.5795 0.344 0.000 0.656
#> SRR1700155 1 0.0000 0.7550 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700156 3 0.3816 0.8407 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700158 3 0.3116 0.8708 0.108 0.000 0.892
#> SRR1700159 1 0.2796 0.7861 0.908 0.092 0.000
#> SRR1700157 3 0.3340 0.8619 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700160 1 0.6468 0.0258 0.552 0.004 0.444
#> SRR1700161 3 0.5591 0.6586 0.304 0.000 0.696
#> SRR1700162 1 0.0747 0.7632 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700164 3 0.2959 0.8761 0.100 0.000 0.900
#> SRR1700163 3 0.1529 0.9094 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700165 3 0.3752 0.8439 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700166 1 0.3846 0.7127 0.876 0.016 0.108
#> SRR1700168 1 0.2537 0.7839 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700167 3 0.2066 0.8996 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700170 1 0.5968 0.2913 0.636 0.000 0.364
#> SRR1700169 1 0.5167 0.6369 0.792 0.016 0.192
#> SRR1700171 3 0.0592 0.9200 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700172 1 0.0424 0.7570 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700174 1 0.6758 0.6047 0.728 0.072 0.200
#> SRR1700173 1 0.5848 0.5153 0.720 0.012 0.268
#> SRR1700175 1 0.1411 0.7569 0.964 0.036 0.000
#> SRR1700176 3 0.0747 0.9190 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700178 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 1 0.0237 0.7554 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700185 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700190 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700191 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700189 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.7876 0.4566 0.080 0.612 0.308
#> SRR1700203 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.3267 0.7743 0.116 0.884 0.000
#> SRR1700209 2 0.0424 0.8608 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.2796 0.7967 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700212 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.1525 0.8429 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700214 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700217 2 0.0237 0.8626 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700216 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700218 2 0.0237 0.8627 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700220 2 0.3551 0.7655 0.132 0.868 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.2448 0.8157 0.076 0.924 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.1015 0.8558 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700227 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0592 0.8592 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0424 0.8613 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700240 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700241 3 0.2773 0.8977 0.048 0.024 0.928
#> SRR1700243 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700246 2 0.6305 0.0774 0.000 0.516 0.484
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.6944 0.1053 0.016 0.516 0.468
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.1643 0.8411 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700259 2 0.4504 0.6825 0.196 0.804 0.000
#> SRR1700260 1 0.6260 0.3630 0.552 0.448 0.000
#> SRR1700261 1 0.5706 0.6395 0.680 0.320 0.000
#> SRR1700262 1 0.5621 0.6566 0.692 0.308 0.000
#> SRR1700263 2 0.0747 0.8583 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.4465 0.7076 0.004 0.820 0.176
#> SRR1700266 2 0.4796 0.6527 0.220 0.780 0.000
#> SRR1700268 3 0.5823 0.7564 0.064 0.144 0.792
#> SRR1700270 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.4452 0.6900 0.192 0.808 0.000
#> SRR1700272 2 0.5327 0.5580 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700273 2 0.0747 0.8585 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700274 2 0.5560 0.5044 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700277 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700275 1 0.4750 0.7559 0.784 0.216 0.000
#> SRR1700276 1 0.6215 0.4519 0.572 0.428 0.000
#> SRR1700278 2 0.6260 -0.0484 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700279 1 0.4002 0.7848 0.840 0.160 0.000
#> SRR1700280 1 0.4842 0.7500 0.776 0.224 0.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8638 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 1 0.5785 0.6359 0.668 0.332 0.000
#> SRR1700282 3 0.8054 0.3167 0.356 0.076 0.568
#> SRR1700284 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700285 1 0.4346 0.7776 0.816 0.184 0.000
#> SRR1700286 2 0.6274 -0.0156 0.456 0.544 0.000
#> SRR1700287 1 0.4291 0.7770 0.820 0.180 0.000
#> SRR1700290 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700289 1 0.4062 0.7838 0.836 0.164 0.000
#> SRR1700288 2 0.0592 0.8593 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700292 1 0.4346 0.7762 0.816 0.184 0.000
#> SRR1700291 1 0.3192 0.7878 0.888 0.112 0.000
#> SRR1700293 2 0.4002 0.7206 0.160 0.840 0.000
#> SRR1700294 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700295 3 0.4399 0.7861 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700297 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700296 1 0.4235 0.7793 0.824 0.176 0.000
#> SRR1700298 1 0.3816 0.7803 0.852 0.148 0.000
#> SRR1700299 1 0.3083 0.7801 0.916 0.060 0.024
#> SRR1700300 1 0.6970 0.5734 0.676 0.048 0.276
#> SRR1700302 1 0.3879 0.7867 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700301 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700303 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700304 1 0.5497 0.6779 0.708 0.292 0.000
#> SRR1700305 1 0.5291 0.7103 0.732 0.268 0.000
#> SRR1700306 3 0.5465 0.5864 0.288 0.000 0.712
#> SRR1700308 1 0.6079 0.5345 0.612 0.388 0.000
#> SRR1700307 3 0.5921 0.6980 0.212 0.032 0.756
#> SRR1700309 3 0.6906 0.6692 0.192 0.084 0.724
#> SRR1700310 1 0.4062 0.7842 0.836 0.164 0.000
#> SRR1700311 1 0.1860 0.7738 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700312 1 0.5760 0.6375 0.672 0.328 0.000
#> SRR1700313 1 0.9497 0.3227 0.468 0.200 0.332
#> SRR1700314 1 0.2550 0.7594 0.936 0.024 0.040
#> SRR1700315 1 0.5894 0.7191 0.752 0.220 0.028
#> SRR1700316 1 0.6104 0.5504 0.648 0.348 0.004
#> SRR1700317 2 0.6215 0.0576 0.428 0.572 0.000
#> SRR1700318 1 0.3941 0.7876 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700319 1 0.2261 0.7459 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700320 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700322 1 0.5431 0.6750 0.716 0.284 0.000
#> SRR1700321 1 0.4178 0.7811 0.828 0.172 0.000
#> SRR1700323 1 0.2448 0.7838 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700324 1 0.4121 0.7828 0.832 0.168 0.000
#> SRR1700325 2 0.6140 0.1838 0.404 0.596 0.000
#> SRR1700326 3 0.1753 0.9068 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700327 1 0.5785 0.6184 0.668 0.332 0.000
#> SRR1700329 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700328 3 0.6336 0.7064 0.180 0.064 0.756
#> SRR1700330 1 0.7548 0.6276 0.684 0.112 0.204
#> SRR1700331 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700332 1 0.3941 0.7858 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700333 1 0.5988 0.5758 0.632 0.368 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.2589 0.82471 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1699875 2 0.2256 0.85989 0.000 0.924 0.056 0.020
#> SRR1699876 3 0.2408 0.80679 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1699877 2 0.0336 0.87786 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1699879 2 0.3219 0.77816 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699878 2 0.0817 0.87110 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1699880 1 0.1489 0.87754 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1699881 1 0.1661 0.87726 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1699882 2 0.4624 0.50150 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1699883 2 0.1109 0.87315 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1699884 2 0.1042 0.87494 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1699885 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699886 3 0.3801 0.71572 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1699888 2 0.1792 0.85626 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1699889 3 0.0921 0.81718 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699890 3 0.4817 0.41967 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1699887 3 0.4431 0.58059 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1699891 3 0.1211 0.81993 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699892 2 0.3619 0.81923 0.004 0.860 0.100 0.036
#> SRR1699893 4 0.4972 0.18446 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1699894 3 0.1305 0.81930 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1699895 3 0.1118 0.81843 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1699896 3 0.8622 0.13199 0.160 0.368 0.412 0.060
#> SRR1699897 2 0.4585 0.53629 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1699898 1 0.2281 0.84169 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1699900 1 0.1909 0.87656 0.940 0.004 0.008 0.048
#> SRR1699899 3 0.1302 0.81915 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699902 1 0.1911 0.87511 0.944 0.004 0.020 0.032
#> SRR1699901 1 0.0469 0.88045 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699903 3 0.1004 0.81662 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1699904 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699905 1 0.0336 0.87996 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699906 3 0.1211 0.81901 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699907 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699908 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699909 3 0.3450 0.77031 0.000 0.156 0.836 0.008
#> SRR1699910 3 0.3046 0.76864 0.016 0.004 0.884 0.096
#> SRR1699911 3 0.2737 0.79902 0.000 0.104 0.888 0.008
#> SRR1699912 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699913 3 0.1867 0.81871 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699914 1 0.4425 0.81082 0.824 0.008 0.076 0.092
#> SRR1699915 3 0.1109 0.80703 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699916 2 0.4679 0.41131 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1699917 3 0.5530 0.42702 0.000 0.032 0.632 0.336
#> SRR1699918 3 0.7365 0.17654 0.000 0.400 0.440 0.160
#> SRR1699919 3 0.0927 0.81341 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1699920 3 0.3765 0.74900 0.032 0.004 0.848 0.116
#> SRR1699921 3 0.0657 0.81283 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699922 3 0.3444 0.76500 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1699923 1 0.1892 0.87571 0.944 0.004 0.016 0.036
#> SRR1699924 1 0.5560 0.52057 0.628 0.004 0.024 0.344
#> SRR1699925 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699926 3 0.1362 0.80838 0.004 0.012 0.964 0.020
#> SRR1699927 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699929 3 0.6935 0.34273 0.052 0.368 0.548 0.032
#> SRR1699928 3 0.0895 0.81482 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1699930 3 0.0921 0.81679 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699931 2 0.6752 0.14949 0.028 0.512 0.420 0.040
#> SRR1699933 1 0.8396 0.43143 0.548 0.212 0.140 0.100
#> SRR1699932 3 0.0921 0.81718 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699934 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699935 3 0.6610 0.00444 0.000 0.080 0.468 0.452
#> SRR1699936 2 0.2814 0.80450 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1699937 2 0.1174 0.86495 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1699938 2 0.0469 0.87747 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1699940 1 0.4581 0.74429 0.804 0.140 0.008 0.048
#> SRR1699939 2 0.4188 0.67937 0.000 0.752 0.244 0.004
#> SRR1699941 1 0.1151 0.87958 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1699942 2 0.4020 0.76047 0.008 0.820 0.016 0.156
#> SRR1699943 2 0.0657 0.87533 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1699944 2 0.1356 0.87442 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1699945 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699946 2 0.1629 0.86016 0.000 0.952 0.024 0.024
#> SRR1699947 2 0.2392 0.85368 0.024 0.928 0.036 0.012
#> SRR1699948 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699949 2 0.4933 0.25952 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1699950 2 0.4431 0.57273 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1699951 2 0.5619 0.67883 0.000 0.724 0.152 0.124
#> SRR1699952 2 0.1174 0.86711 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1699953 2 0.1716 0.85903 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1699954 1 0.2039 0.87467 0.940 0.016 0.008 0.036
#> SRR1699955 2 0.0469 0.87731 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1699956 1 0.0188 0.88075 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699957 2 0.2401 0.84298 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1699959 1 0.4267 0.74177 0.772 0.008 0.004 0.216
#> SRR1699958 4 0.5762 0.42218 0.000 0.352 0.040 0.608
#> SRR1699960 2 0.3367 0.81306 0.000 0.864 0.108 0.028
#> SRR1699961 2 0.6243 0.55382 0.240 0.676 0.024 0.060
#> SRR1699962 2 0.0921 0.87434 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1699963 2 0.5275 0.64200 0.024 0.732 0.020 0.224
#> SRR1699964 2 0.1247 0.86696 0.004 0.968 0.012 0.016
#> SRR1699965 2 0.1557 0.86083 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699966 4 0.9021 0.14944 0.068 0.224 0.324 0.384
#> SRR1699967 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699968 3 0.3390 0.79020 0.000 0.132 0.852 0.016
#> SRR1699969 1 0.2494 0.85885 0.916 0.000 0.036 0.048
#> SRR1699971 1 0.4293 0.81857 0.844 0.064 0.028 0.064
#> SRR1699970 2 0.1042 0.87111 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1699972 1 0.3857 0.83161 0.864 0.056 0.020 0.060
#> SRR1699973 4 0.7279 0.13851 0.000 0.408 0.148 0.444
#> SRR1699974 1 0.0336 0.88037 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699975 3 0.3015 0.80636 0.000 0.092 0.884 0.024
#> SRR1699976 2 0.4369 0.77296 0.080 0.840 0.036 0.044
#> SRR1699977 4 0.8711 0.36976 0.220 0.272 0.056 0.452
#> SRR1699978 1 0.0336 0.88036 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699979 4 0.5664 0.71388 0.064 0.112 0.056 0.768
#> SRR1699980 3 0.1305 0.80812 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1699981 1 0.7084 0.39736 0.572 0.004 0.272 0.152
#> SRR1699982 3 0.0817 0.81599 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699983 3 0.0779 0.81467 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699984 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699985 2 0.5482 0.35753 0.000 0.608 0.368 0.024
#> SRR1699986 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699988 2 0.5594 0.12830 0.000 0.520 0.460 0.020
#> SRR1699987 4 0.4579 0.68238 0.200 0.000 0.032 0.768
#> SRR1699989 3 0.2101 0.81771 0.000 0.060 0.928 0.012
#> SRR1699990 3 0.7356 0.55392 0.032 0.168 0.616 0.184
#> SRR1699992 1 0.2864 0.86190 0.908 0.024 0.016 0.052
#> SRR1699991 1 0.3108 0.84678 0.872 0.000 0.016 0.112
#> SRR1699993 1 0.0336 0.87996 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699994 1 0.0779 0.88033 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1699995 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699996 2 0.1398 0.86749 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1699997 4 0.2839 0.76154 0.004 0.004 0.108 0.884
#> SRR1699998 2 0.2101 0.86187 0.000 0.928 0.060 0.012
#> SRR1699999 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700000 1 0.0921 0.88051 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700002 2 0.6348 0.59134 0.116 0.696 0.020 0.168
#> SRR1700001 1 0.0817 0.88139 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700003 2 0.7174 0.29891 0.064 0.544 0.036 0.356
#> SRR1700004 1 0.0895 0.87972 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700005 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700006 1 0.6999 0.53320 0.620 0.256 0.028 0.096
#> SRR1700007 3 0.3266 0.77429 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700008 1 0.3400 0.76132 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1700009 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700010 1 0.0000 0.88014 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.3485 0.80257 0.000 0.856 0.116 0.028
#> SRR1700013 1 0.7369 0.15698 0.496 0.132 0.008 0.364
#> SRR1700012 2 0.8659 0.29842 0.212 0.508 0.084 0.196
#> SRR1700014 3 0.8912 0.11767 0.208 0.072 0.436 0.284
#> SRR1700015 1 0.7249 0.48310 0.592 0.272 0.028 0.108
#> SRR1700016 1 0.0000 0.88014 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.2450 0.86258 0.912 0.000 0.016 0.072
#> SRR1700017 1 0.2101 0.86815 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR1700019 3 0.3837 0.71651 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.88014 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700021 3 0.1297 0.81423 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1700023 1 0.6665 0.67441 0.692 0.048 0.100 0.160
#> SRR1700022 1 0.1863 0.87440 0.944 0.004 0.012 0.040
#> SRR1700024 3 0.6374 0.40792 0.000 0.084 0.592 0.324
#> SRR1700025 2 0.2441 0.84400 0.004 0.920 0.020 0.056
#> SRR1700026 1 0.2402 0.86809 0.924 0.012 0.012 0.052
#> SRR1700027 1 0.4157 0.82154 0.848 0.060 0.020 0.072
#> SRR1700028 4 0.3694 0.77523 0.028 0.016 0.092 0.864
#> SRR1700029 1 0.4400 0.70277 0.744 0.004 0.004 0.248
#> SRR1700030 3 0.1975 0.82011 0.000 0.048 0.936 0.016
#> SRR1700031 1 0.0921 0.87809 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700032 2 0.1888 0.86274 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1700034 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700035 3 0.1042 0.81476 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1700033 1 0.1209 0.87712 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700036 3 0.1059 0.81475 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1700037 3 0.1209 0.81698 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700038 1 0.1706 0.87529 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR1700039 1 0.0000 0.88014 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.1452 0.87851 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1700041 1 0.6045 0.71960 0.728 0.048 0.056 0.168
#> SRR1700042 1 0.1584 0.87511 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1700043 1 0.1545 0.87614 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1700045 1 0.4894 0.69644 0.720 0.008 0.012 0.260
#> SRR1700044 2 0.8643 0.30495 0.160 0.504 0.248 0.088
#> SRR1700046 1 0.3979 0.82546 0.836 0.008 0.028 0.128
#> SRR1700047 1 0.0895 0.88072 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700048 4 0.8020 0.19184 0.208 0.012 0.360 0.420
#> SRR1700049 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700050 1 0.0707 0.88012 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700051 1 0.0592 0.87962 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700052 1 0.0707 0.88020 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700053 3 0.4148 0.74180 0.072 0.012 0.844 0.072
#> SRR1700054 1 0.2727 0.86264 0.900 0.004 0.012 0.084
#> SRR1700055 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700056 1 0.3306 0.79581 0.840 0.000 0.004 0.156
#> SRR1700057 1 0.3569 0.74557 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1700058 1 0.0657 0.88019 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700059 4 0.3726 0.69111 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1700060 1 0.1118 0.87703 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700061 1 0.1847 0.87250 0.940 0.004 0.004 0.052
#> SRR1700062 1 0.1940 0.86708 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1700063 1 0.2234 0.86999 0.924 0.004 0.008 0.064
#> SRR1700064 3 0.4043 0.74973 0.052 0.008 0.844 0.096
#> SRR1700065 1 0.1492 0.87617 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1700066 1 0.0817 0.87974 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700067 3 0.4946 0.51437 0.004 0.008 0.680 0.308
#> SRR1700068 1 0.5155 0.21725 0.528 0.000 0.004 0.468
#> SRR1700069 3 0.4500 0.69324 0.116 0.004 0.812 0.068
#> SRR1700070 2 0.3390 0.79427 0.000 0.852 0.132 0.016
#> SRR1700071 1 0.3464 0.83742 0.856 0.004 0.016 0.124
#> SRR1700072 1 0.1022 0.87874 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700073 3 0.2943 0.80826 0.000 0.076 0.892 0.032
#> SRR1700075 1 0.3321 0.85288 0.888 0.024 0.024 0.064
#> SRR1700074 1 0.1807 0.87339 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1700076 1 0.5267 0.77730 0.788 0.080 0.032 0.100
#> SRR1700077 1 0.2629 0.86174 0.912 0.004 0.024 0.060
#> SRR1700078 1 0.0592 0.88122 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700080 3 0.6180 0.42177 0.296 0.000 0.624 0.080
#> SRR1700079 1 0.0817 0.88016 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700081 1 0.1722 0.87690 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR1700082 1 0.2408 0.86590 0.920 0.004 0.016 0.060
#> SRR1700083 1 0.0817 0.88038 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700084 1 0.0707 0.87928 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700085 3 0.1398 0.81966 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700086 3 0.6307 0.26509 0.376 0.004 0.564 0.056
#> SRR1700087 4 0.4922 0.75532 0.112 0.088 0.008 0.792
#> SRR1700088 4 0.6342 0.26870 0.040 0.404 0.012 0.544
#> SRR1700089 4 0.5847 0.53706 0.320 0.052 0.000 0.628
#> SRR1700091 4 0.5172 0.67725 0.000 0.188 0.068 0.744
#> SRR1700090 4 0.1821 0.78923 0.032 0.008 0.012 0.948
#> SRR1700092 4 0.5018 0.49147 0.000 0.332 0.012 0.656
#> SRR1700094 4 0.4897 0.72260 0.040 0.160 0.016 0.784
#> SRR1700093 4 0.2392 0.78465 0.012 0.024 0.036 0.928
#> SRR1700095 4 0.4454 0.57968 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR1700096 4 0.1821 0.78393 0.008 0.032 0.012 0.948
#> SRR1700097 1 0.0707 0.87778 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700098 2 0.6566 0.43046 0.000 0.600 0.112 0.288
#> SRR1700099 4 0.4514 0.72000 0.000 0.148 0.056 0.796
#> SRR1700100 4 0.2699 0.77409 0.000 0.068 0.028 0.904
#> SRR1700101 4 0.3836 0.72003 0.000 0.168 0.016 0.816
#> SRR1700102 4 0.6118 0.60830 0.000 0.208 0.120 0.672
#> SRR1700104 4 0.2928 0.78446 0.028 0.056 0.012 0.904
#> SRR1700103 4 0.4516 0.65616 0.252 0.000 0.012 0.736
#> SRR1700105 4 0.2269 0.78800 0.028 0.008 0.032 0.932
#> SRR1700106 4 0.3548 0.78465 0.068 0.000 0.068 0.864
#> SRR1700107 4 0.3471 0.76563 0.000 0.060 0.072 0.868
#> SRR1700108 4 0.4459 0.69657 0.000 0.188 0.032 0.780
#> SRR1700109 2 0.6429 0.56690 0.000 0.648 0.160 0.192
#> SRR1700110 2 0.6822 0.49584 0.000 0.604 0.204 0.192
#> SRR1700112 4 0.7906 -0.02030 0.000 0.300 0.348 0.352
#> SRR1700111 4 0.2611 0.78569 0.096 0.000 0.008 0.896
#> SRR1700113 4 0.6337 0.01630 0.000 0.060 0.464 0.476
#> SRR1700114 4 0.2796 0.76502 0.000 0.092 0.016 0.892
#> SRR1700115 4 0.6238 0.55800 0.000 0.112 0.236 0.652
#> SRR1700116 4 0.1584 0.78905 0.036 0.000 0.012 0.952
#> SRR1700117 1 0.2921 0.80298 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1700119 4 0.2197 0.78869 0.048 0.000 0.024 0.928
#> SRR1700118 4 0.1920 0.78977 0.024 0.004 0.028 0.944
#> SRR1700120 1 0.3528 0.74167 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1700121 4 0.3978 0.69829 0.000 0.012 0.192 0.796
#> SRR1700122 3 0.5427 0.24719 0.000 0.016 0.568 0.416
#> SRR1700123 4 0.2281 0.78491 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1700125 3 0.5466 0.52338 0.000 0.040 0.668 0.292
#> SRR1700126 1 0.3172 0.78877 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1700127 4 0.2081 0.78664 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1700124 4 0.1356 0.78756 0.032 0.000 0.008 0.960
#> SRR1700128 4 0.2675 0.78418 0.100 0.000 0.008 0.892
#> SRR1700129 4 0.4814 0.50790 0.000 0.008 0.316 0.676
#> SRR1700130 4 0.2675 0.76530 0.000 0.008 0.100 0.892
#> SRR1700132 4 0.4991 0.39406 0.388 0.000 0.004 0.608
#> SRR1700131 4 0.4697 0.48284 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1700133 4 0.3606 0.74586 0.020 0.000 0.140 0.840
#> SRR1700134 3 0.5250 0.16674 0.000 0.008 0.552 0.440
#> SRR1700135 4 0.3533 0.78124 0.056 0.000 0.080 0.864
#> SRR1700136 4 0.4382 0.58088 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1700137 4 0.2480 0.77132 0.008 0.000 0.088 0.904
#> SRR1700138 4 0.3485 0.76413 0.028 0.000 0.116 0.856
#> SRR1700140 4 0.1888 0.78391 0.016 0.000 0.044 0.940
#> SRR1700139 4 0.1820 0.78873 0.036 0.000 0.020 0.944
#> SRR1700141 4 0.5383 0.16029 0.000 0.012 0.452 0.536
#> SRR1700142 1 0.3105 0.81228 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1700143 4 0.4843 0.37113 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1700144 1 0.2530 0.85830 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1700145 4 0.4643 0.47670 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1700146 4 0.5290 0.09345 0.000 0.008 0.476 0.516
#> SRR1700147 4 0.2868 0.76774 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1700149 1 0.4713 0.43919 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1700148 4 0.4040 0.65533 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1700150 4 0.4040 0.62967 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700152 4 0.2466 0.78599 0.028 0.000 0.056 0.916
#> SRR1700151 4 0.2216 0.78636 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1700153 4 0.2868 0.76858 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1700154 4 0.2124 0.78899 0.068 0.000 0.008 0.924
#> SRR1700155 4 0.2149 0.76887 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700156 4 0.4008 0.66133 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1700158 1 0.4981 0.10786 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1700159 3 0.5817 0.57756 0.000 0.076 0.676 0.248
#> SRR1700157 4 0.4866 0.31792 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1700160 4 0.2101 0.78951 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1700161 4 0.1970 0.78639 0.060 0.000 0.008 0.932
#> SRR1700162 3 0.4744 0.55410 0.000 0.012 0.704 0.284
#> SRR1700164 1 0.5000 -0.02113 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1700163 1 0.4431 0.55638 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1700165 4 0.3486 0.72712 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1700166 4 0.1820 0.78488 0.020 0.000 0.036 0.944
#> SRR1700168 3 0.6249 0.39125 0.000 0.072 0.592 0.336
#> SRR1700167 1 0.4543 0.51879 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1700170 4 0.3399 0.78447 0.092 0.000 0.040 0.868
#> SRR1700169 4 0.1629 0.78660 0.024 0.000 0.024 0.952
#> SRR1700171 1 0.2345 0.83446 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1700172 4 0.3626 0.70273 0.000 0.004 0.184 0.812
#> SRR1700174 4 0.1724 0.78712 0.020 0.000 0.032 0.948
#> SRR1700173 4 0.1724 0.78606 0.020 0.000 0.032 0.948
#> SRR1700175 4 0.3450 0.72974 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1700176 1 0.2921 0.80259 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1700178 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700177 4 0.2334 0.76943 0.004 0.000 0.088 0.908
#> SRR1700180 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700179 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700181 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700183 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700182 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700184 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700186 2 0.0524 0.87672 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700187 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700185 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700188 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700192 1 0.0336 0.88033 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700190 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700191 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700189 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700193 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700195 2 0.0336 0.87729 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700194 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700197 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700198 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700199 2 0.0188 0.87588 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700200 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700202 2 0.7383 0.41908 0.288 0.584 0.056 0.072
#> SRR1700203 2 0.0336 0.87810 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700204 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700206 2 0.0469 0.87625 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700207 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700208 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700205 2 0.3266 0.75619 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1700209 2 0.0707 0.87624 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700210 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700211 2 0.2329 0.82875 0.072 0.916 0.012 0.000
#> SRR1700212 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700213 2 0.2405 0.85655 0.020 0.928 0.016 0.036
#> SRR1700214 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700215 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700217 2 0.0707 0.87626 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700216 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700218 2 0.0336 0.87844 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700219 2 0.0336 0.87795 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700222 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.2921 0.79739 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1700221 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700223 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700224 2 0.3311 0.76712 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1700226 2 0.0707 0.87544 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700229 2 0.0469 0.87755 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700225 2 0.2676 0.85254 0.012 0.916 0.044 0.028
#> SRR1700227 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700230 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700231 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700228 2 0.0469 0.87618 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700232 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700233 2 0.0376 0.87793 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700234 2 0.0804 0.87713 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1700235 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700237 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700236 2 0.0469 0.87790 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700238 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700239 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700241 1 0.4759 0.71615 0.764 0.032 0.004 0.200
#> SRR1700243 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700244 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700242 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700246 1 0.6384 0.01638 0.480 0.472 0.020 0.028
#> SRR1700245 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700247 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700249 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700250 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700248 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700251 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700252 1 0.7429 0.21016 0.484 0.388 0.016 0.112
#> SRR1700253 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700256 2 0.0707 0.87621 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700254 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700255 2 0.0336 0.87810 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700257 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700258 2 0.2469 0.82690 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1700259 2 0.3569 0.73629 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1700260 3 0.4761 0.43280 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1700261 3 0.3528 0.75288 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1700262 3 0.3764 0.72967 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700263 2 0.2589 0.82190 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700264 2 0.1940 0.85651 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700265 2 0.7644 0.43069 0.272 0.556 0.144 0.028
#> SRR1700266 2 0.4804 0.39526 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1700268 1 0.5936 0.70059 0.752 0.104 0.092 0.052
#> SRR1700270 2 0.0188 0.87840 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700267 2 0.0817 0.87417 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700271 2 0.3907 0.68699 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1700272 2 0.4647 0.58905 0.000 0.704 0.288 0.008
#> SRR1700273 2 0.2401 0.83967 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1700274 2 0.4925 0.24955 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1700277 1 0.0779 0.88067 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700275 3 0.3351 0.78751 0.000 0.148 0.844 0.008
#> SRR1700276 2 0.5833 0.08022 0.000 0.528 0.440 0.032
#> SRR1700278 3 0.4830 0.42662 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700279 3 0.1557 0.81906 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700280 3 0.2973 0.79100 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1700281 2 0.0336 0.87837 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700283 3 0.4222 0.66329 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700282 1 0.8749 0.11112 0.448 0.064 0.296 0.192
#> SRR1700284 3 0.1022 0.81809 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700285 3 0.2530 0.80544 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1700286 3 0.4967 0.19841 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1700287 3 0.2081 0.81468 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1700290 1 0.0188 0.88025 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700289 3 0.1557 0.81988 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700288 2 0.1716 0.85718 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1700292 3 0.1792 0.81814 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700291 3 0.4171 0.77833 0.000 0.084 0.828 0.088
#> SRR1700293 2 0.4054 0.72186 0.000 0.796 0.188 0.016
#> SRR1700294 3 0.1004 0.81575 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700295 1 0.6620 0.48810 0.628 0.000 0.180 0.192
#> SRR1700297 3 0.1302 0.81883 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700296 3 0.1637 0.81927 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700298 3 0.2797 0.80412 0.000 0.032 0.900 0.068
#> SRR1700299 3 0.3439 0.77582 0.016 0.016 0.872 0.096
#> SRR1700300 3 0.6213 0.60050 0.180 0.028 0.708 0.084
#> SRR1700302 3 0.1042 0.81476 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1700301 3 0.1022 0.81782 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700303 3 0.1109 0.81656 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700304 3 0.3494 0.77172 0.000 0.172 0.824 0.004
#> SRR1700305 3 0.3591 0.77425 0.000 0.168 0.824 0.008
#> SRR1700306 1 0.6337 0.34216 0.568 0.000 0.360 0.072
#> SRR1700308 3 0.4049 0.73762 0.000 0.212 0.780 0.008
#> SRR1700307 1 0.7417 0.44092 0.580 0.020 0.244 0.156
#> SRR1700309 1 0.7179 0.47677 0.604 0.028 0.260 0.108
#> SRR1700310 3 0.1398 0.81891 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700311 3 0.1677 0.80650 0.000 0.012 0.948 0.040
#> SRR1700312 3 0.2868 0.79605 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1700313 3 0.9717 0.03961 0.300 0.208 0.332 0.160
#> SRR1700314 3 0.4218 0.68960 0.012 0.008 0.796 0.184
#> SRR1700315 3 0.3941 0.78379 0.004 0.104 0.844 0.048
#> SRR1700316 3 0.7761 0.32200 0.004 0.256 0.476 0.264
#> SRR1700317 3 0.4697 0.50404 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700318 3 0.1339 0.81688 0.004 0.024 0.964 0.008
#> SRR1700319 3 0.4500 0.67084 0.032 0.000 0.776 0.192
#> SRR1700320 3 0.1118 0.81778 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700322 3 0.5766 0.67672 0.000 0.192 0.704 0.104
#> SRR1700321 3 0.1902 0.81889 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700323 3 0.3982 0.65381 0.000 0.004 0.776 0.220
#> SRR1700324 3 0.2530 0.80720 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1700325 2 0.5165 -0.00379 0.000 0.512 0.484 0.004
#> SRR1700326 1 0.4015 0.78859 0.832 0.000 0.052 0.116
#> SRR1700327 3 0.3791 0.74113 0.000 0.200 0.796 0.004
#> SRR1700329 3 0.1211 0.81855 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700328 1 0.6805 0.57954 0.656 0.064 0.228 0.052
#> SRR1700330 3 0.7883 0.43410 0.180 0.056 0.584 0.180
#> SRR1700331 3 0.0817 0.81599 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700332 3 0.1118 0.81778 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700333 3 0.5471 0.64729 0.000 0.268 0.684 0.048
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.3863 0.7491 0.052 0.796 0.000 0.000 0.152
#> SRR1699875 2 0.4141 0.6744 0.248 0.728 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699876 5 0.3058 0.7419 0.044 0.096 0.000 0.000 0.860
#> SRR1699877 2 0.2388 0.8103 0.072 0.900 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699879 2 0.4378 0.6595 0.036 0.716 0.000 0.000 0.248
#> SRR1699878 2 0.3002 0.7846 0.116 0.856 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699880 3 0.2773 0.7257 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.4374 0.6026 0.272 0.000 0.700 0.028 0.000
#> SRR1699882 2 0.5002 0.4702 0.044 0.612 0.000 0.000 0.344
#> SRR1699883 2 0.2344 0.8084 0.064 0.904 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699884 2 0.2669 0.7941 0.104 0.876 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699885 2 0.0693 0.8148 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699886 5 0.4496 0.6463 0.056 0.216 0.000 0.000 0.728
#> SRR1699888 2 0.2886 0.7783 0.016 0.864 0.000 0.004 0.116
#> SRR1699889 5 0.1638 0.7466 0.064 0.004 0.000 0.000 0.932
#> SRR1699890 5 0.4898 0.3986 0.032 0.376 0.000 0.000 0.592
#> SRR1699887 5 0.4728 0.5409 0.040 0.296 0.000 0.000 0.664
#> SRR1699891 5 0.1357 0.7480 0.048 0.004 0.000 0.000 0.948
#> SRR1699892 2 0.6050 0.4324 0.284 0.592 0.004 0.008 0.112
#> SRR1699893 4 0.6273 0.2751 0.164 0.000 0.000 0.500 0.336
#> SRR1699894 5 0.2075 0.7566 0.040 0.032 0.000 0.004 0.924
#> SRR1699895 5 0.1074 0.7514 0.016 0.012 0.000 0.004 0.968
#> SRR1699896 1 0.7826 0.2771 0.460 0.200 0.056 0.016 0.268
#> SRR1699897 2 0.6300 0.3080 0.168 0.496 0.000 0.000 0.336
#> SRR1699898 3 0.4098 0.7012 0.156 0.000 0.780 0.064 0.000
#> SRR1699900 3 0.4299 0.5541 0.316 0.000 0.672 0.004 0.008
#> SRR1699899 5 0.2012 0.7541 0.060 0.020 0.000 0.000 0.920
#> SRR1699902 3 0.3534 0.6627 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1699901 3 0.1831 0.7507 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1699903 5 0.1864 0.7447 0.068 0.004 0.000 0.004 0.924
#> SRR1699904 5 0.1405 0.7516 0.020 0.016 0.000 0.008 0.956
#> SRR1699905 3 0.0880 0.7498 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1699906 5 0.1725 0.7521 0.044 0.020 0.000 0.000 0.936
#> SRR1699907 5 0.1168 0.7452 0.032 0.000 0.000 0.008 0.960
#> SRR1699908 5 0.1365 0.7453 0.040 0.004 0.000 0.004 0.952
#> SRR1699909 5 0.4408 0.7087 0.100 0.104 0.000 0.012 0.784
#> SRR1699910 5 0.4661 0.6656 0.156 0.000 0.012 0.076 0.756
#> SRR1699911 5 0.4185 0.7162 0.112 0.084 0.000 0.008 0.796
#> SRR1699912 5 0.1168 0.7473 0.032 0.008 0.000 0.000 0.960
#> SRR1699913 5 0.2519 0.7598 0.036 0.060 0.000 0.004 0.900
#> SRR1699914 3 0.6103 0.3073 0.364 0.000 0.544 0.044 0.048
#> SRR1699915 5 0.3115 0.7247 0.112 0.000 0.000 0.036 0.852
#> SRR1699916 2 0.5059 0.4546 0.044 0.632 0.000 0.004 0.320
#> SRR1699917 5 0.6830 0.2878 0.140 0.032 0.000 0.332 0.496
#> SRR1699918 5 0.7919 0.0996 0.180 0.356 0.000 0.100 0.364
#> SRR1699919 5 0.1901 0.7427 0.056 0.004 0.000 0.012 0.928
#> SRR1699920 5 0.5967 0.5503 0.204 0.000 0.024 0.128 0.644
#> SRR1699921 5 0.2110 0.7379 0.072 0.000 0.000 0.016 0.912
#> SRR1699922 5 0.4558 0.6737 0.080 0.180 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699923 3 0.3395 0.6721 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1699924 3 0.6871 -0.0667 0.384 0.000 0.408 0.196 0.012
#> SRR1699925 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.3966 0.6878 0.176 0.000 0.004 0.036 0.784
#> SRR1699927 5 0.1243 0.7465 0.028 0.004 0.000 0.008 0.960
#> SRR1699929 1 0.7619 0.0854 0.412 0.184 0.040 0.012 0.352
#> SRR1699928 5 0.0794 0.7460 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1699930 5 0.1442 0.7494 0.032 0.012 0.000 0.004 0.952
#> SRR1699931 2 0.7783 -0.1686 0.328 0.348 0.012 0.032 0.280
#> SRR1699933 1 0.8150 0.4172 0.448 0.108 0.312 0.040 0.092
#> SRR1699932 5 0.1830 0.7500 0.052 0.012 0.000 0.004 0.932
#> SRR1699934 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.6961 0.0784 0.120 0.044 0.000 0.400 0.436
#> SRR1699936 2 0.3565 0.7279 0.024 0.800 0.000 0.000 0.176
#> SRR1699937 2 0.2548 0.7809 0.116 0.876 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699938 2 0.0865 0.8136 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699940 3 0.6055 0.1963 0.380 0.080 0.524 0.016 0.000
#> SRR1699939 2 0.5140 0.6121 0.084 0.664 0.000 0.000 0.252
#> SRR1699941 3 0.3838 0.6296 0.280 0.004 0.716 0.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.5926 0.3867 0.312 0.580 0.004 0.100 0.004
#> SRR1699943 2 0.1282 0.8115 0.044 0.952 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699944 2 0.2426 0.8112 0.064 0.900 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699945 3 0.0703 0.7479 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.3992 0.6371 0.280 0.712 0.004 0.000 0.004
#> SRR1699947 2 0.3797 0.6896 0.232 0.756 0.008 0.000 0.004
#> SRR1699948 2 0.0880 0.8130 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.4740 0.1303 0.016 0.516 0.000 0.000 0.468
#> SRR1699950 2 0.4938 0.5382 0.048 0.640 0.000 0.000 0.312
#> SRR1699951 2 0.7047 0.5002 0.124 0.584 0.000 0.136 0.156
#> SRR1699952 2 0.3489 0.7063 0.208 0.784 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699953 2 0.3019 0.7937 0.048 0.864 0.000 0.000 0.088
#> SRR1699954 3 0.3300 0.6904 0.204 0.004 0.792 0.000 0.000
#> SRR1699955 2 0.1386 0.8143 0.016 0.952 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699956 3 0.1671 0.7493 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.4869 0.6819 0.192 0.712 0.000 0.000 0.096
#> SRR1699959 3 0.6722 -0.0245 0.356 0.000 0.428 0.212 0.004
#> SRR1699958 4 0.6344 0.3237 0.120 0.284 0.000 0.572 0.024
#> SRR1699960 2 0.4897 0.6935 0.036 0.744 0.000 0.048 0.172
#> SRR1699961 1 0.6325 0.2589 0.480 0.392 0.120 0.004 0.004
#> SRR1699962 2 0.1836 0.8173 0.032 0.932 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699963 2 0.6431 0.2736 0.280 0.536 0.008 0.176 0.000
#> SRR1699964 2 0.3067 0.7721 0.140 0.844 0.000 0.012 0.004
#> SRR1699965 2 0.2519 0.7881 0.016 0.884 0.000 0.000 0.100
#> SRR1699966 4 0.9503 -0.1209 0.244 0.140 0.084 0.292 0.240
#> SRR1699967 2 0.1831 0.8056 0.076 0.920 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699968 5 0.5509 0.5856 0.248 0.104 0.000 0.004 0.644
#> SRR1699969 3 0.4676 0.6826 0.156 0.000 0.764 0.044 0.036
#> SRR1699971 3 0.5581 0.1544 0.428 0.060 0.508 0.004 0.000
#> SRR1699970 2 0.2124 0.7991 0.096 0.900 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699972 1 0.5234 -0.0908 0.496 0.044 0.460 0.000 0.000
#> SRR1699973 4 0.7913 0.1087 0.148 0.308 0.000 0.416 0.128
#> SRR1699974 3 0.1544 0.7466 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1699975 5 0.5417 0.6295 0.220 0.072 0.000 0.024 0.684
#> SRR1699976 1 0.5033 0.0317 0.524 0.448 0.024 0.000 0.004
#> SRR1699977 1 0.7374 0.3222 0.548 0.124 0.064 0.244 0.020
#> SRR1699978 3 0.0807 0.7476 0.012 0.000 0.976 0.012 0.000
#> SRR1699979 1 0.6926 0.0237 0.520 0.048 0.028 0.348 0.056
#> SRR1699980 5 0.3266 0.6948 0.200 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR1699981 3 0.7962 -0.2160 0.268 0.000 0.400 0.092 0.240
#> SRR1699982 5 0.1173 0.7509 0.020 0.012 0.000 0.004 0.964
#> SRR1699983 5 0.2052 0.7473 0.080 0.004 0.000 0.004 0.912
#> SRR1699984 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.6251 0.2450 0.112 0.520 0.000 0.012 0.356
#> SRR1699986 3 0.0510 0.7472 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1699988 5 0.6960 0.1533 0.220 0.364 0.000 0.012 0.404
#> SRR1699987 4 0.7167 0.2976 0.272 0.000 0.188 0.496 0.044
#> SRR1699989 5 0.2824 0.7501 0.096 0.032 0.000 0.000 0.872
#> SRR1699990 5 0.7420 0.2832 0.324 0.128 0.004 0.072 0.472
#> SRR1699992 3 0.4499 0.5720 0.292 0.016 0.684 0.008 0.000
#> SRR1699991 3 0.5576 0.3453 0.388 0.000 0.536 0.076 0.000
#> SRR1699993 3 0.0613 0.7471 0.008 0.000 0.984 0.004 0.004
#> SRR1699994 3 0.2763 0.7332 0.148 0.000 0.848 0.000 0.004
#> SRR1699995 3 0.0290 0.7452 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.4284 0.6872 0.204 0.752 0.000 0.004 0.040
#> SRR1699997 4 0.2903 0.7042 0.080 0.000 0.000 0.872 0.048
#> SRR1699998 2 0.4855 0.6626 0.204 0.716 0.000 0.004 0.076
#> SRR1699999 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.2605 0.7277 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1700002 1 0.6992 0.2807 0.452 0.388 0.060 0.100 0.000
#> SRR1700001 3 0.3562 0.7096 0.196 0.000 0.788 0.016 0.000
#> SRR1700003 1 0.7811 0.2332 0.380 0.364 0.032 0.200 0.024
#> SRR1700004 3 0.3527 0.7161 0.148 0.000 0.820 0.028 0.004
#> SRR1700005 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.6800 0.4696 0.536 0.188 0.248 0.028 0.000
#> SRR1700007 5 0.3812 0.6804 0.020 0.196 0.000 0.004 0.780
#> SRR1700008 3 0.4595 0.6138 0.088 0.000 0.740 0.172 0.000
#> SRR1700009 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.1341 0.7504 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.4443 0.7160 0.020 0.776 0.000 0.052 0.152
#> SRR1700013 3 0.8068 -0.1871 0.244 0.104 0.388 0.264 0.000
#> SRR1700012 1 0.7224 0.5240 0.584 0.204 0.124 0.064 0.024
#> SRR1700014 1 0.6560 0.4083 0.652 0.024 0.048 0.112 0.164
#> SRR1700015 1 0.7074 0.4402 0.500 0.196 0.268 0.036 0.000
#> SRR1700016 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 3 0.4597 0.3980 0.424 0.000 0.564 0.012 0.000
#> SRR1700017 3 0.4029 0.5935 0.316 0.000 0.680 0.004 0.000
#> SRR1700019 5 0.3988 0.6737 0.036 0.196 0.000 0.000 0.768
#> SRR1700020 3 0.1197 0.7467 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1700021 5 0.3256 0.7536 0.084 0.028 0.000 0.024 0.864
#> SRR1700023 1 0.6716 0.2330 0.524 0.012 0.352 0.064 0.048
#> SRR1700022 3 0.3661 0.6449 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1700024 1 0.8160 0.0116 0.312 0.100 0.000 0.288 0.300
#> SRR1700025 2 0.4418 0.5043 0.332 0.652 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700026 3 0.4928 0.3738 0.408 0.012 0.568 0.012 0.000
#> SRR1700027 1 0.5629 0.1188 0.548 0.036 0.392 0.024 0.000
#> SRR1700028 4 0.5115 0.6459 0.152 0.012 0.008 0.736 0.092
#> SRR1700029 3 0.6102 0.3685 0.264 0.000 0.560 0.176 0.000
#> SRR1700030 5 0.4687 0.6952 0.200 0.052 0.000 0.012 0.736
#> SRR1700031 3 0.2813 0.7198 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1700032 2 0.4428 0.6166 0.284 0.692 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700034 3 0.0290 0.7453 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.1928 0.7464 0.072 0.004 0.000 0.004 0.920
#> SRR1700033 3 0.2424 0.7349 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1700036 5 0.3558 0.7232 0.156 0.008 0.000 0.020 0.816
#> SRR1700037 5 0.1893 0.7537 0.024 0.028 0.000 0.012 0.936
#> SRR1700038 3 0.4626 0.5392 0.332 0.004 0.648 0.012 0.004
#> SRR1700039 3 0.1544 0.7498 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1700040 3 0.3210 0.7046 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.6839 0.1163 0.476 0.016 0.384 0.104 0.020
#> SRR1700042 3 0.3707 0.6331 0.284 0.000 0.716 0.000 0.000
#> SRR1700043 3 0.3210 0.6882 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.6844 0.0714 0.412 0.008 0.396 0.180 0.004
#> SRR1700044 1 0.7795 0.5052 0.548 0.220 0.088 0.064 0.080
#> SRR1700046 1 0.5991 0.0271 0.512 0.016 0.416 0.044 0.012
#> SRR1700047 3 0.3790 0.6682 0.248 0.000 0.744 0.004 0.004
#> SRR1700048 1 0.7961 0.2874 0.460 0.008 0.092 0.228 0.212
#> SRR1700049 3 0.1043 0.7468 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.1877 0.7484 0.064 0.000 0.924 0.012 0.000
#> SRR1700051 3 0.1544 0.7463 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.2179 0.7412 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1700053 5 0.5831 0.4311 0.320 0.000 0.048 0.036 0.596
#> SRR1700054 3 0.4759 0.4577 0.388 0.000 0.592 0.016 0.004
#> SRR1700055 3 0.0404 0.7450 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.5399 0.5567 0.188 0.000 0.664 0.148 0.000
#> SRR1700057 3 0.5352 0.5803 0.152 0.000 0.684 0.160 0.004
#> SRR1700058 3 0.2516 0.7343 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1700059 4 0.6035 0.4025 0.216 0.000 0.204 0.580 0.000
#> SRR1700060 3 0.3123 0.7175 0.184 0.000 0.812 0.004 0.000
#> SRR1700061 3 0.4003 0.6194 0.288 0.000 0.704 0.008 0.000
#> SRR1700062 3 0.3507 0.7295 0.120 0.000 0.828 0.052 0.000
#> SRR1700063 3 0.3715 0.6627 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000
#> SRR1700064 5 0.6129 0.3898 0.328 0.000 0.032 0.072 0.568
#> SRR1700065 3 0.3039 0.7093 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1700066 3 0.2280 0.7368 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1700067 5 0.6476 0.4685 0.188 0.016 0.000 0.232 0.564
#> SRR1700068 3 0.6995 -0.0779 0.356 0.000 0.372 0.264 0.008
#> SRR1700069 5 0.6429 0.0661 0.444 0.000 0.060 0.048 0.448
#> SRR1700070 2 0.5624 0.5374 0.208 0.648 0.000 0.004 0.140
#> SRR1700071 1 0.5396 -0.1248 0.500 0.000 0.444 0.056 0.000
#> SRR1700072 3 0.2605 0.7313 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1700073 5 0.5605 0.6672 0.172 0.052 0.000 0.076 0.700
#> SRR1700075 3 0.5163 0.3613 0.408 0.008 0.556 0.028 0.000
#> SRR1700074 3 0.4365 0.5956 0.308 0.004 0.676 0.012 0.000
#> SRR1700076 1 0.6492 0.3429 0.580 0.048 0.300 0.060 0.012
#> SRR1700077 3 0.4101 0.5057 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1700078 3 0.3883 0.6610 0.244 0.000 0.744 0.008 0.004
#> SRR1700080 1 0.6948 0.2461 0.440 0.000 0.168 0.024 0.368
#> SRR1700079 3 0.3803 0.7200 0.140 0.000 0.804 0.056 0.000
#> SRR1700081 3 0.3630 0.7026 0.204 0.000 0.780 0.016 0.000
#> SRR1700082 3 0.4894 0.3081 0.456 0.000 0.520 0.024 0.000
#> SRR1700083 3 0.2127 0.7425 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1700084 3 0.1908 0.7432 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1700085 5 0.2976 0.7574 0.064 0.044 0.000 0.012 0.880
#> SRR1700086 1 0.6611 0.3904 0.524 0.000 0.168 0.016 0.292
#> SRR1700087 4 0.5951 0.5947 0.156 0.048 0.108 0.684 0.004
#> SRR1700088 4 0.7319 -0.0323 0.340 0.264 0.012 0.376 0.008
#> SRR1700089 4 0.7319 0.2897 0.192 0.060 0.248 0.500 0.000
#> SRR1700091 4 0.5511 0.6108 0.088 0.116 0.000 0.724 0.072
#> SRR1700090 4 0.2563 0.7070 0.120 0.000 0.008 0.872 0.000
#> SRR1700092 4 0.6014 0.3810 0.096 0.268 0.000 0.612 0.024
#> SRR1700094 4 0.5961 0.4968 0.184 0.152 0.020 0.644 0.000
#> SRR1700093 4 0.1885 0.7026 0.032 0.020 0.000 0.936 0.012
#> SRR1700095 4 0.5658 0.2100 0.080 0.000 0.408 0.512 0.000
#> SRR1700096 4 0.3437 0.6902 0.176 0.004 0.000 0.808 0.012
#> SRR1700097 3 0.1661 0.7474 0.036 0.000 0.940 0.024 0.000
#> SRR1700098 2 0.7105 0.3115 0.068 0.520 0.000 0.284 0.128
#> SRR1700099 4 0.4843 0.6202 0.072 0.136 0.000 0.760 0.032
#> SRR1700100 4 0.2916 0.6997 0.072 0.040 0.000 0.880 0.008
#> SRR1700101 4 0.4497 0.6323 0.092 0.120 0.000 0.776 0.012
#> SRR1700102 4 0.7048 0.4165 0.108 0.172 0.000 0.580 0.140
#> SRR1700104 4 0.3987 0.6954 0.108 0.036 0.004 0.824 0.028
#> SRR1700103 4 0.5878 0.4863 0.152 0.000 0.212 0.628 0.008
#> SRR1700105 4 0.2074 0.7086 0.056 0.008 0.004 0.924 0.008
#> SRR1700106 4 0.3935 0.6946 0.060 0.000 0.084 0.828 0.028
#> SRR1700107 4 0.3426 0.6989 0.084 0.028 0.000 0.856 0.032
#> SRR1700108 4 0.3966 0.6359 0.048 0.132 0.000 0.808 0.012
#> SRR1700109 2 0.6589 0.4423 0.028 0.572 0.000 0.176 0.224
#> SRR1700110 2 0.6739 0.3691 0.020 0.528 0.000 0.200 0.252
#> SRR1700112 4 0.7612 -0.0269 0.044 0.280 0.000 0.364 0.312
#> SRR1700111 4 0.4733 0.6532 0.152 0.000 0.092 0.748 0.008
#> SRR1700113 5 0.6274 0.2577 0.040 0.060 0.000 0.396 0.504
#> SRR1700114 4 0.3573 0.6834 0.072 0.072 0.000 0.844 0.012
#> SRR1700115 4 0.5947 0.4907 0.052 0.072 0.000 0.652 0.224
#> SRR1700116 4 0.1408 0.7085 0.044 0.000 0.008 0.948 0.000
#> SRR1700117 3 0.3309 0.6866 0.036 0.000 0.836 0.128 0.000
#> SRR1700119 4 0.1788 0.7104 0.056 0.000 0.004 0.932 0.008
#> SRR1700118 4 0.3380 0.7050 0.124 0.000 0.008 0.840 0.028
#> SRR1700120 3 0.4203 0.6021 0.052 0.000 0.760 0.188 0.000
#> SRR1700121 4 0.4487 0.6505 0.096 0.008 0.000 0.772 0.124
#> SRR1700122 5 0.5717 0.4262 0.040 0.032 0.000 0.344 0.584
#> SRR1700123 4 0.3176 0.6974 0.080 0.000 0.064 0.856 0.000
#> SRR1700125 5 0.6028 0.4603 0.028 0.072 0.000 0.320 0.580
#> SRR1700126 3 0.3967 0.6891 0.092 0.000 0.800 0.108 0.000
#> SRR1700127 4 0.3962 0.6656 0.112 0.000 0.088 0.800 0.000
#> SRR1700124 4 0.2464 0.7088 0.096 0.000 0.016 0.888 0.000
#> SRR1700128 4 0.3390 0.6885 0.100 0.000 0.060 0.840 0.000
#> SRR1700129 4 0.5081 0.4752 0.032 0.020 0.000 0.664 0.284
#> SRR1700130 4 0.3191 0.6917 0.052 0.004 0.000 0.860 0.084
#> SRR1700132 4 0.6132 0.2707 0.124 0.000 0.348 0.524 0.004
#> SRR1700131 4 0.5406 0.2939 0.068 0.000 0.360 0.572 0.000
#> SRR1700133 4 0.3210 0.6891 0.040 0.008 0.000 0.860 0.092
#> SRR1700134 5 0.5156 0.1539 0.024 0.008 0.000 0.464 0.504
#> SRR1700135 4 0.4666 0.6802 0.096 0.000 0.048 0.784 0.072
#> SRR1700136 4 0.5889 0.2739 0.116 0.000 0.340 0.544 0.000
#> SRR1700137 4 0.2228 0.7121 0.048 0.000 0.000 0.912 0.040
#> SRR1700138 4 0.3151 0.7061 0.064 0.000 0.004 0.864 0.068
#> SRR1700140 4 0.2208 0.7116 0.072 0.000 0.000 0.908 0.020
#> SRR1700139 4 0.1830 0.7108 0.068 0.000 0.008 0.924 0.000
#> SRR1700141 4 0.5665 0.1052 0.032 0.028 0.000 0.532 0.408
#> SRR1700142 3 0.4690 0.6677 0.140 0.000 0.748 0.108 0.004
#> SRR1700143 4 0.5867 0.1497 0.100 0.000 0.404 0.496 0.000
#> SRR1700144 3 0.5751 0.3850 0.372 0.000 0.548 0.072 0.008
#> SRR1700145 4 0.5764 0.2854 0.084 0.000 0.364 0.548 0.004
#> SRR1700146 4 0.5356 0.0469 0.036 0.008 0.000 0.508 0.448
#> SRR1700147 4 0.4761 0.6099 0.124 0.000 0.144 0.732 0.000
#> SRR1700149 3 0.5063 0.4056 0.056 0.000 0.632 0.312 0.000
#> SRR1700148 4 0.5475 0.4679 0.124 0.000 0.232 0.644 0.000
#> SRR1700150 4 0.4607 0.5663 0.048 0.004 0.000 0.720 0.228
#> SRR1700152 4 0.3257 0.7096 0.104 0.000 0.016 0.856 0.024
#> SRR1700151 4 0.3339 0.6940 0.112 0.000 0.048 0.840 0.000
#> SRR1700153 4 0.3390 0.6781 0.060 0.000 0.100 0.840 0.000
#> SRR1700154 4 0.2928 0.7011 0.064 0.000 0.064 0.872 0.000
#> SRR1700155 4 0.1469 0.7051 0.036 0.000 0.000 0.948 0.016
#> SRR1700156 4 0.5013 0.5064 0.084 0.000 0.232 0.684 0.000
#> SRR1700158 3 0.5066 0.3520 0.048 0.000 0.608 0.344 0.000
#> SRR1700159 5 0.6084 0.5660 0.036 0.092 0.000 0.248 0.624
#> SRR1700157 4 0.6347 0.2928 0.156 0.000 0.296 0.540 0.008
#> SRR1700160 4 0.2608 0.7130 0.088 0.000 0.020 0.888 0.004
#> SRR1700161 4 0.2569 0.7066 0.068 0.000 0.032 0.896 0.004
#> SRR1700162 5 0.4789 0.4999 0.028 0.004 0.000 0.324 0.644
#> SRR1700164 3 0.5014 0.2971 0.040 0.000 0.592 0.368 0.000
#> SRR1700163 3 0.4914 0.4820 0.064 0.000 0.676 0.260 0.000
#> SRR1700165 4 0.5177 0.5479 0.132 0.000 0.180 0.688 0.000
#> SRR1700166 4 0.1492 0.7059 0.040 0.000 0.004 0.948 0.008
#> SRR1700168 5 0.6447 0.3927 0.032 0.096 0.000 0.340 0.532
#> SRR1700167 3 0.5238 0.4294 0.064 0.000 0.640 0.292 0.004
#> SRR1700170 4 0.3812 0.6863 0.080 0.000 0.080 0.828 0.012
#> SRR1700169 4 0.2445 0.7118 0.108 0.000 0.004 0.884 0.004
#> SRR1700171 3 0.2464 0.7134 0.016 0.000 0.888 0.096 0.000
#> SRR1700172 4 0.4531 0.6347 0.092 0.004 0.000 0.760 0.144
#> SRR1700174 4 0.2361 0.7125 0.096 0.000 0.000 0.892 0.012
#> SRR1700173 4 0.1697 0.7067 0.060 0.000 0.000 0.932 0.008
#> SRR1700175 4 0.3339 0.6930 0.068 0.008 0.000 0.856 0.068
#> SRR1700176 3 0.4364 0.6359 0.088 0.000 0.764 0.148 0.000
#> SRR1700178 2 0.0451 0.8157 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.2067 0.7087 0.048 0.000 0.000 0.920 0.032
#> SRR1700180 2 0.0290 0.8156 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0566 0.8145 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0451 0.8142 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700183 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0162 0.8143 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700184 2 0.0404 0.8150 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1591 0.8072 0.052 0.940 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700187 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0404 0.8131 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700190 3 0.0162 0.7454 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700191 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0693 0.8182 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700195 2 0.0865 0.8177 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700194 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0324 0.8146 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700197 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0162 0.8143 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700199 2 0.0865 0.8157 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700200 2 0.0566 0.8154 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700201 2 0.0807 0.8163 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700202 2 0.8061 -0.1346 0.108 0.464 0.296 0.100 0.032
#> SRR1700203 2 0.0566 0.8172 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700204 2 0.1644 0.8161 0.048 0.940 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700206 2 0.1502 0.8122 0.056 0.940 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700207 2 0.0324 0.8150 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700208 3 0.0794 0.7473 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.3706 0.7043 0.020 0.792 0.000 0.004 0.184
#> SRR1700209 2 0.1522 0.8170 0.012 0.944 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700210 2 0.1981 0.8106 0.064 0.920 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700211 2 0.4304 0.6977 0.092 0.800 0.092 0.012 0.004
#> SRR1700212 2 0.1117 0.8193 0.020 0.964 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700213 2 0.4896 0.6294 0.228 0.716 0.004 0.028 0.024
#> SRR1700214 2 0.0451 0.8156 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700215 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.1670 0.8141 0.012 0.936 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700216 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1682 0.8165 0.044 0.940 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700219 2 0.0898 0.8165 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700222 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.3224 0.7432 0.016 0.824 0.000 0.000 0.160
#> SRR1700221 2 0.0703 0.8174 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0693 0.8181 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700224 2 0.5296 0.6358 0.100 0.696 0.000 0.012 0.192
#> SRR1700226 2 0.0898 0.8193 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700229 2 0.1211 0.8196 0.024 0.960 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700225 2 0.5089 0.6512 0.212 0.716 0.004 0.028 0.040
#> SRR1700227 2 0.0451 0.8144 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700230 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.1430 0.8127 0.052 0.944 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700228 2 0.1990 0.8045 0.068 0.920 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700232 2 0.0693 0.8171 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700233 2 0.0955 0.8171 0.028 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700234 2 0.2433 0.8071 0.056 0.908 0.000 0.012 0.024
#> SRR1700235 2 0.1430 0.8138 0.052 0.944 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700237 2 0.1243 0.8185 0.028 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700236 2 0.1943 0.8164 0.020 0.924 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700238 2 0.0451 0.8144 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700239 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.6562 0.3545 0.180 0.028 0.596 0.192 0.004
#> SRR1700243 2 0.0451 0.8166 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.0693 0.8190 0.008 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700242 3 0.0162 0.7460 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700246 3 0.7196 -0.1734 0.116 0.352 0.480 0.020 0.032
#> SRR1700245 2 0.0579 0.8167 0.008 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700247 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0771 0.8167 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700248 2 0.0324 0.8138 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700251 2 0.0566 0.8164 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700252 3 0.7913 -0.1715 0.136 0.280 0.460 0.116 0.008
#> SRR1700253 2 0.0324 0.8146 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700256 2 0.1845 0.8129 0.016 0.928 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700254 3 0.0000 0.7457 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0290 0.8154 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700257 2 0.0162 0.8143 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700258 2 0.2777 0.7759 0.016 0.864 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700259 2 0.4206 0.6162 0.020 0.708 0.000 0.000 0.272
#> SRR1700260 5 0.4654 0.4386 0.024 0.348 0.000 0.000 0.628
#> SRR1700261 5 0.3563 0.6682 0.012 0.208 0.000 0.000 0.780
#> SRR1700262 5 0.4067 0.6486 0.020 0.228 0.000 0.004 0.748
#> SRR1700263 2 0.3291 0.7712 0.040 0.840 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700264 2 0.3736 0.7637 0.140 0.808 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700265 2 0.7849 -0.1061 0.312 0.432 0.172 0.008 0.076
#> SRR1700266 2 0.4946 0.4076 0.036 0.596 0.000 0.000 0.368
#> SRR1700268 3 0.6599 0.4452 0.164 0.084 0.660 0.044 0.048
#> SRR1700270 2 0.1310 0.8204 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700267 2 0.2079 0.8044 0.020 0.916 0.000 0.000 0.064
#> SRR1700271 2 0.4610 0.5780 0.020 0.676 0.000 0.008 0.296
#> SRR1700272 2 0.4636 0.5419 0.024 0.664 0.000 0.004 0.308
#> SRR1700273 2 0.3863 0.7448 0.052 0.796 0.000 0.000 0.152
#> SRR1700274 2 0.4855 0.2700 0.024 0.552 0.000 0.000 0.424
#> SRR1700277 3 0.2284 0.7453 0.096 0.004 0.896 0.004 0.000
#> SRR1700275 5 0.4452 0.7068 0.036 0.156 0.000 0.032 0.776
#> SRR1700276 5 0.5890 0.1939 0.028 0.432 0.000 0.044 0.496
#> SRR1700278 5 0.5569 0.4813 0.092 0.320 0.000 0.000 0.588
#> SRR1700279 5 0.2270 0.7506 0.016 0.072 0.000 0.004 0.908
#> SRR1700280 5 0.3639 0.7073 0.020 0.164 0.000 0.008 0.808
#> SRR1700281 2 0.1444 0.8172 0.012 0.948 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700283 5 0.4832 0.5755 0.032 0.292 0.000 0.008 0.668
#> SRR1700282 3 0.8447 -0.0534 0.124 0.056 0.488 0.132 0.200
#> SRR1700284 5 0.2027 0.7560 0.024 0.040 0.000 0.008 0.928
#> SRR1700285 5 0.3959 0.7420 0.068 0.104 0.000 0.012 0.816
#> SRR1700286 5 0.5458 0.3073 0.068 0.380 0.000 0.000 0.552
#> SRR1700287 5 0.2429 0.7479 0.020 0.076 0.000 0.004 0.900
#> SRR1700290 3 0.0162 0.7457 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700289 5 0.2278 0.7533 0.032 0.060 0.000 0.000 0.908
#> SRR1700288 2 0.2419 0.8075 0.028 0.904 0.000 0.004 0.064
#> SRR1700292 5 0.1701 0.7541 0.016 0.048 0.000 0.000 0.936
#> SRR1700291 5 0.6219 0.6341 0.120 0.072 0.000 0.148 0.660
#> SRR1700293 2 0.5125 0.6400 0.068 0.712 0.000 0.020 0.200
#> SRR1700294 5 0.1405 0.7489 0.020 0.008 0.000 0.016 0.956
#> SRR1700295 3 0.6569 0.3760 0.108 0.000 0.624 0.180 0.088
#> SRR1700297 5 0.2072 0.7528 0.020 0.036 0.000 0.016 0.928
#> SRR1700296 5 0.2670 0.7486 0.028 0.080 0.000 0.004 0.888
#> SRR1700298 5 0.4982 0.7080 0.100 0.036 0.000 0.108 0.756
#> SRR1700299 5 0.5530 0.6474 0.116 0.012 0.016 0.144 0.712
#> SRR1700300 5 0.7996 0.2876 0.184 0.032 0.152 0.108 0.524
#> SRR1700302 5 0.1200 0.7500 0.016 0.012 0.000 0.008 0.964
#> SRR1700301 5 0.1493 0.7537 0.024 0.028 0.000 0.000 0.948
#> SRR1700303 5 0.2234 0.7536 0.036 0.032 0.000 0.012 0.920
#> SRR1700304 5 0.4481 0.6996 0.052 0.176 0.000 0.012 0.760
#> SRR1700305 5 0.4002 0.7172 0.044 0.152 0.000 0.008 0.796
#> SRR1700306 3 0.6769 0.2500 0.120 0.000 0.592 0.076 0.212
#> SRR1700308 5 0.5913 0.5663 0.136 0.224 0.000 0.012 0.628
#> SRR1700307 3 0.8198 -0.2296 0.340 0.016 0.392 0.144 0.108
#> SRR1700309 3 0.8177 -0.2168 0.308 0.020 0.404 0.072 0.196
#> SRR1700310 5 0.2228 0.7525 0.020 0.056 0.000 0.008 0.916
#> SRR1700311 5 0.3689 0.7229 0.092 0.004 0.000 0.076 0.828
#> SRR1700312 5 0.3695 0.7119 0.036 0.164 0.000 0.000 0.800
#> SRR1700313 1 0.9748 0.4221 0.308 0.156 0.192 0.140 0.204
#> SRR1700314 5 0.6110 0.4468 0.160 0.000 0.004 0.260 0.576
#> SRR1700315 5 0.5519 0.6687 0.156 0.068 0.012 0.040 0.724
#> SRR1700316 5 0.8399 0.0427 0.228 0.172 0.000 0.244 0.356
#> SRR1700317 5 0.4838 0.4959 0.028 0.336 0.000 0.004 0.632
#> SRR1700318 5 0.2520 0.7492 0.096 0.012 0.000 0.004 0.888
#> SRR1700319 5 0.6544 0.4685 0.192 0.004 0.020 0.200 0.584
#> SRR1700320 5 0.1471 0.7525 0.020 0.024 0.000 0.004 0.952
#> SRR1700322 5 0.6432 0.5991 0.096 0.168 0.000 0.096 0.640
#> SRR1700321 5 0.2629 0.7566 0.032 0.064 0.000 0.008 0.896
#> SRR1700323 5 0.4964 0.6307 0.084 0.004 0.000 0.204 0.708
#> SRR1700324 5 0.3241 0.7447 0.036 0.100 0.000 0.008 0.856
#> SRR1700325 2 0.5735 0.1141 0.056 0.504 0.000 0.012 0.428
#> SRR1700326 3 0.4633 0.6128 0.072 0.000 0.768 0.140 0.020
#> SRR1700327 5 0.5257 0.5962 0.080 0.236 0.000 0.008 0.676
#> SRR1700329 5 0.1997 0.7546 0.024 0.028 0.000 0.016 0.932
#> SRR1700328 3 0.7969 0.1372 0.200 0.052 0.536 0.088 0.124
#> SRR1700330 5 0.8843 -0.0178 0.228 0.044 0.196 0.128 0.404
#> SRR1700331 5 0.0955 0.7472 0.028 0.004 0.000 0.000 0.968
#> SRR1700332 5 0.1954 0.7562 0.028 0.032 0.000 0.008 0.932
#> SRR1700333 5 0.6975 0.5591 0.124 0.188 0.000 0.104 0.584
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.4404 0.6991 0.088 0.752 0.000 0.000 0.136 0.024
#> SRR1699875 2 0.5575 0.5668 0.136 0.620 0.000 0.000 0.028 0.216
#> SRR1699876 5 0.3577 0.6262 0.088 0.084 0.000 0.000 0.816 0.012
#> SRR1699877 2 0.3203 0.7580 0.080 0.848 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR1699879 2 0.4937 0.6041 0.096 0.676 0.000 0.000 0.212 0.016
#> SRR1699878 2 0.3754 0.7298 0.112 0.800 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1699880 3 0.4482 0.5105 0.048 0.000 0.628 0.000 0.000 0.324
#> SRR1699881 3 0.6031 0.3313 0.144 0.000 0.556 0.028 0.004 0.268
#> SRR1699882 2 0.5613 0.2877 0.092 0.520 0.000 0.000 0.368 0.020
#> SRR1699883 2 0.4843 0.6967 0.136 0.728 0.000 0.000 0.064 0.072
#> SRR1699884 2 0.4740 0.6902 0.132 0.732 0.000 0.000 0.040 0.096
#> SRR1699885 2 0.1780 0.7650 0.048 0.924 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699886 5 0.4694 0.5508 0.080 0.184 0.000 0.004 0.716 0.016
#> SRR1699888 2 0.3281 0.7325 0.036 0.832 0.000 0.008 0.120 0.004
#> SRR1699889 5 0.2773 0.6264 0.152 0.000 0.000 0.004 0.836 0.008
#> SRR1699890 5 0.4863 0.3754 0.056 0.324 0.000 0.004 0.612 0.004
#> SRR1699887 5 0.4727 0.4754 0.100 0.240 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1699891 5 0.2908 0.6305 0.140 0.008 0.000 0.008 0.840 0.004
#> SRR1699892 2 0.7645 0.0926 0.220 0.428 0.000 0.032 0.100 0.220
#> SRR1699893 4 0.6881 -0.0254 0.236 0.000 0.000 0.416 0.288 0.060
#> SRR1699894 5 0.2728 0.6472 0.084 0.024 0.000 0.004 0.876 0.012
#> SRR1699895 5 0.1364 0.6406 0.048 0.004 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1699896 1 0.8508 0.2908 0.304 0.124 0.048 0.016 0.220 0.288
#> SRR1699897 2 0.7100 0.0875 0.184 0.416 0.000 0.000 0.296 0.104
#> SRR1699898 3 0.5892 0.5079 0.080 0.000 0.620 0.108 0.000 0.192
#> SRR1699900 3 0.6216 0.1201 0.168 0.000 0.500 0.016 0.008 0.308
#> SRR1699899 5 0.2809 0.6377 0.128 0.004 0.000 0.000 0.848 0.020
#> SRR1699902 3 0.4937 0.4850 0.088 0.000 0.628 0.004 0.000 0.280
#> SRR1699901 3 0.2474 0.6876 0.040 0.000 0.880 0.000 0.000 0.080
#> SRR1699903 5 0.2768 0.6219 0.156 0.000 0.000 0.000 0.832 0.012
#> SRR1699904 5 0.1901 0.6429 0.076 0.004 0.000 0.008 0.912 0.000
#> SRR1699905 3 0.1989 0.6900 0.028 0.000 0.916 0.004 0.000 0.052
#> SRR1699906 5 0.2699 0.6383 0.108 0.020 0.000 0.000 0.864 0.008
#> SRR1699907 5 0.2101 0.6349 0.100 0.000 0.000 0.004 0.892 0.004
#> SRR1699908 5 0.2944 0.6307 0.148 0.000 0.000 0.008 0.832 0.012
#> SRR1699909 5 0.5939 0.4820 0.236 0.068 0.000 0.016 0.616 0.064
#> SRR1699910 5 0.6468 0.2544 0.284 0.000 0.008 0.096 0.532 0.080
#> SRR1699911 5 0.5919 0.4978 0.176 0.064 0.000 0.020 0.648 0.092
#> SRR1699912 5 0.2257 0.6273 0.116 0.000 0.000 0.000 0.876 0.008
#> SRR1699913 5 0.3116 0.6477 0.096 0.036 0.000 0.008 0.852 0.008
#> SRR1699914 3 0.7068 -0.1883 0.184 0.000 0.388 0.036 0.028 0.364
#> SRR1699915 5 0.4771 0.5029 0.256 0.000 0.000 0.032 0.672 0.040
#> SRR1699916 2 0.5787 0.2939 0.092 0.548 0.000 0.028 0.328 0.004
#> SRR1699917 5 0.7481 -0.0250 0.196 0.040 0.000 0.288 0.416 0.060
#> SRR1699918 2 0.8538 -0.3684 0.188 0.312 0.000 0.124 0.268 0.108
#> SRR1699919 5 0.3035 0.6187 0.148 0.000 0.000 0.008 0.828 0.016
#> SRR1699920 5 0.7213 0.0848 0.288 0.000 0.024 0.084 0.460 0.144
#> SRR1699921 5 0.3230 0.5936 0.212 0.000 0.000 0.000 0.776 0.012
#> SRR1699922 5 0.5506 0.5164 0.164 0.120 0.000 0.000 0.660 0.056
#> SRR1699923 3 0.5219 0.4055 0.124 0.000 0.608 0.004 0.000 0.264
#> SRR1699924 6 0.7640 0.2000 0.172 0.000 0.284 0.196 0.004 0.344
#> SRR1699925 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.5271 0.4432 0.264 0.000 0.000 0.016 0.620 0.100
#> SRR1699927 5 0.1908 0.6327 0.096 0.000 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1699929 6 0.7704 -0.3845 0.328 0.108 0.008 0.008 0.216 0.332
#> SRR1699928 5 0.2165 0.6317 0.108 0.000 0.000 0.000 0.884 0.008
#> SRR1699930 5 0.1908 0.6365 0.096 0.000 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1699931 6 0.8356 -0.3401 0.220 0.228 0.008 0.024 0.240 0.280
#> SRR1699933 6 0.8933 -0.0764 0.220 0.100 0.244 0.032 0.092 0.312
#> SRR1699932 5 0.2445 0.6357 0.120 0.000 0.000 0.004 0.868 0.008
#> SRR1699934 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.7394 -0.1257 0.276 0.024 0.000 0.360 0.288 0.052
#> SRR1699936 2 0.4084 0.6612 0.052 0.744 0.000 0.008 0.196 0.000
#> SRR1699937 2 0.3893 0.6945 0.092 0.768 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1699938 2 0.1861 0.7688 0.036 0.928 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1699940 3 0.7077 0.0449 0.160 0.052 0.456 0.020 0.004 0.308
#> SRR1699939 2 0.5314 0.5116 0.088 0.608 0.000 0.000 0.284 0.020
#> SRR1699941 3 0.5016 0.4434 0.096 0.000 0.592 0.000 0.000 0.312
#> SRR1699942 2 0.6792 0.1420 0.128 0.452 0.000 0.100 0.000 0.320
#> SRR1699943 2 0.2389 0.7592 0.060 0.888 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699944 2 0.3916 0.7372 0.100 0.800 0.000 0.000 0.032 0.068
#> SRR1699945 3 0.1285 0.6899 0.004 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699946 2 0.5418 0.5320 0.164 0.608 0.000 0.008 0.000 0.220
#> SRR1699947 2 0.4999 0.5717 0.128 0.632 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1699948 2 0.1320 0.7676 0.036 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699949 5 0.4741 0.1298 0.040 0.420 0.000 0.000 0.536 0.004
#> SRR1699950 2 0.4885 0.4492 0.056 0.596 0.000 0.000 0.340 0.008
#> SRR1699951 2 0.7529 0.3726 0.116 0.524 0.000 0.136 0.124 0.100
#> SRR1699952 2 0.4282 0.6617 0.088 0.720 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1699953 2 0.3977 0.7157 0.056 0.780 0.000 0.000 0.144 0.020
#> SRR1699954 3 0.5083 0.4766 0.088 0.016 0.644 0.000 0.000 0.252
#> SRR1699955 2 0.1511 0.7662 0.012 0.940 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1699956 3 0.3065 0.6732 0.028 0.000 0.820 0.000 0.000 0.152
#> SRR1699957 2 0.5845 0.5966 0.160 0.628 0.000 0.000 0.068 0.144
#> SRR1699959 3 0.7298 -0.1964 0.172 0.000 0.364 0.136 0.000 0.328
#> SRR1699958 4 0.7186 0.1729 0.144 0.252 0.000 0.496 0.044 0.064
#> SRR1699960 2 0.5474 0.6278 0.096 0.692 0.000 0.084 0.120 0.008
#> SRR1699961 6 0.6454 0.0272 0.156 0.252 0.056 0.004 0.000 0.532
#> SRR1699962 2 0.3111 0.7548 0.032 0.856 0.000 0.004 0.088 0.020
#> SRR1699963 2 0.7479 -0.0411 0.124 0.412 0.004 0.204 0.004 0.252
#> SRR1699964 2 0.4429 0.6862 0.076 0.740 0.000 0.012 0.004 0.168
#> SRR1699965 2 0.2491 0.7368 0.020 0.868 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1699966 1 0.9575 0.3243 0.244 0.104 0.076 0.244 0.172 0.160
#> SRR1699967 2 0.2278 0.7635 0.044 0.900 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1699968 5 0.6377 0.3872 0.204 0.068 0.000 0.008 0.576 0.144
#> SRR1699969 3 0.5836 0.5034 0.116 0.000 0.624 0.036 0.012 0.212
#> SRR1699971 6 0.6086 0.1816 0.088 0.024 0.400 0.016 0.000 0.472
#> SRR1699970 2 0.2776 0.7520 0.032 0.860 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1699972 6 0.5756 0.2559 0.104 0.016 0.356 0.004 0.000 0.520
#> SRR1699973 4 0.8463 -0.1050 0.140 0.268 0.000 0.336 0.152 0.104
#> SRR1699974 3 0.1556 0.6862 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1699975 5 0.6361 0.3965 0.216 0.048 0.000 0.016 0.576 0.144
#> SRR1699976 6 0.6804 -0.0452 0.188 0.332 0.032 0.016 0.000 0.432
#> SRR1699977 6 0.7932 -0.1117 0.184 0.104 0.024 0.172 0.040 0.476
#> SRR1699978 3 0.2045 0.6924 0.016 0.000 0.916 0.016 0.000 0.052
#> SRR1699979 6 0.7464 -0.1290 0.252 0.016 0.032 0.256 0.028 0.416
#> SRR1699980 5 0.5051 0.4908 0.220 0.000 0.000 0.008 0.652 0.120
#> SRR1699981 3 0.8570 -0.3952 0.252 0.000 0.296 0.092 0.140 0.220
#> SRR1699982 5 0.1429 0.6417 0.052 0.004 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1699983 5 0.2536 0.6315 0.116 0.000 0.000 0.000 0.864 0.020
#> SRR1699984 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.6808 0.0598 0.120 0.432 0.000 0.016 0.372 0.060
#> SRR1699986 3 0.0713 0.6904 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699988 2 0.7872 -0.2425 0.208 0.340 0.000 0.024 0.296 0.132
#> SRR1699987 4 0.7842 0.1211 0.204 0.000 0.124 0.420 0.040 0.212
#> SRR1699989 5 0.3987 0.6309 0.136 0.036 0.000 0.008 0.792 0.028
#> SRR1699990 5 0.8502 -0.3043 0.248 0.136 0.004 0.076 0.336 0.200
#> SRR1699992 3 0.6198 0.0492 0.120 0.016 0.464 0.016 0.000 0.384
#> SRR1699991 3 0.6727 -0.1194 0.140 0.000 0.396 0.076 0.000 0.388
#> SRR1699993 3 0.1572 0.6907 0.036 0.000 0.936 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699994 3 0.4117 0.5973 0.036 0.000 0.704 0.004 0.000 0.256
#> SRR1699995 3 0.0713 0.6875 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699996 2 0.5399 0.6154 0.120 0.688 0.000 0.008 0.048 0.136
#> SRR1699997 4 0.3951 0.5811 0.112 0.000 0.000 0.796 0.056 0.036
#> SRR1699998 2 0.7074 0.3460 0.204 0.508 0.000 0.016 0.100 0.172
#> SRR1699999 3 0.0363 0.6882 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700000 3 0.4633 0.5804 0.100 0.008 0.704 0.000 0.000 0.188
#> SRR1700002 6 0.7219 -0.0414 0.132 0.340 0.020 0.076 0.004 0.428
#> SRR1700001 3 0.4726 0.6079 0.076 0.000 0.708 0.024 0.000 0.192
#> SRR1700003 6 0.8376 -0.1335 0.248 0.236 0.032 0.152 0.012 0.320
#> SRR1700004 3 0.4615 0.6217 0.068 0.000 0.728 0.032 0.000 0.172
#> SRR1700005 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 6 0.6986 0.1750 0.144 0.116 0.152 0.032 0.000 0.556
#> SRR1700007 5 0.4148 0.5484 0.048 0.188 0.000 0.016 0.748 0.000
#> SRR1700008 3 0.5034 0.5813 0.048 0.000 0.708 0.136 0.000 0.108
#> SRR1700009 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.3268 0.6690 0.044 0.000 0.812 0.000 0.000 0.144
#> SRR1700011 2 0.4909 0.6529 0.064 0.724 0.000 0.056 0.152 0.004
#> SRR1700013 3 0.8718 -0.3686 0.136 0.100 0.276 0.272 0.004 0.212
#> SRR1700012 6 0.7603 -0.0345 0.208 0.132 0.044 0.072 0.028 0.516
#> SRR1700014 6 0.7109 -0.0939 0.220 0.004 0.036 0.112 0.092 0.536
#> SRR1700015 6 0.7154 0.2484 0.112 0.116 0.224 0.032 0.000 0.516
#> SRR1700016 3 0.0260 0.6883 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700018 6 0.4989 0.0601 0.060 0.000 0.408 0.004 0.000 0.528
#> SRR1700017 3 0.5334 0.4018 0.072 0.000 0.568 0.020 0.000 0.340
#> SRR1700019 5 0.4429 0.5539 0.076 0.180 0.000 0.004 0.732 0.008
#> SRR1700020 3 0.2326 0.6879 0.008 0.000 0.888 0.012 0.000 0.092
#> SRR1700021 5 0.4490 0.6032 0.136 0.012 0.000 0.048 0.764 0.040
#> SRR1700023 6 0.7308 0.2014 0.160 0.000 0.260 0.068 0.040 0.472
#> SRR1700022 3 0.4616 0.4083 0.036 0.000 0.576 0.004 0.000 0.384
#> SRR1700024 4 0.8639 -0.2904 0.212 0.080 0.000 0.260 0.252 0.196
#> SRR1700025 2 0.5685 0.3628 0.144 0.540 0.004 0.004 0.000 0.308
#> SRR1700026 6 0.6045 0.0940 0.080 0.008 0.424 0.036 0.000 0.452
#> SRR1700027 6 0.5681 0.3303 0.100 0.020 0.232 0.020 0.000 0.628
#> SRR1700028 4 0.6648 0.4389 0.176 0.012 0.004 0.580 0.104 0.124
#> SRR1700029 3 0.6538 0.2041 0.084 0.000 0.496 0.120 0.000 0.300
#> SRR1700030 5 0.5385 0.5334 0.180 0.032 0.000 0.008 0.672 0.108
#> SRR1700031 3 0.3445 0.6227 0.012 0.000 0.744 0.000 0.000 0.244
#> SRR1700032 2 0.5668 0.5530 0.148 0.616 0.000 0.000 0.032 0.204
#> SRR1700034 3 0.0260 0.6876 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700035 5 0.3239 0.6278 0.120 0.004 0.000 0.004 0.832 0.040
#> SRR1700033 3 0.3955 0.6178 0.032 0.000 0.724 0.004 0.000 0.240
#> SRR1700036 5 0.5372 0.4580 0.236 0.004 0.000 0.012 0.628 0.120
#> SRR1700037 5 0.2169 0.6436 0.080 0.012 0.000 0.000 0.900 0.008
#> SRR1700038 3 0.5650 0.3870 0.108 0.008 0.584 0.008 0.004 0.288
#> SRR1700039 3 0.2357 0.6811 0.012 0.000 0.872 0.000 0.000 0.116
#> SRR1700040 3 0.4644 0.5456 0.068 0.000 0.660 0.004 0.000 0.268
#> SRR1700041 6 0.7203 0.2548 0.180 0.008 0.224 0.092 0.008 0.488
#> SRR1700042 3 0.4809 0.4237 0.044 0.000 0.576 0.008 0.000 0.372
#> SRR1700043 3 0.4167 0.5962 0.056 0.000 0.708 0.000 0.000 0.236
#> SRR1700045 6 0.7415 0.2021 0.216 0.000 0.252 0.148 0.000 0.384
#> SRR1700044 6 0.7971 -0.1614 0.232 0.144 0.028 0.048 0.084 0.464
#> SRR1700046 6 0.6064 0.3246 0.104 0.000 0.256 0.068 0.000 0.572
#> SRR1700047 3 0.5495 0.4506 0.100 0.000 0.596 0.024 0.000 0.280
#> SRR1700048 6 0.8197 -0.2243 0.208 0.000 0.072 0.224 0.116 0.380
#> SRR1700049 3 0.1765 0.6849 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1700050 3 0.3627 0.6717 0.028 0.000 0.808 0.032 0.000 0.132
#> SRR1700051 3 0.2264 0.6853 0.012 0.000 0.888 0.004 0.000 0.096
#> SRR1700052 3 0.2945 0.6696 0.020 0.000 0.824 0.000 0.000 0.156
#> SRR1700053 5 0.7151 -0.2169 0.240 0.000 0.016 0.048 0.400 0.296
#> SRR1700054 6 0.5738 0.0838 0.108 0.000 0.412 0.016 0.000 0.464
#> SRR1700055 3 0.0363 0.6877 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700056 3 0.5933 0.4986 0.096 0.000 0.628 0.128 0.000 0.148
#> SRR1700057 3 0.6384 0.3923 0.076 0.000 0.556 0.168 0.000 0.200
#> SRR1700058 3 0.3619 0.6307 0.024 0.000 0.744 0.000 0.000 0.232
#> SRR1700059 4 0.7103 0.2218 0.164 0.000 0.204 0.468 0.000 0.164
#> SRR1700060 3 0.4476 0.5597 0.044 0.000 0.668 0.008 0.000 0.280
#> SRR1700061 3 0.5961 0.3041 0.124 0.000 0.532 0.032 0.000 0.312
#> SRR1700062 3 0.5033 0.6010 0.052 0.000 0.688 0.060 0.000 0.200
#> SRR1700063 3 0.4994 0.3984 0.060 0.000 0.572 0.008 0.000 0.360
#> SRR1700064 5 0.7266 -0.2185 0.312 0.000 0.012 0.068 0.384 0.224
#> SRR1700065 3 0.4172 0.5646 0.040 0.000 0.680 0.000 0.000 0.280
#> SRR1700066 3 0.2912 0.6661 0.012 0.000 0.816 0.000 0.000 0.172
#> SRR1700067 5 0.7522 -0.1240 0.232 0.012 0.000 0.268 0.384 0.104
#> SRR1700068 6 0.7486 0.1955 0.172 0.000 0.256 0.200 0.000 0.372
#> SRR1700069 5 0.7454 -0.3086 0.256 0.000 0.048 0.032 0.352 0.312
#> SRR1700070 2 0.6819 0.3327 0.108 0.536 0.000 0.008 0.176 0.172
#> SRR1700071 6 0.5988 0.3330 0.108 0.000 0.264 0.056 0.000 0.572
#> SRR1700072 3 0.3588 0.6513 0.044 0.000 0.776 0.000 0.000 0.180
#> SRR1700073 5 0.6271 0.4784 0.192 0.068 0.000 0.052 0.624 0.064
#> SRR1700075 6 0.5991 0.0609 0.124 0.004 0.424 0.016 0.000 0.432
#> SRR1700074 3 0.5464 0.3104 0.092 0.000 0.524 0.012 0.000 0.372
#> SRR1700076 6 0.6995 0.2609 0.164 0.028 0.188 0.056 0.012 0.552
#> SRR1700077 3 0.4937 0.1027 0.052 0.000 0.476 0.004 0.000 0.468
#> SRR1700078 3 0.5052 0.5225 0.064 0.000 0.640 0.004 0.016 0.276
#> SRR1700080 6 0.7689 -0.3386 0.244 0.000 0.060 0.044 0.292 0.360
#> SRR1700079 3 0.4986 0.6028 0.080 0.000 0.692 0.036 0.000 0.192
#> SRR1700081 3 0.4434 0.5849 0.048 0.000 0.684 0.008 0.000 0.260
#> SRR1700082 6 0.5479 0.1653 0.056 0.000 0.368 0.036 0.000 0.540
#> SRR1700083 3 0.3438 0.6602 0.020 0.000 0.788 0.008 0.000 0.184
#> SRR1700084 3 0.2260 0.6760 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1700085 5 0.3612 0.6325 0.148 0.016 0.000 0.000 0.800 0.036
#> SRR1700086 6 0.7276 -0.1781 0.268 0.000 0.096 0.012 0.184 0.440
#> SRR1700087 4 0.7203 0.4021 0.132 0.060 0.096 0.560 0.004 0.148
#> SRR1700088 6 0.7910 -0.1334 0.156 0.240 0.016 0.276 0.000 0.312
#> SRR1700089 4 0.8181 0.1354 0.176 0.068 0.184 0.404 0.000 0.168
#> SRR1700091 4 0.7171 0.3241 0.144 0.172 0.000 0.544 0.064 0.076
#> SRR1700090 4 0.4063 0.5941 0.144 0.000 0.004 0.768 0.004 0.080
#> SRR1700092 4 0.7044 0.1304 0.128 0.296 0.000 0.476 0.024 0.076
#> SRR1700094 4 0.7285 0.3889 0.168 0.076 0.036 0.536 0.012 0.172
#> SRR1700093 4 0.3488 0.5856 0.104 0.008 0.000 0.832 0.020 0.036
#> SRR1700095 4 0.6356 0.0616 0.088 0.000 0.412 0.424 0.000 0.076
#> SRR1700096 4 0.4926 0.5705 0.120 0.012 0.008 0.716 0.004 0.140
#> SRR1700097 3 0.2341 0.6856 0.012 0.000 0.900 0.032 0.000 0.056
#> SRR1700098 2 0.7466 -0.0270 0.128 0.412 0.000 0.296 0.148 0.016
#> SRR1700099 4 0.6369 0.4441 0.128 0.136 0.000 0.628 0.048 0.060
#> SRR1700100 4 0.5511 0.5459 0.128 0.060 0.000 0.696 0.020 0.096
#> SRR1700101 4 0.5691 0.4846 0.124 0.112 0.000 0.684 0.032 0.048
#> SRR1700102 4 0.7509 0.2205 0.132 0.156 0.000 0.508 0.148 0.056
#> SRR1700104 4 0.4678 0.5878 0.128 0.008 0.000 0.740 0.020 0.104
#> SRR1700103 4 0.6602 0.3474 0.124 0.000 0.232 0.540 0.004 0.100
#> SRR1700105 4 0.3340 0.5923 0.100 0.004 0.000 0.840 0.032 0.024
#> SRR1700106 4 0.5827 0.5605 0.188 0.000 0.072 0.656 0.032 0.052
#> SRR1700107 4 0.4887 0.5618 0.140 0.012 0.000 0.736 0.064 0.048
#> SRR1700108 4 0.5658 0.4804 0.108 0.112 0.000 0.692 0.036 0.052
#> SRR1700109 2 0.6983 0.2107 0.068 0.484 0.000 0.216 0.220 0.012
#> SRR1700110 2 0.7061 0.0854 0.076 0.436 0.000 0.224 0.260 0.004
#> SRR1700112 5 0.7686 -0.0796 0.108 0.240 0.000 0.304 0.332 0.016
#> SRR1700111 4 0.5698 0.5343 0.136 0.000 0.056 0.660 0.008 0.140
#> SRR1700113 5 0.6403 0.0504 0.120 0.024 0.000 0.376 0.460 0.020
#> SRR1700114 4 0.5400 0.5386 0.136 0.068 0.000 0.708 0.028 0.060
#> SRR1700115 4 0.6748 0.3176 0.120 0.084 0.000 0.572 0.192 0.032
#> SRR1700116 4 0.3521 0.6019 0.120 0.000 0.000 0.812 0.008 0.060
#> SRR1700117 3 0.3784 0.6414 0.048 0.000 0.808 0.108 0.000 0.036
#> SRR1700119 4 0.3334 0.5987 0.132 0.000 0.008 0.820 0.000 0.040
#> SRR1700118 4 0.5547 0.5420 0.140 0.000 0.016 0.672 0.032 0.140
#> SRR1700120 3 0.5157 0.5293 0.056 0.000 0.692 0.168 0.000 0.084
#> SRR1700121 4 0.5788 0.4467 0.144 0.008 0.000 0.636 0.172 0.040
#> SRR1700122 5 0.6605 0.1324 0.148 0.048 0.000 0.316 0.480 0.008
#> SRR1700123 4 0.5105 0.5471 0.124 0.000 0.104 0.708 0.000 0.064
#> SRR1700125 5 0.6138 0.3120 0.112 0.052 0.000 0.272 0.560 0.004
#> SRR1700126 3 0.4766 0.6069 0.056 0.000 0.736 0.124 0.000 0.084
#> SRR1700127 4 0.5834 0.5123 0.128 0.000 0.084 0.636 0.000 0.152
#> SRR1700124 4 0.3862 0.5909 0.104 0.000 0.008 0.788 0.000 0.100
#> SRR1700128 4 0.6231 0.4809 0.144 0.000 0.128 0.624 0.016 0.088
#> SRR1700129 4 0.5986 0.3383 0.136 0.024 0.000 0.596 0.228 0.016
#> SRR1700130 4 0.4664 0.5692 0.136 0.000 0.000 0.740 0.076 0.048
#> SRR1700132 4 0.6814 0.1429 0.144 0.000 0.332 0.436 0.000 0.088
#> SRR1700131 4 0.6246 0.0497 0.072 0.000 0.420 0.428 0.000 0.080
#> SRR1700133 4 0.4625 0.5620 0.144 0.000 0.000 0.736 0.088 0.032
#> SRR1700134 4 0.6025 -0.0430 0.088 0.024 0.000 0.440 0.436 0.012
#> SRR1700135 4 0.5816 0.5205 0.172 0.000 0.032 0.664 0.056 0.076
#> SRR1700136 4 0.6419 0.2592 0.120 0.000 0.288 0.516 0.000 0.076
#> SRR1700137 4 0.4491 0.5847 0.120 0.004 0.000 0.764 0.060 0.052
#> SRR1700138 4 0.5346 0.5506 0.180 0.000 0.004 0.676 0.044 0.096
#> SRR1700140 4 0.3744 0.5979 0.132 0.000 0.000 0.796 0.012 0.060
#> SRR1700139 4 0.3416 0.5951 0.120 0.000 0.004 0.824 0.008 0.044
#> SRR1700141 4 0.6284 0.0902 0.096 0.040 0.000 0.484 0.368 0.012
#> SRR1700142 3 0.6221 0.4074 0.088 0.000 0.576 0.116 0.000 0.220
#> SRR1700143 4 0.6846 0.1926 0.128 0.000 0.300 0.460 0.000 0.112
#> SRR1700144 6 0.6544 0.0947 0.112 0.000 0.392 0.076 0.000 0.420
#> SRR1700145 4 0.6678 0.2175 0.148 0.000 0.292 0.480 0.000 0.080
#> SRR1700146 4 0.6220 0.0671 0.120 0.028 0.000 0.476 0.368 0.008
#> SRR1700147 4 0.6247 0.4323 0.176 0.000 0.164 0.588 0.004 0.068
#> SRR1700149 3 0.5614 0.4046 0.072 0.000 0.620 0.244 0.000 0.064
#> SRR1700148 4 0.6635 0.3548 0.172 0.000 0.184 0.536 0.000 0.108
#> SRR1700150 4 0.5775 0.3244 0.156 0.004 0.000 0.584 0.240 0.016
#> SRR1700152 4 0.3113 0.5958 0.116 0.000 0.004 0.844 0.012 0.024
#> SRR1700151 4 0.5640 0.5178 0.156 0.000 0.088 0.656 0.000 0.100
#> SRR1700153 4 0.5328 0.5099 0.132 0.000 0.136 0.680 0.000 0.052
#> SRR1700154 4 0.4635 0.5737 0.144 0.000 0.068 0.740 0.000 0.048
#> SRR1700155 4 0.3177 0.5963 0.076 0.004 0.000 0.856 0.024 0.040
#> SRR1700156 4 0.6355 0.3787 0.148 0.000 0.184 0.572 0.000 0.096
#> SRR1700158 3 0.5271 0.2419 0.060 0.000 0.548 0.372 0.000 0.020
#> SRR1700159 5 0.6170 0.3867 0.084 0.108 0.000 0.208 0.596 0.004
#> SRR1700157 4 0.7078 0.2180 0.140 0.000 0.240 0.460 0.000 0.160
#> SRR1700160 4 0.4561 0.5812 0.160 0.000 0.024 0.744 0.008 0.064
#> SRR1700161 4 0.3927 0.5782 0.164 0.000 0.032 0.776 0.000 0.028
#> SRR1700162 5 0.5507 0.2751 0.084 0.012 0.000 0.328 0.568 0.008
#> SRR1700164 3 0.5512 0.2338 0.096 0.000 0.548 0.340 0.000 0.016
#> SRR1700163 3 0.5319 0.4271 0.064 0.000 0.640 0.248 0.000 0.048
#> SRR1700165 4 0.5954 0.4528 0.120 0.000 0.160 0.624 0.000 0.096
#> SRR1700166 4 0.2415 0.5940 0.084 0.000 0.000 0.888 0.012 0.016
#> SRR1700168 5 0.6630 0.1805 0.104 0.072 0.000 0.312 0.500 0.012
#> SRR1700167 3 0.6127 0.2730 0.076 0.000 0.540 0.300 0.000 0.084
#> SRR1700170 4 0.5283 0.5595 0.168 0.000 0.076 0.696 0.012 0.048
#> SRR1700169 4 0.3701 0.5994 0.112 0.000 0.000 0.804 0.012 0.072
#> SRR1700171 3 0.2655 0.6616 0.020 0.000 0.872 0.096 0.000 0.012
#> SRR1700172 4 0.5704 0.4400 0.160 0.000 0.000 0.624 0.176 0.040
#> SRR1700174 4 0.3453 0.5986 0.144 0.000 0.000 0.808 0.008 0.040
#> SRR1700173 4 0.2425 0.5932 0.088 0.000 0.000 0.884 0.004 0.024
#> SRR1700175 4 0.4527 0.5607 0.116 0.008 0.000 0.760 0.088 0.028
#> SRR1700176 3 0.5184 0.5637 0.068 0.000 0.700 0.136 0.000 0.096
#> SRR1700178 2 0.0508 0.7621 0.012 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.3893 0.5909 0.120 0.000 0.000 0.796 0.056 0.028
#> SRR1700180 2 0.1218 0.7647 0.028 0.956 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700179 2 0.0806 0.7644 0.020 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700181 2 0.0551 0.7620 0.008 0.984 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700183 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.7596 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0914 0.7645 0.016 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700186 2 0.2144 0.7633 0.048 0.908 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1700187 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.1053 0.7650 0.012 0.964 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700192 3 0.0291 0.6888 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700190 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700191 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0951 0.7661 0.020 0.968 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700195 2 0.1700 0.7657 0.048 0.928 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700194 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0363 0.7610 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0692 0.7633 0.020 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700199 2 0.1341 0.7673 0.024 0.948 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700200 2 0.1138 0.7680 0.024 0.960 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700201 2 0.0260 0.7606 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700202 2 0.8315 -0.3269 0.116 0.368 0.324 0.104 0.032 0.056
#> SRR1700203 2 0.1148 0.7687 0.016 0.960 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700204 2 0.2318 0.7689 0.048 0.904 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1700206 2 0.2594 0.7623 0.056 0.880 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1700207 2 0.0547 0.7624 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700208 3 0.1321 0.6910 0.024 0.000 0.952 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700205 2 0.4199 0.6334 0.052 0.728 0.000 0.000 0.212 0.008
#> SRR1700209 2 0.2474 0.7572 0.032 0.884 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1700210 2 0.3417 0.7525 0.092 0.832 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR1700211 2 0.6116 0.5526 0.116 0.660 0.104 0.008 0.020 0.092
#> SRR1700212 2 0.2239 0.7698 0.048 0.908 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1700213 2 0.6333 0.4830 0.168 0.592 0.016 0.020 0.016 0.188
#> SRR1700214 2 0.1333 0.7669 0.048 0.944 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700215 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.2373 0.7560 0.024 0.888 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1700216 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3212 0.7544 0.100 0.840 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1700219 2 0.1007 0.7620 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700222 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.3274 0.6997 0.024 0.804 0.000 0.000 0.168 0.004
#> SRR1700221 2 0.1750 0.7703 0.040 0.932 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1700223 2 0.1237 0.7677 0.020 0.956 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700224 2 0.6681 0.3773 0.184 0.544 0.000 0.016 0.196 0.060
#> SRR1700226 2 0.1421 0.7712 0.028 0.944 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700229 2 0.3335 0.7613 0.068 0.844 0.000 0.000 0.056 0.032
#> SRR1700225 2 0.6509 0.4604 0.176 0.576 0.004 0.036 0.024 0.184
#> SRR1700227 2 0.0405 0.7609 0.008 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700230 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.2594 0.7647 0.068 0.884 0.000 0.004 0.004 0.040
#> SRR1700228 2 0.3109 0.7475 0.076 0.848 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR1700232 2 0.1405 0.7708 0.024 0.948 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700233 2 0.1498 0.7694 0.032 0.940 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700234 2 0.3925 0.7371 0.076 0.824 0.004 0.020 0.032 0.044
#> SRR1700235 2 0.2527 0.7620 0.084 0.880 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1700237 2 0.1785 0.7721 0.048 0.928 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1700236 2 0.3238 0.7541 0.060 0.844 0.000 0.000 0.080 0.016
#> SRR1700238 2 0.0717 0.7654 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700239 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.7582 0.1302 0.124 0.048 0.504 0.160 0.004 0.160
#> SRR1700243 2 0.0692 0.7642 0.020 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.1930 0.7728 0.036 0.924 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1700242 3 0.0622 0.6884 0.012 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700246 3 0.7954 -0.1852 0.124 0.284 0.428 0.028 0.032 0.104
#> SRR1700245 2 0.0881 0.7646 0.012 0.972 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700247 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.1148 0.7672 0.020 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700248 2 0.0862 0.7648 0.016 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700251 2 0.0508 0.7638 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700252 3 0.8097 -0.2248 0.124 0.208 0.400 0.048 0.004 0.216
#> SRR1700253 2 0.0653 0.7638 0.004 0.980 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700256 2 0.2452 0.7706 0.056 0.892 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1700254 3 0.0000 0.6880 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.1168 0.7679 0.028 0.956 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700257 2 0.0520 0.7619 0.008 0.984 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700258 2 0.3091 0.7230 0.024 0.824 0.000 0.000 0.148 0.004
#> SRR1700259 2 0.3907 0.5917 0.028 0.704 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1700260 5 0.4442 0.4035 0.032 0.308 0.000 0.004 0.652 0.004
#> SRR1700261 5 0.4095 0.5260 0.060 0.216 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1700262 5 0.3488 0.5668 0.036 0.184 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1700263 2 0.4030 0.7153 0.068 0.780 0.000 0.000 0.132 0.020
#> SRR1700264 2 0.5491 0.6544 0.120 0.676 0.000 0.000 0.092 0.112
#> SRR1700265 2 0.8584 -0.3079 0.168 0.332 0.124 0.008 0.092 0.276
#> SRR1700266 2 0.4995 0.2641 0.052 0.528 0.000 0.000 0.412 0.008
#> SRR1700268 3 0.7367 0.2051 0.160 0.048 0.552 0.016 0.092 0.132
#> SRR1700270 2 0.2274 0.7728 0.028 0.908 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1700267 2 0.2011 0.7632 0.020 0.912 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1700271 2 0.4453 0.4811 0.044 0.624 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1700272 2 0.5244 0.3714 0.048 0.568 0.000 0.016 0.360 0.008
#> SRR1700273 2 0.4303 0.6884 0.064 0.748 0.000 0.000 0.168 0.020
#> SRR1700274 2 0.5035 0.0332 0.052 0.472 0.000 0.000 0.468 0.008
#> SRR1700277 3 0.3770 0.6580 0.044 0.004 0.800 0.016 0.000 0.136
#> SRR1700275 5 0.4182 0.5818 0.052 0.148 0.000 0.032 0.768 0.000
#> SRR1700276 5 0.6132 0.1097 0.068 0.424 0.000 0.052 0.448 0.008
#> SRR1700278 5 0.6594 0.2025 0.140 0.296 0.000 0.004 0.496 0.064
#> SRR1700279 5 0.2164 0.6413 0.068 0.032 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1700280 5 0.3633 0.6125 0.076 0.120 0.000 0.000 0.800 0.004
#> SRR1700281 2 0.2074 0.7716 0.048 0.912 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700283 5 0.4378 0.3951 0.040 0.328 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1700282 3 0.9081 -0.4462 0.192 0.040 0.344 0.140 0.188 0.096
#> SRR1700284 5 0.2145 0.6487 0.056 0.020 0.000 0.004 0.912 0.008
#> SRR1700285 5 0.5054 0.5974 0.128 0.100 0.000 0.020 0.724 0.028
#> SRR1700286 5 0.5753 0.2585 0.112 0.348 0.000 0.000 0.520 0.020
#> SRR1700287 5 0.2263 0.6393 0.036 0.060 0.000 0.004 0.900 0.000
#> SRR1700290 3 0.0146 0.6877 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700289 5 0.2501 0.6495 0.072 0.028 0.000 0.000 0.888 0.012
#> SRR1700288 2 0.4711 0.6859 0.104 0.736 0.000 0.000 0.120 0.040
#> SRR1700292 5 0.1821 0.6438 0.040 0.024 0.000 0.000 0.928 0.008
#> SRR1700291 5 0.7336 0.2737 0.196 0.080 0.000 0.148 0.516 0.060
#> SRR1700293 2 0.5421 0.5483 0.092 0.664 0.000 0.024 0.204 0.016
#> SRR1700294 5 0.1471 0.6382 0.064 0.004 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1700295 3 0.6969 0.2719 0.184 0.000 0.552 0.152 0.056 0.056
#> SRR1700297 5 0.2209 0.6383 0.072 0.024 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1700296 5 0.2519 0.6396 0.048 0.056 0.000 0.000 0.888 0.008
#> SRR1700298 5 0.5977 0.4830 0.184 0.036 0.000 0.068 0.648 0.064
#> SRR1700299 5 0.7018 0.1312 0.256 0.008 0.020 0.152 0.508 0.056
#> SRR1700300 5 0.8846 -0.4483 0.236 0.020 0.176 0.100 0.340 0.128
#> SRR1700302 5 0.1411 0.6399 0.060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1700301 5 0.1578 0.6405 0.048 0.012 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1700303 5 0.1801 0.6374 0.056 0.016 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1700304 5 0.4902 0.5092 0.152 0.172 0.000 0.000 0.672 0.004
#> SRR1700305 5 0.5317 0.5476 0.108 0.156 0.000 0.020 0.692 0.024
#> SRR1700306 3 0.7645 0.0843 0.180 0.000 0.488 0.060 0.144 0.128
#> SRR1700308 5 0.7157 0.2497 0.172 0.192 0.000 0.020 0.508 0.108
#> SRR1700307 1 0.8632 0.1340 0.312 0.004 0.228 0.088 0.136 0.232
#> SRR1700309 3 0.8473 -0.3290 0.212 0.000 0.344 0.100 0.124 0.220
#> SRR1700310 5 0.1780 0.6384 0.048 0.028 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1700311 5 0.5219 0.4920 0.268 0.004 0.000 0.040 0.640 0.048
#> SRR1700312 5 0.4957 0.5636 0.120 0.152 0.000 0.004 0.704 0.020
#> SRR1700313 1 0.9619 0.2919 0.264 0.112 0.124 0.128 0.124 0.248
#> SRR1700314 5 0.7559 -0.1537 0.240 0.000 0.016 0.168 0.428 0.148
#> SRR1700315 5 0.7576 0.1087 0.284 0.072 0.004 0.064 0.456 0.120
#> SRR1700316 5 0.8725 -0.4184 0.256 0.156 0.000 0.208 0.268 0.112
#> SRR1700317 5 0.5528 0.3457 0.108 0.308 0.000 0.000 0.568 0.016
#> SRR1700318 5 0.4211 0.5871 0.192 0.008 0.000 0.012 0.748 0.040
#> SRR1700319 5 0.6722 0.0123 0.332 0.000 0.012 0.156 0.456 0.044
#> SRR1700320 5 0.1668 0.6412 0.060 0.008 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1700322 5 0.6862 0.3058 0.152 0.180 0.000 0.084 0.556 0.028
#> SRR1700321 5 0.3136 0.6383 0.080 0.064 0.000 0.004 0.848 0.004
#> SRR1700323 5 0.6458 0.3001 0.236 0.008 0.000 0.196 0.524 0.036
#> SRR1700324 5 0.4154 0.6005 0.084 0.132 0.000 0.016 0.768 0.000
#> SRR1700325 2 0.5334 0.1341 0.060 0.504 0.000 0.008 0.420 0.008
#> SRR1700326 3 0.5737 0.5155 0.144 0.000 0.676 0.100 0.028 0.052
#> SRR1700327 5 0.5756 0.4776 0.160 0.184 0.000 0.016 0.624 0.016
#> SRR1700329 5 0.2207 0.6464 0.076 0.016 0.000 0.000 0.900 0.008
#> SRR1700328 3 0.8864 -0.2471 0.136 0.048 0.372 0.088 0.112 0.244
#> SRR1700330 1 0.9080 0.4214 0.296 0.028 0.140 0.128 0.268 0.140
#> SRR1700331 5 0.1588 0.6392 0.072 0.000 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1700332 5 0.2730 0.6442 0.092 0.024 0.000 0.004 0.872 0.008
#> SRR1700333 5 0.7617 0.1801 0.188 0.196 0.000 0.084 0.472 0.060
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.170 0.663 0.764 0.2770 0.916 0.916
#> 3 3 0.197 0.643 0.814 0.8737 0.536 0.500
#> 4 4 0.181 0.510 0.716 0.2139 0.886 0.768
#> 5 5 0.278 0.445 0.686 0.1204 0.875 0.696
#> 6 6 0.311 0.352 0.666 0.0394 0.964 0.887
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.9522 0.682 0.372 0.628
#> SRR1699875 2 0.9393 0.692 0.356 0.644
#> SRR1699876 2 0.9881 0.637 0.436 0.564
#> SRR1699877 2 0.6438 0.708 0.164 0.836
#> SRR1699879 2 0.9000 0.707 0.316 0.684
#> SRR1699878 2 0.1184 0.657 0.016 0.984
#> SRR1699880 2 0.7528 0.718 0.216 0.784
#> SRR1699881 2 0.7950 0.711 0.240 0.760
#> SRR1699882 2 0.6887 0.718 0.184 0.816
#> SRR1699883 2 0.6623 0.715 0.172 0.828
#> SRR1699884 2 0.4690 0.685 0.100 0.900
#> SRR1699885 2 0.2423 0.668 0.040 0.960
#> SRR1699886 2 0.7376 0.713 0.208 0.792
#> SRR1699888 2 0.4939 0.700 0.108 0.892
#> SRR1699889 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1699890 2 0.9460 0.683 0.364 0.636
#> SRR1699887 2 0.0938 0.662 0.012 0.988
#> SRR1699891 2 0.9954 0.621 0.460 0.540
#> SRR1699892 2 0.9044 0.708 0.320 0.680
#> SRR1699893 2 0.8813 0.719 0.300 0.700
#> SRR1699894 2 0.8267 0.721 0.260 0.740
#> SRR1699895 2 0.9170 0.706 0.332 0.668
#> SRR1699896 2 0.5842 0.709 0.140 0.860
#> SRR1699897 2 0.1184 0.660 0.016 0.984
#> SRR1699898 2 0.9608 0.678 0.384 0.616
#> SRR1699900 2 0.5737 0.709 0.136 0.864
#> SRR1699899 2 0.9933 0.625 0.452 0.548
#> SRR1699902 2 0.4298 0.689 0.088 0.912
#> SRR1699901 2 0.6973 0.709 0.188 0.812
#> SRR1699903 2 0.9881 0.638 0.436 0.564
#> SRR1699904 2 0.1633 0.668 0.024 0.976
#> SRR1699905 2 0.9970 0.613 0.468 0.532
#> SRR1699906 2 0.8081 0.722 0.248 0.752
#> SRR1699907 2 0.8661 0.720 0.288 0.712
#> SRR1699908 2 0.4431 0.680 0.092 0.908
#> SRR1699909 2 0.9896 0.643 0.440 0.560
#> SRR1699910 2 0.7299 0.718 0.204 0.796
#> SRR1699911 2 0.9963 0.620 0.464 0.536
#> SRR1699912 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1699913 2 0.7139 0.720 0.196 0.804
#> SRR1699914 2 0.9983 0.610 0.476 0.524
#> SRR1699915 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1699916 2 0.7602 0.723 0.220 0.780
#> SRR1699917 2 0.9922 0.638 0.448 0.552
#> SRR1699918 2 0.7219 0.708 0.200 0.800
#> SRR1699919 2 0.9795 0.646 0.416 0.584
#> SRR1699920 2 0.9909 0.628 0.444 0.556
#> SRR1699921 2 0.9866 0.645 0.432 0.568
#> SRR1699922 2 0.2423 0.667 0.040 0.960
#> SRR1699923 2 0.6887 0.699 0.184 0.816
#> SRR1699924 2 0.7376 0.710 0.208 0.792
#> SRR1699925 1 0.0000 0.795 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.9850 0.653 0.428 0.572
#> SRR1699927 2 0.9460 0.692 0.364 0.636
#> SRR1699929 2 0.9248 0.702 0.340 0.660
#> SRR1699928 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1699930 2 0.8207 0.709 0.256 0.744
#> SRR1699931 2 0.9460 0.694 0.364 0.636
#> SRR1699933 2 0.6343 0.698 0.160 0.840
#> SRR1699932 2 0.8813 0.717 0.300 0.700
#> SRR1699934 1 0.0000 0.795 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.9896 0.630 0.440 0.560
#> SRR1699936 2 0.2423 0.678 0.040 0.960
#> SRR1699937 2 0.1414 0.659 0.020 0.980
#> SRR1699938 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1699940 2 0.9996 0.596 0.488 0.512
#> SRR1699939 2 0.8909 0.712 0.308 0.692
#> SRR1699941 2 0.9944 0.627 0.456 0.544
#> SRR1699942 2 0.8555 0.713 0.280 0.720
#> SRR1699943 2 0.9129 0.701 0.328 0.672
#> SRR1699944 2 0.7219 0.723 0.200 0.800
#> SRR1699945 2 0.9970 0.611 0.468 0.532
#> SRR1699946 2 0.9954 0.621 0.460 0.540
#> SRR1699947 2 0.8813 0.717 0.300 0.700
#> SRR1699948 2 0.0672 0.652 0.008 0.992
#> SRR1699949 2 0.9922 0.625 0.448 0.552
#> SRR1699950 2 0.9944 0.622 0.456 0.544
#> SRR1699951 2 0.8608 0.696 0.284 0.716
#> SRR1699952 2 0.0938 0.657 0.012 0.988
#> SRR1699953 2 0.6623 0.719 0.172 0.828
#> SRR1699954 2 0.9988 0.602 0.480 0.520
#> SRR1699955 2 0.2043 0.669 0.032 0.968
#> SRR1699956 2 0.9988 0.598 0.480 0.520
#> SRR1699957 2 0.1414 0.665 0.020 0.980
#> SRR1699959 2 0.9580 0.676 0.380 0.620
#> SRR1699958 2 0.9491 0.687 0.368 0.632
#> SRR1699960 2 0.9775 0.654 0.412 0.588
#> SRR1699961 2 0.3584 0.678 0.068 0.932
#> SRR1699962 2 0.0938 0.659 0.012 0.988
#> SRR1699963 2 0.7219 0.709 0.200 0.800
#> SRR1699964 2 0.2043 0.674 0.032 0.968
#> SRR1699965 2 0.0376 0.654 0.004 0.996
#> SRR1699966 2 0.9608 0.684 0.384 0.616
#> SRR1699967 2 0.1184 0.658 0.016 0.984
#> SRR1699968 2 0.5059 0.706 0.112 0.888
#> SRR1699969 2 0.9866 0.642 0.432 0.568
#> SRR1699971 2 0.7299 0.719 0.204 0.796
#> SRR1699970 2 0.2423 0.666 0.040 0.960
#> SRR1699972 2 0.8713 0.714 0.292 0.708
#> SRR1699973 2 0.9963 0.613 0.464 0.536
#> SRR1699974 2 0.5737 0.692 0.136 0.864
#> SRR1699975 2 0.7376 0.710 0.208 0.792
#> SRR1699976 2 0.9393 0.698 0.356 0.644
#> SRR1699977 2 0.9815 0.653 0.420 0.580
#> SRR1699978 2 0.9881 0.647 0.436 0.564
#> SRR1699979 2 0.7950 0.708 0.240 0.760
#> SRR1699980 2 0.9970 0.615 0.468 0.532
#> SRR1699981 2 0.9954 0.616 0.460 0.540
#> SRR1699982 2 0.9933 0.628 0.452 0.548
#> SRR1699983 2 0.9661 0.662 0.392 0.608
#> SRR1699984 1 0.1843 0.782 0.972 0.028
#> SRR1699985 2 0.9933 0.622 0.452 0.548
#> SRR1699986 2 0.3431 0.664 0.064 0.936
#> SRR1699988 2 0.6801 0.719 0.180 0.820
#> SRR1699987 2 0.9954 0.618 0.460 0.540
#> SRR1699989 2 0.8499 0.717 0.276 0.724
#> SRR1699990 2 0.7815 0.714 0.232 0.768
#> SRR1699992 2 0.5519 0.700 0.128 0.872
#> SRR1699991 2 0.8813 0.712 0.300 0.700
#> SRR1699993 2 0.9988 0.601 0.480 0.520
#> SRR1699994 2 0.8207 0.718 0.256 0.744
#> SRR1699995 1 0.8661 0.237 0.712 0.288
#> SRR1699996 2 0.1184 0.656 0.016 0.984
#> SRR1699997 2 0.9954 0.618 0.460 0.540
#> SRR1699998 2 0.5294 0.684 0.120 0.880
#> SRR1699999 1 0.9358 -0.101 0.648 0.352
#> SRR1700000 2 0.9963 0.615 0.464 0.536
#> SRR1700002 2 0.4939 0.695 0.108 0.892
#> SRR1700001 2 0.7602 0.710 0.220 0.780
#> SRR1700003 2 0.6801 0.718 0.180 0.820
#> SRR1700004 2 0.9896 0.637 0.440 0.560
#> SRR1700005 1 0.1633 0.786 0.976 0.024
#> SRR1700006 2 0.0938 0.658 0.012 0.988
#> SRR1700007 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1700008 2 0.9775 0.662 0.412 0.588
#> SRR1700009 1 0.0672 0.794 0.992 0.008
#> SRR1700010 2 0.9963 0.611 0.464 0.536
#> SRR1700011 2 0.9393 0.696 0.356 0.644
#> SRR1700013 2 0.2423 0.673 0.040 0.960
#> SRR1700012 2 0.9944 0.622 0.456 0.544
#> SRR1700014 2 0.9850 0.639 0.428 0.572
#> SRR1700015 2 0.9522 0.677 0.372 0.628
#> SRR1700016 1 0.9983 -0.419 0.524 0.476
#> SRR1700018 2 0.1633 0.654 0.024 0.976
#> SRR1700017 2 0.9170 0.706 0.332 0.668
#> SRR1700019 2 0.9954 0.619 0.460 0.540
#> SRR1700020 2 0.9970 0.617 0.468 0.532
#> SRR1700021 2 0.9732 0.658 0.404 0.596
#> SRR1700023 2 0.9922 0.626 0.448 0.552
#> SRR1700022 2 0.9909 0.629 0.444 0.556
#> SRR1700024 2 0.9686 0.675 0.396 0.604
#> SRR1700025 2 0.2603 0.673 0.044 0.956
#> SRR1700026 2 0.6973 0.717 0.188 0.812
#> SRR1700027 2 0.7219 0.715 0.200 0.800
#> SRR1700028 2 0.9710 0.670 0.400 0.600
#> SRR1700029 2 0.9732 0.656 0.404 0.596
#> SRR1700030 2 0.9460 0.691 0.364 0.636
#> SRR1700031 2 0.9922 0.623 0.448 0.552
#> SRR1700032 2 0.8713 0.718 0.292 0.708
#> SRR1700034 1 0.7950 0.540 0.760 0.240
#> SRR1700035 2 0.9850 0.636 0.428 0.572
#> SRR1700033 2 0.9129 0.706 0.328 0.672
#> SRR1700036 2 0.8608 0.721 0.284 0.716
#> SRR1700037 2 0.9933 0.624 0.452 0.548
#> SRR1700038 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700039 2 0.9909 0.643 0.444 0.556
#> SRR1700040 2 0.8555 0.718 0.280 0.720
#> SRR1700041 2 0.8813 0.715 0.300 0.700
#> SRR1700042 2 0.9795 0.651 0.416 0.584
#> SRR1700043 2 0.9044 0.714 0.320 0.680
#> SRR1700045 2 0.0938 0.655 0.012 0.988
#> SRR1700044 2 0.1633 0.665 0.024 0.976
#> SRR1700046 2 0.5842 0.711 0.140 0.860
#> SRR1700047 2 0.9993 0.599 0.484 0.516
#> SRR1700048 2 0.7815 0.718 0.232 0.768
#> SRR1700049 2 1.0000 0.571 0.496 0.504
#> SRR1700050 2 0.9996 0.591 0.488 0.512
#> SRR1700051 2 0.9795 0.665 0.416 0.584
#> SRR1700052 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1700053 2 0.8813 0.700 0.300 0.700
#> SRR1700054 2 0.1633 0.647 0.024 0.976
#> SRR1700055 1 0.0376 0.795 0.996 0.004
#> SRR1700056 2 0.9983 0.607 0.476 0.524
#> SRR1700057 2 0.9988 0.599 0.480 0.520
#> SRR1700058 2 0.4939 0.674 0.108 0.892
#> SRR1700059 2 0.9922 0.630 0.448 0.552
#> SRR1700060 2 0.9977 0.608 0.472 0.528
#> SRR1700061 2 0.2423 0.674 0.040 0.960
#> SRR1700062 2 0.9635 0.671 0.388 0.612
#> SRR1700063 2 0.1843 0.664 0.028 0.972
#> SRR1700064 2 0.9815 0.651 0.420 0.580
#> SRR1700065 2 0.7950 0.695 0.240 0.760
#> SRR1700066 2 0.9522 0.686 0.372 0.628
#> SRR1700067 2 0.8713 0.709 0.292 0.708
#> SRR1700068 2 0.6343 0.716 0.160 0.840
#> SRR1700069 2 0.9635 0.677 0.388 0.612
#> SRR1700070 2 0.5178 0.695 0.116 0.884
#> SRR1700071 2 0.3879 0.685 0.076 0.924
#> SRR1700072 2 0.8555 0.701 0.280 0.720
#> SRR1700073 2 0.9963 0.615 0.464 0.536
#> SRR1700075 2 0.8443 0.719 0.272 0.728
#> SRR1700074 2 0.2043 0.651 0.032 0.968
#> SRR1700076 2 0.0938 0.655 0.012 0.988
#> SRR1700077 2 0.2778 0.672 0.048 0.952
#> SRR1700078 2 0.9977 0.607 0.472 0.528
#> SRR1700080 2 0.9954 0.619 0.460 0.540
#> SRR1700079 2 0.9983 0.602 0.476 0.524
#> SRR1700081 2 0.9170 0.700 0.332 0.668
#> SRR1700082 2 0.7815 0.703 0.232 0.768
#> SRR1700083 2 0.9775 0.663 0.412 0.588
#> SRR1700084 2 0.9933 0.627 0.452 0.548
#> SRR1700085 2 0.8327 0.720 0.264 0.736
#> SRR1700086 2 0.9922 0.631 0.448 0.552
#> SRR1700087 2 0.6973 0.716 0.188 0.812
#> SRR1700088 2 0.7139 0.715 0.196 0.804
#> SRR1700089 2 0.9248 0.692 0.340 0.660
#> SRR1700091 2 0.9661 0.677 0.392 0.608
#> SRR1700090 2 0.8909 0.699 0.308 0.692
#> SRR1700092 2 0.4161 0.691 0.084 0.916
#> SRR1700094 2 0.9044 0.703 0.320 0.680
#> SRR1700093 2 0.8555 0.712 0.280 0.720
#> SRR1700095 2 0.9983 0.603 0.476 0.524
#> SRR1700096 2 0.9866 0.644 0.432 0.568
#> SRR1700097 2 0.8081 0.717 0.248 0.752
#> SRR1700098 2 0.9795 0.648 0.416 0.584
#> SRR1700099 2 0.8555 0.721 0.280 0.720
#> SRR1700100 2 0.6712 0.712 0.176 0.824
#> SRR1700101 2 0.8909 0.716 0.308 0.692
#> SRR1700102 2 0.7056 0.720 0.192 0.808
#> SRR1700104 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1700103 2 0.9922 0.631 0.448 0.552
#> SRR1700105 2 0.8555 0.712 0.280 0.720
#> SRR1700106 2 0.9993 0.595 0.484 0.516
#> SRR1700107 2 0.9427 0.697 0.360 0.640
#> SRR1700108 2 0.9358 0.690 0.352 0.648
#> SRR1700109 2 0.8763 0.721 0.296 0.704
#> SRR1700110 2 0.9710 0.658 0.400 0.600
#> SRR1700112 2 0.3879 0.690 0.076 0.924
#> SRR1700111 2 0.9944 0.621 0.456 0.544
#> SRR1700113 2 0.9129 0.706 0.328 0.672
#> SRR1700114 2 0.7745 0.723 0.228 0.772
#> SRR1700115 2 0.9944 0.619 0.456 0.544
#> SRR1700116 2 0.9775 0.653 0.412 0.588
#> SRR1700117 2 0.5294 0.692 0.120 0.880
#> SRR1700119 2 0.9522 0.689 0.372 0.628
#> SRR1700118 2 0.8443 0.722 0.272 0.728
#> SRR1700120 2 0.9970 0.611 0.468 0.532
#> SRR1700121 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1700122 2 0.9833 0.651 0.424 0.576
#> SRR1700123 2 0.9358 0.696 0.352 0.648
#> SRR1700125 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1700126 2 0.7883 0.714 0.236 0.764
#> SRR1700127 2 0.6531 0.708 0.168 0.832
#> SRR1700124 2 0.9580 0.670 0.380 0.620
#> SRR1700128 2 0.9815 0.652 0.420 0.580
#> SRR1700129 2 0.8861 0.709 0.304 0.696
#> SRR1700130 2 0.9393 0.693 0.356 0.644
#> SRR1700132 2 0.9963 0.615 0.464 0.536
#> SRR1700131 2 0.9993 0.595 0.484 0.516
#> SRR1700133 2 0.9732 0.661 0.404 0.596
#> SRR1700134 2 0.9393 0.701 0.356 0.644
#> SRR1700135 2 0.9661 0.667 0.392 0.608
#> SRR1700136 2 0.9944 0.627 0.456 0.544
#> SRR1700137 2 0.9963 0.614 0.464 0.536
#> SRR1700138 2 0.9754 0.667 0.408 0.592
#> SRR1700140 2 0.9866 0.644 0.432 0.568
#> SRR1700139 2 0.7883 0.723 0.236 0.764
#> SRR1700141 2 0.9732 0.658 0.404 0.596
#> SRR1700142 2 0.9909 0.628 0.444 0.556
#> SRR1700143 2 0.9922 0.622 0.448 0.552
#> SRR1700144 2 0.4022 0.691 0.080 0.920
#> SRR1700145 2 0.9993 0.595 0.484 0.516
#> SRR1700146 2 0.9635 0.683 0.388 0.612
#> SRR1700147 2 0.9129 0.714 0.328 0.672
#> SRR1700149 2 0.6247 0.704 0.156 0.844
#> SRR1700148 2 0.9248 0.693 0.340 0.660
#> SRR1700150 2 0.6973 0.709 0.188 0.812
#> SRR1700152 2 0.9833 0.648 0.424 0.576
#> SRR1700151 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1700153 2 0.9909 0.640 0.444 0.556
#> SRR1700154 2 0.6973 0.717 0.188 0.812
#> SRR1700155 2 0.1843 0.666 0.028 0.972
#> SRR1700156 2 0.9977 0.609 0.472 0.528
#> SRR1700158 2 0.9358 0.689 0.352 0.648
#> SRR1700159 2 0.3584 0.686 0.068 0.932
#> SRR1700157 2 0.9209 0.704 0.336 0.664
#> SRR1700160 2 0.9775 0.653 0.412 0.588
#> SRR1700161 2 0.9427 0.690 0.360 0.640
#> SRR1700162 2 0.9850 0.646 0.428 0.572
#> SRR1700164 2 0.9983 0.603 0.476 0.524
#> SRR1700163 2 0.4298 0.673 0.088 0.912
#> SRR1700165 2 0.4939 0.696 0.108 0.892
#> SRR1700166 2 0.9427 0.681 0.360 0.640
#> SRR1700168 2 0.9044 0.703 0.320 0.680
#> SRR1700167 2 0.9993 0.595 0.484 0.516
#> SRR1700170 2 0.1184 0.652 0.016 0.984
#> SRR1700169 2 0.0672 0.658 0.008 0.992
#> SRR1700171 2 0.9998 0.590 0.492 0.508
#> SRR1700172 2 0.9775 0.656 0.412 0.588
#> SRR1700174 2 0.5294 0.705 0.120 0.880
#> SRR1700173 2 0.9988 0.599 0.480 0.520
#> SRR1700175 2 0.1843 0.669 0.028 0.972
#> SRR1700176 2 0.9775 0.645 0.412 0.588
#> SRR1700178 2 0.0672 0.659 0.008 0.992
#> SRR1700177 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1700180 2 0.0672 0.656 0.008 0.992
#> SRR1700179 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700181 2 0.2948 0.675 0.052 0.948
#> SRR1700183 1 0.1184 0.790 0.984 0.016
#> SRR1700182 2 0.0376 0.656 0.004 0.996
#> SRR1700184 2 0.0672 0.652 0.008 0.992
#> SRR1700186 2 0.0672 0.650 0.008 0.992
#> SRR1700187 1 0.8267 0.355 0.740 0.260
#> SRR1700185 1 0.1633 0.787 0.976 0.024
#> SRR1700188 2 0.3431 0.683 0.064 0.936
#> SRR1700192 2 0.2236 0.648 0.036 0.964
#> SRR1700190 2 0.8608 0.713 0.284 0.716
#> SRR1700191 1 0.0000 0.795 1.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.3274 0.661 0.060 0.940
#> SRR1700193 2 0.2948 0.681 0.052 0.948
#> SRR1700195 2 0.1414 0.662 0.020 0.980
#> SRR1700194 1 0.6148 0.670 0.848 0.152
#> SRR1700196 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700197 2 0.9866 0.550 0.432 0.568
#> SRR1700198 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700199 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700200 2 0.2778 0.670 0.048 0.952
#> SRR1700201 2 0.0376 0.654 0.004 0.996
#> SRR1700202 2 0.2948 0.673 0.052 0.948
#> SRR1700203 2 0.0000 0.652 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700206 2 0.8327 0.718 0.264 0.736
#> SRR1700207 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700208 2 0.4431 0.678 0.092 0.908
#> SRR1700205 2 0.5842 0.704 0.140 0.860
#> SRR1700209 2 0.0672 0.653 0.008 0.992
#> SRR1700210 2 0.2603 0.668 0.044 0.956
#> SRR1700211 2 0.0938 0.650 0.012 0.988
#> SRR1700212 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700213 2 0.0672 0.653 0.008 0.992
#> SRR1700214 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700215 1 0.3879 0.737 0.924 0.076
#> SRR1700217 2 0.0376 0.655 0.004 0.996
#> SRR1700216 1 0.0000 0.795 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0376 0.655 0.004 0.996
#> SRR1700219 2 0.0000 0.652 0.000 1.000
#> SRR1700222 2 0.8955 0.581 0.312 0.688
#> SRR1700220 2 0.1633 0.660 0.024 0.976
#> SRR1700221 2 0.1184 0.660 0.016 0.984
#> SRR1700223 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700224 2 0.0672 0.652 0.008 0.992
#> SRR1700226 2 0.0376 0.655 0.004 0.996
#> SRR1700229 2 0.3431 0.676 0.064 0.936
#> SRR1700225 2 0.3431 0.683 0.064 0.936
#> SRR1700227 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700230 2 0.3584 0.664 0.068 0.932
#> SRR1700231 2 0.4022 0.687 0.080 0.920
#> SRR1700228 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700232 2 0.2423 0.668 0.040 0.960
#> SRR1700233 2 0.5629 0.691 0.132 0.868
#> SRR1700234 2 0.2948 0.677 0.052 0.948
#> SRR1700235 2 0.1414 0.659 0.020 0.980
#> SRR1700237 2 0.1633 0.664 0.024 0.976
#> SRR1700236 2 0.2043 0.666 0.032 0.968
#> SRR1700238 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700239 2 0.3879 0.623 0.076 0.924
#> SRR1700240 1 0.0938 0.795 0.988 0.012
#> SRR1700241 2 0.2423 0.662 0.040 0.960
#> SRR1700243 2 0.0000 0.652 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.3733 0.690 0.072 0.928
#> SRR1700242 2 0.2778 0.659 0.048 0.952
#> SRR1700246 2 0.3584 0.659 0.068 0.932
#> SRR1700245 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700247 1 0.9775 -0.351 0.588 0.412
#> SRR1700249 1 0.0000 0.795 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0376 0.655 0.004 0.996
#> SRR1700248 2 0.0672 0.656 0.008 0.992
#> SRR1700251 2 0.3431 0.673 0.064 0.936
#> SRR1700252 2 0.8763 0.712 0.296 0.704
#> SRR1700253 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700256 2 0.0376 0.651 0.004 0.996
#> SRR1700254 2 0.9993 0.225 0.484 0.516
#> SRR1700255 2 0.2778 0.672 0.048 0.952
#> SRR1700257 2 0.0938 0.658 0.012 0.988
#> SRR1700258 2 0.4815 0.702 0.104 0.896
#> SRR1700259 2 0.8327 0.722 0.264 0.736
#> SRR1700260 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1700261 2 0.4690 0.699 0.100 0.900
#> SRR1700262 2 0.9954 0.616 0.460 0.540
#> SRR1700263 2 0.3879 0.676 0.076 0.924
#> SRR1700264 2 0.1414 0.662 0.020 0.980
#> SRR1700265 2 0.9358 0.698 0.352 0.648
#> SRR1700266 2 0.9323 0.701 0.348 0.652
#> SRR1700268 2 0.9209 0.704 0.336 0.664
#> SRR1700270 2 0.1843 0.667 0.028 0.972
#> SRR1700267 2 0.2603 0.670 0.044 0.956
#> SRR1700271 2 0.7602 0.714 0.220 0.780
#> SRR1700272 2 0.9909 0.633 0.444 0.556
#> SRR1700273 2 0.0672 0.656 0.008 0.992
#> SRR1700274 2 0.9732 0.669 0.404 0.596
#> SRR1700277 2 0.2948 0.657 0.052 0.948
#> SRR1700275 2 0.9087 0.714 0.324 0.676
#> SRR1700276 2 0.7950 0.718 0.240 0.760
#> SRR1700278 2 0.4815 0.688 0.104 0.896
#> SRR1700279 2 0.9833 0.646 0.424 0.576
#> SRR1700280 2 0.8144 0.725 0.252 0.748
#> SRR1700281 2 0.8861 0.708 0.304 0.696
#> SRR1700283 2 0.6438 0.699 0.164 0.836
#> SRR1700282 2 0.7815 0.718 0.232 0.768
#> SRR1700284 2 0.9170 0.704 0.332 0.668
#> SRR1700285 2 0.8608 0.713 0.284 0.716
#> SRR1700286 2 0.8608 0.713 0.284 0.716
#> SRR1700287 2 0.9963 0.612 0.464 0.536
#> SRR1700290 2 0.9996 0.594 0.488 0.512
#> SRR1700289 2 0.9922 0.628 0.448 0.552
#> SRR1700288 2 0.1633 0.670 0.024 0.976
#> SRR1700292 2 0.9460 0.692 0.364 0.636
#> SRR1700291 2 0.9686 0.658 0.396 0.604
#> SRR1700293 2 0.0672 0.653 0.008 0.992
#> SRR1700294 2 0.5629 0.706 0.132 0.868
#> SRR1700295 2 0.4431 0.676 0.092 0.908
#> SRR1700297 2 0.7745 0.726 0.228 0.772
#> SRR1700296 2 0.9815 0.650 0.420 0.580
#> SRR1700298 2 0.2603 0.663 0.044 0.956
#> SRR1700299 2 0.8608 0.715 0.284 0.716
#> SRR1700300 2 0.8909 0.714 0.308 0.692
#> SRR1700302 2 0.9710 0.675 0.400 0.600
#> SRR1700301 2 0.8555 0.714 0.280 0.720
#> SRR1700303 2 0.6623 0.710 0.172 0.828
#> SRR1700304 2 0.4939 0.698 0.108 0.892
#> SRR1700305 2 0.2423 0.672 0.040 0.960
#> SRR1700306 2 0.9922 0.632 0.448 0.552
#> SRR1700308 2 0.8608 0.711 0.284 0.716
#> SRR1700307 2 0.9775 0.663 0.412 0.588
#> SRR1700309 2 0.9686 0.661 0.396 0.604
#> SRR1700310 2 0.4298 0.687 0.088 0.912
#> SRR1700311 2 0.9833 0.644 0.424 0.576
#> SRR1700312 2 0.8267 0.717 0.260 0.740
#> SRR1700313 2 0.7602 0.709 0.220 0.780
#> SRR1700314 2 0.9732 0.658 0.404 0.596
#> SRR1700315 2 0.9909 0.639 0.444 0.556
#> SRR1700316 2 0.6712 0.721 0.176 0.824
#> SRR1700317 2 0.7883 0.724 0.236 0.764
#> SRR1700318 2 0.9850 0.654 0.428 0.572
#> SRR1700319 2 0.9460 0.679 0.364 0.636
#> SRR1700320 2 0.9608 0.670 0.384 0.616
#> SRR1700322 2 0.1633 0.659 0.024 0.976
#> SRR1700321 2 0.1633 0.664 0.024 0.976
#> SRR1700323 2 0.9970 0.610 0.468 0.532
#> SRR1700324 2 0.7376 0.723 0.208 0.792
#> SRR1700325 2 0.9087 0.703 0.324 0.676
#> SRR1700326 2 0.9286 0.693 0.344 0.656
#> SRR1700327 2 0.2423 0.670 0.040 0.960
#> SRR1700329 2 0.9661 0.677 0.392 0.608
#> SRR1700328 2 0.9944 0.622 0.456 0.544
#> SRR1700330 2 0.9996 0.591 0.488 0.512
#> SRR1700331 2 0.8661 0.720 0.288 0.712
#> SRR1700332 2 0.9944 0.623 0.456 0.544
#> SRR1700333 2 0.0376 0.655 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 3 0.4121 0.73920 0.000 0.168 0.832
#> SRR1699875 3 0.4555 0.70216 0.000 0.200 0.800
#> SRR1699876 3 0.2066 0.77013 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699877 2 0.6295 0.20224 0.000 0.528 0.472
#> SRR1699879 3 0.5810 0.57553 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699878 2 0.1860 0.78139 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699880 2 0.5968 0.37570 0.000 0.636 0.364
#> SRR1699881 2 0.6140 0.24124 0.000 0.596 0.404
#> SRR1699882 2 0.6140 0.35641 0.000 0.596 0.404
#> SRR1699883 2 0.5785 0.49426 0.000 0.668 0.332
#> SRR1699884 2 0.5678 0.56659 0.000 0.684 0.316
#> SRR1699885 2 0.2959 0.76807 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699886 3 0.6302 0.03045 0.000 0.480 0.520
#> SRR1699888 2 0.5254 0.63186 0.000 0.736 0.264
#> SRR1699889 3 0.0592 0.76545 0.000 0.012 0.988
#> SRR1699890 3 0.5760 0.57077 0.000 0.328 0.672
#> SRR1699887 2 0.1289 0.77942 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699891 3 0.0592 0.76478 0.000 0.012 0.988
#> SRR1699892 3 0.6008 0.50937 0.000 0.372 0.628
#> SRR1699893 3 0.5591 0.57689 0.000 0.304 0.696
#> SRR1699894 3 0.6280 0.17761 0.000 0.460 0.540
#> SRR1699895 3 0.5835 0.56095 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699896 2 0.5138 0.63135 0.000 0.748 0.252
#> SRR1699897 2 0.1031 0.77716 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699898 3 0.5254 0.69360 0.000 0.264 0.736
#> SRR1699900 2 0.5948 0.51880 0.000 0.640 0.360
#> SRR1699899 3 0.2261 0.77781 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699902 2 0.4452 0.73989 0.000 0.808 0.192
#> SRR1699901 2 0.6260 0.30823 0.000 0.552 0.448
#> SRR1699903 3 0.2165 0.77489 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699904 2 0.2878 0.77749 0.000 0.904 0.096
#> SRR1699905 3 0.1289 0.77010 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699906 3 0.6267 0.33162 0.000 0.452 0.548
#> SRR1699907 3 0.5988 0.47351 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699908 2 0.5216 0.65150 0.000 0.740 0.260
#> SRR1699909 3 0.2165 0.77869 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699910 2 0.6192 0.32977 0.000 0.580 0.420
#> SRR1699911 3 0.2165 0.77664 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699912 3 0.0424 0.76308 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699913 2 0.6235 0.18026 0.000 0.564 0.436
#> SRR1699914 3 0.1163 0.77135 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699915 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699916 3 0.6307 0.07098 0.000 0.488 0.512
#> SRR1699917 3 0.3116 0.77819 0.000 0.108 0.892
#> SRR1699918 2 0.5678 0.47338 0.000 0.684 0.316
#> SRR1699919 3 0.3879 0.75303 0.000 0.152 0.848
#> SRR1699920 3 0.2711 0.76130 0.000 0.088 0.912
#> SRR1699921 3 0.4346 0.73394 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699922 2 0.3340 0.76641 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699923 2 0.6307 0.11834 0.000 0.512 0.488
#> SRR1699924 3 0.6215 0.25709 0.000 0.428 0.572
#> SRR1699925 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.3116 0.77396 0.000 0.108 0.892
#> SRR1699927 3 0.5098 0.70504 0.000 0.248 0.752
#> SRR1699929 3 0.5882 0.55403 0.000 0.348 0.652
#> SRR1699928 3 0.1031 0.76765 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699930 2 0.6244 0.05950 0.000 0.560 0.440
#> SRR1699931 3 0.3752 0.74993 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699933 2 0.6192 0.35992 0.000 0.580 0.420
#> SRR1699932 3 0.6111 0.41360 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699934 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.2165 0.76257 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699936 2 0.2165 0.77705 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699937 2 0.1411 0.77973 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699938 2 0.0892 0.77569 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699940 3 0.0747 0.76716 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699939 3 0.6260 0.29361 0.000 0.448 0.552
#> SRR1699941 3 0.2625 0.78002 0.000 0.084 0.916
#> SRR1699942 3 0.5591 0.62239 0.000 0.304 0.696
#> SRR1699943 3 0.5431 0.66836 0.000 0.284 0.716
#> SRR1699944 2 0.6126 0.33518 0.000 0.600 0.400
#> SRR1699945 3 0.0424 0.76265 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699946 3 0.1411 0.77403 0.000 0.036 0.964
#> SRR1699947 3 0.6062 0.49042 0.000 0.384 0.616
#> SRR1699948 2 0.0237 0.76896 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699949 3 0.1411 0.76678 0.000 0.036 0.964
#> SRR1699950 3 0.0892 0.76765 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699951 3 0.5327 0.54715 0.000 0.272 0.728
#> SRR1699952 2 0.1753 0.78023 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699953 2 0.6095 0.39381 0.000 0.608 0.392
#> SRR1699954 3 0.0747 0.76785 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699955 2 0.3752 0.76931 0.000 0.856 0.144
#> SRR1699956 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699957 2 0.2959 0.77856 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699959 3 0.5327 0.65258 0.000 0.272 0.728
#> SRR1699958 3 0.3551 0.75662 0.000 0.132 0.868
#> SRR1699960 3 0.4399 0.74844 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699961 2 0.3482 0.77184 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699962 2 0.1643 0.77917 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699963 2 0.5882 0.45431 0.000 0.652 0.348
#> SRR1699964 2 0.3116 0.77453 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699965 2 0.0592 0.77107 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699966 3 0.3267 0.76335 0.000 0.116 0.884
#> SRR1699967 2 0.1643 0.77898 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699968 2 0.5431 0.62389 0.000 0.716 0.284
#> SRR1699969 3 0.2959 0.77527 0.000 0.100 0.900
#> SRR1699971 2 0.6260 0.08333 0.000 0.552 0.448
#> SRR1699970 2 0.2448 0.76689 0.000 0.924 0.076
#> SRR1699972 3 0.6252 0.25596 0.000 0.444 0.556
#> SRR1699973 3 0.1289 0.77090 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699974 2 0.5397 0.65804 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699975 2 0.6307 0.14964 0.000 0.512 0.488
#> SRR1699976 3 0.5465 0.66028 0.000 0.288 0.712
#> SRR1699977 3 0.4235 0.75707 0.000 0.176 0.824
#> SRR1699978 3 0.1529 0.76972 0.000 0.040 0.960
#> SRR1699979 3 0.6267 0.13799 0.000 0.452 0.548
#> SRR1699980 3 0.1860 0.77596 0.000 0.052 0.948
#> SRR1699981 3 0.0424 0.76255 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699982 3 0.1031 0.77033 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699983 3 0.4974 0.69090 0.000 0.236 0.764
#> SRR1699984 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.1163 0.76977 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699986 2 0.4291 0.74462 0.000 0.820 0.180
#> SRR1699988 2 0.6168 0.38133 0.000 0.588 0.412
#> SRR1699987 3 0.0747 0.76698 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699989 3 0.6260 0.26937 0.000 0.448 0.552
#> SRR1699990 3 0.5988 0.37872 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699992 2 0.4654 0.70424 0.000 0.792 0.208
#> SRR1699991 3 0.6079 0.51628 0.000 0.388 0.612
#> SRR1699993 3 0.0424 0.76310 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699994 2 0.6295 0.00509 0.000 0.528 0.472
#> SRR1699995 3 0.5156 0.66040 0.216 0.008 0.776
#> SRR1699996 2 0.0892 0.77395 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699997 3 0.0424 0.76319 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699998 2 0.5291 0.64287 0.000 0.732 0.268
#> SRR1699999 3 0.2400 0.75795 0.064 0.004 0.932
#> SRR1700000 3 0.2165 0.77400 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700002 2 0.4887 0.70173 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700001 3 0.6260 0.18824 0.000 0.448 0.552
#> SRR1700003 2 0.6280 0.23795 0.000 0.540 0.460
#> SRR1700004 3 0.2878 0.76761 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700005 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.1529 0.77798 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700007 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700008 3 0.3267 0.77392 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700009 1 0.2448 0.88231 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700010 3 0.1529 0.77232 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700011 3 0.5216 0.67156 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700013 2 0.3412 0.77263 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700012 3 0.1529 0.77511 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700014 3 0.3267 0.74854 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700015 3 0.5216 0.69500 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700016 3 0.7345 0.65507 0.192 0.108 0.700
#> SRR1700018 2 0.0892 0.77456 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700017 3 0.5431 0.60792 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700019 3 0.2066 0.77751 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700020 3 0.2356 0.77878 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700021 3 0.5216 0.67804 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700023 3 0.1163 0.76622 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700022 3 0.2448 0.76868 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700024 3 0.4555 0.74088 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700025 2 0.3551 0.75444 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700026 2 0.5733 0.51787 0.000 0.676 0.324
#> SRR1700027 2 0.6291 0.07440 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700028 3 0.2625 0.76775 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700029 3 0.4842 0.72433 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700030 3 0.5178 0.67797 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700031 3 0.3038 0.75385 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700032 3 0.6140 0.30491 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700034 1 0.7481 0.28401 0.596 0.048 0.356
#> SRR1700035 3 0.2878 0.76561 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700033 3 0.6062 0.40525 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700036 3 0.6286 0.27865 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700037 3 0.1031 0.77035 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700038 2 0.0424 0.77103 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700039 3 0.2878 0.77733 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700040 3 0.5733 0.56860 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700041 3 0.6079 0.48851 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700042 3 0.4002 0.75488 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700043 3 0.5431 0.63601 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700045 2 0.1163 0.77719 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700044 2 0.2448 0.78208 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700046 2 0.5397 0.59082 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700047 3 0.0747 0.76622 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700048 2 0.6260 0.15799 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700049 3 0.1753 0.77454 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700050 3 0.0424 0.76412 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700051 3 0.4002 0.74694 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700052 2 0.6291 0.10476 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700053 3 0.5058 0.63614 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700054 2 0.1289 0.77722 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700055 1 0.0424 0.93626 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700056 3 0.1529 0.77153 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700057 3 0.0592 0.76373 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700058 2 0.4974 0.68023 0.000 0.764 0.236
#> SRR1700059 3 0.1031 0.76786 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700060 3 0.1411 0.77163 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700061 2 0.3267 0.77172 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700062 3 0.4702 0.72084 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700063 2 0.2261 0.78259 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700064 3 0.4002 0.76287 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700065 3 0.6062 0.34254 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700066 3 0.5327 0.66399 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700067 3 0.5465 0.63152 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700068 2 0.6026 0.40821 0.000 0.624 0.376
#> SRR1700069 3 0.4178 0.75116 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700070 2 0.5591 0.62402 0.000 0.696 0.304
#> SRR1700071 2 0.4121 0.74044 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700072 3 0.5948 0.48109 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700073 3 0.0592 0.76545 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700075 3 0.6305 0.04831 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700074 2 0.1163 0.77831 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700076 2 0.0424 0.76892 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700077 2 0.2711 0.77524 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700078 3 0.0000 0.75965 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700080 3 0.2537 0.77922 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700079 3 0.0000 0.75965 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700081 3 0.5678 0.57451 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700082 3 0.6267 0.21104 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700083 3 0.4796 0.72390 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700084 3 0.3192 0.77558 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700085 3 0.6168 0.34354 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700086 3 0.2165 0.76898 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700087 2 0.6215 0.20739 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700088 2 0.6244 0.29291 0.000 0.560 0.440
#> SRR1700089 3 0.6062 0.48381 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700091 3 0.3482 0.77185 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700090 3 0.6286 0.30318 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700092 2 0.4796 0.69986 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700094 3 0.6062 0.48751 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700093 2 0.6307 -0.13796 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700095 3 0.0000 0.75965 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700096 3 0.3412 0.76318 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700097 2 0.6244 0.18389 0.000 0.560 0.440
#> SRR1700098 3 0.3752 0.74558 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700099 3 0.6235 0.37853 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700100 2 0.5560 0.53545 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700101 3 0.6008 0.48035 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700102 2 0.6180 0.33308 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700104 3 0.0424 0.76455 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700103 3 0.2448 0.77840 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700105 3 0.6267 0.24700 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700106 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700107 3 0.5254 0.64728 0.000 0.264 0.736
#> SRR1700108 3 0.5650 0.60948 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700109 3 0.5988 0.45824 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700110 3 0.4235 0.75010 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700112 2 0.4452 0.73266 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700111 3 0.1031 0.76943 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700113 3 0.5650 0.58373 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700114 3 0.6308 0.18710 0.000 0.492 0.508
#> SRR1700115 3 0.0747 0.76484 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700116 3 0.4654 0.71500 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700117 2 0.5397 0.64661 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700119 3 0.5465 0.65749 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700118 3 0.5988 0.51074 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700120 3 0.1163 0.76899 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700121 3 0.0000 0.75965 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700122 3 0.3192 0.77530 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700123 3 0.4399 0.74028 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700125 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700126 2 0.6204 0.20915 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700127 2 0.6154 0.30865 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700124 3 0.4178 0.75070 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700128 3 0.4062 0.75793 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700129 3 0.6225 0.33388 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700130 3 0.5591 0.63994 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700132 3 0.2796 0.77143 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700131 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700133 3 0.3686 0.77266 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700134 3 0.4399 0.73190 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700135 3 0.4291 0.74776 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700136 3 0.0892 0.76794 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700137 3 0.0747 0.76541 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700138 3 0.3340 0.76163 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700140 3 0.3816 0.75841 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700139 2 0.6274 0.17430 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700141 3 0.4291 0.75291 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700142 3 0.2796 0.77068 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700143 3 0.2165 0.76249 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700144 2 0.3816 0.76146 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700145 3 0.0592 0.76678 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700146 3 0.3619 0.75843 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700147 3 0.5859 0.52746 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700149 2 0.5560 0.57317 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700148 3 0.6095 0.44489 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700150 2 0.6286 0.14818 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700152 3 0.4178 0.74617 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700151 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700153 3 0.1753 0.77188 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700154 2 0.5882 0.48926 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700155 2 0.2878 0.77754 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700156 3 0.1860 0.77133 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700158 3 0.5905 0.51540 0.000 0.352 0.648
#> SRR1700159 2 0.3879 0.75244 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700157 3 0.5178 0.65698 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700160 3 0.3551 0.76037 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700161 3 0.5465 0.63843 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700162 3 0.2711 0.77712 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700164 3 0.0424 0.76450 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700163 2 0.4235 0.74241 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700165 2 0.5560 0.62631 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700166 3 0.5988 0.48649 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700168 3 0.6192 0.34296 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700167 3 0.0592 0.76558 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700170 2 0.1163 0.77691 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700169 2 0.0592 0.77299 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700171 3 0.0424 0.76371 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700172 3 0.3551 0.76935 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700174 2 0.5497 0.62504 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700173 3 0.0000 0.75965 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.3879 0.76205 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700176 3 0.5058 0.68382 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700178 2 0.1289 0.77846 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700177 3 0.0592 0.76518 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700180 2 0.0747 0.77189 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700179 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.3619 0.76403 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700183 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0424 0.77125 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700184 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1031 0.77695 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700187 3 0.6126 0.39170 0.400 0.000 0.600
#> SRR1700185 1 0.4121 0.76535 0.832 0.000 0.168
#> SRR1700188 2 0.5397 0.63644 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700192 2 0.1964 0.77917 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700190 2 0.6302 0.02646 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700191 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.2625 0.78042 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700193 2 0.3340 0.76993 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700195 2 0.2066 0.77733 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700194 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.7493 0.64076 0.092 0.232 0.676
#> SRR1700198 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0424 0.77086 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700200 2 0.3482 0.76609 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700201 2 0.0424 0.77015 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700202 2 0.3686 0.76029 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700203 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.6280 0.02107 0.000 0.540 0.460
#> SRR1700207 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.4002 0.75076 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700205 2 0.5948 0.53103 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700209 2 0.0592 0.77231 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700210 2 0.3340 0.76255 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700211 2 0.0237 0.76875 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700212 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0237 0.76852 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700214 2 0.0237 0.76911 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700215 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.1411 0.77730 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700216 1 0.0000 0.93947 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0747 0.77375 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700219 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 2 0.9289 0.15802 0.160 0.444 0.396
#> SRR1700220 2 0.2261 0.77149 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700221 2 0.1643 0.77905 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700223 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0424 0.77096 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700226 2 0.0747 0.77457 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700229 2 0.4235 0.73141 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700225 2 0.4654 0.71286 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700227 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 2 0.3752 0.75993 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700231 2 0.5098 0.68398 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700228 2 0.0237 0.76911 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700232 2 0.3752 0.75707 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700233 2 0.5882 0.53445 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700234 2 0.4178 0.75285 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700235 2 0.2625 0.77615 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700237 2 0.2356 0.78011 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700236 2 0.2711 0.77309 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700238 2 0.0237 0.76857 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 2 0.4056 0.77471 0.032 0.876 0.092
#> SRR1700240 1 0.1031 0.92792 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700241 2 0.2796 0.77221 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700243 2 0.1163 0.77827 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700244 2 0.4842 0.69905 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700242 2 0.2165 0.77761 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700246 2 0.3038 0.76697 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700245 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.3989 0.73006 0.124 0.012 0.864
#> SRR1700249 1 0.1031 0.92777 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700250 2 0.0424 0.77048 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700248 2 0.1163 0.77262 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700251 2 0.4178 0.72372 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700252 3 0.5431 0.64468 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700253 2 0.0592 0.77335 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700256 2 0.0000 0.76688 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 3 0.9131 0.43095 0.312 0.168 0.520
#> SRR1700255 2 0.3619 0.75894 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700257 2 0.1163 0.77398 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700258 2 0.5363 0.61111 0.000 0.724 0.276
#> SRR1700259 3 0.6062 0.45218 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700260 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700261 2 0.4887 0.69433 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700262 3 0.0747 0.76541 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700263 2 0.4178 0.71307 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700264 2 0.2356 0.78134 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700265 3 0.5785 0.59173 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700266 3 0.5706 0.60078 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700268 3 0.5431 0.62148 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700270 2 0.2625 0.77560 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700267 2 0.3551 0.76331 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700271 3 0.6299 0.14172 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700272 3 0.3941 0.75905 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700273 2 0.1529 0.77680 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700274 3 0.4178 0.74920 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700277 2 0.2537 0.77470 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700275 3 0.5621 0.60347 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700276 2 0.6154 0.26758 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700278 2 0.5431 0.66050 0.000 0.716 0.284
#> SRR1700279 3 0.3038 0.77490 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700280 3 0.6192 0.35913 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700281 3 0.6295 0.26000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700283 2 0.6286 0.28340 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700282 2 0.6305 0.04143 0.000 0.516 0.484
#> SRR1700284 3 0.5760 0.58035 0.000 0.328 0.672
#> SRR1700285 3 0.6286 0.18864 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700286 3 0.6062 0.42717 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700287 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700290 3 0.0892 0.76842 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700289 3 0.1289 0.77191 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700288 2 0.2066 0.77801 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700292 3 0.5397 0.62906 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700291 3 0.4002 0.74655 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700293 2 0.0592 0.77113 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700294 2 0.5882 0.52020 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700295 2 0.5016 0.70077 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700297 2 0.6225 0.15345 0.000 0.568 0.432
#> SRR1700296 3 0.4555 0.73514 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700298 2 0.2448 0.78158 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700299 3 0.5650 0.62666 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700300 3 0.6062 0.46334 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700302 3 0.3619 0.74986 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700301 3 0.6252 0.23697 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700303 2 0.6225 0.34908 0.000 0.568 0.432
#> SRR1700304 2 0.4842 0.70084 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700305 2 0.2878 0.78088 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700306 3 0.3752 0.75912 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700308 3 0.6302 0.17137 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700307 3 0.4235 0.75788 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700309 3 0.4555 0.73535 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700310 2 0.4605 0.73234 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700311 3 0.2796 0.77125 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700312 3 0.6307 0.15044 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700313 3 0.6045 0.37195 0.000 0.380 0.620
#> SRR1700314 3 0.3752 0.77230 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700315 3 0.1964 0.77713 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700316 2 0.6180 0.30024 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700317 3 0.6235 0.27741 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700318 3 0.3116 0.77267 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700319 3 0.5591 0.62824 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700320 3 0.4842 0.69949 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700322 2 0.1529 0.78063 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700321 2 0.3116 0.77452 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700323 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700324 2 0.6267 0.27287 0.000 0.548 0.452
#> SRR1700325 3 0.6095 0.47734 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700326 3 0.6154 0.45358 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700327 2 0.3752 0.75641 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700329 3 0.4346 0.74426 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700328 3 0.2448 0.77530 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700330 3 0.0237 0.76097 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700331 3 0.6026 0.39582 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700332 3 0.0747 0.76694 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700333 2 0.1031 0.77508 0.000 0.976 0.024
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 3 0.4804 0.641149 0.000 0.148 0.780 0.072
#> SRR1699875 3 0.4713 0.612474 0.000 0.172 0.776 0.052
#> SRR1699876 3 0.2675 0.671648 0.000 0.048 0.908 0.044
#> SRR1699877 2 0.7026 0.227787 0.000 0.476 0.404 0.120
#> SRR1699879 3 0.5614 0.523155 0.000 0.336 0.628 0.036
#> SRR1699878 2 0.4508 0.643801 0.000 0.780 0.036 0.184
#> SRR1699880 2 0.7011 0.307033 0.000 0.552 0.300 0.148
#> SRR1699881 2 0.7884 0.077522 0.000 0.384 0.304 0.312
#> SRR1699882 2 0.6941 0.272863 0.000 0.520 0.360 0.120
#> SRR1699883 2 0.7099 0.410928 0.000 0.552 0.280 0.168
#> SRR1699884 2 0.7331 0.422974 0.000 0.528 0.260 0.212
#> SRR1699885 2 0.3333 0.668051 0.000 0.872 0.088 0.040
#> SRR1699886 3 0.6445 0.061535 0.000 0.444 0.488 0.068
#> SRR1699888 2 0.7044 0.347474 0.000 0.452 0.120 0.428
#> SRR1699889 3 0.0336 0.660538 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699890 3 0.4781 0.543920 0.000 0.336 0.660 0.004
#> SRR1699887 2 0.4387 0.640255 0.000 0.776 0.024 0.200
#> SRR1699891 3 0.0524 0.661394 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699892 3 0.6883 0.506178 0.000 0.260 0.584 0.156
#> SRR1699893 3 0.5062 0.545809 0.000 0.284 0.692 0.024
#> SRR1699894 3 0.5780 0.181302 0.000 0.476 0.496 0.028
#> SRR1699895 3 0.6828 0.472828 0.000 0.264 0.588 0.148
#> SRR1699896 2 0.6689 0.492544 0.000 0.620 0.184 0.196
#> SRR1699897 2 0.4284 0.638791 0.000 0.764 0.012 0.224
#> SRR1699898 3 0.7138 0.405879 0.000 0.164 0.540 0.296
#> SRR1699900 2 0.5903 0.462913 0.000 0.616 0.332 0.052
#> SRR1699899 3 0.3850 0.679865 0.000 0.044 0.840 0.116
#> SRR1699902 2 0.5556 0.539616 0.000 0.720 0.092 0.188
#> SRR1699901 4 0.7317 0.439937 0.000 0.268 0.204 0.528
#> SRR1699903 3 0.1792 0.682328 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699904 2 0.3959 0.667663 0.000 0.840 0.092 0.068
#> SRR1699905 3 0.3224 0.665901 0.000 0.016 0.864 0.120
#> SRR1699906 3 0.7349 0.271353 0.000 0.364 0.472 0.164
#> SRR1699907 3 0.6014 0.411658 0.000 0.360 0.588 0.052
#> SRR1699908 2 0.4103 0.560586 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1699909 3 0.2300 0.687638 0.000 0.064 0.920 0.016
#> SRR1699910 2 0.6147 0.235919 0.000 0.564 0.380 0.056
#> SRR1699911 3 0.3128 0.678906 0.000 0.040 0.884 0.076
#> SRR1699912 3 0.0376 0.659560 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699913 2 0.7037 0.040463 0.000 0.464 0.416 0.120
#> SRR1699914 3 0.3325 0.651641 0.000 0.024 0.864 0.112
#> SRR1699915 3 0.0336 0.657529 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699916 3 0.7253 0.000887 0.000 0.428 0.428 0.144
#> SRR1699917 3 0.4155 0.688432 0.000 0.072 0.828 0.100
#> SRR1699918 2 0.7746 0.252206 0.000 0.440 0.272 0.288
#> SRR1699919 3 0.5820 0.574275 0.000 0.108 0.700 0.192
#> SRR1699920 3 0.5035 0.608886 0.000 0.052 0.744 0.204
#> SRR1699921 3 0.3937 0.662106 0.000 0.188 0.800 0.012
#> SRR1699922 2 0.2530 0.646537 0.000 0.896 0.100 0.004
#> SRR1699923 4 0.6852 0.435977 0.000 0.208 0.192 0.600
#> SRR1699924 3 0.7449 0.260961 0.000 0.332 0.480 0.188
#> SRR1699925 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.2861 0.689539 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1699927 3 0.6068 0.585260 0.000 0.208 0.676 0.116
#> SRR1699929 3 0.6542 0.541739 0.000 0.252 0.620 0.128
#> SRR1699928 3 0.1256 0.670057 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699930 3 0.7823 0.034974 0.000 0.368 0.376 0.256
#> SRR1699931 3 0.4389 0.658133 0.000 0.116 0.812 0.072
#> SRR1699933 2 0.6726 0.312195 0.000 0.536 0.364 0.100
#> SRR1699932 3 0.6549 0.351931 0.000 0.356 0.556 0.088
#> SRR1699934 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.3383 0.652312 0.000 0.052 0.872 0.076
#> SRR1699936 2 0.5279 0.614167 0.000 0.716 0.052 0.232
#> SRR1699937 2 0.2413 0.668994 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR1699938 2 0.4434 0.633127 0.000 0.756 0.016 0.228
#> SRR1699940 3 0.2473 0.669905 0.000 0.012 0.908 0.080
#> SRR1699939 3 0.7026 0.204481 0.000 0.404 0.476 0.120
#> SRR1699941 3 0.3877 0.678601 0.000 0.048 0.840 0.112
#> SRR1699942 3 0.7392 0.376062 0.000 0.232 0.520 0.248
#> SRR1699943 3 0.7135 0.441521 0.000 0.200 0.560 0.240
#> SRR1699944 2 0.7756 0.284579 0.000 0.436 0.296 0.268
#> SRR1699945 3 0.1489 0.665972 0.000 0.004 0.952 0.044
#> SRR1699946 3 0.1209 0.674950 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1699947 3 0.7449 0.336474 0.000 0.188 0.480 0.332
#> SRR1699948 2 0.4624 0.553756 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1699949 3 0.1929 0.668353 0.000 0.024 0.940 0.036
#> SRR1699950 3 0.1042 0.668227 0.000 0.008 0.972 0.020
#> SRR1699951 3 0.4401 0.486562 0.000 0.272 0.724 0.004
#> SRR1699952 2 0.5736 0.541601 0.000 0.628 0.044 0.328
#> SRR1699953 2 0.6055 0.325993 0.000 0.576 0.372 0.052
#> SRR1699954 3 0.2988 0.672194 0.000 0.012 0.876 0.112
#> SRR1699955 2 0.3821 0.672538 0.000 0.840 0.120 0.040
#> SRR1699956 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.4274 0.673163 0.000 0.820 0.072 0.108
#> SRR1699959 3 0.5788 0.606523 0.000 0.228 0.688 0.084
#> SRR1699958 3 0.3796 0.673521 0.000 0.096 0.848 0.056
#> SRR1699960 3 0.5167 0.666328 0.000 0.132 0.760 0.108
#> SRR1699961 2 0.5351 0.650363 0.000 0.744 0.104 0.152
#> SRR1699962 2 0.1929 0.661396 0.000 0.940 0.036 0.024
#> SRR1699963 2 0.7458 0.317523 0.000 0.508 0.240 0.252
#> SRR1699964 2 0.4419 0.665804 0.000 0.812 0.104 0.084
#> SRR1699965 2 0.3768 0.633468 0.000 0.808 0.008 0.184
#> SRR1699966 3 0.2918 0.679185 0.000 0.116 0.876 0.008
#> SRR1699967 2 0.2813 0.669069 0.000 0.896 0.024 0.080
#> SRR1699968 2 0.4776 0.525526 0.000 0.712 0.272 0.016
#> SRR1699969 3 0.2949 0.688871 0.000 0.088 0.888 0.024
#> SRR1699971 2 0.7914 -0.013212 0.000 0.352 0.340 0.308
#> SRR1699970 2 0.4980 0.572011 0.000 0.680 0.016 0.304
#> SRR1699972 3 0.7563 0.148033 0.000 0.364 0.440 0.196
#> SRR1699973 3 0.1938 0.673633 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1699974 4 0.6863 0.397648 0.000 0.348 0.116 0.536
#> SRR1699975 2 0.5506 0.102950 0.000 0.512 0.472 0.016
#> SRR1699976 3 0.6640 0.539762 0.000 0.208 0.624 0.168
#> SRR1699977 3 0.6338 0.596374 0.000 0.120 0.644 0.236
#> SRR1699978 3 0.5388 -0.201801 0.000 0.012 0.532 0.456
#> SRR1699979 3 0.6471 0.230929 0.000 0.416 0.512 0.072
#> SRR1699980 3 0.4010 0.669807 0.000 0.028 0.816 0.156
#> SRR1699981 3 0.0376 0.659409 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699982 3 0.0927 0.669294 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1699983 3 0.4262 0.632683 0.000 0.236 0.756 0.008
#> SRR1699984 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.2928 0.666945 0.000 0.012 0.880 0.108
#> SRR1699986 4 0.5696 0.118864 0.000 0.480 0.024 0.496
#> SRR1699988 2 0.5231 0.328623 0.000 0.604 0.384 0.012
#> SRR1699987 3 0.2124 0.669123 0.000 0.008 0.924 0.068
#> SRR1699989 3 0.6187 0.288831 0.000 0.432 0.516 0.052
#> SRR1699990 3 0.4920 0.377446 0.000 0.368 0.628 0.004
#> SRR1699992 2 0.7001 0.328154 0.000 0.464 0.116 0.420
#> SRR1699991 4 0.5834 0.415774 0.000 0.124 0.172 0.704
#> SRR1699993 3 0.2125 0.654513 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1699994 2 0.7923 -0.114570 0.000 0.340 0.324 0.336
#> SRR1699995 4 0.6931 0.131237 0.184 0.000 0.228 0.588
#> SRR1699996 2 0.4599 0.599535 0.000 0.736 0.016 0.248
#> SRR1699997 3 0.0376 0.659305 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1699998 2 0.5494 0.573128 0.000 0.716 0.208 0.076
#> SRR1699999 4 0.5632 0.349699 0.036 0.000 0.340 0.624
#> SRR1700000 3 0.5144 0.445959 0.000 0.052 0.732 0.216
#> SRR1700002 2 0.7048 0.449322 0.000 0.556 0.160 0.284
#> SRR1700001 2 0.7188 -0.018417 0.000 0.436 0.428 0.136
#> SRR1700003 2 0.7619 0.153258 0.000 0.436 0.356 0.208
#> SRR1700004 3 0.2987 0.680765 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1700005 1 0.3219 0.836268 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1700006 2 0.2413 0.664076 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR1700007 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.4727 0.668500 0.000 0.108 0.792 0.100
#> SRR1700009 1 0.5678 0.567894 0.524 0.000 0.024 0.452
#> SRR1700010 3 0.3196 0.673564 0.000 0.008 0.856 0.136
#> SRR1700011 3 0.6058 0.601202 0.000 0.136 0.684 0.180
#> SRR1700013 2 0.4039 0.648958 0.000 0.836 0.084 0.080
#> SRR1700012 3 0.1584 0.677763 0.000 0.036 0.952 0.012
#> SRR1700014 3 0.6362 0.487789 0.000 0.096 0.616 0.288
#> SRR1700015 3 0.6719 0.536475 0.000 0.152 0.608 0.240
#> SRR1700016 4 0.5620 0.200308 0.120 0.012 0.120 0.748
#> SRR1700018 2 0.4920 0.533163 0.000 0.628 0.004 0.368
#> SRR1700017 3 0.7036 0.439880 0.000 0.208 0.576 0.216
#> SRR1700019 3 0.2578 0.689096 0.000 0.052 0.912 0.036
#> SRR1700020 4 0.5606 0.261076 0.000 0.020 0.480 0.500
#> SRR1700021 3 0.5855 0.626123 0.000 0.136 0.704 0.160
#> SRR1700023 3 0.2363 0.678013 0.000 0.024 0.920 0.056
#> SRR1700022 3 0.5512 0.557591 0.000 0.040 0.660 0.300
#> SRR1700024 3 0.5905 0.649821 0.000 0.144 0.700 0.156
#> SRR1700025 2 0.5416 0.580486 0.000 0.692 0.048 0.260
#> SRR1700026 4 0.7782 -0.124654 0.000 0.360 0.244 0.396
#> SRR1700027 4 0.7778 -0.072462 0.000 0.324 0.256 0.420
#> SRR1700028 3 0.3548 0.674874 0.000 0.068 0.864 0.068
#> SRR1700029 3 0.6308 0.599579 0.000 0.136 0.656 0.208
#> SRR1700030 3 0.4343 0.621367 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700031 4 0.5712 0.381460 0.000 0.032 0.384 0.584
#> SRR1700032 3 0.5984 0.321306 0.000 0.372 0.580 0.048
#> SRR1700034 4 0.6653 -0.301943 0.356 0.000 0.096 0.548
#> SRR1700035 3 0.5021 0.620322 0.000 0.064 0.756 0.180
#> SRR1700033 4 0.5655 0.455583 0.000 0.084 0.212 0.704
#> SRR1700036 4 0.7824 -0.043482 0.000 0.260 0.348 0.392
#> SRR1700037 3 0.0817 0.669291 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700038 2 0.1576 0.656390 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1700039 3 0.4100 0.683090 0.000 0.076 0.832 0.092
#> SRR1700040 3 0.6948 0.417187 0.000 0.204 0.588 0.208
#> SRR1700041 3 0.7777 0.165276 0.000 0.260 0.424 0.316
#> SRR1700042 4 0.5890 0.401549 0.000 0.072 0.268 0.660
#> SRR1700043 4 0.7019 0.460431 0.000 0.132 0.344 0.524
#> SRR1700045 2 0.2563 0.668320 0.000 0.908 0.020 0.072
#> SRR1700044 2 0.1743 0.662338 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1700046 2 0.7545 0.248957 0.000 0.416 0.188 0.396
#> SRR1700047 3 0.1389 0.672326 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700048 2 0.7662 0.152726 0.000 0.436 0.344 0.220
#> SRR1700049 4 0.5673 0.323056 0.000 0.024 0.448 0.528
#> SRR1700050 3 0.3494 0.627678 0.000 0.004 0.824 0.172
#> SRR1700051 4 0.5343 0.397315 0.000 0.028 0.316 0.656
#> SRR1700052 4 0.7873 0.245647 0.000 0.320 0.292 0.388
#> SRR1700053 3 0.4675 0.560258 0.000 0.244 0.736 0.020
#> SRR1700054 2 0.3863 0.654841 0.000 0.828 0.028 0.144
#> SRR1700055 1 0.4053 0.804226 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1700056 3 0.4323 0.632203 0.000 0.028 0.788 0.184
#> SRR1700057 3 0.1792 0.668559 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700058 2 0.6916 0.229952 0.000 0.572 0.148 0.280
#> SRR1700059 3 0.3160 0.668013 0.000 0.020 0.872 0.108
#> SRR1700060 4 0.5097 0.291990 0.000 0.004 0.428 0.568
#> SRR1700061 2 0.3758 0.649973 0.000 0.848 0.104 0.048
#> SRR1700062 3 0.4426 0.652797 0.000 0.204 0.772 0.024
#> SRR1700063 2 0.4957 0.649378 0.000 0.748 0.048 0.204
#> SRR1700064 3 0.5160 0.659413 0.000 0.136 0.760 0.104
#> SRR1700065 3 0.7485 0.063193 0.000 0.336 0.472 0.192
#> SRR1700066 4 0.5940 0.428960 0.000 0.088 0.240 0.672
#> SRR1700067 3 0.6278 0.558048 0.000 0.228 0.652 0.120
#> SRR1700068 2 0.7352 0.308029 0.000 0.496 0.328 0.176
#> SRR1700069 3 0.3591 0.675083 0.000 0.168 0.824 0.008
#> SRR1700070 2 0.5256 0.549179 0.000 0.692 0.272 0.036
#> SRR1700071 2 0.6064 0.600772 0.000 0.672 0.108 0.220
#> SRR1700072 4 0.7490 0.432233 0.000 0.196 0.328 0.476
#> SRR1700073 3 0.0672 0.663357 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700075 3 0.6792 0.148996 0.000 0.428 0.476 0.096
#> SRR1700074 2 0.4720 0.586232 0.000 0.720 0.016 0.264
#> SRR1700076 2 0.4950 0.519720 0.000 0.620 0.004 0.376
#> SRR1700077 2 0.5596 0.536596 0.000 0.632 0.036 0.332
#> SRR1700078 3 0.0188 0.657273 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700080 3 0.3533 0.690431 0.000 0.056 0.864 0.080
#> SRR1700079 3 0.1474 0.665979 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700081 4 0.6362 0.473771 0.000 0.096 0.288 0.616
#> SRR1700082 4 0.7843 0.048223 0.000 0.268 0.344 0.388
#> SRR1700083 3 0.6215 0.493195 0.000 0.072 0.600 0.328
#> SRR1700084 4 0.4900 0.398914 0.000 0.032 0.236 0.732
#> SRR1700085 3 0.6979 0.301038 0.000 0.344 0.528 0.128
#> SRR1700086 3 0.3550 0.666728 0.000 0.044 0.860 0.096
#> SRR1700087 4 0.7724 -0.008521 0.000 0.328 0.240 0.432
#> SRR1700088 2 0.7540 0.169011 0.000 0.444 0.364 0.192
#> SRR1700089 3 0.7434 0.450538 0.000 0.256 0.512 0.232
#> SRR1700091 3 0.5006 0.672234 0.000 0.104 0.772 0.124
#> SRR1700090 3 0.7612 0.351459 0.000 0.264 0.476 0.260
#> SRR1700092 2 0.7327 0.372636 0.000 0.504 0.176 0.320
#> SRR1700094 3 0.7045 0.446106 0.000 0.328 0.532 0.140
#> SRR1700093 4 0.7758 -0.157014 0.000 0.236 0.368 0.396
#> SRR1700095 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700096 3 0.4801 0.648407 0.000 0.048 0.764 0.188
#> SRR1700097 2 0.7740 0.009120 0.000 0.432 0.320 0.248
#> SRR1700098 3 0.5911 0.568924 0.000 0.112 0.692 0.196
#> SRR1700099 3 0.7790 0.184031 0.000 0.252 0.408 0.340
#> SRR1700100 2 0.7573 0.255432 0.000 0.460 0.208 0.332
#> SRR1700101 3 0.7121 0.390266 0.000 0.292 0.544 0.164
#> SRR1700102 2 0.7832 0.125885 0.000 0.380 0.360 0.260
#> SRR1700104 3 0.1722 0.662955 0.000 0.008 0.944 0.048
#> SRR1700103 3 0.3547 0.684517 0.000 0.064 0.864 0.072
#> SRR1700105 3 0.7598 0.306826 0.000 0.324 0.460 0.216
#> SRR1700106 3 0.0817 0.663174 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700107 3 0.5716 0.600225 0.000 0.212 0.700 0.088
#> SRR1700108 3 0.6954 0.483848 0.000 0.152 0.568 0.280
#> SRR1700109 3 0.7220 0.383517 0.000 0.240 0.548 0.212
#> SRR1700110 3 0.6357 0.541918 0.000 0.124 0.644 0.232
#> SRR1700112 2 0.5477 0.588349 0.000 0.728 0.180 0.092
#> SRR1700111 3 0.2773 0.672382 0.000 0.028 0.900 0.072
#> SRR1700113 3 0.6124 0.494411 0.000 0.276 0.640 0.084
#> SRR1700114 4 0.7717 0.032943 0.000 0.264 0.288 0.448
#> SRR1700115 3 0.2988 0.664419 0.000 0.012 0.876 0.112
#> SRR1700116 3 0.5657 0.640429 0.000 0.160 0.720 0.120
#> SRR1700117 2 0.7159 0.262777 0.000 0.552 0.188 0.260
#> SRR1700119 3 0.6452 0.553722 0.000 0.260 0.624 0.116
#> SRR1700118 3 0.7193 0.481502 0.000 0.240 0.552 0.208
#> SRR1700120 3 0.2593 0.678222 0.000 0.016 0.904 0.080
#> SRR1700121 3 0.1118 0.659546 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700122 3 0.4590 0.654555 0.000 0.060 0.792 0.148
#> SRR1700123 3 0.4931 0.668095 0.000 0.132 0.776 0.092
#> SRR1700125 3 0.0188 0.656366 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700126 4 0.5649 0.362630 0.000 0.284 0.052 0.664
#> SRR1700127 4 0.7464 0.093052 0.000 0.296 0.208 0.496
#> SRR1700124 3 0.5877 0.597982 0.000 0.068 0.656 0.276
#> SRR1700128 3 0.5454 0.661858 0.000 0.096 0.732 0.172
#> SRR1700129 3 0.6465 0.353980 0.000 0.412 0.516 0.072
#> SRR1700130 3 0.7028 0.483464 0.000 0.228 0.576 0.196
#> SRR1700132 3 0.3601 0.685715 0.000 0.084 0.860 0.056
#> SRR1700131 3 0.1302 0.662563 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700133 3 0.5292 0.653706 0.000 0.088 0.744 0.168
#> SRR1700134 3 0.4332 0.662025 0.000 0.160 0.800 0.040
#> SRR1700135 3 0.6733 0.447638 0.000 0.112 0.564 0.324
#> SRR1700136 3 0.2376 0.666692 0.000 0.016 0.916 0.068
#> SRR1700137 3 0.1256 0.668039 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700138 3 0.4599 0.665095 0.000 0.088 0.800 0.112
#> SRR1700140 3 0.3123 0.677750 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1700139 2 0.5950 0.059864 0.000 0.544 0.416 0.040
#> SRR1700141 3 0.5719 0.661136 0.000 0.132 0.716 0.152
#> SRR1700142 3 0.6087 0.392982 0.000 0.048 0.540 0.412
#> SRR1700143 3 0.5942 0.157128 0.000 0.040 0.548 0.412
#> SRR1700144 4 0.6834 -0.163153 0.000 0.424 0.100 0.476
#> SRR1700145 3 0.3300 0.638895 0.000 0.008 0.848 0.144
#> SRR1700146 3 0.3978 0.676858 0.000 0.108 0.836 0.056
#> SRR1700147 3 0.6071 0.517406 0.000 0.324 0.612 0.064
#> SRR1700149 4 0.6036 0.409408 0.000 0.292 0.072 0.636
#> SRR1700148 3 0.6163 0.469969 0.000 0.364 0.576 0.060
#> SRR1700150 4 0.7902 -0.110459 0.000 0.352 0.296 0.352
#> SRR1700152 3 0.5018 0.663452 0.000 0.144 0.768 0.088
#> SRR1700151 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700153 3 0.1722 0.678420 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700154 2 0.5614 0.390498 0.000 0.628 0.336 0.036
#> SRR1700155 2 0.4841 0.647669 0.000 0.780 0.080 0.140
#> SRR1700156 3 0.5090 0.569860 0.000 0.016 0.660 0.324
#> SRR1700158 3 0.6733 0.478011 0.000 0.324 0.564 0.112
#> SRR1700159 2 0.4735 0.642550 0.000 0.784 0.148 0.068
#> SRR1700157 3 0.5448 0.598516 0.000 0.196 0.724 0.080
#> SRR1700160 3 0.5102 0.666064 0.000 0.100 0.764 0.136
#> SRR1700161 3 0.6428 0.569045 0.000 0.264 0.624 0.112
#> SRR1700162 3 0.2281 0.686626 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1700164 3 0.1389 0.663239 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700163 4 0.6337 0.178991 0.000 0.468 0.060 0.472
#> SRR1700165 2 0.6771 0.451279 0.000 0.600 0.248 0.152
#> SRR1700166 3 0.6264 0.456551 0.000 0.376 0.560 0.064
#> SRR1700168 3 0.6770 0.318280 0.000 0.408 0.496 0.096
#> SRR1700167 3 0.2255 0.668086 0.000 0.012 0.920 0.068
#> SRR1700170 2 0.4267 0.629096 0.000 0.788 0.024 0.188
#> SRR1700169 2 0.3448 0.638106 0.000 0.828 0.004 0.168
#> SRR1700171 3 0.4647 0.384004 0.000 0.008 0.704 0.288
#> SRR1700172 3 0.4724 0.681790 0.000 0.112 0.792 0.096
#> SRR1700174 2 0.6552 0.506207 0.000 0.628 0.228 0.144
#> SRR1700173 3 0.2081 0.667633 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700175 2 0.5066 0.651735 0.000 0.768 0.120 0.112
#> SRR1700176 3 0.6567 0.527182 0.000 0.128 0.616 0.256
#> SRR1700178 2 0.4675 0.609556 0.000 0.736 0.020 0.244
#> SRR1700177 3 0.0895 0.666425 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700180 2 0.1305 0.655491 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1700179 2 0.4040 0.606418 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1700181 2 0.3463 0.659320 0.000 0.864 0.096 0.040
#> SRR1700183 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.3351 0.658757 0.000 0.844 0.008 0.148
#> SRR1700184 2 0.3528 0.637275 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1700186 2 0.4095 0.634607 0.000 0.804 0.024 0.172
#> SRR1700187 4 0.7058 -0.244611 0.344 0.000 0.136 0.520
#> SRR1700185 1 0.5672 0.714725 0.668 0.000 0.056 0.276
#> SRR1700188 2 0.7238 0.476387 0.000 0.524 0.172 0.304
#> SRR1700192 2 0.4630 0.564088 0.000 0.732 0.016 0.252
#> SRR1700190 4 0.5624 0.404521 0.000 0.172 0.108 0.720
#> SRR1700191 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 4 0.4999 0.326930 0.000 0.328 0.012 0.660
#> SRR1700193 2 0.5646 0.634033 0.000 0.708 0.088 0.204
#> SRR1700195 2 0.1398 0.662215 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1700194 1 0.2530 0.848967 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1700196 2 0.3074 0.627739 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1700197 4 0.5334 0.293099 0.052 0.040 0.128 0.780
#> SRR1700198 2 0.0469 0.647235 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700199 2 0.1356 0.657208 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1700200 2 0.4667 0.656786 0.000 0.796 0.108 0.096
#> SRR1700201 2 0.1302 0.654654 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700202 2 0.2589 0.638210 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700203 2 0.1474 0.657674 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1700204 2 0.1940 0.658149 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700206 3 0.7714 0.128606 0.000 0.376 0.400 0.224
#> SRR1700207 2 0.3219 0.619375 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1700208 4 0.6020 0.285431 0.000 0.384 0.048 0.568
#> SRR1700205 2 0.5018 0.476924 0.000 0.656 0.332 0.012
#> SRR1700209 2 0.2266 0.660674 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1700210 2 0.2266 0.642952 0.000 0.912 0.084 0.004
#> SRR1700211 2 0.2760 0.651239 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1700212 2 0.1022 0.651668 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1700213 2 0.3801 0.612031 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1700214 2 0.3257 0.642301 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR1700215 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.4149 0.665707 0.000 0.812 0.036 0.152
#> SRR1700216 1 0.0000 0.860445 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.2542 0.663633 0.000 0.904 0.012 0.084
#> SRR1700219 2 0.0188 0.645264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700222 4 0.7920 0.249487 0.124 0.192 0.088 0.596
#> SRR1700220 2 0.1557 0.648710 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700221 2 0.1256 0.652911 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1700223 2 0.1389 0.656088 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700224 2 0.4175 0.608812 0.000 0.776 0.012 0.212
#> SRR1700226 2 0.3529 0.660029 0.000 0.836 0.012 0.152
#> SRR1700229 2 0.6033 0.600804 0.000 0.680 0.116 0.204
#> SRR1700225 2 0.4800 0.598945 0.000 0.760 0.196 0.044
#> SRR1700227 2 0.3942 0.624461 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1700230 2 0.5331 0.202102 0.000 0.644 0.024 0.332
#> SRR1700231 2 0.6534 0.542003 0.000 0.632 0.220 0.148
#> SRR1700228 2 0.0895 0.653307 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1700232 2 0.5116 0.639083 0.000 0.764 0.128 0.108
#> SRR1700233 2 0.6280 0.458824 0.000 0.612 0.304 0.084
#> SRR1700234 2 0.3123 0.638006 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700235 2 0.5118 0.624180 0.000 0.752 0.072 0.176
#> SRR1700237 2 0.1576 0.658356 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1700236 2 0.2965 0.657589 0.000 0.892 0.072 0.036
#> SRR1700238 2 0.1305 0.654496 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1700239 4 0.5864 0.306046 0.020 0.384 0.012 0.584
#> SRR1700240 1 0.5004 0.662196 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1700241 2 0.2563 0.648396 0.000 0.908 0.072 0.020
#> SRR1700243 2 0.3245 0.670485 0.000 0.872 0.028 0.100
#> SRR1700244 2 0.4959 0.591798 0.000 0.752 0.196 0.052
#> SRR1700242 2 0.4375 0.521002 0.000 0.788 0.032 0.180
#> SRR1700246 4 0.5097 0.304851 0.000 0.428 0.004 0.568
#> SRR1700245 2 0.2149 0.653770 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1700247 4 0.6448 0.268790 0.108 0.004 0.248 0.640
#> SRR1700249 1 0.3908 0.814243 0.784 0.000 0.004 0.212
#> SRR1700250 2 0.2999 0.660279 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1700248 2 0.0707 0.650948 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700251 2 0.5866 0.532269 0.000 0.624 0.052 0.324
#> SRR1700252 3 0.7224 0.373769 0.000 0.216 0.548 0.236
#> SRR1700253 2 0.4049 0.634723 0.000 0.780 0.008 0.212
#> SRR1700256 2 0.3486 0.639187 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700254 4 0.8071 -0.075573 0.276 0.080 0.100 0.544
#> SRR1700255 2 0.5119 0.642990 0.000 0.764 0.112 0.124
#> SRR1700257 2 0.2918 0.646070 0.000 0.876 0.008 0.116
#> SRR1700258 2 0.5787 0.515466 0.000 0.680 0.244 0.076
#> SRR1700259 3 0.7583 0.285276 0.000 0.280 0.480 0.240
#> SRR1700260 3 0.0336 0.658424 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700261 2 0.4956 0.589697 0.000 0.756 0.188 0.056
#> SRR1700262 3 0.1398 0.671019 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1700263 2 0.6142 0.561714 0.000 0.676 0.140 0.184
#> SRR1700264 2 0.3962 0.669586 0.000 0.832 0.044 0.124
#> SRR1700265 3 0.7171 0.467460 0.000 0.232 0.556 0.212
#> SRR1700266 3 0.6189 0.529327 0.000 0.268 0.640 0.092
#> SRR1700268 3 0.4509 0.576602 0.000 0.288 0.708 0.004
#> SRR1700270 2 0.5062 0.631993 0.000 0.752 0.064 0.184
#> SRR1700267 2 0.2149 0.647614 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1700271 2 0.7861 0.091342 0.000 0.368 0.360 0.272
#> SRR1700272 3 0.5051 0.664884 0.000 0.132 0.768 0.100
#> SRR1700273 2 0.1724 0.661912 0.000 0.948 0.020 0.032
#> SRR1700274 3 0.3583 0.674902 0.000 0.180 0.816 0.004
#> SRR1700277 4 0.5018 0.215777 0.000 0.332 0.012 0.656
#> SRR1700275 3 0.4655 0.563827 0.000 0.312 0.684 0.004
#> SRR1700276 2 0.7404 0.246801 0.000 0.484 0.336 0.180
#> SRR1700278 2 0.4452 0.569908 0.000 0.732 0.260 0.008
#> SRR1700279 3 0.3015 0.688179 0.000 0.092 0.884 0.024
#> SRR1700280 3 0.7540 0.259421 0.000 0.304 0.480 0.216
#> SRR1700281 3 0.7852 0.078754 0.000 0.268 0.372 0.360
#> SRR1700283 2 0.5143 0.268102 0.000 0.540 0.456 0.004
#> SRR1700282 3 0.7860 -0.024229 0.000 0.340 0.384 0.276
#> SRR1700284 3 0.5311 0.547597 0.000 0.328 0.648 0.024
#> SRR1700285 3 0.6376 0.264055 0.000 0.432 0.504 0.064
#> SRR1700286 3 0.6939 0.333745 0.000 0.332 0.540 0.128
#> SRR1700287 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700290 4 0.5167 0.274357 0.000 0.004 0.488 0.508
#> SRR1700289 3 0.1629 0.676258 0.000 0.024 0.952 0.024
#> SRR1700288 2 0.5673 0.575045 0.000 0.660 0.052 0.288
#> SRR1700292 3 0.5472 0.574951 0.000 0.280 0.676 0.044
#> SRR1700291 3 0.4292 0.666915 0.000 0.100 0.820 0.080
#> SRR1700293 2 0.0779 0.649060 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1700294 2 0.5830 0.441636 0.000 0.620 0.332 0.048
#> SRR1700295 2 0.6497 0.577597 0.000 0.640 0.160 0.200
#> SRR1700297 2 0.7674 0.166937 0.000 0.436 0.340 0.224
#> SRR1700296 3 0.3870 0.661287 0.000 0.208 0.788 0.004
#> SRR1700298 2 0.2759 0.667729 0.000 0.904 0.052 0.044
#> SRR1700299 3 0.6352 0.538380 0.000 0.260 0.632 0.108
#> SRR1700300 3 0.6249 0.437754 0.000 0.352 0.580 0.068
#> SRR1700302 3 0.2868 0.663092 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1700301 3 0.5383 0.255708 0.000 0.452 0.536 0.012
#> SRR1700303 2 0.5894 0.271290 0.000 0.536 0.428 0.036
#> SRR1700304 2 0.4245 0.600160 0.000 0.784 0.196 0.020
#> SRR1700305 2 0.4724 0.665469 0.000 0.788 0.076 0.136
#> SRR1700306 3 0.3172 0.676883 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1700308 3 0.6419 0.278441 0.000 0.420 0.512 0.068
#> SRR1700307 3 0.5900 0.612066 0.000 0.096 0.684 0.220
#> SRR1700309 3 0.5395 0.633480 0.000 0.084 0.732 0.184
#> SRR1700310 2 0.4375 0.628782 0.000 0.788 0.180 0.032
#> SRR1700311 3 0.2610 0.682910 0.000 0.088 0.900 0.012
#> SRR1700312 3 0.6842 0.190608 0.000 0.436 0.464 0.100
#> SRR1700313 3 0.6508 0.310589 0.000 0.344 0.568 0.088
#> SRR1700314 3 0.5375 0.654949 0.000 0.116 0.744 0.140
#> SRR1700315 3 0.1890 0.683953 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700316 2 0.6626 0.286988 0.000 0.544 0.364 0.092
#> SRR1700317 3 0.7648 0.050822 0.000 0.348 0.436 0.216
#> SRR1700318 3 0.3634 0.688432 0.000 0.096 0.856 0.048
#> SRR1700319 3 0.5767 0.586612 0.000 0.280 0.660 0.060
#> SRR1700320 3 0.4008 0.628378 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1700322 2 0.4237 0.669759 0.000 0.808 0.040 0.152
#> SRR1700321 2 0.2401 0.652356 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1700323 3 0.0000 0.655217 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700324 2 0.5236 0.220590 0.000 0.560 0.432 0.008
#> SRR1700325 3 0.7456 0.366169 0.000 0.256 0.508 0.236
#> SRR1700326 4 0.3820 0.355904 0.000 0.064 0.088 0.848
#> SRR1700327 2 0.3659 0.657991 0.000 0.840 0.136 0.024
#> SRR1700329 3 0.4731 0.669171 0.000 0.160 0.780 0.060
#> SRR1700328 3 0.5207 0.570711 0.000 0.028 0.680 0.292
#> SRR1700330 3 0.0592 0.659479 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700331 3 0.4936 0.404065 0.000 0.372 0.624 0.004
#> SRR1700332 3 0.0469 0.663399 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700333 2 0.2670 0.664905 0.000 0.904 0.024 0.072
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 5 0.5183 0.52753 0.000 0.072 0.016 0.212 0.700
#> SRR1699875 5 0.4897 0.54426 0.000 0.112 0.004 0.156 0.728
#> SRR1699876 5 0.3123 0.62542 0.000 0.012 0.000 0.160 0.828
#> SRR1699877 2 0.6817 0.13815 0.000 0.476 0.048 0.100 0.376
#> SRR1699879 5 0.5827 0.41429 0.000 0.300 0.000 0.124 0.576
#> SRR1699878 2 0.5030 0.36123 0.000 0.624 0.032 0.336 0.008
#> SRR1699880 2 0.7224 -0.06660 0.000 0.440 0.044 0.352 0.164
#> SRR1699881 4 0.8080 0.35298 0.000 0.264 0.124 0.408 0.204
#> SRR1699882 2 0.6831 0.04675 0.000 0.448 0.008 0.228 0.316
#> SRR1699883 2 0.6845 -0.07348 0.000 0.424 0.012 0.372 0.192
#> SRR1699884 4 0.6560 0.38146 0.000 0.268 0.008 0.520 0.204
#> SRR1699885 2 0.3517 0.59904 0.000 0.840 0.004 0.072 0.084
#> SRR1699886 5 0.6126 0.02630 0.000 0.444 0.016 0.080 0.460
#> SRR1699888 4 0.4233 0.49476 0.000 0.108 0.064 0.804 0.024
#> SRR1699889 5 0.0290 0.66072 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1699890 5 0.4451 0.50435 0.000 0.340 0.000 0.016 0.644
#> SRR1699887 2 0.4858 0.25580 0.000 0.556 0.008 0.424 0.012
#> SRR1699891 5 0.0290 0.66041 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1699892 5 0.6321 0.43786 0.000 0.236 0.012 0.176 0.576
#> SRR1699893 5 0.4637 0.50769 0.000 0.292 0.000 0.036 0.672
#> SRR1699894 5 0.5178 0.16772 0.000 0.476 0.000 0.040 0.484
#> SRR1699895 5 0.6518 0.21810 0.000 0.172 0.012 0.284 0.532
#> SRR1699896 4 0.6224 0.20901 0.000 0.376 0.016 0.512 0.096
#> SRR1699897 4 0.4858 0.06946 0.000 0.424 0.012 0.556 0.008
#> SRR1699898 5 0.7470 0.06599 0.000 0.100 0.108 0.368 0.424
#> SRR1699900 2 0.5964 0.34699 0.000 0.588 0.016 0.092 0.304
#> SRR1699899 5 0.3704 0.66842 0.000 0.036 0.020 0.112 0.832
#> SRR1699902 2 0.5715 0.50585 0.000 0.688 0.180 0.048 0.084
#> SRR1699901 3 0.4662 0.56773 0.000 0.096 0.756 0.008 0.140
#> SRR1699903 5 0.1638 0.67732 0.000 0.064 0.004 0.000 0.932
#> SRR1699904 2 0.3691 0.59189 0.000 0.820 0.000 0.104 0.076
#> SRR1699905 5 0.3359 0.66704 0.000 0.016 0.060 0.064 0.860
#> SRR1699906 4 0.6884 0.30628 0.000 0.228 0.008 0.416 0.348
#> SRR1699907 5 0.6274 0.25129 0.000 0.276 0.004 0.172 0.548
#> SRR1699908 2 0.4342 0.49335 0.000 0.728 0.000 0.040 0.232
#> SRR1699909 5 0.2095 0.68339 0.000 0.060 0.008 0.012 0.920
#> SRR1699910 2 0.5537 0.20560 0.000 0.560 0.048 0.012 0.380
#> SRR1699911 5 0.3068 0.67812 0.000 0.036 0.056 0.028 0.880
#> SRR1699912 5 0.0451 0.66098 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1699913 2 0.6533 -0.00470 0.000 0.428 0.004 0.168 0.400
#> SRR1699914 5 0.3379 0.65813 0.000 0.016 0.148 0.008 0.828
#> SRR1699915 5 0.0579 0.66110 0.000 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1699916 2 0.7059 -0.17666 0.000 0.340 0.008 0.320 0.332
#> SRR1699917 5 0.4330 0.67934 0.000 0.072 0.048 0.072 0.808
#> SRR1699918 4 0.6543 0.44395 0.000 0.208 0.036 0.592 0.164
#> SRR1699919 5 0.5543 0.05894 0.000 0.036 0.016 0.448 0.500
#> SRR1699920 5 0.5091 0.40981 0.000 0.004 0.044 0.328 0.624
#> SRR1699921 5 0.3391 0.64402 0.000 0.188 0.000 0.012 0.800
#> SRR1699922 2 0.1894 0.59556 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1699923 3 0.3755 0.62041 0.000 0.048 0.840 0.032 0.080
#> SRR1699924 5 0.7326 0.17965 0.000 0.240 0.036 0.280 0.444
#> SRR1699925 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.2464 0.67893 0.000 0.096 0.000 0.016 0.888
#> SRR1699927 5 0.5717 0.34334 0.000 0.096 0.004 0.308 0.592
#> SRR1699929 5 0.6345 0.45487 0.000 0.224 0.016 0.176 0.584
#> SRR1699928 5 0.1168 0.66864 0.000 0.008 0.000 0.032 0.960
#> SRR1699930 4 0.5713 0.50541 0.000 0.156 0.004 0.640 0.200
#> SRR1699931 5 0.4983 0.48416 0.000 0.060 0.004 0.256 0.680
#> SRR1699933 2 0.6538 0.22342 0.000 0.536 0.060 0.068 0.336
#> SRR1699932 5 0.6622 0.03068 0.000 0.228 0.004 0.280 0.488
#> SRR1699934 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.3177 0.56782 0.000 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1699936 4 0.4981 0.21645 0.000 0.360 0.012 0.608 0.020
#> SRR1699937 2 0.4124 0.51877 0.000 0.744 0.016 0.232 0.008
#> SRR1699938 4 0.4688 0.02993 0.000 0.456 0.004 0.532 0.008
#> SRR1699940 5 0.3188 0.67391 0.000 0.012 0.100 0.028 0.860
#> SRR1699939 5 0.7034 -0.26746 0.000 0.288 0.008 0.348 0.356
#> SRR1699941 5 0.3834 0.64758 0.000 0.036 0.012 0.140 0.812
#> SRR1699942 4 0.6685 0.20160 0.000 0.068 0.068 0.512 0.352
#> SRR1699943 4 0.6347 0.14692 0.000 0.124 0.008 0.448 0.420
#> SRR1699944 4 0.6141 0.47993 0.000 0.200 0.008 0.596 0.196
#> SRR1699945 5 0.2359 0.67405 0.000 0.000 0.060 0.036 0.904
#> SRR1699946 5 0.1579 0.67634 0.000 0.032 0.000 0.024 0.944
#> SRR1699947 4 0.7114 0.29768 0.000 0.120 0.060 0.472 0.348
#> SRR1699948 4 0.4309 0.29404 0.000 0.308 0.016 0.676 0.000
#> SRR1699949 5 0.2329 0.64133 0.000 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699950 5 0.1082 0.66843 0.000 0.008 0.000 0.028 0.964
#> SRR1699951 5 0.3928 0.46476 0.000 0.296 0.000 0.004 0.700
#> SRR1699952 4 0.4445 0.37839 0.000 0.272 0.004 0.700 0.024
#> SRR1699953 2 0.6636 -0.01944 0.000 0.432 0.000 0.232 0.336
#> SRR1699954 5 0.4272 0.64668 0.000 0.008 0.152 0.060 0.780
#> SRR1699955 2 0.4279 0.59318 0.000 0.784 0.004 0.108 0.104
#> SRR1699956 5 0.0162 0.65782 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699957 2 0.4858 0.50895 0.000 0.688 0.004 0.256 0.052
#> SRR1699959 5 0.6569 0.50333 0.000 0.212 0.064 0.116 0.608
#> SRR1699958 5 0.3516 0.66719 0.000 0.052 0.004 0.108 0.836
#> SRR1699960 5 0.4949 0.62490 0.000 0.100 0.008 0.164 0.728
#> SRR1699961 2 0.6259 0.37622 0.000 0.592 0.044 0.284 0.080
#> SRR1699962 2 0.1809 0.59901 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1699963 4 0.6184 0.44733 0.000 0.216 0.068 0.640 0.076
#> SRR1699964 2 0.4747 0.56524 0.000 0.752 0.012 0.148 0.088
#> SRR1699965 4 0.4559 0.00159 0.000 0.480 0.008 0.512 0.000
#> SRR1699966 5 0.3058 0.66712 0.000 0.096 0.000 0.044 0.860
#> SRR1699967 2 0.3722 0.59579 0.000 0.824 0.032 0.128 0.016
#> SRR1699968 2 0.4552 0.42387 0.000 0.696 0.000 0.040 0.264
#> SRR1699969 5 0.3003 0.68336 0.000 0.064 0.016 0.040 0.880
#> SRR1699971 4 0.6567 0.49503 0.000 0.180 0.056 0.612 0.152
#> SRR1699970 2 0.4451 0.17204 0.000 0.504 0.004 0.492 0.000
#> SRR1699972 5 0.7919 -0.25579 0.000 0.276 0.072 0.308 0.344
#> SRR1699973 5 0.1956 0.67193 0.000 0.012 0.008 0.052 0.928
#> SRR1699974 3 0.2830 0.61741 0.000 0.080 0.876 0.000 0.044
#> SRR1699975 2 0.5140 0.14658 0.000 0.524 0.008 0.024 0.444
#> SRR1699976 5 0.6347 0.26001 0.000 0.156 0.008 0.296 0.540
#> SRR1699977 5 0.6668 0.24315 0.000 0.068 0.060 0.404 0.468
#> SRR1699978 3 0.4161 0.36124 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699979 5 0.6874 0.21015 0.000 0.372 0.040 0.120 0.468
#> SRR1699980 5 0.4110 0.63477 0.000 0.012 0.028 0.184 0.776
#> SRR1699981 5 0.0703 0.66252 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699982 5 0.0798 0.66763 0.000 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1699983 5 0.3671 0.61821 0.000 0.236 0.000 0.008 0.756
#> SRR1699984 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.2771 0.64858 0.000 0.012 0.000 0.128 0.860
#> SRR1699986 3 0.5234 0.44601 0.000 0.260 0.660 0.076 0.004
#> SRR1699988 2 0.4710 0.30272 0.000 0.616 0.012 0.008 0.364
#> SRR1699987 5 0.2408 0.66390 0.000 0.008 0.004 0.096 0.892
#> SRR1699989 5 0.6226 0.21821 0.000 0.412 0.012 0.100 0.476
#> SRR1699990 5 0.4482 0.33872 0.000 0.376 0.000 0.012 0.612
#> SRR1699992 4 0.5283 0.46606 0.000 0.180 0.068 0.716 0.036
#> SRR1699991 4 0.5410 0.43428 0.000 0.020 0.240 0.672 0.068
#> SRR1699993 5 0.3128 0.64419 0.000 0.004 0.168 0.004 0.824
#> SRR1699994 4 0.8164 0.34139 0.000 0.152 0.296 0.384 0.168
#> SRR1699995 3 0.2674 0.53379 0.120 0.000 0.868 0.000 0.012
#> SRR1699996 4 0.4138 0.24253 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1699997 5 0.0324 0.65976 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1699998 2 0.6363 0.47775 0.000 0.644 0.076 0.112 0.168
#> SRR1699999 3 0.1074 0.61005 0.004 0.000 0.968 0.012 0.016
#> SRR1700000 5 0.4891 0.41910 0.000 0.044 0.316 0.000 0.640
#> SRR1700002 2 0.6878 0.13271 0.000 0.504 0.048 0.332 0.116
#> SRR1700001 2 0.6884 -0.02757 0.000 0.376 0.260 0.004 0.360
#> SRR1700003 2 0.7575 -0.02841 0.000 0.428 0.056 0.224 0.292
#> SRR1700004 5 0.2699 0.67572 0.000 0.100 0.008 0.012 0.880
#> SRR1700005 1 0.3366 0.74492 0.768 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.2445 0.57836 0.000 0.884 0.004 0.108 0.004
#> SRR1700007 5 0.0000 0.65607 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700008 5 0.5267 0.65340 0.000 0.100 0.084 0.072 0.744
#> SRR1700009 3 0.4249 -0.11889 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1700010 5 0.4797 0.61406 0.000 0.000 0.172 0.104 0.724
#> SRR1700011 5 0.6112 0.27277 0.000 0.116 0.008 0.328 0.548
#> SRR1700013 2 0.4737 0.49593 0.000 0.712 0.004 0.228 0.056
#> SRR1700012 5 0.1329 0.67350 0.000 0.032 0.004 0.008 0.956
#> SRR1700014 4 0.5480 0.22763 0.000 0.036 0.016 0.548 0.400
#> SRR1700015 5 0.6457 0.13344 0.000 0.092 0.028 0.404 0.476
#> SRR1700016 3 0.0671 0.60026 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR1700018 4 0.4584 0.39659 0.000 0.228 0.056 0.716 0.000
#> SRR1700017 5 0.6926 0.27497 0.000 0.188 0.032 0.260 0.520
#> SRR1700019 5 0.2359 0.68146 0.000 0.036 0.000 0.060 0.904
#> SRR1700020 3 0.4273 0.53066 0.000 0.004 0.748 0.036 0.212
#> SRR1700021 5 0.5441 0.57382 0.000 0.080 0.020 0.220 0.680
#> SRR1700023 5 0.2513 0.66800 0.000 0.000 0.008 0.116 0.876
#> SRR1700022 4 0.6635 -0.02737 0.000 0.060 0.064 0.440 0.436
#> SRR1700024 5 0.6246 0.50677 0.000 0.124 0.020 0.272 0.584
#> SRR1700025 4 0.4618 0.29370 0.000 0.344 0.004 0.636 0.016
#> SRR1700026 4 0.6824 0.42416 0.000 0.200 0.064 0.584 0.152
#> SRR1700027 4 0.4712 0.52169 0.000 0.080 0.068 0.784 0.068
#> SRR1700028 5 0.3321 0.65855 0.000 0.032 0.000 0.136 0.832
#> SRR1700029 5 0.6361 0.35087 0.000 0.104 0.024 0.332 0.540
#> SRR1700030 5 0.3989 0.59678 0.000 0.260 0.004 0.008 0.728
#> SRR1700031 3 0.5408 0.49065 0.000 0.000 0.664 0.180 0.156
#> SRR1700032 5 0.5354 0.32199 0.000 0.372 0.008 0.044 0.576
#> SRR1700034 3 0.3160 0.44840 0.188 0.000 0.808 0.000 0.004
#> SRR1700035 5 0.4623 0.43878 0.000 0.008 0.012 0.340 0.640
#> SRR1700033 3 0.6421 0.44267 0.000 0.048 0.600 0.248 0.104
#> SRR1700036 4 0.5156 0.53261 0.000 0.080 0.028 0.728 0.164
#> SRR1700037 5 0.0703 0.66741 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1700038 2 0.2605 0.57551 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1700039 5 0.4608 0.66893 0.000 0.076 0.104 0.036 0.784
#> SRR1700040 5 0.7175 0.31625 0.000 0.144 0.068 0.268 0.520
#> SRR1700041 4 0.5630 0.53011 0.000 0.116 0.012 0.660 0.212
#> SRR1700042 4 0.6458 0.24372 0.000 0.012 0.308 0.528 0.152
#> SRR1700043 3 0.5035 0.53650 0.000 0.036 0.724 0.044 0.196
#> SRR1700045 2 0.3513 0.58946 0.000 0.828 0.036 0.132 0.004
#> SRR1700044 2 0.2214 0.60396 0.000 0.916 0.004 0.052 0.028
#> SRR1700046 4 0.4136 0.50554 0.000 0.132 0.016 0.800 0.052
#> SRR1700047 5 0.1774 0.67309 0.000 0.000 0.016 0.052 0.932
#> SRR1700048 4 0.6960 0.18797 0.000 0.372 0.008 0.372 0.248
#> SRR1700049 3 0.3461 0.57896 0.000 0.004 0.812 0.016 0.168
#> SRR1700050 5 0.5018 0.53426 0.000 0.000 0.268 0.068 0.664
#> SRR1700051 3 0.0960 0.61539 0.000 0.004 0.972 0.008 0.016
#> SRR1700052 3 0.8033 -0.01043 0.000 0.240 0.408 0.108 0.244
#> SRR1700053 5 0.4514 0.55537 0.000 0.228 0.008 0.036 0.728
#> SRR1700054 2 0.4673 0.51396 0.000 0.732 0.040 0.212 0.016
#> SRR1700055 1 0.4503 0.64268 0.664 0.000 0.312 0.024 0.000
#> SRR1700056 5 0.5670 0.51741 0.000 0.000 0.192 0.176 0.632
#> SRR1700057 5 0.2813 0.66696 0.000 0.000 0.108 0.024 0.868
#> SRR1700058 2 0.6889 0.21289 0.000 0.488 0.360 0.084 0.068
#> SRR1700059 5 0.4058 0.60046 0.000 0.000 0.024 0.236 0.740
#> SRR1700060 3 0.5731 0.45422 0.000 0.004 0.628 0.132 0.236
#> SRR1700061 2 0.3985 0.56710 0.000 0.804 0.004 0.120 0.072
#> SRR1700062 5 0.4702 0.64599 0.000 0.172 0.056 0.020 0.752
#> SRR1700063 2 0.5715 0.34930 0.000 0.564 0.040 0.368 0.028
#> SRR1700064 5 0.5656 0.34237 0.000 0.088 0.004 0.316 0.592
#> SRR1700065 5 0.7884 -0.04611 0.000 0.316 0.224 0.080 0.380
#> SRR1700066 3 0.2364 0.62702 0.000 0.008 0.908 0.020 0.064
#> SRR1700067 5 0.5980 0.48645 0.000 0.212 0.008 0.164 0.616
#> SRR1700068 2 0.7338 -0.03567 0.000 0.404 0.028 0.276 0.292
#> SRR1700069 5 0.3716 0.66851 0.000 0.152 0.012 0.024 0.812
#> SRR1700070 2 0.4431 0.50867 0.000 0.732 0.000 0.052 0.216
#> SRR1700071 2 0.5097 0.28357 0.000 0.568 0.004 0.396 0.032
#> SRR1700072 3 0.5685 0.50253 0.000 0.076 0.664 0.032 0.228
#> SRR1700073 5 0.0854 0.66537 0.000 0.008 0.004 0.012 0.976
#> SRR1700075 5 0.6484 0.12189 0.000 0.432 0.056 0.056 0.456
#> SRR1700074 2 0.5895 0.27198 0.000 0.536 0.084 0.372 0.008
#> SRR1700076 4 0.4224 0.41705 0.000 0.216 0.040 0.744 0.000
#> SRR1700077 4 0.5215 -0.01191 0.000 0.444 0.028 0.520 0.008
#> SRR1700078 5 0.0324 0.65886 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700080 5 0.3822 0.66413 0.000 0.040 0.012 0.132 0.816
#> SRR1700079 5 0.1725 0.67283 0.000 0.000 0.044 0.020 0.936
#> SRR1700081 3 0.6164 0.49505 0.000 0.056 0.652 0.108 0.184
#> SRR1700082 4 0.6026 0.51479 0.000 0.092 0.076 0.676 0.156
#> SRR1700083 5 0.6752 0.36899 0.000 0.032 0.296 0.144 0.528
#> SRR1700084 3 0.1943 0.61533 0.000 0.000 0.924 0.056 0.020
#> SRR1700085 5 0.6612 0.13158 0.000 0.328 0.008 0.180 0.484
#> SRR1700086 5 0.3840 0.59200 0.000 0.008 0.016 0.196 0.780
#> SRR1700087 4 0.7145 0.43614 0.000 0.184 0.132 0.568 0.116
#> SRR1700088 2 0.7463 -0.12616 0.000 0.364 0.032 0.296 0.308
#> SRR1700089 5 0.7577 0.15741 0.000 0.208 0.056 0.328 0.408
#> SRR1700091 5 0.5196 0.60702 0.000 0.080 0.012 0.212 0.696
#> SRR1700090 4 0.6764 0.12958 0.000 0.160 0.016 0.436 0.388
#> SRR1700092 4 0.5200 0.48816 0.000 0.172 0.024 0.720 0.084
#> SRR1700094 5 0.6846 0.26867 0.000 0.280 0.012 0.232 0.476
#> SRR1700093 4 0.5167 0.51529 0.000 0.124 0.036 0.740 0.100
#> SRR1700095 5 0.0324 0.65853 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700096 5 0.4902 0.56341 0.000 0.032 0.016 0.268 0.684
#> SRR1700097 2 0.8559 -0.17941 0.000 0.296 0.208 0.232 0.264
#> SRR1700098 4 0.5254 0.04994 0.000 0.016 0.020 0.516 0.448
#> SRR1700099 4 0.6732 0.35808 0.000 0.164 0.020 0.504 0.312
#> SRR1700100 4 0.5568 0.48480 0.000 0.188 0.064 0.696 0.052
#> SRR1700101 5 0.6799 0.11038 0.000 0.232 0.008 0.296 0.464
#> SRR1700102 4 0.4941 0.51123 0.000 0.080 0.004 0.708 0.208
#> SRR1700104 5 0.2054 0.66148 0.000 0.008 0.004 0.072 0.916
#> SRR1700103 5 0.3999 0.66038 0.000 0.068 0.008 0.116 0.808
#> SRR1700105 4 0.7013 0.10381 0.000 0.236 0.012 0.392 0.360
#> SRR1700106 5 0.0794 0.66425 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700107 5 0.5466 0.52083 0.000 0.192 0.000 0.152 0.656
#> SRR1700108 5 0.7066 0.08766 0.000 0.120 0.052 0.392 0.436
#> SRR1700109 4 0.6786 0.16593 0.000 0.164 0.016 0.436 0.384
#> SRR1700110 4 0.5255 0.31279 0.000 0.052 0.000 0.560 0.388
#> SRR1700112 2 0.5315 0.48306 0.000 0.700 0.012 0.172 0.116
#> SRR1700111 5 0.3582 0.65773 0.000 0.024 0.028 0.108 0.840
#> SRR1700113 5 0.6247 0.32345 0.000 0.204 0.008 0.208 0.580
#> SRR1700114 4 0.2599 0.51058 0.000 0.028 0.024 0.904 0.044
#> SRR1700115 5 0.3612 0.62412 0.000 0.016 0.004 0.184 0.796
#> SRR1700116 5 0.6222 0.58682 0.000 0.156 0.056 0.136 0.652
#> SRR1700117 3 0.7709 0.02091 0.000 0.372 0.388 0.100 0.140
#> SRR1700119 5 0.6887 0.25140 0.000 0.212 0.024 0.252 0.512
#> SRR1700118 5 0.7427 0.34735 0.000 0.196 0.064 0.256 0.484
#> SRR1700120 5 0.3359 0.67586 0.000 0.004 0.052 0.096 0.848
#> SRR1700121 5 0.1478 0.66070 0.000 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700122 5 0.4615 0.55644 0.000 0.052 0.004 0.220 0.724
#> SRR1700123 5 0.5279 0.62653 0.000 0.124 0.016 0.148 0.712
#> SRR1700125 5 0.0162 0.65735 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700126 3 0.3567 0.57990 0.000 0.052 0.832 0.112 0.004
#> SRR1700127 4 0.4353 0.46412 0.000 0.028 0.140 0.788 0.044
#> SRR1700124 5 0.6148 0.31711 0.000 0.060 0.032 0.400 0.508
#> SRR1700128 5 0.5748 0.51855 0.000 0.048 0.036 0.300 0.616
#> SRR1700129 5 0.6575 0.26055 0.000 0.392 0.012 0.144 0.452
#> SRR1700130 4 0.6852 0.01692 0.000 0.100 0.048 0.436 0.416
#> SRR1700132 5 0.4007 0.67315 0.000 0.056 0.088 0.032 0.824
#> SRR1700131 5 0.2338 0.66706 0.000 0.000 0.112 0.004 0.884
#> SRR1700133 5 0.5194 0.55432 0.000 0.068 0.008 0.252 0.672
#> SRR1700134 5 0.4017 0.64542 0.000 0.148 0.000 0.064 0.788
#> SRR1700135 4 0.5045 0.36000 0.000 0.032 0.008 0.620 0.340
#> SRR1700136 5 0.2748 0.65947 0.000 0.008 0.016 0.096 0.880
#> SRR1700137 5 0.1412 0.66924 0.000 0.004 0.008 0.036 0.952
#> SRR1700138 5 0.4746 0.65300 0.000 0.084 0.040 0.100 0.776
#> SRR1700140 5 0.2690 0.66613 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1700139 2 0.5864 0.03437 0.000 0.528 0.020 0.056 0.396
#> SRR1700141 5 0.5755 0.57145 0.000 0.100 0.016 0.244 0.640
#> SRR1700142 4 0.6966 -0.03003 0.000 0.028 0.156 0.420 0.396
#> SRR1700143 5 0.6754 0.01255 0.000 0.000 0.332 0.272 0.396
#> SRR1700144 4 0.7444 0.19720 0.000 0.304 0.200 0.444 0.052
#> SRR1700145 5 0.4335 0.62826 0.000 0.008 0.088 0.120 0.784
#> SRR1700146 5 0.4123 0.65152 0.000 0.092 0.004 0.108 0.796
#> SRR1700147 5 0.6359 0.42524 0.000 0.308 0.020 0.120 0.552
#> SRR1700149 3 0.5908 0.48039 0.000 0.176 0.656 0.144 0.024
#> SRR1700148 5 0.5576 0.43215 0.000 0.360 0.016 0.048 0.576
#> SRR1700150 4 0.7513 0.24103 0.000 0.312 0.048 0.416 0.224
#> SRR1700152 5 0.5364 0.64645 0.000 0.128 0.064 0.076 0.732
#> SRR1700151 5 0.0000 0.65607 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700153 5 0.2086 0.67969 0.000 0.048 0.008 0.020 0.924
#> SRR1700154 2 0.5059 0.32170 0.000 0.632 0.004 0.044 0.320
#> SRR1700155 2 0.4542 0.49546 0.000 0.724 0.008 0.232 0.036
#> SRR1700156 5 0.5750 0.35986 0.000 0.008 0.068 0.396 0.528
#> SRR1700158 5 0.7570 0.41319 0.000 0.232 0.140 0.124 0.504
#> SRR1700159 2 0.4013 0.58846 0.000 0.804 0.004 0.084 0.108
#> SRR1700157 5 0.5566 0.53250 0.000 0.140 0.012 0.172 0.676
#> SRR1700160 5 0.5908 0.57980 0.000 0.080 0.040 0.232 0.648
#> SRR1700161 5 0.6635 0.40609 0.000 0.252 0.012 0.212 0.524
#> SRR1700162 5 0.1965 0.67927 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1700164 5 0.1668 0.66916 0.000 0.000 0.028 0.032 0.940
#> SRR1700163 3 0.5940 0.48181 0.000 0.208 0.652 0.108 0.032
#> SRR1700165 2 0.6707 0.30928 0.000 0.576 0.040 0.204 0.180
#> SRR1700166 5 0.6653 0.35783 0.000 0.364 0.036 0.104 0.496
#> SRR1700168 5 0.6636 0.21565 0.000 0.396 0.016 0.140 0.448
#> SRR1700167 5 0.3243 0.66180 0.000 0.012 0.036 0.092 0.860
#> SRR1700170 4 0.4892 0.14487 0.000 0.408 0.020 0.568 0.004
#> SRR1700169 2 0.4341 0.30782 0.000 0.628 0.008 0.364 0.000
#> SRR1700171 3 0.4302 -0.01109 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1700172 5 0.4826 0.64646 0.000 0.088 0.012 0.156 0.744
#> SRR1700174 2 0.6105 0.32797 0.000 0.588 0.004 0.212 0.196
#> SRR1700173 5 0.2561 0.66390 0.000 0.000 0.020 0.096 0.884
#> SRR1700175 2 0.5281 0.51808 0.000 0.680 0.008 0.224 0.088
#> SRR1700176 5 0.6839 0.46151 0.000 0.056 0.252 0.132 0.560
#> SRR1700178 4 0.4142 0.32762 0.000 0.308 0.004 0.684 0.004
#> SRR1700177 5 0.0833 0.66544 0.000 0.004 0.004 0.016 0.976
#> SRR1700180 2 0.2286 0.58949 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1700179 4 0.4449 -0.03164 0.000 0.484 0.004 0.512 0.000
#> SRR1700181 2 0.2511 0.59515 0.000 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1700183 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.4299 0.42467 0.000 0.672 0.008 0.316 0.004
#> SRR1700184 2 0.4448 0.08721 0.000 0.516 0.004 0.480 0.000
#> SRR1700186 2 0.4037 0.41179 0.000 0.704 0.004 0.288 0.004
#> SRR1700187 3 0.2286 0.53712 0.108 0.000 0.888 0.000 0.004
#> SRR1700185 1 0.4321 0.50246 0.600 0.000 0.396 0.000 0.004
#> SRR1700188 4 0.6040 0.22944 0.000 0.356 0.004 0.528 0.112
#> SRR1700192 2 0.5206 0.42574 0.000 0.672 0.256 0.060 0.012
#> SRR1700190 3 0.2100 0.62004 0.000 0.012 0.924 0.048 0.016
#> SRR1700191 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.1195 0.61162 0.000 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR1700193 2 0.5099 0.36077 0.000 0.608 0.004 0.348 0.040
#> SRR1700195 2 0.2074 0.60537 0.000 0.920 0.000 0.044 0.036
#> SRR1700194 1 0.2732 0.79434 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.4025 0.39443 0.000 0.700 0.008 0.292 0.000
#> SRR1700197 3 0.0798 0.60795 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1700198 2 0.1270 0.59050 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700199 2 0.2648 0.56860 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1700200 2 0.3844 0.56406 0.000 0.808 0.008 0.144 0.040
#> SRR1700201 2 0.1965 0.58136 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1700202 2 0.1197 0.60001 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700203 2 0.2707 0.59380 0.000 0.860 0.008 0.132 0.000
#> SRR1700204 2 0.2971 0.56134 0.000 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR1700206 4 0.6504 0.40203 0.000 0.220 0.004 0.516 0.260
#> SRR1700207 2 0.4009 0.36111 0.000 0.684 0.004 0.312 0.000
#> SRR1700208 3 0.5146 0.48354 0.000 0.192 0.708 0.088 0.012
#> SRR1700205 2 0.4442 0.43328 0.000 0.688 0.000 0.028 0.284
#> SRR1700209 2 0.3398 0.54583 0.000 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR1700210 2 0.0771 0.59453 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700211 2 0.3521 0.54196 0.000 0.820 0.040 0.140 0.000
#> SRR1700212 2 0.1892 0.58340 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1700213 4 0.4655 -0.05547 0.000 0.476 0.012 0.512 0.000
#> SRR1700214 2 0.3491 0.49258 0.000 0.768 0.004 0.228 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.3809 0.50820 0.000 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR1700216 1 0.0000 0.85570 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3861 0.47729 0.000 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR1700219 2 0.0963 0.59056 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700222 3 0.1106 0.59891 0.024 0.012 0.964 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0162 0.58705 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700221 2 0.1168 0.59272 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR1700223 2 0.2516 0.57576 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1700224 2 0.4243 0.40725 0.000 0.712 0.024 0.264 0.000
#> SRR1700226 2 0.3635 0.51364 0.000 0.748 0.004 0.248 0.000
#> SRR1700229 2 0.6461 0.00513 0.000 0.444 0.032 0.440 0.084
#> SRR1700225 2 0.4231 0.53798 0.000 0.776 0.004 0.060 0.160
#> SRR1700227 2 0.4323 0.40143 0.000 0.656 0.012 0.332 0.000
#> SRR1700230 3 0.5268 0.02963 0.000 0.476 0.488 0.016 0.020
#> SRR1700231 2 0.6301 0.33424 0.000 0.592 0.016 0.212 0.180
#> SRR1700228 2 0.0703 0.58996 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700232 2 0.4238 0.58184 0.000 0.800 0.016 0.104 0.080
#> SRR1700233 2 0.5355 0.39370 0.000 0.660 0.000 0.120 0.220
#> SRR1700234 2 0.2825 0.58780 0.000 0.860 0.000 0.016 0.124
#> SRR1700235 2 0.4401 0.37470 0.000 0.684 0.004 0.296 0.016
#> SRR1700237 2 0.1106 0.59860 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1700236 2 0.2426 0.60256 0.000 0.900 0.000 0.064 0.036
#> SRR1700238 2 0.1544 0.59665 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1700239 3 0.1831 0.60541 0.004 0.076 0.920 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.4304 -0.26469 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.1588 0.60043 0.000 0.948 0.008 0.016 0.028
#> SRR1700243 2 0.3874 0.54649 0.000 0.776 0.008 0.200 0.016
#> SRR1700244 2 0.5602 0.39510 0.000 0.636 0.000 0.216 0.148
#> SRR1700242 2 0.4161 0.44550 0.000 0.704 0.280 0.000 0.016
#> SRR1700246 3 0.1197 0.60936 0.000 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.3949 0.36813 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1700247 3 0.1710 0.59478 0.040 0.000 0.940 0.004 0.016
#> SRR1700249 1 0.3837 0.66195 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.3895 0.43460 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1700248 2 0.1671 0.59588 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1700251 2 0.5122 0.09589 0.000 0.496 0.028 0.472 0.004
#> SRR1700252 4 0.5925 0.48158 0.000 0.128 0.000 0.556 0.316
#> SRR1700253 2 0.4305 0.01900 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1700256 2 0.4288 0.33875 0.000 0.612 0.004 0.384 0.000
#> SRR1700254 3 0.2833 0.50940 0.140 0.004 0.852 0.004 0.000
#> SRR1700255 2 0.4822 0.49073 0.000 0.728 0.008 0.192 0.072
#> SRR1700257 2 0.3611 0.51682 0.000 0.780 0.004 0.208 0.008
#> SRR1700258 2 0.6120 0.22981 0.000 0.556 0.000 0.268 0.176
#> SRR1700259 4 0.6598 0.39181 0.000 0.172 0.008 0.476 0.344
#> SRR1700260 5 0.0880 0.66401 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700261 2 0.5513 0.36986 0.000 0.632 0.000 0.252 0.116
#> SRR1700262 5 0.2471 0.65017 0.000 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700263 4 0.6188 0.17206 0.000 0.396 0.008 0.488 0.108
#> SRR1700264 2 0.4481 0.41706 0.000 0.668 0.004 0.312 0.016
#> SRR1700265 5 0.6598 0.14588 0.000 0.172 0.008 0.344 0.476
#> SRR1700266 5 0.6350 0.33139 0.000 0.180 0.012 0.236 0.572
#> SRR1700268 5 0.3969 0.53541 0.000 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1700270 4 0.5359 0.03599 0.000 0.452 0.008 0.504 0.036
#> SRR1700267 2 0.1740 0.59580 0.000 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR1700271 4 0.5894 0.50306 0.000 0.148 0.020 0.652 0.180
#> SRR1700272 5 0.4911 0.62596 0.000 0.124 0.008 0.132 0.736
#> SRR1700273 2 0.2997 0.57310 0.000 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR1700274 5 0.3205 0.66139 0.000 0.176 0.004 0.004 0.816
#> SRR1700277 4 0.5726 0.20317 0.000 0.092 0.372 0.536 0.000
#> SRR1700275 5 0.4127 0.53464 0.000 0.312 0.000 0.008 0.680
#> SRR1700276 4 0.6962 0.17420 0.000 0.336 0.008 0.400 0.256
#> SRR1700278 2 0.3728 0.51080 0.000 0.748 0.000 0.008 0.244
#> SRR1700279 5 0.3062 0.68147 0.000 0.080 0.004 0.048 0.868
#> SRR1700280 5 0.7075 -0.19557 0.000 0.232 0.016 0.348 0.404
#> SRR1700281 4 0.4205 0.52433 0.000 0.056 0.004 0.776 0.164
#> SRR1700283 2 0.4489 0.25756 0.000 0.572 0.000 0.008 0.420
#> SRR1700282 4 0.7678 0.39189 0.000 0.212 0.068 0.424 0.296
#> SRR1700284 5 0.4956 0.52684 0.000 0.312 0.004 0.040 0.644
#> SRR1700285 5 0.6632 0.16166 0.000 0.392 0.016 0.140 0.452
#> SRR1700286 5 0.6831 -0.08075 0.000 0.228 0.008 0.316 0.448
#> SRR1700287 5 0.0000 0.65607 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700290 3 0.2690 0.59169 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1700289 5 0.2046 0.67352 0.000 0.016 0.000 0.068 0.916
#> SRR1700288 4 0.4553 0.31268 0.000 0.328 0.004 0.652 0.016
#> SRR1700292 5 0.5193 0.52639 0.000 0.272 0.008 0.060 0.660
#> SRR1700291 5 0.4326 0.64678 0.000 0.084 0.008 0.124 0.784
#> SRR1700293 2 0.1571 0.59216 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1700294 2 0.5186 0.33766 0.000 0.624 0.004 0.052 0.320
#> SRR1700295 2 0.6495 0.48763 0.000 0.636 0.128 0.084 0.152
#> SRR1700297 4 0.6182 0.39009 0.000 0.256 0.004 0.568 0.172
#> SRR1700296 5 0.3496 0.64675 0.000 0.200 0.000 0.012 0.788
#> SRR1700298 2 0.4121 0.52263 0.000 0.760 0.008 0.208 0.024
#> SRR1700299 5 0.6375 0.34336 0.000 0.192 0.008 0.244 0.556
#> SRR1700300 5 0.6363 0.27913 0.000 0.292 0.008 0.160 0.540
#> SRR1700302 5 0.2516 0.65683 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1700301 5 0.4886 0.24931 0.000 0.448 0.000 0.024 0.528
#> SRR1700303 2 0.5446 0.27984 0.000 0.576 0.004 0.060 0.360
#> SRR1700304 2 0.3772 0.53869 0.000 0.792 0.000 0.036 0.172
#> SRR1700305 2 0.5279 0.44057 0.000 0.644 0.012 0.292 0.052
#> SRR1700306 5 0.2848 0.66392 0.000 0.156 0.000 0.004 0.840
#> SRR1700308 5 0.5981 0.28949 0.000 0.384 0.004 0.100 0.512
#> SRR1700307 5 0.6432 0.52494 0.000 0.068 0.096 0.216 0.620
#> SRR1700309 5 0.5192 0.55235 0.000 0.056 0.016 0.248 0.680
#> SRR1700310 2 0.3646 0.58302 0.000 0.816 0.004 0.036 0.144
#> SRR1700311 5 0.2248 0.67851 0.000 0.088 0.000 0.012 0.900
#> SRR1700312 5 0.7013 0.03639 0.000 0.332 0.012 0.244 0.412
#> SRR1700313 5 0.6112 0.13287 0.000 0.344 0.000 0.140 0.516
#> SRR1700314 5 0.5519 0.18394 0.000 0.048 0.008 0.424 0.520
#> SRR1700315 5 0.1697 0.67981 0.000 0.060 0.000 0.008 0.932
#> SRR1700316 2 0.6738 -0.08888 0.000 0.412 0.000 0.308 0.280
#> SRR1700317 4 0.6704 0.41841 0.000 0.196 0.008 0.468 0.328
#> SRR1700318 5 0.3664 0.67958 0.000 0.096 0.024 0.040 0.840
#> SRR1700319 5 0.5684 0.54749 0.000 0.240 0.016 0.096 0.648
#> SRR1700320 5 0.3452 0.61482 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1700322 2 0.4142 0.55575 0.000 0.752 0.012 0.220 0.016
#> SRR1700321 2 0.2278 0.60108 0.000 0.908 0.000 0.032 0.060
#> SRR1700323 5 0.0162 0.65717 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700324 2 0.5028 0.18530 0.000 0.552 0.008 0.020 0.420
#> SRR1700325 4 0.6738 0.25188 0.000 0.144 0.020 0.448 0.388
#> SRR1700326 3 0.3595 0.58962 0.000 0.024 0.836 0.116 0.024
#> SRR1700327 2 0.4171 0.58099 0.000 0.784 0.000 0.104 0.112
#> SRR1700329 5 0.4744 0.63483 0.000 0.148 0.008 0.096 0.748
#> SRR1700328 5 0.5473 0.47199 0.000 0.016 0.056 0.300 0.628
#> SRR1700330 5 0.1764 0.66930 0.000 0.000 0.064 0.008 0.928
#> SRR1700331 5 0.4276 0.38448 0.000 0.380 0.000 0.004 0.616
#> SRR1700332 5 0.0566 0.66403 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1700333 2 0.2672 0.59074 0.000 0.872 0.008 0.116 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 5 0.4527 0.459175 0.000 0.048 0.004 0.252 0.688 0.008
#> SRR1699875 5 0.4655 0.438866 0.000 0.104 0.000 0.200 0.692 0.004
#> SRR1699876 5 0.2948 0.549938 0.000 0.008 0.000 0.188 0.804 0.000
#> SRR1699877 2 0.6606 0.097747 0.000 0.464 0.012 0.056 0.356 0.112
#> SRR1699879 5 0.5510 0.331328 0.000 0.304 0.000 0.140 0.552 0.004
#> SRR1699878 2 0.4705 0.173709 0.000 0.520 0.000 0.440 0.004 0.036
#> SRR1699880 2 0.6448 -0.110840 0.000 0.436 0.012 0.392 0.128 0.032
#> SRR1699881 4 0.8013 0.300921 0.000 0.232 0.076 0.424 0.148 0.120
#> SRR1699882 2 0.6235 -0.073308 0.000 0.368 0.000 0.324 0.304 0.004
#> SRR1699883 2 0.7058 -0.154705 0.000 0.376 0.000 0.364 0.144 0.116
#> SRR1699884 4 0.5929 0.363580 0.000 0.196 0.000 0.580 0.192 0.032
#> SRR1699885 2 0.3364 0.586159 0.000 0.832 0.000 0.088 0.068 0.012
#> SRR1699886 5 0.6042 0.002841 0.000 0.428 0.004 0.112 0.432 0.024
#> SRR1699888 4 0.4191 0.359916 0.000 0.060 0.020 0.788 0.016 0.116
#> SRR1699889 5 0.0260 0.586065 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1699890 5 0.4318 0.422980 0.000 0.340 0.000 0.020 0.632 0.008
#> SRR1699887 4 0.4300 0.010730 0.000 0.444 0.000 0.540 0.008 0.008
#> SRR1699891 5 0.0405 0.587106 0.000 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1699892 5 0.6092 0.351537 0.000 0.220 0.000 0.168 0.568 0.044
#> SRR1699893 5 0.4712 0.403546 0.000 0.284 0.000 0.032 0.656 0.028
#> SRR1699894 2 0.5149 -0.167181 0.000 0.468 0.000 0.048 0.468 0.016
#> SRR1699895 5 0.6524 0.126251 0.000 0.160 0.000 0.304 0.480 0.056
#> SRR1699896 4 0.4772 0.402613 0.000 0.248 0.000 0.672 0.064 0.016
#> SRR1699897 4 0.5300 0.256214 0.000 0.340 0.000 0.560 0.008 0.092
#> SRR1699898 5 0.8149 -0.282804 0.000 0.092 0.088 0.240 0.388 0.192
#> SRR1699900 2 0.5865 0.363433 0.000 0.576 0.004 0.068 0.292 0.060
#> SRR1699899 5 0.3958 0.567252 0.000 0.028 0.000 0.196 0.756 0.020
#> SRR1699902 2 0.5675 0.510278 0.000 0.684 0.148 0.044 0.084 0.040
#> SRR1699901 3 0.4438 0.548182 0.000 0.088 0.752 0.008 0.140 0.012
#> SRR1699903 5 0.1745 0.604541 0.000 0.068 0.000 0.000 0.920 0.012
#> SRR1699904 2 0.4295 0.568876 0.000 0.772 0.000 0.112 0.076 0.040
#> SRR1699905 5 0.3515 0.585209 0.000 0.008 0.024 0.028 0.828 0.112
#> SRR1699906 4 0.6107 0.254720 0.000 0.176 0.000 0.516 0.284 0.024
#> SRR1699907 5 0.6072 0.190292 0.000 0.268 0.000 0.192 0.520 0.020
#> SRR1699908 2 0.3986 0.502626 0.000 0.732 0.000 0.032 0.228 0.008
#> SRR1699909 5 0.2146 0.608873 0.000 0.060 0.000 0.008 0.908 0.024
#> SRR1699910 2 0.5527 0.155463 0.000 0.540 0.020 0.004 0.364 0.072
#> SRR1699911 5 0.3615 0.599642 0.000 0.036 0.016 0.032 0.836 0.080
#> SRR1699912 5 0.0436 0.586797 0.000 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1699913 5 0.6777 -0.089462 0.000 0.392 0.000 0.116 0.392 0.100
#> SRR1699914 5 0.3518 0.581344 0.000 0.016 0.112 0.004 0.824 0.044
#> SRR1699915 5 0.1285 0.595409 0.000 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1699916 4 0.6717 0.102543 0.000 0.308 0.000 0.348 0.312 0.032
#> SRR1699917 5 0.4508 0.595072 0.000 0.064 0.016 0.076 0.780 0.064
#> SRR1699918 4 0.5215 0.401630 0.000 0.164 0.000 0.676 0.128 0.032
#> SRR1699919 4 0.4758 0.182896 0.000 0.016 0.000 0.596 0.356 0.032
#> SRR1699920 5 0.5124 0.186143 0.000 0.000 0.008 0.444 0.488 0.060
#> SRR1699921 5 0.3419 0.573725 0.000 0.180 0.000 0.016 0.792 0.012
#> SRR1699922 2 0.1444 0.580362 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1699923 3 0.4307 0.597586 0.000 0.048 0.800 0.032 0.064 0.056
#> SRR1699924 5 0.7524 -0.233622 0.000 0.200 0.000 0.232 0.372 0.196
#> SRR1699925 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.2766 0.605878 0.000 0.092 0.000 0.012 0.868 0.028
#> SRR1699927 5 0.5341 0.185030 0.000 0.068 0.000 0.400 0.516 0.016
#> SRR1699929 5 0.6026 0.341828 0.000 0.180 0.000 0.256 0.540 0.024
#> SRR1699928 5 0.1411 0.599388 0.000 0.004 0.000 0.060 0.936 0.000
#> SRR1699930 4 0.5956 0.361960 0.000 0.116 0.000 0.628 0.140 0.116
#> SRR1699931 5 0.4460 0.402957 0.000 0.036 0.000 0.304 0.652 0.008
#> SRR1699933 2 0.6464 0.198205 0.000 0.524 0.020 0.064 0.312 0.080
#> SRR1699932 5 0.6139 -0.022235 0.000 0.208 0.000 0.316 0.464 0.012
#> SRR1699934 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.3076 0.487588 0.000 0.000 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1699936 4 0.3740 0.397203 0.000 0.252 0.000 0.728 0.008 0.012
#> SRR1699937 2 0.3888 0.493316 0.000 0.740 0.000 0.224 0.008 0.028
#> SRR1699938 4 0.5092 0.305689 0.000 0.328 0.000 0.588 0.008 0.076
#> SRR1699940 5 0.4129 0.591648 0.000 0.012 0.048 0.044 0.800 0.096
#> SRR1699939 4 0.6407 0.223960 0.000 0.272 0.000 0.408 0.304 0.016
#> SRR1699941 5 0.4124 0.561107 0.000 0.032 0.012 0.108 0.796 0.052
#> SRR1699942 4 0.7219 -0.177912 0.000 0.048 0.024 0.424 0.244 0.260
#> SRR1699943 4 0.5543 0.116781 0.000 0.076 0.000 0.520 0.380 0.024
#> SRR1699944 4 0.5479 0.395892 0.000 0.172 0.000 0.640 0.160 0.028
#> SRR1699945 5 0.2515 0.602761 0.000 0.000 0.040 0.052 0.892 0.016
#> SRR1699946 5 0.1720 0.606019 0.000 0.032 0.000 0.040 0.928 0.000
#> SRR1699947 4 0.6885 0.052752 0.000 0.084 0.016 0.472 0.320 0.108
#> SRR1699948 4 0.5296 0.363046 0.000 0.260 0.000 0.588 0.000 0.152
#> SRR1699949 5 0.2597 0.553820 0.000 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1699950 5 0.1889 0.603270 0.000 0.004 0.000 0.056 0.920 0.020
#> SRR1699951 5 0.3547 0.374189 0.000 0.300 0.000 0.000 0.696 0.004
#> SRR1699952 4 0.5316 0.344510 0.000 0.192 0.000 0.652 0.024 0.132
#> SRR1699953 2 0.6040 -0.045308 0.000 0.420 0.000 0.288 0.292 0.000
#> SRR1699954 5 0.4422 0.545182 0.000 0.004 0.148 0.028 0.756 0.064
#> SRR1699955 2 0.4839 0.566616 0.000 0.736 0.000 0.084 0.088 0.092
#> SRR1699956 5 0.0146 0.583224 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1699957 2 0.4720 0.440379 0.000 0.640 0.000 0.300 0.048 0.012
#> SRR1699959 5 0.6489 0.411924 0.000 0.204 0.024 0.124 0.584 0.064
#> SRR1699958 5 0.3821 0.579829 0.000 0.052 0.000 0.084 0.812 0.052
#> SRR1699960 5 0.5182 0.522823 0.000 0.080 0.000 0.120 0.704 0.096
#> SRR1699961 2 0.6166 0.216530 0.000 0.512 0.040 0.360 0.064 0.024
#> SRR1699962 2 0.1625 0.582993 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012 0.000
#> SRR1699963 4 0.6527 0.303855 0.000 0.184 0.084 0.604 0.044 0.084
#> SRR1699964 2 0.4543 0.514891 0.000 0.692 0.000 0.224 0.080 0.004
#> SRR1699965 4 0.3636 0.314221 0.000 0.320 0.000 0.676 0.000 0.004
#> SRR1699966 5 0.3455 0.590798 0.000 0.088 0.000 0.068 0.828 0.016
#> SRR1699967 2 0.3659 0.576151 0.000 0.804 0.016 0.148 0.012 0.020
#> SRR1699968 2 0.4421 0.428611 0.000 0.684 0.000 0.056 0.256 0.004
#> SRR1699969 5 0.3409 0.607890 0.000 0.060 0.000 0.036 0.840 0.064
#> SRR1699971 4 0.6218 0.416062 0.000 0.132 0.040 0.644 0.112 0.072
#> SRR1699970 2 0.5186 0.142758 0.000 0.476 0.000 0.436 0.000 0.088
#> SRR1699972 5 0.7859 -0.261380 0.000 0.268 0.028 0.272 0.328 0.104
#> SRR1699973 5 0.1781 0.599424 0.000 0.008 0.000 0.060 0.924 0.008
#> SRR1699974 3 0.1528 0.617553 0.000 0.048 0.936 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699975 2 0.4779 0.138308 0.000 0.524 0.000 0.024 0.436 0.016
#> SRR1699976 5 0.6910 -0.006502 0.000 0.132 0.000 0.208 0.496 0.164
#> SRR1699977 5 0.6655 -0.092067 0.000 0.024 0.016 0.392 0.396 0.172
#> SRR1699978 3 0.4037 0.317037 0.000 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR1699979 5 0.7134 -0.113981 0.000 0.300 0.020 0.052 0.428 0.200
#> SRR1699980 5 0.4460 0.546559 0.000 0.008 0.004 0.160 0.736 0.092
#> SRR1699981 5 0.0713 0.590388 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699982 5 0.0914 0.596140 0.000 0.016 0.000 0.016 0.968 0.000
#> SRR1699983 5 0.3507 0.546563 0.000 0.232 0.000 0.012 0.752 0.004
#> SRR1699984 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.2954 0.567347 0.000 0.004 0.000 0.096 0.852 0.048
#> SRR1699986 3 0.5089 0.464922 0.000 0.200 0.680 0.036 0.000 0.084
#> SRR1699988 2 0.4518 0.278819 0.000 0.612 0.004 0.012 0.356 0.016
#> SRR1699987 5 0.3029 0.567748 0.000 0.008 0.000 0.052 0.852 0.088
#> SRR1699989 5 0.6013 0.132499 0.000 0.400 0.000 0.148 0.436 0.016
#> SRR1699990 5 0.4274 0.237926 0.000 0.380 0.000 0.012 0.600 0.008
#> SRR1699992 4 0.6003 0.194321 0.000 0.164 0.012 0.600 0.028 0.196
#> SRR1699991 4 0.5606 0.327977 0.000 0.012 0.120 0.680 0.064 0.124
#> SRR1699993 5 0.3469 0.547491 0.000 0.004 0.184 0.004 0.788 0.020
#> SRR1699994 4 0.7427 0.192595 0.000 0.096 0.324 0.412 0.140 0.028
#> SRR1699995 3 0.2355 0.553176 0.112 0.000 0.876 0.000 0.004 0.008
#> SRR1699996 4 0.5458 0.282926 0.000 0.320 0.000 0.536 0.000 0.144
#> SRR1699997 5 0.0436 0.585921 0.000 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1699998 2 0.5883 0.488235 0.000 0.648 0.032 0.116 0.172 0.032
#> SRR1699999 3 0.0458 0.615650 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700000 5 0.4406 0.291668 0.000 0.040 0.336 0.000 0.624 0.000
#> SRR1700002 2 0.7306 -0.113716 0.000 0.408 0.012 0.296 0.084 0.200
#> SRR1700001 2 0.6198 -0.137134 0.000 0.372 0.268 0.004 0.356 0.000
#> SRR1700003 2 0.7649 -0.317041 0.000 0.392 0.016 0.124 0.252 0.216
#> SRR1700004 5 0.3052 0.601730 0.000 0.076 0.000 0.008 0.852 0.064
#> SRR1700005 1 0.3050 0.725252 0.764 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.2794 0.563330 0.000 0.860 0.000 0.060 0.000 0.080
#> SRR1700007 5 0.0000 0.581521 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 5 0.5797 0.488857 0.000 0.080 0.068 0.032 0.676 0.144
#> SRR1700009 3 0.3810 -0.061782 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 5 0.5046 0.500588 0.000 0.000 0.188 0.048 0.692 0.072
#> SRR1700011 5 0.6587 -0.011469 0.000 0.096 0.000 0.232 0.528 0.144
#> SRR1700013 2 0.5155 0.437136 0.000 0.684 0.000 0.152 0.032 0.132
#> SRR1700012 5 0.1409 0.601212 0.000 0.032 0.000 0.008 0.948 0.012
#> SRR1700014 4 0.6358 -0.037357 0.000 0.028 0.000 0.464 0.312 0.196
#> SRR1700015 4 0.5997 -0.049336 0.000 0.068 0.000 0.456 0.416 0.060
#> SRR1700016 3 0.0000 0.614128 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 4 0.3370 0.420454 0.000 0.140 0.004 0.812 0.000 0.044
#> SRR1700017 5 0.7354 -0.291630 0.000 0.176 0.012 0.108 0.428 0.276
#> SRR1700019 5 0.2520 0.610532 0.000 0.032 0.000 0.068 0.888 0.012
#> SRR1700020 3 0.5891 0.451032 0.000 0.004 0.608 0.036 0.168 0.184
#> SRR1700021 5 0.5114 0.493272 0.000 0.048 0.000 0.240 0.660 0.052
#> SRR1700023 5 0.2972 0.589114 0.000 0.000 0.000 0.128 0.836 0.036
#> SRR1700022 5 0.7145 -0.335070 0.000 0.048 0.016 0.328 0.384 0.224
#> SRR1700024 5 0.7002 -0.030933 0.000 0.112 0.000 0.160 0.448 0.280
#> SRR1700025 4 0.5547 0.325592 0.000 0.244 0.000 0.592 0.012 0.152
#> SRR1700026 6 0.7450 0.325838 0.000 0.144 0.016 0.348 0.120 0.372
#> SRR1700027 4 0.5168 0.322089 0.000 0.048 0.016 0.692 0.044 0.200
#> SRR1700028 5 0.3468 0.577531 0.000 0.028 0.000 0.148 0.808 0.016
#> SRR1700029 5 0.5795 0.217855 0.000 0.044 0.016 0.416 0.488 0.036
#> SRR1700030 5 0.3691 0.520657 0.000 0.260 0.000 0.008 0.724 0.008
#> SRR1700031 3 0.4924 0.469143 0.000 0.000 0.668 0.212 0.112 0.008
#> SRR1700032 5 0.5010 0.237293 0.000 0.368 0.000 0.028 0.572 0.032
#> SRR1700034 3 0.2527 0.493165 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.4474 0.302408 0.000 0.004 0.000 0.412 0.560 0.024
#> SRR1700033 3 0.6939 0.213054 0.000 0.032 0.468 0.124 0.052 0.324
#> SRR1700036 4 0.4576 0.378863 0.000 0.040 0.000 0.748 0.120 0.092
#> SRR1700037 5 0.0806 0.592965 0.000 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1700038 2 0.2743 0.549881 0.000 0.828 0.000 0.164 0.000 0.008
#> SRR1700039 5 0.5164 0.573851 0.000 0.072 0.080 0.028 0.736 0.084
#> SRR1700040 5 0.7721 -0.043280 0.000 0.136 0.048 0.160 0.464 0.192
#> SRR1700041 4 0.6115 0.290609 0.000 0.072 0.000 0.592 0.144 0.192
#> SRR1700042 4 0.6729 0.033508 0.000 0.004 0.204 0.532 0.100 0.160
#> SRR1700043 3 0.4924 0.522688 0.000 0.032 0.720 0.024 0.180 0.044
#> SRR1700045 2 0.3826 0.564658 0.000 0.796 0.012 0.132 0.004 0.056
#> SRR1700044 2 0.1913 0.587136 0.000 0.924 0.000 0.044 0.016 0.016
#> SRR1700046 4 0.5162 0.333718 0.000 0.116 0.000 0.692 0.044 0.148
#> SRR1700047 5 0.2095 0.600592 0.000 0.000 0.016 0.040 0.916 0.028
#> SRR1700048 2 0.7715 -0.436849 0.000 0.332 0.004 0.268 0.200 0.196
#> SRR1700049 3 0.2830 0.578716 0.000 0.000 0.836 0.000 0.144 0.020
#> SRR1700050 5 0.5582 0.330257 0.000 0.000 0.228 0.012 0.592 0.168
#> SRR1700051 3 0.1155 0.616452 0.000 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1700052 3 0.8526 -0.234841 0.000 0.220 0.320 0.124 0.236 0.100
#> SRR1700053 5 0.4583 0.469086 0.000 0.224 0.000 0.040 0.704 0.032
#> SRR1700054 2 0.5556 0.383180 0.000 0.628 0.012 0.112 0.016 0.232
#> SRR1700055 1 0.5502 0.658870 0.500 0.000 0.136 0.000 0.000 0.364
#> SRR1700056 5 0.6661 0.144026 0.000 0.000 0.144 0.104 0.520 0.232
#> SRR1700057 5 0.3058 0.586454 0.000 0.000 0.108 0.024 0.848 0.020
#> SRR1700058 2 0.6308 0.205160 0.000 0.472 0.396 0.056 0.032 0.044
#> SRR1700059 5 0.5301 0.241109 0.000 0.000 0.000 0.132 0.568 0.300
#> SRR1700060 3 0.6167 0.368612 0.000 0.000 0.584 0.092 0.216 0.108
#> SRR1700061 2 0.4323 0.548549 0.000 0.776 0.000 0.072 0.060 0.092
#> SRR1700062 5 0.4415 0.569506 0.000 0.156 0.076 0.016 0.748 0.004
#> SRR1700063 2 0.6312 0.188393 0.000 0.480 0.020 0.360 0.020 0.120
#> SRR1700064 5 0.5583 0.129345 0.000 0.064 0.000 0.412 0.492 0.032
#> SRR1700065 5 0.7905 -0.245214 0.000 0.308 0.172 0.040 0.360 0.120
#> SRR1700066 3 0.1844 0.626637 0.000 0.000 0.924 0.004 0.048 0.024
#> SRR1700067 5 0.6522 0.308484 0.000 0.180 0.000 0.120 0.556 0.144
#> SRR1700068 2 0.7078 -0.078394 0.000 0.352 0.000 0.292 0.288 0.068
#> SRR1700069 5 0.3818 0.597944 0.000 0.132 0.012 0.020 0.804 0.032
#> SRR1700070 2 0.4293 0.516306 0.000 0.728 0.000 0.024 0.212 0.036
#> SRR1700071 2 0.6156 0.222698 0.000 0.504 0.000 0.292 0.024 0.180
#> SRR1700072 3 0.5333 0.464360 0.000 0.064 0.676 0.032 0.208 0.020
#> SRR1700073 5 0.0767 0.590070 0.000 0.008 0.000 0.004 0.976 0.012
#> SRR1700075 5 0.6235 0.081777 0.000 0.412 0.020 0.036 0.456 0.076
#> SRR1700074 2 0.6527 0.254239 0.000 0.496 0.044 0.280 0.004 0.176
#> SRR1700076 4 0.3546 0.398288 0.000 0.128 0.008 0.808 0.000 0.056
#> SRR1700077 4 0.6128 0.054292 0.000 0.392 0.004 0.420 0.008 0.176
#> SRR1700078 5 0.0820 0.590229 0.000 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1700080 5 0.4323 0.566071 0.000 0.028 0.004 0.196 0.740 0.032
#> SRR1700079 5 0.2575 0.596963 0.000 0.000 0.024 0.004 0.872 0.100
#> SRR1700081 3 0.6697 0.371167 0.000 0.040 0.576 0.056 0.176 0.152
#> SRR1700082 4 0.7199 -0.306463 0.000 0.076 0.024 0.448 0.148 0.304
#> SRR1700083 5 0.6968 0.211197 0.000 0.028 0.260 0.136 0.508 0.068
#> SRR1700084 3 0.1871 0.620977 0.000 0.000 0.928 0.024 0.016 0.032
#> SRR1700085 5 0.6852 -0.048412 0.000 0.328 0.000 0.096 0.436 0.140
#> SRR1700086 5 0.4049 0.482207 0.000 0.004 0.000 0.256 0.708 0.032
#> SRR1700087 4 0.8025 -0.385517 0.000 0.148 0.092 0.340 0.080 0.340
#> SRR1700088 2 0.7781 -0.373608 0.000 0.324 0.008 0.180 0.284 0.204
#> SRR1700089 5 0.7404 -0.190607 0.000 0.124 0.004 0.340 0.348 0.184
#> SRR1700091 5 0.5615 0.469231 0.000 0.064 0.000 0.180 0.648 0.108
#> SRR1700090 5 0.7272 -0.313439 0.000 0.096 0.004 0.316 0.380 0.204
#> SRR1700092 4 0.6595 -0.080247 0.000 0.132 0.012 0.540 0.068 0.248
#> SRR1700094 5 0.7298 -0.122345 0.000 0.248 0.000 0.148 0.416 0.188
#> SRR1700093 4 0.6282 -0.159983 0.000 0.104 0.000 0.532 0.076 0.288
#> SRR1700095 5 0.0458 0.585566 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700096 5 0.5662 0.242626 0.000 0.020 0.000 0.128 0.576 0.276
#> SRR1700097 2 0.8918 -0.460839 0.000 0.244 0.160 0.172 0.212 0.212
#> SRR1700098 4 0.6196 -0.234140 0.000 0.012 0.000 0.416 0.368 0.204
#> SRR1700099 4 0.7415 -0.178516 0.000 0.128 0.000 0.356 0.276 0.240
#> SRR1700100 4 0.5741 0.354491 0.000 0.168 0.020 0.656 0.036 0.120
#> SRR1700101 5 0.7591 -0.422057 0.000 0.212 0.000 0.208 0.352 0.228
#> SRR1700102 4 0.5780 0.187127 0.000 0.060 0.000 0.628 0.184 0.128
#> SRR1700104 5 0.2510 0.568096 0.000 0.008 0.000 0.028 0.884 0.080
#> SRR1700103 5 0.4569 0.522374 0.000 0.060 0.000 0.056 0.748 0.136
#> SRR1700105 6 0.7657 0.469474 0.000 0.184 0.000 0.248 0.276 0.292
#> SRR1700106 5 0.0914 0.589385 0.000 0.000 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1700107 5 0.5482 0.425281 0.000 0.184 0.000 0.120 0.652 0.044
#> SRR1700108 5 0.7200 -0.450285 0.000 0.068 0.008 0.224 0.372 0.328
#> SRR1700109 6 0.7470 0.509756 0.000 0.140 0.000 0.224 0.304 0.332
#> SRR1700110 4 0.5580 0.129050 0.000 0.040 0.000 0.552 0.344 0.064
#> SRR1700112 2 0.5980 0.337946 0.000 0.620 0.000 0.112 0.100 0.168
#> SRR1700111 5 0.4453 0.471391 0.000 0.012 0.004 0.048 0.712 0.224
#> SRR1700113 5 0.6307 0.207461 0.000 0.188 0.000 0.216 0.544 0.052
#> SRR1700114 4 0.4074 0.153537 0.000 0.020 0.000 0.756 0.040 0.184
#> SRR1700115 5 0.4816 0.397854 0.000 0.016 0.000 0.100 0.696 0.188
#> SRR1700116 5 0.6581 0.275551 0.000 0.148 0.008 0.072 0.544 0.228
#> SRR1700117 3 0.7689 -0.070285 0.000 0.304 0.408 0.044 0.112 0.132
#> SRR1700119 5 0.6406 0.121397 0.000 0.192 0.008 0.336 0.448 0.016
#> SRR1700118 5 0.6935 -0.076482 0.000 0.108 0.000 0.136 0.420 0.336
#> SRR1700120 5 0.3559 0.600648 0.000 0.004 0.020 0.108 0.824 0.044
#> SRR1700121 5 0.2030 0.572534 0.000 0.000 0.000 0.028 0.908 0.064
#> SRR1700122 5 0.5019 0.433348 0.000 0.044 0.000 0.156 0.704 0.096
#> SRR1700123 5 0.5589 0.490286 0.000 0.088 0.000 0.108 0.664 0.140
#> SRR1700125 5 0.0146 0.582452 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700126 3 0.3916 0.543377 0.000 0.016 0.792 0.056 0.004 0.132
#> SRR1700127 4 0.5760 0.008134 0.000 0.012 0.084 0.588 0.028 0.288
#> SRR1700124 5 0.6881 -0.287634 0.000 0.040 0.004 0.276 0.388 0.292
#> SRR1700128 5 0.6483 0.153244 0.000 0.036 0.008 0.204 0.520 0.232
#> SRR1700129 5 0.6868 -0.053890 0.000 0.368 0.000 0.072 0.384 0.176
#> SRR1700130 5 0.7382 -0.365379 0.000 0.072 0.012 0.320 0.340 0.256
#> SRR1700132 5 0.4476 0.586149 0.000 0.048 0.092 0.028 0.784 0.048
#> SRR1700131 5 0.2402 0.587643 0.000 0.000 0.120 0.000 0.868 0.012
#> SRR1700133 5 0.5697 0.444434 0.000 0.056 0.000 0.196 0.632 0.116
#> SRR1700134 5 0.3872 0.567181 0.000 0.144 0.000 0.076 0.776 0.004
#> SRR1700135 4 0.6001 0.006469 0.000 0.016 0.004 0.524 0.304 0.152
#> SRR1700136 5 0.3459 0.542924 0.000 0.008 0.004 0.044 0.820 0.124
#> SRR1700137 5 0.2182 0.596004 0.000 0.004 0.004 0.016 0.904 0.072
#> SRR1700138 5 0.4737 0.558852 0.000 0.080 0.000 0.132 0.736 0.052
#> SRR1700140 5 0.2416 0.592060 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1700139 2 0.6056 -0.079602 0.000 0.484 0.004 0.024 0.368 0.120
#> SRR1700141 5 0.5988 0.422892 0.000 0.068 0.000 0.248 0.584 0.100
#> SRR1700142 6 0.7482 0.388502 0.000 0.020 0.072 0.236 0.320 0.352
#> SRR1700143 5 0.7410 -0.250465 0.000 0.000 0.264 0.220 0.376 0.140
#> SRR1700144 6 0.7900 0.214448 0.000 0.224 0.120 0.232 0.036 0.388
#> SRR1700145 5 0.5067 0.413697 0.000 0.008 0.044 0.048 0.688 0.212
#> SRR1700146 5 0.4564 0.510719 0.000 0.076 0.000 0.044 0.748 0.132
#> SRR1700147 5 0.6619 0.100294 0.000 0.260 0.000 0.060 0.488 0.192
#> SRR1700149 3 0.6911 0.292232 0.000 0.168 0.496 0.064 0.016 0.256
#> SRR1700148 5 0.5446 0.373030 0.000 0.332 0.000 0.056 0.572 0.040
#> SRR1700150 4 0.7644 -0.289615 0.000 0.244 0.000 0.328 0.216 0.212
#> SRR1700152 5 0.5717 0.526872 0.000 0.108 0.036 0.048 0.684 0.124
#> SRR1700151 5 0.0000 0.581521 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700153 5 0.1948 0.603038 0.000 0.048 0.008 0.012 0.924 0.008
#> SRR1700154 2 0.4980 0.295096 0.000 0.616 0.000 0.036 0.316 0.032
#> SRR1700155 2 0.5456 0.409446 0.000 0.648 0.000 0.156 0.032 0.164
#> SRR1700156 5 0.6241 -0.226512 0.000 0.000 0.016 0.196 0.416 0.372
#> SRR1700158 5 0.7921 0.014398 0.000 0.172 0.136 0.048 0.420 0.224
#> SRR1700159 2 0.4050 0.569360 0.000 0.776 0.000 0.104 0.108 0.012
#> SRR1700157 5 0.5974 0.389671 0.000 0.120 0.004 0.168 0.628 0.080
#> SRR1700160 5 0.6695 0.150209 0.000 0.052 0.008 0.168 0.488 0.284
#> SRR1700161 5 0.7137 0.075022 0.000 0.192 0.000 0.148 0.460 0.200
#> SRR1700162 5 0.1765 0.605033 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1700164 5 0.1769 0.589833 0.000 0.000 0.012 0.004 0.924 0.060
#> SRR1700163 3 0.6364 0.413461 0.000 0.144 0.604 0.052 0.028 0.172
#> SRR1700165 2 0.7074 -0.026818 0.000 0.488 0.008 0.112 0.164 0.228
#> SRR1700166 5 0.6724 0.098392 0.000 0.372 0.016 0.048 0.436 0.128
#> SRR1700168 5 0.6888 -0.131141 0.000 0.340 0.000 0.064 0.392 0.204
#> SRR1700167 5 0.4113 0.528888 0.000 0.012 0.020 0.028 0.768 0.172
#> SRR1700170 4 0.6021 0.082113 0.000 0.332 0.004 0.448 0.000 0.216
#> SRR1700169 2 0.5699 0.092725 0.000 0.524 0.000 0.252 0.000 0.224
#> SRR1700171 3 0.4992 -0.062161 0.000 0.000 0.468 0.000 0.464 0.068
#> SRR1700172 5 0.5289 0.533056 0.000 0.072 0.000 0.128 0.692 0.108
#> SRR1700174 2 0.6402 0.301930 0.000 0.572 0.000 0.148 0.168 0.112
#> SRR1700173 5 0.3163 0.553159 0.000 0.000 0.000 0.040 0.820 0.140
#> SRR1700175 2 0.6019 0.461292 0.000 0.612 0.000 0.160 0.080 0.148
#> SRR1700176 5 0.7096 0.195175 0.000 0.048 0.176 0.044 0.504 0.228
#> SRR1700178 4 0.4771 0.391485 0.000 0.188 0.000 0.684 0.004 0.124
#> SRR1700177 5 0.0777 0.592038 0.000 0.004 0.000 0.024 0.972 0.000
#> SRR1700180 2 0.2135 0.566890 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1700179 4 0.5645 0.093073 0.000 0.392 0.000 0.456 0.000 0.152
#> SRR1700181 2 0.2954 0.582721 0.000 0.868 0.000 0.060 0.028 0.044
#> SRR1700183 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.5254 0.366095 0.000 0.604 0.000 0.264 0.004 0.128
#> SRR1700184 4 0.5392 0.026182 0.000 0.440 0.000 0.448 0.000 0.112
#> SRR1700186 2 0.5013 0.386337 0.000 0.656 0.000 0.192 0.004 0.148
#> SRR1700187 3 0.1267 0.588827 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.3756 0.464060 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 4 0.6938 0.222826 0.000 0.296 0.000 0.448 0.108 0.148
#> SRR1700192 2 0.5530 0.435467 0.000 0.656 0.216 0.060 0.012 0.056
#> SRR1700190 3 0.1471 0.610611 0.000 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700191 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0146 0.613840 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700193 2 0.5684 0.323241 0.000 0.560 0.000 0.316 0.032 0.092
#> SRR1700195 2 0.2100 0.590742 0.000 0.916 0.000 0.036 0.032 0.016
#> SRR1700194 1 0.2491 0.784858 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.5126 0.345596 0.000 0.624 0.000 0.216 0.000 0.160
#> SRR1700197 3 0.0000 0.614128 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.1141 0.577097 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.2562 0.539219 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.4360 0.540999 0.000 0.768 0.000 0.092 0.040 0.100
#> SRR1700201 2 0.2488 0.568104 0.000 0.880 0.000 0.076 0.000 0.044
#> SRR1700202 2 0.0865 0.585670 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700203 2 0.2805 0.574155 0.000 0.828 0.000 0.160 0.000 0.012
#> SRR1700204 2 0.2972 0.556641 0.000 0.836 0.000 0.128 0.000 0.036
#> SRR1700206 4 0.5935 0.290079 0.000 0.148 0.004 0.580 0.240 0.028
#> SRR1700207 2 0.5156 0.318457 0.000 0.616 0.000 0.232 0.000 0.152
#> SRR1700208 3 0.4934 0.476634 0.000 0.184 0.708 0.072 0.008 0.028
#> SRR1700205 2 0.4215 0.429311 0.000 0.688 0.000 0.024 0.276 0.012
#> SRR1700209 2 0.3904 0.503577 0.000 0.732 0.000 0.232 0.004 0.032
#> SRR1700210 2 0.0458 0.579926 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700211 2 0.3829 0.530116 0.000 0.792 0.012 0.124 0.000 0.072
#> SRR1700212 2 0.2376 0.569178 0.000 0.888 0.000 0.068 0.000 0.044
#> SRR1700213 4 0.5677 0.046912 0.000 0.404 0.000 0.440 0.000 0.156
#> SRR1700214 2 0.4352 0.471620 0.000 0.724 0.000 0.148 0.000 0.128
#> SRR1700215 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.4394 0.502586 0.000 0.716 0.000 0.208 0.008 0.068
#> SRR1700216 1 0.0000 0.857926 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3955 0.363722 0.000 0.648 0.000 0.340 0.008 0.004
#> SRR1700219 2 0.0865 0.575325 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0146 0.612641 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0146 0.573733 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0692 0.576122 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700223 2 0.2632 0.544283 0.000 0.832 0.000 0.164 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.5156 0.368461 0.000 0.648 0.008 0.188 0.000 0.156
#> SRR1700226 2 0.4264 0.498581 0.000 0.720 0.000 0.196 0.000 0.084
#> SRR1700229 4 0.5392 0.178510 0.000 0.380 0.004 0.536 0.064 0.016
#> SRR1700225 2 0.3821 0.533698 0.000 0.776 0.000 0.064 0.156 0.004
#> SRR1700227 2 0.4640 0.290597 0.000 0.576 0.000 0.376 0.000 0.048
#> SRR1700230 3 0.5077 0.118074 0.000 0.428 0.520 0.008 0.020 0.024
#> SRR1700231 2 0.6709 0.296372 0.000 0.544 0.004 0.160 0.176 0.116
#> SRR1700228 2 0.0717 0.577970 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1700232 2 0.4352 0.549272 0.000 0.752 0.000 0.144 0.084 0.020
#> SRR1700233 2 0.5505 0.406858 0.000 0.640 0.000 0.088 0.220 0.052
#> SRR1700234 2 0.2357 0.578243 0.000 0.872 0.000 0.012 0.116 0.000
#> SRR1700235 2 0.5167 0.339391 0.000 0.632 0.000 0.216 0.004 0.148
#> SRR1700237 2 0.0820 0.582812 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1700236 2 0.2249 0.589636 0.000 0.900 0.000 0.064 0.032 0.004
#> SRR1700238 2 0.1588 0.583034 0.000 0.924 0.000 0.072 0.000 0.004
#> SRR1700239 3 0.0891 0.616841 0.000 0.024 0.968 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.3864 -0.213219 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.1230 0.586400 0.000 0.956 0.000 0.008 0.028 0.008
#> SRR1700243 2 0.4626 0.518403 0.000 0.724 0.000 0.144 0.016 0.116
#> SRR1700244 2 0.5068 0.360996 0.000 0.624 0.000 0.240 0.136 0.000
#> SRR1700242 2 0.3601 0.432523 0.000 0.684 0.312 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700246 3 0.0000 0.614128 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.3756 0.219113 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.0653 0.611944 0.012 0.000 0.980 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700249 1 0.3464 0.627530 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.5063 0.360924 0.000 0.604 0.000 0.284 0.000 0.112
#> SRR1700248 2 0.1779 0.581711 0.000 0.920 0.000 0.064 0.000 0.016
#> SRR1700251 2 0.5942 0.042926 0.000 0.424 0.000 0.356 0.000 0.220
#> SRR1700252 4 0.6337 0.185334 0.000 0.100 0.000 0.540 0.268 0.092
#> SRR1700253 2 0.5296 -0.077453 0.000 0.456 0.000 0.444 0.000 0.100
#> SRR1700256 2 0.5155 0.275779 0.000 0.556 0.000 0.344 0.000 0.100
#> SRR1700254 3 0.2219 0.531136 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.5290 0.470260 0.000 0.688 0.000 0.132 0.060 0.120
#> SRR1700257 2 0.4297 0.502815 0.000 0.744 0.000 0.152 0.008 0.096
#> SRR1700258 2 0.5958 0.185325 0.000 0.536 0.000 0.276 0.168 0.020
#> SRR1700259 4 0.6436 0.211273 0.000 0.112 0.000 0.516 0.288 0.084
#> SRR1700260 5 0.1152 0.593255 0.000 0.000 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700261 2 0.5232 0.279559 0.000 0.596 0.000 0.304 0.088 0.012
#> SRR1700262 5 0.2416 0.577377 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1700263 4 0.6680 0.243231 0.000 0.336 0.000 0.436 0.060 0.168
#> SRR1700264 2 0.4610 0.263970 0.000 0.580 0.000 0.384 0.012 0.024
#> SRR1700265 5 0.7038 0.052340 0.000 0.148 0.000 0.300 0.432 0.120
#> SRR1700266 5 0.6262 0.238218 0.000 0.160 0.000 0.256 0.536 0.048
#> SRR1700268 5 0.3766 0.452915 0.000 0.304 0.000 0.012 0.684 0.000
#> SRR1700270 4 0.4321 0.312516 0.000 0.316 0.000 0.652 0.020 0.012
#> SRR1700267 2 0.1297 0.581297 0.000 0.948 0.000 0.012 0.040 0.000
#> SRR1700271 4 0.4223 0.415838 0.000 0.092 0.000 0.776 0.100 0.032
#> SRR1700272 5 0.5011 0.523856 0.000 0.108 0.000 0.204 0.672 0.016
#> SRR1700273 2 0.2558 0.551005 0.000 0.840 0.000 0.156 0.004 0.000
#> SRR1700274 5 0.3424 0.586990 0.000 0.168 0.000 0.004 0.796 0.032
#> SRR1700277 4 0.5271 0.304960 0.000 0.076 0.272 0.624 0.000 0.028
#> SRR1700275 5 0.3802 0.456817 0.000 0.312 0.000 0.012 0.676 0.000
#> SRR1700276 4 0.6594 0.189957 0.000 0.280 0.000 0.440 0.244 0.036
#> SRR1700278 2 0.3394 0.518815 0.000 0.752 0.000 0.000 0.236 0.012
#> SRR1700279 5 0.2822 0.610715 0.000 0.076 0.000 0.056 0.864 0.004
#> SRR1700280 4 0.7118 0.081193 0.000 0.184 0.000 0.384 0.332 0.100
#> SRR1700281 4 0.5041 0.334308 0.000 0.032 0.000 0.696 0.120 0.152
#> SRR1700283 2 0.4032 0.247596 0.000 0.572 0.000 0.008 0.420 0.000
#> SRR1700282 4 0.7719 0.127503 0.000 0.200 0.068 0.412 0.264 0.056
#> SRR1700284 5 0.5071 0.470790 0.000 0.272 0.000 0.028 0.640 0.060
#> SRR1700285 5 0.6690 0.124033 0.000 0.332 0.000 0.180 0.432 0.056
#> SRR1700286 5 0.6380 -0.169209 0.000 0.196 0.000 0.380 0.400 0.024
#> SRR1700287 5 0.0000 0.581521 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700290 3 0.2489 0.594484 0.000 0.000 0.860 0.000 0.128 0.012
#> SRR1700289 5 0.2170 0.603600 0.000 0.012 0.000 0.100 0.888 0.000
#> SRR1700288 4 0.5341 0.364056 0.000 0.228 0.000 0.616 0.008 0.148
#> SRR1700292 5 0.5457 0.406004 0.000 0.264 0.000 0.036 0.616 0.084
#> SRR1700291 5 0.4473 0.564982 0.000 0.060 0.000 0.168 0.740 0.032
#> SRR1700293 2 0.1219 0.576507 0.000 0.948 0.000 0.048 0.000 0.004
#> SRR1700294 2 0.5038 0.313685 0.000 0.596 0.000 0.084 0.316 0.004
#> SRR1700295 2 0.6529 0.476109 0.000 0.612 0.056 0.056 0.140 0.136
#> SRR1700297 4 0.5823 0.399258 0.000 0.204 0.000 0.608 0.144 0.044
#> SRR1700296 5 0.3340 0.571258 0.000 0.196 0.000 0.016 0.784 0.004
#> SRR1700298 2 0.3627 0.492660 0.000 0.752 0.004 0.224 0.020 0.000
#> SRR1700299 5 0.5421 0.281620 0.000 0.132 0.000 0.340 0.528 0.000
#> SRR1700300 5 0.5888 0.205901 0.000 0.292 0.000 0.188 0.512 0.008
#> SRR1700302 5 0.2402 0.575445 0.000 0.140 0.000 0.000 0.856 0.004
#> SRR1700301 5 0.4396 0.209948 0.000 0.456 0.000 0.024 0.520 0.000
#> SRR1700303 2 0.5381 0.267355 0.000 0.568 0.000 0.064 0.340 0.028
#> SRR1700304 2 0.3657 0.537724 0.000 0.788 0.000 0.020 0.168 0.024
#> SRR1700305 2 0.4845 0.333462 0.000 0.580 0.000 0.364 0.048 0.008
#> SRR1700306 5 0.2872 0.591051 0.000 0.152 0.000 0.004 0.832 0.012
#> SRR1700308 5 0.5868 0.209841 0.000 0.368 0.000 0.080 0.508 0.044
#> SRR1700307 5 0.6808 0.382111 0.000 0.060 0.088 0.152 0.592 0.108
#> SRR1700309 5 0.5149 0.475699 0.000 0.032 0.008 0.220 0.676 0.064
#> SRR1700310 2 0.3465 0.577840 0.000 0.812 0.000 0.048 0.132 0.008
#> SRR1700311 5 0.2306 0.604785 0.000 0.092 0.000 0.016 0.888 0.004
#> SRR1700312 5 0.6988 0.062523 0.000 0.244 0.000 0.288 0.400 0.068
#> SRR1700313 5 0.6085 0.047197 0.000 0.336 0.000 0.124 0.504 0.036
#> SRR1700314 5 0.6079 0.010930 0.000 0.024 0.000 0.408 0.432 0.136
#> SRR1700315 5 0.1668 0.605663 0.000 0.060 0.000 0.008 0.928 0.004
#> SRR1700316 2 0.6242 -0.181714 0.000 0.376 0.000 0.372 0.244 0.008
#> SRR1700317 4 0.7142 0.103417 0.000 0.148 0.000 0.432 0.276 0.144
#> SRR1700318 5 0.3914 0.598925 0.000 0.088 0.012 0.016 0.808 0.076
#> SRR1700319 5 0.5977 0.469674 0.000 0.184 0.000 0.128 0.612 0.076
#> SRR1700320 5 0.3265 0.537797 0.000 0.248 0.000 0.004 0.748 0.000
#> SRR1700322 2 0.4450 0.507881 0.000 0.700 0.000 0.236 0.012 0.052
#> SRR1700321 2 0.2541 0.588272 0.000 0.892 0.000 0.024 0.052 0.032
#> SRR1700323 5 0.0146 0.582546 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700324 2 0.4957 0.191722 0.000 0.544 0.000 0.012 0.400 0.044
#> SRR1700325 4 0.6988 0.000161 0.000 0.108 0.008 0.416 0.360 0.108
#> SRR1700326 3 0.3638 0.584203 0.000 0.016 0.824 0.108 0.016 0.036
#> SRR1700327 2 0.4139 0.569035 0.000 0.772 0.000 0.104 0.108 0.016
#> SRR1700329 5 0.5080 0.540150 0.000 0.144 0.000 0.100 0.704 0.052
#> SRR1700328 5 0.5592 0.393629 0.000 0.004 0.016 0.212 0.616 0.152
#> SRR1700330 5 0.1908 0.589553 0.000 0.000 0.096 0.004 0.900 0.000
#> SRR1700331 5 0.3852 0.297520 0.000 0.384 0.000 0.004 0.612 0.000
#> SRR1700332 5 0.0508 0.589055 0.000 0.012 0.000 0.004 0.984 0.000
#> SRR1700333 2 0.2300 0.569893 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.988 0.953 0.965 0.1550 0.878 0.878
#> 3 3 0.280 0.607 0.783 2.5506 0.564 0.503
#> 4 4 0.338 0.575 0.746 0.2163 0.780 0.549
#> 5 5 0.371 0.414 0.639 0.1009 0.855 0.600
#> 6 6 0.465 0.409 0.642 0.0638 0.858 0.530
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699875 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699879 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699880 2 0.2423 0.964 0.040 0.960
#> SRR1699881 2 0.0938 0.967 0.012 0.988
#> SRR1699882 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699884 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699885 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1699886 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1699894 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1699900 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699899 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.2778 0.962 0.048 0.952
#> SRR1699901 2 0.3274 0.959 0.060 0.940
#> SRR1699903 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1699905 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1699906 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1699910 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.2043 0.965 0.032 0.968
#> SRR1699915 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1699917 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1699918 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1699919 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.1843 0.966 0.028 0.972
#> SRR1699924 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1699925 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1699926 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR1699932 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1699935 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1699936 2 0.0938 0.967 0.012 0.988
#> SRR1699937 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1699938 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699940 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699939 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1699942 2 0.2236 0.964 0.036 0.964
#> SRR1699943 2 0.1414 0.960 0.020 0.980
#> SRR1699944 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699945 2 0.3274 0.959 0.060 0.940
#> SRR1699946 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1699947 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.2236 0.950 0.036 0.964
#> SRR1699949 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.1633 0.966 0.024 0.976
#> SRR1699952 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699953 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.1843 0.966 0.028 0.972
#> SRR1699955 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699956 2 0.2423 0.965 0.040 0.960
#> SRR1699957 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1699958 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1699960 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1699961 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699962 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699963 2 0.3114 0.959 0.056 0.944
#> SRR1699964 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1699965 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699966 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1699967 2 0.1184 0.962 0.016 0.984
#> SRR1699968 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR1699971 2 0.2778 0.962 0.048 0.952
#> SRR1699970 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699972 2 0.2043 0.965 0.032 0.968
#> SRR1699973 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1699974 2 0.5737 0.894 0.136 0.864
#> SRR1699975 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1699978 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1699979 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1699980 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1699985 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR1699986 2 0.7376 0.795 0.208 0.792
#> SRR1699988 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1699989 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR1699991 2 0.3114 0.959 0.056 0.944
#> SRR1699993 2 0.5842 0.880 0.140 0.860
#> SRR1699994 2 0.2778 0.962 0.048 0.952
#> SRR1699995 1 0.9815 0.249 0.580 0.420
#> SRR1699996 2 0.1633 0.957 0.024 0.976
#> SRR1699997 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1699998 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1699999 1 0.2043 0.949 0.968 0.032
#> SRR1700000 2 0.2043 0.965 0.032 0.968
#> SRR1700002 2 0.2778 0.963 0.048 0.952
#> SRR1700001 2 0.2778 0.962 0.048 0.952
#> SRR1700003 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1700004 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700006 2 0.2236 0.965 0.036 0.964
#> SRR1700007 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700009 1 0.4022 0.910 0.920 0.080
#> SRR1700010 2 0.3114 0.960 0.056 0.944
#> SRR1700011 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1700013 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700012 2 0.1843 0.965 0.028 0.972
#> SRR1700014 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1700015 2 0.2236 0.964 0.036 0.964
#> SRR1700016 1 0.2043 0.949 0.968 0.032
#> SRR1700018 2 0.2043 0.965 0.032 0.968
#> SRR1700017 2 0.3114 0.960 0.056 0.944
#> SRR1700019 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.4022 0.949 0.080 0.920
#> SRR1700021 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700022 2 0.3114 0.960 0.056 0.944
#> SRR1700024 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1700025 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR1700026 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1700027 2 0.2236 0.964 0.036 0.964
#> SRR1700028 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700029 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700030 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.3584 0.956 0.068 0.932
#> SRR1700032 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700034 1 0.0938 0.960 0.988 0.012
#> SRR1700035 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.3274 0.959 0.060 0.940
#> SRR1700036 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.2043 0.966 0.032 0.968
#> SRR1700039 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1700040 2 0.2423 0.964 0.040 0.960
#> SRR1700041 2 0.2043 0.964 0.032 0.968
#> SRR1700042 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1700043 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR1700045 2 0.2603 0.962 0.044 0.956
#> SRR1700044 2 0.1414 0.966 0.020 0.980
#> SRR1700046 2 0.2236 0.964 0.036 0.964
#> SRR1700047 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700048 2 0.3114 0.959 0.056 0.944
#> SRR1700049 2 0.3431 0.957 0.064 0.936
#> SRR1700050 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700051 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700052 2 0.3274 0.959 0.060 0.940
#> SRR1700053 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.2948 0.962 0.052 0.948
#> SRR1700055 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700056 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700057 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700058 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1700059 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700060 2 0.3114 0.958 0.056 0.944
#> SRR1700061 2 0.2236 0.965 0.036 0.964
#> SRR1700062 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700063 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1700064 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700065 2 0.3431 0.958 0.064 0.936
#> SRR1700066 2 0.2948 0.961 0.052 0.948
#> SRR1700067 2 0.3114 0.959 0.056 0.944
#> SRR1700068 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700069 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.2778 0.961 0.048 0.952
#> SRR1700072 2 0.2778 0.961 0.048 0.952
#> SRR1700073 2 0.2236 0.964 0.036 0.964
#> SRR1700075 2 0.0938 0.967 0.012 0.988
#> SRR1700074 2 0.2948 0.962 0.052 0.948
#> SRR1700076 2 0.1633 0.966 0.024 0.976
#> SRR1700077 2 0.2423 0.964 0.040 0.960
#> SRR1700078 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.3114 0.958 0.056 0.944
#> SRR1700081 2 0.3114 0.958 0.056 0.944
#> SRR1700082 2 0.2423 0.963 0.040 0.960
#> SRR1700083 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700084 2 0.5178 0.907 0.116 0.884
#> SRR1700085 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700087 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700088 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700089 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700091 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700090 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700092 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700094 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700093 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700095 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700096 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700097 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700098 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1700099 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700100 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700101 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700102 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700104 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700103 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700105 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700106 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700107 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700108 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700109 2 0.3274 0.957 0.060 0.940
#> SRR1700110 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700112 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700111 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700113 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700114 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700115 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700116 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700117 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700119 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700118 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700120 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700121 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700122 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700123 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700125 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700126 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700127 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700124 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700128 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700129 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700130 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700132 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700131 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700133 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700134 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700135 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700136 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700137 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700138 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700140 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700139 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700141 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700142 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700143 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700144 2 0.2948 0.960 0.052 0.948
#> SRR1700145 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700146 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700147 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700149 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700148 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700150 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700152 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700151 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700153 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700154 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700155 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700156 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700158 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700159 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700157 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700160 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700161 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700162 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700164 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700163 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700165 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700166 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700168 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700167 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700170 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700169 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700171 2 0.6048 0.875 0.148 0.852
#> SRR1700172 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700174 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700173 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700175 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700176 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700178 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700177 2 0.3431 0.956 0.064 0.936
#> SRR1700180 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700179 2 0.3274 0.930 0.060 0.940
#> SRR1700181 2 0.3274 0.930 0.060 0.940
#> SRR1700183 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700182 2 0.3274 0.929 0.060 0.940
#> SRR1700184 2 0.2423 0.947 0.040 0.960
#> SRR1700186 2 0.2043 0.953 0.032 0.968
#> SRR1700187 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700185 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700188 2 0.2423 0.947 0.040 0.960
#> SRR1700192 1 0.2948 0.933 0.948 0.052
#> SRR1700190 1 0.6148 0.830 0.848 0.152
#> SRR1700191 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700189 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700193 2 0.1184 0.962 0.016 0.984
#> SRR1700195 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR1700194 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700196 2 0.2423 0.947 0.040 0.960
#> SRR1700197 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700198 2 0.2778 0.940 0.048 0.952
#> SRR1700199 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR1700200 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR1700201 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700202 2 0.9954 0.153 0.460 0.540
#> SRR1700203 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700204 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700206 2 0.1414 0.960 0.020 0.980
#> SRR1700207 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700208 1 0.6973 0.775 0.812 0.188
#> SRR1700205 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR1700209 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700210 2 0.1633 0.958 0.024 0.976
#> SRR1700211 2 0.9323 0.423 0.348 0.652
#> SRR1700212 2 0.1843 0.956 0.028 0.972
#> SRR1700213 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR1700214 2 0.2423 0.947 0.040 0.960
#> SRR1700215 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700217 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700216 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700218 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700219 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700222 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700220 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.1633 0.957 0.024 0.976
#> SRR1700223 2 0.1184 0.961 0.016 0.984
#> SRR1700224 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700229 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1700225 2 0.2423 0.964 0.040 0.960
#> SRR1700227 2 0.2948 0.937 0.052 0.948
#> SRR1700230 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700231 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR1700228 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR1700232 2 0.1184 0.961 0.016 0.984
#> SRR1700233 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1700234 2 0.1184 0.961 0.016 0.984
#> SRR1700235 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700237 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700236 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700238 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700239 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700240 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700241 2 0.2603 0.964 0.044 0.956
#> SRR1700243 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR1700244 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1700242 1 0.5408 0.862 0.876 0.124
#> SRR1700246 2 0.7815 0.687 0.232 0.768
#> SRR1700245 2 0.1414 0.959 0.020 0.980
#> SRR1700247 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700249 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700250 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700248 2 0.1633 0.957 0.024 0.976
#> SRR1700251 2 0.2236 0.954 0.036 0.964
#> SRR1700252 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700253 2 0.2423 0.947 0.040 0.960
#> SRR1700256 2 0.0938 0.963 0.012 0.988
#> SRR1700254 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1700255 2 0.2043 0.953 0.032 0.968
#> SRR1700257 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1700258 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700259 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700260 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700264 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700266 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.1184 0.962 0.016 0.984
#> SRR1700270 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700267 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700271 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700272 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1700273 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700274 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.6048 0.863 0.148 0.852
#> SRR1700275 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700276 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR1700278 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0376 0.966 0.004 0.996
#> SRR1700283 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR1700284 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.9323 0.510 0.348 0.652
#> SRR1700289 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0672 0.965 0.008 0.992
#> SRR1700292 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1700297 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700296 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700308 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700309 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1700312 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700315 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0376 0.967 0.004 0.996
#> SRR1700317 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0938 0.967 0.012 0.988
#> SRR1700321 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0938 0.967 0.012 0.988
#> SRR1700324 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.3114 0.951 0.056 0.944
#> SRR1700327 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700330 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR1700331 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.966 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0747 0.7108 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699875 2 0.5036 0.7165 0.020 0.808 0.172
#> SRR1699876 3 0.5785 0.5976 0.000 0.332 0.668
#> SRR1699877 2 0.1529 0.7126 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699879 2 0.2537 0.7024 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699878 2 0.2550 0.7179 0.012 0.932 0.056
#> SRR1699880 2 0.6894 0.6767 0.052 0.692 0.256
#> SRR1699881 2 0.6105 0.6881 0.024 0.724 0.252
#> SRR1699882 2 0.1529 0.7086 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699883 2 0.0892 0.7108 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699884 2 0.1529 0.7140 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699885 2 0.1289 0.7117 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699886 2 0.6111 0.0246 0.000 0.604 0.396
#> SRR1699888 2 0.4178 0.5551 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699889 3 0.5678 0.6120 0.000 0.316 0.684
#> SRR1699890 2 0.5835 0.2359 0.000 0.660 0.340
#> SRR1699887 2 0.6215 -0.1077 0.000 0.572 0.428
#> SRR1699891 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699892 2 0.5016 0.6954 0.000 0.760 0.240
#> SRR1699893 3 0.1643 0.7280 0.000 0.044 0.956
#> SRR1699894 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699895 3 0.5785 0.5973 0.000 0.332 0.668
#> SRR1699896 2 0.5763 0.6936 0.016 0.740 0.244
#> SRR1699897 2 0.3129 0.7189 0.008 0.904 0.088
#> SRR1699898 2 0.8880 0.4068 0.120 0.464 0.416
#> SRR1699900 2 0.6105 0.6889 0.024 0.724 0.252
#> SRR1699899 3 0.6081 0.5883 0.004 0.344 0.652
#> SRR1699902 2 0.6999 0.6677 0.052 0.680 0.268
#> SRR1699901 2 0.8616 0.6204 0.148 0.588 0.264
#> SRR1699903 3 0.4346 0.6907 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699904 3 0.5706 0.6074 0.000 0.320 0.680
#> SRR1699905 2 0.8685 0.6188 0.156 0.584 0.260
#> SRR1699906 3 0.5785 0.5976 0.000 0.332 0.668
#> SRR1699907 3 0.5810 0.5948 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699908 3 0.5016 0.6654 0.000 0.240 0.760
#> SRR1699909 3 0.5591 0.5560 0.000 0.304 0.696
#> SRR1699910 3 0.4540 0.7002 0.028 0.124 0.848
#> SRR1699911 3 0.6244 0.3744 0.000 0.440 0.560
#> SRR1699912 3 0.6677 0.5984 0.024 0.324 0.652
#> SRR1699913 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699914 2 0.6359 0.5796 0.008 0.628 0.364
#> SRR1699915 3 0.4349 0.7006 0.020 0.128 0.852
#> SRR1699916 3 0.6244 0.4330 0.000 0.440 0.560
#> SRR1699917 3 0.1289 0.7310 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699918 3 0.5138 0.5743 0.000 0.252 0.748
#> SRR1699919 3 0.4840 0.6958 0.016 0.168 0.816
#> SRR1699920 3 0.3941 0.6872 0.000 0.156 0.844
#> SRR1699921 3 0.5408 0.6926 0.052 0.136 0.812
#> SRR1699922 2 0.2261 0.6999 0.000 0.932 0.068
#> SRR1699923 2 0.6303 0.6903 0.032 0.720 0.248
#> SRR1699924 3 0.7424 0.1456 0.044 0.364 0.592
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.5461 0.6323 0.016 0.216 0.768
#> SRR1699927 3 0.6255 0.6065 0.012 0.320 0.668
#> SRR1699929 2 0.5858 0.6956 0.020 0.740 0.240
#> SRR1699928 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699930 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699931 2 0.5578 0.6955 0.012 0.748 0.240
#> SRR1699933 2 0.5138 0.6898 0.000 0.748 0.252
#> SRR1699932 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.0747 0.7302 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699936 2 0.6282 0.1165 0.004 0.612 0.384
#> SRR1699937 2 0.4887 0.7002 0.000 0.772 0.228
#> SRR1699938 2 0.1753 0.7128 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699940 2 0.7091 0.6726 0.056 0.676 0.268
#> SRR1699939 2 0.4796 0.5520 0.000 0.780 0.220
#> SRR1699941 2 0.6226 0.6887 0.028 0.720 0.252
#> SRR1699942 2 0.5896 0.6680 0.008 0.700 0.292
#> SRR1699943 2 0.1643 0.7148 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699944 2 0.2301 0.7177 0.004 0.936 0.060
#> SRR1699945 2 0.9315 0.5589 0.220 0.520 0.260
#> SRR1699946 2 0.4887 0.7005 0.000 0.772 0.228
#> SRR1699947 2 0.3213 0.7193 0.028 0.912 0.060
#> SRR1699948 2 0.1525 0.7155 0.004 0.964 0.032
#> SRR1699949 3 0.6235 0.4631 0.000 0.436 0.564
#> SRR1699950 2 0.5678 0.3378 0.000 0.684 0.316
#> SRR1699951 2 0.6280 0.3999 0.000 0.540 0.460
#> SRR1699952 2 0.4978 0.7050 0.004 0.780 0.216
#> SRR1699953 2 0.1643 0.7126 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699954 2 0.6875 0.6864 0.056 0.700 0.244
#> SRR1699955 2 0.4235 0.5777 0.000 0.824 0.176
#> SRR1699956 2 0.8803 0.5572 0.136 0.544 0.320
#> SRR1699957 2 0.3846 0.7213 0.016 0.876 0.108
#> SRR1699959 2 0.6955 0.3697 0.016 0.496 0.488
#> SRR1699958 3 0.4504 0.5485 0.000 0.196 0.804
#> SRR1699960 2 0.6476 -0.0556 0.004 0.548 0.448
#> SRR1699961 2 0.5938 0.6893 0.020 0.732 0.248
#> SRR1699962 2 0.4702 0.5460 0.000 0.788 0.212
#> SRR1699963 2 0.6129 0.6383 0.008 0.668 0.324
#> SRR1699964 2 0.1753 0.7163 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699965 2 0.4887 0.4830 0.000 0.772 0.228
#> SRR1699966 3 0.6180 0.0571 0.000 0.416 0.584
#> SRR1699967 2 0.1411 0.7139 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699968 2 0.7665 0.3210 0.044 0.500 0.456
#> SRR1699969 2 0.7570 0.4837 0.044 0.552 0.404
#> SRR1699971 2 0.6301 0.6835 0.028 0.712 0.260
#> SRR1699970 2 0.3412 0.7200 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699972 2 0.6341 0.6863 0.032 0.716 0.252
#> SRR1699973 3 0.3412 0.6765 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699974 2 0.9271 0.5598 0.228 0.528 0.244
#> SRR1699975 3 0.5480 0.5610 0.004 0.264 0.732
#> SRR1699976 2 0.5938 0.6893 0.020 0.732 0.248
#> SRR1699977 2 0.6307 0.3532 0.000 0.512 0.488
#> SRR1699978 2 0.8939 0.3571 0.124 0.440 0.436
#> SRR1699979 3 0.6286 -0.1895 0.000 0.464 0.536
#> SRR1699980 3 0.7106 0.5712 0.076 0.224 0.700
#> SRR1699981 3 0.5968 0.3194 0.000 0.364 0.636
#> SRR1699982 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699983 3 0.5371 0.6939 0.048 0.140 0.812
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.5678 0.4941 0.000 0.316 0.684
#> SRR1699986 2 0.9581 0.5038 0.288 0.476 0.236
#> SRR1699988 2 0.4842 0.7019 0.000 0.776 0.224
#> SRR1699987 3 0.3267 0.6803 0.000 0.116 0.884
#> SRR1699989 3 0.5431 0.6389 0.000 0.284 0.716
#> SRR1699990 3 0.6111 0.1906 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699992 2 0.6226 0.6887 0.028 0.720 0.252
#> SRR1699991 2 0.6750 0.6191 0.024 0.640 0.336
#> SRR1699993 2 0.9489 0.5090 0.228 0.492 0.280
#> SRR1699994 2 0.7176 0.6750 0.068 0.684 0.248
#> SRR1699995 1 0.7624 0.1330 0.560 0.392 0.048
#> SRR1699996 2 0.2066 0.7212 0.000 0.940 0.060
#> SRR1699997 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.5058 0.6936 0.000 0.756 0.244
#> SRR1699999 1 0.1289 0.9349 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700000 2 0.6452 0.6878 0.036 0.712 0.252
#> SRR1700002 2 0.5986 0.6751 0.012 0.704 0.284
#> SRR1700001 2 0.6834 0.6819 0.048 0.692 0.260
#> SRR1700003 2 0.6330 0.5615 0.004 0.600 0.396
#> SRR1700004 2 0.8109 0.6419 0.108 0.620 0.272
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.6180 0.6842 0.024 0.716 0.260
#> SRR1700007 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700008 3 0.0892 0.7250 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.9072 0.5855 0.192 0.548 0.260
#> SRR1700011 2 0.6521 -0.2212 0.004 0.504 0.492
#> SRR1700013 2 0.6521 0.3687 0.004 0.504 0.492
#> SRR1700012 2 0.5919 0.6779 0.012 0.712 0.276
#> SRR1700014 3 0.6786 -0.1074 0.012 0.448 0.540
#> SRR1700015 2 0.5737 0.6882 0.012 0.732 0.256
#> SRR1700016 1 0.4521 0.7296 0.816 0.180 0.004
#> SRR1700018 2 0.6668 0.6764 0.040 0.696 0.264
#> SRR1700017 2 0.7027 0.6484 0.044 0.660 0.296
#> SRR1700019 3 0.6079 0.5404 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700020 2 0.9339 0.5031 0.188 0.496 0.316
#> SRR1700021 3 0.4974 0.6686 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700023 2 0.7591 0.6314 0.068 0.632 0.300
#> SRR1700022 2 0.6730 0.6626 0.036 0.680 0.284
#> SRR1700024 3 0.4110 0.6736 0.004 0.152 0.844
#> SRR1700025 2 0.5502 0.6909 0.008 0.744 0.248
#> SRR1700026 2 0.6105 0.6887 0.024 0.724 0.252
#> SRR1700027 2 0.6217 0.6819 0.024 0.712 0.264
#> SRR1700028 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700029 3 0.7764 0.1816 0.068 0.328 0.604
#> SRR1700030 3 0.6307 0.4149 0.012 0.328 0.660
#> SRR1700031 2 0.8464 0.6110 0.128 0.592 0.280
#> SRR1700032 2 0.5619 0.6934 0.012 0.744 0.244
#> SRR1700034 1 0.1525 0.9326 0.964 0.032 0.004
#> SRR1700035 3 0.4485 0.7001 0.020 0.136 0.844
#> SRR1700033 2 0.7394 0.6485 0.064 0.652 0.284
#> SRR1700036 3 0.6287 0.5356 0.024 0.272 0.704
#> SRR1700037 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700038 2 0.6105 0.6893 0.024 0.724 0.252
#> SRR1700039 2 0.8790 0.6001 0.160 0.572 0.268
#> SRR1700040 2 0.6964 0.6709 0.052 0.684 0.264
#> SRR1700041 2 0.6825 0.2494 0.012 0.496 0.492
#> SRR1700042 2 0.6880 0.6489 0.036 0.660 0.304
#> SRR1700043 2 0.6452 0.6880 0.036 0.712 0.252
#> SRR1700045 2 0.6944 0.3587 0.016 0.516 0.468
#> SRR1700044 2 0.5178 0.6890 0.000 0.744 0.256
#> SRR1700046 2 0.6651 0.6413 0.024 0.656 0.320
#> SRR1700047 2 0.6890 0.6007 0.028 0.632 0.340
#> SRR1700048 3 0.4033 0.6884 0.008 0.136 0.856
#> SRR1700049 2 0.9480 0.5108 0.236 0.496 0.268
#> SRR1700050 3 0.7451 0.4975 0.156 0.144 0.700
#> SRR1700051 2 0.9405 0.4792 0.192 0.484 0.324
#> SRR1700052 2 0.8938 0.5743 0.164 0.552 0.284
#> SRR1700053 3 0.5945 0.5926 0.024 0.236 0.740
#> SRR1700054 2 0.6539 0.6626 0.028 0.684 0.288
#> SRR1700055 1 0.0424 0.9522 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700056 3 0.1399 0.7247 0.004 0.028 0.968
#> SRR1700057 3 0.5603 0.6272 0.136 0.060 0.804
#> SRR1700058 2 0.7057 0.6690 0.056 0.680 0.264
#> SRR1700059 3 0.4558 0.6768 0.100 0.044 0.856
#> SRR1700060 2 0.8716 0.5306 0.120 0.532 0.348
#> SRR1700061 2 0.6490 0.6853 0.036 0.708 0.256
#> SRR1700062 3 0.7564 0.2290 0.068 0.296 0.636
#> SRR1700063 2 0.6630 0.6519 0.028 0.672 0.300
#> SRR1700064 3 0.6142 0.6087 0.040 0.212 0.748
#> SRR1700065 2 0.7558 0.6433 0.072 0.644 0.284
#> SRR1700066 2 0.7782 0.6595 0.100 0.652 0.248
#> SRR1700067 3 0.1411 0.7298 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700068 3 0.2173 0.7159 0.008 0.048 0.944
#> SRR1700069 3 0.7884 0.4755 0.104 0.252 0.644
#> SRR1700070 2 0.6140 0.4680 0.000 0.596 0.404
#> SRR1700071 2 0.6724 0.4953 0.012 0.568 0.420
#> SRR1700072 2 0.8455 0.5997 0.120 0.584 0.296
#> SRR1700073 3 0.4887 0.6440 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700075 2 0.5843 0.6893 0.016 0.732 0.252
#> SRR1700074 2 0.6904 0.6703 0.048 0.684 0.268
#> SRR1700076 2 0.5404 0.6887 0.004 0.740 0.256
#> SRR1700077 2 0.6834 0.6757 0.048 0.692 0.260
#> SRR1700078 2 0.8160 0.6235 0.104 0.608 0.288
#> SRR1700080 3 0.7424 0.2489 0.044 0.364 0.592
#> SRR1700079 3 0.8676 -0.0821 0.112 0.368 0.520
#> SRR1700081 2 0.8700 0.5358 0.120 0.536 0.344
#> SRR1700082 2 0.6737 0.6705 0.040 0.688 0.272
#> SRR1700083 2 0.9074 0.5202 0.156 0.516 0.328
#> SRR1700084 2 0.8355 0.6382 0.140 0.616 0.244
#> SRR1700085 3 0.3686 0.7021 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700086 3 0.7748 -0.1442 0.048 0.452 0.500
#> SRR1700087 3 0.7466 -0.2780 0.036 0.444 0.520
#> SRR1700088 2 0.6126 0.5499 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700089 3 0.6682 -0.3505 0.008 0.488 0.504
#> SRR1700091 3 0.1964 0.7082 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700090 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700092 3 0.3816 0.6228 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700094 3 0.6252 -0.2269 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700093 3 0.0424 0.7286 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700095 3 0.6062 -0.0122 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700096 3 0.4887 0.4808 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700097 3 0.8892 -0.3690 0.120 0.440 0.440
#> SRR1700098 3 0.6204 0.3740 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700099 3 0.1289 0.7240 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700100 3 0.0747 0.7267 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700101 3 0.0892 0.7280 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700102 3 0.0747 0.7290 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700104 3 0.5397 0.3518 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700103 3 0.4654 0.5239 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700105 3 0.0592 0.7299 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700106 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700107 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700108 3 0.3267 0.7134 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700109 3 0.4605 0.6467 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700110 3 0.4452 0.6514 0.000 0.192 0.808
#> SRR1700112 3 0.4555 0.6491 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700111 3 0.0237 0.7291 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700113 3 0.0237 0.7299 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700114 3 0.1411 0.7190 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700115 3 0.0237 0.7299 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700116 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700117 3 0.7340 0.3402 0.076 0.248 0.676
#> SRR1700119 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700118 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700120 3 0.6111 -0.0629 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700121 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700122 3 0.2356 0.7192 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700123 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700125 3 0.4555 0.6463 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700126 3 0.7979 -0.2981 0.060 0.440 0.500
#> SRR1700127 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700124 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700128 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700129 3 0.0592 0.7300 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700130 3 0.0424 0.7300 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700132 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700131 3 0.0592 0.7276 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700133 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700134 3 0.1529 0.7276 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700135 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700136 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700137 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700138 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700140 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700139 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700141 3 0.1529 0.7274 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700142 3 0.4249 0.6638 0.028 0.108 0.864
#> SRR1700143 3 0.0424 0.7286 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700144 3 0.6964 0.4403 0.052 0.264 0.684
#> SRR1700145 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700146 3 0.0237 0.7300 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700147 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700149 3 0.2066 0.7038 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700148 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700150 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700152 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700151 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700153 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700154 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700155 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700156 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700158 3 0.2625 0.6845 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700159 3 0.4555 0.6463 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700157 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700160 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700161 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700162 3 0.3340 0.6993 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700164 3 0.4796 0.4905 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700163 3 0.2537 0.6884 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700165 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700166 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700168 3 0.4555 0.6463 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700167 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700170 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700169 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700171 3 0.8280 -0.1866 0.080 0.404 0.516
#> SRR1700172 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700174 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700173 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700175 3 0.0237 0.7300 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700176 3 0.6984 -0.1820 0.020 0.420 0.560
#> SRR1700178 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700177 3 0.0000 0.7296 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700179 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700181 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700184 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700186 2 0.1267 0.7141 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700192 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.3619 0.7907 0.864 0.000 0.136
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700195 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700199 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700200 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700201 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700202 2 0.7627 0.3088 0.428 0.528 0.044
#> SRR1700203 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700204 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700206 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700207 2 0.0661 0.7096 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700208 1 0.5276 0.7518 0.820 0.052 0.128
#> SRR1700205 2 0.0424 0.7095 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700209 2 0.3941 0.5796 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700210 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700211 2 0.5506 0.6150 0.220 0.764 0.016
#> SRR1700212 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700213 2 0.4504 0.7097 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700214 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1031 0.7128 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700219 2 0.1289 0.7061 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.6215 -0.1282 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700221 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700223 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700224 2 0.1643 0.7115 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700226 2 0.0424 0.7073 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700229 2 0.0424 0.7089 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700225 2 0.5012 0.7130 0.008 0.788 0.204
#> SRR1700227 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700228 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700232 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700233 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700234 2 0.0747 0.7118 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700235 2 0.1411 0.7175 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700237 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700236 2 0.0747 0.7077 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700238 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.8843 0.5899 0.160 0.564 0.276
#> SRR1700243 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700244 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700242 1 0.1765 0.9208 0.956 0.040 0.004
#> SRR1700246 2 0.6449 0.6657 0.204 0.740 0.056
#> SRR1700245 2 0.0424 0.7092 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0592 0.7108 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700248 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700251 2 0.0475 0.7076 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700252 2 0.5115 0.7010 0.004 0.768 0.228
#> SRR1700253 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700256 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9562 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700257 2 0.0424 0.7095 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700258 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700259 2 0.6180 -0.0349 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700260 3 0.5905 0.5826 0.000 0.352 0.648
#> SRR1700261 3 0.5785 0.5976 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700262 3 0.5785 0.5970 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700263 2 0.1289 0.7117 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700264 2 0.2651 0.7172 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700265 2 0.5292 0.7014 0.008 0.764 0.228
#> SRR1700266 2 0.3500 0.6753 0.004 0.880 0.116
#> SRR1700268 2 0.6049 0.7086 0.040 0.756 0.204
#> SRR1700270 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700267 2 0.2261 0.6757 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700271 2 0.5560 0.3443 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700272 3 0.6274 0.4132 0.000 0.456 0.544
#> SRR1700273 2 0.1031 0.7124 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700274 2 0.4702 0.5245 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700277 2 0.9045 0.5925 0.208 0.556 0.236
#> SRR1700275 3 0.5621 0.6107 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700276 2 0.5926 0.2332 0.000 0.644 0.356
#> SRR1700278 2 0.3038 0.6816 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700279 2 0.6244 -0.1335 0.000 0.560 0.440
#> SRR1700280 2 0.4178 0.6024 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700281 2 0.0592 0.7080 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700283 3 0.6168 0.5091 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700282 2 0.6460 0.3778 0.004 0.556 0.440
#> SRR1700284 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700285 3 0.6154 0.5118 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700286 2 0.6252 -0.1365 0.000 0.556 0.444
#> SRR1700287 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700290 2 0.9274 0.3872 0.384 0.456 0.160
#> SRR1700289 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700288 2 0.0237 0.7079 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700292 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700291 3 0.3619 0.6995 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700293 2 0.3752 0.6218 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700294 3 0.5760 0.6019 0.000 0.328 0.672
#> SRR1700295 3 0.6096 0.4879 0.016 0.280 0.704
#> SRR1700297 3 0.5650 0.6102 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700296 3 0.6095 0.5412 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700298 3 0.6286 0.2289 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700299 3 0.5291 0.5817 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700300 2 0.6168 0.4432 0.000 0.588 0.412
#> SRR1700302 3 0.5706 0.6087 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700301 3 0.5810 0.5946 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700303 3 0.5678 0.6099 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700304 2 0.4164 0.6463 0.008 0.848 0.144
#> SRR1700305 2 0.5785 0.2464 0.000 0.668 0.332
#> SRR1700306 3 0.6507 0.4749 0.028 0.284 0.688
#> SRR1700308 3 0.6305 0.2043 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700307 2 0.6540 0.4948 0.008 0.584 0.408
#> SRR1700309 2 0.6297 0.5912 0.008 0.640 0.352
#> SRR1700310 3 0.5905 0.5800 0.000 0.352 0.648
#> SRR1700311 3 0.4399 0.6832 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700312 2 0.6309 -0.3482 0.000 0.500 0.500
#> SRR1700313 2 0.5291 0.6835 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700314 3 0.3619 0.6980 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700315 3 0.5882 0.4212 0.000 0.348 0.652
#> SRR1700316 3 0.4399 0.6652 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700317 2 0.5058 0.4258 0.000 0.756 0.244
#> SRR1700318 2 0.5905 0.3279 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700319 3 0.3412 0.7045 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700320 3 0.5810 0.5953 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700322 2 0.6297 0.3402 0.008 0.640 0.352
#> SRR1700321 3 0.6235 0.4644 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700323 3 0.3816 0.7096 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700324 3 0.5948 0.5757 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700325 2 0.4235 0.5834 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700326 3 0.7566 -0.1875 0.040 0.448 0.512
#> SRR1700327 3 0.5650 0.6176 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700329 3 0.5785 0.5988 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700328 2 0.5597 0.7063 0.020 0.764 0.216
#> SRR1700330 2 0.5618 0.6692 0.008 0.732 0.260
#> SRR1700331 3 0.5835 0.5914 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700332 3 0.5785 0.5983 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700333 2 0.4842 0.5498 0.000 0.776 0.224
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.4697 0.5337 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1699875 3 0.2271 0.7091 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1699876 4 0.7286 0.4136 0.000 0.364 0.156 0.480
#> SRR1699877 2 0.4843 0.4578 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1699879 3 0.5775 0.1013 0.000 0.408 0.560 0.032
#> SRR1699878 3 0.4304 0.4399 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1699880 3 0.1739 0.7285 0.008 0.024 0.952 0.016
#> SRR1699881 3 0.1833 0.7315 0.000 0.032 0.944 0.024
#> SRR1699882 2 0.5431 0.6251 0.000 0.712 0.224 0.064
#> SRR1699883 2 0.4776 0.5047 0.000 0.624 0.376 0.000
#> SRR1699884 2 0.4877 0.4384 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1699885 2 0.4679 0.5314 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1699886 2 0.7277 0.1863 0.000 0.536 0.204 0.260
#> SRR1699888 2 0.6362 0.5858 0.000 0.656 0.168 0.176
#> SRR1699889 4 0.6075 0.6462 0.000 0.168 0.148 0.684
#> SRR1699890 2 0.7815 0.1965 0.000 0.392 0.352 0.256
#> SRR1699887 2 0.7129 0.2374 0.000 0.560 0.196 0.244
#> SRR1699891 4 0.6943 0.5660 0.000 0.264 0.160 0.576
#> SRR1699892 3 0.3852 0.5935 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR1699893 4 0.3447 0.7156 0.000 0.020 0.128 0.852
#> SRR1699894 4 0.6876 0.5475 0.000 0.288 0.140 0.572
#> SRR1699895 4 0.6673 0.5884 0.000 0.252 0.140 0.608
#> SRR1699896 3 0.1489 0.7166 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1699897 3 0.3937 0.5660 0.000 0.188 0.800 0.012
#> SRR1699898 3 0.3528 0.6792 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1699900 3 0.1471 0.7276 0.004 0.024 0.960 0.012
#> SRR1699899 4 0.6822 0.6090 0.000 0.192 0.204 0.604
#> SRR1699902 3 0.1674 0.7321 0.004 0.012 0.952 0.032
#> SRR1699901 3 0.2297 0.7318 0.024 0.012 0.932 0.032
#> SRR1699903 4 0.5690 0.6642 0.000 0.116 0.168 0.716
#> SRR1699904 4 0.6435 0.6135 0.000 0.224 0.136 0.640
#> SRR1699905 3 0.4599 0.6535 0.036 0.012 0.800 0.152
#> SRR1699906 4 0.6907 0.5902 0.000 0.240 0.172 0.588
#> SRR1699907 4 0.6810 0.5821 0.000 0.248 0.156 0.596
#> SRR1699908 4 0.5678 0.6654 0.000 0.112 0.172 0.716
#> SRR1699909 4 0.5783 0.6453 0.000 0.088 0.220 0.692
#> SRR1699910 4 0.5608 0.6464 0.000 0.060 0.256 0.684
#> SRR1699911 4 0.6996 0.5427 0.000 0.192 0.228 0.580
#> SRR1699912 4 0.6739 0.6085 0.000 0.216 0.172 0.612
#> SRR1699913 4 0.6552 0.6062 0.000 0.228 0.144 0.628
#> SRR1699914 3 0.3836 0.6632 0.000 0.016 0.816 0.168
#> SRR1699915 4 0.5817 0.6470 0.000 0.076 0.248 0.676
#> SRR1699916 4 0.6930 0.3281 0.000 0.356 0.120 0.524
#> SRR1699917 4 0.3647 0.7133 0.000 0.040 0.108 0.852
#> SRR1699918 4 0.6163 0.6282 0.000 0.164 0.160 0.676
#> SRR1699919 4 0.5728 0.6634 0.000 0.104 0.188 0.708
#> SRR1699920 4 0.5772 0.6401 0.000 0.068 0.260 0.672
#> SRR1699921 4 0.5528 0.6498 0.000 0.064 0.236 0.700
#> SRR1699922 2 0.7410 0.4007 0.000 0.488 0.328 0.184
#> SRR1699923 3 0.2329 0.7192 0.020 0.024 0.932 0.024
#> SRR1699924 3 0.5105 0.5057 0.000 0.028 0.696 0.276
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 4 0.5890 0.6278 0.000 0.072 0.268 0.660
#> SRR1699927 4 0.6784 0.5871 0.000 0.244 0.156 0.600
#> SRR1699929 3 0.2976 0.6605 0.000 0.120 0.872 0.008
#> SRR1699928 4 0.6397 0.6334 0.000 0.184 0.164 0.652
#> SRR1699930 4 0.6814 0.5606 0.000 0.276 0.140 0.584
#> SRR1699931 3 0.2741 0.6951 0.000 0.096 0.892 0.012
#> SRR1699933 3 0.1510 0.7293 0.000 0.028 0.956 0.016
#> SRR1699932 4 0.6581 0.6040 0.000 0.232 0.144 0.624
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.2450 0.7175 0.000 0.016 0.072 0.912
#> SRR1699936 2 0.7947 0.1134 0.004 0.384 0.368 0.244
#> SRR1699937 3 0.4511 0.5135 0.000 0.268 0.724 0.008
#> SRR1699938 3 0.5172 0.1450 0.000 0.404 0.588 0.008
#> SRR1699940 3 0.1920 0.7306 0.004 0.028 0.944 0.024
#> SRR1699939 3 0.6572 0.3732 0.000 0.272 0.608 0.120
#> SRR1699941 3 0.1739 0.7285 0.008 0.024 0.952 0.016
#> SRR1699942 3 0.2483 0.7330 0.000 0.032 0.916 0.052
#> SRR1699943 3 0.5183 0.1657 0.000 0.408 0.584 0.008
#> SRR1699944 3 0.4814 0.3794 0.000 0.316 0.676 0.008
#> SRR1699945 3 0.1985 0.7311 0.040 0.004 0.940 0.016
#> SRR1699946 3 0.4086 0.5761 0.000 0.216 0.776 0.008
#> SRR1699947 3 0.3764 0.5465 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1699948 3 0.5212 0.1255 0.000 0.420 0.572 0.008
#> SRR1699949 2 0.7520 -0.0999 0.000 0.456 0.192 0.352
#> SRR1699950 3 0.7501 -0.0119 0.000 0.372 0.444 0.184
#> SRR1699951 3 0.6800 0.5235 0.004 0.160 0.620 0.216
#> SRR1699952 3 0.3300 0.6608 0.000 0.144 0.848 0.008
#> SRR1699953 3 0.5478 -0.0234 0.000 0.444 0.540 0.016
#> SRR1699954 3 0.1837 0.7231 0.028 0.028 0.944 0.000
#> SRR1699955 2 0.5713 0.5081 0.000 0.620 0.340 0.040
#> SRR1699956 3 0.3026 0.7193 0.012 0.032 0.900 0.056
#> SRR1699957 3 0.3402 0.6194 0.000 0.164 0.832 0.004
#> SRR1699959 3 0.3908 0.6553 0.000 0.004 0.784 0.212
#> SRR1699958 4 0.5594 0.5651 0.000 0.100 0.180 0.720
#> SRR1699960 4 0.7717 0.2834 0.000 0.304 0.252 0.444
#> SRR1699961 3 0.1584 0.7256 0.000 0.036 0.952 0.012
#> SRR1699962 2 0.7396 0.1824 0.000 0.432 0.404 0.164
#> SRR1699963 3 0.4036 0.7058 0.000 0.076 0.836 0.088
#> SRR1699964 2 0.5292 0.2049 0.000 0.512 0.480 0.008
#> SRR1699965 2 0.7137 0.4652 0.000 0.536 0.304 0.160
#> SRR1699966 3 0.5530 0.3927 0.000 0.032 0.632 0.336
#> SRR1699967 3 0.4992 -0.0796 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1699968 3 0.4951 0.5345 0.000 0.044 0.744 0.212
#> SRR1699969 3 0.4046 0.6698 0.000 0.048 0.828 0.124
#> SRR1699971 3 0.1920 0.7306 0.004 0.024 0.944 0.028
#> SRR1699970 3 0.4360 0.5113 0.000 0.248 0.744 0.008
#> SRR1699972 3 0.1707 0.7307 0.004 0.020 0.952 0.024
#> SRR1699973 4 0.6429 0.5848 0.000 0.144 0.212 0.644
#> SRR1699974 3 0.2074 0.7302 0.032 0.012 0.940 0.016
#> SRR1699975 4 0.6506 0.3194 0.000 0.072 0.460 0.468
#> SRR1699976 3 0.1584 0.7256 0.000 0.036 0.952 0.012
#> SRR1699977 3 0.5339 0.5280 0.000 0.040 0.688 0.272
#> SRR1699978 3 0.4661 0.5031 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1699979 3 0.5231 0.4709 0.000 0.028 0.676 0.296
#> SRR1699980 3 0.6336 -0.2922 0.000 0.060 0.480 0.460
#> SRR1699981 3 0.6432 0.0307 0.000 0.076 0.552 0.372
#> SRR1699982 4 0.6623 0.6040 0.000 0.232 0.148 0.620
#> SRR1699983 4 0.6258 0.5643 0.000 0.076 0.324 0.600
#> SRR1699984 1 0.0188 0.9390 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699985 4 0.7607 0.4390 0.004 0.204 0.296 0.496
#> SRR1699986 3 0.4456 0.6590 0.148 0.004 0.804 0.044
#> SRR1699988 3 0.6095 0.4674 0.000 0.224 0.668 0.108
#> SRR1699987 4 0.4776 0.3266 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1699989 4 0.7138 0.5427 0.000 0.268 0.180 0.552
#> SRR1699990 3 0.6919 -0.0292 0.000 0.116 0.516 0.368
#> SRR1699992 3 0.1821 0.7284 0.008 0.032 0.948 0.012
#> SRR1699991 3 0.2011 0.7263 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699993 3 0.5567 0.6301 0.068 0.016 0.744 0.172
#> SRR1699994 3 0.1648 0.7289 0.016 0.016 0.956 0.012
#> SRR1699995 3 0.4767 0.5276 0.256 0.000 0.724 0.020
#> SRR1699996 2 0.4277 0.5962 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1699997 4 0.1716 0.7051 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699998 3 0.4485 0.5207 0.000 0.248 0.740 0.012
#> SRR1699999 1 0.3494 0.7724 0.824 0.004 0.172 0.000
#> SRR1700000 3 0.1953 0.7226 0.012 0.044 0.940 0.004
#> SRR1700002 3 0.3525 0.7001 0.000 0.100 0.860 0.040
#> SRR1700001 3 0.1762 0.7303 0.012 0.020 0.952 0.016
#> SRR1700003 3 0.4332 0.6873 0.000 0.040 0.800 0.160
#> SRR1700004 3 0.2363 0.7203 0.000 0.024 0.920 0.056
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.1811 0.7289 0.004 0.028 0.948 0.020
#> SRR1700007 4 0.7133 0.4794 0.000 0.344 0.144 0.512
#> SRR1700008 4 0.2589 0.6807 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700009 1 0.0469 0.9329 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700010 3 0.2486 0.7327 0.048 0.004 0.920 0.028
#> SRR1700011 4 0.7723 0.1995 0.000 0.348 0.232 0.420
#> SRR1700013 3 0.4453 0.6265 0.000 0.012 0.744 0.244
#> SRR1700012 3 0.1677 0.7326 0.000 0.012 0.948 0.040
#> SRR1700014 3 0.5254 0.4291 0.000 0.028 0.672 0.300
#> SRR1700015 3 0.1816 0.7313 0.004 0.024 0.948 0.024
#> SRR1700016 1 0.4456 0.5909 0.716 0.004 0.280 0.000
#> SRR1700018 3 0.1697 0.7316 0.004 0.016 0.952 0.028
#> SRR1700017 3 0.1743 0.7318 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700019 2 0.7314 -0.2714 0.000 0.428 0.152 0.420
#> SRR1700020 3 0.3570 0.7063 0.048 0.000 0.860 0.092
#> SRR1700021 4 0.6650 0.6204 0.000 0.176 0.200 0.624
#> SRR1700023 3 0.2586 0.7137 0.000 0.048 0.912 0.040
#> SRR1700022 3 0.1576 0.7324 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1700024 4 0.6130 0.3851 0.000 0.052 0.400 0.548
#> SRR1700025 3 0.2179 0.7191 0.000 0.064 0.924 0.012
#> SRR1700026 3 0.1598 0.7305 0.004 0.020 0.956 0.020
#> SRR1700027 3 0.1707 0.7307 0.004 0.020 0.952 0.024
#> SRR1700028 4 0.1557 0.7054 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700029 3 0.4697 0.5042 0.000 0.008 0.696 0.296
#> SRR1700030 3 0.6209 -0.2090 0.000 0.052 0.492 0.456
#> SRR1700031 3 0.1854 0.7331 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1700032 3 0.3047 0.6860 0.000 0.116 0.872 0.012
#> SRR1700034 1 0.1902 0.8955 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR1700035 4 0.5727 0.6477 0.000 0.076 0.236 0.688
#> SRR1700033 3 0.1675 0.7326 0.004 0.004 0.948 0.044
#> SRR1700036 4 0.6265 0.3883 0.000 0.056 0.444 0.500
#> SRR1700037 4 0.6320 0.6284 0.000 0.204 0.140 0.656
#> SRR1700038 3 0.1854 0.7288 0.008 0.024 0.948 0.020
#> SRR1700039 3 0.2495 0.7338 0.012 0.028 0.924 0.036
#> SRR1700040 3 0.1707 0.7309 0.004 0.020 0.952 0.024
#> SRR1700041 3 0.4831 0.4861 0.000 0.016 0.704 0.280
#> SRR1700042 3 0.2334 0.7270 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1700043 3 0.1124 0.7276 0.012 0.012 0.972 0.004
#> SRR1700045 3 0.4516 0.5568 0.000 0.012 0.736 0.252
#> SRR1700044 3 0.2089 0.7261 0.000 0.048 0.932 0.020
#> SRR1700046 3 0.3484 0.6936 0.004 0.008 0.844 0.144
#> SRR1700047 3 0.2174 0.7219 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1700048 4 0.5638 0.4481 0.000 0.028 0.388 0.584
#> SRR1700049 3 0.3410 0.7249 0.040 0.016 0.884 0.060
#> SRR1700050 3 0.4955 0.4211 0.000 0.008 0.648 0.344
#> SRR1700051 3 0.3047 0.7130 0.012 0.000 0.872 0.116
#> SRR1700052 3 0.1377 0.7325 0.008 0.008 0.964 0.020
#> SRR1700053 4 0.6206 0.4615 0.000 0.056 0.404 0.540
#> SRR1700054 3 0.1743 0.7333 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700055 1 0.1118 0.9200 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700056 4 0.3610 0.6455 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700057 4 0.5143 0.2363 0.000 0.004 0.456 0.540
#> SRR1700058 3 0.1739 0.7314 0.008 0.016 0.952 0.024
#> SRR1700059 4 0.4713 0.4802 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700060 3 0.3280 0.7098 0.000 0.016 0.860 0.124
#> SRR1700061 3 0.1593 0.7290 0.004 0.024 0.956 0.016
#> SRR1700062 3 0.4730 0.4309 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1700063 3 0.2125 0.7307 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1700064 4 0.6054 0.5445 0.000 0.056 0.352 0.592
#> SRR1700065 3 0.1639 0.7341 0.004 0.008 0.952 0.036
#> SRR1700066 3 0.1617 0.7292 0.024 0.008 0.956 0.012
#> SRR1700067 4 0.3082 0.7165 0.000 0.032 0.084 0.884
#> SRR1700068 4 0.5150 0.3873 0.000 0.008 0.396 0.596
#> SRR1700069 3 0.6079 -0.0835 0.000 0.048 0.544 0.408
#> SRR1700070 3 0.6704 0.4395 0.000 0.136 0.600 0.264
#> SRR1700071 3 0.3791 0.6454 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700072 3 0.1732 0.7354 0.004 0.008 0.948 0.040
#> SRR1700073 4 0.5551 0.6694 0.000 0.112 0.160 0.728
#> SRR1700075 3 0.2111 0.7347 0.000 0.024 0.932 0.044
#> SRR1700074 3 0.1674 0.7321 0.004 0.012 0.952 0.032
#> SRR1700076 3 0.1406 0.7295 0.000 0.024 0.960 0.016
#> SRR1700077 3 0.1707 0.7307 0.004 0.020 0.952 0.024
#> SRR1700078 3 0.2494 0.7075 0.000 0.048 0.916 0.036
#> SRR1700080 3 0.5903 0.2083 0.000 0.052 0.616 0.332
#> SRR1700079 3 0.4434 0.6320 0.004 0.016 0.772 0.208
#> SRR1700081 3 0.2861 0.7203 0.000 0.016 0.888 0.096
#> SRR1700082 3 0.1863 0.7336 0.004 0.012 0.944 0.040
#> SRR1700083 3 0.2466 0.7221 0.000 0.004 0.900 0.096
#> SRR1700084 3 0.1486 0.7282 0.024 0.008 0.960 0.008
#> SRR1700085 4 0.6684 0.5495 0.000 0.104 0.336 0.560
#> SRR1700086 3 0.5141 0.4304 0.000 0.032 0.700 0.268
#> SRR1700087 3 0.7000 0.4425 0.008 0.104 0.548 0.340
#> SRR1700088 3 0.3616 0.7158 0.000 0.036 0.852 0.112
#> SRR1700089 3 0.5791 0.5570 0.000 0.060 0.656 0.284
#> SRR1700091 4 0.3991 0.6712 0.000 0.048 0.120 0.832
#> SRR1700090 4 0.1867 0.7010 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700092 4 0.5647 0.5995 0.000 0.116 0.164 0.720
#> SRR1700094 3 0.7082 0.3713 0.000 0.132 0.500 0.368
#> SRR1700093 4 0.1557 0.7082 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700095 4 0.4996 -0.1394 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700096 4 0.5699 0.2977 0.000 0.032 0.380 0.588
#> SRR1700097 3 0.5311 0.5143 0.024 0.000 0.648 0.328
#> SRR1700098 4 0.7299 0.3830 0.000 0.296 0.184 0.520
#> SRR1700099 4 0.3398 0.7016 0.000 0.060 0.068 0.872
#> SRR1700100 4 0.3219 0.6870 0.000 0.020 0.112 0.868
#> SRR1700101 4 0.3307 0.6853 0.000 0.028 0.104 0.868
#> SRR1700102 4 0.4827 0.6705 0.000 0.092 0.124 0.784
#> SRR1700104 4 0.5695 0.2882 0.000 0.040 0.336 0.624
#> SRR1700103 4 0.4624 0.3469 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700105 4 0.0336 0.7037 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700106 4 0.0469 0.7043 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700107 4 0.2142 0.7103 0.000 0.016 0.056 0.928
#> SRR1700108 4 0.3099 0.6837 0.000 0.104 0.020 0.876
#> SRR1700109 4 0.4936 0.5594 0.000 0.280 0.020 0.700
#> SRR1700110 4 0.4284 0.5920 0.000 0.224 0.012 0.764
#> SRR1700112 4 0.2867 0.6927 0.000 0.104 0.012 0.884
#> SRR1700111 4 0.1302 0.7143 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700113 4 0.0188 0.7038 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700114 4 0.3958 0.6792 0.000 0.052 0.112 0.836
#> SRR1700115 4 0.1724 0.7139 0.000 0.020 0.032 0.948
#> SRR1700116 4 0.1557 0.7046 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700117 4 0.4866 0.1436 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700119 4 0.1389 0.7063 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700118 4 0.2329 0.7164 0.000 0.012 0.072 0.916
#> SRR1700120 3 0.4977 0.2965 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1700121 4 0.0921 0.7090 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700122 4 0.1489 0.7034 0.000 0.044 0.004 0.952
#> SRR1700123 4 0.1211 0.7073 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700125 4 0.2704 0.6675 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700126 3 0.5244 0.4362 0.012 0.000 0.600 0.388
#> SRR1700127 4 0.2216 0.6918 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700124 4 0.2868 0.6650 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700128 4 0.1211 0.7073 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700129 4 0.0336 0.7027 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700130 4 0.0672 0.7000 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1700132 4 0.1474 0.7107 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700131 4 0.2589 0.6779 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700133 4 0.0336 0.7032 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700134 4 0.1637 0.6908 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700135 4 0.1557 0.7144 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700136 4 0.1716 0.7021 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700137 4 0.0921 0.7082 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700138 4 0.1389 0.7088 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700140 4 0.1637 0.7064 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700139 4 0.1474 0.7058 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700141 4 0.0592 0.7027 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700142 4 0.4999 0.0658 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1700143 4 0.2216 0.6913 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700144 3 0.5386 0.2826 0.000 0.020 0.612 0.368
#> SRR1700145 4 0.1637 0.7110 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700146 4 0.0804 0.7076 0.000 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700147 4 0.1389 0.7062 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700149 4 0.3266 0.6276 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700148 4 0.1302 0.7068 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700150 4 0.0000 0.7024 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700152 4 0.1118 0.7080 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700151 4 0.1867 0.7067 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700153 4 0.1557 0.7046 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700154 4 0.1211 0.7073 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700155 4 0.0921 0.7082 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700156 4 0.1716 0.7047 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700158 4 0.4098 0.5756 0.012 0.000 0.204 0.784
#> SRR1700159 4 0.3074 0.6520 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1700157 4 0.2814 0.6922 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700160 4 0.1398 0.7154 0.000 0.004 0.040 0.956
#> SRR1700161 4 0.1557 0.7046 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700162 4 0.2704 0.6628 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700164 4 0.5759 0.2445 0.016 0.016 0.352 0.616
#> SRR1700163 4 0.3893 0.6007 0.008 0.000 0.196 0.796
#> SRR1700165 4 0.1940 0.6983 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700166 4 0.0188 0.7037 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700168 4 0.1940 0.6868 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1700167 4 0.2345 0.6882 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700170 4 0.0469 0.7063 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700169 4 0.1489 0.7092 0.000 0.004 0.044 0.952
#> SRR1700171 4 0.6826 -0.1921 0.084 0.004 0.456 0.456
#> SRR1700172 4 0.1118 0.7093 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700174 4 0.0921 0.7082 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700173 4 0.1389 0.7066 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700175 4 0.0188 0.7020 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700176 3 0.4804 0.4454 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1700178 2 0.1716 0.7096 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1700177 4 0.0921 0.7082 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700180 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700179 2 0.2011 0.7145 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700181 2 0.2342 0.7125 0.008 0.912 0.080 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.2281 0.7177 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700184 2 0.3123 0.7100 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700186 3 0.4996 -0.0943 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.3649 0.6841 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700192 1 0.1004 0.9221 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700190 1 0.2081 0.8775 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0336 0.9355 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700193 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700195 2 0.1792 0.7116 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.2647 0.7133 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1700197 1 0.0188 0.9397 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700198 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700199 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700200 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700201 2 0.3486 0.6856 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1700202 1 0.8427 0.0277 0.408 0.260 0.308 0.024
#> SRR1700203 2 0.3486 0.6809 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1700204 2 0.2345 0.7165 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1700206 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700207 2 0.4406 0.5774 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1700208 1 0.2611 0.8609 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1700205 2 0.5269 0.4709 0.000 0.620 0.364 0.016
#> SRR1700209 2 0.5558 0.6492 0.000 0.712 0.208 0.080
#> SRR1700210 2 0.2345 0.7215 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1700211 2 0.7344 0.4631 0.208 0.524 0.268 0.000
#> SRR1700212 2 0.3074 0.7164 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700213 3 0.5119 0.0204 0.000 0.440 0.556 0.004
#> SRR1700214 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.2530 0.7242 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.4522 0.5702 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1700219 2 0.5018 0.5361 0.000 0.656 0.332 0.012
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 4 0.7226 0.1803 0.000 0.388 0.144 0.468
#> SRR1700221 2 0.2342 0.7126 0.008 0.912 0.080 0.000
#> SRR1700223 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700224 2 0.4964 0.6661 0.000 0.716 0.256 0.028
#> SRR1700226 2 0.2973 0.7128 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1700229 2 0.2944 0.7199 0.000 0.868 0.128 0.004
#> SRR1700225 3 0.5286 0.2162 0.004 0.384 0.604 0.008
#> SRR1700227 2 0.2469 0.7158 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1700230 1 0.0188 0.9397 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700231 2 0.3942 0.6361 0.000 0.764 0.236 0.000
#> SRR1700228 2 0.2973 0.7040 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1700232 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700233 2 0.1792 0.7117 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700234 2 0.4011 0.6817 0.000 0.784 0.208 0.008
#> SRR1700235 2 0.5189 0.4398 0.000 0.616 0.372 0.012
#> SRR1700237 2 0.2401 0.7245 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1700236 2 0.3895 0.6965 0.000 0.804 0.184 0.012
#> SRR1700238 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.8599 0.2772 0.120 0.220 0.528 0.132
#> SRR1700243 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700244 2 0.1940 0.7097 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700242 1 0.3052 0.8287 0.880 0.012 0.104 0.004
#> SRR1700246 3 0.7782 -0.2021 0.180 0.392 0.420 0.008
#> SRR1700245 2 0.2647 0.7279 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.3975 0.6548 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1700248 2 0.1637 0.7073 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700251 2 0.1557 0.7045 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700252 3 0.5018 0.3422 0.012 0.332 0.656 0.000
#> SRR1700253 2 0.1867 0.7125 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700256 2 0.1867 0.7128 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9408 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.2011 0.7143 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700257 2 0.4164 0.5996 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1700258 2 0.3873 0.6715 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1700259 2 0.7432 0.0403 0.000 0.480 0.184 0.336
#> SRR1700260 2 0.7332 -0.2206 0.000 0.448 0.156 0.396
#> SRR1700261 4 0.7231 0.3742 0.000 0.392 0.144 0.464
#> SRR1700262 4 0.6932 0.3852 0.000 0.396 0.112 0.492
#> SRR1700263 2 0.4950 0.5206 0.000 0.620 0.376 0.004
#> SRR1700264 3 0.4624 0.3023 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700265 3 0.2216 0.6976 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700266 2 0.5971 0.3260 0.000 0.532 0.428 0.040
#> SRR1700268 3 0.6674 0.3424 0.044 0.272 0.636 0.048
#> SRR1700270 2 0.2281 0.7192 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700267 2 0.4737 0.6468 0.000 0.728 0.252 0.020
#> SRR1700271 2 0.7105 0.4259 0.000 0.564 0.240 0.196
#> SRR1700272 2 0.6974 0.0513 0.000 0.488 0.116 0.396
#> SRR1700273 2 0.4713 0.5253 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1700274 2 0.6948 0.3803 0.000 0.588 0.204 0.208
#> SRR1700277 3 0.4553 0.6236 0.180 0.040 0.780 0.000
#> SRR1700275 4 0.6574 0.4267 0.000 0.364 0.088 0.548
#> SRR1700276 2 0.7523 0.0593 0.000 0.416 0.184 0.400
#> SRR1700278 2 0.7236 0.4377 0.000 0.520 0.312 0.168
#> SRR1700279 4 0.7882 -0.0007 0.000 0.284 0.348 0.368
#> SRR1700280 3 0.7608 -0.2324 0.000 0.392 0.408 0.200
#> SRR1700281 2 0.4134 0.6553 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR1700283 4 0.7287 0.3239 0.000 0.384 0.152 0.464
#> SRR1700282 3 0.6881 0.1152 0.000 0.104 0.468 0.428
#> SRR1700284 4 0.6788 0.5734 0.000 0.264 0.144 0.592
#> SRR1700285 4 0.7333 0.4359 0.000 0.332 0.172 0.496
#> SRR1700286 4 0.7520 0.3506 0.000 0.352 0.192 0.456
#> SRR1700287 4 0.6945 0.5201 0.000 0.312 0.136 0.552
#> SRR1700290 3 0.5651 0.6234 0.128 0.008 0.740 0.124
#> SRR1700289 4 0.7192 0.4160 0.000 0.368 0.144 0.488
#> SRR1700288 2 0.2408 0.7140 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1700292 4 0.6966 0.4789 0.000 0.340 0.128 0.532
#> SRR1700291 4 0.5515 0.6724 0.000 0.116 0.152 0.732
#> SRR1700293 2 0.6429 0.5526 0.000 0.644 0.144 0.212
#> SRR1700294 4 0.6353 0.6261 0.000 0.208 0.140 0.652
#> SRR1700295 4 0.6286 0.3314 0.000 0.064 0.384 0.552
#> SRR1700297 4 0.5783 0.6330 0.000 0.220 0.088 0.692
#> SRR1700296 4 0.7335 0.3167 0.000 0.400 0.156 0.444
#> SRR1700298 4 0.7353 0.4404 0.000 0.196 0.288 0.516
#> SRR1700299 4 0.6542 0.5993 0.000 0.128 0.252 0.620
#> SRR1700300 3 0.7243 -0.0393 0.000 0.144 0.452 0.404
#> SRR1700302 4 0.6181 0.6332 0.000 0.204 0.128 0.668
#> SRR1700301 4 0.6609 0.6016 0.000 0.236 0.144 0.620
#> SRR1700303 4 0.6184 0.6305 0.000 0.216 0.120 0.664
#> SRR1700304 3 0.8356 -0.0674 0.032 0.308 0.452 0.208
#> SRR1700305 2 0.7660 0.0814 0.000 0.428 0.216 0.356
#> SRR1700306 4 0.6575 0.3076 0.000 0.080 0.412 0.508
#> SRR1700308 4 0.7193 0.4711 0.000 0.208 0.240 0.552
#> SRR1700307 3 0.6061 0.0940 0.000 0.048 0.552 0.400
#> SRR1700309 3 0.5599 0.3627 0.000 0.040 0.644 0.316
#> SRR1700310 4 0.6429 0.6205 0.000 0.212 0.144 0.644
#> SRR1700311 4 0.6204 0.6461 0.000 0.168 0.160 0.672
#> SRR1700312 4 0.7463 0.2279 0.000 0.384 0.176 0.440
#> SRR1700313 3 0.5900 0.4883 0.000 0.096 0.684 0.220
#> SRR1700314 4 0.4919 0.6858 0.000 0.076 0.152 0.772
#> SRR1700315 4 0.6663 0.5591 0.000 0.124 0.280 0.596
#> SRR1700316 4 0.5690 0.6704 0.000 0.096 0.196 0.708
#> SRR1700317 2 0.7117 0.3930 0.000 0.564 0.208 0.228
#> SRR1700318 4 0.7731 0.1778 0.000 0.228 0.376 0.396
#> SRR1700319 4 0.5132 0.6810 0.000 0.068 0.184 0.748
#> SRR1700320 4 0.6637 0.5974 0.000 0.240 0.144 0.616
#> SRR1700322 4 0.7842 0.1217 0.004 0.248 0.296 0.452
#> SRR1700321 4 0.6545 0.6028 0.000 0.216 0.152 0.632
#> SRR1700323 4 0.4655 0.6941 0.000 0.088 0.116 0.796
#> SRR1700324 4 0.7020 0.4029 0.000 0.376 0.124 0.500
#> SRR1700325 2 0.6690 0.5157 0.000 0.620 0.192 0.188
#> SRR1700326 4 0.6024 0.0201 0.004 0.032 0.464 0.500
#> SRR1700327 4 0.6957 0.5775 0.000 0.248 0.172 0.580
#> SRR1700329 4 0.6420 0.6160 0.000 0.228 0.132 0.640
#> SRR1700328 3 0.5628 0.5160 0.000 0.132 0.724 0.144
#> SRR1700330 3 0.7450 0.1326 0.000 0.216 0.504 0.280
#> SRR1700331 4 0.6490 0.6212 0.000 0.204 0.156 0.640
#> SRR1700332 4 0.6426 0.5960 0.000 0.256 0.116 0.628
#> SRR1700333 2 0.7853 0.2102 0.000 0.400 0.292 0.308
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.4824 0.71365 0.000 0.740 0.188 0.036 0.036
#> SRR1699875 3 0.4517 0.60831 0.000 0.124 0.764 0.108 0.004
#> SRR1699876 5 0.4927 0.39878 0.000 0.248 0.052 0.008 0.692
#> SRR1699877 2 0.5161 0.65618 0.000 0.676 0.260 0.044 0.020
#> SRR1699879 2 0.7369 0.37735 0.000 0.456 0.332 0.068 0.144
#> SRR1699878 3 0.5757 -0.15399 0.000 0.416 0.496 0.088 0.000
#> SRR1699880 3 0.1864 0.69123 0.000 0.004 0.924 0.068 0.004
#> SRR1699881 3 0.4067 0.70219 0.000 0.024 0.816 0.100 0.060
#> SRR1699882 2 0.6313 0.62406 0.000 0.636 0.148 0.048 0.168
#> SRR1699883 2 0.4941 0.66803 0.000 0.696 0.244 0.048 0.012
#> SRR1699884 2 0.5031 0.67058 0.000 0.692 0.248 0.036 0.024
#> SRR1699885 2 0.4368 0.71632 0.000 0.764 0.184 0.036 0.016
#> SRR1699886 5 0.6330 0.12462 0.000 0.364 0.080 0.032 0.524
#> SRR1699888 2 0.6142 0.62626 0.000 0.644 0.148 0.036 0.172
#> SRR1699889 5 0.2707 0.40063 0.000 0.080 0.008 0.024 0.888
#> SRR1699890 5 0.7387 -0.04161 0.000 0.364 0.112 0.088 0.436
#> SRR1699887 5 0.6780 -0.10981 0.000 0.408 0.112 0.036 0.444
#> SRR1699891 5 0.4892 0.43300 0.000 0.124 0.016 0.112 0.748
#> SRR1699892 3 0.6057 0.42636 0.000 0.228 0.636 0.100 0.036
#> SRR1699893 5 0.5156 -0.18906 0.000 0.004 0.072 0.256 0.668
#> SRR1699894 5 0.4593 0.42666 0.000 0.128 0.000 0.124 0.748
#> SRR1699895 5 0.4394 0.42241 0.000 0.100 0.000 0.136 0.764
#> SRR1699896 3 0.5248 0.62532 0.000 0.068 0.740 0.128 0.064
#> SRR1699897 3 0.5903 0.44759 0.000 0.216 0.660 0.060 0.064
#> SRR1699898 3 0.4845 0.62347 0.000 0.000 0.724 0.148 0.128
#> SRR1699900 3 0.4287 0.64549 0.000 0.024 0.780 0.164 0.032
#> SRR1699899 5 0.4933 0.40331 0.000 0.128 0.104 0.020 0.748
#> SRR1699902 3 0.1569 0.70052 0.000 0.004 0.944 0.044 0.008
#> SRR1699901 3 0.5211 0.65014 0.012 0.004 0.724 0.140 0.120
#> SRR1699903 5 0.2228 0.34557 0.000 0.020 0.016 0.044 0.920
#> SRR1699904 5 0.4268 0.41230 0.000 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1699905 3 0.6065 0.52979 0.012 0.000 0.616 0.172 0.200
#> SRR1699906 5 0.4615 0.42362 0.000 0.144 0.052 0.032 0.772
#> SRR1699907 5 0.4507 0.43462 0.000 0.112 0.012 0.100 0.776
#> SRR1699908 5 0.2701 0.37879 0.000 0.032 0.036 0.032 0.900
#> SRR1699909 5 0.3996 0.32815 0.000 0.020 0.112 0.052 0.816
#> SRR1699910 5 0.5187 0.15356 0.000 0.000 0.084 0.260 0.656
#> SRR1699911 5 0.5866 0.36636 0.000 0.048 0.132 0.136 0.684
#> SRR1699912 5 0.4969 0.39025 0.000 0.048 0.044 0.164 0.744
#> SRR1699913 5 0.3924 0.42607 0.000 0.080 0.008 0.096 0.816
#> SRR1699914 3 0.5556 0.54854 0.000 0.000 0.616 0.108 0.276
#> SRR1699915 5 0.5342 0.19066 0.000 0.008 0.072 0.268 0.652
#> SRR1699916 5 0.7029 0.31758 0.000 0.296 0.080 0.100 0.524
#> SRR1699917 5 0.4519 0.05434 0.000 0.012 0.048 0.188 0.752
#> SRR1699918 5 0.6599 0.31106 0.000 0.120 0.124 0.124 0.632
#> SRR1699919 5 0.3850 0.31693 0.000 0.012 0.044 0.128 0.816
#> SRR1699920 5 0.5192 0.10810 0.000 0.004 0.132 0.164 0.700
#> SRR1699921 5 0.4837 0.23459 0.000 0.004 0.092 0.176 0.728
#> SRR1699922 2 0.8137 0.12942 0.000 0.336 0.228 0.108 0.328
#> SRR1699923 3 0.5067 0.61615 0.012 0.000 0.724 0.160 0.104
#> SRR1699924 3 0.5408 0.56549 0.000 0.000 0.652 0.120 0.228
#> SRR1699925 1 0.0162 0.94684 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699926 5 0.4648 0.29067 0.000 0.000 0.104 0.156 0.740
#> SRR1699927 5 0.4506 0.40001 0.000 0.052 0.016 0.168 0.764
#> SRR1699929 3 0.6026 0.56000 0.000 0.100 0.672 0.164 0.064
#> SRR1699928 5 0.3967 0.41311 0.000 0.060 0.008 0.124 0.808
#> SRR1699930 5 0.4593 0.42627 0.000 0.128 0.000 0.124 0.748
#> SRR1699931 3 0.5327 0.59779 0.000 0.100 0.728 0.132 0.040
#> SRR1699933 3 0.3729 0.70049 0.000 0.036 0.844 0.064 0.056
#> SRR1699932 5 0.3969 0.42928 0.000 0.096 0.004 0.092 0.808
#> SRR1699934 1 0.0162 0.94684 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699935 5 0.6202 -0.29440 0.000 0.008 0.144 0.284 0.564
#> SRR1699936 2 0.7858 0.08067 0.000 0.324 0.324 0.064 0.288
#> SRR1699937 3 0.6104 0.30634 0.000 0.304 0.564 0.124 0.008
#> SRR1699938 2 0.6192 0.33595 0.000 0.508 0.392 0.076 0.024
#> SRR1699940 3 0.4028 0.70673 0.000 0.016 0.816 0.084 0.084
#> SRR1699939 3 0.7797 0.20852 0.000 0.236 0.428 0.080 0.256
#> SRR1699941 3 0.2165 0.69423 0.004 0.016 0.920 0.056 0.004
#> SRR1699942 3 0.4973 0.68218 0.000 0.048 0.756 0.132 0.064
#> SRR1699943 2 0.6144 0.16131 0.000 0.452 0.432 0.112 0.004
#> SRR1699944 3 0.6600 0.24618 0.000 0.296 0.552 0.112 0.040
#> SRR1699945 3 0.4203 0.70105 0.032 0.000 0.808 0.108 0.052
#> SRR1699946 3 0.5600 0.40158 0.000 0.256 0.632 0.108 0.004
#> SRR1699947 3 0.5554 0.36105 0.000 0.248 0.640 0.108 0.004
#> SRR1699948 2 0.6372 0.22523 0.000 0.460 0.412 0.116 0.012
#> SRR1699949 5 0.6527 0.16155 0.000 0.336 0.112 0.028 0.524
#> SRR1699950 5 0.7974 -0.18131 0.000 0.292 0.316 0.076 0.316
#> SRR1699951 3 0.7404 0.47771 0.000 0.112 0.532 0.152 0.204
#> SRR1699952 3 0.5226 0.54019 0.000 0.164 0.704 0.124 0.008
#> SRR1699953 2 0.6987 0.33618 0.000 0.472 0.368 0.068 0.092
#> SRR1699954 3 0.4680 0.62806 0.008 0.036 0.744 0.200 0.012
#> SRR1699955 2 0.6131 0.56280 0.000 0.612 0.268 0.044 0.076
#> SRR1699956 3 0.4894 0.70021 0.016 0.000 0.748 0.116 0.120
#> SRR1699957 3 0.5393 0.47253 0.000 0.200 0.680 0.112 0.008
#> SRR1699959 3 0.4277 0.64477 0.000 0.000 0.768 0.156 0.076
#> SRR1699958 3 0.7739 -0.37998 0.000 0.052 0.328 0.312 0.308
#> SRR1699960 5 0.7776 -0.04531 0.000 0.240 0.324 0.064 0.372
#> SRR1699961 3 0.2740 0.68017 0.000 0.028 0.876 0.096 0.000
#> SRR1699962 2 0.7533 0.32965 0.000 0.428 0.296 0.052 0.224
#> SRR1699963 3 0.5759 0.63250 0.000 0.120 0.688 0.152 0.040
#> SRR1699964 2 0.5437 0.55276 0.000 0.608 0.328 0.052 0.012
#> SRR1699965 2 0.6657 0.55924 0.000 0.572 0.232 0.036 0.160
#> SRR1699966 3 0.6406 0.31035 0.000 0.004 0.512 0.172 0.312
#> SRR1699967 2 0.5747 0.45433 0.000 0.576 0.336 0.080 0.008
#> SRR1699968 3 0.4777 0.58959 0.000 0.000 0.680 0.052 0.268
#> SRR1699969 3 0.4676 0.64075 0.000 0.000 0.720 0.072 0.208
#> SRR1699971 3 0.2740 0.68295 0.000 0.028 0.876 0.096 0.000
#> SRR1699970 3 0.5925 0.35504 0.000 0.264 0.604 0.124 0.008
#> SRR1699972 3 0.2136 0.68739 0.000 0.008 0.904 0.088 0.000
#> SRR1699973 5 0.7371 -0.08022 0.000 0.036 0.372 0.216 0.376
#> SRR1699974 3 0.2854 0.69669 0.028 0.000 0.880 0.084 0.008
#> SRR1699975 3 0.5767 0.32047 0.000 0.004 0.504 0.076 0.416
#> SRR1699976 3 0.3267 0.67356 0.000 0.044 0.844 0.112 0.000
#> SRR1699977 3 0.5651 0.57825 0.000 0.020 0.656 0.088 0.236
#> SRR1699978 3 0.6442 0.28676 0.000 0.000 0.480 0.324 0.196
#> SRR1699979 3 0.5511 0.57557 0.000 0.012 0.664 0.096 0.228
#> SRR1699980 3 0.5510 0.37262 0.000 0.000 0.548 0.072 0.380
#> SRR1699981 3 0.5652 0.14786 0.000 0.004 0.472 0.064 0.460
#> SRR1699982 5 0.3802 0.42400 0.000 0.080 0.004 0.096 0.820
#> SRR1699983 5 0.5767 0.15575 0.000 0.016 0.292 0.080 0.612
#> SRR1699984 1 0.0771 0.94371 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699985 3 0.6903 0.14363 0.000 0.084 0.432 0.064 0.420
#> SRR1699986 3 0.6411 0.54144 0.132 0.000 0.632 0.176 0.060
#> SRR1699988 3 0.7872 0.31451 0.000 0.176 0.456 0.124 0.244
#> SRR1699987 3 0.6616 -0.09453 0.000 0.000 0.456 0.292 0.252
#> SRR1699989 5 0.5462 0.36107 0.000 0.132 0.140 0.024 0.704
#> SRR1699990 3 0.6011 0.33470 0.000 0.020 0.488 0.064 0.428
#> SRR1699992 3 0.2964 0.68472 0.000 0.024 0.856 0.120 0.000
#> SRR1699991 3 0.3051 0.70197 0.000 0.000 0.864 0.076 0.060
#> SRR1699993 3 0.6912 0.49289 0.040 0.000 0.544 0.196 0.220
#> SRR1699994 3 0.1883 0.69929 0.008 0.000 0.932 0.048 0.012
#> SRR1699995 3 0.5671 0.37696 0.348 0.000 0.568 0.080 0.004
#> SRR1699996 2 0.4442 0.71741 0.000 0.784 0.128 0.068 0.020
#> SRR1699997 5 0.6158 -0.50574 0.000 0.000 0.136 0.384 0.480
#> SRR1699998 3 0.5645 0.30828 0.000 0.300 0.620 0.056 0.024
#> SRR1699999 1 0.3885 0.77769 0.784 0.000 0.176 0.040 0.000
#> SRR1700000 3 0.5777 0.62613 0.004 0.068 0.684 0.196 0.048
#> SRR1700002 3 0.5164 0.62061 0.000 0.120 0.732 0.124 0.024
#> SRR1700001 3 0.3427 0.70901 0.004 0.004 0.852 0.080 0.060
#> SRR1700003 3 0.5359 0.66109 0.000 0.028 0.716 0.108 0.148
#> SRR1700004 3 0.4412 0.67431 0.000 0.000 0.756 0.080 0.164
#> SRR1700005 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.2812 0.68486 0.000 0.024 0.876 0.096 0.004
#> SRR1700007 5 0.4678 0.41740 0.000 0.224 0.000 0.064 0.712
#> SRR1700008 4 0.6021 0.63954 0.000 0.000 0.116 0.476 0.408
#> SRR1700009 1 0.0609 0.94400 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700010 3 0.3404 0.71153 0.024 0.000 0.860 0.068 0.048
#> SRR1700011 5 0.7912 0.03277 0.000 0.260 0.292 0.076 0.372
#> SRR1700013 3 0.5573 0.58945 0.000 0.024 0.676 0.212 0.088
#> SRR1700012 3 0.2069 0.70088 0.000 0.012 0.924 0.052 0.012
#> SRR1700014 3 0.4933 0.59076 0.000 0.000 0.692 0.080 0.228
#> SRR1700015 3 0.3183 0.68336 0.000 0.028 0.856 0.108 0.008
#> SRR1700016 1 0.4656 0.64022 0.700 0.000 0.256 0.040 0.004
#> SRR1700018 3 0.1990 0.69152 0.000 0.008 0.920 0.068 0.004
#> SRR1700017 3 0.2464 0.70424 0.000 0.004 0.892 0.092 0.012
#> SRR1700019 5 0.5189 0.33999 0.000 0.300 0.044 0.012 0.644
#> SRR1700020 3 0.4086 0.69694 0.056 0.000 0.820 0.088 0.036
#> SRR1700021 5 0.4254 0.35688 0.000 0.020 0.024 0.188 0.768
#> SRR1700023 3 0.3914 0.68029 0.000 0.000 0.788 0.048 0.164
#> SRR1700022 3 0.2393 0.70403 0.000 0.004 0.900 0.080 0.016
#> SRR1700024 3 0.6557 0.15364 0.000 0.012 0.440 0.140 0.408
#> SRR1700025 3 0.4361 0.62886 0.000 0.108 0.768 0.124 0.000
#> SRR1700026 3 0.2886 0.68904 0.000 0.016 0.864 0.116 0.004
#> SRR1700027 3 0.1764 0.69350 0.000 0.008 0.928 0.064 0.000
#> SRR1700028 5 0.6121 -0.49754 0.000 0.000 0.132 0.380 0.488
#> SRR1700029 3 0.5405 0.55079 0.000 0.000 0.660 0.136 0.204
#> SRR1700030 3 0.5813 0.28533 0.000 0.004 0.500 0.080 0.416
#> SRR1700031 3 0.2685 0.70868 0.000 0.000 0.880 0.092 0.028
#> SRR1700032 3 0.4360 0.60984 0.000 0.132 0.780 0.080 0.008
#> SRR1700034 1 0.3003 0.87656 0.864 0.000 0.092 0.044 0.000
#> SRR1700035 5 0.4832 0.20091 0.000 0.008 0.180 0.080 0.732
#> SRR1700033 3 0.1788 0.70256 0.000 0.004 0.932 0.056 0.008
#> SRR1700036 3 0.5893 0.18189 0.000 0.000 0.464 0.100 0.436
#> SRR1700037 5 0.3586 0.42044 0.000 0.076 0.000 0.096 0.828
#> SRR1700038 3 0.4901 0.63549 0.004 0.032 0.752 0.164 0.048
#> SRR1700039 3 0.3142 0.70807 0.008 0.000 0.868 0.056 0.068
#> SRR1700040 3 0.1430 0.69740 0.000 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR1700041 3 0.3779 0.65762 0.000 0.004 0.816 0.056 0.124
#> SRR1700042 3 0.2955 0.70034 0.000 0.004 0.876 0.060 0.060
#> SRR1700043 3 0.3393 0.67716 0.008 0.000 0.848 0.100 0.044
#> SRR1700045 3 0.3978 0.64886 0.000 0.004 0.796 0.052 0.148
#> SRR1700044 3 0.3354 0.69782 0.000 0.028 0.864 0.064 0.044
#> SRR1700046 3 0.3065 0.70131 0.000 0.008 0.872 0.048 0.072
#> SRR1700047 3 0.2946 0.70993 0.000 0.000 0.868 0.044 0.088
#> SRR1700048 5 0.6415 -0.12335 0.000 0.004 0.424 0.148 0.424
#> SRR1700049 3 0.4629 0.68814 0.032 0.000 0.780 0.076 0.112
#> SRR1700050 3 0.5792 0.48060 0.000 0.000 0.612 0.164 0.224
#> SRR1700051 3 0.4478 0.67461 0.004 0.000 0.764 0.144 0.088
#> SRR1700052 3 0.2871 0.70055 0.000 0.004 0.876 0.088 0.032
#> SRR1700053 5 0.5904 0.02324 0.000 0.000 0.360 0.112 0.528
#> SRR1700054 3 0.2396 0.70975 0.000 0.004 0.904 0.068 0.024
#> SRR1700055 1 0.1918 0.92613 0.928 0.000 0.036 0.036 0.000
#> SRR1700056 4 0.6652 0.49134 0.000 0.000 0.232 0.420 0.348
#> SRR1700057 3 0.6540 0.16236 0.000 0.000 0.472 0.228 0.300
#> SRR1700058 3 0.1990 0.70049 0.004 0.004 0.928 0.052 0.012
#> SRR1700059 5 0.6784 -0.18014 0.000 0.000 0.352 0.280 0.368
#> SRR1700060 3 0.4316 0.66451 0.000 0.000 0.772 0.108 0.120
#> SRR1700061 3 0.1682 0.70513 0.004 0.000 0.940 0.044 0.012
#> SRR1700062 3 0.5434 0.50267 0.000 0.000 0.656 0.208 0.136
#> SRR1700063 3 0.2437 0.70709 0.000 0.004 0.904 0.060 0.032
#> SRR1700064 5 0.5595 0.06506 0.000 0.000 0.252 0.124 0.624
#> SRR1700065 3 0.1970 0.70152 0.000 0.004 0.924 0.060 0.012
#> SRR1700066 3 0.2100 0.70391 0.016 0.000 0.924 0.048 0.012
#> SRR1700067 5 0.4000 -0.04876 0.000 0.000 0.024 0.228 0.748
#> SRR1700068 3 0.6569 0.11028 0.000 0.000 0.468 0.240 0.292
#> SRR1700069 3 0.5672 0.46134 0.000 0.000 0.584 0.104 0.312
#> SRR1700070 3 0.5972 0.61285 0.000 0.112 0.676 0.056 0.156
#> SRR1700071 3 0.3688 0.66563 0.000 0.000 0.816 0.060 0.124
#> SRR1700072 3 0.4057 0.68374 0.000 0.000 0.792 0.120 0.088
#> SRR1700073 5 0.4288 0.33946 0.000 0.016 0.080 0.108 0.796
#> SRR1700075 3 0.3056 0.71489 0.000 0.000 0.864 0.068 0.068
#> SRR1700074 3 0.2173 0.70338 0.000 0.012 0.920 0.052 0.016
#> SRR1700076 3 0.2606 0.70394 0.000 0.012 0.900 0.056 0.032
#> SRR1700077 3 0.1877 0.69675 0.004 0.004 0.932 0.052 0.008
#> SRR1700078 3 0.4832 0.66118 0.000 0.000 0.720 0.104 0.176
#> SRR1700080 3 0.5104 0.55252 0.000 0.000 0.648 0.068 0.284
#> SRR1700079 3 0.4734 0.62917 0.000 0.000 0.732 0.108 0.160
#> SRR1700081 3 0.4069 0.68768 0.000 0.000 0.792 0.112 0.096
#> SRR1700082 3 0.1704 0.69673 0.000 0.004 0.928 0.068 0.000
#> SRR1700083 3 0.3758 0.69218 0.000 0.000 0.816 0.096 0.088
#> SRR1700084 3 0.2952 0.68928 0.020 0.000 0.868 0.104 0.008
#> SRR1700085 5 0.5880 0.22216 0.000 0.040 0.264 0.064 0.632
#> SRR1700086 3 0.4402 0.62909 0.000 0.000 0.740 0.056 0.204
#> SRR1700087 3 0.6593 0.33491 0.004 0.068 0.548 0.324 0.056
#> SRR1700088 3 0.5231 0.69362 0.000 0.028 0.728 0.140 0.104
#> SRR1700089 3 0.5960 0.53299 0.000 0.040 0.644 0.232 0.084
#> SRR1700091 5 0.7148 -0.31350 0.000 0.016 0.264 0.328 0.392
#> SRR1700090 5 0.6350 -0.57347 0.000 0.000 0.160 0.420 0.420
#> SRR1700092 3 0.7619 -0.32720 0.000 0.044 0.344 0.276 0.336
#> SRR1700094 3 0.7119 0.24248 0.000 0.112 0.484 0.336 0.068
#> SRR1700093 5 0.5675 -0.43317 0.000 0.000 0.092 0.352 0.556
#> SRR1700095 3 0.6368 -0.18203 0.000 0.000 0.436 0.400 0.164
#> SRR1700096 3 0.6491 0.16648 0.000 0.000 0.492 0.244 0.264
#> SRR1700097 3 0.6190 0.25759 0.008 0.000 0.520 0.356 0.116
#> SRR1700098 5 0.8064 0.19357 0.000 0.300 0.196 0.116 0.388
#> SRR1700099 5 0.7120 -0.34803 0.000 0.028 0.204 0.312 0.456
#> SRR1700100 5 0.6853 -0.35345 0.000 0.004 0.252 0.344 0.400
#> SRR1700101 5 0.7043 -0.32034 0.000 0.016 0.236 0.316 0.432
#> SRR1700102 5 0.7165 -0.21480 0.000 0.020 0.264 0.292 0.424
#> SRR1700104 3 0.7016 -0.37209 0.000 0.008 0.368 0.348 0.276
#> SRR1700103 4 0.6746 0.34283 0.000 0.000 0.360 0.380 0.260
#> SRR1700105 5 0.4425 -0.34454 0.000 0.000 0.008 0.392 0.600
#> SRR1700106 5 0.4430 -0.48652 0.000 0.000 0.004 0.456 0.540
#> SRR1700107 5 0.5975 -0.42359 0.000 0.000 0.124 0.344 0.532
#> SRR1700108 5 0.7420 -0.20836 0.000 0.104 0.108 0.316 0.472
#> SRR1700109 5 0.6998 0.17222 0.000 0.224 0.024 0.264 0.488
#> SRR1700110 5 0.7878 0.00935 0.000 0.176 0.108 0.288 0.428
#> SRR1700112 5 0.5294 0.03015 0.000 0.044 0.008 0.352 0.596
#> SRR1700111 5 0.5137 -0.55436 0.000 0.000 0.040 0.424 0.536
#> SRR1700113 5 0.5717 -0.32300 0.000 0.016 0.060 0.348 0.576
#> SRR1700114 5 0.7102 -0.32502 0.000 0.012 0.276 0.340 0.372
#> SRR1700115 5 0.5583 -0.37467 0.000 0.004 0.076 0.336 0.584
#> SRR1700116 4 0.5818 0.62616 0.000 0.000 0.092 0.460 0.448
#> SRR1700117 4 0.6441 0.35731 0.000 0.000 0.240 0.504 0.256
#> SRR1700119 5 0.5454 -0.61399 0.000 0.000 0.060 0.452 0.488
#> SRR1700118 5 0.5375 -0.48438 0.000 0.000 0.064 0.368 0.568
#> SRR1700120 3 0.6373 -0.16754 0.000 0.000 0.424 0.412 0.164
#> SRR1700121 5 0.5353 -0.42654 0.000 0.000 0.064 0.360 0.576
#> SRR1700122 5 0.4936 -0.13623 0.000 0.012 0.012 0.412 0.564
#> SRR1700123 4 0.4906 0.59710 0.000 0.000 0.024 0.496 0.480
#> SRR1700125 5 0.5206 -0.00302 0.000 0.044 0.000 0.428 0.528
#> SRR1700126 3 0.6096 0.23210 0.008 0.000 0.560 0.312 0.120
#> SRR1700127 4 0.6504 0.56522 0.000 0.000 0.196 0.448 0.356
#> SRR1700124 4 0.6356 0.57636 0.000 0.000 0.168 0.468 0.364
#> SRR1700128 4 0.5047 0.60925 0.000 0.000 0.032 0.496 0.472
#> SRR1700129 5 0.4936 -0.26345 0.000 0.008 0.016 0.416 0.560
#> SRR1700130 5 0.4235 -0.30548 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700132 4 0.4976 0.60256 0.000 0.000 0.028 0.504 0.468
#> SRR1700131 4 0.6464 0.56545 0.000 0.000 0.200 0.476 0.324
#> SRR1700133 5 0.4256 -0.42854 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700134 5 0.5055 -0.17263 0.000 0.012 0.016 0.428 0.544
#> SRR1700135 4 0.4821 0.56766 0.000 0.000 0.020 0.516 0.464
#> SRR1700136 4 0.5927 0.63457 0.000 0.000 0.104 0.468 0.428
#> SRR1700137 5 0.5047 -0.58992 0.000 0.000 0.032 0.472 0.496
#> SRR1700138 4 0.5293 0.62500 0.000 0.000 0.048 0.492 0.460
#> SRR1700140 4 0.5736 0.62339 0.000 0.000 0.084 0.468 0.448
#> SRR1700139 4 0.5351 0.62451 0.000 0.000 0.052 0.484 0.464
#> SRR1700141 5 0.5253 -0.19870 0.000 0.016 0.024 0.396 0.564
#> SRR1700142 3 0.6442 0.18167 0.000 0.000 0.504 0.252 0.244
#> SRR1700143 4 0.6336 0.60812 0.000 0.000 0.164 0.468 0.368
#> SRR1700144 3 0.5644 0.52458 0.000 0.000 0.628 0.144 0.228
#> SRR1700145 5 0.4659 -0.57333 0.000 0.000 0.012 0.492 0.496
#> SRR1700146 5 0.4980 -0.23291 0.000 0.008 0.020 0.396 0.576
#> SRR1700147 4 0.5175 0.62138 0.000 0.000 0.040 0.496 0.464
#> SRR1700149 4 0.5907 0.58500 0.004 0.000 0.096 0.532 0.368
#> SRR1700148 4 0.5111 0.61732 0.000 0.000 0.036 0.500 0.464
#> SRR1700150 5 0.4630 -0.36063 0.000 0.000 0.016 0.396 0.588
#> SRR1700152 4 0.4829 0.58214 0.000 0.000 0.020 0.496 0.484
#> SRR1700151 4 0.5604 0.63059 0.000 0.000 0.072 0.468 0.460
#> SRR1700153 4 0.5175 0.62138 0.000 0.000 0.040 0.496 0.464
#> SRR1700154 4 0.5114 0.61010 0.000 0.000 0.036 0.492 0.472
#> SRR1700155 5 0.5009 -0.50779 0.000 0.000 0.032 0.428 0.540
#> SRR1700156 4 0.6017 0.63061 0.000 0.000 0.116 0.480 0.404
#> SRR1700158 4 0.5964 0.53200 0.008 0.000 0.104 0.568 0.320
#> SRR1700159 5 0.5092 -0.03722 0.000 0.036 0.000 0.440 0.524
#> SRR1700157 5 0.5773 -0.60535 0.000 0.000 0.088 0.436 0.476
#> SRR1700160 5 0.4953 -0.53455 0.000 0.000 0.028 0.440 0.532
#> SRR1700161 4 0.5508 0.62990 0.000 0.000 0.064 0.476 0.460
#> SRR1700162 5 0.5858 -0.15131 0.000 0.052 0.020 0.436 0.492
#> SRR1700164 4 0.6864 0.36017 0.028 0.000 0.208 0.528 0.236
#> SRR1700163 4 0.6134 0.48663 0.008 0.000 0.124 0.556 0.312
#> SRR1700165 4 0.6229 0.61563 0.000 0.000 0.144 0.464 0.392
#> SRR1700166 5 0.4617 -0.48118 0.000 0.000 0.012 0.436 0.552
#> SRR1700168 5 0.5250 0.00529 0.000 0.048 0.000 0.416 0.536
#> SRR1700167 4 0.5861 0.64141 0.000 0.000 0.100 0.500 0.400
#> SRR1700170 5 0.4473 -0.39282 0.000 0.000 0.008 0.412 0.580
#> SRR1700169 5 0.5467 -0.55612 0.000 0.000 0.064 0.412 0.524
#> SRR1700171 4 0.7189 0.15464 0.052 0.000 0.344 0.460 0.144
#> SRR1700172 5 0.5285 -0.42226 0.000 0.000 0.060 0.356 0.584
#> SRR1700174 5 0.5331 -0.46404 0.000 0.000 0.060 0.372 0.568
#> SRR1700173 5 0.5443 -0.58723 0.000 0.000 0.060 0.436 0.504
#> SRR1700175 5 0.4354 -0.29920 0.000 0.000 0.008 0.368 0.624
#> SRR1700176 3 0.5862 0.19393 0.000 0.000 0.544 0.344 0.112
#> SRR1700178 2 0.1124 0.74916 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1700177 5 0.4953 -0.51401 0.000 0.000 0.028 0.440 0.532
#> SRR1700180 2 0.1082 0.74587 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1700179 2 0.1638 0.75153 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1700181 2 0.1408 0.75009 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.1768 0.75316 0.000 0.924 0.072 0.004 0.000
#> SRR1700184 2 0.2012 0.75850 0.000 0.920 0.060 0.020 0.000
#> SRR1700186 2 0.5385 0.55159 0.000 0.616 0.312 0.068 0.004
#> SRR1700187 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.2464 0.75853 0.000 0.888 0.096 0.016 0.000
#> SRR1700192 1 0.2308 0.91677 0.912 0.004 0.048 0.036 0.000
#> SRR1700190 1 0.3857 0.85014 0.812 0.000 0.048 0.132 0.008
#> SRR1700191 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0963 0.93274 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0771 0.73805 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700195 2 0.0290 0.73293 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.1484 0.74840 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700197 1 0.1444 0.93671 0.948 0.000 0.012 0.040 0.000
#> SRR1700198 2 0.0693 0.73629 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1700199 2 0.0740 0.73535 0.000 0.980 0.004 0.008 0.008
#> SRR1700200 2 0.0324 0.72965 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.2824 0.75602 0.000 0.864 0.116 0.020 0.000
#> SRR1700202 2 0.9107 0.14689 0.240 0.300 0.220 0.212 0.028
#> SRR1700203 2 0.2332 0.75550 0.000 0.904 0.076 0.016 0.004
#> SRR1700204 2 0.1644 0.75695 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1700206 2 0.0981 0.73803 0.000 0.972 0.012 0.008 0.008
#> SRR1700207 2 0.3061 0.75006 0.000 0.844 0.136 0.020 0.000
#> SRR1700208 1 0.5394 0.72645 0.708 0.008 0.132 0.144 0.008
#> SRR1700205 2 0.4851 0.70108 0.000 0.744 0.168 0.068 0.020
#> SRR1700209 2 0.5350 0.71263 0.000 0.732 0.128 0.056 0.084
#> SRR1700210 2 0.2074 0.75909 0.000 0.920 0.060 0.016 0.004
#> SRR1700211 2 0.7872 0.48023 0.136 0.520 0.188 0.140 0.016
#> SRR1700212 2 0.2234 0.74985 0.000 0.916 0.044 0.036 0.004
#> SRR1700213 2 0.6792 0.36668 0.000 0.484 0.360 0.120 0.036
#> SRR1700214 2 0.0324 0.72965 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.3013 0.75728 0.000 0.880 0.068 0.028 0.024
#> SRR1700216 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.4206 0.73595 0.000 0.784 0.164 0.028 0.024
#> SRR1700219 2 0.3937 0.73005 0.000 0.784 0.184 0.020 0.012
#> SRR1700222 1 0.0162 0.94665 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.6382 0.24072 0.000 0.496 0.080 0.032 0.392
#> SRR1700221 2 0.1211 0.74510 0.000 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR1700223 2 0.1485 0.75074 0.000 0.948 0.032 0.020 0.000
#> SRR1700224 2 0.5294 0.69876 0.000 0.712 0.164 0.020 0.104
#> SRR1700226 2 0.2795 0.75602 0.000 0.892 0.060 0.024 0.024
#> SRR1700229 2 0.3227 0.75499 0.000 0.868 0.072 0.020 0.040
#> SRR1700225 2 0.6669 0.26591 0.000 0.460 0.404 0.100 0.036
#> SRR1700227 2 0.1331 0.74940 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700230 1 0.1579 0.93225 0.944 0.000 0.032 0.024 0.000
#> SRR1700231 2 0.2112 0.75353 0.000 0.908 0.084 0.004 0.004
#> SRR1700228 2 0.1443 0.74912 0.000 0.948 0.044 0.004 0.004
#> SRR1700232 2 0.1211 0.74101 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1700233 2 0.1041 0.74771 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1700234 2 0.5130 0.68124 0.000 0.732 0.148 0.096 0.024
#> SRR1700235 2 0.3967 0.64567 0.000 0.724 0.264 0.000 0.012
#> SRR1700237 2 0.1412 0.74948 0.000 0.952 0.036 0.004 0.008
#> SRR1700236 2 0.3442 0.75732 0.000 0.852 0.088 0.016 0.044
#> SRR1700238 2 0.0451 0.73100 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.8785 0.28249 0.068 0.180 0.420 0.244 0.088
#> SRR1700243 2 0.0162 0.72986 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.1153 0.74523 0.000 0.964 0.024 0.008 0.004
#> SRR1700242 1 0.3170 0.86235 0.856 0.004 0.104 0.036 0.000
#> SRR1700246 2 0.8793 0.27551 0.096 0.396 0.260 0.196 0.052
#> SRR1700245 2 0.2340 0.76217 0.000 0.908 0.068 0.012 0.012
#> SRR1700247 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.2984 0.75552 0.000 0.856 0.124 0.016 0.004
#> SRR1700248 2 0.0290 0.73140 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.1168 0.74195 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700252 2 0.7478 0.18110 0.028 0.416 0.392 0.136 0.028
#> SRR1700253 2 0.1661 0.75062 0.000 0.940 0.036 0.024 0.000
#> SRR1700256 2 0.1243 0.74736 0.000 0.960 0.028 0.004 0.008
#> SRR1700254 1 0.0000 0.94750 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.1741 0.74974 0.000 0.936 0.040 0.024 0.000
#> SRR1700257 2 0.2522 0.75089 0.000 0.880 0.108 0.012 0.000
#> SRR1700258 2 0.3219 0.75361 0.000 0.840 0.136 0.020 0.004
#> SRR1700259 2 0.7031 0.19767 0.000 0.416 0.156 0.032 0.396
#> SRR1700260 5 0.5340 0.30828 0.000 0.324 0.036 0.020 0.620
#> SRR1700261 5 0.4990 0.39992 0.000 0.232 0.056 0.012 0.700
#> SRR1700262 5 0.6110 0.38040 0.000 0.264 0.008 0.144 0.584
#> SRR1700263 2 0.5777 0.64340 0.000 0.644 0.256 0.040 0.060
#> SRR1700264 2 0.5891 0.31982 0.000 0.476 0.448 0.060 0.016
#> SRR1700265 3 0.5605 0.57363 0.004 0.128 0.696 0.152 0.020
#> SRR1700266 2 0.6977 0.53359 0.000 0.552 0.204 0.052 0.192
#> SRR1700268 3 0.8220 0.18086 0.036 0.268 0.456 0.164 0.076
#> SRR1700270 2 0.2150 0.75478 0.004 0.916 0.068 0.004 0.008
#> SRR1700267 2 0.4329 0.72344 0.000 0.776 0.168 0.028 0.028
#> SRR1700271 2 0.7095 0.45409 0.000 0.504 0.172 0.044 0.280
#> SRR1700272 2 0.7611 -0.14899 0.000 0.392 0.064 0.188 0.356
#> SRR1700273 2 0.4747 0.71220 0.000 0.744 0.188 0.032 0.036
#> SRR1700274 2 0.6578 0.32535 0.000 0.516 0.100 0.036 0.348
#> SRR1700277 3 0.7227 0.51369 0.148 0.084 0.572 0.188 0.008
#> SRR1700275 5 0.6746 0.34458 0.000 0.220 0.012 0.268 0.500
#> SRR1700276 2 0.8185 -0.21829 0.000 0.316 0.104 0.288 0.292
#> SRR1700278 2 0.7998 0.29516 0.000 0.420 0.180 0.124 0.276
#> SRR1700279 5 0.8133 0.19565 0.000 0.148 0.168 0.292 0.392
#> SRR1700280 2 0.8256 0.21105 0.000 0.368 0.204 0.144 0.284
#> SRR1700281 2 0.3870 0.74369 0.000 0.808 0.148 0.024 0.020
#> SRR1700283 5 0.6973 0.28963 0.000 0.296 0.060 0.120 0.524
#> SRR1700282 4 0.7734 0.06385 0.000 0.052 0.300 0.336 0.312
#> SRR1700284 5 0.3980 0.41929 0.000 0.076 0.000 0.128 0.796
#> SRR1700285 5 0.5783 0.41458 0.000 0.192 0.068 0.060 0.680
#> SRR1700286 5 0.6771 0.18414 0.000 0.292 0.132 0.040 0.536
#> SRR1700287 5 0.5474 0.41562 0.000 0.188 0.004 0.140 0.668
#> SRR1700290 3 0.6891 0.54154 0.088 0.000 0.592 0.176 0.144
#> SRR1700289 5 0.4906 0.42546 0.000 0.184 0.004 0.092 0.720
#> SRR1700288 2 0.2400 0.75334 0.000 0.912 0.048 0.020 0.020
#> SRR1700292 5 0.5677 0.41355 0.000 0.200 0.004 0.152 0.644
#> SRR1700291 5 0.3968 0.30399 0.000 0.012 0.100 0.072 0.816
#> SRR1700293 2 0.5710 0.54419 0.000 0.652 0.076 0.028 0.244
#> SRR1700294 5 0.4220 0.43099 0.000 0.116 0.004 0.092 0.788
#> SRR1700295 4 0.6776 0.11830 0.000 0.008 0.196 0.416 0.380
#> SRR1700297 5 0.5904 0.36233 0.000 0.124 0.008 0.260 0.608
#> SRR1700296 5 0.6126 0.38993 0.000 0.228 0.028 0.120 0.624
#> SRR1700298 5 0.6344 0.30561 0.000 0.048 0.120 0.208 0.624
#> SRR1700299 5 0.5824 0.26081 0.000 0.016 0.100 0.256 0.628
#> SRR1700300 5 0.7209 0.15387 0.000 0.040 0.192 0.296 0.472
#> SRR1700302 5 0.4782 0.35075 0.000 0.048 0.008 0.236 0.708
#> SRR1700301 5 0.4473 0.42899 0.000 0.116 0.004 0.112 0.768
#> SRR1700303 5 0.4902 0.41355 0.000 0.100 0.004 0.172 0.724
#> SRR1700304 5 0.9349 -0.04315 0.044 0.240 0.224 0.236 0.256
#> SRR1700305 5 0.7663 0.28457 0.000 0.264 0.088 0.184 0.464
#> SRR1700306 5 0.6640 0.04939 0.000 0.004 0.208 0.320 0.468
#> SRR1700308 5 0.6351 0.36906 0.000 0.156 0.164 0.048 0.632
#> SRR1700307 5 0.7189 0.03425 0.000 0.044 0.364 0.156 0.436
#> SRR1700309 3 0.6422 0.36236 0.000 0.008 0.532 0.168 0.292
#> SRR1700310 5 0.4539 0.43229 0.000 0.124 0.008 0.100 0.768
#> SRR1700311 5 0.5444 0.26088 0.000 0.020 0.052 0.288 0.640
#> SRR1700312 5 0.6090 0.40221 0.000 0.236 0.068 0.060 0.636
#> SRR1700313 3 0.6653 0.43048 0.000 0.024 0.548 0.172 0.256
#> SRR1700314 5 0.3851 0.18582 0.000 0.004 0.036 0.164 0.796
#> SRR1700315 5 0.6416 0.28632 0.000 0.040 0.176 0.168 0.616
#> SRR1700316 5 0.4295 0.31063 0.000 0.016 0.084 0.104 0.796
#> SRR1700317 2 0.6928 0.41776 0.000 0.512 0.120 0.052 0.316
#> SRR1700318 5 0.7651 0.19171 0.000 0.080 0.212 0.244 0.464
#> SRR1700319 5 0.4163 0.23249 0.000 0.000 0.032 0.228 0.740
#> SRR1700320 5 0.4493 0.42445 0.000 0.108 0.000 0.136 0.756
#> SRR1700322 5 0.8049 0.08734 0.000 0.136 0.156 0.336 0.372
#> SRR1700321 5 0.4814 0.42392 0.000 0.196 0.036 0.032 0.736
#> SRR1700323 5 0.2951 0.29113 0.000 0.028 0.000 0.112 0.860
#> SRR1700324 5 0.6206 0.41692 0.000 0.200 0.036 0.132 0.632
#> SRR1700325 2 0.7269 0.45763 0.000 0.544 0.132 0.108 0.216
#> SRR1700326 4 0.7264 0.15012 0.000 0.020 0.296 0.376 0.308
#> SRR1700327 5 0.5571 0.35413 0.000 0.120 0.156 0.028 0.696
#> SRR1700329 5 0.4229 0.42480 0.000 0.104 0.004 0.104 0.788
#> SRR1700328 3 0.7608 0.41083 0.004 0.116 0.524 0.168 0.188
#> SRR1700330 5 0.8120 0.09515 0.000 0.104 0.292 0.244 0.360
#> SRR1700331 5 0.3869 0.42808 0.000 0.080 0.012 0.084 0.824
#> SRR1700332 5 0.4535 0.41150 0.000 0.088 0.012 0.128 0.772
#> SRR1700333 5 0.8351 0.19808 0.000 0.232 0.164 0.236 0.368
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.5033 0.61540 0.000 0.688 0.052 0.000 0.060 0.200
#> SRR1699875 6 0.5285 0.56165 0.000 0.108 0.368 0.000 0.000 0.524
#> SRR1699876 5 0.6799 0.51021 0.000 0.128 0.116 0.136 0.584 0.036
#> SRR1699877 2 0.5229 0.54991 0.000 0.644 0.060 0.000 0.044 0.252
#> SRR1699879 2 0.7123 0.32041 0.000 0.448 0.124 0.000 0.236 0.192
#> SRR1699878 6 0.6056 0.22016 0.000 0.392 0.156 0.000 0.016 0.436
#> SRR1699880 3 0.4267 -0.22343 0.000 0.008 0.564 0.008 0.000 0.420
#> SRR1699881 3 0.5292 -0.34784 0.000 0.032 0.488 0.024 0.008 0.448
#> SRR1699882 2 0.6464 0.46004 0.000 0.532 0.056 0.004 0.248 0.160
#> SRR1699883 2 0.5037 0.55174 0.000 0.652 0.052 0.000 0.036 0.260
#> SRR1699884 2 0.4629 0.60777 0.000 0.708 0.060 0.000 0.024 0.208
#> SRR1699885 2 0.4942 0.62454 0.000 0.704 0.064 0.000 0.052 0.180
#> SRR1699886 5 0.6745 0.34856 0.000 0.280 0.128 0.044 0.516 0.032
#> SRR1699888 2 0.6671 0.39547 0.000 0.520 0.084 0.032 0.300 0.064
#> SRR1699889 5 0.5377 0.50252 0.000 0.060 0.020 0.248 0.648 0.024
#> SRR1699890 5 0.6718 0.38337 0.000 0.268 0.060 0.072 0.544 0.056
#> SRR1699887 5 0.6569 0.15032 0.000 0.324 0.088 0.028 0.508 0.052
#> SRR1699891 5 0.5966 0.50419 0.000 0.060 0.076 0.176 0.652 0.036
#> SRR1699892 6 0.7244 0.42980 0.000 0.236 0.280 0.016 0.060 0.408
#> SRR1699893 4 0.5055 0.43680 0.000 0.000 0.068 0.620 0.296 0.016
#> SRR1699894 5 0.4292 0.52542 0.000 0.060 0.008 0.176 0.748 0.008
#> SRR1699895 5 0.4891 0.51091 0.000 0.056 0.028 0.208 0.700 0.008
#> SRR1699896 3 0.6658 -0.26858 0.000 0.108 0.420 0.008 0.068 0.396
#> SRR1699897 3 0.7350 -0.40255 0.000 0.252 0.324 0.000 0.108 0.316
#> SRR1699898 3 0.2373 0.45241 0.000 0.000 0.888 0.084 0.004 0.024
#> SRR1699900 3 0.5292 -0.03736 0.000 0.016 0.516 0.016 0.032 0.420
#> SRR1699899 5 0.6872 0.50379 0.000 0.080 0.160 0.144 0.572 0.044
#> SRR1699902 3 0.3487 0.29883 0.000 0.000 0.756 0.020 0.000 0.224
#> SRR1699901 3 0.4781 0.29238 0.004 0.008 0.704 0.020 0.044 0.220
#> SRR1699903 5 0.6434 0.29130 0.000 0.012 0.112 0.344 0.488 0.044
#> SRR1699904 5 0.4837 0.44029 0.000 0.032 0.016 0.288 0.652 0.012
#> SRR1699905 3 0.6164 0.23737 0.008 0.008 0.592 0.056 0.084 0.252
#> SRR1699906 5 0.6523 0.50441 0.000 0.072 0.096 0.204 0.592 0.036
#> SRR1699907 5 0.6357 0.49276 0.000 0.056 0.060 0.232 0.596 0.056
#> SRR1699908 5 0.6282 0.40069 0.000 0.024 0.108 0.284 0.552 0.032
#> SRR1699909 5 0.6345 0.38937 0.000 0.012 0.044 0.320 0.516 0.108
#> SRR1699910 4 0.6520 0.19257 0.000 0.000 0.204 0.544 0.160 0.092
#> SRR1699911 5 0.6576 0.47605 0.000 0.040 0.032 0.208 0.564 0.156
#> SRR1699912 5 0.7009 0.30635 0.000 0.036 0.164 0.284 0.476 0.040
#> SRR1699913 5 0.4640 0.52152 0.000 0.048 0.016 0.196 0.724 0.016
#> SRR1699914 3 0.5593 0.41275 0.000 0.000 0.660 0.128 0.072 0.140
#> SRR1699915 4 0.7124 0.10235 0.000 0.008 0.188 0.480 0.216 0.108
#> SRR1699916 5 0.6741 0.49776 0.000 0.188 0.056 0.140 0.572 0.044
#> SRR1699917 4 0.5173 0.13407 0.000 0.000 0.064 0.476 0.452 0.008
#> SRR1699918 5 0.7067 0.39898 0.000 0.044 0.116 0.208 0.540 0.092
#> SRR1699919 4 0.6770 -0.07938 0.000 0.008 0.164 0.420 0.360 0.048
#> SRR1699920 4 0.5916 0.24280 0.000 0.000 0.220 0.592 0.144 0.044
#> SRR1699921 4 0.7007 0.05575 0.000 0.008 0.192 0.468 0.256 0.076
#> SRR1699922 5 0.8163 0.07059 0.000 0.212 0.164 0.036 0.320 0.268
#> SRR1699923 3 0.5368 0.14374 0.004 0.008 0.572 0.008 0.064 0.344
#> SRR1699924 3 0.4068 0.45310 0.000 0.000 0.788 0.116 0.052 0.044
#> SRR1699925 1 0.0508 0.94060 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1699926 5 0.7381 0.18785 0.000 0.008 0.220 0.312 0.368 0.092
#> SRR1699927 5 0.6556 0.33448 0.000 0.028 0.120 0.296 0.520 0.036
#> SRR1699929 6 0.7135 0.33086 0.000 0.144 0.340 0.016 0.080 0.420
#> SRR1699928 5 0.6377 0.42867 0.000 0.040 0.100 0.236 0.584 0.040
#> SRR1699930 5 0.4560 0.52247 0.000 0.060 0.020 0.176 0.736 0.008
#> SRR1699931 6 0.7073 0.32479 0.000 0.132 0.356 0.012 0.088 0.412
#> SRR1699933 3 0.5617 0.05003 0.000 0.024 0.568 0.028 0.040 0.340
#> SRR1699932 5 0.5511 0.50929 0.000 0.056 0.036 0.208 0.668 0.032
#> SRR1699934 1 0.0508 0.94060 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1699935 4 0.5952 0.37526 0.000 0.000 0.120 0.528 0.320 0.032
#> SRR1699936 5 0.7832 -0.07891 0.000 0.248 0.248 0.024 0.360 0.120
#> SRR1699937 6 0.6213 0.49755 0.000 0.296 0.264 0.008 0.000 0.432
#> SRR1699938 2 0.6892 -0.07180 0.000 0.420 0.224 0.000 0.064 0.292
#> SRR1699940 3 0.4245 -0.01502 0.000 0.004 0.648 0.008 0.012 0.328
#> SRR1699939 5 0.7905 -0.29811 0.000 0.188 0.276 0.012 0.308 0.216
#> SRR1699941 3 0.4523 -0.19595 0.000 0.012 0.556 0.016 0.000 0.416
#> SRR1699942 6 0.6198 0.48915 0.000 0.072 0.404 0.024 0.032 0.468
#> SRR1699943 2 0.6081 -0.24475 0.000 0.400 0.220 0.000 0.004 0.376
#> SRR1699944 6 0.6768 0.49710 0.000 0.248 0.248 0.000 0.056 0.448
#> SRR1699945 3 0.4493 0.17469 0.020 0.000 0.656 0.004 0.016 0.304
#> SRR1699946 6 0.5961 0.57514 0.000 0.212 0.276 0.008 0.000 0.504
#> SRR1699947 6 0.5762 0.58253 0.000 0.176 0.276 0.000 0.008 0.540
#> SRR1699948 2 0.6125 -0.12686 0.000 0.432 0.212 0.000 0.008 0.348
#> SRR1699949 5 0.6905 0.33267 0.000 0.240 0.136 0.064 0.528 0.032
#> SRR1699950 5 0.7949 -0.06081 0.000 0.208 0.236 0.032 0.380 0.144
#> SRR1699951 3 0.8468 -0.09972 0.000 0.112 0.372 0.144 0.176 0.196
#> SRR1699952 6 0.5724 0.57913 0.000 0.152 0.312 0.008 0.000 0.528
#> SRR1699953 2 0.7468 0.03811 0.000 0.384 0.212 0.000 0.172 0.232
#> SRR1699954 6 0.5046 0.43317 0.008 0.040 0.332 0.000 0.016 0.604
#> SRR1699955 2 0.6856 0.40027 0.000 0.544 0.196 0.016 0.136 0.108
#> SRR1699956 3 0.4679 0.18296 0.004 0.004 0.688 0.024 0.028 0.252
#> SRR1699957 6 0.5451 0.58794 0.000 0.148 0.308 0.000 0.000 0.544
#> SRR1699959 3 0.5178 0.29019 0.000 0.004 0.644 0.212 0.004 0.136
#> SRR1699958 4 0.7580 0.25416 0.000 0.016 0.260 0.388 0.232 0.104
#> SRR1699960 5 0.8122 0.07472 0.000 0.212 0.244 0.072 0.376 0.096
#> SRR1699961 6 0.4805 0.45493 0.000 0.036 0.440 0.008 0.000 0.516
#> SRR1699962 2 0.7809 0.14214 0.000 0.356 0.188 0.028 0.308 0.120
#> SRR1699963 3 0.7170 -0.41862 0.000 0.136 0.400 0.060 0.032 0.372
#> SRR1699964 2 0.4885 0.58471 0.000 0.700 0.100 0.000 0.024 0.176
#> SRR1699965 2 0.7228 0.38947 0.000 0.488 0.148 0.024 0.240 0.100
#> SRR1699966 3 0.6702 0.32047 0.000 0.000 0.508 0.228 0.176 0.088
#> SRR1699967 2 0.5659 0.25257 0.000 0.548 0.152 0.000 0.008 0.292
#> SRR1699968 3 0.5100 0.39393 0.000 0.008 0.716 0.044 0.104 0.128
#> SRR1699969 3 0.2831 0.44250 0.000 0.000 0.876 0.044 0.052 0.028
#> SRR1699971 6 0.4784 0.42950 0.000 0.028 0.464 0.012 0.000 0.496
#> SRR1699970 6 0.6144 0.56246 0.000 0.224 0.248 0.008 0.008 0.512
#> SRR1699972 6 0.4650 0.39554 0.000 0.016 0.456 0.016 0.000 0.512
#> SRR1699973 3 0.7768 -0.09241 0.000 0.020 0.300 0.292 0.284 0.104
#> SRR1699974 3 0.4588 0.14464 0.028 0.004 0.644 0.012 0.000 0.312
#> SRR1699975 3 0.6368 0.32369 0.000 0.000 0.548 0.104 0.248 0.100
#> SRR1699976 6 0.4916 0.50278 0.000 0.048 0.396 0.008 0.000 0.548
#> SRR1699977 3 0.6207 0.31425 0.000 0.008 0.600 0.068 0.192 0.132
#> SRR1699978 3 0.6247 0.32474 0.004 0.004 0.564 0.252 0.044 0.132
#> SRR1699979 3 0.5554 0.40773 0.000 0.000 0.668 0.088 0.136 0.108
#> SRR1699980 3 0.6098 0.35281 0.000 0.000 0.604 0.096 0.180 0.120
#> SRR1699981 3 0.6370 0.36055 0.000 0.000 0.556 0.180 0.192 0.072
#> SRR1699982 5 0.5508 0.50212 0.000 0.048 0.044 0.196 0.676 0.036
#> SRR1699983 3 0.6898 -0.22899 0.000 0.000 0.380 0.272 0.296 0.052
#> SRR1699984 1 0.0547 0.93798 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699985 5 0.7474 0.16256 0.000 0.048 0.292 0.080 0.444 0.136
#> SRR1699986 3 0.6538 0.18910 0.112 0.004 0.568 0.016 0.064 0.236
#> SRR1699988 5 0.8115 -0.24232 0.000 0.164 0.256 0.028 0.300 0.252
#> SRR1699987 3 0.6262 0.10255 0.000 0.000 0.448 0.396 0.064 0.092
#> SRR1699989 5 0.6316 0.46628 0.000 0.056 0.136 0.128 0.632 0.048
#> SRR1699990 3 0.6967 0.18860 0.000 0.004 0.404 0.096 0.364 0.132
#> SRR1699992 6 0.4719 0.32631 0.000 0.016 0.448 0.020 0.000 0.516
#> SRR1699991 3 0.3536 0.42112 0.000 0.000 0.812 0.064 0.008 0.116
#> SRR1699993 3 0.5821 0.29698 0.012 0.004 0.660 0.068 0.084 0.172
#> SRR1699994 3 0.4013 0.18303 0.004 0.004 0.696 0.016 0.000 0.280
#> SRR1699995 3 0.5747 0.20349 0.296 0.000 0.584 0.012 0.028 0.080
#> SRR1699996 2 0.3492 0.69059 0.000 0.828 0.048 0.004 0.016 0.104
#> SRR1699997 4 0.5250 0.55352 0.000 0.000 0.128 0.676 0.160 0.036
#> SRR1699998 6 0.7205 0.45699 0.000 0.276 0.328 0.016 0.044 0.336
#> SRR1699999 1 0.3395 0.80822 0.812 0.000 0.148 0.000 0.020 0.020
#> SRR1700000 6 0.6266 0.38779 0.004 0.096 0.392 0.012 0.028 0.468
#> SRR1700002 6 0.5826 0.48451 0.000 0.112 0.424 0.012 0.004 0.448
#> SRR1700001 3 0.4327 0.30917 0.000 0.008 0.724 0.024 0.020 0.224
#> SRR1700003 3 0.6389 0.26058 0.000 0.012 0.592 0.076 0.172 0.148
#> SRR1700004 3 0.4206 0.42418 0.000 0.000 0.780 0.048 0.060 0.112
#> SRR1700005 1 0.0146 0.94028 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700006 6 0.4964 0.42421 0.000 0.040 0.464 0.012 0.000 0.484
#> SRR1700007 5 0.5044 0.53601 0.000 0.104 0.008 0.192 0.684 0.012
#> SRR1700008 4 0.2703 0.60642 0.000 0.000 0.116 0.860 0.016 0.008
#> SRR1700009 1 0.0508 0.93883 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700010 3 0.4748 0.05839 0.008 0.004 0.640 0.036 0.004 0.308
#> SRR1700011 5 0.8095 0.07485 0.000 0.224 0.244 0.072 0.372 0.088
#> SRR1700013 3 0.6325 0.28294 0.000 0.020 0.564 0.256 0.040 0.120
#> SRR1700012 3 0.4666 -0.12144 0.000 0.012 0.592 0.016 0.008 0.372
#> SRR1700014 3 0.5044 0.41380 0.000 0.000 0.716 0.080 0.084 0.120
#> SRR1700015 6 0.5116 0.45434 0.000 0.052 0.448 0.012 0.000 0.488
#> SRR1700016 1 0.4384 0.65232 0.708 0.000 0.236 0.000 0.028 0.028
#> SRR1700018 3 0.4296 -0.27506 0.000 0.008 0.544 0.008 0.000 0.440
#> SRR1700017 3 0.4199 -0.11734 0.000 0.000 0.600 0.020 0.000 0.380
#> SRR1700019 5 0.5879 0.51257 0.000 0.192 0.076 0.080 0.640 0.012
#> SRR1700020 3 0.3101 0.42495 0.056 0.000 0.864 0.048 0.004 0.028
#> SRR1700021 5 0.5953 0.35959 0.000 0.020 0.032 0.316 0.560 0.072
#> SRR1700023 3 0.3222 0.38175 0.000 0.004 0.844 0.012 0.040 0.100
#> SRR1700022 3 0.4115 -0.06415 0.000 0.000 0.624 0.012 0.004 0.360
#> SRR1700024 3 0.6786 0.15816 0.000 0.000 0.424 0.172 0.336 0.068
#> SRR1700025 6 0.5623 0.55964 0.000 0.112 0.360 0.012 0.000 0.516
#> SRR1700026 3 0.4853 -0.24921 0.000 0.016 0.508 0.020 0.004 0.452
#> SRR1700027 3 0.4634 -0.37746 0.000 0.024 0.496 0.008 0.000 0.472
#> SRR1700028 4 0.5323 0.54805 0.000 0.000 0.104 0.668 0.184 0.044
#> SRR1700029 3 0.4139 0.45683 0.000 0.000 0.776 0.136 0.036 0.052
#> SRR1700030 3 0.6203 0.24775 0.000 0.000 0.536 0.116 0.288 0.060
#> SRR1700031 3 0.3271 0.19066 0.000 0.000 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR1700032 6 0.6328 0.54272 0.000 0.116 0.352 0.016 0.028 0.488
#> SRR1700034 1 0.3191 0.82568 0.832 0.000 0.128 0.000 0.016 0.024
#> SRR1700035 4 0.6878 -0.01635 0.000 0.000 0.272 0.360 0.320 0.048
#> SRR1700033 3 0.3231 0.29013 0.000 0.000 0.784 0.016 0.000 0.200
#> SRR1700036 3 0.6425 0.28801 0.000 0.000 0.548 0.152 0.220 0.080
#> SRR1700037 5 0.4349 0.51597 0.000 0.052 0.012 0.200 0.732 0.004
#> SRR1700038 3 0.5668 -0.08391 0.000 0.044 0.500 0.016 0.028 0.412
#> SRR1700039 3 0.2203 0.40830 0.004 0.000 0.896 0.016 0.000 0.084
#> SRR1700040 3 0.4060 0.11775 0.000 0.008 0.680 0.016 0.000 0.296
#> SRR1700041 3 0.5177 0.37897 0.000 0.000 0.660 0.084 0.032 0.224
#> SRR1700042 3 0.2398 0.42008 0.000 0.000 0.888 0.028 0.004 0.080
#> SRR1700043 3 0.4240 0.24425 0.004 0.008 0.680 0.008 0.008 0.292
#> SRR1700045 3 0.5413 0.37927 0.000 0.000 0.644 0.088 0.044 0.224
#> SRR1700044 3 0.5993 0.05036 0.000 0.024 0.536 0.028 0.068 0.344
#> SRR1700046 3 0.4616 0.32418 0.000 0.000 0.692 0.036 0.032 0.240
#> SRR1700047 3 0.3665 0.44302 0.000 0.000 0.820 0.040 0.048 0.092
#> SRR1700048 3 0.6271 0.37851 0.000 0.000 0.560 0.228 0.144 0.068
#> SRR1700049 3 0.2373 0.42757 0.016 0.000 0.908 0.024 0.012 0.040
#> SRR1700050 3 0.4705 0.38639 0.004 0.000 0.632 0.320 0.028 0.016
#> SRR1700051 3 0.2817 0.45074 0.004 0.000 0.872 0.076 0.008 0.040
#> SRR1700052 3 0.2673 0.38987 0.000 0.000 0.852 0.012 0.004 0.132
#> SRR1700053 3 0.6404 0.05561 0.000 0.000 0.472 0.320 0.168 0.040
#> SRR1700054 3 0.3905 0.24508 0.000 0.000 0.716 0.024 0.004 0.256
#> SRR1700055 1 0.1434 0.92865 0.948 0.000 0.020 0.000 0.024 0.008
#> SRR1700056 4 0.4084 0.50263 0.000 0.000 0.252 0.712 0.024 0.012
#> SRR1700057 3 0.5000 0.29356 0.000 0.000 0.576 0.364 0.032 0.028
#> SRR1700058 3 0.3705 0.26889 0.000 0.004 0.740 0.020 0.000 0.236
#> SRR1700059 4 0.5108 0.09841 0.000 0.000 0.428 0.512 0.036 0.024
#> SRR1700060 3 0.1972 0.44672 0.000 0.000 0.916 0.056 0.004 0.024
#> SRR1700061 3 0.4364 0.23312 0.000 0.008 0.684 0.024 0.008 0.276
#> SRR1700062 3 0.3362 0.44745 0.000 0.000 0.792 0.184 0.012 0.012
#> SRR1700063 3 0.3330 0.43129 0.000 0.000 0.828 0.056 0.008 0.108
#> SRR1700064 4 0.6628 0.13327 0.000 0.000 0.360 0.412 0.180 0.048
#> SRR1700065 3 0.3348 0.30930 0.000 0.000 0.768 0.016 0.000 0.216
#> SRR1700066 3 0.3033 0.38499 0.004 0.004 0.836 0.020 0.000 0.136
#> SRR1700067 4 0.4586 0.39090 0.000 0.000 0.036 0.640 0.312 0.012
#> SRR1700068 3 0.4989 0.21539 0.000 0.000 0.540 0.404 0.040 0.016
#> SRR1700069 3 0.5399 0.40495 0.000 0.000 0.680 0.140 0.108 0.072
#> SRR1700070 3 0.7696 -0.10790 0.000 0.072 0.380 0.064 0.144 0.340
#> SRR1700071 3 0.3564 0.42912 0.000 0.000 0.816 0.040 0.024 0.120
#> SRR1700072 3 0.3095 0.37576 0.000 0.000 0.828 0.012 0.016 0.144
#> SRR1700073 5 0.5591 0.37022 0.000 0.004 0.040 0.336 0.564 0.056
#> SRR1700075 3 0.5032 0.26584 0.000 0.008 0.636 0.044 0.020 0.292
#> SRR1700074 3 0.4199 -0.03429 0.000 0.004 0.620 0.016 0.000 0.360
#> SRR1700076 3 0.5196 0.17774 0.000 0.020 0.628 0.028 0.028 0.296
#> SRR1700077 3 0.4378 -0.09445 0.000 0.008 0.588 0.016 0.000 0.388
#> SRR1700078 3 0.3878 0.40650 0.000 0.000 0.800 0.028 0.064 0.108
#> SRR1700080 3 0.4815 0.42361 0.000 0.000 0.736 0.068 0.088 0.108
#> SRR1700079 3 0.2998 0.45960 0.000 0.000 0.856 0.096 0.024 0.024
#> SRR1700081 3 0.1801 0.44067 0.000 0.000 0.924 0.056 0.004 0.016
#> SRR1700082 3 0.3861 -0.02515 0.000 0.000 0.640 0.008 0.000 0.352
#> SRR1700083 3 0.1904 0.43951 0.004 0.000 0.924 0.048 0.004 0.020
#> SRR1700084 3 0.4155 0.19784 0.012 0.000 0.660 0.012 0.000 0.316
#> SRR1700085 5 0.7377 0.25501 0.000 0.028 0.296 0.188 0.420 0.068
#> SRR1700086 3 0.4774 0.42599 0.000 0.000 0.736 0.060 0.080 0.124
#> SRR1700087 3 0.7416 0.18369 0.000 0.048 0.428 0.328 0.088 0.108
#> SRR1700088 3 0.6902 -0.10695 0.000 0.028 0.496 0.084 0.092 0.300
#> SRR1700089 3 0.6899 0.26342 0.004 0.036 0.536 0.256 0.064 0.104
#> SRR1700091 4 0.7055 0.32514 0.000 0.000 0.236 0.440 0.228 0.096
#> SRR1700090 4 0.5469 0.53111 0.000 0.000 0.188 0.656 0.104 0.052
#> SRR1700092 4 0.7667 0.22541 0.000 0.024 0.280 0.376 0.224 0.096
#> SRR1700094 3 0.7801 0.15387 0.000 0.096 0.380 0.340 0.084 0.100
#> SRR1700093 4 0.5610 0.47812 0.000 0.000 0.080 0.604 0.268 0.048
#> SRR1700095 3 0.5631 0.09289 0.000 0.000 0.460 0.444 0.044 0.052
#> SRR1700096 3 0.6898 0.21505 0.000 0.000 0.440 0.312 0.152 0.096
#> SRR1700097 3 0.5872 0.31519 0.004 0.004 0.580 0.288 0.036 0.088
#> SRR1700098 5 0.8199 0.22445 0.000 0.248 0.204 0.240 0.280 0.028
#> SRR1700099 4 0.6890 0.33515 0.000 0.004 0.172 0.464 0.284 0.076
#> SRR1700100 4 0.6945 0.35438 0.000 0.000 0.224 0.468 0.212 0.096
#> SRR1700101 4 0.6927 0.37721 0.000 0.004 0.212 0.484 0.216 0.084
#> SRR1700102 4 0.7124 0.27682 0.000 0.004 0.236 0.416 0.268 0.076
#> SRR1700104 4 0.6845 0.19190 0.000 0.000 0.336 0.416 0.176 0.072
#> SRR1700103 4 0.5938 0.09643 0.000 0.000 0.396 0.480 0.064 0.060
#> SRR1700105 4 0.4927 0.47249 0.000 0.000 0.020 0.640 0.284 0.056
#> SRR1700106 4 0.2527 0.59426 0.000 0.000 0.000 0.868 0.108 0.024
#> SRR1700107 4 0.5837 0.45488 0.000 0.000 0.104 0.576 0.276 0.044
#> SRR1700108 4 0.6722 0.26398 0.000 0.040 0.096 0.472 0.352 0.040
#> SRR1700109 4 0.6330 -0.03363 0.000 0.100 0.052 0.428 0.416 0.004
#> SRR1700110 4 0.7004 0.15553 0.000 0.084 0.116 0.428 0.356 0.016
#> SRR1700112 4 0.4860 0.17054 0.000 0.040 0.008 0.516 0.436 0.000
#> SRR1700111 4 0.3125 0.61644 0.000 0.000 0.056 0.856 0.064 0.024
#> SRR1700113 4 0.4892 0.47576 0.000 0.004 0.064 0.644 0.280 0.008
#> SRR1700114 4 0.7054 0.32700 0.000 0.000 0.240 0.440 0.224 0.096
#> SRR1700115 4 0.4702 0.48196 0.000 0.000 0.068 0.648 0.280 0.004
#> SRR1700116 4 0.2872 0.62295 0.000 0.000 0.076 0.864 0.052 0.008
#> SRR1700117 4 0.5410 0.45054 0.000 0.000 0.188 0.656 0.040 0.116
#> SRR1700119 4 0.2074 0.62205 0.000 0.000 0.036 0.912 0.048 0.004
#> SRR1700118 4 0.3512 0.60362 0.000 0.000 0.040 0.808 0.140 0.012
#> SRR1700120 3 0.5856 0.12941 0.000 0.000 0.460 0.420 0.036 0.084
#> SRR1700121 4 0.4465 0.52952 0.000 0.000 0.044 0.696 0.244 0.016
#> SRR1700122 4 0.3805 0.44835 0.000 0.004 0.004 0.664 0.328 0.000
#> SRR1700123 4 0.0551 0.60822 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1700125 4 0.4333 0.33905 0.000 0.028 0.000 0.596 0.376 0.000
#> SRR1700126 3 0.5049 0.34179 0.000 0.000 0.596 0.336 0.032 0.036
#> SRR1700127 4 0.4176 0.51405 0.000 0.000 0.232 0.720 0.036 0.012
#> SRR1700124 4 0.3316 0.57560 0.000 0.000 0.152 0.812 0.028 0.008
#> SRR1700128 4 0.0508 0.60960 0.000 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1700129 4 0.3937 0.49313 0.000 0.008 0.008 0.700 0.280 0.004
#> SRR1700130 4 0.4200 0.48733 0.000 0.008 0.000 0.696 0.264 0.032
#> SRR1700132 4 0.0862 0.60797 0.000 0.000 0.008 0.972 0.004 0.016
#> SRR1700131 4 0.3852 0.55120 0.000 0.000 0.192 0.764 0.024 0.020
#> SRR1700133 4 0.2709 0.58941 0.000 0.000 0.000 0.848 0.132 0.020
#> SRR1700134 4 0.4031 0.45550 0.000 0.004 0.008 0.660 0.324 0.004
#> SRR1700135 4 0.2627 0.60277 0.000 0.000 0.016 0.884 0.036 0.064
#> SRR1700136 4 0.2207 0.60713 0.000 0.000 0.076 0.900 0.016 0.008
#> SRR1700137 4 0.0725 0.61207 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR1700138 4 0.0692 0.61003 0.000 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1700140 4 0.1606 0.61630 0.000 0.000 0.056 0.932 0.004 0.008
#> SRR1700139 4 0.0458 0.61018 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1700141 4 0.4128 0.47500 0.000 0.008 0.012 0.676 0.300 0.004
#> SRR1700142 3 0.4798 0.24667 0.000 0.000 0.544 0.412 0.032 0.012
#> SRR1700143 4 0.3201 0.57990 0.000 0.000 0.148 0.820 0.024 0.008
#> SRR1700144 3 0.4882 0.42980 0.000 0.000 0.692 0.212 0.044 0.052
#> SRR1700145 4 0.0748 0.60809 0.000 0.000 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR1700146 4 0.3803 0.48071 0.000 0.004 0.004 0.692 0.296 0.004
#> SRR1700147 4 0.0508 0.60844 0.000 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1700149 4 0.3833 0.57059 0.004 0.000 0.092 0.812 0.028 0.064
#> SRR1700148 4 0.0551 0.60858 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1700150 4 0.3437 0.52622 0.000 0.000 0.008 0.752 0.236 0.004
#> SRR1700152 4 0.0665 0.60718 0.000 0.000 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR1700151 4 0.1082 0.61120 0.000 0.000 0.040 0.956 0.000 0.004
#> SRR1700153 4 0.0748 0.60953 0.000 0.000 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR1700154 4 0.0363 0.60890 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700155 4 0.2234 0.59943 0.000 0.000 0.004 0.872 0.124 0.000
#> SRR1700156 4 0.1980 0.61182 0.000 0.000 0.048 0.920 0.016 0.016
#> SRR1700158 4 0.4023 0.55115 0.004 0.000 0.080 0.800 0.032 0.084
#> SRR1700159 4 0.4312 0.35245 0.000 0.028 0.000 0.604 0.368 0.000
#> SRR1700157 4 0.2402 0.60021 0.000 0.000 0.084 0.888 0.020 0.008
#> SRR1700160 4 0.1643 0.61419 0.000 0.000 0.008 0.924 0.068 0.000
#> SRR1700161 4 0.0972 0.61302 0.000 0.000 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR1700162 4 0.5211 0.40193 0.000 0.036 0.004 0.612 0.308 0.040
#> SRR1700164 4 0.6885 0.39284 0.036 0.008 0.144 0.584 0.076 0.152
#> SRR1700163 4 0.4743 0.51494 0.004 0.000 0.104 0.740 0.036 0.116
#> SRR1700165 4 0.3084 0.58922 0.000 0.000 0.132 0.832 0.032 0.004
#> SRR1700166 4 0.2615 0.59457 0.000 0.000 0.008 0.852 0.136 0.004
#> SRR1700168 4 0.4343 0.33444 0.000 0.028 0.000 0.592 0.380 0.000
#> SRR1700167 4 0.2373 0.60244 0.000 0.000 0.084 0.888 0.024 0.004
#> SRR1700170 4 0.3269 0.56093 0.000 0.000 0.000 0.792 0.184 0.024
#> SRR1700169 4 0.2863 0.61622 0.000 0.000 0.036 0.860 0.096 0.008
#> SRR1700171 4 0.7971 -0.06346 0.076 0.004 0.340 0.356 0.072 0.152
#> SRR1700172 4 0.3839 0.55235 0.000 0.000 0.036 0.748 0.212 0.004
#> SRR1700174 4 0.3878 0.56723 0.000 0.000 0.032 0.748 0.212 0.008
#> SRR1700173 4 0.3693 0.60504 0.000 0.000 0.048 0.800 0.136 0.016
#> SRR1700175 4 0.3699 0.50500 0.000 0.004 0.004 0.728 0.256 0.008
#> SRR1700176 3 0.4658 0.31116 0.000 0.000 0.580 0.376 0.004 0.040
#> SRR1700178 2 0.1333 0.73787 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1700177 4 0.2400 0.60183 0.000 0.000 0.008 0.872 0.116 0.004
#> SRR1700180 2 0.1230 0.73835 0.000 0.956 0.008 0.000 0.008 0.028
#> SRR1700179 2 0.1049 0.73738 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1700181 2 0.0717 0.73738 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1700183 1 0.0260 0.94101 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700182 2 0.1410 0.73755 0.000 0.944 0.004 0.000 0.008 0.044
#> SRR1700184 2 0.2445 0.71796 0.000 0.892 0.040 0.000 0.008 0.060
#> SRR1700186 2 0.5505 0.28530 0.000 0.572 0.160 0.000 0.004 0.264
#> SRR1700187 1 0.0458 0.94098 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700185 1 0.0363 0.94092 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700188 2 0.3065 0.70067 0.000 0.848 0.048 0.000 0.008 0.096
#> SRR1700192 1 0.2287 0.90521 0.904 0.000 0.036 0.000 0.012 0.048
#> SRR1700190 1 0.3698 0.82148 0.804 0.000 0.048 0.000 0.020 0.128
#> SRR1700191 1 0.0363 0.94092 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700189 1 0.1176 0.92559 0.956 0.000 0.024 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700193 2 0.0692 0.74005 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700195 2 0.1003 0.73754 0.000 0.964 0.004 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700194 1 0.0363 0.94092 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700196 2 0.0622 0.73744 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700197 1 0.1787 0.92525 0.932 0.000 0.016 0.000 0.020 0.032
#> SRR1700198 2 0.1049 0.73849 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1700199 2 0.0935 0.73691 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700200 2 0.0748 0.73340 0.000 0.976 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700201 2 0.1767 0.74040 0.000 0.932 0.012 0.000 0.020 0.036
#> SRR1700202 2 0.9039 0.05065 0.144 0.352 0.200 0.040 0.092 0.172
#> SRR1700203 2 0.1536 0.73925 0.000 0.940 0.004 0.000 0.016 0.040
#> SRR1700204 2 0.0922 0.74082 0.000 0.968 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700206 2 0.0858 0.73482 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700207 2 0.2122 0.73975 0.000 0.912 0.008 0.000 0.040 0.040
#> SRR1700208 1 0.5218 0.60680 0.668 0.000 0.148 0.000 0.024 0.160
#> SRR1700205 2 0.5693 0.51966 0.000 0.648 0.116 0.000 0.076 0.160
#> SRR1700209 2 0.5963 0.60196 0.000 0.648 0.076 0.016 0.156 0.104
#> SRR1700210 2 0.2532 0.72924 0.000 0.884 0.024 0.000 0.012 0.080
#> SRR1700211 2 0.6915 0.40047 0.060 0.568 0.132 0.000 0.064 0.176
#> SRR1700212 2 0.3293 0.70386 0.000 0.844 0.040 0.000 0.032 0.084
#> SRR1700213 2 0.5857 0.43394 0.000 0.600 0.164 0.004 0.028 0.204
#> SRR1700214 2 0.0603 0.73115 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700215 1 0.0363 0.94092 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700217 2 0.3231 0.72722 0.000 0.852 0.036 0.000 0.056 0.056
#> SRR1700216 1 0.0508 0.94060 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700218 2 0.3739 0.71224 0.000 0.812 0.048 0.000 0.036 0.104
#> SRR1700219 2 0.3989 0.71208 0.000 0.808 0.060 0.004 0.068 0.060
#> SRR1700222 1 0.0260 0.93990 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700220 2 0.7112 -0.01030 0.000 0.452 0.048 0.116 0.332 0.052
#> SRR1700221 2 0.2165 0.73281 0.004 0.912 0.008 0.000 0.024 0.052
#> SRR1700223 2 0.1138 0.74069 0.000 0.960 0.004 0.000 0.024 0.012
#> SRR1700224 2 0.5859 0.57066 0.000 0.656 0.124 0.008 0.108 0.104
#> SRR1700226 2 0.2703 0.73303 0.000 0.876 0.016 0.000 0.028 0.080
#> SRR1700229 2 0.3316 0.72474 0.000 0.840 0.020 0.000 0.056 0.084
#> SRR1700225 2 0.6389 0.40225 0.000 0.564 0.156 0.012 0.048 0.220
#> SRR1700227 2 0.1167 0.74061 0.000 0.960 0.008 0.000 0.012 0.020
#> SRR1700230 1 0.1959 0.91865 0.924 0.000 0.032 0.000 0.024 0.020
#> SRR1700231 2 0.1265 0.73654 0.000 0.948 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700228 2 0.0891 0.73747 0.000 0.968 0.008 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700232 2 0.0622 0.73786 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1700233 2 0.1370 0.73886 0.000 0.948 0.012 0.000 0.004 0.036
#> SRR1700234 2 0.4300 0.62719 0.000 0.772 0.088 0.004 0.024 0.112
#> SRR1700235 2 0.4557 0.64239 0.000 0.764 0.124 0.012 0.044 0.056
#> SRR1700237 2 0.1649 0.73906 0.000 0.936 0.016 0.000 0.008 0.040
#> SRR1700236 2 0.4521 0.68380 0.000 0.752 0.040 0.000 0.124 0.084
#> SRR1700238 2 0.0603 0.73115 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700239 1 0.0260 0.93990 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.0508 0.94060 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700241 3 0.9243 -0.11870 0.044 0.228 0.288 0.124 0.104 0.212
#> SRR1700243 2 0.0777 0.73074 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700244 2 0.1974 0.73516 0.000 0.920 0.012 0.000 0.020 0.048
#> SRR1700242 1 0.3022 0.86457 0.864 0.004 0.072 0.000 0.016 0.044
#> SRR1700246 2 0.8288 0.15621 0.048 0.416 0.188 0.028 0.096 0.224
#> SRR1700245 2 0.2772 0.73136 0.000 0.876 0.016 0.000 0.048 0.060
#> SRR1700247 1 0.0405 0.93945 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700249 1 0.0363 0.94092 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700250 2 0.3338 0.71934 0.000 0.844 0.048 0.000 0.036 0.072
#> SRR1700248 2 0.0405 0.73566 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700251 2 0.0976 0.73919 0.000 0.968 0.016 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700252 2 0.6873 0.16611 0.008 0.484 0.184 0.008 0.044 0.272
#> SRR1700253 2 0.1003 0.73831 0.000 0.964 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1700256 2 0.1707 0.73704 0.000 0.928 0.012 0.000 0.004 0.056
#> SRR1700254 1 0.0547 0.94073 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700255 2 0.1410 0.73934 0.000 0.944 0.004 0.000 0.008 0.044
#> SRR1700257 2 0.1434 0.73815 0.000 0.948 0.008 0.000 0.020 0.024
#> SRR1700258 2 0.2358 0.74034 0.000 0.900 0.016 0.000 0.028 0.056
#> SRR1700259 5 0.7426 0.03691 0.000 0.320 0.140 0.044 0.424 0.072
#> SRR1700260 5 0.6492 0.50369 0.000 0.188 0.096 0.104 0.592 0.020
#> SRR1700261 5 0.6165 0.51558 0.000 0.116 0.092 0.144 0.632 0.016
#> SRR1700262 5 0.6041 0.45549 0.000 0.164 0.016 0.264 0.548 0.008
#> SRR1700263 2 0.6203 0.51375 0.000 0.584 0.084 0.000 0.132 0.200
#> SRR1700264 2 0.6198 0.13293 0.000 0.468 0.116 0.000 0.044 0.372
#> SRR1700265 6 0.5718 0.54903 0.000 0.128 0.276 0.004 0.016 0.576
#> SRR1700266 2 0.6817 0.38213 0.000 0.476 0.108 0.000 0.280 0.136
#> SRR1700268 2 0.7890 -0.09350 0.004 0.352 0.240 0.028 0.096 0.280
#> SRR1700270 2 0.2231 0.73351 0.000 0.900 0.028 0.000 0.004 0.068
#> SRR1700267 2 0.5472 0.62024 0.000 0.680 0.088 0.004 0.152 0.076
#> SRR1700271 5 0.7223 -0.14718 0.000 0.364 0.104 0.028 0.408 0.096
#> SRR1700272 2 0.7688 -0.26512 0.000 0.328 0.068 0.244 0.324 0.036
#> SRR1700273 2 0.5350 0.62600 0.000 0.684 0.084 0.000 0.084 0.148
#> SRR1700274 2 0.6967 0.12273 0.000 0.448 0.064 0.064 0.364 0.060
#> SRR1700277 6 0.7675 0.34394 0.120 0.152 0.336 0.000 0.028 0.364
#> SRR1700275 5 0.5463 0.30103 0.000 0.080 0.008 0.328 0.572 0.012
#> SRR1700276 5 0.8304 0.29097 0.000 0.204 0.112 0.240 0.360 0.084
#> SRR1700278 5 0.8512 0.11430 0.000 0.276 0.148 0.080 0.288 0.208
#> SRR1700279 5 0.8242 0.27185 0.000 0.104 0.108 0.236 0.392 0.160
#> SRR1700280 5 0.8552 0.20142 0.000 0.248 0.148 0.096 0.320 0.188
#> SRR1700281 2 0.3597 0.72050 0.000 0.828 0.056 0.000 0.044 0.072
#> SRR1700283 5 0.5985 0.52415 0.000 0.176 0.024 0.148 0.624 0.028
#> SRR1700282 4 0.8661 -0.05036 0.000 0.084 0.212 0.272 0.232 0.200
#> SRR1700284 5 0.4841 0.50727 0.000 0.044 0.016 0.200 0.712 0.028
#> SRR1700285 5 0.6261 0.53666 0.000 0.108 0.044 0.192 0.616 0.040
#> SRR1700286 5 0.7113 0.39099 0.000 0.188 0.148 0.060 0.540 0.064
#> SRR1700287 5 0.4044 0.52603 0.000 0.060 0.000 0.176 0.756 0.008
#> SRR1700290 3 0.6116 0.27004 0.060 0.004 0.640 0.036 0.068 0.192
#> SRR1700289 5 0.4867 0.54007 0.000 0.076 0.020 0.176 0.716 0.012
#> SRR1700288 2 0.2283 0.73588 0.000 0.904 0.020 0.000 0.020 0.056
#> SRR1700292 5 0.4236 0.52316 0.000 0.060 0.000 0.188 0.740 0.012
#> SRR1700291 5 0.5631 0.36515 0.000 0.000 0.092 0.284 0.588 0.036
#> SRR1700293 2 0.7116 0.08589 0.000 0.456 0.088 0.052 0.336 0.068
#> SRR1700294 5 0.4949 0.48416 0.000 0.048 0.004 0.268 0.656 0.024
#> SRR1700295 4 0.7038 0.27589 0.000 0.016 0.168 0.528 0.140 0.148
#> SRR1700297 5 0.5196 0.29097 0.000 0.060 0.004 0.352 0.572 0.012
#> SRR1700296 5 0.5058 0.54627 0.000 0.076 0.012 0.172 0.708 0.032
#> SRR1700298 5 0.7172 0.39458 0.000 0.040 0.088 0.236 0.512 0.124
#> SRR1700299 5 0.6926 0.12386 0.000 0.012 0.076 0.376 0.412 0.124
#> SRR1700300 5 0.8271 0.19645 0.000 0.056 0.160 0.220 0.356 0.208
#> SRR1700302 5 0.6186 0.10938 0.000 0.024 0.076 0.416 0.456 0.028
#> SRR1700301 5 0.4445 0.52612 0.000 0.060 0.016 0.172 0.744 0.008
#> SRR1700303 5 0.5031 0.45660 0.000 0.056 0.016 0.272 0.648 0.008
#> SRR1700304 5 0.8963 0.20284 0.008 0.232 0.148 0.132 0.280 0.200
#> SRR1700305 5 0.7561 0.46394 0.000 0.152 0.060 0.144 0.504 0.140
#> SRR1700306 4 0.7548 0.09753 0.000 0.016 0.260 0.420 0.164 0.140
#> SRR1700308 5 0.6809 0.50668 0.000 0.088 0.064 0.132 0.596 0.120
#> SRR1700307 3 0.8423 -0.00465 0.000 0.052 0.288 0.224 0.240 0.196
#> SRR1700309 3 0.7751 0.04555 0.000 0.012 0.328 0.156 0.192 0.312
#> SRR1700310 5 0.4139 0.52595 0.000 0.060 0.000 0.188 0.744 0.008
#> SRR1700311 5 0.6716 0.19174 0.000 0.016 0.052 0.372 0.440 0.120
#> SRR1700312 5 0.6410 0.54242 0.000 0.140 0.032 0.140 0.616 0.072
#> SRR1700313 6 0.8016 0.05521 0.000 0.052 0.252 0.096 0.240 0.360
#> SRR1700314 4 0.5047 0.17577 0.000 0.000 0.056 0.592 0.336 0.016
#> SRR1700315 5 0.7335 0.38660 0.000 0.032 0.072 0.256 0.460 0.180
#> SRR1700316 5 0.6173 0.30584 0.000 0.000 0.088 0.316 0.524 0.072
#> SRR1700317 5 0.7097 0.00675 0.000 0.372 0.072 0.036 0.420 0.100
#> SRR1700318 5 0.8186 0.33076 0.000 0.092 0.148 0.140 0.416 0.204
#> SRR1700319 4 0.6174 0.12608 0.000 0.000 0.104 0.524 0.312 0.060
#> SRR1700320 5 0.4788 0.50580 0.000 0.052 0.008 0.212 0.704 0.024
#> SRR1700322 5 0.8802 0.21610 0.000 0.184 0.144 0.208 0.296 0.168
#> SRR1700321 5 0.5415 0.54282 0.000 0.112 0.004 0.184 0.664 0.036
#> SRR1700323 5 0.5252 0.06883 0.000 0.012 0.028 0.464 0.476 0.020
#> SRR1700324 5 0.5916 0.50145 0.000 0.108 0.016 0.236 0.608 0.032
#> SRR1700325 2 0.7977 0.13941 0.000 0.424 0.128 0.120 0.248 0.080
#> SRR1700326 4 0.8058 0.10329 0.000 0.036 0.272 0.352 0.172 0.168
#> SRR1700327 5 0.6638 0.45485 0.000 0.072 0.172 0.156 0.576 0.024
#> SRR1700329 5 0.4800 0.48917 0.000 0.056 0.004 0.264 0.664 0.012
#> SRR1700328 6 0.8182 0.16379 0.000 0.152 0.272 0.056 0.164 0.356
#> SRR1700330 5 0.8738 0.17315 0.000 0.128 0.184 0.156 0.296 0.236
#> SRR1700331 5 0.5924 0.47094 0.000 0.040 0.060 0.248 0.616 0.036
#> SRR1700332 5 0.5096 0.40672 0.000 0.060 0.004 0.320 0.604 0.012
#> SRR1700333 5 0.8579 0.30169 0.000 0.208 0.144 0.112 0.340 0.196
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.229 0.637 0.815 0.4380 0.558 0.558
#> 3 3 0.374 0.660 0.796 0.3864 0.713 0.542
#> 4 4 0.355 0.307 0.609 0.1837 0.679 0.370
#> 5 5 0.493 0.586 0.723 0.0848 0.788 0.415
#> 6 6 0.532 0.467 0.662 0.0424 0.965 0.853
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 1 0.9522 0.56226 0.628 0.372
#> SRR1699875 1 1.0000 0.24349 0.504 0.496
#> SRR1699876 2 0.4815 0.77345 0.104 0.896
#> SRR1699877 1 0.8955 0.63602 0.688 0.312
#> SRR1699879 2 0.9248 0.38342 0.340 0.660
#> SRR1699878 1 0.9933 0.38667 0.548 0.452
#> SRR1699880 2 0.9833 0.08630 0.424 0.576
#> SRR1699881 2 0.9998 -0.20617 0.492 0.508
#> SRR1699882 2 0.9996 -0.18849 0.488 0.512
#> SRR1699883 1 0.9833 0.44620 0.576 0.424
#> SRR1699884 1 0.8327 0.67797 0.736 0.264
#> SRR1699885 1 0.9129 0.61512 0.672 0.328
#> SRR1699886 2 0.7219 0.68023 0.200 0.800
#> SRR1699888 2 0.8861 0.45010 0.304 0.696
#> SRR1699889 2 0.1184 0.80648 0.016 0.984
#> SRR1699890 1 0.9954 0.17987 0.540 0.460
#> SRR1699887 2 0.7745 0.63345 0.228 0.772
#> SRR1699891 2 0.2236 0.80098 0.036 0.964
#> SRR1699892 2 0.9881 0.04486 0.436 0.564
#> SRR1699893 2 0.1843 0.80580 0.028 0.972
#> SRR1699894 2 0.1633 0.80655 0.024 0.976
#> SRR1699895 2 0.1843 0.80317 0.028 0.972
#> SRR1699896 2 0.9833 0.10462 0.424 0.576
#> SRR1699897 2 0.9522 0.28788 0.372 0.628
#> SRR1699898 2 0.3584 0.78811 0.068 0.932
#> SRR1699900 1 0.9996 0.28388 0.512 0.488
#> SRR1699899 2 0.4161 0.78756 0.084 0.916
#> SRR1699902 2 0.8386 0.56906 0.268 0.732
#> SRR1699901 2 0.4939 0.76701 0.108 0.892
#> SRR1699903 2 0.1414 0.80418 0.020 0.980
#> SRR1699904 2 0.5408 0.73013 0.124 0.876
#> SRR1699905 2 0.9815 0.22599 0.420 0.580
#> SRR1699906 2 0.2423 0.80099 0.040 0.960
#> SRR1699907 2 0.8207 0.54567 0.256 0.744
#> SRR1699908 2 0.1414 0.80482 0.020 0.980
#> SRR1699909 2 0.1414 0.80745 0.020 0.980
#> SRR1699910 2 0.3584 0.77948 0.068 0.932
#> SRR1699911 2 0.8267 0.57880 0.260 0.740
#> SRR1699912 2 0.0672 0.80595 0.008 0.992
#> SRR1699913 2 0.1843 0.80340 0.028 0.972
#> SRR1699914 2 0.2043 0.80619 0.032 0.968
#> SRR1699915 2 0.4562 0.75552 0.096 0.904
#> SRR1699916 2 0.2603 0.80863 0.044 0.956
#> SRR1699917 2 0.0672 0.80630 0.008 0.992
#> SRR1699918 2 0.1633 0.80545 0.024 0.976
#> SRR1699919 2 0.1843 0.80225 0.028 0.972
#> SRR1699920 2 0.1414 0.80594 0.020 0.980
#> SRR1699921 2 0.3114 0.78871 0.056 0.944
#> SRR1699922 1 0.9754 0.35928 0.592 0.408
#> SRR1699923 1 0.9286 0.50429 0.656 0.344
#> SRR1699924 2 0.2423 0.79972 0.040 0.960
#> SRR1699925 1 0.6712 0.64191 0.824 0.176
#> SRR1699926 2 0.6343 0.68659 0.160 0.840
#> SRR1699927 2 0.0672 0.80592 0.008 0.992
#> SRR1699929 1 1.0000 0.22351 0.500 0.500
#> SRR1699928 2 0.1843 0.80333 0.028 0.972
#> SRR1699930 2 0.3584 0.78135 0.068 0.932
#> SRR1699931 2 0.9998 -0.19441 0.492 0.508
#> SRR1699933 2 0.7815 0.64126 0.232 0.768
#> SRR1699932 2 0.0376 0.80614 0.004 0.996
#> SRR1699934 1 0.6048 0.65286 0.852 0.148
#> SRR1699935 2 0.1843 0.80767 0.028 0.972
#> SRR1699936 2 0.6148 0.72642 0.152 0.848
#> SRR1699937 1 0.9358 0.58141 0.648 0.352
#> SRR1699938 2 0.9988 -0.15975 0.480 0.520
#> SRR1699940 2 0.8608 0.52708 0.284 0.716
#> SRR1699939 2 0.8955 0.45335 0.312 0.688
#> SRR1699941 1 0.9922 0.39195 0.552 0.448
#> SRR1699942 2 0.9686 0.22827 0.396 0.604
#> SRR1699943 1 0.8861 0.63712 0.696 0.304
#> SRR1699944 2 0.9954 -0.07437 0.460 0.540
#> SRR1699945 2 0.9795 0.12766 0.416 0.584
#> SRR1699946 1 0.9000 0.62728 0.684 0.316
#> SRR1699947 1 0.9044 0.62852 0.680 0.320
#> SRR1699948 1 0.9522 0.55636 0.628 0.372
#> SRR1699949 2 0.6438 0.72311 0.164 0.836
#> SRR1699950 2 0.8499 0.54668 0.276 0.724
#> SRR1699951 2 0.7602 0.64782 0.220 0.780
#> SRR1699952 1 0.9323 0.58573 0.652 0.348
#> SRR1699953 2 0.9996 -0.20011 0.488 0.512
#> SRR1699954 1 0.4815 0.72180 0.896 0.104
#> SRR1699955 2 0.9815 0.10858 0.420 0.580
#> SRR1699956 2 0.9323 0.37600 0.348 0.652
#> SRR1699957 1 0.9909 0.40680 0.556 0.444
#> SRR1699959 2 0.7950 0.60788 0.240 0.760
#> SRR1699958 2 0.4690 0.78463 0.100 0.900
#> SRR1699960 2 0.5178 0.76031 0.116 0.884
#> SRR1699961 1 0.9635 0.52622 0.612 0.388
#> SRR1699962 2 0.9922 -0.03029 0.448 0.552
#> SRR1699963 2 0.9427 0.33759 0.360 0.640
#> SRR1699964 1 0.9635 0.53146 0.612 0.388
#> SRR1699965 2 0.9552 0.27238 0.376 0.624
#> SRR1699966 2 0.5408 0.75774 0.124 0.876
#> SRR1699967 1 0.8813 0.63941 0.700 0.300
#> SRR1699968 2 0.6712 0.70177 0.176 0.824
#> SRR1699969 2 0.5294 0.75977 0.120 0.880
#> SRR1699971 1 0.9580 0.53884 0.620 0.380
#> SRR1699970 1 0.9661 0.52009 0.608 0.392
#> SRR1699972 1 0.9710 0.50758 0.600 0.400
#> SRR1699973 2 0.4431 0.77510 0.092 0.908
#> SRR1699974 1 0.9686 0.50385 0.604 0.396
#> SRR1699975 2 0.4815 0.76671 0.104 0.896
#> SRR1699976 1 0.9944 0.37254 0.544 0.456
#> SRR1699977 2 0.5294 0.75784 0.120 0.880
#> SRR1699978 2 0.7745 0.59936 0.228 0.772
#> SRR1699979 2 0.4690 0.76994 0.100 0.900
#> SRR1699980 2 0.4022 0.78292 0.080 0.920
#> SRR1699981 2 0.2948 0.80064 0.052 0.948
#> SRR1699982 2 0.0672 0.80595 0.008 0.992
#> SRR1699983 2 0.2236 0.80006 0.036 0.964
#> SRR1699984 1 0.6048 0.65616 0.852 0.148
#> SRR1699985 2 0.4562 0.77674 0.096 0.904
#> SRR1699986 1 0.9795 0.41385 0.584 0.416
#> SRR1699988 2 0.7139 0.67744 0.196 0.804
#> SRR1699987 2 0.3584 0.79142 0.068 0.932
#> SRR1699989 2 0.4298 0.78429 0.088 0.912
#> SRR1699990 2 0.4939 0.76677 0.108 0.892
#> SRR1699992 1 0.9393 0.57669 0.644 0.356
#> SRR1699991 2 0.6438 0.72723 0.164 0.836
#> SRR1699993 2 0.7602 0.61628 0.220 0.780
#> SRR1699994 2 1.0000 -0.19734 0.496 0.504
#> SRR1699995 2 0.1843 0.80686 0.028 0.972
#> SRR1699996 1 0.6801 0.71558 0.820 0.180
#> SRR1699997 2 0.1843 0.80234 0.028 0.972
#> SRR1699998 1 0.9754 0.48645 0.592 0.408
#> SRR1699999 1 0.6048 0.70072 0.852 0.148
#> SRR1700000 1 0.7815 0.70052 0.768 0.232
#> SRR1700002 1 0.9998 0.24624 0.508 0.492
#> SRR1700001 2 0.7602 0.65071 0.220 0.780
#> SRR1700003 2 0.4939 0.77378 0.108 0.892
#> SRR1700004 2 0.5842 0.74474 0.140 0.860
#> SRR1700005 1 0.5178 0.67349 0.884 0.116
#> SRR1700006 1 0.9850 0.43979 0.572 0.428
#> SRR1700007 2 0.2043 0.80095 0.032 0.968
#> SRR1700008 2 0.2603 0.79814 0.044 0.956
#> SRR1700009 2 0.9850 0.19365 0.428 0.572
#> SRR1700010 2 0.9754 0.15810 0.408 0.592
#> SRR1700011 2 0.5519 0.75034 0.128 0.872
#> SRR1700013 2 0.9323 0.36971 0.348 0.652
#> SRR1700012 2 0.9661 0.22572 0.392 0.608
#> SRR1700014 2 0.4690 0.77128 0.100 0.900
#> SRR1700015 1 0.9954 0.35753 0.540 0.460
#> SRR1700016 1 0.8443 0.58597 0.728 0.272
#> SRR1700018 2 0.9977 -0.12315 0.472 0.528
#> SRR1700017 2 0.9358 0.36341 0.352 0.648
#> SRR1700019 2 0.4690 0.77533 0.100 0.900
#> SRR1700020 2 0.4022 0.78969 0.080 0.920
#> SRR1700021 2 0.6148 0.70385 0.152 0.848
#> SRR1700023 2 0.6247 0.72384 0.156 0.844
#> SRR1700022 2 0.8909 0.48060 0.308 0.692
#> SRR1700024 2 0.1843 0.80392 0.028 0.972
#> SRR1700025 1 0.9686 0.50743 0.604 0.396
#> SRR1700026 1 0.9732 0.49379 0.596 0.404
#> SRR1700027 1 0.9909 0.39730 0.556 0.444
#> SRR1700028 2 0.1843 0.80754 0.028 0.972
#> SRR1700029 2 0.2423 0.80265 0.040 0.960
#> SRR1700030 2 0.3879 0.78807 0.076 0.924
#> SRR1700031 2 0.8713 0.51186 0.292 0.708
#> SRR1700032 1 0.9866 0.42684 0.568 0.432
#> SRR1700034 1 0.9710 0.51329 0.600 0.400
#> SRR1700035 2 0.1843 0.80354 0.028 0.972
#> SRR1700033 2 0.7674 0.64438 0.224 0.776
#> SRR1700036 2 0.4815 0.77123 0.104 0.896
#> SRR1700037 2 0.2236 0.80329 0.036 0.964
#> SRR1700038 1 0.9427 0.58549 0.640 0.360
#> SRR1700039 2 0.5842 0.74826 0.140 0.860
#> SRR1700040 2 0.8267 0.58291 0.260 0.740
#> SRR1700041 2 0.5059 0.76998 0.112 0.888
#> SRR1700042 2 0.5294 0.76163 0.120 0.880
#> SRR1700043 1 1.0000 0.23277 0.504 0.496
#> SRR1700045 2 0.4298 0.78715 0.088 0.912
#> SRR1700044 2 1.0000 -0.19459 0.496 0.504
#> SRR1700046 2 0.8267 0.58296 0.260 0.740
#> SRR1700047 2 0.5842 0.74944 0.140 0.860
#> SRR1700048 2 0.0938 0.80632 0.012 0.988
#> SRR1700049 2 0.3733 0.78680 0.072 0.928
#> SRR1700050 2 0.0672 0.80630 0.008 0.992
#> SRR1700051 2 0.2043 0.80213 0.032 0.968
#> SRR1700052 2 0.6712 0.68584 0.176 0.824
#> SRR1700053 2 0.1414 0.80495 0.020 0.980
#> SRR1700054 2 0.9775 0.11097 0.412 0.588
#> SRR1700055 2 0.9850 0.07589 0.428 0.572
#> SRR1700056 2 0.1184 0.80739 0.016 0.984
#> SRR1700057 2 0.1414 0.80483 0.020 0.980
#> SRR1700058 2 0.8909 0.48674 0.308 0.692
#> SRR1700059 2 0.1633 0.80335 0.024 0.976
#> SRR1700060 2 0.2948 0.79627 0.052 0.948
#> SRR1700061 2 0.9881 0.03670 0.436 0.564
#> SRR1700062 2 0.2043 0.80108 0.032 0.968
#> SRR1700063 2 0.5294 0.76749 0.120 0.880
#> SRR1700064 2 0.1414 0.80495 0.020 0.980
#> SRR1700065 2 0.8763 0.45502 0.296 0.704
#> SRR1700066 2 0.9710 0.17635 0.400 0.600
#> SRR1700067 2 0.2423 0.80044 0.040 0.960
#> SRR1700068 2 0.2236 0.80073 0.036 0.964
#> SRR1700069 2 0.3274 0.79344 0.060 0.940
#> SRR1700070 2 0.9552 0.27747 0.376 0.624
#> SRR1700071 2 0.5059 0.76865 0.112 0.888
#> SRR1700072 2 0.3584 0.79199 0.068 0.932
#> SRR1700073 2 0.5737 0.73660 0.136 0.864
#> SRR1700075 2 0.9393 0.24501 0.356 0.644
#> SRR1700074 2 0.9963 -0.08264 0.464 0.536
#> SRR1700076 2 0.9998 -0.21339 0.492 0.508
#> SRR1700077 1 0.9909 0.39622 0.556 0.444
#> SRR1700078 2 0.5737 0.74541 0.136 0.864
#> SRR1700080 2 0.4690 0.77157 0.100 0.900
#> SRR1700079 2 0.2778 0.79779 0.048 0.952
#> SRR1700081 2 0.5059 0.76724 0.112 0.888
#> SRR1700082 2 0.8499 0.55100 0.276 0.724
#> SRR1700083 2 0.4161 0.78259 0.084 0.916
#> SRR1700084 1 0.9580 0.54242 0.620 0.380
#> SRR1700085 2 0.2948 0.79579 0.052 0.948
#> SRR1700086 2 0.4939 0.76732 0.108 0.892
#> SRR1700087 2 0.8081 0.66451 0.248 0.752
#> SRR1700088 2 0.8386 0.56621 0.268 0.732
#> SRR1700089 2 0.6973 0.70883 0.188 0.812
#> SRR1700091 2 0.4022 0.79533 0.080 0.920
#> SRR1700090 2 0.2236 0.80462 0.036 0.964
#> SRR1700092 2 0.4298 0.78772 0.088 0.912
#> SRR1700094 2 0.6973 0.71722 0.188 0.812
#> SRR1700093 2 0.1633 0.80769 0.024 0.976
#> SRR1700095 2 0.3114 0.79618 0.056 0.944
#> SRR1700096 2 0.3431 0.79035 0.064 0.936
#> SRR1700097 2 0.3431 0.79605 0.064 0.936
#> SRR1700098 2 0.7950 0.65568 0.240 0.760
#> SRR1700099 2 0.2778 0.80712 0.048 0.952
#> SRR1700100 2 0.3879 0.79852 0.076 0.924
#> SRR1700101 2 0.4161 0.79709 0.084 0.916
#> SRR1700102 2 0.3431 0.79091 0.064 0.936
#> SRR1700104 2 0.4298 0.80108 0.088 0.912
#> SRR1700103 2 0.3431 0.79629 0.064 0.936
#> SRR1700105 2 0.2603 0.79828 0.044 0.956
#> SRR1700106 2 0.4815 0.75653 0.104 0.896
#> SRR1700107 2 0.3431 0.80599 0.064 0.936
#> SRR1700108 2 0.2603 0.80452 0.044 0.956
#> SRR1700109 2 0.2043 0.80808 0.032 0.968
#> SRR1700110 2 0.3114 0.80522 0.056 0.944
#> SRR1700112 2 0.1633 0.80456 0.024 0.976
#> SRR1700111 2 0.1184 0.80557 0.016 0.984
#> SRR1700113 2 0.1843 0.80580 0.028 0.972
#> SRR1700114 2 0.3733 0.79694 0.072 0.928
#> SRR1700115 2 0.2236 0.80764 0.036 0.964
#> SRR1700116 2 0.2778 0.79849 0.048 0.952
#> SRR1700117 2 0.6048 0.71676 0.148 0.852
#> SRR1700119 2 0.2236 0.80259 0.036 0.964
#> SRR1700118 2 0.1414 0.80568 0.020 0.980
#> SRR1700120 2 0.2043 0.80342 0.032 0.968
#> SRR1700121 2 0.0938 0.80583 0.012 0.988
#> SRR1700122 2 0.2236 0.79913 0.036 0.964
#> SRR1700123 2 0.3733 0.78304 0.072 0.928
#> SRR1700125 2 0.3733 0.78322 0.072 0.928
#> SRR1700126 2 0.3431 0.80480 0.064 0.936
#> SRR1700127 2 0.2778 0.80739 0.048 0.952
#> SRR1700124 2 0.1184 0.80644 0.016 0.984
#> SRR1700128 2 0.3431 0.78782 0.064 0.936
#> SRR1700129 2 0.3114 0.79294 0.056 0.944
#> SRR1700130 2 0.6343 0.69641 0.160 0.840
#> SRR1700132 2 0.2778 0.79426 0.048 0.952
#> SRR1700131 2 0.2603 0.80786 0.044 0.956
#> SRR1700133 2 0.3274 0.79039 0.060 0.940
#> SRR1700134 2 0.1843 0.80218 0.028 0.972
#> SRR1700135 2 0.5408 0.72676 0.124 0.876
#> SRR1700136 2 0.2043 0.80712 0.032 0.968
#> SRR1700137 2 0.1414 0.80553 0.020 0.980
#> SRR1700138 2 0.1414 0.80673 0.020 0.980
#> SRR1700140 2 0.0376 0.80581 0.004 0.996
#> SRR1700139 2 0.2236 0.80334 0.036 0.964
#> SRR1700141 2 0.2043 0.80317 0.032 0.968
#> SRR1700142 2 0.1184 0.80590 0.016 0.984
#> SRR1700143 2 0.1843 0.80647 0.028 0.972
#> SRR1700144 2 0.1633 0.80461 0.024 0.976
#> SRR1700145 2 0.3114 0.79235 0.056 0.944
#> SRR1700146 2 0.0672 0.80575 0.008 0.992
#> SRR1700147 2 0.2603 0.79819 0.044 0.956
#> SRR1700149 2 0.3733 0.78324 0.072 0.928
#> SRR1700148 2 0.2948 0.79470 0.052 0.948
#> SRR1700150 2 0.2603 0.79681 0.044 0.956
#> SRR1700152 2 0.3879 0.77692 0.076 0.924
#> SRR1700151 2 0.1184 0.80590 0.016 0.984
#> SRR1700153 2 0.1414 0.80434 0.020 0.980
#> SRR1700154 2 0.3431 0.78876 0.064 0.936
#> SRR1700155 2 0.2778 0.79613 0.048 0.952
#> SRR1700156 2 0.0672 0.80575 0.008 0.992
#> SRR1700158 2 0.5059 0.75259 0.112 0.888
#> SRR1700159 2 0.2236 0.80139 0.036 0.964
#> SRR1700157 2 0.1633 0.80314 0.024 0.976
#> SRR1700160 2 0.1633 0.80465 0.024 0.976
#> SRR1700161 2 0.2236 0.80233 0.036 0.964
#> SRR1700162 2 0.3879 0.77790 0.076 0.924
#> SRR1700164 2 0.8499 0.52087 0.276 0.724
#> SRR1700163 2 0.6343 0.69453 0.160 0.840
#> SRR1700165 2 0.2043 0.80857 0.032 0.968
#> SRR1700166 2 0.4431 0.77114 0.092 0.908
#> SRR1700168 2 0.4562 0.76178 0.096 0.904
#> SRR1700167 2 0.1633 0.80485 0.024 0.976
#> SRR1700170 2 0.5737 0.72238 0.136 0.864
#> SRR1700169 2 0.2043 0.80554 0.032 0.968
#> SRR1700171 2 0.9044 0.43929 0.320 0.680
#> SRR1700172 2 0.1633 0.80741 0.024 0.976
#> SRR1700174 2 0.1633 0.80756 0.024 0.976
#> SRR1700173 2 0.1184 0.80596 0.016 0.984
#> SRR1700175 2 0.1843 0.80358 0.028 0.972
#> SRR1700176 2 0.1633 0.80772 0.024 0.976
#> SRR1700178 1 0.6623 0.71489 0.828 0.172
#> SRR1700177 2 0.2236 0.80136 0.036 0.964
#> SRR1700180 1 0.4562 0.72224 0.904 0.096
#> SRR1700179 1 0.7453 0.69940 0.788 0.212
#> SRR1700181 1 0.5294 0.72495 0.880 0.120
#> SRR1700183 1 0.3879 0.69052 0.924 0.076
#> SRR1700182 1 0.7299 0.70543 0.796 0.204
#> SRR1700184 1 0.6887 0.71393 0.816 0.184
#> SRR1700186 1 0.7453 0.69974 0.788 0.212
#> SRR1700187 1 0.4022 0.68925 0.920 0.080
#> SRR1700185 1 0.5519 0.66699 0.872 0.128
#> SRR1700188 1 0.6973 0.70990 0.812 0.188
#> SRR1700192 1 0.3114 0.69645 0.944 0.056
#> SRR1700190 1 0.5178 0.72345 0.884 0.116
#> SRR1700191 1 0.4431 0.68599 0.908 0.092
#> SRR1700189 1 0.4431 0.68510 0.908 0.092
#> SRR1700193 1 0.3431 0.71790 0.936 0.064
#> SRR1700195 1 0.1843 0.70435 0.972 0.028
#> SRR1700194 1 0.4298 0.68682 0.912 0.088
#> SRR1700196 1 0.6247 0.71899 0.844 0.156
#> SRR1700197 1 0.1843 0.70144 0.972 0.028
#> SRR1700198 1 0.4939 0.72185 0.892 0.108
#> SRR1700199 1 0.4022 0.71896 0.920 0.080
#> SRR1700200 1 0.2948 0.71395 0.948 0.052
#> SRR1700201 1 0.9323 0.58813 0.652 0.348
#> SRR1700202 1 0.4690 0.68283 0.900 0.100
#> SRR1700203 1 0.2236 0.70091 0.964 0.036
#> SRR1700204 1 0.4431 0.72456 0.908 0.092
#> SRR1700206 1 0.1843 0.70586 0.972 0.028
#> SRR1700207 1 0.7602 0.69783 0.780 0.220
#> SRR1700208 1 0.1184 0.70644 0.984 0.016
#> SRR1700205 1 0.4431 0.68590 0.908 0.092
#> SRR1700209 1 0.9988 0.30396 0.520 0.480
#> SRR1700210 1 0.2603 0.70452 0.956 0.044
#> SRR1700211 1 0.2948 0.69754 0.948 0.052
#> SRR1700212 1 0.2236 0.70079 0.964 0.036
#> SRR1700213 1 0.7815 0.69694 0.768 0.232
#> SRR1700214 1 0.1843 0.71254 0.972 0.028
#> SRR1700215 1 0.5059 0.67999 0.888 0.112
#> SRR1700217 1 0.8861 0.63667 0.696 0.304
#> SRR1700216 1 0.5059 0.67570 0.888 0.112
#> SRR1700218 1 0.8813 0.64314 0.700 0.300
#> SRR1700219 1 0.7602 0.70279 0.780 0.220
#> SRR1700222 1 0.4298 0.68758 0.912 0.088
#> SRR1700220 2 0.5059 0.77487 0.112 0.888
#> SRR1700221 1 0.1843 0.70789 0.972 0.028
#> SRR1700223 1 0.6531 0.71722 0.832 0.168
#> SRR1700224 1 0.6343 0.69638 0.840 0.160
#> SRR1700226 1 0.6048 0.72491 0.852 0.148
#> SRR1700229 1 0.6438 0.72605 0.836 0.164
#> SRR1700225 1 0.9608 0.50939 0.616 0.384
#> SRR1700227 1 0.8081 0.67755 0.752 0.248
#> SRR1700230 1 0.4431 0.68674 0.908 0.092
#> SRR1700231 1 0.7056 0.71204 0.808 0.192
#> SRR1700228 1 0.3114 0.71234 0.944 0.056
#> SRR1700232 1 0.8499 0.66927 0.724 0.276
#> SRR1700233 1 0.3274 0.72044 0.940 0.060
#> SRR1700234 1 0.3431 0.70791 0.936 0.064
#> SRR1700235 1 0.9881 0.41535 0.564 0.436
#> SRR1700237 1 0.7056 0.71392 0.808 0.192
#> SRR1700236 1 0.9775 0.47790 0.588 0.412
#> SRR1700238 1 0.1843 0.71141 0.972 0.028
#> SRR1700239 1 0.4161 0.68816 0.916 0.084
#> SRR1700240 1 0.6531 0.63766 0.832 0.168
#> SRR1700241 1 0.5294 0.67681 0.880 0.120
#> SRR1700243 1 0.5629 0.72274 0.868 0.132
#> SRR1700244 1 0.3584 0.71582 0.932 0.068
#> SRR1700242 1 0.4562 0.68510 0.904 0.096
#> SRR1700246 1 0.4161 0.68908 0.916 0.084
#> SRR1700245 1 0.9896 0.41267 0.560 0.440
#> SRR1700247 1 0.4815 0.68117 0.896 0.104
#> SRR1700249 1 0.6048 0.65755 0.852 0.148
#> SRR1700250 1 0.9922 0.39679 0.552 0.448
#> SRR1700248 1 0.6247 0.72189 0.844 0.156
#> SRR1700251 1 0.3431 0.71994 0.936 0.064
#> SRR1700252 1 0.5842 0.72369 0.860 0.140
#> SRR1700253 1 0.7453 0.70329 0.788 0.212
#> SRR1700256 1 0.3431 0.71953 0.936 0.064
#> SRR1700254 1 0.4815 0.67991 0.896 0.104
#> SRR1700255 1 0.2603 0.71028 0.956 0.044
#> SRR1700257 1 0.1184 0.70839 0.984 0.016
#> SRR1700258 1 0.7745 0.68966 0.772 0.228
#> SRR1700259 2 0.8555 0.53517 0.280 0.720
#> SRR1700260 2 0.4431 0.78231 0.092 0.908
#> SRR1700261 2 0.4022 0.78652 0.080 0.920
#> SRR1700262 2 0.3431 0.80284 0.064 0.936
#> SRR1700263 1 0.9580 0.54801 0.620 0.380
#> SRR1700264 1 0.9775 0.48231 0.588 0.412
#> SRR1700265 1 0.6801 0.71633 0.820 0.180
#> SRR1700266 2 0.9850 0.06904 0.428 0.572
#> SRR1700268 1 0.2603 0.70663 0.956 0.044
#> SRR1700270 1 0.6712 0.71435 0.824 0.176
#> SRR1700267 2 0.9970 -0.09848 0.468 0.532
#> SRR1700271 2 0.8555 0.53902 0.280 0.720
#> SRR1700272 2 0.6801 0.72514 0.180 0.820
#> SRR1700273 1 0.9129 0.61859 0.672 0.328
#> SRR1700274 2 0.8267 0.58346 0.260 0.740
#> SRR1700277 1 0.8144 0.67450 0.748 0.252
#> SRR1700275 2 0.3431 0.79412 0.064 0.936
#> SRR1700276 2 0.9866 0.17960 0.432 0.568
#> SRR1700278 1 0.8327 0.58308 0.736 0.264
#> SRR1700279 2 0.9998 -0.00512 0.492 0.508
#> SRR1700280 1 0.9044 0.48823 0.680 0.320
#> SRR1700281 1 0.9358 0.58191 0.648 0.352
#> SRR1700283 2 0.4690 0.78596 0.100 0.900
#> SRR1700282 1 0.9491 0.41236 0.632 0.368
#> SRR1700284 2 0.0672 0.80623 0.008 0.992
#> SRR1700285 2 0.4690 0.77909 0.100 0.900
#> SRR1700286 2 0.7299 0.66387 0.204 0.796
#> SRR1700287 2 0.5629 0.72561 0.132 0.868
#> SRR1700290 2 0.9909 0.13873 0.444 0.556
#> SRR1700289 2 0.3114 0.79482 0.056 0.944
#> SRR1700288 1 0.3879 0.71993 0.924 0.076
#> SRR1700292 2 0.7219 0.65242 0.200 0.800
#> SRR1700291 2 0.1843 0.80278 0.028 0.972
#> SRR1700293 1 0.7950 0.65731 0.760 0.240
#> SRR1700294 2 0.7745 0.59636 0.228 0.772
#> SRR1700295 2 0.6712 0.66663 0.176 0.824
#> SRR1700297 2 0.5059 0.74252 0.112 0.888
#> SRR1700296 2 0.8207 0.56339 0.256 0.744
#> SRR1700298 2 0.6801 0.67434 0.180 0.820
#> SRR1700299 2 0.6623 0.68181 0.172 0.828
#> SRR1700300 2 0.9522 0.33137 0.372 0.628
#> SRR1700302 2 0.1633 0.80324 0.024 0.976
#> SRR1700301 2 0.3584 0.78144 0.068 0.932
#> SRR1700303 2 0.2236 0.80049 0.036 0.964
#> SRR1700304 1 0.5737 0.66229 0.864 0.136
#> SRR1700305 2 0.9970 0.05646 0.468 0.532
#> SRR1700306 2 0.6801 0.66436 0.180 0.820
#> SRR1700308 2 0.5737 0.74935 0.136 0.864
#> SRR1700307 2 0.5059 0.77815 0.112 0.888
#> SRR1700309 2 0.6801 0.69733 0.180 0.820
#> SRR1700310 2 0.5842 0.71341 0.140 0.860
#> SRR1700311 2 0.7056 0.64536 0.192 0.808
#> SRR1700312 2 0.2948 0.80245 0.052 0.948
#> SRR1700313 2 0.8909 0.47514 0.308 0.692
#> SRR1700314 2 0.1184 0.80590 0.016 0.984
#> SRR1700315 2 0.7219 0.66658 0.200 0.800
#> SRR1700316 2 0.1633 0.80717 0.024 0.976
#> SRR1700317 2 0.9833 0.03462 0.424 0.576
#> SRR1700318 1 0.9998 0.05627 0.508 0.492
#> SRR1700319 2 0.3274 0.78753 0.060 0.940
#> SRR1700320 2 0.2948 0.79292 0.052 0.948
#> SRR1700322 2 0.9970 0.07986 0.468 0.532
#> SRR1700321 2 0.3879 0.79627 0.076 0.924
#> SRR1700323 2 0.0672 0.80639 0.008 0.992
#> SRR1700324 2 0.4690 0.76637 0.100 0.900
#> SRR1700325 1 1.0000 0.20709 0.504 0.496
#> SRR1700326 2 0.9323 0.39201 0.348 0.652
#> SRR1700327 2 0.4562 0.77767 0.096 0.904
#> SRR1700329 2 0.2423 0.79778 0.040 0.960
#> SRR1700328 1 0.5059 0.69136 0.888 0.112
#> SRR1700330 1 0.9996 0.08757 0.512 0.488
#> SRR1700331 2 0.1633 0.80359 0.024 0.976
#> SRR1700332 2 0.1184 0.80491 0.016 0.984
#> SRR1700333 1 0.9775 0.31561 0.588 0.412
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.3797 0.74297 0.056 0.892 0.052
#> SRR1699875 2 0.1453 0.74304 0.024 0.968 0.008
#> SRR1699876 3 0.6373 0.39908 0.004 0.408 0.588
#> SRR1699877 2 0.2448 0.73566 0.076 0.924 0.000
#> SRR1699879 2 0.3272 0.70926 0.004 0.892 0.104
#> SRR1699878 2 0.1337 0.74197 0.016 0.972 0.012
#> SRR1699880 2 0.0661 0.74168 0.004 0.988 0.008
#> SRR1699881 2 0.4206 0.71907 0.040 0.872 0.088
#> SRR1699882 2 0.4418 0.69590 0.020 0.848 0.132
#> SRR1699883 2 0.2564 0.74606 0.028 0.936 0.036
#> SRR1699884 2 0.4228 0.71326 0.148 0.844 0.008
#> SRR1699885 2 0.2625 0.73536 0.084 0.916 0.000
#> SRR1699886 2 0.5815 0.50940 0.004 0.692 0.304
#> SRR1699888 2 0.7828 0.36101 0.068 0.592 0.340
#> SRR1699889 3 0.3573 0.80886 0.004 0.120 0.876
#> SRR1699890 1 0.9125 0.47170 0.540 0.192 0.268
#> SRR1699887 2 0.5244 0.57227 0.004 0.756 0.240
#> SRR1699891 3 0.3539 0.81506 0.012 0.100 0.888
#> SRR1699892 2 0.2116 0.73741 0.012 0.948 0.040
#> SRR1699893 3 0.1999 0.82678 0.012 0.036 0.952
#> SRR1699894 3 0.3043 0.82021 0.008 0.084 0.908
#> SRR1699895 3 0.2096 0.82502 0.004 0.052 0.944
#> SRR1699896 2 0.3045 0.73367 0.020 0.916 0.064
#> SRR1699897 2 0.2496 0.73041 0.004 0.928 0.068
#> SRR1699898 3 0.3965 0.80594 0.008 0.132 0.860
#> SRR1699900 2 0.2806 0.74295 0.032 0.928 0.040
#> SRR1699899 3 0.6359 0.45095 0.004 0.404 0.592
#> SRR1699902 2 0.6287 0.49588 0.024 0.704 0.272
#> SRR1699901 3 0.5408 0.77915 0.136 0.052 0.812
#> SRR1699903 3 0.2301 0.82369 0.004 0.060 0.936
#> SRR1699904 3 0.3356 0.82191 0.056 0.036 0.908
#> SRR1699905 3 0.7979 0.12028 0.440 0.060 0.500
#> SRR1699906 3 0.4521 0.77656 0.004 0.180 0.816
#> SRR1699907 3 0.7283 0.57231 0.260 0.068 0.672
#> SRR1699908 3 0.3112 0.81701 0.004 0.096 0.900
#> SRR1699909 3 0.4521 0.77754 0.004 0.180 0.816
#> SRR1699910 3 0.3112 0.82384 0.028 0.056 0.916
#> SRR1699911 3 0.8433 0.52796 0.204 0.176 0.620
#> SRR1699912 3 0.2301 0.82296 0.004 0.060 0.936
#> SRR1699913 3 0.2636 0.82591 0.020 0.048 0.932
#> SRR1699914 3 0.4883 0.76358 0.004 0.208 0.788
#> SRR1699915 3 0.3797 0.81751 0.052 0.056 0.892
#> SRR1699916 3 0.3791 0.82963 0.048 0.060 0.892
#> SRR1699917 3 0.1765 0.82805 0.004 0.040 0.956
#> SRR1699918 3 0.3155 0.82980 0.040 0.044 0.916
#> SRR1699919 3 0.2749 0.82221 0.012 0.064 0.924
#> SRR1699920 3 0.3500 0.80926 0.004 0.116 0.880
#> SRR1699921 3 0.3502 0.81770 0.020 0.084 0.896
#> SRR1699922 1 0.8976 0.48181 0.552 0.276 0.172
#> SRR1699923 1 0.8963 0.25771 0.468 0.404 0.128
#> SRR1699924 3 0.3532 0.81982 0.008 0.108 0.884
#> SRR1699925 1 0.4821 0.69971 0.840 0.120 0.040
#> SRR1699926 3 0.5961 0.76965 0.096 0.112 0.792
#> SRR1699927 3 0.2400 0.82093 0.004 0.064 0.932
#> SRR1699929 2 0.2703 0.73304 0.016 0.928 0.056
#> SRR1699928 3 0.3112 0.81579 0.004 0.096 0.900
#> SRR1699930 3 0.3129 0.81838 0.008 0.088 0.904
#> SRR1699931 2 0.3791 0.73854 0.048 0.892 0.060
#> SRR1699933 2 0.4645 0.65952 0.008 0.816 0.176
#> SRR1699932 3 0.3715 0.80598 0.004 0.128 0.868
#> SRR1699934 1 0.2806 0.71739 0.928 0.040 0.032
#> SRR1699935 3 0.2313 0.82834 0.024 0.032 0.944
#> SRR1699936 2 0.5958 0.51172 0.008 0.692 0.300
#> SRR1699937 2 0.2711 0.73375 0.088 0.912 0.000
#> SRR1699938 2 0.1453 0.74025 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699940 2 0.3918 0.68510 0.004 0.856 0.140
#> SRR1699939 2 0.3784 0.69028 0.004 0.864 0.132
#> SRR1699941 2 0.2297 0.74540 0.036 0.944 0.020
#> SRR1699942 2 0.2651 0.73524 0.012 0.928 0.060
#> SRR1699943 2 0.2959 0.72767 0.100 0.900 0.000
#> SRR1699944 2 0.3207 0.72418 0.012 0.904 0.084
#> SRR1699945 2 0.3461 0.73495 0.024 0.900 0.076
#> SRR1699946 2 0.3112 0.73711 0.096 0.900 0.004
#> SRR1699947 2 0.1529 0.74260 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699948 2 0.2339 0.74232 0.048 0.940 0.012
#> SRR1699949 2 0.6314 0.34357 0.004 0.604 0.392
#> SRR1699950 2 0.4978 0.61766 0.004 0.780 0.216
#> SRR1699951 2 0.5690 0.55202 0.004 0.708 0.288
#> SRR1699952 2 0.2711 0.73087 0.088 0.912 0.000
#> SRR1699953 2 0.1585 0.73986 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699954 2 0.4750 0.65453 0.216 0.784 0.000
#> SRR1699955 2 0.3112 0.71950 0.004 0.900 0.096
#> SRR1699956 2 0.3896 0.69614 0.008 0.864 0.128
#> SRR1699957 2 0.1182 0.73956 0.012 0.976 0.012
#> SRR1699959 2 0.5541 0.59357 0.008 0.740 0.252
#> SRR1699958 3 0.6083 0.73177 0.060 0.168 0.772
#> SRR1699960 3 0.6518 0.09186 0.004 0.484 0.512
#> SRR1699961 2 0.1878 0.74226 0.044 0.952 0.004
#> SRR1699962 2 0.2866 0.73537 0.008 0.916 0.076
#> SRR1699963 2 0.4068 0.71292 0.016 0.864 0.120
#> SRR1699964 2 0.2400 0.74270 0.064 0.932 0.004
#> SRR1699965 2 0.2584 0.72710 0.008 0.928 0.064
#> SRR1699966 3 0.6676 0.06625 0.008 0.476 0.516
#> SRR1699967 2 0.3769 0.72951 0.104 0.880 0.016
#> SRR1699968 2 0.5244 0.57394 0.004 0.756 0.240
#> SRR1699969 2 0.6521 -0.05836 0.004 0.500 0.496
#> SRR1699971 2 0.3030 0.73397 0.092 0.904 0.004
#> SRR1699970 2 0.1529 0.74166 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699972 2 0.1989 0.74219 0.048 0.948 0.004
#> SRR1699973 3 0.5785 0.61008 0.004 0.300 0.696
#> SRR1699974 2 0.3995 0.73247 0.116 0.868 0.016
#> SRR1699975 3 0.6509 0.21702 0.004 0.472 0.524
#> SRR1699976 2 0.1585 0.74441 0.028 0.964 0.008
#> SRR1699977 2 0.6540 0.25574 0.008 0.584 0.408
#> SRR1699978 3 0.5062 0.72434 0.184 0.016 0.800
#> SRR1699979 3 0.6228 0.50916 0.004 0.372 0.624
#> SRR1699980 3 0.5365 0.71754 0.004 0.252 0.744
#> SRR1699981 3 0.3539 0.82090 0.012 0.100 0.888
#> SRR1699982 3 0.2590 0.82129 0.004 0.072 0.924
#> SRR1699983 3 0.3918 0.80197 0.004 0.140 0.856
#> SRR1699984 1 0.4731 0.69258 0.840 0.128 0.032
#> SRR1699985 3 0.6275 0.58840 0.008 0.348 0.644
#> SRR1699986 1 0.9402 0.39371 0.472 0.184 0.344
#> SRR1699988 2 0.6978 0.42203 0.032 0.632 0.336
#> SRR1699987 3 0.3987 0.80968 0.020 0.108 0.872
#> SRR1699989 3 0.6057 0.53229 0.004 0.340 0.656
#> SRR1699990 3 0.6521 0.11768 0.004 0.496 0.500
#> SRR1699992 2 0.2711 0.73260 0.088 0.912 0.000
#> SRR1699991 3 0.6859 0.42546 0.016 0.420 0.564
#> SRR1699993 3 0.6562 0.70720 0.184 0.072 0.744
#> SRR1699994 2 0.3213 0.74765 0.060 0.912 0.028
#> SRR1699995 3 0.3349 0.81463 0.004 0.108 0.888
#> SRR1699996 2 0.4750 0.65714 0.216 0.784 0.000
#> SRR1699997 3 0.1482 0.82512 0.020 0.012 0.968
#> SRR1699998 2 0.2599 0.74925 0.052 0.932 0.016
#> SRR1699999 1 0.6825 0.07176 0.500 0.488 0.012
#> SRR1700000 2 0.3826 0.72460 0.124 0.868 0.008
#> SRR1700002 2 0.2280 0.74366 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700001 2 0.4784 0.63551 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700003 3 0.6357 0.57604 0.020 0.296 0.684
#> SRR1700004 2 0.6434 0.26176 0.008 0.612 0.380
#> SRR1700005 1 0.3713 0.71358 0.892 0.076 0.032
#> SRR1700006 2 0.2400 0.74314 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700007 3 0.2945 0.81952 0.004 0.088 0.908
#> SRR1700008 3 0.1647 0.82290 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700009 1 0.6451 0.21164 0.560 0.004 0.436
#> SRR1700010 2 0.3295 0.72060 0.008 0.896 0.096
#> SRR1700011 2 0.6451 0.18481 0.004 0.560 0.436
#> SRR1700013 2 0.7065 0.53122 0.052 0.672 0.276
#> SRR1700012 2 0.2384 0.72954 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700014 3 0.6057 0.59992 0.004 0.340 0.656
#> SRR1700015 2 0.2173 0.74403 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700016 1 0.8170 0.54600 0.624 0.256 0.120
#> SRR1700018 2 0.1620 0.74002 0.012 0.964 0.024
#> SRR1700017 2 0.3183 0.73017 0.016 0.908 0.076
#> SRR1700019 3 0.6498 0.45930 0.008 0.396 0.596
#> SRR1700020 3 0.5292 0.73022 0.008 0.228 0.764
#> SRR1700021 3 0.4477 0.81363 0.068 0.068 0.864
#> SRR1700023 2 0.5247 0.58723 0.008 0.768 0.224
#> SRR1700022 2 0.3030 0.71332 0.004 0.904 0.092
#> SRR1700024 3 0.4110 0.79612 0.004 0.152 0.844
#> SRR1700025 2 0.2448 0.73638 0.076 0.924 0.000
#> SRR1700026 2 0.4092 0.73995 0.088 0.876 0.036
#> SRR1700027 2 0.2383 0.74203 0.044 0.940 0.016
#> SRR1700028 3 0.1877 0.82554 0.032 0.012 0.956
#> SRR1700029 3 0.3532 0.81696 0.008 0.108 0.884
#> SRR1700030 3 0.6129 0.62574 0.008 0.324 0.668
#> SRR1700031 2 0.3375 0.71005 0.008 0.892 0.100
#> SRR1700032 2 0.1411 0.74301 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700034 2 0.3263 0.74238 0.040 0.912 0.048
#> SRR1700035 3 0.3784 0.80796 0.004 0.132 0.864
#> SRR1700033 2 0.4808 0.63060 0.008 0.804 0.188
#> SRR1700036 3 0.6189 0.57217 0.004 0.364 0.632
#> SRR1700037 3 0.2400 0.82304 0.004 0.064 0.932
#> SRR1700038 2 0.4742 0.73826 0.104 0.848 0.048
#> SRR1700039 3 0.6298 0.52059 0.004 0.388 0.608
#> SRR1700040 2 0.4575 0.61837 0.004 0.812 0.184
#> SRR1700041 3 0.6169 0.58720 0.004 0.360 0.636
#> SRR1700042 3 0.6476 0.37050 0.004 0.448 0.548
#> SRR1700043 2 0.4748 0.66056 0.024 0.832 0.144
#> SRR1700045 3 0.5201 0.73688 0.004 0.236 0.760
#> SRR1700044 2 0.6208 0.67267 0.088 0.776 0.136
#> SRR1700046 2 0.6888 0.04313 0.016 0.552 0.432
#> SRR1700047 3 0.6143 0.66467 0.012 0.304 0.684
#> SRR1700048 3 0.2945 0.82196 0.004 0.088 0.908
#> SRR1700049 3 0.4521 0.77916 0.004 0.180 0.816
#> SRR1700050 3 0.2866 0.82383 0.008 0.076 0.916
#> SRR1700051 3 0.3272 0.81695 0.004 0.104 0.892
#> SRR1700052 3 0.6724 0.41853 0.012 0.420 0.568
#> SRR1700053 3 0.4172 0.79512 0.004 0.156 0.840
#> SRR1700054 2 0.8100 0.10185 0.068 0.512 0.420
#> SRR1700055 2 0.9224 0.15041 0.160 0.480 0.360
#> SRR1700056 3 0.1774 0.82722 0.024 0.016 0.960
#> SRR1700057 3 0.2590 0.82480 0.004 0.072 0.924
#> SRR1700058 2 0.6936 0.48135 0.044 0.672 0.284
#> SRR1700059 3 0.2173 0.82756 0.008 0.048 0.944
#> SRR1700060 3 0.4733 0.76614 0.004 0.196 0.800
#> SRR1700061 2 0.7534 0.27828 0.048 0.584 0.368
#> SRR1700062 3 0.2339 0.82662 0.012 0.048 0.940
#> SRR1700063 3 0.6104 0.59879 0.004 0.348 0.648
#> SRR1700064 3 0.4047 0.79886 0.004 0.148 0.848
#> SRR1700065 3 0.7174 0.27862 0.024 0.460 0.516
#> SRR1700066 2 0.7546 0.18117 0.044 0.560 0.396
#> SRR1700067 3 0.1919 0.82722 0.024 0.020 0.956
#> SRR1700068 3 0.1989 0.82658 0.004 0.048 0.948
#> SRR1700069 3 0.5502 0.72166 0.008 0.248 0.744
#> SRR1700070 2 0.5012 0.58531 0.008 0.788 0.204
#> SRR1700071 3 0.6386 0.46882 0.004 0.412 0.584
#> SRR1700072 3 0.5905 0.75190 0.044 0.184 0.772
#> SRR1700073 3 0.5730 0.77370 0.060 0.144 0.796
#> SRR1700075 2 0.7665 -0.06452 0.044 0.500 0.456
#> SRR1700074 2 0.3649 0.73101 0.036 0.896 0.068
#> SRR1700076 2 0.6337 0.56957 0.044 0.736 0.220
#> SRR1700077 2 0.4586 0.73753 0.096 0.856 0.048
#> SRR1700078 2 0.6664 -0.04238 0.008 0.528 0.464
#> SRR1700080 3 0.6467 0.51798 0.008 0.388 0.604
#> SRR1700079 3 0.4047 0.80253 0.004 0.148 0.848
#> SRR1700081 3 0.6104 0.56648 0.004 0.348 0.648
#> SRR1700082 2 0.3755 0.68733 0.008 0.872 0.120
#> SRR1700083 3 0.5763 0.68125 0.008 0.276 0.716
#> SRR1700084 2 0.3742 0.74125 0.072 0.892 0.036
#> SRR1700085 3 0.3826 0.80891 0.008 0.124 0.868
#> SRR1700086 3 0.6553 0.47275 0.008 0.412 0.580
#> SRR1700087 3 0.9256 0.03699 0.156 0.400 0.444
#> SRR1700088 2 0.3771 0.70333 0.012 0.876 0.112
#> SRR1700089 2 0.7339 0.36468 0.036 0.572 0.392
#> SRR1700091 3 0.3998 0.82033 0.056 0.060 0.884
#> SRR1700090 3 0.2584 0.81557 0.064 0.008 0.928
#> SRR1700092 3 0.6096 0.71376 0.040 0.208 0.752
#> SRR1700094 3 0.8228 0.32274 0.084 0.364 0.552
#> SRR1700093 3 0.2446 0.82323 0.052 0.012 0.936
#> SRR1700095 3 0.3293 0.80898 0.088 0.012 0.900
#> SRR1700096 3 0.4045 0.81359 0.024 0.104 0.872
#> SRR1700097 3 0.3295 0.80295 0.096 0.008 0.896
#> SRR1700098 3 0.8887 0.10393 0.120 0.424 0.456
#> SRR1700099 3 0.3237 0.82616 0.056 0.032 0.912
#> SRR1700100 3 0.3780 0.82273 0.064 0.044 0.892
#> SRR1700101 3 0.5260 0.79285 0.080 0.092 0.828
#> SRR1700102 3 0.3695 0.81111 0.012 0.108 0.880
#> SRR1700104 3 0.3896 0.82128 0.060 0.052 0.888
#> SRR1700103 3 0.2749 0.82847 0.012 0.064 0.924
#> SRR1700105 3 0.2651 0.82084 0.060 0.012 0.928
#> SRR1700106 3 0.3784 0.77083 0.132 0.004 0.864
#> SRR1700107 3 0.3415 0.81867 0.080 0.020 0.900
#> SRR1700108 3 0.3415 0.81505 0.080 0.020 0.900
#> SRR1700109 3 0.3456 0.82099 0.060 0.036 0.904
#> SRR1700110 3 0.3472 0.82465 0.056 0.040 0.904
#> SRR1700112 3 0.1525 0.82208 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700111 3 0.1647 0.82383 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700113 3 0.1636 0.82468 0.020 0.016 0.964
#> SRR1700114 3 0.4357 0.81902 0.052 0.080 0.868
#> SRR1700115 3 0.1950 0.82010 0.040 0.008 0.952
#> SRR1700116 3 0.2866 0.81032 0.076 0.008 0.916
#> SRR1700117 3 0.3851 0.77226 0.136 0.004 0.860
#> SRR1700119 3 0.2486 0.81550 0.060 0.008 0.932
#> SRR1700118 3 0.2050 0.82544 0.028 0.020 0.952
#> SRR1700120 3 0.2446 0.82063 0.052 0.012 0.936
#> SRR1700121 3 0.2031 0.82321 0.032 0.016 0.952
#> SRR1700122 3 0.1643 0.81970 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700123 3 0.3193 0.79311 0.100 0.004 0.896
#> SRR1700125 3 0.2590 0.80934 0.072 0.004 0.924
#> SRR1700126 3 0.3690 0.80263 0.100 0.016 0.884
#> SRR1700127 3 0.1832 0.82086 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700124 3 0.1905 0.82466 0.028 0.016 0.956
#> SRR1700128 3 0.2096 0.81606 0.052 0.004 0.944
#> SRR1700129 3 0.2066 0.81552 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700130 3 0.4033 0.76927 0.136 0.008 0.856
#> SRR1700132 3 0.2165 0.81138 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700131 3 0.2339 0.82199 0.048 0.012 0.940
#> SRR1700133 3 0.2496 0.81017 0.068 0.004 0.928
#> SRR1700134 3 0.1878 0.81867 0.044 0.004 0.952
#> SRR1700135 3 0.2165 0.81441 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700136 3 0.1878 0.81963 0.044 0.004 0.952
#> SRR1700137 3 0.1832 0.82011 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700138 3 0.1647 0.82025 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700140 3 0.1315 0.82554 0.020 0.008 0.972
#> SRR1700139 3 0.2165 0.81227 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700141 3 0.2096 0.81775 0.052 0.004 0.944
#> SRR1700142 3 0.1999 0.82695 0.012 0.036 0.952
#> SRR1700143 3 0.1878 0.81821 0.044 0.004 0.952
#> SRR1700144 3 0.4409 0.78357 0.004 0.172 0.824
#> SRR1700145 3 0.1989 0.81647 0.048 0.004 0.948
#> SRR1700146 3 0.1751 0.82352 0.028 0.012 0.960
#> SRR1700147 3 0.1643 0.81759 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700149 3 0.2772 0.80532 0.080 0.004 0.916
#> SRR1700148 3 0.2772 0.80773 0.080 0.004 0.916
#> SRR1700150 3 0.1989 0.81884 0.048 0.004 0.948
#> SRR1700152 3 0.3375 0.79619 0.100 0.008 0.892
#> SRR1700151 3 0.1878 0.81830 0.044 0.004 0.952
#> SRR1700153 3 0.1711 0.82078 0.032 0.008 0.960
#> SRR1700154 3 0.2625 0.80407 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700155 3 0.1964 0.81463 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700156 3 0.1877 0.82330 0.032 0.012 0.956
#> SRR1700158 3 0.3983 0.76136 0.144 0.004 0.852
#> SRR1700159 3 0.1647 0.82132 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700157 3 0.1832 0.82156 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700160 3 0.2096 0.81915 0.052 0.004 0.944
#> SRR1700161 3 0.2096 0.81656 0.052 0.004 0.944
#> SRR1700162 3 0.2590 0.80849 0.072 0.004 0.924
#> SRR1700164 3 0.5873 0.52342 0.312 0.004 0.684
#> SRR1700163 3 0.3816 0.75812 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700165 3 0.3009 0.82259 0.052 0.028 0.920
#> SRR1700166 3 0.3412 0.77998 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700168 3 0.3112 0.79593 0.096 0.004 0.900
#> SRR1700167 3 0.2301 0.81368 0.060 0.004 0.936
#> SRR1700170 3 0.3193 0.79746 0.100 0.004 0.896
#> SRR1700169 3 0.2879 0.81986 0.052 0.024 0.924
#> SRR1700171 3 0.6205 0.47257 0.336 0.008 0.656
#> SRR1700172 3 0.1774 0.82516 0.024 0.016 0.960
#> SRR1700174 3 0.2651 0.82026 0.060 0.012 0.928
#> SRR1700173 3 0.2063 0.81994 0.044 0.008 0.948
#> SRR1700175 3 0.1765 0.81927 0.040 0.004 0.956
#> SRR1700176 3 0.2383 0.82301 0.044 0.016 0.940
#> SRR1700178 2 0.4702 0.66224 0.212 0.788 0.000
#> SRR1700177 3 0.1411 0.82008 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700180 2 0.5327 0.60395 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700179 2 0.4605 0.67444 0.204 0.796 0.000
#> SRR1700181 2 0.6673 0.49611 0.344 0.636 0.020
#> SRR1700183 1 0.1529 0.70852 0.960 0.040 0.000
#> SRR1700182 2 0.4750 0.66703 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700184 2 0.4702 0.66432 0.212 0.788 0.000
#> SRR1700186 2 0.4465 0.69680 0.176 0.820 0.004
#> SRR1700187 1 0.1411 0.70978 0.964 0.036 0.000
#> SRR1700185 1 0.1315 0.71478 0.972 0.008 0.020
#> SRR1700188 2 0.4235 0.68773 0.176 0.824 0.000
#> SRR1700192 1 0.4521 0.61316 0.816 0.180 0.004
#> SRR1700190 2 0.5158 0.64266 0.232 0.764 0.004
#> SRR1700191 1 0.0892 0.71297 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700189 1 0.1647 0.71469 0.960 0.036 0.004
#> SRR1700193 2 0.5327 0.60125 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700195 2 0.5621 0.53691 0.308 0.692 0.000
#> SRR1700194 1 0.1643 0.70762 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700196 2 0.4291 0.68509 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700197 1 0.6140 0.23551 0.596 0.404 0.000
#> SRR1700198 2 0.5058 0.63105 0.244 0.756 0.000
#> SRR1700199 2 0.5016 0.63028 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700200 2 0.5560 0.55740 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700201 2 0.6936 0.65743 0.160 0.732 0.108
#> SRR1700202 1 0.1337 0.71512 0.972 0.016 0.012
#> SRR1700203 2 0.6299 0.17636 0.476 0.524 0.000
#> SRR1700204 2 0.6849 0.40517 0.380 0.600 0.020
#> SRR1700206 2 0.6140 0.35663 0.404 0.596 0.000
#> SRR1700207 2 0.4291 0.68645 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700208 2 0.6505 0.23452 0.468 0.528 0.004
#> SRR1700205 1 0.3918 0.66472 0.856 0.140 0.004
#> SRR1700209 2 0.3356 0.74655 0.036 0.908 0.056
#> SRR1700210 2 0.7083 0.39004 0.380 0.592 0.028
#> SRR1700211 1 0.4887 0.56833 0.772 0.228 0.000
#> SRR1700212 1 0.6566 0.25889 0.612 0.376 0.012
#> SRR1700213 2 0.4615 0.71649 0.144 0.836 0.020
#> SRR1700214 2 0.5591 0.55062 0.304 0.696 0.000
#> SRR1700215 1 0.1999 0.71199 0.952 0.012 0.036
#> SRR1700217 2 0.6537 0.63707 0.196 0.740 0.064
#> SRR1700216 1 0.3193 0.69338 0.896 0.100 0.004
#> SRR1700218 2 0.3896 0.72727 0.128 0.864 0.008
#> SRR1700219 2 0.6810 0.63074 0.212 0.720 0.068
#> SRR1700222 1 0.2261 0.69837 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700220 3 0.7114 0.44430 0.028 0.388 0.584
#> SRR1700221 1 0.6204 0.08308 0.576 0.424 0.000
#> SRR1700223 2 0.4978 0.66275 0.216 0.780 0.004
#> SRR1700224 1 0.7824 0.33314 0.580 0.356 0.064
#> SRR1700226 2 0.5285 0.63730 0.244 0.752 0.004
#> SRR1700229 2 0.4521 0.69453 0.180 0.816 0.004
#> SRR1700225 2 0.5815 0.70177 0.104 0.800 0.096
#> SRR1700227 2 0.4605 0.67826 0.204 0.796 0.000
#> SRR1700230 1 0.2749 0.70781 0.924 0.064 0.012
#> SRR1700231 2 0.4555 0.67380 0.200 0.800 0.000
#> SRR1700228 2 0.6654 0.24757 0.456 0.536 0.008
#> SRR1700232 2 0.4810 0.71832 0.140 0.832 0.028
#> SRR1700233 2 0.5678 0.53901 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700234 1 0.6647 0.05415 0.540 0.452 0.008
#> SRR1700235 2 0.3120 0.74253 0.080 0.908 0.012
#> SRR1700237 2 0.5987 0.66435 0.208 0.756 0.036
#> SRR1700236 2 0.3554 0.74594 0.064 0.900 0.036
#> SRR1700238 2 0.5882 0.48307 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700239 1 0.2356 0.70121 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700240 1 0.1129 0.71371 0.976 0.004 0.020
#> SRR1700241 1 0.3765 0.70174 0.888 0.028 0.084
#> SRR1700243 2 0.5692 0.60624 0.268 0.724 0.008
#> SRR1700244 1 0.7674 -0.05958 0.480 0.476 0.044
#> SRR1700242 1 0.1267 0.71547 0.972 0.024 0.004
#> SRR1700246 1 0.2400 0.70592 0.932 0.064 0.004
#> SRR1700245 2 0.3267 0.74833 0.044 0.912 0.044
#> SRR1700247 1 0.1170 0.71409 0.976 0.008 0.016
#> SRR1700249 1 0.2496 0.70208 0.928 0.004 0.068
#> SRR1700250 2 0.3155 0.74699 0.044 0.916 0.040
#> SRR1700248 2 0.5929 0.55151 0.320 0.676 0.004
#> SRR1700251 2 0.6204 0.33311 0.424 0.576 0.000
#> SRR1700252 2 0.5254 0.61471 0.264 0.736 0.000
#> SRR1700253 2 0.4235 0.69063 0.176 0.824 0.000
#> SRR1700256 2 0.6026 0.44378 0.376 0.624 0.000
#> SRR1700254 1 0.1129 0.71406 0.976 0.020 0.004
#> SRR1700255 1 0.6299 -0.06242 0.524 0.476 0.000
#> SRR1700257 2 0.5988 0.44999 0.368 0.632 0.000
#> SRR1700258 2 0.6351 0.67438 0.168 0.760 0.072
#> SRR1700259 2 0.4861 0.63229 0.008 0.800 0.192
#> SRR1700260 3 0.6398 0.38674 0.004 0.416 0.580
#> SRR1700261 3 0.5404 0.70419 0.004 0.256 0.740
#> SRR1700262 3 0.4479 0.81688 0.044 0.096 0.860
#> SRR1700263 2 0.2550 0.74870 0.040 0.936 0.024
#> SRR1700264 2 0.1399 0.74262 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700265 2 0.4399 0.68285 0.188 0.812 0.000
#> SRR1700266 2 0.2939 0.72718 0.012 0.916 0.072
#> SRR1700268 2 0.6235 0.28604 0.436 0.564 0.000
#> SRR1700270 2 0.4750 0.66441 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700267 2 0.3481 0.74874 0.044 0.904 0.052
#> SRR1700271 2 0.5061 0.62331 0.008 0.784 0.208
#> SRR1700272 3 0.8066 0.23787 0.068 0.404 0.528
#> SRR1700273 2 0.3713 0.74734 0.076 0.892 0.032
#> SRR1700274 3 0.9674 0.00892 0.212 0.392 0.396
#> SRR1700277 2 0.4121 0.70092 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700275 3 0.3742 0.82124 0.072 0.036 0.892
#> SRR1700276 1 0.6180 0.28037 0.584 0.000 0.416
#> SRR1700278 1 0.7085 0.62429 0.716 0.188 0.096
#> SRR1700279 1 0.6507 0.53612 0.688 0.028 0.284
#> SRR1700280 1 0.6001 0.65208 0.772 0.052 0.176
#> SRR1700281 2 0.2959 0.72783 0.100 0.900 0.000
#> SRR1700283 3 0.6148 0.76499 0.076 0.148 0.776
#> SRR1700282 1 0.6491 0.62567 0.732 0.052 0.216
#> SRR1700284 3 0.2860 0.81868 0.004 0.084 0.912
#> SRR1700285 3 0.4256 0.81810 0.036 0.096 0.868
#> SRR1700286 2 0.5873 0.48933 0.004 0.684 0.312
#> SRR1700287 3 0.5153 0.79616 0.068 0.100 0.832
#> SRR1700290 3 0.8973 0.17354 0.364 0.136 0.500
#> SRR1700289 3 0.5442 0.79107 0.056 0.132 0.812
#> SRR1700288 2 0.6111 0.40426 0.396 0.604 0.000
#> SRR1700292 3 0.7388 0.61969 0.208 0.100 0.692
#> SRR1700291 3 0.2356 0.82691 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700293 1 0.7479 0.56535 0.660 0.076 0.264
#> SRR1700294 3 0.5911 0.73832 0.156 0.060 0.784
#> SRR1700295 3 0.4749 0.78693 0.116 0.040 0.844
#> SRR1700297 3 0.3310 0.81769 0.064 0.028 0.908
#> SRR1700296 3 0.7222 0.63882 0.220 0.084 0.696
#> SRR1700298 3 0.5757 0.77333 0.056 0.152 0.792
#> SRR1700299 3 0.5554 0.79245 0.076 0.112 0.812
#> SRR1700300 3 0.8056 0.20395 0.400 0.068 0.532
#> SRR1700302 3 0.1711 0.82507 0.008 0.032 0.960
#> SRR1700301 3 0.2774 0.82172 0.008 0.072 0.920
#> SRR1700303 3 0.2313 0.82669 0.024 0.032 0.944
#> SRR1700304 1 0.3528 0.70239 0.892 0.016 0.092
#> SRR1700305 1 0.8482 0.18848 0.500 0.092 0.408
#> SRR1700306 3 0.4887 0.78876 0.096 0.060 0.844
#> SRR1700308 2 0.6410 0.15748 0.004 0.576 0.420
#> SRR1700307 3 0.5307 0.77177 0.048 0.136 0.816
#> SRR1700309 3 0.6756 0.68769 0.056 0.232 0.712
#> SRR1700310 3 0.4370 0.81206 0.076 0.056 0.868
#> SRR1700311 3 0.5581 0.73371 0.168 0.040 0.792
#> SRR1700312 3 0.4679 0.80320 0.020 0.148 0.832
#> SRR1700313 3 0.7412 0.63538 0.112 0.192 0.696
#> SRR1700314 3 0.2774 0.82263 0.008 0.072 0.920
#> SRR1700315 3 0.5760 0.76747 0.064 0.140 0.796
#> SRR1700316 3 0.3030 0.81941 0.004 0.092 0.904
#> SRR1700317 2 0.6375 0.54942 0.036 0.720 0.244
#> SRR1700318 1 0.8747 0.24150 0.492 0.112 0.396
#> SRR1700319 3 0.3589 0.82141 0.048 0.052 0.900
#> SRR1700320 3 0.3293 0.81849 0.012 0.088 0.900
#> SRR1700322 1 0.6467 0.32602 0.604 0.008 0.388
#> SRR1700321 3 0.4953 0.78093 0.016 0.176 0.808
#> SRR1700323 3 0.2301 0.82540 0.004 0.060 0.936
#> SRR1700324 3 0.3967 0.82449 0.072 0.044 0.884
#> SRR1700325 1 0.9991 0.19032 0.352 0.316 0.332
#> SRR1700326 3 0.7029 0.16896 0.440 0.020 0.540
#> SRR1700327 3 0.6057 0.55155 0.004 0.340 0.656
#> SRR1700329 3 0.3272 0.82189 0.016 0.080 0.904
#> SRR1700328 1 0.5945 0.61331 0.740 0.236 0.024
#> SRR1700330 1 0.7983 0.54191 0.636 0.108 0.256
#> SRR1700331 3 0.4810 0.79561 0.028 0.140 0.832
#> SRR1700332 3 0.2229 0.82640 0.012 0.044 0.944
#> SRR1700333 1 0.7932 0.28393 0.552 0.064 0.384
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.5904 0.146654 0.044 0.648 0.300 0.008
#> SRR1699875 3 0.5292 0.140010 0.008 0.480 0.512 0.000
#> SRR1699876 2 0.6311 0.270821 0.004 0.664 0.116 0.216
#> SRR1699877 3 0.6800 0.124470 0.096 0.444 0.460 0.000
#> SRR1699879 2 0.4599 0.206734 0.000 0.736 0.248 0.016
#> SRR1699878 2 0.5151 -0.086034 0.004 0.532 0.464 0.000
#> SRR1699880 2 0.5332 -0.127150 0.004 0.512 0.480 0.004
#> SRR1699881 2 0.6491 0.122884 0.048 0.612 0.316 0.024
#> SRR1699882 2 0.4067 0.273540 0.016 0.828 0.140 0.016
#> SRR1699883 2 0.5652 0.100267 0.028 0.624 0.344 0.004
#> SRR1699884 2 0.7500 -0.064756 0.140 0.448 0.404 0.008
#> SRR1699885 3 0.5833 0.176954 0.032 0.440 0.528 0.000
#> SRR1699886 2 0.5280 0.297999 0.004 0.752 0.168 0.076
#> SRR1699888 2 0.9141 -0.033008 0.068 0.356 0.296 0.280
#> SRR1699889 2 0.7459 -0.034917 0.004 0.484 0.160 0.352
#> SRR1699890 2 0.7924 0.097645 0.280 0.536 0.040 0.144
#> SRR1699887 2 0.4817 0.271663 0.004 0.768 0.188 0.040
#> SRR1699891 2 0.8028 -0.010985 0.028 0.484 0.164 0.324
#> SRR1699892 2 0.4917 0.212866 0.008 0.728 0.248 0.016
#> SRR1699893 4 0.6023 0.428706 0.000 0.344 0.056 0.600
#> SRR1699894 2 0.6908 -0.133239 0.004 0.480 0.092 0.424
#> SRR1699895 2 0.7200 -0.125600 0.008 0.476 0.108 0.408
#> SRR1699896 2 0.5767 0.121994 0.020 0.612 0.356 0.012
#> SRR1699897 2 0.4795 0.183118 0.012 0.696 0.292 0.000
#> SRR1699898 4 0.5944 0.645277 0.000 0.164 0.140 0.696
#> SRR1699900 3 0.5851 0.331518 0.068 0.272 0.660 0.000
#> SRR1699899 2 0.7149 0.195941 0.004 0.576 0.180 0.240
#> SRR1699902 3 0.4923 0.479512 0.028 0.080 0.808 0.084
#> SRR1699901 4 0.8759 0.323267 0.048 0.244 0.292 0.416
#> SRR1699903 2 0.7253 -0.059715 0.000 0.484 0.152 0.364
#> SRR1699904 4 0.6966 0.387167 0.016 0.340 0.084 0.560
#> SRR1699905 1 0.9330 0.157191 0.412 0.208 0.116 0.264
#> SRR1699906 2 0.7098 0.059068 0.000 0.536 0.152 0.312
#> SRR1699907 2 0.8154 0.015651 0.104 0.500 0.068 0.328
#> SRR1699908 2 0.6834 -0.135786 0.000 0.476 0.100 0.424
#> SRR1699909 2 0.7935 -0.128812 0.004 0.384 0.240 0.372
#> SRR1699910 2 0.7281 -0.163680 0.000 0.440 0.148 0.412
#> SRR1699911 2 0.9656 0.081537 0.180 0.340 0.312 0.168
#> SRR1699912 2 0.7313 -0.165799 0.000 0.432 0.152 0.416
#> SRR1699913 4 0.6628 0.357375 0.008 0.376 0.068 0.548
#> SRR1699914 2 0.8060 -0.051491 0.004 0.368 0.316 0.312
#> SRR1699915 4 0.7713 0.279023 0.008 0.356 0.176 0.460
#> SRR1699916 4 0.6627 0.586952 0.032 0.072 0.240 0.656
#> SRR1699917 4 0.5184 0.642781 0.000 0.060 0.204 0.736
#> SRR1699918 4 0.5658 0.551528 0.012 0.032 0.280 0.676
#> SRR1699919 2 0.7387 -0.100157 0.004 0.468 0.144 0.384
#> SRR1699920 2 0.7469 -0.041134 0.000 0.472 0.188 0.340
#> SRR1699921 2 0.7591 -0.064029 0.000 0.452 0.208 0.340
#> SRR1699922 2 0.8363 0.061318 0.296 0.508 0.104 0.092
#> SRR1699923 3 0.8189 0.020581 0.280 0.296 0.412 0.012
#> SRR1699924 4 0.5643 0.301064 0.000 0.024 0.428 0.548
#> SRR1699925 1 0.4716 0.648469 0.820 0.084 0.068 0.028
#> SRR1699926 2 0.8263 0.027815 0.060 0.492 0.128 0.320
#> SRR1699927 2 0.7251 -0.157044 0.000 0.440 0.144 0.416
#> SRR1699929 2 0.5771 0.223709 0.044 0.696 0.244 0.016
#> SRR1699928 2 0.7436 -0.074779 0.000 0.460 0.176 0.364
#> SRR1699930 2 0.7361 -0.036835 0.020 0.508 0.100 0.372
#> SRR1699931 2 0.6265 0.077987 0.040 0.600 0.344 0.016
#> SRR1699933 2 0.6006 -0.025644 0.020 0.508 0.460 0.012
#> SRR1699932 2 0.6944 -0.053453 0.004 0.512 0.100 0.384
#> SRR1699934 1 0.3410 0.674529 0.888 0.036 0.032 0.044
#> SRR1699935 4 0.4283 0.705924 0.004 0.128 0.048 0.820
#> SRR1699936 2 0.6607 0.102571 0.000 0.592 0.296 0.112
#> SRR1699937 3 0.6145 0.145349 0.048 0.460 0.492 0.000
#> SRR1699938 2 0.5193 -0.003396 0.008 0.580 0.412 0.000
#> SRR1699940 2 0.5722 0.153081 0.004 0.660 0.292 0.044
#> SRR1699939 2 0.4307 0.247671 0.000 0.784 0.192 0.024
#> SRR1699941 3 0.5716 0.203797 0.028 0.420 0.552 0.000
#> SRR1699942 3 0.6221 0.345186 0.000 0.316 0.608 0.076
#> SRR1699943 3 0.6452 0.121755 0.068 0.464 0.468 0.000
#> SRR1699944 2 0.5112 0.106374 0.004 0.648 0.340 0.008
#> SRR1699945 2 0.4607 0.173277 0.004 0.716 0.276 0.004
#> SRR1699946 2 0.6471 -0.042531 0.072 0.512 0.416 0.000
#> SRR1699947 3 0.5570 0.185704 0.020 0.440 0.540 0.000
#> SRR1699948 3 0.5812 0.281319 0.020 0.368 0.600 0.012
#> SRR1699949 2 0.4920 0.332977 0.000 0.768 0.068 0.164
#> SRR1699950 2 0.4188 0.278774 0.000 0.812 0.148 0.040
#> SRR1699951 2 0.6663 0.086962 0.000 0.596 0.280 0.124
#> SRR1699952 3 0.5847 0.221927 0.036 0.404 0.560 0.000
#> SRR1699953 2 0.5038 0.104093 0.012 0.652 0.336 0.000
#> SRR1699954 3 0.7270 0.213812 0.176 0.304 0.520 0.000
#> SRR1699955 2 0.6198 -0.006157 0.008 0.560 0.392 0.040
#> SRR1699956 2 0.4136 0.244922 0.000 0.788 0.196 0.016
#> SRR1699957 2 0.5110 0.084809 0.012 0.636 0.352 0.000
#> SRR1699959 3 0.7550 0.241124 0.000 0.332 0.464 0.204
#> SRR1699958 4 0.5060 0.623532 0.008 0.228 0.028 0.736
#> SRR1699960 4 0.7660 -0.052357 0.000 0.232 0.316 0.452
#> SRR1699961 3 0.5525 0.255859 0.016 0.388 0.592 0.004
#> SRR1699962 3 0.5852 0.200107 0.008 0.428 0.544 0.020
#> SRR1699963 3 0.7317 0.382294 0.000 0.268 0.528 0.204
#> SRR1699964 3 0.6919 0.199491 0.076 0.404 0.508 0.012
#> SRR1699965 2 0.5486 0.032558 0.004 0.604 0.376 0.016
#> SRR1699966 2 0.6140 0.291392 0.000 0.652 0.096 0.252
#> SRR1699967 3 0.7152 0.199518 0.080 0.392 0.508 0.020
#> SRR1699968 2 0.5604 0.002977 0.000 0.504 0.476 0.020
#> SRR1699969 2 0.6011 0.313484 0.000 0.688 0.180 0.132
#> SRR1699971 3 0.6658 0.180261 0.056 0.428 0.504 0.012
#> SRR1699970 3 0.5701 0.274369 0.028 0.356 0.612 0.004
#> SRR1699972 3 0.5473 0.303028 0.032 0.324 0.644 0.000
#> SRR1699973 4 0.6811 0.421824 0.000 0.180 0.216 0.604
#> SRR1699974 3 0.6691 0.364415 0.104 0.224 0.652 0.020
#> SRR1699975 2 0.6745 0.280209 0.004 0.628 0.204 0.164
#> SRR1699976 3 0.5193 0.226701 0.008 0.412 0.580 0.000
#> SRR1699977 3 0.6371 0.392427 0.000 0.092 0.608 0.300
#> SRR1699978 4 0.5998 0.546811 0.108 0.004 0.192 0.696
#> SRR1699979 4 0.7282 0.135612 0.000 0.160 0.348 0.492
#> SRR1699980 2 0.7714 0.030257 0.000 0.400 0.376 0.224
#> SRR1699981 2 0.7343 -0.083795 0.008 0.476 0.124 0.392
#> SRR1699982 2 0.7626 -0.156500 0.000 0.412 0.204 0.384
#> SRR1699983 2 0.7654 -0.106329 0.000 0.432 0.216 0.352
#> SRR1699984 1 0.5911 0.396254 0.624 0.044 0.328 0.004
#> SRR1699985 3 0.6793 0.267831 0.000 0.132 0.580 0.288
#> SRR1699986 1 0.9126 0.244705 0.416 0.164 0.312 0.108
#> SRR1699988 2 0.7595 0.220585 0.052 0.580 0.268 0.100
#> SRR1699987 4 0.5726 0.572395 0.004 0.280 0.048 0.668
#> SRR1699989 2 0.6912 0.207347 0.000 0.592 0.192 0.216
#> SRR1699990 2 0.6683 0.269717 0.000 0.620 0.176 0.204
#> SRR1699992 3 0.6426 0.205123 0.072 0.392 0.536 0.000
#> SRR1699991 3 0.4936 0.331937 0.000 0.012 0.672 0.316
#> SRR1699993 2 0.7533 -0.057683 0.108 0.500 0.024 0.368
#> SRR1699994 3 0.4609 0.419471 0.056 0.156 0.788 0.000
#> SRR1699995 3 0.5800 0.017294 0.000 0.032 0.548 0.420
#> SRR1699996 3 0.7512 0.200191 0.236 0.268 0.496 0.000
#> SRR1699997 4 0.4070 0.706537 0.000 0.132 0.044 0.824
#> SRR1699998 2 0.6354 -0.031233 0.064 0.520 0.416 0.000
#> SRR1699999 3 0.7077 0.076167 0.368 0.072 0.536 0.024
#> SRR1700000 3 0.7463 0.132868 0.180 0.364 0.456 0.000
#> SRR1700002 3 0.6483 0.214232 0.040 0.424 0.520 0.016
#> SRR1700001 2 0.6052 0.264857 0.004 0.680 0.224 0.092
#> SRR1700003 4 0.6740 0.360916 0.004 0.104 0.308 0.584
#> SRR1700004 2 0.6891 0.283545 0.012 0.628 0.216 0.144
#> SRR1700005 1 0.4102 0.633260 0.840 0.012 0.108 0.040
#> SRR1700006 3 0.5894 0.236607 0.040 0.392 0.568 0.000
#> SRR1700007 2 0.6103 -0.192782 0.004 0.492 0.036 0.468
#> SRR1700008 4 0.3648 0.729531 0.004 0.056 0.076 0.864
#> SRR1700009 1 0.6944 0.123276 0.512 0.100 0.004 0.384
#> SRR1700010 2 0.4664 0.202155 0.004 0.736 0.248 0.012
#> SRR1700011 3 0.7876 0.199158 0.000 0.352 0.368 0.280
#> SRR1700013 4 0.8989 -0.206694 0.056 0.268 0.316 0.360
#> SRR1700012 3 0.3380 0.479146 0.008 0.088 0.876 0.028
#> SRR1700014 3 0.5088 0.354109 0.000 0.024 0.688 0.288
#> SRR1700015 3 0.4854 0.384954 0.020 0.244 0.732 0.004
#> SRR1700016 3 0.7676 -0.053511 0.404 0.088 0.468 0.040
#> SRR1700018 3 0.4979 0.404266 0.004 0.224 0.740 0.032
#> SRR1700017 3 0.4362 0.493166 0.000 0.096 0.816 0.088
#> SRR1700019 2 0.6879 0.210644 0.000 0.596 0.188 0.216
#> SRR1700020 3 0.5396 -0.027703 0.000 0.012 0.524 0.464
#> SRR1700021 4 0.8473 0.420492 0.048 0.212 0.256 0.484
#> SRR1700023 3 0.5954 0.252373 0.000 0.344 0.604 0.052
#> SRR1700022 3 0.5759 0.465872 0.000 0.180 0.708 0.112
#> SRR1700024 3 0.5478 -0.016545 0.000 0.016 0.540 0.444
#> SRR1700025 3 0.5498 0.345930 0.048 0.272 0.680 0.000
#> SRR1700026 3 0.4740 0.497617 0.048 0.064 0.824 0.064
#> SRR1700027 3 0.4195 0.501428 0.016 0.068 0.844 0.072
#> SRR1700028 4 0.3606 0.700463 0.000 0.024 0.132 0.844
#> SRR1700029 4 0.5483 0.243871 0.000 0.016 0.448 0.536
#> SRR1700030 3 0.7016 0.251875 0.000 0.252 0.572 0.176
#> SRR1700031 3 0.3958 0.505338 0.000 0.052 0.836 0.112
#> SRR1700032 3 0.5411 0.308386 0.032 0.312 0.656 0.000
#> SRR1700034 3 0.4440 0.495565 0.068 0.028 0.836 0.068
#> SRR1700035 4 0.7792 0.292557 0.000 0.260 0.324 0.416
#> SRR1700033 3 0.3573 0.499955 0.004 0.016 0.848 0.132
#> SRR1700036 3 0.6917 0.210884 0.000 0.288 0.568 0.144
#> SRR1700037 4 0.7369 0.207189 0.000 0.408 0.160 0.432
#> SRR1700038 3 0.5493 0.418801 0.144 0.108 0.744 0.004
#> SRR1700039 3 0.5337 0.380301 0.000 0.044 0.696 0.260
#> SRR1700040 3 0.3658 0.499083 0.004 0.064 0.864 0.068
#> SRR1700041 3 0.5472 0.343363 0.000 0.044 0.676 0.280
#> SRR1700042 3 0.4323 0.459696 0.000 0.020 0.776 0.204
#> SRR1700043 3 0.5142 0.425793 0.052 0.160 0.772 0.016
#> SRR1700045 4 0.6241 0.322376 0.004 0.048 0.404 0.544
#> SRR1700044 3 0.4511 0.494924 0.068 0.028 0.832 0.072
#> SRR1700046 3 0.4449 0.484880 0.016 0.016 0.796 0.172
#> SRR1700047 3 0.7330 0.218519 0.004 0.260 0.548 0.188
#> SRR1700048 4 0.6395 0.181393 0.000 0.064 0.460 0.476
#> SRR1700049 3 0.7723 -0.130891 0.000 0.232 0.420 0.348
#> SRR1700050 4 0.5364 0.374881 0.000 0.016 0.392 0.592
#> SRR1700051 3 0.5558 0.020170 0.000 0.020 0.548 0.432
#> SRR1700052 3 0.5301 0.477787 0.032 0.040 0.768 0.160
#> SRR1700053 3 0.7725 0.047336 0.004 0.224 0.476 0.296
#> SRR1700054 3 0.5325 0.465620 0.048 0.012 0.744 0.196
#> SRR1700055 3 0.6342 0.426782 0.084 0.024 0.688 0.204
#> SRR1700056 4 0.4932 0.600670 0.000 0.032 0.240 0.728
#> SRR1700057 4 0.5573 0.555758 0.000 0.052 0.272 0.676
#> SRR1700058 3 0.4473 0.495243 0.044 0.032 0.832 0.092
#> SRR1700059 4 0.4964 0.595978 0.000 0.032 0.244 0.724
#> SRR1700060 3 0.5615 0.197159 0.000 0.032 0.612 0.356
#> SRR1700061 3 0.5137 0.495813 0.036 0.044 0.788 0.132
#> SRR1700062 4 0.4228 0.606602 0.000 0.008 0.232 0.760
#> SRR1700063 3 0.4647 0.342557 0.000 0.008 0.704 0.288
#> SRR1700064 3 0.7696 0.018296 0.004 0.224 0.484 0.288
#> SRR1700065 3 0.4652 0.479545 0.012 0.020 0.776 0.192
#> SRR1700066 3 0.5539 0.480214 0.040 0.072 0.772 0.116
#> SRR1700067 4 0.5866 0.505683 0.004 0.048 0.304 0.644
#> SRR1700068 4 0.5016 0.371215 0.000 0.004 0.396 0.600
#> SRR1700069 3 0.7410 0.122804 0.000 0.256 0.516 0.228
#> SRR1700070 3 0.3024 0.499460 0.012 0.020 0.896 0.072
#> SRR1700071 3 0.4988 0.414432 0.000 0.036 0.728 0.236
#> SRR1700072 3 0.7041 0.261338 0.028 0.084 0.596 0.292
#> SRR1700073 3 0.7971 0.034278 0.060 0.092 0.492 0.356
#> SRR1700075 3 0.6258 0.467807 0.052 0.092 0.728 0.128
#> SRR1700074 3 0.4441 0.477441 0.020 0.104 0.828 0.048
#> SRR1700076 3 0.3510 0.501391 0.028 0.008 0.868 0.096
#> SRR1700077 3 0.4474 0.495605 0.072 0.036 0.836 0.056
#> SRR1700078 3 0.6227 0.321452 0.004 0.232 0.664 0.100
#> SRR1700080 3 0.7250 0.136490 0.000 0.336 0.504 0.160
#> SRR1700079 3 0.5693 -0.112753 0.000 0.024 0.504 0.472
#> SRR1700081 3 0.5143 0.225076 0.000 0.012 0.628 0.360
#> SRR1700082 3 0.4163 0.495970 0.000 0.096 0.828 0.076
#> SRR1700083 3 0.4872 0.240457 0.000 0.004 0.640 0.356
#> SRR1700084 3 0.3697 0.489172 0.068 0.028 0.872 0.032
#> SRR1700085 4 0.7907 0.229743 0.000 0.308 0.328 0.364
#> SRR1700086 3 0.6637 0.262935 0.000 0.260 0.608 0.132
#> SRR1700087 4 0.8159 0.328630 0.080 0.228 0.132 0.560
#> SRR1700088 3 0.6910 0.345295 0.000 0.324 0.548 0.128
#> SRR1700089 4 0.7803 0.012787 0.008 0.348 0.192 0.452
#> SRR1700091 4 0.5053 0.680455 0.028 0.140 0.044 0.788
#> SRR1700090 4 0.2522 0.716854 0.012 0.016 0.052 0.920
#> SRR1700092 4 0.5757 0.582664 0.004 0.128 0.144 0.724
#> SRR1700094 4 0.7059 0.489198 0.048 0.168 0.124 0.660
#> SRR1700093 4 0.4191 0.717031 0.020 0.088 0.048 0.844
#> SRR1700095 4 0.4461 0.704001 0.048 0.092 0.028 0.832
#> SRR1700096 4 0.4541 0.647767 0.000 0.060 0.144 0.796
#> SRR1700097 4 0.3749 0.722919 0.032 0.056 0.040 0.872
#> SRR1700098 4 0.7748 0.390607 0.044 0.248 0.136 0.572
#> SRR1700099 4 0.3634 0.709883 0.008 0.104 0.028 0.860
#> SRR1700100 4 0.4502 0.685526 0.028 0.044 0.100 0.828
#> SRR1700101 4 0.4491 0.689208 0.028 0.084 0.056 0.832
#> SRR1700102 4 0.5001 0.687048 0.004 0.168 0.060 0.768
#> SRR1700104 4 0.4522 0.694492 0.024 0.108 0.044 0.824
#> SRR1700103 4 0.4283 0.624290 0.000 0.256 0.004 0.740
#> SRR1700105 4 0.3442 0.714308 0.028 0.084 0.012 0.876
#> SRR1700106 4 0.3485 0.714768 0.048 0.076 0.004 0.872
#> SRR1700107 4 0.4555 0.696231 0.064 0.068 0.036 0.832
#> SRR1700108 4 0.4813 0.691243 0.048 0.068 0.064 0.820
#> SRR1700109 4 0.3791 0.688131 0.008 0.032 0.108 0.852
#> SRR1700110 4 0.4211 0.709329 0.016 0.120 0.032 0.832
#> SRR1700112 4 0.1824 0.719938 0.000 0.004 0.060 0.936
#> SRR1700111 4 0.2611 0.709800 0.000 0.008 0.096 0.896
#> SRR1700113 4 0.4018 0.624429 0.004 0.224 0.000 0.772
#> SRR1700114 4 0.4949 0.656365 0.012 0.072 0.124 0.792
#> SRR1700115 4 0.2165 0.728208 0.008 0.032 0.024 0.936
#> SRR1700116 4 0.2165 0.730557 0.032 0.008 0.024 0.936
#> SRR1700117 4 0.2650 0.731125 0.040 0.008 0.036 0.916
#> SRR1700119 4 0.3479 0.687085 0.012 0.148 0.000 0.840
#> SRR1700118 4 0.3257 0.670266 0.000 0.004 0.152 0.844
#> SRR1700120 4 0.3200 0.718462 0.012 0.096 0.012 0.880
#> SRR1700121 4 0.4098 0.658954 0.012 0.204 0.000 0.784
#> SRR1700122 4 0.3182 0.731658 0.012 0.064 0.032 0.892
#> SRR1700123 4 0.1510 0.729071 0.016 0.028 0.000 0.956
#> SRR1700125 4 0.2949 0.715300 0.024 0.088 0.000 0.888
#> SRR1700126 4 0.4225 0.667601 0.028 0.016 0.128 0.828
#> SRR1700127 4 0.1584 0.729725 0.000 0.012 0.036 0.952
#> SRR1700124 4 0.2737 0.704056 0.000 0.008 0.104 0.888
#> SRR1700128 4 0.3668 0.728699 0.016 0.056 0.056 0.872
#> SRR1700129 4 0.1590 0.731012 0.008 0.008 0.028 0.956
#> SRR1700130 4 0.2757 0.724418 0.052 0.020 0.016 0.912
#> SRR1700132 4 0.3845 0.696642 0.016 0.132 0.012 0.840
#> SRR1700131 4 0.2809 0.734887 0.004 0.064 0.028 0.904
#> SRR1700133 4 0.2635 0.722234 0.016 0.072 0.004 0.908
#> SRR1700134 4 0.2665 0.714987 0.008 0.088 0.004 0.900
#> SRR1700135 4 0.4019 0.720186 0.008 0.068 0.076 0.848
#> SRR1700136 4 0.1994 0.732118 0.004 0.052 0.008 0.936
#> SRR1700137 4 0.3377 0.688212 0.012 0.140 0.000 0.848
#> SRR1700138 4 0.2856 0.724214 0.004 0.072 0.024 0.900
#> SRR1700140 4 0.3525 0.716897 0.000 0.100 0.040 0.860
#> SRR1700139 4 0.2382 0.722705 0.004 0.080 0.004 0.912
#> SRR1700141 4 0.1114 0.730951 0.008 0.016 0.004 0.972
#> SRR1700142 4 0.5400 0.395842 0.000 0.020 0.372 0.608
#> SRR1700143 4 0.1471 0.731815 0.004 0.024 0.012 0.960
#> SRR1700144 3 0.6421 0.099882 0.000 0.076 0.556 0.368
#> SRR1700145 4 0.2023 0.734289 0.004 0.028 0.028 0.940
#> SRR1700146 4 0.2021 0.729473 0.000 0.012 0.056 0.932
#> SRR1700147 4 0.2443 0.729882 0.000 0.060 0.024 0.916
#> SRR1700149 4 0.1509 0.732439 0.020 0.012 0.008 0.960
#> SRR1700148 4 0.2587 0.720842 0.012 0.004 0.076 0.908
#> SRR1700150 4 0.2923 0.719788 0.016 0.080 0.008 0.896
#> SRR1700152 4 0.4136 0.643991 0.016 0.196 0.000 0.788
#> SRR1700151 4 0.2266 0.713868 0.000 0.004 0.084 0.912
#> SRR1700153 4 0.2401 0.714516 0.004 0.092 0.000 0.904
#> SRR1700154 4 0.1970 0.726922 0.008 0.060 0.000 0.932
#> SRR1700155 4 0.1798 0.727450 0.016 0.040 0.000 0.944
#> SRR1700156 4 0.2255 0.723866 0.000 0.012 0.068 0.920
#> SRR1700158 4 0.2716 0.724966 0.052 0.028 0.008 0.912
#> SRR1700159 4 0.3105 0.700462 0.012 0.120 0.000 0.868
#> SRR1700157 4 0.3636 0.654967 0.000 0.008 0.172 0.820
#> SRR1700160 4 0.1824 0.730212 0.004 0.060 0.000 0.936
#> SRR1700161 4 0.2179 0.729187 0.000 0.064 0.012 0.924
#> SRR1700162 4 0.3547 0.687383 0.016 0.144 0.000 0.840
#> SRR1700164 4 0.5202 0.578433 0.228 0.016 0.024 0.732
#> SRR1700163 4 0.2400 0.731727 0.044 0.004 0.028 0.924
#> SRR1700165 4 0.2731 0.707325 0.004 0.008 0.092 0.896
#> SRR1700166 4 0.3414 0.715030 0.072 0.048 0.004 0.876
#> SRR1700168 4 0.1617 0.731933 0.024 0.008 0.012 0.956
#> SRR1700167 4 0.2631 0.729278 0.008 0.016 0.064 0.912
#> SRR1700170 4 0.1174 0.732164 0.020 0.012 0.000 0.968
#> SRR1700169 4 0.2704 0.688948 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700171 4 0.5595 0.551209 0.240 0.056 0.004 0.700
#> SRR1700172 4 0.3688 0.645622 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700174 4 0.2485 0.724277 0.016 0.064 0.004 0.916
#> SRR1700173 4 0.2474 0.726604 0.008 0.056 0.016 0.920
#> SRR1700175 4 0.1256 0.730181 0.000 0.008 0.028 0.964
#> SRR1700176 4 0.2706 0.715409 0.000 0.020 0.080 0.900
#> SRR1700178 2 0.7544 -0.022096 0.200 0.460 0.340 0.000
#> SRR1700177 4 0.1661 0.726969 0.004 0.052 0.000 0.944
#> SRR1700180 2 0.7554 0.048700 0.244 0.488 0.268 0.000
#> SRR1700179 2 0.7474 0.028944 0.212 0.496 0.292 0.000
#> SRR1700181 2 0.8590 0.039520 0.268 0.468 0.212 0.052
#> SRR1700183 1 0.0859 0.683087 0.980 0.008 0.008 0.004
#> SRR1700182 2 0.7477 0.048070 0.192 0.520 0.284 0.004
#> SRR1700184 2 0.7006 0.027443 0.136 0.536 0.328 0.000
#> SRR1700186 2 0.7638 -0.117064 0.096 0.444 0.428 0.032
#> SRR1700187 1 0.0376 0.682684 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700185 1 0.0992 0.682492 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR1700188 2 0.7030 -0.078301 0.120 0.472 0.408 0.000
#> SRR1700192 1 0.3279 0.655823 0.880 0.088 0.024 0.008
#> SRR1700190 2 0.7720 0.003691 0.216 0.472 0.308 0.004
#> SRR1700191 1 0.0592 0.680474 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700189 1 0.1007 0.683810 0.976 0.008 0.008 0.008
#> SRR1700193 2 0.7715 -0.009595 0.240 0.436 0.324 0.000
#> SRR1700195 2 0.7880 -0.033560 0.284 0.372 0.344 0.000
#> SRR1700194 1 0.0657 0.681025 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700196 2 0.7246 -0.070638 0.144 0.448 0.408 0.000
#> SRR1700197 1 0.6674 0.461170 0.648 0.176 0.168 0.008
#> SRR1700198 2 0.7516 -0.008082 0.200 0.472 0.328 0.000
#> SRR1700199 3 0.7586 0.089198 0.196 0.388 0.416 0.000
#> SRR1700200 2 0.7640 0.057733 0.252 0.468 0.280 0.000
#> SRR1700201 2 0.8397 0.049702 0.168 0.508 0.264 0.060
#> SRR1700202 1 0.1639 0.681556 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1700203 1 0.8008 0.150754 0.420 0.400 0.156 0.024
#> SRR1700204 1 0.8354 0.133419 0.412 0.296 0.272 0.020
#> SRR1700206 1 0.7876 0.033229 0.368 0.352 0.280 0.000
#> SRR1700207 2 0.7253 -0.117616 0.144 0.428 0.428 0.000
#> SRR1700208 2 0.7829 -0.071393 0.368 0.456 0.160 0.016
#> SRR1700205 1 0.2594 0.673196 0.916 0.036 0.044 0.004
#> SRR1700209 2 0.6152 0.254719 0.032 0.712 0.184 0.072
#> SRR1700210 2 0.8088 -0.031500 0.352 0.428 0.204 0.016
#> SRR1700211 1 0.4117 0.618953 0.832 0.116 0.048 0.004
#> SRR1700212 1 0.7309 0.324557 0.528 0.360 0.084 0.028
#> SRR1700213 2 0.7393 0.016676 0.152 0.492 0.352 0.004
#> SRR1700214 2 0.8068 0.002554 0.264 0.416 0.312 0.008
#> SRR1700215 1 0.1824 0.669576 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1700217 2 0.6385 0.252103 0.124 0.704 0.144 0.028
#> SRR1700216 1 0.3323 0.662918 0.876 0.064 0.060 0.000
#> SRR1700218 2 0.6492 0.137913 0.088 0.628 0.276 0.008
#> SRR1700219 2 0.6777 0.196883 0.140 0.664 0.172 0.024
#> SRR1700222 1 0.0469 0.680891 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700220 2 0.5910 0.144340 0.008 0.636 0.040 0.316
#> SRR1700221 1 0.7661 0.247958 0.480 0.392 0.088 0.040
#> SRR1700223 2 0.7669 -0.013884 0.228 0.444 0.328 0.000
#> SRR1700224 2 0.7741 -0.114865 0.368 0.500 0.064 0.068
#> SRR1700226 2 0.7211 0.122603 0.204 0.548 0.248 0.000
#> SRR1700229 2 0.7188 0.074931 0.172 0.536 0.292 0.000
#> SRR1700225 3 0.8545 0.202199 0.064 0.356 0.436 0.144
#> SRR1700227 2 0.7665 -0.052922 0.152 0.468 0.368 0.012
#> SRR1700230 1 0.2023 0.685124 0.940 0.028 0.004 0.028
#> SRR1700231 2 0.7608 -0.006163 0.184 0.472 0.340 0.004
#> SRR1700228 1 0.7955 0.108817 0.412 0.384 0.192 0.012
#> SRR1700232 2 0.7407 0.037133 0.136 0.528 0.324 0.012
#> SRR1700233 2 0.7824 0.010571 0.328 0.404 0.268 0.000
#> SRR1700234 1 0.8676 0.318633 0.472 0.300 0.144 0.084
#> SRR1700235 2 0.6648 0.002331 0.064 0.560 0.364 0.012
#> SRR1700237 2 0.7150 0.170496 0.168 0.620 0.192 0.020
#> SRR1700236 2 0.5073 0.219715 0.056 0.744 0.200 0.000
#> SRR1700238 2 0.7787 -0.044176 0.372 0.384 0.244 0.000
#> SRR1700239 1 0.1377 0.683082 0.964 0.008 0.020 0.008
#> SRR1700240 1 0.1174 0.682583 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1700241 1 0.6509 0.355828 0.584 0.068 0.008 0.340
#> SRR1700243 2 0.7417 0.126669 0.228 0.568 0.192 0.012
#> SRR1700244 2 0.6984 0.038717 0.292 0.600 0.080 0.028
#> SRR1700242 1 0.1151 0.684834 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700246 1 0.1953 0.683100 0.940 0.044 0.012 0.004
#> SRR1700245 2 0.6076 0.067828 0.036 0.608 0.344 0.012
#> SRR1700247 1 0.2489 0.665491 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1700249 1 0.2839 0.645557 0.884 0.004 0.004 0.108
#> SRR1700250 2 0.5606 0.163255 0.032 0.684 0.272 0.012
#> SRR1700248 2 0.8393 0.029911 0.256 0.460 0.252 0.032
#> SRR1700251 1 0.8556 0.126861 0.404 0.316 0.248 0.032
#> SRR1700252 2 0.7632 0.047802 0.244 0.468 0.288 0.000
#> SRR1700253 2 0.8304 -0.078954 0.156 0.408 0.396 0.040
#> SRR1700256 2 0.7517 -0.061692 0.388 0.428 0.184 0.000
#> SRR1700254 1 0.0524 0.682089 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700255 1 0.8353 0.240700 0.472 0.320 0.160 0.048
#> SRR1700257 2 0.8017 0.000304 0.332 0.440 0.216 0.012
#> SRR1700258 2 0.6277 0.178165 0.096 0.668 0.228 0.008
#> SRR1700259 2 0.5755 0.112096 0.000 0.624 0.332 0.044
#> SRR1700260 2 0.5859 0.285681 0.004 0.700 0.088 0.208
#> SRR1700261 2 0.6951 0.092485 0.000 0.556 0.140 0.304
#> SRR1700262 2 0.6946 -0.016339 0.036 0.548 0.048 0.368
#> SRR1700263 3 0.6498 0.129678 0.072 0.440 0.488 0.000
#> SRR1700264 3 0.5827 0.184230 0.032 0.436 0.532 0.000
#> SRR1700265 3 0.7146 0.270746 0.212 0.228 0.560 0.000
#> SRR1700266 2 0.4517 0.270761 0.004 0.792 0.168 0.036
#> SRR1700268 2 0.8090 -0.168425 0.404 0.404 0.168 0.024
#> SRR1700270 2 0.7588 0.024563 0.220 0.468 0.312 0.000
#> SRR1700267 2 0.6127 0.043215 0.040 0.584 0.368 0.008
#> SRR1700271 2 0.5935 -0.104418 0.000 0.496 0.468 0.036
#> SRR1700272 2 0.6898 0.046282 0.016 0.540 0.072 0.372
#> SRR1700273 2 0.5877 0.151104 0.068 0.656 0.276 0.000
#> SRR1700274 2 0.5840 0.271168 0.052 0.708 0.020 0.220
#> SRR1700277 2 0.7609 0.004604 0.192 0.484 0.320 0.004
#> SRR1700275 4 0.6140 0.293973 0.032 0.448 0.008 0.512
#> SRR1700276 4 0.6852 0.328307 0.320 0.124 0.000 0.556
#> SRR1700278 1 0.8160 0.228078 0.460 0.376 0.064 0.100
#> SRR1700279 2 0.7581 -0.057239 0.380 0.424 0.000 0.196
#> SRR1700280 2 0.7860 -0.084769 0.372 0.424 0.008 0.196
#> SRR1700281 3 0.6549 0.233607 0.088 0.356 0.556 0.000
#> SRR1700283 2 0.6665 -0.041542 0.032 0.556 0.036 0.376
#> SRR1700282 2 0.7638 -0.171305 0.404 0.416 0.004 0.176
#> SRR1700284 2 0.6885 -0.164924 0.000 0.460 0.104 0.436
#> SRR1700285 2 0.7057 -0.127064 0.016 0.472 0.076 0.436
#> SRR1700286 2 0.5369 0.310912 0.000 0.744 0.144 0.112
#> SRR1700287 2 0.7488 -0.026957 0.056 0.520 0.060 0.364
#> SRR1700290 1 0.9491 0.093610 0.356 0.328 0.168 0.148
#> SRR1700289 2 0.7577 0.032716 0.028 0.524 0.112 0.336
#> SRR1700288 2 0.7773 -0.031527 0.344 0.512 0.100 0.044
#> SRR1700292 2 0.8337 0.115537 0.152 0.532 0.072 0.244
#> SRR1700291 4 0.6084 0.574820 0.000 0.204 0.120 0.676
#> SRR1700293 1 0.6528 0.505239 0.652 0.120 0.008 0.220
#> SRR1700294 4 0.8300 0.296466 0.092 0.356 0.084 0.468
#> SRR1700295 4 0.6899 0.310197 0.024 0.396 0.056 0.524
#> SRR1700297 4 0.6753 0.257102 0.024 0.432 0.044 0.500
#> SRR1700296 2 0.8364 -0.033377 0.132 0.464 0.060 0.344
#> SRR1700298 4 0.7479 0.142433 0.020 0.436 0.104 0.440
#> SRR1700299 2 0.7253 -0.140099 0.036 0.472 0.060 0.432
#> SRR1700300 2 0.8682 -0.054220 0.220 0.400 0.044 0.336
#> SRR1700302 4 0.6588 0.265560 0.004 0.420 0.068 0.508
#> SRR1700301 2 0.7087 -0.143662 0.008 0.464 0.096 0.432
#> SRR1700303 4 0.6450 0.342702 0.012 0.388 0.048 0.552
#> SRR1700304 1 0.4215 0.631108 0.824 0.104 0.000 0.072
#> SRR1700305 1 0.8753 0.085680 0.396 0.248 0.044 0.312
#> SRR1700306 2 0.8510 -0.071463 0.084 0.452 0.112 0.352
#> SRR1700308 2 0.7170 0.251133 0.012 0.584 0.264 0.140
#> SRR1700307 4 0.8929 0.252276 0.076 0.280 0.204 0.440
#> SRR1700309 2 0.8927 0.122987 0.064 0.412 0.300 0.224
#> SRR1700310 4 0.7622 0.265011 0.028 0.396 0.104 0.472
#> SRR1700311 4 0.8488 0.283459 0.076 0.352 0.120 0.452
#> SRR1700312 2 0.7460 -0.060466 0.024 0.500 0.100 0.376
#> SRR1700313 4 0.8811 0.307782 0.128 0.104 0.316 0.452
#> SRR1700314 4 0.6678 0.264605 0.000 0.412 0.088 0.500
#> SRR1700315 2 0.8905 -0.097613 0.056 0.392 0.240 0.312
#> SRR1700316 2 0.6452 -0.208206 0.000 0.468 0.068 0.464
#> SRR1700317 2 0.7268 0.220193 0.072 0.612 0.256 0.060
#> SRR1700318 2 0.8549 0.030448 0.320 0.404 0.032 0.244
#> SRR1700319 4 0.6756 0.300957 0.008 0.408 0.072 0.512
#> SRR1700320 2 0.7404 -0.137204 0.008 0.448 0.128 0.416
#> SRR1700322 4 0.7597 0.243174 0.308 0.224 0.000 0.468
#> SRR1700321 2 0.6873 -0.016178 0.008 0.524 0.084 0.384
#> SRR1700323 4 0.6703 0.519723 0.000 0.232 0.156 0.612
#> SRR1700324 4 0.7664 0.398681 0.064 0.308 0.076 0.552
#> SRR1700325 2 0.7293 0.198692 0.136 0.608 0.028 0.228
#> SRR1700326 4 0.7590 0.344273 0.272 0.248 0.000 0.480
#> SRR1700327 2 0.6674 0.203677 0.004 0.616 0.120 0.260
#> SRR1700329 2 0.6768 -0.111362 0.008 0.504 0.072 0.416
#> SRR1700328 1 0.6564 0.518409 0.648 0.192 0.156 0.004
#> SRR1700330 1 0.8147 0.124558 0.400 0.348 0.012 0.240
#> SRR1700331 2 0.7857 0.085782 0.020 0.516 0.188 0.276
#> SRR1700332 4 0.6618 0.183301 0.004 0.460 0.068 0.468
#> SRR1700333 1 0.8305 0.223412 0.480 0.200 0.036 0.284
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.471 0.6868 0.032 0.768 0.044 0.004 0.152
#> SRR1699875 2 0.447 0.6684 0.008 0.756 0.180 0.000 0.056
#> SRR1699876 5 0.310 0.7185 0.000 0.100 0.012 0.024 0.864
#> SRR1699877 2 0.543 0.6822 0.060 0.720 0.152 0.000 0.068
#> SRR1699879 2 0.499 0.5217 0.000 0.648 0.044 0.004 0.304
#> SRR1699878 2 0.593 0.6141 0.020 0.648 0.156 0.000 0.176
#> SRR1699880 2 0.397 0.7064 0.004 0.820 0.120 0.024 0.032
#> SRR1699881 2 0.475 0.7075 0.008 0.780 0.052 0.036 0.124
#> SRR1699882 5 0.579 0.2318 0.028 0.404 0.020 0.012 0.536
#> SRR1699883 2 0.526 0.6277 0.024 0.708 0.048 0.008 0.212
#> SRR1699884 2 0.560 0.7079 0.108 0.724 0.120 0.012 0.036
#> SRR1699885 2 0.388 0.7004 0.012 0.824 0.124 0.012 0.028
#> SRR1699886 5 0.476 0.6544 0.036 0.164 0.036 0.004 0.760
#> SRR1699888 2 0.727 0.2634 0.036 0.488 0.076 0.356 0.044
#> SRR1699889 5 0.273 0.7360 0.000 0.048 0.016 0.040 0.896
#> SRR1699890 5 0.545 0.6149 0.172 0.104 0.012 0.008 0.704
#> SRR1699887 5 0.471 0.6547 0.016 0.160 0.060 0.004 0.760
#> SRR1699891 5 0.303 0.7346 0.020 0.032 0.020 0.036 0.892
#> SRR1699892 5 0.578 0.0283 0.020 0.460 0.036 0.004 0.480
#> SRR1699893 5 0.468 0.5666 0.000 0.020 0.016 0.272 0.692
#> SRR1699894 5 0.331 0.7307 0.012 0.024 0.004 0.104 0.856
#> SRR1699895 5 0.381 0.7260 0.012 0.040 0.008 0.108 0.832
#> SRR1699896 5 0.686 0.3397 0.040 0.316 0.116 0.004 0.524
#> SRR1699897 5 0.571 0.5244 0.016 0.236 0.088 0.004 0.656
#> SRR1699898 4 0.613 0.6657 0.004 0.056 0.080 0.656 0.204
#> SRR1699900 3 0.776 0.1360 0.056 0.280 0.344 0.000 0.320
#> SRR1699899 5 0.259 0.7148 0.004 0.076 0.020 0.004 0.896
#> SRR1699902 3 0.498 0.6428 0.020 0.104 0.760 0.008 0.108
#> SRR1699901 5 0.904 -0.0532 0.060 0.088 0.280 0.280 0.292
#> SRR1699903 5 0.258 0.7330 0.016 0.024 0.016 0.032 0.912
#> SRR1699904 5 0.464 0.6840 0.028 0.004 0.036 0.168 0.764
#> SRR1699905 5 0.744 0.0546 0.408 0.020 0.064 0.088 0.420
#> SRR1699906 5 0.267 0.7255 0.004 0.060 0.020 0.016 0.900
#> SRR1699907 5 0.250 0.7190 0.056 0.012 0.004 0.020 0.908
#> SRR1699908 5 0.246 0.7309 0.004 0.008 0.008 0.080 0.900
#> SRR1699909 5 0.565 0.6893 0.008 0.076 0.104 0.084 0.728
#> SRR1699910 5 0.270 0.7271 0.004 0.008 0.028 0.064 0.896
#> SRR1699911 5 0.601 0.5874 0.148 0.032 0.136 0.008 0.676
#> SRR1699912 5 0.280 0.7251 0.004 0.004 0.024 0.084 0.884
#> SRR1699913 5 0.441 0.6940 0.004 0.032 0.016 0.180 0.768
#> SRR1699914 5 0.541 0.6992 0.020 0.040 0.112 0.080 0.748
#> SRR1699915 5 0.429 0.7035 0.016 0.004 0.092 0.084 0.804
#> SRR1699916 4 0.787 0.4468 0.024 0.072 0.180 0.504 0.220
#> SRR1699917 4 0.661 0.4036 0.004 0.000 0.288 0.488 0.220
#> SRR1699918 4 0.697 0.3889 0.040 0.008 0.276 0.544 0.132
#> SRR1699919 5 0.221 0.7275 0.004 0.004 0.024 0.048 0.920
#> SRR1699920 5 0.250 0.7293 0.008 0.012 0.024 0.044 0.912
#> SRR1699921 5 0.287 0.7234 0.008 0.004 0.064 0.036 0.888
#> SRR1699922 5 0.480 0.6712 0.120 0.056 0.032 0.012 0.780
#> SRR1699923 5 0.797 0.2677 0.184 0.108 0.256 0.004 0.448
#> SRR1699924 3 0.628 0.3104 0.004 0.032 0.536 0.364 0.064
#> SRR1699925 1 0.450 0.7236 0.796 0.044 0.044 0.004 0.112
#> SRR1699926 5 0.313 0.7320 0.032 0.020 0.024 0.036 0.888
#> SRR1699927 5 0.242 0.7275 0.000 0.004 0.028 0.064 0.904
#> SRR1699929 5 0.589 0.5864 0.044 0.220 0.068 0.004 0.664
#> SRR1699928 5 0.211 0.7268 0.008 0.004 0.028 0.032 0.928
#> SRR1699930 5 0.220 0.7282 0.020 0.020 0.008 0.024 0.928
#> SRR1699931 5 0.676 0.2316 0.044 0.364 0.088 0.004 0.500
#> SRR1699933 5 0.766 0.1856 0.028 0.232 0.276 0.020 0.444
#> SRR1699932 5 0.215 0.7313 0.000 0.028 0.012 0.036 0.924
#> SRR1699934 1 0.325 0.7649 0.876 0.008 0.028 0.028 0.060
#> SRR1699935 4 0.571 0.6666 0.008 0.048 0.040 0.672 0.232
#> SRR1699936 2 0.621 0.5730 0.004 0.652 0.048 0.192 0.104
#> SRR1699937 2 0.336 0.7063 0.016 0.856 0.100 0.024 0.004
#> SRR1699938 2 0.333 0.7194 0.012 0.876 0.036 0.032 0.044
#> SRR1699940 2 0.619 0.6175 0.008 0.656 0.088 0.048 0.200
#> SRR1699939 2 0.504 0.4768 0.004 0.640 0.028 0.008 0.320
#> SRR1699941 2 0.464 0.6775 0.012 0.756 0.160 0.000 0.072
#> SRR1699942 2 0.581 0.1637 0.008 0.476 0.448 0.068 0.000
#> SRR1699943 2 0.305 0.7128 0.020 0.876 0.076 0.028 0.000
#> SRR1699944 2 0.401 0.7044 0.004 0.816 0.044 0.016 0.120
#> SRR1699945 2 0.527 0.5648 0.004 0.660 0.040 0.016 0.280
#> SRR1699946 2 0.354 0.7218 0.016 0.860 0.068 0.012 0.044
#> SRR1699947 2 0.469 0.6544 0.016 0.744 0.188 0.000 0.052
#> SRR1699948 2 0.495 0.5867 0.016 0.692 0.252 0.040 0.000
#> SRR1699949 5 0.626 0.3200 0.004 0.356 0.024 0.076 0.540
#> SRR1699950 2 0.528 0.3297 0.004 0.580 0.020 0.016 0.380
#> SRR1699951 2 0.646 0.5305 0.000 0.612 0.052 0.216 0.120
#> SRR1699952 2 0.412 0.6611 0.016 0.780 0.184 0.012 0.008
#> SRR1699953 2 0.434 0.6927 0.004 0.796 0.044 0.024 0.132
#> SRR1699954 2 0.631 0.4080 0.152 0.516 0.328 0.000 0.004
#> SRR1699955 2 0.342 0.7072 0.000 0.856 0.024 0.084 0.036
#> SRR1699956 2 0.520 0.4026 0.000 0.600 0.032 0.012 0.356
#> SRR1699957 2 0.531 0.6208 0.008 0.676 0.088 0.000 0.228
#> SRR1699959 2 0.701 0.3238 0.004 0.516 0.268 0.184 0.028
#> SRR1699958 4 0.427 0.6902 0.016 0.168 0.012 0.784 0.020
#> SRR1699960 4 0.666 0.2751 0.008 0.320 0.168 0.500 0.004
#> SRR1699961 2 0.450 0.5891 0.004 0.712 0.256 0.024 0.004
#> SRR1699962 2 0.588 0.5766 0.012 0.648 0.256 0.032 0.052
#> SRR1699963 3 0.695 0.1715 0.004 0.340 0.356 0.300 0.000
#> SRR1699964 2 0.517 0.6551 0.032 0.724 0.200 0.028 0.016
#> SRR1699965 2 0.374 0.7199 0.008 0.852 0.044 0.040 0.056
#> SRR1699966 2 0.748 -0.0488 0.012 0.400 0.032 0.176 0.380
#> SRR1699967 2 0.446 0.6820 0.020 0.780 0.160 0.028 0.012
#> SRR1699968 5 0.603 0.5218 0.004 0.192 0.184 0.004 0.616
#> SRR1699969 5 0.441 0.6789 0.000 0.160 0.032 0.032 0.776
#> SRR1699971 2 0.418 0.6949 0.016 0.800 0.124 0.060 0.000
#> SRR1699970 2 0.481 0.4904 0.016 0.636 0.336 0.000 0.012
#> SRR1699972 2 0.491 0.3945 0.012 0.596 0.380 0.004 0.008
#> SRR1699973 4 0.657 0.4795 0.008 0.224 0.160 0.588 0.020
#> SRR1699974 3 0.657 0.0499 0.076 0.412 0.476 0.012 0.024
#> SRR1699975 5 0.290 0.7088 0.000 0.096 0.028 0.004 0.872
#> SRR1699976 2 0.502 0.6013 0.012 0.696 0.236 0.000 0.056
#> SRR1699977 3 0.725 0.4744 0.004 0.188 0.496 0.272 0.040
#> SRR1699978 4 0.559 0.5207 0.060 0.012 0.276 0.644 0.008
#> SRR1699979 4 0.732 0.3622 0.000 0.164 0.256 0.508 0.072
#> SRR1699980 5 0.493 0.6444 0.004 0.048 0.176 0.028 0.744
#> SRR1699981 5 0.307 0.7350 0.004 0.016 0.016 0.092 0.872
#> SRR1699982 5 0.300 0.7217 0.004 0.000 0.076 0.048 0.872
#> SRR1699983 5 0.291 0.7280 0.000 0.012 0.060 0.044 0.884
#> SRR1699984 1 0.651 0.0883 0.452 0.024 0.432 0.004 0.088
#> SRR1699985 3 0.737 0.4448 0.004 0.112 0.512 0.092 0.280
#> SRR1699986 1 0.848 0.1819 0.364 0.096 0.216 0.020 0.304
#> SRR1699988 5 0.619 0.6026 0.032 0.208 0.076 0.024 0.660
#> SRR1699987 4 0.653 0.4491 0.008 0.132 0.016 0.564 0.280
#> SRR1699989 5 0.362 0.7244 0.000 0.092 0.028 0.036 0.844
#> SRR1699990 5 0.429 0.6930 0.004 0.152 0.016 0.040 0.788
#> SRR1699992 2 0.502 0.6276 0.040 0.708 0.224 0.000 0.028
#> SRR1699991 3 0.471 0.5893 0.004 0.040 0.712 0.240 0.004
#> SRR1699993 5 0.541 0.6646 0.076 0.028 0.012 0.156 0.728
#> SRR1699994 3 0.650 0.4976 0.044 0.236 0.596 0.000 0.124
#> SRR1699995 3 0.421 0.6428 0.004 0.012 0.800 0.128 0.056
#> SRR1699996 2 0.711 0.3923 0.200 0.492 0.272 0.000 0.036
#> SRR1699997 4 0.410 0.7743 0.000 0.016 0.032 0.788 0.164
#> SRR1699998 2 0.628 0.6099 0.032 0.636 0.184 0.004 0.144
#> SRR1699999 3 0.658 0.4308 0.232 0.124 0.604 0.020 0.020
#> SRR1700000 2 0.706 0.5380 0.136 0.564 0.228 0.004 0.068
#> SRR1700002 2 0.548 0.6480 0.028 0.704 0.156 0.112 0.000
#> SRR1700001 2 0.640 0.1992 0.020 0.500 0.036 0.036 0.408
#> SRR1700003 4 0.630 0.4710 0.012 0.116 0.244 0.612 0.016
#> SRR1700004 5 0.390 0.6957 0.008 0.124 0.040 0.008 0.820
#> SRR1700005 1 0.557 0.6204 0.700 0.020 0.196 0.068 0.016
#> SRR1700006 2 0.497 0.5845 0.016 0.696 0.256 0.016 0.016
#> SRR1700007 5 0.462 0.6923 0.008 0.044 0.020 0.156 0.772
#> SRR1700008 4 0.496 0.7390 0.012 0.000 0.144 0.736 0.108
#> SRR1700009 1 0.726 0.2349 0.484 0.016 0.032 0.328 0.140
#> SRR1700010 2 0.484 0.6243 0.000 0.712 0.036 0.020 0.232
#> SRR1700011 2 0.734 0.0703 0.004 0.400 0.176 0.384 0.036
#> SRR1700013 4 0.703 0.2945 0.040 0.208 0.228 0.524 0.000
#> SRR1700012 3 0.454 0.6156 0.012 0.184 0.760 0.008 0.036
#> SRR1700014 3 0.380 0.6807 0.000 0.028 0.836 0.084 0.052
#> SRR1700015 3 0.524 0.0196 0.012 0.460 0.508 0.016 0.004
#> SRR1700016 3 0.608 0.3430 0.260 0.004 0.580 0.000 0.156
#> SRR1700018 3 0.490 0.3890 0.004 0.316 0.644 0.036 0.000
#> SRR1700017 3 0.417 0.6442 0.004 0.160 0.780 0.056 0.000
#> SRR1700019 5 0.327 0.7155 0.012 0.080 0.032 0.008 0.868
#> SRR1700020 3 0.504 0.4122 0.000 0.012 0.628 0.332 0.028
#> SRR1700021 5 0.772 0.1096 0.064 0.008 0.344 0.164 0.420
#> SRR1700023 3 0.734 0.1504 0.008 0.292 0.380 0.012 0.308
#> SRR1700022 3 0.527 0.5427 0.004 0.232 0.672 0.092 0.000
#> SRR1700024 3 0.415 0.6171 0.004 0.004 0.772 0.188 0.032
#> SRR1700025 3 0.540 -0.0714 0.036 0.468 0.488 0.004 0.004
#> SRR1700026 3 0.438 0.6088 0.024 0.192 0.760 0.024 0.000
#> SRR1700027 3 0.456 0.6006 0.012 0.200 0.748 0.036 0.004
#> SRR1700028 4 0.593 0.6879 0.016 0.016 0.188 0.672 0.108
#> SRR1700029 3 0.511 0.3910 0.004 0.024 0.628 0.332 0.012
#> SRR1700030 3 0.543 0.1919 0.004 0.024 0.544 0.016 0.412
#> SRR1700031 3 0.377 0.6733 0.000 0.108 0.824 0.060 0.008
#> SRR1700032 2 0.574 0.3514 0.020 0.560 0.368 0.000 0.052
#> SRR1700034 3 0.369 0.6716 0.020 0.092 0.848 0.020 0.020
#> SRR1700035 5 0.575 0.4969 0.008 0.008 0.284 0.076 0.624
#> SRR1700033 3 0.405 0.6726 0.004 0.128 0.804 0.060 0.004
#> SRR1700036 5 0.563 0.0643 0.008 0.044 0.468 0.004 0.476
#> SRR1700037 5 0.385 0.7215 0.012 0.008 0.064 0.080 0.836
#> SRR1700038 3 0.729 0.3737 0.096 0.276 0.512 0.000 0.116
#> SRR1700039 3 0.405 0.6652 0.004 0.024 0.824 0.092 0.056
#> SRR1700040 3 0.450 0.6381 0.004 0.180 0.764 0.020 0.032
#> SRR1700041 3 0.556 0.6637 0.008 0.076 0.732 0.068 0.116
#> SRR1700042 3 0.361 0.6843 0.004 0.056 0.856 0.052 0.032
#> SRR1700043 3 0.578 0.5649 0.032 0.104 0.672 0.000 0.192
#> SRR1700045 3 0.768 -0.0187 0.012 0.088 0.400 0.396 0.104
#> SRR1700044 3 0.358 0.6640 0.040 0.060 0.860 0.008 0.032
#> SRR1700046 3 0.343 0.6803 0.008 0.064 0.864 0.048 0.016
#> SRR1700047 5 0.580 0.1856 0.016 0.032 0.420 0.012 0.520
#> SRR1700048 3 0.615 0.5149 0.012 0.000 0.604 0.212 0.172
#> SRR1700049 5 0.656 0.0895 0.004 0.024 0.400 0.096 0.476
#> SRR1700050 3 0.567 0.2093 0.004 0.004 0.540 0.392 0.060
#> SRR1700051 3 0.360 0.6258 0.000 0.000 0.796 0.180 0.024
#> SRR1700052 3 0.374 0.6738 0.016 0.040 0.856 0.040 0.048
#> SRR1700053 3 0.567 0.1444 0.004 0.016 0.520 0.036 0.424
#> SRR1700054 3 0.366 0.6713 0.020 0.052 0.848 0.076 0.004
#> SRR1700055 3 0.336 0.6591 0.020 0.016 0.868 0.076 0.020
#> SRR1700056 4 0.598 0.4120 0.000 0.008 0.352 0.544 0.096
#> SRR1700057 4 0.680 0.1700 0.000 0.004 0.372 0.396 0.228
#> SRR1700058 3 0.443 0.6600 0.032 0.132 0.796 0.012 0.028
#> SRR1700059 4 0.618 0.3970 0.000 0.000 0.332 0.516 0.152
#> SRR1700060 3 0.358 0.6702 0.000 0.016 0.844 0.088 0.052
#> SRR1700061 3 0.466 0.6584 0.020 0.160 0.772 0.028 0.020
#> SRR1700062 4 0.546 0.5399 0.008 0.008 0.296 0.636 0.052
#> SRR1700063 3 0.381 0.6703 0.000 0.056 0.820 0.116 0.008
#> SRR1700064 3 0.550 0.1108 0.012 0.000 0.520 0.040 0.428
#> SRR1700065 3 0.347 0.6807 0.004 0.084 0.852 0.052 0.008
#> SRR1700066 3 0.479 0.6334 0.032 0.064 0.772 0.004 0.128
#> SRR1700067 3 0.684 0.0882 0.020 0.000 0.452 0.364 0.164
#> SRR1700068 3 0.530 0.1930 0.000 0.004 0.556 0.396 0.044
#> SRR1700069 5 0.533 0.1476 0.000 0.016 0.448 0.024 0.512
#> SRR1700070 3 0.329 0.6722 0.000 0.104 0.852 0.008 0.036
#> SRR1700071 3 0.354 0.6808 0.000 0.040 0.856 0.052 0.052
#> SRR1700072 3 0.385 0.6487 0.012 0.000 0.824 0.068 0.096
#> SRR1700073 3 0.544 0.5579 0.044 0.000 0.700 0.060 0.196
#> SRR1700075 3 0.495 0.6529 0.024 0.120 0.764 0.008 0.084
#> SRR1700074 3 0.603 0.4404 0.020 0.304 0.608 0.044 0.024
#> SRR1700076 3 0.290 0.6734 0.012 0.072 0.888 0.016 0.012
#> SRR1700077 3 0.424 0.6515 0.044 0.128 0.804 0.012 0.012
#> SRR1700078 3 0.576 0.4369 0.008 0.064 0.616 0.012 0.300
#> SRR1700080 5 0.575 0.2122 0.004 0.048 0.412 0.012 0.524
#> SRR1700079 3 0.499 0.5233 0.004 0.000 0.684 0.248 0.064
#> SRR1700081 3 0.486 0.6168 0.004 0.040 0.724 0.216 0.016
#> SRR1700082 3 0.491 0.5835 0.000 0.236 0.700 0.056 0.008
#> SRR1700083 3 0.395 0.6394 0.000 0.008 0.780 0.188 0.024
#> SRR1700084 3 0.410 0.6463 0.048 0.112 0.812 0.000 0.028
#> SRR1700085 5 0.543 0.4511 0.004 0.008 0.300 0.056 0.632
#> SRR1700086 3 0.529 0.2139 0.000 0.036 0.556 0.008 0.400
#> SRR1700087 4 0.479 0.6469 0.028 0.184 0.036 0.748 0.004
#> SRR1700088 2 0.646 0.0595 0.004 0.444 0.396 0.156 0.000
#> SRR1700089 4 0.598 0.2797 0.012 0.376 0.048 0.548 0.016
#> SRR1700091 4 0.420 0.7264 0.036 0.112 0.016 0.816 0.020
#> SRR1700090 4 0.248 0.7839 0.008 0.012 0.048 0.912 0.020
#> SRR1700092 4 0.422 0.7055 0.008 0.120 0.080 0.792 0.000
#> SRR1700094 4 0.418 0.7003 0.020 0.140 0.044 0.796 0.000
#> SRR1700093 4 0.294 0.7493 0.004 0.116 0.012 0.864 0.004
#> SRR1700095 4 0.316 0.7599 0.032 0.072 0.024 0.872 0.000
#> SRR1700096 4 0.425 0.7147 0.008 0.088 0.100 0.800 0.004
#> SRR1700097 4 0.334 0.7813 0.032 0.048 0.016 0.876 0.028
#> SRR1700098 4 0.567 0.5800 0.032 0.232 0.048 0.676 0.012
#> SRR1700099 4 0.298 0.7536 0.012 0.092 0.012 0.876 0.008
#> SRR1700100 4 0.379 0.7479 0.020 0.052 0.096 0.832 0.000
#> SRR1700101 4 0.294 0.7540 0.012 0.072 0.028 0.884 0.004
#> SRR1700102 4 0.472 0.7511 0.008 0.088 0.052 0.792 0.060
#> SRR1700104 4 0.313 0.7550 0.016 0.080 0.016 0.876 0.012
#> SRR1700103 4 0.575 0.6564 0.008 0.084 0.028 0.684 0.196
#> SRR1700105 4 0.338 0.7574 0.028 0.072 0.016 0.868 0.016
#> SRR1700106 4 0.351 0.7918 0.036 0.016 0.012 0.860 0.076
#> SRR1700107 4 0.305 0.7671 0.028 0.052 0.020 0.888 0.012
#> SRR1700108 4 0.300 0.7624 0.032 0.048 0.028 0.888 0.004
#> SRR1700109 4 0.340 0.7420 0.008 0.036 0.112 0.844 0.000
#> SRR1700110 4 0.269 0.7643 0.020 0.060 0.012 0.900 0.008
#> SRR1700112 4 0.251 0.7791 0.008 0.004 0.076 0.900 0.012
#> SRR1700111 4 0.439 0.7547 0.008 0.000 0.140 0.776 0.076
#> SRR1700113 4 0.538 0.6225 0.012 0.028 0.024 0.668 0.268
#> SRR1700114 4 0.424 0.7217 0.016 0.060 0.116 0.804 0.004
#> SRR1700115 4 0.205 0.7830 0.004 0.032 0.020 0.932 0.012
#> SRR1700116 4 0.283 0.7919 0.012 0.008 0.020 0.892 0.068
#> SRR1700117 4 0.382 0.7829 0.040 0.004 0.068 0.844 0.044
#> SRR1700119 4 0.445 0.7608 0.012 0.040 0.020 0.792 0.136
#> SRR1700118 4 0.373 0.7167 0.000 0.000 0.176 0.792 0.032
#> SRR1700120 4 0.321 0.7838 0.020 0.036 0.024 0.884 0.036
#> SRR1700121 4 0.480 0.7252 0.012 0.032 0.020 0.748 0.188
#> SRR1700122 4 0.406 0.7683 0.008 0.000 0.052 0.796 0.144
#> SRR1700123 4 0.295 0.7957 0.016 0.012 0.028 0.892 0.052
#> SRR1700125 4 0.362 0.7789 0.020 0.008 0.008 0.828 0.136
#> SRR1700126 4 0.357 0.7259 0.016 0.016 0.132 0.832 0.004
#> SRR1700127 4 0.296 0.7871 0.008 0.012 0.060 0.888 0.032
#> SRR1700124 4 0.380 0.7657 0.000 0.012 0.112 0.824 0.052
#> SRR1700128 4 0.533 0.7301 0.016 0.000 0.112 0.704 0.168
#> SRR1700129 4 0.275 0.7862 0.004 0.000 0.048 0.888 0.060
#> SRR1700130 4 0.230 0.7866 0.012 0.004 0.040 0.920 0.024
#> SRR1700132 4 0.529 0.5932 0.016 0.000 0.048 0.648 0.288
#> SRR1700131 4 0.326 0.7986 0.024 0.004 0.032 0.872 0.068
#> SRR1700133 4 0.333 0.7861 0.016 0.004 0.016 0.852 0.112
#> SRR1700134 4 0.399 0.7485 0.012 0.000 0.024 0.784 0.180
#> SRR1700135 4 0.567 0.6832 0.020 0.000 0.116 0.672 0.192
#> SRR1700136 4 0.282 0.7946 0.000 0.024 0.012 0.884 0.080
#> SRR1700137 4 0.469 0.7043 0.004 0.016 0.028 0.728 0.224
#> SRR1700138 4 0.442 0.6758 0.000 0.000 0.040 0.716 0.244
#> SRR1700140 4 0.449 0.7372 0.000 0.004 0.056 0.744 0.196
#> SRR1700139 4 0.381 0.7662 0.012 0.004 0.016 0.804 0.164
#> SRR1700141 4 0.265 0.7903 0.004 0.004 0.020 0.892 0.080
#> SRR1700142 3 0.491 0.2756 0.000 0.000 0.588 0.380 0.032
#> SRR1700143 4 0.268 0.7953 0.004 0.008 0.024 0.896 0.068
#> SRR1700144 3 0.576 0.6059 0.008 0.024 0.684 0.096 0.188
#> SRR1700145 4 0.374 0.7854 0.008 0.004 0.080 0.836 0.072
#> SRR1700146 4 0.407 0.7754 0.004 0.000 0.096 0.800 0.100
#> SRR1700147 4 0.430 0.7683 0.020 0.000 0.044 0.784 0.152
#> SRR1700149 4 0.259 0.7931 0.008 0.004 0.020 0.900 0.068
#> SRR1700148 4 0.467 0.7425 0.008 0.000 0.136 0.756 0.100
#> SRR1700150 4 0.393 0.7582 0.012 0.008 0.016 0.800 0.164
#> SRR1700152 4 0.448 0.7060 0.008 0.020 0.012 0.744 0.216
#> SRR1700151 4 0.454 0.7447 0.004 0.000 0.140 0.760 0.096
#> SRR1700153 4 0.343 0.7711 0.000 0.012 0.012 0.824 0.152
#> SRR1700154 4 0.264 0.7956 0.008 0.008 0.012 0.896 0.076
#> SRR1700155 4 0.313 0.7902 0.008 0.008 0.020 0.868 0.096
#> SRR1700156 4 0.380 0.7765 0.008 0.000 0.100 0.824 0.068
#> SRR1700158 4 0.254 0.7927 0.024 0.000 0.016 0.904 0.056
#> SRR1700159 4 0.395 0.7532 0.008 0.012 0.012 0.792 0.176
#> SRR1700157 4 0.513 0.6222 0.000 0.004 0.252 0.672 0.072
#> SRR1700160 4 0.313 0.7987 0.008 0.016 0.016 0.872 0.088
#> SRR1700161 4 0.315 0.7862 0.000 0.008 0.020 0.852 0.120
#> SRR1700162 4 0.459 0.6776 0.016 0.000 0.024 0.716 0.244
#> SRR1700164 4 0.428 0.7426 0.140 0.004 0.032 0.796 0.028
#> SRR1700163 4 0.325 0.7909 0.012 0.000 0.052 0.864 0.072
#> SRR1700165 4 0.318 0.7577 0.008 0.028 0.096 0.864 0.004
#> SRR1700166 4 0.282 0.7908 0.036 0.012 0.016 0.900 0.036
#> SRR1700168 4 0.324 0.7898 0.032 0.000 0.044 0.872 0.052
#> SRR1700167 4 0.464 0.7509 0.008 0.000 0.112 0.760 0.120
#> SRR1700170 4 0.330 0.7951 0.016 0.004 0.044 0.868 0.068
#> SRR1700169 4 0.364 0.7356 0.004 0.004 0.152 0.816 0.024
#> SRR1700171 4 0.509 0.6877 0.176 0.028 0.012 0.740 0.044
#> SRR1700172 4 0.560 0.5809 0.016 0.036 0.020 0.648 0.280
#> SRR1700174 4 0.287 0.7892 0.008 0.048 0.008 0.892 0.044
#> SRR1700173 4 0.195 0.7859 0.004 0.032 0.012 0.936 0.016
#> SRR1700175 4 0.268 0.7922 0.004 0.004 0.036 0.896 0.060
#> SRR1700176 4 0.321 0.7696 0.000 0.036 0.076 0.868 0.020
#> SRR1700178 2 0.393 0.7030 0.092 0.828 0.036 0.044 0.000
#> SRR1700177 4 0.303 0.7812 0.000 0.008 0.008 0.848 0.136
#> SRR1700180 2 0.381 0.7030 0.120 0.828 0.008 0.032 0.012
#> SRR1700179 2 0.280 0.7055 0.060 0.888 0.008 0.044 0.000
#> SRR1700181 2 0.538 0.5998 0.132 0.696 0.012 0.160 0.000
#> SRR1700183 1 0.224 0.7777 0.924 0.028 0.008 0.032 0.008
#> SRR1700182 2 0.345 0.6970 0.084 0.848 0.000 0.060 0.008
#> SRR1700184 2 0.262 0.7078 0.052 0.900 0.004 0.040 0.004
#> SRR1700186 2 0.436 0.6985 0.040 0.804 0.072 0.084 0.000
#> SRR1700187 1 0.203 0.7788 0.932 0.028 0.008 0.028 0.004
#> SRR1700185 1 0.231 0.7710 0.920 0.004 0.032 0.012 0.032
#> SRR1700188 2 0.323 0.7113 0.056 0.868 0.060 0.016 0.000
#> SRR1700192 1 0.450 0.6310 0.760 0.180 0.008 0.048 0.004
#> SRR1700190 2 0.390 0.7126 0.084 0.832 0.040 0.044 0.000
#> SRR1700191 1 0.170 0.7778 0.948 0.012 0.020 0.012 0.008
#> SRR1700189 1 0.206 0.7787 0.932 0.016 0.020 0.028 0.004
#> SRR1700193 2 0.451 0.6827 0.184 0.760 0.040 0.008 0.008
#> SRR1700195 2 0.481 0.6425 0.228 0.716 0.044 0.008 0.004
#> SRR1700194 1 0.242 0.7800 0.916 0.020 0.024 0.036 0.004
#> SRR1700196 2 0.362 0.7082 0.072 0.844 0.072 0.008 0.004
#> SRR1700197 1 0.582 0.3251 0.600 0.316 0.040 0.044 0.000
#> SRR1700198 2 0.391 0.7028 0.108 0.824 0.032 0.036 0.000
#> SRR1700199 2 0.548 0.6692 0.156 0.692 0.136 0.000 0.016
#> SRR1700200 2 0.468 0.6880 0.148 0.776 0.016 0.040 0.020
#> SRR1700201 2 0.405 0.6742 0.072 0.808 0.004 0.112 0.004
#> SRR1700202 1 0.353 0.7592 0.844 0.028 0.024 0.104 0.000
#> SRR1700203 2 0.585 0.5411 0.268 0.628 0.016 0.084 0.004
#> SRR1700204 2 0.644 0.4144 0.380 0.516 0.068 0.020 0.016
#> SRR1700206 2 0.505 0.5863 0.284 0.668 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700207 2 0.514 0.6889 0.104 0.752 0.084 0.060 0.000
#> SRR1700208 2 0.550 0.5930 0.232 0.676 0.008 0.072 0.012
#> SRR1700205 1 0.395 0.7244 0.820 0.128 0.020 0.016 0.016
#> SRR1700209 2 0.651 0.3741 0.040 0.560 0.040 0.028 0.332
#> SRR1700210 2 0.638 0.4886 0.312 0.576 0.012 0.032 0.068
#> SRR1700211 1 0.460 0.5473 0.716 0.240 0.008 0.036 0.000
#> SRR1700212 2 0.608 0.3456 0.384 0.536 0.008 0.044 0.028
#> SRR1700213 2 0.504 0.7234 0.076 0.784 0.064 0.040 0.036
#> SRR1700214 2 0.483 0.6641 0.192 0.740 0.044 0.020 0.004
#> SRR1700215 1 0.313 0.7572 0.868 0.020 0.008 0.096 0.008
#> SRR1700217 2 0.635 0.5360 0.148 0.620 0.012 0.016 0.204
#> SRR1700216 1 0.358 0.7507 0.852 0.032 0.056 0.000 0.060
#> SRR1700218 2 0.419 0.7045 0.024 0.824 0.024 0.032 0.096
#> SRR1700219 2 0.516 0.6771 0.068 0.768 0.012 0.080 0.072
#> SRR1700222 1 0.198 0.7760 0.936 0.024 0.016 0.004 0.020
#> SRR1700220 5 0.767 0.4269 0.028 0.252 0.028 0.220 0.472
#> SRR1700221 2 0.646 0.3544 0.348 0.516 0.008 0.120 0.008
#> SRR1700223 2 0.449 0.7039 0.124 0.788 0.064 0.004 0.020
#> SRR1700224 5 0.725 0.0569 0.328 0.244 0.012 0.008 0.408
#> SRR1700226 2 0.550 0.6378 0.156 0.696 0.012 0.004 0.132
#> SRR1700229 2 0.752 0.4163 0.156 0.500 0.068 0.008 0.268
#> SRR1700225 2 0.672 0.5764 0.036 0.612 0.192 0.144 0.016
#> SRR1700227 2 0.412 0.6918 0.052 0.812 0.028 0.108 0.000
#> SRR1700230 1 0.442 0.7291 0.796 0.100 0.008 0.084 0.012
#> SRR1700231 2 0.373 0.7116 0.092 0.844 0.024 0.032 0.008
#> SRR1700228 2 0.532 0.4664 0.360 0.592 0.000 0.028 0.020
#> SRR1700232 2 0.397 0.7180 0.036 0.844 0.020 0.040 0.060
#> SRR1700233 2 0.514 0.6224 0.260 0.680 0.044 0.008 0.008
#> SRR1700234 2 0.664 0.2483 0.344 0.496 0.012 0.144 0.004
#> SRR1700235 2 0.315 0.7058 0.008 0.868 0.032 0.088 0.004
#> SRR1700237 2 0.474 0.6893 0.064 0.796 0.016 0.080 0.044
#> SRR1700236 2 0.551 0.5933 0.064 0.660 0.024 0.000 0.252
#> SRR1700238 2 0.555 0.5790 0.296 0.636 0.040 0.020 0.008
#> SRR1700239 1 0.228 0.7759 0.916 0.040 0.008 0.036 0.000
#> SRR1700240 1 0.189 0.7786 0.936 0.004 0.004 0.036 0.020
#> SRR1700241 4 0.659 0.2491 0.312 0.124 0.012 0.540 0.012
#> SRR1700243 2 0.513 0.6657 0.124 0.756 0.012 0.080 0.028
#> SRR1700244 2 0.722 0.3515 0.316 0.492 0.016 0.028 0.148
#> SRR1700242 1 0.296 0.7790 0.888 0.024 0.008 0.064 0.016
#> SRR1700246 1 0.246 0.7729 0.912 0.048 0.008 0.008 0.024
#> SRR1700245 2 0.293 0.7176 0.020 0.896 0.016 0.040 0.028
#> SRR1700247 1 0.259 0.7727 0.904 0.008 0.036 0.048 0.004
#> SRR1700249 1 0.345 0.7250 0.828 0.012 0.016 0.144 0.000
#> SRR1700250 2 0.384 0.7017 0.012 0.840 0.012 0.072 0.064
#> SRR1700248 2 0.578 0.6191 0.132 0.692 0.032 0.140 0.004
#> SRR1700251 2 0.731 0.3143 0.312 0.468 0.056 0.164 0.000
#> SRR1700252 2 0.451 0.6901 0.176 0.768 0.020 0.008 0.028
#> SRR1700253 2 0.548 0.6813 0.084 0.728 0.080 0.108 0.000
#> SRR1700256 2 0.586 0.5484 0.300 0.612 0.012 0.012 0.064
#> SRR1700254 1 0.186 0.7794 0.940 0.012 0.016 0.028 0.004
#> SRR1700255 2 0.599 0.2077 0.428 0.488 0.004 0.072 0.008
#> SRR1700257 2 0.504 0.6021 0.252 0.688 0.004 0.048 0.008
#> SRR1700258 2 0.447 0.6917 0.076 0.796 0.012 0.012 0.104
#> SRR1700259 2 0.521 0.6706 0.004 0.748 0.052 0.068 0.128
#> SRR1700260 5 0.416 0.6964 0.008 0.152 0.012 0.032 0.796
#> SRR1700261 5 0.343 0.7204 0.000 0.100 0.012 0.040 0.848
#> SRR1700262 5 0.410 0.7195 0.016 0.048 0.020 0.088 0.828
#> SRR1700263 2 0.696 0.5122 0.052 0.552 0.224 0.000 0.172
#> SRR1700264 2 0.538 0.6260 0.020 0.688 0.212 0.000 0.080
#> SRR1700265 3 0.750 0.0439 0.232 0.320 0.404 0.000 0.044
#> SRR1700266 5 0.503 0.1990 0.008 0.424 0.020 0.000 0.548
#> SRR1700268 1 0.730 -0.0235 0.400 0.360 0.024 0.004 0.212
#> SRR1700270 2 0.516 0.6806 0.176 0.732 0.048 0.004 0.040
#> SRR1700267 2 0.419 0.7222 0.020 0.828 0.044 0.028 0.080
#> SRR1700271 2 0.661 0.5303 0.004 0.592 0.248 0.048 0.108
#> SRR1700272 4 0.808 -0.0194 0.044 0.348 0.024 0.352 0.232
#> SRR1700273 2 0.475 0.6783 0.044 0.756 0.036 0.000 0.164
#> SRR1700274 5 0.720 0.5237 0.056 0.260 0.032 0.088 0.564
#> SRR1700277 2 0.407 0.7026 0.088 0.820 0.032 0.060 0.000
#> SRR1700275 5 0.716 0.2648 0.040 0.100 0.020 0.344 0.496
#> SRR1700276 4 0.702 0.4288 0.268 0.040 0.024 0.564 0.104
#> SRR1700278 5 0.656 0.1871 0.392 0.084 0.016 0.016 0.492
#> SRR1700279 5 0.594 0.4392 0.324 0.028 0.012 0.040 0.596
#> SRR1700280 5 0.730 0.2865 0.340 0.104 0.012 0.060 0.484
#> SRR1700281 2 0.529 0.5853 0.064 0.656 0.272 0.004 0.004
#> SRR1700283 5 0.649 0.6134 0.040 0.172 0.016 0.128 0.644
#> SRR1700282 1 0.819 0.0647 0.392 0.128 0.016 0.120 0.344
#> SRR1700284 5 0.278 0.7299 0.000 0.016 0.004 0.108 0.872
#> SRR1700285 5 0.457 0.7185 0.020 0.064 0.008 0.120 0.788
#> SRR1700286 5 0.484 0.5802 0.000 0.256 0.028 0.020 0.696
#> SRR1700287 5 0.393 0.7293 0.044 0.052 0.012 0.048 0.844
#> SRR1700290 5 0.692 0.3621 0.272 0.028 0.168 0.004 0.528
#> SRR1700289 5 0.243 0.7203 0.028 0.036 0.008 0.012 0.916
#> SRR1700288 2 0.688 0.4495 0.256 0.540 0.012 0.016 0.176
#> SRR1700292 5 0.367 0.7207 0.052 0.060 0.000 0.040 0.848
#> SRR1700291 5 0.634 0.3347 0.004 0.040 0.064 0.336 0.556
#> SRR1700293 1 0.670 0.5739 0.608 0.084 0.012 0.232 0.064
#> SRR1700294 5 0.543 0.6828 0.080 0.004 0.092 0.084 0.740
#> SRR1700295 5 0.424 0.6549 0.016 0.000 0.020 0.208 0.756
#> SRR1700297 5 0.445 0.6754 0.020 0.016 0.016 0.176 0.772
#> SRR1700296 5 0.402 0.7068 0.112 0.024 0.000 0.048 0.816
#> SRR1700298 5 0.468 0.7233 0.028 0.040 0.024 0.116 0.792
#> SRR1700299 5 0.355 0.7247 0.036 0.020 0.000 0.100 0.844
#> SRR1700300 5 0.623 0.6228 0.168 0.064 0.016 0.076 0.676
#> SRR1700302 5 0.244 0.7171 0.000 0.000 0.004 0.120 0.876
#> SRR1700301 5 0.240 0.7264 0.016 0.004 0.012 0.056 0.912
#> SRR1700303 5 0.451 0.6286 0.012 0.004 0.024 0.224 0.736
#> SRR1700304 1 0.446 0.7126 0.792 0.020 0.008 0.052 0.128
#> SRR1700305 5 0.754 0.2140 0.348 0.052 0.016 0.132 0.452
#> SRR1700306 5 0.315 0.7252 0.028 0.000 0.048 0.048 0.876
#> SRR1700308 5 0.470 0.6838 0.004 0.152 0.064 0.016 0.764
#> SRR1700307 5 0.739 0.5937 0.060 0.104 0.064 0.172 0.600
#> SRR1700309 5 0.448 0.7024 0.036 0.068 0.068 0.016 0.812
#> SRR1700310 5 0.406 0.7118 0.044 0.000 0.032 0.108 0.816
#> SRR1700311 5 0.527 0.6885 0.068 0.004 0.064 0.116 0.748
#> SRR1700312 5 0.350 0.7363 0.004 0.044 0.008 0.096 0.848
#> SRR1700313 5 0.960 0.0687 0.156 0.104 0.212 0.208 0.320
#> SRR1700314 5 0.369 0.7165 0.000 0.024 0.020 0.132 0.824
#> SRR1700315 5 0.507 0.6972 0.052 0.016 0.104 0.056 0.772
#> SRR1700316 5 0.537 0.6168 0.008 0.052 0.016 0.244 0.680
#> SRR1700317 5 0.525 0.6297 0.076 0.156 0.040 0.000 0.728
#> SRR1700318 5 0.448 0.6181 0.216 0.012 0.008 0.020 0.744
#> SRR1700319 5 0.387 0.7052 0.016 0.008 0.016 0.148 0.812
#> SRR1700320 5 0.266 0.7306 0.016 0.008 0.020 0.052 0.904
#> SRR1700322 5 0.798 0.0778 0.304 0.036 0.020 0.280 0.360
#> SRR1700321 5 0.363 0.7302 0.016 0.080 0.004 0.052 0.848
#> SRR1700323 5 0.563 0.3682 0.000 0.000 0.096 0.324 0.580
#> SRR1700324 5 0.676 0.6077 0.100 0.040 0.044 0.176 0.640
#> SRR1700325 5 0.881 0.1675 0.152 0.252 0.020 0.232 0.344
#> SRR1700326 5 0.757 0.0320 0.360 0.012 0.024 0.236 0.368
#> SRR1700327 5 0.375 0.7227 0.000 0.104 0.020 0.044 0.832
#> SRR1700329 5 0.269 0.7290 0.012 0.012 0.004 0.080 0.892
#> SRR1700328 1 0.682 0.5159 0.596 0.100 0.068 0.008 0.228
#> SRR1700330 5 0.700 0.1359 0.408 0.032 0.016 0.096 0.448
#> SRR1700331 5 0.312 0.7173 0.028 0.020 0.056 0.012 0.884
#> SRR1700332 5 0.344 0.7203 0.008 0.028 0.004 0.116 0.844
#> SRR1700333 1 0.682 -0.0180 0.448 0.028 0.016 0.084 0.424
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.549 0.47755 0.004 0.644 0.024 0.000 0.140 0.188
#> SRR1699875 2 0.586 0.47600 0.000 0.624 0.152 0.000 0.064 0.160
#> SRR1699876 5 0.530 0.48707 0.000 0.088 0.008 0.040 0.684 0.180
#> SRR1699877 2 0.672 0.47747 0.056 0.592 0.132 0.000 0.064 0.156
#> SRR1699879 2 0.545 0.37916 0.004 0.616 0.012 0.000 0.244 0.124
#> SRR1699878 2 0.639 0.27906 0.000 0.544 0.072 0.000 0.148 0.236
#> SRR1699880 2 0.530 0.57963 0.000 0.708 0.092 0.028 0.032 0.140
#> SRR1699881 2 0.675 0.41541 0.020 0.572 0.036 0.028 0.124 0.220
#> SRR1699882 5 0.647 -0.06216 0.008 0.344 0.016 0.000 0.428 0.204
#> SRR1699883 2 0.631 0.29229 0.016 0.568 0.032 0.000 0.196 0.188
#> SRR1699884 2 0.688 0.48811 0.096 0.576 0.080 0.012 0.032 0.204
#> SRR1699885 2 0.480 0.58135 0.000 0.740 0.080 0.012 0.032 0.136
#> SRR1699886 5 0.614 0.20246 0.008 0.136 0.032 0.000 0.556 0.268
#> SRR1699888 2 0.819 0.02113 0.048 0.384 0.064 0.272 0.028 0.204
#> SRR1699889 5 0.477 0.48661 0.004 0.024 0.012 0.020 0.680 0.260
#> SRR1699890 5 0.657 0.29103 0.080 0.072 0.008 0.020 0.568 0.252
#> SRR1699887 5 0.551 0.40614 0.000 0.136 0.044 0.000 0.652 0.168
#> SRR1699891 5 0.500 0.43589 0.004 0.020 0.012 0.032 0.656 0.276
#> SRR1699892 2 0.699 -0.13893 0.000 0.424 0.040 0.016 0.300 0.220
#> SRR1699893 5 0.599 0.38727 0.004 0.012 0.012 0.208 0.588 0.176
#> SRR1699894 5 0.451 0.53930 0.000 0.024 0.004 0.052 0.732 0.188
#> SRR1699895 5 0.318 0.58333 0.000 0.020 0.000 0.028 0.840 0.112
#> SRR1699896 5 0.752 -0.32529 0.016 0.252 0.084 0.000 0.360 0.288
#> SRR1699897 5 0.689 -0.17135 0.000 0.252 0.064 0.000 0.428 0.256
#> SRR1699898 4 0.684 0.54516 0.000 0.060 0.096 0.592 0.124 0.128
#> SRR1699900 6 0.815 0.47378 0.028 0.232 0.240 0.000 0.192 0.308
#> SRR1699899 5 0.408 0.53809 0.000 0.064 0.020 0.004 0.784 0.128
#> SRR1699902 3 0.664 0.10263 0.008 0.084 0.532 0.012 0.076 0.288
#> SRR1699901 6 0.885 0.54336 0.068 0.064 0.140 0.156 0.164 0.408
#> SRR1699903 5 0.497 0.43769 0.008 0.008 0.012 0.036 0.648 0.288
#> SRR1699904 5 0.577 0.42884 0.012 0.000 0.024 0.160 0.628 0.176
#> SRR1699905 6 0.862 0.43463 0.216 0.016 0.084 0.120 0.192 0.372
#> SRR1699906 5 0.547 0.40187 0.004 0.044 0.020 0.032 0.644 0.256
#> SRR1699907 5 0.372 0.54803 0.016 0.016 0.004 0.012 0.804 0.148
#> SRR1699908 5 0.456 0.53341 0.000 0.008 0.016 0.064 0.732 0.180
#> SRR1699909 5 0.783 -0.27425 0.004 0.080 0.100 0.088 0.388 0.340
#> SRR1699910 5 0.518 0.42739 0.004 0.000 0.036 0.060 0.660 0.240
#> SRR1699911 5 0.769 -0.06245 0.120 0.060 0.080 0.008 0.456 0.276
#> SRR1699912 5 0.481 0.46585 0.000 0.000 0.028 0.060 0.688 0.224
#> SRR1699913 5 0.663 0.11047 0.004 0.012 0.020 0.192 0.468 0.304
#> SRR1699914 5 0.782 -0.41924 0.000 0.048 0.140 0.112 0.352 0.348
#> SRR1699915 5 0.577 0.45235 0.024 0.000 0.072 0.052 0.652 0.200
#> SRR1699916 4 0.782 -0.01287 0.004 0.032 0.152 0.392 0.120 0.300
#> SRR1699917 4 0.707 0.36020 0.000 0.000 0.260 0.452 0.140 0.148
#> SRR1699918 4 0.771 -0.05293 0.024 0.020 0.212 0.384 0.052 0.308
#> SRR1699919 5 0.368 0.52970 0.008 0.004 0.016 0.008 0.788 0.176
#> SRR1699920 5 0.525 0.41304 0.000 0.020 0.040 0.032 0.656 0.252
#> SRR1699921 5 0.409 0.52813 0.012 0.004 0.040 0.008 0.776 0.160
#> SRR1699922 5 0.635 0.25033 0.060 0.036 0.036 0.008 0.552 0.308
#> SRR1699923 6 0.860 0.60557 0.088 0.108 0.188 0.016 0.232 0.368
#> SRR1699924 4 0.745 -0.04130 0.004 0.020 0.304 0.356 0.052 0.264
#> SRR1699925 1 0.568 0.46009 0.628 0.016 0.036 0.000 0.076 0.244
#> SRR1699926 5 0.525 0.44426 0.008 0.020 0.012 0.044 0.648 0.268
#> SRR1699927 5 0.404 0.53678 0.000 0.000 0.020 0.044 0.764 0.172
#> SRR1699929 5 0.703 -0.22349 0.016 0.204 0.044 0.000 0.408 0.328
#> SRR1699928 5 0.318 0.54629 0.000 0.004 0.024 0.008 0.832 0.132
#> SRR1699930 5 0.337 0.56213 0.004 0.028 0.000 0.016 0.828 0.124
#> SRR1699931 5 0.750 -0.35697 0.004 0.304 0.084 0.008 0.352 0.248
#> SRR1699933 6 0.782 0.61692 0.016 0.152 0.128 0.028 0.212 0.464
#> SRR1699932 5 0.388 0.54146 0.000 0.032 0.004 0.024 0.788 0.152
#> SRR1699934 1 0.481 0.56349 0.692 0.000 0.028 0.008 0.040 0.232
#> SRR1699935 4 0.674 0.41552 0.004 0.036 0.032 0.544 0.152 0.232
#> SRR1699936 2 0.664 0.46440 0.000 0.588 0.032 0.144 0.076 0.160
#> SRR1699937 2 0.330 0.62559 0.004 0.848 0.064 0.020 0.000 0.064
#> SRR1699938 2 0.322 0.63203 0.000 0.864 0.028 0.024 0.028 0.056
#> SRR1699940 2 0.690 0.32062 0.000 0.508 0.052 0.024 0.240 0.176
#> SRR1699939 2 0.557 0.35182 0.000 0.584 0.008 0.008 0.284 0.116
#> SRR1699941 2 0.559 0.56377 0.004 0.660 0.160 0.000 0.052 0.124
#> SRR1699942 2 0.643 0.24266 0.000 0.480 0.352 0.080 0.004 0.084
#> SRR1699943 2 0.312 0.62987 0.004 0.864 0.060 0.016 0.004 0.052
#> SRR1699944 2 0.434 0.60285 0.000 0.768 0.016 0.008 0.104 0.104
#> SRR1699945 2 0.619 0.28862 0.000 0.520 0.024 0.008 0.304 0.144
#> SRR1699946 2 0.304 0.62999 0.008 0.864 0.016 0.004 0.020 0.088
#> SRR1699947 2 0.471 0.58474 0.004 0.732 0.160 0.000 0.032 0.072
#> SRR1699948 2 0.451 0.55774 0.000 0.696 0.236 0.012 0.000 0.056
#> SRR1699949 5 0.618 0.33204 0.004 0.260 0.000 0.056 0.564 0.116
#> SRR1699950 2 0.587 0.18476 0.000 0.492 0.000 0.024 0.372 0.112
#> SRR1699951 2 0.717 0.38944 0.004 0.536 0.028 0.148 0.108 0.176
#> SRR1699952 2 0.399 0.60164 0.004 0.784 0.144 0.004 0.008 0.056
#> SRR1699953 2 0.404 0.61349 0.000 0.804 0.020 0.016 0.084 0.076
#> SRR1699954 2 0.648 0.38306 0.152 0.500 0.288 0.000 0.000 0.060
#> SRR1699955 2 0.414 0.61714 0.000 0.796 0.020 0.080 0.016 0.088
#> SRR1699956 2 0.638 0.12532 0.004 0.424 0.016 0.008 0.396 0.152
#> SRR1699957 2 0.562 0.47332 0.000 0.636 0.044 0.000 0.188 0.132
#> SRR1699959 2 0.778 0.26515 0.000 0.436 0.212 0.164 0.036 0.152
#> SRR1699958 4 0.480 0.67335 0.012 0.132 0.000 0.736 0.024 0.096
#> SRR1699960 4 0.680 0.32381 0.000 0.292 0.124 0.472 0.000 0.112
#> SRR1699961 2 0.454 0.54966 0.004 0.708 0.220 0.004 0.004 0.060
#> SRR1699962 2 0.632 0.46559 0.004 0.584 0.224 0.024 0.028 0.136
#> SRR1699963 2 0.720 -0.05628 0.008 0.360 0.308 0.264 0.000 0.060
#> SRR1699964 2 0.553 0.61934 0.040 0.708 0.136 0.020 0.016 0.080
#> SRR1699965 2 0.393 0.63681 0.000 0.820 0.040 0.020 0.048 0.072
#> SRR1699966 5 0.720 0.14257 0.000 0.308 0.004 0.108 0.412 0.168
#> SRR1699967 2 0.501 0.61465 0.012 0.744 0.104 0.044 0.008 0.088
#> SRR1699968 5 0.669 0.19312 0.000 0.156 0.140 0.000 0.536 0.168
#> SRR1699969 5 0.500 0.54906 0.000 0.096 0.008 0.036 0.720 0.140
#> SRR1699971 2 0.491 0.59126 0.008 0.736 0.084 0.052 0.000 0.120
#> SRR1699970 2 0.462 0.47770 0.004 0.652 0.292 0.000 0.004 0.048
#> SRR1699972 2 0.527 0.34781 0.004 0.560 0.348 0.000 0.004 0.084
#> SRR1699973 4 0.728 0.46598 0.000 0.196 0.112 0.508 0.032 0.152
#> SRR1699974 3 0.730 0.14669 0.076 0.336 0.448 0.020 0.020 0.100
#> SRR1699975 5 0.507 0.46948 0.000 0.100 0.020 0.016 0.708 0.156
#> SRR1699976 2 0.595 0.41845 0.004 0.572 0.256 0.000 0.028 0.140
#> SRR1699977 3 0.794 0.08884 0.004 0.168 0.368 0.268 0.020 0.172
#> SRR1699978 4 0.670 0.48362 0.052 0.004 0.200 0.528 0.008 0.208
#> SRR1699979 4 0.769 0.24918 0.000 0.156 0.164 0.464 0.040 0.176
#> SRR1699980 5 0.529 0.43754 0.000 0.024 0.144 0.004 0.672 0.156
#> SRR1699981 5 0.346 0.59567 0.004 0.004 0.012 0.052 0.836 0.092
#> SRR1699982 5 0.313 0.58377 0.004 0.000 0.032 0.012 0.848 0.104
#> SRR1699983 5 0.274 0.58521 0.000 0.000 0.024 0.024 0.876 0.076
#> SRR1699984 3 0.769 -0.12673 0.324 0.020 0.324 0.004 0.080 0.248
#> SRR1699985 3 0.838 -0.22202 0.000 0.160 0.380 0.096 0.152 0.212
#> SRR1699986 5 0.896 -0.16987 0.156 0.068 0.240 0.028 0.292 0.216
#> SRR1699988 5 0.753 0.03713 0.016 0.204 0.084 0.020 0.480 0.196
#> SRR1699987 4 0.667 0.44840 0.004 0.088 0.012 0.556 0.232 0.108
#> SRR1699989 5 0.497 0.52306 0.004 0.064 0.020 0.024 0.728 0.160
#> SRR1699990 5 0.628 0.40356 0.004 0.160 0.020 0.040 0.608 0.168
#> SRR1699992 2 0.550 0.51183 0.016 0.636 0.236 0.000 0.016 0.096
#> SRR1699991 3 0.542 0.44959 0.000 0.048 0.648 0.216 0.000 0.088
#> SRR1699993 5 0.569 0.55121 0.076 0.028 0.008 0.100 0.704 0.084
#> SRR1699994 3 0.649 0.26722 0.012 0.192 0.576 0.000 0.076 0.144
#> SRR1699995 3 0.539 0.48097 0.004 0.000 0.676 0.092 0.052 0.176
#> SRR1699996 2 0.735 0.31158 0.132 0.436 0.256 0.000 0.008 0.168
#> SRR1699997 4 0.422 0.75536 0.000 0.008 0.056 0.788 0.108 0.040
#> SRR1699998 2 0.720 0.26876 0.020 0.504 0.124 0.004 0.112 0.236
#> SRR1699999 3 0.765 0.20934 0.228 0.156 0.468 0.024 0.012 0.112
#> SRR1700000 2 0.800 0.28562 0.132 0.436 0.160 0.000 0.072 0.200
#> SRR1700002 2 0.533 0.57470 0.004 0.684 0.172 0.060 0.000 0.080
#> SRR1700001 2 0.776 0.04907 0.016 0.388 0.048 0.044 0.324 0.180
#> SRR1700003 4 0.657 0.44337 0.004 0.104 0.184 0.560 0.000 0.148
#> SRR1700004 5 0.465 0.54639 0.004 0.088 0.020 0.012 0.756 0.120
#> SRR1700005 1 0.575 0.49967 0.612 0.008 0.132 0.024 0.000 0.224
#> SRR1700006 2 0.624 0.37886 0.004 0.552 0.236 0.012 0.016 0.180
#> SRR1700007 5 0.393 0.58534 0.000 0.036 0.004 0.084 0.808 0.068
#> SRR1700008 4 0.565 0.69006 0.000 0.000 0.128 0.660 0.096 0.116
#> SRR1700009 1 0.820 0.06102 0.308 0.008 0.016 0.244 0.200 0.224
#> SRR1700010 2 0.639 0.39643 0.004 0.548 0.028 0.016 0.264 0.140
#> SRR1700011 4 0.733 0.09786 0.000 0.344 0.128 0.396 0.016 0.116
#> SRR1700013 4 0.825 0.32563 0.064 0.160 0.148 0.444 0.016 0.168
#> SRR1700012 3 0.536 0.42076 0.000 0.168 0.644 0.012 0.004 0.172
#> SRR1700014 3 0.422 0.56901 0.000 0.048 0.796 0.088 0.012 0.056
#> SRR1700015 3 0.519 0.10806 0.004 0.432 0.496 0.004 0.000 0.064
#> SRR1700016 3 0.737 0.04462 0.176 0.004 0.412 0.004 0.112 0.292
#> SRR1700018 3 0.463 0.42302 0.000 0.288 0.656 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700017 3 0.538 0.54325 0.000 0.120 0.688 0.036 0.012 0.144
#> SRR1700019 5 0.421 0.56184 0.008 0.032 0.028 0.004 0.776 0.152
#> SRR1700020 3 0.691 0.37865 0.004 0.044 0.512 0.244 0.024 0.172
#> SRR1700021 5 0.820 0.00332 0.068 0.000 0.264 0.108 0.352 0.208
#> SRR1700023 5 0.761 -0.13817 0.000 0.168 0.320 0.008 0.344 0.160
#> SRR1700022 3 0.594 0.45751 0.000 0.232 0.604 0.100 0.004 0.060
#> SRR1700024 3 0.497 0.51104 0.000 0.012 0.708 0.164 0.016 0.100
#> SRR1700025 3 0.530 0.06711 0.020 0.424 0.500 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700026 3 0.426 0.53803 0.012 0.148 0.764 0.008 0.000 0.068
#> SRR1700027 3 0.416 0.56059 0.000 0.120 0.780 0.040 0.000 0.060
#> SRR1700028 4 0.689 0.58401 0.008 0.016 0.168 0.568 0.120 0.120
#> SRR1700029 3 0.595 0.36118 0.008 0.020 0.560 0.300 0.004 0.108
#> SRR1700030 3 0.605 0.10866 0.004 0.016 0.512 0.000 0.312 0.156
#> SRR1700031 3 0.345 0.57244 0.000 0.044 0.844 0.052 0.004 0.056
#> SRR1700032 3 0.609 -0.04330 0.004 0.428 0.436 0.000 0.036 0.096
#> SRR1700034 3 0.453 0.55789 0.008 0.076 0.772 0.016 0.016 0.112
#> SRR1700035 5 0.628 0.36291 0.004 0.004 0.204 0.060 0.588 0.140
#> SRR1700033 3 0.386 0.57326 0.004 0.076 0.816 0.056 0.000 0.048
#> SRR1700036 5 0.582 -0.05522 0.000 0.020 0.432 0.000 0.440 0.108
#> SRR1700037 5 0.349 0.58965 0.008 0.000 0.016 0.044 0.832 0.100
#> SRR1700038 3 0.720 0.12808 0.048 0.220 0.468 0.000 0.036 0.228
#> SRR1700039 3 0.558 0.48061 0.004 0.012 0.684 0.060 0.080 0.160
#> SRR1700040 3 0.480 0.50765 0.000 0.160 0.720 0.004 0.024 0.092
#> SRR1700041 3 0.523 0.53489 0.000 0.072 0.736 0.044 0.072 0.076
#> SRR1700042 3 0.383 0.55905 0.000 0.056 0.816 0.028 0.008 0.092
#> SRR1700043 3 0.615 0.38752 0.008 0.104 0.624 0.000 0.140 0.124
#> SRR1700045 4 0.786 -0.08732 0.000 0.092 0.336 0.356 0.056 0.160
#> SRR1700044 3 0.397 0.53384 0.036 0.060 0.804 0.000 0.004 0.096
#> SRR1700046 3 0.365 0.56020 0.012 0.072 0.832 0.024 0.000 0.060
#> SRR1700047 5 0.620 0.05871 0.008 0.028 0.380 0.004 0.480 0.100
#> SRR1700048 3 0.746 0.11462 0.012 0.012 0.440 0.208 0.076 0.252
#> SRR1700049 5 0.676 0.03984 0.000 0.008 0.352 0.060 0.440 0.140
#> SRR1700050 3 0.574 -0.00568 0.000 0.000 0.472 0.420 0.036 0.072
#> SRR1700051 3 0.428 0.50447 0.004 0.000 0.748 0.168 0.008 0.072
#> SRR1700052 3 0.377 0.52905 0.008 0.024 0.800 0.024 0.000 0.144
#> SRR1700053 3 0.638 -0.11585 0.004 0.004 0.464 0.012 0.308 0.208
#> SRR1700054 3 0.344 0.57407 0.012 0.064 0.848 0.044 0.000 0.032
#> SRR1700055 3 0.391 0.55374 0.016 0.008 0.808 0.056 0.004 0.108
#> SRR1700056 4 0.604 0.48423 0.004 0.004 0.292 0.568 0.076 0.056
#> SRR1700057 4 0.721 0.25924 0.004 0.000 0.296 0.412 0.188 0.100
#> SRR1700058 3 0.460 0.52619 0.016 0.128 0.752 0.008 0.004 0.092
#> SRR1700059 4 0.647 0.50478 0.000 0.008 0.248 0.548 0.128 0.068
#> SRR1700060 3 0.369 0.55381 0.000 0.024 0.832 0.068 0.016 0.060
#> SRR1700061 3 0.455 0.54010 0.032 0.116 0.764 0.012 0.000 0.076
#> SRR1700062 4 0.539 0.57484 0.000 0.000 0.276 0.616 0.068 0.040
#> SRR1700063 3 0.473 0.53581 0.004 0.056 0.744 0.132 0.000 0.064
#> SRR1700064 3 0.620 0.02866 0.000 0.004 0.460 0.012 0.340 0.184
#> SRR1700065 3 0.431 0.55306 0.008 0.056 0.788 0.072 0.000 0.076
#> SRR1700066 3 0.482 0.50748 0.004 0.084 0.748 0.004 0.052 0.108
#> SRR1700067 3 0.707 0.07989 0.016 0.000 0.428 0.340 0.076 0.140
#> SRR1700068 3 0.556 -0.04102 0.000 0.004 0.464 0.448 0.024 0.060
#> SRR1700069 3 0.618 -0.07020 0.000 0.016 0.436 0.004 0.388 0.156
#> SRR1700070 3 0.290 0.55637 0.004 0.080 0.868 0.004 0.004 0.040
#> SRR1700071 3 0.332 0.56674 0.000 0.028 0.852 0.044 0.008 0.068
#> SRR1700072 3 0.413 0.51115 0.016 0.000 0.792 0.020 0.056 0.116
#> SRR1700073 3 0.604 0.39874 0.040 0.004 0.660 0.044 0.108 0.144
#> SRR1700075 3 0.491 0.50283 0.004 0.148 0.724 0.008 0.020 0.096
#> SRR1700074 3 0.613 0.36390 0.008 0.272 0.576 0.036 0.008 0.100
#> SRR1700076 3 0.326 0.56282 0.028 0.056 0.864 0.008 0.008 0.036
#> SRR1700077 3 0.354 0.54967 0.016 0.088 0.828 0.000 0.004 0.064
#> SRR1700078 3 0.688 0.16962 0.012 0.044 0.484 0.008 0.292 0.160
#> SRR1700080 5 0.613 -0.00837 0.000 0.016 0.388 0.004 0.444 0.148
#> SRR1700079 3 0.637 0.38254 0.000 0.000 0.556 0.188 0.072 0.184
#> SRR1700081 3 0.617 0.38018 0.000 0.044 0.568 0.256 0.008 0.124
#> SRR1700082 3 0.498 0.50298 0.000 0.184 0.696 0.036 0.000 0.084
#> SRR1700083 3 0.492 0.49132 0.004 0.016 0.704 0.204 0.012 0.060
#> SRR1700084 3 0.425 0.53897 0.032 0.104 0.788 0.000 0.012 0.064
#> SRR1700085 5 0.613 0.27875 0.004 0.008 0.260 0.024 0.564 0.140
#> SRR1700086 3 0.586 0.09945 0.000 0.012 0.500 0.000 0.340 0.148
#> SRR1700087 4 0.553 0.55939 0.020 0.200 0.008 0.640 0.000 0.132
#> SRR1700088 2 0.703 0.16822 0.000 0.444 0.252 0.208 0.000 0.096
#> SRR1700089 4 0.609 0.32113 0.004 0.336 0.020 0.512 0.004 0.124
#> SRR1700091 4 0.471 0.69341 0.012 0.084 0.004 0.744 0.016 0.140
#> SRR1700090 4 0.301 0.75719 0.004 0.008 0.060 0.872 0.012 0.044
#> SRR1700092 4 0.503 0.66383 0.000 0.128 0.040 0.704 0.000 0.128
#> SRR1700094 4 0.505 0.67724 0.016 0.128 0.032 0.736 0.008 0.080
#> SRR1700093 4 0.443 0.73151 0.012 0.056 0.020 0.780 0.012 0.120
#> SRR1700095 4 0.513 0.67906 0.028 0.072 0.004 0.712 0.016 0.168
#> SRR1700096 4 0.430 0.71667 0.000 0.048 0.092 0.776 0.000 0.084
#> SRR1700097 4 0.342 0.74946 0.012 0.036 0.012 0.848 0.008 0.084
#> SRR1700098 4 0.660 0.47368 0.016 0.224 0.028 0.552 0.012 0.168
#> SRR1700099 4 0.411 0.72243 0.004 0.060 0.012 0.792 0.012 0.120
#> SRR1700100 4 0.392 0.74487 0.016 0.012 0.084 0.808 0.000 0.080
#> SRR1700101 4 0.349 0.73382 0.004 0.064 0.016 0.832 0.000 0.084
#> SRR1700102 4 0.571 0.66477 0.004 0.072 0.024 0.688 0.072 0.140
#> SRR1700104 4 0.376 0.73083 0.012 0.064 0.008 0.824 0.008 0.084
#> SRR1700103 4 0.626 0.57581 0.004 0.088 0.008 0.616 0.172 0.112
#> SRR1700105 4 0.496 0.72742 0.028 0.052 0.012 0.760 0.044 0.104
#> SRR1700106 4 0.472 0.72419 0.020 0.008 0.004 0.740 0.080 0.148
#> SRR1700107 4 0.387 0.74984 0.028 0.028 0.016 0.832 0.020 0.076
#> SRR1700108 4 0.314 0.74763 0.004 0.028 0.028 0.856 0.000 0.084
#> SRR1700109 4 0.357 0.73902 0.004 0.012 0.080 0.824 0.000 0.080
#> SRR1700110 4 0.328 0.73746 0.008 0.044 0.004 0.844 0.004 0.096
#> SRR1700112 4 0.302 0.75206 0.008 0.000 0.088 0.860 0.008 0.036
#> SRR1700111 4 0.459 0.72469 0.000 0.000 0.128 0.748 0.048 0.076
#> SRR1700113 4 0.591 0.48916 0.004 0.028 0.000 0.556 0.296 0.116
#> SRR1700114 4 0.567 0.68477 0.012 0.048 0.104 0.672 0.004 0.160
#> SRR1700115 4 0.276 0.75794 0.004 0.016 0.032 0.892 0.016 0.040
#> SRR1700116 4 0.240 0.76257 0.004 0.004 0.032 0.908 0.032 0.020
#> SRR1700117 4 0.378 0.74968 0.012 0.000 0.084 0.824 0.036 0.044
#> SRR1700119 4 0.419 0.72934 0.000 0.048 0.000 0.780 0.116 0.056
#> SRR1700118 4 0.412 0.71029 0.000 0.000 0.160 0.760 0.012 0.068
#> SRR1700120 4 0.455 0.73424 0.008 0.028 0.016 0.776 0.060 0.112
#> SRR1700121 4 0.495 0.70044 0.004 0.036 0.000 0.720 0.120 0.120
#> SRR1700122 4 0.415 0.74555 0.000 0.000 0.040 0.784 0.108 0.068
#> SRR1700123 4 0.279 0.76290 0.008 0.000 0.020 0.884 0.048 0.040
#> SRR1700125 4 0.325 0.75280 0.004 0.000 0.004 0.836 0.104 0.052
#> SRR1700126 4 0.433 0.72310 0.004 0.012 0.136 0.764 0.004 0.080
#> SRR1700127 4 0.257 0.75935 0.000 0.000 0.064 0.888 0.020 0.028
#> SRR1700124 4 0.365 0.74997 0.000 0.008 0.108 0.820 0.016 0.048
#> SRR1700128 4 0.462 0.73346 0.008 0.000 0.056 0.760 0.116 0.060
#> SRR1700129 4 0.330 0.75866 0.004 0.000 0.064 0.852 0.040 0.040
#> SRR1700130 4 0.373 0.76408 0.008 0.016 0.044 0.840 0.032 0.060
#> SRR1700132 4 0.555 0.53581 0.004 0.000 0.024 0.604 0.272 0.096
#> SRR1700131 4 0.372 0.76462 0.004 0.012 0.036 0.832 0.084 0.032
#> SRR1700133 4 0.372 0.75300 0.004 0.000 0.020 0.816 0.096 0.064
#> SRR1700134 4 0.402 0.70073 0.000 0.000 0.016 0.760 0.180 0.044
#> SRR1700135 4 0.568 0.66969 0.008 0.000 0.096 0.664 0.160 0.072
#> SRR1700136 4 0.254 0.75838 0.000 0.004 0.020 0.896 0.048 0.032
#> SRR1700137 4 0.621 0.59350 0.004 0.020 0.024 0.592 0.212 0.148
#> SRR1700138 4 0.457 0.67630 0.000 0.000 0.032 0.716 0.204 0.048
#> SRR1700140 4 0.453 0.72392 0.000 0.000 0.060 0.752 0.132 0.056
#> SRR1700139 4 0.388 0.74972 0.004 0.000 0.028 0.808 0.096 0.064
#> SRR1700141 4 0.305 0.76349 0.000 0.004 0.036 0.868 0.052 0.040
#> SRR1700142 3 0.556 0.18252 0.000 0.000 0.540 0.356 0.028 0.076
#> SRR1700143 4 0.282 0.76349 0.000 0.004 0.036 0.880 0.056 0.024
#> SRR1700144 3 0.645 0.33867 0.004 0.012 0.592 0.120 0.076 0.196
#> SRR1700145 4 0.399 0.76202 0.012 0.000 0.068 0.812 0.036 0.072
#> SRR1700146 4 0.358 0.75345 0.004 0.000 0.068 0.832 0.068 0.028
#> SRR1700147 4 0.476 0.72740 0.004 0.004 0.036 0.740 0.148 0.068
#> SRR1700149 4 0.299 0.75598 0.004 0.000 0.048 0.872 0.044 0.032
#> SRR1700148 4 0.516 0.70163 0.004 0.000 0.124 0.712 0.064 0.096
#> SRR1700150 4 0.409 0.73167 0.000 0.008 0.008 0.780 0.124 0.080
#> SRR1700152 4 0.425 0.67873 0.004 0.000 0.000 0.736 0.176 0.084
#> SRR1700151 4 0.455 0.72972 0.000 0.000 0.112 0.756 0.072 0.060
#> SRR1700153 4 0.385 0.70931 0.000 0.008 0.004 0.776 0.172 0.040
#> SRR1700154 4 0.340 0.76281 0.000 0.008 0.020 0.844 0.052 0.076
#> SRR1700155 4 0.337 0.75853 0.004 0.008 0.020 0.852 0.068 0.048
#> SRR1700156 4 0.383 0.75094 0.004 0.000 0.112 0.808 0.044 0.032
#> SRR1700158 4 0.307 0.76360 0.024 0.000 0.016 0.872 0.044 0.044
#> SRR1700159 4 0.409 0.71556 0.000 0.000 0.008 0.760 0.156 0.076
#> SRR1700157 4 0.481 0.67264 0.000 0.000 0.204 0.700 0.060 0.036
#> SRR1700160 4 0.290 0.76423 0.000 0.008 0.016 0.876 0.056 0.044
#> SRR1700161 4 0.382 0.74835 0.000 0.004 0.036 0.816 0.084 0.060
#> SRR1700162 4 0.443 0.68095 0.004 0.000 0.012 0.728 0.196 0.060
#> SRR1700164 4 0.418 0.71365 0.136 0.000 0.020 0.768 0.000 0.076
#> SRR1700163 4 0.412 0.75626 0.020 0.000 0.056 0.808 0.044 0.072
#> SRR1700165 4 0.397 0.73782 0.004 0.036 0.112 0.800 0.000 0.048
#> SRR1700166 4 0.253 0.76227 0.020 0.004 0.012 0.904 0.024 0.036
#> SRR1700168 4 0.424 0.75998 0.008 0.000 0.068 0.792 0.048 0.084
#> SRR1700167 4 0.493 0.74370 0.012 0.000 0.092 0.744 0.084 0.068
#> SRR1700170 4 0.333 0.76045 0.008 0.000 0.048 0.852 0.064 0.028
#> SRR1700169 4 0.417 0.70448 0.008 0.000 0.168 0.756 0.004 0.064
#> SRR1700171 4 0.563 0.66079 0.108 0.020 0.004 0.684 0.040 0.144
#> SRR1700172 4 0.536 0.45887 0.004 0.016 0.000 0.588 0.316 0.076
#> SRR1700174 4 0.268 0.75597 0.000 0.024 0.012 0.892 0.024 0.048
#> SRR1700173 4 0.270 0.75166 0.004 0.020 0.016 0.892 0.012 0.056
#> SRR1700175 4 0.302 0.76042 0.004 0.004 0.052 0.872 0.020 0.048
#> SRR1700176 4 0.374 0.75270 0.000 0.028 0.068 0.824 0.008 0.072
#> SRR1700178 2 0.398 0.63414 0.076 0.816 0.028 0.024 0.000 0.056
#> SRR1700177 4 0.333 0.74496 0.000 0.000 0.016 0.828 0.120 0.036
#> SRR1700180 2 0.331 0.63470 0.104 0.840 0.004 0.024 0.000 0.028
#> SRR1700179 2 0.354 0.63046 0.032 0.844 0.004 0.044 0.008 0.068
#> SRR1700181 2 0.499 0.59080 0.116 0.720 0.000 0.096 0.000 0.068
#> SRR1700183 1 0.160 0.72275 0.940 0.024 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1700182 2 0.333 0.63161 0.036 0.856 0.004 0.052 0.004 0.048
#> SRR1700184 2 0.361 0.63961 0.044 0.844 0.016 0.020 0.008 0.068
#> SRR1700186 2 0.454 0.61763 0.024 0.780 0.052 0.060 0.000 0.084
#> SRR1700187 1 0.127 0.71994 0.960 0.008 0.004 0.008 0.004 0.016
#> SRR1700185 1 0.348 0.67584 0.816 0.000 0.008 0.016 0.020 0.140
#> SRR1700188 2 0.339 0.63567 0.036 0.852 0.060 0.004 0.004 0.044
#> SRR1700192 1 0.373 0.63436 0.784 0.164 0.000 0.012 0.000 0.040
#> SRR1700190 2 0.560 0.63347 0.128 0.704 0.032 0.032 0.012 0.092
#> SRR1700191 1 0.267 0.70800 0.880 0.012 0.004 0.008 0.008 0.088
#> SRR1700189 1 0.177 0.72062 0.932 0.008 0.004 0.012 0.000 0.044
#> SRR1700193 2 0.507 0.57130 0.244 0.660 0.040 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700195 2 0.422 0.59491 0.228 0.724 0.012 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700194 1 0.196 0.72332 0.924 0.012 0.004 0.016 0.000 0.044
#> SRR1700196 2 0.333 0.63652 0.052 0.856 0.036 0.004 0.004 0.048
#> SRR1700197 1 0.625 0.36888 0.568 0.284 0.056 0.032 0.000 0.060
#> SRR1700198 2 0.364 0.63666 0.088 0.832 0.016 0.024 0.000 0.040
#> SRR1700199 2 0.523 0.60684 0.132 0.696 0.104 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700200 2 0.456 0.62064 0.176 0.740 0.008 0.016 0.004 0.056
#> SRR1700201 2 0.487 0.59432 0.060 0.748 0.008 0.116 0.004 0.064
#> SRR1700202 1 0.244 0.72175 0.904 0.020 0.008 0.040 0.000 0.028
#> SRR1700203 2 0.620 0.45300 0.272 0.572 0.008 0.060 0.004 0.084
#> SRR1700204 2 0.671 0.29281 0.368 0.460 0.044 0.016 0.008 0.104
#> SRR1700206 2 0.552 0.46036 0.316 0.592 0.036 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700207 2 0.493 0.63329 0.112 0.744 0.064 0.016 0.000 0.064
#> SRR1700208 2 0.595 0.47673 0.272 0.592 0.008 0.032 0.008 0.088
#> SRR1700205 1 0.484 0.64604 0.740 0.120 0.016 0.004 0.016 0.104
#> SRR1700209 2 0.703 0.18135 0.024 0.492 0.028 0.012 0.236 0.208
#> SRR1700210 2 0.629 0.49436 0.280 0.560 0.008 0.016 0.028 0.108
#> SRR1700211 1 0.454 0.58177 0.732 0.192 0.020 0.012 0.000 0.044
#> SRR1700212 2 0.626 0.18628 0.408 0.456 0.000 0.040 0.016 0.080
#> SRR1700213 2 0.667 0.51110 0.076 0.608 0.044 0.028 0.044 0.200
#> SRR1700214 2 0.487 0.56402 0.248 0.672 0.012 0.008 0.000 0.060
#> SRR1700215 1 0.243 0.72242 0.900 0.012 0.000 0.036 0.004 0.048
#> SRR1700217 2 0.722 0.43981 0.160 0.524 0.004 0.020 0.140 0.152
#> SRR1700216 1 0.492 0.63118 0.732 0.024 0.048 0.000 0.040 0.156
#> SRR1700218 2 0.432 0.61885 0.024 0.780 0.004 0.008 0.064 0.120
#> SRR1700219 2 0.569 0.60256 0.072 0.692 0.004 0.044 0.044 0.144
#> SRR1700222 1 0.158 0.71810 0.944 0.024 0.000 0.004 0.008 0.020
#> SRR1700220 5 0.718 0.28614 0.008 0.232 0.004 0.116 0.488 0.152
#> SRR1700221 1 0.638 -0.04500 0.452 0.408 0.004 0.052 0.012 0.072
#> SRR1700223 2 0.572 0.60650 0.180 0.660 0.056 0.004 0.008 0.092
#> SRR1700224 5 0.757 -0.09074 0.320 0.204 0.000 0.004 0.328 0.144
#> SRR1700226 2 0.650 0.54037 0.136 0.600 0.012 0.004 0.096 0.152
#> SRR1700229 2 0.781 0.21428 0.068 0.464 0.060 0.012 0.224 0.172
#> SRR1700225 2 0.770 0.35979 0.056 0.504 0.144 0.124 0.008 0.164
#> SRR1700227 2 0.457 0.63609 0.044 0.780 0.032 0.060 0.000 0.084
#> SRR1700230 1 0.463 0.67427 0.772 0.084 0.016 0.036 0.004 0.088
#> SRR1700231 2 0.425 0.63658 0.124 0.780 0.016 0.016 0.000 0.064
#> SRR1700228 2 0.660 0.25389 0.380 0.448 0.028 0.020 0.004 0.120
#> SRR1700232 2 0.544 0.62687 0.040 0.732 0.036 0.032 0.044 0.116
#> SRR1700233 2 0.570 0.46657 0.312 0.568 0.056 0.000 0.000 0.064
#> SRR1700234 2 0.716 0.09131 0.388 0.404 0.020 0.084 0.008 0.096
#> SRR1700235 2 0.412 0.63487 0.012 0.808 0.024 0.068 0.008 0.080
#> SRR1700237 2 0.456 0.63321 0.056 0.788 0.004 0.048 0.032 0.072
#> SRR1700236 2 0.672 0.44207 0.056 0.560 0.020 0.004 0.188 0.172
#> SRR1700238 2 0.556 0.47407 0.328 0.572 0.036 0.004 0.000 0.060
#> SRR1700239 1 0.282 0.72238 0.880 0.036 0.008 0.016 0.000 0.060
#> SRR1700240 1 0.364 0.68793 0.812 0.000 0.012 0.032 0.012 0.132
#> SRR1700241 4 0.638 -0.03250 0.420 0.072 0.004 0.440 0.012 0.052
#> SRR1700243 2 0.489 0.62223 0.116 0.748 0.004 0.044 0.012 0.076
#> SRR1700244 2 0.738 0.23693 0.308 0.432 0.000 0.032 0.144 0.084
#> SRR1700242 1 0.227 0.72327 0.912 0.024 0.004 0.028 0.000 0.032
#> SRR1700246 1 0.390 0.69300 0.808 0.040 0.008 0.008 0.016 0.120
#> SRR1700245 2 0.364 0.63649 0.008 0.840 0.016 0.024 0.032 0.080
#> SRR1700247 1 0.260 0.71311 0.888 0.004 0.008 0.044 0.000 0.056
#> SRR1700249 1 0.342 0.67642 0.820 0.004 0.000 0.092 0.000 0.084
#> SRR1700250 2 0.361 0.62905 0.008 0.836 0.000 0.044 0.044 0.068
#> SRR1700248 2 0.551 0.58129 0.104 0.692 0.012 0.120 0.000 0.072
#> SRR1700251 2 0.712 0.20123 0.340 0.436 0.024 0.116 0.000 0.084
#> SRR1700252 2 0.626 0.53761 0.236 0.600 0.032 0.008 0.028 0.096
#> SRR1700253 2 0.568 0.62964 0.108 0.700 0.064 0.032 0.004 0.092
#> SRR1700256 2 0.635 0.43698 0.320 0.516 0.012 0.000 0.044 0.108
#> SRR1700254 1 0.229 0.71937 0.904 0.008 0.004 0.024 0.000 0.060
#> SRR1700255 1 0.624 0.05176 0.480 0.388 0.004 0.056 0.008 0.064
#> SRR1700257 2 0.494 0.51241 0.288 0.644 0.004 0.012 0.004 0.048
#> SRR1700258 2 0.557 0.59001 0.072 0.700 0.004 0.016 0.100 0.108
#> SRR1700259 2 0.709 0.43728 0.008 0.556 0.044 0.064 0.160 0.168
#> SRR1700260 5 0.429 0.55583 0.000 0.088 0.004 0.012 0.760 0.136
#> SRR1700261 5 0.347 0.58381 0.000 0.076 0.000 0.024 0.832 0.068
#> SRR1700262 5 0.343 0.59183 0.000 0.032 0.000 0.048 0.836 0.084
#> SRR1700263 2 0.793 0.10857 0.020 0.356 0.244 0.000 0.204 0.176
#> SRR1700264 2 0.562 0.55799 0.004 0.648 0.192 0.000 0.048 0.108
#> SRR1700265 3 0.781 0.17144 0.232 0.208 0.412 0.000 0.040 0.108
#> SRR1700266 5 0.536 0.30783 0.004 0.300 0.004 0.000 0.584 0.108
#> SRR1700268 2 0.802 0.01365 0.272 0.320 0.024 0.008 0.272 0.104
#> SRR1700270 2 0.566 0.61114 0.176 0.672 0.020 0.008 0.028 0.096
#> SRR1700267 2 0.465 0.60956 0.004 0.756 0.056 0.012 0.032 0.140
#> SRR1700271 2 0.725 0.36269 0.000 0.492 0.232 0.028 0.152 0.096
#> SRR1700272 2 0.840 -0.05428 0.040 0.284 0.004 0.196 0.276 0.200
#> SRR1700273 2 0.534 0.52513 0.020 0.676 0.016 0.000 0.184 0.104
#> SRR1700274 5 0.602 0.44541 0.016 0.180 0.000 0.044 0.624 0.136
#> SRR1700277 2 0.578 0.62459 0.076 0.696 0.044 0.024 0.024 0.136
#> SRR1700275 5 0.697 0.34327 0.020 0.088 0.000 0.228 0.520 0.144
#> SRR1700276 4 0.774 0.25362 0.240 0.036 0.000 0.432 0.140 0.152
#> SRR1700278 5 0.677 0.26244 0.308 0.052 0.024 0.008 0.512 0.096
#> SRR1700279 5 0.492 0.49285 0.200 0.008 0.000 0.012 0.692 0.088
#> SRR1700280 5 0.644 0.38145 0.248 0.068 0.000 0.020 0.568 0.096
#> SRR1700281 2 0.648 0.37640 0.084 0.504 0.328 0.000 0.012 0.072
#> SRR1700283 5 0.621 0.47674 0.016 0.132 0.000 0.080 0.624 0.148
#> SRR1700282 5 0.768 0.03373 0.356 0.068 0.000 0.068 0.368 0.140
#> SRR1700284 5 0.280 0.58857 0.004 0.004 0.004 0.068 0.876 0.044
#> SRR1700285 5 0.502 0.58141 0.036 0.044 0.000 0.068 0.744 0.108
#> SRR1700286 5 0.512 0.48463 0.000 0.180 0.008 0.012 0.680 0.120
#> SRR1700287 5 0.299 0.59166 0.000 0.036 0.000 0.020 0.860 0.084
#> SRR1700290 5 0.736 0.29136 0.180 0.028 0.108 0.012 0.528 0.144
#> SRR1700289 5 0.306 0.58642 0.004 0.024 0.016 0.004 0.860 0.092
#> SRR1700288 2 0.707 0.37860 0.244 0.492 0.000 0.020 0.168 0.076
#> SRR1700292 5 0.320 0.58956 0.032 0.036 0.000 0.008 0.860 0.064
#> SRR1700291 5 0.674 0.33720 0.000 0.028 0.048 0.256 0.528 0.140
#> SRR1700293 1 0.624 0.54616 0.660 0.068 0.016 0.124 0.028 0.104
#> SRR1700294 5 0.615 0.50575 0.072 0.004 0.064 0.064 0.664 0.132
#> SRR1700295 5 0.516 0.53012 0.016 0.008 0.008 0.128 0.704 0.136
#> SRR1700297 5 0.443 0.55216 0.008 0.020 0.000 0.108 0.764 0.100
#> SRR1700296 5 0.422 0.58013 0.088 0.016 0.000 0.024 0.792 0.080
#> SRR1700298 5 0.496 0.56939 0.048 0.020 0.000 0.092 0.744 0.096
#> SRR1700299 5 0.377 0.58784 0.008 0.016 0.000 0.076 0.816 0.084
#> SRR1700300 5 0.658 0.47046 0.116 0.056 0.008 0.040 0.612 0.168
#> SRR1700302 5 0.286 0.58382 0.004 0.000 0.004 0.060 0.868 0.064
#> SRR1700301 5 0.241 0.58653 0.000 0.004 0.004 0.024 0.892 0.076
#> SRR1700303 5 0.506 0.52108 0.008 0.004 0.016 0.136 0.708 0.128
#> SRR1700304 1 0.476 0.63358 0.764 0.008 0.012 0.040 0.100 0.076
#> SRR1700305 5 0.762 0.17573 0.312 0.040 0.008 0.084 0.428 0.128
#> SRR1700306 5 0.324 0.58269 0.020 0.000 0.016 0.012 0.844 0.108
#> SRR1700308 5 0.575 0.46086 0.008 0.128 0.048 0.016 0.680 0.120
#> SRR1700307 5 0.824 0.20432 0.080 0.116 0.048 0.156 0.492 0.108
#> SRR1700309 5 0.599 0.41030 0.020 0.088 0.044 0.012 0.652 0.184
#> SRR1700310 5 0.440 0.57750 0.024 0.004 0.016 0.072 0.784 0.100
#> SRR1700311 5 0.583 0.52159 0.072 0.000 0.036 0.092 0.680 0.120
#> SRR1700312 5 0.414 0.58040 0.008 0.016 0.004 0.072 0.792 0.108
#> SRR1700313 3 0.987 -0.33411 0.188 0.112 0.224 0.148 0.144 0.184
#> SRR1700314 5 0.387 0.57438 0.000 0.000 0.012 0.104 0.792 0.092
#> SRR1700315 5 0.632 0.44730 0.040 0.032 0.056 0.028 0.620 0.224
#> SRR1700316 5 0.639 0.29832 0.000 0.036 0.012 0.264 0.536 0.152
#> SRR1700317 5 0.505 0.51733 0.040 0.112 0.020 0.000 0.732 0.096
#> SRR1700318 5 0.526 0.47569 0.204 0.012 0.008 0.004 0.668 0.104
#> SRR1700319 5 0.392 0.54156 0.000 0.000 0.000 0.148 0.764 0.088
#> SRR1700320 5 0.276 0.58693 0.008 0.004 0.020 0.024 0.888 0.056
#> SRR1700322 5 0.778 0.17623 0.192 0.032 0.000 0.240 0.412 0.124
#> SRR1700321 5 0.336 0.58787 0.000 0.028 0.008 0.028 0.844 0.092
#> SRR1700323 5 0.599 0.32427 0.000 0.000 0.052 0.288 0.556 0.104
#> SRR1700324 5 0.742 0.43056 0.124 0.036 0.032 0.108 0.560 0.140
#> SRR1700325 5 0.832 0.13139 0.108 0.216 0.000 0.116 0.388 0.172
#> SRR1700326 5 0.775 0.16340 0.272 0.016 0.008 0.160 0.408 0.136
#> SRR1700327 5 0.395 0.58216 0.000 0.048 0.004 0.040 0.804 0.104
#> SRR1700329 5 0.333 0.59068 0.008 0.008 0.004 0.060 0.848 0.072
#> SRR1700328 1 0.797 0.00571 0.424 0.104 0.060 0.004 0.252 0.156
#> SRR1700330 1 0.719 -0.11154 0.400 0.044 0.004 0.064 0.396 0.092
#> SRR1700331 5 0.308 0.57341 0.008 0.008 0.024 0.004 0.856 0.100
#> SRR1700332 5 0.360 0.58317 0.004 0.012 0.004 0.084 0.828 0.068
#> SRR1700333 1 0.687 0.07175 0.444 0.024 0.004 0.048 0.368 0.112
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.001023 0.449 0.732 0.3312 0.941 0.941
#> 3 3 0.000316 0.424 0.593 0.4321 0.642 0.625
#> 4 4 0.002847 0.485 0.580 0.1710 0.724 0.594
#> 5 5 0.021829 0.487 0.550 0.1050 0.952 0.902
#> 6 6 0.045439 0.456 0.543 0.0721 0.949 0.894
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.680 0.62219 0.180 0.820
#> SRR1699875 2 0.680 0.60590 0.180 0.820
#> SRR1699876 2 0.689 0.61435 0.184 0.816
#> SRR1699877 2 0.730 0.61545 0.204 0.796
#> SRR1699879 2 0.634 0.62632 0.160 0.840
#> SRR1699878 2 0.839 0.51894 0.268 0.732
#> SRR1699880 2 0.904 0.24122 0.320 0.680
#> SRR1699881 2 0.913 0.33118 0.328 0.672
#> SRR1699882 2 0.722 0.61145 0.200 0.800
#> SRR1699883 2 0.844 0.59670 0.272 0.728
#> SRR1699884 2 0.689 0.62713 0.184 0.816
#> SRR1699885 2 0.745 0.58007 0.212 0.788
#> SRR1699886 2 0.634 0.62950 0.160 0.840
#> SRR1699888 2 0.615 0.60751 0.152 0.848
#> SRR1699889 2 0.714 0.62575 0.196 0.804
#> SRR1699890 2 0.634 0.60270 0.160 0.840
#> SRR1699887 2 0.671 0.62165 0.176 0.824
#> SRR1699891 2 0.662 0.62465 0.172 0.828
#> SRR1699892 2 0.795 0.55570 0.240 0.760
#> SRR1699893 2 0.833 0.53682 0.264 0.736
#> SRR1699894 2 0.595 0.62082 0.144 0.856
#> SRR1699895 2 0.662 0.62281 0.172 0.828
#> SRR1699896 2 0.775 0.60910 0.228 0.772
#> SRR1699897 2 0.722 0.61679 0.200 0.800
#> SRR1699898 2 0.913 0.25929 0.328 0.672
#> SRR1699900 2 0.697 0.60859 0.188 0.812
#> SRR1699899 2 0.706 0.63581 0.192 0.808
#> SRR1699902 2 0.895 0.42325 0.312 0.688
#> SRR1699901 2 0.929 0.31359 0.344 0.656
#> SRR1699903 2 0.689 0.63460 0.184 0.816
#> SRR1699904 2 0.584 0.62235 0.140 0.860
#> SRR1699905 2 0.876 0.44751 0.296 0.704
#> SRR1699906 2 0.714 0.60752 0.196 0.804
#> SRR1699907 2 0.730 0.62296 0.204 0.796
#> SRR1699908 2 0.615 0.63317 0.152 0.848
#> SRR1699909 2 0.605 0.63408 0.148 0.852
#> SRR1699910 2 0.839 0.50138 0.268 0.732
#> SRR1699911 2 0.714 0.63346 0.196 0.804
#> SRR1699912 2 0.680 0.63325 0.180 0.820
#> SRR1699913 2 0.730 0.63065 0.204 0.796
#> SRR1699914 2 0.886 0.39524 0.304 0.696
#> SRR1699915 2 0.767 0.60723 0.224 0.776
#> SRR1699916 2 0.605 0.61161 0.148 0.852
#> SRR1699917 2 0.775 0.59985 0.228 0.772
#> SRR1699918 2 0.689 0.63464 0.184 0.816
#> SRR1699919 2 0.697 0.62926 0.188 0.812
#> SRR1699920 2 0.839 0.51068 0.268 0.732
#> SRR1699921 2 0.714 0.63375 0.196 0.804
#> SRR1699922 2 0.605 0.63294 0.148 0.852
#> SRR1699923 2 0.808 0.56688 0.248 0.752
#> SRR1699924 2 0.969 0.03277 0.396 0.604
#> SRR1699925 2 0.998 -0.77156 0.476 0.524
#> SRR1699926 2 0.802 0.58639 0.244 0.756
#> SRR1699927 2 0.653 0.63317 0.168 0.832
#> SRR1699929 2 0.808 0.53321 0.248 0.752
#> SRR1699928 2 0.697 0.61294 0.188 0.812
#> SRR1699930 2 0.680 0.61905 0.180 0.820
#> SRR1699931 2 0.767 0.59458 0.224 0.776
#> SRR1699933 2 0.904 0.39258 0.320 0.680
#> SRR1699932 2 0.714 0.63377 0.196 0.804
#> SRR1699934 2 0.998 -0.77156 0.476 0.524
#> SRR1699935 2 0.775 0.59606 0.228 0.772
#> SRR1699936 2 0.680 0.59084 0.180 0.820
#> SRR1699937 2 0.788 0.61146 0.236 0.764
#> SRR1699938 2 0.680 0.60928 0.180 0.820
#> SRR1699940 2 0.833 0.58417 0.264 0.736
#> SRR1699939 2 0.714 0.57723 0.196 0.804
#> SRR1699941 2 0.913 0.27127 0.328 0.672
#> SRR1699942 2 0.949 0.25483 0.368 0.632
#> SRR1699943 2 0.760 0.58231 0.220 0.780
#> SRR1699944 2 0.781 0.59361 0.232 0.768
#> SRR1699945 2 0.985 -0.44196 0.428 0.572
#> SRR1699946 2 0.808 0.60370 0.248 0.752
#> SRR1699947 2 0.738 0.62462 0.208 0.792
#> SRR1699948 2 0.680 0.57658 0.180 0.820
#> SRR1699949 2 0.671 0.60546 0.176 0.824
#> SRR1699950 2 0.689 0.57467 0.184 0.816
#> SRR1699951 2 0.866 0.56305 0.288 0.712
#> SRR1699952 2 0.833 0.59039 0.264 0.736
#> SRR1699953 2 0.680 0.60184 0.180 0.820
#> SRR1699954 2 0.844 0.53789 0.272 0.728
#> SRR1699955 2 0.634 0.58800 0.160 0.840
#> SRR1699956 2 0.971 -0.32884 0.400 0.600
#> SRR1699957 2 0.760 0.60472 0.220 0.780
#> SRR1699959 2 0.855 0.53671 0.280 0.720
#> SRR1699958 2 0.753 0.62015 0.216 0.784
#> SRR1699960 2 0.625 0.60869 0.156 0.844
#> SRR1699961 2 0.876 0.45328 0.296 0.704
#> SRR1699962 2 0.541 0.62100 0.124 0.876
#> SRR1699963 2 0.781 0.62443 0.232 0.768
#> SRR1699964 2 0.760 0.61637 0.220 0.780
#> SRR1699965 2 0.662 0.59154 0.172 0.828
#> SRR1699966 2 0.881 0.51915 0.300 0.700
#> SRR1699967 2 0.781 0.61290 0.232 0.768
#> SRR1699968 2 0.730 0.62778 0.204 0.796
#> SRR1699969 2 0.952 -0.03215 0.372 0.628
#> SRR1699971 2 0.839 0.52071 0.268 0.732
#> SRR1699970 2 0.738 0.58654 0.208 0.792
#> SRR1699972 2 0.833 0.52097 0.264 0.736
#> SRR1699973 2 0.827 0.59045 0.260 0.740
#> SRR1699974 2 0.939 -0.00735 0.356 0.644
#> SRR1699975 2 0.730 0.62735 0.204 0.796
#> SRR1699976 2 0.891 0.40377 0.308 0.692
#> SRR1699977 2 0.850 0.53336 0.276 0.724
#> SRR1699978 2 0.952 -0.04953 0.372 0.628
#> SRR1699979 2 0.886 0.39929 0.304 0.696
#> SRR1699980 2 0.788 0.61939 0.236 0.764
#> SRR1699981 2 0.866 0.46045 0.288 0.712
#> SRR1699982 2 0.644 0.63119 0.164 0.836
#> SRR1699983 2 0.714 0.62895 0.196 0.804
#> SRR1699984 2 0.997 -0.76460 0.468 0.532
#> SRR1699985 2 0.584 0.62922 0.140 0.860
#> SRR1699986 2 0.900 0.26571 0.316 0.684
#> SRR1699988 2 0.738 0.61836 0.208 0.792
#> SRR1699987 2 0.904 0.38869 0.320 0.680
#> SRR1699989 2 0.808 0.60203 0.248 0.752
#> SRR1699990 2 0.861 0.44781 0.284 0.716
#> SRR1699992 2 0.839 0.55180 0.268 0.732
#> SRR1699991 2 0.917 0.26187 0.332 0.668
#> SRR1699993 2 0.913 0.17551 0.328 0.672
#> SRR1699994 2 0.936 0.02664 0.352 0.648
#> SRR1699995 2 0.980 -0.47888 0.416 0.584
#> SRR1699996 2 0.730 0.62702 0.204 0.796
#> SRR1699997 2 0.855 0.51013 0.280 0.720
#> SRR1699998 2 0.671 0.63257 0.176 0.824
#> SRR1699999 2 0.971 -0.27918 0.400 0.600
#> SRR1700000 2 0.767 0.61854 0.224 0.776
#> SRR1700002 2 0.814 0.50829 0.252 0.748
#> SRR1700001 2 0.909 0.32047 0.324 0.676
#> SRR1700003 2 0.808 0.60906 0.248 0.752
#> SRR1700004 2 0.925 0.21359 0.340 0.660
#> SRR1700005 1 1.000 0.87526 0.500 0.500
#> SRR1700006 2 0.913 0.31752 0.328 0.672
#> SRR1700007 2 0.574 0.60767 0.136 0.864
#> SRR1700008 2 0.917 0.24833 0.332 0.668
#> SRR1700009 2 0.991 -0.69847 0.444 0.556
#> SRR1700010 2 0.975 -0.31923 0.408 0.592
#> SRR1700011 2 0.595 0.62152 0.144 0.856
#> SRR1700013 2 0.850 0.50290 0.276 0.724
#> SRR1700012 2 0.795 0.60664 0.240 0.760
#> SRR1700014 2 0.866 0.43473 0.288 0.712
#> SRR1700015 2 0.844 0.49553 0.272 0.728
#> SRR1700016 2 0.993 -0.55905 0.452 0.548
#> SRR1700018 2 0.917 0.38316 0.332 0.668
#> SRR1700017 2 0.921 0.37648 0.336 0.664
#> SRR1700019 2 0.595 0.61563 0.144 0.856
#> SRR1700020 2 1.000 -0.47436 0.488 0.512
#> SRR1700021 2 0.827 0.60196 0.260 0.740
#> SRR1700023 2 0.850 0.50025 0.276 0.724
#> SRR1700022 2 0.946 0.08075 0.364 0.636
#> SRR1700024 2 0.767 0.62098 0.224 0.776
#> SRR1700025 2 0.900 0.46320 0.316 0.684
#> SRR1700026 2 0.861 0.49364 0.284 0.716
#> SRR1700027 2 0.844 0.48700 0.272 0.728
#> SRR1700028 2 0.814 0.54924 0.252 0.748
#> SRR1700029 2 0.943 0.22363 0.360 0.640
#> SRR1700030 2 0.745 0.62267 0.212 0.788
#> SRR1700031 2 0.973 -0.16297 0.404 0.596
#> SRR1700032 2 0.850 0.55906 0.276 0.724
#> SRR1700034 2 0.963 -0.22599 0.388 0.612
#> SRR1700035 2 0.738 0.60536 0.208 0.792
#> SRR1700033 2 0.925 0.20766 0.340 0.660
#> SRR1700036 2 0.904 0.47869 0.320 0.680
#> SRR1700037 2 0.644 0.63205 0.164 0.836
#> SRR1700038 2 0.881 0.37449 0.300 0.700
#> SRR1700039 2 0.981 -0.28895 0.420 0.580
#> SRR1700040 2 0.925 0.14017 0.340 0.660
#> SRR1700041 2 0.955 0.14208 0.376 0.624
#> SRR1700042 2 0.952 0.01263 0.372 0.628
#> SRR1700043 2 0.904 0.30889 0.320 0.680
#> SRR1700045 2 0.900 0.35598 0.316 0.684
#> SRR1700044 2 0.861 0.51874 0.284 0.716
#> SRR1700046 2 0.913 0.34356 0.328 0.672
#> SRR1700047 2 0.966 -0.04404 0.392 0.608
#> SRR1700048 2 0.900 0.35255 0.316 0.684
#> SRR1700049 2 0.949 -0.15781 0.368 0.632
#> SRR1700050 2 0.985 -0.34758 0.428 0.572
#> SRR1700051 2 0.973 -0.18230 0.404 0.596
#> SRR1700052 2 0.929 0.14972 0.344 0.656
#> SRR1700053 2 0.932 0.23444 0.348 0.652
#> SRR1700054 2 0.939 0.16969 0.356 0.644
#> SRR1700055 2 0.971 -0.32715 0.400 0.600
#> SRR1700056 2 0.949 0.09248 0.368 0.632
#> SRR1700057 2 0.978 -0.03359 0.412 0.588
#> SRR1700058 2 0.961 -0.09154 0.384 0.616
#> SRR1700059 2 0.973 -0.03361 0.404 0.596
#> SRR1700060 2 0.932 0.11316 0.348 0.652
#> SRR1700061 2 0.913 0.24469 0.328 0.672
#> SRR1700062 2 0.961 -0.07840 0.384 0.616
#> SRR1700063 2 0.961 -0.04606 0.384 0.616
#> SRR1700064 2 0.904 0.41704 0.320 0.680
#> SRR1700065 2 0.871 0.35948 0.292 0.708
#> SRR1700066 2 0.929 0.19008 0.344 0.656
#> SRR1700067 2 0.844 0.55592 0.272 0.728
#> SRR1700068 2 0.939 0.13491 0.356 0.644
#> SRR1700069 2 0.855 0.51393 0.280 0.720
#> SRR1700070 2 0.634 0.62676 0.160 0.840
#> SRR1700071 2 0.932 0.19996 0.348 0.652
#> SRR1700072 2 0.929 0.25453 0.344 0.656
#> SRR1700073 2 0.697 0.62521 0.188 0.812
#> SRR1700075 2 0.929 0.36472 0.344 0.656
#> SRR1700074 2 0.936 0.26020 0.352 0.648
#> SRR1700076 2 0.881 0.45860 0.300 0.700
#> SRR1700077 2 0.921 0.31718 0.336 0.664
#> SRR1700078 2 0.871 0.42869 0.292 0.708
#> SRR1700080 2 0.844 0.51549 0.272 0.728
#> SRR1700079 2 0.949 0.10411 0.368 0.632
#> SRR1700081 2 0.925 0.12948 0.340 0.660
#> SRR1700082 2 0.904 0.41051 0.320 0.680
#> SRR1700083 2 0.966 0.00580 0.392 0.608
#> SRR1700084 2 0.949 0.05247 0.368 0.632
#> SRR1700085 2 0.722 0.63179 0.200 0.800
#> SRR1700086 2 0.844 0.55783 0.272 0.728
#> SRR1700087 2 0.844 0.57070 0.272 0.728
#> SRR1700088 2 0.781 0.58051 0.232 0.768
#> SRR1700089 2 0.839 0.52646 0.268 0.732
#> SRR1700091 2 0.871 0.49361 0.292 0.708
#> SRR1700090 2 0.866 0.46367 0.288 0.712
#> SRR1700092 2 0.827 0.53394 0.260 0.740
#> SRR1700094 2 0.876 0.39210 0.296 0.704
#> SRR1700093 2 0.855 0.52063 0.280 0.720
#> SRR1700095 2 0.925 0.37046 0.340 0.660
#> SRR1700096 2 0.891 0.35290 0.308 0.692
#> SRR1700097 2 0.943 0.17692 0.360 0.640
#> SRR1700098 2 0.760 0.61074 0.220 0.780
#> SRR1700099 2 0.866 0.49405 0.288 0.712
#> SRR1700100 2 0.844 0.54779 0.272 0.728
#> SRR1700101 2 0.821 0.53389 0.256 0.744
#> SRR1700102 2 0.913 0.45956 0.328 0.672
#> SRR1700104 2 0.876 0.45434 0.296 0.704
#> SRR1700103 2 0.839 0.47958 0.268 0.732
#> SRR1700105 2 0.833 0.53207 0.264 0.736
#> SRR1700106 2 0.861 0.53848 0.284 0.716
#> SRR1700107 2 0.827 0.56550 0.260 0.740
#> SRR1700108 2 0.827 0.55369 0.260 0.740
#> SRR1700109 2 0.552 0.61701 0.128 0.872
#> SRR1700110 2 0.644 0.62027 0.164 0.836
#> SRR1700112 2 0.552 0.61698 0.128 0.872
#> SRR1700111 2 0.921 0.35427 0.336 0.664
#> SRR1700113 2 0.760 0.61739 0.220 0.780
#> SRR1700114 2 0.839 0.52070 0.268 0.732
#> SRR1700115 2 0.913 0.42719 0.328 0.672
#> SRR1700116 2 0.855 0.51551 0.280 0.720
#> SRR1700117 2 0.981 -0.27502 0.420 0.580
#> SRR1700119 2 0.844 0.46919 0.272 0.728
#> SRR1700118 2 0.844 0.51435 0.272 0.728
#> SRR1700120 2 0.839 0.43980 0.268 0.732
#> SRR1700121 2 0.895 0.47595 0.312 0.688
#> SRR1700122 2 0.680 0.63537 0.180 0.820
#> SRR1700123 2 0.917 0.32002 0.332 0.668
#> SRR1700125 2 0.625 0.62115 0.156 0.844
#> SRR1700126 2 0.932 0.19037 0.348 0.652
#> SRR1700127 2 0.895 0.38169 0.312 0.688
#> SRR1700124 2 0.876 0.41976 0.296 0.704
#> SRR1700128 2 0.909 0.34914 0.324 0.676
#> SRR1700129 2 0.689 0.63102 0.184 0.816
#> SRR1700130 2 0.821 0.57806 0.256 0.744
#> SRR1700132 2 0.844 0.47005 0.272 0.728
#> SRR1700131 2 0.925 0.30861 0.340 0.660
#> SRR1700133 2 0.839 0.50921 0.268 0.732
#> SRR1700134 2 0.584 0.63097 0.140 0.860
#> SRR1700135 2 0.913 0.26656 0.328 0.672
#> SRR1700136 2 0.917 0.21021 0.332 0.668
#> SRR1700137 2 0.855 0.52579 0.280 0.720
#> SRR1700138 2 0.833 0.42966 0.264 0.736
#> SRR1700140 2 0.891 0.38073 0.308 0.692
#> SRR1700139 2 0.891 0.41833 0.308 0.692
#> SRR1700141 2 0.671 0.63443 0.176 0.824
#> SRR1700142 2 0.973 -0.03336 0.404 0.596
#> SRR1700143 2 0.939 0.26362 0.356 0.644
#> SRR1700144 2 0.929 0.14785 0.344 0.656
#> SRR1700145 2 0.871 0.47040 0.292 0.708
#> SRR1700146 2 0.680 0.63086 0.180 0.820
#> SRR1700147 2 0.925 0.31941 0.340 0.660
#> SRR1700149 2 0.827 0.47959 0.260 0.740
#> SRR1700148 2 0.925 0.27880 0.340 0.660
#> SRR1700150 2 0.753 0.59427 0.216 0.784
#> SRR1700152 2 0.895 0.39962 0.312 0.688
#> SRR1700151 2 0.909 0.28667 0.324 0.676
#> SRR1700153 2 0.833 0.51562 0.264 0.736
#> SRR1700154 2 0.866 0.44896 0.288 0.712
#> SRR1700155 2 0.855 0.49869 0.280 0.720
#> SRR1700156 2 0.913 0.30202 0.328 0.672
#> SRR1700158 2 0.876 0.32392 0.296 0.704
#> SRR1700159 2 0.574 0.62944 0.136 0.864
#> SRR1700157 2 0.876 0.42700 0.296 0.704
#> SRR1700160 2 0.909 0.35283 0.324 0.676
#> SRR1700161 2 0.932 0.25226 0.348 0.652
#> SRR1700162 2 0.574 0.62935 0.136 0.864
#> SRR1700164 2 0.925 0.34137 0.340 0.660
#> SRR1700163 2 0.932 0.20084 0.348 0.652
#> SRR1700165 2 0.936 0.22704 0.352 0.648
#> SRR1700166 2 0.886 0.42442 0.304 0.696
#> SRR1700168 2 0.689 0.63155 0.184 0.816
#> SRR1700167 2 0.891 0.40497 0.308 0.692
#> SRR1700170 2 0.861 0.51567 0.284 0.716
#> SRR1700169 2 0.921 0.31144 0.336 0.664
#> SRR1700171 2 0.932 0.16316 0.348 0.652
#> SRR1700172 2 0.781 0.56374 0.232 0.768
#> SRR1700174 2 0.827 0.48754 0.260 0.740
#> SRR1700173 2 0.850 0.46755 0.276 0.724
#> SRR1700175 2 0.861 0.48349 0.284 0.716
#> SRR1700176 2 0.936 0.23129 0.352 0.648
#> SRR1700178 2 0.714 0.54340 0.196 0.804
#> SRR1700177 2 0.861 0.49978 0.284 0.716
#> SRR1700180 2 0.714 0.55250 0.196 0.804
#> SRR1700179 2 0.808 0.51994 0.248 0.752
#> SRR1700181 2 0.680 0.55945 0.180 0.820
#> SRR1700183 1 0.999 0.90586 0.516 0.484
#> SRR1700182 2 0.788 0.51969 0.236 0.764
#> SRR1700184 2 0.714 0.56358 0.196 0.804
#> SRR1700186 2 0.745 0.55809 0.212 0.788
#> SRR1700187 1 1.000 0.89300 0.512 0.488
#> SRR1700185 1 1.000 0.90510 0.512 0.488
#> SRR1700188 2 0.730 0.56454 0.204 0.796
#> SRR1700192 2 0.987 -0.60454 0.432 0.568
#> SRR1700190 1 1.000 0.84642 0.512 0.488
#> SRR1700191 1 0.998 0.90394 0.524 0.476
#> SRR1700189 2 0.992 -0.64332 0.448 0.552
#> SRR1700193 2 0.680 0.58284 0.180 0.820
#> SRR1700195 2 0.680 0.59007 0.180 0.820
#> SRR1700194 1 0.999 0.90379 0.516 0.484
#> SRR1700196 2 0.680 0.58236 0.180 0.820
#> SRR1700197 2 0.998 -0.66383 0.476 0.524
#> SRR1700198 2 0.689 0.57565 0.184 0.816
#> SRR1700199 2 0.662 0.57427 0.172 0.828
#> SRR1700200 2 0.605 0.58739 0.148 0.852
#> SRR1700201 2 0.662 0.57702 0.172 0.828
#> SRR1700202 2 0.671 0.63685 0.176 0.824
#> SRR1700203 2 0.745 0.55916 0.212 0.788
#> SRR1700204 2 0.745 0.60324 0.212 0.788
#> SRR1700206 2 0.689 0.63588 0.184 0.816
#> SRR1700207 2 0.662 0.58396 0.172 0.828
#> SRR1700208 1 1.000 0.83887 0.508 0.492
#> SRR1700205 2 0.722 0.58282 0.200 0.800
#> SRR1700209 2 0.563 0.60114 0.132 0.868
#> SRR1700210 2 0.730 0.55693 0.204 0.796
#> SRR1700211 2 0.625 0.59821 0.156 0.844
#> SRR1700212 2 0.653 0.57871 0.168 0.832
#> SRR1700213 2 0.891 0.50615 0.308 0.692
#> SRR1700214 2 0.644 0.57982 0.164 0.836
#> SRR1700215 1 1.000 0.88623 0.508 0.492
#> SRR1700217 2 0.552 0.60494 0.128 0.872
#> SRR1700216 2 1.000 -0.89336 0.500 0.500
#> SRR1700218 2 0.689 0.62232 0.184 0.816
#> SRR1700219 2 0.653 0.59015 0.168 0.832
#> SRR1700222 2 0.999 -0.88086 0.484 0.516
#> SRR1700220 2 0.615 0.58292 0.152 0.848
#> SRR1700221 2 0.680 0.58820 0.180 0.820
#> SRR1700223 2 0.634 0.59853 0.160 0.840
#> SRR1700224 2 0.595 0.63597 0.144 0.856
#> SRR1700226 2 0.722 0.58343 0.200 0.800
#> SRR1700229 2 0.706 0.57958 0.192 0.808
#> SRR1700225 2 0.952 0.26983 0.372 0.628
#> SRR1700227 2 0.706 0.59705 0.192 0.808
#> SRR1700230 2 0.996 -0.78930 0.464 0.536
#> SRR1700231 2 0.689 0.57864 0.184 0.816
#> SRR1700228 2 0.625 0.61354 0.156 0.844
#> SRR1700232 2 0.706 0.58578 0.192 0.808
#> SRR1700233 2 0.662 0.61125 0.172 0.828
#> SRR1700234 2 0.595 0.61657 0.144 0.856
#> SRR1700235 2 0.722 0.62918 0.200 0.800
#> SRR1700237 2 0.689 0.57520 0.184 0.816
#> SRR1700236 2 0.722 0.57520 0.200 0.800
#> SRR1700238 2 0.625 0.59574 0.156 0.844
#> SRR1700239 1 1.000 0.88925 0.500 0.500
#> SRR1700240 1 0.998 0.90242 0.528 0.472
#> SRR1700241 2 0.814 0.54276 0.252 0.748
#> SRR1700243 2 0.605 0.59416 0.148 0.852
#> SRR1700244 2 0.730 0.60880 0.204 0.796
#> SRR1700242 2 0.987 -0.48192 0.432 0.568
#> SRR1700246 2 0.605 0.61167 0.148 0.852
#> SRR1700245 2 0.706 0.56762 0.192 0.808
#> SRR1700247 1 0.998 0.81876 0.528 0.472
#> SRR1700249 1 0.999 0.90763 0.516 0.484
#> SRR1700250 2 0.802 0.51490 0.244 0.756
#> SRR1700248 2 0.714 0.59321 0.196 0.804
#> SRR1700251 2 0.753 0.58032 0.216 0.784
#> SRR1700252 2 0.943 0.08062 0.360 0.640
#> SRR1700253 2 0.697 0.56680 0.188 0.812
#> SRR1700256 2 0.615 0.59361 0.152 0.848
#> SRR1700254 1 0.999 0.89585 0.520 0.480
#> SRR1700255 2 0.605 0.59553 0.148 0.852
#> SRR1700257 2 0.738 0.54445 0.208 0.792
#> SRR1700258 2 0.662 0.59942 0.172 0.828
#> SRR1700259 2 0.615 0.61186 0.152 0.848
#> SRR1700260 2 0.541 0.61290 0.124 0.876
#> SRR1700261 2 0.563 0.61547 0.132 0.868
#> SRR1700262 2 0.482 0.61878 0.104 0.896
#> SRR1700263 2 0.625 0.61687 0.156 0.844
#> SRR1700264 2 0.781 0.61743 0.232 0.768
#> SRR1700265 2 0.760 0.62251 0.220 0.780
#> SRR1700266 2 0.745 0.54929 0.212 0.788
#> SRR1700268 2 0.814 0.45354 0.252 0.748
#> SRR1700270 2 0.653 0.61348 0.168 0.832
#> SRR1700267 2 0.595 0.60231 0.144 0.856
#> SRR1700271 2 0.662 0.60054 0.172 0.828
#> SRR1700272 2 0.574 0.62685 0.136 0.864
#> SRR1700273 2 0.644 0.60136 0.164 0.836
#> SRR1700274 2 0.662 0.61892 0.172 0.828
#> SRR1700277 2 0.991 -0.50375 0.444 0.556
#> SRR1700275 2 0.574 0.62950 0.136 0.864
#> SRR1700276 2 0.706 0.58909 0.192 0.808
#> SRR1700278 2 0.689 0.63192 0.184 0.816
#> SRR1700279 2 0.697 0.59563 0.188 0.812
#> SRR1700280 2 0.697 0.58327 0.188 0.812
#> SRR1700281 2 0.671 0.60201 0.176 0.824
#> SRR1700283 2 0.689 0.59532 0.184 0.816
#> SRR1700282 2 0.808 0.58698 0.248 0.752
#> SRR1700284 2 0.653 0.63235 0.168 0.832
#> SRR1700285 2 0.697 0.63259 0.188 0.812
#> SRR1700286 2 0.722 0.61298 0.200 0.800
#> SRR1700287 2 0.605 0.62768 0.148 0.852
#> SRR1700290 2 0.985 -0.46563 0.428 0.572
#> SRR1700289 2 0.644 0.62911 0.164 0.836
#> SRR1700288 2 0.722 0.63240 0.200 0.800
#> SRR1700292 2 0.662 0.61074 0.172 0.828
#> SRR1700291 2 0.808 0.60603 0.248 0.752
#> SRR1700293 2 0.760 0.58629 0.220 0.780
#> SRR1700294 2 0.563 0.63199 0.132 0.868
#> SRR1700295 2 0.913 0.36727 0.328 0.672
#> SRR1700297 2 0.671 0.60868 0.176 0.824
#> SRR1700296 2 0.662 0.60794 0.172 0.828
#> SRR1700298 2 0.738 0.59490 0.208 0.792
#> SRR1700299 2 0.689 0.62676 0.184 0.816
#> SRR1700300 2 0.714 0.61662 0.196 0.804
#> SRR1700302 2 0.605 0.63374 0.148 0.852
#> SRR1700301 2 0.584 0.61836 0.140 0.860
#> SRR1700303 2 0.541 0.62270 0.124 0.876
#> SRR1700304 2 0.680 0.62631 0.180 0.820
#> SRR1700305 2 0.644 0.63361 0.164 0.836
#> SRR1700306 2 0.821 0.53812 0.256 0.744
#> SRR1700308 2 0.745 0.62947 0.212 0.788
#> SRR1700307 2 0.827 0.51072 0.260 0.740
#> SRR1700309 2 0.827 0.53339 0.260 0.740
#> SRR1700310 2 0.634 0.60054 0.160 0.840
#> SRR1700311 2 0.814 0.55940 0.252 0.748
#> SRR1700312 2 0.738 0.61985 0.208 0.792
#> SRR1700313 2 0.738 0.57418 0.208 0.792
#> SRR1700314 2 0.706 0.59669 0.192 0.808
#> SRR1700315 2 0.697 0.62066 0.188 0.812
#> SRR1700316 2 0.753 0.58967 0.216 0.784
#> SRR1700317 2 0.563 0.62293 0.132 0.868
#> SRR1700318 2 0.827 0.55321 0.260 0.740
#> SRR1700319 2 0.855 0.46440 0.280 0.720
#> SRR1700320 2 0.644 0.62679 0.164 0.836
#> SRR1700322 2 0.706 0.62453 0.192 0.808
#> SRR1700321 2 0.529 0.62237 0.120 0.880
#> SRR1700323 2 0.671 0.63036 0.176 0.824
#> SRR1700324 2 0.615 0.63002 0.152 0.848
#> SRR1700325 2 0.753 0.62280 0.216 0.784
#> SRR1700326 2 0.788 0.58248 0.236 0.764
#> SRR1700327 2 0.680 0.62147 0.180 0.820
#> SRR1700329 2 0.662 0.63433 0.172 0.828
#> SRR1700328 2 0.753 0.61646 0.216 0.784
#> SRR1700330 2 0.802 0.55872 0.244 0.756
#> SRR1700331 2 0.706 0.62949 0.192 0.808
#> SRR1700332 2 0.730 0.62842 0.204 0.796
#> SRR1700333 2 0.753 0.63064 0.216 0.784
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.637 0.63410 NA 0.756 0.176
#> SRR1699875 2 0.626 0.62447 NA 0.776 0.112
#> SRR1699876 2 0.583 0.63353 NA 0.784 0.164
#> SRR1699877 2 0.728 0.61263 NA 0.704 0.192
#> SRR1699879 2 0.612 0.63337 NA 0.772 0.164
#> SRR1699878 2 0.728 0.52563 NA 0.704 0.104
#> SRR1699880 3 0.821 0.51239 NA 0.404 0.520
#> SRR1699881 3 0.847 0.32390 NA 0.456 0.456
#> SRR1699882 2 0.645 0.63446 NA 0.760 0.152
#> SRR1699883 2 0.806 0.54885 NA 0.640 0.236
#> SRR1699884 2 0.678 0.60788 NA 0.736 0.176
#> SRR1699885 2 0.685 0.61345 NA 0.740 0.136
#> SRR1699886 2 0.600 0.63129 NA 0.780 0.156
#> SRR1699888 2 0.499 0.62094 NA 0.836 0.112
#> SRR1699889 2 0.725 0.58684 NA 0.676 0.256
#> SRR1699890 2 0.566 0.62489 NA 0.804 0.128
#> SRR1699887 2 0.684 0.63426 NA 0.732 0.180
#> SRR1699891 2 0.706 0.62576 NA 0.720 0.180
#> SRR1699892 2 0.759 0.30353 NA 0.588 0.360
#> SRR1699893 2 0.827 0.15237 NA 0.520 0.400
#> SRR1699894 2 0.551 0.62731 NA 0.800 0.156
#> SRR1699895 2 0.679 0.62931 NA 0.740 0.160
#> SRR1699896 2 0.731 0.47191 NA 0.656 0.284
#> SRR1699897 2 0.706 0.53568 NA 0.680 0.264
#> SRR1699898 3 0.819 0.51031 NA 0.396 0.528
#> SRR1699900 2 0.738 0.40225 NA 0.628 0.320
#> SRR1699899 2 0.727 0.59575 NA 0.688 0.232
#> SRR1699902 3 0.852 0.26389 NA 0.444 0.464
#> SRR1699901 3 0.807 0.39848 NA 0.456 0.480
#> SRR1699903 2 0.746 0.60090 NA 0.688 0.208
#> SRR1699904 2 0.585 0.62930 NA 0.792 0.140
#> SRR1699905 2 0.798 0.05834 NA 0.536 0.400
#> SRR1699906 2 0.624 0.62412 NA 0.768 0.160
#> SRR1699907 2 0.745 0.56938 NA 0.664 0.260
#> SRR1699908 2 0.645 0.61518 NA 0.744 0.196
#> SRR1699909 2 0.601 0.61842 NA 0.764 0.192
#> SRR1699910 2 0.854 0.11246 NA 0.520 0.380
#> SRR1699911 2 0.734 0.58200 NA 0.684 0.232
#> SRR1699912 2 0.723 0.60751 NA 0.692 0.228
#> SRR1699913 2 0.738 0.61597 NA 0.684 0.228
#> SRR1699914 2 0.819 -0.20529 NA 0.496 0.432
#> SRR1699915 2 0.802 0.50632 NA 0.604 0.308
#> SRR1699916 2 0.461 0.62222 NA 0.844 0.128
#> SRR1699917 2 0.804 0.43078 NA 0.600 0.312
#> SRR1699918 2 0.611 0.61866 NA 0.764 0.184
#> SRR1699919 2 0.737 0.57995 NA 0.668 0.260
#> SRR1699920 2 0.848 0.24784 NA 0.568 0.320
#> SRR1699921 2 0.698 0.59668 NA 0.704 0.228
#> SRR1699922 2 0.630 0.63005 NA 0.764 0.164
#> SRR1699923 2 0.783 0.29582 NA 0.592 0.340
#> SRR1699924 3 0.813 0.57301 NA 0.328 0.584
#> SRR1699925 3 0.949 0.47714 NA 0.256 0.496
#> SRR1699926 2 0.818 0.39096 NA 0.564 0.352
#> SRR1699927 2 0.701 0.62194 NA 0.712 0.208
#> SRR1699929 2 0.796 0.29082 NA 0.576 0.352
#> SRR1699928 2 0.668 0.62867 NA 0.748 0.152
#> SRR1699930 2 0.649 0.62532 NA 0.752 0.172
#> SRR1699931 2 0.742 0.43035 NA 0.632 0.312
#> SRR1699933 2 0.872 -0.04490 NA 0.504 0.384
#> SRR1699932 2 0.674 0.58841 NA 0.708 0.240
#> SRR1699934 3 0.949 0.47714 NA 0.256 0.496
#> SRR1699935 2 0.771 0.39266 NA 0.604 0.332
#> SRR1699936 2 0.580 0.62205 NA 0.800 0.112
#> SRR1699937 2 0.711 0.55748 NA 0.696 0.232
#> SRR1699938 2 0.596 0.62519 NA 0.792 0.108
#> SRR1699940 2 0.851 0.34684 NA 0.580 0.296
#> SRR1699939 2 0.618 0.61227 NA 0.780 0.104
#> SRR1699941 3 0.814 0.32853 NA 0.460 0.472
#> SRR1699942 2 0.868 0.18850 NA 0.548 0.124
#> SRR1699943 2 0.704 0.59898 NA 0.728 0.132
#> SRR1699944 2 0.696 0.61218 NA 0.724 0.184
#> SRR1699945 3 0.820 0.57838 NA 0.276 0.612
#> SRR1699946 2 0.760 0.58254 NA 0.672 0.228
#> SRR1699947 2 0.680 0.61290 NA 0.724 0.204
#> SRR1699948 2 0.571 0.60430 NA 0.804 0.080
#> SRR1699949 2 0.592 0.62904 NA 0.792 0.128
#> SRR1699950 2 0.581 0.61460 NA 0.800 0.092
#> SRR1699951 2 0.850 0.38141 NA 0.564 0.324
#> SRR1699952 2 0.832 0.50068 NA 0.600 0.284
#> SRR1699953 2 0.604 0.62282 NA 0.788 0.108
#> SRR1699954 2 0.855 0.31274 NA 0.560 0.324
#> SRR1699955 2 0.524 0.61805 NA 0.828 0.100
#> SRR1699956 3 0.851 0.58305 NA 0.316 0.568
#> SRR1699957 2 0.715 0.60155 NA 0.720 0.156
#> SRR1699959 2 0.825 0.17046 NA 0.528 0.392
#> SRR1699958 2 0.767 0.52587 NA 0.652 0.260
#> SRR1699960 2 0.570 0.62870 NA 0.800 0.136
#> SRR1699961 2 0.797 -0.05730 NA 0.504 0.436
#> SRR1699962 2 0.479 0.62894 NA 0.844 0.112
#> SRR1699963 2 0.733 0.55089 NA 0.672 0.256
#> SRR1699964 2 0.756 0.55788 NA 0.636 0.296
#> SRR1699965 2 0.536 0.61578 NA 0.820 0.116
#> SRR1699966 2 0.817 0.18803 NA 0.508 0.420
#> SRR1699967 2 0.757 0.57011 NA 0.668 0.240
#> SRR1699968 2 0.708 0.55310 NA 0.684 0.256
#> SRR1699969 3 0.830 0.58804 NA 0.348 0.560
#> SRR1699971 2 0.836 0.13242 NA 0.528 0.384
#> SRR1699970 2 0.662 0.60896 NA 0.752 0.148
#> SRR1699972 2 0.787 0.19114 NA 0.568 0.368
#> SRR1699973 2 0.787 0.44940 NA 0.604 0.320
#> SRR1699974 3 0.863 0.57506 NA 0.356 0.532
#> SRR1699975 2 0.736 0.58226 NA 0.692 0.212
#> SRR1699976 2 0.825 0.00152 NA 0.528 0.392
#> SRR1699977 2 0.798 0.24605 NA 0.584 0.340
#> SRR1699978 3 0.856 0.58694 NA 0.352 0.540
#> SRR1699979 2 0.791 -0.22299 NA 0.492 0.452
#> SRR1699980 2 0.794 0.54786 NA 0.644 0.244
#> SRR1699981 2 0.807 -0.25166 NA 0.476 0.460
#> SRR1699982 2 0.646 0.63403 NA 0.752 0.176
#> SRR1699983 2 0.792 0.59254 NA 0.652 0.228
#> SRR1699984 3 0.954 0.47414 NA 0.256 0.488
#> SRR1699985 2 0.612 0.62771 NA 0.776 0.152
#> SRR1699986 3 0.870 0.52430 NA 0.400 0.492
#> SRR1699988 2 0.727 0.60081 NA 0.700 0.204
#> SRR1699987 3 0.846 0.23576 NA 0.436 0.476
#> SRR1699989 2 0.789 0.40664 NA 0.580 0.352
#> SRR1699990 2 0.836 0.06388 NA 0.544 0.364
#> SRR1699992 2 0.863 0.26622 NA 0.532 0.356
#> SRR1699991 3 0.816 0.50089 NA 0.412 0.516
#> SRR1699993 3 0.862 0.46689 NA 0.420 0.480
#> SRR1699994 3 0.794 0.58102 NA 0.348 0.580
#> SRR1699995 3 0.814 0.56301 NA 0.260 0.624
#> SRR1699996 2 0.724 0.60177 NA 0.700 0.208
#> SRR1699997 2 0.805 0.09353 NA 0.536 0.396
#> SRR1699998 2 0.706 0.60446 NA 0.704 0.220
#> SRR1699999 3 0.825 0.59197 NA 0.324 0.580
#> SRR1700000 2 0.804 0.50317 NA 0.620 0.280
#> SRR1700002 2 0.776 0.10603 NA 0.564 0.380
#> SRR1700001 3 0.840 0.44265 NA 0.436 0.480
#> SRR1700003 2 0.793 0.48931 NA 0.624 0.284
#> SRR1700004 3 0.850 0.49066 NA 0.420 0.488
#> SRR1700005 3 0.940 0.43461 NA 0.208 0.500
#> SRR1700006 2 0.847 -0.32937 NA 0.456 0.456
#> SRR1700007 2 0.474 0.62281 NA 0.848 0.104
#> SRR1700008 3 0.841 0.48810 NA 0.404 0.508
#> SRR1700009 3 0.889 0.51793 NA 0.236 0.572
#> SRR1700010 3 0.857 0.58618 NA 0.296 0.576
#> SRR1700011 2 0.533 0.63396 NA 0.812 0.144
#> SRR1700013 2 0.791 -0.09954 NA 0.496 0.448
#> SRR1700012 2 0.872 0.42693 NA 0.576 0.272
#> SRR1700014 2 0.840 -0.28338 NA 0.464 0.452
#> SRR1700015 2 0.795 0.10379 NA 0.520 0.420
#> SRR1700016 3 0.864 0.56286 NA 0.260 0.588
#> SRR1700018 2 0.889 -0.18360 NA 0.444 0.436
#> SRR1700017 2 0.935 -0.14249 NA 0.464 0.364
#> SRR1700019 2 0.566 0.63184 NA 0.804 0.128
#> SRR1700020 3 0.784 0.52868 NA 0.208 0.664
#> SRR1700021 2 0.800 0.46525 NA 0.620 0.284
#> SRR1700023 2 0.808 -0.04662 NA 0.524 0.408
#> SRR1700022 3 0.790 0.54103 NA 0.376 0.560
#> SRR1700024 2 0.794 0.53546 NA 0.628 0.276
#> SRR1700025 2 0.803 -0.02848 NA 0.516 0.420
#> SRR1700026 2 0.864 0.04476 NA 0.516 0.376
#> SRR1700027 2 0.833 -0.12919 NA 0.488 0.432
#> SRR1700028 2 0.848 0.18270 NA 0.560 0.332
#> SRR1700029 3 0.850 0.51795 NA 0.388 0.516
#> SRR1700030 2 0.840 0.49191 NA 0.592 0.288
#> SRR1700031 3 0.809 0.58752 NA 0.288 0.612
#> SRR1700032 2 0.870 0.28740 NA 0.536 0.344
#> SRR1700034 3 0.808 0.58618 NA 0.268 0.624
#> SRR1700035 2 0.835 0.40382 NA 0.568 0.332
#> SRR1700033 3 0.811 0.54157 NA 0.392 0.536
#> SRR1700036 2 0.930 -0.04193 NA 0.428 0.412
#> SRR1700037 2 0.608 0.63259 NA 0.772 0.168
#> SRR1700038 3 0.845 0.31088 NA 0.428 0.484
#> SRR1700039 3 0.796 0.59279 NA 0.288 0.620
#> SRR1700040 3 0.823 0.56389 NA 0.364 0.552
#> SRR1700041 3 0.812 0.52922 NA 0.372 0.552
#> SRR1700042 3 0.850 0.57840 NA 0.368 0.532
#> SRR1700043 3 0.845 0.43546 NA 0.424 0.488
#> SRR1700045 2 0.807 -0.27764 NA 0.472 0.464
#> SRR1700044 2 0.810 0.14937 NA 0.540 0.388
#> SRR1700046 3 0.825 0.43165 NA 0.428 0.496
#> SRR1700047 3 0.814 0.58425 NA 0.360 0.560
#> SRR1700048 2 0.864 -0.29552 NA 0.452 0.448
#> SRR1700049 3 0.804 0.59276 NA 0.312 0.600
#> SRR1700050 3 0.846 0.58826 NA 0.272 0.596
#> SRR1700051 3 0.754 0.59105 NA 0.304 0.632
#> SRR1700052 3 0.825 0.56933 NA 0.352 0.560
#> SRR1700053 3 0.841 0.51478 NA 0.360 0.544
#> SRR1700054 3 0.868 0.52789 NA 0.352 0.532
#> SRR1700055 3 0.820 0.58224 NA 0.276 0.612
#> SRR1700056 3 0.783 0.58232 NA 0.340 0.592
#> SRR1700057 3 0.796 0.55771 NA 0.288 0.620
#> SRR1700058 3 0.762 0.57760 NA 0.348 0.596
#> SRR1700059 3 0.804 0.57786 NA 0.312 0.600
#> SRR1700060 3 0.749 0.54496 NA 0.380 0.576
#> SRR1700061 3 0.811 0.43913 NA 0.424 0.508
#> SRR1700062 3 0.792 0.58808 NA 0.316 0.604
#> SRR1700063 3 0.806 0.57975 NA 0.304 0.604
#> SRR1700064 2 0.893 -0.11442 NA 0.452 0.424
#> SRR1700065 3 0.820 0.41206 NA 0.444 0.484
#> SRR1700066 3 0.825 0.53179 NA 0.392 0.528
#> SRR1700067 2 0.881 0.17666 NA 0.516 0.360
#> SRR1700068 3 0.797 0.53871 NA 0.372 0.560
#> SRR1700069 2 0.918 -0.03533 NA 0.452 0.400
#> SRR1700070 2 0.620 0.63018 NA 0.760 0.184
#> SRR1700071 3 0.881 0.51735 NA 0.360 0.516
#> SRR1700072 3 0.825 0.43339 NA 0.424 0.500
#> SRR1700073 2 0.742 0.51532 NA 0.648 0.288
#> SRR1700075 3 0.892 0.28782 NA 0.412 0.464
#> SRR1700074 3 0.824 0.45038 NA 0.416 0.508
#> SRR1700076 2 0.834 -0.07147 NA 0.516 0.400
#> SRR1700077 2 0.873 -0.24120 NA 0.476 0.416
#> SRR1700078 2 0.821 -0.22625 NA 0.468 0.460
#> SRR1700080 2 0.871 -0.02219 NA 0.488 0.404
#> SRR1700079 3 0.809 0.56154 NA 0.332 0.584
#> SRR1700081 3 0.803 0.57394 NA 0.368 0.560
#> SRR1700082 2 0.834 -0.28754 NA 0.468 0.452
#> SRR1700083 3 0.833 0.57889 NA 0.328 0.572
#> SRR1700084 3 0.791 0.58550 NA 0.340 0.588
#> SRR1700085 2 0.764 0.56168 NA 0.656 0.256
#> SRR1700086 2 0.936 0.31311 NA 0.496 0.312
#> SRR1700087 2 0.843 0.30635 NA 0.552 0.348
#> SRR1700088 2 0.801 0.30250 NA 0.564 0.364
#> SRR1700089 2 0.849 0.06353 NA 0.496 0.412
#> SRR1700091 2 0.876 -0.00756 NA 0.504 0.380
#> SRR1700090 2 0.806 -0.13878 NA 0.492 0.444
#> SRR1700092 2 0.832 0.13282 NA 0.524 0.392
#> SRR1700094 2 0.846 -0.24263 NA 0.476 0.436
#> SRR1700093 2 0.845 0.14173 NA 0.532 0.372
#> SRR1700095 2 0.807 -0.24244 NA 0.480 0.456
#> SRR1700096 3 0.813 0.36432 NA 0.440 0.492
#> SRR1700097 3 0.828 0.48241 NA 0.404 0.516
#> SRR1700098 2 0.790 0.50573 NA 0.628 0.280
#> SRR1700099 2 0.841 0.06038 NA 0.508 0.404
#> SRR1700100 2 0.776 0.26361 NA 0.580 0.360
#> SRR1700101 2 0.833 0.19393 NA 0.564 0.340
#> SRR1700102 2 0.884 0.36638 NA 0.580 0.204
#> SRR1700104 2 0.810 -0.07342 NA 0.512 0.420
#> SRR1700103 2 0.813 -0.07885 NA 0.492 0.440
#> SRR1700105 2 0.824 0.15847 NA 0.548 0.368
#> SRR1700106 2 0.857 0.23630 NA 0.524 0.372
#> SRR1700107 2 0.766 0.32283 NA 0.588 0.356
#> SRR1700108 2 0.838 0.28652 NA 0.552 0.352
#> SRR1700109 2 0.547 0.62705 NA 0.808 0.140
#> SRR1700110 2 0.631 0.63340 NA 0.768 0.148
#> SRR1700112 2 0.554 0.62909 NA 0.804 0.144
#> SRR1700111 2 0.862 -0.21554 NA 0.476 0.424
#> SRR1700113 2 0.764 0.57093 NA 0.656 0.256
#> SRR1700114 2 0.808 -0.06455 NA 0.520 0.412
#> SRR1700115 2 0.833 -0.16492 NA 0.480 0.440
#> SRR1700116 2 0.798 0.18470 NA 0.556 0.376
#> SRR1700117 3 0.850 0.58552 NA 0.304 0.576
#> SRR1700119 2 0.806 -0.10792 NA 0.492 0.444
#> SRR1700118 2 0.797 0.18976 NA 0.560 0.372
#> SRR1700120 2 0.807 -0.28693 NA 0.480 0.456
#> SRR1700121 2 0.811 0.10469 NA 0.504 0.428
#> SRR1700122 2 0.679 0.61946 NA 0.728 0.196
#> SRR1700123 3 0.788 0.41436 NA 0.428 0.516
#> SRR1700125 2 0.530 0.62585 NA 0.808 0.156
#> SRR1700126 3 0.793 0.49310 NA 0.412 0.528
#> SRR1700127 3 0.846 0.31816 NA 0.436 0.476
#> SRR1700124 3 0.784 0.26001 NA 0.464 0.484
#> SRR1700128 2 0.799 -0.27509 NA 0.484 0.456
#> SRR1700129 2 0.659 0.56648 NA 0.712 0.244
#> SRR1700130 2 0.802 0.41953 NA 0.604 0.308
#> SRR1700132 2 0.804 -0.11103 NA 0.508 0.428
#> SRR1700131 3 0.856 0.43953 NA 0.416 0.488
#> SRR1700133 2 0.768 0.05991 NA 0.540 0.412
#> SRR1700134 2 0.595 0.60602 NA 0.764 0.196
#> SRR1700135 3 0.853 0.51170 NA 0.400 0.504
#> SRR1700136 3 0.770 0.48412 NA 0.420 0.532
#> SRR1700137 2 0.791 -0.02530 NA 0.492 0.452
#> SRR1700138 2 0.814 -0.27844 NA 0.480 0.452
#> SRR1700140 3 0.821 0.31511 NA 0.456 0.472
#> SRR1700139 2 0.784 -0.21529 NA 0.484 0.464
#> SRR1700141 2 0.668 0.62286 NA 0.728 0.208
#> SRR1700142 3 0.805 0.57842 NA 0.292 0.612
#> SRR1700143 3 0.841 0.48629 NA 0.404 0.508
#> SRR1700144 3 0.830 0.52325 NA 0.384 0.532
#> SRR1700145 2 0.786 -0.07036 NA 0.528 0.416
#> SRR1700146 2 0.640 0.62539 NA 0.744 0.200
#> SRR1700147 3 0.784 0.36683 NA 0.460 0.488
#> SRR1700149 2 0.819 -0.16372 NA 0.496 0.432
#> SRR1700148 3 0.800 0.31675 NA 0.464 0.476
#> SRR1700150 2 0.724 0.40849 NA 0.628 0.328
#> SRR1700152 3 0.814 0.26430 NA 0.464 0.468
#> SRR1700151 3 0.759 0.44736 NA 0.412 0.544
#> SRR1700153 2 0.798 0.00427 NA 0.536 0.400
#> SRR1700154 2 0.776 -0.23081 NA 0.480 0.472
#> SRR1700155 2 0.801 0.00261 NA 0.524 0.412
#> SRR1700156 3 0.825 0.42160 NA 0.424 0.500
#> SRR1700158 3 0.790 0.39878 NA 0.436 0.508
#> SRR1700159 2 0.625 0.62340 NA 0.756 0.188
#> SRR1700157 2 0.796 -0.13826 NA 0.516 0.424
#> SRR1700160 3 0.846 0.36146 NA 0.440 0.472
#> SRR1700161 3 0.810 0.37036 NA 0.420 0.512
#> SRR1700162 2 0.553 0.62187 NA 0.792 0.172
#> SRR1700164 3 0.821 0.29818 NA 0.456 0.472
#> SRR1700163 3 0.800 0.50243 NA 0.380 0.552
#> SRR1700165 3 0.759 0.46644 NA 0.412 0.544
#> SRR1700166 2 0.788 -0.14962 NA 0.516 0.428
#> SRR1700168 2 0.685 0.61270 NA 0.716 0.216
#> SRR1700167 3 0.789 0.39995 NA 0.432 0.512
#> SRR1700170 2 0.796 0.02130 NA 0.512 0.428
#> SRR1700169 3 0.759 0.46136 NA 0.412 0.544
#> SRR1700171 3 0.879 0.41167 NA 0.428 0.460
#> SRR1700172 2 0.777 0.15113 NA 0.536 0.412
#> SRR1700174 2 0.796 -0.03332 NA 0.516 0.424
#> SRR1700173 2 0.820 -0.17292 NA 0.484 0.444
#> SRR1700175 2 0.800 0.00784 NA 0.528 0.408
#> SRR1700176 3 0.813 0.50908 NA 0.376 0.548
#> SRR1700178 2 0.570 0.56722 NA 0.804 0.076
#> SRR1700177 2 0.812 0.03525 NA 0.532 0.396
#> SRR1700180 2 0.559 0.58348 NA 0.808 0.068
#> SRR1700179 2 0.621 0.55097 NA 0.772 0.076
#> SRR1700181 2 0.540 0.58047 NA 0.816 0.060
#> SRR1700183 3 0.945 0.41444 NA 0.208 0.488
#> SRR1700182 2 0.629 0.53811 NA 0.768 0.080
#> SRR1700184 2 0.574 0.58790 NA 0.804 0.100
#> SRR1700186 2 0.639 0.58587 NA 0.768 0.112
#> SRR1700187 3 0.972 0.37211 NA 0.228 0.428
#> SRR1700185 3 0.951 0.40637 NA 0.220 0.484
#> SRR1700188 2 0.596 0.58695 NA 0.792 0.096
#> SRR1700192 3 0.988 0.36551 NA 0.360 0.380
#> SRR1700190 3 0.963 0.41769 NA 0.220 0.452
#> SRR1700191 3 0.959 0.39921 NA 0.220 0.464
#> SRR1700189 3 0.981 0.39870 NA 0.332 0.416
#> SRR1700193 2 0.617 0.59200 NA 0.780 0.096
#> SRR1700195 2 0.557 0.61196 NA 0.812 0.080
#> SRR1700194 3 0.967 0.39906 NA 0.232 0.452
#> SRR1700196 2 0.564 0.59684 NA 0.808 0.080
#> SRR1700197 3 0.892 0.53422 NA 0.256 0.564
#> SRR1700198 2 0.665 0.61214 NA 0.752 0.136
#> SRR1700199 2 0.492 0.59630 NA 0.844 0.080
#> SRR1700200 2 0.504 0.59353 NA 0.836 0.060
#> SRR1700201 2 0.610 0.61086 NA 0.784 0.096
#> SRR1700202 2 0.654 0.61691 NA 0.736 0.204
#> SRR1700203 2 0.572 0.57677 NA 0.804 0.084
#> SRR1700204 2 0.665 0.62740 NA 0.752 0.136
#> SRR1700206 2 0.640 0.61036 NA 0.744 0.200
#> SRR1700207 2 0.534 0.60735 NA 0.824 0.096
#> SRR1700208 3 0.995 0.35996 NA 0.288 0.372
#> SRR1700205 2 0.566 0.59364 NA 0.808 0.100
#> SRR1700209 2 0.501 0.61382 NA 0.840 0.076
#> SRR1700210 2 0.538 0.57817 NA 0.820 0.068
#> SRR1700211 2 0.516 0.61395 NA 0.832 0.096
#> SRR1700212 2 0.526 0.59752 NA 0.828 0.092
#> SRR1700213 2 0.817 0.49300 NA 0.644 0.168
#> SRR1700214 2 0.566 0.60597 NA 0.808 0.100
#> SRR1700215 3 0.934 0.43491 NA 0.208 0.512
#> SRR1700217 2 0.466 0.62490 NA 0.852 0.100
#> SRR1700216 3 0.947 0.43062 NA 0.220 0.492
#> SRR1700218 2 0.649 0.62959 NA 0.752 0.172
#> SRR1700219 2 0.578 0.61291 NA 0.800 0.120
#> SRR1700222 3 0.972 0.42108 NA 0.272 0.452
#> SRR1700220 2 0.515 0.59635 NA 0.832 0.068
#> SRR1700221 2 0.551 0.59941 NA 0.816 0.092
#> SRR1700223 2 0.534 0.61307 NA 0.824 0.096
#> SRR1700224 2 0.632 0.63109 NA 0.764 0.160
#> SRR1700226 2 0.566 0.61462 NA 0.808 0.104
#> SRR1700229 2 0.585 0.59237 NA 0.796 0.124
#> SRR1700225 2 0.878 0.26299 NA 0.564 0.148
#> SRR1700227 2 0.600 0.60577 NA 0.788 0.128
#> SRR1700230 3 0.983 0.42234 NA 0.304 0.424
#> SRR1700231 2 0.574 0.60790 NA 0.804 0.104
#> SRR1700228 2 0.545 0.62753 NA 0.816 0.116
#> SRR1700232 2 0.611 0.60694 NA 0.784 0.108
#> SRR1700233 2 0.636 0.62624 NA 0.768 0.136
#> SRR1700234 2 0.570 0.62911 NA 0.804 0.120
#> SRR1700235 2 0.686 0.57672 NA 0.696 0.252
#> SRR1700237 2 0.639 0.61102 NA 0.768 0.116
#> SRR1700236 2 0.550 0.58730 NA 0.816 0.088
#> SRR1700238 2 0.526 0.61494 NA 0.828 0.092
#> SRR1700239 3 0.962 0.41448 NA 0.240 0.468
#> SRR1700240 3 0.950 0.40705 NA 0.204 0.472
#> SRR1700241 2 0.771 0.20577 NA 0.556 0.392
#> SRR1700243 2 0.517 0.60462 NA 0.832 0.092
#> SRR1700244 2 0.606 0.61820 NA 0.784 0.132
#> SRR1700242 2 0.997 -0.29666 NA 0.372 0.312
#> SRR1700246 2 0.565 0.62941 NA 0.808 0.108
#> SRR1700245 2 0.514 0.58895 NA 0.832 0.064
#> SRR1700247 3 0.977 0.37161 NA 0.244 0.428
#> SRR1700249 3 0.960 0.39835 NA 0.216 0.456
#> SRR1700250 2 0.702 0.52569 NA 0.728 0.116
#> SRR1700248 2 0.558 0.61458 NA 0.812 0.088
#> SRR1700251 2 0.639 0.58864 NA 0.768 0.108
#> SRR1700252 3 0.940 0.33894 NA 0.408 0.420
#> SRR1700253 2 0.530 0.60275 NA 0.824 0.068
#> SRR1700256 2 0.561 0.60293 NA 0.808 0.120
#> SRR1700254 3 0.971 0.37861 NA 0.232 0.436
#> SRR1700255 2 0.533 0.61050 NA 0.824 0.100
#> SRR1700257 2 0.609 0.56838 NA 0.780 0.076
#> SRR1700258 2 0.479 0.61713 NA 0.848 0.096
#> SRR1700259 2 0.568 0.62831 NA 0.804 0.124
#> SRR1700260 2 0.552 0.62945 NA 0.812 0.120
#> SRR1700261 2 0.556 0.62616 NA 0.808 0.128
#> SRR1700262 2 0.592 0.62913 NA 0.792 0.128
#> SRR1700263 2 0.648 0.63129 NA 0.748 0.184
#> SRR1700264 2 0.721 0.61230 NA 0.708 0.192
#> SRR1700265 2 0.765 0.58789 NA 0.672 0.220
#> SRR1700266 2 0.710 0.55885 NA 0.724 0.132
#> SRR1700268 2 0.889 -0.08132 NA 0.516 0.352
#> SRR1700270 2 0.576 0.62555 NA 0.792 0.152
#> SRR1700267 2 0.519 0.62596 NA 0.828 0.112
#> SRR1700271 2 0.536 0.61853 NA 0.820 0.116
#> SRR1700272 2 0.557 0.63262 NA 0.804 0.140
#> SRR1700273 2 0.625 0.61648 NA 0.772 0.144
#> SRR1700274 2 0.599 0.63121 NA 0.776 0.168
#> SRR1700277 3 0.947 0.47893 NA 0.344 0.464
#> SRR1700275 2 0.587 0.63005 NA 0.784 0.160
#> SRR1700276 2 0.589 0.61849 NA 0.796 0.104
#> SRR1700278 2 0.695 0.60014 NA 0.692 0.252
#> SRR1700279 2 0.631 0.60832 NA 0.772 0.128
#> SRR1700280 2 0.550 0.61641 NA 0.816 0.088
#> SRR1700281 2 0.586 0.61260 NA 0.796 0.120
#> SRR1700283 2 0.692 0.60358 NA 0.736 0.136
#> SRR1700282 2 0.833 0.37063 NA 0.564 0.340
#> SRR1700284 2 0.641 0.63075 NA 0.756 0.172
#> SRR1700285 2 0.635 0.62790 NA 0.752 0.188
#> SRR1700286 2 0.646 0.62858 NA 0.756 0.164
#> SRR1700287 2 0.530 0.63188 NA 0.808 0.156
#> SRR1700290 3 0.878 0.55178 NA 0.260 0.576
#> SRR1700289 2 0.673 0.63247 NA 0.740 0.172
#> SRR1700288 2 0.665 0.63057 NA 0.744 0.172
#> SRR1700292 2 0.638 0.62167 NA 0.768 0.104
#> SRR1700291 2 0.731 0.44318 NA 0.628 0.324
#> SRR1700293 2 0.764 0.41246 NA 0.624 0.308
#> SRR1700294 2 0.582 0.63473 NA 0.800 0.104
#> SRR1700295 3 0.898 0.34003 NA 0.420 0.452
#> SRR1700297 2 0.600 0.62381 NA 0.788 0.128
#> SRR1700296 2 0.515 0.62719 NA 0.832 0.100
#> SRR1700298 2 0.767 0.38622 NA 0.600 0.340
#> SRR1700299 2 0.702 0.58549 NA 0.704 0.224
#> SRR1700300 2 0.733 0.47688 NA 0.636 0.312
#> SRR1700302 2 0.671 0.62975 NA 0.732 0.196
#> SRR1700301 2 0.563 0.63066 NA 0.804 0.132
#> SRR1700303 2 0.539 0.62942 NA 0.820 0.108
#> SRR1700304 2 0.630 0.63214 NA 0.772 0.132
#> SRR1700305 2 0.645 0.60780 NA 0.740 0.204
#> SRR1700306 2 0.846 0.28074 NA 0.544 0.356
#> SRR1700308 2 0.706 0.58436 NA 0.704 0.220
#> SRR1700307 2 0.761 0.02475 NA 0.536 0.420
#> SRR1700309 2 0.784 0.18546 NA 0.560 0.380
#> SRR1700310 2 0.560 0.62440 NA 0.804 0.136
#> SRR1700311 2 0.802 0.34295 NA 0.576 0.348
#> SRR1700312 2 0.771 0.53581 NA 0.636 0.284
#> SRR1700313 2 0.727 0.32977 NA 0.608 0.352
#> SRR1700314 2 0.723 0.35509 NA 0.616 0.344
#> SRR1700315 2 0.759 0.50372 NA 0.632 0.300
#> SRR1700316 2 0.744 0.36605 NA 0.604 0.348
#> SRR1700317 2 0.585 0.63417 NA 0.796 0.124
#> SRR1700318 2 0.879 0.43386 NA 0.572 0.268
#> SRR1700319 2 0.835 -0.04793 NA 0.508 0.408
#> SRR1700320 2 0.591 0.62877 NA 0.784 0.156
#> SRR1700322 2 0.782 0.56973 NA 0.648 0.252
#> SRR1700321 2 0.517 0.62995 NA 0.828 0.116
#> SRR1700323 2 0.728 0.53716 NA 0.660 0.280
#> SRR1700324 2 0.630 0.63302 NA 0.756 0.184
#> SRR1700325 2 0.696 0.59596 NA 0.684 0.264
#> SRR1700326 2 0.864 0.30275 NA 0.564 0.308
#> SRR1700327 2 0.687 0.63120 NA 0.724 0.196
#> SRR1700329 2 0.733 0.60619 NA 0.692 0.216
#> SRR1700328 2 0.742 0.48727 NA 0.640 0.300
#> SRR1700330 2 0.733 0.21297 NA 0.576 0.388
#> SRR1700331 2 0.744 0.61103 NA 0.684 0.220
#> SRR1700332 2 0.744 0.59181 NA 0.684 0.220
#> SRR1700333 2 0.706 0.61862 NA 0.704 0.220
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.651 0.653447 0.060 0.692 0.192 0.056
#> SRR1699875 2 0.654 0.654675 0.072 0.712 0.132 0.084
#> SRR1699876 2 0.613 0.658903 0.056 0.720 0.176 0.048
#> SRR1699877 2 0.765 0.600543 0.092 0.624 0.176 0.108
#> SRR1699879 2 0.576 0.652843 0.052 0.740 0.172 0.036
#> SRR1699878 2 0.729 0.440875 0.100 0.644 0.068 0.188
#> SRR1699880 3 0.727 0.668537 0.132 0.260 0.588 0.020
#> SRR1699881 3 0.774 0.625652 0.108 0.328 0.524 0.040
#> SRR1699882 2 0.638 0.665215 0.060 0.716 0.152 0.072
#> SRR1699883 2 0.770 0.522424 0.096 0.608 0.208 0.088
#> SRR1699884 2 0.691 0.579008 0.056 0.648 0.232 0.064
#> SRR1699885 2 0.626 0.658109 0.068 0.728 0.136 0.068
#> SRR1699886 2 0.589 0.644468 0.052 0.736 0.168 0.044
#> SRR1699888 2 0.493 0.650189 0.036 0.796 0.136 0.032
#> SRR1699889 2 0.694 0.526944 0.084 0.624 0.260 0.032
#> SRR1699890 2 0.550 0.656585 0.048 0.764 0.148 0.040
#> SRR1699887 2 0.635 0.665732 0.068 0.716 0.156 0.060
#> SRR1699891 2 0.667 0.638686 0.072 0.688 0.180 0.060
#> SRR1699892 2 0.734 -0.137032 0.084 0.464 0.428 0.024
#> SRR1699893 2 0.790 -0.374775 0.084 0.432 0.428 0.056
#> SRR1699894 2 0.624 0.646470 0.052 0.712 0.180 0.056
#> SRR1699895 2 0.679 0.640794 0.064 0.672 0.200 0.064
#> SRR1699896 2 0.786 0.313178 0.072 0.544 0.300 0.084
#> SRR1699897 2 0.734 0.440523 0.084 0.584 0.288 0.044
#> SRR1699898 3 0.722 0.661134 0.128 0.244 0.604 0.024
#> SRR1699900 2 0.768 0.009642 0.080 0.516 0.352 0.052
#> SRR1699899 2 0.726 0.544570 0.076 0.612 0.256 0.056
#> SRR1699902 3 0.792 0.580397 0.128 0.316 0.516 0.040
#> SRR1699901 3 0.710 0.627325 0.104 0.336 0.548 0.012
#> SRR1699903 2 0.798 0.539719 0.072 0.572 0.232 0.124
#> SRR1699904 2 0.581 0.648336 0.052 0.740 0.168 0.040
#> SRR1699905 3 0.807 0.460358 0.120 0.388 0.448 0.044
#> SRR1699906 2 0.620 0.651854 0.056 0.720 0.168 0.056
#> SRR1699907 2 0.769 0.497062 0.108 0.572 0.268 0.052
#> SRR1699908 2 0.623 0.623676 0.056 0.700 0.204 0.040
#> SRR1699909 2 0.624 0.608059 0.060 0.676 0.240 0.024
#> SRR1699910 3 0.777 0.359761 0.084 0.412 0.456 0.048
#> SRR1699911 2 0.739 0.536184 0.080 0.604 0.256 0.060
#> SRR1699912 2 0.771 0.532434 0.092 0.600 0.224 0.084
#> SRR1699913 2 0.724 0.601111 0.080 0.620 0.244 0.056
#> SRR1699914 3 0.711 0.577957 0.088 0.368 0.528 0.016
#> SRR1699915 2 0.787 0.361305 0.084 0.552 0.288 0.076
#> SRR1699916 2 0.473 0.654623 0.048 0.808 0.124 0.020
#> SRR1699917 2 0.836 0.258582 0.104 0.508 0.296 0.092
#> SRR1699918 2 0.686 0.613224 0.072 0.652 0.228 0.048
#> SRR1699919 2 0.730 0.542842 0.092 0.604 0.260 0.044
#> SRR1699920 2 0.846 -0.154666 0.132 0.440 0.364 0.064
#> SRR1699921 2 0.773 0.544654 0.076 0.584 0.252 0.088
#> SRR1699922 2 0.724 0.594484 0.064 0.632 0.224 0.080
#> SRR1699923 2 0.784 -0.280690 0.084 0.448 0.416 0.052
#> SRR1699924 3 0.709 0.596976 0.132 0.196 0.640 0.032
#> SRR1699925 1 0.708 0.630190 0.448 0.124 0.428 0.000
#> SRR1699926 2 0.801 0.103465 0.104 0.476 0.368 0.052
#> SRR1699927 2 0.685 0.621786 0.068 0.664 0.208 0.060
#> SRR1699929 2 0.793 -0.156940 0.104 0.448 0.404 0.044
#> SRR1699928 2 0.669 0.656126 0.060 0.696 0.152 0.092
#> SRR1699930 2 0.633 0.639863 0.040 0.700 0.192 0.068
#> SRR1699931 2 0.729 0.158716 0.080 0.520 0.372 0.028
#> SRR1699933 3 0.845 0.417166 0.124 0.372 0.436 0.068
#> SRR1699932 2 0.693 0.531475 0.064 0.624 0.268 0.044
#> SRR1699934 1 0.708 0.630190 0.448 0.124 0.428 0.000
#> SRR1699935 2 0.797 0.056213 0.100 0.476 0.372 0.052
#> SRR1699936 2 0.544 0.663714 0.052 0.780 0.112 0.056
#> SRR1699937 2 0.719 0.486803 0.064 0.612 0.264 0.060
#> SRR1699938 2 0.635 0.660189 0.072 0.724 0.132 0.072
#> SRR1699940 2 0.847 -0.072337 0.128 0.468 0.332 0.072
#> SRR1699939 2 0.586 0.646313 0.068 0.760 0.092 0.080
#> SRR1699941 3 0.761 0.602996 0.112 0.348 0.512 0.028
#> SRR1699942 4 0.770 0.000000 0.060 0.352 0.072 0.516
#> SRR1699943 2 0.648 0.637755 0.080 0.720 0.108 0.092
#> SRR1699944 2 0.683 0.641663 0.060 0.684 0.160 0.096
#> SRR1699945 3 0.749 0.280740 0.204 0.148 0.608 0.040
#> SRR1699946 2 0.739 0.556417 0.068 0.616 0.236 0.080
#> SRR1699947 2 0.685 0.616559 0.096 0.676 0.176 0.052
#> SRR1699948 2 0.622 0.636277 0.064 0.736 0.096 0.104
#> SRR1699949 2 0.595 0.667567 0.076 0.752 0.112 0.060
#> SRR1699950 2 0.603 0.656883 0.048 0.744 0.112 0.096
#> SRR1699951 2 0.845 0.205957 0.112 0.460 0.348 0.080
#> SRR1699952 2 0.839 0.369282 0.140 0.520 0.264 0.076
#> SRR1699953 2 0.653 0.657539 0.088 0.716 0.116 0.080
#> SRR1699954 2 0.810 -0.006032 0.144 0.488 0.328 0.040
#> SRR1699955 2 0.534 0.655295 0.060 0.788 0.100 0.052
#> SRR1699956 3 0.801 0.407301 0.192 0.184 0.568 0.056
#> SRR1699957 2 0.745 0.614319 0.100 0.648 0.136 0.116
#> SRR1699959 3 0.812 0.350001 0.076 0.404 0.440 0.080
#> SRR1699958 2 0.835 0.265668 0.104 0.512 0.292 0.092
#> SRR1699960 2 0.607 0.655971 0.064 0.728 0.164 0.044
#> SRR1699961 3 0.736 0.508524 0.088 0.360 0.524 0.028
#> SRR1699962 2 0.594 0.660464 0.064 0.736 0.160 0.040
#> SRR1699963 2 0.801 0.354906 0.092 0.524 0.312 0.072
#> SRR1699964 2 0.780 0.461126 0.116 0.552 0.284 0.048
#> SRR1699965 2 0.476 0.653895 0.048 0.812 0.112 0.028
#> SRR1699966 3 0.854 0.248740 0.128 0.376 0.424 0.072
#> SRR1699967 2 0.745 0.541273 0.100 0.604 0.244 0.052
#> SRR1699968 2 0.686 0.479716 0.068 0.624 0.272 0.036
#> SRR1699969 3 0.749 0.539192 0.168 0.200 0.600 0.032
#> SRR1699971 2 0.840 -0.311271 0.124 0.436 0.376 0.064
#> SRR1699970 2 0.663 0.653899 0.076 0.708 0.124 0.092
#> SRR1699972 3 0.801 0.358868 0.136 0.404 0.428 0.032
#> SRR1699973 2 0.808 0.181819 0.108 0.484 0.352 0.056
#> SRR1699974 3 0.739 0.566865 0.188 0.228 0.572 0.012
#> SRR1699975 2 0.769 0.504834 0.100 0.592 0.240 0.068
#> SRR1699976 3 0.797 0.432947 0.096 0.416 0.436 0.052
#> SRR1699977 2 0.791 -0.311659 0.124 0.436 0.408 0.032
#> SRR1699978 3 0.708 0.565438 0.152 0.216 0.616 0.016
#> SRR1699979 3 0.744 0.557453 0.080 0.368 0.516 0.036
#> SRR1699980 2 0.811 0.436509 0.080 0.520 0.308 0.092
#> SRR1699981 3 0.789 0.604160 0.132 0.320 0.512 0.036
#> SRR1699982 2 0.653 0.654907 0.068 0.696 0.180 0.056
#> SRR1699983 2 0.827 0.552646 0.076 0.544 0.236 0.144
#> SRR1699984 1 0.708 0.638527 0.456 0.124 0.420 0.000
#> SRR1699985 2 0.653 0.637941 0.080 0.696 0.176 0.048
#> SRR1699986 3 0.756 0.627771 0.156 0.252 0.568 0.024
#> SRR1699988 2 0.789 0.520805 0.080 0.592 0.208 0.120
#> SRR1699987 3 0.744 0.607556 0.124 0.312 0.544 0.020
#> SRR1699989 2 0.769 0.205040 0.092 0.516 0.348 0.044
#> SRR1699990 3 0.762 0.407658 0.088 0.420 0.456 0.036
#> SRR1699992 2 0.820 -0.108808 0.100 0.464 0.368 0.068
#> SRR1699991 3 0.716 0.666243 0.112 0.264 0.600 0.024
#> SRR1699993 3 0.803 0.620710 0.156 0.296 0.512 0.036
#> SRR1699994 3 0.735 0.579389 0.156 0.220 0.600 0.024
#> SRR1699995 3 0.703 -0.010555 0.236 0.124 0.620 0.020
#> SRR1699996 2 0.766 0.585252 0.116 0.608 0.208 0.068
#> SRR1699997 2 0.776 -0.345824 0.108 0.436 0.424 0.032
#> SRR1699998 2 0.787 0.543419 0.112 0.580 0.236 0.072
#> SRR1699999 3 0.711 0.461745 0.200 0.180 0.608 0.012
#> SRR1700000 2 0.801 0.315029 0.112 0.532 0.296 0.060
#> SRR1700002 3 0.779 0.379150 0.080 0.428 0.440 0.052
#> SRR1700001 3 0.731 0.653530 0.104 0.312 0.560 0.024
#> SRR1700003 2 0.832 0.186052 0.100 0.476 0.344 0.080
#> SRR1700004 3 0.736 0.642365 0.112 0.268 0.588 0.032
#> SRR1700005 1 0.699 0.769840 0.508 0.092 0.392 0.008
#> SRR1700006 3 0.772 0.620043 0.116 0.340 0.512 0.032
#> SRR1700007 2 0.491 0.651461 0.052 0.800 0.124 0.024
#> SRR1700008 3 0.765 0.666260 0.132 0.264 0.568 0.036
#> SRR1700009 3 0.712 -0.358195 0.328 0.108 0.552 0.012
#> SRR1700010 3 0.783 0.345858 0.208 0.164 0.580 0.048
#> SRR1700011 2 0.632 0.654832 0.072 0.704 0.184 0.040
#> SRR1700013 3 0.802 0.474911 0.120 0.408 0.432 0.040
#> SRR1700012 2 0.888 0.172493 0.136 0.456 0.300 0.108
#> SRR1700014 3 0.801 0.617956 0.112 0.312 0.520 0.056
#> SRR1700015 3 0.794 0.358884 0.112 0.416 0.432 0.040
#> SRR1700016 3 0.773 -0.078872 0.280 0.140 0.548 0.032
#> SRR1700018 3 0.887 0.444870 0.144 0.344 0.420 0.092
#> SRR1700017 3 0.944 0.244414 0.148 0.324 0.368 0.160
#> SRR1700019 2 0.593 0.666595 0.044 0.732 0.172 0.052
#> SRR1700020 3 0.681 0.075860 0.156 0.088 0.688 0.068
#> SRR1700021 2 0.831 0.281970 0.108 0.520 0.284 0.088
#> SRR1700023 3 0.779 0.472039 0.092 0.404 0.460 0.044
#> SRR1700022 3 0.706 0.647912 0.096 0.252 0.620 0.032
#> SRR1700024 2 0.784 0.420409 0.108 0.552 0.284 0.056
#> SRR1700025 3 0.802 0.442653 0.100 0.424 0.424 0.052
#> SRR1700026 2 0.816 -0.363352 0.092 0.420 0.420 0.068
#> SRR1700027 3 0.793 0.511068 0.096 0.372 0.480 0.052
#> SRR1700028 2 0.848 -0.278308 0.120 0.420 0.388 0.072
#> SRR1700029 3 0.778 0.655082 0.128 0.268 0.560 0.044
#> SRR1700030 2 0.886 0.201457 0.168 0.476 0.260 0.096
#> SRR1700031 3 0.670 0.408044 0.140 0.164 0.672 0.024
#> SRR1700032 2 0.825 -0.071130 0.120 0.448 0.376 0.056
#> SRR1700034 3 0.654 0.323383 0.172 0.128 0.680 0.020
#> SRR1700035 2 0.865 0.160007 0.124 0.464 0.320 0.092
#> SRR1700033 3 0.695 0.646022 0.092 0.272 0.612 0.024
#> SRR1700036 3 0.913 0.316853 0.156 0.364 0.372 0.108
#> SRR1700037 2 0.690 0.646611 0.060 0.668 0.192 0.080
#> SRR1700038 3 0.827 0.576360 0.156 0.324 0.476 0.044
#> SRR1700039 3 0.679 0.342192 0.168 0.136 0.668 0.028
#> SRR1700040 3 0.706 0.632624 0.116 0.240 0.620 0.024
#> SRR1700041 3 0.770 0.627151 0.136 0.240 0.580 0.044
#> SRR1700042 3 0.693 0.626039 0.108 0.236 0.632 0.024
#> SRR1700043 3 0.812 0.610356 0.156 0.300 0.504 0.040
#> SRR1700045 3 0.732 0.579316 0.104 0.376 0.504 0.016
#> SRR1700044 2 0.794 -0.315019 0.128 0.448 0.392 0.032
#> SRR1700046 3 0.760 0.651380 0.108 0.292 0.560 0.040
#> SRR1700047 3 0.783 0.594653 0.152 0.236 0.568 0.044
#> SRR1700048 3 0.783 0.595076 0.116 0.328 0.516 0.040
#> SRR1700049 3 0.667 0.389827 0.152 0.168 0.664 0.016
#> SRR1700050 3 0.713 0.382125 0.164 0.140 0.652 0.044
#> SRR1700051 3 0.607 0.471084 0.116 0.152 0.716 0.016
#> SRR1700052 3 0.722 0.556427 0.152 0.208 0.616 0.024
#> SRR1700053 3 0.758 0.634365 0.104 0.256 0.588 0.052
#> SRR1700054 3 0.796 0.617491 0.116 0.252 0.564 0.068
#> SRR1700055 3 0.671 0.258628 0.180 0.136 0.664 0.020
#> SRR1700056 3 0.707 0.577585 0.132 0.204 0.636 0.028
#> SRR1700057 3 0.700 0.382170 0.124 0.148 0.672 0.056
#> SRR1700058 3 0.635 0.602823 0.096 0.208 0.680 0.016
#> SRR1700059 3 0.672 0.514102 0.080 0.172 0.688 0.060
#> SRR1700060 3 0.616 0.631836 0.072 0.216 0.692 0.020
#> SRR1700061 3 0.763 0.651725 0.092 0.296 0.560 0.052
#> SRR1700062 3 0.624 0.515139 0.104 0.184 0.696 0.016
#> SRR1700063 3 0.741 0.480251 0.156 0.204 0.608 0.032
#> SRR1700064 2 0.852 -0.363917 0.144 0.400 0.396 0.060
#> SRR1700065 3 0.785 0.638640 0.132 0.308 0.524 0.036
#> SRR1700066 3 0.733 0.628024 0.132 0.240 0.600 0.028
#> SRR1700067 2 0.879 -0.231698 0.108 0.412 0.368 0.112
#> SRR1700068 3 0.727 0.656342 0.100 0.264 0.600 0.036
#> SRR1700069 3 0.895 0.334418 0.152 0.360 0.396 0.092
#> SRR1700070 2 0.646 0.643861 0.068 0.680 0.216 0.036
#> SRR1700071 3 0.805 0.546406 0.136 0.252 0.552 0.060
#> SRR1700072 3 0.816 0.627381 0.172 0.296 0.496 0.036
#> SRR1700073 2 0.756 0.419655 0.100 0.556 0.304 0.040
#> SRR1700075 3 0.840 0.551761 0.136 0.320 0.480 0.064
#> SRR1700074 3 0.738 0.653269 0.100 0.284 0.580 0.036
#> SRR1700076 3 0.786 0.474292 0.076 0.416 0.448 0.060
#> SRR1700077 3 0.814 0.543519 0.140 0.356 0.464 0.040
#> SRR1700078 3 0.784 0.555671 0.096 0.364 0.492 0.048
#> SRR1700080 3 0.831 0.412631 0.148 0.384 0.424 0.044
#> SRR1700079 3 0.660 0.503163 0.116 0.184 0.676 0.024
#> SRR1700081 3 0.679 0.603863 0.128 0.212 0.644 0.016
#> SRR1700082 3 0.795 0.569271 0.116 0.344 0.496 0.044
#> SRR1700083 3 0.672 0.528615 0.120 0.172 0.676 0.032
#> SRR1700084 3 0.645 0.577550 0.120 0.196 0.672 0.012
#> SRR1700085 2 0.801 0.467030 0.080 0.544 0.284 0.092
#> SRR1700086 2 0.925 -0.027494 0.164 0.412 0.300 0.124
#> SRR1700087 2 0.840 -0.068888 0.124 0.440 0.372 0.064
#> SRR1700088 2 0.801 -0.051577 0.120 0.484 0.352 0.044
#> SRR1700089 3 0.790 0.409375 0.136 0.372 0.464 0.028
#> SRR1700091 3 0.823 0.403903 0.104 0.408 0.424 0.064
#> SRR1700090 3 0.779 0.582723 0.124 0.336 0.508 0.032
#> SRR1700092 3 0.816 0.272176 0.108 0.412 0.424 0.056
#> SRR1700094 3 0.784 0.566303 0.116 0.360 0.488 0.036
#> SRR1700093 3 0.821 0.354706 0.108 0.408 0.424 0.060
#> SRR1700095 3 0.849 0.544323 0.164 0.336 0.448 0.052
#> SRR1700096 3 0.701 0.630555 0.100 0.300 0.584 0.016
#> SRR1700097 3 0.740 0.666713 0.108 0.256 0.596 0.040
#> SRR1700098 2 0.796 0.376776 0.112 0.552 0.272 0.064
#> SRR1700099 3 0.787 0.390230 0.128 0.412 0.432 0.028
#> SRR1700100 2 0.805 -0.295712 0.116 0.424 0.416 0.044
#> SRR1700101 2 0.797 -0.298640 0.108 0.428 0.420 0.044
#> SRR1700102 2 0.869 0.193850 0.088 0.484 0.148 0.280
#> SRR1700104 3 0.797 0.518493 0.120 0.364 0.476 0.040
#> SRR1700103 3 0.776 0.482800 0.128 0.380 0.468 0.024
#> SRR1700105 2 0.783 -0.287755 0.100 0.432 0.428 0.040
#> SRR1700106 2 0.864 -0.086499 0.144 0.436 0.348 0.072
#> SRR1700107 2 0.776 -0.086159 0.088 0.496 0.368 0.048
#> SRR1700108 2 0.806 -0.174166 0.120 0.456 0.380 0.044
#> SRR1700109 2 0.570 0.651213 0.048 0.760 0.132 0.060
#> SRR1700110 2 0.550 0.658063 0.048 0.764 0.148 0.040
#> SRR1700112 2 0.567 0.654160 0.048 0.756 0.148 0.048
#> SRR1700111 3 0.834 0.525357 0.112 0.372 0.448 0.068
#> SRR1700113 2 0.804 0.472515 0.068 0.544 0.276 0.112
#> SRR1700114 3 0.729 0.527112 0.072 0.388 0.508 0.032
#> SRR1700115 3 0.795 0.564056 0.100 0.336 0.508 0.056
#> SRR1700116 3 0.798 0.400409 0.132 0.408 0.428 0.032
#> SRR1700117 3 0.745 0.477141 0.192 0.180 0.600 0.028
#> SRR1700119 3 0.801 0.557929 0.124 0.336 0.496 0.044
#> SRR1700118 2 0.794 -0.282717 0.112 0.448 0.400 0.040
#> SRR1700120 3 0.780 0.621590 0.104 0.336 0.516 0.044
#> SRR1700121 3 0.798 0.321915 0.116 0.404 0.440 0.040
#> SRR1700122 2 0.702 0.603831 0.092 0.644 0.220 0.044
#> SRR1700123 3 0.771 0.643575 0.104 0.312 0.540 0.044
#> SRR1700125 2 0.548 0.644587 0.052 0.752 0.172 0.024
#> SRR1700126 3 0.736 0.667069 0.112 0.268 0.588 0.032
#> SRR1700127 3 0.735 0.630046 0.092 0.316 0.560 0.032
#> SRR1700124 3 0.781 0.603321 0.092 0.324 0.528 0.056
#> SRR1700128 3 0.729 0.606037 0.104 0.332 0.544 0.020
#> SRR1700129 2 0.713 0.470062 0.076 0.600 0.284 0.040
#> SRR1700130 2 0.839 0.049938 0.152 0.460 0.336 0.052
#> SRR1700132 3 0.786 0.540140 0.108 0.372 0.480 0.040
#> SRR1700131 3 0.775 0.664440 0.140 0.284 0.544 0.032
#> SRR1700133 3 0.698 0.415615 0.072 0.416 0.496 0.016
#> SRR1700134 2 0.624 0.587765 0.060 0.676 0.240 0.024
#> SRR1700135 3 0.790 0.662146 0.148 0.268 0.544 0.040
#> SRR1700136 3 0.691 0.655805 0.100 0.280 0.604 0.016
#> SRR1700137 3 0.795 0.462457 0.124 0.376 0.464 0.036
#> SRR1700138 3 0.745 0.594692 0.112 0.352 0.516 0.020
#> SRR1700140 3 0.772 0.606182 0.120 0.328 0.520 0.032
#> SRR1700139 3 0.772 0.568370 0.116 0.340 0.512 0.032
#> SRR1700141 2 0.586 0.613066 0.040 0.712 0.216 0.032
#> SRR1700142 3 0.770 0.498473 0.168 0.188 0.596 0.048
#> SRR1700143 3 0.773 0.661577 0.124 0.268 0.564 0.044
#> SRR1700144 3 0.781 0.657756 0.112 0.256 0.572 0.060
#> SRR1700145 3 0.793 0.478974 0.104 0.404 0.448 0.044
#> SRR1700146 2 0.625 0.633610 0.072 0.696 0.204 0.028
#> SRR1700147 3 0.725 0.648166 0.116 0.288 0.576 0.020
#> SRR1700149 3 0.759 0.567772 0.108 0.356 0.508 0.028
#> SRR1700148 3 0.712 0.628401 0.076 0.336 0.560 0.028
#> SRR1700150 2 0.778 0.036797 0.116 0.488 0.364 0.032
#> SRR1700152 3 0.810 0.597224 0.120 0.336 0.492 0.052
#> SRR1700151 3 0.685 0.656071 0.088 0.280 0.612 0.020
#> SRR1700153 3 0.772 0.489412 0.116 0.376 0.480 0.028
#> SRR1700154 3 0.754 0.590607 0.104 0.328 0.536 0.032
#> SRR1700155 3 0.783 0.511722 0.096 0.356 0.500 0.048
#> SRR1700156 3 0.752 0.639358 0.120 0.280 0.568 0.032
#> SRR1700158 3 0.726 0.649436 0.108 0.292 0.576 0.024
#> SRR1700159 2 0.569 0.623799 0.048 0.728 0.200 0.024
#> SRR1700157 3 0.755 0.576195 0.116 0.380 0.484 0.020
#> SRR1700160 3 0.743 0.640710 0.100 0.312 0.556 0.032
#> SRR1700161 3 0.715 0.626067 0.084 0.316 0.572 0.028
#> SRR1700162 2 0.570 0.622903 0.040 0.716 0.220 0.024
#> SRR1700164 3 0.737 0.608509 0.108 0.340 0.532 0.020
#> SRR1700163 3 0.741 0.662002 0.120 0.260 0.588 0.032
#> SRR1700165 3 0.734 0.658858 0.112 0.280 0.580 0.028
#> SRR1700166 3 0.778 0.546961 0.100 0.376 0.484 0.040
#> SRR1700168 2 0.691 0.592566 0.080 0.648 0.228 0.044
#> SRR1700167 3 0.754 0.649064 0.128 0.284 0.560 0.028
#> SRR1700170 3 0.816 0.486990 0.116 0.384 0.448 0.052
#> SRR1700169 3 0.752 0.663893 0.108 0.292 0.564 0.036
#> SRR1700171 3 0.867 0.501867 0.224 0.316 0.416 0.044
#> SRR1700172 3 0.775 0.343060 0.088 0.404 0.464 0.044
#> SRR1700174 3 0.765 0.467404 0.080 0.412 0.464 0.044
#> SRR1700173 3 0.793 0.533383 0.120 0.348 0.492 0.040
#> SRR1700175 3 0.828 0.477164 0.148 0.360 0.448 0.044
#> SRR1700176 3 0.726 0.663746 0.116 0.232 0.616 0.036
#> SRR1700178 2 0.588 0.578176 0.100 0.756 0.052 0.092
#> SRR1700177 3 0.749 0.500040 0.108 0.396 0.476 0.020
#> SRR1700180 2 0.560 0.608376 0.052 0.772 0.068 0.108
#> SRR1700179 2 0.550 0.557045 0.072 0.780 0.052 0.096
#> SRR1700181 2 0.504 0.619347 0.076 0.808 0.060 0.056
#> SRR1700183 1 0.655 0.792022 0.556 0.088 0.356 0.000
#> SRR1700182 2 0.571 0.551266 0.056 0.760 0.052 0.132
#> SRR1700184 2 0.572 0.627293 0.072 0.768 0.096 0.064
#> SRR1700186 2 0.600 0.616090 0.072 0.752 0.088 0.088
#> SRR1700187 1 0.653 0.711784 0.636 0.100 0.256 0.008
#> SRR1700185 1 0.675 0.790434 0.560 0.112 0.328 0.000
#> SRR1700188 2 0.498 0.617178 0.060 0.812 0.064 0.064
#> SRR1700192 1 0.831 0.534976 0.464 0.252 0.256 0.028
#> SRR1700190 1 0.872 0.622250 0.432 0.092 0.352 0.124
#> SRR1700191 1 0.654 0.785390 0.580 0.096 0.324 0.000
#> SRR1700189 1 0.806 0.625522 0.444 0.204 0.336 0.016
#> SRR1700193 2 0.578 0.629970 0.100 0.764 0.064 0.072
#> SRR1700195 2 0.554 0.656774 0.068 0.780 0.084 0.068
#> SRR1700194 1 0.670 0.783417 0.584 0.120 0.296 0.000
#> SRR1700196 2 0.546 0.638757 0.084 0.784 0.068 0.064
#> SRR1700197 3 0.785 -0.235606 0.300 0.128 0.532 0.040
#> SRR1700198 2 0.587 0.652781 0.068 0.752 0.128 0.052
#> SRR1700199 2 0.489 0.650660 0.060 0.816 0.072 0.052
#> SRR1700200 2 0.508 0.640989 0.076 0.804 0.076 0.044
#> SRR1700201 2 0.559 0.648641 0.108 0.772 0.072 0.048
#> SRR1700202 2 0.702 0.632544 0.112 0.664 0.172 0.052
#> SRR1700203 2 0.556 0.598395 0.076 0.776 0.052 0.096
#> SRR1700204 2 0.637 0.659726 0.056 0.716 0.152 0.076
#> SRR1700206 2 0.727 0.580538 0.112 0.620 0.228 0.040
#> SRR1700207 2 0.505 0.649971 0.064 0.804 0.092 0.040
#> SRR1700208 1 0.906 0.482299 0.480 0.152 0.216 0.152
#> SRR1700205 2 0.600 0.617719 0.092 0.752 0.072 0.084
#> SRR1700209 2 0.516 0.657133 0.064 0.792 0.112 0.032
#> SRR1700210 2 0.577 0.597813 0.084 0.764 0.056 0.096
#> SRR1700211 2 0.534 0.656216 0.048 0.788 0.100 0.064
#> SRR1700212 2 0.560 0.648880 0.060 0.776 0.080 0.084
#> SRR1700213 2 0.871 0.193972 0.120 0.516 0.144 0.220
#> SRR1700214 2 0.525 0.653836 0.060 0.796 0.080 0.064
#> SRR1700215 1 0.683 0.767435 0.504 0.088 0.404 0.004
#> SRR1700217 2 0.459 0.657391 0.040 0.820 0.112 0.028
#> SRR1700216 1 0.690 0.775264 0.512 0.096 0.388 0.004
#> SRR1700218 2 0.637 0.653257 0.072 0.708 0.172 0.048
#> SRR1700219 2 0.559 0.656536 0.072 0.772 0.108 0.048
#> SRR1700222 1 0.707 0.773616 0.524 0.140 0.336 0.000
#> SRR1700220 2 0.497 0.649637 0.068 0.812 0.064 0.056
#> SRR1700221 2 0.521 0.650086 0.064 0.796 0.092 0.048
#> SRR1700223 2 0.485 0.656458 0.056 0.816 0.084 0.044
#> SRR1700224 2 0.685 0.641414 0.096 0.672 0.184 0.048
#> SRR1700226 2 0.548 0.661791 0.060 0.780 0.104 0.056
#> SRR1700229 2 0.580 0.644255 0.088 0.764 0.084 0.064
#> SRR1700225 2 0.934 -0.506928 0.152 0.408 0.148 0.292
#> SRR1700227 2 0.592 0.639763 0.076 0.756 0.100 0.068
#> SRR1700230 1 0.794 0.709275 0.492 0.184 0.304 0.020
#> SRR1700231 2 0.536 0.654435 0.040 0.784 0.108 0.068
#> SRR1700228 2 0.547 0.666239 0.044 0.772 0.132 0.052
#> SRR1700232 2 0.619 0.652006 0.092 0.740 0.092 0.076
#> SRR1700233 2 0.621 0.663347 0.092 0.732 0.124 0.052
#> SRR1700234 2 0.559 0.662897 0.080 0.768 0.116 0.036
#> SRR1700235 2 0.721 0.502013 0.100 0.600 0.268 0.032
#> SRR1700237 2 0.633 0.657041 0.072 0.728 0.120 0.080
#> SRR1700236 2 0.525 0.644756 0.072 0.796 0.076 0.056
#> SRR1700238 2 0.502 0.655159 0.076 0.804 0.088 0.032
#> SRR1700239 1 0.722 0.778625 0.544 0.132 0.316 0.008
#> SRR1700240 1 0.660 0.782248 0.576 0.084 0.336 0.004
#> SRR1700241 2 0.746 -0.289431 0.088 0.472 0.412 0.028
#> SRR1700243 2 0.501 0.653897 0.068 0.808 0.080 0.044
#> SRR1700244 2 0.668 0.651012 0.104 0.704 0.120 0.072
#> SRR1700242 1 0.858 0.325923 0.432 0.300 0.228 0.040
#> SRR1700246 2 0.565 0.662999 0.068 0.752 0.152 0.028
#> SRR1700245 2 0.474 0.639312 0.048 0.824 0.068 0.060
#> SRR1700247 1 0.786 0.683555 0.548 0.132 0.276 0.044
#> SRR1700249 1 0.643 0.786301 0.588 0.088 0.324 0.000
#> SRR1700250 2 0.660 0.504068 0.072 0.700 0.068 0.160
#> SRR1700248 2 0.607 0.651135 0.088 0.748 0.084 0.080
#> SRR1700251 2 0.619 0.624185 0.092 0.740 0.076 0.092
#> SRR1700252 3 0.888 0.368668 0.240 0.336 0.372 0.052
#> SRR1700253 2 0.567 0.653379 0.068 0.772 0.072 0.088
#> SRR1700256 2 0.574 0.636130 0.084 0.768 0.080 0.068
#> SRR1700254 1 0.690 0.720694 0.616 0.124 0.248 0.012
#> SRR1700255 2 0.509 0.652867 0.060 0.804 0.084 0.052
#> SRR1700257 2 0.518 0.609229 0.068 0.800 0.056 0.076
#> SRR1700258 2 0.523 0.661795 0.052 0.788 0.120 0.040
#> SRR1700259 2 0.614 0.663802 0.096 0.736 0.120 0.048
#> SRR1700260 2 0.574 0.659145 0.064 0.756 0.136 0.044
#> SRR1700261 2 0.496 0.655957 0.040 0.796 0.132 0.032
#> SRR1700262 2 0.610 0.656573 0.068 0.724 0.168 0.040
#> SRR1700263 2 0.622 0.665311 0.080 0.728 0.140 0.052
#> SRR1700264 2 0.716 0.627357 0.104 0.660 0.168 0.068
#> SRR1700265 2 0.821 0.520653 0.100 0.564 0.216 0.120
#> SRR1700266 2 0.696 0.527314 0.072 0.672 0.080 0.176
#> SRR1700268 2 0.872 -0.439177 0.176 0.400 0.364 0.060
#> SRR1700270 2 0.584 0.665661 0.068 0.752 0.132 0.048
#> SRR1700267 2 0.519 0.662356 0.056 0.792 0.112 0.040
#> SRR1700271 2 0.522 0.655896 0.040 0.784 0.132 0.044
#> SRR1700272 2 0.590 0.655309 0.072 0.736 0.160 0.032
#> SRR1700273 2 0.595 0.661092 0.064 0.752 0.112 0.072
#> SRR1700274 2 0.695 0.652750 0.096 0.656 0.204 0.044
#> SRR1700277 3 0.939 -0.000849 0.292 0.244 0.364 0.100
#> SRR1700275 2 0.597 0.656900 0.056 0.728 0.176 0.040
#> SRR1700276 2 0.587 0.662222 0.076 0.756 0.112 0.056
#> SRR1700278 2 0.659 0.553581 0.052 0.640 0.272 0.036
#> SRR1700279 2 0.654 0.644256 0.084 0.716 0.092 0.108
#> SRR1700280 2 0.607 0.648253 0.040 0.736 0.092 0.132
#> SRR1700281 2 0.618 0.653778 0.076 0.740 0.100 0.084
#> SRR1700283 2 0.688 0.631995 0.084 0.692 0.112 0.112
#> SRR1700282 2 0.784 0.057282 0.088 0.484 0.376 0.052
#> SRR1700284 2 0.699 0.644066 0.092 0.648 0.216 0.044
#> SRR1700285 2 0.622 0.643749 0.076 0.696 0.204 0.024
#> SRR1700286 2 0.695 0.637288 0.088 0.664 0.192 0.056
#> SRR1700287 2 0.538 0.660168 0.032 0.764 0.160 0.044
#> SRR1700290 3 0.788 -0.078115 0.288 0.136 0.536 0.040
#> SRR1700289 2 0.720 0.644649 0.132 0.664 0.128 0.076
#> SRR1700288 2 0.676 0.644755 0.080 0.680 0.184 0.056
#> SRR1700292 2 0.676 0.655145 0.088 0.700 0.120 0.092
#> SRR1700291 2 0.747 0.200494 0.100 0.496 0.380 0.024
#> SRR1700293 2 0.746 0.175039 0.096 0.540 0.332 0.032
#> SRR1700294 2 0.597 0.667430 0.096 0.744 0.120 0.040
#> SRR1700295 3 0.885 0.512203 0.164 0.324 0.432 0.080
#> SRR1700297 2 0.608 0.663635 0.092 0.724 0.156 0.028
#> SRR1700296 2 0.535 0.664887 0.060 0.784 0.112 0.044
#> SRR1700298 2 0.741 0.103930 0.096 0.504 0.376 0.024
#> SRR1700299 2 0.741 0.542746 0.084 0.612 0.240 0.064
#> SRR1700300 2 0.759 0.232423 0.088 0.536 0.332 0.044
#> SRR1700302 2 0.667 0.643771 0.080 0.672 0.208 0.040
#> SRR1700301 2 0.570 0.657907 0.052 0.756 0.144 0.048
#> SRR1700303 2 0.533 0.654202 0.072 0.772 0.136 0.020
#> SRR1700304 2 0.708 0.645780 0.088 0.672 0.152 0.088
#> SRR1700305 2 0.641 0.583721 0.068 0.680 0.220 0.032
#> SRR1700306 3 0.848 0.165724 0.120 0.404 0.404 0.072
#> SRR1700308 2 0.744 0.503380 0.092 0.604 0.248 0.056
#> SRR1700307 3 0.748 0.441616 0.092 0.392 0.488 0.028
#> SRR1700309 3 0.804 0.376991 0.092 0.404 0.444 0.060
#> SRR1700310 2 0.529 0.662751 0.064 0.780 0.128 0.028
#> SRR1700311 2 0.832 -0.047919 0.136 0.444 0.368 0.052
#> SRR1700312 2 0.749 0.450126 0.112 0.564 0.292 0.032
#> SRR1700313 2 0.735 -0.093709 0.096 0.492 0.392 0.020
#> SRR1700314 2 0.718 -0.125371 0.060 0.472 0.436 0.032
#> SRR1700315 2 0.769 0.339671 0.092 0.548 0.308 0.052
#> SRR1700316 2 0.751 0.026328 0.104 0.492 0.380 0.024
#> SRR1700317 2 0.610 0.668365 0.060 0.736 0.140 0.064
#> SRR1700318 2 0.888 0.279447 0.112 0.476 0.268 0.144
#> SRR1700319 3 0.783 0.509535 0.120 0.372 0.476 0.032
#> SRR1700320 2 0.595 0.649510 0.068 0.724 0.180 0.028
#> SRR1700322 2 0.774 0.481012 0.096 0.572 0.268 0.064
#> SRR1700321 2 0.560 0.665508 0.048 0.764 0.136 0.052
#> SRR1700323 2 0.706 0.414432 0.088 0.568 0.324 0.020
#> SRR1700324 2 0.601 0.653816 0.076 0.732 0.156 0.036
#> SRR1700325 2 0.679 0.579135 0.076 0.628 0.268 0.028
#> SRR1700326 2 0.833 -0.029709 0.116 0.472 0.344 0.068
#> SRR1700327 2 0.749 0.633825 0.104 0.632 0.184 0.080
#> SRR1700329 2 0.749 0.594811 0.100 0.620 0.212 0.068
#> SRR1700328 2 0.795 0.262023 0.116 0.516 0.320 0.048
#> SRR1700330 3 0.734 0.266407 0.084 0.444 0.448 0.024
#> SRR1700331 2 0.774 0.592689 0.080 0.592 0.236 0.092
#> SRR1700332 2 0.767 0.531193 0.088 0.588 0.252 0.072
#> SRR1700333 2 0.724 0.594996 0.056 0.636 0.212 0.096
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.613 0.6533 0.032 0.676 0.180 NA 0.024
#> SRR1699875 2 0.648 0.6545 0.044 0.660 0.124 NA 0.024
#> SRR1699876 2 0.563 0.6628 0.012 0.696 0.160 NA 0.012
#> SRR1699877 2 0.748 0.6025 0.068 0.584 0.132 NA 0.044
#> SRR1699879 2 0.587 0.6612 0.028 0.696 0.152 NA 0.016
#> SRR1699878 2 0.691 0.5224 0.032 0.576 0.048 NA 0.068
#> SRR1699880 3 0.749 0.6115 0.116 0.204 0.564 NA 0.024
#> SRR1699881 3 0.772 0.6149 0.096 0.284 0.492 NA 0.016
#> SRR1699882 2 0.619 0.6632 0.032 0.664 0.148 NA 0.012
#> SRR1699883 2 0.780 0.5358 0.072 0.532 0.184 NA 0.032
#> SRR1699884 2 0.703 0.5656 0.036 0.572 0.244 NA 0.024
#> SRR1699885 2 0.580 0.6661 0.028 0.704 0.108 NA 0.016
#> SRR1699886 2 0.594 0.6510 0.032 0.688 0.152 NA 0.012
#> SRR1699888 2 0.442 0.6547 0.020 0.804 0.104 NA 0.012
#> SRR1699889 2 0.717 0.5259 0.056 0.572 0.240 NA 0.024
#> SRR1699890 2 0.483 0.6603 0.020 0.776 0.104 NA 0.012
#> SRR1699887 2 0.599 0.6725 0.036 0.696 0.144 NA 0.020
#> SRR1699891 2 0.652 0.6428 0.044 0.656 0.144 NA 0.024
#> SRR1699892 2 0.750 -0.1520 0.076 0.412 0.408 NA 0.016
#> SRR1699893 3 0.797 0.3332 0.064 0.392 0.396 NA 0.044
#> SRR1699894 2 0.582 0.6505 0.024 0.700 0.168 NA 0.024
#> SRR1699895 2 0.642 0.6477 0.048 0.660 0.168 NA 0.020
#> SRR1699896 2 0.765 0.2903 0.052 0.484 0.300 NA 0.024
#> SRR1699897 2 0.714 0.4480 0.052 0.548 0.272 NA 0.016
#> SRR1699898 3 0.678 0.6254 0.108 0.208 0.608 NA 0.008
#> SRR1699900 2 0.769 -0.1285 0.044 0.440 0.344 NA 0.024
#> SRR1699899 2 0.742 0.4987 0.048 0.548 0.232 NA 0.028
#> SRR1699902 3 0.809 0.5761 0.104 0.264 0.488 NA 0.040
#> SRR1699901 3 0.716 0.6385 0.112 0.260 0.552 NA 0.012
#> SRR1699903 2 0.770 0.5277 0.036 0.540 0.204 NA 0.060
#> SRR1699904 2 0.510 0.6559 0.024 0.752 0.148 NA 0.016
#> SRR1699905 3 0.797 0.4920 0.084 0.320 0.440 NA 0.020
#> SRR1699906 2 0.551 0.6575 0.032 0.720 0.148 NA 0.008
#> SRR1699907 2 0.709 0.4882 0.068 0.552 0.264 NA 0.008
#> SRR1699908 2 0.634 0.6247 0.036 0.644 0.196 NA 0.012
#> SRR1699909 2 0.578 0.6159 0.060 0.668 0.216 NA 0.000
#> SRR1699910 3 0.777 0.3972 0.080 0.360 0.432 NA 0.020
#> SRR1699911 2 0.728 0.5353 0.060 0.560 0.236 NA 0.020
#> SRR1699912 2 0.704 0.5420 0.040 0.580 0.216 NA 0.020
#> SRR1699913 2 0.676 0.6013 0.044 0.612 0.204 NA 0.016
#> SRR1699914 3 0.692 0.5864 0.092 0.292 0.556 NA 0.024
#> SRR1699915 2 0.771 0.2924 0.052 0.476 0.308 NA 0.028
#> SRR1699916 2 0.434 0.6570 0.040 0.812 0.096 NA 0.008
#> SRR1699917 2 0.799 0.2878 0.056 0.464 0.288 NA 0.036
#> SRR1699918 2 0.604 0.6185 0.044 0.648 0.212 NA 0.000
#> SRR1699919 2 0.723 0.5316 0.064 0.560 0.256 NA 0.024
#> SRR1699920 2 0.804 -0.1555 0.120 0.420 0.340 NA 0.020
#> SRR1699921 2 0.718 0.5349 0.028 0.564 0.244 NA 0.040
#> SRR1699922 2 0.719 0.5712 0.028 0.572 0.200 NA 0.036
#> SRR1699923 3 0.796 0.3310 0.088 0.372 0.400 NA 0.020
#> SRR1699924 3 0.751 0.5717 0.116 0.168 0.584 NA 0.036
#> SRR1699925 1 0.589 0.6757 0.520 0.064 0.400 NA 0.000
#> SRR1699926 2 0.772 0.1002 0.088 0.428 0.352 NA 0.008
#> SRR1699927 2 0.667 0.6299 0.044 0.636 0.180 NA 0.024
#> SRR1699929 2 0.749 -0.1260 0.068 0.424 0.400 NA 0.020
#> SRR1699928 2 0.606 0.6615 0.028 0.692 0.140 NA 0.028
#> SRR1699930 2 0.610 0.6393 0.028 0.672 0.172 NA 0.016
#> SRR1699931 2 0.728 0.1405 0.068 0.480 0.356 NA 0.016
#> SRR1699933 3 0.863 0.4315 0.112 0.288 0.408 NA 0.044
#> SRR1699932 2 0.654 0.5313 0.052 0.604 0.252 NA 0.008
#> SRR1699934 1 0.589 0.6757 0.520 0.064 0.400 NA 0.000
#> SRR1699935 2 0.761 0.0411 0.048 0.436 0.380 NA 0.036
#> SRR1699936 2 0.532 0.6704 0.028 0.756 0.088 NA 0.028
#> SRR1699937 2 0.745 0.4608 0.060 0.544 0.240 NA 0.024
#> SRR1699938 2 0.606 0.6660 0.040 0.700 0.096 NA 0.028
#> SRR1699940 2 0.854 -0.1373 0.100 0.416 0.284 NA 0.040
#> SRR1699939 2 0.598 0.6582 0.036 0.704 0.080 NA 0.032
#> SRR1699941 3 0.769 0.5892 0.128 0.296 0.480 NA 0.012
#> SRR1699942 5 0.768 0.0000 0.044 0.204 0.052 NA 0.544
#> SRR1699943 2 0.643 0.6432 0.044 0.668 0.084 NA 0.036
#> SRR1699944 2 0.687 0.6397 0.040 0.624 0.144 NA 0.032
#> SRR1699945 3 0.703 0.1556 0.232 0.092 0.588 NA 0.020
#> SRR1699946 2 0.739 0.5535 0.056 0.576 0.196 NA 0.036
#> SRR1699947 2 0.696 0.6146 0.056 0.620 0.168 NA 0.028
#> SRR1699948 2 0.618 0.6402 0.032 0.688 0.084 NA 0.040
#> SRR1699949 2 0.573 0.6720 0.036 0.728 0.080 NA 0.032
#> SRR1699950 2 0.593 0.6627 0.032 0.712 0.092 NA 0.036
#> SRR1699951 2 0.851 0.1940 0.096 0.424 0.292 NA 0.048
#> SRR1699952 2 0.811 0.3856 0.092 0.492 0.228 NA 0.032
#> SRR1699953 2 0.606 0.6663 0.040 0.700 0.096 NA 0.028
#> SRR1699954 2 0.827 -0.0129 0.124 0.440 0.284 NA 0.024
#> SRR1699955 2 0.477 0.6591 0.028 0.788 0.072 NA 0.016
#> SRR1699956 3 0.716 0.3594 0.164 0.124 0.600 NA 0.016
#> SRR1699957 2 0.698 0.5968 0.048 0.600 0.108 NA 0.028
#> SRR1699959 3 0.826 0.3931 0.092 0.344 0.396 NA 0.028
#> SRR1699958 2 0.833 0.1998 0.076 0.464 0.232 NA 0.044
#> SRR1699960 2 0.537 0.6639 0.028 0.744 0.128 NA 0.020
#> SRR1699961 3 0.754 0.5196 0.080 0.316 0.492 NA 0.020
#> SRR1699962 2 0.563 0.6720 0.040 0.724 0.120 NA 0.012
#> SRR1699963 2 0.777 0.3127 0.048 0.492 0.252 NA 0.028
#> SRR1699964 2 0.784 0.4619 0.076 0.508 0.268 NA 0.040
#> SRR1699965 2 0.496 0.6580 0.020 0.776 0.096 NA 0.024
#> SRR1699966 3 0.864 0.3234 0.100 0.320 0.380 NA 0.044
#> SRR1699967 2 0.719 0.5546 0.052 0.576 0.220 NA 0.024
#> SRR1699968 2 0.690 0.4877 0.052 0.556 0.280 NA 0.008
#> SRR1699969 3 0.704 0.5199 0.156 0.164 0.580 NA 0.000
#> SRR1699971 2 0.831 -0.3633 0.092 0.384 0.360 NA 0.036
#> SRR1699970 2 0.648 0.6639 0.024 0.660 0.108 NA 0.048
#> SRR1699972 3 0.746 0.4177 0.092 0.340 0.448 NA 0.000
#> SRR1699973 2 0.818 0.0596 0.080 0.424 0.316 NA 0.028
#> SRR1699974 3 0.682 0.5248 0.180 0.180 0.588 NA 0.004
#> SRR1699975 2 0.765 0.4604 0.060 0.516 0.260 NA 0.028
#> SRR1699976 3 0.814 0.4506 0.100 0.368 0.392 NA 0.028
#> SRR1699977 3 0.786 0.3747 0.068 0.380 0.404 NA 0.024
#> SRR1699978 3 0.682 0.5184 0.172 0.168 0.604 NA 0.012
#> SRR1699979 3 0.754 0.5612 0.084 0.312 0.500 NA 0.028
#> SRR1699980 2 0.788 0.4176 0.052 0.508 0.240 NA 0.044
#> SRR1699981 3 0.770 0.6086 0.084 0.280 0.500 NA 0.020
#> SRR1699982 2 0.623 0.6564 0.036 0.664 0.144 NA 0.012
#> SRR1699983 2 0.792 0.5255 0.028 0.504 0.212 NA 0.072
#> SRR1699984 1 0.583 0.6853 0.532 0.060 0.392 NA 0.000
#> SRR1699985 2 0.594 0.6534 0.056 0.704 0.144 NA 0.016
#> SRR1699986 3 0.711 0.6001 0.136 0.204 0.584 NA 0.016
#> SRR1699988 2 0.801 0.4497 0.056 0.512 0.196 NA 0.052
#> SRR1699987 3 0.784 0.5917 0.092 0.264 0.504 NA 0.028
#> SRR1699989 2 0.760 0.1651 0.056 0.460 0.340 NA 0.020
#> SRR1699990 3 0.714 0.4308 0.080 0.364 0.472 NA 0.004
#> SRR1699992 2 0.794 -0.1292 0.088 0.420 0.352 NA 0.020
#> SRR1699991 3 0.684 0.6386 0.116 0.216 0.604 NA 0.020
#> SRR1699993 3 0.785 0.6136 0.152 0.244 0.500 NA 0.020
#> SRR1699994 3 0.748 0.5363 0.148 0.180 0.572 NA 0.032
#> SRR1699995 3 0.665 -0.1385 0.240 0.068 0.608 NA 0.012
#> SRR1699996 2 0.742 0.5876 0.076 0.580 0.172 NA 0.028
#> SRR1699997 2 0.771 -0.3567 0.100 0.416 0.392 NA 0.032
#> SRR1699998 2 0.756 0.4962 0.040 0.520 0.228 NA 0.028
#> SRR1699999 3 0.668 0.4313 0.196 0.136 0.612 NA 0.008
#> SRR1700000 2 0.819 0.1905 0.088 0.452 0.276 NA 0.028
#> SRR1700002 3 0.715 0.3698 0.056 0.384 0.456 NA 0.008
#> SRR1700001 3 0.690 0.6369 0.100 0.264 0.568 NA 0.008
#> SRR1700003 2 0.833 0.1534 0.080 0.440 0.296 NA 0.048
#> SRR1700004 3 0.690 0.6168 0.096 0.212 0.592 NA 0.004
#> SRR1700005 1 0.555 0.7643 0.572 0.048 0.368 NA 0.004
#> SRR1700006 3 0.765 0.5844 0.068 0.300 0.500 NA 0.032
#> SRR1700007 2 0.448 0.6564 0.040 0.804 0.096 NA 0.008
#> SRR1700008 3 0.768 0.6508 0.132 0.236 0.528 NA 0.024
#> SRR1700009 3 0.661 -0.4072 0.348 0.064 0.532 NA 0.008
#> SRR1700010 3 0.724 0.3101 0.188 0.128 0.584 NA 0.016
#> SRR1700011 2 0.603 0.6689 0.036 0.684 0.136 NA 0.012
#> SRR1700013 3 0.773 0.4723 0.104 0.356 0.440 NA 0.020
#> SRR1700012 2 0.859 0.0794 0.064 0.396 0.264 NA 0.052
#> SRR1700014 3 0.774 0.6043 0.080 0.272 0.508 NA 0.028
#> SRR1700015 3 0.817 0.3893 0.092 0.344 0.408 NA 0.028
#> SRR1700016 3 0.763 -0.2296 0.296 0.084 0.508 NA 0.036
#> SRR1700018 3 0.916 0.4303 0.108 0.288 0.356 NA 0.088
#> SRR1700017 3 0.971 -0.1163 0.116 0.208 0.304 NA 0.168
#> SRR1700019 2 0.529 0.6732 0.028 0.736 0.144 NA 0.008
#> SRR1700020 3 0.780 -0.2227 0.192 0.024 0.524 NA 0.080
#> SRR1700021 2 0.791 0.2712 0.064 0.476 0.264 NA 0.024
#> SRR1700023 3 0.774 0.4895 0.076 0.360 0.448 NA 0.036
#> SRR1700022 3 0.731 0.5966 0.132 0.208 0.576 NA 0.036
#> SRR1700024 2 0.762 0.4119 0.056 0.508 0.268 NA 0.024
#> SRR1700025 3 0.775 0.4395 0.072 0.372 0.416 NA 0.016
#> SRR1700026 2 0.835 -0.3835 0.124 0.368 0.364 NA 0.028
#> SRR1700027 3 0.785 0.5269 0.092 0.304 0.464 NA 0.016
#> SRR1700028 2 0.834 -0.2784 0.076 0.384 0.352 NA 0.040
#> SRR1700029 3 0.775 0.6259 0.108 0.212 0.548 NA 0.040
#> SRR1700030 2 0.881 0.1038 0.092 0.404 0.224 NA 0.056
#> SRR1700031 3 0.716 0.2519 0.164 0.100 0.612 NA 0.028
#> SRR1700032 2 0.844 -0.0567 0.092 0.404 0.312 NA 0.036
#> SRR1700034 3 0.644 0.1608 0.176 0.068 0.660 NA 0.020
#> SRR1700035 2 0.851 0.1129 0.064 0.408 0.304 NA 0.060
#> SRR1700033 3 0.690 0.5695 0.104 0.188 0.612 NA 0.012
#> SRR1700036 3 0.924 0.3322 0.124 0.312 0.328 NA 0.092
#> SRR1700037 2 0.591 0.6520 0.016 0.684 0.164 NA 0.020
#> SRR1700038 3 0.802 0.5786 0.092 0.272 0.468 NA 0.020
#> SRR1700039 3 0.738 0.2692 0.200 0.100 0.580 NA 0.028
#> SRR1700040 3 0.670 0.5692 0.120 0.188 0.616 NA 0.004
#> SRR1700041 3 0.794 0.5770 0.100 0.216 0.516 NA 0.028
#> SRR1700042 3 0.689 0.5792 0.108 0.180 0.616 NA 0.012
#> SRR1700043 3 0.815 0.6038 0.140 0.252 0.472 NA 0.024
#> SRR1700045 3 0.725 0.5783 0.112 0.320 0.504 NA 0.016
#> SRR1700044 2 0.806 -0.2706 0.112 0.412 0.352 NA 0.024
#> SRR1700046 3 0.767 0.6232 0.108 0.268 0.512 NA 0.020
#> SRR1700047 3 0.752 0.5794 0.156 0.200 0.544 NA 0.012
#> SRR1700048 3 0.775 0.5878 0.112 0.280 0.496 NA 0.020
#> SRR1700049 3 0.664 0.2917 0.152 0.104 0.652 NA 0.020
#> SRR1700050 3 0.726 0.3561 0.148 0.108 0.612 NA 0.036
#> SRR1700051 3 0.649 0.3799 0.124 0.096 0.668 NA 0.016
#> SRR1700052 3 0.714 0.5096 0.124 0.152 0.612 NA 0.024
#> SRR1700053 3 0.798 0.6007 0.104 0.208 0.532 NA 0.048
#> SRR1700054 3 0.802 0.5874 0.116 0.196 0.524 NA 0.036
#> SRR1700055 3 0.651 0.0824 0.212 0.068 0.636 NA 0.016
#> SRR1700056 3 0.722 0.5275 0.136 0.164 0.596 NA 0.020
#> SRR1700057 3 0.719 0.3040 0.116 0.100 0.624 NA 0.040
#> SRR1700058 3 0.633 0.5751 0.088 0.168 0.668 NA 0.016
#> SRR1700059 3 0.723 0.4060 0.084 0.116 0.616 NA 0.040
#> SRR1700060 3 0.604 0.6019 0.080 0.184 0.672 NA 0.004
#> SRR1700061 3 0.758 0.6410 0.092 0.240 0.540 NA 0.024
#> SRR1700062 3 0.669 0.4591 0.140 0.128 0.644 NA 0.016
#> SRR1700063 3 0.767 0.3692 0.156 0.140 0.560 NA 0.024
#> SRR1700064 3 0.846 0.4070 0.116 0.336 0.388 NA 0.036
#> SRR1700065 3 0.773 0.6427 0.124 0.232 0.520 NA 0.016
#> SRR1700066 3 0.773 0.5588 0.120 0.180 0.556 NA 0.032
#> SRR1700067 2 0.871 -0.2103 0.064 0.364 0.328 NA 0.072
#> SRR1700068 3 0.732 0.6025 0.104 0.200 0.588 NA 0.036
#> SRR1700069 2 0.909 -0.3282 0.120 0.324 0.320 NA 0.064
#> SRR1700070 2 0.607 0.6510 0.040 0.672 0.188 NA 0.012
#> SRR1700071 3 0.844 0.4405 0.132 0.192 0.496 NA 0.064
#> SRR1700072 3 0.832 0.6010 0.180 0.252 0.448 NA 0.032
#> SRR1700073 2 0.728 0.4293 0.096 0.524 0.276 NA 0.004
#> SRR1700075 3 0.861 0.5226 0.112 0.268 0.424 NA 0.044
#> SRR1700074 3 0.750 0.6328 0.100 0.256 0.540 NA 0.028
#> SRR1700076 3 0.782 0.4900 0.076 0.348 0.436 NA 0.020
#> SRR1700077 3 0.842 0.5350 0.116 0.284 0.440 NA 0.044
#> SRR1700078 3 0.795 0.5545 0.116 0.296 0.460 NA 0.016
#> SRR1700080 3 0.860 0.4220 0.116 0.332 0.384 NA 0.048
#> SRR1700079 3 0.681 0.3992 0.108 0.124 0.644 NA 0.020
#> SRR1700081 3 0.666 0.5601 0.112 0.168 0.640 NA 0.016
#> SRR1700082 3 0.837 0.5871 0.104 0.280 0.448 NA 0.044
#> SRR1700083 3 0.677 0.4371 0.124 0.108 0.644 NA 0.016
#> SRR1700084 3 0.658 0.5477 0.108 0.144 0.652 NA 0.012
#> SRR1700085 2 0.784 0.4618 0.072 0.512 0.244 NA 0.032
#> SRR1700086 2 0.929 -0.0831 0.124 0.360 0.260 NA 0.096
#> SRR1700087 2 0.807 -0.2393 0.064 0.372 0.348 NA 0.016
#> SRR1700088 2 0.755 -0.1681 0.072 0.424 0.364 NA 0.004
#> SRR1700089 3 0.805 0.4432 0.128 0.312 0.444 NA 0.024
#> SRR1700091 3 0.807 0.3718 0.076 0.372 0.404 NA 0.040
#> SRR1700090 3 0.759 0.5723 0.088 0.284 0.492 NA 0.008
#> SRR1700092 3 0.793 0.2650 0.096 0.384 0.388 NA 0.016
#> SRR1700094 3 0.792 0.5573 0.116 0.312 0.460 NA 0.024
#> SRR1700093 3 0.820 0.3926 0.100 0.360 0.400 NA 0.036
#> SRR1700095 3 0.811 0.5420 0.164 0.296 0.432 NA 0.016
#> SRR1700096 3 0.691 0.6262 0.112 0.256 0.572 NA 0.012
#> SRR1700097 3 0.699 0.6481 0.100 0.208 0.592 NA 0.008
#> SRR1700098 2 0.764 0.3597 0.072 0.504 0.248 NA 0.012
#> SRR1700099 3 0.778 0.3921 0.128 0.372 0.408 NA 0.012
#> SRR1700100 3 0.783 0.3812 0.096 0.360 0.396 NA 0.004
#> SRR1700101 3 0.796 0.3365 0.120 0.384 0.392 NA 0.024
#> SRR1700102 2 0.867 0.1976 0.036 0.416 0.128 NA 0.252
#> SRR1700104 3 0.755 0.5260 0.096 0.300 0.480 NA 0.004
#> SRR1700103 3 0.784 0.4357 0.132 0.360 0.416 NA 0.016
#> SRR1700105 3 0.798 0.3260 0.104 0.384 0.388 NA 0.020
#> SRR1700106 2 0.837 -0.1174 0.108 0.384 0.324 NA 0.020
#> SRR1700107 2 0.766 -0.1713 0.064 0.424 0.352 NA 0.008
#> SRR1700108 2 0.797 -0.2209 0.096 0.408 0.356 NA 0.016
#> SRR1700109 2 0.482 0.6586 0.020 0.776 0.112 NA 0.012
#> SRR1700110 2 0.530 0.6662 0.040 0.752 0.120 NA 0.016
#> SRR1700112 2 0.506 0.6635 0.032 0.760 0.132 NA 0.012
#> SRR1700111 3 0.842 0.5056 0.100 0.300 0.420 NA 0.036
#> SRR1700113 2 0.785 0.4447 0.036 0.488 0.264 NA 0.048
#> SRR1700114 3 0.766 0.5427 0.096 0.332 0.464 NA 0.016
#> SRR1700115 3 0.782 0.5402 0.120 0.324 0.456 NA 0.020
#> SRR1700116 3 0.796 0.4569 0.084 0.340 0.432 NA 0.024
#> SRR1700117 3 0.739 0.4435 0.192 0.136 0.576 NA 0.028
#> SRR1700119 3 0.757 0.5330 0.112 0.300 0.500 NA 0.024
#> SRR1700118 3 0.813 0.3644 0.108 0.360 0.392 NA 0.020
#> SRR1700120 3 0.759 0.6236 0.116 0.264 0.520 NA 0.020
#> SRR1700121 3 0.796 0.3563 0.104 0.348 0.428 NA 0.024
#> SRR1700122 2 0.705 0.6133 0.056 0.596 0.196 NA 0.020
#> SRR1700123 3 0.764 0.6245 0.136 0.264 0.508 NA 0.016
#> SRR1700125 2 0.495 0.6467 0.028 0.748 0.148 NA 0.000
#> SRR1700126 3 0.749 0.6473 0.116 0.216 0.552 NA 0.016
#> SRR1700127 3 0.731 0.6072 0.100 0.264 0.540 NA 0.012
#> SRR1700124 3 0.786 0.5882 0.088 0.280 0.492 NA 0.028
#> SRR1700128 3 0.731 0.5948 0.092 0.284 0.536 NA 0.024
#> SRR1700129 2 0.702 0.4654 0.076 0.560 0.272 NA 0.012
#> SRR1700130 2 0.819 -0.0563 0.076 0.400 0.332 NA 0.024
#> SRR1700132 3 0.773 0.5400 0.084 0.328 0.468 NA 0.024
#> SRR1700131 3 0.736 0.6464 0.144 0.232 0.544 NA 0.012
#> SRR1700133 3 0.678 0.4249 0.084 0.368 0.496 NA 0.004
#> SRR1700134 2 0.586 0.6018 0.036 0.668 0.220 NA 0.008
#> SRR1700135 3 0.783 0.6472 0.132 0.236 0.520 NA 0.032
#> SRR1700136 3 0.703 0.6348 0.112 0.224 0.588 NA 0.020
#> SRR1700137 3 0.794 0.4720 0.116 0.344 0.432 NA 0.024
#> SRR1700138 3 0.722 0.5642 0.108 0.304 0.520 NA 0.016
#> SRR1700140 3 0.768 0.5858 0.128 0.280 0.492 NA 0.012
#> SRR1700139 3 0.754 0.5726 0.104 0.284 0.492 NA 0.004
#> SRR1700141 2 0.572 0.6158 0.044 0.696 0.192 NA 0.012
#> SRR1700142 3 0.777 0.4436 0.164 0.132 0.556 NA 0.032
#> SRR1700143 3 0.765 0.6494 0.136 0.220 0.532 NA 0.016
#> SRR1700144 3 0.741 0.6134 0.112 0.196 0.572 NA 0.020
#> SRR1700145 3 0.780 0.5320 0.096 0.332 0.436 NA 0.008
#> SRR1700146 2 0.631 0.6350 0.056 0.652 0.192 NA 0.008
#> SRR1700147 3 0.728 0.6364 0.108 0.252 0.552 NA 0.016
#> SRR1700149 3 0.758 0.5911 0.112 0.280 0.504 NA 0.012
#> SRR1700148 3 0.728 0.6078 0.100 0.284 0.532 NA 0.016
#> SRR1700150 2 0.763 -0.0303 0.088 0.428 0.372 NA 0.012
#> SRR1700152 3 0.788 0.5976 0.116 0.276 0.480 NA 0.016
#> SRR1700151 3 0.689 0.6458 0.104 0.228 0.596 NA 0.016
#> SRR1700153 3 0.768 0.5507 0.112 0.300 0.480 NA 0.012
#> SRR1700154 3 0.731 0.5760 0.108 0.280 0.524 NA 0.008
#> SRR1700155 3 0.773 0.5023 0.104 0.332 0.452 NA 0.012
#> SRR1700156 3 0.724 0.6250 0.112 0.228 0.568 NA 0.016
#> SRR1700158 3 0.705 0.6320 0.136 0.236 0.560 NA 0.004
#> SRR1700159 2 0.564 0.6371 0.040 0.700 0.188 NA 0.008
#> SRR1700157 3 0.773 0.5926 0.124 0.300 0.468 NA 0.008
#> SRR1700160 3 0.722 0.6141 0.092 0.276 0.544 NA 0.016
#> SRR1700161 3 0.697 0.5878 0.096 0.272 0.564 NA 0.016
#> SRR1700162 2 0.590 0.6231 0.028 0.660 0.212 NA 0.004
#> SRR1700164 3 0.749 0.6129 0.108 0.292 0.508 NA 0.016
#> SRR1700163 3 0.723 0.6428 0.120 0.228 0.560 NA 0.008
#> SRR1700165 3 0.743 0.6364 0.128 0.248 0.540 NA 0.020
#> SRR1700166 3 0.774 0.5785 0.120 0.300 0.468 NA 0.008
#> SRR1700168 2 0.672 0.5888 0.068 0.620 0.204 NA 0.012
#> SRR1700167 3 0.700 0.6406 0.108 0.216 0.572 NA 0.000
#> SRR1700170 3 0.793 0.5144 0.100 0.316 0.452 NA 0.020
#> SRR1700169 3 0.718 0.6438 0.116 0.236 0.564 NA 0.012
#> SRR1700171 3 0.821 0.4359 0.268 0.236 0.400 NA 0.012
#> SRR1700172 3 0.780 0.3456 0.072 0.368 0.424 NA 0.024
#> SRR1700174 3 0.752 0.5008 0.080 0.332 0.472 NA 0.012
#> SRR1700173 3 0.771 0.5392 0.116 0.304 0.468 NA 0.008
#> SRR1700175 3 0.809 0.4933 0.156 0.316 0.416 NA 0.012
#> SRR1700176 3 0.728 0.6158 0.116 0.184 0.596 NA 0.036
#> SRR1700178 2 0.582 0.6170 0.036 0.696 0.040 NA 0.036
#> SRR1700177 3 0.769 0.5273 0.100 0.324 0.456 NA 0.008
#> SRR1700180 2 0.527 0.6306 0.020 0.732 0.048 NA 0.024
#> SRR1700179 2 0.558 0.6098 0.040 0.728 0.036 NA 0.040
#> SRR1700181 2 0.495 0.6357 0.024 0.760 0.048 NA 0.016
#> SRR1700183 1 0.508 0.7774 0.628 0.044 0.324 NA 0.000
#> SRR1700182 2 0.580 0.6123 0.032 0.716 0.040 NA 0.060
#> SRR1700184 2 0.578 0.6369 0.040 0.712 0.076 NA 0.020
#> SRR1700186 2 0.603 0.6290 0.044 0.696 0.080 NA 0.024
#> SRR1700187 1 0.535 0.7075 0.680 0.052 0.244 NA 0.004
#> SRR1700185 1 0.546 0.7709 0.624 0.060 0.304 NA 0.000
#> SRR1700188 2 0.529 0.6257 0.032 0.744 0.048 NA 0.024
#> SRR1700192 1 0.771 0.5240 0.488 0.196 0.240 NA 0.012
#> SRR1700190 1 0.878 0.4707 0.420 0.064 0.264 NA 0.116
#> SRR1700191 1 0.493 0.7646 0.660 0.044 0.292 NA 0.000
#> SRR1700189 1 0.752 0.5713 0.456 0.148 0.324 NA 0.004
#> SRR1700193 2 0.570 0.6452 0.048 0.704 0.068 NA 0.008
#> SRR1700195 2 0.560 0.6632 0.028 0.716 0.080 NA 0.016
#> SRR1700194 1 0.526 0.7583 0.656 0.056 0.276 NA 0.000
#> SRR1700196 2 0.533 0.6537 0.044 0.752 0.052 NA 0.024
#> SRR1700197 3 0.763 -0.3069 0.336 0.080 0.476 NA 0.032
#> SRR1700198 2 0.555 0.6610 0.032 0.716 0.092 NA 0.008
#> SRR1700199 2 0.431 0.6590 0.024 0.796 0.060 NA 0.000
#> SRR1700200 2 0.503 0.6526 0.032 0.772 0.064 NA 0.020
#> SRR1700201 2 0.548 0.6565 0.036 0.736 0.068 NA 0.020
#> SRR1700202 2 0.670 0.6360 0.064 0.624 0.176 NA 0.008
#> SRR1700203 2 0.512 0.6283 0.024 0.732 0.024 NA 0.028
#> SRR1700204 2 0.619 0.6642 0.032 0.680 0.132 NA 0.024
#> SRR1700206 2 0.695 0.5481 0.060 0.572 0.248 NA 0.008
#> SRR1700207 2 0.478 0.6545 0.024 0.792 0.064 NA 0.028
#> SRR1700208 1 0.887 0.2712 0.460 0.112 0.144 NA 0.108
#> SRR1700205 2 0.543 0.6474 0.028 0.712 0.048 NA 0.016
#> SRR1700209 2 0.469 0.6624 0.024 0.772 0.096 NA 0.000
#> SRR1700210 2 0.536 0.6253 0.020 0.700 0.032 NA 0.024
#> SRR1700211 2 0.523 0.6658 0.032 0.748 0.072 NA 0.012
#> SRR1700212 2 0.585 0.6489 0.020 0.696 0.056 NA 0.044
#> SRR1700213 2 0.880 0.2454 0.068 0.440 0.124 NA 0.144
#> SRR1700214 2 0.520 0.6630 0.020 0.756 0.084 NA 0.024
#> SRR1700215 1 0.552 0.7646 0.564 0.044 0.380 NA 0.004
#> SRR1700217 2 0.451 0.6610 0.024 0.800 0.112 NA 0.016
#> SRR1700216 1 0.529 0.7698 0.592 0.040 0.360 NA 0.004
#> SRR1700218 2 0.598 0.6608 0.052 0.684 0.152 NA 0.004
#> SRR1700219 2 0.535 0.6617 0.040 0.756 0.076 NA 0.024
#> SRR1700222 1 0.582 0.7638 0.592 0.076 0.316 NA 0.000
#> SRR1700220 2 0.470 0.6615 0.032 0.764 0.052 NA 0.000
#> SRR1700221 2 0.506 0.6541 0.036 0.768 0.064 NA 0.016
#> SRR1700223 2 0.434 0.6612 0.024 0.812 0.056 NA 0.012
#> SRR1700224 2 0.658 0.6388 0.048 0.628 0.160 NA 0.008
#> SRR1700226 2 0.528 0.6708 0.024 0.748 0.080 NA 0.020
#> SRR1700229 2 0.565 0.6540 0.020 0.708 0.084 NA 0.020
#> SRR1700225 2 0.930 -0.4541 0.076 0.312 0.116 NA 0.220
#> SRR1700227 2 0.590 0.6533 0.040 0.696 0.080 NA 0.016
#> SRR1700230 1 0.715 0.6786 0.504 0.124 0.312 NA 0.004
#> SRR1700231 2 0.554 0.6624 0.040 0.720 0.080 NA 0.008
#> SRR1700228 2 0.568 0.6734 0.028 0.716 0.116 NA 0.016
#> SRR1700232 2 0.620 0.6585 0.048 0.676 0.072 NA 0.024
#> SRR1700233 2 0.573 0.6717 0.044 0.712 0.108 NA 0.008
#> SRR1700234 2 0.540 0.6672 0.044 0.740 0.108 NA 0.008
#> SRR1700235 2 0.702 0.5066 0.100 0.580 0.228 NA 0.008
#> SRR1700237 2 0.594 0.6626 0.032 0.692 0.104 NA 0.016
#> SRR1700236 2 0.549 0.6596 0.020 0.728 0.080 NA 0.024
#> SRR1700238 2 0.488 0.6623 0.052 0.776 0.068 NA 0.004
#> SRR1700239 1 0.616 0.7589 0.588 0.072 0.300 NA 0.000
#> SRR1700240 1 0.524 0.7635 0.644 0.044 0.300 NA 0.004
#> SRR1700241 3 0.719 0.3321 0.084 0.400 0.440 NA 0.008
#> SRR1700243 2 0.484 0.6631 0.032 0.776 0.068 NA 0.008
#> SRR1700244 2 0.638 0.6725 0.064 0.680 0.088 NA 0.028
#> SRR1700242 1 0.845 0.2903 0.416 0.248 0.200 NA 0.020
#> SRR1700246 2 0.544 0.6648 0.040 0.740 0.104 NA 0.012
#> SRR1700245 2 0.484 0.6465 0.020 0.784 0.060 NA 0.028
#> SRR1700247 1 0.681 0.6505 0.600 0.068 0.248 NA 0.028
#> SRR1700249 1 0.479 0.7646 0.668 0.036 0.292 NA 0.000
#> SRR1700250 2 0.638 0.6024 0.024 0.648 0.044 NA 0.072
#> SRR1700248 2 0.575 0.6630 0.040 0.720 0.076 NA 0.024
#> SRR1700251 2 0.602 0.6385 0.052 0.704 0.052 NA 0.040
#> SRR1700252 3 0.857 0.3098 0.264 0.272 0.340 NA 0.016
#> SRR1700253 2 0.513 0.6587 0.028 0.760 0.048 NA 0.028
#> SRR1700256 2 0.562 0.6517 0.040 0.708 0.060 NA 0.012
#> SRR1700254 1 0.585 0.6920 0.660 0.060 0.232 NA 0.004
#> SRR1700255 2 0.495 0.6600 0.020 0.768 0.076 NA 0.016
#> SRR1700257 2 0.510 0.6328 0.032 0.756 0.044 NA 0.020
#> SRR1700258 2 0.486 0.6671 0.012 0.760 0.088 NA 0.008
#> SRR1700259 2 0.575 0.6689 0.040 0.720 0.076 NA 0.024
#> SRR1700260 2 0.558 0.6632 0.032 0.732 0.112 NA 0.020
#> SRR1700261 2 0.496 0.6640 0.020 0.776 0.096 NA 0.024
#> SRR1700262 2 0.529 0.6640 0.024 0.748 0.124 NA 0.020
#> SRR1700263 2 0.608 0.6711 0.048 0.692 0.108 NA 0.016
#> SRR1700264 2 0.705 0.6107 0.060 0.604 0.160 NA 0.020
#> SRR1700265 2 0.801 0.4928 0.064 0.520 0.180 NA 0.052
#> SRR1700266 2 0.673 0.5852 0.020 0.624 0.056 NA 0.096
#> SRR1700268 3 0.857 0.4207 0.152 0.348 0.348 NA 0.028
#> SRR1700270 2 0.558 0.6731 0.032 0.732 0.108 NA 0.020
#> SRR1700267 2 0.499 0.6692 0.020 0.768 0.096 NA 0.016
#> SRR1700271 2 0.469 0.6573 0.028 0.800 0.084 NA 0.028
#> SRR1700272 2 0.546 0.6694 0.040 0.732 0.128 NA 0.008
#> SRR1700273 2 0.610 0.6682 0.036 0.692 0.096 NA 0.028
#> SRR1700274 2 0.681 0.6633 0.064 0.620 0.168 NA 0.012
#> SRR1700277 3 0.889 -0.0734 0.312 0.188 0.332 NA 0.036
#> SRR1700275 2 0.566 0.6663 0.036 0.704 0.152 NA 0.004
#> SRR1700276 2 0.573 0.6704 0.036 0.716 0.080 NA 0.020
#> SRR1700278 2 0.679 0.5714 0.064 0.596 0.252 NA 0.020
#> SRR1700279 2 0.599 0.6623 0.020 0.684 0.092 NA 0.028
#> SRR1700280 2 0.564 0.6591 0.020 0.728 0.052 NA 0.060
#> SRR1700281 2 0.589 0.6643 0.040 0.692 0.084 NA 0.012
#> SRR1700283 2 0.637 0.6386 0.024 0.644 0.096 NA 0.028
#> SRR1700282 2 0.773 0.0461 0.088 0.448 0.348 NA 0.020
#> SRR1700284 2 0.655 0.6418 0.040 0.620 0.196 NA 0.008
#> SRR1700285 2 0.639 0.6441 0.052 0.644 0.192 NA 0.008
#> SRR1700286 2 0.660 0.6304 0.056 0.644 0.164 NA 0.016
#> SRR1700287 2 0.529 0.6674 0.020 0.732 0.140 NA 0.008
#> SRR1700290 3 0.754 -0.0992 0.356 0.084 0.460 NA 0.020
#> SRR1700289 2 0.619 0.6531 0.032 0.656 0.108 NA 0.012
#> SRR1700288 2 0.663 0.6452 0.088 0.636 0.136 NA 0.004
#> SRR1700292 2 0.620 0.6600 0.024 0.652 0.096 NA 0.020
#> SRR1700291 2 0.771 0.1002 0.068 0.448 0.328 NA 0.012
#> SRR1700293 2 0.757 0.1683 0.084 0.488 0.312 NA 0.016
#> SRR1700294 2 0.579 0.6741 0.044 0.712 0.112 NA 0.012
#> SRR1700295 3 0.899 0.5209 0.152 0.276 0.376 NA 0.056
#> SRR1700297 2 0.580 0.6689 0.044 0.716 0.108 NA 0.016
#> SRR1700296 2 0.462 0.6659 0.036 0.800 0.080 NA 0.012
#> SRR1700298 2 0.733 0.0812 0.096 0.456 0.368 NA 0.008
#> SRR1700299 2 0.729 0.5263 0.072 0.564 0.224 NA 0.016
#> SRR1700300 2 0.753 0.1686 0.088 0.472 0.324 NA 0.008
#> SRR1700302 2 0.649 0.6504 0.056 0.656 0.172 NA 0.020
#> SRR1700301 2 0.547 0.6645 0.032 0.740 0.116 NA 0.020
#> SRR1700303 2 0.534 0.6616 0.028 0.736 0.116 NA 0.008
#> SRR1700304 2 0.665 0.6546 0.040 0.644 0.112 NA 0.032
#> SRR1700305 2 0.635 0.5804 0.052 0.632 0.240 NA 0.016
#> SRR1700306 3 0.852 0.2304 0.092 0.364 0.368 NA 0.056
#> SRR1700308 2 0.724 0.4671 0.072 0.540 0.240 NA 0.004
#> SRR1700307 3 0.737 0.4833 0.096 0.328 0.496 NA 0.020
#> SRR1700309 3 0.803 0.4500 0.100 0.344 0.392 NA 0.008
#> SRR1700310 2 0.530 0.6682 0.036 0.756 0.104 NA 0.020
#> SRR1700311 2 0.819 -0.0916 0.100 0.384 0.348 NA 0.016
#> SRR1700312 2 0.758 0.4125 0.104 0.516 0.260 NA 0.012
#> SRR1700313 2 0.717 -0.0930 0.092 0.448 0.392 NA 0.008
#> SRR1700314 3 0.736 0.2181 0.060 0.408 0.424 NA 0.016
#> SRR1700315 2 0.759 0.2931 0.096 0.484 0.308 NA 0.012
#> SRR1700316 2 0.754 0.0218 0.080 0.444 0.364 NA 0.012
#> SRR1700317 2 0.602 0.6735 0.020 0.680 0.128 NA 0.020
#> SRR1700318 2 0.867 0.2332 0.088 0.432 0.244 NA 0.060
#> SRR1700319 3 0.766 0.5041 0.092 0.308 0.460 NA 0.004
#> SRR1700320 2 0.579 0.6595 0.040 0.700 0.156 NA 0.008
#> SRR1700322 2 0.749 0.4896 0.080 0.532 0.240 NA 0.012
#> SRR1700321 2 0.539 0.6733 0.036 0.736 0.124 NA 0.008
#> SRR1700323 2 0.738 0.3841 0.100 0.516 0.296 NA 0.016
#> SRR1700324 2 0.553 0.6556 0.036 0.720 0.152 NA 0.008
#> SRR1700325 2 0.687 0.5799 0.064 0.592 0.236 NA 0.012
#> SRR1700326 2 0.821 -0.1691 0.104 0.408 0.316 NA 0.016
#> SRR1700327 2 0.684 0.6380 0.036 0.616 0.184 NA 0.028
#> SRR1700329 2 0.717 0.6022 0.064 0.592 0.160 NA 0.020
#> SRR1700328 2 0.795 0.1223 0.100 0.448 0.300 NA 0.012
#> SRR1700330 3 0.704 0.2749 0.076 0.384 0.468 NA 0.008
#> SRR1700331 2 0.721 0.5801 0.024 0.548 0.220 NA 0.028
#> SRR1700332 2 0.711 0.5417 0.048 0.576 0.224 NA 0.020
#> SRR1700333 2 0.714 0.5994 0.044 0.584 0.172 NA 0.024
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.606 0.6577 0.020 0.640 0.036 0.168 NA 0.008
#> SRR1699875 2 0.612 0.6612 0.024 0.660 0.060 0.084 NA 0.016
#> SRR1699876 2 0.569 0.6595 0.008 0.636 0.028 0.160 NA 0.000
#> SRR1699877 2 0.710 0.5967 0.040 0.564 0.048 0.116 NA 0.028
#> SRR1699879 2 0.561 0.6720 0.028 0.672 0.016 0.140 NA 0.004
#> SRR1699878 2 0.708 0.5158 0.028 0.520 0.060 0.048 NA 0.052
#> SRR1699880 4 0.724 0.4408 0.084 0.156 0.152 0.556 NA 0.016
#> SRR1699881 4 0.713 0.5920 0.076 0.252 0.112 0.512 NA 0.000
#> SRR1699882 2 0.607 0.6705 0.016 0.628 0.040 0.140 NA 0.004
#> SRR1699883 2 0.756 0.5453 0.060 0.500 0.068 0.164 NA 0.008
#> SRR1699884 2 0.679 0.5530 0.032 0.552 0.040 0.232 NA 0.008
#> SRR1699885 2 0.535 0.6743 0.024 0.684 0.012 0.096 NA 0.004
#> SRR1699886 2 0.587 0.6519 0.024 0.620 0.008 0.164 NA 0.004
#> SRR1699888 2 0.389 0.6584 0.008 0.792 0.000 0.116 NA 0.004
#> SRR1699889 2 0.716 0.5054 0.060 0.520 0.056 0.220 NA 0.000
#> SRR1699890 2 0.476 0.6641 0.016 0.748 0.016 0.104 NA 0.004
#> SRR1699887 2 0.564 0.6817 0.028 0.688 0.016 0.136 NA 0.016
#> SRR1699891 2 0.638 0.6462 0.048 0.620 0.036 0.124 NA 0.004
#> SRR1699892 4 0.732 0.1244 0.040 0.376 0.084 0.404 NA 0.004
#> SRR1699893 4 0.812 0.3860 0.060 0.316 0.096 0.396 NA 0.024
#> SRR1699894 2 0.581 0.6522 0.024 0.656 0.020 0.168 NA 0.008
#> SRR1699895 2 0.621 0.6484 0.020 0.640 0.040 0.144 NA 0.016
#> SRR1699896 2 0.745 0.2559 0.048 0.448 0.068 0.304 NA 0.004
#> SRR1699897 2 0.697 0.4425 0.032 0.528 0.076 0.256 NA 0.004
#> SRR1699898 4 0.603 0.5046 0.060 0.156 0.108 0.648 NA 0.000
#> SRR1699900 2 0.753 -0.2667 0.036 0.376 0.100 0.360 NA 0.000
#> SRR1699899 2 0.737 0.4517 0.036 0.500 0.064 0.240 NA 0.012
#> SRR1699902 4 0.785 0.4029 0.052 0.220 0.200 0.452 NA 0.020
#> SRR1699901 4 0.683 0.5287 0.096 0.204 0.088 0.572 NA 0.004
#> SRR1699903 2 0.768 0.5088 0.040 0.504 0.072 0.160 NA 0.028
#> SRR1699904 2 0.514 0.6580 0.020 0.712 0.012 0.156 NA 0.008
#> SRR1699905 4 0.814 0.5120 0.072 0.272 0.136 0.412 NA 0.012
#> SRR1699906 2 0.549 0.6622 0.032 0.672 0.012 0.132 NA 0.000
#> SRR1699907 2 0.715 0.4660 0.036 0.512 0.060 0.256 NA 0.008
#> SRR1699908 2 0.584 0.6376 0.028 0.648 0.032 0.176 NA 0.000
#> SRR1699909 2 0.579 0.6190 0.040 0.656 0.032 0.188 NA 0.000
#> SRR1699910 4 0.759 0.3855 0.068 0.328 0.072 0.424 NA 0.004
#> SRR1699911 2 0.719 0.5305 0.036 0.520 0.060 0.244 NA 0.012
#> SRR1699912 2 0.736 0.5400 0.032 0.544 0.064 0.180 NA 0.032
#> SRR1699913 2 0.653 0.6022 0.040 0.568 0.028 0.188 NA 0.000
#> SRR1699914 4 0.657 0.5900 0.060 0.232 0.076 0.584 NA 0.004
#> SRR1699915 2 0.764 0.2957 0.036 0.440 0.064 0.292 NA 0.016
#> SRR1699916 2 0.424 0.6599 0.020 0.788 0.020 0.108 NA 0.000
#> SRR1699917 2 0.814 0.2262 0.064 0.404 0.088 0.268 NA 0.012
#> SRR1699918 2 0.613 0.6109 0.036 0.616 0.032 0.204 NA 0.000
#> SRR1699919 2 0.701 0.5287 0.048 0.536 0.032 0.236 NA 0.012
#> SRR1699920 2 0.799 -0.2238 0.068 0.368 0.092 0.352 NA 0.012
#> SRR1699921 2 0.714 0.5348 0.024 0.552 0.084 0.212 NA 0.024
#> SRR1699922 2 0.716 0.5410 0.044 0.524 0.036 0.196 NA 0.012
#> SRR1699923 4 0.765 0.4051 0.044 0.308 0.092 0.432 NA 0.008
#> SRR1699924 4 0.726 0.3315 0.056 0.112 0.200 0.548 NA 0.012
#> SRR1699925 1 0.536 0.5671 0.504 0.032 0.036 0.424 NA 0.000
#> SRR1699926 2 0.763 0.0936 0.060 0.388 0.072 0.340 NA 0.000
#> SRR1699927 2 0.665 0.6331 0.032 0.600 0.040 0.152 NA 0.016
#> SRR1699929 2 0.745 -0.1382 0.052 0.388 0.068 0.388 NA 0.008
#> SRR1699928 2 0.604 0.6628 0.024 0.648 0.036 0.128 NA 0.008
#> SRR1699930 2 0.608 0.6409 0.036 0.644 0.024 0.144 NA 0.008
#> SRR1699931 2 0.730 0.0586 0.048 0.428 0.072 0.356 NA 0.004
#> SRR1699933 4 0.868 0.4068 0.064 0.256 0.184 0.344 NA 0.024
#> SRR1699932 2 0.668 0.4959 0.028 0.548 0.052 0.260 NA 0.004
#> SRR1699934 1 0.536 0.5671 0.504 0.032 0.036 0.424 NA 0.000
#> SRR1699935 2 0.754 0.0389 0.036 0.408 0.080 0.360 NA 0.016
#> SRR1699936 2 0.512 0.6755 0.020 0.732 0.020 0.064 NA 0.020
#> SRR1699937 2 0.713 0.4247 0.028 0.508 0.076 0.252 NA 0.004
#> SRR1699938 2 0.562 0.6745 0.016 0.684 0.032 0.080 NA 0.016
#> SRR1699940 2 0.858 -0.2089 0.048 0.344 0.140 0.292 NA 0.032
#> SRR1699939 2 0.585 0.6646 0.036 0.680 0.036 0.060 NA 0.020
#> SRR1699941 4 0.730 0.5450 0.112 0.240 0.088 0.504 NA 0.000
#> SRR1699942 6 0.808 0.0000 0.024 0.136 0.080 0.052 NA 0.392
#> SRR1699943 2 0.630 0.6459 0.044 0.652 0.044 0.072 NA 0.024
#> SRR1699944 2 0.686 0.6376 0.040 0.600 0.048 0.112 NA 0.028
#> SRR1699945 4 0.683 0.0688 0.192 0.060 0.148 0.564 NA 0.032
#> SRR1699946 2 0.744 0.5286 0.044 0.540 0.068 0.192 NA 0.028
#> SRR1699947 2 0.697 0.6154 0.064 0.588 0.056 0.164 NA 0.012
#> SRR1699948 2 0.594 0.6420 0.040 0.672 0.044 0.056 NA 0.016
#> SRR1699949 2 0.560 0.6804 0.028 0.704 0.032 0.084 NA 0.016
#> SRR1699950 2 0.576 0.6654 0.028 0.688 0.036 0.080 NA 0.016
#> SRR1699951 2 0.861 0.1155 0.052 0.384 0.140 0.260 NA 0.048
#> SRR1699952 2 0.807 0.3283 0.068 0.440 0.104 0.240 NA 0.012
#> SRR1699953 2 0.577 0.6720 0.028 0.680 0.036 0.080 NA 0.012
#> SRR1699954 2 0.835 -0.0853 0.100 0.388 0.116 0.276 NA 0.012
#> SRR1699955 2 0.448 0.6666 0.016 0.768 0.024 0.072 NA 0.000
#> SRR1699956 4 0.764 0.1559 0.116 0.104 0.152 0.544 NA 0.044
#> SRR1699957 2 0.704 0.5948 0.040 0.564 0.060 0.116 NA 0.016
#> SRR1699959 4 0.796 0.4301 0.048 0.288 0.120 0.408 NA 0.008
#> SRR1699958 2 0.818 0.0258 0.052 0.396 0.092 0.264 NA 0.016
#> SRR1699960 2 0.521 0.6738 0.024 0.712 0.028 0.132 NA 0.000
#> SRR1699961 4 0.757 0.5567 0.052 0.268 0.168 0.448 NA 0.004
#> SRR1699962 2 0.571 0.6784 0.028 0.684 0.040 0.112 NA 0.004
#> SRR1699963 2 0.777 0.2507 0.032 0.440 0.092 0.256 NA 0.012
#> SRR1699964 2 0.798 0.4362 0.072 0.460 0.100 0.228 NA 0.012
#> SRR1699965 2 0.469 0.6620 0.016 0.760 0.016 0.100 NA 0.008
#> SRR1699966 4 0.845 0.3747 0.044 0.272 0.148 0.372 NA 0.028
#> SRR1699967 2 0.726 0.5527 0.048 0.540 0.076 0.192 NA 0.008
#> SRR1699968 2 0.696 0.4828 0.028 0.520 0.056 0.280 NA 0.012
#> SRR1699969 4 0.715 0.3922 0.120 0.128 0.124 0.572 NA 0.008
#> SRR1699971 4 0.803 0.4165 0.064 0.340 0.132 0.368 NA 0.012
#> SRR1699970 2 0.639 0.6624 0.028 0.632 0.040 0.100 NA 0.024
#> SRR1699972 4 0.749 0.4974 0.060 0.284 0.084 0.456 NA 0.000
#> SRR1699973 2 0.808 -0.1049 0.028 0.368 0.136 0.308 NA 0.016
#> SRR1699974 4 0.649 0.4260 0.156 0.144 0.072 0.604 NA 0.004
#> SRR1699975 2 0.753 0.4488 0.044 0.484 0.048 0.244 NA 0.020
#> SRR1699976 4 0.795 0.5044 0.064 0.312 0.148 0.396 NA 0.012
#> SRR1699977 4 0.796 0.4525 0.052 0.312 0.112 0.400 NA 0.012
#> SRR1699978 4 0.699 0.3220 0.136 0.112 0.124 0.584 NA 0.012
#> SRR1699979 4 0.758 0.5793 0.056 0.260 0.124 0.476 NA 0.008
#> SRR1699980 2 0.801 0.3532 0.032 0.436 0.108 0.220 NA 0.020
#> SRR1699981 4 0.736 0.5528 0.056 0.236 0.120 0.508 NA 0.004
#> SRR1699982 2 0.625 0.6626 0.024 0.620 0.044 0.140 NA 0.004
#> SRR1699983 2 0.790 0.4882 0.040 0.456 0.060 0.192 NA 0.032
#> SRR1699984 1 0.529 0.5759 0.516 0.028 0.036 0.416 NA 0.000
#> SRR1699985 2 0.604 0.6589 0.044 0.664 0.044 0.132 NA 0.004
#> SRR1699986 4 0.690 0.4816 0.112 0.168 0.112 0.576 NA 0.008
#> SRR1699988 2 0.813 0.3827 0.056 0.472 0.096 0.172 NA 0.032
#> SRR1699987 4 0.815 0.5427 0.076 0.220 0.140 0.448 NA 0.016
#> SRR1699989 2 0.756 0.1445 0.028 0.428 0.080 0.316 NA 0.012
#> SRR1699990 4 0.698 0.4155 0.052 0.324 0.068 0.488 NA 0.004
#> SRR1699992 2 0.801 -0.2457 0.060 0.380 0.108 0.344 NA 0.020
#> SRR1699991 4 0.697 0.4553 0.076 0.132 0.184 0.568 NA 0.012
#> SRR1699993 4 0.777 0.5344 0.144 0.220 0.108 0.460 NA 0.000
#> SRR1699994 4 0.745 0.3203 0.108 0.132 0.176 0.528 NA 0.008
#> SRR1699995 4 0.601 -0.1948 0.228 0.036 0.136 0.592 NA 0.000
#> SRR1699996 2 0.710 0.5913 0.052 0.544 0.044 0.188 NA 0.008
#> SRR1699997 4 0.786 0.4447 0.044 0.324 0.120 0.412 NA 0.024
#> SRR1699998 2 0.816 0.4099 0.064 0.460 0.084 0.188 NA 0.028
#> SRR1699999 4 0.622 0.3240 0.156 0.104 0.092 0.628 NA 0.000
#> SRR1700000 2 0.804 0.0552 0.032 0.384 0.120 0.288 NA 0.012
#> SRR1700002 4 0.689 0.3862 0.028 0.328 0.092 0.476 NA 0.000
#> SRR1700001 4 0.634 0.5608 0.060 0.216 0.080 0.608 NA 0.004
#> SRR1700003 2 0.810 0.0584 0.052 0.404 0.096 0.304 NA 0.024
#> SRR1700004 4 0.730 0.5001 0.080 0.192 0.128 0.536 NA 0.004
#> SRR1700005 1 0.536 0.6382 0.544 0.032 0.040 0.380 NA 0.004
#> SRR1700006 4 0.735 0.5702 0.060 0.232 0.132 0.500 NA 0.000
#> SRR1700007 2 0.428 0.6591 0.024 0.784 0.012 0.092 NA 0.000
#> SRR1700008 4 0.769 0.5270 0.060 0.196 0.160 0.504 NA 0.024
#> SRR1700009 4 0.612 -0.4398 0.332 0.036 0.088 0.532 NA 0.008
#> SRR1700010 4 0.733 0.1378 0.140 0.092 0.144 0.560 NA 0.044
#> SRR1700011 2 0.582 0.6759 0.032 0.652 0.016 0.144 NA 0.004
#> SRR1700013 4 0.773 0.5165 0.072 0.316 0.132 0.416 NA 0.008
#> SRR1700012 2 0.878 -0.1099 0.052 0.320 0.172 0.224 NA 0.024
#> SRR1700014 4 0.728 0.5756 0.052 0.236 0.120 0.520 NA 0.008
#> SRR1700015 4 0.795 0.4500 0.072 0.280 0.148 0.412 NA 0.004
#> SRR1700016 4 0.719 -0.2387 0.256 0.052 0.176 0.484 NA 0.008
#> SRR1700018 4 0.895 -0.2784 0.080 0.176 0.268 0.320 NA 0.040
#> SRR1700017 3 0.949 0.3060 0.120 0.144 0.260 0.224 NA 0.056
#> SRR1700019 2 0.540 0.6822 0.016 0.704 0.024 0.136 NA 0.012
#> SRR1700020 3 0.742 0.3822 0.108 0.016 0.404 0.376 NA 0.036
#> SRR1700021 2 0.808 0.1576 0.044 0.412 0.076 0.280 NA 0.028
#> SRR1700023 4 0.769 0.5218 0.036 0.296 0.172 0.424 NA 0.020
#> SRR1700022 4 0.706 0.4155 0.076 0.168 0.176 0.544 NA 0.004
#> SRR1700024 2 0.798 0.4041 0.060 0.460 0.092 0.224 NA 0.016
#> SRR1700025 4 0.744 0.4139 0.032 0.336 0.132 0.416 NA 0.004
#> SRR1700026 4 0.845 0.4190 0.080 0.316 0.144 0.352 NA 0.028
#> SRR1700027 4 0.790 0.5198 0.060 0.264 0.180 0.424 NA 0.012
#> SRR1700028 4 0.814 0.3407 0.040 0.304 0.124 0.352 NA 0.008
#> SRR1700029 4 0.754 0.4635 0.080 0.164 0.152 0.528 NA 0.012
#> SRR1700030 2 0.888 -0.0210 0.072 0.344 0.172 0.212 NA 0.028
#> SRR1700031 4 0.663 -0.1164 0.116 0.052 0.248 0.556 NA 0.004
#> SRR1700032 2 0.857 -0.1920 0.064 0.348 0.152 0.296 NA 0.028
#> SRR1700034 4 0.617 -0.0530 0.144 0.036 0.180 0.616 NA 0.004
#> SRR1700035 2 0.862 0.0403 0.076 0.364 0.164 0.260 NA 0.024
#> SRR1700033 4 0.674 0.3167 0.056 0.116 0.192 0.588 NA 0.008
#> SRR1700036 4 0.929 0.2250 0.080 0.236 0.212 0.292 NA 0.088
#> SRR1700037 2 0.600 0.6575 0.020 0.644 0.032 0.160 NA 0.008
#> SRR1700038 4 0.809 0.4877 0.068 0.244 0.136 0.428 NA 0.008
#> SRR1700039 4 0.712 -0.0790 0.124 0.056 0.232 0.536 NA 0.012
#> SRR1700040 4 0.616 0.3956 0.064 0.140 0.132 0.640 NA 0.004
#> SRR1700041 4 0.747 0.3498 0.052 0.168 0.228 0.492 NA 0.012
#> SRR1700042 4 0.670 0.4433 0.080 0.124 0.136 0.612 NA 0.008
#> SRR1700043 4 0.818 0.4930 0.112 0.204 0.120 0.464 NA 0.024
#> SRR1700045 4 0.719 0.5969 0.064 0.260 0.104 0.520 NA 0.016
#> SRR1700044 2 0.791 -0.2973 0.072 0.372 0.116 0.356 NA 0.012
#> SRR1700046 4 0.746 0.5157 0.076 0.212 0.140 0.500 NA 0.000
#> SRR1700047 4 0.722 0.4211 0.124 0.136 0.128 0.560 NA 0.008
#> SRR1700048 4 0.741 0.5638 0.068 0.260 0.088 0.500 NA 0.008
#> SRR1700049 4 0.654 0.0683 0.112 0.076 0.160 0.616 NA 0.008
#> SRR1700050 4 0.670 0.0438 0.128 0.060 0.200 0.580 NA 0.012
#> SRR1700051 4 0.623 0.0156 0.088 0.028 0.208 0.624 NA 0.012
#> SRR1700052 4 0.715 0.2676 0.120 0.112 0.172 0.552 NA 0.004
#> SRR1700053 4 0.777 0.3893 0.068 0.168 0.208 0.484 NA 0.020
#> SRR1700054 4 0.759 0.3637 0.068 0.152 0.192 0.516 NA 0.020
#> SRR1700055 4 0.602 -0.0782 0.164 0.036 0.160 0.624 NA 0.004
#> SRR1700056 4 0.683 0.3158 0.068 0.120 0.204 0.568 NA 0.004
#> SRR1700057 4 0.691 -0.1897 0.080 0.052 0.280 0.532 NA 0.012
#> SRR1700058 4 0.584 0.4429 0.072 0.112 0.120 0.672 NA 0.000
#> SRR1700059 4 0.728 0.0158 0.028 0.096 0.228 0.536 NA 0.028
#> SRR1700060 4 0.570 0.4900 0.044 0.136 0.108 0.684 NA 0.004
#> SRR1700061 4 0.709 0.5628 0.052 0.196 0.156 0.544 NA 0.008
#> SRR1700062 4 0.595 0.2305 0.060 0.080 0.196 0.644 NA 0.008
#> SRR1700063 4 0.726 -0.0501 0.108 0.080 0.240 0.520 NA 0.008
#> SRR1700064 4 0.866 0.3830 0.080 0.248 0.212 0.348 NA 0.028
#> SRR1700065 4 0.742 0.4970 0.088 0.160 0.160 0.520 NA 0.000
#> SRR1700066 4 0.729 0.3602 0.072 0.136 0.216 0.524 NA 0.008
#> SRR1700067 2 0.892 -0.2862 0.084 0.300 0.164 0.284 NA 0.028
#> SRR1700068 4 0.709 0.3565 0.084 0.128 0.232 0.520 NA 0.000
#> SRR1700069 4 0.899 0.3130 0.068 0.232 0.228 0.300 NA 0.036
#> SRR1700070 2 0.625 0.6467 0.040 0.640 0.044 0.168 NA 0.008
#> SRR1700071 4 0.840 -0.0862 0.096 0.136 0.280 0.392 NA 0.032
#> SRR1700072 4 0.807 0.4897 0.136 0.204 0.172 0.432 NA 0.008
#> SRR1700073 2 0.729 0.3958 0.052 0.484 0.068 0.296 NA 0.008
#> SRR1700075 4 0.847 0.4054 0.072 0.204 0.188 0.404 NA 0.020
#> SRR1700074 4 0.743 0.4773 0.068 0.196 0.160 0.520 NA 0.016
#> SRR1700076 4 0.787 0.5166 0.052 0.288 0.152 0.416 NA 0.008
#> SRR1700077 4 0.822 0.4281 0.076 0.224 0.212 0.408 NA 0.020
#> SRR1700078 4 0.786 0.5449 0.068 0.256 0.160 0.440 NA 0.008
#> SRR1700080 4 0.827 0.4209 0.084 0.260 0.220 0.364 NA 0.012
#> SRR1700079 4 0.652 0.1013 0.048 0.096 0.248 0.572 NA 0.004
#> SRR1700081 4 0.661 0.4026 0.096 0.128 0.136 0.608 NA 0.004
#> SRR1700082 4 0.784 0.3913 0.044 0.220 0.216 0.432 NA 0.008
#> SRR1700083 4 0.615 0.1514 0.056 0.060 0.228 0.620 NA 0.008
#> SRR1700084 4 0.631 0.3631 0.064 0.100 0.180 0.620 NA 0.000
#> SRR1700085 2 0.765 0.4395 0.052 0.504 0.116 0.216 NA 0.016
#> SRR1700086 2 0.938 -0.2251 0.104 0.284 0.196 0.212 NA 0.052
#> SRR1700087 4 0.802 0.3064 0.044 0.332 0.100 0.352 NA 0.008
#> SRR1700088 4 0.727 0.2515 0.052 0.380 0.092 0.400 NA 0.000
#> SRR1700089 4 0.777 0.4753 0.088 0.260 0.080 0.456 NA 0.004
#> SRR1700091 4 0.784 0.4072 0.052 0.312 0.072 0.428 NA 0.024
#> SRR1700090 4 0.724 0.5764 0.048 0.244 0.100 0.516 NA 0.004
#> SRR1700092 4 0.799 0.2959 0.052 0.336 0.108 0.376 NA 0.012
#> SRR1700094 4 0.765 0.5481 0.076 0.284 0.108 0.452 NA 0.004
#> SRR1700093 4 0.788 0.4254 0.064 0.308 0.100 0.424 NA 0.016
#> SRR1700095 4 0.815 0.5012 0.120 0.248 0.148 0.408 NA 0.004
#> SRR1700096 4 0.646 0.5841 0.068 0.192 0.096 0.604 NA 0.000
#> SRR1700097 4 0.674 0.5200 0.064 0.152 0.116 0.604 NA 0.004
#> SRR1700098 2 0.759 0.3368 0.048 0.472 0.084 0.240 NA 0.004
#> SRR1700099 4 0.771 0.4316 0.088 0.296 0.092 0.428 NA 0.000
#> SRR1700100 4 0.777 0.4439 0.056 0.312 0.104 0.412 NA 0.004
#> SRR1700101 4 0.783 0.3866 0.072 0.336 0.080 0.408 NA 0.016
#> SRR1700102 2 0.891 0.0678 0.024 0.344 0.108 0.120 NA 0.216
#> SRR1700104 4 0.751 0.5237 0.068 0.272 0.092 0.476 NA 0.004
#> SRR1700103 4 0.798 0.4955 0.096 0.300 0.100 0.416 NA 0.012
#> SRR1700105 4 0.787 0.3131 0.064 0.348 0.092 0.392 NA 0.016
#> SRR1700106 4 0.816 0.1890 0.052 0.332 0.104 0.348 NA 0.012
#> SRR1700107 2 0.744 -0.2745 0.028 0.372 0.088 0.364 NA 0.000
#> SRR1700108 4 0.744 0.2415 0.032 0.356 0.076 0.396 NA 0.004
#> SRR1700109 2 0.503 0.6632 0.016 0.732 0.028 0.124 NA 0.004
#> SRR1700110 2 0.554 0.6779 0.032 0.700 0.024 0.120 NA 0.008
#> SRR1700112 2 0.530 0.6688 0.020 0.712 0.036 0.144 NA 0.004
#> SRR1700111 4 0.802 0.4559 0.052 0.264 0.144 0.416 NA 0.008
#> SRR1700113 2 0.795 0.4360 0.040 0.464 0.076 0.216 NA 0.032
#> SRR1700114 4 0.750 0.5439 0.040 0.292 0.140 0.452 NA 0.008
#> SRR1700115 4 0.764 0.5210 0.052 0.272 0.108 0.464 NA 0.008
#> SRR1700116 4 0.803 0.5103 0.072 0.280 0.108 0.424 NA 0.012
#> SRR1700117 4 0.714 0.2184 0.112 0.100 0.188 0.556 NA 0.012
#> SRR1700119 4 0.709 0.5359 0.064 0.260 0.088 0.524 NA 0.004
#> SRR1700118 4 0.814 0.4126 0.064 0.292 0.148 0.392 NA 0.012
#> SRR1700120 4 0.757 0.5818 0.064 0.224 0.140 0.496 NA 0.008
#> SRR1700121 4 0.788 0.3662 0.064 0.304 0.108 0.416 NA 0.008
#> SRR1700122 2 0.676 0.6110 0.036 0.572 0.040 0.188 NA 0.008
#> SRR1700123 4 0.733 0.5788 0.056 0.212 0.148 0.520 NA 0.008
#> SRR1700125 2 0.518 0.6512 0.020 0.716 0.036 0.136 NA 0.000
#> SRR1700126 4 0.677 0.5139 0.060 0.156 0.124 0.604 NA 0.012
#> SRR1700127 4 0.692 0.5872 0.056 0.236 0.100 0.544 NA 0.000
#> SRR1700124 4 0.750 0.5836 0.076 0.228 0.104 0.516 NA 0.016
#> SRR1700128 4 0.678 0.5951 0.060 0.224 0.076 0.580 NA 0.012
#> SRR1700129 2 0.687 0.4240 0.052 0.512 0.044 0.300 NA 0.004
#> SRR1700130 2 0.789 -0.1306 0.060 0.364 0.080 0.340 NA 0.004
#> SRR1700132 4 0.728 0.5594 0.056 0.272 0.084 0.488 NA 0.000
#> SRR1700131 4 0.682 0.5619 0.060 0.208 0.116 0.564 NA 0.000
#> SRR1700133 4 0.678 0.4285 0.044 0.324 0.076 0.496 NA 0.000
#> SRR1700134 2 0.580 0.6048 0.028 0.640 0.036 0.216 NA 0.000
#> SRR1700135 4 0.713 0.5411 0.088 0.188 0.128 0.552 NA 0.008
#> SRR1700136 4 0.663 0.5459 0.068 0.168 0.104 0.608 NA 0.004
#> SRR1700137 4 0.783 0.4858 0.072 0.288 0.112 0.440 NA 0.012
#> SRR1700138 4 0.696 0.5831 0.072 0.252 0.088 0.532 NA 0.000
#> SRR1700140 4 0.699 0.5804 0.064 0.220 0.108 0.552 NA 0.004
#> SRR1700139 4 0.750 0.5746 0.068 0.248 0.104 0.492 NA 0.004
#> SRR1700141 2 0.623 0.6146 0.052 0.640 0.032 0.184 NA 0.012
#> SRR1700142 4 0.743 0.1174 0.136 0.072 0.196 0.528 NA 0.012
#> SRR1700143 4 0.701 0.5277 0.064 0.152 0.148 0.576 NA 0.008
#> SRR1700144 4 0.703 0.4745 0.060 0.156 0.168 0.560 NA 0.004
#> SRR1700145 4 0.773 0.5443 0.056 0.260 0.104 0.468 NA 0.012
#> SRR1700146 2 0.643 0.6298 0.040 0.612 0.052 0.192 NA 0.004
#> SRR1700147 4 0.706 0.5779 0.068 0.224 0.092 0.548 NA 0.004
#> SRR1700149 4 0.734 0.5628 0.056 0.216 0.128 0.524 NA 0.008
#> SRR1700148 4 0.697 0.5934 0.056 0.224 0.092 0.560 NA 0.008
#> SRR1700150 2 0.766 -0.1309 0.068 0.392 0.084 0.356 NA 0.004
#> SRR1700152 4 0.776 0.5850 0.076 0.240 0.104 0.476 NA 0.008
#> SRR1700151 4 0.690 0.5704 0.064 0.216 0.112 0.560 NA 0.004
#> SRR1700153 4 0.772 0.5516 0.060 0.256 0.116 0.476 NA 0.016
#> SRR1700154 4 0.679 0.5802 0.056 0.228 0.096 0.560 NA 0.000
#> SRR1700155 4 0.759 0.5032 0.048 0.284 0.096 0.460 NA 0.008
#> SRR1700156 4 0.631 0.5760 0.048 0.176 0.104 0.628 NA 0.004
#> SRR1700158 4 0.653 0.5681 0.068 0.184 0.108 0.600 NA 0.000
#> SRR1700159 2 0.562 0.6386 0.028 0.672 0.040 0.180 NA 0.000
#> SRR1700157 4 0.753 0.5747 0.076 0.264 0.116 0.476 NA 0.004
#> SRR1700160 4 0.649 0.5836 0.040 0.208 0.104 0.592 NA 0.000
#> SRR1700161 4 0.637 0.5797 0.052 0.200 0.072 0.612 NA 0.000
#> SRR1700162 2 0.593 0.6230 0.020 0.624 0.024 0.212 NA 0.004
#> SRR1700164 4 0.724 0.5869 0.072 0.228 0.128 0.520 NA 0.004
#> SRR1700163 4 0.665 0.5475 0.064 0.176 0.124 0.596 NA 0.004
#> SRR1700165 4 0.647 0.5604 0.080 0.192 0.096 0.604 NA 0.004
#> SRR1700166 4 0.712 0.5833 0.060 0.256 0.084 0.524 NA 0.004
#> SRR1700168 2 0.682 0.5786 0.056 0.572 0.064 0.196 NA 0.000
#> SRR1700167 4 0.661 0.5544 0.064 0.184 0.096 0.604 NA 0.004
#> SRR1700170 4 0.768 0.5078 0.048 0.292 0.116 0.448 NA 0.012
#> SRR1700169 4 0.711 0.5735 0.060 0.204 0.100 0.564 NA 0.016
#> SRR1700171 4 0.831 0.3557 0.208 0.204 0.104 0.392 NA 0.004
#> SRR1700172 4 0.752 0.3817 0.028 0.328 0.104 0.428 NA 0.012
#> SRR1700174 4 0.674 0.5137 0.048 0.288 0.064 0.528 NA 0.000
#> SRR1700173 4 0.755 0.5303 0.064 0.272 0.104 0.460 NA 0.000
#> SRR1700175 4 0.768 0.4780 0.092 0.296 0.084 0.432 NA 0.000
#> SRR1700176 4 0.677 0.5066 0.072 0.148 0.128 0.604 NA 0.012
#> SRR1700178 2 0.559 0.6189 0.048 0.692 0.016 0.036 NA 0.032
#> SRR1700177 4 0.745 0.5386 0.064 0.280 0.084 0.476 NA 0.004
#> SRR1700180 2 0.500 0.6325 0.028 0.724 0.012 0.032 NA 0.024
#> SRR1700179 2 0.560 0.6178 0.048 0.680 0.016 0.036 NA 0.024
#> SRR1700181 2 0.483 0.6438 0.028 0.744 0.008 0.052 NA 0.016
#> SRR1700183 1 0.457 0.6754 0.628 0.028 0.008 0.332 NA 0.000
#> SRR1700182 2 0.559 0.6112 0.044 0.688 0.016 0.028 NA 0.040
#> SRR1700184 2 0.529 0.6415 0.028 0.700 0.012 0.068 NA 0.012
#> SRR1700186 2 0.552 0.6341 0.028 0.704 0.044 0.056 NA 0.012
#> SRR1700187 1 0.531 0.6101 0.660 0.056 0.016 0.244 NA 0.016
#> SRR1700185 1 0.514 0.6748 0.604 0.044 0.008 0.328 NA 0.004
#> SRR1700188 2 0.492 0.6286 0.024 0.728 0.020 0.044 NA 0.008
#> SRR1700192 1 0.748 0.3118 0.488 0.172 0.072 0.224 NA 0.012
#> SRR1700190 1 0.859 0.0320 0.284 0.052 0.144 0.252 NA 0.256
#> SRR1700191 1 0.458 0.6758 0.648 0.032 0.004 0.308 NA 0.004
#> SRR1700189 1 0.744 0.4084 0.448 0.144 0.048 0.308 NA 0.016
#> SRR1700193 2 0.524 0.6507 0.036 0.692 0.020 0.060 NA 0.000
#> SRR1700195 2 0.507 0.6683 0.028 0.712 0.016 0.060 NA 0.004
#> SRR1700194 1 0.508 0.6644 0.640 0.044 0.012 0.288 NA 0.004
#> SRR1700196 2 0.518 0.6604 0.028 0.732 0.032 0.040 NA 0.020
#> SRR1700197 4 0.791 -0.2505 0.252 0.068 0.124 0.464 NA 0.068
#> SRR1700198 2 0.537 0.6665 0.024 0.688 0.016 0.096 NA 0.004
#> SRR1700199 2 0.411 0.6680 0.028 0.780 0.004 0.048 NA 0.000
#> SRR1700200 2 0.463 0.6594 0.028 0.768 0.012 0.056 NA 0.012
#> SRR1700201 2 0.519 0.6654 0.028 0.720 0.024 0.064 NA 0.008
#> SRR1700202 2 0.673 0.6299 0.048 0.588 0.032 0.172 NA 0.012
#> SRR1700203 2 0.518 0.6479 0.028 0.692 0.020 0.032 NA 0.012
#> SRR1700204 2 0.610 0.6668 0.016 0.640 0.048 0.132 NA 0.008
#> SRR1700206 2 0.686 0.5305 0.032 0.548 0.052 0.252 NA 0.012
#> SRR1700207 2 0.473 0.6641 0.020 0.764 0.024 0.072 NA 0.008
#> SRR1700208 1 0.869 0.0641 0.340 0.084 0.068 0.160 NA 0.300
#> SRR1700205 2 0.518 0.6645 0.036 0.692 0.028 0.040 NA 0.000
#> SRR1700209 2 0.472 0.6688 0.016 0.740 0.016 0.092 NA 0.000
#> SRR1700210 2 0.534 0.6387 0.032 0.676 0.016 0.028 NA 0.020
#> SRR1700211 2 0.526 0.6718 0.040 0.728 0.024 0.060 NA 0.012
#> SRR1700212 2 0.556 0.6536 0.024 0.680 0.028 0.036 NA 0.028
#> SRR1700213 2 0.895 0.2528 0.080 0.388 0.072 0.112 NA 0.136
#> SRR1700214 2 0.486 0.6680 0.028 0.740 0.008 0.076 NA 0.008
#> SRR1700215 1 0.490 0.6398 0.564 0.028 0.016 0.388 NA 0.004
#> SRR1700217 2 0.413 0.6683 0.016 0.792 0.008 0.112 NA 0.004
#> SRR1700216 1 0.473 0.6513 0.580 0.024 0.012 0.380 NA 0.004
#> SRR1700218 2 0.575 0.6671 0.048 0.672 0.028 0.152 NA 0.000
#> SRR1700219 2 0.522 0.6685 0.024 0.728 0.040 0.088 NA 0.004
#> SRR1700222 1 0.582 0.6383 0.560 0.064 0.032 0.328 NA 0.000
#> SRR1700220 2 0.504 0.6701 0.028 0.724 0.020 0.064 NA 0.004
#> SRR1700221 2 0.469 0.6604 0.016 0.764 0.024 0.048 NA 0.016
#> SRR1700223 2 0.459 0.6692 0.020 0.764 0.008 0.068 NA 0.012
#> SRR1700224 2 0.645 0.6403 0.032 0.628 0.052 0.136 NA 0.012
#> SRR1700226 2 0.521 0.6771 0.020 0.724 0.028 0.072 NA 0.012
#> SRR1700229 2 0.568 0.6684 0.020 0.664 0.024 0.096 NA 0.008
#> SRR1700225 2 0.950 -0.4556 0.100 0.260 0.108 0.088 NA 0.208
#> SRR1700227 2 0.575 0.6574 0.020 0.680 0.036 0.072 NA 0.020
#> SRR1700230 1 0.704 0.5117 0.500 0.108 0.044 0.300 NA 0.016
#> SRR1700231 2 0.535 0.6679 0.028 0.708 0.020 0.088 NA 0.008
#> SRR1700228 2 0.565 0.6806 0.024 0.696 0.044 0.112 NA 0.008
#> SRR1700232 2 0.651 0.6661 0.060 0.624 0.048 0.076 NA 0.012
#> SRR1700233 2 0.566 0.6777 0.028 0.696 0.032 0.104 NA 0.012
#> SRR1700234 2 0.524 0.6783 0.020 0.716 0.020 0.112 NA 0.008
#> SRR1700235 2 0.720 0.5143 0.084 0.552 0.072 0.192 NA 0.004
#> SRR1700237 2 0.569 0.6677 0.024 0.668 0.028 0.104 NA 0.004
#> SRR1700236 2 0.550 0.6718 0.020 0.696 0.020 0.080 NA 0.020
#> SRR1700238 2 0.480 0.6669 0.044 0.756 0.020 0.084 NA 0.000
#> SRR1700239 1 0.591 0.6357 0.580 0.052 0.032 0.308 NA 0.008
#> SRR1700240 1 0.512 0.6649 0.608 0.028 0.032 0.324 NA 0.008
#> SRR1700241 4 0.672 0.3565 0.064 0.360 0.060 0.472 NA 0.000
#> SRR1700243 2 0.460 0.6699 0.024 0.752 0.012 0.076 NA 0.000
#> SRR1700244 2 0.624 0.6798 0.044 0.656 0.048 0.100 NA 0.012
#> SRR1700242 1 0.834 0.1189 0.412 0.224 0.064 0.188 NA 0.024
#> SRR1700246 2 0.506 0.6663 0.024 0.716 0.008 0.120 NA 0.004
#> SRR1700245 2 0.468 0.6539 0.020 0.768 0.032 0.052 NA 0.008
#> SRR1700247 1 0.679 0.5126 0.572 0.052 0.072 0.244 NA 0.024
#> SRR1700249 1 0.444 0.6747 0.656 0.024 0.004 0.308 NA 0.004
#> SRR1700250 2 0.638 0.6131 0.028 0.628 0.040 0.040 NA 0.060
#> SRR1700248 2 0.597 0.6650 0.036 0.668 0.040 0.080 NA 0.012
#> SRR1700251 2 0.593 0.6470 0.060 0.676 0.036 0.032 NA 0.028
#> SRR1700252 4 0.894 0.1438 0.220 0.256 0.120 0.296 NA 0.032
#> SRR1700253 2 0.507 0.6680 0.024 0.724 0.016 0.052 NA 0.016
#> SRR1700256 2 0.543 0.6644 0.032 0.696 0.024 0.064 NA 0.008
#> SRR1700254 1 0.567 0.5552 0.660 0.052 0.052 0.212 NA 0.008
#> SRR1700255 2 0.468 0.6677 0.024 0.756 0.016 0.068 NA 0.004
#> SRR1700257 2 0.503 0.6415 0.032 0.732 0.016 0.044 NA 0.016
#> SRR1700258 2 0.484 0.6755 0.004 0.736 0.032 0.096 NA 0.004
#> SRR1700259 2 0.562 0.6774 0.024 0.704 0.048 0.084 NA 0.012
#> SRR1700260 2 0.561 0.6695 0.020 0.692 0.024 0.112 NA 0.016
#> SRR1700261 2 0.469 0.6707 0.016 0.760 0.012 0.092 NA 0.012
#> SRR1700262 2 0.503 0.6711 0.012 0.728 0.016 0.132 NA 0.012
#> SRR1700263 2 0.600 0.6781 0.040 0.656 0.040 0.092 NA 0.004
#> SRR1700264 2 0.697 0.6083 0.048 0.588 0.096 0.112 NA 0.008
#> SRR1700265 2 0.815 0.4246 0.040 0.472 0.108 0.136 NA 0.048
#> SRR1700266 2 0.673 0.5948 0.040 0.588 0.028 0.048 NA 0.068
#> SRR1700268 4 0.854 0.4226 0.128 0.304 0.148 0.332 NA 0.016
#> SRR1700270 2 0.520 0.6800 0.028 0.720 0.020 0.104 NA 0.004
#> SRR1700267 2 0.474 0.6775 0.012 0.728 0.008 0.084 NA 0.004
#> SRR1700271 2 0.443 0.6637 0.012 0.784 0.024 0.088 NA 0.008
#> SRR1700272 2 0.544 0.6763 0.020 0.708 0.036 0.128 NA 0.008
#> SRR1700273 2 0.590 0.6718 0.036 0.664 0.012 0.108 NA 0.020
#> SRR1700274 2 0.650 0.6695 0.028 0.620 0.056 0.136 NA 0.012
#> SRR1700277 4 0.924 -0.2971 0.224 0.128 0.120 0.344 NA 0.108
#> SRR1700275 2 0.540 0.6734 0.028 0.696 0.028 0.140 NA 0.000
#> SRR1700276 2 0.547 0.6773 0.024 0.712 0.028 0.076 NA 0.020
#> SRR1700278 2 0.634 0.5693 0.028 0.596 0.044 0.240 NA 0.008
#> SRR1700279 2 0.592 0.6709 0.032 0.656 0.024 0.092 NA 0.012
#> SRR1700280 2 0.585 0.6677 0.036 0.684 0.032 0.056 NA 0.028
#> SRR1700281 2 0.556 0.6724 0.016 0.652 0.020 0.092 NA 0.004
#> SRR1700283 2 0.625 0.6565 0.012 0.624 0.040 0.092 NA 0.028
#> SRR1700282 2 0.757 0.0645 0.072 0.420 0.084 0.344 NA 0.008
#> SRR1700284 2 0.656 0.6476 0.028 0.596 0.056 0.160 NA 0.004
#> SRR1700285 2 0.613 0.6458 0.036 0.624 0.036 0.188 NA 0.000
#> SRR1700286 2 0.652 0.6298 0.028 0.620 0.052 0.160 NA 0.016
#> SRR1700287 2 0.530 0.6751 0.012 0.700 0.020 0.132 NA 0.008
#> SRR1700290 4 0.772 -0.1338 0.256 0.068 0.152 0.464 NA 0.024
#> SRR1700289 2 0.641 0.6546 0.044 0.616 0.036 0.108 NA 0.008
#> SRR1700288 2 0.663 0.6473 0.052 0.616 0.068 0.128 NA 0.004
#> SRR1700292 2 0.567 0.6702 0.020 0.636 0.020 0.072 NA 0.008
#> SRR1700291 2 0.727 0.1093 0.044 0.440 0.080 0.332 NA 0.000
#> SRR1700293 2 0.748 0.1395 0.052 0.440 0.072 0.316 NA 0.004
#> SRR1700294 2 0.568 0.6791 0.040 0.680 0.032 0.116 NA 0.000
#> SRR1700295 4 0.904 0.2776 0.116 0.216 0.160 0.348 NA 0.036
#> SRR1700297 2 0.573 0.6719 0.028 0.676 0.024 0.124 NA 0.008
#> SRR1700296 2 0.507 0.6750 0.028 0.732 0.032 0.096 NA 0.000
#> SRR1700298 2 0.719 0.0891 0.056 0.432 0.056 0.372 NA 0.008
#> SRR1700299 2 0.697 0.5028 0.024 0.524 0.084 0.228 NA 0.000
#> SRR1700300 2 0.782 0.0850 0.056 0.404 0.076 0.328 NA 0.012
#> SRR1700302 2 0.663 0.6501 0.040 0.620 0.056 0.156 NA 0.016
#> SRR1700301 2 0.550 0.6727 0.016 0.688 0.020 0.112 NA 0.012
#> SRR1700303 2 0.550 0.6703 0.028 0.696 0.028 0.104 NA 0.004
#> SRR1700304 2 0.651 0.6564 0.052 0.620 0.036 0.108 NA 0.012
#> SRR1700305 2 0.643 0.5743 0.040 0.592 0.044 0.232 NA 0.004
#> SRR1700306 4 0.848 0.2363 0.064 0.328 0.116 0.344 NA 0.032
#> SRR1700308 2 0.729 0.4577 0.040 0.476 0.052 0.264 NA 0.004
#> SRR1700307 4 0.697 0.4973 0.076 0.276 0.064 0.528 NA 0.008
#> SRR1700309 4 0.820 0.4780 0.084 0.296 0.104 0.384 NA 0.008
#> SRR1700310 2 0.525 0.6727 0.012 0.716 0.032 0.124 NA 0.008
#> SRR1700311 4 0.801 0.1010 0.076 0.352 0.080 0.356 NA 0.008
#> SRR1700312 2 0.720 0.3800 0.052 0.480 0.072 0.292 NA 0.000
#> SRR1700313 4 0.704 0.1331 0.044 0.388 0.076 0.416 NA 0.000
#> SRR1700314 4 0.728 0.2545 0.036 0.376 0.100 0.416 NA 0.012
#> SRR1700315 2 0.742 0.2618 0.060 0.444 0.080 0.312 NA 0.000
#> SRR1700316 2 0.729 -0.0582 0.040 0.400 0.080 0.372 NA 0.000
#> SRR1700317 2 0.570 0.6800 0.012 0.672 0.036 0.096 NA 0.012
#> SRR1700318 2 0.883 0.2074 0.084 0.376 0.088 0.208 NA 0.048
#> SRR1700319 4 0.756 0.5101 0.056 0.288 0.108 0.456 NA 0.004
#> SRR1700320 2 0.576 0.6669 0.032 0.672 0.028 0.148 NA 0.004
#> SRR1700322 2 0.718 0.4908 0.056 0.508 0.056 0.236 NA 0.000
#> SRR1700321 2 0.567 0.6832 0.032 0.688 0.020 0.116 NA 0.012
#> SRR1700323 2 0.694 0.3733 0.052 0.500 0.088 0.300 NA 0.000
#> SRR1700324 2 0.523 0.6564 0.016 0.696 0.024 0.160 NA 0.000
#> SRR1700325 2 0.682 0.5760 0.040 0.556 0.052 0.244 NA 0.008
#> SRR1700326 2 0.823 -0.1941 0.076 0.368 0.104 0.304 NA 0.008
#> SRR1700327 2 0.710 0.6379 0.032 0.564 0.048 0.168 NA 0.028
#> SRR1700329 2 0.683 0.5945 0.044 0.560 0.040 0.172 NA 0.004
#> SRR1700328 2 0.761 -0.0632 0.076 0.404 0.072 0.336 NA 0.000
#> SRR1700330 4 0.681 0.2778 0.056 0.348 0.036 0.484 NA 0.008
#> SRR1700331 2 0.756 0.5465 0.036 0.496 0.056 0.184 NA 0.024
#> SRR1700332 2 0.720 0.5376 0.044 0.536 0.052 0.200 NA 0.012
#> SRR1700333 2 0.694 0.5927 0.020 0.552 0.052 0.168 NA 0.016
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.827 0.916 0.962 0.4983 0.501 0.501
#> 3 3 0.493 0.743 0.831 0.2565 0.723 0.518
#> 4 4 0.479 0.498 0.707 0.1428 0.807 0.547
#> 5 5 0.542 0.580 0.725 0.0872 0.818 0.467
#> 6 6 0.625 0.565 0.728 0.0514 0.941 0.743
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699881 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.7950 0.7002 0.240 0.760
#> SRR1699893 1 0.9427 0.4858 0.640 0.360
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699896 1 0.9988 0.1095 0.520 0.480
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699900 1 0.4562 0.8815 0.904 0.096
#> SRR1699899 2 0.0376 0.9636 0.004 0.996
#> SRR1699902 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699901 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699910 1 0.3584 0.9079 0.932 0.068
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699914 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699915 2 0.7299 0.7406 0.204 0.796
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699920 1 0.8555 0.6389 0.720 0.280
#> SRR1699921 2 0.0376 0.9636 0.004 0.996
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699923 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699924 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699926 1 0.8499 0.6404 0.724 0.276
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.7219 0.7578 0.200 0.800
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.6801 0.7890 0.180 0.820
#> SRR1699933 1 0.2603 0.9263 0.956 0.044
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0938 0.9584 0.012 0.988
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.7219 0.7616 0.200 0.800
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699940 1 0.2948 0.9199 0.948 0.052
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699941 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.2603 0.9340 0.044 0.956
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.2043 0.9439 0.032 0.968
#> SRR1699947 2 0.4815 0.8785 0.104 0.896
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0376 0.9636 0.004 0.996
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699954 1 0.9044 0.5475 0.680 0.320
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699959 1 0.0672 0.9501 0.992 0.008
#> SRR1699958 2 0.1414 0.9528 0.020 0.980
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699961 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.3114 0.9243 0.056 0.944
#> SRR1699964 2 0.4939 0.8746 0.108 0.892
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699966 1 0.7745 0.7252 0.772 0.228
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699969 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699971 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699972 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699973 2 0.2603 0.9344 0.044 0.956
#> SRR1699974 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699975 2 0.4022 0.9025 0.080 0.920
#> SRR1699976 1 0.7376 0.7529 0.792 0.208
#> SRR1699977 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699978 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699979 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699981 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699987 1 0.0938 0.9478 0.988 0.012
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1699990 1 0.2043 0.9355 0.968 0.032
#> SRR1699992 1 0.5629 0.8460 0.868 0.132
#> SRR1699991 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699993 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699994 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0938 0.9585 0.012 0.988
#> SRR1699997 1 0.7883 0.7160 0.764 0.236
#> SRR1699998 2 0.6247 0.8190 0.156 0.844
#> SRR1699999 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.9170 0.5308 0.668 0.332
#> SRR1700002 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700001 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700003 1 0.9608 0.4071 0.616 0.384
#> SRR1700004 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700013 1 0.3879 0.9023 0.924 0.076
#> SRR1700012 2 0.8861 0.5837 0.304 0.696
#> SRR1700014 1 0.1414 0.9432 0.980 0.020
#> SRR1700015 1 0.0938 0.9479 0.988 0.012
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700017 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700023 1 0.2948 0.9213 0.948 0.052
#> SRR1700022 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700025 1 0.4161 0.8926 0.916 0.084
#> SRR1700026 1 0.1843 0.9381 0.972 0.028
#> SRR1700027 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700028 2 0.7056 0.7709 0.192 0.808
#> SRR1700029 1 0.3733 0.9045 0.928 0.072
#> SRR1700030 2 0.1184 0.9557 0.016 0.984
#> SRR1700031 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700036 2 0.0376 0.9636 0.004 0.996
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700038 1 0.5519 0.8490 0.872 0.128
#> SRR1700039 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.0938 0.9479 0.988 0.012
#> SRR1700042 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700043 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700044 2 0.5408 0.8514 0.124 0.876
#> SRR1700046 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700047 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700048 1 0.4690 0.8799 0.900 0.100
#> SRR1700049 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.3114 0.9178 0.944 0.056
#> SRR1700054 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700059 1 0.1184 0.9456 0.984 0.016
#> SRR1700060 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700061 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700062 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700063 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700064 1 0.7883 0.7153 0.764 0.236
#> SRR1700065 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700066 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700068 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700069 2 0.2948 0.9262 0.052 0.948
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700071 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700072 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700073 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700075 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700074 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700076 1 0.2948 0.9214 0.948 0.052
#> SRR1700077 1 0.3584 0.9082 0.932 0.068
#> SRR1700078 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700080 1 0.4815 0.8762 0.896 0.104
#> SRR1700079 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700081 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700082 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700083 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700084 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.6973 0.7647 0.188 0.812
#> SRR1700087 1 0.1633 0.9409 0.976 0.024
#> SRR1700088 1 0.5519 0.8518 0.872 0.128
#> SRR1700089 1 0.6438 0.8066 0.836 0.164
#> SRR1700091 2 0.2423 0.9368 0.040 0.960
#> SRR1700090 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700092 2 0.1414 0.9530 0.020 0.980
#> SRR1700094 1 0.0672 0.9500 0.992 0.008
#> SRR1700093 1 0.6148 0.8236 0.848 0.152
#> SRR1700095 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700096 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700097 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.4690 0.8833 0.100 0.900
#> SRR1700100 1 0.2778 0.9228 0.952 0.048
#> SRR1700101 1 0.9993 0.0984 0.516 0.484
#> SRR1700102 2 0.2603 0.9341 0.044 0.956
#> SRR1700104 1 0.0672 0.9500 0.992 0.008
#> SRR1700103 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700105 2 0.9686 0.3300 0.396 0.604
#> SRR1700106 2 0.9000 0.5288 0.316 0.684
#> SRR1700107 2 0.4815 0.8793 0.104 0.896
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700111 1 0.2043 0.9352 0.968 0.032
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700114 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700115 2 0.1184 0.9556 0.016 0.984
#> SRR1700116 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700117 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700119 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700118 1 0.1843 0.9381 0.972 0.028
#> SRR1700120 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700121 2 0.9286 0.4776 0.344 0.656
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700123 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700127 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700124 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700128 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.4815 0.8790 0.104 0.896
#> SRR1700130 2 0.5629 0.8484 0.132 0.868
#> SRR1700132 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700131 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700133 1 0.1414 0.9432 0.980 0.020
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700135 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700136 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700137 1 0.9000 0.5775 0.684 0.316
#> SRR1700138 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700140 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700139 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700144 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700145 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700147 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700150 2 0.9248 0.4982 0.340 0.660
#> SRR1700152 1 0.2043 0.9353 0.968 0.032
#> SRR1700151 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700153 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700154 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700155 1 0.7219 0.7667 0.800 0.200
#> SRR1700156 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700157 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700161 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700166 1 0.2778 0.9239 0.952 0.048
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700169 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700171 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700172 1 0.7219 0.7647 0.800 0.200
#> SRR1700174 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700173 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700175 1 0.9909 0.2058 0.556 0.444
#> SRR1700176 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700177 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.9248 0.4965 0.660 0.340
#> SRR1700190 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.5408 0.8570 0.124 0.876
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.0376 0.9521 0.996 0.004
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.4022 0.9021 0.080 0.920
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0376 0.9636 0.004 0.996
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0938 0.9586 0.012 0.988
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700241 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700242 2 0.5629 0.8439 0.132 0.868
#> SRR1700246 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700252 1 0.8713 0.6026 0.708 0.292
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.6343 0.8139 0.160 0.840
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700268 1 0.4562 0.8797 0.904 0.096
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.2043 0.9438 0.032 0.968
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700282 1 0.8327 0.6601 0.736 0.264
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.1843 0.9471 0.028 0.972
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.7056 0.7666 0.192 0.808
#> SRR1700293 2 0.2423 0.9378 0.040 0.960
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700295 1 0.9635 0.4175 0.612 0.388
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.6343 0.8152 0.160 0.840
#> SRR1700299 2 0.9686 0.3534 0.396 0.604
#> SRR1700300 2 0.8327 0.6597 0.264 0.736
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700306 1 0.8144 0.6916 0.748 0.252
#> SRR1700308 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1700307 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700309 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.8955 0.5593 0.312 0.688
#> SRR1700312 2 0.2043 0.9439 0.032 0.968
#> SRR1700313 1 0.3274 0.9140 0.940 0.060
#> SRR1700314 1 0.2043 0.9359 0.968 0.032
#> SRR1700315 2 0.9954 0.1522 0.460 0.540
#> SRR1700316 1 0.9881 0.2774 0.564 0.436
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700319 1 0.0000 0.9541 1.000 0.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.5059 0.8702 0.112 0.888
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.8713 0.6060 0.292 0.708
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.1633 0.9501 0.024 0.976
#> SRR1700326 2 0.9983 0.0587 0.476 0.524
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700328 1 0.8144 0.6752 0.748 0.252
#> SRR1700330 1 0.0938 0.9478 0.988 0.012
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9661 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.3879 0.86434 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699875 2 0.2711 0.89166 0.000 0.912 0.088
#> SRR1699876 2 0.2796 0.89759 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699877 2 0.4974 0.78823 0.000 0.764 0.236
#> SRR1699879 2 0.1411 0.90625 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699878 2 0.3686 0.87289 0.000 0.860 0.140
#> SRR1699880 1 0.2356 0.82789 0.928 0.000 0.072
#> SRR1699881 1 0.6274 -0.00404 0.544 0.000 0.456
#> SRR1699882 2 0.0892 0.90558 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699883 2 0.3752 0.87211 0.000 0.856 0.144
#> SRR1699884 2 0.1289 0.90689 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699885 2 0.0592 0.90291 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699886 2 0.4002 0.87994 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699888 2 0.3192 0.86212 0.000 0.888 0.112
#> SRR1699889 2 0.6126 0.58231 0.000 0.600 0.400
#> SRR1699890 2 0.1411 0.90461 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699887 2 0.0592 0.90429 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699891 2 0.3941 0.87317 0.000 0.844 0.156
#> SRR1699892 3 0.2947 0.72823 0.020 0.060 0.920
#> SRR1699893 3 0.2569 0.73244 0.032 0.032 0.936
#> SRR1699894 2 0.3879 0.87566 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699895 2 0.3879 0.87551 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699896 3 0.4056 0.75527 0.092 0.032 0.876
#> SRR1699897 2 0.4399 0.82561 0.000 0.812 0.188
#> SRR1699898 1 0.3192 0.81152 0.888 0.000 0.112
#> SRR1699900 3 0.1860 0.73584 0.052 0.000 0.948
#> SRR1699899 2 0.5216 0.81192 0.000 0.740 0.260
#> SRR1699902 3 0.4555 0.74520 0.200 0.000 0.800
#> SRR1699901 1 0.2878 0.82061 0.904 0.000 0.096
#> SRR1699903 2 0.5529 0.76959 0.000 0.704 0.296
#> SRR1699904 2 0.3116 0.89007 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699905 1 0.6299 0.22721 0.524 0.000 0.476
#> SRR1699906 2 0.3482 0.88751 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699907 2 0.4702 0.84358 0.000 0.788 0.212
#> SRR1699908 2 0.3686 0.88289 0.000 0.860 0.140
#> SRR1699909 3 0.4452 0.62879 0.000 0.192 0.808
#> SRR1699910 3 0.2749 0.74312 0.064 0.012 0.924
#> SRR1699911 3 0.6244 -0.08617 0.000 0.440 0.560
#> SRR1699912 2 0.5016 0.82632 0.000 0.760 0.240
#> SRR1699913 2 0.4346 0.86249 0.000 0.816 0.184
#> SRR1699914 1 0.5397 0.60036 0.720 0.000 0.280
#> SRR1699915 3 0.3941 0.63583 0.000 0.156 0.844
#> SRR1699916 2 0.3941 0.87426 0.000 0.844 0.156
#> SRR1699917 3 0.6192 0.09403 0.000 0.420 0.580
#> SRR1699918 3 0.4346 0.60579 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699919 2 0.5098 0.78443 0.000 0.752 0.248
#> SRR1699920 3 0.3805 0.75466 0.092 0.024 0.884
#> SRR1699921 2 0.6062 0.56622 0.000 0.616 0.384
#> SRR1699922 2 0.4178 0.87305 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699923 3 0.5465 0.64661 0.288 0.000 0.712
#> SRR1699924 3 0.5016 0.73170 0.240 0.000 0.760
#> SRR1699925 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.2492 0.73714 0.048 0.016 0.936
#> SRR1699927 2 0.3551 0.88230 0.000 0.868 0.132
#> SRR1699929 3 0.2031 0.72497 0.016 0.032 0.952
#> SRR1699928 2 0.4002 0.87490 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699930 2 0.4062 0.86972 0.000 0.836 0.164
#> SRR1699931 3 0.4618 0.68946 0.024 0.136 0.840
#> SRR1699933 3 0.3377 0.73825 0.092 0.012 0.896
#> SRR1699932 2 0.2959 0.89518 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699934 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.5560 0.48475 0.000 0.300 0.700
#> SRR1699936 2 0.0424 0.90323 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699937 2 0.7567 0.27099 0.048 0.576 0.376
#> SRR1699938 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699940 3 0.4931 0.64841 0.212 0.004 0.784
#> SRR1699939 2 0.0592 0.90379 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699941 1 0.5621 0.52803 0.692 0.000 0.308
#> SRR1699942 2 0.5859 0.66614 0.000 0.656 0.344
#> SRR1699943 2 0.0747 0.90244 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699944 2 0.1411 0.90625 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699945 1 0.1964 0.82997 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699946 2 0.3879 0.82049 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699947 2 0.5503 0.79360 0.020 0.772 0.208
#> SRR1699948 2 0.0424 0.90264 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699949 2 0.0424 0.90373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699950 2 0.0424 0.90323 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699951 2 0.2796 0.88615 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699952 2 0.5529 0.69528 0.000 0.704 0.296
#> SRR1699953 2 0.1163 0.90371 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699954 3 0.9017 0.50516 0.228 0.212 0.560
#> SRR1699955 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 1 0.2711 0.82332 0.912 0.000 0.088
#> SRR1699957 2 0.1964 0.90596 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699959 3 0.5138 0.71642 0.252 0.000 0.748
#> SRR1699958 3 0.4209 0.69844 0.020 0.120 0.860
#> SRR1699960 2 0.1163 0.90540 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699961 3 0.5327 0.70827 0.272 0.000 0.728
#> SRR1699962 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699963 3 0.4345 0.70245 0.016 0.136 0.848
#> SRR1699964 3 0.6189 0.21510 0.004 0.364 0.632
#> SRR1699965 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 3 0.4563 0.76025 0.112 0.036 0.852
#> SRR1699967 2 0.2356 0.88586 0.000 0.928 0.072
#> SRR1699968 2 0.5497 0.72578 0.000 0.708 0.292
#> SRR1699969 1 0.4291 0.75119 0.820 0.000 0.180
#> SRR1699971 3 0.5024 0.73428 0.220 0.004 0.776
#> SRR1699970 2 0.1529 0.89710 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699972 3 0.5098 0.71471 0.248 0.000 0.752
#> SRR1699973 3 0.1753 0.71132 0.000 0.048 0.952
#> SRR1699974 1 0.1964 0.82997 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699975 3 0.1267 0.71399 0.004 0.024 0.972
#> SRR1699976 3 0.5637 0.75864 0.172 0.040 0.788
#> SRR1699977 3 0.4002 0.75082 0.160 0.000 0.840
#> SRR1699978 1 0.1860 0.82992 0.948 0.000 0.052
#> SRR1699979 3 0.5201 0.73437 0.236 0.004 0.760
#> SRR1699980 2 0.6225 0.49582 0.000 0.568 0.432
#> SRR1699981 3 0.5254 0.69555 0.264 0.000 0.736
#> SRR1699982 2 0.4291 0.86158 0.000 0.820 0.180
#> SRR1699983 2 0.4399 0.86081 0.000 0.812 0.188
#> SRR1699984 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.4002 0.87514 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699986 1 0.1964 0.82997 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699988 2 0.4346 0.86122 0.000 0.816 0.184
#> SRR1699987 3 0.4750 0.74478 0.216 0.000 0.784
#> SRR1699989 3 0.6180 0.09154 0.000 0.416 0.584
#> SRR1699990 3 0.4750 0.74497 0.216 0.000 0.784
#> SRR1699992 3 0.7330 0.70884 0.216 0.092 0.692
#> SRR1699991 3 0.5431 0.69614 0.284 0.000 0.716
#> SRR1699993 1 0.6307 -0.12813 0.512 0.000 0.488
#> SRR1699994 1 0.4842 0.70003 0.776 0.000 0.224
#> SRR1699995 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699996 3 0.6008 0.30921 0.000 0.372 0.628
#> SRR1699997 3 0.2749 0.75057 0.064 0.012 0.924
#> SRR1699998 2 0.6682 0.38120 0.008 0.504 0.488
#> SRR1699999 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.2339 0.73875 0.048 0.012 0.940
#> SRR1700002 3 0.4887 0.73494 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700001 1 0.6192 0.14666 0.580 0.000 0.420
#> SRR1700003 3 0.2152 0.73983 0.036 0.016 0.948
#> SRR1700004 1 0.6140 0.25346 0.596 0.000 0.404
#> SRR1700005 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5363 0.70391 0.276 0.000 0.724
#> SRR1700007 2 0.2356 0.90120 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700008 3 0.5397 0.69945 0.280 0.000 0.720
#> SRR1700009 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.1964 0.82997 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700011 2 0.1529 0.90236 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700013 3 0.6067 0.73449 0.236 0.028 0.736
#> SRR1700012 3 0.1781 0.72440 0.020 0.020 0.960
#> SRR1700014 3 0.4796 0.74170 0.220 0.000 0.780
#> SRR1700015 3 0.6079 0.54035 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700016 1 0.0892 0.80761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700018 3 0.5098 0.72465 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700017 3 0.5882 0.61239 0.348 0.000 0.652
#> SRR1700019 2 0.2537 0.89951 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700020 1 0.3340 0.80677 0.880 0.000 0.120
#> SRR1700021 2 0.6260 0.34365 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700023 3 0.4931 0.74736 0.212 0.004 0.784
#> SRR1700022 1 0.5760 0.49468 0.672 0.000 0.328
#> SRR1700024 3 0.5216 0.51285 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700025 3 0.5597 0.74791 0.216 0.020 0.764
#> SRR1700026 3 0.5070 0.74017 0.224 0.004 0.772
#> SRR1700027 3 0.4842 0.74008 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700028 3 0.2443 0.73635 0.028 0.032 0.940
#> SRR1700029 3 0.4887 0.73793 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700030 3 0.4172 0.62362 0.004 0.156 0.840
#> SRR1700031 1 0.2448 0.82672 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700032 2 0.5591 0.61282 0.000 0.696 0.304
#> SRR1700034 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 3 0.5254 0.54616 0.000 0.264 0.736
#> SRR1700033 1 0.5397 0.61267 0.720 0.000 0.280
#> SRR1700036 3 0.5835 0.46291 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700037 2 0.3482 0.88608 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700038 3 0.4874 0.75100 0.144 0.028 0.828
#> SRR1700039 1 0.2537 0.82672 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700040 1 0.5178 0.66217 0.744 0.000 0.256
#> SRR1700041 3 0.4887 0.73727 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700042 1 0.5178 0.65453 0.744 0.000 0.256
#> SRR1700043 3 0.6215 0.41558 0.428 0.000 0.572
#> SRR1700045 3 0.5254 0.71565 0.264 0.000 0.736
#> SRR1700044 3 0.3030 0.69225 0.004 0.092 0.904
#> SRR1700046 3 0.4974 0.73303 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700047 1 0.3551 0.79662 0.868 0.000 0.132
#> SRR1700048 3 0.2860 0.75037 0.084 0.004 0.912
#> SRR1700049 1 0.0747 0.82427 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700050 1 0.2959 0.82366 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700051 1 0.2066 0.82953 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700052 1 0.2537 0.82730 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700053 3 0.4110 0.76059 0.152 0.004 0.844
#> SRR1700054 3 0.4931 0.73665 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700055 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.5650 0.66473 0.312 0.000 0.688
#> SRR1700057 3 0.5178 0.71843 0.256 0.000 0.744
#> SRR1700058 1 0.2537 0.82559 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700059 3 0.4834 0.74958 0.204 0.004 0.792
#> SRR1700060 1 0.2959 0.81771 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700061 3 0.5058 0.72863 0.244 0.000 0.756
#> SRR1700062 1 0.2796 0.82184 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700063 3 0.6291 0.28998 0.468 0.000 0.532
#> SRR1700064 3 0.2116 0.73462 0.040 0.012 0.948
#> SRR1700065 1 0.6095 0.44585 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700066 1 0.4555 0.73036 0.800 0.000 0.200
#> SRR1700067 3 0.5016 0.53633 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700068 3 0.5497 0.68790 0.292 0.000 0.708
#> SRR1700069 3 0.4551 0.68993 0.024 0.132 0.844
#> SRR1700070 2 0.4235 0.84459 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700071 3 0.4931 0.73486 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700072 3 0.4121 0.74801 0.168 0.000 0.832
#> SRR1700073 3 0.2537 0.69439 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700075 3 0.3918 0.75585 0.140 0.004 0.856
#> SRR1700074 3 0.5178 0.72217 0.256 0.000 0.744
#> SRR1700076 3 0.5728 0.75289 0.196 0.032 0.772
#> SRR1700077 3 0.4861 0.75423 0.192 0.008 0.800
#> SRR1700078 3 0.4842 0.74194 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700080 3 0.4164 0.75961 0.144 0.008 0.848
#> SRR1700079 3 0.4842 0.73411 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700081 1 0.2261 0.82879 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700082 3 0.6026 0.50848 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700083 1 0.5560 0.56517 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700084 1 0.2066 0.83028 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700085 2 0.4605 0.82724 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700086 3 0.2711 0.69652 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700087 3 0.2625 0.74581 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700088 3 0.3846 0.75808 0.108 0.016 0.876
#> SRR1700089 3 0.3886 0.75481 0.096 0.024 0.880
#> SRR1700091 3 0.6079 0.49092 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700090 3 0.4654 0.74373 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700092 3 0.5254 0.59839 0.000 0.264 0.736
#> SRR1700094 3 0.5138 0.72413 0.252 0.000 0.748
#> SRR1700093 3 0.4912 0.75300 0.196 0.008 0.796
#> SRR1700095 3 0.5859 0.61608 0.344 0.000 0.656
#> SRR1700096 3 0.6026 0.56458 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700097 1 0.4399 0.74568 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700098 3 0.6280 0.28988 0.000 0.460 0.540
#> SRR1700099 3 0.6287 0.59138 0.024 0.272 0.704
#> SRR1700100 3 0.4178 0.75275 0.172 0.000 0.828
#> SRR1700101 3 0.5883 0.74920 0.112 0.092 0.796
#> SRR1700102 3 0.5053 0.67876 0.024 0.164 0.812
#> SRR1700104 3 0.4842 0.74128 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700103 3 0.5404 0.72156 0.256 0.004 0.740
#> SRR1700105 3 0.4836 0.74466 0.072 0.080 0.848
#> SRR1700106 3 0.2486 0.71414 0.008 0.060 0.932
#> SRR1700107 3 0.3295 0.72043 0.008 0.096 0.896
#> SRR1700108 2 0.6235 0.20946 0.000 0.564 0.436
#> SRR1700109 2 0.2537 0.89410 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700110 2 0.1031 0.90608 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700112 2 0.5706 0.61196 0.000 0.680 0.320
#> SRR1700111 3 0.2711 0.72781 0.088 0.000 0.912
#> SRR1700113 2 0.3192 0.88974 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700114 3 0.5058 0.72754 0.244 0.000 0.756
#> SRR1700115 3 0.4861 0.67110 0.012 0.180 0.808
#> SRR1700116 3 0.3816 0.75249 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700117 3 0.5650 0.64198 0.312 0.000 0.688
#> SRR1700119 3 0.5291 0.71093 0.268 0.000 0.732
#> SRR1700118 3 0.1753 0.73769 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700120 1 0.6180 0.18688 0.584 0.000 0.416
#> SRR1700121 3 0.3377 0.71398 0.012 0.092 0.896
#> SRR1700122 3 0.6154 0.01985 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700123 3 0.4931 0.73617 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700125 2 0.2796 0.89483 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700126 1 0.3116 0.81295 0.892 0.000 0.108
#> SRR1700127 3 0.6215 0.43128 0.428 0.000 0.572
#> SRR1700124 3 0.4750 0.74540 0.216 0.000 0.784
#> SRR1700128 3 0.4702 0.73785 0.212 0.000 0.788
#> SRR1700129 3 0.0848 0.72196 0.008 0.008 0.984
#> SRR1700130 3 0.1453 0.71542 0.008 0.024 0.968
#> SRR1700132 3 0.3752 0.75420 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700131 1 0.5431 0.58800 0.716 0.000 0.284
#> SRR1700133 3 0.4099 0.76049 0.140 0.008 0.852
#> SRR1700134 3 0.4346 0.65408 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700135 3 0.6274 0.26080 0.456 0.000 0.544
#> SRR1700136 1 0.5497 0.59698 0.708 0.000 0.292
#> SRR1700137 3 0.5153 0.75330 0.100 0.068 0.832
#> SRR1700138 3 0.4974 0.73838 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700140 3 0.4555 0.74454 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700139 3 0.4399 0.74772 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700141 3 0.5706 0.31613 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700142 1 0.5678 0.56336 0.684 0.000 0.316
#> SRR1700143 3 0.5138 0.72125 0.252 0.000 0.748
#> SRR1700144 3 0.5810 0.57206 0.336 0.000 0.664
#> SRR1700145 3 0.4555 0.74609 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700146 3 0.5678 0.53270 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700147 3 0.5968 0.57737 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700149 3 0.5905 0.55432 0.352 0.000 0.648
#> SRR1700148 3 0.5254 0.71358 0.264 0.000 0.736
#> SRR1700150 3 0.1647 0.72080 0.004 0.036 0.960
#> SRR1700152 3 0.4293 0.75631 0.164 0.004 0.832
#> SRR1700151 3 0.5138 0.72059 0.252 0.000 0.748
#> SRR1700153 3 0.4842 0.73288 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700154 3 0.4931 0.73631 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700155 3 0.4665 0.75918 0.100 0.048 0.852
#> SRR1700156 3 0.5678 0.65855 0.316 0.000 0.684
#> SRR1700158 1 0.3686 0.79096 0.860 0.000 0.140
#> SRR1700159 2 0.2796 0.89538 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700157 3 0.6302 0.08282 0.480 0.000 0.520
#> SRR1700160 3 0.5178 0.71897 0.256 0.000 0.744
#> SRR1700161 3 0.5948 0.59085 0.360 0.000 0.640
#> SRR1700162 2 0.6225 0.31876 0.000 0.568 0.432
#> SRR1700164 3 0.5138 0.72441 0.252 0.000 0.748
#> SRR1700163 1 0.4931 0.69772 0.768 0.000 0.232
#> SRR1700165 3 0.6140 0.49836 0.404 0.000 0.596
#> SRR1700166 3 0.4883 0.75019 0.208 0.004 0.788
#> SRR1700168 2 0.5650 0.70333 0.000 0.688 0.312
#> SRR1700167 1 0.5835 0.51496 0.660 0.000 0.340
#> SRR1700170 3 0.1860 0.73953 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700169 3 0.5098 0.72357 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700171 3 0.5882 0.60337 0.348 0.000 0.652
#> SRR1700172 3 0.5174 0.76087 0.128 0.048 0.824
#> SRR1700174 3 0.5115 0.74107 0.228 0.004 0.768
#> SRR1700173 3 0.4682 0.75570 0.192 0.004 0.804
#> SRR1700175 3 0.3965 0.76102 0.132 0.008 0.860
#> SRR1700176 1 0.2537 0.82623 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700178 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700177 3 0.4047 0.75847 0.148 0.004 0.848
#> SRR1700180 2 0.0592 0.90218 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700179 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700181 2 0.0237 0.90221 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0592 0.90218 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700186 2 0.2448 0.88900 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700187 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700192 1 0.9852 0.01263 0.416 0.272 0.312
#> SRR1700190 1 0.1411 0.82793 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700191 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0237 0.82086 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700193 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700195 2 0.0592 0.90291 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700194 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0237 0.90221 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700197 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0747 0.90257 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700199 2 0.1031 0.90333 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700200 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700201 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.2796 0.89505 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700203 2 0.1411 0.90261 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700204 2 0.1289 0.90605 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700206 2 0.5945 0.69819 0.024 0.740 0.236
#> SRR1700207 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 1 0.6432 0.14264 0.568 0.004 0.428
#> SRR1700205 2 0.2711 0.89160 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700209 2 0.0237 0.90221 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700210 2 0.1643 0.90252 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700211 2 0.0747 0.90233 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700212 2 0.1860 0.89971 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700213 2 0.2878 0.88320 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700214 2 0.0592 0.90310 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700215 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0592 0.90218 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700216 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3412 0.84996 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700219 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700223 2 0.0237 0.90221 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700224 2 0.2796 0.90099 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700226 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.3551 0.87841 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700225 2 0.5621 0.71140 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700227 2 0.0747 0.90233 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700230 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0892 0.90296 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700228 2 0.3482 0.86102 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700232 2 0.0892 0.90377 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700233 2 0.0747 0.90341 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700234 2 0.0592 0.90218 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700235 2 0.5650 0.51213 0.000 0.688 0.312
#> SRR1700237 2 0.0747 0.90244 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700236 2 0.1163 0.90440 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700238 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0747 0.81046 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700241 3 0.5285 0.73000 0.244 0.004 0.752
#> SRR1700243 2 0.0747 0.90244 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700244 2 0.0592 0.90218 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700242 2 0.7551 0.31227 0.048 0.580 0.372
#> SRR1700246 2 0.3340 0.88471 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700245 2 0.0592 0.90247 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700247 1 0.2165 0.77733 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700249 1 0.0000 0.82026 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0747 0.90296 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700248 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700251 2 0.0237 0.90337 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700252 3 0.8482 0.61078 0.200 0.184 0.616
#> SRR1700253 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.1411 0.90321 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700254 1 0.0892 0.80761 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700255 2 0.0237 0.90221 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700257 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0424 0.90201 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700259 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.3192 0.89233 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700261 2 0.1411 0.90503 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700262 2 0.1411 0.90495 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700263 2 0.4346 0.86375 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700264 2 0.0424 0.90331 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700265 2 0.5618 0.72404 0.008 0.732 0.260
#> SRR1700266 2 0.0424 0.90323 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700268 3 0.6066 0.72633 0.248 0.024 0.728
#> SRR1700270 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.90255 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0592 0.90483 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700273 2 0.1411 0.90422 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700274 2 0.4291 0.86692 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700277 1 0.4887 0.69802 0.772 0.000 0.228
#> SRR1700275 2 0.1643 0.90489 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700276 2 0.0747 0.90491 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700278 2 0.4589 0.83856 0.008 0.820 0.172
#> SRR1700279 2 0.3038 0.89472 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700280 2 0.1289 0.90587 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700281 2 0.0747 0.90384 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700283 2 0.4178 0.86664 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700282 3 0.6447 0.70719 0.196 0.060 0.744
#> SRR1700284 2 0.2796 0.89469 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700285 2 0.4346 0.83889 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700286 2 0.3752 0.88520 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700287 2 0.3038 0.89538 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700290 1 0.2878 0.82012 0.904 0.000 0.096
#> SRR1700289 2 0.4654 0.84839 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700288 2 0.0424 0.90444 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700292 2 0.4178 0.86371 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700291 3 0.5442 0.70458 0.056 0.132 0.812
#> SRR1700293 3 0.5982 0.50725 0.004 0.328 0.668
#> SRR1700294 2 0.3879 0.87268 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700295 3 0.4558 0.75381 0.100 0.044 0.856
#> SRR1700297 2 0.4504 0.85601 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700296 2 0.2878 0.89546 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700298 3 0.4485 0.69567 0.020 0.136 0.844
#> SRR1700299 3 0.0892 0.72653 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700300 3 0.2689 0.72156 0.036 0.032 0.932
#> SRR1700302 2 0.3116 0.89249 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700301 2 0.2625 0.89597 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700303 2 0.2537 0.89695 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700304 2 0.1643 0.90259 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700305 2 0.2711 0.89508 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700306 3 0.2096 0.73916 0.052 0.004 0.944
#> SRR1700308 3 0.5859 0.31657 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700307 3 0.5098 0.72858 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700309 3 0.5882 0.40895 0.348 0.000 0.652
#> SRR1700310 2 0.2711 0.89562 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700311 3 0.3213 0.71408 0.028 0.060 0.912
#> SRR1700312 3 0.6330 0.10726 0.004 0.396 0.600
#> SRR1700313 3 0.4399 0.75628 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700314 3 0.3267 0.75847 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700315 3 0.2152 0.73402 0.036 0.016 0.948
#> SRR1700316 3 0.2599 0.74312 0.052 0.016 0.932
#> SRR1700317 2 0.2711 0.89637 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700318 2 0.3619 0.88472 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700319 3 0.4887 0.74470 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700320 2 0.2711 0.89542 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700322 3 0.6126 0.25858 0.004 0.352 0.644
#> SRR1700321 2 0.2537 0.89703 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700323 3 0.6764 0.59110 0.060 0.224 0.716
#> SRR1700324 2 0.2261 0.89962 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700325 2 0.5678 0.64697 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700326 3 0.4477 0.73405 0.068 0.068 0.864
#> SRR1700327 2 0.2537 0.90056 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700329 3 0.6095 0.12158 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700328 3 0.4002 0.66436 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700330 3 0.4555 0.75297 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700331 2 0.4555 0.85310 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700332 2 0.6180 0.46465 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700333 2 0.3752 0.87992 0.000 0.856 0.144
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.4614 0.56538 0.004 0.752 0.016 0.228
#> SRR1699875 2 0.2266 0.71298 0.004 0.912 0.000 0.084
#> SRR1699876 2 0.4941 0.26523 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1699877 2 0.5976 0.53237 0.024 0.688 0.044 0.244
#> SRR1699879 2 0.3257 0.67834 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR1699878 2 0.4511 0.52327 0.008 0.724 0.000 0.268
#> SRR1699880 1 0.4978 0.68263 0.664 0.000 0.324 0.012
#> SRR1699881 3 0.6646 0.25632 0.304 0.000 0.584 0.112
#> SRR1699882 2 0.2125 0.73145 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1699883 2 0.5060 0.47127 0.016 0.692 0.004 0.288
#> SRR1699884 2 0.3032 0.70624 0.000 0.868 0.008 0.124
#> SRR1699885 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.4978 0.40030 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR1699888 2 0.2830 0.70939 0.000 0.900 0.060 0.040
#> SRR1699889 4 0.5198 0.43726 0.000 0.252 0.040 0.708
#> SRR1699890 2 0.4277 0.54007 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1699887 2 0.2216 0.71131 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1699891 4 0.4898 0.11975 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1699892 3 0.5378 0.33745 0.000 0.012 0.540 0.448
#> SRR1699893 4 0.5688 -0.15881 0.000 0.024 0.464 0.512
#> SRR1699894 4 0.4907 0.10896 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1699895 4 0.4925 0.07577 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1699896 3 0.6431 0.54011 0.016 0.048 0.588 0.348
#> SRR1699897 4 0.6795 0.18069 0.000 0.432 0.096 0.472
#> SRR1699898 3 0.5682 -0.21422 0.456 0.000 0.520 0.024
#> SRR1699900 4 0.6149 -0.38903 0.048 0.000 0.476 0.476
#> SRR1699899 4 0.5858 0.30901 0.020 0.328 0.020 0.632
#> SRR1699902 3 0.4964 0.62972 0.032 0.000 0.724 0.244
#> SRR1699901 1 0.5792 0.64004 0.648 0.000 0.296 0.056
#> SRR1699903 4 0.4682 0.46568 0.024 0.212 0.004 0.760
#> SRR1699904 2 0.4925 0.27516 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1699905 3 0.7315 0.27853 0.300 0.000 0.516 0.184
#> SRR1699906 2 0.5143 0.21743 0.000 0.540 0.004 0.456
#> SRR1699907 4 0.4820 0.36908 0.012 0.296 0.000 0.692
#> SRR1699908 4 0.4998 -0.08589 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1699909 4 0.5540 0.54231 0.000 0.108 0.164 0.728
#> SRR1699910 4 0.4035 0.42171 0.020 0.000 0.176 0.804
#> SRR1699911 4 0.4943 0.55230 0.016 0.164 0.040 0.780
#> SRR1699912 4 0.4631 0.40862 0.008 0.260 0.004 0.728
#> SRR1699913 4 0.5427 0.03391 0.004 0.444 0.008 0.544
#> SRR1699914 3 0.6546 -0.02657 0.396 0.000 0.524 0.080
#> SRR1699915 4 0.4100 0.54220 0.016 0.040 0.100 0.844
#> SRR1699916 4 0.5000 -0.12443 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1699917 4 0.6065 0.53145 0.016 0.196 0.084 0.704
#> SRR1699918 4 0.5414 0.55510 0.016 0.072 0.152 0.760
#> SRR1699919 4 0.5793 0.28541 0.000 0.360 0.040 0.600
#> SRR1699920 4 0.4746 0.25823 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699921 4 0.6164 0.45892 0.000 0.264 0.092 0.644
#> SRR1699922 2 0.5016 0.32336 0.000 0.600 0.004 0.396
#> SRR1699923 3 0.6595 0.57181 0.120 0.000 0.604 0.276
#> SRR1699924 3 0.3577 0.66715 0.012 0.000 0.832 0.156
#> SRR1699925 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699926 4 0.4807 0.38615 0.024 0.000 0.248 0.728
#> SRR1699927 2 0.4996 0.15650 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1699929 4 0.4434 0.43487 0.016 0.000 0.228 0.756
#> SRR1699928 4 0.5669 -0.03654 0.016 0.464 0.004 0.516
#> SRR1699930 4 0.4941 0.06842 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1699931 4 0.6261 0.04957 0.000 0.056 0.440 0.504
#> SRR1699933 3 0.6068 0.34755 0.044 0.000 0.508 0.448
#> SRR1699932 2 0.4855 0.32434 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1699934 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699935 4 0.6451 0.12204 0.000 0.068 0.456 0.476
#> SRR1699936 2 0.2081 0.72425 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1699937 2 0.6929 0.20309 0.008 0.608 0.244 0.140
#> SRR1699938 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.7081 0.43584 0.128 0.000 0.484 0.388
#> SRR1699939 2 0.1302 0.74052 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1699941 1 0.6580 0.36766 0.504 0.000 0.416 0.080
#> SRR1699942 2 0.8160 0.07244 0.032 0.496 0.192 0.280
#> SRR1699943 2 0.0376 0.74190 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1699944 2 0.2053 0.73118 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1699945 1 0.4509 0.71649 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1699946 2 0.4206 0.59928 0.000 0.816 0.048 0.136
#> SRR1699947 2 0.5684 0.48646 0.020 0.716 0.044 0.220
#> SRR1699948 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.1792 0.73296 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1699950 2 0.1978 0.73081 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1699951 2 0.4801 0.62349 0.000 0.764 0.048 0.188
#> SRR1699952 2 0.7255 0.10641 0.016 0.540 0.108 0.336
#> SRR1699953 2 0.1118 0.73985 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1699954 3 0.8978 0.01584 0.072 0.364 0.368 0.196
#> SRR1699955 2 0.0707 0.74325 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699956 1 0.4936 0.66695 0.652 0.000 0.340 0.008
#> SRR1699957 2 0.3402 0.68652 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR1699959 3 0.4720 0.65335 0.044 0.000 0.768 0.188
#> SRR1699958 3 0.6872 0.47627 0.024 0.072 0.592 0.312
#> SRR1699960 2 0.2714 0.71120 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR1699961 3 0.4237 0.64150 0.040 0.000 0.808 0.152
#> SRR1699962 2 0.0336 0.74332 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699963 3 0.7254 0.49996 0.024 0.104 0.572 0.300
#> SRR1699964 4 0.7726 0.29472 0.016 0.348 0.152 0.484
#> SRR1699965 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699966 3 0.4547 0.67719 0.024 0.008 0.784 0.184
#> SRR1699967 2 0.2002 0.72082 0.000 0.936 0.020 0.044
#> SRR1699968 4 0.6265 0.31240 0.000 0.340 0.072 0.588
#> SRR1699969 3 0.5285 -0.24786 0.468 0.000 0.524 0.008
#> SRR1699971 3 0.5583 0.62295 0.048 0.008 0.704 0.240
#> SRR1699970 2 0.1902 0.72725 0.004 0.932 0.000 0.064
#> SRR1699972 3 0.5851 0.60119 0.084 0.000 0.680 0.236
#> SRR1699973 4 0.6936 -0.33336 0.040 0.036 0.448 0.476
#> SRR1699974 1 0.4535 0.71417 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1699975 4 0.3450 0.47419 0.040 0.004 0.084 0.872
#> SRR1699976 3 0.5478 0.62786 0.016 0.048 0.736 0.200
#> SRR1699977 3 0.5673 0.62164 0.052 0.000 0.660 0.288
#> SRR1699978 1 0.4867 0.72470 0.736 0.000 0.232 0.032
#> SRR1699979 3 0.3074 0.69567 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699980 4 0.5569 0.49954 0.024 0.196 0.044 0.736
#> SRR1699981 3 0.4387 0.64986 0.052 0.000 0.804 0.144
#> SRR1699982 4 0.5339 0.20041 0.016 0.384 0.000 0.600
#> SRR1699983 4 0.5189 0.25065 0.012 0.372 0.000 0.616
#> SRR1699984 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699985 4 0.5478 0.15018 0.008 0.404 0.008 0.580
#> SRR1699986 1 0.4509 0.71649 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1699988 4 0.6374 0.07202 0.024 0.444 0.024 0.508
#> SRR1699987 3 0.3355 0.67405 0.004 0.000 0.836 0.160
#> SRR1699989 4 0.5851 0.51922 0.012 0.192 0.080 0.716
#> SRR1699990 3 0.3945 0.64114 0.004 0.000 0.780 0.216
#> SRR1699992 3 0.6117 0.59036 0.012 0.144 0.708 0.136
#> SRR1699991 3 0.3999 0.64097 0.036 0.000 0.824 0.140
#> SRR1699993 3 0.5812 0.62468 0.156 0.000 0.708 0.136
#> SRR1699994 3 0.6508 0.12900 0.344 0.000 0.568 0.088
#> SRR1699995 1 0.1389 0.78018 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1699996 4 0.7553 0.45445 0.016 0.296 0.152 0.536
#> SRR1699997 3 0.4838 0.63413 0.024 0.000 0.724 0.252
#> SRR1699998 4 0.7722 0.21238 0.040 0.372 0.096 0.492
#> SRR1699999 1 0.1389 0.78035 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1700000 3 0.6324 0.39338 0.044 0.008 0.532 0.416
#> SRR1700002 3 0.4552 0.66135 0.044 0.000 0.784 0.172
#> SRR1700001 3 0.6698 0.05591 0.372 0.000 0.532 0.096
#> SRR1700003 3 0.5277 0.64057 0.028 0.000 0.668 0.304
#> SRR1700004 3 0.6086 0.49367 0.188 0.000 0.680 0.132
#> SRR1700005 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700006 3 0.4387 0.64844 0.052 0.000 0.804 0.144
#> SRR1700007 2 0.4843 0.34838 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1700008 3 0.3335 0.67940 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR1700009 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700010 1 0.4584 0.70780 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR1700011 2 0.3306 0.68915 0.004 0.840 0.000 0.156
#> SRR1700013 3 0.4833 0.68801 0.008 0.040 0.776 0.176
#> SRR1700012 4 0.5986 -0.00603 0.040 0.008 0.332 0.620
#> SRR1700014 3 0.3668 0.65034 0.004 0.000 0.808 0.188
#> SRR1700015 3 0.6284 0.53598 0.164 0.000 0.664 0.172
#> SRR1700016 1 0.0817 0.76793 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700018 3 0.3925 0.65894 0.016 0.000 0.808 0.176
#> SRR1700017 3 0.5647 0.58818 0.116 0.000 0.720 0.164
#> SRR1700019 2 0.4916 0.30151 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1700020 3 0.5143 -0.22627 0.456 0.000 0.540 0.004
#> SRR1700021 4 0.5876 0.31888 0.016 0.356 0.020 0.608
#> SRR1700023 3 0.4123 0.64774 0.008 0.000 0.772 0.220
#> SRR1700022 3 0.6136 0.14417 0.356 0.000 0.584 0.060
#> SRR1700024 4 0.4639 0.56990 0.016 0.132 0.044 0.808
#> SRR1700025 3 0.4680 0.63942 0.032 0.004 0.772 0.192
#> SRR1700026 3 0.3982 0.64610 0.004 0.000 0.776 0.220
#> SRR1700027 3 0.4214 0.64359 0.016 0.000 0.780 0.204
#> SRR1700028 3 0.5368 0.53876 0.024 0.000 0.636 0.340
#> SRR1700029 3 0.3105 0.68957 0.004 0.000 0.856 0.140
#> SRR1700030 4 0.6539 0.41805 0.024 0.084 0.228 0.664
#> SRR1700031 1 0.5143 0.63556 0.628 0.000 0.360 0.012
#> SRR1700032 2 0.7345 0.02796 0.000 0.508 0.184 0.308
#> SRR1700034 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700035 4 0.5309 0.54559 0.000 0.092 0.164 0.744
#> SRR1700033 3 0.6221 0.25367 0.316 0.000 0.608 0.076
#> SRR1700036 4 0.6445 0.42111 0.000 0.096 0.304 0.600
#> SRR1700037 2 0.4981 0.20529 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1700038 3 0.5803 0.47365 0.024 0.008 0.596 0.372
#> SRR1700039 1 0.5400 0.60891 0.608 0.000 0.372 0.020
#> SRR1700040 3 0.5599 0.17567 0.352 0.000 0.616 0.032
#> SRR1700041 3 0.2401 0.67611 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR1700042 3 0.6543 0.01182 0.372 0.000 0.544 0.084
#> SRR1700043 3 0.5531 0.57762 0.140 0.000 0.732 0.128
#> SRR1700045 3 0.3803 0.66500 0.032 0.000 0.836 0.132
#> SRR1700044 4 0.5859 -0.31258 0.024 0.004 0.468 0.504
#> SRR1700046 3 0.3910 0.64861 0.024 0.000 0.820 0.156
#> SRR1700047 1 0.5688 0.37795 0.512 0.000 0.464 0.024
#> SRR1700048 3 0.5600 0.35092 0.020 0.000 0.512 0.468
#> SRR1700049 1 0.3982 0.74883 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1700050 1 0.4814 0.67805 0.676 0.000 0.316 0.008
#> SRR1700051 1 0.4792 0.69797 0.680 0.000 0.312 0.008
#> SRR1700052 1 0.5423 0.66632 0.640 0.000 0.332 0.028
#> SRR1700053 3 0.4632 0.57532 0.004 0.000 0.688 0.308
#> SRR1700054 3 0.3895 0.64713 0.012 0.000 0.804 0.184
#> SRR1700055 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700056 3 0.1724 0.67051 0.032 0.000 0.948 0.020
#> SRR1700057 3 0.2300 0.68525 0.016 0.000 0.920 0.064
#> SRR1700058 1 0.5159 0.63471 0.624 0.000 0.364 0.012
#> SRR1700059 3 0.2266 0.68987 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1700060 1 0.5428 0.59310 0.600 0.000 0.380 0.020
#> SRR1700061 3 0.4149 0.64409 0.028 0.000 0.804 0.168
#> SRR1700062 1 0.5132 0.47213 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1700063 3 0.4300 0.62715 0.092 0.000 0.820 0.088
#> SRR1700064 4 0.5186 0.20202 0.016 0.000 0.344 0.640
#> SRR1700065 1 0.7630 0.18956 0.428 0.000 0.364 0.208
#> SRR1700066 3 0.6614 0.08646 0.360 0.000 0.548 0.092
#> SRR1700067 4 0.4162 0.55473 0.016 0.052 0.088 0.844
#> SRR1700068 3 0.2282 0.67546 0.024 0.000 0.924 0.052
#> SRR1700069 4 0.4855 0.29375 0.000 0.004 0.352 0.644
#> SRR1700070 4 0.5938 -0.01363 0.000 0.476 0.036 0.488
#> SRR1700071 3 0.3808 0.64498 0.012 0.000 0.812 0.176
#> SRR1700072 3 0.5883 0.46591 0.040 0.000 0.572 0.388
#> SRR1700073 4 0.3016 0.50118 0.004 0.004 0.120 0.872
#> SRR1700075 3 0.5626 0.47373 0.028 0.000 0.588 0.384
#> SRR1700074 3 0.3910 0.64761 0.024 0.000 0.820 0.156
#> SRR1700076 3 0.4776 0.63782 0.040 0.004 0.772 0.184
#> SRR1700077 3 0.4700 0.63682 0.016 0.012 0.764 0.208
#> SRR1700078 3 0.3908 0.64660 0.004 0.000 0.784 0.212
#> SRR1700080 3 0.4585 0.53512 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1700079 3 0.4332 0.64864 0.032 0.000 0.792 0.176
#> SRR1700081 1 0.4699 0.69270 0.676 0.000 0.320 0.004
#> SRR1700082 3 0.6931 0.47218 0.184 0.000 0.588 0.228
#> SRR1700083 3 0.5431 0.47640 0.224 0.000 0.712 0.064
#> SRR1700084 1 0.5823 0.63064 0.608 0.000 0.348 0.044
#> SRR1700085 4 0.5606 -0.07674 0.000 0.480 0.020 0.500
#> SRR1700086 4 0.5188 0.28908 0.024 0.004 0.276 0.696
#> SRR1700087 3 0.6042 0.48688 0.048 0.000 0.560 0.392
#> SRR1700088 3 0.4675 0.62962 0.020 0.000 0.736 0.244
#> SRR1700089 3 0.5321 0.57071 0.032 0.000 0.672 0.296
#> SRR1700091 3 0.7216 0.30973 0.000 0.284 0.536 0.180
#> SRR1700090 3 0.4636 0.66056 0.040 0.000 0.772 0.188
#> SRR1700092 3 0.7146 0.39736 0.000 0.212 0.560 0.228
#> SRR1700094 3 0.4104 0.69352 0.028 0.000 0.808 0.164
#> SRR1700093 3 0.3266 0.66714 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700095 3 0.4127 0.67644 0.052 0.000 0.824 0.124
#> SRR1700096 3 0.3621 0.67326 0.068 0.000 0.860 0.072
#> SRR1700097 3 0.6648 0.13759 0.372 0.000 0.536 0.092
#> SRR1700098 2 0.7273 -0.15281 0.000 0.452 0.400 0.148
#> SRR1700099 3 0.6026 0.50815 0.004 0.080 0.672 0.244
#> SRR1700100 3 0.4888 0.64419 0.036 0.000 0.740 0.224
#> SRR1700101 3 0.3901 0.65973 0.004 0.012 0.816 0.168
#> SRR1700102 3 0.7293 0.48964 0.024 0.132 0.596 0.248
#> SRR1700104 3 0.3443 0.67802 0.016 0.000 0.848 0.136
#> SRR1700103 3 0.3335 0.68140 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR1700105 3 0.4431 0.58781 0.004 0.004 0.740 0.252
#> SRR1700106 4 0.5352 0.20529 0.016 0.000 0.388 0.596
#> SRR1700107 3 0.5364 0.62659 0.028 0.016 0.720 0.236
#> SRR1700108 3 0.7775 -0.08964 0.000 0.352 0.404 0.244
#> SRR1700109 2 0.2546 0.72861 0.000 0.912 0.028 0.060
#> SRR1700110 2 0.3377 0.69378 0.000 0.848 0.012 0.140
#> SRR1700112 2 0.7892 -0.30224 0.000 0.368 0.292 0.340
#> SRR1700111 4 0.6327 -0.34775 0.060 0.000 0.444 0.496
#> SRR1700113 2 0.5151 0.20442 0.000 0.532 0.004 0.464
#> SRR1700114 3 0.3278 0.68422 0.020 0.000 0.864 0.116
#> SRR1700115 3 0.5228 0.44766 0.000 0.024 0.664 0.312
#> SRR1700116 3 0.5354 0.63147 0.056 0.000 0.712 0.232
#> SRR1700117 3 0.4663 0.66851 0.064 0.000 0.788 0.148
#> SRR1700119 3 0.3441 0.68073 0.024 0.000 0.856 0.120
#> SRR1700118 3 0.5987 0.43085 0.040 0.000 0.520 0.440
#> SRR1700120 3 0.6681 0.37764 0.292 0.000 0.588 0.120
#> SRR1700121 3 0.4576 0.58376 0.000 0.012 0.728 0.260
#> SRR1700122 4 0.4117 0.53925 0.004 0.116 0.048 0.832
#> SRR1700123 3 0.3108 0.68520 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR1700125 2 0.5277 0.18952 0.000 0.532 0.008 0.460
#> SRR1700126 1 0.5543 0.59534 0.612 0.000 0.360 0.028
#> SRR1700127 3 0.5102 0.64283 0.100 0.000 0.764 0.136
#> SRR1700124 3 0.3142 0.67954 0.008 0.000 0.860 0.132
#> SRR1700128 3 0.5056 0.65680 0.044 0.000 0.732 0.224
#> SRR1700129 4 0.5833 -0.09464 0.032 0.000 0.440 0.528
#> SRR1700130 4 0.5522 0.28506 0.044 0.000 0.288 0.668
#> SRR1700132 3 0.5231 0.55804 0.028 0.000 0.676 0.296
#> SRR1700131 3 0.6217 0.40899 0.292 0.000 0.624 0.084
#> SRR1700133 3 0.4482 0.56216 0.008 0.000 0.728 0.264
#> SRR1700134 4 0.5693 0.07000 0.000 0.024 0.472 0.504
#> SRR1700135 3 0.7079 0.40296 0.276 0.000 0.556 0.168
#> SRR1700136 3 0.6133 0.42940 0.268 0.000 0.644 0.088
#> SRR1700137 3 0.3751 0.64934 0.000 0.004 0.800 0.196
#> SRR1700138 3 0.3495 0.67624 0.016 0.000 0.844 0.140
#> SRR1700140 3 0.4831 0.64886 0.040 0.000 0.752 0.208
#> SRR1700139 3 0.4818 0.64538 0.036 0.000 0.748 0.216
#> SRR1700141 4 0.5646 0.51337 0.000 0.088 0.204 0.708
#> SRR1700142 1 0.6332 0.24379 0.488 0.000 0.452 0.060
#> SRR1700143 3 0.3166 0.67864 0.016 0.000 0.868 0.116
#> SRR1700144 3 0.6695 0.48333 0.164 0.000 0.616 0.220
#> SRR1700145 3 0.4868 0.64492 0.040 0.000 0.748 0.212
#> SRR1700146 4 0.7297 0.28147 0.000 0.152 0.392 0.456
#> SRR1700147 3 0.5850 0.57987 0.184 0.000 0.700 0.116
#> SRR1700149 3 0.5839 0.62434 0.104 0.000 0.696 0.200
#> SRR1700148 3 0.3266 0.68316 0.024 0.000 0.868 0.108
#> SRR1700150 4 0.5466 0.06551 0.016 0.000 0.436 0.548
#> SRR1700152 3 0.4781 0.64376 0.036 0.000 0.752 0.212
#> SRR1700151 3 0.3219 0.67928 0.020 0.000 0.868 0.112
#> SRR1700153 3 0.4994 0.65015 0.048 0.000 0.744 0.208
#> SRR1700154 3 0.3335 0.67870 0.016 0.000 0.856 0.128
#> SRR1700155 3 0.4886 0.58766 0.008 0.016 0.732 0.244
#> SRR1700156 3 0.3037 0.67843 0.020 0.000 0.880 0.100
#> SRR1700158 3 0.6592 0.12667 0.392 0.000 0.524 0.084
#> SRR1700159 2 0.5337 0.24208 0.000 0.564 0.012 0.424
#> SRR1700157 3 0.7630 0.16977 0.364 0.000 0.428 0.208
#> SRR1700160 3 0.3219 0.67761 0.020 0.000 0.868 0.112
#> SRR1700161 3 0.3858 0.67024 0.056 0.000 0.844 0.100
#> SRR1700162 4 0.6936 0.40301 0.000 0.284 0.148 0.568
#> SRR1700164 3 0.4237 0.67323 0.040 0.000 0.808 0.152
#> SRR1700163 3 0.5968 0.49205 0.236 0.000 0.672 0.092
#> SRR1700165 3 0.4236 0.65777 0.088 0.000 0.824 0.088
#> SRR1700166 3 0.3529 0.66845 0.012 0.000 0.836 0.152
#> SRR1700168 4 0.6334 0.46598 0.016 0.244 0.076 0.664
#> SRR1700167 3 0.7186 0.07058 0.384 0.000 0.476 0.140
#> SRR1700170 3 0.5420 0.60388 0.044 0.000 0.684 0.272
#> SRR1700169 3 0.3278 0.68537 0.020 0.000 0.864 0.116
#> SRR1700171 3 0.5330 0.63449 0.132 0.000 0.748 0.120
#> SRR1700172 3 0.4268 0.60520 0.004 0.004 0.760 0.232
#> SRR1700174 3 0.3547 0.67306 0.016 0.000 0.840 0.144
#> SRR1700173 3 0.3479 0.67160 0.012 0.000 0.840 0.148
#> SRR1700175 3 0.4621 0.53423 0.008 0.000 0.708 0.284
#> SRR1700176 1 0.4737 0.71833 0.728 0.000 0.252 0.020
#> SRR1700178 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.4831 0.64776 0.040 0.000 0.752 0.208
#> SRR1700180 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0188 0.74191 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0188 0.74191 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700183 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1629 0.73131 0.000 0.952 0.024 0.024
#> SRR1700187 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700185 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700192 2 0.9387 -0.19874 0.272 0.336 0.300 0.092
#> SRR1700190 1 0.4155 0.74053 0.756 0.000 0.240 0.004
#> SRR1700191 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700189 1 0.2402 0.76031 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1700193 2 0.0336 0.74275 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700195 2 0.0469 0.74130 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700194 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700198 2 0.0804 0.73860 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1700199 2 0.1637 0.71743 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700200 2 0.0188 0.74301 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700201 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.3161 0.68722 0.012 0.864 0.000 0.124
#> SRR1700203 2 0.1389 0.72734 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700204 2 0.2266 0.72682 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1700206 2 0.6083 0.41906 0.016 0.688 0.228 0.068
#> SRR1700207 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.8345 -0.07378 0.400 0.052 0.412 0.136
#> SRR1700205 2 0.3257 0.65535 0.004 0.844 0.000 0.152
#> SRR1700209 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.1557 0.72228 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700211 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.1677 0.72903 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1700213 2 0.3853 0.64754 0.000 0.820 0.020 0.160
#> SRR1700214 2 0.0469 0.74349 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700215 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700217 2 0.0336 0.74149 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700216 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700218 2 0.3486 0.64767 0.000 0.864 0.044 0.092
#> SRR1700219 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700220 2 0.0188 0.74191 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700221 2 0.0188 0.74173 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700223 2 0.0188 0.74300 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.4454 0.52832 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700226 2 0.0188 0.74331 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700229 2 0.4579 0.56500 0.016 0.756 0.004 0.224
#> SRR1700225 2 0.6933 0.17187 0.016 0.544 0.076 0.364
#> SRR1700227 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.1302 0.78057 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700231 2 0.0336 0.74181 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700228 2 0.3517 0.69645 0.004 0.868 0.040 0.088
#> SRR1700232 2 0.0469 0.74184 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700233 2 0.0469 0.74350 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700234 2 0.0188 0.74173 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700235 2 0.4168 0.58634 0.000 0.828 0.092 0.080
#> SRR1700237 2 0.0817 0.74329 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700236 2 0.0657 0.74311 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1700238 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700240 1 0.0921 0.77133 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700241 3 0.4077 0.68014 0.012 0.004 0.800 0.184
#> SRR1700243 2 0.0188 0.74310 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.0524 0.74228 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700242 2 0.6301 0.33344 0.008 0.668 0.224 0.100
#> SRR1700246 2 0.3768 0.62953 0.008 0.808 0.000 0.184
#> SRR1700245 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0376 0.74420 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700249 1 0.1211 0.78056 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700250 2 0.0188 0.74191 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700248 2 0.0336 0.74149 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700251 2 0.0188 0.74252 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700252 3 0.8146 0.38998 0.048 0.212 0.540 0.200
#> SRR1700253 2 0.0336 0.74335 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700256 2 0.2101 0.71689 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR1700254 1 0.0817 0.76793 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700255 2 0.0188 0.74308 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700257 2 0.0188 0.74191 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700258 2 0.1398 0.74027 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1700259 2 0.0921 0.74147 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700260 2 0.4776 0.40699 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1700261 2 0.4790 0.38855 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1700262 2 0.4872 0.41582 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1700263 2 0.6099 0.26057 0.016 0.564 0.024 0.396
#> SRR1700264 2 0.1118 0.74212 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700265 2 0.7122 0.27824 0.016 0.600 0.132 0.252
#> SRR1700266 2 0.1302 0.73820 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700268 3 0.6500 0.63638 0.036 0.056 0.660 0.248
#> SRR1700270 2 0.0188 0.74341 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700267 2 0.0469 0.74354 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700271 2 0.0000 0.74236 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.2216 0.72354 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700273 2 0.1743 0.73305 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1700274 4 0.5088 0.08713 0.000 0.424 0.004 0.572
#> SRR1700277 3 0.5838 -0.18908 0.444 0.000 0.524 0.032
#> SRR1700275 2 0.4304 0.50677 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1700276 2 0.3074 0.66718 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1700278 2 0.6309 0.28621 0.000 0.588 0.076 0.336
#> SRR1700279 2 0.4916 0.29181 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1700280 2 0.4382 0.50063 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700281 2 0.2053 0.73129 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1700283 4 0.4933 0.07972 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1700282 3 0.5806 0.55187 0.036 0.004 0.620 0.340
#> SRR1700284 2 0.4888 0.31086 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1700285 2 0.6416 0.12148 0.004 0.512 0.056 0.428
#> SRR1700286 2 0.5125 0.34742 0.000 0.604 0.008 0.388
#> SRR1700287 2 0.5295 0.12339 0.000 0.504 0.008 0.488
#> SRR1700290 1 0.5220 0.65030 0.632 0.000 0.352 0.016
#> SRR1700289 4 0.4889 0.25353 0.004 0.360 0.000 0.636
#> SRR1700288 2 0.2216 0.71777 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700292 4 0.5576 -0.02823 0.012 0.488 0.004 0.496
#> SRR1700291 3 0.5678 0.16694 0.000 0.024 0.524 0.452
#> SRR1700293 3 0.7249 -0.13870 0.000 0.144 0.444 0.412
#> SRR1700294 4 0.5294 -0.02977 0.008 0.484 0.000 0.508
#> SRR1700295 4 0.5132 0.09432 0.000 0.004 0.448 0.548
#> SRR1700297 4 0.5482 0.13732 0.004 0.412 0.012 0.572
#> SRR1700296 2 0.4961 0.24618 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1700298 3 0.5864 0.04902 0.004 0.024 0.492 0.480
#> SRR1700299 4 0.5090 0.32936 0.044 0.000 0.228 0.728
#> SRR1700300 4 0.4190 0.43191 0.032 0.004 0.148 0.816
#> SRR1700302 2 0.4981 0.21300 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1700301 2 0.4888 0.31250 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1700303 2 0.4925 0.28775 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1700304 2 0.4406 0.47670 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700305 2 0.5138 0.32795 0.000 0.600 0.008 0.392
#> SRR1700306 4 0.4434 0.42923 0.016 0.004 0.208 0.772
#> SRR1700308 4 0.3946 0.56467 0.016 0.080 0.048 0.856
#> SRR1700307 3 0.3447 0.67808 0.020 0.000 0.852 0.128
#> SRR1700309 1 0.7900 -0.13465 0.360 0.000 0.296 0.344
#> SRR1700310 2 0.4907 0.29650 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1700311 4 0.5308 0.41488 0.024 0.012 0.256 0.708
#> SRR1700312 4 0.6993 0.47878 0.000 0.132 0.336 0.532
#> SRR1700313 3 0.5244 0.52089 0.012 0.000 0.600 0.388
#> SRR1700314 3 0.5130 0.64575 0.016 0.000 0.652 0.332
#> SRR1700315 4 0.4163 0.42455 0.020 0.000 0.188 0.792
#> SRR1700316 3 0.6413 0.38270 0.016 0.036 0.520 0.428
#> SRR1700317 2 0.4948 0.25511 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1700318 2 0.5158 0.18105 0.000 0.524 0.004 0.472
#> SRR1700319 3 0.5897 0.49793 0.044 0.000 0.588 0.368
#> SRR1700320 2 0.4977 0.22227 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1700322 4 0.6615 0.53175 0.020 0.116 0.196 0.668
#> SRR1700321 2 0.4933 0.28119 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1700323 4 0.7051 0.15723 0.004 0.104 0.436 0.456
#> SRR1700324 2 0.4713 0.40811 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1700325 2 0.7808 -0.18435 0.000 0.416 0.272 0.312
#> SRR1700326 4 0.5562 0.06398 0.024 0.008 0.316 0.652
#> SRR1700327 2 0.4800 0.42028 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR1700329 4 0.3781 0.55137 0.004 0.124 0.028 0.844
#> SRR1700328 4 0.6116 0.20502 0.136 0.004 0.168 0.692
#> SRR1700330 3 0.5252 0.60284 0.020 0.000 0.644 0.336
#> SRR1700331 4 0.5443 0.25611 0.016 0.364 0.004 0.616
#> SRR1700332 4 0.6373 0.48769 0.000 0.248 0.116 0.636
#> SRR1700333 2 0.5402 0.14999 0.000 0.516 0.012 0.472
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.4594 0.72664 0.000 0.764 0.116 0.008 0.112
#> SRR1699875 2 0.2959 0.81295 0.000 0.864 0.036 0.000 0.100
#> SRR1699876 5 0.3621 0.73055 0.000 0.192 0.020 0.000 0.788
#> SRR1699877 2 0.6428 0.46990 0.000 0.560 0.140 0.020 0.280
#> SRR1699879 2 0.4535 0.46462 0.000 0.684 0.024 0.004 0.288
#> SRR1699878 2 0.5110 0.61909 0.000 0.680 0.096 0.000 0.224
#> SRR1699880 1 0.6699 0.08646 0.464 0.000 0.336 0.192 0.008
#> SRR1699881 3 0.6483 0.51091 0.220 0.000 0.540 0.232 0.008
#> SRR1699882 2 0.3663 0.72358 0.000 0.776 0.016 0.000 0.208
#> SRR1699883 2 0.5733 0.48815 0.000 0.608 0.136 0.000 0.256
#> SRR1699884 2 0.4125 0.74225 0.000 0.772 0.056 0.000 0.172
#> SRR1699885 2 0.0898 0.85440 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1699886 5 0.5708 0.31588 0.000 0.408 0.072 0.004 0.516
#> SRR1699888 2 0.2710 0.82793 0.000 0.896 0.016 0.056 0.032
#> SRR1699889 5 0.3831 0.75968 0.000 0.072 0.076 0.020 0.832
#> SRR1699890 5 0.4576 0.50509 0.000 0.376 0.016 0.000 0.608
#> SRR1699887 2 0.4497 0.22577 0.000 0.632 0.016 0.000 0.352
#> SRR1699891 5 0.2825 0.74996 0.000 0.124 0.016 0.000 0.860
#> SRR1699892 3 0.6823 0.37712 0.000 0.008 0.464 0.260 0.268
#> SRR1699893 4 0.5584 0.24008 0.000 0.000 0.076 0.532 0.392
#> SRR1699894 5 0.2873 0.75065 0.000 0.128 0.016 0.000 0.856
#> SRR1699895 5 0.2771 0.75026 0.000 0.128 0.012 0.000 0.860
#> SRR1699896 3 0.6608 0.50125 0.012 0.040 0.616 0.212 0.120
#> SRR1699897 5 0.7406 0.49894 0.000 0.320 0.168 0.060 0.452
#> SRR1699898 4 0.7026 -0.11786 0.284 0.000 0.252 0.448 0.016
#> SRR1699900 3 0.4023 0.44586 0.004 0.004 0.800 0.048 0.144
#> SRR1699899 5 0.3828 0.74187 0.000 0.072 0.120 0.000 0.808
#> SRR1699902 3 0.4149 0.54515 0.004 0.000 0.768 0.188 0.040
#> SRR1699901 1 0.6131 0.37952 0.532 0.000 0.376 0.048 0.044
#> SRR1699903 5 0.2511 0.72525 0.000 0.028 0.080 0.000 0.892
#> SRR1699904 5 0.3421 0.72972 0.000 0.204 0.008 0.000 0.788
#> SRR1699905 3 0.7568 0.03331 0.168 0.000 0.448 0.308 0.076
#> SRR1699906 5 0.3399 0.73878 0.000 0.168 0.020 0.000 0.812
#> SRR1699907 5 0.3924 0.73470 0.000 0.068 0.120 0.004 0.808
#> SRR1699908 5 0.3241 0.74917 0.000 0.144 0.024 0.000 0.832
#> SRR1699909 5 0.4806 0.74227 0.000 0.068 0.048 0.112 0.772
#> SRR1699910 5 0.5928 0.41364 0.000 0.000 0.328 0.124 0.548
#> SRR1699911 5 0.5350 0.63370 0.000 0.044 0.264 0.028 0.664
#> SRR1699912 5 0.2569 0.74142 0.000 0.040 0.068 0.000 0.892
#> SRR1699913 5 0.3433 0.74844 0.000 0.132 0.032 0.004 0.832
#> SRR1699914 3 0.6827 0.28760 0.332 0.000 0.416 0.248 0.004
#> SRR1699915 5 0.4483 0.69328 0.000 0.012 0.156 0.064 0.768
#> SRR1699916 5 0.3563 0.73340 0.000 0.208 0.012 0.000 0.780
#> SRR1699917 5 0.5346 0.72712 0.000 0.080 0.116 0.068 0.736
#> SRR1699918 5 0.5028 0.70302 0.000 0.028 0.140 0.088 0.744
#> SRR1699919 5 0.4138 0.75369 0.000 0.120 0.036 0.036 0.808
#> SRR1699920 5 0.5037 0.60725 0.000 0.000 0.088 0.228 0.684
#> SRR1699921 5 0.4302 0.75773 0.000 0.088 0.044 0.060 0.808
#> SRR1699922 5 0.4451 0.71338 0.000 0.248 0.040 0.000 0.712
#> SRR1699923 3 0.5849 0.49669 0.072 0.000 0.684 0.172 0.072
#> SRR1699924 4 0.4816 -0.45329 0.008 0.000 0.488 0.496 0.008
#> SRR1699925 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.5510 0.60250 0.000 0.000 0.184 0.164 0.652
#> SRR1699927 5 0.3343 0.73965 0.000 0.172 0.016 0.000 0.812
#> SRR1699929 3 0.5657 -0.22574 0.000 0.008 0.480 0.056 0.456
#> SRR1699928 5 0.3507 0.74376 0.000 0.120 0.052 0.000 0.828
#> SRR1699930 5 0.2921 0.74901 0.000 0.124 0.020 0.000 0.856
#> SRR1699931 3 0.7233 -0.01906 0.000 0.032 0.396 0.196 0.376
#> SRR1699933 3 0.5288 0.55496 0.008 0.000 0.696 0.176 0.120
#> SRR1699932 5 0.4454 0.71065 0.000 0.268 0.020 0.008 0.704
#> SRR1699934 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.5448 0.42983 0.000 0.016 0.040 0.360 0.584
#> SRR1699936 2 0.3274 0.72117 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1699937 2 0.5294 0.43025 0.000 0.608 0.332 0.056 0.004
#> SRR1699938 2 0.0162 0.85184 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.6330 0.32957 0.056 0.000 0.640 0.164 0.140
#> SRR1699939 2 0.1830 0.84504 0.000 0.924 0.008 0.000 0.068
#> SRR1699941 3 0.6417 0.26003 0.348 0.000 0.488 0.160 0.004
#> SRR1699942 2 0.8159 0.24084 0.000 0.408 0.256 0.156 0.180
#> SRR1699943 2 0.0794 0.85079 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.2390 0.83460 0.000 0.896 0.020 0.000 0.084
#> SRR1699945 1 0.5925 0.48781 0.628 0.000 0.236 0.120 0.016
#> SRR1699946 2 0.3437 0.74938 0.000 0.808 0.176 0.012 0.004
#> SRR1699947 2 0.5191 0.62314 0.000 0.672 0.244 0.004 0.080
#> SRR1699948 2 0.0579 0.85288 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1699949 2 0.3010 0.77014 0.000 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1699950 2 0.3010 0.76568 0.000 0.824 0.004 0.000 0.172
#> SRR1699951 2 0.5834 0.55269 0.000 0.636 0.052 0.048 0.264
#> SRR1699952 2 0.6674 0.30455 0.000 0.484 0.376 0.036 0.104
#> SRR1699953 2 0.1386 0.85481 0.000 0.952 0.016 0.000 0.032
#> SRR1699954 3 0.6479 0.20462 0.020 0.384 0.512 0.064 0.020
#> SRR1699955 2 0.0880 0.85234 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699956 1 0.6323 0.39237 0.572 0.000 0.268 0.144 0.016
#> SRR1699957 2 0.4276 0.74470 0.000 0.764 0.068 0.000 0.168
#> SRR1699959 3 0.4846 0.59280 0.020 0.000 0.644 0.324 0.012
#> SRR1699958 4 0.5566 0.56857 0.000 0.020 0.216 0.672 0.092
#> SRR1699960 2 0.3550 0.69254 0.000 0.760 0.000 0.004 0.236
#> SRR1699961 3 0.4642 0.61272 0.020 0.000 0.648 0.328 0.004
#> SRR1699962 2 0.1662 0.84914 0.000 0.936 0.004 0.004 0.056
#> SRR1699963 3 0.6210 0.41683 0.000 0.060 0.656 0.136 0.148
#> SRR1699964 3 0.7539 -0.16651 0.000 0.348 0.372 0.044 0.236
#> SRR1699965 2 0.0510 0.85273 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699966 3 0.5002 0.39174 0.000 0.000 0.612 0.344 0.044
#> SRR1699967 2 0.2502 0.83808 0.000 0.904 0.060 0.012 0.024
#> SRR1699968 5 0.5175 0.74622 0.000 0.156 0.108 0.016 0.720
#> SRR1699969 3 0.7037 0.29327 0.316 0.000 0.372 0.304 0.008
#> SRR1699971 3 0.4009 0.53408 0.004 0.008 0.800 0.152 0.036
#> SRR1699970 2 0.2773 0.82671 0.000 0.868 0.020 0.000 0.112
#> SRR1699972 3 0.4706 0.51789 0.028 0.000 0.764 0.148 0.060
#> SRR1699973 3 0.6814 -0.06198 0.000 0.016 0.500 0.268 0.216
#> SRR1699974 1 0.6011 0.45987 0.612 0.000 0.240 0.136 0.012
#> SRR1699975 5 0.4936 0.40962 0.000 0.008 0.416 0.016 0.560
#> SRR1699976 3 0.5197 0.61508 0.004 0.044 0.652 0.292 0.008
#> SRR1699977 3 0.3839 0.50180 0.004 0.000 0.816 0.108 0.072
#> SRR1699978 1 0.4830 0.57212 0.700 0.000 0.040 0.248 0.012
#> SRR1699979 4 0.4607 0.03368 0.008 0.000 0.364 0.620 0.008
#> SRR1699980 5 0.3801 0.70111 0.000 0.040 0.140 0.008 0.812
#> SRR1699981 3 0.5832 0.08752 0.012 0.000 0.504 0.420 0.064
#> SRR1699982 5 0.3912 0.73726 0.000 0.088 0.108 0.000 0.804
#> SRR1699983 5 0.4411 0.73978 0.000 0.120 0.116 0.000 0.764
#> SRR1699984 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.3991 0.74424 0.000 0.156 0.048 0.004 0.792
#> SRR1699986 1 0.5687 0.47907 0.620 0.000 0.264 0.112 0.004
#> SRR1699988 5 0.6166 0.50725 0.000 0.244 0.200 0.000 0.556
#> SRR1699987 3 0.5029 0.49299 0.004 0.000 0.528 0.444 0.024
#> SRR1699989 5 0.4471 0.72879 0.000 0.056 0.132 0.028 0.784
#> SRR1699990 3 0.4882 0.61209 0.004 0.000 0.636 0.328 0.032
#> SRR1699992 3 0.6653 0.54135 0.012 0.144 0.528 0.308 0.008
#> SRR1699991 3 0.4467 0.60578 0.016 0.000 0.640 0.344 0.000
#> SRR1699993 4 0.5801 -0.44320 0.060 0.000 0.444 0.484 0.012
#> SRR1699994 3 0.5997 0.61516 0.108 0.000 0.588 0.292 0.012
#> SRR1699995 1 0.0451 0.75216 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1699996 5 0.8024 0.32003 0.000 0.256 0.276 0.092 0.376
#> SRR1699997 4 0.4325 0.61110 0.000 0.000 0.220 0.736 0.044
#> SRR1699998 3 0.7202 -0.00833 0.004 0.252 0.472 0.024 0.248
#> SRR1699999 1 0.0740 0.75155 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR1700000 3 0.5461 0.27751 0.000 0.004 0.672 0.164 0.160
#> SRR1700002 3 0.4502 0.61044 0.012 0.000 0.668 0.312 0.008
#> SRR1700001 3 0.7195 0.30007 0.324 0.000 0.420 0.232 0.024
#> SRR1700003 3 0.5874 -0.14276 0.000 0.004 0.476 0.436 0.084
#> SRR1700004 3 0.5808 0.61529 0.100 0.000 0.600 0.292 0.008
#> SRR1700005 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5166 0.58240 0.028 0.000 0.592 0.368 0.012
#> SRR1700007 5 0.3491 0.71027 0.000 0.228 0.004 0.000 0.768
#> SRR1700008 4 0.3966 0.62784 0.004 0.000 0.176 0.784 0.036
#> SRR1700009 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.5958 0.46416 0.616 0.000 0.244 0.128 0.012
#> SRR1700011 2 0.4297 0.63495 0.000 0.692 0.020 0.000 0.288
#> SRR1700013 4 0.5443 0.20084 0.008 0.052 0.292 0.640 0.008
#> SRR1700012 3 0.3391 0.41515 0.000 0.000 0.800 0.012 0.188
#> SRR1700014 3 0.4299 0.60896 0.004 0.000 0.672 0.316 0.008
#> SRR1700015 3 0.5292 0.63048 0.084 0.000 0.660 0.252 0.004
#> SRR1700016 1 0.1205 0.73458 0.956 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1700018 3 0.4777 0.59745 0.008 0.000 0.620 0.356 0.016
#> SRR1700017 3 0.5140 0.62957 0.060 0.004 0.652 0.284 0.000
#> SRR1700019 5 0.3585 0.72033 0.000 0.220 0.004 0.004 0.772
#> SRR1700020 4 0.6340 0.03225 0.260 0.000 0.192 0.544 0.004
#> SRR1700021 5 0.4826 0.71079 0.000 0.144 0.116 0.004 0.736
#> SRR1700023 3 0.4522 0.60826 0.000 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1700022 3 0.6740 0.47142 0.236 0.000 0.484 0.272 0.008
#> SRR1700024 5 0.5321 0.70253 0.000 0.068 0.168 0.044 0.720
#> SRR1700025 3 0.4560 0.61261 0.008 0.000 0.672 0.304 0.016
#> SRR1700026 3 0.4401 0.60731 0.000 0.000 0.656 0.328 0.016
#> SRR1700027 3 0.4142 0.60885 0.004 0.000 0.684 0.308 0.004
#> SRR1700028 4 0.5957 0.51942 0.000 0.004 0.232 0.604 0.160
#> SRR1700029 4 0.4814 -0.23150 0.004 0.000 0.412 0.568 0.016
#> SRR1700030 5 0.5920 0.32012 0.000 0.008 0.384 0.084 0.524
#> SRR1700031 1 0.6798 -0.11699 0.400 0.000 0.392 0.200 0.008
#> SRR1700032 3 0.7136 0.37525 0.000 0.300 0.512 0.092 0.096
#> SRR1700034 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.3878 0.71648 0.000 0.020 0.120 0.040 0.820
#> SRR1700033 3 0.5767 0.61070 0.112 0.000 0.604 0.280 0.004
#> SRR1700036 5 0.6162 0.22828 0.000 0.024 0.376 0.076 0.524
#> SRR1700037 5 0.3352 0.73216 0.000 0.192 0.004 0.004 0.800
#> SRR1700038 3 0.5433 0.56822 0.004 0.008 0.676 0.224 0.088
#> SRR1700039 3 0.6789 0.21253 0.360 0.000 0.408 0.228 0.004
#> SRR1700040 3 0.6808 0.44319 0.248 0.000 0.428 0.320 0.004
#> SRR1700041 3 0.4803 0.44853 0.004 0.000 0.492 0.492 0.012
#> SRR1700042 3 0.6268 0.58956 0.140 0.000 0.564 0.284 0.012
#> SRR1700043 3 0.5328 0.58848 0.064 0.000 0.584 0.352 0.000
#> SRR1700045 3 0.5343 0.45890 0.024 0.000 0.492 0.468 0.016
#> SRR1700044 3 0.4390 0.49978 0.000 0.008 0.776 0.076 0.140
#> SRR1700046 3 0.4580 0.60287 0.008 0.000 0.628 0.356 0.008
#> SRR1700047 3 0.6919 0.22389 0.356 0.000 0.400 0.236 0.008
#> SRR1700048 3 0.5450 0.56083 0.000 0.000 0.648 0.228 0.124
#> SRR1700049 1 0.4424 0.63321 0.768 0.000 0.144 0.084 0.004
#> SRR1700050 1 0.6250 0.37499 0.540 0.000 0.300 0.156 0.004
#> SRR1700051 1 0.6146 0.31680 0.528 0.000 0.340 0.128 0.004
#> SRR1700052 1 0.6599 -0.05664 0.416 0.000 0.400 0.180 0.004
#> SRR1700053 3 0.6164 0.56459 0.000 0.000 0.520 0.328 0.152
#> SRR1700054 3 0.4552 0.60300 0.004 0.000 0.632 0.352 0.012
#> SRR1700055 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 4 0.4070 0.27746 0.012 0.000 0.256 0.728 0.004
#> SRR1700057 4 0.2177 0.61619 0.004 0.000 0.080 0.908 0.008
#> SRR1700058 3 0.6860 0.15587 0.380 0.000 0.396 0.216 0.008
#> SRR1700059 4 0.1697 0.64075 0.000 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700060 3 0.6778 0.25272 0.348 0.000 0.420 0.228 0.004
#> SRR1700061 3 0.4748 0.58419 0.016 0.000 0.596 0.384 0.004
#> SRR1700062 1 0.6908 -0.08481 0.380 0.000 0.276 0.340 0.004
#> SRR1700063 3 0.5143 0.55310 0.032 0.000 0.544 0.420 0.004
#> SRR1700064 3 0.5459 0.46973 0.000 0.000 0.644 0.120 0.236
#> SRR1700065 3 0.6131 0.11170 0.288 0.000 0.600 0.064 0.048
#> SRR1700066 3 0.6449 0.52172 0.204 0.000 0.524 0.268 0.004
#> SRR1700067 5 0.4713 0.67311 0.000 0.016 0.208 0.044 0.732
#> SRR1700068 4 0.4769 -0.21581 0.016 0.000 0.392 0.588 0.004
#> SRR1700069 5 0.4805 0.52016 0.000 0.000 0.312 0.040 0.648
#> SRR1700070 5 0.7003 0.46973 0.000 0.240 0.292 0.016 0.452
#> SRR1700071 3 0.4403 0.60607 0.004 0.000 0.648 0.340 0.008
#> SRR1700072 3 0.5388 0.57869 0.012 0.000 0.672 0.232 0.084
#> SRR1700073 5 0.4915 0.64254 0.000 0.012 0.240 0.048 0.700
#> SRR1700075 3 0.4150 0.60424 0.000 0.000 0.748 0.216 0.036
#> SRR1700074 3 0.4299 0.60934 0.004 0.000 0.672 0.316 0.008
#> SRR1700076 3 0.4932 0.61460 0.004 0.016 0.656 0.308 0.016
#> SRR1700077 3 0.4425 0.61917 0.000 0.000 0.680 0.296 0.024
#> SRR1700078 3 0.4703 0.60850 0.008 0.000 0.640 0.336 0.016
#> SRR1700080 3 0.4584 0.61181 0.000 0.000 0.660 0.312 0.028
#> SRR1700079 3 0.4658 0.51509 0.008 0.000 0.720 0.228 0.044
#> SRR1700081 1 0.6067 0.40609 0.588 0.000 0.240 0.168 0.004
#> SRR1700082 3 0.5494 0.51913 0.108 0.000 0.716 0.132 0.044
#> SRR1700083 3 0.5986 0.59396 0.112 0.000 0.548 0.336 0.004
#> SRR1700084 3 0.6524 0.29622 0.324 0.000 0.500 0.168 0.008
#> SRR1700085 5 0.4761 0.74381 0.000 0.172 0.080 0.008 0.740
#> SRR1700086 3 0.4588 0.19974 0.000 0.000 0.604 0.016 0.380
#> SRR1700087 4 0.6099 0.42559 0.000 0.000 0.352 0.512 0.136
#> SRR1700088 3 0.4067 0.60899 0.000 0.004 0.748 0.228 0.020
#> SRR1700089 4 0.4177 0.56142 0.000 0.000 0.164 0.772 0.064
#> SRR1700091 4 0.4541 0.53784 0.000 0.192 0.032 0.752 0.024
#> SRR1700090 4 0.3373 0.63829 0.008 0.000 0.168 0.816 0.008
#> SRR1700092 4 0.6232 0.41028 0.000 0.212 0.096 0.636 0.056
#> SRR1700094 4 0.3022 0.58065 0.012 0.000 0.136 0.848 0.004
#> SRR1700093 4 0.1787 0.66159 0.000 0.004 0.044 0.936 0.016
#> SRR1700095 4 0.1579 0.66161 0.032 0.000 0.024 0.944 0.000
#> SRR1700096 4 0.2153 0.65396 0.040 0.000 0.044 0.916 0.000
#> SRR1700097 4 0.5505 0.53139 0.184 0.000 0.100 0.692 0.024
#> SRR1700098 4 0.5813 0.34031 0.000 0.352 0.036 0.572 0.040
#> SRR1700099 4 0.3255 0.65302 0.000 0.024 0.040 0.868 0.068
#> SRR1700100 4 0.4649 0.58864 0.000 0.000 0.220 0.716 0.064
#> SRR1700101 4 0.1630 0.66056 0.000 0.004 0.036 0.944 0.016
#> SRR1700102 4 0.5469 0.57813 0.000 0.020 0.224 0.676 0.080
#> SRR1700104 4 0.1412 0.65822 0.004 0.000 0.036 0.952 0.008
#> SRR1700103 4 0.1843 0.66084 0.004 0.004 0.044 0.936 0.012
#> SRR1700105 4 0.2426 0.65700 0.000 0.000 0.036 0.900 0.064
#> SRR1700106 4 0.6383 0.35563 0.000 0.012 0.148 0.544 0.296
#> SRR1700107 4 0.4890 0.58919 0.000 0.004 0.216 0.708 0.072
#> SRR1700108 4 0.5712 0.49789 0.000 0.188 0.028 0.676 0.108
#> SRR1700109 2 0.3817 0.76375 0.000 0.808 0.016 0.024 0.152
#> SRR1700110 2 0.4404 0.61525 0.000 0.712 0.000 0.036 0.252
#> SRR1700112 5 0.6765 0.43861 0.000 0.156 0.020 0.348 0.476
#> SRR1700111 4 0.6886 0.36450 0.020 0.000 0.344 0.460 0.176
#> SRR1700113 5 0.3705 0.73357 0.000 0.192 0.008 0.012 0.788
#> SRR1700114 4 0.1285 0.65730 0.004 0.000 0.036 0.956 0.004
#> SRR1700115 4 0.2871 0.64851 0.000 0.004 0.032 0.876 0.088
#> SRR1700116 4 0.4369 0.59515 0.000 0.000 0.208 0.740 0.052
#> SRR1700117 4 0.2694 0.63399 0.008 0.000 0.108 0.876 0.008
#> SRR1700119 4 0.1059 0.66126 0.004 0.000 0.020 0.968 0.008
#> SRR1700118 4 0.6172 0.39880 0.000 0.000 0.356 0.500 0.144
#> SRR1700120 4 0.4574 0.56470 0.184 0.000 0.060 0.748 0.008
#> SRR1700121 4 0.3344 0.63907 0.000 0.012 0.028 0.848 0.112
#> SRR1700122 5 0.2492 0.73745 0.000 0.024 0.048 0.020 0.908
#> SRR1700123 4 0.1502 0.64305 0.004 0.000 0.056 0.940 0.000
#> SRR1700125 5 0.4773 0.73060 0.000 0.216 0.004 0.064 0.716
#> SRR1700126 1 0.6326 0.19973 0.452 0.000 0.136 0.408 0.004
#> SRR1700127 4 0.3869 0.64357 0.080 0.000 0.084 0.824 0.012
#> SRR1700124 4 0.0898 0.66071 0.000 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1700128 4 0.4318 0.60110 0.004 0.000 0.228 0.736 0.032
#> SRR1700129 4 0.5447 0.53600 0.000 0.000 0.248 0.640 0.112
#> SRR1700130 4 0.6557 0.37612 0.000 0.000 0.288 0.472 0.240
#> SRR1700132 4 0.3780 0.58372 0.000 0.000 0.132 0.808 0.060
#> SRR1700131 4 0.3686 0.51840 0.204 0.000 0.012 0.780 0.004
#> SRR1700133 4 0.2130 0.65490 0.000 0.000 0.012 0.908 0.080
#> SRR1700134 4 0.4359 0.46808 0.000 0.004 0.016 0.692 0.288
#> SRR1700135 4 0.4799 0.55675 0.112 0.000 0.108 0.760 0.020
#> SRR1700136 4 0.3154 0.59214 0.148 0.000 0.012 0.836 0.004
#> SRR1700137 4 0.2054 0.66265 0.000 0.000 0.028 0.920 0.052
#> SRR1700138 4 0.0693 0.66276 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700140 4 0.3759 0.62136 0.004 0.000 0.180 0.792 0.024
#> SRR1700139 4 0.4149 0.60939 0.004 0.000 0.188 0.768 0.040
#> SRR1700141 5 0.5381 0.66527 0.000 0.048 0.052 0.196 0.704
#> SRR1700142 4 0.6976 -0.14733 0.340 0.000 0.260 0.392 0.008
#> SRR1700143 4 0.0451 0.65855 0.004 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1700144 3 0.6094 0.58070 0.080 0.000 0.616 0.264 0.040
#> SRR1700145 4 0.4186 0.60821 0.004 0.000 0.184 0.768 0.044
#> SRR1700146 5 0.5392 0.22772 0.000 0.032 0.012 0.456 0.500
#> SRR1700147 4 0.2644 0.65036 0.060 0.000 0.036 0.896 0.008
#> SRR1700149 4 0.5079 0.59961 0.044 0.000 0.184 0.728 0.044
#> SRR1700148 4 0.0960 0.65761 0.004 0.000 0.016 0.972 0.008
#> SRR1700150 4 0.6022 0.29007 0.000 0.000 0.136 0.540 0.324
#> SRR1700152 4 0.4028 0.61218 0.000 0.000 0.176 0.776 0.048
#> SRR1700151 4 0.0613 0.65905 0.004 0.000 0.008 0.984 0.004
#> SRR1700153 4 0.4114 0.61044 0.004 0.000 0.176 0.776 0.044
#> SRR1700154 4 0.1026 0.66608 0.004 0.004 0.024 0.968 0.000
#> SRR1700155 4 0.2060 0.66522 0.000 0.008 0.016 0.924 0.052
#> SRR1700156 4 0.0613 0.65804 0.004 0.000 0.008 0.984 0.004
#> SRR1700158 4 0.3920 0.45857 0.268 0.000 0.004 0.724 0.004
#> SRR1700159 5 0.5309 0.68958 0.000 0.272 0.008 0.068 0.652
#> SRR1700157 4 0.7687 0.30728 0.212 0.000 0.300 0.420 0.068
#> SRR1700160 4 0.0671 0.65711 0.004 0.000 0.016 0.980 0.000
#> SRR1700161 4 0.0955 0.65734 0.028 0.000 0.004 0.968 0.000
#> SRR1700162 5 0.4580 0.68139 0.000 0.052 0.008 0.200 0.740
#> SRR1700164 4 0.3381 0.63635 0.004 0.000 0.160 0.820 0.016
#> SRR1700163 4 0.2228 0.63855 0.092 0.000 0.004 0.900 0.004
#> SRR1700165 4 0.1569 0.65067 0.044 0.000 0.008 0.944 0.004
#> SRR1700166 4 0.1828 0.66538 0.004 0.000 0.028 0.936 0.032
#> SRR1700168 5 0.6463 0.66357 0.000 0.092 0.112 0.156 0.640
#> SRR1700167 4 0.7231 0.28512 0.304 0.000 0.172 0.476 0.048
#> SRR1700170 4 0.4302 0.60447 0.000 0.000 0.208 0.744 0.048
#> SRR1700169 4 0.2179 0.62316 0.008 0.000 0.072 0.912 0.008
#> SRR1700171 4 0.1461 0.66602 0.028 0.000 0.016 0.952 0.004
#> SRR1700172 4 0.2264 0.65954 0.004 0.000 0.024 0.912 0.060
#> SRR1700174 4 0.0955 0.66204 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700173 4 0.1168 0.66165 0.000 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1700175 4 0.3160 0.63595 0.004 0.000 0.028 0.852 0.116
#> SRR1700176 1 0.5790 0.48630 0.604 0.000 0.116 0.276 0.004
#> SRR1700178 2 0.0290 0.85237 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700177 4 0.4150 0.61190 0.004 0.000 0.180 0.772 0.044
#> SRR1700180 2 0.0162 0.85184 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0324 0.85189 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0703 0.85219 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700183 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0703 0.85293 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700184 2 0.0510 0.85110 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.2180 0.84313 0.000 0.924 0.032 0.024 0.020
#> SRR1700187 1 0.0290 0.75298 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0451 0.85254 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700192 2 0.8910 -0.14613 0.248 0.324 0.136 0.264 0.028
#> SRR1700190 1 0.5224 0.57130 0.704 0.000 0.196 0.084 0.016
#> SRR1700191 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.1612 0.73175 0.948 0.000 0.016 0.024 0.012
#> SRR1700193 2 0.0798 0.85426 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1700195 2 0.0771 0.85369 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700194 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0290 0.85284 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700197 1 0.0566 0.75238 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700198 2 0.0865 0.85016 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1700199 2 0.1830 0.83593 0.000 0.932 0.028 0.000 0.040
#> SRR1700200 2 0.0992 0.85532 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700201 2 0.0671 0.85292 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700202 2 0.3401 0.79126 0.000 0.840 0.096 0.000 0.064
#> SRR1700203 2 0.1952 0.82968 0.000 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1700204 2 0.2411 0.82750 0.000 0.884 0.008 0.000 0.108
#> SRR1700206 2 0.4767 0.69219 0.008 0.760 0.032 0.168 0.032
#> SRR1700207 2 0.0609 0.85239 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700208 1 0.7953 -0.02584 0.396 0.068 0.356 0.164 0.016
#> SRR1700205 2 0.3688 0.76940 0.000 0.816 0.060 0.000 0.124
#> SRR1700209 2 0.0771 0.85352 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700210 2 0.2305 0.82067 0.000 0.896 0.012 0.000 0.092
#> SRR1700211 2 0.0671 0.85449 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700212 2 0.2424 0.83699 0.000 0.908 0.032 0.008 0.052
#> SRR1700213 2 0.3622 0.79891 0.000 0.832 0.096 0.004 0.068
#> SRR1700214 2 0.0771 0.85480 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700215 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0693 0.85243 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700216 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.2736 0.82421 0.000 0.892 0.068 0.016 0.024
#> SRR1700219 2 0.0703 0.85219 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700222 1 0.0162 0.75356 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.0510 0.85267 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700221 2 0.0693 0.85341 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1700223 2 0.1341 0.84573 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700224 2 0.5330 0.25228 0.000 0.564 0.024 0.020 0.392
#> SRR1700226 2 0.1041 0.85500 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1700229 2 0.5032 0.64761 0.000 0.704 0.128 0.000 0.168
#> SRR1700225 2 0.6366 0.40431 0.000 0.524 0.320 0.008 0.148
#> SRR1700227 2 0.0693 0.85382 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1700230 1 0.1095 0.74833 0.968 0.000 0.008 0.012 0.012
#> SRR1700231 2 0.0798 0.85318 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1700228 2 0.4261 0.78452 0.000 0.804 0.076 0.024 0.096
#> SRR1700232 2 0.0771 0.85405 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700233 2 0.0912 0.85444 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700234 2 0.0798 0.85539 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1700235 2 0.2742 0.81729 0.000 0.892 0.068 0.020 0.020
#> SRR1700237 2 0.1564 0.85033 0.000 0.948 0.024 0.004 0.024
#> SRR1700236 2 0.1430 0.85143 0.000 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1700238 2 0.0404 0.85288 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700239 1 0.0290 0.75298 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.0162 0.75109 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700241 4 0.2143 0.65188 0.008 0.004 0.060 0.920 0.008
#> SRR1700243 2 0.1195 0.85126 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1700244 2 0.0671 0.85287 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700242 2 0.5106 0.68657 0.012 0.752 0.032 0.148 0.056
#> SRR1700246 2 0.4199 0.73849 0.000 0.764 0.056 0.000 0.180
#> SRR1700245 2 0.0865 0.85386 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1700247 1 0.1168 0.73707 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1700249 1 0.0000 0.75402 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0992 0.85348 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700248 2 0.0566 0.85215 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700251 2 0.0794 0.85338 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700252 3 0.7215 0.49331 0.024 0.164 0.552 0.228 0.032
#> SRR1700253 2 0.1341 0.84853 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700256 2 0.3400 0.80325 0.000 0.840 0.116 0.004 0.040
#> SRR1700254 1 0.0992 0.74169 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1700255 2 0.0510 0.85259 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700257 2 0.0404 0.85303 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700258 2 0.2424 0.80394 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1700259 2 0.1478 0.84425 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1700260 5 0.4861 0.22757 0.000 0.428 0.024 0.000 0.548
#> SRR1700261 5 0.3790 0.70081 0.000 0.248 0.004 0.004 0.744
#> SRR1700262 5 0.3790 0.68144 0.000 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1700263 2 0.6608 0.18829 0.000 0.488 0.132 0.020 0.360
#> SRR1700264 2 0.1364 0.85472 0.000 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1700265 2 0.6494 0.32074 0.000 0.496 0.380 0.032 0.092
#> SRR1700266 2 0.2929 0.76361 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1700268 3 0.7053 0.48332 0.008 0.068 0.488 0.360 0.076
#> SRR1700270 2 0.0771 0.85567 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700267 2 0.1331 0.85246 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040
#> SRR1700271 2 0.0609 0.85239 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700272 2 0.3544 0.72833 0.000 0.788 0.004 0.008 0.200
#> SRR1700273 2 0.2451 0.83950 0.000 0.904 0.056 0.004 0.036
#> SRR1700274 5 0.3925 0.73349 0.000 0.180 0.032 0.004 0.784
#> SRR1700277 3 0.7070 0.26271 0.332 0.000 0.416 0.236 0.016
#> SRR1700275 5 0.4637 0.51590 0.000 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1700276 2 0.4310 0.12639 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1700278 5 0.7025 0.63356 0.000 0.284 0.104 0.080 0.532
#> SRR1700279 5 0.3618 0.72802 0.000 0.196 0.012 0.004 0.788
#> SRR1700280 5 0.4236 0.62614 0.000 0.328 0.004 0.004 0.664
#> SRR1700281 2 0.2672 0.82145 0.000 0.872 0.008 0.004 0.116
#> SRR1700283 5 0.3291 0.74754 0.000 0.120 0.040 0.000 0.840
#> SRR1700282 4 0.7578 0.10787 0.044 0.020 0.212 0.508 0.216
#> SRR1700284 5 0.4460 0.70621 0.000 0.252 0.020 0.012 0.716
#> SRR1700285 5 0.5861 0.70877 0.000 0.228 0.096 0.028 0.648
#> SRR1700286 5 0.5302 0.59750 0.000 0.320 0.052 0.008 0.620
#> SRR1700287 5 0.3300 0.73526 0.000 0.204 0.000 0.004 0.792
#> SRR1700290 1 0.6645 0.35502 0.536 0.000 0.240 0.208 0.016
#> SRR1700289 5 0.3523 0.75062 0.000 0.076 0.072 0.008 0.844
#> SRR1700288 2 0.2921 0.76368 0.000 0.844 0.004 0.004 0.148
#> SRR1700292 5 0.4337 0.72134 0.000 0.196 0.056 0.000 0.748
#> SRR1700291 5 0.6915 0.15291 0.000 0.020 0.172 0.392 0.416
#> SRR1700293 5 0.7794 0.46037 0.000 0.172 0.100 0.292 0.436
#> SRR1700294 5 0.3769 0.73725 0.000 0.180 0.032 0.000 0.788
#> SRR1700295 5 0.5111 0.23297 0.000 0.004 0.028 0.452 0.516
#> SRR1700297 5 0.4062 0.75278 0.000 0.136 0.040 0.020 0.804
#> SRR1700296 5 0.3489 0.72458 0.000 0.208 0.004 0.004 0.784
#> SRR1700298 5 0.5903 0.22471 0.000 0.028 0.044 0.460 0.468
#> SRR1700299 5 0.6594 0.30843 0.000 0.008 0.312 0.184 0.496
#> SRR1700300 5 0.5709 0.56049 0.000 0.008 0.240 0.116 0.636
#> SRR1700302 5 0.3899 0.73619 0.000 0.192 0.020 0.008 0.780
#> SRR1700301 5 0.3607 0.70784 0.000 0.244 0.000 0.004 0.752
#> SRR1700303 5 0.4234 0.69826 0.000 0.252 0.020 0.004 0.724
#> SRR1700304 5 0.4211 0.60323 0.000 0.360 0.000 0.004 0.636
#> SRR1700305 5 0.4766 0.70007 0.000 0.272 0.016 0.024 0.688
#> SRR1700306 5 0.5811 0.54326 0.000 0.000 0.264 0.140 0.596
#> SRR1700308 5 0.4674 0.57512 0.000 0.024 0.316 0.004 0.656
#> SRR1700307 4 0.4446 -0.42692 0.004 0.000 0.476 0.520 0.000
#> SRR1700309 3 0.6634 0.15935 0.244 0.000 0.588 0.064 0.104
#> SRR1700310 5 0.3989 0.69732 0.000 0.260 0.008 0.004 0.728
#> SRR1700311 5 0.6190 0.54078 0.000 0.008 0.172 0.236 0.584
#> SRR1700312 5 0.6112 0.55552 0.000 0.048 0.064 0.284 0.604
#> SRR1700313 4 0.6928 0.00643 0.004 0.004 0.260 0.440 0.292
#> SRR1700314 4 0.6576 0.11352 0.004 0.000 0.352 0.460 0.184
#> SRR1700315 5 0.5390 0.52314 0.000 0.000 0.324 0.076 0.600
#> SRR1700316 4 0.7747 -0.14237 0.000 0.056 0.300 0.364 0.280
#> SRR1700317 5 0.3579 0.71641 0.000 0.240 0.000 0.004 0.756
#> SRR1700318 5 0.4107 0.74422 0.000 0.192 0.020 0.016 0.772
#> SRR1700319 4 0.5953 0.36818 0.020 0.000 0.124 0.636 0.220
#> SRR1700320 5 0.3578 0.72616 0.000 0.204 0.008 0.004 0.784
#> SRR1700322 5 0.6381 0.60411 0.000 0.044 0.136 0.200 0.620
#> SRR1700321 5 0.3790 0.70261 0.000 0.248 0.004 0.004 0.744
#> SRR1700323 5 0.7108 0.26135 0.000 0.020 0.256 0.280 0.444
#> SRR1700324 5 0.4283 0.67039 0.000 0.292 0.004 0.012 0.692
#> SRR1700325 5 0.7124 0.59372 0.000 0.208 0.040 0.248 0.504
#> SRR1700326 5 0.6710 0.28877 0.000 0.008 0.264 0.236 0.492
#> SRR1700327 5 0.4620 0.60106 0.000 0.372 0.004 0.012 0.612
#> SRR1700329 5 0.3830 0.72706 0.000 0.028 0.108 0.036 0.828
#> SRR1700328 3 0.6025 0.04550 0.068 0.000 0.548 0.024 0.360
#> SRR1700330 4 0.6415 0.17670 0.004 0.004 0.256 0.552 0.184
#> SRR1700331 5 0.4677 0.73608 0.000 0.104 0.132 0.008 0.756
#> SRR1700332 5 0.4494 0.75539 0.000 0.088 0.020 0.108 0.784
#> SRR1700333 5 0.4583 0.74333 0.000 0.204 0.044 0.012 0.740
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.4999 7.19e-01 0.000 0.728 0.068 0.008 0.064 0.132
#> SRR1699875 2 0.4021 7.72e-01 0.000 0.796 0.028 0.008 0.048 0.120
#> SRR1699876 5 0.3124 7.30e-01 0.000 0.040 0.016 0.000 0.848 0.096
#> SRR1699877 2 0.7148 3.08e-01 0.000 0.432 0.044 0.024 0.228 0.272
#> SRR1699879 2 0.6047 6.02e-02 0.000 0.456 0.012 0.016 0.408 0.108
#> SRR1699878 2 0.5729 5.55e-01 0.000 0.604 0.024 0.004 0.136 0.232
#> SRR1699880 3 0.4810 8.88e-02 0.400 0.000 0.552 0.008 0.000 0.040
#> SRR1699881 3 0.4936 5.98e-01 0.116 0.004 0.724 0.040 0.000 0.116
#> SRR1699882 2 0.5410 5.75e-01 0.000 0.612 0.020 0.000 0.260 0.108
#> SRR1699883 2 0.5931 3.09e-01 0.000 0.496 0.016 0.004 0.124 0.360
#> SRR1699884 2 0.5369 6.67e-01 0.000 0.668 0.056 0.000 0.184 0.092
#> SRR1699885 2 0.0665 8.40e-01 0.000 0.980 0.008 0.004 0.000 0.008
#> SRR1699886 5 0.6445 5.04e-01 0.000 0.232 0.052 0.004 0.536 0.176
#> SRR1699888 2 0.3249 8.19e-01 0.000 0.860 0.016 0.032 0.064 0.028
#> SRR1699889 5 0.3411 7.24e-01 0.000 0.008 0.052 0.004 0.828 0.108
#> SRR1699890 5 0.4975 6.38e-01 0.000 0.192 0.020 0.004 0.692 0.092
#> SRR1699887 5 0.5258 1.85e-01 0.000 0.464 0.008 0.004 0.464 0.060
#> SRR1699891 5 0.3387 7.26e-01 0.000 0.032 0.024 0.004 0.836 0.104
#> SRR1699892 3 0.7546 6.12e-02 0.000 0.012 0.408 0.128 0.204 0.248
#> SRR1699893 4 0.6516 2.82e-01 0.000 0.000 0.076 0.520 0.256 0.148
#> SRR1699894 5 0.3315 7.31e-01 0.000 0.036 0.024 0.004 0.844 0.092
#> SRR1699895 5 0.2658 7.31e-01 0.000 0.024 0.016 0.004 0.884 0.072
#> SRR1699896 3 0.6549 1.81e-01 0.004 0.040 0.440 0.076 0.028 0.412
#> SRR1699897 5 0.7875 2.65e-01 0.000 0.124 0.184 0.040 0.404 0.248
#> SRR1699898 3 0.7191 1.24e-01 0.180 0.000 0.368 0.340 0.000 0.112
#> SRR1699900 6 0.5495 4.10e-01 0.000 0.004 0.284 0.068 0.036 0.608
#> SRR1699899 5 0.3976 6.86e-01 0.000 0.008 0.044 0.004 0.764 0.180
#> SRR1699902 3 0.5016 2.21e-01 0.000 0.000 0.592 0.096 0.000 0.312
#> SRR1699901 1 0.6944 2.04e-01 0.428 0.000 0.208 0.076 0.000 0.288
#> SRR1699903 5 0.3543 6.91e-01 0.000 0.000 0.020 0.004 0.764 0.212
#> SRR1699904 5 0.3017 7.32e-01 0.000 0.064 0.016 0.000 0.860 0.060
#> SRR1699905 6 0.6606 3.68e-01 0.088 0.000 0.112 0.288 0.004 0.508
#> SRR1699906 5 0.3774 7.19e-01 0.000 0.052 0.020 0.004 0.808 0.116
#> SRR1699907 5 0.3512 6.75e-01 0.000 0.000 0.008 0.004 0.740 0.248
#> SRR1699908 5 0.3196 7.29e-01 0.000 0.036 0.016 0.004 0.848 0.096
#> SRR1699909 5 0.4604 7.12e-01 0.000 0.008 0.052 0.052 0.756 0.132
#> SRR1699910 5 0.6338 2.76e-01 0.000 0.000 0.216 0.020 0.440 0.324
#> SRR1699911 5 0.5871 4.84e-01 0.000 0.020 0.140 0.000 0.532 0.308
#> SRR1699912 5 0.3733 6.96e-01 0.000 0.004 0.024 0.004 0.760 0.208
#> SRR1699913 5 0.3801 7.16e-01 0.000 0.036 0.024 0.004 0.800 0.136
#> SRR1699914 3 0.4158 4.65e-01 0.236 0.000 0.720 0.020 0.000 0.024
#> SRR1699915 5 0.4002 6.11e-01 0.000 0.000 0.020 0.000 0.660 0.320
#> SRR1699916 5 0.3066 7.36e-01 0.000 0.060 0.024 0.000 0.860 0.056
#> SRR1699917 5 0.5032 6.28e-01 0.000 0.052 0.008 0.016 0.640 0.284
#> SRR1699918 5 0.5064 6.01e-01 0.000 0.004 0.032 0.040 0.636 0.288
#> SRR1699919 5 0.2978 7.29e-01 0.000 0.016 0.032 0.008 0.868 0.076
#> SRR1699920 5 0.5534 6.31e-01 0.000 0.000 0.100 0.104 0.672 0.124
#> SRR1699921 5 0.2918 7.28e-01 0.000 0.020 0.032 0.000 0.864 0.084
#> SRR1699922 5 0.4980 7.08e-01 0.000 0.096 0.044 0.004 0.720 0.136
#> SRR1699923 6 0.6669 2.00e-01 0.068 0.000 0.328 0.120 0.008 0.476
#> SRR1699924 3 0.4342 4.75e-01 0.004 0.000 0.692 0.252 0.000 0.052
#> SRR1699925 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.5530 5.31e-01 0.000 0.000 0.028 0.080 0.564 0.328
#> SRR1699927 5 0.2542 7.28e-01 0.000 0.020 0.016 0.000 0.884 0.080
#> SRR1699929 6 0.6655 1.56e-01 0.000 0.004 0.272 0.028 0.268 0.428
#> SRR1699928 5 0.3754 7.03e-01 0.000 0.028 0.016 0.004 0.788 0.164
#> SRR1699930 5 0.3399 7.27e-01 0.000 0.040 0.020 0.004 0.836 0.100
#> SRR1699931 3 0.7602 1.54e-03 0.000 0.020 0.388 0.096 0.248 0.248
#> SRR1699933 3 0.5554 2.02e-01 0.012 0.000 0.492 0.032 0.036 0.428
#> SRR1699932 5 0.4174 7.37e-01 0.000 0.088 0.020 0.020 0.796 0.076
#> SRR1699934 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.6355 4.86e-01 0.000 0.008 0.076 0.248 0.564 0.104
#> SRR1699936 2 0.4310 6.74e-01 0.000 0.684 0.008 0.000 0.272 0.036
#> SRR1699937 2 0.6585 1.96e-01 0.000 0.480 0.292 0.044 0.004 0.180
#> SRR1699938 2 0.1196 8.40e-01 0.000 0.952 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR1699940 6 0.5736 4.48e-01 0.028 0.000 0.140 0.152 0.024 0.656
#> SRR1699939 2 0.3355 8.02e-01 0.000 0.828 0.008 0.000 0.100 0.064
#> SRR1699941 3 0.5514 5.32e-01 0.232 0.000 0.624 0.020 0.004 0.120
#> SRR1699942 6 0.7288 9.91e-02 0.000 0.360 0.060 0.148 0.036 0.396
#> SRR1699943 2 0.1674 8.36e-01 0.000 0.924 0.004 0.000 0.004 0.068
#> SRR1699944 2 0.4380 7.84e-01 0.000 0.776 0.048 0.008 0.052 0.116
#> SRR1699945 1 0.4597 4.25e-01 0.584 0.000 0.376 0.004 0.000 0.036
#> SRR1699946 2 0.5212 6.32e-01 0.000 0.684 0.100 0.016 0.016 0.184
#> SRR1699947 2 0.5614 5.55e-01 0.000 0.620 0.092 0.012 0.024 0.252
#> SRR1699948 2 0.1390 8.41e-01 0.000 0.948 0.004 0.000 0.016 0.032
#> SRR1699949 2 0.4469 6.70e-01 0.000 0.668 0.000 0.004 0.276 0.052
#> SRR1699950 2 0.4091 7.33e-01 0.000 0.732 0.004 0.000 0.212 0.052
#> SRR1699951 2 0.6310 5.38e-01 0.000 0.560 0.032 0.064 0.288 0.056
#> SRR1699952 6 0.7333 1.65e-01 0.000 0.324 0.224 0.028 0.048 0.376
#> SRR1699953 2 0.1933 8.42e-01 0.000 0.924 0.012 0.000 0.032 0.032
#> SRR1699954 3 0.6957 4.44e-02 0.008 0.344 0.408 0.028 0.012 0.200
#> SRR1699955 2 0.1168 8.40e-01 0.000 0.956 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1699956 1 0.5068 1.93e-01 0.484 0.000 0.460 0.024 0.000 0.032
#> SRR1699957 2 0.5898 6.24e-01 0.000 0.612 0.032 0.008 0.160 0.188
#> SRR1699959 3 0.5649 5.37e-01 0.016 0.008 0.636 0.116 0.008 0.216
#> SRR1699958 4 0.4608 3.83e-01 0.000 0.008 0.012 0.632 0.020 0.328
#> SRR1699960 2 0.4268 6.84e-01 0.000 0.696 0.008 0.004 0.264 0.028
#> SRR1699961 3 0.3852 5.95e-01 0.008 0.000 0.784 0.072 0.000 0.136
#> SRR1699962 2 0.1826 8.42e-01 0.000 0.924 0.004 0.000 0.052 0.020
#> SRR1699963 6 0.6910 3.27e-01 0.000 0.036 0.288 0.080 0.088 0.508
#> SRR1699964 6 0.7699 2.80e-01 0.000 0.240 0.164 0.036 0.124 0.436
#> SRR1699965 2 0.0692 8.38e-01 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699966 6 0.6656 -7.94e-03 0.000 0.004 0.360 0.224 0.028 0.384
#> SRR1699967 2 0.3166 8.07e-01 0.000 0.852 0.036 0.008 0.012 0.092
#> SRR1699968 5 0.4762 7.03e-01 0.000 0.028 0.056 0.032 0.752 0.132
#> SRR1699969 3 0.4931 4.86e-01 0.208 0.000 0.688 0.072 0.000 0.032
#> SRR1699971 3 0.6103 9.59e-03 0.004 0.028 0.440 0.112 0.000 0.416
#> SRR1699970 2 0.3366 8.03e-01 0.000 0.824 0.004 0.000 0.092 0.080
#> SRR1699972 6 0.5912 2.76e-02 0.024 0.004 0.424 0.096 0.000 0.452
#> SRR1699973 6 0.5860 4.96e-01 0.000 0.012 0.116 0.216 0.036 0.620
#> SRR1699974 1 0.4606 3.53e-01 0.548 0.000 0.420 0.012 0.000 0.020
#> SRR1699975 6 0.4859 4.01e-01 0.000 0.000 0.080 0.024 0.204 0.692
#> SRR1699976 3 0.4962 5.51e-01 0.000 0.028 0.708 0.056 0.016 0.192
#> SRR1699977 6 0.5343 1.45e-01 0.000 0.000 0.408 0.108 0.000 0.484
#> SRR1699978 1 0.4977 6.08e-01 0.684 0.000 0.172 0.128 0.000 0.016
#> SRR1699979 3 0.5450 1.15e-01 0.000 0.000 0.452 0.428 0.000 0.120
#> SRR1699980 5 0.4268 6.38e-01 0.000 0.004 0.036 0.008 0.712 0.240
#> SRR1699981 3 0.6239 -1.79e-01 0.004 0.000 0.364 0.308 0.000 0.324
#> SRR1699982 5 0.3735 6.71e-01 0.000 0.004 0.016 0.004 0.744 0.232
#> SRR1699983 5 0.3812 6.82e-01 0.000 0.000 0.016 0.004 0.712 0.268
#> SRR1699984 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.3733 7.06e-01 0.000 0.028 0.020 0.000 0.784 0.168
#> SRR1699986 1 0.4869 4.49e-01 0.584 0.000 0.360 0.012 0.000 0.044
#> SRR1699988 6 0.6693 -3.33e-02 0.000 0.116 0.024 0.040 0.404 0.416
#> SRR1699987 3 0.5772 4.23e-01 0.000 0.000 0.548 0.292 0.016 0.144
#> SRR1699989 5 0.4448 6.40e-01 0.000 0.008 0.020 0.016 0.684 0.272
#> SRR1699990 3 0.4619 5.85e-01 0.000 0.000 0.716 0.060 0.028 0.196
#> SRR1699992 3 0.5764 5.31e-01 0.000 0.108 0.648 0.072 0.004 0.168
#> SRR1699991 3 0.3405 6.01e-01 0.000 0.000 0.812 0.076 0.000 0.112
#> SRR1699993 3 0.5526 4.98e-01 0.044 0.000 0.636 0.236 0.004 0.080
#> SRR1699994 3 0.3552 5.95e-01 0.088 0.000 0.828 0.044 0.000 0.040
#> SRR1699995 1 0.2146 7.56e-01 0.880 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699996 6 0.7992 2.06e-01 0.000 0.220 0.148 0.036 0.212 0.384
#> SRR1699997 4 0.4034 5.25e-01 0.000 0.000 0.024 0.708 0.008 0.260
#> SRR1699998 6 0.5943 4.86e-01 0.000 0.068 0.156 0.044 0.068 0.664
#> SRR1699999 1 0.1644 7.79e-01 0.920 0.000 0.076 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700000 6 0.5124 5.03e-01 0.000 0.000 0.116 0.176 0.028 0.680
#> SRR1700002 3 0.4541 5.54e-01 0.000 0.000 0.704 0.096 0.004 0.196
#> SRR1700001 3 0.6601 4.36e-01 0.236 0.000 0.528 0.072 0.004 0.160
#> SRR1700003 6 0.5716 2.72e-01 0.000 0.000 0.136 0.356 0.008 0.500
#> SRR1700004 3 0.3308 6.11e-01 0.044 0.000 0.844 0.032 0.000 0.080
#> SRR1700005 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5024 5.63e-01 0.016 0.000 0.680 0.140 0.000 0.164
#> SRR1700007 5 0.2985 7.34e-01 0.000 0.068 0.020 0.004 0.868 0.040
#> SRR1700008 4 0.4809 5.03e-01 0.000 0.000 0.128 0.664 0.000 0.208
#> SRR1700009 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.4697 3.92e-01 0.568 0.000 0.392 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700011 2 0.5687 5.87e-01 0.000 0.596 0.028 0.004 0.268 0.104
#> SRR1700013 4 0.5900 2.61e-01 0.000 0.008 0.292 0.528 0.004 0.168
#> SRR1700012 6 0.5328 4.27e-01 0.000 0.004 0.244 0.056 0.048 0.648
#> SRR1700014 3 0.3017 6.00e-01 0.000 0.000 0.840 0.052 0.000 0.108
#> SRR1700015 3 0.5017 5.89e-01 0.048 0.008 0.724 0.060 0.004 0.156
#> SRR1700016 1 0.1865 7.73e-01 0.920 0.000 0.040 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700018 3 0.4280 5.75e-01 0.000 0.000 0.736 0.092 0.004 0.168
#> SRR1700017 3 0.3603 6.04e-01 0.012 0.000 0.808 0.056 0.000 0.124
#> SRR1700019 5 0.1938 7.36e-01 0.000 0.052 0.008 0.000 0.920 0.020
#> SRR1700020 4 0.6101 1.02e-05 0.140 0.000 0.400 0.436 0.000 0.024
#> SRR1700021 5 0.5005 6.10e-01 0.000 0.064 0.020 0.016 0.696 0.204
#> SRR1700023 3 0.4702 5.80e-01 0.004 0.000 0.720 0.068 0.024 0.184
#> SRR1700022 3 0.4159 5.86e-01 0.124 0.000 0.776 0.072 0.000 0.028
#> SRR1700024 5 0.6245 5.44e-01 0.000 0.052 0.080 0.024 0.572 0.272
#> SRR1700025 3 0.4281 5.65e-01 0.000 0.004 0.748 0.072 0.008 0.168
#> SRR1700026 3 0.3852 5.75e-01 0.000 0.000 0.784 0.072 0.008 0.136
#> SRR1700027 3 0.3821 5.74e-01 0.000 0.000 0.776 0.064 0.004 0.156
#> SRR1700028 4 0.5360 3.41e-01 0.000 0.000 0.036 0.584 0.056 0.324
#> SRR1700029 3 0.4947 3.01e-01 0.000 0.000 0.552 0.384 0.004 0.060
#> SRR1700030 5 0.6900 -1.67e-01 0.000 0.004 0.220 0.048 0.376 0.352
#> SRR1700031 3 0.4173 4.08e-01 0.268 0.000 0.696 0.024 0.000 0.012
#> SRR1700032 3 0.6792 3.56e-01 0.000 0.132 0.568 0.040 0.068 0.192
#> SRR1700034 1 0.1644 7.78e-01 0.920 0.000 0.076 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700035 5 0.2209 7.30e-01 0.000 0.004 0.040 0.000 0.904 0.052
#> SRR1700033 3 0.2781 6.01e-01 0.040 0.000 0.880 0.036 0.000 0.044
#> SRR1700036 3 0.6489 1.24e-01 0.000 0.008 0.440 0.024 0.352 0.176
#> SRR1700037 5 0.1649 7.36e-01 0.000 0.036 0.000 0.000 0.932 0.032
#> SRR1700038 3 0.5537 2.81e-01 0.000 0.016 0.544 0.044 0.024 0.372
#> SRR1700039 3 0.4429 4.49e-01 0.244 0.000 0.700 0.032 0.000 0.024
#> SRR1700040 3 0.4344 5.50e-01 0.168 0.000 0.748 0.056 0.000 0.028
#> SRR1700041 3 0.3312 5.53e-01 0.000 0.000 0.792 0.180 0.000 0.028
#> SRR1700042 3 0.2889 5.98e-01 0.048 0.000 0.868 0.068 0.000 0.016
#> SRR1700043 3 0.3620 6.03e-01 0.028 0.000 0.816 0.112 0.000 0.044
#> SRR1700045 3 0.5156 4.94e-01 0.000 0.000 0.644 0.208 0.008 0.140
#> SRR1700044 3 0.5657 -3.07e-02 0.000 0.000 0.468 0.064 0.036 0.432
#> SRR1700046 3 0.3096 6.02e-01 0.004 0.000 0.848 0.048 0.004 0.096
#> SRR1700047 3 0.4269 4.85e-01 0.220 0.000 0.724 0.036 0.000 0.020
#> SRR1700048 3 0.5522 2.62e-01 0.000 0.000 0.524 0.048 0.044 0.384
#> SRR1700049 1 0.4455 4.93e-01 0.616 0.000 0.352 0.016 0.000 0.016
#> SRR1700050 1 0.6477 2.32e-01 0.436 0.000 0.384 0.048 0.004 0.128
#> SRR1700051 3 0.5270 -2.88e-02 0.412 0.000 0.516 0.028 0.000 0.044
#> SRR1700052 3 0.4365 3.63e-01 0.292 0.000 0.668 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700053 3 0.4820 5.74e-01 0.000 0.000 0.728 0.056 0.076 0.140
#> SRR1700054 3 0.2886 6.06e-01 0.000 0.000 0.860 0.064 0.004 0.072
#> SRR1700055 1 0.0508 7.98e-01 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700056 3 0.4439 1.18e-01 0.000 0.000 0.540 0.432 0.000 0.028
#> SRR1700057 4 0.4011 5.68e-01 0.000 0.000 0.304 0.672 0.000 0.024
#> SRR1700058 3 0.4228 4.39e-01 0.252 0.000 0.704 0.032 0.000 0.012
#> SRR1700059 4 0.3686 6.52e-01 0.000 0.000 0.220 0.748 0.000 0.032
#> SRR1700060 3 0.4149 4.47e-01 0.248 0.000 0.712 0.024 0.000 0.016
#> SRR1700061 3 0.3883 5.99e-01 0.004 0.000 0.788 0.116 0.004 0.088
#> SRR1700062 3 0.5945 3.60e-01 0.224 0.000 0.568 0.180 0.000 0.028
#> SRR1700063 3 0.2633 5.91e-01 0.004 0.000 0.864 0.112 0.000 0.020
#> SRR1700064 3 0.5521 2.06e-01 0.000 0.000 0.516 0.020 0.080 0.384
#> SRR1700065 6 0.6836 1.83e-01 0.216 0.000 0.284 0.052 0.004 0.444
#> SRR1700066 3 0.3281 5.88e-01 0.124 0.000 0.828 0.036 0.000 0.012
#> SRR1700067 5 0.5319 5.41e-01 0.000 0.008 0.084 0.008 0.600 0.300
#> SRR1700068 3 0.4371 2.20e-01 0.000 0.000 0.580 0.392 0.000 0.028
#> SRR1700069 5 0.5521 4.46e-01 0.000 0.004 0.272 0.016 0.600 0.108
#> SRR1700070 5 0.7600 -9.22e-03 0.000 0.140 0.308 0.016 0.380 0.156
#> SRR1700071 3 0.2776 6.02e-01 0.000 0.000 0.860 0.052 0.000 0.088
#> SRR1700072 3 0.4885 3.15e-01 0.000 0.000 0.576 0.028 0.024 0.372
#> SRR1700073 5 0.5050 5.68e-01 0.000 0.000 0.108 0.004 0.628 0.260
#> SRR1700075 3 0.4502 4.56e-01 0.004 0.000 0.664 0.028 0.012 0.292
#> SRR1700074 3 0.3475 5.94e-01 0.000 0.000 0.800 0.060 0.000 0.140
#> SRR1700076 3 0.3743 5.79e-01 0.000 0.000 0.792 0.064 0.008 0.136
#> SRR1700077 3 0.3573 5.91e-01 0.000 0.000 0.796 0.052 0.004 0.148
#> SRR1700078 3 0.3783 5.89e-01 0.000 0.000 0.792 0.060 0.012 0.136
#> SRR1700080 3 0.4152 5.80e-01 0.000 0.000 0.772 0.060 0.028 0.140
#> SRR1700079 3 0.5204 1.38e-01 0.000 0.000 0.584 0.124 0.000 0.292
#> SRR1700081 1 0.4867 2.45e-01 0.504 0.000 0.452 0.024 0.000 0.020
#> SRR1700082 3 0.5869 6.04e-02 0.044 0.000 0.536 0.088 0.000 0.332
#> SRR1700083 3 0.3535 5.96e-01 0.068 0.000 0.832 0.060 0.000 0.040
#> SRR1700084 3 0.3056 5.73e-01 0.140 0.000 0.832 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700085 5 0.3702 7.27e-01 0.000 0.032 0.072 0.008 0.828 0.060
#> SRR1700086 6 0.6635 3.42e-01 0.000 0.000 0.264 0.048 0.224 0.464
#> SRR1700087 6 0.4217 1.01e-01 0.000 0.000 0.004 0.464 0.008 0.524
#> SRR1700088 3 0.4963 4.67e-01 0.000 0.008 0.640 0.060 0.008 0.284
#> SRR1700089 4 0.5007 4.55e-01 0.000 0.000 0.080 0.636 0.012 0.272
#> SRR1700091 4 0.5302 5.68e-01 0.000 0.148 0.056 0.712 0.052 0.032
#> SRR1700090 4 0.1594 6.93e-01 0.000 0.000 0.016 0.932 0.000 0.052
#> SRR1700092 4 0.7217 3.44e-01 0.000 0.192 0.104 0.536 0.056 0.112
#> SRR1700094 4 0.3394 6.68e-01 0.000 0.000 0.200 0.776 0.000 0.024
#> SRR1700093 4 0.2452 7.19e-01 0.000 0.000 0.084 0.884 0.004 0.028
#> SRR1700095 4 0.2222 7.23e-01 0.008 0.000 0.084 0.896 0.000 0.012
#> SRR1700096 4 0.3148 7.20e-01 0.024 0.000 0.116 0.840 0.000 0.020
#> SRR1700097 4 0.5860 5.13e-01 0.092 0.000 0.132 0.636 0.000 0.140
#> SRR1700098 4 0.6017 4.36e-01 0.000 0.220 0.048 0.628 0.048 0.056
#> SRR1700099 4 0.2927 7.08e-01 0.000 0.004 0.064 0.872 0.040 0.020
#> SRR1700100 4 0.4219 4.18e-01 0.000 0.000 0.032 0.648 0.000 0.320
#> SRR1700101 4 0.2207 7.18e-01 0.000 0.000 0.076 0.900 0.008 0.016
#> SRR1700102 4 0.4652 4.31e-01 0.000 0.016 0.032 0.628 0.000 0.324
#> SRR1700104 4 0.2006 7.19e-01 0.000 0.000 0.080 0.904 0.000 0.016
#> SRR1700103 4 0.2609 7.19e-01 0.000 0.000 0.096 0.868 0.000 0.036
#> SRR1700105 4 0.3217 7.07e-01 0.000 0.000 0.068 0.852 0.044 0.036
#> SRR1700106 4 0.5693 2.96e-01 0.000 0.000 0.016 0.572 0.148 0.264
#> SRR1700107 4 0.3833 4.93e-01 0.000 0.000 0.016 0.708 0.004 0.272
#> SRR1700108 4 0.4768 6.15e-01 0.000 0.120 0.044 0.756 0.056 0.024
#> SRR1700109 2 0.5687 6.02e-01 0.000 0.628 0.016 0.032 0.240 0.084
#> SRR1700110 2 0.5241 5.60e-01 0.000 0.608 0.000 0.040 0.304 0.048
#> SRR1700112 5 0.6303 3.63e-01 0.000 0.064 0.024 0.348 0.512 0.052
#> SRR1700111 6 0.6089 7.25e-02 0.004 0.000 0.084 0.412 0.044 0.456
#> SRR1700113 5 0.2094 7.36e-01 0.000 0.028 0.004 0.016 0.920 0.032
#> SRR1700114 4 0.2404 7.19e-01 0.000 0.000 0.112 0.872 0.000 0.016
#> SRR1700115 4 0.3029 7.04e-01 0.000 0.004 0.060 0.868 0.040 0.028
#> SRR1700116 4 0.3835 4.53e-01 0.000 0.000 0.016 0.684 0.000 0.300
#> SRR1700117 4 0.4338 6.38e-01 0.004 0.000 0.100 0.744 0.004 0.148
#> SRR1700119 4 0.1866 7.20e-01 0.000 0.000 0.084 0.908 0.000 0.008
#> SRR1700118 6 0.4921 2.30e-01 0.000 0.000 0.036 0.364 0.020 0.580
#> SRR1700120 4 0.4394 6.40e-01 0.128 0.000 0.076 0.760 0.000 0.036
#> SRR1700121 4 0.3724 6.96e-01 0.000 0.000 0.068 0.820 0.064 0.048
#> SRR1700122 5 0.3667 7.19e-01 0.000 0.020 0.016 0.004 0.788 0.172
#> SRR1700123 4 0.3130 7.09e-01 0.000 0.000 0.144 0.824 0.004 0.028
#> SRR1700125 5 0.3490 7.23e-01 0.000 0.068 0.000 0.072 0.832 0.028
#> SRR1700126 3 0.6942 -1.89e-02 0.308 0.000 0.344 0.296 0.000 0.052
#> SRR1700127 4 0.3692 7.02e-01 0.028 0.000 0.092 0.816 0.000 0.064
#> SRR1700124 4 0.2121 7.21e-01 0.000 0.000 0.096 0.892 0.000 0.012
#> SRR1700128 4 0.4348 5.10e-01 0.000 0.000 0.064 0.688 0.000 0.248
#> SRR1700129 4 0.3998 5.67e-01 0.000 0.000 0.016 0.736 0.024 0.224
#> SRR1700130 6 0.4898 1.34e-01 0.000 0.000 0.008 0.420 0.044 0.528
#> SRR1700132 4 0.4400 5.26e-01 0.000 0.000 0.052 0.708 0.012 0.228
#> SRR1700131 4 0.4517 6.41e-01 0.120 0.000 0.128 0.736 0.000 0.016
#> SRR1700133 4 0.2541 7.17e-01 0.000 0.000 0.052 0.892 0.032 0.024
#> SRR1700134 4 0.4472 5.32e-01 0.000 0.000 0.028 0.708 0.228 0.036
#> SRR1700135 4 0.5114 5.73e-01 0.044 0.000 0.076 0.696 0.004 0.180
#> SRR1700136 4 0.3507 6.99e-01 0.044 0.000 0.116 0.820 0.000 0.020
#> SRR1700137 4 0.3158 7.07e-01 0.000 0.000 0.052 0.856 0.032 0.060
#> SRR1700138 4 0.2290 7.23e-01 0.000 0.000 0.084 0.892 0.004 0.020
#> SRR1700140 4 0.3104 6.00e-01 0.000 0.000 0.016 0.800 0.000 0.184
#> SRR1700139 4 0.3555 4.95e-01 0.000 0.000 0.008 0.712 0.000 0.280
#> SRR1700141 5 0.4518 6.30e-01 0.000 0.008 0.000 0.204 0.708 0.080
#> SRR1700142 3 0.7636 9.98e-02 0.204 0.000 0.368 0.240 0.004 0.184
#> SRR1700143 4 0.2214 7.18e-01 0.000 0.000 0.096 0.888 0.000 0.016
#> SRR1700144 3 0.5243 4.12e-01 0.076 0.000 0.660 0.032 0.004 0.228
#> SRR1700145 4 0.3595 4.78e-01 0.000 0.000 0.008 0.704 0.000 0.288
#> SRR1700146 4 0.5762 -7.21e-02 0.000 0.012 0.028 0.456 0.448 0.056
#> SRR1700147 4 0.3383 7.12e-01 0.012 0.000 0.104 0.828 0.000 0.056
#> SRR1700149 4 0.4403 4.86e-01 0.016 0.000 0.032 0.684 0.000 0.268
#> SRR1700148 4 0.2971 7.11e-01 0.004 0.000 0.144 0.832 0.000 0.020
#> SRR1700150 4 0.5360 3.16e-01 0.000 0.000 0.012 0.604 0.116 0.268
#> SRR1700152 4 0.3767 5.25e-01 0.000 0.000 0.016 0.720 0.004 0.260
#> SRR1700151 4 0.1970 7.21e-01 0.000 0.000 0.092 0.900 0.000 0.008
#> SRR1700153 4 0.3834 4.97e-01 0.000 0.000 0.024 0.708 0.000 0.268
#> SRR1700154 4 0.2066 7.25e-01 0.000 0.000 0.072 0.904 0.000 0.024
#> SRR1700155 4 0.2693 7.16e-01 0.000 0.000 0.052 0.884 0.036 0.028
#> SRR1700156 4 0.2494 7.15e-01 0.000 0.000 0.120 0.864 0.000 0.016
#> SRR1700158 4 0.4565 6.18e-01 0.152 0.000 0.096 0.732 0.000 0.020
#> SRR1700159 5 0.3890 6.99e-01 0.000 0.152 0.000 0.036 0.784 0.028
#> SRR1700157 6 0.6861 2.24e-01 0.144 0.000 0.080 0.328 0.004 0.444
#> SRR1700160 4 0.2118 7.21e-01 0.000 0.000 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR1700161 4 0.2803 7.13e-01 0.012 0.000 0.116 0.856 0.000 0.016
#> SRR1700162 5 0.4489 5.51e-01 0.000 0.012 0.000 0.264 0.680 0.044
#> SRR1700164 4 0.2604 6.72e-01 0.004 0.000 0.028 0.872 0.000 0.096
#> SRR1700163 4 0.3301 7.03e-01 0.032 0.000 0.124 0.828 0.000 0.016
#> SRR1700165 4 0.3142 7.10e-01 0.024 0.000 0.132 0.832 0.000 0.012
#> SRR1700166 4 0.1923 7.21e-01 0.000 0.000 0.064 0.916 0.004 0.016
#> SRR1700168 5 0.5281 5.95e-01 0.000 0.016 0.008 0.088 0.644 0.244
#> SRR1700167 4 0.6419 2.27e-01 0.180 0.000 0.048 0.508 0.000 0.264
#> SRR1700170 4 0.3541 5.26e-01 0.000 0.000 0.012 0.728 0.000 0.260
#> SRR1700169 4 0.3731 6.44e-01 0.000 0.000 0.240 0.736 0.004 0.020
#> SRR1700171 4 0.2377 7.24e-01 0.008 0.000 0.076 0.892 0.000 0.024
#> SRR1700172 4 0.2345 7.17e-01 0.000 0.000 0.060 0.900 0.020 0.020
#> SRR1700174 4 0.1858 7.20e-01 0.000 0.000 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR1700173 4 0.2039 7.21e-01 0.000 0.000 0.072 0.908 0.004 0.016
#> SRR1700175 4 0.2896 7.17e-01 0.000 0.000 0.076 0.868 0.028 0.028
#> SRR1700176 1 0.7084 3.75e-01 0.472 0.000 0.244 0.156 0.004 0.124
#> SRR1700178 2 0.0653 8.38e-01 0.000 0.980 0.004 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700177 4 0.4061 5.19e-01 0.000 0.000 0.044 0.708 0.000 0.248
#> SRR1700180 2 0.0837 8.39e-01 0.000 0.972 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700179 2 0.1148 8.40e-01 0.000 0.960 0.004 0.000 0.016 0.020
#> SRR1700181 2 0.0767 8.38e-01 0.000 0.976 0.008 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0653 8.38e-01 0.000 0.980 0.004 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700184 2 0.0881 8.39e-01 0.000 0.972 0.008 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700186 2 0.2572 8.29e-01 0.000 0.892 0.016 0.020 0.008 0.064
#> SRR1700187 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700188 2 0.0779 8.38e-01 0.000 0.976 0.008 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700192 2 0.8726 -1.46e-01 0.244 0.304 0.180 0.188 0.008 0.076
#> SRR1700190 1 0.4701 4.70e-01 0.608 0.000 0.344 0.012 0.000 0.036
#> SRR1700191 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700189 1 0.2019 7.55e-01 0.924 0.004 0.020 0.020 0.000 0.032
#> SRR1700193 2 0.1577 8.41e-01 0.000 0.940 0.008 0.000 0.016 0.036
#> SRR1700195 2 0.1116 8.38e-01 0.000 0.960 0.008 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700194 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700196 2 0.0725 8.39e-01 0.000 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1700197 1 0.0508 7.99e-01 0.984 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700198 2 0.0984 8.37e-01 0.000 0.968 0.012 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700199 2 0.1511 8.40e-01 0.000 0.944 0.012 0.000 0.012 0.032
#> SRR1700200 2 0.1218 8.41e-01 0.000 0.956 0.004 0.000 0.012 0.028
#> SRR1700201 2 0.0508 8.37e-01 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700202 2 0.4170 7.83e-01 0.000 0.776 0.020 0.004 0.068 0.132
#> SRR1700203 2 0.2263 8.29e-01 0.000 0.908 0.008 0.004 0.036 0.044
#> SRR1700204 2 0.2762 8.29e-01 0.000 0.880 0.012 0.004 0.056 0.048
#> SRR1700206 2 0.5770 6.44e-01 0.012 0.680 0.024 0.156 0.036 0.092
#> SRR1700207 2 0.0972 8.39e-01 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1700208 1 0.7816 -9.34e-02 0.384 0.052 0.308 0.068 0.004 0.184
#> SRR1700205 2 0.3927 7.87e-01 0.000 0.800 0.020 0.004 0.072 0.104
#> SRR1700209 2 0.1321 8.40e-01 0.000 0.952 0.004 0.000 0.024 0.020
#> SRR1700210 2 0.2527 8.21e-01 0.000 0.892 0.008 0.004 0.040 0.056
#> SRR1700211 2 0.1167 8.40e-01 0.000 0.960 0.008 0.000 0.012 0.020
#> SRR1700212 2 0.2519 8.30e-01 0.000 0.888 0.020 0.000 0.020 0.072
#> SRR1700213 2 0.4982 7.03e-01 0.000 0.724 0.064 0.004 0.072 0.136
#> SRR1700214 2 0.1908 8.43e-01 0.000 0.924 0.012 0.000 0.044 0.020
#> SRR1700215 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.2118 8.40e-01 0.000 0.916 0.012 0.004 0.020 0.048
#> SRR1700216 1 0.0000 7.99e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3822 7.69e-01 0.000 0.812 0.032 0.024 0.016 0.116
#> SRR1700219 2 0.0806 8.40e-01 0.000 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1700222 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700220 2 0.1138 8.40e-01 0.000 0.960 0.012 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700221 2 0.1149 8.39e-01 0.000 0.960 0.008 0.000 0.008 0.024
#> SRR1700223 2 0.1633 8.39e-01 0.000 0.932 0.000 0.000 0.044 0.024
#> SRR1700224 5 0.5709 3.21e-02 0.000 0.412 0.000 0.020 0.472 0.096
#> SRR1700226 2 0.1426 8.43e-01 0.000 0.948 0.008 0.000 0.028 0.016
#> SRR1700229 2 0.5523 5.82e-01 0.000 0.608 0.008 0.012 0.112 0.260
#> SRR1700225 2 0.7258 8.10e-02 0.000 0.416 0.148 0.032 0.064 0.340
#> SRR1700227 2 0.0984 8.39e-01 0.000 0.968 0.008 0.000 0.012 0.012
#> SRR1700230 1 0.1088 7.94e-01 0.960 0.000 0.016 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700231 2 0.0820 8.37e-01 0.000 0.972 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700228 2 0.5129 7.51e-01 0.000 0.728 0.064 0.016 0.116 0.076
#> SRR1700232 2 0.0862 8.40e-01 0.000 0.972 0.008 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700233 2 0.1053 8.38e-01 0.000 0.964 0.012 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700234 2 0.1700 8.42e-01 0.000 0.936 0.012 0.000 0.024 0.028
#> SRR1700235 2 0.3717 7.55e-01 0.000 0.824 0.040 0.036 0.008 0.092
#> SRR1700237 2 0.2574 8.30e-01 0.000 0.884 0.008 0.004 0.024 0.080
#> SRR1700236 2 0.2918 8.31e-01 0.000 0.872 0.016 0.004 0.052 0.056
#> SRR1700238 2 0.0870 8.38e-01 0.000 0.972 0.004 0.000 0.012 0.012
#> SRR1700239 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700241 4 0.4471 6.17e-01 0.000 0.004 0.128 0.740 0.008 0.120
#> SRR1700243 2 0.1864 8.40e-01 0.000 0.924 0.004 0.000 0.032 0.040
#> SRR1700244 2 0.1820 8.40e-01 0.000 0.928 0.012 0.000 0.016 0.044
#> SRR1700242 2 0.6051 6.62e-01 0.016 0.684 0.044 0.080 0.060 0.116
#> SRR1700246 2 0.4610 7.20e-01 0.000 0.724 0.008 0.004 0.112 0.152
#> SRR1700245 2 0.0520 8.40e-01 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700247 1 0.0713 7.88e-01 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700249 1 0.0260 7.99e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700250 2 0.1059 8.41e-01 0.000 0.964 0.004 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700248 2 0.1265 8.39e-01 0.000 0.948 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700251 2 0.1059 8.40e-01 0.000 0.964 0.004 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700252 3 0.6629 4.38e-01 0.008 0.120 0.588 0.080 0.016 0.188
#> SRR1700253 2 0.1320 8.41e-01 0.000 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1700256 2 0.3666 8.12e-01 0.000 0.824 0.060 0.000 0.068 0.048
#> SRR1700254 1 0.0858 7.86e-01 0.968 0.000 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700255 2 0.1232 8.41e-01 0.000 0.956 0.004 0.000 0.024 0.016
#> SRR1700257 2 0.0976 8.38e-01 0.000 0.968 0.008 0.000 0.016 0.008
#> SRR1700258 2 0.3969 7.39e-01 0.000 0.740 0.000 0.004 0.212 0.044
#> SRR1700259 2 0.1563 8.37e-01 0.000 0.932 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1700260 5 0.4741 5.51e-01 0.000 0.232 0.008 0.008 0.688 0.064
#> SRR1700261 5 0.1838 7.35e-01 0.000 0.068 0.000 0.000 0.916 0.016
#> SRR1700262 5 0.2683 7.29e-01 0.000 0.104 0.004 0.004 0.868 0.020
#> SRR1700263 2 0.6888 1.78e-01 0.000 0.408 0.012 0.032 0.240 0.308
#> SRR1700264 2 0.2573 8.35e-01 0.000 0.884 0.008 0.000 0.064 0.044
#> SRR1700265 2 0.7609 -2.35e-01 0.000 0.320 0.300 0.032 0.060 0.288
#> SRR1700266 2 0.4361 7.00e-01 0.000 0.700 0.004 0.000 0.236 0.060
#> SRR1700268 3 0.7349 4.06e-01 0.008 0.048 0.516 0.172 0.060 0.196
#> SRR1700270 2 0.1679 8.44e-01 0.000 0.936 0.008 0.000 0.028 0.028
#> SRR1700267 2 0.1757 8.36e-01 0.000 0.916 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1700271 2 0.1074 8.39e-01 0.000 0.960 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1700272 2 0.4452 6.36e-01 0.000 0.664 0.000 0.008 0.288 0.040
#> SRR1700273 2 0.3266 8.16e-01 0.000 0.840 0.016 0.004 0.032 0.108
#> SRR1700274 5 0.3428 7.42e-01 0.000 0.052 0.008 0.008 0.832 0.100
#> SRR1700277 3 0.5176 4.27e-01 0.252 0.000 0.648 0.044 0.000 0.056
#> SRR1700275 5 0.4792 5.64e-01 0.000 0.320 0.008 0.012 0.628 0.032
#> SRR1700276 5 0.4300 2.22e-01 0.000 0.456 0.004 0.000 0.528 0.012
#> SRR1700278 5 0.6380 6.19e-01 0.000 0.152 0.080 0.076 0.632 0.060
#> SRR1700279 5 0.2744 7.36e-01 0.000 0.072 0.000 0.000 0.864 0.064
#> SRR1700280 5 0.3725 7.00e-01 0.000 0.172 0.004 0.000 0.776 0.048
#> SRR1700281 2 0.3977 7.89e-01 0.000 0.792 0.020 0.004 0.124 0.060
#> SRR1700283 5 0.3555 7.22e-01 0.000 0.040 0.004 0.008 0.808 0.140
#> SRR1700282 4 0.7592 3.51e-02 0.012 0.000 0.256 0.396 0.204 0.132
#> SRR1700284 5 0.3162 7.29e-01 0.000 0.080 0.000 0.008 0.844 0.068
#> SRR1700285 5 0.5353 6.87e-01 0.000 0.096 0.072 0.028 0.720 0.084
#> SRR1700286 5 0.5552 6.14e-01 0.000 0.212 0.016 0.012 0.636 0.124
#> SRR1700287 5 0.2960 7.39e-01 0.000 0.056 0.008 0.008 0.868 0.060
#> SRR1700290 3 0.6021 -1.48e-01 0.424 0.000 0.440 0.096 0.000 0.040
#> SRR1700289 5 0.3809 7.05e-01 0.000 0.020 0.000 0.016 0.756 0.208
#> SRR1700288 2 0.3892 6.97e-01 0.000 0.744 0.004 0.004 0.220 0.028
#> SRR1700292 5 0.4207 7.09e-01 0.000 0.064 0.008 0.004 0.752 0.172
#> SRR1700291 5 0.6943 3.00e-01 0.000 0.000 0.204 0.216 0.476 0.104
#> SRR1700293 5 0.7988 3.28e-01 0.000 0.128 0.104 0.184 0.456 0.128
#> SRR1700294 5 0.3844 7.23e-01 0.000 0.092 0.004 0.004 0.792 0.108
#> SRR1700295 5 0.5978 3.51e-01 0.000 0.000 0.064 0.324 0.536 0.076
#> SRR1700297 5 0.3252 7.29e-01 0.000 0.020 0.004 0.020 0.836 0.120
#> SRR1700296 5 0.1984 7.34e-01 0.000 0.056 0.000 0.000 0.912 0.032
#> SRR1700298 5 0.6043 3.26e-01 0.000 0.008 0.032 0.368 0.500 0.092
#> SRR1700299 6 0.5615 3.79e-01 0.000 0.004 0.012 0.160 0.220 0.604
#> SRR1700300 5 0.6364 2.98e-01 0.004 0.000 0.076 0.076 0.448 0.396
#> SRR1700302 5 0.2291 7.35e-01 0.000 0.044 0.000 0.012 0.904 0.040
#> SRR1700301 5 0.1471 7.33e-01 0.000 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1700303 5 0.2737 7.28e-01 0.000 0.084 0.004 0.000 0.868 0.044
#> SRR1700304 5 0.3976 6.79e-01 0.000 0.196 0.004 0.000 0.748 0.052
#> SRR1700305 5 0.3867 7.23e-01 0.000 0.072 0.004 0.032 0.812 0.080
#> SRR1700306 5 0.6190 4.88e-01 0.000 0.000 0.096 0.072 0.536 0.296
#> SRR1700308 5 0.5662 2.89e-01 0.000 0.000 0.120 0.008 0.468 0.404
#> SRR1700307 3 0.5007 5.34e-01 0.000 0.000 0.652 0.212 0.004 0.132
#> SRR1700309 6 0.6006 3.97e-01 0.188 0.000 0.104 0.084 0.004 0.620
#> SRR1700310 5 0.2333 7.32e-01 0.000 0.092 0.000 0.000 0.884 0.024
#> SRR1700311 5 0.6250 5.21e-01 0.000 0.012 0.040 0.128 0.560 0.260
#> SRR1700312 5 0.5495 5.94e-01 0.000 0.008 0.044 0.180 0.668 0.100
#> SRR1700313 3 0.7567 5.42e-02 0.000 0.004 0.360 0.288 0.188 0.160
#> SRR1700314 4 0.7418 -6.95e-02 0.000 0.000 0.208 0.360 0.140 0.292
#> SRR1700315 5 0.6000 3.95e-01 0.000 0.000 0.176 0.016 0.512 0.296
#> SRR1700316 6 0.7890 8.98e-02 0.000 0.020 0.260 0.224 0.148 0.348
#> SRR1700317 5 0.2173 7.38e-01 0.000 0.064 0.000 0.004 0.904 0.028
#> SRR1700318 5 0.2954 7.41e-01 0.000 0.032 0.020 0.008 0.872 0.068
#> SRR1700319 4 0.6773 2.77e-01 0.008 0.000 0.188 0.512 0.224 0.068
#> SRR1700320 5 0.2077 7.35e-01 0.000 0.044 0.004 0.004 0.916 0.032
#> SRR1700322 5 0.5455 5.25e-01 0.000 0.004 0.004 0.124 0.580 0.288
#> SRR1700321 5 0.2320 7.31e-01 0.000 0.080 0.000 0.004 0.892 0.024
#> SRR1700323 5 0.6529 2.68e-01 0.000 0.000 0.284 0.188 0.480 0.048
#> SRR1700324 5 0.3589 7.09e-01 0.000 0.148 0.000 0.012 0.800 0.040
#> SRR1700325 5 0.6071 6.05e-01 0.000 0.060 0.044 0.180 0.644 0.072
#> SRR1700326 5 0.7385 -8.11e-02 0.000 0.000 0.136 0.208 0.372 0.284
#> SRR1700327 5 0.4073 7.09e-01 0.000 0.128 0.000 0.012 0.772 0.088
#> SRR1700329 5 0.3716 6.77e-01 0.000 0.000 0.008 0.012 0.732 0.248
#> SRR1700328 6 0.6038 4.78e-01 0.052 0.004 0.136 0.048 0.092 0.668
#> SRR1700330 4 0.7044 7.51e-02 0.000 0.004 0.324 0.428 0.108 0.136
#> SRR1700331 5 0.4109 6.45e-01 0.000 0.004 0.016 0.004 0.676 0.300
#> SRR1700332 5 0.3346 7.16e-01 0.000 0.012 0.004 0.080 0.840 0.064
#> SRR1700333 5 0.4572 7.29e-01 0.000 0.080 0.044 0.008 0.764 0.104
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.813 0.908 0.959 0.5010 0.499 0.499
#> 3 3 0.424 0.595 0.766 0.2956 0.838 0.686
#> 4 4 0.413 0.472 0.695 0.1307 0.854 0.635
#> 5 5 0.416 0.361 0.610 0.0688 0.945 0.814
#> 6 6 0.428 0.258 0.533 0.0432 0.937 0.774
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699881 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.1184 0.9480 0.016 0.984
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699892 1 0.9996 0.0293 0.512 0.488
#> SRR1699893 1 0.9170 0.5361 0.668 0.332
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699896 1 0.8763 0.6050 0.704 0.296
#> SRR1699897 2 0.0376 0.9553 0.004 0.996
#> SRR1699898 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699900 1 0.2603 0.9286 0.956 0.044
#> SRR1699899 2 0.0672 0.9529 0.008 0.992
#> SRR1699902 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699901 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0938 0.9504 0.012 0.988
#> SRR1699910 1 0.3274 0.9163 0.940 0.060
#> SRR1699911 2 0.0938 0.9504 0.012 0.988
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699914 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699915 2 0.8955 0.5467 0.312 0.688
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.1184 0.9476 0.016 0.984
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699920 1 0.6531 0.8051 0.832 0.168
#> SRR1699921 2 0.1414 0.9455 0.020 0.980
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699923 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699924 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699926 1 0.5842 0.8367 0.860 0.140
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.9998 0.0231 0.492 0.508
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.9944 0.1843 0.456 0.544
#> SRR1699933 1 0.1633 0.9431 0.976 0.024
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.3431 0.9099 0.064 0.936
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.9608 0.4052 0.384 0.616
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699940 1 0.1184 0.9480 0.984 0.016
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699941 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.2603 0.9278 0.044 0.956
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.3431 0.9109 0.064 0.936
#> SRR1699947 2 0.5737 0.8392 0.136 0.864
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.1414 0.9454 0.020 0.980
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699954 1 0.7219 0.7554 0.800 0.200
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699959 1 0.0938 0.9505 0.988 0.012
#> SRR1699958 2 0.2603 0.9278 0.044 0.956
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699961 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.5059 0.8658 0.112 0.888
#> SRR1699964 2 0.6048 0.8262 0.148 0.852
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699966 1 0.4939 0.8733 0.892 0.108
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699969 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699971 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699972 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699973 2 0.4431 0.8859 0.092 0.908
#> SRR1699974 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699975 2 0.6801 0.7859 0.180 0.820
#> SRR1699976 1 0.4939 0.8730 0.892 0.108
#> SRR1699977 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699978 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699979 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699981 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699987 1 0.1184 0.9481 0.984 0.016
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1699990 1 0.0672 0.9528 0.992 0.008
#> SRR1699992 1 0.4431 0.8879 0.908 0.092
#> SRR1699991 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699993 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699994 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.4690 0.8763 0.100 0.900
#> SRR1699997 1 0.6712 0.7961 0.824 0.176
#> SRR1699998 2 0.6247 0.8160 0.156 0.844
#> SRR1699999 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.6438 0.8085 0.836 0.164
#> SRR1700002 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700001 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700003 1 0.8661 0.6121 0.712 0.288
#> SRR1700004 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700013 1 0.2948 0.9234 0.948 0.052
#> SRR1700012 2 0.9775 0.3312 0.412 0.588
#> SRR1700014 1 0.0672 0.9528 0.992 0.008
#> SRR1700015 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700017 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700023 1 0.0938 0.9505 0.988 0.012
#> SRR1700022 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700025 1 0.2043 0.9371 0.968 0.032
#> SRR1700026 1 0.1184 0.9482 0.984 0.016
#> SRR1700027 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700028 2 0.9922 0.2026 0.448 0.552
#> SRR1700029 1 0.4022 0.8992 0.920 0.080
#> SRR1700030 2 0.1633 0.9425 0.024 0.976
#> SRR1700031 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700032 2 0.1184 0.9481 0.016 0.984
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700036 2 0.2236 0.9331 0.036 0.964
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700038 1 0.3431 0.9135 0.936 0.064
#> SRR1700039 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1700042 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700043 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700044 2 0.9358 0.4591 0.352 0.648
#> SRR1700046 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700047 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700048 1 0.3879 0.9030 0.924 0.076
#> SRR1700049 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.2043 0.9375 0.968 0.032
#> SRR1700054 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700059 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1700060 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700061 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700062 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700063 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700064 1 0.6343 0.8157 0.840 0.160
#> SRR1700065 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700066 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700068 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700069 2 0.8144 0.6681 0.252 0.748
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700071 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700072 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700073 2 0.2603 0.9275 0.044 0.956
#> SRR1700075 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700074 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700076 1 0.2043 0.9379 0.968 0.032
#> SRR1700077 1 0.2948 0.9225 0.948 0.052
#> SRR1700078 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700080 1 0.3584 0.9105 0.932 0.068
#> SRR1700079 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700081 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700082 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700083 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700084 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.9522 0.4054 0.372 0.628
#> SRR1700087 1 0.0672 0.9528 0.992 0.008
#> SRR1700088 1 0.3879 0.9039 0.924 0.076
#> SRR1700089 1 0.4022 0.8979 0.920 0.080
#> SRR1700091 2 0.7299 0.7451 0.204 0.796
#> SRR1700090 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700092 2 0.4690 0.8748 0.100 0.900
#> SRR1700094 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1700093 1 0.4939 0.8720 0.892 0.108
#> SRR1700095 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700096 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700097 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700098 2 0.1414 0.9451 0.020 0.980
#> SRR1700099 2 0.6048 0.8262 0.148 0.852
#> SRR1700100 1 0.0938 0.9504 0.988 0.012
#> SRR1700101 1 0.9170 0.5278 0.668 0.332
#> SRR1700102 2 0.6531 0.7988 0.168 0.832
#> SRR1700104 1 0.0672 0.9529 0.992 0.008
#> SRR1700103 1 0.0376 0.9548 0.996 0.004
#> SRR1700105 1 0.9944 0.1900 0.544 0.456
#> SRR1700106 1 0.9909 0.2354 0.556 0.444
#> SRR1700107 2 0.7528 0.7367 0.216 0.784
#> SRR1700108 2 0.0376 0.9552 0.004 0.996
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700111 1 0.1414 0.9455 0.980 0.020
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700114 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700115 2 0.3879 0.8994 0.076 0.924
#> SRR1700116 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700117 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700119 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700118 1 0.0672 0.9527 0.992 0.008
#> SRR1700120 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700121 1 0.9732 0.3489 0.596 0.404
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700123 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700127 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700124 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700128 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.7815 0.7121 0.232 0.768
#> SRR1700130 2 0.7139 0.7660 0.196 0.804
#> SRR1700132 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700131 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700133 1 0.0376 0.9549 0.996 0.004
#> SRR1700134 2 0.0376 0.9552 0.004 0.996
#> SRR1700135 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700136 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700137 1 0.8661 0.6221 0.712 0.288
#> SRR1700138 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700140 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700139 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700144 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700145 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700147 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700150 1 0.9710 0.3473 0.600 0.400
#> SRR1700152 1 0.1414 0.9456 0.980 0.020
#> SRR1700151 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700153 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700154 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700155 1 0.5519 0.8518 0.872 0.128
#> SRR1700156 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700157 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700161 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700166 1 0.1843 0.9403 0.972 0.028
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700169 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700171 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700172 1 0.5629 0.8472 0.868 0.132
#> SRR1700174 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700173 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700175 1 0.9393 0.4521 0.644 0.356
#> SRR1700176 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700177 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0672 0.9528 0.008 0.992
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.7453 0.7340 0.788 0.212
#> SRR1700190 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.6531 0.8025 0.168 0.832
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0376 0.9553 0.004 0.996
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1843 0.9399 0.028 0.972
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.3584 0.9078 0.068 0.932
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.1843 0.9398 0.028 0.972
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.2423 0.9313 0.040 0.960
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700241 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700242 2 0.9286 0.4908 0.344 0.656
#> SRR1700246 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700252 1 0.6048 0.8235 0.852 0.148
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.7139 0.7651 0.196 0.804
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700268 1 0.3733 0.9057 0.928 0.072
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.4815 0.8741 0.104 0.896
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700282 1 0.5842 0.8358 0.860 0.140
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.2778 0.9246 0.048 0.952
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.8763 0.5955 0.296 0.704
#> SRR1700293 2 0.3431 0.9118 0.064 0.936
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700295 1 0.9000 0.5694 0.684 0.316
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.9209 0.5190 0.336 0.664
#> SRR1700299 1 0.8267 0.6655 0.740 0.260
#> SRR1700300 2 0.9866 0.2721 0.432 0.568
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700306 1 0.6148 0.8254 0.848 0.152
#> SRR1700308 2 0.2423 0.9311 0.040 0.960
#> SRR1700307 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700309 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.9970 0.1282 0.468 0.532
#> SRR1700312 2 0.5519 0.8483 0.128 0.872
#> SRR1700313 1 0.2603 0.9279 0.956 0.044
#> SRR1700314 1 0.1414 0.9456 0.980 0.020
#> SRR1700315 1 0.8763 0.5918 0.704 0.296
#> SRR1700316 1 0.7883 0.7108 0.764 0.236
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700319 1 0.0000 0.9568 1.000 0.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.6148 0.8213 0.152 0.848
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.9358 0.4823 0.352 0.648
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.3431 0.9119 0.064 0.936
#> SRR1700326 1 0.9522 0.4342 0.628 0.372
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700328 1 0.5178 0.8607 0.884 0.116
#> SRR1700330 1 0.0376 0.9549 0.996 0.004
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.4121 0.68305 0.168 0.832 0.000
#> SRR1699875 2 0.3816 0.69128 0.148 0.852 0.000
#> SRR1699876 2 0.5431 0.60714 0.284 0.716 0.000
#> SRR1699877 2 0.5443 0.60872 0.260 0.736 0.004
#> SRR1699879 2 0.2796 0.73767 0.092 0.908 0.000
#> SRR1699878 2 0.5291 0.57944 0.268 0.732 0.000
#> SRR1699880 3 0.0592 0.82845 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699881 3 0.0661 0.82937 0.008 0.004 0.988
#> SRR1699882 2 0.2959 0.73675 0.100 0.900 0.000
#> SRR1699883 2 0.5733 0.50150 0.324 0.676 0.000
#> SRR1699884 2 0.1964 0.74167 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699885 2 0.1031 0.73921 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699886 2 0.5785 0.54466 0.332 0.668 0.000
#> SRR1699888 2 0.2711 0.73153 0.088 0.912 0.000
#> SRR1699889 1 0.6598 0.07463 0.564 0.428 0.008
#> SRR1699890 2 0.5529 0.58704 0.296 0.704 0.000
#> SRR1699887 2 0.3267 0.72078 0.116 0.884 0.000
#> SRR1699891 2 0.6215 0.35384 0.428 0.572 0.000
#> SRR1699892 1 0.9901 0.41362 0.392 0.336 0.272
#> SRR1699893 1 0.7454 0.45235 0.668 0.080 0.252
#> SRR1699894 2 0.6225 0.35725 0.432 0.568 0.000
#> SRR1699895 2 0.6260 0.31484 0.448 0.552 0.000
#> SRR1699896 3 0.9517 -0.06809 0.280 0.232 0.488
#> SRR1699897 2 0.5178 0.69491 0.164 0.808 0.028
#> SRR1699898 3 0.1529 0.83470 0.040 0.000 0.960
#> SRR1699900 3 0.7030 0.36724 0.396 0.024 0.580
#> SRR1699899 1 0.6509 -0.09059 0.524 0.472 0.004
#> SRR1699902 3 0.2959 0.82640 0.100 0.000 0.900
#> SRR1699901 3 0.1529 0.83174 0.040 0.000 0.960
#> SRR1699903 1 0.5882 0.22595 0.652 0.348 0.000
#> SRR1699904 2 0.6079 0.42658 0.388 0.612 0.000
#> SRR1699905 3 0.4555 0.77324 0.200 0.000 0.800
#> SRR1699906 2 0.6215 0.37296 0.428 0.572 0.000
#> SRR1699907 1 0.5988 0.19172 0.632 0.368 0.000
#> SRR1699908 2 0.6260 0.29451 0.448 0.552 0.000
#> SRR1699909 1 0.6632 0.22311 0.596 0.392 0.012
#> SRR1699910 3 0.7069 0.14420 0.472 0.020 0.508
#> SRR1699911 1 0.6625 0.32398 0.660 0.316 0.024
#> SRR1699912 1 0.5926 0.20778 0.644 0.356 0.000
#> SRR1699913 1 0.6308 -0.17514 0.508 0.492 0.000
#> SRR1699914 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699915 1 0.7113 0.50737 0.720 0.168 0.112
#> SRR1699916 2 0.6045 0.44379 0.380 0.620 0.000
#> SRR1699917 1 0.6079 0.21489 0.612 0.388 0.000
#> SRR1699918 1 0.6865 0.24958 0.596 0.384 0.020
#> SRR1699919 2 0.6286 0.25138 0.464 0.536 0.000
#> SRR1699920 1 0.8731 0.37853 0.516 0.116 0.368
#> SRR1699921 1 0.6252 0.02884 0.556 0.444 0.000
#> SRR1699922 2 0.6235 0.34158 0.436 0.564 0.000
#> SRR1699923 3 0.4452 0.76699 0.192 0.000 0.808
#> SRR1699924 3 0.3116 0.83335 0.108 0.000 0.892
#> SRR1699925 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699926 1 0.7246 0.48090 0.648 0.052 0.300
#> SRR1699927 2 0.6204 0.36064 0.424 0.576 0.000
#> SRR1699929 1 0.9559 0.47016 0.472 0.220 0.308
#> SRR1699928 2 0.6286 0.27170 0.464 0.536 0.000
#> SRR1699930 2 0.6309 0.19340 0.496 0.504 0.000
#> SRR1699931 1 0.9880 0.42704 0.404 0.324 0.272
#> SRR1699933 3 0.6677 0.47867 0.324 0.024 0.652
#> SRR1699932 2 0.5529 0.55351 0.296 0.704 0.000
#> SRR1699934 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699935 1 0.8203 0.14932 0.484 0.444 0.072
#> SRR1699936 2 0.1643 0.74216 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699937 2 0.6475 0.23377 0.028 0.692 0.280
#> SRR1699938 2 0.0237 0.73422 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699940 3 0.8091 0.41202 0.320 0.088 0.592
#> SRR1699939 2 0.0892 0.73870 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699941 3 0.1411 0.82886 0.036 0.000 0.964
#> SRR1699942 2 0.6737 0.29439 0.384 0.600 0.016
#> SRR1699943 2 0.0747 0.73533 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699944 2 0.2625 0.73540 0.084 0.916 0.000
#> SRR1699945 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.4423 0.66515 0.088 0.864 0.048
#> SRR1699947 2 0.7391 0.43811 0.196 0.696 0.108
#> SRR1699948 2 0.0424 0.73526 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699949 2 0.2261 0.74184 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699950 2 0.0892 0.73840 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699951 2 0.2261 0.73624 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699952 2 0.5726 0.58567 0.216 0.760 0.024
#> SRR1699953 2 0.1529 0.73897 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699954 3 0.7742 0.18025 0.060 0.356 0.584
#> SRR1699955 2 0.0747 0.73753 0.016 0.984 0.000
#> SRR1699956 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.3551 0.72844 0.132 0.868 0.000
#> SRR1699959 3 0.4921 0.79154 0.164 0.020 0.816
#> SRR1699958 1 0.7013 0.20205 0.548 0.432 0.020
#> SRR1699960 2 0.2261 0.74195 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699961 3 0.2339 0.83372 0.048 0.012 0.940
#> SRR1699962 2 0.0592 0.73820 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699963 2 0.8179 0.16120 0.352 0.564 0.084
#> SRR1699964 2 0.8837 -0.11538 0.424 0.460 0.116
#> SRR1699965 2 0.0892 0.73941 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699966 3 0.9615 0.08360 0.324 0.220 0.456
#> SRR1699967 2 0.1289 0.73998 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699968 2 0.5580 0.62807 0.256 0.736 0.008
#> SRR1699969 3 0.0424 0.83009 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699971 3 0.2772 0.82524 0.080 0.004 0.916
#> SRR1699970 2 0.2625 0.72380 0.084 0.916 0.000
#> SRR1699972 3 0.3879 0.79894 0.152 0.000 0.848
#> SRR1699973 1 0.7699 0.22550 0.532 0.420 0.048
#> SRR1699974 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699975 1 0.6062 0.50293 0.776 0.160 0.064
#> SRR1699976 3 0.7624 0.48718 0.104 0.224 0.672
#> SRR1699977 3 0.5690 0.68077 0.288 0.004 0.708
#> SRR1699978 3 0.0592 0.83142 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699979 3 0.4453 0.81918 0.152 0.012 0.836
#> SRR1699980 1 0.6140 0.13348 0.596 0.404 0.000
#> SRR1699981 3 0.4702 0.78231 0.212 0.000 0.788
#> SRR1699982 1 0.6295 -0.11137 0.528 0.472 0.000
#> SRR1699983 1 0.6252 -0.00632 0.556 0.444 0.000
#> SRR1699984 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699985 2 0.5948 0.51242 0.360 0.640 0.000
#> SRR1699986 3 0.0424 0.83002 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699988 2 0.6095 0.40380 0.392 0.608 0.000
#> SRR1699987 3 0.5881 0.74470 0.256 0.016 0.728
#> SRR1699989 1 0.6421 0.10606 0.572 0.424 0.004
#> SRR1699990 3 0.4755 0.79073 0.184 0.008 0.808
#> SRR1699992 3 0.5371 0.72962 0.048 0.140 0.812
#> SRR1699991 3 0.2261 0.83533 0.068 0.000 0.932
#> SRR1699993 3 0.1860 0.83652 0.052 0.000 0.948
#> SRR1699994 3 0.0747 0.82941 0.016 0.000 0.984
#> SRR1699995 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699996 2 0.8906 -0.00569 0.344 0.520 0.136
#> SRR1699997 1 0.8394 0.22058 0.576 0.108 0.316
#> SRR1699998 2 0.8633 -0.09489 0.436 0.464 0.100
#> SRR1699999 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700000 1 0.9185 0.18213 0.444 0.148 0.408
#> SRR1700002 3 0.5334 0.79525 0.120 0.060 0.820
#> SRR1700001 3 0.1163 0.83353 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700003 1 0.8404 0.35343 0.592 0.120 0.288
#> SRR1700004 3 0.1031 0.83025 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700005 3 0.0237 0.82890 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700006 3 0.3192 0.83383 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700007 2 0.5560 0.57471 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700008 3 0.4291 0.80730 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700009 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700010 3 0.0237 0.82852 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700011 2 0.3619 0.72102 0.136 0.864 0.000
#> SRR1700013 3 0.6792 0.70413 0.124 0.132 0.744
#> SRR1700012 1 0.9380 0.47168 0.512 0.232 0.256
#> SRR1700014 3 0.4551 0.81281 0.140 0.020 0.840
#> SRR1700015 3 0.3987 0.76599 0.020 0.108 0.872
#> SRR1700016 3 0.1643 0.82383 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700018 3 0.6191 0.76350 0.140 0.084 0.776
#> SRR1700017 3 0.1643 0.83450 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700019 2 0.4654 0.67216 0.208 0.792 0.000
#> SRR1700020 3 0.1643 0.83405 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700021 2 0.6235 0.32512 0.436 0.564 0.000
#> SRR1700023 3 0.4748 0.80174 0.144 0.024 0.832
#> SRR1700022 3 0.0592 0.83175 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700024 1 0.6483 0.20956 0.600 0.392 0.008
#> SRR1700025 3 0.6585 0.59482 0.064 0.200 0.736
#> SRR1700026 3 0.4779 0.80082 0.124 0.036 0.840
#> SRR1700027 3 0.4179 0.80095 0.072 0.052 0.876
#> SRR1700028 1 0.8527 0.52534 0.612 0.192 0.196
#> SRR1700029 3 0.5506 0.77554 0.220 0.016 0.764
#> SRR1700030 1 0.6507 0.40079 0.688 0.284 0.028
#> SRR1700031 3 0.0237 0.82912 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700032 2 0.4591 0.70742 0.120 0.848 0.032
#> SRR1700034 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700035 1 0.6724 0.10104 0.568 0.420 0.012
#> SRR1700033 3 0.1411 0.82917 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700036 2 0.8619 0.06429 0.368 0.524 0.108
#> SRR1700037 2 0.6154 0.38880 0.408 0.592 0.000
#> SRR1700038 3 0.6400 0.65895 0.208 0.052 0.740
#> SRR1700039 3 0.0892 0.83284 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700040 3 0.0424 0.83030 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700041 3 0.5020 0.79869 0.192 0.012 0.796
#> SRR1700042 3 0.1289 0.83351 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700043 3 0.1964 0.83570 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700045 3 0.2796 0.83619 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700044 1 0.9645 0.34408 0.412 0.380 0.208
#> SRR1700046 3 0.3038 0.83270 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700047 3 0.0592 0.82976 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700048 3 0.6839 0.53866 0.352 0.024 0.624
#> SRR1700049 3 0.0237 0.82953 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700050 3 0.1964 0.82325 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700051 3 0.0237 0.82943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700052 3 0.1289 0.82968 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700053 3 0.5831 0.68681 0.284 0.008 0.708
#> SRR1700054 3 0.3267 0.83149 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700055 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700056 3 0.2878 0.83236 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700057 3 0.4605 0.79193 0.204 0.000 0.796
#> SRR1700058 3 0.0424 0.82856 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700059 3 0.5929 0.70044 0.320 0.004 0.676
#> SRR1700060 3 0.0237 0.82903 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700061 3 0.2066 0.83631 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700062 3 0.0892 0.83220 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700063 3 0.1964 0.83585 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700064 3 0.7835 0.01757 0.456 0.052 0.492
#> SRR1700065 3 0.3192 0.80301 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700066 3 0.0892 0.82884 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700067 1 0.5760 0.32433 0.672 0.328 0.000
#> SRR1700068 3 0.2796 0.83280 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700069 1 0.9111 0.43879 0.532 0.292 0.176
#> SRR1700070 2 0.4452 0.70299 0.192 0.808 0.000
#> SRR1700071 3 0.3482 0.82593 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700072 3 0.4346 0.75669 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700073 1 0.5536 0.42176 0.752 0.236 0.012
#> SRR1700075 3 0.4733 0.76372 0.196 0.004 0.800
#> SRR1700074 3 0.1860 0.83217 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700076 3 0.4569 0.79035 0.072 0.068 0.860
#> SRR1700077 3 0.4931 0.79128 0.140 0.032 0.828
#> SRR1700078 3 0.3752 0.81145 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700080 3 0.7259 0.58096 0.248 0.072 0.680
#> SRR1700079 3 0.4062 0.81736 0.164 0.000 0.836
#> SRR1700081 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700082 3 0.3116 0.82372 0.108 0.000 0.892
#> SRR1700083 3 0.1411 0.83353 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700084 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700085 2 0.5706 0.56717 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700086 1 0.8095 0.52049 0.648 0.200 0.152
#> SRR1700087 1 0.6816 -0.31496 0.516 0.012 0.472
#> SRR1700088 3 0.9006 0.32483 0.256 0.188 0.556
#> SRR1700089 3 0.9030 0.25510 0.368 0.140 0.492
#> SRR1700091 2 0.7331 0.28532 0.256 0.672 0.072
#> SRR1700090 3 0.5968 0.64109 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700092 2 0.7076 0.40295 0.256 0.684 0.060
#> SRR1700094 3 0.6318 0.75767 0.172 0.068 0.760
#> SRR1700093 3 0.7760 0.55179 0.360 0.060 0.580
#> SRR1700095 3 0.4504 0.78809 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700096 3 0.3752 0.81387 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700097 3 0.3192 0.82857 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700098 2 0.4629 0.54409 0.188 0.808 0.004
#> SRR1700099 2 0.7940 -0.03772 0.416 0.524 0.060
#> SRR1700100 3 0.8009 0.44100 0.412 0.064 0.524
#> SRR1700101 2 0.9982 -0.36227 0.332 0.360 0.308
#> SRR1700102 2 0.8157 -0.08546 0.412 0.516 0.072
#> SRR1700104 3 0.7140 0.64038 0.328 0.040 0.632
#> SRR1700103 3 0.5024 0.78456 0.220 0.004 0.776
#> SRR1700105 1 0.9929 0.33290 0.392 0.296 0.312
#> SRR1700106 1 0.7412 0.54303 0.696 0.112 0.192
#> SRR1700107 1 0.8465 0.33642 0.528 0.376 0.096
#> SRR1700108 2 0.5588 0.46235 0.276 0.720 0.004
#> SRR1700109 2 0.4121 0.70523 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700110 2 0.4002 0.70588 0.160 0.840 0.000
#> SRR1700112 2 0.5216 0.58679 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700111 1 0.6215 -0.08683 0.572 0.000 0.428
#> SRR1700113 2 0.5835 0.52311 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700114 3 0.5024 0.77254 0.220 0.004 0.776
#> SRR1700115 1 0.7188 0.09443 0.488 0.488 0.024
#> SRR1700116 3 0.6295 0.46510 0.472 0.000 0.528
#> SRR1700117 3 0.4887 0.77610 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700119 3 0.4931 0.76021 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700118 1 0.6777 0.02975 0.616 0.020 0.364
#> SRR1700120 3 0.3340 0.82388 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700121 1 0.9429 0.46675 0.504 0.232 0.264
#> SRR1700122 1 0.5178 0.40412 0.744 0.256 0.000
#> SRR1700123 3 0.5254 0.75418 0.264 0.000 0.736
#> SRR1700125 2 0.5859 0.50367 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700126 3 0.1529 0.83398 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700127 3 0.3551 0.82099 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700124 3 0.5591 0.71003 0.304 0.000 0.696
#> SRR1700128 3 0.5216 0.74957 0.260 0.000 0.740
#> SRR1700129 1 0.2383 0.51425 0.940 0.044 0.016
#> SRR1700130 1 0.3481 0.52686 0.904 0.044 0.052
#> SRR1700132 3 0.5968 0.62882 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700131 3 0.3192 0.82424 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700133 1 0.6735 -0.10293 0.564 0.012 0.424
#> SRR1700134 1 0.5591 0.37697 0.696 0.304 0.000
#> SRR1700135 3 0.5016 0.76492 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700136 3 0.3686 0.81477 0.140 0.000 0.860
#> SRR1700137 1 0.9460 0.01254 0.424 0.180 0.396
#> SRR1700138 3 0.5178 0.74531 0.256 0.000 0.744
#> SRR1700140 3 0.5968 0.64341 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700139 3 0.6286 0.48996 0.464 0.000 0.536
#> SRR1700141 1 0.5178 0.42882 0.744 0.256 0.000
#> SRR1700142 3 0.2878 0.82735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700143 3 0.5431 0.72265 0.284 0.000 0.716
#> SRR1700144 3 0.3816 0.80063 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700145 3 0.5968 0.63927 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700146 1 0.6192 0.17628 0.580 0.420 0.000
#> SRR1700147 3 0.4452 0.78973 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700149 3 0.4931 0.76780 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700148 3 0.3941 0.81354 0.156 0.000 0.844
#> SRR1700150 1 0.5791 0.54652 0.792 0.060 0.148
#> SRR1700152 3 0.6565 0.55887 0.416 0.008 0.576
#> SRR1700151 3 0.5529 0.70727 0.296 0.000 0.704
#> SRR1700153 3 0.5760 0.68155 0.328 0.000 0.672
#> SRR1700154 3 0.5621 0.70393 0.308 0.000 0.692
#> SRR1700155 1 0.7777 -0.07843 0.532 0.052 0.416
#> SRR1700156 3 0.4750 0.77321 0.216 0.000 0.784
#> SRR1700158 3 0.3482 0.81939 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700159 2 0.6140 0.38624 0.404 0.596 0.000
#> SRR1700157 3 0.4605 0.77390 0.204 0.000 0.796
#> SRR1700160 3 0.5098 0.75157 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700161 3 0.4291 0.79389 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700162 1 0.6286 0.04712 0.536 0.464 0.000
#> SRR1700164 3 0.5016 0.76271 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700163 3 0.3941 0.80676 0.156 0.000 0.844
#> SRR1700165 3 0.3879 0.80925 0.152 0.000 0.848
#> SRR1700166 3 0.6881 0.64099 0.320 0.032 0.648
#> SRR1700168 1 0.5882 0.30666 0.652 0.348 0.000
#> SRR1700167 3 0.3686 0.81928 0.140 0.000 0.860
#> SRR1700170 1 0.5926 0.05769 0.644 0.000 0.356
#> SRR1700169 3 0.4654 0.78783 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700171 3 0.5058 0.76369 0.244 0.000 0.756
#> SRR1700172 1 0.8794 -0.12782 0.448 0.112 0.440
#> SRR1700174 3 0.6129 0.67208 0.324 0.008 0.668
#> SRR1700173 3 0.7378 0.50258 0.404 0.036 0.560
#> SRR1700175 1 0.8073 0.20727 0.576 0.080 0.344
#> SRR1700176 3 0.2711 0.82884 0.088 0.000 0.912
#> SRR1700178 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.6302 0.44799 0.480 0.000 0.520
#> SRR1700180 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0237 0.73484 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700183 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.2229 0.72002 0.044 0.944 0.012
#> SRR1700187 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700185 3 0.0237 0.82852 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700188 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.6355 0.45856 0.024 0.280 0.696
#> SRR1700190 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700191 3 0.0237 0.82890 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700189 3 0.0237 0.82890 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700193 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.1643 0.73725 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700194 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700198 2 0.0237 0.73378 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700199 2 0.2261 0.73063 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700200 2 0.0424 0.73640 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.4195 0.69964 0.136 0.852 0.012
#> SRR1700203 2 0.3412 0.72330 0.124 0.876 0.000
#> SRR1700204 2 0.2959 0.73579 0.100 0.900 0.000
#> SRR1700206 2 0.6325 0.53563 0.116 0.772 0.112
#> SRR1700207 2 0.0592 0.73688 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700208 3 0.3618 0.77432 0.012 0.104 0.884
#> SRR1700205 2 0.5016 0.63724 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700209 2 0.0892 0.73886 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700210 2 0.3879 0.71136 0.152 0.848 0.000
#> SRR1700211 2 0.0747 0.73595 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700212 2 0.3340 0.71543 0.120 0.880 0.000
#> SRR1700213 2 0.2860 0.73878 0.084 0.912 0.004
#> SRR1700214 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700217 2 0.0892 0.74007 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700216 3 0.0237 0.82890 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700218 2 0.3009 0.69280 0.028 0.920 0.052
#> SRR1700219 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700220 2 0.0892 0.73916 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0747 0.73887 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700224 2 0.5016 0.66186 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700226 2 0.1860 0.74336 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700229 2 0.5431 0.59206 0.284 0.716 0.000
#> SRR1700225 2 0.6335 0.54509 0.240 0.724 0.036
#> SRR1700227 2 0.1163 0.73426 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700230 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700231 2 0.1289 0.73446 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700228 2 0.3995 0.70869 0.116 0.868 0.016
#> SRR1700232 2 0.1860 0.73731 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700233 2 0.0237 0.73454 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700234 2 0.0592 0.73711 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700235 2 0.4165 0.66142 0.076 0.876 0.048
#> SRR1700237 2 0.0892 0.73809 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700236 2 0.3116 0.72272 0.108 0.892 0.000
#> SRR1700238 2 0.0424 0.73565 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700239 3 0.0237 0.82890 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700240 3 0.1163 0.82782 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700241 3 0.4615 0.81617 0.144 0.020 0.836
#> SRR1700243 2 0.0592 0.73671 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700244 2 0.1411 0.74190 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700242 2 0.8013 0.13589 0.112 0.636 0.252
#> SRR1700246 2 0.4750 0.64873 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700245 2 0.0747 0.73727 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700247 3 0.2356 0.82104 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700249 3 0.0000 0.82872 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700250 2 0.2066 0.72809 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700248 2 0.0237 0.73390 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700251 2 0.1031 0.74004 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700252 3 0.7562 0.32041 0.064 0.308 0.628
#> SRR1700253 2 0.1031 0.74034 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700256 2 0.3038 0.73876 0.104 0.896 0.000
#> SRR1700254 3 0.1753 0.82522 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700255 2 0.0237 0.73503 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.73373 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0592 0.73755 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700259 2 0.0892 0.73879 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700260 2 0.4931 0.66764 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700261 2 0.4654 0.67045 0.208 0.792 0.000
#> SRR1700262 2 0.5178 0.61794 0.256 0.744 0.000
#> SRR1700263 2 0.6008 0.44237 0.372 0.628 0.000
#> SRR1700264 2 0.1289 0.73874 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700265 2 0.8061 0.33877 0.192 0.652 0.156
#> SRR1700266 2 0.1031 0.73924 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700268 3 0.6511 0.67409 0.104 0.136 0.760
#> SRR1700270 2 0.0892 0.73975 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700267 2 0.0892 0.73848 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700271 2 0.1289 0.74002 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700272 2 0.2796 0.73789 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700273 2 0.2796 0.72177 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700274 2 0.5905 0.52458 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700277 3 0.0892 0.83338 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700275 2 0.4399 0.67744 0.188 0.812 0.000
#> SRR1700276 2 0.3340 0.71682 0.120 0.880 0.000
#> SRR1700278 2 0.7184 0.53679 0.240 0.688 0.072
#> SRR1700279 2 0.6154 0.39846 0.408 0.592 0.000
#> SRR1700280 2 0.4796 0.66165 0.220 0.780 0.000
#> SRR1700281 2 0.2796 0.73575 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700283 2 0.6260 0.33026 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700282 3 0.8331 0.45700 0.208 0.164 0.628
#> SRR1700284 2 0.5859 0.49407 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700285 2 0.6937 0.56223 0.272 0.680 0.048
#> SRR1700286 2 0.4346 0.69952 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700287 2 0.5706 0.54463 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700290 3 0.0592 0.83133 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700289 1 0.6225 0.01321 0.568 0.432 0.000
#> SRR1700288 2 0.2878 0.73333 0.096 0.904 0.000
#> SRR1700292 2 0.6295 0.23314 0.472 0.528 0.000
#> SRR1700291 1 0.9151 0.46787 0.528 0.292 0.180
#> SRR1700293 2 0.6407 0.52673 0.272 0.700 0.028
#> SRR1700294 2 0.6252 0.30066 0.444 0.556 0.000
#> SRR1700295 1 0.8491 0.39993 0.572 0.116 0.312
#> SRR1700297 2 0.6260 0.33078 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700296 2 0.6045 0.45493 0.380 0.620 0.000
#> SRR1700298 1 0.8170 0.49549 0.624 0.256 0.120
#> SRR1700299 1 0.5514 0.55020 0.800 0.044 0.156
#> SRR1700300 1 0.6673 0.55219 0.732 0.068 0.200
#> SRR1700302 2 0.6154 0.39009 0.408 0.592 0.000
#> SRR1700301 2 0.5905 0.47311 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700303 2 0.5785 0.50489 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700304 2 0.4931 0.62429 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700305 2 0.5560 0.56359 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700306 1 0.6906 0.39453 0.644 0.032 0.324
#> SRR1700308 1 0.7181 0.37037 0.648 0.304 0.048
#> SRR1700307 3 0.3267 0.83328 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700309 3 0.5733 0.58521 0.324 0.000 0.676
#> SRR1700310 2 0.5859 0.49200 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700311 1 0.7244 0.55885 0.700 0.092 0.208
#> SRR1700312 1 0.7773 0.39395 0.612 0.316 0.072
#> SRR1700313 3 0.6847 0.63611 0.232 0.060 0.708
#> SRR1700314 3 0.6931 0.34652 0.456 0.016 0.528
#> SRR1700315 1 0.7180 0.51044 0.672 0.060 0.268
#> SRR1700316 1 0.8972 0.13471 0.460 0.128 0.412
#> SRR1700317 2 0.5678 0.54452 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700318 2 0.6111 0.40709 0.396 0.604 0.000
#> SRR1700319 3 0.5678 0.63212 0.316 0.000 0.684
#> SRR1700320 2 0.5760 0.51239 0.328 0.672 0.000
#> SRR1700322 1 0.7353 0.38704 0.632 0.316 0.052
#> SRR1700321 2 0.5706 0.52520 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700323 1 0.9787 0.41778 0.424 0.328 0.248
#> SRR1700324 2 0.5058 0.62117 0.244 0.756 0.000
#> SRR1700325 2 0.6437 0.55186 0.220 0.732 0.048
#> SRR1700326 1 0.9042 0.52809 0.544 0.176 0.280
#> SRR1700327 2 0.4235 0.69302 0.176 0.824 0.000
#> SRR1700329 1 0.5553 0.37319 0.724 0.272 0.004
#> SRR1700328 1 0.7491 0.03118 0.492 0.036 0.472
#> SRR1700330 3 0.5627 0.74880 0.188 0.032 0.780
#> SRR1700331 1 0.6299 -0.09527 0.524 0.476 0.000
#> SRR1700332 1 0.6495 0.00516 0.536 0.460 0.004
#> SRR1700333 2 0.5873 0.56396 0.312 0.684 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.4988 0.60980 0.236 0.728 0.000 0.036
#> SRR1699875 2 0.4881 0.63424 0.196 0.756 0.000 0.048
#> SRR1699876 2 0.5273 0.15930 0.456 0.536 0.000 0.008
#> SRR1699877 2 0.6701 0.36850 0.328 0.564 0.000 0.108
#> SRR1699879 2 0.3937 0.68661 0.188 0.800 0.000 0.012
#> SRR1699878 2 0.5821 0.34945 0.368 0.592 0.000 0.040
#> SRR1699880 3 0.1406 0.70986 0.016 0.000 0.960 0.024
#> SRR1699881 3 0.2797 0.71287 0.032 0.000 0.900 0.068
#> SRR1699882 2 0.4567 0.63977 0.244 0.740 0.000 0.016
#> SRR1699883 2 0.6024 0.18814 0.416 0.540 0.000 0.044
#> SRR1699884 2 0.4008 0.69088 0.148 0.820 0.000 0.032
#> SRR1699885 2 0.2197 0.71414 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR1699886 2 0.6114 0.22553 0.428 0.524 0.000 0.048
#> SRR1699888 2 0.4719 0.67754 0.180 0.772 0.000 0.048
#> SRR1699889 1 0.6113 0.56346 0.688 0.208 0.008 0.096
#> SRR1699890 2 0.5099 0.35195 0.380 0.612 0.000 0.008
#> SRR1699887 2 0.4019 0.66938 0.196 0.792 0.000 0.012
#> SRR1699891 1 0.4730 0.36987 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1699892 1 0.9727 0.08639 0.348 0.240 0.156 0.256
#> SRR1699893 4 0.7360 0.29693 0.416 0.012 0.112 0.460
#> SRR1699894 1 0.4804 0.32792 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1699895 1 0.5127 0.37803 0.632 0.356 0.000 0.012
#> SRR1699896 3 0.9662 -0.24378 0.272 0.160 0.364 0.204
#> SRR1699897 2 0.7292 0.22959 0.332 0.544 0.020 0.104
#> SRR1699898 3 0.2999 0.70041 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1699900 3 0.8628 -0.18266 0.304 0.032 0.384 0.280
#> SRR1699899 1 0.5900 0.53401 0.684 0.220 0.000 0.096
#> SRR1699902 3 0.5781 0.60610 0.072 0.000 0.676 0.252
#> SRR1699901 3 0.1902 0.70778 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1699903 1 0.4215 0.57339 0.824 0.104 0.000 0.072
#> SRR1699904 1 0.5756 0.30568 0.568 0.400 0.000 0.032
#> SRR1699905 3 0.5932 0.55359 0.096 0.000 0.680 0.224
#> SRR1699906 1 0.5526 0.23355 0.564 0.416 0.000 0.020
#> SRR1699907 1 0.4282 0.57540 0.816 0.124 0.000 0.060
#> SRR1699908 1 0.6543 0.36536 0.544 0.372 0.000 0.084
#> SRR1699909 1 0.7183 0.55687 0.616 0.168 0.020 0.196
#> SRR1699910 1 0.7916 -0.32486 0.412 0.016 0.404 0.168
#> SRR1699911 1 0.5159 0.58531 0.772 0.152 0.012 0.064
#> SRR1699912 1 0.3667 0.57456 0.856 0.088 0.000 0.056
#> SRR1699913 1 0.6052 0.50547 0.640 0.284 0.000 0.076
#> SRR1699914 3 0.1661 0.71471 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1699915 1 0.4076 0.48874 0.836 0.020 0.020 0.124
#> SRR1699916 1 0.5404 0.10688 0.512 0.476 0.000 0.012
#> SRR1699917 1 0.6440 0.57741 0.644 0.208 0.000 0.148
#> SRR1699918 1 0.6500 0.58745 0.664 0.184 0.008 0.144
#> SRR1699919 1 0.5877 0.49505 0.656 0.276 0.000 0.068
#> SRR1699920 1 0.8394 -0.19689 0.452 0.032 0.224 0.292
#> SRR1699921 1 0.5352 0.57034 0.740 0.188 0.004 0.068
#> SRR1699922 1 0.6140 0.12855 0.500 0.452 0.000 0.048
#> SRR1699923 3 0.5956 0.53593 0.100 0.000 0.680 0.220
#> SRR1699924 3 0.5446 0.59738 0.044 0.000 0.680 0.276
#> SRR1699925 3 0.0188 0.70249 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699926 1 0.6907 0.21311 0.632 0.012 0.180 0.176
#> SRR1699927 1 0.5152 0.43574 0.664 0.316 0.000 0.020
#> SRR1699929 1 0.7934 0.23232 0.600 0.100 0.180 0.120
#> SRR1699928 1 0.5497 0.48556 0.672 0.284 0.000 0.044
#> SRR1699930 1 0.4500 0.43900 0.684 0.316 0.000 0.000
#> SRR1699931 1 0.9888 0.03249 0.328 0.232 0.224 0.216
#> SRR1699933 3 0.7351 0.25428 0.292 0.008 0.544 0.156
#> SRR1699932 2 0.5755 0.07646 0.444 0.528 0.000 0.028
#> SRR1699934 3 0.0188 0.70249 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699935 1 0.8997 0.34539 0.360 0.308 0.056 0.276
#> SRR1699936 2 0.3636 0.69836 0.172 0.820 0.000 0.008
#> SRR1699937 2 0.7086 0.39853 0.072 0.672 0.136 0.120
#> SRR1699938 2 0.1452 0.70611 0.036 0.956 0.000 0.008
#> SRR1699940 3 0.8568 0.09163 0.244 0.056 0.484 0.216
#> SRR1699939 2 0.2924 0.71361 0.100 0.884 0.000 0.016
#> SRR1699941 3 0.1256 0.71030 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1699942 2 0.7502 0.26053 0.268 0.536 0.008 0.188
#> SRR1699943 2 0.2376 0.70512 0.068 0.916 0.000 0.016
#> SRR1699944 2 0.3910 0.68605 0.156 0.820 0.000 0.024
#> SRR1699945 3 0.0469 0.70522 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699946 2 0.5851 0.59044 0.124 0.748 0.032 0.096
#> SRR1699947 2 0.7236 0.43636 0.208 0.640 0.084 0.068
#> SRR1699948 2 0.1722 0.70855 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR1699949 2 0.4019 0.67716 0.196 0.792 0.000 0.012
#> SRR1699950 2 0.3249 0.70575 0.140 0.852 0.000 0.008
#> SRR1699951 2 0.5476 0.63648 0.144 0.736 0.000 0.120
#> SRR1699952 2 0.6762 0.42479 0.248 0.632 0.016 0.104
#> SRR1699953 2 0.2861 0.71452 0.096 0.888 0.000 0.016
#> SRR1699954 3 0.8316 0.08642 0.100 0.296 0.512 0.092
#> SRR1699955 2 0.1867 0.70804 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.1109 0.70966 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1699957 2 0.4964 0.63506 0.244 0.724 0.000 0.032
#> SRR1699959 3 0.6879 0.49146 0.092 0.020 0.612 0.276
#> SRR1699958 4 0.7281 0.25626 0.240 0.180 0.008 0.572
#> SRR1699960 2 0.4630 0.68135 0.196 0.768 0.000 0.036
#> SRR1699961 3 0.4692 0.67461 0.040 0.004 0.780 0.176
#> SRR1699962 2 0.2300 0.71726 0.064 0.920 0.000 0.016
#> SRR1699963 4 0.8975 -0.12449 0.256 0.336 0.056 0.352
#> SRR1699964 1 0.8465 0.28929 0.448 0.340 0.052 0.160
#> SRR1699965 2 0.2081 0.70747 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1699966 4 0.9330 0.45174 0.136 0.184 0.252 0.428
#> SRR1699967 2 0.3691 0.69619 0.068 0.856 0.000 0.076
#> SRR1699968 2 0.6889 0.15033 0.396 0.496 0.000 0.108
#> SRR1699969 3 0.2011 0.71555 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699971 3 0.6373 0.54265 0.072 0.012 0.640 0.276
#> SRR1699970 2 0.4234 0.67907 0.132 0.816 0.000 0.052
#> SRR1699972 3 0.6080 0.55213 0.100 0.000 0.664 0.236
#> SRR1699973 4 0.8143 -0.11086 0.324 0.248 0.012 0.416
#> SRR1699974 3 0.0895 0.70590 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1699975 1 0.5515 0.43708 0.732 0.048 0.016 0.204
#> SRR1699976 3 0.9151 0.04578 0.124 0.196 0.460 0.220
#> SRR1699977 3 0.7239 0.22831 0.156 0.000 0.500 0.344
#> SRR1699978 3 0.1211 0.71094 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699979 3 0.6574 0.28459 0.040 0.020 0.520 0.420
#> SRR1699980 1 0.5551 0.58034 0.728 0.160 0.000 0.112
#> SRR1699981 3 0.5830 0.50248 0.048 0.000 0.620 0.332
#> SRR1699982 1 0.4826 0.51378 0.716 0.264 0.000 0.020
#> SRR1699983 1 0.4867 0.55488 0.736 0.232 0.000 0.032
#> SRR1699984 3 0.0188 0.70249 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699985 1 0.6660 -0.00834 0.464 0.452 0.000 0.084
#> SRR1699986 3 0.0779 0.70611 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1699988 2 0.7003 -0.02667 0.424 0.460 0.000 0.116
#> SRR1699987 3 0.7006 0.35611 0.092 0.012 0.544 0.352
#> SRR1699989 1 0.6570 0.51790 0.604 0.280 0.000 0.116
#> SRR1699990 3 0.7156 0.42679 0.148 0.008 0.576 0.268
#> SRR1699992 3 0.7431 0.43271 0.036 0.144 0.608 0.212
#> SRR1699991 3 0.4253 0.68270 0.016 0.000 0.776 0.208
#> SRR1699993 3 0.3447 0.70590 0.020 0.000 0.852 0.128
#> SRR1699994 3 0.1938 0.71075 0.012 0.000 0.936 0.052
#> SRR1699995 3 0.0817 0.70721 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699996 1 0.9351 0.30903 0.356 0.352 0.136 0.156
#> SRR1699997 4 0.6477 0.58535 0.148 0.048 0.096 0.708
#> SRR1699998 1 0.9014 0.30471 0.396 0.336 0.080 0.188
#> SRR1699999 3 0.0000 0.70283 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.9591 -0.27281 0.332 0.120 0.264 0.284
#> SRR1700002 3 0.7608 0.40591 0.068 0.068 0.556 0.308
#> SRR1700001 3 0.2867 0.71129 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1700003 4 0.8482 0.48425 0.256 0.064 0.176 0.504
#> SRR1700004 3 0.2124 0.71412 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR1700005 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700006 3 0.5256 0.62793 0.040 0.000 0.700 0.260
#> SRR1700007 2 0.4761 0.40029 0.372 0.628 0.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.5322 0.55896 0.028 0.000 0.660 0.312
#> SRR1700009 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700010 3 0.1042 0.70767 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1700011 2 0.5235 0.61855 0.236 0.716 0.000 0.048
#> SRR1700013 3 0.8014 0.18868 0.040 0.148 0.520 0.292
#> SRR1700012 1 0.9276 0.03554 0.432 0.140 0.164 0.264
#> SRR1700014 3 0.6728 0.43981 0.084 0.008 0.572 0.336
#> SRR1700015 3 0.6578 0.56982 0.036 0.084 0.680 0.200
#> SRR1700016 3 0.1411 0.70770 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR1700018 3 0.7902 0.25555 0.068 0.076 0.492 0.364
#> SRR1700017 3 0.4378 0.68892 0.040 0.000 0.796 0.164
#> SRR1700019 2 0.4905 0.45518 0.364 0.632 0.000 0.004
#> SRR1700020 3 0.3074 0.69787 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700021 1 0.7403 0.37141 0.488 0.356 0.004 0.152
#> SRR1700023 3 0.7300 0.45256 0.140 0.016 0.576 0.268
#> SRR1700022 3 0.3428 0.70619 0.012 0.000 0.844 0.144
#> SRR1700024 1 0.6931 0.54966 0.608 0.192 0.004 0.196
#> SRR1700025 3 0.8526 0.22735 0.076 0.160 0.508 0.256
#> SRR1700026 3 0.7648 0.45336 0.108 0.052 0.580 0.260
#> SRR1700027 3 0.7007 0.54875 0.096 0.036 0.636 0.232
#> SRR1700028 4 0.8090 0.28714 0.332 0.084 0.080 0.504
#> SRR1700029 3 0.6822 0.33154 0.072 0.012 0.532 0.384
#> SRR1700030 1 0.6864 0.40593 0.616 0.104 0.016 0.264
#> SRR1700031 3 0.1978 0.71118 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1700032 2 0.7113 0.43459 0.220 0.612 0.016 0.152
#> SRR1700034 3 0.0188 0.70249 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700035 1 0.5719 0.58688 0.716 0.132 0.000 0.152
#> SRR1700033 3 0.2928 0.71083 0.012 0.000 0.880 0.108
#> SRR1700036 1 0.8456 0.39334 0.456 0.300 0.040 0.204
#> SRR1700037 1 0.5398 0.28197 0.580 0.404 0.000 0.016
#> SRR1700038 3 0.7693 0.34864 0.232 0.040 0.580 0.148
#> SRR1700039 3 0.2329 0.71164 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1700040 3 0.2021 0.71355 0.012 0.000 0.932 0.056
#> SRR1700041 3 0.6423 0.35086 0.060 0.004 0.540 0.396
#> SRR1700042 3 0.2610 0.71348 0.012 0.000 0.900 0.088
#> SRR1700043 3 0.4485 0.69205 0.052 0.000 0.796 0.152
#> SRR1700045 3 0.4988 0.65364 0.036 0.000 0.728 0.236
#> SRR1700044 1 0.9606 0.01603 0.372 0.188 0.160 0.280
#> SRR1700046 3 0.5917 0.53691 0.056 0.000 0.624 0.320
#> SRR1700047 3 0.2021 0.71406 0.012 0.000 0.932 0.056
#> SRR1700048 3 0.8044 -0.13335 0.352 0.008 0.400 0.240
#> SRR1700049 3 0.0592 0.70652 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700050 3 0.2335 0.71335 0.020 0.000 0.920 0.060
#> SRR1700051 3 0.1677 0.71238 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR1700052 3 0.2021 0.71465 0.012 0.000 0.932 0.056
#> SRR1700053 3 0.7995 0.05892 0.248 0.012 0.468 0.272
#> SRR1700054 3 0.5815 0.58568 0.060 0.000 0.652 0.288
#> SRR1700055 3 0.0188 0.70249 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700056 3 0.4452 0.63496 0.008 0.000 0.732 0.260
#> SRR1700057 3 0.5560 0.38250 0.024 0.000 0.584 0.392
#> SRR1700058 3 0.1452 0.71099 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1700059 4 0.5900 0.48313 0.076 0.000 0.260 0.664
#> SRR1700060 3 0.1474 0.71169 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700061 3 0.5358 0.62876 0.048 0.000 0.700 0.252
#> SRR1700062 3 0.2466 0.71061 0.004 0.000 0.900 0.096
#> SRR1700063 3 0.3763 0.70331 0.024 0.000 0.832 0.144
#> SRR1700064 1 0.7970 -0.21203 0.464 0.016 0.328 0.192
#> SRR1700065 3 0.4094 0.68325 0.056 0.000 0.828 0.116
#> SRR1700066 3 0.2706 0.71334 0.020 0.000 0.900 0.080
#> SRR1700067 1 0.6537 0.55175 0.636 0.164 0.000 0.200
#> SRR1700068 3 0.4737 0.64308 0.020 0.000 0.728 0.252
#> SRR1700069 1 0.8122 0.35564 0.572 0.112 0.100 0.216
#> SRR1700070 2 0.6391 0.42489 0.328 0.588 0.000 0.084
#> SRR1700071 3 0.6026 0.59507 0.080 0.004 0.672 0.244
#> SRR1700072 3 0.6110 0.55994 0.176 0.000 0.680 0.144
#> SRR1700073 1 0.4726 0.49338 0.784 0.048 0.004 0.164
#> SRR1700075 3 0.5428 0.65010 0.088 0.004 0.744 0.164
#> SRR1700074 3 0.5337 0.63208 0.044 0.000 0.696 0.260
#> SRR1700076 3 0.7535 0.48580 0.072 0.084 0.604 0.240
#> SRR1700077 3 0.7102 0.54227 0.112 0.032 0.628 0.228
#> SRR1700078 3 0.6474 0.53363 0.120 0.000 0.624 0.256
#> SRR1700080 3 0.8424 -0.01526 0.264 0.028 0.436 0.272
#> SRR1700079 3 0.5453 0.57378 0.036 0.000 0.660 0.304
#> SRR1700081 3 0.1743 0.71362 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1700082 3 0.4511 0.67606 0.040 0.000 0.784 0.176
#> SRR1700083 3 0.3479 0.70795 0.012 0.000 0.840 0.148
#> SRR1700084 3 0.1584 0.70949 0.012 0.000 0.952 0.036
#> SRR1700085 2 0.6337 0.02269 0.468 0.472 0.000 0.060
#> SRR1700086 1 0.7542 0.24401 0.596 0.064 0.088 0.252
#> SRR1700087 4 0.7760 0.51007 0.208 0.016 0.248 0.528
#> SRR1700088 4 0.9524 0.27692 0.136 0.192 0.320 0.352
#> SRR1700089 4 0.8731 0.51373 0.136 0.112 0.252 0.500
#> SRR1700091 2 0.7273 0.17081 0.068 0.548 0.040 0.344
#> SRR1700090 4 0.5498 0.51222 0.048 0.000 0.272 0.680
#> SRR1700092 2 0.8546 0.01240 0.172 0.460 0.056 0.312
#> SRR1700094 3 0.6171 0.21723 0.020 0.020 0.532 0.428
#> SRR1700093 4 0.6353 0.54161 0.056 0.028 0.252 0.664
#> SRR1700095 3 0.5613 0.35555 0.028 0.000 0.592 0.380
#> SRR1700096 3 0.4955 0.51709 0.008 0.000 0.648 0.344
#> SRR1700097 3 0.3801 0.65464 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700098 2 0.6392 0.24385 0.068 0.584 0.004 0.344
#> SRR1700099 4 0.7214 0.27127 0.100 0.284 0.028 0.588
#> SRR1700100 4 0.6399 0.56638 0.116 0.012 0.196 0.676
#> SRR1700101 4 0.7350 0.54822 0.064 0.164 0.128 0.644
#> SRR1700102 4 0.8007 0.13730 0.152 0.300 0.036 0.512
#> SRR1700104 4 0.5795 0.53879 0.040 0.020 0.244 0.696
#> SRR1700103 3 0.6015 0.11398 0.032 0.004 0.512 0.452
#> SRR1700105 4 0.8101 0.54774 0.128 0.128 0.152 0.592
#> SRR1700106 4 0.7971 0.13256 0.424 0.068 0.076 0.432
#> SRR1700107 4 0.6472 0.44106 0.156 0.128 0.024 0.692
#> SRR1700108 2 0.7012 0.04383 0.104 0.496 0.004 0.396
#> SRR1700109 2 0.5631 0.59329 0.232 0.696 0.000 0.072
#> SRR1700110 2 0.5102 0.64020 0.188 0.748 0.000 0.064
#> SRR1700112 2 0.7387 0.17486 0.256 0.520 0.000 0.224
#> SRR1700111 4 0.8038 0.41658 0.304 0.004 0.308 0.384
#> SRR1700113 1 0.6969 0.16498 0.452 0.436 0.000 0.112
#> SRR1700114 4 0.5560 0.23530 0.024 0.000 0.392 0.584
#> SRR1700115 4 0.6739 0.33881 0.120 0.232 0.012 0.636
#> SRR1700116 4 0.6147 0.55387 0.112 0.000 0.224 0.664
#> SRR1700117 3 0.6121 0.44319 0.072 0.000 0.620 0.308
#> SRR1700119 4 0.5611 0.25719 0.024 0.000 0.412 0.564
#> SRR1700118 4 0.7082 0.48264 0.304 0.004 0.136 0.556
#> SRR1700120 3 0.3975 0.62016 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700121 4 0.8710 0.41283 0.208 0.152 0.120 0.520
#> SRR1700122 1 0.5932 0.55969 0.696 0.132 0.000 0.172
#> SRR1700123 4 0.5586 0.10717 0.020 0.000 0.452 0.528
#> SRR1700125 2 0.7052 0.03667 0.372 0.500 0.000 0.128
#> SRR1700126 3 0.1890 0.71390 0.008 0.000 0.936 0.056
#> SRR1700127 3 0.5024 0.44723 0.008 0.000 0.632 0.360
#> SRR1700124 4 0.5444 0.49241 0.048 0.000 0.264 0.688
#> SRR1700128 4 0.5842 0.09845 0.032 0.000 0.448 0.520
#> SRR1700129 4 0.5210 0.34478 0.332 0.008 0.008 0.652
#> SRR1700130 1 0.6473 -0.05713 0.476 0.028 0.024 0.472
#> SRR1700132 3 0.6752 -0.06276 0.092 0.000 0.468 0.440
#> SRR1700131 3 0.4222 0.58918 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1700133 4 0.6462 0.59777 0.140 0.004 0.200 0.656
#> SRR1700134 4 0.6792 0.11457 0.340 0.112 0.000 0.548
#> SRR1700135 3 0.6027 0.53767 0.088 0.000 0.660 0.252
#> SRR1700136 3 0.4677 0.50837 0.004 0.000 0.680 0.316
#> SRR1700137 4 0.7634 0.58632 0.144 0.084 0.144 0.628
#> SRR1700138 4 0.5604 0.01102 0.020 0.000 0.476 0.504
#> SRR1700140 4 0.5282 0.50231 0.036 0.000 0.276 0.688
#> SRR1700139 4 0.5394 0.54542 0.060 0.000 0.228 0.712
#> SRR1700141 1 0.6794 0.48211 0.584 0.136 0.000 0.280
#> SRR1700142 3 0.4088 0.69378 0.040 0.000 0.820 0.140
#> SRR1700143 4 0.5329 0.22908 0.012 0.000 0.420 0.568
#> SRR1700144 3 0.4820 0.67911 0.060 0.000 0.772 0.168
#> SRR1700145 4 0.6007 0.41428 0.056 0.000 0.340 0.604
#> SRR1700146 4 0.7852 -0.34800 0.360 0.268 0.000 0.372
#> SRR1700147 3 0.5233 0.50015 0.020 0.000 0.648 0.332
#> SRR1700149 3 0.5582 0.29499 0.024 0.000 0.576 0.400
#> SRR1700148 3 0.5152 0.51074 0.020 0.000 0.664 0.316
#> SRR1700150 4 0.6950 0.22798 0.404 0.032 0.048 0.516
#> SRR1700152 4 0.6422 0.51919 0.080 0.008 0.284 0.628
#> SRR1700151 4 0.5311 0.42362 0.024 0.000 0.328 0.648
#> SRR1700153 4 0.6031 0.22929 0.044 0.000 0.420 0.536
#> SRR1700154 4 0.5498 0.27189 0.020 0.000 0.404 0.576
#> SRR1700155 4 0.6835 0.60432 0.136 0.040 0.148 0.676
#> SRR1700156 3 0.5183 0.32908 0.008 0.000 0.584 0.408
#> SRR1700158 3 0.3837 0.63858 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700159 2 0.6586 -0.00789 0.420 0.500 0.000 0.080
#> SRR1700157 3 0.5235 0.59013 0.048 0.000 0.716 0.236
#> SRR1700160 4 0.5466 0.17176 0.016 0.000 0.436 0.548
#> SRR1700161 3 0.5273 0.18245 0.008 0.000 0.536 0.456
#> SRR1700162 1 0.7674 0.46118 0.460 0.280 0.000 0.260
#> SRR1700164 3 0.5564 0.23381 0.020 0.000 0.544 0.436
#> SRR1700163 3 0.4283 0.59127 0.004 0.000 0.740 0.256
#> SRR1700165 3 0.4957 0.53622 0.012 0.000 0.668 0.320
#> SRR1700166 4 0.6730 0.48415 0.072 0.016 0.324 0.588
#> SRR1700168 1 0.6942 0.54861 0.584 0.240 0.000 0.176
#> SRR1700167 3 0.4690 0.59185 0.016 0.000 0.724 0.260
#> SRR1700170 4 0.6798 0.58768 0.224 0.000 0.172 0.604
#> SRR1700169 3 0.5851 0.23894 0.024 0.004 0.516 0.456
#> SRR1700171 3 0.5150 0.31029 0.008 0.000 0.596 0.396
#> SRR1700172 4 0.8248 0.58319 0.132 0.104 0.196 0.568
#> SRR1700174 4 0.5338 0.55096 0.036 0.008 0.240 0.716
#> SRR1700173 4 0.5864 0.56758 0.048 0.024 0.220 0.708
#> SRR1700175 4 0.6724 0.59183 0.176 0.024 0.132 0.668
#> SRR1700176 3 0.2563 0.70989 0.020 0.000 0.908 0.072
#> SRR1700178 2 0.0707 0.70212 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.5672 0.58602 0.100 0.000 0.188 0.712
#> SRR1700180 2 0.0707 0.70102 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0469 0.70045 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.1022 0.70354 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1700183 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700182 2 0.0592 0.70017 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0817 0.70368 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.3211 0.68350 0.056 0.892 0.012 0.040
#> SRR1700187 3 0.0469 0.70411 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700185 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700188 2 0.0672 0.70050 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1700192 3 0.7178 0.29121 0.024 0.244 0.608 0.124
#> SRR1700190 3 0.1118 0.70907 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700191 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700189 3 0.1743 0.71299 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1700193 2 0.1151 0.70612 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1700195 2 0.2466 0.71129 0.096 0.900 0.000 0.004
#> SRR1700194 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700196 2 0.1211 0.70713 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0657 0.70471 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1700198 2 0.0927 0.70412 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1700199 2 0.2714 0.71042 0.112 0.884 0.000 0.004
#> SRR1700200 2 0.1209 0.70762 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1700201 2 0.0817 0.70111 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.5023 0.65680 0.164 0.772 0.008 0.056
#> SRR1700203 2 0.4204 0.66538 0.192 0.788 0.000 0.020
#> SRR1700204 2 0.4387 0.65333 0.236 0.752 0.000 0.012
#> SRR1700206 2 0.7496 0.42183 0.116 0.640 0.088 0.156
#> SRR1700207 2 0.1389 0.70607 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.4815 0.66638 0.032 0.080 0.816 0.072
#> SRR1700205 2 0.5036 0.57381 0.280 0.696 0.000 0.024
#> SRR1700209 2 0.2376 0.71692 0.068 0.916 0.000 0.016
#> SRR1700210 2 0.3982 0.66255 0.220 0.776 0.000 0.004
#> SRR1700211 2 0.2522 0.71589 0.076 0.908 0.000 0.016
#> SRR1700212 2 0.4517 0.67444 0.168 0.792 0.004 0.036
#> SRR1700213 2 0.5626 0.59860 0.244 0.696 0.004 0.056
#> SRR1700214 2 0.1635 0.71133 0.044 0.948 0.000 0.008
#> SRR1700215 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700217 2 0.1867 0.71325 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1700216 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700218 2 0.4245 0.65884 0.104 0.832 0.008 0.056
#> SRR1700219 2 0.1302 0.70636 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700220 2 0.2081 0.70616 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0469 0.69954 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.2081 0.70985 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.6212 0.40241 0.348 0.592 0.004 0.056
#> SRR1700226 2 0.3172 0.69113 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.5298 0.40485 0.372 0.612 0.000 0.016
#> SRR1700225 2 0.7521 0.19818 0.336 0.532 0.032 0.100
#> SRR1700227 2 0.1584 0.70737 0.036 0.952 0.000 0.012
#> SRR1700230 3 0.0336 0.70411 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700231 2 0.2174 0.70883 0.052 0.928 0.000 0.020
#> SRR1700228 2 0.5914 0.61567 0.220 0.696 0.008 0.076
#> SRR1700232 2 0.2408 0.71542 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.1824 0.71426 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1700234 2 0.2329 0.71673 0.072 0.916 0.000 0.012
#> SRR1700235 2 0.5561 0.60540 0.108 0.752 0.012 0.128
#> SRR1700237 2 0.2450 0.71096 0.072 0.912 0.000 0.016
#> SRR1700236 2 0.3695 0.69834 0.156 0.828 0.000 0.016
#> SRR1700238 2 0.0817 0.70250 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700240 3 0.1042 0.70573 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1700241 3 0.5858 0.55224 0.028 0.024 0.672 0.276
#> SRR1700243 2 0.1022 0.70502 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.2480 0.71698 0.088 0.904 0.000 0.008
#> SRR1700242 2 0.8817 -0.00535 0.124 0.488 0.260 0.128
#> SRR1700246 2 0.5366 0.56247 0.276 0.684 0.000 0.040
#> SRR1700245 2 0.1661 0.70912 0.052 0.944 0.000 0.004
#> SRR1700247 3 0.2722 0.70136 0.032 0.000 0.904 0.064
#> SRR1700249 3 0.0336 0.70285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700250 2 0.2871 0.70918 0.072 0.896 0.000 0.032
#> SRR1700248 2 0.1211 0.70864 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.2081 0.71286 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1700252 3 0.8029 0.11053 0.044 0.296 0.520 0.140
#> SRR1700253 2 0.2081 0.70950 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.4399 0.67612 0.212 0.768 0.000 0.020
#> SRR1700254 3 0.1820 0.70945 0.020 0.000 0.944 0.036
#> SRR1700255 2 0.1305 0.70757 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1700257 2 0.0921 0.70266 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.2704 0.70889 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.2011 0.71147 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.4907 0.33050 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.4720 0.51601 0.324 0.672 0.000 0.004
#> SRR1700262 2 0.4804 0.36918 0.384 0.616 0.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.6500 0.05726 0.444 0.484 0.000 0.072
#> SRR1700264 2 0.2342 0.71724 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR1700265 2 0.8432 0.24958 0.216 0.544 0.104 0.136
#> SRR1700266 2 0.3402 0.69980 0.164 0.832 0.000 0.004
#> SRR1700268 3 0.7930 0.36270 0.084 0.136 0.596 0.184
#> SRR1700270 2 0.2376 0.71602 0.068 0.916 0.000 0.016
#> SRR1700267 2 0.2266 0.71467 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR1700271 2 0.2647 0.70729 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.4212 0.66003 0.216 0.772 0.000 0.012
#> SRR1700273 2 0.4020 0.69325 0.156 0.820 0.008 0.016
#> SRR1700274 1 0.5550 0.14648 0.552 0.428 0.000 0.020
#> SRR1700277 3 0.2342 0.71606 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1700275 2 0.4606 0.57946 0.264 0.724 0.000 0.012
#> SRR1700276 2 0.4072 0.57963 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1700278 2 0.7549 0.32377 0.276 0.580 0.056 0.088
#> SRR1700279 1 0.5780 0.06181 0.496 0.476 0.000 0.028
#> SRR1700280 2 0.5003 0.51011 0.308 0.676 0.000 0.016
#> SRR1700281 2 0.3653 0.70635 0.128 0.844 0.000 0.028
#> SRR1700283 1 0.5127 0.38457 0.632 0.356 0.000 0.012
#> SRR1700282 3 0.8765 0.09123 0.144 0.116 0.504 0.236
#> SRR1700284 1 0.5560 0.32930 0.584 0.392 0.000 0.024
#> SRR1700285 2 0.7568 0.19976 0.336 0.528 0.032 0.104
#> SRR1700286 2 0.5323 0.46686 0.352 0.628 0.000 0.020
#> SRR1700287 2 0.5143 0.15273 0.456 0.540 0.000 0.004
#> SRR1700290 3 0.1474 0.71208 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700289 1 0.5111 0.55273 0.740 0.204 0.000 0.056
#> SRR1700288 2 0.4636 0.65518 0.188 0.772 0.000 0.040
#> SRR1700292 1 0.5452 0.39196 0.616 0.360 0.000 0.024
#> SRR1700291 4 0.9088 0.02810 0.280 0.216 0.084 0.420
#> SRR1700293 2 0.7886 -0.00620 0.268 0.472 0.008 0.252
#> SRR1700294 1 0.4957 0.46263 0.668 0.320 0.000 0.012
#> SRR1700295 1 0.9146 -0.26730 0.376 0.088 0.196 0.340
#> SRR1700297 1 0.5453 0.32874 0.592 0.388 0.000 0.020
#> SRR1700296 1 0.5097 0.23100 0.568 0.428 0.000 0.004
#> SRR1700298 4 0.9040 0.00186 0.356 0.160 0.096 0.388
#> SRR1700299 1 0.7429 0.01152 0.532 0.020 0.116 0.332
#> SRR1700300 1 0.7621 0.20021 0.592 0.040 0.152 0.216
#> SRR1700302 1 0.6009 0.36186 0.572 0.380 0.000 0.048
#> SRR1700301 2 0.5137 0.10330 0.452 0.544 0.000 0.004
#> SRR1700303 1 0.5778 0.10627 0.500 0.472 0.000 0.028
#> SRR1700304 2 0.4814 0.44503 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR1700305 2 0.6020 0.23148 0.384 0.568 0.000 0.048
#> SRR1700306 1 0.8029 -0.19048 0.476 0.016 0.228 0.280
#> SRR1700308 1 0.7094 0.54737 0.636 0.208 0.032 0.124
#> SRR1700307 3 0.5558 0.52359 0.036 0.000 0.640 0.324
#> SRR1700309 3 0.6946 0.35918 0.200 0.000 0.588 0.212
#> SRR1700310 1 0.5151 0.14152 0.532 0.464 0.000 0.004
#> SRR1700311 1 0.7798 0.11816 0.572 0.040 0.168 0.220
#> SRR1700312 1 0.7975 0.51943 0.524 0.252 0.028 0.196
#> SRR1700313 3 0.8468 0.07796 0.168 0.060 0.492 0.280
#> SRR1700314 4 0.7989 0.46705 0.300 0.004 0.288 0.408
#> SRR1700315 1 0.6872 0.17249 0.624 0.008 0.160 0.208
#> SRR1700316 4 0.9723 0.36249 0.244 0.152 0.260 0.344
#> SRR1700317 2 0.4999 0.01987 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1700318 1 0.6454 0.41411 0.572 0.344 0.000 0.084
#> SRR1700319 3 0.6951 0.32977 0.140 0.000 0.556 0.304
#> SRR1700320 1 0.5506 0.09859 0.512 0.472 0.000 0.016
#> SRR1700322 1 0.7950 0.48287 0.580 0.180 0.060 0.180
#> SRR1700321 2 0.5636 0.17771 0.424 0.552 0.000 0.024
#> SRR1700323 1 0.9552 0.11112 0.348 0.216 0.128 0.308
#> SRR1700324 2 0.5420 0.38461 0.352 0.624 0.000 0.024
#> SRR1700325 2 0.8007 0.27332 0.220 0.552 0.044 0.184
#> SRR1700326 4 0.9740 0.28858 0.284 0.152 0.236 0.328
#> SRR1700327 2 0.5383 0.52315 0.292 0.672 0.000 0.036
#> SRR1700329 1 0.5770 0.58891 0.712 0.148 0.000 0.140
#> SRR1700328 3 0.8175 -0.08783 0.336 0.020 0.436 0.208
#> SRR1700330 3 0.7630 0.36551 0.132 0.040 0.580 0.248
#> SRR1700331 1 0.4939 0.54590 0.740 0.220 0.000 0.040
#> SRR1700332 1 0.7243 0.52556 0.556 0.268 0.004 0.172
#> SRR1700333 2 0.6659 -0.11028 0.448 0.468 0.000 0.084
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.5782 0.56993 0.104 0.648 0.004 0.012 0.232
#> SRR1699875 2 0.5430 0.60255 0.124 0.680 0.000 0.008 0.188
#> SRR1699876 5 0.6011 0.06273 0.100 0.404 0.000 0.004 0.492
#> SRR1699877 2 0.7280 0.27323 0.196 0.468 0.000 0.044 0.292
#> SRR1699879 2 0.5911 0.58837 0.108 0.656 0.000 0.032 0.204
#> SRR1699878 2 0.6024 0.15842 0.116 0.472 0.000 0.000 0.412
#> SRR1699880 3 0.2797 0.66054 0.060 0.000 0.880 0.060 0.000
#> SRR1699881 3 0.4868 0.63121 0.140 0.004 0.748 0.100 0.008
#> SRR1699882 2 0.5590 0.51628 0.088 0.608 0.000 0.004 0.300
#> SRR1699883 5 0.6837 0.13022 0.172 0.392 0.000 0.016 0.420
#> SRR1699884 2 0.5588 0.61286 0.168 0.680 0.000 0.016 0.136
#> SRR1699885 2 0.3485 0.66183 0.048 0.828 0.000 0.000 0.124
#> SRR1699886 2 0.7092 0.06215 0.124 0.440 0.000 0.052 0.384
#> SRR1699888 2 0.5524 0.61231 0.120 0.684 0.000 0.016 0.180
#> SRR1699889 5 0.6635 0.44993 0.156 0.124 0.000 0.096 0.624
#> SRR1699890 2 0.5562 0.22661 0.072 0.520 0.000 0.000 0.408
#> SRR1699887 2 0.5532 0.52678 0.092 0.644 0.000 0.008 0.256
#> SRR1699891 5 0.4794 0.46084 0.044 0.248 0.000 0.008 0.700
#> SRR1699892 5 0.9721 -0.39901 0.256 0.128 0.132 0.224 0.260
#> SRR1699893 4 0.8276 -0.06952 0.248 0.020 0.064 0.348 0.320
#> SRR1699894 5 0.5217 0.41732 0.056 0.288 0.000 0.008 0.648
#> SRR1699895 5 0.5036 0.49963 0.060 0.216 0.000 0.016 0.708
#> SRR1699896 1 0.9712 0.31496 0.276 0.108 0.252 0.184 0.180
#> SRR1699897 2 0.8670 -0.01694 0.228 0.368 0.032 0.096 0.276
#> SRR1699898 3 0.4129 0.63788 0.040 0.000 0.756 0.204 0.000
#> SRR1699900 1 0.9236 0.18682 0.292 0.044 0.268 0.228 0.168
#> SRR1699899 5 0.7077 0.46300 0.188 0.168 0.000 0.080 0.564
#> SRR1699902 3 0.7007 0.43309 0.216 0.000 0.520 0.228 0.036
#> SRR1699901 3 0.3446 0.65110 0.048 0.000 0.840 0.108 0.004
#> SRR1699903 5 0.4337 0.43984 0.124 0.040 0.000 0.040 0.796
#> SRR1699904 5 0.6164 0.44765 0.112 0.280 0.000 0.020 0.588
#> SRR1699905 3 0.6240 0.48978 0.152 0.000 0.604 0.224 0.020
#> SRR1699906 5 0.5602 0.37189 0.092 0.292 0.000 0.004 0.612
#> SRR1699907 5 0.4294 0.47818 0.112 0.084 0.000 0.012 0.792
#> SRR1699908 5 0.7463 0.44545 0.164 0.256 0.000 0.084 0.496
#> SRR1699909 5 0.7507 0.32305 0.212 0.100 0.004 0.156 0.528
#> SRR1699910 5 0.8311 -0.41761 0.200 0.004 0.288 0.132 0.376
#> SRR1699911 5 0.6090 0.40448 0.208 0.076 0.016 0.036 0.664
#> SRR1699912 5 0.3759 0.48003 0.084 0.080 0.000 0.008 0.828
#> SRR1699913 5 0.6366 0.52622 0.140 0.184 0.000 0.048 0.628
#> SRR1699914 3 0.3815 0.66456 0.080 0.000 0.824 0.088 0.008
#> SRR1699915 5 0.6022 0.34211 0.176 0.028 0.032 0.076 0.688
#> SRR1699916 2 0.6721 -0.06970 0.112 0.432 0.000 0.032 0.424
#> SRR1699917 5 0.7551 0.46793 0.224 0.180 0.000 0.096 0.500
#> SRR1699918 5 0.7227 0.29497 0.280 0.108 0.000 0.096 0.516
#> SRR1699919 5 0.6508 0.48813 0.172 0.128 0.000 0.072 0.628
#> SRR1699920 5 0.8855 -0.38580 0.220 0.020 0.204 0.200 0.356
#> SRR1699921 5 0.6674 0.47592 0.180 0.112 0.008 0.072 0.628
#> SRR1699922 5 0.6264 0.40843 0.116 0.316 0.000 0.016 0.552
#> SRR1699923 3 0.7036 0.39487 0.176 0.000 0.564 0.188 0.072
#> SRR1699924 3 0.6946 0.39968 0.172 0.004 0.508 0.292 0.024
#> SRR1699925 3 0.0290 0.64241 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1699926 5 0.7366 -0.01849 0.180 0.004 0.164 0.100 0.552
#> SRR1699927 5 0.4765 0.53103 0.092 0.168 0.000 0.004 0.736
#> SRR1699929 5 0.8889 -0.25786 0.312 0.100 0.160 0.064 0.364
#> SRR1699928 5 0.5901 0.49449 0.104 0.220 0.000 0.028 0.648
#> SRR1699930 5 0.3829 0.50776 0.028 0.196 0.000 0.000 0.776
#> SRR1699931 1 0.9681 0.32986 0.316 0.160 0.144 0.148 0.232
#> SRR1699933 3 0.8209 -0.23986 0.236 0.008 0.400 0.096 0.260
#> SRR1699932 5 0.7134 0.20525 0.132 0.396 0.004 0.040 0.428
#> SRR1699934 3 0.0290 0.64241 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1699935 5 0.8889 0.17611 0.228 0.212 0.020 0.196 0.344
#> SRR1699936 2 0.4289 0.64531 0.064 0.760 0.000 0.000 0.176
#> SRR1699937 2 0.7898 0.26253 0.236 0.520 0.100 0.108 0.036
#> SRR1699938 2 0.2740 0.65659 0.064 0.888 0.000 0.004 0.044
#> SRR1699940 3 0.9314 -0.39776 0.252 0.060 0.328 0.180 0.180
#> SRR1699939 2 0.4833 0.65179 0.124 0.736 0.000 0.004 0.136
#> SRR1699941 3 0.3496 0.65611 0.124 0.000 0.832 0.040 0.004
#> SRR1699942 2 0.8282 0.18078 0.172 0.448 0.012 0.152 0.216
#> SRR1699943 2 0.3617 0.65566 0.128 0.824 0.000 0.004 0.044
#> SRR1699944 2 0.4833 0.63547 0.136 0.736 0.000 0.004 0.124
#> SRR1699945 3 0.1399 0.65437 0.020 0.000 0.952 0.028 0.000
#> SRR1699946 2 0.6823 0.47292 0.236 0.584 0.008 0.048 0.124
#> SRR1699947 2 0.7446 0.41563 0.180 0.576 0.068 0.032 0.144
#> SRR1699948 2 0.2853 0.65967 0.076 0.880 0.000 0.004 0.040
#> SRR1699949 2 0.4930 0.57339 0.072 0.684 0.000 0.000 0.244
#> SRR1699950 2 0.3995 0.65732 0.060 0.788 0.000 0.000 0.152
#> SRR1699951 2 0.6836 0.50164 0.164 0.588 0.000 0.068 0.180
#> SRR1699952 2 0.7843 0.17464 0.252 0.456 0.008 0.072 0.212
#> SRR1699953 2 0.4548 0.66435 0.092 0.780 0.000 0.020 0.108
#> SRR1699954 3 0.8715 -0.28065 0.176 0.268 0.412 0.076 0.068
#> SRR1699955 2 0.2946 0.65876 0.044 0.868 0.000 0.000 0.088
#> SRR1699956 3 0.2228 0.65912 0.040 0.000 0.912 0.048 0.000
#> SRR1699957 2 0.6397 0.46650 0.168 0.572 0.000 0.016 0.244
#> SRR1699959 3 0.8508 -0.04619 0.228 0.028 0.416 0.228 0.100
#> SRR1699958 4 0.8094 0.00219 0.224 0.152 0.008 0.464 0.152
#> SRR1699960 2 0.5388 0.59962 0.080 0.668 0.000 0.012 0.240
#> SRR1699961 3 0.6491 0.46368 0.264 0.004 0.560 0.160 0.012
#> SRR1699962 2 0.4078 0.66879 0.072 0.796 0.000 0.004 0.128
#> SRR1699963 1 0.8905 0.13488 0.340 0.252 0.024 0.220 0.164
#> SRR1699964 1 0.8994 -0.08500 0.288 0.280 0.036 0.124 0.272
#> SRR1699965 2 0.2722 0.65643 0.020 0.872 0.000 0.000 0.108
#> SRR1699966 4 0.9484 -0.20849 0.276 0.116 0.172 0.316 0.120
#> SRR1699967 2 0.6253 0.57039 0.192 0.644 0.000 0.064 0.100
#> SRR1699968 5 0.8138 0.34156 0.272 0.252 0.000 0.108 0.368
#> SRR1699969 3 0.3888 0.66308 0.064 0.000 0.800 0.136 0.000
#> SRR1699971 3 0.7263 0.29170 0.260 0.012 0.468 0.244 0.016
#> SRR1699970 2 0.5407 0.62704 0.092 0.700 0.000 0.024 0.184
#> SRR1699972 3 0.7490 0.20174 0.256 0.012 0.440 0.268 0.024
#> SRR1699973 4 0.8722 -0.24201 0.280 0.240 0.008 0.296 0.176
#> SRR1699974 3 0.1211 0.65132 0.024 0.000 0.960 0.016 0.000
#> SRR1699975 5 0.6898 0.11440 0.280 0.024 0.008 0.156 0.532
#> SRR1699976 1 0.9273 0.23231 0.304 0.140 0.284 0.212 0.060
#> SRR1699977 3 0.7901 -0.08084 0.280 0.004 0.376 0.280 0.060
#> SRR1699978 3 0.2069 0.65566 0.012 0.000 0.912 0.076 0.000
#> SRR1699979 3 0.7680 -0.08741 0.228 0.012 0.368 0.360 0.032
#> SRR1699980 5 0.6714 0.42042 0.216 0.112 0.000 0.076 0.596
#> SRR1699981 3 0.6380 0.33061 0.136 0.000 0.528 0.324 0.012
#> SRR1699982 5 0.5368 0.50218 0.092 0.248 0.000 0.004 0.656
#> SRR1699983 5 0.5309 0.51787 0.144 0.140 0.000 0.012 0.704
#> SRR1699984 3 0.0324 0.64293 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1699985 5 0.7247 0.24268 0.172 0.336 0.000 0.044 0.448
#> SRR1699986 3 0.2054 0.66141 0.028 0.000 0.920 0.052 0.000
#> SRR1699988 2 0.7997 -0.21967 0.200 0.352 0.000 0.100 0.348
#> SRR1699987 4 0.7830 0.12555 0.216 0.000 0.328 0.380 0.076
#> SRR1699989 5 0.7958 0.40502 0.228 0.220 0.008 0.088 0.456
#> SRR1699990 3 0.8492 -0.17419 0.288 0.020 0.348 0.256 0.088
#> SRR1699992 3 0.7984 0.24670 0.180 0.124 0.512 0.164 0.020
#> SRR1699991 3 0.5619 0.57788 0.156 0.000 0.636 0.208 0.000
#> SRR1699993 3 0.4436 0.64431 0.088 0.000 0.768 0.140 0.004
#> SRR1699994 3 0.4128 0.65578 0.112 0.000 0.800 0.080 0.008
#> SRR1699995 3 0.1041 0.64982 0.004 0.000 0.964 0.032 0.000
#> SRR1699996 2 0.9455 -0.30185 0.204 0.308 0.104 0.112 0.272
#> SRR1699997 4 0.7208 0.28035 0.200 0.020 0.060 0.580 0.140
#> SRR1699998 5 0.9427 -0.00871 0.212 0.264 0.060 0.184 0.280
#> SRR1699999 3 0.0798 0.64629 0.008 0.000 0.976 0.016 0.000
#> SRR1700000 1 0.9487 0.25864 0.292 0.072 0.168 0.216 0.252
#> SRR1700002 3 0.8042 -0.07141 0.272 0.048 0.368 0.296 0.016
#> SRR1700001 3 0.4455 0.65572 0.096 0.000 0.768 0.132 0.004
#> SRR1700003 4 0.8872 -0.08189 0.276 0.072 0.100 0.400 0.152
#> SRR1700004 3 0.4237 0.64771 0.152 0.000 0.772 0.076 0.000
#> SRR1700005 3 0.0162 0.64251 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.6858 0.36078 0.216 0.000 0.488 0.280 0.016
#> SRR1700007 5 0.5280 0.02826 0.048 0.440 0.000 0.000 0.512
#> SRR1700008 3 0.6150 0.39161 0.120 0.000 0.544 0.328 0.008
#> SRR1700009 3 0.0451 0.64310 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700010 3 0.2304 0.65426 0.044 0.000 0.908 0.048 0.000
#> SRR1700011 2 0.5781 0.53193 0.112 0.620 0.000 0.008 0.260
#> SRR1700013 3 0.8672 -0.13542 0.220 0.128 0.404 0.220 0.028
#> SRR1700012 1 0.9442 0.27721 0.320 0.100 0.112 0.228 0.240
#> SRR1700014 3 0.8208 -0.01922 0.244 0.020 0.372 0.304 0.060
#> SRR1700015 3 0.7180 0.39270 0.232 0.044 0.548 0.164 0.012
#> SRR1700016 3 0.1195 0.65259 0.028 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1700018 3 0.8104 -0.15044 0.292 0.044 0.336 0.308 0.020
#> SRR1700017 3 0.5847 0.55553 0.204 0.000 0.608 0.188 0.000
#> SRR1700019 2 0.5733 0.15640 0.084 0.476 0.000 0.000 0.440
#> SRR1700020 3 0.4431 0.63186 0.052 0.000 0.732 0.216 0.000
#> SRR1700021 5 0.8371 0.39389 0.196 0.260 0.012 0.124 0.408
#> SRR1700023 3 0.8154 0.03008 0.268 0.016 0.392 0.260 0.064
#> SRR1700022 3 0.4417 0.65220 0.092 0.000 0.760 0.148 0.000
#> SRR1700024 5 0.8126 0.30945 0.272 0.164 0.004 0.136 0.424
#> SRR1700025 1 0.8587 0.19182 0.356 0.092 0.336 0.180 0.036
#> SRR1700026 3 0.8455 -0.10018 0.284 0.068 0.376 0.240 0.032
#> SRR1700027 3 0.7963 0.08787 0.316 0.020 0.396 0.224 0.044
#> SRR1700028 4 0.8697 -0.07932 0.236 0.080 0.052 0.404 0.228
#> SRR1700029 3 0.7636 0.27105 0.196 0.012 0.468 0.276 0.048
#> SRR1700030 5 0.8185 0.10022 0.264 0.092 0.012 0.212 0.420
#> SRR1700031 3 0.3420 0.65734 0.076 0.000 0.840 0.084 0.000
#> SRR1700032 2 0.7969 0.04708 0.332 0.408 0.016 0.064 0.180
#> SRR1700034 3 0.0771 0.64529 0.004 0.000 0.976 0.020 0.000
#> SRR1700035 5 0.6701 0.44581 0.180 0.092 0.000 0.116 0.612
#> SRR1700033 3 0.4316 0.65471 0.108 0.000 0.772 0.120 0.000
#> SRR1700036 5 0.9190 0.11981 0.256 0.252 0.048 0.140 0.304
#> SRR1700037 5 0.5955 0.41741 0.080 0.316 0.000 0.020 0.584
#> SRR1700038 3 0.8657 -0.23531 0.236 0.032 0.404 0.112 0.216
#> SRR1700039 3 0.3303 0.66519 0.076 0.000 0.848 0.076 0.000
#> SRR1700040 3 0.3517 0.66722 0.068 0.000 0.832 0.100 0.000
#> SRR1700041 3 0.7436 0.17494 0.188 0.012 0.432 0.340 0.028
#> SRR1700042 3 0.5015 0.63717 0.120 0.000 0.732 0.136 0.012
#> SRR1700043 3 0.5286 0.62571 0.136 0.000 0.712 0.136 0.016
#> SRR1700045 3 0.5436 0.58908 0.092 0.000 0.660 0.240 0.008
#> SRR1700044 1 0.9290 0.30102 0.348 0.156 0.064 0.216 0.216
#> SRR1700046 3 0.6611 0.42687 0.264 0.000 0.512 0.216 0.008
#> SRR1700047 3 0.3479 0.66681 0.080 0.000 0.836 0.084 0.000
#> SRR1700048 1 0.8807 0.20973 0.308 0.012 0.256 0.180 0.244
#> SRR1700049 3 0.1485 0.65167 0.020 0.000 0.948 0.032 0.000
#> SRR1700050 3 0.3143 0.66195 0.044 0.000 0.872 0.068 0.016
#> SRR1700051 3 0.2592 0.66241 0.052 0.000 0.892 0.056 0.000
#> SRR1700052 3 0.3272 0.66570 0.072 0.000 0.860 0.060 0.008
#> SRR1700053 1 0.8842 0.16328 0.284 0.012 0.284 0.220 0.200
#> SRR1700054 3 0.6889 0.43142 0.232 0.000 0.524 0.216 0.028
#> SRR1700055 3 0.0404 0.64268 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700056 3 0.5373 0.56233 0.092 0.000 0.632 0.276 0.000
#> SRR1700057 3 0.6599 0.20227 0.148 0.000 0.452 0.388 0.012
#> SRR1700058 3 0.3075 0.65830 0.048 0.000 0.860 0.092 0.000
#> SRR1700059 4 0.6394 0.34461 0.192 0.000 0.188 0.596 0.024
#> SRR1700060 3 0.3169 0.66643 0.060 0.000 0.856 0.084 0.000
#> SRR1700061 3 0.6215 0.53537 0.192 0.000 0.596 0.200 0.012
#> SRR1700062 3 0.3622 0.66273 0.048 0.000 0.816 0.136 0.000
#> SRR1700063 3 0.5165 0.63224 0.088 0.000 0.696 0.208 0.008
#> SRR1700064 5 0.8458 -0.39893 0.328 0.020 0.196 0.100 0.356
#> SRR1700065 3 0.4961 0.62828 0.140 0.000 0.744 0.096 0.020
#> SRR1700066 3 0.3977 0.66024 0.100 0.000 0.812 0.080 0.008
#> SRR1700067 5 0.7186 0.37294 0.228 0.120 0.000 0.104 0.548
#> SRR1700068 3 0.5606 0.52018 0.104 0.000 0.600 0.296 0.000
#> SRR1700069 5 0.8914 -0.03461 0.284 0.092 0.092 0.136 0.396
#> SRR1700070 2 0.7789 -0.03532 0.212 0.404 0.000 0.076 0.308
#> SRR1700071 3 0.7822 0.16603 0.292 0.008 0.420 0.224 0.056
#> SRR1700072 3 0.6864 0.43998 0.168 0.000 0.600 0.104 0.128
#> SRR1700073 5 0.6983 0.25095 0.252 0.048 0.000 0.164 0.536
#> SRR1700075 3 0.7227 0.42248 0.192 0.000 0.548 0.172 0.088
#> SRR1700074 3 0.6312 0.50724 0.236 0.004 0.572 0.184 0.004
#> SRR1700076 3 0.8125 0.20931 0.256 0.068 0.480 0.152 0.044
#> SRR1700077 3 0.8030 0.21394 0.272 0.044 0.468 0.168 0.048
#> SRR1700078 3 0.7486 0.19737 0.284 0.000 0.444 0.220 0.052
#> SRR1700080 1 0.8854 0.23926 0.368 0.032 0.272 0.168 0.160
#> SRR1700079 3 0.6755 0.40216 0.208 0.000 0.512 0.264 0.016
#> SRR1700081 3 0.2669 0.66665 0.020 0.000 0.876 0.104 0.000
#> SRR1700082 3 0.6151 0.53417 0.176 0.000 0.604 0.208 0.012
#> SRR1700083 3 0.4366 0.65789 0.096 0.000 0.776 0.124 0.004
#> SRR1700084 3 0.2922 0.66009 0.072 0.000 0.872 0.056 0.000
#> SRR1700085 2 0.7469 -0.05443 0.168 0.408 0.000 0.060 0.364
#> SRR1700086 1 0.8714 0.22769 0.380 0.076 0.064 0.168 0.312
#> SRR1700087 4 0.8531 0.16052 0.212 0.028 0.216 0.428 0.116
#> SRR1700088 1 0.9658 0.25928 0.288 0.128 0.196 0.260 0.128
#> SRR1700089 4 0.9515 -0.07249 0.220 0.100 0.236 0.316 0.128
#> SRR1700091 2 0.7615 0.03081 0.156 0.436 0.012 0.344 0.052
#> SRR1700090 4 0.5601 0.41565 0.100 0.000 0.196 0.680 0.024
#> SRR1700092 2 0.8833 -0.17648 0.176 0.332 0.028 0.312 0.152
#> SRR1700094 3 0.7339 0.07830 0.192 0.016 0.420 0.356 0.016
#> SRR1700093 4 0.6878 0.37476 0.172 0.016 0.156 0.608 0.048
#> SRR1700095 3 0.6075 0.37649 0.100 0.000 0.552 0.336 0.012
#> SRR1700096 3 0.5736 0.32155 0.088 0.000 0.512 0.400 0.000
#> SRR1700097 3 0.4509 0.59729 0.048 0.000 0.716 0.236 0.000
#> SRR1700098 2 0.7324 0.22447 0.168 0.508 0.004 0.264 0.056
#> SRR1700099 4 0.7794 0.07765 0.136 0.180 0.012 0.524 0.148
#> SRR1700100 4 0.7235 0.31114 0.220 0.016 0.168 0.552 0.044
#> SRR1700101 4 0.7797 0.12375 0.172 0.176 0.056 0.544 0.052
#> SRR1700102 4 0.8702 -0.16371 0.204 0.312 0.032 0.348 0.104
#> SRR1700104 4 0.5509 0.40696 0.112 0.008 0.148 0.712 0.020
#> SRR1700103 4 0.7277 0.27086 0.148 0.016 0.340 0.468 0.028
#> SRR1700105 4 0.8638 0.11365 0.148 0.148 0.104 0.492 0.108
#> SRR1700106 5 0.9022 -0.16802 0.244 0.076 0.076 0.256 0.348
#> SRR1700107 4 0.7500 0.13373 0.240 0.120 0.024 0.544 0.072
#> SRR1700108 2 0.7204 0.09967 0.124 0.460 0.000 0.352 0.064
#> SRR1700109 2 0.7326 0.32955 0.108 0.520 0.000 0.116 0.256
#> SRR1700110 2 0.6139 0.57547 0.088 0.652 0.000 0.064 0.196
#> SRR1700112 2 0.8102 0.04274 0.176 0.436 0.000 0.192 0.196
#> SRR1700111 4 0.8508 0.01104 0.188 0.000 0.236 0.316 0.260
#> SRR1700113 5 0.7987 0.33511 0.180 0.284 0.000 0.120 0.416
#> SRR1700114 4 0.6517 0.27529 0.148 0.000 0.308 0.528 0.016
#> SRR1700115 4 0.7029 0.18401 0.192 0.116 0.004 0.588 0.100
#> SRR1700116 4 0.6503 0.35389 0.192 0.000 0.156 0.608 0.044
#> SRR1700117 3 0.5978 0.46224 0.080 0.000 0.608 0.284 0.028
#> SRR1700119 4 0.6527 0.31929 0.112 0.000 0.336 0.524 0.028
#> SRR1700118 4 0.8104 0.13458 0.260 0.000 0.152 0.416 0.172
#> SRR1700120 3 0.4355 0.59516 0.044 0.000 0.732 0.224 0.000
#> SRR1700121 4 0.9212 0.00872 0.224 0.104 0.096 0.380 0.196
#> SRR1700122 5 0.7126 0.42272 0.192 0.116 0.000 0.124 0.568
#> SRR1700123 4 0.7117 0.27349 0.156 0.004 0.344 0.464 0.032
#> SRR1700125 5 0.7667 0.22829 0.112 0.368 0.000 0.120 0.400
#> SRR1700126 3 0.3400 0.65780 0.036 0.000 0.828 0.136 0.000
#> SRR1700127 3 0.5439 0.39436 0.068 0.000 0.560 0.372 0.000
#> SRR1700124 4 0.6117 0.38634 0.160 0.000 0.208 0.616 0.016
#> SRR1700128 4 0.6519 0.09122 0.124 0.000 0.404 0.456 0.016
#> SRR1700129 4 0.6748 0.12903 0.204 0.016 0.000 0.512 0.268
#> SRR1700130 4 0.7666 -0.03513 0.280 0.020 0.016 0.360 0.324
#> SRR1700132 3 0.7500 -0.10118 0.100 0.000 0.424 0.364 0.112
#> SRR1700131 3 0.4114 0.59959 0.024 0.000 0.732 0.244 0.000
#> SRR1700133 4 0.7276 0.33015 0.176 0.004 0.128 0.568 0.124
#> SRR1700134 4 0.7546 0.03480 0.144 0.088 0.000 0.456 0.312
#> SRR1700135 3 0.6371 0.45116 0.100 0.000 0.588 0.272 0.040
#> SRR1700136 3 0.4527 0.55743 0.040 0.000 0.700 0.260 0.000
#> SRR1700137 4 0.7059 0.36595 0.188 0.036 0.108 0.612 0.056
#> SRR1700138 4 0.7331 0.28689 0.176 0.004 0.324 0.456 0.040
#> SRR1700140 4 0.5877 0.40367 0.156 0.000 0.180 0.648 0.016
#> SRR1700139 4 0.5495 0.40293 0.120 0.000 0.148 0.704 0.028
#> SRR1700141 5 0.7930 0.27185 0.196 0.116 0.000 0.248 0.440
#> SRR1700142 3 0.4512 0.64794 0.080 0.000 0.772 0.136 0.012
#> SRR1700143 4 0.6159 0.32901 0.096 0.000 0.348 0.540 0.016
#> SRR1700144 3 0.6249 0.57180 0.144 0.000 0.652 0.144 0.060
#> SRR1700145 4 0.6353 0.37124 0.136 0.000 0.240 0.596 0.028
#> SRR1700146 5 0.8306 0.23057 0.152 0.200 0.000 0.300 0.348
#> SRR1700147 3 0.5908 0.47870 0.068 0.000 0.624 0.272 0.036
#> SRR1700149 3 0.5850 0.14810 0.096 0.000 0.476 0.428 0.000
#> SRR1700148 3 0.6227 0.38426 0.092 0.004 0.552 0.336 0.016
#> SRR1700150 4 0.8085 0.01711 0.208 0.016 0.064 0.388 0.324
#> SRR1700152 4 0.6889 0.37818 0.136 0.000 0.224 0.572 0.068
#> SRR1700151 4 0.6361 0.38998 0.124 0.000 0.236 0.604 0.036
#> SRR1700153 4 0.6224 0.31736 0.128 0.000 0.328 0.536 0.008
#> SRR1700154 4 0.6184 0.35455 0.108 0.000 0.316 0.560 0.016
#> SRR1700155 4 0.7937 0.33177 0.172 0.032 0.136 0.536 0.124
#> SRR1700156 3 0.6038 0.05129 0.100 0.000 0.452 0.444 0.004
#> SRR1700158 3 0.3675 0.61883 0.024 0.000 0.788 0.188 0.000
#> SRR1700159 2 0.7445 -0.16774 0.108 0.412 0.000 0.096 0.384
#> SRR1700157 3 0.6006 0.46472 0.116 0.000 0.596 0.276 0.012
#> SRR1700160 4 0.5789 0.28004 0.088 0.000 0.356 0.552 0.004
#> SRR1700161 3 0.5646 0.27717 0.080 0.000 0.520 0.400 0.000
#> SRR1700162 5 0.8191 0.39563 0.152 0.224 0.000 0.216 0.408
#> SRR1700164 3 0.5365 0.21421 0.044 0.000 0.512 0.440 0.004
#> SRR1700163 3 0.4817 0.51581 0.044 0.000 0.656 0.300 0.000
#> SRR1700165 3 0.5470 0.38552 0.072 0.000 0.564 0.364 0.000
#> SRR1700166 4 0.7101 0.34086 0.112 0.008 0.296 0.528 0.056
#> SRR1700168 5 0.7498 0.45887 0.124 0.196 0.000 0.156 0.524
#> SRR1700167 3 0.5126 0.51475 0.064 0.000 0.636 0.300 0.000
#> SRR1700170 4 0.6767 0.37239 0.176 0.004 0.148 0.608 0.064
#> SRR1700169 4 0.6826 -0.05062 0.156 0.000 0.404 0.420 0.020
#> SRR1700171 3 0.5606 0.33686 0.084 0.000 0.556 0.360 0.000
#> SRR1700172 4 0.8528 0.23364 0.212 0.064 0.144 0.476 0.104
#> SRR1700174 4 0.6339 0.40720 0.144 0.004 0.192 0.628 0.032
#> SRR1700173 4 0.6150 0.39419 0.164 0.016 0.116 0.672 0.032
#> SRR1700175 4 0.7194 0.31269 0.164 0.052 0.060 0.616 0.108
#> SRR1700176 3 0.3298 0.65211 0.036 0.000 0.856 0.096 0.012
#> SRR1700178 2 0.1211 0.64538 0.024 0.960 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700177 4 0.6605 0.36297 0.192 0.004 0.124 0.620 0.060
#> SRR1700180 2 0.2149 0.65236 0.048 0.916 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700179 2 0.1364 0.64602 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700181 2 0.1485 0.64915 0.020 0.948 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700183 3 0.0290 0.64269 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.1568 0.64777 0.020 0.944 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700184 2 0.2086 0.65600 0.048 0.924 0.000 0.008 0.020
#> SRR1700186 2 0.4612 0.63612 0.128 0.784 0.004 0.044 0.040
#> SRR1700187 3 0.0865 0.64799 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1700185 3 0.0451 0.64345 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1700188 2 0.1818 0.64997 0.044 0.932 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700192 3 0.7108 0.37711 0.120 0.136 0.624 0.088 0.032
#> SRR1700190 3 0.2077 0.65763 0.040 0.000 0.920 0.040 0.000
#> SRR1700191 3 0.0693 0.64406 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000
#> SRR1700189 3 0.2740 0.66056 0.064 0.000 0.888 0.044 0.004
#> SRR1700193 2 0.2729 0.66271 0.056 0.884 0.000 0.000 0.060
#> SRR1700195 2 0.3517 0.66851 0.068 0.832 0.000 0.000 0.100
#> SRR1700194 3 0.0404 0.64332 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.1661 0.65146 0.024 0.940 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700197 3 0.1195 0.64927 0.028 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1700198 2 0.2026 0.65032 0.044 0.928 0.000 0.012 0.016
#> SRR1700199 2 0.3934 0.65457 0.076 0.800 0.000 0.000 0.124
#> SRR1700200 2 0.3169 0.66647 0.060 0.856 0.000 0.000 0.084
#> SRR1700201 2 0.1403 0.64494 0.024 0.952 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700202 2 0.6822 0.54555 0.120 0.644 0.036 0.056 0.144
#> SRR1700203 2 0.3883 0.63442 0.036 0.780 0.000 0.000 0.184
#> SRR1700204 2 0.4753 0.63525 0.100 0.740 0.000 0.004 0.156
#> SRR1700206 2 0.8438 0.25754 0.184 0.500 0.068 0.132 0.116
#> SRR1700207 2 0.2511 0.64973 0.028 0.892 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700208 3 0.5546 0.60166 0.136 0.036 0.716 0.108 0.004
#> SRR1700205 2 0.5263 0.44817 0.056 0.616 0.000 0.004 0.324
#> SRR1700209 2 0.3301 0.66583 0.048 0.856 0.000 0.008 0.088
#> SRR1700210 2 0.4923 0.55539 0.068 0.680 0.000 0.000 0.252
#> SRR1700211 2 0.3333 0.66910 0.076 0.856 0.000 0.008 0.060
#> SRR1700212 2 0.5839 0.58988 0.132 0.668 0.000 0.028 0.172
#> SRR1700213 2 0.6277 0.53735 0.180 0.628 0.000 0.036 0.156
#> SRR1700214 2 0.3096 0.66144 0.040 0.868 0.000 0.008 0.084
#> SRR1700215 3 0.0579 0.64342 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1700217 2 0.3916 0.65952 0.056 0.804 0.000 0.004 0.136
#> SRR1700216 3 0.0451 0.64345 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1700218 2 0.6104 0.51480 0.220 0.636 0.004 0.024 0.116
#> SRR1700219 2 0.1670 0.65024 0.012 0.936 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700222 3 0.0510 0.64460 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.2511 0.65801 0.016 0.892 0.000 0.004 0.088
#> SRR1700221 2 0.2554 0.65676 0.072 0.892 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700223 2 0.3164 0.66751 0.044 0.852 0.000 0.000 0.104
#> SRR1700224 2 0.7550 0.19599 0.180 0.468 0.000 0.076 0.276
#> SRR1700226 2 0.4168 0.64697 0.052 0.764 0.000 0.000 0.184
#> SRR1700229 2 0.6288 0.31777 0.116 0.516 0.000 0.012 0.356
#> SRR1700225 2 0.7969 0.00645 0.240 0.416 0.016 0.052 0.276
#> SRR1700227 2 0.2790 0.66169 0.068 0.880 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700230 3 0.1300 0.65028 0.028 0.000 0.956 0.016 0.000
#> SRR1700231 2 0.3946 0.65922 0.100 0.820 0.000 0.016 0.064
#> SRR1700228 2 0.5942 0.58768 0.124 0.668 0.004 0.028 0.176
#> SRR1700232 2 0.3214 0.66271 0.036 0.844 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700233 2 0.3055 0.66858 0.064 0.864 0.000 0.000 0.072
#> SRR1700234 2 0.3865 0.66359 0.092 0.808 0.000 0.000 0.100
#> SRR1700235 2 0.6987 0.46796 0.192 0.608 0.016 0.092 0.092
#> SRR1700237 2 0.4353 0.66405 0.100 0.792 0.004 0.008 0.096
#> SRR1700236 2 0.4606 0.65691 0.112 0.768 0.000 0.012 0.108
#> SRR1700238 2 0.2438 0.65585 0.060 0.900 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700239 3 0.0912 0.64731 0.016 0.000 0.972 0.012 0.000
#> SRR1700240 3 0.0798 0.64489 0.016 0.000 0.976 0.008 0.000
#> SRR1700241 3 0.7370 0.21651 0.192 0.028 0.492 0.272 0.016
#> SRR1700243 2 0.2859 0.66340 0.056 0.876 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700244 2 0.4069 0.66731 0.096 0.792 0.000 0.000 0.112
#> SRR1700242 2 0.9140 -0.30072 0.184 0.388 0.232 0.112 0.084
#> SRR1700246 2 0.5656 0.45504 0.088 0.592 0.000 0.004 0.316
#> SRR1700245 2 0.3043 0.66325 0.080 0.864 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700247 3 0.2747 0.65399 0.060 0.000 0.888 0.048 0.004
#> SRR1700249 3 0.0566 0.64369 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR1700250 2 0.3649 0.66785 0.088 0.824 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700248 2 0.2885 0.66307 0.064 0.880 0.000 0.004 0.052
#> SRR1700251 2 0.3216 0.66312 0.044 0.848 0.000 0.000 0.108
#> SRR1700252 3 0.8883 -0.27167 0.200 0.220 0.396 0.144 0.040
#> SRR1700253 2 0.3192 0.66038 0.040 0.848 0.000 0.000 0.112
#> SRR1700256 2 0.5411 0.59381 0.092 0.664 0.000 0.008 0.236
#> SRR1700254 3 0.1710 0.65447 0.040 0.000 0.940 0.016 0.004
#> SRR1700255 2 0.2388 0.65849 0.028 0.900 0.000 0.000 0.072
#> SRR1700257 2 0.1331 0.64541 0.008 0.952 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700258 2 0.3355 0.65955 0.036 0.832 0.000 0.000 0.132
#> SRR1700259 2 0.3214 0.65031 0.036 0.844 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700260 5 0.5862 0.01830 0.084 0.420 0.000 0.004 0.492
#> SRR1700261 2 0.5808 0.23085 0.080 0.504 0.000 0.004 0.412
#> SRR1700262 2 0.5643 0.13183 0.064 0.492 0.000 0.004 0.440
#> SRR1700263 2 0.7349 -0.10088 0.172 0.400 0.000 0.048 0.380
#> SRR1700264 2 0.3956 0.66750 0.108 0.808 0.000 0.004 0.080
#> SRR1700265 2 0.8878 0.09952 0.232 0.408 0.092 0.068 0.200
#> SRR1700266 2 0.4429 0.63140 0.064 0.744 0.000 0.000 0.192
#> SRR1700268 3 0.8609 0.09054 0.180 0.096 0.476 0.172 0.076
#> SRR1700270 2 0.4299 0.66686 0.088 0.796 0.000 0.016 0.100
#> SRR1700267 2 0.3051 0.65483 0.028 0.852 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700271 2 0.3192 0.65638 0.040 0.848 0.000 0.000 0.112
#> SRR1700272 2 0.4701 0.58473 0.052 0.712 0.000 0.004 0.232
#> SRR1700273 2 0.5665 0.60944 0.120 0.688 0.004 0.020 0.168
#> SRR1700274 5 0.6515 0.25791 0.124 0.348 0.000 0.020 0.508
#> SRR1700277 3 0.4505 0.65520 0.088 0.004 0.772 0.132 0.004
#> SRR1700275 2 0.6232 0.41654 0.104 0.576 0.000 0.024 0.296
#> SRR1700276 2 0.4948 0.52353 0.036 0.672 0.000 0.012 0.280
#> SRR1700278 2 0.8612 -0.09482 0.188 0.400 0.048 0.080 0.284
#> SRR1700279 5 0.6019 0.25407 0.084 0.384 0.000 0.012 0.520
#> SRR1700280 2 0.5256 0.27625 0.048 0.532 0.000 0.000 0.420
#> SRR1700281 2 0.5795 0.58133 0.124 0.640 0.000 0.012 0.224
#> SRR1700283 5 0.5580 0.42933 0.064 0.320 0.000 0.012 0.604
#> SRR1700282 3 0.9389 -0.37222 0.232 0.116 0.368 0.140 0.144
#> SRR1700284 5 0.6260 0.35609 0.108 0.340 0.000 0.016 0.536
#> SRR1700285 2 0.8608 -0.25416 0.212 0.336 0.032 0.088 0.332
#> SRR1700286 2 0.6857 0.20463 0.148 0.476 0.000 0.028 0.348
#> SRR1700287 5 0.5606 0.29630 0.072 0.360 0.000 0.004 0.564
#> SRR1700290 3 0.3634 0.66481 0.076 0.000 0.832 0.088 0.004
#> SRR1700289 5 0.5104 0.52469 0.104 0.164 0.000 0.012 0.720
#> SRR1700288 2 0.6054 0.56767 0.124 0.644 0.000 0.032 0.200
#> SRR1700292 5 0.5583 0.41305 0.092 0.288 0.000 0.004 0.616
#> SRR1700291 4 0.8931 -0.16500 0.264 0.108 0.040 0.324 0.264
#> SRR1700293 2 0.8505 -0.01369 0.208 0.404 0.012 0.220 0.156
#> SRR1700294 5 0.5112 0.46616 0.064 0.268 0.000 0.004 0.664
#> SRR1700295 5 0.9093 -0.39848 0.224 0.028 0.192 0.268 0.288
#> SRR1700297 5 0.6237 0.47503 0.108 0.256 0.000 0.032 0.604
#> SRR1700296 5 0.5548 0.29710 0.060 0.356 0.000 0.008 0.576
#> SRR1700298 4 0.8896 -0.13431 0.268 0.116 0.032 0.296 0.288
#> SRR1700299 5 0.8501 -0.25002 0.252 0.016 0.120 0.220 0.392
#> SRR1700300 5 0.8738 -0.20177 0.248 0.032 0.140 0.180 0.400
#> SRR1700302 5 0.6341 0.48105 0.116 0.260 0.000 0.032 0.592
#> SRR1700301 5 0.5302 0.14043 0.052 0.412 0.000 0.000 0.536
#> SRR1700303 5 0.6377 0.25706 0.120 0.384 0.000 0.012 0.484
#> SRR1700304 2 0.5606 0.36884 0.068 0.584 0.000 0.008 0.340
#> SRR1700305 2 0.7334 0.06063 0.132 0.460 0.000 0.072 0.336
#> SRR1700306 5 0.8637 -0.40514 0.228 0.008 0.224 0.184 0.356
#> SRR1700308 5 0.8170 0.32022 0.248 0.164 0.032 0.084 0.472
#> SRR1700307 3 0.7254 0.16230 0.176 0.004 0.436 0.352 0.032
#> SRR1700309 3 0.7219 0.34954 0.164 0.000 0.548 0.200 0.088
#> SRR1700310 5 0.5619 0.21847 0.064 0.416 0.000 0.004 0.516
#> SRR1700311 5 0.8692 -0.08263 0.220 0.044 0.108 0.204 0.424
#> SRR1700312 5 0.8429 0.30532 0.196 0.140 0.032 0.164 0.468
#> SRR1700313 3 0.9015 -0.22060 0.228 0.048 0.384 0.188 0.152
#> SRR1700314 4 0.8733 0.01984 0.284 0.016 0.220 0.332 0.148
#> SRR1700315 5 0.8405 -0.26177 0.268 0.020 0.172 0.120 0.420
#> SRR1700316 1 0.9823 0.26228 0.272 0.124 0.200 0.208 0.196
#> SRR1700317 5 0.6205 0.21120 0.108 0.412 0.000 0.008 0.472
#> SRR1700318 5 0.7321 0.33215 0.144 0.332 0.000 0.064 0.460
#> SRR1700319 3 0.7837 -0.01533 0.164 0.000 0.428 0.300 0.108
#> SRR1700320 5 0.6308 0.22565 0.124 0.380 0.000 0.008 0.488
#> SRR1700322 5 0.8259 0.20803 0.220 0.076 0.052 0.164 0.488
#> SRR1700321 5 0.6394 0.21337 0.088 0.388 0.000 0.028 0.496
#> SRR1700323 5 0.9759 -0.15518 0.236 0.180 0.112 0.200 0.272
#> SRR1700324 2 0.6732 0.14715 0.116 0.500 0.000 0.036 0.348
#> SRR1700325 2 0.8285 0.20368 0.188 0.460 0.016 0.144 0.192
#> SRR1700326 5 0.9811 -0.43056 0.216 0.116 0.184 0.240 0.244
#> SRR1700327 2 0.6942 0.20662 0.168 0.480 0.000 0.028 0.324
#> SRR1700329 5 0.6267 0.44626 0.184 0.088 0.000 0.080 0.648
#> SRR1700328 3 0.8851 -0.30251 0.244 0.036 0.388 0.144 0.188
#> SRR1700330 3 0.8428 0.01719 0.224 0.024 0.428 0.220 0.104
#> SRR1700331 5 0.5282 0.48198 0.168 0.100 0.000 0.020 0.712
#> SRR1700332 5 0.7779 0.43581 0.180 0.188 0.000 0.144 0.488
#> SRR1700333 2 0.7807 -0.01242 0.172 0.420 0.004 0.080 0.324
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.6656 0.471556 0.156 0.560 0.000 0.028 0.204 0.052
#> SRR1699875 2 0.6571 0.464074 0.196 0.564 0.000 0.024 0.168 0.048
#> SRR1699876 5 0.6232 0.080729 0.136 0.400 0.000 0.008 0.436 0.020
#> SRR1699877 2 0.7742 0.185576 0.196 0.424 0.000 0.060 0.248 0.072
#> SRR1699879 2 0.6303 0.368203 0.136 0.536 0.000 0.028 0.284 0.016
#> SRR1699878 2 0.6410 0.130308 0.144 0.452 0.000 0.012 0.368 0.024
#> SRR1699880 3 0.3160 0.574799 0.008 0.000 0.840 0.048 0.000 0.104
#> SRR1699881 3 0.5424 0.499661 0.052 0.004 0.648 0.064 0.000 0.232
#> SRR1699882 2 0.6057 0.459254 0.136 0.556 0.000 0.016 0.276 0.016
#> SRR1699883 2 0.7259 0.070237 0.172 0.420 0.000 0.028 0.320 0.060
#> SRR1699884 2 0.6722 0.465999 0.176 0.564 0.000 0.028 0.168 0.064
#> SRR1699885 2 0.3826 0.620774 0.088 0.784 0.000 0.000 0.124 0.004
#> SRR1699886 5 0.7455 0.128783 0.212 0.344 0.000 0.024 0.352 0.068
#> SRR1699888 2 0.6390 0.523394 0.096 0.604 0.000 0.052 0.204 0.044
#> SRR1699889 5 0.7543 0.205000 0.260 0.088 0.000 0.084 0.472 0.096
#> SRR1699890 2 0.5477 0.132524 0.096 0.476 0.000 0.000 0.420 0.008
#> SRR1699887 2 0.5817 0.446022 0.132 0.580 0.000 0.000 0.256 0.032
#> SRR1699891 5 0.4969 0.419191 0.092 0.256 0.000 0.000 0.644 0.008
#> SRR1699892 6 0.9751 -0.245265 0.180 0.116 0.108 0.144 0.200 0.252
#> SRR1699893 4 0.9013 -0.182434 0.216 0.032 0.056 0.256 0.244 0.196
#> SRR1699894 5 0.5241 0.376570 0.072 0.276 0.000 0.000 0.624 0.028
#> SRR1699895 5 0.5499 0.433303 0.116 0.236 0.000 0.004 0.624 0.020
#> SRR1699896 6 0.9859 0.005518 0.208 0.128 0.176 0.144 0.124 0.220
#> SRR1699897 2 0.8621 -0.089984 0.228 0.348 0.020 0.052 0.200 0.152
#> SRR1699898 3 0.5127 0.531113 0.024 0.000 0.668 0.204 0.000 0.104
#> SRR1699900 3 0.9261 -0.437862 0.192 0.020 0.228 0.216 0.132 0.212
#> SRR1699899 5 0.7873 0.218156 0.208 0.128 0.004 0.096 0.472 0.092
#> SRR1699902 3 0.7362 0.114900 0.076 0.000 0.436 0.172 0.028 0.288
#> SRR1699901 3 0.3387 0.571933 0.020 0.000 0.836 0.072 0.000 0.072
#> SRR1699903 5 0.5948 0.276846 0.212 0.040 0.000 0.044 0.636 0.068
#> SRR1699904 5 0.6118 0.428524 0.152 0.232 0.000 0.012 0.576 0.028
#> SRR1699905 3 0.6951 0.320900 0.080 0.000 0.520 0.240 0.024 0.136
#> SRR1699906 5 0.5639 0.350489 0.132 0.292 0.000 0.004 0.564 0.008
#> SRR1699907 5 0.5479 0.338944 0.160 0.056 0.000 0.044 0.696 0.044
#> SRR1699908 5 0.7944 0.280112 0.184 0.200 0.000 0.112 0.436 0.068
#> SRR1699909 5 0.8082 -0.041838 0.264 0.060 0.008 0.088 0.400 0.180
#> SRR1699910 3 0.9023 -0.450364 0.156 0.008 0.256 0.136 0.228 0.216
#> SRR1699911 5 0.7139 0.200871 0.240 0.080 0.000 0.032 0.504 0.144
#> SRR1699912 5 0.5490 0.330504 0.144 0.064 0.000 0.032 0.700 0.060
#> SRR1699913 5 0.6733 0.381579 0.164 0.160 0.000 0.056 0.576 0.044
#> SRR1699914 3 0.4206 0.575209 0.036 0.000 0.784 0.064 0.004 0.112
#> SRR1699915 5 0.6942 0.202937 0.188 0.044 0.012 0.068 0.580 0.108
#> SRR1699916 5 0.7217 0.356201 0.148 0.288 0.000 0.036 0.464 0.064
#> SRR1699917 5 0.7762 0.222114 0.232 0.128 0.004 0.104 0.468 0.064
#> SRR1699918 5 0.8570 0.037803 0.184 0.136 0.012 0.120 0.404 0.144
#> SRR1699919 5 0.6798 0.319705 0.216 0.104 0.000 0.048 0.564 0.068
#> SRR1699920 5 0.9084 -0.337917 0.168 0.024 0.104 0.184 0.308 0.212
#> SRR1699921 5 0.7290 0.228347 0.204 0.056 0.012 0.076 0.544 0.108
#> SRR1699922 5 0.7200 0.312279 0.176 0.320 0.000 0.032 0.424 0.048
#> SRR1699923 3 0.7198 0.287606 0.088 0.000 0.512 0.184 0.032 0.184
#> SRR1699924 3 0.7319 0.261191 0.096 0.000 0.488 0.192 0.028 0.196
#> SRR1699925 3 0.0000 0.552707 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.8457 -0.255597 0.208 0.008 0.132 0.112 0.404 0.136
#> SRR1699927 5 0.5665 0.408227 0.184 0.140 0.000 0.012 0.640 0.024
#> SRR1699929 5 0.9127 -0.308151 0.280 0.100 0.076 0.064 0.284 0.196
#> SRR1699928 5 0.5776 0.405402 0.136 0.144 0.000 0.028 0.660 0.032
#> SRR1699930 5 0.4094 0.428220 0.040 0.224 0.000 0.000 0.728 0.008
#> SRR1699931 1 0.9689 0.232094 0.260 0.136 0.108 0.108 0.172 0.216
#> SRR1699933 3 0.8814 -0.412191 0.204 0.020 0.296 0.056 0.188 0.236
#> SRR1699932 5 0.7137 0.328582 0.184 0.320 0.000 0.040 0.424 0.032
#> SRR1699934 3 0.0000 0.552707 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 1 0.9294 0.306401 0.268 0.116 0.036 0.144 0.228 0.208
#> SRR1699936 2 0.4586 0.587406 0.068 0.704 0.000 0.004 0.216 0.008
#> SRR1699937 2 0.8155 0.080660 0.152 0.460 0.068 0.076 0.032 0.212
#> SRR1699938 2 0.2781 0.609855 0.048 0.876 0.000 0.008 0.064 0.004
#> SRR1699940 3 0.9290 -0.308115 0.164 0.080 0.352 0.120 0.104 0.180
#> SRR1699939 2 0.5349 0.586225 0.112 0.668 0.000 0.004 0.184 0.032
#> SRR1699941 3 0.4791 0.549816 0.064 0.000 0.732 0.048 0.004 0.152
#> SRR1699942 2 0.8418 -0.022984 0.216 0.364 0.004 0.136 0.208 0.072
#> SRR1699943 2 0.3958 0.613267 0.096 0.808 0.000 0.008 0.052 0.036
#> SRR1699944 2 0.6031 0.561996 0.116 0.632 0.000 0.020 0.180 0.052
#> SRR1699945 3 0.2425 0.570693 0.008 0.000 0.880 0.012 0.000 0.100
#> SRR1699946 2 0.6947 0.488148 0.136 0.592 0.012 0.040 0.088 0.132
#> SRR1699947 2 0.7642 0.392968 0.160 0.524 0.044 0.020 0.132 0.120
#> SRR1699948 2 0.3517 0.621762 0.080 0.836 0.000 0.008 0.056 0.020
#> SRR1699949 2 0.5260 0.518824 0.096 0.628 0.000 0.004 0.260 0.012
#> SRR1699950 2 0.4335 0.619666 0.096 0.764 0.000 0.008 0.120 0.012
#> SRR1699951 2 0.7936 0.279282 0.192 0.452 0.000 0.076 0.144 0.136
#> SRR1699952 2 0.8365 0.056687 0.176 0.388 0.008 0.056 0.188 0.184
#> SRR1699953 2 0.4797 0.623118 0.100 0.748 0.000 0.012 0.100 0.040
#> SRR1699954 3 0.9094 -0.371711 0.124 0.232 0.324 0.076 0.052 0.192
#> SRR1699955 2 0.3354 0.612236 0.060 0.812 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1699956 3 0.3139 0.577141 0.020 0.000 0.852 0.048 0.000 0.080
#> SRR1699957 2 0.7397 0.126151 0.184 0.404 0.000 0.016 0.304 0.092
#> SRR1699959 3 0.8522 -0.203312 0.148 0.032 0.372 0.176 0.036 0.236
#> SRR1699958 4 0.8573 -0.164404 0.192 0.120 0.012 0.400 0.152 0.124
#> SRR1699960 2 0.6006 0.507307 0.092 0.584 0.000 0.032 0.272 0.020
#> SRR1699961 3 0.7241 0.104436 0.096 0.016 0.440 0.108 0.008 0.332
#> SRR1699962 2 0.5286 0.583369 0.108 0.680 0.000 0.008 0.176 0.028
#> SRR1699963 6 0.9242 -0.290439 0.180 0.212 0.024 0.204 0.120 0.260
#> SRR1699964 1 0.9130 0.115187 0.264 0.220 0.032 0.080 0.240 0.164
#> SRR1699965 2 0.3054 0.612691 0.040 0.840 0.000 0.000 0.116 0.004
#> SRR1699966 6 0.9552 -0.053312 0.180 0.120 0.108 0.240 0.088 0.264
#> SRR1699967 2 0.6990 0.440499 0.208 0.552 0.000 0.052 0.100 0.088
#> SRR1699968 5 0.8655 0.068576 0.200 0.240 0.000 0.104 0.300 0.156
#> SRR1699969 3 0.5427 0.529811 0.028 0.000 0.660 0.148 0.004 0.160
#> SRR1699971 3 0.7574 0.128248 0.084 0.016 0.440 0.204 0.012 0.244
#> SRR1699970 2 0.6156 0.549540 0.132 0.612 0.000 0.024 0.192 0.040
#> SRR1699972 3 0.7244 0.102642 0.092 0.000 0.436 0.232 0.008 0.232
#> SRR1699973 6 0.9143 -0.367025 0.236 0.168 0.012 0.188 0.152 0.244
#> SRR1699974 3 0.1863 0.566796 0.004 0.000 0.920 0.016 0.000 0.060
#> SRR1699975 5 0.7752 -0.118912 0.248 0.016 0.008 0.136 0.420 0.172
#> SRR1699976 6 0.9374 0.248813 0.132 0.120 0.240 0.116 0.080 0.312
#> SRR1699977 3 0.7932 -0.223222 0.116 0.000 0.312 0.284 0.028 0.260
#> SRR1699978 3 0.3093 0.577568 0.012 0.000 0.852 0.076 0.000 0.060
#> SRR1699979 3 0.8193 -0.285097 0.152 0.012 0.292 0.272 0.016 0.256
#> SRR1699980 5 0.7735 0.209172 0.228 0.092 0.000 0.092 0.468 0.120
#> SRR1699981 3 0.7021 0.202375 0.072 0.000 0.464 0.280 0.012 0.172
#> SRR1699982 5 0.6250 0.405340 0.160 0.196 0.000 0.016 0.588 0.040
#> SRR1699983 5 0.6743 0.327654 0.232 0.108 0.000 0.036 0.556 0.068
#> SRR1699984 3 0.0146 0.552489 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699985 5 0.8221 0.179484 0.252 0.244 0.000 0.056 0.328 0.120
#> SRR1699986 3 0.1970 0.570684 0.008 0.000 0.920 0.028 0.000 0.044
#> SRR1699988 5 0.8453 0.073607 0.208 0.256 0.000 0.092 0.324 0.120
#> SRR1699987 6 0.8275 0.009720 0.124 0.004 0.252 0.284 0.044 0.292
#> SRR1699989 5 0.7985 0.145573 0.188 0.120 0.000 0.112 0.456 0.124
#> SRR1699990 6 0.8455 0.203968 0.132 0.008 0.296 0.160 0.072 0.332
#> SRR1699992 3 0.8712 -0.251153 0.096 0.124 0.368 0.124 0.028 0.260
#> SRR1699991 3 0.6481 0.309017 0.036 0.000 0.504 0.228 0.004 0.228
#> SRR1699993 3 0.6498 0.404323 0.076 0.000 0.568 0.176 0.008 0.172
#> SRR1699994 3 0.4900 0.537841 0.040 0.000 0.712 0.044 0.012 0.192
#> SRR1699995 3 0.1719 0.566769 0.000 0.000 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1699996 5 0.9563 -0.241337 0.160 0.244 0.080 0.100 0.252 0.164
#> SRR1699997 4 0.7750 0.255442 0.140 0.032 0.032 0.508 0.108 0.180
#> SRR1699998 1 0.9392 0.238921 0.236 0.200 0.036 0.124 0.232 0.172
#> SRR1699999 3 0.0777 0.557148 0.000 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1700000 1 0.9629 0.130943 0.224 0.060 0.128 0.196 0.200 0.192
#> SRR1700002 6 0.8559 0.167350 0.124 0.064 0.228 0.240 0.012 0.332
#> SRR1700001 3 0.5701 0.501658 0.064 0.000 0.652 0.088 0.008 0.188
#> SRR1700003 4 0.8856 0.023669 0.232 0.048 0.060 0.340 0.104 0.216
#> SRR1700004 3 0.4867 0.542239 0.028 0.000 0.700 0.064 0.004 0.204
#> SRR1700005 3 0.0405 0.554871 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700006 3 0.7411 -0.020266 0.096 0.004 0.392 0.224 0.004 0.280
#> SRR1700007 5 0.5276 0.090349 0.068 0.412 0.000 0.000 0.508 0.012
#> SRR1700008 3 0.7279 0.120961 0.092 0.000 0.420 0.268 0.008 0.212
#> SRR1700009 3 0.0291 0.553480 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700010 3 0.2669 0.569426 0.004 0.000 0.864 0.024 0.000 0.108
#> SRR1700011 2 0.6004 0.418006 0.112 0.572 0.000 0.016 0.276 0.024
#> SRR1700013 3 0.9376 -0.432327 0.140 0.124 0.276 0.212 0.044 0.204
#> SRR1700012 6 0.9624 -0.230427 0.192 0.080 0.092 0.204 0.208 0.224
#> SRR1700014 6 0.8129 0.205556 0.148 0.016 0.300 0.188 0.016 0.332
#> SRR1700015 3 0.7936 -0.029207 0.096 0.060 0.428 0.120 0.012 0.284
#> SRR1700016 3 0.2432 0.570111 0.016 0.000 0.892 0.020 0.000 0.072
#> SRR1700018 6 0.7995 0.226020 0.068 0.040 0.272 0.220 0.016 0.384
#> SRR1700017 3 0.6674 0.279284 0.076 0.000 0.500 0.120 0.008 0.296
#> SRR1700019 5 0.5959 -0.042185 0.120 0.412 0.000 0.004 0.448 0.016
#> SRR1700020 3 0.4996 0.541321 0.024 0.000 0.692 0.164 0.000 0.120
#> SRR1700021 5 0.8543 0.151524 0.248 0.172 0.008 0.108 0.360 0.104
#> SRR1700023 6 0.8342 0.251938 0.160 0.020 0.268 0.148 0.036 0.368
#> SRR1700022 3 0.5369 0.504792 0.032 0.000 0.644 0.104 0.000 0.220
#> SRR1700024 5 0.8525 0.041525 0.224 0.160 0.000 0.104 0.348 0.164
#> SRR1700025 6 0.8940 0.296127 0.128 0.084 0.256 0.112 0.060 0.360
#> SRR1700026 6 0.8026 0.274423 0.112 0.028 0.308 0.128 0.028 0.396
#> SRR1700027 6 0.8071 0.288093 0.112 0.032 0.280 0.144 0.024 0.408
#> SRR1700028 4 0.9257 -0.245211 0.184 0.096 0.036 0.280 0.196 0.208
#> SRR1700029 3 0.8083 -0.131762 0.112 0.016 0.380 0.236 0.024 0.232
#> SRR1700030 5 0.8563 -0.217915 0.248 0.064 0.004 0.168 0.304 0.212
#> SRR1700031 3 0.3691 0.566372 0.004 0.000 0.780 0.048 0.000 0.168
#> SRR1700032 6 0.8725 -0.291964 0.148 0.308 0.040 0.052 0.136 0.316
#> SRR1700034 3 0.0865 0.557127 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700035 5 0.7626 0.214614 0.220 0.072 0.004 0.088 0.492 0.124
#> SRR1700033 3 0.4701 0.533874 0.028 0.000 0.700 0.056 0.000 0.216
#> SRR1700036 6 0.9499 -0.313582 0.188 0.176 0.052 0.116 0.216 0.252
#> SRR1700037 5 0.6489 0.433364 0.124 0.256 0.000 0.024 0.552 0.044
#> SRR1700038 3 0.9036 -0.287771 0.176 0.044 0.348 0.100 0.112 0.220
#> SRR1700039 3 0.4142 0.567271 0.024 0.000 0.764 0.052 0.000 0.160
#> SRR1700040 3 0.5117 0.542263 0.040 0.000 0.688 0.096 0.000 0.176
#> SRR1700041 3 0.8006 -0.142664 0.088 0.012 0.352 0.248 0.028 0.272
#> SRR1700042 3 0.4772 0.547557 0.016 0.000 0.708 0.084 0.004 0.188
#> SRR1700043 3 0.6687 0.297031 0.072 0.000 0.512 0.168 0.004 0.244
#> SRR1700045 3 0.6916 0.234656 0.076 0.000 0.476 0.212 0.004 0.232
#> SRR1700044 6 0.9391 -0.195420 0.156 0.100 0.072 0.184 0.164 0.324
#> SRR1700046 3 0.7810 -0.168208 0.128 0.004 0.344 0.172 0.020 0.332
#> SRR1700047 3 0.4917 0.549143 0.040 0.000 0.708 0.084 0.000 0.168
#> SRR1700048 6 0.8998 0.157227 0.176 0.008 0.220 0.156 0.152 0.288
#> SRR1700049 3 0.1124 0.560673 0.000 0.000 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1700050 3 0.4185 0.572120 0.012 0.000 0.772 0.096 0.004 0.116
#> SRR1700051 3 0.2872 0.576105 0.008 0.000 0.864 0.052 0.000 0.076
#> SRR1700052 3 0.3946 0.570285 0.040 0.000 0.792 0.028 0.004 0.136
#> SRR1700053 6 0.8997 0.189483 0.188 0.016 0.228 0.148 0.116 0.304
#> SRR1700054 6 0.7562 0.186229 0.108 0.000 0.344 0.188 0.016 0.344
#> SRR1700055 3 0.0000 0.552707 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.6075 0.387841 0.020 0.000 0.524 0.252 0.000 0.204
#> SRR1700057 3 0.7221 0.050004 0.060 0.000 0.380 0.356 0.020 0.184
#> SRR1700058 3 0.3088 0.573954 0.000 0.000 0.832 0.048 0.000 0.120
#> SRR1700059 4 0.7434 0.221890 0.104 0.000 0.148 0.464 0.032 0.252
#> SRR1700060 3 0.3054 0.577068 0.004 0.000 0.840 0.040 0.000 0.116
#> SRR1700061 3 0.7001 0.216470 0.104 0.000 0.480 0.140 0.008 0.268
#> SRR1700062 3 0.4574 0.558268 0.008 0.000 0.716 0.164 0.000 0.112
#> SRR1700063 3 0.6230 0.413410 0.040 0.000 0.552 0.160 0.004 0.244
#> SRR1700064 6 0.9111 0.138002 0.208 0.020 0.244 0.096 0.188 0.244
#> SRR1700065 3 0.5185 0.538749 0.048 0.000 0.708 0.096 0.008 0.140
#> SRR1700066 3 0.4645 0.555214 0.024 0.000 0.732 0.076 0.004 0.164
#> SRR1700067 5 0.7695 0.101703 0.216 0.068 0.000 0.104 0.472 0.140
#> SRR1700068 3 0.7238 0.142406 0.084 0.000 0.416 0.280 0.008 0.212
#> SRR1700069 5 0.8935 -0.239416 0.220 0.064 0.060 0.096 0.344 0.216
#> SRR1700070 2 0.8497 -0.152134 0.180 0.320 0.000 0.072 0.208 0.220
#> SRR1700071 6 0.7799 0.268966 0.140 0.008 0.304 0.112 0.032 0.404
#> SRR1700072 3 0.8003 -0.080641 0.164 0.000 0.420 0.100 0.080 0.236
#> SRR1700073 5 0.8067 -0.102241 0.212 0.036 0.012 0.136 0.424 0.180
#> SRR1700075 3 0.7499 0.138887 0.108 0.000 0.464 0.108 0.052 0.268
#> SRR1700074 3 0.6798 0.089931 0.056 0.000 0.424 0.152 0.008 0.360
#> SRR1700076 6 0.8535 0.291496 0.112 0.064 0.284 0.128 0.036 0.376
#> SRR1700077 6 0.8156 0.283688 0.120 0.016 0.316 0.136 0.044 0.368
#> SRR1700078 6 0.8245 0.273358 0.104 0.000 0.308 0.160 0.092 0.336
#> SRR1700080 6 0.8934 0.231201 0.164 0.020 0.204 0.128 0.136 0.348
#> SRR1700079 3 0.7156 0.101733 0.064 0.000 0.404 0.272 0.008 0.252
#> SRR1700081 3 0.3577 0.579438 0.012 0.000 0.812 0.060 0.000 0.116
#> SRR1700082 3 0.6093 0.435472 0.048 0.000 0.588 0.148 0.004 0.212
#> SRR1700083 3 0.5706 0.482894 0.024 0.000 0.600 0.168 0.000 0.208
#> SRR1700084 3 0.3084 0.570613 0.004 0.000 0.832 0.032 0.000 0.132
#> SRR1700085 2 0.8146 -0.260587 0.224 0.308 0.000 0.060 0.308 0.100
#> SRR1700086 5 0.9043 -0.324392 0.248 0.048 0.048 0.156 0.252 0.248
#> SRR1700087 4 0.8324 0.188516 0.176 0.008 0.168 0.408 0.064 0.176
#> SRR1700088 6 0.9491 0.105809 0.172 0.116 0.144 0.172 0.080 0.316
#> SRR1700089 4 0.9591 -0.017390 0.128 0.140 0.196 0.292 0.084 0.160
#> SRR1700091 2 0.8750 -0.199873 0.152 0.364 0.020 0.224 0.088 0.152
#> SRR1700090 4 0.5949 0.324653 0.072 0.000 0.172 0.616 0.000 0.140
#> SRR1700092 1 0.9067 0.243840 0.248 0.232 0.008 0.200 0.148 0.164
#> SRR1700094 3 0.8176 -0.210718 0.068 0.036 0.328 0.288 0.024 0.256
#> SRR1700093 4 0.7804 0.279165 0.136 0.016 0.124 0.484 0.040 0.200
#> SRR1700095 3 0.6994 0.052025 0.100 0.000 0.408 0.356 0.004 0.132
#> SRR1700096 3 0.6423 0.332553 0.056 0.000 0.488 0.316 0.000 0.140
#> SRR1700097 3 0.5063 0.522753 0.016 0.000 0.664 0.232 0.004 0.084
#> SRR1700098 2 0.8376 -0.040269 0.128 0.420 0.020 0.220 0.068 0.144
#> SRR1700099 4 0.8659 -0.217062 0.108 0.216 0.024 0.392 0.160 0.100
#> SRR1700100 4 0.8032 0.224464 0.144 0.008 0.196 0.412 0.032 0.208
#> SRR1700101 4 0.8510 0.143534 0.144 0.116 0.060 0.436 0.048 0.196
#> SRR1700102 4 0.9118 -0.249729 0.200 0.196 0.032 0.324 0.116 0.132
#> SRR1700104 4 0.6739 0.341276 0.132 0.008 0.100 0.592 0.020 0.148
#> SRR1700103 3 0.7730 -0.060410 0.104 0.004 0.372 0.304 0.020 0.196
#> SRR1700105 4 0.9422 0.039053 0.232 0.092 0.108 0.308 0.108 0.152
#> SRR1700106 5 0.9203 -0.351516 0.160 0.044 0.104 0.272 0.284 0.136
#> SRR1700107 4 0.7936 -0.048892 0.168 0.120 0.000 0.468 0.112 0.132
#> SRR1700108 2 0.8538 -0.341807 0.152 0.300 0.000 0.296 0.128 0.124
#> SRR1700109 2 0.7116 0.348116 0.184 0.508 0.000 0.084 0.200 0.024
#> SRR1700110 2 0.6547 0.424928 0.100 0.568 0.000 0.060 0.240 0.032
#> SRR1700112 2 0.8376 -0.102772 0.144 0.352 0.000 0.196 0.232 0.076
#> SRR1700111 4 0.8602 0.115808 0.132 0.000 0.212 0.344 0.140 0.172
#> SRR1700113 5 0.7963 0.275658 0.228 0.208 0.000 0.124 0.396 0.044
#> SRR1700114 4 0.7255 0.100504 0.072 0.000 0.268 0.432 0.016 0.212
#> SRR1700115 4 0.7974 0.042944 0.192 0.128 0.012 0.480 0.084 0.104
#> SRR1700116 4 0.7193 0.303803 0.132 0.000 0.136 0.528 0.032 0.172
#> SRR1700117 3 0.6481 0.399685 0.056 0.000 0.556 0.244 0.016 0.128
#> SRR1700119 4 0.7131 0.148613 0.112 0.000 0.320 0.452 0.024 0.092
#> SRR1700118 4 0.8455 0.173625 0.204 0.000 0.128 0.348 0.096 0.224
#> SRR1700120 3 0.5591 0.466737 0.040 0.000 0.596 0.280 0.000 0.084
#> SRR1700121 4 0.9021 0.000121 0.172 0.064 0.076 0.380 0.136 0.172
#> SRR1700122 5 0.6764 0.265005 0.176 0.060 0.000 0.120 0.584 0.060
#> SRR1700123 4 0.7036 0.112917 0.068 0.000 0.336 0.432 0.016 0.148
#> SRR1700125 5 0.7693 0.323524 0.160 0.292 0.000 0.124 0.396 0.028
#> SRR1700126 3 0.4267 0.571616 0.016 0.000 0.760 0.120 0.000 0.104
#> SRR1700127 3 0.6251 0.273127 0.028 0.000 0.464 0.344 0.000 0.164
#> SRR1700124 4 0.6978 0.268881 0.124 0.000 0.172 0.516 0.008 0.180
#> SRR1700128 4 0.7164 0.143100 0.080 0.000 0.280 0.444 0.012 0.184
#> SRR1700129 4 0.7988 -0.049185 0.188 0.036 0.008 0.428 0.204 0.136
#> SRR1700130 4 0.8347 -0.156038 0.204 0.024 0.036 0.356 0.272 0.108
#> SRR1700132 3 0.7709 -0.066748 0.100 0.000 0.372 0.300 0.028 0.200
#> SRR1700131 3 0.5218 0.507419 0.024 0.000 0.644 0.240 0.000 0.092
#> SRR1700133 4 0.8299 0.244935 0.168 0.008 0.144 0.432 0.088 0.160
#> SRR1700134 4 0.7639 -0.126996 0.232 0.040 0.000 0.408 0.248 0.072
#> SRR1700135 3 0.6627 0.385723 0.084 0.000 0.552 0.224 0.012 0.128
#> SRR1700136 3 0.5358 0.452515 0.028 0.000 0.604 0.292 0.000 0.076
#> SRR1700137 4 0.8587 0.246043 0.140 0.052 0.084 0.452 0.132 0.140
#> SRR1700138 4 0.7772 0.158041 0.136 0.000 0.292 0.396 0.036 0.140
#> SRR1700140 4 0.6800 0.298239 0.112 0.000 0.160 0.540 0.008 0.180
#> SRR1700139 4 0.6139 0.356973 0.092 0.000 0.136 0.640 0.020 0.112
#> SRR1700141 5 0.8148 0.133730 0.220 0.120 0.000 0.160 0.412 0.088
#> SRR1700142 3 0.5670 0.514100 0.052 0.000 0.652 0.156 0.004 0.136
#> SRR1700143 4 0.5951 0.236494 0.072 0.000 0.276 0.572 0.000 0.080
#> SRR1700144 3 0.6933 0.343313 0.080 0.000 0.528 0.172 0.020 0.200
#> SRR1700145 4 0.6690 0.258220 0.076 0.000 0.260 0.540 0.024 0.100
#> SRR1700146 4 0.8619 -0.336585 0.156 0.184 0.000 0.284 0.276 0.100
#> SRR1700147 3 0.6197 0.377390 0.032 0.000 0.524 0.296 0.004 0.144
#> SRR1700149 3 0.6150 0.098103 0.024 0.000 0.428 0.400 0.000 0.148
#> SRR1700148 3 0.6412 0.277382 0.028 0.000 0.476 0.344 0.012 0.140
#> SRR1700150 4 0.8441 -0.051654 0.292 0.016 0.044 0.324 0.192 0.132
#> SRR1700152 4 0.7926 0.276837 0.140 0.008 0.212 0.460 0.056 0.124
#> SRR1700151 4 0.6822 0.282529 0.084 0.000 0.192 0.532 0.012 0.180
#> SRR1700153 4 0.7022 0.136007 0.084 0.000 0.324 0.444 0.012 0.136
#> SRR1700154 4 0.6987 0.180365 0.056 0.000 0.288 0.460 0.016 0.180
#> SRR1700155 4 0.8523 0.279095 0.196 0.040 0.120 0.432 0.068 0.144
#> SRR1700156 3 0.6197 0.194332 0.036 0.000 0.444 0.392 0.000 0.128
#> SRR1700158 3 0.4673 0.525909 0.016 0.000 0.684 0.240 0.000 0.060
#> SRR1700159 5 0.7828 0.322769 0.180 0.280 0.000 0.096 0.396 0.048
#> SRR1700157 3 0.6571 0.296897 0.040 0.000 0.496 0.280 0.008 0.176
#> SRR1700160 4 0.6520 0.247081 0.056 0.000 0.232 0.540 0.008 0.164
#> SRR1700161 3 0.6335 0.117969 0.040 0.000 0.416 0.404 0.000 0.140
#> SRR1700162 5 0.8402 0.036024 0.192 0.172 0.000 0.244 0.328 0.064
#> SRR1700164 3 0.6269 0.280315 0.032 0.000 0.480 0.360 0.008 0.120
#> SRR1700163 3 0.5642 0.441905 0.024 0.000 0.576 0.288 0.000 0.112
#> SRR1700165 3 0.6241 0.365780 0.048 0.000 0.524 0.288 0.000 0.140
#> SRR1700166 4 0.7940 0.280114 0.128 0.008 0.176 0.476 0.068 0.144
#> SRR1700168 5 0.7992 0.254770 0.168 0.180 0.000 0.132 0.444 0.076
#> SRR1700167 3 0.5320 0.448255 0.020 0.000 0.600 0.296 0.000 0.084
#> SRR1700170 4 0.7302 0.325819 0.116 0.000 0.100 0.540 0.076 0.168
#> SRR1700169 3 0.7467 0.039194 0.100 0.000 0.384 0.296 0.012 0.208
#> SRR1700171 3 0.6732 0.230511 0.080 0.000 0.472 0.336 0.012 0.100
#> SRR1700172 4 0.8968 0.167148 0.176 0.052 0.100 0.392 0.132 0.148
#> SRR1700174 4 0.7222 0.343787 0.104 0.016 0.152 0.560 0.032 0.136
#> SRR1700173 4 0.6646 0.349668 0.120 0.004 0.092 0.616 0.044 0.124
#> SRR1700175 4 0.8179 0.271035 0.168 0.008 0.092 0.448 0.112 0.172
#> SRR1700176 3 0.3710 0.573021 0.016 0.000 0.804 0.120 0.000 0.060
#> SRR1700178 2 0.1644 0.597746 0.028 0.932 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700177 4 0.6816 0.331186 0.108 0.000 0.128 0.576 0.032 0.156
#> SRR1700180 2 0.2100 0.603078 0.036 0.916 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR1700179 2 0.2144 0.604779 0.032 0.912 0.000 0.004 0.048 0.004
#> SRR1700181 2 0.2134 0.602110 0.044 0.904 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700183 3 0.0405 0.554137 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700182 2 0.1908 0.600136 0.056 0.916 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700184 2 0.2979 0.615199 0.036 0.876 0.000 0.016 0.052 0.020
#> SRR1700186 2 0.5102 0.591353 0.096 0.748 0.008 0.028 0.044 0.076
#> SRR1700187 3 0.1952 0.566137 0.012 0.000 0.920 0.016 0.000 0.052
#> SRR1700185 3 0.0603 0.554789 0.004 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700188 2 0.2088 0.604938 0.068 0.904 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700192 3 0.8195 0.035924 0.132 0.128 0.492 0.080 0.036 0.132
#> SRR1700190 3 0.3048 0.572155 0.008 0.000 0.848 0.044 0.000 0.100
#> SRR1700191 3 0.0405 0.554276 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700189 3 0.3938 0.565937 0.036 0.000 0.808 0.072 0.004 0.080
#> SRR1700193 2 0.4037 0.623611 0.072 0.796 0.000 0.008 0.104 0.020
#> SRR1700195 2 0.4212 0.621264 0.096 0.772 0.000 0.000 0.108 0.024
#> SRR1700194 3 0.1036 0.559793 0.004 0.000 0.964 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700196 2 0.3029 0.620938 0.088 0.852 0.000 0.000 0.052 0.008
#> SRR1700197 3 0.1578 0.562758 0.012 0.000 0.936 0.004 0.000 0.048
#> SRR1700198 2 0.2476 0.611319 0.072 0.888 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1700199 2 0.4999 0.589513 0.108 0.696 0.000 0.004 0.172 0.020
#> SRR1700200 2 0.3942 0.617628 0.092 0.780 0.000 0.000 0.120 0.008
#> SRR1700201 2 0.1049 0.591728 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700202 2 0.8119 0.274153 0.148 0.500 0.052 0.076 0.152 0.072
#> SRR1700203 2 0.4818 0.576980 0.092 0.700 0.000 0.008 0.192 0.008
#> SRR1700204 2 0.5916 0.555629 0.156 0.628 0.000 0.020 0.168 0.028
#> SRR1700206 2 0.8723 0.130969 0.188 0.428 0.056 0.108 0.096 0.124
#> SRR1700207 2 0.2457 0.606498 0.036 0.880 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1700208 3 0.6951 0.344162 0.076 0.052 0.584 0.108 0.008 0.172
#> SRR1700205 2 0.5910 0.452412 0.112 0.564 0.000 0.012 0.292 0.020
#> SRR1700209 2 0.4505 0.612745 0.072 0.764 0.000 0.012 0.124 0.028
#> SRR1700210 2 0.5299 0.486252 0.116 0.608 0.000 0.004 0.268 0.004
#> SRR1700211 2 0.5533 0.594064 0.164 0.664 0.000 0.016 0.132 0.024
#> SRR1700212 2 0.6394 0.509293 0.188 0.584 0.000 0.016 0.156 0.056
#> SRR1700213 2 0.8084 0.177393 0.232 0.420 0.004 0.060 0.140 0.144
#> SRR1700214 2 0.4295 0.623734 0.104 0.780 0.000 0.016 0.084 0.016
#> SRR1700215 3 0.0000 0.552707 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.3471 0.622788 0.056 0.824 0.000 0.008 0.108 0.004
#> SRR1700216 3 0.0260 0.554354 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700218 2 0.7482 0.415208 0.204 0.544 0.036 0.060 0.068 0.088
#> SRR1700219 2 0.2412 0.602174 0.028 0.880 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1700222 3 0.1757 0.565349 0.008 0.000 0.928 0.012 0.000 0.052
#> SRR1700220 2 0.4151 0.605963 0.084 0.748 0.000 0.000 0.164 0.004
#> SRR1700221 2 0.3063 0.620395 0.064 0.860 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1700223 2 0.3983 0.610090 0.056 0.768 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1700224 2 0.8026 0.118481 0.220 0.400 0.008 0.056 0.240 0.076
#> SRR1700226 2 0.5310 0.522075 0.112 0.624 0.000 0.000 0.248 0.016
#> SRR1700229 2 0.6720 0.184240 0.184 0.432 0.000 0.012 0.340 0.032
#> SRR1700225 2 0.8359 -0.079600 0.164 0.356 0.012 0.036 0.200 0.232
#> SRR1700227 2 0.3502 0.624887 0.108 0.812 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1700230 3 0.2043 0.567964 0.012 0.000 0.912 0.012 0.000 0.064
#> SRR1700231 2 0.4446 0.615491 0.112 0.776 0.000 0.016 0.060 0.036
#> SRR1700228 2 0.7735 0.340457 0.176 0.476 0.004 0.072 0.196 0.076
#> SRR1700232 2 0.4289 0.620007 0.096 0.756 0.000 0.004 0.136 0.008
#> SRR1700233 2 0.4765 0.618841 0.116 0.748 0.000 0.012 0.088 0.036
#> SRR1700234 2 0.4319 0.624238 0.116 0.772 0.000 0.004 0.080 0.028
#> SRR1700235 2 0.8074 0.233583 0.176 0.488 0.028 0.092 0.076 0.140
#> SRR1700237 2 0.5698 0.588986 0.152 0.664 0.000 0.024 0.128 0.032
#> SRR1700236 2 0.6220 0.545780 0.148 0.604 0.000 0.020 0.184 0.044
#> SRR1700238 2 0.2928 0.617794 0.084 0.856 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1700239 3 0.1194 0.560938 0.004 0.000 0.956 0.008 0.000 0.032
#> SRR1700240 3 0.1138 0.560046 0.004 0.000 0.960 0.012 0.000 0.024
#> SRR1700241 3 0.8312 0.029049 0.164 0.040 0.436 0.196 0.036 0.128
#> SRR1700243 2 0.3632 0.622396 0.088 0.828 0.000 0.012 0.056 0.016
#> SRR1700244 2 0.4678 0.619486 0.104 0.740 0.000 0.008 0.128 0.020
#> SRR1700242 2 0.9700 -0.478449 0.208 0.248 0.196 0.116 0.096 0.136
#> SRR1700246 2 0.6047 0.373323 0.156 0.520 0.000 0.008 0.304 0.012
#> SRR1700245 2 0.3260 0.620443 0.072 0.832 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1700247 3 0.4151 0.557937 0.056 0.000 0.796 0.068 0.004 0.076
#> SRR1700249 3 0.0862 0.557506 0.004 0.000 0.972 0.008 0.000 0.016
#> SRR1700250 2 0.4350 0.623017 0.108 0.768 0.000 0.012 0.100 0.012
#> SRR1700248 2 0.3414 0.620806 0.068 0.844 0.000 0.008 0.060 0.020
#> SRR1700251 2 0.3907 0.617428 0.100 0.784 0.000 0.000 0.108 0.008
#> SRR1700252 3 0.8867 -0.271237 0.172 0.168 0.396 0.068 0.056 0.140
#> SRR1700253 2 0.3596 0.623264 0.072 0.820 0.000 0.000 0.088 0.020
#> SRR1700256 2 0.5935 0.531952 0.148 0.620 0.000 0.012 0.184 0.036
#> SRR1700254 3 0.3170 0.571234 0.036 0.000 0.856 0.052 0.000 0.056
#> SRR1700255 2 0.2630 0.608080 0.032 0.872 0.000 0.004 0.092 0.000
#> SRR1700257 2 0.1970 0.601158 0.060 0.912 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700258 2 0.4580 0.579316 0.068 0.692 0.000 0.004 0.232 0.004
#> SRR1700259 2 0.3419 0.605822 0.040 0.804 0.000 0.000 0.152 0.004
#> SRR1700260 5 0.6236 -0.046904 0.136 0.412 0.000 0.008 0.424 0.020
#> SRR1700261 2 0.5802 0.124726 0.120 0.440 0.000 0.008 0.428 0.004
#> SRR1700262 5 0.5361 0.038113 0.084 0.416 0.000 0.000 0.492 0.008
#> SRR1700263 5 0.7686 0.110288 0.236 0.324 0.000 0.040 0.336 0.064
#> SRR1700264 2 0.5449 0.587274 0.144 0.684 0.000 0.004 0.092 0.076
#> SRR1700265 2 0.9152 -0.345246 0.248 0.264 0.040 0.072 0.160 0.216
#> SRR1700266 2 0.4877 0.571987 0.096 0.676 0.000 0.000 0.216 0.012
#> SRR1700268 3 0.9422 -0.373812 0.144 0.136 0.328 0.136 0.072 0.184
#> SRR1700270 2 0.4781 0.623561 0.116 0.744 0.000 0.020 0.100 0.020
#> SRR1700267 2 0.4189 0.607936 0.096 0.748 0.000 0.000 0.152 0.004
#> SRR1700271 2 0.3891 0.602635 0.064 0.768 0.000 0.000 0.164 0.004
#> SRR1700272 2 0.5730 0.460156 0.104 0.580 0.000 0.008 0.288 0.020
#> SRR1700273 2 0.5864 0.568365 0.156 0.640 0.000 0.008 0.140 0.056
#> SRR1700274 5 0.6754 0.179282 0.176 0.336 0.000 0.008 0.436 0.044
#> SRR1700277 3 0.5331 0.538356 0.052 0.000 0.696 0.104 0.008 0.140
#> SRR1700275 2 0.6725 0.255835 0.172 0.480 0.000 0.028 0.296 0.024
#> SRR1700276 2 0.5517 0.417555 0.096 0.584 0.000 0.004 0.300 0.016
#> SRR1700278 2 0.8917 -0.228399 0.236 0.292 0.016 0.104 0.228 0.124
#> SRR1700279 5 0.5749 0.157284 0.096 0.396 0.000 0.004 0.488 0.016
#> SRR1700280 2 0.5646 0.053980 0.112 0.448 0.000 0.004 0.432 0.004
#> SRR1700281 2 0.6562 0.507536 0.148 0.576 0.000 0.032 0.196 0.048
#> SRR1700283 5 0.6036 0.408339 0.108 0.276 0.000 0.016 0.572 0.028
#> SRR1700282 3 0.9338 -0.408829 0.200 0.076 0.296 0.168 0.064 0.196
#> SRR1700284 5 0.7315 0.375247 0.220 0.260 0.000 0.036 0.436 0.048
#> SRR1700285 5 0.8687 0.133088 0.188 0.248 0.012 0.088 0.336 0.128
#> SRR1700286 2 0.7809 -0.140518 0.216 0.340 0.000 0.040 0.320 0.084
#> SRR1700287 5 0.5463 0.267373 0.084 0.344 0.000 0.008 0.556 0.008
#> SRR1700290 3 0.3747 0.577770 0.024 0.000 0.816 0.060 0.004 0.096
#> SRR1700289 5 0.5689 0.380437 0.188 0.096 0.000 0.016 0.656 0.044
#> SRR1700288 2 0.7315 0.368491 0.152 0.480 0.000 0.040 0.252 0.076
#> SRR1700292 5 0.5521 0.402469 0.112 0.280 0.000 0.008 0.592 0.008
#> SRR1700291 6 0.9245 -0.301393 0.156 0.104 0.032 0.228 0.224 0.256
#> SRR1700293 2 0.9255 -0.319839 0.196 0.296 0.028 0.176 0.148 0.156
#> SRR1700294 5 0.5873 0.430311 0.124 0.240 0.000 0.016 0.600 0.020
#> SRR1700295 1 0.9426 0.093084 0.256 0.040 0.132 0.208 0.204 0.160
#> SRR1700297 5 0.5973 0.417972 0.152 0.216 0.000 0.016 0.596 0.020
#> SRR1700296 5 0.5904 0.401648 0.156 0.264 0.000 0.008 0.560 0.012
#> SRR1700298 5 0.9225 -0.294021 0.208 0.084 0.040 0.184 0.288 0.196
#> SRR1700299 5 0.8982 -0.334293 0.232 0.028 0.076 0.236 0.288 0.140
#> SRR1700300 1 0.9241 0.270011 0.284 0.048 0.124 0.140 0.276 0.128
#> SRR1700302 5 0.6361 0.418410 0.152 0.188 0.000 0.040 0.592 0.028
#> SRR1700301 5 0.5662 0.309995 0.128 0.308 0.000 0.008 0.552 0.004
#> SRR1700303 5 0.6679 0.362646 0.188 0.284 0.000 0.012 0.480 0.036
#> SRR1700304 2 0.6226 0.135577 0.116 0.468 0.000 0.012 0.380 0.024
#> SRR1700305 2 0.7713 -0.185308 0.160 0.352 0.000 0.096 0.352 0.040
#> SRR1700306 5 0.8940 -0.354256 0.216 0.008 0.148 0.136 0.300 0.192
#> SRR1700308 5 0.9036 -0.183181 0.236 0.120 0.040 0.112 0.344 0.148
#> SRR1700307 3 0.7490 0.020090 0.100 0.000 0.392 0.248 0.012 0.248
#> SRR1700309 3 0.7646 0.159015 0.084 0.000 0.476 0.184 0.068 0.188
#> SRR1700310 5 0.5783 0.219650 0.092 0.376 0.000 0.008 0.508 0.016
#> SRR1700311 5 0.9330 -0.351920 0.200 0.040 0.136 0.148 0.300 0.176
#> SRR1700312 5 0.8662 -0.064757 0.184 0.088 0.016 0.164 0.384 0.164
#> SRR1700313 3 0.9264 -0.388074 0.164 0.056 0.304 0.172 0.080 0.224
#> SRR1700314 4 0.8844 0.051337 0.188 0.000 0.164 0.272 0.148 0.228
#> SRR1700315 5 0.8836 -0.321066 0.224 0.012 0.144 0.116 0.336 0.168
#> SRR1700316 1 0.9760 0.088793 0.240 0.104 0.140 0.216 0.124 0.176
#> SRR1700317 5 0.6571 0.301609 0.172 0.328 0.000 0.004 0.456 0.040
#> SRR1700318 5 0.7489 0.327849 0.220 0.192 0.000 0.052 0.468 0.068
#> SRR1700319 3 0.8382 -0.214892 0.164 0.000 0.356 0.212 0.072 0.196
#> SRR1700320 5 0.6620 0.410837 0.168 0.240 0.000 0.012 0.528 0.052
#> SRR1700322 5 0.8650 -0.037419 0.200 0.120 0.032 0.128 0.416 0.104
#> SRR1700321 5 0.6674 0.148796 0.132 0.368 0.000 0.028 0.444 0.028
#> SRR1700323 5 0.9460 -0.307228 0.176 0.104 0.060 0.160 0.268 0.232
#> SRR1700324 2 0.6911 -0.013013 0.164 0.416 0.000 0.036 0.360 0.024
#> SRR1700325 2 0.8846 -0.032749 0.200 0.340 0.016 0.108 0.208 0.128
#> SRR1700326 5 0.9733 -0.418045 0.156 0.076 0.176 0.200 0.236 0.156
#> SRR1700327 2 0.7667 -0.076268 0.204 0.372 0.000 0.040 0.312 0.072
#> SRR1700329 5 0.7404 0.203139 0.240 0.064 0.000 0.096 0.496 0.104
#> SRR1700328 3 0.9289 -0.355867 0.192 0.036 0.308 0.148 0.148 0.168
#> SRR1700330 3 0.8926 -0.270384 0.124 0.024 0.340 0.224 0.108 0.180
#> SRR1700331 5 0.6129 0.364225 0.192 0.124 0.000 0.012 0.612 0.060
#> SRR1700332 5 0.8742 -0.020822 0.204 0.156 0.004 0.196 0.328 0.112
#> SRR1700333 5 0.7968 0.224481 0.244 0.228 0.000 0.072 0.384 0.072
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.159 0.546 0.751 0.3731 0.540 0.540
#> 3 3 0.121 0.441 0.687 0.4416 0.562 0.396
#> 4 4 0.171 0.376 0.651 0.1203 0.801 0.615
#> 5 5 0.195 0.365 0.637 0.0543 0.973 0.929
#> 6 6 0.208 0.333 0.629 0.0242 0.976 0.934
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.4431 0.65357 0.092 0.908
#> SRR1699875 2 0.6887 0.61181 0.184 0.816
#> SRR1699876 2 0.2423 0.63668 0.040 0.960
#> SRR1699877 2 0.7299 0.63494 0.204 0.796
#> SRR1699879 2 0.4431 0.65235 0.092 0.908
#> SRR1699878 2 0.0672 0.64765 0.008 0.992
#> SRR1699880 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699881 1 0.9491 0.72529 0.632 0.368
#> SRR1699882 2 0.2778 0.65561 0.048 0.952
#> SRR1699883 2 0.7139 0.60585 0.196 0.804
#> SRR1699884 2 0.7376 0.59733 0.208 0.792
#> SRR1699885 2 0.4562 0.61161 0.096 0.904
#> SRR1699886 2 0.6973 0.61110 0.188 0.812
#> SRR1699888 2 0.2043 0.64896 0.032 0.968
#> SRR1699889 2 0.8207 0.53176 0.256 0.744
#> SRR1699890 2 0.6887 0.53049 0.184 0.816
#> SRR1699887 2 0.6048 0.56328 0.148 0.852
#> SRR1699891 2 0.3879 0.62865 0.076 0.924
#> SRR1699892 2 0.9754 0.14495 0.408 0.592
#> SRR1699893 2 0.9580 0.24060 0.380 0.620
#> SRR1699894 2 0.5059 0.59683 0.112 0.888
#> SRR1699895 2 0.2948 0.63826 0.052 0.948
#> SRR1699896 2 0.9460 0.28228 0.364 0.636
#> SRR1699897 2 0.9608 0.22203 0.384 0.616
#> SRR1699898 1 0.6973 0.77340 0.812 0.188
#> SRR1699900 1 0.9754 0.65630 0.592 0.408
#> SRR1699899 2 0.7745 0.57396 0.228 0.772
#> SRR1699902 1 0.8661 0.76884 0.712 0.288
#> SRR1699901 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699903 2 0.9635 0.19563 0.388 0.612
#> SRR1699904 2 0.2778 0.63910 0.048 0.952
#> SRR1699905 1 0.6973 0.77366 0.812 0.188
#> SRR1699906 2 0.5629 0.57982 0.132 0.868
#> SRR1699907 2 0.7602 0.57922 0.220 0.780
#> SRR1699908 2 0.8144 0.53776 0.252 0.748
#> SRR1699909 2 0.9608 0.22677 0.384 0.616
#> SRR1699910 1 0.9922 0.55820 0.552 0.448
#> SRR1699911 2 0.7219 0.60256 0.200 0.800
#> SRR1699912 2 0.4022 0.65473 0.080 0.920
#> SRR1699913 2 0.5519 0.58924 0.128 0.872
#> SRR1699914 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699915 2 0.9635 0.18720 0.388 0.612
#> SRR1699916 2 0.4431 0.65407 0.092 0.908
#> SRR1699917 2 0.6887 0.64625 0.184 0.816
#> SRR1699918 2 0.7745 0.57026 0.228 0.772
#> SRR1699919 2 0.7376 0.60234 0.208 0.792
#> SRR1699920 1 0.9977 0.46132 0.528 0.472
#> SRR1699921 2 0.9427 0.29368 0.360 0.640
#> SRR1699922 2 0.6438 0.62544 0.164 0.836
#> SRR1699923 1 0.8499 0.77191 0.724 0.276
#> SRR1699924 1 0.9608 0.69722 0.616 0.384
#> SRR1699925 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699926 2 1.0000 -0.35563 0.496 0.504
#> SRR1699927 2 0.4022 0.63613 0.080 0.920
#> SRR1699929 2 0.9983 -0.22291 0.476 0.524
#> SRR1699928 2 0.3733 0.65500 0.072 0.928
#> SRR1699930 2 0.6531 0.55254 0.168 0.832
#> SRR1699931 2 0.9775 0.12699 0.412 0.588
#> SRR1699933 1 0.9815 0.64626 0.580 0.420
#> SRR1699932 2 0.7602 0.58354 0.220 0.780
#> SRR1699934 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699935 2 0.8327 0.52953 0.264 0.736
#> SRR1699936 2 0.6973 0.53420 0.188 0.812
#> SRR1699937 2 0.7674 0.58195 0.224 0.776
#> SRR1699938 2 0.4815 0.60210 0.104 0.896
#> SRR1699940 1 0.9795 0.65531 0.584 0.416
#> SRR1699939 2 0.2948 0.64449 0.052 0.948
#> SRR1699941 1 0.9491 0.72462 0.632 0.368
#> SRR1699942 2 0.5519 0.64152 0.128 0.872
#> SRR1699943 2 0.6438 0.62738 0.164 0.836
#> SRR1699944 2 0.6623 0.61986 0.172 0.828
#> SRR1699945 1 0.7219 0.77832 0.800 0.200
#> SRR1699946 2 0.8861 0.45828 0.304 0.696
#> SRR1699947 2 0.7883 0.56928 0.236 0.764
#> SRR1699948 2 0.1843 0.65111 0.028 0.972
#> SRR1699949 2 0.5408 0.58253 0.124 0.876
#> SRR1699950 2 0.3114 0.62580 0.056 0.944
#> SRR1699951 2 0.7883 0.60751 0.236 0.764
#> SRR1699952 2 0.8763 0.46437 0.296 0.704
#> SRR1699953 2 0.2423 0.63295 0.040 0.960
#> SRR1699954 2 0.9963 -0.19843 0.464 0.536
#> SRR1699955 2 0.7056 0.53027 0.192 0.808
#> SRR1699956 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699957 2 0.3274 0.65560 0.060 0.940
#> SRR1699959 2 0.9909 -0.06158 0.444 0.556
#> SRR1699958 2 0.7453 0.58736 0.212 0.788
#> SRR1699960 2 0.6438 0.54910 0.164 0.836
#> SRR1699961 1 0.8955 0.75838 0.688 0.312
#> SRR1699962 2 0.2236 0.64930 0.036 0.964
#> SRR1699963 2 0.7528 0.58353 0.216 0.784
#> SRR1699964 2 0.7602 0.58635 0.220 0.780
#> SRR1699965 2 0.6887 0.53423 0.184 0.816
#> SRR1699966 2 0.9909 -0.03764 0.444 0.556
#> SRR1699967 2 0.6801 0.62019 0.180 0.820
#> SRR1699968 2 0.7139 0.60815 0.196 0.804
#> SRR1699969 1 0.6973 0.77340 0.812 0.188
#> SRR1699971 1 0.9661 0.69653 0.608 0.392
#> SRR1699970 2 0.5294 0.58564 0.120 0.880
#> SRR1699972 1 0.9795 0.64701 0.584 0.416
#> SRR1699973 2 0.8144 0.54836 0.252 0.748
#> SRR1699974 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699975 2 0.9754 0.11229 0.408 0.592
#> SRR1699976 2 0.9866 -0.01058 0.432 0.568
#> SRR1699977 2 0.9983 -0.27054 0.476 0.524
#> SRR1699978 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699979 1 0.9815 0.64603 0.580 0.420
#> SRR1699980 2 0.6801 0.61675 0.180 0.820
#> SRR1699981 1 0.9323 0.73676 0.652 0.348
#> SRR1699982 2 0.1414 0.64565 0.020 0.980
#> SRR1699983 2 0.2603 0.65471 0.044 0.956
#> SRR1699984 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699985 2 0.5946 0.64443 0.144 0.856
#> SRR1699986 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699988 2 0.7883 0.55971 0.236 0.764
#> SRR1699987 1 0.9686 0.69079 0.604 0.396
#> SRR1699989 2 0.8813 0.44620 0.300 0.700
#> SRR1699990 1 0.9775 0.65575 0.588 0.412
#> SRR1699992 1 0.9993 0.44319 0.516 0.484
#> SRR1699991 1 0.9754 0.66455 0.592 0.408
#> SRR1699993 1 0.9635 0.70241 0.612 0.388
#> SRR1699994 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1699995 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1699996 2 0.9129 0.38560 0.328 0.672
#> SRR1699997 2 0.9580 0.23881 0.380 0.620
#> SRR1699998 2 0.8499 0.49633 0.276 0.724
#> SRR1699999 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700000 1 0.9998 0.40840 0.508 0.492
#> SRR1700002 2 0.9732 0.12947 0.404 0.596
#> SRR1700001 1 0.9129 0.75363 0.672 0.328
#> SRR1700003 2 0.9460 0.26436 0.364 0.636
#> SRR1700004 1 0.9393 0.73621 0.644 0.356
#> SRR1700005 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700006 1 0.9815 0.63797 0.580 0.420
#> SRR1700007 2 0.6712 0.54532 0.176 0.824
#> SRR1700008 1 0.9552 0.71799 0.624 0.376
#> SRR1700009 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700010 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700011 2 0.4298 0.61364 0.088 0.912
#> SRR1700013 2 0.9580 0.22557 0.380 0.620
#> SRR1700012 2 0.9608 0.21187 0.384 0.616
#> SRR1700014 1 0.9866 0.59749 0.568 0.432
#> SRR1700015 2 0.9850 0.03014 0.428 0.572
#> SRR1700016 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700018 2 0.9996 -0.28616 0.488 0.512
#> SRR1700017 1 0.9754 0.65555 0.592 0.408
#> SRR1700019 2 0.4022 0.65618 0.080 0.920
#> SRR1700020 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700021 2 0.6973 0.61641 0.188 0.812
#> SRR1700023 2 0.9815 0.05230 0.420 0.580
#> SRR1700022 1 0.9248 0.74563 0.660 0.340
#> SRR1700024 2 0.6438 0.62463 0.164 0.836
#> SRR1700025 2 0.9850 0.04839 0.428 0.572
#> SRR1700026 2 0.9795 0.07323 0.416 0.584
#> SRR1700027 2 0.9933 -0.09001 0.452 0.548
#> SRR1700028 2 0.9635 0.22486 0.388 0.612
#> SRR1700029 1 0.9933 0.53534 0.548 0.452
#> SRR1700030 2 0.7815 0.56982 0.232 0.768
#> SRR1700031 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700032 2 0.7815 0.56507 0.232 0.768
#> SRR1700034 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700035 2 0.7056 0.63604 0.192 0.808
#> SRR1700033 1 0.6973 0.77562 0.812 0.188
#> SRR1700036 2 0.9000 0.43687 0.316 0.684
#> SRR1700037 2 0.3114 0.62910 0.056 0.944
#> SRR1700038 2 0.9983 -0.26403 0.476 0.524
#> SRR1700039 1 0.6973 0.77565 0.812 0.188
#> SRR1700040 1 0.7528 0.77994 0.784 0.216
#> SRR1700041 1 0.9522 0.71304 0.628 0.372
#> SRR1700042 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700043 1 0.9129 0.75558 0.672 0.328
#> SRR1700045 1 0.9635 0.69823 0.612 0.388
#> SRR1700044 2 0.7950 0.55503 0.240 0.760
#> SRR1700046 1 0.9850 0.60816 0.572 0.428
#> SRR1700047 1 0.7219 0.77705 0.800 0.200
#> SRR1700048 1 0.9909 0.56123 0.556 0.444
#> SRR1700049 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700050 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700051 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700052 1 0.6973 0.77366 0.812 0.188
#> SRR1700053 2 0.9933 -0.08582 0.452 0.548
#> SRR1700054 1 0.9881 0.58526 0.564 0.436
#> SRR1700055 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700056 1 0.9087 0.75745 0.676 0.324
#> SRR1700057 1 0.8713 0.76749 0.708 0.292
#> SRR1700058 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700059 1 0.9866 0.59962 0.568 0.432
#> SRR1700060 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700061 1 0.9635 0.69801 0.612 0.388
#> SRR1700062 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700063 1 0.7745 0.77872 0.772 0.228
#> SRR1700064 2 0.9998 -0.31839 0.492 0.508
#> SRR1700065 1 0.8443 0.77258 0.728 0.272
#> SRR1700066 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700067 2 0.3733 0.65584 0.072 0.928
#> SRR1700068 1 0.9522 0.71799 0.628 0.372
#> SRR1700069 2 0.9209 0.43977 0.336 0.664
#> SRR1700070 2 0.5294 0.64778 0.120 0.880
#> SRR1700071 2 0.9775 0.11131 0.412 0.588
#> SRR1700072 1 0.9993 0.41027 0.516 0.484
#> SRR1700073 2 0.7453 0.59472 0.212 0.788
#> SRR1700075 1 0.9732 0.67854 0.596 0.404
#> SRR1700074 1 0.9635 0.69169 0.612 0.388
#> SRR1700076 2 0.9087 0.39180 0.324 0.676
#> SRR1700077 1 0.9732 0.67819 0.596 0.404
#> SRR1700078 1 0.9996 0.39418 0.512 0.488
#> SRR1700080 2 0.9815 0.07193 0.420 0.580
#> SRR1700079 1 0.7139 0.77803 0.804 0.196
#> SRR1700081 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700082 1 0.8499 0.77155 0.724 0.276
#> SRR1700083 1 0.7139 0.77562 0.804 0.196
#> SRR1700084 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700085 2 0.1633 0.65182 0.024 0.976
#> SRR1700086 2 0.8499 0.49645 0.276 0.724
#> SRR1700087 1 0.9909 0.57265 0.556 0.444
#> SRR1700088 2 0.9775 0.11131 0.412 0.588
#> SRR1700089 2 0.9944 -0.15415 0.456 0.544
#> SRR1700091 2 0.9491 0.29189 0.368 0.632
#> SRR1700090 1 0.9970 0.47898 0.532 0.468
#> SRR1700092 2 0.7674 0.58231 0.224 0.776
#> SRR1700094 2 0.9850 0.04909 0.428 0.572
#> SRR1700093 2 1.0000 -0.36042 0.496 0.504
#> SRR1700095 1 0.9635 0.69738 0.612 0.388
#> SRR1700096 1 0.9732 0.66360 0.596 0.404
#> SRR1700097 1 0.7528 0.77976 0.784 0.216
#> SRR1700098 2 0.9552 0.25200 0.376 0.624
#> SRR1700099 2 0.9460 0.29799 0.364 0.636
#> SRR1700100 2 0.9970 -0.23492 0.468 0.532
#> SRR1700101 2 0.9635 0.21188 0.388 0.612
#> SRR1700102 2 0.8955 0.44081 0.312 0.688
#> SRR1700104 2 0.9833 0.07013 0.424 0.576
#> SRR1700103 1 0.9754 0.65604 0.592 0.408
#> SRR1700105 2 0.9710 0.14793 0.400 0.600
#> SRR1700106 2 0.9754 0.14463 0.408 0.592
#> SRR1700107 2 0.9170 0.38964 0.332 0.668
#> SRR1700108 2 0.9248 0.36892 0.340 0.660
#> SRR1700109 2 0.2603 0.64374 0.044 0.956
#> SRR1700110 2 0.3114 0.63916 0.056 0.944
#> SRR1700112 2 0.6438 0.63942 0.164 0.836
#> SRR1700111 2 0.9732 0.13833 0.404 0.596
#> SRR1700113 2 0.6887 0.63061 0.184 0.816
#> SRR1700114 2 0.9954 -0.13612 0.460 0.540
#> SRR1700115 2 0.7602 0.60756 0.220 0.780
#> SRR1700116 1 0.9795 0.65421 0.584 0.416
#> SRR1700117 1 0.7376 0.77877 0.792 0.208
#> SRR1700119 1 0.9998 0.37566 0.508 0.492
#> SRR1700118 2 0.9635 0.19619 0.388 0.612
#> SRR1700120 1 0.7745 0.77995 0.772 0.228
#> SRR1700121 2 0.9522 0.26607 0.372 0.628
#> SRR1700122 2 0.6712 0.64508 0.176 0.824
#> SRR1700123 1 0.9866 0.59778 0.568 0.432
#> SRR1700125 2 0.4161 0.65456 0.084 0.916
#> SRR1700126 1 0.7674 0.77987 0.776 0.224
#> SRR1700127 1 0.9129 0.75362 0.672 0.328
#> SRR1700124 1 0.9881 0.58571 0.564 0.436
#> SRR1700128 1 0.9661 0.68537 0.608 0.392
#> SRR1700129 2 0.7602 0.57918 0.220 0.780
#> SRR1700130 2 0.9393 0.32194 0.356 0.644
#> SRR1700132 1 0.9129 0.75373 0.672 0.328
#> SRR1700131 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700133 2 0.9850 0.04852 0.428 0.572
#> SRR1700134 2 0.7674 0.58229 0.224 0.776
#> SRR1700135 1 0.9460 0.72193 0.636 0.364
#> SRR1700136 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700137 1 0.9993 0.44371 0.516 0.484
#> SRR1700138 1 0.9661 0.69653 0.608 0.392
#> SRR1700140 1 0.9795 0.64784 0.584 0.416
#> SRR1700139 1 0.9944 0.53758 0.544 0.456
#> SRR1700141 2 0.5519 0.65306 0.128 0.872
#> SRR1700142 1 0.7602 0.77996 0.780 0.220
#> SRR1700143 1 0.9044 0.75933 0.680 0.320
#> SRR1700144 1 0.9580 0.71372 0.620 0.380
#> SRR1700145 1 0.9608 0.69847 0.616 0.384
#> SRR1700146 2 0.3733 0.61705 0.072 0.928
#> SRR1700147 1 0.9170 0.74846 0.668 0.332
#> SRR1700149 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700148 1 0.9358 0.73688 0.648 0.352
#> SRR1700150 2 0.9635 0.22370 0.388 0.612
#> SRR1700152 1 0.9754 0.65555 0.592 0.408
#> SRR1700151 1 0.9044 0.75564 0.680 0.320
#> SRR1700153 1 0.8813 0.76557 0.700 0.300
#> SRR1700154 1 0.9686 0.69081 0.604 0.396
#> SRR1700155 2 0.9909 -0.06336 0.444 0.556
#> SRR1700156 1 0.7674 0.78017 0.776 0.224
#> SRR1700158 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700159 2 0.2236 0.64117 0.036 0.964
#> SRR1700157 1 0.7674 0.77983 0.776 0.224
#> SRR1700160 1 0.9522 0.71309 0.628 0.372
#> SRR1700161 1 0.9427 0.72592 0.640 0.360
#> SRR1700162 2 0.2778 0.65065 0.048 0.952
#> SRR1700164 1 0.8144 0.77733 0.748 0.252
#> SRR1700163 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700165 1 0.8386 0.77336 0.732 0.268
#> SRR1700166 2 0.9909 -0.08962 0.444 0.556
#> SRR1700168 2 0.4939 0.63893 0.108 0.892
#> SRR1700167 1 0.7528 0.77973 0.784 0.216
#> SRR1700170 2 0.9661 0.19562 0.392 0.608
#> SRR1700169 1 0.9608 0.69798 0.616 0.384
#> SRR1700171 1 0.9427 0.73025 0.640 0.360
#> SRR1700172 2 0.9896 -0.01980 0.440 0.560
#> SRR1700174 2 0.9881 0.00446 0.436 0.564
#> SRR1700173 2 0.9732 0.13042 0.404 0.596
#> SRR1700175 2 0.9661 0.18109 0.392 0.608
#> SRR1700176 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700178 2 0.3114 0.63435 0.056 0.944
#> SRR1700177 1 0.9970 0.47655 0.532 0.468
#> SRR1700180 2 0.5178 0.58849 0.116 0.884
#> SRR1700179 2 0.5294 0.59153 0.120 0.880
#> SRR1700181 2 0.6247 0.56328 0.156 0.844
#> SRR1700183 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700182 2 0.6343 0.55295 0.160 0.840
#> SRR1700184 2 0.2423 0.65347 0.040 0.960
#> SRR1700186 2 0.7528 0.58799 0.216 0.784
#> SRR1700187 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700185 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700188 2 0.1633 0.64494 0.024 0.976
#> SRR1700192 2 0.9795 0.07390 0.416 0.584
#> SRR1700190 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700191 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700189 1 0.9635 0.69842 0.612 0.388
#> SRR1700193 2 0.2603 0.65436 0.044 0.956
#> SRR1700195 2 0.5629 0.64149 0.132 0.868
#> SRR1700194 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700196 2 0.3114 0.62552 0.056 0.944
#> SRR1700197 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700198 2 0.3733 0.65498 0.072 0.928
#> SRR1700199 2 0.4298 0.65355 0.088 0.912
#> SRR1700200 2 0.1414 0.64712 0.020 0.980
#> SRR1700201 2 0.6973 0.53057 0.188 0.812
#> SRR1700202 2 0.7602 0.58706 0.220 0.780
#> SRR1700203 2 0.5408 0.59425 0.124 0.876
#> SRR1700204 2 0.5294 0.64666 0.120 0.880
#> SRR1700206 2 0.8207 0.53183 0.256 0.744
#> SRR1700207 2 0.6887 0.53447 0.184 0.816
#> SRR1700208 1 0.9988 0.42612 0.520 0.480
#> SRR1700205 2 0.1184 0.64644 0.016 0.984
#> SRR1700209 2 0.4939 0.60501 0.108 0.892
#> SRR1700210 2 0.4298 0.63306 0.088 0.912
#> SRR1700211 2 0.5629 0.64636 0.132 0.868
#> SRR1700212 2 0.6148 0.63499 0.152 0.848
#> SRR1700213 2 0.7528 0.59458 0.216 0.784
#> SRR1700214 2 0.2948 0.65026 0.052 0.948
#> SRR1700215 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700217 2 0.3114 0.65501 0.056 0.944
#> SRR1700216 1 0.6973 0.77340 0.812 0.188
#> SRR1700218 2 0.8499 0.50515 0.276 0.724
#> SRR1700219 2 0.7056 0.53027 0.192 0.808
#> SRR1700222 1 0.6973 0.77366 0.812 0.188
#> SRR1700220 2 0.6712 0.54543 0.176 0.824
#> SRR1700221 2 0.2603 0.65278 0.044 0.956
#> SRR1700223 2 0.5059 0.60236 0.112 0.888
#> SRR1700224 2 0.6887 0.61214 0.184 0.816
#> SRR1700226 2 0.3733 0.62138 0.072 0.928
#> SRR1700229 2 0.2236 0.65282 0.036 0.964
#> SRR1700225 2 0.6712 0.62326 0.176 0.824
#> SRR1700227 2 0.3431 0.64840 0.064 0.936
#> SRR1700230 1 0.7056 0.77616 0.808 0.192
#> SRR1700231 2 0.4562 0.65120 0.096 0.904
#> SRR1700228 2 0.8267 0.52828 0.260 0.740
#> SRR1700232 2 0.4939 0.59979 0.108 0.892
#> SRR1700233 2 0.4939 0.65309 0.108 0.892
#> SRR1700234 2 0.3431 0.65462 0.064 0.936
#> SRR1700235 2 0.9286 0.36010 0.344 0.656
#> SRR1700237 2 0.4690 0.65214 0.100 0.900
#> SRR1700236 2 0.1633 0.64623 0.024 0.976
#> SRR1700238 2 0.4431 0.60753 0.092 0.908
#> SRR1700239 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700240 1 0.6973 0.77366 0.812 0.188
#> SRR1700241 1 0.9686 0.69113 0.604 0.396
#> SRR1700243 2 0.6048 0.63762 0.148 0.852
#> SRR1700244 2 0.6531 0.63105 0.168 0.832
#> SRR1700242 2 0.9775 0.11131 0.412 0.588
#> SRR1700246 2 0.5842 0.64044 0.140 0.860
#> SRR1700245 2 0.6148 0.56653 0.152 0.848
#> SRR1700247 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700249 1 0.6887 0.77347 0.816 0.184
#> SRR1700250 2 0.4431 0.64566 0.092 0.908
#> SRR1700248 2 0.5946 0.63621 0.144 0.856
#> SRR1700251 2 0.6148 0.56321 0.152 0.848
#> SRR1700252 1 0.9983 0.44381 0.524 0.476
#> SRR1700253 2 0.6623 0.54550 0.172 0.828
#> SRR1700256 2 0.4815 0.65268 0.104 0.896
#> SRR1700254 1 0.7453 0.77936 0.788 0.212
#> SRR1700255 2 0.6801 0.53807 0.180 0.820
#> SRR1700257 2 0.4562 0.60723 0.096 0.904
#> SRR1700258 2 0.4815 0.60154 0.104 0.896
#> SRR1700259 2 0.6973 0.53418 0.188 0.812
#> SRR1700260 2 0.3431 0.64612 0.064 0.936
#> SRR1700261 2 0.5946 0.57515 0.144 0.856
#> SRR1700262 2 0.5737 0.57949 0.136 0.864
#> SRR1700263 2 0.6148 0.63247 0.152 0.848
#> SRR1700264 2 0.4690 0.61379 0.100 0.900
#> SRR1700265 2 0.9552 0.24108 0.376 0.624
#> SRR1700266 2 0.4562 0.60507 0.096 0.904
#> SRR1700268 1 0.9977 0.47515 0.528 0.472
#> SRR1700270 2 0.3584 0.65452 0.068 0.932
#> SRR1700267 2 0.6247 0.55591 0.156 0.844
#> SRR1700271 2 0.5294 0.59669 0.120 0.880
#> SRR1700272 2 0.6887 0.53790 0.184 0.816
#> SRR1700273 2 0.5178 0.65100 0.116 0.884
#> SRR1700274 2 0.1414 0.65130 0.020 0.980
#> SRR1700277 1 0.8955 0.75873 0.688 0.312
#> SRR1700275 2 0.5519 0.62849 0.128 0.872
#> SRR1700276 2 0.4690 0.60999 0.100 0.900
#> SRR1700278 2 0.9044 0.41207 0.320 0.680
#> SRR1700279 2 0.4298 0.62433 0.088 0.912
#> SRR1700280 2 0.3733 0.65547 0.072 0.928
#> SRR1700281 2 0.4022 0.65565 0.080 0.920
#> SRR1700283 2 0.5629 0.57580 0.132 0.868
#> SRR1700282 2 0.9993 -0.30061 0.484 0.516
#> SRR1700284 2 0.6247 0.61012 0.156 0.844
#> SRR1700285 2 0.9286 0.35924 0.344 0.656
#> SRR1700286 2 0.2043 0.65371 0.032 0.968
#> SRR1700287 2 0.6048 0.57797 0.148 0.852
#> SRR1700290 1 0.7056 0.77356 0.808 0.192
#> SRR1700289 2 0.3879 0.65477 0.076 0.924
#> SRR1700288 2 0.5519 0.64946 0.128 0.872
#> SRR1700292 2 0.6048 0.56907 0.148 0.852
#> SRR1700291 2 0.8955 0.44112 0.312 0.688
#> SRR1700293 2 0.7056 0.60672 0.192 0.808
#> SRR1700294 2 0.4815 0.59722 0.104 0.896
#> SRR1700295 2 0.9850 0.00847 0.428 0.572
#> SRR1700297 2 0.7453 0.62485 0.212 0.788
#> SRR1700296 2 0.6247 0.55651 0.156 0.844
#> SRR1700298 2 0.8608 0.48986 0.284 0.716
#> SRR1700299 2 0.9393 0.31458 0.356 0.644
#> SRR1700300 2 0.9775 0.12721 0.412 0.588
#> SRR1700302 2 0.6712 0.59728 0.176 0.824
#> SRR1700301 2 0.5946 0.56941 0.144 0.856
#> SRR1700303 2 0.6148 0.55941 0.152 0.848
#> SRR1700304 2 0.5737 0.57246 0.136 0.864
#> SRR1700305 2 0.4815 0.65123 0.104 0.896
#> SRR1700306 2 0.9970 -0.17258 0.468 0.532
#> SRR1700308 2 0.9427 0.31417 0.360 0.640
#> SRR1700307 1 0.9881 0.60622 0.564 0.436
#> SRR1700309 1 0.9608 0.69722 0.616 0.384
#> SRR1700310 2 0.5737 0.57228 0.136 0.864
#> SRR1700311 2 0.9710 0.14761 0.400 0.600
#> SRR1700312 2 0.8909 0.43255 0.308 0.692
#> SRR1700313 2 0.9710 0.14806 0.400 0.600
#> SRR1700314 2 0.9977 -0.20232 0.472 0.528
#> SRR1700315 2 0.9608 0.21205 0.384 0.616
#> SRR1700316 2 0.9754 0.11229 0.408 0.592
#> SRR1700317 2 0.4161 0.62288 0.084 0.916
#> SRR1700318 2 0.6801 0.61397 0.180 0.820
#> SRR1700319 1 0.9963 0.51962 0.536 0.464
#> SRR1700320 2 0.4298 0.65201 0.088 0.912
#> SRR1700322 2 0.7219 0.59880 0.200 0.800
#> SRR1700321 2 0.6438 0.56705 0.164 0.836
#> SRR1700323 2 0.9087 0.41398 0.324 0.676
#> SRR1700324 2 0.2603 0.64290 0.044 0.956
#> SRR1700325 2 0.8081 0.55311 0.248 0.752
#> SRR1700326 2 0.9963 -0.17665 0.464 0.536
#> SRR1700327 2 0.6973 0.64350 0.188 0.812
#> SRR1700329 2 0.8144 0.55332 0.252 0.748
#> SRR1700328 2 0.9866 0.00474 0.432 0.568
#> SRR1700330 1 0.9833 0.61846 0.576 0.424
#> SRR1700331 2 0.5519 0.65344 0.128 0.872
#> SRR1700332 2 0.8081 0.54389 0.248 0.752
#> SRR1700333 2 0.6148 0.63186 0.152 0.848
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.829 0.456668 0.124 0.612 0.264
#> SRR1699875 2 0.760 0.408775 0.056 0.600 0.344
#> SRR1699876 2 0.756 0.469217 0.188 0.688 0.124
#> SRR1699877 1 0.977 -0.033070 0.420 0.340 0.240
#> SRR1699879 2 0.804 0.508077 0.116 0.636 0.248
#> SRR1699878 1 0.992 0.253798 0.384 0.340 0.276
#> SRR1699880 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699881 3 0.459 0.657085 0.032 0.120 0.848
#> SRR1699882 2 0.851 0.499615 0.212 0.612 0.176
#> SRR1699883 2 0.874 0.290682 0.108 0.464 0.428
#> SRR1699884 3 0.946 0.073661 0.264 0.236 0.500
#> SRR1699885 2 0.649 0.461556 0.192 0.744 0.064
#> SRR1699886 3 0.991 -0.230481 0.276 0.332 0.392
#> SRR1699888 2 0.811 0.388056 0.116 0.628 0.256
#> SRR1699889 3 0.881 0.151193 0.128 0.344 0.528
#> SRR1699890 2 0.629 0.263501 0.288 0.692 0.020
#> SRR1699887 2 0.579 0.388107 0.192 0.772 0.036
#> SRR1699891 2 0.464 0.441947 0.104 0.852 0.044
#> SRR1699892 3 0.697 0.370282 0.028 0.356 0.616
#> SRR1699893 3 0.852 0.498841 0.180 0.208 0.612
#> SRR1699894 2 0.698 0.450671 0.220 0.708 0.072
#> SRR1699895 2 0.653 0.509819 0.152 0.756 0.092
#> SRR1699896 3 0.754 0.169380 0.040 0.432 0.528
#> SRR1699897 3 0.684 0.257090 0.016 0.412 0.572
#> SRR1699898 3 0.455 0.627293 0.200 0.000 0.800
#> SRR1699900 3 0.516 0.592369 0.008 0.216 0.776
#> SRR1699899 3 0.911 -0.051080 0.144 0.384 0.472
#> SRR1699902 3 0.362 0.666320 0.072 0.032 0.896
#> SRR1699901 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699903 3 0.786 0.462615 0.204 0.132 0.664
#> SRR1699904 2 0.941 -0.068910 0.276 0.504 0.220
#> SRR1699905 3 0.440 0.630437 0.188 0.000 0.812
#> SRR1699906 2 0.851 0.011750 0.296 0.580 0.124
#> SRR1699907 2 0.888 0.288806 0.120 0.460 0.420
#> SRR1699908 3 0.844 -0.071906 0.388 0.092 0.520
#> SRR1699909 3 0.772 0.401695 0.068 0.320 0.612
#> SRR1699910 3 0.506 0.634788 0.032 0.148 0.820
#> SRR1699911 3 0.803 -0.120611 0.420 0.064 0.516
#> SRR1699912 2 0.822 0.499691 0.212 0.636 0.152
#> SRR1699913 2 0.874 -0.030658 0.392 0.496 0.112
#> SRR1699914 3 0.450 0.629119 0.196 0.000 0.804
#> SRR1699915 3 0.783 0.508301 0.136 0.196 0.668
#> SRR1699916 2 0.829 0.386448 0.236 0.624 0.140
#> SRR1699917 2 0.999 -0.271842 0.320 0.356 0.324
#> SRR1699918 2 0.798 0.358333 0.068 0.556 0.376
#> SRR1699919 2 0.889 0.204539 0.120 0.456 0.424
#> SRR1699920 3 0.499 0.642945 0.024 0.160 0.816
#> SRR1699921 3 0.842 0.233025 0.096 0.364 0.540
#> SRR1699922 2 0.886 0.369528 0.132 0.524 0.344
#> SRR1699923 3 0.296 0.663698 0.080 0.008 0.912
#> SRR1699924 3 0.216 0.670407 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699925 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699926 3 0.676 0.548956 0.056 0.232 0.712
#> SRR1699927 2 0.715 0.477545 0.200 0.708 0.092
#> SRR1699929 3 0.649 0.584973 0.172 0.076 0.752
#> SRR1699928 1 0.920 0.451452 0.460 0.152 0.388
#> SRR1699930 2 0.552 0.388451 0.164 0.796 0.040
#> SRR1699931 3 0.740 0.366115 0.048 0.340 0.612
#> SRR1699933 3 0.413 0.636443 0.132 0.012 0.856
#> SRR1699932 2 0.710 0.387249 0.028 0.588 0.384
#> SRR1699934 3 0.470 0.623083 0.212 0.000 0.788
#> SRR1699935 2 0.747 0.240200 0.036 0.520 0.444
#> SRR1699936 2 0.635 0.216849 0.204 0.744 0.052
#> SRR1699937 3 0.957 0.064236 0.212 0.328 0.460
#> SRR1699938 2 0.555 0.485562 0.112 0.812 0.076
#> SRR1699940 3 0.509 0.665044 0.072 0.092 0.836
#> SRR1699939 1 0.992 0.328314 0.376 0.352 0.272
#> SRR1699941 3 0.541 0.623096 0.032 0.172 0.796
#> SRR1699942 1 0.811 0.394204 0.508 0.068 0.424
#> SRR1699943 2 0.957 0.174048 0.196 0.416 0.388
#> SRR1699944 2 0.967 0.156161 0.212 0.412 0.376
#> SRR1699945 3 0.472 0.637254 0.160 0.016 0.824
#> SRR1699946 2 0.749 0.146799 0.036 0.492 0.472
#> SRR1699947 2 0.796 0.303369 0.060 0.516 0.424
#> SRR1699948 2 0.709 0.522975 0.084 0.708 0.208
#> SRR1699949 2 0.603 0.395821 0.152 0.780 0.068
#> SRR1699950 2 0.688 0.506742 0.172 0.732 0.096
#> SRR1699951 3 0.972 -0.215758 0.300 0.252 0.448
#> SRR1699952 2 0.874 0.170432 0.108 0.452 0.440
#> SRR1699953 2 0.692 0.519589 0.140 0.736 0.124
#> SRR1699954 3 0.712 0.577538 0.204 0.088 0.708
#> SRR1699955 2 0.746 -0.085488 0.400 0.560 0.040
#> SRR1699956 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699957 2 0.630 0.521765 0.048 0.744 0.208
#> SRR1699959 3 0.638 0.546495 0.032 0.256 0.712
#> SRR1699958 3 0.950 -0.031356 0.308 0.212 0.480
#> SRR1699960 1 0.882 0.431453 0.552 0.304 0.144
#> SRR1699961 3 0.606 0.605239 0.048 0.188 0.764
#> SRR1699962 2 0.904 0.374520 0.280 0.544 0.176
#> SRR1699963 3 0.735 -0.003820 0.436 0.032 0.532
#> SRR1699964 3 0.919 0.063901 0.364 0.156 0.480
#> SRR1699965 2 0.199 0.392022 0.048 0.948 0.004
#> SRR1699966 3 0.670 0.385482 0.020 0.348 0.632
#> SRR1699967 2 0.850 0.371127 0.100 0.532 0.368
#> SRR1699968 2 0.769 0.409997 0.056 0.580 0.364
#> SRR1699969 3 0.435 0.630832 0.184 0.000 0.816
#> SRR1699971 3 0.385 0.662856 0.016 0.108 0.876
#> SRR1699970 2 0.602 0.233440 0.256 0.724 0.020
#> SRR1699972 3 0.377 0.653501 0.084 0.028 0.888
#> SRR1699973 3 0.898 0.140770 0.316 0.152 0.532
#> SRR1699974 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699975 3 0.792 0.506976 0.120 0.228 0.652
#> SRR1699976 3 0.726 0.442023 0.048 0.316 0.636
#> SRR1699977 3 0.630 0.534707 0.248 0.032 0.720
#> SRR1699978 3 0.460 0.626420 0.204 0.000 0.796
#> SRR1699979 3 0.460 0.588018 0.204 0.000 0.796
#> SRR1699980 3 0.954 -0.093555 0.364 0.196 0.440
#> SRR1699981 3 0.164 0.666534 0.020 0.016 0.964
#> SRR1699982 1 0.990 0.208097 0.400 0.320 0.280
#> SRR1699983 2 0.877 0.471973 0.204 0.588 0.208
#> SRR1699984 3 0.445 0.630189 0.192 0.000 0.808
#> SRR1699985 3 0.979 -0.406608 0.348 0.240 0.412
#> SRR1699986 3 0.440 0.631045 0.188 0.000 0.812
#> SRR1699988 3 0.940 0.105951 0.292 0.208 0.500
#> SRR1699987 3 0.389 0.670155 0.032 0.084 0.884
#> SRR1699989 2 0.888 0.258869 0.120 0.464 0.416
#> SRR1699990 3 0.475 0.637794 0.012 0.172 0.816
#> SRR1699992 3 0.635 0.613460 0.156 0.080 0.764
#> SRR1699991 3 0.411 0.648649 0.004 0.152 0.844
#> SRR1699993 3 0.269 0.668587 0.032 0.036 0.932
#> SRR1699994 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699995 3 0.460 0.626560 0.204 0.000 0.796
#> SRR1699996 3 0.779 0.132653 0.052 0.424 0.524
#> SRR1699997 3 0.672 0.259856 0.380 0.016 0.604
#> SRR1699998 3 0.735 -0.046831 0.432 0.032 0.536
#> SRR1699999 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700000 3 0.654 0.605108 0.084 0.164 0.752
#> SRR1700002 3 0.658 0.531241 0.224 0.052 0.724
#> SRR1700001 3 0.140 0.661360 0.028 0.004 0.968
#> SRR1700003 3 0.671 0.164803 0.416 0.012 0.572
#> SRR1700004 3 0.199 0.657415 0.048 0.004 0.948
#> SRR1700005 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700006 3 0.501 0.608378 0.180 0.016 0.804
#> SRR1700007 1 0.775 0.150851 0.492 0.460 0.048
#> SRR1700008 3 0.207 0.655112 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700009 3 0.440 0.631045 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700010 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700011 1 0.938 0.482183 0.504 0.288 0.208
#> SRR1700013 3 0.634 0.358383 0.360 0.008 0.632
#> SRR1700012 3 0.654 0.353702 0.344 0.016 0.640
#> SRR1700014 3 0.478 0.574864 0.200 0.004 0.796
#> SRR1700015 3 0.608 0.581804 0.168 0.060 0.772
#> SRR1700016 3 0.450 0.629119 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700018 3 0.737 0.575350 0.104 0.200 0.696
#> SRR1700017 3 0.450 0.579320 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700019 1 0.929 0.437721 0.516 0.200 0.284
#> SRR1700020 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700021 3 0.894 -0.311968 0.436 0.124 0.440
#> SRR1700023 3 0.807 0.558747 0.164 0.184 0.652
#> SRR1700022 3 0.353 0.671366 0.032 0.068 0.900
#> SRR1700024 1 0.815 0.399379 0.520 0.072 0.408
#> SRR1700025 3 0.671 0.589477 0.140 0.112 0.748
#> SRR1700026 3 0.670 0.574232 0.188 0.076 0.736
#> SRR1700027 3 0.595 0.587482 0.172 0.052 0.776
#> SRR1700028 3 0.737 0.500655 0.200 0.104 0.696
#> SRR1700029 3 0.550 0.630839 0.124 0.064 0.812
#> SRR1700030 3 0.950 0.105741 0.236 0.272 0.492
#> SRR1700031 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700032 3 0.923 0.155543 0.316 0.176 0.508
#> SRR1700034 3 0.440 0.631045 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700035 1 0.978 0.151275 0.384 0.384 0.232
#> SRR1700033 3 0.418 0.634485 0.172 0.000 0.828
#> SRR1700036 2 0.719 0.093528 0.024 0.496 0.480
#> SRR1700037 1 0.968 0.101564 0.420 0.364 0.216
#> SRR1700038 3 0.746 0.561216 0.088 0.236 0.676
#> SRR1700039 3 0.418 0.634541 0.172 0.000 0.828
#> SRR1700040 3 0.348 0.649237 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700041 3 0.245 0.671815 0.012 0.052 0.936
#> SRR1700042 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700043 3 0.250 0.659062 0.068 0.004 0.928
#> SRR1700045 3 0.183 0.660013 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700044 3 0.933 0.030213 0.268 0.216 0.516
#> SRR1700046 3 0.478 0.604654 0.164 0.016 0.820
#> SRR1700047 3 0.450 0.631998 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700048 3 0.552 0.604835 0.164 0.040 0.796
#> SRR1700049 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700050 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700051 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700052 3 0.435 0.630911 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700053 3 0.670 0.437448 0.024 0.328 0.648
#> SRR1700054 3 0.429 0.640909 0.092 0.040 0.868
#> SRR1700055 3 0.435 0.630075 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700056 3 0.165 0.658480 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700057 3 0.341 0.668049 0.068 0.028 0.904
#> SRR1700058 3 0.460 0.626962 0.204 0.000 0.796
#> SRR1700059 3 0.488 0.572536 0.208 0.004 0.788
#> SRR1700060 3 0.455 0.628082 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700061 3 0.231 0.667302 0.032 0.024 0.944
#> SRR1700062 3 0.455 0.628234 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700063 3 0.585 0.637537 0.180 0.044 0.776
#> SRR1700064 3 0.751 0.560314 0.144 0.160 0.696
#> SRR1700065 3 0.186 0.661799 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700066 3 0.440 0.630140 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700067 1 0.816 0.550072 0.608 0.104 0.288
#> SRR1700068 3 0.285 0.669273 0.012 0.068 0.920
#> SRR1700069 3 0.937 0.096038 0.172 0.376 0.452
#> SRR1700070 2 0.764 0.462432 0.076 0.640 0.284
#> SRR1700071 3 0.715 0.568434 0.092 0.200 0.708
#> SRR1700072 3 0.585 0.580209 0.028 0.216 0.756
#> SRR1700073 3 0.782 -0.077348 0.440 0.052 0.508
#> SRR1700075 3 0.505 0.639483 0.024 0.164 0.812
#> SRR1700074 3 0.398 0.652312 0.004 0.144 0.852
#> SRR1700076 3 0.837 0.351264 0.104 0.324 0.572
#> SRR1700077 3 0.410 0.655850 0.008 0.140 0.852
#> SRR1700078 3 0.568 0.634985 0.048 0.160 0.792
#> SRR1700080 3 0.770 0.569911 0.140 0.180 0.680
#> SRR1700079 3 0.423 0.639255 0.160 0.004 0.836
#> SRR1700081 3 0.470 0.623083 0.212 0.000 0.788
#> SRR1700082 3 0.164 0.660772 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700083 3 0.445 0.631714 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700084 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700085 2 0.888 0.475252 0.220 0.576 0.204
#> SRR1700086 3 0.917 -0.030442 0.148 0.396 0.456
#> SRR1700087 3 0.527 0.583153 0.212 0.012 0.776
#> SRR1700088 3 0.603 0.569092 0.212 0.036 0.752
#> SRR1700089 3 0.777 0.566918 0.148 0.176 0.676
#> SRR1700091 3 0.670 0.465007 0.256 0.044 0.700
#> SRR1700090 3 0.455 0.576723 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700092 3 0.912 0.131069 0.232 0.220 0.548
#> SRR1700094 3 0.558 0.569763 0.204 0.024 0.772
#> SRR1700093 3 0.568 0.553047 0.236 0.016 0.748
#> SRR1700095 3 0.249 0.671354 0.016 0.048 0.936
#> SRR1700096 3 0.400 0.608664 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700097 3 0.400 0.644873 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700098 3 0.638 0.298470 0.368 0.008 0.624
#> SRR1700099 3 0.711 0.371011 0.308 0.044 0.648
#> SRR1700100 3 0.631 0.405117 0.328 0.012 0.660
#> SRR1700101 3 0.653 0.389924 0.320 0.020 0.660
#> SRR1700102 3 0.759 0.372140 0.268 0.080 0.652
#> SRR1700104 3 0.546 0.568673 0.204 0.020 0.776
#> SRR1700103 3 0.348 0.627676 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700105 3 0.704 0.561146 0.168 0.108 0.724
#> SRR1700106 3 0.566 0.529403 0.248 0.012 0.740
#> SRR1700107 3 0.728 0.205250 0.376 0.036 0.588
#> SRR1700108 3 0.721 0.139500 0.384 0.032 0.584
#> SRR1700109 1 0.913 0.536444 0.516 0.164 0.320
#> SRR1700110 1 0.922 0.545155 0.524 0.192 0.284
#> SRR1700112 1 0.907 0.450715 0.448 0.136 0.416
#> SRR1700111 3 0.633 0.379790 0.332 0.012 0.656
#> SRR1700113 2 0.835 0.382799 0.100 0.568 0.332
#> SRR1700114 3 0.692 0.583517 0.132 0.132 0.736
#> SRR1700115 1 0.792 0.221353 0.476 0.056 0.468
#> SRR1700116 3 0.445 0.595109 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700117 3 0.440 0.635220 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700119 3 0.639 0.593125 0.048 0.216 0.736
#> SRR1700118 3 0.642 0.475656 0.288 0.024 0.688
#> SRR1700120 3 0.382 0.648805 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700121 3 0.678 0.279965 0.364 0.020 0.616
#> SRR1700122 1 0.711 0.531244 0.624 0.036 0.340
#> SRR1700123 3 0.429 0.611660 0.152 0.008 0.840
#> SRR1700125 1 0.888 0.535558 0.540 0.144 0.316
#> SRR1700126 3 0.334 0.652270 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700127 3 0.103 0.657822 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700124 3 0.455 0.576723 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700128 3 0.236 0.649180 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700129 3 0.744 0.054937 0.428 0.036 0.536
#> SRR1700130 3 0.696 0.123940 0.412 0.020 0.568
#> SRR1700132 3 0.200 0.664612 0.036 0.012 0.952
#> SRR1700131 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700133 3 0.601 0.577672 0.184 0.048 0.768
#> SRR1700134 3 0.906 0.000994 0.152 0.336 0.512
#> SRR1700135 3 0.230 0.671292 0.004 0.060 0.936
#> SRR1700136 3 0.445 0.630207 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700137 3 0.524 0.622254 0.160 0.032 0.808
#> SRR1700138 3 0.464 0.660473 0.036 0.116 0.848
#> SRR1700140 3 0.318 0.669680 0.024 0.064 0.912
#> SRR1700139 3 0.506 0.549655 0.244 0.000 0.756
#> SRR1700141 3 0.989 -0.491948 0.264 0.356 0.380
#> SRR1700142 3 0.375 0.648676 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700143 3 0.175 0.656320 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700144 3 0.288 0.647848 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700145 3 0.375 0.618165 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700146 1 0.902 0.547591 0.552 0.184 0.264
#> SRR1700147 3 0.113 0.657588 0.020 0.004 0.976
#> SRR1700149 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700148 3 0.318 0.672872 0.024 0.064 0.912
#> SRR1700150 3 0.748 0.409537 0.284 0.068 0.648
#> SRR1700152 3 0.458 0.589478 0.184 0.004 0.812
#> SRR1700151 3 0.205 0.665691 0.028 0.020 0.952
#> SRR1700153 3 0.116 0.657795 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700154 3 0.397 0.667681 0.044 0.072 0.884
#> SRR1700155 3 0.551 0.565604 0.220 0.016 0.764
#> SRR1700156 3 0.362 0.649578 0.136 0.000 0.864
#> SRR1700158 3 0.455 0.628504 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700159 2 0.574 0.523779 0.072 0.800 0.128
#> SRR1700157 3 0.334 0.651919 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700160 3 0.101 0.660947 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700161 3 0.200 0.669862 0.012 0.036 0.952
#> SRR1700162 1 0.970 0.478162 0.444 0.236 0.320
#> SRR1700164 3 0.348 0.654633 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700163 3 0.450 0.629565 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700165 3 0.175 0.662536 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700166 3 0.596 0.520738 0.264 0.016 0.720
#> SRR1700168 1 0.846 0.543249 0.592 0.128 0.280
#> SRR1700167 3 0.388 0.645829 0.152 0.000 0.848
#> SRR1700170 3 0.593 0.461279 0.296 0.008 0.696
#> SRR1700169 3 0.116 0.657326 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700171 3 0.206 0.657797 0.044 0.008 0.948
#> SRR1700172 3 0.745 0.580773 0.160 0.140 0.700
#> SRR1700174 3 0.550 0.561278 0.208 0.020 0.772
#> SRR1700173 3 0.554 0.550608 0.252 0.008 0.740
#> SRR1700175 3 0.729 0.534390 0.092 0.212 0.696
#> SRR1700176 3 0.455 0.628082 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700178 2 0.677 0.366401 0.144 0.744 0.112
#> SRR1700177 3 0.541 0.613421 0.020 0.200 0.780
#> SRR1700180 2 0.739 0.377134 0.308 0.636 0.056
#> SRR1700179 2 0.368 0.434195 0.080 0.892 0.028
#> SRR1700181 2 0.923 -0.383618 0.416 0.432 0.152
#> SRR1700183 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700182 2 0.338 0.392779 0.100 0.892 0.008
#> SRR1700184 2 0.932 0.208560 0.296 0.508 0.196
#> SRR1700186 2 0.894 0.366396 0.132 0.500 0.368
#> SRR1700187 3 0.450 0.629885 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700185 3 0.450 0.629431 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700188 2 0.948 -0.059763 0.264 0.496 0.240
#> SRR1700192 3 0.765 0.541922 0.124 0.196 0.680
#> SRR1700190 3 0.435 0.630075 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700191 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700189 3 0.480 0.639545 0.020 0.156 0.824
#> SRR1700193 2 0.939 0.209166 0.248 0.512 0.240
#> SRR1700195 2 0.865 0.447543 0.140 0.576 0.284
#> SRR1700194 3 0.465 0.625032 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700196 2 0.808 0.445656 0.260 0.628 0.112
#> SRR1700197 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700198 2 0.738 0.518640 0.084 0.680 0.236
#> SRR1700199 2 0.652 0.515786 0.040 0.712 0.248
#> SRR1700200 2 0.965 0.106974 0.348 0.436 0.216
#> SRR1700201 2 0.327 0.380248 0.116 0.884 0.000
#> SRR1700202 2 0.963 0.228852 0.204 0.404 0.392
#> SRR1700203 1 0.898 0.254601 0.452 0.420 0.128
#> SRR1700204 2 0.788 0.505871 0.104 0.644 0.252
#> SRR1700206 3 0.919 -0.127466 0.148 0.416 0.436
#> SRR1700207 2 0.380 0.364305 0.092 0.884 0.024
#> SRR1700208 3 0.680 0.499560 0.040 0.280 0.680
#> SRR1700205 1 0.886 0.469647 0.576 0.192 0.232
#> SRR1700209 2 0.509 0.437333 0.136 0.824 0.040
#> SRR1700210 2 0.763 0.474470 0.200 0.680 0.120
#> SRR1700211 2 0.927 0.337905 0.188 0.512 0.300
#> SRR1700212 1 0.911 0.353970 0.432 0.140 0.428
#> SRR1700213 2 0.863 0.401457 0.112 0.532 0.356
#> SRR1700214 2 0.589 0.528156 0.052 0.780 0.168
#> SRR1700215 3 0.440 0.631045 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700217 2 0.821 0.493602 0.148 0.636 0.216
#> SRR1700216 3 0.435 0.630832 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700218 2 0.675 0.280578 0.012 0.556 0.432
#> SRR1700219 2 0.388 0.380138 0.152 0.848 0.000
#> SRR1700222 3 0.445 0.629948 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700220 2 0.775 0.151134 0.312 0.616 0.072
#> SRR1700221 2 0.857 0.397195 0.168 0.604 0.228
#> SRR1700223 2 0.582 0.459347 0.144 0.792 0.064
#> SRR1700224 2 0.995 0.089993 0.284 0.364 0.352
#> SRR1700226 2 0.559 0.494517 0.092 0.812 0.096
#> SRR1700229 2 0.695 0.523645 0.084 0.720 0.196
#> SRR1700225 2 0.882 0.390138 0.128 0.524 0.348
#> SRR1700227 2 0.826 0.492435 0.196 0.636 0.168
#> SRR1700230 3 0.429 0.633205 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700231 2 0.947 0.250326 0.272 0.496 0.232
#> SRR1700228 3 0.986 -0.207036 0.264 0.328 0.408
#> SRR1700232 2 0.767 0.332967 0.312 0.620 0.068
#> SRR1700233 2 0.609 0.528546 0.076 0.780 0.144
#> SRR1700234 2 0.748 0.519659 0.116 0.692 0.192
#> SRR1700235 3 0.847 0.344834 0.116 0.308 0.576
#> SRR1700237 2 0.844 0.481191 0.144 0.608 0.248
#> SRR1700236 2 0.942 0.311222 0.328 0.480 0.192
#> SRR1700238 2 0.551 0.466182 0.136 0.808 0.056
#> SRR1700239 3 0.445 0.630189 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700240 3 0.440 0.630773 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700241 3 0.417 0.666924 0.048 0.076 0.876
#> SRR1700243 2 0.911 0.412834 0.168 0.524 0.308
#> SRR1700244 2 0.784 0.477725 0.084 0.624 0.292
#> SRR1700242 3 0.668 0.419869 0.024 0.324 0.652
#> SRR1700246 1 0.990 0.013659 0.392 0.336 0.272
#> SRR1700245 2 0.437 0.432105 0.108 0.860 0.032
#> SRR1700247 3 0.465 0.625032 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700249 3 0.429 0.630564 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700250 2 0.554 0.528982 0.052 0.804 0.144
#> SRR1700248 2 0.780 0.453816 0.080 0.624 0.296
#> SRR1700251 1 0.900 0.417566 0.468 0.400 0.132
#> SRR1700252 3 0.605 0.506835 0.012 0.292 0.696
#> SRR1700253 2 0.745 0.069899 0.396 0.564 0.040
#> SRR1700256 1 0.942 0.407145 0.488 0.200 0.312
#> SRR1700254 3 0.429 0.638133 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700255 2 0.550 0.352688 0.248 0.744 0.008
#> SRR1700257 2 0.587 0.401305 0.160 0.784 0.056
#> SRR1700258 2 0.751 0.434820 0.268 0.656 0.076
#> SRR1700259 2 0.274 0.378107 0.052 0.928 0.020
#> SRR1700260 1 0.776 0.553085 0.604 0.068 0.328
#> SRR1700261 2 0.499 0.415881 0.160 0.816 0.024
#> SRR1700262 2 0.658 0.346744 0.200 0.736 0.064
#> SRR1700263 2 0.912 0.386575 0.160 0.512 0.328
#> SRR1700264 2 0.680 0.469971 0.204 0.724 0.072
#> SRR1700265 3 0.767 0.425878 0.300 0.072 0.628
#> SRR1700266 2 0.720 0.311021 0.160 0.716 0.124
#> SRR1700268 3 0.663 0.530126 0.036 0.272 0.692
#> SRR1700270 2 0.619 0.528072 0.060 0.764 0.176
#> SRR1700267 2 0.734 0.169313 0.300 0.644 0.056
#> SRR1700271 2 0.694 0.323611 0.188 0.724 0.088
#> SRR1700272 1 0.882 0.428334 0.552 0.304 0.144
#> SRR1700273 2 0.788 0.498099 0.096 0.636 0.268
#> SRR1700274 1 0.922 0.406302 0.532 0.208 0.260
#> SRR1700277 3 0.468 0.654599 0.040 0.112 0.848
#> SRR1700275 2 0.657 0.499174 0.160 0.752 0.088
#> SRR1700276 2 0.635 0.464505 0.156 0.764 0.080
#> SRR1700278 3 0.953 -0.000881 0.272 0.240 0.488
#> SRR1700279 2 0.873 0.373961 0.288 0.568 0.144
#> SRR1700280 2 0.760 0.505103 0.124 0.684 0.192
#> SRR1700281 2 0.872 0.333835 0.188 0.592 0.220
#> SRR1700283 1 0.849 0.333973 0.572 0.312 0.116
#> SRR1700282 3 0.662 0.585425 0.196 0.068 0.736
#> SRR1700284 2 0.928 0.007648 0.352 0.480 0.168
#> SRR1700285 3 0.971 -0.012427 0.296 0.252 0.452
#> SRR1700286 2 0.844 0.476312 0.160 0.616 0.224
#> SRR1700287 1 0.808 0.527983 0.648 0.148 0.204
#> SRR1700290 3 0.460 0.626844 0.204 0.000 0.796
#> SRR1700289 2 0.990 0.060345 0.304 0.404 0.292
#> SRR1700288 2 0.751 0.497156 0.156 0.696 0.148
#> SRR1700292 1 0.769 0.500691 0.680 0.136 0.184
#> SRR1700291 3 0.707 -0.052074 0.020 0.480 0.500
#> SRR1700293 2 0.942 0.259884 0.180 0.456 0.364
#> SRR1700294 1 0.910 0.352881 0.492 0.360 0.148
#> SRR1700295 3 0.736 0.425529 0.048 0.332 0.620
#> SRR1700297 2 0.766 0.448108 0.228 0.668 0.104
#> SRR1700296 1 0.792 0.117210 0.484 0.460 0.056
#> SRR1700298 3 0.859 -0.044250 0.100 0.400 0.500
#> SRR1700299 3 0.745 0.310125 0.332 0.052 0.616
#> SRR1700300 3 0.770 0.561871 0.140 0.180 0.680
#> SRR1700302 1 0.854 0.356613 0.576 0.300 0.124
#> SRR1700301 2 0.643 0.344963 0.348 0.640 0.012
#> SRR1700303 1 0.783 0.492669 0.672 0.160 0.168
#> SRR1700304 2 0.745 0.292886 0.332 0.616 0.052
#> SRR1700305 2 0.649 0.502602 0.032 0.700 0.268
#> SRR1700306 3 0.670 0.391572 0.020 0.348 0.632
#> SRR1700308 3 0.726 0.087214 0.028 0.444 0.528
#> SRR1700307 3 0.412 0.651318 0.084 0.040 0.876
#> SRR1700309 3 0.327 0.667263 0.004 0.104 0.892
#> SRR1700310 1 0.867 0.332235 0.544 0.336 0.120
#> SRR1700311 3 0.819 0.457029 0.128 0.244 0.628
#> SRR1700312 3 0.815 0.245739 0.332 0.088 0.580
#> SRR1700313 3 0.737 0.296919 0.036 0.400 0.564
#> SRR1700314 3 0.734 0.596818 0.148 0.144 0.708
#> SRR1700315 3 0.792 0.494800 0.104 0.256 0.640
#> SRR1700316 3 0.808 0.548705 0.148 0.204 0.648
#> SRR1700317 2 0.874 0.056818 0.428 0.464 0.108
#> SRR1700318 3 0.997 -0.179327 0.316 0.312 0.372
#> SRR1700319 3 0.645 0.636505 0.104 0.132 0.764
#> SRR1700320 1 0.994 0.291416 0.372 0.344 0.284
#> SRR1700322 2 0.964 0.338430 0.228 0.456 0.316
#> SRR1700321 1 0.788 0.127682 0.548 0.392 0.060
#> SRR1700323 3 0.725 0.078091 0.028 0.436 0.536
#> SRR1700324 2 0.823 0.432437 0.208 0.636 0.156
#> SRR1700325 3 0.960 0.131044 0.292 0.236 0.472
#> SRR1700326 3 0.691 0.600150 0.120 0.144 0.736
#> SRR1700327 2 0.846 0.421911 0.124 0.588 0.288
#> SRR1700329 2 0.969 0.254516 0.224 0.432 0.344
#> SRR1700328 3 0.764 0.542832 0.096 0.240 0.664
#> SRR1700330 3 0.536 0.596183 0.012 0.220 0.768
#> SRR1700331 2 0.875 0.485643 0.244 0.584 0.172
#> SRR1700332 2 0.741 0.313574 0.036 0.548 0.416
#> SRR1700333 2 0.795 0.480672 0.100 0.632 0.268
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 1 0.7945 0.369164 0.580 0.084 0.228 0.108
#> SRR1699875 1 0.7118 0.330755 0.592 0.056 0.300 0.052
#> SRR1699876 2 0.8076 0.381304 0.224 0.568 0.076 0.132
#> SRR1699877 4 0.9949 -0.148413 0.240 0.264 0.208 0.288
#> SRR1699879 2 0.8547 0.080697 0.340 0.392 0.236 0.032
#> SRR1699878 2 0.8778 0.408869 0.080 0.452 0.160 0.308
#> SRR1699880 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.4527 0.602263 0.192 0.008 0.780 0.020
#> SRR1699882 2 0.8882 -0.084626 0.340 0.420 0.152 0.088
#> SRR1699883 2 0.8987 0.143819 0.172 0.388 0.356 0.084
#> SRR1699884 3 0.8756 -0.277449 0.172 0.064 0.388 0.376
#> SRR1699885 2 0.8126 0.289291 0.352 0.480 0.056 0.112
#> SRR1699886 2 0.8872 0.254758 0.060 0.412 0.308 0.220
#> SRR1699888 1 0.5896 0.446440 0.728 0.016 0.156 0.100
#> SRR1699889 3 0.9327 0.040559 0.292 0.164 0.408 0.136
#> SRR1699890 2 0.7028 0.263269 0.304 0.548 0.000 0.148
#> SRR1699887 1 0.4396 0.393068 0.824 0.104 0.008 0.064
#> SRR1699891 1 0.7545 -0.038853 0.496 0.376 0.028 0.100
#> SRR1699892 3 0.6813 0.367308 0.080 0.316 0.588 0.016
#> SRR1699893 3 0.8072 0.289209 0.272 0.028 0.504 0.196
#> SRR1699894 2 0.7889 0.334190 0.324 0.524 0.064 0.088
#> SRR1699895 1 0.7195 0.382968 0.624 0.232 0.040 0.104
#> SRR1699896 3 0.6403 0.275337 0.444 0.012 0.504 0.040
#> SRR1699897 3 0.6759 0.360400 0.376 0.056 0.548 0.020
#> SRR1699898 3 0.0921 0.620618 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699900 3 0.5652 0.599117 0.140 0.096 0.748 0.016
#> SRR1699899 1 0.8165 0.071180 0.440 0.052 0.392 0.116
#> SRR1699902 3 0.3672 0.642674 0.028 0.028 0.872 0.072
#> SRR1699901 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699903 3 0.7988 0.102927 0.016 0.200 0.468 0.316
#> SRR1699904 2 0.9562 0.206993 0.284 0.312 0.112 0.292
#> SRR1699905 3 0.0336 0.627937 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699906 1 0.6722 0.359045 0.648 0.084 0.028 0.240
#> SRR1699907 2 0.7370 0.236251 0.056 0.524 0.368 0.052
#> SRR1699908 4 0.7415 0.494074 0.020 0.120 0.316 0.544
#> SRR1699909 3 0.8005 0.377765 0.276 0.104 0.548 0.072
#> SRR1699910 3 0.6019 0.535690 0.020 0.224 0.696 0.060
#> SRR1699911 4 0.6536 0.503616 0.032 0.040 0.320 0.608
#> SRR1699912 2 0.8318 0.303577 0.240 0.544 0.096 0.120
#> SRR1699913 2 0.8412 0.082309 0.344 0.368 0.020 0.268
#> SRR1699914 3 0.1749 0.628530 0.012 0.012 0.952 0.024
#> SRR1699915 3 0.9015 0.194162 0.100 0.204 0.464 0.232
#> SRR1699916 1 0.9111 -0.102055 0.348 0.296 0.064 0.292
#> SRR1699917 2 0.9327 0.300834 0.140 0.368 0.148 0.344
#> SRR1699918 1 0.6270 0.312870 0.608 0.028 0.336 0.028
#> SRR1699919 1 0.6152 0.318770 0.616 0.020 0.332 0.032
#> SRR1699920 3 0.6642 0.521910 0.256 0.020 0.640 0.084
#> SRR1699921 3 0.8588 0.152390 0.104 0.340 0.456 0.100
#> SRR1699922 1 0.9462 0.037381 0.328 0.280 0.292 0.100
#> SRR1699923 3 0.3601 0.635651 0.012 0.024 0.864 0.100
#> SRR1699924 3 0.4811 0.631255 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1699925 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6703 0.388878 0.024 0.332 0.588 0.056
#> SRR1699927 1 0.7530 0.373517 0.620 0.204 0.068 0.108
#> SRR1699929 3 0.7141 0.427274 0.088 0.032 0.596 0.284
#> SRR1699928 4 0.7743 0.444985 0.136 0.076 0.176 0.612
#> SRR1699930 1 0.4578 0.363438 0.788 0.160 0.000 0.052
#> SRR1699931 3 0.6118 0.279249 0.024 0.404 0.556 0.016
#> SRR1699933 3 0.5193 0.507691 0.020 0.000 0.656 0.324
#> SRR1699932 3 0.7992 -0.293413 0.260 0.360 0.376 0.004
#> SRR1699934 3 0.1389 0.609257 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699935 1 0.7091 0.124715 0.484 0.088 0.416 0.012
#> SRR1699936 1 0.3286 0.392225 0.876 0.044 0.000 0.080
#> SRR1699937 3 0.9469 -0.142842 0.244 0.136 0.404 0.216
#> SRR1699938 1 0.5364 0.438909 0.788 0.084 0.048 0.080
#> SRR1699940 3 0.6748 0.591847 0.100 0.048 0.684 0.168
#> SRR1699939 1 0.8086 0.162995 0.448 0.028 0.160 0.364
#> SRR1699941 3 0.4939 0.603433 0.180 0.016 0.772 0.032
#> SRR1699942 4 0.5101 0.527816 0.036 0.008 0.212 0.744
#> SRR1699943 3 0.9831 -0.321546 0.180 0.280 0.320 0.220
#> SRR1699944 1 0.7848 0.349551 0.560 0.060 0.272 0.108
#> SRR1699945 3 0.0817 0.633558 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1699946 3 0.7984 0.044070 0.252 0.296 0.444 0.008
#> SRR1699947 3 0.8673 -0.070530 0.292 0.256 0.412 0.040
#> SRR1699948 2 0.8184 0.179715 0.356 0.420 0.204 0.020
#> SRR1699949 1 0.6015 0.366029 0.676 0.252 0.012 0.060
#> SRR1699950 1 0.7976 0.171944 0.468 0.376 0.044 0.112
#> SRR1699951 3 0.9683 -0.338245 0.140 0.240 0.332 0.288
#> SRR1699952 3 0.8637 -0.045884 0.164 0.356 0.420 0.060
#> SRR1699953 1 0.8407 0.158327 0.496 0.308 0.104 0.092
#> SRR1699954 3 0.6774 0.387142 0.120 0.000 0.568 0.312
#> SRR1699955 2 0.6521 0.356701 0.124 0.620 0.000 0.256
#> SRR1699956 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699957 1 0.5296 0.438375 0.760 0.028 0.176 0.036
#> SRR1699959 3 0.6591 0.445415 0.336 0.016 0.588 0.060
#> SRR1699958 4 0.9119 0.362680 0.244 0.072 0.308 0.376
#> SRR1699960 4 0.7044 -0.009227 0.276 0.164 0.000 0.560
#> SRR1699961 3 0.5283 0.581788 0.200 0.012 0.744 0.044
#> SRR1699962 2 0.6358 0.484581 0.052 0.716 0.152 0.080
#> SRR1699963 4 0.6074 0.460306 0.000 0.060 0.340 0.600
#> SRR1699964 4 0.7916 0.320279 0.156 0.020 0.388 0.436
#> SRR1699965 1 0.3279 0.384023 0.872 0.096 0.000 0.032
#> SRR1699966 3 0.6490 0.385009 0.088 0.300 0.608 0.004
#> SRR1699967 3 0.8963 -0.354182 0.284 0.316 0.348 0.052
#> SRR1699968 2 0.7707 0.244880 0.180 0.472 0.340 0.008
#> SRR1699969 3 0.0188 0.627980 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699971 3 0.4511 0.608794 0.176 0.000 0.784 0.040
#> SRR1699970 1 0.8251 -0.198025 0.372 0.336 0.012 0.280
#> SRR1699972 3 0.5344 0.560221 0.028 0.012 0.712 0.248
#> SRR1699973 4 0.8355 0.298801 0.088 0.088 0.404 0.420
#> SRR1699974 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699975 3 0.7728 0.352895 0.032 0.272 0.552 0.144
#> SRR1699976 3 0.8036 0.417955 0.116 0.236 0.568 0.080
#> SRR1699977 3 0.5833 0.249548 0.032 0.000 0.528 0.440
#> SRR1699978 3 0.1211 0.613968 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699979 3 0.4877 0.371633 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR1699980 4 0.8590 0.198330 0.292 0.028 0.312 0.368
#> SRR1699981 3 0.4004 0.617141 0.024 0.000 0.812 0.164
#> SRR1699982 2 0.7671 0.456709 0.052 0.604 0.180 0.164
#> SRR1699983 1 0.8220 0.392290 0.576 0.104 0.164 0.156
#> SRR1699984 3 0.0469 0.627427 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699985 4 0.8445 0.388432 0.176 0.092 0.188 0.544
#> SRR1699986 3 0.0336 0.628113 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699988 4 0.9097 0.290233 0.136 0.120 0.360 0.384
#> SRR1699987 3 0.5397 0.629454 0.076 0.020 0.768 0.136
#> SRR1699989 2 0.8908 0.074068 0.192 0.384 0.356 0.068
#> SRR1699990 3 0.6066 0.611315 0.132 0.072 0.740 0.056
#> SRR1699992 3 0.6984 0.460391 0.144 0.004 0.584 0.268
#> SRR1699991 3 0.4959 0.581696 0.224 0.016 0.744 0.016
#> SRR1699993 3 0.4821 0.620670 0.008 0.048 0.784 0.160
#> SRR1699994 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699995 3 0.0817 0.624125 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699996 3 0.6779 0.194041 0.448 0.040 0.484 0.028
#> SRR1699997 4 0.4804 0.368529 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1699998 4 0.4832 0.516151 0.004 0.004 0.312 0.680
#> SRR1699999 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.6812 0.469414 0.020 0.248 0.632 0.100
#> SRR1700002 3 0.6754 0.253555 0.012 0.068 0.540 0.380
#> SRR1700001 3 0.4249 0.611013 0.008 0.016 0.800 0.176
#> SRR1700003 4 0.4643 0.449858 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700004 3 0.4604 0.595460 0.008 0.012 0.756 0.224
#> SRR1700005 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5159 0.433536 0.000 0.012 0.624 0.364
#> SRR1700007 2 0.7247 0.242305 0.124 0.444 0.004 0.428
#> SRR1700008 3 0.3975 0.584968 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700009 3 0.0336 0.628113 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700010 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700011 4 0.5283 0.199916 0.200 0.044 0.012 0.744
#> SRR1700013 4 0.5080 0.217559 0.000 0.004 0.420 0.576
#> SRR1700012 4 0.6343 0.248317 0.008 0.044 0.428 0.520
#> SRR1700014 3 0.5244 0.358176 0.000 0.012 0.600 0.388
#> SRR1700015 3 0.6589 0.393118 0.032 0.040 0.596 0.332
#> SRR1700016 3 0.0707 0.624863 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700018 3 0.5937 0.431572 0.340 0.000 0.608 0.052
#> SRR1700017 3 0.4830 0.357188 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700019 4 0.8181 0.266825 0.148 0.120 0.148 0.584
#> SRR1700020 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700021 4 0.7088 0.527373 0.112 0.024 0.252 0.612
#> SRR1700023 3 0.7827 0.409745 0.244 0.032 0.552 0.172
#> SRR1700022 3 0.4362 0.637437 0.088 0.000 0.816 0.096
#> SRR1700024 4 0.5837 0.501655 0.012 0.064 0.220 0.704
#> SRR1700025 3 0.7064 0.432115 0.108 0.020 0.600 0.272
#> SRR1700026 3 0.7048 0.379699 0.044 0.048 0.556 0.352
#> SRR1700027 3 0.6185 0.395677 0.036 0.016 0.604 0.344
#> SRR1700028 3 0.8290 0.138268 0.072 0.116 0.500 0.312
#> SRR1700029 3 0.5953 0.499794 0.076 0.000 0.656 0.268
#> SRR1700030 3 0.8940 -0.125826 0.364 0.072 0.376 0.188
#> SRR1700031 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700032 4 0.8328 0.321128 0.200 0.028 0.356 0.416
#> SRR1700034 3 0.0336 0.628113 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700035 1 0.8240 0.353188 0.552 0.132 0.084 0.232
#> SRR1700033 3 0.0524 0.631405 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1700036 1 0.7009 -0.045456 0.464 0.072 0.448 0.016
#> SRR1700037 4 0.9554 -0.226007 0.272 0.224 0.132 0.372
#> SRR1700038 3 0.6825 0.402378 0.348 0.008 0.556 0.088
#> SRR1700039 3 0.0336 0.630485 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700040 3 0.1474 0.636453 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700041 3 0.4731 0.632162 0.096 0.004 0.800 0.100
#> SRR1700042 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700043 3 0.3945 0.603213 0.000 0.004 0.780 0.216
#> SRR1700045 3 0.4420 0.595198 0.008 0.012 0.776 0.204
#> SRR1700044 4 0.8923 0.314300 0.128 0.108 0.356 0.408
#> SRR1700046 3 0.5884 0.451464 0.032 0.012 0.636 0.320
#> SRR1700047 3 0.2099 0.625921 0.012 0.008 0.936 0.044
#> SRR1700048 3 0.5847 0.438456 0.052 0.000 0.628 0.320
#> SRR1700049 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.0188 0.628041 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700053 3 0.7017 0.422442 0.112 0.256 0.612 0.020
#> SRR1700054 3 0.5922 0.527975 0.060 0.008 0.676 0.256
#> SRR1700055 3 0.0188 0.627567 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700056 3 0.4153 0.597884 0.004 0.008 0.784 0.204
#> SRR1700057 3 0.4219 0.641991 0.072 0.012 0.840 0.076
#> SRR1700058 3 0.1109 0.623857 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1700059 3 0.5138 0.345907 0.008 0.000 0.600 0.392
#> SRR1700060 3 0.1443 0.625011 0.008 0.004 0.960 0.028
#> SRR1700061 3 0.4738 0.614897 0.032 0.012 0.784 0.172
#> SRR1700062 3 0.0707 0.625741 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700063 3 0.2759 0.625328 0.052 0.000 0.904 0.044
#> SRR1700064 3 0.6856 0.403723 0.284 0.000 0.576 0.140
#> SRR1700065 3 0.3676 0.615782 0.004 0.004 0.820 0.172
#> SRR1700066 3 0.0712 0.630029 0.004 0.004 0.984 0.008
#> SRR1700067 4 0.7090 0.208755 0.036 0.252 0.092 0.620
#> SRR1700068 3 0.4934 0.622492 0.012 0.104 0.796 0.088
#> SRR1700069 3 0.8553 -0.000411 0.392 0.112 0.412 0.084
#> SRR1700070 2 0.8910 0.241031 0.300 0.396 0.248 0.056
#> SRR1700071 3 0.7939 0.446955 0.068 0.172 0.588 0.172
#> SRR1700072 3 0.5889 0.447956 0.016 0.300 0.652 0.032
#> SRR1700073 4 0.6267 0.503819 0.036 0.028 0.300 0.636
#> SRR1700075 3 0.5797 0.588259 0.036 0.168 0.740 0.056
#> SRR1700074 3 0.5299 0.617582 0.152 0.036 0.772 0.040
#> SRR1700076 1 0.6504 -0.121989 0.484 0.008 0.456 0.052
#> SRR1700077 3 0.5600 0.628684 0.088 0.068 0.776 0.068
#> SRR1700078 3 0.6768 0.545818 0.212 0.032 0.660 0.096
#> SRR1700080 3 0.6780 0.420853 0.296 0.004 0.588 0.112
#> SRR1700079 3 0.0779 0.633914 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1700081 3 0.1389 0.609257 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700082 3 0.3400 0.607930 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700083 3 0.0817 0.627178 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700084 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.6426 0.474581 0.064 0.700 0.184 0.052
#> SRR1700086 1 0.7868 0.125863 0.484 0.064 0.376 0.076
#> SRR1700087 3 0.5334 0.367104 0.008 0.004 0.588 0.400
#> SRR1700088 3 0.6007 0.358421 0.040 0.004 0.584 0.372
#> SRR1700089 3 0.6663 0.399239 0.344 0.000 0.556 0.100
#> SRR1700091 3 0.6450 0.034394 0.032 0.020 0.504 0.444
#> SRR1700090 3 0.4991 0.359962 0.004 0.000 0.608 0.388
#> SRR1700092 3 0.9050 -0.259296 0.204 0.076 0.380 0.340
#> SRR1700094 3 0.5525 0.359122 0.008 0.012 0.600 0.380
#> SRR1700093 3 0.5756 0.320190 0.012 0.012 0.552 0.424
#> SRR1700095 3 0.4656 0.628139 0.072 0.000 0.792 0.136
#> SRR1700096 3 0.4781 0.455392 0.004 0.000 0.660 0.336
#> SRR1700097 3 0.1474 0.636632 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700098 4 0.4866 0.330346 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700099 4 0.6280 0.184829 0.028 0.016 0.452 0.504
#> SRR1700100 4 0.4992 0.045563 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700101 4 0.5503 0.112308 0.000 0.016 0.468 0.516
#> SRR1700102 4 0.6851 0.144937 0.076 0.008 0.456 0.460
#> SRR1700104 3 0.5643 0.354814 0.012 0.012 0.596 0.380
#> SRR1700103 3 0.4500 0.488843 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700105 3 0.7720 0.356405 0.080 0.060 0.536 0.324
#> SRR1700106 3 0.6461 0.218901 0.020 0.036 0.544 0.400
#> SRR1700107 4 0.5916 0.352592 0.016 0.016 0.400 0.568
#> SRR1700108 4 0.6167 0.388565 0.016 0.028 0.388 0.568
#> SRR1700109 4 0.5720 0.367552 0.036 0.092 0.112 0.760
#> SRR1700110 4 0.6060 0.354227 0.136 0.032 0.100 0.732
#> SRR1700112 4 0.6552 0.393265 0.020 0.136 0.164 0.680
#> SRR1700111 4 0.6150 0.150128 0.008 0.032 0.460 0.500
#> SRR1700113 1 0.6376 0.355178 0.624 0.024 0.308 0.044
#> SRR1700114 3 0.6823 0.447606 0.244 0.000 0.596 0.160
#> SRR1700115 4 0.5368 0.546211 0.020 0.020 0.248 0.712
#> SRR1700116 3 0.4978 0.400893 0.004 0.000 0.612 0.384
#> SRR1700117 3 0.2124 0.619843 0.000 0.008 0.924 0.068
#> SRR1700119 3 0.7208 0.517690 0.184 0.092 0.652 0.072
#> SRR1700118 4 0.5864 -0.083106 0.024 0.004 0.484 0.488
#> SRR1700120 3 0.2281 0.629503 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700121 4 0.5243 0.298043 0.004 0.004 0.416 0.576
#> SRR1700122 4 0.6057 0.341499 0.044 0.120 0.096 0.740
#> SRR1700123 3 0.5093 0.453176 0.004 0.008 0.652 0.336
#> SRR1700125 4 0.7197 0.232655 0.028 0.204 0.144 0.624
#> SRR1700126 3 0.1637 0.637464 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700127 3 0.3791 0.597665 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700124 3 0.4991 0.359962 0.004 0.000 0.608 0.388
#> SRR1700128 3 0.4072 0.559579 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1700129 4 0.5874 0.430249 0.008 0.032 0.344 0.616
#> SRR1700130 4 0.5229 0.474653 0.008 0.008 0.336 0.648
#> SRR1700132 3 0.4359 0.615132 0.020 0.008 0.796 0.176
#> SRR1700131 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700133 3 0.6811 0.408521 0.068 0.024 0.596 0.312
#> SRR1700134 3 0.9021 -0.102544 0.112 0.352 0.400 0.136
#> SRR1700135 3 0.4791 0.631617 0.100 0.004 0.796 0.100
#> SRR1700136 3 0.0657 0.629060 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700137 3 0.6236 0.476232 0.012 0.052 0.624 0.312
#> SRR1700138 3 0.5727 0.616534 0.128 0.020 0.748 0.104
#> SRR1700140 3 0.6125 0.607172 0.108 0.024 0.720 0.148
#> SRR1700139 3 0.4948 0.279942 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1700141 1 0.8142 -0.200524 0.404 0.020 0.192 0.384
#> SRR1700142 3 0.1637 0.637486 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700143 3 0.4053 0.592973 0.000 0.004 0.768 0.228
#> SRR1700144 3 0.4277 0.558596 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700145 3 0.5227 0.481183 0.012 0.008 0.668 0.312
#> SRR1700146 4 0.6167 0.307200 0.104 0.088 0.068 0.740
#> SRR1700147 3 0.4176 0.603452 0.008 0.012 0.800 0.180
#> SRR1700149 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700148 3 0.4866 0.636849 0.044 0.036 0.808 0.112
#> SRR1700150 3 0.7280 -0.062711 0.016 0.096 0.480 0.408
#> SRR1700152 3 0.4776 0.388399 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1700151 3 0.4605 0.624387 0.012 0.048 0.808 0.132
#> SRR1700153 3 0.3933 0.599410 0.004 0.004 0.796 0.196
#> SRR1700154 3 0.5731 0.612839 0.028 0.060 0.740 0.172
#> SRR1700155 3 0.5846 0.370058 0.004 0.032 0.592 0.372
#> SRR1700156 3 0.1902 0.638412 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1700158 3 0.0707 0.625910 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700159 1 0.7751 0.127590 0.524 0.336 0.084 0.056
#> SRR1700157 3 0.1930 0.637995 0.004 0.004 0.936 0.056
#> SRR1700160 3 0.4508 0.613337 0.028 0.012 0.800 0.160
#> SRR1700161 3 0.4626 0.630651 0.072 0.004 0.804 0.120
#> SRR1700162 4 0.7375 0.080314 0.016 0.320 0.124 0.540
#> SRR1700164 3 0.2921 0.624794 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700163 3 0.0592 0.626873 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700165 3 0.2921 0.624771 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700166 3 0.5288 0.212094 0.000 0.008 0.520 0.472
#> SRR1700168 4 0.6545 0.288075 0.092 0.128 0.068 0.712
#> SRR1700167 3 0.1302 0.637123 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700170 3 0.5292 0.063422 0.000 0.008 0.512 0.480
#> SRR1700169 3 0.3688 0.591554 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700171 3 0.4053 0.593087 0.004 0.000 0.768 0.228
#> SRR1700172 3 0.6996 0.438311 0.200 0.004 0.600 0.196
#> SRR1700174 3 0.5658 0.336399 0.008 0.016 0.588 0.388
#> SRR1700173 3 0.5516 0.309860 0.004 0.012 0.556 0.428
#> SRR1700175 3 0.8614 0.390587 0.124 0.140 0.532 0.204
#> SRR1700176 3 0.0817 0.623712 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700178 1 0.5241 0.445065 0.792 0.040 0.068 0.100
#> SRR1700177 3 0.6585 0.541275 0.228 0.060 0.668 0.044
#> SRR1700180 2 0.6410 0.348610 0.212 0.680 0.024 0.084
#> SRR1700179 1 0.4184 0.398183 0.828 0.132 0.020 0.020
#> SRR1700181 4 0.7385 -0.370739 0.116 0.400 0.012 0.472
#> SRR1700183 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700182 1 0.6537 -0.045739 0.500 0.424 0.000 0.076
#> SRR1700184 2 0.9012 0.424189 0.104 0.452 0.168 0.276
#> SRR1700186 2 0.7569 0.306702 0.064 0.528 0.348 0.060
#> SRR1700187 3 0.0592 0.627122 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700185 3 0.0592 0.626695 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700188 1 0.9379 0.013056 0.360 0.184 0.120 0.336
#> SRR1700192 3 0.7050 0.359874 0.008 0.296 0.572 0.124
#> SRR1700190 3 0.0188 0.627567 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700191 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.5564 0.618084 0.076 0.096 0.776 0.052
#> SRR1700193 2 0.7925 0.473222 0.096 0.604 0.152 0.148
#> SRR1700195 2 0.8326 0.354008 0.164 0.520 0.256 0.060
#> SRR1700194 3 0.1118 0.617439 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700196 2 0.8681 0.337808 0.284 0.484 0.092 0.140
#> SRR1700197 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.8287 0.161313 0.328 0.432 0.216 0.024
#> SRR1700199 1 0.7656 0.306097 0.572 0.180 0.220 0.028
#> SRR1700200 2 0.8760 0.446060 0.096 0.500 0.176 0.228
#> SRR1700201 2 0.5182 0.336867 0.288 0.684 0.000 0.028
#> SRR1700202 3 0.9461 -0.126253 0.288 0.208 0.380 0.124
#> SRR1700203 2 0.6277 0.417134 0.092 0.700 0.024 0.184
#> SRR1700204 2 0.7180 0.434573 0.116 0.620 0.232 0.032
#> SRR1700206 1 0.8099 0.083715 0.448 0.048 0.388 0.116
#> SRR1700207 2 0.5478 0.322359 0.344 0.628 0.000 0.028
#> SRR1700208 3 0.5903 0.402585 0.032 0.324 0.632 0.012
#> SRR1700205 2 0.7686 0.384408 0.028 0.440 0.108 0.424
#> SRR1700209 1 0.6099 0.292157 0.688 0.220 0.012 0.080
#> SRR1700210 2 0.6091 0.464726 0.136 0.732 0.096 0.036
#> SRR1700211 2 0.9335 0.358236 0.196 0.428 0.244 0.132
#> SRR1700212 4 0.7794 0.321845 0.012 0.220 0.260 0.508
#> SRR1700213 2 0.6707 0.330515 0.060 0.580 0.340 0.020
#> SRR1700214 1 0.6180 0.426656 0.716 0.112 0.148 0.024
#> SRR1700215 3 0.0336 0.628113 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700217 2 0.7759 0.460900 0.136 0.600 0.200 0.064
#> SRR1700216 3 0.0188 0.627980 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700218 3 0.7680 -0.087023 0.388 0.184 0.424 0.004
#> SRR1700219 2 0.4678 0.342611 0.232 0.744 0.000 0.024
#> SRR1700222 3 0.0469 0.627477 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700220 2 0.5562 0.387668 0.132 0.740 0.004 0.124
#> SRR1700221 2 0.9493 0.201033 0.324 0.360 0.156 0.160
#> SRR1700223 1 0.8145 0.016170 0.516 0.304 0.064 0.116
#> SRR1700224 2 0.9219 0.265397 0.100 0.420 0.260 0.220
#> SRR1700226 1 0.6777 0.314142 0.596 0.312 0.072 0.020
#> SRR1700229 1 0.8631 0.162319 0.508 0.216 0.196 0.080
#> SRR1700225 2 0.6366 0.357343 0.048 0.604 0.332 0.016
#> SRR1700227 2 0.6920 0.478271 0.116 0.672 0.164 0.048
#> SRR1700230 3 0.0336 0.629957 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700231 2 0.7947 0.461449 0.092 0.592 0.200 0.116
#> SRR1700228 2 0.7457 0.240185 0.016 0.504 0.360 0.120
#> SRR1700232 2 0.6168 0.447810 0.108 0.736 0.052 0.104
#> SRR1700233 1 0.7683 -0.064641 0.492 0.360 0.124 0.024
#> SRR1700234 2 0.8464 0.417011 0.184 0.544 0.176 0.096
#> SRR1700235 3 0.8877 0.233846 0.196 0.172 0.504 0.128
#> SRR1700237 2 0.7992 0.422447 0.148 0.568 0.224 0.060
#> SRR1700236 2 0.7486 0.481365 0.048 0.620 0.176 0.156
#> SRR1700238 2 0.7276 0.297726 0.340 0.548 0.032 0.080
#> SRR1700239 3 0.0469 0.627427 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700240 3 0.0336 0.628085 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700241 3 0.5332 0.614600 0.008 0.076 0.756 0.160
#> SRR1700243 2 0.8943 0.190871 0.240 0.416 0.280 0.064
#> SRR1700244 2 0.8040 0.398972 0.176 0.552 0.224 0.048
#> SRR1700242 3 0.5816 0.327594 0.024 0.376 0.592 0.008
#> SRR1700246 2 0.7975 0.435237 0.044 0.556 0.180 0.220
#> SRR1700245 1 0.5217 0.387834 0.720 0.244 0.024 0.012
#> SRR1700247 3 0.1302 0.611885 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700249 3 0.0000 0.627748 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700250 1 0.6741 0.287000 0.620 0.236 0.140 0.004
#> SRR1700248 1 0.7995 0.338283 0.560 0.088 0.260 0.092
#> SRR1700251 4 0.6890 -0.077885 0.152 0.268 0.000 0.580
#> SRR1700252 3 0.5339 0.449383 0.356 0.020 0.624 0.000
#> SRR1700253 1 0.6760 0.312758 0.592 0.112 0.004 0.292
#> SRR1700256 4 0.7966 -0.079306 0.024 0.332 0.164 0.480
#> SRR1700254 3 0.1867 0.622894 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700255 2 0.5727 0.366647 0.200 0.712 0.004 0.084
#> SRR1700257 2 0.6251 0.362154 0.248 0.664 0.012 0.076
#> SRR1700258 2 0.6882 0.361142 0.176 0.672 0.048 0.104
#> SRR1700259 1 0.4800 0.277398 0.760 0.196 0.000 0.044
#> SRR1700260 4 0.5896 0.410302 0.024 0.092 0.148 0.736
#> SRR1700261 1 0.3877 0.394537 0.840 0.124 0.004 0.032
#> SRR1700262 1 0.4834 0.379254 0.784 0.120 0.000 0.096
#> SRR1700263 2 0.9102 0.260060 0.184 0.432 0.284 0.100
#> SRR1700264 2 0.7721 0.345376 0.284 0.564 0.064 0.088
#> SRR1700265 3 0.8186 -0.076077 0.096 0.068 0.448 0.388
#> SRR1700266 1 0.4923 0.431679 0.812 0.052 0.048 0.088
#> SRR1700268 3 0.6999 0.531728 0.180 0.116 0.660 0.044
#> SRR1700270 1 0.7295 0.402096 0.636 0.168 0.152 0.044
#> SRR1700267 2 0.5480 0.381116 0.124 0.736 0.000 0.140
#> SRR1700271 1 0.3841 0.422266 0.868 0.048 0.032 0.052
#> SRR1700272 4 0.7098 -0.085551 0.312 0.152 0.000 0.536
#> SRR1700273 1 0.8339 0.169106 0.440 0.280 0.256 0.024
#> SRR1700274 2 0.7707 0.394731 0.016 0.444 0.140 0.400
#> SRR1700277 3 0.3486 0.605295 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1700275 1 0.6957 0.420199 0.680 0.144 0.068 0.108
#> SRR1700276 1 0.6716 0.312738 0.644 0.256 0.044 0.056
#> SRR1700278 2 0.6961 0.159772 0.000 0.496 0.388 0.116
#> SRR1700279 2 0.9017 -0.104250 0.372 0.380 0.104 0.144
#> SRR1700280 1 0.8338 0.064290 0.496 0.296 0.152 0.056
#> SRR1700281 1 0.7053 0.418796 0.664 0.052 0.124 0.160
#> SRR1700283 2 0.5882 0.383474 0.064 0.672 0.004 0.260
#> SRR1700282 3 0.6896 0.386286 0.016 0.080 0.568 0.336
#> SRR1700284 2 0.8376 0.232085 0.236 0.476 0.036 0.252
#> SRR1700285 3 0.8205 -0.194333 0.016 0.356 0.400 0.228
#> SRR1700286 1 0.8019 0.398126 0.592 0.120 0.184 0.104
#> SRR1700287 4 0.6762 0.138964 0.132 0.180 0.024 0.664
#> SRR1700290 3 0.1118 0.617065 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700289 1 0.8597 0.347993 0.524 0.092 0.192 0.192
#> SRR1700288 1 0.7209 0.427913 0.668 0.100 0.112 0.120
#> SRR1700292 4 0.6065 0.092572 0.080 0.276 0.000 0.644
#> SRR1700291 1 0.5766 -0.041838 0.512 0.020 0.464 0.004
#> SRR1700293 1 0.9576 0.107702 0.348 0.156 0.320 0.176
#> SRR1700294 2 0.6510 0.376192 0.056 0.628 0.024 0.292
#> SRR1700295 3 0.6922 0.394769 0.360 0.036 0.556 0.048
#> SRR1700297 1 0.7785 0.345691 0.588 0.232 0.068 0.112
#> SRR1700296 2 0.6500 0.375189 0.120 0.620 0.000 0.260
#> SRR1700298 2 0.8270 0.008023 0.120 0.412 0.412 0.056
#> SRR1700299 4 0.6044 0.296742 0.036 0.004 0.416 0.544
#> SRR1700300 3 0.6538 0.413375 0.332 0.008 0.588 0.072
#> SRR1700302 2 0.6259 0.374770 0.068 0.652 0.012 0.268
#> SRR1700301 2 0.6879 0.348316 0.164 0.624 0.008 0.204
#> SRR1700303 4 0.6275 0.037039 0.076 0.328 0.000 0.596
#> SRR1700304 2 0.5981 0.371427 0.156 0.712 0.008 0.124
#> SRR1700305 1 0.7908 0.131765 0.504 0.232 0.248 0.016
#> SRR1700306 3 0.7009 0.436281 0.144 0.232 0.612 0.012
#> SRR1700308 3 0.7563 0.247441 0.236 0.244 0.516 0.004
#> SRR1700307 3 0.5732 0.551721 0.064 0.000 0.672 0.264
#> SRR1700309 3 0.5010 0.632921 0.112 0.020 0.796 0.072
#> SRR1700310 2 0.5184 0.393778 0.056 0.732 0.000 0.212
#> SRR1700311 3 0.6305 0.232005 0.000 0.424 0.516 0.060
#> SRR1700312 4 0.7704 0.285362 0.024 0.120 0.396 0.460
#> SRR1700313 3 0.7865 0.378015 0.268 0.144 0.548 0.040
#> SRR1700314 3 0.7292 0.458954 0.196 0.020 0.604 0.180
#> SRR1700315 3 0.8359 0.395838 0.196 0.100 0.556 0.148
#> SRR1700316 3 0.7100 0.387584 0.356 0.024 0.544 0.076
#> SRR1700317 1 0.8404 0.312292 0.512 0.200 0.056 0.232
#> SRR1700318 4 0.9569 0.195161 0.164 0.172 0.292 0.372
#> SRR1700319 3 0.7126 0.551704 0.140 0.040 0.648 0.172
#> SRR1700320 2 0.9251 0.203063 0.156 0.404 0.128 0.312
#> SRR1700322 2 0.8378 0.360957 0.092 0.532 0.252 0.124
#> SRR1700321 2 0.5926 0.389934 0.080 0.708 0.012 0.200
#> SRR1700323 3 0.7491 0.131041 0.416 0.084 0.468 0.032
#> SRR1700324 1 0.8846 0.063101 0.456 0.284 0.080 0.180
#> SRR1700325 3 0.9024 -0.162934 0.296 0.064 0.388 0.252
#> SRR1700326 3 0.6651 0.450957 0.300 0.004 0.596 0.100
#> SRR1700327 2 0.8807 0.335141 0.224 0.460 0.248 0.068
#> SRR1700329 1 0.8664 0.313622 0.496 0.124 0.272 0.108
#> SRR1700328 3 0.5947 0.399617 0.376 0.020 0.588 0.016
#> SRR1700330 3 0.5980 0.577263 0.116 0.144 0.724 0.016
#> SRR1700331 2 0.9179 0.188658 0.280 0.436 0.148 0.136
#> SRR1700332 3 0.8307 -0.137841 0.352 0.232 0.396 0.020
#> SRR1700333 2 0.6980 0.435611 0.112 0.644 0.212 0.032
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 5 0.7211 0.33801 0.020 0.084 0.228 0.092 0.576
#> SRR1699875 5 0.6581 0.25313 0.024 0.044 0.288 0.056 0.588
#> SRR1699876 2 0.8277 0.34634 0.248 0.480 0.064 0.068 0.140
#> SRR1699877 4 0.9943 -0.15729 0.156 0.196 0.192 0.228 0.228
#> SRR1699879 2 0.8035 0.08426 0.040 0.400 0.224 0.028 0.308
#> SRR1699878 2 0.7679 0.35036 0.020 0.464 0.140 0.320 0.056
#> SRR1699880 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.4237 0.62161 0.032 0.000 0.780 0.020 0.168
#> SRR1699882 2 0.9263 -0.09378 0.208 0.308 0.140 0.060 0.284
#> SRR1699883 3 0.8769 -0.21549 0.108 0.344 0.356 0.060 0.132
#> SRR1699884 3 0.8216 -0.20465 0.076 0.024 0.388 0.340 0.172
#> SRR1699885 2 0.8188 0.31645 0.100 0.464 0.044 0.104 0.288
#> SRR1699886 2 0.8865 0.22777 0.156 0.380 0.272 0.152 0.040
#> SRR1699888 5 0.5171 0.43142 0.028 0.012 0.144 0.068 0.748
#> SRR1699889 3 0.9315 -0.01530 0.184 0.100 0.372 0.120 0.224
#> SRR1699890 2 0.8052 0.22772 0.244 0.408 0.000 0.112 0.236
#> SRR1699887 5 0.3977 0.41451 0.040 0.092 0.008 0.028 0.832
#> SRR1699891 1 0.7786 -0.14760 0.396 0.204 0.016 0.040 0.344
#> SRR1699892 3 0.6789 0.44823 0.132 0.228 0.588 0.008 0.044
#> SRR1699893 3 0.7862 0.35643 0.164 0.004 0.496 0.160 0.176
#> SRR1699894 2 0.8106 0.36087 0.128 0.484 0.056 0.064 0.268
#> SRR1699895 5 0.6558 0.37270 0.236 0.120 0.016 0.024 0.604
#> SRR1699896 3 0.5956 0.27489 0.008 0.008 0.484 0.060 0.440
#> SRR1699897 3 0.6734 0.43033 0.164 0.012 0.548 0.012 0.264
#> SRR1699898 3 0.0794 0.63387 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1699900 3 0.5135 0.60596 0.228 0.016 0.704 0.008 0.044
#> SRR1699899 5 0.7974 0.02589 0.128 0.024 0.384 0.076 0.388
#> SRR1699902 3 0.3362 0.63447 0.176 0.004 0.812 0.004 0.004
#> SRR1699901 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699903 3 0.8387 0.00810 0.192 0.116 0.412 0.264 0.016
#> SRR1699904 2 0.9546 0.16587 0.132 0.308 0.100 0.232 0.228
#> SRR1699905 3 0.0451 0.64054 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1699906 5 0.6460 0.36369 0.060 0.064 0.024 0.204 0.648
#> SRR1699907 2 0.7112 0.13698 0.068 0.500 0.356 0.044 0.032
#> SRR1699908 4 0.7536 0.37441 0.128 0.072 0.292 0.496 0.012
#> SRR1699909 3 0.6321 0.41403 0.364 0.016 0.536 0.016 0.068
#> SRR1699910 3 0.5312 0.52196 0.344 0.032 0.608 0.012 0.004
#> SRR1699911 4 0.6151 0.45132 0.120 0.000 0.300 0.568 0.012
#> SRR1699912 1 0.6177 0.06704 0.708 0.104 0.084 0.060 0.044
#> SRR1699913 2 0.8818 0.09948 0.188 0.308 0.012 0.232 0.260
#> SRR1699914 3 0.3495 0.63415 0.160 0.000 0.812 0.028 0.000
#> SRR1699915 1 0.7268 -0.15296 0.432 0.056 0.408 0.088 0.016
#> SRR1699916 5 0.9258 -0.14688 0.240 0.252 0.036 0.220 0.252
#> SRR1699917 2 0.9424 0.08679 0.264 0.280 0.108 0.256 0.092
#> SRR1699918 5 0.6511 0.17212 0.088 0.008 0.328 0.028 0.548
#> SRR1699919 5 0.6812 0.15979 0.100 0.012 0.328 0.032 0.528
#> SRR1699920 3 0.6173 0.53410 0.260 0.004 0.608 0.020 0.108
#> SRR1699921 1 0.6677 -0.13035 0.476 0.036 0.408 0.068 0.012
#> SRR1699922 1 0.9578 0.05448 0.264 0.188 0.256 0.076 0.216
#> SRR1699923 3 0.3474 0.63159 0.192 0.004 0.796 0.008 0.000
#> SRR1699924 3 0.4301 0.64707 0.116 0.000 0.800 0.052 0.032
#> SRR1699925 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6836 0.48510 0.244 0.140 0.568 0.044 0.004
#> SRR1699927 1 0.8215 -0.16276 0.396 0.100 0.056 0.076 0.372
#> SRR1699929 3 0.5858 0.50565 0.312 0.004 0.596 0.076 0.012
#> SRR1699928 4 0.7688 0.32959 0.172 0.020 0.152 0.548 0.108
#> SRR1699930 5 0.5048 0.39477 0.132 0.096 0.000 0.028 0.744
#> SRR1699931 3 0.6574 0.35838 0.200 0.244 0.544 0.004 0.008
#> SRR1699933 3 0.4910 0.50411 0.012 0.000 0.628 0.340 0.020
#> SRR1699932 3 0.7475 -0.23491 0.032 0.368 0.372 0.004 0.224
#> SRR1699934 3 0.1544 0.61002 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1699935 5 0.6625 0.03606 0.056 0.068 0.416 0.000 0.460
#> SRR1699936 5 0.2875 0.40655 0.020 0.032 0.000 0.060 0.888
#> SRR1699937 3 0.8172 -0.09593 0.000 0.140 0.404 0.220 0.236
#> SRR1699938 5 0.4376 0.44392 0.028 0.056 0.044 0.048 0.824
#> SRR1699940 3 0.6524 0.50516 0.288 0.004 0.572 0.100 0.036
#> SRR1699939 5 0.7667 0.13633 0.024 0.036 0.160 0.356 0.424
#> SRR1699941 3 0.5025 0.62680 0.056 0.008 0.760 0.040 0.136
#> SRR1699942 4 0.3753 0.45026 0.012 0.008 0.180 0.796 0.004
#> SRR1699943 3 0.9318 -0.27864 0.060 0.268 0.316 0.188 0.168
#> SRR1699944 5 0.7643 0.24776 0.120 0.024 0.260 0.076 0.520
#> SRR1699945 3 0.0703 0.64445 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1699946 3 0.7530 0.02778 0.052 0.288 0.432 0.000 0.228
#> SRR1699947 3 0.8198 -0.03108 0.060 0.240 0.408 0.024 0.268
#> SRR1699948 2 0.7280 0.22214 0.004 0.464 0.200 0.032 0.300
#> SRR1699949 5 0.6000 0.38782 0.088 0.212 0.008 0.032 0.660
#> SRR1699950 5 0.8354 0.10331 0.284 0.260 0.028 0.060 0.368
#> SRR1699951 3 0.9378 -0.32692 0.076 0.204 0.324 0.256 0.140
#> SRR1699952 3 0.8272 -0.03446 0.056 0.344 0.404 0.056 0.140
#> SRR1699953 5 0.7592 0.15875 0.012 0.324 0.088 0.104 0.472
#> SRR1699954 3 0.5811 0.42206 0.000 0.000 0.568 0.316 0.116
#> SRR1699955 2 0.5657 0.36813 0.076 0.712 0.000 0.124 0.088
#> SRR1699956 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699957 5 0.4166 0.42491 0.000 0.008 0.148 0.056 0.788
#> SRR1699959 3 0.6769 0.49031 0.112 0.008 0.584 0.048 0.248
#> SRR1699958 4 0.8596 0.29978 0.088 0.032 0.288 0.372 0.220
#> SRR1699960 4 0.7526 0.00773 0.156 0.108 0.000 0.508 0.228
#> SRR1699961 3 0.4588 0.58877 0.000 0.004 0.732 0.056 0.208
#> SRR1699962 2 0.4151 0.46732 0.032 0.800 0.144 0.020 0.004
#> SRR1699963 4 0.5963 0.41537 0.040 0.040 0.332 0.584 0.004
#> SRR1699964 4 0.6934 0.26464 0.004 0.020 0.388 0.436 0.152
#> SRR1699965 5 0.2770 0.40666 0.016 0.076 0.000 0.020 0.888
#> SRR1699966 3 0.5964 0.41909 0.028 0.292 0.604 0.000 0.076
#> SRR1699967 3 0.8254 -0.28394 0.032 0.320 0.348 0.044 0.256
#> SRR1699968 2 0.6747 0.21115 0.012 0.512 0.328 0.012 0.136
#> SRR1699969 3 0.0162 0.63886 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699971 3 0.3805 0.61773 0.000 0.000 0.784 0.032 0.184
#> SRR1699970 5 0.7644 -0.19177 0.028 0.328 0.008 0.288 0.348
#> SRR1699972 3 0.4929 0.57403 0.012 0.012 0.708 0.240 0.028
#> SRR1699973 3 0.8388 -0.21900 0.096 0.072 0.404 0.348 0.080
#> SRR1699974 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699975 3 0.7830 0.35275 0.116 0.220 0.520 0.124 0.020
#> SRR1699976 3 0.7978 0.46160 0.176 0.140 0.544 0.076 0.064
#> SRR1699977 3 0.4902 0.26188 0.000 0.000 0.508 0.468 0.024
#> SRR1699978 3 0.1197 0.62353 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699979 3 0.4464 0.40084 0.008 0.000 0.584 0.408 0.000
#> SRR1699980 4 0.8100 0.17695 0.096 0.000 0.288 0.348 0.268
#> SRR1699981 3 0.3818 0.63216 0.016 0.000 0.812 0.144 0.028
#> SRR1699982 2 0.7941 0.31493 0.280 0.444 0.180 0.088 0.008
#> SRR1699983 5 0.8309 0.34381 0.160 0.064 0.152 0.108 0.516
#> SRR1699984 3 0.0404 0.63852 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1699985 4 0.8398 0.23518 0.212 0.048 0.136 0.484 0.120
#> SRR1699986 3 0.0290 0.63896 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1699988 4 0.8443 0.27181 0.048 0.096 0.340 0.396 0.120
#> SRR1699987 3 0.4867 0.63767 0.008 0.020 0.764 0.136 0.072
#> SRR1699989 3 0.9133 -0.23424 0.116 0.312 0.324 0.068 0.180
#> SRR1699990 3 0.5185 0.59542 0.248 0.004 0.684 0.012 0.052
#> SRR1699992 3 0.6253 0.45571 0.004 0.004 0.560 0.288 0.144
#> SRR1699991 3 0.5058 0.59868 0.224 0.000 0.692 0.004 0.080
#> SRR1699993 3 0.4320 0.63103 0.008 0.044 0.784 0.156 0.008
#> SRR1699994 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699995 3 0.0703 0.63623 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1699996 3 0.6768 0.26500 0.116 0.012 0.480 0.016 0.376
#> SRR1699997 4 0.4238 0.33679 0.004 0.000 0.368 0.628 0.000
#> SRR1699998 4 0.3944 0.47865 0.004 0.000 0.272 0.720 0.004
#> SRR1699999 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.7031 0.48327 0.220 0.120 0.580 0.072 0.008
#> SRR1700002 3 0.6161 0.31686 0.028 0.060 0.540 0.368 0.004
#> SRR1700001 3 0.3904 0.64082 0.156 0.000 0.792 0.052 0.000
#> SRR1700003 4 0.3895 0.43951 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700004 3 0.4522 0.61398 0.068 0.000 0.736 0.196 0.000
#> SRR1700005 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.4683 0.46489 0.008 0.012 0.624 0.356 0.000
#> SRR1700007 2 0.8302 0.17688 0.248 0.360 0.004 0.276 0.112
#> SRR1700008 3 0.3452 0.59318 0.000 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1700009 3 0.0290 0.63896 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700010 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700011 4 0.4479 0.19413 0.080 0.016 0.000 0.780 0.124
#> SRR1700013 4 0.4299 0.21777 0.004 0.000 0.388 0.608 0.000
#> SRR1700012 4 0.5972 0.17291 0.084 0.008 0.420 0.488 0.000
#> SRR1700014 3 0.5274 0.43082 0.064 0.000 0.600 0.336 0.000
#> SRR1700015 3 0.5871 0.42665 0.008 0.036 0.592 0.332 0.032
#> SRR1700016 3 0.0609 0.63672 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700018 3 0.5099 0.45372 0.004 0.000 0.608 0.040 0.348
#> SRR1700017 3 0.4182 0.38116 0.000 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1700019 4 0.7838 0.20994 0.100 0.076 0.128 0.576 0.120
#> SRR1700020 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700021 4 0.6669 0.44051 0.048 0.020 0.236 0.612 0.084
#> SRR1700023 3 0.7045 0.42900 0.016 0.024 0.544 0.172 0.244
#> SRR1700022 3 0.3759 0.64443 0.000 0.000 0.816 0.092 0.092
#> SRR1700024 4 0.4958 0.44860 0.012 0.048 0.208 0.724 0.008
#> SRR1700025 3 0.6706 0.47489 0.044 0.016 0.600 0.244 0.096
#> SRR1700026 3 0.6814 0.47139 0.240 0.012 0.544 0.192 0.012
#> SRR1700027 3 0.6019 0.44912 0.040 0.012 0.604 0.308 0.036
#> SRR1700028 3 0.8006 0.13244 0.156 0.044 0.476 0.272 0.052
#> SRR1700029 3 0.5374 0.51902 0.008 0.000 0.652 0.264 0.076
#> SRR1700030 3 0.8603 -0.10210 0.160 0.024 0.372 0.136 0.308
#> SRR1700031 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700032 4 0.8277 0.27621 0.104 0.012 0.348 0.356 0.180
#> SRR1700034 3 0.0290 0.63896 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700035 5 0.8062 0.31896 0.192 0.056 0.068 0.164 0.520
#> SRR1700033 3 0.0451 0.64231 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1700036 3 0.7042 0.11624 0.096 0.040 0.440 0.012 0.412
#> SRR1700037 4 0.9820 -0.20908 0.240 0.164 0.128 0.252 0.216
#> SRR1700038 3 0.6300 0.40242 0.008 0.008 0.536 0.104 0.344
#> SRR1700039 3 0.0290 0.64113 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700040 3 0.1670 0.64891 0.012 0.000 0.936 0.052 0.000
#> SRR1700041 3 0.4394 0.64592 0.036 0.000 0.800 0.092 0.072
#> SRR1700042 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700043 3 0.3550 0.60398 0.000 0.004 0.760 0.236 0.000
#> SRR1700045 3 0.4237 0.62842 0.076 0.000 0.772 0.152 0.000
#> SRR1700044 4 0.7967 0.28818 0.016 0.100 0.344 0.420 0.120
#> SRR1700046 3 0.5714 0.51530 0.112 0.000 0.632 0.248 0.008
#> SRR1700047 3 0.3090 0.63250 0.088 0.000 0.860 0.052 0.000
#> SRR1700048 3 0.5286 0.46250 0.008 0.000 0.624 0.316 0.052
#> SRR1700049 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.0162 0.63892 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700053 3 0.6773 0.47893 0.124 0.200 0.604 0.004 0.068
#> SRR1700054 3 0.5475 0.54988 0.032 0.000 0.672 0.240 0.056
#> SRR1700055 3 0.0162 0.63874 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700056 3 0.3652 0.60930 0.012 0.000 0.784 0.200 0.004
#> SRR1700057 3 0.3612 0.63359 0.184 0.000 0.796 0.016 0.004
#> SRR1700058 3 0.1082 0.63777 0.008 0.000 0.964 0.028 0.000
#> SRR1700059 3 0.4446 0.37092 0.000 0.000 0.592 0.400 0.008
#> SRR1700060 3 0.1668 0.64232 0.032 0.000 0.940 0.028 0.000
#> SRR1700061 3 0.4652 0.64129 0.100 0.000 0.772 0.108 0.020
#> SRR1700062 3 0.0794 0.63501 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700063 3 0.2726 0.62651 0.000 0.000 0.884 0.064 0.052
#> SRR1700064 3 0.6000 0.43118 0.004 0.000 0.576 0.132 0.288
#> SRR1700065 3 0.3489 0.63597 0.036 0.000 0.820 0.144 0.000
#> SRR1700066 3 0.1894 0.64736 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR1700067 4 0.7556 0.11017 0.292 0.120 0.072 0.500 0.016
#> SRR1700068 3 0.4407 0.64563 0.112 0.040 0.796 0.052 0.000
#> SRR1700069 3 0.8294 -0.00883 0.076 0.076 0.388 0.084 0.376
#> SRR1700070 2 0.8145 0.23766 0.020 0.416 0.232 0.064 0.268
#> SRR1700071 3 0.7478 0.50715 0.172 0.100 0.580 0.120 0.028
#> SRR1700072 3 0.5980 0.52714 0.200 0.156 0.632 0.008 0.004
#> SRR1700073 4 0.6943 0.37802 0.188 0.004 0.284 0.504 0.020
#> SRR1700075 3 0.5510 0.57516 0.264 0.032 0.660 0.040 0.004
#> SRR1700074 3 0.4538 0.58548 0.280 0.012 0.692 0.000 0.016
#> SRR1700076 5 0.5639 -0.15172 0.012 0.000 0.448 0.048 0.492
#> SRR1700077 3 0.5153 0.64336 0.028 0.052 0.776 0.068 0.076
#> SRR1700078 3 0.6252 0.56483 0.224 0.008 0.636 0.036 0.096
#> SRR1700080 3 0.6314 0.44837 0.036 0.000 0.584 0.096 0.284
#> SRR1700079 3 0.0671 0.64445 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1700081 3 0.1544 0.61002 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700082 3 0.2929 0.61598 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1700083 3 0.0955 0.63862 0.004 0.000 0.968 0.028 0.000
#> SRR1700084 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.5682 0.44477 0.080 0.696 0.184 0.032 0.008
#> SRR1700086 5 0.7930 0.07060 0.136 0.020 0.344 0.076 0.424
#> SRR1700087 3 0.4516 0.38605 0.000 0.004 0.576 0.416 0.004
#> SRR1700088 3 0.5118 0.39459 0.000 0.004 0.584 0.376 0.036
#> SRR1700089 3 0.5884 0.39918 0.000 0.000 0.536 0.112 0.352
#> SRR1700091 3 0.5559 0.10744 0.000 0.020 0.500 0.448 0.032
#> SRR1700090 3 0.4564 0.38881 0.008 0.000 0.600 0.388 0.004
#> SRR1700092 3 0.7991 -0.21466 0.008 0.076 0.380 0.344 0.192
#> SRR1700094 3 0.4759 0.39475 0.000 0.012 0.600 0.380 0.008
#> SRR1700093 3 0.5220 0.34728 0.024 0.000 0.536 0.428 0.012
#> SRR1700095 3 0.4010 0.63479 0.000 0.000 0.792 0.136 0.072
#> SRR1700096 3 0.4270 0.47737 0.004 0.000 0.656 0.336 0.004
#> SRR1700097 3 0.1270 0.64732 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700098 4 0.4074 0.34509 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1700099 4 0.6491 0.24422 0.104 0.004 0.408 0.468 0.016
#> SRR1700100 4 0.4273 0.06279 0.000 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700101 4 0.5293 0.03859 0.048 0.000 0.460 0.492 0.000
#> SRR1700102 4 0.5792 0.07085 0.004 0.000 0.452 0.468 0.076
#> SRR1700104 3 0.5080 0.39913 0.016 0.004 0.596 0.372 0.012
#> SRR1700103 3 0.3895 0.50625 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1700105 3 0.7385 0.39778 0.100 0.036 0.520 0.300 0.044
#> SRR1700106 3 0.6553 0.22061 0.120 0.012 0.516 0.344 0.008
#> SRR1700107 4 0.5054 0.29930 0.008 0.012 0.392 0.580 0.008
#> SRR1700108 4 0.6575 0.30063 0.104 0.012 0.380 0.492 0.012
#> SRR1700109 4 0.4361 0.33958 0.020 0.060 0.092 0.812 0.016
#> SRR1700110 4 0.5161 0.32799 0.020 0.024 0.088 0.760 0.108
#> SRR1700112 4 0.5444 0.36405 0.012 0.112 0.140 0.720 0.016
#> SRR1700111 4 0.5421 0.10002 0.040 0.008 0.448 0.504 0.000
#> SRR1700113 5 0.5492 0.26471 0.040 0.004 0.308 0.020 0.628
#> SRR1700114 3 0.5866 0.47233 0.000 0.000 0.596 0.156 0.248
#> SRR1700115 4 0.4028 0.46810 0.012 0.004 0.212 0.764 0.008
#> SRR1700116 3 0.4426 0.43066 0.004 0.000 0.612 0.380 0.004
#> SRR1700117 3 0.2570 0.62318 0.028 0.000 0.888 0.084 0.000
#> SRR1700119 3 0.6409 0.53757 0.008 0.084 0.648 0.072 0.188
#> SRR1700118 4 0.5316 -0.08561 0.012 0.004 0.456 0.508 0.020
#> SRR1700120 3 0.2179 0.63406 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1700121 4 0.4806 0.24140 0.016 0.000 0.408 0.572 0.004
#> SRR1700122 4 0.6945 0.14787 0.324 0.044 0.052 0.540 0.040
#> SRR1700123 3 0.4989 0.50178 0.056 0.000 0.648 0.296 0.000
#> SRR1700125 4 0.7708 0.23581 0.136 0.172 0.144 0.536 0.012
#> SRR1700126 3 0.1410 0.64717 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700127 3 0.3353 0.60854 0.008 0.000 0.796 0.196 0.000
#> SRR1700124 3 0.4321 0.38338 0.000 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR1700128 3 0.3508 0.57218 0.000 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1700129 4 0.4487 0.39523 0.004 0.008 0.324 0.660 0.004
#> SRR1700130 4 0.3857 0.46223 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700132 3 0.4288 0.64527 0.116 0.000 0.788 0.088 0.008
#> SRR1700131 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700133 3 0.6186 0.50948 0.248 0.000 0.596 0.140 0.016
#> SRR1700134 3 0.8978 -0.03459 0.196 0.240 0.396 0.084 0.084
#> SRR1700135 3 0.4481 0.64893 0.096 0.000 0.796 0.060 0.048
#> SRR1700136 3 0.0693 0.64155 0.008 0.000 0.980 0.012 0.000
#> SRR1700137 3 0.6434 0.48037 0.056 0.048 0.584 0.300 0.012
#> SRR1700138 3 0.5679 0.62410 0.076 0.008 0.724 0.116 0.076
#> SRR1700140 3 0.5210 0.56873 0.292 0.000 0.652 0.028 0.028
#> SRR1700139 3 0.4278 0.30261 0.000 0.000 0.548 0.452 0.000
#> SRR1700141 5 0.8040 -0.22663 0.096 0.004 0.184 0.356 0.360
#> SRR1700142 3 0.1571 0.64851 0.004 0.000 0.936 0.060 0.000
#> SRR1700143 3 0.3521 0.60275 0.004 0.000 0.764 0.232 0.000
#> SRR1700144 3 0.3707 0.56995 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1700145 3 0.5191 0.53592 0.088 0.000 0.660 0.252 0.000
#> SRR1700146 4 0.5681 0.29264 0.040 0.068 0.060 0.744 0.088
#> SRR1700147 3 0.3971 0.63883 0.100 0.000 0.800 0.100 0.000
#> SRR1700149 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700148 3 0.4347 0.64593 0.008 0.036 0.808 0.108 0.040
#> SRR1700150 3 0.6807 0.02651 0.052 0.060 0.476 0.400 0.012
#> SRR1700152 3 0.4126 0.41565 0.000 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1700151 3 0.3933 0.62971 0.196 0.008 0.776 0.020 0.000
#> SRR1700153 3 0.3734 0.62143 0.036 0.000 0.796 0.168 0.000
#> SRR1700154 3 0.5750 0.59929 0.168 0.020 0.680 0.128 0.004
#> SRR1700155 3 0.5815 0.45571 0.096 0.008 0.592 0.304 0.000
#> SRR1700156 3 0.1877 0.65047 0.012 0.000 0.924 0.064 0.000
#> SRR1700158 3 0.0794 0.63487 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700159 5 0.7010 0.17182 0.020 0.320 0.076 0.052 0.532
#> SRR1700157 3 0.2153 0.65209 0.040 0.000 0.916 0.044 0.000
#> SRR1700160 3 0.4075 0.64000 0.096 0.000 0.800 0.100 0.004
#> SRR1700161 3 0.4193 0.64707 0.112 0.000 0.804 0.064 0.020
#> SRR1700162 4 0.7934 0.05680 0.152 0.256 0.104 0.476 0.012
#> SRR1700164 3 0.2648 0.63176 0.000 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700163 3 0.0510 0.63822 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700165 3 0.2516 0.63316 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1700166 3 0.5112 0.23885 0.036 0.000 0.496 0.468 0.000
#> SRR1700168 4 0.6651 0.20624 0.216 0.052 0.036 0.632 0.064
#> SRR1700167 3 0.1121 0.64707 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700170 3 0.4305 0.14508 0.000 0.000 0.512 0.488 0.000
#> SRR1700169 3 0.3177 0.60041 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1700171 3 0.3612 0.60393 0.000 0.000 0.764 0.228 0.008
#> SRR1700172 3 0.6025 0.46756 0.000 0.004 0.600 0.192 0.204
#> SRR1700174 3 0.5687 0.41571 0.088 0.004 0.584 0.324 0.000
#> SRR1700173 3 0.4905 0.34313 0.004 0.012 0.548 0.432 0.004
#> SRR1700175 3 0.8139 0.42060 0.176 0.052 0.508 0.192 0.072
#> SRR1700176 3 0.0880 0.63271 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700178 5 0.4354 0.44259 0.020 0.032 0.052 0.076 0.820
#> SRR1700177 3 0.5683 0.53888 0.296 0.012 0.620 0.004 0.068
#> SRR1700180 2 0.5894 0.38692 0.100 0.700 0.016 0.036 0.148
#> SRR1700179 5 0.4025 0.42196 0.040 0.108 0.012 0.016 0.824
#> SRR1700181 4 0.6948 -0.37334 0.044 0.388 0.008 0.468 0.092
#> SRR1700183 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 5 0.6311 -0.07143 0.060 0.436 0.000 0.040 0.464
#> SRR1700184 2 0.7373 0.38059 0.000 0.452 0.160 0.328 0.060
#> SRR1700186 2 0.6669 0.20777 0.064 0.540 0.340 0.020 0.036
#> SRR1700187 3 0.0510 0.63851 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700185 3 0.0510 0.63810 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700188 4 0.8353 -0.19572 0.012 0.192 0.108 0.348 0.340
#> SRR1700192 3 0.5983 0.38651 0.000 0.312 0.564 0.120 0.004
#> SRR1700190 3 0.0324 0.63980 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1700191 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.4880 0.63166 0.004 0.096 0.776 0.048 0.076
#> SRR1700193 2 0.5765 0.46750 0.016 0.704 0.116 0.140 0.024
#> SRR1700195 2 0.7512 0.35803 0.068 0.556 0.236 0.040 0.100
#> SRR1700194 3 0.1270 0.62162 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700196 2 0.8590 0.36230 0.104 0.460 0.076 0.116 0.244
#> SRR1700197 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.6874 0.23995 0.008 0.520 0.212 0.012 0.248
#> SRR1700199 5 0.7003 0.31657 0.036 0.184 0.216 0.008 0.556
#> SRR1700200 2 0.8870 0.36621 0.256 0.400 0.168 0.124 0.052
#> SRR1700201 2 0.3716 0.39330 0.024 0.812 0.000 0.012 0.152
#> SRR1700202 3 0.9150 -0.11363 0.156 0.152 0.376 0.068 0.248
#> SRR1700203 2 0.6287 0.37965 0.172 0.652 0.004 0.120 0.052
#> SRR1700204 2 0.6338 0.42399 0.080 0.644 0.216 0.016 0.044
#> SRR1700206 5 0.7379 0.07941 0.020 0.044 0.372 0.112 0.452
#> SRR1700207 2 0.4386 0.38777 0.016 0.728 0.000 0.016 0.240
#> SRR1700208 3 0.5014 0.42740 0.000 0.332 0.628 0.008 0.032
#> SRR1700205 2 0.7961 0.31728 0.088 0.420 0.096 0.364 0.032
#> SRR1700209 5 0.5883 0.31278 0.076 0.176 0.012 0.044 0.692
#> SRR1700210 2 0.5634 0.45327 0.096 0.740 0.084 0.024 0.056
#> SRR1700211 2 0.9029 0.33195 0.084 0.412 0.232 0.120 0.152
#> SRR1700212 4 0.7781 0.28935 0.056 0.212 0.240 0.476 0.016
#> SRR1700213 2 0.6352 0.23967 0.036 0.576 0.324 0.036 0.028
#> SRR1700214 5 0.5755 0.43608 0.036 0.092 0.144 0.016 0.712
#> SRR1700215 3 0.0290 0.63896 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700217 2 0.6207 0.45916 0.040 0.672 0.184 0.024 0.080
#> SRR1700216 3 0.0162 0.63886 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700218 3 0.6617 -0.02604 0.000 0.184 0.420 0.004 0.392
#> SRR1700219 2 0.3590 0.39151 0.092 0.828 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700222 3 0.0510 0.63794 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700220 2 0.3549 0.39598 0.040 0.852 0.000 0.032 0.076
#> SRR1700221 2 0.8590 0.19646 0.016 0.356 0.140 0.184 0.304
#> SRR1700223 5 0.7588 0.04677 0.028 0.324 0.052 0.116 0.480
#> SRR1700224 2 0.9226 0.14951 0.172 0.352 0.232 0.188 0.056
#> SRR1700226 5 0.6374 0.32258 0.048 0.296 0.060 0.008 0.588
#> SRR1700229 5 0.7768 0.19246 0.012 0.204 0.196 0.084 0.504
#> SRR1700225 2 0.5308 0.26218 0.024 0.624 0.328 0.008 0.016
#> SRR1700227 2 0.5541 0.46900 0.028 0.720 0.160 0.016 0.076
#> SRR1700230 3 0.0290 0.64067 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700231 2 0.5593 0.44340 0.012 0.708 0.184 0.052 0.044
#> SRR1700228 2 0.6305 0.18198 0.020 0.524 0.356 0.100 0.000
#> SRR1700232 2 0.5231 0.44315 0.040 0.772 0.048 0.052 0.088
#> SRR1700233 5 0.7308 -0.07563 0.044 0.372 0.104 0.020 0.460
#> SRR1700234 2 0.7974 0.44248 0.084 0.552 0.160 0.068 0.136
#> SRR1700235 3 0.7956 0.28663 0.016 0.168 0.504 0.116 0.196
#> SRR1700237 2 0.5649 0.43015 0.004 0.680 0.212 0.028 0.076
#> SRR1700236 2 0.6973 0.45351 0.092 0.616 0.172 0.104 0.016
#> SRR1700238 2 0.6669 0.32602 0.088 0.560 0.012 0.036 0.304
#> SRR1700239 3 0.0404 0.63852 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700240 3 0.0290 0.63917 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700241 3 0.5022 0.63247 0.028 0.068 0.756 0.140 0.008
#> SRR1700243 2 0.8679 0.16980 0.088 0.392 0.272 0.044 0.204
#> SRR1700244 2 0.7818 0.39883 0.160 0.528 0.188 0.020 0.104
#> SRR1700242 3 0.4585 0.35840 0.000 0.396 0.592 0.004 0.008
#> SRR1700246 2 0.8078 0.35199 0.220 0.476 0.132 0.160 0.012
#> SRR1700245 5 0.5345 0.40072 0.068 0.204 0.012 0.012 0.704
#> SRR1700247 3 0.1270 0.62182 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.63870 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 5 0.6497 0.30817 0.028 0.220 0.136 0.008 0.608
#> SRR1700248 5 0.7329 0.30485 0.040 0.072 0.244 0.076 0.568
#> SRR1700251 4 0.6221 -0.02947 0.028 0.276 0.000 0.592 0.104
#> SRR1700252 3 0.4958 0.46665 0.032 0.004 0.616 0.000 0.348
#> SRR1700253 5 0.7079 0.29967 0.136 0.076 0.000 0.240 0.548
#> SRR1700256 4 0.7983 -0.09645 0.108 0.300 0.148 0.436 0.008
#> SRR1700254 3 0.1851 0.62670 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1700255 2 0.5826 0.37266 0.132 0.688 0.000 0.048 0.132
#> SRR1700257 2 0.4582 0.40435 0.028 0.792 0.008 0.060 0.112
#> SRR1700258 2 0.7445 0.30148 0.328 0.484 0.044 0.024 0.120
#> SRR1700259 5 0.4600 0.31026 0.016 0.212 0.000 0.036 0.736
#> SRR1700260 4 0.4778 0.38983 0.020 0.048 0.144 0.772 0.016
#> SRR1700261 5 0.3948 0.41335 0.060 0.080 0.004 0.024 0.832
#> SRR1700262 5 0.5022 0.34985 0.252 0.044 0.000 0.016 0.688
#> SRR1700263 2 0.8975 0.17138 0.120 0.388 0.284 0.080 0.128
#> SRR1700264 2 0.6839 0.40668 0.032 0.620 0.064 0.072 0.212
#> SRR1700265 3 0.8137 -0.03216 0.132 0.028 0.428 0.324 0.088
#> SRR1700266 5 0.4970 0.39750 0.168 0.028 0.036 0.016 0.752
#> SRR1700268 3 0.6502 0.56200 0.032 0.096 0.660 0.044 0.168
#> SRR1700270 5 0.6385 0.41382 0.000 0.168 0.136 0.060 0.636
#> SRR1700267 2 0.3365 0.39838 0.036 0.864 0.000 0.064 0.036
#> SRR1700271 5 0.3383 0.41397 0.052 0.040 0.012 0.024 0.872
#> SRR1700272 4 0.7457 -0.05670 0.124 0.120 0.000 0.512 0.244
#> SRR1700273 5 0.7664 0.17874 0.040 0.280 0.248 0.008 0.424
#> SRR1700274 2 0.8430 0.29675 0.188 0.368 0.124 0.308 0.012
#> SRR1700277 3 0.3160 0.61624 0.004 0.000 0.808 0.000 0.188
#> SRR1700275 5 0.7002 0.41066 0.080 0.116 0.060 0.096 0.648
#> SRR1700276 5 0.6851 0.31474 0.144 0.196 0.024 0.032 0.604
#> SRR1700278 2 0.5449 0.14719 0.000 0.556 0.376 0.068 0.000
#> SRR1700279 1 0.8598 -0.15306 0.396 0.192 0.088 0.040 0.284
#> SRR1700280 5 0.7928 0.12102 0.056 0.268 0.148 0.040 0.488
#> SRR1700281 5 0.6594 0.40847 0.044 0.044 0.104 0.144 0.664
#> SRR1700283 2 0.6738 0.31316 0.324 0.528 0.004 0.108 0.036
#> SRR1700282 3 0.6698 0.44852 0.108 0.052 0.556 0.284 0.000
#> SRR1700284 2 0.8814 0.17637 0.256 0.376 0.028 0.180 0.160
#> SRR1700285 3 0.7440 -0.13701 0.032 0.372 0.400 0.188 0.008
#> SRR1700286 5 0.8005 0.35632 0.088 0.088 0.184 0.092 0.548
#> SRR1700287 4 0.7405 0.06801 0.204 0.124 0.016 0.564 0.092
#> SRR1700290 3 0.1502 0.61967 0.004 0.000 0.940 0.056 0.000
#> SRR1700289 5 0.8558 0.21128 0.244 0.028 0.188 0.120 0.420
#> SRR1700288 5 0.6302 0.43554 0.020 0.084 0.100 0.108 0.688
#> SRR1700292 4 0.6971 0.06436 0.288 0.168 0.000 0.508 0.036
#> SRR1700291 5 0.4695 -0.09918 0.004 0.008 0.464 0.000 0.524
#> SRR1700293 5 0.8956 0.06074 0.040 0.136 0.296 0.188 0.340
#> SRR1700294 2 0.6755 0.29417 0.136 0.572 0.000 0.240 0.052
#> SRR1700295 3 0.6638 0.40566 0.024 0.032 0.540 0.060 0.344
#> SRR1700297 5 0.8118 0.22579 0.288 0.140 0.036 0.076 0.460
#> SRR1700296 1 0.6898 -0.33171 0.444 0.408 0.000 0.084 0.064
#> SRR1700298 1 0.7591 0.01695 0.396 0.156 0.392 0.020 0.036
#> SRR1700299 4 0.5033 0.26608 0.000 0.004 0.400 0.568 0.028
#> SRR1700300 3 0.6117 0.42306 0.032 0.004 0.576 0.060 0.328
#> SRR1700302 2 0.7061 0.25731 0.300 0.500 0.004 0.164 0.032
#> SRR1700301 2 0.7447 0.32922 0.252 0.520 0.004 0.100 0.124
#> SRR1700303 4 0.7293 -0.02860 0.312 0.200 0.000 0.448 0.040
#> SRR1700304 2 0.6368 0.33362 0.228 0.620 0.000 0.080 0.072
#> SRR1700305 5 0.6816 0.18191 0.000 0.220 0.244 0.020 0.516
#> SRR1700306 3 0.6841 0.49309 0.188 0.124 0.596 0.000 0.092
#> SRR1700308 3 0.7352 0.25999 0.064 0.212 0.504 0.000 0.220
#> SRR1700307 3 0.5257 0.54786 0.008 0.000 0.648 0.284 0.060
#> SRR1700309 3 0.4042 0.63449 0.196 0.000 0.772 0.012 0.020
#> SRR1700310 2 0.5084 0.39027 0.128 0.744 0.000 0.096 0.032
#> SRR1700311 3 0.6277 0.24160 0.028 0.400 0.496 0.076 0.000
#> SRR1700312 3 0.7762 -0.18103 0.156 0.080 0.388 0.372 0.004
#> SRR1700313 3 0.7401 0.39190 0.016 0.132 0.528 0.060 0.264
#> SRR1700314 3 0.6939 0.50564 0.128 0.000 0.596 0.124 0.152
#> SRR1700315 3 0.7689 0.43559 0.036 0.080 0.556 0.140 0.188
#> SRR1700316 3 0.7160 0.44783 0.216 0.000 0.532 0.060 0.192
#> SRR1700317 5 0.8613 0.21115 0.296 0.104 0.052 0.136 0.412
#> SRR1700318 4 0.9251 0.15649 0.112 0.120 0.272 0.364 0.132
#> SRR1700319 3 0.6176 0.55140 0.256 0.000 0.612 0.096 0.036
#> SRR1700320 1 0.9489 -0.07389 0.324 0.228 0.120 0.224 0.104
#> SRR1700322 2 0.8622 0.24431 0.204 0.440 0.212 0.092 0.052
#> SRR1700321 2 0.6458 0.30538 0.276 0.572 0.000 0.120 0.032
#> SRR1700323 3 0.7291 0.19074 0.084 0.064 0.468 0.016 0.368
#> SRR1700324 5 0.8364 0.09991 0.088 0.260 0.048 0.144 0.460
#> SRR1700325 3 0.8657 -0.10519 0.116 0.028 0.388 0.204 0.264
#> SRR1700326 3 0.6425 0.47281 0.052 0.000 0.588 0.088 0.272
#> SRR1700327 2 0.8146 0.30853 0.036 0.468 0.236 0.064 0.196
#> SRR1700329 5 0.8651 0.16414 0.204 0.056 0.236 0.080 0.424
#> SRR1700328 3 0.5802 0.43089 0.064 0.008 0.584 0.008 0.336
#> SRR1700330 3 0.5433 0.58982 0.240 0.044 0.680 0.004 0.032
#> SRR1700331 2 0.9417 0.19512 0.208 0.364 0.120 0.116 0.192
#> SRR1700332 3 0.8255 -0.06617 0.112 0.196 0.396 0.008 0.288
#> SRR1700333 2 0.4682 0.44598 0.000 0.756 0.172 0.036 0.036
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 5 0.7162 0.346919 0.032 0.076 0.228 0.080 0.552 0.032
#> SRR1699875 5 0.6320 0.304326 0.032 0.032 0.280 0.056 0.580 0.020
#> SRR1699876 1 0.6936 0.470203 0.540 0.268 0.048 0.060 0.072 0.012
#> SRR1699877 6 0.9246 0.032946 0.032 0.120 0.180 0.164 0.208 0.296
#> SRR1699879 2 0.7572 0.075650 0.004 0.364 0.224 0.016 0.312 0.080
#> SRR1699878 2 0.7011 0.296873 0.016 0.468 0.136 0.320 0.048 0.012
#> SRR1699880 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.3985 0.622835 0.008 0.000 0.780 0.020 0.160 0.032
#> SRR1699882 2 0.9374 -0.110782 0.208 0.272 0.132 0.068 0.236 0.084
#> SRR1699883 3 0.8478 -0.207994 0.028 0.292 0.352 0.052 0.104 0.172
#> SRR1699884 3 0.8243 -0.185414 0.072 0.028 0.384 0.300 0.156 0.060
#> SRR1699885 2 0.8192 0.094335 0.060 0.452 0.044 0.068 0.228 0.148
#> SRR1699886 2 0.7453 0.204512 0.332 0.340 0.244 0.060 0.024 0.000
#> SRR1699888 5 0.5673 0.414898 0.048 0.032 0.136 0.064 0.704 0.016
#> SRR1699889 3 0.9025 -0.079259 0.224 0.052 0.352 0.116 0.172 0.084
#> SRR1699890 1 0.8010 0.392418 0.332 0.264 0.000 0.032 0.128 0.244
#> SRR1699887 5 0.3932 0.300428 0.012 0.064 0.008 0.020 0.820 0.076
#> SRR1699891 1 0.7306 0.475434 0.532 0.160 0.012 0.036 0.184 0.076
#> SRR1699892 3 0.6499 0.450234 0.036 0.220 0.584 0.008 0.028 0.124
#> SRR1699893 3 0.7626 0.334913 0.036 0.004 0.480 0.140 0.140 0.200
#> SRR1699894 2 0.8117 0.041996 0.068 0.420 0.052 0.024 0.224 0.212
#> SRR1699895 5 0.6202 0.135935 0.216 0.132 0.008 0.020 0.600 0.024
#> SRR1699896 3 0.5119 0.264811 0.004 0.000 0.476 0.068 0.452 0.000
#> SRR1699897 3 0.6427 0.441632 0.024 0.008 0.548 0.012 0.244 0.164
#> SRR1699898 3 0.0790 0.628791 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1699900 3 0.5207 0.593264 0.048 0.016 0.684 0.008 0.024 0.220
#> SRR1699899 3 0.7493 -0.043378 0.248 0.016 0.384 0.044 0.292 0.016
#> SRR1699902 3 0.3089 0.627552 0.008 0.000 0.800 0.000 0.004 0.188
#> SRR1699901 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699903 3 0.8039 -0.032008 0.240 0.080 0.392 0.208 0.000 0.080
#> SRR1699904 2 0.9091 -0.231257 0.208 0.296 0.084 0.192 0.192 0.028
#> SRR1699905 3 0.0405 0.636413 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1699906 5 0.6351 0.177588 0.068 0.044 0.016 0.200 0.628 0.044
#> SRR1699907 2 0.6841 0.205251 0.012 0.464 0.352 0.044 0.016 0.112
#> SRR1699908 4 0.7170 0.411255 0.024 0.068 0.280 0.488 0.008 0.132
#> SRR1699909 3 0.6175 0.325956 0.128 0.004 0.496 0.012 0.012 0.348
#> SRR1699910 3 0.5227 0.503805 0.060 0.008 0.592 0.012 0.000 0.328
#> SRR1699911 4 0.6053 0.482662 0.036 0.000 0.292 0.556 0.008 0.108
#> SRR1699912 6 0.7082 -0.177091 0.252 0.076 0.072 0.016 0.044 0.540
#> SRR1699913 6 0.7965 -0.098091 0.020 0.192 0.012 0.156 0.204 0.416
#> SRR1699914 3 0.3460 0.629467 0.008 0.000 0.796 0.028 0.000 0.168
#> SRR1699915 6 0.6480 -0.134360 0.056 0.012 0.352 0.084 0.004 0.492
#> SRR1699916 1 0.7975 0.453312 0.428 0.224 0.024 0.140 0.168 0.016
#> SRR1699917 4 0.9259 -0.436573 0.188 0.260 0.080 0.260 0.048 0.164
#> SRR1699918 5 0.6402 0.239547 0.024 0.004 0.324 0.028 0.520 0.100
#> SRR1699919 5 0.6183 0.247576 0.008 0.000 0.320 0.028 0.516 0.128
#> SRR1699920 3 0.5882 0.524375 0.040 0.004 0.600 0.012 0.072 0.272
#> SRR1699921 3 0.7206 -0.000610 0.212 0.004 0.356 0.068 0.004 0.356
#> SRR1699922 6 0.9425 -0.014258 0.072 0.160 0.240 0.080 0.180 0.268
#> SRR1699923 3 0.3141 0.624585 0.012 0.000 0.788 0.000 0.000 0.200
#> SRR1699924 3 0.3907 0.642056 0.008 0.000 0.800 0.036 0.028 0.128
#> SRR1699925 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6410 0.494595 0.040 0.092 0.568 0.040 0.000 0.260
#> SRR1699927 6 0.7806 -0.058510 0.116 0.052 0.052 0.036 0.300 0.444
#> SRR1699929 3 0.5206 0.488465 0.052 0.004 0.588 0.020 0.000 0.336
#> SRR1699928 4 0.8273 0.170006 0.200 0.012 0.136 0.440 0.096 0.116
#> SRR1699930 5 0.5043 0.237257 0.056 0.108 0.000 0.024 0.740 0.072
#> SRR1699931 3 0.6583 0.360463 0.072 0.216 0.536 0.004 0.000 0.172
#> SRR1699933 3 0.4689 0.488449 0.012 0.000 0.612 0.348 0.016 0.012
#> SRR1699932 3 0.7637 -0.278761 0.072 0.352 0.356 0.004 0.184 0.032
#> SRR1699934 3 0.1501 0.601912 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.6718 0.035080 0.044 0.064 0.408 0.000 0.428 0.056
#> SRR1699936 5 0.3156 0.296916 0.044 0.024 0.000 0.020 0.868 0.044
#> SRR1699937 3 0.7524 -0.079167 0.008 0.136 0.404 0.220 0.232 0.000
#> SRR1699938 5 0.4134 0.372200 0.004 0.036 0.044 0.036 0.816 0.064
#> SRR1699940 3 0.6925 0.473274 0.132 0.004 0.556 0.104 0.020 0.184
#> SRR1699939 5 0.6979 0.139902 0.008 0.004 0.156 0.348 0.424 0.060
#> SRR1699941 3 0.4745 0.626985 0.020 0.004 0.760 0.040 0.124 0.052
#> SRR1699942 4 0.3457 0.425202 0.008 0.000 0.152 0.808 0.004 0.028
#> SRR1699943 3 0.8739 -0.291557 0.096 0.260 0.312 0.176 0.148 0.008
#> SRR1699944 5 0.7124 0.272289 0.036 0.000 0.256 0.056 0.488 0.164
#> SRR1699945 3 0.0632 0.640288 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699946 3 0.7271 0.087644 0.036 0.280 0.432 0.000 0.208 0.044
#> SRR1699947 3 0.8019 0.002057 0.116 0.204 0.404 0.024 0.236 0.016
#> SRR1699948 2 0.6977 0.235920 0.024 0.468 0.200 0.024 0.276 0.008
#> SRR1699949 5 0.5501 0.251867 0.036 0.180 0.008 0.032 0.692 0.052
#> SRR1699950 1 0.7831 0.367833 0.376 0.224 0.028 0.056 0.296 0.020
#> SRR1699951 3 0.8659 -0.303742 0.000 0.180 0.324 0.224 0.132 0.140
#> SRR1699952 3 0.7962 -0.029298 0.040 0.332 0.396 0.060 0.132 0.040
#> SRR1699953 5 0.7391 0.169192 0.000 0.312 0.080 0.100 0.448 0.060
#> SRR1699954 3 0.5219 0.426738 0.000 0.000 0.568 0.316 0.116 0.000
#> SRR1699955 2 0.5579 -0.076424 0.148 0.684 0.000 0.084 0.068 0.016
#> SRR1699956 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699957 5 0.3475 0.419490 0.000 0.000 0.140 0.060 0.800 0.000
#> SRR1699959 3 0.6637 0.494113 0.160 0.008 0.584 0.044 0.176 0.028
#> SRR1699958 4 0.7629 0.355166 0.008 0.004 0.284 0.372 0.216 0.116
#> SRR1699960 4 0.6499 -0.273967 0.036 0.000 0.000 0.428 0.188 0.348
#> SRR1699961 3 0.4067 0.585398 0.000 0.000 0.728 0.060 0.212 0.000
#> SRR1699962 2 0.3508 0.387456 0.016 0.820 0.136 0.012 0.004 0.012
#> SRR1699963 4 0.5531 0.419337 0.064 0.032 0.324 0.576 0.004 0.000
#> SRR1699964 4 0.6353 0.256419 0.004 0.020 0.384 0.436 0.152 0.004
#> SRR1699965 5 0.2317 0.300748 0.000 0.020 0.000 0.016 0.900 0.064
#> SRR1699966 3 0.5969 0.439519 0.060 0.260 0.604 0.000 0.048 0.028
#> SRR1699967 3 0.8061 -0.273814 0.036 0.308 0.348 0.040 0.228 0.040
#> SRR1699968 2 0.6247 0.285763 0.012 0.524 0.316 0.008 0.124 0.016
#> SRR1699969 3 0.0146 0.634643 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699971 3 0.3418 0.616096 0.000 0.000 0.784 0.032 0.184 0.000
#> SRR1699970 5 0.7222 -0.319300 0.032 0.316 0.008 0.316 0.316 0.012
#> SRR1699972 3 0.4719 0.572279 0.020 0.012 0.704 0.232 0.024 0.008
#> SRR1699973 3 0.7853 -0.183114 0.244 0.052 0.396 0.252 0.040 0.016
#> SRR1699974 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699975 3 0.7814 0.291270 0.144 0.188 0.488 0.116 0.012 0.052
#> SRR1699976 3 0.7539 0.457273 0.028 0.120 0.536 0.080 0.048 0.188
#> SRR1699977 3 0.4406 0.254242 0.000 0.000 0.500 0.476 0.024 0.000
#> SRR1699978 3 0.1075 0.620856 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1699979 3 0.4010 0.403525 0.000 0.000 0.584 0.408 0.000 0.008
#> SRR1699980 4 0.7820 0.109072 0.112 0.000 0.260 0.348 0.256 0.024
#> SRR1699981 3 0.3833 0.634364 0.068 0.000 0.804 0.108 0.016 0.004
#> SRR1699982 6 0.7559 -0.169065 0.068 0.340 0.168 0.044 0.000 0.380
#> SRR1699983 5 0.8380 0.229664 0.116 0.032 0.132 0.072 0.444 0.204
#> SRR1699984 3 0.0363 0.634396 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699985 1 0.7323 0.081111 0.432 0.044 0.120 0.340 0.060 0.004
#> SRR1699986 3 0.0260 0.634743 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699988 4 0.8005 0.266646 0.024 0.084 0.332 0.392 0.116 0.052
#> SRR1699987 3 0.4659 0.637953 0.060 0.016 0.764 0.108 0.052 0.000
#> SRR1699989 3 0.8572 -0.243258 0.004 0.272 0.304 0.072 0.180 0.168
#> SRR1699990 3 0.5236 0.582917 0.060 0.004 0.668 0.008 0.028 0.232
#> SRR1699992 3 0.5734 0.451583 0.004 0.004 0.556 0.292 0.140 0.004
#> SRR1699991 3 0.4904 0.581361 0.020 0.000 0.668 0.004 0.056 0.252
#> SRR1699993 3 0.4198 0.633454 0.036 0.040 0.780 0.136 0.008 0.000
#> SRR1699994 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699995 3 0.0632 0.632450 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1699996 3 0.6470 0.261344 0.020 0.008 0.472 0.012 0.356 0.132
#> SRR1699997 4 0.3807 0.322487 0.000 0.000 0.368 0.628 0.000 0.004
#> SRR1699998 4 0.3606 0.490710 0.016 0.000 0.256 0.728 0.000 0.000
#> SRR1699999 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.6886 0.463535 0.188 0.076 0.572 0.060 0.000 0.104
#> SRR1700002 3 0.5534 0.324619 0.004 0.060 0.540 0.368 0.000 0.028
#> SRR1700001 3 0.3610 0.637411 0.004 0.000 0.792 0.052 0.000 0.152
#> SRR1700003 4 0.3464 0.444496 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1700004 3 0.4120 0.606059 0.000 0.000 0.728 0.204 0.000 0.068
#> SRR1700005 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.4219 0.463262 0.000 0.012 0.620 0.360 0.000 0.008
#> SRR1700007 1 0.6567 0.514595 0.576 0.188 0.000 0.152 0.060 0.024
#> SRR1700008 3 0.3215 0.591348 0.004 0.000 0.756 0.240 0.000 0.000
#> SRR1700009 3 0.0260 0.634743 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700011 4 0.3957 -0.031301 0.080 0.028 0.000 0.808 0.076 0.008
#> SRR1700013 4 0.3841 0.219212 0.000 0.000 0.380 0.616 0.000 0.004
#> SRR1700012 4 0.5806 0.175440 0.028 0.000 0.412 0.468 0.000 0.092
#> SRR1700014 3 0.4911 0.434119 0.008 0.000 0.600 0.332 0.000 0.060
#> SRR1700015 3 0.5614 0.435196 0.020 0.032 0.592 0.320 0.024 0.012
#> SRR1700016 3 0.0547 0.632851 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700018 3 0.4979 0.458076 0.020 0.000 0.604 0.024 0.340 0.012
#> SRR1700017 3 0.3756 0.384941 0.000 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1700019 4 0.8236 0.099101 0.080 0.056 0.124 0.500 0.104 0.136
#> SRR1700020 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700021 4 0.6102 0.425884 0.040 0.020 0.204 0.636 0.084 0.016
#> SRR1700023 3 0.6670 0.428907 0.016 0.024 0.540 0.168 0.236 0.016
#> SRR1700022 3 0.3468 0.641067 0.004 0.000 0.816 0.092 0.088 0.000
#> SRR1700024 4 0.4597 0.426747 0.012 0.052 0.176 0.740 0.004 0.016
#> SRR1700025 3 0.6289 0.478204 0.016 0.016 0.600 0.240 0.084 0.044
#> SRR1700026 3 0.6156 0.467231 0.028 0.004 0.540 0.164 0.000 0.264
#> SRR1700027 3 0.5595 0.452441 0.012 0.012 0.604 0.304 0.032 0.036
#> SRR1700028 3 0.7999 0.130580 0.164 0.024 0.464 0.192 0.036 0.120
#> SRR1700029 3 0.4827 0.518345 0.000 0.000 0.652 0.264 0.076 0.008
#> SRR1700030 3 0.8268 -0.098369 0.068 0.004 0.368 0.108 0.256 0.196
#> SRR1700031 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700032 3 0.7912 -0.290626 0.220 0.012 0.336 0.304 0.116 0.012
#> SRR1700034 3 0.0260 0.634743 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.7766 0.167528 0.072 0.032 0.056 0.152 0.516 0.172
#> SRR1700033 3 0.0405 0.637954 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1700036 3 0.7001 0.063682 0.032 0.032 0.420 0.020 0.400 0.096
#> SRR1700037 1 0.9571 0.177307 0.280 0.084 0.120 0.168 0.128 0.220
#> SRR1700038 3 0.5705 0.396630 0.000 0.008 0.528 0.108 0.348 0.008
#> SRR1700039 3 0.0260 0.636776 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700040 3 0.1500 0.644547 0.000 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012
#> SRR1700041 3 0.3947 0.641659 0.000 0.000 0.800 0.092 0.072 0.036
#> SRR1700042 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700043 3 0.3215 0.598503 0.000 0.004 0.756 0.240 0.000 0.000
#> SRR1700045 3 0.3981 0.626791 0.008 0.000 0.772 0.144 0.000 0.076
#> SRR1700044 4 0.7315 0.295778 0.004 0.100 0.336 0.424 0.116 0.020
#> SRR1700046 3 0.5444 0.513872 0.020 0.000 0.628 0.240 0.004 0.108
#> SRR1700047 3 0.2897 0.625628 0.000 0.000 0.852 0.060 0.000 0.088
#> SRR1700048 3 0.4826 0.463841 0.004 0.000 0.624 0.316 0.048 0.008
#> SRR1700049 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.0146 0.634690 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700053 3 0.6533 0.489115 0.032 0.172 0.600 0.004 0.052 0.140
#> SRR1700054 3 0.4985 0.544891 0.000 0.000 0.668 0.240 0.056 0.036
#> SRR1700055 3 0.0146 0.634586 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.3390 0.604253 0.008 0.000 0.780 0.200 0.000 0.012
#> SRR1700057 3 0.3292 0.625819 0.008 0.000 0.784 0.008 0.000 0.200
#> SRR1700058 3 0.0972 0.634188 0.000 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1700059 3 0.4024 0.375374 0.004 0.000 0.592 0.400 0.004 0.000
#> SRR1700060 3 0.1498 0.638986 0.000 0.000 0.940 0.028 0.000 0.032
#> SRR1700061 3 0.4201 0.637114 0.008 0.000 0.772 0.104 0.008 0.108
#> SRR1700062 3 0.0713 0.631540 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700063 3 0.2506 0.621310 0.000 0.000 0.880 0.068 0.052 0.000
#> SRR1700064 3 0.5271 0.435603 0.000 0.000 0.576 0.132 0.292 0.000
#> SRR1700065 3 0.3134 0.631438 0.000 0.000 0.820 0.144 0.000 0.036
#> SRR1700066 3 0.1845 0.644248 0.004 0.000 0.916 0.008 0.000 0.072
#> SRR1700067 4 0.7616 -0.085347 0.076 0.076 0.064 0.424 0.016 0.344
#> SRR1700068 3 0.3959 0.642594 0.000 0.040 0.796 0.052 0.000 0.112
#> SRR1700069 3 0.7577 -0.026627 0.000 0.052 0.376 0.088 0.364 0.120
#> SRR1700070 2 0.7822 0.243692 0.028 0.404 0.232 0.068 0.252 0.016
#> SRR1700071 3 0.6799 0.511769 0.008 0.092 0.580 0.108 0.024 0.188
#> SRR1700072 3 0.5755 0.527445 0.020 0.136 0.624 0.008 0.004 0.208
#> SRR1700073 4 0.7004 0.418476 0.072 0.004 0.264 0.492 0.012 0.156
#> SRR1700075 3 0.5547 0.536607 0.036 0.024 0.616 0.040 0.000 0.284
#> SRR1700074 3 0.4372 0.565254 0.032 0.004 0.668 0.000 0.004 0.292
#> SRR1700076 5 0.5241 -0.163046 0.012 0.000 0.448 0.044 0.488 0.008
#> SRR1700077 3 0.4649 0.640324 0.000 0.052 0.776 0.068 0.072 0.032
#> SRR1700078 3 0.6275 0.554836 0.056 0.008 0.624 0.028 0.084 0.200
#> SRR1700080 3 0.6217 0.456676 0.056 0.000 0.580 0.084 0.260 0.020
#> SRR1700079 3 0.1442 0.644842 0.040 0.000 0.944 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700081 3 0.1501 0.601912 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1700082 3 0.2631 0.611238 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1700083 3 0.0858 0.634866 0.000 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1700084 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.5088 0.406709 0.000 0.664 0.184 0.012 0.000 0.140
#> SRR1700086 5 0.7504 0.131876 0.032 0.000 0.328 0.080 0.392 0.168
#> SRR1700087 3 0.4292 0.379885 0.008 0.004 0.568 0.416 0.004 0.000
#> SRR1700088 3 0.4597 0.398247 0.000 0.004 0.584 0.376 0.036 0.000
#> SRR1700089 3 0.5277 0.391267 0.000 0.000 0.528 0.108 0.364 0.000
#> SRR1700091 3 0.4993 0.123758 0.000 0.020 0.500 0.448 0.032 0.000
#> SRR1700090 3 0.4100 0.392190 0.004 0.000 0.600 0.388 0.000 0.008
#> SRR1700092 3 0.7773 -0.222162 0.032 0.064 0.372 0.340 0.176 0.016
#> SRR1700094 3 0.4274 0.397934 0.000 0.012 0.600 0.380 0.008 0.000
#> SRR1700093 3 0.4854 0.340153 0.012 0.000 0.528 0.432 0.008 0.020
#> SRR1700095 3 0.3982 0.636224 0.032 0.000 0.792 0.116 0.060 0.000
#> SRR1700096 3 0.3835 0.477281 0.000 0.000 0.656 0.336 0.004 0.004
#> SRR1700097 3 0.1141 0.642894 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700098 4 0.3647 0.338403 0.000 0.000 0.360 0.640 0.000 0.000
#> SRR1700099 4 0.6412 0.267913 0.216 0.004 0.384 0.384 0.008 0.004
#> SRR1700100 4 0.3838 0.041848 0.000 0.000 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR1700101 4 0.5165 0.062792 0.056 0.000 0.448 0.484 0.000 0.012
#> SRR1700102 4 0.5655 0.076263 0.012 0.000 0.444 0.460 0.072 0.012
#> SRR1700104 3 0.4942 0.412876 0.032 0.004 0.596 0.352 0.008 0.008
#> SRR1700103 3 0.3499 0.505314 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1700105 3 0.6981 0.370598 0.020 0.036 0.504 0.304 0.032 0.104
#> SRR1700106 3 0.6589 0.215038 0.072 0.008 0.504 0.304 0.000 0.112
#> SRR1700107 4 0.4713 0.281796 0.016 0.012 0.392 0.572 0.008 0.000
#> SRR1700108 4 0.6806 0.260934 0.064 0.012 0.376 0.424 0.000 0.124
#> SRR1700109 4 0.3378 0.232218 0.056 0.016 0.076 0.844 0.008 0.000
#> SRR1700110 4 0.4817 0.244184 0.016 0.032 0.084 0.772 0.072 0.024
#> SRR1700112 4 0.4476 0.251007 0.020 0.092 0.104 0.768 0.016 0.000
#> SRR1700111 4 0.4897 0.075476 0.000 0.000 0.448 0.492 0.000 0.060
#> SRR1700113 5 0.5596 0.316347 0.072 0.000 0.296 0.016 0.596 0.020
#> SRR1700114 3 0.5361 0.476334 0.004 0.000 0.596 0.148 0.252 0.000
#> SRR1700115 4 0.3371 0.459931 0.000 0.008 0.180 0.796 0.012 0.004
#> SRR1700116 3 0.3976 0.432271 0.004 0.000 0.612 0.380 0.000 0.004
#> SRR1700117 3 0.2412 0.614669 0.000 0.000 0.880 0.092 0.000 0.028
#> SRR1700119 3 0.5893 0.535946 0.004 0.084 0.644 0.072 0.188 0.008
#> SRR1700118 4 0.5109 -0.073575 0.012 0.000 0.444 0.504 0.020 0.020
#> SRR1700120 3 0.2003 0.629100 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700121 4 0.4652 0.231274 0.024 0.000 0.404 0.560 0.000 0.012
#> SRR1700122 1 0.6715 0.281674 0.488 0.024 0.024 0.360 0.044 0.060
#> SRR1700123 3 0.4653 0.500351 0.004 0.000 0.644 0.292 0.000 0.060
#> SRR1700125 4 0.7971 0.095612 0.148 0.116 0.136 0.480 0.004 0.116
#> SRR1700126 3 0.1267 0.642506 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700127 3 0.3012 0.603793 0.000 0.000 0.796 0.196 0.000 0.008
#> SRR1700124 3 0.4209 0.389066 0.020 0.000 0.596 0.384 0.000 0.000
#> SRR1700128 3 0.3151 0.568943 0.000 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1700129 4 0.3998 0.393762 0.000 0.008 0.316 0.668 0.004 0.004
#> SRR1700130 4 0.3390 0.477212 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700132 3 0.4303 0.642708 0.056 0.000 0.784 0.068 0.004 0.088
#> SRR1700131 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700133 3 0.5397 0.514394 0.008 0.000 0.596 0.108 0.004 0.284
#> SRR1700134 3 0.8592 -0.019542 0.052 0.208 0.388 0.064 0.068 0.220
#> SRR1700135 3 0.4118 0.645479 0.004 0.000 0.796 0.060 0.048 0.092
#> SRR1700136 3 0.0622 0.637457 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700137 3 0.6367 0.475141 0.052 0.040 0.572 0.276 0.004 0.056
#> SRR1700138 3 0.5181 0.615954 0.000 0.008 0.716 0.124 0.076 0.076
#> SRR1700140 3 0.4917 0.539045 0.056 0.000 0.628 0.016 0.000 0.300
#> SRR1700139 3 0.3843 0.309982 0.000 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1700141 4 0.7888 0.166934 0.200 0.008 0.180 0.328 0.280 0.004
#> SRR1700142 3 0.1411 0.644144 0.000 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR1700143 3 0.3189 0.597868 0.000 0.000 0.760 0.236 0.000 0.004
#> SRR1700144 3 0.3468 0.565741 0.004 0.000 0.712 0.284 0.000 0.000
#> SRR1700145 3 0.5040 0.532907 0.016 0.000 0.652 0.244 0.000 0.088
#> SRR1700146 4 0.5417 0.171727 0.028 0.044 0.056 0.744 0.068 0.060
#> SRR1700147 3 0.3566 0.635369 0.000 0.000 0.800 0.096 0.000 0.104
#> SRR1700149 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700148 3 0.3905 0.641387 0.000 0.036 0.808 0.108 0.040 0.008
#> SRR1700150 3 0.6659 -0.006586 0.016 0.056 0.460 0.380 0.008 0.080
#> SRR1700152 3 0.3706 0.417730 0.000 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700151 3 0.3521 0.622166 0.008 0.004 0.768 0.008 0.000 0.212
#> SRR1700153 3 0.3354 0.616488 0.000 0.000 0.796 0.168 0.000 0.036
#> SRR1700154 3 0.5428 0.584253 0.004 0.020 0.660 0.132 0.004 0.180
#> SRR1700155 3 0.5455 0.462537 0.008 0.008 0.592 0.292 0.000 0.100
#> SRR1700156 3 0.1686 0.646099 0.000 0.000 0.924 0.064 0.000 0.012
#> SRR1700158 3 0.0713 0.631372 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700159 5 0.6650 0.144506 0.044 0.304 0.064 0.040 0.536 0.012
#> SRR1700157 3 0.1934 0.647815 0.000 0.000 0.916 0.044 0.000 0.040
#> SRR1700160 3 0.3660 0.636711 0.000 0.000 0.800 0.096 0.004 0.100
#> SRR1700161 3 0.3862 0.643235 0.004 0.000 0.804 0.064 0.020 0.108
#> SRR1700162 4 0.7294 -0.204571 0.324 0.176 0.100 0.392 0.000 0.008
#> SRR1700164 3 0.2416 0.626373 0.000 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR1700163 3 0.0458 0.634199 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700165 3 0.2260 0.628033 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1700166 3 0.4594 0.229182 0.000 0.000 0.488 0.476 0.000 0.036
#> SRR1700168 4 0.6846 0.017517 0.040 0.056 0.032 0.592 0.072 0.208
#> SRR1700167 3 0.1007 0.642646 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1700170 3 0.3868 0.150642 0.000 0.000 0.508 0.492 0.000 0.000
#> SRR1700169 3 0.2854 0.596060 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1700171 3 0.3488 0.605635 0.016 0.000 0.764 0.216 0.004 0.000
#> SRR1700172 3 0.5724 0.474886 0.016 0.004 0.600 0.184 0.196 0.000
#> SRR1700174 3 0.5266 0.417101 0.008 0.000 0.580 0.316 0.000 0.096
#> SRR1700173 3 0.4406 0.347655 0.000 0.012 0.548 0.432 0.004 0.004
#> SRR1700175 3 0.7748 0.393663 0.048 0.036 0.492 0.196 0.048 0.180
#> SRR1700176 3 0.0790 0.629339 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700178 5 0.4089 0.359968 0.068 0.024 0.044 0.052 0.812 0.000
#> SRR1700177 3 0.5988 0.533716 0.112 0.008 0.616 0.004 0.044 0.216
#> SRR1700180 2 0.5701 0.102142 0.004 0.640 0.012 0.020 0.128 0.196
#> SRR1700179 5 0.3826 0.298189 0.016 0.092 0.004 0.040 0.824 0.024
#> SRR1700181 4 0.6441 -0.448530 0.040 0.376 0.008 0.484 0.072 0.020
#> SRR1700183 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.5883 -0.111850 0.100 0.444 0.000 0.028 0.428 0.000
#> SRR1700184 2 0.6508 0.311901 0.000 0.432 0.156 0.364 0.048 0.000
#> SRR1700186 2 0.6595 0.268622 0.040 0.516 0.336 0.016 0.032 0.060
#> SRR1700187 3 0.0458 0.634482 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700185 3 0.0458 0.634077 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700188 4 0.7716 -0.220733 0.016 0.196 0.096 0.356 0.328 0.008
#> SRR1700192 3 0.5374 0.393656 0.000 0.312 0.564 0.120 0.004 0.000
#> SRR1700190 3 0.1843 0.643113 0.080 0.000 0.912 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700191 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.4445 0.628797 0.000 0.096 0.772 0.052 0.076 0.004
#> SRR1700193 2 0.4957 0.328051 0.048 0.732 0.100 0.112 0.008 0.000
#> SRR1700195 2 0.6795 0.369129 0.060 0.572 0.232 0.032 0.088 0.016
#> SRR1700194 3 0.1141 0.619138 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.8513 0.129530 0.036 0.408 0.068 0.096 0.232 0.160
#> SRR1700197 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.6003 0.263476 0.008 0.548 0.204 0.004 0.232 0.004
#> SRR1700199 5 0.6695 0.316881 0.056 0.180 0.220 0.008 0.532 0.004
#> SRR1700200 2 0.7942 0.093996 0.340 0.364 0.152 0.056 0.008 0.080
#> SRR1700201 2 0.2965 0.168841 0.012 0.856 0.000 0.016 0.108 0.008
#> SRR1700202 3 0.8759 -0.087407 0.196 0.120 0.372 0.056 0.212 0.044
#> SRR1700203 2 0.6202 0.090188 0.028 0.644 0.004 0.120 0.064 0.140
#> SRR1700204 2 0.6204 0.407623 0.116 0.608 0.216 0.008 0.028 0.024
#> SRR1700206 5 0.6723 0.099396 0.000 0.028 0.360 0.116 0.456 0.040
#> SRR1700207 2 0.3998 0.146587 0.016 0.768 0.000 0.028 0.180 0.008
#> SRR1700208 3 0.5413 0.455689 0.064 0.276 0.624 0.004 0.028 0.004
#> SRR1700205 2 0.7483 0.113975 0.036 0.412 0.088 0.368 0.020 0.076
#> SRR1700209 5 0.5105 0.176113 0.040 0.204 0.012 0.052 0.692 0.000
#> SRR1700210 2 0.5735 0.280129 0.020 0.676 0.072 0.008 0.052 0.172
#> SRR1700211 2 0.8497 0.319658 0.016 0.408 0.216 0.128 0.136 0.096
#> SRR1700212 4 0.7372 0.274982 0.064 0.192 0.228 0.480 0.008 0.028
#> SRR1700213 2 0.6365 0.288662 0.008 0.536 0.316 0.024 0.028 0.088
#> SRR1700214 5 0.5397 0.421509 0.056 0.084 0.140 0.012 0.704 0.004
#> SRR1700215 3 0.0260 0.634743 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.5032 0.433214 0.016 0.712 0.184 0.012 0.064 0.012
#> SRR1700216 3 0.0146 0.634643 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700218 3 0.6145 0.002281 0.000 0.180 0.420 0.004 0.388 0.008
#> SRR1700219 2 0.1624 0.170743 0.008 0.936 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1700222 3 0.0458 0.634054 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.2358 0.171994 0.016 0.908 0.000 0.020 0.044 0.012
#> SRR1700221 2 0.8302 0.164094 0.040 0.356 0.124 0.180 0.284 0.016
#> SRR1700223 5 0.7597 -0.018784 0.016 0.312 0.052 0.104 0.448 0.068
#> SRR1700224 2 0.8812 0.126492 0.036 0.304 0.216 0.160 0.040 0.244
#> SRR1700226 5 0.5905 0.253424 0.016 0.292 0.060 0.012 0.592 0.028
#> SRR1700229 5 0.7196 0.178245 0.008 0.204 0.196 0.092 0.492 0.008
#> SRR1700225 2 0.4890 0.312041 0.004 0.616 0.324 0.000 0.012 0.044
#> SRR1700227 2 0.5310 0.421329 0.020 0.708 0.160 0.004 0.044 0.064
#> SRR1700230 3 0.0260 0.636381 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.4678 0.429059 0.016 0.736 0.180 0.044 0.020 0.004
#> SRR1700228 2 0.5735 0.226171 0.000 0.520 0.356 0.100 0.000 0.024
#> SRR1700232 2 0.4998 0.260556 0.016 0.768 0.048 0.048 0.048 0.072
#> SRR1700233 5 0.6787 -0.070470 0.000 0.364 0.104 0.028 0.452 0.052
#> SRR1700234 2 0.7163 0.337184 0.116 0.560 0.144 0.072 0.108 0.000
#> SRR1700235 3 0.7492 0.282270 0.012 0.164 0.496 0.116 0.192 0.020
#> SRR1700237 2 0.4741 0.420635 0.004 0.708 0.212 0.020 0.052 0.004
#> SRR1700236 2 0.6319 0.372805 0.152 0.600 0.172 0.064 0.008 0.004
#> SRR1700238 2 0.5983 0.079448 0.044 0.580 0.012 0.044 0.304 0.016
#> SRR1700239 3 0.0363 0.634396 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.0260 0.635027 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.4511 0.629247 0.000 0.068 0.756 0.140 0.008 0.028
#> SRR1700243 2 0.7895 0.176828 0.000 0.352 0.268 0.020 0.196 0.164
#> SRR1700244 2 0.7552 0.103749 0.332 0.392 0.176 0.020 0.068 0.012
#> SRR1700242 3 0.4118 0.365802 0.000 0.396 0.592 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700246 2 0.7417 0.191262 0.044 0.416 0.108 0.092 0.000 0.340
#> SRR1700245 5 0.5424 0.258827 0.024 0.168 0.012 0.004 0.680 0.112
#> SRR1700247 3 0.1141 0.619311 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.634482 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 5 0.6677 0.305781 0.028 0.204 0.112 0.012 0.588 0.056
#> SRR1700248 5 0.6967 0.339573 0.056 0.076 0.232 0.080 0.552 0.004
#> SRR1700251 4 0.5911 -0.244943 0.068 0.220 0.000 0.624 0.076 0.012
#> SRR1700252 3 0.4554 0.469666 0.008 0.004 0.616 0.000 0.348 0.024
#> SRR1700253 5 0.6716 0.071740 0.072 0.008 0.000 0.208 0.528 0.184
#> SRR1700256 4 0.7668 -0.088889 0.008 0.256 0.148 0.412 0.008 0.168
#> SRR1700254 3 0.2020 0.619197 0.008 0.000 0.896 0.096 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.5416 0.086441 0.008 0.572 0.000 0.008 0.084 0.328
#> SRR1700257 2 0.3788 0.171490 0.032 0.828 0.004 0.060 0.068 0.008
#> SRR1700258 1 0.7682 0.453641 0.424 0.284 0.044 0.004 0.076 0.168
#> SRR1700259 5 0.4300 0.178400 0.012 0.200 0.000 0.036 0.740 0.012
#> SRR1700260 4 0.4307 0.357369 0.008 0.032 0.140 0.776 0.004 0.040
#> SRR1700261 5 0.3235 0.313696 0.020 0.016 0.004 0.016 0.856 0.088
#> SRR1700262 5 0.6152 -0.008721 0.232 0.072 0.000 0.008 0.592 0.096
#> SRR1700263 2 0.8413 0.199772 0.016 0.360 0.280 0.064 0.104 0.176
#> SRR1700264 2 0.6624 0.226592 0.000 0.588 0.060 0.040 0.176 0.136
#> SRR1700265 3 0.7926 -0.045588 0.072 0.004 0.412 0.272 0.072 0.168
#> SRR1700266 5 0.5831 0.146364 0.220 0.024 0.024 0.028 0.652 0.052
#> SRR1700268 3 0.6183 0.564735 0.020 0.088 0.656 0.048 0.160 0.028
#> SRR1700270 5 0.5781 0.399689 0.000 0.168 0.124 0.072 0.636 0.000
#> SRR1700267 2 0.3031 0.170832 0.016 0.864 0.000 0.024 0.012 0.084
#> SRR1700271 5 0.2534 0.316450 0.016 0.044 0.012 0.012 0.904 0.012
#> SRR1700272 4 0.6345 -0.273330 0.012 0.004 0.000 0.432 0.220 0.332
#> SRR1700273 5 0.7478 0.159758 0.020 0.256 0.244 0.000 0.400 0.080
#> SRR1700274 2 0.8604 0.087629 0.148 0.316 0.116 0.300 0.008 0.112
#> SRR1700277 3 0.2871 0.613175 0.000 0.000 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1700275 5 0.6575 0.334884 0.004 0.060 0.052 0.092 0.608 0.184
#> SRR1700276 5 0.6731 0.137832 0.036 0.156 0.024 0.028 0.592 0.164
#> SRR1700278 2 0.4747 0.205596 0.000 0.568 0.376 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700279 1 0.8148 0.366472 0.460 0.092 0.088 0.016 0.192 0.152
#> SRR1700280 5 0.7701 0.122047 0.040 0.252 0.140 0.020 0.472 0.076
#> SRR1700281 5 0.6562 0.364205 0.072 0.056 0.096 0.136 0.632 0.008
#> SRR1700283 2 0.6497 -0.042869 0.056 0.480 0.000 0.040 0.052 0.372
#> SRR1700282 3 0.6202 0.455069 0.008 0.048 0.556 0.276 0.000 0.112
#> SRR1700284 6 0.7819 -0.039682 0.028 0.240 0.024 0.112 0.132 0.464
#> SRR1700285 3 0.7126 -0.123214 0.088 0.328 0.400 0.180 0.004 0.000
#> SRR1700286 5 0.7964 0.296975 0.172 0.092 0.184 0.088 0.460 0.004
#> SRR1700287 4 0.6111 -0.229831 0.040 0.012 0.008 0.456 0.052 0.432
#> SRR1700290 3 0.1471 0.611622 0.000 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700289 5 0.8589 0.108417 0.140 0.004 0.184 0.092 0.336 0.244
#> SRR1700288 5 0.6475 0.386848 0.020 0.088 0.096 0.104 0.652 0.040
#> SRR1700292 4 0.6148 -0.218635 0.096 0.040 0.000 0.432 0.004 0.428
#> SRR1700291 5 0.4117 -0.117437 0.004 0.000 0.464 0.000 0.528 0.004
#> SRR1700293 5 0.8708 0.075184 0.036 0.124 0.300 0.172 0.316 0.052
#> SRR1700294 2 0.6842 -0.107065 0.036 0.528 0.000 0.184 0.040 0.212
#> SRR1700295 3 0.6312 0.402795 0.020 0.024 0.532 0.068 0.336 0.020
#> SRR1700297 6 0.4395 -0.001990 0.008 0.000 0.016 0.000 0.396 0.580
#> SRR1700296 1 0.6909 0.454276 0.516 0.280 0.000 0.056 0.052 0.096
#> SRR1700298 6 0.6199 -0.144346 0.020 0.076 0.388 0.012 0.016 0.488
#> SRR1700299 4 0.4521 0.247858 0.000 0.004 0.400 0.568 0.028 0.000
#> SRR1700300 3 0.5485 0.422369 0.000 0.000 0.572 0.060 0.328 0.040
#> SRR1700302 6 0.5753 -0.100425 0.036 0.316 0.000 0.080 0.004 0.564
#> SRR1700301 2 0.7595 -0.331796 0.368 0.388 0.004 0.064 0.084 0.092
#> SRR1700303 6 0.5387 -0.054562 0.016 0.056 0.000 0.340 0.012 0.576
#> SRR1700304 2 0.5410 0.016524 0.024 0.488 0.000 0.004 0.048 0.436
#> SRR1700305 5 0.6480 0.169914 0.012 0.220 0.240 0.016 0.508 0.004
#> SRR1700306 3 0.6686 0.490812 0.172 0.096 0.596 0.000 0.052 0.084
#> SRR1700308 3 0.6814 0.266545 0.008 0.208 0.500 0.000 0.220 0.064
#> SRR1700307 3 0.4804 0.546236 0.004 0.000 0.648 0.284 0.056 0.008
#> SRR1700309 3 0.4138 0.632722 0.052 0.000 0.768 0.008 0.012 0.160
#> SRR1700310 2 0.4439 0.138830 0.036 0.792 0.000 0.064 0.052 0.056
#> SRR1700311 3 0.6446 0.246822 0.072 0.352 0.484 0.084 0.000 0.008
#> SRR1700312 3 0.7416 -0.187878 0.028 0.048 0.376 0.336 0.004 0.208
#> SRR1700313 3 0.6725 0.387399 0.000 0.128 0.520 0.068 0.268 0.016
#> SRR1700314 3 0.6314 0.514352 0.004 0.000 0.596 0.104 0.144 0.152
#> SRR1700315 3 0.7532 0.434133 0.084 0.072 0.548 0.120 0.156 0.020
#> SRR1700316 3 0.6839 0.441773 0.020 0.000 0.524 0.060 0.180 0.216
#> SRR1700317 6 0.6913 0.026099 0.056 0.020 0.044 0.048 0.340 0.492
#> SRR1700318 4 0.8858 0.194508 0.120 0.116 0.248 0.368 0.108 0.040
#> SRR1700319 3 0.6111 0.544366 0.048 0.000 0.604 0.080 0.028 0.240
#> SRR1700320 6 0.9194 -0.060866 0.188 0.116 0.108 0.144 0.076 0.368
#> SRR1700322 2 0.7918 0.145257 0.004 0.356 0.196 0.084 0.044 0.316
#> SRR1700321 6 0.5259 -0.110842 0.024 0.396 0.000 0.028 0.012 0.540
#> SRR1700323 3 0.7587 0.199755 0.124 0.052 0.468 0.016 0.280 0.060
#> SRR1700324 5 0.7651 -0.056231 0.044 0.288 0.040 0.152 0.448 0.028
#> SRR1700325 3 0.7630 -0.083455 0.008 0.000 0.388 0.188 0.244 0.172
#> SRR1700326 3 0.6164 0.475050 0.020 0.000 0.584 0.084 0.260 0.052
#> SRR1700327 2 0.7756 0.300353 0.004 0.440 0.236 0.044 0.188 0.088
#> SRR1700329 5 0.7590 0.109155 0.040 0.000 0.228 0.056 0.352 0.324
#> SRR1700328 3 0.6273 0.444445 0.120 0.008 0.576 0.008 0.248 0.040
#> SRR1700330 3 0.5145 0.575139 0.024 0.036 0.660 0.004 0.016 0.260
#> SRR1700331 6 0.8408 0.000377 0.008 0.264 0.116 0.076 0.172 0.364
#> SRR1700332 3 0.8464 0.002757 0.124 0.132 0.396 0.008 0.224 0.116
#> SRR1700333 2 0.3700 0.413806 0.000 0.800 0.140 0.036 0.024 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.0720 0.477 0.693 0.3367 0.881 0.881
#> 3 3 0.0813 0.461 0.665 0.6909 0.541 0.487
#> 4 4 0.2553 0.364 0.643 0.2068 0.719 0.459
#> 5 5 0.3242 0.370 0.639 0.0804 0.807 0.495
#> 6 6 0.3817 0.328 0.563 0.0498 0.902 0.665
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.925 0.403 0.340 0.660
#> SRR1699875 2 0.992 0.340 0.448 0.552
#> SRR1699876 2 0.861 0.516 0.284 0.716
#> SRR1699877 2 0.866 0.508 0.288 0.712
#> SRR1699879 2 0.574 0.555 0.136 0.864
#> SRR1699878 2 1.000 0.246 0.488 0.512
#> SRR1699880 2 0.714 0.445 0.196 0.804
#> SRR1699881 2 0.644 0.473 0.164 0.836
#> SRR1699882 2 0.973 0.395 0.404 0.596
#> SRR1699883 2 1.000 0.234 0.500 0.500
#> SRR1699884 2 0.827 0.486 0.260 0.740
#> SRR1699885 2 0.980 0.297 0.416 0.584
#> SRR1699886 2 0.961 0.411 0.384 0.616
#> SRR1699888 2 0.343 0.599 0.064 0.936
#> SRR1699889 2 0.904 0.493 0.320 0.680
#> SRR1699890 2 0.994 0.301 0.456 0.544
#> SRR1699887 2 0.260 0.584 0.044 0.956
#> SRR1699891 2 0.949 0.418 0.368 0.632
#> SRR1699892 2 0.295 0.598 0.052 0.948
#> SRR1699893 2 0.430 0.593 0.088 0.912
#> SRR1699894 2 0.876 0.487 0.296 0.704
#> SRR1699895 2 0.839 0.502 0.268 0.732
#> SRR1699896 2 0.943 0.441 0.360 0.640
#> SRR1699897 2 0.584 0.514 0.140 0.860
#> SRR1699898 2 0.921 0.498 0.336 0.664
#> SRR1699900 2 0.975 0.389 0.408 0.592
#> SRR1699899 2 0.949 0.437 0.368 0.632
#> SRR1699902 2 0.871 0.513 0.292 0.708
#> SRR1699901 2 0.952 0.471 0.372 0.628
#> SRR1699903 2 0.966 0.389 0.392 0.608
#> SRR1699904 2 0.904 0.487 0.320 0.680
#> SRR1699905 2 0.990 0.372 0.440 0.560
#> SRR1699906 2 0.966 0.387 0.392 0.608
#> SRR1699907 2 0.971 0.381 0.400 0.600
#> SRR1699908 2 0.850 0.518 0.276 0.724
#> SRR1699909 2 0.469 0.592 0.100 0.900
#> SRR1699910 2 0.850 0.497 0.276 0.724
#> SRR1699911 2 0.987 0.357 0.432 0.568
#> SRR1699912 2 0.963 0.390 0.388 0.612
#> SRR1699913 2 0.971 0.395 0.400 0.600
#> SRR1699914 2 0.584 0.540 0.140 0.860
#> SRR1699915 2 0.866 0.490 0.288 0.712
#> SRR1699916 2 0.644 0.574 0.164 0.836
#> SRR1699917 2 0.827 0.505 0.260 0.740
#> SRR1699918 2 0.814 0.512 0.252 0.748
#> SRR1699919 2 0.358 0.594 0.068 0.932
#> SRR1699920 2 0.482 0.583 0.104 0.896
#> SRR1699921 2 0.689 0.583 0.184 0.816
#> SRR1699922 2 0.978 0.381 0.412 0.588
#> SRR1699923 2 0.936 0.469 0.352 0.648
#> SRR1699924 2 0.416 0.570 0.084 0.916
#> SRR1699925 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1699926 2 0.909 0.472 0.324 0.676
#> SRR1699927 2 0.574 0.595 0.136 0.864
#> SRR1699929 2 0.886 0.472 0.304 0.696
#> SRR1699928 2 0.921 0.466 0.336 0.664
#> SRR1699930 2 0.969 0.384 0.396 0.604
#> SRR1699931 2 0.615 0.563 0.152 0.848
#> SRR1699933 2 0.985 0.364 0.428 0.572
#> SRR1699932 2 0.625 0.540 0.156 0.844
#> SRR1699934 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1699935 2 0.469 0.596 0.100 0.900
#> SRR1699936 2 0.827 0.521 0.260 0.740
#> SRR1699937 2 0.697 0.462 0.188 0.812
#> SRR1699938 2 0.738 0.482 0.208 0.792
#> SRR1699940 2 1.000 0.291 0.492 0.508
#> SRR1699939 2 0.900 0.474 0.316 0.684
#> SRR1699941 2 0.795 0.454 0.240 0.760
#> SRR1699942 2 0.978 0.430 0.412 0.588
#> SRR1699943 2 0.900 0.433 0.316 0.684
#> SRR1699944 2 0.795 0.475 0.240 0.760
#> SRR1699945 2 0.788 0.424 0.236 0.764
#> SRR1699946 2 0.943 0.415 0.360 0.640
#> SRR1699947 1 0.995 -0.199 0.540 0.460
#> SRR1699948 2 0.697 0.503 0.188 0.812
#> SRR1699949 2 0.886 0.496 0.304 0.696
#> SRR1699950 2 0.518 0.556 0.116 0.884
#> SRR1699951 2 0.260 0.576 0.044 0.956
#> SRR1699952 2 0.936 0.333 0.352 0.648
#> SRR1699953 2 0.552 0.564 0.128 0.872
#> SRR1699954 2 0.802 0.424 0.244 0.756
#> SRR1699955 2 0.917 0.477 0.332 0.668
#> SRR1699956 2 0.689 0.458 0.184 0.816
#> SRR1699957 2 0.738 0.502 0.208 0.792
#> SRR1699959 2 0.541 0.596 0.124 0.876
#> SRR1699958 2 0.952 0.451 0.372 0.628
#> SRR1699960 2 0.634 0.605 0.160 0.840
#> SRR1699961 2 0.416 0.558 0.084 0.916
#> SRR1699962 2 0.644 0.479 0.164 0.836
#> SRR1699963 2 0.844 0.514 0.272 0.728
#> SRR1699964 2 0.958 0.407 0.380 0.620
#> SRR1699965 2 0.634 0.502 0.160 0.840
#> SRR1699966 2 0.881 0.516 0.300 0.700
#> SRR1699967 2 0.541 0.517 0.124 0.876
#> SRR1699968 2 0.295 0.595 0.052 0.948
#> SRR1699969 2 0.518 0.558 0.116 0.884
#> SRR1699971 2 0.966 0.397 0.392 0.608
#> SRR1699970 2 0.932 0.456 0.348 0.652
#> SRR1699972 2 0.958 0.442 0.380 0.620
#> SRR1699973 2 0.936 0.484 0.352 0.648
#> SRR1699974 2 0.781 0.434 0.232 0.768
#> SRR1699975 2 0.969 0.387 0.396 0.604
#> SRR1699976 2 0.634 0.466 0.160 0.840
#> SRR1699977 2 0.971 0.428 0.400 0.600
#> SRR1699978 2 0.760 0.521 0.220 0.780
#> SRR1699979 2 0.430 0.569 0.088 0.912
#> SRR1699980 2 0.891 0.506 0.308 0.692
#> SRR1699981 2 0.925 0.491 0.340 0.660
#> SRR1699982 2 0.966 0.393 0.392 0.608
#> SRR1699983 2 0.996 0.305 0.464 0.536
#> SRR1699984 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1699985 2 0.844 0.519 0.272 0.728
#> SRR1699986 1 1.000 -0.306 0.508 0.492
#> SRR1699988 2 0.925 0.476 0.340 0.660
#> SRR1699987 2 0.469 0.558 0.100 0.900
#> SRR1699989 2 0.808 0.513 0.248 0.752
#> SRR1699990 2 0.343 0.576 0.064 0.936
#> SRR1699992 2 0.634 0.455 0.160 0.840
#> SRR1699991 2 0.388 0.571 0.076 0.924
#> SRR1699993 2 0.552 0.551 0.128 0.872
#> SRR1699994 2 0.541 0.542 0.124 0.876
#> SRR1699995 2 0.634 0.532 0.160 0.840
#> SRR1699996 2 0.929 0.386 0.344 0.656
#> SRR1699997 2 0.921 0.487 0.336 0.664
#> SRR1699998 1 1.000 -0.278 0.500 0.500
#> SRR1699999 2 0.991 -0.482 0.444 0.556
#> SRR1700000 2 0.988 0.361 0.436 0.564
#> SRR1700002 2 0.917 0.481 0.332 0.668
#> SRR1700001 2 0.909 0.503 0.324 0.676
#> SRR1700003 2 0.929 0.490 0.344 0.656
#> SRR1700004 2 0.506 0.539 0.112 0.888
#> SRR1700005 1 0.895 0.594 0.688 0.312
#> SRR1700006 2 0.781 0.566 0.232 0.768
#> SRR1700007 2 0.958 0.407 0.380 0.620
#> SRR1700008 2 0.871 0.535 0.292 0.708
#> SRR1700009 1 0.999 0.661 0.520 0.480
#> SRR1700010 2 0.781 0.434 0.232 0.768
#> SRR1700011 2 0.886 0.491 0.304 0.696
#> SRR1700013 2 0.482 0.547 0.104 0.896
#> SRR1700012 2 0.961 0.406 0.384 0.616
#> SRR1700014 2 0.373 0.572 0.072 0.928
#> SRR1700015 2 0.482 0.550 0.104 0.896
#> SRR1700016 2 0.955 0.380 0.376 0.624
#> SRR1700018 2 0.574 0.583 0.136 0.864
#> SRR1700017 2 0.494 0.578 0.108 0.892
#> SRR1700019 2 0.311 0.592 0.056 0.944
#> SRR1700020 2 0.563 0.534 0.132 0.868
#> SRR1700021 2 0.891 0.509 0.308 0.692
#> SRR1700023 2 0.327 0.578 0.060 0.940
#> SRR1700022 2 0.714 0.576 0.196 0.804
#> SRR1700024 2 0.961 0.402 0.384 0.616
#> SRR1700025 2 0.574 0.501 0.136 0.864
#> SRR1700026 2 0.373 0.566 0.072 0.928
#> SRR1700027 2 0.327 0.563 0.060 0.940
#> SRR1700028 2 0.921 0.487 0.336 0.664
#> SRR1700029 2 0.402 0.568 0.080 0.920
#> SRR1700030 2 0.876 0.509 0.296 0.704
#> SRR1700031 2 0.482 0.553 0.104 0.896
#> SRR1700032 2 0.443 0.544 0.092 0.908
#> SRR1700034 2 0.855 0.280 0.280 0.720
#> SRR1700035 2 0.615 0.604 0.152 0.848
#> SRR1700033 2 0.615 0.550 0.152 0.848
#> SRR1700036 2 0.327 0.577 0.060 0.940
#> SRR1700037 2 0.886 0.507 0.304 0.696
#> SRR1700038 2 0.881 0.472 0.300 0.700
#> SRR1700039 2 0.529 0.547 0.120 0.880
#> SRR1700040 2 0.541 0.551 0.124 0.876
#> SRR1700041 2 0.469 0.568 0.100 0.900
#> SRR1700042 2 0.388 0.581 0.076 0.924
#> SRR1700043 2 0.861 0.542 0.284 0.716
#> SRR1700045 2 0.730 0.595 0.204 0.796
#> SRR1700044 2 0.871 0.508 0.292 0.708
#> SRR1700046 2 0.506 0.600 0.112 0.888
#> SRR1700047 2 0.605 0.542 0.148 0.852
#> SRR1700048 2 0.808 0.510 0.248 0.752
#> SRR1700049 2 0.574 0.559 0.136 0.864
#> SRR1700050 2 0.866 0.496 0.288 0.712
#> SRR1700051 2 0.909 0.507 0.324 0.676
#> SRR1700052 2 0.625 0.557 0.156 0.844
#> SRR1700053 2 0.388 0.584 0.076 0.924
#> SRR1700054 2 0.388 0.575 0.076 0.924
#> SRR1700055 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1700056 2 0.494 0.552 0.108 0.892
#> SRR1700057 2 0.518 0.546 0.116 0.884
#> SRR1700058 2 0.416 0.561 0.084 0.916
#> SRR1700059 2 0.615 0.511 0.152 0.848
#> SRR1700060 2 0.469 0.589 0.100 0.900
#> SRR1700061 2 0.402 0.572 0.080 0.920
#> SRR1700062 2 0.518 0.544 0.116 0.884
#> SRR1700063 2 0.469 0.558 0.100 0.900
#> SRR1700064 2 0.871 0.488 0.292 0.708
#> SRR1700065 2 0.990 0.374 0.440 0.560
#> SRR1700066 2 0.595 0.604 0.144 0.856
#> SRR1700067 2 0.925 0.449 0.340 0.660
#> SRR1700068 2 0.443 0.562 0.092 0.908
#> SRR1700069 2 0.388 0.569 0.076 0.924
#> SRR1700070 2 0.605 0.601 0.148 0.852
#> SRR1700071 2 0.343 0.575 0.064 0.936
#> SRR1700072 2 0.946 0.431 0.364 0.636
#> SRR1700073 2 0.939 0.439 0.356 0.644
#> SRR1700075 2 0.706 0.524 0.192 0.808
#> SRR1700074 2 0.358 0.569 0.068 0.932
#> SRR1700076 2 0.541 0.528 0.124 0.876
#> SRR1700077 2 0.456 0.557 0.096 0.904
#> SRR1700078 2 0.343 0.574 0.064 0.936
#> SRR1700080 2 0.358 0.574 0.068 0.932
#> SRR1700079 2 0.895 0.506 0.312 0.688
#> SRR1700081 2 0.753 0.450 0.216 0.784
#> SRR1700082 2 0.895 0.508 0.312 0.688
#> SRR1700083 2 0.775 0.559 0.228 0.772
#> SRR1700084 2 0.494 0.567 0.108 0.892
#> SRR1700085 2 0.343 0.576 0.064 0.936
#> SRR1700086 2 0.876 0.511 0.296 0.704
#> SRR1700087 2 0.995 0.349 0.460 0.540
#> SRR1700088 2 0.909 0.501 0.324 0.676
#> SRR1700089 2 0.866 0.492 0.288 0.712
#> SRR1700091 2 0.595 0.525 0.144 0.856
#> SRR1700090 2 0.943 0.459 0.360 0.640
#> SRR1700092 2 0.327 0.586 0.060 0.940
#> SRR1700094 2 0.416 0.570 0.084 0.916
#> SRR1700093 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700095 2 0.615 0.511 0.152 0.848
#> SRR1700096 2 0.605 0.511 0.148 0.852
#> SRR1700097 2 0.952 0.456 0.372 0.628
#> SRR1700098 2 0.456 0.575 0.096 0.904
#> SRR1700099 2 0.605 0.509 0.148 0.852
#> SRR1700100 2 0.958 0.447 0.380 0.620
#> SRR1700101 2 0.574 0.549 0.136 0.864
#> SRR1700102 2 0.939 0.477 0.356 0.644
#> SRR1700104 2 0.595 0.513 0.144 0.856
#> SRR1700103 2 0.518 0.555 0.116 0.884
#> SRR1700105 2 0.563 0.538 0.132 0.868
#> SRR1700106 2 0.895 0.467 0.312 0.688
#> SRR1700107 2 0.949 0.454 0.368 0.632
#> SRR1700108 2 0.595 0.516 0.144 0.856
#> SRR1700109 2 0.876 0.514 0.296 0.704
#> SRR1700110 2 0.541 0.537 0.124 0.876
#> SRR1700112 2 0.563 0.531 0.132 0.868
#> SRR1700111 2 0.990 0.374 0.440 0.560
#> SRR1700113 2 0.482 0.555 0.104 0.896
#> SRR1700114 2 0.605 0.509 0.148 0.852
#> SRR1700115 2 0.615 0.508 0.152 0.848
#> SRR1700116 2 0.988 0.394 0.436 0.564
#> SRR1700117 2 0.866 0.475 0.288 0.712
#> SRR1700119 2 0.563 0.529 0.132 0.868
#> SRR1700118 2 0.996 0.345 0.464 0.536
#> SRR1700120 2 0.891 0.524 0.308 0.692
#> SRR1700121 2 0.574 0.548 0.136 0.864
#> SRR1700122 2 0.981 0.378 0.420 0.580
#> SRR1700123 2 0.574 0.525 0.136 0.864
#> SRR1700125 2 0.615 0.539 0.152 0.848
#> SRR1700126 2 0.595 0.580 0.144 0.856
#> SRR1700127 2 0.932 0.476 0.348 0.652
#> SRR1700124 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700128 2 0.925 0.482 0.340 0.660
#> SRR1700129 2 0.995 0.357 0.460 0.540
#> SRR1700130 2 0.998 0.335 0.472 0.528
#> SRR1700132 2 0.909 0.464 0.324 0.676
#> SRR1700131 2 0.552 0.547 0.128 0.872
#> SRR1700133 2 0.595 0.536 0.144 0.856
#> SRR1700134 2 0.615 0.508 0.152 0.848
#> SRR1700135 2 0.909 0.469 0.324 0.676
#> SRR1700136 2 0.605 0.509 0.148 0.852
#> SRR1700137 2 0.625 0.503 0.156 0.844
#> SRR1700138 2 0.625 0.503 0.156 0.844
#> SRR1700140 2 0.952 0.449 0.372 0.628
#> SRR1700139 2 0.955 0.446 0.376 0.624
#> SRR1700141 2 0.961 0.455 0.384 0.616
#> SRR1700142 2 0.866 0.501 0.288 0.712
#> SRR1700143 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700144 2 0.821 0.514 0.256 0.744
#> SRR1700145 2 0.946 0.462 0.364 0.636
#> SRR1700146 2 0.595 0.517 0.144 0.856
#> SRR1700147 2 0.814 0.562 0.252 0.748
#> SRR1700149 2 0.955 0.452 0.376 0.624
#> SRR1700148 2 0.563 0.536 0.132 0.868
#> SRR1700150 2 0.939 0.442 0.356 0.644
#> SRR1700152 2 0.958 0.450 0.380 0.620
#> SRR1700151 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700153 2 0.955 0.446 0.376 0.624
#> SRR1700154 2 0.634 0.525 0.160 0.840
#> SRR1700155 2 0.634 0.535 0.160 0.840
#> SRR1700156 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700158 2 0.634 0.516 0.160 0.840
#> SRR1700159 2 0.529 0.568 0.120 0.880
#> SRR1700157 2 0.994 0.361 0.456 0.544
#> SRR1700160 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700161 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700162 2 0.605 0.534 0.148 0.852
#> SRR1700164 2 0.932 0.474 0.348 0.652
#> SRR1700163 2 0.574 0.531 0.136 0.864
#> SRR1700165 2 0.595 0.513 0.144 0.856
#> SRR1700166 2 0.529 0.555 0.120 0.880
#> SRR1700168 2 0.925 0.456 0.340 0.660
#> SRR1700167 2 0.952 0.456 0.372 0.628
#> SRR1700170 2 0.987 0.397 0.432 0.568
#> SRR1700169 2 0.541 0.536 0.124 0.876
#> SRR1700171 2 0.753 0.513 0.216 0.784
#> SRR1700172 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700174 2 0.584 0.519 0.140 0.860
#> SRR1700173 2 0.615 0.507 0.152 0.848
#> SRR1700175 2 0.552 0.537 0.128 0.872
#> SRR1700176 2 0.895 0.473 0.312 0.688
#> SRR1700178 2 0.680 0.461 0.180 0.820
#> SRR1700177 2 0.952 0.449 0.372 0.628
#> SRR1700180 2 0.981 0.354 0.420 0.580
#> SRR1700179 2 0.714 0.459 0.196 0.804
#> SRR1700181 2 0.625 0.507 0.156 0.844
#> SRR1700183 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1700182 2 0.697 0.461 0.188 0.812
#> SRR1700184 2 0.697 0.474 0.188 0.812
#> SRR1700186 2 0.615 0.506 0.152 0.848
#> SRR1700187 1 0.998 0.665 0.524 0.476
#> SRR1700185 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1700188 2 0.689 0.461 0.184 0.816
#> SRR1700192 2 1.000 -0.635 0.492 0.508
#> SRR1700190 2 0.802 0.400 0.244 0.756
#> SRR1700191 1 0.939 0.618 0.644 0.356
#> SRR1700189 1 0.999 0.629 0.516 0.484
#> SRR1700193 2 0.671 0.460 0.176 0.824
#> SRR1700195 2 0.998 0.259 0.476 0.524
#> SRR1700194 1 0.988 0.648 0.564 0.436
#> SRR1700196 2 0.745 0.464 0.212 0.788
#> SRR1700197 1 1.000 0.656 0.512 0.488
#> SRR1700198 2 0.671 0.460 0.176 0.824
#> SRR1700199 2 0.983 0.305 0.424 0.576
#> SRR1700200 2 0.949 0.413 0.368 0.632
#> SRR1700201 2 0.680 0.461 0.180 0.820
#> SRR1700202 1 0.943 0.544 0.640 0.360
#> SRR1700203 1 1.000 -0.245 0.504 0.496
#> SRR1700204 2 0.644 0.549 0.164 0.836
#> SRR1700206 2 0.697 0.496 0.188 0.812
#> SRR1700207 2 0.753 0.474 0.216 0.784
#> SRR1700208 2 1.000 -0.630 0.488 0.512
#> SRR1700205 2 0.994 0.303 0.456 0.544
#> SRR1700209 2 0.574 0.516 0.136 0.864
#> SRR1700210 1 1.000 -0.250 0.500 0.500
#> SRR1700211 2 0.980 0.362 0.416 0.584
#> SRR1700212 2 0.999 0.255 0.484 0.516
#> SRR1700213 2 0.634 0.516 0.160 0.840
#> SRR1700214 2 0.625 0.495 0.156 0.844
#> SRR1700215 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1700217 2 0.653 0.467 0.168 0.832
#> SRR1700216 1 0.936 0.615 0.648 0.352
#> SRR1700218 2 0.653 0.457 0.168 0.832
#> SRR1700219 2 0.697 0.461 0.188 0.812
#> SRR1700222 1 0.999 0.664 0.520 0.480
#> SRR1700220 2 0.615 0.502 0.152 0.848
#> SRR1700221 2 0.662 0.460 0.172 0.828
#> SRR1700223 2 0.821 0.435 0.256 0.744
#> SRR1700224 2 0.808 0.555 0.248 0.752
#> SRR1700226 2 0.895 0.382 0.312 0.688
#> SRR1700229 2 0.985 0.349 0.428 0.572
#> SRR1700225 2 0.952 0.346 0.372 0.628
#> SRR1700227 2 0.966 0.389 0.392 0.608
#> SRR1700230 1 1.000 0.651 0.512 0.488
#> SRR1700231 2 0.961 0.390 0.384 0.616
#> SRR1700228 2 0.946 0.430 0.364 0.636
#> SRR1700232 2 0.861 0.409 0.284 0.716
#> SRR1700233 2 0.574 0.516 0.136 0.864
#> SRR1700234 2 0.653 0.467 0.168 0.832
#> SRR1700235 2 0.595 0.495 0.144 0.856
#> SRR1700237 2 0.844 0.472 0.272 0.728
#> SRR1700236 2 0.966 0.415 0.392 0.608
#> SRR1700238 2 0.671 0.461 0.176 0.824
#> SRR1700239 1 0.998 0.667 0.524 0.476
#> SRR1700240 1 0.921 0.596 0.664 0.336
#> SRR1700241 2 0.595 0.533 0.144 0.856
#> SRR1700243 2 0.689 0.476 0.184 0.816
#> SRR1700244 2 0.697 0.487 0.188 0.812
#> SRR1700242 2 0.998 -0.620 0.472 0.528
#> SRR1700246 2 1.000 0.226 0.496 0.504
#> SRR1700245 2 0.978 0.381 0.412 0.588
#> SRR1700247 1 0.714 0.362 0.804 0.196
#> SRR1700249 1 0.998 0.669 0.528 0.472
#> SRR1700250 2 0.939 0.438 0.356 0.644
#> SRR1700248 2 0.671 0.460 0.176 0.824
#> SRR1700251 2 0.881 0.364 0.300 0.700
#> SRR1700252 2 0.662 0.481 0.172 0.828
#> SRR1700253 2 0.943 0.461 0.360 0.640
#> SRR1700256 2 0.990 0.350 0.440 0.560
#> SRR1700254 1 0.943 0.609 0.640 0.360
#> SRR1700255 2 0.653 0.467 0.168 0.832
#> SRR1700257 2 0.680 0.461 0.180 0.820
#> SRR1700258 2 0.753 0.463 0.216 0.784
#> SRR1700259 2 0.443 0.568 0.092 0.908
#> SRR1700260 2 0.971 0.392 0.400 0.600
#> SRR1700261 2 0.242 0.585 0.040 0.960
#> SRR1700262 2 0.895 0.481 0.312 0.688
#> SRR1700263 2 0.978 0.374 0.412 0.588
#> SRR1700264 2 0.584 0.544 0.140 0.860
#> SRR1700265 2 0.929 0.462 0.344 0.656
#> SRR1700266 2 0.900 0.485 0.316 0.684
#> SRR1700268 2 0.680 0.448 0.180 0.820
#> SRR1700270 2 0.653 0.467 0.168 0.832
#> SRR1700267 2 0.714 0.510 0.196 0.804
#> SRR1700271 2 0.595 0.549 0.144 0.856
#> SRR1700272 2 0.833 0.520 0.264 0.736
#> SRR1700273 2 0.855 0.390 0.280 0.720
#> SRR1700274 2 0.833 0.505 0.264 0.736
#> SRR1700277 2 0.615 0.524 0.152 0.848
#> SRR1700275 2 0.456 0.570 0.096 0.904
#> SRR1700276 2 0.595 0.607 0.144 0.856
#> SRR1700278 2 0.518 0.533 0.116 0.884
#> SRR1700279 2 0.955 0.425 0.376 0.624
#> SRR1700280 2 0.958 0.420 0.380 0.620
#> SRR1700281 2 0.855 0.512 0.280 0.720
#> SRR1700283 2 0.963 0.389 0.388 0.612
#> SRR1700282 2 0.595 0.516 0.144 0.856
#> SRR1700284 2 0.430 0.598 0.088 0.912
#> SRR1700285 2 0.518 0.590 0.116 0.884
#> SRR1700286 2 0.788 0.505 0.236 0.764
#> SRR1700287 2 0.827 0.511 0.260 0.740
#> SRR1700290 2 0.552 0.563 0.128 0.872
#> SRR1700289 2 0.966 0.386 0.392 0.608
#> SRR1700288 2 0.574 0.517 0.136 0.864
#> SRR1700292 2 0.998 0.281 0.472 0.528
#> SRR1700291 2 0.469 0.558 0.100 0.900
#> SRR1700293 2 0.506 0.554 0.112 0.888
#> SRR1700294 2 0.943 0.431 0.360 0.640
#> SRR1700295 2 0.482 0.561 0.104 0.896
#> SRR1700297 2 0.946 0.434 0.364 0.636
#> SRR1700296 2 0.904 0.478 0.320 0.680
#> SRR1700298 2 0.494 0.552 0.108 0.892
#> SRR1700299 2 0.990 0.346 0.440 0.560
#> SRR1700300 2 0.980 0.380 0.416 0.584
#> SRR1700302 2 0.662 0.596 0.172 0.828
#> SRR1700301 2 0.680 0.534 0.180 0.820
#> SRR1700303 2 0.278 0.588 0.048 0.952
#> SRR1700304 2 0.563 0.543 0.132 0.868
#> SRR1700305 2 0.260 0.587 0.044 0.956
#> SRR1700306 2 0.767 0.518 0.224 0.776
#> SRR1700308 2 0.991 0.339 0.444 0.556
#> SRR1700307 2 0.781 0.570 0.232 0.768
#> SRR1700309 1 1.000 -0.313 0.504 0.496
#> SRR1700310 2 0.518 0.590 0.116 0.884
#> SRR1700311 2 0.821 0.496 0.256 0.744
#> SRR1700312 2 0.529 0.584 0.120 0.880
#> SRR1700313 2 0.416 0.577 0.084 0.916
#> SRR1700314 2 0.871 0.510 0.292 0.708
#> SRR1700315 2 0.895 0.478 0.312 0.688
#> SRR1700316 2 0.689 0.557 0.184 0.816
#> SRR1700317 2 0.753 0.542 0.216 0.784
#> SRR1700318 2 0.767 0.581 0.224 0.776
#> SRR1700319 2 0.482 0.556 0.104 0.896
#> SRR1700320 2 0.278 0.586 0.048 0.952
#> SRR1700322 2 0.891 0.472 0.308 0.692
#> SRR1700321 2 0.260 0.583 0.044 0.956
#> SRR1700323 2 0.402 0.567 0.080 0.920
#> SRR1700324 2 0.358 0.602 0.068 0.932
#> SRR1700325 2 0.402 0.576 0.080 0.920
#> SRR1700326 2 0.866 0.520 0.288 0.712
#> SRR1700327 2 0.373 0.582 0.072 0.928
#> SRR1700329 2 0.973 0.382 0.404 0.596
#> SRR1700328 2 1.000 0.263 0.488 0.512
#> SRR1700330 2 0.494 0.541 0.108 0.892
#> SRR1700331 2 0.886 0.469 0.304 0.696
#> SRR1700332 2 0.680 0.597 0.180 0.820
#> SRR1700333 2 0.904 0.503 0.320 0.680
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.803 0.520344 0.240 0.640 0.120
#> SRR1699875 2 0.277 0.518924 0.072 0.920 0.008
#> SRR1699876 2 0.427 0.529650 0.024 0.860 0.116
#> SRR1699877 2 0.409 0.533723 0.068 0.880 0.052
#> SRR1699879 2 0.736 0.529302 0.112 0.700 0.188
#> SRR1699878 2 0.452 0.451874 0.180 0.816 0.004
#> SRR1699880 3 0.921 0.307911 0.304 0.180 0.516
#> SRR1699881 3 0.884 0.445471 0.208 0.212 0.580
#> SRR1699882 2 0.218 0.540757 0.032 0.948 0.020
#> SRR1699883 2 0.601 0.456676 0.184 0.768 0.048
#> SRR1699884 2 0.639 0.560934 0.108 0.768 0.124
#> SRR1699885 2 0.711 0.535585 0.196 0.712 0.092
#> SRR1699886 2 0.398 0.531495 0.048 0.884 0.068
#> SRR1699888 2 0.740 0.516152 0.052 0.624 0.324
#> SRR1699889 3 0.821 0.345041 0.072 0.460 0.468
#> SRR1699890 2 0.388 0.519090 0.068 0.888 0.044
#> SRR1699887 2 0.788 0.512573 0.096 0.636 0.268
#> SRR1699891 2 0.777 0.476677 0.172 0.676 0.152
#> SRR1699892 3 0.804 0.556571 0.104 0.272 0.624
#> SRR1699893 3 0.586 0.569890 0.020 0.240 0.740
#> SRR1699894 2 0.849 0.497360 0.156 0.608 0.236
#> SRR1699895 2 0.885 0.467067 0.152 0.556 0.292
#> SRR1699896 3 0.889 0.373121 0.120 0.424 0.456
#> SRR1699897 3 0.927 0.024674 0.156 0.420 0.424
#> SRR1699898 3 0.700 0.553573 0.052 0.268 0.680
#> SRR1699900 3 0.966 0.381480 0.212 0.372 0.416
#> SRR1699899 2 0.783 0.069251 0.088 0.632 0.280
#> SRR1699902 3 0.838 0.495027 0.092 0.368 0.540
#> SRR1699901 2 0.960 -0.378980 0.200 0.404 0.396
#> SRR1699903 2 0.947 -0.086634 0.212 0.488 0.300
#> SRR1699904 2 0.563 0.556944 0.032 0.780 0.188
#> SRR1699905 3 0.953 0.402216 0.216 0.308 0.476
#> SRR1699906 2 0.627 0.469490 0.140 0.772 0.088
#> SRR1699907 2 0.710 0.434275 0.172 0.720 0.108
#> SRR1699908 2 0.717 -0.143104 0.028 0.568 0.404
#> SRR1699909 3 0.679 0.443199 0.028 0.324 0.648
#> SRR1699910 3 0.847 0.520008 0.208 0.176 0.616
#> SRR1699911 2 0.950 -0.053344 0.200 0.468 0.332
#> SRR1699912 2 0.802 0.363009 0.184 0.656 0.160
#> SRR1699913 2 0.693 0.379120 0.076 0.716 0.208
#> SRR1699914 3 0.825 0.532381 0.164 0.200 0.636
#> SRR1699915 3 0.887 0.463790 0.200 0.224 0.576
#> SRR1699916 2 0.711 0.496219 0.036 0.624 0.340
#> SRR1699917 3 0.887 0.365507 0.160 0.280 0.560
#> SRR1699918 3 0.875 0.447626 0.172 0.244 0.584
#> SRR1699919 3 0.735 0.306710 0.040 0.368 0.592
#> SRR1699920 3 0.429 0.642310 0.032 0.104 0.864
#> SRR1699921 3 0.790 0.386996 0.068 0.356 0.576
#> SRR1699922 2 0.409 0.528553 0.064 0.880 0.056
#> SRR1699923 2 0.874 -0.403205 0.108 0.464 0.428
#> SRR1699924 3 0.501 0.639905 0.076 0.084 0.840
#> SRR1699925 1 0.630 0.793604 0.772 0.132 0.096
#> SRR1699926 3 0.868 0.510055 0.188 0.216 0.596
#> SRR1699927 2 0.740 0.318671 0.036 0.552 0.412
#> SRR1699929 3 0.960 0.421039 0.276 0.248 0.476
#> SRR1699928 2 0.621 0.451346 0.068 0.768 0.164
#> SRR1699930 2 0.649 0.447405 0.160 0.756 0.084
#> SRR1699931 3 0.896 0.427184 0.156 0.304 0.540
#> SRR1699933 3 0.959 0.439291 0.240 0.284 0.476
#> SRR1699932 2 0.725 0.296503 0.028 0.536 0.436
#> SRR1699934 1 0.630 0.793604 0.772 0.132 0.096
#> SRR1699935 3 0.610 0.596773 0.032 0.228 0.740
#> SRR1699936 2 0.435 0.534677 0.020 0.852 0.128
#> SRR1699937 2 0.927 0.281062 0.240 0.528 0.232
#> SRR1699938 2 0.711 0.507471 0.184 0.716 0.100
#> SRR1699940 3 0.979 0.337288 0.236 0.368 0.396
#> SRR1699939 2 0.492 0.567874 0.072 0.844 0.084
#> SRR1699941 3 0.927 0.410471 0.240 0.232 0.528
#> SRR1699942 2 0.661 0.425229 0.072 0.740 0.188
#> SRR1699943 2 0.604 0.548265 0.112 0.788 0.100
#> SRR1699944 2 0.696 0.532832 0.152 0.732 0.116
#> SRR1699945 3 0.930 0.158416 0.376 0.164 0.460
#> SRR1699946 2 0.682 0.536677 0.108 0.740 0.152
#> SRR1699947 2 0.764 0.500740 0.180 0.684 0.136
#> SRR1699948 2 0.694 0.527311 0.160 0.732 0.108
#> SRR1699949 2 0.380 0.563165 0.024 0.884 0.092
#> SRR1699950 2 0.772 0.511637 0.164 0.680 0.156
#> SRR1699951 3 0.892 -0.030163 0.124 0.412 0.464
#> SRR1699952 2 0.946 0.399180 0.280 0.496 0.224
#> SRR1699953 2 0.783 0.523597 0.168 0.672 0.160
#> SRR1699954 2 0.971 0.111262 0.252 0.452 0.296
#> SRR1699955 2 0.514 0.577425 0.064 0.832 0.104
#> SRR1699956 3 0.925 0.320002 0.296 0.188 0.516
#> SRR1699957 2 0.793 0.511401 0.168 0.664 0.168
#> SRR1699959 3 0.832 0.561604 0.148 0.228 0.624
#> SRR1699958 3 0.760 0.481389 0.060 0.328 0.612
#> SRR1699960 2 0.718 0.557474 0.060 0.672 0.268
#> SRR1699961 3 0.882 0.471335 0.232 0.188 0.580
#> SRR1699962 2 0.781 0.498504 0.180 0.672 0.148
#> SRR1699963 2 0.857 -0.378903 0.096 0.472 0.432
#> SRR1699964 2 0.979 -0.071599 0.236 0.400 0.364
#> SRR1699965 2 0.766 0.505747 0.144 0.684 0.172
#> SRR1699966 3 0.725 0.584260 0.052 0.300 0.648
#> SRR1699967 2 0.846 0.459023 0.168 0.616 0.216
#> SRR1699968 3 0.798 0.429573 0.076 0.340 0.584
#> SRR1699969 3 0.523 0.616341 0.104 0.068 0.828
#> SRR1699971 2 0.909 -0.347712 0.140 0.464 0.396
#> SRR1699970 2 0.290 0.520157 0.064 0.920 0.016
#> SRR1699972 2 0.915 -0.382743 0.144 0.444 0.412
#> SRR1699973 3 0.806 0.421067 0.064 0.444 0.492
#> SRR1699974 3 0.933 0.010880 0.408 0.164 0.428
#> SRR1699975 3 0.970 0.321926 0.216 0.388 0.396
#> SRR1699976 3 0.919 0.398019 0.208 0.256 0.536
#> SRR1699977 3 0.903 0.413086 0.132 0.428 0.440
#> SRR1699978 3 0.874 0.497986 0.232 0.180 0.588
#> SRR1699979 3 0.692 0.590538 0.124 0.140 0.736
#> SRR1699980 2 0.762 -0.096951 0.056 0.596 0.348
#> SRR1699981 3 0.725 0.527840 0.056 0.288 0.656
#> SRR1699982 2 0.736 0.443058 0.172 0.704 0.124
#> SRR1699983 2 0.909 0.114575 0.168 0.528 0.304
#> SRR1699984 1 0.643 0.792456 0.764 0.140 0.096
#> SRR1699985 2 0.716 0.005478 0.040 0.628 0.332
#> SRR1699986 3 0.984 0.381572 0.248 0.360 0.392
#> SRR1699988 2 0.700 0.200871 0.052 0.680 0.268
#> SRR1699987 3 0.390 0.639966 0.056 0.056 0.888
#> SRR1699989 3 0.949 0.361684 0.220 0.292 0.488
#> SRR1699990 3 0.548 0.634482 0.076 0.108 0.816
#> SRR1699992 3 0.961 0.273244 0.244 0.284 0.472
#> SRR1699991 3 0.593 0.612499 0.124 0.084 0.792
#> SRR1699993 3 0.625 0.604623 0.120 0.104 0.776
#> SRR1699994 3 0.906 0.415149 0.248 0.200 0.552
#> SRR1699995 3 0.901 0.341772 0.304 0.160 0.536
#> SRR1699996 2 0.996 0.083321 0.292 0.372 0.336
#> SRR1699997 3 0.681 0.542822 0.044 0.268 0.688
#> SRR1699998 2 0.952 -0.160513 0.208 0.472 0.320
#> SRR1699999 1 0.822 0.673768 0.636 0.152 0.212
#> SRR1700000 3 0.972 0.351124 0.224 0.364 0.412
#> SRR1700002 3 0.881 0.482102 0.124 0.360 0.516
#> SRR1700001 3 0.892 0.503978 0.140 0.336 0.524
#> SRR1700003 3 0.797 0.485149 0.064 0.396 0.540
#> SRR1700004 3 0.740 0.574306 0.148 0.148 0.704
#> SRR1700005 1 0.463 0.655512 0.856 0.088 0.056
#> SRR1700006 3 0.693 0.615702 0.060 0.240 0.700
#> SRR1700007 2 0.500 0.512302 0.072 0.840 0.088
#> SRR1700008 3 0.595 0.618049 0.040 0.196 0.764
#> SRR1700009 1 0.637 0.794058 0.768 0.132 0.100
#> SRR1700010 1 0.930 0.049440 0.436 0.160 0.404
#> SRR1700011 2 0.389 0.537323 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700013 3 0.804 0.522741 0.148 0.200 0.652
#> SRR1700012 2 0.943 -0.362419 0.176 0.424 0.400
#> SRR1700014 3 0.565 0.623773 0.108 0.084 0.808
#> SRR1700015 3 0.867 0.488431 0.180 0.224 0.596
#> SRR1700016 3 0.949 0.456483 0.352 0.192 0.456
#> SRR1700018 3 0.651 0.635887 0.088 0.156 0.756
#> SRR1700017 3 0.848 0.552522 0.152 0.240 0.608
#> SRR1700019 2 0.728 0.503463 0.044 0.620 0.336
#> SRR1700020 3 0.389 0.616371 0.084 0.032 0.884
#> SRR1700021 2 0.750 -0.265359 0.040 0.548 0.412
#> SRR1700023 3 0.684 0.603388 0.116 0.144 0.740
#> SRR1700022 3 0.764 0.606629 0.092 0.248 0.660
#> SRR1700024 2 0.884 -0.298866 0.116 0.452 0.432
#> SRR1700025 3 0.899 0.429377 0.220 0.216 0.564
#> SRR1700026 3 0.803 0.549653 0.176 0.168 0.656
#> SRR1700027 3 0.844 0.505348 0.188 0.192 0.620
#> SRR1700028 3 0.663 0.523798 0.036 0.272 0.692
#> SRR1700029 3 0.464 0.635726 0.060 0.084 0.856
#> SRR1700030 2 0.807 -0.385126 0.064 0.472 0.464
#> SRR1700031 3 0.797 0.529605 0.220 0.128 0.652
#> SRR1700032 3 0.924 0.322438 0.172 0.328 0.500
#> SRR1700034 1 0.922 0.132624 0.468 0.156 0.376
#> SRR1700035 3 0.731 0.471317 0.048 0.324 0.628
#> SRR1700033 3 0.853 0.521765 0.192 0.196 0.612
#> SRR1700036 3 0.721 0.567891 0.088 0.212 0.700
#> SRR1700037 2 0.619 0.541210 0.040 0.744 0.216
#> SRR1700038 3 0.932 0.478148 0.296 0.196 0.508
#> SRR1700039 3 0.566 0.611809 0.128 0.068 0.804
#> SRR1700040 3 0.550 0.621349 0.100 0.084 0.816
#> SRR1700041 3 0.456 0.641033 0.064 0.076 0.860
#> SRR1700042 3 0.718 0.585988 0.168 0.116 0.716
#> SRR1700043 3 0.868 0.530629 0.124 0.328 0.548
#> SRR1700045 3 0.706 0.624205 0.068 0.236 0.696
#> SRR1700044 2 0.816 -0.269625 0.076 0.540 0.384
#> SRR1700046 3 0.666 0.638687 0.072 0.192 0.736
#> SRR1700047 3 0.603 0.603771 0.116 0.096 0.788
#> SRR1700048 3 0.895 0.529089 0.260 0.180 0.560
#> SRR1700049 3 0.819 0.532773 0.220 0.144 0.636
#> SRR1700050 3 0.847 0.552196 0.228 0.160 0.612
#> SRR1700051 3 0.857 0.481279 0.100 0.392 0.508
#> SRR1700052 3 0.869 0.536168 0.196 0.208 0.596
#> SRR1700053 3 0.563 0.614630 0.032 0.188 0.780
#> SRR1700054 3 0.596 0.626366 0.112 0.096 0.792
#> SRR1700055 1 0.643 0.792626 0.764 0.140 0.096
#> SRR1700056 3 0.338 0.633166 0.048 0.044 0.908
#> SRR1700057 3 0.219 0.625291 0.028 0.024 0.948
#> SRR1700058 3 0.777 0.551752 0.196 0.132 0.672
#> SRR1700059 3 0.192 0.615890 0.024 0.020 0.956
#> SRR1700060 3 0.774 0.586782 0.136 0.188 0.676
#> SRR1700061 3 0.533 0.620295 0.100 0.076 0.824
#> SRR1700062 3 0.230 0.620048 0.036 0.020 0.944
#> SRR1700063 3 0.486 0.618083 0.116 0.044 0.840
#> SRR1700064 3 0.880 0.518398 0.220 0.196 0.584
#> SRR1700065 3 0.982 0.368288 0.248 0.344 0.408
#> SRR1700066 3 0.880 0.549556 0.156 0.276 0.568
#> SRR1700067 3 0.941 0.266301 0.180 0.360 0.460
#> SRR1700068 3 0.244 0.627893 0.032 0.028 0.940
#> SRR1700069 3 0.517 0.619578 0.036 0.148 0.816
#> SRR1700070 3 0.813 0.331578 0.068 0.444 0.488
#> SRR1700071 3 0.692 0.610110 0.104 0.164 0.732
#> SRR1700072 3 0.954 0.467372 0.252 0.260 0.488
#> SRR1700073 3 0.918 0.377781 0.156 0.360 0.484
#> SRR1700075 3 0.863 0.546186 0.280 0.140 0.580
#> SRR1700074 3 0.840 0.515904 0.188 0.188 0.624
#> SRR1700076 3 0.861 0.473085 0.200 0.196 0.604
#> SRR1700077 3 0.872 0.482137 0.192 0.216 0.592
#> SRR1700078 3 0.526 0.629647 0.088 0.084 0.828
#> SRR1700080 3 0.539 0.637390 0.072 0.108 0.820
#> SRR1700079 3 0.777 0.518768 0.072 0.316 0.612
#> SRR1700081 3 0.913 0.295896 0.320 0.164 0.516
#> SRR1700082 3 0.877 0.460456 0.112 0.408 0.480
#> SRR1700083 3 0.668 0.614975 0.064 0.208 0.728
#> SRR1700084 3 0.763 0.563235 0.200 0.120 0.680
#> SRR1700085 3 0.687 0.392963 0.044 0.276 0.680
#> SRR1700086 2 0.814 -0.371643 0.068 0.484 0.448
#> SRR1700087 3 0.957 0.400707 0.212 0.328 0.460
#> SRR1700088 3 0.818 0.433821 0.072 0.424 0.504
#> SRR1700089 3 0.832 0.545055 0.268 0.124 0.608
#> SRR1700091 3 0.618 0.615047 0.072 0.156 0.772
#> SRR1700090 3 0.599 0.596131 0.056 0.168 0.776
#> SRR1700092 3 0.670 0.554543 0.040 0.268 0.692
#> SRR1700094 3 0.516 0.624635 0.072 0.096 0.832
#> SRR1700093 3 0.171 0.605716 0.032 0.008 0.960
#> SRR1700095 3 0.348 0.628415 0.044 0.052 0.904
#> SRR1700096 3 0.341 0.605419 0.080 0.020 0.900
#> SRR1700097 3 0.658 0.586441 0.068 0.192 0.740
#> SRR1700098 3 0.728 0.497594 0.060 0.280 0.660
#> SRR1700099 3 0.230 0.612410 0.036 0.020 0.944
#> SRR1700100 3 0.720 0.516832 0.064 0.260 0.676
#> SRR1700101 3 0.570 0.638328 0.064 0.136 0.800
#> SRR1700102 3 0.764 0.478796 0.048 0.396 0.556
#> SRR1700104 3 0.228 0.607367 0.052 0.008 0.940
#> SRR1700103 3 0.358 0.628830 0.044 0.056 0.900
#> SRR1700105 3 0.372 0.627189 0.024 0.088 0.888
#> SRR1700106 3 0.762 0.537885 0.188 0.128 0.684
#> SRR1700107 3 0.715 0.513117 0.048 0.300 0.652
#> SRR1700108 3 0.557 0.548753 0.032 0.184 0.784
#> SRR1700109 2 0.537 0.530453 0.016 0.776 0.208
#> SRR1700110 3 0.748 -0.231192 0.036 0.460 0.504
#> SRR1700112 3 0.498 0.516923 0.020 0.168 0.812
#> SRR1700111 3 0.947 0.393550 0.200 0.324 0.476
#> SRR1700113 3 0.625 0.439804 0.024 0.268 0.708
#> SRR1700114 3 0.188 0.610483 0.032 0.012 0.956
#> SRR1700115 3 0.321 0.609167 0.028 0.060 0.912
#> SRR1700116 3 0.873 0.454321 0.112 0.388 0.500
#> SRR1700117 3 0.695 0.566870 0.196 0.084 0.720
#> SRR1700119 3 0.113 0.610694 0.020 0.004 0.976
#> SRR1700118 3 0.949 0.402887 0.208 0.312 0.480
#> SRR1700120 3 0.722 0.592661 0.056 0.284 0.660
#> SRR1700121 3 0.399 0.640110 0.012 0.124 0.864
#> SRR1700122 2 0.932 -0.114804 0.172 0.476 0.352
#> SRR1700123 3 0.171 0.605716 0.032 0.008 0.960
#> SRR1700125 3 0.711 0.117536 0.028 0.388 0.584
#> SRR1700126 3 0.754 0.587548 0.120 0.192 0.688
#> SRR1700127 3 0.557 0.607086 0.044 0.160 0.796
#> SRR1700124 3 0.140 0.605505 0.028 0.004 0.968
#> SRR1700128 3 0.677 0.526282 0.040 0.276 0.684
#> SRR1700129 3 0.854 0.441427 0.096 0.408 0.496
#> SRR1700130 3 0.958 0.355666 0.212 0.332 0.456
#> SRR1700132 3 0.718 0.558557 0.196 0.096 0.708
#> SRR1700131 3 0.232 0.620579 0.028 0.028 0.944
#> SRR1700133 3 0.437 0.633488 0.032 0.108 0.860
#> SRR1700134 3 0.429 0.593319 0.032 0.104 0.864
#> SRR1700135 3 0.737 0.552634 0.200 0.104 0.696
#> SRR1700136 3 0.153 0.602195 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700137 3 0.218 0.602927 0.032 0.020 0.948
#> SRR1700138 3 0.129 0.599611 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700140 3 0.689 0.537578 0.060 0.236 0.704
#> SRR1700139 3 0.711 0.514143 0.060 0.260 0.680
#> SRR1700141 2 0.755 -0.134840 0.044 0.560 0.396
#> SRR1700142 3 0.790 0.562867 0.208 0.132 0.660
#> SRR1700143 3 0.153 0.602195 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700144 3 0.853 0.553024 0.224 0.168 0.608
#> SRR1700145 3 0.759 0.513402 0.068 0.300 0.632
#> SRR1700146 3 0.426 0.599126 0.036 0.096 0.868
#> SRR1700147 3 0.719 0.605105 0.080 0.224 0.696
#> SRR1700149 3 0.712 0.520549 0.056 0.272 0.672
#> SRR1700148 3 0.232 0.626076 0.028 0.028 0.944
#> SRR1700150 3 0.768 0.544880 0.188 0.132 0.680
#> SRR1700152 3 0.756 0.514982 0.064 0.308 0.628
#> SRR1700151 3 0.129 0.599611 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700153 3 0.711 0.514143 0.060 0.260 0.680
#> SRR1700154 3 0.191 0.607475 0.028 0.016 0.956
#> SRR1700155 3 0.518 0.621450 0.032 0.156 0.812
#> SRR1700156 3 0.153 0.603402 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700158 3 0.244 0.616582 0.032 0.028 0.940
#> SRR1700159 3 0.708 -0.233024 0.020 0.488 0.492
#> SRR1700157 3 0.951 0.391335 0.196 0.348 0.456
#> SRR1700160 3 0.153 0.602399 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700161 3 0.153 0.602195 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700162 3 0.673 0.423127 0.036 0.284 0.680
#> SRR1700164 3 0.619 0.590605 0.060 0.176 0.764
#> SRR1700163 3 0.203 0.608503 0.032 0.016 0.952
#> SRR1700165 3 0.270 0.608258 0.056 0.016 0.928
#> SRR1700166 3 0.275 0.632546 0.012 0.064 0.924
#> SRR1700168 3 0.911 0.215904 0.172 0.300 0.528
#> SRR1700167 3 0.700 0.521502 0.052 0.268 0.680
#> SRR1700170 3 0.843 0.469064 0.092 0.384 0.524
#> SRR1700169 3 0.230 0.619596 0.036 0.020 0.944
#> SRR1700171 3 0.636 0.619771 0.096 0.136 0.768
#> SRR1700172 3 0.218 0.608524 0.032 0.020 0.948
#> SRR1700174 3 0.244 0.616956 0.032 0.028 0.940
#> SRR1700173 3 0.171 0.605716 0.032 0.008 0.960
#> SRR1700175 3 0.177 0.621382 0.016 0.024 0.960
#> SRR1700176 3 0.823 0.565674 0.256 0.124 0.620
#> SRR1700178 2 0.738 0.434669 0.252 0.672 0.076
#> SRR1700177 3 0.702 0.516479 0.056 0.260 0.684
#> SRR1700180 2 0.566 0.569922 0.092 0.808 0.100
#> SRR1700179 2 0.727 0.458632 0.232 0.688 0.080
#> SRR1700181 2 0.774 0.414752 0.268 0.644 0.088
#> SRR1700183 1 0.636 0.792007 0.768 0.136 0.096
#> SRR1700182 2 0.756 0.418397 0.264 0.656 0.080
#> SRR1700184 2 0.734 0.449772 0.240 0.680 0.080
#> SRR1700186 2 0.798 0.428834 0.256 0.636 0.108
#> SRR1700187 1 0.692 0.789874 0.736 0.136 0.128
#> SRR1700185 1 0.643 0.793945 0.764 0.140 0.096
#> SRR1700188 2 0.730 0.442327 0.244 0.680 0.076
#> SRR1700192 1 0.898 0.600096 0.564 0.232 0.204
#> SRR1700190 3 0.933 0.000754 0.408 0.164 0.428
#> SRR1700191 1 0.457 0.695910 0.860 0.072 0.068
#> SRR1700189 1 0.848 0.688253 0.616 0.192 0.192
#> SRR1700193 2 0.737 0.424170 0.260 0.668 0.072
#> SRR1700195 2 0.635 0.558262 0.140 0.768 0.092
#> SRR1700194 1 0.664 0.776858 0.748 0.160 0.092
#> SRR1700196 2 0.717 0.484317 0.208 0.704 0.088
#> SRR1700197 1 0.704 0.785715 0.728 0.140 0.132
#> SRR1700198 2 0.762 0.409758 0.272 0.648 0.080
#> SRR1700199 2 0.763 0.515683 0.232 0.668 0.100
#> SRR1700200 2 0.589 0.557082 0.104 0.796 0.100
#> SRR1700201 2 0.785 0.429436 0.248 0.648 0.104
#> SRR1700202 1 0.851 0.082893 0.512 0.392 0.096
#> SRR1700203 2 0.429 0.455184 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700204 2 0.778 0.521649 0.168 0.676 0.156
#> SRR1700206 2 0.899 0.338934 0.216 0.564 0.220
#> SRR1700207 2 0.757 0.496118 0.184 0.688 0.128
#> SRR1700208 1 0.902 0.611372 0.556 0.252 0.192
#> SRR1700205 2 0.507 0.454739 0.196 0.792 0.012
#> SRR1700209 2 0.802 0.485126 0.184 0.656 0.160
#> SRR1700210 2 0.547 0.499244 0.168 0.796 0.036
#> SRR1700211 2 0.446 0.553876 0.080 0.864 0.056
#> SRR1700212 2 0.357 0.495848 0.120 0.876 0.004
#> SRR1700213 2 0.821 0.472054 0.192 0.640 0.168
#> SRR1700214 2 0.746 0.445201 0.244 0.672 0.084
#> SRR1700215 1 0.630 0.793604 0.772 0.132 0.096
#> SRR1700217 2 0.787 0.462433 0.216 0.660 0.124
#> SRR1700216 1 0.429 0.683913 0.872 0.060 0.068
#> SRR1700218 2 0.869 0.392524 0.232 0.592 0.176
#> SRR1700219 2 0.767 0.498337 0.164 0.684 0.152
#> SRR1700222 1 0.740 0.776096 0.704 0.144 0.152
#> SRR1700220 2 0.804 0.503779 0.128 0.644 0.228
#> SRR1700221 2 0.718 0.416320 0.268 0.672 0.060
#> SRR1700223 2 0.779 0.516511 0.192 0.672 0.136
#> SRR1700224 2 0.624 0.583675 0.072 0.768 0.160
#> SRR1700226 2 0.817 0.496986 0.236 0.632 0.132
#> SRR1700229 2 0.585 0.485688 0.172 0.780 0.048
#> SRR1700225 2 0.901 0.441241 0.296 0.540 0.164
#> SRR1700227 2 0.397 0.525654 0.088 0.880 0.032
#> SRR1700230 1 0.697 0.788245 0.732 0.148 0.120
#> SRR1700231 2 0.473 0.545281 0.088 0.852 0.060
#> SRR1700228 2 0.386 0.534372 0.072 0.888 0.040
#> SRR1700232 2 0.819 0.495938 0.244 0.628 0.128
#> SRR1700233 2 0.817 0.462424 0.212 0.640 0.148
#> SRR1700234 2 0.778 0.458666 0.220 0.664 0.116
#> SRR1700235 2 0.962 0.064114 0.204 0.416 0.380
#> SRR1700237 2 0.682 0.534015 0.152 0.740 0.108
#> SRR1700236 2 0.318 0.530426 0.064 0.912 0.024
#> SRR1700238 2 0.753 0.433793 0.252 0.664 0.084
#> SRR1700239 1 0.739 0.771992 0.704 0.140 0.156
#> SRR1700240 1 0.456 0.659240 0.860 0.080 0.060
#> SRR1700241 3 0.853 0.449931 0.188 0.200 0.612
#> SRR1700243 2 0.753 0.478945 0.208 0.684 0.108
#> SRR1700244 2 0.751 0.505454 0.184 0.692 0.124
#> SRR1700242 1 0.870 0.549752 0.568 0.292 0.140
#> SRR1700246 2 0.557 0.477969 0.184 0.784 0.032
#> SRR1700245 2 0.280 0.529882 0.060 0.924 0.016
#> SRR1700247 1 0.840 0.305021 0.592 0.288 0.120
#> SRR1700249 1 0.636 0.792007 0.768 0.136 0.096
#> SRR1700250 2 0.318 0.510644 0.076 0.908 0.016
#> SRR1700248 2 0.753 0.434453 0.252 0.664 0.084
#> SRR1700251 2 0.800 0.495388 0.236 0.644 0.120
#> SRR1700252 2 0.986 0.014379 0.280 0.416 0.304
#> SRR1700253 2 0.512 0.580025 0.060 0.832 0.108
#> SRR1700256 2 0.304 0.551169 0.044 0.920 0.036
#> SRR1700254 1 0.542 0.678487 0.820 0.080 0.100
#> SRR1700255 2 0.754 0.470752 0.216 0.680 0.104
#> SRR1700257 2 0.764 0.441529 0.240 0.664 0.096
#> SRR1700258 2 0.728 0.521776 0.152 0.712 0.136
#> SRR1700259 2 0.802 0.507282 0.160 0.656 0.184
#> SRR1700260 2 0.587 0.541592 0.088 0.796 0.116
#> SRR1700261 2 0.726 0.419171 0.032 0.568 0.400
#> SRR1700262 2 0.653 0.562057 0.068 0.744 0.188
#> SRR1700263 2 0.657 0.450623 0.172 0.748 0.080
#> SRR1700264 2 0.770 0.512828 0.180 0.680 0.140
#> SRR1700265 2 0.701 0.396328 0.092 0.720 0.188
#> SRR1700266 2 0.484 0.569014 0.076 0.848 0.076
#> SRR1700268 3 0.980 0.125978 0.268 0.300 0.432
#> SRR1700270 2 0.776 0.486482 0.180 0.676 0.144
#> SRR1700267 2 0.722 0.523670 0.132 0.716 0.152
#> SRR1700271 2 0.733 0.531620 0.116 0.704 0.180
#> SRR1700272 2 0.428 0.546995 0.020 0.856 0.124
#> SRR1700273 2 0.774 0.507142 0.216 0.668 0.116
#> SRR1700274 2 0.861 0.510232 0.160 0.596 0.244
#> SRR1700277 3 0.901 0.387948 0.256 0.188 0.556
#> SRR1700275 2 0.672 0.480922 0.016 0.604 0.380
#> SRR1700276 2 0.616 0.550083 0.016 0.696 0.288
#> SRR1700278 2 0.851 0.436154 0.116 0.568 0.316
#> SRR1700279 2 0.378 0.526295 0.044 0.892 0.064
#> SRR1700280 2 0.266 0.549804 0.024 0.932 0.044
#> SRR1700281 2 0.438 0.538174 0.072 0.868 0.060
#> SRR1700283 2 0.675 0.443288 0.168 0.740 0.092
#> SRR1700282 3 0.846 0.500985 0.156 0.232 0.612
#> SRR1700284 2 0.689 0.358887 0.016 0.552 0.432
#> SRR1700285 2 0.784 0.339992 0.056 0.536 0.408
#> SRR1700286 2 0.800 0.546120 0.148 0.656 0.196
#> SRR1700287 2 0.870 0.476346 0.136 0.564 0.300
#> SRR1700290 3 0.776 0.571662 0.144 0.180 0.676
#> SRR1700289 2 0.681 0.440504 0.172 0.736 0.092
#> SRR1700288 2 0.791 0.495238 0.148 0.664 0.188
#> SRR1700292 2 0.556 0.449016 0.152 0.800 0.048
#> SRR1700291 3 0.255 0.638997 0.012 0.056 0.932
#> SRR1700293 3 0.863 0.254455 0.116 0.340 0.544
#> SRR1700294 2 0.787 0.486748 0.152 0.668 0.180
#> SRR1700295 3 0.385 0.639122 0.016 0.108 0.876
#> SRR1700297 2 0.773 0.499982 0.132 0.676 0.192
#> SRR1700296 2 0.479 0.531644 0.044 0.844 0.112
#> SRR1700298 3 0.553 0.616262 0.036 0.172 0.792
#> SRR1700299 2 0.960 -0.316727 0.200 0.400 0.400
#> SRR1700300 3 0.959 0.333566 0.200 0.376 0.424
#> SRR1700302 2 0.697 0.402701 0.020 0.564 0.416
#> SRR1700301 2 0.782 0.509437 0.072 0.604 0.324
#> SRR1700303 2 0.688 0.457754 0.020 0.592 0.388
#> SRR1700304 2 0.686 0.529774 0.052 0.696 0.252
#> SRR1700305 2 0.696 0.424055 0.020 0.568 0.412
#> SRR1700306 3 0.806 0.529767 0.192 0.156 0.652
#> SRR1700308 2 0.967 -0.169650 0.224 0.440 0.336
#> SRR1700307 3 0.687 0.611460 0.048 0.264 0.688
#> SRR1700309 3 0.992 0.332920 0.276 0.344 0.380
#> SRR1700310 2 0.651 0.495334 0.012 0.624 0.364
#> SRR1700311 3 0.826 0.425144 0.116 0.276 0.608
#> SRR1700312 3 0.586 0.569100 0.020 0.240 0.740
#> SRR1700313 3 0.503 0.642526 0.040 0.132 0.828
#> SRR1700314 3 0.715 0.563782 0.060 0.264 0.676
#> SRR1700315 3 0.864 0.517792 0.212 0.188 0.600
#> SRR1700316 3 0.826 0.512578 0.120 0.268 0.612
#> SRR1700317 2 0.708 0.534785 0.044 0.652 0.304
#> SRR1700318 2 0.614 0.534944 0.012 0.684 0.304
#> SRR1700319 3 0.321 0.639327 0.028 0.060 0.912
#> SRR1700320 2 0.688 0.455688 0.020 0.592 0.388
#> SRR1700322 3 0.930 0.068450 0.192 0.300 0.508
#> SRR1700321 2 0.687 0.391874 0.016 0.560 0.424
#> SRR1700323 3 0.414 0.641070 0.032 0.096 0.872
#> SRR1700324 2 0.678 0.485822 0.020 0.616 0.364
#> SRR1700325 3 0.826 0.050833 0.084 0.372 0.544
#> SRR1700326 3 0.803 0.445788 0.064 0.420 0.516
#> SRR1700327 2 0.767 0.143702 0.044 0.500 0.456
#> SRR1700329 2 0.952 -0.207406 0.196 0.452 0.352
#> SRR1700328 2 0.981 -0.222835 0.252 0.420 0.328
#> SRR1700330 3 0.825 0.496256 0.128 0.252 0.620
#> SRR1700331 2 0.907 0.448858 0.164 0.528 0.308
#> SRR1700332 3 0.692 0.182126 0.016 0.448 0.536
#> SRR1700333 2 0.512 0.587826 0.032 0.816 0.152
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.5897 0.62795 0.036 0.748 0.104 0.112
#> SRR1699875 2 0.4463 0.62193 0.008 0.808 0.040 0.144
#> SRR1699876 2 0.8275 -0.23057 0.016 0.400 0.256 0.328
#> SRR1699877 2 0.7130 0.41846 0.008 0.596 0.196 0.200
#> SRR1699879 2 0.4486 0.62825 0.020 0.784 0.188 0.008
#> SRR1699878 2 0.6355 0.46145 0.036 0.632 0.032 0.300
#> SRR1699880 1 0.6774 0.17320 0.472 0.080 0.444 0.004
#> SRR1699881 3 0.6359 0.38443 0.132 0.220 0.648 0.000
#> SRR1699882 2 0.3993 0.64526 0.004 0.844 0.060 0.092
#> SRR1699883 2 0.7185 0.34098 0.036 0.520 0.060 0.384
#> SRR1699884 2 0.4793 0.64098 0.040 0.756 0.204 0.000
#> SRR1699885 2 0.3509 0.62230 0.028 0.872 0.012 0.088
#> SRR1699886 4 0.7956 0.23702 0.012 0.360 0.196 0.432
#> SRR1699888 2 0.7734 0.00669 0.012 0.456 0.372 0.160
#> SRR1699889 3 0.7284 -0.15982 0.016 0.096 0.476 0.412
#> SRR1699890 4 0.6942 0.26132 0.008 0.392 0.088 0.512
#> SRR1699887 2 0.5760 0.43006 0.028 0.596 0.372 0.004
#> SRR1699891 4 0.6864 0.47186 0.004 0.192 0.188 0.616
#> SRR1699892 3 0.4377 0.46990 0.032 0.124 0.824 0.020
#> SRR1699893 3 0.5784 0.42531 0.016 0.076 0.728 0.180
#> SRR1699894 4 0.7219 0.43349 0.004 0.152 0.300 0.544
#> SRR1699895 4 0.6881 0.40771 0.000 0.120 0.340 0.540
#> SRR1699896 3 0.7999 0.25937 0.044 0.308 0.516 0.132
#> SRR1699897 2 0.8160 0.13282 0.076 0.444 0.396 0.084
#> SRR1699898 3 0.5607 0.15964 0.016 0.004 0.560 0.420
#> SRR1699900 4 0.6557 0.40180 0.028 0.056 0.284 0.632
#> SRR1699899 4 0.6373 0.44214 0.012 0.092 0.232 0.664
#> SRR1699902 3 0.5799 0.15915 0.004 0.048 0.656 0.292
#> SRR1699901 4 0.8633 0.07098 0.264 0.032 0.348 0.356
#> SRR1699903 4 0.3933 0.46778 0.004 0.004 0.196 0.796
#> SRR1699904 4 0.8243 0.38551 0.016 0.304 0.260 0.420
#> SRR1699905 4 0.3662 0.45604 0.004 0.012 0.148 0.836
#> SRR1699906 4 0.7215 0.45642 0.008 0.252 0.164 0.576
#> SRR1699907 4 0.4717 0.49316 0.004 0.084 0.112 0.800
#> SRR1699908 4 0.7579 0.33186 0.004 0.176 0.352 0.468
#> SRR1699909 3 0.7221 0.01882 0.016 0.104 0.540 0.340
#> SRR1699910 4 0.5284 0.31967 0.004 0.004 0.436 0.556
#> SRR1699911 4 0.6360 0.46573 0.012 0.076 0.264 0.648
#> SRR1699912 4 0.6451 0.47436 0.004 0.136 0.204 0.656
#> SRR1699913 4 0.6174 0.49098 0.016 0.152 0.124 0.708
#> SRR1699914 3 0.7073 0.40064 0.156 0.064 0.668 0.112
#> SRR1699915 4 0.5016 0.35929 0.004 0.000 0.396 0.600
#> SRR1699916 3 0.7805 -0.03657 0.020 0.148 0.476 0.356
#> SRR1699917 4 0.5560 0.32173 0.004 0.024 0.344 0.628
#> SRR1699918 4 0.5760 0.26789 0.000 0.028 0.448 0.524
#> SRR1699919 3 0.7109 0.05361 0.016 0.108 0.576 0.300
#> SRR1699920 3 0.5130 0.17664 0.000 0.016 0.652 0.332
#> SRR1699921 3 0.7039 -0.10517 0.016 0.080 0.520 0.384
#> SRR1699922 4 0.7413 0.37278 0.016 0.344 0.120 0.520
#> SRR1699923 4 0.6878 0.41509 0.024 0.092 0.260 0.624
#> SRR1699924 3 0.1943 0.50312 0.016 0.008 0.944 0.032
#> SRR1699925 1 0.0927 0.75455 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1699926 4 0.5497 0.35464 0.008 0.012 0.372 0.608
#> SRR1699927 3 0.7371 -0.05099 0.016 0.116 0.524 0.344
#> SRR1699929 4 0.7316 0.27392 0.060 0.040 0.420 0.480
#> SRR1699928 4 0.7425 0.44940 0.012 0.200 0.220 0.568
#> SRR1699930 4 0.6373 0.43783 0.000 0.248 0.116 0.636
#> SRR1699931 3 0.8845 0.04863 0.052 0.320 0.392 0.236
#> SRR1699933 3 0.7098 -0.01453 0.036 0.060 0.552 0.352
#> SRR1699932 2 0.7896 -0.24908 0.000 0.360 0.348 0.292
#> SRR1699934 1 0.0804 0.75314 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1699935 3 0.7010 0.24714 0.012 0.112 0.584 0.292
#> SRR1699936 2 0.7315 0.25277 0.004 0.556 0.232 0.208
#> SRR1699937 2 0.6404 0.52755 0.220 0.644 0.136 0.000
#> SRR1699938 2 0.2675 0.66878 0.048 0.908 0.044 0.000
#> SRR1699940 4 0.8051 0.17058 0.040 0.156 0.284 0.520
#> SRR1699939 2 0.4011 0.67185 0.024 0.844 0.112 0.020
#> SRR1699941 3 0.7820 0.18007 0.296 0.172 0.512 0.020
#> SRR1699942 4 0.6956 -0.16406 0.016 0.456 0.068 0.460
#> SRR1699943 2 0.2307 0.65858 0.048 0.928 0.016 0.008
#> SRR1699944 2 0.2847 0.68070 0.016 0.896 0.084 0.004
#> SRR1699945 1 0.6071 0.44141 0.600 0.048 0.348 0.004
#> SRR1699946 2 0.5527 0.64080 0.052 0.748 0.176 0.024
#> SRR1699947 2 0.5335 0.59139 0.036 0.772 0.044 0.148
#> SRR1699948 2 0.3144 0.67465 0.044 0.884 0.072 0.000
#> SRR1699949 2 0.5591 0.55721 0.004 0.732 0.168 0.096
#> SRR1699950 2 0.4726 0.66565 0.048 0.784 0.164 0.004
#> SRR1699951 3 0.7423 0.14187 0.060 0.364 0.524 0.052
#> SRR1699952 2 0.8561 0.47358 0.112 0.528 0.228 0.132
#> SRR1699953 2 0.3725 0.64025 0.008 0.812 0.180 0.000
#> SRR1699954 2 0.8113 0.32712 0.232 0.476 0.272 0.020
#> SRR1699955 2 0.4419 0.66967 0.040 0.840 0.056 0.064
#> SRR1699956 3 0.6912 -0.11929 0.428 0.092 0.476 0.004
#> SRR1699957 2 0.5690 0.61935 0.096 0.708 0.196 0.000
#> SRR1699959 3 0.6412 0.45134 0.064 0.168 0.708 0.060
#> SRR1699958 4 0.5161 -0.09532 0.000 0.004 0.476 0.520
#> SRR1699960 2 0.7739 0.23027 0.024 0.524 0.304 0.148
#> SRR1699961 3 0.7274 0.24276 0.216 0.172 0.596 0.016
#> SRR1699962 2 0.4374 0.67492 0.068 0.812 0.120 0.000
#> SRR1699963 3 0.7794 0.08923 0.028 0.148 0.528 0.296
#> SRR1699964 3 0.8587 -0.09204 0.040 0.260 0.440 0.260
#> SRR1699965 2 0.3999 0.65612 0.036 0.824 0.140 0.000
#> SRR1699966 3 0.6101 0.44445 0.012 0.076 0.684 0.228
#> SRR1699967 2 0.6262 0.57922 0.132 0.660 0.208 0.000
#> SRR1699968 3 0.4477 0.46267 0.016 0.140 0.812 0.032
#> SRR1699969 3 0.2954 0.51201 0.064 0.008 0.900 0.028
#> SRR1699971 2 0.8968 0.06571 0.056 0.364 0.324 0.256
#> SRR1699970 2 0.5118 0.61941 0.012 0.784 0.100 0.104
#> SRR1699972 3 0.8766 0.06053 0.068 0.184 0.448 0.300
#> SRR1699973 4 0.7651 -0.07820 0.012 0.148 0.380 0.460
#> SRR1699974 1 0.6290 0.40890 0.568 0.068 0.364 0.000
#> SRR1699975 4 0.4632 0.39209 0.004 0.000 0.308 0.688
#> SRR1699976 3 0.7569 0.10342 0.196 0.300 0.500 0.004
#> SRR1699977 3 0.7675 -0.01577 0.040 0.096 0.512 0.352
#> SRR1699978 3 0.8802 0.19025 0.292 0.048 0.404 0.256
#> SRR1699979 3 0.3432 0.50864 0.036 0.060 0.884 0.020
#> SRR1699980 4 0.7100 0.27894 0.016 0.084 0.388 0.512
#> SRR1699981 3 0.4916 0.10810 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1699982 4 0.6861 0.46849 0.004 0.180 0.200 0.616
#> SRR1699983 4 0.6981 0.45486 0.004 0.236 0.164 0.596
#> SRR1699984 1 0.0804 0.75314 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1699985 3 0.7747 -0.12371 0.008 0.192 0.476 0.324
#> SRR1699986 3 0.9039 -0.09642 0.264 0.060 0.352 0.324
#> SRR1699988 4 0.7297 0.38846 0.008 0.260 0.168 0.564
#> SRR1699987 3 0.2872 0.50888 0.012 0.008 0.896 0.084
#> SRR1699989 4 0.6102 0.23834 0.012 0.024 0.472 0.492
#> SRR1699990 3 0.1690 0.50195 0.008 0.032 0.952 0.008
#> SRR1699992 2 0.7782 0.05140 0.244 0.396 0.360 0.000
#> SRR1699991 3 0.1297 0.50138 0.020 0.016 0.964 0.000
#> SRR1699993 3 0.6317 0.32298 0.080 0.020 0.680 0.220
#> SRR1699994 3 0.6227 0.22170 0.284 0.076 0.636 0.004
#> SRR1699995 3 0.7293 0.14501 0.388 0.032 0.508 0.072
#> SRR1699996 4 0.8949 0.24067 0.064 0.288 0.236 0.412
#> SRR1699997 3 0.5132 0.13720 0.000 0.004 0.548 0.448
#> SRR1699998 4 0.7755 0.32164 0.036 0.220 0.172 0.572
#> SRR1699999 1 0.3812 0.69796 0.832 0.028 0.140 0.000
#> SRR1700000 4 0.7574 0.18695 0.036 0.108 0.304 0.552
#> SRR1700002 3 0.7061 0.36300 0.060 0.244 0.632 0.064
#> SRR1700001 3 0.7251 0.35913 0.096 0.128 0.664 0.112
#> SRR1700003 4 0.6994 -0.05072 0.012 0.080 0.420 0.488
#> SRR1700004 3 0.3648 0.48425 0.076 0.056 0.864 0.004
#> SRR1700005 1 0.2737 0.69232 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1700006 3 0.2917 0.49063 0.008 0.040 0.904 0.048
#> SRR1700007 4 0.7481 0.45104 0.012 0.260 0.176 0.552
#> SRR1700008 3 0.5067 0.45944 0.004 0.036 0.736 0.224
#> SRR1700009 1 0.1584 0.75589 0.952 0.012 0.036 0.000
#> SRR1700010 1 0.6127 0.45491 0.600 0.052 0.344 0.004
#> SRR1700011 2 0.7524 0.29351 0.016 0.564 0.228 0.192
#> SRR1700013 3 0.7542 0.37298 0.124 0.236 0.596 0.044
#> SRR1700012 4 0.6993 0.14922 0.020 0.064 0.456 0.460
#> SRR1700014 3 0.1297 0.50177 0.020 0.016 0.964 0.000
#> SRR1700015 3 0.6941 0.33275 0.172 0.188 0.628 0.012
#> SRR1700016 3 0.7634 0.06726 0.152 0.020 0.536 0.292
#> SRR1700018 3 0.3841 0.50251 0.032 0.048 0.868 0.052
#> SRR1700017 3 0.5565 0.43717 0.112 0.124 0.752 0.012
#> SRR1700019 3 0.6612 -0.07412 0.012 0.448 0.488 0.052
#> SRR1700020 3 0.3972 0.48281 0.016 0.004 0.816 0.164
#> SRR1700021 4 0.6757 0.35733 0.000 0.120 0.308 0.572
#> SRR1700023 3 0.3001 0.49435 0.036 0.064 0.896 0.004
#> SRR1700022 3 0.5711 0.48832 0.068 0.064 0.768 0.100
#> SRR1700024 4 0.6449 0.29238 0.008 0.056 0.380 0.556
#> SRR1700025 3 0.7640 0.10331 0.220 0.252 0.520 0.008
#> SRR1700026 3 0.5659 0.40540 0.140 0.124 0.732 0.004
#> SRR1700027 3 0.5473 0.42031 0.100 0.152 0.744 0.004
#> SRR1700028 3 0.5147 0.11520 0.000 0.004 0.536 0.460
#> SRR1700029 3 0.2757 0.51246 0.016 0.020 0.912 0.052
#> SRR1700030 4 0.6394 0.30905 0.004 0.060 0.384 0.552
#> SRR1700031 3 0.6025 0.39491 0.228 0.048 0.696 0.028
#> SRR1700032 3 0.6308 0.35346 0.088 0.268 0.640 0.004
#> SRR1700034 1 0.5300 0.53392 0.664 0.028 0.308 0.000
#> SRR1700035 3 0.6813 0.04877 0.016 0.080 0.588 0.316
#> SRR1700033 3 0.5221 0.45173 0.120 0.092 0.776 0.012
#> SRR1700036 3 0.3108 0.49593 0.020 0.064 0.896 0.020
#> SRR1700037 4 0.8288 0.36344 0.016 0.264 0.320 0.400
#> SRR1700038 3 0.7632 -0.18350 0.056 0.064 0.468 0.412
#> SRR1700039 3 0.2660 0.50526 0.072 0.008 0.908 0.012
#> SRR1700040 3 0.2594 0.51132 0.044 0.004 0.916 0.036
#> SRR1700041 3 0.2392 0.50955 0.016 0.008 0.924 0.052
#> SRR1700042 3 0.2353 0.50171 0.040 0.024 0.928 0.008
#> SRR1700043 3 0.6533 0.40259 0.060 0.116 0.712 0.112
#> SRR1700045 3 0.3954 0.50705 0.020 0.040 0.856 0.084
#> SRR1700044 3 0.7479 -0.03118 0.008 0.144 0.484 0.364
#> SRR1700046 3 0.2627 0.49567 0.020 0.036 0.920 0.024
#> SRR1700047 3 0.3734 0.50218 0.116 0.020 0.852 0.012
#> SRR1700048 3 0.5833 0.12322 0.016 0.024 0.636 0.324
#> SRR1700049 3 0.5064 0.43946 0.208 0.036 0.748 0.008
#> SRR1700050 3 0.6229 0.14387 0.036 0.008 0.492 0.464
#> SRR1700051 3 0.6498 0.12555 0.056 0.020 0.616 0.308
#> SRR1700052 3 0.5954 0.43782 0.120 0.084 0.748 0.048
#> SRR1700053 3 0.5803 0.26670 0.012 0.064 0.708 0.216
#> SRR1700054 3 0.1762 0.50032 0.020 0.016 0.952 0.012
#> SRR1700055 1 0.2111 0.75312 0.932 0.024 0.044 0.000
#> SRR1700056 3 0.3027 0.50711 0.020 0.004 0.888 0.088
#> SRR1700057 3 0.2704 0.49494 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700058 3 0.3932 0.46489 0.128 0.032 0.836 0.004
#> SRR1700059 3 0.3726 0.45884 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700060 3 0.4007 0.48738 0.068 0.056 0.856 0.020
#> SRR1700061 3 0.1247 0.50142 0.016 0.012 0.968 0.004
#> SRR1700062 3 0.3950 0.47064 0.004 0.008 0.804 0.184
#> SRR1700063 3 0.1707 0.50569 0.020 0.004 0.952 0.024
#> SRR1700064 4 0.5912 0.28110 0.012 0.016 0.464 0.508
#> SRR1700065 4 0.6614 0.15191 0.052 0.012 0.452 0.484
#> SRR1700066 3 0.5083 0.45815 0.088 0.080 0.800 0.032
#> SRR1700067 4 0.5712 0.37733 0.000 0.032 0.384 0.584
#> SRR1700068 3 0.1489 0.50404 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1700069 3 0.3200 0.46290 0.004 0.024 0.880 0.092
#> SRR1700070 3 0.4603 0.45351 0.012 0.160 0.796 0.032
#> SRR1700071 3 0.2467 0.49901 0.024 0.052 0.920 0.004
#> SRR1700072 4 0.6463 0.27829 0.028 0.024 0.448 0.500
#> SRR1700073 4 0.6194 0.30721 0.008 0.036 0.428 0.528
#> SRR1700075 3 0.6204 0.29590 0.060 0.032 0.696 0.212
#> SRR1700074 3 0.4932 0.45974 0.104 0.096 0.792 0.008
#> SRR1700076 3 0.7418 0.28722 0.152 0.268 0.564 0.016
#> SRR1700077 3 0.6363 0.37012 0.144 0.184 0.668 0.004
#> SRR1700078 3 0.1917 0.49468 0.008 0.012 0.944 0.036
#> SRR1700080 3 0.1124 0.49938 0.012 0.012 0.972 0.004
#> SRR1700079 3 0.4792 0.15363 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR1700081 1 0.6766 0.22212 0.484 0.080 0.432 0.004
#> SRR1700082 3 0.7046 0.11974 0.048 0.056 0.596 0.300
#> SRR1700083 3 0.2790 0.47966 0.012 0.012 0.904 0.072
#> SRR1700084 3 0.4130 0.47260 0.136 0.036 0.824 0.004
#> SRR1700085 3 0.5742 0.26774 0.004 0.076 0.704 0.216
#> SRR1700086 3 0.6671 0.01181 0.012 0.064 0.552 0.372
#> SRR1700087 4 0.5088 0.17825 0.004 0.020 0.276 0.700
#> SRR1700088 3 0.7229 0.34025 0.036 0.296 0.584 0.084
#> SRR1700089 3 0.8034 0.32871 0.068 0.096 0.516 0.320
#> SRR1700091 3 0.5906 0.47338 0.024 0.064 0.720 0.192
#> SRR1700090 3 0.4624 0.38508 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700092 3 0.6410 0.47082 0.024 0.192 0.688 0.096
#> SRR1700094 3 0.4254 0.51516 0.024 0.040 0.840 0.096
#> SRR1700093 3 0.3801 0.45212 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700095 3 0.4153 0.46284 0.004 0.008 0.784 0.204
#> SRR1700096 3 0.4527 0.46696 0.020 0.008 0.780 0.192
#> SRR1700097 3 0.5189 0.30401 0.000 0.012 0.616 0.372
#> SRR1700098 3 0.6834 0.44055 0.028 0.232 0.644 0.096
#> SRR1700099 3 0.4522 0.43724 0.004 0.004 0.728 0.264
#> SRR1700100 4 0.4998 -0.10099 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700101 3 0.5881 0.47428 0.020 0.064 0.716 0.200
#> SRR1700102 3 0.6607 0.21463 0.000 0.088 0.536 0.376
#> SRR1700104 3 0.4201 0.46285 0.012 0.004 0.788 0.196
#> SRR1700103 3 0.4247 0.50025 0.016 0.036 0.832 0.116
#> SRR1700105 3 0.5896 0.28609 0.004 0.032 0.576 0.388
#> SRR1700106 4 0.4483 0.25971 0.000 0.004 0.284 0.712
#> SRR1700107 4 0.5296 -0.12587 0.000 0.008 0.492 0.500
#> SRR1700108 3 0.6471 0.22732 0.000 0.072 0.512 0.416
#> SRR1700109 4 0.7901 0.31479 0.016 0.344 0.176 0.464
#> SRR1700110 3 0.8059 0.15317 0.008 0.352 0.396 0.244
#> SRR1700112 3 0.6192 0.17478 0.000 0.052 0.512 0.436
#> SRR1700111 4 0.3208 0.47927 0.004 0.000 0.148 0.848
#> SRR1700113 3 0.6915 0.11263 0.000 0.108 0.476 0.416
#> SRR1700114 3 0.3751 0.45956 0.004 0.000 0.800 0.196
#> SRR1700115 3 0.4509 0.41680 0.000 0.004 0.708 0.288
#> SRR1700116 4 0.5478 0.29647 0.016 0.048 0.200 0.736
#> SRR1700117 4 0.4814 0.22107 0.008 0.000 0.316 0.676
#> SRR1700119 3 0.4250 0.42510 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1700118 4 0.2958 0.39449 0.004 0.004 0.116 0.876
#> SRR1700120 3 0.6594 0.33153 0.016 0.052 0.556 0.376
#> SRR1700121 3 0.6183 0.42778 0.016 0.060 0.664 0.260
#> SRR1700122 4 0.3754 0.48867 0.004 0.048 0.092 0.856
#> SRR1700123 3 0.4624 0.36024 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700125 4 0.7545 -0.04250 0.016 0.124 0.384 0.476
#> SRR1700126 3 0.6941 0.48510 0.076 0.080 0.676 0.168
#> SRR1700127 3 0.4799 0.41908 0.008 0.004 0.704 0.284
#> SRR1700124 3 0.4313 0.43753 0.000 0.004 0.736 0.260
#> SRR1700128 4 0.4948 0.10373 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700129 4 0.3974 0.41804 0.016 0.060 0.068 0.856
#> SRR1700130 4 0.0779 0.44310 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR1700132 4 0.4634 0.27296 0.004 0.004 0.280 0.712
#> SRR1700131 3 0.3958 0.47652 0.024 0.000 0.816 0.160
#> SRR1700133 3 0.6506 0.14559 0.008 0.052 0.480 0.460
#> SRR1700134 3 0.5597 0.17271 0.000 0.020 0.516 0.464
#> SRR1700135 4 0.4828 0.30322 0.008 0.008 0.268 0.716
#> SRR1700136 3 0.3801 0.45226 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700137 3 0.4898 0.26323 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700138 3 0.5105 0.23803 0.000 0.004 0.564 0.432
#> SRR1700140 4 0.4989 -0.10280 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700139 4 0.4193 0.23718 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700141 4 0.6133 0.35098 0.016 0.128 0.144 0.712
#> SRR1700142 3 0.5893 0.14632 0.016 0.012 0.528 0.444
#> SRR1700143 3 0.4134 0.43580 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700144 3 0.5572 0.15881 0.024 0.012 0.668 0.296
#> SRR1700145 4 0.4401 0.23373 0.004 0.000 0.272 0.724
#> SRR1700146 3 0.6130 0.19258 0.000 0.048 0.512 0.440
#> SRR1700147 4 0.6903 0.05817 0.016 0.068 0.400 0.516
#> SRR1700149 4 0.4761 0.07215 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700148 3 0.4741 0.31393 0.000 0.004 0.668 0.328
#> SRR1700150 4 0.4511 0.28104 0.000 0.008 0.268 0.724
#> SRR1700152 4 0.4374 0.29125 0.004 0.008 0.228 0.760
#> SRR1700151 3 0.4103 0.43722 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1700153 4 0.4804 0.06446 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700154 3 0.4964 0.31700 0.000 0.004 0.616 0.380
#> SRR1700155 4 0.7057 -0.11060 0.016 0.076 0.436 0.472
#> SRR1700156 3 0.4018 0.45531 0.000 0.004 0.772 0.224
#> SRR1700158 3 0.5112 0.36441 0.004 0.008 0.648 0.340
#> SRR1700159 4 0.7614 -0.03875 0.016 0.132 0.380 0.472
#> SRR1700157 4 0.5120 0.35566 0.044 0.008 0.196 0.752
#> SRR1700160 3 0.4584 0.40786 0.000 0.004 0.696 0.300
#> SRR1700161 3 0.4304 0.42014 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1700162 4 0.7365 -0.06870 0.016 0.104 0.404 0.476
#> SRR1700164 4 0.5039 0.02060 0.000 0.004 0.404 0.592
#> SRR1700163 3 0.5112 0.23023 0.000 0.004 0.560 0.436
#> SRR1700165 3 0.4255 0.46449 0.008 0.008 0.784 0.200
#> SRR1700166 3 0.6024 0.21972 0.000 0.044 0.540 0.416
#> SRR1700168 4 0.4522 0.28604 0.004 0.004 0.264 0.728
#> SRR1700167 4 0.5163 -0.09271 0.000 0.004 0.480 0.516
#> SRR1700170 4 0.3930 0.41561 0.016 0.044 0.084 0.856
#> SRR1700169 3 0.3528 0.47195 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700171 4 0.6378 0.02374 0.012 0.044 0.388 0.556
#> SRR1700172 3 0.4991 0.30585 0.000 0.004 0.608 0.388
#> SRR1700174 3 0.4744 0.42483 0.000 0.012 0.704 0.284
#> SRR1700173 3 0.4585 0.37636 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1700175 3 0.5016 0.22651 0.000 0.004 0.600 0.396
#> SRR1700176 4 0.5919 -0.15115 0.016 0.012 0.484 0.488
#> SRR1700178 2 0.3978 0.60643 0.192 0.796 0.012 0.000
#> SRR1700177 4 0.4916 -0.00027 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700180 2 0.1590 0.65931 0.008 0.956 0.008 0.028
#> SRR1700179 2 0.3764 0.61824 0.172 0.816 0.012 0.000
#> SRR1700181 2 0.4198 0.57827 0.224 0.768 0.004 0.004
#> SRR1700183 1 0.0927 0.75455 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700182 2 0.4175 0.59072 0.212 0.776 0.012 0.000
#> SRR1700184 2 0.3142 0.63823 0.132 0.860 0.008 0.000
#> SRR1700186 2 0.4375 0.63769 0.156 0.808 0.020 0.016
#> SRR1700187 1 0.1706 0.75267 0.948 0.036 0.016 0.000
#> SRR1700185 1 0.0927 0.75455 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700188 2 0.2988 0.64820 0.112 0.876 0.012 0.000
#> SRR1700192 1 0.6048 0.24066 0.588 0.368 0.036 0.008
#> SRR1700190 1 0.6674 0.49010 0.584 0.096 0.316 0.004
#> SRR1700191 1 0.2197 0.71065 0.916 0.004 0.000 0.080
#> SRR1700189 1 0.4599 0.60337 0.780 0.184 0.032 0.004
#> SRR1700193 2 0.3831 0.59236 0.204 0.792 0.004 0.000
#> SRR1700195 2 0.2363 0.63701 0.024 0.920 0.000 0.056
#> SRR1700194 1 0.1284 0.75352 0.964 0.012 0.024 0.000
#> SRR1700196 2 0.3217 0.64103 0.128 0.860 0.012 0.000
#> SRR1700197 1 0.2982 0.74051 0.896 0.032 0.068 0.004
#> SRR1700198 2 0.3751 0.59904 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1700199 2 0.4025 0.58645 0.036 0.832 0.004 0.128
#> SRR1700200 2 0.1339 0.65840 0.024 0.964 0.008 0.004
#> SRR1700201 2 0.4353 0.57357 0.232 0.756 0.012 0.000
#> SRR1700202 2 0.8203 0.21483 0.372 0.456 0.056 0.116
#> SRR1700203 2 0.5083 0.52043 0.036 0.716 0.000 0.248
#> SRR1700204 2 0.6525 0.59795 0.120 0.672 0.192 0.016
#> SRR1700206 2 0.6124 0.56011 0.228 0.692 0.036 0.044
#> SRR1700207 2 0.4701 0.62648 0.164 0.780 0.056 0.000
#> SRR1700208 1 0.6174 0.08144 0.540 0.416 0.036 0.008
#> SRR1700205 2 0.5926 0.45456 0.028 0.648 0.020 0.304
#> SRR1700209 2 0.3691 0.67066 0.076 0.856 0.068 0.000
#> SRR1700210 2 0.5400 0.51849 0.036 0.708 0.008 0.248
#> SRR1700211 2 0.2099 0.66152 0.012 0.936 0.008 0.044
#> SRR1700212 2 0.3972 0.60866 0.016 0.824 0.008 0.152
#> SRR1700213 2 0.6462 0.58757 0.140 0.656 0.200 0.004
#> SRR1700214 2 0.3808 0.62320 0.176 0.812 0.012 0.000
#> SRR1700215 1 0.1297 0.75699 0.964 0.016 0.020 0.000
#> SRR1700217 2 0.4059 0.65606 0.124 0.832 0.040 0.004
#> SRR1700216 1 0.2469 0.68920 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1700218 2 0.5235 0.56672 0.236 0.716 0.048 0.000
#> SRR1700219 2 0.5361 0.61733 0.148 0.744 0.108 0.000
#> SRR1700222 1 0.1584 0.75339 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1700220 2 0.4888 0.64341 0.072 0.784 0.140 0.004
#> SRR1700221 2 0.3908 0.58686 0.212 0.784 0.004 0.000
#> SRR1700223 2 0.3852 0.66807 0.048 0.868 0.036 0.048
#> SRR1700224 2 0.7601 0.39384 0.028 0.564 0.264 0.144
#> SRR1700226 2 0.5027 0.64215 0.052 0.804 0.044 0.100
#> SRR1700229 2 0.7361 0.39256 0.036 0.584 0.100 0.280
#> SRR1700225 2 0.8370 0.52929 0.120 0.564 0.152 0.164
#> SRR1700227 2 0.1821 0.66124 0.008 0.948 0.012 0.032
#> SRR1700230 1 0.2032 0.75144 0.936 0.036 0.028 0.000
#> SRR1700231 2 0.3017 0.66764 0.044 0.904 0.028 0.024
#> SRR1700228 2 0.3720 0.65555 0.016 0.860 0.024 0.100
#> SRR1700232 2 0.5319 0.64706 0.096 0.788 0.040 0.076
#> SRR1700233 2 0.5309 0.62481 0.164 0.756 0.072 0.008
#> SRR1700234 2 0.4399 0.59434 0.212 0.768 0.020 0.000
#> SRR1700235 2 0.7319 0.37140 0.224 0.556 0.216 0.004
#> SRR1700237 2 0.1796 0.67616 0.016 0.948 0.032 0.004
#> SRR1700236 2 0.3765 0.63328 0.004 0.848 0.032 0.116
#> SRR1700238 2 0.3908 0.59228 0.212 0.784 0.004 0.000
#> SRR1700239 1 0.1624 0.75678 0.952 0.028 0.020 0.000
#> SRR1700240 1 0.3447 0.66833 0.852 0.000 0.020 0.128
#> SRR1700241 3 0.9433 0.11490 0.100 0.252 0.332 0.316
#> SRR1700243 2 0.2973 0.65476 0.096 0.884 0.020 0.000
#> SRR1700244 2 0.3247 0.67521 0.060 0.880 0.060 0.000
#> SRR1700242 1 0.5821 0.07297 0.536 0.432 0.032 0.000
#> SRR1700246 2 0.5856 0.48591 0.036 0.668 0.016 0.280
#> SRR1700245 2 0.1888 0.65947 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1700247 1 0.6605 0.32593 0.556 0.008 0.068 0.368
#> SRR1700249 1 0.1406 0.75580 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR1700250 2 0.3771 0.65276 0.048 0.868 0.020 0.064
#> SRR1700248 2 0.4095 0.60852 0.192 0.792 0.016 0.000
#> SRR1700251 2 0.4378 0.64694 0.072 0.836 0.020 0.072
#> SRR1700252 2 0.7230 0.42527 0.308 0.548 0.136 0.008
#> SRR1700253 2 0.2871 0.66993 0.000 0.896 0.072 0.032
#> SRR1700256 2 0.3222 0.65567 0.004 0.884 0.036 0.076
#> SRR1700254 1 0.4425 0.65439 0.800 0.036 0.004 0.160
#> SRR1700255 2 0.3636 0.62433 0.172 0.820 0.008 0.000
#> SRR1700257 2 0.4328 0.56386 0.244 0.748 0.008 0.000
#> SRR1700258 2 0.3726 0.67716 0.060 0.864 0.068 0.008
#> SRR1700259 2 0.6077 0.59291 0.076 0.660 0.260 0.004
#> SRR1700260 2 0.7153 0.18091 0.008 0.520 0.112 0.360
#> SRR1700261 3 0.6564 0.10093 0.000 0.380 0.536 0.084
#> SRR1700262 4 0.6891 0.39419 0.008 0.324 0.100 0.568
#> SRR1700263 4 0.6938 0.00582 0.000 0.400 0.112 0.488
#> SRR1700264 2 0.5883 0.60403 0.128 0.700 0.172 0.000
#> SRR1700265 2 0.8302 0.40125 0.048 0.516 0.228 0.208
#> SRR1700266 2 0.4522 0.66428 0.020 0.824 0.104 0.052
#> SRR1700268 2 0.8621 0.33169 0.268 0.496 0.152 0.084
#> SRR1700270 2 0.4542 0.66283 0.088 0.804 0.108 0.000
#> SRR1700267 2 0.4331 0.66465 0.028 0.800 0.168 0.004
#> SRR1700271 2 0.4546 0.64443 0.028 0.780 0.188 0.004
#> SRR1700272 2 0.7019 0.32406 0.004 0.596 0.184 0.216
#> SRR1700273 2 0.5551 0.64776 0.132 0.768 0.048 0.052
#> SRR1700274 3 0.8072 -0.21046 0.004 0.324 0.356 0.316
#> SRR1700277 3 0.8908 -0.04860 0.292 0.224 0.420 0.064
#> SRR1700275 2 0.7660 -0.07918 0.000 0.428 0.356 0.216
#> SRR1700276 2 0.7921 0.10973 0.016 0.500 0.260 0.224
#> SRR1700278 2 0.8575 0.07116 0.044 0.452 0.276 0.228
#> SRR1700279 4 0.7355 0.32166 0.012 0.380 0.116 0.492
#> SRR1700280 2 0.5750 0.39393 0.004 0.672 0.052 0.272
#> SRR1700281 2 0.5971 0.59783 0.024 0.728 0.160 0.088
#> SRR1700283 4 0.6546 0.47122 0.000 0.192 0.172 0.636
#> SRR1700282 3 0.8690 0.14927 0.044 0.296 0.420 0.240
#> SRR1700284 3 0.7963 -0.00337 0.016 0.180 0.440 0.364
#> SRR1700285 3 0.8337 0.02954 0.020 0.312 0.412 0.256
#> SRR1700286 2 0.7454 0.45938 0.032 0.584 0.260 0.124
#> SRR1700287 4 0.6461 0.36567 0.000 0.144 0.216 0.640
#> SRR1700290 3 0.6645 0.33281 0.080 0.044 0.680 0.196
#> SRR1700289 4 0.5722 0.49182 0.000 0.148 0.136 0.716
#> SRR1700288 2 0.5071 0.62798 0.036 0.764 0.184 0.016
#> SRR1700292 4 0.5717 0.25681 0.004 0.360 0.028 0.608
#> SRR1700291 3 0.5318 0.26544 0.004 0.012 0.624 0.360
#> SRR1700293 2 0.8700 -0.14036 0.036 0.368 0.328 0.268
#> SRR1700294 4 0.5878 0.35760 0.000 0.312 0.056 0.632
#> SRR1700295 3 0.6098 0.15572 0.008 0.036 0.572 0.384
#> SRR1700297 4 0.6140 0.47028 0.004 0.228 0.096 0.672
#> SRR1700296 4 0.7935 0.42858 0.016 0.292 0.204 0.488
#> SRR1700298 4 0.6845 -0.12739 0.000 0.100 0.448 0.452
#> SRR1700299 4 0.4182 0.46960 0.004 0.140 0.036 0.820
#> SRR1700300 4 0.4673 0.47439 0.008 0.012 0.232 0.748
#> SRR1700302 4 0.7661 0.09845 0.016 0.136 0.388 0.460
#> SRR1700301 4 0.8089 0.23282 0.012 0.260 0.284 0.444
#> SRR1700303 3 0.7439 0.04631 0.008 0.164 0.532 0.296
#> SRR1700304 2 0.5473 0.57517 0.012 0.728 0.212 0.048
#> SRR1700305 3 0.7921 -0.00847 0.000 0.328 0.348 0.324
#> SRR1700306 4 0.5677 0.24223 0.004 0.016 0.476 0.504
#> SRR1700308 4 0.6751 0.44861 0.036 0.060 0.276 0.628
#> SRR1700307 3 0.5637 0.44494 0.012 0.040 0.696 0.252
#> SRR1700309 4 0.5701 0.43956 0.172 0.016 0.076 0.736
#> SRR1700310 4 0.7886 0.08036 0.016 0.164 0.396 0.424
#> SRR1700311 4 0.7679 0.24427 0.012 0.164 0.332 0.492
#> SRR1700312 3 0.7426 0.06361 0.016 0.108 0.448 0.428
#> SRR1700313 3 0.5982 0.24380 0.012 0.052 0.668 0.268
#> SRR1700314 3 0.4955 -0.05826 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1700315 4 0.5524 0.32128 0.004 0.012 0.432 0.552
#> SRR1700316 3 0.8535 0.14360 0.032 0.260 0.420 0.288
#> SRR1700317 3 0.7770 -0.17896 0.012 0.164 0.448 0.376
#> SRR1700318 3 0.7811 -0.09841 0.000 0.260 0.404 0.336
#> SRR1700319 3 0.4699 0.19965 0.000 0.004 0.676 0.320
#> SRR1700320 3 0.7099 0.05409 0.000 0.168 0.552 0.280
#> SRR1700322 4 0.5033 0.27086 0.004 0.020 0.268 0.708
#> SRR1700321 3 0.7269 0.06444 0.000 0.180 0.524 0.296
#> SRR1700323 3 0.4635 0.22841 0.000 0.012 0.720 0.268
#> SRR1700324 3 0.7505 0.05923 0.004 0.196 0.516 0.284
#> SRR1700325 3 0.7830 0.22528 0.020 0.352 0.476 0.152
#> SRR1700326 4 0.7286 0.26015 0.004 0.132 0.388 0.476
#> SRR1700327 2 0.7250 0.08603 0.016 0.500 0.388 0.096
#> SRR1700329 4 0.4516 0.46680 0.000 0.012 0.252 0.736
#> SRR1700328 4 0.6466 0.46583 0.064 0.076 0.148 0.712
#> SRR1700330 3 0.8461 0.15608 0.052 0.212 0.496 0.240
#> SRR1700331 4 0.7125 0.35324 0.008 0.116 0.336 0.540
#> SRR1700332 3 0.8012 -0.07838 0.016 0.184 0.404 0.396
#> SRR1700333 2 0.8214 -0.24871 0.012 0.400 0.280 0.308
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.4639 0.69718 0.004 0.760 0.176 0.032 0.028
#> SRR1699875 2 0.5124 0.61132 0.004 0.668 0.260 0.000 0.068
#> SRR1699876 5 0.5948 0.42999 0.000 0.196 0.028 0.124 0.652
#> SRR1699877 2 0.7526 0.37840 0.028 0.500 0.308 0.056 0.108
#> SRR1699879 2 0.5717 0.56125 0.020 0.660 0.012 0.248 0.060
#> SRR1699878 2 0.6245 0.42147 0.004 0.504 0.404 0.032 0.056
#> SRR1699880 1 0.7590 -0.07950 0.380 0.044 0.300 0.276 0.000
#> SRR1699881 4 0.7675 -0.07316 0.092 0.128 0.348 0.428 0.004
#> SRR1699882 2 0.4981 0.67584 0.000 0.744 0.060 0.036 0.160
#> SRR1699883 2 0.7080 0.41294 0.004 0.496 0.332 0.052 0.116
#> SRR1699884 2 0.5282 0.70178 0.032 0.760 0.104 0.076 0.028
#> SRR1699885 2 0.3523 0.70285 0.004 0.832 0.120 0.000 0.044
#> SRR1699886 5 0.7894 0.22370 0.004 0.256 0.248 0.072 0.420
#> SRR1699888 4 0.7126 0.05936 0.004 0.252 0.020 0.476 0.248
#> SRR1699889 5 0.4610 0.55008 0.000 0.008 0.092 0.140 0.760
#> SRR1699890 5 0.5942 0.37571 0.000 0.284 0.116 0.008 0.592
#> SRR1699887 2 0.7866 0.32858 0.028 0.468 0.044 0.256 0.204
#> SRR1699891 5 0.3627 0.56205 0.000 0.032 0.120 0.016 0.832
#> SRR1699892 4 0.7654 0.17449 0.012 0.080 0.280 0.492 0.136
#> SRR1699893 4 0.4341 0.23204 0.000 0.000 0.004 0.592 0.404
#> SRR1699894 5 0.3666 0.57948 0.000 0.020 0.092 0.048 0.840
#> SRR1699895 5 0.4301 0.58164 0.000 0.016 0.092 0.096 0.796
#> SRR1699896 4 0.8731 -0.18395 0.044 0.264 0.188 0.400 0.104
#> SRR1699897 2 0.7590 0.16312 0.036 0.456 0.100 0.360 0.048
#> SRR1699898 4 0.6502 0.03207 0.012 0.004 0.340 0.516 0.128
#> SRR1699900 3 0.6696 0.27404 0.008 0.016 0.560 0.240 0.176
#> SRR1699899 5 0.6415 0.31745 0.000 0.024 0.352 0.104 0.520
#> SRR1699902 4 0.7318 -0.13135 0.012 0.024 0.352 0.436 0.176
#> SRR1699901 3 0.7475 0.31826 0.220 0.000 0.448 0.280 0.052
#> SRR1699903 5 0.5066 0.44419 0.000 0.000 0.344 0.048 0.608
#> SRR1699904 5 0.2649 0.57495 0.000 0.048 0.016 0.036 0.900
#> SRR1699905 3 0.6035 0.18659 0.000 0.000 0.528 0.340 0.132
#> SRR1699906 5 0.4596 0.54636 0.000 0.044 0.148 0.036 0.772
#> SRR1699907 5 0.5158 0.54239 0.000 0.064 0.212 0.020 0.704
#> SRR1699908 5 0.3972 0.52018 0.000 0.008 0.032 0.172 0.788
#> SRR1699909 5 0.5025 0.43251 0.000 0.020 0.028 0.288 0.664
#> SRR1699910 5 0.6778 0.27974 0.000 0.004 0.312 0.244 0.440
#> SRR1699911 5 0.5945 0.42438 0.004 0.048 0.352 0.028 0.568
#> SRR1699912 5 0.4514 0.53109 0.000 0.024 0.220 0.020 0.736
#> SRR1699913 5 0.4960 0.54275 0.000 0.016 0.144 0.100 0.740
#> SRR1699914 4 0.6769 0.16684 0.140 0.024 0.240 0.580 0.016
#> SRR1699915 5 0.5386 0.54345 0.000 0.004 0.148 0.168 0.680
#> SRR1699916 5 0.4618 0.49858 0.000 0.024 0.016 0.248 0.712
#> SRR1699917 5 0.5624 0.56194 0.000 0.012 0.108 0.224 0.656
#> SRR1699918 5 0.5205 0.55239 0.000 0.008 0.096 0.200 0.696
#> SRR1699919 5 0.4758 0.40355 0.000 0.012 0.024 0.288 0.676
#> SRR1699920 4 0.5102 0.26212 0.000 0.000 0.044 0.580 0.376
#> SRR1699921 5 0.4776 0.53391 0.000 0.008 0.076 0.180 0.736
#> SRR1699922 5 0.5916 0.47433 0.004 0.196 0.152 0.008 0.640
#> SRR1699923 3 0.7304 0.25527 0.048 0.004 0.508 0.244 0.196
#> SRR1699924 4 0.4861 0.36356 0.000 0.008 0.220 0.712 0.060
#> SRR1699925 1 0.0290 0.74547 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.6701 0.39339 0.000 0.012 0.292 0.196 0.500
#> SRR1699927 5 0.3656 0.52667 0.000 0.020 0.000 0.196 0.784
#> SRR1699929 3 0.7686 0.09078 0.004 0.056 0.396 0.348 0.196
#> SRR1699928 5 0.4930 0.49768 0.000 0.032 0.244 0.024 0.700
#> SRR1699930 5 0.4339 0.55138 0.000 0.084 0.136 0.004 0.776
#> SRR1699931 4 0.8791 -0.05816 0.044 0.304 0.120 0.372 0.160
#> SRR1699933 3 0.6951 0.21997 0.012 0.024 0.500 0.336 0.128
#> SRR1699932 5 0.6810 0.31040 0.000 0.296 0.004 0.264 0.436
#> SRR1699934 1 0.0290 0.74547 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.5377 0.39473 0.000 0.024 0.052 0.664 0.260
#> SRR1699936 5 0.7256 0.02530 0.000 0.348 0.088 0.100 0.464
#> SRR1699937 2 0.7498 0.41234 0.140 0.504 0.248 0.108 0.000
#> SRR1699938 2 0.3233 0.70184 0.028 0.852 0.112 0.000 0.008
#> SRR1699940 3 0.6257 0.31089 0.004 0.148 0.664 0.120 0.064
#> SRR1699939 2 0.5278 0.69872 0.028 0.760 0.112 0.036 0.064
#> SRR1699941 3 0.8408 0.22530 0.176 0.088 0.416 0.288 0.032
#> SRR1699942 2 0.8469 0.05392 0.008 0.336 0.316 0.208 0.132
#> SRR1699943 2 0.3564 0.70171 0.028 0.844 0.100 0.000 0.028
#> SRR1699944 2 0.3513 0.70154 0.004 0.828 0.132 0.000 0.036
#> SRR1699945 1 0.6410 0.33174 0.556 0.016 0.280 0.148 0.000
#> SRR1699946 2 0.6057 0.65876 0.036 0.704 0.136 0.084 0.040
#> SRR1699947 2 0.5320 0.61815 0.008 0.656 0.264 0.000 0.072
#> SRR1699948 2 0.4268 0.70801 0.024 0.812 0.116 0.028 0.020
#> SRR1699949 2 0.7157 0.49860 0.016 0.556 0.068 0.096 0.264
#> SRR1699950 2 0.6731 0.64515 0.032 0.660 0.096 0.120 0.092
#> SRR1699951 4 0.8634 0.01551 0.020 0.236 0.156 0.400 0.188
#> SRR1699952 2 0.7399 0.45055 0.036 0.496 0.284 0.168 0.016
#> SRR1699953 2 0.5452 0.66856 0.000 0.720 0.128 0.044 0.108
#> SRR1699954 2 0.8909 0.26634 0.180 0.380 0.268 0.124 0.048
#> SRR1699955 2 0.6247 0.63424 0.028 0.656 0.080 0.028 0.208
#> SRR1699956 3 0.7611 0.19083 0.300 0.044 0.368 0.288 0.000
#> SRR1699957 2 0.6117 0.66892 0.024 0.692 0.152 0.084 0.048
#> SRR1699959 4 0.8193 -0.05463 0.068 0.116 0.348 0.416 0.052
#> SRR1699958 4 0.6148 0.06325 0.000 0.000 0.304 0.536 0.160
#> SRR1699960 5 0.7755 0.11947 0.000 0.296 0.056 0.288 0.360
#> SRR1699961 3 0.7871 0.22801 0.140 0.104 0.456 0.292 0.008
#> SRR1699962 2 0.4856 0.68817 0.028 0.768 0.060 0.136 0.008
#> SRR1699963 3 0.7954 0.35628 0.028 0.116 0.528 0.168 0.160
#> SRR1699964 3 0.8346 0.21117 0.008 0.240 0.396 0.236 0.120
#> SRR1699965 2 0.5606 0.64281 0.028 0.716 0.044 0.176 0.036
#> SRR1699966 4 0.6963 0.14260 0.012 0.056 0.268 0.564 0.100
#> SRR1699967 2 0.6709 0.55823 0.060 0.616 0.120 0.196 0.008
#> SRR1699968 4 0.7161 0.28332 0.000 0.080 0.216 0.548 0.156
#> SRR1699969 4 0.4859 0.30928 0.020 0.008 0.292 0.672 0.008
#> SRR1699971 3 0.8388 0.17550 0.068 0.268 0.464 0.116 0.084
#> SRR1699970 2 0.5196 0.64672 0.004 0.712 0.180 0.008 0.096
#> SRR1699972 3 0.6238 0.37700 0.052 0.092 0.696 0.124 0.036
#> SRR1699973 4 0.8129 -0.15107 0.004 0.084 0.284 0.360 0.268
#> SRR1699974 1 0.7087 0.19863 0.504 0.036 0.220 0.240 0.000
#> SRR1699975 3 0.6309 -0.08081 0.000 0.000 0.492 0.168 0.340
#> SRR1699976 3 0.8067 0.18137 0.092 0.300 0.348 0.260 0.000
#> SRR1699977 3 0.6666 0.37827 0.052 0.024 0.640 0.180 0.104
#> SRR1699978 4 0.7171 0.11013 0.236 0.012 0.160 0.548 0.044
#> SRR1699979 4 0.5359 0.26740 0.004 0.028 0.328 0.620 0.020
#> SRR1699980 5 0.6191 0.28848 0.000 0.000 0.244 0.204 0.552
#> SRR1699981 4 0.5476 0.00390 0.000 0.000 0.388 0.544 0.068
#> SRR1699982 5 0.3310 0.55629 0.000 0.024 0.136 0.004 0.836
#> SRR1699983 5 0.6384 0.50481 0.000 0.168 0.156 0.048 0.628
#> SRR1699984 1 0.0290 0.74547 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.6680 0.22139 0.000 0.032 0.156 0.256 0.556
#> SRR1699986 4 0.8587 -0.29863 0.232 0.008 0.304 0.312 0.144
#> SRR1699988 3 0.8625 -0.06285 0.012 0.256 0.304 0.128 0.300
#> SRR1699987 4 0.4651 0.41611 0.000 0.004 0.156 0.748 0.092
#> SRR1699989 5 0.6856 0.22621 0.000 0.024 0.152 0.376 0.448
#> SRR1699990 4 0.4916 0.38495 0.004 0.008 0.172 0.736 0.080
#> SRR1699992 2 0.8494 -0.04114 0.196 0.332 0.236 0.236 0.000
#> SRR1699991 4 0.5238 0.26170 0.004 0.016 0.340 0.616 0.024
#> SRR1699993 4 0.5108 0.35585 0.024 0.016 0.224 0.712 0.024
#> SRR1699994 3 0.7589 0.20695 0.228 0.040 0.392 0.336 0.004
#> SRR1699995 4 0.7161 -0.10128 0.312 0.016 0.232 0.436 0.004
#> SRR1699996 2 0.8538 0.12233 0.012 0.372 0.228 0.256 0.132
#> SRR1699997 4 0.6005 0.17147 0.000 0.000 0.156 0.568 0.276
#> SRR1699998 3 0.7988 0.17409 0.004 0.248 0.456 0.164 0.128
#> SRR1699999 1 0.3792 0.65961 0.828 0.012 0.064 0.096 0.000
#> SRR1700000 3 0.6650 0.30238 0.004 0.096 0.600 0.236 0.064
#> SRR1700002 3 0.8374 0.25600 0.052 0.168 0.436 0.280 0.064
#> SRR1700001 3 0.8082 0.13310 0.080 0.040 0.396 0.380 0.104
#> SRR1700003 4 0.6587 -0.04588 0.000 0.008 0.352 0.472 0.168
#> SRR1700004 4 0.5703 0.18636 0.020 0.032 0.376 0.564 0.008
#> SRR1700005 1 0.2818 0.67657 0.856 0.000 0.132 0.012 0.000
#> SRR1700006 3 0.6227 -0.05637 0.008 0.036 0.468 0.448 0.040
#> SRR1700007 5 0.2701 0.56541 0.000 0.048 0.044 0.012 0.896
#> SRR1700008 4 0.4023 0.38878 0.004 0.008 0.096 0.816 0.076
#> SRR1700009 1 0.1329 0.74268 0.956 0.008 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700010 1 0.6601 0.37571 0.564 0.032 0.260 0.144 0.000
#> SRR1700011 5 0.7680 0.11454 0.000 0.308 0.180 0.080 0.432
#> SRR1700013 4 0.7307 0.00908 0.060 0.168 0.284 0.488 0.000
#> SRR1700012 3 0.6271 0.30347 0.000 0.016 0.596 0.176 0.212
#> SRR1700014 4 0.5577 0.30502 0.008 0.004 0.284 0.632 0.072
#> SRR1700015 3 0.8168 0.23396 0.132 0.116 0.464 0.264 0.024
#> SRR1700016 3 0.7522 0.15232 0.064 0.012 0.420 0.388 0.116
#> SRR1700018 4 0.6591 0.15604 0.008 0.040 0.372 0.512 0.068
#> SRR1700017 3 0.7906 0.12189 0.096 0.064 0.452 0.340 0.048
#> SRR1700019 5 0.6946 0.26371 0.000 0.232 0.016 0.284 0.468
#> SRR1700020 4 0.3474 0.40185 0.000 0.004 0.192 0.796 0.008
#> SRR1700021 5 0.7084 0.32786 0.000 0.072 0.140 0.244 0.544
#> SRR1700023 4 0.5916 0.16478 0.012 0.036 0.396 0.536 0.020
#> SRR1700022 4 0.6881 0.00751 0.044 0.044 0.436 0.444 0.032
#> SRR1700024 5 0.5752 0.42080 0.000 0.008 0.100 0.280 0.612
#> SRR1700025 3 0.7916 0.26036 0.112 0.200 0.440 0.248 0.000
#> SRR1700026 4 0.8014 -0.09292 0.084 0.080 0.392 0.396 0.048
#> SRR1700027 3 0.7444 0.03162 0.072 0.072 0.420 0.412 0.024
#> SRR1700028 4 0.5920 0.15619 0.000 0.004 0.108 0.560 0.328
#> SRR1700029 4 0.4227 0.42910 0.008 0.004 0.112 0.800 0.076
#> SRR1700030 5 0.6458 0.22383 0.000 0.000 0.240 0.260 0.500
#> SRR1700031 3 0.7430 0.10883 0.164 0.028 0.412 0.380 0.016
#> SRR1700032 3 0.8171 0.17093 0.040 0.280 0.344 0.308 0.028
#> SRR1700034 1 0.5641 0.47099 0.660 0.008 0.180 0.152 0.000
#> SRR1700035 5 0.4812 0.43831 0.000 0.008 0.032 0.288 0.672
#> SRR1700033 4 0.7666 -0.00641 0.132 0.028 0.356 0.440 0.044
#> SRR1700036 4 0.6176 0.32848 0.000 0.016 0.164 0.608 0.212
#> SRR1700037 5 0.2151 0.56905 0.000 0.020 0.016 0.040 0.924
#> SRR1700038 4 0.7077 -0.05397 0.004 0.052 0.400 0.440 0.104
#> SRR1700039 4 0.5176 0.26054 0.020 0.012 0.340 0.620 0.008
#> SRR1700040 4 0.4629 0.31140 0.008 0.008 0.304 0.672 0.008
#> SRR1700041 4 0.5163 0.36008 0.004 0.008 0.224 0.696 0.068
#> SRR1700042 4 0.6206 0.25980 0.032 0.012 0.296 0.600 0.060
#> SRR1700043 4 0.8321 -0.08499 0.096 0.040 0.312 0.428 0.124
#> SRR1700045 4 0.5268 0.32819 0.016 0.016 0.228 0.700 0.040
#> SRR1700044 3 0.8265 0.24879 0.028 0.048 0.344 0.304 0.276
#> SRR1700046 4 0.5865 0.24818 0.008 0.028 0.332 0.592 0.040
#> SRR1700047 4 0.4579 0.34732 0.032 0.012 0.212 0.740 0.004
#> SRR1700048 4 0.6820 0.07671 0.000 0.008 0.252 0.464 0.276
#> SRR1700049 4 0.6900 0.05903 0.152 0.012 0.340 0.484 0.012
#> SRR1700050 4 0.6106 0.16891 0.016 0.004 0.216 0.628 0.136
#> SRR1700051 4 0.7275 -0.14747 0.048 0.004 0.396 0.416 0.136
#> SRR1700052 4 0.7193 0.09611 0.116 0.016 0.308 0.516 0.044
#> SRR1700053 4 0.4733 0.34697 0.000 0.000 0.028 0.624 0.348
#> SRR1700054 4 0.5315 0.33290 0.008 0.012 0.240 0.684 0.056
#> SRR1700055 1 0.1300 0.74435 0.956 0.000 0.028 0.016 0.000
#> SRR1700056 4 0.3016 0.44010 0.000 0.000 0.132 0.848 0.020
#> SRR1700057 4 0.3339 0.47178 0.000 0.000 0.048 0.840 0.112
#> SRR1700058 4 0.6113 0.17112 0.060 0.016 0.360 0.552 0.012
#> SRR1700059 4 0.2722 0.47563 0.000 0.000 0.020 0.872 0.108
#> SRR1700060 4 0.6255 0.21941 0.096 0.008 0.280 0.596 0.020
#> SRR1700061 4 0.4004 0.35730 0.000 0.004 0.232 0.748 0.016
#> SRR1700062 4 0.2017 0.45373 0.000 0.000 0.080 0.912 0.008
#> SRR1700063 4 0.4674 0.31977 0.000 0.008 0.292 0.676 0.024
#> SRR1700064 4 0.6947 -0.01708 0.000 0.008 0.344 0.400 0.248
#> SRR1700065 3 0.5334 0.34042 0.012 0.000 0.672 0.240 0.076
#> SRR1700066 4 0.7333 0.02966 0.104 0.028 0.372 0.460 0.036
#> SRR1700067 5 0.4347 0.56976 0.000 0.008 0.112 0.096 0.784
#> SRR1700068 4 0.4203 0.43808 0.000 0.000 0.128 0.780 0.092
#> SRR1700069 4 0.4602 0.41051 0.000 0.000 0.052 0.708 0.240
#> SRR1700070 4 0.8396 0.13741 0.024 0.128 0.180 0.452 0.216
#> SRR1700071 4 0.6231 0.28479 0.024 0.016 0.268 0.616 0.076
#> SRR1700072 3 0.7217 0.16163 0.004 0.016 0.396 0.352 0.232
#> SRR1700073 5 0.3805 0.56420 0.000 0.004 0.084 0.092 0.820
#> SRR1700075 4 0.6931 0.12469 0.020 0.020 0.320 0.520 0.120
#> SRR1700074 4 0.6569 0.09091 0.064 0.040 0.388 0.500 0.008
#> SRR1700076 4 0.7544 -0.04585 0.080 0.216 0.216 0.488 0.000
#> SRR1700077 3 0.7866 0.15331 0.080 0.112 0.436 0.348 0.024
#> SRR1700078 4 0.4523 0.38898 0.004 0.004 0.144 0.768 0.080
#> SRR1700080 4 0.5427 0.32551 0.004 0.012 0.268 0.656 0.060
#> SRR1700079 3 0.6158 0.12762 0.000 0.000 0.480 0.384 0.136
#> SRR1700081 1 0.7288 -0.21023 0.372 0.028 0.228 0.372 0.000
#> SRR1700082 3 0.6292 0.29598 0.048 0.012 0.628 0.248 0.064
#> SRR1700083 4 0.5991 0.16533 0.008 0.008 0.364 0.548 0.072
#> SRR1700084 4 0.6265 0.14024 0.068 0.016 0.380 0.524 0.012
#> SRR1700085 4 0.6220 0.17282 0.000 0.044 0.052 0.512 0.392
#> SRR1700086 5 0.6785 -0.08372 0.000 0.000 0.340 0.284 0.376
#> SRR1700087 3 0.5459 0.25415 0.000 0.000 0.600 0.316 0.084
#> SRR1700088 3 0.8907 0.25463 0.048 0.268 0.368 0.208 0.108
#> SRR1700089 4 0.7436 0.08964 0.020 0.100 0.320 0.496 0.064
#> SRR1700091 4 0.5644 0.36102 0.008 0.060 0.172 0.708 0.052
#> SRR1700090 4 0.3700 0.34550 0.000 0.000 0.008 0.752 0.240
#> SRR1700092 4 0.6349 0.31662 0.008 0.128 0.156 0.656 0.052
#> SRR1700094 4 0.4337 0.33583 0.000 0.016 0.284 0.696 0.004
#> SRR1700093 4 0.1750 0.46630 0.000 0.000 0.036 0.936 0.028
#> SRR1700095 4 0.1740 0.45995 0.000 0.000 0.056 0.932 0.012
#> SRR1700096 4 0.3160 0.39582 0.000 0.004 0.188 0.808 0.000
#> SRR1700097 4 0.5070 0.27226 0.000 0.004 0.160 0.712 0.124
#> SRR1700098 4 0.6473 0.18382 0.012 0.232 0.152 0.592 0.012
#> SRR1700099 4 0.2929 0.47322 0.000 0.004 0.044 0.876 0.076
#> SRR1700100 4 0.5369 0.03753 0.000 0.000 0.388 0.552 0.060
#> SRR1700101 4 0.4972 0.39062 0.000 0.028 0.176 0.736 0.060
#> SRR1700102 4 0.7492 -0.00219 0.000 0.104 0.272 0.492 0.132
#> SRR1700104 4 0.2660 0.43245 0.000 0.000 0.128 0.864 0.008
#> SRR1700103 4 0.3966 0.40896 0.000 0.036 0.176 0.784 0.004
#> SRR1700105 4 0.3224 0.47299 0.000 0.044 0.012 0.864 0.080
#> SRR1700106 4 0.6132 -0.08870 0.000 0.004 0.124 0.524 0.348
#> SRR1700107 4 0.6084 0.13104 0.000 0.000 0.208 0.572 0.220
#> SRR1700108 4 0.3675 0.44480 0.000 0.024 0.000 0.788 0.188
#> SRR1700109 5 0.5588 0.50554 0.000 0.096 0.012 0.240 0.652
#> SRR1700110 4 0.6387 0.16613 0.000 0.164 0.016 0.572 0.248
#> SRR1700112 4 0.4570 0.20837 0.000 0.020 0.000 0.632 0.348
#> SRR1700111 5 0.6638 0.27555 0.000 0.000 0.328 0.236 0.436
#> SRR1700113 4 0.4659 -0.07992 0.000 0.012 0.000 0.496 0.492
#> SRR1700114 4 0.1990 0.45440 0.000 0.004 0.068 0.920 0.008
#> SRR1700115 4 0.3213 0.47003 0.000 0.004 0.016 0.836 0.144
#> SRR1700116 4 0.6706 -0.12150 0.000 0.000 0.288 0.428 0.284
#> SRR1700117 4 0.5912 0.19522 0.004 0.000 0.196 0.616 0.184
#> SRR1700119 4 0.1914 0.47086 0.000 0.000 0.016 0.924 0.060
#> SRR1700118 3 0.6480 0.03402 0.000 0.000 0.412 0.404 0.184
#> SRR1700120 4 0.5345 0.31016 0.032 0.004 0.112 0.732 0.120
#> SRR1700121 4 0.3197 0.46479 0.000 0.004 0.012 0.832 0.152
#> SRR1700122 5 0.4339 0.55471 0.000 0.004 0.136 0.084 0.776
#> SRR1700123 4 0.2248 0.46981 0.000 0.000 0.012 0.900 0.088
#> SRR1700125 5 0.4718 0.27044 0.000 0.016 0.000 0.444 0.540
#> SRR1700126 4 0.5414 0.36733 0.092 0.008 0.124 0.736 0.040
#> SRR1700127 4 0.4786 0.33586 0.008 0.004 0.076 0.748 0.164
#> SRR1700124 4 0.1608 0.46897 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700128 4 0.6054 0.14204 0.000 0.000 0.148 0.548 0.304
#> SRR1700129 5 0.4969 0.45853 0.000 0.000 0.056 0.292 0.652
#> SRR1700130 5 0.6562 0.37595 0.000 0.000 0.308 0.228 0.464
#> SRR1700132 4 0.6268 0.06125 0.004 0.000 0.184 0.556 0.256
#> SRR1700131 4 0.2243 0.46044 0.016 0.000 0.056 0.916 0.012
#> SRR1700133 4 0.3766 0.36144 0.000 0.000 0.004 0.728 0.268
#> SRR1700134 4 0.4151 0.21217 0.000 0.004 0.000 0.652 0.344
#> SRR1700135 4 0.6576 -0.03053 0.004 0.000 0.216 0.496 0.284
#> SRR1700136 4 0.1331 0.46686 0.000 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700137 4 0.2074 0.46456 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700138 4 0.2230 0.46256 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700140 4 0.5452 0.18825 0.000 0.000 0.092 0.616 0.292
#> SRR1700139 4 0.6067 0.12227 0.000 0.000 0.164 0.560 0.276
#> SRR1700141 5 0.4527 0.48542 0.000 0.004 0.028 0.272 0.696
#> SRR1700142 4 0.6074 0.16951 0.004 0.004 0.244 0.600 0.148
#> SRR1700143 4 0.1544 0.46699 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700144 4 0.6422 0.05700 0.004 0.004 0.352 0.500 0.140
#> SRR1700145 4 0.6003 0.12483 0.000 0.000 0.224 0.584 0.192
#> SRR1700146 4 0.4127 0.28288 0.000 0.008 0.000 0.680 0.312
#> SRR1700147 4 0.5722 0.19745 0.000 0.008 0.088 0.600 0.304
#> SRR1700149 4 0.5666 0.12841 0.000 0.000 0.244 0.620 0.136
#> SRR1700148 4 0.3336 0.47091 0.000 0.000 0.060 0.844 0.096
#> SRR1700150 5 0.5874 0.29854 0.000 0.004 0.084 0.436 0.476
#> SRR1700152 4 0.5802 0.01362 0.000 0.000 0.096 0.516 0.388
#> SRR1700151 4 0.1768 0.46814 0.000 0.000 0.004 0.924 0.072
#> SRR1700153 4 0.5775 0.16753 0.000 0.000 0.148 0.608 0.244
#> SRR1700154 4 0.2068 0.46593 0.000 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR1700155 4 0.4101 0.22809 0.000 0.004 0.000 0.664 0.332
#> SRR1700156 4 0.1571 0.46766 0.000 0.000 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700158 4 0.2149 0.46718 0.012 0.000 0.036 0.924 0.028
#> SRR1700159 5 0.5137 0.28319 0.000 0.040 0.000 0.424 0.536
#> SRR1700157 3 0.6530 0.16407 0.020 0.000 0.512 0.340 0.128
#> SRR1700160 4 0.1608 0.46783 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700161 4 0.1478 0.46733 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700162 4 0.4727 -0.06137 0.000 0.016 0.000 0.532 0.452
#> SRR1700164 4 0.5140 0.28080 0.000 0.004 0.060 0.652 0.284
#> SRR1700163 4 0.2416 0.46579 0.000 0.000 0.012 0.888 0.100
#> SRR1700165 4 0.0955 0.45603 0.000 0.004 0.028 0.968 0.000
#> SRR1700166 4 0.3689 0.45938 0.000 0.032 0.008 0.816 0.144
#> SRR1700168 5 0.5849 0.45836 0.000 0.004 0.100 0.332 0.564
#> SRR1700167 4 0.5441 0.12283 0.000 0.000 0.280 0.624 0.096
#> SRR1700170 5 0.5068 0.44887 0.000 0.000 0.060 0.300 0.640
#> SRR1700169 4 0.2511 0.47501 0.000 0.000 0.028 0.892 0.080
#> SRR1700171 4 0.4823 0.32973 0.000 0.000 0.072 0.700 0.228
#> SRR1700172 4 0.1478 0.47275 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700174 4 0.1892 0.46748 0.000 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1700173 4 0.1732 0.46839 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700175 4 0.3607 0.41639 0.000 0.000 0.004 0.752 0.244
#> SRR1700176 4 0.5588 0.18138 0.004 0.004 0.216 0.660 0.116
#> SRR1700178 2 0.3900 0.68097 0.108 0.816 0.068 0.008 0.000
#> SRR1700177 4 0.5737 0.16767 0.000 0.000 0.120 0.592 0.288
#> SRR1700180 2 0.3579 0.70244 0.000 0.828 0.100 0.000 0.072
#> SRR1700179 2 0.4472 0.68668 0.088 0.796 0.092 0.008 0.016
#> SRR1700181 2 0.3867 0.66468 0.144 0.804 0.048 0.004 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.74471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.4595 0.67129 0.124 0.768 0.096 0.012 0.000
#> SRR1700184 2 0.4365 0.68737 0.100 0.800 0.080 0.008 0.012
#> SRR1700186 2 0.4447 0.68619 0.100 0.788 0.092 0.020 0.000
#> SRR1700187 1 0.1356 0.74418 0.956 0.012 0.004 0.028 0.000
#> SRR1700185 1 0.0162 0.74525 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.3983 0.68785 0.092 0.812 0.088 0.008 0.000
#> SRR1700192 1 0.6354 0.20894 0.532 0.344 0.024 0.100 0.000
#> SRR1700190 1 0.6873 0.37412 0.556 0.048 0.236 0.160 0.000
#> SRR1700191 1 0.1478 0.72701 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.4207 0.67688 0.824 0.088 0.016 0.044 0.028
#> SRR1700193 2 0.3446 0.67960 0.116 0.840 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700195 2 0.3222 0.69518 0.004 0.852 0.036 0.000 0.108
#> SRR1700194 1 0.1082 0.73745 0.964 0.000 0.008 0.028 0.000
#> SRR1700196 2 0.2724 0.70729 0.052 0.900 0.020 0.004 0.024
#> SRR1700197 1 0.2151 0.73512 0.924 0.016 0.020 0.040 0.000
#> SRR1700198 2 0.3197 0.68121 0.116 0.852 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700199 2 0.3773 0.67117 0.008 0.824 0.108 0.000 0.060
#> SRR1700200 2 0.2359 0.70332 0.004 0.912 0.016 0.008 0.060
#> SRR1700201 2 0.4179 0.67166 0.140 0.796 0.044 0.020 0.000
#> SRR1700202 2 0.8018 0.39149 0.288 0.484 0.096 0.080 0.052
#> SRR1700203 2 0.5678 0.56706 0.008 0.680 0.208 0.020 0.084
#> SRR1700204 2 0.6153 0.65128 0.016 0.696 0.088 0.084 0.116
#> SRR1700206 2 0.6479 0.64026 0.144 0.660 0.016 0.120 0.060
#> SRR1700207 2 0.4755 0.71502 0.064 0.796 0.024 0.084 0.032
#> SRR1700208 1 0.6237 0.22958 0.560 0.336 0.020 0.076 0.008
#> SRR1700205 2 0.6702 0.41501 0.004 0.560 0.248 0.024 0.164
#> SRR1700209 2 0.4556 0.68181 0.032 0.784 0.012 0.144 0.028
#> SRR1700210 2 0.5639 0.57139 0.008 0.692 0.172 0.016 0.112
#> SRR1700211 2 0.2935 0.69271 0.000 0.860 0.016 0.004 0.120
#> SRR1700212 2 0.4676 0.64858 0.004 0.760 0.116 0.004 0.116
#> SRR1700213 2 0.6001 0.63522 0.052 0.708 0.060 0.144 0.036
#> SRR1700214 2 0.3296 0.70005 0.076 0.868 0.028 0.004 0.024
#> SRR1700215 1 0.0324 0.74658 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700217 2 0.3990 0.70894 0.040 0.836 0.016 0.084 0.024
#> SRR1700216 1 0.2424 0.67868 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.5859 0.64653 0.120 0.704 0.020 0.128 0.028
#> SRR1700219 2 0.4871 0.68211 0.052 0.772 0.012 0.132 0.032
#> SRR1700222 1 0.0960 0.74800 0.972 0.004 0.008 0.016 0.000
#> SRR1700220 2 0.5212 0.63891 0.028 0.728 0.004 0.172 0.068
#> SRR1700221 2 0.3549 0.68778 0.100 0.848 0.024 0.004 0.024
#> SRR1700223 2 0.4152 0.70684 0.004 0.820 0.032 0.092 0.052
#> SRR1700224 2 0.7624 0.39468 0.016 0.508 0.056 0.212 0.208
#> SRR1700226 2 0.4899 0.69680 0.008 0.780 0.052 0.092 0.068
#> SRR1700229 2 0.6796 0.43869 0.004 0.556 0.240 0.028 0.172
#> SRR1700225 2 0.7198 0.48614 0.028 0.556 0.256 0.120 0.040
#> SRR1700227 2 0.3018 0.70108 0.004 0.872 0.056 0.000 0.068
#> SRR1700230 1 0.1836 0.73767 0.936 0.016 0.008 0.040 0.000
#> SRR1700231 2 0.3584 0.70764 0.028 0.848 0.040 0.000 0.084
#> SRR1700228 2 0.4397 0.69769 0.020 0.804 0.032 0.024 0.120
#> SRR1700232 2 0.4668 0.71098 0.020 0.804 0.048 0.064 0.064
#> SRR1700233 2 0.4510 0.70137 0.056 0.808 0.020 0.088 0.028
#> SRR1700234 2 0.4357 0.69897 0.088 0.816 0.020 0.052 0.024
#> SRR1700235 2 0.7102 0.51928 0.088 0.580 0.096 0.224 0.012
#> SRR1700237 2 0.2597 0.71118 0.008 0.904 0.012 0.016 0.060
#> SRR1700236 2 0.5108 0.66719 0.000 0.744 0.080 0.040 0.136
#> SRR1700238 2 0.3646 0.68519 0.112 0.840 0.020 0.008 0.020
#> SRR1700239 1 0.0854 0.74744 0.976 0.004 0.012 0.008 0.000
#> SRR1700240 1 0.3808 0.64677 0.808 0.004 0.152 0.032 0.004
#> SRR1700241 4 0.7320 0.12050 0.088 0.272 0.024 0.544 0.072
#> SRR1700243 2 0.2555 0.70808 0.032 0.912 0.020 0.008 0.028
#> SRR1700244 2 0.3816 0.70837 0.024 0.840 0.012 0.096 0.028
#> SRR1700242 1 0.5805 -0.09095 0.480 0.444 0.008 0.068 0.000
#> SRR1700246 2 0.6232 0.50009 0.004 0.608 0.248 0.020 0.120
#> SRR1700245 2 0.3931 0.69429 0.004 0.820 0.060 0.008 0.108
#> SRR1700247 1 0.6146 0.31087 0.496 0.000 0.412 0.064 0.028
#> SRR1700249 1 0.0000 0.74471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.4738 0.69254 0.028 0.784 0.096 0.008 0.084
#> SRR1700248 2 0.3867 0.68990 0.088 0.824 0.076 0.012 0.000
#> SRR1700251 2 0.3824 0.71022 0.008 0.848 0.044 0.048 0.052
#> SRR1700252 2 0.8562 0.26533 0.228 0.412 0.224 0.108 0.028
#> SRR1700253 2 0.4692 0.67175 0.000 0.744 0.024 0.040 0.192
#> SRR1700256 2 0.4311 0.67869 0.000 0.788 0.044 0.024 0.144
#> SRR1700254 1 0.3430 0.66162 0.824 0.012 0.152 0.012 0.000
#> SRR1700255 2 0.3350 0.71138 0.060 0.872 0.020 0.036 0.012
#> SRR1700257 2 0.3737 0.66854 0.144 0.816 0.020 0.020 0.000
#> SRR1700258 2 0.3861 0.70617 0.004 0.828 0.020 0.112 0.036
#> SRR1700259 2 0.7746 0.49781 0.032 0.540 0.072 0.176 0.180
#> SRR1700260 5 0.6741 0.28626 0.000 0.292 0.072 0.084 0.552
#> SRR1700261 5 0.6862 0.17090 0.000 0.156 0.024 0.360 0.460
#> SRR1700262 5 0.4462 0.57614 0.000 0.096 0.040 0.068 0.796
#> SRR1700263 2 0.8029 0.01607 0.000 0.356 0.296 0.088 0.260
#> SRR1700264 2 0.5978 0.65973 0.020 0.696 0.164 0.048 0.072
#> SRR1700265 2 0.7469 0.36069 0.032 0.492 0.324 0.044 0.108
#> SRR1700266 2 0.5959 0.66500 0.024 0.700 0.088 0.036 0.152
#> SRR1700268 2 0.7946 0.38811 0.184 0.496 0.040 0.228 0.052
#> SRR1700270 2 0.4259 0.70250 0.028 0.816 0.024 0.108 0.024
#> SRR1700267 2 0.6030 0.65147 0.004 0.684 0.068 0.152 0.092
#> SRR1700271 2 0.6779 0.60004 0.020 0.624 0.060 0.196 0.100
#> SRR1700272 5 0.7297 -0.01985 0.004 0.388 0.044 0.148 0.416
#> SRR1700273 2 0.4809 0.71540 0.024 0.796 0.064 0.072 0.044
#> SRR1700274 5 0.7704 0.39171 0.000 0.212 0.108 0.196 0.484
#> SRR1700277 3 0.8357 0.22341 0.232 0.132 0.376 0.256 0.004
#> SRR1700275 4 0.7059 -0.12555 0.004 0.328 0.004 0.376 0.288
#> SRR1700276 5 0.6608 0.35673 0.000 0.256 0.000 0.284 0.460
#> SRR1700278 2 0.7832 0.18316 0.028 0.436 0.032 0.292 0.212
#> SRR1700279 5 0.4879 0.52441 0.000 0.156 0.124 0.000 0.720
#> SRR1700280 2 0.5959 0.16096 0.008 0.480 0.024 0.036 0.452
#> SRR1700281 2 0.6709 0.60550 0.028 0.632 0.064 0.072 0.204
#> SRR1700283 5 0.3810 0.54486 0.000 0.036 0.176 0.000 0.788
#> SRR1700282 4 0.7388 0.07954 0.032 0.304 0.060 0.520 0.084
#> SRR1700284 5 0.5475 0.42729 0.000 0.076 0.004 0.308 0.612
#> SRR1700285 4 0.8464 -0.00371 0.028 0.324 0.072 0.340 0.236
#> SRR1700286 2 0.7168 0.40643 0.004 0.528 0.048 0.248 0.172
#> SRR1700287 5 0.6150 0.54903 0.000 0.044 0.092 0.236 0.628
#> SRR1700290 4 0.5983 0.29757 0.092 0.012 0.236 0.644 0.016
#> SRR1700289 5 0.4378 0.54872 0.000 0.040 0.188 0.012 0.760
#> SRR1700288 2 0.5475 0.59554 0.028 0.696 0.008 0.212 0.056
#> SRR1700292 5 0.6059 0.46207 0.000 0.204 0.220 0.000 0.576
#> SRR1700291 4 0.3327 0.47558 0.000 0.000 0.028 0.828 0.144
#> SRR1700293 4 0.7243 0.04137 0.028 0.368 0.008 0.432 0.164
#> SRR1700294 5 0.5377 0.53279 0.000 0.136 0.136 0.020 0.708
#> SRR1700295 4 0.4438 0.21419 0.000 0.004 0.004 0.608 0.384
#> SRR1700297 5 0.5137 0.56948 0.000 0.048 0.088 0.116 0.748
#> SRR1700296 5 0.2204 0.56393 0.000 0.036 0.036 0.008 0.920
#> SRR1700298 4 0.5353 0.27962 0.020 0.028 0.008 0.644 0.300
#> SRR1700299 5 0.7074 0.38928 0.000 0.136 0.344 0.048 0.472
#> SRR1700300 5 0.5256 0.41356 0.000 0.004 0.356 0.048 0.592
#> SRR1700302 5 0.3961 0.51604 0.000 0.016 0.000 0.248 0.736
#> SRR1700301 5 0.6487 0.49336 0.000 0.148 0.036 0.220 0.596
#> SRR1700303 5 0.5115 0.42045 0.000 0.040 0.016 0.280 0.664
#> SRR1700304 2 0.7654 0.28850 0.060 0.480 0.008 0.224 0.228
#> SRR1700305 4 0.7398 -0.12422 0.020 0.288 0.004 0.372 0.316
#> SRR1700306 5 0.6432 0.37406 0.000 0.004 0.204 0.264 0.528
#> SRR1700308 5 0.7074 0.28085 0.004 0.064 0.396 0.088 0.448
#> SRR1700307 4 0.5020 0.38617 0.020 0.012 0.152 0.752 0.064
#> SRR1700309 3 0.6896 0.11475 0.080 0.000 0.588 0.156 0.176
#> SRR1700310 5 0.4603 0.49736 0.000 0.028 0.012 0.248 0.712
#> SRR1700311 5 0.7788 0.36080 0.000 0.116 0.152 0.284 0.448
#> SRR1700312 4 0.4969 -0.09771 0.000 0.020 0.004 0.508 0.468
#> SRR1700313 4 0.5903 0.38879 0.000 0.024 0.180 0.656 0.140
#> SRR1700314 4 0.6495 0.08487 0.000 0.000 0.188 0.424 0.388
#> SRR1700315 5 0.6495 0.34853 0.000 0.004 0.316 0.184 0.496
#> SRR1700316 4 0.7194 0.20197 0.012 0.196 0.064 0.572 0.156
#> SRR1700317 5 0.7069 0.46974 0.000 0.120 0.104 0.208 0.568
#> SRR1700318 5 0.6589 0.44581 0.000 0.224 0.028 0.176 0.572
#> SRR1700319 4 0.5565 0.40358 0.000 0.000 0.144 0.640 0.216
#> SRR1700320 5 0.6046 0.37095 0.000 0.060 0.044 0.296 0.600
#> SRR1700322 4 0.7282 -0.23314 0.004 0.028 0.196 0.428 0.344
#> SRR1700321 5 0.5379 0.39194 0.000 0.056 0.012 0.300 0.632
#> SRR1700323 4 0.6252 0.36421 0.000 0.012 0.156 0.580 0.252
#> SRR1700324 5 0.6169 0.37549 0.004 0.104 0.012 0.308 0.572
#> SRR1700325 4 0.6117 0.26564 0.016 0.228 0.012 0.636 0.108
#> SRR1700326 5 0.8163 0.11649 0.012 0.096 0.184 0.292 0.416
#> SRR1700327 4 0.7001 0.01935 0.000 0.364 0.020 0.424 0.192
#> SRR1700329 5 0.3615 0.55629 0.000 0.000 0.156 0.036 0.808
#> SRR1700328 3 0.6306 0.10433 0.008 0.052 0.648 0.092 0.200
#> SRR1700330 4 0.8588 0.11158 0.040 0.160 0.196 0.456 0.148
#> SRR1700331 5 0.7643 0.46146 0.000 0.148 0.192 0.152 0.508
#> SRR1700332 5 0.6318 0.42037 0.000 0.128 0.016 0.300 0.556
#> SRR1700333 5 0.7754 0.07295 0.020 0.368 0.052 0.148 0.412
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.5841 0.54484 0.000 0.600 0.048 0.004 0.096 0.252
#> SRR1699875 2 0.5729 0.44472 0.000 0.508 0.032 0.004 0.068 0.388
#> SRR1699876 5 0.7121 0.32709 0.000 0.120 0.040 0.172 0.544 0.124
#> SRR1699877 2 0.6879 0.29335 0.004 0.512 0.100 0.024 0.072 0.288
#> SRR1699879 2 0.5456 0.55731 0.000 0.672 0.032 0.204 0.028 0.064
#> SRR1699878 2 0.6799 0.25469 0.000 0.464 0.056 0.012 0.148 0.320
#> SRR1699880 1 0.7616 -0.08592 0.364 0.040 0.356 0.152 0.000 0.088
#> SRR1699881 3 0.7390 0.43834 0.068 0.104 0.496 0.244 0.000 0.088
#> SRR1699882 2 0.5523 0.55161 0.000 0.656 0.028 0.012 0.108 0.196
#> SRR1699883 2 0.7490 0.18102 0.000 0.444 0.072 0.048 0.156 0.280
#> SRR1699884 2 0.4524 0.63563 0.008 0.756 0.036 0.016 0.020 0.164
#> SRR1699885 2 0.5023 0.57289 0.000 0.656 0.028 0.000 0.064 0.252
#> SRR1699886 5 0.7776 -0.02365 0.000 0.224 0.060 0.084 0.436 0.196
#> SRR1699888 4 0.7856 0.08415 0.004 0.216 0.048 0.436 0.200 0.096
#> SRR1699889 5 0.6059 0.48696 0.000 0.004 0.072 0.144 0.616 0.164
#> SRR1699890 5 0.5685 0.37449 0.000 0.184 0.020 0.020 0.644 0.132
#> SRR1699887 2 0.7440 0.28912 0.008 0.444 0.024 0.288 0.164 0.072
#> SRR1699891 5 0.3424 0.52495 0.000 0.008 0.060 0.044 0.848 0.040
#> SRR1699892 4 0.7711 -0.16656 0.004 0.060 0.328 0.404 0.076 0.128
#> SRR1699893 4 0.5014 0.38034 0.000 0.000 0.008 0.660 0.208 0.124
#> SRR1699894 5 0.4247 0.54864 0.000 0.008 0.052 0.084 0.792 0.064
#> SRR1699895 5 0.4244 0.55114 0.000 0.004 0.048 0.108 0.784 0.056
#> SRR1699896 3 0.7971 0.06519 0.016 0.252 0.424 0.184 0.044 0.080
#> SRR1699897 2 0.7055 0.33541 0.012 0.520 0.128 0.248 0.016 0.076
#> SRR1699898 4 0.6438 -0.05903 0.004 0.000 0.396 0.440 0.088 0.072
#> SRR1699900 6 0.7794 0.44085 0.000 0.020 0.276 0.180 0.152 0.372
#> SRR1699899 5 0.6975 0.23096 0.000 0.012 0.096 0.124 0.476 0.292
#> SRR1699902 3 0.7670 -0.00172 0.004 0.020 0.400 0.276 0.100 0.200
#> SRR1699901 3 0.8388 -0.24004 0.164 0.004 0.336 0.192 0.052 0.252
#> SRR1699903 5 0.5590 0.33583 0.000 0.000 0.072 0.056 0.612 0.260
#> SRR1699904 5 0.4426 0.52810 0.000 0.016 0.020 0.068 0.768 0.128
#> SRR1699905 4 0.7662 -0.41495 0.000 0.000 0.244 0.296 0.188 0.272
#> SRR1699906 5 0.3684 0.49686 0.000 0.012 0.008 0.040 0.808 0.132
#> SRR1699907 5 0.4177 0.49483 0.000 0.048 0.056 0.028 0.808 0.060
#> SRR1699908 5 0.5151 0.44535 0.000 0.000 0.024 0.244 0.648 0.084
#> SRR1699909 5 0.6108 0.37837 0.000 0.000 0.040 0.300 0.528 0.132
#> SRR1699910 5 0.6607 0.33858 0.000 0.000 0.224 0.200 0.508 0.068
#> SRR1699911 5 0.6169 0.37513 0.000 0.032 0.192 0.052 0.624 0.100
#> SRR1699912 5 0.4748 0.45941 0.000 0.004 0.068 0.044 0.736 0.148
#> SRR1699913 5 0.4033 0.50610 0.000 0.000 0.004 0.080 0.760 0.156
#> SRR1699914 3 0.6313 0.40136 0.104 0.016 0.488 0.364 0.004 0.024
#> SRR1699915 5 0.5540 0.51747 0.000 0.000 0.084 0.160 0.664 0.092
#> SRR1699916 5 0.5861 0.46107 0.000 0.016 0.020 0.252 0.596 0.116
#> SRR1699917 5 0.4662 0.55028 0.000 0.012 0.056 0.184 0.728 0.020
#> SRR1699918 5 0.4678 0.54052 0.000 0.000 0.056 0.184 0.720 0.040
#> SRR1699919 5 0.6308 0.20181 0.000 0.000 0.032 0.380 0.432 0.156
#> SRR1699920 4 0.5592 0.21622 0.000 0.000 0.044 0.564 0.328 0.064
#> SRR1699921 5 0.5835 0.53252 0.000 0.000 0.056 0.144 0.620 0.180
#> SRR1699922 5 0.6266 0.33881 0.000 0.212 0.044 0.028 0.600 0.116
#> SRR1699923 6 0.7966 0.31377 0.012 0.008 0.292 0.236 0.136 0.316
#> SRR1699924 4 0.5299 -0.07702 0.000 0.000 0.404 0.520 0.024 0.052
#> SRR1699925 1 0.0767 0.76006 0.976 0.000 0.008 0.000 0.004 0.012
#> SRR1699926 5 0.5997 0.40844 0.000 0.008 0.232 0.148 0.584 0.028
#> SRR1699927 5 0.5656 0.49520 0.000 0.000 0.024 0.220 0.604 0.152
#> SRR1699929 3 0.7936 -0.13529 0.000 0.028 0.380 0.200 0.232 0.160
#> SRR1699928 5 0.5444 0.45016 0.000 0.020 0.024 0.052 0.620 0.284
#> SRR1699930 5 0.3453 0.50771 0.000 0.032 0.052 0.024 0.852 0.040
#> SRR1699931 4 0.8945 -0.14807 0.016 0.224 0.228 0.296 0.112 0.124
#> SRR1699933 3 0.7061 -0.10735 0.004 0.012 0.532 0.164 0.136 0.152
#> SRR1699932 4 0.7690 -0.19170 0.000 0.272 0.024 0.312 0.308 0.084
#> SRR1699934 1 0.0767 0.76006 0.976 0.000 0.008 0.000 0.004 0.012
#> SRR1699935 4 0.6192 0.36808 0.004 0.016 0.120 0.640 0.132 0.088
#> SRR1699936 5 0.7881 -0.01435 0.004 0.208 0.024 0.112 0.352 0.300
#> SRR1699937 2 0.7420 0.49424 0.084 0.480 0.056 0.124 0.000 0.256
#> SRR1699938 2 0.3817 0.61006 0.004 0.744 0.008 0.000 0.016 0.228
#> SRR1699940 6 0.8228 0.39731 0.000 0.124 0.312 0.088 0.136 0.340
#> SRR1699939 2 0.5617 0.58811 0.004 0.644 0.028 0.024 0.060 0.240
#> SRR1699941 3 0.8158 0.37964 0.096 0.076 0.460 0.216 0.024 0.128
#> SRR1699942 6 0.7716 0.23321 0.000 0.232 0.040 0.216 0.092 0.420
#> SRR1699943 2 0.4028 0.60641 0.004 0.732 0.016 0.000 0.016 0.232
#> SRR1699944 2 0.4726 0.59498 0.000 0.656 0.024 0.004 0.028 0.288
#> SRR1699945 1 0.6846 0.21405 0.468 0.016 0.344 0.088 0.004 0.080
#> SRR1699946 2 0.4896 0.60274 0.008 0.688 0.036 0.016 0.012 0.240
#> SRR1699947 2 0.6393 0.41535 0.000 0.476 0.072 0.000 0.104 0.348
#> SRR1699948 2 0.4564 0.61573 0.004 0.700 0.008 0.032 0.012 0.244
#> SRR1699949 2 0.8027 0.14658 0.004 0.356 0.044 0.092 0.280 0.224
#> SRR1699950 2 0.6946 0.54677 0.008 0.544 0.012 0.116 0.112 0.208
#> SRR1699951 4 0.8488 -0.03388 0.004 0.228 0.072 0.352 0.160 0.184
#> SRR1699952 2 0.7945 0.42787 0.000 0.440 0.096 0.140 0.096 0.228
#> SRR1699953 2 0.6101 0.58594 0.000 0.612 0.032 0.044 0.084 0.228
#> SRR1699954 2 0.8420 0.33585 0.136 0.364 0.128 0.076 0.012 0.284
#> SRR1699955 2 0.6941 0.43195 0.012 0.500 0.024 0.024 0.236 0.204
#> SRR1699956 3 0.7609 0.35590 0.224 0.048 0.460 0.176 0.000 0.092
#> SRR1699957 2 0.6556 0.59473 0.008 0.596 0.064 0.096 0.028 0.208
#> SRR1699959 3 0.7203 0.40006 0.032 0.124 0.548 0.204 0.020 0.072
#> SRR1699958 4 0.6166 0.16017 0.000 0.000 0.068 0.584 0.164 0.184
#> SRR1699960 5 0.8378 0.01936 0.000 0.208 0.048 0.196 0.280 0.268
#> SRR1699961 3 0.8666 0.24168 0.100 0.180 0.364 0.188 0.008 0.160
#> SRR1699962 2 0.4923 0.64222 0.004 0.740 0.020 0.108 0.020 0.108
#> SRR1699963 6 0.8457 0.27485 0.008 0.148 0.240 0.096 0.124 0.384
#> SRR1699964 3 0.8582 -0.23390 0.000 0.232 0.324 0.096 0.172 0.176
#> SRR1699965 2 0.6056 0.57694 0.008 0.636 0.012 0.184 0.052 0.108
#> SRR1699966 3 0.7282 0.23369 0.004 0.088 0.420 0.368 0.052 0.068
#> SRR1699967 2 0.6567 0.55051 0.008 0.584 0.028 0.188 0.036 0.156
#> SRR1699968 4 0.7388 0.20398 0.000 0.072 0.156 0.532 0.124 0.116
#> SRR1699969 3 0.4909 0.23378 0.020 0.004 0.496 0.464 0.004 0.012
#> SRR1699971 6 0.8168 0.15627 0.036 0.268 0.304 0.044 0.040 0.308
#> SRR1699970 2 0.5582 0.52583 0.004 0.596 0.012 0.008 0.092 0.288
#> SRR1699972 3 0.7492 -0.11824 0.036 0.092 0.424 0.056 0.032 0.360
#> SRR1699973 4 0.8402 -0.21615 0.004 0.076 0.128 0.368 0.196 0.228
#> SRR1699974 1 0.6851 0.07212 0.468 0.036 0.328 0.140 0.004 0.024
#> SRR1699975 5 0.7486 -0.28724 0.000 0.000 0.168 0.184 0.332 0.316
#> SRR1699976 2 0.8242 -0.04253 0.048 0.328 0.260 0.212 0.000 0.152
#> SRR1699977 6 0.7862 0.31529 0.016 0.024 0.344 0.160 0.096 0.360
#> SRR1699978 3 0.7333 0.33590 0.188 0.004 0.388 0.344 0.024 0.052
#> SRR1699979 4 0.6144 -0.25727 0.004 0.052 0.432 0.452 0.016 0.044
#> SRR1699980 5 0.6732 0.15907 0.000 0.000 0.044 0.232 0.408 0.316
#> SRR1699981 4 0.6865 -0.04158 0.000 0.000 0.204 0.464 0.080 0.252
#> SRR1699982 5 0.3373 0.52020 0.000 0.004 0.056 0.036 0.848 0.056
#> SRR1699983 5 0.6251 0.44401 0.000 0.128 0.072 0.096 0.648 0.056
#> SRR1699984 1 0.1007 0.76383 0.968 0.000 0.008 0.004 0.004 0.016
#> SRR1699985 5 0.7353 0.07217 0.000 0.020 0.076 0.300 0.412 0.192
#> SRR1699986 3 0.7815 0.01325 0.204 0.004 0.472 0.156 0.076 0.088
#> SRR1699988 6 0.8363 0.30134 0.004 0.224 0.060 0.148 0.200 0.364
#> SRR1699987 4 0.5222 0.27594 0.000 0.000 0.196 0.676 0.060 0.068
#> SRR1699989 5 0.6875 0.27117 0.000 0.024 0.144 0.292 0.488 0.052
#> SRR1699990 4 0.5823 0.11581 0.000 0.004 0.284 0.584 0.052 0.076
#> SRR1699992 2 0.8299 0.11609 0.132 0.388 0.220 0.168 0.000 0.092
#> SRR1699991 3 0.4429 0.28811 0.000 0.000 0.548 0.424 0.000 0.028
#> SRR1699993 4 0.5527 -0.08200 0.020 0.012 0.396 0.532 0.020 0.020
#> SRR1699994 3 0.7257 0.41711 0.176 0.068 0.516 0.196 0.004 0.040
#> SRR1699995 3 0.7154 0.40517 0.264 0.016 0.396 0.288 0.008 0.028
#> SRR1699996 2 0.8162 0.12946 0.000 0.412 0.172 0.144 0.196 0.076
#> SRR1699997 4 0.5728 0.21310 0.000 0.000 0.064 0.572 0.304 0.060
#> SRR1699998 6 0.8269 0.49240 0.000 0.180 0.116 0.144 0.144 0.416
#> SRR1699999 1 0.3830 0.68943 0.808 0.004 0.120 0.048 0.008 0.012
#> SRR1700000 6 0.8387 0.47765 0.000 0.096 0.200 0.192 0.136 0.376
#> SRR1700002 3 0.6815 0.23987 0.016 0.188 0.588 0.092 0.024 0.092
#> SRR1700001 3 0.5733 0.34248 0.072 0.048 0.704 0.120 0.044 0.012
#> SRR1700003 4 0.6617 -0.02382 0.004 0.000 0.100 0.476 0.088 0.332
#> SRR1700004 3 0.5391 0.39102 0.020 0.048 0.568 0.352 0.000 0.012
#> SRR1700005 1 0.3538 0.69149 0.836 0.000 0.076 0.004 0.040 0.044
#> SRR1700006 3 0.5411 0.41559 0.008 0.040 0.684 0.188 0.008 0.072
#> SRR1700007 5 0.3594 0.52405 0.000 0.020 0.012 0.048 0.832 0.088
#> SRR1700008 4 0.5112 0.03806 0.000 0.008 0.412 0.532 0.032 0.016
#> SRR1700009 1 0.1706 0.76430 0.936 0.000 0.032 0.024 0.004 0.004
#> SRR1700010 1 0.6679 0.38259 0.548 0.024 0.264 0.084 0.004 0.076
#> SRR1700011 5 0.7765 -0.04056 0.000 0.200 0.044 0.080 0.372 0.304
#> SRR1700013 4 0.7306 -0.31408 0.012 0.176 0.372 0.372 0.012 0.056
#> SRR1700012 6 0.7694 0.44535 0.004 0.012 0.256 0.176 0.148 0.404
#> SRR1700014 4 0.5952 -0.16734 0.000 0.000 0.400 0.468 0.036 0.096
#> SRR1700015 3 0.8049 0.34900 0.076 0.148 0.444 0.208 0.004 0.120
#> SRR1700016 3 0.6637 0.00625 0.084 0.000 0.600 0.148 0.128 0.040
#> SRR1700018 3 0.7744 0.30151 0.012 0.052 0.388 0.308 0.040 0.200
#> SRR1700017 3 0.7197 0.39521 0.072 0.076 0.568 0.156 0.008 0.120
#> SRR1700019 4 0.8122 -0.10451 0.000 0.240 0.036 0.324 0.256 0.144
#> SRR1700020 4 0.4074 0.19511 0.000 0.000 0.288 0.684 0.004 0.024
#> SRR1700021 5 0.7422 0.28900 0.000 0.068 0.068 0.256 0.480 0.128
#> SRR1700023 3 0.6103 0.36001 0.000 0.052 0.496 0.368 0.004 0.080
#> SRR1700022 3 0.6470 0.37285 0.036 0.040 0.612 0.192 0.012 0.108
#> SRR1700024 5 0.5997 0.33186 0.000 0.012 0.040 0.260 0.588 0.100
#> SRR1700025 3 0.8350 0.22254 0.064 0.244 0.340 0.196 0.000 0.156
#> SRR1700026 3 0.7862 0.39558 0.032 0.100 0.420 0.312 0.028 0.108
#> SRR1700027 3 0.7787 0.39614 0.028 0.144 0.436 0.280 0.020 0.092
#> SRR1700028 4 0.5678 0.19887 0.000 0.000 0.064 0.564 0.320 0.052
#> SRR1700029 4 0.5381 0.16926 0.000 0.008 0.280 0.624 0.044 0.044
#> SRR1700030 5 0.6863 0.11399 0.000 0.000 0.048 0.304 0.376 0.272
#> SRR1700031 3 0.6855 0.45549 0.124 0.020 0.504 0.280 0.000 0.072
#> SRR1700032 2 0.8256 -0.12974 0.012 0.300 0.228 0.280 0.020 0.160
#> SRR1700034 1 0.5655 0.51433 0.656 0.016 0.208 0.080 0.004 0.036
#> SRR1700035 5 0.6385 0.36135 0.000 0.000 0.032 0.324 0.460 0.184
#> SRR1700033 3 0.5908 0.46827 0.096 0.020 0.636 0.212 0.008 0.028
#> SRR1700036 4 0.6521 0.22018 0.000 0.012 0.168 0.584 0.100 0.136
#> SRR1700037 5 0.4710 0.53246 0.000 0.004 0.036 0.084 0.740 0.136
#> SRR1700038 3 0.7357 0.04452 0.000 0.016 0.452 0.256 0.156 0.120
#> SRR1700039 3 0.4528 0.24105 0.012 0.000 0.524 0.452 0.004 0.008
#> SRR1700040 3 0.4325 0.19384 0.000 0.000 0.504 0.480 0.008 0.008
#> SRR1700041 4 0.5753 -0.01359 0.000 0.000 0.348 0.532 0.036 0.084
#> SRR1700042 3 0.6144 0.43890 0.036 0.008 0.576 0.292 0.024 0.064
#> SRR1700043 3 0.6258 0.35157 0.044 0.040 0.628 0.216 0.052 0.020
#> SRR1700045 3 0.5026 0.31590 0.004 0.016 0.588 0.360 0.016 0.016
#> SRR1700044 6 0.8555 0.21633 0.012 0.064 0.248 0.244 0.116 0.316
#> SRR1700046 3 0.5672 0.42100 0.004 0.028 0.584 0.304 0.004 0.076
#> SRR1700047 4 0.4806 -0.06389 0.012 0.008 0.400 0.560 0.000 0.020
#> SRR1700048 4 0.7441 -0.11037 0.000 0.004 0.308 0.316 0.272 0.100
#> SRR1700049 3 0.6251 0.44493 0.132 0.012 0.512 0.324 0.008 0.012
#> SRR1700050 4 0.6660 -0.04396 0.016 0.000 0.344 0.436 0.180 0.024
#> SRR1700051 3 0.6744 0.11475 0.024 0.000 0.500 0.312 0.092 0.072
#> SRR1700052 3 0.6907 0.39925 0.064 0.016 0.500 0.328 0.048 0.044
#> SRR1700053 4 0.5443 0.38105 0.000 0.000 0.048 0.664 0.152 0.136
#> SRR1700054 3 0.5604 0.22823 0.000 0.008 0.476 0.428 0.012 0.076
#> SRR1700055 1 0.1881 0.76476 0.928 0.000 0.044 0.008 0.008 0.012
#> SRR1700056 4 0.3893 0.30015 0.000 0.000 0.220 0.744 0.016 0.020
#> SRR1700057 4 0.3783 0.43674 0.000 0.000 0.052 0.816 0.060 0.072
#> SRR1700058 3 0.5293 0.41864 0.052 0.012 0.584 0.340 0.004 0.008
#> SRR1700059 4 0.2699 0.45815 0.000 0.000 0.028 0.884 0.048 0.040
#> SRR1700060 3 0.5622 0.29516 0.048 0.004 0.500 0.416 0.008 0.024
#> SRR1700061 4 0.4446 -0.10856 0.000 0.000 0.444 0.532 0.004 0.020
#> SRR1700062 4 0.3787 0.32437 0.008 0.000 0.208 0.760 0.008 0.016
#> SRR1700063 4 0.4444 -0.10770 0.000 0.000 0.436 0.536 0.000 0.028
#> SRR1700064 3 0.7120 -0.11207 0.000 0.004 0.348 0.320 0.268 0.060
#> SRR1700065 3 0.7491 -0.37350 0.008 0.000 0.392 0.172 0.140 0.288
#> SRR1700066 3 0.4837 0.40923 0.084 0.012 0.724 0.164 0.004 0.012
#> SRR1700067 5 0.4174 0.53465 0.000 0.000 0.048 0.104 0.784 0.064
#> SRR1700068 4 0.4482 0.36834 0.000 0.000 0.128 0.756 0.048 0.068
#> SRR1700069 4 0.5303 0.36053 0.000 0.000 0.076 0.692 0.120 0.112
#> SRR1700070 4 0.8744 -0.05259 0.004 0.148 0.172 0.344 0.140 0.192
#> SRR1700071 4 0.6305 -0.02177 0.008 0.016 0.324 0.532 0.032 0.088
#> SRR1700072 3 0.6970 -0.09811 0.004 0.004 0.516 0.184 0.184 0.108
#> SRR1700073 5 0.5079 0.52328 0.000 0.000 0.048 0.116 0.704 0.132
#> SRR1700075 3 0.7490 0.22995 0.012 0.008 0.400 0.328 0.148 0.104
#> SRR1700074 3 0.6722 0.45347 0.056 0.072 0.520 0.308 0.004 0.040
#> SRR1700076 4 0.7825 -0.31619 0.048 0.248 0.292 0.352 0.004 0.056
#> SRR1700077 3 0.7812 0.40188 0.064 0.144 0.484 0.208 0.012 0.088
#> SRR1700078 4 0.5737 0.19200 0.000 0.000 0.240 0.612 0.068 0.080
#> SRR1700080 4 0.6059 0.07038 0.000 0.012 0.284 0.568 0.040 0.096
#> SRR1700079 4 0.7330 -0.16718 0.000 0.000 0.316 0.344 0.112 0.228
#> SRR1700081 3 0.6961 0.33123 0.328 0.032 0.424 0.196 0.004 0.016
#> SRR1700082 3 0.7380 -0.00944 0.048 0.020 0.480 0.124 0.040 0.288
#> SRR1700083 3 0.4578 0.33965 0.004 0.000 0.616 0.348 0.016 0.016
#> SRR1700084 3 0.5213 0.43509 0.084 0.028 0.708 0.160 0.004 0.016
#> SRR1700085 4 0.6250 0.32967 0.000 0.008 0.056 0.584 0.208 0.144
#> SRR1700086 4 0.7344 -0.13070 0.000 0.000 0.104 0.328 0.276 0.292
#> SRR1700087 4 0.7738 -0.40805 0.000 0.004 0.232 0.300 0.176 0.288
#> SRR1700088 3 0.7800 0.01054 0.016 0.228 0.464 0.072 0.048 0.172
#> SRR1700089 4 0.7984 -0.18243 0.004 0.088 0.340 0.368 0.108 0.092
#> SRR1700091 4 0.5824 0.21790 0.004 0.072 0.204 0.652 0.028 0.040
#> SRR1700090 4 0.4600 0.34327 0.000 0.000 0.056 0.708 0.212 0.024
#> SRR1700092 4 0.6610 0.16676 0.004 0.112 0.200 0.588 0.028 0.068
#> SRR1700094 4 0.5544 -0.12370 0.000 0.028 0.404 0.512 0.008 0.048
#> SRR1700093 4 0.2425 0.41584 0.000 0.000 0.088 0.884 0.004 0.024
#> SRR1700095 4 0.2830 0.38885 0.000 0.000 0.144 0.836 0.000 0.020
#> SRR1700096 4 0.4083 0.21389 0.000 0.008 0.284 0.688 0.000 0.020
#> SRR1700097 4 0.5273 0.09795 0.000 0.000 0.380 0.544 0.048 0.028
#> SRR1700098 4 0.6964 0.01505 0.004 0.292 0.152 0.480 0.016 0.056
#> SRR1700099 4 0.2364 0.43861 0.000 0.004 0.052 0.904 0.020 0.020
#> SRR1700100 4 0.6016 0.10598 0.000 0.000 0.100 0.584 0.072 0.244
#> SRR1700101 4 0.5538 0.25851 0.008 0.040 0.212 0.672 0.028 0.040
#> SRR1700102 4 0.7792 -0.02809 0.000 0.088 0.288 0.424 0.108 0.092
#> SRR1700104 4 0.2790 0.37540 0.000 0.000 0.132 0.844 0.000 0.024
#> SRR1700103 4 0.4680 0.20565 0.000 0.028 0.264 0.676 0.004 0.028
#> SRR1700105 4 0.4299 0.43316 0.000 0.048 0.076 0.796 0.060 0.020
#> SRR1700106 4 0.5118 -0.10633 0.000 0.000 0.084 0.512 0.404 0.000
#> SRR1700107 4 0.5937 0.21181 0.000 0.000 0.064 0.596 0.232 0.108
#> SRR1700108 4 0.4356 0.44645 0.000 0.012 0.060 0.780 0.112 0.036
#> SRR1700109 5 0.6438 0.43294 0.000 0.048 0.016 0.284 0.536 0.116
#> SRR1700110 4 0.5760 0.40409 0.000 0.076 0.036 0.684 0.132 0.072
#> SRR1700112 4 0.3827 0.34169 0.000 0.004 0.000 0.720 0.256 0.020
#> SRR1700111 5 0.6503 0.18985 0.000 0.000 0.164 0.248 0.520 0.068
#> SRR1700113 4 0.5177 0.09258 0.000 0.000 0.004 0.548 0.364 0.084
#> SRR1700114 4 0.2949 0.38332 0.000 0.000 0.140 0.832 0.000 0.028
#> SRR1700115 4 0.2763 0.46168 0.000 0.000 0.028 0.876 0.072 0.024
#> SRR1700116 4 0.6738 -0.14286 0.000 0.000 0.052 0.444 0.232 0.272
#> SRR1700117 4 0.5943 0.22251 0.004 0.000 0.164 0.576 0.232 0.024
#> SRR1700119 4 0.2252 0.44746 0.000 0.000 0.044 0.908 0.028 0.020
#> SRR1700118 4 0.7110 -0.20493 0.000 0.000 0.112 0.416 0.300 0.172
#> SRR1700120 4 0.5547 0.06143 0.012 0.000 0.404 0.512 0.052 0.020
#> SRR1700121 4 0.3342 0.45705 0.000 0.000 0.040 0.844 0.044 0.072
#> SRR1700122 5 0.3981 0.51192 0.000 0.000 0.024 0.092 0.792 0.092
#> SRR1700123 4 0.2545 0.45874 0.000 0.000 0.028 0.892 0.052 0.028
#> SRR1700125 4 0.5450 0.05498 0.000 0.004 0.004 0.556 0.328 0.108
#> SRR1700126 4 0.5997 -0.11911 0.040 0.008 0.412 0.484 0.012 0.044
#> SRR1700127 4 0.5324 0.17337 0.000 0.000 0.328 0.580 0.068 0.024
#> SRR1700124 4 0.1296 0.45768 0.000 0.000 0.004 0.952 0.032 0.012
#> SRR1700128 4 0.6098 0.16176 0.000 0.000 0.084 0.528 0.320 0.068
#> SRR1700129 5 0.5490 0.39159 0.000 0.000 0.020 0.320 0.568 0.092
#> SRR1700130 5 0.6365 0.30779 0.000 0.000 0.060 0.244 0.536 0.160
#> SRR1700132 4 0.5907 0.10358 0.000 0.000 0.152 0.536 0.292 0.020
#> SRR1700131 4 0.3331 0.38726 0.008 0.000 0.128 0.828 0.008 0.028
#> SRR1700133 4 0.3924 0.43109 0.000 0.000 0.016 0.772 0.168 0.044
#> SRR1700134 4 0.3956 0.31557 0.000 0.000 0.004 0.716 0.252 0.028
#> SRR1700135 4 0.6319 0.06335 0.004 0.000 0.204 0.488 0.284 0.020
#> SRR1700136 4 0.2313 0.44071 0.004 0.000 0.060 0.904 0.016 0.016
#> SRR1700137 4 0.2169 0.46187 0.000 0.000 0.008 0.900 0.080 0.012
#> SRR1700138 4 0.2375 0.46015 0.000 0.000 0.020 0.896 0.068 0.016
#> SRR1700140 4 0.5134 0.23990 0.000 0.000 0.044 0.624 0.292 0.040
#> SRR1700139 4 0.5410 0.18470 0.000 0.000 0.036 0.600 0.296 0.068
#> SRR1700141 5 0.5573 0.42732 0.000 0.000 0.016 0.300 0.568 0.116
#> SRR1700142 4 0.6286 0.06507 0.004 0.000 0.300 0.496 0.176 0.024
#> SRR1700143 4 0.1851 0.45240 0.000 0.000 0.024 0.928 0.036 0.012
#> SRR1700144 3 0.6314 0.08691 0.000 0.000 0.468 0.332 0.168 0.032
#> SRR1700145 4 0.6267 0.11675 0.000 0.000 0.064 0.564 0.168 0.204
#> SRR1700146 4 0.3830 0.38123 0.000 0.000 0.000 0.744 0.212 0.044
#> SRR1700147 4 0.6846 0.17399 0.000 0.004 0.208 0.492 0.220 0.076
#> SRR1700149 4 0.6324 0.12184 0.000 0.000 0.088 0.568 0.136 0.208
#> SRR1700148 4 0.3692 0.44054 0.000 0.000 0.092 0.816 0.064 0.028
#> SRR1700150 5 0.5037 0.37628 0.000 0.000 0.080 0.380 0.540 0.000
#> SRR1700152 4 0.5614 0.04252 0.000 0.000 0.052 0.524 0.376 0.048
#> SRR1700151 4 0.1692 0.45855 0.000 0.000 0.008 0.932 0.048 0.012
#> SRR1700153 4 0.5977 0.19598 0.000 0.000 0.064 0.580 0.256 0.100
#> SRR1700154 4 0.2251 0.45952 0.000 0.000 0.036 0.904 0.052 0.008
#> SRR1700155 4 0.4485 0.35075 0.000 0.000 0.012 0.716 0.200 0.072
#> SRR1700156 4 0.2122 0.44731 0.000 0.000 0.032 0.916 0.028 0.024
#> SRR1700158 4 0.3878 0.39522 0.008 0.004 0.160 0.788 0.028 0.012
#> SRR1700159 4 0.6199 -0.13288 0.000 0.024 0.012 0.468 0.384 0.112
#> SRR1700157 4 0.7970 -0.38561 0.012 0.000 0.208 0.280 0.232 0.268
#> SRR1700160 4 0.1949 0.45564 0.000 0.000 0.020 0.924 0.036 0.020
#> SRR1700161 4 0.2152 0.45223 0.000 0.000 0.040 0.912 0.036 0.012
#> SRR1700162 4 0.5109 0.15520 0.000 0.008 0.004 0.608 0.308 0.072
#> SRR1700164 4 0.5708 0.28401 0.000 0.000 0.216 0.608 0.144 0.032
#> SRR1700163 4 0.3425 0.44914 0.000 0.000 0.084 0.836 0.048 0.032
#> SRR1700165 4 0.2562 0.35916 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1700166 4 0.4472 0.44736 0.000 0.032 0.084 0.772 0.100 0.012
#> SRR1700168 5 0.4921 0.44035 0.000 0.000 0.056 0.352 0.584 0.008
#> SRR1700167 4 0.6404 0.11477 0.004 0.000 0.108 0.564 0.096 0.228
#> SRR1700170 5 0.5711 0.38554 0.000 0.000 0.032 0.312 0.560 0.096
#> SRR1700169 4 0.2843 0.44839 0.000 0.000 0.048 0.876 0.044 0.032
#> SRR1700171 4 0.5409 0.37769 0.000 0.000 0.104 0.668 0.172 0.056
#> SRR1700172 4 0.2614 0.45505 0.000 0.000 0.036 0.888 0.052 0.024
#> SRR1700174 4 0.2213 0.45707 0.000 0.000 0.048 0.908 0.032 0.012
#> SRR1700173 4 0.1528 0.46159 0.000 0.000 0.000 0.936 0.048 0.016
#> SRR1700175 4 0.3769 0.43666 0.000 0.000 0.012 0.776 0.176 0.036
#> SRR1700176 4 0.6178 0.06118 0.008 0.000 0.336 0.480 0.164 0.012
#> SRR1700178 2 0.4427 0.62084 0.056 0.740 0.004 0.020 0.000 0.180
#> SRR1700177 4 0.5341 0.20744 0.000 0.000 0.044 0.604 0.300 0.052
#> SRR1700180 2 0.4412 0.61048 0.000 0.716 0.024 0.000 0.040 0.220
#> SRR1700179 2 0.5106 0.61991 0.060 0.692 0.012 0.024 0.004 0.208
#> SRR1700181 2 0.4491 0.61606 0.080 0.736 0.000 0.008 0.008 0.168
#> SRR1700183 1 0.0820 0.76393 0.972 0.000 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700182 2 0.5204 0.60817 0.084 0.688 0.008 0.024 0.004 0.192
#> SRR1700184 2 0.4891 0.61808 0.072 0.708 0.008 0.024 0.000 0.188
#> SRR1700186 2 0.5100 0.60837 0.076 0.688 0.008 0.028 0.000 0.200
#> SRR1700187 1 0.2290 0.76535 0.912 0.020 0.040 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700185 1 0.1010 0.76652 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700188 2 0.5007 0.60789 0.072 0.684 0.008 0.020 0.000 0.216
#> SRR1700192 1 0.6724 -0.01212 0.444 0.388 0.056 0.076 0.000 0.036
#> SRR1700190 1 0.7321 0.46361 0.548 0.080 0.172 0.096 0.004 0.100
#> SRR1700191 1 0.2103 0.73594 0.916 0.000 0.040 0.000 0.020 0.024
#> SRR1700189 1 0.4951 0.66085 0.764 0.084 0.052 0.056 0.008 0.036
#> SRR1700193 2 0.3969 0.62835 0.064 0.780 0.000 0.016 0.000 0.140
#> SRR1700195 2 0.3301 0.60726 0.000 0.844 0.024 0.000 0.064 0.068
#> SRR1700194 1 0.1668 0.75864 0.928 0.008 0.060 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.3125 0.64455 0.016 0.856 0.008 0.008 0.012 0.100
#> SRR1700197 1 0.2501 0.76318 0.900 0.016 0.040 0.008 0.000 0.036
#> SRR1700198 2 0.3219 0.63738 0.068 0.848 0.000 0.020 0.000 0.064
#> SRR1700199 2 0.4518 0.52194 0.000 0.752 0.036 0.000 0.112 0.100
#> SRR1700200 2 0.1844 0.62590 0.000 0.928 0.016 0.000 0.040 0.016
#> SRR1700201 2 0.5034 0.63149 0.056 0.728 0.008 0.104 0.000 0.104
#> SRR1700202 2 0.8065 0.37405 0.224 0.476 0.032 0.084 0.084 0.100
#> SRR1700203 2 0.5777 0.37398 0.000 0.632 0.044 0.004 0.148 0.172
#> SRR1700204 2 0.6064 0.56914 0.000 0.656 0.028 0.108 0.116 0.092
#> SRR1700206 2 0.5258 0.58584 0.060 0.704 0.008 0.176 0.012 0.040
#> SRR1700207 2 0.4953 0.62977 0.016 0.740 0.004 0.132 0.036 0.072
#> SRR1700208 1 0.6365 0.20263 0.520 0.344 0.040 0.052 0.004 0.040
#> SRR1700205 2 0.6691 0.23666 0.000 0.532 0.060 0.020 0.256 0.132
#> SRR1700209 2 0.3894 0.60081 0.004 0.784 0.004 0.164 0.028 0.016
#> SRR1700210 2 0.5655 0.40710 0.000 0.648 0.044 0.004 0.156 0.148
#> SRR1700211 2 0.2788 0.61363 0.004 0.880 0.016 0.000 0.056 0.044
#> SRR1700212 2 0.4748 0.52507 0.000 0.728 0.040 0.000 0.084 0.148
#> SRR1700213 2 0.4938 0.60701 0.008 0.748 0.028 0.132 0.028 0.056
#> SRR1700214 2 0.1961 0.63821 0.012 0.932 0.004 0.016 0.016 0.020
#> SRR1700215 1 0.1026 0.76589 0.968 0.000 0.012 0.008 0.004 0.008
#> SRR1700217 2 0.2609 0.63008 0.004 0.868 0.000 0.112 0.008 0.008
#> SRR1700216 1 0.2917 0.70744 0.872 0.000 0.048 0.000 0.040 0.040
#> SRR1700218 2 0.4710 0.60749 0.048 0.748 0.004 0.148 0.008 0.044
#> SRR1700219 2 0.3492 0.59671 0.012 0.796 0.000 0.172 0.004 0.016
#> SRR1700222 1 0.1647 0.76760 0.940 0.016 0.032 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700220 2 0.5012 0.53325 0.008 0.676 0.008 0.244 0.048 0.016
#> SRR1700221 2 0.1481 0.63176 0.016 0.952 0.004 0.008 0.008 0.012
#> SRR1700223 2 0.4583 0.62373 0.000 0.768 0.012 0.100 0.072 0.048
#> SRR1700224 2 0.7522 0.37173 0.004 0.536 0.116 0.096 0.136 0.112
#> SRR1700226 2 0.5274 0.59079 0.000 0.716 0.016 0.104 0.060 0.104
#> SRR1700229 2 0.6856 0.23191 0.000 0.508 0.064 0.016 0.248 0.164
#> SRR1700225 2 0.7108 0.41385 0.000 0.572 0.100 0.092 0.120 0.116
#> SRR1700227 2 0.3690 0.62317 0.004 0.808 0.016 0.000 0.044 0.128
#> SRR1700230 1 0.2325 0.76305 0.912 0.028 0.028 0.016 0.000 0.016
#> SRR1700231 2 0.2822 0.62609 0.004 0.876 0.012 0.000 0.048 0.060
#> SRR1700228 2 0.4050 0.60050 0.008 0.808 0.020 0.008 0.076 0.080
#> SRR1700232 2 0.5084 0.61464 0.008 0.744 0.012 0.072 0.088 0.076
#> SRR1700233 2 0.3467 0.62662 0.004 0.828 0.004 0.120 0.028 0.016
#> SRR1700234 2 0.3328 0.63293 0.024 0.844 0.004 0.104 0.012 0.012
#> SRR1700235 2 0.6192 0.49671 0.024 0.608 0.044 0.244 0.012 0.068
#> SRR1700237 2 0.1950 0.62809 0.000 0.924 0.016 0.000 0.032 0.028
#> SRR1700236 2 0.5581 0.54490 0.000 0.668 0.032 0.016 0.136 0.148
#> SRR1700238 2 0.1938 0.63469 0.024 0.932 0.004 0.012 0.008 0.020
#> SRR1700239 1 0.1598 0.76746 0.940 0.004 0.040 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.4258 0.66095 0.796 0.000 0.084 0.016 0.056 0.048
#> SRR1700241 4 0.7292 -0.03601 0.060 0.328 0.132 0.444 0.020 0.016
#> SRR1700243 2 0.1519 0.63375 0.004 0.948 0.004 0.008 0.008 0.028
#> SRR1700244 2 0.2099 0.64207 0.008 0.924 0.012 0.036 0.008 0.012
#> SRR1700242 2 0.5477 0.24961 0.412 0.496 0.004 0.080 0.004 0.004
#> SRR1700246 2 0.6172 0.33956 0.004 0.600 0.076 0.000 0.188 0.132
#> SRR1700245 2 0.4628 0.60349 0.000 0.712 0.024 0.000 0.064 0.200
#> SRR1700247 1 0.6924 0.27046 0.496 0.000 0.164 0.012 0.076 0.252
#> SRR1700249 1 0.0547 0.76539 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.4897 0.58969 0.004 0.680 0.020 0.000 0.064 0.232
#> SRR1700248 2 0.3879 0.63671 0.036 0.792 0.004 0.024 0.000 0.144
#> SRR1700251 2 0.4124 0.61928 0.004 0.812 0.016 0.044 0.056 0.068
#> SRR1700252 2 0.8249 0.30840 0.160 0.420 0.168 0.076 0.004 0.172
#> SRR1700253 2 0.4934 0.55823 0.000 0.708 0.028 0.008 0.184 0.072
#> SRR1700256 2 0.4597 0.57648 0.000 0.748 0.036 0.004 0.072 0.140
#> SRR1700254 1 0.4418 0.67137 0.792 0.016 0.076 0.004 0.056 0.056
#> SRR1700255 2 0.2715 0.64561 0.016 0.888 0.004 0.064 0.020 0.008
#> SRR1700257 2 0.3404 0.63248 0.052 0.832 0.000 0.096 0.000 0.020
#> SRR1700258 2 0.4905 0.62304 0.004 0.748 0.016 0.124 0.048 0.060
#> SRR1700259 2 0.7498 0.45288 0.008 0.476 0.012 0.156 0.172 0.176
#> SRR1700260 5 0.6657 0.31474 0.000 0.164 0.032 0.104 0.592 0.108
#> SRR1700261 4 0.7274 0.13168 0.000 0.080 0.040 0.480 0.268 0.132
#> SRR1700262 5 0.4623 0.53717 0.000 0.044 0.016 0.088 0.768 0.084
#> SRR1700263 2 0.8064 -0.16867 0.000 0.336 0.108 0.064 0.328 0.164
#> SRR1700264 2 0.6660 0.57411 0.008 0.572 0.044 0.064 0.064 0.248
#> SRR1700265 2 0.6855 0.34247 0.008 0.504 0.148 0.008 0.060 0.272
#> SRR1700266 2 0.6702 0.51380 0.008 0.552 0.024 0.036 0.156 0.224
#> SRR1700268 2 0.6963 0.45248 0.124 0.576 0.100 0.156 0.004 0.040
#> SRR1700270 2 0.3018 0.64323 0.004 0.856 0.004 0.104 0.008 0.024
#> SRR1700267 2 0.6632 0.58174 0.000 0.592 0.024 0.132 0.116 0.136
#> SRR1700271 2 0.7293 0.48665 0.000 0.500 0.028 0.192 0.108 0.172
#> SRR1700272 5 0.7973 0.06524 0.000 0.248 0.036 0.156 0.384 0.176
#> SRR1700273 2 0.5168 0.64124 0.000 0.716 0.016 0.076 0.048 0.144
#> SRR1700274 5 0.6949 0.28815 0.000 0.204 0.052 0.192 0.520 0.032
#> SRR1700277 3 0.8608 0.26818 0.176 0.132 0.384 0.180 0.008 0.120
#> SRR1700275 4 0.6990 0.05010 0.000 0.348 0.016 0.420 0.160 0.056
#> SRR1700276 5 0.7846 0.31553 0.000 0.224 0.036 0.268 0.372 0.100
#> SRR1700278 2 0.7241 0.30084 0.008 0.492 0.072 0.268 0.132 0.028
#> SRR1700279 5 0.4690 0.49416 0.000 0.068 0.008 0.028 0.736 0.160
#> SRR1700280 2 0.6382 -0.00720 0.000 0.432 0.016 0.036 0.416 0.100
#> SRR1700281 2 0.6965 0.47606 0.008 0.564 0.040 0.056 0.164 0.168
#> SRR1700283 5 0.2856 0.50502 0.000 0.004 0.052 0.016 0.876 0.052
#> SRR1700282 4 0.7423 -0.09012 0.004 0.284 0.248 0.392 0.044 0.028
#> SRR1700284 5 0.6576 0.32043 0.000 0.040 0.016 0.340 0.476 0.128
#> SRR1700285 2 0.8377 0.04121 0.008 0.328 0.136 0.300 0.172 0.056
#> SRR1700286 2 0.7434 0.38929 0.000 0.488 0.044 0.220 0.152 0.096
#> SRR1700287 5 0.4733 0.53011 0.000 0.024 0.016 0.224 0.704 0.032
#> SRR1700290 4 0.6557 -0.23219 0.088 0.020 0.408 0.444 0.020 0.020
#> SRR1700289 5 0.3508 0.49771 0.000 0.012 0.044 0.024 0.840 0.080
#> SRR1700288 2 0.4431 0.56621 0.008 0.740 0.016 0.200 0.020 0.016
#> SRR1700292 5 0.5273 0.41700 0.000 0.132 0.056 0.016 0.712 0.084
#> SRR1700291 4 0.4415 0.43453 0.000 0.000 0.096 0.756 0.120 0.028
#> SRR1700293 2 0.6589 0.21368 0.008 0.468 0.056 0.360 0.104 0.004
#> SRR1700294 5 0.4464 0.51458 0.000 0.072 0.052 0.060 0.788 0.028
#> SRR1700295 4 0.4810 0.19750 0.000 0.000 0.012 0.604 0.340 0.044
#> SRR1700297 5 0.4073 0.54180 0.000 0.024 0.036 0.092 0.808 0.040
#> SRR1700296 5 0.3216 0.52730 0.000 0.004 0.008 0.040 0.840 0.108
#> SRR1700298 4 0.5709 0.27396 0.004 0.036 0.032 0.636 0.248 0.044
#> SRR1700299 5 0.6782 0.33881 0.000 0.128 0.104 0.052 0.596 0.120
#> SRR1700300 5 0.5552 0.36134 0.000 0.000 0.236 0.084 0.628 0.052
#> SRR1700302 5 0.5419 0.49188 0.000 0.004 0.008 0.256 0.608 0.124
#> SRR1700301 5 0.6277 0.43648 0.000 0.088 0.004 0.260 0.560 0.088
#> SRR1700303 5 0.6233 0.22866 0.000 0.040 0.008 0.368 0.484 0.100
#> SRR1700304 2 0.7969 0.17933 0.076 0.416 0.020 0.252 0.200 0.036
#> SRR1700305 4 0.7471 -0.03843 0.004 0.284 0.028 0.388 0.248 0.048
#> SRR1700306 5 0.6767 0.37553 0.004 0.000 0.140 0.260 0.504 0.092
#> SRR1700308 5 0.7198 0.10925 0.000 0.024 0.260 0.076 0.472 0.168
#> SRR1700307 3 0.5189 0.13774 0.000 0.016 0.492 0.452 0.024 0.016
#> SRR1700309 6 0.8271 0.40071 0.044 0.000 0.268 0.164 0.220 0.304
#> SRR1700310 5 0.6041 0.43501 0.000 0.016 0.016 0.272 0.560 0.136
#> SRR1700311 5 0.7585 0.34237 0.000 0.080 0.124 0.296 0.436 0.064
#> SRR1700312 4 0.6261 0.01818 0.000 0.008 0.048 0.504 0.344 0.096
#> SRR1700313 4 0.6164 0.18075 0.000 0.012 0.288 0.552 0.112 0.036
#> SRR1700314 4 0.6663 0.10623 0.000 0.000 0.156 0.440 0.340 0.064
#> SRR1700315 5 0.6295 0.40020 0.000 0.000 0.240 0.128 0.556 0.076
#> SRR1700316 4 0.8070 0.10498 0.004 0.180 0.164 0.448 0.128 0.076
#> SRR1700317 5 0.7249 0.44574 0.000 0.080 0.048 0.220 0.512 0.140
#> SRR1700318 5 0.7216 0.44686 0.000 0.164 0.044 0.192 0.520 0.080
#> SRR1700319 4 0.5489 0.36045 0.000 0.000 0.156 0.632 0.188 0.024
#> SRR1700320 5 0.6699 0.17125 0.000 0.044 0.020 0.384 0.432 0.120
#> SRR1700322 5 0.6058 0.22677 0.000 0.008 0.120 0.420 0.436 0.016
#> SRR1700321 5 0.5982 0.14618 0.000 0.024 0.012 0.416 0.464 0.084
#> SRR1700323 4 0.5561 0.34824 0.000 0.000 0.124 0.624 0.220 0.032
#> SRR1700324 5 0.6623 0.35201 0.000 0.096 0.024 0.304 0.516 0.060
#> SRR1700325 4 0.6796 0.21636 0.004 0.244 0.100 0.548 0.080 0.024
#> SRR1700326 5 0.8014 0.04163 0.004 0.072 0.300 0.196 0.364 0.064
#> SRR1700327 4 0.7083 0.17242 0.004 0.312 0.060 0.488 0.076 0.060
#> SRR1700329 5 0.3844 0.50976 0.000 0.000 0.060 0.056 0.812 0.072
#> SRR1700328 6 0.8087 0.38608 0.008 0.076 0.244 0.052 0.256 0.364
#> SRR1700330 4 0.8330 -0.10558 0.020 0.128 0.288 0.372 0.144 0.048
#> SRR1700331 5 0.7246 0.39663 0.000 0.120 0.096 0.208 0.524 0.052
#> SRR1700332 5 0.7505 0.36747 0.000 0.100 0.048 0.320 0.424 0.108
#> SRR1700333 5 0.8173 0.10067 0.004 0.304 0.136 0.112 0.368 0.076
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.313 0.740 0.863 0.4741 0.515 0.515
#> 3 3 0.242 0.477 0.705 0.3441 0.730 0.538
#> 4 4 0.369 0.440 0.678 0.1474 0.775 0.490
#> 5 5 0.441 0.417 0.628 0.0761 0.845 0.521
#> 6 6 0.520 0.474 0.636 0.0441 0.876 0.525
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 1 0.4431 0.83728 0.908 0.092
#> SRR1699875 1 0.2236 0.82614 0.964 0.036
#> SRR1699876 2 0.4161 0.84604 0.084 0.916
#> SRR1699877 1 0.7602 0.74569 0.780 0.220
#> SRR1699879 1 0.7453 0.76592 0.788 0.212
#> SRR1699878 1 0.4161 0.80353 0.916 0.084
#> SRR1699880 1 0.7528 0.75739 0.784 0.216
#> SRR1699881 1 0.8327 0.70104 0.736 0.264
#> SRR1699882 1 0.4022 0.83976 0.920 0.080
#> SRR1699883 1 0.1414 0.82003 0.980 0.020
#> SRR1699884 1 0.4815 0.83039 0.896 0.104
#> SRR1699885 1 0.2423 0.83535 0.960 0.040
#> SRR1699886 2 0.9710 0.33007 0.400 0.600
#> SRR1699888 2 0.5408 0.81624 0.124 0.876
#> SRR1699889 2 0.1843 0.86010 0.028 0.972
#> SRR1699890 1 1.0000 0.01380 0.504 0.496
#> SRR1699887 1 0.9922 0.31488 0.552 0.448
#> SRR1699891 2 0.5408 0.81894 0.124 0.876
#> SRR1699892 2 0.9522 0.37193 0.372 0.628
#> SRR1699893 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1699894 2 0.7950 0.68541 0.240 0.760
#> SRR1699895 2 0.3114 0.85552 0.056 0.944
#> SRR1699896 1 0.3733 0.83949 0.928 0.072
#> SRR1699897 1 0.5842 0.81652 0.860 0.140
#> SRR1699898 2 0.0938 0.85607 0.012 0.988
#> SRR1699900 2 0.8016 0.68801 0.244 0.756
#> SRR1699899 2 0.7602 0.72123 0.220 0.780
#> SRR1699902 2 0.2778 0.85504 0.048 0.952
#> SRR1699901 2 0.5737 0.79278 0.136 0.864
#> SRR1699903 2 0.4022 0.81917 0.080 0.920
#> SRR1699904 2 0.5178 0.81466 0.116 0.884
#> SRR1699905 2 0.5629 0.77993 0.132 0.868
#> SRR1699906 2 0.4815 0.82689 0.104 0.896
#> SRR1699907 2 0.9661 0.38634 0.392 0.608
#> SRR1699908 2 0.2043 0.85922 0.032 0.968
#> SRR1699909 2 0.2043 0.85863 0.032 0.968
#> SRR1699910 2 0.4431 0.83197 0.092 0.908
#> SRR1699911 2 0.9815 0.30949 0.420 0.580
#> SRR1699912 2 0.1414 0.85500 0.020 0.980
#> SRR1699913 2 0.0376 0.85282 0.004 0.996
#> SRR1699914 2 0.9358 0.47511 0.352 0.648
#> SRR1699915 2 0.0938 0.85444 0.012 0.988
#> SRR1699916 2 0.4815 0.82828 0.104 0.896
#> SRR1699917 2 0.0376 0.85489 0.004 0.996
#> SRR1699918 2 0.0672 0.85668 0.008 0.992
#> SRR1699919 2 0.2948 0.85800 0.052 0.948
#> SRR1699920 2 0.1184 0.85888 0.016 0.984
#> SRR1699921 2 0.2236 0.85999 0.036 0.964
#> SRR1699922 1 0.9710 0.36918 0.600 0.400
#> SRR1699923 2 0.9286 0.51334 0.344 0.656
#> SRR1699924 2 0.2236 0.85745 0.036 0.964
#> SRR1699925 1 0.7745 0.74097 0.772 0.228
#> SRR1699926 2 0.5842 0.78962 0.140 0.860
#> SRR1699927 2 0.0938 0.85779 0.012 0.988
#> SRR1699929 1 0.5737 0.82249 0.864 0.136
#> SRR1699928 2 0.8955 0.58725 0.312 0.688
#> SRR1699930 2 0.7376 0.71710 0.208 0.792
#> SRR1699931 1 0.7815 0.75968 0.768 0.232
#> SRR1699933 1 0.7453 0.75420 0.788 0.212
#> SRR1699932 1 0.9710 0.43385 0.600 0.400
#> SRR1699934 1 0.2778 0.81709 0.952 0.048
#> SRR1699935 2 0.3584 0.85086 0.068 0.932
#> SRR1699936 2 0.3879 0.84765 0.076 0.924
#> SRR1699937 1 0.6438 0.80322 0.836 0.164
#> SRR1699938 1 0.6973 0.78533 0.812 0.188
#> SRR1699940 1 0.6973 0.75088 0.812 0.188
#> SRR1699939 1 0.9129 0.59312 0.672 0.328
#> SRR1699941 1 0.5294 0.82682 0.880 0.120
#> SRR1699942 2 0.6712 0.76628 0.176 0.824
#> SRR1699943 1 0.5519 0.82214 0.872 0.128
#> SRR1699944 1 0.4161 0.83639 0.916 0.084
#> SRR1699945 1 0.3584 0.84058 0.932 0.068
#> SRR1699946 1 0.3431 0.83965 0.936 0.064
#> SRR1699947 1 0.0938 0.82499 0.988 0.012
#> SRR1699948 1 0.7745 0.74833 0.772 0.228
#> SRR1699949 2 0.9427 0.47709 0.360 0.640
#> SRR1699950 1 0.8955 0.63097 0.688 0.312
#> SRR1699951 2 0.9996 -0.08473 0.488 0.512
#> SRR1699952 1 0.4161 0.83770 0.916 0.084
#> SRR1699953 1 0.8327 0.71624 0.736 0.264
#> SRR1699954 1 0.0938 0.82707 0.988 0.012
#> SRR1699955 2 0.9866 0.18945 0.432 0.568
#> SRR1699956 1 0.7299 0.77025 0.796 0.204
#> SRR1699957 1 0.3733 0.83784 0.928 0.072
#> SRR1699959 2 0.9775 0.23351 0.412 0.588
#> SRR1699958 2 0.1633 0.85849 0.024 0.976
#> SRR1699960 2 0.5408 0.81924 0.124 0.876
#> SRR1699961 1 0.9922 0.32810 0.552 0.448
#> SRR1699962 1 0.7674 0.74749 0.776 0.224
#> SRR1699963 2 0.4939 0.83255 0.108 0.892
#> SRR1699964 1 0.6531 0.80882 0.832 0.168
#> SRR1699965 1 0.8661 0.66744 0.712 0.288
#> SRR1699966 2 0.7453 0.72749 0.212 0.788
#> SRR1699967 1 0.8016 0.73528 0.756 0.244
#> SRR1699968 2 0.9087 0.55845 0.324 0.676
#> SRR1699969 2 0.7299 0.75353 0.204 0.796
#> SRR1699971 1 0.8555 0.67393 0.720 0.280
#> SRR1699970 1 0.7745 0.75237 0.772 0.228
#> SRR1699972 1 0.9866 0.30779 0.568 0.432
#> SRR1699973 2 0.2236 0.85682 0.036 0.964
#> SRR1699974 1 0.7299 0.77662 0.796 0.204
#> SRR1699975 2 0.4298 0.82767 0.088 0.912
#> SRR1699976 1 0.6887 0.78782 0.816 0.184
#> SRR1699977 2 0.6247 0.79494 0.156 0.844
#> SRR1699978 2 0.8763 0.61083 0.296 0.704
#> SRR1699979 2 0.7376 0.73130 0.208 0.792
#> SRR1699980 2 0.2603 0.85559 0.044 0.956
#> SRR1699981 2 0.2043 0.85309 0.032 0.968
#> SRR1699982 2 0.5294 0.80408 0.120 0.880
#> SRR1699983 2 0.9170 0.50166 0.332 0.668
#> SRR1699984 1 0.9286 0.56015 0.656 0.344
#> SRR1699985 2 0.2236 0.85734 0.036 0.964
#> SRR1699986 1 0.6887 0.74953 0.816 0.184
#> SRR1699988 2 0.9491 0.47505 0.368 0.632
#> SRR1699987 2 0.1843 0.85854 0.028 0.972
#> SRR1699989 2 0.7602 0.71888 0.220 0.780
#> SRR1699990 2 0.6048 0.80270 0.148 0.852
#> SRR1699992 1 0.6438 0.80057 0.836 0.164
#> SRR1699991 2 0.4298 0.84193 0.088 0.912
#> SRR1699993 1 0.9954 0.29731 0.540 0.460
#> SRR1699994 1 0.8386 0.70545 0.732 0.268
#> SRR1699995 2 0.3584 0.85242 0.068 0.932
#> SRR1699996 1 0.3274 0.83756 0.940 0.060
#> SRR1699997 2 0.0938 0.85680 0.012 0.988
#> SRR1699998 1 0.9896 0.17795 0.560 0.440
#> SRR1699999 1 0.5294 0.83104 0.880 0.120
#> SRR1700000 1 0.8813 0.56649 0.700 0.300
#> SRR1700002 1 0.9970 0.20659 0.532 0.468
#> SRR1700001 2 0.9833 0.25205 0.424 0.576
#> SRR1700003 2 0.1414 0.85548 0.020 0.980
#> SRR1700004 1 1.0000 0.09338 0.504 0.496
#> SRR1700005 1 0.4022 0.81377 0.920 0.080
#> SRR1700006 2 0.6531 0.78519 0.168 0.832
#> SRR1700007 2 0.1184 0.85733 0.016 0.984
#> SRR1700008 2 0.3733 0.85276 0.072 0.928
#> SRR1700009 1 0.9460 0.54057 0.636 0.364
#> SRR1700010 1 0.7453 0.76946 0.788 0.212
#> SRR1700011 2 0.4161 0.84388 0.084 0.916
#> SRR1700013 1 0.9710 0.45190 0.600 0.400
#> SRR1700012 2 0.7139 0.75326 0.196 0.804
#> SRR1700014 2 0.3879 0.84860 0.076 0.924
#> SRR1700015 1 0.9044 0.63428 0.680 0.320
#> SRR1700016 2 0.9170 0.49791 0.332 0.668
#> SRR1700018 2 0.9044 0.51159 0.320 0.680
#> SRR1700017 2 0.9815 0.23250 0.420 0.580
#> SRR1700019 1 0.9996 0.19474 0.512 0.488
#> SRR1700020 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700021 2 0.7528 0.71266 0.216 0.784
#> SRR1700023 2 0.9866 0.23060 0.432 0.568
#> SRR1700022 2 0.6148 0.80256 0.152 0.848
#> SRR1700024 2 0.0376 0.85489 0.004 0.996
#> SRR1700025 1 0.7745 0.75606 0.772 0.228
#> SRR1700026 2 0.9977 -0.01590 0.472 0.528
#> SRR1700027 2 0.9983 -0.00653 0.476 0.524
#> SRR1700028 2 0.1414 0.85932 0.020 0.980
#> SRR1700029 2 0.2043 0.85847 0.032 0.968
#> SRR1700030 2 0.1184 0.85737 0.016 0.984
#> SRR1700031 2 0.6623 0.77530 0.172 0.828
#> SRR1700032 1 0.9248 0.57758 0.660 0.340
#> SRR1700034 2 0.9686 0.29564 0.396 0.604
#> SRR1700035 2 0.0672 0.85576 0.008 0.992
#> SRR1700033 2 0.9460 0.43731 0.364 0.636
#> SRR1700036 2 0.7219 0.74638 0.200 0.800
#> SRR1700037 2 0.3114 0.85294 0.056 0.944
#> SRR1700038 1 0.9427 0.55896 0.640 0.360
#> SRR1700039 2 0.5408 0.81694 0.124 0.876
#> SRR1700040 2 0.5519 0.82764 0.128 0.872
#> SRR1700041 2 0.1843 0.85802 0.028 0.972
#> SRR1700042 2 0.2423 0.85762 0.040 0.960
#> SRR1700043 2 0.9963 0.02752 0.464 0.536
#> SRR1700045 2 0.3879 0.84924 0.076 0.924
#> SRR1700044 2 0.5294 0.82458 0.120 0.880
#> SRR1700046 2 0.3274 0.85296 0.060 0.940
#> SRR1700047 2 0.9460 0.45560 0.364 0.636
#> SRR1700048 2 0.1633 0.85964 0.024 0.976
#> SRR1700049 2 0.3879 0.84734 0.076 0.924
#> SRR1700050 2 0.0938 0.85490 0.012 0.988
#> SRR1700051 2 0.2423 0.85664 0.040 0.960
#> SRR1700052 2 0.8443 0.62462 0.272 0.728
#> SRR1700053 2 0.0938 0.85696 0.012 0.988
#> SRR1700054 2 0.2948 0.85465 0.052 0.948
#> SRR1700055 1 0.9998 0.15675 0.508 0.492
#> SRR1700056 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700057 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700058 2 0.7056 0.75974 0.192 0.808
#> SRR1700059 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700060 2 0.3274 0.85541 0.060 0.940
#> SRR1700061 2 0.6531 0.78656 0.168 0.832
#> SRR1700062 2 0.0672 0.85576 0.008 0.992
#> SRR1700063 2 0.2043 0.85948 0.032 0.968
#> SRR1700064 2 0.7299 0.74117 0.204 0.796
#> SRR1700065 2 0.6438 0.75939 0.164 0.836
#> SRR1700066 2 0.5946 0.81349 0.144 0.856
#> SRR1700067 2 0.0376 0.85494 0.004 0.996
#> SRR1700068 2 0.0672 0.85576 0.008 0.992
#> SRR1700069 2 0.3879 0.84724 0.076 0.924
#> SRR1700070 2 0.5946 0.80978 0.144 0.856
#> SRR1700071 2 0.4562 0.83575 0.096 0.904
#> SRR1700072 1 0.9635 0.40520 0.612 0.388
#> SRR1700073 2 0.0000 0.85344 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.8713 0.59450 0.292 0.708
#> SRR1700074 2 0.9170 0.51444 0.332 0.668
#> SRR1700076 1 0.9044 0.61943 0.680 0.320
#> SRR1700077 1 0.9000 0.63980 0.684 0.316
#> SRR1700078 2 0.5629 0.80808 0.132 0.868
#> SRR1700080 2 0.7219 0.75443 0.200 0.800
#> SRR1700079 2 0.1414 0.85703 0.020 0.980
#> SRR1700081 2 1.0000 -0.06411 0.496 0.504
#> SRR1700082 2 0.4431 0.84068 0.092 0.908
#> SRR1700083 2 0.2043 0.85843 0.032 0.968
#> SRR1700084 2 0.9427 0.41358 0.360 0.640
#> SRR1700085 2 0.2423 0.85834 0.040 0.960
#> SRR1700086 2 0.2778 0.85540 0.048 0.952
#> SRR1700087 2 0.5178 0.80345 0.116 0.884
#> SRR1700088 2 0.9977 0.08388 0.472 0.528
#> SRR1700089 1 0.9933 0.32071 0.548 0.452
#> SRR1700091 2 0.5842 0.80718 0.140 0.860
#> SRR1700090 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700092 2 0.7056 0.76490 0.192 0.808
#> SRR1700094 2 0.5059 0.83042 0.112 0.888
#> SRR1700093 2 0.1184 0.85696 0.016 0.984
#> SRR1700095 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700096 2 0.1633 0.85750 0.024 0.976
#> SRR1700097 2 0.0938 0.85673 0.012 0.988
#> SRR1700098 2 0.9833 0.24533 0.424 0.576
#> SRR1700099 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700100 2 0.1414 0.85670 0.020 0.980
#> SRR1700101 2 0.5294 0.82561 0.120 0.880
#> SRR1700102 2 0.6887 0.77420 0.184 0.816
#> SRR1700104 2 0.1414 0.85763 0.020 0.980
#> SRR1700103 2 0.5059 0.83727 0.112 0.888
#> SRR1700105 2 0.7453 0.73266 0.212 0.788
#> SRR1700106 2 0.1843 0.85880 0.028 0.972
#> SRR1700107 2 0.2778 0.85845 0.048 0.952
#> SRR1700108 2 0.3584 0.85283 0.068 0.932
#> SRR1700109 2 0.1414 0.85867 0.020 0.980
#> SRR1700110 2 0.2603 0.85644 0.044 0.956
#> SRR1700112 2 0.2043 0.85769 0.032 0.968
#> SRR1700111 2 0.0376 0.85282 0.004 0.996
#> SRR1700113 2 0.1184 0.85769 0.016 0.984
#> SRR1700114 2 0.1414 0.85753 0.020 0.980
#> SRR1700115 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700116 2 0.2423 0.83977 0.040 0.960
#> SRR1700117 2 0.0376 0.85489 0.004 0.996
#> SRR1700119 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700118 2 0.1184 0.84868 0.016 0.984
#> SRR1700120 2 0.2778 0.85382 0.048 0.952
#> SRR1700121 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700122 2 0.0000 0.85344 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700125 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700126 2 0.0672 0.85644 0.008 0.992
#> SRR1700127 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700124 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700128 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700129 2 0.0000 0.85344 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.4298 0.80949 0.088 0.912
#> SRR1700132 2 0.0000 0.85344 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.2948 0.85626 0.052 0.948
#> SRR1700133 2 0.1184 0.85696 0.016 0.984
#> SRR1700134 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700135 2 0.3114 0.83602 0.056 0.944
#> SRR1700136 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700137 2 0.1184 0.85746 0.016 0.984
#> SRR1700138 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700140 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700139 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700141 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700142 2 0.0672 0.85329 0.008 0.992
#> SRR1700143 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700144 2 0.3274 0.85428 0.060 0.940
#> SRR1700145 2 0.2778 0.84930 0.048 0.952
#> SRR1700146 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700147 2 0.3274 0.85030 0.060 0.940
#> SRR1700149 2 0.0938 0.85313 0.012 0.988
#> SRR1700148 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700150 2 0.0672 0.85574 0.008 0.992
#> SRR1700152 2 0.1184 0.85774 0.016 0.984
#> SRR1700151 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700153 2 0.0672 0.85668 0.008 0.992
#> SRR1700154 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700155 2 0.4690 0.83186 0.100 0.900
#> SRR1700156 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700158 2 0.4562 0.83862 0.096 0.904
#> SRR1700159 2 0.1633 0.85867 0.024 0.976
#> SRR1700157 2 0.4815 0.80028 0.104 0.896
#> SRR1700160 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700161 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700162 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700164 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700163 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700165 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700166 2 0.6247 0.79171 0.156 0.844
#> SRR1700168 2 0.0376 0.85489 0.004 0.996
#> SRR1700167 2 0.1414 0.84986 0.020 0.980
#> SRR1700170 2 0.0000 0.85344 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700171 2 0.1414 0.85762 0.020 0.980
#> SRR1700172 2 0.2043 0.85838 0.032 0.968
#> SRR1700174 2 0.1184 0.85746 0.016 0.984
#> SRR1700173 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700175 2 0.0938 0.85642 0.012 0.988
#> SRR1700176 2 0.3274 0.84681 0.060 0.940
#> SRR1700178 1 0.2778 0.83736 0.952 0.048
#> SRR1700177 2 0.0376 0.85469 0.004 0.996
#> SRR1700180 1 0.0376 0.82311 0.996 0.004
#> SRR1700179 1 0.4022 0.83653 0.920 0.080
#> SRR1700181 1 0.3274 0.84005 0.940 0.060
#> SRR1700183 1 0.0376 0.82166 0.996 0.004
#> SRR1700182 1 0.3274 0.83932 0.940 0.060
#> SRR1700184 1 0.2043 0.83392 0.968 0.032
#> SRR1700186 1 0.4690 0.83581 0.900 0.100
#> SRR1700187 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700185 1 0.1184 0.82181 0.984 0.016
#> SRR1700188 1 0.2423 0.83613 0.960 0.040
#> SRR1700192 1 0.0672 0.82405 0.992 0.008
#> SRR1700190 1 0.4431 0.83629 0.908 0.092
#> SRR1700191 1 0.1184 0.81972 0.984 0.016
#> SRR1700189 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700193 1 0.1843 0.83276 0.972 0.028
#> SRR1700195 1 0.0000 0.82054 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.1184 0.81920 0.984 0.016
#> SRR1700196 1 0.1843 0.83282 0.972 0.028
#> SRR1700197 1 0.0672 0.82519 0.992 0.008
#> SRR1700198 1 0.1633 0.83142 0.976 0.024
#> SRR1700199 1 0.1184 0.82662 0.984 0.016
#> SRR1700200 1 0.0938 0.82732 0.988 0.012
#> SRR1700201 1 0.3879 0.83780 0.924 0.076
#> SRR1700202 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700203 1 0.1184 0.81668 0.984 0.016
#> SRR1700204 1 0.3274 0.83977 0.940 0.060
#> SRR1700206 1 0.2778 0.83795 0.952 0.048
#> SRR1700207 1 0.3584 0.83878 0.932 0.068
#> SRR1700208 1 0.0672 0.82518 0.992 0.008
#> SRR1700205 1 0.4562 0.79554 0.904 0.096
#> SRR1700209 1 0.6343 0.80993 0.840 0.160
#> SRR1700210 1 0.1184 0.81745 0.984 0.016
#> SRR1700211 1 0.0672 0.81781 0.992 0.008
#> SRR1700212 1 0.0672 0.81781 0.992 0.008
#> SRR1700213 1 0.2603 0.83827 0.956 0.044
#> SRR1700214 1 0.4161 0.83864 0.916 0.084
#> SRR1700215 1 0.2423 0.83150 0.960 0.040
#> SRR1700217 1 0.4161 0.83707 0.916 0.084
#> SRR1700216 1 0.2043 0.81730 0.968 0.032
#> SRR1700218 1 0.2778 0.83806 0.952 0.048
#> SRR1700219 1 0.3584 0.83825 0.932 0.068
#> SRR1700222 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700220 1 0.7602 0.76299 0.780 0.220
#> SRR1700221 1 0.3733 0.83790 0.928 0.072
#> SRR1700223 1 0.3733 0.83805 0.928 0.072
#> SRR1700224 1 0.4161 0.82228 0.916 0.084
#> SRR1700226 1 0.2236 0.83474 0.964 0.036
#> SRR1700229 1 0.2043 0.81873 0.968 0.032
#> SRR1700225 1 0.1843 0.83127 0.972 0.028
#> SRR1700227 1 0.2236 0.83577 0.964 0.036
#> SRR1700230 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700231 1 0.0672 0.82552 0.992 0.008
#> SRR1700228 1 0.0938 0.81875 0.988 0.012
#> SRR1700232 1 0.3431 0.83871 0.936 0.064
#> SRR1700233 1 0.2778 0.83916 0.952 0.048
#> SRR1700234 1 0.2948 0.83849 0.948 0.052
#> SRR1700235 1 0.6148 0.80934 0.848 0.152
#> SRR1700237 1 0.1184 0.82872 0.984 0.016
#> SRR1700236 1 0.2423 0.83251 0.960 0.040
#> SRR1700238 1 0.3274 0.83815 0.940 0.060
#> SRR1700239 1 0.1184 0.82512 0.984 0.016
#> SRR1700240 1 0.3274 0.81248 0.940 0.060
#> SRR1700241 1 0.6531 0.80991 0.832 0.168
#> SRR1700243 1 0.0938 0.82699 0.988 0.012
#> SRR1700244 1 0.3114 0.83920 0.944 0.056
#> SRR1700242 1 0.0672 0.82229 0.992 0.008
#> SRR1700246 1 0.1633 0.81802 0.976 0.024
#> SRR1700245 1 0.2948 0.83877 0.948 0.052
#> SRR1700247 1 0.2236 0.81679 0.964 0.036
#> SRR1700249 1 0.0938 0.82281 0.988 0.012
#> SRR1700250 1 0.5519 0.82125 0.872 0.128
#> SRR1700248 1 0.4431 0.83486 0.908 0.092
#> SRR1700251 1 0.2236 0.83505 0.964 0.036
#> SRR1700252 1 0.3584 0.84034 0.932 0.068
#> SRR1700253 1 0.5946 0.80751 0.856 0.144
#> SRR1700256 1 0.1184 0.82326 0.984 0.016
#> SRR1700254 1 0.2043 0.82037 0.968 0.032
#> SRR1700255 1 0.5178 0.82846 0.884 0.116
#> SRR1700257 1 0.2603 0.83674 0.956 0.044
#> SRR1700258 1 0.3733 0.83870 0.928 0.072
#> SRR1700259 1 0.9944 0.27934 0.544 0.456
#> SRR1700260 2 0.7299 0.74888 0.204 0.796
#> SRR1700261 2 0.3733 0.84820 0.072 0.928
#> SRR1700262 2 0.9552 0.40571 0.376 0.624
#> SRR1700263 1 0.8861 0.59140 0.696 0.304
#> SRR1700264 1 0.5519 0.82643 0.872 0.128
#> SRR1700265 1 0.2236 0.83207 0.964 0.036
#> SRR1700266 1 0.7745 0.74468 0.772 0.228
#> SRR1700268 1 0.3274 0.83815 0.940 0.060
#> SRR1700270 1 0.4022 0.83623 0.920 0.080
#> SRR1700267 1 0.6531 0.80000 0.832 0.168
#> SRR1700271 1 0.9323 0.56011 0.652 0.348
#> SRR1700272 2 0.5519 0.82179 0.128 0.872
#> SRR1700273 1 0.2423 0.83613 0.960 0.040
#> SRR1700274 1 0.9580 0.52663 0.620 0.380
#> SRR1700277 1 0.6973 0.79180 0.812 0.188
#> SRR1700275 1 0.9491 0.53272 0.632 0.368
#> SRR1700276 1 0.9491 0.55516 0.632 0.368
#> SRR1700278 1 0.6048 0.81876 0.852 0.148
#> SRR1700279 2 0.9922 0.23383 0.448 0.552
#> SRR1700280 1 0.4161 0.83555 0.916 0.084
#> SRR1700281 1 0.9970 0.17849 0.532 0.468
#> SRR1700283 2 0.2236 0.84291 0.036 0.964
#> SRR1700282 1 0.6801 0.79799 0.820 0.180
#> SRR1700284 2 0.6247 0.79898 0.156 0.844
#> SRR1700285 1 0.8144 0.73342 0.748 0.252
#> SRR1700286 1 0.5629 0.82333 0.868 0.132
#> SRR1700287 2 0.6438 0.78677 0.164 0.836
#> SRR1700290 1 0.9944 0.29708 0.544 0.456
#> SRR1700289 2 0.6048 0.78132 0.148 0.852
#> SRR1700288 1 0.4161 0.83723 0.916 0.084
#> SRR1700292 2 0.9970 0.16916 0.468 0.532
#> SRR1700291 2 0.3274 0.85486 0.060 0.940
#> SRR1700293 1 0.8713 0.67381 0.708 0.292
#> SRR1700294 2 0.9944 0.18992 0.456 0.544
#> SRR1700295 2 0.2778 0.85589 0.048 0.952
#> SRR1700297 2 0.7299 0.73769 0.204 0.796
#> SRR1700296 2 0.2778 0.85547 0.048 0.952
#> SRR1700298 2 0.4690 0.83245 0.100 0.900
#> SRR1700299 2 0.9850 0.29906 0.428 0.572
#> SRR1700300 2 0.7139 0.73192 0.196 0.804
#> SRR1700302 2 0.1184 0.85770 0.016 0.984
#> SRR1700301 2 0.6801 0.75977 0.180 0.820
#> SRR1700303 2 0.7950 0.68934 0.240 0.760
#> SRR1700304 1 0.2778 0.83300 0.952 0.048
#> SRR1700305 1 0.8713 0.67913 0.708 0.292
#> SRR1700306 2 0.7056 0.75091 0.192 0.808
#> SRR1700308 1 0.9358 0.45863 0.648 0.352
#> SRR1700307 2 0.4690 0.84002 0.100 0.900
#> SRR1700309 2 0.9944 0.21400 0.456 0.544
#> SRR1700310 2 0.4161 0.84347 0.084 0.916
#> SRR1700311 2 0.9087 0.53127 0.324 0.676
#> SRR1700312 2 0.4431 0.83766 0.092 0.908
#> SRR1700313 2 0.9754 0.27130 0.408 0.592
#> SRR1700314 2 0.1633 0.85977 0.024 0.976
#> SRR1700315 2 0.6887 0.74126 0.184 0.816
#> SRR1700316 1 0.9944 0.24918 0.544 0.456
#> SRR1700317 2 0.9922 0.15395 0.448 0.552
#> SRR1700318 1 0.8327 0.69002 0.736 0.264
#> SRR1700319 2 0.1843 0.85943 0.028 0.972
#> SRR1700320 2 0.9129 0.53781 0.328 0.672
#> SRR1700322 1 0.9491 0.51681 0.632 0.368
#> SRR1700321 2 0.7139 0.75806 0.196 0.804
#> SRR1700323 2 0.4815 0.83183 0.104 0.896
#> SRR1700324 2 0.7745 0.70028 0.228 0.772
#> SRR1700325 2 0.9686 0.27354 0.396 0.604
#> SRR1700326 2 0.9983 0.09422 0.476 0.524
#> SRR1700327 1 0.9998 0.10905 0.508 0.492
#> SRR1700329 2 0.2043 0.85715 0.032 0.968
#> SRR1700328 1 0.5408 0.77959 0.876 0.124
#> SRR1700330 1 0.6623 0.80655 0.828 0.172
#> SRR1700331 1 0.7950 0.72058 0.760 0.240
#> SRR1700332 2 0.8081 0.68419 0.248 0.752
#> SRR1700333 1 0.3431 0.83556 0.936 0.064
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.4092 0.615372 0.088 0.876 0.036
#> SRR1699875 2 0.5254 0.503372 0.264 0.736 0.000
#> SRR1699876 3 0.9654 0.317439 0.288 0.248 0.464
#> SRR1699877 2 0.6685 0.507703 0.244 0.708 0.048
#> SRR1699879 2 0.5603 0.588690 0.060 0.804 0.136
#> SRR1699878 2 0.6570 0.412067 0.292 0.680 0.028
#> SRR1699880 2 0.4179 0.618452 0.052 0.876 0.072
#> SRR1699881 2 0.4121 0.617338 0.040 0.876 0.084
#> SRR1699882 2 0.3896 0.590351 0.128 0.864 0.008
#> SRR1699883 2 0.6169 0.381218 0.360 0.636 0.004
#> SRR1699884 2 0.3091 0.611007 0.072 0.912 0.016
#> SRR1699885 2 0.2261 0.592433 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699886 2 0.9172 0.125729 0.396 0.456 0.148
#> SRR1699888 3 0.5899 0.573986 0.020 0.244 0.736
#> SRR1699889 3 0.6481 0.671774 0.224 0.048 0.728
#> SRR1699890 1 0.8873 0.461815 0.576 0.224 0.200
#> SRR1699887 2 0.7692 0.522953 0.108 0.668 0.224
#> SRR1699891 3 0.7484 0.259927 0.460 0.036 0.504
#> SRR1699892 2 0.9106 0.414169 0.208 0.548 0.244
#> SRR1699893 3 0.2356 0.724070 0.072 0.000 0.928
#> SRR1699894 3 0.8511 0.257261 0.428 0.092 0.480
#> SRR1699895 3 0.5486 0.699935 0.196 0.024 0.780
#> SRR1699896 2 0.4413 0.567353 0.160 0.832 0.008
#> SRR1699897 2 0.5408 0.615114 0.136 0.812 0.052
#> SRR1699898 3 0.4335 0.692670 0.100 0.036 0.864
#> SRR1699900 1 0.8941 0.204063 0.548 0.160 0.292
#> SRR1699899 1 0.9547 -0.115091 0.416 0.192 0.392
#> SRR1699902 3 0.9787 0.210236 0.348 0.240 0.412
#> SRR1699901 1 0.8963 -0.079411 0.468 0.128 0.404
#> SRR1699903 1 0.8304 -0.091747 0.504 0.080 0.416
#> SRR1699904 3 0.6079 0.660236 0.128 0.088 0.784
#> SRR1699905 1 0.7995 -0.109718 0.480 0.060 0.460
#> SRR1699906 3 0.8590 0.427065 0.320 0.120 0.560
#> SRR1699907 1 0.8354 0.336217 0.576 0.104 0.320
#> SRR1699908 3 0.4848 0.712182 0.128 0.036 0.836
#> SRR1699909 3 0.4261 0.717729 0.140 0.012 0.848
#> SRR1699910 3 0.7492 0.535227 0.340 0.052 0.608
#> SRR1699911 1 0.7244 0.428220 0.700 0.092 0.208
#> SRR1699912 3 0.6126 0.503991 0.400 0.000 0.600
#> SRR1699913 3 0.4629 0.644683 0.188 0.004 0.808
#> SRR1699914 3 0.9646 0.327246 0.260 0.272 0.468
#> SRR1699915 3 0.5835 0.552210 0.340 0.000 0.660
#> SRR1699916 3 0.4845 0.720398 0.104 0.052 0.844
#> SRR1699917 3 0.3043 0.728588 0.084 0.008 0.908
#> SRR1699918 3 0.4351 0.704846 0.168 0.004 0.828
#> SRR1699919 3 0.5708 0.684366 0.204 0.028 0.768
#> SRR1699920 3 0.3349 0.724135 0.108 0.004 0.888
#> SRR1699921 3 0.6487 0.640625 0.268 0.032 0.700
#> SRR1699922 1 0.6349 0.507072 0.768 0.092 0.140
#> SRR1699923 1 0.8637 0.210610 0.564 0.128 0.308
#> SRR1699924 3 0.6079 0.674086 0.088 0.128 0.784
#> SRR1699925 1 0.8763 0.441524 0.588 0.196 0.216
#> SRR1699926 3 0.7203 0.342049 0.416 0.028 0.556
#> SRR1699927 3 0.5384 0.693089 0.188 0.024 0.788
#> SRR1699929 1 0.7175 0.078085 0.592 0.376 0.032
#> SRR1699928 1 0.9598 0.033385 0.444 0.208 0.348
#> SRR1699930 3 0.8649 0.284105 0.360 0.112 0.528
#> SRR1699931 2 0.8685 0.301394 0.260 0.584 0.156
#> SRR1699933 2 0.6896 0.377057 0.392 0.588 0.020
#> SRR1699932 3 0.9285 -0.025988 0.160 0.392 0.448
#> SRR1699934 1 0.6441 0.465484 0.696 0.276 0.028
#> SRR1699935 3 0.5793 0.688706 0.084 0.116 0.800
#> SRR1699936 3 0.7905 0.016466 0.056 0.444 0.500
#> SRR1699937 2 0.4544 0.612061 0.084 0.860 0.056
#> SRR1699938 2 0.3369 0.617517 0.040 0.908 0.052
#> SRR1699940 2 0.6927 0.433631 0.296 0.664 0.040
#> SRR1699939 2 0.4489 0.613417 0.036 0.856 0.108
#> SRR1699941 2 0.4256 0.612879 0.096 0.868 0.036
#> SRR1699942 2 0.9581 0.230014 0.252 0.480 0.268
#> SRR1699943 2 0.2443 0.610666 0.032 0.940 0.028
#> SRR1699944 2 0.3530 0.613747 0.068 0.900 0.032
#> SRR1699945 2 0.2772 0.583012 0.080 0.916 0.004
#> SRR1699946 2 0.1620 0.606343 0.024 0.964 0.012
#> SRR1699947 2 0.3116 0.601091 0.108 0.892 0.000
#> SRR1699948 2 0.5344 0.607870 0.084 0.824 0.092
#> SRR1699949 2 0.6965 0.515765 0.060 0.696 0.244
#> SRR1699950 2 0.5178 0.593569 0.028 0.808 0.164
#> SRR1699951 2 0.8386 0.444703 0.112 0.584 0.304
#> SRR1699952 2 0.3933 0.617633 0.092 0.880 0.028
#> SRR1699953 2 0.6250 0.593452 0.120 0.776 0.104
#> SRR1699954 2 0.4291 0.581072 0.180 0.820 0.000
#> SRR1699955 2 0.6882 0.568109 0.096 0.732 0.172
#> SRR1699956 2 0.3967 0.620790 0.044 0.884 0.072
#> SRR1699957 2 0.2680 0.606608 0.068 0.924 0.008
#> SRR1699959 2 0.8340 0.485851 0.144 0.620 0.236
#> SRR1699958 3 0.4232 0.700982 0.084 0.044 0.872
#> SRR1699960 3 0.7558 0.173987 0.044 0.400 0.556
#> SRR1699961 2 0.7217 0.560225 0.132 0.716 0.152
#> SRR1699962 2 0.3375 0.617952 0.044 0.908 0.048
#> SRR1699963 2 0.9717 0.203449 0.304 0.448 0.248
#> SRR1699964 2 0.7624 0.386454 0.392 0.560 0.048
#> SRR1699965 2 0.5635 0.582504 0.036 0.784 0.180
#> SRR1699966 2 0.7724 0.439500 0.072 0.620 0.308
#> SRR1699967 2 0.5710 0.607300 0.080 0.804 0.116
#> SRR1699968 2 0.8546 0.330009 0.108 0.544 0.348
#> SRR1699969 3 0.8437 0.201653 0.092 0.388 0.520
#> SRR1699971 2 0.4121 0.592812 0.108 0.868 0.024
#> SRR1699970 2 0.5595 0.554049 0.228 0.756 0.016
#> SRR1699972 2 0.6723 0.505453 0.248 0.704 0.048
#> SRR1699973 2 0.8935 0.050714 0.124 0.452 0.424
#> SRR1699974 2 0.5954 0.614112 0.116 0.792 0.092
#> SRR1699975 1 0.9449 -0.127536 0.436 0.180 0.384
#> SRR1699976 2 0.4945 0.606949 0.104 0.840 0.056
#> SRR1699977 1 0.9920 -0.014041 0.388 0.280 0.332
#> SRR1699978 3 0.8338 0.145912 0.400 0.084 0.516
#> SRR1699979 2 0.7962 0.234863 0.060 0.512 0.428
#> SRR1699980 3 0.8456 0.469995 0.328 0.108 0.564
#> SRR1699981 3 0.7530 0.530094 0.252 0.084 0.664
#> SRR1699982 3 0.6823 0.336030 0.484 0.012 0.504
#> SRR1699983 3 0.9491 0.015393 0.396 0.184 0.420
#> SRR1699984 1 0.6968 0.404355 0.716 0.204 0.080
#> SRR1699985 3 0.9347 0.411495 0.288 0.204 0.508
#> SRR1699986 1 0.5650 0.490202 0.808 0.108 0.084
#> SRR1699988 1 0.9796 0.178070 0.420 0.248 0.332
#> SRR1699987 3 0.6518 0.639358 0.080 0.168 0.752
#> SRR1699989 3 0.9027 0.360968 0.160 0.308 0.532
#> SRR1699990 3 0.9046 0.376392 0.160 0.312 0.528
#> SRR1699992 2 0.2804 0.617453 0.016 0.924 0.060
#> SRR1699991 3 0.9294 0.250235 0.172 0.344 0.484
#> SRR1699993 3 0.9639 0.073772 0.332 0.220 0.448
#> SRR1699994 2 0.5901 0.596451 0.176 0.776 0.048
#> SRR1699995 3 0.5947 0.652303 0.052 0.172 0.776
#> SRR1699996 2 0.6931 -0.060599 0.456 0.528 0.016
#> SRR1699997 3 0.2599 0.726926 0.052 0.016 0.932
#> SRR1699998 1 0.9256 0.181581 0.444 0.400 0.156
#> SRR1699999 2 0.7997 0.148507 0.360 0.568 0.072
#> SRR1700000 1 0.8985 0.354584 0.544 0.292 0.164
#> SRR1700002 2 0.6714 0.576549 0.140 0.748 0.112
#> SRR1700001 2 0.8322 0.449827 0.212 0.628 0.160
#> SRR1700003 3 0.6622 0.600190 0.164 0.088 0.748
#> SRR1700004 2 0.8271 0.496195 0.156 0.632 0.212
#> SRR1700005 1 0.5778 0.478738 0.768 0.200 0.032
#> SRR1700006 2 0.8628 0.362362 0.116 0.544 0.340
#> SRR1700007 3 0.5503 0.679526 0.208 0.020 0.772
#> SRR1700008 3 0.5639 0.692114 0.080 0.112 0.808
#> SRR1700009 1 0.8834 0.459831 0.580 0.196 0.224
#> SRR1700010 2 0.4565 0.616575 0.076 0.860 0.064
#> SRR1700011 3 0.9870 0.119431 0.256 0.364 0.380
#> SRR1700013 2 0.7739 0.499477 0.088 0.644 0.268
#> SRR1700012 1 0.9642 -0.039482 0.440 0.216 0.344
#> SRR1700014 2 0.9520 0.006761 0.188 0.416 0.396
#> SRR1700015 2 0.6527 0.566516 0.188 0.744 0.068
#> SRR1700016 1 0.4615 0.489327 0.836 0.020 0.144
#> SRR1700018 2 0.8872 0.372546 0.140 0.536 0.324
#> SRR1700017 2 0.8361 0.483640 0.216 0.624 0.160
#> SRR1700019 3 0.9757 -0.057641 0.228 0.384 0.388
#> SRR1700020 3 0.4269 0.711149 0.052 0.076 0.872
#> SRR1700021 3 0.8409 0.473638 0.308 0.112 0.580
#> SRR1700023 2 0.7878 0.525649 0.160 0.668 0.172
#> SRR1700022 2 0.8291 0.411648 0.100 0.580 0.320
#> SRR1700024 3 0.4934 0.718891 0.156 0.024 0.820
#> SRR1700025 2 0.6148 0.584753 0.148 0.776 0.076
#> SRR1700026 2 0.8518 0.479044 0.180 0.612 0.208
#> SRR1700027 2 0.8350 0.489689 0.196 0.628 0.176
#> SRR1700028 3 0.3377 0.723236 0.092 0.012 0.896
#> SRR1700029 3 0.5737 0.689882 0.092 0.104 0.804
#> SRR1700030 3 0.7944 0.539798 0.296 0.088 0.616
#> SRR1700031 2 0.9199 0.295436 0.168 0.504 0.328
#> SRR1700032 2 0.6865 0.569189 0.160 0.736 0.104
#> SRR1700034 2 0.8847 0.406332 0.148 0.552 0.300
#> SRR1700035 3 0.4953 0.695357 0.176 0.016 0.808
#> SRR1700033 2 0.8542 0.466937 0.220 0.608 0.172
#> SRR1700036 2 0.9402 0.222418 0.184 0.472 0.344
#> SRR1700037 3 0.5988 0.688460 0.168 0.056 0.776
#> SRR1700038 1 0.9399 0.256442 0.500 0.292 0.208
#> SRR1700039 3 0.8896 0.389833 0.156 0.292 0.552
#> SRR1700040 3 0.8079 0.505028 0.108 0.268 0.624
#> SRR1700041 3 0.7458 0.594997 0.112 0.196 0.692
#> SRR1700042 3 0.9539 0.266883 0.204 0.336 0.460
#> SRR1700043 2 0.8670 0.422693 0.240 0.592 0.168
#> SRR1700045 3 0.7104 0.648150 0.136 0.140 0.724
#> SRR1700044 2 0.9959 0.008743 0.324 0.376 0.300
#> SRR1700046 3 0.9304 0.376001 0.192 0.300 0.508
#> SRR1700047 3 0.7997 0.410064 0.072 0.360 0.568
#> SRR1700048 3 0.8732 0.489377 0.316 0.132 0.552
#> SRR1700049 3 0.9173 0.358595 0.176 0.304 0.520
#> SRR1700050 3 0.4062 0.688178 0.164 0.000 0.836
#> SRR1700051 3 0.8738 0.454986 0.328 0.128 0.544
#> SRR1700052 3 0.9512 0.407590 0.260 0.248 0.492
#> SRR1700053 3 0.5911 0.690604 0.156 0.060 0.784
#> SRR1700054 3 0.8915 0.503243 0.216 0.212 0.572
#> SRR1700055 2 0.8631 0.482635 0.180 0.600 0.220
#> SRR1700056 3 0.3590 0.725168 0.076 0.028 0.896
#> SRR1700057 3 0.2446 0.724561 0.052 0.012 0.936
#> SRR1700058 2 0.9438 0.260253 0.196 0.480 0.324
#> SRR1700059 3 0.2339 0.725119 0.048 0.012 0.940
#> SRR1700060 3 0.8821 0.518862 0.232 0.188 0.580
#> SRR1700061 3 0.8556 0.525560 0.164 0.232 0.604
#> SRR1700062 3 0.0892 0.723190 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700063 3 0.8493 0.503984 0.148 0.248 0.604
#> SRR1700064 3 0.9602 0.264574 0.396 0.200 0.404
#> SRR1700065 1 0.8820 -0.116989 0.476 0.116 0.408
#> SRR1700066 2 0.9659 0.259593 0.252 0.464 0.284
#> SRR1700067 3 0.6742 0.643065 0.240 0.052 0.708
#> SRR1700068 3 0.4483 0.707578 0.128 0.024 0.848
#> SRR1700069 3 0.9092 0.460358 0.200 0.252 0.548
#> SRR1700070 2 0.9334 0.322758 0.200 0.508 0.292
#> SRR1700071 3 0.9645 0.083386 0.208 0.380 0.412
#> SRR1700072 1 0.3850 0.472658 0.884 0.028 0.088
#> SRR1700073 3 0.6053 0.649902 0.260 0.020 0.720
#> SRR1700075 3 0.9793 0.283712 0.284 0.280 0.436
#> SRR1700074 2 0.8399 0.484961 0.188 0.624 0.188
#> SRR1700076 2 0.6728 0.586846 0.124 0.748 0.128
#> SRR1700077 2 0.7419 0.529803 0.232 0.680 0.088
#> SRR1700078 3 0.9211 0.416549 0.196 0.276 0.528
#> SRR1700080 2 0.9468 0.289603 0.212 0.488 0.300
#> SRR1700079 3 0.8779 0.485740 0.260 0.164 0.576
#> SRR1700081 2 0.6481 0.557388 0.048 0.728 0.224
#> SRR1700082 2 0.9876 0.118707 0.300 0.412 0.288
#> SRR1700083 3 0.8437 0.542882 0.200 0.180 0.620
#> SRR1700084 2 0.8760 0.441185 0.240 0.584 0.176
#> SRR1700085 3 0.8753 0.510389 0.188 0.224 0.588
#> SRR1700086 3 0.8976 0.441722 0.316 0.152 0.532
#> SRR1700087 3 0.9109 0.162678 0.364 0.148 0.488
#> SRR1700088 2 0.6309 0.596648 0.100 0.772 0.128
#> SRR1700089 2 0.8108 0.324406 0.072 0.536 0.392
#> SRR1700091 3 0.5884 0.525645 0.012 0.272 0.716
#> SRR1700090 3 0.1315 0.719935 0.020 0.008 0.972
#> SRR1700092 3 0.7699 0.253990 0.052 0.388 0.560
#> SRR1700094 3 0.6897 0.483180 0.040 0.292 0.668
#> SRR1700093 3 0.1315 0.723060 0.008 0.020 0.972
#> SRR1700095 3 0.1964 0.721732 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700096 3 0.5315 0.594759 0.012 0.216 0.772
#> SRR1700097 3 0.2625 0.706332 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700098 3 0.7164 0.050617 0.024 0.452 0.524
#> SRR1700099 3 0.1015 0.719733 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700100 3 0.6663 0.605735 0.156 0.096 0.748
#> SRR1700101 3 0.6161 0.512180 0.016 0.288 0.696
#> SRR1700102 3 0.8586 0.244704 0.104 0.376 0.520
#> SRR1700104 3 0.2116 0.721516 0.012 0.040 0.948
#> SRR1700103 3 0.6295 0.599788 0.036 0.236 0.728
#> SRR1700105 3 0.3694 0.708856 0.052 0.052 0.896
#> SRR1700106 3 0.2269 0.718646 0.040 0.016 0.944
#> SRR1700107 3 0.3742 0.713084 0.072 0.036 0.892
#> SRR1700108 3 0.2918 0.719906 0.032 0.044 0.924
#> SRR1700109 3 0.1832 0.727576 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700110 3 0.3043 0.705134 0.008 0.084 0.908
#> SRR1700112 3 0.0747 0.721562 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700111 3 0.5024 0.642359 0.220 0.004 0.776
#> SRR1700113 3 0.1989 0.727816 0.048 0.004 0.948
#> SRR1700114 3 0.3213 0.703498 0.008 0.092 0.900
#> SRR1700115 3 0.0475 0.721043 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700116 3 0.4121 0.654683 0.168 0.000 0.832
#> SRR1700117 3 0.1753 0.716867 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700119 3 0.1031 0.722536 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700118 3 0.5115 0.621331 0.228 0.004 0.768
#> SRR1700120 3 0.4708 0.693028 0.120 0.036 0.844
#> SRR1700121 3 0.1267 0.723186 0.024 0.004 0.972
#> SRR1700122 3 0.4399 0.677292 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700123 3 0.2384 0.728157 0.056 0.008 0.936
#> SRR1700125 3 0.1129 0.717275 0.020 0.004 0.976
#> SRR1700126 3 0.3461 0.732184 0.076 0.024 0.900
#> SRR1700127 3 0.1832 0.720767 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700124 3 0.1031 0.722228 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700128 3 0.3619 0.702146 0.136 0.000 0.864
#> SRR1700129 3 0.2959 0.706484 0.100 0.000 0.900
#> SRR1700130 3 0.5216 0.561311 0.260 0.000 0.740
#> SRR1700132 3 0.2448 0.710591 0.076 0.000 0.924
#> SRR1700131 3 0.2689 0.720149 0.032 0.036 0.932
#> SRR1700133 3 0.1643 0.719498 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700134 3 0.1289 0.716947 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700135 3 0.4605 0.640962 0.204 0.000 0.796
#> SRR1700136 3 0.1643 0.719261 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700137 3 0.2063 0.720377 0.044 0.008 0.948
#> SRR1700138 3 0.1031 0.718980 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700140 3 0.1647 0.719128 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700139 3 0.2496 0.711284 0.068 0.004 0.928
#> SRR1700141 3 0.1031 0.717261 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700142 3 0.3267 0.716685 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700143 3 0.0892 0.718187 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700144 3 0.7453 0.586804 0.292 0.064 0.644
#> SRR1700145 3 0.5551 0.623657 0.224 0.016 0.760
#> SRR1700146 3 0.0892 0.721678 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700147 3 0.4146 0.716878 0.080 0.044 0.876
#> SRR1700149 3 0.4233 0.660273 0.160 0.004 0.836
#> SRR1700148 3 0.1529 0.723724 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700150 3 0.1964 0.714456 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700152 3 0.4475 0.670649 0.144 0.016 0.840
#> SRR1700151 3 0.0592 0.719587 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700153 3 0.3030 0.720957 0.092 0.004 0.904
#> SRR1700154 3 0.1525 0.718646 0.032 0.004 0.964
#> SRR1700155 3 0.3356 0.709308 0.056 0.036 0.908
#> SRR1700156 3 0.1031 0.721893 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700158 3 0.2564 0.717292 0.028 0.036 0.936
#> SRR1700159 3 0.1832 0.719679 0.036 0.008 0.956
#> SRR1700157 3 0.7534 0.317390 0.428 0.040 0.532
#> SRR1700160 3 0.0424 0.718543 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700161 3 0.1289 0.716797 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700162 3 0.1031 0.717365 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700164 3 0.2537 0.711201 0.080 0.000 0.920
#> SRR1700163 3 0.1753 0.715234 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700165 3 0.0661 0.719682 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700166 3 0.4469 0.689130 0.060 0.076 0.864
#> SRR1700168 3 0.1860 0.722630 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700167 3 0.4351 0.670962 0.168 0.004 0.828
#> SRR1700170 3 0.3267 0.705198 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700169 3 0.2845 0.725686 0.068 0.012 0.920
#> SRR1700171 3 0.3644 0.698199 0.124 0.004 0.872
#> SRR1700172 3 0.1015 0.722347 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700174 3 0.2152 0.719133 0.036 0.016 0.948
#> SRR1700173 3 0.1170 0.720807 0.016 0.008 0.976
#> SRR1700175 3 0.0892 0.721352 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700176 3 0.4912 0.644855 0.196 0.008 0.796
#> SRR1700178 2 0.2866 0.573637 0.076 0.916 0.008
#> SRR1700177 3 0.2356 0.717983 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700180 2 0.3482 0.529066 0.128 0.872 0.000
#> SRR1700179 2 0.2636 0.599715 0.048 0.932 0.020
#> SRR1700181 2 0.5798 0.491579 0.184 0.776 0.040
#> SRR1700183 1 0.6286 0.250530 0.536 0.464 0.000
#> SRR1700182 2 0.2492 0.589839 0.048 0.936 0.016
#> SRR1700184 2 0.3083 0.588938 0.060 0.916 0.024
#> SRR1700186 2 0.3888 0.595041 0.064 0.888 0.048
#> SRR1700187 1 0.6460 0.303420 0.556 0.440 0.004
#> SRR1700185 1 0.6008 0.389265 0.628 0.372 0.000
#> SRR1700188 2 0.1878 0.585813 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700192 2 0.6520 -0.181055 0.488 0.508 0.004
#> SRR1700190 2 0.2806 0.603437 0.040 0.928 0.032
#> SRR1700191 1 0.6008 0.389958 0.628 0.372 0.000
#> SRR1700189 1 0.6330 0.375947 0.600 0.396 0.004
#> SRR1700193 2 0.4750 0.443450 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700195 2 0.5327 0.338797 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700194 1 0.6079 0.373530 0.612 0.388 0.000
#> SRR1700196 2 0.4654 0.466780 0.208 0.792 0.000
#> SRR1700197 2 0.5968 0.152488 0.364 0.636 0.000
#> SRR1700198 2 0.5072 0.470551 0.196 0.792 0.012
#> SRR1700199 2 0.5926 0.195611 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700200 2 0.6026 0.102467 0.376 0.624 0.000
#> SRR1700201 2 0.2269 0.594795 0.040 0.944 0.016
#> SRR1700202 1 0.6373 0.348937 0.588 0.408 0.004
#> SRR1700203 1 0.6126 0.353042 0.600 0.400 0.000
#> SRR1700204 2 0.5982 0.343267 0.328 0.668 0.004
#> SRR1700206 2 0.6630 0.309887 0.300 0.672 0.028
#> SRR1700207 2 0.2774 0.582453 0.072 0.920 0.008
#> SRR1700208 2 0.5926 0.162209 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700205 1 0.4968 0.487112 0.800 0.188 0.012
#> SRR1700209 2 0.6176 0.558941 0.120 0.780 0.100
#> SRR1700210 1 0.6267 0.292380 0.548 0.452 0.000
#> SRR1700211 1 0.6252 0.299064 0.556 0.444 0.000
#> SRR1700212 1 0.6442 0.297829 0.564 0.432 0.004
#> SRR1700213 2 0.5812 0.444042 0.264 0.724 0.012
#> SRR1700214 2 0.7233 0.351701 0.264 0.672 0.064
#> SRR1700215 1 0.6228 0.393268 0.624 0.372 0.004
#> SRR1700217 2 0.6621 0.332156 0.284 0.684 0.032
#> SRR1700216 1 0.5845 0.445395 0.688 0.308 0.004
#> SRR1700218 2 0.3695 0.554906 0.108 0.880 0.012
#> SRR1700219 2 0.5845 0.292456 0.308 0.688 0.004
#> SRR1700222 1 0.6180 0.339454 0.584 0.416 0.000
#> SRR1700220 2 0.7728 0.436498 0.084 0.640 0.276
#> SRR1700221 2 0.4912 0.463934 0.196 0.796 0.008
#> SRR1700223 2 0.5356 0.494357 0.196 0.784 0.020
#> SRR1700224 1 0.8269 0.415033 0.584 0.316 0.100
#> SRR1700226 2 0.6045 0.104235 0.380 0.620 0.000
#> SRR1700229 1 0.6161 0.446861 0.696 0.288 0.016
#> SRR1700225 2 0.4912 0.550782 0.196 0.796 0.008
#> SRR1700227 2 0.2866 0.581414 0.076 0.916 0.008
#> SRR1700230 2 0.6307 -0.174355 0.488 0.512 0.000
#> SRR1700231 2 0.3500 0.548262 0.116 0.880 0.004
#> SRR1700228 2 0.6373 0.050114 0.408 0.588 0.004
#> SRR1700232 2 0.4978 0.488820 0.216 0.780 0.004
#> SRR1700233 2 0.6099 0.434769 0.228 0.740 0.032
#> SRR1700234 2 0.6483 0.105593 0.392 0.600 0.008
#> SRR1700235 2 0.3889 0.610421 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700237 2 0.4555 0.460774 0.200 0.800 0.000
#> SRR1700236 2 0.5305 0.554139 0.192 0.788 0.020
#> SRR1700238 2 0.4521 0.488156 0.180 0.816 0.004
#> SRR1700239 1 0.6527 0.347378 0.588 0.404 0.008
#> SRR1700240 1 0.6129 0.458061 0.700 0.284 0.016
#> SRR1700241 2 0.9626 -0.200613 0.392 0.404 0.204
#> SRR1700243 2 0.5497 0.328199 0.292 0.708 0.000
#> SRR1700244 2 0.5595 0.429628 0.228 0.756 0.016
#> SRR1700242 1 0.6682 0.204806 0.504 0.488 0.008
#> SRR1700246 1 0.5529 0.449660 0.704 0.296 0.000
#> SRR1700245 2 0.2280 0.597158 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700247 1 0.5414 0.478756 0.772 0.212 0.016
#> SRR1700249 1 0.6688 0.351785 0.580 0.408 0.012
#> SRR1700250 2 0.3764 0.608849 0.068 0.892 0.040
#> SRR1700248 2 0.2063 0.588910 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700251 2 0.6498 0.188318 0.396 0.596 0.008
#> SRR1700252 2 0.5480 0.495026 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700253 2 0.6393 0.508321 0.216 0.736 0.048
#> SRR1700256 2 0.6302 -0.000454 0.480 0.520 0.000
#> SRR1700254 1 0.6490 0.401309 0.628 0.360 0.012
#> SRR1700255 2 0.6443 0.398768 0.240 0.720 0.040
#> SRR1700257 2 0.4834 0.462019 0.204 0.792 0.004
#> SRR1700258 2 0.5247 0.455191 0.224 0.768 0.008
#> SRR1700259 2 0.7333 0.557457 0.116 0.704 0.180
#> SRR1700260 3 0.7850 0.435678 0.076 0.316 0.608
#> SRR1700261 3 0.7556 0.560867 0.100 0.224 0.676
#> SRR1700262 3 0.7412 0.525781 0.192 0.112 0.696
#> SRR1700263 1 0.8691 0.119255 0.528 0.356 0.116
#> SRR1700264 2 0.4848 0.600302 0.128 0.836 0.036
#> SRR1700265 2 0.4452 0.582262 0.192 0.808 0.000
#> SRR1700266 2 0.2443 0.609250 0.032 0.940 0.028
#> SRR1700268 2 0.5541 0.380111 0.252 0.740 0.008
#> SRR1700270 2 0.3461 0.574988 0.076 0.900 0.024
#> SRR1700267 2 0.6693 0.600632 0.148 0.748 0.104
#> SRR1700271 2 0.6719 0.564775 0.068 0.728 0.204
#> SRR1700272 3 0.7824 0.264238 0.060 0.376 0.564
#> SRR1700273 2 0.3573 0.583175 0.120 0.876 0.004
#> SRR1700274 1 0.9563 0.309177 0.480 0.236 0.284
#> SRR1700277 2 0.5263 0.614915 0.084 0.828 0.088
#> SRR1700275 3 0.8635 0.221500 0.112 0.356 0.532
#> SRR1700276 3 0.9585 -0.161525 0.332 0.212 0.456
#> SRR1700278 2 0.8968 -0.117181 0.408 0.464 0.128
#> SRR1700279 1 0.8386 0.508441 0.620 0.156 0.224
#> SRR1700280 1 0.7868 0.342397 0.524 0.420 0.056
#> SRR1700281 2 0.6383 0.583980 0.128 0.768 0.104
#> SRR1700283 3 0.6129 0.572655 0.324 0.008 0.668
#> SRR1700282 2 0.9399 -0.067103 0.372 0.452 0.176
#> SRR1700284 3 0.4658 0.718463 0.076 0.068 0.856
#> SRR1700285 2 0.9917 -0.205539 0.272 0.376 0.352
#> SRR1700286 2 0.6841 0.477679 0.200 0.724 0.076
#> SRR1700287 3 0.5036 0.657257 0.172 0.020 0.808
#> SRR1700290 3 0.9235 0.094067 0.384 0.156 0.460
#> SRR1700289 3 0.7032 0.447898 0.368 0.028 0.604
#> SRR1700288 2 0.7050 0.122559 0.372 0.600 0.028
#> SRR1700292 1 0.8835 0.446230 0.568 0.164 0.268
#> SRR1700291 3 0.3742 0.722277 0.036 0.072 0.892
#> SRR1700293 2 0.9180 0.030924 0.152 0.472 0.376
#> SRR1700294 1 0.9176 0.326757 0.496 0.160 0.344
#> SRR1700295 3 0.3445 0.725208 0.088 0.016 0.896
#> SRR1700297 3 0.6839 0.508132 0.272 0.044 0.684
#> SRR1700296 3 0.6188 0.643391 0.216 0.040 0.744
#> SRR1700298 3 0.3370 0.724471 0.072 0.024 0.904
#> SRR1700299 1 0.8998 0.174009 0.472 0.132 0.396
#> SRR1700300 1 0.6823 -0.198071 0.504 0.012 0.484
#> SRR1700302 3 0.2682 0.724664 0.076 0.004 0.920
#> SRR1700301 3 0.5961 0.649147 0.112 0.096 0.792
#> SRR1700303 3 0.6254 0.670997 0.116 0.108 0.776
#> SRR1700304 1 0.8297 0.403925 0.560 0.348 0.092
#> SRR1700305 3 0.9987 -0.358723 0.308 0.344 0.348
#> SRR1700306 3 0.6859 0.518092 0.356 0.024 0.620
#> SRR1700308 1 0.8992 0.341149 0.552 0.176 0.272
#> SRR1700307 3 0.4045 0.712177 0.024 0.104 0.872
#> SRR1700309 1 0.8933 0.368120 0.556 0.168 0.276
#> SRR1700310 3 0.4345 0.697815 0.136 0.016 0.848
#> SRR1700311 3 0.8705 0.162927 0.360 0.116 0.524
#> SRR1700312 3 0.3791 0.721998 0.060 0.048 0.892
#> SRR1700313 3 0.8024 0.539803 0.220 0.132 0.648
#> SRR1700314 3 0.4873 0.710317 0.152 0.024 0.824
#> SRR1700315 1 0.6783 -0.072708 0.588 0.016 0.396
#> SRR1700316 2 0.8426 0.248922 0.092 0.524 0.384
#> SRR1700317 3 0.9251 0.410955 0.212 0.260 0.528
#> SRR1700318 1 0.9561 0.403424 0.468 0.316 0.216
#> SRR1700319 3 0.3590 0.728144 0.076 0.028 0.896
#> SRR1700320 3 0.7474 0.611292 0.216 0.100 0.684
#> SRR1700322 1 0.8701 0.309029 0.492 0.108 0.400
#> SRR1700321 3 0.5696 0.684887 0.064 0.136 0.800
#> SRR1700323 3 0.6309 0.665315 0.100 0.128 0.772
#> SRR1700324 3 0.5656 0.691494 0.128 0.068 0.804
#> SRR1700325 3 0.6919 0.052178 0.016 0.448 0.536
#> SRR1700326 1 0.8233 0.420022 0.612 0.116 0.272
#> SRR1700327 2 0.8384 0.242251 0.088 0.520 0.392
#> SRR1700329 3 0.6501 0.599070 0.316 0.020 0.664
#> SRR1700328 1 0.4982 0.488040 0.828 0.136 0.036
#> SRR1700330 1 0.9462 0.167132 0.420 0.400 0.180
#> SRR1700331 1 0.8716 0.484174 0.588 0.240 0.172
#> SRR1700332 3 0.5449 0.669231 0.068 0.116 0.816
#> SRR1700333 1 0.8342 0.297826 0.464 0.456 0.080
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.3670 0.60270 0.092 0.860 0.044 0.004
#> SRR1699875 2 0.6698 0.20404 0.096 0.532 0.372 0.000
#> SRR1699876 3 0.6762 0.57583 0.040 0.164 0.680 0.116
#> SRR1699877 3 0.6953 0.15721 0.068 0.444 0.472 0.016
#> SRR1699879 2 0.6100 0.39158 0.300 0.640 0.012 0.048
#> SRR1699878 3 0.6809 0.33388 0.104 0.324 0.568 0.004
#> SRR1699880 2 0.3695 0.57818 0.156 0.828 0.016 0.000
#> SRR1699881 2 0.4083 0.60437 0.100 0.832 0.068 0.000
#> SRR1699882 2 0.7577 0.34749 0.188 0.520 0.284 0.008
#> SRR1699883 3 0.6992 0.29912 0.156 0.280 0.564 0.000
#> SRR1699884 2 0.5031 0.55365 0.212 0.740 0.048 0.000
#> SRR1699885 2 0.4986 0.51408 0.216 0.740 0.044 0.000
#> SRR1699886 3 0.5662 0.54472 0.056 0.192 0.732 0.020
#> SRR1699888 4 0.5993 0.53414 0.028 0.256 0.036 0.680
#> SRR1699889 3 0.7479 0.15838 0.036 0.080 0.496 0.388
#> SRR1699890 3 0.6836 0.39977 0.260 0.096 0.624 0.020
#> SRR1699887 2 0.5371 0.58483 0.056 0.788 0.092 0.064
#> SRR1699891 3 0.7293 0.45891 0.248 0.024 0.596 0.132
#> SRR1699892 2 0.6281 0.37479 0.016 0.596 0.348 0.040
#> SRR1699893 4 0.5148 0.61529 0.020 0.012 0.248 0.720
#> SRR1699894 3 0.9449 0.34437 0.172 0.148 0.396 0.284
#> SRR1699895 4 0.6464 0.35637 0.032 0.024 0.396 0.548
#> SRR1699896 2 0.8158 0.14037 0.304 0.380 0.308 0.008
#> SRR1699897 2 0.7193 0.46369 0.268 0.580 0.140 0.012
#> SRR1699898 4 0.6150 0.24131 0.000 0.060 0.360 0.580
#> SRR1699900 3 0.5707 0.56988 0.100 0.060 0.768 0.072
#> SRR1699899 3 0.5729 0.58323 0.052 0.140 0.756 0.052
#> SRR1699902 3 0.4890 0.48225 0.004 0.236 0.736 0.024
#> SRR1699901 3 0.5711 0.58421 0.056 0.084 0.768 0.092
#> SRR1699903 3 0.3576 0.59065 0.048 0.028 0.880 0.044
#> SRR1699904 4 0.6543 0.58205 0.156 0.016 0.152 0.676
#> SRR1699905 3 0.5554 0.54738 0.096 0.016 0.756 0.132
#> SRR1699906 3 0.6040 0.61365 0.044 0.088 0.740 0.128
#> SRR1699907 3 0.8252 0.30724 0.324 0.032 0.460 0.184
#> SRR1699908 4 0.6680 0.33831 0.004 0.088 0.344 0.564
#> SRR1699909 4 0.5349 0.52843 0.020 0.004 0.320 0.656
#> SRR1699910 3 0.6540 0.24110 0.056 0.016 0.588 0.340
#> SRR1699911 3 0.6658 0.39454 0.312 0.044 0.608 0.036
#> SRR1699912 3 0.3586 0.59649 0.040 0.012 0.872 0.076
#> SRR1699913 4 0.5748 0.20884 0.012 0.012 0.420 0.556
#> SRR1699914 3 0.8218 0.44314 0.064 0.232 0.544 0.160
#> SRR1699915 3 0.6833 0.10433 0.052 0.024 0.528 0.396
#> SRR1699916 4 0.5750 0.61199 0.024 0.044 0.216 0.716
#> SRR1699917 4 0.5585 0.63353 0.012 0.064 0.192 0.732
#> SRR1699918 4 0.6351 0.33279 0.020 0.032 0.388 0.560
#> SRR1699919 4 0.6118 0.37068 0.024 0.016 0.404 0.556
#> SRR1699920 4 0.5947 0.51931 0.044 0.008 0.308 0.640
#> SRR1699921 3 0.7425 -0.08322 0.072 0.036 0.448 0.444
#> SRR1699922 3 0.6648 0.35703 0.328 0.044 0.596 0.032
#> SRR1699923 3 0.5877 0.57745 0.124 0.048 0.752 0.076
#> SRR1699924 4 0.7205 0.28966 0.000 0.172 0.296 0.532
#> SRR1699925 1 0.7488 0.22830 0.596 0.032 0.220 0.152
#> SRR1699926 3 0.8431 0.24024 0.164 0.048 0.448 0.340
#> SRR1699927 4 0.6068 0.22912 0.000 0.044 0.448 0.508
#> SRR1699929 3 0.7204 0.41474 0.224 0.200 0.572 0.004
#> SRR1699928 3 0.5575 0.56898 0.056 0.156 0.756 0.032
#> SRR1699930 3 0.8381 0.36511 0.224 0.032 0.456 0.288
#> SRR1699931 3 0.9252 0.04677 0.284 0.316 0.324 0.076
#> SRR1699933 3 0.5614 0.38199 0.044 0.304 0.652 0.000
#> SRR1699932 1 0.8477 0.01497 0.428 0.060 0.140 0.372
#> SRR1699934 1 0.5662 0.41210 0.708 0.032 0.236 0.024
#> SRR1699935 4 0.6779 0.50175 0.008 0.192 0.164 0.636
#> SRR1699936 2 0.6011 0.37961 0.004 0.652 0.064 0.280
#> SRR1699937 2 0.2674 0.59871 0.068 0.908 0.020 0.004
#> SRR1699938 2 0.3196 0.57700 0.136 0.856 0.008 0.000
#> SRR1699940 2 0.7579 0.36474 0.120 0.568 0.276 0.036
#> SRR1699939 2 0.3232 0.59347 0.108 0.872 0.016 0.004
#> SRR1699941 2 0.4955 0.53040 0.216 0.748 0.028 0.008
#> SRR1699942 3 0.8052 0.26402 0.020 0.388 0.416 0.176
#> SRR1699943 2 0.3266 0.56037 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.2799 0.58780 0.108 0.884 0.008 0.000
#> SRR1699945 2 0.5369 0.39829 0.324 0.652 0.020 0.004
#> SRR1699946 2 0.3534 0.58113 0.148 0.840 0.004 0.008
#> SRR1699947 2 0.3441 0.59242 0.120 0.856 0.024 0.000
#> SRR1699948 2 0.2271 0.60003 0.052 0.928 0.012 0.008
#> SRR1699949 2 0.6735 0.50303 0.188 0.668 0.028 0.116
#> SRR1699950 2 0.4719 0.56463 0.160 0.792 0.016 0.032
#> SRR1699951 2 0.6040 0.58282 0.052 0.740 0.136 0.072
#> SRR1699952 2 0.3619 0.60026 0.100 0.860 0.036 0.004
#> SRR1699953 2 0.3485 0.60951 0.048 0.876 0.068 0.008
#> SRR1699954 2 0.5864 0.48573 0.264 0.664 0.072 0.000
#> SRR1699955 2 0.3768 0.60923 0.048 0.872 0.044 0.036
#> SRR1699956 2 0.5044 0.54372 0.212 0.748 0.028 0.012
#> SRR1699957 2 0.4417 0.58808 0.160 0.796 0.044 0.000
#> SRR1699959 2 0.4616 0.54965 0.016 0.812 0.124 0.048
#> SRR1699958 4 0.5358 0.51092 0.004 0.052 0.220 0.724
#> SRR1699960 2 0.5908 0.32429 0.004 0.636 0.048 0.312
#> SRR1699961 2 0.2877 0.59921 0.008 0.904 0.060 0.028
#> SRR1699962 2 0.5309 0.53232 0.256 0.700 0.044 0.000
#> SRR1699963 3 0.6460 0.31943 0.008 0.384 0.552 0.056
#> SRR1699964 2 0.7096 0.38481 0.116 0.572 0.300 0.012
#> SRR1699965 2 0.4971 0.57827 0.172 0.776 0.024 0.028
#> SRR1699966 2 0.4607 0.57848 0.016 0.820 0.076 0.088
#> SRR1699967 2 0.5217 0.58698 0.164 0.768 0.048 0.020
#> SRR1699968 2 0.7754 0.34644 0.048 0.576 0.244 0.132
#> SRR1699969 2 0.7461 0.13155 0.016 0.548 0.144 0.292
#> SRR1699971 2 0.4644 0.58068 0.132 0.800 0.064 0.004
#> SRR1699970 2 0.6383 0.19095 0.076 0.568 0.356 0.000
#> SRR1699972 2 0.6697 0.03231 0.048 0.524 0.408 0.020
#> SRR1699973 2 0.7001 0.14188 0.004 0.584 0.264 0.148
#> SRR1699974 2 0.6868 0.53012 0.240 0.640 0.088 0.032
#> SRR1699975 3 0.4179 0.60061 0.004 0.104 0.832 0.060
#> SRR1699976 2 0.3795 0.60558 0.080 0.856 0.060 0.004
#> SRR1699977 3 0.6487 0.48477 0.012 0.296 0.620 0.072
#> SRR1699978 4 0.8186 0.15572 0.320 0.032 0.176 0.472
#> SRR1699979 2 0.5785 0.47072 0.032 0.720 0.040 0.208
#> SRR1699980 3 0.5577 0.58164 0.008 0.104 0.744 0.144
#> SRR1699981 3 0.6841 0.45166 0.012 0.100 0.600 0.288
#> SRR1699982 3 0.6264 0.56051 0.116 0.020 0.704 0.160
#> SRR1699983 3 0.8519 0.48091 0.208 0.100 0.536 0.156
#> SRR1699984 1 0.6718 -0.09627 0.476 0.052 0.456 0.016
#> SRR1699985 3 0.6315 0.43683 0.004 0.300 0.620 0.076
#> SRR1699986 3 0.5658 0.45117 0.244 0.044 0.700 0.012
#> SRR1699988 3 0.7747 0.53009 0.132 0.196 0.604 0.068
#> SRR1699987 4 0.7309 0.34317 0.008 0.256 0.172 0.564
#> SRR1699989 2 0.8971 -0.23858 0.052 0.344 0.312 0.292
#> SRR1699990 2 0.8677 -0.22280 0.032 0.340 0.292 0.336
#> SRR1699992 2 0.4464 0.51775 0.224 0.760 0.012 0.004
#> SRR1699991 2 0.7812 -0.11181 0.004 0.460 0.292 0.244
#> SRR1699993 4 0.8967 0.17395 0.304 0.092 0.168 0.436
#> SRR1699994 2 0.6315 0.51652 0.100 0.652 0.244 0.004
#> SRR1699995 4 0.7087 0.40956 0.008 0.256 0.148 0.588
#> SRR1699996 1 0.6734 0.50819 0.636 0.244 0.104 0.016
#> SRR1699997 4 0.3909 0.70661 0.012 0.052 0.080 0.856
#> SRR1699998 3 0.7173 0.44482 0.200 0.104 0.644 0.052
#> SRR1699999 1 0.7044 0.43537 0.620 0.264 0.048 0.068
#> SRR1700000 3 0.6978 0.45054 0.172 0.072 0.672 0.084
#> SRR1700002 2 0.2310 0.60429 0.020 0.932 0.032 0.016
#> SRR1700001 2 0.8372 0.34718 0.168 0.504 0.272 0.056
#> SRR1700003 3 0.7467 0.34989 0.016 0.124 0.512 0.348
#> SRR1700004 2 0.5268 0.50071 0.016 0.724 0.236 0.024
#> SRR1700005 1 0.6265 0.21865 0.600 0.040 0.344 0.016
#> SRR1700006 2 0.4411 0.56602 0.000 0.812 0.108 0.080
#> SRR1700007 4 0.6914 0.19743 0.024 0.056 0.404 0.516
#> SRR1700008 4 0.5591 0.68093 0.068 0.092 0.064 0.776
#> SRR1700009 1 0.6397 0.32639 0.664 0.016 0.084 0.236
#> SRR1700010 2 0.4645 0.57950 0.152 0.800 0.024 0.024
#> SRR1700011 3 0.7607 0.28732 0.032 0.392 0.480 0.096
#> SRR1700013 2 0.6996 0.44459 0.140 0.640 0.024 0.196
#> SRR1700012 3 0.5363 0.55717 0.024 0.168 0.760 0.048
#> SRR1700014 2 0.6945 0.10988 0.000 0.552 0.312 0.136
#> SRR1700015 2 0.3166 0.57847 0.016 0.868 0.116 0.000
#> SRR1700016 3 0.5462 0.51784 0.192 0.032 0.744 0.032
#> SRR1700018 2 0.4636 0.52394 0.000 0.792 0.140 0.068
#> SRR1700017 2 0.4431 0.46475 0.004 0.740 0.252 0.004
#> SRR1700019 2 0.9899 -0.17028 0.188 0.304 0.252 0.256
#> SRR1700020 4 0.5392 0.59926 0.000 0.204 0.072 0.724
#> SRR1700021 3 0.8184 0.49654 0.100 0.104 0.556 0.240
#> SRR1700023 2 0.4917 0.54052 0.024 0.776 0.176 0.024
#> SRR1700022 2 0.4549 0.54127 0.008 0.816 0.100 0.076
#> SRR1700024 4 0.6817 0.37083 0.012 0.088 0.316 0.584
#> SRR1700025 2 0.4756 0.56057 0.052 0.772 0.176 0.000
#> SRR1700026 2 0.4944 0.48734 0.004 0.744 0.220 0.032
#> SRR1700027 2 0.4841 0.43939 0.012 0.712 0.272 0.004
#> SRR1700028 4 0.5473 0.60257 0.012 0.048 0.212 0.728
#> SRR1700029 4 0.7068 0.43151 0.012 0.208 0.168 0.612
#> SRR1700030 3 0.5581 0.55748 0.000 0.140 0.728 0.132
#> SRR1700031 2 0.5877 0.35372 0.000 0.656 0.276 0.068
#> SRR1700032 2 0.4335 0.56063 0.036 0.796 0.168 0.000
#> SRR1700034 2 0.6250 0.31230 0.004 0.632 0.288 0.076
#> SRR1700035 4 0.6296 0.31251 0.000 0.064 0.388 0.548
#> SRR1700033 2 0.5636 0.37467 0.016 0.692 0.260 0.032
#> SRR1700036 2 0.6810 0.10247 0.008 0.532 0.380 0.080
#> SRR1700037 4 0.6106 0.49146 0.028 0.024 0.320 0.628
#> SRR1700038 3 0.9090 0.37357 0.260 0.176 0.452 0.112
#> SRR1700039 4 0.8294 -0.19005 0.012 0.316 0.328 0.344
#> SRR1700040 4 0.8123 0.31382 0.048 0.152 0.276 0.524
#> SRR1700041 4 0.7681 0.01310 0.000 0.344 0.224 0.432
#> SRR1700042 3 0.7352 0.13652 0.004 0.428 0.432 0.136
#> SRR1700043 2 0.7343 -0.02480 0.048 0.460 0.440 0.052
#> SRR1700045 4 0.8458 -0.13323 0.028 0.228 0.360 0.384
#> SRR1700044 3 0.5814 0.35133 0.012 0.344 0.620 0.024
#> SRR1700046 2 0.7538 -0.13075 0.000 0.428 0.384 0.188
#> SRR1700047 4 0.8769 0.07825 0.072 0.336 0.164 0.428
#> SRR1700048 3 0.7151 0.44611 0.008 0.168 0.588 0.236
#> SRR1700049 2 0.7474 -0.18573 0.000 0.424 0.400 0.176
#> SRR1700050 4 0.6280 0.38353 0.004 0.064 0.332 0.600
#> SRR1700051 3 0.5977 0.52976 0.008 0.220 0.692 0.080
#> SRR1700052 3 0.8384 0.35461 0.028 0.284 0.444 0.244
#> SRR1700053 4 0.7298 0.03408 0.008 0.116 0.436 0.440
#> SRR1700054 3 0.7841 0.28444 0.000 0.324 0.400 0.276
#> SRR1700055 2 0.6040 0.35633 0.016 0.684 0.240 0.060
#> SRR1700056 4 0.5160 0.65090 0.000 0.136 0.104 0.760
#> SRR1700057 4 0.4758 0.64122 0.000 0.064 0.156 0.780
#> SRR1700058 2 0.7226 0.04345 0.008 0.504 0.372 0.116
#> SRR1700059 4 0.4282 0.67699 0.000 0.060 0.124 0.816
#> SRR1700060 3 0.7609 0.35990 0.000 0.272 0.476 0.252
#> SRR1700061 2 0.8293 -0.26062 0.012 0.348 0.316 0.324
#> SRR1700062 4 0.3366 0.71277 0.004 0.028 0.096 0.872
#> SRR1700063 4 0.7820 -0.10418 0.000 0.360 0.256 0.384
#> SRR1700064 3 0.7897 0.44494 0.060 0.248 0.568 0.124
#> SRR1700065 3 0.4800 0.59936 0.016 0.096 0.808 0.080
#> SRR1700066 3 0.6742 0.25907 0.016 0.360 0.560 0.064
#> SRR1700067 4 0.7588 -0.03257 0.004 0.168 0.408 0.420
#> SRR1700068 4 0.6435 0.49593 0.000 0.136 0.224 0.640
#> SRR1700069 3 0.8111 0.29376 0.008 0.300 0.404 0.288
#> SRR1700070 2 0.5903 0.27185 0.000 0.616 0.332 0.052
#> SRR1700071 2 0.6926 0.04346 0.000 0.496 0.392 0.112
#> SRR1700072 3 0.5659 0.47742 0.240 0.040 0.704 0.016
#> SRR1700073 3 0.6294 -0.03433 0.004 0.048 0.512 0.436
#> SRR1700075 3 0.7974 0.25980 0.024 0.348 0.468 0.160
#> SRR1700074 2 0.5468 0.44186 0.024 0.708 0.248 0.020
#> SRR1700076 2 0.7653 0.50295 0.124 0.616 0.188 0.072
#> SRR1700077 2 0.5619 0.35946 0.040 0.640 0.320 0.000
#> SRR1700078 2 0.7799 -0.21462 0.000 0.384 0.368 0.248
#> SRR1700080 2 0.6896 0.13184 0.004 0.544 0.348 0.104
#> SRR1700079 3 0.6771 0.48770 0.000 0.248 0.600 0.152
#> SRR1700081 2 0.6486 0.56426 0.128 0.712 0.052 0.108
#> SRR1700082 3 0.5942 0.32542 0.000 0.412 0.548 0.040
#> SRR1700083 2 0.7629 -0.30581 0.000 0.404 0.392 0.204
#> SRR1700084 2 0.5850 0.02985 0.000 0.512 0.456 0.032
#> SRR1700085 4 0.7740 -0.00904 0.000 0.236 0.348 0.416
#> SRR1700086 3 0.5922 0.54048 0.004 0.184 0.704 0.108
#> SRR1700087 3 0.7705 0.32373 0.032 0.112 0.504 0.352
#> SRR1700088 2 0.4131 0.60448 0.108 0.840 0.036 0.016
#> SRR1700089 2 0.7199 0.30916 0.076 0.536 0.028 0.360
#> SRR1700091 4 0.4289 0.66282 0.024 0.132 0.020 0.824
#> SRR1700090 4 0.1721 0.70985 0.012 0.008 0.028 0.952
#> SRR1700092 4 0.6623 0.38752 0.060 0.320 0.020 0.600
#> SRR1700094 4 0.5509 0.64884 0.024 0.148 0.068 0.760
#> SRR1700093 4 0.2210 0.71540 0.020 0.028 0.016 0.936
#> SRR1700095 4 0.1929 0.71717 0.024 0.000 0.036 0.940
#> SRR1700096 4 0.3949 0.67808 0.016 0.140 0.012 0.832
#> SRR1700097 4 0.3791 0.66505 0.012 0.016 0.128 0.844
#> SRR1700098 4 0.6311 0.53717 0.112 0.192 0.012 0.684
#> SRR1700099 4 0.1509 0.71174 0.012 0.008 0.020 0.960
#> SRR1700100 4 0.6678 0.20258 0.016 0.060 0.360 0.564
#> SRR1700101 4 0.4517 0.64215 0.028 0.172 0.008 0.792
#> SRR1700102 4 0.8950 0.11274 0.104 0.284 0.156 0.456
#> SRR1700104 4 0.1975 0.71341 0.012 0.016 0.028 0.944
#> SRR1700103 4 0.6133 0.61560 0.048 0.192 0.048 0.712
#> SRR1700105 4 0.2940 0.70594 0.088 0.008 0.012 0.892
#> SRR1700106 4 0.2210 0.71775 0.028 0.016 0.020 0.936
#> SRR1700107 4 0.4190 0.67786 0.040 0.024 0.092 0.844
#> SRR1700108 4 0.2605 0.71537 0.040 0.024 0.016 0.920
#> SRR1700109 4 0.3228 0.71838 0.032 0.032 0.040 0.896
#> SRR1700110 4 0.2284 0.71668 0.020 0.036 0.012 0.932
#> SRR1700112 4 0.1762 0.71860 0.016 0.020 0.012 0.952
#> SRR1700111 4 0.5367 0.49942 0.000 0.032 0.304 0.664
#> SRR1700113 4 0.3439 0.71309 0.016 0.016 0.096 0.872
#> SRR1700114 4 0.2246 0.71701 0.004 0.052 0.016 0.928
#> SRR1700115 4 0.2099 0.71293 0.004 0.040 0.020 0.936
#> SRR1700116 4 0.5034 0.46103 0.008 0.012 0.280 0.700
#> SRR1700117 4 0.1509 0.71655 0.008 0.012 0.020 0.960
#> SRR1700119 4 0.1484 0.71795 0.004 0.020 0.016 0.960
#> SRR1700118 3 0.6468 0.15078 0.024 0.028 0.492 0.456
#> SRR1700120 4 0.4485 0.69493 0.048 0.024 0.100 0.828
#> SRR1700121 4 0.1853 0.72034 0.012 0.012 0.028 0.948
#> SRR1700122 4 0.3389 0.71046 0.004 0.024 0.104 0.868
#> SRR1700123 4 0.2786 0.72064 0.020 0.020 0.048 0.912
#> SRR1700125 4 0.1369 0.71482 0.016 0.016 0.004 0.964
#> SRR1700126 4 0.4824 0.69906 0.024 0.084 0.080 0.812
#> SRR1700127 4 0.1958 0.71237 0.020 0.008 0.028 0.944
#> SRR1700124 4 0.1733 0.71484 0.000 0.024 0.028 0.948
#> SRR1700128 4 0.4050 0.66877 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR1700129 4 0.1953 0.71075 0.012 0.004 0.044 0.940
#> SRR1700130 4 0.5270 0.40746 0.012 0.008 0.320 0.660
#> SRR1700132 4 0.1356 0.71910 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR1700131 4 0.3565 0.71531 0.036 0.080 0.012 0.872
#> SRR1700133 4 0.2099 0.71821 0.020 0.004 0.040 0.936
#> SRR1700134 4 0.1362 0.71433 0.012 0.004 0.020 0.964
#> SRR1700135 4 0.3976 0.69418 0.044 0.004 0.112 0.840
#> SRR1700136 4 0.2076 0.71832 0.008 0.004 0.056 0.932
#> SRR1700137 4 0.1993 0.71961 0.016 0.024 0.016 0.944
#> SRR1700138 4 0.1690 0.71601 0.008 0.008 0.032 0.952
#> SRR1700140 4 0.1911 0.71376 0.004 0.020 0.032 0.944
#> SRR1700139 4 0.3304 0.66678 0.008 0.008 0.120 0.864
#> SRR1700141 4 0.1302 0.71370 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700142 4 0.4899 0.68649 0.028 0.052 0.116 0.804
#> SRR1700143 4 0.1247 0.71056 0.012 0.004 0.016 0.968
#> SRR1700144 3 0.7348 0.15141 0.008 0.128 0.492 0.372
#> SRR1700145 4 0.6491 0.28286 0.040 0.024 0.352 0.584
#> SRR1700146 4 0.1631 0.71776 0.008 0.016 0.020 0.956
#> SRR1700147 4 0.3858 0.72075 0.040 0.044 0.048 0.868
#> SRR1700149 4 0.5274 0.53549 0.020 0.020 0.236 0.724
#> SRR1700148 4 0.2891 0.71330 0.004 0.020 0.080 0.896
#> SRR1700150 4 0.1339 0.71555 0.004 0.008 0.024 0.964
#> SRR1700152 4 0.4219 0.67613 0.040 0.004 0.136 0.820
#> SRR1700151 4 0.1674 0.71683 0.004 0.012 0.032 0.952
#> SRR1700153 4 0.3836 0.68867 0.028 0.004 0.128 0.840
#> SRR1700154 4 0.1884 0.71375 0.016 0.016 0.020 0.948
#> SRR1700155 4 0.2101 0.71515 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1700156 4 0.1297 0.71614 0.000 0.020 0.016 0.964
#> SRR1700158 4 0.2917 0.71536 0.060 0.020 0.016 0.904
#> SRR1700159 4 0.2188 0.71894 0.032 0.012 0.020 0.936
#> SRR1700157 3 0.6796 0.48875 0.072 0.036 0.640 0.252
#> SRR1700160 4 0.1631 0.71726 0.008 0.016 0.020 0.956
#> SRR1700161 4 0.0804 0.71157 0.012 0.000 0.008 0.980
#> SRR1700162 4 0.1721 0.71735 0.028 0.008 0.012 0.952
#> SRR1700164 4 0.2142 0.70773 0.016 0.000 0.056 0.928
#> SRR1700163 4 0.1543 0.71667 0.008 0.004 0.032 0.956
#> SRR1700165 4 0.1174 0.71329 0.000 0.020 0.012 0.968
#> SRR1700166 4 0.3289 0.69356 0.120 0.004 0.012 0.864
#> SRR1700168 4 0.1271 0.71661 0.008 0.012 0.012 0.968
#> SRR1700167 4 0.5010 0.48342 0.000 0.024 0.276 0.700
#> SRR1700170 4 0.2365 0.71273 0.012 0.004 0.064 0.920
#> SRR1700169 4 0.3787 0.69786 0.000 0.036 0.124 0.840
#> SRR1700171 4 0.2936 0.71405 0.056 0.004 0.040 0.900
#> SRR1700172 4 0.2074 0.72102 0.012 0.016 0.032 0.940
#> SRR1700174 4 0.2261 0.71300 0.036 0.008 0.024 0.932
#> SRR1700173 4 0.1394 0.71357 0.012 0.016 0.008 0.964
#> SRR1700175 4 0.2115 0.71888 0.004 0.024 0.036 0.936
#> SRR1700176 4 0.3812 0.69160 0.028 0.008 0.116 0.848
#> SRR1700178 2 0.4950 0.29170 0.376 0.620 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.2665 0.69934 0.004 0.008 0.088 0.900
#> SRR1700180 2 0.5137 0.14967 0.452 0.544 0.000 0.004
#> SRR1700179 2 0.4356 0.45385 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR1700181 1 0.6529 0.14773 0.512 0.420 0.004 0.064
#> SRR1700183 1 0.2773 0.61806 0.900 0.072 0.028 0.000
#> SRR1700182 2 0.5057 0.37204 0.340 0.648 0.000 0.012
#> SRR1700184 2 0.4922 0.43663 0.284 0.700 0.004 0.012
#> SRR1700186 2 0.6262 0.39550 0.296 0.636 0.016 0.052
#> SRR1700187 1 0.1733 0.62143 0.948 0.028 0.024 0.000
#> SRR1700185 1 0.3900 0.51229 0.816 0.020 0.164 0.000
#> SRR1700188 2 0.4781 0.38151 0.336 0.660 0.004 0.000
#> SRR1700192 1 0.3217 0.60415 0.860 0.128 0.012 0.000
#> SRR1700190 2 0.4839 0.47864 0.256 0.724 0.004 0.016
#> SRR1700191 1 0.4841 0.54160 0.780 0.080 0.140 0.000
#> SRR1700189 1 0.2218 0.62002 0.932 0.028 0.036 0.004
#> SRR1700193 1 0.4925 0.20085 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR1700195 1 0.5040 0.36130 0.628 0.364 0.008 0.000
#> SRR1700194 1 0.2510 0.60327 0.916 0.012 0.064 0.008
#> SRR1700196 1 0.5147 0.10885 0.536 0.460 0.004 0.000
#> SRR1700197 1 0.4725 0.51290 0.728 0.256 0.012 0.004
#> SRR1700198 1 0.5168 0.07054 0.504 0.492 0.000 0.004
#> SRR1700199 1 0.5069 0.45384 0.664 0.320 0.016 0.000
#> SRR1700200 1 0.4114 0.56766 0.788 0.200 0.008 0.004
#> SRR1700201 2 0.4741 0.39305 0.328 0.668 0.004 0.000
#> SRR1700202 1 0.1911 0.62069 0.944 0.032 0.020 0.004
#> SRR1700203 1 0.5614 0.59443 0.756 0.140 0.080 0.024
#> SRR1700204 1 0.6437 0.39504 0.584 0.340 0.072 0.004
#> SRR1700206 1 0.5869 0.37702 0.620 0.336 0.004 0.040
#> SRR1700207 2 0.5099 0.31163 0.380 0.612 0.008 0.000
#> SRR1700208 1 0.4462 0.51614 0.736 0.256 0.004 0.004
#> SRR1700205 1 0.6591 0.26866 0.596 0.056 0.328 0.020
#> SRR1700209 2 0.7109 -0.01671 0.444 0.456 0.012 0.088
#> SRR1700210 1 0.3525 0.61703 0.860 0.100 0.040 0.000
#> SRR1700211 1 0.2522 0.61575 0.908 0.076 0.016 0.000
#> SRR1700212 1 0.6908 0.53458 0.656 0.140 0.176 0.028
#> SRR1700213 1 0.6071 0.12331 0.504 0.452 0.044 0.000
#> SRR1700214 1 0.6292 0.44811 0.632 0.296 0.012 0.060
#> SRR1700215 1 0.4506 0.55857 0.812 0.052 0.128 0.008
#> SRR1700217 1 0.5255 0.49644 0.696 0.272 0.004 0.028
#> SRR1700216 1 0.5279 0.42626 0.716 0.052 0.232 0.000
#> SRR1700218 2 0.5332 0.08702 0.480 0.512 0.004 0.004
#> SRR1700219 1 0.4899 0.45173 0.688 0.300 0.004 0.008
#> SRR1700222 1 0.1953 0.62194 0.944 0.032 0.012 0.012
#> SRR1700220 4 0.8049 -0.23518 0.336 0.292 0.004 0.368
#> SRR1700221 1 0.5461 0.06185 0.508 0.480 0.004 0.008
#> SRR1700223 2 0.5912 0.04221 0.464 0.508 0.016 0.012
#> SRR1700224 1 0.6252 0.56170 0.736 0.080 0.092 0.092
#> SRR1700226 1 0.4590 0.58461 0.772 0.192 0.036 0.000
#> SRR1700229 1 0.7075 0.28039 0.552 0.132 0.312 0.004
#> SRR1700225 2 0.5568 0.56264 0.152 0.728 0.120 0.000
#> SRR1700227 2 0.6130 0.23378 0.396 0.560 0.036 0.008
#> SRR1700230 1 0.2876 0.61497 0.892 0.092 0.008 0.008
#> SRR1700231 2 0.6900 0.06229 0.416 0.488 0.092 0.004
#> SRR1700228 1 0.6449 0.54800 0.688 0.124 0.168 0.020
#> SRR1700232 2 0.6203 0.21626 0.368 0.580 0.044 0.008
#> SRR1700233 1 0.6237 0.14797 0.504 0.448 0.004 0.044
#> SRR1700234 1 0.4301 0.57415 0.788 0.192 0.008 0.012
#> SRR1700235 2 0.5450 0.46594 0.292 0.676 0.012 0.020
#> SRR1700237 2 0.5334 0.05257 0.484 0.508 0.004 0.004
#> SRR1700236 2 0.7939 0.28280 0.292 0.524 0.148 0.036
#> SRR1700238 1 0.5308 0.17154 0.540 0.452 0.004 0.004
#> SRR1700239 1 0.2660 0.61344 0.916 0.024 0.048 0.012
#> SRR1700240 1 0.4034 0.48089 0.796 0.004 0.192 0.008
#> SRR1700241 1 0.6030 0.40623 0.632 0.040 0.012 0.316
#> SRR1700243 1 0.5598 0.42504 0.636 0.332 0.028 0.004
#> SRR1700244 1 0.5486 0.33102 0.604 0.376 0.004 0.016
#> SRR1700242 1 0.2457 0.61685 0.912 0.076 0.008 0.004
#> SRR1700246 1 0.3736 0.55435 0.848 0.016 0.124 0.012
#> SRR1700245 2 0.4544 0.52050 0.220 0.760 0.016 0.004
#> SRR1700247 1 0.6200 0.29765 0.620 0.036 0.324 0.020
#> SRR1700249 1 0.2186 0.61216 0.932 0.008 0.048 0.012
#> SRR1700250 2 0.5179 0.53822 0.184 0.760 0.036 0.020
#> SRR1700248 2 0.5112 0.40932 0.316 0.668 0.004 0.012
#> SRR1700251 1 0.4496 0.55834 0.768 0.212 0.008 0.012
#> SRR1700252 2 0.6709 -0.04135 0.452 0.460 0.088 0.000
#> SRR1700253 2 0.6710 0.02224 0.416 0.516 0.020 0.048
#> SRR1700256 1 0.6087 0.53755 0.684 0.208 0.104 0.004
#> SRR1700254 1 0.2907 0.58579 0.900 0.004 0.064 0.032
#> SRR1700255 1 0.5783 0.39786 0.636 0.324 0.008 0.032
#> SRR1700257 1 0.5119 0.18792 0.556 0.440 0.000 0.004
#> SRR1700258 1 0.6165 0.19084 0.532 0.428 0.016 0.024
#> SRR1700259 2 0.4672 0.60483 0.092 0.820 0.064 0.024
#> SRR1700260 4 0.7985 0.30142 0.068 0.320 0.092 0.520
#> SRR1700261 4 0.7008 0.52727 0.020 0.120 0.240 0.620
#> SRR1700262 4 0.7130 0.36735 0.304 0.008 0.128 0.560
#> SRR1700263 3 0.7100 0.46797 0.112 0.240 0.620 0.028
#> SRR1700264 2 0.4261 0.60219 0.068 0.820 0.112 0.000
#> SRR1700265 2 0.7250 0.31044 0.168 0.516 0.316 0.000
#> SRR1700266 2 0.4797 0.47579 0.260 0.720 0.020 0.000
#> SRR1700268 1 0.5574 0.36015 0.604 0.372 0.004 0.020
#> SRR1700270 2 0.5516 0.19775 0.428 0.556 0.012 0.004
#> SRR1700267 2 0.6832 0.52189 0.204 0.652 0.120 0.024
#> SRR1700271 2 0.5148 0.59057 0.140 0.784 0.032 0.044
#> SRR1700272 2 0.8051 0.09938 0.052 0.444 0.104 0.400
#> SRR1700273 2 0.5062 0.41896 0.300 0.680 0.020 0.000
#> SRR1700274 3 0.9563 0.13017 0.308 0.120 0.332 0.240
#> SRR1700277 2 0.6489 0.39022 0.280 0.640 0.040 0.040
#> SRR1700275 4 0.6727 0.48542 0.272 0.060 0.036 0.632
#> SRR1700276 4 0.6311 0.36545 0.356 0.040 0.016 0.588
#> SRR1700278 1 0.7383 0.48582 0.616 0.120 0.044 0.220
#> SRR1700279 1 0.7712 -0.11569 0.436 0.036 0.432 0.096
#> SRR1700280 1 0.5380 0.60825 0.788 0.068 0.088 0.056
#> SRR1700281 2 0.5862 0.57711 0.104 0.748 0.116 0.032
#> SRR1700283 3 0.6823 0.28034 0.044 0.036 0.568 0.352
#> SRR1700282 1 0.5774 0.56214 0.720 0.088 0.008 0.184
#> SRR1700284 4 0.5506 0.67592 0.040 0.064 0.124 0.772
#> SRR1700285 1 0.7765 0.14415 0.488 0.068 0.064 0.380
#> SRR1700286 2 0.7687 0.28221 0.332 0.528 0.096 0.044
#> SRR1700287 4 0.5519 0.66429 0.100 0.032 0.096 0.772
#> SRR1700290 4 0.7544 0.47617 0.212 0.024 0.184 0.580
#> SRR1700289 3 0.7007 0.42248 0.076 0.036 0.612 0.276
#> SRR1700288 1 0.5841 0.57685 0.736 0.152 0.020 0.092
#> SRR1700292 3 0.8112 0.20204 0.388 0.040 0.440 0.132
#> SRR1700291 4 0.5095 0.67854 0.008 0.120 0.092 0.780
#> SRR1700293 1 0.6909 0.06985 0.464 0.072 0.012 0.452
#> SRR1700294 1 0.7528 0.07816 0.496 0.012 0.140 0.352
#> SRR1700295 4 0.5201 0.67665 0.068 0.016 0.140 0.776
#> SRR1700297 4 0.7598 0.41444 0.268 0.044 0.112 0.576
#> SRR1700296 4 0.6952 0.54153 0.128 0.028 0.196 0.648
#> SRR1700298 4 0.4743 0.69664 0.052 0.024 0.112 0.812
#> SRR1700299 3 0.8123 0.34455 0.228 0.020 0.472 0.280
#> SRR1700300 3 0.8240 0.42918 0.232 0.032 0.492 0.244
#> SRR1700302 4 0.4481 0.69472 0.024 0.032 0.124 0.820
#> SRR1700301 4 0.5054 0.67358 0.132 0.012 0.072 0.784
#> SRR1700303 4 0.6940 0.60744 0.096 0.064 0.164 0.676
#> SRR1700304 1 0.3847 0.56786 0.844 0.012 0.020 0.124
#> SRR1700305 1 0.6645 0.13544 0.528 0.024 0.040 0.408
#> SRR1700306 4 0.7749 0.28425 0.124 0.028 0.352 0.496
#> SRR1700308 3 0.7492 0.47312 0.248 0.096 0.600 0.056
#> SRR1700307 4 0.6373 0.60366 0.036 0.124 0.128 0.712
#> SRR1700309 3 0.6468 0.46846 0.188 0.056 0.696 0.060
#> SRR1700310 4 0.4347 0.70252 0.068 0.008 0.096 0.828
#> SRR1700311 4 0.7719 0.35208 0.280 0.020 0.168 0.532
#> SRR1700312 4 0.4215 0.68794 0.012 0.024 0.144 0.820
#> SRR1700313 4 0.7623 0.53725 0.188 0.052 0.152 0.608
#> SRR1700314 4 0.6078 0.51672 0.012 0.048 0.296 0.644
#> SRR1700315 3 0.6825 0.51998 0.168 0.024 0.660 0.148
#> SRR1700316 4 0.9082 0.03071 0.160 0.324 0.104 0.412
#> SRR1700317 4 0.9011 0.01806 0.068 0.244 0.280 0.408
#> SRR1700318 1 0.6371 0.44334 0.712 0.036 0.120 0.132
#> SRR1700319 4 0.4960 0.68122 0.040 0.020 0.156 0.784
#> SRR1700320 4 0.7679 0.47176 0.152 0.036 0.236 0.576
#> SRR1700322 1 0.7388 -0.05937 0.452 0.024 0.088 0.436
#> SRR1700321 4 0.5932 0.65341 0.088 0.028 0.148 0.736
#> SRR1700323 4 0.6073 0.61228 0.012 0.100 0.184 0.704
#> SRR1700324 4 0.7290 0.56628 0.180 0.076 0.096 0.648
#> SRR1700325 4 0.8109 0.12203 0.160 0.336 0.032 0.472
#> SRR1700326 1 0.7949 0.13627 0.536 0.036 0.264 0.164
#> SRR1700327 4 0.8900 0.09581 0.220 0.296 0.064 0.420
#> SRR1700329 4 0.6963 0.37143 0.044 0.044 0.348 0.564
#> SRR1700328 3 0.5775 0.40996 0.260 0.044 0.684 0.012
#> SRR1700330 1 0.6903 0.45764 0.668 0.052 0.092 0.188
#> SRR1700331 1 0.8079 -0.09552 0.440 0.044 0.396 0.120
#> SRR1700332 4 0.5346 0.67421 0.112 0.028 0.080 0.780
#> SRR1700333 1 0.4809 0.61570 0.820 0.060 0.048 0.072
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.437 0.632925 0.052 0.812 0.088 0.008 0.040
#> SRR1699875 2 0.741 0.041471 0.068 0.428 0.144 0.000 0.360
#> SRR1699876 5 0.731 0.253131 0.044 0.068 0.360 0.044 0.484
#> SRR1699877 5 0.757 0.381303 0.044 0.244 0.164 0.028 0.520
#> SRR1699879 2 0.632 0.566589 0.136 0.692 0.052 0.056 0.064
#> SRR1699878 5 0.703 0.442242 0.052 0.232 0.156 0.004 0.556
#> SRR1699880 2 0.263 0.639684 0.040 0.904 0.040 0.004 0.012
#> SRR1699881 2 0.546 0.540437 0.052 0.688 0.216 0.000 0.044
#> SRR1699882 2 0.755 0.232353 0.108 0.488 0.136 0.000 0.268
#> SRR1699883 5 0.727 0.385818 0.132 0.232 0.100 0.000 0.536
#> SRR1699884 2 0.577 0.589233 0.128 0.684 0.152 0.000 0.036
#> SRR1699885 2 0.422 0.613508 0.144 0.792 0.020 0.000 0.044
#> SRR1699886 5 0.625 0.507549 0.056 0.092 0.172 0.012 0.668
#> SRR1699888 4 0.516 0.577771 0.004 0.200 0.060 0.716 0.020
#> SRR1699889 3 0.830 -0.038666 0.060 0.048 0.380 0.152 0.360
#> SRR1699890 5 0.683 0.493943 0.144 0.088 0.168 0.000 0.600
#> SRR1699887 2 0.673 0.062505 0.032 0.484 0.396 0.016 0.072
#> SRR1699891 5 0.774 0.204646 0.180 0.016 0.316 0.048 0.440
#> SRR1699892 3 0.700 0.060607 0.004 0.396 0.408 0.016 0.176
#> SRR1699893 4 0.708 0.422116 0.032 0.004 0.236 0.520 0.208
#> SRR1699894 3 0.833 0.060721 0.208 0.032 0.444 0.080 0.236
#> SRR1699895 3 0.797 0.099769 0.052 0.020 0.432 0.280 0.216
#> SRR1699896 5 0.825 0.116011 0.176 0.328 0.132 0.004 0.360
#> SRR1699897 2 0.826 0.176655 0.188 0.388 0.288 0.004 0.132
#> SRR1699898 4 0.667 -0.023376 0.008 0.048 0.060 0.460 0.424
#> SRR1699900 5 0.641 0.501756 0.096 0.024 0.184 0.040 0.656
#> SRR1699899 5 0.576 0.432679 0.036 0.036 0.288 0.008 0.632
#> SRR1699902 5 0.530 0.183036 0.008 0.032 0.480 0.000 0.480
#> SRR1699901 5 0.579 0.506016 0.040 0.024 0.168 0.060 0.708
#> SRR1699903 5 0.520 0.472140 0.052 0.016 0.192 0.016 0.724
#> SRR1699904 4 0.844 0.306657 0.176 0.012 0.196 0.424 0.192
#> SRR1699905 5 0.519 0.520317 0.096 0.004 0.084 0.060 0.756
#> SRR1699906 5 0.713 0.351608 0.040 0.052 0.308 0.060 0.540
#> SRR1699907 5 0.824 0.270383 0.204 0.012 0.228 0.116 0.440
#> SRR1699908 4 0.824 -0.060843 0.024 0.052 0.272 0.348 0.304
#> SRR1699909 3 0.760 -0.041863 0.052 0.004 0.384 0.376 0.184
#> SRR1699910 3 0.780 0.012755 0.068 0.016 0.428 0.140 0.348
#> SRR1699911 3 0.763 -0.198247 0.276 0.028 0.352 0.008 0.336
#> SRR1699912 5 0.567 0.305059 0.028 0.008 0.336 0.028 0.600
#> SRR1699913 5 0.639 -0.066966 0.028 0.016 0.048 0.432 0.476
#> SRR1699914 3 0.641 0.343185 0.052 0.048 0.648 0.036 0.216
#> SRR1699915 3 0.803 0.068681 0.092 0.008 0.428 0.188 0.284
#> SRR1699916 4 0.637 0.291757 0.036 0.000 0.372 0.516 0.076
#> SRR1699917 4 0.699 0.516780 0.020 0.048 0.216 0.592 0.124
#> SRR1699918 4 0.750 0.227540 0.044 0.004 0.292 0.448 0.212
#> SRR1699919 3 0.781 0.132074 0.060 0.012 0.460 0.212 0.256
#> SRR1699920 3 0.845 0.018076 0.092 0.020 0.356 0.316 0.216
#> SRR1699921 3 0.676 0.252154 0.060 0.004 0.592 0.116 0.228
#> SRR1699922 5 0.806 0.321186 0.268 0.048 0.244 0.024 0.416
#> SRR1699923 5 0.583 0.502375 0.080 0.020 0.208 0.016 0.676
#> SRR1699924 3 0.720 0.285622 0.004 0.068 0.484 0.340 0.104
#> SRR1699925 1 0.789 0.235517 0.532 0.032 0.164 0.092 0.180
#> SRR1699926 5 0.864 0.216905 0.132 0.040 0.240 0.156 0.432
#> SRR1699927 3 0.714 0.207693 0.032 0.008 0.524 0.196 0.240
#> SRR1699929 3 0.744 0.015471 0.112 0.072 0.464 0.008 0.344
#> SRR1699928 5 0.562 0.416412 0.024 0.032 0.324 0.008 0.612
#> SRR1699930 5 0.883 0.176557 0.144 0.052 0.304 0.124 0.376
#> SRR1699931 3 0.846 0.122790 0.128 0.136 0.460 0.040 0.236
#> SRR1699933 3 0.712 0.140311 0.052 0.124 0.500 0.004 0.320
#> SRR1699932 3 0.945 -0.010538 0.264 0.076 0.284 0.236 0.140
#> SRR1699934 1 0.611 0.401243 0.664 0.040 0.064 0.020 0.212
#> SRR1699935 4 0.721 0.466512 0.008 0.084 0.160 0.576 0.172
#> SRR1699936 2 0.625 0.466094 0.008 0.640 0.060 0.228 0.064
#> SRR1699937 2 0.269 0.630620 0.008 0.892 0.068 0.000 0.032
#> SRR1699938 2 0.137 0.634462 0.008 0.960 0.016 0.008 0.008
#> SRR1699940 2 0.642 0.476898 0.068 0.620 0.020 0.040 0.252
#> SRR1699939 2 0.329 0.638307 0.036 0.876 0.048 0.008 0.032
#> SRR1699941 2 0.545 0.628625 0.088 0.740 0.108 0.008 0.056
#> SRR1699942 5 0.760 0.449849 0.040 0.176 0.080 0.132 0.572
#> SRR1699943 2 0.226 0.633107 0.044 0.920 0.008 0.004 0.024
#> SRR1699944 2 0.267 0.636188 0.020 0.904 0.032 0.004 0.040
#> SRR1699945 2 0.666 0.561908 0.132 0.636 0.148 0.008 0.076
#> SRR1699946 2 0.354 0.639265 0.040 0.856 0.052 0.000 0.052
#> SRR1699947 2 0.398 0.629116 0.044 0.820 0.108 0.000 0.028
#> SRR1699948 2 0.400 0.618126 0.008 0.828 0.096 0.020 0.048
#> SRR1699949 2 0.601 0.593761 0.092 0.720 0.044 0.052 0.092
#> SRR1699950 2 0.407 0.629887 0.040 0.840 0.028 0.032 0.060
#> SRR1699951 2 0.694 0.505468 0.036 0.612 0.216 0.064 0.072
#> SRR1699952 2 0.493 0.589209 0.044 0.732 0.192 0.000 0.032
#> SRR1699953 2 0.343 0.636482 0.004 0.860 0.076 0.016 0.044
#> SRR1699954 2 0.576 0.544382 0.208 0.664 0.108 0.004 0.016
#> SRR1699955 2 0.400 0.626001 0.004 0.820 0.116 0.036 0.024
#> SRR1699956 2 0.436 0.642273 0.052 0.812 0.096 0.012 0.028
#> SRR1699957 2 0.535 0.616302 0.076 0.732 0.132 0.000 0.060
#> SRR1699959 2 0.648 0.242697 0.008 0.560 0.324 0.048 0.060
#> SRR1699958 4 0.608 0.332859 0.012 0.072 0.012 0.576 0.328
#> SRR1699960 2 0.701 0.158437 0.000 0.448 0.120 0.384 0.048
#> SRR1699961 2 0.533 0.482913 0.004 0.672 0.256 0.016 0.052
#> SRR1699962 2 0.528 0.617064 0.148 0.728 0.096 0.004 0.024
#> SRR1699963 5 0.713 0.333282 0.016 0.112 0.320 0.040 0.512
#> SRR1699964 2 0.819 0.334112 0.136 0.472 0.168 0.016 0.208
#> SRR1699965 2 0.494 0.633413 0.068 0.780 0.100 0.020 0.032
#> SRR1699966 2 0.602 0.521338 0.000 0.672 0.068 0.092 0.168
#> SRR1699967 2 0.563 0.623465 0.072 0.724 0.140 0.012 0.052
#> SRR1699968 3 0.732 0.396036 0.048 0.240 0.572 0.060 0.080
#> SRR1699969 3 0.862 0.209969 0.032 0.324 0.368 0.156 0.120
#> SRR1699971 2 0.487 0.609930 0.064 0.772 0.020 0.016 0.128
#> SRR1699970 3 0.793 -0.094028 0.080 0.236 0.348 0.000 0.336
#> SRR1699972 5 0.753 0.354538 0.048 0.208 0.216 0.016 0.512
#> SRR1699973 2 0.765 -0.095661 0.004 0.428 0.092 0.124 0.352
#> SRR1699974 2 0.818 0.187932 0.248 0.344 0.336 0.028 0.044
#> SRR1699975 5 0.522 0.492195 0.012 0.056 0.188 0.020 0.724
#> SRR1699976 2 0.453 0.593281 0.036 0.736 0.216 0.000 0.012
#> SRR1699977 5 0.648 0.417380 0.004 0.104 0.244 0.044 0.604
#> SRR1699978 4 0.750 0.356776 0.276 0.004 0.092 0.500 0.128
#> SRR1699979 2 0.665 0.361425 0.012 0.572 0.092 0.288 0.036
#> SRR1699980 3 0.565 -0.138616 0.012 0.008 0.496 0.032 0.452
#> SRR1699981 5 0.670 0.465224 0.016 0.044 0.176 0.140 0.624
#> SRR1699982 3 0.704 -0.019961 0.128 0.004 0.440 0.036 0.392
#> SRR1699983 3 0.749 0.009582 0.108 0.068 0.440 0.012 0.372
#> SRR1699984 3 0.729 -0.085971 0.344 0.008 0.384 0.012 0.252
#> SRR1699985 3 0.448 0.456172 0.000 0.072 0.772 0.012 0.144
#> SRR1699986 5 0.723 0.406012 0.288 0.020 0.200 0.012 0.480
#> SRR1699988 5 0.714 0.486732 0.080 0.096 0.164 0.040 0.620
#> SRR1699987 4 0.799 -0.006877 0.012 0.156 0.352 0.396 0.084
#> SRR1699989 3 0.901 0.125005 0.040 0.172 0.376 0.204 0.208
#> SRR1699990 3 0.664 0.409124 0.008 0.100 0.644 0.132 0.116
#> SRR1699992 2 0.354 0.633360 0.072 0.860 0.036 0.012 0.020
#> SRR1699991 3 0.627 0.450841 0.000 0.124 0.660 0.132 0.084
#> SRR1699993 3 0.900 0.031953 0.304 0.052 0.340 0.184 0.120
#> SRR1699994 3 0.637 0.405871 0.072 0.220 0.624 0.000 0.084
#> SRR1699995 4 0.721 -0.039670 0.012 0.076 0.416 0.428 0.068
#> SRR1699996 1 0.661 0.537816 0.604 0.244 0.024 0.024 0.104
#> SRR1699997 4 0.401 0.678700 0.008 0.056 0.024 0.832 0.080
#> SRR1699998 5 0.676 0.502554 0.128 0.100 0.104 0.020 0.648
#> SRR1699999 1 0.795 0.394453 0.524 0.228 0.124 0.056 0.068
#> SRR1700000 5 0.605 0.516061 0.136 0.044 0.044 0.068 0.708
#> SRR1700002 2 0.456 0.612642 0.024 0.776 0.156 0.008 0.036
#> SRR1700001 2 0.830 0.002659 0.072 0.376 0.204 0.024 0.324
#> SRR1700003 5 0.707 0.404567 0.008 0.064 0.108 0.272 0.548
#> SRR1700004 3 0.588 0.270370 0.004 0.364 0.552 0.008 0.072
#> SRR1700005 1 0.648 0.284842 0.596 0.040 0.088 0.008 0.268
#> SRR1700006 2 0.645 0.513366 0.020 0.656 0.180 0.088 0.056
#> SRR1700007 5 0.796 0.035748 0.032 0.020 0.316 0.312 0.320
#> SRR1700008 4 0.620 0.609631 0.044 0.072 0.100 0.708 0.076
#> SRR1700009 1 0.656 0.376249 0.648 0.016 0.052 0.144 0.140
#> SRR1700010 2 0.528 0.603964 0.044 0.732 0.168 0.008 0.048
#> SRR1700011 5 0.732 0.404627 0.028 0.148 0.200 0.052 0.572
#> SRR1700013 2 0.769 0.276918 0.088 0.480 0.060 0.328 0.044
#> SRR1700012 5 0.621 0.383303 0.020 0.044 0.332 0.028 0.576
#> SRR1700014 3 0.491 0.501219 0.000 0.132 0.760 0.048 0.060
#> SRR1700015 3 0.552 0.037868 0.004 0.464 0.484 0.004 0.044
#> SRR1700016 5 0.690 0.267434 0.180 0.000 0.340 0.020 0.460
#> SRR1700018 2 0.665 0.241351 0.000 0.524 0.340 0.060 0.076
#> SRR1700017 3 0.594 0.244077 0.008 0.364 0.552 0.008 0.068
#> SRR1700019 3 0.689 0.370175 0.108 0.036 0.648 0.088 0.120
#> SRR1700020 4 0.615 0.584848 0.004 0.108 0.144 0.676 0.068
#> SRR1700021 3 0.762 0.003957 0.104 0.036 0.480 0.052 0.328
#> SRR1700023 3 0.591 0.305068 0.004 0.364 0.544 0.004 0.084
#> SRR1700022 2 0.704 -0.079467 0.004 0.452 0.396 0.080 0.068
#> SRR1700024 3 0.606 0.422445 0.020 0.012 0.656 0.200 0.112
#> SRR1700025 3 0.535 0.104436 0.032 0.416 0.540 0.000 0.012
#> SRR1700026 3 0.500 0.424454 0.000 0.276 0.672 0.012 0.040
#> SRR1700027 3 0.483 0.423815 0.004 0.260 0.692 0.004 0.040
#> SRR1700028 4 0.661 0.342770 0.016 0.008 0.300 0.544 0.132
#> SRR1700029 3 0.672 0.195619 0.008 0.060 0.504 0.372 0.056
#> SRR1700030 3 0.395 0.457412 0.004 0.012 0.800 0.024 0.160
#> SRR1700031 3 0.624 0.391258 0.004 0.280 0.604 0.048 0.064
#> SRR1700032 3 0.568 0.107345 0.020 0.440 0.500 0.000 0.040
#> SRR1700034 3 0.632 0.437534 0.008 0.192 0.652 0.060 0.088
#> SRR1700035 3 0.455 0.456212 0.008 0.004 0.776 0.116 0.096
#> SRR1700033 3 0.518 0.428387 0.000 0.260 0.668 0.008 0.064
#> SRR1700036 3 0.432 0.505686 0.008 0.136 0.796 0.016 0.044
#> SRR1700037 3 0.731 -0.043275 0.036 0.008 0.416 0.388 0.152
#> SRR1700038 3 0.869 0.026633 0.212 0.076 0.392 0.052 0.268
#> SRR1700039 3 0.576 0.508536 0.016 0.076 0.728 0.088 0.092
#> SRR1700040 3 0.669 0.424902 0.052 0.032 0.628 0.216 0.072
#> SRR1700041 3 0.613 0.436057 0.000 0.100 0.644 0.208 0.048
#> SRR1700042 3 0.451 0.498983 0.000 0.096 0.792 0.036 0.076
#> SRR1700043 3 0.714 0.385439 0.044 0.192 0.588 0.028 0.148
#> SRR1700045 3 0.729 0.419969 0.036 0.088 0.608 0.148 0.120
#> SRR1700044 3 0.460 0.452134 0.012 0.064 0.768 0.004 0.152
#> SRR1700046 3 0.542 0.476882 0.000 0.124 0.728 0.088 0.060
#> SRR1700047 3 0.714 0.444011 0.048 0.124 0.632 0.088 0.108
#> SRR1700048 3 0.502 0.403296 0.036 0.008 0.736 0.032 0.188
#> SRR1700049 3 0.495 0.508412 0.000 0.112 0.760 0.040 0.088
#> SRR1700050 3 0.748 0.086217 0.020 0.024 0.400 0.384 0.172
#> SRR1700051 3 0.466 0.388481 0.008 0.024 0.744 0.020 0.204
#> SRR1700052 3 0.357 0.495084 0.000 0.020 0.844 0.040 0.096
#> SRR1700053 3 0.450 0.491829 0.004 0.020 0.792 0.088 0.096
#> SRR1700054 3 0.514 0.489977 0.000 0.060 0.752 0.100 0.088
#> SRR1700055 3 0.620 0.428709 0.008 0.252 0.624 0.032 0.084
#> SRR1700056 4 0.569 0.530785 0.004 0.036 0.248 0.660 0.052
#> SRR1700057 4 0.556 0.302104 0.000 0.008 0.380 0.556 0.056
#> SRR1700058 3 0.474 0.502037 0.008 0.120 0.780 0.028 0.064
#> SRR1700059 4 0.534 0.514373 0.000 0.004 0.260 0.652 0.084
#> SRR1700060 3 0.340 0.496153 0.004 0.032 0.868 0.048 0.048
#> SRR1700061 3 0.533 0.499802 0.016 0.092 0.748 0.112 0.032
#> SRR1700062 4 0.485 0.659837 0.012 0.020 0.148 0.764 0.056
#> SRR1700063 3 0.648 0.410585 0.000 0.096 0.624 0.200 0.080
#> SRR1700064 3 0.446 0.475742 0.028 0.052 0.804 0.012 0.104
#> SRR1700065 5 0.647 0.295477 0.044 0.016 0.356 0.044 0.540
#> SRR1700066 3 0.377 0.489719 0.012 0.056 0.828 0.000 0.104
#> SRR1700067 3 0.566 0.430818 0.020 0.016 0.692 0.200 0.072
#> SRR1700068 4 0.619 0.175392 0.000 0.044 0.416 0.492 0.048
#> SRR1700069 3 0.374 0.497450 0.004 0.040 0.844 0.028 0.084
#> SRR1700070 3 0.435 0.481857 0.004 0.172 0.772 0.008 0.044
#> SRR1700071 3 0.352 0.502096 0.000 0.104 0.840 0.008 0.048
#> SRR1700072 3 0.605 0.279561 0.148 0.008 0.632 0.008 0.204
#> SRR1700073 3 0.580 0.405253 0.020 0.000 0.664 0.160 0.156
#> SRR1700075 3 0.443 0.503638 0.008 0.064 0.812 0.052 0.064
#> SRR1700074 3 0.536 0.428886 0.008 0.280 0.656 0.012 0.044
#> SRR1700076 3 0.707 0.348058 0.096 0.284 0.552 0.024 0.044
#> SRR1700077 3 0.529 0.431092 0.036 0.228 0.696 0.004 0.036
#> SRR1700078 3 0.337 0.502074 0.004 0.052 0.868 0.024 0.052
#> SRR1700080 3 0.452 0.503369 0.004 0.132 0.784 0.020 0.060
#> SRR1700079 3 0.618 -0.047374 0.000 0.040 0.500 0.052 0.408
#> SRR1700081 2 0.703 0.471174 0.044 0.596 0.144 0.192 0.024
#> SRR1700082 5 0.658 0.181655 0.004 0.096 0.416 0.024 0.460
#> SRR1700083 3 0.644 0.417014 0.004 0.124 0.644 0.064 0.164
#> SRR1700084 3 0.352 0.486812 0.000 0.100 0.832 0.000 0.068
#> SRR1700085 3 0.385 0.506228 0.000 0.040 0.836 0.076 0.048
#> SRR1700086 3 0.284 0.480328 0.000 0.020 0.880 0.012 0.088
#> SRR1700087 5 0.685 0.396655 0.020 0.104 0.028 0.296 0.552
#> SRR1700088 2 0.471 0.628711 0.048 0.800 0.080 0.052 0.020
#> SRR1700089 2 0.556 0.343381 0.020 0.576 0.020 0.372 0.012
#> SRR1700091 4 0.427 0.630623 0.012 0.152 0.012 0.792 0.032
#> SRR1700090 4 0.198 0.688812 0.016 0.020 0.004 0.936 0.024
#> SRR1700092 4 0.684 0.456822 0.036 0.252 0.076 0.596 0.040
#> SRR1700094 4 0.540 0.586604 0.016 0.180 0.060 0.720 0.024
#> SRR1700093 4 0.229 0.689767 0.012 0.024 0.028 0.924 0.012
#> SRR1700095 4 0.419 0.696471 0.016 0.024 0.048 0.824 0.088
#> SRR1700096 4 0.434 0.632750 0.012 0.148 0.028 0.792 0.020
#> SRR1700097 4 0.380 0.657719 0.004 0.028 0.016 0.824 0.128
#> SRR1700098 4 0.526 0.497466 0.024 0.280 0.008 0.664 0.024
#> SRR1700099 4 0.249 0.689522 0.028 0.020 0.012 0.916 0.024
#> SRR1700100 4 0.630 0.041841 0.012 0.040 0.036 0.496 0.416
#> SRR1700101 4 0.452 0.570329 0.004 0.224 0.020 0.736 0.016
#> SRR1700102 4 0.763 0.118959 0.036 0.348 0.020 0.428 0.168
#> SRR1700104 4 0.308 0.687169 0.016 0.048 0.020 0.888 0.028
#> SRR1700103 4 0.670 0.475488 0.024 0.268 0.032 0.588 0.088
#> SRR1700105 4 0.366 0.692285 0.068 0.036 0.012 0.856 0.028
#> SRR1700106 4 0.327 0.699563 0.020 0.036 0.020 0.880 0.044
#> SRR1700107 4 0.390 0.668987 0.020 0.052 0.008 0.836 0.084
#> SRR1700108 4 0.283 0.689386 0.032 0.036 0.020 0.900 0.012
#> SRR1700109 4 0.370 0.688765 0.024 0.036 0.036 0.860 0.044
#> SRR1700110 4 0.242 0.686928 0.016 0.044 0.012 0.916 0.012
#> SRR1700112 4 0.244 0.697298 0.016 0.008 0.020 0.916 0.040
#> SRR1700111 4 0.635 0.489394 0.016 0.020 0.080 0.584 0.300
#> SRR1700113 4 0.645 0.614748 0.052 0.024 0.116 0.668 0.140
#> SRR1700114 4 0.350 0.685473 0.008 0.040 0.060 0.864 0.028
#> SRR1700115 4 0.216 0.688602 0.000 0.036 0.016 0.924 0.024
#> SRR1700116 4 0.446 0.442052 0.000 0.000 0.020 0.660 0.320
#> SRR1700117 4 0.191 0.696652 0.008 0.000 0.016 0.932 0.044
#> SRR1700119 4 0.290 0.701684 0.012 0.012 0.024 0.892 0.060
#> SRR1700118 5 0.624 0.149729 0.016 0.008 0.068 0.432 0.476
#> SRR1700120 4 0.417 0.685528 0.036 0.024 0.008 0.812 0.120
#> SRR1700121 4 0.376 0.701522 0.016 0.016 0.044 0.848 0.076
#> SRR1700122 4 0.438 0.667738 0.000 0.004 0.140 0.772 0.084
#> SRR1700123 4 0.512 0.668879 0.044 0.008 0.060 0.756 0.132
#> SRR1700125 4 0.158 0.693007 0.012 0.004 0.016 0.952 0.016
#> SRR1700126 4 0.510 0.658991 0.024 0.024 0.084 0.768 0.100
#> SRR1700127 4 0.232 0.697147 0.008 0.028 0.008 0.920 0.036
#> SRR1700124 4 0.270 0.695370 0.000 0.012 0.072 0.892 0.024
#> SRR1700128 4 0.488 0.594801 0.000 0.000 0.108 0.716 0.176
#> SRR1700129 4 0.261 0.696606 0.012 0.000 0.032 0.900 0.056
#> SRR1700130 4 0.492 0.375708 0.024 0.000 0.008 0.620 0.348
#> SRR1700132 4 0.274 0.698800 0.016 0.008 0.008 0.892 0.076
#> SRR1700131 4 0.350 0.700109 0.020 0.036 0.024 0.868 0.052
#> SRR1700133 4 0.435 0.676750 0.032 0.000 0.064 0.800 0.104
#> SRR1700134 4 0.346 0.689854 0.024 0.004 0.036 0.860 0.076
#> SRR1700135 4 0.471 0.671574 0.052 0.000 0.052 0.776 0.120
#> SRR1700136 4 0.260 0.699681 0.004 0.012 0.016 0.900 0.068
#> SRR1700137 4 0.329 0.699117 0.032 0.024 0.012 0.876 0.056
#> SRR1700138 4 0.338 0.691508 0.012 0.000 0.056 0.856 0.076
#> SRR1700140 4 0.305 0.694625 0.008 0.016 0.020 0.880 0.076
#> SRR1700139 4 0.348 0.641155 0.012 0.004 0.004 0.816 0.164
#> SRR1700141 4 0.191 0.697968 0.000 0.008 0.016 0.932 0.044
#> SRR1700142 4 0.675 0.500534 0.032 0.036 0.236 0.608 0.088
#> SRR1700143 4 0.157 0.690987 0.020 0.000 0.000 0.944 0.036
#> SRR1700144 3 0.744 0.317301 0.036 0.036 0.548 0.168 0.212
#> SRR1700145 5 0.584 -0.045044 0.044 0.012 0.008 0.460 0.476
#> SRR1700146 4 0.271 0.700724 0.012 0.012 0.040 0.904 0.032
#> SRR1700147 4 0.475 0.692622 0.052 0.044 0.040 0.804 0.060
#> SRR1700149 4 0.514 0.366210 0.020 0.012 0.004 0.600 0.364
#> SRR1700148 4 0.448 0.682529 0.028 0.000 0.116 0.788 0.068
#> SRR1700150 4 0.287 0.696404 0.020 0.004 0.016 0.888 0.072
#> SRR1700152 4 0.435 0.659325 0.036 0.004 0.012 0.772 0.176
#> SRR1700151 4 0.278 0.698065 0.016 0.004 0.056 0.896 0.028
#> SRR1700153 4 0.515 0.615234 0.036 0.004 0.032 0.708 0.220
#> SRR1700154 4 0.209 0.693468 0.020 0.008 0.004 0.928 0.040
#> SRR1700155 4 0.258 0.696154 0.072 0.000 0.008 0.896 0.024
#> SRR1700156 4 0.274 0.695386 0.004 0.004 0.064 0.892 0.036
#> SRR1700158 4 0.299 0.697493 0.056 0.016 0.008 0.888 0.032
#> SRR1700159 4 0.307 0.698492 0.020 0.012 0.020 0.884 0.064
#> SRR1700157 5 0.664 0.478755 0.072 0.008 0.128 0.156 0.636
#> SRR1700160 4 0.237 0.694445 0.016 0.008 0.028 0.920 0.028
#> SRR1700161 4 0.130 0.690481 0.020 0.000 0.008 0.960 0.012
#> SRR1700162 4 0.206 0.696349 0.024 0.000 0.012 0.928 0.036
#> SRR1700164 4 0.326 0.690624 0.040 0.000 0.008 0.856 0.096
#> SRR1700163 4 0.246 0.698560 0.000 0.004 0.024 0.900 0.072
#> SRR1700165 4 0.196 0.690076 0.004 0.028 0.020 0.936 0.012
#> SRR1700166 4 0.326 0.689015 0.100 0.012 0.004 0.860 0.024
#> SRR1700168 4 0.302 0.698572 0.036 0.000 0.036 0.884 0.044
#> SRR1700167 4 0.522 0.177697 0.004 0.000 0.036 0.536 0.424
#> SRR1700170 4 0.347 0.692766 0.020 0.000 0.032 0.848 0.100
#> SRR1700169 4 0.516 0.648511 0.008 0.004 0.160 0.720 0.108
#> SRR1700171 4 0.386 0.694748 0.064 0.004 0.028 0.840 0.064
#> SRR1700172 4 0.537 0.662574 0.020 0.040 0.080 0.752 0.108
#> SRR1700174 4 0.255 0.693933 0.036 0.020 0.008 0.912 0.024
#> SRR1700173 4 0.168 0.692355 0.004 0.016 0.012 0.948 0.020
#> SRR1700175 4 0.277 0.697132 0.012 0.000 0.048 0.892 0.048
#> SRR1700176 4 0.421 0.686740 0.028 0.020 0.036 0.824 0.092
#> SRR1700178 2 0.352 0.577087 0.164 0.812 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700177 4 0.370 0.687651 0.016 0.004 0.028 0.832 0.120
#> SRR1700180 2 0.377 0.569220 0.196 0.784 0.004 0.012 0.004
#> SRR1700179 2 0.328 0.611543 0.116 0.852 0.004 0.016 0.012
#> SRR1700181 2 0.574 0.336750 0.344 0.556 0.000 0.100 0.000
#> SRR1700183 1 0.404 0.631078 0.800 0.148 0.028 0.000 0.024
#> SRR1700182 2 0.354 0.587126 0.176 0.804 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700184 2 0.332 0.608732 0.124 0.844 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700186 2 0.503 0.586884 0.168 0.748 0.012 0.040 0.032
#> SRR1700187 1 0.304 0.643328 0.864 0.104 0.000 0.008 0.024
#> SRR1700185 1 0.439 0.573116 0.796 0.044 0.044 0.000 0.116
#> SRR1700188 2 0.362 0.572685 0.196 0.788 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700192 1 0.364 0.598588 0.776 0.212 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700190 2 0.389 0.618854 0.116 0.828 0.012 0.016 0.028
#> SRR1700191 1 0.496 0.577028 0.748 0.092 0.024 0.000 0.136
#> SRR1700189 1 0.324 0.644362 0.856 0.100 0.000 0.008 0.036
#> SRR1700193 2 0.480 0.101308 0.452 0.532 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700195 2 0.455 0.047577 0.468 0.524 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700194 1 0.263 0.645773 0.892 0.072 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700196 2 0.497 0.299046 0.388 0.584 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700197 1 0.479 0.509670 0.672 0.296 0.008 0.016 0.008
#> SRR1700198 2 0.465 0.425226 0.312 0.664 0.004 0.012 0.008
#> SRR1700199 1 0.512 0.162263 0.504 0.464 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700200 1 0.455 0.508927 0.684 0.292 0.008 0.004 0.012
#> SRR1700201 2 0.324 0.575715 0.180 0.812 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700202 1 0.230 0.641188 0.892 0.100 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700203 1 0.598 0.493512 0.580 0.308 0.000 0.012 0.100
#> SRR1700204 1 0.653 0.311202 0.520 0.364 0.048 0.004 0.064
#> SRR1700206 1 0.596 0.161436 0.516 0.404 0.000 0.056 0.024
#> SRR1700207 2 0.453 0.466808 0.296 0.680 0.012 0.000 0.012
#> SRR1700208 1 0.486 0.318293 0.580 0.400 0.004 0.008 0.008
#> SRR1700205 1 0.684 0.292992 0.560 0.064 0.040 0.032 0.304
#> SRR1700209 2 0.675 0.370437 0.300 0.556 0.024 0.100 0.020
#> SRR1700210 1 0.424 0.616294 0.752 0.208 0.004 0.000 0.036
#> SRR1700211 1 0.354 0.620799 0.812 0.164 0.000 0.008 0.016
#> SRR1700212 1 0.755 0.360136 0.444 0.256 0.000 0.056 0.244
#> SRR1700213 1 0.742 0.281654 0.456 0.364 0.108 0.016 0.056
#> SRR1700214 1 0.632 0.248394 0.496 0.396 0.004 0.088 0.016
#> SRR1700215 1 0.392 0.632686 0.824 0.080 0.008 0.004 0.084
#> SRR1700217 1 0.588 0.446006 0.588 0.340 0.020 0.024 0.028
#> SRR1700216 1 0.557 0.476550 0.696 0.056 0.060 0.000 0.188
#> SRR1700218 2 0.441 0.527738 0.232 0.736 0.008 0.012 0.012
#> SRR1700219 1 0.546 0.411754 0.600 0.348 0.016 0.008 0.028
#> SRR1700222 1 0.235 0.643211 0.896 0.092 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700220 4 0.756 -0.172935 0.228 0.364 0.020 0.372 0.016
#> SRR1700221 2 0.520 0.318354 0.356 0.600 0.000 0.032 0.012
#> SRR1700223 2 0.556 0.338068 0.352 0.592 0.008 0.028 0.020
#> SRR1700224 1 0.563 0.630398 0.728 0.112 0.024 0.028 0.108
#> SRR1700226 1 0.584 0.594801 0.664 0.232 0.040 0.008 0.056
#> SRR1700229 1 0.750 0.179118 0.452 0.112 0.088 0.004 0.344
#> SRR1700225 2 0.822 0.211621 0.188 0.416 0.252 0.004 0.140
#> SRR1700227 2 0.497 0.536607 0.228 0.712 0.004 0.024 0.032
#> SRR1700230 1 0.321 0.613654 0.812 0.180 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700231 2 0.473 0.508593 0.244 0.708 0.000 0.012 0.036
#> SRR1700228 1 0.668 0.517517 0.592 0.188 0.028 0.008 0.184
#> SRR1700232 2 0.480 0.590721 0.160 0.764 0.020 0.016 0.040
#> SRR1700233 2 0.616 0.076426 0.408 0.504 0.004 0.060 0.024
#> SRR1700234 1 0.452 0.562033 0.724 0.236 0.000 0.028 0.012
#> SRR1700235 2 0.504 0.620212 0.144 0.760 0.020 0.048 0.028
#> SRR1700237 2 0.457 0.424420 0.332 0.648 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700236 2 0.705 0.401238 0.188 0.548 0.008 0.036 0.220
#> SRR1700238 2 0.532 0.038027 0.444 0.520 0.008 0.008 0.020
#> SRR1700239 1 0.292 0.647278 0.884 0.076 0.004 0.012 0.024
#> SRR1700240 1 0.459 0.458444 0.752 0.008 0.028 0.016 0.196
#> SRR1700241 1 0.672 0.145016 0.444 0.108 0.008 0.420 0.020
#> SRR1700243 2 0.523 -0.001488 0.464 0.500 0.008 0.000 0.028
#> SRR1700244 2 0.590 0.232251 0.376 0.556 0.028 0.016 0.024
#> SRR1700242 1 0.329 0.627643 0.828 0.156 0.004 0.008 0.004
#> SRR1700246 1 0.374 0.614458 0.828 0.056 0.004 0.004 0.108
#> SRR1700245 2 0.326 0.624438 0.100 0.860 0.012 0.004 0.024
#> SRR1700247 1 0.584 0.310268 0.624 0.020 0.040 0.020 0.296
#> SRR1700249 1 0.266 0.647544 0.900 0.060 0.004 0.012 0.024
#> SRR1700250 2 0.360 0.631257 0.060 0.856 0.008 0.020 0.056
#> SRR1700248 2 0.405 0.593173 0.152 0.800 0.008 0.032 0.008
#> SRR1700251 1 0.504 0.581519 0.716 0.220 0.028 0.008 0.028
#> SRR1700252 1 0.683 0.309873 0.504 0.356 0.080 0.004 0.056
#> SRR1700253 2 0.630 0.370255 0.292 0.600 0.016 0.056 0.036
#> SRR1700256 1 0.673 0.466681 0.552 0.276 0.044 0.000 0.128
#> SRR1700254 1 0.329 0.634553 0.864 0.052 0.000 0.016 0.068
#> SRR1700255 1 0.622 0.303764 0.528 0.372 0.004 0.076 0.020
#> SRR1700257 2 0.492 0.149899 0.432 0.548 0.004 0.008 0.008
#> SRR1700258 2 0.605 0.384579 0.308 0.600 0.008 0.044 0.040
#> SRR1700259 2 0.523 0.637936 0.032 0.768 0.096 0.040 0.064
#> SRR1700260 2 0.929 -0.103840 0.064 0.328 0.176 0.272 0.160
#> SRR1700261 3 0.805 0.103236 0.028 0.060 0.420 0.328 0.164
#> SRR1700262 4 0.845 0.236618 0.224 0.012 0.204 0.412 0.148
#> SRR1700263 5 0.709 0.485966 0.080 0.144 0.136 0.024 0.616
#> SRR1700264 2 0.467 0.558595 0.020 0.704 0.256 0.000 0.020
#> SRR1700265 2 0.830 0.129108 0.160 0.356 0.296 0.000 0.188
#> SRR1700266 2 0.558 0.598072 0.076 0.740 0.056 0.020 0.108
#> SRR1700268 2 0.608 0.072386 0.400 0.524 0.040 0.016 0.020
#> SRR1700270 2 0.476 0.524073 0.256 0.704 0.008 0.012 0.020
#> SRR1700267 2 0.607 0.587811 0.080 0.684 0.144 0.004 0.088
#> SRR1700271 2 0.466 0.636863 0.052 0.800 0.092 0.036 0.020
#> SRR1700272 2 0.775 0.295036 0.044 0.492 0.052 0.300 0.112
#> SRR1700273 2 0.377 0.609173 0.124 0.824 0.020 0.000 0.032
#> SRR1700274 5 0.994 0.113343 0.184 0.172 0.232 0.176 0.236
#> SRR1700277 2 0.529 0.587907 0.148 0.744 0.016 0.052 0.040
#> SRR1700275 4 0.848 0.399108 0.188 0.120 0.092 0.500 0.100
#> SRR1700276 4 0.723 0.286380 0.296 0.104 0.012 0.524 0.064
#> SRR1700278 1 0.766 0.537141 0.560 0.164 0.040 0.168 0.068
#> SRR1700279 1 0.762 -0.058704 0.420 0.036 0.100 0.048 0.396
#> SRR1700280 1 0.674 0.573330 0.616 0.152 0.016 0.040 0.176
#> SRR1700281 2 0.686 0.539391 0.076 0.640 0.108 0.028 0.148
#> SRR1700283 5 0.759 0.266386 0.040 0.012 0.272 0.212 0.464
#> SRR1700282 1 0.723 0.551906 0.580 0.192 0.016 0.140 0.072
#> SRR1700284 4 0.797 0.365535 0.044 0.044 0.252 0.480 0.180
#> SRR1700285 1 0.917 0.250234 0.364 0.152 0.100 0.280 0.104
#> SRR1700286 2 0.818 0.363175 0.156 0.532 0.128 0.060 0.124
#> SRR1700287 4 0.749 0.498821 0.092 0.036 0.172 0.584 0.116
#> SRR1700290 4 0.889 0.025363 0.260 0.024 0.276 0.300 0.140
#> SRR1700289 5 0.724 0.350664 0.052 0.024 0.228 0.128 0.568
#> SRR1700288 1 0.690 0.501801 0.580 0.264 0.032 0.088 0.036
#> SRR1700292 5 0.795 0.321823 0.300 0.068 0.080 0.068 0.484
#> SRR1700291 4 0.815 0.277115 0.036 0.096 0.292 0.460 0.116
#> SRR1700293 4 0.754 -0.199875 0.384 0.172 0.032 0.396 0.016
#> SRR1700294 1 0.824 0.026425 0.428 0.016 0.128 0.288 0.140
#> SRR1700295 4 0.749 0.414262 0.104 0.000 0.248 0.504 0.144
#> SRR1700297 4 0.863 0.304540 0.212 0.040 0.124 0.440 0.184
#> SRR1700296 4 0.854 0.209826 0.192 0.008 0.204 0.388 0.208
#> SRR1700298 4 0.693 0.564207 0.080 0.012 0.156 0.616 0.136
#> SRR1700299 5 0.767 0.404801 0.212 0.024 0.056 0.188 0.520
#> SRR1700300 5 0.846 0.228156 0.216 0.004 0.208 0.188 0.384
#> SRR1700302 4 0.734 0.477315 0.044 0.024 0.200 0.556 0.176
#> SRR1700301 4 0.722 0.543677 0.108 0.024 0.136 0.608 0.124
#> SRR1700303 4 0.867 0.161267 0.128 0.028 0.304 0.368 0.172
#> SRR1700304 1 0.425 0.627144 0.820 0.056 0.008 0.080 0.036
#> SRR1700305 1 0.826 0.236820 0.468 0.052 0.092 0.276 0.112
#> SRR1700306 3 0.856 0.044004 0.116 0.016 0.356 0.288 0.224
#> SRR1700308 3 0.820 -0.178375 0.220 0.052 0.372 0.028 0.328
#> SRR1700307 4 0.802 0.214497 0.060 0.072 0.312 0.468 0.088
#> SRR1700309 5 0.584 0.530845 0.148 0.036 0.060 0.040 0.716
#> SRR1700310 4 0.699 0.507726 0.100 0.000 0.196 0.580 0.124
#> SRR1700311 4 0.853 0.132750 0.328 0.020 0.160 0.360 0.132
#> SRR1700312 4 0.773 0.285637 0.036 0.028 0.308 0.456 0.172
#> SRR1700313 4 0.904 -0.001323 0.204 0.028 0.288 0.296 0.184
#> SRR1700314 4 0.769 0.116313 0.016 0.032 0.352 0.392 0.208
#> SRR1700315 3 0.597 0.312599 0.132 0.000 0.652 0.028 0.188
#> SRR1700316 2 0.924 -0.099057 0.060 0.320 0.224 0.264 0.132
#> SRR1700317 3 0.622 0.445010 0.040 0.072 0.704 0.076 0.108
#> SRR1700318 1 0.771 0.333262 0.560 0.048 0.144 0.068 0.180
#> SRR1700319 4 0.743 0.473301 0.044 0.028 0.212 0.548 0.168
#> SRR1700320 3 0.867 -0.004233 0.208 0.012 0.328 0.296 0.156
#> SRR1700322 4 0.796 0.187868 0.348 0.032 0.044 0.408 0.168
#> SRR1700321 4 0.744 0.485078 0.084 0.016 0.196 0.560 0.144
#> SRR1700323 3 0.730 0.188556 0.024 0.036 0.500 0.320 0.120
#> SRR1700324 4 0.825 0.345544 0.260 0.028 0.156 0.456 0.100
#> SRR1700325 4 0.809 0.049079 0.076 0.364 0.052 0.416 0.092
#> SRR1700326 1 0.734 0.328403 0.568 0.020 0.108 0.084 0.220
#> SRR1700327 4 0.965 -0.000777 0.136 0.276 0.176 0.284 0.128
#> SRR1700329 4 0.816 0.069811 0.044 0.024 0.296 0.348 0.288
#> SRR1700328 5 0.574 0.480545 0.220 0.044 0.044 0.012 0.680
#> SRR1700330 1 0.774 0.487713 0.580 0.084 0.080 0.156 0.100
#> SRR1700331 5 0.845 0.146006 0.300 0.040 0.300 0.048 0.312
#> SRR1700332 4 0.783 0.509056 0.104 0.052 0.160 0.564 0.120
#> SRR1700333 1 0.737 0.476081 0.608 0.096 0.120 0.044 0.132
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.461 0.65766 0.040 0.788 0.076 0.008 0.048 0.040
#> SRR1699875 2 0.693 0.27944 0.040 0.516 0.068 0.000 0.104 0.272
#> SRR1699876 5 0.580 0.49338 0.012 0.060 0.072 0.016 0.676 0.164
#> SRR1699877 6 0.693 0.43635 0.028 0.268 0.112 0.012 0.052 0.528
#> SRR1699879 2 0.725 0.47249 0.104 0.536 0.016 0.072 0.228 0.044
#> SRR1699878 6 0.762 0.39170 0.056 0.268 0.068 0.000 0.176 0.432
#> SRR1699880 2 0.374 0.65646 0.036 0.844 0.056 0.016 0.024 0.024
#> SRR1699881 2 0.651 0.51786 0.040 0.600 0.100 0.012 0.212 0.036
#> SRR1699882 2 0.719 0.24503 0.092 0.432 0.036 0.000 0.348 0.092
#> SRR1699883 6 0.807 0.22435 0.076 0.272 0.072 0.000 0.232 0.348
#> SRR1699884 2 0.645 0.58456 0.152 0.604 0.132 0.000 0.092 0.020
#> SRR1699885 2 0.411 0.64877 0.080 0.804 0.044 0.000 0.012 0.060
#> SRR1699886 6 0.715 0.39604 0.044 0.108 0.072 0.000 0.300 0.476
#> SRR1699888 4 0.502 0.62980 0.004 0.188 0.052 0.712 0.024 0.020
#> SRR1699889 5 0.491 0.55455 0.020 0.016 0.064 0.040 0.764 0.096
#> SRR1699890 5 0.750 -0.08987 0.120 0.068 0.044 0.008 0.424 0.336
#> SRR1699887 2 0.749 -0.09642 0.028 0.380 0.172 0.016 0.360 0.044
#> SRR1699891 5 0.548 0.44975 0.036 0.012 0.088 0.012 0.696 0.156
#> SRR1699892 5 0.700 0.24569 0.004 0.308 0.164 0.012 0.456 0.056
#> SRR1699893 5 0.545 0.52650 0.000 0.004 0.056 0.256 0.632 0.052
#> SRR1699894 5 0.644 0.49408 0.048 0.016 0.136 0.036 0.636 0.128
#> SRR1699895 5 0.534 0.58663 0.004 0.012 0.116 0.104 0.712 0.052
#> SRR1699896 2 0.827 -0.11544 0.124 0.296 0.036 0.008 0.248 0.288
#> SRR1699897 5 0.711 0.40291 0.164 0.180 0.088 0.000 0.532 0.036
#> SRR1699898 4 0.630 0.09933 0.000 0.036 0.028 0.480 0.072 0.384
#> SRR1699900 6 0.604 0.59943 0.040 0.024 0.128 0.036 0.092 0.680
#> SRR1699899 6 0.577 0.28302 0.016 0.008 0.088 0.000 0.392 0.496
#> SRR1699902 6 0.609 0.45180 0.000 0.016 0.260 0.000 0.216 0.508
#> SRR1699901 6 0.536 0.58896 0.012 0.028 0.120 0.020 0.104 0.716
#> SRR1699903 5 0.514 0.11220 0.000 0.016 0.056 0.000 0.560 0.368
#> SRR1699904 5 0.686 0.47811 0.072 0.008 0.048 0.284 0.532 0.056
#> SRR1699905 6 0.454 0.54933 0.012 0.004 0.032 0.044 0.148 0.760
#> SRR1699906 5 0.598 0.42814 0.000 0.040 0.060 0.044 0.620 0.236
#> SRR1699907 5 0.441 0.55095 0.056 0.004 0.012 0.048 0.788 0.092
#> SRR1699908 5 0.680 0.52922 0.004 0.036 0.060 0.228 0.560 0.112
#> SRR1699909 5 0.702 0.43442 0.016 0.000 0.212 0.236 0.476 0.060
#> SRR1699910 5 0.474 0.53858 0.008 0.004 0.116 0.032 0.752 0.088
#> SRR1699911 5 0.789 0.07713 0.172 0.024 0.160 0.004 0.404 0.236
#> SRR1699912 5 0.581 0.29335 0.008 0.004 0.140 0.004 0.560 0.284
#> SRR1699913 6 0.729 0.05470 0.000 0.032 0.032 0.316 0.272 0.348
#> SRR1699914 5 0.741 0.25587 0.072 0.032 0.320 0.008 0.440 0.128
#> SRR1699915 5 0.588 0.54445 0.016 0.004 0.144 0.060 0.664 0.112
#> SRR1699916 3 0.699 0.04530 0.024 0.000 0.384 0.384 0.168 0.040
#> SRR1699917 4 0.799 0.31820 0.004 0.052 0.216 0.432 0.168 0.128
#> SRR1699918 4 0.783 -0.15723 0.012 0.000 0.244 0.312 0.280 0.152
#> SRR1699919 5 0.513 0.57392 0.020 0.004 0.112 0.080 0.736 0.048
#> SRR1699920 5 0.564 0.58176 0.016 0.008 0.092 0.148 0.688 0.048
#> SRR1699921 5 0.518 0.54272 0.020 0.000 0.208 0.040 0.688 0.044
#> SRR1699922 5 0.634 0.45737 0.136 0.016 0.052 0.016 0.628 0.152
#> SRR1699923 6 0.595 0.51309 0.060 0.000 0.084 0.012 0.228 0.616
#> SRR1699924 3 0.698 0.48097 0.000 0.052 0.544 0.216 0.124 0.064
#> SRR1699925 1 0.766 0.08026 0.432 0.028 0.076 0.040 0.332 0.092
#> SRR1699926 5 0.496 0.55331 0.008 0.028 0.016 0.088 0.744 0.116
#> SRR1699927 5 0.510 0.55339 0.004 0.004 0.172 0.060 0.708 0.052
#> SRR1699929 5 0.651 0.41797 0.044 0.068 0.152 0.000 0.612 0.124
#> SRR1699928 6 0.627 0.34569 0.016 0.020 0.108 0.008 0.316 0.532
#> SRR1699930 5 0.524 0.56960 0.044 0.024 0.040 0.056 0.752 0.084
#> SRR1699931 5 0.631 0.52070 0.076 0.084 0.112 0.008 0.660 0.060
#> SRR1699933 5 0.793 -0.04542 0.048 0.088 0.276 0.000 0.356 0.232
#> SRR1699932 5 0.607 0.54843 0.192 0.040 0.028 0.044 0.656 0.040
#> SRR1699934 1 0.714 0.31180 0.520 0.032 0.036 0.020 0.236 0.156
#> SRR1699935 4 0.790 0.23291 0.012 0.052 0.120 0.456 0.240 0.120
#> SRR1699936 2 0.568 0.50188 0.000 0.656 0.040 0.208 0.064 0.032
#> SRR1699937 2 0.314 0.64268 0.008 0.864 0.072 0.016 0.004 0.036
#> SRR1699938 2 0.168 0.64621 0.020 0.944 0.008 0.008 0.012 0.008
#> SRR1699940 2 0.597 0.54586 0.028 0.644 0.012 0.032 0.076 0.208
#> SRR1699939 2 0.386 0.65508 0.044 0.836 0.048 0.008 0.032 0.032
#> SRR1699941 2 0.570 0.61498 0.084 0.676 0.060 0.000 0.156 0.024
#> SRR1699942 6 0.624 0.56704 0.012 0.152 0.056 0.112 0.024 0.644
#> SRR1699943 2 0.263 0.64764 0.040 0.896 0.016 0.000 0.020 0.028
#> SRR1699944 2 0.349 0.65321 0.012 0.856 0.044 0.012 0.040 0.036
#> SRR1699945 2 0.754 0.44229 0.124 0.480 0.084 0.012 0.260 0.040
#> SRR1699946 2 0.394 0.65566 0.040 0.828 0.032 0.004 0.060 0.036
#> SRR1699947 2 0.455 0.64900 0.048 0.776 0.104 0.000 0.044 0.028
#> SRR1699948 2 0.437 0.62509 0.016 0.788 0.112 0.028 0.008 0.048
#> SRR1699949 2 0.604 0.57694 0.052 0.644 0.012 0.040 0.208 0.044
#> SRR1699950 2 0.479 0.62149 0.008 0.732 0.024 0.024 0.184 0.028
#> SRR1699951 2 0.722 0.39775 0.028 0.520 0.276 0.048 0.068 0.060
#> SRR1699952 2 0.542 0.54030 0.052 0.636 0.264 0.000 0.028 0.020
#> SRR1699953 2 0.366 0.65249 0.000 0.836 0.052 0.012 0.052 0.048
#> SRR1699954 2 0.602 0.53232 0.228 0.620 0.088 0.004 0.024 0.036
#> SRR1699955 2 0.430 0.65148 0.008 0.792 0.116 0.028 0.020 0.036
#> SRR1699956 2 0.592 0.54968 0.064 0.620 0.032 0.012 0.252 0.020
#> SRR1699957 2 0.559 0.61395 0.028 0.668 0.084 0.000 0.188 0.032
#> SRR1699959 3 0.643 0.13879 0.004 0.424 0.428 0.060 0.008 0.076
#> SRR1699958 4 0.585 0.31870 0.008 0.068 0.008 0.544 0.024 0.348
#> SRR1699960 4 0.688 -0.01804 0.000 0.388 0.140 0.404 0.020 0.048
#> SRR1699961 2 0.566 0.47751 0.008 0.628 0.260 0.020 0.020 0.064
#> SRR1699962 2 0.608 0.62088 0.160 0.636 0.120 0.000 0.064 0.020
#> SRR1699963 6 0.612 0.41536 0.004 0.076 0.292 0.024 0.032 0.572
#> SRR1699964 2 0.834 0.28428 0.056 0.428 0.128 0.024 0.156 0.208
#> SRR1699965 2 0.520 0.63696 0.076 0.728 0.044 0.008 0.128 0.016
#> SRR1699966 2 0.671 0.50974 0.000 0.592 0.072 0.056 0.104 0.176
#> SRR1699967 2 0.631 0.60845 0.088 0.640 0.172 0.012 0.048 0.040
#> SRR1699968 5 0.749 0.13337 0.036 0.144 0.360 0.024 0.400 0.036
#> SRR1699969 5 0.731 0.42412 0.000 0.248 0.120 0.052 0.496 0.084
#> SRR1699971 2 0.421 0.63698 0.044 0.784 0.040 0.000 0.008 0.124
#> SRR1699970 3 0.686 -0.05087 0.048 0.128 0.412 0.004 0.016 0.392
#> SRR1699972 6 0.638 0.50706 0.044 0.196 0.152 0.004 0.016 0.588
#> SRR1699973 2 0.711 0.04000 0.000 0.440 0.076 0.172 0.012 0.300
#> SRR1699974 3 0.706 0.30445 0.268 0.156 0.500 0.020 0.020 0.036
#> SRR1699975 6 0.603 0.26338 0.000 0.048 0.056 0.012 0.412 0.472
#> SRR1699976 2 0.535 0.62100 0.052 0.688 0.184 0.004 0.064 0.008
#> SRR1699977 6 0.605 0.56225 0.020 0.068 0.192 0.044 0.024 0.652
#> SRR1699978 4 0.810 0.32973 0.200 0.016 0.092 0.468 0.096 0.128
#> SRR1699979 2 0.674 0.30914 0.008 0.512 0.128 0.292 0.016 0.044
#> SRR1699980 6 0.629 0.15712 0.000 0.000 0.236 0.012 0.352 0.400
#> SRR1699981 6 0.642 0.55875 0.004 0.024 0.092 0.120 0.136 0.624
#> SRR1699982 5 0.682 0.23543 0.064 0.000 0.216 0.004 0.480 0.236
#> SRR1699983 5 0.541 0.52877 0.044 0.032 0.084 0.008 0.724 0.108
#> SRR1699984 3 0.784 -0.07849 0.264 0.008 0.300 0.000 0.252 0.176
#> SRR1699985 3 0.552 0.47926 0.000 0.032 0.620 0.000 0.240 0.108
#> SRR1699986 5 0.737 -0.03917 0.160 0.012 0.080 0.008 0.392 0.348
#> SRR1699988 6 0.646 0.59581 0.072 0.072 0.100 0.020 0.076 0.660
#> SRR1699987 5 0.812 0.26358 0.004 0.128 0.224 0.292 0.320 0.032
#> SRR1699989 5 0.705 0.55583 0.020 0.096 0.088 0.088 0.608 0.100
#> SRR1699990 5 0.569 0.43773 0.008 0.040 0.332 0.020 0.576 0.024
#> SRR1699992 2 0.370 0.65434 0.080 0.832 0.044 0.008 0.032 0.004
#> SRR1699991 3 0.508 0.65098 0.000 0.072 0.748 0.064 0.048 0.068
#> SRR1699993 5 0.775 0.50213 0.192 0.024 0.160 0.076 0.500 0.048
#> SRR1699994 3 0.706 0.22973 0.048 0.144 0.460 0.000 0.312 0.036
#> SRR1699995 3 0.707 0.46245 0.016 0.068 0.548 0.244 0.056 0.068
#> SRR1699996 1 0.784 0.45595 0.500 0.184 0.036 0.032 0.116 0.132
#> SRR1699997 4 0.401 0.73884 0.004 0.036 0.024 0.820 0.040 0.076
#> SRR1699998 6 0.582 0.58127 0.108 0.084 0.044 0.012 0.052 0.700
#> SRR1699999 1 0.766 0.47496 0.544 0.128 0.160 0.056 0.056 0.056
#> SRR1700000 6 0.489 0.57045 0.088 0.036 0.020 0.048 0.036 0.772
#> SRR1700002 2 0.463 0.61793 0.032 0.752 0.160 0.024 0.004 0.028
#> SRR1700001 5 0.735 0.33901 0.052 0.172 0.048 0.016 0.528 0.184
#> SRR1700003 6 0.601 0.53378 0.008 0.024 0.088 0.232 0.028 0.620
#> SRR1700004 5 0.652 0.32879 0.016 0.212 0.276 0.000 0.480 0.016
#> SRR1700005 1 0.758 0.14636 0.432 0.020 0.072 0.012 0.204 0.260
#> SRR1700006 2 0.657 0.50127 0.012 0.600 0.216 0.040 0.072 0.060
#> SRR1700007 5 0.626 0.53625 0.000 0.012 0.104 0.156 0.616 0.112
#> SRR1700008 4 0.613 0.65273 0.052 0.052 0.120 0.684 0.028 0.064
#> SRR1700009 1 0.670 0.38814 0.580 0.012 0.020 0.116 0.208 0.064
#> SRR1700010 2 0.682 0.49645 0.056 0.560 0.084 0.008 0.244 0.048
#> SRR1700011 6 0.731 0.52953 0.008 0.164 0.168 0.048 0.076 0.536
#> SRR1700013 4 0.721 0.13874 0.052 0.380 0.076 0.428 0.016 0.048
#> SRR1700012 6 0.559 0.50448 0.012 0.016 0.268 0.012 0.068 0.624
#> SRR1700014 3 0.446 0.65888 0.004 0.052 0.796 0.040 0.064 0.044
#> SRR1700015 3 0.607 0.41679 0.008 0.312 0.560 0.008 0.048 0.064
#> SRR1700016 6 0.752 0.20088 0.104 0.000 0.256 0.012 0.240 0.388
#> SRR1700018 2 0.634 0.00132 0.004 0.448 0.416 0.052 0.012 0.068
#> SRR1700017 3 0.590 0.50403 0.004 0.240 0.624 0.024 0.036 0.072
#> SRR1700019 5 0.625 0.48223 0.084 0.008 0.264 0.020 0.584 0.040
#> SRR1700020 4 0.618 0.59654 0.000 0.080 0.168 0.636 0.032 0.084
#> SRR1700021 3 0.799 0.24190 0.124 0.020 0.464 0.044 0.136 0.212
#> SRR1700023 5 0.676 -0.04693 0.008 0.256 0.340 0.000 0.372 0.024
#> SRR1700022 3 0.643 0.45439 0.004 0.316 0.532 0.068 0.020 0.060
#> SRR1700024 3 0.566 0.60995 0.036 0.008 0.704 0.124 0.052 0.076
#> SRR1700025 3 0.517 0.52426 0.040 0.236 0.672 0.000 0.024 0.028
#> SRR1700026 3 0.413 0.64961 0.008 0.084 0.808 0.016 0.064 0.020
#> SRR1700027 3 0.390 0.62415 0.008 0.136 0.800 0.004 0.020 0.032
#> SRR1700028 4 0.671 0.12063 0.012 0.008 0.380 0.448 0.052 0.100
#> SRR1700029 3 0.606 0.51704 0.008 0.032 0.624 0.232 0.064 0.040
#> SRR1700030 3 0.437 0.60725 0.000 0.000 0.740 0.008 0.124 0.128
#> SRR1700031 3 0.547 0.61413 0.008 0.120 0.716 0.068 0.024 0.064
#> SRR1700032 3 0.621 0.38019 0.028 0.332 0.540 0.004 0.044 0.052
#> SRR1700034 3 0.544 0.61942 0.004 0.104 0.716 0.040 0.036 0.100
#> SRR1700035 3 0.528 0.57378 0.004 0.012 0.692 0.084 0.180 0.028
#> SRR1700033 3 0.446 0.61404 0.000 0.168 0.748 0.024 0.008 0.052
#> SRR1700036 3 0.445 0.63589 0.000 0.032 0.744 0.008 0.180 0.036
#> SRR1700037 5 0.661 0.53499 0.016 0.008 0.180 0.216 0.548 0.032
#> SRR1700038 3 0.883 0.13314 0.084 0.048 0.368 0.084 0.208 0.208
#> SRR1700039 3 0.460 0.64721 0.024 0.004 0.780 0.040 0.084 0.068
#> SRR1700040 3 0.580 0.58982 0.008 0.012 0.652 0.140 0.160 0.028
#> SRR1700041 3 0.473 0.60806 0.000 0.024 0.740 0.164 0.032 0.040
#> SRR1700042 3 0.441 0.64730 0.000 0.040 0.772 0.016 0.132 0.040
#> SRR1700043 5 0.788 0.08573 0.024 0.112 0.320 0.016 0.384 0.144
#> SRR1700045 3 0.804 -0.04593 0.064 0.024 0.392 0.148 0.316 0.056
#> SRR1700044 3 0.387 0.64001 0.024 0.028 0.824 0.000 0.056 0.068
#> SRR1700046 3 0.369 0.65218 0.004 0.044 0.844 0.036 0.040 0.032
#> SRR1700047 3 0.695 0.43235 0.040 0.064 0.564 0.036 0.244 0.052
#> SRR1700048 3 0.600 0.50343 0.012 0.004 0.624 0.036 0.184 0.140
#> SRR1700049 3 0.545 0.57590 0.008 0.040 0.668 0.012 0.220 0.052
#> SRR1700050 3 0.694 0.29426 0.008 0.020 0.456 0.356 0.064 0.096
#> SRR1700051 3 0.482 0.63177 0.000 0.016 0.736 0.028 0.072 0.148
#> SRR1700052 3 0.422 0.64817 0.004 0.012 0.784 0.016 0.128 0.056
#> SRR1700053 3 0.445 0.62775 0.000 0.000 0.748 0.068 0.152 0.032
#> SRR1700054 3 0.361 0.65619 0.008 0.008 0.844 0.056 0.048 0.036
#> SRR1700055 3 0.531 0.62430 0.012 0.136 0.724 0.028 0.032 0.068
#> SRR1700056 4 0.550 0.41566 0.000 0.072 0.328 0.572 0.004 0.024
#> SRR1700057 3 0.597 0.09323 0.000 0.020 0.480 0.412 0.052 0.036
#> SRR1700058 3 0.451 0.66095 0.004 0.028 0.772 0.024 0.132 0.040
#> SRR1700059 4 0.593 0.27188 0.000 0.020 0.376 0.516 0.048 0.040
#> SRR1700060 3 0.355 0.65702 0.004 0.008 0.840 0.032 0.084 0.032
#> SRR1700061 3 0.430 0.65662 0.032 0.012 0.808 0.072 0.048 0.028
#> SRR1700062 4 0.568 0.53743 0.004 0.020 0.268 0.620 0.060 0.028
#> SRR1700063 3 0.504 0.60732 0.000 0.060 0.728 0.132 0.012 0.068
#> SRR1700064 3 0.505 0.52651 0.028 0.008 0.656 0.000 0.264 0.044
#> SRR1700065 6 0.661 -0.06006 0.020 0.004 0.400 0.044 0.092 0.440
#> SRR1700066 3 0.430 0.62724 0.008 0.012 0.752 0.000 0.172 0.056
#> SRR1700067 3 0.413 0.62351 0.016 0.004 0.792 0.132 0.024 0.032
#> SRR1700068 3 0.603 0.07766 0.000 0.020 0.476 0.408 0.068 0.028
#> SRR1700069 3 0.494 0.54524 0.008 0.012 0.680 0.016 0.248 0.036
#> SRR1700070 3 0.349 0.65247 0.004 0.076 0.840 0.008 0.060 0.012
#> SRR1700071 3 0.386 0.65857 0.000 0.032 0.816 0.016 0.100 0.036
#> SRR1700072 3 0.586 0.47796 0.080 0.000 0.632 0.000 0.140 0.148
#> SRR1700073 3 0.586 0.55657 0.004 0.004 0.628 0.088 0.216 0.060
#> SRR1700075 3 0.390 0.65231 0.004 0.012 0.816 0.020 0.096 0.052
#> SRR1700074 3 0.524 0.58177 0.012 0.196 0.700 0.020 0.036 0.036
#> SRR1700076 3 0.624 0.57786 0.108 0.124 0.664 0.028 0.044 0.032
#> SRR1700077 3 0.438 0.63558 0.048 0.096 0.792 0.008 0.012 0.044
#> SRR1700078 3 0.431 0.59616 0.012 0.004 0.748 0.012 0.192 0.032
#> SRR1700080 3 0.512 0.43931 0.004 0.040 0.632 0.008 0.296 0.020
#> SRR1700079 3 0.548 0.15314 0.000 0.012 0.540 0.056 0.016 0.376
#> SRR1700081 2 0.733 0.38685 0.036 0.532 0.168 0.180 0.016 0.068
#> SRR1700082 6 0.616 0.26033 0.004 0.064 0.384 0.024 0.028 0.496
#> SRR1700083 3 0.529 0.61136 0.000 0.060 0.712 0.060 0.024 0.144
#> SRR1700084 3 0.369 0.64784 0.012 0.024 0.828 0.000 0.084 0.052
#> SRR1700085 3 0.389 0.64674 0.000 0.012 0.796 0.044 0.136 0.012
#> SRR1700086 3 0.428 0.61884 0.008 0.008 0.752 0.000 0.168 0.064
#> SRR1700087 6 0.530 0.40641 0.000 0.096 0.000 0.300 0.012 0.592
#> SRR1700088 2 0.526 0.62354 0.060 0.736 0.112 0.052 0.008 0.032
#> SRR1700089 2 0.547 0.10660 0.016 0.504 0.008 0.428 0.016 0.028
#> SRR1700091 4 0.412 0.68214 0.024 0.152 0.012 0.784 0.016 0.012
#> SRR1700090 4 0.192 0.73960 0.004 0.024 0.016 0.932 0.004 0.020
#> SRR1700092 4 0.635 0.61468 0.048 0.172 0.072 0.644 0.020 0.044
#> SRR1700094 4 0.494 0.69572 0.024 0.108 0.056 0.760 0.016 0.036
#> SRR1700093 4 0.336 0.74079 0.012 0.052 0.024 0.860 0.008 0.044
#> SRR1700095 4 0.505 0.65361 0.020 0.012 0.020 0.712 0.192 0.044
#> SRR1700096 4 0.425 0.70259 0.004 0.128 0.032 0.788 0.020 0.028
#> SRR1700097 4 0.474 0.71540 0.012 0.060 0.008 0.768 0.056 0.096
#> SRR1700098 4 0.518 0.55489 0.036 0.284 0.004 0.640 0.012 0.024
#> SRR1700099 4 0.227 0.73796 0.016 0.036 0.004 0.916 0.012 0.016
#> SRR1700100 4 0.539 0.21246 0.004 0.024 0.032 0.516 0.008 0.416
#> SRR1700101 4 0.387 0.66396 0.016 0.188 0.012 0.772 0.008 0.004
#> SRR1700102 4 0.717 0.20214 0.036 0.320 0.004 0.444 0.040 0.156
#> SRR1700104 4 0.263 0.73815 0.008 0.060 0.000 0.888 0.008 0.036
#> SRR1700103 4 0.724 0.12817 0.020 0.296 0.016 0.396 0.252 0.020
#> SRR1700105 4 0.363 0.73708 0.052 0.052 0.004 0.844 0.028 0.020
#> SRR1700106 4 0.456 0.70872 0.004 0.052 0.008 0.764 0.132 0.040
#> SRR1700107 4 0.368 0.73398 0.012 0.080 0.008 0.836 0.020 0.044
#> SRR1700108 4 0.400 0.73336 0.044 0.056 0.016 0.824 0.008 0.052
#> SRR1700109 4 0.390 0.73911 0.040 0.032 0.052 0.836 0.016 0.024
#> SRR1700110 4 0.327 0.73531 0.016 0.072 0.020 0.860 0.004 0.028
#> SRR1700112 4 0.263 0.74602 0.008 0.016 0.040 0.900 0.024 0.012
#> SRR1700111 4 0.635 0.57334 0.004 0.016 0.048 0.596 0.144 0.192
#> SRR1700113 4 0.598 0.10723 0.008 0.024 0.056 0.488 0.408 0.016
#> SRR1700114 4 0.392 0.74417 0.004 0.040 0.064 0.828 0.036 0.028
#> SRR1700115 4 0.290 0.74382 0.004 0.044 0.036 0.884 0.012 0.020
#> SRR1700116 4 0.517 0.47715 0.000 0.008 0.020 0.612 0.048 0.312
#> SRR1700117 4 0.291 0.74635 0.008 0.008 0.036 0.884 0.044 0.020
#> SRR1700119 4 0.397 0.71770 0.004 0.016 0.028 0.808 0.116 0.028
#> SRR1700118 4 0.628 0.23819 0.004 0.016 0.044 0.512 0.072 0.352
#> SRR1700120 4 0.480 0.72557 0.036 0.048 0.008 0.776 0.068 0.064
#> SRR1700121 4 0.461 0.73686 0.004 0.028 0.028 0.776 0.096 0.068
#> SRR1700122 4 0.501 0.69247 0.000 0.008 0.128 0.728 0.076 0.060
#> SRR1700123 4 0.550 0.60849 0.024 0.012 0.032 0.680 0.204 0.048
#> SRR1700125 4 0.177 0.74127 0.016 0.008 0.016 0.940 0.004 0.016
#> SRR1700126 4 0.594 0.66280 0.016 0.056 0.112 0.688 0.032 0.096
#> SRR1700127 4 0.351 0.75070 0.012 0.048 0.020 0.856 0.040 0.024
#> SRR1700124 4 0.340 0.73071 0.000 0.016 0.108 0.836 0.012 0.028
#> SRR1700128 4 0.638 0.46280 0.000 0.008 0.072 0.552 0.104 0.264
#> SRR1700129 4 0.321 0.74646 0.028 0.000 0.040 0.864 0.016 0.052
#> SRR1700130 4 0.507 0.41863 0.016 0.000 0.020 0.576 0.020 0.368
#> SRR1700132 4 0.357 0.74064 0.000 0.012 0.028 0.836 0.084 0.040
#> SRR1700131 4 0.449 0.74033 0.012 0.072 0.028 0.796 0.056 0.036
#> SRR1700133 4 0.511 0.62501 0.024 0.004 0.028 0.708 0.188 0.048
#> SRR1700134 4 0.422 0.69852 0.012 0.008 0.024 0.788 0.132 0.036
#> SRR1700135 4 0.576 0.65548 0.024 0.000 0.052 0.672 0.120 0.132
#> SRR1700136 4 0.263 0.74289 0.004 0.012 0.020 0.896 0.052 0.016
#> SRR1700137 4 0.445 0.71509 0.012 0.028 0.024 0.784 0.120 0.032
#> SRR1700138 4 0.454 0.66407 0.012 0.004 0.044 0.756 0.156 0.028
#> SRR1700140 4 0.342 0.74044 0.000 0.020 0.028 0.852 0.056 0.044
#> SRR1700139 4 0.368 0.64116 0.004 0.000 0.008 0.764 0.016 0.208
#> SRR1700141 4 0.296 0.74485 0.000 0.024 0.032 0.880 0.040 0.024
#> SRR1700142 4 0.699 0.26745 0.020 0.028 0.324 0.488 0.040 0.100
#> SRR1700143 4 0.200 0.74308 0.004 0.004 0.016 0.928 0.020 0.028
#> SRR1700144 3 0.777 0.38258 0.008 0.040 0.472 0.120 0.168 0.192
#> SRR1700145 6 0.584 0.17440 0.048 0.004 0.012 0.372 0.036 0.528
#> SRR1700146 4 0.330 0.74707 0.012 0.024 0.036 0.868 0.040 0.020
#> SRR1700147 4 0.490 0.73668 0.036 0.036 0.060 0.776 0.068 0.024
#> SRR1700149 4 0.560 0.34231 0.008 0.012 0.016 0.560 0.052 0.352
#> SRR1700148 4 0.539 0.66807 0.008 0.004 0.108 0.696 0.140 0.044
#> SRR1700150 4 0.361 0.73334 0.012 0.012 0.016 0.840 0.084 0.036
#> SRR1700152 4 0.505 0.69505 0.020 0.008 0.012 0.724 0.100 0.136
#> SRR1700151 4 0.373 0.74051 0.004 0.008 0.060 0.832 0.064 0.032
#> SRR1700153 4 0.596 0.62569 0.044 0.012 0.024 0.652 0.072 0.196
#> SRR1700154 4 0.292 0.74439 0.032 0.008 0.012 0.884 0.016 0.048
#> SRR1700155 4 0.346 0.74378 0.052 0.004 0.032 0.856 0.028 0.028
#> SRR1700156 4 0.357 0.73671 0.000 0.004 0.084 0.832 0.048 0.032
#> SRR1700158 4 0.371 0.73749 0.064 0.024 0.016 0.844 0.024 0.028
#> SRR1700159 4 0.387 0.73321 0.024 0.016 0.016 0.832 0.072 0.040
#> SRR1700157 6 0.596 0.53263 0.032 0.016 0.152 0.148 0.008 0.644
#> SRR1700160 4 0.227 0.74271 0.004 0.016 0.024 0.916 0.032 0.008
#> SRR1700161 4 0.184 0.73732 0.012 0.000 0.012 0.932 0.036 0.008
#> SRR1700162 4 0.260 0.73145 0.012 0.004 0.012 0.892 0.068 0.012
#> SRR1700164 4 0.319 0.74989 0.016 0.008 0.028 0.872 0.032 0.044
#> SRR1700163 4 0.293 0.74010 0.000 0.004 0.020 0.868 0.080 0.028
#> SRR1700165 4 0.285 0.74342 0.004 0.020 0.044 0.888 0.020 0.024
#> SRR1700166 4 0.378 0.73830 0.064 0.032 0.004 0.836 0.028 0.036
#> SRR1700168 4 0.376 0.74691 0.016 0.004 0.056 0.836 0.036 0.052
#> SRR1700167 6 0.522 0.04687 0.000 0.004 0.024 0.416 0.036 0.520
#> SRR1700170 4 0.407 0.73784 0.020 0.000 0.044 0.812 0.056 0.068
#> SRR1700169 4 0.613 0.61536 0.008 0.008 0.180 0.628 0.112 0.064
#> SRR1700171 4 0.405 0.73200 0.048 0.008 0.008 0.816 0.064 0.056
#> SRR1700172 4 0.586 0.29344 0.008 0.040 0.016 0.568 0.328 0.040
#> SRR1700174 4 0.297 0.74057 0.024 0.036 0.000 0.876 0.012 0.052
#> SRR1700173 4 0.257 0.74294 0.012 0.032 0.008 0.904 0.024 0.020
#> SRR1700175 4 0.366 0.74448 0.012 0.004 0.080 0.836 0.028 0.040
#> SRR1700176 4 0.488 0.69512 0.004 0.028 0.020 0.748 0.120 0.080
#> SRR1700178 2 0.350 0.59173 0.184 0.788 0.000 0.012 0.004 0.012
#> SRR1700177 4 0.522 0.67858 0.008 0.016 0.016 0.708 0.144 0.108
#> SRR1700180 2 0.332 0.61525 0.164 0.808 0.000 0.016 0.008 0.004
#> SRR1700179 2 0.275 0.62710 0.132 0.852 0.004 0.004 0.004 0.004
#> SRR1700181 2 0.582 0.17030 0.400 0.484 0.000 0.092 0.008 0.016
#> SRR1700183 1 0.352 0.63625 0.852 0.048 0.024 0.004 0.028 0.044
#> SRR1700182 2 0.369 0.56831 0.216 0.756 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1700184 2 0.265 0.63977 0.080 0.880 0.004 0.000 0.008 0.028
#> SRR1700186 2 0.549 0.58967 0.184 0.688 0.012 0.020 0.028 0.068
#> SRR1700187 1 0.252 0.63469 0.908 0.020 0.012 0.012 0.024 0.024
#> SRR1700185 1 0.554 0.50079 0.696 0.024 0.036 0.004 0.116 0.124
#> SRR1700188 2 0.353 0.59950 0.188 0.784 0.012 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700192 1 0.341 0.61625 0.824 0.128 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR1700190 2 0.487 0.62595 0.148 0.748 0.036 0.012 0.024 0.032
#> SRR1700191 1 0.517 0.56706 0.732 0.052 0.016 0.004 0.096 0.100
#> SRR1700189 1 0.302 0.63441 0.880 0.048 0.008 0.016 0.020 0.028
#> SRR1700193 1 0.455 0.23459 0.576 0.396 0.008 0.000 0.012 0.008
#> SRR1700195 1 0.459 0.04111 0.512 0.460 0.000 0.004 0.020 0.004
#> SRR1700194 1 0.225 0.63184 0.916 0.020 0.004 0.004 0.028 0.028
#> SRR1700196 2 0.488 0.19995 0.444 0.516 0.004 0.004 0.024 0.008
#> SRR1700197 1 0.408 0.56545 0.744 0.212 0.008 0.000 0.020 0.016
#> SRR1700198 2 0.444 0.26107 0.380 0.592 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1700199 1 0.513 0.12016 0.492 0.452 0.004 0.000 0.032 0.020
#> SRR1700200 1 0.444 0.55078 0.728 0.216 0.008 0.016 0.024 0.008
#> SRR1700201 2 0.291 0.59881 0.180 0.812 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700202 1 0.276 0.63220 0.896 0.028 0.008 0.020 0.024 0.024
#> SRR1700203 1 0.594 0.53129 0.608 0.220 0.008 0.016 0.012 0.136
#> SRR1700204 1 0.672 0.41987 0.532 0.280 0.028 0.004 0.104 0.052
#> SRR1700206 1 0.591 0.24186 0.512 0.380 0.000 0.060 0.024 0.024
#> SRR1700207 2 0.553 0.24572 0.408 0.512 0.044 0.000 0.016 0.020
#> SRR1700208 1 0.492 0.49114 0.660 0.280 0.012 0.016 0.016 0.016
#> SRR1700205 1 0.763 0.22559 0.452 0.040 0.044 0.020 0.188 0.256
#> SRR1700209 2 0.672 0.36388 0.268 0.524 0.000 0.080 0.112 0.016
#> SRR1700210 1 0.385 0.60906 0.788 0.160 0.012 0.000 0.024 0.016
#> SRR1700211 1 0.280 0.62611 0.876 0.080 0.000 0.016 0.008 0.020
#> SRR1700212 1 0.678 0.36062 0.448 0.220 0.000 0.032 0.012 0.288
#> SRR1700213 1 0.750 0.26817 0.444 0.304 0.084 0.004 0.120 0.044
#> SRR1700214 1 0.605 0.46546 0.580 0.280 0.004 0.084 0.040 0.012
#> SRR1700215 1 0.539 0.60996 0.748 0.048 0.048 0.040 0.048 0.068
#> SRR1700217 1 0.587 0.49830 0.600 0.256 0.004 0.028 0.104 0.008
#> SRR1700216 1 0.693 0.39136 0.568 0.032 0.068 0.008 0.160 0.164
#> SRR1700218 2 0.524 0.49007 0.280 0.636 0.004 0.012 0.052 0.016
#> SRR1700219 1 0.488 0.49369 0.664 0.256 0.008 0.008 0.064 0.000
#> SRR1700222 1 0.217 0.63010 0.920 0.036 0.004 0.008 0.016 0.016
#> SRR1700220 2 0.799 -0.04001 0.228 0.316 0.008 0.312 0.116 0.020
#> SRR1700221 2 0.526 0.05128 0.452 0.488 0.004 0.028 0.024 0.004
#> SRR1700223 2 0.579 0.10919 0.440 0.476 0.024 0.020 0.024 0.016
#> SRR1700224 1 0.596 0.59388 0.652 0.064 0.004 0.028 0.188 0.064
#> SRR1700226 1 0.620 0.55818 0.608 0.204 0.020 0.008 0.132 0.028
#> SRR1700229 5 0.826 -0.10942 0.292 0.108 0.052 0.004 0.308 0.236
#> SRR1700225 3 0.861 -0.00229 0.152 0.284 0.296 0.000 0.128 0.140
#> SRR1700227 2 0.491 0.51419 0.276 0.656 0.004 0.016 0.004 0.044
#> SRR1700230 1 0.341 0.62377 0.848 0.088 0.004 0.020 0.020 0.020
#> SRR1700231 2 0.504 0.47545 0.280 0.648 0.004 0.012 0.012 0.044
#> SRR1700228 1 0.578 0.57238 0.668 0.124 0.016 0.000 0.068 0.124
#> SRR1700232 2 0.460 0.62368 0.120 0.768 0.012 0.012 0.068 0.020
#> SRR1700233 1 0.638 0.23588 0.472 0.400 0.012 0.060 0.024 0.032
#> SRR1700234 1 0.445 0.60905 0.764 0.156 0.008 0.036 0.020 0.016
#> SRR1700235 2 0.517 0.62973 0.152 0.728 0.016 0.024 0.028 0.052
#> SRR1700237 2 0.459 0.45231 0.328 0.632 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1700236 2 0.692 0.46190 0.208 0.528 0.016 0.024 0.028 0.196
#> SRR1700238 1 0.488 0.35520 0.592 0.364 0.012 0.008 0.016 0.008
#> SRR1700239 1 0.235 0.63504 0.908 0.012 0.008 0.004 0.016 0.052
#> SRR1700240 1 0.573 0.40865 0.624 0.004 0.016 0.008 0.152 0.196
#> SRR1700241 1 0.675 0.24780 0.460 0.080 0.000 0.368 0.052 0.040
#> SRR1700243 1 0.571 0.16936 0.500 0.408 0.004 0.012 0.060 0.016
#> SRR1700244 2 0.623 0.04856 0.376 0.400 0.000 0.000 0.212 0.012
#> SRR1700242 1 0.284 0.62849 0.884 0.060 0.004 0.012 0.024 0.016
#> SRR1700246 1 0.426 0.59429 0.792 0.036 0.004 0.008 0.060 0.100
#> SRR1700245 2 0.350 0.64608 0.092 0.840 0.012 0.004 0.016 0.036
#> SRR1700247 1 0.616 0.26093 0.528 0.020 0.028 0.008 0.068 0.348
#> SRR1700249 1 0.273 0.63092 0.892 0.004 0.008 0.020 0.036 0.040
#> SRR1700250 2 0.389 0.64763 0.048 0.824 0.004 0.008 0.060 0.056
#> SRR1700248 2 0.359 0.63452 0.104 0.828 0.000 0.036 0.020 0.012
#> SRR1700251 1 0.494 0.62302 0.768 0.088 0.040 0.056 0.024 0.024
#> SRR1700252 1 0.693 0.42925 0.524 0.268 0.060 0.004 0.108 0.036
#> SRR1700253 2 0.640 0.20595 0.348 0.520 0.012 0.040 0.040 0.040
#> SRR1700256 1 0.656 0.50952 0.584 0.204 0.044 0.004 0.032 0.132
#> SRR1700254 1 0.373 0.61248 0.832 0.024 0.004 0.028 0.024 0.088
#> SRR1700255 1 0.556 0.54080 0.664 0.216 0.008 0.064 0.028 0.020
#> SRR1700257 1 0.492 0.18944 0.544 0.412 0.000 0.012 0.020 0.012
#> SRR1700258 2 0.597 0.49881 0.236 0.616 0.004 0.032 0.092 0.020
#> SRR1700259 2 0.577 0.64431 0.036 0.708 0.124 0.036 0.052 0.044
#> SRR1700260 5 0.678 0.49276 0.024 0.212 0.024 0.140 0.568 0.032
#> SRR1700261 5 0.566 0.58399 0.012 0.020 0.132 0.148 0.672 0.016
#> SRR1700262 5 0.628 0.56465 0.116 0.024 0.008 0.164 0.632 0.056
#> SRR1700263 6 0.768 0.17137 0.036 0.140 0.048 0.028 0.372 0.376
#> SRR1700264 2 0.560 0.58492 0.040 0.636 0.244 0.000 0.064 0.016
#> SRR1700265 6 0.880 0.11198 0.200 0.232 0.228 0.000 0.108 0.232
#> SRR1700266 2 0.549 0.51904 0.068 0.612 0.004 0.012 0.288 0.016
#> SRR1700268 2 0.716 -0.06223 0.376 0.380 0.016 0.036 0.180 0.012
#> SRR1700270 2 0.544 0.43197 0.308 0.596 0.004 0.012 0.072 0.008
#> SRR1700267 2 0.588 0.54092 0.044 0.600 0.036 0.004 0.284 0.032
#> SRR1700271 2 0.533 0.65133 0.060 0.740 0.104 0.024 0.040 0.032
#> SRR1700272 2 0.773 0.16319 0.028 0.408 0.024 0.188 0.300 0.052
#> SRR1700273 2 0.373 0.64265 0.096 0.824 0.012 0.008 0.052 0.008
#> SRR1700274 5 0.574 0.57106 0.032 0.076 0.036 0.068 0.720 0.068
#> SRR1700277 2 0.594 0.55485 0.180 0.668 0.032 0.028 0.064 0.028
#> SRR1700275 5 0.756 0.42170 0.140 0.076 0.004 0.280 0.452 0.048
#> SRR1700276 4 0.715 0.21191 0.288 0.096 0.000 0.452 0.152 0.012
#> SRR1700278 1 0.746 0.42631 0.520 0.088 0.036 0.072 0.244 0.040
#> SRR1700279 5 0.704 0.17494 0.280 0.016 0.004 0.036 0.440 0.224
#> SRR1700280 1 0.585 0.56161 0.644 0.072 0.000 0.020 0.200 0.064
#> SRR1700281 2 0.749 0.48994 0.084 0.540 0.148 0.012 0.068 0.148
#> SRR1700283 5 0.604 0.56163 0.008 0.012 0.068 0.116 0.652 0.144
#> SRR1700282 1 0.771 0.45669 0.472 0.156 0.008 0.164 0.172 0.028
#> SRR1700284 5 0.665 0.56310 0.024 0.048 0.064 0.204 0.608 0.052
#> SRR1700285 5 0.749 0.15788 0.336 0.076 0.020 0.100 0.436 0.032
#> SRR1700286 5 0.718 0.31724 0.080 0.276 0.036 0.020 0.516 0.072
#> SRR1700287 5 0.636 0.33610 0.032 0.024 0.024 0.372 0.504 0.044
#> SRR1700290 5 0.746 0.51433 0.204 0.016 0.084 0.084 0.536 0.076
#> SRR1700289 5 0.586 0.52347 0.016 0.028 0.028 0.068 0.656 0.204
#> SRR1700288 1 0.658 0.49651 0.588 0.152 0.016 0.032 0.188 0.024
#> SRR1700292 5 0.725 0.10829 0.160 0.016 0.024 0.036 0.424 0.340
#> SRR1700291 5 0.775 0.47713 0.028 0.084 0.152 0.252 0.460 0.024
#> SRR1700293 1 0.629 0.31221 0.508 0.060 0.008 0.340 0.084 0.000
#> SRR1700294 1 0.787 -0.24408 0.364 0.004 0.044 0.204 0.308 0.076
#> SRR1700295 5 0.753 0.40202 0.084 0.004 0.120 0.292 0.452 0.048
#> SRR1700297 5 0.712 0.45614 0.076 0.024 0.036 0.292 0.512 0.060
#> SRR1700296 5 0.682 0.53427 0.064 0.008 0.080 0.256 0.552 0.040
#> SRR1700298 4 0.762 0.07489 0.084 0.012 0.068 0.440 0.320 0.076
#> SRR1700299 6 0.759 0.02690 0.120 0.020 0.008 0.120 0.348 0.384
#> SRR1700300 5 0.753 0.47768 0.080 0.008 0.092 0.100 0.524 0.196
#> SRR1700302 5 0.628 0.45489 0.020 0.020 0.032 0.312 0.556 0.060
#> SRR1700301 4 0.673 -0.17954 0.104 0.012 0.032 0.428 0.404 0.020
#> SRR1700303 5 0.790 0.51273 0.108 0.020 0.136 0.172 0.500 0.064
#> SRR1700304 1 0.305 0.63401 0.876 0.012 0.004 0.048 0.036 0.024
#> SRR1700305 1 0.692 0.02179 0.452 0.020 0.016 0.124 0.356 0.032
#> SRR1700306 5 0.491 0.58690 0.024 0.008 0.080 0.068 0.764 0.056
#> SRR1700308 5 0.671 0.49744 0.136 0.056 0.144 0.000 0.596 0.068
#> SRR1700307 5 0.770 0.32289 0.024 0.036 0.168 0.340 0.388 0.044
#> SRR1700309 6 0.633 0.52941 0.108 0.040 0.036 0.016 0.160 0.640
#> SRR1700310 4 0.747 -0.17479 0.096 0.000 0.096 0.396 0.360 0.052
#> SRR1700311 5 0.706 0.53728 0.168 0.004 0.040 0.172 0.548 0.068
#> SRR1700312 5 0.619 0.56969 0.024 0.024 0.084 0.212 0.628 0.028
#> SRR1700313 5 0.778 0.50961 0.164 0.024 0.100 0.172 0.500 0.040
#> SRR1700314 5 0.595 0.55262 0.004 0.008 0.124 0.192 0.628 0.044
#> SRR1700315 3 0.627 0.18789 0.072 0.000 0.496 0.004 0.352 0.076
#> SRR1700316 5 0.675 0.49066 0.036 0.224 0.024 0.100 0.580 0.036
#> SRR1700317 5 0.683 0.31546 0.060 0.068 0.348 0.012 0.484 0.028
#> SRR1700318 5 0.547 0.43416 0.304 0.004 0.016 0.044 0.608 0.024
#> SRR1700319 5 0.617 0.43425 0.012 0.028 0.068 0.316 0.556 0.020
#> SRR1700320 5 0.638 0.57951 0.112 0.004 0.096 0.100 0.644 0.044
#> SRR1700322 5 0.805 0.32740 0.192 0.036 0.012 0.240 0.408 0.112
#> SRR1700321 5 0.677 0.48322 0.068 0.016 0.064 0.300 0.528 0.024
#> SRR1700323 5 0.670 0.55109 0.020 0.036 0.220 0.104 0.584 0.036
#> SRR1700324 1 0.850 0.09730 0.364 0.036 0.104 0.292 0.152 0.052
#> SRR1700325 4 0.880 -0.12515 0.164 0.260 0.032 0.284 0.220 0.040
#> SRR1700326 1 0.653 0.44583 0.624 0.004 0.092 0.048 0.080 0.152
#> SRR1700327 5 0.763 0.49463 0.096 0.164 0.024 0.132 0.532 0.052
#> SRR1700329 5 0.573 0.57014 0.008 0.008 0.052 0.188 0.660 0.084
#> SRR1700328 6 0.614 0.53747 0.128 0.036 0.032 0.012 0.140 0.652
#> SRR1700330 1 0.728 0.44094 0.552 0.056 0.028 0.112 0.204 0.048
#> SRR1700331 5 0.443 0.54262 0.044 0.036 0.020 0.004 0.784 0.112
#> SRR1700332 5 0.670 0.45272 0.044 0.028 0.048 0.308 0.536 0.036
#> SRR1700333 1 0.592 0.18162 0.512 0.052 0.012 0.016 0.388 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.951 0.945 0.974 0.103 0.916 0.916
#> 3 3 0.757 0.861 0.934 0.663 0.971 0.968
#> 4 4 0.645 0.850 0.915 0.197 0.992 0.991
#> 5 5 0.544 0.817 0.900 0.113 0.991 0.990
#> 6 6 0.446 0.806 0.886 0.120 0.995 0.995
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.2778 0.943 0.048 0.952
#> SRR1699881 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699882 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699894 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699897 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.3114 0.934 0.056 0.944
#> SRR1699900 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699899 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1699901 2 0.2423 0.951 0.040 0.960
#> SRR1699903 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699904 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699905 2 0.2423 0.949 0.040 0.960
#> SRR1699906 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699911 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699912 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1699915 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699924 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.828 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699927 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699932 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.828 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1699939 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1699942 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1699943 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.6343 0.792 0.160 0.840
#> SRR1699946 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1699947 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1699953 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.1414 0.966 0.020 0.980
#> SRR1699955 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.6973 0.739 0.188 0.812
#> SRR1699957 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699959 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1699958 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.2236 0.955 0.036 0.964
#> SRR1699962 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699964 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699968 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.3431 0.924 0.064 0.936
#> SRR1699971 2 0.0938 0.973 0.012 0.988
#> SRR1699970 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR1699973 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699974 2 0.3274 0.929 0.060 0.940
#> SRR1699975 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699977 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699978 2 0.6801 0.754 0.180 0.820
#> SRR1699979 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.2236 0.953 0.036 0.964
#> SRR1699982 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.828 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR1699988 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699987 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR1699989 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699990 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699991 2 0.2423 0.950 0.040 0.960
#> SRR1699993 2 0.4298 0.895 0.088 0.912
#> SRR1699994 2 0.2603 0.946 0.044 0.956
#> SRR1699995 1 0.9977 0.324 0.528 0.472
#> SRR1699996 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699997 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1699999 2 0.8713 0.514 0.292 0.708
#> SRR1700000 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700001 2 0.2603 0.946 0.044 0.956
#> SRR1700003 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700004 2 0.2423 0.951 0.040 0.960
#> SRR1700005 1 0.3879 0.842 0.924 0.076
#> SRR1700006 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR1700007 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.2423 0.951 0.040 0.960
#> SRR1700009 1 0.7376 0.790 0.792 0.208
#> SRR1700010 2 0.8144 0.610 0.252 0.748
#> SRR1700011 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0938 0.973 0.012 0.988
#> SRR1700012 2 0.1843 0.962 0.028 0.972
#> SRR1700014 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700015 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700016 2 1.0000 -0.251 0.496 0.504
#> SRR1700018 2 0.1843 0.961 0.028 0.972
#> SRR1700017 2 0.2043 0.957 0.032 0.968
#> SRR1700019 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.4298 0.894 0.088 0.912
#> SRR1700021 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700022 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1700024 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700025 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700026 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700027 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700028 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700030 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.5059 0.861 0.112 0.888
#> SRR1700032 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700034 2 0.9993 -0.206 0.484 0.516
#> SRR1700035 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.2948 0.939 0.052 0.948
#> SRR1700036 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700039 2 0.6531 0.779 0.168 0.832
#> SRR1700040 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1700041 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR1700042 2 0.2236 0.954 0.036 0.964
#> SRR1700043 2 0.2778 0.942 0.048 0.952
#> SRR1700045 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700044 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700046 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700047 2 0.2423 0.950 0.040 0.960
#> SRR1700048 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700049 2 0.9209 0.387 0.336 0.664
#> SRR1700050 2 0.7453 0.695 0.212 0.788
#> SRR1700051 2 0.7219 0.723 0.200 0.800
#> SRR1700052 2 0.4815 0.876 0.104 0.896
#> SRR1700053 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700055 1 0.7883 0.767 0.764 0.236
#> SRR1700056 2 0.1843 0.961 0.028 0.972
#> SRR1700057 2 0.3584 0.920 0.068 0.932
#> SRR1700058 2 0.2778 0.942 0.048 0.952
#> SRR1700059 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1700060 2 0.2236 0.954 0.036 0.964
#> SRR1700061 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1700062 2 0.3584 0.919 0.068 0.932
#> SRR1700063 2 0.2778 0.942 0.048 0.952
#> SRR1700064 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700065 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1700066 2 0.2948 0.939 0.052 0.948
#> SRR1700067 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700069 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR1700072 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1700073 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1700074 2 0.1414 0.968 0.020 0.980
#> SRR1700076 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.1843 0.961 0.028 0.972
#> SRR1700078 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700080 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700079 2 0.2778 0.941 0.048 0.952
#> SRR1700081 2 0.3114 0.934 0.056 0.944
#> SRR1700082 2 0.3274 0.928 0.060 0.940
#> SRR1700083 2 0.4815 0.876 0.104 0.896
#> SRR1700084 2 0.3879 0.912 0.076 0.924
#> SRR1700085 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0938 0.973 0.012 0.988
#> SRR1700087 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700088 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700091 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700090 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700093 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.1414 0.967 0.020 0.980
#> SRR1700096 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700097 2 0.3584 0.920 0.068 0.932
#> SRR1700098 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700105 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700113 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700115 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700117 2 0.4690 0.882 0.100 0.900
#> SRR1700119 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700118 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700121 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700125 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.1633 0.963 0.024 0.976
#> SRR1700127 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700124 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700128 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700129 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700133 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700136 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700137 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700138 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.1843 0.961 0.028 0.972
#> SRR1700143 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700144 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR1700145 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700146 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700149 2 0.3879 0.911 0.076 0.924
#> SRR1700148 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700150 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700151 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700153 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700154 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700156 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.3114 0.933 0.056 0.944
#> SRR1700159 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.1843 0.961 0.028 0.972
#> SRR1700160 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700161 2 0.0672 0.974 0.008 0.992
#> SRR1700162 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0938 0.973 0.012 0.988
#> SRR1700163 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR1700165 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR1700166 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700170 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700169 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700171 2 0.2948 0.939 0.052 0.948
#> SRR1700172 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700173 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700175 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.2043 0.957 0.032 0.968
#> SRR1700178 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700180 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0672 0.832 0.992 0.008
#> SRR1700182 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.8763 0.713 0.704 0.296
#> SRR1700185 1 0.5178 0.835 0.884 0.116
#> SRR1700188 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700192 2 0.4939 0.863 0.108 0.892
#> SRR1700190 2 0.8813 0.492 0.300 0.700
#> SRR1700191 1 0.1184 0.835 0.984 0.016
#> SRR1700189 2 0.8386 0.577 0.268 0.732
#> SRR1700193 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.3114 0.842 0.944 0.056
#> SRR1700196 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700197 2 0.8081 0.623 0.248 0.752
#> SRR1700198 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700203 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700206 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.7602 0.680 0.220 0.780
#> SRR1700205 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700212 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700214 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.1633 0.837 0.976 0.024
#> SRR1700217 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.828 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.8955 0.690 0.688 0.312
#> SRR1700220 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700227 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700230 2 0.8081 0.623 0.248 0.752
#> SRR1700231 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700228 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.9608 0.565 0.616 0.384
#> SRR1700240 1 0.5629 0.829 0.868 0.132
#> SRR1700241 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700243 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700242 2 0.7299 0.711 0.204 0.796
#> SRR1700246 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.9922 0.409 0.552 0.448
#> SRR1700249 1 0.3584 0.843 0.932 0.068
#> SRR1700250 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700253 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.8763 0.713 0.704 0.296
#> SRR1700255 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700266 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR1700270 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700274 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.5946 0.813 0.144 0.856
#> SRR1700275 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700281 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700284 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.6801 0.760 0.180 0.820
#> SRR1700289 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700292 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.2043 0.956 0.032 0.968
#> SRR1700297 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700299 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700302 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700308 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700309 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR1700310 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700314 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700315 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700316 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700320 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR1700321 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700323 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.1184 0.970 0.016 0.984
#> SRR1700327 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
#> SRR1700330 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.978 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0376 0.976 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699875 2 0.1411 0.9401 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699876 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699877 2 0.0592 0.9386 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699879 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699878 2 0.0892 0.9398 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699880 2 0.4063 0.8451 0.020 0.868 0.112
#> SRR1699881 2 0.1163 0.9403 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699882 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699883 2 0.0424 0.9382 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699884 2 0.0892 0.9399 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699885 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699886 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699888 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699889 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699890 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699887 2 0.0424 0.9390 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699891 2 0.0592 0.9378 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699892 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699893 2 0.2096 0.9329 0.004 0.944 0.052
#> SRR1699894 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699895 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699896 2 0.0892 0.9401 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699897 2 0.0747 0.9388 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699898 2 0.4137 0.8479 0.032 0.872 0.096
#> SRR1699900 2 0.1647 0.9386 0.004 0.960 0.036
#> SRR1699899 2 0.1163 0.9389 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699902 2 0.2939 0.9086 0.012 0.916 0.072
#> SRR1699901 2 0.3886 0.8652 0.024 0.880 0.096
#> SRR1699903 2 0.1289 0.9393 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699904 2 0.0237 0.9372 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699905 2 0.3973 0.8693 0.032 0.880 0.088
#> SRR1699906 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699907 2 0.0892 0.9390 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699908 2 0.1031 0.9390 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699909 2 0.0747 0.9380 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699910 2 0.1411 0.9395 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699911 2 0.1129 0.9396 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699912 2 0.0747 0.9381 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699913 2 0.0747 0.9380 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699914 2 0.2446 0.9242 0.012 0.936 0.052
#> SRR1699915 2 0.1031 0.9394 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699916 2 0.0237 0.9372 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699917 2 0.1031 0.9400 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699918 2 0.0424 0.9376 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699919 2 0.0892 0.9390 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699920 2 0.1753 0.9378 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699921 2 0.1411 0.9390 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699922 2 0.0592 0.9379 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699923 2 0.1860 0.9327 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699924 2 0.2066 0.9295 0.000 0.940 0.060
#> SRR1699925 1 0.1411 0.5738 0.964 0.000 0.036
#> SRR1699926 2 0.1289 0.9393 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699927 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699929 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699928 2 0.0592 0.9375 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699930 2 0.0424 0.9376 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699931 2 0.1163 0.9402 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699933 2 0.1765 0.9388 0.004 0.956 0.040
#> SRR1699932 2 0.0747 0.9382 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699934 1 0.1411 0.5738 0.964 0.000 0.036
#> SRR1699935 2 0.1753 0.9373 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699936 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699937 2 0.0892 0.9389 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699938 2 0.0592 0.9382 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699940 2 0.2384 0.9248 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699939 2 0.0592 0.9380 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699941 2 0.2496 0.9199 0.004 0.928 0.068
#> SRR1699942 2 0.2384 0.9302 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699943 2 0.0592 0.9384 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699944 2 0.0892 0.9390 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699945 2 0.8273 -0.6421 0.076 0.476 0.448
#> SRR1699946 2 0.1411 0.9385 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699947 2 0.0892 0.9386 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699948 2 0.0747 0.9394 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699949 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699950 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699951 2 0.1753 0.9368 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699952 2 0.1267 0.9391 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699953 2 0.0747 0.9391 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699954 2 0.2496 0.9188 0.004 0.928 0.068
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.7209 0.5865 0.036 0.360 0.604
#> SRR1699957 2 0.1267 0.9404 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699959 2 0.2384 0.9295 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699958 2 0.1411 0.9387 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699960 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699961 2 0.3120 0.8983 0.012 0.908 0.080
#> SRR1699962 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699963 2 0.1765 0.9391 0.004 0.956 0.040
#> SRR1699964 2 0.1031 0.9402 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.1964 0.9345 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699967 2 0.1163 0.9406 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699968 2 0.1163 0.9401 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699969 2 0.4539 0.7665 0.016 0.836 0.148
#> SRR1699971 2 0.3213 0.8957 0.008 0.900 0.092
#> SRR1699970 2 0.0747 0.9382 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699972 2 0.2096 0.9313 0.004 0.944 0.052
#> SRR1699973 2 0.1989 0.9342 0.004 0.948 0.048
#> SRR1699974 2 0.4749 0.8036 0.040 0.844 0.116
#> SRR1699975 2 0.1289 0.9401 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699976 2 0.1753 0.9372 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699977 2 0.1989 0.9374 0.004 0.948 0.048
#> SRR1699978 2 0.6880 0.5287 0.156 0.736 0.108
#> SRR1699979 2 0.1964 0.9357 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699980 2 0.1289 0.9391 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699981 2 0.3539 0.8680 0.012 0.888 0.100
#> SRR1699982 2 0.0892 0.9394 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699983 2 0.1031 0.9391 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699984 1 0.1860 0.5718 0.948 0.000 0.052
#> SRR1699985 2 0.0424 0.9378 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699986 2 0.3207 0.8913 0.012 0.904 0.084
#> SRR1699988 2 0.1289 0.9406 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699987 2 0.2584 0.9181 0.008 0.928 0.064
#> SRR1699989 2 0.1267 0.9400 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699990 2 0.1643 0.9381 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699992 2 0.1267 0.9406 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699991 2 0.3276 0.8968 0.024 0.908 0.068
#> SRR1699993 2 0.5757 0.6837 0.056 0.792 0.152
#> SRR1699994 2 0.3752 0.8626 0.020 0.884 0.096
#> SRR1699995 1 0.9041 -0.3276 0.488 0.372 0.140
#> SRR1699996 2 0.1399 0.9406 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699997 2 0.1643 0.9358 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699998 2 0.1267 0.9399 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699999 2 0.8505 -0.0919 0.256 0.600 0.144
#> SRR1700000 2 0.1643 0.9362 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700002 2 0.1399 0.9401 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700001 2 0.3682 0.8520 0.008 0.876 0.116
#> SRR1700003 2 0.1031 0.9406 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700004 2 0.3272 0.8911 0.016 0.904 0.080
#> SRR1700005 1 0.3694 0.5738 0.896 0.052 0.052
#> SRR1700006 2 0.2384 0.9240 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 2 0.3670 0.8637 0.020 0.888 0.092
#> SRR1700009 1 0.6295 0.3847 0.764 0.164 0.072
#> SRR1700010 3 0.6715 0.3756 0.056 0.228 0.716
#> SRR1700011 2 0.0592 0.9382 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700013 2 0.2680 0.9150 0.008 0.924 0.068
#> SRR1700012 2 0.2703 0.9195 0.016 0.928 0.056
#> SRR1700014 2 0.2173 0.9363 0.008 0.944 0.048
#> SRR1700015 2 0.2301 0.9271 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700016 1 0.8391 -0.3637 0.484 0.432 0.084
#> SRR1700018 2 0.3234 0.8966 0.020 0.908 0.072
#> SRR1700017 2 0.4002 0.7944 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700019 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700020 2 0.6188 0.5774 0.040 0.744 0.216
#> SRR1700021 2 0.1031 0.9403 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700023 2 0.2200 0.9295 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700022 2 0.3539 0.8766 0.012 0.888 0.100
#> SRR1700024 2 0.1289 0.9399 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700025 2 0.1163 0.9408 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700026 2 0.1832 0.9379 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700027 2 0.2749 0.9182 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700028 2 0.1964 0.9322 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700029 2 0.3295 0.8909 0.008 0.896 0.096
#> SRR1700030 2 0.1289 0.9398 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700031 2 0.6091 0.6551 0.092 0.784 0.124
#> SRR1700032 2 0.0983 0.9398 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700034 1 0.8842 -0.3898 0.452 0.432 0.116
#> SRR1700035 2 0.1411 0.9394 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700033 2 0.3889 0.8638 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700036 2 0.1643 0.9379 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700037 2 0.0424 0.9376 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700038 2 0.1315 0.9403 0.008 0.972 0.020
#> SRR1700039 2 0.7624 0.2517 0.104 0.672 0.224
#> SRR1700040 2 0.3445 0.8875 0.016 0.896 0.088
#> SRR1700041 2 0.2866 0.9086 0.008 0.916 0.076
#> SRR1700042 2 0.4280 0.8337 0.020 0.856 0.124
#> SRR1700043 2 0.3910 0.8480 0.020 0.876 0.104
#> SRR1700045 2 0.2486 0.9244 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700044 2 0.1411 0.9392 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700046 2 0.1860 0.9355 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700047 2 0.3769 0.8525 0.016 0.880 0.104
#> SRR1700048 2 0.1989 0.9373 0.004 0.948 0.048
#> SRR1700049 2 0.9153 -0.4156 0.300 0.524 0.176
#> SRR1700050 2 0.7572 0.3456 0.184 0.688 0.128
#> SRR1700051 2 0.7615 0.3852 0.164 0.688 0.148
#> SRR1700052 2 0.5897 0.7048 0.076 0.792 0.132
#> SRR1700053 2 0.1643 0.9385 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700054 2 0.2384 0.9288 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700055 1 0.7179 0.3188 0.712 0.184 0.104
#> SRR1700056 2 0.3183 0.8951 0.016 0.908 0.076
#> SRR1700057 2 0.4790 0.7961 0.056 0.848 0.096
#> SRR1700058 2 0.4172 0.8434 0.028 0.868 0.104
#> SRR1700059 2 0.3293 0.8841 0.012 0.900 0.088
#> SRR1700060 2 0.3618 0.8662 0.012 0.884 0.104
#> SRR1700061 2 0.2703 0.9237 0.016 0.928 0.056
#> SRR1700062 2 0.4708 0.8029 0.036 0.844 0.120
#> SRR1700063 2 0.3406 0.8884 0.028 0.904 0.068
#> SRR1700064 2 0.1753 0.9381 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700065 2 0.2947 0.9073 0.020 0.920 0.060
#> SRR1700066 2 0.4371 0.8294 0.032 0.860 0.108
#> SRR1700067 2 0.1411 0.9382 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700068 2 0.2772 0.9082 0.004 0.916 0.080
#> SRR1700069 2 0.1643 0.9382 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700070 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700071 2 0.2550 0.9242 0.012 0.932 0.056
#> SRR1700072 2 0.2599 0.9218 0.016 0.932 0.052
#> SRR1700073 2 0.0424 0.9384 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700075 2 0.2339 0.9287 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700074 2 0.2280 0.9264 0.008 0.940 0.052
#> SRR1700076 2 0.0892 0.9391 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700077 2 0.2486 0.9238 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700078 2 0.2486 0.9278 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700080 2 0.2261 0.9250 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700079 2 0.4449 0.8223 0.040 0.860 0.100
#> SRR1700081 2 0.4446 0.8367 0.032 0.856 0.112
#> SRR1700082 2 0.5156 0.6487 0.008 0.776 0.216
#> SRR1700083 2 0.5722 0.7204 0.068 0.800 0.132
#> SRR1700084 2 0.5166 0.7707 0.056 0.828 0.116
#> SRR1700085 2 0.0892 0.9407 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700086 2 0.2339 0.9333 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700087 2 0.3377 0.8838 0.012 0.896 0.092
#> SRR1700088 2 0.1753 0.9351 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700089 2 0.2165 0.9330 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700091 2 0.2096 0.9353 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700090 2 0.1860 0.9362 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700092 2 0.1860 0.9326 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700094 2 0.1878 0.9350 0.004 0.952 0.044
#> SRR1700093 2 0.1860 0.9328 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700095 2 0.3193 0.8769 0.004 0.896 0.100
#> SRR1700096 2 0.1860 0.9310 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700097 2 0.5067 0.7750 0.052 0.832 0.116
#> SRR1700098 2 0.1289 0.9396 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700099 2 0.1643 0.9359 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700100 2 0.1964 0.9325 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700101 2 0.1643 0.9376 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700102 2 0.1753 0.9350 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700104 2 0.1411 0.9378 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700103 2 0.2537 0.9096 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700105 2 0.2165 0.9283 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700106 2 0.2356 0.9146 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700107 2 0.1753 0.9354 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700108 2 0.1163 0.9403 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700110 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700112 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700111 2 0.2496 0.9218 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700113 2 0.1411 0.9380 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700114 2 0.2096 0.9334 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700115 2 0.1643 0.9365 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700116 2 0.2584 0.9249 0.008 0.928 0.064
#> SRR1700117 2 0.5944 0.6628 0.064 0.784 0.152
#> SRR1700119 2 0.1989 0.9354 0.004 0.948 0.048
#> SRR1700118 2 0.1753 0.9369 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700120 2 0.2682 0.9115 0.004 0.920 0.076
#> SRR1700121 2 0.1964 0.9326 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700122 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700123 2 0.2448 0.9141 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700125 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700126 2 0.3610 0.8703 0.016 0.888 0.096
#> SRR1700127 2 0.1964 0.9295 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700124 2 0.2261 0.9226 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700128 2 0.2711 0.9105 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700129 2 0.0747 0.9388 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700130 2 0.2066 0.9290 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700132 2 0.1964 0.9289 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700131 2 0.2400 0.9247 0.004 0.932 0.064
#> SRR1700133 2 0.1643 0.9371 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700134 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700135 2 0.1753 0.9339 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700136 2 0.2955 0.9065 0.008 0.912 0.080
#> SRR1700137 2 0.2384 0.9284 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700138 2 0.2165 0.9274 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700140 2 0.2356 0.9247 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700139 2 0.2356 0.9242 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700141 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700142 2 0.3091 0.8996 0.016 0.912 0.072
#> SRR1700143 2 0.2860 0.9063 0.004 0.912 0.084
#> SRR1700144 2 0.2384 0.9266 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700145 2 0.3043 0.9051 0.008 0.908 0.084
#> SRR1700146 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700147 2 0.2261 0.9214 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700149 2 0.5174 0.7601 0.048 0.824 0.128
#> SRR1700148 2 0.1860 0.9350 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700150 2 0.1289 0.9395 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700152 2 0.2096 0.9312 0.004 0.944 0.052
#> SRR1700151 2 0.2860 0.9076 0.004 0.912 0.084
#> SRR1700153 2 0.2860 0.9059 0.004 0.912 0.084
#> SRR1700154 2 0.1860 0.9321 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700155 2 0.1860 0.9318 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700156 2 0.2448 0.9159 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700158 2 0.4609 0.8203 0.052 0.856 0.092
#> SRR1700159 2 0.0592 0.9378 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700157 2 0.2998 0.9156 0.016 0.916 0.068
#> SRR1700160 2 0.2356 0.9218 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700161 2 0.2261 0.9233 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700162 2 0.0592 0.9386 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700164 2 0.2955 0.9010 0.008 0.912 0.080
#> SRR1700163 2 0.3272 0.8915 0.016 0.904 0.080
#> SRR1700165 2 0.2772 0.9080 0.004 0.916 0.080
#> SRR1700166 2 0.1529 0.9369 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700168 2 0.0747 0.9387 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700167 2 0.2384 0.9241 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700170 2 0.1643 0.9364 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700169 2 0.1643 0.9357 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700171 2 0.4591 0.8053 0.032 0.848 0.120
#> SRR1700172 2 0.1860 0.9325 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700174 2 0.1399 0.9398 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700173 2 0.1643 0.9383 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700175 2 0.1529 0.9370 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700176 2 0.3502 0.8848 0.020 0.896 0.084
#> SRR1700178 2 0.0747 0.9381 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700177 2 0.1753 0.9359 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700180 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700179 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700181 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700183 1 0.1399 0.5773 0.968 0.004 0.028
#> SRR1700182 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700184 2 0.0892 0.9388 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700186 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700187 1 0.7474 0.2461 0.684 0.216 0.100
#> SRR1700185 1 0.4075 0.5569 0.880 0.072 0.048
#> SRR1700188 2 0.0592 0.9379 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700192 2 0.6835 0.4773 0.088 0.732 0.180
#> SRR1700190 3 0.6955 0.1514 0.100 0.172 0.728
#> SRR1700191 1 0.1163 0.5735 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700189 2 0.8474 -0.0851 0.252 0.604 0.144
#> SRR1700193 2 0.0592 0.9385 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700195 2 0.0747 0.9394 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700194 1 0.2050 0.5831 0.952 0.028 0.020
#> SRR1700196 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700197 2 0.9411 -0.7050 0.176 0.444 0.380
#> SRR1700198 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700199 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700200 2 0.0592 0.9377 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.0747 0.9406 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700203 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700204 2 0.0829 0.9392 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700206 2 0.0592 0.9394 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.8288 0.5740 0.080 0.408 0.512
#> SRR1700205 2 0.0592 0.9385 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700209 2 0.0592 0.9384 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700210 2 0.0592 0.9379 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700211 2 0.0592 0.9402 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700212 2 0.0424 0.9376 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700213 2 0.1129 0.9403 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700214 2 0.0424 0.9381 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700215 1 0.1774 0.5825 0.960 0.016 0.024
#> SRR1700217 2 0.0747 0.9385 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700216 1 0.1411 0.5738 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700218 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.7531 0.1792 0.672 0.236 0.092
#> SRR1700220 2 0.0237 0.9372 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700221 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700223 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700224 2 0.0747 0.9389 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700226 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700229 2 0.0892 0.9396 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700225 2 0.1031 0.9404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700227 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700230 2 0.8821 -0.2201 0.188 0.580 0.232
#> SRR1700231 2 0.1129 0.9403 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700228 2 0.0747 0.9383 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700232 2 0.0424 0.9381 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700233 2 0.0592 0.9395 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700234 2 0.0424 0.9381 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700235 2 0.0892 0.9399 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700237 2 0.1031 0.9396 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700236 2 0.0592 0.9382 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700238 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 1 0.8455 -0.0998 0.584 0.296 0.120
#> SRR1700240 1 0.4423 0.5382 0.864 0.088 0.048
#> SRR1700241 2 0.1399 0.9391 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700243 2 0.0592 0.9392 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700244 2 0.0892 0.9403 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700242 2 0.7917 0.2157 0.184 0.664 0.152
#> SRR1700246 2 0.0592 0.9383 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700245 2 0.0747 0.9389 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700247 1 0.8769 -0.2792 0.528 0.348 0.124
#> SRR1700249 1 0.2689 0.5816 0.932 0.036 0.032
#> SRR1700250 2 0.0592 0.9379 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700248 2 0.0592 0.9392 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700251 2 0.0747 0.9384 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700252 2 0.1525 0.9383 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700253 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.7298 0.2404 0.692 0.220 0.088
#> SRR1700255 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700257 2 0.0424 0.9374 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700258 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700261 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0424 0.9383 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700264 2 0.0747 0.9383 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700265 2 0.1289 0.9400 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700266 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700268 2 0.1877 0.9361 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700270 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700267 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9366 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0661 0.9389 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700274 2 0.0424 0.9375 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700277 3 0.7744 0.5403 0.048 0.448 0.504
#> SRR1700275 2 0.0592 0.9391 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700276 2 0.0747 0.9389 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700278 2 0.0592 0.9390 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700279 2 0.0592 0.9390 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700280 2 0.0983 0.9395 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700281 2 0.0592 0.9378 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700283 2 0.0747 0.9392 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700282 2 0.1399 0.9403 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700284 2 0.1031 0.9398 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700285 2 0.0424 0.9384 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700286 2 0.0892 0.9392 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700287 2 0.0747 0.9391 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700290 2 0.7772 0.2870 0.132 0.672 0.196
#> SRR1700289 2 0.0747 0.9385 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700288 2 0.1129 0.9399 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700292 2 0.0892 0.9387 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700291 2 0.1643 0.9378 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700293 2 0.0424 0.9376 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700294 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700295 2 0.4164 0.7927 0.008 0.848 0.144
#> SRR1700297 2 0.0237 0.9370 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700296 2 0.0424 0.9373 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700298 2 0.1399 0.9396 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700299 2 0.1031 0.9386 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700300 2 0.2301 0.9233 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700302 2 0.1031 0.9393 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700301 2 0.0747 0.9388 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700303 2 0.0424 0.9378 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700304 2 0.1163 0.9400 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700305 2 0.0592 0.9386 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700306 2 0.2165 0.9283 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700308 2 0.0592 0.9378 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700307 2 0.1643 0.9379 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700309 2 0.3644 0.8451 0.004 0.872 0.124
#> SRR1700310 2 0.0237 0.9371 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700311 2 0.1529 0.9387 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700312 2 0.0747 0.9391 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700313 2 0.1129 0.9405 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700314 2 0.1647 0.9382 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700315 2 0.1267 0.9397 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700316 2 0.1031 0.9393 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700317 2 0.0592 0.9378 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700318 2 0.1411 0.9391 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700319 2 0.2066 0.9333 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700320 2 0.0592 0.9385 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700322 2 0.1585 0.9394 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700321 2 0.0829 0.9404 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700323 2 0.1163 0.9399 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700324 2 0.0424 0.9372 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700325 2 0.0237 0.9368 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700326 2 0.2301 0.9262 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700327 2 0.0747 0.9393 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700329 2 0.0592 0.9384 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700328 2 0.1753 0.9365 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700330 2 0.0747 0.9396 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700331 2 0.1163 0.9396 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700332 2 0.1031 0.9393 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700333 2 0.0892 0.9402 0.000 0.980 0.020
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 3 0.0672 0.9304 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1699875 3 0.1209 0.9315 0.000 0.004 0.964 0.032
#> SRR1699876 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699877 3 0.0895 0.9309 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699879 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699878 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699880 3 0.4179 0.8195 0.004 0.060 0.832 0.104
#> SRR1699881 3 0.1256 0.9314 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699882 3 0.0336 0.9273 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699883 3 0.0657 0.9295 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1699884 3 0.1004 0.9310 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1699885 3 0.0592 0.9283 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699886 3 0.0188 0.9274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699888 3 0.0469 0.9287 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699889 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699890 3 0.0336 0.9279 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699887 3 0.0524 0.9296 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1699891 3 0.0469 0.9281 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699892 3 0.0524 0.9305 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1699893 3 0.2060 0.9244 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1699894 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699895 3 0.0469 0.9284 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699896 3 0.0927 0.9315 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1699897 3 0.0592 0.9297 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699898 3 0.4532 0.7986 0.020 0.044 0.820 0.116
#> SRR1699900 3 0.1576 0.9287 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1699899 3 0.1042 0.9299 0.000 0.008 0.972 0.020
#> SRR1699902 3 0.3477 0.8773 0.008 0.032 0.872 0.088
#> SRR1699901 3 0.3736 0.8473 0.012 0.016 0.848 0.124
#> SRR1699903 3 0.1256 0.9308 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699904 3 0.0336 0.9284 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699905 3 0.4258 0.8327 0.028 0.028 0.836 0.108
#> SRR1699906 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699907 3 0.0804 0.9297 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1699908 3 0.1151 0.9308 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699909 3 0.0592 0.9284 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699910 3 0.1284 0.9313 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1699911 3 0.0895 0.9302 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699912 3 0.0657 0.9285 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1699913 3 0.0592 0.9284 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699914 3 0.2561 0.9104 0.004 0.016 0.912 0.068
#> SRR1699915 3 0.0927 0.9302 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1699916 3 0.0188 0.9275 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699917 3 0.1109 0.9314 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699918 3 0.0469 0.9287 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699919 3 0.0804 0.9297 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1699920 3 0.1833 0.9288 0.000 0.024 0.944 0.032
#> SRR1699921 3 0.1256 0.9306 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699922 3 0.0657 0.9286 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1699923 3 0.2300 0.9168 0.000 0.016 0.920 0.064
#> SRR1699924 3 0.2443 0.9155 0.000 0.024 0.916 0.060
#> SRR1699925 1 0.2610 0.6888 0.900 0.012 0.000 0.088
#> SRR1699926 3 0.1256 0.9308 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699927 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699929 3 0.0524 0.9305 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1699928 3 0.0469 0.9280 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699930 3 0.0336 0.9279 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699931 3 0.1256 0.9316 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699933 3 0.1767 0.9298 0.000 0.012 0.944 0.044
#> SRR1699932 3 0.0592 0.9287 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699934 1 0.2610 0.6888 0.900 0.012 0.000 0.088
#> SRR1699935 3 0.1890 0.9275 0.000 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699936 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699937 3 0.0895 0.9302 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699938 3 0.0592 0.9288 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699940 3 0.2570 0.9130 0.004 0.028 0.916 0.052
#> SRR1699939 3 0.0592 0.9287 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699941 3 0.2500 0.9129 0.000 0.040 0.916 0.044
#> SRR1699942 3 0.2441 0.9194 0.004 0.020 0.920 0.056
#> SRR1699943 3 0.0469 0.9289 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699944 3 0.1151 0.9309 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699945 2 0.7955 0.5621 0.044 0.480 0.364 0.112
#> SRR1699946 3 0.1584 0.9290 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1699947 3 0.1109 0.9306 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699948 3 0.0657 0.9300 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1699949 3 0.0469 0.9281 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699950 3 0.0469 0.9281 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699951 3 0.1913 0.9278 0.000 0.020 0.940 0.040
#> SRR1699952 3 0.1305 0.9304 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1699953 3 0.0779 0.9298 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699954 3 0.2797 0.9001 0.000 0.032 0.900 0.068
#> SRR1699955 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699956 2 0.5659 0.4817 0.008 0.700 0.240 0.052
#> SRR1699957 3 0.1256 0.9317 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699959 3 0.2335 0.9193 0.000 0.020 0.920 0.060
#> SRR1699958 3 0.1820 0.9279 0.000 0.020 0.944 0.036
#> SRR1699960 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699961 3 0.3239 0.8807 0.000 0.052 0.880 0.068
#> SRR1699962 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699963 3 0.2197 0.9234 0.000 0.024 0.928 0.048
#> SRR1699964 3 0.1109 0.9313 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699965 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699966 3 0.2089 0.9250 0.000 0.020 0.932 0.048
#> SRR1699967 3 0.1151 0.9318 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699968 3 0.1151 0.9311 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699969 3 0.4802 0.7357 0.004 0.128 0.792 0.076
#> SRR1699971 3 0.3403 0.8675 0.004 0.020 0.864 0.112
#> SRR1699970 3 0.0592 0.9287 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699972 3 0.2282 0.9175 0.000 0.024 0.924 0.052
#> SRR1699973 3 0.2060 0.9241 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1699974 3 0.4855 0.7701 0.024 0.052 0.804 0.120
#> SRR1699975 3 0.1356 0.9317 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1699976 3 0.1975 0.9256 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1699977 3 0.2142 0.9252 0.000 0.016 0.928 0.056
#> SRR1699978 3 0.6511 0.4323 0.116 0.016 0.672 0.196
#> SRR1699979 3 0.2060 0.9271 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1699980 3 0.1356 0.9309 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1699981 3 0.3453 0.8630 0.000 0.052 0.868 0.080
#> SRR1699982 3 0.0779 0.9300 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699983 3 0.0895 0.9298 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699984 1 0.2924 0.6876 0.884 0.016 0.000 0.100
#> SRR1699985 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699986 3 0.3916 0.8393 0.004 0.056 0.848 0.092
#> SRR1699988 3 0.1256 0.9321 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699987 3 0.2830 0.9009 0.000 0.040 0.900 0.060
#> SRR1699989 3 0.1151 0.9312 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699990 3 0.1584 0.9302 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1699992 3 0.1452 0.9306 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1699991 3 0.3629 0.8701 0.016 0.028 0.868 0.088
#> SRR1699993 3 0.6026 0.6280 0.032 0.112 0.736 0.120
#> SRR1699994 3 0.4152 0.8194 0.012 0.048 0.840 0.100
#> SRR1699995 1 0.8597 -0.1796 0.404 0.036 0.236 0.324
#> SRR1699996 3 0.1545 0.9305 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1699997 3 0.1975 0.9237 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1699998 3 0.1584 0.9310 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1699999 3 0.8726 -0.3997 0.192 0.076 0.484 0.248
#> SRR1700000 3 0.1820 0.9269 0.000 0.020 0.944 0.036
#> SRR1700002 3 0.1356 0.9314 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700001 3 0.4153 0.8195 0.004 0.084 0.836 0.076
#> SRR1700003 3 0.1151 0.9319 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700004 3 0.3614 0.8622 0.008 0.044 0.868 0.080
#> SRR1700005 1 0.3455 0.6922 0.852 0.012 0.004 0.132
#> SRR1700006 3 0.2623 0.9043 0.000 0.028 0.908 0.064
#> SRR1700007 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700008 3 0.4202 0.7988 0.008 0.040 0.828 0.124
#> SRR1700009 1 0.5935 0.6126 0.692 0.012 0.064 0.232
#> SRR1700010 2 0.4071 0.0558 0.016 0.844 0.104 0.036
#> SRR1700011 3 0.0592 0.9288 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700013 3 0.2489 0.9107 0.000 0.020 0.912 0.068
#> SRR1700012 3 0.2731 0.9067 0.004 0.028 0.908 0.060
#> SRR1700014 3 0.1938 0.9288 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700015 3 0.2546 0.9114 0.000 0.028 0.912 0.060
#> SRR1700016 1 0.8192 -0.2554 0.460 0.020 0.268 0.252
#> SRR1700018 3 0.3493 0.8722 0.008 0.052 0.876 0.064
#> SRR1700017 3 0.4888 0.6224 0.000 0.036 0.740 0.224
#> SRR1700019 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700020 3 0.7368 -0.4180 0.024 0.088 0.480 0.408
#> SRR1700021 3 0.0937 0.9314 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1700023 3 0.2363 0.9174 0.000 0.024 0.920 0.056
#> SRR1700022 3 0.3634 0.8601 0.008 0.028 0.860 0.104
#> SRR1700024 3 0.1256 0.9314 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700025 3 0.1151 0.9320 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700026 3 0.1888 0.9268 0.000 0.016 0.940 0.044
#> SRR1700027 3 0.2750 0.9058 0.004 0.032 0.908 0.056
#> SRR1700028 3 0.2032 0.9245 0.000 0.028 0.936 0.036
#> SRR1700029 3 0.3289 0.8679 0.004 0.012 0.864 0.120
#> SRR1700030 3 0.1488 0.9315 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700031 3 0.6815 0.3924 0.044 0.080 0.660 0.216
#> SRR1700032 3 0.0921 0.9314 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700034 1 0.9204 -0.3559 0.340 0.072 0.288 0.300
#> SRR1700035 3 0.1388 0.9309 0.000 0.012 0.960 0.028
#> SRR1700033 3 0.3989 0.8435 0.020 0.048 0.856 0.076
#> SRR1700036 3 0.1629 0.9299 0.000 0.024 0.952 0.024
#> SRR1700037 3 0.0336 0.9279 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700038 3 0.1489 0.9289 0.000 0.004 0.952 0.044
#> SRR1700039 3 0.7980 -0.1224 0.044 0.184 0.556 0.216
#> SRR1700040 3 0.3463 0.8646 0.004 0.032 0.868 0.096
#> SRR1700041 3 0.3037 0.8946 0.000 0.036 0.888 0.076
#> SRR1700042 3 0.4221 0.8085 0.008 0.036 0.824 0.132
#> SRR1700043 3 0.4014 0.8262 0.008 0.064 0.848 0.080
#> SRR1700045 3 0.2522 0.9097 0.000 0.016 0.908 0.076
#> SRR1700044 3 0.1584 0.9303 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1700046 3 0.2048 0.9225 0.000 0.008 0.928 0.064
#> SRR1700047 3 0.4220 0.8129 0.008 0.068 0.836 0.088
#> SRR1700048 3 0.2060 0.9277 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1700049 3 0.9299 -0.6968 0.180 0.112 0.356 0.352
#> SRR1700050 3 0.7835 -0.1537 0.096 0.060 0.544 0.300
#> SRR1700051 3 0.7765 0.0209 0.116 0.052 0.568 0.264
#> SRR1700052 3 0.5596 0.6751 0.048 0.040 0.756 0.156
#> SRR1700053 3 0.1733 0.9306 0.000 0.024 0.948 0.028
#> SRR1700054 3 0.2329 0.9153 0.000 0.012 0.916 0.072
#> SRR1700055 1 0.7197 0.5440 0.564 0.036 0.072 0.328
#> SRR1700056 3 0.3232 0.8688 0.004 0.016 0.872 0.108
#> SRR1700057 3 0.4851 0.7316 0.020 0.044 0.796 0.140
#> SRR1700058 3 0.4362 0.8034 0.008 0.056 0.824 0.112
#> SRR1700059 3 0.3821 0.8183 0.000 0.040 0.840 0.120
#> SRR1700060 3 0.3758 0.8436 0.000 0.048 0.848 0.104
#> SRR1700061 3 0.2695 0.9132 0.008 0.024 0.912 0.056
#> SRR1700062 3 0.4757 0.7495 0.012 0.048 0.796 0.144
#> SRR1700063 3 0.3421 0.8713 0.020 0.016 0.876 0.088
#> SRR1700064 3 0.1938 0.9274 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700065 3 0.2923 0.8940 0.008 0.016 0.896 0.080
#> SRR1700066 3 0.4733 0.7688 0.012 0.060 0.804 0.124
#> SRR1700067 3 0.1488 0.9305 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700068 3 0.2924 0.8868 0.000 0.016 0.884 0.100
#> SRR1700069 3 0.1854 0.9273 0.000 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700070 3 0.0469 0.9281 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700071 3 0.2742 0.9016 0.000 0.024 0.900 0.076
#> SRR1700072 3 0.2521 0.9085 0.000 0.024 0.912 0.064
#> SRR1700073 3 0.0657 0.9296 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700075 3 0.2207 0.9198 0.004 0.012 0.928 0.056
#> SRR1700074 3 0.2198 0.9139 0.000 0.008 0.920 0.072
#> SRR1700076 3 0.1109 0.9313 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700077 3 0.2813 0.8981 0.000 0.024 0.896 0.080
#> SRR1700078 3 0.2750 0.9128 0.004 0.032 0.908 0.056
#> SRR1700080 3 0.2450 0.9127 0.000 0.016 0.912 0.072
#> SRR1700079 3 0.4668 0.7510 0.016 0.036 0.800 0.148
#> SRR1700081 3 0.4657 0.7941 0.016 0.040 0.804 0.140
#> SRR1700082 3 0.5783 0.5491 0.000 0.172 0.708 0.120
#> SRR1700083 3 0.6163 0.6050 0.040 0.072 0.720 0.168
#> SRR1700084 3 0.5208 0.7320 0.032 0.052 0.784 0.132
#> SRR1700085 3 0.0895 0.9318 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700086 3 0.2441 0.9211 0.004 0.020 0.920 0.056
#> SRR1700087 3 0.3464 0.8557 0.000 0.032 0.860 0.108
#> SRR1700088 3 0.2032 0.9250 0.000 0.028 0.936 0.036
#> SRR1700089 3 0.2443 0.9216 0.000 0.024 0.916 0.060
#> SRR1700091 3 0.2335 0.9198 0.000 0.020 0.920 0.060
#> SRR1700090 3 0.2089 0.9256 0.000 0.020 0.932 0.048
#> SRR1700092 3 0.2174 0.9217 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1700094 3 0.2021 0.9214 0.000 0.012 0.932 0.056
#> SRR1700093 3 0.2021 0.9252 0.000 0.024 0.936 0.040
#> SRR1700095 3 0.3523 0.8425 0.000 0.032 0.856 0.112
#> SRR1700096 3 0.2466 0.9121 0.000 0.028 0.916 0.056
#> SRR1700097 3 0.5202 0.7376 0.032 0.060 0.788 0.120
#> SRR1700098 3 0.1584 0.9297 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1700099 3 0.2060 0.9234 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1700100 3 0.1929 0.9268 0.000 0.024 0.940 0.036
#> SRR1700101 3 0.1975 0.9269 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1700102 3 0.2124 0.9241 0.000 0.028 0.932 0.040
#> SRR1700104 3 0.1733 0.9278 0.000 0.028 0.948 0.024
#> SRR1700103 3 0.2871 0.8941 0.000 0.032 0.896 0.072
#> SRR1700105 3 0.2483 0.9173 0.000 0.032 0.916 0.052
#> SRR1700106 3 0.3013 0.8851 0.000 0.032 0.888 0.080
#> SRR1700107 3 0.1938 0.9257 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700108 3 0.1211 0.9311 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700109 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700110 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700112 3 0.0188 0.9274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700111 3 0.2796 0.8992 0.000 0.016 0.892 0.092
#> SRR1700113 3 0.1767 0.9267 0.000 0.012 0.944 0.044
#> SRR1700114 3 0.2124 0.9246 0.000 0.028 0.932 0.040
#> SRR1700115 3 0.1635 0.9287 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700116 3 0.2489 0.9161 0.000 0.020 0.912 0.068
#> SRR1700117 3 0.6021 0.5852 0.028 0.072 0.720 0.180
#> SRR1700119 3 0.2179 0.9214 0.000 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700118 3 0.2089 0.9259 0.000 0.020 0.932 0.048
#> SRR1700120 3 0.3048 0.8822 0.000 0.016 0.876 0.108
#> SRR1700121 3 0.2282 0.9213 0.000 0.024 0.924 0.052
#> SRR1700122 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700123 3 0.2973 0.8877 0.000 0.020 0.884 0.096
#> SRR1700125 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700126 3 0.3943 0.8344 0.008 0.036 0.844 0.112
#> SRR1700127 3 0.2300 0.9159 0.000 0.016 0.920 0.064
#> SRR1700124 3 0.2623 0.9085 0.000 0.028 0.908 0.064
#> SRR1700128 3 0.3107 0.8927 0.000 0.036 0.884 0.080
#> SRR1700129 3 0.0779 0.9299 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700130 3 0.2142 0.9224 0.000 0.016 0.928 0.056
#> SRR1700132 3 0.2089 0.9204 0.000 0.020 0.932 0.048
#> SRR1700131 3 0.2773 0.9028 0.000 0.028 0.900 0.072
#> SRR1700133 3 0.1888 0.9277 0.000 0.016 0.940 0.044
#> SRR1700134 3 0.0469 0.9284 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700135 3 0.2179 0.9162 0.000 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700136 3 0.3389 0.8737 0.004 0.024 0.868 0.104
#> SRR1700137 3 0.2271 0.9170 0.000 0.008 0.916 0.076
#> SRR1700138 3 0.2282 0.9194 0.000 0.024 0.924 0.052
#> SRR1700140 3 0.2376 0.9171 0.000 0.016 0.916 0.068
#> SRR1700139 3 0.2596 0.9125 0.000 0.024 0.908 0.068
#> SRR1700141 3 0.0469 0.9292 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700142 3 0.3172 0.8823 0.008 0.020 0.884 0.088
#> SRR1700143 3 0.3307 0.8722 0.000 0.028 0.868 0.104
#> SRR1700144 3 0.2596 0.9084 0.000 0.024 0.908 0.068
#> SRR1700145 3 0.3082 0.8914 0.000 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700146 3 0.0469 0.9290 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700147 3 0.2706 0.9021 0.000 0.020 0.900 0.080
#> SRR1700149 3 0.5261 0.7108 0.024 0.052 0.772 0.152
#> SRR1700148 3 0.1978 0.9227 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700150 3 0.1452 0.9303 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700152 3 0.1975 0.9244 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1700151 3 0.2973 0.8917 0.000 0.020 0.884 0.096
#> SRR1700153 3 0.3158 0.8841 0.004 0.020 0.880 0.096
#> SRR1700154 3 0.2174 0.9211 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1700155 3 0.1854 0.9247 0.000 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700156 3 0.2563 0.9073 0.000 0.020 0.908 0.072
#> SRR1700158 3 0.4925 0.7591 0.036 0.032 0.796 0.136
#> SRR1700159 3 0.0469 0.9281 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700157 3 0.2984 0.8983 0.000 0.028 0.888 0.084
#> SRR1700160 3 0.2623 0.9109 0.000 0.028 0.908 0.064
#> SRR1700161 3 0.2593 0.9074 0.000 0.016 0.904 0.080
#> SRR1700162 3 0.0592 0.9296 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700164 3 0.2949 0.8888 0.000 0.024 0.888 0.088
#> SRR1700163 3 0.3648 0.8517 0.004 0.032 0.856 0.108
#> SRR1700165 3 0.2742 0.9009 0.000 0.024 0.900 0.076
#> SRR1700166 3 0.1767 0.9265 0.000 0.012 0.944 0.044
#> SRR1700168 3 0.0707 0.9300 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700167 3 0.2412 0.9077 0.000 0.008 0.908 0.084
#> SRR1700170 3 0.1970 0.9229 0.000 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700169 3 0.2089 0.9231 0.000 0.020 0.932 0.048
#> SRR1700171 3 0.4639 0.7498 0.012 0.040 0.800 0.148
#> SRR1700172 3 0.1929 0.9245 0.000 0.024 0.940 0.036
#> SRR1700174 3 0.1452 0.9310 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700173 3 0.2101 0.9239 0.000 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700175 3 0.1820 0.9272 0.000 0.020 0.944 0.036
#> SRR1700176 3 0.3812 0.8453 0.008 0.028 0.848 0.116
#> SRR1700178 3 0.0895 0.9301 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700177 3 0.1975 0.9253 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1700180 3 0.0592 0.9283 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700179 3 0.0779 0.9296 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700181 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700183 1 0.1978 0.6929 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1700182 3 0.0592 0.9283 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700184 3 0.0817 0.9297 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700186 3 0.0524 0.9297 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700187 1 0.7218 0.5313 0.636 0.052 0.100 0.212
#> SRR1700185 1 0.3400 0.6848 0.856 0.004 0.012 0.128
#> SRR1700188 3 0.0657 0.9300 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700192 3 0.7934 -0.0211 0.060 0.160 0.580 0.200
#> SRR1700190 2 0.5282 -0.0935 0.084 0.792 0.080 0.044
#> SRR1700191 1 0.2522 0.6933 0.908 0.016 0.000 0.076
#> SRR1700189 3 0.8631 -0.3025 0.240 0.096 0.512 0.152
#> SRR1700193 3 0.0592 0.9293 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700195 3 0.0779 0.9301 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700194 1 0.1847 0.6942 0.940 0.004 0.004 0.052
#> SRR1700196 3 0.0469 0.9279 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700197 2 0.9289 0.5447 0.148 0.384 0.332 0.136
#> SRR1700198 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700199 3 0.0592 0.9293 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700200 3 0.0592 0.9283 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700201 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700202 3 0.0804 0.9316 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1700203 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700204 3 0.0707 0.9300 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700206 3 0.0657 0.9311 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700207 3 0.0336 0.9281 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700208 2 0.7585 0.5962 0.056 0.548 0.320 0.076
#> SRR1700205 3 0.0657 0.9300 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700209 3 0.0469 0.9289 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700210 3 0.0524 0.9283 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700211 3 0.0657 0.9311 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700212 3 0.0524 0.9297 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700213 3 0.0927 0.9319 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700214 3 0.0592 0.9295 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700215 1 0.1211 0.6947 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700217 3 0.0592 0.9289 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700216 1 0.2610 0.6888 0.900 0.012 0.000 0.088
#> SRR1700218 3 0.0336 0.9273 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700219 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700222 1 0.7267 0.4823 0.636 0.048 0.120 0.196
#> SRR1700220 3 0.0188 0.9275 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700221 3 0.0469 0.9283 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700223 3 0.0469 0.9279 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700224 3 0.0672 0.9296 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700226 3 0.0469 0.9282 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700229 3 0.0895 0.9310 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700225 3 0.1411 0.9310 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1700227 3 0.0469 0.9279 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700230 3 0.8922 -0.4278 0.160 0.240 0.484 0.116
#> SRR1700231 3 0.1042 0.9316 0.000 0.008 0.972 0.020
#> SRR1700228 3 0.0895 0.9299 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700232 3 0.0592 0.9295 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700233 3 0.0592 0.9303 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700234 3 0.0336 0.9285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700235 3 0.0927 0.9309 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700237 3 0.1004 0.9306 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700236 3 0.0657 0.9291 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700238 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 1 0.8304 0.3316 0.548 0.080 0.152 0.220
#> SRR1700240 1 0.3790 0.6796 0.840 0.004 0.024 0.132
#> SRR1700241 3 0.1297 0.9311 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR1700243 3 0.0657 0.9297 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700244 3 0.0804 0.9315 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700242 3 0.8047 0.0373 0.168 0.100 0.592 0.140
#> SRR1700246 3 0.0469 0.9287 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700245 3 0.0707 0.9295 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700247 1 0.8632 -0.0855 0.472 0.056 0.224 0.248
#> SRR1700249 1 0.1822 0.6962 0.944 0.008 0.004 0.044
#> SRR1700250 3 0.0672 0.9297 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700248 3 0.0524 0.9298 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700251 3 0.0817 0.9303 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700252 3 0.1510 0.9297 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1700253 3 0.0469 0.9282 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700256 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700254 1 0.6924 0.5341 0.656 0.040 0.100 0.204
#> SRR1700255 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700257 3 0.0469 0.9279 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700258 3 0.0336 0.9273 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700259 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700260 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700261 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700262 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700263 3 0.0336 0.9288 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700264 3 0.0895 0.9308 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700265 3 0.1545 0.9295 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700266 3 0.0188 0.9274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700268 3 0.2364 0.9149 0.008 0.028 0.928 0.036
#> SRR1700270 3 0.0188 0.9274 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700267 3 0.0469 0.9277 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700271 3 0.0188 0.9272 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700272 3 0.0000 0.9269 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 3 0.0469 0.9295 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700274 3 0.0592 0.9289 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700277 2 0.7391 0.5908 0.032 0.524 0.360 0.084
#> SRR1700275 3 0.0524 0.9295 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700276 3 0.0895 0.9303 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700278 3 0.0524 0.9294 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700279 3 0.0779 0.9303 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700280 3 0.0895 0.9305 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700281 3 0.0469 0.9283 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700283 3 0.0804 0.9301 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1700282 3 0.1575 0.9307 0.004 0.012 0.956 0.028
#> SRR1700284 3 0.1042 0.9307 0.000 0.008 0.972 0.020
#> SRR1700285 3 0.0524 0.9293 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700286 3 0.1004 0.9305 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700287 3 0.0657 0.9295 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700290 3 0.8102 0.0537 0.092 0.156 0.584 0.168
#> SRR1700289 3 0.0779 0.9294 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700288 3 0.0927 0.9312 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700292 3 0.0707 0.9292 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700291 3 0.1706 0.9290 0.000 0.016 0.948 0.036
#> SRR1700293 3 0.0524 0.9283 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700294 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700295 3 0.4669 0.7367 0.000 0.104 0.796 0.100
#> SRR1700297 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700296 3 0.0336 0.9276 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700298 3 0.1174 0.9308 0.000 0.012 0.968 0.020
#> SRR1700299 3 0.1256 0.9301 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700300 3 0.2224 0.9172 0.000 0.032 0.928 0.040
#> SRR1700302 3 0.0927 0.9299 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700301 3 0.0657 0.9293 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700303 3 0.0469 0.9289 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700304 3 0.1256 0.9316 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700305 3 0.0469 0.9289 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700306 3 0.2699 0.9051 0.000 0.028 0.904 0.068
#> SRR1700308 3 0.0779 0.9307 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700307 3 0.1624 0.9309 0.000 0.020 0.952 0.028
#> SRR1700309 3 0.4036 0.8225 0.000 0.088 0.836 0.076
#> SRR1700310 3 0.0336 0.9282 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700311 3 0.1488 0.9309 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700312 3 0.0804 0.9305 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1700313 3 0.1109 0.9319 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700314 3 0.1510 0.9300 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1700315 3 0.1284 0.9310 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1700316 3 0.1256 0.9308 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700317 3 0.0592 0.9291 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700318 3 0.1629 0.9304 0.000 0.024 0.952 0.024
#> SRR1700319 3 0.2111 0.9247 0.000 0.024 0.932 0.044
#> SRR1700320 3 0.0524 0.9290 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700322 3 0.1284 0.9312 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1700321 3 0.0657 0.9311 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700323 3 0.0921 0.9309 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700324 3 0.0336 0.9277 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700325 3 0.0469 0.9283 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700326 3 0.2708 0.9044 0.004 0.016 0.904 0.076
#> SRR1700327 3 0.0592 0.9297 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700329 3 0.0779 0.9301 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1700328 3 0.2174 0.9210 0.000 0.020 0.928 0.052
#> SRR1700330 3 0.0657 0.9305 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700331 3 0.1151 0.9306 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1700332 3 0.0927 0.9299 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700333 3 0.0804 0.9309 0.000 0.008 0.980 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0566 0.9173 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1699875 2 0.0963 0.9192 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699876 2 0.0510 0.9151 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699877 2 0.0771 0.9182 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1699879 2 0.0290 0.9150 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699878 2 0.0609 0.9177 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699880 2 0.4244 0.7454 0.004 0.788 0.064 0.140 0.004
#> SRR1699881 2 0.1205 0.9187 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699882 2 0.0290 0.9137 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699883 2 0.0609 0.9180 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699884 2 0.0794 0.9182 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699885 2 0.0510 0.9149 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699886 2 0.0290 0.9148 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699888 2 0.0510 0.9161 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699889 2 0.0290 0.9143 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699890 2 0.0404 0.9152 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699887 2 0.0451 0.9164 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1699891 2 0.0510 0.9156 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699892 2 0.0510 0.9187 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699893 2 0.1956 0.9098 0.000 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR1699894 2 0.0609 0.9166 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699895 2 0.0703 0.9171 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699896 2 0.1082 0.9194 0.000 0.964 0.008 0.028 0.000
#> SRR1699897 2 0.0510 0.9165 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699898 2 0.4335 0.7473 0.020 0.792 0.044 0.140 0.004
#> SRR1699900 2 0.1768 0.9098 0.000 0.924 0.004 0.072 0.000
#> SRR1699899 2 0.1041 0.9182 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1699902 2 0.3206 0.8553 0.000 0.856 0.024 0.108 0.012
#> SRR1699901 2 0.4047 0.7765 0.008 0.800 0.020 0.156 0.016
#> SRR1699903 2 0.1282 0.9185 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1699904 2 0.0510 0.9163 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699905 2 0.4191 0.8045 0.028 0.816 0.032 0.112 0.012
#> SRR1699906 2 0.0404 0.9150 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699907 2 0.1041 0.9186 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1699908 2 0.1041 0.9183 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1699909 2 0.0703 0.9160 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699910 2 0.1270 0.9180 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1699911 2 0.0865 0.9175 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1699912 2 0.0703 0.9171 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699913 2 0.0703 0.9160 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699914 2 0.2408 0.8911 0.004 0.892 0.008 0.096 0.000
#> SRR1699915 2 0.1043 0.9182 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699916 2 0.0404 0.9155 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699917 2 0.1124 0.9187 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1699918 2 0.0404 0.9156 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699919 2 0.0955 0.9186 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR1699920 2 0.1764 0.9143 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR1699921 2 0.1270 0.9174 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1699922 2 0.0510 0.9153 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699923 2 0.2390 0.8949 0.000 0.896 0.020 0.084 0.000
#> SRR1699924 2 0.2701 0.8875 0.000 0.884 0.012 0.092 0.012
#> SRR1699925 1 0.2879 0.6728 0.868 0.000 0.000 0.032 0.100
#> SRR1699926 2 0.1282 0.9182 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1699927 2 0.0404 0.9150 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699929 2 0.0510 0.9187 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699928 2 0.0510 0.9154 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699930 2 0.0510 0.9156 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699931 2 0.1205 0.9193 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699933 2 0.1990 0.9127 0.000 0.920 0.008 0.068 0.004
#> SRR1699932 2 0.0510 0.9157 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699934 1 0.2879 0.6728 0.868 0.000 0.000 0.032 0.100
#> SRR1699935 2 0.1831 0.9131 0.000 0.920 0.004 0.076 0.000
#> SRR1699936 2 0.0404 0.9142 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699937 2 0.0771 0.9179 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1699938 2 0.0510 0.9156 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699940 2 0.2880 0.8826 0.004 0.888 0.028 0.068 0.012
#> SRR1699939 2 0.0510 0.9154 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699941 2 0.2580 0.8946 0.000 0.900 0.020 0.064 0.016
#> SRR1699942 2 0.2238 0.9073 0.004 0.912 0.020 0.064 0.000
#> SRR1699943 2 0.0404 0.9156 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699944 2 0.0955 0.9187 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1699945 3 0.7346 -0.2087 0.040 0.316 0.472 0.164 0.008
#> SRR1699946 2 0.1484 0.9174 0.000 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR1699947 2 0.0955 0.9186 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1699948 2 0.0510 0.9170 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699949 2 0.0404 0.9148 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699950 2 0.0404 0.9148 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699951 2 0.1768 0.9139 0.000 0.924 0.004 0.072 0.000
#> SRR1699952 2 0.1267 0.9191 0.000 0.960 0.012 0.024 0.004
#> SRR1699953 2 0.0609 0.9168 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699954 2 0.2880 0.8697 0.000 0.868 0.020 0.108 0.004
#> SRR1699955 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699956 3 0.5958 0.0450 0.004 0.196 0.664 0.104 0.032
#> SRR1699957 2 0.1153 0.9197 0.000 0.964 0.008 0.024 0.004
#> SRR1699959 2 0.2414 0.9000 0.000 0.900 0.012 0.080 0.008
#> SRR1699958 2 0.1569 0.9172 0.000 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR1699960 2 0.0510 0.9149 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699961 2 0.3498 0.8383 0.000 0.848 0.044 0.092 0.016
#> SRR1699962 2 0.0404 0.9147 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699963 2 0.2037 0.9112 0.000 0.920 0.012 0.064 0.004
#> SRR1699964 2 0.0955 0.9192 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR1699965 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699966 2 0.1990 0.9119 0.000 0.920 0.004 0.068 0.008
#> SRR1699967 2 0.1026 0.9194 0.000 0.968 0.004 0.024 0.004
#> SRR1699968 2 0.1124 0.9186 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1699969 2 0.4300 0.7008 0.000 0.772 0.132 0.096 0.000
#> SRR1699971 2 0.3519 0.8200 0.000 0.828 0.008 0.136 0.028
#> SRR1699970 2 0.0510 0.9154 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699972 2 0.2623 0.8807 0.000 0.884 0.016 0.096 0.004
#> SRR1699973 2 0.1792 0.9099 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1699974 2 0.4718 0.7097 0.020 0.772 0.040 0.152 0.016
#> SRR1699975 2 0.1197 0.9194 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1699976 2 0.2032 0.9113 0.000 0.924 0.020 0.052 0.004
#> SRR1699977 2 0.2052 0.9095 0.000 0.912 0.004 0.080 0.004
#> SRR1699978 2 0.6767 0.2584 0.084 0.632 0.032 0.196 0.056
#> SRR1699979 2 0.1894 0.9145 0.000 0.920 0.008 0.072 0.000
#> SRR1699980 2 0.1205 0.9186 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699981 2 0.3485 0.8118 0.000 0.828 0.048 0.124 0.000
#> SRR1699982 2 0.0703 0.9173 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699983 2 0.0880 0.9168 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699984 1 0.3289 0.6696 0.852 0.000 0.004 0.048 0.096
#> SRR1699985 2 0.0404 0.9153 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699986 2 0.3913 0.7933 0.004 0.820 0.044 0.120 0.012
#> SRR1699988 2 0.1041 0.9202 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1699987 2 0.3063 0.8648 0.000 0.864 0.036 0.096 0.004
#> SRR1699989 2 0.1205 0.9188 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1699990 2 0.1410 0.9170 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1699992 2 0.1492 0.9184 0.000 0.948 0.004 0.040 0.008
#> SRR1699991 2 0.3499 0.8307 0.008 0.836 0.024 0.128 0.004
#> SRR1699993 2 0.5566 0.5714 0.032 0.712 0.120 0.132 0.004
#> SRR1699994 2 0.4354 0.7314 0.004 0.788 0.048 0.144 0.016
#> SRR1699995 4 0.8013 0.2645 0.284 0.152 0.028 0.464 0.072
#> SRR1699996 2 0.1430 0.9183 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR1699997 2 0.1798 0.9109 0.000 0.928 0.004 0.064 0.004
#> SRR1699998 2 0.1571 0.9177 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1699999 2 0.8553 -0.6195 0.184 0.420 0.080 0.268 0.048
#> SRR1700000 2 0.2172 0.9063 0.000 0.916 0.020 0.060 0.004
#> SRR1700002 2 0.1251 0.9197 0.000 0.956 0.008 0.036 0.000
#> SRR1700001 2 0.4279 0.7467 0.004 0.792 0.064 0.132 0.008
#> SRR1700003 2 0.1121 0.9196 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700004 2 0.3721 0.8018 0.004 0.820 0.028 0.140 0.008
#> SRR1700005 1 0.3492 0.6733 0.848 0.004 0.004 0.064 0.080
#> SRR1700006 2 0.2881 0.8706 0.000 0.876 0.024 0.092 0.008
#> SRR1700007 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700008 2 0.4001 0.7577 0.004 0.804 0.040 0.144 0.008
#> SRR1700009 1 0.6542 0.4751 0.608 0.040 0.016 0.252 0.084
#> SRR1700010 3 0.4719 -0.0209 0.004 0.092 0.788 0.060 0.056
#> SRR1700011 2 0.0609 0.9161 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700013 2 0.2291 0.8995 0.000 0.908 0.012 0.072 0.008
#> SRR1700012 2 0.2709 0.8875 0.004 0.888 0.020 0.084 0.004
#> SRR1700014 2 0.1638 0.9177 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR1700015 2 0.2541 0.8957 0.000 0.900 0.020 0.068 0.012
#> SRR1700016 1 0.8163 -0.4246 0.440 0.216 0.008 0.220 0.116
#> SRR1700018 2 0.3792 0.8146 0.000 0.832 0.044 0.100 0.024
#> SRR1700017 2 0.5461 0.4470 0.000 0.680 0.008 0.140 0.172
#> SRR1700019 2 0.0404 0.9147 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700020 5 0.6500 0.0000 0.020 0.272 0.016 0.104 0.588
#> SRR1700021 2 0.0865 0.9197 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700023 2 0.2414 0.8992 0.000 0.900 0.008 0.080 0.012
#> SRR1700022 2 0.3869 0.7895 0.000 0.812 0.020 0.140 0.028
#> SRR1700024 2 0.1043 0.9190 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700025 2 0.1043 0.9200 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700026 2 0.1934 0.9124 0.000 0.928 0.016 0.052 0.004
#> SRR1700027 2 0.2804 0.8876 0.004 0.892 0.020 0.068 0.016
#> SRR1700028 2 0.2005 0.9121 0.000 0.924 0.016 0.056 0.004
#> SRR1700029 2 0.3387 0.8254 0.000 0.832 0.008 0.140 0.020
#> SRR1700030 2 0.1502 0.9181 0.000 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR1700031 2 0.6635 0.1039 0.016 0.596 0.048 0.264 0.076
#> SRR1700032 2 0.1124 0.9199 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1700034 4 0.8633 -0.1227 0.248 0.220 0.064 0.408 0.060
#> SRR1700035 2 0.1197 0.9191 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1700033 2 0.4038 0.8078 0.012 0.828 0.032 0.100 0.028
#> SRR1700036 2 0.1697 0.9152 0.000 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR1700037 2 0.0404 0.9154 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700038 2 0.2026 0.9058 0.000 0.924 0.008 0.056 0.012
#> SRR1700039 2 0.7527 -0.5241 0.016 0.464 0.152 0.324 0.044
#> SRR1700040 2 0.3582 0.8289 0.000 0.840 0.024 0.108 0.028
#> SRR1700041 2 0.3131 0.8652 0.000 0.860 0.028 0.104 0.008
#> SRR1700042 2 0.4156 0.7449 0.004 0.780 0.020 0.180 0.016
#> SRR1700043 2 0.4168 0.7664 0.004 0.804 0.056 0.124 0.012
#> SRR1700045 2 0.2588 0.8867 0.000 0.884 0.008 0.100 0.008
#> SRR1700044 2 0.1357 0.9190 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR1700046 2 0.1965 0.9020 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1700047 2 0.4447 0.7377 0.004 0.792 0.048 0.128 0.028
#> SRR1700048 2 0.1894 0.9145 0.000 0.920 0.008 0.072 0.000
#> SRR1700049 4 0.7602 -0.3901 0.056 0.240 0.072 0.552 0.080
#> SRR1700050 2 0.6998 -0.5705 0.024 0.456 0.044 0.412 0.064
#> SRR1700051 2 0.7358 -0.4161 0.068 0.484 0.040 0.356 0.052
#> SRR1700052 2 0.5692 0.5928 0.036 0.716 0.040 0.168 0.040
#> SRR1700053 2 0.1628 0.9178 0.000 0.936 0.008 0.056 0.000
#> SRR1700054 2 0.2452 0.8921 0.000 0.896 0.016 0.084 0.004
#> SRR1700055 4 0.6645 -0.4683 0.400 0.004 0.048 0.480 0.068
#> SRR1700056 2 0.3416 0.8304 0.000 0.840 0.020 0.124 0.016
#> SRR1700057 2 0.4751 0.6079 0.004 0.740 0.020 0.200 0.036
#> SRR1700058 2 0.4391 0.7338 0.008 0.780 0.048 0.156 0.008
#> SRR1700059 2 0.4247 0.7421 0.000 0.792 0.036 0.144 0.028
#> SRR1700060 2 0.3601 0.8145 0.000 0.824 0.032 0.136 0.008
#> SRR1700061 2 0.2552 0.8956 0.004 0.896 0.016 0.080 0.004
#> SRR1700062 2 0.4932 0.6424 0.008 0.748 0.024 0.172 0.048
#> SRR1700063 2 0.3445 0.8441 0.008 0.856 0.012 0.092 0.032
#> SRR1700064 2 0.2068 0.9050 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1700065 2 0.2970 0.8701 0.004 0.872 0.012 0.100 0.012
#> SRR1700066 2 0.4657 0.7060 0.012 0.768 0.060 0.152 0.008
#> SRR1700067 2 0.1430 0.9178 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700068 2 0.2942 0.8577 0.000 0.856 0.008 0.128 0.008
#> SRR1700069 2 0.1928 0.9116 0.000 0.920 0.004 0.072 0.004
#> SRR1700070 2 0.0404 0.9147 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700071 2 0.2844 0.8734 0.000 0.876 0.028 0.092 0.004
#> SRR1700072 2 0.2505 0.8835 0.000 0.888 0.020 0.092 0.000
#> SRR1700073 2 0.0703 0.9180 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700075 2 0.2630 0.8879 0.000 0.892 0.016 0.080 0.012
#> SRR1700074 2 0.2568 0.8903 0.000 0.900 0.012 0.064 0.024
#> SRR1700076 2 0.1043 0.9189 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700077 2 0.2871 0.8738 0.000 0.876 0.032 0.088 0.004
#> SRR1700078 2 0.2804 0.8861 0.004 0.880 0.012 0.096 0.008
#> SRR1700080 2 0.2358 0.8906 0.000 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR1700079 2 0.4479 0.6396 0.000 0.748 0.012 0.200 0.040
#> SRR1700081 2 0.4637 0.7396 0.016 0.772 0.044 0.156 0.012
#> SRR1700082 2 0.6045 0.3423 0.000 0.644 0.140 0.188 0.028
#> SRR1700083 2 0.6019 0.4355 0.028 0.664 0.056 0.224 0.028
#> SRR1700084 2 0.5488 0.5991 0.024 0.724 0.044 0.172 0.036
#> SRR1700085 2 0.0794 0.9200 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700086 2 0.2513 0.9020 0.004 0.900 0.012 0.076 0.008
#> SRR1700087 2 0.3450 0.8343 0.000 0.848 0.044 0.096 0.012
#> SRR1700088 2 0.1857 0.9123 0.000 0.928 0.008 0.060 0.004
#> SRR1700089 2 0.2339 0.9015 0.000 0.892 0.004 0.100 0.004
#> SRR1700091 2 0.2295 0.9031 0.000 0.900 0.004 0.088 0.008
#> SRR1700090 2 0.2115 0.9105 0.000 0.916 0.008 0.068 0.008
#> SRR1700092 2 0.1928 0.9082 0.000 0.920 0.004 0.072 0.004
#> SRR1700094 2 0.2141 0.9046 0.000 0.916 0.016 0.064 0.004
#> SRR1700093 2 0.1864 0.9112 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR1700095 2 0.3400 0.8159 0.000 0.840 0.040 0.116 0.004
#> SRR1700096 2 0.2429 0.8954 0.000 0.900 0.020 0.076 0.004
#> SRR1700097 2 0.4706 0.6938 0.028 0.764 0.060 0.148 0.000
#> SRR1700098 2 0.1569 0.9172 0.000 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR1700099 2 0.1704 0.9128 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700100 2 0.1644 0.9165 0.000 0.940 0.008 0.048 0.004
#> SRR1700101 2 0.1717 0.9165 0.000 0.936 0.008 0.052 0.004
#> SRR1700102 2 0.2054 0.9091 0.000 0.916 0.008 0.072 0.004
#> SRR1700104 2 0.1569 0.9165 0.000 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR1700103 2 0.2608 0.8804 0.000 0.888 0.020 0.088 0.004
#> SRR1700105 2 0.2295 0.9026 0.000 0.900 0.008 0.088 0.004
#> SRR1700106 2 0.2681 0.8685 0.000 0.876 0.012 0.108 0.004
#> SRR1700107 2 0.1638 0.9135 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1700108 2 0.1121 0.9191 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700109 2 0.0404 0.9153 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700110 2 0.0404 0.9146 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700112 2 0.0404 0.9150 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700111 2 0.2802 0.8815 0.000 0.876 0.008 0.100 0.016
#> SRR1700113 2 0.1638 0.9125 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1700114 2 0.1901 0.9141 0.000 0.928 0.012 0.056 0.004
#> SRR1700115 2 0.1430 0.9168 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700116 2 0.2295 0.9035 0.000 0.900 0.008 0.088 0.004
#> SRR1700117 2 0.5661 0.4822 0.016 0.684 0.064 0.216 0.020
#> SRR1700119 2 0.1892 0.9094 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1700118 2 0.1798 0.9151 0.000 0.928 0.004 0.064 0.004
#> SRR1700120 2 0.3170 0.8514 0.000 0.852 0.016 0.120 0.012
#> SRR1700121 2 0.1831 0.9114 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1700122 2 0.0290 0.9150 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700123 2 0.2952 0.8660 0.000 0.868 0.020 0.104 0.008
#> SRR1700125 2 0.0404 0.9153 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700126 2 0.3665 0.8188 0.004 0.836 0.036 0.112 0.012
#> SRR1700127 2 0.2305 0.8945 0.000 0.896 0.012 0.092 0.000
#> SRR1700124 2 0.2408 0.8917 0.000 0.892 0.008 0.096 0.004
#> SRR1700128 2 0.2783 0.8725 0.000 0.868 0.012 0.116 0.004
#> SRR1700129 2 0.0703 0.9172 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700130 2 0.2077 0.9049 0.000 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1700132 2 0.1928 0.9063 0.000 0.920 0.004 0.072 0.004
#> SRR1700131 2 0.2707 0.8796 0.000 0.876 0.024 0.100 0.000
#> SRR1700133 2 0.1809 0.9152 0.000 0.928 0.012 0.060 0.000
#> SRR1700134 2 0.0609 0.9159 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700135 2 0.2116 0.8998 0.000 0.912 0.008 0.076 0.004
#> SRR1700136 2 0.3355 0.8455 0.004 0.848 0.024 0.116 0.008
#> SRR1700137 2 0.2295 0.9006 0.000 0.900 0.008 0.088 0.004
#> SRR1700138 2 0.2069 0.9055 0.000 0.912 0.012 0.076 0.000
#> SRR1700140 2 0.2228 0.9007 0.000 0.900 0.004 0.092 0.004
#> SRR1700139 2 0.2179 0.8959 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1700141 2 0.0609 0.9166 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700142 2 0.3114 0.8316 0.004 0.844 0.004 0.140 0.008
#> SRR1700143 2 0.3201 0.8404 0.000 0.844 0.016 0.132 0.008
#> SRR1700144 2 0.2645 0.8815 0.000 0.884 0.012 0.096 0.008
#> SRR1700145 2 0.2908 0.8733 0.000 0.868 0.016 0.108 0.008
#> SRR1700146 2 0.0510 0.9161 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700147 2 0.2645 0.8831 0.000 0.884 0.012 0.096 0.008
#> SRR1700149 2 0.4799 0.6713 0.012 0.756 0.064 0.160 0.008
#> SRR1700148 2 0.2011 0.9050 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1700150 2 0.1282 0.9191 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1700152 2 0.2102 0.9076 0.000 0.916 0.004 0.068 0.012
#> SRR1700151 2 0.2908 0.8739 0.000 0.868 0.016 0.108 0.008
#> SRR1700153 2 0.2982 0.8615 0.000 0.860 0.020 0.116 0.004
#> SRR1700154 2 0.2017 0.9050 0.000 0.912 0.008 0.080 0.000
#> SRR1700155 2 0.1704 0.9112 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700156 2 0.2408 0.8900 0.000 0.892 0.008 0.096 0.004
#> SRR1700158 2 0.4640 0.7415 0.036 0.788 0.032 0.128 0.016
#> SRR1700159 2 0.0609 0.9160 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700157 2 0.2857 0.8760 0.000 0.868 0.012 0.112 0.008
#> SRR1700160 2 0.2304 0.8938 0.000 0.892 0.008 0.100 0.000
#> SRR1700161 2 0.2392 0.8909 0.000 0.888 0.004 0.104 0.004
#> SRR1700162 2 0.0609 0.9168 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700164 2 0.2731 0.8721 0.000 0.876 0.016 0.104 0.004
#> SRR1700163 2 0.3481 0.8265 0.004 0.840 0.036 0.116 0.004
#> SRR1700165 2 0.2642 0.8851 0.000 0.888 0.024 0.084 0.004
#> SRR1700166 2 0.1704 0.9115 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700168 2 0.0703 0.9173 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700167 2 0.2857 0.8653 0.000 0.868 0.008 0.112 0.012
#> SRR1700170 2 0.1768 0.9096 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1700169 2 0.2050 0.9098 0.000 0.920 0.008 0.064 0.008
#> SRR1700171 2 0.4769 0.6895 0.008 0.768 0.060 0.144 0.020
#> SRR1700172 2 0.1864 0.9094 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR1700174 2 0.1557 0.9178 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1700173 2 0.1894 0.9118 0.000 0.920 0.008 0.072 0.000
#> SRR1700175 2 0.1502 0.9160 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1700176 2 0.3842 0.8011 0.004 0.820 0.028 0.132 0.016
#> SRR1700178 2 0.0771 0.9170 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700177 2 0.1704 0.9129 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1700180 2 0.0510 0.9149 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700179 2 0.0671 0.9165 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700181 2 0.0404 0.9142 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700183 1 0.2426 0.6818 0.900 0.000 0.000 0.036 0.064
#> SRR1700182 2 0.0510 0.9149 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700184 2 0.0703 0.9166 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700186 2 0.0451 0.9167 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700187 1 0.7022 0.4699 0.640 0.068 0.060 0.088 0.144
#> SRR1700185 1 0.3283 0.6690 0.868 0.012 0.020 0.016 0.084
#> SRR1700188 2 0.0566 0.9169 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700192 2 0.8172 -0.3107 0.056 0.520 0.148 0.184 0.092
#> SRR1700190 3 0.4598 -0.0802 0.044 0.064 0.812 0.040 0.040
#> SRR1700191 1 0.2295 0.6834 0.900 0.000 0.008 0.004 0.088
#> SRR1700189 2 0.8292 -0.4127 0.240 0.488 0.112 0.104 0.056
#> SRR1700193 2 0.0609 0.9173 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700195 2 0.0609 0.9170 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700194 1 0.1428 0.6870 0.956 0.004 0.012 0.004 0.024
#> SRR1700196 2 0.0404 0.9144 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700197 3 0.8853 -0.1695 0.132 0.300 0.380 0.132 0.056
#> SRR1700198 2 0.0404 0.9142 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700199 2 0.0609 0.9172 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700200 2 0.0510 0.9149 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700201 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700202 2 0.0963 0.9198 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700203 2 0.0162 0.9136 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700204 2 0.0671 0.9170 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700206 2 0.0771 0.9200 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700207 2 0.0404 0.9151 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700208 3 0.6712 -0.0633 0.036 0.296 0.576 0.052 0.040
#> SRR1700205 2 0.0510 0.9171 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700209 2 0.0404 0.9156 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700210 2 0.0404 0.9151 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700211 2 0.0703 0.9198 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700212 2 0.0771 0.9188 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700213 2 0.1082 0.9198 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1700214 2 0.0510 0.9163 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700215 1 0.1582 0.6867 0.944 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR1700217 2 0.0703 0.9164 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700216 1 0.2879 0.6728 0.868 0.000 0.000 0.032 0.100
#> SRR1700218 2 0.0290 0.9137 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700219 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700222 1 0.6982 0.4081 0.644 0.084 0.044 0.108 0.120
#> SRR1700220 2 0.0162 0.9140 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700221 2 0.0404 0.9149 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700223 2 0.0404 0.9144 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700224 2 0.0609 0.9180 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700226 2 0.0404 0.9148 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700229 2 0.0794 0.9194 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700225 2 0.1522 0.9176 0.000 0.944 0.012 0.044 0.000
#> SRR1700227 2 0.0404 0.9144 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700230 2 0.8291 -0.5131 0.148 0.460 0.256 0.104 0.032
#> SRR1700231 2 0.0898 0.9196 0.000 0.972 0.008 0.020 0.000
#> SRR1700228 2 0.0703 0.9170 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700232 2 0.0510 0.9163 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700233 2 0.0510 0.9172 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700234 2 0.0290 0.9152 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700235 2 0.0865 0.9186 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700237 2 0.0794 0.9176 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700236 2 0.0510 0.9159 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700238 2 0.0162 0.9136 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700239 1 0.8190 0.1734 0.540 0.116 0.080 0.120 0.144
#> SRR1700240 1 0.3534 0.6561 0.856 0.024 0.016 0.016 0.088
#> SRR1700241 2 0.1408 0.9182 0.000 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR1700243 2 0.0510 0.9166 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700244 2 0.0833 0.9195 0.000 0.976 0.004 0.016 0.004
#> SRR1700242 2 0.7727 -0.1097 0.168 0.568 0.116 0.104 0.044
#> SRR1700246 2 0.0510 0.9161 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700245 2 0.0609 0.9163 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700247 1 0.8579 -0.2521 0.468 0.184 0.052 0.176 0.120
#> SRR1700249 1 0.1758 0.6887 0.944 0.004 0.008 0.020 0.024
#> SRR1700250 2 0.0566 0.9167 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700248 2 0.0510 0.9179 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700251 2 0.0703 0.9173 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700252 2 0.1569 0.9164 0.000 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR1700253 2 0.0404 0.9148 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700256 2 0.0162 0.9136 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700254 1 0.6784 0.4763 0.660 0.068 0.048 0.100 0.124
#> SRR1700255 2 0.0404 0.9142 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700257 2 0.0404 0.9144 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700258 2 0.0290 0.9137 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700259 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700260 2 0.0290 0.9143 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700261 2 0.0404 0.9146 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700262 2 0.0404 0.9153 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700263 2 0.0290 0.9156 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700264 2 0.0833 0.9185 0.000 0.976 0.004 0.016 0.004
#> SRR1700265 2 0.1638 0.9124 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR1700266 2 0.0162 0.9139 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700268 2 0.2411 0.8957 0.004 0.912 0.024 0.052 0.008
#> SRR1700270 2 0.0162 0.9139 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700267 2 0.0404 0.9142 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700271 2 0.0290 0.9142 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700272 2 0.0162 0.9140 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700273 2 0.0404 0.9166 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700274 2 0.0510 0.9158 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700277 3 0.6563 -0.1217 0.020 0.328 0.556 0.064 0.032
#> SRR1700275 2 0.0566 0.9177 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700276 2 0.0794 0.9179 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700278 2 0.0451 0.9163 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700279 2 0.0703 0.9179 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700280 2 0.0865 0.9180 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700281 2 0.0404 0.9149 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700283 2 0.0609 0.9174 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700282 2 0.1502 0.9178 0.004 0.940 0.000 0.056 0.000
#> SRR1700284 2 0.0865 0.9185 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700285 2 0.0404 0.9164 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700286 2 0.0794 0.9183 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700287 2 0.0566 0.9165 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700290 2 0.7529 -0.1467 0.076 0.552 0.132 0.216 0.024
#> SRR1700289 2 0.0703 0.9166 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700288 2 0.0794 0.9193 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700292 2 0.0794 0.9167 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700291 2 0.1502 0.9169 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1700293 2 0.0609 0.9174 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700294 2 0.0510 0.9155 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700295 2 0.4357 0.6788 0.000 0.768 0.104 0.128 0.000
#> SRR1700297 2 0.0404 0.9155 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700296 2 0.0510 0.9151 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700298 2 0.0992 0.9188 0.000 0.968 0.008 0.024 0.000
#> SRR1700299 2 0.1121 0.9180 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700300 2 0.2144 0.8993 0.000 0.912 0.020 0.068 0.000
#> SRR1700302 2 0.0865 0.9171 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700301 2 0.0703 0.9169 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700303 2 0.0609 0.9167 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700304 2 0.1124 0.9195 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1700305 2 0.0404 0.9160 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700306 2 0.2517 0.8818 0.000 0.884 0.004 0.104 0.008
#> SRR1700308 2 0.0865 0.9190 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700307 2 0.1591 0.9184 0.000 0.940 0.004 0.052 0.004
#> SRR1700309 2 0.4156 0.7649 0.000 0.800 0.068 0.120 0.012
#> SRR1700310 2 0.0510 0.9159 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700311 2 0.1410 0.9179 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1700312 2 0.0865 0.9185 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1700313 2 0.1168 0.9202 0.000 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1700314 2 0.1410 0.9165 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1700315 2 0.1205 0.9191 0.000 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1700316 2 0.1121 0.9193 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700317 2 0.0510 0.9159 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700318 2 0.1731 0.9152 0.000 0.932 0.004 0.060 0.004
#> SRR1700319 2 0.2068 0.9022 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1700320 2 0.0510 0.9160 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700322 2 0.1106 0.9198 0.000 0.964 0.012 0.024 0.000
#> SRR1700321 2 0.0671 0.9187 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700323 2 0.1041 0.9192 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700324 2 0.0510 0.9159 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700325 2 0.0404 0.9149 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700326 2 0.2792 0.8824 0.000 0.884 0.016 0.084 0.016
#> SRR1700327 2 0.0510 0.9167 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700329 2 0.0703 0.9177 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700328 2 0.2206 0.9027 0.000 0.912 0.016 0.068 0.004
#> SRR1700330 2 0.0794 0.9198 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700331 2 0.1043 0.9184 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700332 2 0.0771 0.9172 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700333 2 0.0703 0.9188 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.0603 0.9129 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699875 2 0.1007 0.9158 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699876 2 0.0458 0.9104 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699877 2 0.0692 0.9137 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1699879 2 0.0458 0.9120 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699878 2 0.0632 0.9139 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699880 2 0.4805 0.6839 0.004 0.720 0.036 0.032 0.012 0.196
#> SRR1699881 2 0.1411 0.9139 0.000 0.936 0.004 0.000 0.000 0.060
#> SRR1699882 2 0.0458 0.9110 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699883 2 0.0547 0.9134 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699884 2 0.0865 0.9152 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699885 2 0.0458 0.9100 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699886 2 0.0363 0.9109 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699888 2 0.0547 0.9119 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699889 2 0.0458 0.9109 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699890 2 0.0458 0.9110 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699887 2 0.0603 0.9131 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699891 2 0.0547 0.9114 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699892 2 0.0458 0.9141 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699893 2 0.2265 0.9043 0.000 0.896 0.004 0.008 0.008 0.084
#> SRR1699894 2 0.0632 0.9123 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699895 2 0.0790 0.9131 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699896 2 0.1364 0.9147 0.000 0.944 0.004 0.004 0.000 0.048
#> SRR1699897 2 0.0632 0.9132 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699898 2 0.4481 0.7143 0.012 0.744 0.020 0.048 0.000 0.176
#> SRR1699900 2 0.1897 0.9045 0.000 0.908 0.004 0.004 0.000 0.084
#> SRR1699899 2 0.1082 0.9143 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1699902 2 0.3325 0.8345 0.000 0.816 0.008 0.008 0.016 0.152
#> SRR1699901 2 0.4056 0.7790 0.004 0.776 0.008 0.036 0.012 0.164
#> SRR1699903 2 0.1285 0.9149 0.000 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699904 2 0.0458 0.9116 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699905 2 0.4246 0.7953 0.020 0.784 0.008 0.040 0.012 0.136
#> SRR1699906 2 0.0458 0.9108 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699907 2 0.1152 0.9147 0.000 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699908 2 0.1082 0.9142 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1699909 2 0.0632 0.9114 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699910 2 0.1327 0.9142 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1699911 2 0.0935 0.9141 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1699912 2 0.0632 0.9127 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699913 2 0.0632 0.9114 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699914 2 0.2519 0.8810 0.004 0.864 0.004 0.004 0.000 0.124
#> SRR1699915 2 0.1141 0.9139 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699916 2 0.0363 0.9106 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699917 2 0.1152 0.9149 0.000 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699918 2 0.0363 0.9108 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699919 2 0.1082 0.9146 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1699920 2 0.1644 0.9121 0.000 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR1699921 2 0.1387 0.9132 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1699922 2 0.0547 0.9113 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699923 2 0.2520 0.8871 0.000 0.872 0.012 0.008 0.000 0.108
#> SRR1699924 2 0.2815 0.8693 0.000 0.848 0.004 0.012 0.004 0.132
#> SRR1699925 1 0.1293 0.6171 0.956 0.000 0.004 0.020 0.016 0.004
#> SRR1699926 2 0.1349 0.9147 0.000 0.940 0.004 0.000 0.000 0.056
#> SRR1699927 2 0.0458 0.9107 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699929 2 0.0458 0.9141 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699928 2 0.0632 0.9117 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699930 2 0.0458 0.9109 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699931 2 0.1219 0.9158 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699933 2 0.2222 0.9057 0.000 0.896 0.000 0.008 0.012 0.084
#> SRR1699932 2 0.0632 0.9118 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699934 1 0.1293 0.6171 0.956 0.000 0.004 0.020 0.016 0.004
#> SRR1699935 2 0.1987 0.9094 0.000 0.908 0.004 0.004 0.004 0.080
#> SRR1699936 2 0.0458 0.9102 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699937 2 0.0858 0.9148 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1699938 2 0.0547 0.9113 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699940 2 0.2753 0.8824 0.004 0.876 0.016 0.012 0.004 0.088
#> SRR1699939 2 0.0458 0.9106 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699941 2 0.2722 0.8854 0.000 0.876 0.016 0.012 0.008 0.088
#> SRR1699942 2 0.2482 0.9014 0.000 0.892 0.012 0.020 0.004 0.072
#> SRR1699943 2 0.0458 0.9114 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699944 2 0.1082 0.9152 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1699945 3 0.7735 0.2240 0.024 0.228 0.444 0.120 0.008 0.176
#> SRR1699946 2 0.1204 0.9151 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1699947 2 0.0858 0.9146 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1699948 2 0.0632 0.9134 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699949 2 0.0458 0.9108 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699950 2 0.0363 0.9100 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699951 2 0.1949 0.9077 0.000 0.904 0.004 0.000 0.004 0.088
#> SRR1699952 2 0.1268 0.9151 0.000 0.952 0.000 0.004 0.008 0.036
#> SRR1699953 2 0.0547 0.9121 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699954 2 0.3047 0.8547 0.000 0.832 0.008 0.012 0.004 0.144
#> SRR1699955 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699956 3 0.6054 -0.0838 0.004 0.144 0.652 0.048 0.028 0.124
#> SRR1699957 2 0.1268 0.9164 0.000 0.952 0.004 0.000 0.008 0.036
#> SRR1699959 2 0.2325 0.8969 0.000 0.884 0.008 0.008 0.000 0.100
#> SRR1699958 2 0.1615 0.9122 0.000 0.928 0.004 0.004 0.000 0.064
#> SRR1699960 2 0.0458 0.9101 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699961 2 0.3666 0.8273 0.000 0.816 0.024 0.024 0.012 0.124
#> SRR1699962 2 0.0363 0.9099 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699963 2 0.2009 0.9058 0.000 0.904 0.008 0.000 0.004 0.084
#> SRR1699964 2 0.1082 0.9156 0.000 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1699965 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699966 2 0.2205 0.9039 0.000 0.896 0.004 0.004 0.008 0.088
#> SRR1699967 2 0.1155 0.9161 0.000 0.956 0.004 0.000 0.004 0.036
#> SRR1699968 2 0.1219 0.9153 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699969 2 0.4644 0.6857 0.000 0.736 0.096 0.032 0.000 0.136
#> SRR1699971 2 0.3492 0.8091 0.000 0.796 0.004 0.016 0.012 0.172
#> SRR1699970 2 0.0632 0.9122 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699972 2 0.2841 0.8751 0.000 0.860 0.008 0.020 0.004 0.108
#> SRR1699973 2 0.1858 0.9073 0.000 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR1699974 2 0.4582 0.6626 0.020 0.720 0.028 0.012 0.004 0.216
#> SRR1699975 2 0.1349 0.9153 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1699976 2 0.1957 0.9073 0.000 0.912 0.008 0.008 0.000 0.072
#> SRR1699977 2 0.2292 0.9005 0.000 0.884 0.004 0.004 0.004 0.104
#> SRR1699978 2 0.6728 0.1026 0.060 0.552 0.000 0.168 0.024 0.196
#> SRR1699979 2 0.2001 0.9090 0.000 0.900 0.000 0.004 0.004 0.092
#> SRR1699980 2 0.1219 0.9147 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699981 2 0.3771 0.7909 0.000 0.788 0.044 0.004 0.008 0.156
#> SRR1699982 2 0.0790 0.9131 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699983 2 0.1152 0.9138 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1699984 1 0.1647 0.6137 0.940 0.000 0.004 0.032 0.016 0.008
#> SRR1699985 2 0.0363 0.9105 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699986 2 0.4213 0.7794 0.004 0.788 0.028 0.040 0.012 0.128
#> SRR1699988 2 0.1219 0.9163 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699987 2 0.3056 0.8510 0.000 0.832 0.016 0.012 0.000 0.140
#> SRR1699989 2 0.1219 0.9156 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699990 2 0.1471 0.9139 0.000 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1699992 2 0.1643 0.9117 0.000 0.924 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR1699991 2 0.3429 0.8269 0.004 0.808 0.008 0.004 0.016 0.160
#> SRR1699993 2 0.5844 0.5360 0.028 0.664 0.076 0.068 0.000 0.164
#> SRR1699994 2 0.4363 0.7216 0.004 0.752 0.020 0.016 0.024 0.184
#> SRR1699995 6 0.8221 -0.3065 0.252 0.096 0.012 0.240 0.044 0.356
#> SRR1699996 2 0.1555 0.9139 0.000 0.932 0.000 0.004 0.004 0.060
#> SRR1699997 2 0.1949 0.9038 0.000 0.904 0.000 0.004 0.004 0.088
#> SRR1699998 2 0.1444 0.9146 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1699999 2 0.8281 -0.6393 0.132 0.336 0.032 0.264 0.012 0.224
#> SRR1700000 2 0.2451 0.8973 0.000 0.892 0.012 0.004 0.016 0.076
#> SRR1700002 2 0.1152 0.9163 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1700001 2 0.4195 0.7556 0.004 0.772 0.036 0.020 0.008 0.160
#> SRR1700003 2 0.1204 0.9152 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700004 2 0.3510 0.8121 0.004 0.808 0.008 0.012 0.012 0.156
#> SRR1700005 1 0.3507 0.5755 0.764 0.000 0.000 0.216 0.008 0.012
#> SRR1700006 2 0.3075 0.8548 0.000 0.840 0.012 0.004 0.016 0.128
#> SRR1700007 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700008 2 0.4090 0.7478 0.004 0.772 0.012 0.036 0.008 0.168
#> SRR1700009 1 0.6776 0.2900 0.572 0.012 0.020 0.160 0.056 0.180
#> SRR1700010 3 0.4450 -0.3082 0.000 0.040 0.792 0.052 0.056 0.060
#> SRR1700011 2 0.0547 0.9114 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700013 2 0.2110 0.9004 0.000 0.900 0.004 0.012 0.000 0.084
#> SRR1700012 2 0.2785 0.8740 0.004 0.860 0.004 0.004 0.012 0.116
#> SRR1700014 2 0.1588 0.9144 0.000 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1700015 2 0.2317 0.8959 0.000 0.892 0.008 0.008 0.004 0.088
#> SRR1700016 1 0.8282 -0.4614 0.368 0.124 0.004 0.280 0.076 0.148
#> SRR1700018 2 0.4303 0.7605 0.000 0.768 0.028 0.012 0.040 0.152
#> SRR1700017 2 0.5644 0.3867 0.000 0.616 0.000 0.028 0.196 0.160
#> SRR1700019 2 0.0363 0.9099 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700020 5 0.4186 0.0000 0.016 0.096 0.004 0.024 0.800 0.060
#> SRR1700021 2 0.1010 0.9158 0.000 0.960 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700023 2 0.2579 0.8929 0.000 0.876 0.008 0.008 0.008 0.100
#> SRR1700022 2 0.3920 0.7697 0.000 0.772 0.008 0.036 0.008 0.176
#> SRR1700024 2 0.1075 0.9150 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700025 2 0.1606 0.9140 0.000 0.932 0.000 0.004 0.008 0.056
#> SRR1700026 2 0.1769 0.9109 0.000 0.924 0.012 0.004 0.000 0.060
#> SRR1700027 2 0.2871 0.8774 0.000 0.864 0.012 0.016 0.008 0.100
#> SRR1700028 2 0.2145 0.9064 0.000 0.904 0.012 0.004 0.004 0.076
#> SRR1700029 2 0.3387 0.8183 0.000 0.808 0.004 0.016 0.012 0.160
#> SRR1700030 2 0.1444 0.9142 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1700031 2 0.7055 -0.1413 0.004 0.496 0.024 0.112 0.080 0.284
#> SRR1700032 2 0.1080 0.9164 0.000 0.960 0.000 0.004 0.004 0.032
#> SRR1700034 6 0.8605 -0.2464 0.212 0.124 0.028 0.236 0.048 0.352
#> SRR1700035 2 0.1075 0.9158 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700033 2 0.4404 0.7669 0.008 0.772 0.020 0.028 0.024 0.148
#> SRR1700036 2 0.1556 0.9116 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700037 2 0.0458 0.9112 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700038 2 0.2350 0.8961 0.000 0.896 0.004 0.016 0.008 0.076
#> SRR1700039 2 0.8037 -0.6106 0.008 0.364 0.120 0.180 0.032 0.296
#> SRR1700040 2 0.3484 0.8296 0.000 0.820 0.008 0.024 0.016 0.132
#> SRR1700041 2 0.3302 0.8445 0.000 0.824 0.028 0.004 0.008 0.136
#> SRR1700042 2 0.4084 0.7150 0.000 0.736 0.016 0.016 0.008 0.224
#> SRR1700043 2 0.4410 0.7358 0.004 0.760 0.032 0.044 0.004 0.156
#> SRR1700045 2 0.2488 0.8830 0.000 0.864 0.004 0.008 0.000 0.124
#> SRR1700044 2 0.1327 0.9149 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1700046 2 0.2261 0.8958 0.000 0.884 0.000 0.008 0.004 0.104
#> SRR1700047 2 0.4800 0.6960 0.000 0.736 0.036 0.024 0.040 0.164
#> SRR1700048 2 0.2093 0.9099 0.000 0.900 0.004 0.004 0.004 0.088
#> SRR1700049 6 0.7774 -0.1384 0.052 0.164 0.048 0.188 0.044 0.504
#> SRR1700050 6 0.7245 -0.0858 0.020 0.380 0.020 0.120 0.052 0.408
#> SRR1700051 2 0.7998 -0.5557 0.056 0.376 0.032 0.156 0.044 0.336
#> SRR1700052 2 0.5676 0.5864 0.028 0.680 0.020 0.072 0.020 0.180
#> SRR1700053 2 0.1753 0.9111 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR1700054 2 0.2588 0.8704 0.000 0.860 0.004 0.000 0.012 0.124
#> SRR1700055 1 0.7126 0.1629 0.376 0.000 0.024 0.188 0.044 0.368
#> SRR1700056 2 0.3344 0.8140 0.000 0.808 0.004 0.024 0.004 0.160
#> SRR1700057 2 0.5066 0.5245 0.004 0.672 0.004 0.052 0.028 0.240
#> SRR1700058 2 0.4264 0.7159 0.008 0.740 0.020 0.028 0.000 0.204
#> SRR1700059 2 0.4400 0.7134 0.000 0.744 0.008 0.040 0.024 0.184
#> SRR1700060 2 0.3707 0.8001 0.000 0.792 0.016 0.020 0.008 0.164
#> SRR1700061 2 0.2548 0.8890 0.000 0.876 0.004 0.016 0.004 0.100
#> SRR1700062 2 0.5296 0.5597 0.008 0.680 0.016 0.024 0.056 0.216
#> SRR1700063 2 0.3376 0.8391 0.004 0.832 0.004 0.012 0.028 0.120
#> SRR1700064 2 0.2261 0.8979 0.000 0.884 0.000 0.008 0.004 0.104
#> SRR1700065 2 0.3193 0.8528 0.000 0.836 0.012 0.012 0.012 0.128
#> SRR1700066 2 0.4648 0.6998 0.008 0.732 0.028 0.032 0.008 0.192
#> SRR1700067 2 0.1728 0.9124 0.000 0.924 0.004 0.000 0.008 0.064
#> SRR1700068 2 0.2994 0.8351 0.000 0.820 0.008 0.008 0.000 0.164
#> SRR1700069 2 0.1949 0.9081 0.000 0.904 0.004 0.000 0.004 0.088
#> SRR1700070 2 0.0363 0.9099 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700071 2 0.2785 0.8675 0.000 0.852 0.008 0.008 0.004 0.128
#> SRR1700072 2 0.2884 0.8594 0.000 0.848 0.008 0.004 0.012 0.128
#> SRR1700073 2 0.0713 0.9135 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700075 2 0.2615 0.8829 0.000 0.872 0.004 0.012 0.008 0.104
#> SRR1700074 2 0.2760 0.8735 0.000 0.868 0.004 0.016 0.012 0.100
#> SRR1700076 2 0.1075 0.9158 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700077 2 0.2896 0.8633 0.000 0.848 0.008 0.008 0.008 0.128
#> SRR1700078 2 0.2611 0.8832 0.000 0.864 0.012 0.008 0.000 0.116
#> SRR1700080 2 0.2685 0.8726 0.000 0.852 0.008 0.008 0.000 0.132
#> SRR1700079 2 0.4962 0.5512 0.000 0.676 0.008 0.052 0.024 0.240
#> SRR1700081 2 0.4522 0.7177 0.012 0.732 0.016 0.048 0.000 0.192
#> SRR1700082 2 0.6435 0.3575 0.000 0.596 0.104 0.052 0.040 0.208
#> SRR1700083 2 0.6451 0.3025 0.016 0.584 0.032 0.092 0.028 0.248
#> SRR1700084 2 0.5785 0.5475 0.024 0.668 0.024 0.040 0.044 0.200
#> SRR1700085 2 0.0790 0.9159 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700086 2 0.2518 0.8960 0.000 0.880 0.012 0.008 0.004 0.096
#> SRR1700087 2 0.3559 0.8241 0.000 0.820 0.036 0.032 0.000 0.112
#> SRR1700088 2 0.1806 0.9070 0.000 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700089 2 0.2292 0.9031 0.000 0.884 0.004 0.004 0.004 0.104
#> SRR1700091 2 0.2243 0.8973 0.000 0.880 0.000 0.004 0.004 0.112
#> SRR1700090 2 0.2101 0.9032 0.000 0.892 0.004 0.004 0.000 0.100
#> SRR1700092 2 0.1806 0.9054 0.000 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700094 2 0.1957 0.9052 0.000 0.912 0.008 0.008 0.000 0.072
#> SRR1700093 2 0.1700 0.9085 0.000 0.916 0.004 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700095 2 0.3770 0.7917 0.000 0.800 0.032 0.024 0.004 0.140
#> SRR1700096 2 0.2515 0.8899 0.000 0.876 0.008 0.008 0.004 0.104
#> SRR1700097 2 0.4712 0.6988 0.016 0.732 0.020 0.060 0.000 0.172
#> SRR1700098 2 0.1555 0.9128 0.000 0.932 0.004 0.004 0.000 0.060
#> SRR1700099 2 0.1700 0.9092 0.000 0.916 0.004 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700100 2 0.1701 0.9111 0.000 0.920 0.008 0.000 0.000 0.072
#> SRR1700101 2 0.1732 0.9114 0.000 0.920 0.004 0.004 0.000 0.072
#> SRR1700102 2 0.1866 0.9075 0.000 0.908 0.008 0.000 0.000 0.084
#> SRR1700104 2 0.1668 0.9116 0.000 0.928 0.008 0.000 0.004 0.060
#> SRR1700103 2 0.2803 0.8775 0.000 0.868 0.016 0.016 0.004 0.096
#> SRR1700105 2 0.2020 0.9042 0.000 0.896 0.008 0.000 0.000 0.096
#> SRR1700106 2 0.2654 0.8737 0.000 0.864 0.008 0.008 0.004 0.116
#> SRR1700107 2 0.1556 0.9099 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700108 2 0.1075 0.9152 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700109 2 0.0458 0.9110 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700110 2 0.0363 0.9098 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700112 2 0.0363 0.9103 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700111 2 0.2784 0.8707 0.000 0.848 0.000 0.008 0.012 0.132
#> SRR1700113 2 0.1556 0.9092 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700114 2 0.1788 0.9104 0.000 0.916 0.004 0.004 0.000 0.076
#> SRR1700115 2 0.1327 0.9129 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1700116 2 0.2355 0.8967 0.000 0.876 0.000 0.008 0.004 0.112
#> SRR1700117 2 0.5818 0.4572 0.012 0.640 0.028 0.092 0.012 0.216
#> SRR1700119 2 0.2062 0.9053 0.000 0.900 0.000 0.004 0.008 0.088
#> SRR1700118 2 0.1918 0.9085 0.000 0.904 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR1700120 2 0.3234 0.8374 0.000 0.820 0.008 0.008 0.012 0.152
#> SRR1700121 2 0.1908 0.9062 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1700122 2 0.0458 0.9125 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700123 2 0.3056 0.8636 0.000 0.848 0.012 0.016 0.008 0.116
#> SRR1700125 2 0.0363 0.9106 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700126 2 0.3610 0.8044 0.004 0.800 0.020 0.020 0.000 0.156
#> SRR1700127 2 0.2543 0.8845 0.000 0.868 0.004 0.008 0.004 0.116
#> SRR1700124 2 0.2377 0.8839 0.000 0.868 0.004 0.004 0.000 0.124
#> SRR1700128 2 0.2730 0.8742 0.000 0.856 0.004 0.012 0.004 0.124
#> SRR1700129 2 0.0790 0.9129 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700130 2 0.1910 0.9012 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1700132 2 0.1858 0.9027 0.000 0.904 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR1700131 2 0.2964 0.8584 0.000 0.836 0.012 0.012 0.000 0.140
#> SRR1700133 2 0.1843 0.9105 0.000 0.912 0.004 0.004 0.000 0.080
#> SRR1700134 2 0.0547 0.9113 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700135 2 0.2462 0.8862 0.000 0.876 0.000 0.028 0.000 0.096
#> SRR1700136 2 0.3453 0.8333 0.000 0.812 0.008 0.024 0.008 0.148
#> SRR1700137 2 0.2288 0.8929 0.000 0.876 0.004 0.004 0.000 0.116
#> SRR1700138 2 0.2257 0.9034 0.000 0.900 0.008 0.012 0.004 0.076
#> SRR1700140 2 0.2355 0.8949 0.000 0.876 0.004 0.008 0.000 0.112
#> SRR1700139 2 0.2191 0.8963 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR1700141 2 0.0547 0.9120 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700142 2 0.3375 0.8187 0.004 0.816 0.008 0.008 0.012 0.152
#> SRR1700143 2 0.3441 0.8273 0.000 0.812 0.012 0.024 0.004 0.148
#> SRR1700144 2 0.2742 0.8649 0.000 0.852 0.012 0.008 0.000 0.128
#> SRR1700145 2 0.2995 0.8709 0.000 0.844 0.012 0.008 0.008 0.128
#> SRR1700146 2 0.0547 0.9114 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700147 2 0.2820 0.8734 0.000 0.860 0.008 0.012 0.008 0.112
#> SRR1700149 2 0.5041 0.6463 0.008 0.716 0.036 0.056 0.008 0.176
#> SRR1700148 2 0.2325 0.8984 0.000 0.884 0.000 0.008 0.008 0.100
#> SRR1700150 2 0.1349 0.9149 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1700152 2 0.2009 0.9046 0.000 0.904 0.000 0.004 0.008 0.084
#> SRR1700151 2 0.2948 0.8600 0.000 0.836 0.004 0.008 0.008 0.144
#> SRR1700153 2 0.2952 0.8494 0.000 0.828 0.004 0.008 0.004 0.156
#> SRR1700154 2 0.2467 0.8923 0.000 0.880 0.004 0.008 0.008 0.100
#> SRR1700155 2 0.1663 0.9067 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700156 2 0.2612 0.8829 0.000 0.868 0.008 0.016 0.000 0.108
#> SRR1700158 2 0.4640 0.7417 0.032 0.760 0.016 0.040 0.008 0.144
#> SRR1700159 2 0.0547 0.9112 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700157 2 0.2656 0.8804 0.000 0.860 0.012 0.008 0.000 0.120
#> SRR1700160 2 0.2631 0.8833 0.000 0.860 0.004 0.008 0.004 0.124
#> SRR1700161 2 0.2531 0.8826 0.000 0.860 0.004 0.008 0.000 0.128
#> SRR1700162 2 0.0790 0.9140 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700164 2 0.2794 0.8772 0.000 0.864 0.008 0.020 0.004 0.104
#> SRR1700163 2 0.3582 0.8136 0.004 0.808 0.012 0.024 0.004 0.148
#> SRR1700165 2 0.2473 0.8863 0.000 0.876 0.012 0.008 0.000 0.104
#> SRR1700166 2 0.1663 0.9077 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700168 2 0.0632 0.9126 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700167 2 0.3057 0.8568 0.000 0.844 0.008 0.024 0.004 0.120
#> SRR1700170 2 0.1753 0.9073 0.000 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR1700169 2 0.1806 0.9077 0.000 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700171 2 0.4712 0.6702 0.004 0.732 0.028 0.060 0.004 0.172
#> SRR1700172 2 0.1858 0.9039 0.000 0.904 0.004 0.000 0.000 0.092
#> SRR1700174 2 0.1732 0.9124 0.000 0.920 0.000 0.004 0.004 0.072
#> SRR1700173 2 0.2009 0.9075 0.000 0.904 0.004 0.008 0.000 0.084
#> SRR1700175 2 0.1644 0.9104 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR1700176 2 0.4155 0.7632 0.004 0.768 0.020 0.036 0.004 0.168
#> SRR1700178 2 0.0777 0.9128 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700177 2 0.1897 0.9079 0.000 0.908 0.000 0.004 0.004 0.084
#> SRR1700180 2 0.0547 0.9107 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700179 2 0.0692 0.9120 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700181 2 0.0458 0.9102 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700183 1 0.1003 0.6257 0.964 0.000 0.000 0.028 0.004 0.004
#> SRR1700182 2 0.0632 0.9118 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700184 2 0.0865 0.9144 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700186 2 0.0508 0.9126 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700187 1 0.4971 0.0270 0.492 0.016 0.012 0.464 0.000 0.016
#> SRR1700185 1 0.3244 0.5214 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0692 0.9134 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700192 2 0.7687 -0.4272 0.016 0.424 0.088 0.300 0.024 0.148
#> SRR1700190 3 0.4803 -0.3140 0.028 0.032 0.780 0.084 0.036 0.040
#> SRR1700191 1 0.2213 0.6190 0.888 0.000 0.004 0.100 0.008 0.000
#> SRR1700189 2 0.7978 -0.4336 0.204 0.424 0.060 0.216 0.004 0.092
#> SRR1700193 2 0.0547 0.9127 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700195 2 0.0632 0.9127 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700194 1 0.2378 0.6002 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0458 0.9105 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700197 3 0.8861 0.1953 0.108 0.228 0.300 0.228 0.012 0.124
#> SRR1700198 2 0.0547 0.9113 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700199 2 0.0632 0.9135 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700200 2 0.0547 0.9107 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700201 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700202 2 0.1082 0.9161 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1700203 2 0.0260 0.9097 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700204 2 0.0777 0.9144 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700206 2 0.0777 0.9160 0.000 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1700207 2 0.0363 0.9103 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700208 3 0.6850 0.2907 0.020 0.248 0.532 0.140 0.008 0.052
#> SRR1700205 2 0.0458 0.9125 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700209 2 0.0458 0.9114 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700210 2 0.0458 0.9109 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700211 2 0.0935 0.9160 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700212 2 0.0777 0.9149 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700213 2 0.1265 0.9156 0.000 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR1700214 2 0.0547 0.9121 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700215 1 0.1267 0.6249 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0632 0.9118 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700216 1 0.1377 0.6183 0.952 0.000 0.004 0.024 0.016 0.004
#> SRR1700218 2 0.0458 0.9112 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700219 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700222 1 0.5766 -0.2205 0.512 0.036 0.016 0.392 0.000 0.044
#> SRR1700220 2 0.0363 0.9113 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700221 2 0.0363 0.9100 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700223 2 0.0458 0.9107 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700224 2 0.0713 0.9147 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700226 2 0.0458 0.9108 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700229 2 0.0865 0.9157 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700225 2 0.1728 0.9117 0.000 0.924 0.004 0.000 0.008 0.064
#> SRR1700227 2 0.0458 0.9105 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700230 2 0.8323 -0.4900 0.116 0.404 0.220 0.156 0.004 0.100
#> SRR1700231 2 0.1082 0.9162 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700228 2 0.0713 0.9126 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700232 2 0.0547 0.9121 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700233 2 0.0547 0.9128 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700234 2 0.0260 0.9103 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700235 2 0.0858 0.9148 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700237 2 0.0713 0.9132 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700236 2 0.0547 0.9118 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700238 2 0.0260 0.9097 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700239 4 0.6561 0.1163 0.396 0.044 0.020 0.460 0.012 0.068
#> SRR1700240 1 0.3309 0.5070 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.1555 0.9140 0.000 0.932 0.000 0.004 0.004 0.060
#> SRR1700243 2 0.0547 0.9124 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700244 2 0.0935 0.9159 0.000 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700242 2 0.7602 -0.1764 0.128 0.504 0.060 0.208 0.008 0.092
#> SRR1700246 2 0.0458 0.9113 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700245 2 0.0632 0.9121 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700247 4 0.7194 0.4111 0.340 0.116 0.020 0.424 0.000 0.100
#> SRR1700249 1 0.2482 0.6044 0.848 0.000 0.000 0.148 0.000 0.004
#> SRR1700250 2 0.0692 0.9139 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1700248 2 0.0713 0.9150 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700251 2 0.0713 0.9136 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700252 2 0.1387 0.9118 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700253 2 0.0458 0.9108 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700256 2 0.0363 0.9118 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700254 1 0.5152 0.0567 0.520 0.016 0.012 0.424 0.000 0.028
#> SRR1700255 2 0.0458 0.9102 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700257 2 0.0458 0.9105 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700258 2 0.0363 0.9098 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700259 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700260 2 0.0260 0.9094 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700261 2 0.0363 0.9098 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700262 2 0.0363 0.9105 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700263 2 0.0260 0.9107 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700264 2 0.0837 0.9144 0.000 0.972 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR1700265 2 0.1674 0.9106 0.000 0.924 0.004 0.004 0.000 0.068
#> SRR1700266 2 0.0260 0.9112 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700268 2 0.2663 0.8848 0.004 0.892 0.012 0.020 0.012 0.060
#> SRR1700270 2 0.0260 0.9107 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700267 2 0.0458 0.9102 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700271 2 0.0260 0.9093 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700272 2 0.0146 0.9091 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700273 2 0.0363 0.9119 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700274 2 0.0547 0.9128 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700277 3 0.6777 0.2289 0.008 0.280 0.524 0.084 0.012 0.092
#> SRR1700275 2 0.0603 0.9141 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700276 2 0.0713 0.9135 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700278 2 0.0777 0.9144 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700279 2 0.0713 0.9138 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700280 2 0.0858 0.9142 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700281 2 0.0458 0.9109 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700283 2 0.0713 0.9144 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700282 2 0.1531 0.9138 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1700284 2 0.0935 0.9143 0.000 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700285 2 0.0458 0.9128 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700286 2 0.0713 0.9141 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700287 2 0.0603 0.9125 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700290 2 0.7867 -0.2607 0.068 0.472 0.104 0.132 0.008 0.216
#> SRR1700289 2 0.0865 0.9147 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700288 2 0.0935 0.9152 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1700292 2 0.0713 0.9122 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700291 2 0.1531 0.9133 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1700293 2 0.0547 0.9127 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700294 2 0.0458 0.9107 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700295 2 0.5180 0.6177 0.000 0.708 0.068 0.064 0.008 0.152
#> SRR1700297 2 0.0363 0.9107 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700296 2 0.0458 0.9104 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700298 2 0.1155 0.9152 0.000 0.956 0.004 0.000 0.004 0.036
#> SRR1700299 2 0.1141 0.9142 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700300 2 0.2402 0.8907 0.000 0.888 0.020 0.000 0.008 0.084
#> SRR1700302 2 0.0777 0.9128 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700301 2 0.0713 0.9128 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700303 2 0.0547 0.9120 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700304 2 0.1219 0.9158 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700305 2 0.0363 0.9112 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700306 2 0.2512 0.8798 0.000 0.868 0.000 0.008 0.008 0.116
#> SRR1700308 2 0.0777 0.9146 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700307 2 0.1555 0.9152 0.000 0.932 0.004 0.000 0.004 0.060
#> SRR1700309 2 0.3956 0.7749 0.000 0.784 0.040 0.032 0.000 0.144
#> SRR1700310 2 0.0458 0.9112 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700311 2 0.1471 0.9145 0.000 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1700312 2 0.0858 0.9146 0.000 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700313 2 0.1080 0.9166 0.000 0.960 0.000 0.004 0.004 0.032
#> SRR1700314 2 0.1471 0.9137 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1700315 2 0.1152 0.9157 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1700316 2 0.1141 0.9157 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700317 2 0.0458 0.9111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700318 2 0.1644 0.9122 0.000 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR1700319 2 0.2212 0.8958 0.000 0.880 0.000 0.008 0.000 0.112
#> SRR1700320 2 0.0547 0.9118 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700322 2 0.1261 0.9163 0.000 0.956 0.004 0.004 0.008 0.028
#> SRR1700321 2 0.0603 0.9143 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700323 2 0.1082 0.9157 0.000 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1700324 2 0.0458 0.9110 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700325 2 0.0547 0.9123 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700326 2 0.2730 0.8868 0.000 0.872 0.004 0.024 0.008 0.092
#> SRR1700327 2 0.0547 0.9125 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700329 2 0.0790 0.9143 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700328 2 0.2274 0.8978 0.000 0.892 0.008 0.012 0.000 0.088
#> SRR1700330 2 0.0865 0.9158 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700331 2 0.1075 0.9147 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700332 2 0.0777 0.9132 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700333 2 0.0937 0.9155 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.634 0.916 0.943 0.3760 0.586 0.586
#> 3 3 0.876 0.901 0.964 0.4503 0.697 0.549
#> 4 4 0.564 0.678 0.827 0.2326 0.809 0.607
#> 5 5 0.565 0.654 0.735 0.1008 0.836 0.545
#> 6 6 0.638 0.643 0.770 0.0542 0.930 0.725
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699881 1 0.9963 0.4065 0.536 0.464
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699900 2 0.8555 0.5234 0.280 0.720
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699902 1 0.7219 0.8715 0.800 0.200
#> SRR1699901 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699903 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.7883 0.6287 0.236 0.764
#> SRR1699911 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699914 1 0.8144 0.8162 0.748 0.252
#> SRR1699915 2 0.0938 0.9657 0.012 0.988
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.1184 0.9620 0.016 0.984
#> SRR1699921 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699923 1 0.6343 0.9016 0.840 0.160
#> SRR1699924 1 0.8861 0.7478 0.696 0.304
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.6623 0.7559 0.172 0.828
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.5737 0.8121 0.136 0.864
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699941 1 0.7745 0.8406 0.772 0.228
#> SRR1699942 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699946 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699954 1 0.9996 0.3051 0.512 0.488
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.4431 0.8748 0.092 0.908
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.3114 0.9188 0.056 0.944
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.1184 0.9618 0.016 0.984
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699969 1 0.6623 0.8940 0.828 0.172
#> SRR1699971 1 0.8955 0.7364 0.688 0.312
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699972 1 0.9661 0.5800 0.608 0.392
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699974 1 0.5629 0.9054 0.868 0.132
#> SRR1699975 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1699977 2 0.4022 0.8903 0.080 0.920
#> SRR1699978 1 0.5059 0.8967 0.888 0.112
#> SRR1699979 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699981 1 0.6623 0.8942 0.828 0.172
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.5294 0.9003 0.880 0.120
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.8861 0.4602 0.304 0.696
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.8144 0.5938 0.252 0.748
#> SRR1699991 1 0.6247 0.9038 0.844 0.156
#> SRR1699993 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699994 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1699995 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.9866 0.4834 0.568 0.432
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700001 1 0.7602 0.8513 0.780 0.220
#> SRR1700003 2 0.0672 0.9692 0.008 0.992
#> SRR1700004 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700005 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.8555 0.5361 0.280 0.720
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700009 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.4562 0.8691 0.096 0.904
#> SRR1700012 2 0.1184 0.9618 0.016 0.984
#> SRR1700014 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700016 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.9977 0.3619 0.528 0.472
#> SRR1700017 1 0.8144 0.8180 0.748 0.252
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0672 0.8472 0.992 0.008
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.1633 0.9541 0.024 0.976
#> SRR1700022 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.9427 0.2752 0.360 0.640
#> SRR1700027 2 0.1184 0.9620 0.016 0.984
#> SRR1700028 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700029 1 0.6247 0.9039 0.844 0.156
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700031 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700036 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700038 1 0.9393 0.6613 0.644 0.356
#> SRR1700039 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700040 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700041 1 0.8661 0.7683 0.712 0.288
#> SRR1700042 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700043 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700045 1 0.8713 0.7643 0.708 0.292
#> SRR1700044 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700046 1 0.9522 0.6286 0.628 0.372
#> SRR1700047 1 0.6247 0.9039 0.844 0.156
#> SRR1700048 2 0.2778 0.9287 0.048 0.952
#> SRR1700049 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.4431 0.8873 0.908 0.092
#> SRR1700051 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.5737 0.9070 0.864 0.136
#> SRR1700053 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1700054 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700055 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700057 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700058 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700059 1 0.6973 0.8819 0.812 0.188
#> SRR1700060 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700061 1 0.6973 0.8819 0.812 0.188
#> SRR1700062 1 0.5842 0.9084 0.860 0.140
#> SRR1700063 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700064 2 0.0938 0.9657 0.012 0.988
#> SRR1700065 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700066 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700067 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700068 1 0.6148 0.9061 0.848 0.152
#> SRR1700069 2 0.1414 0.9583 0.020 0.980
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700071 1 0.6048 0.9079 0.852 0.148
#> SRR1700072 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700073 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700075 1 0.6712 0.8912 0.824 0.176
#> SRR1700074 1 0.7056 0.8783 0.808 0.192
#> SRR1700076 2 0.1633 0.9541 0.024 0.976
#> SRR1700077 1 0.6973 0.8816 0.812 0.188
#> SRR1700078 1 0.9393 0.6495 0.644 0.356
#> SRR1700080 2 0.3274 0.9131 0.060 0.940
#> SRR1700079 1 0.6623 0.8938 0.828 0.172
#> SRR1700081 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700082 1 0.8327 0.8018 0.736 0.264
#> SRR1700083 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700084 1 0.0376 0.8452 0.996 0.004
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.6973 0.7280 0.188 0.812
#> SRR1700087 2 0.6048 0.7925 0.148 0.852
#> SRR1700088 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.2236 0.9413 0.036 0.964
#> SRR1700091 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0672 0.9692 0.008 0.992
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700095 1 0.8763 0.7574 0.704 0.296
#> SRR1700096 2 0.3274 0.9145 0.060 0.940
#> SRR1700097 1 0.5737 0.9070 0.864 0.136
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.9933 -0.1033 0.452 0.548
#> SRR1700105 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.8144 0.6008 0.252 0.748
#> SRR1700107 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.2603 0.9327 0.044 0.956
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.4161 0.8849 0.084 0.916
#> SRR1700117 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700119 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1700120 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700121 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700123 1 0.8861 0.7466 0.696 0.304
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700127 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700124 2 0.9754 0.1155 0.408 0.592
#> SRR1700128 1 0.9000 0.7295 0.684 0.316
#> SRR1700129 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700132 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700131 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700133 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.9129 0.3792 0.328 0.672
#> SRR1700136 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700137 2 0.1184 0.9619 0.016 0.984
#> SRR1700138 2 0.2603 0.9321 0.044 0.956
#> SRR1700140 2 0.2603 0.9325 0.044 0.956
#> SRR1700139 2 0.8016 0.6042 0.244 0.756
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700143 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700144 1 0.6247 0.9040 0.844 0.156
#> SRR1700145 1 0.6048 0.9079 0.852 0.148
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700147 1 0.6247 0.9041 0.844 0.156
#> SRR1700149 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700148 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700150 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.4690 0.8620 0.100 0.900
#> SRR1700151 1 0.9323 0.6763 0.652 0.348
#> SRR1700153 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700154 1 0.9795 0.5338 0.584 0.416
#> SRR1700155 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700156 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700158 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700157 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700160 2 0.1843 0.9503 0.028 0.972
#> SRR1700161 1 0.9944 0.4250 0.544 0.456
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700163 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700165 1 0.7139 0.8753 0.804 0.196
#> SRR1700166 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700170 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1700171 1 0.5842 0.9084 0.860 0.140
#> SRR1700172 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700176 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.7219 0.8705 0.800 0.200
#> SRR1700190 1 0.1184 0.8511 0.984 0.016
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.6148 0.9060 0.848 0.152
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.1843 0.9501 0.028 0.972
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.5946 0.9097 0.856 0.144
#> SRR1700246 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.8432 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.1184 0.9615 0.016 0.984
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.6531 0.8966 0.832 0.168
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0672 0.9692 0.008 0.992
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.2423 0.8624 0.960 0.040
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.9775 0.0723 0.412 0.588
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.8207 0.5879 0.256 0.744
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0938 0.9655 0.012 0.988
#> SRR1700309 2 0.6531 0.7602 0.168 0.832
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.9833 0.0555 0.424 0.576
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.1633 0.9539 0.024 0.976
#> SRR1700330 2 0.0376 0.9727 0.004 0.996
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699881 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699892 2 0.4555 0.7152 0.000 0.800 0.200
#> SRR1699893 3 0.0424 0.9423 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699896 2 0.4974 0.6679 0.000 0.764 0.236
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699898 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699900 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699902 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699901 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0592 0.9446 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699905 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699910 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.1163 0.9304 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699914 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699915 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699917 2 0.4178 0.7648 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699918 2 0.0237 0.9512 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699920 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.3686 0.8016 0.000 0.860 0.140
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699923 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699924 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6291 0.0965 0.000 0.468 0.532
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699929 2 0.3038 0.8479 0.000 0.896 0.104
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699931 2 0.5178 0.6427 0.000 0.744 0.256
#> SRR1699933 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.4750 0.7027 0.000 0.784 0.216
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699941 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.3038 0.8495 0.000 0.896 0.104
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0592 0.9448 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.0237 0.9512 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699954 3 0.0424 0.9423 0.000 0.008 0.992
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699959 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0747 0.9412 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699961 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.6308 0.0487 0.000 0.508 0.492
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 3 0.3551 0.7902 0.000 0.132 0.868
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.4178 0.7645 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699969 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699971 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.2448 0.8820 0.000 0.924 0.076
#> SRR1699974 3 0.0424 0.9435 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699975 2 0.5397 0.5878 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699976 3 0.2625 0.8558 0.000 0.084 0.916
#> SRR1699977 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699978 3 0.0237 0.9462 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699979 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.4121 0.7700 0.000 0.832 0.168
#> SRR1699981 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699983 2 0.0237 0.9512 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699986 3 0.0237 0.9462 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699988 2 0.0892 0.9376 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699987 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699990 3 0.2066 0.8854 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699992 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699991 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699993 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699994 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699995 1 0.0424 0.9697 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699996 2 0.0747 0.9412 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699997 3 0.1163 0.9226 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699999 1 0.0424 0.9701 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700000 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700002 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700001 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700003 3 0.1031 0.9260 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700004 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700013 3 0.1529 0.9078 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700012 3 0.3879 0.7577 0.000 0.152 0.848
#> SRR1700014 3 0.0592 0.9388 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700015 3 0.4750 0.6620 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700017 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700020 3 0.0592 0.9405 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700023 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700022 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700024 2 0.2356 0.8858 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700025 2 0.0892 0.9377 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700026 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700027 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700028 3 0.5529 0.5261 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700029 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0237 0.9512 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700031 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700033 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.5098 0.6408 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700038 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700039 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700040 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700041 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700042 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700043 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700045 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700044 3 0.3038 0.8287 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700046 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700047 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700048 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700049 3 0.3038 0.8505 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700050 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700051 3 0.1529 0.9157 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700052 3 0.0237 0.9462 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700053 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700054 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700057 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700058 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700059 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700060 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700061 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700062 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700063 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700064 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700065 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700066 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700067 3 0.5431 0.5457 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700068 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700069 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700071 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700072 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700073 2 0.1163 0.9295 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700075 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700074 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700076 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700077 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700078 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700080 3 0.0592 0.9386 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700079 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700081 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700082 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700083 3 0.0237 0.9462 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700084 3 0.0424 0.9435 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700086 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700087 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700088 3 0.2625 0.8564 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700089 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700091 3 0.5706 0.4845 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700090 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.6095 0.3805 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700094 3 0.6299 0.0718 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700093 2 0.6079 0.3908 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700095 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700096 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700097 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700100 3 0.6308 0.0051 0.000 0.492 0.508
#> SRR1700101 2 0.0592 0.9447 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700102 2 0.4452 0.7373 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700104 3 0.5098 0.6110 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700103 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700105 3 0.6154 0.3103 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700106 3 0.0592 0.9384 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700107 2 0.6307 0.0536 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700108 2 0.1529 0.9184 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700111 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700114 3 0.5859 0.4415 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700116 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700117 3 0.0592 0.9403 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700119 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700118 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700120 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.5465 0.5906 0.000 0.712 0.288
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700123 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700126 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700127 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700124 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700128 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0237 0.9512 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700130 3 0.6008 0.3935 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700132 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700131 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700133 3 0.4750 0.6588 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700135 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700136 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700137 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700138 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700140 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700139 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700142 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700143 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700144 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700145 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0237 0.9511 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700147 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700149 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700148 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.5810 0.5037 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700152 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700151 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700153 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700154 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700155 3 0.0892 0.9308 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700156 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700158 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700157 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700160 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700161 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700164 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700163 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700165 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700166 3 0.0424 0.9424 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700167 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700170 3 0.0424 0.9425 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700169 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700171 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700172 2 0.6309 0.0227 0.000 0.504 0.496
#> SRR1700174 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700173 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.3116 0.8451 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700176 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.2066 0.8849 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.3686 0.7738 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700190 3 0.2796 0.8636 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.6305 0.0428 0.484 0.000 0.516
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.6309 -0.0239 0.500 0.000 0.500
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.3619 0.8108 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.5098 0.6472 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.2066 0.8981 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.2796 0.8645 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700246 2 0.1964 0.9028 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.6260 0.2106 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9769 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.0424 0.9481 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.6308 0.0531 0.000 0.508 0.492
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700277 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700282 2 0.4887 0.6852 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700290 3 0.2066 0.8967 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700291 2 0.0592 0.9447 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700295 3 0.0424 0.9424 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700298 2 0.1031 0.9336 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700299 3 0.3619 0.7833 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700300 2 0.5591 0.5498 0.000 0.696 0.304
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700306 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700307 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700309 3 0.0000 0.9488 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700311 2 0.1643 0.9144 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700313 3 0.6215 0.2426 0.000 0.428 0.572
#> SRR1700314 3 0.1289 0.9177 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700315 2 0.5905 0.4604 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700316 2 0.5948 0.4594 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700318 2 0.0747 0.9412 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700319 3 0.4887 0.6372 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700323 2 0.0592 0.9447 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700326 3 0.0237 0.9458 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700328 3 0.4702 0.6626 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700330 2 0.4452 0.7380 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9543 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.1452 0.79272 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1699876 2 0.3837 0.74730 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1699877 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.1474 0.81125 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1699878 2 0.0188 0.81717 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699880 3 0.1118 0.85831 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699881 3 0.3494 0.78471 0.000 0.004 0.824 0.172
#> SRR1699882 2 0.0336 0.81893 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699883 2 0.0336 0.81522 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699884 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.3649 0.75900 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1699888 2 0.0188 0.81877 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699889 2 0.4661 0.65003 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1699890 2 0.2345 0.79913 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1699887 2 0.3400 0.76967 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1699891 2 0.4624 0.65914 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1699892 2 0.5226 0.64439 0.000 0.756 0.128 0.116
#> SRR1699893 4 0.2149 0.66585 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1699894 2 0.4624 0.65914 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1699895 2 0.4624 0.65914 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1699896 2 0.7033 0.44463 0.000 0.528 0.136 0.336
#> SRR1699897 2 0.0592 0.81835 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699898 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699900 3 0.1474 0.86363 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699899 2 0.4543 0.67579 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1699902 3 0.0469 0.86741 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699901 3 0.0469 0.86725 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699903 2 0.4989 0.42872 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1699904 2 0.4713 0.63443 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1699905 3 0.0921 0.86514 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699906 2 0.4382 0.69942 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1699907 2 0.4730 0.62870 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1699908 2 0.4877 0.56186 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1699909 2 0.4790 0.59046 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1699910 4 0.3024 0.66142 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1699911 2 0.4961 0.48947 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1699912 2 0.4761 0.61784 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1699913 2 0.4477 0.68553 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1699914 3 0.1022 0.86618 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699915 4 0.2647 0.66360 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1699916 2 0.3444 0.76020 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1699917 4 0.3024 0.59775 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1699918 2 0.4907 0.54189 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1699919 4 0.4998 -0.32432 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1699920 4 0.3942 0.61406 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1699921 4 0.5143 0.43842 0.000 0.256 0.036 0.708
#> SRR1699922 2 0.4382 0.69817 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1699923 3 0.0707 0.86778 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699924 3 0.3024 0.78545 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1699925 1 0.1474 0.97141 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699926 4 0.5466 0.50131 0.000 0.220 0.068 0.712
#> SRR1699927 2 0.4761 0.61781 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1699929 2 0.5762 0.60348 0.000 0.608 0.040 0.352
#> SRR1699928 2 0.4790 0.60653 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1699930 2 0.4500 0.68210 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1699931 2 0.6273 0.30639 0.000 0.488 0.056 0.456
#> SRR1699933 3 0.3157 0.81324 0.000 0.004 0.852 0.144
#> SRR1699932 2 0.4679 0.64509 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1699934 1 0.1474 0.97141 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699935 4 0.3726 0.50313 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1699936 2 0.0336 0.81862 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699937 2 0.1767 0.78606 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR1699938 2 0.0188 0.81713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699940 3 0.3229 0.82038 0.000 0.048 0.880 0.072
#> SRR1699939 2 0.0592 0.81779 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699941 3 0.1637 0.85748 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1699942 2 0.4605 0.64427 0.000 0.800 0.092 0.108
#> SRR1699943 2 0.1452 0.79272 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1699944 2 0.1209 0.79856 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1699945 3 0.1118 0.85921 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699946 2 0.2845 0.75224 0.000 0.896 0.028 0.076
#> SRR1699947 2 0.1452 0.79272 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1699948 2 0.0707 0.80861 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699949 2 0.1792 0.80735 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1699950 2 0.0592 0.81803 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699951 2 0.2799 0.77389 0.000 0.884 0.008 0.108
#> SRR1699952 2 0.1545 0.79067 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1699953 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699954 3 0.3081 0.82212 0.000 0.048 0.888 0.064
#> SRR1699955 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.1118 0.85831 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699957 2 0.1452 0.79272 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1699959 3 0.3942 0.70399 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1699958 4 0.4761 0.47179 0.000 0.332 0.004 0.664
#> SRR1699960 2 0.0336 0.81862 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699961 3 0.3398 0.81050 0.000 0.060 0.872 0.068
#> SRR1699962 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.7741 -0.16216 0.000 0.440 0.296 0.264
#> SRR1699964 2 0.1022 0.80227 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1699965 2 0.0188 0.81877 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699966 4 0.5620 0.59185 0.000 0.084 0.208 0.708
#> SRR1699967 2 0.1305 0.79540 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1699968 2 0.6543 0.49036 0.000 0.544 0.084 0.372
#> SRR1699969 3 0.3074 0.76697 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699971 3 0.2216 0.84727 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699970 2 0.1004 0.80395 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1699972 3 0.1716 0.85407 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699973 4 0.4245 0.60102 0.000 0.196 0.020 0.784
#> SRR1699974 3 0.0000 0.86721 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699975 4 0.6435 -0.07249 0.000 0.396 0.072 0.532
#> SRR1699976 3 0.4879 0.71539 0.000 0.128 0.780 0.092
#> SRR1699977 3 0.3172 0.79904 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699978 3 0.0592 0.86685 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699979 3 0.4941 0.19966 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1699980 4 0.5780 -0.32345 0.000 0.476 0.028 0.496
#> SRR1699981 3 0.1474 0.85613 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699982 2 0.4624 0.65914 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1699983 2 0.4977 0.45654 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1699984 1 0.1474 0.97141 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699985 2 0.3764 0.74717 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1699986 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699988 2 0.4679 0.63254 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1699987 4 0.4907 0.27243 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1699989 2 0.4643 0.65615 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1699990 4 0.5947 0.36250 0.000 0.044 0.384 0.572
#> SRR1699992 3 0.2469 0.84131 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699991 3 0.0592 0.86742 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699993 3 0.3074 0.76577 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699994 3 0.0000 0.86721 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.2198 0.92214 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1699996 2 0.1297 0.81250 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1699997 4 0.2814 0.66398 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1699998 2 0.2089 0.77853 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1699999 1 0.3249 0.83673 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1700000 3 0.1824 0.85502 0.000 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700002 3 0.4466 0.75384 0.000 0.036 0.784 0.180
#> SRR1700001 3 0.1302 0.86207 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700003 3 0.4966 0.72858 0.000 0.076 0.768 0.156
#> SRR1700004 3 0.0592 0.86730 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700005 1 0.0188 0.97773 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700006 3 0.2996 0.82729 0.000 0.044 0.892 0.064
#> SRR1700007 2 0.3837 0.74696 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1700008 3 0.4933 0.08496 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1700009 1 0.0336 0.97779 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700010 3 0.1022 0.86008 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700011 2 0.0469 0.81825 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700013 3 0.6716 0.34527 0.000 0.112 0.568 0.320
#> SRR1700012 3 0.5321 0.66865 0.000 0.140 0.748 0.112
#> SRR1700014 3 0.4605 0.49687 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700015 3 0.6881 0.31302 0.000 0.340 0.540 0.120
#> SRR1700016 1 0.1151 0.96269 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1700018 3 0.2048 0.85122 0.000 0.008 0.928 0.064
#> SRR1700017 3 0.1716 0.85627 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700019 2 0.3311 0.77247 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1700020 3 0.0376 0.86664 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1700021 2 0.4948 0.50386 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1700023 3 0.2888 0.82694 0.000 0.004 0.872 0.124
#> SRR1700022 3 0.1211 0.85890 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700024 4 0.4546 0.42074 0.000 0.256 0.012 0.732
#> SRR1700025 2 0.3542 0.71270 0.000 0.864 0.076 0.060
#> SRR1700026 3 0.2521 0.85007 0.000 0.024 0.912 0.064
#> SRR1700027 3 0.1978 0.85270 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700028 4 0.2345 0.66378 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700029 3 0.3172 0.76671 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700030 2 0.4973 0.64568 0.000 0.644 0.008 0.348
#> SRR1700031 3 0.0188 0.86697 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700032 2 0.1913 0.80220 0.000 0.940 0.020 0.040
#> SRR1700034 1 0.0524 0.97565 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700035 2 0.4948 0.50142 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1700033 3 0.0188 0.86714 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700036 2 0.7335 0.25954 0.000 0.444 0.156 0.400
#> SRR1700037 2 0.4522 0.67905 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1700038 3 0.1211 0.86436 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700039 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700040 3 0.0000 0.86721 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700041 3 0.1118 0.86570 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700042 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700043 3 0.0336 0.86833 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700045 3 0.2081 0.84646 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700044 3 0.3286 0.81345 0.000 0.044 0.876 0.080
#> SRR1700046 3 0.1211 0.86429 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700047 3 0.0469 0.86791 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700048 3 0.4624 0.43425 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700049 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700050 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700051 3 0.0524 0.86622 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1700052 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700053 3 0.4277 0.55145 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700054 3 0.0817 0.86810 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700055 1 0.1118 0.97453 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700056 3 0.2216 0.81875 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700057 3 0.1940 0.83721 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700058 3 0.0188 0.86736 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700059 4 0.4925 0.33013 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1700060 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700061 3 0.0921 0.86749 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700062 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700063 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700064 4 0.4730 0.44236 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700065 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700066 3 0.0188 0.86704 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700067 4 0.2480 0.66498 0.000 0.008 0.088 0.904
#> SRR1700068 3 0.1302 0.85819 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700069 3 0.4961 0.08769 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700070 2 0.3764 0.74308 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1700071 3 0.0000 0.86721 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700072 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700073 4 0.5099 0.09630 0.000 0.380 0.008 0.612
#> SRR1700075 3 0.1118 0.86570 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700074 3 0.1118 0.86492 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700076 3 0.3074 0.78444 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700077 3 0.0921 0.86684 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700078 3 0.1637 0.85057 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700080 3 0.3160 0.80225 0.000 0.020 0.872 0.108
#> SRR1700079 3 0.0921 0.86741 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700081 3 0.0469 0.86726 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700082 3 0.0817 0.86739 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700083 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700084 3 0.0376 0.86664 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1700085 2 0.4643 0.65482 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1700086 3 0.3024 0.79536 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700087 4 0.5550 0.20924 0.000 0.020 0.428 0.552
#> SRR1700088 4 0.7747 0.09719 0.000 0.232 0.380 0.388
#> SRR1700089 4 0.5326 0.33666 0.000 0.016 0.380 0.604
#> SRR1700091 4 0.5880 0.54103 0.000 0.232 0.088 0.680
#> SRR1700090 4 0.3942 0.60329 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700092 4 0.5953 0.52926 0.000 0.268 0.076 0.656
#> SRR1700094 4 0.6298 0.52783 0.000 0.268 0.100 0.632
#> SRR1700093 4 0.3731 0.64258 0.000 0.120 0.036 0.844
#> SRR1700095 4 0.4790 0.34542 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1700096 4 0.5183 0.28853 0.000 0.008 0.408 0.584
#> SRR1700097 3 0.0817 0.86547 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700098 2 0.3444 0.68874 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1700099 4 0.4522 0.46299 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1700100 4 0.4261 0.64787 0.000 0.112 0.068 0.820
#> SRR1700101 4 0.4456 0.51827 0.000 0.280 0.004 0.716
#> SRR1700102 4 0.4663 0.53676 0.000 0.272 0.012 0.716
#> SRR1700104 4 0.5690 0.55241 0.000 0.084 0.216 0.700
#> SRR1700103 4 0.4804 0.33706 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700105 4 0.2722 0.66245 0.000 0.032 0.064 0.904
#> SRR1700106 4 0.3311 0.65237 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700107 4 0.3611 0.66322 0.000 0.060 0.080 0.860
#> SRR1700108 4 0.4761 0.48211 0.000 0.332 0.004 0.664
#> SRR1700109 2 0.1557 0.81031 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700110 2 0.0921 0.81623 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700112 2 0.4888 0.55206 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1700111 4 0.4356 0.54706 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700113 4 0.4454 0.32044 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1700114 4 0.3552 0.65763 0.000 0.024 0.128 0.848
#> SRR1700115 4 0.3569 0.55149 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700116 4 0.4040 0.59866 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700117 3 0.4679 0.31194 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700119 4 0.3356 0.64959 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700118 4 0.4661 0.46130 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR1700120 3 0.3726 0.65863 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700121 4 0.2224 0.64856 0.000 0.040 0.032 0.928
#> SRR1700122 4 0.4500 0.29913 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1700123 4 0.4730 0.44479 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700125 2 0.4933 0.51181 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1700126 3 0.2345 0.81742 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700127 4 0.4933 0.31315 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700124 4 0.4761 0.42882 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700128 4 0.4454 0.53884 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700129 4 0.2466 0.62499 0.000 0.096 0.004 0.900
#> SRR1700130 4 0.2401 0.66505 0.000 0.004 0.092 0.904
#> SRR1700132 4 0.4888 0.35639 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700131 4 0.4961 0.28794 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1700133 4 0.2469 0.66560 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700134 4 0.3219 0.58206 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1700135 4 0.3486 0.64326 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700136 4 0.4996 0.19498 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700137 4 0.2921 0.66212 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700138 4 0.3219 0.65478 0.000 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700140 4 0.3907 0.61198 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700139 4 0.4250 0.56484 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1700141 4 0.4431 0.32731 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1700142 3 0.2345 0.81151 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700143 4 0.4989 0.22917 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700144 3 0.0336 0.86677 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700145 4 0.4994 0.21602 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700146 4 0.3157 0.60384 0.000 0.144 0.004 0.852
#> SRR1700147 4 0.4948 0.30976 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700149 3 0.4967 -0.00243 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1700148 4 0.4992 0.22471 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700150 4 0.2840 0.64848 0.000 0.056 0.044 0.900
#> SRR1700152 4 0.3486 0.64305 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700151 4 0.4817 0.39021 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700153 4 0.4948 0.30818 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700154 4 0.4643 0.46869 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700155 4 0.2868 0.66347 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700156 4 0.4996 0.20164 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700158 3 0.4907 0.10750 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1700159 4 0.4992 -0.26661 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1700157 3 0.4898 0.11864 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700160 4 0.3801 0.62275 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700161 4 0.4382 0.54728 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700162 4 0.3172 0.58609 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700164 4 0.4989 0.23226 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700163 4 0.4999 0.17490 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1700165 4 0.4948 0.27357 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700166 4 0.3024 0.66027 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700168 4 0.4817 0.05406 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700167 3 0.4972 -0.01421 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700170 4 0.3123 0.65827 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700169 4 0.4134 0.58402 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700171 4 0.5151 0.21843 0.004 0.000 0.464 0.532
#> SRR1700172 4 0.2739 0.65874 0.000 0.036 0.060 0.904
#> SRR1700174 4 0.3172 0.65137 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700173 4 0.2704 0.66195 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700175 4 0.2610 0.62988 0.000 0.088 0.012 0.900
#> SRR1700176 3 0.1118 0.86030 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700178 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.2281 0.66463 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700180 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.1389 0.97225 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700182 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1305 0.79540 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1700187 1 0.0336 0.97709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 1 0.0000 0.97790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0188 0.81713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700192 3 0.5781 0.67924 0.044 0.128 0.756 0.072
#> SRR1700190 3 0.2739 0.82175 0.060 0.000 0.904 0.036
#> SRR1700191 1 0.1302 0.97287 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700189 3 0.5298 0.37109 0.372 0.000 0.612 0.016
#> SRR1700193 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.97790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.5353 0.23317 0.432 0.000 0.556 0.012
#> SRR1700198 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.3606 0.69091 0.000 0.840 0.020 0.140
#> SRR1700203 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.2773 0.84156 0.000 0.004 0.880 0.116
#> SRR1700205 2 0.0469 0.81872 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700209 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0188 0.81769 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700212 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.5330 0.58044 0.000 0.748 0.120 0.132
#> SRR1700214 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.1389 0.97225 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700217 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.1474 0.97141 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700218 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0336 0.97709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700220 2 0.0336 0.81894 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700221 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0921 0.81698 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700226 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.2999 0.72068 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1700227 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.2522 0.81873 0.076 0.000 0.908 0.016
#> SRR1700231 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0336 0.81922 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700235 2 0.0188 0.81774 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700237 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0336 0.97709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.0000 0.97790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 4 0.5310 0.30920 0.000 0.012 0.412 0.576
#> SRR1700243 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.3312 0.83338 0.052 0.000 0.876 0.072
#> SRR1700246 2 0.2450 0.78922 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1700245 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0336 0.97709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700249 1 0.0000 0.97790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.6461 0.37057 0.000 0.640 0.216 0.144
#> SRR1700253 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0336 0.97709 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700255 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0592 0.81803 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700260 2 0.1792 0.80751 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700261 2 0.2589 0.79399 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1700262 2 0.1302 0.81431 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700263 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.2313 0.77241 0.000 0.924 0.044 0.032
#> SRR1700266 2 0.0469 0.81825 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700268 2 0.7728 -0.01763 0.000 0.416 0.232 0.352
#> SRR1700270 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0592 0.81779 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700272 2 0.0921 0.81652 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700273 2 0.0188 0.81881 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700274 2 0.0188 0.81898 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700277 3 0.1940 0.85434 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700275 2 0.4382 0.70248 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700276 2 0.3266 0.77496 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1700278 2 0.4164 0.71908 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1700279 2 0.4522 0.67906 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1700280 2 0.4277 0.71027 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1700281 2 0.0000 0.81879 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.4406 0.69705 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700282 4 0.5085 0.07790 0.000 0.376 0.008 0.616
#> SRR1700284 2 0.4564 0.67157 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1700285 2 0.4661 0.65064 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1700286 2 0.3569 0.76188 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1700287 2 0.4277 0.71076 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1700290 3 0.1975 0.83852 0.048 0.000 0.936 0.016
#> SRR1700289 2 0.4454 0.68901 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700288 2 0.0469 0.81907 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700292 2 0.4406 0.69611 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700291 4 0.4950 0.08947 0.000 0.376 0.004 0.620
#> SRR1700293 2 0.3873 0.73964 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1700294 2 0.4564 0.67093 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1700295 4 0.3123 0.66030 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700297 2 0.4454 0.68901 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700296 2 0.4250 0.71284 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1700298 2 0.4994 0.41053 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1700299 4 0.3948 0.66540 0.000 0.064 0.096 0.840
#> SRR1700300 4 0.5985 0.22104 0.000 0.352 0.052 0.596
#> SRR1700302 2 0.4804 0.60038 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1700301 2 0.4431 0.69215 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1700303 2 0.4605 0.66295 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1700304 2 0.4454 0.68860 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700305 2 0.4454 0.68864 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700306 4 0.2868 0.66336 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700308 2 0.4624 0.65221 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1700307 4 0.5155 0.19805 0.000 0.004 0.468 0.528
#> SRR1700309 4 0.4585 0.49562 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700310 2 0.4382 0.69826 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700311 4 0.4088 0.48015 0.000 0.232 0.004 0.764
#> SRR1700312 2 0.4304 0.70459 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1700313 4 0.6827 0.35305 0.000 0.304 0.128 0.568
#> SRR1700314 4 0.2976 0.66653 0.000 0.008 0.120 0.872
#> SRR1700315 4 0.6568 0.26949 0.000 0.332 0.096 0.572
#> SRR1700316 4 0.5247 0.51758 0.000 0.228 0.052 0.720
#> SRR1700317 2 0.3873 0.73851 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1700318 2 0.4933 0.52025 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1700319 4 0.3013 0.66627 0.000 0.032 0.080 0.888
#> SRR1700320 2 0.4661 0.65003 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1700322 2 0.4605 0.66026 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1700321 2 0.4564 0.67154 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1700323 4 0.4972 -0.22877 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1700324 2 0.4382 0.69859 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700325 2 0.2868 0.78501 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1700326 4 0.3982 0.63266 0.000 0.004 0.220 0.776
#> SRR1700327 2 0.4406 0.69840 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700329 2 0.4454 0.68910 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1700328 4 0.7241 0.45237 0.000 0.188 0.276 0.536
#> SRR1700330 4 0.4898 0.43893 0.000 0.260 0.024 0.716
#> SRR1700331 2 0.4804 0.60074 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1700332 2 0.4643 0.65547 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1700333 2 0.4331 0.70023 0.000 0.712 0.000 0.288
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.2533 0.7537 0.000 0.888 0.008 0.008 0.096
#> SRR1699876 5 0.4300 0.5932 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1699877 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699879 2 0.2127 0.7325 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1699878 2 0.0162 0.8376 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699880 3 0.3359 0.7614 0.000 0.000 0.840 0.108 0.052
#> SRR1699881 3 0.5572 0.7081 0.000 0.000 0.644 0.192 0.164
#> SRR1699882 2 0.1121 0.8098 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699883 2 0.0609 0.8339 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699884 2 0.1121 0.8171 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699885 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 5 0.4446 0.5839 0.000 0.476 0.000 0.004 0.520
#> SRR1699888 2 0.0609 0.8284 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699889 5 0.4537 0.7012 0.000 0.396 0.000 0.012 0.592
#> SRR1699890 2 0.4235 -0.3323 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1699887 5 0.4305 0.5612 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1699891 5 0.4341 0.6950 0.000 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR1699892 2 0.7146 0.3523 0.000 0.548 0.192 0.072 0.188
#> SRR1699893 4 0.3783 0.6866 0.000 0.000 0.008 0.740 0.252
#> SRR1699894 5 0.4350 0.6933 0.000 0.408 0.000 0.004 0.588
#> SRR1699895 5 0.4350 0.6933 0.000 0.408 0.000 0.004 0.588
#> SRR1699896 5 0.6384 0.3570 0.000 0.156 0.216 0.028 0.600
#> SRR1699897 2 0.2074 0.7771 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1699898 3 0.3284 0.7223 0.000 0.000 0.828 0.148 0.024
#> SRR1699900 3 0.4337 0.7588 0.000 0.000 0.748 0.056 0.196
#> SRR1699899 5 0.4219 0.6848 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1699902 3 0.3336 0.7725 0.000 0.000 0.844 0.060 0.096
#> SRR1699901 3 0.3146 0.7207 0.000 0.000 0.844 0.128 0.028
#> SRR1699903 5 0.5458 0.7153 0.000 0.304 0.000 0.088 0.608
#> SRR1699904 5 0.4517 0.7055 0.000 0.388 0.000 0.012 0.600
#> SRR1699905 3 0.4045 0.7150 0.004 0.000 0.796 0.136 0.064
#> SRR1699906 5 0.4273 0.6446 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1699907 5 0.4527 0.7035 0.000 0.392 0.000 0.012 0.596
#> SRR1699908 5 0.5080 0.7168 0.000 0.348 0.000 0.048 0.604
#> SRR1699909 5 0.5500 0.6936 0.000 0.376 0.000 0.072 0.552
#> SRR1699910 5 0.4644 0.0077 0.000 0.000 0.012 0.460 0.528
#> SRR1699911 5 0.5018 0.7116 0.000 0.284 0.004 0.052 0.660
#> SRR1699912 5 0.4663 0.7103 0.000 0.376 0.000 0.020 0.604
#> SRR1699913 5 0.4504 0.6753 0.000 0.428 0.000 0.008 0.564
#> SRR1699914 3 0.4386 0.7702 0.000 0.000 0.764 0.096 0.140
#> SRR1699915 5 0.4482 0.2350 0.000 0.000 0.012 0.376 0.612
#> SRR1699916 2 0.4161 -0.2618 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1699917 5 0.5263 0.3179 0.000 0.056 0.000 0.368 0.576
#> SRR1699918 5 0.5253 0.7129 0.000 0.340 0.008 0.044 0.608
#> SRR1699919 5 0.5661 0.7103 0.000 0.272 0.000 0.120 0.608
#> SRR1699920 5 0.6204 0.0186 0.000 0.000 0.164 0.312 0.524
#> SRR1699921 5 0.5740 0.5802 0.000 0.144 0.000 0.244 0.612
#> SRR1699922 5 0.4273 0.6463 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1699923 3 0.3803 0.7707 0.000 0.000 0.804 0.056 0.140
#> SRR1699924 3 0.4818 0.6973 0.000 0.000 0.708 0.212 0.080
#> SRR1699925 1 0.2654 0.8946 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1699926 5 0.5489 0.5042 0.000 0.084 0.012 0.248 0.656
#> SRR1699927 5 0.5030 0.7157 0.000 0.352 0.000 0.044 0.604
#> SRR1699929 5 0.5429 0.5847 0.000 0.168 0.092 0.032 0.708
#> SRR1699928 5 0.4734 0.7115 0.000 0.372 0.000 0.024 0.604
#> SRR1699930 5 0.4242 0.6737 0.000 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1699931 5 0.5911 0.5740 0.000 0.180 0.064 0.080 0.676
#> SRR1699933 3 0.5167 0.7346 0.000 0.000 0.684 0.116 0.200
#> SRR1699932 5 0.4527 0.7036 0.000 0.392 0.000 0.012 0.596
#> SRR1699934 1 0.2654 0.8946 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1699935 5 0.5826 0.4592 0.000 0.100 0.008 0.296 0.596
#> SRR1699936 2 0.0290 0.8350 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699937 2 0.5614 0.5401 0.000 0.688 0.072 0.044 0.196
#> SRR1699938 2 0.0613 0.8328 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR1699940 3 0.5873 0.7152 0.000 0.048 0.668 0.084 0.200
#> SRR1699939 2 0.1043 0.8169 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1699941 3 0.4819 0.7457 0.000 0.000 0.716 0.092 0.192
#> SRR1699942 2 0.6817 0.3999 0.000 0.588 0.148 0.068 0.196
#> SRR1699943 2 0.1770 0.7996 0.000 0.936 0.008 0.008 0.048
#> SRR1699944 2 0.1455 0.8117 0.000 0.952 0.008 0.008 0.032
#> SRR1699945 3 0.4761 0.6565 0.000 0.000 0.732 0.144 0.124
#> SRR1699946 2 0.5601 0.5276 0.000 0.680 0.100 0.024 0.196
#> SRR1699947 2 0.4270 0.6234 0.000 0.764 0.040 0.008 0.188
#> SRR1699948 2 0.1243 0.8188 0.000 0.960 0.004 0.008 0.028
#> SRR1699949 2 0.2648 0.6544 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1699950 2 0.0880 0.8180 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699951 2 0.4817 0.6309 0.000 0.748 0.016 0.080 0.156
#> SRR1699952 2 0.4968 0.5757 0.000 0.724 0.068 0.016 0.192
#> SRR1699953 2 0.0404 0.8363 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699954 3 0.5604 0.7205 0.000 0.036 0.688 0.084 0.192
#> SRR1699955 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.4317 0.7277 0.000 0.000 0.772 0.116 0.112
#> SRR1699957 2 0.2753 0.7508 0.000 0.876 0.008 0.012 0.104
#> SRR1699959 3 0.5954 0.6133 0.000 0.000 0.576 0.272 0.152
#> SRR1699958 4 0.5097 0.6634 0.000 0.148 0.016 0.728 0.108
#> SRR1699960 2 0.0703 0.8250 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699961 3 0.5873 0.7097 0.000 0.048 0.668 0.084 0.200
#> SRR1699962 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.8181 -0.1370 0.000 0.392 0.276 0.148 0.184
#> SRR1699964 2 0.1770 0.8037 0.000 0.936 0.008 0.008 0.048
#> SRR1699965 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699966 4 0.7086 0.4572 0.000 0.040 0.168 0.488 0.304
#> SRR1699967 2 0.2241 0.7739 0.000 0.908 0.008 0.008 0.076
#> SRR1699968 5 0.5553 0.6251 0.000 0.228 0.072 0.028 0.672
#> SRR1699969 3 0.4451 0.6907 0.000 0.000 0.712 0.248 0.040
#> SRR1699971 3 0.5060 0.7342 0.000 0.000 0.692 0.104 0.204
#> SRR1699970 2 0.2533 0.7579 0.000 0.888 0.008 0.008 0.096
#> SRR1699972 3 0.4803 0.7441 0.000 0.000 0.720 0.096 0.184
#> SRR1699973 4 0.5706 0.5857 0.000 0.096 0.012 0.632 0.260
#> SRR1699974 3 0.3110 0.6984 0.000 0.000 0.860 0.080 0.060
#> SRR1699975 5 0.6137 0.6223 0.000 0.176 0.068 0.096 0.660
#> SRR1699976 3 0.6086 0.7078 0.000 0.052 0.652 0.096 0.200
#> SRR1699977 3 0.5446 0.7273 0.000 0.000 0.660 0.164 0.176
#> SRR1699978 3 0.4767 0.6586 0.004 0.000 0.732 0.180 0.084
#> SRR1699979 4 0.6564 -0.2072 0.000 0.000 0.376 0.420 0.204
#> SRR1699980 5 0.5231 0.6693 0.000 0.188 0.036 0.060 0.716
#> SRR1699981 3 0.4212 0.7463 0.000 0.000 0.776 0.144 0.080
#> SRR1699982 5 0.4210 0.6900 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1699983 5 0.5458 0.7158 0.000 0.304 0.000 0.088 0.608
#> SRR1699984 1 0.2654 0.8946 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1699985 2 0.4201 -0.3146 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1699986 3 0.4121 0.6492 0.000 0.000 0.788 0.112 0.100
#> SRR1699988 5 0.5181 0.5719 0.000 0.400 0.020 0.016 0.564
#> SRR1699987 4 0.5091 0.5355 0.000 0.000 0.236 0.676 0.088
#> SRR1699989 5 0.4321 0.6935 0.000 0.396 0.000 0.004 0.600
#> SRR1699990 3 0.6882 0.3260 0.000 0.004 0.392 0.264 0.340
#> SRR1699992 3 0.5348 0.7327 0.000 0.008 0.684 0.108 0.200
#> SRR1699991 3 0.3702 0.7743 0.000 0.000 0.820 0.084 0.096
#> SRR1699993 3 0.5615 0.5873 0.004 0.000 0.644 0.224 0.128
#> SRR1699994 3 0.2139 0.7480 0.000 0.000 0.916 0.052 0.032
#> SRR1699995 1 0.6758 0.6535 0.584 0.000 0.232 0.072 0.112
#> SRR1699996 2 0.3485 0.7016 0.000 0.828 0.048 0.000 0.124
#> SRR1699997 4 0.3844 0.7735 0.000 0.000 0.044 0.792 0.164
#> SRR1699998 2 0.5869 0.5403 0.000 0.688 0.096 0.064 0.152
#> SRR1699999 1 0.7044 0.5401 0.516 0.000 0.296 0.060 0.128
#> SRR1700000 3 0.5055 0.7341 0.000 0.004 0.704 0.096 0.196
#> SRR1700002 3 0.6026 0.7146 0.000 0.036 0.652 0.120 0.192
#> SRR1700001 3 0.4675 0.7671 0.000 0.000 0.736 0.100 0.164
#> SRR1700003 3 0.6373 0.6911 0.000 0.064 0.632 0.108 0.196
#> SRR1700004 3 0.4548 0.7683 0.000 0.000 0.752 0.124 0.124
#> SRR1700005 1 0.0404 0.9054 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700006 3 0.5665 0.7209 0.000 0.028 0.676 0.096 0.200
#> SRR1700007 5 0.4307 0.5522 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1700008 4 0.4527 0.5659 0.000 0.000 0.272 0.692 0.036
#> SRR1700009 1 0.1386 0.9017 0.952 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR1700010 3 0.4164 0.7028 0.000 0.000 0.784 0.120 0.096
#> SRR1700011 2 0.0703 0.8251 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700013 4 0.7841 -0.2165 0.000 0.084 0.340 0.380 0.196
#> SRR1700012 3 0.6133 0.6970 0.000 0.052 0.648 0.100 0.200
#> SRR1700014 3 0.5635 0.6983 0.000 0.000 0.620 0.128 0.252
#> SRR1700015 3 0.7651 0.4326 0.000 0.260 0.460 0.080 0.200
#> SRR1700016 1 0.5220 0.8074 0.732 0.000 0.136 0.032 0.100
#> SRR1700018 3 0.5453 0.7246 0.000 0.024 0.692 0.088 0.196
#> SRR1700017 3 0.4886 0.7387 0.000 0.000 0.712 0.100 0.188
#> SRR1700019 2 0.4305 -0.5252 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1700020 3 0.3620 0.6726 0.000 0.000 0.824 0.108 0.068
#> SRR1700021 5 0.5505 0.7149 0.000 0.304 0.000 0.092 0.604
#> SRR1700023 3 0.5184 0.7370 0.000 0.000 0.688 0.136 0.176
#> SRR1700022 3 0.4169 0.7644 0.000 0.000 0.784 0.100 0.116
#> SRR1700024 5 0.5856 0.5636 0.000 0.116 0.036 0.176 0.672
#> SRR1700025 2 0.6768 0.3885 0.000 0.588 0.152 0.060 0.200
#> SRR1700026 3 0.5498 0.7298 0.000 0.020 0.684 0.096 0.200
#> SRR1700027 3 0.4982 0.7341 0.000 0.000 0.700 0.100 0.200
#> SRR1700028 4 0.4143 0.7477 0.000 0.004 0.036 0.764 0.196
#> SRR1700029 3 0.5535 0.3313 0.000 0.000 0.536 0.392 0.072
#> SRR1700030 5 0.4525 0.7116 0.000 0.360 0.000 0.016 0.624
#> SRR1700031 3 0.1918 0.7362 0.000 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1700032 2 0.6126 0.4882 0.000 0.628 0.076 0.052 0.244
#> SRR1700034 1 0.4378 0.8581 0.800 0.000 0.080 0.032 0.088
#> SRR1700035 5 0.5289 0.7181 0.000 0.312 0.000 0.072 0.616
#> SRR1700033 3 0.1809 0.7545 0.000 0.000 0.928 0.060 0.012
#> SRR1700036 5 0.5242 0.5980 0.000 0.144 0.116 0.020 0.720
#> SRR1700037 5 0.4235 0.6768 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1700038 3 0.4421 0.7590 0.000 0.000 0.748 0.068 0.184
#> SRR1700039 3 0.3464 0.6870 0.000 0.000 0.836 0.096 0.068
#> SRR1700040 3 0.2853 0.7647 0.000 0.000 0.876 0.072 0.052
#> SRR1700041 3 0.3921 0.7732 0.000 0.000 0.800 0.072 0.128
#> SRR1700042 3 0.2300 0.7560 0.000 0.000 0.904 0.072 0.024
#> SRR1700043 3 0.3289 0.7785 0.000 0.000 0.844 0.048 0.108
#> SRR1700045 3 0.4696 0.7689 0.000 0.000 0.736 0.108 0.156
#> SRR1700044 3 0.4975 0.7457 0.000 0.004 0.700 0.076 0.220
#> SRR1700046 3 0.4114 0.7670 0.000 0.000 0.776 0.060 0.164
#> SRR1700047 3 0.3688 0.7760 0.000 0.000 0.816 0.060 0.124
#> SRR1700048 3 0.5763 0.6672 0.000 0.000 0.620 0.192 0.188
#> SRR1700049 3 0.3854 0.6701 0.004 0.000 0.816 0.100 0.080
#> SRR1700050 3 0.3825 0.6963 0.000 0.000 0.804 0.136 0.060
#> SRR1700051 3 0.3857 0.6608 0.000 0.000 0.808 0.108 0.084
#> SRR1700052 3 0.2511 0.7360 0.000 0.000 0.892 0.080 0.028
#> SRR1700053 3 0.5613 0.6061 0.000 0.000 0.592 0.100 0.308
#> SRR1700054 3 0.3506 0.7727 0.000 0.000 0.832 0.064 0.104
#> SRR1700055 1 0.2139 0.8993 0.916 0.000 0.000 0.032 0.052
#> SRR1700056 3 0.4637 0.5888 0.000 0.000 0.672 0.292 0.036
#> SRR1700057 3 0.4691 0.5682 0.000 0.000 0.680 0.276 0.044
#> SRR1700058 3 0.2291 0.7626 0.000 0.000 0.908 0.056 0.036
#> SRR1700059 4 0.3197 0.7564 0.000 0.000 0.140 0.836 0.024
#> SRR1700060 3 0.3130 0.7620 0.000 0.000 0.856 0.096 0.048
#> SRR1700061 3 0.3780 0.7723 0.000 0.000 0.808 0.060 0.132
#> SRR1700062 3 0.3506 0.7146 0.000 0.000 0.824 0.132 0.044
#> SRR1700063 3 0.3346 0.7720 0.000 0.000 0.844 0.064 0.092
#> SRR1700064 5 0.6518 -0.0532 0.000 0.000 0.240 0.276 0.484
#> SRR1700065 3 0.3180 0.7693 0.000 0.000 0.856 0.076 0.068
#> SRR1700066 3 0.1992 0.7435 0.000 0.000 0.924 0.044 0.032
#> SRR1700067 4 0.4816 0.1085 0.000 0.008 0.008 0.496 0.488
#> SRR1700068 3 0.3942 0.6875 0.000 0.000 0.748 0.232 0.020
#> SRR1700069 5 0.5927 -0.0341 0.000 0.000 0.340 0.120 0.540
#> SRR1700070 2 0.4403 -0.2550 0.000 0.560 0.004 0.000 0.436
#> SRR1700071 3 0.3303 0.7750 0.000 0.000 0.848 0.076 0.076
#> SRR1700072 3 0.2927 0.7667 0.000 0.000 0.872 0.060 0.068
#> SRR1700073 5 0.5848 0.6420 0.000 0.192 0.000 0.200 0.608
#> SRR1700075 3 0.4010 0.7688 0.000 0.000 0.784 0.056 0.160
#> SRR1700074 3 0.4297 0.7625 0.000 0.000 0.764 0.072 0.164
#> SRR1700076 3 0.5205 0.7370 0.000 0.000 0.672 0.104 0.224
#> SRR1700077 3 0.3622 0.7709 0.000 0.000 0.816 0.048 0.136
#> SRR1700078 3 0.4693 0.7464 0.000 0.000 0.724 0.080 0.196
#> SRR1700080 3 0.4877 0.7449 0.000 0.000 0.692 0.072 0.236
#> SRR1700079 3 0.4349 0.7419 0.000 0.000 0.756 0.176 0.068
#> SRR1700081 3 0.2964 0.7398 0.000 0.000 0.856 0.120 0.024
#> SRR1700082 3 0.4098 0.7665 0.000 0.000 0.780 0.064 0.156
#> SRR1700083 3 0.3506 0.6867 0.000 0.000 0.832 0.104 0.064
#> SRR1700084 3 0.2304 0.7259 0.000 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1700085 5 0.4537 0.7013 0.000 0.396 0.000 0.012 0.592
#> SRR1700086 3 0.4985 0.7207 0.000 0.000 0.680 0.076 0.244
#> SRR1700087 4 0.4456 0.6500 0.000 0.016 0.156 0.772 0.056
#> SRR1700088 4 0.8249 -0.0812 0.000 0.156 0.288 0.372 0.184
#> SRR1700089 4 0.5222 0.6101 0.000 0.016 0.156 0.716 0.112
#> SRR1700091 4 0.4393 0.7183 0.000 0.088 0.020 0.792 0.100
#> SRR1700090 4 0.3281 0.7854 0.000 0.000 0.060 0.848 0.092
#> SRR1700092 4 0.4952 0.6938 0.000 0.112 0.032 0.756 0.100
#> SRR1700094 4 0.5216 0.6701 0.000 0.124 0.036 0.736 0.104
#> SRR1700093 4 0.3986 0.7569 0.000 0.036 0.020 0.808 0.136
#> SRR1700095 4 0.2411 0.7402 0.000 0.000 0.108 0.884 0.008
#> SRR1700096 4 0.3546 0.7153 0.000 0.004 0.116 0.832 0.048
#> SRR1700097 3 0.4797 0.6245 0.000 0.000 0.724 0.172 0.104
#> SRR1700098 2 0.4983 0.4453 0.000 0.680 0.004 0.256 0.060
#> SRR1700099 4 0.5269 0.6677 0.000 0.136 0.012 0.708 0.144
#> SRR1700100 4 0.4082 0.7578 0.000 0.032 0.028 0.804 0.136
#> SRR1700101 4 0.4654 0.7078 0.000 0.100 0.016 0.768 0.116
#> SRR1700102 4 0.4894 0.6935 0.000 0.116 0.016 0.748 0.120
#> SRR1700104 4 0.4254 0.7631 0.000 0.028 0.060 0.804 0.108
#> SRR1700103 4 0.3427 0.7550 0.000 0.000 0.108 0.836 0.056
#> SRR1700105 4 0.3676 0.6994 0.000 0.004 0.004 0.760 0.232
#> SRR1700106 4 0.3093 0.7515 0.000 0.000 0.008 0.824 0.168
#> SRR1700107 4 0.4021 0.7620 0.000 0.016 0.036 0.800 0.148
#> SRR1700108 4 0.5153 0.6214 0.000 0.204 0.000 0.684 0.112
#> SRR1700109 2 0.1908 0.7553 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1700110 2 0.1197 0.8053 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700112 5 0.5204 0.7095 0.000 0.368 0.000 0.052 0.580
#> SRR1700111 4 0.3791 0.7898 0.000 0.000 0.076 0.812 0.112
#> SRR1700113 5 0.6220 0.5569 0.000 0.188 0.000 0.272 0.540
#> SRR1700114 4 0.3849 0.7728 0.000 0.004 0.052 0.808 0.136
#> SRR1700115 4 0.5683 0.4129 0.000 0.108 0.000 0.588 0.304
#> SRR1700116 4 0.3075 0.7890 0.000 0.000 0.048 0.860 0.092
#> SRR1700117 4 0.5094 0.3965 0.000 0.000 0.352 0.600 0.048
#> SRR1700119 4 0.3437 0.7877 0.000 0.000 0.048 0.832 0.120
#> SRR1700118 4 0.3946 0.7826 0.000 0.000 0.120 0.800 0.080
#> SRR1700120 4 0.5058 0.3069 0.000 0.000 0.384 0.576 0.040
#> SRR1700121 4 0.3962 0.6793 0.000 0.012 0.004 0.744 0.240
#> SRR1700122 5 0.5719 0.5071 0.000 0.120 0.000 0.284 0.596
#> SRR1700123 4 0.3035 0.7666 0.000 0.000 0.112 0.856 0.032
#> SRR1700125 5 0.5168 0.7137 0.000 0.356 0.000 0.052 0.592
#> SRR1700126 3 0.5137 0.1892 0.000 0.000 0.536 0.424 0.040
#> SRR1700127 4 0.2798 0.7417 0.000 0.000 0.140 0.852 0.008
#> SRR1700124 4 0.3386 0.7725 0.000 0.000 0.128 0.832 0.040
#> SRR1700128 4 0.3800 0.7823 0.000 0.000 0.108 0.812 0.080
#> SRR1700129 4 0.4275 0.6101 0.000 0.020 0.000 0.696 0.284
#> SRR1700130 4 0.3934 0.7032 0.000 0.004 0.012 0.748 0.236
#> SRR1700132 4 0.3016 0.7572 0.000 0.000 0.132 0.848 0.020
#> SRR1700131 4 0.3449 0.7395 0.000 0.000 0.164 0.812 0.024
#> SRR1700133 4 0.4129 0.7458 0.000 0.000 0.040 0.756 0.204
#> SRR1700134 5 0.5263 0.3221 0.000 0.056 0.000 0.368 0.576
#> SRR1700135 4 0.3967 0.7873 0.000 0.000 0.092 0.800 0.108
#> SRR1700136 4 0.3355 0.6997 0.000 0.000 0.184 0.804 0.012
#> SRR1700137 4 0.3995 0.7780 0.000 0.000 0.060 0.788 0.152
#> SRR1700138 4 0.4083 0.7851 0.000 0.000 0.080 0.788 0.132
#> SRR1700140 4 0.3967 0.7865 0.000 0.000 0.108 0.800 0.092
#> SRR1700139 4 0.3916 0.7848 0.000 0.000 0.104 0.804 0.092
#> SRR1700141 5 0.5909 0.5883 0.000 0.164 0.000 0.244 0.592
#> SRR1700142 3 0.4861 0.2277 0.000 0.000 0.548 0.428 0.024
#> SRR1700143 4 0.3224 0.7287 0.000 0.000 0.160 0.824 0.016
#> SRR1700144 3 0.3688 0.7646 0.000 0.000 0.816 0.124 0.060
#> SRR1700145 4 0.3106 0.7422 0.000 0.000 0.140 0.840 0.020
#> SRR1700146 5 0.5173 0.0357 0.000 0.040 0.000 0.460 0.500
#> SRR1700147 4 0.2909 0.7424 0.000 0.000 0.140 0.848 0.012
#> SRR1700149 4 0.4822 0.5257 0.000 0.000 0.288 0.664 0.048
#> SRR1700148 4 0.2886 0.7381 0.000 0.000 0.148 0.844 0.008
#> SRR1700150 4 0.4194 0.6334 0.000 0.012 0.004 0.708 0.276
#> SRR1700152 4 0.4064 0.7869 0.000 0.000 0.092 0.792 0.116
#> SRR1700151 4 0.3622 0.7689 0.000 0.000 0.136 0.816 0.048
#> SRR1700153 4 0.2763 0.7414 0.000 0.000 0.148 0.848 0.004
#> SRR1700154 4 0.3719 0.7793 0.000 0.000 0.116 0.816 0.068
#> SRR1700155 4 0.4078 0.7799 0.000 0.000 0.068 0.784 0.148
#> SRR1700156 4 0.3010 0.7170 0.000 0.000 0.172 0.824 0.004
#> SRR1700158 4 0.4468 0.5962 0.000 0.000 0.240 0.716 0.044
#> SRR1700159 5 0.5834 0.6994 0.000 0.276 0.000 0.136 0.588
#> SRR1700157 4 0.4114 0.6233 0.000 0.000 0.244 0.732 0.024
#> SRR1700160 4 0.3754 0.7879 0.000 0.000 0.084 0.816 0.100
#> SRR1700161 4 0.3442 0.7780 0.000 0.000 0.104 0.836 0.060
#> SRR1700162 5 0.5080 0.3164 0.000 0.044 0.000 0.368 0.588
#> SRR1700164 4 0.3489 0.7263 0.000 0.000 0.144 0.820 0.036
#> SRR1700163 4 0.3710 0.6754 0.000 0.000 0.192 0.784 0.024
#> SRR1700165 4 0.2843 0.7475 0.000 0.000 0.144 0.848 0.008
#> SRR1700166 4 0.3930 0.7776 0.000 0.000 0.056 0.792 0.152
#> SRR1700168 5 0.5930 0.6543 0.000 0.208 0.000 0.196 0.596
#> SRR1700167 4 0.4397 0.5723 0.000 0.000 0.276 0.696 0.028
#> SRR1700170 4 0.4069 0.7857 0.000 0.000 0.076 0.788 0.136
#> SRR1700169 4 0.4317 0.7848 0.000 0.000 0.116 0.772 0.112
#> SRR1700171 4 0.3953 0.6967 0.012 0.000 0.144 0.804 0.040
#> SRR1700172 4 0.3975 0.6919 0.000 0.008 0.008 0.744 0.240
#> SRR1700174 4 0.3682 0.7853 0.000 0.000 0.072 0.820 0.108
#> SRR1700173 4 0.3477 0.7801 0.000 0.000 0.040 0.824 0.136
#> SRR1700175 4 0.4080 0.6528 0.000 0.020 0.000 0.728 0.252
#> SRR1700176 3 0.5160 0.4221 0.000 0.000 0.608 0.336 0.056
#> SRR1700178 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.3642 0.7093 0.000 0.000 0.008 0.760 0.232
#> SRR1700180 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.2438 0.8965 0.900 0.000 0.000 0.040 0.060
#> SRR1700182 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700186 2 0.2026 0.7917 0.000 0.924 0.012 0.008 0.056
#> SRR1700187 1 0.3369 0.8821 0.856 0.000 0.024 0.028 0.092
#> SRR1700185 1 0.0324 0.9046 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700188 2 0.0613 0.8327 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR1700192 3 0.8286 0.4226 0.092 0.092 0.508 0.092 0.216
#> SRR1700190 3 0.6147 0.5387 0.072 0.000 0.668 0.128 0.132
#> SRR1700191 1 0.2438 0.8965 0.900 0.000 0.000 0.040 0.060
#> SRR1700189 3 0.7500 0.0914 0.272 0.000 0.492 0.112 0.124
#> SRR1700193 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700194 1 0.0451 0.9053 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700196 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.7121 -0.0728 0.352 0.000 0.468 0.060 0.120
#> SRR1700198 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700200 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.3349 0.7386 0.000 0.860 0.016 0.052 0.072
#> SRR1700203 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0955 0.8261 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700206 2 0.1121 0.8196 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.6033 0.6463 0.004 0.004 0.612 0.160 0.220
#> SRR1700205 2 0.1197 0.8011 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700209 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700211 2 0.0671 0.8328 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700212 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.6446 0.4307 0.000 0.600 0.164 0.032 0.204
#> SRR1700214 2 0.0404 0.8357 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700215 1 0.2438 0.8965 0.900 0.000 0.000 0.040 0.060
#> SRR1700217 2 0.0404 0.8328 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700216 1 0.2654 0.8946 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1700218 2 0.0865 0.8302 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.2958 0.8885 0.880 0.000 0.020 0.024 0.076
#> SRR1700220 2 0.0880 0.8182 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700221 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.2329 0.7465 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0290 0.8374 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700225 2 0.5361 0.5663 0.000 0.712 0.084 0.032 0.172
#> SRR1700227 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700230 3 0.6633 0.4315 0.124 0.000 0.628 0.112 0.136
#> SRR1700231 2 0.0290 0.8372 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700228 2 0.0510 0.8344 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700232 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700233 2 0.1124 0.8200 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1700234 2 0.1041 0.8270 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1700235 2 0.0955 0.8279 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700237 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700239 1 0.3564 0.8784 0.844 0.000 0.028 0.028 0.100
#> SRR1700240 1 0.0451 0.9044 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700241 4 0.5795 0.5032 0.000 0.012 0.196 0.648 0.144
#> SRR1700243 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.6894 0.4639 0.096 0.000 0.596 0.156 0.152
#> SRR1700246 2 0.3565 0.6813 0.000 0.800 0.024 0.000 0.176
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.4308 0.8601 0.804 0.000 0.068 0.032 0.096
#> SRR1700249 1 0.0451 0.9052 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700250 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700248 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0162 0.8382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700252 2 0.7265 0.2976 0.000 0.536 0.180 0.080 0.204
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.3647 0.8772 0.840 0.000 0.032 0.028 0.100
#> SRR1700255 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0703 0.8243 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700260 2 0.3039 0.5584 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1700261 2 0.4262 -0.3794 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1700262 2 0.3424 0.4208 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1700263 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.2968 0.7437 0.000 0.872 0.028 0.008 0.092
#> SRR1700265 2 0.4791 0.6105 0.000 0.748 0.064 0.020 0.168
#> SRR1700266 2 0.0963 0.8143 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700268 5 0.7736 0.3518 0.000 0.220 0.148 0.144 0.488
#> SRR1700270 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0880 0.8177 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700272 2 0.1965 0.7421 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1700273 2 0.0404 0.8372 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700274 2 0.0510 0.8307 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700277 3 0.5073 0.7349 0.000 0.000 0.688 0.100 0.212
#> SRR1700275 5 0.4604 0.6698 0.000 0.428 0.000 0.012 0.560
#> SRR1700276 2 0.4268 -0.3982 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1700278 5 0.4307 0.5572 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1700279 5 0.4367 0.6870 0.000 0.416 0.000 0.004 0.580
#> SRR1700280 5 0.4304 0.5826 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8386 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 5 0.4430 0.6354 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1700282 5 0.6241 0.6085 0.000 0.192 0.004 0.240 0.564
#> SRR1700284 5 0.4359 0.6906 0.000 0.412 0.000 0.004 0.584
#> SRR1700285 5 0.4537 0.7018 0.000 0.396 0.000 0.012 0.592
#> SRR1700286 2 0.4256 -0.3635 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1700287 5 0.4304 0.5815 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1700290 3 0.5959 0.5277 0.068 0.000 0.684 0.112 0.136
#> SRR1700289 5 0.4235 0.6769 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1700288 2 0.1121 0.8027 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700292 5 0.4262 0.6584 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1700291 5 0.5808 0.6939 0.000 0.232 0.000 0.160 0.608
#> SRR1700293 2 0.4242 -0.3835 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1700294 5 0.4497 0.6797 0.000 0.424 0.000 0.008 0.568
#> SRR1700295 4 0.5168 0.1963 0.000 0.000 0.040 0.508 0.452
#> SRR1700297 5 0.4242 0.6737 0.000 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1700296 5 0.4304 0.5826 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1700298 5 0.5264 0.7112 0.000 0.256 0.000 0.092 0.652
#> SRR1700299 5 0.5141 0.3343 0.000 0.036 0.012 0.320 0.632
#> SRR1700300 5 0.6276 0.6120 0.000 0.184 0.024 0.180 0.612
#> SRR1700302 5 0.4921 0.7147 0.000 0.360 0.000 0.036 0.604
#> SRR1700301 5 0.4256 0.6638 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1700303 5 0.4446 0.6992 0.000 0.400 0.000 0.008 0.592
#> SRR1700304 5 0.4504 0.6764 0.000 0.428 0.000 0.008 0.564
#> SRR1700305 5 0.4542 0.6381 0.000 0.456 0.000 0.008 0.536
#> SRR1700306 5 0.4909 0.2034 0.000 0.000 0.032 0.380 0.588
#> SRR1700308 5 0.5093 0.6318 0.000 0.340 0.020 0.020 0.620
#> SRR1700307 5 0.6094 -0.0195 0.000 0.004 0.312 0.132 0.552
#> SRR1700309 5 0.5516 0.2397 0.000 0.000 0.128 0.232 0.640
#> SRR1700310 5 0.4278 0.6423 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1700311 5 0.5570 0.4991 0.000 0.104 0.000 0.288 0.608
#> SRR1700312 5 0.4300 0.6100 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1700313 5 0.6445 0.4643 0.000 0.116 0.096 0.144 0.644
#> SRR1700314 5 0.4610 0.1854 0.000 0.000 0.016 0.388 0.596
#> SRR1700315 5 0.5956 0.6226 0.000 0.188 0.020 0.148 0.644
#> SRR1700316 5 0.5803 0.3972 0.000 0.080 0.016 0.300 0.604
#> SRR1700317 2 0.4300 -0.5128 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1700318 5 0.5045 0.7169 0.000 0.308 0.000 0.056 0.636
#> SRR1700319 5 0.4651 0.1308 0.000 0.004 0.008 0.428 0.560
#> SRR1700320 5 0.4610 0.7060 0.000 0.388 0.000 0.016 0.596
#> SRR1700322 5 0.4744 0.6974 0.000 0.408 0.000 0.020 0.572
#> SRR1700321 5 0.4210 0.6887 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1700323 5 0.5806 0.7011 0.000 0.256 0.000 0.144 0.600
#> SRR1700324 5 0.4268 0.6521 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1700325 2 0.4138 -0.2029 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1700326 4 0.5314 0.2881 0.000 0.004 0.044 0.548 0.404
#> SRR1700327 5 0.4383 0.6768 0.000 0.424 0.000 0.004 0.572
#> SRR1700329 5 0.4517 0.6660 0.000 0.436 0.000 0.008 0.556
#> SRR1700328 5 0.6900 0.3343 0.000 0.080 0.168 0.164 0.588
#> SRR1700330 5 0.5729 0.5049 0.000 0.104 0.012 0.248 0.636
#> SRR1700331 5 0.4812 0.7120 0.000 0.372 0.000 0.028 0.600
#> SRR1700332 5 0.4588 0.7097 0.000 0.380 0.000 0.016 0.604
#> SRR1700333 5 0.4451 0.5860 0.000 0.492 0.000 0.004 0.504
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.3337 0.88601 0.000 0.736 0.000 0.000 0.260 0.004
#> SRR1699875 2 0.3236 0.79734 0.000 0.820 0.036 0.000 0.140 0.004
#> SRR1699876 5 0.0951 0.78883 0.000 0.020 0.004 0.000 0.968 0.008
#> SRR1699877 2 0.3126 0.88617 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1699879 2 0.4072 0.66326 0.000 0.544 0.000 0.000 0.448 0.008
#> SRR1699878 2 0.3380 0.87855 0.000 0.748 0.004 0.000 0.244 0.004
#> SRR1699880 3 0.5229 0.32811 0.000 0.108 0.608 0.008 0.000 0.276
#> SRR1699881 3 0.5109 0.48924 0.000 0.108 0.728 0.084 0.012 0.068
#> SRR1699882 2 0.3975 0.75332 0.000 0.600 0.000 0.000 0.392 0.008
#> SRR1699883 2 0.3217 0.87532 0.000 0.768 0.008 0.000 0.224 0.000
#> SRR1699884 2 0.3424 0.85983 0.000 0.772 0.024 0.000 0.204 0.000
#> SRR1699885 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1699886 5 0.0870 0.79299 0.000 0.012 0.004 0.000 0.972 0.012
#> SRR1699888 2 0.3330 0.87578 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1699889 5 0.0798 0.79530 0.000 0.004 0.004 0.004 0.976 0.012
#> SRR1699890 5 0.2213 0.71761 0.000 0.100 0.004 0.000 0.888 0.008
#> SRR1699887 5 0.1370 0.77967 0.000 0.036 0.004 0.000 0.948 0.012
#> SRR1699891 5 0.0653 0.79628 0.000 0.000 0.004 0.004 0.980 0.012
#> SRR1699892 3 0.6030 0.16362 0.000 0.400 0.460 0.004 0.112 0.024
#> SRR1699893 4 0.2762 0.82814 0.000 0.008 0.036 0.884 0.056 0.016
#> SRR1699894 5 0.0551 0.79624 0.000 0.000 0.004 0.004 0.984 0.008
#> SRR1699895 5 0.0696 0.79525 0.000 0.004 0.004 0.004 0.980 0.008
#> SRR1699896 3 0.5783 0.12157 0.000 0.108 0.488 0.000 0.384 0.020
#> SRR1699897 2 0.4385 0.70832 0.000 0.588 0.012 0.000 0.388 0.012
#> SRR1699898 6 0.5246 0.22326 0.000 0.016 0.456 0.056 0.000 0.472
#> SRR1699900 3 0.3120 0.57552 0.000 0.040 0.860 0.016 0.008 0.076
#> SRR1699899 5 0.0767 0.79250 0.000 0.012 0.004 0.000 0.976 0.008
#> SRR1699902 3 0.3520 0.46951 0.000 0.000 0.776 0.036 0.000 0.188
#> SRR1699901 3 0.5106 0.06453 0.000 0.020 0.564 0.048 0.000 0.368
#> SRR1699903 5 0.1666 0.79649 0.000 0.000 0.008 0.036 0.936 0.020
#> SRR1699904 5 0.0551 0.79763 0.000 0.000 0.004 0.008 0.984 0.004
#> SRR1699905 3 0.5245 0.10544 0.000 0.024 0.568 0.056 0.000 0.352
#> SRR1699906 5 0.0862 0.79059 0.000 0.016 0.004 0.000 0.972 0.008
#> SRR1699907 5 0.0653 0.79628 0.000 0.000 0.004 0.004 0.980 0.012
#> SRR1699908 5 0.1232 0.79804 0.000 0.000 0.004 0.024 0.956 0.016
#> SRR1699909 5 0.3394 0.78303 0.000 0.056 0.020 0.052 0.852 0.020
#> SRR1699910 5 0.4890 0.30302 0.000 0.004 0.008 0.404 0.548 0.036
#> SRR1699911 5 0.2714 0.78157 0.000 0.008 0.052 0.032 0.888 0.020
#> SRR1699912 5 0.0964 0.79787 0.000 0.000 0.004 0.016 0.968 0.012
#> SRR1699913 5 0.0767 0.79289 0.000 0.012 0.004 0.000 0.976 0.008
#> SRR1699914 3 0.3664 0.54876 0.000 0.012 0.816 0.052 0.008 0.112
#> SRR1699915 5 0.4861 0.56574 0.000 0.008 0.032 0.252 0.676 0.032
#> SRR1699916 5 0.3265 0.49476 0.000 0.248 0.004 0.000 0.748 0.000
#> SRR1699917 5 0.4204 0.55504 0.000 0.004 0.012 0.296 0.676 0.012
#> SRR1699918 5 0.4344 0.75642 0.000 0.060 0.064 0.068 0.792 0.016
#> SRR1699919 5 0.2365 0.78513 0.000 0.000 0.012 0.068 0.896 0.024
#> SRR1699920 5 0.6964 0.26771 0.000 0.016 0.264 0.236 0.444 0.040
#> SRR1699921 5 0.3540 0.72216 0.000 0.004 0.020 0.140 0.812 0.024
#> SRR1699922 5 0.1321 0.79063 0.000 0.024 0.004 0.000 0.952 0.020
#> SRR1699923 3 0.3182 0.54383 0.000 0.012 0.828 0.024 0.000 0.136
#> SRR1699924 3 0.4923 0.36267 0.000 0.000 0.676 0.184 0.008 0.132
#> SRR1699925 1 0.1679 0.84946 0.936 0.036 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1699926 5 0.4681 0.68431 0.000 0.012 0.068 0.148 0.744 0.028
#> SRR1699927 5 0.0951 0.79792 0.000 0.000 0.004 0.020 0.968 0.008
#> SRR1699929 5 0.5073 0.49682 0.000 0.060 0.288 0.000 0.628 0.024
#> SRR1699928 5 0.0767 0.79704 0.000 0.000 0.004 0.008 0.976 0.012
#> SRR1699930 5 0.0951 0.78894 0.000 0.020 0.004 0.000 0.968 0.008
#> SRR1699931 5 0.5972 0.44974 0.000 0.068 0.296 0.036 0.576 0.024
#> SRR1699933 3 0.3009 0.56438 0.000 0.096 0.860 0.012 0.012 0.020
#> SRR1699932 5 0.0653 0.79628 0.000 0.000 0.004 0.004 0.980 0.012
#> SRR1699934 1 0.1679 0.84946 0.936 0.036 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1699935 5 0.4984 0.54661 0.000 0.016 0.040 0.292 0.640 0.012
#> SRR1699936 2 0.3351 0.87174 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1699937 2 0.4110 0.62682 0.000 0.744 0.184 0.000 0.068 0.004
#> SRR1699938 2 0.2969 0.87315 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1699940 3 0.4734 0.48324 0.000 0.132 0.724 0.016 0.004 0.124
#> SRR1699939 2 0.3563 0.78552 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1699941 3 0.4483 0.48721 0.000 0.120 0.728 0.008 0.000 0.144
#> SRR1699942 2 0.4548 0.34506 0.000 0.640 0.320 0.012 0.024 0.004
#> SRR1699943 2 0.2491 0.83161 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1699944 2 0.2491 0.82973 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1699945 6 0.4840 0.46807 0.000 0.060 0.312 0.008 0.000 0.620
#> SRR1699946 2 0.4095 0.56411 0.000 0.724 0.216 0.000 0.060 0.000
#> SRR1699947 2 0.3469 0.71951 0.000 0.808 0.104 0.000 0.088 0.000
#> SRR1699948 2 0.2664 0.84649 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1699949 5 0.3868 -0.53541 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1699950 2 0.3684 0.78184 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1699951 2 0.5888 0.58027 0.000 0.600 0.104 0.040 0.248 0.008
#> SRR1699952 2 0.3602 0.65059 0.000 0.784 0.160 0.000 0.056 0.000
#> SRR1699953 2 0.3390 0.86040 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1699954 3 0.3004 0.55772 0.000 0.112 0.848 0.012 0.000 0.028
#> SRR1699955 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1699956 6 0.5422 0.22500 0.000 0.080 0.436 0.012 0.000 0.472
#> SRR1699957 2 0.3459 0.78402 0.000 0.792 0.032 0.000 0.172 0.004
#> SRR1699959 3 0.6056 0.34695 0.000 0.116 0.612 0.192 0.004 0.076
#> SRR1699958 4 0.3641 0.78008 0.000 0.096 0.048 0.824 0.028 0.004
#> SRR1699960 2 0.3515 0.84198 0.000 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1699961 3 0.3646 0.54328 0.000 0.136 0.804 0.008 0.004 0.048
#> SRR1699962 2 0.3244 0.88401 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1699963 3 0.5071 0.21366 0.000 0.400 0.528 0.068 0.000 0.004
#> SRR1699964 2 0.3053 0.83525 0.000 0.812 0.012 0.004 0.172 0.000
#> SRR1699965 2 0.3244 0.88382 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1699966 4 0.7895 0.08966 0.000 0.124 0.292 0.376 0.168 0.040
#> SRR1699967 2 0.2632 0.83126 0.000 0.832 0.004 0.000 0.164 0.000
#> SRR1699968 5 0.4288 0.66227 0.000 0.044 0.204 0.000 0.732 0.020
#> SRR1699969 3 0.6267 -0.17315 0.000 0.040 0.472 0.116 0.004 0.368
#> SRR1699971 3 0.2844 0.56075 0.000 0.104 0.860 0.016 0.000 0.020
#> SRR1699970 2 0.2826 0.80105 0.000 0.844 0.028 0.000 0.128 0.000
#> SRR1699972 3 0.2904 0.56064 0.000 0.112 0.852 0.008 0.000 0.028
#> SRR1699973 4 0.4999 0.69149 0.000 0.084 0.052 0.720 0.140 0.004
#> SRR1699974 6 0.4859 0.43553 0.000 0.040 0.348 0.016 0.000 0.596
#> SRR1699975 5 0.5223 0.59462 0.000 0.088 0.184 0.012 0.688 0.028
#> SRR1699976 3 0.3161 0.53993 0.000 0.156 0.820 0.008 0.004 0.012
#> SRR1699977 3 0.3514 0.55924 0.000 0.096 0.828 0.040 0.000 0.036
#> SRR1699978 6 0.5606 0.30307 0.000 0.016 0.420 0.092 0.000 0.472
#> SRR1699979 3 0.5241 0.32975 0.000 0.100 0.636 0.248 0.004 0.012
#> SRR1699980 5 0.3756 0.73662 0.000 0.032 0.096 0.028 0.824 0.020
#> SRR1699981 3 0.5606 -0.13088 0.000 0.040 0.492 0.056 0.000 0.412
#> SRR1699982 5 0.0405 0.79471 0.000 0.008 0.000 0.004 0.988 0.000
#> SRR1699983 5 0.1858 0.79364 0.000 0.000 0.012 0.052 0.924 0.012
#> SRR1699984 1 0.1679 0.84946 0.936 0.036 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1699985 5 0.3426 0.43206 0.000 0.276 0.000 0.000 0.720 0.004
#> SRR1699986 6 0.4519 0.54329 0.000 0.036 0.248 0.024 0.000 0.692
#> SRR1699988 5 0.4631 0.67472 0.000 0.132 0.112 0.008 0.736 0.012
#> SRR1699987 4 0.5398 0.47529 0.000 0.056 0.288 0.616 0.008 0.032
#> SRR1699989 5 0.1802 0.79319 0.000 0.024 0.024 0.000 0.932 0.020
#> SRR1699990 3 0.6240 0.40265 0.000 0.100 0.652 0.100 0.096 0.052
#> SRR1699992 3 0.3307 0.55846 0.000 0.120 0.828 0.012 0.000 0.040
#> SRR1699991 3 0.3773 0.44748 0.000 0.000 0.752 0.044 0.000 0.204
#> SRR1699993 6 0.5976 0.47243 0.000 0.052 0.252 0.104 0.004 0.588
#> SRR1699994 3 0.4711 0.08356 0.000 0.016 0.568 0.024 0.000 0.392
#> SRR1699995 6 0.4874 -0.04235 0.324 0.024 0.028 0.004 0.000 0.620
#> SRR1699996 2 0.5388 0.72275 0.000 0.604 0.200 0.000 0.192 0.004
#> SRR1699997 4 0.1893 0.84542 0.000 0.004 0.024 0.928 0.036 0.008
#> SRR1699998 2 0.5353 0.10360 0.000 0.512 0.404 0.004 0.072 0.008
#> SRR1699999 6 0.4900 0.12329 0.212 0.068 0.024 0.004 0.000 0.692
#> SRR1700000 3 0.2604 0.56182 0.000 0.100 0.872 0.008 0.000 0.020
#> SRR1700002 3 0.3694 0.54182 0.000 0.124 0.804 0.056 0.000 0.016
#> SRR1700001 3 0.4248 0.48065 0.000 0.060 0.752 0.012 0.004 0.172
#> SRR1700003 3 0.3352 0.53647 0.000 0.148 0.812 0.032 0.000 0.008
#> SRR1700004 3 0.5260 0.07484 0.000 0.048 0.576 0.024 0.004 0.348
#> SRR1700005 1 0.1082 0.86409 0.956 0.004 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700006 3 0.2466 0.56389 0.000 0.112 0.872 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700007 5 0.0790 0.78368 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1700008 4 0.4656 0.49820 0.000 0.016 0.036 0.640 0.000 0.308
#> SRR1700009 1 0.1970 0.85640 0.900 0.008 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1700010 6 0.5110 0.34787 0.000 0.072 0.396 0.004 0.000 0.528
#> SRR1700011 2 0.3563 0.83046 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1700013 3 0.6038 0.20860 0.000 0.156 0.536 0.284 0.004 0.020
#> SRR1700012 3 0.2556 0.55888 0.000 0.120 0.864 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700014 3 0.3317 0.57713 0.000 0.068 0.856 0.028 0.020 0.028
#> SRR1700015 3 0.3919 0.44372 0.000 0.244 0.728 0.016 0.004 0.008
#> SRR1700016 1 0.4730 0.48846 0.496 0.016 0.020 0.000 0.000 0.468
#> SRR1700018 3 0.2864 0.56546 0.000 0.100 0.860 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700017 3 0.2858 0.57062 0.000 0.088 0.868 0.012 0.004 0.028
#> SRR1700019 5 0.1501 0.75032 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1700020 6 0.4877 0.47206 0.000 0.028 0.344 0.028 0.000 0.600
#> SRR1700021 5 0.2058 0.78770 0.000 0.012 0.008 0.072 0.908 0.000
#> SRR1700023 3 0.4289 0.52889 0.000 0.112 0.780 0.052 0.004 0.052
#> SRR1700022 3 0.2858 0.56065 0.000 0.028 0.864 0.016 0.000 0.092
#> SRR1700024 5 0.5836 0.56435 0.000 0.032 0.152 0.188 0.620 0.008
#> SRR1700025 2 0.4381 0.33160 0.000 0.640 0.328 0.004 0.024 0.004
#> SRR1700026 3 0.2384 0.58346 0.000 0.040 0.900 0.016 0.000 0.044
#> SRR1700027 3 0.2478 0.57712 0.000 0.076 0.888 0.012 0.000 0.024
#> SRR1700028 4 0.3666 0.80291 0.000 0.040 0.052 0.832 0.068 0.008
#> SRR1700029 3 0.5662 -0.04506 0.000 0.012 0.460 0.432 0.004 0.092
#> SRR1700030 5 0.1476 0.79651 0.000 0.008 0.028 0.004 0.948 0.012
#> SRR1700031 3 0.5063 -0.15899 0.000 0.024 0.496 0.032 0.000 0.448
#> SRR1700032 2 0.5488 0.43529 0.000 0.576 0.260 0.004 0.160 0.000
#> SRR1700034 1 0.4651 0.64495 0.588 0.028 0.012 0.000 0.000 0.372
#> SRR1700035 5 0.2146 0.78993 0.000 0.008 0.024 0.060 0.908 0.000
#> SRR1700033 3 0.4634 0.17635 0.000 0.008 0.604 0.036 0.000 0.352
#> SRR1700036 5 0.3888 0.66057 0.000 0.004 0.212 0.012 0.752 0.020
#> SRR1700037 5 0.0547 0.79008 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1700038 3 0.2505 0.56811 0.000 0.016 0.888 0.012 0.004 0.080
#> SRR1700039 6 0.4895 0.48724 0.000 0.056 0.316 0.012 0.000 0.616
#> SRR1700040 3 0.4608 0.31208 0.000 0.012 0.656 0.044 0.000 0.288
#> SRR1700041 3 0.3000 0.53937 0.000 0.004 0.840 0.032 0.000 0.124
#> SRR1700042 3 0.4696 0.16310 0.000 0.008 0.600 0.040 0.000 0.352
#> SRR1700043 3 0.3018 0.54089 0.000 0.024 0.848 0.016 0.000 0.112
#> SRR1700045 3 0.3610 0.56245 0.000 0.028 0.820 0.052 0.000 0.100
#> SRR1700044 3 0.2475 0.58184 0.000 0.036 0.892 0.012 0.000 0.060
#> SRR1700046 3 0.2558 0.54800 0.000 0.000 0.868 0.028 0.000 0.104
#> SRR1700047 3 0.4321 0.42401 0.000 0.020 0.716 0.036 0.000 0.228
#> SRR1700048 3 0.4297 0.54942 0.000 0.020 0.788 0.096 0.024 0.072
#> SRR1700049 6 0.4640 0.50995 0.000 0.024 0.284 0.032 0.000 0.660
#> SRR1700050 6 0.5382 0.40446 0.000 0.032 0.376 0.052 0.000 0.540
#> SRR1700051 6 0.4794 0.46276 0.000 0.024 0.340 0.028 0.000 0.608
#> SRR1700052 3 0.4784 0.12772 0.000 0.024 0.592 0.024 0.000 0.360
#> SRR1700053 3 0.4695 0.48332 0.000 0.012 0.760 0.056 0.104 0.068
#> SRR1700054 3 0.3354 0.49068 0.000 0.000 0.796 0.036 0.000 0.168
#> SRR1700055 1 0.1442 0.86006 0.944 0.040 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700056 6 0.6371 0.31804 0.000 0.012 0.320 0.280 0.000 0.388
#> SRR1700057 6 0.5964 0.45456 0.000 0.020 0.296 0.140 0.004 0.540
#> SRR1700058 3 0.4342 0.29129 0.000 0.008 0.656 0.028 0.000 0.308
#> SRR1700059 4 0.2941 0.80235 0.000 0.008 0.044 0.868 0.008 0.072
#> SRR1700060 3 0.5094 0.17278 0.000 0.020 0.596 0.044 0.004 0.336
#> SRR1700061 3 0.3079 0.53199 0.000 0.008 0.836 0.028 0.000 0.128
#> SRR1700062 6 0.5077 0.33034 0.000 0.024 0.404 0.036 0.000 0.536
#> SRR1700063 3 0.3562 0.47972 0.000 0.004 0.784 0.036 0.000 0.176
#> SRR1700064 5 0.6648 0.12674 0.000 0.000 0.296 0.272 0.400 0.032
#> SRR1700065 3 0.4159 0.37468 0.000 0.004 0.704 0.040 0.000 0.252
#> SRR1700066 3 0.4783 -0.08170 0.000 0.020 0.524 0.020 0.000 0.436
#> SRR1700067 4 0.3995 -0.02641 0.000 0.004 0.000 0.516 0.480 0.000
#> SRR1700068 3 0.6119 -0.12889 0.000 0.012 0.472 0.168 0.004 0.344
#> SRR1700069 3 0.6330 0.14932 0.000 0.024 0.516 0.068 0.340 0.052
#> SRR1700070 5 0.5067 0.36333 0.000 0.308 0.080 0.000 0.604 0.008
#> SRR1700071 3 0.4302 0.42469 0.000 0.012 0.724 0.040 0.004 0.220
#> SRR1700072 3 0.4316 0.37131 0.000 0.008 0.696 0.032 0.004 0.260
#> SRR1700073 5 0.3093 0.72219 0.000 0.012 0.008 0.164 0.816 0.000
#> SRR1700075 3 0.2715 0.55608 0.000 0.012 0.872 0.028 0.000 0.088
#> SRR1700074 3 0.2182 0.56470 0.000 0.004 0.900 0.020 0.000 0.076
#> SRR1700076 3 0.2688 0.58225 0.000 0.020 0.892 0.016 0.024 0.048
#> SRR1700077 3 0.2901 0.53030 0.000 0.000 0.840 0.032 0.000 0.128
#> SRR1700078 3 0.5685 0.15927 0.000 0.044 0.576 0.012 0.048 0.320
#> SRR1700080 3 0.4543 0.45382 0.000 0.020 0.756 0.016 0.140 0.068
#> SRR1700079 3 0.5738 -0.00886 0.000 0.016 0.528 0.104 0.004 0.348
#> SRR1700081 3 0.4755 0.16246 0.000 0.008 0.596 0.044 0.000 0.352
#> SRR1700082 3 0.2052 0.57217 0.000 0.004 0.912 0.028 0.000 0.056
#> SRR1700083 6 0.4675 0.41785 0.000 0.016 0.376 0.024 0.000 0.584
#> SRR1700084 3 0.4796 0.05485 0.000 0.020 0.560 0.024 0.000 0.396
#> SRR1700085 5 0.0665 0.79658 0.000 0.008 0.000 0.008 0.980 0.004
#> SRR1700086 3 0.2949 0.57575 0.000 0.036 0.876 0.012 0.020 0.056
#> SRR1700087 4 0.4180 0.71644 0.000 0.092 0.120 0.772 0.004 0.012
#> SRR1700088 3 0.6108 0.15423 0.000 0.196 0.464 0.328 0.000 0.012
#> SRR1700089 4 0.4233 0.67397 0.000 0.088 0.168 0.740 0.000 0.004
#> SRR1700091 4 0.2788 0.81282 0.000 0.056 0.056 0.876 0.008 0.004
#> SRR1700090 4 0.1699 0.84475 0.000 0.004 0.040 0.936 0.012 0.008
#> SRR1700092 4 0.3142 0.80578 0.000 0.076 0.048 0.856 0.016 0.004
#> SRR1700094 4 0.4211 0.73750 0.000 0.120 0.072 0.780 0.020 0.008
#> SRR1700093 4 0.2554 0.82985 0.000 0.032 0.044 0.896 0.024 0.004
#> SRR1700095 4 0.2408 0.83018 0.000 0.028 0.056 0.900 0.004 0.012
#> SRR1700096 4 0.4038 0.77712 0.000 0.072 0.088 0.800 0.004 0.036
#> SRR1700097 6 0.4602 0.55974 0.000 0.008 0.196 0.092 0.000 0.704
#> SRR1700098 2 0.6621 0.34558 0.000 0.444 0.036 0.320 0.196 0.004
#> SRR1700099 4 0.3946 0.77895 0.000 0.064 0.040 0.808 0.084 0.004
#> SRR1700100 4 0.2594 0.82654 0.000 0.040 0.048 0.892 0.016 0.004
#> SRR1700101 4 0.3142 0.81211 0.000 0.064 0.048 0.860 0.024 0.004
#> SRR1700102 4 0.3031 0.80901 0.000 0.068 0.048 0.864 0.016 0.004
#> SRR1700104 4 0.2792 0.82013 0.000 0.048 0.052 0.880 0.016 0.004
#> SRR1700103 4 0.2878 0.82578 0.000 0.028 0.068 0.876 0.008 0.020
#> SRR1700105 4 0.1578 0.83769 0.000 0.004 0.012 0.936 0.048 0.000
#> SRR1700106 4 0.1628 0.84271 0.000 0.004 0.012 0.940 0.036 0.008
#> SRR1700107 4 0.2693 0.82569 0.000 0.036 0.048 0.888 0.024 0.004
#> SRR1700108 4 0.3371 0.79059 0.000 0.064 0.040 0.848 0.044 0.004
#> SRR1700109 2 0.4576 0.68816 0.000 0.560 0.000 0.040 0.400 0.000
#> SRR1700110 2 0.4206 0.77006 0.000 0.620 0.000 0.024 0.356 0.000
#> SRR1700112 5 0.2775 0.76695 0.000 0.040 0.000 0.104 0.856 0.000
#> SRR1700111 4 0.1232 0.84540 0.000 0.004 0.024 0.956 0.016 0.000
#> SRR1700113 5 0.3646 0.58830 0.000 0.004 0.004 0.292 0.700 0.000
#> SRR1700114 4 0.2399 0.83692 0.000 0.024 0.044 0.904 0.024 0.004
#> SRR1700115 4 0.4072 0.67124 0.000 0.008 0.032 0.736 0.220 0.004
#> SRR1700116 4 0.1476 0.84602 0.000 0.004 0.028 0.948 0.012 0.008
#> SRR1700117 4 0.4960 0.38738 0.000 0.020 0.044 0.600 0.000 0.336
#> SRR1700119 4 0.1528 0.84608 0.000 0.000 0.028 0.944 0.016 0.012
#> SRR1700118 4 0.1232 0.84531 0.000 0.000 0.024 0.956 0.016 0.004
#> SRR1700120 4 0.4901 0.48433 0.000 0.016 0.060 0.640 0.000 0.284
#> SRR1700121 4 0.1904 0.83643 0.000 0.004 0.020 0.924 0.048 0.004
#> SRR1700122 5 0.3337 0.62546 0.000 0.004 0.000 0.260 0.736 0.000
#> SRR1700123 4 0.0820 0.84106 0.000 0.000 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1700125 5 0.1866 0.78412 0.000 0.008 0.000 0.084 0.908 0.000
#> SRR1700126 6 0.6019 0.31720 0.000 0.008 0.180 0.388 0.000 0.424
#> SRR1700127 4 0.2189 0.82566 0.000 0.016 0.016 0.912 0.004 0.052
#> SRR1700124 4 0.1218 0.84398 0.000 0.000 0.028 0.956 0.004 0.012
#> SRR1700128 4 0.1364 0.84173 0.000 0.000 0.016 0.952 0.012 0.020
#> SRR1700129 4 0.2320 0.78557 0.000 0.004 0.000 0.864 0.132 0.000
#> SRR1700130 4 0.1501 0.82598 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700132 4 0.1738 0.82779 0.000 0.004 0.016 0.928 0.000 0.052
#> SRR1700131 4 0.2126 0.81773 0.000 0.004 0.020 0.904 0.000 0.072
#> SRR1700133 4 0.1610 0.82331 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1700134 5 0.3684 0.42070 0.000 0.000 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1700135 4 0.1794 0.84582 0.000 0.000 0.016 0.932 0.028 0.024
#> SRR1700136 4 0.2844 0.78506 0.000 0.012 0.020 0.856 0.000 0.112
#> SRR1700137 4 0.1476 0.84625 0.000 0.004 0.008 0.948 0.028 0.012
#> SRR1700138 4 0.1766 0.84627 0.000 0.004 0.016 0.936 0.028 0.016
#> SRR1700140 4 0.1452 0.84493 0.000 0.000 0.020 0.948 0.020 0.012
#> SRR1700139 4 0.1325 0.84283 0.000 0.004 0.016 0.956 0.012 0.012
#> SRR1700141 5 0.3136 0.67166 0.000 0.004 0.000 0.228 0.768 0.000
#> SRR1700142 6 0.6549 0.33519 0.000 0.020 0.232 0.348 0.004 0.396
#> SRR1700143 4 0.2520 0.81057 0.000 0.008 0.024 0.888 0.004 0.076
#> SRR1700144 3 0.5087 0.22764 0.000 0.012 0.616 0.064 0.004 0.304
#> SRR1700145 4 0.2294 0.81769 0.000 0.008 0.020 0.896 0.000 0.076
#> SRR1700146 4 0.3866 0.00604 0.000 0.000 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR1700147 4 0.2308 0.81340 0.000 0.012 0.016 0.896 0.000 0.076
#> SRR1700149 4 0.4224 0.47815 0.000 0.008 0.016 0.640 0.000 0.336
#> SRR1700148 4 0.2971 0.77466 0.000 0.012 0.024 0.848 0.000 0.116
#> SRR1700150 4 0.2234 0.78568 0.000 0.000 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR1700152 4 0.1346 0.84444 0.000 0.000 0.008 0.952 0.024 0.016
#> SRR1700151 4 0.2044 0.83818 0.000 0.008 0.020 0.924 0.016 0.032
#> SRR1700153 4 0.1945 0.82770 0.000 0.004 0.016 0.920 0.004 0.056
#> SRR1700154 4 0.1448 0.84105 0.000 0.000 0.016 0.948 0.012 0.024
#> SRR1700155 4 0.1307 0.84459 0.000 0.000 0.008 0.952 0.032 0.008
#> SRR1700156 4 0.2468 0.79934 0.000 0.008 0.016 0.880 0.000 0.096
#> SRR1700158 4 0.4022 0.59332 0.000 0.008 0.020 0.700 0.000 0.272
#> SRR1700159 5 0.2624 0.76455 0.000 0.020 0.000 0.124 0.856 0.000
#> SRR1700157 4 0.3865 0.66559 0.000 0.020 0.016 0.748 0.000 0.216
#> SRR1700160 4 0.0820 0.84540 0.000 0.000 0.016 0.972 0.012 0.000
#> SRR1700161 4 0.1578 0.83996 0.000 0.004 0.012 0.944 0.012 0.028
#> SRR1700162 5 0.3515 0.50677 0.000 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700164 4 0.2847 0.78157 0.000 0.012 0.016 0.852 0.000 0.120
#> SRR1700163 4 0.3321 0.72215 0.000 0.008 0.016 0.796 0.000 0.180
#> SRR1700165 4 0.1168 0.84123 0.000 0.000 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR1700166 4 0.1251 0.84590 0.000 0.000 0.012 0.956 0.024 0.008
#> SRR1700168 5 0.2948 0.71749 0.000 0.008 0.000 0.188 0.804 0.000
#> SRR1700167 4 0.4254 0.62178 0.000 0.012 0.044 0.720 0.000 0.224
#> SRR1700170 4 0.1176 0.84717 0.000 0.000 0.020 0.956 0.024 0.000
#> SRR1700169 4 0.1176 0.84698 0.000 0.000 0.024 0.956 0.020 0.000
#> SRR1700171 4 0.3492 0.73879 0.000 0.020 0.016 0.796 0.000 0.168
#> SRR1700172 4 0.1757 0.82542 0.000 0.000 0.000 0.916 0.076 0.008
#> SRR1700174 4 0.1659 0.84581 0.000 0.004 0.028 0.940 0.020 0.008
#> SRR1700173 4 0.1401 0.84431 0.000 0.004 0.028 0.948 0.020 0.000
#> SRR1700175 4 0.1588 0.82573 0.000 0.004 0.000 0.924 0.072 0.000
#> SRR1700176 6 0.5985 0.40361 0.000 0.012 0.176 0.320 0.000 0.492
#> SRR1700178 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700177 4 0.1493 0.83473 0.000 0.000 0.004 0.936 0.056 0.004
#> SRR1700180 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700179 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700181 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700183 1 0.0790 0.85730 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700184 2 0.3151 0.88697 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700186 2 0.2704 0.81042 0.000 0.844 0.016 0.000 0.140 0.000
#> SRR1700187 1 0.4067 0.77624 0.700 0.040 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1700185 1 0.1387 0.86304 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700188 2 0.2854 0.86477 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1700192 6 0.6302 0.27965 0.020 0.156 0.308 0.012 0.000 0.504
#> SRR1700190 6 0.4249 0.52593 0.000 0.068 0.188 0.008 0.000 0.736
#> SRR1700191 1 0.1401 0.85936 0.948 0.028 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700189 6 0.4906 0.34856 0.128 0.060 0.068 0.008 0.000 0.736
#> SRR1700193 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700195 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700194 1 0.1219 0.86410 0.948 0.004 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700196 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700197 6 0.5441 0.12333 0.208 0.056 0.084 0.000 0.000 0.652
#> SRR1700198 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700199 2 0.3151 0.88652 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700200 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700201 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700202 2 0.5242 0.79423 0.000 0.668 0.048 0.060 0.220 0.004
#> SRR1700203 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700204 2 0.3368 0.87976 0.000 0.756 0.012 0.000 0.232 0.000
#> SRR1700206 2 0.3593 0.87497 0.000 0.748 0.024 0.000 0.228 0.000
#> SRR1700207 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700208 6 0.5807 0.33196 0.000 0.112 0.316 0.028 0.000 0.544
#> SRR1700205 2 0.3446 0.84774 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1700209 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700210 2 0.3314 0.88693 0.000 0.740 0.004 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700211 2 0.3463 0.88091 0.000 0.748 0.008 0.000 0.240 0.004
#> SRR1700212 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700213 2 0.5230 0.33428 0.000 0.592 0.316 0.008 0.080 0.004
#> SRR1700214 2 0.3126 0.88549 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1700215 1 0.1194 0.85433 0.956 0.032 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.3244 0.88403 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1700216 1 0.1679 0.84946 0.936 0.036 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700218 2 0.3076 0.88390 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1700219 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700222 1 0.3979 0.78020 0.708 0.036 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1700220 2 0.3482 0.84795 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1700221 2 0.3151 0.88652 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700223 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700224 2 0.4154 0.78417 0.000 0.652 0.020 0.000 0.324 0.004
#> SRR1700226 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700229 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700225 2 0.5518 0.51055 0.000 0.612 0.264 0.024 0.096 0.004
#> SRR1700227 2 0.3151 0.88671 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700230 6 0.3853 0.43290 0.044 0.068 0.060 0.008 0.000 0.820
#> SRR1700231 2 0.3175 0.88723 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700228 2 0.3298 0.88157 0.000 0.756 0.008 0.000 0.236 0.000
#> SRR1700232 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700233 2 0.3483 0.88033 0.000 0.748 0.016 0.000 0.236 0.000
#> SRR1700234 2 0.3290 0.88092 0.000 0.744 0.004 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700235 2 0.3136 0.87912 0.000 0.768 0.004 0.000 0.228 0.000
#> SRR1700237 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700236 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700238 2 0.3151 0.88652 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1700239 1 0.4344 0.74200 0.652 0.044 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1700240 1 0.1588 0.86178 0.924 0.004 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1700241 4 0.5694 0.18792 0.000 0.072 0.404 0.496 0.008 0.020
#> SRR1700243 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700244 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700242 6 0.5779 0.46347 0.028 0.060 0.224 0.048 0.000 0.640
#> SRR1700246 2 0.5632 0.56997 0.000 0.528 0.132 0.000 0.332 0.008
#> SRR1700245 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700247 1 0.4561 0.65284 0.568 0.040 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1700249 1 0.1285 0.86404 0.944 0.004 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700250 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700248 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700251 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700252 2 0.5617 -0.03561 0.000 0.488 0.428 0.016 0.044 0.024
#> SRR1700253 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700256 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700254 1 0.4332 0.75212 0.664 0.048 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1700255 2 0.3175 0.88707 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1700257 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700258 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700259 2 0.3499 0.84349 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1700260 5 0.3774 -0.26633 0.000 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1700261 5 0.1387 0.75399 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1700262 5 0.3659 -0.06464 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1700263 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700264 2 0.3694 0.78707 0.000 0.784 0.076 0.000 0.140 0.000
#> SRR1700265 2 0.4787 0.60071 0.000 0.672 0.220 0.000 0.104 0.004
#> SRR1700266 2 0.3647 0.79999 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000
#> SRR1700268 5 0.8456 0.13152 0.000 0.168 0.184 0.116 0.380 0.152
#> SRR1700270 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700267 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700271 2 0.3634 0.80427 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1700272 2 0.3833 0.66720 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1700273 2 0.3383 0.88361 0.000 0.728 0.004 0.000 0.268 0.000
#> SRR1700274 2 0.3390 0.86664 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1700277 3 0.5927 0.14838 0.000 0.112 0.544 0.028 0.004 0.312
#> SRR1700275 5 0.0820 0.79509 0.000 0.016 0.000 0.012 0.972 0.000
#> SRR1700276 5 0.2778 0.63420 0.000 0.168 0.000 0.008 0.824 0.000
#> SRR1700278 5 0.1958 0.73697 0.000 0.100 0.000 0.000 0.896 0.004
#> SRR1700279 5 0.0547 0.79074 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1700280 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700281 2 0.3198 0.88705 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1700283 5 0.0937 0.78028 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1700282 5 0.4395 0.64898 0.000 0.008 0.028 0.236 0.712 0.016
#> SRR1700284 5 0.0260 0.79467 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1700285 5 0.0291 0.79678 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1700286 5 0.2300 0.64997 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1700287 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700290 6 0.3318 0.55155 0.004 0.052 0.100 0.008 0.000 0.836
#> SRR1700289 5 0.0632 0.78793 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1700288 2 0.3482 0.84033 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1700292 5 0.0632 0.78779 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1700291 5 0.3675 0.71379 0.000 0.012 0.012 0.192 0.776 0.008
#> SRR1700293 5 0.3023 0.53600 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1700294 5 0.0547 0.79010 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1700295 5 0.6173 0.13059 0.000 0.020 0.012 0.396 0.456 0.116
#> SRR1700297 5 0.0632 0.78779 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1700296 5 0.1007 0.77719 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1700298 5 0.2681 0.77937 0.000 0.008 0.044 0.048 0.888 0.012
#> SRR1700299 5 0.5481 0.50014 0.000 0.016 0.068 0.280 0.616 0.020
#> SRR1700300 5 0.5715 0.65779 0.000 0.060 0.128 0.124 0.672 0.016
#> SRR1700302 5 0.0363 0.79747 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700301 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700303 5 0.0458 0.79189 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1700304 5 0.0935 0.78856 0.000 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1700305 5 0.0865 0.78231 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1700306 5 0.5333 0.46544 0.000 0.012 0.012 0.292 0.612 0.072
#> SRR1700308 5 0.4438 0.69616 0.000 0.140 0.088 0.012 0.752 0.008
#> SRR1700307 3 0.6747 -0.03561 0.000 0.040 0.412 0.124 0.400 0.024
#> SRR1700309 5 0.6807 0.37762 0.000 0.020 0.248 0.176 0.508 0.048
#> SRR1700310 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700311 5 0.3684 0.64167 0.000 0.004 0.008 0.236 0.744 0.008
#> SRR1700312 5 0.2101 0.73677 0.000 0.100 0.004 0.000 0.892 0.004
#> SRR1700313 5 0.6458 0.47098 0.000 0.080 0.268 0.092 0.548 0.012
#> SRR1700314 5 0.5124 0.44297 0.000 0.012 0.040 0.328 0.604 0.016
#> SRR1700315 5 0.5820 0.67811 0.000 0.104 0.084 0.112 0.676 0.024
#> SRR1700316 5 0.5993 0.51861 0.000 0.044 0.092 0.264 0.588 0.012
#> SRR1700317 5 0.2340 0.67666 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1700318 5 0.2348 0.79071 0.000 0.012 0.024 0.044 0.908 0.012
#> SRR1700319 5 0.4813 0.42030 0.000 0.004 0.016 0.352 0.600 0.028
#> SRR1700320 5 0.0291 0.79548 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1700322 5 0.1750 0.78326 0.000 0.056 0.004 0.004 0.928 0.008
#> SRR1700321 5 0.0458 0.79189 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1700323 5 0.2624 0.75565 0.000 0.004 0.004 0.148 0.844 0.000
#> SRR1700324 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700325 5 0.2883 0.54191 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1700326 4 0.6141 0.12048 0.000 0.020 0.008 0.460 0.388 0.124
#> SRR1700327 5 0.0291 0.79582 0.000 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1700329 5 0.0713 0.78585 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700328 5 0.7088 0.21627 0.000 0.056 0.324 0.148 0.444 0.028
#> SRR1700330 5 0.5272 0.61404 0.000 0.016 0.088 0.212 0.668 0.016
#> SRR1700331 5 0.0924 0.79846 0.000 0.004 0.008 0.008 0.972 0.008
#> SRR1700332 5 0.0291 0.79695 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1700333 5 0.2442 0.68334 0.000 0.144 0.000 0.000 0.852 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.895 0.929 0.969 0.4963 0.505 0.505
#> 3 3 0.655 0.778 0.890 0.3353 0.764 0.562
#> 4 4 0.635 0.714 0.845 0.1174 0.872 0.647
#> 5 5 0.592 0.595 0.768 0.0595 0.959 0.846
#> 6 6 0.586 0.466 0.692 0.0382 0.981 0.922
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699880 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699881 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.6438 0.8026 0.164 0.836
#> SRR1699893 1 0.7745 0.7082 0.772 0.228
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.8443 0.6396 0.272 0.728
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699900 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699902 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699901 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699903 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1699904 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699905 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699910 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699911 2 0.0672 0.9615 0.008 0.992
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699914 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699915 1 0.2778 0.9325 0.952 0.048
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0672 0.9616 0.008 0.992
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699920 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699921 2 0.2603 0.9331 0.044 0.956
#> SRR1699922 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699923 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699924 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.8763 0.6018 0.296 0.704
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.5294 0.8580 0.120 0.880
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.5946 0.8313 0.144 0.856
#> SRR1699933 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.2948 0.9259 0.052 0.948
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699940 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699941 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.1843 0.9466 0.028 0.972
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699945 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.0672 0.9616 0.008 0.992
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699954 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699956 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699959 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699961 1 0.1184 0.9591 0.984 0.016
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.8386 0.6515 0.268 0.732
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699966 1 0.9993 0.0519 0.516 0.484
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.4431 0.8875 0.092 0.908
#> SRR1699969 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699971 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699972 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699974 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699975 2 0.2603 0.9327 0.044 0.956
#> SRR1699976 1 0.8144 0.6752 0.748 0.252
#> SRR1699977 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699978 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699979 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1699980 2 0.1414 0.9527 0.020 0.980
#> SRR1699981 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.0672 0.9615 0.008 0.992
#> SRR1699987 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699990 1 0.8386 0.6465 0.732 0.268
#> SRR1699992 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699991 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699993 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699994 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.2236 0.9397 0.036 0.964
#> SRR1699997 2 0.9970 0.1208 0.468 0.532
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700000 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700002 1 0.3879 0.9068 0.924 0.076
#> SRR1700001 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700003 1 0.7219 0.7508 0.800 0.200
#> SRR1700004 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.1184 0.9590 0.984 0.016
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700010 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700013 1 0.6343 0.8070 0.840 0.160
#> SRR1700012 1 0.8955 0.5510 0.688 0.312
#> SRR1700014 1 0.7745 0.7092 0.772 0.228
#> SRR1700015 1 0.9833 0.2736 0.576 0.424
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700017 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700023 1 0.1843 0.9497 0.972 0.028
#> SRR1700022 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1700026 1 0.1414 0.9560 0.980 0.020
#> SRR1700027 1 0.0672 0.9648 0.992 0.008
#> SRR1700028 2 0.7674 0.7242 0.224 0.776
#> SRR1700029 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700031 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700033 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700036 2 0.2948 0.9253 0.052 0.948
#> SRR1700037 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700038 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700039 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700042 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700043 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700044 1 0.5842 0.8356 0.860 0.140
#> SRR1700046 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700047 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700048 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700049 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.2236 0.9433 0.964 0.036
#> SRR1700054 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700059 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700060 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700061 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700062 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700063 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700064 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700065 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700066 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700067 2 0.8081 0.6808 0.248 0.752
#> SRR1700068 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700069 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700071 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700072 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700073 2 0.0376 0.9643 0.004 0.996
#> SRR1700075 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700074 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700076 1 0.3114 0.9255 0.944 0.056
#> SRR1700077 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700078 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700080 1 0.3114 0.9258 0.944 0.056
#> SRR1700079 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700081 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700082 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700083 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700084 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700086 1 0.2043 0.9462 0.968 0.032
#> SRR1700087 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700088 1 0.9866 0.2423 0.568 0.432
#> SRR1700089 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700091 2 0.7950 0.6958 0.240 0.760
#> SRR1700090 1 0.2603 0.9358 0.956 0.044
#> SRR1700092 2 0.5842 0.8356 0.140 0.860
#> SRR1700094 2 0.8909 0.5713 0.308 0.692
#> SRR1700093 2 0.3431 0.9157 0.064 0.936
#> SRR1700095 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700096 1 0.4298 0.8934 0.912 0.088
#> SRR1700097 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.5629 0.8452 0.132 0.868
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.1414 0.9527 0.020 0.980
#> SRR1700104 2 0.8861 0.5738 0.304 0.696
#> SRR1700103 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700105 2 0.8499 0.6338 0.276 0.724
#> SRR1700106 1 0.3114 0.9249 0.944 0.056
#> SRR1700107 2 0.1633 0.9496 0.024 0.976
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700111 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.4161 0.8962 0.084 0.916
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700116 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700117 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700119 1 0.1184 0.9590 0.984 0.016
#> SRR1700118 1 0.2236 0.9433 0.964 0.036
#> SRR1700120 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700121 2 0.1633 0.9498 0.024 0.976
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700123 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700127 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700124 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700128 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.8016 0.6844 0.244 0.756
#> SRR1700132 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700131 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700133 1 0.9358 0.4714 0.648 0.352
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700135 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700136 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700137 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700138 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700140 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700139 1 0.0672 0.9647 0.992 0.008
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700142 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700144 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700145 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700147 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700150 2 0.1414 0.9528 0.020 0.980
#> SRR1700152 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700151 1 0.0376 0.9673 0.996 0.004
#> SRR1700153 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700154 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700155 1 0.7950 0.6943 0.760 0.240
#> SRR1700156 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700157 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.0672 0.9647 0.992 0.008
#> SRR1700161 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700164 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700166 1 0.3274 0.9223 0.940 0.060
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700167 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.3584 0.9145 0.932 0.068
#> SRR1700169 1 0.2778 0.9329 0.952 0.048
#> SRR1700171 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700172 2 0.5408 0.8532 0.124 0.876
#> SRR1700174 1 0.3274 0.9219 0.940 0.060
#> SRR1700173 1 0.6247 0.8160 0.844 0.156
#> SRR1700175 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700176 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.9909 0.2130 0.444 0.556
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.5842 0.8354 0.140 0.860
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.7376 0.7444 0.208 0.792
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.2043 0.9432 0.032 0.968
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700241 1 0.0672 0.9647 0.992 0.008
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700246 2 0.6887 0.7806 0.184 0.816
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.9795 0.3062 0.416 0.584
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700268 1 0.9970 0.1066 0.532 0.468
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700277 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.8443 0.6443 0.272 0.728
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700289 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700295 1 0.0938 0.9619 0.988 0.012
#> SRR1700297 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.1184 0.9558 0.016 0.984
#> SRR1700299 1 0.8813 0.5823 0.700 0.300
#> SRR1700300 2 0.8499 0.6296 0.276 0.724
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700306 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700307 1 0.1184 0.9590 0.984 0.016
#> SRR1700309 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0672 0.9616 0.008 0.992
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.9993 0.0714 0.484 0.516
#> SRR1700314 1 0.6801 0.7839 0.820 0.180
#> SRR1700315 2 0.7745 0.7129 0.228 0.772
#> SRR1700316 2 0.3114 0.9227 0.056 0.944
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0672 0.9616 0.008 0.992
#> SRR1700319 2 0.9996 0.0639 0.488 0.512
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700326 1 0.0000 0.9697 1.000 0.000
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700328 1 0.5842 0.8334 0.860 0.140
#> SRR1700330 2 0.7883 0.7062 0.236 0.764
#> SRR1700331 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.9670 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 1 0.5098 0.70543 0.752 0.248 0.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.4346 0.74669 0.184 0.816 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699881 3 0.1482 0.91008 0.012 0.020 0.968
#> SRR1699882 2 0.3340 0.81301 0.120 0.880 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 1 0.5926 0.51963 0.644 0.356 0.000
#> SRR1699888 2 0.2796 0.83745 0.092 0.908 0.000
#> SRR1699889 1 0.2625 0.82940 0.916 0.084 0.000
#> SRR1699890 1 0.6045 0.49097 0.620 0.380 0.000
#> SRR1699887 1 0.5560 0.62472 0.700 0.300 0.000
#> SRR1699891 1 0.2448 0.83227 0.924 0.076 0.000
#> SRR1699892 2 0.3472 0.83293 0.040 0.904 0.056
#> SRR1699893 1 0.2165 0.79806 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699894 1 0.1964 0.83236 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699895 1 0.2066 0.83239 0.940 0.060 0.000
#> SRR1699896 2 0.9241 -0.05677 0.388 0.456 0.156
#> SRR1699897 2 0.2356 0.85287 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699898 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699900 3 0.1163 0.90738 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699899 1 0.2878 0.82633 0.904 0.096 0.000
#> SRR1699902 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699901 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699903 1 0.1860 0.83235 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699904 1 0.1860 0.83245 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699905 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699906 1 0.3038 0.82368 0.896 0.104 0.000
#> SRR1699907 1 0.1964 0.83236 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699908 1 0.1753 0.83237 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699909 1 0.4654 0.75795 0.792 0.208 0.000
#> SRR1699910 1 0.3267 0.76691 0.884 0.000 0.116
#> SRR1699911 1 0.2682 0.83198 0.920 0.076 0.004
#> SRR1699912 1 0.1643 0.83168 0.956 0.044 0.000
#> SRR1699913 1 0.2959 0.82495 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699914 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699915 1 0.1163 0.81545 0.972 0.000 0.028
#> SRR1699916 1 0.6235 0.38730 0.564 0.436 0.000
#> SRR1699917 1 0.0237 0.81736 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699918 1 0.5810 0.57773 0.664 0.336 0.000
#> SRR1699919 1 0.1753 0.83225 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699920 1 0.5733 0.48421 0.676 0.000 0.324
#> SRR1699921 1 0.1289 0.82908 0.968 0.032 0.000
#> SRR1699922 1 0.4062 0.79586 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699923 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699924 3 0.1529 0.90624 0.040 0.000 0.960
#> SRR1699925 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699926 1 0.2527 0.82097 0.936 0.020 0.044
#> SRR1699927 1 0.1643 0.83162 0.956 0.044 0.000
#> SRR1699929 1 0.8450 0.25193 0.484 0.428 0.088
#> SRR1699928 1 0.1753 0.83228 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699930 1 0.2448 0.83107 0.924 0.076 0.000
#> SRR1699931 2 0.8070 -0.16788 0.468 0.468 0.064
#> SRR1699933 3 0.1989 0.89187 0.004 0.048 0.948
#> SRR1699932 1 0.2066 0.83249 0.940 0.060 0.000
#> SRR1699934 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699935 1 0.1860 0.82230 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699936 2 0.1753 0.86396 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.5650 0.54085 0.000 0.312 0.688
#> SRR1699939 2 0.2711 0.83911 0.088 0.912 0.000
#> SRR1699941 3 0.0592 0.91615 0.000 0.012 0.988
#> SRR1699942 2 0.1636 0.86715 0.016 0.964 0.020
#> SRR1699943 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.5216 0.64197 0.260 0.740 0.000
#> SRR1699950 2 0.2959 0.82814 0.100 0.900 0.000
#> SRR1699951 2 0.3879 0.78747 0.152 0.848 0.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.0892 0.87845 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699954 3 0.4178 0.76921 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699955 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0424 0.88294 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699959 3 0.1491 0.91128 0.016 0.016 0.968
#> SRR1699958 2 0.5098 0.70399 0.248 0.752 0.000
#> SRR1699960 2 0.1643 0.86655 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699961 2 0.5760 0.50236 0.000 0.672 0.328
#> SRR1699962 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.4172 0.79027 0.028 0.868 0.104
#> SRR1699964 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.0592 0.88111 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699966 1 0.8794 -0.05349 0.448 0.440 0.112
#> SRR1699967 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 1 0.6252 0.52211 0.648 0.344 0.008
#> SRR1699969 3 0.0747 0.91662 0.016 0.000 0.984
#> SRR1699971 3 0.1031 0.91010 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699970 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.1163 0.90803 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699973 2 0.6192 0.38115 0.420 0.580 0.000
#> SRR1699974 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699975 1 0.5109 0.74933 0.780 0.212 0.008
#> SRR1699976 2 0.4796 0.67084 0.000 0.780 0.220
#> SRR1699977 3 0.1905 0.90448 0.016 0.028 0.956
#> SRR1699978 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699979 3 0.2269 0.89666 0.040 0.016 0.944
#> SRR1699980 1 0.1411 0.83004 0.964 0.036 0.000
#> SRR1699981 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699982 1 0.1964 0.83236 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699983 1 0.1529 0.83102 0.960 0.040 0.000
#> SRR1699984 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699985 2 0.5621 0.49061 0.308 0.692 0.000
#> SRR1699986 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.6045 0.29549 0.380 0.620 0.000
#> SRR1699987 3 0.2356 0.88808 0.072 0.000 0.928
#> SRR1699989 1 0.4002 0.79811 0.840 0.160 0.000
#> SRR1699990 1 0.9402 0.10760 0.416 0.172 0.412
#> SRR1699992 3 0.1163 0.90785 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699991 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699993 3 0.0237 0.91982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699994 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699995 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699996 2 0.1315 0.87445 0.008 0.972 0.020
#> SRR1699997 1 0.4556 0.77122 0.860 0.060 0.080
#> SRR1699998 2 0.0237 0.88367 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699999 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700000 3 0.0747 0.91436 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700002 2 0.6625 0.49871 0.024 0.660 0.316
#> SRR1700001 3 0.0237 0.91957 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700003 3 0.6299 0.08182 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700004 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700005 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700006 3 0.5497 0.58142 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700007 1 0.5216 0.69249 0.740 0.260 0.000
#> SRR1700008 3 0.0747 0.91655 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700009 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700010 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.2261 0.85120 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700013 3 0.6521 -0.01186 0.004 0.496 0.500
#> SRR1700012 2 0.7526 0.22224 0.040 0.536 0.424
#> SRR1700014 1 0.9289 0.17480 0.444 0.160 0.396
#> SRR1700015 2 0.2955 0.82483 0.008 0.912 0.080
#> SRR1700016 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700018 3 0.4702 0.71845 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700017 3 0.0237 0.91953 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700019 1 0.6274 0.24810 0.544 0.456 0.000
#> SRR1700020 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700021 1 0.1753 0.83345 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700023 3 0.6927 0.62400 0.060 0.240 0.700
#> SRR1700022 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700024 1 0.5178 0.62912 0.744 0.256 0.000
#> SRR1700025 2 0.0475 0.88156 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700026 3 0.3715 0.82062 0.004 0.128 0.868
#> SRR1700027 3 0.4702 0.72531 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700028 1 0.7444 0.58250 0.684 0.220 0.096
#> SRR1700029 3 0.0892 0.91504 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700030 1 0.2959 0.82696 0.900 0.100 0.000
#> SRR1700031 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.1529 0.86864 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700034 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700035 1 0.1529 0.83122 0.960 0.040 0.000
#> SRR1700033 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700036 1 0.2590 0.83495 0.924 0.072 0.004
#> SRR1700037 1 0.2356 0.83306 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700038 3 0.0237 0.91954 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700039 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700040 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700041 3 0.0237 0.91989 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700042 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700043 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700045 3 0.0237 0.91985 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700044 3 0.7606 0.57328 0.092 0.244 0.664
#> SRR1700046 3 0.0237 0.91958 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700047 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700048 3 0.3551 0.83667 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700049 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700052 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700053 3 0.6672 0.07615 0.472 0.008 0.520
#> SRR1700054 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700055 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700056 3 0.0237 0.91984 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700057 3 0.0592 0.91767 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700058 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700059 3 0.3482 0.84501 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700060 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700061 3 0.0237 0.91954 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700062 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700063 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700064 1 0.6235 0.20202 0.564 0.000 0.436
#> SRR1700065 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700066 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700067 1 0.0000 0.81517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700068 3 0.0424 0.91880 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700069 1 0.5785 0.48786 0.668 0.000 0.332
#> SRR1700070 2 0.5138 0.59369 0.252 0.748 0.000
#> SRR1700071 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700072 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700073 1 0.2066 0.83489 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700075 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700074 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700076 3 0.5505 0.78356 0.096 0.088 0.816
#> SRR1700077 3 0.0424 0.91799 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700078 3 0.1031 0.91000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700080 3 0.5356 0.72060 0.196 0.020 0.784
#> SRR1700079 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700081 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700082 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700083 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700084 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700085 1 0.2537 0.83260 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700086 3 0.5803 0.63783 0.248 0.016 0.736
#> SRR1700087 3 0.7163 0.46742 0.040 0.332 0.628
#> SRR1700088 2 0.4994 0.77046 0.052 0.836 0.112
#> SRR1700089 3 0.7279 0.37317 0.036 0.376 0.588
#> SRR1700091 2 0.5998 0.74859 0.128 0.788 0.084
#> SRR1700090 3 0.7344 0.63283 0.240 0.080 0.680
#> SRR1700092 2 0.6576 0.70073 0.192 0.740 0.068
#> SRR1700094 2 0.6915 0.68081 0.124 0.736 0.140
#> SRR1700093 2 0.6521 0.14229 0.492 0.504 0.004
#> SRR1700095 3 0.1643 0.90401 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700096 3 0.8033 0.16876 0.064 0.424 0.512
#> SRR1700097 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.2796 0.84349 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700099 2 0.5905 0.51694 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700100 2 0.6750 0.53860 0.336 0.640 0.024
#> SRR1700101 2 0.4974 0.71750 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700102 2 0.5988 0.51094 0.368 0.632 0.000
#> SRR1700104 2 0.7944 0.57534 0.244 0.644 0.112
#> SRR1700103 3 0.3116 0.86001 0.108 0.000 0.892
#> SRR1700105 1 0.4316 0.78419 0.868 0.088 0.044
#> SRR1700106 1 0.6305 0.00249 0.516 0.000 0.484
#> SRR1700107 2 0.6180 0.39782 0.416 0.584 0.000
#> SRR1700108 2 0.5650 0.60928 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700109 2 0.5138 0.65870 0.252 0.748 0.000
#> SRR1700110 2 0.4178 0.75968 0.172 0.828 0.000
#> SRR1700112 1 0.4555 0.75126 0.800 0.200 0.000
#> SRR1700111 3 0.5621 0.61007 0.308 0.000 0.692
#> SRR1700113 1 0.4555 0.73048 0.800 0.200 0.000
#> SRR1700114 2 0.6750 0.52650 0.336 0.640 0.024
#> SRR1700115 1 0.5291 0.59711 0.732 0.268 0.000
#> SRR1700116 3 0.5497 0.62684 0.292 0.000 0.708
#> SRR1700117 3 0.0424 0.91880 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700119 3 0.6305 0.14110 0.484 0.000 0.516
#> SRR1700118 3 0.5016 0.71565 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700120 3 0.0237 0.91979 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700121 1 0.2772 0.80295 0.916 0.080 0.004
#> SRR1700122 1 0.1289 0.82975 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700123 3 0.2448 0.88674 0.076 0.000 0.924
#> SRR1700125 1 0.1860 0.83344 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700126 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700127 3 0.1860 0.90019 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700124 3 0.2878 0.87234 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700128 3 0.4654 0.76015 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700129 1 0.0000 0.81517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700130 1 0.1170 0.81911 0.976 0.016 0.008
#> SRR1700132 3 0.1753 0.90180 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700131 3 0.1753 0.90226 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700133 1 0.2796 0.78113 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700134 1 0.0424 0.81942 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700135 3 0.6154 0.38267 0.408 0.000 0.592
#> SRR1700136 3 0.1643 0.90411 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700137 1 0.5785 0.45106 0.668 0.000 0.332
#> SRR1700138 1 0.6260 0.11115 0.552 0.000 0.448
#> SRR1700140 3 0.6026 0.46350 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700139 3 0.5098 0.70573 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700141 1 0.1031 0.82645 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700142 3 0.0237 0.91984 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700143 3 0.1860 0.90003 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700144 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700145 3 0.1753 0.90173 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700146 1 0.0592 0.82126 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700147 3 0.2356 0.88745 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700149 3 0.0592 0.91760 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700148 3 0.1411 0.90832 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700150 1 0.0237 0.81649 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700152 3 0.5926 0.51702 0.356 0.000 0.644
#> SRR1700151 3 0.3816 0.82604 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700153 3 0.2165 0.89216 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700154 3 0.3816 0.82626 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700155 1 0.3038 0.77310 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700156 3 0.1529 0.90647 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700158 3 0.1163 0.91153 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700159 1 0.1964 0.83401 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700157 3 0.0892 0.91482 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700160 3 0.6587 0.47794 0.352 0.016 0.632
#> SRR1700161 3 0.3752 0.83120 0.144 0.000 0.856
#> SRR1700162 1 0.0000 0.81517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700164 3 0.0892 0.91503 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700163 3 0.0892 0.91495 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700165 3 0.1643 0.90432 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700166 1 0.5722 0.53065 0.704 0.004 0.292
#> SRR1700168 1 0.1860 0.83302 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700167 3 0.0747 0.91631 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700170 1 0.6936 0.07375 0.524 0.016 0.460
#> SRR1700169 3 0.5926 0.51492 0.356 0.000 0.644
#> SRR1700171 3 0.0892 0.91498 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700172 1 0.0747 0.81954 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700174 1 0.6859 0.38274 0.620 0.024 0.356
#> SRR1700173 1 0.6224 0.51522 0.688 0.016 0.296
#> SRR1700175 1 0.0747 0.81930 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700176 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 1 0.0237 0.81522 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700180 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700185 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.1031 0.91002 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700190 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700191 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700189 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.3791 0.83027 0.048 0.892 0.060
#> SRR1700203 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.0237 0.91987 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700205 2 0.3482 0.78586 0.128 0.872 0.000
#> SRR1700209 2 0.0592 0.88067 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700210 2 0.0237 0.88375 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.2955 0.82695 0.008 0.912 0.080
#> SRR1700214 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700217 2 0.2537 0.84249 0.080 0.920 0.000
#> SRR1700216 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700218 2 0.0237 0.88382 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700220 2 0.4346 0.73936 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.2066 0.85278 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700226 2 0.0237 0.88393 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.1015 0.87862 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700227 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.1411 0.86894 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700240 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700241 3 0.3987 0.83416 0.020 0.108 0.872
#> SRR1700243 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0237 0.88394 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700242 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700246 2 0.4586 0.80063 0.096 0.856 0.048
#> SRR1700245 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.4235 0.73191 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700253 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.2448 0.84651 0.076 0.924 0.000
#> SRR1700260 2 0.5948 0.42881 0.360 0.640 0.000
#> SRR1700261 1 0.6252 0.28603 0.556 0.444 0.000
#> SRR1700262 2 0.6286 0.06804 0.464 0.536 0.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.0848 0.88095 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700266 2 0.2261 0.85279 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700268 2 0.9265 0.09183 0.156 0.428 0.416
#> SRR1700270 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0892 0.87821 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700271 2 0.3116 0.82123 0.108 0.892 0.000
#> SRR1700272 2 0.4605 0.71837 0.204 0.796 0.000
#> SRR1700273 2 0.1031 0.87720 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700274 2 0.1163 0.87531 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700277 3 0.0237 0.91962 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700275 1 0.4605 0.75211 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700276 1 0.6291 0.23673 0.532 0.468 0.000
#> SRR1700278 1 0.5835 0.59176 0.660 0.340 0.000
#> SRR1700279 1 0.2356 0.83195 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700280 1 0.4291 0.78203 0.820 0.180 0.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.88508 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 1 0.4605 0.76363 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700282 1 0.4446 0.78344 0.856 0.032 0.112
#> SRR1700284 1 0.2066 0.83255 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700285 1 0.3752 0.80662 0.856 0.144 0.000
#> SRR1700286 2 0.6286 0.05877 0.464 0.536 0.000
#> SRR1700287 1 0.4178 0.78948 0.828 0.172 0.000
#> SRR1700290 3 0.0000 0.92074 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700289 1 0.3412 0.81573 0.876 0.124 0.000
#> SRR1700288 2 0.3192 0.80661 0.112 0.888 0.000
#> SRR1700292 1 0.2537 0.83097 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700291 1 0.1643 0.83282 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700293 2 0.6095 0.24551 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700294 1 0.2356 0.83119 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700295 1 0.6308 -0.01632 0.508 0.000 0.492
#> SRR1700297 1 0.2448 0.83179 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700296 1 0.4702 0.75564 0.788 0.212 0.000
#> SRR1700298 1 0.2261 0.83352 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700299 1 0.4443 0.80151 0.864 0.052 0.084
#> SRR1700300 1 0.5741 0.75587 0.776 0.188 0.036
#> SRR1700302 1 0.1753 0.83213 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700301 1 0.2711 0.82809 0.912 0.088 0.000
#> SRR1700303 1 0.1964 0.83236 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700304 1 0.4062 0.79477 0.836 0.164 0.000
#> SRR1700305 1 0.4235 0.78563 0.824 0.176 0.000
#> SRR1700306 1 0.5591 0.54832 0.696 0.000 0.304
#> SRR1700308 1 0.5882 0.57840 0.652 0.348 0.000
#> SRR1700307 3 0.6621 0.54863 0.284 0.032 0.684
#> SRR1700309 3 0.6079 0.34826 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700310 1 0.3482 0.81330 0.872 0.128 0.000
#> SRR1700311 1 0.1031 0.82657 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700312 1 0.5098 0.71868 0.752 0.248 0.000
#> SRR1700313 1 0.7762 0.65832 0.668 0.212 0.120
#> SRR1700314 1 0.4349 0.77004 0.852 0.020 0.128
#> SRR1700315 1 0.5223 0.77408 0.800 0.176 0.024
#> SRR1700316 1 0.5639 0.71764 0.752 0.232 0.016
#> SRR1700317 1 0.6045 0.51249 0.620 0.380 0.000
#> SRR1700318 1 0.2356 0.83225 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700319 1 0.2959 0.78466 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700320 1 0.2066 0.83239 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700322 1 0.4235 0.78647 0.824 0.176 0.000
#> SRR1700321 1 0.3551 0.81412 0.868 0.132 0.000
#> SRR1700323 1 0.1289 0.82948 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700324 1 0.3412 0.81708 0.876 0.124 0.000
#> SRR1700325 2 0.6252 0.09392 0.444 0.556 0.000
#> SRR1700326 3 0.5397 0.60745 0.280 0.000 0.720
#> SRR1700327 1 0.5327 0.66578 0.728 0.272 0.000
#> SRR1700329 1 0.3482 0.81359 0.872 0.128 0.000
#> SRR1700328 3 0.8098 0.52341 0.216 0.140 0.644
#> SRR1700330 1 0.5804 0.77424 0.800 0.088 0.112
#> SRR1700331 1 0.2066 0.83239 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700332 1 0.2448 0.83133 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700333 1 0.5591 0.64891 0.696 0.304 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.1042 0.88815 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR1699875 2 0.1624 0.88297 0.028 0.952 0.000 0.020
#> SRR1699876 1 0.3791 0.73197 0.796 0.200 0.000 0.004
#> SRR1699877 2 0.0524 0.89061 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1699879 2 0.4535 0.67714 0.240 0.744 0.000 0.016
#> SRR1699878 2 0.1182 0.88673 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1699880 3 0.1305 0.85475 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1699881 3 0.3564 0.80761 0.016 0.012 0.860 0.112
#> SRR1699882 2 0.4194 0.69928 0.228 0.764 0.000 0.008
#> SRR1699883 2 0.0804 0.89058 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR1699884 2 0.0336 0.88986 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699885 2 0.0188 0.88969 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699886 1 0.3942 0.69865 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR1699888 2 0.2814 0.81780 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1699889 1 0.1452 0.80076 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1699890 1 0.4605 0.55454 0.664 0.336 0.000 0.000
#> SRR1699887 1 0.3810 0.73848 0.804 0.188 0.000 0.008
#> SRR1699891 1 0.0895 0.79824 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699892 2 0.6112 0.69736 0.104 0.740 0.104 0.052
#> SRR1699893 4 0.3768 0.69302 0.184 0.000 0.008 0.808
#> SRR1699894 1 0.1004 0.79935 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1699895 1 0.0927 0.79671 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1699896 1 0.8170 0.39762 0.504 0.316 0.120 0.060
#> SRR1699897 2 0.4808 0.67334 0.236 0.736 0.000 0.028
#> SRR1699898 3 0.1474 0.84882 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699900 3 0.2920 0.83318 0.020 0.032 0.908 0.040
#> SRR1699899 1 0.0707 0.79772 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699902 3 0.0779 0.85827 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1699901 3 0.0469 0.85848 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699903 1 0.0524 0.79263 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1699904 1 0.0804 0.79506 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1699905 3 0.0469 0.85847 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699906 1 0.1302 0.80087 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1699907 1 0.0937 0.79478 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1699908 1 0.0657 0.79649 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1699909 1 0.2949 0.78951 0.888 0.088 0.000 0.024
#> SRR1699910 1 0.5877 0.49021 0.656 0.000 0.068 0.276
#> SRR1699911 1 0.1182 0.79751 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1699912 1 0.0524 0.79370 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1699913 1 0.0707 0.79857 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699914 3 0.1888 0.85158 0.016 0.000 0.940 0.044
#> SRR1699915 1 0.2021 0.77556 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR1699916 1 0.4998 0.19430 0.512 0.488 0.000 0.000
#> SRR1699917 1 0.4477 0.51246 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1699918 1 0.6611 0.45866 0.560 0.356 0.004 0.080
#> SRR1699919 1 0.0779 0.79039 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1699920 1 0.7485 0.08905 0.472 0.000 0.192 0.336
#> SRR1699921 1 0.0895 0.79015 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1699922 1 0.2048 0.80148 0.928 0.064 0.000 0.008
#> SRR1699923 3 0.0469 0.85842 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699924 3 0.4606 0.64451 0.012 0.000 0.724 0.264
#> SRR1699925 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699926 1 0.1798 0.78256 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1699927 1 0.0672 0.79236 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1699929 1 0.7217 0.61521 0.652 0.184 0.084 0.080
#> SRR1699928 1 0.0672 0.79401 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1699930 1 0.0895 0.79825 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699931 1 0.8220 0.46250 0.532 0.276 0.084 0.108
#> SRR1699933 3 0.4368 0.78377 0.016 0.056 0.832 0.096
#> SRR1699932 1 0.0592 0.79676 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1699934 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699935 1 0.6374 0.47143 0.592 0.084 0.000 0.324
#> SRR1699936 2 0.2048 0.86773 0.064 0.928 0.000 0.008
#> SRR1699937 2 0.1452 0.87701 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR1699938 2 0.0336 0.88896 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699940 3 0.5918 0.57808 0.004 0.208 0.696 0.092
#> SRR1699939 2 0.3271 0.80969 0.132 0.856 0.000 0.012
#> SRR1699941 3 0.1822 0.84514 0.004 0.008 0.944 0.044
#> SRR1699942 2 0.3109 0.83153 0.004 0.880 0.016 0.100
#> SRR1699943 2 0.0469 0.88812 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699944 2 0.0707 0.88779 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699945 3 0.0707 0.85754 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699946 2 0.1767 0.87315 0.012 0.944 0.000 0.044
#> SRR1699947 2 0.0895 0.88611 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1699948 2 0.0336 0.88896 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699949 2 0.4677 0.54261 0.316 0.680 0.000 0.004
#> SRR1699950 2 0.3450 0.78503 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1699951 2 0.4780 0.76513 0.116 0.788 0.000 0.096
#> SRR1699952 2 0.1356 0.87810 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR1699953 2 0.2329 0.86169 0.072 0.916 0.000 0.012
#> SRR1699954 3 0.3705 0.78406 0.004 0.084 0.860 0.052
#> SRR1699955 2 0.0524 0.89025 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1699956 3 0.0707 0.85814 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699957 2 0.2546 0.86556 0.060 0.912 0.000 0.028
#> SRR1699959 3 0.5464 0.54096 0.008 0.020 0.656 0.316
#> SRR1699958 4 0.5903 0.43691 0.052 0.332 0.000 0.616
#> SRR1699960 2 0.1807 0.87534 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR1699961 3 0.6999 0.05548 0.008 0.448 0.456 0.088
#> SRR1699962 2 0.1004 0.88712 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1699963 2 0.5961 0.54486 0.004 0.660 0.064 0.272
#> SRR1699964 2 0.0188 0.88976 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699965 2 0.1209 0.88371 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1699966 4 0.9147 0.22598 0.276 0.244 0.080 0.400
#> SRR1699967 2 0.0336 0.88889 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699968 1 0.5192 0.72340 0.764 0.168 0.012 0.056
#> SRR1699969 3 0.2647 0.82063 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699971 3 0.3360 0.81270 0.004 0.036 0.876 0.084
#> SRR1699970 2 0.0779 0.88510 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1699972 3 0.2570 0.83412 0.004 0.028 0.916 0.052
#> SRR1699973 4 0.7434 0.35037 0.232 0.256 0.000 0.512
#> SRR1699974 3 0.0469 0.85800 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699975 1 0.5000 0.72601 0.772 0.100 0.000 0.128
#> SRR1699976 2 0.6924 0.39227 0.016 0.588 0.304 0.092
#> SRR1699977 3 0.6130 0.32075 0.008 0.036 0.560 0.396
#> SRR1699978 3 0.1022 0.85449 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699979 4 0.6343 0.26796 0.036 0.016 0.392 0.556
#> SRR1699980 1 0.2207 0.78390 0.928 0.012 0.004 0.056
#> SRR1699981 3 0.1722 0.85345 0.008 0.000 0.944 0.048
#> SRR1699982 1 0.1151 0.79981 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1699983 1 0.0804 0.79474 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1699984 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699985 2 0.4973 0.42247 0.348 0.644 0.000 0.008
#> SRR1699986 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699988 2 0.5712 0.22950 0.384 0.584 0.000 0.032
#> SRR1699987 4 0.5463 0.31536 0.012 0.004 0.404 0.580
#> SRR1699989 1 0.2662 0.79505 0.900 0.084 0.000 0.016
#> SRR1699990 1 0.9474 -0.08118 0.356 0.152 0.160 0.332
#> SRR1699992 3 0.2310 0.84007 0.004 0.008 0.920 0.068
#> SRR1699991 3 0.2345 0.82974 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699993 3 0.1022 0.85600 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699994 3 0.0524 0.85780 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1699995 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699996 2 0.2409 0.87138 0.040 0.924 0.004 0.032
#> SRR1699997 4 0.2737 0.73806 0.104 0.000 0.008 0.888
#> SRR1699998 2 0.2123 0.87489 0.028 0.936 0.004 0.032
#> SRR1699999 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700000 3 0.1639 0.85221 0.008 0.004 0.952 0.036
#> SRR1700002 2 0.8165 0.01802 0.012 0.420 0.296 0.272
#> SRR1700001 3 0.1661 0.85468 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1700003 2 0.8060 -0.14419 0.004 0.368 0.320 0.308
#> SRR1700004 3 0.1302 0.85795 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700005 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700006 3 0.5905 0.58614 0.004 0.200 0.700 0.096
#> SRR1700007 1 0.4193 0.66029 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.3764 0.69139 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700009 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700010 3 0.0817 0.85519 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700011 2 0.2542 0.85390 0.084 0.904 0.000 0.012
#> SRR1700013 3 0.8167 -0.18257 0.008 0.288 0.356 0.348
#> SRR1700012 2 0.8405 -0.04304 0.024 0.388 0.352 0.236
#> SRR1700014 4 0.8559 0.33411 0.244 0.036 0.292 0.428
#> SRR1700015 2 0.5954 0.62427 0.008 0.712 0.168 0.112
#> SRR1700016 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700018 3 0.4625 0.74912 0.008 0.092 0.812 0.088
#> SRR1700017 3 0.3128 0.81800 0.008 0.008 0.876 0.108
#> SRR1700019 1 0.5070 0.45500 0.620 0.372 0.000 0.008
#> SRR1700020 3 0.0469 0.85812 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700021 1 0.1406 0.80023 0.960 0.024 0.000 0.016
#> SRR1700023 3 0.7771 0.34157 0.044 0.112 0.540 0.304
#> SRR1700022 3 0.1661 0.85135 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1700024 1 0.7242 0.22605 0.476 0.148 0.000 0.376
#> SRR1700025 2 0.1786 0.87357 0.008 0.948 0.008 0.036
#> SRR1700026 3 0.4601 0.74222 0.004 0.104 0.808 0.084
#> SRR1700027 3 0.5347 0.69676 0.004 0.108 0.756 0.132
#> SRR1700028 4 0.4987 0.68394 0.176 0.036 0.016 0.772
#> SRR1700029 3 0.4543 0.51357 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1700030 1 0.1388 0.79811 0.960 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700031 3 0.0336 0.85761 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700032 2 0.4139 0.78712 0.144 0.816 0.000 0.040
#> SRR1700034 3 0.0188 0.85814 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700035 1 0.0804 0.79597 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700033 3 0.0707 0.85666 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700036 1 0.2438 0.79052 0.924 0.016 0.012 0.048
#> SRR1700037 1 0.1118 0.80114 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700038 3 0.1356 0.85418 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700039 3 0.0469 0.85847 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700040 3 0.0707 0.85851 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700041 3 0.3249 0.80148 0.008 0.000 0.852 0.140
#> SRR1700042 3 0.0817 0.85917 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700043 3 0.1209 0.85280 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1700045 3 0.3945 0.72877 0.004 0.000 0.780 0.216
#> SRR1700044 3 0.7746 0.51450 0.140 0.116 0.624 0.120
#> SRR1700046 3 0.3391 0.79589 0.004 0.004 0.844 0.148
#> SRR1700047 3 0.1042 0.85867 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1700048 3 0.6570 0.39170 0.100 0.000 0.580 0.320
#> SRR1700049 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700050 3 0.1118 0.85554 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700051 3 0.0188 0.85814 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700052 3 0.0188 0.85806 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700053 3 0.7785 0.09611 0.368 0.008 0.440 0.184
#> SRR1700054 3 0.1389 0.85453 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700055 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700056 3 0.3123 0.76612 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700057 3 0.3494 0.75447 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR1700058 3 0.0336 0.85801 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700059 4 0.4546 0.64175 0.012 0.000 0.256 0.732
#> SRR1700060 3 0.1109 0.85732 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1700061 3 0.1398 0.85626 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR1700062 3 0.1637 0.84989 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700063 3 0.0921 0.85797 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700064 1 0.7646 0.07043 0.460 0.000 0.236 0.304
#> SRR1700065 3 0.0469 0.85858 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700066 3 0.0336 0.85736 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700067 4 0.5168 -0.00401 0.496 0.000 0.004 0.500
#> SRR1700068 3 0.4539 0.60563 0.008 0.000 0.720 0.272
#> SRR1700069 1 0.7182 0.31163 0.552 0.000 0.248 0.200
#> SRR1700070 2 0.4546 0.59824 0.256 0.732 0.000 0.012
#> SRR1700071 3 0.1902 0.85013 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1700072 3 0.0921 0.85891 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700073 1 0.3323 0.78679 0.876 0.064 0.000 0.060
#> SRR1700075 3 0.1305 0.85738 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1700074 3 0.2334 0.84261 0.004 0.000 0.908 0.088
#> SRR1700076 3 0.7748 0.44841 0.136 0.056 0.592 0.216
#> SRR1700077 3 0.1489 0.84920 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1700078 3 0.2224 0.84185 0.040 0.000 0.928 0.032
#> SRR1700080 3 0.6516 0.41144 0.308 0.000 0.592 0.100
#> SRR1700079 3 0.2714 0.82807 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1700081 3 0.0921 0.85925 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700082 3 0.2593 0.83409 0.004 0.000 0.892 0.104
#> SRR1700083 3 0.0524 0.85788 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1700084 3 0.0469 0.85708 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700085 1 0.1767 0.80140 0.944 0.044 0.000 0.012
#> SRR1700086 3 0.6619 0.52286 0.232 0.008 0.640 0.120
#> SRR1700087 4 0.5165 0.70420 0.000 0.080 0.168 0.752
#> SRR1700088 2 0.6554 0.31236 0.012 0.556 0.056 0.376
#> SRR1700089 4 0.5571 0.67187 0.004 0.072 0.204 0.720
#> SRR1700091 4 0.5342 0.63433 0.024 0.220 0.024 0.732
#> SRR1700090 4 0.2214 0.76447 0.028 0.000 0.044 0.928
#> SRR1700092 4 0.5573 0.57897 0.028 0.264 0.016 0.692
#> SRR1700094 4 0.6849 0.44944 0.040 0.320 0.048 0.592
#> SRR1700093 4 0.3584 0.73566 0.064 0.064 0.004 0.868
#> SRR1700095 4 0.3764 0.70284 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700096 4 0.3822 0.75320 0.004 0.032 0.120 0.844
#> SRR1700097 3 0.0707 0.85766 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700098 2 0.6221 0.43083 0.076 0.608 0.000 0.316
#> SRR1700099 4 0.6233 0.57015 0.124 0.216 0.000 0.660
#> SRR1700100 4 0.3947 0.71491 0.040 0.116 0.004 0.840
#> SRR1700101 4 0.5881 0.58435 0.084 0.240 0.000 0.676
#> SRR1700102 4 0.5627 0.58461 0.068 0.240 0.000 0.692
#> SRR1700104 4 0.3093 0.74240 0.040 0.064 0.004 0.892
#> SRR1700103 4 0.4250 0.62359 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1700105 4 0.2714 0.73056 0.112 0.004 0.000 0.884
#> SRR1700106 4 0.3497 0.77031 0.036 0.000 0.104 0.860
#> SRR1700107 4 0.3320 0.73761 0.068 0.056 0.000 0.876
#> SRR1700108 4 0.5772 0.56885 0.068 0.260 0.000 0.672
#> SRR1700109 2 0.6178 0.56992 0.228 0.660 0.000 0.112
#> SRR1700110 2 0.5657 0.67720 0.160 0.720 0.000 0.120
#> SRR1700112 1 0.7121 0.48754 0.564 0.220 0.000 0.216
#> SRR1700111 4 0.2644 0.76647 0.032 0.000 0.060 0.908
#> SRR1700113 1 0.7501 0.22999 0.472 0.196 0.000 0.332
#> SRR1700114 4 0.2924 0.74472 0.036 0.060 0.004 0.900
#> SRR1700115 4 0.6293 0.48523 0.276 0.096 0.000 0.628
#> SRR1700116 4 0.3166 0.76988 0.016 0.000 0.116 0.868
#> SRR1700117 3 0.4008 0.64421 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1700119 4 0.2385 0.76476 0.028 0.000 0.052 0.920
#> SRR1700118 4 0.2844 0.76561 0.048 0.000 0.052 0.900
#> SRR1700120 3 0.2760 0.79771 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700121 4 0.4012 0.68105 0.184 0.016 0.000 0.800
#> SRR1700122 1 0.4963 0.55626 0.696 0.020 0.000 0.284
#> SRR1700123 4 0.3494 0.73762 0.004 0.000 0.172 0.824
#> SRR1700125 1 0.4919 0.65776 0.752 0.048 0.000 0.200
#> SRR1700126 3 0.2760 0.79215 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700127 4 0.4164 0.64817 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1700124 4 0.3402 0.74270 0.004 0.000 0.164 0.832
#> SRR1700128 4 0.4152 0.74611 0.032 0.000 0.160 0.808
#> SRR1700129 4 0.4677 0.50808 0.316 0.004 0.000 0.680
#> SRR1700130 4 0.4034 0.69460 0.180 0.004 0.012 0.804
#> SRR1700132 4 0.5039 0.38894 0.004 0.000 0.404 0.592
#> SRR1700131 4 0.5000 0.07875 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1700133 4 0.4248 0.66115 0.220 0.000 0.012 0.768
#> SRR1700134 1 0.5028 0.29698 0.596 0.004 0.000 0.400
#> SRR1700135 4 0.4667 0.75000 0.108 0.000 0.096 0.796
#> SRR1700136 4 0.4925 0.31085 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1700137 4 0.2908 0.75885 0.064 0.000 0.040 0.896
#> SRR1700138 4 0.3907 0.74698 0.120 0.000 0.044 0.836
#> SRR1700140 4 0.3149 0.77117 0.032 0.000 0.088 0.880
#> SRR1700139 4 0.3439 0.77092 0.048 0.000 0.084 0.868
#> SRR1700141 1 0.5131 0.55601 0.692 0.028 0.000 0.280
#> SRR1700142 3 0.3907 0.67378 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700143 4 0.4585 0.53428 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700144 3 0.3208 0.78434 0.004 0.000 0.848 0.148
#> SRR1700145 4 0.4509 0.61564 0.004 0.000 0.288 0.708
#> SRR1700146 1 0.5168 -0.00941 0.504 0.004 0.000 0.492
#> SRR1700147 4 0.5069 0.56299 0.016 0.000 0.320 0.664
#> SRR1700149 3 0.4605 0.46035 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700148 4 0.5126 0.26622 0.004 0.000 0.444 0.552
#> SRR1700150 4 0.4632 0.51098 0.308 0.004 0.000 0.688
#> SRR1700152 4 0.3312 0.76862 0.052 0.000 0.072 0.876
#> SRR1700151 4 0.4485 0.71208 0.028 0.000 0.200 0.772
#> SRR1700153 4 0.4103 0.66149 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700154 4 0.3080 0.76899 0.024 0.000 0.096 0.880
#> SRR1700155 4 0.3108 0.73830 0.112 0.000 0.016 0.872
#> SRR1700156 4 0.4955 0.27382 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700158 3 0.4730 0.37913 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1700159 1 0.4417 0.71298 0.796 0.044 0.000 0.160
#> SRR1700157 4 0.5151 0.21495 0.004 0.000 0.464 0.532
#> SRR1700160 4 0.2984 0.76990 0.028 0.000 0.084 0.888
#> SRR1700161 4 0.2805 0.76908 0.012 0.000 0.100 0.888
#> SRR1700162 1 0.4539 0.56996 0.720 0.008 0.000 0.272
#> SRR1700164 3 0.5070 0.20080 0.004 0.000 0.580 0.416
#> SRR1700163 3 0.4855 0.28516 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700165 4 0.4482 0.64174 0.008 0.000 0.264 0.728
#> SRR1700166 4 0.2926 0.76119 0.056 0.000 0.048 0.896
#> SRR1700168 1 0.5820 0.59228 0.680 0.080 0.000 0.240
#> SRR1700167 3 0.4500 0.51942 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700170 4 0.3382 0.77255 0.040 0.004 0.080 0.876
#> SRR1700169 4 0.2408 0.76301 0.036 0.000 0.044 0.920
#> SRR1700171 3 0.4134 0.62861 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700172 4 0.3982 0.64915 0.220 0.004 0.000 0.776
#> SRR1700174 4 0.2282 0.75628 0.052 0.000 0.024 0.924
#> SRR1700173 4 0.2335 0.75249 0.060 0.000 0.020 0.920
#> SRR1700175 4 0.4343 0.58444 0.264 0.004 0.000 0.732
#> SRR1700176 3 0.2149 0.82581 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700178 2 0.0000 0.88981 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.3074 0.71309 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1700180 2 0.0376 0.89033 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1700179 2 0.0376 0.89024 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700183 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700182 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0376 0.89024 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1700186 2 0.0469 0.88861 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700187 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700185 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700188 2 0.0336 0.88896 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700192 3 0.1297 0.85582 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1700190 3 0.0469 0.85819 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700191 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700189 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700193 2 0.0000 0.88981 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0376 0.89044 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1700194 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700196 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700197 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700198 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.4080 0.81490 0.056 0.852 0.072 0.020
#> SRR1700203 2 0.0336 0.89025 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.88981 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0524 0.88984 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1700207 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.1492 0.85805 0.004 0.004 0.956 0.036
#> SRR1700205 2 0.3266 0.75704 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1700209 2 0.1940 0.85743 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.1209 0.88237 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1700211 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0469 0.89037 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.4546 0.77139 0.024 0.824 0.104 0.048
#> SRR1700214 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700215 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700217 2 0.2921 0.80744 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1700216 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700218 2 0.0672 0.89038 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1700219 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700220 2 0.3837 0.70054 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.2944 0.80854 0.128 0.868 0.000 0.004
#> SRR1700226 2 0.0921 0.88687 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0336 0.89052 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.1174 0.88693 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1700227 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700231 2 0.0672 0.89056 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1700228 2 0.0336 0.89036 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.1305 0.88195 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1700235 2 0.0524 0.89035 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1700237 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0469 0.89013 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700240 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700241 3 0.6027 0.53876 0.000 0.092 0.664 0.244
#> SRR1700243 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0707 0.88902 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700246 2 0.4489 0.78867 0.088 0.824 0.076 0.012
#> SRR1700245 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700249 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700250 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.5694 0.63777 0.008 0.728 0.176 0.088
#> SRR1700253 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0779 0.89002 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1700254 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700255 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0469 0.88994 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.2593 0.83855 0.104 0.892 0.000 0.004
#> SRR1700260 2 0.5126 0.16910 0.444 0.552 0.000 0.004
#> SRR1700261 1 0.4819 0.52495 0.652 0.344 0.000 0.004
#> SRR1700262 1 0.4830 0.41380 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0524 0.89048 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1700264 2 0.0817 0.88641 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700265 2 0.2650 0.86840 0.036 0.916 0.008 0.040
#> SRR1700266 2 0.2976 0.82512 0.120 0.872 0.000 0.008
#> SRR1700268 3 0.9347 0.00415 0.188 0.316 0.380 0.116
#> SRR1700270 2 0.0188 0.89046 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.1305 0.88290 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1700271 2 0.3539 0.76673 0.176 0.820 0.000 0.004
#> SRR1700272 2 0.4283 0.65441 0.256 0.740 0.000 0.004
#> SRR1700273 2 0.1867 0.86430 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.3257 0.79476 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1700277 3 0.1822 0.85396 0.004 0.008 0.944 0.044
#> SRR1700275 1 0.3591 0.75377 0.824 0.168 0.000 0.008
#> SRR1700276 1 0.5392 0.24397 0.528 0.460 0.000 0.012
#> SRR1700278 1 0.4134 0.69063 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1700279 1 0.1398 0.80154 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1700280 1 0.2760 0.78234 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR1700281 2 0.0469 0.89016 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700283 1 0.4262 0.71123 0.756 0.236 0.000 0.008
#> SRR1700282 1 0.7564 0.49468 0.604 0.048 0.132 0.216
#> SRR1700284 1 0.1042 0.79933 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1700285 1 0.2546 0.79364 0.900 0.092 0.000 0.008
#> SRR1700286 1 0.5165 0.10365 0.512 0.484 0.000 0.004
#> SRR1700287 1 0.3074 0.76819 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1700290 3 0.0336 0.85828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700289 1 0.1557 0.80019 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700288 2 0.3311 0.75710 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1700292 1 0.1474 0.80055 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700291 1 0.3501 0.75008 0.848 0.020 0.000 0.132
#> SRR1700293 2 0.5666 0.35760 0.348 0.616 0.000 0.036
#> SRR1700294 1 0.0817 0.79899 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700295 3 0.7916 -0.24052 0.316 0.000 0.356 0.328
#> SRR1700297 1 0.1302 0.80075 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1700296 1 0.3569 0.74527 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1700298 1 0.1488 0.79415 0.956 0.012 0.000 0.032
#> SRR1700299 1 0.4920 0.70645 0.792 0.024 0.040 0.144
#> SRR1700300 1 0.5693 0.73129 0.760 0.132 0.044 0.064
#> SRR1700302 1 0.0524 0.79370 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1700301 1 0.0921 0.79970 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700303 1 0.0895 0.79791 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700304 1 0.2197 0.79730 0.916 0.080 0.000 0.004
#> SRR1700305 1 0.2610 0.79697 0.900 0.088 0.000 0.012
#> SRR1700306 1 0.6428 0.41844 0.624 0.000 0.264 0.112
#> SRR1700308 1 0.5573 0.64929 0.676 0.272 0.000 0.052
#> SRR1700307 3 0.7773 0.27400 0.300 0.028 0.528 0.144
#> SRR1700309 3 0.7283 0.05607 0.420 0.000 0.432 0.148
#> SRR1700310 1 0.1211 0.80079 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700311 1 0.1970 0.78213 0.932 0.008 0.000 0.060
#> SRR1700312 1 0.3356 0.75565 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1700313 1 0.8084 0.52960 0.592 0.160 0.132 0.116
#> SRR1700314 1 0.5406 0.56292 0.692 0.004 0.036 0.268
#> SRR1700315 1 0.4523 0.76016 0.816 0.128 0.020 0.036
#> SRR1700316 1 0.7166 0.56642 0.600 0.172 0.012 0.216
#> SRR1700317 1 0.4741 0.58303 0.668 0.328 0.000 0.004
#> SRR1700318 1 0.0895 0.79888 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700319 1 0.4986 0.63651 0.740 0.000 0.044 0.216
#> SRR1700320 1 0.0927 0.79671 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1700322 1 0.2589 0.78751 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700321 1 0.2466 0.79359 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1700323 1 0.2255 0.78280 0.920 0.012 0.000 0.068
#> SRR1700324 1 0.2216 0.79412 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1700325 2 0.4972 0.08013 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR1700326 3 0.6360 0.50770 0.180 0.000 0.656 0.164
#> SRR1700327 1 0.3978 0.73360 0.796 0.192 0.000 0.012
#> SRR1700329 1 0.1824 0.80151 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR1700328 3 0.8640 0.30276 0.164 0.132 0.536 0.168
#> SRR1700330 1 0.5658 0.69451 0.768 0.044 0.088 0.100
#> SRR1700331 1 0.0524 0.79313 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700332 1 0.1004 0.79916 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700333 1 0.5228 0.60815 0.664 0.312 0.000 0.024
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.2747 0.841051 0.048 0.888 0.000 0.004 0.060
#> SRR1699875 2 0.3607 0.801447 0.144 0.820 0.000 0.008 0.028
#> SRR1699876 5 0.4221 0.687599 0.052 0.160 0.000 0.008 0.780
#> SRR1699877 2 0.1364 0.855427 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699879 2 0.4993 0.642754 0.064 0.684 0.000 0.004 0.248
#> SRR1699878 2 0.2879 0.839690 0.080 0.880 0.000 0.008 0.032
#> SRR1699880 3 0.3336 0.655131 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.5291 0.409801 0.312 0.004 0.632 0.044 0.008
#> SRR1699882 2 0.4193 0.666429 0.024 0.720 0.000 0.000 0.256
#> SRR1699883 2 0.2642 0.842136 0.084 0.888 0.000 0.004 0.024
#> SRR1699884 2 0.2463 0.835159 0.100 0.888 0.000 0.008 0.004
#> SRR1699885 2 0.1026 0.853629 0.024 0.968 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699886 5 0.4001 0.652763 0.024 0.208 0.000 0.004 0.764
#> SRR1699888 2 0.3544 0.775782 0.016 0.812 0.000 0.008 0.164
#> SRR1699889 5 0.1808 0.744721 0.044 0.012 0.000 0.008 0.936
#> SRR1699890 5 0.4346 0.568421 0.012 0.304 0.000 0.004 0.680
#> SRR1699887 5 0.4209 0.641200 0.028 0.224 0.000 0.004 0.744
#> SRR1699891 5 0.1026 0.740651 0.024 0.004 0.000 0.004 0.968
#> SRR1699892 2 0.7363 0.266962 0.316 0.516 0.056 0.040 0.072
#> SRR1699893 4 0.5317 0.595461 0.196 0.000 0.008 0.688 0.108
#> SRR1699894 5 0.1369 0.743407 0.028 0.008 0.000 0.008 0.956
#> SRR1699895 5 0.1018 0.740794 0.016 0.000 0.000 0.016 0.968
#> SRR1699896 5 0.8100 0.006247 0.360 0.172 0.064 0.024 0.380
#> SRR1699897 2 0.6008 0.528075 0.120 0.600 0.000 0.012 0.268
#> SRR1699898 3 0.3911 0.692537 0.144 0.000 0.796 0.060 0.000
#> SRR1699900 3 0.5635 0.456595 0.300 0.016 0.632 0.024 0.028
#> SRR1699899 5 0.2264 0.745486 0.060 0.024 0.000 0.004 0.912
#> SRR1699902 3 0.3663 0.674155 0.208 0.000 0.776 0.016 0.000
#> SRR1699901 3 0.1704 0.722910 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1699903 5 0.1894 0.734556 0.072 0.000 0.000 0.008 0.920
#> SRR1699904 5 0.1195 0.739948 0.012 0.000 0.000 0.028 0.960
#> SRR1699905 3 0.1484 0.722090 0.048 0.000 0.944 0.008 0.000
#> SRR1699906 5 0.2157 0.746076 0.036 0.040 0.000 0.004 0.920
#> SRR1699907 5 0.1430 0.737064 0.052 0.000 0.000 0.004 0.944
#> SRR1699908 5 0.1518 0.740753 0.048 0.004 0.000 0.004 0.944
#> SRR1699909 5 0.3861 0.720641 0.092 0.088 0.000 0.004 0.816
#> SRR1699910 5 0.6993 0.353643 0.160 0.000 0.052 0.248 0.540
#> SRR1699911 5 0.3066 0.728409 0.116 0.004 0.008 0.012 0.860
#> SRR1699912 5 0.1205 0.738049 0.040 0.000 0.000 0.004 0.956
#> SRR1699913 5 0.1948 0.749574 0.036 0.024 0.000 0.008 0.932
#> SRR1699914 3 0.5807 0.418460 0.320 0.000 0.596 0.056 0.028
#> SRR1699915 5 0.4379 0.681285 0.124 0.000 0.012 0.080 0.784
#> SRR1699916 2 0.5282 -0.005186 0.032 0.520 0.000 0.008 0.440
#> SRR1699917 5 0.6035 0.474872 0.144 0.004 0.000 0.272 0.580
#> SRR1699918 5 0.7571 0.394242 0.144 0.268 0.000 0.104 0.484
#> SRR1699919 5 0.1831 0.736328 0.076 0.000 0.000 0.004 0.920
#> SRR1699920 5 0.7934 -0.085457 0.324 0.000 0.100 0.188 0.388
#> SRR1699921 5 0.1877 0.735861 0.064 0.000 0.000 0.012 0.924
#> SRR1699922 5 0.3297 0.740002 0.084 0.068 0.000 0.000 0.848
#> SRR1699923 3 0.3243 0.675074 0.180 0.000 0.812 0.004 0.004
#> SRR1699924 3 0.6595 0.086118 0.328 0.000 0.472 0.196 0.004
#> SRR1699925 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.3767 0.701910 0.132 0.000 0.016 0.032 0.820
#> SRR1699927 5 0.1041 0.739172 0.032 0.000 0.000 0.004 0.964
#> SRR1699929 5 0.7313 0.410805 0.272 0.128 0.048 0.020 0.532
#> SRR1699928 5 0.0992 0.738328 0.024 0.000 0.000 0.008 0.968
#> SRR1699930 5 0.1267 0.743219 0.024 0.004 0.000 0.012 0.960
#> SRR1699931 5 0.8696 -0.016174 0.304 0.236 0.052 0.064 0.344
#> SRR1699933 3 0.6488 0.000902 0.412 0.036 0.492 0.028 0.032
#> SRR1699932 5 0.1124 0.737367 0.036 0.000 0.000 0.004 0.960
#> SRR1699934 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.7341 0.397780 0.184 0.052 0.004 0.256 0.504
#> SRR1699936 2 0.3498 0.817660 0.044 0.848 0.000 0.016 0.092
#> SRR1699937 2 0.2971 0.795659 0.156 0.836 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699938 2 0.1386 0.852645 0.032 0.952 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699940 3 0.5855 -0.117576 0.452 0.072 0.468 0.008 0.000
#> SRR1699939 2 0.5055 0.702929 0.072 0.708 0.000 0.012 0.208
#> SRR1699941 3 0.3796 0.581950 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.4548 0.673692 0.232 0.716 0.000 0.052 0.000
#> SRR1699943 2 0.1764 0.845437 0.064 0.928 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699944 2 0.2069 0.845232 0.076 0.912 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699945 3 0.1341 0.719620 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.3628 0.750997 0.216 0.772 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699947 2 0.2877 0.815025 0.144 0.848 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699948 2 0.1282 0.849210 0.044 0.952 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699949 2 0.5025 0.577292 0.044 0.660 0.000 0.008 0.288
#> SRR1699950 2 0.4297 0.732524 0.036 0.756 0.000 0.008 0.200
#> SRR1699951 2 0.5903 0.665791 0.168 0.672 0.000 0.040 0.120
#> SRR1699952 2 0.3039 0.777423 0.192 0.808 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.3110 0.817060 0.028 0.856 0.000 0.004 0.112
#> SRR1699954 3 0.5126 0.343369 0.356 0.040 0.600 0.004 0.000
#> SRR1699955 2 0.1310 0.852744 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699956 3 0.2516 0.705414 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.4583 0.758137 0.144 0.756 0.000 0.004 0.096
#> SRR1699959 1 0.6734 0.321503 0.428 0.000 0.352 0.216 0.004
#> SRR1699958 4 0.6201 0.375693 0.120 0.228 0.000 0.620 0.032
#> SRR1699960 2 0.3624 0.817967 0.052 0.844 0.000 0.020 0.084
#> SRR1699961 1 0.6425 0.470377 0.528 0.200 0.268 0.000 0.004
#> SRR1699962 2 0.1753 0.853127 0.032 0.936 0.000 0.000 0.032
#> SRR1699963 2 0.7179 -0.126082 0.336 0.400 0.020 0.244 0.000
#> SRR1699964 2 0.1798 0.849874 0.064 0.928 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699965 2 0.2248 0.834009 0.012 0.900 0.000 0.000 0.088
#> SRR1699966 1 0.8941 0.182047 0.392 0.124 0.056 0.256 0.172
#> SRR1699967 2 0.1571 0.850011 0.060 0.936 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699968 5 0.6528 0.500285 0.240 0.144 0.008 0.020 0.588
#> SRR1699969 3 0.4952 0.612145 0.216 0.000 0.708 0.068 0.008
#> SRR1699971 3 0.5187 0.068248 0.484 0.016 0.484 0.016 0.000
#> SRR1699970 2 0.1792 0.841401 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.4986 0.234407 0.444 0.012 0.532 0.012 0.000
#> SRR1699973 4 0.7923 0.266855 0.180 0.168 0.000 0.468 0.184
#> SRR1699974 3 0.1892 0.720855 0.080 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR1699975 5 0.6287 0.475046 0.296 0.064 0.000 0.056 0.584
#> SRR1699976 1 0.6411 0.521220 0.604 0.236 0.132 0.016 0.012
#> SRR1699977 1 0.6711 0.488555 0.544 0.024 0.240 0.192 0.000
#> SRR1699978 3 0.1997 0.719011 0.040 0.000 0.924 0.036 0.000
#> SRR1699979 1 0.6880 0.316161 0.524 0.008 0.160 0.288 0.020
#> SRR1699980 5 0.3578 0.689821 0.204 0.004 0.000 0.008 0.784
#> SRR1699981 3 0.4305 0.668838 0.176 0.000 0.768 0.048 0.008
#> SRR1699982 5 0.1405 0.742598 0.020 0.008 0.000 0.016 0.956
#> SRR1699983 5 0.1831 0.742212 0.076 0.000 0.000 0.004 0.920
#> SRR1699984 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.6336 0.354783 0.112 0.544 0.000 0.020 0.324
#> SRR1699986 3 0.0703 0.716934 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.6927 0.053461 0.168 0.456 0.000 0.024 0.352
#> SRR1699987 4 0.6961 -0.123104 0.268 0.000 0.312 0.412 0.008
#> SRR1699989 5 0.3667 0.724376 0.140 0.048 0.000 0.000 0.812
#> SRR1699990 1 0.8679 0.337535 0.428 0.060 0.092 0.164 0.256
#> SRR1699992 3 0.4866 0.435933 0.352 0.012 0.620 0.016 0.000
#> SRR1699991 3 0.5490 0.519060 0.248 0.000 0.636 0.116 0.000
#> SRR1699993 3 0.1357 0.717952 0.048 0.000 0.948 0.004 0.000
#> SRR1699994 3 0.2230 0.715984 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1699995 3 0.0510 0.715399 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.4610 0.752862 0.140 0.780 0.012 0.016 0.052
#> SRR1699997 4 0.2409 0.683055 0.068 0.000 0.000 0.900 0.032
#> SRR1699998 2 0.4577 0.721614 0.208 0.736 0.000 0.008 0.048
#> SRR1699999 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.3790 0.593122 0.272 0.004 0.724 0.000 0.000
#> SRR1700002 1 0.6705 0.477080 0.608 0.184 0.080 0.128 0.000
#> SRR1700001 3 0.4073 0.647901 0.216 0.000 0.752 0.032 0.000
#> SRR1700003 1 0.7771 0.485134 0.476 0.228 0.176 0.120 0.000
#> SRR1700004 3 0.3016 0.715020 0.132 0.000 0.848 0.020 0.000
#> SRR1700005 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.6103 0.319300 0.520 0.088 0.380 0.008 0.004
#> SRR1700007 5 0.4492 0.616492 0.016 0.256 0.000 0.016 0.712
#> SRR1700008 3 0.5091 0.447668 0.084 0.000 0.672 0.244 0.000
#> SRR1700009 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.2648 0.706010 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1700011 2 0.3883 0.796825 0.032 0.824 0.000 0.032 0.112
#> SRR1700013 1 0.8692 0.365161 0.300 0.164 0.252 0.276 0.008
#> SRR1700012 1 0.7186 0.478726 0.584 0.204 0.080 0.116 0.016
#> SRR1700014 1 0.6447 0.471722 0.672 0.028 0.084 0.152 0.064
#> SRR1700015 2 0.6605 0.057962 0.400 0.476 0.072 0.052 0.000
#> SRR1700016 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.4902 -0.053307 0.508 0.024 0.468 0.000 0.000
#> SRR1700017 1 0.5258 -0.080182 0.488 0.004 0.472 0.036 0.000
#> SRR1700019 5 0.5452 0.473640 0.052 0.332 0.000 0.012 0.604
#> SRR1700020 3 0.2249 0.719614 0.096 0.000 0.896 0.008 0.000
#> SRR1700021 5 0.2504 0.738989 0.032 0.004 0.000 0.064 0.900
#> SRR1700023 1 0.7084 0.553230 0.576 0.032 0.220 0.144 0.028
#> SRR1700022 3 0.4497 0.508353 0.352 0.000 0.632 0.016 0.000
#> SRR1700024 5 0.8125 0.102314 0.260 0.104 0.000 0.272 0.364
#> SRR1700025 2 0.4015 0.682847 0.264 0.724 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700026 3 0.6143 0.251536 0.332 0.072 0.564 0.032 0.000
#> SRR1700027 1 0.6436 0.332845 0.524 0.092 0.352 0.032 0.000
#> SRR1700028 4 0.6009 0.555713 0.216 0.012 0.008 0.640 0.124
#> SRR1700029 3 0.6624 -0.007005 0.264 0.000 0.456 0.280 0.000
#> SRR1700030 5 0.3344 0.737373 0.104 0.028 0.000 0.016 0.852
#> SRR1700031 3 0.3231 0.683970 0.196 0.000 0.800 0.004 0.000
#> SRR1700032 2 0.5971 0.588876 0.236 0.628 0.000 0.020 0.116
#> SRR1700034 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.2228 0.740906 0.048 0.000 0.000 0.040 0.912
#> SRR1700033 3 0.3086 0.698329 0.180 0.000 0.816 0.004 0.000
#> SRR1700036 5 0.4542 0.646309 0.236 0.020 0.000 0.020 0.724
#> SRR1700037 5 0.1772 0.748911 0.020 0.032 0.000 0.008 0.940
#> SRR1700038 3 0.4520 0.567070 0.296 0.008 0.680 0.016 0.000
#> SRR1700039 3 0.2470 0.720606 0.104 0.000 0.884 0.012 0.000
#> SRR1700040 3 0.3519 0.676675 0.216 0.000 0.776 0.008 0.000
#> SRR1700041 3 0.5510 0.364171 0.380 0.000 0.548 0.072 0.000
#> SRR1700042 3 0.3196 0.688545 0.192 0.000 0.804 0.004 0.000
#> SRR1700043 3 0.3171 0.694479 0.176 0.000 0.816 0.008 0.000
#> SRR1700045 3 0.6176 0.154711 0.388 0.000 0.488 0.120 0.004
#> SRR1700044 1 0.7488 0.527324 0.548 0.092 0.256 0.048 0.056
#> SRR1700046 3 0.5601 0.139551 0.460 0.004 0.476 0.060 0.000
#> SRR1700047 3 0.3852 0.667267 0.220 0.000 0.760 0.020 0.000
#> SRR1700048 1 0.7495 0.404687 0.444 0.000 0.308 0.188 0.060
#> SRR1700049 3 0.1608 0.718192 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.3267 0.710707 0.112 0.000 0.844 0.044 0.000
#> SRR1700051 3 0.1732 0.718419 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.2377 0.713131 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.7891 0.468638 0.484 0.008 0.172 0.108 0.228
#> SRR1700054 3 0.4668 0.501254 0.352 0.000 0.624 0.024 0.000
#> SRR1700055 3 0.0290 0.715051 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.5083 0.567585 0.140 0.000 0.700 0.160 0.000
#> SRR1700057 3 0.5159 0.555178 0.124 0.000 0.688 0.188 0.000
#> SRR1700058 3 0.3039 0.694894 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1700059 4 0.6141 0.322262 0.172 0.000 0.248 0.576 0.004
#> SRR1700060 3 0.3993 0.668343 0.216 0.000 0.756 0.028 0.000
#> SRR1700061 3 0.4616 0.582852 0.288 0.000 0.676 0.036 0.000
#> SRR1700062 3 0.4226 0.681002 0.140 0.000 0.776 0.084 0.000
#> SRR1700063 3 0.4219 0.636137 0.260 0.000 0.716 0.024 0.000
#> SRR1700064 1 0.8469 0.319315 0.344 0.000 0.200 0.232 0.224
#> SRR1700065 3 0.3160 0.688721 0.188 0.000 0.808 0.004 0.000
#> SRR1700066 3 0.2773 0.701316 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR1700067 4 0.6186 0.278328 0.152 0.000 0.000 0.512 0.336
#> SRR1700068 3 0.6541 0.166651 0.260 0.000 0.480 0.260 0.000
#> SRR1700069 1 0.7418 0.255110 0.440 0.000 0.128 0.080 0.352
#> SRR1700070 2 0.5823 0.533115 0.184 0.628 0.000 0.004 0.184
#> SRR1700071 3 0.4990 0.422137 0.384 0.000 0.580 0.036 0.000
#> SRR1700072 3 0.2719 0.712437 0.144 0.000 0.852 0.004 0.000
#> SRR1700073 5 0.5094 0.687907 0.080 0.044 0.000 0.128 0.748
#> SRR1700075 3 0.4716 0.555772 0.308 0.000 0.656 0.036 0.000
#> SRR1700074 3 0.4671 0.526735 0.332 0.000 0.640 0.028 0.000
#> SRR1700076 1 0.7683 0.471632 0.508 0.032 0.284 0.104 0.072
#> SRR1700077 3 0.4460 0.444579 0.392 0.004 0.600 0.004 0.000
#> SRR1700078 3 0.4810 0.584837 0.228 0.000 0.716 0.020 0.036
#> SRR1700080 1 0.7419 0.386373 0.404 0.000 0.316 0.036 0.244
#> SRR1700079 3 0.5104 0.592707 0.192 0.000 0.692 0.116 0.000
#> SRR1700081 3 0.3877 0.673582 0.212 0.000 0.764 0.024 0.000
#> SRR1700082 3 0.5071 0.328087 0.424 0.000 0.540 0.036 0.000
#> SRR1700083 3 0.2179 0.715833 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1700084 3 0.2329 0.710637 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1700085 5 0.2418 0.749968 0.044 0.024 0.000 0.020 0.912
#> SRR1700086 1 0.6860 0.451043 0.540 0.008 0.292 0.032 0.128
#> SRR1700087 4 0.6569 0.413069 0.228 0.036 0.152 0.584 0.000
#> SRR1700088 1 0.7356 0.202267 0.420 0.272 0.032 0.276 0.000
#> SRR1700089 4 0.7040 0.328093 0.260 0.068 0.132 0.540 0.000
#> SRR1700091 4 0.5924 0.561089 0.156 0.116 0.020 0.688 0.020
#> SRR1700090 4 0.2811 0.681790 0.100 0.000 0.012 0.876 0.012
#> SRR1700092 4 0.5727 0.440175 0.140 0.192 0.000 0.656 0.012
#> SRR1700094 4 0.7127 0.359950 0.180 0.184 0.036 0.576 0.024
#> SRR1700093 4 0.2869 0.669194 0.048 0.024 0.008 0.896 0.024
#> SRR1700095 4 0.4712 0.596253 0.100 0.000 0.168 0.732 0.000
#> SRR1700096 4 0.5696 0.556176 0.248 0.024 0.068 0.656 0.004
#> SRR1700097 3 0.1310 0.719686 0.020 0.000 0.956 0.024 0.000
#> SRR1700098 2 0.6932 0.256941 0.076 0.504 0.000 0.336 0.084
#> SRR1700099 4 0.5869 0.510257 0.064 0.152 0.000 0.688 0.096
#> SRR1700100 4 0.4053 0.661059 0.128 0.036 0.004 0.812 0.020
#> SRR1700101 4 0.5637 0.535573 0.104 0.144 0.000 0.704 0.048
#> SRR1700102 4 0.6546 0.459652 0.152 0.152 0.004 0.632 0.060
#> SRR1700104 4 0.3114 0.665420 0.076 0.036 0.000 0.872 0.016
#> SRR1700103 4 0.6197 0.363268 0.192 0.000 0.232 0.572 0.004
#> SRR1700105 4 0.2433 0.679204 0.056 0.000 0.012 0.908 0.024
#> SRR1700106 4 0.3546 0.681580 0.060 0.000 0.076 0.848 0.016
#> SRR1700107 4 0.3309 0.665844 0.108 0.016 0.000 0.852 0.024
#> SRR1700108 4 0.5215 0.532276 0.076 0.152 0.000 0.732 0.040
#> SRR1700109 2 0.6927 0.380645 0.036 0.532 0.000 0.192 0.240
#> SRR1700110 2 0.6199 0.563713 0.028 0.628 0.000 0.176 0.168
#> SRR1700112 5 0.7099 0.323998 0.028 0.200 0.000 0.312 0.460
#> SRR1700111 4 0.3010 0.685360 0.100 0.000 0.020 0.868 0.012
#> SRR1700113 5 0.7087 0.185927 0.048 0.132 0.000 0.372 0.448
#> SRR1700114 4 0.4311 0.660309 0.092 0.048 0.004 0.812 0.044
#> SRR1700115 4 0.5962 0.495869 0.064 0.068 0.000 0.660 0.208
#> SRR1700116 4 0.3682 0.683146 0.088 0.000 0.064 0.836 0.012
#> SRR1700117 3 0.4465 0.548087 0.056 0.000 0.732 0.212 0.000
#> SRR1700119 4 0.2452 0.683987 0.084 0.000 0.016 0.896 0.004
#> SRR1700118 4 0.3774 0.679745 0.140 0.000 0.028 0.816 0.016
#> SRR1700120 3 0.3214 0.670471 0.036 0.000 0.844 0.120 0.000
#> SRR1700121 4 0.3558 0.651592 0.064 0.000 0.000 0.828 0.108
#> SRR1700122 5 0.5554 0.314776 0.016 0.040 0.000 0.404 0.540
#> SRR1700123 4 0.3921 0.648494 0.072 0.000 0.128 0.800 0.000
#> SRR1700125 5 0.5554 0.520129 0.032 0.044 0.000 0.288 0.636
#> SRR1700126 3 0.3759 0.652715 0.056 0.000 0.808 0.136 0.000
#> SRR1700127 4 0.5830 0.374636 0.124 0.000 0.268 0.604 0.004
#> SRR1700124 4 0.3915 0.659932 0.088 0.000 0.096 0.812 0.004
#> SRR1700128 4 0.4640 0.615735 0.112 0.000 0.120 0.760 0.008
#> SRR1700129 4 0.4150 0.559981 0.036 0.000 0.000 0.748 0.216
#> SRR1700130 4 0.4228 0.642631 0.076 0.012 0.000 0.796 0.116
#> SRR1700132 4 0.6025 0.171469 0.120 0.000 0.384 0.496 0.000
#> SRR1700131 3 0.6164 0.015287 0.116 0.000 0.472 0.408 0.004
#> SRR1700133 4 0.4263 0.650678 0.072 0.000 0.012 0.792 0.124
#> SRR1700134 5 0.5036 0.188889 0.024 0.004 0.000 0.452 0.520
#> SRR1700135 4 0.5254 0.625707 0.132 0.000 0.100 0.732 0.036
#> SRR1700136 4 0.5906 0.117388 0.104 0.000 0.404 0.492 0.000
#> SRR1700137 4 0.3187 0.682182 0.088 0.000 0.012 0.864 0.036
#> SRR1700138 4 0.5042 0.643488 0.180 0.000 0.040 0.732 0.048
#> SRR1700140 4 0.3735 0.669445 0.132 0.000 0.048 0.816 0.004
#> SRR1700139 4 0.4444 0.666378 0.104 0.000 0.088 0.788 0.020
#> SRR1700141 5 0.4919 0.407006 0.016 0.012 0.000 0.368 0.604
#> SRR1700142 3 0.5271 0.546923 0.152 0.000 0.680 0.168 0.000
#> SRR1700143 4 0.5837 0.204349 0.088 0.000 0.376 0.532 0.004
#> SRR1700144 3 0.5405 0.532895 0.256 0.000 0.640 0.104 0.000
#> SRR1700145 4 0.5422 0.382162 0.088 0.000 0.296 0.616 0.000
#> SRR1700146 4 0.5418 0.041293 0.040 0.008 0.000 0.508 0.444
#> SRR1700147 4 0.5740 0.338528 0.112 0.000 0.308 0.580 0.000
#> SRR1700149 3 0.4687 0.421219 0.040 0.000 0.672 0.288 0.000
#> SRR1700148 4 0.5895 0.124697 0.104 0.000 0.396 0.500 0.000
#> SRR1700150 4 0.4134 0.586992 0.044 0.000 0.000 0.760 0.196
#> SRR1700152 4 0.4160 0.673789 0.112 0.000 0.068 0.804 0.016
#> SRR1700151 4 0.5778 0.527106 0.168 0.000 0.156 0.660 0.016
#> SRR1700153 4 0.5282 0.511965 0.100 0.000 0.220 0.676 0.004
#> SRR1700154 4 0.3759 0.656326 0.092 0.000 0.092 0.816 0.000
#> SRR1700155 4 0.2605 0.681869 0.056 0.000 0.004 0.896 0.044
#> SRR1700156 4 0.5883 0.176219 0.104 0.000 0.388 0.508 0.000
#> SRR1700158 3 0.5119 0.255824 0.048 0.000 0.592 0.360 0.000
#> SRR1700159 5 0.4616 0.625555 0.008 0.040 0.000 0.232 0.720
#> SRR1700157 4 0.6408 0.036688 0.172 0.000 0.388 0.440 0.000
#> SRR1700160 4 0.4046 0.675475 0.120 0.000 0.068 0.804 0.008
#> SRR1700161 4 0.3926 0.662690 0.084 0.000 0.084 0.820 0.012
#> SRR1700162 5 0.4668 0.431884 0.024 0.000 0.000 0.352 0.624
#> SRR1700164 3 0.4908 0.257658 0.036 0.000 0.608 0.356 0.000
#> SRR1700163 3 0.5368 0.287428 0.072 0.000 0.596 0.332 0.000
#> SRR1700165 4 0.5711 0.423899 0.136 0.000 0.252 0.612 0.000
#> SRR1700166 4 0.1844 0.676709 0.040 0.000 0.012 0.936 0.012
#> SRR1700168 5 0.5869 0.395234 0.028 0.052 0.000 0.356 0.564
#> SRR1700167 3 0.5325 0.329797 0.076 0.000 0.616 0.308 0.000
#> SRR1700170 4 0.3498 0.685165 0.096 0.004 0.044 0.848 0.008
#> SRR1700169 4 0.3019 0.682800 0.108 0.000 0.012 0.864 0.016
#> SRR1700171 3 0.4096 0.553123 0.040 0.000 0.760 0.200 0.000
#> SRR1700172 4 0.5006 0.562583 0.116 0.000 0.000 0.704 0.180
#> SRR1700174 4 0.3170 0.684535 0.120 0.000 0.012 0.852 0.016
#> SRR1700173 4 0.2138 0.677009 0.044 0.004 0.004 0.924 0.024
#> SRR1700175 4 0.4186 0.586893 0.044 0.004 0.000 0.768 0.184
#> SRR1700176 3 0.3454 0.678134 0.064 0.000 0.836 0.100 0.000
#> SRR1700178 2 0.0404 0.850887 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.2585 0.675405 0.036 0.000 0.004 0.896 0.064
#> SRR1700180 2 0.0162 0.849897 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0290 0.850953 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0162 0.850241 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0162 0.850042 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0290 0.850019 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1121 0.850205 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700187 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700185 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0880 0.852056 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.1970 0.708997 0.060 0.012 0.924 0.004 0.000
#> SRR1700190 3 0.0794 0.717448 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1700191 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0290 0.850220 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0771 0.853085 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700194 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0324 0.850526 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700197 3 0.0290 0.714858 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0486 0.850791 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700199 2 0.0162 0.849551 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0451 0.850650 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700201 2 0.0566 0.853056 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700202 2 0.5400 0.719970 0.052 0.760 0.068 0.032 0.088
#> SRR1700203 2 0.0912 0.853008 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700204 2 0.1124 0.853733 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700206 2 0.1443 0.853305 0.044 0.948 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700207 2 0.0451 0.851497 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700208 3 0.2050 0.710076 0.064 0.008 0.920 0.008 0.000
#> SRR1700205 2 0.3419 0.745776 0.016 0.804 0.000 0.000 0.180
#> SRR1700209 2 0.2054 0.848092 0.028 0.920 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700210 2 0.1485 0.852838 0.032 0.948 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700211 2 0.1173 0.853888 0.020 0.964 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700212 2 0.1310 0.855251 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700213 2 0.6736 0.520760 0.204 0.624 0.100 0.024 0.048
#> SRR1700214 2 0.0671 0.850664 0.016 0.980 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700215 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.2723 0.814503 0.012 0.864 0.000 0.000 0.124
#> SRR1700216 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.2012 0.851447 0.060 0.920 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700219 2 0.0451 0.850650 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700222 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.3935 0.706694 0.012 0.760 0.000 0.008 0.220
#> SRR1700221 2 0.0771 0.851376 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700223 2 0.0566 0.850312 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.4045 0.758161 0.064 0.796 0.000 0.004 0.136
#> SRR1700226 2 0.1518 0.852466 0.004 0.944 0.000 0.004 0.048
#> SRR1700229 2 0.1668 0.854790 0.032 0.940 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700225 2 0.3727 0.776099 0.152 0.812 0.000 0.020 0.016
#> SRR1700227 2 0.0324 0.849826 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700230 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.1630 0.854978 0.036 0.944 0.000 0.004 0.016
#> SRR1700228 2 0.0963 0.853558 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0771 0.850705 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700233 2 0.1124 0.852431 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700234 2 0.3136 0.820685 0.052 0.868 0.000 0.008 0.072
#> SRR1700235 2 0.1670 0.850902 0.052 0.936 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700237 2 0.0324 0.852680 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700236 2 0.0955 0.853957 0.028 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700238 2 0.0451 0.849941 0.008 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700239 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.6776 0.303820 0.152 0.068 0.620 0.152 0.008
#> SRR1700243 2 0.0566 0.850999 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.1522 0.852771 0.012 0.944 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700242 3 0.0671 0.716474 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR1700246 2 0.6030 0.574465 0.084 0.680 0.140 0.000 0.096
#> SRR1700245 2 0.0566 0.851442 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700247 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700249 3 0.0000 0.714233 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0290 0.851070 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0290 0.850690 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0613 0.852043 0.008 0.984 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700252 2 0.7298 0.175884 0.216 0.528 0.200 0.048 0.008
#> SRR1700253 2 0.0451 0.851497 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700256 2 0.1579 0.853799 0.024 0.944 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700254 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0566 0.850372 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700257 2 0.0693 0.852154 0.008 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700258 2 0.1399 0.853031 0.020 0.952 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700259 2 0.3774 0.782307 0.032 0.808 0.000 0.008 0.152
#> SRR1700260 5 0.5486 0.018052 0.032 0.468 0.000 0.016 0.484
#> SRR1700261 5 0.4850 0.541375 0.020 0.304 0.000 0.016 0.660
#> SRR1700262 5 0.5078 0.229752 0.028 0.424 0.000 0.004 0.544
#> SRR1700263 2 0.0955 0.853999 0.028 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700264 2 0.2733 0.829372 0.112 0.872 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700265 2 0.5195 0.720317 0.188 0.724 0.012 0.016 0.060
#> SRR1700266 2 0.4271 0.758721 0.044 0.768 0.000 0.008 0.180
#> SRR1700268 3 0.9499 -0.433733 0.212 0.200 0.340 0.096 0.152
#> SRR1700270 2 0.1386 0.854533 0.032 0.952 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700267 2 0.1914 0.847132 0.016 0.924 0.000 0.000 0.060
#> SRR1700271 2 0.3289 0.777472 0.008 0.816 0.000 0.004 0.172
#> SRR1700272 2 0.4209 0.675368 0.016 0.732 0.000 0.008 0.244
#> SRR1700273 2 0.2751 0.844319 0.052 0.888 0.000 0.004 0.056
#> SRR1700274 2 0.3656 0.751278 0.020 0.784 0.000 0.000 0.196
#> SRR1700277 3 0.3879 0.659906 0.188 0.012 0.784 0.016 0.000
#> SRR1700275 5 0.4547 0.618520 0.024 0.252 0.000 0.012 0.712
#> SRR1700276 5 0.5097 0.117544 0.012 0.476 0.000 0.016 0.496
#> SRR1700278 5 0.4387 0.670835 0.044 0.208 0.000 0.004 0.744
#> SRR1700279 5 0.1153 0.746525 0.004 0.024 0.000 0.008 0.964
#> SRR1700280 5 0.3155 0.727289 0.016 0.128 0.000 0.008 0.848
#> SRR1700281 2 0.1195 0.854122 0.012 0.960 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700283 5 0.4796 0.605508 0.028 0.280 0.000 0.012 0.680
#> SRR1700282 5 0.8442 0.238825 0.128 0.052 0.160 0.168 0.492
#> SRR1700284 5 0.1106 0.742534 0.012 0.000 0.000 0.024 0.964
#> SRR1700285 5 0.3215 0.733914 0.056 0.092 0.000 0.000 0.852
#> SRR1700286 5 0.5406 0.192663 0.040 0.432 0.000 0.008 0.520
#> SRR1700287 5 0.3471 0.707303 0.012 0.156 0.000 0.012 0.820
#> SRR1700290 3 0.0162 0.714370 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700289 5 0.1893 0.747342 0.028 0.024 0.000 0.012 0.936
#> SRR1700288 2 0.3616 0.796849 0.052 0.828 0.000 0.004 0.116
#> SRR1700292 5 0.1525 0.745962 0.004 0.036 0.000 0.012 0.948
#> SRR1700291 5 0.5992 0.638709 0.124 0.064 0.000 0.132 0.680
#> SRR1700293 2 0.5976 0.307953 0.052 0.568 0.000 0.036 0.344
#> SRR1700294 5 0.1299 0.741555 0.020 0.008 0.000 0.012 0.960
#> SRR1700295 3 0.8054 -0.201854 0.104 0.008 0.452 0.204 0.232
#> SRR1700297 5 0.2072 0.746562 0.020 0.036 0.000 0.016 0.928
#> SRR1700296 5 0.3190 0.721939 0.008 0.140 0.000 0.012 0.840
#> SRR1700298 5 0.2491 0.742228 0.068 0.000 0.000 0.036 0.896
#> SRR1700299 5 0.6413 0.593182 0.156 0.024 0.036 0.124 0.660
#> SRR1700300 5 0.6602 0.633424 0.152 0.104 0.016 0.076 0.652
#> SRR1700302 5 0.1399 0.741060 0.020 0.000 0.000 0.028 0.952
#> SRR1700301 5 0.1617 0.743787 0.020 0.020 0.000 0.012 0.948
#> SRR1700303 5 0.1372 0.741585 0.024 0.004 0.000 0.016 0.956
#> SRR1700304 5 0.2881 0.739504 0.024 0.092 0.000 0.008 0.876
#> SRR1700305 5 0.2835 0.743575 0.036 0.080 0.000 0.004 0.880
#> SRR1700306 5 0.7489 -0.124904 0.128 0.000 0.344 0.088 0.440
#> SRR1700308 5 0.6968 0.485403 0.188 0.228 0.000 0.044 0.540
#> SRR1700307 3 0.8397 -0.403647 0.304 0.008 0.324 0.104 0.260
#> SRR1700309 3 0.8389 -0.319207 0.216 0.004 0.376 0.144 0.260
#> SRR1700310 5 0.1547 0.745338 0.016 0.032 0.000 0.004 0.948
#> SRR1700311 5 0.3479 0.725363 0.080 0.000 0.000 0.084 0.836
#> SRR1700312 5 0.3742 0.685240 0.020 0.188 0.000 0.004 0.788
#> SRR1700313 5 0.9024 0.142087 0.212 0.156 0.132 0.080 0.420
#> SRR1700314 5 0.7026 0.359970 0.132 0.004 0.048 0.288 0.528
#> SRR1700315 5 0.5458 0.682591 0.116 0.100 0.012 0.036 0.736
#> SRR1700316 5 0.7820 0.411096 0.192 0.128 0.004 0.180 0.496
#> SRR1700317 5 0.5229 0.424038 0.044 0.368 0.000 0.004 0.584
#> SRR1700318 5 0.1469 0.741817 0.036 0.000 0.000 0.016 0.948
#> SRR1700319 5 0.6469 0.492317 0.144 0.000 0.040 0.212 0.604
#> SRR1700320 5 0.0912 0.738612 0.016 0.000 0.000 0.012 0.972
#> SRR1700322 5 0.4123 0.737135 0.056 0.080 0.000 0.044 0.820
#> SRR1700321 5 0.3518 0.734070 0.048 0.104 0.000 0.008 0.840
#> SRR1700323 5 0.3669 0.715609 0.048 0.008 0.000 0.116 0.828
#> SRR1700324 5 0.2666 0.743055 0.020 0.076 0.000 0.012 0.892
#> SRR1700325 5 0.4727 0.182235 0.016 0.452 0.000 0.000 0.532
#> SRR1700326 3 0.6509 0.289776 0.088 0.000 0.636 0.148 0.128
#> SRR1700327 5 0.4550 0.652024 0.064 0.188 0.000 0.004 0.744
#> SRR1700329 5 0.2554 0.745054 0.020 0.076 0.000 0.008 0.896
#> SRR1700328 3 0.9068 -0.300913 0.188 0.096 0.428 0.132 0.156
#> SRR1700330 5 0.6678 0.577514 0.160 0.036 0.076 0.072 0.656
#> SRR1700331 5 0.1725 0.741068 0.044 0.000 0.000 0.020 0.936
#> SRR1700332 5 0.1974 0.748535 0.036 0.016 0.000 0.016 0.932
#> SRR1700333 5 0.6237 0.522668 0.068 0.300 0.000 0.048 0.584
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.3187 0.79136 0.052 0.860 0.000 0.004 0.036 0.048
#> SRR1699875 2 0.4655 0.74156 0.088 0.740 0.000 0.004 0.028 0.140
#> SRR1699876 5 0.4667 0.51060 0.120 0.144 0.000 0.000 0.720 0.016
#> SRR1699877 2 0.2900 0.79630 0.088 0.860 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1699879 2 0.5588 0.60661 0.100 0.648 0.000 0.012 0.208 0.032
#> SRR1699878 2 0.3635 0.78405 0.072 0.824 0.000 0.004 0.020 0.080
#> SRR1699880 3 0.4107 0.57427 0.028 0.000 0.688 0.004 0.000 0.280
#> SRR1699881 3 0.6073 0.21335 0.076 0.000 0.536 0.052 0.008 0.328
#> SRR1699882 2 0.5146 0.55506 0.104 0.636 0.000 0.000 0.248 0.012
#> SRR1699883 2 0.4151 0.76482 0.100 0.780 0.000 0.000 0.028 0.092
#> SRR1699884 2 0.3314 0.78803 0.092 0.828 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1699885 2 0.1572 0.79655 0.028 0.936 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699886 5 0.4659 0.48632 0.108 0.180 0.000 0.000 0.704 0.008
#> SRR1699888 2 0.4209 0.67459 0.044 0.744 0.000 0.008 0.196 0.008
#> SRR1699889 5 0.3483 0.58423 0.144 0.036 0.000 0.000 0.808 0.012
#> SRR1699890 5 0.4720 0.36863 0.072 0.304 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1699887 5 0.4354 0.46787 0.080 0.216 0.000 0.000 0.704 0.000
#> SRR1699891 5 0.2911 0.58607 0.144 0.024 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1699892 2 0.8483 -0.11205 0.196 0.384 0.068 0.032 0.076 0.244
#> SRR1699893 4 0.6692 0.30347 0.252 0.000 0.000 0.508 0.108 0.132
#> SRR1699894 5 0.2182 0.59622 0.068 0.020 0.000 0.008 0.904 0.000
#> SRR1699895 5 0.1615 0.58878 0.064 0.004 0.000 0.004 0.928 0.000
#> SRR1699896 1 0.8809 0.44316 0.288 0.120 0.076 0.020 0.256 0.240
#> SRR1699897 2 0.6962 0.29270 0.212 0.476 0.000 0.004 0.224 0.084
#> SRR1699898 3 0.4585 0.64752 0.048 0.000 0.736 0.052 0.000 0.164
#> SRR1699900 3 0.6800 0.11917 0.172 0.008 0.484 0.028 0.016 0.292
#> SRR1699899 5 0.3232 0.57824 0.140 0.020 0.000 0.000 0.824 0.016
#> SRR1699902 3 0.4403 0.61382 0.048 0.000 0.712 0.016 0.000 0.224
#> SRR1699901 3 0.2110 0.68334 0.012 0.000 0.900 0.004 0.000 0.084
#> SRR1699903 5 0.3509 0.54235 0.180 0.000 0.000 0.016 0.788 0.016
#> SRR1699904 5 0.2151 0.59064 0.072 0.008 0.000 0.016 0.904 0.000
#> SRR1699905 3 0.2345 0.68442 0.020 0.000 0.900 0.020 0.000 0.060
#> SRR1699906 5 0.2510 0.58935 0.100 0.028 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1699907 5 0.1610 0.57584 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR1699908 5 0.2482 0.56535 0.148 0.000 0.000 0.004 0.848 0.000
#> SRR1699909 5 0.4849 0.49827 0.192 0.056 0.000 0.008 0.712 0.032
#> SRR1699910 5 0.7147 -0.27645 0.284 0.000 0.024 0.196 0.444 0.052
#> SRR1699911 5 0.4059 0.53405 0.152 0.004 0.004 0.008 0.776 0.056
#> SRR1699912 5 0.1918 0.57940 0.088 0.000 0.000 0.008 0.904 0.000
#> SRR1699913 5 0.3000 0.59653 0.088 0.044 0.000 0.000 0.856 0.012
#> SRR1699914 3 0.6916 0.30300 0.192 0.000 0.496 0.052 0.020 0.240
#> SRR1699915 5 0.5619 0.33299 0.228 0.000 0.016 0.068 0.644 0.044
#> SRR1699916 2 0.5507 0.08365 0.088 0.504 0.000 0.008 0.396 0.004
#> SRR1699917 5 0.7680 -0.16635 0.220 0.032 0.000 0.240 0.412 0.096
#> SRR1699918 5 0.8351 -0.24342 0.204 0.244 0.000 0.104 0.352 0.096
#> SRR1699919 5 0.3109 0.54080 0.168 0.000 0.000 0.004 0.812 0.016
#> SRR1699920 1 0.8350 0.48079 0.324 0.000 0.072 0.156 0.288 0.160
#> SRR1699921 5 0.2442 0.56104 0.144 0.000 0.000 0.004 0.852 0.000
#> SRR1699922 5 0.3909 0.56466 0.172 0.036 0.000 0.000 0.772 0.020
#> SRR1699923 3 0.4945 0.53899 0.140 0.000 0.664 0.004 0.000 0.192
#> SRR1699924 3 0.7191 0.04281 0.128 0.000 0.424 0.180 0.000 0.268
#> SRR1699925 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.5064 0.38895 0.232 0.000 0.000 0.044 0.668 0.056
#> SRR1699927 5 0.1866 0.57973 0.084 0.000 0.000 0.008 0.908 0.000
#> SRR1699929 5 0.8702 -0.47099 0.268 0.080 0.060 0.052 0.352 0.188
#> SRR1699928 5 0.1970 0.57569 0.092 0.000 0.000 0.000 0.900 0.008
#> SRR1699930 5 0.2361 0.59203 0.088 0.028 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1699931 1 0.8677 0.47317 0.352 0.128 0.016 0.080 0.232 0.192
#> SRR1699933 6 0.7346 0.37248 0.192 0.012 0.324 0.064 0.008 0.400
#> SRR1699932 5 0.2325 0.58250 0.100 0.008 0.000 0.000 0.884 0.008
#> SRR1699934 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.7861 -0.17983 0.212 0.056 0.000 0.232 0.412 0.088
#> SRR1699936 2 0.3849 0.76428 0.052 0.816 0.000 0.004 0.080 0.048
#> SRR1699937 2 0.4293 0.71878 0.084 0.740 0.000 0.008 0.000 0.168
#> SRR1699938 2 0.2826 0.78843 0.052 0.876 0.000 0.004 0.012 0.056
#> SRR1699940 6 0.7045 0.41615 0.132 0.048 0.288 0.036 0.004 0.492
#> SRR1699939 2 0.6012 0.60381 0.112 0.620 0.000 0.004 0.184 0.080
#> SRR1699941 3 0.5358 0.35740 0.080 0.000 0.560 0.016 0.000 0.344
#> SRR1699942 2 0.6098 0.45171 0.104 0.536 0.004 0.044 0.000 0.312
#> SRR1699943 2 0.2617 0.78652 0.040 0.876 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR1699944 2 0.3661 0.77510 0.076 0.812 0.000 0.004 0.008 0.100
#> SRR1699945 3 0.2673 0.67750 0.012 0.000 0.852 0.004 0.000 0.132
#> SRR1699946 2 0.5433 0.59428 0.140 0.616 0.000 0.004 0.008 0.232
#> SRR1699947 2 0.3829 0.76209 0.068 0.788 0.000 0.004 0.004 0.136
#> SRR1699948 2 0.2263 0.79084 0.036 0.900 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1699949 2 0.6071 0.42610 0.096 0.552 0.000 0.012 0.304 0.036
#> SRR1699950 2 0.5559 0.62654 0.092 0.652 0.000 0.004 0.200 0.052
#> SRR1699951 2 0.7577 0.43108 0.120 0.516 0.000 0.100 0.112 0.152
#> SRR1699952 2 0.4183 0.71374 0.076 0.740 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1699953 2 0.4543 0.74642 0.072 0.764 0.000 0.004 0.104 0.056
#> SRR1699954 3 0.5454 0.17542 0.076 0.012 0.524 0.004 0.000 0.384
#> SRR1699955 2 0.2901 0.78679 0.056 0.876 0.000 0.004 0.032 0.032
#> SRR1699956 3 0.3679 0.64254 0.040 0.000 0.760 0.000 0.000 0.200
#> SRR1699957 2 0.6041 0.61818 0.140 0.612 0.000 0.004 0.064 0.180
#> SRR1699959 6 0.7596 0.35917 0.188 0.008 0.232 0.172 0.000 0.400
#> SRR1699958 4 0.7494 0.23487 0.172 0.208 0.000 0.476 0.036 0.108
#> SRR1699960 2 0.4672 0.74083 0.084 0.756 0.000 0.004 0.092 0.064
#> SRR1699961 6 0.6688 0.32889 0.156 0.140 0.124 0.012 0.000 0.568
#> SRR1699962 2 0.2570 0.79923 0.032 0.892 0.000 0.000 0.040 0.036
#> SRR1699963 2 0.7854 -0.11899 0.128 0.368 0.032 0.176 0.000 0.296
#> SRR1699964 2 0.3512 0.78765 0.076 0.828 0.000 0.012 0.004 0.080
#> SRR1699965 2 0.2758 0.77612 0.036 0.872 0.000 0.000 0.080 0.012
#> SRR1699966 6 0.8926 -0.10642 0.244 0.072 0.044 0.200 0.108 0.332
#> SRR1699967 2 0.3079 0.78912 0.056 0.844 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1699968 5 0.7794 -0.19660 0.224 0.116 0.000 0.032 0.404 0.224
#> SRR1699969 3 0.5569 0.50765 0.100 0.000 0.620 0.040 0.000 0.240
#> SRR1699971 6 0.5909 0.30186 0.096 0.020 0.340 0.012 0.000 0.532
#> SRR1699970 2 0.3548 0.76700 0.068 0.796 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1699972 6 0.5302 -0.10279 0.064 0.004 0.452 0.008 0.000 0.472
#> SRR1699973 4 0.8386 0.11209 0.176 0.120 0.000 0.396 0.144 0.164
#> SRR1699974 3 0.2446 0.67977 0.012 0.000 0.864 0.000 0.000 0.124
#> SRR1699975 5 0.7346 -0.26187 0.296 0.020 0.000 0.076 0.416 0.192
#> SRR1699976 6 0.6575 0.25100 0.156 0.192 0.084 0.008 0.000 0.560
#> SRR1699977 6 0.7177 0.34550 0.160 0.004 0.152 0.156 0.012 0.516
#> SRR1699978 3 0.3159 0.67576 0.032 0.000 0.856 0.056 0.000 0.056
#> SRR1699979 6 0.6524 0.22769 0.200 0.000 0.064 0.216 0.000 0.520
#> SRR1699980 5 0.4932 0.40205 0.240 0.000 0.000 0.012 0.660 0.088
#> SRR1699981 3 0.5694 0.54925 0.120 0.000 0.648 0.044 0.008 0.180
#> SRR1699982 5 0.2681 0.60022 0.072 0.028 0.000 0.020 0.880 0.000
#> SRR1699983 5 0.3053 0.55959 0.172 0.000 0.000 0.004 0.812 0.012
#> SRR1699984 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.6748 0.29938 0.136 0.512 0.000 0.020 0.276 0.056
#> SRR1699986 3 0.1340 0.68200 0.008 0.000 0.948 0.004 0.000 0.040
#> SRR1699988 2 0.8121 -0.34419 0.240 0.328 0.004 0.036 0.276 0.116
#> SRR1699987 4 0.7551 -0.06721 0.144 0.000 0.224 0.372 0.004 0.256
#> SRR1699989 5 0.5164 0.49725 0.216 0.052 0.000 0.004 0.676 0.052
#> SRR1699990 6 0.8298 -0.25828 0.308 0.020 0.056 0.112 0.136 0.368
#> SRR1699992 3 0.6493 0.09104 0.144 0.012 0.472 0.032 0.000 0.340
#> SRR1699991 3 0.6329 0.25977 0.092 0.000 0.484 0.076 0.000 0.348
#> SRR1699993 3 0.2911 0.66826 0.072 0.000 0.868 0.024 0.000 0.036
#> SRR1699994 3 0.3618 0.65245 0.040 0.000 0.768 0.000 0.000 0.192
#> SRR1699995 3 0.0858 0.67795 0.004 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699996 2 0.6325 0.55499 0.164 0.624 0.004 0.028 0.056 0.124
#> SRR1699997 4 0.3768 0.58916 0.096 0.000 0.000 0.812 0.036 0.056
#> SRR1699998 2 0.6801 0.47052 0.184 0.532 0.000 0.020 0.060 0.204
#> SRR1699999 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 3 0.5104 0.48506 0.080 0.008 0.624 0.004 0.000 0.284
#> SRR1700002 6 0.7281 0.27402 0.132 0.164 0.056 0.112 0.000 0.536
#> SRR1700001 3 0.5594 0.51195 0.072 0.004 0.612 0.044 0.000 0.268
#> SRR1700003 6 0.8036 0.25881 0.180 0.136 0.096 0.140 0.000 0.448
#> SRR1700004 3 0.4368 0.63337 0.064 0.000 0.740 0.012 0.004 0.180
#> SRR1700005 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 6 0.6323 0.44214 0.084 0.068 0.268 0.016 0.000 0.564
#> SRR1700007 5 0.4969 0.44588 0.064 0.240 0.000 0.016 0.672 0.008
#> SRR1700008 3 0.5327 0.47722 0.064 0.000 0.656 0.220 0.000 0.060
#> SRR1700009 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.3279 0.66373 0.028 0.000 0.796 0.000 0.000 0.176
#> SRR1700011 2 0.4570 0.74154 0.064 0.768 0.000 0.016 0.112 0.040
#> SRR1700013 6 0.8536 0.26437 0.160 0.136 0.148 0.188 0.000 0.368
#> SRR1700012 6 0.7722 0.24953 0.140 0.144 0.076 0.108 0.012 0.520
#> SRR1700014 6 0.7923 0.05511 0.212 0.008 0.056 0.184 0.092 0.448
#> SRR1700015 6 0.7406 0.10771 0.132 0.328 0.056 0.060 0.000 0.424
#> SRR1700016 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700018 6 0.5617 0.36786 0.096 0.008 0.324 0.012 0.000 0.560
#> SRR1700017 6 0.5893 0.21606 0.088 0.000 0.368 0.040 0.000 0.504
#> SRR1700019 5 0.6532 0.24449 0.152 0.296 0.000 0.020 0.504 0.028
#> SRR1700020 3 0.2933 0.68382 0.008 0.000 0.852 0.032 0.000 0.108
#> SRR1700021 5 0.4292 0.55979 0.128 0.016 0.000 0.048 0.780 0.028
#> SRR1700023 6 0.7691 0.30114 0.216 0.032 0.120 0.112 0.024 0.496
#> SRR1700022 3 0.5060 0.46781 0.056 0.000 0.588 0.016 0.000 0.340
#> SRR1700024 4 0.8664 -0.24916 0.200 0.096 0.000 0.288 0.244 0.172
#> SRR1700025 2 0.5479 0.54583 0.136 0.596 0.000 0.012 0.000 0.256
#> SRR1700026 3 0.6973 -0.11290 0.164 0.032 0.416 0.032 0.000 0.356
#> SRR1700027 6 0.6874 0.44112 0.120 0.064 0.248 0.036 0.000 0.532
#> SRR1700028 4 0.7004 0.38391 0.172 0.012 0.000 0.524 0.132 0.160
#> SRR1700029 3 0.7267 0.00835 0.144 0.000 0.428 0.216 0.000 0.212
#> SRR1700030 5 0.4953 0.52342 0.184 0.036 0.000 0.012 0.712 0.056
#> SRR1700031 3 0.3970 0.59843 0.028 0.000 0.692 0.000 0.000 0.280
#> SRR1700032 2 0.7235 0.26991 0.164 0.460 0.000 0.016 0.096 0.264
#> SRR1700034 3 0.0458 0.67597 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700035 5 0.3306 0.58206 0.080 0.008 0.000 0.048 0.848 0.016
#> SRR1700033 3 0.3514 0.64426 0.020 0.000 0.752 0.000 0.000 0.228
#> SRR1700036 5 0.6231 0.08626 0.252 0.012 0.000 0.016 0.532 0.188
#> SRR1700037 5 0.2599 0.60009 0.076 0.028 0.000 0.004 0.884 0.008
#> SRR1700038 3 0.5649 0.44157 0.124 0.004 0.588 0.016 0.000 0.268
#> SRR1700039 3 0.3042 0.68063 0.032 0.000 0.836 0.004 0.000 0.128
#> SRR1700040 3 0.4025 0.62990 0.048 0.000 0.720 0.000 0.000 0.232
#> SRR1700041 3 0.6795 -0.05352 0.168 0.000 0.392 0.068 0.000 0.372
#> SRR1700042 3 0.3956 0.61692 0.036 0.000 0.712 0.000 0.000 0.252
#> SRR1700043 3 0.4641 0.57375 0.092 0.000 0.668 0.000 0.000 0.240
#> SRR1700045 3 0.7308 -0.15932 0.180 0.000 0.360 0.132 0.000 0.328
#> SRR1700044 6 0.8416 0.28373 0.212 0.056 0.192 0.052 0.068 0.420
#> SRR1700046 6 0.6873 0.20642 0.140 0.000 0.328 0.084 0.004 0.444
#> SRR1700047 3 0.4806 0.59363 0.072 0.000 0.676 0.016 0.000 0.236
#> SRR1700048 6 0.8059 0.30316 0.188 0.000 0.240 0.168 0.036 0.368
#> SRR1700049 3 0.2213 0.67701 0.008 0.000 0.888 0.004 0.000 0.100
#> SRR1700050 3 0.4136 0.66187 0.036 0.000 0.780 0.060 0.000 0.124
#> SRR1700051 3 0.2039 0.68260 0.020 0.000 0.904 0.000 0.000 0.076
#> SRR1700052 3 0.3014 0.66086 0.012 0.000 0.804 0.000 0.000 0.184
#> SRR1700053 6 0.8511 -0.16632 0.304 0.008 0.116 0.092 0.156 0.324
#> SRR1700054 3 0.6085 0.31696 0.108 0.000 0.504 0.044 0.000 0.344
#> SRR1700055 3 0.0458 0.67551 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700056 3 0.5337 0.56156 0.060 0.000 0.680 0.156 0.000 0.104
#> SRR1700057 3 0.5842 0.52469 0.068 0.000 0.628 0.140 0.000 0.164
#> SRR1700058 3 0.4093 0.64047 0.056 0.000 0.736 0.004 0.000 0.204
#> SRR1700059 4 0.6938 0.27698 0.136 0.000 0.208 0.508 0.004 0.144
#> SRR1700060 3 0.4887 0.59754 0.072 0.000 0.672 0.020 0.000 0.236
#> SRR1700061 3 0.5342 0.49963 0.072 0.000 0.600 0.028 0.000 0.300
#> SRR1700062 3 0.4167 0.66470 0.040 0.000 0.768 0.040 0.000 0.152
#> SRR1700063 3 0.5276 0.51242 0.076 0.000 0.596 0.020 0.000 0.308
#> SRR1700064 1 0.8752 0.22956 0.296 0.000 0.124 0.164 0.196 0.220
#> SRR1700065 3 0.4510 0.59078 0.044 0.000 0.676 0.012 0.000 0.268
#> SRR1700066 3 0.3245 0.66721 0.028 0.000 0.800 0.000 0.000 0.172
#> SRR1700067 5 0.7291 -0.29062 0.180 0.004 0.000 0.352 0.356 0.108
#> SRR1700068 3 0.7198 0.10508 0.116 0.000 0.420 0.208 0.000 0.256
#> SRR1700069 5 0.8351 -0.60526 0.268 0.000 0.096 0.084 0.284 0.268
#> SRR1700070 2 0.6984 0.24527 0.196 0.496 0.000 0.004 0.192 0.112
#> SRR1700071 3 0.6163 0.24456 0.104 0.000 0.468 0.048 0.000 0.380
#> SRR1700072 3 0.3671 0.64707 0.036 0.000 0.756 0.000 0.000 0.208
#> SRR1700073 5 0.6460 0.36746 0.136 0.060 0.000 0.132 0.620 0.052
#> SRR1700075 3 0.5992 0.37366 0.156 0.000 0.532 0.024 0.000 0.288
#> SRR1700074 3 0.5788 0.35343 0.084 0.000 0.516 0.036 0.000 0.364
#> SRR1700076 6 0.8567 0.28067 0.208 0.048 0.188 0.088 0.060 0.408
#> SRR1700077 3 0.5255 0.21509 0.072 0.000 0.480 0.008 0.000 0.440
#> SRR1700078 3 0.6885 0.20743 0.176 0.000 0.516 0.032 0.044 0.232
#> SRR1700080 6 0.7805 0.02041 0.224 0.000 0.216 0.008 0.208 0.344
#> SRR1700079 3 0.6087 0.50720 0.116 0.000 0.608 0.104 0.000 0.172
#> SRR1700081 3 0.4043 0.64953 0.036 0.000 0.740 0.012 0.000 0.212
#> SRR1700082 3 0.5828 0.23082 0.088 0.000 0.472 0.032 0.000 0.408
#> SRR1700083 3 0.3343 0.67507 0.040 0.000 0.812 0.004 0.000 0.144
#> SRR1700084 3 0.2572 0.67470 0.012 0.000 0.852 0.000 0.000 0.136
#> SRR1700085 5 0.3778 0.58931 0.096 0.052 0.000 0.004 0.816 0.032
#> SRR1700086 6 0.8054 0.16502 0.244 0.008 0.196 0.036 0.120 0.396
#> SRR1700087 4 0.7359 0.26187 0.108 0.032 0.120 0.460 0.000 0.280
#> SRR1700088 6 0.7778 0.11737 0.164 0.188 0.020 0.196 0.004 0.428
#> SRR1700089 4 0.7704 0.14939 0.144 0.032 0.128 0.396 0.000 0.300
#> SRR1700091 4 0.6863 0.43637 0.160 0.100 0.004 0.560 0.016 0.160
#> SRR1700090 4 0.4940 0.59587 0.132 0.000 0.032 0.708 0.000 0.128
#> SRR1700092 4 0.7452 0.30197 0.156 0.168 0.004 0.496 0.024 0.152
#> SRR1700094 4 0.8292 0.18656 0.164 0.168 0.024 0.396 0.028 0.220
#> SRR1700093 4 0.4520 0.55915 0.116 0.020 0.000 0.768 0.024 0.072
#> SRR1700095 4 0.5941 0.50759 0.088 0.000 0.160 0.624 0.000 0.128
#> SRR1700096 4 0.6611 0.47593 0.144 0.016 0.052 0.556 0.004 0.228
#> SRR1700097 3 0.2643 0.68012 0.040 0.000 0.888 0.036 0.000 0.036
#> SRR1700098 2 0.7688 0.15184 0.128 0.440 0.000 0.276 0.076 0.080
#> SRR1700099 4 0.7269 0.31644 0.128 0.156 0.000 0.544 0.104 0.068
#> SRR1700100 4 0.5974 0.51194 0.160 0.032 0.000 0.636 0.028 0.144
#> SRR1700101 4 0.7520 0.31387 0.184 0.148 0.000 0.500 0.056 0.112
#> SRR1700102 4 0.7261 0.36888 0.152 0.132 0.000 0.536 0.048 0.132
#> SRR1700104 4 0.5181 0.56627 0.128 0.028 0.000 0.708 0.016 0.120
#> SRR1700103 4 0.7058 0.28956 0.124 0.000 0.188 0.488 0.004 0.196
#> SRR1700105 4 0.4094 0.58086 0.088 0.008 0.000 0.800 0.036 0.068
#> SRR1700106 4 0.5193 0.59947 0.136 0.000 0.076 0.712 0.008 0.068
#> SRR1700107 4 0.5226 0.55620 0.140 0.036 0.000 0.716 0.028 0.080
#> SRR1700108 4 0.6443 0.38874 0.128 0.160 0.000 0.612 0.040 0.060
#> SRR1700109 2 0.7340 0.17885 0.072 0.452 0.000 0.196 0.252 0.028
#> SRR1700110 2 0.6702 0.42525 0.064 0.560 0.000 0.188 0.164 0.024
#> SRR1700112 5 0.7431 0.06866 0.080 0.204 0.000 0.296 0.400 0.020
#> SRR1700111 4 0.4704 0.60458 0.124 0.000 0.060 0.748 0.004 0.064
#> SRR1700113 5 0.7533 -0.00323 0.156 0.096 0.000 0.296 0.420 0.032
#> SRR1700114 4 0.5429 0.55674 0.144 0.044 0.000 0.692 0.016 0.104
#> SRR1700115 4 0.6696 0.32503 0.116 0.040 0.000 0.568 0.216 0.060
#> SRR1700116 4 0.4158 0.60693 0.112 0.000 0.032 0.780 0.000 0.076
#> SRR1700117 3 0.4740 0.50939 0.040 0.000 0.692 0.228 0.000 0.040
#> SRR1700119 4 0.4292 0.59736 0.136 0.000 0.012 0.752 0.000 0.100
#> SRR1700118 4 0.5354 0.58189 0.144 0.000 0.028 0.684 0.012 0.132
#> SRR1700120 3 0.4409 0.61670 0.040 0.000 0.760 0.128 0.000 0.072
#> SRR1700121 4 0.5737 0.50923 0.160 0.012 0.000 0.664 0.088 0.076
#> SRR1700122 5 0.5742 0.21511 0.088 0.036 0.000 0.328 0.548 0.000
#> SRR1700123 4 0.4996 0.58634 0.108 0.000 0.104 0.720 0.000 0.068
#> SRR1700125 5 0.5711 0.31189 0.064 0.048 0.000 0.280 0.600 0.008
#> SRR1700126 3 0.4669 0.63421 0.064 0.000 0.748 0.084 0.000 0.104
#> SRR1700127 4 0.6130 0.42444 0.088 0.000 0.172 0.600 0.000 0.140
#> SRR1700124 4 0.5051 0.58572 0.112 0.000 0.044 0.704 0.000 0.140
#> SRR1700128 4 0.5741 0.52291 0.100 0.000 0.116 0.680 0.020 0.084
#> SRR1700129 4 0.5349 0.33713 0.084 0.004 0.000 0.632 0.256 0.024
#> SRR1700130 4 0.5370 0.51961 0.120 0.016 0.000 0.700 0.120 0.044
#> SRR1700132 4 0.6478 0.08223 0.076 0.000 0.384 0.436 0.000 0.104
#> SRR1700131 3 0.6525 0.10924 0.096 0.000 0.460 0.352 0.000 0.092
#> SRR1700133 4 0.5373 0.52209 0.132 0.004 0.004 0.696 0.112 0.052
#> SRR1700134 5 0.5278 0.12083 0.076 0.004 0.000 0.392 0.524 0.004
#> SRR1700135 4 0.6258 0.51199 0.140 0.000 0.092 0.644 0.052 0.072
#> SRR1700136 4 0.6416 0.11075 0.080 0.000 0.384 0.444 0.000 0.092
#> SRR1700137 4 0.4593 0.58342 0.116 0.000 0.020 0.760 0.020 0.084
#> SRR1700138 4 0.5987 0.50914 0.196 0.000 0.028 0.624 0.028 0.124
#> SRR1700140 4 0.5250 0.57078 0.136 0.000 0.040 0.704 0.012 0.108
#> SRR1700139 4 0.4694 0.59410 0.132 0.000 0.056 0.740 0.000 0.072
#> SRR1700141 5 0.5920 0.16327 0.096 0.024 0.000 0.352 0.520 0.008
#> SRR1700142 3 0.6147 0.44997 0.076 0.000 0.588 0.200 0.000 0.136
#> SRR1700143 4 0.6613 0.18764 0.084 0.000 0.332 0.464 0.000 0.120
#> SRR1700144 3 0.6891 0.26173 0.120 0.000 0.480 0.144 0.000 0.256
#> SRR1700145 4 0.6285 0.33322 0.104 0.000 0.256 0.552 0.000 0.088
#> SRR1700146 4 0.6344 -0.08251 0.140 0.016 0.000 0.436 0.392 0.016
#> SRR1700147 4 0.6659 0.29590 0.132 0.000 0.268 0.512 0.004 0.084
#> SRR1700149 3 0.5037 0.45990 0.052 0.000 0.652 0.260 0.000 0.036
#> SRR1700148 4 0.6430 0.13400 0.068 0.000 0.360 0.472 0.004 0.096
#> SRR1700150 4 0.5280 0.41448 0.116 0.000 0.000 0.664 0.188 0.032
#> SRR1700152 4 0.5293 0.58187 0.140 0.000 0.036 0.708 0.024 0.092
#> SRR1700151 4 0.6838 0.39778 0.172 0.000 0.168 0.536 0.008 0.116
#> SRR1700153 4 0.6298 0.35954 0.088 0.000 0.228 0.564 0.000 0.120
#> SRR1700154 4 0.5116 0.55745 0.096 0.000 0.096 0.712 0.000 0.096
#> SRR1700155 4 0.3397 0.59107 0.092 0.000 0.000 0.836 0.036 0.036
#> SRR1700156 4 0.6398 0.17065 0.096 0.000 0.344 0.480 0.000 0.080
#> SRR1700158 3 0.5281 0.32484 0.060 0.000 0.588 0.324 0.000 0.028
#> SRR1700159 5 0.5027 0.44170 0.052 0.048 0.000 0.204 0.692 0.004
#> SRR1700157 4 0.7011 0.10113 0.120 0.000 0.328 0.416 0.000 0.136
#> SRR1700160 4 0.4907 0.59888 0.136 0.004 0.024 0.724 0.004 0.108
#> SRR1700161 4 0.4868 0.57745 0.128 0.000 0.064 0.728 0.000 0.080
#> SRR1700162 5 0.4859 0.24927 0.056 0.000 0.000 0.332 0.604 0.008
#> SRR1700164 3 0.5012 0.37446 0.040 0.000 0.620 0.308 0.000 0.032
#> SRR1700163 3 0.5778 0.34070 0.076 0.000 0.584 0.280 0.000 0.060
#> SRR1700165 4 0.6814 0.33357 0.116 0.000 0.204 0.508 0.000 0.172
#> SRR1700166 4 0.3221 0.59525 0.092 0.000 0.004 0.844 0.008 0.052
#> SRR1700168 5 0.6347 0.18860 0.088 0.056 0.000 0.332 0.512 0.012
#> SRR1700167 3 0.5920 0.40460 0.064 0.000 0.592 0.244 0.000 0.100
#> SRR1700170 4 0.4282 0.59738 0.104 0.004 0.008 0.784 0.020 0.080
#> SRR1700169 4 0.4918 0.58874 0.140 0.000 0.020 0.716 0.008 0.116
#> SRR1700171 3 0.4558 0.54113 0.040 0.000 0.732 0.176 0.000 0.052
#> SRR1700172 4 0.5978 0.41911 0.172 0.000 0.000 0.608 0.156 0.064
#> SRR1700174 4 0.4157 0.59848 0.088 0.000 0.008 0.784 0.016 0.104
#> SRR1700173 4 0.3259 0.58851 0.104 0.000 0.000 0.836 0.012 0.048
#> SRR1700175 4 0.5384 0.45938 0.136 0.000 0.000 0.668 0.152 0.044
#> SRR1700176 3 0.3457 0.66535 0.024 0.000 0.832 0.084 0.000 0.060
#> SRR1700178 2 0.0914 0.79354 0.016 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700177 4 0.4006 0.58381 0.112 0.000 0.004 0.796 0.060 0.028
#> SRR1700180 2 0.1418 0.79151 0.024 0.944 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700179 2 0.1261 0.79221 0.024 0.952 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700181 2 0.0909 0.79254 0.020 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700183 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0914 0.79189 0.016 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700184 2 0.1492 0.79416 0.036 0.940 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700186 2 0.2670 0.78949 0.040 0.872 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1700187 3 0.0405 0.67492 0.004 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700188 2 0.1644 0.79359 0.012 0.932 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1700192 3 0.3125 0.65766 0.056 0.016 0.852 0.000 0.000 0.076
#> SRR1700190 3 0.1075 0.67938 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700191 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0405 0.67526 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700193 2 0.1700 0.80054 0.048 0.928 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700195 2 0.1232 0.79715 0.024 0.956 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700194 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.0405 0.78983 0.008 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700197 3 0.0291 0.67505 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700198 2 0.0717 0.79264 0.016 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700199 2 0.1563 0.79309 0.056 0.932 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700200 2 0.1082 0.79197 0.040 0.956 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.0862 0.79425 0.016 0.972 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700202 2 0.7133 0.46186 0.176 0.588 0.084 0.048 0.060 0.044
#> SRR1700203 2 0.1434 0.79682 0.048 0.940 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700204 2 0.2209 0.79177 0.072 0.900 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1700206 2 0.2653 0.79592 0.064 0.876 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1700207 2 0.0260 0.78948 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 3 0.3906 0.62631 0.076 0.008 0.796 0.008 0.000 0.112
#> SRR1700205 2 0.3943 0.70199 0.068 0.776 0.000 0.004 0.148 0.004
#> SRR1700209 2 0.2928 0.77308 0.056 0.856 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1700210 2 0.2890 0.79132 0.096 0.860 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1700211 2 0.3009 0.78211 0.092 0.860 0.000 0.004 0.020 0.024
#> SRR1700212 2 0.2171 0.80103 0.040 0.912 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR1700213 2 0.7673 0.25887 0.192 0.484 0.072 0.036 0.020 0.196
#> SRR1700214 2 0.1584 0.79596 0.064 0.928 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700215 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.3976 0.68756 0.052 0.748 0.000 0.000 0.196 0.004
#> SRR1700216 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3447 0.79349 0.088 0.836 0.000 0.004 0.020 0.052
#> SRR1700219 2 0.0692 0.79218 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700222 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.3837 0.68159 0.052 0.752 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1700221 2 0.2110 0.78993 0.084 0.900 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700223 2 0.1219 0.79317 0.048 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700224 2 0.5407 0.63013 0.164 0.672 0.000 0.004 0.120 0.040
#> SRR1700226 2 0.2325 0.79789 0.048 0.900 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1700229 2 0.2896 0.79806 0.076 0.868 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR1700225 2 0.5640 0.58795 0.184 0.632 0.000 0.016 0.012 0.156
#> SRR1700227 2 0.1007 0.79267 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.0260 0.67513 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700231 2 0.2290 0.79546 0.060 0.904 0.000 0.008 0.004 0.024
#> SRR1700228 2 0.3159 0.77162 0.108 0.836 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1700232 2 0.0858 0.79442 0.028 0.968 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700233 2 0.2474 0.78973 0.080 0.884 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1700234 2 0.4059 0.75223 0.116 0.796 0.000 0.008 0.044 0.036
#> SRR1700235 2 0.3288 0.78399 0.096 0.836 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR1700237 2 0.1364 0.79718 0.048 0.944 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700236 2 0.2002 0.80083 0.056 0.916 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1700238 2 0.1588 0.79028 0.072 0.924 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700239 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700240 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700241 3 0.7959 -0.13903 0.180 0.080 0.448 0.116 0.000 0.176
#> SRR1700243 2 0.1719 0.79487 0.060 0.924 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700244 2 0.2189 0.80251 0.060 0.904 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700242 3 0.1401 0.67849 0.028 0.000 0.948 0.004 0.000 0.020
#> SRR1700246 2 0.7018 0.39963 0.168 0.568 0.148 0.008 0.056 0.052
#> SRR1700245 2 0.1194 0.79679 0.032 0.956 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700247 3 0.0146 0.67426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700249 3 0.0000 0.67419 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.1341 0.79371 0.028 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700248 2 0.1578 0.79730 0.048 0.936 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700251 2 0.1010 0.79228 0.036 0.960 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.8175 -0.08915 0.136 0.416 0.196 0.052 0.008 0.192
#> SRR1700253 2 0.0865 0.79493 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.2666 0.79603 0.092 0.872 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1700254 3 0.0291 0.67473 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700255 2 0.1387 0.79303 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0547 0.79234 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.1838 0.79585 0.040 0.928 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1700259 2 0.4309 0.71904 0.056 0.764 0.000 0.004 0.148 0.028
#> SRR1700260 5 0.6265 0.02683 0.084 0.420 0.000 0.024 0.444 0.028
#> SRR1700261 5 0.5170 0.35121 0.072 0.300 0.000 0.004 0.612 0.012
#> SRR1700262 5 0.5378 0.29756 0.072 0.336 0.000 0.004 0.572 0.016
#> SRR1700263 2 0.3231 0.79851 0.080 0.852 0.000 0.004 0.024 0.040
#> SRR1700264 2 0.3992 0.76820 0.076 0.788 0.000 0.008 0.008 0.120
#> SRR1700265 2 0.7140 0.46767 0.156 0.532 0.020 0.016 0.068 0.208
#> SRR1700266 2 0.5375 0.64414 0.076 0.668 0.000 0.004 0.200 0.052
#> SRR1700268 3 0.9707 -0.46057 0.184 0.176 0.260 0.084 0.132 0.164
#> SRR1700270 2 0.2401 0.80141 0.048 0.900 0.000 0.000 0.028 0.024
#> SRR1700267 2 0.2772 0.79380 0.036 0.884 0.000 0.004 0.048 0.028
#> SRR1700271 2 0.4169 0.68710 0.044 0.748 0.000 0.000 0.188 0.020
#> SRR1700272 2 0.5025 0.59642 0.072 0.672 0.000 0.008 0.232 0.016
#> SRR1700273 2 0.4110 0.76941 0.076 0.796 0.000 0.004 0.084 0.040
#> SRR1700274 2 0.4743 0.64813 0.060 0.700 0.000 0.004 0.216 0.020
#> SRR1700277 3 0.4820 0.57185 0.084 0.008 0.704 0.012 0.000 0.192
#> SRR1700275 5 0.5297 0.46220 0.088 0.216 0.000 0.016 0.664 0.016
#> SRR1700276 5 0.5931 0.11585 0.084 0.440 0.000 0.032 0.440 0.004
#> SRR1700278 5 0.5264 0.41176 0.108 0.232 0.000 0.000 0.640 0.020
#> SRR1700279 5 0.2649 0.59680 0.068 0.052 0.000 0.004 0.876 0.000
#> SRR1700280 5 0.3552 0.57312 0.084 0.116 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1700281 2 0.1851 0.79808 0.036 0.928 0.000 0.000 0.024 0.012
#> SRR1700283 5 0.5426 0.35249 0.080 0.292 0.000 0.012 0.604 0.012
#> SRR1700282 5 0.9191 -0.46666 0.220 0.068 0.156 0.120 0.344 0.092
#> SRR1700284 5 0.2102 0.59363 0.068 0.012 0.000 0.000 0.908 0.012
#> SRR1700285 5 0.4379 0.55867 0.136 0.104 0.000 0.004 0.748 0.008
#> SRR1700286 2 0.6303 -0.06850 0.116 0.424 0.000 0.004 0.416 0.040
#> SRR1700287 5 0.3315 0.57882 0.076 0.104 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1700290 3 0.0291 0.67569 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700289 5 0.3039 0.59959 0.084 0.056 0.000 0.000 0.852 0.008
#> SRR1700288 2 0.4656 0.70227 0.120 0.732 0.000 0.004 0.128 0.016
#> SRR1700292 5 0.2197 0.59487 0.044 0.056 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1700291 5 0.6745 0.24545 0.192 0.028 0.000 0.164 0.556 0.060
#> SRR1700293 2 0.6893 0.23157 0.120 0.504 0.000 0.072 0.280 0.024
#> SRR1700294 5 0.2044 0.59235 0.040 0.028 0.000 0.008 0.920 0.004
#> SRR1700295 3 0.8267 -0.20829 0.172 0.000 0.384 0.196 0.180 0.068
#> SRR1700297 5 0.2649 0.59287 0.052 0.048 0.000 0.016 0.884 0.000
#> SRR1700296 5 0.3633 0.55908 0.064 0.136 0.000 0.000 0.796 0.004
#> SRR1700298 5 0.4430 0.51877 0.180 0.016 0.000 0.012 0.744 0.048
#> SRR1700299 5 0.7257 -0.01714 0.244 0.016 0.024 0.112 0.516 0.088
#> SRR1700300 5 0.7101 0.11011 0.280 0.056 0.048 0.056 0.528 0.032
#> SRR1700302 5 0.1268 0.58386 0.036 0.004 0.000 0.000 0.952 0.008
#> SRR1700301 5 0.1807 0.59441 0.060 0.020 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1700303 5 0.2137 0.59456 0.048 0.028 0.000 0.012 0.912 0.000
#> SRR1700304 5 0.3809 0.57649 0.108 0.072 0.000 0.008 0.804 0.008
#> SRR1700305 5 0.3669 0.58367 0.084 0.092 0.000 0.004 0.812 0.008
#> SRR1700306 5 0.8237 -0.46304 0.204 0.000 0.264 0.116 0.348 0.068
#> SRR1700308 5 0.8041 -0.16057 0.248 0.204 0.000 0.072 0.388 0.088
#> SRR1700307 3 0.8725 -0.41736 0.264 0.004 0.292 0.096 0.164 0.180
#> SRR1700309 3 0.8801 -0.49870 0.232 0.000 0.268 0.124 0.208 0.168
#> SRR1700310 5 0.1829 0.59289 0.036 0.028 0.000 0.000 0.928 0.008
#> SRR1700311 5 0.4250 0.54052 0.132 0.004 0.000 0.068 0.772 0.024
#> SRR1700312 5 0.4843 0.46820 0.104 0.192 0.000 0.004 0.692 0.008
#> SRR1700313 5 0.9493 -0.55225 0.244 0.120 0.080 0.108 0.272 0.176
#> SRR1700314 5 0.7551 -0.26179 0.256 0.004 0.024 0.200 0.432 0.084
#> SRR1700315 5 0.6780 0.22890 0.228 0.072 0.016 0.044 0.580 0.060
#> SRR1700316 5 0.8583 -0.36140 0.260 0.120 0.004 0.120 0.340 0.156
#> SRR1700317 5 0.5533 0.35112 0.124 0.272 0.000 0.000 0.588 0.016
#> SRR1700318 5 0.3582 0.54387 0.192 0.000 0.000 0.008 0.776 0.024
#> SRR1700319 5 0.6934 0.00831 0.240 0.000 0.028 0.120 0.528 0.084
#> SRR1700320 5 0.2053 0.59223 0.052 0.024 0.000 0.004 0.916 0.004
#> SRR1700322 5 0.5114 0.50756 0.168 0.076 0.000 0.032 0.708 0.016
#> SRR1700321 5 0.4720 0.55747 0.132 0.112 0.000 0.016 0.732 0.008
#> SRR1700323 5 0.5175 0.46065 0.156 0.008 0.000 0.120 0.692 0.024
#> SRR1700324 5 0.3393 0.57978 0.068 0.108 0.000 0.000 0.820 0.004
#> SRR1700325 5 0.5415 0.05486 0.088 0.448 0.000 0.000 0.456 0.008
#> SRR1700326 3 0.6883 0.24851 0.152 0.000 0.580 0.104 0.116 0.048
#> SRR1700327 5 0.6192 0.40743 0.148 0.140 0.000 0.012 0.620 0.080
#> SRR1700329 5 0.3265 0.59251 0.088 0.068 0.000 0.000 0.836 0.008
#> SRR1700328 3 0.9501 -0.45364 0.208 0.068 0.280 0.132 0.116 0.196
#> SRR1700330 5 0.7697 -0.03205 0.260 0.036 0.080 0.072 0.492 0.060
#> SRR1700331 5 0.2213 0.58179 0.100 0.000 0.000 0.008 0.888 0.004
#> SRR1700332 5 0.2858 0.59454 0.100 0.020 0.000 0.008 0.864 0.008
#> SRR1700333 5 0.6699 0.15060 0.208 0.268 0.000 0.040 0.476 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.123 0.616 0.728 0.3914 0.511 0.511
#> 3 3 0.131 0.629 0.795 0.3121 0.798 0.658
#> 4 4 0.161 0.494 0.696 0.2098 0.908 0.810
#> 5 5 0.233 0.406 0.679 0.0976 0.861 0.675
#> 6 6 0.252 0.400 0.662 0.0236 0.987 0.960
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.9998 -0.49961 0.492 0.508
#> SRR1699875 2 0.9358 0.29613 0.352 0.648
#> SRR1699876 2 0.7815 0.57773 0.232 0.768
#> SRR1699877 1 0.8861 0.83836 0.696 0.304
#> SRR1699879 2 0.6247 0.68949 0.156 0.844
#> SRR1699878 1 0.9286 0.81015 0.656 0.344
#> SRR1699880 2 1.0000 -0.51141 0.500 0.500
#> SRR1699881 2 0.8267 0.51783 0.260 0.740
#> SRR1699882 2 0.9552 0.08492 0.376 0.624
#> SRR1699883 1 0.9686 0.74562 0.604 0.396
#> SRR1699884 1 0.9248 0.81101 0.660 0.340
#> SRR1699885 1 0.8555 0.84721 0.720 0.280
#> SRR1699886 1 0.8443 0.84689 0.728 0.272
#> SRR1699888 1 0.9358 0.81526 0.648 0.352
#> SRR1699889 2 0.2043 0.70440 0.032 0.968
#> SRR1699890 2 0.8955 0.40409 0.312 0.688
#> SRR1699887 1 0.9248 0.81105 0.660 0.340
#> SRR1699891 2 0.8327 0.55316 0.264 0.736
#> SRR1699892 1 0.9881 0.63285 0.564 0.436
#> SRR1699893 2 0.7299 0.63258 0.204 0.796
#> SRR1699894 1 0.9732 0.71021 0.596 0.404
#> SRR1699895 2 0.9963 -0.36222 0.464 0.536
#> SRR1699896 2 0.9427 0.20180 0.360 0.640
#> SRR1699897 1 0.9087 0.83745 0.676 0.324
#> SRR1699898 2 0.3114 0.71375 0.056 0.944
#> SRR1699900 1 0.9044 0.84391 0.680 0.320
#> SRR1699899 2 0.1843 0.70227 0.028 0.972
#> SRR1699902 1 0.8713 0.84852 0.708 0.292
#> SRR1699901 2 0.9866 0.00341 0.432 0.568
#> SRR1699903 2 0.2423 0.71105 0.040 0.960
#> SRR1699904 1 0.8813 0.82507 0.700 0.300
#> SRR1699905 2 0.5737 0.68791 0.136 0.864
#> SRR1699906 2 0.9996 -0.45569 0.488 0.512
#> SRR1699907 2 0.7815 0.59626 0.232 0.768
#> SRR1699908 1 0.8608 0.84902 0.716 0.284
#> SRR1699909 2 0.6973 0.66341 0.188 0.812
#> SRR1699910 2 0.5946 0.68966 0.144 0.856
#> SRR1699911 2 0.3114 0.70367 0.056 0.944
#> SRR1699912 2 0.7299 0.65174 0.204 0.796
#> SRR1699913 1 0.9608 0.73086 0.616 0.384
#> SRR1699914 2 0.5946 0.69956 0.144 0.856
#> SRR1699915 2 0.4431 0.69290 0.092 0.908
#> SRR1699916 1 0.8909 0.84828 0.692 0.308
#> SRR1699917 2 0.9129 0.42763 0.328 0.672
#> SRR1699918 1 0.9209 0.83177 0.664 0.336
#> SRR1699919 2 0.3114 0.69800 0.056 0.944
#> SRR1699920 2 0.3274 0.69894 0.060 0.940
#> SRR1699921 2 0.1633 0.70452 0.024 0.976
#> SRR1699922 1 0.8713 0.84012 0.708 0.292
#> SRR1699923 1 0.9522 0.71818 0.628 0.372
#> SRR1699924 2 0.8207 0.58771 0.256 0.744
#> SRR1699925 2 0.8386 0.46515 0.268 0.732
#> SRR1699926 2 0.6973 0.67450 0.188 0.812
#> SRR1699927 2 0.4298 0.70031 0.088 0.912
#> SRR1699929 1 0.9998 0.53979 0.508 0.492
#> SRR1699928 2 0.5408 0.70932 0.124 0.876
#> SRR1699930 2 0.8661 0.46011 0.288 0.712
#> SRR1699931 1 0.9998 0.52786 0.508 0.492
#> SRR1699933 1 0.9087 0.81776 0.676 0.324
#> SRR1699932 1 0.9909 0.62130 0.556 0.444
#> SRR1699934 2 0.8661 0.46501 0.288 0.712
#> SRR1699935 2 0.6973 0.64299 0.188 0.812
#> SRR1699936 1 0.9358 0.80041 0.648 0.352
#> SRR1699937 1 0.9248 0.81072 0.660 0.340
#> SRR1699938 1 0.9248 0.81101 0.660 0.340
#> SRR1699940 2 0.5408 0.69128 0.124 0.876
#> SRR1699939 2 0.8443 0.49293 0.272 0.728
#> SRR1699941 2 0.3733 0.71739 0.072 0.928
#> SRR1699942 2 0.6438 0.67235 0.164 0.836
#> SRR1699943 2 0.9522 0.14871 0.372 0.628
#> SRR1699944 2 0.9000 0.37524 0.316 0.684
#> SRR1699945 2 0.2603 0.70086 0.044 0.956
#> SRR1699946 2 0.7056 0.67179 0.192 0.808
#> SRR1699947 1 0.9993 0.58204 0.516 0.484
#> SRR1699948 1 0.9286 0.80649 0.656 0.344
#> SRR1699949 2 0.3114 0.69800 0.056 0.944
#> SRR1699950 2 0.9963 -0.38928 0.464 0.536
#> SRR1699951 2 0.9209 0.35214 0.336 0.664
#> SRR1699952 1 0.9170 0.82312 0.668 0.332
#> SRR1699953 1 0.9998 0.56334 0.508 0.492
#> SRR1699954 2 0.1184 0.70104 0.016 0.984
#> SRR1699955 1 0.9815 0.72732 0.580 0.420
#> SRR1699956 2 0.1633 0.70405 0.024 0.976
#> SRR1699957 1 0.9608 0.72690 0.616 0.384
#> SRR1699959 2 0.6438 0.67075 0.164 0.836
#> SRR1699958 2 0.8555 0.43735 0.280 0.720
#> SRR1699960 2 0.3274 0.71648 0.060 0.940
#> SRR1699961 1 0.9358 0.80782 0.648 0.352
#> SRR1699962 1 0.8813 0.84308 0.700 0.300
#> SRR1699963 1 0.9323 0.80459 0.652 0.348
#> SRR1699964 1 0.9393 0.80501 0.644 0.356
#> SRR1699965 1 0.9323 0.80148 0.652 0.348
#> SRR1699966 2 0.8144 0.55915 0.252 0.748
#> SRR1699967 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1699968 1 0.9661 0.76403 0.608 0.392
#> SRR1699969 2 0.1843 0.70582 0.028 0.972
#> SRR1699971 2 0.8327 0.52922 0.264 0.736
#> SRR1699970 1 0.8861 0.84178 0.696 0.304
#> SRR1699972 1 0.9608 0.78937 0.616 0.384
#> SRR1699973 2 0.0376 0.69740 0.004 0.996
#> SRR1699974 1 0.9491 0.75231 0.632 0.368
#> SRR1699975 1 0.9896 0.62035 0.560 0.440
#> SRR1699976 2 0.4939 0.71483 0.108 0.892
#> SRR1699977 2 0.4431 0.70173 0.092 0.908
#> SRR1699978 2 0.7056 0.67958 0.192 0.808
#> SRR1699979 2 0.6148 0.68612 0.152 0.848
#> SRR1699980 2 0.6973 0.65035 0.188 0.812
#> SRR1699981 2 0.0938 0.69996 0.012 0.988
#> SRR1699982 2 0.8081 0.59743 0.248 0.752
#> SRR1699983 2 0.2043 0.70658 0.032 0.968
#> SRR1699984 2 0.8861 0.46791 0.304 0.696
#> SRR1699985 2 0.9209 0.37420 0.336 0.664
#> SRR1699986 1 0.8443 0.84423 0.728 0.272
#> SRR1699988 1 0.8661 0.83977 0.712 0.288
#> SRR1699987 2 0.6148 0.68361 0.152 0.848
#> SRR1699989 2 0.9896 -0.23030 0.440 0.560
#> SRR1699990 2 0.9866 -0.09107 0.432 0.568
#> SRR1699992 1 0.9427 0.80595 0.640 0.360
#> SRR1699991 2 0.7674 0.59069 0.224 0.776
#> SRR1699993 2 0.5408 0.70902 0.124 0.876
#> SRR1699994 1 0.9491 0.79503 0.632 0.368
#> SRR1699995 2 0.8608 0.48090 0.284 0.716
#> SRR1699996 1 0.9209 0.81595 0.664 0.336
#> SRR1699997 2 0.5737 0.68658 0.136 0.864
#> SRR1699998 1 0.9732 0.75351 0.596 0.404
#> SRR1699999 2 0.9087 0.49802 0.324 0.676
#> SRR1700000 2 0.8267 0.57340 0.260 0.740
#> SRR1700002 1 0.8955 0.83171 0.688 0.312
#> SRR1700001 1 0.8763 0.84902 0.704 0.296
#> SRR1700003 1 0.9754 0.75077 0.592 0.408
#> SRR1700004 2 0.0938 0.70141 0.012 0.988
#> SRR1700005 1 0.9661 -0.21864 0.608 0.392
#> SRR1700006 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700007 2 0.0376 0.69751 0.004 0.996
#> SRR1700008 2 0.5294 0.70262 0.120 0.880
#> SRR1700009 2 0.9209 0.46199 0.336 0.664
#> SRR1700010 2 0.8499 0.49266 0.276 0.724
#> SRR1700011 2 0.9087 0.40896 0.324 0.676
#> SRR1700013 1 0.9775 0.74404 0.588 0.412
#> SRR1700012 2 0.5842 0.68963 0.140 0.860
#> SRR1700014 2 0.3584 0.70116 0.068 0.932
#> SRR1700015 1 1.0000 0.51549 0.504 0.496
#> SRR1700016 2 0.9552 0.47256 0.376 0.624
#> SRR1700018 1 0.9323 0.80148 0.652 0.348
#> SRR1700017 2 0.8499 0.47859 0.276 0.724
#> SRR1700019 2 0.6148 0.67732 0.152 0.848
#> SRR1700020 2 0.2236 0.69328 0.036 0.964
#> SRR1700021 2 0.4161 0.71777 0.084 0.916
#> SRR1700023 2 0.4161 0.71594 0.084 0.916
#> SRR1700022 2 0.1184 0.70107 0.016 0.984
#> SRR1700024 2 0.7950 0.56702 0.240 0.760
#> SRR1700025 1 0.9248 0.81136 0.660 0.340
#> SRR1700026 1 0.9922 0.63494 0.552 0.448
#> SRR1700027 2 0.6247 0.67696 0.156 0.844
#> SRR1700028 2 0.3733 0.70983 0.072 0.928
#> SRR1700029 2 0.2603 0.71100 0.044 0.956
#> SRR1700030 2 0.5629 0.69740 0.132 0.868
#> SRR1700031 2 0.6148 0.67699 0.152 0.848
#> SRR1700032 2 0.9209 0.34248 0.336 0.664
#> SRR1700034 1 0.9710 -0.11859 0.600 0.400
#> SRR1700035 2 0.2423 0.70186 0.040 0.960
#> SRR1700033 2 0.9970 -0.19645 0.468 0.532
#> SRR1700036 2 0.7139 0.62698 0.196 0.804
#> SRR1700037 2 0.2423 0.70807 0.040 0.960
#> SRR1700038 1 0.8499 0.84708 0.724 0.276
#> SRR1700039 2 0.9044 0.34127 0.320 0.680
#> SRR1700040 2 0.9922 -0.15398 0.448 0.552
#> SRR1700041 2 0.8144 0.57143 0.252 0.748
#> SRR1700042 2 0.3733 0.70139 0.072 0.928
#> SRR1700043 2 0.9393 0.29889 0.356 0.644
#> SRR1700045 1 0.8713 0.84622 0.708 0.292
#> SRR1700044 1 0.8555 0.84063 0.720 0.280
#> SRR1700046 1 0.9460 0.80493 0.636 0.364
#> SRR1700047 2 0.3879 0.70354 0.076 0.924
#> SRR1700048 1 0.9491 0.77374 0.632 0.368
#> SRR1700049 2 0.8081 0.50145 0.248 0.752
#> SRR1700050 2 0.6438 0.67627 0.164 0.836
#> SRR1700051 2 0.6148 0.63277 0.152 0.848
#> SRR1700052 2 0.7883 0.60409 0.236 0.764
#> SRR1700053 1 0.9795 0.74161 0.584 0.416
#> SRR1700054 1 0.8499 0.84346 0.724 0.276
#> SRR1700055 2 0.8763 0.46481 0.296 0.704
#> SRR1700056 2 0.4298 0.70436 0.088 0.912
#> SRR1700057 2 0.0376 0.69737 0.004 0.996
#> SRR1700058 1 0.8661 0.84202 0.712 0.288
#> SRR1700059 2 0.1633 0.70379 0.024 0.976
#> SRR1700060 2 0.8499 0.52476 0.276 0.724
#> SRR1700061 1 0.8763 0.84186 0.704 0.296
#> SRR1700062 2 0.4815 0.71150 0.104 0.896
#> SRR1700063 1 0.9988 0.60195 0.520 0.480
#> SRR1700064 2 0.9983 -0.41838 0.476 0.524
#> SRR1700065 2 0.9732 0.09861 0.404 0.596
#> SRR1700066 2 0.8909 0.49413 0.308 0.692
#> SRR1700067 1 0.9963 0.63194 0.536 0.464
#> SRR1700068 1 0.9608 0.74008 0.616 0.384
#> SRR1700069 2 0.6048 0.69575 0.148 0.852
#> SRR1700070 1 0.9209 0.80497 0.664 0.336
#> SRR1700071 1 0.8443 0.84420 0.728 0.272
#> SRR1700072 2 0.9833 0.03379 0.424 0.576
#> SRR1700073 2 0.2948 0.71243 0.052 0.948
#> SRR1700075 1 0.8909 0.81433 0.692 0.308
#> SRR1700074 1 0.8909 0.84457 0.692 0.308
#> SRR1700076 1 0.9833 0.72337 0.576 0.424
#> SRR1700077 2 0.9896 -0.23210 0.440 0.560
#> SRR1700078 2 0.0000 0.69569 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.2948 0.70359 0.052 0.948
#> SRR1700079 2 0.3879 0.70123 0.076 0.924
#> SRR1700081 2 0.9209 0.27981 0.336 0.664
#> SRR1700082 1 0.9993 0.59027 0.516 0.484
#> SRR1700083 2 0.7674 0.63818 0.224 0.776
#> SRR1700084 2 0.4022 0.70550 0.080 0.920
#> SRR1700085 2 0.9881 -0.14261 0.436 0.564
#> SRR1700086 2 0.2948 0.70628 0.052 0.948
#> SRR1700087 1 0.8555 0.84825 0.720 0.280
#> SRR1700088 2 0.9460 0.30327 0.364 0.636
#> SRR1700089 2 0.5178 0.70251 0.116 0.884
#> SRR1700091 2 0.6048 0.70262 0.148 0.852
#> SRR1700090 2 0.3879 0.71320 0.076 0.924
#> SRR1700092 2 0.9954 -0.20882 0.460 0.540
#> SRR1700094 2 0.3274 0.70488 0.060 0.940
#> SRR1700093 1 0.9933 0.64669 0.548 0.452
#> SRR1700095 2 0.3733 0.69387 0.072 0.928
#> SRR1700096 2 0.5737 0.68563 0.136 0.864
#> SRR1700097 2 0.9795 0.02616 0.416 0.584
#> SRR1700098 2 0.4022 0.70504 0.080 0.920
#> SRR1700099 2 0.9552 0.13368 0.376 0.624
#> SRR1700100 1 0.9922 0.66895 0.552 0.448
#> SRR1700101 1 0.9209 0.82852 0.664 0.336
#> SRR1700102 2 0.7299 0.61597 0.204 0.796
#> SRR1700104 2 0.1184 0.70230 0.016 0.984
#> SRR1700103 2 0.3431 0.71731 0.064 0.936
#> SRR1700105 2 0.2778 0.70532 0.048 0.952
#> SRR1700106 2 0.0000 0.69569 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.4562 0.71402 0.096 0.904
#> SRR1700108 2 0.7602 0.61064 0.220 0.780
#> SRR1700109 2 0.9427 0.27344 0.360 0.640
#> SRR1700110 2 0.9815 -0.17690 0.420 0.580
#> SRR1700112 1 0.8861 0.83584 0.696 0.304
#> SRR1700111 2 0.2236 0.70745 0.036 0.964
#> SRR1700113 2 0.6887 0.65745 0.184 0.816
#> SRR1700114 2 0.7453 0.61651 0.212 0.788
#> SRR1700115 2 0.0376 0.69756 0.004 0.996
#> SRR1700116 2 0.0376 0.69742 0.004 0.996
#> SRR1700117 1 0.8608 0.84287 0.716 0.284
#> SRR1700119 2 0.7602 0.59077 0.220 0.780
#> SRR1700118 2 0.9170 0.31144 0.332 0.668
#> SRR1700120 2 0.1843 0.70222 0.028 0.972
#> SRR1700121 2 0.3114 0.70433 0.056 0.944
#> SRR1700122 2 0.9000 0.43158 0.316 0.684
#> SRR1700123 2 0.4690 0.70149 0.100 0.900
#> SRR1700125 2 0.4431 0.69889 0.092 0.908
#> SRR1700126 1 0.9933 0.49857 0.548 0.452
#> SRR1700127 2 0.6623 0.65721 0.172 0.828
#> SRR1700124 1 0.9993 0.57615 0.516 0.484
#> SRR1700128 2 0.4431 0.71085 0.092 0.908
#> SRR1700129 2 0.9795 -0.11771 0.416 0.584
#> SRR1700130 2 0.6973 0.67971 0.188 0.812
#> SRR1700132 2 0.3274 0.70896 0.060 0.940
#> SRR1700131 2 0.1633 0.70186 0.024 0.976
#> SRR1700133 2 0.0938 0.69988 0.012 0.988
#> SRR1700134 2 0.8909 0.44888 0.308 0.692
#> SRR1700135 2 0.6801 0.64746 0.180 0.820
#> SRR1700136 2 0.3879 0.69541 0.076 0.924
#> SRR1700137 2 0.0938 0.69988 0.012 0.988
#> SRR1700138 2 0.6623 0.67711 0.172 0.828
#> SRR1700140 2 0.6973 0.63790 0.188 0.812
#> SRR1700139 2 0.8909 0.43006 0.308 0.692
#> SRR1700141 2 0.2043 0.70597 0.032 0.968
#> SRR1700142 2 0.8713 0.40638 0.292 0.708
#> SRR1700143 2 0.6801 0.64863 0.180 0.820
#> SRR1700144 1 0.8713 0.85034 0.708 0.292
#> SRR1700145 2 0.6623 0.67611 0.172 0.828
#> SRR1700146 2 0.2948 0.70013 0.052 0.948
#> SRR1700147 2 0.8267 0.60187 0.260 0.740
#> SRR1700149 1 0.9963 0.48912 0.536 0.464
#> SRR1700148 2 0.9732 0.06556 0.404 0.596
#> SRR1700150 1 0.8499 0.84732 0.724 0.276
#> SRR1700152 2 0.5178 0.70245 0.116 0.884
#> SRR1700151 2 0.4022 0.69013 0.080 0.920
#> SRR1700153 2 0.7815 0.62047 0.232 0.768
#> SRR1700154 1 0.9209 0.79276 0.664 0.336
#> SRR1700155 1 0.9000 0.80902 0.684 0.316
#> SRR1700156 2 0.2948 0.71344 0.052 0.948
#> SRR1700158 2 0.6148 0.67156 0.152 0.848
#> SRR1700159 2 0.9552 0.25438 0.376 0.624
#> SRR1700157 2 0.9775 0.06798 0.412 0.588
#> SRR1700160 2 0.0672 0.69920 0.008 0.992
#> SRR1700161 2 0.1633 0.70549 0.024 0.976
#> SRR1700162 2 0.5946 0.69561 0.144 0.856
#> SRR1700164 2 0.7528 0.64891 0.216 0.784
#> SRR1700163 1 0.8327 0.82682 0.736 0.264
#> SRR1700165 1 0.8909 0.84920 0.692 0.308
#> SRR1700166 2 0.4690 0.68828 0.100 0.900
#> SRR1700168 2 0.8713 0.47632 0.292 0.708
#> SRR1700167 2 0.7745 0.63300 0.228 0.772
#> SRR1700170 1 0.9732 0.75675 0.596 0.404
#> SRR1700169 1 0.9358 0.80370 0.648 0.352
#> SRR1700171 2 0.1184 0.69121 0.016 0.984
#> SRR1700172 2 0.3584 0.71053 0.068 0.932
#> SRR1700174 2 0.9993 -0.34789 0.484 0.516
#> SRR1700173 2 0.2603 0.70184 0.044 0.956
#> SRR1700175 1 0.9129 0.82495 0.672 0.328
#> SRR1700176 2 0.5408 0.70399 0.124 0.876
#> SRR1700178 2 1.0000 -0.51211 0.496 0.504
#> SRR1700177 2 0.4431 0.68677 0.092 0.908
#> SRR1700180 1 0.9795 0.72860 0.584 0.416
#> SRR1700179 1 0.8555 0.84694 0.720 0.280
#> SRR1700181 1 0.9000 0.82499 0.684 0.316
#> SRR1700183 2 0.8386 0.46488 0.268 0.732
#> SRR1700182 1 0.8327 0.84288 0.736 0.264
#> SRR1700184 1 0.8327 0.84352 0.736 0.264
#> SRR1700186 1 0.8661 0.84691 0.712 0.288
#> SRR1700187 1 0.9922 -0.24053 0.552 0.448
#> SRR1700185 2 0.9000 0.46903 0.316 0.684
#> SRR1700188 1 0.8555 0.84734 0.720 0.280
#> SRR1700192 1 0.8555 0.84628 0.720 0.280
#> SRR1700190 1 0.9954 0.60925 0.540 0.460
#> SRR1700191 2 0.9427 0.45002 0.360 0.640
#> SRR1700189 1 0.8555 0.81496 0.720 0.280
#> SRR1700193 2 0.9881 -0.01450 0.436 0.564
#> SRR1700195 1 0.8608 0.84719 0.716 0.284
#> SRR1700194 1 0.4939 0.34368 0.892 0.108
#> SRR1700196 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700197 1 0.9323 0.23409 0.652 0.348
#> SRR1700198 1 0.8661 0.84668 0.712 0.288
#> SRR1700199 1 0.8661 0.84911 0.712 0.288
#> SRR1700200 1 0.8608 0.83929 0.716 0.284
#> SRR1700201 1 0.8763 0.84481 0.704 0.296
#> SRR1700202 1 0.8763 0.83285 0.704 0.296
#> SRR1700203 1 0.8327 0.84288 0.736 0.264
#> SRR1700204 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700206 2 0.9922 -0.27440 0.448 0.552
#> SRR1700207 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700208 1 0.9608 0.75707 0.616 0.384
#> SRR1700205 2 0.9944 -0.20697 0.456 0.544
#> SRR1700209 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700210 1 0.8661 0.83271 0.712 0.288
#> SRR1700211 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700212 1 0.8661 0.84682 0.712 0.288
#> SRR1700213 1 0.8713 0.84934 0.708 0.292
#> SRR1700214 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700215 2 0.9732 0.43486 0.404 0.596
#> SRR1700217 1 0.8861 0.83772 0.696 0.304
#> SRR1700216 2 0.8661 0.46412 0.288 0.712
#> SRR1700218 1 0.8909 0.84455 0.692 0.308
#> SRR1700219 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700222 1 0.7950 0.39576 0.760 0.240
#> SRR1700220 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700221 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700223 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700224 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700226 1 0.8713 0.84605 0.708 0.292
#> SRR1700229 1 0.8763 0.84293 0.704 0.296
#> SRR1700225 1 0.8555 0.83810 0.720 0.280
#> SRR1700227 1 0.9209 0.81521 0.664 0.336
#> SRR1700230 1 0.9323 0.76583 0.652 0.348
#> SRR1700231 2 0.9661 0.20111 0.392 0.608
#> SRR1700228 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700232 1 0.9170 0.81257 0.668 0.332
#> SRR1700233 1 0.8813 0.83037 0.700 0.300
#> SRR1700234 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700235 1 0.8327 0.84150 0.736 0.264
#> SRR1700237 1 0.8763 0.84487 0.704 0.296
#> SRR1700236 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700238 1 0.8327 0.84315 0.736 0.264
#> SRR1700239 1 0.9209 0.78333 0.664 0.336
#> SRR1700240 2 0.9286 0.46136 0.344 0.656
#> SRR1700241 1 0.8499 0.84408 0.724 0.276
#> SRR1700243 1 0.8661 0.84638 0.712 0.288
#> SRR1700244 1 0.9000 0.83975 0.684 0.316
#> SRR1700242 1 0.8081 0.83296 0.752 0.248
#> SRR1700246 1 0.8555 0.81382 0.720 0.280
#> SRR1700245 1 0.9044 0.83061 0.680 0.320
#> SRR1700247 2 0.7528 0.63346 0.216 0.784
#> SRR1700249 2 0.8207 0.47714 0.256 0.744
#> SRR1700250 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700248 1 0.9358 0.78682 0.648 0.352
#> SRR1700251 1 0.9635 0.77754 0.612 0.388
#> SRR1700252 1 0.9795 0.69411 0.584 0.416
#> SRR1700253 1 0.8813 0.84294 0.700 0.300
#> SRR1700256 1 0.8909 0.83900 0.692 0.308
#> SRR1700254 1 0.9909 0.53520 0.556 0.444
#> SRR1700255 1 0.8386 0.84155 0.732 0.268
#> SRR1700257 1 0.8267 0.84134 0.740 0.260
#> SRR1700258 1 0.9044 0.83392 0.680 0.320
#> SRR1700259 2 0.6343 0.68632 0.160 0.840
#> SRR1700260 2 0.2236 0.70182 0.036 0.964
#> SRR1700261 1 0.8955 0.83604 0.688 0.312
#> SRR1700262 2 0.2423 0.70129 0.040 0.960
#> SRR1700263 1 0.9896 0.66830 0.560 0.440
#> SRR1700264 1 0.8813 0.84247 0.700 0.300
#> SRR1700265 1 0.9661 0.75117 0.608 0.392
#> SRR1700266 1 1.0000 0.52563 0.504 0.496
#> SRR1700268 2 0.7528 0.62947 0.216 0.784
#> SRR1700270 1 0.9993 0.57232 0.516 0.484
#> SRR1700267 1 0.8327 0.84317 0.736 0.264
#> SRR1700271 2 0.9393 0.16553 0.356 0.644
#> SRR1700272 2 0.5737 0.68888 0.136 0.864
#> SRR1700273 1 0.8386 0.84287 0.732 0.268
#> SRR1700274 2 0.7528 0.63988 0.216 0.784
#> SRR1700277 1 0.9323 0.80148 0.652 0.348
#> SRR1700275 2 0.4815 0.71748 0.104 0.896
#> SRR1700276 2 0.6887 0.65251 0.184 0.816
#> SRR1700278 1 0.9129 0.79996 0.672 0.328
#> SRR1700279 2 0.3584 0.70389 0.068 0.932
#> SRR1700280 2 1.0000 -0.41227 0.496 0.504
#> SRR1700281 1 0.9209 0.83267 0.664 0.336
#> SRR1700283 2 0.9963 -0.15529 0.464 0.536
#> SRR1700282 1 1.0000 0.50937 0.504 0.496
#> SRR1700284 2 0.6887 0.66901 0.184 0.816
#> SRR1700285 2 0.7139 0.64068 0.196 0.804
#> SRR1700286 2 0.8016 0.53510 0.244 0.756
#> SRR1700287 2 0.1633 0.70573 0.024 0.976
#> SRR1700290 2 0.2236 0.70042 0.036 0.964
#> SRR1700289 2 0.5178 0.70093 0.116 0.884
#> SRR1700288 1 0.9358 0.81798 0.648 0.352
#> SRR1700292 2 0.8713 0.51549 0.292 0.708
#> SRR1700291 2 0.2236 0.70962 0.036 0.964
#> SRR1700293 1 0.8327 0.84183 0.736 0.264
#> SRR1700294 1 0.9996 0.43712 0.512 0.488
#> SRR1700295 1 0.9170 0.78605 0.668 0.332
#> SRR1700297 1 0.9850 0.71583 0.572 0.428
#> SRR1700296 2 0.8081 0.60222 0.248 0.752
#> SRR1700298 1 0.8661 0.84888 0.712 0.288
#> SRR1700299 2 0.7815 0.57933 0.232 0.768
#> SRR1700300 1 0.9286 0.80985 0.656 0.344
#> SRR1700302 2 0.6343 0.69698 0.160 0.840
#> SRR1700301 2 0.9866 -0.13241 0.432 0.568
#> SRR1700303 2 0.8555 0.54244 0.280 0.720
#> SRR1700304 1 0.9977 0.51510 0.528 0.472
#> SRR1700305 1 0.8555 0.83791 0.720 0.280
#> SRR1700306 2 0.8144 0.57609 0.252 0.748
#> SRR1700308 2 0.9970 -0.25388 0.468 0.532
#> SRR1700307 2 0.9977 -0.27792 0.472 0.528
#> SRR1700309 2 0.8661 0.51390 0.288 0.712
#> SRR1700310 2 0.9954 -0.24323 0.460 0.540
#> SRR1700311 2 0.3431 0.69941 0.064 0.936
#> SRR1700312 1 0.9922 0.59194 0.552 0.448
#> SRR1700313 1 0.9833 0.66383 0.576 0.424
#> SRR1700314 2 0.5178 0.70139 0.116 0.884
#> SRR1700315 2 0.4562 0.68731 0.096 0.904
#> SRR1700316 2 0.9993 -0.48781 0.484 0.516
#> SRR1700317 1 0.8813 0.84619 0.700 0.300
#> SRR1700318 2 0.6247 0.68479 0.156 0.844
#> SRR1700319 2 0.2603 0.71291 0.044 0.956
#> SRR1700320 2 0.5408 0.68854 0.124 0.876
#> SRR1700322 1 0.9044 0.84124 0.680 0.320
#> SRR1700321 1 0.8555 0.84746 0.720 0.280
#> SRR1700323 2 0.4298 0.68933 0.088 0.912
#> SRR1700324 1 0.9552 0.76308 0.624 0.376
#> SRR1700325 2 0.8016 0.55279 0.244 0.756
#> SRR1700326 2 0.7815 0.60836 0.232 0.768
#> SRR1700327 1 0.8661 0.84612 0.712 0.288
#> SRR1700329 2 0.7883 0.62976 0.236 0.764
#> SRR1700328 2 0.4431 0.70646 0.092 0.908
#> SRR1700330 2 0.7376 0.65204 0.208 0.792
#> SRR1700331 2 0.7602 0.63385 0.220 0.780
#> SRR1700332 2 0.8327 0.55097 0.264 0.736
#> SRR1700333 1 0.8608 0.84709 0.716 0.284
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.6062 0.4268 0.000 0.616 0.384
#> SRR1699875 3 0.6286 0.3229 0.000 0.464 0.536
#> SRR1699876 3 0.5431 0.6536 0.000 0.284 0.716
#> SRR1699877 2 0.4346 0.6765 0.000 0.816 0.184
#> SRR1699879 3 0.5465 0.6960 0.000 0.288 0.712
#> SRR1699878 2 0.3116 0.7636 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699880 2 0.5254 0.6280 0.000 0.736 0.264
#> SRR1699881 3 0.6305 0.2165 0.000 0.484 0.516
#> SRR1699882 2 0.6260 0.1335 0.000 0.552 0.448
#> SRR1699883 2 0.3879 0.7528 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699884 2 0.3192 0.7577 0.000 0.888 0.112
#> SRR1699885 2 0.1031 0.7886 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699886 2 0.0747 0.7879 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699888 2 0.3482 0.7673 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699889 3 0.2959 0.7124 0.000 0.100 0.900
#> SRR1699890 2 0.6252 0.0512 0.000 0.556 0.444
#> SRR1699887 2 0.2625 0.7826 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699891 3 0.5497 0.6359 0.000 0.292 0.708
#> SRR1699892 2 0.4291 0.6953 0.000 0.820 0.180
#> SRR1699893 3 0.6008 0.5428 0.000 0.372 0.628
#> SRR1699894 2 0.4062 0.7230 0.000 0.836 0.164
#> SRR1699895 2 0.5968 0.4519 0.000 0.636 0.364
#> SRR1699896 2 0.6154 0.2348 0.000 0.592 0.408
#> SRR1699897 2 0.3038 0.7805 0.000 0.896 0.104
#> SRR1699898 3 0.3482 0.7283 0.000 0.128 0.872
#> SRR1699900 2 0.2878 0.7887 0.000 0.904 0.096
#> SRR1699899 3 0.2261 0.6955 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699902 2 0.1753 0.7905 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699901 3 0.6754 0.3270 0.012 0.432 0.556
#> SRR1699903 3 0.4887 0.7031 0.000 0.228 0.772
#> SRR1699904 2 0.1860 0.7731 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699905 3 0.5882 0.6403 0.000 0.348 0.652
#> SRR1699906 2 0.5529 0.5809 0.000 0.704 0.296
#> SRR1699907 3 0.5948 0.5978 0.000 0.360 0.640
#> SRR1699908 2 0.1163 0.7915 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699909 3 0.5016 0.6828 0.000 0.240 0.760
#> SRR1699910 3 0.5835 0.6525 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699911 3 0.4291 0.7265 0.000 0.180 0.820
#> SRR1699912 3 0.5760 0.6531 0.000 0.328 0.672
#> SRR1699913 2 0.3879 0.7192 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699914 3 0.4931 0.7062 0.004 0.212 0.784
#> SRR1699915 3 0.4974 0.7085 0.000 0.236 0.764
#> SRR1699916 2 0.2796 0.7869 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699917 3 0.6308 0.3584 0.000 0.492 0.508
#> SRR1699918 2 0.3116 0.7831 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699919 3 0.2448 0.6816 0.000 0.076 0.924
#> SRR1699920 3 0.2261 0.6738 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699921 3 0.2448 0.7015 0.000 0.076 0.924
#> SRR1699922 2 0.1529 0.7850 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699923 2 0.4453 0.7187 0.012 0.836 0.152
#> SRR1699924 3 0.5882 0.6292 0.000 0.348 0.652
#> SRR1699925 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.5988 0.6162 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699927 3 0.2878 0.6953 0.000 0.096 0.904
#> SRR1699929 2 0.5327 0.6313 0.000 0.728 0.272
#> SRR1699928 3 0.5138 0.7302 0.000 0.252 0.748
#> SRR1699930 2 0.6305 -0.1059 0.000 0.516 0.484
#> SRR1699931 2 0.5529 0.5917 0.000 0.704 0.296
#> SRR1699933 2 0.3267 0.7587 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699932 2 0.5810 0.4668 0.000 0.664 0.336
#> SRR1699934 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.4399 0.7055 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699936 2 0.3482 0.7483 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699937 2 0.2959 0.7654 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699938 2 0.3192 0.7577 0.000 0.888 0.112
#> SRR1699940 3 0.3686 0.7104 0.000 0.140 0.860
#> SRR1699939 3 0.6299 0.2493 0.000 0.476 0.524
#> SRR1699941 3 0.4178 0.7433 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699942 3 0.5810 0.6151 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699943 3 0.6305 0.2050 0.000 0.484 0.516
#> SRR1699944 3 0.6308 0.2016 0.000 0.492 0.508
#> SRR1699945 3 0.2261 0.6841 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699946 3 0.5254 0.7161 0.000 0.264 0.736
#> SRR1699947 2 0.6079 0.4050 0.000 0.612 0.388
#> SRR1699948 2 0.3267 0.7547 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699949 3 0.2448 0.6779 0.000 0.076 0.924
#> SRR1699950 2 0.6192 0.3189 0.000 0.580 0.420
#> SRR1699951 3 0.5988 0.5177 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699952 2 0.2959 0.7738 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699953 2 0.5859 0.5132 0.000 0.656 0.344
#> SRR1699954 3 0.1031 0.6594 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699955 2 0.4796 0.7034 0.000 0.780 0.220
#> SRR1699956 3 0.2878 0.7134 0.000 0.096 0.904
#> SRR1699957 2 0.5216 0.5802 0.000 0.740 0.260
#> SRR1699959 3 0.5988 0.5596 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699958 3 0.6307 0.1485 0.000 0.488 0.512
#> SRR1699960 3 0.3412 0.7283 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699961 2 0.3482 0.7580 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699962 2 0.1753 0.7878 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699963 2 0.3412 0.7539 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699964 2 0.3412 0.7563 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699965 2 0.3412 0.7485 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699966 3 0.6095 0.5304 0.000 0.392 0.608
#> SRR1699967 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.4178 0.7292 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699969 3 0.4399 0.7207 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699971 3 0.6215 0.4283 0.000 0.428 0.572
#> SRR1699970 2 0.2165 0.7845 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699972 2 0.4974 0.6917 0.000 0.764 0.236
#> SRR1699973 3 0.0747 0.6549 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699974 2 0.3573 0.7554 0.004 0.876 0.120
#> SRR1699975 2 0.6008 0.3470 0.000 0.628 0.372
#> SRR1699976 3 0.4555 0.7411 0.000 0.200 0.800
#> SRR1699977 3 0.3482 0.7086 0.000 0.128 0.872
#> SRR1699978 3 0.6357 0.6573 0.012 0.336 0.652
#> SRR1699979 3 0.5650 0.6804 0.000 0.312 0.688
#> SRR1699980 3 0.6111 0.4996 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699981 3 0.1289 0.6661 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699982 3 0.6045 0.5933 0.000 0.380 0.620
#> SRR1699983 3 0.4399 0.7326 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699984 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.6225 -0.0447 0.000 0.568 0.432
#> SRR1699986 2 0.1753 0.7828 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699988 2 0.1163 0.7840 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699987 3 0.4399 0.6694 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699989 2 0.5859 0.4452 0.000 0.656 0.344
#> SRR1699990 2 0.5905 0.3514 0.000 0.648 0.352
#> SRR1699992 2 0.3412 0.7648 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699991 3 0.5621 0.6254 0.000 0.308 0.692
#> SRR1699993 3 0.3784 0.6907 0.004 0.132 0.864
#> SRR1699994 2 0.3619 0.7551 0.000 0.864 0.136
#> SRR1699995 3 0.6848 0.0142 0.416 0.016 0.568
#> SRR1699996 2 0.3340 0.7592 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699997 3 0.4291 0.6634 0.000 0.180 0.820
#> SRR1699998 2 0.4178 0.7408 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699999 3 0.7155 0.5950 0.128 0.152 0.720
#> SRR1700000 3 0.6476 0.4192 0.004 0.448 0.548
#> SRR1700002 2 0.3116 0.7594 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700001 2 0.1529 0.7927 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700003 2 0.4842 0.7124 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700004 3 0.3941 0.7269 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700005 1 0.7309 0.6599 0.708 0.168 0.124
#> SRR1700006 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700007 3 0.0892 0.6571 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700008 3 0.5948 0.6204 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700009 1 0.8168 0.5619 0.612 0.108 0.280
#> SRR1700010 3 0.6111 0.5013 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700011 2 0.6307 -0.1849 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700013 2 0.4452 0.7300 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700012 3 0.5465 0.6726 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700014 3 0.3482 0.7129 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700015 2 0.5529 0.5866 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700016 3 0.8310 0.3408 0.312 0.104 0.584
#> SRR1700018 2 0.3412 0.7485 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700017 3 0.6307 0.1963 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700019 3 0.5988 0.5525 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700020 3 0.2550 0.6881 0.012 0.056 0.932
#> SRR1700021 3 0.5529 0.6792 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700023 3 0.3192 0.7161 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700022 3 0.1529 0.6767 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700024 3 0.6225 0.3979 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700025 2 0.3340 0.7588 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700026 2 0.4555 0.7107 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700027 3 0.5926 0.5906 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700028 3 0.2625 0.6916 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700029 3 0.3619 0.7337 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700030 3 0.4887 0.7126 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700031 3 0.5678 0.6392 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700032 3 0.6244 0.3819 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700034 1 0.9623 0.2137 0.412 0.204 0.384
#> SRR1700035 3 0.1529 0.6646 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700033 2 0.6075 0.4818 0.008 0.676 0.316
#> SRR1700036 3 0.5363 0.6666 0.000 0.276 0.724
#> SRR1700037 3 0.3412 0.7207 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700038 2 0.1163 0.7904 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700039 2 0.6252 0.0961 0.000 0.556 0.444
#> SRR1700040 2 0.6126 0.2127 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700041 3 0.6267 0.3888 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700042 3 0.2955 0.6819 0.008 0.080 0.912
#> SRR1700043 3 0.6819 0.2112 0.012 0.476 0.512
#> SRR1700045 2 0.2066 0.7893 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700044 2 0.0892 0.7834 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700046 2 0.3116 0.7823 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700047 3 0.3116 0.6676 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700048 2 0.4702 0.6716 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700049 3 0.6527 0.3203 0.320 0.020 0.660
#> SRR1700050 3 0.5327 0.6883 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700051 3 0.4821 0.6663 0.064 0.088 0.848
#> SRR1700052 3 0.6140 0.4969 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700053 2 0.5291 0.6560 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700054 2 0.1267 0.7888 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700055 1 0.4915 0.7023 0.804 0.012 0.184
#> SRR1700056 3 0.3752 0.7200 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700057 3 0.0424 0.6474 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700058 2 0.2537 0.7719 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700059 3 0.1411 0.6599 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700060 3 0.6008 0.5604 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700061 2 0.1411 0.7881 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700062 3 0.3619 0.7164 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700063 2 0.5431 0.6296 0.000 0.716 0.284
#> SRR1700064 2 0.5591 0.5580 0.000 0.696 0.304
#> SRR1700065 3 0.6307 0.2623 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700066 2 0.6676 -0.1628 0.008 0.516 0.476
#> SRR1700067 2 0.5926 0.4917 0.000 0.644 0.356
#> SRR1700068 2 0.3482 0.7483 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700069 3 0.4750 0.7211 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700070 2 0.3116 0.7595 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700071 2 0.1289 0.7861 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700072 2 0.6359 0.2930 0.008 0.628 0.364
#> SRR1700073 3 0.4062 0.7324 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700075 2 0.1964 0.7673 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700074 2 0.2165 0.7900 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700076 2 0.4796 0.7103 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700077 2 0.6215 0.2091 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700078 3 0.0424 0.6505 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700080 3 0.4062 0.7295 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700079 3 0.4110 0.7045 0.004 0.152 0.844
#> SRR1700081 3 0.6442 0.3229 0.004 0.432 0.564
#> SRR1700082 2 0.5497 0.6171 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700083 3 0.6169 0.6046 0.004 0.360 0.636
#> SRR1700084 3 0.3459 0.6992 0.012 0.096 0.892
#> SRR1700085 2 0.6295 -0.0528 0.000 0.528 0.472
#> SRR1700086 3 0.2625 0.6982 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700087 2 0.1529 0.7898 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700088 2 0.6154 0.1296 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700089 3 0.5431 0.6746 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700091 3 0.4504 0.7356 0.000 0.196 0.804
#> SRR1700090 3 0.4654 0.7393 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700092 2 0.5968 0.3430 0.000 0.636 0.364
#> SRR1700094 3 0.3116 0.7095 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700093 2 0.4796 0.6952 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700095 3 0.3267 0.6570 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700096 3 0.5882 0.5754 0.000 0.348 0.652
#> SRR1700097 2 0.5905 0.3965 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700098 3 0.4346 0.7312 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700099 2 0.6168 0.2209 0.000 0.588 0.412
#> SRR1700100 2 0.4842 0.6886 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700101 2 0.2878 0.7874 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700102 3 0.5397 0.6612 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700104 3 0.3816 0.7319 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700103 3 0.4555 0.7466 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700105 3 0.3482 0.7096 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700106 3 0.0000 0.6428 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700107 3 0.4452 0.7462 0.000 0.192 0.808
#> SRR1700108 3 0.6225 0.4477 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700109 3 0.6307 0.2701 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700110 2 0.6026 0.4008 0.000 0.624 0.376
#> SRR1700112 2 0.1753 0.7845 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700111 3 0.2796 0.7098 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700113 3 0.5591 0.6604 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700114 3 0.5926 0.5753 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700115 3 0.2448 0.7045 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700116 3 0.2711 0.7133 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700117 2 0.1411 0.7834 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700119 3 0.6062 0.4961 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700118 2 0.6302 -0.0584 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700120 3 0.3272 0.7136 0.004 0.104 0.892
#> SRR1700121 3 0.2448 0.6678 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700122 3 0.6026 0.5282 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700123 3 0.5363 0.7045 0.000 0.276 0.724
#> SRR1700125 3 0.4346 0.7112 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700126 2 0.5315 0.6318 0.012 0.772 0.216
#> SRR1700127 3 0.5706 0.6388 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700124 2 0.5529 0.6135 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700128 3 0.5560 0.6827 0.000 0.300 0.700
#> SRR1700129 2 0.5835 0.4694 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700130 3 0.5216 0.7214 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700132 3 0.5138 0.6941 0.000 0.252 0.748
#> SRR1700131 3 0.1989 0.6669 0.004 0.048 0.948
#> SRR1700133 3 0.0747 0.6541 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700134 3 0.6140 0.4891 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700135 3 0.4796 0.7061 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700136 3 0.3375 0.6475 0.008 0.100 0.892
#> SRR1700137 3 0.1031 0.6568 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700138 3 0.5016 0.6833 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700140 3 0.6062 0.5128 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700139 3 0.6302 0.2710 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700141 3 0.2165 0.6911 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700142 3 0.6509 0.1710 0.004 0.472 0.524
#> SRR1700143 3 0.4974 0.6889 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700144 2 0.1289 0.7915 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700145 3 0.4784 0.6736 0.004 0.200 0.796
#> SRR1700146 3 0.2796 0.6609 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700147 3 0.6299 0.4211 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700149 2 0.5406 0.6492 0.012 0.764 0.224
#> SRR1700148 2 0.5948 0.3637 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700150 2 0.1529 0.7899 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700152 3 0.4605 0.7113 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700151 3 0.3482 0.6510 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700153 3 0.6235 0.4964 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700154 2 0.2796 0.7538 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700155 2 0.2261 0.7653 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700156 3 0.4002 0.7363 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700158 3 0.6008 0.5317 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700159 2 0.6045 0.1991 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700157 2 0.6062 0.2293 0.000 0.616 0.384
#> SRR1700160 3 0.3752 0.7266 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700161 3 0.3116 0.7198 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700162 3 0.6045 0.5786 0.000 0.380 0.620
#> SRR1700164 3 0.6498 0.5683 0.008 0.396 0.596
#> SRR1700163 2 0.1585 0.7826 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700165 2 0.2448 0.7938 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700166 3 0.4291 0.6784 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700168 2 0.6291 -0.0815 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700167 3 0.5785 0.6537 0.004 0.300 0.696
#> SRR1700170 2 0.4504 0.7258 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700169 2 0.3482 0.7511 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700171 3 0.0829 0.6419 0.012 0.004 0.984
#> SRR1700172 3 0.4974 0.7091 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700174 2 0.6225 0.1271 0.000 0.568 0.432
#> SRR1700173 3 0.3038 0.6797 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700175 2 0.3340 0.7721 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700176 3 0.4654 0.7175 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700178 2 0.5497 0.5909 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700177 3 0.4555 0.6901 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700180 2 0.4750 0.7076 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700179 2 0.1031 0.7882 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700181 2 0.1964 0.7802 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700183 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0424 0.7846 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700184 2 0.0424 0.7847 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700186 2 0.1411 0.7892 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700187 2 0.9653 -0.1644 0.212 0.424 0.364
#> SRR1700185 1 0.8391 0.2541 0.484 0.084 0.432
#> SRR1700188 2 0.1031 0.7886 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700192 2 0.1529 0.7875 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700190 2 0.5285 0.6578 0.004 0.752 0.244
#> SRR1700191 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.2446 0.7727 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700193 2 0.5810 0.3412 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700195 2 0.1289 0.7889 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700194 1 0.6936 0.6208 0.704 0.232 0.064
#> SRR1700196 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 2 0.8839 0.3977 0.172 0.572 0.256
#> SRR1700198 2 0.1289 0.7889 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700199 2 0.1289 0.7908 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700200 2 0.1031 0.7830 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700201 2 0.1753 0.7878 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700202 2 0.1964 0.7799 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700203 2 0.0237 0.7829 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700204 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.5948 0.4382 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700207 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.4291 0.7179 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700205 2 0.6045 0.2677 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700209 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.1163 0.7789 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700211 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.1289 0.7891 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700213 2 0.1753 0.7929 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700214 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.1753 0.7855 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700216 1 0.0000 0.7710 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.2625 0.7911 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700219 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 2 0.8077 0.4967 0.176 0.652 0.172
#> SRR1700220 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.1411 0.7891 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700229 2 0.4291 0.6810 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700225 2 0.0892 0.7813 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700227 2 0.3116 0.7637 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700230 2 0.3845 0.7593 0.012 0.872 0.116
#> SRR1700231 3 0.6267 0.3788 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700228 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.2711 0.7764 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700233 2 0.2537 0.7727 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700234 2 0.0424 0.7839 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700235 2 0.0237 0.7820 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700237 2 0.1643 0.7911 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700236 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0237 0.7831 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 2 0.3377 0.7728 0.012 0.896 0.092
#> SRR1700240 1 0.8630 0.4598 0.552 0.120 0.328
#> SRR1700241 2 0.0892 0.7868 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700243 2 0.1289 0.7889 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700244 2 0.2537 0.7848 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700242 2 0.0848 0.7844 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700246 2 0.2229 0.7732 0.012 0.944 0.044
#> SRR1700245 2 0.2448 0.7791 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700247 3 0.7145 0.6611 0.072 0.236 0.692
#> SRR1700249 1 0.6527 0.4554 0.588 0.008 0.404
#> SRR1700250 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.4887 0.6266 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700251 2 0.4235 0.7450 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700252 2 0.5678 0.5039 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700253 2 0.1860 0.7867 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700256 2 0.1964 0.7862 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700254 2 0.5171 0.6557 0.012 0.784 0.204
#> SRR1700255 2 0.0592 0.7827 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700257 2 0.0000 0.7816 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.2448 0.7817 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700259 3 0.5591 0.6806 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700260 3 0.2796 0.7058 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700261 2 0.2165 0.7831 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700262 3 0.1964 0.6736 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700263 2 0.4842 0.6856 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700264 2 0.3879 0.7176 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700265 2 0.3941 0.7497 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700266 2 0.5733 0.5369 0.000 0.676 0.324
#> SRR1700268 3 0.5397 0.6803 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700270 2 0.5216 0.6445 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700267 2 0.0237 0.7831 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700271 3 0.6026 0.4131 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700272 3 0.4605 0.7252 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700273 2 0.0424 0.7834 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700274 3 0.6126 0.5575 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700277 2 0.3482 0.7488 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700275 3 0.3551 0.7200 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700276 3 0.5733 0.6297 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700278 2 0.2448 0.7589 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700279 3 0.4654 0.7226 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700280 2 0.5254 0.5753 0.000 0.736 0.264
#> SRR1700281 2 0.3340 0.7803 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700283 2 0.6026 0.1908 0.000 0.624 0.376
#> SRR1700282 2 0.5098 0.6533 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700284 3 0.5650 0.6875 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700285 3 0.6168 0.4604 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700286 3 0.5621 0.6112 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700287 3 0.1964 0.6817 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700290 3 0.5220 0.7258 0.012 0.208 0.780
#> SRR1700289 3 0.4974 0.7188 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700288 2 0.3267 0.7700 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700292 3 0.6286 0.3984 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700291 3 0.2261 0.6913 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700293 2 0.0237 0.7822 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700294 2 0.5098 0.5871 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700295 2 0.2711 0.7565 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700297 2 0.4842 0.6970 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700296 3 0.6295 0.4230 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700298 2 0.1529 0.7906 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700299 3 0.5397 0.6541 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700300 2 0.3482 0.7619 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700302 3 0.5591 0.7014 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700301 2 0.5650 0.4911 0.000 0.688 0.312
#> SRR1700303 3 0.6295 0.4049 0.000 0.472 0.528
#> SRR1700304 2 0.4796 0.6442 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700305 2 0.1163 0.7793 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700306 3 0.6079 0.5653 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700308 2 0.5291 0.5316 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700307 2 0.6192 0.1452 0.000 0.580 0.420
#> SRR1700309 3 0.6302 0.3666 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700310 2 0.5988 0.2888 0.000 0.632 0.368
#> SRR1700311 3 0.3686 0.6957 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700312 2 0.4399 0.6773 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700313 2 0.5254 0.5945 0.000 0.736 0.264
#> SRR1700314 3 0.4346 0.7259 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700315 3 0.4974 0.6972 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700316 2 0.6280 0.2055 0.000 0.540 0.460
#> SRR1700317 2 0.1964 0.7886 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700318 3 0.5529 0.6917 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700319 3 0.4346 0.7363 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700320 3 0.5098 0.7006 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700322 2 0.2448 0.7924 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700321 2 0.1289 0.7893 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700323 3 0.3482 0.6540 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700324 2 0.3482 0.7491 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700325 3 0.6302 0.2250 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700326 3 0.6225 0.4272 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700327 2 0.1289 0.7896 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700329 3 0.6180 0.5563 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700328 3 0.3941 0.7292 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700330 3 0.6260 0.4847 0.000 0.448 0.552
#> SRR1700331 3 0.5591 0.6638 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700332 3 0.6180 0.5244 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700333 2 0.1031 0.7893 0.000 0.976 0.024
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.7814 0.22715 0.000 0.416 0.304 0.280
#> SRR1699875 3 0.6182 0.25850 0.000 0.428 0.520 0.052
#> SRR1699876 3 0.6565 0.50208 0.000 0.148 0.628 0.224
#> SRR1699877 2 0.3539 0.61485 0.000 0.820 0.176 0.004
#> SRR1699879 3 0.5968 0.57962 0.000 0.236 0.672 0.092
#> SRR1699878 2 0.5288 0.63913 0.000 0.732 0.068 0.200
#> SRR1699880 2 0.6731 0.53970 0.000 0.604 0.148 0.248
#> SRR1699881 2 0.7847 0.06019 0.000 0.396 0.328 0.276
#> SRR1699882 2 0.7849 0.01463 0.000 0.380 0.352 0.268
#> SRR1699883 2 0.5515 0.66735 0.000 0.732 0.116 0.152
#> SRR1699884 2 0.5180 0.64264 0.000 0.740 0.064 0.196
#> SRR1699885 2 0.2730 0.70858 0.000 0.896 0.016 0.088
#> SRR1699886 2 0.1798 0.70671 0.000 0.944 0.016 0.040
#> SRR1699888 2 0.5851 0.63054 0.000 0.680 0.084 0.236
#> SRR1699889 3 0.2271 0.60076 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1699890 2 0.5873 0.12677 0.000 0.548 0.416 0.036
#> SRR1699887 2 0.3354 0.70557 0.000 0.872 0.084 0.044
#> SRR1699891 3 0.4677 0.46221 0.000 0.316 0.680 0.004
#> SRR1699892 2 0.3311 0.65435 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1699893 3 0.7740 0.31437 0.000 0.236 0.416 0.348
#> SRR1699894 2 0.3443 0.67265 0.000 0.848 0.136 0.016
#> SRR1699895 2 0.7748 0.23265 0.000 0.436 0.260 0.304
#> SRR1699896 2 0.7551 0.32968 0.000 0.488 0.240 0.272
#> SRR1699897 2 0.5636 0.62641 0.000 0.680 0.060 0.260
#> SRR1699898 3 0.5646 0.36434 0.000 0.056 0.672 0.272
#> SRR1699900 2 0.4916 0.68218 0.000 0.760 0.056 0.184
#> SRR1699899 3 0.3836 0.58739 0.000 0.016 0.816 0.168
#> SRR1699902 2 0.5386 0.40223 0.000 0.612 0.020 0.368
#> SRR1699901 4 0.7190 0.30458 0.000 0.192 0.260 0.548
#> SRR1699903 3 0.5109 0.58824 0.000 0.196 0.744 0.060
#> SRR1699904 2 0.3937 0.59191 0.000 0.800 0.012 0.188
#> SRR1699905 3 0.6552 0.45440 0.000 0.144 0.628 0.228
#> SRR1699906 2 0.7035 0.50777 0.000 0.572 0.184 0.244
#> SRR1699907 3 0.7324 0.45347 0.000 0.240 0.532 0.228
#> SRR1699908 2 0.1406 0.70421 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1699909 3 0.3831 0.55569 0.000 0.204 0.792 0.004
#> SRR1699910 3 0.6388 0.50282 0.000 0.156 0.652 0.192
#> SRR1699911 3 0.4426 0.58246 0.000 0.092 0.812 0.096
#> SRR1699912 3 0.6317 0.53218 0.000 0.280 0.624 0.096
#> SRR1699913 2 0.4150 0.63134 0.000 0.824 0.120 0.056
#> SRR1699914 3 0.4565 0.56819 0.000 0.140 0.796 0.064
#> SRR1699915 3 0.5277 0.56289 0.000 0.132 0.752 0.116
#> SRR1699916 2 0.4534 0.69963 0.000 0.800 0.068 0.132
#> SRR1699917 3 0.6659 0.32348 0.000 0.448 0.468 0.084
#> SRR1699918 2 0.5011 0.68084 0.000 0.764 0.076 0.160
#> SRR1699919 3 0.5024 0.48054 0.000 0.008 0.632 0.360
#> SRR1699920 3 0.5143 0.46470 0.000 0.012 0.628 0.360
#> SRR1699921 3 0.3547 0.55622 0.000 0.016 0.840 0.144
#> SRR1699922 2 0.2867 0.65877 0.000 0.884 0.012 0.104
#> SRR1699923 2 0.5888 -0.11243 0.000 0.540 0.036 0.424
#> SRR1699924 3 0.6544 0.50297 0.000 0.284 0.604 0.112
#> SRR1699925 1 0.0000 0.76807 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.6617 0.49661 0.000 0.280 0.600 0.120
#> SRR1699927 3 0.4818 0.56080 0.000 0.036 0.748 0.216
#> SRR1699929 2 0.7349 0.37241 0.000 0.456 0.160 0.384
#> SRR1699928 3 0.5628 0.60646 0.000 0.216 0.704 0.080
#> SRR1699930 2 0.7724 0.13562 0.000 0.436 0.320 0.244
#> SRR1699931 2 0.7135 0.47619 0.000 0.560 0.240 0.200
#> SRR1699933 2 0.4499 0.62191 0.000 0.804 0.072 0.124
#> SRR1699932 2 0.7271 0.39636 0.000 0.532 0.192 0.276
#> SRR1699934 1 0.0000 0.76807 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.5594 0.54920 0.000 0.100 0.720 0.180
#> SRR1699936 2 0.5845 0.59303 0.000 0.672 0.076 0.252
#> SRR1699937 2 0.5062 0.65173 0.000 0.752 0.064 0.184
#> SRR1699938 2 0.5180 0.64505 0.000 0.740 0.064 0.196
#> SRR1699940 3 0.4605 0.58170 0.000 0.072 0.796 0.132
#> SRR1699939 3 0.7836 0.13155 0.000 0.348 0.388 0.264
#> SRR1699941 3 0.4706 0.62665 0.000 0.140 0.788 0.072
#> SRR1699942 3 0.7479 0.43424 0.000 0.244 0.504 0.252
#> SRR1699943 3 0.7356 0.27541 0.000 0.368 0.468 0.164
#> SRR1699944 3 0.7581 0.23908 0.000 0.360 0.440 0.200
#> SRR1699945 3 0.4387 0.55956 0.000 0.024 0.776 0.200
#> SRR1699946 3 0.5170 0.58300 0.000 0.228 0.724 0.048
#> SRR1699947 2 0.6993 0.39124 0.000 0.532 0.336 0.132
#> SRR1699948 2 0.5533 0.61843 0.000 0.708 0.072 0.220
#> SRR1699949 3 0.4328 0.50870 0.000 0.008 0.748 0.244
#> SRR1699950 2 0.7605 0.26537 0.000 0.452 0.336 0.212
#> SRR1699951 3 0.4776 0.37897 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR1699952 2 0.4318 0.68940 0.000 0.816 0.068 0.116
#> SRR1699953 2 0.7694 0.28534 0.000 0.452 0.296 0.252
#> SRR1699954 3 0.2197 0.57549 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1699955 2 0.6731 0.55580 0.000 0.604 0.148 0.248
#> SRR1699956 3 0.3301 0.61450 0.000 0.076 0.876 0.048
#> SRR1699957 2 0.4720 0.54340 0.000 0.720 0.264 0.016
#> SRR1699959 3 0.7464 0.41060 0.000 0.296 0.496 0.208
#> SRR1699958 3 0.6611 0.06728 0.000 0.456 0.464 0.080
#> SRR1699960 3 0.4104 0.61695 0.000 0.080 0.832 0.088
#> SRR1699961 2 0.5727 0.61713 0.000 0.692 0.080 0.228
#> SRR1699962 2 0.3160 0.70468 0.000 0.872 0.020 0.108
#> SRR1699963 2 0.5690 0.60227 0.000 0.672 0.060 0.268
#> SRR1699964 2 0.5118 0.65145 0.000 0.752 0.072 0.176
#> SRR1699965 2 0.5890 0.58199 0.000 0.660 0.072 0.268
#> SRR1699966 3 0.6494 0.45903 0.000 0.340 0.572 0.088
#> SRR1699967 2 0.0188 0.68862 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699968 2 0.5968 0.59598 0.000 0.672 0.092 0.236
#> SRR1699969 3 0.5204 0.60220 0.000 0.160 0.752 0.088
#> SRR1699971 3 0.7664 0.35217 0.000 0.292 0.460 0.248
#> SRR1699970 2 0.3962 0.69363 0.000 0.832 0.044 0.124
#> SRR1699972 2 0.6620 0.58853 0.000 0.628 0.192 0.180
#> SRR1699973 3 0.0524 0.56093 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1699974 2 0.5838 -0.15036 0.000 0.524 0.032 0.444
#> SRR1699975 2 0.4819 0.40493 0.000 0.652 0.344 0.004
#> SRR1699976 3 0.4004 0.61466 0.000 0.164 0.812 0.024
#> SRR1699977 3 0.5387 0.50880 0.000 0.048 0.696 0.256
#> SRR1699978 4 0.6273 0.37371 0.000 0.108 0.248 0.644
#> SRR1699979 3 0.6474 0.56853 0.000 0.256 0.624 0.120
#> SRR1699980 3 0.6979 0.40880 0.000 0.344 0.528 0.128
#> SRR1699981 3 0.1109 0.56948 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699982 3 0.5436 0.48922 0.000 0.356 0.620 0.024
#> SRR1699983 3 0.3743 0.60525 0.000 0.160 0.824 0.016
#> SRR1699984 1 0.0000 0.76807 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.5119 -0.01558 0.000 0.556 0.440 0.004
#> SRR1699986 2 0.4608 0.43782 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR1699988 2 0.0927 0.69627 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1699987 3 0.3606 0.56961 0.000 0.140 0.840 0.020
#> SRR1699989 2 0.7538 0.31783 0.000 0.492 0.248 0.260
#> SRR1699990 2 0.4746 0.33703 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1699992 2 0.4465 0.68263 0.000 0.800 0.056 0.144
#> SRR1699991 4 0.4949 0.39020 0.000 0.060 0.180 0.760
#> SRR1699993 3 0.4753 0.51926 0.000 0.084 0.788 0.128
#> SRR1699994 2 0.5328 0.65010 0.000 0.724 0.064 0.212
#> SRR1699995 4 0.7190 0.03500 0.192 0.000 0.260 0.548
#> SRR1699996 2 0.5464 0.64357 0.000 0.708 0.064 0.228
#> SRR1699997 3 0.3032 0.56549 0.000 0.124 0.868 0.008
#> SRR1699998 2 0.5800 0.64493 0.000 0.708 0.128 0.164
#> SRR1699999 4 0.7350 0.17683 0.100 0.024 0.336 0.540
#> SRR1700000 3 0.7515 0.16620 0.000 0.364 0.448 0.188
#> SRR1700002 2 0.2861 0.67758 0.000 0.888 0.096 0.016
#> SRR1700001 2 0.3280 0.65726 0.000 0.860 0.016 0.124
#> SRR1700003 2 0.6678 0.57637 0.000 0.612 0.148 0.240
#> SRR1700004 3 0.3803 0.60241 0.000 0.132 0.836 0.032
#> SRR1700005 1 0.7329 0.59477 0.652 0.112 0.080 0.156
#> SRR1700006 2 0.0188 0.68820 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700007 3 0.0000 0.55613 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.6140 0.53375 0.000 0.252 0.652 0.096
#> SRR1700009 1 0.7907 0.25862 0.408 0.004 0.236 0.352
#> SRR1700010 3 0.7346 0.36766 0.000 0.280 0.520 0.200
#> SRR1700011 3 0.7083 0.14795 0.000 0.432 0.444 0.124
#> SRR1700013 2 0.6303 0.61642 0.000 0.660 0.148 0.192
#> SRR1700012 3 0.7103 0.38088 0.000 0.128 0.468 0.404
#> SRR1700014 3 0.6089 0.48835 0.000 0.064 0.608 0.328
#> SRR1700015 2 0.7271 0.44806 0.000 0.532 0.192 0.276
#> SRR1700016 4 0.4485 0.04515 0.200 0.000 0.028 0.772
#> SRR1700018 2 0.5916 0.58081 0.000 0.656 0.072 0.272
#> SRR1700017 2 0.7684 -0.06465 0.000 0.396 0.388 0.216
#> SRR1700019 3 0.7212 0.41395 0.000 0.324 0.516 0.160
#> SRR1700020 4 0.5000 0.08231 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1700021 3 0.5837 0.56620 0.000 0.260 0.668 0.072
#> SRR1700023 3 0.4301 0.60585 0.000 0.064 0.816 0.120
#> SRR1700022 3 0.2775 0.57974 0.000 0.020 0.896 0.084
#> SRR1700024 3 0.7761 0.23682 0.000 0.340 0.416 0.244
#> SRR1700025 2 0.6052 0.57318 0.000 0.616 0.064 0.320
#> SRR1700026 2 0.5763 0.64413 0.000 0.712 0.156 0.132
#> SRR1700027 3 0.7539 0.44232 0.000 0.256 0.492 0.252
#> SRR1700028 3 0.4418 0.56618 0.000 0.032 0.784 0.184
#> SRR1700029 3 0.5827 0.52482 0.000 0.052 0.632 0.316
#> SRR1700030 3 0.5304 0.56583 0.000 0.148 0.748 0.104
#> SRR1700031 4 0.6001 0.38794 0.000 0.128 0.184 0.688
#> SRR1700032 3 0.7384 0.33696 0.000 0.352 0.476 0.172
#> SRR1700034 4 0.7622 -0.02217 0.224 0.008 0.244 0.524
#> SRR1700035 3 0.4134 0.55259 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700033 4 0.6115 0.38960 0.000 0.172 0.148 0.680
#> SRR1700036 3 0.6916 0.45731 0.000 0.148 0.572 0.280
#> SRR1700037 3 0.3307 0.60927 0.000 0.104 0.868 0.028
#> SRR1700038 2 0.3266 0.70962 0.000 0.868 0.024 0.108
#> SRR1700039 2 0.6387 -0.01672 0.000 0.492 0.444 0.064
#> SRR1700040 4 0.7494 0.28686 0.000 0.352 0.188 0.460
#> SRR1700041 3 0.7136 0.35257 0.000 0.376 0.488 0.136
#> SRR1700042 4 0.4452 0.38000 0.000 0.008 0.260 0.732
#> SRR1700043 4 0.7753 0.42931 0.000 0.256 0.312 0.432
#> SRR1700045 2 0.4838 0.61822 0.000 0.724 0.024 0.252
#> SRR1700044 2 0.1576 0.67962 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1700046 2 0.4906 0.68400 0.000 0.776 0.084 0.140
#> SRR1700047 3 0.1978 0.56918 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700048 2 0.5470 0.53946 0.000 0.732 0.100 0.168
#> SRR1700049 4 0.7755 0.24853 0.200 0.004 0.368 0.428
#> SRR1700050 3 0.6574 0.24530 0.000 0.088 0.548 0.364
#> SRR1700051 4 0.5285 0.28439 0.004 0.012 0.352 0.632
#> SRR1700052 4 0.7096 0.22047 0.000 0.140 0.344 0.516
#> SRR1700053 2 0.6887 0.48705 0.000 0.560 0.132 0.308
#> SRR1700054 2 0.4800 0.29251 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR1700055 1 0.5454 0.68199 0.732 0.000 0.096 0.172
#> SRR1700056 4 0.4933 0.21823 0.000 0.016 0.296 0.688
#> SRR1700057 3 0.1305 0.55737 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700058 2 0.4635 0.46467 0.000 0.720 0.012 0.268
#> SRR1700059 3 0.2334 0.55642 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1700060 4 0.7654 0.27123 0.000 0.252 0.284 0.464
#> SRR1700061 2 0.0817 0.69544 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700062 3 0.4231 0.60369 0.000 0.080 0.824 0.096
#> SRR1700063 2 0.7456 0.41964 0.000 0.492 0.200 0.308
#> SRR1700064 2 0.7668 0.28891 0.000 0.432 0.220 0.348
#> SRR1700065 2 0.7768 -0.08498 0.000 0.428 0.312 0.260
#> SRR1700066 4 0.7227 0.41742 0.000 0.224 0.228 0.548
#> SRR1700067 2 0.7252 0.43285 0.000 0.544 0.232 0.224
#> SRR1700068 2 0.3372 0.69240 0.000 0.868 0.096 0.036
#> SRR1700069 3 0.4579 0.59248 0.000 0.200 0.768 0.032
#> SRR1700070 2 0.1792 0.68948 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700071 2 0.3486 0.59382 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700072 2 0.7251 0.20683 0.000 0.536 0.272 0.192
#> SRR1700073 3 0.4700 0.58549 0.000 0.084 0.792 0.124
#> SRR1700075 2 0.0895 0.68882 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1700074 2 0.4197 0.69693 0.000 0.808 0.036 0.156
#> SRR1700076 2 0.7235 0.44070 0.000 0.492 0.152 0.356
#> SRR1700077 2 0.7828 0.10111 0.000 0.412 0.292 0.296
#> SRR1700078 3 0.0592 0.55758 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700080 3 0.6216 0.55808 0.000 0.120 0.660 0.220
#> SRR1700079 3 0.4411 0.54535 0.000 0.080 0.812 0.108
#> SRR1700081 4 0.7373 0.10012 0.000 0.192 0.300 0.508
#> SRR1700082 2 0.7341 0.45599 0.000 0.516 0.192 0.292
#> SRR1700083 3 0.7285 0.19494 0.000 0.180 0.520 0.300
#> SRR1700084 4 0.4535 0.34304 0.000 0.016 0.240 0.744
#> SRR1700085 2 0.7003 0.04831 0.000 0.508 0.368 0.124
#> SRR1700086 3 0.4741 0.56259 0.000 0.028 0.744 0.228
#> SRR1700087 2 0.2670 0.69655 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1700088 2 0.6737 0.12899 0.000 0.532 0.368 0.100
#> SRR1700089 3 0.7113 0.48822 0.000 0.152 0.532 0.316
#> SRR1700091 3 0.5077 0.60994 0.000 0.160 0.760 0.080
#> SRR1700090 3 0.4989 0.61307 0.000 0.164 0.764 0.072
#> SRR1700092 2 0.6720 0.36633 0.000 0.580 0.300 0.120
#> SRR1700094 3 0.4798 0.58222 0.000 0.052 0.768 0.180
#> SRR1700093 2 0.6477 0.56660 0.000 0.600 0.100 0.300
#> SRR1700095 3 0.1938 0.54980 0.000 0.052 0.936 0.012
#> SRR1700096 3 0.5973 0.47039 0.000 0.332 0.612 0.056
#> SRR1700097 2 0.7777 -0.00664 0.000 0.428 0.268 0.304
#> SRR1700098 3 0.6187 0.56046 0.000 0.108 0.656 0.236
#> SRR1700099 2 0.7769 0.14204 0.000 0.432 0.296 0.272
#> SRR1700100 2 0.6833 0.52950 0.000 0.584 0.144 0.272
#> SRR1700101 2 0.4245 0.70398 0.000 0.820 0.064 0.116
#> SRR1700102 3 0.7043 0.43059 0.000 0.128 0.504 0.368
#> SRR1700104 3 0.4534 0.62097 0.000 0.132 0.800 0.068
#> SRR1700103 3 0.5998 0.54217 0.000 0.092 0.668 0.240
#> SRR1700105 3 0.2813 0.59068 0.000 0.080 0.896 0.024
#> SRR1700106 3 0.0707 0.55038 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700107 3 0.5771 0.61549 0.000 0.144 0.712 0.144
#> SRR1700108 3 0.7363 0.39555 0.000 0.284 0.516 0.200
#> SRR1700109 3 0.7006 0.24456 0.000 0.428 0.456 0.116
#> SRR1700110 2 0.7459 0.39557 0.000 0.508 0.248 0.244
#> SRR1700112 2 0.2021 0.70116 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1700111 3 0.4406 0.55380 0.000 0.028 0.780 0.192
#> SRR1700113 3 0.5195 0.52932 0.000 0.276 0.692 0.032
#> SRR1700114 3 0.7745 0.33965 0.000 0.240 0.420 0.340
#> SRR1700115 3 0.2797 0.59824 0.000 0.068 0.900 0.032
#> SRR1700116 3 0.4579 0.54747 0.000 0.032 0.768 0.200
#> SRR1700117 2 0.2987 0.66122 0.000 0.880 0.016 0.104
#> SRR1700119 3 0.6310 0.42304 0.000 0.352 0.576 0.072
#> SRR1700118 3 0.7920 -0.05379 0.000 0.340 0.344 0.316
#> SRR1700120 3 0.4332 0.60922 0.000 0.072 0.816 0.112
#> SRR1700121 3 0.2032 0.55852 0.000 0.036 0.936 0.028
#> SRR1700122 3 0.5473 0.43653 0.000 0.324 0.644 0.032
#> SRR1700123 3 0.5689 0.53025 0.000 0.104 0.712 0.184
#> SRR1700125 3 0.3962 0.59144 0.000 0.124 0.832 0.044
#> SRR1700126 4 0.7024 0.38714 0.000 0.360 0.128 0.512
#> SRR1700127 4 0.7249 -0.33981 0.000 0.144 0.412 0.444
#> SRR1700124 2 0.7158 0.45466 0.000 0.512 0.148 0.340
#> SRR1700128 3 0.5669 0.52719 0.000 0.092 0.708 0.200
#> SRR1700129 2 0.6259 0.42845 0.000 0.616 0.300 0.084
#> SRR1700130 3 0.6295 0.57021 0.000 0.212 0.656 0.132
#> SRR1700132 3 0.6330 0.55326 0.000 0.200 0.656 0.144
#> SRR1700131 3 0.4194 0.49542 0.000 0.028 0.800 0.172
#> SRR1700133 3 0.2466 0.57349 0.000 0.004 0.900 0.096
#> SRR1700134 3 0.4936 0.42085 0.000 0.372 0.624 0.004
#> SRR1700135 3 0.6702 0.44870 0.000 0.100 0.544 0.356
#> SRR1700136 3 0.3239 0.52975 0.000 0.052 0.880 0.068
#> SRR1700137 3 0.0804 0.55975 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700138 3 0.5572 0.56079 0.000 0.196 0.716 0.088
#> SRR1700140 3 0.7250 0.36047 0.000 0.336 0.504 0.160
#> SRR1700139 3 0.7527 0.33647 0.000 0.356 0.452 0.192
#> SRR1700141 3 0.3787 0.59800 0.000 0.036 0.840 0.124
#> SRR1700142 4 0.7806 0.02214 0.000 0.264 0.324 0.412
#> SRR1700143 4 0.3196 0.35585 0.000 0.008 0.136 0.856
#> SRR1700144 2 0.3015 0.70714 0.000 0.884 0.024 0.092
#> SRR1700145 3 0.4581 0.54332 0.000 0.120 0.800 0.080
#> SRR1700146 3 0.1610 0.55283 0.000 0.032 0.952 0.016
#> SRR1700147 3 0.5657 0.41575 0.000 0.436 0.540 0.024
#> SRR1700149 2 0.7396 -0.18639 0.000 0.432 0.164 0.404
#> SRR1700148 2 0.7830 0.07745 0.000 0.384 0.260 0.356
#> SRR1700150 2 0.3547 0.67974 0.000 0.840 0.016 0.144
#> SRR1700152 3 0.5102 0.59357 0.000 0.136 0.764 0.100
#> SRR1700151 3 0.1716 0.55233 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1700153 3 0.6570 0.43542 0.000 0.320 0.580 0.100
#> SRR1700154 2 0.4017 0.62404 0.000 0.828 0.044 0.128
#> SRR1700155 2 0.1584 0.69202 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR1700156 3 0.6050 0.54906 0.000 0.100 0.668 0.232
#> SRR1700158 3 0.6280 0.46243 0.000 0.316 0.604 0.080
#> SRR1700159 2 0.6168 0.13029 0.000 0.556 0.388 0.056
#> SRR1700157 2 0.7325 0.03003 0.000 0.492 0.340 0.168
#> SRR1700160 3 0.4428 0.60599 0.000 0.124 0.808 0.068
#> SRR1700161 3 0.4149 0.56546 0.000 0.036 0.812 0.152
#> SRR1700162 3 0.5349 0.49569 0.000 0.336 0.640 0.024
#> SRR1700164 3 0.7344 0.20074 0.000 0.224 0.528 0.248
#> SRR1700163 2 0.5088 0.05457 0.000 0.572 0.004 0.424
#> SRR1700165 2 0.3931 0.69669 0.000 0.832 0.040 0.128
#> SRR1700166 3 0.3404 0.57977 0.000 0.104 0.864 0.032
#> SRR1700168 2 0.6887 -0.17376 0.000 0.452 0.444 0.104
#> SRR1700167 3 0.7236 0.05723 0.000 0.168 0.520 0.312
#> SRR1700170 4 0.6609 -0.36405 0.000 0.448 0.080 0.472
#> SRR1700169 2 0.5537 0.61222 0.000 0.688 0.056 0.256
#> SRR1700171 3 0.2408 0.50803 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700172 3 0.6275 0.56064 0.000 0.204 0.660 0.136
#> SRR1700174 2 0.7221 0.19644 0.000 0.524 0.308 0.168
#> SRR1700173 3 0.4095 0.52549 0.000 0.024 0.804 0.172
#> SRR1700175 2 0.5102 0.57375 0.000 0.748 0.064 0.188
#> SRR1700176 3 0.5890 0.26374 0.000 0.072 0.660 0.268
#> SRR1700178 2 0.7289 0.44261 0.000 0.532 0.200 0.268
#> SRR1700177 3 0.2999 0.58304 0.000 0.132 0.864 0.004
#> SRR1700180 2 0.6992 0.52621 0.000 0.576 0.176 0.248
#> SRR1700179 2 0.2142 0.70859 0.000 0.928 0.016 0.056
#> SRR1700181 2 0.1109 0.69587 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1700183 1 0.2401 0.77234 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1700182 2 0.0524 0.69235 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700184 2 0.2081 0.70876 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1700186 2 0.2032 0.70717 0.000 0.936 0.028 0.036
#> SRR1700187 4 0.8070 0.03661 0.196 0.036 0.240 0.528
#> SRR1700185 4 0.7842 0.02310 0.208 0.016 0.264 0.512
#> SRR1700188 2 0.2329 0.70924 0.000 0.916 0.012 0.072
#> SRR1700192 2 0.3048 0.67998 0.000 0.876 0.016 0.108
#> SRR1700190 4 0.5997 0.36525 0.004 0.232 0.084 0.680
#> SRR1700191 1 0.2868 0.76048 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1700189 4 0.4855 0.27205 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1700193 2 0.5878 0.35032 0.000 0.632 0.312 0.056
#> SRR1700195 2 0.2089 0.70817 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1700194 1 0.8092 0.45927 0.512 0.136 0.048 0.304
#> SRR1700196 2 0.0188 0.68820 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700197 4 0.6947 0.16565 0.152 0.096 0.072 0.680
#> SRR1700198 2 0.2521 0.70877 0.000 0.912 0.024 0.064
#> SRR1700199 2 0.1975 0.70828 0.000 0.936 0.016 0.048
#> SRR1700200 2 0.0376 0.69021 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700201 2 0.3435 0.70446 0.000 0.864 0.036 0.100
#> SRR1700202 2 0.0921 0.69152 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700203 2 0.1398 0.70245 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1700204 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.7166 0.40903 0.000 0.544 0.280 0.176
#> SRR1700207 2 0.0188 0.68820 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700208 2 0.6198 0.49583 0.000 0.660 0.116 0.224
#> SRR1700205 2 0.4800 0.35791 0.000 0.656 0.340 0.004
#> SRR1700209 2 0.0469 0.69008 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700210 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.2413 0.70857 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR1700213 2 0.2943 0.71242 0.000 0.892 0.032 0.076
#> SRR1700214 2 0.0188 0.68820 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700215 1 0.1792 0.77368 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1700217 2 0.1510 0.70095 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1700216 1 0.0000 0.76807 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.4127 0.70632 0.000 0.824 0.052 0.124
#> SRR1700219 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 4 0.7500 0.14952 0.100 0.252 0.052 0.596
#> SRR1700220 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0469 0.69193 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700224 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.2706 0.70901 0.000 0.900 0.020 0.080
#> SRR1700229 2 0.4332 0.61471 0.000 0.792 0.176 0.032
#> SRR1700225 2 0.0336 0.68927 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700227 2 0.5256 0.64441 0.000 0.732 0.064 0.204
#> SRR1700230 2 0.4235 0.65665 0.000 0.824 0.084 0.092
#> SRR1700231 3 0.5478 0.29874 0.000 0.444 0.540 0.016
#> SRR1700228 2 0.0469 0.69255 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700232 2 0.3117 0.69101 0.000 0.880 0.092 0.028
#> SRR1700233 2 0.1389 0.68958 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700234 2 0.0336 0.68969 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700235 2 0.0188 0.68820 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700237 2 0.1767 0.70121 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1700236 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0524 0.69242 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700239 4 0.5607 0.23664 0.000 0.488 0.020 0.492
#> SRR1700240 4 0.8022 -0.14593 0.304 0.008 0.256 0.432
#> SRR1700241 2 0.0817 0.69282 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700243 2 0.2363 0.70931 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1700244 2 0.4485 0.68698 0.000 0.796 0.052 0.152
#> SRR1700242 2 0.1867 0.67195 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700246 4 0.4994 0.27647 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1700245 2 0.4332 0.68263 0.000 0.800 0.040 0.160
#> SRR1700247 4 0.7636 0.28234 0.060 0.072 0.332 0.536
#> SRR1700249 1 0.7756 0.27976 0.424 0.000 0.248 0.328
#> SRR1700250 2 0.0336 0.69002 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700248 2 0.4678 0.56733 0.000 0.744 0.232 0.024
#> SRR1700251 2 0.6065 0.64304 0.000 0.684 0.140 0.176
#> SRR1700252 2 0.6078 0.45725 0.000 0.620 0.312 0.068
#> SRR1700253 2 0.3149 0.70770 0.000 0.880 0.032 0.088
#> SRR1700256 2 0.2892 0.70886 0.000 0.896 0.036 0.068
#> SRR1700254 4 0.7053 0.36903 0.000 0.356 0.132 0.512
#> SRR1700255 2 0.0188 0.68806 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700257 2 0.0336 0.69176 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700258 2 0.4285 0.68307 0.000 0.804 0.040 0.156
#> SRR1700259 3 0.6724 0.54680 0.000 0.224 0.612 0.164
#> SRR1700260 3 0.3793 0.59831 0.000 0.044 0.844 0.112
#> SRR1700261 2 0.3612 0.69940 0.000 0.856 0.044 0.100
#> SRR1700262 3 0.3545 0.55825 0.000 0.008 0.828 0.164
#> SRR1700263 2 0.5705 0.61863 0.000 0.704 0.204 0.092
#> SRR1700264 2 0.4105 0.64326 0.000 0.812 0.156 0.032
#> SRR1700265 2 0.5110 0.67883 0.000 0.764 0.132 0.104
#> SRR1700266 2 0.7529 0.32954 0.000 0.488 0.288 0.224
#> SRR1700268 3 0.5740 0.56433 0.000 0.208 0.700 0.092
#> SRR1700270 2 0.6970 0.51107 0.000 0.576 0.168 0.256
#> SRR1700267 2 0.0592 0.69488 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700271 3 0.7073 0.38400 0.000 0.180 0.564 0.256
#> SRR1700272 3 0.6080 0.51636 0.000 0.100 0.664 0.236
#> SRR1700273 2 0.0779 0.69457 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1700274 3 0.6508 0.48503 0.000 0.344 0.568 0.088
#> SRR1700277 2 0.6499 0.42333 0.000 0.524 0.076 0.400
#> SRR1700275 3 0.3894 0.60619 0.000 0.068 0.844 0.088
#> SRR1700276 3 0.7216 0.44176 0.000 0.156 0.508 0.336
#> SRR1700278 2 0.0817 0.69163 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700279 3 0.6623 0.51853 0.000 0.148 0.620 0.232
#> SRR1700280 2 0.4053 0.58062 0.000 0.768 0.228 0.004
#> SRR1700281 2 0.5517 0.66373 0.000 0.724 0.092 0.184
#> SRR1700283 2 0.5217 0.18873 0.000 0.608 0.380 0.012
#> SRR1700282 2 0.5889 0.60253 0.000 0.688 0.212 0.100
#> SRR1700284 3 0.4632 0.54189 0.000 0.308 0.688 0.004
#> SRR1700285 3 0.7529 0.35285 0.000 0.324 0.472 0.204
#> SRR1700286 3 0.6854 0.45015 0.000 0.120 0.548 0.332
#> SRR1700287 3 0.1629 0.57990 0.000 0.024 0.952 0.024
#> SRR1700290 4 0.5755 0.32683 0.000 0.044 0.332 0.624
#> SRR1700289 3 0.6121 0.57470 0.000 0.164 0.680 0.156
#> SRR1700288 2 0.5361 0.64407 0.000 0.716 0.060 0.224
#> SRR1700292 3 0.6895 0.38918 0.000 0.400 0.492 0.108
#> SRR1700291 3 0.1888 0.58883 0.000 0.044 0.940 0.016
#> SRR1700293 2 0.0000 0.68759 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700294 2 0.5593 0.53850 0.000 0.708 0.212 0.080
#> SRR1700295 2 0.2089 0.69205 0.000 0.932 0.048 0.020
#> SRR1700297 2 0.6805 0.54193 0.000 0.592 0.148 0.260
#> SRR1700296 3 0.4948 0.40455 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1700298 2 0.2214 0.70954 0.000 0.928 0.028 0.044
#> SRR1700299 3 0.6821 0.45927 0.000 0.152 0.592 0.256
#> SRR1700300 2 0.3421 0.68524 0.000 0.868 0.088 0.044
#> SRR1700302 3 0.5723 0.59625 0.000 0.220 0.696 0.084
#> SRR1700301 2 0.5331 0.42538 0.000 0.644 0.332 0.024
#> SRR1700303 3 0.5657 0.40197 0.000 0.436 0.540 0.024
#> SRR1700304 2 0.5655 0.54713 0.000 0.704 0.212 0.084
#> SRR1700305 2 0.0336 0.68642 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700306 3 0.6916 0.42337 0.000 0.280 0.572 0.148
#> SRR1700308 2 0.4331 0.49906 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1700307 2 0.7525 -0.00322 0.000 0.492 0.232 0.276
#> SRR1700309 3 0.5163 0.29234 0.000 0.480 0.516 0.004
#> SRR1700310 2 0.4522 0.38661 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1700311 3 0.2676 0.58702 0.000 0.092 0.896 0.012
#> SRR1700312 2 0.4323 0.61628 0.000 0.776 0.204 0.020
#> SRR1700313 2 0.5867 0.50953 0.000 0.688 0.216 0.096
#> SRR1700314 3 0.6553 0.48814 0.000 0.100 0.584 0.316
#> SRR1700315 3 0.4332 0.58403 0.000 0.160 0.800 0.040
#> SRR1700316 2 0.7567 0.12689 0.000 0.412 0.396 0.192
#> SRR1700317 2 0.3464 0.70503 0.000 0.860 0.032 0.108
#> SRR1700318 3 0.4188 0.58605 0.000 0.244 0.752 0.004
#> SRR1700319 3 0.5809 0.58879 0.000 0.092 0.692 0.216
#> SRR1700320 3 0.5874 0.51713 0.000 0.124 0.700 0.176
#> SRR1700322 2 0.3601 0.71262 0.000 0.860 0.056 0.084
#> SRR1700321 2 0.1520 0.70409 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1700323 3 0.1867 0.55282 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1700324 2 0.2281 0.68896 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700325 3 0.7046 0.12147 0.000 0.432 0.448 0.120
#> SRR1700326 4 0.6503 0.37856 0.000 0.196 0.164 0.640
#> SRR1700327 2 0.1059 0.70021 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1700329 3 0.5942 0.45114 0.000 0.412 0.548 0.040
#> SRR1700328 3 0.5937 0.50807 0.000 0.052 0.608 0.340
#> SRR1700330 3 0.5244 0.45141 0.000 0.388 0.600 0.012
#> SRR1700331 3 0.4883 0.52658 0.000 0.288 0.696 0.016
#> SRR1700332 3 0.4855 0.45301 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1700333 2 0.2670 0.71126 0.000 0.904 0.024 0.072
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 3 0.6177 0.53559 0.000 0.304 0.532 0.000 0.164
#> SRR1699875 5 0.5752 0.12220 0.000 0.412 0.088 0.000 0.500
#> SRR1699876 5 0.5906 -0.11958 0.000 0.104 0.404 0.000 0.492
#> SRR1699877 2 0.3280 0.57944 0.000 0.812 0.012 0.000 0.176
#> SRR1699879 5 0.5840 0.38783 0.000 0.232 0.164 0.000 0.604
#> SRR1699878 2 0.4182 0.27141 0.000 0.644 0.352 0.000 0.004
#> SRR1699880 2 0.5106 -0.15019 0.000 0.508 0.456 0.000 0.036
#> SRR1699881 3 0.6428 0.54322 0.008 0.320 0.516 0.000 0.156
#> SRR1699882 3 0.6139 0.58486 0.000 0.260 0.556 0.000 0.184
#> SRR1699883 2 0.4960 0.46125 0.000 0.688 0.232 0.000 0.080
#> SRR1699884 2 0.4101 0.25468 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.2516 0.63505 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.1628 0.66407 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR1699888 3 0.4796 0.13090 0.012 0.468 0.516 0.000 0.004
#> SRR1699889 5 0.2790 0.59873 0.000 0.068 0.052 0.000 0.880
#> SRR1699890 2 0.5773 0.08072 0.000 0.544 0.100 0.000 0.356
#> SRR1699887 2 0.3242 0.64280 0.000 0.852 0.076 0.000 0.072
#> SRR1699891 5 0.4047 0.43503 0.004 0.320 0.000 0.000 0.676
#> SRR1699892 2 0.3513 0.58576 0.000 0.800 0.020 0.000 0.180
#> SRR1699893 3 0.7188 0.51650 0.064 0.188 0.532 0.000 0.216
#> SRR1699894 2 0.3099 0.62681 0.012 0.848 0.008 0.000 0.132
#> SRR1699895 3 0.7584 0.44828 0.076 0.328 0.432 0.000 0.164
#> SRR1699896 3 0.5484 0.48859 0.000 0.336 0.584 0.000 0.080
#> SRR1699897 2 0.5815 0.33075 0.088 0.576 0.328 0.000 0.008
#> SRR1699898 5 0.6630 0.39043 0.216 0.044 0.152 0.000 0.588
#> SRR1699900 2 0.5237 0.49256 0.040 0.684 0.244 0.000 0.032
#> SRR1699899 5 0.4658 0.49063 0.028 0.004 0.296 0.000 0.672
#> SRR1699902 2 0.6033 0.26012 0.328 0.556 0.108 0.000 0.008
#> SRR1699901 1 0.4372 0.34654 0.752 0.040 0.008 0.000 0.200
#> SRR1699903 5 0.5521 0.53717 0.028 0.188 0.092 0.000 0.692
#> SRR1699904 2 0.4899 0.52727 0.144 0.736 0.112 0.000 0.008
#> SRR1699905 5 0.6158 0.53814 0.180 0.116 0.052 0.000 0.652
#> SRR1699906 2 0.5812 -0.20725 0.000 0.476 0.432 0.000 0.092
#> SRR1699907 3 0.6598 0.29358 0.004 0.180 0.420 0.000 0.396
#> SRR1699908 2 0.1386 0.66651 0.000 0.952 0.032 0.000 0.016
#> SRR1699909 5 0.3527 0.57079 0.000 0.192 0.016 0.000 0.792
#> SRR1699910 5 0.6099 0.55399 0.152 0.116 0.064 0.000 0.668
#> SRR1699911 5 0.3872 0.59968 0.060 0.064 0.040 0.000 0.836
#> SRR1699912 5 0.6179 0.41378 0.032 0.280 0.092 0.000 0.596
#> SRR1699913 2 0.3950 0.59542 0.052 0.816 0.016 0.000 0.116
#> SRR1699914 5 0.4711 0.59942 0.068 0.116 0.040 0.000 0.776
#> SRR1699915 5 0.4755 0.60246 0.056 0.084 0.080 0.000 0.780
#> SRR1699916 2 0.4812 0.57762 0.020 0.736 0.192 0.000 0.052
#> SRR1699917 5 0.6238 0.23906 0.076 0.444 0.024 0.000 0.456
#> SRR1699918 2 0.4508 0.51091 0.004 0.708 0.256 0.000 0.032
#> SRR1699919 3 0.5351 0.22890 0.060 0.000 0.560 0.000 0.380
#> SRR1699920 3 0.5897 0.17760 0.088 0.004 0.496 0.000 0.412
#> SRR1699921 5 0.4389 0.57430 0.120 0.008 0.092 0.000 0.780
#> SRR1699922 2 0.3265 0.62660 0.088 0.860 0.040 0.000 0.012
#> SRR1699923 1 0.4628 0.39329 0.688 0.276 0.004 0.000 0.032
#> SRR1699924 5 0.6829 0.30560 0.016 0.216 0.272 0.000 0.496
#> SRR1699925 4 0.0162 0.77741 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1699926 5 0.6658 0.44589 0.080 0.252 0.084 0.000 0.584
#> SRR1699927 5 0.5089 0.22594 0.012 0.020 0.400 0.000 0.568
#> SRR1699929 3 0.6722 0.45062 0.112 0.312 0.532 0.000 0.044
#> SRR1699928 5 0.5641 0.46631 0.004 0.200 0.148 0.000 0.648
#> SRR1699930 3 0.6015 0.47346 0.000 0.360 0.516 0.000 0.124
#> SRR1699931 2 0.6603 -0.14837 0.012 0.480 0.352 0.000 0.156
#> SRR1699933 2 0.4679 0.58885 0.096 0.784 0.056 0.000 0.064
#> SRR1699932 2 0.7573 0.15788 0.132 0.504 0.232 0.000 0.132
#> SRR1699934 4 0.0162 0.77741 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1699935 5 0.5355 0.28775 0.000 0.084 0.292 0.000 0.624
#> SRR1699936 2 0.4452 -0.15291 0.000 0.500 0.496 0.000 0.004
#> SRR1699937 2 0.3837 0.38307 0.000 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.3876 0.39122 0.000 0.684 0.316 0.000 0.000
#> SRR1699940 5 0.4509 0.43238 0.000 0.048 0.236 0.000 0.716
#> SRR1699939 3 0.6278 0.56910 0.000 0.252 0.536 0.000 0.212
#> SRR1699941 5 0.4868 0.56070 0.008 0.124 0.128 0.000 0.740
#> SRR1699942 3 0.6885 0.25266 0.028 0.152 0.472 0.000 0.348
#> SRR1699943 5 0.6766 -0.20533 0.000 0.320 0.284 0.000 0.396
#> SRR1699944 5 0.6820 -0.33535 0.000 0.312 0.344 0.000 0.344
#> SRR1699945 5 0.4714 0.27350 0.004 0.016 0.372 0.000 0.608
#> SRR1699946 5 0.5149 0.49964 0.000 0.216 0.104 0.000 0.680
#> SRR1699947 2 0.6351 0.09953 0.000 0.516 0.204 0.000 0.280
#> SRR1699948 2 0.4219 0.10276 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1699949 5 0.4291 -0.05476 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1699950 2 0.6674 -0.35543 0.000 0.408 0.356 0.000 0.236
#> SRR1699951 5 0.4238 0.35673 0.000 0.368 0.004 0.000 0.628
#> SRR1699952 2 0.3596 0.56413 0.000 0.776 0.212 0.000 0.012
#> SRR1699953 3 0.6422 0.53546 0.000 0.316 0.488 0.000 0.196
#> SRR1699954 5 0.2932 0.57993 0.032 0.000 0.104 0.000 0.864
#> SRR1699955 2 0.5473 -0.09207 0.000 0.520 0.416 0.000 0.064
#> SRR1699956 5 0.4011 0.57550 0.008 0.072 0.112 0.000 0.808
#> SRR1699957 2 0.4301 0.48543 0.000 0.712 0.028 0.000 0.260
#> SRR1699959 3 0.6773 0.34596 0.004 0.228 0.424 0.000 0.344
#> SRR1699958 5 0.6211 -0.04759 0.004 0.436 0.120 0.000 0.440
#> SRR1699960 5 0.4522 0.56956 0.004 0.060 0.192 0.000 0.744
#> SRR1699961 2 0.4686 0.13027 0.004 0.588 0.396 0.000 0.012
#> SRR1699962 2 0.2561 0.61991 0.000 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR1699963 3 0.4858 0.27194 0.008 0.424 0.556 0.000 0.012
#> SRR1699964 2 0.3884 0.41187 0.000 0.708 0.288 0.000 0.004
#> SRR1699965 3 0.4219 0.32054 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1699966 5 0.6244 0.16933 0.000 0.336 0.160 0.000 0.504
#> SRR1699967 2 0.0290 0.65672 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.4457 0.20114 0.000 0.620 0.368 0.000 0.012
#> SRR1699969 5 0.5968 0.51073 0.036 0.144 0.156 0.000 0.664
#> SRR1699971 3 0.6629 0.48664 0.004 0.224 0.484 0.000 0.288
#> SRR1699970 2 0.2929 0.58561 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1699972 2 0.6000 0.13338 0.000 0.540 0.328 0.000 0.132
#> SRR1699973 5 0.1502 0.57707 0.000 0.004 0.056 0.000 0.940
#> SRR1699974 1 0.5021 0.35202 0.588 0.380 0.008 0.000 0.024
#> SRR1699975 2 0.4151 0.36651 0.000 0.652 0.004 0.000 0.344
#> SRR1699976 5 0.4559 0.57726 0.000 0.152 0.100 0.000 0.748
#> SRR1699977 3 0.5232 0.10928 0.008 0.028 0.492 0.000 0.472
#> SRR1699978 1 0.3525 0.40446 0.856 0.048 0.036 0.000 0.060
#> SRR1699979 5 0.6373 0.40779 0.012 0.212 0.204 0.000 0.572
#> SRR1699980 5 0.6646 -0.08059 0.000 0.324 0.240 0.000 0.436
#> SRR1699981 5 0.1908 0.56734 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1699982 5 0.5394 0.43542 0.008 0.328 0.056 0.000 0.608
#> SRR1699983 5 0.4019 0.57948 0.004 0.152 0.052 0.000 0.792
#> SRR1699984 4 0.0290 0.77829 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1699985 2 0.5014 0.00722 0.000 0.536 0.032 0.000 0.432
#> SRR1699986 2 0.5789 0.38541 0.276 0.620 0.088 0.000 0.016
#> SRR1699988 2 0.0912 0.66219 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1699987 5 0.3142 0.59887 0.004 0.108 0.032 0.000 0.856
#> SRR1699989 3 0.5815 0.41995 0.000 0.396 0.508 0.000 0.096
#> SRR1699990 2 0.4101 0.31043 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1699992 2 0.4479 0.50571 0.004 0.704 0.264 0.000 0.028
#> SRR1699991 3 0.5862 0.12962 0.360 0.024 0.560 0.000 0.056
#> SRR1699993 5 0.4989 0.56238 0.140 0.064 0.044 0.000 0.752
#> SRR1699994 2 0.4793 0.44417 0.056 0.684 0.260 0.000 0.000
#> SRR1699995 1 0.3039 0.24267 0.836 0.000 0.012 0.152 0.000
#> SRR1699996 2 0.4537 0.29464 0.012 0.592 0.396 0.000 0.000
#> SRR1699997 5 0.1965 0.59831 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1699998 2 0.4914 0.39262 0.000 0.676 0.260 0.000 0.064
#> SRR1699999 1 0.3359 0.30909 0.844 0.000 0.000 0.072 0.084
#> SRR1700000 5 0.7704 0.09104 0.192 0.340 0.072 0.000 0.396
#> SRR1700002 2 0.4075 0.60706 0.004 0.800 0.096 0.000 0.100
#> SRR1700001 2 0.3463 0.62770 0.124 0.836 0.032 0.000 0.008
#> SRR1700003 2 0.6719 0.10028 0.044 0.484 0.376 0.000 0.096
#> SRR1700004 5 0.3967 0.59316 0.008 0.124 0.060 0.000 0.808
#> SRR1700005 4 0.4367 0.60151 0.416 0.000 0.000 0.580 0.004
#> SRR1700006 2 0.0609 0.65891 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700007 5 0.1197 0.57143 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700008 5 0.6181 0.50407 0.076 0.200 0.076 0.000 0.648
#> SRR1700009 1 0.4288 -0.22704 0.612 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR1700010 5 0.7713 -0.05419 0.072 0.248 0.244 0.000 0.436
#> SRR1700011 2 0.6534 -0.24151 0.000 0.416 0.196 0.000 0.388
#> SRR1700013 2 0.5730 -0.00286 0.004 0.528 0.392 0.000 0.076
#> SRR1700012 3 0.7069 0.38904 0.124 0.076 0.540 0.000 0.260
#> SRR1700014 3 0.4770 0.40479 0.024 0.028 0.716 0.000 0.232
#> SRR1700015 3 0.5940 0.45448 0.004 0.364 0.532 0.000 0.100
#> SRR1700016 1 0.3196 0.20917 0.804 0.000 0.004 0.192 0.000
#> SRR1700018 3 0.4227 0.31261 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1700017 3 0.6622 0.39586 0.004 0.252 0.492 0.000 0.252
#> SRR1700019 5 0.6765 -0.22060 0.000 0.304 0.296 0.000 0.400
#> SRR1700020 5 0.6590 0.12455 0.288 0.000 0.248 0.000 0.464
#> SRR1700021 5 0.6417 0.35232 0.008 0.216 0.224 0.000 0.552
#> SRR1700023 5 0.4782 0.51987 0.016 0.048 0.208 0.000 0.728
#> SRR1700022 5 0.4275 0.54653 0.024 0.008 0.228 0.000 0.740
#> SRR1700024 3 0.6937 0.48053 0.008 0.268 0.424 0.000 0.300
#> SRR1700025 2 0.5778 -0.08248 0.088 0.464 0.448 0.000 0.000
#> SRR1700026 2 0.6021 0.35173 0.020 0.608 0.268 0.000 0.104
#> SRR1700027 3 0.6285 0.45305 0.004 0.176 0.548 0.000 0.272
#> SRR1700028 5 0.3809 0.43153 0.000 0.008 0.256 0.000 0.736
#> SRR1700029 3 0.5764 -0.06868 0.036 0.028 0.504 0.000 0.432
#> SRR1700030 5 0.5182 0.59627 0.088 0.120 0.048 0.000 0.744
#> SRR1700031 3 0.6342 0.17713 0.336 0.076 0.548 0.000 0.040
#> SRR1700032 3 0.6649 0.38161 0.000 0.268 0.448 0.000 0.284
#> SRR1700034 1 0.3551 0.16945 0.772 0.000 0.000 0.220 0.008
#> SRR1700035 5 0.5080 0.42509 0.056 0.000 0.316 0.000 0.628
#> SRR1700033 1 0.6030 0.37187 0.680 0.084 0.140 0.000 0.096
#> SRR1700036 3 0.5260 0.38795 0.000 0.064 0.604 0.000 0.332
#> SRR1700037 5 0.3706 0.60825 0.020 0.076 0.064 0.000 0.840
#> SRR1700038 2 0.3734 0.55735 0.004 0.752 0.240 0.000 0.004
#> SRR1700039 5 0.6262 0.09911 0.072 0.436 0.028 0.000 0.464
#> SRR1700040 1 0.8327 0.04066 0.344 0.304 0.168 0.000 0.184
#> SRR1700041 5 0.7258 -0.07306 0.024 0.332 0.248 0.000 0.396
#> SRR1700042 1 0.6177 0.23776 0.532 0.000 0.304 0.000 0.164
#> SRR1700043 1 0.6824 0.38555 0.524 0.204 0.024 0.000 0.248
#> SRR1700045 2 0.5299 0.49579 0.120 0.668 0.212 0.000 0.000
#> SRR1700044 2 0.1808 0.65972 0.040 0.936 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700046 2 0.5860 0.33768 0.020 0.580 0.332 0.000 0.068
#> SRR1700047 5 0.1893 0.59286 0.000 0.048 0.024 0.000 0.928
#> SRR1700048 2 0.5956 0.48604 0.144 0.684 0.100 0.000 0.072
#> SRR1700049 1 0.7680 0.23062 0.452 0.000 0.088 0.176 0.284
#> SRR1700050 5 0.6618 0.41181 0.292 0.056 0.092 0.000 0.560
#> SRR1700051 1 0.3437 0.32339 0.832 0.000 0.048 0.000 0.120
#> SRR1700052 1 0.7953 0.13668 0.420 0.120 0.172 0.000 0.288
#> SRR1700053 2 0.6347 0.10715 0.048 0.496 0.400 0.000 0.056
#> SRR1700054 2 0.5893 0.14771 0.372 0.548 0.056 0.000 0.024
#> SRR1700055 4 0.5057 0.67506 0.356 0.000 0.036 0.604 0.004
#> SRR1700056 3 0.6655 0.13913 0.300 0.012 0.504 0.000 0.184
#> SRR1700057 5 0.2006 0.58414 0.012 0.000 0.072 0.000 0.916
#> SRR1700058 2 0.4744 0.46838 0.252 0.692 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700059 5 0.3201 0.57780 0.052 0.000 0.096 0.000 0.852
#> SRR1700060 1 0.8288 0.05522 0.376 0.236 0.148 0.000 0.240
#> SRR1700061 2 0.1211 0.66457 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1700062 5 0.4375 0.53835 0.004 0.072 0.156 0.000 0.768
#> SRR1700063 2 0.7299 -0.24714 0.096 0.432 0.380 0.000 0.092
#> SRR1700064 3 0.6800 0.52212 0.072 0.308 0.536 0.000 0.084
#> SRR1700065 2 0.7902 -0.04676 0.236 0.400 0.084 0.000 0.280
#> SRR1700066 1 0.4705 0.44676 0.744 0.172 0.008 0.000 0.076
#> SRR1700067 2 0.7437 0.14681 0.088 0.508 0.240 0.000 0.164
#> SRR1700068 2 0.3270 0.63821 0.004 0.852 0.044 0.000 0.100
#> SRR1700069 5 0.4826 0.57712 0.024 0.176 0.056 0.000 0.744
#> SRR1700070 2 0.1638 0.65904 0.000 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1700071 2 0.4262 0.55672 0.100 0.776 0.124 0.000 0.000
#> SRR1700072 2 0.7131 0.13002 0.232 0.484 0.032 0.000 0.252
#> SRR1700073 5 0.5089 0.59509 0.088 0.060 0.096 0.000 0.756
#> SRR1700075 2 0.0867 0.66040 0.008 0.976 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700074 2 0.4138 0.53113 0.016 0.708 0.276 0.000 0.000
#> SRR1700076 3 0.6741 0.49285 0.084 0.292 0.552 0.000 0.072
#> SRR1700077 3 0.8000 0.39626 0.100 0.324 0.372 0.000 0.204
#> SRR1700078 5 0.1408 0.57687 0.008 0.000 0.044 0.000 0.948
#> SRR1700080 5 0.6178 0.08091 0.020 0.080 0.404 0.000 0.496
#> SRR1700079 5 0.3839 0.60242 0.088 0.056 0.024 0.000 0.832
#> SRR1700081 3 0.7824 0.27753 0.212 0.112 0.464 0.000 0.212
#> SRR1700082 3 0.5892 0.52413 0.012 0.288 0.600 0.000 0.100
#> SRR1700083 5 0.6965 0.41346 0.252 0.140 0.060 0.000 0.548
#> SRR1700084 1 0.4440 0.37264 0.776 0.016 0.060 0.000 0.148
#> SRR1700085 2 0.6787 0.06723 0.080 0.500 0.064 0.000 0.356
#> SRR1700086 5 0.5411 0.19495 0.024 0.024 0.392 0.000 0.560
#> SRR1700087 2 0.3941 0.62251 0.020 0.812 0.132 0.000 0.036
#> SRR1700088 2 0.6369 -0.02960 0.008 0.508 0.140 0.000 0.344
#> SRR1700089 3 0.7412 -0.00863 0.092 0.108 0.400 0.000 0.400
#> SRR1700091 5 0.4830 0.55140 0.004 0.120 0.140 0.000 0.736
#> SRR1700090 5 0.5266 0.55744 0.012 0.148 0.132 0.000 0.708
#> SRR1700092 2 0.6889 -0.08157 0.008 0.420 0.340 0.000 0.232
#> SRR1700094 5 0.5106 0.28280 0.004 0.036 0.372 0.000 0.588
#> SRR1700093 3 0.6094 0.28217 0.020 0.412 0.496 0.000 0.072
#> SRR1700095 5 0.0404 0.57897 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1700096 5 0.6266 0.35117 0.008 0.276 0.156 0.000 0.560
#> SRR1700097 2 0.8451 -0.17061 0.208 0.328 0.184 0.000 0.280
#> SRR1700098 5 0.5830 0.05256 0.008 0.072 0.416 0.000 0.504
#> SRR1700099 3 0.6562 0.44792 0.004 0.376 0.444 0.000 0.176
#> SRR1700100 3 0.5432 0.43682 0.004 0.376 0.564 0.000 0.056
#> SRR1700101 2 0.5024 0.53629 0.012 0.712 0.204 0.000 0.072
#> SRR1700102 3 0.6323 0.37586 0.072 0.056 0.592 0.000 0.280
#> SRR1700104 5 0.4381 0.58336 0.008 0.124 0.088 0.000 0.780
#> SRR1700103 5 0.6239 0.53880 0.076 0.072 0.216 0.000 0.636
#> SRR1700105 5 0.2661 0.60010 0.008 0.052 0.044 0.000 0.896
#> SRR1700106 5 0.0290 0.57561 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700107 5 0.5803 0.41210 0.008 0.112 0.264 0.000 0.616
#> SRR1700108 5 0.7577 0.33023 0.080 0.204 0.236 0.000 0.480
#> SRR1700109 5 0.7127 0.03960 0.012 0.316 0.304 0.000 0.368
#> SRR1700110 3 0.5883 0.42457 0.000 0.388 0.508 0.000 0.104
#> SRR1700112 2 0.4077 0.60682 0.012 0.804 0.124 0.000 0.060
#> SRR1700111 5 0.4658 0.54265 0.044 0.008 0.228 0.000 0.720
#> SRR1700113 5 0.5731 0.46383 0.016 0.240 0.100 0.000 0.644
#> SRR1700114 3 0.6200 0.49337 0.020 0.132 0.600 0.000 0.248
#> SRR1700115 5 0.2757 0.60625 0.008 0.072 0.032 0.000 0.888
#> SRR1700116 5 0.5440 0.53446 0.080 0.024 0.208 0.000 0.688
#> SRR1700117 2 0.3244 0.64008 0.084 0.860 0.048 0.000 0.008
#> SRR1700119 5 0.6186 0.12886 0.000 0.336 0.152 0.000 0.512
#> SRR1700118 5 0.8376 0.10330 0.224 0.256 0.164 0.000 0.356
#> SRR1700120 5 0.4771 0.49997 0.008 0.060 0.208 0.000 0.724
#> SRR1700121 5 0.0727 0.58287 0.004 0.012 0.004 0.000 0.980
#> SRR1700122 5 0.5632 0.41230 0.008 0.284 0.088 0.000 0.620
#> SRR1700123 5 0.4945 0.56368 0.144 0.036 0.068 0.000 0.752
#> SRR1700125 5 0.3339 0.60469 0.008 0.068 0.068 0.000 0.856
#> SRR1700126 1 0.6977 0.38630 0.592 0.152 0.128 0.000 0.128
#> SRR1700127 3 0.7278 0.34801 0.160 0.072 0.516 0.000 0.252
#> SRR1700124 3 0.6676 0.29907 0.036 0.340 0.512 0.000 0.112
#> SRR1700128 5 0.5911 0.52198 0.100 0.044 0.188 0.000 0.668
#> SRR1700129 2 0.6411 0.21001 0.028 0.552 0.108 0.000 0.312
#> SRR1700130 5 0.6686 0.44483 0.040 0.164 0.220 0.000 0.576
#> SRR1700132 5 0.7056 0.40235 0.088 0.164 0.176 0.000 0.572
#> SRR1700131 5 0.3678 0.56447 0.168 0.008 0.020 0.000 0.804
#> SRR1700133 5 0.3506 0.58936 0.044 0.000 0.132 0.000 0.824
#> SRR1700134 5 0.4457 0.36446 0.000 0.368 0.012 0.000 0.620
#> SRR1700135 3 0.6052 0.27640 0.052 0.036 0.540 0.000 0.372
#> SRR1700136 5 0.1808 0.58919 0.040 0.020 0.004 0.000 0.936
#> SRR1700137 5 0.1282 0.57653 0.000 0.004 0.044 0.000 0.952
#> SRR1700138 5 0.5042 0.58635 0.044 0.172 0.048 0.000 0.736
#> SRR1700140 5 0.6771 -0.25847 0.000 0.324 0.284 0.000 0.392
#> SRR1700139 5 0.7464 0.08069 0.036 0.276 0.292 0.000 0.396
#> SRR1700141 5 0.4106 0.56013 0.008 0.028 0.196 0.000 0.768
#> SRR1700142 3 0.8166 0.11883 0.188 0.140 0.388 0.000 0.284
#> SRR1700143 1 0.5216 0.19307 0.520 0.000 0.436 0.000 0.044
#> SRR1700144 2 0.4771 0.57483 0.028 0.752 0.168 0.000 0.052
#> SRR1700145 5 0.4287 0.58928 0.072 0.096 0.028 0.000 0.804
#> SRR1700146 5 0.0324 0.57673 0.000 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1700147 5 0.5363 0.33058 0.012 0.388 0.036 0.000 0.564
#> SRR1700149 1 0.7821 0.28900 0.432 0.304 0.140 0.000 0.124
#> SRR1700148 3 0.7971 0.42335 0.144 0.308 0.408 0.000 0.140
#> SRR1700150 2 0.4256 0.59634 0.044 0.760 0.192 0.000 0.004
#> SRR1700152 5 0.4851 0.60127 0.040 0.088 0.104 0.000 0.768
#> SRR1700151 5 0.1251 0.58388 0.000 0.036 0.008 0.000 0.956
#> SRR1700153 5 0.5864 0.46710 0.040 0.272 0.060 0.000 0.628
#> SRR1700154 2 0.4142 0.59398 0.108 0.812 0.044 0.000 0.036
#> SRR1700155 2 0.2316 0.65762 0.012 0.916 0.036 0.000 0.036
#> SRR1700156 5 0.6669 0.47522 0.108 0.072 0.224 0.000 0.596
#> SRR1700158 5 0.6358 0.34373 0.040 0.300 0.088 0.000 0.572
#> SRR1700159 2 0.5770 0.12805 0.040 0.540 0.028 0.000 0.392
#> SRR1700157 2 0.7285 0.00198 0.064 0.456 0.136 0.000 0.344
#> SRR1700160 5 0.5320 0.52899 0.016 0.068 0.240 0.000 0.676
#> SRR1700161 5 0.4062 0.58355 0.040 0.020 0.136 0.000 0.804
#> SRR1700162 5 0.5365 0.41884 0.000 0.284 0.088 0.000 0.628
#> SRR1700164 5 0.7540 0.33462 0.216 0.156 0.116 0.000 0.512
#> SRR1700163 1 0.5876 0.21505 0.496 0.432 0.048 0.000 0.024
#> SRR1700165 2 0.5103 0.51446 0.016 0.688 0.244 0.000 0.052
#> SRR1700166 5 0.2876 0.60298 0.016 0.052 0.044 0.000 0.888
#> SRR1700168 5 0.6957 0.12055 0.012 0.344 0.224 0.000 0.420
#> SRR1700167 5 0.7733 0.16364 0.268 0.096 0.180 0.000 0.456
#> SRR1700170 3 0.6178 0.47134 0.096 0.196 0.648 0.000 0.060
#> SRR1700169 2 0.5294 0.19017 0.008 0.596 0.352 0.000 0.044
#> SRR1700171 5 0.2813 0.58348 0.084 0.000 0.040 0.000 0.876
#> SRR1700172 5 0.6396 0.09137 0.000 0.188 0.324 0.000 0.488
#> SRR1700174 2 0.7313 0.10246 0.128 0.476 0.076 0.000 0.320
#> SRR1700173 5 0.4072 0.55979 0.108 0.000 0.100 0.000 0.792
#> SRR1700175 2 0.5702 0.50564 0.144 0.704 0.080 0.000 0.072
#> SRR1700176 5 0.6037 0.34887 0.232 0.012 0.144 0.000 0.612
#> SRR1700178 3 0.5510 0.42787 0.000 0.380 0.548 0.000 0.072
#> SRR1700177 5 0.2286 0.60300 0.004 0.108 0.000 0.000 0.888
#> SRR1700180 3 0.5447 0.37113 0.000 0.400 0.536 0.000 0.064
#> SRR1700179 2 0.2280 0.65650 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.1493 0.66420 0.000 0.948 0.028 0.000 0.024
#> SRR1700183 4 0.3636 0.74946 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1700182 2 0.0510 0.65958 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.2561 0.65117 0.000 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.2074 0.66062 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.2848 0.24272 0.840 0.000 0.000 0.156 0.004
#> SRR1700185 1 0.3353 0.20371 0.796 0.000 0.000 0.196 0.008
#> SRR1700188 2 0.2074 0.65622 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1700192 2 0.3961 0.58082 0.028 0.760 0.212 0.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.6658 -0.10133 0.436 0.148 0.404 0.008 0.004
#> SRR1700191 4 0.4045 0.68928 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1700189 1 0.2179 0.41934 0.896 0.100 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.5827 0.25493 0.000 0.596 0.144 0.000 0.260
#> SRR1700195 2 0.2020 0.65732 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.4397 -0.33645 0.564 0.004 0.000 0.432 0.000
#> SRR1700196 2 0.0880 0.65878 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.3685 0.30300 0.832 0.024 0.012 0.124 0.008
#> SRR1700198 2 0.2127 0.64924 0.000 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.2338 0.65590 0.000 0.884 0.112 0.000 0.004
#> SRR1700200 2 0.0671 0.65959 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700201 2 0.3039 0.60455 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.0794 0.66112 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700203 2 0.1341 0.66404 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0162 0.65650 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.6527 -0.30564 0.000 0.428 0.376 0.000 0.196
#> SRR1700207 2 0.1043 0.65843 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.6713 0.38835 0.192 0.604 0.128 0.000 0.076
#> SRR1700205 2 0.4734 0.35622 0.000 0.652 0.036 0.000 0.312
#> SRR1700209 2 0.1270 0.65864 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.65501 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0162 0.65509 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.2280 0.65238 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.3055 0.64651 0.000 0.840 0.144 0.000 0.016
#> SRR1700214 2 0.0703 0.65862 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700215 4 0.3039 0.77563 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1700217 2 0.1800 0.66630 0.000 0.932 0.048 0.000 0.020
#> SRR1700216 4 0.0162 0.77741 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1700218 2 0.4244 0.60700 0.028 0.780 0.168 0.000 0.024
#> SRR1700219 2 0.0162 0.65509 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.2956 0.32330 0.884 0.016 0.008 0.076 0.016
#> SRR1700220 2 0.0000 0.65501 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.65501 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0510 0.65925 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0290 0.65669 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.2471 0.64367 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.4404 0.56554 0.000 0.760 0.088 0.000 0.152
#> SRR1700225 2 0.0290 0.65708 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.4150 0.28156 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700230 2 0.4199 0.57507 0.180 0.772 0.008 0.000 0.040
#> SRR1700231 5 0.5393 0.17279 0.000 0.440 0.056 0.000 0.504
#> SRR1700228 2 0.0703 0.66145 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.4054 0.61283 0.000 0.788 0.140 0.000 0.072
#> SRR1700233 2 0.1197 0.66003 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700234 2 0.0579 0.65983 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700235 2 0.0404 0.65717 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.1661 0.66736 0.000 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR1700236 2 0.0290 0.65664 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.1341 0.66424 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.3715 0.40551 0.736 0.260 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.4025 0.01687 0.700 0.000 0.000 0.292 0.008
#> SRR1700241 2 0.1012 0.66290 0.020 0.968 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.2230 0.65483 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.4063 0.46824 0.000 0.708 0.280 0.000 0.012
#> SRR1700242 2 0.2574 0.64148 0.112 0.876 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.2773 0.41822 0.836 0.164 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.3932 0.40224 0.000 0.672 0.328 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.3882 0.39009 0.840 0.052 0.004 0.036 0.068
#> SRR1700249 1 0.4436 -0.25679 0.596 0.000 0.000 0.396 0.008
#> SRR1700250 2 0.1043 0.66245 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.4617 0.49596 0.000 0.716 0.060 0.000 0.224
#> SRR1700251 3 0.5491 0.02624 0.004 0.452 0.492 0.000 0.052
#> SRR1700252 2 0.5901 0.30530 0.000 0.584 0.148 0.000 0.268
#> SRR1700253 2 0.3039 0.62017 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.2329 0.63942 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.3203 0.42686 0.820 0.168 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700255 2 0.0162 0.65615 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0404 0.65939 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.3336 0.53490 0.000 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR1700259 5 0.6381 0.13753 0.000 0.212 0.276 0.000 0.512
#> SRR1700260 5 0.4028 0.51574 0.000 0.040 0.192 0.000 0.768
#> SRR1700261 2 0.2773 0.59891 0.000 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR1700262 5 0.3796 0.36197 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1700263 2 0.5392 0.44350 0.000 0.664 0.192 0.000 0.144
#> SRR1700264 2 0.3975 0.59621 0.000 0.792 0.064 0.000 0.144
#> SRR1700265 2 0.5446 0.39957 0.008 0.632 0.288 0.000 0.072
#> SRR1700266 3 0.6272 0.49788 0.000 0.348 0.492 0.000 0.160
#> SRR1700268 5 0.5502 0.42523 0.000 0.192 0.156 0.000 0.652
#> SRR1700270 3 0.5352 0.38676 0.000 0.408 0.536 0.000 0.056
#> SRR1700267 2 0.0771 0.66081 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700271 3 0.5591 0.34211 0.000 0.076 0.528 0.000 0.396
#> SRR1700272 5 0.5670 -0.01540 0.000 0.084 0.388 0.000 0.528
#> SRR1700273 2 0.0955 0.66256 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1700274 5 0.6133 0.23414 0.000 0.328 0.148 0.000 0.524
#> SRR1700277 3 0.5768 0.29565 0.088 0.428 0.484 0.000 0.000
#> SRR1700275 5 0.4035 0.54773 0.000 0.060 0.156 0.000 0.784
#> SRR1700276 3 0.6957 0.41632 0.068 0.112 0.536 0.000 0.284
#> SRR1700278 2 0.0609 0.66058 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700279 5 0.6219 -0.18209 0.000 0.140 0.420 0.000 0.440
#> SRR1700280 2 0.4054 0.50788 0.000 0.748 0.028 0.000 0.224
#> SRR1700281 2 0.4974 0.14039 0.000 0.560 0.408 0.000 0.032
#> SRR1700283 2 0.4800 0.23325 0.000 0.604 0.028 0.000 0.368
#> SRR1700282 2 0.6013 0.36334 0.016 0.632 0.176 0.000 0.176
#> SRR1700284 5 0.4365 0.50120 0.004 0.308 0.012 0.000 0.676
#> SRR1700285 3 0.6764 0.33517 0.000 0.268 0.372 0.000 0.360
#> SRR1700286 3 0.6291 0.30635 0.052 0.052 0.528 0.000 0.368
#> SRR1700287 5 0.2331 0.58104 0.000 0.020 0.080 0.000 0.900
#> SRR1700290 1 0.4360 0.34168 0.748 0.024 0.016 0.000 0.212
#> SRR1700289 5 0.6022 0.22013 0.000 0.156 0.280 0.000 0.564
#> SRR1700288 2 0.4350 0.23502 0.000 0.588 0.408 0.000 0.004
#> SRR1700292 5 0.7031 -0.07742 0.008 0.316 0.300 0.000 0.376
#> SRR1700291 5 0.2300 0.59171 0.000 0.040 0.052 0.000 0.908
#> SRR1700293 2 0.0290 0.65624 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700294 2 0.5198 0.48277 0.048 0.708 0.036 0.000 0.208
#> SRR1700295 2 0.2217 0.66352 0.024 0.920 0.012 0.000 0.044
#> SRR1700297 3 0.5272 0.38864 0.000 0.396 0.552 0.000 0.052
#> SRR1700296 5 0.4383 0.32709 0.000 0.424 0.004 0.000 0.572
#> SRR1700298 2 0.2629 0.64326 0.000 0.860 0.136 0.000 0.004
#> SRR1700299 3 0.5895 0.22330 0.000 0.100 0.456 0.000 0.444
#> SRR1700300 2 0.3634 0.64279 0.012 0.840 0.076 0.000 0.072
#> SRR1700302 5 0.5648 0.54899 0.036 0.212 0.076 0.000 0.676
#> SRR1700301 2 0.5080 0.29940 0.000 0.628 0.056 0.000 0.316
#> SRR1700303 5 0.5383 0.31452 0.020 0.420 0.024 0.000 0.536
#> SRR1700304 2 0.5314 0.49530 0.060 0.700 0.032 0.000 0.208
#> SRR1700305 2 0.0162 0.65562 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700306 5 0.6629 0.45789 0.136 0.252 0.040 0.000 0.572
#> SRR1700308 2 0.3796 0.41990 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1700307 2 0.7260 0.10286 0.280 0.460 0.036 0.000 0.224
#> SRR1700309 5 0.4700 0.24760 0.004 0.472 0.008 0.000 0.516
#> SRR1700310 2 0.3876 0.37103 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1700311 5 0.2615 0.60379 0.008 0.080 0.020 0.000 0.892
#> SRR1700312 2 0.3929 0.53585 0.000 0.764 0.028 0.000 0.208
#> SRR1700313 2 0.6100 0.45751 0.060 0.656 0.092 0.000 0.192
#> SRR1700314 3 0.6536 0.23412 0.060 0.060 0.500 0.000 0.380
#> SRR1700315 5 0.3589 0.60317 0.040 0.132 0.004 0.000 0.824
#> SRR1700316 3 0.6822 0.39941 0.000 0.332 0.348 0.000 0.320
#> SRR1700317 2 0.3333 0.58516 0.000 0.788 0.208 0.000 0.004
#> SRR1700318 5 0.3720 0.57038 0.000 0.228 0.012 0.000 0.760
#> SRR1700319 5 0.6463 0.45850 0.072 0.080 0.244 0.000 0.604
#> SRR1700320 5 0.5796 0.56266 0.144 0.112 0.052 0.000 0.692
#> SRR1700322 2 0.4240 0.55281 0.000 0.736 0.228 0.000 0.036
#> SRR1700321 2 0.1270 0.65914 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700323 5 0.1430 0.58715 0.000 0.052 0.004 0.000 0.944
#> SRR1700324 2 0.2011 0.65173 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088
#> SRR1700325 2 0.6697 -0.30348 0.000 0.404 0.244 0.000 0.352
#> SRR1700326 1 0.7330 0.17342 0.492 0.148 0.288 0.000 0.072
#> SRR1700327 2 0.0992 0.66269 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1700329 5 0.5386 0.30116 0.000 0.396 0.060 0.000 0.544
#> SRR1700328 3 0.6260 0.02133 0.072 0.028 0.468 0.000 0.432
#> SRR1700330 5 0.4607 0.39900 0.008 0.364 0.008 0.000 0.620
#> SRR1700331 5 0.4433 0.50615 0.008 0.280 0.016 0.000 0.696
#> SRR1700332 5 0.4310 0.38681 0.000 0.392 0.004 0.000 0.604
#> SRR1700333 2 0.3292 0.64484 0.008 0.836 0.140 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 5 0.5529 0.5380 0.000 0.284 0.000 0.152 0.560 0.004
#> SRR1699875 4 0.5123 0.1308 0.000 0.408 0.000 0.508 0.084 0.000
#> SRR1699876 4 0.5309 -0.0989 0.000 0.104 0.000 0.488 0.408 0.000
#> SRR1699877 2 0.3087 0.5782 0.000 0.808 0.000 0.176 0.004 0.012
#> SRR1699879 4 0.5425 0.3864 0.000 0.232 0.000 0.604 0.156 0.008
#> SRR1699878 2 0.3769 0.2622 0.000 0.640 0.000 0.004 0.356 0.000
#> SRR1699880 2 0.4591 -0.1565 0.000 0.500 0.000 0.036 0.464 0.000
#> SRR1699881 5 0.5815 0.5349 0.000 0.308 0.004 0.148 0.532 0.008
#> SRR1699882 5 0.5279 0.5747 0.000 0.244 0.000 0.160 0.596 0.000
#> SRR1699883 2 0.4831 0.4419 0.000 0.676 0.000 0.076 0.232 0.016
#> SRR1699884 2 0.3695 0.2488 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1699885 2 0.2362 0.6265 0.000 0.860 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR1699886 2 0.1462 0.6553 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056 0.000
#> SRR1699888 5 0.4829 0.1943 0.000 0.436 0.012 0.004 0.524 0.024
#> SRR1699889 4 0.2263 0.5934 0.000 0.056 0.000 0.896 0.048 0.000
#> SRR1699890 2 0.5297 0.0950 0.000 0.536 0.000 0.364 0.096 0.004
#> SRR1699887 2 0.2912 0.6357 0.000 0.852 0.000 0.072 0.076 0.000
#> SRR1699891 4 0.3636 0.4310 0.000 0.320 0.000 0.676 0.004 0.000
#> SRR1699892 2 0.3419 0.5855 0.000 0.792 0.000 0.180 0.016 0.012
#> SRR1699893 5 0.7011 0.5048 0.000 0.184 0.048 0.212 0.516 0.040
#> SRR1699894 2 0.2917 0.6204 0.000 0.840 0.008 0.136 0.016 0.000
#> SRR1699895 5 0.6692 0.4546 0.000 0.316 0.048 0.148 0.476 0.012
#> SRR1699896 5 0.4604 0.5026 0.000 0.300 0.000 0.064 0.636 0.000
#> SRR1699897 2 0.5802 0.3183 0.000 0.564 0.064 0.008 0.320 0.044
#> SRR1699898 4 0.6876 0.3850 0.000 0.044 0.212 0.556 0.116 0.072
#> SRR1699900 2 0.4991 0.4520 0.000 0.660 0.036 0.032 0.264 0.008
#> SRR1699899 4 0.4570 0.4858 0.000 0.004 0.016 0.664 0.288 0.028
#> SRR1699902 2 0.5462 0.2565 0.000 0.552 0.332 0.004 0.108 0.004
#> SRR1699901 3 0.3752 0.3620 0.000 0.036 0.760 0.200 0.004 0.000
#> SRR1699903 4 0.5073 0.5394 0.000 0.180 0.024 0.700 0.084 0.012
#> SRR1699904 2 0.4982 0.5233 0.000 0.728 0.112 0.008 0.108 0.044
#> SRR1699905 4 0.5923 0.5379 0.000 0.108 0.148 0.660 0.052 0.032
#> SRR1699906 5 0.5153 0.2177 0.000 0.456 0.000 0.084 0.460 0.000
#> SRR1699907 5 0.5898 0.3010 0.000 0.176 0.004 0.380 0.440 0.000
#> SRR1699908 2 0.1245 0.6578 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032 0.000
#> SRR1699909 4 0.2989 0.5693 0.000 0.176 0.000 0.812 0.008 0.004
#> SRR1699910 4 0.5682 0.5553 0.000 0.096 0.116 0.692 0.060 0.036
#> SRR1699911 4 0.3577 0.5946 0.000 0.064 0.048 0.840 0.036 0.012
#> SRR1699912 4 0.5466 0.4109 0.000 0.276 0.028 0.604 0.092 0.000
#> SRR1699913 2 0.3802 0.5901 0.000 0.812 0.036 0.116 0.024 0.012
#> SRR1699914 4 0.4372 0.5953 0.000 0.104 0.060 0.784 0.032 0.020
#> SRR1699915 4 0.4309 0.5923 0.000 0.052 0.032 0.800 0.052 0.064
#> SRR1699916 2 0.4485 0.5643 0.000 0.724 0.012 0.052 0.204 0.008
#> SRR1699917 4 0.5915 0.2364 0.000 0.444 0.056 0.452 0.024 0.024
#> SRR1699918 2 0.4225 0.4996 0.000 0.696 0.000 0.028 0.264 0.012
#> SRR1699919 5 0.4518 0.2598 0.000 0.000 0.036 0.348 0.612 0.004
#> SRR1699920 5 0.5525 0.1618 0.000 0.004 0.072 0.408 0.500 0.016
#> SRR1699921 4 0.4024 0.5723 0.000 0.004 0.088 0.796 0.088 0.024
#> SRR1699922 2 0.3229 0.6236 0.000 0.860 0.060 0.012 0.044 0.024
#> SRR1699923 3 0.4115 0.3812 0.000 0.268 0.696 0.032 0.004 0.000
#> SRR1699924 4 0.7569 0.2287 0.000 0.168 0.004 0.380 0.196 0.252
#> SRR1699925 1 0.0146 0.7883 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 4 0.6031 0.4554 0.000 0.240 0.056 0.608 0.076 0.020
#> SRR1699927 4 0.4791 0.2218 0.000 0.012 0.004 0.552 0.408 0.024
#> SRR1699929 5 0.6223 0.4629 0.000 0.292 0.080 0.040 0.560 0.028
#> SRR1699928 4 0.5112 0.4649 0.000 0.196 0.000 0.652 0.144 0.008
#> SRR1699930 5 0.5876 0.4723 0.000 0.348 0.004 0.120 0.512 0.016
#> SRR1699931 2 0.5922 -0.1300 0.000 0.476 0.008 0.144 0.368 0.004
#> SRR1699933 2 0.4521 0.5880 0.000 0.784 0.080 0.060 0.036 0.040
#> SRR1699932 2 0.7187 0.1764 0.000 0.504 0.104 0.120 0.240 0.032
#> SRR1699934 1 0.0146 0.7883 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.4928 0.2961 0.000 0.084 0.000 0.624 0.288 0.004
#> SRR1699936 5 0.4127 0.1691 0.000 0.484 0.000 0.004 0.508 0.004
#> SRR1699937 2 0.3446 0.3792 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1699938 2 0.3499 0.3865 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1699940 4 0.4163 0.4366 0.000 0.048 0.000 0.716 0.232 0.004
#> SRR1699939 5 0.5461 0.5559 0.000 0.228 0.000 0.200 0.572 0.000
#> SRR1699941 4 0.4458 0.5590 0.000 0.120 0.008 0.748 0.116 0.008
#> SRR1699942 5 0.7390 0.1931 0.000 0.132 0.012 0.308 0.408 0.140
#> SRR1699943 4 0.6371 -0.1981 0.000 0.320 0.000 0.388 0.280 0.012
#> SRR1699944 4 0.6247 -0.3061 0.000 0.312 0.000 0.344 0.340 0.004
#> SRR1699945 4 0.4109 0.2423 0.000 0.012 0.000 0.576 0.412 0.000
#> SRR1699946 4 0.4546 0.5027 0.000 0.204 0.000 0.692 0.104 0.000
#> SRR1699947 2 0.5921 0.1195 0.000 0.512 0.000 0.276 0.204 0.008
#> SRR1699948 2 0.3804 0.0839 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1699949 4 0.3864 -0.0622 0.000 0.000 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1699950 2 0.5995 -0.3239 0.000 0.408 0.000 0.236 0.356 0.000
#> SRR1699951 4 0.3782 0.3584 0.000 0.360 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1699952 2 0.3604 0.5556 0.000 0.760 0.000 0.012 0.216 0.012
#> SRR1699953 5 0.5692 0.5356 0.000 0.296 0.000 0.192 0.512 0.000
#> SRR1699954 4 0.2554 0.5784 0.000 0.000 0.028 0.876 0.092 0.004
#> SRR1699955 2 0.4929 -0.1077 0.000 0.508 0.000 0.064 0.428 0.000
#> SRR1699956 4 0.3466 0.5740 0.000 0.072 0.008 0.820 0.100 0.000
#> SRR1699957 2 0.3863 0.4917 0.000 0.712 0.000 0.260 0.028 0.000
#> SRR1699959 5 0.6518 0.3256 0.000 0.208 0.000 0.340 0.420 0.032
#> SRR1699958 2 0.6086 -0.1050 0.000 0.436 0.000 0.420 0.104 0.040
#> SRR1699960 4 0.4585 0.5646 0.000 0.052 0.000 0.736 0.164 0.048
#> SRR1699961 2 0.4321 0.1173 0.000 0.580 0.008 0.012 0.400 0.000
#> SRR1699962 2 0.2300 0.6117 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1699963 5 0.5260 0.3027 0.000 0.400 0.000 0.012 0.520 0.068
#> SRR1699964 2 0.3489 0.4094 0.000 0.708 0.000 0.004 0.288 0.000
#> SRR1699965 5 0.3659 0.3892 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1699966 4 0.5590 0.1809 0.000 0.328 0.000 0.512 0.160 0.000
#> SRR1699967 2 0.0260 0.6482 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699968 2 0.4004 0.2041 0.000 0.620 0.000 0.012 0.368 0.000
#> SRR1699969 4 0.5158 0.5209 0.000 0.144 0.032 0.684 0.140 0.000
#> SRR1699971 5 0.6011 0.4735 0.000 0.216 0.004 0.276 0.500 0.004
#> SRR1699970 2 0.2631 0.5778 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1699972 2 0.5781 0.1139 0.000 0.528 0.000 0.132 0.324 0.016
#> SRR1699973 4 0.1168 0.5741 0.000 0.000 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1699974 3 0.4266 0.3456 0.000 0.348 0.628 0.016 0.008 0.000
#> SRR1699975 2 0.3728 0.3756 0.000 0.652 0.000 0.344 0.004 0.000
#> SRR1699976 4 0.4231 0.5738 0.000 0.140 0.000 0.760 0.084 0.016
#> SRR1699977 5 0.5713 0.0835 0.000 0.028 0.004 0.448 0.452 0.068
#> SRR1699978 3 0.3453 0.4171 0.000 0.040 0.852 0.052 0.032 0.024
#> SRR1699979 4 0.6850 0.4108 0.000 0.172 0.000 0.512 0.144 0.172
#> SRR1699980 4 0.5942 -0.0490 0.000 0.324 0.000 0.444 0.232 0.000
#> SRR1699981 4 0.1444 0.5683 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1699982 4 0.4760 0.4163 0.000 0.328 0.000 0.604 0.068 0.000
#> SRR1699983 4 0.3309 0.5746 0.000 0.148 0.004 0.816 0.028 0.004
#> SRR1699984 1 0.0260 0.7888 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.4635 -0.0029 0.000 0.524 0.000 0.444 0.020 0.012
#> SRR1699986 2 0.5946 0.3414 0.000 0.580 0.264 0.000 0.080 0.076
#> SRR1699988 2 0.0820 0.6536 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012 0.000
#> SRR1699987 4 0.3951 0.5872 0.000 0.100 0.000 0.796 0.028 0.076
#> SRR1699989 5 0.5093 0.4127 0.000 0.388 0.000 0.084 0.528 0.000
#> SRR1699990 2 0.3706 0.3139 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1699992 2 0.5299 0.4403 0.000 0.648 0.004 0.012 0.200 0.136
#> SRR1699991 5 0.5427 0.1492 0.000 0.020 0.328 0.056 0.584 0.012
#> SRR1699993 4 0.4527 0.5625 0.000 0.064 0.144 0.752 0.036 0.004
#> SRR1699994 2 0.4414 0.4372 0.000 0.676 0.064 0.000 0.260 0.000
#> SRR1699995 3 0.2531 0.3027 0.132 0.000 0.856 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699996 2 0.5277 0.2378 0.000 0.556 0.004 0.000 0.340 0.100
#> SRR1699997 4 0.1501 0.5928 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1699998 2 0.4414 0.3944 0.000 0.676 0.000 0.064 0.260 0.000
#> SRR1699999 3 0.2384 0.3593 0.048 0.000 0.888 0.064 0.000 0.000
#> SRR1700000 4 0.6968 0.1078 0.000 0.320 0.200 0.404 0.076 0.000
#> SRR1700002 2 0.4692 0.5695 0.000 0.748 0.000 0.092 0.076 0.084
#> SRR1700001 2 0.3235 0.6157 0.000 0.824 0.136 0.008 0.032 0.000
#> SRR1700003 2 0.7095 0.0716 0.000 0.456 0.020 0.056 0.272 0.196
#> SRR1700004 4 0.3945 0.5864 0.000 0.120 0.008 0.800 0.048 0.024
#> SRR1700005 1 0.3804 0.5376 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0806 0.6515 0.000 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1700007 4 0.0632 0.5687 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700008 4 0.7093 0.4440 0.000 0.192 0.060 0.544 0.068 0.136
#> SRR1700009 3 0.3717 -0.1666 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 4 0.7534 -0.0648 0.000 0.224 0.068 0.400 0.276 0.032
#> SRR1700011 2 0.6355 -0.2128 0.000 0.412 0.000 0.384 0.176 0.028
#> SRR1700013 2 0.5988 -0.0720 0.000 0.496 0.000 0.076 0.372 0.056
#> SRR1700012 5 0.6493 0.3759 0.000 0.068 0.100 0.252 0.560 0.020
#> SRR1700014 5 0.5294 0.3846 0.000 0.016 0.008 0.204 0.660 0.112
#> SRR1700015 5 0.6350 0.4623 0.000 0.340 0.000 0.096 0.488 0.076
#> SRR1700016 3 0.2730 0.2549 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 5 0.3695 0.3759 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1700017 5 0.7358 0.3528 0.000 0.212 0.000 0.216 0.412 0.160
#> SRR1700019 4 0.6062 -0.1784 0.000 0.304 0.000 0.408 0.288 0.000
#> SRR1700020 4 0.7182 0.1015 0.000 0.000 0.148 0.404 0.140 0.308
#> SRR1700021 4 0.6075 0.3683 0.000 0.204 0.008 0.564 0.204 0.020
#> SRR1700023 4 0.4522 0.5314 0.000 0.048 0.016 0.732 0.192 0.012
#> SRR1700022 4 0.5059 0.5130 0.000 0.000 0.004 0.652 0.172 0.172
#> SRR1700024 5 0.6899 0.4654 0.000 0.268 0.000 0.276 0.400 0.056
#> SRR1700025 5 0.5616 0.1094 0.000 0.444 0.060 0.000 0.460 0.036
#> SRR1700026 2 0.6269 0.3000 0.000 0.576 0.004 0.092 0.232 0.096
#> SRR1700027 5 0.6632 0.4194 0.000 0.160 0.000 0.244 0.512 0.084
#> SRR1700028 4 0.3881 0.4397 0.000 0.004 0.000 0.720 0.252 0.024
#> SRR1700029 5 0.5757 -0.0310 0.000 0.020 0.020 0.408 0.496 0.056
#> SRR1700030 4 0.4829 0.5932 0.000 0.108 0.064 0.756 0.044 0.028
#> SRR1700031 5 0.5570 0.1713 0.000 0.052 0.324 0.032 0.580 0.012
#> SRR1700032 5 0.6505 0.4136 0.000 0.264 0.000 0.248 0.456 0.032
#> SRR1700034 3 0.3432 0.2035 0.216 0.000 0.764 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700035 4 0.4649 0.4408 0.000 0.000 0.040 0.636 0.312 0.012
#> SRR1700033 3 0.6727 0.3314 0.000 0.064 0.592 0.064 0.108 0.172
#> SRR1700036 5 0.4507 0.4041 0.000 0.052 0.000 0.284 0.660 0.004
#> SRR1700037 4 0.3118 0.6001 0.000 0.064 0.012 0.860 0.056 0.008
#> SRR1700038 2 0.3448 0.5080 0.000 0.716 0.004 0.000 0.280 0.000
#> SRR1700039 4 0.5836 0.1157 0.000 0.416 0.088 0.468 0.024 0.004
#> SRR1700040 3 0.8443 0.1565 0.000 0.248 0.356 0.152 0.128 0.116
#> SRR1700041 4 0.6784 -0.0493 0.000 0.328 0.024 0.400 0.236 0.012
#> SRR1700042 3 0.6281 0.2628 0.000 0.000 0.508 0.148 0.300 0.044
#> SRR1700043 3 0.6235 0.3716 0.000 0.188 0.528 0.256 0.020 0.008
#> SRR1700045 2 0.5389 0.4925 0.000 0.660 0.084 0.000 0.200 0.056
#> SRR1700044 2 0.1624 0.6525 0.000 0.936 0.040 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700046 2 0.6175 0.2836 0.000 0.544 0.012 0.064 0.312 0.068
#> SRR1700047 4 0.1225 0.5846 0.000 0.036 0.000 0.952 0.012 0.000
#> SRR1700048 2 0.6346 0.4541 0.000 0.644 0.108 0.060 0.096 0.092
#> SRR1700049 3 0.7642 0.1855 0.172 0.000 0.404 0.280 0.120 0.024
#> SRR1700050 4 0.7451 0.3652 0.000 0.056 0.252 0.480 0.092 0.120
#> SRR1700051 3 0.3781 0.3428 0.000 0.000 0.804 0.120 0.044 0.032
#> SRR1700052 3 0.8383 0.1567 0.000 0.116 0.368 0.248 0.140 0.128
#> SRR1700053 2 0.6250 0.0971 0.000 0.488 0.036 0.052 0.384 0.040
#> SRR1700054 2 0.6157 0.0323 0.000 0.484 0.372 0.008 0.032 0.104
#> SRR1700055 1 0.5391 0.6675 0.456 0.000 0.112 0.000 0.000 0.432
#> SRR1700056 5 0.7577 0.0460 0.000 0.012 0.244 0.140 0.408 0.196
#> SRR1700057 4 0.2259 0.5816 0.000 0.000 0.008 0.904 0.044 0.044
#> SRR1700058 2 0.4699 0.4671 0.000 0.684 0.240 0.000 0.056 0.020
#> SRR1700059 4 0.4653 0.5479 0.000 0.000 0.036 0.732 0.076 0.156
#> SRR1700060 3 0.8038 0.0341 0.000 0.228 0.348 0.256 0.132 0.036
#> SRR1700061 2 0.1448 0.6576 0.000 0.948 0.000 0.024 0.012 0.016
#> SRR1700062 4 0.4149 0.5497 0.000 0.068 0.000 0.772 0.136 0.024
#> SRR1700063 2 0.6988 -0.2590 0.000 0.416 0.076 0.088 0.388 0.032
#> SRR1700064 5 0.6209 0.5078 0.000 0.304 0.056 0.068 0.552 0.020
#> SRR1700065 2 0.8122 -0.0674 0.000 0.380 0.196 0.252 0.076 0.096
#> SRR1700066 3 0.4178 0.4470 0.000 0.156 0.760 0.072 0.008 0.004
#> SRR1700067 2 0.7381 0.1526 0.000 0.500 0.068 0.140 0.224 0.068
#> SRR1700068 2 0.3091 0.6353 0.000 0.852 0.000 0.092 0.036 0.020
#> SRR1700069 4 0.4417 0.5761 0.000 0.160 0.036 0.748 0.056 0.000
#> SRR1700070 2 0.1471 0.6519 0.000 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700071 2 0.4478 0.5551 0.000 0.764 0.064 0.000 0.076 0.096
#> SRR1700072 2 0.6659 0.1381 0.000 0.480 0.228 0.252 0.020 0.020
#> SRR1700073 4 0.4828 0.5937 0.000 0.060 0.052 0.764 0.084 0.040
#> SRR1700075 2 0.1026 0.6541 0.000 0.968 0.008 0.004 0.008 0.012
#> SRR1700074 2 0.4304 0.5191 0.000 0.704 0.020 0.000 0.248 0.028
#> SRR1700076 5 0.6151 0.5121 0.000 0.264 0.060 0.072 0.584 0.020
#> SRR1700077 5 0.7487 0.4022 0.000 0.312 0.100 0.188 0.384 0.016
#> SRR1700078 4 0.1036 0.5722 0.000 0.000 0.008 0.964 0.024 0.004
#> SRR1700080 4 0.5438 0.0657 0.000 0.068 0.008 0.480 0.436 0.008
#> SRR1700079 4 0.3583 0.5988 0.000 0.052 0.076 0.836 0.012 0.024
#> SRR1700081 5 0.8532 0.2038 0.000 0.100 0.164 0.176 0.348 0.212
#> SRR1700082 5 0.6260 0.5073 0.000 0.284 0.008 0.084 0.552 0.072
#> SRR1700083 4 0.6699 0.4096 0.000 0.132 0.236 0.544 0.068 0.020
#> SRR1700084 3 0.3744 0.3985 0.000 0.012 0.804 0.124 0.056 0.004
#> SRR1700085 2 0.6399 0.0659 0.000 0.492 0.052 0.364 0.064 0.028
#> SRR1700086 4 0.4891 0.1590 0.000 0.024 0.016 0.536 0.420 0.004
#> SRR1700087 2 0.4609 0.5719 0.000 0.752 0.012 0.020 0.100 0.116
#> SRR1700088 2 0.6345 -0.0180 0.000 0.496 0.000 0.316 0.136 0.052
#> SRR1700089 5 0.7909 -0.0298 0.000 0.104 0.060 0.332 0.360 0.144
#> SRR1700091 4 0.5499 0.5321 0.000 0.100 0.000 0.676 0.112 0.112
#> SRR1700090 4 0.5584 0.5554 0.000 0.132 0.008 0.680 0.100 0.080
#> SRR1700092 2 0.7545 -0.1835 0.000 0.340 0.000 0.176 0.284 0.200
#> SRR1700094 4 0.5216 0.2898 0.000 0.032 0.000 0.572 0.352 0.044
#> SRR1700093 5 0.6778 0.2518 0.000 0.376 0.004 0.048 0.388 0.184
#> SRR1700095 4 0.0363 0.5739 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1700096 4 0.7125 0.2457 0.000 0.264 0.000 0.436 0.120 0.180
#> SRR1700097 2 0.8860 -0.2112 0.000 0.280 0.160 0.200 0.164 0.196
#> SRR1700098 4 0.6398 0.1117 0.000 0.072 0.000 0.452 0.376 0.100
#> SRR1700099 5 0.6353 0.4666 0.000 0.348 0.000 0.160 0.456 0.036
#> SRR1700100 5 0.4998 0.4489 0.000 0.356 0.000 0.048 0.580 0.016
#> SRR1700101 2 0.5687 0.4014 0.000 0.628 0.000 0.044 0.140 0.188
#> SRR1700102 5 0.6564 0.3312 0.000 0.048 0.044 0.276 0.548 0.084
#> SRR1700104 4 0.5147 0.5647 0.000 0.124 0.000 0.704 0.064 0.108
#> SRR1700103 4 0.6393 0.5439 0.000 0.064 0.044 0.624 0.144 0.124
#> SRR1700105 4 0.4324 0.5615 0.000 0.052 0.000 0.756 0.036 0.156
#> SRR1700106 4 0.0692 0.5754 0.000 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1700107 4 0.6643 0.3922 0.000 0.104 0.000 0.532 0.196 0.168
#> SRR1700108 4 0.8101 0.2709 0.000 0.160 0.048 0.388 0.188 0.216
#> SRR1700109 4 0.7712 0.0400 0.000 0.244 0.000 0.280 0.216 0.260
#> SRR1700110 5 0.5241 0.4442 0.000 0.364 0.000 0.104 0.532 0.000
#> SRR1700112 2 0.5096 0.4679 0.000 0.676 0.000 0.032 0.088 0.204
#> SRR1700111 4 0.5742 0.4664 0.000 0.008 0.008 0.580 0.156 0.248
#> SRR1700113 4 0.5132 0.4636 0.000 0.236 0.016 0.656 0.088 0.004
#> SRR1700114 5 0.7087 0.3866 0.000 0.116 0.012 0.200 0.504 0.168
#> SRR1700115 4 0.4316 0.5784 0.000 0.072 0.000 0.760 0.028 0.140
#> SRR1700116 4 0.6463 0.4634 0.000 0.016 0.048 0.560 0.152 0.224
#> SRR1700117 2 0.3525 0.6313 0.000 0.840 0.072 0.008 0.044 0.036
#> SRR1700119 4 0.5650 0.1374 0.000 0.332 0.000 0.516 0.148 0.004
#> SRR1700118 4 0.8593 0.0940 0.000 0.244 0.180 0.324 0.132 0.120
#> SRR1700120 4 0.4064 0.5102 0.000 0.056 0.004 0.740 0.200 0.000
#> SRR1700121 4 0.1500 0.5839 0.000 0.012 0.000 0.936 0.000 0.052
#> SRR1700122 4 0.6179 0.3778 0.000 0.268 0.000 0.548 0.056 0.128
#> SRR1700123 4 0.5752 0.5537 0.000 0.032 0.100 0.684 0.064 0.120
#> SRR1700125 4 0.3475 0.5973 0.000 0.056 0.000 0.836 0.040 0.068
#> SRR1700126 3 0.7342 0.3316 0.000 0.112 0.524 0.088 0.076 0.200
#> SRR1700127 5 0.8055 0.2137 0.000 0.060 0.140 0.216 0.412 0.172
#> SRR1700124 5 0.7384 0.2716 0.000 0.300 0.012 0.080 0.376 0.232
#> SRR1700128 4 0.6530 0.4941 0.000 0.036 0.060 0.596 0.132 0.176
#> SRR1700129 2 0.7039 0.1604 0.000 0.512 0.020 0.220 0.088 0.160
#> SRR1700130 4 0.7165 0.3807 0.000 0.116 0.012 0.488 0.168 0.216
#> SRR1700132 4 0.6261 0.4252 0.000 0.148 0.100 0.588 0.164 0.000
#> SRR1700131 4 0.3929 0.5620 0.000 0.004 0.176 0.772 0.016 0.032
#> SRR1700133 4 0.3498 0.5909 0.000 0.000 0.024 0.828 0.092 0.056
#> SRR1700134 4 0.3979 0.3609 0.000 0.360 0.000 0.628 0.012 0.000
#> SRR1700135 5 0.5724 0.2632 0.000 0.036 0.040 0.360 0.544 0.020
#> SRR1700136 4 0.2476 0.5897 0.000 0.020 0.036 0.900 0.004 0.040
#> SRR1700137 4 0.0777 0.5727 0.000 0.004 0.000 0.972 0.024 0.000
#> SRR1700138 4 0.4917 0.5840 0.000 0.164 0.012 0.724 0.040 0.060
#> SRR1700140 4 0.6075 -0.2331 0.000 0.324 0.000 0.396 0.280 0.000
#> SRR1700139 4 0.7899 0.0278 0.000 0.228 0.008 0.296 0.224 0.244
#> SRR1700141 4 0.4919 0.5409 0.000 0.020 0.000 0.696 0.164 0.120
#> SRR1700142 5 0.8653 0.1243 0.000 0.136 0.132 0.204 0.328 0.200
#> SRR1700143 3 0.5969 0.1940 0.000 0.000 0.456 0.028 0.404 0.112
#> SRR1700144 2 0.5740 0.4272 0.000 0.648 0.020 0.028 0.128 0.176
#> SRR1700145 4 0.5007 0.5712 0.000 0.072 0.056 0.740 0.020 0.112
#> SRR1700146 4 0.0922 0.5774 0.000 0.004 0.000 0.968 0.004 0.024
#> SRR1700147 4 0.6254 0.2763 0.000 0.360 0.004 0.468 0.028 0.140
#> SRR1700149 3 0.8360 0.2186 0.000 0.264 0.336 0.084 0.116 0.200
#> SRR1700148 5 0.7651 0.4114 0.000 0.300 0.112 0.144 0.408 0.036
#> SRR1700150 2 0.4575 0.5757 0.000 0.736 0.016 0.004 0.152 0.092
#> SRR1700152 4 0.5476 0.5875 0.000 0.088 0.024 0.708 0.092 0.088
#> SRR1700151 4 0.0692 0.5746 0.000 0.020 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1700153 4 0.6020 0.4690 0.000 0.244 0.036 0.608 0.032 0.080
#> SRR1700154 2 0.4199 0.5920 0.000 0.804 0.080 0.044 0.044 0.028
#> SRR1700155 2 0.3090 0.6361 0.000 0.864 0.012 0.020 0.028 0.076
#> SRR1700156 4 0.7498 0.3980 0.000 0.064 0.072 0.488 0.180 0.196
#> SRR1700158 4 0.7113 0.2594 0.000 0.296 0.024 0.468 0.080 0.132
#> SRR1700159 2 0.5345 0.1110 0.000 0.524 0.028 0.408 0.028 0.012
#> SRR1700157 2 0.7557 -0.0369 0.000 0.424 0.044 0.304 0.092 0.136
#> SRR1700160 4 0.6173 0.4482 0.000 0.040 0.000 0.548 0.180 0.232
#> SRR1700161 4 0.5341 0.5568 0.000 0.020 0.024 0.692 0.128 0.136
#> SRR1700162 4 0.5338 0.4229 0.000 0.276 0.000 0.620 0.064 0.040
#> SRR1700164 4 0.7772 0.3060 0.000 0.136 0.192 0.472 0.068 0.132
#> SRR1700163 3 0.6491 0.2082 0.000 0.404 0.432 0.012 0.048 0.104
#> SRR1700165 2 0.5833 0.3464 0.000 0.580 0.000 0.024 0.180 0.216
#> SRR1700166 4 0.4431 0.5745 0.000 0.052 0.008 0.760 0.032 0.148
#> SRR1700168 4 0.7514 0.0859 0.000 0.288 0.000 0.332 0.148 0.232
#> SRR1700167 4 0.8481 0.0557 0.000 0.092 0.204 0.332 0.132 0.240
#> SRR1700170 5 0.7274 0.3489 0.000 0.176 0.076 0.036 0.492 0.220
#> SRR1700169 2 0.5532 0.2115 0.000 0.584 0.000 0.020 0.288 0.108
#> SRR1700171 4 0.2891 0.5847 0.000 0.000 0.060 0.872 0.032 0.036
#> SRR1700172 4 0.5863 0.0757 0.000 0.184 0.000 0.484 0.328 0.004
#> SRR1700174 2 0.7770 0.0260 0.000 0.424 0.096 0.284 0.068 0.128
#> SRR1700173 4 0.4905 0.5544 0.000 0.000 0.076 0.728 0.080 0.116
#> SRR1700175 2 0.6093 0.4753 0.000 0.664 0.112 0.052 0.076 0.096
#> SRR1700176 4 0.7228 0.2285 0.000 0.012 0.220 0.472 0.108 0.188
#> SRR1700178 5 0.5293 0.4381 0.000 0.360 0.000 0.064 0.556 0.020
#> SRR1700177 4 0.1753 0.5943 0.000 0.084 0.004 0.912 0.000 0.000
#> SRR1700180 5 0.4902 0.4193 0.000 0.364 0.000 0.060 0.572 0.004
#> SRR1700179 2 0.2357 0.6474 0.000 0.872 0.000 0.000 0.116 0.012
#> SRR1700181 2 0.1620 0.6563 0.000 0.940 0.000 0.024 0.024 0.012
#> SRR1700183 1 0.3266 0.7205 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0508 0.6509 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700184 2 0.2744 0.6398 0.000 0.840 0.000 0.000 0.144 0.016
#> SRR1700186 2 0.2170 0.6523 0.000 0.888 0.000 0.000 0.100 0.012
#> SRR1700187 3 0.2048 0.3114 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 3 0.2762 0.2497 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.2020 0.6473 0.000 0.896 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1700192 2 0.4444 0.5576 0.000 0.736 0.016 0.000 0.164 0.084
#> SRR1700190 3 0.6111 0.0161 0.004 0.092 0.448 0.000 0.416 0.040
#> SRR1700191 1 0.3659 0.6296 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.1588 0.4299 0.000 0.072 0.924 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700193 2 0.5640 0.2609 0.000 0.588 0.000 0.256 0.136 0.020
#> SRR1700195 2 0.1910 0.6469 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1700194 3 0.3810 -0.2737 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.1168 0.6510 0.000 0.956 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1700197 3 0.2575 0.3545 0.100 0.024 0.872 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700198 2 0.1910 0.6404 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1700199 2 0.2196 0.6476 0.000 0.884 0.000 0.004 0.108 0.004
#> SRR1700200 2 0.0665 0.6512 0.000 0.980 0.000 0.004 0.008 0.008
#> SRR1700201 2 0.2948 0.5967 0.000 0.804 0.000 0.000 0.188 0.008
#> SRR1700202 2 0.0858 0.6537 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700203 2 0.1285 0.6552 0.000 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1700204 2 0.0146 0.6480 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700206 2 0.6141 -0.3362 0.000 0.400 0.012 0.188 0.400 0.000
#> SRR1700207 2 0.1391 0.6502 0.000 0.944 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1700208 2 0.6123 0.3570 0.000 0.584 0.212 0.068 0.136 0.000
#> SRR1700205 2 0.4477 0.3652 0.000 0.648 0.000 0.308 0.036 0.008
#> SRR1700209 2 0.1556 0.6450 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.6465 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0146 0.6465 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700212 2 0.2312 0.6439 0.000 0.876 0.000 0.000 0.112 0.012
#> SRR1700213 2 0.3056 0.6367 0.000 0.832 0.000 0.016 0.140 0.012
#> SRR1700214 2 0.0891 0.6513 0.000 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1700215 1 0.2730 0.7646 0.808 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.2001 0.6587 0.000 0.920 0.000 0.020 0.044 0.016
#> SRR1700216 1 0.0146 0.7883 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3873 0.5953 0.000 0.772 0.032 0.020 0.176 0.000
#> SRR1700219 2 0.0146 0.6465 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700222 3 0.2245 0.3549 0.068 0.004 0.904 0.012 0.012 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.6465 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.6465 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0508 0.6506 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700224 2 0.0508 0.6506 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700226 2 0.2531 0.6342 0.000 0.856 0.000 0.000 0.132 0.012
#> SRR1700229 2 0.3967 0.5674 0.000 0.760 0.000 0.148 0.092 0.000
#> SRR1700225 2 0.0405 0.6494 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700227 2 0.4292 0.2497 0.000 0.588 0.000 0.000 0.388 0.024
#> SRR1700230 2 0.3958 0.5669 0.000 0.764 0.180 0.040 0.016 0.000
#> SRR1700231 4 0.5185 0.1710 0.000 0.432 0.000 0.500 0.052 0.016
#> SRR1700228 2 0.0632 0.6529 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700232 2 0.4020 0.5913 0.000 0.764 0.000 0.068 0.160 0.008
#> SRR1700233 2 0.1075 0.6527 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0520 0.6513 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1700235 2 0.0520 0.6495 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700237 2 0.1636 0.6596 0.000 0.936 0.000 0.036 0.024 0.004
#> SRR1700236 2 0.0260 0.6481 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700238 2 0.1333 0.6564 0.000 0.944 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1700239 3 0.3189 0.4073 0.000 0.236 0.760 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700240 3 0.3371 0.0782 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.0909 0.6547 0.000 0.968 0.020 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700243 2 0.2218 0.6463 0.000 0.884 0.000 0.000 0.104 0.012
#> SRR1700244 2 0.3670 0.4566 0.000 0.704 0.000 0.012 0.284 0.000
#> SRR1700242 2 0.2420 0.6302 0.000 0.864 0.128 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700246 3 0.2048 0.4304 0.000 0.120 0.880 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.3607 0.3649 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000
#> SRR1700247 3 0.3085 0.4220 0.020 0.052 0.868 0.052 0.004 0.004
#> SRR1700249 3 0.3747 -0.1983 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.1297 0.6544 0.000 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1700248 2 0.4259 0.5013 0.000 0.716 0.000 0.220 0.060 0.004
#> SRR1700251 5 0.6284 0.0926 0.000 0.412 0.000 0.044 0.420 0.124
#> SRR1700252 2 0.5596 0.2861 0.000 0.568 0.000 0.268 0.156 0.008
#> SRR1700253 2 0.3200 0.6050 0.000 0.788 0.000 0.000 0.196 0.016
#> SRR1700256 2 0.2092 0.6303 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1700254 3 0.2513 0.4359 0.000 0.140 0.852 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0146 0.6477 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700257 2 0.0363 0.6507 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700258 2 0.2996 0.5276 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1700259 4 0.5928 0.1496 0.000 0.208 0.000 0.512 0.272 0.008
#> SRR1700260 4 0.3555 0.5183 0.000 0.040 0.000 0.776 0.184 0.000
#> SRR1700261 2 0.2491 0.5918 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1700262 4 0.3428 0.3635 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304 0.000
#> SRR1700263 2 0.5257 0.4367 0.000 0.648 0.000 0.140 0.196 0.016
#> SRR1700264 2 0.3782 0.5938 0.000 0.788 0.000 0.140 0.064 0.008
#> SRR1700265 2 0.4949 0.3311 0.000 0.600 0.000 0.064 0.328 0.008
#> SRR1700266 5 0.5501 0.4938 0.000 0.336 0.000 0.144 0.520 0.000
#> SRR1700268 4 0.4910 0.4249 0.000 0.192 0.000 0.656 0.152 0.000
#> SRR1700270 5 0.4720 0.4066 0.000 0.388 0.000 0.052 0.560 0.000
#> SRR1700267 2 0.0692 0.6520 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700271 5 0.5218 0.3434 0.000 0.068 0.000 0.376 0.544 0.012
#> SRR1700272 4 0.5059 0.0145 0.000 0.080 0.000 0.528 0.392 0.000
#> SRR1700273 2 0.0922 0.6540 0.000 0.968 0.000 0.004 0.024 0.004
#> SRR1700274 4 0.5509 0.2326 0.000 0.328 0.000 0.524 0.148 0.000
#> SRR1700277 5 0.5050 0.3166 0.000 0.416 0.076 0.000 0.508 0.000
#> SRR1700275 4 0.3475 0.5534 0.000 0.060 0.000 0.800 0.140 0.000
#> SRR1700276 5 0.6641 0.4145 0.000 0.108 0.052 0.268 0.540 0.032
#> SRR1700278 2 0.0547 0.6522 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700279 5 0.5587 0.1803 0.000 0.140 0.000 0.424 0.436 0.000
#> SRR1700280 2 0.3641 0.5082 0.000 0.748 0.000 0.224 0.028 0.000
#> SRR1700281 2 0.4644 0.0358 0.000 0.524 0.000 0.032 0.440 0.004
#> SRR1700283 2 0.4435 0.2483 0.000 0.604 0.000 0.364 0.028 0.004
#> SRR1700282 2 0.5484 0.3496 0.000 0.620 0.016 0.184 0.180 0.000
#> SRR1700284 4 0.3903 0.4964 0.000 0.304 0.000 0.680 0.004 0.012
#> SRR1700285 5 0.6141 0.3296 0.000 0.244 0.000 0.352 0.400 0.004
#> SRR1700286 5 0.5524 0.2959 0.000 0.044 0.036 0.356 0.556 0.008
#> SRR1700287 4 0.2094 0.5797 0.000 0.016 0.000 0.908 0.068 0.008
#> SRR1700290 3 0.4078 0.3468 0.000 0.020 0.736 0.224 0.012 0.008
#> SRR1700289 4 0.5410 0.2259 0.000 0.156 0.000 0.564 0.280 0.000
#> SRR1700288 2 0.4493 0.1524 0.000 0.548 0.000 0.004 0.424 0.024
#> SRR1700292 4 0.7244 -0.0766 0.000 0.252 0.000 0.336 0.320 0.092
#> SRR1700291 4 0.1723 0.5868 0.000 0.036 0.000 0.928 0.036 0.000
#> SRR1700293 2 0.0291 0.6477 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700294 2 0.4921 0.4864 0.000 0.704 0.036 0.208 0.032 0.020
#> SRR1700295 2 0.2476 0.6533 0.000 0.900 0.036 0.044 0.012 0.008
#> SRR1700297 5 0.4684 0.4162 0.000 0.372 0.000 0.052 0.576 0.000
#> SRR1700296 4 0.3923 0.3243 0.000 0.416 0.000 0.580 0.004 0.000
#> SRR1700298 2 0.2402 0.6334 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140 0.000
#> SRR1700299 5 0.5285 0.2371 0.000 0.100 0.000 0.420 0.480 0.000
#> SRR1700300 2 0.3510 0.6313 0.000 0.828 0.008 0.064 0.092 0.008
#> SRR1700302 4 0.5136 0.5405 0.000 0.208 0.020 0.684 0.072 0.016
#> SRR1700301 2 0.4538 0.2849 0.000 0.612 0.000 0.340 0.048 0.000
#> SRR1700303 4 0.5068 0.3103 0.000 0.408 0.012 0.540 0.020 0.020
#> SRR1700304 2 0.4999 0.4935 0.000 0.692 0.052 0.212 0.036 0.008
#> SRR1700305 2 0.0146 0.6471 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700306 4 0.6291 0.4702 0.000 0.228 0.108 0.592 0.036 0.036
#> SRR1700308 2 0.3601 0.4123 0.000 0.684 0.000 0.312 0.000 0.004
#> SRR1700307 2 0.7251 0.0639 0.000 0.428 0.276 0.220 0.044 0.032
#> SRR1700309 4 0.4297 0.2636 0.000 0.452 0.004 0.532 0.012 0.000
#> SRR1700310 2 0.3601 0.3802 0.000 0.684 0.004 0.312 0.000 0.000
#> SRR1700311 4 0.2145 0.5945 0.000 0.056 0.008 0.912 0.020 0.004
#> SRR1700312 2 0.3586 0.5316 0.000 0.756 0.000 0.216 0.028 0.000
#> SRR1700313 2 0.5761 0.4621 0.000 0.652 0.056 0.180 0.100 0.012
#> SRR1700314 5 0.5844 0.2562 0.000 0.060 0.032 0.356 0.536 0.016
#> SRR1700315 4 0.3100 0.5958 0.000 0.108 0.028 0.848 0.012 0.004
#> SRR1700316 5 0.6126 0.3722 0.000 0.332 0.000 0.316 0.352 0.000
#> SRR1700317 2 0.3134 0.5763 0.000 0.784 0.000 0.004 0.208 0.004
#> SRR1700318 4 0.3171 0.5719 0.000 0.204 0.000 0.784 0.012 0.000
#> SRR1700319 4 0.6049 0.4703 0.000 0.068 0.064 0.616 0.228 0.024
#> SRR1700320 4 0.5573 0.5620 0.000 0.100 0.112 0.700 0.052 0.036
#> SRR1700322 2 0.3933 0.5266 0.000 0.716 0.000 0.036 0.248 0.000
#> SRR1700321 2 0.1141 0.6501 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700323 4 0.0858 0.5783 0.000 0.028 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR1700324 2 0.1806 0.6449 0.000 0.908 0.000 0.088 0.004 0.000
#> SRR1700325 2 0.6130 -0.2714 0.000 0.404 0.000 0.352 0.240 0.004
#> SRR1700326 3 0.6674 0.2164 0.000 0.116 0.508 0.072 0.292 0.012
#> SRR1700327 2 0.0891 0.6538 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR1700329 4 0.4823 0.3035 0.000 0.388 0.000 0.552 0.060 0.000
#> SRR1700328 5 0.5630 0.0592 0.000 0.028 0.036 0.412 0.504 0.020
#> SRR1700330 4 0.4091 0.4089 0.000 0.340 0.004 0.644 0.008 0.004
#> SRR1700331 4 0.3947 0.5098 0.000 0.264 0.008 0.712 0.012 0.004
#> SRR1700332 4 0.3852 0.3863 0.000 0.384 0.000 0.612 0.004 0.000
#> SRR1700333 2 0.3176 0.6309 0.000 0.824 0.004 0.016 0.148 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.989 0.995 0.1155 0.889 0.889
#> 3 3 0.296 0.590 0.776 3.6685 0.566 0.513
#> 4 4 0.377 0.547 0.769 0.2621 0.703 0.438
#> 5 5 0.377 0.506 0.627 0.0743 0.868 0.603
#> 6 6 0.410 0.293 0.586 0.0491 0.812 0.429
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699881 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699900 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699901 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699905 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR1699906 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699915 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699924 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699971 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699978 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR1699979 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699993 2 0.1843 0.968 0.028 0.972
#> SRR1699994 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699995 2 0.8713 0.577 0.292 0.708
#> SRR1699996 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.5842 0.849 0.860 0.140
#> SRR1700000 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700003 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.0672 0.969 0.992 0.008
#> SRR1700010 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700016 1 0.5946 0.844 0.856 0.144
#> SRR1700018 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700027 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700028 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1700035 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700039 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700040 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700041 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700042 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700043 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700045 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700044 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700047 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700048 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700049 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700050 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700051 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700052 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700053 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700056 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700057 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700058 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700059 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700060 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700061 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700062 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700063 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700064 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700065 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700066 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700069 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700072 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700073 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700074 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700076 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700078 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700081 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700082 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700083 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700084 2 0.3114 0.938 0.056 0.944
#> SRR1700085 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700087 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700096 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700097 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700105 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700119 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700127 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700124 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700128 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700133 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700136 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700137 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700143 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700144 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700145 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700149 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700148 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700153 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700154 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700160 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700163 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700165 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700166 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700170 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700171 2 0.1414 0.976 0.020 0.980
#> SRR1700172 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700177 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700179 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700181 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700183 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700184 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700187 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.8267 0.669 0.740 0.260
#> SRR1700190 2 0.5178 0.866 0.116 0.884
#> SRR1700191 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700197 1 0.1184 0.963 0.984 0.016
#> SRR1700198 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700199 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700200 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.8443 0.618 0.272 0.728
#> SRR1700203 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700204 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700208 2 0.9044 0.519 0.320 0.680
#> SRR1700205 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.5059 0.871 0.112 0.888
#> SRR1700212 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700215 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR1700223 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700230 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700232 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.2236 0.960 0.036 0.964
#> SRR1700243 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR1700246 2 0.4161 0.906 0.084 0.916
#> SRR1700245 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700252 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.974 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700275 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.7602 0.712 0.220 0.780
#> SRR1700289 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR1700305 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.0376 0.992 0.004 0.996
#> SRR1700327 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700330 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.2165 0.69952 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699875 2 0.5327 0.38913 0.000 0.728 0.272
#> SRR1699876 2 0.6244 0.48266 0.000 0.560 0.440
#> SRR1699877 2 0.1643 0.69803 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699879 2 0.4605 0.66933 0.000 0.796 0.204
#> SRR1699878 2 0.2625 0.67714 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699880 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699881 3 0.6026 0.58291 0.000 0.376 0.624
#> SRR1699882 2 0.3267 0.69565 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699883 2 0.1964 0.69521 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699884 2 0.2537 0.68158 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699885 2 0.2537 0.67926 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699886 2 0.5948 0.58354 0.000 0.640 0.360
#> SRR1699888 2 0.3116 0.70008 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699889 3 0.6286 -0.34148 0.000 0.464 0.536
#> SRR1699890 2 0.5098 0.62979 0.000 0.752 0.248
#> SRR1699887 2 0.5835 0.57828 0.000 0.660 0.340
#> SRR1699891 2 0.6295 0.46191 0.000 0.528 0.472
#> SRR1699892 3 0.6274 0.49899 0.000 0.456 0.544
#> SRR1699893 3 0.1163 0.67197 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699894 2 0.6204 0.48574 0.000 0.576 0.424
#> SRR1699895 2 0.6225 0.47655 0.000 0.568 0.432
#> SRR1699896 3 0.6291 0.46917 0.000 0.468 0.532
#> SRR1699897 2 0.5115 0.60206 0.004 0.768 0.228
#> SRR1699898 3 0.5797 0.63537 0.008 0.280 0.712
#> SRR1699900 3 0.6126 0.55825 0.000 0.400 0.600
#> SRR1699899 3 0.6267 -0.31451 0.000 0.452 0.548
#> SRR1699902 3 0.6095 0.56365 0.000 0.392 0.608
#> SRR1699901 3 0.7032 0.60068 0.028 0.368 0.604
#> SRR1699903 3 0.4178 0.54944 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699904 2 0.6235 0.47290 0.000 0.564 0.436
#> SRR1699905 3 0.7824 0.58813 0.064 0.356 0.580
#> SRR1699906 2 0.6295 0.47474 0.000 0.528 0.472
#> SRR1699907 2 0.6252 0.46087 0.000 0.556 0.444
#> SRR1699908 3 0.5733 0.19173 0.000 0.324 0.676
#> SRR1699909 3 0.4974 0.60631 0.000 0.236 0.764
#> SRR1699910 3 0.2261 0.66195 0.000 0.068 0.932
#> SRR1699911 3 0.5497 0.47903 0.000 0.292 0.708
#> SRR1699912 3 0.5497 0.26629 0.000 0.292 0.708
#> SRR1699913 2 0.6244 0.47381 0.000 0.560 0.440
#> SRR1699914 3 0.4465 0.68022 0.004 0.176 0.820
#> SRR1699915 3 0.2448 0.65717 0.000 0.076 0.924
#> SRR1699916 2 0.5497 0.58984 0.000 0.708 0.292
#> SRR1699917 3 0.2165 0.66302 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699918 3 0.5465 0.55596 0.000 0.288 0.712
#> SRR1699919 3 0.4346 0.52692 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699920 3 0.1525 0.67673 0.004 0.032 0.964
#> SRR1699921 3 0.3038 0.63653 0.000 0.104 0.896
#> SRR1699922 2 0.2711 0.70365 0.000 0.912 0.088
#> SRR1699923 3 0.7534 0.52448 0.040 0.428 0.532
#> SRR1699924 3 0.4399 0.67845 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699925 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.3192 0.64627 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699927 2 0.6309 0.38836 0.000 0.500 0.500
#> SRR1699929 3 0.6252 0.49737 0.000 0.444 0.556
#> SRR1699928 2 0.6307 0.41182 0.000 0.512 0.488
#> SRR1699930 2 0.6192 0.48923 0.000 0.580 0.420
#> SRR1699931 3 0.6260 0.48661 0.000 0.448 0.552
#> SRR1699933 3 0.5988 0.58559 0.000 0.368 0.632
#> SRR1699932 2 0.6267 0.45561 0.000 0.548 0.452
#> SRR1699934 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.2356 0.65794 0.000 0.072 0.928
#> SRR1699936 2 0.4291 0.68047 0.000 0.820 0.180
#> SRR1699937 2 0.6079 -0.04252 0.000 0.612 0.388
#> SRR1699938 2 0.2448 0.68267 0.000 0.924 0.076
#> SRR1699940 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699939 2 0.5016 0.65857 0.000 0.760 0.240
#> SRR1699941 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699942 3 0.6126 0.55511 0.000 0.400 0.600
#> SRR1699943 2 0.1411 0.70430 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699944 2 0.2796 0.67277 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699945 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699946 2 0.5859 0.14426 0.000 0.656 0.344
#> SRR1699947 2 0.2959 0.66765 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699948 2 0.2537 0.68045 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699949 2 0.6008 0.54151 0.000 0.628 0.372
#> SRR1699950 2 0.4931 0.65777 0.000 0.768 0.232
#> SRR1699951 3 0.5327 0.63933 0.000 0.272 0.728
#> SRR1699952 2 0.6252 -0.23491 0.000 0.556 0.444
#> SRR1699953 2 0.2625 0.68166 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699954 3 0.6713 0.52835 0.012 0.416 0.572
#> SRR1699955 2 0.2959 0.70254 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699956 3 0.6189 0.58300 0.004 0.364 0.632
#> SRR1699957 2 0.5291 0.39256 0.000 0.732 0.268
#> SRR1699959 3 0.5882 0.59980 0.000 0.348 0.652
#> SRR1699958 3 0.2625 0.67807 0.000 0.084 0.916
#> SRR1699960 2 0.4504 0.67219 0.000 0.804 0.196
#> SRR1699961 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699962 2 0.3619 0.69299 0.000 0.864 0.136
#> SRR1699963 3 0.6079 0.56699 0.000 0.388 0.612
#> SRR1699964 2 0.3340 0.64778 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699965 2 0.3267 0.69648 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699966 3 0.3551 0.68854 0.000 0.132 0.868
#> SRR1699967 2 0.3340 0.64698 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699968 3 0.5292 0.64991 0.008 0.228 0.764
#> SRR1699969 3 0.4504 0.67666 0.000 0.196 0.804
#> SRR1699971 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699970 2 0.3752 0.62160 0.000 0.856 0.144
#> SRR1699972 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699973 3 0.1289 0.67279 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699974 3 0.7083 0.55910 0.028 0.380 0.592
#> SRR1699975 3 0.2537 0.68580 0.000 0.080 0.920
#> SRR1699976 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699977 3 0.5216 0.64968 0.000 0.260 0.740
#> SRR1699978 3 0.7424 0.59536 0.044 0.364 0.592
#> SRR1699979 3 0.4629 0.67302 0.004 0.188 0.808
#> SRR1699980 3 0.2680 0.67639 0.008 0.068 0.924
#> SRR1699981 3 0.5678 0.63647 0.000 0.316 0.684
#> SRR1699982 2 0.6252 0.47154 0.000 0.556 0.444
#> SRR1699983 3 0.2066 0.65943 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699984 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.5810 0.39306 0.000 0.336 0.664
#> SRR1699986 3 0.7490 0.58209 0.044 0.380 0.576
#> SRR1699988 2 0.5178 0.34758 0.000 0.744 0.256
#> SRR1699987 3 0.2796 0.68928 0.000 0.092 0.908
#> SRR1699989 3 0.5291 0.43222 0.000 0.268 0.732
#> SRR1699990 3 0.3784 0.68530 0.004 0.132 0.864
#> SRR1699992 3 0.6140 0.55231 0.000 0.404 0.596
#> SRR1699991 3 0.6062 0.57131 0.000 0.384 0.616
#> SRR1699993 3 0.6803 0.63009 0.040 0.280 0.680
#> SRR1699994 3 0.6095 0.55885 0.000 0.392 0.608
#> SRR1699995 3 0.9833 0.26909 0.300 0.276 0.424
#> SRR1699996 2 0.4002 0.53113 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699997 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1699998 3 0.6274 0.48642 0.000 0.456 0.544
#> SRR1699999 1 0.4526 0.82322 0.856 0.104 0.040
#> SRR1700000 3 0.6126 0.55511 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700002 3 0.6140 0.55581 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700001 3 0.6095 0.56365 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700003 3 0.6079 0.56264 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700004 3 0.5902 0.62466 0.004 0.316 0.680
#> SRR1700005 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700007 2 0.6192 0.48923 0.000 0.580 0.420
#> SRR1700008 3 0.1964 0.67018 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700009 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.6079 0.56377 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700011 2 0.5968 0.56987 0.000 0.636 0.364
#> SRR1700013 3 0.6180 0.55306 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700012 3 0.6111 0.55948 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700014 3 0.4033 0.68127 0.008 0.136 0.856
#> SRR1700015 3 0.6126 0.55159 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700016 1 0.5911 0.72682 0.784 0.156 0.060
#> SRR1700018 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700017 3 0.6079 0.56382 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700019 2 0.5397 0.61259 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700020 3 0.6333 0.60362 0.012 0.332 0.656
#> SRR1700021 3 0.6192 0.01152 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700023 3 0.5733 0.61233 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700022 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700024 3 0.2384 0.68058 0.008 0.056 0.936
#> SRR1700025 3 0.6286 0.47244 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700026 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700027 3 0.6111 0.55429 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700028 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700029 3 0.3983 0.68609 0.004 0.144 0.852
#> SRR1700030 3 0.5061 0.57847 0.008 0.208 0.784
#> SRR1700031 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700032 2 0.6305 -0.32928 0.000 0.516 0.484
#> SRR1700034 1 0.4146 0.85035 0.876 0.044 0.080
#> SRR1700035 3 0.2537 0.65227 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700033 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700036 3 0.3213 0.68284 0.008 0.092 0.900
#> SRR1700037 2 0.6204 0.48583 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700038 3 0.6111 0.56121 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700039 3 0.6081 0.59816 0.004 0.344 0.652
#> SRR1700040 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700041 3 0.4974 0.64714 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700042 3 0.6008 0.57741 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700043 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700045 3 0.5397 0.65638 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700044 3 0.6154 0.55005 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700046 3 0.5678 0.61434 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700047 3 0.5497 0.63145 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700048 3 0.2400 0.68444 0.004 0.064 0.932
#> SRR1700049 3 0.7308 0.60950 0.060 0.284 0.656
#> SRR1700050 3 0.4195 0.68288 0.012 0.136 0.852
#> SRR1700051 3 0.6096 0.63192 0.016 0.280 0.704
#> SRR1700052 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700053 3 0.3116 0.68585 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700054 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700055 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.2200 0.68315 0.004 0.056 0.940
#> SRR1700057 3 0.1950 0.67804 0.008 0.040 0.952
#> SRR1700058 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700059 3 0.0983 0.67180 0.004 0.016 0.980
#> SRR1700060 3 0.5722 0.63082 0.004 0.292 0.704
#> SRR1700061 3 0.6079 0.56768 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700062 3 0.5020 0.67125 0.012 0.192 0.796
#> SRR1700063 3 0.6045 0.57030 0.000 0.380 0.620
#> SRR1700064 3 0.1753 0.67981 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700065 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700066 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700067 3 0.2066 0.66576 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700068 3 0.2400 0.68220 0.004 0.064 0.932
#> SRR1700069 3 0.2063 0.67848 0.008 0.044 0.948
#> SRR1700070 3 0.6235 0.39584 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700071 3 0.5098 0.65137 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700072 3 0.6079 0.56304 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700073 3 0.4887 0.54115 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700075 3 0.6026 0.58657 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700074 3 0.6095 0.55899 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700076 3 0.6079 0.57875 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700077 3 0.6095 0.55899 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700078 3 0.5815 0.62548 0.004 0.304 0.692
#> SRR1700080 3 0.2590 0.68421 0.004 0.072 0.924
#> SRR1700079 3 0.3941 0.68187 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700081 3 0.6102 0.61254 0.008 0.320 0.672
#> SRR1700082 3 0.6062 0.56706 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700083 3 0.6566 0.60050 0.016 0.348 0.636
#> SRR1700084 3 0.6737 0.55693 0.016 0.384 0.600
#> SRR1700085 3 0.4974 0.38815 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700086 3 0.4233 0.67939 0.004 0.160 0.836
#> SRR1700087 3 0.6661 0.57872 0.012 0.400 0.588
#> SRR1700088 3 0.6126 0.56025 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700089 3 0.6442 0.55969 0.004 0.432 0.564
#> SRR1700091 3 0.4178 0.68483 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700090 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700092 3 0.2448 0.68614 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700094 3 0.5733 0.62812 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700093 3 0.2711 0.65460 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700095 3 0.5098 0.66056 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700096 3 0.4121 0.68631 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700097 3 0.6627 0.62270 0.020 0.336 0.644
#> SRR1700098 2 0.6308 -0.17611 0.000 0.508 0.492
#> SRR1700099 3 0.2448 0.65803 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700100 3 0.2356 0.67687 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700101 3 0.2448 0.67660 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700102 3 0.2165 0.67134 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700104 3 0.4178 0.67899 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700103 3 0.3879 0.68289 0.000 0.152 0.848
#> SRR1700105 3 0.2448 0.66244 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700106 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700107 3 0.1964 0.67014 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700108 3 0.5591 0.27395 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700109 2 0.6215 0.48348 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700110 2 0.6215 0.48348 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700112 2 0.6235 0.47525 0.000 0.564 0.436
#> SRR1700111 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700113 3 0.4002 0.57148 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700114 3 0.2261 0.67530 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700115 3 0.3192 0.62877 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700116 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700117 3 0.6099 0.67065 0.032 0.228 0.740
#> SRR1700119 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700118 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700120 3 0.5588 0.64766 0.004 0.276 0.720
#> SRR1700121 3 0.2066 0.66557 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700122 3 0.4974 0.43482 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700123 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700125 2 0.6204 0.48574 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700126 3 0.6416 0.63873 0.020 0.304 0.676
#> SRR1700127 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700124 3 0.2066 0.67137 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700128 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700129 3 0.2448 0.65734 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700130 3 0.2261 0.66214 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700132 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700131 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700133 3 0.2165 0.66393 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700134 3 0.4062 0.56581 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700135 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700136 3 0.1964 0.67032 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700137 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700138 3 0.1753 0.67095 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700140 3 0.1753 0.66884 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700139 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700141 3 0.6026 0.00530 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700142 3 0.2550 0.68241 0.012 0.056 0.932
#> SRR1700143 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700144 3 0.2400 0.68268 0.004 0.064 0.932
#> SRR1700145 3 0.1753 0.66912 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700146 3 0.2959 0.63943 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700147 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700149 3 0.2796 0.68177 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700148 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700150 3 0.2959 0.63997 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700152 3 0.1964 0.67032 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700151 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700153 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700154 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700155 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700156 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700158 3 0.3340 0.68487 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700159 2 0.6286 0.43422 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700157 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700160 3 0.2066 0.67137 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700161 3 0.1964 0.66938 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700162 3 0.5098 0.40762 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700164 3 0.6539 0.63628 0.028 0.288 0.684
#> SRR1700163 3 0.2711 0.67895 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700165 3 0.3116 0.68529 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700166 3 0.2356 0.65976 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700168 3 0.6309 -0.36096 0.000 0.496 0.504
#> SRR1700167 3 0.1964 0.67035 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700170 3 0.2448 0.67373 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700169 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700171 3 0.5692 0.64888 0.008 0.268 0.724
#> SRR1700172 3 0.2066 0.66555 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700174 3 0.1964 0.66938 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700173 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700175 3 0.3340 0.62032 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700176 3 0.7085 0.59866 0.032 0.356 0.612
#> SRR1700178 2 0.0424 0.70760 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700177 3 0.1860 0.66805 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700180 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1529 0.70186 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700187 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0424 0.70925 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700192 1 0.5366 0.70935 0.776 0.208 0.016
#> SRR1700190 3 0.8270 0.33492 0.376 0.084 0.540
#> SRR1700191 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.0475 0.94116 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700198 2 0.0237 0.70950 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700199 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0592 0.71093 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700202 2 0.6566 0.24650 0.376 0.612 0.012
#> SRR1700203 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0592 0.70986 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700207 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 1 0.9707 -0.10918 0.432 0.228 0.340
#> SRR1700205 2 0.0424 0.71164 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700209 2 0.2711 0.70386 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700210 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.2200 0.69182 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700212 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.5948 -0.05852 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700214 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0592 0.71302 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700216 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0892 0.70934 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700219 2 0.1163 0.71293 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700222 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.6062 0.52337 0.000 0.616 0.384
#> SRR1700221 2 0.0237 0.71108 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700223 2 0.0237 0.71206 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700224 2 0.0592 0.70926 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700226 2 0.1529 0.69169 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700229 2 0.1163 0.71347 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700225 2 0.6260 -0.30840 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700227 2 0.0237 0.71063 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700230 1 0.0747 0.93576 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700231 2 0.0424 0.71033 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700228 2 0.0424 0.70898 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700232 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.0592 0.70806 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700235 2 0.4702 0.52552 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700237 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.1643 0.71228 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700238 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.8918 -0.30904 0.128 0.492 0.380
#> SRR1700243 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0237 0.71207 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700242 1 0.1964 0.90104 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700246 2 0.6744 0.37566 0.300 0.668 0.032
#> SRR1700245 2 0.0747 0.71029 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700247 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.1031 0.70780 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700248 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.6168 -0.28156 0.000 0.588 0.412
#> SRR1700253 2 0.0237 0.70963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700256 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.94554 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.5497 0.60829 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700260 2 0.6180 0.49488 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700261 2 0.6215 0.49647 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700262 2 0.6062 0.52631 0.000 0.616 0.384
#> SRR1700263 2 0.1289 0.70607 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700264 2 0.2796 0.67263 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700265 2 0.5706 0.22234 0.000 0.680 0.320
#> SRR1700266 2 0.2878 0.68617 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700268 2 0.6387 0.13027 0.020 0.680 0.300
#> SRR1700270 2 0.0000 0.71110 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.2711 0.70457 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700271 2 0.5529 0.60686 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700272 2 0.5363 0.61212 0.000 0.724 0.276
#> SRR1700273 2 0.1031 0.70878 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700274 2 0.3619 0.69161 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700277 3 0.6919 0.53926 0.016 0.448 0.536
#> SRR1700275 2 0.6045 0.52878 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700276 2 0.3879 0.67488 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700278 2 0.3038 0.69738 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700279 2 0.4796 0.64026 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700280 2 0.4002 0.67278 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700281 2 0.1643 0.71206 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700283 2 0.6154 0.50182 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700282 2 0.6299 -0.14756 0.000 0.524 0.476
#> SRR1700284 2 0.6274 0.46011 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700285 2 0.5327 0.61586 0.000 0.728 0.272
#> SRR1700286 2 0.6215 0.51806 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700287 2 0.5948 0.55115 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700290 2 0.9987 -0.18018 0.332 0.356 0.312
#> SRR1700289 2 0.5968 0.54668 0.000 0.636 0.364
#> SRR1700288 2 0.0237 0.71123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700292 2 0.6168 0.49851 0.000 0.588 0.412
#> SRR1700291 3 0.3116 0.64135 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700293 2 0.3879 0.68016 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700294 2 0.6180 0.49165 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700295 3 0.4605 0.65264 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700297 2 0.6204 0.48574 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700296 2 0.5529 0.59909 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700298 3 0.6305 -0.00493 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700299 3 0.4605 0.63425 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700300 2 0.6045 -0.09679 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700302 2 0.6286 0.43032 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700301 2 0.6192 0.48923 0.000 0.580 0.420
#> SRR1700303 2 0.6204 0.48574 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700304 2 0.3551 0.68570 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700305 2 0.4796 0.65002 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700306 3 0.5216 0.63283 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700308 3 0.6026 0.49431 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700307 3 0.6204 0.56334 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700309 3 0.5706 0.64008 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700310 2 0.6095 0.51472 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700311 3 0.4555 0.52538 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700312 2 0.4605 0.65705 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700313 2 0.6299 -0.43068 0.000 0.524 0.476
#> SRR1700314 3 0.2537 0.66706 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700315 3 0.5733 0.59000 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700316 3 0.4605 0.64910 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700317 2 0.4399 0.66189 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700318 2 0.5621 0.51490 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700319 3 0.3340 0.61951 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700320 2 0.6204 0.48960 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700322 2 0.5016 0.60558 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700321 2 0.6095 0.52582 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700323 3 0.6180 -0.14300 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700324 2 0.5835 0.56481 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700325 2 0.3879 0.67883 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700326 3 0.6750 0.56780 0.024 0.336 0.640
#> SRR1700327 3 0.6095 -0.09304 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700329 2 0.6302 0.38978 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700328 3 0.6286 0.50068 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700330 2 0.5216 0.34058 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700331 3 0.6045 -0.08152 0.000 0.380 0.620
#> SRR1700332 2 0.6215 0.48124 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700333 2 0.2537 0.70271 0.000 0.920 0.080
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.4327 0.661465 0.000 0.768 0.216 0.016
#> SRR1699875 3 0.4290 0.578595 0.000 0.212 0.772 0.016
#> SRR1699876 2 0.5323 0.434723 0.000 0.628 0.020 0.352
#> SRR1699877 2 0.4008 0.615187 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1699879 2 0.7304 0.398462 0.000 0.492 0.344 0.164
#> SRR1699878 3 0.4996 -0.150291 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1699880 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1699881 3 0.2676 0.742078 0.000 0.012 0.896 0.092
#> SRR1699882 2 0.4114 0.691299 0.000 0.828 0.060 0.112
#> SRR1699883 2 0.4817 0.392072 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1699884 2 0.4991 0.386873 0.000 0.608 0.388 0.004
#> SRR1699885 2 0.3356 0.687229 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1699886 2 0.5228 0.552835 0.000 0.696 0.036 0.268
#> SRR1699888 2 0.2363 0.720876 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1699889 4 0.3900 0.546515 0.000 0.164 0.020 0.816
#> SRR1699890 2 0.7371 0.502349 0.000 0.520 0.212 0.268
#> SRR1699887 2 0.4391 0.560193 0.000 0.740 0.008 0.252
#> SRR1699891 4 0.5310 0.075532 0.000 0.412 0.012 0.576
#> SRR1699892 3 0.4801 0.652935 0.000 0.188 0.764 0.048
#> SRR1699893 4 0.4193 0.590717 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1699894 4 0.5105 0.024659 0.000 0.432 0.004 0.564
#> SRR1699895 4 0.4040 0.436331 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1699896 3 0.4389 0.673342 0.000 0.072 0.812 0.116
#> SRR1699897 3 0.6743 -0.061876 0.000 0.392 0.512 0.096
#> SRR1699898 3 0.2944 0.698379 0.000 0.004 0.868 0.128
#> SRR1699900 3 0.1975 0.748411 0.000 0.048 0.936 0.016
#> SRR1699899 4 0.4259 0.575851 0.000 0.128 0.056 0.816
#> SRR1699902 3 0.1109 0.757619 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699901 3 0.3157 0.683875 0.004 0.000 0.852 0.144
#> SRR1699903 4 0.1706 0.633766 0.000 0.036 0.016 0.948
#> SRR1699904 4 0.4134 0.414856 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1699905 3 0.4423 0.643602 0.036 0.000 0.788 0.176
#> SRR1699906 4 0.5592 0.078118 0.000 0.404 0.024 0.572
#> SRR1699907 4 0.4990 0.228032 0.000 0.352 0.008 0.640
#> SRR1699908 4 0.1610 0.635844 0.000 0.032 0.016 0.952
#> SRR1699909 4 0.3810 0.612038 0.000 0.092 0.060 0.848
#> SRR1699910 4 0.3625 0.652297 0.000 0.012 0.160 0.828
#> SRR1699911 4 0.5628 0.504287 0.000 0.132 0.144 0.724
#> SRR1699912 4 0.4857 0.378716 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR1699913 4 0.4220 0.441378 0.000 0.248 0.004 0.748
#> SRR1699914 3 0.5112 0.027336 0.000 0.004 0.560 0.436
#> SRR1699915 4 0.3931 0.653692 0.000 0.040 0.128 0.832
#> SRR1699916 2 0.4950 0.459605 0.000 0.620 0.004 0.376
#> SRR1699917 4 0.1256 0.650342 0.000 0.008 0.028 0.964
#> SRR1699918 4 0.5217 0.608375 0.000 0.108 0.136 0.756
#> SRR1699919 4 0.3404 0.593920 0.000 0.104 0.032 0.864
#> SRR1699920 4 0.4872 0.494123 0.000 0.004 0.356 0.640
#> SRR1699921 4 0.3323 0.647300 0.000 0.060 0.064 0.876
#> SRR1699922 2 0.5869 0.463683 0.000 0.596 0.044 0.360
#> SRR1699923 3 0.4935 0.674642 0.048 0.024 0.796 0.132
#> SRR1699924 3 0.5050 0.180717 0.000 0.004 0.588 0.408
#> SRR1699925 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 4 0.2021 0.639589 0.000 0.012 0.056 0.932
#> SRR1699927 4 0.4567 0.392481 0.000 0.276 0.008 0.716
#> SRR1699929 3 0.5429 0.582306 0.000 0.072 0.720 0.208
#> SRR1699928 4 0.4387 0.453824 0.000 0.236 0.012 0.752
#> SRR1699930 4 0.5050 0.086866 0.000 0.408 0.004 0.588
#> SRR1699931 3 0.5361 0.592190 0.000 0.068 0.724 0.208
#> SRR1699933 3 0.2401 0.739769 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR1699932 4 0.3945 0.480775 0.000 0.216 0.004 0.780
#> SRR1699934 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.2654 0.656521 0.000 0.004 0.108 0.888
#> SRR1699936 2 0.5568 0.653244 0.000 0.728 0.120 0.152
#> SRR1699937 3 0.4574 0.626645 0.000 0.220 0.756 0.024
#> SRR1699938 2 0.4072 0.625220 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1699940 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1699939 2 0.7325 0.463279 0.000 0.520 0.288 0.192
#> SRR1699941 3 0.1209 0.756143 0.000 0.004 0.964 0.032
#> SRR1699942 3 0.2494 0.754111 0.000 0.048 0.916 0.036
#> SRR1699943 2 0.4843 0.372488 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1699944 2 0.5399 0.205949 0.000 0.520 0.468 0.012
#> SRR1699945 3 0.0895 0.755398 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699946 3 0.4284 0.582146 0.000 0.224 0.764 0.012
#> SRR1699947 3 0.4916 0.018008 0.000 0.424 0.576 0.000
#> SRR1699948 2 0.4994 0.216563 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1699949 2 0.4820 0.515310 0.000 0.692 0.012 0.296
#> SRR1699950 2 0.5500 0.593311 0.000 0.708 0.068 0.224
#> SRR1699951 3 0.6522 0.405480 0.000 0.112 0.608 0.280
#> SRR1699952 3 0.3606 0.706830 0.000 0.132 0.844 0.024
#> SRR1699953 2 0.5292 0.659150 0.000 0.724 0.216 0.060
#> SRR1699954 3 0.0992 0.750154 0.008 0.012 0.976 0.004
#> SRR1699955 2 0.3266 0.714174 0.000 0.876 0.084 0.040
#> SRR1699956 3 0.1109 0.757080 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699957 3 0.5682 0.263229 0.000 0.352 0.612 0.036
#> SRR1699959 3 0.2999 0.715520 0.000 0.004 0.864 0.132
#> SRR1699958 4 0.5157 0.575878 0.000 0.028 0.284 0.688
#> SRR1699960 2 0.5724 0.637807 0.000 0.716 0.140 0.144
#> SRR1699961 3 0.1452 0.756276 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1699962 2 0.4444 0.703155 0.000 0.808 0.072 0.120
#> SRR1699963 3 0.2996 0.750846 0.000 0.064 0.892 0.044
#> SRR1699964 2 0.5088 0.320884 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1699965 2 0.2775 0.716504 0.000 0.896 0.020 0.084
#> SRR1699966 4 0.5161 0.196419 0.000 0.004 0.476 0.520
#> SRR1699967 2 0.4925 0.318277 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1699968 3 0.5700 0.095172 0.000 0.028 0.560 0.412
#> SRR1699969 3 0.5132 0.000275 0.000 0.004 0.548 0.448
#> SRR1699971 3 0.1610 0.757917 0.000 0.016 0.952 0.032
#> SRR1699970 3 0.5167 -0.135326 0.000 0.488 0.508 0.004
#> SRR1699972 3 0.1452 0.756276 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1699973 4 0.5746 0.486862 0.000 0.040 0.348 0.612
#> SRR1699974 3 0.1388 0.749213 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1699975 4 0.5355 0.475277 0.000 0.020 0.360 0.620
#> SRR1699976 3 0.1452 0.756276 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1699977 3 0.5112 0.056771 0.000 0.004 0.560 0.436
#> SRR1699978 3 0.4549 0.624835 0.036 0.000 0.776 0.188
#> SRR1699979 3 0.5039 0.141004 0.000 0.004 0.592 0.404
#> SRR1699980 4 0.5070 0.367104 0.000 0.004 0.416 0.580
#> SRR1699981 3 0.4343 0.531345 0.000 0.004 0.732 0.264
#> SRR1699982 4 0.4535 0.361704 0.000 0.292 0.004 0.704
#> SRR1699983 4 0.3710 0.639456 0.000 0.004 0.192 0.804
#> SRR1699984 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 4 0.7313 0.321022 0.000 0.176 0.316 0.508
#> SRR1699986 3 0.3485 0.708645 0.028 0.000 0.856 0.116
#> SRR1699988 3 0.7818 -0.117723 0.000 0.324 0.408 0.268
#> SRR1699987 4 0.5080 0.370540 0.000 0.004 0.420 0.576
#> SRR1699989 4 0.5293 0.621135 0.000 0.100 0.152 0.748
#> SRR1699990 4 0.5097 0.364425 0.000 0.004 0.428 0.568
#> SRR1699992 3 0.1488 0.752525 0.000 0.032 0.956 0.012
#> SRR1699991 3 0.2197 0.742956 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1699993 3 0.6156 0.254860 0.048 0.004 0.576 0.372
#> SRR1699994 3 0.0895 0.755408 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699995 3 0.3978 0.689613 0.108 0.000 0.836 0.056
#> SRR1699996 2 0.7001 0.217761 0.000 0.464 0.420 0.116
#> SRR1699997 4 0.3907 0.615104 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1699998 3 0.3842 0.723106 0.000 0.128 0.836 0.036
#> SRR1699999 1 0.3852 0.794798 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1700000 3 0.0524 0.749898 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700002 3 0.2892 0.748919 0.000 0.068 0.896 0.036
#> SRR1700001 3 0.1510 0.757655 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1700003 3 0.2124 0.752326 0.000 0.008 0.924 0.068
#> SRR1700004 3 0.2999 0.704805 0.000 0.004 0.864 0.132
#> SRR1700005 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700007 2 0.5119 0.249376 0.000 0.556 0.004 0.440
#> SRR1700008 4 0.4222 0.589050 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700009 1 0.0592 0.927044 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700010 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700011 2 0.5074 0.583939 0.000 0.724 0.040 0.236
#> SRR1700013 3 0.3090 0.748494 0.000 0.056 0.888 0.056
#> SRR1700012 3 0.2002 0.757967 0.000 0.020 0.936 0.044
#> SRR1700014 3 0.5097 0.063899 0.000 0.004 0.568 0.428
#> SRR1700015 3 0.2032 0.757592 0.000 0.028 0.936 0.036
#> SRR1700016 1 0.4220 0.722038 0.748 0.004 0.248 0.000
#> SRR1700018 3 0.1452 0.756276 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700017 3 0.1545 0.755583 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700019 2 0.5113 0.532802 0.000 0.684 0.024 0.292
#> SRR1700020 3 0.1743 0.753157 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700021 4 0.5759 0.438028 0.000 0.180 0.112 0.708
#> SRR1700023 3 0.1978 0.748954 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700022 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700024 4 0.5472 0.308140 0.000 0.016 0.440 0.544
#> SRR1700025 3 0.3674 0.726930 0.000 0.116 0.848 0.036
#> SRR1700026 3 0.1297 0.755776 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR1700027 3 0.1584 0.756947 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1700028 4 0.3907 0.616862 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700029 3 0.4972 0.019666 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700030 4 0.6229 0.477305 0.000 0.088 0.284 0.628
#> SRR1700031 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700032 3 0.4465 0.683272 0.000 0.144 0.800 0.056
#> SRR1700034 1 0.3355 0.830647 0.836 0.004 0.160 0.000
#> SRR1700035 4 0.2255 0.656904 0.000 0.012 0.068 0.920
#> SRR1700033 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700036 3 0.5163 -0.101556 0.000 0.004 0.516 0.480
#> SRR1700037 4 0.3945 0.483279 0.000 0.216 0.004 0.780
#> SRR1700038 3 0.2796 0.733415 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1700039 3 0.1743 0.752491 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700040 3 0.1305 0.755748 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700041 3 0.4950 0.219170 0.000 0.004 0.620 0.376
#> SRR1700042 3 0.2125 0.742312 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1700043 3 0.0376 0.749309 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700045 3 0.5183 0.198729 0.000 0.008 0.584 0.408
#> SRR1700044 3 0.4292 0.720420 0.000 0.100 0.820 0.080
#> SRR1700046 3 0.3751 0.605670 0.000 0.004 0.800 0.196
#> SRR1700047 3 0.3123 0.674780 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700048 4 0.5105 0.353390 0.000 0.004 0.432 0.564
#> SRR1700049 3 0.3781 0.714319 0.028 0.004 0.844 0.124
#> SRR1700050 3 0.4991 0.204478 0.000 0.004 0.608 0.388
#> SRR1700051 3 0.2125 0.747650 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1700052 3 0.0524 0.750583 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700053 4 0.5155 0.248798 0.000 0.004 0.468 0.528
#> SRR1700054 3 0.1305 0.757087 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700055 1 0.0592 0.933901 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700056 4 0.4500 0.531351 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1700057 4 0.4972 0.282329 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1700058 3 0.1004 0.755686 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700059 4 0.4605 0.523521 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700060 3 0.3105 0.693128 0.000 0.004 0.856 0.140
#> SRR1700061 3 0.0895 0.754062 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700062 3 0.5004 0.192916 0.000 0.004 0.604 0.392
#> SRR1700063 3 0.1743 0.751805 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700064 4 0.4313 0.601920 0.000 0.004 0.260 0.736
#> SRR1700065 3 0.1004 0.754855 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700066 3 0.1004 0.755686 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700067 4 0.2081 0.656229 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700068 4 0.4948 0.311000 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700069 4 0.5070 0.379222 0.000 0.004 0.416 0.580
#> SRR1700070 4 0.7752 0.160356 0.000 0.264 0.300 0.436
#> SRR1700071 3 0.4781 0.318981 0.000 0.004 0.660 0.336
#> SRR1700072 3 0.0376 0.749309 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700073 4 0.2706 0.614836 0.000 0.080 0.020 0.900
#> SRR1700075 3 0.2401 0.746591 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR1700074 3 0.1576 0.754110 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1700076 3 0.4121 0.674642 0.000 0.020 0.796 0.184
#> SRR1700077 3 0.1356 0.756730 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700078 3 0.3448 0.685017 0.000 0.004 0.828 0.168
#> SRR1700080 4 0.5126 0.307939 0.000 0.004 0.444 0.552
#> SRR1700079 3 0.5088 0.092917 0.000 0.004 0.572 0.424
#> SRR1700081 3 0.1978 0.748134 0.000 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700082 3 0.1398 0.755426 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1700083 3 0.2149 0.743534 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700084 3 0.1762 0.737505 0.048 0.004 0.944 0.004
#> SRR1700085 4 0.4568 0.652473 0.000 0.076 0.124 0.800
#> SRR1700086 3 0.5112 0.046558 0.000 0.004 0.560 0.436
#> SRR1700087 3 0.4985 0.682024 0.008 0.064 0.780 0.148
#> SRR1700088 3 0.2830 0.753332 0.000 0.040 0.900 0.060
#> SRR1700089 3 0.4805 0.700641 0.000 0.132 0.784 0.084
#> SRR1700091 4 0.5478 0.488768 0.000 0.028 0.344 0.628
#> SRR1700090 4 0.4134 0.599623 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700092 4 0.5189 0.454330 0.000 0.012 0.372 0.616
#> SRR1700094 3 0.5374 0.544399 0.000 0.052 0.704 0.244
#> SRR1700093 4 0.3751 0.628820 0.000 0.004 0.196 0.800
#> SRR1700095 3 0.4866 0.250949 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1700096 4 0.4941 0.321233 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700097 3 0.2888 0.707339 0.004 0.000 0.872 0.124
#> SRR1700098 4 0.7355 0.315284 0.000 0.340 0.172 0.488
#> SRR1700099 4 0.5397 0.619254 0.000 0.064 0.220 0.716
#> SRR1700100 4 0.4647 0.570116 0.000 0.008 0.288 0.704
#> SRR1700101 4 0.4980 0.551874 0.000 0.016 0.304 0.680
#> SRR1700102 4 0.4482 0.597611 0.000 0.008 0.264 0.728
#> SRR1700104 4 0.5147 0.205360 0.000 0.004 0.460 0.536
#> SRR1700103 4 0.4933 0.294079 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700105 4 0.2216 0.654163 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700106 4 0.3610 0.635389 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700107 4 0.4328 0.612604 0.000 0.008 0.244 0.748
#> SRR1700108 4 0.3935 0.656100 0.000 0.060 0.100 0.840
#> SRR1700109 2 0.5060 0.334690 0.000 0.584 0.004 0.412
#> SRR1700110 2 0.5453 0.351834 0.000 0.592 0.020 0.388
#> SRR1700112 4 0.4431 0.330147 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1700111 4 0.3801 0.622152 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700113 4 0.1820 0.654176 0.000 0.020 0.036 0.944
#> SRR1700114 4 0.4868 0.602208 0.000 0.024 0.256 0.720
#> SRR1700115 4 0.3048 0.657523 0.000 0.016 0.108 0.876
#> SRR1700116 4 0.3942 0.612063 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700117 3 0.4817 0.302583 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700119 4 0.3726 0.629070 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700118 4 0.4008 0.606557 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700120 3 0.4382 0.482640 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700121 4 0.3266 0.644478 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700122 4 0.1305 0.637353 0.000 0.036 0.004 0.960
#> SRR1700123 4 0.3975 0.611317 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700125 4 0.4500 0.307660 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1700126 3 0.4401 0.548602 0.000 0.004 0.724 0.272
#> SRR1700127 4 0.4134 0.593704 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700124 4 0.4008 0.610323 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700128 4 0.3837 0.621209 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700129 4 0.1902 0.656583 0.000 0.004 0.064 0.932
#> SRR1700130 4 0.1940 0.655910 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700132 4 0.4040 0.608792 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700131 4 0.4382 0.561445 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700133 4 0.2530 0.654319 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700134 4 0.3962 0.583370 0.000 0.152 0.028 0.820
#> SRR1700135 4 0.3837 0.623145 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700136 4 0.4103 0.598458 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700137 4 0.3873 0.617705 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700138 4 0.3975 0.614732 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700140 4 0.3975 0.612831 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700139 4 0.3837 0.620003 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700141 4 0.2999 0.576533 0.000 0.132 0.004 0.864
#> SRR1700142 4 0.4916 0.341222 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700143 4 0.4250 0.579581 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1700144 4 0.5163 0.207828 0.000 0.004 0.480 0.516
#> SRR1700145 4 0.4040 0.607849 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700146 4 0.0779 0.646237 0.000 0.004 0.016 0.980
#> SRR1700147 4 0.3942 0.612063 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700149 4 0.4936 0.458530 0.004 0.000 0.372 0.624
#> SRR1700148 4 0.4008 0.613362 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700150 4 0.1637 0.654997 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700152 4 0.3726 0.630886 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700151 4 0.3942 0.612063 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700153 4 0.3942 0.612063 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700154 4 0.3907 0.614777 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700155 4 0.3610 0.631821 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700156 4 0.4040 0.603211 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700158 4 0.4967 0.285452 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700159 4 0.4406 0.340863 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1700157 4 0.4008 0.606526 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700160 4 0.3801 0.623287 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700161 4 0.3942 0.612063 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700162 4 0.5392 0.428745 0.000 0.280 0.040 0.680
#> SRR1700164 3 0.6067 0.267178 0.052 0.000 0.572 0.376
#> SRR1700163 4 0.5396 0.230361 0.012 0.000 0.464 0.524
#> SRR1700165 4 0.4454 0.550017 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700166 4 0.3024 0.651481 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700168 4 0.2011 0.609743 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1700167 4 0.4103 0.598320 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700170 4 0.2466 0.655872 0.000 0.004 0.096 0.900
#> SRR1700169 4 0.3942 0.613866 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700171 3 0.5070 0.267172 0.008 0.000 0.620 0.372
#> SRR1700172 4 0.3123 0.645928 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700174 4 0.4040 0.604519 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700173 4 0.3837 0.620093 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700175 4 0.0188 0.642087 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700176 3 0.3048 0.737532 0.016 0.000 0.876 0.108
#> SRR1700178 2 0.0817 0.712628 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700177 4 0.3444 0.637914 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700180 2 0.0469 0.710006 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700179 2 0.1474 0.711139 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700181 2 0.0921 0.712349 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.1637 0.712976 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700184 2 0.0817 0.712448 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700186 2 0.4855 0.367857 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.2760 0.700060 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1700192 1 0.4457 0.810525 0.816 0.108 0.072 0.004
#> SRR1700190 1 0.5325 0.186710 0.524 0.004 0.468 0.004
#> SRR1700191 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0336 0.708694 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700195 2 0.0469 0.710650 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.4193 0.563150 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1700197 1 0.1305 0.923028 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR1700198 2 0.0707 0.711876 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700199 2 0.0336 0.708070 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700200 2 0.0188 0.706627 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.3105 0.695978 0.000 0.856 0.140 0.004
#> SRR1700202 2 0.8674 0.334963 0.256 0.504 0.112 0.128
#> SRR1700203 2 0.0469 0.710283 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700204 2 0.3428 0.688064 0.000 0.844 0.144 0.012
#> SRR1700206 2 0.4356 0.533720 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1700207 2 0.4454 0.508401 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1700208 1 0.5670 0.645027 0.704 0.056 0.232 0.008
#> SRR1700205 2 0.4940 0.693402 0.000 0.776 0.128 0.096
#> SRR1700209 2 0.2036 0.723034 0.000 0.936 0.032 0.032
#> SRR1700210 2 0.2670 0.714313 0.000 0.908 0.040 0.052
#> SRR1700211 2 0.5385 0.598832 0.160 0.764 0.032 0.044
#> SRR1700212 2 0.1059 0.713007 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1700213 3 0.5746 0.303341 0.000 0.348 0.612 0.040
#> SRR1700214 2 0.0524 0.709835 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700215 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.1677 0.714439 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1700216 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.4819 0.460763 0.000 0.652 0.344 0.004
#> SRR1700219 2 0.4761 0.476137 0.000 0.664 0.332 0.004
#> SRR1700222 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 4 0.5161 0.009546 0.000 0.476 0.004 0.520
#> SRR1700221 2 0.2224 0.718046 0.000 0.928 0.040 0.032
#> SRR1700223 2 0.0188 0.706627 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700224 2 0.5279 0.649161 0.000 0.736 0.192 0.072
#> SRR1700226 2 0.0657 0.712186 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1700229 2 0.2179 0.716353 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1700225 3 0.5393 0.477573 0.000 0.268 0.688 0.044
#> SRR1700227 2 0.2589 0.699099 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700230 1 0.0657 0.933613 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700231 2 0.5090 0.483578 0.000 0.660 0.324 0.016
#> SRR1700228 2 0.5458 0.596166 0.000 0.704 0.236 0.060
#> SRR1700232 2 0.0336 0.709030 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700233 2 0.2443 0.716177 0.000 0.916 0.060 0.024
#> SRR1700234 2 0.6566 0.556053 0.000 0.624 0.236 0.140
#> SRR1700235 2 0.6249 0.353795 0.000 0.580 0.352 0.068
#> SRR1700237 2 0.1211 0.712733 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1700236 2 0.1302 0.717967 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700238 2 0.0188 0.706627 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.8608 0.364691 0.184 0.160 0.536 0.120
#> SRR1700243 2 0.0817 0.710852 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700244 2 0.0779 0.711442 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1700242 1 0.1059 0.927488 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1700246 2 0.9338 0.222264 0.192 0.376 0.320 0.112
#> SRR1700245 2 0.1302 0.716153 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.2408 0.704472 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1700248 2 0.0895 0.714028 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1700251 2 0.0469 0.710020 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700252 3 0.6952 0.216026 0.032 0.352 0.560 0.056
#> SRR1700253 2 0.0336 0.709030 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700256 2 0.0376 0.707657 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700254 1 0.0000 0.938738 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0779 0.711942 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1700257 2 0.4643 0.455239 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1700258 2 0.3764 0.628129 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1700259 2 0.4054 0.638090 0.000 0.796 0.016 0.188
#> SRR1700260 2 0.4761 0.452398 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1700261 2 0.4767 0.557205 0.000 0.724 0.020 0.256
#> SRR1700262 2 0.4955 0.436677 0.000 0.648 0.008 0.344
#> SRR1700263 2 0.4511 0.588958 0.000 0.724 0.268 0.008
#> SRR1700264 3 0.4998 -0.153357 0.000 0.488 0.512 0.000
#> SRR1700265 3 0.4295 0.524606 0.000 0.240 0.752 0.008
#> SRR1700266 2 0.5111 0.672151 0.000 0.740 0.204 0.056
#> SRR1700268 3 0.8607 0.107792 0.044 0.248 0.448 0.260
#> SRR1700270 2 0.3074 0.681655 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1700267 2 0.3081 0.720117 0.000 0.888 0.048 0.064
#> SRR1700271 2 0.4079 0.635897 0.000 0.800 0.020 0.180
#> SRR1700272 2 0.4086 0.602075 0.000 0.776 0.008 0.216
#> SRR1700273 2 0.3047 0.712106 0.000 0.872 0.116 0.012
#> SRR1700274 2 0.3280 0.685770 0.000 0.860 0.016 0.124
#> SRR1700277 3 0.3908 0.713112 0.032 0.116 0.844 0.008
#> SRR1700275 2 0.4872 0.441006 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1700276 2 0.4978 0.514829 0.000 0.664 0.012 0.324
#> SRR1700278 2 0.5428 0.434622 0.000 0.600 0.020 0.380
#> SRR1700279 4 0.6906 -0.192725 0.000 0.408 0.108 0.484
#> SRR1700280 2 0.7297 0.358984 0.000 0.456 0.152 0.392
#> SRR1700281 2 0.1209 0.717836 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1700283 2 0.5119 0.290443 0.000 0.556 0.004 0.440
#> SRR1700282 4 0.6554 0.116413 0.000 0.084 0.376 0.540
#> SRR1700284 4 0.4722 0.349460 0.000 0.300 0.008 0.692
#> SRR1700285 4 0.5933 -0.134316 0.000 0.464 0.036 0.500
#> SRR1700286 2 0.5673 0.365357 0.000 0.596 0.032 0.372
#> SRR1700287 2 0.5168 0.181018 0.000 0.500 0.004 0.496
#> SRR1700290 3 0.6056 0.477292 0.248 0.000 0.660 0.092
#> SRR1700289 2 0.5292 0.213130 0.000 0.512 0.008 0.480
#> SRR1700288 2 0.1854 0.709910 0.000 0.940 0.012 0.048
#> SRR1700292 4 0.4889 0.219004 0.000 0.360 0.004 0.636
#> SRR1700291 4 0.1888 0.654470 0.000 0.016 0.044 0.940
#> SRR1700293 2 0.5487 0.415165 0.000 0.580 0.020 0.400
#> SRR1700294 4 0.5055 0.187923 0.000 0.368 0.008 0.624
#> SRR1700295 4 0.5884 0.244550 0.000 0.044 0.364 0.592
#> SRR1700297 4 0.4655 0.323744 0.000 0.312 0.004 0.684
#> SRR1700296 2 0.6506 0.266140 0.000 0.472 0.072 0.456
#> SRR1700298 4 0.6924 0.279428 0.000 0.180 0.232 0.588
#> SRR1700299 4 0.4532 0.564812 0.000 0.052 0.156 0.792
#> SRR1700300 4 0.7863 -0.178941 0.000 0.304 0.300 0.396
#> SRR1700302 4 0.4072 0.430156 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1700301 4 0.4428 0.393638 0.000 0.276 0.004 0.720
#> SRR1700303 4 0.4250 0.388647 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1700304 4 0.7919 -0.214853 0.004 0.320 0.252 0.424
#> SRR1700305 2 0.5508 0.226891 0.000 0.508 0.016 0.476
#> SRR1700306 4 0.5769 0.179736 0.000 0.036 0.376 0.588
#> SRR1700308 4 0.6819 0.426976 0.000 0.188 0.208 0.604
#> SRR1700307 3 0.6087 0.237461 0.000 0.048 0.540 0.412
#> SRR1700309 3 0.5060 0.296388 0.000 0.004 0.584 0.412
#> SRR1700310 4 0.4018 0.471815 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR1700311 4 0.4633 0.511923 0.000 0.172 0.048 0.780
#> SRR1700312 2 0.5263 0.318113 0.000 0.544 0.008 0.448
#> SRR1700313 3 0.7598 0.134028 0.000 0.216 0.460 0.324
#> SRR1700314 4 0.2530 0.655332 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700315 4 0.5375 0.526118 0.000 0.116 0.140 0.744
#> SRR1700316 4 0.4139 0.637838 0.000 0.024 0.176 0.800
#> SRR1700317 2 0.3933 0.657037 0.000 0.792 0.008 0.200
#> SRR1700318 4 0.7210 0.112912 0.000 0.276 0.184 0.540
#> SRR1700319 4 0.3144 0.605098 0.000 0.072 0.044 0.884
#> SRR1700320 4 0.4584 0.351463 0.000 0.300 0.004 0.696
#> SRR1700322 4 0.7476 0.035088 0.000 0.260 0.236 0.504
#> SRR1700321 4 0.5173 0.311476 0.000 0.320 0.020 0.660
#> SRR1700323 4 0.2944 0.569533 0.000 0.128 0.004 0.868
#> SRR1700324 2 0.5158 0.241438 0.000 0.524 0.004 0.472
#> SRR1700325 2 0.4576 0.586227 0.000 0.728 0.012 0.260
#> SRR1700326 4 0.4907 0.086232 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700327 4 0.5689 0.571076 0.000 0.184 0.104 0.712
#> SRR1700329 4 0.4098 0.493696 0.000 0.204 0.012 0.784
#> SRR1700328 3 0.6389 0.156045 0.000 0.064 0.488 0.448
#> SRR1700330 4 0.7857 -0.061840 0.004 0.228 0.340 0.428
#> SRR1700331 4 0.3812 0.558561 0.000 0.140 0.028 0.832
#> SRR1700332 4 0.5183 0.081469 0.000 0.408 0.008 0.584
#> SRR1700333 2 0.6708 0.412868 0.000 0.528 0.096 0.376
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.3750 0.69113 0.000 0.824 0.088 0.004 0.084
#> SRR1699875 3 0.7054 0.53763 0.000 0.220 0.556 0.152 0.072
#> SRR1699876 2 0.6910 -0.18604 0.000 0.480 0.016 0.268 0.236
#> SRR1699877 2 0.3803 0.68392 0.000 0.804 0.140 0.000 0.056
#> SRR1699879 2 0.6960 0.47652 0.000 0.592 0.164 0.124 0.120
#> SRR1699878 2 0.5158 0.56517 0.000 0.656 0.264 0.000 0.080
#> SRR1699880 3 0.4039 0.64758 0.000 0.004 0.776 0.184 0.036
#> SRR1699881 3 0.5091 0.64228 0.000 0.024 0.712 0.208 0.056
#> SRR1699882 2 0.5057 0.61902 0.000 0.756 0.056 0.076 0.112
#> SRR1699883 2 0.4337 0.63982 0.000 0.744 0.204 0.000 0.052
#> SRR1699884 2 0.4453 0.61889 0.000 0.724 0.228 0.000 0.048
#> SRR1699885 2 0.3176 0.69269 0.000 0.856 0.080 0.000 0.064
#> SRR1699886 2 0.6850 -0.09875 0.000 0.508 0.024 0.184 0.284
#> SRR1699888 2 0.3932 0.67619 0.000 0.828 0.036 0.044 0.092
#> SRR1699889 5 0.6642 0.64130 0.000 0.164 0.012 0.344 0.480
#> SRR1699890 2 0.6812 0.09048 0.000 0.516 0.032 0.148 0.304
#> SRR1699887 2 0.6313 0.16286 0.000 0.576 0.012 0.172 0.240
#> SRR1699891 5 0.6349 0.71899 0.000 0.220 0.004 0.228 0.548
#> SRR1699892 3 0.6540 0.56134 0.000 0.208 0.616 0.084 0.092
#> SRR1699893 4 0.3593 0.62599 0.000 0.000 0.088 0.828 0.084
#> SRR1699894 5 0.6328 0.73040 0.000 0.196 0.004 0.252 0.548
#> SRR1699895 5 0.5968 0.73093 0.000 0.156 0.000 0.268 0.576
#> SRR1699896 3 0.5860 0.54009 0.000 0.104 0.680 0.048 0.168
#> SRR1699897 2 0.7723 0.32804 0.000 0.472 0.256 0.156 0.116
#> SRR1699898 3 0.5271 0.51870 0.000 0.000 0.628 0.296 0.076
#> SRR1699900 3 0.3281 0.65386 0.000 0.024 0.864 0.032 0.080
#> SRR1699899 5 0.7242 0.52009 0.000 0.164 0.044 0.368 0.424
#> SRR1699902 3 0.2885 0.65884 0.000 0.004 0.880 0.052 0.064
#> SRR1699901 3 0.4776 0.55235 0.004 0.004 0.740 0.176 0.076
#> SRR1699903 5 0.5767 0.41965 0.000 0.040 0.024 0.448 0.488
#> SRR1699904 5 0.5940 0.72398 0.000 0.140 0.000 0.292 0.568
#> SRR1699905 3 0.5492 0.52756 0.020 0.000 0.692 0.176 0.112
#> SRR1699906 5 0.6567 0.70617 0.000 0.208 0.008 0.264 0.520
#> SRR1699907 5 0.5918 0.73185 0.000 0.168 0.000 0.240 0.592
#> SRR1699908 5 0.5801 0.47612 0.000 0.060 0.012 0.444 0.484
#> SRR1699909 5 0.6697 0.46634 0.000 0.076 0.060 0.360 0.504
#> SRR1699910 4 0.6750 -0.07411 0.000 0.012 0.196 0.484 0.308
#> SRR1699911 5 0.6867 0.63271 0.000 0.088 0.092 0.256 0.564
#> SRR1699912 5 0.5232 0.63326 0.000 0.060 0.000 0.340 0.600
#> SRR1699913 5 0.5811 0.72702 0.000 0.140 0.000 0.264 0.596
#> SRR1699914 3 0.5891 -0.11606 0.000 0.000 0.468 0.432 0.100
#> SRR1699915 5 0.7049 0.33022 0.000 0.024 0.184 0.388 0.404
#> SRR1699916 5 0.6565 0.49833 0.000 0.360 0.004 0.180 0.456
#> SRR1699917 4 0.4457 0.28491 0.000 0.004 0.012 0.656 0.328
#> SRR1699918 4 0.7984 -0.19103 0.000 0.128 0.172 0.424 0.276
#> SRR1699919 5 0.5899 0.61322 0.000 0.040 0.048 0.320 0.592
#> SRR1699920 4 0.4960 0.54182 0.000 0.000 0.180 0.708 0.112
#> SRR1699921 5 0.6723 0.45209 0.000 0.024 0.136 0.364 0.476
#> SRR1699922 5 0.7190 0.37305 0.000 0.364 0.064 0.120 0.452
#> SRR1699923 3 0.5690 0.55943 0.016 0.036 0.720 0.100 0.128
#> SRR1699924 4 0.5639 0.15634 0.000 0.000 0.396 0.524 0.080
#> SRR1699925 1 0.0703 0.92829 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699926 5 0.6281 0.38088 0.000 0.020 0.088 0.420 0.472
#> SRR1699927 5 0.5557 0.72041 0.000 0.116 0.000 0.260 0.624
#> SRR1699929 3 0.6769 0.44351 0.000 0.120 0.592 0.076 0.212
#> SRR1699928 5 0.5472 0.71853 0.000 0.108 0.000 0.260 0.632
#> SRR1699930 5 0.6084 0.71085 0.000 0.220 0.000 0.208 0.572
#> SRR1699931 3 0.6807 0.45671 0.000 0.104 0.604 0.116 0.176
#> SRR1699933 3 0.4820 0.61485 0.000 0.012 0.708 0.236 0.044
#> SRR1699932 5 0.5525 0.71172 0.000 0.100 0.000 0.288 0.612
#> SRR1699934 1 0.0703 0.92829 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699935 4 0.5351 0.37790 0.000 0.008 0.068 0.644 0.280
#> SRR1699936 2 0.6132 0.56115 0.000 0.672 0.092 0.096 0.140
#> SRR1699937 3 0.7088 0.54844 0.000 0.224 0.548 0.160 0.068
#> SRR1699938 2 0.4269 0.67297 0.000 0.780 0.140 0.004 0.076
#> SRR1699940 3 0.4745 0.64642 0.000 0.020 0.740 0.192 0.048
#> SRR1699939 2 0.6796 0.48225 0.000 0.612 0.128 0.136 0.124
#> SRR1699941 3 0.3801 0.66396 0.000 0.012 0.808 0.152 0.028
#> SRR1699942 3 0.5893 0.63768 0.000 0.072 0.676 0.184 0.068
#> SRR1699943 2 0.6212 0.40357 0.000 0.600 0.272 0.092 0.036
#> SRR1699944 2 0.7155 0.17988 0.000 0.472 0.348 0.108 0.072
#> SRR1699945 3 0.2767 0.65386 0.004 0.004 0.884 0.020 0.088
#> SRR1699946 3 0.6412 0.50157 0.000 0.244 0.608 0.072 0.076
#> SRR1699947 2 0.5894 0.31082 0.000 0.520 0.400 0.016 0.064
#> SRR1699948 2 0.5427 0.52643 0.000 0.636 0.284 0.008 0.072
#> SRR1699949 2 0.6136 0.23053 0.000 0.616 0.016 0.188 0.180
#> SRR1699950 2 0.5911 0.48975 0.000 0.684 0.056 0.136 0.124
#> SRR1699951 4 0.7232 0.05470 0.000 0.088 0.396 0.424 0.092
#> SRR1699952 3 0.6503 0.61088 0.000 0.116 0.628 0.180 0.076
#> SRR1699953 2 0.4266 0.67967 0.000 0.800 0.072 0.020 0.108
#> SRR1699954 3 0.3562 0.63634 0.012 0.024 0.836 0.004 0.124
#> SRR1699955 2 0.3689 0.69383 0.000 0.836 0.084 0.012 0.068
#> SRR1699956 3 0.3748 0.67181 0.000 0.004 0.824 0.080 0.092
#> SRR1699957 3 0.7634 0.36947 0.000 0.300 0.448 0.168 0.084
#> SRR1699959 3 0.5073 0.53149 0.000 0.008 0.640 0.312 0.040
#> SRR1699958 4 0.5356 0.59684 0.000 0.016 0.176 0.700 0.108
#> SRR1699960 2 0.6068 0.58115 0.000 0.680 0.092 0.108 0.120
#> SRR1699961 3 0.4535 0.64562 0.000 0.020 0.756 0.184 0.040
#> SRR1699962 2 0.4833 0.65756 0.000 0.772 0.048 0.080 0.100
#> SRR1699963 3 0.6154 0.61497 0.000 0.076 0.640 0.220 0.064
#> SRR1699964 2 0.6029 0.47488 0.000 0.612 0.280 0.044 0.064
#> SRR1699965 2 0.4644 0.64733 0.000 0.780 0.032 0.084 0.104
#> SRR1699966 4 0.5254 0.57441 0.000 0.012 0.236 0.680 0.072
#> SRR1699967 2 0.6122 0.45066 0.000 0.600 0.288 0.044 0.068
#> SRR1699968 4 0.6550 0.16046 0.000 0.028 0.384 0.484 0.104
#> SRR1699969 4 0.5365 0.15387 0.000 0.000 0.416 0.528 0.056
#> SRR1699971 3 0.4735 0.65335 0.000 0.016 0.748 0.172 0.064
#> SRR1699970 2 0.7113 0.11894 0.000 0.460 0.368 0.100 0.072
#> SRR1699972 3 0.4221 0.65687 0.000 0.016 0.780 0.168 0.036
#> SRR1699973 4 0.5781 0.59283 0.000 0.016 0.208 0.652 0.124
#> SRR1699974 3 0.3627 0.65787 0.008 0.000 0.836 0.064 0.092
#> SRR1699975 4 0.5604 0.55883 0.000 0.000 0.240 0.628 0.132
#> SRR1699976 3 0.4848 0.64130 0.000 0.016 0.732 0.192 0.060
#> SRR1699977 4 0.5440 0.02597 0.000 0.004 0.468 0.480 0.048
#> SRR1699978 3 0.5947 0.49290 0.036 0.008 0.660 0.224 0.072
#> SRR1699979 4 0.5296 0.02338 0.000 0.000 0.472 0.480 0.048
#> SRR1699980 4 0.5904 0.52858 0.000 0.000 0.232 0.596 0.172
#> SRR1699981 3 0.5559 0.31986 0.000 0.000 0.544 0.380 0.076
#> SRR1699982 5 0.6014 0.72832 0.000 0.172 0.000 0.252 0.576
#> SRR1699983 4 0.5120 0.48088 0.000 0.012 0.056 0.680 0.252
#> SRR1699984 1 0.0609 0.92760 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699985 4 0.7832 0.38320 0.000 0.148 0.180 0.480 0.192
#> SRR1699986 3 0.5452 0.57096 0.044 0.004 0.728 0.132 0.092
#> SRR1699988 3 0.7959 -0.19958 0.000 0.348 0.352 0.092 0.208
#> SRR1699987 4 0.5019 0.44126 0.000 0.000 0.316 0.632 0.052
#> SRR1699989 4 0.7196 0.20638 0.000 0.108 0.096 0.524 0.272
#> SRR1699990 4 0.5541 0.45222 0.000 0.004 0.300 0.612 0.084
#> SRR1699992 3 0.3302 0.66457 0.000 0.020 0.864 0.044 0.072
#> SRR1699991 3 0.3762 0.61978 0.000 0.004 0.748 0.244 0.004
#> SRR1699993 3 0.5964 0.29154 0.016 0.000 0.588 0.304 0.092
#> SRR1699994 3 0.2962 0.67130 0.000 0.000 0.868 0.084 0.048
#> SRR1699995 3 0.5674 0.60114 0.100 0.000 0.712 0.112 0.076
#> SRR1699996 2 0.6164 0.29483 0.000 0.492 0.368 0.000 0.140
#> SRR1699997 4 0.3421 0.61792 0.000 0.000 0.080 0.840 0.080
#> SRR1699998 3 0.6557 0.60588 0.000 0.160 0.620 0.156 0.064
#> SRR1699999 1 0.4803 0.79733 0.756 0.000 0.140 0.020 0.084
#> SRR1700000 3 0.2630 0.65171 0.000 0.012 0.892 0.016 0.080
#> SRR1700002 3 0.5894 0.63746 0.000 0.060 0.672 0.192 0.076
#> SRR1700001 3 0.3473 0.67455 0.000 0.008 0.840 0.112 0.040
#> SRR1700003 3 0.4855 0.60690 0.000 0.012 0.696 0.252 0.040
#> SRR1700004 3 0.5035 0.56241 0.000 0.000 0.672 0.252 0.076
#> SRR1700005 1 0.0794 0.92619 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700006 3 0.4352 0.65431 0.000 0.020 0.772 0.172 0.036
#> SRR1700007 2 0.6932 -0.40694 0.000 0.396 0.008 0.240 0.356
#> SRR1700008 4 0.3595 0.57842 0.000 0.000 0.140 0.816 0.044
#> SRR1700009 1 0.0955 0.92499 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700010 3 0.4332 0.66034 0.000 0.004 0.768 0.164 0.064
#> SRR1700011 2 0.6280 0.38109 0.000 0.636 0.044 0.172 0.148
#> SRR1700013 3 0.5430 0.65200 0.000 0.084 0.704 0.180 0.032
#> SRR1700012 3 0.4630 0.63396 0.000 0.016 0.732 0.216 0.036
#> SRR1700014 4 0.5697 0.13841 0.000 0.000 0.404 0.512 0.084
#> SRR1700015 3 0.5769 0.64162 0.000 0.056 0.684 0.184 0.076
#> SRR1700016 1 0.5158 0.72046 0.704 0.000 0.200 0.012 0.084
#> SRR1700018 3 0.4338 0.64386 0.000 0.020 0.764 0.188 0.028
#> SRR1700017 3 0.4901 0.64317 0.000 0.016 0.732 0.184 0.068
#> SRR1700019 2 0.6630 0.12413 0.000 0.568 0.028 0.212 0.192
#> SRR1700020 3 0.4670 0.63673 0.000 0.000 0.724 0.200 0.076
#> SRR1700021 5 0.6803 0.65315 0.000 0.096 0.064 0.300 0.540
#> SRR1700023 3 0.5249 0.60146 0.000 0.012 0.676 0.244 0.068
#> SRR1700022 3 0.4415 0.64645 0.000 0.012 0.760 0.184 0.044
#> SRR1700024 4 0.5883 0.51285 0.000 0.008 0.256 0.612 0.124
#> SRR1700025 3 0.6830 0.59619 0.000 0.136 0.596 0.184 0.084
#> SRR1700026 3 0.2965 0.65945 0.000 0.012 0.876 0.028 0.084
#> SRR1700027 3 0.4618 0.64460 0.000 0.024 0.748 0.192 0.036
#> SRR1700028 4 0.4158 0.60992 0.000 0.000 0.124 0.784 0.092
#> SRR1700029 4 0.5314 0.09106 0.000 0.000 0.420 0.528 0.052
#> SRR1700030 4 0.7932 0.13748 0.000 0.116 0.164 0.404 0.316
#> SRR1700031 3 0.4324 0.64553 0.000 0.004 0.760 0.184 0.052
#> SRR1700032 3 0.7332 0.51102 0.000 0.196 0.512 0.224 0.068
#> SRR1700034 1 0.4058 0.80654 0.784 0.000 0.152 0.000 0.064
#> SRR1700035 4 0.4240 0.34944 0.000 0.004 0.008 0.684 0.304
#> SRR1700033 3 0.3919 0.64801 0.000 0.000 0.776 0.188 0.036
#> SRR1700036 4 0.5714 0.39137 0.000 0.000 0.312 0.580 0.108
#> SRR1700037 5 0.5729 0.73313 0.000 0.148 0.000 0.236 0.616
#> SRR1700038 3 0.4434 0.62728 0.000 0.088 0.796 0.032 0.084
#> SRR1700039 3 0.4237 0.64212 0.000 0.000 0.772 0.152 0.076
#> SRR1700040 3 0.3724 0.64126 0.000 0.000 0.776 0.204 0.020
#> SRR1700041 3 0.4886 0.10030 0.000 0.004 0.512 0.468 0.016
#> SRR1700042 3 0.4689 0.57363 0.000 0.000 0.688 0.264 0.048
#> SRR1700043 3 0.2054 0.64826 0.000 0.000 0.920 0.028 0.052
#> SRR1700045 4 0.5750 0.20275 0.000 0.024 0.388 0.544 0.044
#> SRR1700044 3 0.6618 0.58265 0.000 0.100 0.628 0.136 0.136
#> SRR1700046 3 0.4632 0.36328 0.000 0.004 0.608 0.376 0.012
#> SRR1700047 3 0.4404 0.56118 0.000 0.000 0.704 0.264 0.032
#> SRR1700048 4 0.5396 0.38384 0.000 0.000 0.340 0.588 0.072
#> SRR1700049 3 0.5540 0.57729 0.020 0.000 0.656 0.252 0.072
#> SRR1700050 4 0.5736 -0.04390 0.000 0.000 0.448 0.468 0.084
#> SRR1700051 3 0.4604 0.62123 0.004 0.000 0.748 0.168 0.080
#> SRR1700052 3 0.2654 0.64787 0.000 0.000 0.888 0.048 0.064
#> SRR1700053 4 0.5606 0.39133 0.000 0.000 0.344 0.568 0.088
#> SRR1700054 3 0.3351 0.66896 0.000 0.004 0.828 0.148 0.020
#> SRR1700055 1 0.1469 0.91980 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1700056 4 0.4035 0.59588 0.000 0.000 0.156 0.784 0.060
#> SRR1700057 4 0.5105 0.42630 0.000 0.000 0.264 0.660 0.076
#> SRR1700058 3 0.3051 0.67076 0.000 0.000 0.852 0.120 0.028
#> SRR1700059 4 0.2889 0.62326 0.000 0.000 0.084 0.872 0.044
#> SRR1700060 3 0.5325 0.50215 0.000 0.000 0.616 0.308 0.076
#> SRR1700061 3 0.2864 0.66416 0.000 0.008 0.884 0.064 0.044
#> SRR1700062 3 0.5611 0.23261 0.000 0.000 0.516 0.408 0.076
#> SRR1700063 3 0.3993 0.63186 0.000 0.000 0.756 0.216 0.028
#> SRR1700064 4 0.3906 0.61224 0.000 0.000 0.068 0.800 0.132
#> SRR1700065 3 0.2409 0.66395 0.000 0.000 0.900 0.068 0.032
#> SRR1700066 3 0.3130 0.66846 0.000 0.000 0.856 0.096 0.048
#> SRR1700067 4 0.4717 0.37842 0.000 0.004 0.048 0.704 0.244
#> SRR1700068 4 0.4619 0.51723 0.000 0.000 0.216 0.720 0.064
#> SRR1700069 4 0.5010 0.46439 0.000 0.000 0.248 0.676 0.076
#> SRR1700070 4 0.8126 0.16940 0.000 0.264 0.184 0.408 0.144
#> SRR1700071 3 0.5505 0.10721 0.000 0.000 0.484 0.452 0.064
#> SRR1700072 3 0.2149 0.64506 0.000 0.000 0.916 0.036 0.048
#> SRR1700073 5 0.6557 0.50405 0.000 0.072 0.048 0.408 0.472
#> SRR1700075 3 0.4201 0.61346 0.000 0.000 0.752 0.204 0.044
#> SRR1700074 3 0.4067 0.63008 0.000 0.004 0.748 0.228 0.020
#> SRR1700076 3 0.6776 0.45488 0.000 0.068 0.596 0.168 0.168
#> SRR1700077 3 0.3838 0.66861 0.000 0.004 0.804 0.148 0.044
#> SRR1700078 3 0.5089 0.56521 0.000 0.016 0.728 0.104 0.152
#> SRR1700080 4 0.5425 0.37624 0.000 0.000 0.320 0.600 0.080
#> SRR1700079 4 0.5635 0.03070 0.000 0.000 0.428 0.496 0.076
#> SRR1700081 3 0.5051 0.57294 0.000 0.000 0.664 0.264 0.072
#> SRR1700082 3 0.4297 0.64618 0.000 0.008 0.756 0.200 0.036
#> SRR1700083 3 0.4527 0.63267 0.000 0.000 0.732 0.204 0.064
#> SRR1700084 3 0.3160 0.64187 0.032 0.000 0.872 0.024 0.072
#> SRR1700085 4 0.6290 0.01343 0.000 0.116 0.020 0.564 0.300
#> SRR1700086 4 0.5538 0.05885 0.000 0.000 0.428 0.504 0.068
#> SRR1700087 3 0.6151 0.56838 0.008 0.076 0.600 0.292 0.024
#> SRR1700088 3 0.5845 0.62837 0.000 0.044 0.660 0.220 0.076
#> SRR1700089 3 0.6322 0.57027 0.000 0.132 0.576 0.272 0.020
#> SRR1700091 4 0.5617 0.56267 0.000 0.036 0.232 0.668 0.064
#> SRR1700090 4 0.4162 0.62881 0.000 0.000 0.176 0.768 0.056
#> SRR1700092 4 0.5424 0.53337 0.000 0.012 0.264 0.652 0.072
#> SRR1700094 3 0.6276 0.39770 0.000 0.068 0.544 0.348 0.040
#> SRR1700093 4 0.5669 0.47547 0.000 0.012 0.128 0.660 0.200
#> SRR1700095 4 0.4900 -0.03465 0.000 0.000 0.464 0.512 0.024
#> SRR1700096 4 0.5152 0.40518 0.000 0.004 0.344 0.608 0.044
#> SRR1700097 3 0.4710 0.56722 0.004 0.004 0.736 0.196 0.060
#> SRR1700098 4 0.7439 0.20991 0.000 0.276 0.104 0.496 0.124
#> SRR1700099 4 0.5889 0.53722 0.000 0.036 0.116 0.668 0.180
#> SRR1700100 4 0.4939 0.61934 0.000 0.012 0.180 0.728 0.080
#> SRR1700101 4 0.5376 0.60096 0.000 0.012 0.196 0.688 0.104
#> SRR1700102 4 0.5197 0.60466 0.000 0.012 0.180 0.708 0.100
#> SRR1700104 4 0.5706 0.55704 0.000 0.016 0.236 0.648 0.100
#> SRR1700103 4 0.4114 0.50579 0.000 0.000 0.272 0.712 0.016
#> SRR1700105 4 0.6134 0.01983 0.000 0.008 0.124 0.556 0.312
#> SRR1700106 4 0.4317 0.46065 0.000 0.000 0.112 0.772 0.116
#> SRR1700107 4 0.4624 0.60842 0.000 0.004 0.148 0.752 0.096
#> SRR1700108 4 0.6428 0.20166 0.000 0.096 0.064 0.616 0.224
#> SRR1700109 2 0.7110 -0.39285 0.000 0.412 0.016 0.316 0.256
#> SRR1700110 2 0.7220 -0.26373 0.000 0.452 0.036 0.316 0.196
#> SRR1700112 5 0.6241 0.70832 0.000 0.164 0.000 0.324 0.512
#> SRR1700111 4 0.3688 0.58528 0.000 0.000 0.124 0.816 0.060
#> SRR1700113 4 0.4715 0.37243 0.000 0.012 0.024 0.684 0.280
#> SRR1700114 4 0.4902 0.61255 0.000 0.004 0.172 0.724 0.100
#> SRR1700115 4 0.4496 0.44325 0.000 0.004 0.040 0.724 0.232
#> SRR1700116 4 0.2735 0.63185 0.000 0.000 0.084 0.880 0.036
#> SRR1700117 4 0.6033 0.00433 0.008 0.004 0.428 0.484 0.076
#> SRR1700119 4 0.2708 0.58951 0.000 0.000 0.044 0.884 0.072
#> SRR1700118 4 0.2859 0.62093 0.000 0.000 0.068 0.876 0.056
#> SRR1700120 3 0.4731 0.39205 0.000 0.000 0.640 0.328 0.032
#> SRR1700121 4 0.4317 0.56391 0.000 0.000 0.076 0.764 0.160
#> SRR1700122 5 0.5083 0.52805 0.000 0.028 0.004 0.428 0.540
#> SRR1700123 4 0.2676 0.55025 0.000 0.000 0.080 0.884 0.036
#> SRR1700125 5 0.5834 0.72173 0.000 0.132 0.000 0.284 0.584
#> SRR1700126 3 0.5290 0.39615 0.000 0.004 0.560 0.392 0.044
#> SRR1700127 4 0.2843 0.63430 0.000 0.000 0.144 0.848 0.008
#> SRR1700124 4 0.1661 0.61442 0.000 0.000 0.036 0.940 0.024
#> SRR1700128 4 0.3019 0.54912 0.000 0.000 0.088 0.864 0.048
#> SRR1700129 4 0.4692 0.22902 0.000 0.024 0.004 0.652 0.320
#> SRR1700130 4 0.4907 0.19736 0.000 0.000 0.056 0.664 0.280
#> SRR1700132 4 0.2370 0.55203 0.000 0.000 0.040 0.904 0.056
#> SRR1700131 4 0.3016 0.62986 0.000 0.000 0.132 0.848 0.020
#> SRR1700133 4 0.4930 0.29158 0.000 0.000 0.072 0.684 0.244
#> SRR1700134 5 0.4907 0.34510 0.000 0.024 0.000 0.484 0.492
#> SRR1700135 4 0.4020 0.55204 0.000 0.000 0.096 0.796 0.108
#> SRR1700136 4 0.2172 0.62488 0.000 0.000 0.076 0.908 0.016
#> SRR1700137 4 0.1041 0.58557 0.000 0.000 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700138 4 0.2079 0.60110 0.000 0.000 0.020 0.916 0.064
#> SRR1700140 4 0.1915 0.61356 0.000 0.000 0.040 0.928 0.032
#> SRR1700139 4 0.1670 0.56853 0.000 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700141 5 0.5435 0.56278 0.000 0.060 0.000 0.428 0.512
#> SRR1700142 4 0.4674 0.49242 0.000 0.000 0.232 0.708 0.060
#> SRR1700143 4 0.3106 0.63067 0.000 0.000 0.140 0.840 0.020
#> SRR1700144 4 0.5552 0.33576 0.000 0.000 0.328 0.584 0.088
#> SRR1700145 4 0.2773 0.49652 0.000 0.000 0.112 0.868 0.020
#> SRR1700146 4 0.4353 0.22794 0.000 0.008 0.004 0.660 0.328
#> SRR1700147 4 0.1117 0.58370 0.000 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR1700149 4 0.4584 0.42544 0.000 0.000 0.228 0.716 0.056
#> SRR1700148 4 0.3115 0.52072 0.000 0.000 0.112 0.852 0.036
#> SRR1700150 4 0.3766 0.36522 0.000 0.000 0.004 0.728 0.268
#> SRR1700152 4 0.2632 0.54895 0.000 0.000 0.040 0.888 0.072
#> SRR1700151 4 0.0693 0.59088 0.000 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1700153 4 0.0798 0.58765 0.000 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1700154 4 0.1668 0.57540 0.000 0.000 0.028 0.940 0.032
#> SRR1700155 4 0.2179 0.55039 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700156 4 0.1216 0.59670 0.000 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1700158 4 0.5063 0.34209 0.000 0.000 0.312 0.632 0.056
#> SRR1700159 5 0.5737 0.71862 0.000 0.120 0.000 0.288 0.592
#> SRR1700157 4 0.1211 0.59692 0.000 0.000 0.024 0.960 0.016
#> SRR1700160 4 0.2769 0.58616 0.000 0.000 0.032 0.876 0.092
#> SRR1700161 4 0.1106 0.59378 0.000 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1700162 5 0.5741 0.50212 0.000 0.072 0.004 0.440 0.484
#> SRR1700164 3 0.7330 0.18216 0.064 0.008 0.488 0.324 0.116
#> SRR1700163 4 0.5579 0.32338 0.012 0.000 0.352 0.580 0.056
#> SRR1700165 4 0.3942 0.56691 0.000 0.000 0.232 0.748 0.020
#> SRR1700166 4 0.4431 0.37990 0.000 0.000 0.052 0.732 0.216
#> SRR1700168 4 0.5650 -0.50731 0.000 0.076 0.000 0.468 0.456
#> SRR1700167 4 0.1725 0.59762 0.000 0.000 0.044 0.936 0.020
#> SRR1700170 4 0.5461 0.21539 0.000 0.000 0.096 0.620 0.284
#> SRR1700169 4 0.2946 0.58733 0.000 0.000 0.044 0.868 0.088
#> SRR1700171 3 0.5452 0.20583 0.004 0.000 0.556 0.384 0.056
#> SRR1700172 4 0.3953 0.53994 0.000 0.000 0.048 0.784 0.168
#> SRR1700174 4 0.4123 0.61773 0.000 0.000 0.104 0.788 0.108
#> SRR1700173 4 0.3056 0.61636 0.000 0.000 0.068 0.864 0.068
#> SRR1700175 4 0.4937 -0.10216 0.000 0.004 0.024 0.580 0.392
#> SRR1700176 3 0.5543 0.55056 0.008 0.004 0.624 0.300 0.064
#> SRR1700178 2 0.1310 0.70768 0.000 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR1700177 4 0.2389 0.54768 0.000 0.000 0.004 0.880 0.116
#> SRR1700180 2 0.1012 0.70502 0.000 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR1700179 2 0.2172 0.70473 0.000 0.908 0.076 0.000 0.016
#> SRR1700181 2 0.2012 0.70689 0.000 0.920 0.060 0.000 0.020
#> SRR1700183 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700182 2 0.2189 0.70061 0.000 0.904 0.084 0.000 0.012
#> SRR1700184 2 0.1568 0.70891 0.000 0.944 0.036 0.000 0.020
#> SRR1700186 2 0.4652 0.56792 0.000 0.700 0.260 0.008 0.032
#> SRR1700187 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700188 2 0.2482 0.70554 0.000 0.892 0.084 0.000 0.024
#> SRR1700192 1 0.6210 0.73699 0.692 0.128 0.072 0.020 0.088
#> SRR1700190 1 0.6065 0.30395 0.472 0.000 0.420 0.004 0.104
#> SRR1700191 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700189 1 0.0000 0.92961 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.1117 0.70275 0.000 0.964 0.016 0.000 0.020
#> SRR1700195 2 0.1282 0.69755 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR1700194 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700196 2 0.2825 0.68728 0.000 0.860 0.124 0.000 0.016
#> SRR1700197 1 0.3644 0.84528 0.824 0.000 0.096 0.000 0.080
#> SRR1700198 2 0.1741 0.70828 0.000 0.936 0.040 0.000 0.024
#> SRR1700199 2 0.1124 0.69788 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1700200 2 0.1168 0.70025 0.000 0.960 0.008 0.000 0.032
#> SRR1700201 2 0.2974 0.70692 0.000 0.868 0.080 0.000 0.052
#> SRR1700202 2 0.8290 0.30360 0.148 0.460 0.196 0.016 0.180
#> SRR1700203 2 0.2313 0.70937 0.000 0.912 0.040 0.004 0.044
#> SRR1700204 2 0.2592 0.70566 0.000 0.892 0.056 0.000 0.052
#> SRR1700206 2 0.2964 0.69056 0.000 0.856 0.120 0.000 0.024
#> SRR1700207 2 0.4000 0.67985 0.000 0.800 0.132 0.004 0.064
#> SRR1700208 1 0.7371 0.49741 0.524 0.072 0.276 0.012 0.116
#> SRR1700205 2 0.4567 0.62666 0.000 0.752 0.080 0.004 0.164
#> SRR1700209 2 0.3411 0.69520 0.000 0.860 0.036 0.032 0.072
#> SRR1700210 2 0.3622 0.66300 0.000 0.820 0.056 0.000 0.124
#> SRR1700211 2 0.6722 0.50272 0.096 0.636 0.128 0.008 0.132
#> SRR1700212 2 0.1768 0.69325 0.000 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1700213 3 0.5981 0.11395 0.000 0.384 0.512 0.004 0.100
#> SRR1700214 2 0.1270 0.69469 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700215 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.2689 0.68620 0.000 0.888 0.016 0.012 0.084
#> SRR1700216 1 0.0609 0.92898 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700218 2 0.3724 0.66282 0.000 0.788 0.184 0.000 0.028
#> SRR1700219 2 0.4294 0.68718 0.000 0.792 0.112 0.012 0.084
#> SRR1700222 1 0.0000 0.92961 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.6962 -0.14111 0.000 0.468 0.016 0.260 0.256
#> SRR1700221 2 0.3086 0.69357 0.004 0.868 0.032 0.004 0.092
#> SRR1700223 2 0.1331 0.69873 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040
#> SRR1700224 2 0.4478 0.63663 0.000 0.764 0.088 0.004 0.144
#> SRR1700226 2 0.2450 0.70444 0.000 0.896 0.028 0.000 0.076
#> SRR1700229 2 0.3040 0.68710 0.000 0.876 0.012 0.044 0.068
#> SRR1700225 3 0.6471 0.38065 0.000 0.272 0.576 0.036 0.116
#> SRR1700227 2 0.1399 0.70730 0.000 0.952 0.028 0.000 0.020
#> SRR1700230 1 0.0613 0.92760 0.984 0.004 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700231 2 0.4604 0.65455 0.000 0.748 0.168 0.004 0.080
#> SRR1700228 2 0.4049 0.66023 0.000 0.792 0.084 0.000 0.124
#> SRR1700232 2 0.1041 0.69663 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1700233 2 0.2535 0.69941 0.000 0.892 0.032 0.000 0.076
#> SRR1700234 2 0.5696 0.48357 0.000 0.628 0.200 0.000 0.172
#> SRR1700235 2 0.6215 0.37997 0.000 0.608 0.152 0.220 0.020
#> SRR1700237 2 0.0992 0.69920 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700236 2 0.2054 0.70591 0.000 0.920 0.028 0.000 0.052
#> SRR1700238 2 0.0794 0.69416 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700239 1 0.0162 0.92919 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700241 3 0.8441 0.25550 0.104 0.220 0.472 0.048 0.156
#> SRR1700243 2 0.0609 0.69433 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700244 2 0.1697 0.69625 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1700242 1 0.1441 0.91922 0.956 0.008 0.008 0.004 0.024
#> SRR1700246 2 0.7792 0.32344 0.076 0.472 0.248 0.008 0.196
#> SRR1700245 2 0.0807 0.70316 0.000 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1700247 1 0.0162 0.92919 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700249 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700250 2 0.1211 0.70694 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1700248 2 0.0404 0.69681 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700251 2 0.0609 0.69446 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700252 3 0.6396 0.03581 0.000 0.388 0.460 0.004 0.148
#> SRR1700253 2 0.1484 0.69931 0.000 0.944 0.008 0.000 0.048
#> SRR1700256 2 0.1121 0.69550 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700254 1 0.0290 0.92994 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700255 2 0.2473 0.70515 0.000 0.896 0.032 0.000 0.072
#> SRR1700257 2 0.3835 0.66888 0.000 0.796 0.156 0.000 0.048
#> SRR1700258 2 0.3612 0.69712 0.000 0.832 0.100 0.004 0.064
#> SRR1700259 2 0.6033 0.43456 0.000 0.648 0.028 0.164 0.160
#> SRR1700260 2 0.6537 0.00670 0.000 0.544 0.012 0.212 0.232
#> SRR1700261 2 0.6775 -0.04675 0.000 0.512 0.016 0.236 0.236
#> SRR1700262 2 0.6775 -0.07350 0.000 0.496 0.012 0.236 0.256
#> SRR1700263 2 0.2618 0.71282 0.000 0.900 0.052 0.012 0.036
#> SRR1700264 2 0.5487 0.47791 0.000 0.600 0.324 0.004 0.072
#> SRR1700265 3 0.5309 0.39808 0.000 0.264 0.644 0.000 0.092
#> SRR1700266 2 0.4547 0.65975 0.000 0.792 0.076 0.044 0.088
#> SRR1700268 3 0.8446 0.13572 0.024 0.248 0.420 0.104 0.204
#> SRR1700270 2 0.1943 0.71116 0.000 0.924 0.056 0.000 0.020
#> SRR1700267 2 0.2568 0.70484 0.000 0.904 0.032 0.016 0.048
#> SRR1700271 2 0.6266 0.39609 0.000 0.624 0.032 0.156 0.188
#> SRR1700272 2 0.5825 0.28591 0.000 0.644 0.012 0.200 0.144
#> SRR1700273 2 0.2217 0.70697 0.000 0.920 0.024 0.012 0.044
#> SRR1700274 2 0.4561 0.56943 0.000 0.776 0.020 0.128 0.076
#> SRR1700277 3 0.5655 0.58407 0.024 0.148 0.708 0.012 0.108
#> SRR1700275 2 0.6952 -0.43373 0.000 0.392 0.012 0.216 0.380
#> SRR1700276 2 0.7158 -0.06691 0.000 0.496 0.044 0.184 0.276
#> SRR1700278 2 0.7669 -0.24302 0.000 0.436 0.096 0.148 0.320
#> SRR1700279 5 0.8313 0.54069 0.000 0.288 0.140 0.228 0.344
#> SRR1700280 2 0.7848 -0.19139 0.000 0.424 0.104 0.172 0.300
#> SRR1700281 2 0.1310 0.70445 0.000 0.956 0.020 0.000 0.024
#> SRR1700283 5 0.6883 0.49243 0.000 0.364 0.008 0.224 0.404
#> SRR1700282 3 0.8289 -0.35621 0.000 0.128 0.328 0.244 0.300
#> SRR1700284 5 0.5693 0.72944 0.000 0.144 0.000 0.236 0.620
#> SRR1700285 5 0.7280 0.53598 0.000 0.344 0.024 0.252 0.380
#> SRR1700286 2 0.7043 -0.18171 0.000 0.452 0.024 0.328 0.196
#> SRR1700287 5 0.6436 0.59369 0.000 0.296 0.008 0.168 0.528
#> SRR1700290 3 0.6771 0.47790 0.164 0.004 0.620 0.096 0.116
#> SRR1700289 5 0.6533 0.65052 0.000 0.284 0.004 0.208 0.504
#> SRR1700288 2 0.2573 0.67908 0.000 0.880 0.016 0.000 0.104
#> SRR1700292 5 0.6415 0.66739 0.000 0.252 0.008 0.192 0.548
#> SRR1700291 4 0.4706 0.21196 0.000 0.004 0.020 0.632 0.344
#> SRR1700293 2 0.6790 -0.17103 0.000 0.464 0.024 0.144 0.368
#> SRR1700294 5 0.6851 0.72248 0.000 0.212 0.016 0.284 0.488
#> SRR1700295 4 0.7547 -0.30837 0.000 0.040 0.264 0.360 0.336
#> SRR1700297 5 0.6224 0.71860 0.000 0.220 0.000 0.232 0.548
#> SRR1700296 5 0.7054 0.57544 0.000 0.320 0.028 0.188 0.464
#> SRR1700298 5 0.7056 0.62861 0.000 0.108 0.088 0.260 0.544
#> SRR1700299 5 0.7211 0.53229 0.000 0.060 0.136 0.332 0.472
#> SRR1700300 5 0.8035 0.39132 0.000 0.236 0.184 0.144 0.436
#> SRR1700302 5 0.5640 0.72191 0.000 0.116 0.000 0.276 0.608
#> SRR1700301 5 0.6124 0.72721 0.000 0.200 0.000 0.236 0.564
#> SRR1700303 5 0.6181 0.72985 0.000 0.196 0.000 0.252 0.552
#> SRR1700304 2 0.8475 -0.34906 0.000 0.316 0.216 0.184 0.284
#> SRR1700305 5 0.6858 0.60156 0.000 0.280 0.028 0.176 0.516
#> SRR1700306 4 0.7551 -0.27169 0.000 0.040 0.276 0.372 0.312
#> SRR1700308 4 0.8277 -0.05827 0.000 0.192 0.156 0.368 0.284
#> SRR1700307 3 0.7596 0.05420 0.000 0.072 0.464 0.216 0.248
#> SRR1700309 3 0.6752 0.17743 0.000 0.020 0.520 0.272 0.188
#> SRR1700310 5 0.6289 0.71925 0.000 0.228 0.000 0.236 0.536
#> SRR1700311 5 0.6990 0.59698 0.000 0.068 0.104 0.316 0.512
#> SRR1700312 5 0.6794 0.39430 0.000 0.360 0.032 0.128 0.480
#> SRR1700313 3 0.7725 0.14587 0.000 0.256 0.432 0.072 0.240
#> SRR1700314 4 0.6175 0.00481 0.000 0.008 0.124 0.544 0.324
#> SRR1700315 5 0.7399 0.56771 0.000 0.108 0.124 0.256 0.512
#> SRR1700316 4 0.6792 0.27350 0.000 0.040 0.140 0.540 0.280
#> SRR1700317 2 0.6021 0.30756 0.000 0.608 0.020 0.104 0.268
#> SRR1700318 5 0.8046 0.56073 0.000 0.164 0.152 0.256 0.428
#> SRR1700319 5 0.6321 0.50718 0.000 0.024 0.088 0.388 0.500
#> SRR1700320 5 0.6063 0.73093 0.000 0.176 0.000 0.256 0.568
#> SRR1700322 5 0.8114 0.56995 0.000 0.220 0.140 0.220 0.420
#> SRR1700321 5 0.7126 0.60687 0.000 0.272 0.016 0.300 0.412
#> SRR1700323 5 0.5924 0.63855 0.000 0.096 0.004 0.376 0.524
#> SRR1700324 5 0.6705 0.63409 0.000 0.296 0.008 0.212 0.484
#> SRR1700325 2 0.6202 0.26001 0.000 0.604 0.016 0.164 0.216
#> SRR1700326 3 0.7589 -0.14304 0.000 0.052 0.384 0.344 0.220
#> SRR1700327 4 0.7064 0.00730 0.000 0.144 0.056 0.520 0.280
#> SRR1700329 5 0.6596 0.66845 0.000 0.140 0.016 0.364 0.480
#> SRR1700328 3 0.7616 0.15136 0.000 0.092 0.484 0.188 0.236
#> SRR1700330 5 0.8356 0.34593 0.000 0.220 0.252 0.164 0.364
#> SRR1700331 5 0.5786 0.69052 0.000 0.092 0.008 0.308 0.592
#> SRR1700332 5 0.6152 0.73571 0.000 0.168 0.004 0.256 0.572
#> SRR1700333 5 0.7573 0.34223 0.000 0.368 0.088 0.136 0.408
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.4652 0.70284 0.000 0.728 0.008 0.116 0.008 0.140
#> SRR1699875 6 0.5179 0.32512 0.000 0.228 0.020 0.080 0.008 0.664
#> SRR1699876 5 0.7121 0.18392 0.000 0.344 0.088 0.072 0.448 0.048
#> SRR1699877 2 0.3084 0.74018 0.000 0.856 0.008 0.068 0.004 0.064
#> SRR1699879 2 0.6490 0.62329 0.000 0.628 0.072 0.104 0.128 0.068
#> SRR1699878 2 0.5669 0.56591 0.000 0.588 0.024 0.104 0.004 0.280
#> SRR1699880 6 0.2771 0.43172 0.000 0.008 0.100 0.016 0.008 0.868
#> SRR1699881 6 0.4392 0.41101 0.000 0.020 0.096 0.032 0.068 0.784
#> SRR1699882 2 0.4970 0.70230 0.000 0.740 0.040 0.132 0.056 0.032
#> SRR1699883 2 0.4113 0.71986 0.000 0.788 0.016 0.092 0.008 0.096
#> SRR1699884 2 0.4144 0.70808 0.000 0.784 0.020 0.064 0.008 0.124
#> SRR1699885 2 0.4178 0.69664 0.000 0.748 0.000 0.092 0.004 0.156
#> SRR1699886 2 0.7029 0.05406 0.000 0.400 0.108 0.076 0.392 0.024
#> SRR1699888 2 0.5099 0.68041 0.000 0.732 0.052 0.084 0.112 0.020
#> SRR1699889 5 0.5452 0.50704 0.000 0.128 0.080 0.076 0.700 0.016
#> SRR1699890 2 0.6748 0.10735 0.000 0.424 0.072 0.104 0.388 0.012
#> SRR1699887 2 0.6401 0.29962 0.000 0.512 0.064 0.096 0.320 0.008
#> SRR1699891 5 0.5324 0.49958 0.000 0.156 0.056 0.108 0.680 0.000
#> SRR1699892 6 0.7745 0.24312 0.000 0.196 0.216 0.060 0.084 0.444
#> SRR1699893 5 0.7268 -0.34740 0.000 0.000 0.292 0.132 0.396 0.180
#> SRR1699894 5 0.4565 0.50342 0.000 0.152 0.020 0.096 0.732 0.000
#> SRR1699895 5 0.3942 0.49168 0.000 0.120 0.012 0.084 0.784 0.000
#> SRR1699896 6 0.8088 0.10211 0.000 0.124 0.276 0.056 0.176 0.368
#> SRR1699897 2 0.7829 0.45076 0.000 0.476 0.120 0.108 0.108 0.188
#> SRR1699898 3 0.5215 -0.01869 0.000 0.000 0.468 0.012 0.060 0.460
#> SRR1699900 6 0.6040 0.25172 0.000 0.044 0.392 0.032 0.036 0.496
#> SRR1699899 5 0.5702 0.50006 0.000 0.116 0.096 0.072 0.688 0.028
#> SRR1699902 6 0.4454 0.19413 0.000 0.008 0.476 0.004 0.008 0.504
#> SRR1699901 3 0.5881 0.10559 0.000 0.004 0.548 0.040 0.084 0.324
#> SRR1699903 5 0.3326 0.44923 0.000 0.016 0.048 0.056 0.856 0.024
#> SRR1699904 5 0.3813 0.48975 0.000 0.108 0.012 0.084 0.796 0.000
#> SRR1699905 3 0.7083 0.15513 0.012 0.008 0.508 0.088 0.140 0.244
#> SRR1699906 5 0.5455 0.49533 0.000 0.168 0.060 0.084 0.680 0.008
#> SRR1699907 5 0.4392 0.50355 0.000 0.120 0.032 0.088 0.760 0.000
#> SRR1699908 5 0.3614 0.47078 0.000 0.060 0.044 0.040 0.840 0.016
#> SRR1699909 5 0.5217 0.47791 0.000 0.052 0.052 0.112 0.732 0.052
#> SRR1699910 5 0.5527 0.20133 0.000 0.008 0.176 0.072 0.672 0.072
#> SRR1699911 5 0.4857 0.47249 0.000 0.036 0.076 0.108 0.752 0.028
#> SRR1699912 5 0.4771 0.47964 0.000 0.056 0.040 0.100 0.764 0.040
#> SRR1699913 5 0.4487 0.50040 0.000 0.124 0.012 0.116 0.744 0.004
#> SRR1699914 3 0.7416 0.24471 0.000 0.000 0.364 0.132 0.268 0.236
#> SRR1699915 5 0.5200 0.34980 0.000 0.012 0.152 0.080 0.708 0.048
#> SRR1699916 5 0.5487 0.24444 0.000 0.328 0.016 0.084 0.568 0.004
#> SRR1699917 5 0.4786 0.35246 0.000 0.000 0.096 0.076 0.740 0.088
#> SRR1699918 5 0.6721 0.44314 0.000 0.104 0.104 0.084 0.612 0.096
#> SRR1699919 5 0.3518 0.46088 0.000 0.016 0.060 0.068 0.840 0.016
#> SRR1699920 5 0.7375 -0.56972 0.000 0.000 0.248 0.236 0.384 0.132
#> SRR1699921 5 0.4095 0.43756 0.000 0.020 0.080 0.056 0.808 0.036
#> SRR1699922 5 0.7063 0.10439 0.000 0.316 0.080 0.128 0.456 0.020
#> SRR1699923 3 0.6837 0.02368 0.000 0.048 0.504 0.044 0.104 0.300
#> SRR1699924 3 0.6533 0.21999 0.000 0.004 0.464 0.052 0.136 0.344
#> SRR1699925 1 0.2110 0.89805 0.900 0.000 0.004 0.084 0.012 0.000
#> SRR1699926 5 0.4143 0.42722 0.000 0.004 0.124 0.072 0.780 0.020
#> SRR1699927 5 0.4541 0.49456 0.000 0.108 0.040 0.100 0.752 0.000
#> SRR1699929 3 0.8295 0.00730 0.000 0.128 0.288 0.056 0.264 0.264
#> SRR1699928 5 0.4399 0.49267 0.000 0.092 0.032 0.116 0.760 0.000
#> SRR1699930 5 0.4795 0.48080 0.000 0.180 0.012 0.112 0.696 0.000
#> SRR1699931 3 0.8101 0.01541 0.000 0.104 0.296 0.048 0.264 0.288
#> SRR1699933 6 0.5361 0.23750 0.000 0.012 0.316 0.016 0.060 0.596
#> SRR1699932 5 0.4225 0.49964 0.000 0.116 0.016 0.104 0.764 0.000
#> SRR1699934 1 0.2110 0.89805 0.900 0.000 0.004 0.084 0.012 0.000
#> SRR1699935 5 0.5467 0.29547 0.000 0.000 0.164 0.048 0.660 0.128
#> SRR1699936 2 0.7066 0.59323 0.000 0.548 0.056 0.136 0.072 0.188
#> SRR1699937 6 0.4998 0.33477 0.000 0.212 0.016 0.080 0.008 0.684
#> SRR1699938 2 0.5182 0.57657 0.000 0.604 0.004 0.092 0.004 0.296
#> SRR1699940 6 0.2360 0.44240 0.000 0.020 0.040 0.024 0.008 0.908
#> SRR1699939 2 0.7437 0.55360 0.000 0.512 0.060 0.124 0.112 0.192
#> SRR1699941 6 0.2627 0.43661 0.000 0.008 0.104 0.008 0.008 0.872
#> SRR1699942 6 0.3159 0.41975 0.000 0.056 0.012 0.060 0.012 0.860
#> SRR1699943 2 0.4891 0.49029 0.000 0.576 0.004 0.060 0.000 0.360
#> SRR1699944 6 0.5342 -0.26252 0.000 0.420 0.004 0.092 0.000 0.484
#> SRR1699945 6 0.4699 0.35619 0.000 0.008 0.232 0.080 0.000 0.680
#> SRR1699946 6 0.5235 0.22081 0.000 0.264 0.016 0.084 0.004 0.632
#> SRR1699947 6 0.5534 -0.29431 0.000 0.440 0.020 0.076 0.000 0.464
#> SRR1699948 2 0.5311 0.51261 0.000 0.556 0.008 0.092 0.000 0.344
#> SRR1699949 2 0.6839 0.25194 0.000 0.496 0.080 0.080 0.312 0.032
#> SRR1699950 2 0.7342 0.56212 0.000 0.528 0.060 0.136 0.104 0.172
#> SRR1699951 6 0.7634 0.13983 0.000 0.116 0.108 0.108 0.160 0.508
#> SRR1699952 6 0.4425 0.35593 0.000 0.156 0.008 0.092 0.004 0.740
#> SRR1699953 2 0.5644 0.66563 0.000 0.656 0.024 0.132 0.020 0.168
#> SRR1699954 6 0.4842 0.35987 0.000 0.024 0.128 0.112 0.008 0.728
#> SRR1699955 2 0.5005 0.70500 0.000 0.724 0.032 0.116 0.012 0.116
#> SRR1699956 6 0.4746 0.36216 0.000 0.008 0.240 0.080 0.000 0.672
#> SRR1699957 6 0.6286 0.06796 0.000 0.316 0.028 0.112 0.020 0.524
#> SRR1699959 6 0.5624 0.23101 0.000 0.012 0.280 0.036 0.064 0.608
#> SRR1699958 5 0.7142 -0.05619 0.000 0.016 0.232 0.052 0.420 0.280
#> SRR1699960 2 0.6880 0.61235 0.000 0.588 0.080 0.144 0.072 0.116
#> SRR1699961 6 0.1533 0.43894 0.000 0.012 0.016 0.016 0.008 0.948
#> SRR1699962 2 0.5793 0.68009 0.000 0.680 0.064 0.140 0.040 0.076
#> SRR1699963 6 0.4810 0.41419 0.000 0.060 0.088 0.052 0.036 0.764
#> SRR1699964 2 0.5420 0.62206 0.000 0.652 0.036 0.092 0.004 0.216
#> SRR1699965 2 0.4833 0.70760 0.000 0.756 0.064 0.104 0.052 0.024
#> SRR1699966 6 0.7054 -0.23623 0.000 0.008 0.276 0.044 0.324 0.348
#> SRR1699967 2 0.5493 0.49481 0.000 0.552 0.012 0.088 0.004 0.344
#> SRR1699968 6 0.7071 -0.08729 0.000 0.032 0.356 0.048 0.144 0.420
#> SRR1699969 6 0.5919 -0.11531 0.000 0.000 0.424 0.016 0.132 0.428
#> SRR1699971 6 0.2317 0.44200 0.000 0.016 0.036 0.036 0.004 0.908
#> SRR1699970 6 0.5664 -0.28282 0.000 0.440 0.012 0.092 0.004 0.452
#> SRR1699972 6 0.1509 0.44089 0.000 0.008 0.024 0.012 0.008 0.948
#> SRR1699973 5 0.7104 -0.16629 0.000 0.000 0.276 0.072 0.356 0.296
#> SRR1699974 6 0.5009 0.20277 0.000 0.004 0.448 0.048 0.004 0.496
#> SRR1699975 5 0.7372 -0.20473 0.000 0.012 0.320 0.068 0.324 0.276
#> SRR1699976 6 0.1950 0.44369 0.000 0.012 0.032 0.020 0.008 0.928
#> SRR1699977 6 0.6178 0.00949 0.000 0.000 0.332 0.048 0.116 0.504
#> SRR1699978 3 0.6960 0.14978 0.044 0.012 0.536 0.056 0.084 0.268
#> SRR1699979 6 0.5809 -0.04678 0.000 0.000 0.416 0.028 0.092 0.464
#> SRR1699980 3 0.7063 0.14504 0.000 0.000 0.364 0.068 0.280 0.288
#> SRR1699981 3 0.6751 0.17557 0.000 0.008 0.404 0.044 0.168 0.376
#> SRR1699982 5 0.4723 0.49595 0.000 0.128 0.028 0.104 0.736 0.004
#> SRR1699983 5 0.6096 0.25389 0.000 0.008 0.148 0.064 0.616 0.164
#> SRR1699984 1 0.1625 0.89931 0.928 0.000 0.012 0.060 0.000 0.000
#> SRR1699985 5 0.8324 0.03314 0.000 0.100 0.188 0.096 0.340 0.276
#> SRR1699986 3 0.6602 0.09379 0.028 0.004 0.540 0.056 0.084 0.288
#> SRR1699988 2 0.8005 0.08651 0.000 0.340 0.184 0.084 0.324 0.068
#> SRR1699987 3 0.6700 0.25630 0.000 0.000 0.396 0.044 0.212 0.348
#> SRR1699989 5 0.7534 0.36025 0.000 0.076 0.136 0.108 0.512 0.168
#> SRR1699990 6 0.7144 -0.22870 0.000 0.000 0.320 0.080 0.248 0.352
#> SRR1699992 6 0.5093 0.38855 0.000 0.040 0.236 0.028 0.020 0.676
#> SRR1699991 6 0.4715 0.20909 0.000 0.004 0.348 0.004 0.040 0.604
#> SRR1699993 3 0.6779 0.24419 0.000 0.000 0.508 0.104 0.180 0.208
#> SRR1699994 6 0.4104 0.33624 0.000 0.008 0.316 0.008 0.004 0.664
#> SRR1699995 3 0.6148 0.03521 0.084 0.000 0.552 0.016 0.044 0.304
#> SRR1699996 2 0.6832 0.52839 0.000 0.584 0.144 0.064 0.144 0.064
#> SRR1699997 5 0.6974 -0.32172 0.000 0.000 0.276 0.092 0.444 0.188
#> SRR1699998 6 0.5510 0.38535 0.000 0.144 0.088 0.076 0.008 0.684
#> SRR1699999 1 0.5132 0.77069 0.696 0.000 0.164 0.080 0.000 0.060
#> SRR1700000 6 0.4412 0.37549 0.000 0.012 0.160 0.080 0.004 0.744
#> SRR1700002 6 0.3620 0.43472 0.000 0.060 0.048 0.048 0.008 0.836
#> SRR1700001 6 0.4408 0.32626 0.000 0.016 0.324 0.004 0.012 0.644
#> SRR1700003 6 0.4787 0.36443 0.000 0.024 0.208 0.032 0.024 0.712
#> SRR1700004 3 0.5288 0.05210 0.000 0.000 0.524 0.016 0.064 0.396
#> SRR1700005 1 0.1563 0.90008 0.932 0.000 0.012 0.056 0.000 0.000
#> SRR1700006 6 0.1801 0.44235 0.000 0.012 0.040 0.012 0.004 0.932
#> SRR1700007 5 0.5900 0.21276 0.000 0.352 0.052 0.076 0.520 0.000
#> SRR1700008 3 0.7179 -0.57643 0.000 0.000 0.408 0.192 0.288 0.112
#> SRR1700009 1 0.1908 0.90105 0.924 0.000 0.020 0.044 0.012 0.000
#> SRR1700010 6 0.3601 0.41252 0.000 0.008 0.168 0.028 0.004 0.792
#> SRR1700011 2 0.7506 0.43722 0.000 0.508 0.096 0.128 0.192 0.076
#> SRR1700013 6 0.5566 0.38523 0.000 0.084 0.196 0.020 0.036 0.664
#> SRR1700012 6 0.4109 0.39970 0.000 0.024 0.180 0.016 0.016 0.764
#> SRR1700014 6 0.6219 -0.12088 0.000 0.000 0.420 0.048 0.108 0.424
#> SRR1700015 6 0.2838 0.42649 0.000 0.052 0.016 0.044 0.008 0.880
#> SRR1700016 1 0.5744 0.67662 0.636 0.000 0.180 0.068 0.000 0.116
#> SRR1700018 6 0.1705 0.43872 0.000 0.012 0.024 0.016 0.008 0.940
#> SRR1700017 6 0.3037 0.42781 0.000 0.008 0.132 0.012 0.008 0.840
#> SRR1700019 2 0.6475 0.27362 0.000 0.496 0.068 0.096 0.332 0.008
#> SRR1700020 6 0.5166 0.07960 0.000 0.004 0.448 0.016 0.040 0.492
#> SRR1700021 5 0.4473 0.49682 0.000 0.068 0.068 0.100 0.764 0.000
#> SRR1700023 6 0.4950 0.26530 0.000 0.012 0.304 0.012 0.040 0.632
#> SRR1700022 6 0.3672 0.41261 0.000 0.008 0.160 0.020 0.016 0.796
#> SRR1700024 3 0.7161 0.13581 0.000 0.000 0.328 0.076 0.300 0.296
#> SRR1700025 6 0.4691 0.36631 0.000 0.160 0.020 0.080 0.008 0.732
#> SRR1700026 6 0.4890 0.36727 0.000 0.024 0.268 0.044 0.004 0.660
#> SRR1700027 6 0.1684 0.44446 0.000 0.016 0.028 0.008 0.008 0.940
#> SRR1700028 5 0.6834 -0.15747 0.000 0.000 0.268 0.064 0.444 0.224
#> SRR1700029 3 0.6218 0.20923 0.000 0.000 0.472 0.044 0.120 0.364
#> SRR1700030 5 0.7395 0.32490 0.000 0.076 0.200 0.060 0.504 0.160
#> SRR1700031 6 0.3658 0.40912 0.000 0.008 0.184 0.024 0.004 0.780
#> SRR1700032 6 0.7136 0.26472 0.000 0.236 0.132 0.084 0.036 0.512
#> SRR1700034 1 0.5080 0.73367 0.696 0.000 0.140 0.036 0.000 0.128
#> SRR1700035 5 0.5157 0.27924 0.000 0.000 0.104 0.088 0.708 0.100
#> SRR1700033 6 0.4070 0.32258 0.000 0.008 0.308 0.008 0.004 0.672
#> SRR1700036 3 0.6999 0.23646 0.000 0.000 0.396 0.072 0.224 0.308
#> SRR1700037 5 0.4631 0.49894 0.000 0.140 0.016 0.120 0.724 0.000
#> SRR1700038 6 0.6516 0.23069 0.000 0.076 0.396 0.048 0.028 0.452
#> SRR1700039 3 0.4482 -0.07288 0.000 0.000 0.528 0.012 0.012 0.448
#> SRR1700040 6 0.3586 0.34912 0.000 0.004 0.280 0.004 0.000 0.712
#> SRR1700041 6 0.5748 0.02037 0.000 0.000 0.324 0.040 0.084 0.552
#> SRR1700042 6 0.4991 0.09703 0.000 0.000 0.424 0.012 0.044 0.520
#> SRR1700043 6 0.4872 0.22349 0.000 0.008 0.444 0.016 0.016 0.516
#> SRR1700045 3 0.6987 0.22199 0.000 0.012 0.412 0.064 0.156 0.356
#> SRR1700044 6 0.7495 0.15227 0.000 0.088 0.296 0.052 0.120 0.444
#> SRR1700046 6 0.5366 0.13719 0.000 0.004 0.356 0.020 0.060 0.560
#> SRR1700047 3 0.5430 0.02203 0.000 0.000 0.476 0.024 0.060 0.440
#> SRR1700048 3 0.6734 0.28981 0.000 0.000 0.448 0.060 0.192 0.300
#> SRR1700049 3 0.5485 0.01705 0.008 0.000 0.536 0.016 0.064 0.376
#> SRR1700050 3 0.6858 0.18694 0.000 0.000 0.408 0.116 0.112 0.364
#> SRR1700051 3 0.5376 0.03752 0.004 0.000 0.560 0.016 0.068 0.352
#> SRR1700052 3 0.4406 -0.16679 0.000 0.000 0.516 0.012 0.008 0.464
#> SRR1700053 3 0.7341 0.14053 0.000 0.000 0.332 0.104 0.280 0.284
#> SRR1700054 6 0.4428 0.22974 0.000 0.004 0.388 0.012 0.008 0.588
#> SRR1700055 1 0.3175 0.87062 0.832 0.000 0.080 0.088 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.7301 -0.71666 0.000 0.000 0.348 0.280 0.272 0.100
#> SRR1700057 3 0.7498 -0.07720 0.000 0.000 0.376 0.216 0.176 0.232
#> SRR1700058 6 0.4053 0.28334 0.000 0.004 0.360 0.004 0.004 0.628
#> SRR1700059 3 0.7516 -0.63607 0.000 0.000 0.332 0.272 0.252 0.144
#> SRR1700060 3 0.5080 -0.00523 0.000 0.000 0.484 0.008 0.056 0.452
#> SRR1700061 6 0.4819 0.22642 0.000 0.008 0.404 0.016 0.016 0.556
#> SRR1700062 3 0.5426 0.02956 0.000 0.000 0.504 0.020 0.068 0.408
#> SRR1700063 6 0.4786 0.12902 0.000 0.000 0.444 0.016 0.024 0.516
#> SRR1700064 5 0.7298 -0.51749 0.000 0.000 0.252 0.216 0.404 0.128
#> SRR1700065 6 0.4454 0.18985 0.000 0.004 0.476 0.008 0.008 0.504
#> SRR1700066 6 0.4239 0.19758 0.000 0.004 0.452 0.004 0.004 0.536
#> SRR1700067 5 0.4743 0.21492 0.000 0.000 0.088 0.088 0.744 0.080
#> SRR1700068 3 0.7491 -0.18895 0.000 0.000 0.380 0.212 0.180 0.228
#> SRR1700069 3 0.7015 0.08178 0.000 0.000 0.420 0.080 0.224 0.276
#> SRR1700070 6 0.8560 0.02640 0.000 0.232 0.124 0.108 0.216 0.320
#> SRR1700071 6 0.5598 -0.03797 0.000 0.000 0.428 0.024 0.076 0.472
#> SRR1700072 3 0.4534 -0.16388 0.000 0.004 0.516 0.008 0.012 0.460
#> SRR1700073 5 0.4450 0.47466 0.000 0.060 0.040 0.092 0.784 0.024
#> SRR1700075 6 0.5972 0.05530 0.000 0.016 0.440 0.028 0.068 0.448
#> SRR1700074 6 0.3916 0.29830 0.000 0.000 0.300 0.000 0.020 0.680
#> SRR1700076 6 0.7626 -0.05695 0.000 0.060 0.312 0.044 0.212 0.372
#> SRR1700077 6 0.3647 0.39603 0.000 0.008 0.216 0.004 0.012 0.760
#> SRR1700078 3 0.6210 0.07398 0.000 0.008 0.536 0.040 0.116 0.300
#> SRR1700080 3 0.6711 0.21823 0.000 0.000 0.424 0.060 0.172 0.344
#> SRR1700079 3 0.5680 0.17596 0.000 0.000 0.516 0.020 0.100 0.364
#> SRR1700081 6 0.5169 0.00982 0.000 0.000 0.464 0.012 0.056 0.468
#> SRR1700082 6 0.3142 0.43051 0.000 0.004 0.156 0.016 0.004 0.820
#> SRR1700083 3 0.4886 -0.04196 0.000 0.000 0.520 0.012 0.036 0.432
#> SRR1700084 6 0.5034 0.24318 0.020 0.004 0.420 0.028 0.000 0.528
#> SRR1700085 5 0.6795 0.40795 0.000 0.084 0.140 0.064 0.596 0.116
#> SRR1700086 6 0.5873 -0.07799 0.000 0.000 0.424 0.032 0.092 0.452
#> SRR1700087 6 0.5053 0.34113 0.012 0.064 0.064 0.012 0.100 0.748
#> SRR1700088 6 0.3886 0.41994 0.000 0.036 0.040 0.048 0.048 0.828
#> SRR1700089 6 0.6025 0.32995 0.000 0.124 0.152 0.024 0.056 0.644
#> SRR1700091 6 0.7495 -0.21652 0.000 0.028 0.264 0.056 0.308 0.344
#> SRR1700090 5 0.7113 -0.31065 0.000 0.000 0.332 0.088 0.372 0.208
#> SRR1700092 6 0.7277 -0.23015 0.000 0.012 0.304 0.056 0.312 0.316
#> SRR1700094 6 0.7283 -0.01296 0.000 0.068 0.168 0.040 0.240 0.484
#> SRR1700093 5 0.6312 0.17260 0.000 0.004 0.200 0.068 0.576 0.152
#> SRR1700095 3 0.6897 0.27157 0.000 0.000 0.396 0.068 0.196 0.340
#> SRR1700096 6 0.6743 -0.19503 0.000 0.000 0.288 0.048 0.236 0.428
#> SRR1700097 3 0.6170 0.07233 0.004 0.004 0.512 0.044 0.088 0.348
#> SRR1700098 2 0.8403 -0.12350 0.000 0.300 0.140 0.068 0.276 0.216
#> SRR1700099 5 0.7288 0.10940 0.000 0.024 0.220 0.076 0.464 0.216
#> SRR1700100 5 0.7118 -0.13797 0.000 0.012 0.296 0.048 0.388 0.256
#> SRR1700101 5 0.7422 -0.18438 0.000 0.020 0.248 0.064 0.364 0.304
#> SRR1700102 5 0.6801 -0.10425 0.000 0.004 0.228 0.044 0.432 0.292
#> SRR1700104 5 0.7090 -0.12726 0.000 0.012 0.268 0.044 0.384 0.292
#> SRR1700103 3 0.6981 0.18459 0.000 0.000 0.376 0.064 0.240 0.320
#> SRR1700105 5 0.4282 0.35955 0.000 0.000 0.144 0.052 0.764 0.040
#> SRR1700106 5 0.6559 -0.42593 0.000 0.000 0.244 0.192 0.504 0.060
#> SRR1700107 5 0.6961 -0.12701 0.000 0.000 0.280 0.072 0.420 0.228
#> SRR1700108 5 0.6719 0.39868 0.000 0.116 0.100 0.064 0.608 0.112
#> SRR1700109 5 0.6420 0.37464 0.000 0.288 0.068 0.056 0.552 0.036
#> SRR1700110 5 0.7421 0.29891 0.000 0.296 0.092 0.056 0.456 0.100
#> SRR1700112 5 0.4221 0.49419 0.000 0.120 0.016 0.088 0.772 0.004
#> SRR1700111 5 0.6949 -0.52826 0.000 0.000 0.308 0.136 0.440 0.116
#> SRR1700113 5 0.4930 0.33489 0.000 0.008 0.096 0.052 0.736 0.108
#> SRR1700114 5 0.7164 -0.13803 0.000 0.012 0.272 0.056 0.404 0.256
#> SRR1700115 5 0.5600 0.28313 0.000 0.012 0.104 0.048 0.668 0.168
#> SRR1700116 5 0.7318 -0.50517 0.000 0.000 0.320 0.144 0.368 0.168
#> SRR1700117 3 0.7530 -0.21652 0.008 0.000 0.376 0.220 0.276 0.120
#> SRR1700119 5 0.7166 -0.62321 0.000 0.000 0.240 0.220 0.428 0.112
#> SRR1700118 5 0.7179 -0.50538 0.000 0.000 0.272 0.156 0.428 0.144
#> SRR1700120 3 0.6252 0.20499 0.000 0.000 0.516 0.052 0.128 0.304
#> SRR1700121 5 0.5798 0.09297 0.000 0.000 0.152 0.072 0.636 0.140
#> SRR1700122 5 0.4033 0.43990 0.000 0.024 0.032 0.084 0.812 0.048
#> SRR1700123 5 0.6999 -0.84543 0.000 0.000 0.276 0.276 0.384 0.064
#> SRR1700125 5 0.3943 0.49114 0.000 0.116 0.008 0.084 0.788 0.004
#> SRR1700126 3 0.6438 0.22088 0.000 0.000 0.452 0.044 0.156 0.348
#> SRR1700127 3 0.7302 -0.33737 0.000 0.000 0.388 0.132 0.292 0.188
#> SRR1700124 5 0.7442 -0.77616 0.000 0.000 0.248 0.268 0.352 0.132
#> SRR1700128 5 0.7204 -0.85931 0.000 0.000 0.236 0.284 0.384 0.096
#> SRR1700129 5 0.4531 0.33911 0.000 0.008 0.044 0.084 0.768 0.096
#> SRR1700130 5 0.4007 0.28957 0.000 0.000 0.068 0.108 0.792 0.032
#> SRR1700132 4 0.7080 0.89225 0.000 0.000 0.276 0.344 0.312 0.068
#> SRR1700131 3 0.7596 -0.54517 0.000 0.000 0.324 0.252 0.256 0.168
#> SRR1700133 5 0.5041 0.03655 0.000 0.000 0.092 0.172 0.696 0.040
#> SRR1700134 5 0.3947 0.43067 0.000 0.012 0.028 0.080 0.812 0.068
#> SRR1700135 5 0.6690 -0.40340 0.000 0.000 0.204 0.148 0.528 0.120
#> SRR1700136 3 0.7514 -0.77422 0.000 0.000 0.300 0.288 0.276 0.136
#> SRR1700137 5 0.7157 -0.79686 0.000 0.000 0.224 0.296 0.388 0.092
#> SRR1700138 5 0.7218 -0.72256 0.000 0.000 0.228 0.288 0.384 0.100
#> SRR1700140 5 0.7364 -0.78499 0.000 0.000 0.240 0.292 0.352 0.116
#> SRR1700139 5 0.7204 -0.86888 0.000 0.000 0.232 0.320 0.356 0.092
#> SRR1700141 5 0.4250 0.44272 0.000 0.036 0.024 0.096 0.796 0.048
#> SRR1700142 3 0.7339 -0.05062 0.000 0.000 0.420 0.192 0.172 0.216
#> SRR1700143 3 0.7286 -0.23187 0.000 0.000 0.416 0.144 0.252 0.188
#> SRR1700144 3 0.6542 0.28282 0.000 0.000 0.528 0.092 0.136 0.244
#> SRR1700145 5 0.6794 -0.84754 0.000 0.000 0.296 0.296 0.368 0.040
#> SRR1700146 5 0.4508 0.34403 0.000 0.004 0.056 0.092 0.768 0.080
#> SRR1700147 4 0.7182 0.93406 0.000 0.000 0.276 0.332 0.312 0.080
#> SRR1700149 3 0.7354 -0.58566 0.004 0.000 0.336 0.272 0.300 0.088
#> SRR1700148 5 0.7018 -0.86499 0.000 0.000 0.300 0.296 0.344 0.060
#> SRR1700150 5 0.4823 0.23349 0.000 0.000 0.060 0.124 0.732 0.084
#> SRR1700152 5 0.7072 -0.71620 0.000 0.000 0.200 0.296 0.412 0.092
#> SRR1700151 5 0.7217 -0.90575 0.000 0.000 0.256 0.312 0.344 0.088
#> SRR1700153 4 0.7259 0.93460 0.000 0.000 0.264 0.332 0.312 0.092
#> SRR1700154 5 0.7148 -0.90021 0.000 0.000 0.248 0.332 0.340 0.080
#> SRR1700155 5 0.6775 -0.54706 0.000 0.000 0.168 0.248 0.492 0.092
#> SRR1700156 4 0.7219 0.93123 0.000 0.000 0.292 0.328 0.296 0.084
#> SRR1700158 3 0.7385 -0.40408 0.000 0.000 0.344 0.256 0.284 0.116
#> SRR1700159 5 0.3779 0.48862 0.000 0.092 0.008 0.084 0.808 0.008
#> SRR1700157 4 0.7302 0.92366 0.000 0.000 0.284 0.320 0.300 0.096
#> SRR1700160 5 0.7073 -0.61546 0.000 0.000 0.216 0.256 0.432 0.096
#> SRR1700161 5 0.7238 -0.88399 0.000 0.000 0.252 0.308 0.348 0.092
#> SRR1700162 5 0.4117 0.44715 0.000 0.028 0.020 0.064 0.804 0.084
#> SRR1700164 3 0.8545 0.13476 0.080 0.008 0.320 0.144 0.296 0.152
#> SRR1700163 3 0.7686 -0.33085 0.020 0.000 0.340 0.208 0.324 0.108
#> SRR1700165 3 0.7383 0.02430 0.000 0.004 0.364 0.100 0.288 0.244
#> SRR1700166 5 0.5945 -0.10342 0.000 0.000 0.124 0.216 0.600 0.060
#> SRR1700168 5 0.4088 0.46550 0.000 0.064 0.020 0.076 0.808 0.032
#> SRR1700167 3 0.7223 -0.88873 0.000 0.000 0.316 0.308 0.292 0.084
#> SRR1700170 5 0.4920 0.29613 0.000 0.000 0.088 0.148 0.716 0.048
#> SRR1700169 5 0.7023 -0.55546 0.000 0.000 0.184 0.236 0.464 0.116
#> SRR1700171 3 0.6671 0.27445 0.000 0.000 0.528 0.104 0.176 0.192
#> SRR1700172 5 0.5904 0.02840 0.000 0.000 0.168 0.068 0.620 0.144
#> SRR1700174 5 0.6837 -0.25431 0.000 0.000 0.216 0.124 0.504 0.156
#> SRR1700173 5 0.6759 -0.37522 0.000 0.000 0.272 0.104 0.488 0.136
#> SRR1700175 5 0.2945 0.39481 0.000 0.004 0.028 0.064 0.872 0.032
#> SRR1700176 3 0.6079 0.02632 0.008 0.000 0.460 0.048 0.068 0.416
#> SRR1700178 2 0.2663 0.73658 0.000 0.876 0.012 0.028 0.000 0.084
#> SRR1700177 5 0.6417 -0.38106 0.000 0.000 0.148 0.216 0.552 0.084
#> SRR1700180 2 0.2663 0.73478 0.000 0.876 0.012 0.028 0.000 0.084
#> SRR1700179 2 0.2841 0.73251 0.000 0.864 0.012 0.032 0.000 0.092
#> SRR1700181 2 0.2494 0.74015 0.000 0.892 0.008 0.020 0.008 0.072
#> SRR1700183 1 0.0363 0.90692 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.2605 0.73413 0.000 0.876 0.012 0.020 0.000 0.092
#> SRR1700184 2 0.2790 0.73242 0.000 0.868 0.012 0.032 0.000 0.088
#> SRR1700186 2 0.4669 0.59279 0.000 0.648 0.004 0.064 0.000 0.284
#> SRR1700187 1 0.0632 0.90667 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0891 0.90613 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700188 2 0.3424 0.71729 0.000 0.816 0.008 0.048 0.000 0.128
#> SRR1700192 1 0.6008 0.73889 0.664 0.112 0.076 0.124 0.008 0.016
#> SRR1700190 1 0.6909 0.34198 0.456 0.000 0.140 0.112 0.000 0.292
#> SRR1700191 1 0.0632 0.90667 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0146 0.90648 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.1686 0.74231 0.000 0.932 0.004 0.008 0.004 0.052
#> SRR1700195 2 0.2209 0.74103 0.000 0.904 0.000 0.052 0.004 0.040
#> SRR1700194 1 0.0632 0.90667 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.2280 0.74271 0.000 0.904 0.016 0.004 0.012 0.064
#> SRR1700197 1 0.3634 0.84707 0.808 0.000 0.064 0.116 0.000 0.012
#> SRR1700198 2 0.1728 0.74357 0.000 0.924 0.004 0.000 0.008 0.064
#> SRR1700199 2 0.1370 0.73442 0.000 0.948 0.000 0.036 0.004 0.012
#> SRR1700200 2 0.1621 0.73619 0.000 0.936 0.004 0.048 0.004 0.008
#> SRR1700201 2 0.2183 0.75056 0.000 0.912 0.000 0.028 0.020 0.040
#> SRR1700202 2 0.8974 0.14117 0.176 0.288 0.256 0.104 0.160 0.016
#> SRR1700203 2 0.1536 0.73783 0.000 0.940 0.000 0.040 0.016 0.004
#> SRR1700204 2 0.2288 0.72864 0.000 0.896 0.004 0.072 0.028 0.000
#> SRR1700206 2 0.2101 0.73713 0.000 0.920 0.016 0.040 0.008 0.016
#> SRR1700207 2 0.2290 0.74589 0.000 0.912 0.012 0.020 0.016 0.040
#> SRR1700208 1 0.8065 0.44242 0.460 0.048 0.168 0.116 0.020 0.188
#> SRR1700205 2 0.6273 0.55624 0.004 0.616 0.120 0.088 0.164 0.008
#> SRR1700209 2 0.4651 0.71631 0.000 0.772 0.056 0.088 0.060 0.024
#> SRR1700210 2 0.5702 0.62093 0.000 0.672 0.104 0.112 0.104 0.008
#> SRR1700211 2 0.7951 0.45132 0.124 0.504 0.168 0.104 0.076 0.024
#> SRR1700212 2 0.3563 0.71823 0.000 0.828 0.032 0.100 0.036 0.004
#> SRR1700213 2 0.7472 0.28962 0.000 0.464 0.124 0.056 0.084 0.272
#> SRR1700214 2 0.1901 0.72838 0.000 0.912 0.004 0.076 0.008 0.000
#> SRR1700215 1 0.0993 0.90574 0.964 0.000 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700217 2 0.3692 0.72686 0.000 0.828 0.064 0.056 0.048 0.004
#> SRR1700216 1 0.1442 0.90516 0.944 0.000 0.004 0.040 0.012 0.000
#> SRR1700218 2 0.3441 0.73722 0.000 0.844 0.040 0.052 0.004 0.060
#> SRR1700219 2 0.2632 0.74590 0.000 0.896 0.040 0.020 0.016 0.028
#> SRR1700222 1 0.0000 0.90615 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.6184 0.26329 0.000 0.496 0.048 0.084 0.364 0.008
#> SRR1700221 2 0.4444 0.69330 0.008 0.780 0.040 0.100 0.068 0.004
#> SRR1700223 2 0.1690 0.74276 0.000 0.940 0.020 0.020 0.016 0.004
#> SRR1700224 2 0.5942 0.63044 0.000 0.668 0.088 0.084 0.128 0.032
#> SRR1700226 2 0.2689 0.74731 0.000 0.888 0.008 0.056 0.016 0.032
#> SRR1700229 2 0.3195 0.74072 0.000 0.856 0.012 0.076 0.044 0.012
#> SRR1700225 2 0.7576 0.14877 0.000 0.408 0.104 0.064 0.088 0.336
#> SRR1700227 2 0.1909 0.74174 0.000 0.920 0.004 0.024 0.000 0.052
#> SRR1700230 1 0.1563 0.89402 0.932 0.000 0.056 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.3820 0.73195 0.000 0.828 0.024 0.068 0.048 0.032
#> SRR1700228 2 0.4581 0.66970 0.000 0.764 0.044 0.092 0.092 0.008
#> SRR1700232 2 0.1337 0.74209 0.000 0.956 0.008 0.016 0.012 0.008
#> SRR1700233 2 0.3173 0.71720 0.000 0.848 0.024 0.092 0.036 0.000
#> SRR1700234 2 0.6577 0.51497 0.000 0.584 0.136 0.100 0.164 0.016
#> SRR1700235 2 0.6112 0.54755 0.000 0.640 0.068 0.056 0.052 0.184
#> SRR1700237 2 0.1398 0.73188 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700236 2 0.3416 0.74497 0.000 0.848 0.032 0.076 0.016 0.028
#> SRR1700238 2 0.1333 0.73148 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700239 1 0.0260 0.90611 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0993 0.90574 0.964 0.000 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700241 3 0.9160 0.03351 0.096 0.192 0.368 0.100 0.160 0.084
#> SRR1700243 2 0.0547 0.73353 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.2467 0.73458 0.000 0.884 0.016 0.088 0.012 0.000
#> SRR1700242 1 0.3310 0.85973 0.840 0.012 0.108 0.028 0.000 0.012
#> SRR1700246 2 0.8465 0.28062 0.056 0.376 0.264 0.116 0.164 0.024
#> SRR1700245 2 0.1605 0.74556 0.000 0.936 0.000 0.044 0.004 0.016
#> SRR1700247 1 0.0260 0.90611 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0547 0.90686 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.2519 0.74003 0.000 0.884 0.004 0.044 0.000 0.068
#> SRR1700248 2 0.0806 0.73799 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1700251 2 0.1312 0.73780 0.008 0.956 0.000 0.020 0.012 0.004
#> SRR1700252 2 0.8350 0.21671 0.020 0.412 0.164 0.092 0.076 0.236
#> SRR1700253 2 0.1325 0.74393 0.000 0.956 0.012 0.012 0.016 0.004
#> SRR1700256 2 0.1643 0.73136 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008 0.000
#> SRR1700254 1 0.0692 0.90704 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1700255 2 0.2339 0.73126 0.000 0.896 0.012 0.072 0.020 0.000
#> SRR1700257 2 0.2024 0.74176 0.000 0.924 0.008 0.020 0.012 0.036
#> SRR1700258 2 0.1578 0.74246 0.000 0.944 0.004 0.028 0.012 0.012
#> SRR1700259 2 0.6740 0.55909 0.000 0.592 0.080 0.128 0.152 0.048
#> SRR1700260 2 0.6578 0.06608 0.000 0.444 0.068 0.080 0.392 0.016
#> SRR1700261 2 0.6712 0.13989 0.000 0.448 0.084 0.088 0.368 0.012
#> SRR1700262 2 0.6184 0.19328 0.000 0.480 0.052 0.076 0.384 0.008
#> SRR1700263 2 0.3455 0.74296 0.000 0.840 0.020 0.080 0.008 0.052
#> SRR1700264 2 0.5315 0.54947 0.000 0.584 0.016 0.084 0.000 0.316
#> SRR1700265 6 0.7058 0.10101 0.000 0.316 0.088 0.076 0.044 0.476
#> SRR1700266 2 0.5448 0.69584 0.000 0.712 0.040 0.108 0.048 0.092
#> SRR1700268 2 0.8635 0.12171 0.008 0.296 0.260 0.128 0.232 0.076
#> SRR1700270 2 0.1546 0.73810 0.000 0.944 0.004 0.028 0.004 0.020
#> SRR1700267 2 0.4298 0.72600 0.000 0.796 0.048 0.088 0.028 0.040
#> SRR1700271 2 0.6274 0.50928 0.000 0.600 0.072 0.104 0.208 0.016
#> SRR1700272 2 0.5560 0.44822 0.000 0.608 0.040 0.060 0.284 0.008
#> SRR1700273 2 0.3326 0.74730 0.000 0.848 0.016 0.084 0.012 0.040
#> SRR1700274 2 0.5237 0.62218 0.000 0.704 0.048 0.068 0.164 0.016
#> SRR1700277 6 0.6628 0.31669 0.016 0.152 0.132 0.104 0.004 0.592
#> SRR1700275 5 0.6086 0.26105 0.000 0.320 0.056 0.084 0.536 0.004
#> SRR1700276 5 0.6903 -0.01938 0.000 0.380 0.112 0.092 0.408 0.008
#> SRR1700278 5 0.7076 0.12773 0.000 0.320 0.132 0.104 0.436 0.008
#> SRR1700279 5 0.6609 0.36593 0.000 0.232 0.132 0.084 0.544 0.008
#> SRR1700280 5 0.7227 0.12935 0.000 0.308 0.136 0.112 0.432 0.012
#> SRR1700281 2 0.2588 0.74542 0.000 0.888 0.040 0.060 0.004 0.008
#> SRR1700283 5 0.5734 0.33387 0.000 0.280 0.036 0.104 0.580 0.000
#> SRR1700282 5 0.7388 0.28008 0.000 0.092 0.260 0.128 0.476 0.044
#> SRR1700284 5 0.4737 0.49958 0.000 0.120 0.024 0.120 0.732 0.004
#> SRR1700285 5 0.6222 0.39277 0.000 0.224 0.084 0.104 0.584 0.004
#> SRR1700286 2 0.7649 0.06918 0.000 0.388 0.092 0.108 0.348 0.064
#> SRR1700287 5 0.6163 0.34440 0.000 0.240 0.036 0.136 0.576 0.012
#> SRR1700290 3 0.7936 0.08031 0.124 0.004 0.468 0.116 0.088 0.200
#> SRR1700289 5 0.5323 0.42396 0.000 0.216 0.024 0.116 0.644 0.000
#> SRR1700288 2 0.4834 0.68902 0.000 0.748 0.068 0.092 0.084 0.008
#> SRR1700292 5 0.5011 0.43045 0.000 0.224 0.012 0.104 0.660 0.000
#> SRR1700291 5 0.4537 0.35812 0.000 0.000 0.080 0.068 0.760 0.092
#> SRR1700293 5 0.6621 -0.03164 0.000 0.396 0.076 0.084 0.432 0.012
#> SRR1700294 5 0.4471 0.50113 0.000 0.156 0.016 0.092 0.736 0.000
#> SRR1700295 5 0.6155 0.26087 0.000 0.008 0.224 0.116 0.592 0.060
#> SRR1700297 5 0.4222 0.49254 0.000 0.184 0.000 0.088 0.728 0.000
#> SRR1700296 5 0.5837 0.32662 0.000 0.272 0.040 0.112 0.576 0.000
#> SRR1700298 5 0.5372 0.47843 0.000 0.056 0.092 0.124 0.708 0.020
#> SRR1700299 5 0.4347 0.42716 0.000 0.012 0.108 0.092 0.772 0.016
#> SRR1700300 5 0.7130 0.34090 0.000 0.164 0.140 0.144 0.528 0.024
#> SRR1700302 5 0.3932 0.49260 0.000 0.092 0.024 0.088 0.796 0.000
#> SRR1700301 5 0.4617 0.49604 0.000 0.168 0.012 0.104 0.716 0.000
#> SRR1700303 5 0.4259 0.49550 0.000 0.164 0.008 0.084 0.744 0.000
#> SRR1700304 5 0.6975 0.27720 0.000 0.252 0.132 0.104 0.500 0.012
#> SRR1700305 5 0.5744 0.41074 0.000 0.200 0.036 0.136 0.624 0.004
#> SRR1700306 5 0.6504 0.24044 0.000 0.028 0.224 0.136 0.568 0.044
#> SRR1700308 5 0.7574 0.39053 0.000 0.136 0.092 0.100 0.512 0.160
#> SRR1700307 5 0.7701 0.10601 0.000 0.060 0.252 0.096 0.448 0.144
#> SRR1700309 5 0.7223 0.09021 0.000 0.020 0.256 0.092 0.472 0.160
#> SRR1700310 5 0.4809 0.47085 0.000 0.188 0.004 0.128 0.680 0.000
#> SRR1700311 5 0.3556 0.46551 0.000 0.040 0.052 0.068 0.836 0.004
#> SRR1700312 5 0.6269 0.23839 0.000 0.300 0.052 0.104 0.536 0.008
#> SRR1700313 5 0.8261 0.09060 0.000 0.220 0.212 0.076 0.372 0.120
#> SRR1700314 5 0.4312 0.37758 0.000 0.000 0.072 0.132 0.764 0.032
#> SRR1700315 5 0.5463 0.45424 0.000 0.060 0.084 0.108 0.712 0.036
#> SRR1700316 5 0.6218 0.34308 0.000 0.008 0.124 0.104 0.616 0.148
#> SRR1700317 2 0.6257 0.20553 0.000 0.468 0.048 0.100 0.380 0.004
#> SRR1700318 5 0.6469 0.39210 0.000 0.100 0.152 0.144 0.592 0.012
#> SRR1700319 5 0.3782 0.43273 0.000 0.024 0.088 0.080 0.808 0.000
#> SRR1700320 5 0.4447 0.50061 0.000 0.148 0.012 0.104 0.736 0.000
#> SRR1700322 5 0.6645 0.41795 0.000 0.136 0.148 0.120 0.580 0.016
#> SRR1700321 5 0.6352 0.41446 0.000 0.212 0.064 0.104 0.596 0.024
#> SRR1700323 5 0.3222 0.49219 0.000 0.068 0.036 0.036 0.856 0.004
#> SRR1700324 5 0.5379 0.39142 0.000 0.244 0.032 0.092 0.632 0.000
#> SRR1700325 2 0.6880 0.25675 0.000 0.468 0.084 0.096 0.332 0.020
#> SRR1700326 5 0.7480 0.11172 0.000 0.048 0.332 0.152 0.404 0.064
#> SRR1700327 5 0.7257 0.41088 0.000 0.124 0.120 0.076 0.552 0.128
#> SRR1700329 5 0.4439 0.50647 0.000 0.152 0.012 0.088 0.744 0.004
#> SRR1700328 5 0.8023 -0.04432 0.000 0.112 0.328 0.076 0.356 0.128
#> SRR1700330 5 0.7430 0.29975 0.000 0.156 0.212 0.144 0.468 0.020
#> SRR1700331 5 0.3906 0.48621 0.000 0.048 0.052 0.096 0.804 0.000
#> SRR1700332 5 0.4324 0.50660 0.000 0.152 0.020 0.076 0.752 0.000
#> SRR1700333 5 0.7390 0.12097 0.000 0.296 0.148 0.128 0.416 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.203 0.645 0.818 0.4020 0.639 0.639
#> 3 3 0.489 0.714 0.856 0.4978 0.641 0.491
#> 4 4 0.360 0.404 0.641 0.1927 0.809 0.566
#> 5 5 0.475 0.559 0.703 0.0884 0.824 0.477
#> 6 6 0.531 0.449 0.657 0.0437 0.969 0.864
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.8608 0.5945 0.284 0.716
#> SRR1699875 2 0.7674 0.6776 0.224 0.776
#> SRR1699876 2 0.4431 0.7707 0.092 0.908
#> SRR1699877 2 0.9881 0.2255 0.436 0.564
#> SRR1699879 2 0.5408 0.7553 0.124 0.876
#> SRR1699878 2 0.8386 0.6189 0.268 0.732
#> SRR1699880 2 0.8081 0.6487 0.248 0.752
#> SRR1699881 2 0.7299 0.6984 0.204 0.796
#> SRR1699882 2 0.7528 0.6889 0.216 0.784
#> SRR1699883 2 0.8327 0.6288 0.264 0.736
#> SRR1699884 1 0.9944 0.1892 0.544 0.456
#> SRR1699885 2 0.9580 0.3914 0.380 0.620
#> SRR1699886 2 0.5178 0.7793 0.116 0.884
#> SRR1699888 2 0.8267 0.6396 0.260 0.740
#> SRR1699889 2 0.2043 0.7860 0.032 0.968
#> SRR1699890 1 0.9963 0.2737 0.536 0.464
#> SRR1699887 2 0.4562 0.7734 0.096 0.904
#> SRR1699891 2 0.5519 0.7245 0.128 0.872
#> SRR1699892 2 0.7453 0.6913 0.212 0.788
#> SRR1699893 2 0.0672 0.7851 0.008 0.992
#> SRR1699894 2 0.3879 0.7658 0.076 0.924
#> SRR1699895 2 0.4431 0.7553 0.092 0.908
#> SRR1699896 2 0.7453 0.7125 0.212 0.788
#> SRR1699897 2 0.6438 0.7315 0.164 0.836
#> SRR1699898 2 0.3879 0.7730 0.076 0.924
#> SRR1699900 2 0.8763 0.5817 0.296 0.704
#> SRR1699899 2 0.2043 0.7864 0.032 0.968
#> SRR1699902 2 0.7056 0.7150 0.192 0.808
#> SRR1699901 2 0.8661 0.4869 0.288 0.712
#> SRR1699903 2 0.2778 0.7780 0.048 0.952
#> SRR1699904 2 0.8144 0.5352 0.252 0.748
#> SRR1699905 1 0.7602 0.6651 0.780 0.220
#> SRR1699906 2 0.1184 0.7864 0.016 0.984
#> SRR1699907 2 0.8813 0.4267 0.300 0.700
#> SRR1699908 2 0.2778 0.7771 0.048 0.952
#> SRR1699909 2 0.3114 0.7794 0.056 0.944
#> SRR1699910 2 0.7528 0.6012 0.216 0.784
#> SRR1699911 2 0.8555 0.4749 0.280 0.720
#> SRR1699912 2 0.2423 0.7796 0.040 0.960
#> SRR1699913 2 0.2948 0.7764 0.052 0.948
#> SRR1699914 2 0.2043 0.7841 0.032 0.968
#> SRR1699915 2 0.8608 0.4645 0.284 0.716
#> SRR1699916 2 0.5519 0.7496 0.128 0.872
#> SRR1699917 2 0.3733 0.7676 0.072 0.928
#> SRR1699918 2 0.3114 0.7770 0.056 0.944
#> SRR1699919 2 0.4815 0.7458 0.104 0.896
#> SRR1699920 2 0.1843 0.7845 0.028 0.972
#> SRR1699921 2 0.7056 0.6375 0.192 0.808
#> SRR1699922 1 0.9686 0.4453 0.604 0.396
#> SRR1699923 1 0.9754 0.4160 0.592 0.408
#> SRR1699924 2 0.2236 0.7842 0.036 0.964
#> SRR1699925 1 0.6048 0.6985 0.852 0.148
#> SRR1699926 2 0.5737 0.7149 0.136 0.864
#> SRR1699927 2 0.3431 0.7721 0.064 0.936
#> SRR1699929 2 0.6343 0.7567 0.160 0.840
#> SRR1699928 2 0.4939 0.7431 0.108 0.892
#> SRR1699930 2 0.5629 0.7198 0.132 0.868
#> SRR1699931 2 0.6623 0.7357 0.172 0.828
#> SRR1699933 2 0.5946 0.7449 0.144 0.856
#> SRR1699932 2 0.3114 0.7745 0.056 0.944
#> SRR1699934 1 0.5737 0.7067 0.864 0.136
#> SRR1699935 2 0.2778 0.7771 0.048 0.952
#> SRR1699936 2 0.6438 0.7306 0.164 0.836
#> SRR1699937 2 0.9427 0.4396 0.360 0.640
#> SRR1699938 2 0.7602 0.6815 0.220 0.780
#> SRR1699940 2 0.6887 0.7156 0.184 0.816
#> SRR1699939 2 0.5946 0.7438 0.144 0.856
#> SRR1699941 2 0.8327 0.6236 0.264 0.736
#> SRR1699942 2 0.8207 0.6387 0.256 0.744
#> SRR1699943 2 0.9993 0.0405 0.484 0.516
#> SRR1699944 2 0.8144 0.6422 0.252 0.748
#> SRR1699945 2 0.7528 0.6886 0.216 0.784
#> SRR1699946 2 0.9552 0.4003 0.376 0.624
#> SRR1699947 2 0.9580 0.3854 0.380 0.620
#> SRR1699948 2 0.9209 0.4928 0.336 0.664
#> SRR1699949 2 0.4690 0.7675 0.100 0.900
#> SRR1699950 2 0.6148 0.7389 0.152 0.848
#> SRR1699951 2 0.6343 0.7342 0.160 0.840
#> SRR1699952 2 0.9129 0.5117 0.328 0.672
#> SRR1699953 2 0.7883 0.6635 0.236 0.764
#> SRR1699954 1 0.9248 0.4788 0.660 0.340
#> SRR1699955 2 0.7674 0.6772 0.224 0.776
#> SRR1699956 2 0.6712 0.7254 0.176 0.824
#> SRR1699957 2 0.7453 0.6907 0.212 0.788
#> SRR1699959 2 0.6343 0.7369 0.160 0.840
#> SRR1699958 2 0.4562 0.7747 0.096 0.904
#> SRR1699960 2 0.6438 0.7312 0.164 0.836
#> SRR1699961 2 0.9170 0.5026 0.332 0.668
#> SRR1699962 2 0.7219 0.7014 0.200 0.800
#> SRR1699963 2 0.7376 0.6977 0.208 0.792
#> SRR1699964 2 0.7528 0.6862 0.216 0.784
#> SRR1699965 2 0.7376 0.6941 0.208 0.792
#> SRR1699966 2 0.4562 0.7693 0.096 0.904
#> SRR1699967 2 0.9909 0.1921 0.444 0.556
#> SRR1699968 2 0.4939 0.7609 0.108 0.892
#> SRR1699969 2 0.4431 0.7712 0.092 0.908
#> SRR1699971 2 0.9129 0.5153 0.328 0.672
#> SRR1699970 2 0.9087 0.5236 0.324 0.676
#> SRR1699972 2 0.9087 0.5208 0.324 0.676
#> SRR1699973 2 0.4161 0.7731 0.084 0.916
#> SRR1699974 2 0.6247 0.7450 0.156 0.844
#> SRR1699975 2 0.4298 0.7688 0.088 0.912
#> SRR1699976 2 0.7674 0.6771 0.224 0.776
#> SRR1699977 2 0.5178 0.7581 0.116 0.884
#> SRR1699978 1 0.9522 0.4782 0.628 0.372
#> SRR1699979 2 0.4431 0.7682 0.092 0.908
#> SRR1699980 2 0.3114 0.7803 0.056 0.944
#> SRR1699981 2 0.2778 0.7874 0.048 0.952
#> SRR1699982 2 0.2423 0.7801 0.040 0.960
#> SRR1699983 2 0.1633 0.7861 0.024 0.976
#> SRR1699984 1 0.5059 0.7076 0.888 0.112
#> SRR1699985 2 0.4161 0.7702 0.084 0.916
#> SRR1699986 2 0.9286 0.3513 0.344 0.656
#> SRR1699988 2 0.8267 0.6099 0.260 0.740
#> SRR1699987 2 0.3879 0.7730 0.076 0.924
#> SRR1699989 2 0.4298 0.7710 0.088 0.912
#> SRR1699990 2 0.3879 0.7736 0.076 0.924
#> SRR1699992 2 0.9850 0.2676 0.428 0.572
#> SRR1699991 2 0.5842 0.7548 0.140 0.860
#> SRR1699993 2 0.9970 -0.0982 0.468 0.532
#> SRR1699994 2 0.7674 0.6805 0.224 0.776
#> SRR1699995 2 0.3879 0.7662 0.076 0.924
#> SRR1699996 1 0.9000 0.4984 0.684 0.316
#> SRR1699997 2 0.1414 0.7852 0.020 0.980
#> SRR1699998 2 0.7376 0.6985 0.208 0.792
#> SRR1699999 1 0.8813 0.5886 0.700 0.300
#> SRR1700000 2 0.9608 0.4050 0.384 0.616
#> SRR1700002 2 0.7528 0.6866 0.216 0.784
#> SRR1700001 2 0.6973 0.7159 0.188 0.812
#> SRR1700003 2 0.5294 0.7569 0.120 0.880
#> SRR1700004 2 0.4022 0.7747 0.080 0.920
#> SRR1700005 1 0.4562 0.7131 0.904 0.096
#> SRR1700006 2 0.9044 0.5293 0.320 0.680
#> SRR1700007 2 0.2948 0.7758 0.052 0.948
#> SRR1700008 2 0.3733 0.7676 0.072 0.928
#> SRR1700009 1 0.7139 0.6683 0.804 0.196
#> SRR1700010 2 0.7453 0.6922 0.212 0.788
#> SRR1700011 2 0.5629 0.7511 0.132 0.868
#> SRR1700013 2 0.9944 0.1908 0.456 0.544
#> SRR1700012 2 0.6623 0.7282 0.172 0.828
#> SRR1700014 2 0.4161 0.7703 0.084 0.916
#> SRR1700015 2 0.9044 0.5302 0.320 0.680
#> SRR1700016 1 0.8661 0.6177 0.712 0.288
#> SRR1700018 2 0.9795 0.2840 0.416 0.584
#> SRR1700017 2 0.6712 0.7231 0.176 0.824
#> SRR1700019 2 0.4562 0.7872 0.096 0.904
#> SRR1700020 2 0.3879 0.7748 0.076 0.924
#> SRR1700021 2 0.9661 0.1839 0.392 0.608
#> SRR1700023 2 0.4690 0.7643 0.100 0.900
#> SRR1700022 2 0.6343 0.7354 0.160 0.840
#> SRR1700024 2 0.1184 0.7860 0.016 0.984
#> SRR1700025 2 0.8555 0.6005 0.280 0.720
#> SRR1700026 2 0.9522 0.4242 0.372 0.628
#> SRR1700027 2 0.9087 0.5238 0.324 0.676
#> SRR1700028 2 0.3114 0.7852 0.056 0.944
#> SRR1700029 2 0.3114 0.7807 0.056 0.944
#> SRR1700030 2 0.2948 0.7883 0.052 0.948
#> SRR1700031 2 0.6623 0.7256 0.172 0.828
#> SRR1700032 2 0.6148 0.7392 0.152 0.848
#> SRR1700034 1 0.4939 0.7197 0.892 0.108
#> SRR1700035 2 0.1633 0.7836 0.024 0.976
#> SRR1700033 2 0.6623 0.7254 0.172 0.828
#> SRR1700036 2 0.2948 0.7818 0.052 0.948
#> SRR1700037 2 0.3584 0.7700 0.068 0.932
#> SRR1700038 2 0.9833 0.2072 0.424 0.576
#> SRR1700039 2 0.2423 0.7840 0.040 0.960
#> SRR1700040 2 0.6247 0.7387 0.156 0.844
#> SRR1700041 2 0.5519 0.7575 0.128 0.872
#> SRR1700042 2 0.4562 0.7694 0.096 0.904
#> SRR1700043 2 0.9000 0.5458 0.316 0.684
#> SRR1700045 2 0.1633 0.7864 0.024 0.976
#> SRR1700044 2 0.9850 0.1429 0.428 0.572
#> SRR1700046 2 0.5294 0.7670 0.120 0.880
#> SRR1700047 2 0.0672 0.7867 0.008 0.992
#> SRR1700048 2 0.1843 0.7833 0.028 0.972
#> SRR1700049 2 0.2423 0.7835 0.040 0.960
#> SRR1700050 2 0.1843 0.7828 0.028 0.972
#> SRR1700051 2 0.3114 0.7766 0.056 0.944
#> SRR1700052 2 0.7815 0.6462 0.232 0.768
#> SRR1700053 2 0.1184 0.7851 0.016 0.984
#> SRR1700054 2 0.5842 0.7562 0.140 0.860
#> SRR1700055 1 0.8713 0.6228 0.708 0.292
#> SRR1700056 2 0.3879 0.7658 0.076 0.924
#> SRR1700057 2 0.1843 0.7829 0.028 0.972
#> SRR1700058 2 0.7453 0.6966 0.212 0.788
#> SRR1700059 2 0.2043 0.7815 0.032 0.968
#> SRR1700060 2 0.2603 0.7831 0.044 0.956
#> SRR1700061 2 0.5408 0.7659 0.124 0.876
#> SRR1700062 2 0.1843 0.7860 0.028 0.972
#> SRR1700063 2 0.2043 0.7889 0.032 0.968
#> SRR1700064 2 0.2423 0.7801 0.040 0.960
#> SRR1700065 2 0.3733 0.7894 0.072 0.928
#> SRR1700066 2 0.7139 0.7096 0.196 0.804
#> SRR1700067 2 0.4690 0.7501 0.100 0.900
#> SRR1700068 2 0.1414 0.7841 0.020 0.980
#> SRR1700069 2 0.1184 0.7861 0.016 0.984
#> SRR1700070 2 0.7219 0.7050 0.200 0.800
#> SRR1700071 2 0.4161 0.7707 0.084 0.916
#> SRR1700072 2 0.8144 0.5249 0.252 0.748
#> SRR1700073 2 0.9833 0.1064 0.424 0.576
#> SRR1700075 2 0.3584 0.7886 0.068 0.932
#> SRR1700074 2 0.5178 0.7618 0.116 0.884
#> SRR1700076 2 0.4815 0.7789 0.104 0.896
#> SRR1700077 2 0.9323 0.4743 0.348 0.652
#> SRR1700078 2 0.4815 0.7691 0.104 0.896
#> SRR1700080 2 0.3879 0.7736 0.076 0.924
#> SRR1700079 2 0.0938 0.7857 0.012 0.988
#> SRR1700081 2 0.3879 0.7755 0.076 0.924
#> SRR1700082 2 0.5842 0.7461 0.140 0.860
#> SRR1700083 2 0.2603 0.7892 0.044 0.956
#> SRR1700084 2 0.9996 -0.0268 0.488 0.512
#> SRR1700085 2 0.2043 0.7865 0.032 0.968
#> SRR1700086 2 0.4298 0.7688 0.088 0.912
#> SRR1700087 2 0.9000 0.5579 0.316 0.684
#> SRR1700088 2 0.6887 0.7166 0.184 0.816
#> SRR1700089 2 0.8608 0.6115 0.284 0.716
#> SRR1700091 2 0.5178 0.7725 0.116 0.884
#> SRR1700090 2 0.3584 0.7707 0.068 0.932
#> SRR1700092 2 0.3584 0.7762 0.068 0.932
#> SRR1700094 2 0.6712 0.7415 0.176 0.824
#> SRR1700093 2 0.4022 0.7730 0.080 0.920
#> SRR1700095 2 0.5294 0.7641 0.120 0.880
#> SRR1700096 2 0.4562 0.7660 0.096 0.904
#> SRR1700097 2 0.6247 0.7064 0.156 0.844
#> SRR1700098 2 0.7453 0.7039 0.212 0.788
#> SRR1700099 2 0.2778 0.7838 0.048 0.952
#> SRR1700100 2 0.3879 0.7828 0.076 0.924
#> SRR1700101 2 0.5519 0.7741 0.128 0.872
#> SRR1700102 2 0.4161 0.7785 0.084 0.916
#> SRR1700104 2 0.4431 0.7842 0.092 0.908
#> SRR1700103 2 0.2948 0.7859 0.052 0.948
#> SRR1700105 2 0.4815 0.7463 0.104 0.896
#> SRR1700106 2 0.6343 0.6999 0.160 0.840
#> SRR1700107 2 0.3274 0.7887 0.060 0.940
#> SRR1700108 2 0.4690 0.7622 0.100 0.900
#> SRR1700109 2 0.2948 0.7804 0.052 0.948
#> SRR1700110 2 0.3431 0.7871 0.064 0.936
#> SRR1700112 2 0.3733 0.7685 0.072 0.928
#> SRR1700111 2 0.3584 0.7699 0.068 0.932
#> SRR1700113 2 0.1633 0.7834 0.024 0.976
#> SRR1700114 2 0.3431 0.7885 0.064 0.936
#> SRR1700115 2 0.3274 0.7729 0.060 0.940
#> SRR1700116 2 0.3274 0.7729 0.060 0.940
#> SRR1700117 2 0.9491 0.2685 0.368 0.632
#> SRR1700119 2 0.3431 0.7712 0.064 0.936
#> SRR1700118 2 0.3431 0.7727 0.064 0.936
#> SRR1700120 2 0.4161 0.7620 0.084 0.916
#> SRR1700121 2 0.1633 0.7840 0.024 0.976
#> SRR1700122 2 0.5519 0.7385 0.128 0.872
#> SRR1700123 2 0.4690 0.7489 0.100 0.900
#> SRR1700125 2 0.4431 0.7551 0.092 0.908
#> SRR1700126 2 0.4298 0.7663 0.088 0.912
#> SRR1700127 2 0.1843 0.7832 0.028 0.972
#> SRR1700124 2 0.2778 0.7777 0.048 0.952
#> SRR1700128 2 0.5519 0.7266 0.128 0.872
#> SRR1700129 2 0.3879 0.7652 0.076 0.924
#> SRR1700130 2 0.5946 0.7147 0.144 0.856
#> SRR1700132 2 0.4022 0.7666 0.080 0.920
#> SRR1700131 2 0.2043 0.7821 0.032 0.968
#> SRR1700133 2 0.4431 0.7549 0.092 0.908
#> SRR1700134 2 0.3733 0.7678 0.072 0.928
#> SRR1700135 2 0.5629 0.7214 0.132 0.868
#> SRR1700136 2 0.1184 0.7850 0.016 0.984
#> SRR1700137 2 0.2948 0.7771 0.052 0.948
#> SRR1700138 2 0.2778 0.7771 0.048 0.952
#> SRR1700140 2 0.1843 0.7831 0.028 0.972
#> SRR1700139 2 0.3431 0.7712 0.064 0.936
#> SRR1700141 2 0.3584 0.7722 0.068 0.932
#> SRR1700142 2 0.2236 0.7807 0.036 0.964
#> SRR1700143 2 0.2043 0.7821 0.032 0.968
#> SRR1700144 2 0.1414 0.7842 0.020 0.980
#> SRR1700145 2 0.4815 0.7462 0.104 0.896
#> SRR1700146 2 0.3584 0.7698 0.068 0.932
#> SRR1700147 2 0.3431 0.7717 0.064 0.936
#> SRR1700149 2 0.5519 0.7259 0.128 0.872
#> SRR1700148 2 0.6343 0.6872 0.160 0.840
#> SRR1700150 2 0.3584 0.7696 0.068 0.932
#> SRR1700152 2 0.5178 0.7423 0.116 0.884
#> SRR1700151 2 0.3431 0.7712 0.064 0.936
#> SRR1700153 2 0.2948 0.7761 0.052 0.948
#> SRR1700154 2 0.4939 0.7525 0.108 0.892
#> SRR1700155 2 0.3431 0.7712 0.064 0.936
#> SRR1700156 2 0.3584 0.7696 0.068 0.932
#> SRR1700158 2 0.7056 0.6557 0.192 0.808
#> SRR1700159 2 0.4562 0.7540 0.096 0.904
#> SRR1700157 2 0.3274 0.7729 0.060 0.940
#> SRR1700160 2 0.2778 0.7775 0.048 0.952
#> SRR1700161 2 0.3274 0.7729 0.060 0.940
#> SRR1700162 2 0.4562 0.7516 0.096 0.904
#> SRR1700164 1 0.9170 0.5344 0.668 0.332
#> SRR1700163 2 0.9815 0.0924 0.420 0.580
#> SRR1700165 2 0.3431 0.7775 0.064 0.936
#> SRR1700166 2 0.6148 0.7059 0.152 0.848
#> SRR1700168 2 0.5294 0.7353 0.120 0.880
#> SRR1700167 2 0.3431 0.7730 0.064 0.936
#> SRR1700170 2 0.6801 0.6676 0.180 0.820
#> SRR1700169 2 0.3733 0.7676 0.072 0.928
#> SRR1700171 1 0.9866 0.3588 0.568 0.432
#> SRR1700172 2 0.1843 0.7829 0.028 0.972
#> SRR1700174 2 0.1184 0.7844 0.016 0.984
#> SRR1700173 2 0.3431 0.7717 0.064 0.936
#> SRR1700175 2 0.5059 0.7386 0.112 0.888
#> SRR1700176 2 0.1633 0.7854 0.024 0.976
#> SRR1700178 1 0.9358 0.4511 0.648 0.352
#> SRR1700177 2 0.3584 0.7696 0.068 0.932
#> SRR1700180 1 0.9580 0.3914 0.620 0.380
#> SRR1700179 1 0.9998 0.0557 0.508 0.492
#> SRR1700181 1 0.9552 0.3908 0.624 0.376
#> SRR1700183 1 0.3879 0.7155 0.924 0.076
#> SRR1700182 1 0.9933 0.2018 0.548 0.452
#> SRR1700184 1 0.9754 0.3289 0.592 0.408
#> SRR1700186 1 0.9909 0.2262 0.556 0.444
#> SRR1700187 1 0.4298 0.7150 0.912 0.088
#> SRR1700185 1 0.4562 0.7131 0.904 0.096
#> SRR1700188 1 0.9944 0.1866 0.544 0.456
#> SRR1700192 1 0.2236 0.7116 0.964 0.036
#> SRR1700190 1 0.9044 0.5065 0.680 0.320
#> SRR1700191 1 0.4431 0.7143 0.908 0.092
#> SRR1700189 1 0.4431 0.7143 0.908 0.092
#> SRR1700193 1 0.4815 0.6795 0.896 0.104
#> SRR1700195 1 0.3879 0.6914 0.924 0.076
#> SRR1700194 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700196 1 0.9552 0.4058 0.624 0.376
#> SRR1700197 1 0.1633 0.7072 0.976 0.024
#> SRR1700198 1 0.7883 0.6041 0.764 0.236
#> SRR1700199 1 0.8016 0.5929 0.756 0.244
#> SRR1700200 1 0.2423 0.6987 0.960 0.040
#> SRR1700201 2 0.9460 0.4356 0.364 0.636
#> SRR1700202 1 0.4298 0.7150 0.912 0.088
#> SRR1700203 1 0.4939 0.7033 0.892 0.108
#> SRR1700204 1 0.8081 0.5911 0.752 0.248
#> SRR1700206 1 0.9393 0.4447 0.644 0.356
#> SRR1700207 1 0.9491 0.4170 0.632 0.368
#> SRR1700208 1 0.2603 0.6890 0.956 0.044
#> SRR1700205 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700209 2 0.7883 0.6651 0.236 0.764
#> SRR1700210 1 0.2778 0.7133 0.952 0.048
#> SRR1700211 1 0.2948 0.7148 0.948 0.052
#> SRR1700212 1 0.2423 0.7079 0.960 0.040
#> SRR1700213 1 0.9323 0.4612 0.652 0.348
#> SRR1700214 1 0.2778 0.6930 0.952 0.048
#> SRR1700215 1 0.4562 0.7131 0.904 0.096
#> SRR1700217 1 0.8955 0.5894 0.688 0.312
#> SRR1700216 1 0.4562 0.7131 0.904 0.096
#> SRR1700218 2 0.9323 0.4696 0.348 0.652
#> SRR1700219 1 0.9977 0.0840 0.528 0.472
#> SRR1700222 1 0.4298 0.7151 0.912 0.088
#> SRR1700220 2 0.2603 0.7870 0.044 0.956
#> SRR1700221 1 0.3733 0.7099 0.928 0.072
#> SRR1700223 1 0.9775 0.2987 0.588 0.412
#> SRR1700224 1 0.7056 0.6826 0.808 0.192
#> SRR1700226 1 0.9988 0.0952 0.520 0.480
#> SRR1700229 2 0.8207 0.6474 0.256 0.744
#> SRR1700225 2 0.7883 0.6660 0.236 0.764
#> SRR1700227 1 0.9998 0.0530 0.508 0.492
#> SRR1700230 1 0.4690 0.7121 0.900 0.100
#> SRR1700231 2 0.9944 0.1464 0.456 0.544
#> SRR1700228 1 0.2603 0.7131 0.956 0.044
#> SRR1700232 2 0.9996 0.0294 0.488 0.512
#> SRR1700233 1 0.3274 0.7140 0.940 0.060
#> SRR1700234 1 0.4815 0.7206 0.896 0.104
#> SRR1700235 2 0.7674 0.6832 0.224 0.776
#> SRR1700237 1 0.9635 0.3716 0.612 0.388
#> SRR1700236 2 0.9286 0.4824 0.344 0.656
#> SRR1700238 1 0.5178 0.6862 0.884 0.116
#> SRR1700239 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700240 1 0.4815 0.7106 0.896 0.104
#> SRR1700241 1 0.4431 0.7217 0.908 0.092
#> SRR1700243 1 0.9686 0.3528 0.604 0.396
#> SRR1700244 1 0.4939 0.7061 0.892 0.108
#> SRR1700242 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700246 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700245 2 0.8267 0.6320 0.260 0.740
#> SRR1700247 1 0.4161 0.7155 0.916 0.084
#> SRR1700249 1 0.4431 0.7144 0.908 0.092
#> SRR1700250 2 0.9833 0.2622 0.424 0.576
#> SRR1700248 1 0.9522 0.4067 0.628 0.372
#> SRR1700251 1 0.7815 0.6135 0.768 0.232
#> SRR1700252 1 0.4562 0.6858 0.904 0.096
#> SRR1700253 2 0.9775 0.3140 0.412 0.588
#> SRR1700256 1 0.8813 0.5265 0.700 0.300
#> SRR1700254 1 0.4431 0.7142 0.908 0.092
#> SRR1700255 1 0.2948 0.7149 0.948 0.052
#> SRR1700257 1 0.8016 0.5946 0.756 0.244
#> SRR1700258 1 0.9963 0.1364 0.536 0.464
#> SRR1700259 2 0.5629 0.7509 0.132 0.868
#> SRR1700260 2 0.3584 0.7809 0.068 0.932
#> SRR1700261 2 0.3431 0.7781 0.064 0.936
#> SRR1700262 2 0.4022 0.7908 0.080 0.920
#> SRR1700263 2 0.8207 0.6421 0.256 0.744
#> SRR1700264 2 0.9323 0.4670 0.348 0.652
#> SRR1700265 1 0.8081 0.6002 0.752 0.248
#> SRR1700266 2 0.7528 0.6867 0.216 0.784
#> SRR1700268 1 0.7299 0.6762 0.796 0.204
#> SRR1700270 1 0.9833 0.2859 0.576 0.424
#> SRR1700267 2 0.6887 0.7181 0.184 0.816
#> SRR1700271 2 0.5178 0.7596 0.116 0.884
#> SRR1700272 2 0.6623 0.7504 0.172 0.828
#> SRR1700273 2 0.8608 0.5964 0.284 0.716
#> SRR1700274 2 0.9170 0.5401 0.332 0.668
#> SRR1700277 1 0.9993 0.0851 0.516 0.484
#> SRR1700275 2 0.4690 0.7672 0.100 0.900
#> SRR1700276 1 0.6887 0.6863 0.816 0.184
#> SRR1700278 1 0.9044 0.5635 0.680 0.320
#> SRR1700279 1 0.9580 0.4644 0.620 0.380
#> SRR1700280 1 0.6887 0.6864 0.816 0.184
#> SRR1700281 2 0.9710 0.3426 0.400 0.600
#> SRR1700283 2 0.4298 0.7653 0.088 0.912
#> SRR1700282 1 0.7883 0.6511 0.764 0.236
#> SRR1700284 2 0.3114 0.7745 0.056 0.944
#> SRR1700285 2 0.7528 0.6444 0.216 0.784
#> SRR1700286 2 0.4431 0.7672 0.092 0.908
#> SRR1700287 2 0.9815 0.0803 0.420 0.580
#> SRR1700290 1 0.8813 0.5896 0.700 0.300
#> SRR1700289 2 0.7453 0.6143 0.212 0.788
#> SRR1700288 1 0.7602 0.6665 0.780 0.220
#> SRR1700292 2 0.8713 0.4519 0.292 0.708
#> SRR1700291 2 0.0672 0.7851 0.008 0.992
#> SRR1700293 2 0.9491 0.3438 0.368 0.632
#> SRR1700294 2 0.9850 0.0485 0.428 0.572
#> SRR1700295 2 0.9686 0.1579 0.396 0.604
#> SRR1700297 2 0.8207 0.5258 0.256 0.744
#> SRR1700296 1 0.9963 0.2827 0.536 0.464
#> SRR1700298 2 0.9522 0.2145 0.372 0.628
#> SRR1700299 2 0.6148 0.6977 0.152 0.848
#> SRR1700300 1 0.9977 0.2603 0.528 0.472
#> SRR1700302 2 0.4690 0.7491 0.100 0.900
#> SRR1700301 2 0.7056 0.6389 0.192 0.808
#> SRR1700303 2 0.4690 0.7543 0.100 0.900
#> SRR1700304 1 0.5519 0.7015 0.872 0.128
#> SRR1700305 2 0.9393 0.3064 0.356 0.644
#> SRR1700306 2 0.9795 0.0850 0.416 0.584
#> SRR1700308 2 0.4298 0.7745 0.088 0.912
#> SRR1700307 2 0.5519 0.7292 0.128 0.872
#> SRR1700309 2 0.5629 0.7242 0.132 0.868
#> SRR1700310 2 0.9129 0.3619 0.328 0.672
#> SRR1700311 2 0.9661 0.1684 0.392 0.608
#> SRR1700312 2 0.6531 0.7150 0.168 0.832
#> SRR1700313 1 0.9922 0.3318 0.552 0.448
#> SRR1700314 2 0.3431 0.7716 0.064 0.936
#> SRR1700315 2 0.7602 0.5982 0.220 0.780
#> SRR1700316 2 0.1414 0.7850 0.020 0.980
#> SRR1700317 2 0.5059 0.7689 0.112 0.888
#> SRR1700318 1 0.8016 0.6364 0.756 0.244
#> SRR1700319 2 0.7528 0.6016 0.216 0.784
#> SRR1700320 2 0.6887 0.6525 0.184 0.816
#> SRR1700322 1 0.9954 0.2974 0.540 0.460
#> SRR1700321 2 0.2043 0.7867 0.032 0.968
#> SRR1700323 2 0.4431 0.7555 0.092 0.908
#> SRR1700324 2 0.9248 0.3336 0.340 0.660
#> SRR1700325 2 0.8499 0.6219 0.276 0.724
#> SRR1700326 1 0.9896 0.3479 0.560 0.440
#> SRR1700327 2 0.3733 0.7756 0.072 0.928
#> SRR1700329 2 0.3274 0.7770 0.060 0.940
#> SRR1700328 1 0.8443 0.6200 0.728 0.272
#> SRR1700330 1 0.7219 0.6731 0.800 0.200
#> SRR1700331 2 0.3733 0.7692 0.072 0.928
#> SRR1700332 2 0.4939 0.7437 0.108 0.892
#> SRR1700333 1 0.6801 0.6882 0.820 0.180
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0592 0.807978 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699875 2 0.0237 0.806038 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699876 3 0.5835 0.542663 0.000 0.340 0.660
#> SRR1699877 2 0.1529 0.799692 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699879 2 0.4654 0.659766 0.000 0.792 0.208
#> SRR1699878 2 0.0829 0.806227 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699880 2 0.0848 0.807068 0.008 0.984 0.008
#> SRR1699881 2 0.2680 0.798031 0.008 0.924 0.068
#> SRR1699882 2 0.1753 0.805128 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699883 2 0.1170 0.808738 0.008 0.976 0.016
#> SRR1699884 2 0.2959 0.768612 0.100 0.900 0.000
#> SRR1699885 2 0.0892 0.803865 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699886 3 0.7777 0.273601 0.052 0.416 0.532
#> SRR1699888 2 0.7949 0.425861 0.084 0.608 0.308
#> SRR1699889 3 0.3816 0.799013 0.000 0.148 0.852
#> SRR1699890 1 0.8543 0.482988 0.580 0.128 0.292
#> SRR1699887 2 0.6235 0.217966 0.000 0.564 0.436
#> SRR1699891 3 0.1636 0.858020 0.016 0.020 0.964
#> SRR1699892 2 0.2384 0.800178 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699893 3 0.1163 0.854941 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699894 3 0.0237 0.855443 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699895 3 0.0983 0.854619 0.016 0.004 0.980
#> SRR1699896 2 0.3267 0.754892 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699897 2 0.3752 0.737247 0.000 0.856 0.144
#> SRR1699898 3 0.4002 0.790607 0.000 0.160 0.840
#> SRR1699900 2 0.2749 0.797036 0.012 0.924 0.064
#> SRR1699899 3 0.4235 0.778665 0.000 0.176 0.824
#> SRR1699902 2 0.7526 0.166846 0.040 0.536 0.424
#> SRR1699901 3 0.5728 0.708788 0.196 0.032 0.772
#> SRR1699903 3 0.0475 0.855903 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699904 3 0.1643 0.843697 0.044 0.000 0.956
#> SRR1699905 1 0.5882 0.446649 0.652 0.000 0.348
#> SRR1699906 3 0.2796 0.834184 0.000 0.092 0.908
#> SRR1699907 3 0.2774 0.828065 0.072 0.008 0.920
#> SRR1699908 3 0.1031 0.855586 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699909 3 0.3695 0.827556 0.012 0.108 0.880
#> SRR1699910 3 0.1753 0.841644 0.048 0.000 0.952
#> SRR1699911 3 0.4370 0.834099 0.056 0.076 0.868
#> SRR1699912 3 0.0424 0.854217 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699913 3 0.0983 0.856882 0.004 0.016 0.980
#> SRR1699914 3 0.1647 0.855911 0.004 0.036 0.960
#> SRR1699915 3 0.1964 0.836561 0.056 0.000 0.944
#> SRR1699916 3 0.4676 0.812296 0.112 0.040 0.848
#> SRR1699917 3 0.1015 0.856925 0.008 0.012 0.980
#> SRR1699918 3 0.1620 0.858773 0.012 0.024 0.964
#> SRR1699919 3 0.0983 0.854483 0.016 0.004 0.980
#> SRR1699920 3 0.1950 0.855612 0.008 0.040 0.952
#> SRR1699921 3 0.1399 0.851670 0.028 0.004 0.968
#> SRR1699922 1 0.9136 0.175516 0.456 0.144 0.400
#> SRR1699923 1 0.7945 0.622030 0.652 0.124 0.224
#> SRR1699924 3 0.3116 0.830906 0.000 0.108 0.892
#> SRR1699925 1 0.2711 0.760189 0.912 0.000 0.088
#> SRR1699926 3 0.1337 0.856841 0.012 0.016 0.972
#> SRR1699927 3 0.0661 0.855563 0.008 0.004 0.988
#> SRR1699929 2 0.5623 0.561090 0.004 0.716 0.280
#> SRR1699928 3 0.1015 0.855733 0.012 0.008 0.980
#> SRR1699930 3 0.1482 0.857138 0.012 0.020 0.968
#> SRR1699931 2 0.5785 0.516526 0.004 0.696 0.300
#> SRR1699933 2 0.5178 0.610508 0.000 0.744 0.256
#> SRR1699932 3 0.1129 0.858015 0.004 0.020 0.976
#> SRR1699934 1 0.2261 0.764757 0.932 0.000 0.068
#> SRR1699935 3 0.1163 0.856664 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699936 2 0.2448 0.790131 0.000 0.924 0.076
#> SRR1699937 2 0.1289 0.802622 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699938 2 0.0237 0.807103 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699940 2 0.0592 0.806998 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699939 2 0.3941 0.716824 0.000 0.844 0.156
#> SRR1699941 2 0.1337 0.809565 0.012 0.972 0.016
#> SRR1699942 2 0.0000 0.806089 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699943 2 0.1753 0.796566 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699944 2 0.0237 0.806038 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699945 2 0.0983 0.808539 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699946 2 0.1163 0.802642 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699947 2 0.0892 0.803865 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699948 2 0.0892 0.803763 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699949 2 0.6062 0.384180 0.000 0.616 0.384
#> SRR1699950 2 0.3412 0.758685 0.000 0.876 0.124
#> SRR1699951 2 0.4654 0.670526 0.000 0.792 0.208
#> SRR1699952 2 0.1031 0.803040 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699953 2 0.1129 0.808631 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699954 2 0.4178 0.706108 0.172 0.828 0.000
#> SRR1699955 2 0.1163 0.805624 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699956 2 0.1753 0.803398 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699957 2 0.0892 0.808808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699959 2 0.4346 0.693091 0.000 0.816 0.184
#> SRR1699958 3 0.5956 0.551389 0.004 0.324 0.672
#> SRR1699960 2 0.2796 0.779103 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699961 2 0.0592 0.805552 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699962 2 0.2878 0.772869 0.000 0.904 0.096
#> SRR1699963 2 0.1529 0.803798 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699964 2 0.1453 0.809023 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699965 2 0.1765 0.805802 0.004 0.956 0.040
#> SRR1699966 2 0.6286 0.138384 0.000 0.536 0.464
#> SRR1699967 2 0.1163 0.802540 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699968 2 0.5397 0.573406 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699969 3 0.5497 0.634287 0.000 0.292 0.708
#> SRR1699971 2 0.0892 0.804405 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699970 2 0.1163 0.802393 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699972 2 0.1031 0.803040 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699973 3 0.4555 0.751359 0.000 0.200 0.800
#> SRR1699974 2 0.2959 0.776351 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699975 3 0.5706 0.586466 0.000 0.320 0.680
#> SRR1699976 2 0.0983 0.807739 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699977 2 0.6244 0.185289 0.000 0.560 0.440
#> SRR1699978 3 0.6095 0.358106 0.392 0.000 0.608
#> SRR1699979 3 0.6126 0.427576 0.000 0.400 0.600
#> SRR1699980 3 0.3340 0.818800 0.000 0.120 0.880
#> SRR1699981 3 0.3918 0.802626 0.004 0.140 0.856
#> SRR1699982 3 0.0747 0.855865 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699983 3 0.1031 0.854863 0.000 0.024 0.976
#> SRR1699984 1 0.2269 0.766033 0.944 0.040 0.016
#> SRR1699985 3 0.5760 0.602906 0.000 0.328 0.672
#> SRR1699986 3 0.4862 0.744648 0.160 0.020 0.820
#> SRR1699988 2 0.9599 0.057179 0.200 0.412 0.388
#> SRR1699987 3 0.5216 0.687207 0.000 0.260 0.740
#> SRR1699989 3 0.6140 0.401060 0.000 0.404 0.596
#> SRR1699990 3 0.4750 0.740993 0.000 0.216 0.784
#> SRR1699992 2 0.2902 0.803311 0.064 0.920 0.016
#> SRR1699991 2 0.6026 0.349593 0.000 0.624 0.376
#> SRR1699993 3 0.6298 0.302272 0.388 0.004 0.608
#> SRR1699994 2 0.1453 0.809676 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699995 3 0.0848 0.856035 0.008 0.008 0.984
#> SRR1699996 2 0.5247 0.663356 0.224 0.768 0.008
#> SRR1699997 3 0.0237 0.855443 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699998 2 0.0983 0.807185 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699999 1 0.6062 0.719351 0.776 0.064 0.160
#> SRR1700000 2 0.1411 0.801064 0.036 0.964 0.000
#> SRR1700002 2 0.0747 0.806957 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700001 2 0.2496 0.794003 0.004 0.928 0.068
#> SRR1700003 2 0.4796 0.644886 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700004 3 0.5785 0.566259 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700005 1 0.1289 0.767306 0.968 0.000 0.032
#> SRR1700006 2 0.0592 0.805057 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700007 3 0.1529 0.853784 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700008 3 0.0424 0.854916 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700009 1 0.4062 0.727228 0.836 0.000 0.164
#> SRR1700010 2 0.1964 0.800285 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700011 2 0.5216 0.601960 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700013 2 0.3618 0.782930 0.104 0.884 0.012
#> SRR1700012 2 0.3193 0.773885 0.004 0.896 0.100
#> SRR1700014 3 0.4796 0.739483 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700015 2 0.1267 0.805434 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700016 1 0.5961 0.719277 0.788 0.136 0.076
#> SRR1700018 2 0.1163 0.802432 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700017 2 0.1964 0.801966 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700019 3 0.6669 0.160226 0.008 0.468 0.524
#> SRR1700020 3 0.5591 0.624787 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700021 3 0.4293 0.753351 0.164 0.004 0.832
#> SRR1700023 2 0.5397 0.572886 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700022 2 0.1753 0.804063 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700024 3 0.2537 0.841969 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700025 2 0.0829 0.807419 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700026 2 0.1711 0.807129 0.032 0.960 0.008
#> SRR1700027 2 0.1337 0.809001 0.012 0.972 0.016
#> SRR1700028 3 0.1636 0.857195 0.020 0.016 0.964
#> SRR1700029 3 0.1877 0.856766 0.012 0.032 0.956
#> SRR1700030 3 0.5285 0.715098 0.004 0.244 0.752
#> SRR1700031 2 0.1411 0.805470 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700032 2 0.1643 0.803265 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700034 1 0.6189 0.419515 0.632 0.364 0.004
#> SRR1700035 3 0.1163 0.854994 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700033 2 0.2955 0.790506 0.008 0.912 0.080
#> SRR1700036 3 0.4887 0.730365 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700037 3 0.1453 0.858362 0.008 0.024 0.968
#> SRR1700038 2 0.7092 0.596447 0.084 0.708 0.208
#> SRR1700039 3 0.3941 0.797063 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700040 2 0.3412 0.747185 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700041 3 0.6421 0.377173 0.004 0.424 0.572
#> SRR1700042 3 0.6252 0.335569 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700043 2 0.3181 0.801712 0.024 0.912 0.064
#> SRR1700045 3 0.2448 0.845643 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700044 3 0.9509 0.184525 0.220 0.296 0.484
#> SRR1700046 3 0.6777 0.504993 0.020 0.364 0.616
#> SRR1700047 3 0.4452 0.763620 0.000 0.192 0.808
#> SRR1700048 3 0.1964 0.849912 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700049 3 0.2537 0.840315 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700050 3 0.1399 0.857167 0.004 0.028 0.968
#> SRR1700051 3 0.1170 0.857655 0.008 0.016 0.976
#> SRR1700052 3 0.8132 0.500539 0.096 0.304 0.600
#> SRR1700053 3 0.2261 0.846265 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700054 3 0.6359 0.429311 0.004 0.404 0.592
#> SRR1700055 1 0.7361 0.664378 0.704 0.124 0.172
#> SRR1700056 3 0.0848 0.856242 0.008 0.008 0.984
#> SRR1700057 3 0.1411 0.855144 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700058 2 0.5122 0.660376 0.012 0.788 0.200
#> SRR1700059 3 0.0000 0.855290 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700060 3 0.2796 0.834620 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700061 3 0.6467 0.450850 0.008 0.388 0.604
#> SRR1700062 3 0.1753 0.851670 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700063 3 0.5497 0.652418 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700064 3 0.0892 0.857053 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700065 3 0.5591 0.631782 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700066 2 0.6543 0.437191 0.016 0.640 0.344
#> SRR1700067 3 0.0892 0.852797 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700068 3 0.1411 0.855399 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700069 3 0.1860 0.850642 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700070 2 0.6675 0.231773 0.012 0.584 0.404
#> SRR1700071 3 0.5178 0.703132 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700072 3 0.7112 0.636279 0.060 0.260 0.680
#> SRR1700073 3 0.5443 0.638240 0.260 0.004 0.736
#> SRR1700075 3 0.5864 0.650043 0.008 0.288 0.704
#> SRR1700074 2 0.5397 0.556377 0.000 0.720 0.280
#> SRR1700076 3 0.8162 0.425713 0.084 0.348 0.568
#> SRR1700077 2 0.3406 0.797611 0.028 0.904 0.068
#> SRR1700078 3 0.4931 0.794810 0.032 0.140 0.828
#> SRR1700080 3 0.3267 0.823640 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700079 3 0.2448 0.844165 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700081 3 0.4887 0.732733 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700082 2 0.2537 0.786261 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700083 3 0.3678 0.836733 0.028 0.080 0.892
#> SRR1700084 2 0.5207 0.761827 0.124 0.824 0.052
#> SRR1700085 3 0.1753 0.851501 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700086 3 0.5785 0.579175 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700087 2 0.6393 0.681103 0.148 0.764 0.088
#> SRR1700088 2 0.1163 0.806440 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700089 2 0.4324 0.764364 0.028 0.860 0.112
#> SRR1700091 3 0.7130 0.258547 0.024 0.432 0.544
#> SRR1700090 3 0.0475 0.855841 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700092 3 0.5178 0.689432 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700094 2 0.7487 0.302949 0.040 0.552 0.408
#> SRR1700093 3 0.1182 0.858467 0.012 0.012 0.976
#> SRR1700095 3 0.4423 0.815674 0.088 0.048 0.864
#> SRR1700096 3 0.5968 0.467540 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700097 3 0.2806 0.844088 0.032 0.040 0.928
#> SRR1700098 2 0.7885 0.376078 0.068 0.580 0.352
#> SRR1700099 3 0.3267 0.819355 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700100 3 0.3918 0.808048 0.004 0.140 0.856
#> SRR1700101 3 0.7308 0.561297 0.056 0.296 0.648
#> SRR1700102 3 0.5178 0.670881 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700104 3 0.6375 0.644275 0.036 0.244 0.720
#> SRR1700103 3 0.3619 0.788888 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700105 3 0.0592 0.854628 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700106 3 0.2878 0.818933 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700107 3 0.2383 0.852889 0.016 0.044 0.940
#> SRR1700108 3 0.2773 0.847315 0.048 0.024 0.928
#> SRR1700109 3 0.0661 0.856392 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700110 3 0.4249 0.818048 0.028 0.108 0.864
#> SRR1700112 3 0.0747 0.853874 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700111 3 0.0892 0.852918 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700113 3 0.1163 0.855326 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700114 3 0.2056 0.857785 0.024 0.024 0.952
#> SRR1700115 3 0.0661 0.856429 0.008 0.004 0.988
#> SRR1700116 3 0.0000 0.855290 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700117 3 0.3918 0.777509 0.140 0.004 0.856
#> SRR1700119 3 0.0661 0.856042 0.008 0.004 0.988
#> SRR1700118 3 0.0475 0.855678 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700120 3 0.1267 0.855248 0.024 0.004 0.972
#> SRR1700121 3 0.0747 0.855583 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700122 3 0.2165 0.838186 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700123 3 0.0592 0.853510 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700125 3 0.0747 0.852994 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700126 3 0.2955 0.830685 0.080 0.008 0.912
#> SRR1700127 3 0.0661 0.856223 0.008 0.004 0.988
#> SRR1700124 3 0.0475 0.855768 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700128 3 0.1753 0.843393 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700129 3 0.1031 0.851142 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700130 3 0.1753 0.844048 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700132 3 0.1031 0.852731 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700131 3 0.1129 0.855580 0.020 0.004 0.976
#> SRR1700133 3 0.0747 0.852914 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700134 3 0.1031 0.850815 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700135 3 0.1529 0.846083 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700136 3 0.0475 0.855841 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700137 3 0.0237 0.854970 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700138 3 0.0661 0.855322 0.008 0.004 0.988
#> SRR1700140 3 0.0592 0.856250 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700139 3 0.0892 0.852802 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700141 3 0.1031 0.852604 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700142 3 0.0892 0.857077 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700143 3 0.0000 0.855290 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700144 3 0.1753 0.852054 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700145 3 0.0747 0.852946 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700146 3 0.0424 0.854217 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700147 3 0.1031 0.851142 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700149 3 0.1753 0.843740 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700148 3 0.1529 0.846060 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700150 3 0.0237 0.855400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700152 3 0.2066 0.838236 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700151 3 0.0237 0.854970 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700153 3 0.0424 0.855092 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700154 3 0.2537 0.828846 0.080 0.000 0.920
#> SRR1700155 3 0.0747 0.854121 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700156 3 0.0237 0.855400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700158 3 0.2796 0.819108 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700159 3 0.1163 0.849707 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700157 3 0.0892 0.851969 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700160 3 0.0661 0.857863 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700161 3 0.0592 0.853510 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700162 3 0.0892 0.852128 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700164 3 0.6225 0.227894 0.432 0.000 0.568
#> SRR1700163 3 0.4654 0.700840 0.208 0.000 0.792
#> SRR1700165 3 0.1585 0.856383 0.028 0.008 0.964
#> SRR1700166 3 0.1964 0.840435 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700168 3 0.1643 0.845921 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700167 3 0.0892 0.852530 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700170 3 0.1753 0.845812 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700169 3 0.0592 0.853928 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700171 3 0.6286 0.098374 0.464 0.000 0.536
#> SRR1700172 3 0.0592 0.856250 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700174 3 0.0747 0.855416 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700173 3 0.0475 0.855678 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700175 3 0.1031 0.851768 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700176 3 0.1860 0.853185 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700178 2 0.3879 0.727164 0.152 0.848 0.000
#> SRR1700177 3 0.0747 0.853140 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700180 2 0.3482 0.750015 0.128 0.872 0.000
#> SRR1700179 2 0.1753 0.796352 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700181 2 0.4654 0.684657 0.208 0.792 0.000
#> SRR1700183 1 0.1163 0.761053 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700182 2 0.2537 0.780439 0.080 0.920 0.000
#> SRR1700184 2 0.3340 0.753763 0.120 0.880 0.000
#> SRR1700186 2 0.2165 0.789724 0.064 0.936 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.767991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0592 0.768452 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700188 2 0.2356 0.785616 0.072 0.928 0.000
#> SRR1700192 1 0.4399 0.656257 0.812 0.188 0.000
#> SRR1700190 2 0.3619 0.742047 0.136 0.864 0.000
#> SRR1700191 1 0.0237 0.767338 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.767991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.5905 0.454454 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700195 2 0.5678 0.505815 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700194 1 0.1031 0.762211 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700196 2 0.3816 0.731522 0.148 0.852 0.000
#> SRR1700197 1 0.5760 0.474021 0.672 0.328 0.000
#> SRR1700198 2 0.4291 0.697873 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700199 2 0.5016 0.629824 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700200 2 0.5810 0.454018 0.336 0.664 0.000
#> SRR1700201 2 0.1289 0.804188 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700202 1 0.0237 0.767268 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700203 2 0.6509 0.089918 0.472 0.524 0.004
#> SRR1700204 2 0.5905 0.436634 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700206 2 0.4555 0.680118 0.200 0.800 0.000
#> SRR1700207 2 0.4346 0.698348 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700208 2 0.6434 0.371615 0.380 0.612 0.008
#> SRR1700205 1 0.2261 0.745549 0.932 0.068 0.000
#> SRR1700209 2 0.3031 0.792561 0.012 0.912 0.076
#> SRR1700210 1 0.5678 0.492778 0.684 0.316 0.000
#> SRR1700211 1 0.4504 0.649688 0.804 0.196 0.000
#> SRR1700212 2 0.6680 -0.000890 0.484 0.508 0.008
#> SRR1700213 2 0.5156 0.659674 0.216 0.776 0.008
#> SRR1700214 2 0.5650 0.513589 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700215 1 0.1337 0.769852 0.972 0.012 0.016
#> SRR1700217 1 0.7357 0.400922 0.620 0.332 0.048
#> SRR1700216 1 0.2152 0.767440 0.948 0.036 0.016
#> SRR1700218 2 0.1015 0.807235 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700219 2 0.2866 0.793218 0.076 0.916 0.008
#> SRR1700222 1 0.0237 0.768621 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700220 3 0.4974 0.712548 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700221 1 0.6305 0.000403 0.516 0.484 0.000
#> SRR1700223 2 0.4840 0.733890 0.168 0.816 0.016
#> SRR1700224 1 0.6955 -0.027433 0.496 0.488 0.016
#> SRR1700226 2 0.2496 0.793575 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700229 2 0.2902 0.799428 0.016 0.920 0.064
#> SRR1700225 2 0.1529 0.806989 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700227 2 0.1964 0.793388 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700230 1 0.1337 0.769941 0.972 0.012 0.016
#> SRR1700231 2 0.3550 0.786285 0.080 0.896 0.024
#> SRR1700228 2 0.6260 0.165960 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700232 2 0.2200 0.797654 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700233 1 0.6299 0.060990 0.524 0.476 0.000
#> SRR1700234 1 0.6180 0.309873 0.584 0.416 0.000
#> SRR1700235 2 0.2537 0.789847 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700237 2 0.4293 0.729760 0.164 0.832 0.004
#> SRR1700236 2 0.1905 0.808901 0.016 0.956 0.028
#> SRR1700238 2 0.5591 0.522151 0.304 0.696 0.000
#> SRR1700239 1 0.1964 0.750608 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700240 1 0.0892 0.768081 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700241 1 0.4449 0.732806 0.860 0.100 0.040
#> SRR1700243 2 0.3482 0.751054 0.128 0.872 0.000
#> SRR1700244 2 0.7471 0.093943 0.448 0.516 0.036
#> SRR1700242 1 0.0237 0.767910 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700246 1 0.1753 0.755720 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700245 2 0.1399 0.809610 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700247 1 0.0424 0.766017 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700249 1 0.0475 0.768359 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700250 2 0.1267 0.805041 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700248 2 0.5902 0.528479 0.316 0.680 0.004
#> SRR1700251 2 0.5733 0.518047 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700252 2 0.5465 0.554487 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700253 2 0.3120 0.792279 0.080 0.908 0.012
#> SRR1700256 2 0.4702 0.669201 0.212 0.788 0.000
#> SRR1700254 1 0.0237 0.767648 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700255 1 0.6140 0.310979 0.596 0.404 0.000
#> SRR1700257 2 0.4887 0.651610 0.228 0.772 0.000
#> SRR1700258 2 0.2590 0.789939 0.072 0.924 0.004
#> SRR1700259 2 0.4931 0.637478 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700260 3 0.5621 0.587341 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700261 3 0.4796 0.734275 0.000 0.220 0.780
#> SRR1700262 3 0.6102 0.571185 0.008 0.320 0.672
#> SRR1700263 2 0.1832 0.808503 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700264 2 0.1031 0.803040 0.024 0.976 0.000
#> SRR1700265 2 0.4121 0.715593 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700266 2 0.0592 0.808372 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700268 1 0.8486 0.377711 0.548 0.348 0.104
#> SRR1700270 2 0.3752 0.736596 0.144 0.856 0.000
#> SRR1700267 2 0.3425 0.770495 0.004 0.884 0.112
#> SRR1700271 2 0.5560 0.541909 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700272 2 0.6753 0.390720 0.016 0.596 0.388
#> SRR1700273 2 0.2173 0.805319 0.008 0.944 0.048
#> SRR1700274 2 0.8386 0.514802 0.204 0.624 0.172
#> SRR1700277 2 0.2356 0.786878 0.072 0.928 0.000
#> SRR1700275 3 0.4015 0.826170 0.028 0.096 0.876
#> SRR1700276 1 0.3340 0.750514 0.880 0.000 0.120
#> SRR1700278 1 0.5020 0.708539 0.796 0.012 0.192
#> SRR1700279 1 0.6373 0.338322 0.588 0.004 0.408
#> SRR1700280 1 0.3112 0.758765 0.900 0.004 0.096
#> SRR1700281 2 0.2998 0.800467 0.068 0.916 0.016
#> SRR1700283 3 0.2947 0.848041 0.020 0.060 0.920
#> SRR1700282 1 0.4164 0.738737 0.848 0.008 0.144
#> SRR1700284 3 0.0892 0.857063 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700285 3 0.5757 0.754637 0.152 0.056 0.792
#> SRR1700286 3 0.6305 0.114732 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700287 3 0.8020 0.437633 0.308 0.088 0.604
#> SRR1700290 1 0.7030 0.313609 0.580 0.024 0.396
#> SRR1700289 3 0.4097 0.835214 0.060 0.060 0.880
#> SRR1700288 1 0.7841 -0.013655 0.476 0.472 0.052
#> SRR1700292 3 0.3045 0.839005 0.064 0.020 0.916
#> SRR1700291 3 0.1289 0.854784 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700293 3 0.7190 0.477108 0.320 0.044 0.636
#> SRR1700294 3 0.4121 0.741255 0.168 0.000 0.832
#> SRR1700295 3 0.3500 0.792101 0.116 0.004 0.880
#> SRR1700297 3 0.2200 0.841287 0.056 0.004 0.940
#> SRR1700296 3 0.6737 0.341549 0.384 0.016 0.600
#> SRR1700298 3 0.4848 0.780584 0.128 0.036 0.836
#> SRR1700299 3 0.1751 0.855821 0.028 0.012 0.960
#> SRR1700300 3 0.8285 0.441600 0.288 0.112 0.600
#> SRR1700302 3 0.0892 0.852049 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700301 3 0.1919 0.856400 0.024 0.020 0.956
#> SRR1700303 3 0.1289 0.848913 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700304 1 0.3816 0.734621 0.852 0.000 0.148
#> SRR1700305 3 0.5267 0.781380 0.140 0.044 0.816
#> SRR1700306 3 0.3941 0.749403 0.156 0.000 0.844
#> SRR1700308 3 0.6140 0.433120 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700307 3 0.2774 0.848416 0.008 0.072 0.920
#> SRR1700309 3 0.3272 0.845872 0.016 0.080 0.904
#> SRR1700310 3 0.2682 0.828999 0.076 0.004 0.920
#> SRR1700311 3 0.3116 0.795644 0.108 0.000 0.892
#> SRR1700312 3 0.4662 0.806323 0.032 0.124 0.844
#> SRR1700313 3 0.8683 0.450079 0.236 0.172 0.592
#> SRR1700314 3 0.1015 0.855733 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700315 3 0.2229 0.856409 0.012 0.044 0.944
#> SRR1700316 3 0.2261 0.846105 0.000 0.068 0.932
#> SRR1700317 3 0.6369 0.595830 0.016 0.316 0.668
#> SRR1700318 1 0.5859 0.473314 0.656 0.000 0.344
#> SRR1700319 3 0.1031 0.851368 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700320 3 0.1453 0.855231 0.024 0.008 0.968
#> SRR1700322 3 0.6476 0.132723 0.448 0.004 0.548
#> SRR1700321 3 0.3686 0.811249 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700323 3 0.0424 0.854217 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700324 3 0.4634 0.765582 0.164 0.012 0.824
#> SRR1700325 3 0.9269 0.281290 0.184 0.308 0.508
#> SRR1700326 1 0.6386 0.329117 0.584 0.004 0.412
#> SRR1700327 3 0.5216 0.690484 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700329 3 0.2663 0.854662 0.024 0.044 0.932
#> SRR1700328 1 0.6159 0.694889 0.756 0.048 0.196
#> SRR1700330 1 0.4351 0.722971 0.828 0.004 0.168
#> SRR1700331 3 0.1999 0.857045 0.012 0.036 0.952
#> SRR1700332 3 0.1015 0.856045 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700333 1 0.5178 0.626651 0.744 0.000 0.256
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.2635 0.72273 0.020 0.904 0.076 0.000
#> SRR1699875 2 0.3764 0.70714 0.012 0.816 0.172 0.000
#> SRR1699876 3 0.7576 0.21513 0.004 0.212 0.508 0.276
#> SRR1699877 2 0.3732 0.72442 0.056 0.852 0.092 0.000
#> SRR1699879 2 0.6352 0.46561 0.000 0.632 0.260 0.108
#> SRR1699878 2 0.3529 0.72497 0.012 0.836 0.152 0.000
#> SRR1699880 2 0.2480 0.73443 0.000 0.904 0.088 0.008
#> SRR1699881 2 0.4174 0.69424 0.000 0.816 0.140 0.044
#> SRR1699882 2 0.5856 0.55605 0.016 0.668 0.280 0.036
#> SRR1699883 2 0.4729 0.66422 0.012 0.752 0.224 0.012
#> SRR1699884 2 0.5006 0.69590 0.124 0.772 0.104 0.000
#> SRR1699885 2 0.2522 0.72738 0.016 0.908 0.076 0.000
#> SRR1699886 3 0.7788 0.26964 0.028 0.204 0.556 0.212
#> SRR1699888 2 0.9214 0.22711 0.100 0.424 0.240 0.236
#> SRR1699889 3 0.6868 0.07919 0.004 0.096 0.528 0.372
#> SRR1699890 3 0.9597 0.06479 0.284 0.124 0.340 0.252
#> SRR1699887 3 0.7504 0.29914 0.016 0.240 0.564 0.180
#> SRR1699891 3 0.5801 -0.11069 0.016 0.008 0.508 0.468
#> SRR1699892 2 0.5085 0.60582 0.004 0.688 0.292 0.016
#> SRR1699893 4 0.4722 0.46344 0.000 0.008 0.300 0.692
#> SRR1699894 4 0.5303 0.25230 0.004 0.004 0.448 0.544
#> SRR1699895 4 0.5310 0.28008 0.012 0.000 0.412 0.576
#> SRR1699896 3 0.6788 -0.20863 0.036 0.452 0.480 0.032
#> SRR1699897 3 0.6597 -0.08295 0.008 0.420 0.512 0.060
#> SRR1699898 4 0.6193 0.40081 0.000 0.148 0.180 0.672
#> SRR1699900 2 0.6676 0.41312 0.068 0.528 0.396 0.008
#> SRR1699899 3 0.6661 0.21036 0.004 0.104 0.600 0.292
#> SRR1699902 3 0.7683 0.27401 0.056 0.232 0.592 0.120
#> SRR1699901 4 0.8037 -0.00788 0.208 0.012 0.388 0.392
#> SRR1699903 3 0.5636 -0.05158 0.004 0.016 0.544 0.436
#> SRR1699904 4 0.5250 0.42014 0.024 0.000 0.316 0.660
#> SRR1699905 1 0.6650 0.47165 0.640 0.004 0.172 0.184
#> SRR1699906 3 0.6052 0.06420 0.000 0.048 0.556 0.396
#> SRR1699907 4 0.6188 0.12778 0.028 0.012 0.480 0.480
#> SRR1699908 4 0.5704 0.14155 0.008 0.012 0.484 0.496
#> SRR1699909 3 0.6678 0.02594 0.000 0.088 0.500 0.412
#> SRR1699910 4 0.5366 0.25305 0.012 0.000 0.440 0.548
#> SRR1699911 3 0.6694 0.03292 0.044 0.024 0.536 0.396
#> SRR1699912 4 0.5161 0.19596 0.000 0.004 0.476 0.520
#> SRR1699913 4 0.4866 0.33711 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1699914 3 0.5673 0.10043 0.000 0.032 0.596 0.372
#> SRR1699915 4 0.5320 0.30764 0.012 0.000 0.416 0.572
#> SRR1699916 4 0.7387 0.06086 0.088 0.024 0.432 0.456
#> SRR1699917 4 0.4406 0.44283 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1699918 4 0.5945 0.17390 0.024 0.008 0.428 0.540
#> SRR1699919 3 0.5576 -0.14273 0.012 0.004 0.500 0.484
#> SRR1699920 3 0.5833 0.02868 0.004 0.028 0.572 0.396
#> SRR1699921 3 0.5590 -0.13859 0.008 0.008 0.504 0.480
#> SRR1699922 3 0.8463 0.28300 0.192 0.108 0.548 0.152
#> SRR1699923 3 0.8212 -0.01973 0.340 0.092 0.488 0.080
#> SRR1699924 3 0.6134 0.08098 0.004 0.040 0.532 0.424
#> SRR1699925 1 0.3071 0.71219 0.888 0.000 0.044 0.068
#> SRR1699926 3 0.6182 -0.09062 0.012 0.028 0.500 0.460
#> SRR1699927 4 0.5158 0.21200 0.004 0.000 0.472 0.524
#> SRR1699929 3 0.7196 0.26736 0.020 0.308 0.568 0.104
#> SRR1699928 3 0.5464 -0.15494 0.008 0.004 0.496 0.492
#> SRR1699930 3 0.6297 -0.11744 0.020 0.024 0.492 0.464
#> SRR1699931 3 0.7428 0.09851 0.024 0.384 0.496 0.096
#> SRR1699933 3 0.7016 -0.01620 0.024 0.392 0.520 0.064
#> SRR1699932 3 0.5773 -0.12141 0.004 0.020 0.500 0.476
#> SRR1699934 1 0.3156 0.71195 0.884 0.000 0.048 0.068
#> SRR1699935 4 0.5233 0.43179 0.000 0.020 0.332 0.648
#> SRR1699936 2 0.5292 0.66380 0.000 0.744 0.168 0.088
#> SRR1699937 2 0.1767 0.72799 0.012 0.944 0.044 0.000
#> SRR1699938 2 0.0817 0.72860 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1699940 2 0.2011 0.73306 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1699939 2 0.5436 0.62010 0.000 0.732 0.176 0.092
#> SRR1699941 2 0.2380 0.73627 0.008 0.920 0.064 0.008
#> SRR1699942 2 0.5806 0.63837 0.020 0.712 0.216 0.052
#> SRR1699943 2 0.2463 0.72628 0.036 0.924 0.032 0.008
#> SRR1699944 2 0.1994 0.72584 0.004 0.936 0.052 0.008
#> SRR1699945 2 0.3556 0.73371 0.012 0.864 0.104 0.020
#> SRR1699946 2 0.2032 0.72742 0.028 0.936 0.036 0.000
#> SRR1699947 2 0.3160 0.72572 0.020 0.872 0.108 0.000
#> SRR1699948 2 0.3547 0.70334 0.016 0.840 0.144 0.000
#> SRR1699949 2 0.7936 0.10188 0.008 0.460 0.260 0.272
#> SRR1699950 2 0.5091 0.63264 0.000 0.752 0.180 0.068
#> SRR1699951 2 0.5889 0.57020 0.000 0.688 0.100 0.212
#> SRR1699952 2 0.3597 0.70460 0.016 0.836 0.148 0.000
#> SRR1699953 2 0.2730 0.72041 0.000 0.896 0.088 0.016
#> SRR1699954 2 0.6162 0.63261 0.156 0.676 0.168 0.000
#> SRR1699955 2 0.2546 0.72517 0.000 0.912 0.060 0.028
#> SRR1699956 2 0.5057 0.65224 0.004 0.748 0.204 0.044
#> SRR1699957 2 0.3585 0.71558 0.004 0.828 0.164 0.004
#> SRR1699959 2 0.4938 0.69733 0.000 0.772 0.148 0.080
#> SRR1699958 4 0.6389 0.33471 0.008 0.192 0.128 0.672
#> SRR1699960 2 0.5798 0.62278 0.000 0.704 0.184 0.112
#> SRR1699961 2 0.2611 0.72140 0.008 0.896 0.096 0.000
#> SRR1699962 2 0.4885 0.65391 0.004 0.728 0.248 0.020
#> SRR1699963 2 0.7888 0.36701 0.016 0.500 0.280 0.204
#> SRR1699964 2 0.2862 0.72834 0.012 0.900 0.076 0.012
#> SRR1699965 2 0.3502 0.72168 0.016 0.868 0.100 0.016
#> SRR1699966 2 0.7985 -0.08062 0.004 0.408 0.308 0.280
#> SRR1699967 2 0.3307 0.71532 0.028 0.868 0.104 0.000
#> SRR1699968 3 0.6055 0.08843 0.000 0.372 0.576 0.052
#> SRR1699969 3 0.7221 0.20640 0.000 0.168 0.524 0.308
#> SRR1699971 2 0.3444 0.71684 0.016 0.868 0.104 0.012
#> SRR1699970 2 0.4635 0.66919 0.028 0.756 0.216 0.000
#> SRR1699972 2 0.4741 0.66345 0.028 0.744 0.228 0.000
#> SRR1699973 4 0.5944 0.43166 0.000 0.140 0.164 0.696
#> SRR1699974 2 0.6442 0.50452 0.020 0.592 0.344 0.044
#> SRR1699975 3 0.7174 0.24180 0.004 0.164 0.564 0.268
#> SRR1699976 2 0.3583 0.70265 0.004 0.816 0.180 0.000
#> SRR1699977 3 0.7566 0.00883 0.000 0.392 0.416 0.192
#> SRR1699978 4 0.7636 0.20033 0.188 0.012 0.272 0.528
#> SRR1699979 4 0.7771 -0.05507 0.000 0.292 0.276 0.432
#> SRR1699980 3 0.5430 0.22187 0.000 0.036 0.664 0.300
#> SRR1699981 3 0.6890 0.16485 0.008 0.104 0.576 0.312
#> SRR1699982 4 0.5143 0.22914 0.000 0.004 0.456 0.540
#> SRR1699983 3 0.5399 -0.11628 0.000 0.012 0.520 0.468
#> SRR1699984 1 0.4187 0.67322 0.816 0.024 0.152 0.008
#> SRR1699985 3 0.7164 0.28811 0.000 0.156 0.524 0.320
#> SRR1699986 4 0.7776 0.16880 0.156 0.016 0.356 0.472
#> SRR1699988 3 0.9137 0.25544 0.104 0.244 0.444 0.208
#> SRR1699987 4 0.7059 0.28243 0.000 0.184 0.248 0.568
#> SRR1699989 3 0.7094 0.25828 0.004 0.168 0.580 0.248
#> SRR1699990 3 0.7155 0.13036 0.000 0.144 0.504 0.352
#> SRR1699992 2 0.5633 0.68159 0.100 0.716 0.184 0.000
#> SRR1699991 3 0.7692 0.26465 0.008 0.240 0.512 0.240
#> SRR1699993 4 0.8208 0.05129 0.260 0.012 0.344 0.384
#> SRR1699994 2 0.6121 0.37449 0.032 0.528 0.432 0.008
#> SRR1699995 3 0.5433 0.02716 0.004 0.008 0.540 0.448
#> SRR1699996 2 0.7216 0.50502 0.284 0.536 0.180 0.000
#> SRR1699997 4 0.2976 0.57607 0.000 0.008 0.120 0.872
#> SRR1699998 2 0.3923 0.72510 0.016 0.828 0.148 0.008
#> SRR1699999 1 0.6983 0.53353 0.640 0.048 0.236 0.076
#> SRR1700000 2 0.5705 0.63053 0.064 0.676 0.260 0.000
#> SRR1700002 2 0.3550 0.72190 0.000 0.860 0.096 0.044
#> SRR1700001 2 0.4888 0.64862 0.000 0.740 0.224 0.036
#> SRR1700003 2 0.7436 0.29338 0.004 0.484 0.356 0.156
#> SRR1700004 3 0.7044 0.23245 0.000 0.164 0.560 0.276
#> SRR1700005 1 0.2884 0.71793 0.900 0.004 0.028 0.068
#> SRR1700006 2 0.4136 0.68682 0.016 0.788 0.196 0.000
#> SRR1700007 4 0.6136 0.30243 0.000 0.060 0.356 0.584
#> SRR1700008 4 0.3450 0.57447 0.008 0.000 0.156 0.836
#> SRR1700009 1 0.4307 0.64312 0.784 0.000 0.024 0.192
#> SRR1700010 2 0.5753 0.56634 0.000 0.680 0.248 0.072
#> SRR1700011 2 0.6773 0.41924 0.000 0.584 0.132 0.284
#> SRR1700013 2 0.8349 0.45050 0.120 0.560 0.124 0.196
#> SRR1700012 3 0.6566 -0.25051 0.008 0.452 0.484 0.056
#> SRR1700014 3 0.6375 0.25321 0.000 0.088 0.600 0.312
#> SRR1700015 2 0.5274 0.63884 0.020 0.724 0.236 0.020
#> SRR1700016 1 0.7450 0.27934 0.480 0.052 0.412 0.056
#> SRR1700018 2 0.4434 0.66004 0.016 0.756 0.228 0.000
#> SRR1700017 2 0.7018 0.33292 0.008 0.492 0.408 0.092
#> SRR1700019 3 0.8175 0.21868 0.012 0.348 0.392 0.248
#> SRR1700020 3 0.7347 0.08809 0.004 0.136 0.448 0.412
#> SRR1700021 4 0.6851 0.32243 0.116 0.000 0.344 0.540
#> SRR1700023 2 0.6416 0.30682 0.004 0.512 0.428 0.056
#> SRR1700022 2 0.6992 0.34902 0.008 0.508 0.392 0.092
#> SRR1700024 3 0.5816 0.12998 0.000 0.036 0.572 0.392
#> SRR1700025 2 0.4986 0.64027 0.024 0.724 0.248 0.004
#> SRR1700026 2 0.8055 0.40529 0.088 0.500 0.340 0.072
#> SRR1700027 2 0.7599 0.30778 0.044 0.472 0.408 0.076
#> SRR1700028 4 0.4422 0.53461 0.020 0.016 0.160 0.804
#> SRR1700029 4 0.6439 0.15902 0.040 0.016 0.400 0.544
#> SRR1700030 3 0.6147 0.33936 0.000 0.112 0.664 0.224
#> SRR1700031 3 0.6997 -0.21388 0.008 0.440 0.464 0.088
#> SRR1700032 2 0.5125 0.52094 0.004 0.616 0.376 0.004
#> SRR1700034 3 0.8871 -0.03139 0.300 0.184 0.440 0.076
#> SRR1700035 4 0.5321 0.20393 0.004 0.004 0.464 0.528
#> SRR1700033 3 0.7487 -0.04364 0.020 0.368 0.500 0.112
#> SRR1700036 3 0.5431 0.33130 0.000 0.064 0.712 0.224
#> SRR1700037 4 0.5408 0.29293 0.004 0.008 0.432 0.556
#> SRR1700038 3 0.8400 -0.10898 0.132 0.364 0.444 0.060
#> SRR1700039 3 0.6078 0.25882 0.000 0.068 0.620 0.312
#> SRR1700040 3 0.6684 -0.19437 0.008 0.448 0.480 0.064
#> SRR1700041 3 0.7396 0.37031 0.008 0.216 0.560 0.216
#> SRR1700042 3 0.6997 0.33853 0.016 0.156 0.628 0.200
#> SRR1700043 3 0.6886 -0.12513 0.088 0.368 0.536 0.008
#> SRR1700045 3 0.5946 -0.05542 0.004 0.028 0.496 0.472
#> SRR1700044 3 0.8557 0.25438 0.196 0.124 0.540 0.140
#> SRR1700046 3 0.7299 0.29304 0.036 0.104 0.600 0.260
#> SRR1700047 3 0.5749 0.33731 0.008 0.068 0.708 0.216
#> SRR1700048 3 0.6086 0.04972 0.004 0.036 0.516 0.444
#> SRR1700049 3 0.5306 0.18333 0.000 0.020 0.632 0.348
#> SRR1700050 4 0.5330 0.11356 0.004 0.004 0.476 0.516
#> SRR1700051 3 0.5995 0.13097 0.016 0.020 0.572 0.392
#> SRR1700052 3 0.7756 0.34145 0.084 0.112 0.608 0.196
#> SRR1700053 3 0.5075 0.19823 0.000 0.012 0.644 0.344
#> SRR1700054 3 0.7909 0.31074 0.060 0.132 0.572 0.236
#> SRR1700055 3 0.8317 0.25060 0.188 0.080 0.552 0.180
#> SRR1700056 4 0.4699 0.40557 0.004 0.000 0.320 0.676
#> SRR1700057 4 0.4855 0.29851 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700058 3 0.8141 0.15195 0.048 0.280 0.520 0.152
#> SRR1700059 4 0.4304 0.46247 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700060 3 0.5614 0.21997 0.000 0.036 0.628 0.336
#> SRR1700061 3 0.7286 0.36661 0.024 0.188 0.612 0.176
#> SRR1700062 4 0.5291 0.37412 0.000 0.024 0.324 0.652
#> SRR1700063 3 0.6930 0.31441 0.024 0.108 0.632 0.236
#> SRR1700064 3 0.4941 0.03117 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1700065 3 0.7586 0.27625 0.040 0.112 0.568 0.280
#> SRR1700066 3 0.7668 0.27020 0.056 0.244 0.588 0.112
#> SRR1700067 4 0.4855 0.47667 0.020 0.000 0.268 0.712
#> SRR1700068 4 0.5263 0.16425 0.000 0.008 0.448 0.544
#> SRR1700069 3 0.5038 0.17363 0.000 0.012 0.652 0.336
#> SRR1700070 3 0.7448 0.23922 0.028 0.292 0.564 0.116
#> SRR1700071 3 0.6104 0.32475 0.000 0.104 0.664 0.232
#> SRR1700072 3 0.7366 0.34108 0.076 0.080 0.628 0.216
#> SRR1700073 4 0.6894 0.26211 0.128 0.000 0.320 0.552
#> SRR1700075 3 0.6774 0.33575 0.020 0.108 0.644 0.228
#> SRR1700074 3 0.6943 0.09768 0.004 0.348 0.540 0.108
#> SRR1700076 3 0.7659 0.33930 0.072 0.116 0.612 0.200
#> SRR1700077 3 0.7511 -0.01373 0.052 0.352 0.528 0.068
#> SRR1700078 3 0.6278 0.32245 0.036 0.052 0.684 0.228
#> SRR1700080 3 0.4988 0.29723 0.000 0.036 0.728 0.236
#> SRR1700079 4 0.6206 0.18672 0.000 0.056 0.404 0.540
#> SRR1700081 3 0.6580 0.18745 0.004 0.076 0.556 0.364
#> SRR1700082 2 0.6840 0.45321 0.008 0.572 0.324 0.096
#> SRR1700083 3 0.6722 0.21511 0.032 0.048 0.592 0.328
#> SRR1700084 3 0.8143 -0.10176 0.156 0.332 0.476 0.036
#> SRR1700085 3 0.5151 -0.08261 0.004 0.000 0.532 0.464
#> SRR1700086 3 0.5662 0.39153 0.004 0.136 0.732 0.128
#> SRR1700087 2 0.8767 0.18298 0.088 0.400 0.132 0.380
#> SRR1700088 2 0.5783 0.62269 0.000 0.704 0.188 0.108
#> SRR1700089 2 0.7411 0.38940 0.016 0.544 0.132 0.308
#> SRR1700091 4 0.7127 0.28098 0.036 0.220 0.112 0.632
#> SRR1700090 4 0.2489 0.56452 0.020 0.000 0.068 0.912
#> SRR1700092 4 0.6497 0.29377 0.000 0.160 0.200 0.640
#> SRR1700094 4 0.7912 0.12603 0.032 0.296 0.152 0.520
#> SRR1700093 4 0.4473 0.52151 0.032 0.044 0.092 0.832
#> SRR1700095 4 0.6490 0.42603 0.088 0.088 0.104 0.720
#> SRR1700096 4 0.7054 0.18079 0.000 0.232 0.196 0.572
#> SRR1700097 4 0.5114 0.48821 0.052 0.028 0.132 0.788
#> SRR1700098 4 0.7924 -0.00310 0.028 0.388 0.136 0.448
#> SRR1700099 4 0.5021 0.46856 0.004 0.100 0.116 0.780
#> SRR1700100 4 0.5985 0.38068 0.004 0.132 0.160 0.704
#> SRR1700101 4 0.6869 0.35596 0.040 0.160 0.128 0.672
#> SRR1700102 4 0.5840 0.41216 0.008 0.148 0.120 0.724
#> SRR1700104 4 0.6618 0.37443 0.032 0.148 0.132 0.688
#> SRR1700103 4 0.5397 0.48642 0.004 0.108 0.136 0.752
#> SRR1700105 4 0.3234 0.56963 0.012 0.020 0.084 0.884
#> SRR1700106 4 0.3239 0.56649 0.068 0.000 0.052 0.880
#> SRR1700107 4 0.4549 0.51612 0.016 0.056 0.108 0.820
#> SRR1700108 4 0.5081 0.49523 0.064 0.036 0.100 0.800
#> SRR1700109 4 0.4437 0.49681 0.020 0.020 0.152 0.808
#> SRR1700110 4 0.5343 0.46847 0.020 0.104 0.100 0.776
#> SRR1700112 4 0.2775 0.55707 0.020 0.000 0.084 0.896
#> SRR1700111 4 0.3577 0.53530 0.012 0.000 0.156 0.832
#> SRR1700113 4 0.3925 0.52445 0.000 0.016 0.176 0.808
#> SRR1700114 4 0.4323 0.53282 0.032 0.040 0.088 0.840
#> SRR1700115 4 0.2631 0.56137 0.016 0.008 0.064 0.912
#> SRR1700116 4 0.1706 0.57807 0.016 0.000 0.036 0.948
#> SRR1700117 4 0.5436 0.47346 0.092 0.000 0.176 0.732
#> SRR1700119 4 0.4557 0.49991 0.004 0.032 0.180 0.784
#> SRR1700118 4 0.3529 0.52373 0.012 0.000 0.152 0.836
#> SRR1700120 4 0.3674 0.55133 0.020 0.028 0.084 0.868
#> SRR1700121 4 0.3080 0.56266 0.000 0.024 0.096 0.880
#> SRR1700122 4 0.3474 0.57868 0.068 0.000 0.064 0.868
#> SRR1700123 4 0.2142 0.57640 0.016 0.000 0.056 0.928
#> SRR1700125 4 0.2610 0.58579 0.012 0.000 0.088 0.900
#> SRR1700126 4 0.5182 0.46195 0.068 0.012 0.148 0.772
#> SRR1700127 4 0.3380 0.55024 0.004 0.008 0.136 0.852
#> SRR1700124 4 0.3340 0.55912 0.004 0.004 0.144 0.848
#> SRR1700128 4 0.3881 0.55570 0.016 0.000 0.172 0.812
#> SRR1700129 4 0.2522 0.58062 0.016 0.000 0.076 0.908
#> SRR1700130 4 0.2759 0.57451 0.044 0.000 0.052 0.904
#> SRR1700132 4 0.3757 0.55774 0.020 0.000 0.152 0.828
#> SRR1700131 4 0.3172 0.58265 0.012 0.004 0.112 0.872
#> SRR1700133 4 0.2973 0.58034 0.020 0.000 0.096 0.884
#> SRR1700134 4 0.2976 0.57622 0.008 0.000 0.120 0.872
#> SRR1700135 4 0.4284 0.52227 0.012 0.000 0.224 0.764
#> SRR1700136 4 0.2433 0.58533 0.012 0.008 0.060 0.920
#> SRR1700137 4 0.3123 0.56670 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700138 4 0.4452 0.48860 0.000 0.008 0.260 0.732
#> SRR1700140 4 0.3494 0.55975 0.000 0.004 0.172 0.824
#> SRR1700139 4 0.2799 0.57768 0.008 0.000 0.108 0.884
#> SRR1700141 4 0.2060 0.58848 0.016 0.000 0.052 0.932
#> SRR1700142 4 0.5047 0.34845 0.004 0.004 0.356 0.636
#> SRR1700143 4 0.1807 0.58969 0.000 0.008 0.052 0.940
#> SRR1700144 3 0.5294 -0.06353 0.000 0.008 0.508 0.484
#> SRR1700145 4 0.3606 0.55774 0.020 0.000 0.140 0.840
#> SRR1700146 4 0.3157 0.56291 0.004 0.000 0.144 0.852
#> SRR1700147 4 0.2593 0.58394 0.016 0.000 0.080 0.904
#> SRR1700149 4 0.2699 0.58536 0.028 0.000 0.068 0.904
#> SRR1700148 4 0.3806 0.55629 0.020 0.000 0.156 0.824
#> SRR1700150 4 0.2675 0.59072 0.008 0.000 0.100 0.892
#> SRR1700152 4 0.3984 0.56774 0.040 0.000 0.132 0.828
#> SRR1700151 4 0.3351 0.56467 0.008 0.000 0.148 0.844
#> SRR1700153 4 0.2125 0.59109 0.004 0.000 0.076 0.920
#> SRR1700154 4 0.2739 0.58249 0.060 0.000 0.036 0.904
#> SRR1700155 4 0.2676 0.58497 0.012 0.000 0.092 0.896
#> SRR1700156 4 0.2382 0.58355 0.004 0.004 0.080 0.912
#> SRR1700158 4 0.2830 0.57996 0.040 0.000 0.060 0.900
#> SRR1700159 4 0.3658 0.55843 0.020 0.000 0.144 0.836
#> SRR1700157 4 0.3681 0.54161 0.008 0.000 0.176 0.816
#> SRR1700160 4 0.2853 0.58979 0.016 0.008 0.076 0.900
#> SRR1700161 4 0.3289 0.57192 0.004 0.004 0.140 0.852
#> SRR1700162 4 0.3853 0.55535 0.020 0.000 0.160 0.820
#> SRR1700164 4 0.5213 0.34034 0.328 0.000 0.020 0.652
#> SRR1700163 4 0.4938 0.52534 0.148 0.000 0.080 0.772
#> SRR1700165 4 0.4374 0.52695 0.032 0.016 0.132 0.820
#> SRR1700166 4 0.2036 0.57967 0.032 0.000 0.032 0.936
#> SRR1700168 4 0.2675 0.57673 0.048 0.000 0.044 0.908
#> SRR1700167 4 0.3249 0.56425 0.008 0.000 0.140 0.852
#> SRR1700170 4 0.2983 0.58523 0.040 0.000 0.068 0.892
#> SRR1700169 4 0.4121 0.49622 0.020 0.000 0.184 0.796
#> SRR1700171 4 0.5350 0.38790 0.260 0.004 0.036 0.700
#> SRR1700172 4 0.4785 0.46646 0.004 0.012 0.264 0.720
#> SRR1700174 4 0.2949 0.57490 0.000 0.024 0.088 0.888
#> SRR1700173 4 0.2287 0.56452 0.012 0.004 0.060 0.924
#> SRR1700175 4 0.2255 0.58263 0.012 0.000 0.068 0.920
#> SRR1700176 4 0.4875 0.45252 0.000 0.068 0.160 0.772
#> SRR1700178 2 0.3067 0.71654 0.084 0.888 0.024 0.004
#> SRR1700177 4 0.2271 0.58506 0.008 0.000 0.076 0.916
#> SRR1700180 2 0.2048 0.71857 0.064 0.928 0.008 0.000
#> SRR1700179 2 0.3187 0.71782 0.052 0.896 0.028 0.024
#> SRR1700181 2 0.5312 0.67951 0.120 0.784 0.044 0.052
#> SRR1700183 1 0.1762 0.72384 0.952 0.020 0.012 0.016
#> SRR1700182 2 0.3007 0.71723 0.060 0.900 0.028 0.012
#> SRR1700184 2 0.3001 0.71710 0.072 0.896 0.024 0.008
#> SRR1700186 2 0.3558 0.72300 0.044 0.880 0.052 0.024
#> SRR1700187 1 0.1247 0.72825 0.968 0.012 0.004 0.016
#> SRR1700185 1 0.1059 0.72894 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1700188 2 0.2670 0.71700 0.072 0.904 0.024 0.000
#> SRR1700192 1 0.4070 0.66002 0.836 0.124 0.024 0.016
#> SRR1700190 2 0.3453 0.72091 0.080 0.868 0.052 0.000
#> SRR1700191 1 0.1114 0.72964 0.972 0.004 0.008 0.016
#> SRR1700189 1 0.1059 0.73012 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1700193 2 0.5003 0.55741 0.308 0.676 0.016 0.000
#> SRR1700195 2 0.5403 0.47867 0.348 0.628 0.024 0.000
#> SRR1700194 1 0.0927 0.72200 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR1700196 2 0.3015 0.71253 0.092 0.884 0.024 0.000
#> SRR1700197 1 0.4798 0.56175 0.760 0.204 0.032 0.004
#> SRR1700198 2 0.3161 0.70302 0.124 0.864 0.012 0.000
#> SRR1700199 2 0.5279 0.60512 0.252 0.704 0.044 0.000
#> SRR1700200 2 0.6077 0.44889 0.332 0.612 0.052 0.004
#> SRR1700201 2 0.3038 0.72316 0.036 0.904 0.032 0.028
#> SRR1700202 1 0.1706 0.73004 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR1700203 2 0.7286 0.25132 0.392 0.508 0.044 0.056
#> SRR1700204 2 0.6192 0.40595 0.364 0.588 0.020 0.028
#> SRR1700206 2 0.4599 0.66994 0.184 0.780 0.032 0.004
#> SRR1700207 2 0.5646 0.67686 0.140 0.760 0.056 0.044
#> SRR1700208 2 0.7387 0.51499 0.236 0.616 0.080 0.068
#> SRR1700205 1 0.2929 0.71985 0.908 0.040 0.024 0.028
#> SRR1700209 2 0.6536 0.52002 0.032 0.608 0.320 0.040
#> SRR1700210 1 0.5864 0.50229 0.680 0.248 0.068 0.004
#> SRR1700211 1 0.3551 0.66508 0.856 0.120 0.016 0.008
#> SRR1700212 1 0.6725 -0.03820 0.460 0.460 0.076 0.004
#> SRR1700213 2 0.6691 0.59684 0.232 0.640 0.116 0.012
#> SRR1700214 2 0.5213 0.50603 0.328 0.652 0.020 0.000
#> SRR1700215 1 0.1520 0.73211 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1700217 1 0.7980 0.42281 0.556 0.216 0.184 0.044
#> SRR1700216 1 0.1509 0.72684 0.960 0.020 0.008 0.012
#> SRR1700218 2 0.4871 0.66631 0.024 0.768 0.192 0.016
#> SRR1700219 2 0.5495 0.67176 0.076 0.776 0.108 0.040
#> SRR1700222 1 0.0657 0.73062 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700220 4 0.7507 0.11556 0.008 0.144 0.380 0.468
#> SRR1700221 2 0.7927 0.27422 0.352 0.500 0.080 0.068
#> SRR1700223 2 0.4786 0.69855 0.132 0.796 0.064 0.008
#> SRR1700224 1 0.8518 0.06386 0.420 0.352 0.184 0.044
#> SRR1700226 2 0.5010 0.69370 0.120 0.772 0.108 0.000
#> SRR1700229 2 0.6649 0.57302 0.048 0.640 0.268 0.044
#> SRR1700225 2 0.4923 0.70357 0.020 0.756 0.208 0.016
#> SRR1700227 2 0.3315 0.72529 0.040 0.892 0.040 0.028
#> SRR1700230 1 0.2495 0.73052 0.924 0.012 0.028 0.036
#> SRR1700231 2 0.4720 0.70718 0.072 0.820 0.080 0.028
#> SRR1700228 1 0.6434 -0.04489 0.500 0.432 0.068 0.000
#> SRR1700232 2 0.5037 0.70302 0.084 0.776 0.136 0.004
#> SRR1700233 1 0.6281 0.13627 0.568 0.380 0.040 0.012
#> SRR1700234 1 0.6307 0.34595 0.596 0.344 0.048 0.012
#> SRR1700235 2 0.5280 0.65858 0.000 0.748 0.156 0.096
#> SRR1700237 2 0.5267 0.68360 0.100 0.788 0.080 0.032
#> SRR1700236 2 0.4958 0.69187 0.040 0.772 0.176 0.012
#> SRR1700238 2 0.5649 0.47850 0.344 0.620 0.036 0.000
#> SRR1700239 1 0.1854 0.72149 0.948 0.024 0.020 0.008
#> SRR1700240 1 0.1584 0.73081 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1700241 1 0.8216 0.53903 0.560 0.132 0.088 0.220
#> SRR1700243 2 0.4855 0.69070 0.120 0.804 0.052 0.024
#> SRR1700244 2 0.8582 0.28169 0.244 0.488 0.208 0.060
#> SRR1700242 1 0.1878 0.73095 0.944 0.008 0.008 0.040
#> SRR1700246 1 0.2170 0.71902 0.936 0.036 0.016 0.012
#> SRR1700245 2 0.3629 0.71913 0.028 0.868 0.088 0.016
#> SRR1700247 1 0.0967 0.73035 0.976 0.004 0.004 0.016
#> SRR1700249 1 0.1820 0.72859 0.944 0.000 0.020 0.036
#> SRR1700250 2 0.3689 0.71293 0.036 0.872 0.068 0.024
#> SRR1700248 2 0.6407 0.60652 0.188 0.696 0.036 0.080
#> SRR1700251 2 0.8515 0.43755 0.228 0.532 0.108 0.132
#> SRR1700252 2 0.5383 0.55024 0.292 0.672 0.036 0.000
#> SRR1700253 2 0.6041 0.66459 0.080 0.748 0.068 0.104
#> SRR1700256 2 0.6027 0.61108 0.192 0.684 0.124 0.000
#> SRR1700254 1 0.1182 0.73011 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1700255 1 0.7034 0.34251 0.588 0.312 0.052 0.048
#> SRR1700257 2 0.4861 0.65453 0.196 0.764 0.032 0.008
#> SRR1700258 2 0.4645 0.69325 0.048 0.820 0.104 0.028
#> SRR1700259 2 0.5244 0.67759 0.004 0.764 0.124 0.108
#> SRR1700260 4 0.7973 -0.00453 0.008 0.220 0.364 0.408
#> SRR1700261 3 0.7175 0.10968 0.000 0.144 0.496 0.360
#> SRR1700262 3 0.7764 0.05941 0.012 0.164 0.452 0.372
#> SRR1700263 2 0.4322 0.71627 0.044 0.804 0.152 0.000
#> SRR1700264 2 0.3404 0.72275 0.032 0.864 0.104 0.000
#> SRR1700265 2 0.7065 0.52402 0.212 0.572 0.216 0.000
#> SRR1700266 2 0.4124 0.68963 0.012 0.812 0.164 0.012
#> SRR1700268 1 0.9427 0.28066 0.384 0.264 0.240 0.112
#> SRR1700270 2 0.3612 0.71132 0.100 0.856 0.044 0.000
#> SRR1700267 2 0.3994 0.72871 0.008 0.848 0.088 0.056
#> SRR1700271 2 0.6664 0.55184 0.008 0.648 0.188 0.156
#> SRR1700272 2 0.7827 0.16139 0.008 0.456 0.200 0.336
#> SRR1700273 2 0.4327 0.70118 0.020 0.812 0.152 0.016
#> SRR1700274 2 0.9155 0.12084 0.104 0.424 0.288 0.184
#> SRR1700277 2 0.2915 0.72407 0.044 0.908 0.024 0.024
#> SRR1700275 4 0.7558 0.08709 0.020 0.112 0.424 0.444
#> SRR1700276 1 0.6611 0.39807 0.560 0.004 0.080 0.356
#> SRR1700278 1 0.8549 0.18500 0.424 0.036 0.308 0.232
#> SRR1700279 1 0.7568 0.11334 0.448 0.000 0.200 0.352
#> SRR1700280 1 0.6784 0.54328 0.648 0.016 0.200 0.136
#> SRR1700281 2 0.5291 0.69119 0.080 0.740 0.180 0.000
#> SRR1700283 4 0.7122 0.13962 0.024 0.068 0.424 0.484
#> SRR1700282 1 0.7695 0.49868 0.588 0.040 0.184 0.188
#> SRR1700284 4 0.5606 0.15564 0.000 0.020 0.480 0.500
#> SRR1700285 3 0.7553 -0.00667 0.080 0.040 0.492 0.388
#> SRR1700286 3 0.7476 0.24777 0.000 0.236 0.504 0.260
#> SRR1700287 3 0.9184 0.08799 0.176 0.104 0.396 0.324
#> SRR1700290 1 0.8079 0.19448 0.460 0.020 0.324 0.196
#> SRR1700289 3 0.7390 0.13980 0.040 0.080 0.552 0.328
#> SRR1700288 2 0.9313 0.05375 0.248 0.388 0.268 0.096
#> SRR1700292 4 0.6992 0.14179 0.064 0.020 0.448 0.468
#> SRR1700291 4 0.5750 0.21294 0.000 0.028 0.440 0.532
#> SRR1700293 4 0.8531 0.20278 0.296 0.048 0.196 0.460
#> SRR1700294 4 0.6941 0.28879 0.120 0.000 0.360 0.520
#> SRR1700295 4 0.5723 0.32160 0.032 0.000 0.388 0.580
#> SRR1700297 4 0.6119 0.30364 0.044 0.004 0.384 0.568
#> SRR1700296 4 0.8144 0.07836 0.296 0.008 0.308 0.388
#> SRR1700298 3 0.6725 -0.07901 0.060 0.012 0.496 0.432
#> SRR1700299 4 0.5829 0.26894 0.020 0.008 0.416 0.556
#> SRR1700300 3 0.8930 0.04775 0.156 0.088 0.400 0.356
#> SRR1700302 4 0.5452 0.26243 0.016 0.000 0.428 0.556
#> SRR1700301 4 0.5998 0.20402 0.016 0.016 0.444 0.524
#> SRR1700303 4 0.5130 0.40786 0.016 0.000 0.332 0.652
#> SRR1700304 1 0.4662 0.66269 0.796 0.000 0.092 0.112
#> SRR1700305 4 0.7797 0.09864 0.104 0.036 0.428 0.432
#> SRR1700306 4 0.6700 0.20069 0.076 0.004 0.420 0.500
#> SRR1700308 3 0.7512 0.25335 0.000 0.236 0.496 0.268
#> SRR1700307 3 0.6649 0.12045 0.016 0.056 0.556 0.372
#> SRR1700309 3 0.6803 0.09129 0.012 0.072 0.540 0.376
#> SRR1700310 4 0.6064 0.20688 0.044 0.000 0.444 0.512
#> SRR1700311 4 0.5807 0.35955 0.044 0.000 0.344 0.612
#> SRR1700312 3 0.7920 0.07945 0.044 0.108 0.480 0.368
#> SRR1700313 3 0.9394 0.17027 0.216 0.112 0.384 0.288
#> SRR1700314 4 0.5299 0.32604 0.008 0.004 0.388 0.600
#> SRR1700315 3 0.6322 -0.01001 0.016 0.032 0.532 0.420
#> SRR1700316 4 0.6005 0.15448 0.000 0.040 0.460 0.500
#> SRR1700317 3 0.7459 0.23720 0.004 0.212 0.532 0.252
#> SRR1700318 1 0.7401 0.27847 0.512 0.004 0.320 0.164
#> SRR1700319 4 0.5387 0.30614 0.016 0.000 0.400 0.584
#> SRR1700320 4 0.5653 0.23324 0.016 0.004 0.448 0.532
#> SRR1700322 4 0.7610 0.21279 0.200 0.004 0.304 0.492
#> SRR1700321 3 0.7075 -0.02424 0.008 0.096 0.480 0.416
#> SRR1700323 4 0.5055 0.37348 0.008 0.000 0.368 0.624
#> SRR1700324 4 0.7477 0.14540 0.152 0.004 0.416 0.428
#> SRR1700325 4 0.8737 -0.07545 0.040 0.252 0.348 0.360
#> SRR1700326 1 0.7625 0.14683 0.472 0.004 0.188 0.336
#> SRR1700327 3 0.6961 0.18692 0.000 0.136 0.548 0.316
#> SRR1700329 4 0.6549 0.13638 0.012 0.048 0.452 0.488
#> SRR1700328 1 0.7398 0.55237 0.616 0.036 0.188 0.160
#> SRR1700330 1 0.6496 0.54237 0.656 0.004 0.160 0.180
#> SRR1700331 3 0.5558 -0.05817 0.008 0.008 0.540 0.444
#> SRR1700332 4 0.5807 0.16749 0.016 0.008 0.484 0.492
#> SRR1700333 1 0.7974 0.31126 0.504 0.020 0.220 0.256
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.483 0.69664 0.020 0.772 0.068 0.012 0.128
#> SRR1699875 2 0.572 0.54599 0.008 0.608 0.292 0.000 0.092
#> SRR1699876 5 0.422 0.69308 0.000 0.108 0.044 0.040 0.808
#> SRR1699877 2 0.554 0.66484 0.044 0.712 0.136 0.000 0.108
#> SRR1699879 5 0.605 -0.14603 0.004 0.460 0.040 0.032 0.464
#> SRR1699878 2 0.617 0.59499 0.008 0.620 0.196 0.008 0.168
#> SRR1699880 2 0.437 0.69788 0.000 0.796 0.100 0.024 0.080
#> SRR1699881 2 0.530 0.63850 0.000 0.688 0.060 0.024 0.228
#> SRR1699882 5 0.599 0.07053 0.024 0.392 0.060 0.000 0.524
#> SRR1699883 2 0.599 0.44616 0.024 0.576 0.060 0.004 0.336
#> SRR1699884 2 0.595 0.63871 0.080 0.664 0.200 0.000 0.056
#> SRR1699885 2 0.434 0.67539 0.008 0.788 0.152 0.016 0.036
#> SRR1699886 5 0.470 0.66963 0.016 0.092 0.076 0.024 0.792
#> SRR1699888 2 0.964 0.21845 0.124 0.328 0.176 0.216 0.156
#> SRR1699889 5 0.273 0.72217 0.008 0.028 0.024 0.036 0.904
#> SRR1699890 5 0.533 0.63213 0.180 0.056 0.012 0.028 0.724
#> SRR1699887 5 0.449 0.67316 0.032 0.100 0.052 0.012 0.804
#> SRR1699891 5 0.430 0.71017 0.016 0.008 0.092 0.076 0.808
#> SRR1699892 2 0.663 0.20189 0.012 0.448 0.096 0.016 0.428
#> SRR1699893 5 0.522 0.05876 0.008 0.008 0.016 0.432 0.536
#> SRR1699894 5 0.354 0.69515 0.012 0.000 0.020 0.144 0.824
#> SRR1699895 5 0.395 0.67116 0.012 0.000 0.024 0.176 0.788
#> SRR1699896 5 0.717 0.32852 0.036 0.232 0.196 0.008 0.528
#> SRR1699897 5 0.613 0.50442 0.024 0.152 0.176 0.004 0.644
#> SRR1699898 4 0.658 0.65107 0.000 0.132 0.088 0.628 0.152
#> SRR1699900 3 0.794 -0.00206 0.052 0.276 0.356 0.008 0.308
#> SRR1699899 5 0.333 0.69112 0.004 0.048 0.072 0.012 0.864
#> SRR1699902 3 0.530 0.64456 0.028 0.056 0.760 0.044 0.112
#> SRR1699901 5 0.828 -0.02117 0.160 0.004 0.340 0.148 0.348
#> SRR1699903 5 0.337 0.72116 0.020 0.012 0.052 0.044 0.872
#> SRR1699904 5 0.664 0.21741 0.036 0.000 0.108 0.340 0.516
#> SRR1699905 1 0.649 0.49637 0.624 0.004 0.208 0.056 0.108
#> SRR1699906 5 0.380 0.69642 0.000 0.036 0.088 0.040 0.836
#> SRR1699907 5 0.314 0.72381 0.024 0.004 0.036 0.056 0.880
#> SRR1699908 5 0.281 0.71903 0.000 0.004 0.024 0.096 0.876
#> SRR1699909 5 0.560 0.66846 0.012 0.028 0.144 0.100 0.716
#> SRR1699910 5 0.522 0.65621 0.028 0.000 0.072 0.184 0.716
#> SRR1699911 5 0.562 0.66531 0.060 0.016 0.148 0.052 0.724
#> SRR1699912 5 0.396 0.69482 0.004 0.000 0.064 0.128 0.804
#> SRR1699913 5 0.445 0.60608 0.000 0.000 0.040 0.248 0.712
#> SRR1699914 5 0.539 0.58267 0.008 0.008 0.232 0.072 0.680
#> SRR1699915 5 0.536 0.64471 0.028 0.000 0.096 0.164 0.712
#> SRR1699916 3 0.834 0.24426 0.076 0.024 0.396 0.216 0.288
#> SRR1699917 4 0.687 0.35825 0.012 0.000 0.292 0.468 0.228
#> SRR1699918 3 0.723 0.38997 0.028 0.012 0.484 0.312 0.164
#> SRR1699919 5 0.305 0.72208 0.012 0.000 0.048 0.064 0.876
#> SRR1699920 5 0.414 0.70282 0.000 0.012 0.104 0.080 0.804
#> SRR1699921 5 0.405 0.70749 0.016 0.004 0.096 0.064 0.820
#> SRR1699922 5 0.467 0.65826 0.092 0.036 0.072 0.008 0.792
#> SRR1699923 5 0.786 0.18675 0.196 0.060 0.300 0.012 0.432
#> SRR1699924 3 0.646 0.50881 0.016 0.020 0.564 0.316 0.084
#> SRR1699925 1 0.382 0.72038 0.840 0.000 0.052 0.048 0.060
#> SRR1699926 5 0.319 0.72035 0.012 0.008 0.060 0.044 0.876
#> SRR1699927 5 0.355 0.70389 0.000 0.000 0.052 0.124 0.824
#> SRR1699929 5 0.601 0.56942 0.032 0.112 0.144 0.020 0.692
#> SRR1699928 5 0.296 0.72026 0.004 0.004 0.044 0.068 0.880
#> SRR1699930 5 0.281 0.72128 0.012 0.008 0.012 0.080 0.888
#> SRR1699931 5 0.636 0.49239 0.032 0.208 0.112 0.012 0.636
#> SRR1699933 3 0.652 0.50612 0.012 0.096 0.604 0.036 0.252
#> SRR1699932 5 0.258 0.72537 0.008 0.008 0.020 0.060 0.904
#> SRR1699934 1 0.441 0.69916 0.804 0.000 0.064 0.068 0.064
#> SRR1699935 5 0.606 0.38659 0.004 0.024 0.068 0.324 0.580
#> SRR1699936 2 0.482 0.59540 0.004 0.744 0.076 0.168 0.008
#> SRR1699937 2 0.296 0.69032 0.000 0.876 0.080 0.036 0.008
#> SRR1699938 2 0.274 0.69647 0.004 0.900 0.044 0.036 0.016
#> SRR1699940 2 0.464 0.68953 0.000 0.760 0.112 0.008 0.120
#> SRR1699939 2 0.588 0.49170 0.000 0.588 0.060 0.028 0.324
#> SRR1699941 2 0.355 0.70618 0.000 0.848 0.076 0.016 0.060
#> SRR1699942 2 0.642 0.32605 0.012 0.544 0.288 0.156 0.000
#> SRR1699943 2 0.267 0.69355 0.012 0.904 0.032 0.044 0.008
#> SRR1699944 2 0.339 0.70567 0.000 0.860 0.044 0.024 0.072
#> SRR1699945 2 0.436 0.70338 0.000 0.792 0.072 0.020 0.116
#> SRR1699946 2 0.348 0.69198 0.004 0.848 0.100 0.008 0.040
#> SRR1699947 2 0.496 0.66293 0.016 0.736 0.160 0.000 0.088
#> SRR1699948 2 0.420 0.61866 0.000 0.752 0.212 0.032 0.004
#> SRR1699949 2 0.684 0.12807 0.004 0.440 0.012 0.164 0.380
#> SRR1699950 2 0.542 0.47922 0.000 0.604 0.028 0.028 0.340
#> SRR1699951 2 0.562 0.50123 0.000 0.652 0.020 0.248 0.080
#> SRR1699952 2 0.385 0.65337 0.004 0.792 0.180 0.008 0.016
#> SRR1699953 2 0.367 0.69385 0.004 0.828 0.032 0.008 0.128
#> SRR1699954 2 0.627 0.49060 0.084 0.572 0.316 0.020 0.008
#> SRR1699955 2 0.284 0.67642 0.000 0.876 0.020 0.096 0.008
#> SRR1699956 2 0.538 0.47930 0.000 0.612 0.024 0.032 0.332
#> SRR1699957 2 0.620 0.57606 0.016 0.596 0.144 0.000 0.244
#> SRR1699959 2 0.680 0.55706 0.000 0.612 0.128 0.124 0.136
#> SRR1699958 4 0.487 0.64223 0.004 0.200 0.016 0.732 0.048
#> SRR1699960 2 0.579 0.48936 0.000 0.632 0.180 0.184 0.004
#> SRR1699961 2 0.369 0.66061 0.000 0.804 0.168 0.012 0.016
#> SRR1699962 2 0.623 0.37889 0.000 0.560 0.328 0.080 0.032
#> SRR1699963 3 0.715 0.32420 0.016 0.280 0.404 0.300 0.000
#> SRR1699964 2 0.367 0.68196 0.004 0.840 0.084 0.064 0.008
#> SRR1699965 2 0.431 0.68609 0.012 0.784 0.044 0.004 0.156
#> SRR1699966 5 0.619 0.40835 0.000 0.296 0.016 0.116 0.572
#> SRR1699967 2 0.496 0.64803 0.028 0.732 0.196 0.004 0.040
#> SRR1699968 5 0.660 0.23168 0.008 0.140 0.336 0.008 0.508
#> SRR1699969 5 0.407 0.70382 0.000 0.092 0.052 0.036 0.820
#> SRR1699971 2 0.381 0.66440 0.000 0.816 0.116 0.064 0.004
#> SRR1699970 2 0.507 0.48869 0.008 0.616 0.348 0.004 0.024
#> SRR1699972 2 0.545 0.42710 0.012 0.560 0.392 0.004 0.032
#> SRR1699973 4 0.552 0.69657 0.000 0.112 0.056 0.720 0.112
#> SRR1699974 3 0.741 0.01177 0.024 0.288 0.404 0.004 0.280
#> SRR1699975 5 0.326 0.69866 0.000 0.060 0.064 0.012 0.864
#> SRR1699976 2 0.567 0.52895 0.004 0.604 0.296 0.000 0.096
#> SRR1699977 3 0.745 0.47769 0.000 0.220 0.516 0.168 0.096
#> SRR1699978 4 0.678 0.13607 0.156 0.016 0.328 0.496 0.004
#> SRR1699979 4 0.766 0.28287 0.000 0.276 0.152 0.468 0.104
#> SRR1699980 5 0.525 0.47327 0.000 0.028 0.300 0.028 0.644
#> SRR1699981 5 0.309 0.70924 0.008 0.048 0.044 0.016 0.884
#> SRR1699982 5 0.414 0.67990 0.000 0.000 0.064 0.160 0.776
#> SRR1699983 5 0.413 0.70707 0.004 0.004 0.096 0.092 0.804
#> SRR1699984 1 0.527 0.55629 0.668 0.016 0.272 0.008 0.036
#> SRR1699985 3 0.668 0.55507 0.000 0.100 0.596 0.080 0.224
#> SRR1699986 5 0.861 0.31065 0.220 0.020 0.144 0.212 0.404
#> SRR1699988 5 0.662 0.59679 0.064 0.176 0.052 0.052 0.656
#> SRR1699987 4 0.659 0.40139 0.000 0.160 0.016 0.520 0.304
#> SRR1699989 5 0.434 0.67357 0.000 0.088 0.096 0.020 0.796
#> SRR1699990 5 0.384 0.71148 0.000 0.100 0.020 0.052 0.828
#> SRR1699992 2 0.742 0.41379 0.092 0.468 0.336 0.004 0.100
#> SRR1699991 3 0.522 0.64763 0.008 0.120 0.716 0.152 0.004
#> SRR1699993 5 0.488 0.64176 0.188 0.008 0.008 0.060 0.736
#> SRR1699994 3 0.571 0.44178 0.012 0.208 0.664 0.004 0.112
#> SRR1699995 3 0.514 0.52285 0.016 0.000 0.660 0.284 0.040
#> SRR1699996 2 0.787 0.33977 0.232 0.372 0.320 0.000 0.076
#> SRR1699997 4 0.452 0.74922 0.004 0.000 0.064 0.748 0.184
#> SRR1699998 2 0.548 0.61603 0.004 0.668 0.220 0.004 0.104
#> SRR1699999 1 0.677 0.06426 0.460 0.012 0.420 0.052 0.056
#> SRR1700000 3 0.651 -0.22684 0.056 0.440 0.456 0.008 0.040
#> SRR1700002 2 0.463 0.63820 0.000 0.760 0.104 0.128 0.008
#> SRR1700001 2 0.670 0.38682 0.008 0.484 0.148 0.008 0.352
#> SRR1700003 3 0.747 0.42048 0.008 0.252 0.468 0.236 0.036
#> SRR1700004 5 0.367 0.70720 0.000 0.064 0.048 0.040 0.848
#> SRR1700005 1 0.424 0.68328 0.800 0.004 0.108 0.080 0.008
#> SRR1700006 2 0.526 0.47178 0.008 0.588 0.372 0.008 0.024
#> SRR1700007 5 0.541 0.47406 0.020 0.032 0.008 0.296 0.644
#> SRR1700008 4 0.561 0.69326 0.012 0.000 0.128 0.668 0.192
#> SRR1700009 1 0.456 0.68747 0.784 0.000 0.036 0.120 0.060
#> SRR1700010 2 0.605 0.29711 0.000 0.504 0.076 0.016 0.404
#> SRR1700011 2 0.629 0.08153 0.004 0.476 0.092 0.416 0.012
#> SRR1700013 2 0.743 0.19802 0.104 0.436 0.100 0.360 0.000
#> SRR1700012 3 0.507 0.58035 0.008 0.164 0.744 0.056 0.028
#> SRR1700014 3 0.475 0.62607 0.000 0.024 0.732 0.208 0.036
#> SRR1700015 2 0.603 0.25760 0.012 0.524 0.388 0.072 0.004
#> SRR1700016 3 0.614 0.43606 0.260 0.020 0.632 0.028 0.060
#> SRR1700018 2 0.567 0.24573 0.016 0.516 0.428 0.036 0.004
#> SRR1700017 3 0.580 0.58191 0.016 0.184 0.656 0.144 0.000
#> SRR1700019 5 0.631 0.57114 0.024 0.188 0.044 0.080 0.664
#> SRR1700020 3 0.629 0.36454 0.024 0.052 0.532 0.376 0.016
#> SRR1700021 5 0.845 0.03685 0.160 0.000 0.252 0.292 0.296
#> SRR1700023 3 0.727 0.33359 0.004 0.248 0.500 0.040 0.208
#> SRR1700022 3 0.584 0.57217 0.008 0.184 0.636 0.172 0.000
#> SRR1700024 3 0.524 0.49355 0.004 0.016 0.644 0.304 0.032
#> SRR1700025 2 0.552 0.23194 0.012 0.500 0.456 0.020 0.012
#> SRR1700026 3 0.573 0.53211 0.036 0.216 0.668 0.080 0.000
#> SRR1700027 3 0.491 0.61489 0.020 0.156 0.744 0.080 0.000
#> SRR1700028 4 0.505 0.66699 0.008 0.008 0.180 0.728 0.076
#> SRR1700029 3 0.543 0.08694 0.008 0.020 0.484 0.476 0.012
#> SRR1700030 5 0.607 0.17129 0.008 0.040 0.420 0.028 0.504
#> SRR1700031 3 0.482 0.63360 0.008 0.140 0.752 0.096 0.004
#> SRR1700032 3 0.624 0.10840 0.012 0.336 0.536 0.000 0.116
#> SRR1700034 3 0.472 0.62771 0.100 0.048 0.792 0.048 0.012
#> SRR1700035 5 0.649 0.39756 0.004 0.004 0.272 0.184 0.536
#> SRR1700033 3 0.420 0.63766 0.004 0.136 0.792 0.064 0.004
#> SRR1700036 3 0.544 0.27541 0.000 0.028 0.576 0.024 0.372
#> SRR1700037 5 0.549 0.61045 0.012 0.000 0.120 0.188 0.680
#> SRR1700038 3 0.589 0.49505 0.088 0.176 0.684 0.004 0.048
#> SRR1700039 3 0.545 0.64374 0.004 0.024 0.716 0.132 0.124
#> SRR1700040 3 0.444 0.61978 0.000 0.148 0.780 0.044 0.028
#> SRR1700041 3 0.606 0.59670 0.000 0.140 0.664 0.048 0.148
#> SRR1700042 3 0.417 0.67983 0.004 0.040 0.808 0.124 0.024
#> SRR1700043 3 0.525 0.56187 0.048 0.104 0.740 0.000 0.108
#> SRR1700045 3 0.712 0.13609 0.004 0.024 0.428 0.172 0.372
#> SRR1700044 3 0.450 0.64197 0.084 0.044 0.812 0.028 0.032
#> SRR1700046 3 0.435 0.65844 0.012 0.028 0.780 0.168 0.012
#> SRR1700047 3 0.548 -0.01413 0.004 0.016 0.500 0.024 0.456
#> SRR1700048 3 0.607 0.54382 0.016 0.008 0.620 0.260 0.096
#> SRR1700049 3 0.588 0.02149 0.004 0.000 0.464 0.084 0.448
#> SRR1700050 3 0.552 0.35702 0.004 0.004 0.564 0.376 0.052
#> SRR1700051 3 0.505 0.57354 0.016 0.000 0.684 0.256 0.044
#> SRR1700052 3 0.322 0.66384 0.028 0.024 0.884 0.036 0.028
#> SRR1700053 3 0.536 0.46498 0.004 0.004 0.648 0.068 0.276
#> SRR1700054 3 0.405 0.66755 0.016 0.028 0.808 0.140 0.008
#> SRR1700055 3 0.407 0.64412 0.068 0.008 0.824 0.084 0.016
#> SRR1700056 4 0.674 0.27832 0.012 0.004 0.324 0.496 0.164
#> SRR1700057 4 0.700 0.06772 0.004 0.004 0.348 0.392 0.252
#> SRR1700058 3 0.430 0.66552 0.024 0.084 0.816 0.064 0.012
#> SRR1700059 4 0.644 0.43202 0.004 0.004 0.268 0.544 0.180
#> SRR1700060 3 0.458 0.63620 0.000 0.004 0.748 0.172 0.076
#> SRR1700061 3 0.418 0.67456 0.016 0.048 0.832 0.052 0.052
#> SRR1700062 4 0.543 0.31359 0.000 0.012 0.364 0.580 0.044
#> SRR1700063 3 0.445 0.67527 0.024 0.020 0.796 0.132 0.028
#> SRR1700064 3 0.661 0.20078 0.012 0.000 0.464 0.152 0.372
#> SRR1700065 3 0.442 0.64638 0.020 0.028 0.768 0.180 0.004
#> SRR1700066 3 0.452 0.63165 0.040 0.068 0.804 0.008 0.080
#> SRR1700067 4 0.630 0.47735 0.020 0.000 0.268 0.580 0.132
#> SRR1700068 3 0.571 0.26350 0.000 0.004 0.512 0.412 0.072
#> SRR1700069 5 0.541 0.27204 0.004 0.000 0.392 0.052 0.552
#> SRR1700070 3 0.426 0.60560 0.000 0.128 0.788 0.008 0.076
#> SRR1700071 3 0.379 0.67668 0.000 0.016 0.832 0.084 0.068
#> SRR1700072 3 0.381 0.65483 0.044 0.020 0.852 0.028 0.056
#> SRR1700073 3 0.755 0.29686 0.112 0.008 0.460 0.336 0.084
#> SRR1700075 3 0.414 0.66060 0.036 0.028 0.836 0.040 0.060
#> SRR1700074 3 0.436 0.65311 0.000 0.108 0.800 0.052 0.040
#> SRR1700076 3 0.393 0.66697 0.032 0.012 0.836 0.092 0.028
#> SRR1700077 3 0.303 0.63847 0.016 0.096 0.872 0.008 0.008
#> SRR1700078 5 0.628 0.25097 0.020 0.028 0.380 0.040 0.532
#> SRR1700080 5 0.542 0.12888 0.000 0.024 0.456 0.020 0.500
#> SRR1700079 3 0.673 0.19135 0.000 0.024 0.444 0.400 0.132
#> SRR1700081 3 0.609 0.55620 0.008 0.048 0.612 0.288 0.044
#> SRR1700082 3 0.630 0.37529 0.000 0.292 0.548 0.152 0.008
#> SRR1700083 3 0.465 0.61968 0.020 0.012 0.740 0.212 0.016
#> SRR1700084 3 0.461 0.60989 0.052 0.100 0.796 0.008 0.044
#> SRR1700085 5 0.631 0.26620 0.004 0.004 0.348 0.128 0.516
#> SRR1700086 3 0.491 0.44461 0.004 0.008 0.656 0.024 0.308
#> SRR1700087 4 0.568 0.44799 0.044 0.300 0.036 0.620 0.000
#> SRR1700088 2 0.649 0.33561 0.012 0.548 0.188 0.252 0.000
#> SRR1700089 4 0.600 0.24814 0.016 0.404 0.040 0.524 0.016
#> SRR1700091 4 0.540 0.59003 0.016 0.232 0.036 0.692 0.024
#> SRR1700090 4 0.298 0.76202 0.016 0.020 0.012 0.888 0.064
#> SRR1700092 4 0.503 0.63442 0.008 0.144 0.084 0.748 0.016
#> SRR1700094 4 0.524 0.57183 0.036 0.212 0.040 0.708 0.004
#> SRR1700093 4 0.433 0.69422 0.032 0.124 0.012 0.804 0.028
#> SRR1700095 4 0.521 0.64447 0.044 0.168 0.028 0.740 0.020
#> SRR1700096 4 0.525 0.62006 0.004 0.164 0.076 0.728 0.028
#> SRR1700097 4 0.437 0.70980 0.024 0.080 0.040 0.820 0.036
#> SRR1700098 4 0.598 0.42783 0.032 0.328 0.016 0.592 0.032
#> SRR1700099 4 0.416 0.69085 0.012 0.144 0.008 0.800 0.036
#> SRR1700100 4 0.464 0.66301 0.008 0.136 0.052 0.780 0.024
#> SRR1700101 4 0.520 0.64790 0.024 0.192 0.024 0.728 0.032
#> SRR1700102 4 0.506 0.67941 0.004 0.144 0.028 0.748 0.076
#> SRR1700104 4 0.489 0.63744 0.024 0.192 0.008 0.740 0.036
#> SRR1700103 4 0.525 0.72185 0.008 0.104 0.020 0.736 0.132
#> SRR1700105 4 0.458 0.75117 0.032 0.052 0.008 0.792 0.116
#> SRR1700106 4 0.484 0.75442 0.072 0.024 0.020 0.784 0.100
#> SRR1700107 4 0.424 0.71021 0.020 0.112 0.012 0.812 0.044
#> SRR1700108 4 0.419 0.71261 0.036 0.092 0.016 0.824 0.032
#> SRR1700109 4 0.358 0.69935 0.004 0.060 0.068 0.852 0.016
#> SRR1700110 4 0.488 0.70021 0.032 0.128 0.020 0.776 0.044
#> SRR1700112 4 0.351 0.73788 0.016 0.000 0.088 0.848 0.048
#> SRR1700111 4 0.447 0.71369 0.020 0.004 0.128 0.788 0.060
#> SRR1700113 4 0.535 0.60033 0.004 0.056 0.008 0.648 0.284
#> SRR1700114 4 0.472 0.72368 0.028 0.060 0.052 0.804 0.056
#> SRR1700115 4 0.265 0.74939 0.012 0.020 0.020 0.908 0.040
#> SRR1700116 4 0.344 0.76700 0.012 0.008 0.024 0.852 0.104
#> SRR1700117 4 0.513 0.67436 0.076 0.004 0.136 0.748 0.036
#> SRR1700119 4 0.588 0.62145 0.024 0.064 0.012 0.648 0.252
#> SRR1700118 4 0.398 0.70197 0.004 0.004 0.140 0.804 0.048
#> SRR1700120 4 0.416 0.74940 0.024 0.052 0.012 0.824 0.088
#> SRR1700121 4 0.482 0.74903 0.024 0.048 0.016 0.772 0.140
#> SRR1700122 4 0.444 0.76071 0.044 0.004 0.036 0.796 0.120
#> SRR1700123 4 0.332 0.76463 0.012 0.020 0.020 0.868 0.080
#> SRR1700125 4 0.451 0.71939 0.024 0.004 0.012 0.736 0.224
#> SRR1700126 4 0.462 0.69362 0.036 0.032 0.104 0.800 0.028
#> SRR1700127 4 0.364 0.73193 0.000 0.000 0.100 0.824 0.076
#> SRR1700124 4 0.403 0.72951 0.008 0.000 0.100 0.808 0.084
#> SRR1700128 4 0.535 0.61216 0.028 0.000 0.040 0.656 0.276
#> SRR1700129 4 0.371 0.75784 0.012 0.000 0.056 0.832 0.100
#> SRR1700130 4 0.346 0.76123 0.036 0.004 0.024 0.860 0.076
#> SRR1700132 4 0.525 0.55009 0.020 0.004 0.024 0.632 0.320
#> SRR1700131 4 0.442 0.68372 0.000 0.016 0.012 0.712 0.260
#> SRR1700133 4 0.471 0.73815 0.036 0.008 0.016 0.748 0.192
#> SRR1700134 4 0.465 0.69554 0.012 0.004 0.028 0.724 0.232
#> SRR1700135 4 0.565 0.58176 0.016 0.000 0.080 0.636 0.268
#> SRR1700136 4 0.345 0.76657 0.000 0.024 0.012 0.836 0.128
#> SRR1700137 4 0.503 0.62561 0.020 0.000 0.028 0.664 0.288
#> SRR1700138 4 0.512 0.15012 0.004 0.004 0.020 0.496 0.476
#> SRR1700140 4 0.491 0.65793 0.000 0.004 0.048 0.672 0.276
#> SRR1700139 4 0.462 0.70233 0.012 0.012 0.012 0.716 0.248
#> SRR1700141 4 0.367 0.76059 0.020 0.008 0.004 0.816 0.152
#> SRR1700142 4 0.552 0.21074 0.004 0.000 0.392 0.544 0.060
#> SRR1700143 4 0.375 0.76989 0.000 0.016 0.036 0.824 0.124
#> SRR1700144 3 0.611 0.50924 0.008 0.004 0.600 0.256 0.132
#> SRR1700145 4 0.483 0.73406 0.012 0.008 0.112 0.764 0.104
#> SRR1700146 4 0.481 0.73614 0.008 0.004 0.092 0.752 0.144
#> SRR1700147 4 0.445 0.73710 0.012 0.000 0.040 0.752 0.196
#> SRR1700149 4 0.365 0.75904 0.020 0.000 0.024 0.828 0.128
#> SRR1700148 4 0.542 0.69584 0.028 0.000 0.136 0.712 0.124
#> SRR1700150 4 0.446 0.74065 0.020 0.012 0.016 0.764 0.188
#> SRR1700152 4 0.496 0.64973 0.064 0.000 0.000 0.668 0.268
#> SRR1700151 4 0.524 0.71750 0.012 0.000 0.088 0.696 0.204
#> SRR1700153 4 0.317 0.76002 0.000 0.008 0.004 0.828 0.160
#> SRR1700154 4 0.404 0.76492 0.048 0.004 0.016 0.816 0.116
#> SRR1700155 4 0.408 0.73224 0.012 0.008 0.008 0.768 0.204
#> SRR1700156 4 0.376 0.75870 0.012 0.000 0.044 0.824 0.120
#> SRR1700158 4 0.430 0.76265 0.056 0.012 0.004 0.792 0.136
#> SRR1700159 4 0.483 0.64456 0.036 0.004 0.004 0.684 0.272
#> SRR1700157 4 0.480 0.68216 0.008 0.000 0.176 0.736 0.080
#> SRR1700160 4 0.369 0.76440 0.012 0.016 0.004 0.816 0.152
#> SRR1700161 4 0.440 0.68673 0.008 0.000 0.020 0.712 0.260
#> SRR1700162 4 0.485 0.58135 0.016 0.000 0.016 0.644 0.324
#> SRR1700164 4 0.529 0.59641 0.252 0.004 0.028 0.680 0.036
#> SRR1700163 4 0.584 0.71340 0.096 0.000 0.092 0.700 0.112
#> SRR1700165 4 0.414 0.74050 0.024 0.036 0.056 0.836 0.048
#> SRR1700166 4 0.389 0.76617 0.044 0.012 0.008 0.828 0.108
#> SRR1700168 4 0.404 0.76456 0.036 0.004 0.028 0.820 0.112
#> SRR1700167 4 0.474 0.72972 0.012 0.000 0.100 0.756 0.132
#> SRR1700170 4 0.489 0.76268 0.048 0.016 0.052 0.784 0.100
#> SRR1700169 4 0.416 0.67472 0.012 0.004 0.156 0.792 0.036
#> SRR1700171 4 0.495 0.67676 0.152 0.048 0.020 0.760 0.020
#> SRR1700172 5 0.589 -0.03392 0.008 0.048 0.012 0.452 0.480
#> SRR1700174 4 0.381 0.76905 0.004 0.024 0.020 0.824 0.128
#> SRR1700173 4 0.270 0.75646 0.012 0.004 0.032 0.900 0.052
#> SRR1700175 4 0.402 0.75985 0.020 0.004 0.056 0.824 0.096
#> SRR1700176 4 0.422 0.68894 0.004 0.080 0.072 0.816 0.028
#> SRR1700178 2 0.343 0.67722 0.052 0.860 0.028 0.060 0.000
#> SRR1700177 4 0.407 0.72794 0.020 0.000 0.008 0.760 0.212
#> SRR1700180 2 0.289 0.68466 0.044 0.892 0.004 0.044 0.016
#> SRR1700179 2 0.275 0.66846 0.016 0.884 0.000 0.088 0.012
#> SRR1700181 2 0.376 0.63896 0.092 0.816 0.000 0.092 0.000
#> SRR1700183 1 0.218 0.74857 0.924 0.032 0.024 0.020 0.000
#> SRR1700182 2 0.271 0.68114 0.036 0.900 0.004 0.048 0.012
#> SRR1700184 2 0.295 0.68295 0.040 0.892 0.012 0.044 0.012
#> SRR1700186 2 0.292 0.68219 0.020 0.884 0.028 0.068 0.000
#> SRR1700187 1 0.178 0.74995 0.944 0.020 0.012 0.004 0.020
#> SRR1700185 1 0.181 0.74677 0.940 0.004 0.036 0.012 0.008
#> SRR1700188 2 0.257 0.69198 0.028 0.908 0.044 0.016 0.004
#> SRR1700192 1 0.398 0.70317 0.824 0.116 0.028 0.020 0.012
#> SRR1700190 2 0.407 0.69827 0.072 0.832 0.052 0.008 0.036
#> SRR1700191 1 0.187 0.74871 0.940 0.008 0.028 0.008 0.016
#> SRR1700189 1 0.192 0.74539 0.936 0.008 0.036 0.016 0.004
#> SRR1700193 2 0.550 0.52150 0.292 0.640 0.040 0.004 0.024
#> SRR1700195 2 0.478 0.50684 0.292 0.672 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700194 1 0.179 0.73988 0.936 0.004 0.044 0.016 0.000
#> SRR1700196 2 0.321 0.69338 0.060 0.876 0.032 0.004 0.028
#> SRR1700197 1 0.439 0.60188 0.748 0.188 0.064 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.268 0.69122 0.048 0.904 0.024 0.016 0.008
#> SRR1700199 2 0.598 0.57618 0.236 0.628 0.120 0.004 0.012
#> SRR1700200 2 0.561 0.36846 0.356 0.584 0.012 0.008 0.040
#> SRR1700201 2 0.289 0.67879 0.020 0.888 0.008 0.072 0.012
#> SRR1700202 1 0.288 0.73702 0.888 0.024 0.028 0.060 0.000
#> SRR1700203 2 0.666 0.17827 0.396 0.480 0.008 0.088 0.028
#> SRR1700204 2 0.598 0.29951 0.384 0.540 0.036 0.036 0.004
#> SRR1700206 2 0.519 0.62811 0.192 0.712 0.080 0.004 0.012
#> SRR1700207 2 0.482 0.63190 0.108 0.764 0.028 0.100 0.000
#> SRR1700208 2 0.572 0.53654 0.216 0.676 0.004 0.068 0.036
#> SRR1700205 1 0.317 0.74432 0.880 0.056 0.008 0.036 0.020
#> SRR1700209 5 0.710 -0.02100 0.044 0.372 0.100 0.012 0.472
#> SRR1700210 1 0.520 0.60611 0.716 0.164 0.016 0.000 0.104
#> SRR1700211 1 0.362 0.69323 0.832 0.128 0.024 0.008 0.008
#> SRR1700212 1 0.645 0.30241 0.536 0.344 0.008 0.020 0.092
#> SRR1700213 2 0.719 0.56189 0.204 0.568 0.104 0.004 0.120
#> SRR1700214 2 0.586 0.41914 0.344 0.584 0.036 0.012 0.024
#> SRR1700215 1 0.253 0.74876 0.912 0.008 0.024 0.040 0.016
#> SRR1700217 1 0.683 0.42088 0.544 0.164 0.016 0.012 0.264
#> SRR1700216 1 0.235 0.74791 0.920 0.012 0.040 0.016 0.012
#> SRR1700218 2 0.548 0.48546 0.008 0.596 0.048 0.004 0.344
#> SRR1700219 2 0.503 0.65383 0.076 0.756 0.012 0.020 0.136
#> SRR1700222 1 0.216 0.74788 0.928 0.016 0.028 0.004 0.024
#> SRR1700220 5 0.544 0.58901 0.004 0.116 0.004 0.196 0.680
#> SRR1700221 2 0.722 0.17260 0.380 0.456 0.008 0.080 0.076
#> SRR1700223 2 0.593 0.65284 0.144 0.696 0.052 0.008 0.100
#> SRR1700224 1 0.746 0.16240 0.384 0.228 0.024 0.008 0.356
#> SRR1700226 2 0.657 0.60331 0.120 0.620 0.076 0.000 0.184
#> SRR1700229 5 0.713 -0.07505 0.064 0.368 0.112 0.000 0.456
#> SRR1700225 2 0.649 0.46193 0.016 0.564 0.324 0.056 0.040
#> SRR1700227 2 0.336 0.68080 0.024 0.864 0.020 0.084 0.008
#> SRR1700230 1 0.187 0.75121 0.940 0.016 0.008 0.008 0.028
#> SRR1700231 2 0.423 0.69597 0.036 0.820 0.020 0.024 0.100
#> SRR1700228 1 0.697 0.03250 0.472 0.384 0.084 0.008 0.052
#> SRR1700232 2 0.599 0.63345 0.084 0.680 0.048 0.008 0.180
#> SRR1700233 1 0.607 0.33324 0.588 0.312 0.076 0.016 0.008
#> SRR1700234 1 0.619 0.45953 0.620 0.276 0.044 0.040 0.020
#> SRR1700235 2 0.619 0.61624 0.004 0.652 0.036 0.144 0.164
#> SRR1700237 2 0.537 0.65916 0.092 0.752 0.012 0.060 0.084
#> SRR1700236 2 0.597 0.58614 0.040 0.632 0.060 0.004 0.264
#> SRR1700238 2 0.661 0.45314 0.320 0.548 0.080 0.004 0.048
#> SRR1700239 1 0.274 0.74358 0.900 0.024 0.048 0.024 0.004
#> SRR1700240 1 0.231 0.74519 0.920 0.004 0.020 0.040 0.016
#> SRR1700241 1 0.687 0.50639 0.572 0.140 0.000 0.224 0.064
#> SRR1700243 2 0.458 0.66221 0.104 0.792 0.004 0.064 0.036
#> SRR1700244 5 0.759 -0.13356 0.276 0.344 0.012 0.020 0.348
#> SRR1700242 1 0.203 0.74942 0.932 0.016 0.012 0.036 0.004
#> SRR1700246 1 0.235 0.74957 0.920 0.036 0.012 0.008 0.024
#> SRR1700245 2 0.338 0.69990 0.008 0.856 0.024 0.012 0.100
#> SRR1700247 1 0.286 0.74644 0.896 0.032 0.032 0.036 0.004
#> SRR1700249 1 0.204 0.74290 0.928 0.008 0.028 0.036 0.000
#> SRR1700250 2 0.324 0.69110 0.000 0.848 0.004 0.032 0.116
#> SRR1700248 2 0.504 0.57296 0.128 0.716 0.000 0.152 0.004
#> SRR1700251 2 0.706 0.34202 0.188 0.512 0.040 0.260 0.000
#> SRR1700252 2 0.538 0.51945 0.296 0.644 0.028 0.004 0.028
#> SRR1700253 2 0.535 0.61673 0.044 0.724 0.028 0.184 0.020
#> SRR1700256 2 0.702 0.47745 0.200 0.532 0.044 0.000 0.224
#> SRR1700254 1 0.170 0.74923 0.948 0.008 0.020 0.012 0.012
#> SRR1700255 1 0.584 0.38193 0.600 0.324 0.020 0.044 0.012
#> SRR1700257 2 0.520 0.60983 0.208 0.716 0.012 0.024 0.040
#> SRR1700258 2 0.415 0.67601 0.052 0.832 0.012 0.052 0.052
#> SRR1700259 2 0.536 0.63665 0.000 0.720 0.036 0.092 0.152
#> SRR1700260 5 0.566 0.60776 0.004 0.152 0.008 0.164 0.672
#> SRR1700261 5 0.314 0.71389 0.000 0.060 0.032 0.032 0.876
#> SRR1700262 5 0.452 0.69168 0.044 0.072 0.012 0.064 0.808
#> SRR1700263 2 0.678 0.57754 0.036 0.576 0.208 0.004 0.176
#> SRR1700264 2 0.479 0.65311 0.012 0.740 0.176 0.000 0.072
#> SRR1700265 3 0.711 -0.13721 0.200 0.372 0.408 0.004 0.016
#> SRR1700266 2 0.487 0.63512 0.004 0.708 0.044 0.008 0.236
#> SRR1700268 5 0.769 0.22824 0.212 0.244 0.016 0.048 0.480
#> SRR1700270 2 0.566 0.66580 0.124 0.712 0.080 0.000 0.084
#> SRR1700267 2 0.523 0.66496 0.008 0.752 0.064 0.124 0.052
#> SRR1700271 2 0.735 0.50427 0.004 0.560 0.116 0.152 0.168
#> SRR1700272 2 0.729 0.34758 0.024 0.492 0.012 0.228 0.244
#> SRR1700273 2 0.602 0.60819 0.028 0.640 0.068 0.012 0.252
#> SRR1700274 5 0.735 0.25172 0.104 0.324 0.016 0.060 0.496
#> SRR1700277 2 0.335 0.68473 0.020 0.872 0.012 0.060 0.036
#> SRR1700275 5 0.483 0.68915 0.040 0.064 0.008 0.108 0.780
#> SRR1700276 1 0.667 0.43580 0.572 0.040 0.008 0.280 0.100
#> SRR1700278 5 0.556 0.61264 0.188 0.040 0.012 0.052 0.708
#> SRR1700279 5 0.595 0.16667 0.420 0.004 0.000 0.092 0.484
#> SRR1700280 1 0.588 0.18529 0.524 0.016 0.016 0.032 0.412
#> SRR1700281 2 0.677 0.52338 0.096 0.548 0.292 0.000 0.064
#> SRR1700283 5 0.524 0.67469 0.036 0.064 0.008 0.152 0.740
#> SRR1700282 1 0.661 0.24737 0.504 0.048 0.004 0.068 0.376
#> SRR1700284 5 0.286 0.71327 0.000 0.008 0.012 0.112 0.868
#> SRR1700285 5 0.398 0.70055 0.064 0.036 0.012 0.048 0.840
#> SRR1700286 5 0.392 0.70207 0.000 0.096 0.020 0.060 0.824
#> SRR1700287 5 0.511 0.67824 0.116 0.044 0.012 0.064 0.764
#> SRR1700290 5 0.725 0.04351 0.396 0.004 0.112 0.060 0.428
#> SRR1700289 5 0.307 0.70355 0.036 0.032 0.036 0.008 0.888
#> SRR1700288 5 0.721 0.26183 0.188 0.280 0.012 0.024 0.496
#> SRR1700292 5 0.322 0.71263 0.044 0.000 0.012 0.080 0.864
#> SRR1700291 5 0.388 0.68325 0.000 0.012 0.024 0.168 0.796
#> SRR1700293 1 0.765 -0.00722 0.344 0.028 0.008 0.312 0.308
#> SRR1700294 5 0.597 0.64865 0.120 0.000 0.068 0.128 0.684
#> SRR1700295 5 0.481 0.60277 0.044 0.000 0.020 0.208 0.728
#> SRR1700297 5 0.441 0.66589 0.052 0.000 0.012 0.168 0.768
#> SRR1700296 5 0.518 0.59381 0.228 0.004 0.004 0.076 0.688
#> SRR1700298 5 0.522 0.70749 0.068 0.008 0.088 0.076 0.760
#> SRR1700299 5 0.396 0.67442 0.016 0.004 0.012 0.180 0.788
#> SRR1700300 5 0.547 0.65854 0.152 0.028 0.024 0.064 0.732
#> SRR1700302 5 0.350 0.69903 0.012 0.000 0.024 0.132 0.832
#> SRR1700301 5 0.307 0.71269 0.016 0.000 0.016 0.104 0.864
#> SRR1700303 5 0.479 0.48641 0.036 0.000 0.004 0.292 0.668
#> SRR1700304 1 0.452 0.64703 0.772 0.004 0.024 0.036 0.164
#> SRR1700305 5 0.468 0.69881 0.080 0.020 0.004 0.120 0.776
#> SRR1700306 5 0.411 0.71249 0.064 0.000 0.028 0.092 0.816
#> SRR1700308 5 0.528 0.63434 0.008 0.164 0.064 0.032 0.732
#> SRR1700307 5 0.453 0.69633 0.016 0.024 0.120 0.044 0.796
#> SRR1700309 5 0.327 0.71499 0.020 0.024 0.064 0.016 0.876
#> SRR1700310 5 0.463 0.70923 0.064 0.000 0.056 0.092 0.788
#> SRR1700311 5 0.620 0.55493 0.060 0.000 0.080 0.228 0.632
#> SRR1700312 5 0.379 0.72022 0.040 0.032 0.028 0.044 0.856
#> SRR1700313 5 0.839 0.38940 0.216 0.068 0.156 0.076 0.484
#> SRR1700314 5 0.412 0.66718 0.008 0.012 0.016 0.184 0.780
#> SRR1700315 5 0.514 0.69649 0.028 0.024 0.132 0.056 0.760
#> SRR1700316 5 0.421 0.70067 0.000 0.028 0.028 0.156 0.788
#> SRR1700317 5 0.395 0.67954 0.036 0.096 0.028 0.008 0.832
#> SRR1700318 5 0.542 0.18814 0.448 0.000 0.024 0.020 0.508
#> SRR1700319 5 0.435 0.61243 0.032 0.000 0.008 0.216 0.744
#> SRR1700320 5 0.380 0.70641 0.020 0.000 0.036 0.120 0.824
#> SRR1700322 5 0.651 0.55645 0.176 0.016 0.016 0.180 0.612
#> SRR1700321 5 0.356 0.72168 0.012 0.040 0.020 0.068 0.860
#> SRR1700323 5 0.451 0.60851 0.016 0.000 0.024 0.232 0.728
#> SRR1700324 5 0.433 0.69747 0.104 0.000 0.020 0.080 0.796
#> SRR1700325 5 0.641 0.56908 0.068 0.176 0.008 0.096 0.652
#> SRR1700326 1 0.645 0.01720 0.468 0.000 0.016 0.116 0.400
#> SRR1700327 5 0.373 0.70998 0.000 0.068 0.048 0.040 0.844
#> SRR1700329 5 0.332 0.71219 0.016 0.020 0.000 0.116 0.848
#> SRR1700328 1 0.707 0.46357 0.568 0.044 0.020 0.120 0.248
#> SRR1700330 1 0.526 0.42178 0.628 0.004 0.004 0.048 0.316
#> SRR1700331 5 0.326 0.71692 0.008 0.000 0.080 0.052 0.860
#> SRR1700332 5 0.307 0.72109 0.020 0.008 0.008 0.092 0.872
#> SRR1700333 5 0.679 0.07758 0.412 0.024 0.008 0.108 0.448
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.488 0.564292 0.012 0.740 0.040 0.000 0.100 0.108
#> SRR1699875 2 0.603 0.443564 0.000 0.568 0.268 0.000 0.064 0.100
#> SRR1699876 5 0.509 0.444593 0.000 0.116 0.004 0.016 0.680 0.184
#> SRR1699877 2 0.643 0.485462 0.032 0.616 0.092 0.000 0.100 0.160
#> SRR1699879 2 0.630 -0.001775 0.004 0.424 0.016 0.012 0.420 0.124
#> SRR1699878 2 0.672 0.339569 0.008 0.544 0.096 0.000 0.196 0.156
#> SRR1699880 2 0.496 0.568215 0.000 0.724 0.060 0.008 0.056 0.152
#> SRR1699881 2 0.588 0.442026 0.000 0.612 0.032 0.008 0.200 0.148
#> SRR1699882 5 0.616 -0.049021 0.004 0.368 0.016 0.000 0.456 0.156
#> SRR1699883 2 0.621 0.328892 0.016 0.568 0.020 0.004 0.248 0.144
#> SRR1699884 2 0.727 0.434578 0.092 0.524 0.168 0.000 0.048 0.168
#> SRR1699885 2 0.479 0.580678 0.012 0.740 0.124 0.004 0.016 0.104
#> SRR1699886 5 0.631 0.300210 0.024 0.100 0.024 0.016 0.592 0.244
#> SRR1699888 6 0.947 0.389670 0.072 0.220 0.148 0.128 0.132 0.300
#> SRR1699889 5 0.399 0.575876 0.004 0.032 0.008 0.012 0.780 0.164
#> SRR1699890 5 0.638 0.386405 0.112 0.072 0.000 0.020 0.596 0.200
#> SRR1699887 5 0.408 0.539240 0.004 0.068 0.008 0.004 0.780 0.136
#> SRR1699891 5 0.474 0.540475 0.024 0.000 0.012 0.048 0.716 0.200
#> SRR1699892 2 0.797 -0.163424 0.020 0.368 0.084 0.020 0.268 0.240
#> SRR1699893 5 0.638 0.107614 0.000 0.008 0.012 0.344 0.436 0.200
#> SRR1699894 5 0.398 0.594832 0.004 0.000 0.004 0.096 0.780 0.116
#> SRR1699895 5 0.460 0.541567 0.000 0.000 0.004 0.144 0.708 0.144
#> SRR1699896 5 0.745 -0.101155 0.024 0.156 0.108 0.004 0.476 0.232
#> SRR1699897 5 0.679 0.056260 0.012 0.144 0.088 0.000 0.532 0.224
#> SRR1699898 4 0.784 0.342947 0.000 0.172 0.072 0.464 0.116 0.176
#> SRR1699900 6 0.849 0.396477 0.064 0.168 0.240 0.000 0.252 0.276
#> SRR1699899 5 0.347 0.554114 0.000 0.032 0.012 0.004 0.816 0.136
#> SRR1699902 3 0.681 0.193016 0.036 0.040 0.564 0.044 0.056 0.260
#> SRR1699901 6 0.875 0.508962 0.096 0.016 0.196 0.120 0.224 0.348
#> SRR1699903 5 0.391 0.546984 0.000 0.004 0.012 0.036 0.772 0.176
#> SRR1699904 5 0.712 0.093476 0.004 0.000 0.080 0.280 0.420 0.216
#> SRR1699905 1 0.829 -0.315494 0.348 0.000 0.128 0.088 0.148 0.288
#> SRR1699906 5 0.458 0.497733 0.000 0.016 0.024 0.028 0.720 0.212
#> SRR1699907 5 0.337 0.591522 0.016 0.000 0.000 0.036 0.824 0.124
#> SRR1699908 5 0.305 0.589339 0.000 0.004 0.004 0.032 0.844 0.116
#> SRR1699909 5 0.652 0.293493 0.000 0.028 0.092 0.068 0.568 0.244
#> SRR1699910 5 0.462 0.547253 0.000 0.000 0.016 0.112 0.724 0.148
#> SRR1699911 5 0.553 0.524392 0.056 0.008 0.056 0.036 0.712 0.132
#> SRR1699912 5 0.417 0.562743 0.000 0.000 0.024 0.064 0.768 0.144
#> SRR1699913 5 0.617 0.153519 0.000 0.000 0.016 0.276 0.488 0.220
#> SRR1699914 5 0.658 0.112296 0.004 0.012 0.136 0.048 0.536 0.264
#> SRR1699915 5 0.512 0.546679 0.000 0.000 0.040 0.108 0.692 0.160
#> SRR1699916 6 0.870 0.397957 0.052 0.012 0.252 0.204 0.208 0.272
#> SRR1699917 4 0.739 0.199397 0.004 0.000 0.188 0.432 0.212 0.164
#> SRR1699918 3 0.815 -0.313751 0.016 0.016 0.300 0.288 0.124 0.256
#> SRR1699919 5 0.258 0.598349 0.000 0.000 0.000 0.040 0.872 0.088
#> SRR1699920 5 0.489 0.459295 0.000 0.004 0.048 0.036 0.692 0.220
#> SRR1699921 5 0.286 0.603173 0.000 0.000 0.012 0.036 0.864 0.088
#> SRR1699922 5 0.567 0.429610 0.084 0.028 0.024 0.004 0.660 0.200
#> SRR1699923 5 0.869 -0.500043 0.216 0.060 0.192 0.008 0.276 0.248
#> SRR1699924 3 0.741 0.121341 0.008 0.044 0.440 0.264 0.032 0.212
#> SRR1699925 1 0.493 0.525094 0.716 0.000 0.016 0.028 0.060 0.180
#> SRR1699926 5 0.310 0.582191 0.004 0.000 0.008 0.020 0.836 0.132
#> SRR1699927 5 0.392 0.592071 0.000 0.000 0.016 0.072 0.788 0.124
#> SRR1699929 5 0.695 0.062047 0.024 0.092 0.084 0.008 0.528 0.264
#> SRR1699928 5 0.364 0.576864 0.004 0.004 0.004 0.048 0.808 0.132
#> SRR1699930 5 0.251 0.612893 0.004 0.000 0.000 0.040 0.884 0.072
#> SRR1699931 5 0.726 -0.048053 0.020 0.164 0.068 0.008 0.476 0.264
#> SRR1699933 3 0.767 -0.359759 0.012 0.068 0.388 0.020 0.224 0.288
#> SRR1699932 5 0.349 0.564065 0.000 0.004 0.000 0.040 0.796 0.160
#> SRR1699934 1 0.537 0.522286 0.704 0.004 0.024 0.044 0.060 0.164
#> SRR1699935 5 0.710 -0.023023 0.008 0.024 0.016 0.260 0.396 0.296
#> SRR1699936 2 0.593 0.460971 0.004 0.640 0.108 0.104 0.000 0.144
#> SRR1699937 2 0.252 0.604883 0.000 0.896 0.048 0.016 0.004 0.036
#> SRR1699938 2 0.226 0.601658 0.000 0.908 0.036 0.004 0.008 0.044
#> SRR1699940 2 0.570 0.561890 0.000 0.656 0.104 0.000 0.116 0.124
#> SRR1699939 2 0.558 0.367716 0.000 0.584 0.020 0.004 0.296 0.096
#> SRR1699941 2 0.557 0.579713 0.012 0.696 0.100 0.008 0.056 0.128
#> SRR1699942 2 0.630 0.244121 0.000 0.492 0.336 0.060 0.000 0.112
#> SRR1699943 2 0.233 0.608187 0.000 0.904 0.048 0.008 0.004 0.036
#> SRR1699944 2 0.361 0.598126 0.000 0.824 0.032 0.000 0.060 0.084
#> SRR1699945 2 0.654 0.480488 0.008 0.588 0.068 0.012 0.136 0.188
#> SRR1699946 2 0.411 0.596714 0.008 0.780 0.112 0.000 0.008 0.092
#> SRR1699947 2 0.482 0.584601 0.004 0.720 0.156 0.000 0.024 0.096
#> SRR1699948 2 0.425 0.516888 0.000 0.672 0.284 0.000 0.000 0.044
#> SRR1699949 2 0.640 0.115131 0.000 0.456 0.000 0.052 0.360 0.132
#> SRR1699950 2 0.512 0.374171 0.000 0.604 0.008 0.000 0.300 0.088
#> SRR1699951 2 0.587 0.461163 0.000 0.660 0.024 0.128 0.052 0.136
#> SRR1699952 2 0.424 0.555534 0.000 0.716 0.236 0.004 0.008 0.036
#> SRR1699953 2 0.350 0.594650 0.000 0.828 0.024 0.000 0.092 0.056
#> SRR1699954 2 0.647 0.323902 0.084 0.456 0.364 0.000 0.000 0.096
#> SRR1699955 2 0.355 0.576304 0.000 0.832 0.032 0.044 0.004 0.088
#> SRR1699956 2 0.631 0.239666 0.004 0.484 0.016 0.008 0.336 0.152
#> SRR1699957 2 0.625 0.381162 0.000 0.552 0.072 0.000 0.256 0.120
#> SRR1699959 2 0.749 0.339647 0.000 0.500 0.104 0.056 0.144 0.196
#> SRR1699958 4 0.496 0.578080 0.000 0.200 0.000 0.668 0.008 0.124
#> SRR1699960 2 0.581 0.442997 0.000 0.644 0.136 0.112 0.000 0.108
#> SRR1699961 2 0.424 0.561113 0.000 0.736 0.196 0.000 0.012 0.056
#> SRR1699962 2 0.688 0.254183 0.004 0.448 0.360 0.040 0.028 0.120
#> SRR1699963 3 0.715 0.201973 0.000 0.232 0.408 0.264 0.000 0.096
#> SRR1699964 2 0.404 0.594793 0.000 0.808 0.072 0.036 0.012 0.072
#> SRR1699965 2 0.450 0.595152 0.004 0.776 0.056 0.004 0.088 0.072
#> SRR1699966 5 0.585 0.208088 0.000 0.336 0.004 0.028 0.536 0.096
#> SRR1699967 2 0.570 0.515687 0.020 0.620 0.244 0.000 0.020 0.096
#> SRR1699968 5 0.626 0.173880 0.000 0.056 0.256 0.004 0.556 0.128
#> SRR1699969 5 0.397 0.575697 0.000 0.092 0.008 0.008 0.792 0.100
#> SRR1699971 2 0.416 0.572952 0.000 0.780 0.112 0.032 0.000 0.076
#> SRR1699970 2 0.538 0.357756 0.012 0.520 0.396 0.000 0.004 0.068
#> SRR1699972 2 0.568 0.260380 0.012 0.476 0.420 0.000 0.008 0.084
#> SRR1699973 4 0.676 0.590615 0.000 0.132 0.060 0.600 0.092 0.116
#> SRR1699974 3 0.837 -0.137527 0.040 0.168 0.344 0.008 0.228 0.212
#> SRR1699975 5 0.391 0.555559 0.000 0.080 0.008 0.008 0.796 0.108
#> SRR1699976 2 0.599 0.465272 0.004 0.584 0.264 0.004 0.040 0.104
#> SRR1699977 3 0.792 0.047807 0.000 0.176 0.424 0.160 0.044 0.196
#> SRR1699978 4 0.744 0.217668 0.104 0.012 0.220 0.464 0.008 0.192
#> SRR1699979 4 0.833 -0.140338 0.000 0.256 0.140 0.348 0.072 0.184
#> SRR1699980 5 0.537 0.414618 0.000 0.008 0.192 0.024 0.664 0.112
#> SRR1699981 5 0.331 0.599896 0.008 0.040 0.000 0.020 0.848 0.084
#> SRR1699982 5 0.417 0.595630 0.000 0.000 0.032 0.104 0.780 0.084
#> SRR1699983 5 0.342 0.603515 0.000 0.000 0.028 0.040 0.832 0.100
#> SRR1699984 1 0.703 0.284844 0.512 0.020 0.204 0.016 0.036 0.212
#> SRR1699985 3 0.771 0.080153 0.000 0.096 0.484 0.080 0.172 0.168
#> SRR1699986 5 0.875 0.057924 0.112 0.028 0.100 0.152 0.376 0.232
#> SRR1699988 5 0.701 0.273233 0.076 0.192 0.012 0.024 0.556 0.140
#> SRR1699987 4 0.735 0.205150 0.000 0.196 0.008 0.456 0.188 0.152
#> SRR1699989 5 0.432 0.507295 0.000 0.068 0.012 0.004 0.748 0.168
#> SRR1699990 5 0.479 0.538422 0.000 0.104 0.004 0.044 0.740 0.108
#> SRR1699992 2 0.751 0.296464 0.076 0.424 0.320 0.004 0.040 0.136
#> SRR1699991 3 0.529 0.497018 0.000 0.068 0.688 0.148 0.000 0.096
#> SRR1699993 5 0.513 0.564279 0.120 0.016 0.004 0.020 0.716 0.124
#> SRR1699994 3 0.542 0.378191 0.012 0.140 0.684 0.000 0.036 0.128
#> SRR1699995 3 0.648 0.391797 0.008 0.000 0.564 0.168 0.068 0.192
#> SRR1699996 1 0.819 -0.124424 0.280 0.256 0.264 0.008 0.016 0.176
#> SRR1699997 4 0.462 0.707435 0.000 0.000 0.060 0.752 0.092 0.096
#> SRR1699998 2 0.715 0.403713 0.020 0.496 0.252 0.008 0.064 0.160
#> SRR1699999 3 0.796 0.072069 0.332 0.016 0.372 0.052 0.064 0.164
#> SRR1700000 3 0.630 -0.155071 0.036 0.400 0.452 0.000 0.012 0.100
#> SRR1700002 2 0.512 0.544830 0.000 0.700 0.156 0.080 0.000 0.064
#> SRR1700001 2 0.802 0.267390 0.024 0.436 0.128 0.024 0.216 0.172
#> SRR1700003 3 0.741 0.194420 0.008 0.172 0.444 0.212 0.000 0.164
#> SRR1700004 5 0.465 0.581073 0.012 0.052 0.016 0.016 0.756 0.148
#> SRR1700005 1 0.546 0.527544 0.684 0.004 0.064 0.064 0.008 0.176
#> SRR1700006 2 0.569 0.391836 0.004 0.548 0.320 0.000 0.012 0.116
#> SRR1700007 5 0.584 0.494919 0.008 0.052 0.000 0.164 0.640 0.136
#> SRR1700008 4 0.626 0.551108 0.000 0.000 0.072 0.572 0.160 0.196
#> SRR1700009 1 0.632 0.460706 0.616 0.004 0.020 0.080 0.088 0.192
#> SRR1700010 2 0.681 0.186555 0.000 0.424 0.056 0.004 0.340 0.176
#> SRR1700011 2 0.644 0.113843 0.000 0.464 0.068 0.368 0.004 0.096
#> SRR1700013 2 0.791 0.112985 0.084 0.416 0.100 0.276 0.000 0.124
#> SRR1700012 3 0.503 0.452908 0.004 0.128 0.712 0.024 0.004 0.128
#> SRR1700014 3 0.469 0.536192 0.000 0.008 0.740 0.140 0.024 0.088
#> SRR1700015 2 0.597 0.086786 0.004 0.444 0.432 0.032 0.000 0.088
#> SRR1700016 3 0.736 0.201405 0.112 0.020 0.480 0.016 0.092 0.280
#> SRR1700018 3 0.505 0.097745 0.000 0.368 0.548 0.000 0.000 0.084
#> SRR1700017 3 0.511 0.501157 0.000 0.088 0.704 0.064 0.000 0.144
#> SRR1700019 5 0.641 0.422127 0.016 0.120 0.016 0.028 0.576 0.244
#> SRR1700020 3 0.667 0.338510 0.000 0.040 0.504 0.212 0.012 0.232
#> SRR1700021 5 0.837 -0.000039 0.088 0.000 0.172 0.124 0.332 0.284
#> SRR1700023 3 0.761 0.137379 0.000 0.188 0.440 0.020 0.192 0.160
#> SRR1700022 3 0.546 0.504940 0.000 0.108 0.680 0.100 0.000 0.112
#> SRR1700024 3 0.508 0.486804 0.000 0.000 0.676 0.180 0.020 0.124
#> SRR1700025 3 0.568 -0.075415 0.008 0.420 0.480 0.004 0.008 0.080
#> SRR1700026 3 0.434 0.506086 0.012 0.124 0.776 0.028 0.000 0.060
#> SRR1700027 3 0.376 0.560678 0.004 0.048 0.820 0.040 0.000 0.088
#> SRR1700028 4 0.678 0.505060 0.012 0.008 0.120 0.544 0.076 0.240
#> SRR1700029 3 0.596 0.246606 0.008 0.012 0.492 0.364 0.000 0.124
#> SRR1700030 5 0.580 0.266772 0.000 0.016 0.224 0.000 0.568 0.192
#> SRR1700031 3 0.329 0.566037 0.000 0.052 0.848 0.036 0.000 0.064
#> SRR1700032 3 0.619 0.245471 0.004 0.256 0.556 0.000 0.044 0.140
#> SRR1700034 3 0.390 0.541081 0.048 0.020 0.804 0.004 0.004 0.120
#> SRR1700035 5 0.618 0.403394 0.000 0.000 0.164 0.092 0.596 0.148
#> SRR1700033 3 0.404 0.562416 0.000 0.056 0.808 0.068 0.008 0.060
#> SRR1700036 3 0.561 0.118392 0.000 0.000 0.532 0.004 0.316 0.148
#> SRR1700037 5 0.550 0.541453 0.004 0.000 0.084 0.088 0.680 0.144
#> SRR1700038 3 0.619 0.358122 0.088 0.136 0.640 0.004 0.016 0.116
#> SRR1700039 3 0.721 0.257315 0.012 0.004 0.468 0.084 0.172 0.260
#> SRR1700040 3 0.368 0.542203 0.000 0.084 0.816 0.024 0.000 0.076
#> SRR1700041 3 0.531 0.521634 0.004 0.088 0.732 0.032 0.060 0.084
#> SRR1700042 3 0.266 0.566770 0.000 0.016 0.888 0.052 0.004 0.040
#> SRR1700043 3 0.551 0.448597 0.028 0.060 0.712 0.004 0.088 0.108
#> SRR1700045 3 0.842 -0.362408 0.004 0.048 0.320 0.172 0.216 0.240
#> SRR1700044 3 0.456 0.515477 0.076 0.036 0.780 0.020 0.004 0.084
#> SRR1700046 3 0.384 0.544139 0.004 0.012 0.796 0.128 0.000 0.060
#> SRR1700047 5 0.683 0.044817 0.020 0.016 0.352 0.020 0.452 0.140
#> SRR1700048 3 0.616 0.423299 0.016 0.000 0.624 0.172 0.076 0.112
#> SRR1700049 5 0.675 0.020169 0.000 0.004 0.336 0.044 0.420 0.196
#> SRR1700050 3 0.564 0.366777 0.000 0.000 0.576 0.288 0.024 0.112
#> SRR1700051 3 0.510 0.485772 0.004 0.000 0.684 0.180 0.020 0.112
#> SRR1700052 3 0.387 0.536993 0.028 0.004 0.820 0.024 0.024 0.100
#> SRR1700053 3 0.590 0.255813 0.004 0.000 0.604 0.040 0.216 0.136
#> SRR1700054 3 0.381 0.563393 0.004 0.020 0.816 0.096 0.004 0.060
#> SRR1700055 3 0.379 0.557599 0.028 0.000 0.800 0.044 0.000 0.128
#> SRR1700056 4 0.679 0.320903 0.000 0.000 0.244 0.496 0.104 0.156
#> SRR1700057 4 0.759 -0.127430 0.000 0.000 0.284 0.288 0.272 0.156
#> SRR1700058 3 0.404 0.560955 0.004 0.048 0.816 0.064 0.012 0.056
#> SRR1700059 4 0.695 0.385432 0.000 0.000 0.180 0.496 0.164 0.160
#> SRR1700060 3 0.447 0.532648 0.000 0.000 0.748 0.128 0.024 0.100
#> SRR1700061 3 0.403 0.555188 0.016 0.028 0.820 0.024 0.024 0.088
#> SRR1700062 4 0.666 0.328787 0.000 0.008 0.280 0.500 0.056 0.156
#> SRR1700063 3 0.477 0.535026 0.000 0.024 0.748 0.108 0.020 0.100
#> SRR1700064 3 0.690 -0.056645 0.000 0.000 0.384 0.088 0.376 0.152
#> SRR1700065 3 0.403 0.546179 0.008 0.008 0.780 0.140 0.000 0.064
#> SRR1700066 3 0.455 0.514370 0.024 0.048 0.788 0.008 0.048 0.084
#> SRR1700067 4 0.661 0.437962 0.000 0.000 0.236 0.524 0.100 0.140
#> SRR1700068 3 0.607 0.321921 0.000 0.000 0.528 0.312 0.044 0.116
#> SRR1700069 5 0.583 0.255080 0.000 0.000 0.284 0.028 0.560 0.128
#> SRR1700070 3 0.412 0.510660 0.004 0.088 0.792 0.000 0.032 0.084
#> SRR1700071 3 0.353 0.556992 0.000 0.004 0.836 0.048 0.036 0.076
#> SRR1700072 3 0.358 0.544542 0.020 0.004 0.844 0.020 0.044 0.068
#> SRR1700073 3 0.781 0.197330 0.100 0.000 0.424 0.276 0.068 0.132
#> SRR1700075 3 0.462 0.540709 0.028 0.020 0.788 0.028 0.052 0.084
#> SRR1700074 3 0.499 0.516104 0.004 0.084 0.736 0.048 0.008 0.120
#> SRR1700076 3 0.415 0.566220 0.004 0.020 0.800 0.060 0.016 0.100
#> SRR1700077 3 0.240 0.545618 0.008 0.040 0.908 0.004 0.012 0.028
#> SRR1700078 5 0.743 0.069004 0.024 0.024 0.244 0.024 0.416 0.268
#> SRR1700080 5 0.578 0.180418 0.004 0.000 0.316 0.012 0.540 0.128
#> SRR1700079 3 0.796 0.087753 0.000 0.044 0.360 0.248 0.100 0.248
#> SRR1700081 3 0.610 0.380671 0.000 0.020 0.572 0.240 0.016 0.152
#> SRR1700082 3 0.610 0.416560 0.004 0.208 0.600 0.120 0.000 0.068
#> SRR1700083 3 0.436 0.529690 0.004 0.000 0.740 0.156 0.004 0.096
#> SRR1700084 3 0.389 0.520150 0.044 0.056 0.820 0.000 0.012 0.068
#> SRR1700085 5 0.605 0.350441 0.000 0.000 0.212 0.048 0.580 0.160
#> SRR1700086 3 0.619 0.099556 0.008 0.004 0.496 0.008 0.320 0.164
#> SRR1700087 4 0.617 0.361676 0.008 0.296 0.024 0.528 0.000 0.144
#> SRR1700088 2 0.664 0.338853 0.000 0.544 0.152 0.160 0.000 0.144
#> SRR1700089 4 0.595 0.296655 0.004 0.352 0.016 0.500 0.000 0.128
#> SRR1700091 4 0.570 0.507603 0.004 0.228 0.020 0.604 0.000 0.144
#> SRR1700090 4 0.285 0.723304 0.004 0.008 0.012 0.876 0.020 0.080
#> SRR1700092 4 0.535 0.617204 0.000 0.116 0.052 0.688 0.004 0.140
#> SRR1700094 4 0.539 0.539598 0.008 0.208 0.008 0.648 0.004 0.124
#> SRR1700093 4 0.461 0.663792 0.008 0.100 0.016 0.752 0.004 0.120
#> SRR1700095 4 0.598 0.529795 0.028 0.172 0.012 0.604 0.000 0.184
#> SRR1700096 4 0.562 0.608512 0.000 0.120 0.068 0.680 0.012 0.120
#> SRR1700097 4 0.513 0.654786 0.012 0.072 0.024 0.724 0.016 0.152
#> SRR1700098 4 0.585 0.420765 0.008 0.288 0.000 0.548 0.008 0.148
#> SRR1700099 4 0.453 0.632227 0.000 0.152 0.004 0.732 0.008 0.104
#> SRR1700100 4 0.495 0.643568 0.000 0.100 0.052 0.728 0.004 0.116
#> SRR1700101 4 0.481 0.606440 0.008 0.156 0.012 0.716 0.000 0.108
#> SRR1700102 4 0.631 0.589488 0.004 0.148 0.024 0.608 0.040 0.176
#> SRR1700104 4 0.455 0.602146 0.000 0.180 0.000 0.708 0.004 0.108
#> SRR1700103 4 0.642 0.588136 0.004 0.140 0.008 0.592 0.076 0.180
#> SRR1700105 4 0.540 0.679362 0.020 0.040 0.004 0.704 0.084 0.148
#> SRR1700106 4 0.439 0.707064 0.016 0.008 0.012 0.772 0.052 0.140
#> SRR1700107 4 0.346 0.677042 0.000 0.100 0.000 0.816 0.004 0.080
#> SRR1700108 4 0.405 0.687852 0.012 0.064 0.008 0.800 0.008 0.108
#> SRR1700109 4 0.349 0.694258 0.000 0.032 0.040 0.828 0.000 0.100
#> SRR1700110 4 0.447 0.658040 0.004 0.104 0.008 0.756 0.008 0.120
#> SRR1700112 4 0.274 0.722232 0.004 0.008 0.024 0.888 0.016 0.060
#> SRR1700111 4 0.393 0.714502 0.000 0.000 0.064 0.800 0.036 0.100
#> SRR1700113 4 0.599 0.516661 0.000 0.052 0.000 0.580 0.244 0.124
#> SRR1700114 4 0.492 0.695193 0.016 0.024 0.040 0.748 0.028 0.144
#> SRR1700115 4 0.254 0.712604 0.000 0.024 0.000 0.880 0.008 0.088
#> SRR1700116 4 0.275 0.729096 0.000 0.000 0.004 0.868 0.048 0.080
#> SRR1700117 4 0.488 0.670764 0.040 0.000 0.096 0.740 0.012 0.112
#> SRR1700119 4 0.570 0.600826 0.004 0.060 0.000 0.644 0.192 0.100
#> SRR1700118 4 0.336 0.690493 0.000 0.008 0.068 0.836 0.004 0.084
#> SRR1700120 4 0.529 0.668042 0.028 0.080 0.004 0.708 0.024 0.156
#> SRR1700121 4 0.444 0.708839 0.008 0.060 0.000 0.776 0.056 0.100
#> SRR1700122 4 0.319 0.724435 0.016 0.000 0.012 0.860 0.056 0.056
#> SRR1700123 4 0.256 0.724410 0.000 0.000 0.012 0.884 0.028 0.076
#> SRR1700125 4 0.414 0.678843 0.004 0.000 0.004 0.756 0.164 0.072
#> SRR1700126 4 0.341 0.696384 0.008 0.008 0.068 0.836 0.000 0.080
#> SRR1700127 4 0.356 0.710986 0.000 0.000 0.076 0.828 0.032 0.064
#> SRR1700124 4 0.414 0.705800 0.000 0.000 0.068 0.788 0.048 0.096
#> SRR1700128 4 0.523 0.624047 0.000 0.000 0.032 0.672 0.176 0.120
#> SRR1700129 4 0.265 0.722453 0.000 0.000 0.016 0.884 0.044 0.056
#> SRR1700130 4 0.273 0.720102 0.004 0.004 0.012 0.884 0.028 0.068
#> SRR1700132 4 0.535 0.502843 0.004 0.000 0.000 0.596 0.256 0.144
#> SRR1700131 4 0.478 0.671616 0.000 0.016 0.004 0.716 0.160 0.104
#> SRR1700133 4 0.415 0.696674 0.000 0.000 0.012 0.764 0.136 0.088
#> SRR1700134 4 0.446 0.678513 0.000 0.000 0.020 0.744 0.140 0.096
#> SRR1700135 4 0.623 0.522983 0.004 0.000 0.076 0.588 0.208 0.124
#> SRR1700136 4 0.339 0.720898 0.000 0.012 0.004 0.836 0.060 0.088
#> SRR1700137 4 0.542 0.545869 0.000 0.000 0.032 0.620 0.260 0.088
#> SRR1700138 4 0.576 0.225899 0.000 0.000 0.012 0.476 0.388 0.124
#> SRR1700140 4 0.560 0.570559 0.000 0.000 0.036 0.620 0.228 0.116
#> SRR1700139 4 0.411 0.679228 0.004 0.000 0.004 0.764 0.144 0.084
#> SRR1700141 4 0.318 0.725462 0.000 0.012 0.004 0.852 0.076 0.056
#> SRR1700142 4 0.641 0.115911 0.000 0.000 0.372 0.444 0.052 0.132
#> SRR1700143 4 0.363 0.727460 0.000 0.004 0.020 0.824 0.068 0.084
#> SRR1700144 3 0.618 0.365332 0.000 0.000 0.588 0.200 0.092 0.120
#> SRR1700145 4 0.384 0.715410 0.000 0.000 0.052 0.808 0.044 0.096
#> SRR1700146 4 0.310 0.718370 0.000 0.000 0.032 0.860 0.056 0.052
#> SRR1700147 4 0.420 0.698560 0.000 0.000 0.016 0.760 0.148 0.076
#> SRR1700149 4 0.292 0.717575 0.000 0.000 0.012 0.864 0.052 0.072
#> SRR1700148 4 0.540 0.634663 0.004 0.000 0.080 0.692 0.096 0.128
#> SRR1700150 4 0.427 0.683589 0.000 0.004 0.012 0.764 0.124 0.096
#> SRR1700152 4 0.524 0.595661 0.016 0.000 0.008 0.668 0.196 0.112
#> SRR1700151 4 0.498 0.664280 0.000 0.000 0.040 0.708 0.144 0.108
#> SRR1700153 4 0.400 0.708574 0.000 0.004 0.012 0.788 0.112 0.084
#> SRR1700154 4 0.330 0.722083 0.004 0.000 0.012 0.844 0.068 0.072
#> SRR1700155 4 0.396 0.712313 0.008 0.000 0.004 0.788 0.096 0.104
#> SRR1700156 4 0.321 0.724951 0.000 0.004 0.024 0.856 0.060 0.056
#> SRR1700158 4 0.352 0.720882 0.012 0.004 0.004 0.832 0.056 0.092
#> SRR1700159 4 0.519 0.603319 0.016 0.004 0.004 0.668 0.216 0.092
#> SRR1700157 4 0.445 0.686248 0.000 0.000 0.108 0.760 0.040 0.092
#> SRR1700160 4 0.400 0.723302 0.008 0.016 0.004 0.804 0.072 0.096
#> SRR1700161 4 0.433 0.666894 0.000 0.000 0.008 0.740 0.156 0.096
#> SRR1700162 4 0.488 0.601953 0.004 0.000 0.008 0.676 0.224 0.088
#> SRR1700164 4 0.470 0.626068 0.184 0.008 0.012 0.728 0.008 0.060
#> SRR1700163 4 0.500 0.696895 0.040 0.000 0.040 0.744 0.060 0.116
#> SRR1700165 4 0.346 0.699700 0.004 0.028 0.040 0.836 0.000 0.092
#> SRR1700166 4 0.288 0.722895 0.016 0.012 0.004 0.884 0.040 0.044
#> SRR1700168 4 0.278 0.724486 0.004 0.000 0.008 0.872 0.032 0.084
#> SRR1700167 4 0.542 0.666865 0.004 0.000 0.060 0.684 0.116 0.136
#> SRR1700170 4 0.448 0.716837 0.008 0.004 0.040 0.776 0.064 0.108
#> SRR1700169 4 0.362 0.691333 0.000 0.004 0.084 0.816 0.008 0.088
#> SRR1700171 4 0.606 0.572648 0.128 0.036 0.008 0.632 0.016 0.180
#> SRR1700172 4 0.587 0.203498 0.000 0.028 0.000 0.472 0.400 0.100
#> SRR1700174 4 0.386 0.714519 0.000 0.028 0.004 0.808 0.056 0.104
#> SRR1700173 4 0.159 0.718979 0.000 0.008 0.000 0.936 0.008 0.048
#> SRR1700175 4 0.289 0.726090 0.000 0.000 0.024 0.868 0.032 0.076
#> SRR1700176 4 0.378 0.689961 0.000 0.048 0.032 0.820 0.008 0.092
#> SRR1700178 2 0.341 0.595055 0.016 0.848 0.036 0.024 0.000 0.076
#> SRR1700177 4 0.414 0.672227 0.000 0.000 0.008 0.752 0.168 0.072
#> SRR1700180 2 0.262 0.608857 0.028 0.900 0.016 0.016 0.004 0.036
#> SRR1700179 2 0.255 0.599099 0.008 0.892 0.008 0.016 0.004 0.072
#> SRR1700181 2 0.333 0.589073 0.048 0.856 0.004 0.040 0.004 0.048
#> SRR1700183 1 0.203 0.655299 0.916 0.004 0.008 0.012 0.000 0.060
#> SRR1700182 2 0.215 0.609600 0.016 0.920 0.004 0.012 0.008 0.040
#> SRR1700184 2 0.299 0.615399 0.016 0.868 0.020 0.000 0.016 0.080
#> SRR1700186 2 0.324 0.589265 0.004 0.856 0.048 0.032 0.000 0.060
#> SRR1700187 1 0.137 0.656295 0.952 0.004 0.000 0.008 0.008 0.028
#> SRR1700185 1 0.242 0.640009 0.888 0.008 0.004 0.012 0.000 0.088
#> SRR1700188 2 0.253 0.607154 0.012 0.892 0.064 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700192 1 0.428 0.623221 0.792 0.092 0.020 0.016 0.004 0.076
#> SRR1700190 2 0.555 0.608491 0.056 0.708 0.080 0.008 0.024 0.124
#> SRR1700191 1 0.174 0.653949 0.936 0.004 0.008 0.008 0.004 0.040
#> SRR1700189 1 0.163 0.652333 0.940 0.000 0.004 0.012 0.008 0.036
#> SRR1700193 2 0.658 0.413442 0.288 0.540 0.044 0.012 0.016 0.100
#> SRR1700195 2 0.583 0.320135 0.344 0.536 0.036 0.000 0.004 0.080
#> SRR1700194 1 0.173 0.651211 0.932 0.000 0.012 0.012 0.000 0.044
#> SRR1700196 2 0.434 0.610085 0.060 0.792 0.056 0.000 0.016 0.076
#> SRR1700197 1 0.575 0.540115 0.672 0.136 0.072 0.016 0.000 0.104
#> SRR1700198 2 0.349 0.613694 0.060 0.840 0.036 0.000 0.004 0.060
#> SRR1700199 2 0.647 0.448848 0.256 0.536 0.136 0.004 0.000 0.068
#> SRR1700200 2 0.562 0.378382 0.308 0.588 0.008 0.008 0.016 0.072
#> SRR1700201 2 0.297 0.608069 0.012 0.880 0.016 0.020 0.012 0.060
#> SRR1700202 1 0.233 0.654029 0.904 0.004 0.008 0.044 0.000 0.040
#> SRR1700203 2 0.745 0.117109 0.332 0.420 0.016 0.104 0.012 0.116
#> SRR1700204 1 0.660 -0.071202 0.416 0.412 0.048 0.016 0.000 0.108
#> SRR1700206 2 0.589 0.554980 0.172 0.628 0.108 0.000 0.000 0.092
#> SRR1700207 2 0.531 0.577151 0.112 0.724 0.048 0.044 0.000 0.072
#> SRR1700208 2 0.599 0.501414 0.196 0.620 0.000 0.028 0.024 0.132
#> SRR1700205 1 0.324 0.653299 0.864 0.036 0.008 0.036 0.004 0.052
#> SRR1700209 2 0.803 -0.087957 0.064 0.344 0.064 0.004 0.292 0.232
#> SRR1700210 1 0.626 0.452380 0.612 0.180 0.020 0.004 0.044 0.140
#> SRR1700211 1 0.408 0.627596 0.808 0.064 0.012 0.028 0.004 0.084
#> SRR1700212 1 0.671 0.218227 0.480 0.332 0.004 0.012 0.052 0.120
#> SRR1700213 2 0.836 0.230950 0.192 0.392 0.088 0.004 0.120 0.204
#> SRR1700214 2 0.629 0.310267 0.324 0.508 0.048 0.000 0.004 0.116
#> SRR1700215 1 0.234 0.654904 0.908 0.012 0.004 0.024 0.004 0.048
#> SRR1700217 1 0.724 0.271836 0.488 0.168 0.012 0.000 0.152 0.180
#> SRR1700216 1 0.258 0.638504 0.880 0.000 0.012 0.008 0.008 0.092
#> SRR1700218 2 0.663 0.440670 0.028 0.568 0.040 0.004 0.196 0.164
#> SRR1700219 2 0.586 0.548989 0.088 0.672 0.012 0.008 0.080 0.140
#> SRR1700222 1 0.177 0.655513 0.936 0.008 0.012 0.004 0.004 0.036
#> SRR1700220 5 0.707 0.320907 0.020 0.128 0.000 0.196 0.524 0.132
#> SRR1700221 1 0.695 -0.051541 0.408 0.392 0.004 0.024 0.044 0.128
#> SRR1700223 2 0.695 0.534760 0.128 0.600 0.080 0.020 0.040 0.132
#> SRR1700224 1 0.795 -0.076460 0.332 0.236 0.016 0.000 0.224 0.192
#> SRR1700226 2 0.724 0.486607 0.116 0.556 0.084 0.000 0.116 0.128
#> SRR1700229 2 0.834 0.000369 0.112 0.320 0.080 0.000 0.280 0.208
#> SRR1700225 2 0.762 0.196945 0.024 0.432 0.272 0.088 0.008 0.176
#> SRR1700227 2 0.475 0.599880 0.024 0.772 0.064 0.060 0.004 0.076
#> SRR1700230 1 0.352 0.643958 0.840 0.024 0.012 0.028 0.004 0.092
#> SRR1700231 2 0.560 0.580318 0.120 0.704 0.012 0.040 0.024 0.100
#> SRR1700228 1 0.767 0.080134 0.404 0.312 0.092 0.012 0.020 0.160
#> SRR1700232 2 0.746 0.454780 0.092 0.540 0.060 0.016 0.104 0.188
#> SRR1700233 1 0.700 0.375742 0.532 0.224 0.076 0.024 0.004 0.140
#> SRR1700234 1 0.700 0.339959 0.508 0.284 0.052 0.032 0.008 0.116
#> SRR1700235 2 0.612 0.502482 0.008 0.660 0.024 0.088 0.088 0.132
#> SRR1700237 2 0.439 0.599795 0.064 0.784 0.004 0.004 0.056 0.088
#> SRR1700236 2 0.687 0.403414 0.044 0.564 0.048 0.004 0.172 0.168
#> SRR1700238 2 0.727 0.232966 0.332 0.428 0.080 0.004 0.020 0.136
#> SRR1700239 1 0.242 0.656074 0.904 0.020 0.016 0.012 0.000 0.048
#> SRR1700240 1 0.243 0.639356 0.892 0.004 0.000 0.028 0.004 0.072
#> SRR1700241 1 0.701 0.329883 0.528 0.080 0.000 0.248 0.048 0.096
#> SRR1700243 2 0.512 0.592801 0.104 0.736 0.024 0.012 0.020 0.104
#> SRR1700244 2 0.788 0.122684 0.236 0.352 0.004 0.012 0.248 0.148
#> SRR1700242 1 0.184 0.657999 0.932 0.012 0.004 0.020 0.000 0.032
#> SRR1700246 1 0.173 0.653203 0.936 0.012 0.004 0.004 0.004 0.040
#> SRR1700245 2 0.510 0.600594 0.040 0.756 0.048 0.012 0.056 0.088
#> SRR1700247 1 0.185 0.656653 0.932 0.008 0.008 0.020 0.000 0.032
#> SRR1700249 1 0.255 0.655109 0.896 0.008 0.012 0.040 0.000 0.044
#> SRR1700250 2 0.247 0.606472 0.004 0.888 0.000 0.000 0.060 0.048
#> SRR1700248 2 0.537 0.494180 0.052 0.700 0.008 0.144 0.004 0.092
#> SRR1700251 2 0.760 0.245377 0.152 0.460 0.044 0.236 0.000 0.108
#> SRR1700252 2 0.695 0.171646 0.368 0.428 0.044 0.016 0.008 0.136
#> SRR1700253 2 0.741 0.472039 0.100 0.548 0.068 0.144 0.008 0.132
#> SRR1700256 2 0.733 0.367870 0.172 0.492 0.020 0.000 0.164 0.152
#> SRR1700254 1 0.148 0.657164 0.944 0.008 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1700255 1 0.632 0.328756 0.536 0.304 0.028 0.028 0.000 0.104
#> SRR1700257 2 0.606 0.528179 0.220 0.628 0.016 0.016 0.036 0.084
#> SRR1700258 2 0.456 0.591565 0.048 0.780 0.004 0.028 0.036 0.104
#> SRR1700259 2 0.561 0.470904 0.000 0.648 0.012 0.024 0.144 0.172
#> SRR1700260 5 0.549 0.495494 0.004 0.136 0.000 0.044 0.668 0.148
#> SRR1700261 5 0.285 0.606890 0.004 0.052 0.000 0.008 0.872 0.064
#> SRR1700262 5 0.459 0.586686 0.020 0.052 0.000 0.032 0.760 0.136
#> SRR1700263 2 0.795 0.291722 0.036 0.404 0.180 0.000 0.176 0.204
#> SRR1700264 2 0.559 0.571942 0.016 0.660 0.172 0.000 0.028 0.124
#> SRR1700265 3 0.800 0.095213 0.136 0.248 0.400 0.000 0.052 0.164
#> SRR1700266 2 0.586 0.433825 0.004 0.596 0.024 0.004 0.244 0.128
#> SRR1700268 5 0.829 0.060806 0.184 0.184 0.012 0.032 0.372 0.216
#> SRR1700270 2 0.586 0.579203 0.096 0.680 0.104 0.000 0.036 0.084
#> SRR1700267 2 0.608 0.544754 0.004 0.656 0.072 0.108 0.024 0.136
#> SRR1700271 2 0.773 0.358081 0.004 0.492 0.148 0.060 0.124 0.172
#> SRR1700272 2 0.760 0.209927 0.040 0.460 0.000 0.104 0.208 0.188
#> SRR1700273 2 0.574 0.496159 0.008 0.636 0.044 0.000 0.204 0.108
#> SRR1700274 5 0.711 0.161539 0.092 0.300 0.004 0.016 0.472 0.116
#> SRR1700277 2 0.579 0.588914 0.048 0.684 0.040 0.032 0.024 0.172
#> SRR1700275 5 0.569 0.552882 0.020 0.084 0.000 0.092 0.684 0.120
#> SRR1700276 1 0.687 0.299318 0.512 0.024 0.000 0.272 0.072 0.120
#> SRR1700278 5 0.589 0.430764 0.232 0.032 0.000 0.020 0.616 0.100
#> SRR1700279 5 0.600 0.237035 0.376 0.000 0.000 0.044 0.488 0.092
#> SRR1700280 5 0.549 0.148264 0.428 0.012 0.000 0.000 0.472 0.088
#> SRR1700281 2 0.759 0.295915 0.088 0.392 0.340 0.004 0.032 0.144
#> SRR1700283 5 0.609 0.519756 0.028 0.068 0.000 0.156 0.644 0.104
#> SRR1700282 1 0.706 0.153987 0.464 0.048 0.000 0.040 0.312 0.136
#> SRR1700284 5 0.253 0.611735 0.000 0.000 0.004 0.056 0.884 0.056
#> SRR1700285 5 0.478 0.593442 0.068 0.036 0.000 0.032 0.760 0.104
#> SRR1700286 5 0.485 0.531226 0.000 0.132 0.004 0.016 0.712 0.136
#> SRR1700287 5 0.444 0.600530 0.064 0.028 0.000 0.016 0.772 0.120
#> SRR1700290 5 0.803 0.061686 0.284 0.008 0.084 0.044 0.368 0.212
#> SRR1700289 5 0.298 0.601755 0.028 0.020 0.000 0.004 0.864 0.084
#> SRR1700288 5 0.744 -0.058157 0.160 0.300 0.000 0.012 0.404 0.124
#> SRR1700292 5 0.336 0.616172 0.032 0.008 0.004 0.044 0.856 0.056
#> SRR1700291 5 0.535 0.548109 0.008 0.012 0.012 0.136 0.684 0.148
#> SRR1700293 1 0.809 -0.201400 0.304 0.028 0.000 0.280 0.224 0.164
#> SRR1700294 5 0.554 0.577391 0.096 0.000 0.016 0.108 0.696 0.084
#> SRR1700295 5 0.543 0.554460 0.048 0.004 0.004 0.124 0.688 0.132
#> SRR1700297 5 0.485 0.569031 0.024 0.000 0.004 0.120 0.720 0.132
#> SRR1700296 5 0.429 0.562667 0.184 0.000 0.000 0.016 0.740 0.060
#> SRR1700298 5 0.511 0.601682 0.076 0.000 0.032 0.056 0.740 0.096
#> SRR1700299 5 0.501 0.538082 0.016 0.004 0.000 0.184 0.688 0.108
#> SRR1700300 5 0.692 0.469509 0.144 0.036 0.016 0.064 0.588 0.152
#> SRR1700302 5 0.367 0.609410 0.004 0.000 0.012 0.084 0.816 0.084
#> SRR1700301 5 0.367 0.609876 0.012 0.000 0.008 0.088 0.820 0.072
#> SRR1700303 5 0.546 0.399327 0.012 0.004 0.004 0.284 0.604 0.092
#> SRR1700304 1 0.364 0.583603 0.816 0.000 0.008 0.008 0.108 0.060
#> SRR1700305 5 0.492 0.589826 0.088 0.012 0.000 0.064 0.744 0.092
#> SRR1700306 5 0.417 0.603404 0.032 0.000 0.004 0.052 0.780 0.132
#> SRR1700308 5 0.653 0.387717 0.008 0.148 0.032 0.044 0.604 0.164
#> SRR1700307 5 0.474 0.563911 0.028 0.016 0.036 0.024 0.764 0.132
#> SRR1700309 5 0.295 0.608609 0.008 0.004 0.004 0.028 0.864 0.092
#> SRR1700310 5 0.423 0.612947 0.048 0.000 0.012 0.064 0.796 0.080
#> SRR1700311 5 0.549 0.496624 0.016 0.000 0.028 0.204 0.660 0.092
#> SRR1700312 5 0.453 0.604584 0.080 0.040 0.000 0.040 0.784 0.056
#> SRR1700313 5 0.928 -0.340008 0.228 0.068 0.144 0.076 0.308 0.176
#> SRR1700314 5 0.469 0.556529 0.004 0.004 0.008 0.160 0.724 0.100
#> SRR1700315 5 0.494 0.594188 0.024 0.016 0.044 0.028 0.748 0.140
#> SRR1700316 5 0.547 0.448049 0.000 0.020 0.004 0.164 0.644 0.168
#> SRR1700317 5 0.388 0.566876 0.008 0.096 0.000 0.008 0.800 0.088
#> SRR1700318 5 0.556 0.335850 0.340 0.000 0.004 0.016 0.552 0.088
#> SRR1700319 5 0.398 0.592346 0.004 0.000 0.008 0.124 0.784 0.080
#> SRR1700320 5 0.371 0.607794 0.016 0.000 0.008 0.084 0.820 0.072
#> SRR1700322 5 0.691 0.383692 0.108 0.024 0.000 0.216 0.540 0.112
#> SRR1700321 5 0.400 0.603718 0.008 0.052 0.000 0.044 0.808 0.088
#> SRR1700323 5 0.575 0.520741 0.012 0.004 0.028 0.132 0.648 0.176
#> SRR1700324 5 0.445 0.609602 0.084 0.004 0.004 0.056 0.780 0.072
#> SRR1700325 5 0.673 0.404337 0.040 0.184 0.000 0.064 0.576 0.136
#> SRR1700326 5 0.652 0.116723 0.400 0.000 0.000 0.068 0.412 0.120
#> SRR1700327 5 0.264 0.609618 0.000 0.024 0.000 0.012 0.876 0.088
#> SRR1700329 5 0.378 0.617608 0.016 0.012 0.004 0.084 0.824 0.060
#> SRR1700328 1 0.689 0.372021 0.580 0.044 0.008 0.072 0.192 0.104
#> SRR1700330 1 0.517 0.355250 0.636 0.000 0.000 0.032 0.268 0.064
#> SRR1700331 5 0.287 0.610341 0.004 0.004 0.008 0.032 0.872 0.080
#> SRR1700332 5 0.297 0.617564 0.012 0.004 0.000 0.080 0.864 0.040
#> SRR1700333 1 0.728 -0.063671 0.384 0.028 0.000 0.092 0.380 0.116
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.979 0.990 0.0715 0.924 0.924
#> 3 3 0.921 0.937 0.949 1.0232 0.978 0.977
#> 4 4 0.211 0.464 0.800 1.1981 0.979 0.977
#> 5 5 0.191 0.442 0.775 0.0870 0.975 0.972
#> 6 6 0.156 0.403 0.736 0.1356 0.924 0.912
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699881 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699900 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699901 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699905 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1699906 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699915 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699924 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.834 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.834 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699971 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699978 2 0.0938 0.982 0.012 0.988
#> SRR1699979 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.9686 0.555 0.604 0.396
#> SRR1699985 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699993 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699994 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699995 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1699996 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1699999 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1700000 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700003 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.5294 0.813 0.880 0.120
#> SRR1700006 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.9427 0.609 0.640 0.360
#> SRR1700010 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700016 2 0.9087 0.380 0.324 0.676
#> SRR1700018 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700021 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700027 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700028 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700034 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700039 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700040 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700041 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700042 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700043 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700045 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700044 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700047 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700048 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700049 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700050 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700051 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700052 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700053 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700055 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1700056 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700057 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700058 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700059 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700060 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700061 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700062 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700063 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700064 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700065 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700066 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700069 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700072 2 0.0938 0.982 0.012 0.988
#> SRR1700073 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700074 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700076 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700078 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700081 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700082 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700083 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700084 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700087 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700096 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700097 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700105 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700119 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700127 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700124 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700128 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700133 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700136 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700137 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700143 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700144 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700145 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700149 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700148 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700153 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700154 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700160 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700163 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700165 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700166 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700170 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700171 2 0.0672 0.987 0.008 0.992
#> SRR1700172 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0672 0.836 0.992 0.008
#> SRR1700182 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.9833 0.501 0.576 0.424
#> SRR1700185 1 0.0672 0.836 0.992 0.008
#> SRR1700188 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700192 2 0.8144 0.575 0.252 0.748
#> SRR1700190 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.834 1.000 0.000
#> SRR1700189 2 0.9963 -0.176 0.464 0.536
#> SRR1700193 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0376 0.835 0.996 0.004
#> SRR1700196 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700197 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.0938 0.982 0.012 0.988
#> SRR1700203 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.0672 0.986 0.008 0.992
#> SRR1700209 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.834 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0938 0.837 0.988 0.012
#> SRR1700218 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.9732 0.544 0.596 0.404
#> SRR1700220 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700230 2 0.8081 0.585 0.248 0.752
#> SRR1700231 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.9815 0.511 0.580 0.420
#> SRR1700240 1 0.1843 0.836 0.972 0.028
#> SRR1700241 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700242 2 0.7602 0.648 0.220 0.780
#> SRR1700246 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.9795 0.520 0.584 0.416
#> SRR1700249 1 0.4562 0.824 0.904 0.096
#> SRR1700250 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.4690 0.822 0.900 0.100
#> SRR1700255 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1700289 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.2603 0.942 0.044 0.956
#> SRR1700327 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700330 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.996 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.1031 0.967360 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699875 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699876 2 0.1529 0.966329 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699877 2 0.0892 0.968338 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699879 2 0.0892 0.968014 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699878 2 0.0892 0.968338 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699880 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699881 2 0.0747 0.965322 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699882 2 0.0892 0.968014 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699883 2 0.0892 0.968338 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699884 2 0.0892 0.968269 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699885 2 0.1031 0.967360 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699886 2 0.1529 0.966329 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699888 2 0.1529 0.966329 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699889 2 0.1411 0.966420 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699890 2 0.1529 0.966329 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699887 2 0.1529 0.966329 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699891 2 0.1411 0.966420 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699892 2 0.1411 0.968195 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699893 2 0.1643 0.968660 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699894 2 0.1411 0.966420 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699895 2 0.1411 0.966420 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699896 2 0.1643 0.961894 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699897 2 0.1163 0.968208 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699898 2 0.1163 0.968577 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699900 2 0.1529 0.963695 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699899 2 0.1411 0.967514 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699902 2 0.2537 0.943539 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699901 2 0.2537 0.943539 0.000 0.920 0.080
#> SRR1699903 2 0.1643 0.966161 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699904 2 0.1643 0.963996 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699905 2 0.3686 0.885683 0.000 0.860 0.140
#> SRR1699906 2 0.1860 0.963223 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699907 2 0.1753 0.963929 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699908 2 0.1411 0.968129 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699909 2 0.1964 0.961873 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699910 2 0.3267 0.910952 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699911 2 0.2261 0.953404 0.000 0.932 0.068
#> SRR1699912 2 0.1753 0.963929 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699913 2 0.1753 0.965007 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699914 2 0.3340 0.909385 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699915 2 0.3267 0.914231 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699916 2 0.1964 0.963283 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699917 2 0.1643 0.970209 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699918 2 0.1860 0.964330 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699919 2 0.1860 0.962854 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699920 2 0.3267 0.910952 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699921 2 0.3267 0.910952 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699922 2 0.1411 0.967093 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699923 2 0.2796 0.936340 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699924 2 0.1964 0.960103 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699925 1 0.0000 0.890310 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.1964 0.956747 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699927 2 0.1411 0.966716 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699929 2 0.1411 0.968033 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699928 2 0.1860 0.963223 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699930 2 0.1289 0.967154 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699931 2 0.1411 0.968925 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699933 2 0.1643 0.965140 0.000 0.956 0.044
#> SRR1699932 2 0.1529 0.966498 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699934 1 0.0000 0.890310 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.1753 0.969190 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699936 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699937 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699938 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699940 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699939 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699941 2 0.0747 0.965322 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699942 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699943 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699944 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699945 2 0.1163 0.963923 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699946 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699947 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699948 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699949 2 0.0892 0.966351 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699950 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699951 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699952 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699953 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699954 2 0.0747 0.966284 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699955 2 0.0892 0.966567 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699956 2 0.1163 0.963923 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699957 2 0.0747 0.966053 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699959 2 0.1529 0.965340 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699958 2 0.1163 0.965160 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699960 2 0.1163 0.967568 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699961 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699962 2 0.1163 0.967568 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699963 2 0.1163 0.967938 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699964 2 0.1031 0.967688 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699965 2 0.0892 0.966567 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699966 2 0.0892 0.967416 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699967 2 0.0747 0.966053 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699968 2 0.1289 0.967419 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699969 2 0.0747 0.966053 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699971 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699970 2 0.0747 0.966053 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699972 2 0.0592 0.966714 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699973 2 0.1031 0.967961 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699974 2 0.0892 0.967929 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699975 2 0.0747 0.968664 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699976 2 0.0747 0.967612 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699977 2 0.0892 0.968427 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699978 2 0.3879 0.873195 0.000 0.848 0.152
#> SRR1699979 2 0.0747 0.968515 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699980 2 0.1289 0.967419 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699981 2 0.1163 0.968475 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699982 2 0.0892 0.969150 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699983 2 0.0592 0.968981 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699984 3 0.5785 -0.123974 0.300 0.004 0.696
#> SRR1699985 2 0.1411 0.969070 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699986 2 0.1411 0.965963 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699988 2 0.1163 0.968135 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699987 2 0.0892 0.968905 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699989 2 0.1289 0.968946 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699990 2 0.0747 0.968664 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699992 2 0.0747 0.967895 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699991 2 0.1753 0.967127 0.000 0.952 0.048
#> SRR1699993 2 0.1860 0.962396 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699994 2 0.0892 0.969160 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699995 2 0.4702 0.796213 0.000 0.788 0.212
#> SRR1699996 2 0.1031 0.967171 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699997 2 0.1163 0.968059 0.000 0.972 0.028
#> SRR1699998 2 0.0747 0.966053 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699999 2 0.3619 0.895233 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700000 2 0.0424 0.967402 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700002 2 0.1031 0.967688 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700001 2 0.0592 0.967968 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700003 2 0.1031 0.967688 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700004 2 0.1411 0.969688 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700005 1 0.4931 0.785592 0.768 0.000 0.232
#> SRR1700006 2 0.0892 0.965159 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700007 2 0.1031 0.968814 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700008 2 0.1529 0.967769 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700009 3 0.6126 -0.156930 0.352 0.004 0.644
#> SRR1700010 2 0.1163 0.963923 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700011 2 0.1163 0.967568 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700013 2 0.1031 0.966120 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700012 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700014 2 0.1411 0.967014 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700015 2 0.0892 0.968432 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700016 3 0.3983 0.347739 0.004 0.144 0.852
#> SRR1700018 2 0.0592 0.966714 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700017 2 0.0747 0.966284 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700019 2 0.1031 0.968626 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700020 2 0.1529 0.968370 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700021 2 0.2625 0.947186 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700023 2 0.0892 0.968660 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700022 2 0.0747 0.967508 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700024 2 0.1411 0.967014 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700025 2 0.0892 0.968571 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700026 2 0.0892 0.969585 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700027 2 0.0237 0.967342 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700028 2 0.1031 0.968720 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700029 2 0.1163 0.968943 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700030 2 0.1289 0.969916 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700031 2 0.1289 0.969450 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700032 2 0.1163 0.969155 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700034 2 0.3551 0.896193 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700035 2 0.1643 0.964998 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700033 2 0.1163 0.969011 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700036 2 0.1643 0.965346 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700037 2 0.1753 0.967373 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700038 2 0.1411 0.966866 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700039 2 0.1860 0.961651 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700040 2 0.1643 0.966716 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700041 2 0.1753 0.964505 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700042 2 0.1860 0.965103 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700043 2 0.1860 0.962365 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700045 2 0.1964 0.960251 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700044 2 0.1289 0.966862 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700046 2 0.1753 0.962412 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700047 2 0.1860 0.962626 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700048 2 0.1753 0.963268 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700049 2 0.1964 0.959717 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700050 2 0.2711 0.939556 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700051 2 0.3551 0.900084 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700052 2 0.2448 0.952484 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700053 2 0.1643 0.963332 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700054 2 0.1643 0.963332 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700055 2 0.3941 0.865101 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700056 2 0.2066 0.957492 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700057 2 0.2537 0.949245 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700058 2 0.2165 0.959531 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700059 2 0.2066 0.959210 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700060 2 0.1529 0.967281 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700061 2 0.1643 0.963332 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700062 2 0.1529 0.966276 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700063 2 0.1860 0.963557 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700064 2 0.1753 0.962412 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700065 2 0.1753 0.963659 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700066 2 0.1529 0.965826 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700067 2 0.1643 0.963332 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700068 2 0.1529 0.963748 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700069 2 0.1529 0.964073 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700070 2 0.1289 0.968450 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700071 2 0.1753 0.962412 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700072 2 0.2625 0.943962 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700073 2 0.1753 0.964829 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700075 2 0.1753 0.962726 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700074 2 0.1529 0.966018 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700076 2 0.1411 0.965200 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700077 2 0.1753 0.963375 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700078 2 0.1529 0.966415 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700080 2 0.1411 0.964640 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700079 2 0.1964 0.961655 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700081 2 0.1753 0.964769 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700082 2 0.0892 0.967061 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700083 2 0.1529 0.966955 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700084 2 0.1643 0.964842 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700085 2 0.1529 0.966749 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700086 2 0.1411 0.964640 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700087 2 0.0892 0.967130 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700088 2 0.1163 0.965160 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700089 2 0.0892 0.967538 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700091 2 0.0892 0.966351 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700090 2 0.1411 0.969524 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700092 2 0.1031 0.966686 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700094 2 0.1031 0.967378 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700093 2 0.1289 0.967199 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700095 2 0.3412 0.903139 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700096 2 0.1031 0.965518 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700097 2 0.1031 0.969448 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700098 2 0.0892 0.965951 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700099 2 0.1031 0.965518 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700100 2 0.1163 0.965160 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700101 2 0.1163 0.965160 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700102 2 0.0892 0.964687 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700104 2 0.1031 0.965518 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700103 2 0.1163 0.967046 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700105 2 0.1289 0.967686 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700106 2 0.1643 0.968202 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700107 2 0.1411 0.967967 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700108 2 0.1163 0.966261 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700109 2 0.1411 0.968789 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700110 2 0.1529 0.968753 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700112 2 0.1529 0.968833 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700111 2 0.1643 0.969736 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700113 2 0.1753 0.969331 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700114 2 0.0892 0.965992 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700115 2 0.1031 0.966686 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700116 2 0.0747 0.969190 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700117 2 0.2711 0.939487 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700119 2 0.1753 0.966791 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700118 2 0.1860 0.961659 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700120 2 0.1860 0.966711 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700121 2 0.1643 0.969505 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700122 2 0.2066 0.960341 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700123 2 0.2261 0.955615 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700125 2 0.1529 0.969072 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700126 2 0.1643 0.964307 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700127 2 0.1753 0.962230 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700124 2 0.1860 0.960737 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700128 2 0.2066 0.957492 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700129 2 0.2066 0.959249 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700130 2 0.1964 0.958990 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700132 2 0.1964 0.958973 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700131 2 0.1860 0.960500 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700133 2 0.1860 0.960662 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700134 2 0.2066 0.959249 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700135 2 0.2356 0.951853 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700136 2 0.2261 0.954229 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700137 2 0.1860 0.960500 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700138 2 0.1753 0.962230 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700140 2 0.1964 0.958973 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700139 2 0.1860 0.960550 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700141 2 0.1964 0.960532 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700142 2 0.2165 0.955654 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700143 2 0.2261 0.954229 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700144 2 0.1860 0.961777 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700145 2 0.2625 0.943648 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700146 2 0.1964 0.960532 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700147 2 0.1860 0.960500 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700149 2 0.2625 0.943054 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700148 2 0.2165 0.955561 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700150 2 0.1643 0.964523 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700152 2 0.2066 0.957299 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700151 2 0.1964 0.958990 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700153 2 0.1860 0.960737 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700154 2 0.1964 0.959354 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700155 2 0.2066 0.957299 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700156 2 0.2066 0.957676 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700158 2 0.2537 0.950017 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700159 2 0.2066 0.959249 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700157 2 0.1860 0.961562 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700160 2 0.2066 0.957299 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700161 2 0.2066 0.957299 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700162 2 0.2066 0.959249 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700164 2 0.3686 0.886940 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700163 2 0.3116 0.920467 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700165 2 0.1753 0.961822 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700166 2 0.1964 0.958973 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700168 2 0.2165 0.964405 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700167 2 0.3038 0.927781 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700170 2 0.1860 0.960662 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700169 2 0.1860 0.960662 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700171 2 0.3619 0.883887 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700172 2 0.1753 0.963996 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700174 2 0.2165 0.964864 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700173 2 0.1163 0.969875 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700175 2 0.1411 0.965447 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700176 2 0.1860 0.961482 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700178 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700177 2 0.1860 0.960662 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700180 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700179 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700181 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700183 1 0.1031 0.892833 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700182 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700184 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700186 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700187 3 0.5365 0.023376 0.252 0.004 0.744
#> SRR1700185 1 0.4399 0.837172 0.812 0.000 0.188
#> SRR1700188 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700192 3 0.5098 0.373950 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700190 2 0.2625 0.933399 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700191 1 0.0000 0.890310 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.7287 0.251269 0.212 0.092 0.696
#> SRR1700193 2 0.0747 0.965223 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700195 2 0.1163 0.965083 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700194 1 0.1163 0.892881 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700196 2 0.0892 0.965036 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700197 2 0.2625 0.933399 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700198 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700199 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700200 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700201 2 0.0892 0.966738 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700202 2 0.4605 0.796549 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700203 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700204 2 0.1163 0.965251 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700206 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700207 2 0.0892 0.966738 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700208 2 0.2625 0.933399 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700205 2 0.4346 0.821523 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700209 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700210 2 0.1163 0.967696 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700211 2 0.1031 0.968267 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700212 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700213 2 0.1163 0.968069 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700214 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700215 1 0.0424 0.892489 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.1289 0.964980 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700216 1 0.0892 0.893270 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700218 2 0.1031 0.965679 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700219 2 0.0892 0.966738 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700222 3 0.5956 -0.077076 0.324 0.004 0.672
#> SRR1700220 2 0.1163 0.965251 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700221 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700223 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700224 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700226 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700229 2 0.0892 0.965036 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700225 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700227 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700230 3 0.5502 0.369938 0.008 0.248 0.744
#> SRR1700231 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700228 2 0.0892 0.967493 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700232 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700233 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700234 2 0.1411 0.967548 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700235 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700237 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700236 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700238 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700239 3 0.5553 0.004389 0.272 0.004 0.724
#> SRR1700240 1 0.4796 0.816174 0.780 0.000 0.220
#> SRR1700241 2 0.1289 0.965855 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700243 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700244 2 0.0747 0.966638 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700242 3 0.5905 0.285284 0.000 0.352 0.648
#> SRR1700246 2 0.1529 0.966313 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700245 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700247 3 0.5588 -0.000449 0.276 0.004 0.720
#> SRR1700249 1 0.5098 0.795342 0.752 0.000 0.248
#> SRR1700250 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700248 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700251 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700252 2 0.0892 0.966459 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700253 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700256 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700254 1 0.5431 0.760143 0.716 0.000 0.284
#> SRR1700255 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700257 2 0.1031 0.964404 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700258 2 0.1031 0.964365 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700259 2 0.1163 0.967531 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700260 2 0.1163 0.967531 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700261 2 0.1163 0.967531 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700262 2 0.0892 0.968247 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700263 2 0.1289 0.968566 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700264 2 0.0747 0.965544 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700265 2 0.2959 0.921859 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700266 2 0.0892 0.965992 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700268 2 0.1289 0.967756 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700270 2 0.1031 0.967085 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700267 2 0.1163 0.967531 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700271 2 0.1031 0.968608 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700272 2 0.1031 0.968608 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700273 2 0.0892 0.965951 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700274 2 0.1163 0.967531 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700277 2 0.1411 0.961627 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700275 2 0.1529 0.968840 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700276 2 0.1411 0.968516 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700278 2 0.1529 0.968319 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700279 2 0.1529 0.968114 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700280 2 0.1529 0.968114 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700281 2 0.1411 0.967786 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700283 2 0.1289 0.968529 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700282 2 0.2959 0.922165 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700284 2 0.1529 0.969069 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700285 2 0.1163 0.968982 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700286 2 0.1289 0.968851 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700287 2 0.1529 0.969474 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700290 2 0.3879 0.873708 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700289 2 0.1411 0.969927 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700288 2 0.1289 0.968529 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700292 2 0.1411 0.969115 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700291 2 0.1860 0.966385 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700293 2 0.1753 0.967664 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700294 2 0.2066 0.960396 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700295 2 0.3551 0.897884 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700297 2 0.1529 0.968801 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700296 2 0.1964 0.967037 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700298 2 0.1964 0.966565 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700299 2 0.2066 0.959249 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700300 2 0.1753 0.964144 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700302 2 0.1753 0.964725 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700301 2 0.1643 0.968226 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700303 2 0.1753 0.967287 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700304 2 0.2711 0.937649 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700305 2 0.1964 0.962762 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700306 2 0.1753 0.964144 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700308 2 0.1964 0.965946 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700307 2 0.1753 0.963300 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700309 2 0.2261 0.954803 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700310 2 0.1964 0.965683 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700311 2 0.1964 0.960532 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700312 2 0.1753 0.965972 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700313 2 0.1964 0.961078 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700314 2 0.1964 0.960532 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700315 2 0.2066 0.960222 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700316 2 0.1964 0.962542 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700317 2 0.1964 0.968028 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700318 2 0.2796 0.937169 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700319 2 0.1964 0.961871 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700320 2 0.2066 0.960839 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700322 2 0.1964 0.963204 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700321 2 0.1529 0.969466 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700323 2 0.1964 0.960532 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700324 2 0.1964 0.966210 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700325 2 0.1529 0.969270 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700326 2 0.4654 0.764328 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700327 2 0.1529 0.969350 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700329 2 0.1964 0.966899 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700328 2 0.2356 0.951624 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700330 2 0.2165 0.953697 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700331 2 0.1411 0.968152 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700332 2 0.1289 0.968529 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700333 2 0.1753 0.966513 0.000 0.952 0.048
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 3 0.2053 0.64322 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1699875 3 0.1474 0.61871 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1699876 3 0.4323 0.54999 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1699877 3 0.2271 0.64273 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1699879 3 0.1978 0.64141 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1699878 3 0.2271 0.63888 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1699880 3 0.1389 0.62697 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699881 3 0.1637 0.63042 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1699882 3 0.2053 0.64588 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1699883 3 0.2198 0.64155 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1699884 3 0.2546 0.64426 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1699885 3 0.2125 0.64396 0.000 0.076 0.920 0.004
#> SRR1699886 3 0.4284 0.56422 0.000 0.200 0.780 0.020
#> SRR1699888 3 0.4323 0.55861 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1699889 3 0.4361 0.54640 0.000 0.208 0.772 0.020
#> SRR1699890 3 0.4323 0.55861 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1699887 3 0.3991 0.59316 0.000 0.172 0.808 0.020
#> SRR1699891 3 0.4361 0.54640 0.000 0.208 0.772 0.020
#> SRR1699892 3 0.3597 0.61097 0.000 0.148 0.836 0.016
#> SRR1699893 3 0.3764 0.60453 0.000 0.172 0.816 0.012
#> SRR1699894 3 0.4361 0.54640 0.000 0.208 0.772 0.020
#> SRR1699895 3 0.4361 0.54640 0.000 0.208 0.772 0.020
#> SRR1699896 3 0.4562 0.52650 0.000 0.208 0.764 0.028
#> SRR1699897 3 0.1940 0.65095 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1699898 3 0.3907 0.54768 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1699900 3 0.4524 0.53171 0.000 0.204 0.768 0.028
#> SRR1699899 3 0.4323 0.55440 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1699902 3 0.5482 -0.14143 0.000 0.368 0.608 0.024
#> SRR1699901 3 0.5482 -0.14143 0.000 0.368 0.608 0.024
#> SRR1699903 3 0.4327 0.53858 0.000 0.216 0.768 0.016
#> SRR1699904 3 0.4574 0.51378 0.000 0.220 0.756 0.024
#> SRR1699905 3 0.6147 -0.77103 0.000 0.464 0.488 0.048
#> SRR1699906 3 0.4737 0.46483 0.000 0.252 0.728 0.020
#> SRR1699907 3 0.4576 0.50132 0.000 0.232 0.748 0.020
#> SRR1699908 3 0.4323 0.55542 0.000 0.204 0.776 0.020
#> SRR1699909 3 0.4855 0.43041 0.000 0.268 0.712 0.020
#> SRR1699910 3 0.5881 -0.55240 0.000 0.420 0.544 0.036
#> SRR1699911 3 0.5141 0.35699 0.000 0.268 0.700 0.032
#> SRR1699912 3 0.4576 0.50132 0.000 0.232 0.748 0.020
#> SRR1699913 3 0.4535 0.49860 0.000 0.240 0.744 0.016
#> SRR1699914 3 0.5888 -0.56085 0.000 0.424 0.540 0.036
#> SRR1699915 3 0.5816 -0.40362 0.000 0.392 0.572 0.036
#> SRR1699916 3 0.4661 0.48126 0.000 0.256 0.728 0.016
#> SRR1699917 3 0.3852 0.58803 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR1699918 3 0.4690 0.46733 0.000 0.260 0.724 0.016
#> SRR1699919 3 0.4770 0.37913 0.000 0.288 0.700 0.012
#> SRR1699920 3 0.5815 -0.56621 0.000 0.428 0.540 0.032
#> SRR1699921 3 0.5881 -0.55240 0.000 0.420 0.544 0.036
#> SRR1699922 3 0.4436 0.53263 0.000 0.216 0.764 0.020
#> SRR1699923 3 0.5613 -0.22231 0.000 0.380 0.592 0.028
#> SRR1699924 3 0.4990 0.07734 0.000 0.352 0.640 0.008
#> SRR1699925 1 0.0000 0.86625 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.5113 0.38194 0.000 0.264 0.704 0.032
#> SRR1699927 3 0.4436 0.53150 0.000 0.216 0.764 0.020
#> SRR1699929 3 0.4225 0.56947 0.000 0.184 0.792 0.024
#> SRR1699928 3 0.4661 0.46334 0.000 0.256 0.728 0.016
#> SRR1699930 3 0.4436 0.52934 0.000 0.216 0.764 0.020
#> SRR1699931 3 0.4035 0.58616 0.000 0.176 0.804 0.020
#> SRR1699933 3 0.4079 0.58135 0.000 0.180 0.800 0.020
#> SRR1699932 3 0.4361 0.54353 0.000 0.208 0.772 0.020
#> SRR1699934 1 0.0000 0.86625 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 3 0.3852 0.59907 0.000 0.180 0.808 0.012
#> SRR1699936 3 0.1302 0.62217 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699937 3 0.1557 0.61963 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699938 3 0.1211 0.62539 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699940 3 0.1867 0.62498 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699939 3 0.1302 0.62698 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699941 3 0.1792 0.63269 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1699942 3 0.1716 0.62273 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1699943 3 0.1474 0.61766 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1699944 3 0.1557 0.61963 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699945 3 0.4188 0.22549 0.000 0.244 0.752 0.004
#> SRR1699946 3 0.1557 0.61963 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699947 3 0.1557 0.61963 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699948 3 0.1389 0.62227 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699949 3 0.1474 0.62533 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1699950 3 0.1302 0.62698 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699951 3 0.1389 0.62316 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699952 3 0.1557 0.61963 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1699953 3 0.1302 0.62698 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1699954 3 0.1743 0.63385 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1699955 3 0.1398 0.63858 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1699956 3 0.4283 0.18587 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1699957 3 0.1637 0.62661 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1699959 3 0.2924 0.62559 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1699958 3 0.1637 0.62544 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1699960 3 0.1576 0.64239 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1699961 3 0.1716 0.62318 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1699962 3 0.1902 0.64709 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1699963 3 0.2408 0.63713 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1699964 3 0.2011 0.63486 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1699965 3 0.1398 0.63858 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1699966 3 0.1940 0.63824 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1699967 3 0.1867 0.62743 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1699968 3 0.3219 0.60299 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1699969 3 0.2081 0.63812 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1699971 3 0.1474 0.62366 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1699970 3 0.2011 0.63189 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1699972 3 0.1978 0.63895 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1699973 3 0.2081 0.64247 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1699974 3 0.3649 0.56109 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1699975 3 0.2589 0.64041 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1699976 3 0.2281 0.64068 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1699977 3 0.2647 0.63648 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1699978 3 0.6500 -0.79785 0.000 0.444 0.484 0.072
#> SRR1699979 3 0.2647 0.63472 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1699980 3 0.3219 0.60299 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1699981 3 0.3444 0.60348 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1699982 3 0.4137 0.57087 0.000 0.208 0.780 0.012
#> SRR1699983 3 0.2589 0.63881 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1699984 4 0.4560 0.22249 0.296 0.004 0.000 0.700
#> SRR1699985 3 0.2973 0.63629 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1699986 3 0.4103 0.48805 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1699988 3 0.1940 0.65068 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1699987 3 0.2704 0.63395 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1699989 3 0.3402 0.61911 0.000 0.164 0.832 0.004
#> SRR1699990 3 0.2647 0.63849 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1699992 3 0.2408 0.64449 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1699991 3 0.4313 0.46484 0.000 0.260 0.736 0.004
#> SRR1699993 3 0.4477 0.35297 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1699994 3 0.3074 0.61235 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1699995 2 0.6483 0.79203 0.000 0.532 0.392 0.076
#> SRR1699996 3 0.1716 0.64624 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1699997 3 0.2469 0.64614 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1699998 3 0.2011 0.64440 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1699999 3 0.6005 -0.77443 0.000 0.460 0.500 0.040
#> SRR1700000 3 0.2589 0.64790 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1700002 3 0.2345 0.63666 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1700001 3 0.2216 0.65104 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700003 3 0.2216 0.64099 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1700004 3 0.3486 0.59769 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1700005 1 0.3907 0.72290 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1700006 3 0.2011 0.63474 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1700007 3 0.1576 0.64159 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700008 3 0.4040 0.50934 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1700009 4 0.4855 0.25830 0.352 0.000 0.004 0.644
#> SRR1700010 3 0.4252 0.19172 0.000 0.252 0.744 0.004
#> SRR1700011 3 0.1743 0.64322 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700013 3 0.1302 0.64660 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700012 3 0.1557 0.63910 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700014 3 0.3801 0.56482 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1700015 3 0.1902 0.65089 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700016 4 0.3895 0.40970 0.000 0.132 0.036 0.832
#> SRR1700018 3 0.1902 0.62632 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1700017 3 0.1978 0.62216 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700019 3 0.2198 0.64431 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1700020 3 0.3768 0.55623 0.000 0.184 0.808 0.008
#> SRR1700021 3 0.4974 0.45093 0.000 0.224 0.736 0.040
#> SRR1700023 3 0.2589 0.63908 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1700022 3 0.2466 0.64528 0.000 0.096 0.900 0.004
#> SRR1700024 3 0.3764 0.56852 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1700025 3 0.1474 0.64711 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700026 3 0.2530 0.64802 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR1700027 3 0.3052 0.64336 0.000 0.136 0.860 0.004
#> SRR1700028 3 0.2053 0.65103 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1700029 3 0.4040 0.51924 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1700030 3 0.3577 0.62063 0.000 0.156 0.832 0.012
#> SRR1700031 3 0.3528 0.58996 0.000 0.192 0.808 0.000
#> SRR1700032 3 0.2081 0.65177 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1700034 2 0.5600 0.80574 0.000 0.512 0.468 0.020
#> SRR1700035 3 0.3907 0.54074 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700033 3 0.3688 0.58165 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1700036 3 0.3942 0.53500 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700037 3 0.4353 0.53565 0.000 0.232 0.756 0.012
#> SRR1700038 3 0.4252 0.48262 0.000 0.252 0.744 0.004
#> SRR1700039 3 0.4761 0.01307 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1700040 3 0.4313 0.46855 0.000 0.260 0.736 0.004
#> SRR1700041 3 0.4222 0.45001 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700042 3 0.4343 0.46424 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700043 3 0.5161 0.29040 0.000 0.300 0.676 0.024
#> SRR1700045 3 0.4500 0.32054 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700044 3 0.4008 0.50738 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1700046 3 0.4382 0.38394 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1700047 3 0.4477 0.33550 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700048 3 0.4391 0.47423 0.000 0.252 0.740 0.008
#> SRR1700049 3 0.4790 -0.03776 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1700050 3 0.4967 -0.49232 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1700051 2 0.5606 0.75179 0.000 0.500 0.480 0.020
#> SRR1700052 3 0.4872 0.10493 0.000 0.356 0.640 0.004
#> SRR1700053 3 0.4222 0.45223 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700054 3 0.4331 0.39759 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700055 2 0.5731 0.83327 0.000 0.544 0.428 0.028
#> SRR1700056 3 0.4697 0.15919 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700057 3 0.5060 -0.19657 0.000 0.412 0.584 0.004
#> SRR1700058 3 0.4781 0.23002 0.000 0.336 0.660 0.004
#> SRR1700059 3 0.4713 0.15313 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1700060 3 0.4304 0.41598 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1700061 3 0.4428 0.43076 0.000 0.276 0.720 0.004
#> SRR1700062 3 0.4624 0.26610 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700063 3 0.4720 0.27474 0.000 0.324 0.672 0.004
#> SRR1700064 3 0.4277 0.42703 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1700065 3 0.4331 0.39053 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700066 3 0.4164 0.46067 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1700067 3 0.4313 0.46781 0.000 0.260 0.736 0.004
#> SRR1700068 3 0.4624 0.23655 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700069 3 0.4134 0.46476 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700070 3 0.2868 0.63860 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1700071 3 0.4304 0.40772 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1700072 3 0.5407 0.24627 0.000 0.296 0.668 0.036
#> SRR1700073 3 0.4331 0.43395 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700075 3 0.4477 0.33705 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700074 3 0.4277 0.44582 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1700076 3 0.3975 0.50822 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700077 3 0.4331 0.41345 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700078 3 0.4072 0.49633 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1700080 3 0.3907 0.52273 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700079 3 0.4679 0.18703 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700081 3 0.4331 0.39864 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700082 3 0.2081 0.63967 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1700083 3 0.4134 0.47130 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700084 3 0.4277 0.41406 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1700085 3 0.3873 0.55260 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1700086 3 0.3942 0.51731 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700087 3 0.1824 0.62803 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700088 3 0.1557 0.63448 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700089 3 0.1743 0.63806 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700091 3 0.1389 0.63494 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700090 3 0.2944 0.64200 0.000 0.128 0.868 0.004
#> SRR1700092 3 0.1557 0.63724 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700094 3 0.1824 0.63507 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700093 3 0.2281 0.64944 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1700095 3 0.6078 -0.19578 0.000 0.312 0.620 0.068
#> SRR1700096 3 0.1792 0.64397 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700097 3 0.4136 0.55715 0.000 0.196 0.788 0.016
#> SRR1700098 3 0.1389 0.63401 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700099 3 0.1389 0.63997 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700100 3 0.1389 0.63499 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700101 3 0.1637 0.63336 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700102 3 0.1389 0.62961 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700104 3 0.1792 0.64558 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700103 3 0.2149 0.64846 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1700105 3 0.2654 0.64730 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR1700106 3 0.2704 0.63819 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1700107 3 0.2125 0.64951 0.000 0.076 0.920 0.004
#> SRR1700108 3 0.2053 0.64566 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1700109 3 0.2530 0.64694 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR1700110 3 0.3157 0.62396 0.000 0.144 0.852 0.004
#> SRR1700112 3 0.3448 0.60810 0.000 0.168 0.828 0.004
#> SRR1700111 3 0.3591 0.61236 0.000 0.168 0.824 0.008
#> SRR1700113 3 0.3591 0.61313 0.000 0.168 0.824 0.008
#> SRR1700114 3 0.1557 0.64678 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700115 3 0.1792 0.64423 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700116 3 0.3105 0.64238 0.000 0.140 0.856 0.004
#> SRR1700117 3 0.4967 -0.49337 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1700119 3 0.4123 0.54995 0.000 0.220 0.772 0.008
#> SRR1700118 3 0.4406 0.39392 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700120 3 0.3942 0.53647 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700121 3 0.3448 0.61508 0.000 0.168 0.828 0.004
#> SRR1700122 3 0.4741 0.29533 0.000 0.328 0.668 0.004
#> SRR1700123 3 0.4697 0.18321 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700125 3 0.3402 0.61272 0.000 0.164 0.832 0.004
#> SRR1700126 3 0.4222 0.45277 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700127 3 0.4406 0.36756 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700124 3 0.4643 0.23487 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700128 3 0.4697 0.17591 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700129 3 0.4643 0.24587 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700130 3 0.4661 0.20866 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700132 3 0.4543 0.29847 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700131 3 0.4522 0.30692 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700133 3 0.4741 0.30664 0.000 0.328 0.668 0.004
#> SRR1700134 3 0.4624 0.26674 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700135 3 0.4843 -0.07019 0.000 0.396 0.604 0.000
#> SRR1700136 3 0.4643 0.21419 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700137 3 0.4624 0.25426 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700138 3 0.4543 0.31706 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700140 3 0.4661 0.21132 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700139 3 0.4624 0.25231 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700141 3 0.4624 0.26436 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700142 3 0.4804 0.00141 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1700143 3 0.4643 0.22066 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700144 3 0.4661 0.22065 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700145 3 0.4877 -0.16084 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1700146 3 0.4624 0.26436 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700147 3 0.4564 0.28739 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1700149 3 0.4948 -0.40438 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1700148 3 0.4730 0.16182 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1700150 3 0.4522 0.35269 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700152 3 0.4585 0.27585 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700151 3 0.4661 0.22337 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700153 3 0.4585 0.27947 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700154 3 0.4585 0.28239 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700155 3 0.4624 0.26590 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700156 3 0.4564 0.28277 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1700158 3 0.4950 0.00587 0.000 0.376 0.620 0.004
#> SRR1700159 3 0.4624 0.26674 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700157 3 0.4624 0.24757 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700160 3 0.4697 0.18921 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700161 3 0.4679 0.20582 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1700162 3 0.4643 0.24587 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700164 3 0.6079 -0.76463 0.000 0.464 0.492 0.044
#> SRR1700163 3 0.5550 -0.46779 0.000 0.428 0.552 0.020
#> SRR1700165 3 0.4632 0.35661 0.000 0.308 0.688 0.004
#> SRR1700166 3 0.4605 0.28196 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR1700168 3 0.4220 0.51865 0.000 0.248 0.748 0.004
#> SRR1700167 3 0.5408 -0.30045 0.000 0.408 0.576 0.016
#> SRR1700170 3 0.4543 0.31676 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700169 3 0.4720 0.30902 0.000 0.324 0.672 0.004
#> SRR1700171 3 0.6458 -0.67822 0.000 0.408 0.520 0.072
#> SRR1700172 3 0.4482 0.47299 0.000 0.264 0.728 0.008
#> SRR1700174 3 0.4343 0.46835 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700173 3 0.3626 0.60783 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1700175 3 0.4406 0.40485 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700176 3 0.4331 0.40754 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700178 3 0.1474 0.62274 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700177 3 0.4509 0.40817 0.000 0.288 0.708 0.004
#> SRR1700180 3 0.1637 0.62389 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700179 3 0.1474 0.62274 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700181 3 0.1389 0.62078 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700183 1 0.0817 0.86880 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700182 3 0.1474 0.62274 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700184 3 0.1474 0.62274 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700186 3 0.1557 0.62481 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700187 4 0.4400 0.41156 0.248 0.004 0.004 0.744
#> SRR1700185 1 0.3486 0.79280 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1700188 3 0.1474 0.62274 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1700192 4 0.5416 0.41405 0.000 0.112 0.148 0.740
#> SRR1700190 3 0.5821 -0.16716 0.000 0.432 0.536 0.032
#> SRR1700191 1 0.0000 0.86625 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 4 0.6113 0.41894 0.208 0.096 0.008 0.688
#> SRR1700193 3 0.1557 0.62706 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700195 3 0.1635 0.63519 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700194 1 0.0921 0.86870 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700196 3 0.1305 0.62907 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1700197 3 0.5821 -0.16716 0.000 0.432 0.536 0.032
#> SRR1700198 3 0.1807 0.63350 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700199 3 0.1970 0.63002 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700200 3 0.1970 0.63832 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700201 3 0.0895 0.63744 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1700202 3 0.7082 -0.58859 0.000 0.368 0.500 0.132
#> SRR1700203 3 0.1722 0.63169 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700204 3 0.1722 0.62992 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700206 3 0.1807 0.62754 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700207 3 0.1109 0.63634 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700208 3 0.5821 -0.16716 0.000 0.432 0.536 0.032
#> SRR1700205 3 0.6907 -0.53746 0.000 0.348 0.532 0.120
#> SRR1700209 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700210 3 0.3325 0.63883 0.000 0.112 0.864 0.024
#> SRR1700211 3 0.2542 0.64957 0.000 0.084 0.904 0.012
#> SRR1700212 3 0.1890 0.63230 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700213 3 0.2466 0.64128 0.000 0.096 0.900 0.004
#> SRR1700214 3 0.1807 0.63350 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700215 1 0.0336 0.86875 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 3 0.2124 0.63329 0.000 0.068 0.924 0.008
#> SRR1700216 1 0.0707 0.86936 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700218 3 0.1398 0.62793 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700219 3 0.1109 0.63634 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700222 4 0.4897 0.32494 0.324 0.004 0.004 0.668
#> SRR1700220 3 0.1635 0.63264 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700221 3 0.1722 0.62862 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700223 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700224 3 0.2124 0.63427 0.000 0.068 0.924 0.008
#> SRR1700226 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700229 3 0.1743 0.63061 0.000 0.056 0.940 0.004
#> SRR1700225 3 0.1792 0.63779 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700227 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700230 4 0.5712 0.42032 0.004 0.136 0.132 0.728
#> SRR1700231 3 0.1545 0.62782 0.000 0.040 0.952 0.008
#> SRR1700228 3 0.1637 0.64724 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700232 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700233 3 0.1722 0.63119 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700234 3 0.3653 0.63025 0.000 0.128 0.844 0.028
#> SRR1700235 3 0.1807 0.62908 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700237 3 0.1722 0.63119 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700236 3 0.1635 0.63202 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700238 3 0.1807 0.62908 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700239 4 0.4551 0.39851 0.268 0.004 0.004 0.724
#> SRR1700240 1 0.3801 0.76382 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1700241 3 0.3907 0.56902 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700243 3 0.1635 0.63056 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700244 3 0.1807 0.62978 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700242 4 0.6555 0.29962 0.000 0.156 0.212 0.632
#> SRR1700246 3 0.3856 0.62410 0.000 0.136 0.832 0.032
#> SRR1700245 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700247 4 0.4579 0.39457 0.272 0.004 0.004 0.720
#> SRR1700249 1 0.4040 0.73416 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1700250 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700248 3 0.1970 0.63002 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1700251 3 0.1890 0.63413 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700252 3 0.1716 0.63593 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1700253 3 0.1890 0.63413 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700256 3 0.1635 0.62896 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700254 1 0.4304 0.68523 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1700255 3 0.1890 0.63413 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700257 3 0.1722 0.63169 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700258 3 0.1398 0.63607 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700259 3 0.1489 0.63930 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700260 3 0.1489 0.63930 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700261 3 0.1489 0.63930 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700262 3 0.1635 0.64247 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1700263 3 0.1661 0.63888 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1700264 3 0.1211 0.62540 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1700265 3 0.5219 0.38450 0.000 0.216 0.728 0.056
#> SRR1700266 3 0.1302 0.62773 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700268 3 0.2704 0.63574 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1700270 3 0.1557 0.63621 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700267 3 0.1398 0.63675 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR1700271 3 0.1722 0.64236 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700272 3 0.1722 0.64236 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700273 3 0.1557 0.63673 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1700274 3 0.1661 0.64456 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1700277 3 0.4535 0.11820 0.000 0.292 0.704 0.004
#> SRR1700275 3 0.3105 0.63312 0.000 0.120 0.868 0.012
#> SRR1700276 3 0.3428 0.63553 0.000 0.144 0.844 0.012
#> SRR1700278 3 0.4049 0.56525 0.000 0.212 0.780 0.008
#> SRR1700279 3 0.3978 0.58037 0.000 0.192 0.796 0.012
#> SRR1700280 3 0.4019 0.58057 0.000 0.196 0.792 0.012
#> SRR1700281 3 0.1978 0.64096 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700283 3 0.3161 0.62838 0.000 0.124 0.864 0.012
#> SRR1700282 3 0.5619 0.20156 0.000 0.268 0.676 0.056
#> SRR1700284 3 0.4175 0.55783 0.000 0.212 0.776 0.012
#> SRR1700285 3 0.3870 0.57440 0.000 0.208 0.788 0.004
#> SRR1700286 3 0.1637 0.65163 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700287 3 0.4059 0.57315 0.000 0.200 0.788 0.012
#> SRR1700290 2 0.6330 0.77947 0.000 0.492 0.448 0.060
#> SRR1700289 3 0.4019 0.58202 0.000 0.196 0.792 0.012
#> SRR1700288 3 0.3105 0.63738 0.000 0.120 0.868 0.012
#> SRR1700292 3 0.3672 0.61472 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR1700291 3 0.4360 0.49975 0.000 0.248 0.744 0.008
#> SRR1700293 3 0.3810 0.58939 0.000 0.188 0.804 0.008
#> SRR1700294 3 0.4500 0.35164 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700295 3 0.5992 -0.69311 0.000 0.444 0.516 0.040
#> SRR1700297 3 0.4295 0.54062 0.000 0.240 0.752 0.008
#> SRR1700296 3 0.4453 0.51845 0.000 0.244 0.744 0.012
#> SRR1700298 3 0.4546 0.47746 0.000 0.256 0.732 0.012
#> SRR1700299 3 0.4564 0.29074 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1700300 3 0.4522 0.31352 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700302 3 0.4483 0.42968 0.000 0.284 0.712 0.004
#> SRR1700301 3 0.4387 0.52110 0.000 0.236 0.752 0.012
#> SRR1700303 3 0.4420 0.52496 0.000 0.240 0.748 0.012
#> SRR1700304 3 0.5649 0.22036 0.000 0.284 0.664 0.052
#> SRR1700305 3 0.4456 0.42772 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1700306 3 0.4500 0.32770 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700308 3 0.4428 0.45798 0.000 0.276 0.720 0.004
#> SRR1700307 3 0.4605 0.26947 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR1700309 3 0.4746 0.14110 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1700310 3 0.4511 0.47587 0.000 0.268 0.724 0.008
#> SRR1700311 3 0.4624 0.24121 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700312 3 0.4343 0.47897 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700313 3 0.4605 0.27155 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR1700314 3 0.4624 0.24622 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700315 3 0.4781 0.24939 0.000 0.336 0.660 0.004
#> SRR1700316 3 0.4585 0.29750 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700317 3 0.4053 0.54797 0.000 0.228 0.768 0.004
#> SRR1700318 3 0.5649 0.21974 0.000 0.284 0.664 0.052
#> SRR1700319 3 0.4585 0.28394 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1700320 3 0.4431 0.38359 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1700322 3 0.4608 0.38533 0.000 0.304 0.692 0.004
#> SRR1700321 3 0.3908 0.56160 0.000 0.212 0.784 0.004
#> SRR1700323 3 0.4564 0.28521 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1700324 3 0.4485 0.50136 0.000 0.248 0.740 0.012
#> SRR1700325 3 0.3893 0.58575 0.000 0.196 0.796 0.008
#> SRR1700326 3 0.7121 -0.37528 0.000 0.292 0.544 0.164
#> SRR1700327 3 0.1824 0.64922 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1700329 3 0.4428 0.46571 0.000 0.276 0.720 0.004
#> SRR1700328 3 0.5113 0.44061 0.000 0.252 0.712 0.036
#> SRR1700330 3 0.5231 0.28338 0.000 0.296 0.676 0.028
#> SRR1700331 3 0.4155 0.52305 0.000 0.240 0.756 0.004
#> SRR1700332 3 0.3577 0.61197 0.000 0.156 0.832 0.012
#> SRR1700333 3 0.4516 0.48459 0.000 0.252 0.736 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.2102 0.6197 0.000 0.916 0.068 0.012 0.004
#> SRR1699875 2 0.1704 0.5965 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR1699876 2 0.4453 0.5057 0.000 0.744 0.212 0.024 0.020
#> SRR1699877 2 0.2270 0.6192 0.000 0.908 0.072 0.016 0.004
#> SRR1699879 2 0.2050 0.6181 0.000 0.920 0.064 0.008 0.008
#> SRR1699878 2 0.2270 0.6155 0.000 0.908 0.072 0.016 0.004
#> SRR1699880 2 0.1731 0.6026 0.000 0.932 0.060 0.004 0.004
#> SRR1699881 2 0.1798 0.6120 0.000 0.928 0.064 0.004 0.004
#> SRR1699882 2 0.2291 0.6206 0.000 0.908 0.072 0.012 0.008
#> SRR1699883 2 0.2206 0.6182 0.000 0.912 0.068 0.016 0.004
#> SRR1699884 2 0.2351 0.6215 0.000 0.896 0.088 0.016 0.000
#> SRR1699885 2 0.2166 0.6201 0.000 0.912 0.072 0.012 0.004
#> SRR1699886 2 0.4356 0.5211 0.000 0.756 0.200 0.024 0.020
#> SRR1699888 2 0.4389 0.5150 0.000 0.752 0.204 0.024 0.020
#> SRR1699889 2 0.4536 0.5018 0.000 0.740 0.212 0.028 0.020
#> SRR1699890 2 0.4389 0.5150 0.000 0.752 0.204 0.024 0.020
#> SRR1699887 2 0.4015 0.5576 0.000 0.788 0.172 0.024 0.016
#> SRR1699891 2 0.4536 0.5018 0.000 0.740 0.212 0.028 0.020
#> SRR1699892 2 0.3714 0.5755 0.000 0.808 0.160 0.016 0.016
#> SRR1699893 2 0.3806 0.5723 0.000 0.792 0.180 0.016 0.012
#> SRR1699894 2 0.4536 0.5018 0.000 0.740 0.212 0.028 0.020
#> SRR1699895 2 0.4536 0.5018 0.000 0.740 0.212 0.028 0.020
#> SRR1699896 2 0.4623 0.4854 0.000 0.736 0.212 0.028 0.024
#> SRR1699897 2 0.2170 0.6250 0.000 0.904 0.088 0.004 0.004
#> SRR1699898 2 0.3989 0.5130 0.000 0.728 0.260 0.008 0.004
#> SRR1699900 2 0.4505 0.4968 0.000 0.744 0.208 0.028 0.020
#> SRR1699899 2 0.4453 0.5095 0.000 0.744 0.212 0.024 0.020
#> SRR1699902 2 0.5262 -0.2593 0.000 0.552 0.408 0.028 0.012
#> SRR1699901 2 0.5262 -0.2593 0.000 0.552 0.408 0.028 0.012
#> SRR1699903 2 0.4542 0.4836 0.000 0.724 0.236 0.020 0.020
#> SRR1699904 2 0.4792 0.4734 0.000 0.720 0.224 0.032 0.024
#> SRR1699905 3 0.5830 0.7516 0.000 0.428 0.504 0.036 0.032
#> SRR1699906 2 0.4915 0.4020 0.000 0.684 0.268 0.028 0.020
#> SRR1699907 2 0.4766 0.4506 0.000 0.708 0.244 0.028 0.020
#> SRR1699908 2 0.4421 0.5148 0.000 0.740 0.220 0.024 0.016
#> SRR1699909 2 0.4721 0.3694 0.000 0.672 0.296 0.016 0.016
#> SRR1699910 2 0.5631 -0.6048 0.000 0.484 0.460 0.036 0.020
#> SRR1699911 2 0.5070 0.3022 0.000 0.656 0.296 0.024 0.024
#> SRR1699912 2 0.4710 0.4518 0.000 0.708 0.248 0.024 0.020
#> SRR1699913 2 0.4700 0.4383 0.000 0.700 0.260 0.020 0.020
#> SRR1699914 2 0.5632 -0.6100 0.000 0.480 0.464 0.036 0.020
#> SRR1699915 2 0.5603 -0.4698 0.000 0.520 0.424 0.036 0.020
#> SRR1699916 2 0.4748 0.4226 0.000 0.692 0.268 0.020 0.020
#> SRR1699917 2 0.3815 0.5539 0.000 0.764 0.220 0.004 0.012
#> SRR1699918 2 0.4726 0.4097 0.000 0.684 0.280 0.016 0.020
#> SRR1699919 2 0.4920 0.3044 0.000 0.660 0.300 0.020 0.020
#> SRR1699920 2 0.5567 -0.6141 0.000 0.480 0.468 0.032 0.020
#> SRR1699921 2 0.5631 -0.6048 0.000 0.484 0.460 0.036 0.020
#> SRR1699922 2 0.4684 0.4846 0.000 0.720 0.232 0.028 0.020
#> SRR1699923 2 0.5295 -0.3164 0.000 0.532 0.428 0.028 0.012
#> SRR1699924 2 0.4856 -0.0512 0.000 0.584 0.392 0.020 0.004
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8367 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.5008 0.3293 0.000 0.668 0.284 0.024 0.024
#> SRR1699927 2 0.4601 0.4852 0.000 0.724 0.232 0.024 0.020
#> SRR1699929 2 0.4289 0.5300 0.000 0.764 0.192 0.024 0.020
#> SRR1699928 2 0.4771 0.4055 0.000 0.688 0.272 0.020 0.020
#> SRR1699930 2 0.4601 0.4830 0.000 0.724 0.232 0.024 0.020
#> SRR1699931 2 0.4125 0.5479 0.000 0.776 0.184 0.024 0.016
#> SRR1699933 2 0.4048 0.5417 0.000 0.772 0.196 0.016 0.016
#> SRR1699932 2 0.4543 0.4978 0.000 0.732 0.224 0.024 0.020
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8367 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.3814 0.5661 0.000 0.784 0.192 0.012 0.012
#> SRR1699936 2 0.1041 0.6032 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1699937 2 0.1864 0.5949 0.000 0.924 0.068 0.004 0.004
#> SRR1699938 2 0.1124 0.6060 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1699940 2 0.2052 0.6027 0.000 0.912 0.080 0.004 0.004
#> SRR1699939 2 0.1412 0.6051 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1699941 2 0.1991 0.6115 0.000 0.916 0.076 0.004 0.004
#> SRR1699942 2 0.1991 0.5974 0.000 0.916 0.076 0.004 0.004
#> SRR1699943 2 0.1662 0.5998 0.000 0.936 0.056 0.004 0.004
#> SRR1699944 2 0.1864 0.5949 0.000 0.924 0.068 0.004 0.004
#> SRR1699945 2 0.4260 0.1773 0.000 0.736 0.236 0.016 0.012
#> SRR1699946 2 0.1864 0.5949 0.000 0.924 0.068 0.004 0.004
#> SRR1699947 2 0.1798 0.5977 0.000 0.928 0.064 0.004 0.004
#> SRR1699948 2 0.1365 0.6010 0.000 0.952 0.040 0.004 0.004
#> SRR1699949 2 0.1525 0.6005 0.000 0.948 0.036 0.012 0.004
#> SRR1699950 2 0.1412 0.6051 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1699951 2 0.1478 0.6005 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.1798 0.5918 0.000 0.928 0.064 0.004 0.004
#> SRR1699953 2 0.1285 0.6056 0.000 0.956 0.036 0.004 0.004
#> SRR1699954 2 0.1901 0.6128 0.000 0.928 0.056 0.012 0.004
#> SRR1699955 2 0.1412 0.6171 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1699956 2 0.4369 0.1418 0.000 0.720 0.252 0.016 0.012
#> SRR1699957 2 0.2054 0.5971 0.000 0.916 0.072 0.008 0.004
#> SRR1699959 2 0.3414 0.5982 0.000 0.844 0.116 0.020 0.020
#> SRR1699958 2 0.1502 0.6029 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1699960 2 0.1484 0.6221 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1699961 2 0.1991 0.5976 0.000 0.916 0.076 0.004 0.004
#> SRR1699962 2 0.1788 0.6267 0.000 0.932 0.056 0.008 0.004
#> SRR1699963 2 0.2462 0.6104 0.000 0.880 0.112 0.008 0.000
#> SRR1699964 2 0.2249 0.6087 0.000 0.896 0.096 0.008 0.000
#> SRR1699965 2 0.1412 0.6171 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1699966 2 0.1908 0.6136 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1699967 2 0.1894 0.6070 0.000 0.920 0.072 0.008 0.000
#> SRR1699968 2 0.3196 0.5790 0.000 0.804 0.192 0.004 0.000
#> SRR1699969 2 0.2304 0.6155 0.000 0.892 0.100 0.008 0.000
#> SRR1699971 2 0.1928 0.5986 0.000 0.920 0.072 0.004 0.004
#> SRR1699970 2 0.2136 0.6045 0.000 0.904 0.088 0.008 0.000
#> SRR1699972 2 0.2095 0.6200 0.000 0.920 0.060 0.012 0.008
#> SRR1699973 2 0.2338 0.6172 0.000 0.884 0.112 0.004 0.000
#> SRR1699974 2 0.3728 0.5174 0.000 0.748 0.244 0.008 0.000
#> SRR1699975 2 0.2753 0.6159 0.000 0.856 0.136 0.008 0.000
#> SRR1699976 2 0.2358 0.6150 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1699977 2 0.2798 0.6115 0.000 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR1699978 3 0.6563 0.7574 0.000 0.424 0.452 0.088 0.036
#> SRR1699979 2 0.2798 0.6096 0.000 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR1699980 2 0.3196 0.5790 0.000 0.804 0.192 0.004 0.000
#> SRR1699981 2 0.3487 0.5702 0.000 0.780 0.212 0.008 0.000
#> SRR1699982 2 0.4231 0.5360 0.000 0.740 0.232 0.012 0.016
#> SRR1699983 2 0.2753 0.6149 0.000 0.856 0.136 0.008 0.000
#> SRR1699984 4 0.6049 0.2827 0.272 0.000 0.000 0.564 0.164
#> SRR1699985 2 0.2964 0.6124 0.000 0.840 0.152 0.004 0.004
#> SRR1699986 2 0.3796 0.4432 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.2011 0.6295 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000
#> SRR1699987 2 0.2929 0.6106 0.000 0.840 0.152 0.008 0.000
#> SRR1699989 2 0.3462 0.5905 0.000 0.792 0.196 0.000 0.012
#> SRR1699990 2 0.2798 0.6138 0.000 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR1699992 2 0.2411 0.6226 0.000 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1699991 2 0.4152 0.4210 0.000 0.692 0.296 0.012 0.000
#> SRR1699993 2 0.4387 0.2826 0.000 0.640 0.348 0.012 0.000
#> SRR1699994 2 0.3246 0.5816 0.000 0.808 0.184 0.008 0.000
#> SRR1699995 3 0.6452 0.6980 0.000 0.340 0.500 0.152 0.008
#> SRR1699996 2 0.1952 0.6247 0.000 0.912 0.084 0.004 0.000
#> SRR1699997 2 0.2583 0.6217 0.000 0.864 0.132 0.004 0.000
#> SRR1699998 2 0.2077 0.6212 0.000 0.908 0.084 0.008 0.000
#> SRR1699999 2 0.6038 -0.7339 0.000 0.452 0.444 0.100 0.004
#> SRR1700000 2 0.2536 0.6239 0.000 0.868 0.128 0.004 0.000
#> SRR1700002 2 0.2411 0.6105 0.000 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1700001 2 0.2488 0.6272 0.000 0.872 0.124 0.004 0.000
#> SRR1700003 2 0.2411 0.6152 0.000 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1700004 2 0.3210 0.5636 0.000 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1700005 1 0.3779 0.6841 0.752 0.000 0.000 0.012 0.236
#> SRR1700006 2 0.1764 0.6155 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1700007 2 0.1628 0.6211 0.000 0.936 0.056 0.008 0.000
#> SRR1700008 2 0.3884 0.4537 0.000 0.708 0.288 0.004 0.000
#> SRR1700009 5 0.4047 0.4213 0.320 0.000 0.000 0.004 0.676
#> SRR1700010 2 0.4342 0.1472 0.000 0.724 0.248 0.016 0.012
#> SRR1700011 2 0.1484 0.6228 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700013 2 0.1197 0.6282 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700012 2 0.1518 0.6176 0.000 0.944 0.048 0.004 0.004
#> SRR1700014 2 0.3762 0.5269 0.000 0.748 0.244 0.004 0.004
#> SRR1700015 2 0.1430 0.6316 0.000 0.944 0.052 0.004 0.000
#> SRR1700016 4 0.5491 0.3717 0.000 0.032 0.068 0.684 0.216
#> SRR1700018 2 0.2054 0.5981 0.000 0.916 0.072 0.008 0.004
#> SRR1700017 2 0.2116 0.5936 0.000 0.912 0.076 0.008 0.004
#> SRR1700019 2 0.2172 0.6212 0.000 0.908 0.076 0.016 0.000
#> SRR1700020 2 0.4173 0.4781 0.000 0.760 0.204 0.028 0.008
#> SRR1700021 2 0.5090 0.3511 0.000 0.692 0.244 0.032 0.032
#> SRR1700023 2 0.2846 0.6165 0.000 0.864 0.120 0.008 0.008
#> SRR1700022 2 0.2967 0.6214 0.000 0.868 0.104 0.016 0.012
#> SRR1700024 2 0.3734 0.5316 0.000 0.752 0.240 0.004 0.004
#> SRR1700025 2 0.1662 0.6272 0.000 0.936 0.056 0.004 0.004
#> SRR1700026 2 0.2497 0.6262 0.000 0.880 0.112 0.004 0.004
#> SRR1700027 2 0.2798 0.6182 0.000 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR1700028 2 0.2054 0.6299 0.000 0.916 0.072 0.008 0.004
#> SRR1700029 2 0.4138 0.4851 0.000 0.708 0.276 0.016 0.000
#> SRR1700030 2 0.3631 0.5901 0.000 0.804 0.172 0.012 0.012
#> SRR1700031 2 0.3596 0.5514 0.000 0.776 0.212 0.012 0.000
#> SRR1700032 2 0.2124 0.6279 0.000 0.900 0.096 0.004 0.000
#> SRR1700034 3 0.6930 0.7095 0.000 0.392 0.440 0.132 0.036
#> SRR1700035 2 0.3715 0.5031 0.000 0.736 0.260 0.000 0.004
#> SRR1700033 2 0.3582 0.5477 0.000 0.768 0.224 0.008 0.000
#> SRR1700036 2 0.3612 0.5004 0.000 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1700037 2 0.4241 0.4782 0.000 0.716 0.264 0.008 0.012
#> SRR1700038 2 0.4173 0.4073 0.000 0.688 0.300 0.000 0.012
#> SRR1700039 2 0.4481 -0.0589 0.000 0.576 0.416 0.008 0.000
#> SRR1700040 2 0.4262 0.4341 0.000 0.696 0.288 0.012 0.004
#> SRR1700041 2 0.4127 0.3975 0.000 0.680 0.312 0.008 0.000
#> SRR1700042 2 0.4173 0.4257 0.000 0.688 0.300 0.012 0.000
#> SRR1700043 2 0.5042 0.2228 0.000 0.628 0.332 0.012 0.028
#> SRR1700045 2 0.4416 0.2554 0.000 0.632 0.356 0.012 0.000
#> SRR1700044 2 0.3968 0.4552 0.000 0.716 0.276 0.004 0.004
#> SRR1700046 2 0.4235 0.3328 0.000 0.656 0.336 0.008 0.000
#> SRR1700047 2 0.4298 0.2690 0.000 0.640 0.352 0.008 0.000
#> SRR1700048 2 0.4130 0.4298 0.000 0.696 0.292 0.012 0.000
#> SRR1700049 2 0.4597 -0.1305 0.000 0.564 0.424 0.012 0.000
#> SRR1700050 3 0.4561 0.5177 0.000 0.488 0.504 0.008 0.000
#> SRR1700051 3 0.5466 0.7461 0.000 0.424 0.520 0.052 0.004
#> SRR1700052 2 0.4537 0.0670 0.000 0.592 0.396 0.012 0.000
#> SRR1700053 2 0.4108 0.4095 0.000 0.684 0.308 0.008 0.000
#> SRR1700054 2 0.4183 0.3552 0.000 0.668 0.324 0.008 0.000
#> SRR1700055 3 0.7514 0.5817 0.000 0.288 0.444 0.212 0.056
#> SRR1700056 2 0.4331 0.1161 0.000 0.596 0.400 0.004 0.000
#> SRR1700057 2 0.4878 -0.2237 0.000 0.536 0.440 0.024 0.000
#> SRR1700058 2 0.4482 0.1864 0.000 0.612 0.376 0.012 0.000
#> SRR1700059 2 0.4557 0.0634 0.000 0.584 0.404 0.012 0.000
#> SRR1700060 2 0.4165 0.3729 0.000 0.672 0.320 0.008 0.000
#> SRR1700061 2 0.4147 0.3850 0.000 0.676 0.316 0.008 0.000
#> SRR1700062 2 0.4403 0.1936 0.000 0.608 0.384 0.008 0.000
#> SRR1700063 2 0.4354 0.2313 0.000 0.624 0.368 0.008 0.000
#> SRR1700064 2 0.4165 0.3764 0.000 0.672 0.320 0.008 0.000
#> SRR1700065 2 0.4084 0.3461 0.000 0.668 0.328 0.004 0.000
#> SRR1700066 2 0.4067 0.4150 0.000 0.692 0.300 0.008 0.000
#> SRR1700067 2 0.4067 0.4242 0.000 0.692 0.300 0.008 0.000
#> SRR1700068 2 0.4299 0.1607 0.000 0.608 0.388 0.004 0.000
#> SRR1700069 2 0.4046 0.4263 0.000 0.696 0.296 0.008 0.000
#> SRR1700070 2 0.2763 0.6145 0.000 0.848 0.148 0.004 0.000
#> SRR1700071 2 0.4147 0.3789 0.000 0.676 0.316 0.008 0.000
#> SRR1700072 2 0.5268 0.2172 0.000 0.624 0.324 0.020 0.032
#> SRR1700073 2 0.4066 0.3671 0.000 0.672 0.324 0.000 0.004
#> SRR1700075 2 0.4283 0.3018 0.000 0.644 0.348 0.008 0.000
#> SRR1700074 2 0.4088 0.4127 0.000 0.688 0.304 0.008 0.000
#> SRR1700076 2 0.3910 0.4695 0.000 0.720 0.272 0.008 0.000
#> SRR1700077 2 0.4183 0.3703 0.000 0.668 0.324 0.008 0.000
#> SRR1700078 2 0.3884 0.4549 0.000 0.708 0.288 0.004 0.000
#> SRR1700080 2 0.3885 0.4821 0.000 0.724 0.268 0.008 0.000
#> SRR1700079 2 0.4505 0.1647 0.000 0.604 0.384 0.012 0.000
#> SRR1700081 2 0.4183 0.3559 0.000 0.668 0.324 0.008 0.000
#> SRR1700082 2 0.2463 0.6133 0.000 0.888 0.100 0.008 0.004
#> SRR1700083 2 0.4046 0.4272 0.000 0.696 0.296 0.008 0.000
#> SRR1700084 2 0.4047 0.3749 0.000 0.676 0.320 0.004 0.000
#> SRR1700085 2 0.3534 0.5181 0.000 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR1700086 2 0.3910 0.4765 0.000 0.720 0.272 0.008 0.000
#> SRR1700087 2 0.1628 0.6087 0.000 0.936 0.056 0.008 0.000
#> SRR1700088 2 0.1484 0.6129 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700089 2 0.1484 0.6183 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700091 2 0.1197 0.6163 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700090 2 0.2763 0.6147 0.000 0.848 0.148 0.004 0.000
#> SRR1700092 2 0.1502 0.6170 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1700094 2 0.1557 0.6156 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700093 2 0.2074 0.6278 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1700095 2 0.6530 -0.3589 0.000 0.556 0.308 0.084 0.052
#> SRR1700096 2 0.1571 0.6235 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1700097 2 0.4597 0.4804 0.000 0.744 0.200 0.036 0.020
#> SRR1700098 2 0.1331 0.6119 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700099 2 0.1557 0.6215 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700100 2 0.1205 0.6153 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1700101 2 0.1557 0.6117 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700102 2 0.1197 0.6116 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700104 2 0.1410 0.6253 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700103 2 0.2020 0.6295 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1700105 2 0.2513 0.6243 0.000 0.876 0.116 0.008 0.000
#> SRR1700106 2 0.2377 0.6171 0.000 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR1700107 2 0.1991 0.6306 0.000 0.916 0.076 0.004 0.004
#> SRR1700108 2 0.2052 0.6257 0.000 0.912 0.080 0.004 0.004
#> SRR1700109 2 0.2463 0.6220 0.000 0.888 0.100 0.008 0.004
#> SRR1700110 2 0.3129 0.5933 0.000 0.832 0.156 0.008 0.004
#> SRR1700112 2 0.3439 0.5758 0.000 0.800 0.188 0.008 0.004
#> SRR1700111 2 0.3807 0.5752 0.000 0.776 0.204 0.008 0.012
#> SRR1700113 2 0.3548 0.5781 0.000 0.796 0.188 0.004 0.012
#> SRR1700114 2 0.1410 0.6269 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700115 2 0.1704 0.6236 0.000 0.928 0.068 0.004 0.000
#> SRR1700116 2 0.3047 0.6142 0.000 0.832 0.160 0.004 0.004
#> SRR1700117 3 0.4560 0.5423 0.000 0.484 0.508 0.008 0.000
#> SRR1700119 2 0.4070 0.5012 0.000 0.728 0.256 0.004 0.012
#> SRR1700118 2 0.3983 0.3249 0.000 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR1700120 2 0.3790 0.4939 0.000 0.724 0.272 0.004 0.000
#> SRR1700121 2 0.3705 0.5813 0.000 0.788 0.192 0.012 0.008
#> SRR1700122 2 0.4426 0.1850 0.000 0.612 0.380 0.004 0.004
#> SRR1700123 2 0.4604 0.0735 0.000 0.584 0.404 0.008 0.004
#> SRR1700125 2 0.3365 0.5809 0.000 0.808 0.180 0.008 0.004
#> SRR1700126 2 0.4066 0.3812 0.000 0.672 0.324 0.004 0.000
#> SRR1700127 2 0.4015 0.2998 0.000 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR1700124 2 0.4171 0.1572 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1700128 2 0.4201 0.0959 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1700129 2 0.4171 0.1498 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1700130 2 0.4321 0.1395 0.000 0.600 0.396 0.004 0.000
#> SRR1700132 2 0.4251 0.2185 0.000 0.624 0.372 0.004 0.000
#> SRR1700131 2 0.4101 0.2242 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1700133 2 0.4251 0.2494 0.000 0.624 0.372 0.004 0.000
#> SRR1700134 2 0.4161 0.1720 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700135 2 0.4528 -0.1702 0.000 0.548 0.444 0.008 0.000
#> SRR1700136 2 0.4310 0.1354 0.000 0.604 0.392 0.004 0.000
#> SRR1700137 2 0.4150 0.1821 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700138 2 0.4251 0.2406 0.000 0.624 0.372 0.000 0.004
#> SRR1700140 2 0.4310 0.1578 0.000 0.604 0.392 0.004 0.000
#> SRR1700139 2 0.4161 0.1757 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700141 2 0.4161 0.1700 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700142 2 0.4397 -0.0705 0.000 0.564 0.432 0.004 0.000
#> SRR1700143 2 0.4310 0.1395 0.000 0.604 0.392 0.004 0.000
#> SRR1700144 2 0.4321 0.1551 0.000 0.600 0.396 0.004 0.000
#> SRR1700145 2 0.4637 -0.2553 0.000 0.536 0.452 0.012 0.000
#> SRR1700146 2 0.4161 0.1700 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700147 2 0.4126 0.2112 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700149 2 0.4658 -0.4805 0.000 0.504 0.484 0.012 0.000
#> SRR1700148 2 0.4219 0.0791 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1700150 2 0.4060 0.2904 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1700152 2 0.4138 0.2009 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1700151 2 0.4182 0.1388 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1700153 2 0.4276 0.2011 0.000 0.616 0.380 0.004 0.000
#> SRR1700154 2 0.4126 0.2116 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700155 2 0.4150 0.1939 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700156 2 0.4264 0.2010 0.000 0.620 0.376 0.004 0.000
#> SRR1700158 2 0.4590 -0.0806 0.000 0.568 0.420 0.012 0.000
#> SRR1700159 2 0.4161 0.1720 0.000 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1700157 2 0.4494 0.1750 0.000 0.608 0.380 0.012 0.000
#> SRR1700160 2 0.4201 0.0988 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1700161 2 0.4192 0.1264 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1700162 2 0.4171 0.1498 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1700164 3 0.5949 0.7505 0.000 0.432 0.492 0.048 0.028
#> SRR1700163 2 0.5396 -0.5467 0.000 0.492 0.464 0.032 0.012
#> SRR1700165 2 0.4362 0.2750 0.000 0.632 0.360 0.004 0.004
#> SRR1700166 2 0.4138 0.2101 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1700168 2 0.4088 0.4759 0.000 0.712 0.276 0.008 0.004
#> SRR1700167 2 0.5107 -0.3862 0.000 0.520 0.448 0.028 0.004
#> SRR1700170 2 0.4264 0.2307 0.000 0.620 0.376 0.000 0.004
#> SRR1700169 2 0.4402 0.2378 0.000 0.620 0.372 0.004 0.004
#> SRR1700171 2 0.6752 -0.7115 0.000 0.456 0.404 0.096 0.044
#> SRR1700172 2 0.4325 0.4138 0.000 0.684 0.300 0.004 0.012
#> SRR1700174 2 0.4009 0.4013 0.000 0.684 0.312 0.000 0.004
#> SRR1700173 2 0.3675 0.5660 0.000 0.772 0.216 0.004 0.008
#> SRR1700175 2 0.4151 0.3313 0.000 0.652 0.344 0.000 0.004
#> SRR1700176 2 0.4118 0.3369 0.000 0.660 0.336 0.004 0.000
#> SRR1700178 2 0.1251 0.6017 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700177 2 0.4270 0.3303 0.000 0.656 0.336 0.004 0.004
#> SRR1700180 2 0.1408 0.6024 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1700179 2 0.1251 0.6017 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700181 2 0.1168 0.5997 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700183 1 0.0703 0.8413 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700182 2 0.1251 0.6017 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700184 2 0.1251 0.6017 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700186 2 0.1331 0.6035 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700187 5 0.3783 0.5508 0.216 0.000 0.004 0.012 0.768
#> SRR1700185 1 0.3333 0.7572 0.788 0.000 0.000 0.004 0.208
#> SRR1700188 2 0.1251 0.6017 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700192 5 0.4308 0.3179 0.000 0.052 0.104 0.040 0.804
#> SRR1700190 2 0.7181 -0.2800 0.000 0.432 0.392 0.076 0.100
#> SRR1700191 1 0.0162 0.8388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700189 5 0.5261 0.5063 0.196 0.000 0.080 0.020 0.704
#> SRR1700193 2 0.1331 0.6052 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700195 2 0.1267 0.6149 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700194 1 0.0963 0.8409 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700196 2 0.1059 0.6074 0.000 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR1700197 2 0.7181 -0.2800 0.000 0.432 0.392 0.076 0.100
#> SRR1700198 2 0.1442 0.6130 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700199 2 0.1605 0.6096 0.000 0.944 0.040 0.012 0.004
#> SRR1700200 2 0.1787 0.6195 0.000 0.936 0.044 0.016 0.004
#> SRR1700201 2 0.1059 0.6161 0.000 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR1700202 2 0.7256 -0.6002 0.000 0.452 0.360 0.076 0.112
#> SRR1700203 2 0.1356 0.6115 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700204 2 0.1356 0.6100 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700206 2 0.1442 0.6077 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700207 2 0.1243 0.6148 0.000 0.960 0.028 0.008 0.004
#> SRR1700208 2 0.7181 -0.2800 0.000 0.432 0.392 0.076 0.100
#> SRR1700205 2 0.7077 -0.5795 0.000 0.476 0.352 0.068 0.104
#> SRR1700209 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700210 2 0.3206 0.6133 0.000 0.856 0.108 0.024 0.012
#> SRR1700211 2 0.2414 0.6281 0.000 0.900 0.080 0.012 0.008
#> SRR1700212 2 0.1605 0.6146 0.000 0.944 0.040 0.012 0.004
#> SRR1700213 2 0.2130 0.6194 0.000 0.908 0.080 0.012 0.000
#> SRR1700214 2 0.1442 0.6130 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700215 1 0.0290 0.8405 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.1830 0.6152 0.000 0.932 0.052 0.012 0.004
#> SRR1700216 1 0.0609 0.8419 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700218 2 0.0992 0.6101 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1700219 2 0.1243 0.6148 0.000 0.960 0.028 0.008 0.004
#> SRR1700222 5 0.4199 0.4893 0.296 0.000 0.004 0.008 0.692
#> SRR1700220 2 0.1267 0.6124 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700221 2 0.1356 0.6089 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700223 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700224 2 0.1787 0.6117 0.000 0.936 0.044 0.016 0.004
#> SRR1700226 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700229 2 0.1412 0.6104 0.000 0.952 0.036 0.008 0.004
#> SRR1700225 2 0.1410 0.6193 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700230 5 0.4956 0.2764 0.000 0.056 0.124 0.060 0.760
#> SRR1700231 2 0.1267 0.6059 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700228 2 0.1764 0.6270 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1700232 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700233 2 0.1356 0.6110 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700234 2 0.3553 0.6037 0.000 0.832 0.128 0.024 0.016
#> SRR1700235 2 0.1442 0.6091 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700237 2 0.1356 0.6110 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700236 2 0.1267 0.6120 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700238 2 0.1442 0.6091 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700239 5 0.4033 0.5512 0.236 0.000 0.004 0.016 0.744
#> SRR1700240 1 0.3607 0.7200 0.752 0.000 0.000 0.004 0.244
#> SRR1700241 2 0.3689 0.5295 0.000 0.740 0.256 0.004 0.000
#> SRR1700243 2 0.1267 0.6107 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700244 2 0.1442 0.6099 0.000 0.952 0.032 0.012 0.004
#> SRR1700242 5 0.6120 0.0853 0.000 0.120 0.156 0.060 0.664
#> SRR1700246 2 0.3644 0.5977 0.000 0.824 0.136 0.024 0.016
#> SRR1700245 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700247 5 0.4061 0.5505 0.240 0.000 0.004 0.016 0.740
#> SRR1700249 1 0.3766 0.6921 0.728 0.000 0.000 0.004 0.268
#> SRR1700250 2 0.1267 0.6091 0.000 0.960 0.024 0.012 0.004
#> SRR1700248 2 0.1605 0.6096 0.000 0.944 0.040 0.012 0.004
#> SRR1700251 2 0.1525 0.6133 0.000 0.948 0.036 0.012 0.004
#> SRR1700252 2 0.1571 0.6171 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1700253 2 0.1525 0.6133 0.000 0.948 0.036 0.012 0.004
#> SRR1700256 2 0.1356 0.6069 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700254 1 0.3969 0.6370 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1700255 2 0.1525 0.6133 0.000 0.948 0.036 0.012 0.004
#> SRR1700257 2 0.1356 0.6115 0.000 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1700258 2 0.1444 0.6142 0.000 0.948 0.040 0.012 0.000
#> SRR1700259 2 0.1557 0.6193 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1700260 2 0.1484 0.6186 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700261 2 0.1484 0.6186 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1700262 2 0.1701 0.6204 0.000 0.936 0.048 0.016 0.000
#> SRR1700263 2 0.1628 0.6182 0.000 0.936 0.056 0.008 0.000
#> SRR1700264 2 0.1168 0.6053 0.000 0.960 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700265 2 0.5399 0.3044 0.000 0.692 0.216 0.044 0.048
#> SRR1700266 2 0.1205 0.6082 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1700268 2 0.2488 0.6100 0.000 0.872 0.124 0.004 0.000
#> SRR1700270 2 0.1331 0.6140 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700267 2 0.1408 0.6162 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1700271 2 0.1670 0.6214 0.000 0.936 0.052 0.012 0.000
#> SRR1700272 2 0.1774 0.6202 0.000 0.932 0.052 0.016 0.000
#> SRR1700273 2 0.1331 0.6175 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700274 2 0.1788 0.6246 0.000 0.932 0.056 0.008 0.004
#> SRR1700277 2 0.4486 0.0817 0.000 0.688 0.288 0.012 0.012
#> SRR1700275 2 0.2957 0.6096 0.000 0.860 0.120 0.012 0.008
#> SRR1700276 2 0.3145 0.6111 0.000 0.844 0.136 0.012 0.008
#> SRR1700278 2 0.3905 0.5238 0.000 0.752 0.232 0.004 0.012
#> SRR1700279 2 0.3935 0.5414 0.000 0.760 0.220 0.008 0.012
#> SRR1700280 2 0.3904 0.5420 0.000 0.764 0.216 0.008 0.012
#> SRR1700281 2 0.1670 0.6210 0.000 0.936 0.052 0.012 0.000
#> SRR1700283 2 0.3107 0.6022 0.000 0.852 0.124 0.016 0.008
#> SRR1700282 2 0.5681 0.0623 0.000 0.640 0.272 0.040 0.048
#> SRR1700284 2 0.4025 0.5233 0.000 0.748 0.232 0.008 0.012
#> SRR1700285 2 0.3734 0.5415 0.000 0.752 0.240 0.004 0.004
#> SRR1700286 2 0.1671 0.6289 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1700287 2 0.4054 0.5243 0.000 0.744 0.236 0.008 0.012
#> SRR1700290 3 0.6567 0.7314 0.000 0.404 0.476 0.056 0.064
#> SRR1700289 2 0.3996 0.5471 0.000 0.752 0.228 0.008 0.012
#> SRR1700288 2 0.2672 0.6179 0.000 0.872 0.116 0.008 0.004
#> SRR1700292 2 0.3597 0.5747 0.000 0.800 0.180 0.008 0.012
#> SRR1700291 2 0.4262 0.4303 0.000 0.696 0.288 0.004 0.012
#> SRR1700293 2 0.3737 0.5421 0.000 0.764 0.224 0.004 0.008
#> SRR1700294 2 0.4045 0.2858 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1700295 3 0.6098 0.7241 0.000 0.456 0.460 0.040 0.044
#> SRR1700297 2 0.4134 0.4819 0.000 0.720 0.264 0.008 0.008
#> SRR1700296 2 0.4289 0.4563 0.000 0.708 0.272 0.008 0.012
#> SRR1700298 2 0.4318 0.4102 0.000 0.688 0.296 0.008 0.008
#> SRR1700299 2 0.4126 0.2056 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700300 2 0.4211 0.2628 0.000 0.636 0.360 0.004 0.000
#> SRR1700302 2 0.4253 0.3546 0.000 0.660 0.332 0.004 0.004
#> SRR1700301 2 0.4289 0.4596 0.000 0.708 0.272 0.008 0.012
#> SRR1700303 2 0.4265 0.4641 0.000 0.712 0.268 0.008 0.012
#> SRR1700304 2 0.5504 0.1518 0.000 0.624 0.308 0.028 0.040
#> SRR1700305 2 0.4047 0.3628 0.000 0.676 0.320 0.000 0.004
#> SRR1700306 2 0.4060 0.2738 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1700308 2 0.4059 0.4280 0.000 0.700 0.292 0.004 0.004
#> SRR1700307 2 0.4150 0.1852 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700309 2 0.4359 0.0702 0.000 0.584 0.412 0.004 0.000
#> SRR1700310 2 0.4305 0.4090 0.000 0.688 0.296 0.004 0.012
#> SRR1700311 2 0.4150 0.1739 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700312 2 0.4081 0.4313 0.000 0.696 0.296 0.004 0.004
#> SRR1700313 2 0.4138 0.2060 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1700314 2 0.4150 0.1793 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700315 2 0.4276 0.2003 0.000 0.616 0.380 0.000 0.004
#> SRR1700316 2 0.4114 0.2167 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000
#> SRR1700317 2 0.3817 0.5035 0.000 0.740 0.252 0.004 0.004
#> SRR1700318 2 0.5355 0.1930 0.000 0.632 0.308 0.024 0.036
#> SRR1700319 2 0.4126 0.2126 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700320 2 0.3999 0.3205 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR1700322 2 0.4151 0.3232 0.000 0.652 0.344 0.004 0.000
#> SRR1700321 2 0.3762 0.5297 0.000 0.748 0.244 0.004 0.004
#> SRR1700323 2 0.4126 0.2077 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1700324 2 0.4336 0.4473 0.000 0.700 0.280 0.008 0.012
#> SRR1700325 2 0.3845 0.5483 0.000 0.760 0.224 0.004 0.012
#> SRR1700326 2 0.7223 -0.4582 0.000 0.472 0.304 0.044 0.180
#> SRR1700327 2 0.1894 0.6272 0.000 0.920 0.072 0.008 0.000
#> SRR1700329 2 0.4122 0.4280 0.000 0.688 0.304 0.004 0.004
#> SRR1700328 2 0.4851 0.3818 0.000 0.680 0.276 0.012 0.032
#> SRR1700330 2 0.5145 0.1845 0.000 0.624 0.332 0.020 0.024
#> SRR1700331 2 0.4159 0.4686 0.000 0.716 0.268 0.008 0.008
#> SRR1700332 2 0.3670 0.5725 0.000 0.792 0.188 0.008 0.012
#> SRR1700333 2 0.4240 0.4330 0.000 0.700 0.284 0.004 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.1895 0.60372 0.000 0.912 0.072 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699875 2 0.1584 0.57828 0.000 0.928 0.064 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699876 2 0.4527 0.39376 0.000 0.672 0.272 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699877 2 0.2094 0.60100 0.000 0.900 0.080 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699879 2 0.1895 0.60136 0.000 0.912 0.072 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699878 2 0.2147 0.59825 0.000 0.896 0.084 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699880 2 0.1745 0.58527 0.000 0.920 0.068 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699881 2 0.2019 0.59483 0.000 0.900 0.088 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699882 2 0.2094 0.60452 0.000 0.900 0.080 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699883 2 0.2094 0.60029 0.000 0.900 0.080 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699884 2 0.2214 0.60019 0.000 0.888 0.096 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699885 2 0.1967 0.60447 0.000 0.904 0.084 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699886 2 0.4465 0.41542 0.000 0.684 0.260 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699888 2 0.4465 0.41520 0.000 0.684 0.260 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699889 2 0.4605 0.37885 0.000 0.664 0.276 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699890 2 0.4486 0.40667 0.000 0.680 0.264 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699887 2 0.4202 0.46722 0.000 0.716 0.236 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699891 2 0.4605 0.37885 0.000 0.664 0.276 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699892 2 0.3821 0.49873 0.000 0.740 0.220 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699893 2 0.3860 0.49794 0.000 0.728 0.236 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699894 2 0.4605 0.37885 0.000 0.664 0.276 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699895 2 0.4605 0.37885 0.000 0.664 0.276 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699896 2 0.4676 0.36667 0.000 0.664 0.268 0.004 0.060 0.004
#> SRR1699897 2 0.2450 0.60516 0.000 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699898 2 0.4011 0.42324 0.000 0.672 0.304 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699900 2 0.4565 0.37806 0.000 0.672 0.268 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699899 2 0.4449 0.39548 0.000 0.672 0.272 0.000 0.052 0.004
#> SRR1699902 2 0.5128 -0.40660 0.000 0.476 0.464 0.024 0.036 0.000
#> SRR1699901 2 0.5128 -0.40660 0.000 0.476 0.464 0.024 0.036 0.000
#> SRR1699903 2 0.4520 0.36446 0.000 0.656 0.296 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699904 2 0.4914 0.34943 0.000 0.648 0.276 0.012 0.060 0.004
#> SRR1699905 3 0.6313 0.63923 0.000 0.364 0.496 0.056 0.064 0.020
#> SRR1699906 2 0.4890 0.26047 0.000 0.616 0.324 0.012 0.044 0.004
#> SRR1699907 2 0.4838 0.32409 0.000 0.640 0.296 0.012 0.048 0.004
#> SRR1699908 2 0.4465 0.39802 0.000 0.668 0.284 0.004 0.040 0.004
#> SRR1699909 2 0.4808 0.19296 0.000 0.596 0.356 0.012 0.032 0.004
#> SRR1699910 3 0.5728 0.61948 0.000 0.412 0.492 0.052 0.036 0.008
#> SRR1699911 2 0.5393 0.12703 0.000 0.584 0.332 0.016 0.052 0.016
#> SRR1699912 2 0.4752 0.32601 0.000 0.640 0.304 0.012 0.040 0.004
#> SRR1699913 2 0.4708 0.30543 0.000 0.632 0.316 0.008 0.040 0.004
#> SRR1699914 3 0.5728 0.61652 0.000 0.412 0.492 0.052 0.036 0.008
#> SRR1699915 3 0.5839 0.52928 0.000 0.444 0.456 0.048 0.040 0.012
#> SRR1699916 2 0.4752 0.26697 0.000 0.620 0.328 0.008 0.040 0.004
#> SRR1699917 2 0.4060 0.46082 0.000 0.684 0.284 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699918 2 0.4806 0.23945 0.000 0.604 0.344 0.008 0.040 0.004
#> SRR1699919 2 0.5031 0.13132 0.000 0.588 0.352 0.024 0.032 0.004
#> SRR1699920 3 0.5668 0.62466 0.000 0.404 0.504 0.048 0.036 0.008
#> SRR1699921 3 0.5728 0.61948 0.000 0.412 0.492 0.052 0.036 0.008
#> SRR1699922 2 0.4697 0.35059 0.000 0.644 0.296 0.004 0.052 0.004
#> SRR1699923 3 0.5007 0.42647 0.000 0.464 0.484 0.024 0.028 0.000
#> SRR1699924 2 0.4719 -0.28930 0.000 0.500 0.464 0.012 0.024 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.81560 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.5378 0.18357 0.000 0.600 0.312 0.016 0.056 0.016
#> SRR1699927 2 0.4581 0.36061 0.000 0.652 0.296 0.004 0.044 0.004
#> SRR1699929 2 0.4342 0.42551 0.000 0.692 0.252 0.000 0.052 0.004
#> SRR1699928 2 0.4844 0.26359 0.000 0.616 0.328 0.012 0.040 0.004
#> SRR1699930 2 0.4581 0.35831 0.000 0.652 0.296 0.004 0.044 0.004
#> SRR1699931 2 0.4099 0.45476 0.000 0.708 0.244 0.000 0.048 0.000
#> SRR1699933 2 0.3979 0.45877 0.000 0.708 0.256 0.000 0.036 0.000
#> SRR1699932 2 0.4526 0.38509 0.000 0.664 0.284 0.004 0.044 0.004
#> SRR1699934 1 0.0000 0.81560 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.3950 0.49799 0.000 0.720 0.240 0.000 0.040 0.000
#> SRR1699936 2 0.0972 0.58423 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699937 2 0.1745 0.57793 0.000 0.920 0.068 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699938 2 0.1049 0.58669 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699940 2 0.2121 0.58339 0.000 0.892 0.096 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699939 2 0.1049 0.58589 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699941 2 0.2170 0.59320 0.000 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699942 2 0.1858 0.58032 0.000 0.912 0.076 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699943 2 0.1563 0.58251 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699944 2 0.1745 0.57793 0.000 0.920 0.068 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699945 2 0.4544 0.16544 0.000 0.712 0.092 0.008 0.188 0.000
#> SRR1699946 2 0.1745 0.57793 0.000 0.920 0.068 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699947 2 0.1625 0.57942 0.000 0.928 0.060 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699948 2 0.1225 0.58210 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699949 2 0.1151 0.58188 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699950 2 0.1049 0.58589 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699951 2 0.1531 0.58654 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699952 2 0.1686 0.57522 0.000 0.924 0.064 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699953 2 0.1151 0.58627 0.000 0.956 0.032 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699954 2 0.1829 0.60131 0.000 0.920 0.056 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699955 2 0.1265 0.59906 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699956 2 0.4747 0.09475 0.000 0.688 0.100 0.008 0.204 0.000
#> SRR1699957 2 0.1895 0.57985 0.000 0.912 0.072 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699959 2 0.3455 0.57100 0.000 0.816 0.128 0.004 0.048 0.004
#> SRR1699958 2 0.1462 0.59064 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699960 2 0.1411 0.60411 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699961 2 0.1858 0.58021 0.000 0.912 0.076 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699962 2 0.1643 0.60828 0.000 0.924 0.068 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699963 2 0.2450 0.58861 0.000 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699964 2 0.2170 0.58994 0.000 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699965 2 0.1265 0.59906 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699966 2 0.1970 0.59495 0.000 0.900 0.092 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699967 2 0.1802 0.58867 0.000 0.916 0.072 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699968 2 0.3348 0.54088 0.000 0.768 0.216 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699969 2 0.2581 0.59124 0.000 0.856 0.128 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699971 2 0.1913 0.58144 0.000 0.908 0.080 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699970 2 0.2112 0.58362 0.000 0.896 0.088 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699972 2 0.2122 0.60723 0.000 0.900 0.076 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699973 2 0.2446 0.59610 0.000 0.864 0.124 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699974 2 0.3970 0.43460 0.000 0.692 0.280 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699975 2 0.2744 0.58972 0.000 0.840 0.144 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699976 2 0.2311 0.59335 0.000 0.880 0.104 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699977 2 0.2821 0.58340 0.000 0.832 0.152 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699978 3 0.6653 0.61512 0.000 0.324 0.500 0.084 0.068 0.024
#> SRR1699979 2 0.2821 0.58124 0.000 0.832 0.152 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699980 2 0.3348 0.54447 0.000 0.768 0.216 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699981 2 0.3645 0.51969 0.000 0.740 0.236 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699982 2 0.4094 0.46806 0.000 0.700 0.264 0.000 0.032 0.004
#> SRR1699983 2 0.2859 0.58540 0.000 0.828 0.156 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699984 4 0.4255 0.47900 0.224 0.000 0.000 0.708 0.000 0.068
#> SRR1699985 2 0.3201 0.56941 0.000 0.780 0.208 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699986 2 0.4118 0.31273 0.000 0.628 0.352 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699988 2 0.2121 0.60957 0.000 0.892 0.096 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699987 2 0.3071 0.57304 0.000 0.804 0.180 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699989 2 0.3645 0.53909 0.000 0.740 0.236 0.000 0.024 0.000
#> SRR1699990 2 0.2783 0.58720 0.000 0.836 0.148 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699992 2 0.2404 0.60077 0.000 0.872 0.112 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699991 2 0.4332 0.27913 0.000 0.616 0.352 0.000 0.032 0.000
#> SRR1699993 2 0.4410 0.03141 0.000 0.560 0.412 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699994 2 0.3487 0.52384 0.000 0.756 0.224 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699995 3 0.6722 0.36194 0.000 0.236 0.532 0.144 0.076 0.012
#> SRR1699996 2 0.2020 0.60731 0.000 0.896 0.096 0.000 0.008 0.000
#> SRR1699997 2 0.2692 0.59425 0.000 0.840 0.148 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699998 2 0.2060 0.59958 0.000 0.900 0.084 0.000 0.016 0.000
#> SRR1699999 3 0.6609 0.58729 0.000 0.364 0.456 0.100 0.072 0.008
#> SRR1700000 2 0.2750 0.59840 0.000 0.844 0.136 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700002 2 0.2404 0.59099 0.000 0.872 0.112 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700001 2 0.2805 0.59691 0.000 0.828 0.160 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700003 2 0.2450 0.59075 0.000 0.868 0.116 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700004 2 0.3405 0.49141 0.000 0.724 0.272 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700005 1 0.3615 0.62034 0.700 0.000 0.000 0.008 0.000 0.292
#> SRR1700006 2 0.1858 0.60315 0.000 0.912 0.076 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700007 2 0.1524 0.60450 0.000 0.932 0.060 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700008 2 0.4092 0.31727 0.000 0.636 0.344 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700009 6 0.3794 0.52221 0.248 0.000 0.000 0.028 0.000 0.724
#> SRR1700010 2 0.4703 0.10625 0.000 0.692 0.096 0.008 0.204 0.000
#> SRR1700011 2 0.1349 0.60605 0.000 0.940 0.056 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700013 2 0.1700 0.61303 0.000 0.916 0.080 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700012 2 0.1461 0.59778 0.000 0.940 0.044 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700014 2 0.3897 0.45879 0.000 0.696 0.280 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700015 2 0.1701 0.61435 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700016 4 0.3987 0.52552 0.000 0.020 0.044 0.812 0.032 0.092
#> SRR1700018 2 0.1838 0.58001 0.000 0.916 0.068 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700017 2 0.2006 0.57695 0.000 0.904 0.080 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700019 2 0.2070 0.60213 0.000 0.896 0.092 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700020 2 0.4549 0.38633 0.000 0.684 0.256 0.008 0.048 0.004
#> SRR1700021 2 0.5413 0.22045 0.000 0.624 0.272 0.028 0.068 0.008
#> SRR1700023 2 0.3101 0.58325 0.000 0.820 0.148 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700022 2 0.2784 0.59891 0.000 0.848 0.124 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700024 2 0.3970 0.45619 0.000 0.692 0.280 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700025 2 0.1866 0.61197 0.000 0.908 0.084 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700026 2 0.2748 0.60316 0.000 0.848 0.128 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700027 2 0.3088 0.58501 0.000 0.808 0.172 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700028 2 0.2170 0.60855 0.000 0.888 0.100 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700029 2 0.4355 0.36546 0.000 0.644 0.320 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700030 2 0.3921 0.54140 0.000 0.752 0.204 0.004 0.036 0.004
#> SRR1700031 2 0.3592 0.51391 0.000 0.740 0.240 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700032 2 0.2212 0.60656 0.000 0.880 0.112 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700034 3 0.7289 0.07588 0.000 0.256 0.392 0.068 0.272 0.012
#> SRR1700035 2 0.3952 0.41677 0.000 0.672 0.308 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700033 2 0.3766 0.48285 0.000 0.720 0.256 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700036 2 0.3853 0.42955 0.000 0.680 0.304 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700037 2 0.4270 0.38243 0.000 0.652 0.316 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700038 2 0.4328 0.27135 0.000 0.620 0.352 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700039 2 0.4753 -0.27718 0.000 0.496 0.456 0.000 0.048 0.000
#> SRR1700040 2 0.4357 0.29998 0.000 0.624 0.340 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700041 2 0.4289 0.26708 0.000 0.612 0.360 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700042 2 0.4210 0.32847 0.000 0.636 0.336 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700043 2 0.5216 -0.03147 0.000 0.548 0.384 0.012 0.048 0.008
#> SRR1700045 2 0.4542 0.04348 0.000 0.556 0.412 0.004 0.028 0.000
#> SRR1700044 2 0.4062 0.36172 0.000 0.660 0.316 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700046 2 0.4333 0.17569 0.000 0.596 0.376 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700047 2 0.4578 0.08060 0.000 0.568 0.396 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700048 2 0.4385 0.32419 0.000 0.636 0.328 0.004 0.032 0.000
#> SRR1700049 3 0.4808 0.33312 0.000 0.472 0.476 0.000 0.052 0.000
#> SRR1700050 3 0.4500 0.59722 0.000 0.392 0.572 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700051 3 0.5748 0.63129 0.000 0.316 0.568 0.052 0.060 0.004
#> SRR1700052 2 0.4553 -0.16003 0.000 0.520 0.452 0.008 0.020 0.000
#> SRR1700053 2 0.4251 0.30038 0.000 0.624 0.348 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700054 2 0.4367 0.21468 0.000 0.604 0.364 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700055 3 0.6350 -0.69798 0.000 0.024 0.480 0.116 0.360 0.020
#> SRR1700056 2 0.4256 -0.12925 0.000 0.520 0.464 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700057 2 0.5059 -0.34476 0.000 0.480 0.464 0.020 0.036 0.000
#> SRR1700058 2 0.4538 -0.06771 0.000 0.536 0.436 0.008 0.020 0.000
#> SRR1700059 2 0.4621 -0.13974 0.000 0.520 0.448 0.008 0.024 0.000
#> SRR1700060 2 0.4218 0.25994 0.000 0.616 0.360 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700061 2 0.4251 0.27939 0.000 0.624 0.348 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700062 2 0.4591 0.02522 0.000 0.552 0.408 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700063 2 0.4423 0.01087 0.000 0.552 0.420 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700064 2 0.4332 0.26842 0.000 0.616 0.352 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700065 2 0.4189 0.21142 0.000 0.604 0.376 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700066 2 0.4180 0.29386 0.000 0.628 0.348 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700067 2 0.4238 0.30737 0.000 0.628 0.344 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700068 2 0.4449 -0.06513 0.000 0.532 0.440 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700069 2 0.4210 0.31744 0.000 0.636 0.336 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700070 2 0.3103 0.57024 0.000 0.784 0.208 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700071 2 0.4344 0.24317 0.000 0.612 0.356 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700072 2 0.5335 -0.02685 0.000 0.552 0.376 0.012 0.040 0.020
#> SRR1700073 2 0.4199 0.20477 0.000 0.600 0.380 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700075 2 0.4109 0.12663 0.000 0.576 0.412 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700074 2 0.4193 0.29041 0.000 0.624 0.352 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700076 2 0.4045 0.36498 0.000 0.664 0.312 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700077 2 0.4241 0.24703 0.000 0.608 0.368 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700078 2 0.4224 0.32393 0.000 0.632 0.340 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700080 2 0.4101 0.39032 0.000 0.664 0.308 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700079 2 0.4663 0.00803 0.000 0.552 0.408 0.004 0.036 0.000
#> SRR1700081 2 0.4333 0.20495 0.000 0.596 0.376 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700082 2 0.2704 0.58770 0.000 0.844 0.140 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700083 2 0.4238 0.30429 0.000 0.628 0.344 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700084 2 0.4289 0.25051 0.000 0.612 0.360 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700085 2 0.3816 0.44421 0.000 0.688 0.296 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700086 2 0.4152 0.39350 0.000 0.664 0.304 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700087 2 0.1411 0.59560 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700088 2 0.1411 0.59981 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700089 2 0.1531 0.60503 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700091 2 0.1411 0.60218 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700090 2 0.2778 0.58986 0.000 0.824 0.168 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700092 2 0.1444 0.60485 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700094 2 0.1471 0.60023 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700093 2 0.2146 0.60838 0.000 0.880 0.116 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700095 2 0.6561 -0.41402 0.000 0.476 0.356 0.060 0.092 0.016
#> SRR1700096 2 0.1501 0.60813 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700097 2 0.4587 0.40006 0.000 0.692 0.244 0.008 0.048 0.008
#> SRR1700098 2 0.1411 0.60180 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700099 2 0.1588 0.60738 0.000 0.924 0.072 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700100 2 0.1267 0.60307 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700101 2 0.1471 0.59860 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700102 2 0.1411 0.59915 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700104 2 0.1644 0.60953 0.000 0.920 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700103 2 0.2100 0.61368 0.000 0.884 0.112 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700105 2 0.2595 0.59435 0.000 0.836 0.160 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700106 2 0.2482 0.59841 0.000 0.848 0.148 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700107 2 0.2053 0.61181 0.000 0.888 0.108 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700108 2 0.1958 0.60950 0.000 0.896 0.100 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700109 2 0.2302 0.59891 0.000 0.872 0.120 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700110 2 0.2882 0.56657 0.000 0.812 0.180 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700112 2 0.3161 0.53891 0.000 0.776 0.216 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700111 2 0.3770 0.51901 0.000 0.728 0.244 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700113 2 0.3665 0.51068 0.000 0.728 0.252 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700114 2 0.1700 0.61056 0.000 0.916 0.080 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700115 2 0.1610 0.60900 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700116 2 0.2948 0.58476 0.000 0.804 0.188 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700117 3 0.4283 0.61416 0.000 0.384 0.592 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700119 2 0.4064 0.37207 0.000 0.644 0.336 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700118 2 0.4025 0.12359 0.000 0.576 0.416 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700120 2 0.3898 0.36000 0.000 0.652 0.336 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700121 2 0.3558 0.52669 0.000 0.736 0.248 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700122 2 0.4314 -0.02181 0.000 0.536 0.444 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700123 2 0.4183 -0.15793 0.000 0.508 0.480 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700125 2 0.3133 0.54463 0.000 0.780 0.212 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700126 2 0.4131 0.23439 0.000 0.600 0.384 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700127 2 0.4123 0.09097 0.000 0.568 0.420 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700124 2 0.4091 -0.10060 0.000 0.520 0.472 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700128 2 0.3995 -0.13841 0.000 0.516 0.480 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700129 2 0.4089 -0.07711 0.000 0.524 0.468 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700130 2 0.3993 -0.09982 0.000 0.520 0.476 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700132 2 0.4305 -0.00739 0.000 0.544 0.436 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700131 2 0.4161 -0.02168 0.000 0.540 0.448 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700133 2 0.4238 0.03514 0.000 0.540 0.444 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700134 2 0.4083 -0.03204 0.000 0.532 0.460 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700135 3 0.4214 0.35750 0.000 0.460 0.528 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700136 2 0.4253 -0.10645 0.000 0.524 0.460 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700137 2 0.4250 -0.05706 0.000 0.528 0.456 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700138 2 0.4157 0.01575 0.000 0.544 0.444 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700140 2 0.4086 -0.08480 0.000 0.528 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700139 2 0.4083 -0.05639 0.000 0.532 0.460 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700141 2 0.4086 -0.05456 0.000 0.528 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700142 3 0.4097 0.23681 0.000 0.492 0.500 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700143 2 0.4089 -0.10381 0.000 0.524 0.468 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700144 2 0.4331 -0.11314 0.000 0.516 0.464 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700145 3 0.4293 0.41518 0.000 0.448 0.536 0.004 0.012 0.000
#> SRR1700146 2 0.4086 -0.05456 0.000 0.528 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700147 2 0.4080 -0.05101 0.000 0.536 0.456 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700149 3 0.4176 0.57875 0.000 0.404 0.580 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700148 2 0.4097 -0.17254 0.000 0.504 0.488 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700150 2 0.4039 0.09116 0.000 0.568 0.424 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700152 2 0.4083 -0.04907 0.000 0.532 0.460 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700151 2 0.4093 -0.11013 0.000 0.516 0.476 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700153 2 0.4080 -0.03059 0.000 0.536 0.456 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700154 2 0.4169 -0.03444 0.000 0.532 0.456 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700155 2 0.4086 -0.03864 0.000 0.528 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700156 2 0.4310 -0.03093 0.000 0.540 0.440 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700158 3 0.4468 0.31130 0.000 0.484 0.492 0.004 0.020 0.000
#> SRR1700159 2 0.4083 -0.03204 0.000 0.532 0.460 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700157 2 0.4591 -0.09139 0.000 0.516 0.452 0.004 0.028 0.000
#> SRR1700160 2 0.4091 -0.10324 0.000 0.520 0.472 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700161 2 0.3996 -0.13525 0.000 0.512 0.484 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700162 2 0.4089 -0.07711 0.000 0.524 0.468 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700164 3 0.6238 0.64552 0.000 0.356 0.504 0.060 0.068 0.012
#> SRR1700163 3 0.5255 0.61112 0.000 0.396 0.532 0.032 0.040 0.000
#> SRR1700165 2 0.4229 0.07091 0.000 0.548 0.436 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700166 2 0.4083 -0.01895 0.000 0.532 0.460 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700168 2 0.3725 0.40230 0.000 0.676 0.316 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700167 3 0.5162 0.53181 0.000 0.424 0.512 0.024 0.040 0.000
#> SRR1700170 2 0.4152 0.06720 0.000 0.548 0.440 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700169 2 0.4234 0.05394 0.000 0.544 0.440 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700171 3 0.6854 0.59649 0.000 0.368 0.444 0.084 0.080 0.024
#> SRR1700172 2 0.4252 0.25096 0.000 0.604 0.372 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700174 2 0.4037 0.24882 0.000 0.608 0.380 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700173 2 0.3534 0.52195 0.000 0.740 0.244 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700175 2 0.4002 0.17359 0.000 0.588 0.404 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700176 2 0.4168 0.15779 0.000 0.584 0.400 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700178 2 0.0935 0.58326 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700177 2 0.4101 0.17640 0.000 0.580 0.408 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700180 2 0.1152 0.58732 0.000 0.952 0.044 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700179 2 0.1010 0.58654 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700181 2 0.0935 0.58481 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700183 1 0.0790 0.81855 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700182 2 0.1010 0.58654 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700184 2 0.0935 0.58326 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700186 2 0.1010 0.58510 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700187 6 0.2925 0.65001 0.148 0.000 0.004 0.016 0.000 0.832
#> SRR1700185 1 0.3421 0.70725 0.736 0.000 0.000 0.008 0.000 0.256
#> SRR1700188 2 0.0935 0.58326 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700192 6 0.4572 0.46903 0.000 0.028 0.048 0.024 0.140 0.760
#> SRR1700190 5 0.6255 0.99214 0.000 0.308 0.072 0.012 0.540 0.068
#> SRR1700191 1 0.0146 0.81781 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700189 6 0.4583 0.62029 0.140 0.000 0.032 0.008 0.068 0.752
#> SRR1700193 2 0.1082 0.58989 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700195 2 0.1245 0.59814 0.000 0.952 0.032 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700194 1 0.0937 0.81999 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700196 2 0.0806 0.59284 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700197 5 0.6267 0.98447 0.000 0.312 0.072 0.012 0.536 0.068
#> SRR1700198 2 0.1391 0.59554 0.000 0.944 0.040 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700199 2 0.1616 0.59343 0.000 0.932 0.048 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700200 2 0.1909 0.59985 0.000 0.920 0.052 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700201 2 0.0806 0.59824 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700202 2 0.7723 -0.48938 0.000 0.380 0.340 0.064 0.136 0.080
#> SRR1700203 2 0.1320 0.59451 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700204 2 0.1367 0.59781 0.000 0.944 0.044 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700206 2 0.1461 0.59274 0.000 0.940 0.044 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700207 2 0.0972 0.59731 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700208 5 0.6255 0.99214 0.000 0.308 0.072 0.012 0.540 0.068
#> SRR1700205 2 0.7561 -0.48316 0.000 0.400 0.340 0.060 0.128 0.072
#> SRR1700209 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700210 2 0.3366 0.57782 0.000 0.824 0.128 0.004 0.036 0.008
#> SRR1700211 2 0.2517 0.60422 0.000 0.876 0.100 0.000 0.016 0.008
#> SRR1700212 2 0.1738 0.59724 0.000 0.928 0.052 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700213 2 0.2112 0.60544 0.000 0.896 0.088 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700214 2 0.1391 0.59554 0.000 0.944 0.040 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700215 1 0.0260 0.81942 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700217 2 0.1838 0.60167 0.000 0.916 0.068 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700216 1 0.0547 0.82104 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700218 2 0.1408 0.59857 0.000 0.944 0.036 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700219 2 0.0972 0.59731 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700222 6 0.3437 0.57444 0.236 0.000 0.004 0.008 0.000 0.752
#> SRR1700220 2 0.1320 0.59959 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700221 2 0.1605 0.59590 0.000 0.936 0.044 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700223 2 0.1320 0.59420 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700224 2 0.1765 0.59427 0.000 0.924 0.052 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700226 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700229 2 0.1297 0.59237 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700225 2 0.1411 0.60579 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700227 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700230 6 0.5165 0.42657 0.000 0.032 0.060 0.044 0.140 0.724
#> SRR1700231 2 0.1168 0.59244 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700228 2 0.1644 0.60954 0.000 0.920 0.076 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700232 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700233 2 0.1391 0.59548 0.000 0.944 0.040 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700234 2 0.3660 0.56255 0.000 0.800 0.144 0.004 0.044 0.008
#> SRR1700235 2 0.1391 0.59300 0.000 0.944 0.040 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700237 2 0.1334 0.59456 0.000 0.948 0.032 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700236 2 0.1334 0.59623 0.000 0.948 0.032 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700238 2 0.1461 0.59395 0.000 0.940 0.044 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700239 6 0.2946 0.64549 0.160 0.000 0.004 0.012 0.000 0.824
#> SRR1700240 1 0.3595 0.66701 0.704 0.000 0.000 0.008 0.000 0.288
#> SRR1700241 2 0.3819 0.45734 0.000 0.700 0.280 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700243 2 0.1390 0.59357 0.000 0.948 0.032 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700244 2 0.1410 0.59617 0.000 0.944 0.044 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700242 6 0.6383 0.21154 0.000 0.080 0.088 0.048 0.156 0.628
#> SRR1700246 2 0.3932 0.55368 0.000 0.784 0.148 0.008 0.052 0.008
#> SRR1700245 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700247 6 0.2982 0.64257 0.164 0.000 0.004 0.012 0.000 0.820
#> SRR1700249 1 0.3528 0.66011 0.700 0.000 0.000 0.004 0.000 0.296
#> SRR1700250 2 0.1320 0.59435 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700248 2 0.1480 0.59401 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700251 2 0.1480 0.59502 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700252 2 0.1524 0.60416 0.000 0.932 0.060 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700253 2 0.1480 0.59502 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700256 2 0.1168 0.59092 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700254 1 0.3819 0.59072 0.652 0.000 0.000 0.008 0.000 0.340
#> SRR1700255 2 0.1480 0.59502 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020 0.000
#> SRR1700257 2 0.1320 0.59451 0.000 0.948 0.036 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700258 2 0.1398 0.59608 0.000 0.940 0.052 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700259 2 0.1462 0.60299 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700260 2 0.1462 0.60241 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700261 2 0.1462 0.60241 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700262 2 0.1563 0.60339 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700263 2 0.1701 0.60107 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700264 2 0.0858 0.58619 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700265 2 0.5799 0.19757 0.000 0.624 0.240 0.028 0.080 0.028
#> SRR1700266 2 0.0865 0.58894 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.2593 0.59256 0.000 0.844 0.148 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700270 2 0.1010 0.59807 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700267 2 0.1462 0.60246 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700271 2 0.1524 0.60410 0.000 0.932 0.060 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700272 2 0.1625 0.60301 0.000 0.928 0.060 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700273 2 0.1265 0.59982 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700274 2 0.1524 0.60727 0.000 0.932 0.060 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700277 2 0.5082 0.01023 0.000 0.652 0.100 0.004 0.236 0.008
#> SRR1700275 2 0.3000 0.57811 0.000 0.824 0.156 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700276 2 0.3178 0.57340 0.000 0.804 0.176 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700278 2 0.4107 0.43115 0.000 0.688 0.280 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700279 2 0.4109 0.46092 0.000 0.700 0.268 0.004 0.024 0.004
#> SRR1700280 2 0.4065 0.46763 0.000 0.708 0.260 0.004 0.024 0.004
#> SRR1700281 2 0.1812 0.60508 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700283 2 0.3122 0.56966 0.000 0.816 0.160 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700282 2 0.6171 -0.07202 0.000 0.564 0.288 0.032 0.088 0.028
#> SRR1700284 2 0.3977 0.44794 0.000 0.692 0.284 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700285 2 0.3575 0.47394 0.000 0.708 0.284 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700286 2 0.1858 0.60933 0.000 0.904 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700287 2 0.3993 0.46037 0.000 0.700 0.272 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700290 3 0.6759 0.59921 0.000 0.328 0.472 0.036 0.136 0.028
#> SRR1700289 2 0.3855 0.48509 0.000 0.704 0.276 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700288 2 0.2932 0.58524 0.000 0.836 0.140 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700292 2 0.3680 0.51624 0.000 0.744 0.232 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700291 2 0.4187 0.29943 0.000 0.624 0.356 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700293 2 0.3767 0.47152 0.000 0.708 0.276 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700294 2 0.3907 0.16921 0.000 0.588 0.408 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700295 3 0.6105 0.63492 0.000 0.376 0.492 0.032 0.088 0.012
#> SRR1700297 2 0.3922 0.39702 0.000 0.664 0.320 0.000 0.016 0.000
#> SRR1700296 2 0.4199 0.34811 0.000 0.640 0.336 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700298 2 0.4322 0.28348 0.000 0.620 0.356 0.004 0.016 0.004
#> SRR1700299 2 0.3847 -0.00903 0.000 0.544 0.456 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700300 2 0.4045 0.06276 0.000 0.564 0.428 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700302 2 0.4047 0.24260 0.000 0.604 0.384 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700301 2 0.4105 0.36745 0.000 0.648 0.332 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700303 2 0.4090 0.37317 0.000 0.652 0.328 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700304 2 0.5806 -0.06790 0.000 0.548 0.344 0.024 0.064 0.020
#> SRR1700305 2 0.3899 0.18354 0.000 0.592 0.404 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700306 2 0.3817 0.07775 0.000 0.568 0.432 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700308 2 0.3934 0.26021 0.000 0.616 0.376 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700307 2 0.4080 -0.03227 0.000 0.536 0.456 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700309 2 0.4095 -0.16489 0.000 0.512 0.480 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700310 2 0.4174 0.30443 0.000 0.628 0.352 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700311 2 0.3854 -0.05179 0.000 0.536 0.464 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700312 2 0.3923 0.28362 0.000 0.620 0.372 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700313 2 0.3851 -0.01931 0.000 0.540 0.460 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700314 2 0.3986 -0.06407 0.000 0.532 0.464 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700315 2 0.4300 -0.02639 0.000 0.540 0.444 0.008 0.008 0.000
#> SRR1700316 2 0.3843 0.00742 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700317 2 0.3672 0.43192 0.000 0.688 0.304 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700318 2 0.5631 -0.00977 0.000 0.560 0.344 0.024 0.056 0.016
#> SRR1700319 2 0.3975 -0.00601 0.000 0.544 0.452 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700320 2 0.3930 0.13590 0.000 0.576 0.420 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700322 2 0.3923 0.16109 0.000 0.580 0.416 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700321 2 0.3575 0.47166 0.000 0.708 0.284 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700323 2 0.3975 -0.02145 0.000 0.544 0.452 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700324 2 0.4134 0.35299 0.000 0.640 0.340 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700325 2 0.3788 0.48016 0.000 0.704 0.280 0.000 0.012 0.004
#> SRR1700326 2 0.7762 -0.38925 0.000 0.400 0.280 0.032 0.136 0.152
#> SRR1700327 2 0.1918 0.61008 0.000 0.904 0.088 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700329 2 0.3955 0.27488 0.000 0.608 0.384 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700328 2 0.5008 0.25755 0.000 0.608 0.328 0.004 0.040 0.020
#> SRR1700330 2 0.5403 -0.03929 0.000 0.548 0.372 0.020 0.052 0.008
#> SRR1700331 2 0.4219 0.34907 0.000 0.648 0.320 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700332 2 0.3731 0.51561 0.000 0.736 0.240 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700333 2 0.4481 0.30246 0.000 0.628 0.336 0.004 0.028 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.432 0.744 0.854 0.2530 0.909 0.909
#> 3 3 0.838 0.898 0.959 1.1560 0.546 0.500
#> 4 4 0.627 0.783 0.867 0.2549 0.762 0.525
#> 5 5 0.617 0.579 0.736 0.0927 0.911 0.731
#> 6 6 0.653 0.619 0.746 0.0581 0.837 0.472
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699881 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.1843 0.813 0.028 0.972
#> SRR1699897 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.9732 0.576 0.404 0.596
#> SRR1699900 2 0.8608 0.688 0.284 0.716
#> SRR1699899 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699901 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699903 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.8661 0.682 0.288 0.712
#> SRR1699905 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699906 2 0.4022 0.796 0.080 0.920
#> SRR1699907 2 0.7376 0.735 0.208 0.792
#> SRR1699908 2 0.4022 0.796 0.080 0.920
#> SRR1699909 2 0.9087 0.654 0.324 0.676
#> SRR1699910 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699911 2 0.9044 0.657 0.320 0.680
#> SRR1699912 2 0.7139 0.742 0.196 0.804
#> SRR1699913 2 0.4939 0.785 0.108 0.892
#> SRR1699914 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699915 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699916 2 0.5737 0.773 0.136 0.864
#> SRR1699917 2 0.5059 0.784 0.112 0.888
#> SRR1699918 2 0.7056 0.744 0.192 0.808
#> SRR1699919 2 0.8955 0.664 0.312 0.688
#> SRR1699920 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699921 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699922 2 0.7602 0.728 0.220 0.780
#> SRR1699923 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699924 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699925 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.8713 0.679 0.292 0.708
#> SRR1699927 2 0.5059 0.783 0.112 0.888
#> SRR1699929 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.7674 0.725 0.224 0.776
#> SRR1699930 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.1184 0.817 0.016 0.984
#> SRR1699934 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.2778 0.803 0.048 0.952
#> SRR1699946 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.6048 0.751 0.148 0.852
#> SRR1699957 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699971 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699975 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699978 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699979 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.5629 0.775 0.132 0.868
#> SRR1699982 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699988 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0672 0.819 0.008 0.992
#> SRR1699989 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699993 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699994 2 0.8909 0.648 0.308 0.692
#> SRR1699995 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1699996 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1699999 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700000 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0376 0.819 0.004 0.996
#> SRR1700003 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700009 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.2043 0.810 0.032 0.968
#> SRR1700011 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700016 1 0.0376 0.983 0.996 0.004
#> SRR1700018 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.1414 0.814 0.020 0.980
#> SRR1700019 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700020 2 0.9580 0.595 0.380 0.620
#> SRR1700021 2 0.8555 0.688 0.280 0.720
#> SRR1700023 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.3114 0.800 0.056 0.944
#> SRR1700024 2 0.1843 0.814 0.028 0.972
#> SRR1700025 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.1184 0.816 0.016 0.984
#> SRR1700027 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700028 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700030 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.9170 0.630 0.332 0.668
#> SRR1700032 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700034 2 0.9850 0.550 0.428 0.572
#> SRR1700035 2 0.0672 0.819 0.008 0.992
#> SRR1700033 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700036 2 0.0376 0.820 0.004 0.996
#> SRR1700037 2 0.5946 0.769 0.144 0.856
#> SRR1700038 2 0.9686 0.589 0.396 0.604
#> SRR1700039 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700040 2 0.9815 0.561 0.420 0.580
#> SRR1700041 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700042 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700043 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700045 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700044 2 0.8955 0.665 0.312 0.688
#> SRR1700046 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700047 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700048 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700049 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700050 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700051 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700052 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700053 2 0.9754 0.576 0.408 0.592
#> SRR1700054 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700055 2 0.9977 0.463 0.472 0.528
#> SRR1700056 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700057 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700058 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700059 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700060 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700061 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700062 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700063 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700064 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700065 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700066 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700067 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700068 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700069 2 0.9795 0.567 0.416 0.584
#> SRR1700070 2 0.2603 0.808 0.044 0.956
#> SRR1700071 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700072 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700073 2 0.9754 0.576 0.408 0.592
#> SRR1700075 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700074 2 0.7453 0.718 0.212 0.788
#> SRR1700076 2 0.9427 0.624 0.360 0.640
#> SRR1700077 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700078 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700080 2 0.5059 0.782 0.112 0.888
#> SRR1700079 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700081 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700082 2 0.4022 0.789 0.080 0.920
#> SRR1700083 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700084 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700085 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.5629 0.776 0.132 0.868
#> SRR1700087 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700096 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700097 2 0.9044 0.637 0.320 0.680
#> SRR1700098 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700105 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.9129 0.651 0.328 0.672
#> SRR1700113 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700119 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700120 2 0.9795 0.566 0.416 0.584
#> SRR1700121 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.8267 0.702 0.260 0.740
#> SRR1700123 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700125 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700127 2 0.9580 0.606 0.380 0.620
#> SRR1700124 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700128 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700129 2 0.7950 0.715 0.240 0.760
#> SRR1700130 2 0.9686 0.589 0.396 0.604
#> SRR1700132 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700131 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700133 2 0.9795 0.567 0.416 0.584
#> SRR1700134 2 0.8763 0.676 0.296 0.704
#> SRR1700135 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700136 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700137 2 0.9732 0.580 0.404 0.596
#> SRR1700138 2 0.9686 0.589 0.396 0.604
#> SRR1700140 2 0.9580 0.605 0.380 0.620
#> SRR1700139 2 0.9754 0.576 0.408 0.592
#> SRR1700141 2 0.7674 0.725 0.224 0.776
#> SRR1700142 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700143 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700144 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700145 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700146 2 0.7745 0.723 0.228 0.772
#> SRR1700147 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700149 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700148 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700150 2 0.6247 0.763 0.156 0.844
#> SRR1700152 2 0.9754 0.576 0.408 0.592
#> SRR1700151 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700153 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700154 2 0.9795 0.567 0.416 0.584
#> SRR1700155 2 0.9635 0.597 0.388 0.612
#> SRR1700156 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700158 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700159 2 0.5294 0.780 0.120 0.880
#> SRR1700157 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700160 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700161 2 0.9795 0.567 0.416 0.584
#> SRR1700162 2 0.8763 0.676 0.296 0.704
#> SRR1700164 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700163 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700165 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700166 2 0.9710 0.584 0.400 0.600
#> SRR1700168 2 0.1184 0.817 0.016 0.984
#> SRR1700167 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700170 2 0.9661 0.593 0.392 0.608
#> SRR1700169 2 0.9686 0.589 0.396 0.604
#> SRR1700171 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700172 2 0.1184 0.817 0.016 0.984
#> SRR1700174 2 0.4939 0.785 0.108 0.892
#> SRR1700173 2 0.5408 0.780 0.124 0.876
#> SRR1700175 2 0.8608 0.685 0.284 0.716
#> SRR1700176 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700178 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.8763 0.677 0.296 0.704
#> SRR1700180 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700192 2 0.9460 0.599 0.364 0.636
#> SRR1700190 2 0.4690 0.778 0.100 0.900
#> SRR1700191 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700197 2 0.9129 0.632 0.328 0.672
#> SRR1700198 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700202 2 0.9323 0.634 0.348 0.652
#> SRR1700203 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.2423 0.810 0.040 0.960
#> SRR1700209 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.3584 0.898 0.932 0.068
#> SRR1700231 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.5737 0.773 0.136 0.864
#> SRR1700235 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.9209 0.644 0.336 0.664
#> SRR1700243 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.5059 0.823 0.888 0.112
#> SRR1700246 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700245 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.5059 0.783 0.112 0.888
#> SRR1700279 2 0.4939 0.785 0.108 0.892
#> SRR1700280 2 0.1414 0.816 0.020 0.980
#> SRR1700281 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0672 0.819 0.008 0.992
#> SRR1700284 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700289 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.5059 0.783 0.112 0.888
#> SRR1700293 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.8499 0.691 0.276 0.724
#> SRR1700295 2 0.9833 0.557 0.424 0.576
#> SRR1700297 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.5629 0.775 0.132 0.868
#> SRR1700298 2 0.8499 0.691 0.276 0.724
#> SRR1700299 2 0.8608 0.685 0.284 0.716
#> SRR1700300 2 0.9661 0.593 0.392 0.608
#> SRR1700302 2 0.7745 0.723 0.228 0.772
#> SRR1700301 2 0.6623 0.755 0.172 0.828
#> SRR1700303 2 0.5178 0.782 0.116 0.884
#> SRR1700304 2 0.9248 0.640 0.340 0.660
#> SRR1700305 2 0.6048 0.767 0.148 0.852
#> SRR1700306 2 0.9815 0.562 0.420 0.580
#> SRR1700308 2 0.1184 0.817 0.016 0.984
#> SRR1700307 2 0.9170 0.648 0.332 0.668
#> SRR1700309 2 0.9775 0.571 0.412 0.588
#> SRR1700310 2 0.7674 0.725 0.224 0.776
#> SRR1700311 2 0.9635 0.597 0.388 0.612
#> SRR1700312 2 0.2043 0.812 0.032 0.968
#> SRR1700313 2 0.9661 0.593 0.392 0.608
#> SRR1700314 2 0.9491 0.616 0.368 0.632
#> SRR1700315 2 0.9732 0.580 0.404 0.596
#> SRR1700316 2 0.5059 0.783 0.112 0.888
#> SRR1700317 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.9248 0.641 0.340 0.660
#> SRR1700319 2 0.9580 0.605 0.380 0.620
#> SRR1700320 2 0.5178 0.782 0.116 0.884
#> SRR1700322 2 0.5294 0.780 0.120 0.880
#> SRR1700321 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.3431 0.802 0.064 0.936
#> SRR1700324 2 0.5059 0.783 0.112 0.888
#> SRR1700325 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700326 2 0.9686 0.589 0.396 0.604
#> SRR1700327 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1700330 2 0.9608 0.601 0.384 0.616
#> SRR1700331 2 0.7602 0.728 0.220 0.780
#> SRR1700332 2 0.0000 0.821 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.7602 0.728 0.220 0.780
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.1751 0.9116 0.012 0.960 0.028
#> SRR1699881 2 0.2339 0.8897 0.012 0.940 0.048
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.2261 0.8733 0.000 0.932 0.068
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699891 2 0.0237 0.9389 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699892 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699893 2 0.6302 0.0471 0.000 0.520 0.480
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699895 2 0.4399 0.7130 0.000 0.812 0.188
#> SRR1699896 2 0.4931 0.6458 0.000 0.768 0.232
#> SRR1699897 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699898 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699900 3 0.5254 0.6242 0.000 0.264 0.736
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699902 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699901 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699903 3 0.5365 0.6438 0.004 0.252 0.744
#> SRR1699904 3 0.2537 0.8820 0.000 0.080 0.920
#> SRR1699905 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699906 3 0.4808 0.7391 0.008 0.188 0.804
#> SRR1699907 3 0.2796 0.8696 0.000 0.092 0.908
#> SRR1699908 3 0.4605 0.7225 0.000 0.204 0.796
#> SRR1699909 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699910 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699911 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699912 3 0.1163 0.9302 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699913 3 0.3038 0.8563 0.000 0.104 0.896
#> SRR1699914 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699915 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699916 3 0.2959 0.8608 0.000 0.100 0.900
#> SRR1699917 3 0.0424 0.9464 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699918 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699919 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699920 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699921 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699922 3 0.3116 0.8517 0.000 0.108 0.892
#> SRR1699923 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699924 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699926 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699927 3 0.3038 0.8581 0.000 0.104 0.896
#> SRR1699929 3 0.5178 0.6439 0.000 0.256 0.744
#> SRR1699928 3 0.1163 0.9302 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699930 2 0.6111 0.3481 0.000 0.604 0.396
#> SRR1699931 2 0.4178 0.7374 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699933 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699932 3 0.3340 0.8417 0.000 0.120 0.880
#> SRR1699934 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699935 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699938 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699940 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699939 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699941 2 0.3618 0.8211 0.012 0.884 0.104
#> SRR1699942 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699943 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699944 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699945 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699946 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699947 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699950 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699951 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699952 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699953 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699954 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699955 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699956 2 0.6200 0.5000 0.012 0.676 0.312
#> SRR1699957 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699959 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699961 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699962 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699963 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699964 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699965 2 0.0424 0.9384 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699966 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699967 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699968 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699969 3 0.5122 0.6949 0.012 0.200 0.788
#> SRR1699971 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699970 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699972 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699973 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699974 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699975 2 0.6404 0.4500 0.012 0.644 0.344
#> SRR1699976 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699977 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699978 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699979 2 0.6816 0.1162 0.012 0.516 0.472
#> SRR1699980 3 0.1482 0.9324 0.012 0.020 0.968
#> SRR1699981 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699982 2 0.5902 0.5059 0.004 0.680 0.316
#> SRR1699983 3 0.2339 0.9067 0.012 0.048 0.940
#> SRR1699984 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699985 3 0.2550 0.9035 0.012 0.056 0.932
#> SRR1699986 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699988 2 0.2339 0.8932 0.012 0.940 0.048
#> SRR1699987 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699989 2 0.5536 0.6336 0.012 0.752 0.236
#> SRR1699990 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699992 3 0.5315 0.6710 0.012 0.216 0.772
#> SRR1699991 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699993 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699994 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699995 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699996 2 0.0829 0.9350 0.012 0.984 0.004
#> SRR1699997 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1699998 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1699999 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700000 2 0.1182 0.9289 0.012 0.976 0.012
#> SRR1700002 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700001 3 0.6019 0.5383 0.012 0.288 0.700
#> SRR1700003 2 0.0829 0.9343 0.012 0.984 0.004
#> SRR1700004 3 0.1964 0.9055 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700005 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700006 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700009 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700010 2 0.4968 0.7045 0.012 0.800 0.188
#> SRR1700011 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700013 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700012 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700014 3 0.0592 0.9433 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700015 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700016 1 0.2066 0.9410 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700018 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700017 2 0.3989 0.7953 0.012 0.864 0.124
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700020 3 0.3695 0.8318 0.012 0.108 0.880
#> SRR1700021 3 0.2796 0.8696 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700023 2 0.2651 0.8784 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700022 2 0.6617 0.3613 0.012 0.600 0.388
#> SRR1700024 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700025 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700026 2 0.6126 0.3495 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700027 2 0.3532 0.8216 0.008 0.884 0.108
#> SRR1700028 3 0.6513 0.0821 0.004 0.476 0.520
#> SRR1700029 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700030 3 0.3619 0.8271 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700031 3 0.0829 0.9424 0.012 0.004 0.984
#> SRR1700032 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700034 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700035 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700033 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700036 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700037 3 0.2796 0.8696 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700038 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700039 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700040 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700041 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700042 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700043 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700045 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700044 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700046 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700047 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700048 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700049 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700050 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700051 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700052 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700053 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700054 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700055 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700056 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700057 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700058 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700059 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700060 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700061 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700062 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700063 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700064 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700065 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700066 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700067 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700068 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700069 3 0.0424 0.9464 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700070 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700071 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700072 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700073 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700075 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700074 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700076 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700077 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700078 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700080 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700079 3 0.0424 0.9464 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700081 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700082 3 0.5315 0.6678 0.012 0.216 0.772
#> SRR1700083 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700084 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700085 3 0.3375 0.8607 0.008 0.100 0.892
#> SRR1700086 3 0.0592 0.9445 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700091 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700090 3 0.4842 0.6726 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700093 2 0.3038 0.8288 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700095 3 0.0592 0.9422 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700096 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700097 3 0.4629 0.7223 0.004 0.188 0.808
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700104 2 0.0424 0.9384 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700103 2 0.6282 0.3774 0.004 0.612 0.384
#> SRR1700105 3 0.4452 0.7433 0.000 0.192 0.808
#> SRR1700106 3 0.5926 0.4564 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700107 2 0.0237 0.9390 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700112 3 0.5785 0.5068 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700111 3 0.0237 0.9477 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700113 2 0.2625 0.8544 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700114 2 0.1525 0.9125 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700116 3 0.3482 0.8186 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700117 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700119 3 0.0747 0.9410 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700118 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700120 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700121 3 0.2537 0.8878 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700122 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700123 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700125 3 0.3267 0.8467 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700126 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700127 3 0.0424 0.9464 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700124 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700128 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700129 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700130 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700132 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700131 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700133 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700134 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700135 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700136 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700137 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700138 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700140 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700139 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700141 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700142 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700143 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700144 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700145 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700146 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700147 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700149 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700148 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700150 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700152 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700151 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700153 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700154 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700155 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700156 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700158 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700159 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700157 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700160 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700161 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700162 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700164 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700163 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700165 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700166 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700168 3 0.3192 0.8514 0.000 0.112 0.888
#> SRR1700167 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700170 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700169 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700171 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700172 3 0.0592 0.9433 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700174 3 0.0237 0.9477 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700173 3 0.0237 0.9477 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700175 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700176 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700185 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 2 0.0424 0.9371 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700190 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700189 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 2 0.1031 0.9214 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 2 0.5785 0.4843 0.000 0.668 0.332
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.0237 0.9388 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.4291 0.7979 0.820 0.000 0.180
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.4796 0.6657 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700240 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700241 3 0.0424 0.9464 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 1 0.5096 0.8633 0.836 0.080 0.084
#> SRR1700246 2 0.6154 0.3259 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700249 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0592 0.9833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700278 2 0.6126 0.3373 0.000 0.600 0.400
#> SRR1700279 2 0.5529 0.5409 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700280 2 0.1031 0.9211 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700282 2 0.2261 0.8733 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700284 3 0.6095 0.3808 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700285 2 0.6204 0.2655 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700286 2 0.0592 0.9368 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700290 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700289 2 0.5621 0.5218 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0237 0.9389 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700291 3 0.1860 0.9106 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700293 2 0.6192 0.2785 0.000 0.580 0.420
#> SRR1700294 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700295 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700297 3 0.4702 0.7128 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700296 3 0.5178 0.6333 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700298 3 0.0592 0.9425 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700299 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700300 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700302 3 0.0592 0.9424 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700301 3 0.2625 0.8780 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700303 3 0.3038 0.8608 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700304 3 0.2878 0.8653 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700305 3 0.0747 0.9395 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700306 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700308 3 0.0892 0.9389 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700307 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700309 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700310 3 0.0592 0.9424 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700311 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700312 3 0.4399 0.7501 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700313 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700314 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700315 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700316 3 0.0237 0.9477 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700317 2 0.1753 0.8965 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700318 3 0.1289 0.9268 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700319 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700320 3 0.1163 0.9315 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700322 3 0.2625 0.8797 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700321 2 0.0747 0.9289 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700323 3 0.0237 0.9479 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700324 3 0.3752 0.8113 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9412 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700326 2 0.6291 0.0986 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700327 2 0.0237 0.9398 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700329 3 0.3038 0.8608 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700328 3 0.3752 0.8069 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700330 3 0.0000 0.9491 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700331 3 0.2711 0.8738 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700332 2 0.1411 0.9090 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700333 3 0.3116 0.8517 0.000 0.108 0.892
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699875 2 0.2281 0.8569 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1699876 4 0.4624 0.4402 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1699877 2 0.2408 0.8626 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1699879 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1699878 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699880 2 0.4382 0.6453 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1699881 2 0.4746 0.5300 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1699882 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699883 2 0.2408 0.8626 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1699884 2 0.2530 0.8566 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1699885 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699886 4 0.2921 0.7080 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1699888 2 0.4605 0.5545 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1699889 4 0.2704 0.7226 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1699890 4 0.2760 0.7186 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1699887 4 0.4790 0.3527 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1699891 4 0.2704 0.7226 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1699892 2 0.0707 0.8865 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699893 4 0.2859 0.7392 0.000 0.112 0.008 0.880
#> SRR1699894 4 0.2760 0.7186 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1699895 4 0.2647 0.7261 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1699896 4 0.2773 0.7279 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1699897 2 0.2466 0.8589 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR1699898 3 0.2216 0.8732 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699900 4 0.2542 0.7534 0.000 0.084 0.012 0.904
#> SRR1699899 4 0.2760 0.7186 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1699902 4 0.4804 0.2959 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1699901 4 0.4356 0.5540 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR1699903 4 0.1256 0.7942 0.000 0.028 0.008 0.964
#> SRR1699904 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699905 4 0.1940 0.8004 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1699906 4 0.1004 0.8082 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1699907 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699908 4 0.1488 0.7922 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1699909 4 0.3486 0.7511 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699910 4 0.2530 0.7954 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699911 4 0.1022 0.8076 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699912 4 0.1022 0.8076 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699913 4 0.1022 0.8093 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699914 4 0.3837 0.7146 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1699915 4 0.2345 0.7982 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1699916 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699917 4 0.3400 0.7642 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR1699918 4 0.3726 0.7306 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1699919 4 0.2530 0.7954 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699920 4 0.2530 0.7954 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699921 4 0.2530 0.7954 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699922 4 0.0927 0.8028 0.000 0.008 0.016 0.976
#> SRR1699923 4 0.4564 0.5011 0.000 0.000 0.328 0.672
#> SRR1699924 3 0.4585 0.6196 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1699925 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699926 4 0.1022 0.8076 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699927 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699929 4 0.2124 0.7669 0.000 0.068 0.008 0.924
#> SRR1699928 4 0.1474 0.8095 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1699930 4 0.2469 0.7362 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1699931 4 0.2773 0.7309 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1699933 2 0.5337 0.3250 0.000 0.564 0.012 0.424
#> SRR1699932 4 0.0927 0.8029 0.000 0.008 0.016 0.976
#> SRR1699934 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699935 4 0.2760 0.7186 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1699936 2 0.1211 0.8762 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1699937 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699938 2 0.2216 0.8587 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699940 2 0.2647 0.8429 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1699939 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699941 2 0.4948 0.3727 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1699942 2 0.2408 0.8524 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1699943 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699944 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699945 2 0.3486 0.7863 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1699946 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699947 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699948 2 0.2011 0.8638 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1699949 2 0.1940 0.8655 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1699950 2 0.2216 0.8587 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699951 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699952 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699953 2 0.2216 0.8587 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699954 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699955 2 0.2216 0.8587 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699956 3 0.4804 0.2094 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1699957 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699959 2 0.4244 0.7980 0.000 0.804 0.160 0.036
#> SRR1699958 2 0.1940 0.8655 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1699960 2 0.1867 0.8670 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1699961 2 0.2589 0.8452 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1699962 2 0.2469 0.8501 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1699963 2 0.2530 0.8474 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1699964 2 0.2530 0.8474 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1699965 2 0.2216 0.8587 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699966 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699967 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1699968 2 0.4164 0.6938 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1699969 3 0.2888 0.6589 0.000 0.124 0.872 0.004
#> SRR1699971 2 0.2921 0.8290 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1699970 2 0.2760 0.8387 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1699972 2 0.3266 0.8043 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1699973 2 0.2868 0.8322 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1699974 3 0.1151 0.8117 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1699975 3 0.5080 0.0924 0.000 0.420 0.576 0.004
#> SRR1699976 2 0.3172 0.8126 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1699977 3 0.1824 0.7366 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1699978 3 0.3172 0.8476 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1699979 3 0.2530 0.6735 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1699980 3 0.4055 0.6820 0.000 0.060 0.832 0.108
#> SRR1699981 3 0.1584 0.7731 0.000 0.036 0.952 0.012
#> SRR1699982 4 0.2466 0.7502 0.000 0.096 0.004 0.900
#> SRR1699983 3 0.2542 0.7071 0.000 0.084 0.904 0.012
#> SRR1699984 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699985 3 0.5174 0.5940 0.000 0.124 0.760 0.116
#> SRR1699986 3 0.2281 0.8750 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1699988 2 0.5540 0.7335 0.000 0.728 0.164 0.108
#> SRR1699987 3 0.1970 0.7415 0.000 0.060 0.932 0.008
#> SRR1699989 4 0.7169 0.3033 0.000 0.344 0.148 0.508
#> SRR1699990 3 0.1902 0.7312 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1699992 3 0.2401 0.6983 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1699991 3 0.1584 0.8197 0.000 0.012 0.952 0.036
#> SRR1699993 3 0.2345 0.8767 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699994 3 0.1305 0.7631 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1699995 3 0.2589 0.8766 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1699996 2 0.3117 0.8706 0.000 0.880 0.092 0.028
#> SRR1699997 3 0.1824 0.7366 0.000 0.060 0.936 0.004
#> SRR1699998 2 0.2530 0.8474 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1699999 3 0.2408 0.8756 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700000 2 0.4304 0.6671 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1700002 2 0.3123 0.8160 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700001 3 0.3105 0.6374 0.000 0.140 0.856 0.004
#> SRR1700003 2 0.3356 0.7978 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1700004 4 0.3999 0.7966 0.000 0.036 0.140 0.824
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.1488 0.8797 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR1700007 4 0.4989 0.1303 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1700008 3 0.2345 0.8764 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700009 1 0.0336 0.9486 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700010 2 0.4907 0.4177 0.000 0.580 0.420 0.000
#> SRR1700011 2 0.2281 0.8569 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700013 2 0.2216 0.8591 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1700012 2 0.2704 0.8404 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1700014 3 0.5250 0.2369 0.000 0.008 0.552 0.440
#> SRR1700015 2 0.2149 0.8619 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1700016 1 0.5272 0.7474 0.752 0.000 0.136 0.112
#> SRR1700018 2 0.3400 0.7934 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1700017 3 0.4972 -0.0556 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1700019 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700020 3 0.2179 0.8434 0.000 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700021 4 0.1209 0.8068 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR1700023 2 0.4933 0.3952 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1700022 3 0.4964 0.2196 0.000 0.380 0.616 0.004
#> SRR1700024 3 0.1867 0.8604 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700025 2 0.2345 0.8547 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1700026 3 0.7811 0.1016 0.000 0.368 0.380 0.252
#> SRR1700027 2 0.4877 0.4250 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1700028 3 0.6371 0.1621 0.000 0.428 0.508 0.064
#> SRR1700029 3 0.2704 0.8700 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700030 4 0.2124 0.7965 0.000 0.040 0.028 0.932
#> SRR1700031 3 0.0707 0.8173 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700032 2 0.2530 0.8474 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1700034 3 0.2408 0.8756 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700035 4 0.3172 0.7804 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1700033 3 0.2345 0.8767 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700036 4 0.4331 0.6509 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700037 4 0.0921 0.8074 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700038 4 0.2081 0.8011 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700039 3 0.2345 0.8767 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700040 3 0.2149 0.8719 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700041 3 0.2408 0.8773 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700042 3 0.2469 0.8778 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700043 3 0.3266 0.8411 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700045 3 0.2469 0.8779 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700044 3 0.2760 0.8722 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700046 3 0.2469 0.8779 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700047 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700048 4 0.4477 0.5360 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700049 3 0.2408 0.8773 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700050 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700051 3 0.2589 0.8766 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700052 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700053 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700054 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700055 3 0.2408 0.8756 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700056 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700057 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700058 3 0.2469 0.8779 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700059 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700060 3 0.2281 0.8750 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700061 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700062 3 0.2216 0.8732 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700063 3 0.2530 0.8780 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700064 3 0.2530 0.8780 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700065 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700066 3 0.2281 0.8750 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700067 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700068 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700069 3 0.2345 0.8764 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700070 3 0.1724 0.8097 0.000 0.020 0.948 0.032
#> SRR1700071 3 0.1716 0.8539 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700072 3 0.2760 0.8718 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700073 4 0.3074 0.7766 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1700075 3 0.2408 0.8773 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700074 3 0.0804 0.7914 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1700076 3 0.2408 0.8773 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700077 3 0.2216 0.8732 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700078 3 0.2408 0.8773 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700080 3 0.1109 0.7713 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700079 3 0.2216 0.8739 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700081 3 0.2281 0.8750 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1700082 3 0.2888 0.6567 0.000 0.124 0.872 0.004
#> SRR1700083 3 0.2149 0.8719 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700084 3 0.2216 0.8739 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700085 4 0.5277 0.5885 0.000 0.028 0.304 0.668
#> SRR1700086 3 0.2216 0.8732 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700087 2 0.0592 0.8810 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700088 2 0.1637 0.8711 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700089 2 0.0188 0.8829 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700091 2 0.1867 0.8669 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700090 4 0.6204 0.6784 0.000 0.168 0.160 0.672
#> SRR1700092 2 0.0592 0.8810 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700094 2 0.0657 0.8853 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1700093 4 0.5558 0.2972 0.000 0.432 0.020 0.548
#> SRR1700095 4 0.2742 0.8039 0.000 0.024 0.076 0.900
#> SRR1700096 2 0.1867 0.8669 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1700097 3 0.4804 0.7055 0.000 0.160 0.776 0.064
#> SRR1700098 2 0.1792 0.8856 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700099 2 0.2011 0.8791 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700100 2 0.0707 0.8866 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700101 2 0.1004 0.8873 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1700102 2 0.1637 0.8707 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700104 2 0.2281 0.8570 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700103 2 0.5088 0.3643 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1700105 4 0.2983 0.7925 0.000 0.068 0.040 0.892
#> SRR1700106 4 0.5279 0.7075 0.000 0.192 0.072 0.736
#> SRR1700107 2 0.2593 0.8387 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR1700108 2 0.2081 0.8764 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1700109 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700110 2 0.1743 0.8887 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1700112 4 0.2089 0.7921 0.000 0.048 0.020 0.932
#> SRR1700111 4 0.2469 0.8000 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700113 4 0.3142 0.7259 0.000 0.132 0.008 0.860
#> SRR1700114 2 0.2345 0.8561 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1700115 2 0.1256 0.8877 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1700116 4 0.6743 0.2940 0.000 0.096 0.392 0.512
#> SRR1700117 3 0.3801 0.7736 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700119 4 0.2593 0.8068 0.000 0.016 0.080 0.904
#> SRR1700118 3 0.3975 0.7474 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700120 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700121 4 0.1833 0.8041 0.000 0.024 0.032 0.944
#> SRR1700122 4 0.3486 0.7511 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700123 3 0.4998 0.0676 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700125 4 0.2480 0.8093 0.000 0.008 0.088 0.904
#> SRR1700126 3 0.2530 0.8780 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700127 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700124 3 0.2760 0.8716 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700128 3 0.3024 0.8559 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700129 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700130 4 0.4543 0.5536 0.000 0.000 0.324 0.676
#> SRR1700132 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700131 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700133 4 0.3074 0.7764 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1700134 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700135 3 0.4040 0.7312 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700136 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700137 4 0.4888 0.3252 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700138 3 0.5000 0.0344 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1700140 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700139 3 0.2814 0.8685 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700141 4 0.4008 0.6898 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700142 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700143 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700144 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700145 4 0.4431 0.5912 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700146 4 0.4454 0.5848 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700147 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700149 3 0.2704 0.8741 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700148 3 0.2760 0.8718 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700150 4 0.4193 0.6546 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700152 3 0.3688 0.7865 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700151 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700153 3 0.2760 0.8718 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700154 3 0.3837 0.7676 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700155 3 0.3801 0.7698 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700156 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700158 3 0.3123 0.8502 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700159 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700157 3 0.2589 0.8777 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700160 4 0.4624 0.5185 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700161 4 0.4730 0.4611 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700162 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700164 4 0.2011 0.8002 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR1700163 3 0.3942 0.7554 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1700165 3 0.3907 0.7611 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700166 4 0.3123 0.7742 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700168 4 0.2081 0.8089 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700167 3 0.3610 0.8079 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700170 4 0.2760 0.7903 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700169 4 0.2921 0.7837 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700171 3 0.2760 0.8718 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700172 4 0.3873 0.7112 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700174 4 0.4955 0.2140 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700173 3 0.4761 0.4669 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1700175 4 0.4072 0.6780 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1700176 3 0.2530 0.8780 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700178 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700177 4 0.2216 0.8009 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700180 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700179 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700181 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700183 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700182 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700184 2 0.1389 0.8885 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700186 2 0.0707 0.8861 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700187 1 0.0336 0.9486 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.1302 0.8884 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700192 2 0.5409 0.5315 0.020 0.644 0.004 0.332
#> SRR1700190 2 0.2125 0.8789 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1700191 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700189 1 0.0336 0.9486 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700193 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700195 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700194 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700197 2 0.5922 0.6544 0.004 0.704 0.184 0.108
#> SRR1700198 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700199 2 0.1792 0.8856 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700200 2 0.2469 0.8594 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1700201 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700202 4 0.2715 0.7318 0.004 0.100 0.004 0.892
#> SRR1700203 2 0.1867 0.8837 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700204 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700206 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700207 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700208 2 0.2401 0.8712 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1700205 4 0.2704 0.7226 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700209 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700210 2 0.3688 0.7529 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1700211 2 0.2973 0.8265 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1700212 2 0.2469 0.8594 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1700213 2 0.1356 0.8884 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1700214 2 0.2408 0.8626 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700215 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700217 2 0.2408 0.8627 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700216 1 0.0188 0.9496 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700218 2 0.1978 0.8700 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1700219 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700222 1 0.0188 0.9492 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700221 2 0.2345 0.8656 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700223 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700224 2 0.2973 0.8268 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1700226 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700229 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700225 2 0.2408 0.8524 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1700227 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700230 1 0.6383 0.4031 0.568 0.000 0.076 0.356
#> SRR1700231 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700228 2 0.2300 0.8894 0.000 0.920 0.016 0.064
#> SRR1700232 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700233 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700234 4 0.4985 0.0553 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1700235 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700237 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700236 2 0.1792 0.8857 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700238 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700239 1 0.0336 0.9486 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.2469 0.8779 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1700243 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700244 2 0.2011 0.8792 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700242 1 0.5223 0.3886 0.584 0.004 0.004 0.408
#> SRR1700246 4 0.4560 0.4912 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1700245 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700247 1 0.0336 0.9486 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700248 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700251 2 0.2081 0.8768 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1700252 2 0.1256 0.8873 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1700253 2 0.2281 0.8686 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1700256 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.2281 0.8686 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1700257 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700258 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700259 2 0.1743 0.8887 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1700260 2 0.2142 0.8891 0.000 0.928 0.016 0.056
#> SRR1700261 2 0.2983 0.8858 0.000 0.892 0.040 0.068
#> SRR1700262 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700263 2 0.1743 0.8887 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1700264 2 0.1022 0.8781 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700265 2 0.3982 0.7329 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR1700266 2 0.1398 0.8775 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1700268 2 0.1902 0.8881 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1700270 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700267 2 0.1557 0.8884 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700271 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700272 2 0.1716 0.8874 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700273 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700274 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700277 2 0.1004 0.8866 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1700275 4 0.4103 0.5886 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1700276 2 0.2973 0.8280 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1700278 4 0.2469 0.7363 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1700279 4 0.2589 0.7293 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700280 4 0.2704 0.7226 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700281 2 0.1637 0.8880 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700283 4 0.4250 0.5571 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1700282 4 0.2888 0.7202 0.000 0.124 0.004 0.872
#> SRR1700284 4 0.2408 0.7960 0.000 0.044 0.036 0.920
#> SRR1700285 4 0.3229 0.7860 0.000 0.072 0.048 0.880
#> SRR1700286 2 0.2281 0.8568 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1700287 4 0.3074 0.7043 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1700290 4 0.1940 0.8004 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700289 4 0.2408 0.7418 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700288 2 0.2216 0.8718 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1700292 4 0.2760 0.7186 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700291 4 0.0921 0.8074 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700293 4 0.2408 0.7395 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700294 4 0.1940 0.8088 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700295 4 0.2345 0.7988 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700297 4 0.1488 0.7948 0.000 0.032 0.012 0.956
#> SRR1700296 4 0.1042 0.7979 0.000 0.020 0.008 0.972
#> SRR1700298 4 0.1022 0.8076 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700299 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700300 4 0.3907 0.7067 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700302 4 0.1474 0.8095 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700301 4 0.1211 0.8090 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700303 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700304 4 0.0817 0.8056 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700305 4 0.2814 0.7926 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700306 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700308 4 0.3266 0.7693 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700307 4 0.3764 0.7259 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700309 4 0.3688 0.7328 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700310 4 0.3123 0.7769 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700311 4 0.3610 0.7406 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700312 4 0.2859 0.8005 0.000 0.008 0.112 0.880
#> SRR1700313 4 0.4072 0.6794 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1700314 3 0.4989 0.1157 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1700315 4 0.3610 0.7406 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700316 4 0.3311 0.7653 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700317 4 0.4123 0.6565 0.000 0.220 0.008 0.772
#> SRR1700318 4 0.1022 0.8070 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700319 4 0.3649 0.7368 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700320 4 0.2814 0.7930 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700322 4 0.2868 0.7903 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700321 4 0.4814 0.5282 0.000 0.316 0.008 0.676
#> SRR1700323 4 0.3569 0.7473 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1700324 4 0.1474 0.8111 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700325 4 0.3528 0.6661 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1700326 4 0.2654 0.7319 0.000 0.108 0.004 0.888
#> SRR1700327 2 0.2149 0.8610 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1700329 4 0.2469 0.8038 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1700328 4 0.1004 0.8067 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1700330 4 0.1022 0.8076 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700331 4 0.0707 0.8064 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700332 4 0.2704 0.7229 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700333 4 0.0779 0.8041 0.000 0.004 0.016 0.980
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1699875 2 0.4192 0.3181 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699876 5 0.4541 0.4521 0.000 0.288 0.032 0.000 0.680
#> SRR1699877 2 0.2505 0.6799 0.000 0.888 0.020 0.000 0.092
#> SRR1699879 2 0.0771 0.7284 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699878 2 0.0579 0.7293 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1699880 3 0.5195 0.3855 0.000 0.388 0.564 0.048 0.000
#> SRR1699881 3 0.5523 0.5143 0.000 0.320 0.592 0.088 0.000
#> SRR1699882 2 0.0324 0.7296 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1699883 2 0.2653 0.6741 0.000 0.880 0.024 0.000 0.096
#> SRR1699884 2 0.2233 0.6933 0.000 0.904 0.016 0.000 0.080
#> SRR1699885 2 0.0451 0.7293 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1699886 5 0.4295 0.5351 0.000 0.216 0.044 0.000 0.740
#> SRR1699888 2 0.4966 0.2581 0.000 0.564 0.032 0.000 0.404
#> SRR1699889 5 0.2067 0.7173 0.000 0.048 0.032 0.000 0.920
#> SRR1699890 5 0.3953 0.5908 0.000 0.168 0.048 0.000 0.784
#> SRR1699887 5 0.4836 0.3494 0.000 0.356 0.032 0.000 0.612
#> SRR1699891 5 0.2124 0.7097 0.000 0.056 0.028 0.000 0.916
#> SRR1699892 2 0.4707 0.5793 0.000 0.708 0.228 0.000 0.064
#> SRR1699893 5 0.2157 0.7176 0.000 0.040 0.036 0.004 0.920
#> SRR1699894 5 0.2221 0.7090 0.000 0.052 0.036 0.000 0.912
#> SRR1699895 5 0.1818 0.7198 0.000 0.044 0.024 0.000 0.932
#> SRR1699896 5 0.2378 0.7024 0.000 0.048 0.048 0.000 0.904
#> SRR1699897 2 0.4446 0.3083 0.000 0.592 0.400 0.000 0.008
#> SRR1699898 4 0.3730 0.6693 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1699900 5 0.2438 0.7004 0.000 0.040 0.060 0.000 0.900
#> SRR1699899 5 0.2193 0.7077 0.000 0.060 0.028 0.000 0.912
#> SRR1699902 5 0.5834 0.2932 0.000 0.000 0.136 0.276 0.588
#> SRR1699901 5 0.5577 0.4278 0.000 0.000 0.120 0.256 0.624
#> SRR1699903 5 0.1716 0.7360 0.000 0.024 0.016 0.016 0.944
#> SRR1699904 5 0.1949 0.7479 0.000 0.012 0.016 0.040 0.932
#> SRR1699905 5 0.3736 0.6800 0.000 0.000 0.140 0.052 0.808
#> SRR1699906 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699907 5 0.1844 0.7481 0.000 0.012 0.012 0.040 0.936
#> SRR1699908 5 0.1623 0.7407 0.000 0.016 0.016 0.020 0.948
#> SRR1699909 5 0.3582 0.7370 0.000 0.000 0.008 0.224 0.768
#> SRR1699910 5 0.2408 0.7537 0.000 0.000 0.016 0.092 0.892
#> SRR1699911 5 0.1949 0.7479 0.000 0.012 0.016 0.040 0.932
#> SRR1699912 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699913 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699914 5 0.4268 0.6246 0.000 0.000 0.008 0.344 0.648
#> SRR1699915 5 0.2408 0.7537 0.000 0.000 0.016 0.092 0.892
#> SRR1699916 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699917 5 0.3401 0.7149 0.000 0.000 0.064 0.096 0.840
#> SRR1699918 5 0.3877 0.7118 0.000 0.000 0.024 0.212 0.764
#> SRR1699919 5 0.2304 0.7542 0.000 0.000 0.008 0.100 0.892
#> SRR1699920 5 0.2304 0.7542 0.000 0.000 0.008 0.100 0.892
#> SRR1699921 5 0.2408 0.7537 0.000 0.000 0.016 0.092 0.892
#> SRR1699922 5 0.1764 0.7473 0.000 0.012 0.012 0.036 0.940
#> SRR1699923 5 0.5702 0.3282 0.000 0.000 0.104 0.320 0.576
#> SRR1699924 4 0.5861 0.3691 0.000 0.000 0.104 0.520 0.376
#> SRR1699925 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1699926 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699927 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1699929 5 0.1822 0.7242 0.000 0.036 0.024 0.004 0.936
#> SRR1699928 5 0.2291 0.7549 0.000 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1699930 5 0.1646 0.7282 0.000 0.032 0.020 0.004 0.944
#> SRR1699931 5 0.2260 0.7053 0.000 0.064 0.028 0.000 0.908
#> SRR1699933 5 0.6241 0.1078 0.000 0.324 0.164 0.000 0.512
#> SRR1699932 5 0.1299 0.7446 0.000 0.012 0.008 0.020 0.960
#> SRR1699934 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1699935 5 0.2221 0.7121 0.000 0.052 0.036 0.000 0.912
#> SRR1699936 2 0.2516 0.6644 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.4192 0.3181 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.4101 0.3798 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.4562 0.0452 0.000 0.492 0.500 0.008 0.000
#> SRR1699939 2 0.4201 0.3092 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1699941 3 0.5618 0.5634 0.000 0.280 0.608 0.112 0.000
#> SRR1699942 2 0.4210 0.2994 0.000 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1699943 2 0.4182 0.3269 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.4192 0.3181 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699945 3 0.4500 0.4442 0.000 0.316 0.664 0.016 0.004
#> SRR1699946 2 0.4192 0.3181 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.4192 0.3181 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1699948 2 0.3561 0.5475 0.000 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.3857 0.4782 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.4088 0.3874 0.000 0.632 0.368 0.000 0.000
#> SRR1699951 2 0.4210 0.2994 0.000 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.4210 0.2994 0.000 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.4138 0.3577 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.4210 0.3018 0.000 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1699955 2 0.4114 0.3725 0.000 0.624 0.376 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.4848 0.5973 0.000 0.144 0.724 0.132 0.000
#> SRR1699957 2 0.4219 0.2895 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1699959 3 0.5879 0.4719 0.000 0.260 0.632 0.032 0.076
#> SRR1699958 2 0.4015 0.4219 0.000 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR1699960 2 0.3636 0.5326 0.000 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1699961 2 0.4557 0.0416 0.000 0.516 0.476 0.008 0.000
#> SRR1699962 2 0.4227 0.2805 0.000 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.4542 0.1342 0.000 0.536 0.456 0.008 0.000
#> SRR1699964 2 0.4235 0.2695 0.000 0.576 0.424 0.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.3932 0.4539 0.000 0.672 0.328 0.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.4227 0.2784 0.000 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR1699967 2 0.4201 0.3092 0.000 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1699968 3 0.5141 0.5893 0.000 0.236 0.672 0.092 0.000
#> SRR1699969 3 0.4616 0.4066 0.000 0.036 0.676 0.288 0.000
#> SRR1699971 3 0.4974 0.0780 0.000 0.484 0.492 0.020 0.004
#> SRR1699970 3 0.4627 0.2087 0.000 0.444 0.544 0.012 0.000
#> SRR1699972 3 0.5392 0.3245 0.000 0.384 0.568 0.024 0.024
#> SRR1699973 3 0.5049 0.0932 0.000 0.480 0.488 0.032 0.000
#> SRR1699974 4 0.3857 0.6441 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1699975 3 0.5841 0.5993 0.000 0.180 0.608 0.212 0.000
#> SRR1699976 3 0.4969 0.4101 0.000 0.376 0.588 0.036 0.000
#> SRR1699977 3 0.4268 0.3144 0.000 0.008 0.648 0.344 0.000
#> SRR1699978 4 0.5713 0.4863 0.000 0.000 0.416 0.500 0.084
#> SRR1699979 3 0.4485 0.3902 0.000 0.028 0.680 0.292 0.000
#> SRR1699980 3 0.5358 0.3647 0.000 0.008 0.660 0.252 0.080
#> SRR1699981 3 0.4425 -0.1162 0.000 0.004 0.544 0.452 0.000
#> SRR1699982 5 0.1653 0.7455 0.000 0.024 0.004 0.028 0.944
#> SRR1699983 3 0.4624 0.3714 0.000 0.016 0.676 0.296 0.012
#> SRR1699984 1 0.0955 0.9793 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1699985 3 0.5598 0.4113 0.000 0.036 0.628 0.296 0.040
#> SRR1699986 4 0.3661 0.6794 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1699988 3 0.6668 0.3903 0.000 0.320 0.532 0.044 0.104
#> SRR1699987 3 0.4211 0.2467 0.000 0.004 0.636 0.360 0.000
#> SRR1699989 3 0.6888 0.2898 0.000 0.172 0.448 0.020 0.360
#> SRR1699990 3 0.4727 0.3521 0.000 0.012 0.636 0.340 0.012
#> SRR1699992 3 0.4485 0.3902 0.000 0.028 0.680 0.292 0.000
#> SRR1699991 4 0.3913 0.6361 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1699993 4 0.4416 0.6316 0.000 0.000 0.356 0.632 0.012
#> SRR1699994 4 0.4251 0.5450 0.000 0.004 0.372 0.624 0.000
#> SRR1699995 4 0.4689 0.5747 0.000 0.000 0.424 0.560 0.016
#> SRR1699996 2 0.5128 0.3105 0.000 0.572 0.392 0.008 0.028
#> SRR1699997 3 0.4706 0.2184 0.000 0.004 0.496 0.492 0.008
#> SRR1699998 2 0.4517 0.2097 0.000 0.556 0.436 0.008 0.000
#> SRR1699999 4 0.4727 0.5526 0.000 0.000 0.452 0.532 0.016
#> SRR1700000 3 0.5217 0.5855 0.000 0.232 0.676 0.088 0.004
#> SRR1700002 3 0.5042 0.1729 0.000 0.460 0.508 0.032 0.000
#> SRR1700001 3 0.4464 0.3934 0.000 0.028 0.684 0.288 0.000
#> SRR1700003 3 0.5044 0.1577 0.000 0.464 0.504 0.032 0.000
#> SRR1700004 5 0.5279 0.7045 0.000 0.028 0.044 0.252 0.676
#> SRR1700005 1 0.0865 0.9777 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700006 2 0.5347 0.4571 0.000 0.616 0.316 0.004 0.064
#> SRR1700007 2 0.5061 0.0733 0.000 0.528 0.020 0.008 0.444
#> SRR1700008 4 0.2329 0.6747 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1700009 1 0.1638 0.9687 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700010 3 0.5788 0.5407 0.000 0.300 0.580 0.120 0.000
#> SRR1700011 2 0.4171 0.3342 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1700013 2 0.4150 0.3683 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700012 3 0.4748 0.0467 0.000 0.492 0.492 0.016 0.000
#> SRR1700014 5 0.6767 0.0640 0.000 0.004 0.228 0.340 0.428
#> SRR1700015 2 0.4610 0.1616 0.000 0.556 0.432 0.012 0.000
#> SRR1700016 3 0.7935 -0.4081 0.344 0.000 0.384 0.140 0.132
#> SRR1700018 3 0.4787 0.4178 0.000 0.364 0.608 0.028 0.000
#> SRR1700017 3 0.5079 0.6133 0.000 0.164 0.700 0.136 0.000
#> SRR1700019 2 0.2074 0.7162 0.000 0.920 0.036 0.000 0.044
#> SRR1700020 4 0.4731 0.5378 0.000 0.000 0.456 0.528 0.016
#> SRR1700021 5 0.1808 0.7342 0.000 0.012 0.044 0.008 0.936
#> SRR1700023 3 0.5327 0.6034 0.000 0.216 0.664 0.120 0.000
#> SRR1700022 3 0.4877 0.6014 0.000 0.136 0.732 0.128 0.004
#> SRR1700024 4 0.3913 0.6385 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700025 2 0.4150 0.3480 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR1700026 3 0.8528 0.0934 0.000 0.280 0.292 0.240 0.188
#> SRR1700027 3 0.5863 0.5442 0.000 0.292 0.588 0.116 0.004
#> SRR1700028 3 0.7490 0.5162 0.000 0.220 0.456 0.268 0.056
#> SRR1700029 4 0.4540 0.6465 0.000 0.000 0.320 0.656 0.024
#> SRR1700030 5 0.2180 0.7454 0.000 0.024 0.020 0.032 0.924
#> SRR1700031 4 0.4118 0.6365 0.000 0.000 0.336 0.660 0.004
#> SRR1700032 2 0.4504 0.2286 0.000 0.564 0.428 0.008 0.000
#> SRR1700034 4 0.4718 0.5582 0.000 0.000 0.444 0.540 0.016
#> SRR1700035 5 0.4766 0.6721 0.000 0.000 0.136 0.132 0.732
#> SRR1700033 4 0.4088 0.6645 0.000 0.000 0.304 0.688 0.008
#> SRR1700036 5 0.5714 0.4939 0.000 0.000 0.212 0.164 0.624
#> SRR1700037 5 0.1195 0.7503 0.000 0.012 0.000 0.028 0.960
#> SRR1700038 5 0.3016 0.7502 0.000 0.000 0.020 0.132 0.848
#> SRR1700039 4 0.3857 0.6692 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1700040 4 0.3837 0.6637 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1700041 4 0.3612 0.6834 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1700042 4 0.3661 0.6828 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700043 4 0.5626 0.5081 0.000 0.000 0.420 0.504 0.076
#> SRR1700045 4 0.3586 0.6846 0.000 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1700044 4 0.4428 0.6796 0.000 0.000 0.268 0.700 0.032
#> SRR1700046 4 0.3612 0.6834 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1700047 4 0.3835 0.6875 0.000 0.000 0.260 0.732 0.008
#> SRR1700048 5 0.5967 0.2655 0.000 0.000 0.136 0.308 0.556
#> SRR1700049 4 0.3661 0.6810 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700050 4 0.2513 0.6792 0.000 0.000 0.116 0.876 0.008
#> SRR1700051 4 0.4658 0.5863 0.000 0.000 0.408 0.576 0.016
#> SRR1700052 4 0.3741 0.6845 0.000 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700053 4 0.3741 0.6865 0.000 0.000 0.264 0.732 0.004
#> SRR1700054 4 0.3561 0.6860 0.000 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700055 4 0.4666 0.5851 0.000 0.000 0.412 0.572 0.016
#> SRR1700056 4 0.3123 0.6873 0.000 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR1700057 4 0.3636 0.6837 0.000 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700058 4 0.3612 0.6842 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1700059 4 0.3689 0.6876 0.000 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1700060 4 0.3684 0.6760 0.000 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1700061 4 0.3561 0.6860 0.000 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700062 4 0.3661 0.6794 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700063 4 0.3561 0.6860 0.000 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1700064 4 0.3612 0.6834 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1700065 4 0.3586 0.6846 0.000 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1700066 4 0.3661 0.6794 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700067 4 0.3586 0.6846 0.000 0.000 0.264 0.736 0.000
#> SRR1700068 4 0.3395 0.6885 0.000 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1700069 4 0.3661 0.6794 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700070 4 0.4138 0.5441 0.000 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR1700071 4 0.3774 0.6621 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1700072 4 0.4649 0.5900 0.000 0.000 0.404 0.580 0.016
#> SRR1700073 5 0.4166 0.6684 0.000 0.000 0.004 0.348 0.648
#> SRR1700075 4 0.3612 0.6834 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1700074 4 0.3895 0.6349 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700076 4 0.3636 0.6815 0.000 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1700077 4 0.3707 0.6732 0.000 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1700078 4 0.3730 0.6768 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700080 4 0.4321 0.5087 0.000 0.004 0.396 0.600 0.000
#> SRR1700079 4 0.3837 0.6632 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1700081 4 0.3661 0.6794 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1700082 3 0.4893 0.0650 0.000 0.028 0.568 0.404 0.000
#> SRR1700083 4 0.4066 0.6488 0.000 0.000 0.324 0.672 0.004
#> SRR1700084 4 0.4306 0.6464 0.000 0.000 0.328 0.660 0.012
#> SRR1700085 5 0.6446 0.3690 0.000 0.004 0.308 0.180 0.508
#> SRR1700086 4 0.3876 0.6493 0.000 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700087 2 0.3305 0.6007 0.000 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.3796 0.5098 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000
#> SRR1700089 2 0.3582 0.6125 0.000 0.768 0.224 0.000 0.008
#> SRR1700091 2 0.3895 0.4828 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1700090 5 0.6640 0.5367 0.000 0.120 0.028 0.352 0.500
#> SRR1700092 2 0.3430 0.6022 0.000 0.776 0.220 0.004 0.000
#> SRR1700094 2 0.2773 0.6555 0.000 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR1700093 5 0.7349 0.4311 0.000 0.296 0.040 0.220 0.444
#> SRR1700095 5 0.6288 0.5633 0.000 0.020 0.232 0.152 0.596
#> SRR1700096 2 0.5071 0.4363 0.000 0.640 0.308 0.048 0.004
#> SRR1700097 4 0.6511 0.3743 0.000 0.112 0.360 0.504 0.024
#> SRR1700098 2 0.1668 0.7248 0.000 0.940 0.032 0.000 0.028
#> SRR1700099 2 0.1907 0.7133 0.000 0.928 0.028 0.000 0.044
#> SRR1700100 2 0.3048 0.6466 0.000 0.820 0.176 0.000 0.004
#> SRR1700101 2 0.2230 0.6908 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.3636 0.5458 0.000 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1700104 2 0.5825 0.1299 0.000 0.508 0.412 0.072 0.008
#> SRR1700103 3 0.7071 0.3972 0.000 0.296 0.404 0.288 0.012
#> SRR1700105 5 0.5400 0.6998 0.000 0.056 0.020 0.268 0.656
#> SRR1700106 5 0.6090 0.6619 0.000 0.132 0.016 0.244 0.608
#> SRR1700107 2 0.6398 0.4544 0.000 0.636 0.188 0.088 0.088
#> SRR1700108 2 0.2585 0.7055 0.000 0.896 0.036 0.004 0.064
#> SRR1700109 2 0.2722 0.7000 0.000 0.892 0.040 0.008 0.060
#> SRR1700110 2 0.2949 0.6992 0.000 0.876 0.068 0.004 0.052
#> SRR1700112 5 0.4916 0.7018 0.000 0.032 0.012 0.288 0.668
#> SRR1700111 5 0.4040 0.7104 0.000 0.000 0.012 0.276 0.712
#> SRR1700113 5 0.4612 0.7336 0.000 0.084 0.028 0.108 0.780
#> SRR1700114 2 0.6458 -0.0346 0.000 0.452 0.400 0.140 0.008
#> SRR1700115 2 0.4325 0.6221 0.000 0.776 0.168 0.024 0.032
#> SRR1700116 4 0.6387 -0.2841 0.000 0.080 0.032 0.492 0.396
#> SRR1700117 4 0.3620 0.5734 0.000 0.000 0.068 0.824 0.108
#> SRR1700119 5 0.4658 0.7065 0.000 0.016 0.016 0.284 0.684
#> SRR1700118 4 0.2280 0.5754 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700120 4 0.1845 0.6585 0.000 0.000 0.056 0.928 0.016
#> SRR1700121 5 0.4563 0.7307 0.000 0.028 0.016 0.228 0.728
#> SRR1700122 5 0.4101 0.6505 0.000 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700123 4 0.3837 0.1353 0.000 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700125 5 0.4895 0.6883 0.000 0.024 0.012 0.316 0.648
#> SRR1700126 4 0.1608 0.6690 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1700127 4 0.1410 0.6342 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1700124 4 0.1544 0.6305 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700128 4 0.1671 0.6259 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700129 5 0.4227 0.5948 0.000 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700130 4 0.4273 -0.3372 0.000 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1700132 4 0.1211 0.6576 0.000 0.000 0.024 0.960 0.016
#> SRR1700131 4 0.1408 0.6450 0.000 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700133 5 0.4171 0.6256 0.000 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700134 5 0.4150 0.6335 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700135 4 0.2280 0.5732 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700136 4 0.1331 0.6465 0.000 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700137 4 0.4045 -0.0420 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1700138 4 0.4060 -0.0523 0.000 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700140 4 0.1671 0.6250 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700139 4 0.1544 0.6299 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700141 5 0.4249 0.5777 0.000 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700142 4 0.1725 0.6630 0.000 0.000 0.044 0.936 0.020
#> SRR1700143 4 0.1251 0.6477 0.000 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700144 4 0.1403 0.6568 0.000 0.000 0.024 0.952 0.024
#> SRR1700145 4 0.4235 -0.2670 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1700146 5 0.4305 0.4782 0.000 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700147 4 0.1205 0.6448 0.000 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1700149 4 0.1628 0.6400 0.000 0.000 0.008 0.936 0.056
#> SRR1700148 4 0.1544 0.6303 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700150 5 0.4302 0.4944 0.000 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700152 4 0.2966 0.4605 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700151 4 0.1282 0.6433 0.000 0.000 0.004 0.952 0.044
#> SRR1700153 4 0.1671 0.6250 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700154 4 0.2516 0.5433 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700155 4 0.2732 0.5064 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700156 4 0.1251 0.6478 0.000 0.000 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700158 4 0.1894 0.6297 0.000 0.000 0.008 0.920 0.072
#> SRR1700159 5 0.4150 0.6335 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700157 4 0.1408 0.6451 0.000 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700160 4 0.4287 -0.3668 0.000 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1700161 4 0.4192 -0.2066 0.000 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1700162 5 0.4150 0.6335 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1700164 5 0.5759 0.5937 0.000 0.000 0.200 0.180 0.620
#> SRR1700163 4 0.3119 0.6109 0.000 0.000 0.072 0.860 0.068
#> SRR1700165 4 0.2773 0.5067 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1700166 5 0.4235 0.5898 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700168 5 0.4608 0.6782 0.000 0.012 0.008 0.336 0.644
#> SRR1700167 4 0.2654 0.6203 0.000 0.000 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700170 5 0.4045 0.6667 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700169 5 0.4201 0.6121 0.000 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700171 4 0.4974 0.5469 0.000 0.000 0.408 0.560 0.032
#> SRR1700172 5 0.4283 0.5368 0.000 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1700174 4 0.4482 -0.1281 0.000 0.000 0.012 0.612 0.376
#> SRR1700173 4 0.4173 0.1491 0.000 0.000 0.012 0.688 0.300
#> SRR1700175 5 0.4278 0.5463 0.000 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700176 4 0.0807 0.6555 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1700178 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700177 5 0.3949 0.6860 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700180 2 0.0912 0.7269 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700179 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700183 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700182 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700184 2 0.0404 0.7281 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0703 0.7241 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.1831 0.9646 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR1700185 1 0.0162 0.9796 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0510 0.7271 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700192 2 0.7196 -0.0926 0.016 0.368 0.288 0.000 0.328
#> SRR1700190 2 0.4933 0.4518 0.000 0.688 0.236 0.000 0.076
#> SRR1700191 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700189 1 0.2011 0.9592 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR1700193 2 0.0912 0.7269 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1700195 2 0.1469 0.7199 0.000 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR1700194 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700197 3 0.7259 -0.0359 0.016 0.392 0.404 0.016 0.172
#> SRR1700198 2 0.1211 0.7241 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1700199 2 0.1914 0.7076 0.000 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1700200 2 0.2511 0.6845 0.000 0.892 0.028 0.000 0.080
#> SRR1700201 2 0.0693 0.7292 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700202 5 0.5528 0.4341 0.000 0.140 0.216 0.000 0.644
#> SRR1700203 2 0.1845 0.7100 0.000 0.928 0.016 0.000 0.056
#> SRR1700204 2 0.1195 0.7240 0.000 0.960 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700206 2 0.1549 0.7184 0.000 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700207 2 0.0566 0.7286 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700208 2 0.4409 0.5368 0.000 0.752 0.176 0.000 0.072
#> SRR1700205 5 0.4394 0.5270 0.000 0.220 0.048 0.000 0.732
#> SRR1700209 2 0.1549 0.7183 0.000 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700210 2 0.4425 0.4736 0.000 0.716 0.040 0.000 0.244
#> SRR1700211 2 0.2769 0.6708 0.000 0.876 0.032 0.000 0.092
#> SRR1700212 2 0.2511 0.6845 0.000 0.892 0.028 0.000 0.080
#> SRR1700213 2 0.3317 0.6861 0.000 0.840 0.116 0.000 0.044
#> SRR1700214 2 0.2208 0.6965 0.000 0.908 0.020 0.000 0.072
#> SRR1700215 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700217 2 0.2110 0.6995 0.000 0.912 0.016 0.000 0.072
#> SRR1700216 1 0.0566 0.9785 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700218 2 0.2230 0.6801 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0404 0.7292 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700222 1 0.1282 0.9740 0.952 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.0451 0.7295 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700221 2 0.2110 0.6995 0.000 0.912 0.016 0.000 0.072
#> SRR1700223 2 0.1012 0.7261 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1700224 2 0.2669 0.6687 0.000 0.876 0.020 0.000 0.104
#> SRR1700226 2 0.1549 0.7184 0.000 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700229 2 0.1549 0.7184 0.000 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700225 2 0.4276 0.3555 0.000 0.616 0.380 0.000 0.004
#> SRR1700227 2 0.0579 0.7295 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700230 5 0.7912 -0.2304 0.260 0.012 0.284 0.048 0.396
#> SRR1700231 2 0.1469 0.7199 0.000 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR1700228 2 0.1310 0.7292 0.000 0.956 0.020 0.000 0.024
#> SRR1700232 2 0.0798 0.7276 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1700233 2 0.1469 0.7199 0.000 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR1700234 2 0.5467 0.2181 0.000 0.524 0.064 0.000 0.412
#> SRR1700235 2 0.1701 0.7145 0.000 0.936 0.016 0.000 0.048
#> SRR1700237 2 0.1195 0.7241 0.000 0.960 0.012 0.000 0.028
#> SRR1700236 2 0.1845 0.7100 0.000 0.928 0.016 0.000 0.056
#> SRR1700238 2 0.1701 0.7146 0.000 0.936 0.016 0.000 0.048
#> SRR1700239 1 0.1952 0.9613 0.912 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.0671 0.9787 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700241 4 0.1557 0.6619 0.000 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1700243 2 0.1300 0.7228 0.000 0.956 0.016 0.000 0.028
#> SRR1700244 2 0.1981 0.7050 0.000 0.920 0.016 0.000 0.064
#> SRR1700242 5 0.8021 -0.1789 0.208 0.108 0.284 0.000 0.400
#> SRR1700246 5 0.6477 0.1817 0.000 0.252 0.252 0.000 0.496
#> SRR1700245 2 0.0566 0.7287 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700247 1 0.1952 0.9613 0.912 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9795 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0451 0.7295 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700248 2 0.1469 0.7199 0.000 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR1700251 2 0.1914 0.7076 0.000 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1700252 2 0.0794 0.7229 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.2046 0.7022 0.000 0.916 0.016 0.000 0.068
#> SRR1700256 2 0.1549 0.7184 0.000 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1700254 1 0.0671 0.9787 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700255 2 0.2208 0.6965 0.000 0.908 0.020 0.000 0.072
#> SRR1700257 2 0.1626 0.7166 0.000 0.940 0.016 0.000 0.044
#> SRR1700258 2 0.0671 0.7287 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700259 2 0.1357 0.7241 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1700260 2 0.2124 0.7043 0.000 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR1700261 2 0.4962 0.5583 0.000 0.720 0.168 0.004 0.108
#> SRR1700262 2 0.1668 0.7242 0.000 0.940 0.032 0.000 0.028
#> SRR1700263 2 0.1205 0.7256 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1700264 2 0.1544 0.7076 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.5925 0.2569 0.000 0.556 0.128 0.000 0.316
#> SRR1700266 2 0.2127 0.6853 0.000 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.1116 0.7278 0.000 0.964 0.028 0.004 0.004
#> SRR1700270 2 0.0771 0.7283 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700267 2 0.1124 0.7268 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1700271 2 0.0955 0.7279 0.000 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1700272 2 0.1041 0.7276 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1700273 2 0.0865 0.7283 0.000 0.972 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700274 2 0.1124 0.7270 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1700277 2 0.0703 0.7241 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700275 5 0.5215 0.1966 0.000 0.444 0.028 0.008 0.520
#> SRR1700276 2 0.3012 0.6451 0.000 0.852 0.024 0.000 0.124
#> SRR1700278 5 0.1997 0.7165 0.000 0.040 0.036 0.000 0.924
#> SRR1700279 5 0.2450 0.7021 0.000 0.052 0.048 0.000 0.900
#> SRR1700280 5 0.3019 0.6754 0.000 0.088 0.048 0.000 0.864
#> SRR1700281 2 0.0992 0.7292 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1700283 2 0.4803 0.0752 0.000 0.536 0.020 0.000 0.444
#> SRR1700282 5 0.2983 0.6853 0.000 0.076 0.056 0.000 0.868
#> SRR1700284 5 0.3883 0.7542 0.000 0.028 0.012 0.160 0.800
#> SRR1700285 5 0.4306 0.7498 0.000 0.044 0.012 0.172 0.772
#> SRR1700286 2 0.4192 0.3182 0.000 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1700287 5 0.4410 0.6766 0.000 0.160 0.028 0.036 0.776
#> SRR1700290 5 0.4528 0.6108 0.000 0.000 0.212 0.060 0.728
#> SRR1700289 5 0.3132 0.7570 0.000 0.036 0.008 0.092 0.864
#> SRR1700288 2 0.2046 0.7024 0.000 0.916 0.016 0.000 0.068
#> SRR1700292 5 0.2992 0.7116 0.000 0.092 0.024 0.012 0.872
#> SRR1700291 5 0.3203 0.7559 0.000 0.012 0.000 0.168 0.820
#> SRR1700293 5 0.3718 0.7528 0.000 0.048 0.008 0.120 0.824
#> SRR1700294 5 0.3863 0.7309 0.000 0.012 0.000 0.248 0.740
#> SRR1700295 5 0.3489 0.7558 0.000 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR1700297 5 0.3443 0.7555 0.000 0.012 0.008 0.164 0.816
#> SRR1700296 5 0.1605 0.7518 0.000 0.012 0.004 0.040 0.944
#> SRR1700298 5 0.2771 0.7615 0.000 0.012 0.000 0.128 0.860
#> SRR1700299 5 0.4045 0.6621 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700300 5 0.4182 0.6173 0.000 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1700302 5 0.3427 0.7499 0.000 0.012 0.000 0.192 0.796
#> SRR1700301 5 0.3242 0.7542 0.000 0.012 0.000 0.172 0.816
#> SRR1700303 5 0.3462 0.7485 0.000 0.012 0.000 0.196 0.792
#> SRR1700304 5 0.2433 0.7316 0.000 0.012 0.056 0.024 0.908
#> SRR1700305 5 0.4109 0.7103 0.000 0.012 0.000 0.288 0.700
#> SRR1700306 5 0.4045 0.6622 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700308 5 0.4151 0.6739 0.000 0.004 0.000 0.344 0.652
#> SRR1700307 5 0.4171 0.6239 0.000 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700309 5 0.3999 0.6715 0.000 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1700310 5 0.4152 0.7053 0.000 0.012 0.000 0.296 0.692
#> SRR1700311 5 0.4060 0.6586 0.000 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700312 5 0.4090 0.7207 0.000 0.016 0.000 0.268 0.716
#> SRR1700313 5 0.4235 0.5839 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700314 4 0.4015 -0.0163 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700315 5 0.3837 0.6959 0.000 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700316 5 0.3983 0.6763 0.000 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1700317 5 0.5080 0.6744 0.000 0.184 0.012 0.088 0.716
#> SRR1700318 5 0.2390 0.7377 0.000 0.012 0.044 0.032 0.912
#> SRR1700319 5 0.4045 0.6632 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700320 5 0.4109 0.7103 0.000 0.012 0.000 0.288 0.700
#> SRR1700322 5 0.4130 0.7082 0.000 0.012 0.000 0.292 0.696
#> SRR1700321 5 0.5885 0.6066 0.000 0.236 0.020 0.108 0.636
#> SRR1700323 5 0.4264 0.6454 0.000 0.004 0.000 0.376 0.620
#> SRR1700324 5 0.3779 0.7345 0.000 0.012 0.000 0.236 0.752
#> SRR1700325 5 0.4846 0.6180 0.000 0.220 0.028 0.032 0.720
#> SRR1700326 5 0.4150 0.5811 0.000 0.036 0.216 0.000 0.748
#> SRR1700327 2 0.4810 0.3167 0.000 0.580 0.400 0.008 0.012
#> SRR1700329 5 0.4289 0.7172 0.000 0.012 0.008 0.272 0.708
#> SRR1700328 5 0.2124 0.7530 0.000 0.012 0.020 0.044 0.924
#> SRR1700330 5 0.2551 0.7440 0.000 0.012 0.040 0.044 0.904
#> SRR1700331 5 0.2162 0.7541 0.000 0.012 0.008 0.064 0.916
#> SRR1700332 5 0.1701 0.7227 0.000 0.048 0.016 0.000 0.936
#> SRR1700333 5 0.1670 0.7566 0.000 0.012 0.000 0.052 0.936
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.1075 0.83274 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699875 6 0.3489 0.68943 0.000 0.288 0.004 0.000 0.000 0.708
#> SRR1699876 5 0.4474 0.70380 0.000 0.120 0.000 0.172 0.708 0.000
#> SRR1699877 2 0.1152 0.83144 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1699879 2 0.1949 0.80724 0.000 0.904 0.000 0.004 0.004 0.088
#> SRR1699878 2 0.1225 0.83978 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1699880 6 0.4148 0.75477 0.000 0.108 0.148 0.000 0.000 0.744
#> SRR1699881 6 0.4062 0.74038 0.000 0.080 0.176 0.000 0.000 0.744
#> SRR1699882 2 0.1367 0.83588 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1699883 2 0.1908 0.80185 0.000 0.900 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1699884 2 0.2810 0.74924 0.000 0.832 0.000 0.004 0.156 0.008
#> SRR1699885 2 0.1124 0.83896 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1699886 5 0.4434 0.70621 0.000 0.116 0.000 0.172 0.712 0.000
#> SRR1699888 5 0.4520 0.11000 0.000 0.448 0.000 0.032 0.520 0.000
#> SRR1699889 5 0.3799 0.77274 0.000 0.020 0.000 0.276 0.704 0.000
#> SRR1699890 5 0.4445 0.74311 0.000 0.072 0.000 0.208 0.712 0.008
#> SRR1699887 5 0.4767 0.65657 0.000 0.168 0.000 0.156 0.676 0.000
#> SRR1699891 5 0.3907 0.77216 0.000 0.028 0.000 0.268 0.704 0.000
#> SRR1699892 2 0.6041 -0.25301 0.000 0.404 0.008 0.000 0.184 0.404
#> SRR1699893 5 0.3834 0.77299 0.000 0.024 0.000 0.268 0.708 0.000
#> SRR1699894 5 0.3886 0.77120 0.000 0.028 0.000 0.264 0.708 0.000
#> SRR1699895 5 0.3876 0.77318 0.000 0.024 0.000 0.276 0.700 0.000
#> SRR1699896 5 0.4158 0.76966 0.000 0.028 0.000 0.252 0.708 0.012
#> SRR1699897 6 0.3979 0.70787 0.000 0.264 0.008 0.000 0.020 0.708
#> SRR1699898 3 0.1857 0.81447 0.000 0.000 0.924 0.028 0.004 0.044
#> SRR1699900 5 0.4150 0.76392 0.000 0.028 0.000 0.236 0.720 0.016
#> SRR1699899 5 0.3886 0.77120 0.000 0.028 0.000 0.264 0.708 0.000
#> SRR1699902 5 0.5576 0.49031 0.000 0.004 0.232 0.136 0.612 0.016
#> SRR1699901 5 0.5324 0.57791 0.000 0.000 0.148 0.196 0.640 0.016
#> SRR1699903 5 0.3634 0.77231 0.000 0.008 0.000 0.296 0.696 0.000
#> SRR1699904 5 0.3756 0.76826 0.000 0.004 0.000 0.316 0.676 0.004
#> SRR1699905 5 0.3740 0.69535 0.000 0.000 0.012 0.200 0.764 0.024
#> SRR1699906 5 0.3636 0.76526 0.000 0.004 0.000 0.320 0.676 0.000
#> SRR1699907 5 0.3636 0.76694 0.000 0.004 0.000 0.320 0.676 0.000
#> SRR1699908 5 0.3729 0.77332 0.000 0.012 0.000 0.296 0.692 0.000
#> SRR1699909 4 0.4385 -0.32197 0.000 0.000 0.024 0.532 0.444 0.000
#> SRR1699910 5 0.3756 0.74567 0.000 0.000 0.004 0.352 0.644 0.000
#> SRR1699911 5 0.3636 0.76679 0.000 0.004 0.000 0.320 0.676 0.000
#> SRR1699912 5 0.3652 0.76472 0.000 0.004 0.000 0.324 0.672 0.000
#> SRR1699913 5 0.3668 0.76356 0.000 0.004 0.000 0.328 0.668 0.000
#> SRR1699914 5 0.5505 0.22247 0.000 0.000 0.128 0.420 0.452 0.000
#> SRR1699915 5 0.3634 0.74332 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1699916 5 0.3668 0.76356 0.000 0.004 0.000 0.328 0.668 0.000
#> SRR1699917 5 0.4844 0.73823 0.000 0.000 0.060 0.272 0.652 0.016
#> SRR1699918 5 0.5004 0.59442 0.000 0.000 0.084 0.348 0.568 0.000
#> SRR1699919 5 0.3861 0.74295 0.000 0.000 0.008 0.352 0.640 0.000
#> SRR1699920 5 0.3861 0.74295 0.000 0.000 0.008 0.352 0.640 0.000
#> SRR1699921 5 0.3756 0.74567 0.000 0.000 0.004 0.352 0.644 0.000
#> SRR1699922 5 0.3636 0.76694 0.000 0.004 0.000 0.320 0.676 0.000
#> SRR1699923 5 0.5480 0.46307 0.000 0.000 0.220 0.160 0.608 0.012
#> SRR1699924 3 0.5724 -0.02323 0.000 0.000 0.424 0.164 0.412 0.000
#> SRR1699925 1 0.0972 0.96091 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1699926 5 0.3547 0.76073 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1699927 5 0.3652 0.76472 0.000 0.004 0.000 0.324 0.672 0.000
#> SRR1699929 5 0.3876 0.77418 0.000 0.024 0.000 0.276 0.700 0.000
#> SRR1699928 5 0.3668 0.76356 0.000 0.004 0.000 0.328 0.668 0.000
#> SRR1699930 5 0.3840 0.77221 0.000 0.020 0.000 0.284 0.696 0.000
#> SRR1699931 5 0.3956 0.77091 0.000 0.032 0.000 0.264 0.704 0.000
#> SRR1699933 5 0.5460 0.59407 0.000 0.080 0.004 0.080 0.680 0.156
#> SRR1699932 5 0.3672 0.76878 0.000 0.008 0.000 0.304 0.688 0.000
#> SRR1699934 1 0.0972 0.96091 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1699935 5 0.3799 0.77274 0.000 0.020 0.000 0.276 0.704 0.000
#> SRR1699936 2 0.2624 0.74835 0.000 0.844 0.000 0.004 0.004 0.148
#> SRR1699937 6 0.3371 0.68092 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR1699938 6 0.3789 0.49009 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1699940 6 0.4111 0.76240 0.000 0.144 0.108 0.000 0.000 0.748
#> SRR1699939 6 0.3428 0.67301 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1699941 6 0.3979 0.74033 0.000 0.076 0.172 0.000 0.000 0.752
#> SRR1699942 6 0.3288 0.69498 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1699943 6 0.3563 0.63301 0.000 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1699944 6 0.3464 0.66509 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688
#> SRR1699945 6 0.4360 0.66598 0.000 0.112 0.044 0.000 0.076 0.768
#> SRR1699946 6 0.3351 0.68512 0.000 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR1699947 6 0.3428 0.67151 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1699948 2 0.3390 0.49915 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1699949 2 0.4049 0.10959 0.000 0.580 0.000 0.004 0.004 0.412
#> SRR1699950 6 0.3843 0.40069 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1699951 6 0.3309 0.69138 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1699952 6 0.3266 0.69716 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1699953 6 0.3774 0.50897 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1699954 6 0.3266 0.69716 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1699955 6 0.3955 0.44148 0.000 0.436 0.000 0.004 0.000 0.560
#> SRR1699956 6 0.4169 0.69487 0.000 0.036 0.176 0.000 0.032 0.756
#> SRR1699957 6 0.3490 0.70252 0.000 0.268 0.008 0.000 0.000 0.724
#> SRR1699959 6 0.5562 0.72509 0.000 0.116 0.152 0.004 0.060 0.668
#> SRR1699958 6 0.4178 0.44790 0.000 0.428 0.000 0.008 0.004 0.560
#> SRR1699960 2 0.4009 0.31152 0.000 0.632 0.000 0.008 0.004 0.356
#> SRR1699961 6 0.4148 0.76231 0.000 0.148 0.108 0.000 0.000 0.744
#> SRR1699962 6 0.3476 0.70770 0.000 0.260 0.004 0.004 0.000 0.732
#> SRR1699963 6 0.4196 0.76182 0.000 0.144 0.116 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699964 6 0.3470 0.71627 0.000 0.248 0.012 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699965 2 0.3915 0.10854 0.000 0.584 0.000 0.004 0.000 0.412
#> SRR1699966 6 0.3445 0.70868 0.000 0.260 0.008 0.000 0.000 0.732
#> SRR1699967 6 0.3534 0.69787 0.000 0.276 0.008 0.000 0.000 0.716
#> SRR1699968 6 0.4062 0.68488 0.000 0.032 0.240 0.000 0.008 0.720
#> SRR1699969 6 0.3565 0.63277 0.000 0.000 0.276 0.004 0.004 0.716
#> SRR1699971 6 0.4209 0.76332 0.000 0.160 0.104 0.000 0.000 0.736
#> SRR1699970 6 0.4154 0.74712 0.000 0.096 0.164 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699972 6 0.4356 0.75445 0.000 0.136 0.140 0.000 0.000 0.724
#> SRR1699973 6 0.4196 0.75590 0.000 0.116 0.144 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699974 3 0.1838 0.80129 0.000 0.000 0.916 0.016 0.000 0.068
#> SRR1699975 6 0.4103 0.67101 0.000 0.024 0.248 0.004 0.008 0.716
#> SRR1699976 6 0.4282 0.73789 0.000 0.084 0.180 0.000 0.004 0.732
#> SRR1699977 6 0.4060 0.59325 0.000 0.000 0.296 0.016 0.008 0.680
#> SRR1699978 3 0.5190 0.56349 0.000 0.000 0.660 0.016 0.168 0.156
#> SRR1699979 6 0.3565 0.63396 0.000 0.000 0.276 0.004 0.004 0.716
#> SRR1699980 6 0.5168 0.54050 0.000 0.000 0.288 0.012 0.088 0.612
#> SRR1699981 6 0.4165 0.37917 0.000 0.000 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1699982 5 0.4395 0.72457 0.000 0.012 0.004 0.344 0.628 0.012
#> SRR1699983 6 0.3650 0.63681 0.000 0.000 0.272 0.008 0.004 0.716
#> SRR1699984 1 0.1092 0.96781 0.960 0.000 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1699985 6 0.4012 0.64110 0.000 0.000 0.256 0.024 0.008 0.712
#> SRR1699986 3 0.2036 0.82744 0.000 0.000 0.916 0.048 0.008 0.028
#> SRR1699988 6 0.5274 0.69285 0.000 0.064 0.140 0.008 0.084 0.704
#> SRR1699987 6 0.3861 0.57634 0.000 0.000 0.316 0.008 0.004 0.672
#> SRR1699989 6 0.5963 0.54672 0.000 0.040 0.056 0.080 0.168 0.656
#> SRR1699990 6 0.3936 0.62254 0.000 0.000 0.276 0.020 0.004 0.700
#> SRR1699992 6 0.3586 0.62894 0.000 0.000 0.280 0.004 0.004 0.712
#> SRR1699991 3 0.1967 0.79274 0.000 0.000 0.904 0.012 0.000 0.084
#> SRR1699993 3 0.4187 0.75277 0.000 0.000 0.784 0.044 0.084 0.088
#> SRR1699994 3 0.2838 0.67120 0.000 0.000 0.808 0.004 0.000 0.188
#> SRR1699995 3 0.4622 0.63069 0.000 0.000 0.720 0.012 0.132 0.136
#> SRR1699996 6 0.4962 0.67929 0.000 0.292 0.056 0.000 0.020 0.632
#> SRR1699997 6 0.5813 0.37421 0.000 0.000 0.208 0.268 0.004 0.520
#> SRR1699998 6 0.4175 0.76273 0.000 0.156 0.104 0.000 0.000 0.740
#> SRR1699999 3 0.4601 0.62831 0.000 0.000 0.716 0.008 0.140 0.136
#> SRR1700000 6 0.4163 0.69583 0.000 0.048 0.232 0.000 0.004 0.716
#> SRR1700002 6 0.4190 0.75424 0.000 0.112 0.148 0.000 0.000 0.740
#> SRR1700001 6 0.3626 0.61830 0.000 0.000 0.288 0.004 0.004 0.704
#> SRR1700003 6 0.4203 0.75834 0.000 0.124 0.136 0.000 0.000 0.740
#> SRR1700004 4 0.4028 0.39882 0.000 0.020 0.016 0.752 0.204 0.008
#> SRR1700005 1 0.1480 0.96470 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1700006 6 0.5603 0.35322 0.000 0.440 0.040 0.004 0.044 0.472
#> SRR1700007 2 0.6311 0.16357 0.000 0.508 0.000 0.268 0.188 0.036
#> SRR1700008 3 0.4491 0.02784 0.000 0.000 0.500 0.476 0.008 0.016
#> SRR1700009 1 0.2294 0.95405 0.892 0.000 0.000 0.000 0.072 0.036
#> SRR1700010 6 0.4355 0.74473 0.000 0.092 0.164 0.000 0.008 0.736
#> SRR1700011 6 0.3872 0.54011 0.000 0.392 0.000 0.004 0.000 0.604
#> SRR1700013 6 0.4383 0.58494 0.000 0.356 0.000 0.016 0.012 0.616
#> SRR1700012 6 0.4117 0.76175 0.000 0.140 0.112 0.000 0.000 0.748
#> SRR1700014 4 0.5428 0.23596 0.000 0.000 0.392 0.520 0.064 0.024
#> SRR1700015 6 0.5731 0.59483 0.000 0.332 0.080 0.016 0.016 0.556
#> SRR1700016 3 0.7354 0.07382 0.124 0.000 0.408 0.004 0.272 0.192
#> SRR1700018 6 0.4753 0.74982 0.000 0.120 0.148 0.004 0.012 0.716
#> SRR1700017 6 0.4682 0.67845 0.000 0.056 0.228 0.004 0.016 0.696
#> SRR1700019 2 0.3710 0.75886 0.000 0.820 0.000 0.060 0.044 0.076
#> SRR1700020 3 0.4563 0.62376 0.000 0.000 0.712 0.004 0.132 0.152
#> SRR1700021 5 0.4365 0.75871 0.000 0.004 0.000 0.292 0.664 0.040
#> SRR1700023 6 0.3960 0.69711 0.000 0.032 0.224 0.000 0.008 0.736
#> SRR1700022 6 0.4283 0.68965 0.000 0.032 0.224 0.004 0.016 0.724
#> SRR1700024 3 0.2213 0.80946 0.000 0.000 0.904 0.044 0.004 0.048
#> SRR1700025 6 0.4442 0.67190 0.000 0.308 0.032 0.004 0.004 0.652
#> SRR1700026 3 0.7529 0.26006 0.000 0.272 0.456 0.084 0.132 0.056
#> SRR1700027 6 0.6579 0.40603 0.000 0.160 0.384 0.012 0.028 0.416
#> SRR1700028 6 0.7848 0.35730 0.000 0.124 0.188 0.276 0.032 0.380
#> SRR1700029 3 0.2414 0.81321 0.000 0.000 0.900 0.028 0.028 0.044
#> SRR1700030 5 0.4675 0.59976 0.000 0.012 0.012 0.416 0.552 0.008
#> SRR1700031 3 0.2395 0.80081 0.000 0.000 0.892 0.020 0.012 0.076
#> SRR1700032 6 0.4030 0.75572 0.000 0.172 0.080 0.000 0.000 0.748
#> SRR1700034 3 0.4564 0.63058 0.000 0.000 0.720 0.008 0.136 0.136
#> SRR1700035 4 0.5821 -0.25220 0.000 0.000 0.108 0.504 0.364 0.024
#> SRR1700033 3 0.1644 0.82808 0.000 0.000 0.932 0.040 0.000 0.028
#> SRR1700036 4 0.6882 -0.25673 0.000 0.000 0.264 0.388 0.296 0.052
#> SRR1700037 5 0.4315 0.71017 0.000 0.008 0.000 0.364 0.612 0.016
#> SRR1700038 5 0.5503 0.47585 0.000 0.000 0.080 0.448 0.456 0.016
#> SRR1700039 3 0.2709 0.81092 0.000 0.000 0.884 0.044 0.032 0.040
#> SRR1700040 3 0.1700 0.81731 0.000 0.000 0.928 0.024 0.000 0.048
#> SRR1700041 3 0.1462 0.82648 0.000 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR1700042 3 0.1616 0.82836 0.000 0.000 0.932 0.048 0.000 0.020
#> SRR1700043 3 0.4403 0.65251 0.000 0.000 0.740 0.012 0.148 0.100
#> SRR1700045 3 0.1500 0.82716 0.000 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012
#> SRR1700044 3 0.1895 0.82430 0.000 0.000 0.912 0.072 0.000 0.016
#> SRR1700046 3 0.1528 0.82728 0.000 0.000 0.936 0.048 0.000 0.016
#> SRR1700047 3 0.1663 0.81098 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1700048 3 0.6260 -0.00454 0.000 0.000 0.444 0.160 0.368 0.028
#> SRR1700049 3 0.2123 0.82502 0.000 0.000 0.912 0.052 0.012 0.024
#> SRR1700050 3 0.3163 0.64328 0.000 0.000 0.764 0.232 0.000 0.004
#> SRR1700051 3 0.4793 0.62849 0.000 0.000 0.712 0.020 0.132 0.136
#> SRR1700052 3 0.1531 0.82229 0.000 0.000 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR1700053 3 0.1858 0.80966 0.000 0.000 0.904 0.092 0.000 0.004
#> SRR1700054 3 0.1267 0.82498 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700055 3 0.4429 0.65241 0.000 0.000 0.740 0.012 0.124 0.124
#> SRR1700056 3 0.2762 0.69422 0.000 0.000 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1700057 3 0.1701 0.82156 0.000 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008
#> SRR1700058 3 0.1462 0.82725 0.000 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR1700059 3 0.1765 0.80516 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1700060 3 0.1633 0.82622 0.000 0.000 0.932 0.044 0.000 0.024
#> SRR1700061 3 0.1610 0.81406 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1700062 3 0.1682 0.82775 0.000 0.000 0.928 0.052 0.000 0.020
#> SRR1700063 3 0.1471 0.82482 0.000 0.000 0.932 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700064 3 0.1462 0.82648 0.000 0.000 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR1700065 3 0.1501 0.81933 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1700066 3 0.1789 0.82630 0.000 0.000 0.924 0.044 0.000 0.032
#> SRR1700067 3 0.1556 0.81652 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1700068 3 0.2048 0.78232 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1700069 3 0.1713 0.82580 0.000 0.000 0.928 0.044 0.000 0.028
#> SRR1700070 3 0.3245 0.69176 0.000 0.000 0.800 0.028 0.000 0.172
#> SRR1700071 3 0.1720 0.81893 0.000 0.000 0.928 0.032 0.000 0.040
#> SRR1700072 3 0.4396 0.66334 0.000 0.000 0.748 0.016 0.120 0.116
#> SRR1700073 4 0.3182 0.53916 0.000 0.000 0.036 0.832 0.124 0.008
#> SRR1700075 3 0.1500 0.82709 0.000 0.000 0.936 0.052 0.000 0.012
#> SRR1700074 3 0.2266 0.76730 0.000 0.000 0.880 0.012 0.000 0.108
#> SRR1700076 3 0.1528 0.82728 0.000 0.000 0.936 0.048 0.000 0.016
#> SRR1700077 3 0.1720 0.82481 0.000 0.000 0.928 0.040 0.000 0.032
#> SRR1700078 3 0.2022 0.82726 0.000 0.000 0.916 0.052 0.008 0.024
#> SRR1700080 3 0.2669 0.70667 0.000 0.000 0.836 0.008 0.000 0.156
#> SRR1700079 3 0.1832 0.82412 0.000 0.000 0.928 0.032 0.008 0.032
#> SRR1700081 3 0.1644 0.82688 0.000 0.000 0.932 0.040 0.000 0.028
#> SRR1700082 6 0.3966 0.31860 0.000 0.000 0.444 0.004 0.000 0.552
#> SRR1700083 3 0.1434 0.81321 0.000 0.000 0.940 0.012 0.000 0.048
#> SRR1700084 3 0.2394 0.80010 0.000 0.000 0.900 0.020 0.032 0.048
#> SRR1700085 4 0.7282 0.04565 0.000 0.000 0.220 0.424 0.144 0.212
#> SRR1700086 3 0.2152 0.80423 0.000 0.000 0.904 0.024 0.004 0.068
#> SRR1700087 2 0.4172 0.45238 0.000 0.672 0.000 0.016 0.012 0.300
#> SRR1700088 2 0.4657 -0.20676 0.000 0.496 0.000 0.016 0.016 0.472
#> SRR1700089 2 0.4495 0.32147 0.000 0.624 0.000 0.020 0.016 0.340
#> SRR1700091 2 0.4546 -0.02792 0.000 0.540 0.000 0.016 0.012 0.432
#> SRR1700090 4 0.4836 0.56444 0.000 0.080 0.080 0.760 0.052 0.028
#> SRR1700092 2 0.4354 0.55445 0.000 0.704 0.000 0.044 0.012 0.240
#> SRR1700094 2 0.3829 0.64791 0.000 0.760 0.000 0.024 0.016 0.200
#> SRR1700093 4 0.4608 0.40330 0.000 0.208 0.000 0.712 0.036 0.044
#> SRR1700095 4 0.6454 -0.04412 0.000 0.008 0.040 0.416 0.412 0.124
#> SRR1700096 6 0.5701 0.24904 0.000 0.436 0.000 0.112 0.012 0.440
#> SRR1700097 3 0.7975 0.38809 0.000 0.064 0.440 0.176 0.152 0.168
#> SRR1700098 2 0.1750 0.82747 0.000 0.932 0.000 0.016 0.012 0.040
#> SRR1700099 2 0.2515 0.82303 0.000 0.892 0.000 0.016 0.040 0.052
#> SRR1700100 2 0.4002 0.61376 0.000 0.740 0.000 0.032 0.012 0.216
#> SRR1700101 2 0.3019 0.75438 0.000 0.840 0.000 0.020 0.012 0.128
#> SRR1700102 2 0.4179 0.39204 0.000 0.652 0.000 0.016 0.008 0.324
#> SRR1700104 6 0.5432 0.62051 0.000 0.268 0.000 0.124 0.012 0.596
#> SRR1700103 6 0.6921 0.46185 0.000 0.164 0.040 0.296 0.028 0.472
#> SRR1700105 4 0.2384 0.54347 0.000 0.032 0.000 0.884 0.084 0.000
#> SRR1700106 4 0.3592 0.48537 0.000 0.116 0.000 0.808 0.068 0.008
#> SRR1700107 2 0.6667 0.10522 0.000 0.444 0.000 0.272 0.044 0.240
#> SRR1700108 2 0.3604 0.75590 0.000 0.820 0.000 0.104 0.044 0.032
#> SRR1700109 2 0.3677 0.74999 0.000 0.816 0.000 0.088 0.024 0.072
#> SRR1700110 2 0.3702 0.74770 0.000 0.812 0.000 0.088 0.020 0.080
#> SRR1700112 4 0.2162 0.54706 0.000 0.012 0.000 0.896 0.088 0.004
#> SRR1700111 4 0.3009 0.56447 0.000 0.004 0.040 0.844 0.112 0.000
#> SRR1700113 4 0.5155 0.03245 0.000 0.088 0.000 0.596 0.308 0.008
#> SRR1700114 6 0.6254 0.46821 0.000 0.256 0.000 0.260 0.016 0.468
#> SRR1700115 2 0.5338 0.50540 0.000 0.640 0.000 0.184 0.016 0.160
#> SRR1700116 4 0.4167 0.61702 0.000 0.016 0.116 0.792 0.048 0.028
#> SRR1700117 4 0.4327 0.42521 0.000 0.000 0.316 0.652 0.016 0.016
#> SRR1700119 4 0.2169 0.56633 0.000 0.008 0.012 0.900 0.080 0.000
#> SRR1700118 4 0.3330 0.50958 0.000 0.000 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR1700120 4 0.4395 0.36740 0.000 0.000 0.360 0.612 0.016 0.012
#> SRR1700121 4 0.2214 0.53399 0.000 0.016 0.000 0.888 0.096 0.000
#> SRR1700122 4 0.0891 0.60727 0.000 0.000 0.024 0.968 0.008 0.000
#> SRR1700123 4 0.2912 0.58533 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1700125 4 0.1787 0.56526 0.000 0.008 0.000 0.920 0.068 0.004
#> SRR1700126 3 0.4111 0.13114 0.000 0.000 0.536 0.456 0.004 0.004
#> SRR1700127 4 0.3672 0.48035 0.000 0.000 0.304 0.688 0.008 0.000
#> SRR1700124 4 0.3592 0.41999 0.000 0.000 0.344 0.656 0.000 0.000
#> SRR1700128 4 0.3464 0.46807 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1700129 4 0.1471 0.62557 0.000 0.000 0.064 0.932 0.004 0.000
#> SRR1700130 4 0.2631 0.61856 0.000 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1700132 4 0.3782 0.39147 0.000 0.000 0.360 0.636 0.004 0.000
#> SRR1700131 4 0.3659 0.38116 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000
#> SRR1700133 4 0.1757 0.62690 0.000 0.000 0.076 0.916 0.008 0.000
#> SRR1700134 4 0.1082 0.61689 0.000 0.000 0.040 0.956 0.004 0.000
#> SRR1700135 4 0.3390 0.49373 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700136 4 0.3634 0.39706 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR1700137 4 0.2762 0.60519 0.000 0.000 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1700138 4 0.2762 0.60544 0.000 0.000 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1700140 4 0.3390 0.49057 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700139 4 0.3390 0.49057 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700141 4 0.1349 0.62338 0.000 0.000 0.056 0.940 0.004 0.000
#> SRR1700142 3 0.3659 0.39438 0.000 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700143 4 0.3634 0.39706 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR1700144 3 0.3868 -0.02182 0.000 0.000 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1700145 4 0.2730 0.61042 0.000 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1700146 4 0.2053 0.63432 0.000 0.000 0.108 0.888 0.004 0.000
#> SRR1700147 4 0.3592 0.41966 0.000 0.000 0.344 0.656 0.000 0.000
#> SRR1700149 4 0.3647 0.38955 0.000 0.000 0.360 0.640 0.000 0.000
#> SRR1700148 4 0.3578 0.42695 0.000 0.000 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1700150 4 0.2320 0.63565 0.000 0.000 0.132 0.864 0.004 0.000
#> SRR1700152 4 0.3151 0.54885 0.000 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1700151 4 0.3634 0.39706 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR1700153 4 0.3390 0.49057 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700154 4 0.3266 0.52458 0.000 0.000 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR1700155 4 0.3244 0.53055 0.000 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR1700156 4 0.3634 0.39706 0.000 0.000 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR1700158 4 0.3607 0.41212 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000 0.000
#> SRR1700159 4 0.0891 0.61037 0.000 0.000 0.024 0.968 0.008 0.000
#> SRR1700157 4 0.3647 0.38877 0.000 0.000 0.360 0.640 0.000 0.000
#> SRR1700160 4 0.2562 0.62413 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1700161 4 0.2562 0.62405 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1700162 4 0.1010 0.61504 0.000 0.000 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR1700164 5 0.6212 0.21384 0.000 0.000 0.052 0.356 0.484 0.108
#> SRR1700163 4 0.4667 0.36926 0.000 0.000 0.348 0.608 0.028 0.016
#> SRR1700165 4 0.3508 0.49941 0.000 0.000 0.292 0.704 0.004 0.000
#> SRR1700166 4 0.1908 0.63231 0.000 0.000 0.096 0.900 0.004 0.000
#> SRR1700168 4 0.1606 0.56792 0.000 0.008 0.000 0.932 0.056 0.004
#> SRR1700167 4 0.3607 0.41737 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000 0.000
#> SRR1700170 4 0.1807 0.61916 0.000 0.000 0.060 0.920 0.020 0.000
#> SRR1700169 4 0.2070 0.63281 0.000 0.000 0.100 0.892 0.008 0.000
#> SRR1700171 3 0.5791 0.52061 0.000 0.000 0.612 0.040 0.180 0.168
#> SRR1700172 4 0.2772 0.62571 0.000 0.004 0.092 0.864 0.040 0.000
#> SRR1700174 4 0.3139 0.62467 0.000 0.000 0.160 0.812 0.028 0.000
#> SRR1700173 4 0.3139 0.62219 0.000 0.000 0.160 0.812 0.028 0.000
#> SRR1700175 4 0.1866 0.63119 0.000 0.000 0.084 0.908 0.008 0.000
#> SRR1700176 4 0.3955 0.34215 0.000 0.000 0.384 0.608 0.008 0.000
#> SRR1700178 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700177 4 0.1349 0.57511 0.000 0.000 0.004 0.940 0.056 0.000
#> SRR1700180 2 0.0725 0.84135 0.000 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1700179 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700181 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700183 1 0.0363 0.96619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700182 2 0.0713 0.83777 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700184 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700186 2 0.0937 0.83448 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700187 1 0.2728 0.94329 0.860 0.000 0.000 0.000 0.100 0.040
#> SRR1700185 1 0.0520 0.96757 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700188 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700192 5 0.6554 -0.02896 0.016 0.188 0.044 0.004 0.564 0.184
#> SRR1700190 2 0.5462 0.49005 0.000 0.628 0.020 0.000 0.200 0.152
#> SRR1700191 1 0.0363 0.96619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700189 1 0.2934 0.93527 0.844 0.000 0.000 0.000 0.112 0.044
#> SRR1700193 2 0.0622 0.84108 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1700195 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700194 1 0.0363 0.96619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700196 2 0.0790 0.83686 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700197 5 0.7885 -0.23293 0.012 0.316 0.144 0.008 0.336 0.184
#> SRR1700198 2 0.0777 0.83999 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700199 2 0.0935 0.83666 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700200 2 0.1693 0.82020 0.000 0.932 0.000 0.004 0.044 0.020
#> SRR1700201 2 0.0713 0.83777 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700202 5 0.4563 0.53628 0.000 0.064 0.016 0.068 0.776 0.076
#> SRR1700203 2 0.0865 0.83646 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700204 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700206 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700207 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700208 2 0.4802 0.59343 0.000 0.700 0.012 0.000 0.152 0.136
#> SRR1700205 5 0.5393 0.62294 0.000 0.188 0.000 0.128 0.652 0.032
#> SRR1700209 2 0.0790 0.83789 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700210 2 0.3204 0.72279 0.000 0.820 0.000 0.004 0.144 0.032
#> SRR1700211 2 0.1951 0.81053 0.000 0.916 0.000 0.004 0.060 0.020
#> SRR1700212 2 0.1511 0.82557 0.000 0.940 0.000 0.004 0.044 0.012
#> SRR1700213 2 0.3909 0.64471 0.000 0.772 0.012 0.004 0.036 0.176
#> SRR1700214 2 0.1226 0.83140 0.000 0.952 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1700215 1 0.0363 0.96619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700217 2 0.1493 0.82216 0.000 0.936 0.000 0.004 0.056 0.004
#> SRR1700216 1 0.0363 0.96619 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700218 2 0.1556 0.81498 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700219 2 0.0603 0.84113 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1700222 1 0.1984 0.95920 0.912 0.000 0.000 0.000 0.056 0.032
#> SRR1700220 2 0.0725 0.84140 0.000 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1700221 2 0.1364 0.82738 0.000 0.944 0.000 0.004 0.048 0.004
#> SRR1700223 2 0.0777 0.84047 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700224 2 0.1493 0.82216 0.000 0.936 0.000 0.004 0.056 0.004
#> SRR1700226 2 0.0713 0.83897 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700229 2 0.0865 0.83646 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700225 6 0.4189 0.60253 0.000 0.376 0.020 0.000 0.000 0.604
#> SRR1700227 2 0.0909 0.84017 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1700230 5 0.6236 0.02339 0.056 0.020 0.104 0.008 0.628 0.184
#> SRR1700231 2 0.0713 0.83897 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700228 2 0.1092 0.83781 0.000 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1700232 2 0.0891 0.84039 0.000 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1700233 2 0.0713 0.83897 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700234 2 0.5166 0.39520 0.000 0.600 0.004 0.020 0.324 0.052
#> SRR1700235 2 0.1010 0.83645 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700237 2 0.0713 0.83897 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1700236 2 0.0865 0.83646 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1700238 2 0.0790 0.83780 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1700239 1 0.2728 0.94329 0.860 0.000 0.000 0.000 0.100 0.040
#> SRR1700240 1 0.0891 0.96812 0.968 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1700241 4 0.4403 0.31242 0.000 0.000 0.396 0.580 0.012 0.012
#> SRR1700243 2 0.0777 0.83999 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700244 2 0.0935 0.83669 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1700242 5 0.6069 0.07204 0.044 0.072 0.048 0.004 0.648 0.184
#> SRR1700246 5 0.5737 0.26655 0.000 0.168 0.044 0.012 0.652 0.124
#> SRR1700245 2 0.0777 0.83999 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700247 1 0.2728 0.94329 0.860 0.000 0.000 0.000 0.100 0.040
#> SRR1700249 1 0.0692 0.96842 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1700250 2 0.0508 0.84055 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700248 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700251 2 0.1010 0.83490 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1700252 2 0.1049 0.83960 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1700253 2 0.1082 0.83311 0.000 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1700256 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700254 1 0.0777 0.96828 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1700255 2 0.1226 0.83140 0.000 0.952 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1700257 2 0.0632 0.83976 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1700258 2 0.0865 0.83601 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700259 2 0.2467 0.79601 0.000 0.884 0.000 0.016 0.012 0.088
#> SRR1700260 2 0.2665 0.78236 0.000 0.868 0.000 0.016 0.012 0.104
#> SRR1700261 2 0.6024 0.44605 0.000 0.604 0.000 0.152 0.068 0.176
#> SRR1700262 2 0.3092 0.79240 0.000 0.860 0.000 0.036 0.040 0.064
#> SRR1700263 2 0.2362 0.80268 0.000 0.892 0.000 0.016 0.012 0.080
#> SRR1700264 2 0.2051 0.79916 0.000 0.896 0.000 0.004 0.004 0.096
#> SRR1700265 2 0.5790 0.28803 0.000 0.516 0.016 0.016 0.376 0.076
#> SRR1700266 2 0.2588 0.77201 0.000 0.860 0.000 0.012 0.004 0.124
#> SRR1700268 2 0.2358 0.81636 0.000 0.900 0.000 0.028 0.016 0.056
#> SRR1700270 2 0.0858 0.83748 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1700267 2 0.2308 0.80576 0.000 0.896 0.000 0.016 0.012 0.076
#> SRR1700271 2 0.2043 0.81576 0.000 0.912 0.000 0.012 0.012 0.064
#> SRR1700272 2 0.1983 0.81823 0.000 0.916 0.000 0.012 0.012 0.060
#> SRR1700273 2 0.1511 0.82937 0.000 0.940 0.000 0.004 0.012 0.044
#> SRR1700274 2 0.2339 0.80748 0.000 0.896 0.000 0.020 0.012 0.072
#> SRR1700277 2 0.1088 0.84037 0.000 0.960 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR1700275 2 0.5819 0.14842 0.000 0.536 0.000 0.196 0.260 0.008
#> SRR1700276 2 0.2164 0.81116 0.000 0.908 0.000 0.020 0.060 0.012
#> SRR1700278 5 0.4415 0.77014 0.000 0.028 0.000 0.268 0.684 0.020
#> SRR1700279 5 0.4628 0.76514 0.000 0.024 0.000 0.268 0.672 0.036
#> SRR1700280 5 0.4837 0.75870 0.000 0.036 0.000 0.256 0.668 0.040
#> SRR1700281 2 0.1434 0.83364 0.000 0.948 0.000 0.012 0.012 0.028
#> SRR1700283 2 0.4624 0.50555 0.000 0.692 0.000 0.080 0.220 0.008
#> SRR1700282 5 0.5353 0.73470 0.000 0.068 0.000 0.256 0.632 0.044
#> SRR1700284 4 0.4093 0.09064 0.000 0.012 0.000 0.656 0.324 0.008
#> SRR1700285 4 0.4228 0.11937 0.000 0.020 0.000 0.656 0.316 0.008
#> SRR1700286 6 0.3996 0.60379 0.000 0.352 0.008 0.004 0.000 0.636
#> SRR1700287 4 0.6283 -0.32462 0.000 0.268 0.000 0.384 0.340 0.008
#> SRR1700290 5 0.5458 0.52440 0.000 0.000 0.040 0.148 0.656 0.156
#> SRR1700289 4 0.4853 -0.21512 0.000 0.044 0.000 0.556 0.392 0.008
#> SRR1700288 2 0.1578 0.82383 0.000 0.936 0.000 0.004 0.048 0.012
#> SRR1700292 5 0.5999 0.50102 0.000 0.180 0.000 0.364 0.448 0.008
#> SRR1700291 4 0.4045 0.06918 0.000 0.008 0.000 0.648 0.336 0.008
#> SRR1700293 4 0.4696 -0.04835 0.000 0.040 0.000 0.600 0.352 0.008
#> SRR1700294 4 0.3728 0.33505 0.000 0.004 0.012 0.748 0.228 0.008
#> SRR1700295 4 0.5244 -0.18242 0.000 0.000 0.020 0.560 0.360 0.060
#> SRR1700297 4 0.4061 0.12384 0.000 0.012 0.000 0.664 0.316 0.008
#> SRR1700296 5 0.4284 0.69057 0.000 0.008 0.000 0.384 0.596 0.012
#> SRR1700298 4 0.4069 -0.11943 0.000 0.004 0.000 0.612 0.376 0.008
#> SRR1700299 4 0.3036 0.52490 0.000 0.000 0.028 0.840 0.124 0.008
#> SRR1700300 4 0.3275 0.54496 0.000 0.000 0.044 0.828 0.120 0.008
#> SRR1700302 4 0.3928 0.13632 0.000 0.004 0.004 0.684 0.300 0.008
#> SRR1700301 4 0.3983 0.01210 0.000 0.004 0.000 0.640 0.348 0.008
#> SRR1700303 4 0.3950 0.12771 0.000 0.008 0.000 0.672 0.312 0.008
#> SRR1700304 5 0.4878 0.75080 0.000 0.004 0.012 0.292 0.640 0.052
#> SRR1700305 4 0.3560 0.39465 0.000 0.004 0.012 0.772 0.204 0.008
#> SRR1700306 4 0.3275 0.51116 0.000 0.000 0.032 0.820 0.140 0.008
#> SRR1700308 4 0.3206 0.46343 0.000 0.004 0.008 0.808 0.172 0.008
#> SRR1700307 4 0.3486 0.54276 0.000 0.000 0.052 0.812 0.128 0.008
#> SRR1700309 4 0.3194 0.52063 0.000 0.000 0.032 0.828 0.132 0.008
#> SRR1700310 4 0.3766 0.42988 0.000 0.004 0.028 0.772 0.188 0.008
#> SRR1700311 4 0.2993 0.52945 0.000 0.000 0.028 0.844 0.120 0.008
#> SRR1700312 4 0.3959 0.28201 0.000 0.008 0.008 0.712 0.264 0.008
#> SRR1700313 4 0.3612 0.57818 0.000 0.000 0.076 0.808 0.108 0.008
#> SRR1700314 4 0.2920 0.63015 0.000 0.000 0.168 0.820 0.004 0.008
#> SRR1700315 4 0.3688 0.42144 0.000 0.000 0.028 0.768 0.196 0.008
#> SRR1700316 4 0.2848 0.47590 0.000 0.000 0.004 0.828 0.160 0.008
#> SRR1700317 4 0.5550 0.01764 0.000 0.128 0.000 0.588 0.268 0.016
#> SRR1700318 5 0.4468 0.75889 0.000 0.004 0.000 0.316 0.640 0.040
#> SRR1700319 4 0.2993 0.52945 0.000 0.000 0.028 0.844 0.120 0.008
#> SRR1700320 4 0.3499 0.40726 0.000 0.004 0.012 0.780 0.196 0.008
#> SRR1700322 4 0.3658 0.38151 0.000 0.008 0.008 0.760 0.216 0.008
#> SRR1700321 4 0.5597 0.13614 0.000 0.160 0.000 0.608 0.212 0.020
#> SRR1700323 4 0.2915 0.54129 0.000 0.000 0.024 0.848 0.120 0.008
#> SRR1700324 4 0.3736 0.26917 0.000 0.008 0.000 0.716 0.268 0.008
#> SRR1700325 4 0.6331 -0.30762 0.000 0.312 0.000 0.360 0.320 0.008
#> SRR1700326 5 0.5298 0.56687 0.000 0.028 0.024 0.112 0.704 0.132
#> SRR1700327 6 0.5297 0.58600 0.000 0.320 0.000 0.068 0.024 0.588
#> SRR1700329 4 0.3535 0.36590 0.000 0.012 0.000 0.760 0.220 0.008
#> SRR1700328 5 0.4701 0.45119 0.000 0.008 0.000 0.480 0.484 0.028
#> SRR1700330 5 0.4513 0.75360 0.000 0.004 0.000 0.328 0.628 0.040
#> SRR1700331 5 0.3940 0.75739 0.000 0.004 0.000 0.336 0.652 0.008
#> SRR1700332 5 0.4518 0.72370 0.000 0.032 0.000 0.336 0.624 0.008
#> SRR1700333 5 0.4280 0.61963 0.000 0.008 0.000 0.428 0.556 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.805 0.894 0.955 0.5001 0.500 0.500
#> 3 3 0.666 0.680 0.834 0.3055 0.763 0.564
#> 4 4 0.690 0.743 0.849 0.1132 0.826 0.563
#> 5 5 0.698 0.709 0.844 0.0756 0.840 0.508
#> 6 6 0.700 0.605 0.781 0.0534 0.886 0.551
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.3274 0.9097 0.060 0.940
#> SRR1699881 2 0.1633 0.9407 0.024 0.976
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.5519 0.8381 0.128 0.872
#> SRR1699894 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.5519 0.8343 0.128 0.872
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699898 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699900 1 0.0672 0.9390 0.992 0.008
#> SRR1699899 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699902 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699901 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699903 2 0.8443 0.6113 0.272 0.728
#> SRR1699904 1 0.4298 0.8756 0.912 0.088
#> SRR1699905 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699906 2 0.9754 0.2767 0.408 0.592
#> SRR1699907 1 0.6712 0.7839 0.824 0.176
#> SRR1699908 2 0.8909 0.5378 0.308 0.692
#> SRR1699909 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699910 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699911 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699912 1 0.6712 0.7839 0.824 0.176
#> SRR1699913 1 0.9580 0.4313 0.620 0.380
#> SRR1699914 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699915 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699916 1 0.8763 0.6063 0.704 0.296
#> SRR1699917 1 0.3431 0.8974 0.936 0.064
#> SRR1699918 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699919 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699920 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699921 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699922 1 0.6801 0.7795 0.820 0.180
#> SRR1699923 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699924 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699926 1 0.0376 0.9415 0.996 0.004
#> SRR1699927 1 0.9522 0.4499 0.628 0.372
#> SRR1699929 1 1.0000 0.0663 0.504 0.496
#> SRR1699928 1 0.6801 0.7793 0.820 0.180
#> SRR1699930 2 0.1843 0.9371 0.028 0.972
#> SRR1699931 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.1633 0.9409 0.024 0.976
#> SRR1699932 2 0.9988 0.0172 0.480 0.520
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.1633 0.9408 0.024 0.976
#> SRR1699942 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.5737 0.8291 0.136 0.864
#> SRR1699946 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.9635 0.3781 0.388 0.612
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.2948 0.9172 0.052 0.948
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.8909 0.5625 0.308 0.692
#> SRR1699971 2 0.0938 0.9500 0.012 0.988
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.3431 0.9059 0.064 0.936
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699974 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699977 1 0.9815 0.2729 0.580 0.420
#> SRR1699978 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699979 2 0.4562 0.8741 0.096 0.904
#> SRR1699980 2 0.8661 0.6003 0.288 0.712
#> SRR1699981 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699986 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699987 1 0.6712 0.7713 0.824 0.176
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.4431 0.8801 0.092 0.908
#> SRR1699992 2 0.5946 0.8210 0.144 0.856
#> SRR1699991 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699993 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699994 1 0.4161 0.8748 0.916 0.084
#> SRR1699995 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.5408 0.8455 0.124 0.876
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700000 2 0.2778 0.9206 0.048 0.952
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.9580 0.3991 0.380 0.620
#> SRR1700003 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700004 1 0.9866 0.2381 0.568 0.432
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700008 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.6801 0.7728 0.180 0.820
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700014 1 0.9044 0.5335 0.680 0.320
#> SRR1700015 2 0.0376 0.9558 0.004 0.996
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700018 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.6623 0.7837 0.172 0.828
#> SRR1700019 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.4022 0.8786 0.920 0.080
#> SRR1700021 1 0.4562 0.8683 0.904 0.096
#> SRR1700023 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.9286 0.4855 0.344 0.656
#> SRR1700024 1 0.0672 0.9390 0.992 0.008
#> SRR1700025 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.9833 0.2767 0.424 0.576
#> SRR1700027 2 0.6623 0.7840 0.172 0.828
#> SRR1700028 2 0.4298 0.8843 0.088 0.912
#> SRR1700029 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700030 2 0.4815 0.8651 0.104 0.896
#> SRR1700031 1 0.5059 0.8458 0.888 0.112
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700035 1 0.9635 0.4120 0.612 0.388
#> SRR1700033 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700036 1 0.8267 0.6734 0.740 0.260
#> SRR1700037 1 0.7453 0.7388 0.788 0.212
#> SRR1700038 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700039 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700040 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700041 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700042 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700043 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700045 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700044 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700046 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700047 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700048 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700049 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700053 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700054 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700055 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700059 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700060 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700061 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700062 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700063 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700064 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700065 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700066 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700067 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700068 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700069 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700070 1 0.1633 0.9278 0.976 0.024
#> SRR1700071 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700072 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700073 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700075 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700074 1 0.2236 0.9174 0.964 0.036
#> SRR1700076 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700077 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700078 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700080 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700079 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700081 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700082 2 0.9896 0.2266 0.440 0.560
#> SRR1700083 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700084 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700085 2 0.1414 0.9437 0.020 0.980
#> SRR1700086 1 0.1184 0.9329 0.984 0.016
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.9460 0.4400 0.364 0.636
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700095 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700096 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700097 1 0.6973 0.7524 0.812 0.188
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.6343 0.8001 0.160 0.840
#> SRR1700105 1 0.9866 0.2784 0.568 0.432
#> SRR1700106 2 0.2778 0.9214 0.048 0.952
#> SRR1700107 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700111 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700116 1 0.9775 0.2968 0.588 0.412
#> SRR1700117 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700119 1 0.9896 0.2120 0.560 0.440
#> SRR1700118 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700120 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700121 2 0.6048 0.8147 0.148 0.852
#> SRR1700122 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700123 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700126 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700127 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700124 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700128 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700129 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700130 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700132 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700131 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700133 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700134 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700135 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700136 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700137 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700138 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700140 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700139 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700141 1 0.3114 0.9032 0.944 0.056
#> SRR1700142 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700144 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700145 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700146 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700147 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700150 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700152 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700151 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700153 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700154 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700155 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700156 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700159 1 0.6973 0.7695 0.812 0.188
#> SRR1700157 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700161 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700162 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700164 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700166 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700168 2 0.9044 0.5114 0.320 0.680
#> SRR1700167 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700169 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700171 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700172 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700174 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700173 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700175 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700176 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700177 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700192 2 0.0672 0.9530 0.008 0.992
#> SRR1700190 2 0.5842 0.8244 0.140 0.860
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.9580 0.3849 0.620 0.380
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700202 1 0.5294 0.8451 0.880 0.120
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.0938 0.9499 0.012 0.988
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.9170 0.4831 0.332 0.668
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700241 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0376 0.9415 0.996 0.004
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.9552 0.3708 0.376 0.624
#> SRR1700279 2 0.9286 0.4545 0.344 0.656
#> SRR1700280 2 0.3114 0.9120 0.056 0.944
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.5178 0.8519 0.116 0.884
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.3274 0.9082 0.060 0.940
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700290 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700289 2 0.0376 0.9558 0.004 0.996
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700291 1 0.9427 0.4780 0.640 0.360
#> SRR1700293 2 0.2043 0.9338 0.032 0.968
#> SRR1700294 1 0.2423 0.9156 0.960 0.040
#> SRR1700295 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700297 2 0.7745 0.6897 0.228 0.772
#> SRR1700296 1 0.9754 0.3589 0.592 0.408
#> SRR1700298 1 0.0376 0.9415 0.996 0.004
#> SRR1700299 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700300 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700302 1 0.5842 0.8243 0.860 0.140
#> SRR1700301 1 0.7745 0.7158 0.772 0.228
#> SRR1700303 1 0.9552 0.4405 0.624 0.376
#> SRR1700304 1 0.2043 0.9216 0.968 0.032
#> SRR1700305 1 0.6801 0.7797 0.820 0.180
#> SRR1700306 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700308 1 0.9833 0.3147 0.576 0.424
#> SRR1700307 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700309 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700310 1 0.6531 0.7932 0.832 0.168
#> SRR1700311 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700312 2 0.8608 0.5873 0.284 0.716
#> SRR1700313 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700314 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700315 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700316 1 0.4298 0.8773 0.912 0.088
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700318 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700319 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700320 1 0.8555 0.6346 0.720 0.280
#> SRR1700322 1 0.9044 0.5614 0.680 0.320
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700323 1 0.9323 0.5052 0.652 0.348
#> SRR1700324 1 0.9795 0.3370 0.584 0.416
#> SRR1700325 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700326 1 0.0376 0.9414 0.996 0.004
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.2043 0.9338 0.032 0.968
#> SRR1700328 1 0.4022 0.8831 0.920 0.080
#> SRR1700330 1 0.0000 0.9441 1.000 0.000
#> SRR1700331 1 0.6623 0.7886 0.828 0.172
#> SRR1700332 2 0.0000 0.9587 0.000 1.000
#> SRR1700333 1 0.7528 0.7331 0.784 0.216
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 2 0.4796 0.6955 0.220 0.780 0.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.0747 0.9125 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699881 2 0.0424 0.9192 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699882 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 1 0.4399 0.5317 0.812 0.188 0.000
#> SRR1699888 2 0.3038 0.8330 0.104 0.896 0.000
#> SRR1699889 1 0.3038 0.5583 0.896 0.104 0.000
#> SRR1699890 1 0.2261 0.5973 0.932 0.068 0.000
#> SRR1699887 2 0.4399 0.7373 0.188 0.812 0.000
#> SRR1699891 1 0.2796 0.5697 0.908 0.092 0.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699893 1 0.1267 0.6025 0.972 0.024 0.004
#> SRR1699894 1 0.2261 0.5829 0.932 0.068 0.000
#> SRR1699895 1 0.1711 0.5971 0.960 0.032 0.008
#> SRR1699896 1 0.0848 0.6116 0.984 0.008 0.008
#> SRR1699897 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699898 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699900 1 0.5859 0.6135 0.656 0.000 0.344
#> SRR1699899 1 0.5926 0.2643 0.644 0.356 0.000
#> SRR1699902 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699901 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699903 1 0.2998 0.5639 0.916 0.016 0.068
#> SRR1699904 1 0.0592 0.6027 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699905 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699906 1 0.5754 0.1369 0.700 0.004 0.296
#> SRR1699907 1 0.2066 0.5748 0.940 0.000 0.060
#> SRR1699908 1 0.2682 0.5596 0.920 0.004 0.076
#> SRR1699909 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1699910 1 0.2356 0.5799 0.928 0.000 0.072
#> SRR1699911 1 0.0892 0.5998 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699912 1 0.4062 0.4439 0.836 0.000 0.164
#> SRR1699913 1 0.5650 0.0920 0.688 0.000 0.312
#> SRR1699914 3 0.5216 0.5490 0.260 0.000 0.740
#> SRR1699915 1 0.2165 0.5719 0.936 0.000 0.064
#> SRR1699916 1 0.4178 0.4306 0.828 0.000 0.172
#> SRR1699917 1 0.5678 0.3085 0.684 0.000 0.316
#> SRR1699918 3 0.6079 0.5958 0.388 0.000 0.612
#> SRR1699919 1 0.4931 0.3091 0.768 0.000 0.232
#> SRR1699920 1 0.5591 0.4043 0.696 0.000 0.304
#> SRR1699921 1 0.1753 0.5843 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699922 1 0.1529 0.5892 0.960 0.000 0.040
#> SRR1699923 1 0.6126 0.6016 0.600 0.000 0.400
#> SRR1699924 1 0.6307 0.4952 0.512 0.000 0.488
#> SRR1699925 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699926 1 0.2261 0.5683 0.932 0.000 0.068
#> SRR1699927 1 0.5785 0.1245 0.696 0.004 0.300
#> SRR1699929 1 0.1751 0.6054 0.960 0.012 0.028
#> SRR1699928 1 0.5733 0.0505 0.676 0.000 0.324
#> SRR1699930 1 0.2689 0.5833 0.932 0.036 0.032
#> SRR1699931 1 0.5443 0.5029 0.736 0.260 0.004
#> SRR1699933 2 0.8395 -0.0485 0.436 0.480 0.084
#> SRR1699932 1 0.3851 0.4856 0.860 0.004 0.136
#> SRR1699934 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699935 1 0.4504 0.5067 0.804 0.196 0.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699941 2 0.0424 0.9192 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699942 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 2 0.7091 0.5181 0.056 0.676 0.268
#> SRR1699946 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.0237 0.9223 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 2 0.8373 0.1854 0.088 0.524 0.388
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699959 2 0.9090 0.1176 0.332 0.512 0.156
#> SRR1699958 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.0237 0.9225 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699969 3 0.6445 0.3429 0.020 0.308 0.672
#> SRR1699971 2 0.0237 0.9223 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 2 0.1832 0.8889 0.008 0.956 0.036
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699974 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699975 2 0.5397 0.5680 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699976 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699977 3 0.6154 0.5553 0.044 0.204 0.752
#> SRR1699978 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699979 2 0.5650 0.5105 0.000 0.688 0.312
#> SRR1699980 3 0.8737 0.2919 0.232 0.180 0.588
#> SRR1699981 3 0.0475 0.6824 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699982 2 0.9167 0.1123 0.392 0.460 0.148
#> SRR1699983 3 0.8557 0.5087 0.180 0.212 0.608
#> SRR1699984 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1699985 3 0.8113 0.4237 0.092 0.312 0.596
#> SRR1699986 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699988 2 0.0848 0.9137 0.008 0.984 0.008
#> SRR1699987 3 0.1919 0.6840 0.024 0.020 0.956
#> SRR1699989 2 0.5307 0.7389 0.048 0.816 0.136
#> SRR1699990 3 0.7949 0.4347 0.084 0.308 0.608
#> SRR1699992 3 0.6309 0.0457 0.000 0.496 0.504
#> SRR1699991 3 0.1289 0.6551 0.032 0.000 0.968
#> SRR1699993 3 0.3879 0.4833 0.152 0.000 0.848
#> SRR1699994 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1699995 3 0.5835 -0.0199 0.340 0.000 0.660
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699997 3 0.8557 0.5106 0.180 0.212 0.608
#> SRR1699998 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699999 1 0.6111 0.6037 0.604 0.000 0.396
#> SRR1700000 2 0.4602 0.7836 0.040 0.852 0.108
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700001 3 0.6398 0.1802 0.008 0.372 0.620
#> SRR1700003 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700004 3 0.8769 0.4870 0.348 0.124 0.528
#> SRR1700005 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700006 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700007 2 0.5706 0.5466 0.320 0.680 0.000
#> SRR1700008 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700009 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700010 2 0.4861 0.7090 0.008 0.800 0.192
#> SRR1700011 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700014 3 0.6079 0.5959 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700015 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700016 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700018 2 0.0237 0.9223 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700017 2 0.6313 0.5082 0.016 0.676 0.308
#> SRR1700019 2 0.0592 0.9165 0.012 0.988 0.000
#> SRR1700020 1 0.6688 0.5846 0.580 0.012 0.408
#> SRR1700021 1 0.0424 0.6040 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700023 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700022 2 0.7519 0.2894 0.044 0.568 0.388
#> SRR1700024 3 0.4677 0.6717 0.132 0.028 0.840
#> SRR1700025 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700026 1 0.9572 0.4320 0.416 0.196 0.388
#> SRR1700027 2 0.6129 0.5522 0.016 0.700 0.284
#> SRR1700028 2 0.6398 0.6655 0.060 0.748 0.192
#> SRR1700029 1 0.6192 0.5758 0.580 0.000 0.420
#> SRR1700030 1 0.9156 0.0901 0.540 0.256 0.204
#> SRR1700031 3 0.1765 0.6443 0.040 0.004 0.956
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700034 1 0.6260 0.5387 0.552 0.000 0.448
#> SRR1700035 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700033 3 0.2448 0.6045 0.076 0.000 0.924
#> SRR1700036 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700037 1 0.1964 0.5779 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700038 1 0.5948 0.5814 0.640 0.000 0.360
#> SRR1700039 3 0.0592 0.6730 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700040 3 0.1529 0.6470 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700041 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700042 3 0.1289 0.6551 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700043 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700045 3 0.0237 0.6819 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700044 3 0.0592 0.6823 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700046 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700047 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700048 1 0.6111 0.6048 0.604 0.000 0.396
#> SRR1700049 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700050 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700051 3 0.6309 -0.4484 0.496 0.000 0.504
#> SRR1700052 3 0.1289 0.6553 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700053 3 0.2625 0.6855 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700054 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700055 3 0.3267 0.5461 0.116 0.000 0.884
#> SRR1700056 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700057 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700058 3 0.0592 0.6730 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700059 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700060 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700061 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700062 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700063 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700064 3 0.0892 0.6856 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700065 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700066 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700067 3 0.0237 0.6820 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700068 3 0.0592 0.6841 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700069 3 0.0592 0.6841 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700070 3 0.7585 0.5984 0.180 0.132 0.688
#> SRR1700071 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700072 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700073 3 0.6252 0.5390 0.444 0.000 0.556
#> SRR1700075 3 0.0424 0.6832 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700074 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700076 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700077 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700078 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700080 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700079 3 0.1529 0.6474 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700081 3 0.0424 0.6761 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700082 3 0.4861 0.4385 0.008 0.192 0.800
#> SRR1700083 3 0.2165 0.6200 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700084 3 0.2165 0.6200 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700085 3 0.7192 0.5770 0.380 0.032 0.588
#> SRR1700086 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700090 2 0.9152 -0.1186 0.144 0.428 0.428
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700093 2 0.6229 0.5846 0.280 0.700 0.020
#> SRR1700095 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700096 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700097 3 0.7770 0.0178 0.272 0.088 0.640
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700103 2 0.3879 0.7755 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700105 1 0.9715 -0.2866 0.400 0.220 0.380
#> SRR1700106 2 0.9601 -0.0263 0.392 0.408 0.200
#> SRR1700107 2 0.0237 0.9224 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700109 2 0.1289 0.9003 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700112 3 0.8108 0.5185 0.392 0.072 0.536
#> SRR1700111 3 0.6307 -0.3250 0.488 0.000 0.512
#> SRR1700113 2 0.6451 0.4215 0.384 0.608 0.008
#> SRR1700114 2 0.0237 0.9223 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700116 3 0.8157 0.5575 0.308 0.096 0.596
#> SRR1700117 3 0.2625 0.5940 0.084 0.000 0.916
#> SRR1700119 3 0.8213 0.5410 0.344 0.088 0.568
#> SRR1700118 3 0.1163 0.6735 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700120 3 0.0747 0.6834 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700121 3 0.8998 0.4298 0.396 0.132 0.472
#> SRR1700122 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700123 3 0.2711 0.6852 0.088 0.000 0.912
#> SRR1700125 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700126 3 0.1529 0.6487 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700127 3 0.1860 0.6871 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700124 3 0.1163 0.6867 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700128 3 0.3340 0.6808 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700129 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700130 3 0.5835 0.6189 0.340 0.000 0.660
#> SRR1700132 3 0.1163 0.6863 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700131 3 0.0424 0.6804 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700133 3 0.6026 0.6027 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700134 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700135 3 0.3619 0.6779 0.136 0.000 0.864
#> SRR1700136 3 0.0892 0.6854 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700137 3 0.5560 0.6344 0.300 0.000 0.700
#> SRR1700138 3 0.5058 0.6528 0.244 0.000 0.756
#> SRR1700140 3 0.5397 0.6415 0.280 0.000 0.720
#> SRR1700139 3 0.3816 0.6756 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700141 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700142 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700143 3 0.0592 0.6840 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700144 3 0.0424 0.6830 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700145 3 0.2448 0.6632 0.076 0.000 0.924
#> SRR1700146 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700147 3 0.1411 0.6870 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700149 3 0.0000 0.6803 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700148 3 0.1163 0.6866 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700150 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700152 3 0.4750 0.6601 0.216 0.000 0.784
#> SRR1700151 3 0.1529 0.6871 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700153 3 0.2356 0.6863 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700154 3 0.3192 0.6818 0.112 0.000 0.888
#> SRR1700155 3 0.5529 0.6362 0.296 0.000 0.704
#> SRR1700156 3 0.1163 0.6863 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700158 3 0.0592 0.6734 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700159 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700157 3 0.0892 0.6854 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700160 3 0.5397 0.6415 0.280 0.000 0.720
#> SRR1700161 3 0.5621 0.6315 0.308 0.000 0.692
#> SRR1700162 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700164 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700163 3 0.6062 -0.1751 0.384 0.000 0.616
#> SRR1700165 3 0.0892 0.6859 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700166 3 0.6026 0.6028 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700168 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700167 3 0.1163 0.6609 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700170 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700169 3 0.5968 0.6083 0.364 0.000 0.636
#> SRR1700171 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700172 3 0.6026 0.6027 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700174 3 0.5016 0.6541 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700173 3 0.4974 0.6553 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700175 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700176 3 0.0237 0.6818 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.6140 0.5830 0.404 0.000 0.596
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700185 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 1 0.8349 0.5730 0.608 0.128 0.264
#> SRR1700190 1 0.9639 0.3946 0.448 0.332 0.220
#> SRR1700191 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700189 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0237 0.9223 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 1 0.1289 0.6145 0.968 0.000 0.032
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.5560 0.5390 0.300 0.700 0.000
#> SRR1700205 1 0.1860 0.6059 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.6260 0.1629 0.448 0.552 0.000
#> SRR1700211 2 0.1643 0.8890 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 1 0.6721 0.3210 0.604 0.380 0.016
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700240 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700241 3 0.0237 0.6784 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700246 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700249 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.2066 0.8761 0.060 0.940 0.000
#> SRR1700262 2 0.0892 0.9102 0.020 0.980 0.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 1 0.6330 0.2872 0.600 0.396 0.004
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.0237 0.9225 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.5859 0.5043 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700276 2 0.2959 0.8373 0.100 0.900 0.000
#> SRR1700278 1 0.0661 0.6038 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700279 1 0.0592 0.6058 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700280 1 0.1163 0.6067 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.5678 0.5519 0.316 0.684 0.000
#> SRR1700282 1 0.1182 0.6130 0.976 0.012 0.012
#> SRR1700284 3 0.9285 0.3854 0.392 0.160 0.448
#> SRR1700285 1 0.9792 -0.2673 0.392 0.236 0.372
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700287 2 0.6079 0.4255 0.388 0.612 0.000
#> SRR1700290 1 0.6095 0.6076 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700289 2 0.8627 0.2147 0.392 0.504 0.104
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9252 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.6095 0.4180 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700291 3 0.6421 0.5581 0.424 0.004 0.572
#> SRR1700293 2 0.8844 0.1762 0.392 0.488 0.120
#> SRR1700294 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700295 1 0.3941 0.6163 0.844 0.000 0.156
#> SRR1700297 3 0.7129 0.5685 0.392 0.028 0.580
#> SRR1700296 1 0.1453 0.5966 0.968 0.008 0.024
#> SRR1700298 1 0.3267 0.5159 0.884 0.000 0.116
#> SRR1700299 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700300 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700302 3 0.6111 0.5896 0.396 0.000 0.604
#> SRR1700301 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700303 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700304 1 0.0592 0.6056 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700305 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700306 3 0.6079 0.5958 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700308 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700307 3 0.6026 0.6027 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700309 3 0.5948 0.6102 0.360 0.000 0.640
#> SRR1700310 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700311 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700312 3 0.7712 0.5421 0.392 0.052 0.556
#> SRR1700313 3 0.6026 0.6027 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700314 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700315 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700316 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700317 2 0.7230 0.4424 0.344 0.616 0.040
#> SRR1700318 1 0.0424 0.6069 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700319 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700320 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700322 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700321 2 0.6200 0.5435 0.312 0.676 0.012
#> SRR1700323 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700324 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700325 2 0.5988 0.4622 0.368 0.632 0.000
#> SRR1700326 1 0.5905 0.6128 0.648 0.000 0.352
#> SRR1700327 2 0.0237 0.9225 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700329 3 0.6095 0.5934 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700328 1 0.2496 0.6205 0.928 0.004 0.068
#> SRR1700330 1 0.0424 0.6040 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700331 1 0.2261 0.5683 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700332 2 0.6659 0.2594 0.460 0.532 0.008
#> SRR1700333 1 0.0892 0.5996 0.980 0.000 0.020
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699876 4 0.4761 0.4350 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1699877 2 0.0188 0.9260 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.4372 0.7133 0.004 0.728 0.268 0.000
#> SRR1699881 2 0.4643 0.6001 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1699882 2 0.0188 0.9260 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699883 2 0.0188 0.9260 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699884 2 0.1389 0.8971 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 4 0.4922 0.6005 0.036 0.228 0.000 0.736
#> SRR1699888 2 0.4761 0.3666 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1699889 4 0.3523 0.7051 0.032 0.112 0.000 0.856
#> SRR1699890 4 0.4731 0.6348 0.160 0.060 0.000 0.780
#> SRR1699887 4 0.4830 0.3888 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1699891 4 0.4335 0.6564 0.036 0.168 0.000 0.796
#> SRR1699892 2 0.1256 0.9189 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1699893 4 0.4852 0.6406 0.152 0.072 0.000 0.776
#> SRR1699894 4 0.4465 0.6637 0.056 0.144 0.000 0.800
#> SRR1699895 4 0.3548 0.7115 0.068 0.068 0.000 0.864
#> SRR1699896 4 0.5050 0.2497 0.408 0.004 0.000 0.588
#> SRR1699897 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699898 3 0.1913 0.7884 0.020 0.000 0.940 0.040
#> SRR1699900 1 0.2469 0.8038 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1699899 4 0.4175 0.6397 0.016 0.200 0.000 0.784
#> SRR1699902 1 0.1474 0.8432 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1699901 1 0.1637 0.8395 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1699903 4 0.1843 0.7506 0.028 0.008 0.016 0.948
#> SRR1699904 4 0.3266 0.6561 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1699905 1 0.0592 0.8608 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699906 4 0.0188 0.7535 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1699907 4 0.1118 0.7515 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1699908 4 0.1022 0.7528 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1699909 4 0.3311 0.6529 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699910 4 0.1211 0.7516 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1699911 4 0.2589 0.7043 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1699912 4 0.0592 0.7548 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1699913 4 0.0188 0.7535 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1699914 4 0.5607 -0.2308 0.020 0.000 0.484 0.496
#> SRR1699915 4 0.0469 0.7545 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1699916 4 0.0469 0.7545 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1699917 3 0.5931 0.0508 0.036 0.000 0.504 0.460
#> SRR1699918 3 0.4941 0.4584 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1699919 4 0.0469 0.7545 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1699920 4 0.2521 0.7429 0.064 0.000 0.024 0.912
#> SRR1699921 4 0.1118 0.7517 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1699922 4 0.1302 0.7490 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1699923 1 0.2081 0.8231 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1699924 1 0.7597 -0.0078 0.440 0.000 0.356 0.204
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 4 0.0707 0.7547 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1699927 4 0.0336 0.7540 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1699929 4 0.4815 0.6008 0.216 0.028 0.004 0.752
#> SRR1699928 4 0.0469 0.7545 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1699930 4 0.2224 0.7426 0.032 0.040 0.000 0.928
#> SRR1699931 4 0.7146 0.3861 0.228 0.212 0.000 0.560
#> SRR1699933 1 0.7443 0.4367 0.552 0.312 0.028 0.108
#> SRR1699932 4 0.0779 0.7554 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.5183 0.6389 0.084 0.148 0.004 0.764
#> SRR1699936 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699938 2 0.1302 0.9133 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1699940 2 0.3356 0.8152 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1699939 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699941 2 0.4925 0.4218 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1699942 2 0.1557 0.9078 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699943 2 0.1302 0.9133 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1699944 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699945 1 0.6150 0.3360 0.580 0.360 0.060 0.000
#> SRR1699946 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699947 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.0188 0.9267 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699950 2 0.1118 0.9167 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1699951 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699952 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699953 2 0.1389 0.9115 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1699954 2 0.1854 0.9081 0.012 0.940 0.048 0.000
#> SRR1699955 2 0.1211 0.9150 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1699956 1 0.7394 0.4334 0.520 0.244 0.236 0.000
#> SRR1699957 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699959 1 0.3840 0.7614 0.844 0.104 0.052 0.000
#> SRR1699958 2 0.0469 0.9247 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699961 2 0.3356 0.8154 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1699962 2 0.1867 0.8986 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1699963 2 0.3311 0.8194 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1699964 2 0.2281 0.8821 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1699965 2 0.1022 0.9182 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1699966 2 0.1557 0.9078 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1699967 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699968 2 0.4950 0.5418 0.000 0.620 0.376 0.004
#> SRR1699969 3 0.1716 0.7503 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1699971 2 0.2868 0.8524 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1699970 2 0.3975 0.7483 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1699972 2 0.5234 0.7504 0.096 0.752 0.152 0.000
#> SRR1699973 2 0.4522 0.6493 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1699974 3 0.0779 0.7994 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1699975 3 0.4018 0.5475 0.000 0.224 0.772 0.004
#> SRR1699976 2 0.4250 0.7087 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1699977 3 0.0000 0.7995 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699978 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699979 3 0.2345 0.7105 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1699980 3 0.4894 0.5071 0.012 0.008 0.720 0.260
#> SRR1699981 3 0.0336 0.7986 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1699982 4 0.2871 0.7333 0.000 0.032 0.072 0.896
#> SRR1699983 3 0.1256 0.7902 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1699984 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.1209 0.7837 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1699986 3 0.1975 0.8152 0.016 0.000 0.936 0.048
#> SRR1699988 2 0.5458 0.7019 0.000 0.704 0.236 0.060
#> SRR1699987 3 0.0000 0.7995 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699989 2 0.7479 0.2261 0.000 0.480 0.196 0.324
#> SRR1699990 3 0.0000 0.7995 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699992 3 0.2216 0.7263 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1699991 3 0.1716 0.7755 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1699993 1 0.5472 0.5492 0.676 0.000 0.280 0.044
#> SRR1699994 3 0.0592 0.7967 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1699995 1 0.2888 0.7950 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1699996 2 0.2704 0.8615 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1699997 3 0.0188 0.8011 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699998 2 0.3219 0.8266 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699999 1 0.1211 0.8507 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1700000 2 0.7627 0.2305 0.272 0.472 0.256 0.000
#> SRR1700002 2 0.4406 0.6755 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1700001 3 0.3047 0.6874 0.012 0.116 0.872 0.000
#> SRR1700003 2 0.4164 0.7236 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1700004 4 0.6657 0.5009 0.012 0.088 0.284 0.616
#> SRR1700005 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.1118 0.9180 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1700007 4 0.4992 0.1918 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1700008 3 0.1557 0.8171 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700009 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.5387 0.4364 0.016 0.584 0.400 0.000
#> SRR1700011 2 0.1022 0.9181 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700013 2 0.1302 0.9142 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700012 2 0.3123 0.8340 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700014 3 0.2647 0.7856 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700015 2 0.2255 0.8973 0.012 0.920 0.068 0.000
#> SRR1700016 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 2 0.3710 0.7970 0.004 0.804 0.192 0.000
#> SRR1700017 2 0.7084 0.3908 0.140 0.520 0.340 0.000
#> SRR1700019 2 0.2081 0.8611 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1700020 1 0.3219 0.7704 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1700021 4 0.4222 0.5548 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1700023 2 0.4948 0.4047 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1700022 1 0.7883 0.1857 0.364 0.284 0.352 0.000
#> SRR1700024 3 0.0000 0.7995 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700025 2 0.1637 0.9062 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700026 1 0.3638 0.7670 0.848 0.120 0.032 0.000
#> SRR1700027 2 0.6770 0.5031 0.128 0.580 0.292 0.000
#> SRR1700028 3 0.5259 0.2380 0.004 0.376 0.612 0.008
#> SRR1700029 1 0.4454 0.5517 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1700030 4 0.4425 0.7038 0.012 0.080 0.080 0.828
#> SRR1700031 3 0.1716 0.7748 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1700032 2 0.2647 0.8640 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1700034 1 0.2342 0.8249 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1700035 4 0.4072 0.6263 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1700033 3 0.4868 0.5872 0.256 0.000 0.720 0.024
#> SRR1700036 3 0.4981 -0.0235 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700037 4 0.2647 0.7008 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1700038 1 0.4487 0.7423 0.808 0.000 0.092 0.100
#> SRR1700039 3 0.3229 0.7991 0.072 0.000 0.880 0.048
#> SRR1700040 3 0.2589 0.7344 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1700041 3 0.1854 0.8157 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1700042 3 0.3009 0.8065 0.056 0.000 0.892 0.052
#> SRR1700043 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700045 3 0.1902 0.8176 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1700044 3 0.2222 0.8184 0.016 0.000 0.924 0.060
#> SRR1700046 3 0.1661 0.8163 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1700047 3 0.3598 0.8122 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR1700048 1 0.1398 0.8494 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1700049 3 0.2300 0.8134 0.028 0.000 0.924 0.048
#> SRR1700050 3 0.3157 0.8048 0.004 0.000 0.852 0.144
#> SRR1700051 1 0.1489 0.8471 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1700052 3 0.4920 0.7385 0.164 0.000 0.768 0.068
#> SRR1700053 3 0.2714 0.8132 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1700054 3 0.2699 0.8177 0.028 0.000 0.904 0.068
#> SRR1700055 1 0.4898 0.6063 0.716 0.000 0.260 0.024
#> SRR1700056 3 0.3529 0.8026 0.012 0.000 0.836 0.152
#> SRR1700057 3 0.2892 0.8168 0.036 0.000 0.896 0.068
#> SRR1700058 3 0.2844 0.8098 0.048 0.000 0.900 0.052
#> SRR1700059 3 0.2859 0.8138 0.008 0.000 0.880 0.112
#> SRR1700060 3 0.1767 0.8148 0.012 0.000 0.944 0.044
#> SRR1700061 3 0.3015 0.8176 0.024 0.000 0.884 0.092
#> SRR1700062 3 0.1209 0.8122 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1700063 3 0.2983 0.8154 0.040 0.000 0.892 0.068
#> SRR1700064 3 0.2053 0.8179 0.004 0.000 0.924 0.072
#> SRR1700065 3 0.2596 0.8178 0.024 0.000 0.908 0.068
#> SRR1700066 3 0.2089 0.8145 0.020 0.000 0.932 0.048
#> SRR1700067 3 0.2053 0.8181 0.004 0.000 0.924 0.072
#> SRR1700068 3 0.2216 0.8161 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700069 3 0.1722 0.8156 0.008 0.000 0.944 0.048
#> SRR1700070 3 0.0469 0.8051 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700071 3 0.0657 0.8051 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1700072 1 0.0336 0.8642 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700073 4 0.4516 0.5401 0.012 0.000 0.252 0.736
#> SRR1700075 3 0.1661 0.8163 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1700074 3 0.0707 0.7955 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1700076 3 0.1854 0.8155 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1700077 3 0.1284 0.8011 0.024 0.000 0.964 0.012
#> SRR1700078 3 0.2586 0.8084 0.048 0.000 0.912 0.040
#> SRR1700080 3 0.0592 0.7967 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1700079 3 0.2924 0.7714 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR1700081 3 0.2214 0.8122 0.028 0.000 0.928 0.044
#> SRR1700082 3 0.1743 0.7563 0.004 0.056 0.940 0.000
#> SRR1700083 3 0.3400 0.6478 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1700084 3 0.5677 0.4034 0.332 0.000 0.628 0.040
#> SRR1700085 3 0.5112 0.1747 0.000 0.008 0.608 0.384
#> SRR1700086 3 0.0779 0.7963 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.0188 0.9267 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700089 2 0.0592 0.9206 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1700091 2 0.0592 0.9235 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700090 3 0.7972 0.2267 0.028 0.372 0.456 0.144
#> SRR1700092 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700093 2 0.5511 0.5955 0.000 0.720 0.084 0.196
#> SRR1700095 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700096 2 0.0921 0.9182 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700097 1 0.1888 0.8457 0.940 0.016 0.044 0.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700104 2 0.2408 0.8777 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1700103 2 0.4933 0.3442 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1700105 4 0.6210 0.6597 0.016 0.160 0.120 0.704
#> SRR1700106 4 0.6422 0.5846 0.000 0.248 0.120 0.632
#> SRR1700107 2 0.0895 0.9173 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1700108 2 0.0188 0.9261 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1700109 2 0.0336 0.9239 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700110 2 0.0188 0.9259 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700112 4 0.2376 0.7427 0.000 0.016 0.068 0.916
#> SRR1700111 1 0.7469 0.3151 0.532 0.004 0.240 0.224
#> SRR1700113 4 0.5125 0.4507 0.004 0.376 0.004 0.616
#> SRR1700114 2 0.3266 0.8106 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1700115 2 0.0469 0.9226 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700116 3 0.5100 0.7356 0.000 0.076 0.756 0.168
#> SRR1700117 1 0.7504 -0.0518 0.464 0.000 0.344 0.192
#> SRR1700119 4 0.6023 0.3677 0.024 0.028 0.304 0.644
#> SRR1700118 3 0.5291 0.7640 0.080 0.000 0.740 0.180
#> SRR1700120 3 0.2081 0.8178 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700121 4 0.3533 0.7393 0.000 0.056 0.080 0.864
#> SRR1700122 4 0.4008 0.5628 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700123 3 0.4193 0.7198 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700125 4 0.2530 0.7205 0.000 0.004 0.100 0.896
#> SRR1700126 3 0.3749 0.7738 0.128 0.000 0.840 0.032
#> SRR1700127 3 0.3610 0.7798 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700124 3 0.3764 0.7693 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700128 3 0.3873 0.7599 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1700129 4 0.4746 0.2850 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700130 3 0.4624 0.6167 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700132 3 0.3311 0.7942 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700131 3 0.3751 0.7815 0.004 0.000 0.800 0.196
#> SRR1700133 4 0.4843 0.1918 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700134 4 0.4454 0.4410 0.000 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700135 3 0.4222 0.7150 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1700136 3 0.3528 0.7842 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700137 3 0.4382 0.6841 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700138 3 0.4193 0.7201 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700140 3 0.3688 0.7751 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700139 3 0.3726 0.7722 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700141 4 0.4866 0.1656 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700142 3 0.3400 0.7903 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700143 3 0.3528 0.7842 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700144 3 0.3400 0.7903 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700145 3 0.7092 0.4860 0.148 0.000 0.532 0.320
#> SRR1700146 3 0.4830 0.5129 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700147 3 0.3688 0.7748 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700149 3 0.4707 0.7670 0.036 0.000 0.760 0.204
#> SRR1700148 3 0.3907 0.7563 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700150 3 0.4843 0.5053 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1700152 3 0.4008 0.7454 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1700151 3 0.3610 0.7798 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700153 3 0.3688 0.7748 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700154 3 0.3837 0.7636 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700155 3 0.4040 0.7412 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700156 3 0.3610 0.7798 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1700158 3 0.6308 0.6928 0.136 0.000 0.656 0.208
#> SRR1700159 4 0.4193 0.5222 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700157 3 0.3688 0.7748 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700160 3 0.4605 0.6239 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700161 3 0.4661 0.6030 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700162 4 0.4331 0.4831 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700164 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.5820 0.5700 0.700 0.000 0.192 0.108
#> SRR1700165 3 0.4422 0.7338 0.008 0.000 0.736 0.256
#> SRR1700166 4 0.4994 -0.1451 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700168 4 0.2704 0.7004 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1700167 3 0.6167 0.7025 0.116 0.000 0.664 0.220
#> SRR1700170 4 0.4746 0.2770 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700169 3 0.5000 0.2151 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1700171 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700172 3 0.4564 0.6396 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1700174 3 0.3907 0.7569 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700173 3 0.3801 0.7661 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700175 3 0.4985 0.3109 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700176 3 0.2868 0.8074 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700177 4 0.3356 0.6490 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700192 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.2011 0.8136 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0336 0.9241 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 1 0.0707 0.8555 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 1 0.3610 0.6882 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR1700205 4 0.5213 0.4473 0.328 0.020 0.000 0.652
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.5016 0.3425 0.396 0.600 0.000 0.004
#> SRR1700211 2 0.3172 0.7831 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.1109 0.9195 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0188 0.9260 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.1940 0.8963 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0469 0.9247 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700234 1 0.1716 0.8237 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.2376 0.8204 0.016 0.000 0.916 0.068
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.2861 0.8483 0.000 0.888 0.016 0.096
#> SRR1700262 2 0.1867 0.8732 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700263 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700265 1 0.0927 0.8563 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700275 4 0.4500 0.5459 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1700276 2 0.3172 0.7683 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700278 4 0.3801 0.6089 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1700279 4 0.4283 0.5731 0.256 0.004 0.000 0.740
#> SRR1700280 4 0.4690 0.5604 0.260 0.016 0.000 0.724
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9275 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 4 0.4830 0.4112 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700282 1 0.4567 0.5436 0.716 0.008 0.000 0.276
#> SRR1700284 4 0.1004 0.7509 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1700285 4 0.2644 0.7458 0.000 0.032 0.060 0.908
#> SRR1700286 2 0.1474 0.9097 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700287 4 0.4040 0.6165 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700290 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700289 4 0.2345 0.7291 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1700288 2 0.0188 0.9259 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700292 4 0.3610 0.6477 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700291 4 0.1022 0.7467 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700293 4 0.1807 0.7528 0.000 0.052 0.008 0.940
#> SRR1700294 4 0.1557 0.7377 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700295 1 0.4008 0.6081 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1700297 4 0.0672 0.7543 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1700296 4 0.2281 0.7259 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1700298 4 0.2089 0.7505 0.048 0.000 0.020 0.932
#> SRR1700299 4 0.3907 0.5774 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700300 4 0.4406 0.4549 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1700302 4 0.0817 0.7489 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700301 4 0.0707 0.7498 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700303 4 0.0336 0.7519 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700304 4 0.4948 0.2437 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1700305 4 0.2589 0.7028 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700306 4 0.4502 0.5629 0.016 0.000 0.236 0.748
#> SRR1700308 4 0.4103 0.5417 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1700307 4 0.4998 -0.1755 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700309 4 0.4877 0.1376 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700310 4 0.2216 0.7197 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700311 4 0.3942 0.5708 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1700312 4 0.2345 0.7144 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700313 3 0.4955 0.3968 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1700314 3 0.4522 0.6512 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1700315 4 0.3610 0.6179 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700316 4 0.4277 0.4986 0.000 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700317 4 0.4635 0.6075 0.000 0.268 0.012 0.720
#> SRR1700318 1 0.4925 0.1789 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1700319 4 0.3610 0.6196 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1700320 4 0.1940 0.7287 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700322 4 0.2814 0.6898 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700321 4 0.5000 0.1258 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1700323 4 0.4193 0.5242 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1700324 4 0.1867 0.7305 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700325 4 0.4585 0.5331 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1700326 1 0.0000 0.8666 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700327 2 0.1545 0.9146 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1700329 4 0.2149 0.7224 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700328 1 0.2408 0.7945 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1700330 1 0.4998 -0.0315 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1700331 4 0.0469 0.7545 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1700332 4 0.3219 0.6808 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1700333 4 0.2530 0.7198 0.112 0.000 0.000 0.888
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0290 0.8782 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.3452 0.7546 0.000 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR1699876 5 0.1341 0.7995 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1699877 2 0.1197 0.8627 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1699879 2 0.1270 0.8726 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0566 0.8784 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1699880 3 0.2929 0.6131 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1699881 3 0.2424 0.6627 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1699882 2 0.0566 0.8788 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1699883 2 0.2329 0.8062 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1699884 2 0.3336 0.6827 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1699885 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699886 5 0.1341 0.7986 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1699888 5 0.4101 0.3592 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1699889 5 0.0324 0.8246 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1699890 5 0.1331 0.8064 0.008 0.040 0.000 0.000 0.952
#> SRR1699887 5 0.1851 0.7737 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1699891 5 0.0404 0.8222 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1699892 2 0.5775 0.5386 0.000 0.608 0.148 0.000 0.244
#> SRR1699893 5 0.1911 0.8058 0.036 0.004 0.000 0.028 0.932
#> SRR1699894 5 0.0290 0.8232 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1699895 5 0.0324 0.8246 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1699896 5 0.1981 0.7873 0.064 0.016 0.000 0.000 0.920
#> SRR1699897 2 0.6023 0.5521 0.000 0.572 0.260 0.000 0.168
#> SRR1699898 3 0.3935 0.7225 0.016 0.000 0.808 0.140 0.036
#> SRR1699900 5 0.4307 -0.1319 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR1699899 5 0.0609 0.8191 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1699902 1 0.4084 0.5287 0.668 0.000 0.004 0.000 0.328
#> SRR1699901 1 0.3730 0.5997 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1699903 5 0.0404 0.8266 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1699904 5 0.0671 0.8229 0.016 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1699905 1 0.2329 0.7999 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1699906 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699907 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699908 5 0.0566 0.8268 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1699909 4 0.4306 0.1400 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1699910 5 0.1205 0.8203 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956
#> SRR1699911 5 0.0693 0.8245 0.012 0.000 0.000 0.008 0.980
#> SRR1699912 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699913 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699914 4 0.4440 0.5329 0.012 0.000 0.004 0.660 0.324
#> SRR1699915 5 0.1043 0.8205 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1699916 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699917 5 0.5209 0.5938 0.008 0.000 0.116 0.172 0.704
#> SRR1699918 5 0.5578 0.4311 0.000 0.000 0.112 0.272 0.616
#> SRR1699919 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699920 5 0.1484 0.8167 0.008 0.000 0.000 0.048 0.944
#> SRR1699921 5 0.0771 0.8271 0.004 0.000 0.000 0.020 0.976
#> SRR1699922 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699923 1 0.3074 0.7265 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1699924 5 0.7870 -0.0259 0.336 0.000 0.084 0.204 0.376
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699927 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699929 5 0.1901 0.8016 0.040 0.024 0.000 0.004 0.932
#> SRR1699928 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699930 5 0.0510 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699931 5 0.2491 0.7703 0.036 0.068 0.000 0.000 0.896
#> SRR1699933 5 0.6739 0.3395 0.248 0.112 0.064 0.000 0.576
#> SRR1699932 5 0.0609 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.1442 0.8142 0.012 0.032 0.004 0.000 0.952
#> SRR1699936 2 0.1732 0.8644 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1699937 2 0.3586 0.7422 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.2929 0.8135 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1699940 3 0.3242 0.5579 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1699939 2 0.3561 0.7463 0.000 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR1699941 3 0.2127 0.6776 0.000 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1699942 2 0.3730 0.7163 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR1699943 2 0.3274 0.7837 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.3508 0.7546 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1699945 1 0.6529 0.2157 0.476 0.228 0.296 0.000 0.000
#> SRR1699946 2 0.3586 0.7422 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.3480 0.7586 0.000 0.752 0.248 0.000 0.000
#> SRR1699948 2 0.2020 0.8570 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.2280 0.8492 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.2891 0.8165 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1699951 2 0.3612 0.7384 0.000 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1699952 2 0.3684 0.7250 0.000 0.720 0.280 0.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.3143 0.7962 0.000 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.4138 0.7173 0.016 0.708 0.276 0.000 0.000
#> SRR1699955 2 0.2891 0.8164 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1699956 3 0.4428 0.5822 0.160 0.084 0.756 0.000 0.000
#> SRR1699957 2 0.3774 0.7063 0.000 0.704 0.296 0.000 0.000
#> SRR1699959 1 0.5290 0.3337 0.560 0.044 0.392 0.000 0.004
#> SRR1699958 2 0.2561 0.8371 0.000 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR1699960 2 0.2280 0.8491 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1699961 3 0.3274 0.5493 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1699962 2 0.3928 0.7033 0.000 0.700 0.296 0.004 0.000
#> SRR1699963 3 0.3857 0.3510 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR1699964 2 0.4045 0.6178 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.2648 0.8318 0.000 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.4126 0.5759 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1699967 2 0.3480 0.7583 0.000 0.752 0.248 0.000 0.000
#> SRR1699968 3 0.0794 0.7080 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1699969 3 0.0404 0.7232 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1699971 3 0.4225 0.2042 0.004 0.364 0.632 0.000 0.000
#> SRR1699970 3 0.1965 0.6832 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1699972 3 0.4598 0.5061 0.036 0.240 0.716 0.000 0.008
#> SRR1699973 3 0.2719 0.6545 0.000 0.144 0.852 0.004 0.000
#> SRR1699974 3 0.3035 0.7291 0.008 0.000 0.848 0.136 0.008
#> SRR1699975 3 0.0798 0.7239 0.000 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR1699976 3 0.2077 0.6933 0.000 0.084 0.908 0.008 0.000
#> SRR1699977 3 0.1544 0.7353 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1699978 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699979 3 0.0510 0.7243 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1699980 3 0.1774 0.7146 0.000 0.000 0.932 0.016 0.052
#> SRR1699981 3 0.1831 0.7354 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1699982 5 0.0798 0.8244 0.000 0.000 0.016 0.008 0.976
#> SRR1699983 3 0.0510 0.7243 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.0609 0.7258 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1699986 3 0.4265 0.6585 0.012 0.000 0.712 0.268 0.008
#> SRR1699988 3 0.3821 0.6350 0.000 0.148 0.800 0.000 0.052
#> SRR1699987 3 0.1671 0.7359 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1699989 3 0.5959 -0.0203 0.000 0.108 0.472 0.000 0.420
#> SRR1699990 3 0.1270 0.7343 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1699992 3 0.0510 0.7243 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1699991 3 0.2990 0.7333 0.024 0.000 0.868 0.100 0.008
#> SRR1699993 1 0.4905 0.6297 0.728 0.000 0.176 0.088 0.008
#> SRR1699994 3 0.2179 0.7349 0.000 0.000 0.896 0.100 0.004
#> SRR1699995 1 0.1757 0.8495 0.936 0.000 0.048 0.012 0.004
#> SRR1699996 2 0.3949 0.6363 0.000 0.696 0.300 0.000 0.004
#> SRR1699997 3 0.3707 0.5945 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1699998 3 0.3983 0.2668 0.000 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1699999 1 0.0671 0.8739 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700000 3 0.2992 0.6684 0.064 0.068 0.868 0.000 0.000
#> SRR1700002 3 0.2230 0.6717 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1700001 3 0.0703 0.7269 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1700003 3 0.3210 0.5634 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1700004 4 0.7139 0.4877 0.008 0.068 0.140 0.568 0.216
#> SRR1700005 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.4086 0.6822 0.000 0.704 0.284 0.000 0.012
#> SRR1700007 2 0.5031 0.6122 0.000 0.692 0.036 0.024 0.248
#> SRR1700008 4 0.3885 0.4694 0.000 0.000 0.268 0.724 0.008
#> SRR1700009 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.3196 0.6064 0.000 0.192 0.804 0.004 0.000
#> SRR1700011 2 0.2891 0.8165 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1700013 2 0.3421 0.7972 0.000 0.788 0.204 0.008 0.000
#> SRR1700012 3 0.3612 0.4578 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR1700014 3 0.5366 0.3760 0.000 0.012 0.528 0.428 0.032
#> SRR1700015 2 0.4298 0.5879 0.008 0.640 0.352 0.000 0.000
#> SRR1700016 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 3 0.3177 0.5775 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1700017 3 0.2462 0.6734 0.008 0.112 0.880 0.000 0.000
#> SRR1700019 2 0.2983 0.8490 0.000 0.880 0.048 0.012 0.060
#> SRR1700020 1 0.4025 0.6369 0.748 0.000 0.232 0.012 0.008
#> SRR1700021 5 0.4249 0.5490 0.296 0.000 0.000 0.016 0.688
#> SRR1700023 3 0.0794 0.7107 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1700022 3 0.3117 0.6692 0.036 0.100 0.860 0.004 0.000
#> SRR1700024 3 0.3013 0.7265 0.000 0.000 0.832 0.160 0.008
#> SRR1700025 2 0.4045 0.6084 0.000 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1700026 1 0.4755 0.6977 0.752 0.104 0.136 0.004 0.004
#> SRR1700027 3 0.3328 0.6359 0.004 0.176 0.812 0.008 0.000
#> SRR1700028 3 0.6113 0.5045 0.000 0.232 0.584 0.180 0.004
#> SRR1700029 1 0.5496 0.4070 0.624 0.000 0.300 0.064 0.012
#> SRR1700030 5 0.2703 0.7982 0.000 0.024 0.060 0.020 0.896
#> SRR1700031 3 0.3106 0.7322 0.020 0.000 0.856 0.116 0.008
#> SRR1700032 3 0.4437 -0.1825 0.000 0.464 0.532 0.004 0.000
#> SRR1700034 1 0.1412 0.8597 0.952 0.000 0.036 0.004 0.008
#> SRR1700035 5 0.5188 0.3959 0.000 0.000 0.344 0.056 0.600
#> SRR1700033 3 0.6220 0.5512 0.236 0.000 0.580 0.176 0.008
#> SRR1700036 3 0.4768 0.3283 0.000 0.000 0.592 0.024 0.384
#> SRR1700037 5 0.2208 0.7977 0.072 0.000 0.000 0.020 0.908
#> SRR1700038 1 0.5699 0.6364 0.700 0.000 0.048 0.132 0.120
#> SRR1700039 3 0.5551 0.6051 0.080 0.000 0.624 0.288 0.008
#> SRR1700040 3 0.4093 0.7209 0.068 0.000 0.800 0.124 0.008
#> SRR1700041 3 0.4423 0.6310 0.012 0.000 0.684 0.296 0.008
#> SRR1700042 3 0.4798 0.6476 0.036 0.000 0.684 0.272 0.008
#> SRR1700043 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700045 3 0.4127 0.6185 0.000 0.000 0.680 0.312 0.008
#> SRR1700044 3 0.4453 0.5986 0.008 0.000 0.660 0.324 0.008
#> SRR1700046 3 0.4134 0.6621 0.008 0.000 0.720 0.264 0.008
#> SRR1700047 3 0.5646 0.4165 0.052 0.000 0.532 0.404 0.012
#> SRR1700048 1 0.3058 0.8181 0.880 0.000 0.056 0.040 0.024
#> SRR1700049 3 0.4289 0.6545 0.012 0.000 0.708 0.272 0.008
#> SRR1700050 4 0.3293 0.6645 0.008 0.000 0.160 0.824 0.008
#> SRR1700051 1 0.1280 0.8643 0.960 0.000 0.024 0.008 0.008
#> SRR1700052 3 0.6859 0.4133 0.284 0.000 0.452 0.256 0.008
#> SRR1700053 3 0.4510 0.4055 0.000 0.000 0.560 0.432 0.008
#> SRR1700054 3 0.4826 0.5906 0.024 0.000 0.644 0.324 0.008
#> SRR1700055 1 0.4316 0.7040 0.784 0.000 0.128 0.080 0.008
#> SRR1700056 4 0.4715 0.3621 0.024 0.000 0.300 0.668 0.008
#> SRR1700057 3 0.5046 0.6212 0.044 0.000 0.656 0.292 0.008
#> SRR1700058 3 0.5194 0.6480 0.068 0.000 0.672 0.252 0.008
#> SRR1700059 3 0.4913 0.2508 0.012 0.000 0.492 0.488 0.008
#> SRR1700060 3 0.4083 0.6681 0.008 0.000 0.728 0.256 0.008
#> SRR1700061 3 0.5184 0.4109 0.028 0.000 0.544 0.420 0.008
#> SRR1700062 3 0.4156 0.6432 0.004 0.000 0.700 0.288 0.008
#> SRR1700063 3 0.4815 0.6151 0.028 0.000 0.660 0.304 0.008
#> SRR1700064 3 0.4298 0.5610 0.000 0.000 0.640 0.352 0.008
#> SRR1700065 3 0.4718 0.5720 0.016 0.000 0.636 0.340 0.008
#> SRR1700066 3 0.4030 0.6736 0.008 0.000 0.736 0.248 0.008
#> SRR1700067 3 0.4664 0.3996 0.004 0.000 0.552 0.436 0.008
#> SRR1700068 4 0.4528 -0.0755 0.000 0.000 0.444 0.548 0.008
#> SRR1700069 3 0.3826 0.6828 0.004 0.000 0.752 0.236 0.008
#> SRR1700070 3 0.3282 0.7111 0.000 0.000 0.804 0.188 0.008
#> SRR1700071 3 0.3421 0.7033 0.000 0.000 0.788 0.204 0.008
#> SRR1700072 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700073 4 0.2891 0.7291 0.000 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700075 3 0.4127 0.6181 0.000 0.000 0.680 0.312 0.008
#> SRR1700074 3 0.2358 0.7343 0.000 0.000 0.888 0.104 0.008
#> SRR1700076 3 0.4230 0.6495 0.008 0.000 0.704 0.280 0.008
#> SRR1700077 3 0.4054 0.6822 0.012 0.000 0.744 0.236 0.008
#> SRR1700078 3 0.5028 0.6464 0.048 0.000 0.668 0.276 0.008
#> SRR1700080 3 0.2304 0.7354 0.000 0.000 0.892 0.100 0.008
#> SRR1700079 3 0.4648 0.6989 0.072 0.000 0.748 0.172 0.008
#> SRR1700081 3 0.4209 0.6747 0.016 0.000 0.732 0.244 0.008
#> SRR1700082 3 0.1341 0.7352 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700083 3 0.4245 0.7117 0.092 0.000 0.792 0.108 0.008
#> SRR1700084 3 0.5858 0.6025 0.204 0.000 0.632 0.156 0.008
#> SRR1700085 3 0.4425 0.5583 0.000 0.004 0.744 0.048 0.204
#> SRR1700086 3 0.3111 0.7269 0.004 0.000 0.840 0.144 0.012
#> SRR1700087 2 0.1965 0.8585 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.2280 0.8504 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1700089 2 0.2880 0.8505 0.004 0.868 0.108 0.020 0.000
#> SRR1700091 2 0.2439 0.8485 0.000 0.876 0.120 0.004 0.000
#> SRR1700090 4 0.4822 0.5652 0.000 0.192 0.072 0.728 0.008
#> SRR1700092 2 0.2519 0.8549 0.000 0.884 0.100 0.016 0.000
#> SRR1700094 2 0.1914 0.8694 0.000 0.924 0.060 0.016 0.000
#> SRR1700093 4 0.5828 0.3775 0.000 0.316 0.064 0.596 0.024
#> SRR1700095 1 0.0162 0.8806 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700096 2 0.4334 0.7851 0.000 0.768 0.140 0.092 0.000
#> SRR1700097 1 0.0854 0.8729 0.976 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700098 2 0.0955 0.8766 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1700099 2 0.1153 0.8780 0.000 0.964 0.024 0.008 0.004
#> SRR1700100 2 0.1502 0.8724 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1700101 2 0.1571 0.8703 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1700102 2 0.2338 0.8519 0.000 0.884 0.112 0.004 0.000
#> SRR1700104 2 0.5462 0.6627 0.000 0.652 0.212 0.136 0.000
#> SRR1700103 4 0.6821 -0.0969 0.000 0.328 0.320 0.352 0.000
#> SRR1700105 4 0.4582 0.6631 0.004 0.128 0.008 0.772 0.088
#> SRR1700106 4 0.5419 0.5385 0.000 0.208 0.012 0.680 0.100
#> SRR1700107 2 0.4637 0.7401 0.000 0.740 0.100 0.160 0.000
#> SRR1700108 2 0.1750 0.8688 0.000 0.936 0.028 0.036 0.000
#> SRR1700109 2 0.1845 0.8705 0.000 0.928 0.056 0.016 0.000
#> SRR1700110 2 0.1901 0.8702 0.000 0.928 0.056 0.012 0.004
#> SRR1700112 4 0.3656 0.6860 0.000 0.020 0.000 0.784 0.196
#> SRR1700111 4 0.5607 0.4618 0.300 0.000 0.008 0.612 0.080
#> SRR1700113 2 0.7036 0.0192 0.000 0.432 0.016 0.232 0.320
#> SRR1700114 2 0.6166 0.4820 0.000 0.548 0.180 0.272 0.000
#> SRR1700115 2 0.3586 0.8160 0.000 0.828 0.076 0.096 0.000
#> SRR1700116 4 0.1948 0.7857 0.000 0.036 0.024 0.932 0.008
#> SRR1700117 4 0.3455 0.6720 0.208 0.000 0.008 0.784 0.000
#> SRR1700119 4 0.3727 0.7223 0.000 0.020 0.016 0.812 0.152
#> SRR1700118 4 0.2142 0.7837 0.048 0.000 0.028 0.920 0.004
#> SRR1700120 4 0.2753 0.6958 0.000 0.000 0.136 0.856 0.008
#> SRR1700121 4 0.4169 0.6214 0.000 0.028 0.000 0.732 0.240
#> SRR1700122 4 0.1851 0.7813 0.000 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700123 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700125 4 0.2648 0.7392 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700126 4 0.5504 0.5069 0.168 0.000 0.148 0.676 0.008
#> SRR1700127 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700124 4 0.1124 0.7936 0.000 0.000 0.036 0.960 0.004
#> SRR1700128 4 0.0955 0.8001 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700129 4 0.1544 0.7906 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700130 4 0.0992 0.8026 0.000 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1700132 4 0.1357 0.7864 0.000 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700131 4 0.1041 0.7954 0.000 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700133 4 0.1697 0.7974 0.000 0.000 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700134 4 0.1732 0.7844 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700135 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700136 4 0.1282 0.7886 0.000 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700137 4 0.0955 0.8001 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700138 4 0.1082 0.8015 0.000 0.000 0.028 0.964 0.008
#> SRR1700140 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700139 4 0.0955 0.7970 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700141 4 0.1478 0.7924 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1700142 4 0.2068 0.7522 0.000 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1700143 4 0.1357 0.7861 0.000 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700144 4 0.2674 0.7019 0.000 0.000 0.140 0.856 0.004
#> SRR1700145 4 0.2053 0.7978 0.048 0.000 0.004 0.924 0.024
#> SRR1700146 4 0.1121 0.8005 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700147 4 0.1041 0.7955 0.000 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1700149 4 0.1386 0.7934 0.016 0.000 0.032 0.952 0.000
#> SRR1700148 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700150 4 0.1168 0.8049 0.000 0.000 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700152 4 0.0955 0.7970 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700151 4 0.1282 0.7889 0.000 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700153 4 0.0880 0.7972 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700154 4 0.0794 0.7985 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1700155 4 0.0955 0.8001 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1700156 4 0.1282 0.7889 0.000 0.000 0.044 0.952 0.004
#> SRR1700158 4 0.1750 0.7893 0.036 0.000 0.028 0.936 0.000
#> SRR1700159 4 0.1908 0.7796 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700157 4 0.1121 0.7913 0.000 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1700160 4 0.1310 0.8051 0.000 0.000 0.020 0.956 0.024
#> SRR1700161 4 0.0798 0.8030 0.000 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1700162 4 0.1732 0.7844 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700164 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700163 4 0.4367 0.3888 0.372 0.000 0.008 0.620 0.000
#> SRR1700165 4 0.0880 0.7977 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1700166 4 0.1408 0.8022 0.000 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700168 4 0.2230 0.7639 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700167 4 0.1965 0.7824 0.052 0.000 0.024 0.924 0.000
#> SRR1700170 4 0.1638 0.7958 0.000 0.000 0.004 0.932 0.064
#> SRR1700169 4 0.1408 0.8026 0.000 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700171 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700172 4 0.1018 0.8049 0.000 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1700174 4 0.0865 0.8013 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700173 4 0.0510 0.8014 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700175 4 0.1197 0.7992 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700176 4 0.1704 0.7717 0.000 0.000 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700178 2 0.0162 0.8783 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.2280 0.7654 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1700180 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700179 2 0.0162 0.8783 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700181 2 0.0162 0.8783 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0290 0.8781 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700184 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0162 0.8783 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700187 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0162 0.8783 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700192 1 0.0162 0.8800 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.2358 0.7963 0.888 0.104 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700195 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0290 0.8781 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700197 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700199 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700200 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700201 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700202 1 0.0566 0.8744 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700203 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700204 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700206 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700207 2 0.0290 0.8781 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700208 1 0.4173 0.5547 0.688 0.300 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700205 5 0.3898 0.7177 0.116 0.080 0.000 0.000 0.804
#> SRR1700209 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700210 2 0.4485 0.5246 0.292 0.680 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700211 2 0.2305 0.8195 0.092 0.896 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700212 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700213 2 0.2354 0.8561 0.008 0.904 0.076 0.000 0.012
#> SRR1700214 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1043 0.8769 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700222 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700221 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700223 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700224 2 0.0609 0.8754 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700226 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700229 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700225 2 0.3720 0.7484 0.000 0.760 0.228 0.000 0.012
#> SRR1700227 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700230 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700228 2 0.0807 0.8776 0.000 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1700232 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700233 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700234 1 0.2488 0.7829 0.872 0.124 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700235 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700237 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700236 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700238 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700239 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 4 0.4829 0.1690 0.016 0.000 0.372 0.604 0.008
#> SRR1700243 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700244 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700242 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700247 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700248 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700251 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700252 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700256 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700254 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700257 2 0.0404 0.8779 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700258 2 0.0290 0.8780 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.1502 0.8710 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1700260 2 0.1638 0.8691 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1700261 2 0.4484 0.8004 0.000 0.788 0.096 0.024 0.092
#> SRR1700262 2 0.2234 0.8661 0.000 0.920 0.036 0.012 0.032
#> SRR1700263 2 0.1502 0.8710 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1700264 2 0.1608 0.8676 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1700265 1 0.1408 0.8522 0.948 0.044 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700266 2 0.1608 0.8672 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.1251 0.8753 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1700270 2 0.0290 0.8782 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.1197 0.8731 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0963 0.8755 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0865 0.8769 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1700273 2 0.0609 0.8777 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.1205 0.8746 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1700277 2 0.0162 0.8784 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.4905 0.0247 0.000 0.500 0.000 0.024 0.476
#> SRR1700276 2 0.1877 0.8476 0.000 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR1700278 5 0.1877 0.8039 0.064 0.000 0.000 0.012 0.924
#> SRR1700279 5 0.3757 0.6746 0.208 0.000 0.000 0.020 0.772
#> SRR1700280 5 0.4334 0.6540 0.220 0.020 0.000 0.016 0.744
#> SRR1700281 2 0.0566 0.8781 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700283 2 0.4464 0.2613 0.000 0.584 0.000 0.008 0.408
#> SRR1700282 1 0.4156 0.5365 0.700 0.008 0.000 0.004 0.288
#> SRR1700284 5 0.4251 0.4840 0.000 0.012 0.000 0.316 0.672
#> SRR1700285 5 0.5861 0.2269 0.000 0.088 0.004 0.388 0.520
#> SRR1700286 2 0.3582 0.7792 0.000 0.768 0.224 0.008 0.000
#> SRR1700287 5 0.5232 0.4343 0.000 0.340 0.000 0.060 0.600
#> SRR1700290 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700289 5 0.3906 0.7260 0.000 0.112 0.000 0.084 0.804
#> SRR1700288 2 0.1043 0.8679 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700292 5 0.2795 0.7661 0.000 0.100 0.000 0.028 0.872
#> SRR1700291 5 0.4262 0.1637 0.000 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700293 5 0.5562 0.4579 0.000 0.100 0.000 0.296 0.604
#> SRR1700294 4 0.4297 0.1506 0.000 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1700295 1 0.3454 0.7601 0.836 0.000 0.000 0.064 0.100
#> SRR1700297 5 0.3949 0.4648 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700296 5 0.3239 0.7785 0.068 0.000 0.000 0.080 0.852
#> SRR1700298 5 0.5276 0.1253 0.048 0.000 0.000 0.436 0.516
#> SRR1700299 4 0.3480 0.6494 0.000 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700300 4 0.3143 0.7016 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700302 5 0.4227 0.2284 0.000 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1700301 5 0.4015 0.4219 0.000 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR1700303 5 0.4219 0.2457 0.000 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700304 1 0.4443 0.0208 0.524 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR1700305 4 0.4060 0.4572 0.000 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700306 4 0.4016 0.6105 0.012 0.000 0.000 0.716 0.272
#> SRR1700308 4 0.3366 0.6707 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700307 4 0.3527 0.7365 0.000 0.000 0.024 0.804 0.172
#> SRR1700309 4 0.3132 0.7369 0.000 0.000 0.008 0.820 0.172
#> SRR1700310 4 0.4201 0.3417 0.000 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700311 4 0.3508 0.6441 0.000 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1700312 4 0.4974 0.2888 0.000 0.032 0.000 0.560 0.408
#> SRR1700313 4 0.2293 0.7906 0.000 0.000 0.016 0.900 0.084
#> SRR1700314 4 0.1281 0.8062 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1700315 4 0.3796 0.5752 0.000 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1700316 4 0.3074 0.7092 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700317 2 0.6541 -0.0781 0.000 0.440 0.008 0.152 0.400
#> SRR1700318 1 0.4390 0.1747 0.568 0.000 0.000 0.004 0.428
#> SRR1700319 4 0.3395 0.6657 0.000 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1700320 4 0.4219 0.3188 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700322 4 0.4015 0.4811 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1700321 2 0.6831 0.3307 0.000 0.544 0.036 0.172 0.248
#> SRR1700323 4 0.3177 0.6974 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700324 4 0.4291 0.1697 0.000 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1700325 2 0.5103 0.0657 0.000 0.512 0.000 0.036 0.452
#> SRR1700326 1 0.0000 0.8824 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700327 2 0.4263 0.7866 0.000 0.760 0.200 0.024 0.016
#> SRR1700329 4 0.4264 0.4145 0.000 0.004 0.000 0.620 0.376
#> SRR1700328 1 0.2286 0.8015 0.888 0.004 0.000 0.000 0.108
#> SRR1700330 1 0.4564 0.3189 0.612 0.000 0.000 0.016 0.372
#> SRR1700331 5 0.0703 0.8264 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700332 5 0.1310 0.8188 0.000 0.024 0.000 0.020 0.956
#> SRR1700333 5 0.4406 0.7216 0.128 0.000 0.000 0.108 0.764
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.2738 0.69533 0.000 0.820 0.000 0.000 0.004 0.176
#> SRR1699875 6 0.3738 0.58192 0.000 0.280 0.016 0.000 0.000 0.704
#> SRR1699876 5 0.0458 0.82059 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1699877 2 0.0713 0.78182 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1699879 2 0.3809 0.53533 0.000 0.684 0.000 0.008 0.004 0.304
#> SRR1699878 2 0.2221 0.76548 0.000 0.896 0.000 0.000 0.032 0.072
#> SRR1699880 6 0.3713 0.61406 0.000 0.032 0.224 0.000 0.000 0.744
#> SRR1699881 6 0.3403 0.61992 0.000 0.020 0.212 0.000 0.000 0.768
#> SRR1699882 2 0.2457 0.75904 0.000 0.880 0.000 0.000 0.036 0.084
#> SRR1699883 2 0.3200 0.63593 0.000 0.788 0.000 0.000 0.196 0.016
#> SRR1699884 2 0.4224 0.44412 0.000 0.632 0.000 0.000 0.340 0.028
#> SRR1699885 2 0.1349 0.77926 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1699886 5 0.0458 0.82148 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1699888 5 0.3290 0.60118 0.000 0.252 0.000 0.004 0.744 0.000
#> SRR1699889 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699890 5 0.0508 0.82224 0.004 0.012 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1699887 5 0.0632 0.81547 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1699891 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699892 5 0.6037 0.05273 0.000 0.352 0.000 0.000 0.396 0.252
#> SRR1699893 5 0.1082 0.80650 0.004 0.000 0.000 0.040 0.956 0.000
#> SRR1699894 5 0.0000 0.82592 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699895 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699896 5 0.0458 0.82100 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1699897 6 0.5981 0.51557 0.000 0.200 0.028 0.000 0.208 0.564
#> SRR1699898 3 0.2222 0.78470 0.004 0.000 0.912 0.012 0.032 0.040
#> SRR1699900 5 0.3050 0.58069 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1699899 5 0.0146 0.82599 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1699902 5 0.4366 0.13439 0.428 0.000 0.024 0.000 0.548 0.000
#> SRR1699901 1 0.3860 0.12959 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1699903 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699904 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699905 1 0.2697 0.71024 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1699906 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699907 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699908 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699909 5 0.4565 -0.00202 0.000 0.000 0.036 0.432 0.532 0.000
#> SRR1699910 5 0.0622 0.82347 0.008 0.000 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1699911 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699912 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699913 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699914 5 0.5285 -0.06632 0.000 0.000 0.100 0.420 0.480 0.000
#> SRR1699915 5 0.0937 0.81523 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699916 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699917 5 0.3495 0.73465 0.008 0.000 0.088 0.048 0.836 0.020
#> SRR1699918 5 0.3874 0.64429 0.000 0.000 0.172 0.068 0.760 0.000
#> SRR1699919 5 0.0260 0.82624 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699920 5 0.0820 0.82048 0.012 0.000 0.000 0.016 0.972 0.000
#> SRR1699921 5 0.0260 0.82624 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699922 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699923 1 0.3861 0.43753 0.640 0.000 0.008 0.000 0.352 0.000
#> SRR1699924 5 0.6476 0.38730 0.168 0.000 0.228 0.060 0.540 0.004
#> SRR1699925 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.0260 0.82624 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699927 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699929 5 0.0777 0.81647 0.024 0.000 0.000 0.004 0.972 0.000
#> SRR1699928 5 0.0260 0.82624 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699930 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699931 5 0.1410 0.79983 0.004 0.044 0.000 0.000 0.944 0.008
#> SRR1699933 5 0.4797 0.64267 0.096 0.096 0.008 0.000 0.748 0.052
#> SRR1699932 5 0.0146 0.82723 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.0603 0.81931 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000
#> SRR1699936 2 0.4662 0.34370 0.000 0.576 0.008 0.024 0.004 0.388
#> SRR1699937 6 0.3315 0.63243 0.000 0.200 0.020 0.000 0.000 0.780
#> SRR1699938 6 0.3969 0.44812 0.000 0.344 0.008 0.004 0.000 0.644
#> SRR1699940 6 0.3381 0.65417 0.000 0.044 0.156 0.000 0.000 0.800
#> SRR1699939 6 0.2979 0.62544 0.000 0.188 0.004 0.004 0.000 0.804
#> SRR1699941 6 0.3109 0.60728 0.000 0.004 0.224 0.000 0.000 0.772
#> SRR1699942 6 0.3284 0.63479 0.000 0.196 0.020 0.000 0.000 0.784
#> SRR1699943 6 0.3674 0.56981 0.000 0.268 0.016 0.000 0.000 0.716
#> SRR1699944 6 0.3261 0.62855 0.000 0.204 0.016 0.000 0.000 0.780
#> SRR1699945 6 0.4991 0.27555 0.396 0.020 0.036 0.000 0.000 0.548
#> SRR1699946 6 0.3432 0.62306 0.000 0.216 0.020 0.000 0.000 0.764
#> SRR1699947 6 0.3432 0.62244 0.000 0.216 0.020 0.000 0.000 0.764
#> SRR1699948 2 0.3995 0.07147 0.000 0.516 0.000 0.004 0.000 0.480
#> SRR1699949 6 0.4512 0.04565 0.000 0.456 0.004 0.016 0.004 0.520
#> SRR1699950 6 0.3795 0.38389 0.000 0.364 0.000 0.004 0.000 0.632
#> SRR1699951 6 0.3261 0.62232 0.000 0.204 0.016 0.000 0.000 0.780
#> SRR1699952 6 0.3333 0.63700 0.000 0.192 0.024 0.000 0.000 0.784
#> SRR1699953 6 0.3725 0.50119 0.000 0.316 0.008 0.000 0.000 0.676
#> SRR1699954 6 0.3488 0.62719 0.004 0.216 0.016 0.000 0.000 0.764
#> SRR1699955 6 0.3874 0.38941 0.000 0.356 0.000 0.008 0.000 0.636
#> SRR1699956 6 0.5321 0.48752 0.156 0.004 0.232 0.000 0.000 0.608
#> SRR1699957 6 0.3202 0.64500 0.000 0.176 0.024 0.000 0.000 0.800
#> SRR1699959 6 0.4984 0.39059 0.324 0.008 0.068 0.000 0.000 0.600
#> SRR1699958 6 0.4290 0.32411 0.000 0.364 0.004 0.020 0.000 0.612
#> SRR1699960 6 0.4390 0.00318 0.000 0.472 0.004 0.016 0.000 0.508
#> SRR1699961 6 0.3807 0.63936 0.000 0.052 0.192 0.000 0.000 0.756
#> SRR1699962 6 0.3376 0.63070 0.000 0.180 0.024 0.004 0.000 0.792
#> SRR1699963 6 0.3790 0.65994 0.000 0.072 0.156 0.000 0.000 0.772
#> SRR1699964 6 0.3417 0.65327 0.000 0.160 0.044 0.000 0.000 0.796
#> SRR1699965 6 0.4172 0.21345 0.000 0.424 0.004 0.008 0.000 0.564
#> SRR1699966 6 0.2979 0.66358 0.000 0.116 0.044 0.000 0.000 0.840
#> SRR1699967 6 0.3652 0.58632 0.000 0.264 0.016 0.000 0.000 0.720
#> SRR1699968 6 0.3830 0.41790 0.000 0.004 0.376 0.000 0.000 0.620
#> SRR1699969 6 0.3789 0.34747 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1699971 6 0.4392 0.65801 0.000 0.136 0.144 0.000 0.000 0.720
#> SRR1699970 6 0.4067 0.58200 0.000 0.040 0.260 0.000 0.000 0.700
#> SRR1699972 6 0.5360 0.59055 0.012 0.200 0.160 0.000 0.000 0.628
#> SRR1699973 6 0.3406 0.63441 0.000 0.020 0.180 0.008 0.000 0.792
#> SRR1699974 3 0.1411 0.77407 0.000 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1699975 6 0.3862 0.38700 0.000 0.000 0.388 0.000 0.004 0.608
#> SRR1699976 6 0.4118 0.51346 0.000 0.028 0.312 0.000 0.000 0.660
#> SRR1699977 6 0.3998 0.12123 0.000 0.000 0.492 0.004 0.000 0.504
#> SRR1699978 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699979 6 0.3804 0.31499 0.000 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1699980 3 0.5824 0.01609 0.000 0.000 0.452 0.000 0.192 0.356
#> SRR1699981 3 0.3881 0.20042 0.000 0.000 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR1699982 5 0.1720 0.79936 0.000 0.000 0.000 0.032 0.928 0.040
#> SRR1699983 6 0.3915 0.34227 0.000 0.000 0.412 0.000 0.004 0.584
#> SRR1699984 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 6 0.3756 0.35922 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1699986 3 0.1418 0.80464 0.000 0.000 0.944 0.032 0.000 0.024
#> SRR1699988 6 0.6264 0.46297 0.000 0.088 0.260 0.000 0.100 0.552
#> SRR1699987 3 0.4526 -0.02134 0.000 0.000 0.512 0.032 0.000 0.456
#> SRR1699989 6 0.6068 0.36401 0.000 0.032 0.124 0.004 0.304 0.536
#> SRR1699990 6 0.3817 0.29618 0.000 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1699992 6 0.3823 0.28841 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1699991 3 0.1531 0.75978 0.004 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068
#> SRR1699993 1 0.3986 0.49514 0.664 0.000 0.316 0.020 0.000 0.000
#> SRR1699994 3 0.2703 0.65395 0.004 0.000 0.824 0.000 0.000 0.172
#> SRR1699995 1 0.3351 0.58957 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.4729 -0.07893 0.000 0.544 0.040 0.004 0.000 0.412
#> SRR1699997 3 0.6051 0.09770 0.000 0.000 0.384 0.256 0.000 0.360
#> SRR1699998 6 0.4387 0.66094 0.000 0.128 0.152 0.000 0.000 0.720
#> SRR1699999 1 0.1765 0.81419 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700000 6 0.4746 0.46701 0.016 0.036 0.332 0.000 0.000 0.616
#> SRR1700002 6 0.3860 0.60512 0.000 0.036 0.236 0.000 0.000 0.728
#> SRR1700001 6 0.3823 0.29311 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1700003 6 0.3835 0.64234 0.000 0.056 0.188 0.000 0.000 0.756
#> SRR1700004 4 0.6717 0.43821 0.008 0.016 0.100 0.540 0.068 0.268
#> SRR1700005 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.4681 -0.07755 0.000 0.524 0.044 0.000 0.000 0.432
#> SRR1700007 2 0.7036 0.24198 0.000 0.404 0.008 0.128 0.096 0.364
#> SRR1700008 3 0.3547 0.38441 0.000 0.000 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 6 0.3645 0.60226 0.000 0.024 0.236 0.000 0.000 0.740
#> SRR1700011 6 0.3969 0.42112 0.000 0.344 0.004 0.008 0.000 0.644
#> SRR1700013 6 0.4063 0.49147 0.000 0.280 0.008 0.020 0.000 0.692
#> SRR1700012 6 0.3672 0.65154 0.000 0.056 0.168 0.000 0.000 0.776
#> SRR1700014 3 0.5399 0.45682 0.000 0.000 0.600 0.220 0.004 0.176
#> SRR1700015 6 0.5303 0.51494 0.000 0.272 0.108 0.012 0.000 0.608
#> SRR1700016 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700018 6 0.3705 0.61428 0.000 0.024 0.224 0.004 0.000 0.748
#> SRR1700017 6 0.3875 0.52350 0.004 0.004 0.312 0.004 0.000 0.676
#> SRR1700019 2 0.5754 0.44278 0.000 0.548 0.008 0.076 0.028 0.340
#> SRR1700020 1 0.3923 0.31319 0.580 0.000 0.416 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700021 5 0.6662 0.24561 0.352 0.000 0.000 0.104 0.444 0.100
#> SRR1700023 6 0.3175 0.58717 0.000 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1700022 6 0.4254 0.51538 0.028 0.004 0.312 0.000 0.000 0.656
#> SRR1700024 3 0.1930 0.78055 0.000 0.000 0.916 0.036 0.000 0.048
#> SRR1700025 6 0.4390 0.61291 0.000 0.232 0.064 0.004 0.000 0.700
#> SRR1700026 1 0.5849 0.48563 0.568 0.184 0.228 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700027 6 0.4912 0.31823 0.008 0.044 0.432 0.000 0.000 0.516
#> SRR1700028 6 0.6491 0.36143 0.000 0.056 0.276 0.148 0.004 0.516
#> SRR1700029 3 0.4120 0.05612 0.468 0.000 0.524 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700030 5 0.5900 0.58328 0.000 0.004 0.064 0.152 0.632 0.148
#> SRR1700031 3 0.1333 0.77207 0.008 0.000 0.944 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700032 6 0.3469 0.67793 0.000 0.088 0.104 0.000 0.000 0.808
#> SRR1700034 1 0.3175 0.63976 0.744 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 3 0.7393 -0.10768 0.000 0.004 0.356 0.196 0.328 0.116
#> SRR1700033 3 0.2544 0.75753 0.120 0.000 0.864 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700036 3 0.5536 0.32003 0.000 0.000 0.572 0.056 0.324 0.048
#> SRR1700037 5 0.5620 0.60818 0.096 0.000 0.000 0.148 0.660 0.096
#> SRR1700038 1 0.6536 0.52080 0.588 0.000 0.196 0.116 0.072 0.028
#> SRR1700039 3 0.2322 0.79462 0.036 0.000 0.896 0.064 0.000 0.004
#> SRR1700040 3 0.1737 0.79058 0.040 0.000 0.932 0.008 0.000 0.020
#> SRR1700041 3 0.1769 0.79972 0.004 0.000 0.924 0.060 0.000 0.012
#> SRR1700042 3 0.1738 0.80115 0.016 0.000 0.928 0.052 0.000 0.004
#> SRR1700043 1 0.0713 0.85574 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700045 3 0.1594 0.80191 0.000 0.000 0.932 0.052 0.000 0.016
#> SRR1700044 3 0.1779 0.79697 0.000 0.000 0.920 0.064 0.000 0.016
#> SRR1700046 3 0.1367 0.80307 0.000 0.000 0.944 0.044 0.000 0.012
#> SRR1700047 3 0.2418 0.76789 0.016 0.000 0.884 0.092 0.000 0.008
#> SRR1700048 1 0.4492 0.64574 0.712 0.000 0.216 0.020 0.052 0.000
#> SRR1700049 3 0.1219 0.80097 0.004 0.000 0.948 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700050 3 0.3563 0.34184 0.000 0.000 0.664 0.336 0.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.3464 0.55222 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.2860 0.75446 0.100 0.000 0.852 0.048 0.000 0.000
#> SRR1700053 3 0.1714 0.77165 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1700054 3 0.1845 0.79147 0.008 0.000 0.916 0.072 0.000 0.004
#> SRR1700055 3 0.4169 0.09656 0.456 0.000 0.532 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.3163 0.57982 0.000 0.000 0.764 0.232 0.000 0.004
#> SRR1700057 3 0.1888 0.79343 0.012 0.000 0.916 0.068 0.000 0.004
#> SRR1700058 3 0.1857 0.80098 0.028 0.000 0.924 0.044 0.000 0.004
#> SRR1700059 3 0.2346 0.73931 0.008 0.000 0.868 0.124 0.000 0.000
#> SRR1700060 3 0.1148 0.80395 0.004 0.000 0.960 0.020 0.000 0.016
#> SRR1700061 3 0.1806 0.77610 0.004 0.000 0.908 0.088 0.000 0.000
#> SRR1700062 3 0.1152 0.80126 0.000 0.000 0.952 0.044 0.000 0.004
#> SRR1700063 3 0.1787 0.79361 0.008 0.000 0.920 0.068 0.000 0.004
#> SRR1700064 3 0.1588 0.78952 0.000 0.000 0.924 0.072 0.000 0.004
#> SRR1700065 3 0.1757 0.78815 0.008 0.000 0.916 0.076 0.000 0.000
#> SRR1700066 3 0.1313 0.80439 0.004 0.000 0.952 0.028 0.000 0.016
#> SRR1700067 3 0.2003 0.74686 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700068 3 0.2703 0.67981 0.000 0.000 0.824 0.172 0.000 0.004
#> SRR1700069 3 0.1649 0.80341 0.000 0.000 0.932 0.032 0.000 0.036
#> SRR1700070 3 0.1967 0.76504 0.000 0.000 0.904 0.012 0.000 0.084
#> SRR1700071 3 0.1225 0.79524 0.000 0.000 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1700072 1 0.1610 0.82457 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700073 4 0.4440 0.67803 0.000 0.000 0.072 0.768 0.072 0.088
#> SRR1700075 3 0.1398 0.80090 0.000 0.000 0.940 0.052 0.000 0.008
#> SRR1700074 3 0.2006 0.73211 0.000 0.000 0.892 0.004 0.000 0.104
#> SRR1700076 3 0.1297 0.80382 0.000 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR1700077 3 0.1405 0.80268 0.004 0.000 0.948 0.024 0.000 0.024
#> SRR1700078 3 0.3210 0.75927 0.020 0.000 0.844 0.096 0.000 0.040
#> SRR1700080 3 0.2191 0.70827 0.004 0.000 0.876 0.000 0.000 0.120
#> SRR1700079 3 0.1409 0.80163 0.032 0.000 0.948 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700081 3 0.1138 0.80459 0.004 0.000 0.960 0.024 0.000 0.012
#> SRR1700082 3 0.3706 0.23060 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1700083 3 0.1682 0.78143 0.052 0.000 0.928 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700084 3 0.2361 0.76893 0.104 0.000 0.880 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700085 3 0.7096 0.16360 0.000 0.008 0.432 0.140 0.100 0.320
#> SRR1700086 3 0.1584 0.76192 0.000 0.000 0.928 0.008 0.000 0.064
#> SRR1700087 2 0.4987 0.23974 0.000 0.516 0.008 0.040 0.004 0.432
#> SRR1700088 6 0.4644 0.23616 0.000 0.380 0.008 0.024 0.004 0.584
#> SRR1700089 6 0.5425 -0.13246 0.012 0.456 0.008 0.048 0.004 0.472
#> SRR1700091 6 0.4914 0.05334 0.000 0.420 0.008 0.036 0.004 0.532
#> SRR1700090 4 0.5794 0.46768 0.000 0.060 0.084 0.616 0.004 0.236
#> SRR1700092 6 0.5506 -0.16476 0.000 0.452 0.008 0.084 0.004 0.452
#> SRR1700094 2 0.5108 0.33178 0.000 0.536 0.008 0.052 0.004 0.400
#> SRR1700093 4 0.5637 0.23718 0.000 0.104 0.016 0.564 0.004 0.312
#> SRR1700095 1 0.0508 0.86056 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700096 6 0.5641 0.23228 0.000 0.316 0.012 0.112 0.004 0.556
#> SRR1700097 1 0.2833 0.80853 0.876 0.000 0.048 0.028 0.000 0.048
#> SRR1700098 2 0.4642 0.55088 0.000 0.648 0.008 0.040 0.004 0.300
#> SRR1700099 2 0.4481 0.61055 0.000 0.696 0.008 0.048 0.004 0.244
#> SRR1700100 2 0.5105 0.39019 0.000 0.560 0.008 0.056 0.004 0.372
#> SRR1700101 2 0.4893 0.40863 0.000 0.572 0.008 0.040 0.004 0.376
#> SRR1700102 6 0.4878 -0.03079 0.000 0.444 0.008 0.032 0.004 0.512
#> SRR1700104 6 0.5011 0.51337 0.000 0.152 0.012 0.144 0.004 0.688
#> SRR1700103 6 0.5137 0.48161 0.000 0.048 0.040 0.252 0.004 0.656
#> SRR1700105 4 0.3525 0.62666 0.000 0.032 0.016 0.816 0.004 0.132
#> SRR1700106 4 0.5455 0.49672 0.000 0.112 0.024 0.676 0.020 0.168
#> SRR1700107 6 0.6263 -0.04303 0.000 0.360 0.008 0.212 0.004 0.416
#> SRR1700108 2 0.5327 0.49999 0.000 0.596 0.008 0.096 0.004 0.296
#> SRR1700109 2 0.5764 0.40440 0.000 0.536 0.008 0.108 0.012 0.336
#> SRR1700110 2 0.5575 0.35710 0.000 0.520 0.008 0.100 0.004 0.368
#> SRR1700112 4 0.3098 0.63805 0.000 0.004 0.008 0.832 0.016 0.140
#> SRR1700111 4 0.6302 0.43469 0.280 0.000 0.100 0.552 0.056 0.012
#> SRR1700113 4 0.7576 -0.11122 0.000 0.288 0.012 0.328 0.096 0.276
#> SRR1700114 6 0.5457 0.47180 0.000 0.104 0.024 0.236 0.004 0.632
#> SRR1700115 2 0.6066 0.17751 0.000 0.432 0.008 0.164 0.004 0.392
#> SRR1700116 4 0.4146 0.63692 0.000 0.008 0.084 0.768 0.004 0.136
#> SRR1700117 4 0.5273 0.52037 0.184 0.000 0.212 0.604 0.000 0.000
#> SRR1700119 4 0.3809 0.67997 0.000 0.004 0.064 0.820 0.064 0.048
#> SRR1700118 4 0.4438 0.52255 0.044 0.000 0.328 0.628 0.000 0.000
#> SRR1700120 4 0.4076 0.26822 0.000 0.000 0.452 0.540 0.000 0.008
#> SRR1700121 4 0.4211 0.63611 0.000 0.016 0.032 0.796 0.088 0.068
#> SRR1700122 4 0.1875 0.70572 0.000 0.000 0.032 0.928 0.020 0.020
#> SRR1700123 4 0.2912 0.66079 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1700125 4 0.2794 0.65766 0.000 0.004 0.008 0.864 0.020 0.104
#> SRR1700126 3 0.5144 0.13476 0.092 0.000 0.536 0.372 0.000 0.000
#> SRR1700127 4 0.3298 0.64629 0.000 0.000 0.236 0.756 0.000 0.008
#> SRR1700124 4 0.3515 0.55824 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000 0.000
#> SRR1700128 4 0.3101 0.64185 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR1700129 4 0.1411 0.70650 0.000 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR1700130 4 0.2664 0.67871 0.000 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1700132 4 0.3390 0.59155 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700131 4 0.3428 0.58269 0.000 0.000 0.304 0.696 0.000 0.000
#> SRR1700133 4 0.1714 0.70418 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1700134 4 0.2015 0.70749 0.000 0.000 0.056 0.916 0.016 0.012
#> SRR1700135 4 0.3076 0.64457 0.000 0.000 0.240 0.760 0.000 0.000
#> SRR1700136 4 0.3499 0.56293 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR1700137 4 0.2805 0.67732 0.000 0.000 0.184 0.812 0.000 0.004
#> SRR1700138 4 0.2823 0.66680 0.000 0.000 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR1700140 4 0.2996 0.65490 0.000 0.000 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR1700139 4 0.3175 0.62992 0.000 0.000 0.256 0.744 0.000 0.000
#> SRR1700141 4 0.1728 0.70731 0.000 0.000 0.064 0.924 0.004 0.008
#> SRR1700142 4 0.3868 0.20220 0.000 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1700143 4 0.3499 0.56188 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR1700144 4 0.3998 0.21357 0.000 0.000 0.492 0.504 0.000 0.004
#> SRR1700145 4 0.3514 0.66254 0.020 0.000 0.208 0.768 0.004 0.000
#> SRR1700146 4 0.1812 0.70626 0.000 0.000 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR1700147 4 0.3409 0.58649 0.000 0.000 0.300 0.700 0.000 0.000
#> SRR1700149 4 0.3564 0.61916 0.012 0.000 0.264 0.724 0.000 0.000
#> SRR1700148 4 0.3266 0.61833 0.000 0.000 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR1700150 4 0.1910 0.70176 0.000 0.000 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1700152 4 0.2996 0.65321 0.000 0.000 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR1700151 4 0.3446 0.57994 0.000 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR1700153 4 0.3151 0.63469 0.000 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1700154 4 0.3126 0.63821 0.000 0.000 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR1700155 4 0.2730 0.67474 0.000 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1700156 4 0.3390 0.59051 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1700158 4 0.4110 0.60186 0.040 0.000 0.268 0.692 0.000 0.000
#> SRR1700159 4 0.1536 0.70293 0.000 0.000 0.020 0.944 0.012 0.024
#> SRR1700157 4 0.3607 0.52981 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000 0.000
#> SRR1700160 4 0.2300 0.69429 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1700161 4 0.2416 0.68982 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1700162 4 0.1785 0.70709 0.000 0.000 0.048 0.928 0.016 0.008
#> SRR1700164 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700163 4 0.5794 0.23680 0.384 0.000 0.180 0.436 0.000 0.000
#> SRR1700165 4 0.3126 0.64020 0.000 0.000 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR1700166 4 0.1957 0.70137 0.000 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1700168 4 0.2089 0.68269 0.000 0.004 0.012 0.908 0.004 0.072
#> SRR1700167 4 0.4462 0.57347 0.060 0.000 0.280 0.660 0.000 0.000
#> SRR1700170 4 0.1806 0.70480 0.000 0.000 0.088 0.908 0.004 0.000
#> SRR1700169 4 0.2191 0.70020 0.000 0.000 0.120 0.876 0.004 0.000
#> SRR1700171 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700172 4 0.2092 0.69989 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1700174 4 0.2653 0.69237 0.000 0.000 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR1700173 4 0.2288 0.69956 0.000 0.000 0.116 0.876 0.004 0.004
#> SRR1700175 4 0.1556 0.70527 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1700176 4 0.3659 0.50313 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000
#> SRR1700178 2 0.0713 0.78934 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700177 4 0.1720 0.70668 0.000 0.000 0.040 0.928 0.032 0.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.1141 0.78055 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1700181 2 0.0937 0.78526 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1700183 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.1075 0.78235 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700186 2 0.1007 0.78508 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700187 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0790 0.78901 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1700192 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.3151 0.64108 0.748 0.252 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700199 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700200 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 1 0.0146 0.86498 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700203 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700204 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700206 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700207 2 0.0260 0.79386 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700208 1 0.3823 0.30857 0.564 0.436 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700205 5 0.5400 0.54393 0.180 0.172 0.000 0.000 0.632 0.016
#> SRR1700209 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700210 2 0.2346 0.68510 0.124 0.868 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700211 2 0.0790 0.77686 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700213 2 0.3154 0.59050 0.004 0.800 0.012 0.000 0.000 0.184
#> SRR1700214 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0291 0.79318 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700216 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1814 0.75669 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1700219 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700223 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700224 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700226 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700229 2 0.0363 0.79080 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700225 2 0.4277 0.13196 0.000 0.616 0.028 0.000 0.000 0.356
#> SRR1700227 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700230 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700228 2 0.1267 0.75442 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1700232 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700233 2 0.0260 0.79267 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700234 1 0.3266 0.61417 0.728 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.0260 0.79301 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700237 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700236 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700238 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.4889 0.26016 0.028 0.000 0.596 0.348 0.000 0.028
#> SRR1700243 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700244 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.0146 0.79407 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700247 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.79466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700251 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700252 2 0.1075 0.78059 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1700253 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700256 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700257 2 0.0146 0.79472 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700258 2 0.2738 0.69617 0.000 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR1700259 2 0.4666 0.48452 0.000 0.616 0.008 0.032 0.004 0.340
#> SRR1700260 2 0.4893 0.41154 0.000 0.572 0.008 0.040 0.004 0.376
#> SRR1700261 6 0.6156 -0.02061 0.000 0.336 0.008 0.128 0.024 0.504
#> SRR1700262 2 0.5646 0.47270 0.000 0.568 0.008 0.064 0.032 0.328
#> SRR1700263 2 0.4675 0.51259 0.000 0.628 0.008 0.036 0.004 0.324
#> SRR1700264 2 0.3595 0.56010 0.000 0.704 0.000 0.008 0.000 0.288
#> SRR1700265 1 0.1074 0.84754 0.960 0.028 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700266 2 0.4579 0.43290 0.000 0.608 0.008 0.024 0.004 0.356
#> SRR1700268 2 0.4867 0.53932 0.000 0.624 0.008 0.052 0.004 0.312
#> SRR1700270 2 0.1918 0.75750 0.000 0.904 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR1700267 2 0.4389 0.54050 0.000 0.660 0.008 0.024 0.004 0.304
#> SRR1700271 2 0.4297 0.57244 0.000 0.680 0.008 0.024 0.004 0.284
#> SRR1700272 2 0.4370 0.57374 0.000 0.676 0.008 0.028 0.004 0.284
#> SRR1700273 2 0.3161 0.65638 0.000 0.776 0.000 0.008 0.000 0.216
#> SRR1700274 2 0.4513 0.54599 0.000 0.656 0.008 0.032 0.004 0.300
#> SRR1700277 2 0.1429 0.78310 0.000 0.940 0.004 0.004 0.000 0.052
#> SRR1700275 2 0.7222 0.27027 0.000 0.456 0.008 0.104 0.220 0.212
#> SRR1700276 2 0.1942 0.75890 0.000 0.916 0.000 0.008 0.012 0.064
#> SRR1700278 5 0.4285 0.71736 0.084 0.008 0.000 0.044 0.788 0.076
#> SRR1700279 5 0.6526 0.44022 0.264 0.012 0.000 0.088 0.544 0.092
#> SRR1700280 5 0.7600 0.38550 0.248 0.100 0.000 0.076 0.472 0.104
#> SRR1700281 2 0.2886 0.72181 0.000 0.836 0.000 0.016 0.004 0.144
#> SRR1700283 2 0.4055 0.60840 0.000 0.768 0.000 0.008 0.136 0.088
#> SRR1700282 1 0.5156 0.61238 0.708 0.036 0.000 0.028 0.176 0.052
#> SRR1700284 4 0.6499 0.12940 0.000 0.036 0.008 0.464 0.344 0.148
#> SRR1700285 4 0.6742 0.28536 0.000 0.060 0.008 0.508 0.228 0.196
#> SRR1700286 6 0.4158 0.50989 0.000 0.280 0.012 0.020 0.000 0.688
#> SRR1700287 2 0.7880 -0.15068 0.000 0.288 0.008 0.224 0.276 0.204
#> SRR1700290 1 0.0146 0.86525 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700289 5 0.7318 0.28614 0.000 0.228 0.000 0.228 0.408 0.136
#> SRR1700288 2 0.0653 0.78770 0.000 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1700292 5 0.7125 0.39454 0.000 0.204 0.004 0.172 0.480 0.140
#> SRR1700291 4 0.5402 0.37277 0.000 0.000 0.012 0.584 0.296 0.108
#> SRR1700293 4 0.7292 0.09112 0.000 0.236 0.000 0.404 0.236 0.124
#> SRR1700294 4 0.4929 0.53966 0.000 0.000 0.016 0.684 0.192 0.108
#> SRR1700295 1 0.3562 0.74522 0.824 0.000 0.000 0.100 0.036 0.040
#> SRR1700297 4 0.5726 0.27939 0.000 0.008 0.004 0.544 0.308 0.136
#> SRR1700296 5 0.6306 0.42043 0.060 0.008 0.000 0.272 0.552 0.108
#> SRR1700298 4 0.5617 0.44981 0.032 0.000 0.004 0.620 0.240 0.104
#> SRR1700299 4 0.4165 0.64587 0.000 0.000 0.024 0.776 0.092 0.108
#> SRR1700300 4 0.4191 0.66291 0.000 0.000 0.036 0.780 0.080 0.104
#> SRR1700302 4 0.5438 0.39454 0.000 0.000 0.016 0.592 0.284 0.108
#> SRR1700301 4 0.5571 0.24131 0.000 0.000 0.012 0.528 0.352 0.108
#> SRR1700303 4 0.5340 0.39521 0.000 0.000 0.008 0.596 0.276 0.120
#> SRR1700304 1 0.5209 0.38769 0.612 0.000 0.000 0.032 0.300 0.056
#> SRR1700305 4 0.4715 0.57365 0.000 0.000 0.016 0.712 0.164 0.108
#> SRR1700306 4 0.4839 0.63462 0.016 0.000 0.032 0.744 0.108 0.100
#> SRR1700308 4 0.4212 0.64141 0.000 0.000 0.024 0.772 0.096 0.108
#> SRR1700307 4 0.4973 0.66313 0.000 0.000 0.096 0.724 0.080 0.100
#> SRR1700309 4 0.4534 0.68167 0.000 0.000 0.072 0.760 0.072 0.096
#> SRR1700310 4 0.4934 0.55921 0.000 0.000 0.020 0.692 0.176 0.112
#> SRR1700311 4 0.4223 0.63302 0.000 0.000 0.020 0.768 0.108 0.104
#> SRR1700312 4 0.5692 0.52504 0.000 0.032 0.016 0.652 0.176 0.124
#> SRR1700313 4 0.4266 0.69367 0.000 0.000 0.096 0.776 0.040 0.088
#> SRR1700314 4 0.4039 0.69030 0.000 0.000 0.116 0.780 0.016 0.088
#> SRR1700315 4 0.5183 0.60799 0.000 0.000 0.052 0.692 0.156 0.100
#> SRR1700316 4 0.3972 0.65448 0.000 0.004 0.020 0.796 0.072 0.108
#> SRR1700317 4 0.7720 0.00079 0.000 0.296 0.004 0.304 0.176 0.220
#> SRR1700318 1 0.4754 0.49195 0.664 0.000 0.000 0.024 0.268 0.044
#> SRR1700319 4 0.4120 0.64913 0.000 0.000 0.024 0.780 0.092 0.104
#> SRR1700320 4 0.4871 0.54971 0.000 0.000 0.016 0.692 0.184 0.108
#> SRR1700322 4 0.4761 0.59769 0.000 0.008 0.016 0.728 0.132 0.116
#> SRR1700321 4 0.7290 0.11459 0.000 0.196 0.008 0.372 0.088 0.336
#> SRR1700323 4 0.3652 0.66118 0.000 0.000 0.016 0.808 0.056 0.120
#> SRR1700324 4 0.5065 0.52328 0.000 0.000 0.016 0.668 0.200 0.116
#> SRR1700325 2 0.7382 0.16697 0.000 0.436 0.004 0.204 0.180 0.176
#> SRR1700326 1 0.0000 0.86731 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700327 6 0.4223 0.50426 0.000 0.108 0.008 0.116 0.004 0.764
#> SRR1700329 4 0.4777 0.54948 0.000 0.000 0.008 0.696 0.156 0.140
#> SRR1700328 1 0.2697 0.80124 0.888 0.004 0.000 0.024 0.044 0.040
#> SRR1700330 1 0.5196 0.54138 0.680 0.000 0.000 0.064 0.192 0.064
#> SRR1700331 5 0.2875 0.74611 0.000 0.000 0.000 0.096 0.852 0.052
#> SRR1700332 5 0.5849 0.58363 0.000 0.132 0.000 0.116 0.640 0.112
#> SRR1700333 5 0.7339 0.24657 0.152 0.016 0.000 0.308 0.420 0.104
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.519 0.798 0.906 0.4753 0.517 0.517
#> 3 3 0.446 0.730 0.878 0.0499 0.952 0.910
#> 4 4 0.433 0.637 0.810 0.3291 0.743 0.525
#> 5 5 0.480 0.550 0.770 0.0671 0.954 0.861
#> 6 6 0.515 0.565 0.737 0.0766 0.930 0.774
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.1843 0.8922 0.028 0.972
#> SRR1699877 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1699881 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699882 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699883 2 0.0376 0.8993 0.004 0.996
#> SRR1699884 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.8327 0.6677 0.264 0.736
#> SRR1699888 2 0.4939 0.8243 0.108 0.892
#> SRR1699889 2 0.9000 0.5752 0.316 0.684
#> SRR1699890 1 0.7674 0.7255 0.776 0.224
#> SRR1699887 2 0.0376 0.8995 0.004 0.996
#> SRR1699891 2 0.8763 0.6226 0.296 0.704
#> SRR1699892 2 0.9000 0.5521 0.316 0.684
#> SRR1699893 1 0.4562 0.8419 0.904 0.096
#> SRR1699894 1 0.6343 0.7975 0.840 0.160
#> SRR1699895 1 0.7950 0.7011 0.760 0.240
#> SRR1699896 1 0.9909 0.2552 0.556 0.444
#> SRR1699897 2 0.5842 0.8134 0.140 0.860
#> SRR1699898 1 0.4431 0.8461 0.908 0.092
#> SRR1699900 1 0.4690 0.8418 0.900 0.100
#> SRR1699899 2 0.8763 0.6222 0.296 0.704
#> SRR1699902 1 0.4690 0.8418 0.900 0.100
#> SRR1699901 1 0.4431 0.8470 0.908 0.092
#> SRR1699903 1 0.3431 0.8623 0.936 0.064
#> SRR1699904 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699905 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699906 1 0.3879 0.8545 0.924 0.076
#> SRR1699907 1 0.2043 0.8739 0.968 0.032
#> SRR1699908 1 0.4022 0.8520 0.920 0.080
#> SRR1699909 1 0.0672 0.8784 0.992 0.008
#> SRR1699910 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699911 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699912 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699913 1 0.4022 0.8548 0.920 0.080
#> SRR1699914 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699915 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699916 1 0.4022 0.8536 0.920 0.080
#> SRR1699917 1 0.4161 0.8511 0.916 0.084
#> SRR1699918 1 0.3879 0.8545 0.924 0.076
#> SRR1699919 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699920 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699921 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699922 1 0.2778 0.8699 0.952 0.048
#> SRR1699923 1 0.0672 0.8784 0.992 0.008
#> SRR1699924 1 0.2423 0.8725 0.960 0.040
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699926 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699927 1 0.3584 0.8589 0.932 0.068
#> SRR1699929 1 0.4562 0.8419 0.904 0.096
#> SRR1699928 1 0.0938 0.8789 0.988 0.012
#> SRR1699930 1 0.6048 0.8096 0.852 0.148
#> SRR1699931 1 0.6973 0.7721 0.812 0.188
#> SRR1699933 2 0.7299 0.7490 0.204 0.796
#> SRR1699932 1 0.9815 0.3048 0.580 0.420
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699935 1 0.7219 0.7525 0.800 0.200
#> SRR1699936 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699937 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699939 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699941 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699942 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699943 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699946 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699950 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699951 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699952 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699955 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.2236 0.8870 0.036 0.964
#> SRR1699957 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.9881 0.2184 0.436 0.564
#> SRR1699958 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699960 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699961 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1699967 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699969 2 0.1843 0.8922 0.028 0.972
#> SRR1699971 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.7674 0.7243 0.224 0.776
#> SRR1699973 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1699974 2 0.8608 0.6329 0.284 0.716
#> SRR1699975 2 0.7219 0.7443 0.200 0.800
#> SRR1699976 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699977 1 0.5737 0.8182 0.864 0.136
#> SRR1699978 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699979 2 0.6343 0.7885 0.160 0.840
#> SRR1699980 2 0.9129 0.5631 0.328 0.672
#> SRR1699981 1 0.9815 0.2891 0.580 0.420
#> SRR1699982 2 0.7453 0.7361 0.212 0.788
#> SRR1699983 2 0.2603 0.8847 0.044 0.956
#> SRR1699984 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.7139 0.7483 0.196 0.804
#> SRR1699986 1 0.9963 0.1035 0.536 0.464
#> SRR1699988 2 0.1184 0.8952 0.016 0.984
#> SRR1699987 1 0.4939 0.8403 0.892 0.108
#> SRR1699989 2 0.6343 0.7889 0.160 0.840
#> SRR1699990 2 0.9286 0.5319 0.344 0.656
#> SRR1699992 2 0.6801 0.7705 0.180 0.820
#> SRR1699991 1 0.4298 0.8470 0.912 0.088
#> SRR1699993 1 0.7745 0.6964 0.772 0.228
#> SRR1699994 2 0.4562 0.8514 0.096 0.904
#> SRR1699995 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1699996 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.6438 0.7944 0.164 0.836
#> SRR1699998 2 0.0938 0.8970 0.012 0.988
#> SRR1699999 1 0.0376 0.8795 0.996 0.004
#> SRR1700000 2 0.7056 0.7553 0.192 0.808
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.2603 0.8800 0.044 0.956
#> SRR1700003 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1700004 2 0.5294 0.8304 0.120 0.880
#> SRR1700005 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700008 2 0.6801 0.7808 0.180 0.820
#> SRR1700009 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.0376 0.8995 0.004 0.996
#> SRR1700011 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700013 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700014 1 0.3584 0.8628 0.932 0.068
#> SRR1700015 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700016 1 0.0376 0.8799 0.996 0.004
#> SRR1700018 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.2043 0.8875 0.032 0.968
#> SRR1700019 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700020 1 0.9909 0.2866 0.556 0.444
#> SRR1700021 1 0.8713 0.5894 0.708 0.292
#> SRR1700023 2 0.1633 0.8932 0.024 0.976
#> SRR1700022 2 0.8144 0.6345 0.252 0.748
#> SRR1700024 2 0.2603 0.8833 0.044 0.956
#> SRR1700025 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.4939 0.8446 0.108 0.892
#> SRR1700027 2 0.1184 0.8939 0.016 0.984
#> SRR1700028 2 0.0938 0.8979 0.012 0.988
#> SRR1700029 1 0.4562 0.8433 0.904 0.096
#> SRR1700030 2 0.7056 0.7507 0.192 0.808
#> SRR1700031 1 0.9833 0.3491 0.576 0.424
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700035 2 0.9922 0.2621 0.448 0.552
#> SRR1700033 1 0.0376 0.8802 0.996 0.004
#> SRR1700036 2 0.9833 0.3012 0.424 0.576
#> SRR1700037 2 0.9358 0.5220 0.352 0.648
#> SRR1700038 1 0.7815 0.7051 0.768 0.232
#> SRR1700039 1 0.0376 0.8799 0.996 0.004
#> SRR1700040 1 0.8144 0.6870 0.748 0.252
#> SRR1700041 2 0.9248 0.5246 0.340 0.660
#> SRR1700042 1 0.3584 0.8590 0.932 0.068
#> SRR1700043 2 0.9988 0.1091 0.480 0.520
#> SRR1700045 1 0.3431 0.8670 0.936 0.064
#> SRR1700044 2 0.7453 0.7311 0.212 0.788
#> SRR1700046 1 0.1184 0.8790 0.984 0.016
#> SRR1700047 1 0.0376 0.8803 0.996 0.004
#> SRR1700048 1 0.1633 0.8771 0.976 0.024
#> SRR1700049 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700050 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700051 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700052 1 0.0376 0.8795 0.996 0.004
#> SRR1700053 1 0.5294 0.8206 0.880 0.120
#> SRR1700054 1 0.3114 0.8664 0.944 0.056
#> SRR1700055 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700056 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700057 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700058 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700059 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700060 1 0.2423 0.8730 0.960 0.040
#> SRR1700061 1 0.0376 0.8803 0.996 0.004
#> SRR1700062 1 0.7376 0.7151 0.792 0.208
#> SRR1700063 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700064 1 0.7950 0.6827 0.760 0.240
#> SRR1700065 1 0.1184 0.8788 0.984 0.016
#> SRR1700066 2 0.9087 0.5837 0.324 0.676
#> SRR1700067 1 0.6887 0.7612 0.816 0.184
#> SRR1700068 1 0.5408 0.8183 0.876 0.124
#> SRR1700069 1 0.8144 0.6594 0.748 0.252
#> SRR1700070 2 0.8861 0.6094 0.304 0.696
#> SRR1700071 1 0.4690 0.8418 0.900 0.100
#> SRR1700072 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700073 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700075 2 0.8861 0.6116 0.304 0.696
#> SRR1700074 2 0.1414 0.8937 0.020 0.980
#> SRR1700076 2 0.8081 0.6910 0.248 0.752
#> SRR1700077 2 0.7219 0.7443 0.200 0.800
#> SRR1700078 1 0.9881 0.2055 0.564 0.436
#> SRR1700080 1 0.9996 -0.0138 0.512 0.488
#> SRR1700079 2 0.8267 0.6879 0.260 0.740
#> SRR1700081 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700082 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700083 1 0.4298 0.8477 0.912 0.088
#> SRR1700084 2 0.8713 0.6202 0.292 0.708
#> SRR1700085 2 0.6247 0.8003 0.156 0.844
#> SRR1700086 2 0.8861 0.6196 0.304 0.696
#> SRR1700087 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700089 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700091 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700090 2 0.6623 0.7735 0.172 0.828
#> SRR1700092 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700094 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700093 2 0.1633 0.8922 0.024 0.976
#> SRR1700095 1 0.4298 0.8514 0.912 0.088
#> SRR1700096 2 0.4022 0.8511 0.080 0.920
#> SRR1700097 2 0.7056 0.7258 0.192 0.808
#> SRR1700098 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700099 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0376 0.8991 0.004 0.996
#> SRR1700101 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700104 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700103 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700105 2 0.1184 0.8969 0.016 0.984
#> SRR1700106 2 0.3879 0.8585 0.076 0.924
#> SRR1700107 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700108 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700109 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700110 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700112 2 0.4690 0.8416 0.100 0.900
#> SRR1700111 1 0.7299 0.7327 0.796 0.204
#> SRR1700113 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700114 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700115 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700116 2 0.4815 0.8401 0.104 0.896
#> SRR1700117 1 0.4815 0.8435 0.896 0.104
#> SRR1700119 2 0.5946 0.8096 0.144 0.856
#> SRR1700118 1 0.3114 0.8648 0.944 0.056
#> SRR1700120 2 0.9460 0.4965 0.364 0.636
#> SRR1700121 2 0.9922 0.2482 0.448 0.552
#> SRR1700122 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700123 1 0.0672 0.8798 0.992 0.008
#> SRR1700125 2 0.3431 0.8715 0.064 0.936
#> SRR1700126 1 0.8813 0.6142 0.700 0.300
#> SRR1700127 2 0.9881 0.2972 0.436 0.564
#> SRR1700124 1 0.6438 0.7794 0.836 0.164
#> SRR1700128 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700129 1 0.8386 0.6329 0.732 0.268
#> SRR1700130 1 0.0672 0.8784 0.992 0.008
#> SRR1700132 1 0.4815 0.8353 0.896 0.104
#> SRR1700131 2 0.9909 0.2709 0.444 0.556
#> SRR1700133 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700134 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700135 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700136 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700137 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700138 1 0.0376 0.8803 0.996 0.004
#> SRR1700140 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700139 2 0.9393 0.4929 0.356 0.644
#> SRR1700141 1 0.9977 0.0623 0.528 0.472
#> SRR1700142 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700143 1 0.0376 0.8801 0.996 0.004
#> SRR1700144 1 0.4815 0.8450 0.896 0.104
#> SRR1700145 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700146 1 0.8763 0.5798 0.704 0.296
#> SRR1700147 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700149 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700148 1 0.5842 0.8016 0.860 0.140
#> SRR1700150 1 0.9522 0.4220 0.628 0.372
#> SRR1700152 1 0.9933 0.1549 0.548 0.452
#> SRR1700151 1 0.5059 0.8286 0.888 0.112
#> SRR1700153 1 0.9358 0.4609 0.648 0.352
#> SRR1700154 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700155 1 0.4690 0.8403 0.900 0.100
#> SRR1700156 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700158 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700159 1 0.0938 0.8794 0.988 0.012
#> SRR1700157 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700160 1 0.1843 0.8751 0.972 0.028
#> SRR1700161 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700162 1 0.7139 0.7372 0.804 0.196
#> SRR1700164 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700163 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700165 1 0.1414 0.8777 0.980 0.020
#> SRR1700166 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700168 1 1.0000 -0.0024 0.500 0.500
#> SRR1700167 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700170 1 0.1414 0.8783 0.980 0.020
#> SRR1700169 1 0.0938 0.8800 0.988 0.012
#> SRR1700171 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700172 2 0.9635 0.4225 0.388 0.612
#> SRR1700174 2 0.9170 0.5477 0.332 0.668
#> SRR1700173 2 0.8763 0.6324 0.296 0.704
#> SRR1700175 1 0.1184 0.8788 0.984 0.016
#> SRR1700176 1 0.6148 0.7890 0.848 0.152
#> SRR1700178 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700177 1 0.5946 0.8004 0.856 0.144
#> SRR1700180 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.9983 0.1683 0.524 0.476
#> SRR1700190 2 0.3114 0.8671 0.056 0.944
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700197 2 0.6148 0.7738 0.152 0.848
#> SRR1700198 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700202 1 0.9795 0.3488 0.584 0.416
#> SRR1700203 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700205 2 0.8763 0.6023 0.296 0.704
#> SRR1700209 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.4022 0.8562 0.080 0.920
#> SRR1700211 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700218 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700220 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.2948 0.8754 0.052 0.948
#> SRR1700226 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.9996 0.0829 0.512 0.488
#> SRR1700231 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.7602 0.7229 0.220 0.780
#> SRR1700235 2 0.0672 0.8985 0.008 0.992
#> SRR1700237 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.1184 0.8786 0.984 0.016
#> SRR1700240 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.6247 0.7936 0.156 0.844
#> SRR1700243 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.9580 0.4448 0.620 0.380
#> SRR1700246 2 0.7219 0.7438 0.200 0.800
#> SRR1700245 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0376 0.8796 0.996 0.004
#> SRR1700255 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700259 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700260 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700261 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700262 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700263 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700264 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700266 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700270 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700273 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700277 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700276 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.8955 0.5726 0.312 0.688
#> SRR1700279 2 0.9087 0.5732 0.324 0.676
#> SRR1700280 2 0.8608 0.6466 0.284 0.716
#> SRR1700281 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700282 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700284 2 0.2948 0.8762 0.052 0.948
#> SRR1700285 2 0.7376 0.7411 0.208 0.792
#> SRR1700286 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700287 2 0.0672 0.8989 0.008 0.992
#> SRR1700290 1 0.0672 0.8798 0.992 0.008
#> SRR1700289 2 0.7602 0.7276 0.220 0.780
#> SRR1700288 2 0.0000 0.9000 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.1414 0.8955 0.020 0.980
#> SRR1700291 2 0.7602 0.7208 0.220 0.780
#> SRR1700293 2 0.7056 0.7555 0.192 0.808
#> SRR1700294 1 0.9522 0.4064 0.628 0.372
#> SRR1700295 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700297 2 0.8608 0.6490 0.284 0.716
#> SRR1700296 2 0.9552 0.4643 0.376 0.624
#> SRR1700298 1 0.9977 0.0760 0.528 0.472
#> SRR1700299 2 0.9686 0.4151 0.396 0.604
#> SRR1700300 2 0.9954 0.1973 0.460 0.540
#> SRR1700302 1 0.9850 0.2344 0.572 0.428
#> SRR1700301 1 0.9993 0.0116 0.516 0.484
#> SRR1700303 2 0.9286 0.5369 0.344 0.656
#> SRR1700304 1 0.9248 0.4963 0.660 0.340
#> SRR1700305 2 0.8661 0.6378 0.288 0.712
#> SRR1700306 1 0.1414 0.8774 0.980 0.020
#> SRR1700308 2 0.8763 0.6225 0.296 0.704
#> SRR1700307 1 0.3584 0.8610 0.932 0.068
#> SRR1700309 1 0.4431 0.8434 0.908 0.092
#> SRR1700310 2 0.9393 0.5150 0.356 0.644
#> SRR1700311 1 0.9850 0.2357 0.572 0.428
#> SRR1700312 2 0.7602 0.7251 0.220 0.780
#> SRR1700313 1 0.9209 0.5073 0.664 0.336
#> SRR1700314 1 0.9323 0.4666 0.652 0.348
#> SRR1700315 1 0.1184 0.8784 0.984 0.016
#> SRR1700316 2 0.7453 0.7305 0.212 0.788
#> SRR1700317 2 0.0376 0.8995 0.004 0.996
#> SRR1700318 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700319 1 0.3733 0.8557 0.928 0.072
#> SRR1700320 2 0.9000 0.5978 0.316 0.684
#> SRR1700322 2 0.7950 0.7095 0.240 0.760
#> SRR1700321 2 0.2236 0.8850 0.036 0.964
#> SRR1700323 2 0.8909 0.6121 0.308 0.692
#> SRR1700324 2 0.8713 0.6348 0.292 0.708
#> SRR1700325 2 0.0938 0.8982 0.012 0.988
#> SRR1700326 1 0.5519 0.8259 0.872 0.128
#> SRR1700327 2 0.0376 0.8996 0.004 0.996
#> SRR1700329 2 0.6048 0.8111 0.148 0.852
#> SRR1700328 2 0.6531 0.7864 0.168 0.832
#> SRR1700330 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700331 1 0.0000 0.8803 1.000 0.000
#> SRR1700332 2 0.4690 0.8453 0.100 0.900
#> SRR1700333 2 0.7950 0.6976 0.240 0.760
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699876 2 0.2845 0.8558 0.012 0.920 0.068
#> SRR1699877 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.0237 0.8704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699881 2 0.2550 0.8564 0.012 0.932 0.056
#> SRR1699882 2 0.2384 0.8570 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699883 2 0.0237 0.8707 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699884 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.5420 0.6745 0.008 0.752 0.240
#> SRR1699888 2 0.2878 0.8158 0.000 0.904 0.096
#> SRR1699889 2 0.6282 0.5659 0.012 0.664 0.324
#> SRR1699890 3 0.5812 0.6276 0.012 0.264 0.724
#> SRR1699887 2 0.0661 0.8715 0.004 0.988 0.008
#> SRR1699891 2 0.6129 0.5633 0.008 0.668 0.324
#> SRR1699892 2 0.5560 0.5585 0.000 0.700 0.300
#> SRR1699893 3 0.4062 0.7114 0.000 0.164 0.836
#> SRR1699894 3 0.5202 0.6738 0.008 0.220 0.772
#> SRR1699895 3 0.5848 0.6315 0.012 0.268 0.720
#> SRR1699896 2 0.6307 -0.0818 0.000 0.512 0.488
#> SRR1699897 2 0.3482 0.8021 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699898 3 0.4062 0.7187 0.000 0.164 0.836
#> SRR1699900 3 0.4702 0.6866 0.000 0.212 0.788
#> SRR1699899 2 0.6228 0.5816 0.012 0.672 0.316
#> SRR1699902 3 0.4702 0.6866 0.000 0.212 0.788
#> SRR1699901 3 0.4605 0.6963 0.000 0.204 0.796
#> SRR1699903 3 0.3377 0.7615 0.012 0.092 0.896
#> SRR1699904 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699905 3 0.0475 0.7736 0.004 0.004 0.992
#> SRR1699906 3 0.3851 0.7392 0.004 0.136 0.860
#> SRR1699907 3 0.2165 0.7738 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699908 3 0.4002 0.7303 0.000 0.160 0.840
#> SRR1699909 3 0.2066 0.7588 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699910 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699911 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699912 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699913 3 0.4291 0.7173 0.000 0.180 0.820
#> SRR1699914 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699915 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699916 3 0.4178 0.7231 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699917 3 0.4399 0.7100 0.000 0.188 0.812
#> SRR1699918 3 0.4121 0.7219 0.000 0.168 0.832
#> SRR1699919 3 0.0237 0.7748 0.000 0.004 0.996
#> SRR1699920 3 0.0747 0.7750 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699921 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699922 3 0.3482 0.7514 0.000 0.128 0.872
#> SRR1699923 3 0.2066 0.7588 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699924 3 0.3267 0.7546 0.000 0.116 0.884
#> SRR1699925 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699926 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699927 3 0.3412 0.7486 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699929 3 0.4346 0.7029 0.000 0.184 0.816
#> SRR1699928 3 0.1289 0.7751 0.000 0.032 0.968
#> SRR1699930 3 0.4629 0.7123 0.004 0.188 0.808
#> SRR1699931 3 0.5363 0.6330 0.000 0.276 0.724
#> SRR1699933 2 0.4504 0.7307 0.000 0.804 0.196
#> SRR1699932 3 0.6713 0.2663 0.012 0.416 0.572
#> SRR1699934 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699935 3 0.5698 0.6372 0.012 0.252 0.736
#> SRR1699936 2 0.1031 0.8687 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699937 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699940 2 0.0747 0.8704 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699939 2 0.1129 0.8696 0.004 0.976 0.020
#> SRR1699941 2 0.2486 0.8553 0.008 0.932 0.060
#> SRR1699942 2 0.0747 0.8701 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699943 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699945 2 0.2384 0.8569 0.008 0.936 0.056
#> SRR1699946 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.0237 0.8710 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699948 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699949 2 0.2301 0.8563 0.004 0.936 0.060
#> SRR1699950 2 0.2096 0.8594 0.004 0.944 0.052
#> SRR1699951 2 0.0892 0.8697 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699952 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.0237 0.8711 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699955 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699956 2 0.3377 0.8416 0.012 0.896 0.092
#> SRR1699957 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699959 2 0.6771 0.2174 0.012 0.548 0.440
#> SRR1699958 2 0.2486 0.8554 0.008 0.932 0.060
#> SRR1699960 2 0.1289 0.8677 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699961 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699962 2 0.0983 0.8700 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699963 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.1620 0.8676 0.012 0.964 0.024
#> SRR1699967 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1699969 2 0.3207 0.8464 0.012 0.904 0.084
#> SRR1699971 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699972 2 0.4702 0.7101 0.000 0.788 0.212
#> SRR1699973 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1699974 2 0.5517 0.6287 0.004 0.728 0.268
#> SRR1699975 2 0.4682 0.7253 0.004 0.804 0.192
#> SRR1699976 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699977 3 0.4842 0.6833 0.000 0.224 0.776
#> SRR1699978 3 0.1989 0.7668 0.004 0.048 0.948
#> SRR1699979 2 0.4291 0.7694 0.008 0.840 0.152
#> SRR1699980 2 0.6529 0.4764 0.012 0.620 0.368
#> SRR1699981 3 0.6647 0.3178 0.012 0.396 0.592
#> SRR1699982 2 0.5775 0.6707 0.012 0.728 0.260
#> SRR1699983 2 0.3618 0.8370 0.012 0.884 0.104
#> SRR1699984 3 0.6308 -0.2117 0.492 0.000 0.508
#> SRR1699985 2 0.4861 0.7220 0.008 0.800 0.192
#> SRR1699986 3 0.6600 0.3248 0.012 0.384 0.604
#> SRR1699988 2 0.1170 0.8688 0.008 0.976 0.016
#> SRR1699987 3 0.3425 0.7588 0.004 0.112 0.884
#> SRR1699989 2 0.4473 0.7609 0.008 0.828 0.164
#> SRR1699990 2 0.6529 0.4503 0.012 0.620 0.368
#> SRR1699992 2 0.4700 0.7433 0.008 0.812 0.180
#> SRR1699991 3 0.3879 0.7240 0.000 0.152 0.848
#> SRR1699993 3 0.5020 0.6784 0.012 0.192 0.796
#> SRR1699994 2 0.3295 0.8355 0.008 0.896 0.096
#> SRR1699995 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1699996 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699997 2 0.5171 0.7512 0.012 0.784 0.204
#> SRR1699998 2 0.0592 0.8696 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699999 3 0.1989 0.7630 0.004 0.048 0.948
#> SRR1700000 2 0.4346 0.7371 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700002 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700001 2 0.2400 0.8556 0.004 0.932 0.064
#> SRR1700003 2 0.0237 0.8704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700004 2 0.5220 0.7352 0.012 0.780 0.208
#> SRR1700005 3 0.6079 0.1035 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700006 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700007 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700008 2 0.6113 0.6157 0.012 0.688 0.300
#> SRR1700009 3 0.0747 0.7702 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700010 2 0.1525 0.8661 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700011 2 0.1647 0.8656 0.004 0.960 0.036
#> SRR1700013 2 0.0424 0.8707 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700014 3 0.3618 0.7603 0.012 0.104 0.884
#> SRR1700015 2 0.0747 0.8701 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700016 3 0.0475 0.7738 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700018 2 0.0424 0.8710 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700017 2 0.2772 0.8490 0.004 0.916 0.080
#> SRR1700019 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700020 3 0.6724 0.3168 0.012 0.420 0.568
#> SRR1700021 3 0.5619 0.6231 0.012 0.244 0.744
#> SRR1700023 2 0.2939 0.8507 0.012 0.916 0.072
#> SRR1700022 2 0.5919 0.6037 0.012 0.712 0.276
#> SRR1700024 2 0.3918 0.8228 0.012 0.868 0.120
#> SRR1700025 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700026 2 0.4164 0.8115 0.008 0.848 0.144
#> SRR1700027 2 0.1129 0.8681 0.004 0.976 0.020
#> SRR1700028 2 0.2749 0.8532 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700029 3 0.4291 0.7080 0.000 0.180 0.820
#> SRR1700030 2 0.6051 0.6090 0.012 0.696 0.292
#> SRR1700031 3 0.6713 0.3444 0.012 0.416 0.572
#> SRR1700032 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700034 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700035 3 0.6804 0.0267 0.012 0.460 0.528
#> SRR1700033 3 0.0661 0.7776 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700036 2 0.6779 0.2598 0.012 0.544 0.444
#> SRR1700037 2 0.6754 0.3319 0.012 0.556 0.432
#> SRR1700038 3 0.5327 0.6455 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700039 3 0.0829 0.7744 0.012 0.004 0.984
#> SRR1700040 3 0.5810 0.5645 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700041 2 0.5835 0.4760 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700042 3 0.3644 0.7461 0.004 0.124 0.872
#> SRR1700043 2 0.6505 0.1090 0.004 0.528 0.468
#> SRR1700045 3 0.3340 0.7581 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700044 2 0.4978 0.6980 0.004 0.780 0.216
#> SRR1700046 3 0.2356 0.7619 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700047 3 0.0475 0.7762 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700048 3 0.2878 0.7642 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700049 3 0.0424 0.7739 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700050 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700051 3 0.0237 0.7726 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700052 3 0.1860 0.7634 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700053 3 0.3340 0.7572 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700054 3 0.2711 0.7701 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700055 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700056 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700057 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700058 3 0.1289 0.7749 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700059 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700060 3 0.2625 0.7712 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700061 3 0.1289 0.7753 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700062 3 0.4915 0.6238 0.012 0.184 0.804
#> SRR1700063 3 0.1163 0.7735 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700064 3 0.5020 0.6838 0.012 0.192 0.796
#> SRR1700065 3 0.2165 0.7639 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700066 2 0.6598 0.3502 0.008 0.564 0.428
#> SRR1700067 3 0.4575 0.7106 0.004 0.184 0.812
#> SRR1700068 3 0.3695 0.7482 0.012 0.108 0.880
#> SRR1700069 3 0.5268 0.6575 0.012 0.212 0.776
#> SRR1700070 2 0.6104 0.4787 0.004 0.648 0.348
#> SRR1700071 3 0.4750 0.6823 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700072 3 0.0661 0.7738 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700073 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.6379 0.4467 0.008 0.624 0.368
#> SRR1700074 2 0.1031 0.8668 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700076 2 0.5216 0.6408 0.000 0.740 0.260
#> SRR1700077 2 0.4504 0.7208 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700078 3 0.6529 0.3619 0.012 0.368 0.620
#> SRR1700080 3 0.6661 0.2765 0.012 0.400 0.588
#> SRR1700079 2 0.6529 0.4963 0.012 0.620 0.368
#> SRR1700081 3 0.0237 0.7744 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700082 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700083 3 0.3686 0.7320 0.000 0.140 0.860
#> SRR1700084 2 0.5529 0.5781 0.000 0.704 0.296
#> SRR1700085 2 0.5360 0.7334 0.012 0.768 0.220
#> SRR1700086 2 0.6688 0.4039 0.012 0.580 0.408
#> SRR1700087 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700088 2 0.1529 0.8655 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700089 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700091 2 0.1529 0.8656 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700090 2 0.5493 0.7035 0.012 0.756 0.232
#> SRR1700092 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700094 2 0.2200 0.8583 0.004 0.940 0.056
#> SRR1700093 2 0.3031 0.8488 0.012 0.912 0.076
#> SRR1700095 3 0.3293 0.7638 0.012 0.088 0.900
#> SRR1700096 2 0.3989 0.8139 0.012 0.864 0.124
#> SRR1700097 2 0.5493 0.6777 0.012 0.756 0.232
#> SRR1700098 2 0.1525 0.8670 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700099 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700100 2 0.0237 0.8704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700101 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.0848 0.8706 0.008 0.984 0.008
#> SRR1700104 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700103 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700105 2 0.2486 0.8590 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700106 2 0.3918 0.8201 0.012 0.868 0.120
#> SRR1700107 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700108 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700109 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700110 2 0.2550 0.8563 0.012 0.932 0.056
#> SRR1700112 2 0.3682 0.8175 0.008 0.876 0.116
#> SRR1700111 3 0.5502 0.5935 0.008 0.248 0.744
#> SRR1700113 2 0.2446 0.8583 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700114 2 0.0829 0.8706 0.004 0.984 0.012
#> SRR1700115 2 0.1711 0.8664 0.008 0.960 0.032
#> SRR1700116 2 0.4805 0.7740 0.012 0.812 0.176
#> SRR1700117 3 0.4399 0.7249 0.000 0.188 0.812
#> SRR1700119 2 0.4915 0.7675 0.012 0.804 0.184
#> SRR1700118 3 0.3038 0.7589 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700120 2 0.6786 0.2703 0.012 0.540 0.448
#> SRR1700121 3 0.6823 -0.0466 0.012 0.484 0.504
#> SRR1700122 3 0.0424 0.7739 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700123 3 0.2066 0.7712 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700125 2 0.4059 0.8212 0.012 0.860 0.128
#> SRR1700126 3 0.5988 0.5258 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700127 3 0.6825 -0.0860 0.012 0.488 0.500
#> SRR1700124 3 0.4062 0.7278 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700128 3 0.0592 0.7734 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700129 3 0.5406 0.6462 0.012 0.224 0.764
#> SRR1700130 3 0.1964 0.7613 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700132 3 0.2749 0.7697 0.012 0.064 0.924
#> SRR1700131 3 0.6823 -0.0884 0.012 0.484 0.504
#> SRR1700133 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700134 3 0.0237 0.7749 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700135 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700136 3 0.1163 0.7739 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700137 3 0.0237 0.7760 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700138 3 0.0661 0.7758 0.008 0.004 0.988
#> SRR1700140 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.6467 0.4112 0.008 0.604 0.388
#> SRR1700141 3 0.6724 0.1864 0.012 0.420 0.568
#> SRR1700142 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700143 3 0.1031 0.7766 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700144 3 0.4178 0.7283 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700145 3 0.0237 0.7749 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700146 3 0.5580 0.6130 0.008 0.256 0.736
#> SRR1700147 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700149 3 0.1031 0.7742 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700148 3 0.3918 0.7419 0.012 0.120 0.868
#> SRR1700150 3 0.5948 0.4895 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700152 3 0.6577 0.2640 0.008 0.420 0.572
#> SRR1700151 3 0.3459 0.7555 0.012 0.096 0.892
#> SRR1700153 3 0.6082 0.5451 0.012 0.296 0.692
#> SRR1700154 3 0.0592 0.7756 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700155 3 0.3482 0.7547 0.000 0.128 0.872
#> SRR1700156 3 0.0424 0.7739 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700158 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700159 3 0.1015 0.7761 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700157 3 0.1411 0.7711 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700160 3 0.1315 0.7784 0.008 0.020 0.972
#> SRR1700161 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700162 3 0.4575 0.7060 0.012 0.160 0.828
#> SRR1700164 3 0.0237 0.7749 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700163 3 0.0747 0.7753 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700165 3 0.1337 0.7775 0.012 0.016 0.972
#> SRR1700166 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700168 3 0.6825 -0.0347 0.012 0.492 0.496
#> SRR1700167 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700170 3 0.1643 0.7831 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700169 3 0.2066 0.7687 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700171 3 0.0237 0.7740 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700172 2 0.6809 0.2001 0.012 0.524 0.464
#> SRR1700174 2 0.6075 0.5447 0.008 0.676 0.316
#> SRR1700173 2 0.6632 0.4420 0.012 0.596 0.392
#> SRR1700175 3 0.1411 0.7766 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700176 3 0.3989 0.7360 0.012 0.124 0.864
#> SRR1700178 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 3 0.3771 0.7464 0.012 0.112 0.876
#> SRR1700180 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700182 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700187 3 0.4399 0.5410 0.188 0.000 0.812
#> SRR1700185 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700188 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 2 0.6500 0.0358 0.004 0.532 0.464
#> SRR1700190 2 0.1860 0.8472 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700191 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700189 3 0.0237 0.7726 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700193 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700196 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 2 0.3816 0.7578 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700198 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 3 0.6307 0.1708 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700203 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.5058 0.6567 0.000 0.756 0.244
#> SRR1700209 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.2448 0.8379 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700211 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700217 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0592 0.9060 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700218 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.6546 0.4257 0.240 0.044 0.716
#> SRR1700220 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.1860 0.8534 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 2 0.6476 0.1027 0.004 0.548 0.448
#> SRR1700231 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.4750 0.6989 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700235 2 0.0424 0.8705 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700237 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.2772 0.7613 0.004 0.080 0.916
#> SRR1700240 1 0.6180 0.4251 0.584 0.000 0.416
#> SRR1700241 2 0.4353 0.7675 0.008 0.836 0.156
#> SRR1700243 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.6489 0.2819 0.004 0.456 0.540
#> SRR1700246 2 0.4784 0.7147 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.0237 0.7726 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700249 1 0.3412 0.8282 0.876 0.000 0.124
#> SRR1700250 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.6483 0.4675 0.600 0.008 0.392
#> SRR1700255 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.2301 0.8563 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700259 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700260 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700261 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700262 2 0.2446 0.8581 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700263 2 0.2550 0.8562 0.012 0.932 0.056
#> SRR1700264 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.1585 0.8674 0.008 0.964 0.028
#> SRR1700266 2 0.0424 0.8709 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700268 2 0.2339 0.8601 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700270 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0237 0.8709 0.004 0.996 0.000
#> SRR1700271 2 0.0237 0.8711 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700272 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700273 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700277 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700275 2 0.2651 0.8541 0.012 0.928 0.060
#> SRR1700276 2 0.1315 0.8688 0.008 0.972 0.020
#> SRR1700278 2 0.5986 0.5947 0.012 0.704 0.284
#> SRR1700279 2 0.6566 0.4672 0.012 0.612 0.376
#> SRR1700280 2 0.6490 0.4911 0.012 0.628 0.360
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.1832 0.8653 0.008 0.956 0.036
#> SRR1700282 2 0.2063 0.8628 0.008 0.948 0.044
#> SRR1700284 2 0.2680 0.8494 0.008 0.924 0.068
#> SRR1700285 2 0.5775 0.6735 0.012 0.728 0.260
#> SRR1700286 2 0.1525 0.8659 0.004 0.964 0.032
#> SRR1700287 2 0.2446 0.8583 0.012 0.936 0.052
#> SRR1700290 3 0.1015 0.7760 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700289 2 0.5986 0.6393 0.012 0.704 0.284
#> SRR1700288 2 0.0000 0.8712 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.2749 0.8566 0.012 0.924 0.064
#> SRR1700291 2 0.5360 0.6882 0.012 0.768 0.220
#> SRR1700293 2 0.4504 0.7252 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700294 3 0.6126 0.4528 0.004 0.352 0.644
#> SRR1700295 3 0.0000 0.7737 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.6548 0.4849 0.012 0.616 0.372
#> SRR1700296 2 0.6786 0.2742 0.012 0.540 0.448
#> SRR1700298 3 0.6633 0.2049 0.008 0.444 0.548
#> SRR1700299 2 0.6763 0.2784 0.012 0.552 0.436
#> SRR1700300 2 0.6299 0.0820 0.000 0.524 0.476
#> SRR1700302 3 0.6600 0.3125 0.012 0.384 0.604
#> SRR1700301 3 0.6745 0.1560 0.012 0.428 0.560
#> SRR1700303 2 0.6527 0.3705 0.008 0.588 0.404
#> SRR1700304 3 0.5968 0.4818 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700305 2 0.6033 0.5065 0.004 0.660 0.336
#> SRR1700306 3 0.1315 0.7782 0.008 0.020 0.972
#> SRR1700308 2 0.6427 0.5160 0.012 0.640 0.348
#> SRR1700307 3 0.2772 0.7746 0.004 0.080 0.916
#> SRR1700309 3 0.3031 0.7652 0.012 0.076 0.912
#> SRR1700310 2 0.6763 0.3077 0.012 0.552 0.436
#> SRR1700311 3 0.6434 0.3321 0.008 0.380 0.612
#> SRR1700312 2 0.5775 0.6645 0.012 0.728 0.260
#> SRR1700313 3 0.5785 0.5474 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700314 3 0.6082 0.5428 0.012 0.296 0.692
#> SRR1700315 3 0.0661 0.7775 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700316 2 0.5247 0.6915 0.008 0.768 0.224
#> SRR1700317 2 0.0661 0.8709 0.008 0.988 0.004
#> SRR1700318 3 0.0592 0.7734 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700319 3 0.2339 0.7741 0.012 0.048 0.940
#> SRR1700320 2 0.6735 0.3619 0.012 0.564 0.424
#> SRR1700322 2 0.6018 0.5690 0.008 0.684 0.308
#> SRR1700321 2 0.1950 0.8611 0.008 0.952 0.040
#> SRR1700323 2 0.6713 0.3833 0.012 0.572 0.416
#> SRR1700324 2 0.6252 0.5048 0.008 0.648 0.344
#> SRR1700325 2 0.2339 0.8616 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700326 3 0.4195 0.7475 0.012 0.136 0.852
#> SRR1700327 2 0.2116 0.8629 0.012 0.948 0.040
#> SRR1700329 2 0.4912 0.7532 0.008 0.796 0.196
#> SRR1700328 2 0.4968 0.7506 0.012 0.800 0.188
#> SRR1700330 3 0.1163 0.7737 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700331 3 0.0424 0.7739 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700332 2 0.4059 0.8141 0.012 0.860 0.128
#> SRR1700333 2 0.5244 0.6646 0.004 0.756 0.240
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.2216 0.7869 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1699875 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699876 2 0.5478 -0.0521 0.000 0.540 0.016 0.444
#> SRR1699877 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.0592 0.8314 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699881 4 0.4985 0.3768 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1699882 2 0.4866 0.0993 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1699883 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.6651 0.4627 0.000 0.616 0.236 0.148
#> SRR1699888 2 0.3399 0.7609 0.000 0.868 0.092 0.040
#> SRR1699889 4 0.4842 0.6317 0.000 0.048 0.192 0.760
#> SRR1699890 4 0.6202 0.5355 0.000 0.076 0.312 0.612
#> SRR1699887 2 0.2081 0.7980 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1699891 2 0.7782 -0.1362 0.000 0.424 0.264 0.312
#> SRR1699892 2 0.5636 0.4870 0.000 0.648 0.308 0.044
#> SRR1699893 3 0.2760 0.7040 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699894 3 0.5291 0.4392 0.000 0.024 0.652 0.324
#> SRR1699895 4 0.5036 0.5727 0.000 0.024 0.280 0.696
#> SRR1699896 3 0.5039 0.2977 0.000 0.404 0.592 0.004
#> SRR1699897 2 0.3933 0.6858 0.000 0.792 0.200 0.008
#> SRR1699898 3 0.2840 0.7267 0.000 0.056 0.900 0.044
#> SRR1699900 3 0.2216 0.7130 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1699899 4 0.7443 0.5102 0.000 0.312 0.196 0.492
#> SRR1699902 3 0.2522 0.7215 0.000 0.076 0.908 0.016
#> SRR1699901 3 0.2401 0.7131 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1699903 4 0.6101 0.4198 0.000 0.052 0.388 0.560
#> SRR1699904 3 0.1211 0.7528 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699905 3 0.0000 0.7500 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699906 3 0.2773 0.7239 0.000 0.072 0.900 0.028
#> SRR1699907 3 0.1833 0.7496 0.000 0.024 0.944 0.032
#> SRR1699908 3 0.2329 0.7252 0.000 0.072 0.916 0.012
#> SRR1699909 3 0.0000 0.7500 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699910 3 0.1557 0.7533 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699911 3 0.0188 0.7505 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699912 3 0.1211 0.7563 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699913 3 0.2255 0.7289 0.000 0.068 0.920 0.012
#> SRR1699914 3 0.0000 0.7500 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699915 3 0.2530 0.7327 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1699916 3 0.2521 0.7263 0.000 0.064 0.912 0.024
#> SRR1699917 3 0.2489 0.7257 0.000 0.068 0.912 0.020
#> SRR1699918 3 0.2271 0.7238 0.000 0.076 0.916 0.008
#> SRR1699919 3 0.0336 0.7523 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699920 3 0.0817 0.7549 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699921 3 0.1716 0.7552 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699922 3 0.1211 0.7459 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699923 3 0.0000 0.7500 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699924 3 0.1022 0.7483 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 3 0.1474 0.7519 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699927 3 0.2443 0.7308 0.000 0.060 0.916 0.024
#> SRR1699929 3 0.2473 0.7181 0.000 0.080 0.908 0.012
#> SRR1699928 3 0.0779 0.7565 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1699930 3 0.6168 0.1331 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1699931 3 0.3311 0.6476 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1699933 2 0.4767 0.6063 0.000 0.724 0.256 0.020
#> SRR1699932 4 0.6141 0.5497 0.000 0.072 0.312 0.616
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 4 0.4855 0.3482 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1699936 2 0.3266 0.7218 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1699937 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699940 2 0.2081 0.8030 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1699939 2 0.1637 0.8071 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1699941 4 0.4898 0.4838 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1699942 2 0.1557 0.8114 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699943 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699945 4 0.4977 0.3790 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1699946 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699947 2 0.0469 0.8315 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699948 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699949 4 0.4817 0.5235 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1699950 2 0.4193 0.4789 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1699951 2 0.3610 0.6269 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1699952 2 0.0336 0.8336 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699953 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699954 2 0.0921 0.8290 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1699955 2 0.0188 0.8347 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699956 4 0.4560 0.6314 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1699957 2 0.0336 0.8336 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699959 4 0.5874 0.6527 0.000 0.112 0.192 0.696
#> SRR1699958 4 0.4454 0.6073 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1699960 2 0.4356 0.5425 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1699961 2 0.0188 0.8347 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699962 2 0.3024 0.7597 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1699963 2 0.0707 0.8313 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699964 2 0.0592 0.8314 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699965 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699966 2 0.3528 0.6834 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1699967 2 0.0336 0.8336 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699968 4 0.4981 0.3630 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1699969 4 0.4973 0.5834 0.000 0.348 0.008 0.644
#> SRR1699971 2 0.0188 0.8347 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699970 2 0.0592 0.8314 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699972 2 0.4361 0.6633 0.000 0.772 0.208 0.020
#> SRR1699973 2 0.5000 -0.2632 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1699974 2 0.5623 0.5246 0.000 0.660 0.292 0.048
#> SRR1699975 2 0.5750 0.5873 0.000 0.696 0.216 0.088
#> SRR1699976 2 0.0336 0.8339 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699977 3 0.3447 0.6809 0.000 0.128 0.852 0.020
#> SRR1699978 3 0.0000 0.7500 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699979 2 0.5175 0.6819 0.000 0.760 0.120 0.120
#> SRR1699980 4 0.6819 0.6221 0.000 0.208 0.188 0.604
#> SRR1699981 4 0.5018 0.6337 0.000 0.088 0.144 0.768
#> SRR1699982 4 0.7333 0.4732 0.000 0.332 0.172 0.496
#> SRR1699983 4 0.4963 0.6415 0.000 0.284 0.020 0.696
#> SRR1699984 3 0.4898 0.2022 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1699985 2 0.5759 0.6037 0.000 0.708 0.180 0.112
#> SRR1699986 4 0.5604 0.5723 0.000 0.160 0.116 0.724
#> SRR1699988 2 0.2450 0.7992 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1699987 3 0.5742 0.4830 0.000 0.060 0.664 0.276
#> SRR1699989 2 0.5330 0.6588 0.000 0.748 0.132 0.120
#> SRR1699990 2 0.7677 0.0151 0.000 0.456 0.248 0.296
#> SRR1699992 2 0.5109 0.6482 0.000 0.744 0.196 0.060
#> SRR1699991 3 0.2546 0.7117 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1699993 4 0.4364 0.5295 0.000 0.016 0.220 0.764
#> SRR1699994 2 0.5142 0.6432 0.000 0.744 0.064 0.192
#> SRR1699995 4 0.4843 0.1406 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1699996 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699997 4 0.4688 0.6697 0.000 0.128 0.080 0.792
#> SRR1699998 2 0.1059 0.8282 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1699999 3 0.1211 0.7571 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700000 2 0.3610 0.6782 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1700002 2 0.0707 0.8311 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700001 2 0.2773 0.7838 0.000 0.900 0.028 0.072
#> SRR1700003 2 0.0524 0.8335 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700004 4 0.3401 0.6736 0.000 0.152 0.008 0.840
#> SRR1700005 3 0.4661 0.3651 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1700006 2 0.0592 0.8313 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700007 4 0.4624 0.5959 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1700008 4 0.0927 0.6289 0.000 0.008 0.016 0.976
#> SRR1700009 3 0.0804 0.7526 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1700010 2 0.3837 0.6013 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1700011 2 0.2973 0.7199 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1700013 2 0.3172 0.7409 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700012 2 0.1118 0.8262 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700014 4 0.4697 0.5364 0.000 0.008 0.296 0.696
#> SRR1700015 2 0.3610 0.6963 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1700016 3 0.4500 0.6120 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700018 2 0.2814 0.7508 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1700017 4 0.4304 0.6299 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1700019 4 0.4134 0.6543 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1700020 4 0.3718 0.6754 0.000 0.168 0.012 0.820
#> SRR1700021 4 0.0469 0.6257 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700023 4 0.3942 0.6657 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700022 4 0.4482 0.6424 0.000 0.264 0.008 0.728
#> SRR1700024 4 0.2760 0.6747 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1700025 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700026 4 0.6487 0.3935 0.000 0.428 0.072 0.500
#> SRR1700027 2 0.2973 0.7794 0.000 0.884 0.020 0.096
#> SRR1700028 4 0.4193 0.6492 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1700029 3 0.2843 0.7174 0.000 0.088 0.892 0.020
#> SRR1700030 4 0.2408 0.6712 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700031 4 0.6934 0.6187 0.000 0.276 0.152 0.572
#> SRR1700032 2 0.0336 0.8339 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700034 3 0.1302 0.7449 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700035 4 0.3606 0.6468 0.000 0.024 0.132 0.844
#> SRR1700033 3 0.4164 0.6171 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1700036 4 0.6426 0.5977 0.000 0.116 0.256 0.628
#> SRR1700037 4 0.3552 0.6525 0.000 0.024 0.128 0.848
#> SRR1700038 3 0.5328 0.5160 0.000 0.248 0.704 0.048
#> SRR1700039 4 0.1211 0.6241 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700040 3 0.4248 0.5878 0.000 0.220 0.768 0.012
#> SRR1700041 2 0.5313 0.3911 0.000 0.608 0.376 0.016
#> SRR1700042 3 0.2888 0.7040 0.000 0.004 0.872 0.124
#> SRR1700043 3 0.7544 0.0776 0.000 0.340 0.460 0.200
#> SRR1700045 3 0.4127 0.7335 0.000 0.052 0.824 0.124
#> SRR1700044 2 0.5073 0.6370 0.000 0.744 0.200 0.056
#> SRR1700046 3 0.2329 0.7579 0.000 0.012 0.916 0.072
#> SRR1700047 3 0.4624 0.5850 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700048 3 0.1970 0.7347 0.000 0.008 0.932 0.060
#> SRR1700049 4 0.4967 0.0332 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700050 3 0.3569 0.6874 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700051 3 0.3726 0.6761 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1700052 3 0.0336 0.7522 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700053 3 0.6350 0.5540 0.000 0.092 0.612 0.296
#> SRR1700054 3 0.4578 0.6960 0.000 0.052 0.788 0.160
#> SRR1700055 3 0.3356 0.6989 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700056 3 0.0921 0.7571 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700057 3 0.3024 0.7288 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700058 3 0.0592 0.7543 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700059 3 0.3123 0.7090 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700060 3 0.3176 0.7503 0.000 0.036 0.880 0.084
#> SRR1700061 3 0.3791 0.6868 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700062 4 0.2081 0.6095 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700063 3 0.1211 0.7561 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700064 4 0.5228 0.3673 0.000 0.024 0.312 0.664
#> SRR1700065 3 0.3591 0.7086 0.000 0.008 0.824 0.168
#> SRR1700066 4 0.6112 0.5536 0.000 0.196 0.128 0.676
#> SRR1700067 3 0.6491 0.0661 0.000 0.072 0.496 0.432
#> SRR1700068 4 0.6077 -0.1354 0.000 0.044 0.460 0.496
#> SRR1700069 4 0.5256 0.4601 0.000 0.040 0.260 0.700
#> SRR1700070 2 0.7088 0.3545 0.000 0.568 0.204 0.228
#> SRR1700071 3 0.2546 0.7117 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1700072 3 0.1867 0.7534 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700073 3 0.1211 0.7510 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700075 2 0.6859 0.2098 0.000 0.512 0.108 0.380
#> SRR1700074 2 0.3105 0.7398 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR1700076 2 0.5250 0.6307 0.000 0.744 0.176 0.080
#> SRR1700077 2 0.4544 0.6887 0.000 0.788 0.164 0.048
#> SRR1700078 4 0.3448 0.6262 0.000 0.004 0.168 0.828
#> SRR1700080 4 0.4764 0.6203 0.000 0.088 0.124 0.788
#> SRR1700079 4 0.2489 0.6305 0.000 0.020 0.068 0.912
#> SRR1700081 3 0.3569 0.7151 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700082 2 0.1118 0.8269 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700083 3 0.3542 0.7124 0.000 0.028 0.852 0.120
#> SRR1700084 2 0.6695 0.4526 0.000 0.616 0.220 0.164
#> SRR1700085 4 0.3577 0.6787 0.000 0.156 0.012 0.832
#> SRR1700086 4 0.4093 0.6402 0.000 0.072 0.096 0.832
#> SRR1700087 2 0.0469 0.8319 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700088 2 0.4761 0.3175 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1700089 4 0.3942 0.6629 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700091 2 0.4193 0.5832 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1700090 4 0.3444 0.6690 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1700092 4 0.4585 0.5692 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1700094 4 0.4907 0.4074 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1700093 4 0.3975 0.6636 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700095 4 0.4079 0.6244 0.000 0.020 0.180 0.800
#> SRR1700096 4 0.3907 0.6635 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700097 4 0.4387 0.6666 0.000 0.236 0.012 0.752
#> SRR1700098 2 0.4431 0.5170 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1700099 2 0.2704 0.7628 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1700100 2 0.2921 0.7464 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1700101 2 0.2921 0.7464 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1700102 2 0.3123 0.7379 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1700104 4 0.4304 0.6289 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1700103 4 0.3801 0.6667 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1700105 4 0.4830 0.4525 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1700106 4 0.4277 0.6406 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1700107 4 0.4522 0.5939 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1700108 4 0.4040 0.6574 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1700109 4 0.3907 0.6644 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700110 4 0.3942 0.6630 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700112 2 0.6280 0.4229 0.000 0.604 0.080 0.316
#> SRR1700111 4 0.6148 0.5172 0.000 0.084 0.280 0.636
#> SRR1700113 4 0.4817 0.5254 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1700114 2 0.3801 0.6794 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1700115 2 0.4543 0.4612 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1700116 4 0.3681 0.6780 0.000 0.176 0.008 0.816
#> SRR1700117 3 0.3761 0.7085 0.000 0.068 0.852 0.080
#> SRR1700119 4 0.6347 0.6037 0.000 0.276 0.100 0.624
#> SRR1700118 3 0.3356 0.6883 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700120 4 0.1356 0.6472 0.000 0.032 0.008 0.960
#> SRR1700121 4 0.3731 0.6522 0.000 0.036 0.120 0.844
#> SRR1700122 4 0.4713 0.4005 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700123 3 0.1807 0.7383 0.000 0.008 0.940 0.052
#> SRR1700125 4 0.3443 0.6803 0.000 0.136 0.016 0.848
#> SRR1700126 3 0.5661 0.5350 0.000 0.220 0.700 0.080
#> SRR1700127 4 0.4990 0.5924 0.000 0.184 0.060 0.756
#> SRR1700124 3 0.5998 0.6141 0.000 0.108 0.680 0.212
#> SRR1700128 4 0.3356 0.5761 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700129 4 0.3123 0.5951 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700130 3 0.0188 0.7512 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700132 4 0.4372 0.4326 0.000 0.004 0.268 0.728
#> SRR1700131 4 0.1890 0.6270 0.000 0.008 0.056 0.936
#> SRR1700133 3 0.4994 0.2774 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700134 3 0.3356 0.7085 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700135 3 0.2589 0.7408 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700136 3 0.1474 0.7559 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700137 3 0.2530 0.7504 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700138 3 0.4790 0.5249 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700140 3 0.4072 0.6747 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1700139 4 0.7205 0.3383 0.000 0.344 0.152 0.504
#> SRR1700141 4 0.2773 0.6067 0.000 0.004 0.116 0.880
#> SRR1700142 3 0.4331 0.6615 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1700143 3 0.4155 0.6707 0.000 0.004 0.756 0.240
#> SRR1700144 3 0.3758 0.7202 0.000 0.104 0.848 0.048
#> SRR1700145 3 0.3311 0.7111 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1700146 4 0.5432 0.5124 0.000 0.032 0.316 0.652
#> SRR1700147 3 0.3486 0.6908 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700149 3 0.2973 0.7225 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700148 4 0.6023 0.2743 0.000 0.056 0.344 0.600
#> SRR1700150 3 0.7806 0.2364 0.000 0.324 0.412 0.264
#> SRR1700152 4 0.7649 0.2361 0.000 0.312 0.232 0.456
#> SRR1700151 4 0.3123 0.5902 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1700153 4 0.3757 0.6077 0.000 0.020 0.152 0.828
#> SRR1700154 3 0.1474 0.7458 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700155 3 0.5113 0.6793 0.000 0.088 0.760 0.152
#> SRR1700156 3 0.4790 0.5401 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700158 3 0.3123 0.7324 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1700159 4 0.2216 0.6135 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700157 3 0.3356 0.7015 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700160 4 0.4877 0.3542 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1700161 3 0.4713 0.5918 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700162 4 0.2973 0.5970 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700164 3 0.2149 0.7487 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1700163 3 0.1389 0.7545 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700165 4 0.4406 0.4241 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1700166 3 0.2216 0.7434 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1700168 4 0.4617 0.6190 0.000 0.032 0.204 0.764
#> SRR1700167 3 0.4193 0.6512 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1700170 3 0.3647 0.6850 0.000 0.016 0.832 0.152
#> SRR1700169 3 0.4155 0.6933 0.000 0.004 0.756 0.240
#> SRR1700171 3 0.2589 0.7396 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700172 4 0.4070 0.6549 0.000 0.044 0.132 0.824
#> SRR1700174 2 0.7348 0.3468 0.000 0.528 0.240 0.232
#> SRR1700173 4 0.1833 0.6511 0.000 0.032 0.024 0.944
#> SRR1700175 3 0.3355 0.7054 0.000 0.004 0.836 0.160
#> SRR1700176 4 0.0921 0.6258 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700178 2 0.0188 0.8344 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700177 4 0.3311 0.6223 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1700180 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700187 3 0.3626 0.6232 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700192 3 0.6207 0.0901 0.000 0.452 0.496 0.052
#> SRR1700190 2 0.1474 0.8095 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 3 0.0188 0.7504 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700193 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700197 2 0.4746 0.6617 0.000 0.776 0.168 0.056
#> SRR1700198 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700202 3 0.5387 0.2989 0.000 0.400 0.584 0.016
#> SRR1700203 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700208 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700205 2 0.4454 0.5451 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.2011 0.7921 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8869 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700222 3 0.3801 0.5781 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0469 0.8327 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700223 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.1637 0.8069 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 3 0.5158 0.0692 0.000 0.472 0.524 0.004
#> SRR1700231 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.4331 0.5744 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1700235 2 0.0336 0.8334 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700239 3 0.0336 0.7511 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1700240 1 0.4907 0.2918 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1700241 2 0.4482 0.6223 0.000 0.728 0.008 0.264
#> SRR1700243 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700242 3 0.4790 0.3717 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1700246 2 0.3837 0.6512 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700247 3 0.2921 0.7380 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700249 1 0.2814 0.7831 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.4916 0.2842 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700258 4 0.4916 0.4609 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1700259 4 0.3975 0.6615 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1700260 4 0.3907 0.6635 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1700261 4 0.4661 0.5877 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1700262 4 0.4961 0.4363 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1700263 4 0.4992 0.3500 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1700264 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700265 2 0.4697 0.3923 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1700266 2 0.1867 0.8025 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700268 4 0.4843 0.4879 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1700270 2 0.0336 0.8339 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700267 2 0.0817 0.8269 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700271 2 0.1302 0.8202 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700272 4 0.4564 0.5869 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1700273 2 0.0921 0.8267 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1700274 4 0.4624 0.5820 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1700277 2 0.1211 0.8179 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1700275 4 0.4746 0.5555 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1700276 2 0.4382 0.5461 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700278 2 0.6886 0.4245 0.000 0.596 0.200 0.204
#> SRR1700279 4 0.5910 0.6327 0.000 0.088 0.236 0.676
#> SRR1700280 4 0.7001 0.5805 0.000 0.224 0.196 0.580
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8356 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.4804 0.2238 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1700282 4 0.4790 0.4959 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1700284 2 0.4262 0.6579 0.000 0.756 0.008 0.236
#> SRR1700285 4 0.6403 0.6483 0.000 0.232 0.128 0.640
#> SRR1700286 2 0.3172 0.6938 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1700287 4 0.4941 0.4268 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1700290 4 0.3649 0.5746 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1700289 4 0.6112 0.6528 0.000 0.196 0.128 0.676
#> SRR1700288 2 0.0188 0.8348 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700292 4 0.5125 0.4572 0.000 0.388 0.008 0.604
#> SRR1700291 2 0.5624 0.5290 0.000 0.668 0.052 0.280
#> SRR1700293 2 0.5277 0.6485 0.000 0.752 0.116 0.132
#> SRR1700294 3 0.7854 0.1647 0.000 0.296 0.400 0.304
#> SRR1700295 3 0.3444 0.7108 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700297 4 0.5118 0.6672 0.000 0.072 0.176 0.752
#> SRR1700296 4 0.6678 0.5686 0.000 0.208 0.172 0.620
#> SRR1700298 3 0.7877 0.0305 0.000 0.360 0.360 0.280
#> SRR1700299 4 0.7368 0.2081 0.000 0.376 0.164 0.460
#> SRR1700300 2 0.7586 0.0649 0.000 0.460 0.328 0.212
#> SRR1700302 4 0.4677 0.5845 0.000 0.048 0.176 0.776
#> SRR1700301 4 0.3636 0.5830 0.000 0.008 0.172 0.820
#> SRR1700303 2 0.7379 0.0863 0.000 0.468 0.168 0.364
#> SRR1700304 3 0.5807 0.4192 0.000 0.312 0.636 0.052
#> SRR1700305 2 0.6506 0.4395 0.000 0.628 0.132 0.240
#> SRR1700306 4 0.4898 0.0863 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700308 2 0.7544 0.0210 0.000 0.460 0.200 0.340
#> SRR1700307 3 0.3088 0.7453 0.000 0.052 0.888 0.060
#> SRR1700309 3 0.5861 0.1690 0.000 0.032 0.488 0.480
#> SRR1700310 4 0.7290 0.3427 0.000 0.328 0.168 0.504
#> SRR1700311 4 0.6330 0.5113 0.000 0.144 0.200 0.656
#> SRR1700312 4 0.5527 0.4495 0.000 0.356 0.028 0.616
#> SRR1700313 3 0.7576 0.3212 0.000 0.308 0.472 0.220
#> SRR1700314 4 0.3681 0.5741 0.000 0.008 0.176 0.816
#> SRR1700315 3 0.4898 0.4412 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1700316 2 0.4713 0.4834 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1700317 2 0.2773 0.7753 0.000 0.880 0.004 0.116
#> SRR1700318 3 0.4998 -0.0978 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1700319 4 0.3764 0.5297 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700320 4 0.4144 0.6214 0.000 0.068 0.104 0.828
#> SRR1700322 2 0.6688 0.2693 0.000 0.536 0.096 0.368
#> SRR1700321 2 0.4244 0.7056 0.000 0.800 0.032 0.168
#> SRR1700323 4 0.4482 0.6332 0.000 0.128 0.068 0.804
#> SRR1700324 2 0.6766 0.2159 0.000 0.520 0.100 0.380
#> SRR1700325 2 0.5028 0.1273 0.000 0.596 0.004 0.400
#> SRR1700326 4 0.4647 0.5526 0.000 0.008 0.288 0.704
#> SRR1700327 2 0.4817 0.2483 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1700329 2 0.5925 0.1105 0.000 0.512 0.036 0.452
#> SRR1700328 2 0.5582 0.3470 0.000 0.576 0.024 0.400
#> SRR1700330 3 0.2760 0.7282 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700331 3 0.3400 0.6941 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700332 2 0.5533 0.5910 0.000 0.708 0.072 0.220
#> SRR1700333 2 0.6065 0.5507 0.000 0.684 0.140 0.176
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.2127 0.781108 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1699875 2 0.0579 0.818447 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1699876 5 0.4648 0.190158 0.000 0.464 0.012 0.000 0.524
#> SRR1699877 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699879 2 0.0324 0.819035 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1699878 2 0.0451 0.818927 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1699880 2 0.2124 0.801228 0.000 0.916 0.000 0.028 0.056
#> SRR1699881 5 0.4549 0.336361 0.000 0.464 0.000 0.008 0.528
#> SRR1699882 2 0.4235 0.109642 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1699883 2 0.0404 0.818653 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699884 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699885 2 0.0000 0.819007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.6018 0.471916 0.000 0.596 0.260 0.008 0.136
#> SRR1699888 2 0.2946 0.757333 0.000 0.868 0.088 0.000 0.044
#> SRR1699889 5 0.2423 0.596232 0.000 0.024 0.080 0.000 0.896
#> SRR1699890 5 0.4717 0.320772 0.000 0.020 0.396 0.000 0.584
#> SRR1699887 2 0.2971 0.759661 0.000 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR1699891 2 0.6869 -0.109323 0.000 0.404 0.264 0.004 0.328
#> SRR1699892 2 0.5651 0.454919 0.000 0.616 0.288 0.008 0.088
#> SRR1699893 3 0.2605 0.662692 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1699894 3 0.4696 0.315109 0.000 0.024 0.616 0.000 0.360
#> SRR1699895 5 0.4524 0.400312 0.000 0.020 0.336 0.000 0.644
#> SRR1699896 3 0.4147 0.277508 0.000 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR1699897 2 0.4328 0.666559 0.000 0.756 0.200 0.012 0.032
#> SRR1699898 3 0.0865 0.717420 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1699900 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699899 5 0.6496 0.353064 0.000 0.300 0.192 0.004 0.504
#> SRR1699902 3 0.0162 0.714429 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1699901 3 0.0324 0.715141 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1699903 5 0.4287 0.230590 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1699904 3 0.0609 0.715457 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1699905 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699906 3 0.0510 0.715818 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699907 3 0.0510 0.715798 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1699908 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699909 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699910 3 0.1608 0.721488 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1699911 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699912 3 0.2864 0.705239 0.000 0.000 0.852 0.136 0.012
#> SRR1699913 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699914 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699915 3 0.2773 0.691105 0.000 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1699916 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699917 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699918 3 0.0162 0.714429 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1699919 3 0.0771 0.722490 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1699920 3 0.0794 0.722789 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1699921 3 0.2843 0.708020 0.000 0.000 0.848 0.144 0.008
#> SRR1699922 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699923 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699924 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699925 4 0.4262 -0.422986 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1699926 3 0.1557 0.704270 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1699927 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699929 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1699928 3 0.1591 0.726335 0.000 0.004 0.940 0.052 0.004
#> SRR1699930 3 0.4599 0.222183 0.000 0.020 0.624 0.000 0.356
#> SRR1699931 3 0.2389 0.640221 0.000 0.116 0.880 0.000 0.004
#> SRR1699933 2 0.4971 0.600422 0.000 0.696 0.244 0.016 0.044
#> SRR1699932 5 0.4686 0.338964 0.000 0.020 0.384 0.000 0.596
#> SRR1699934 4 0.4262 -0.422986 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1699935 5 0.3715 0.411020 0.000 0.004 0.260 0.000 0.736
#> SRR1699936 2 0.3612 0.632616 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1699937 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699938 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699940 2 0.2674 0.782986 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1699939 2 0.1544 0.799486 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1699941 5 0.4171 0.429843 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1699942 2 0.1671 0.801457 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1699943 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699944 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699945 5 0.4171 0.430555 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1699946 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699947 2 0.0609 0.816882 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699948 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699949 5 0.4114 0.447204 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1699950 2 0.3661 0.482303 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1699951 2 0.3109 0.647880 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1699952 2 0.0794 0.817663 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1699953 2 0.0404 0.818817 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1699954 2 0.1410 0.812294 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1699955 2 0.0671 0.820012 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1699956 5 0.3724 0.573763 0.000 0.204 0.000 0.020 0.776
#> SRR1699957 2 0.1106 0.818287 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1699959 5 0.4469 0.567692 0.000 0.096 0.148 0.000 0.756
#> SRR1699958 5 0.2852 0.583804 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1699960 2 0.4235 0.354546 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1699961 2 0.0451 0.819819 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1699962 2 0.4016 0.664842 0.000 0.716 0.000 0.012 0.272
#> SRR1699963 2 0.2124 0.799815 0.000 0.916 0.000 0.028 0.056
#> SRR1699964 2 0.2139 0.799672 0.000 0.916 0.000 0.032 0.052
#> SRR1699965 2 0.0693 0.818889 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1699966 2 0.3487 0.694031 0.000 0.780 0.000 0.008 0.212
#> SRR1699967 2 0.1082 0.816114 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1699968 5 0.4989 0.337651 0.000 0.416 0.000 0.032 0.552
#> SRR1699969 5 0.4867 0.477740 0.000 0.308 0.004 0.036 0.652
#> SRR1699971 2 0.0510 0.819803 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699970 2 0.1965 0.802435 0.000 0.924 0.000 0.024 0.052
#> SRR1699972 2 0.4543 0.685489 0.000 0.760 0.172 0.016 0.052
#> SRR1699973 5 0.4957 0.302539 0.000 0.444 0.000 0.028 0.528
#> SRR1699974 2 0.6077 0.534345 0.000 0.632 0.240 0.044 0.084
#> SRR1699975 2 0.5813 0.624103 0.000 0.680 0.152 0.036 0.132
#> SRR1699976 2 0.1211 0.814051 0.000 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1699977 3 0.3949 0.618779 0.000 0.100 0.824 0.028 0.048
#> SRR1699978 3 0.0609 0.707835 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1699979 2 0.5160 0.660771 0.000 0.696 0.036 0.036 0.232
#> SRR1699980 5 0.6383 0.455228 0.000 0.204 0.148 0.036 0.612
#> SRR1699981 5 0.6305 0.451535 0.000 0.076 0.088 0.196 0.640
#> SRR1699982 5 0.7207 0.298000 0.000 0.328 0.168 0.044 0.460
#> SRR1699983 5 0.4101 0.566422 0.000 0.184 0.000 0.048 0.768
#> SRR1699984 1 0.2605 0.687412 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.5724 0.637076 0.000 0.688 0.120 0.036 0.156
#> SRR1699986 4 0.6688 -0.006371 0.000 0.160 0.012 0.420 0.408
#> SRR1699988 2 0.3294 0.771479 0.000 0.852 0.008 0.036 0.104
#> SRR1699987 3 0.5789 0.376458 0.000 0.044 0.628 0.048 0.280
#> SRR1699989 2 0.5568 0.663281 0.000 0.708 0.092 0.048 0.152
#> SRR1699990 2 0.7895 0.075548 0.000 0.432 0.152 0.128 0.288
#> SRR1699992 2 0.5434 0.665232 0.000 0.716 0.140 0.036 0.108
#> SRR1699991 3 0.1588 0.703351 0.000 0.008 0.948 0.028 0.016
#> SRR1699993 5 0.5887 0.099893 0.000 0.012 0.068 0.424 0.496
#> SRR1699994 2 0.5270 0.612164 0.000 0.684 0.048 0.028 0.240
#> SRR1699995 4 0.6519 0.166937 0.000 0.000 0.192 0.404 0.404
#> SRR1699996 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699997 5 0.1564 0.601748 0.000 0.024 0.004 0.024 0.948
#> SRR1699998 2 0.2451 0.795372 0.000 0.904 0.004 0.036 0.056
#> SRR1699999 3 0.1502 0.726020 0.000 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1700000 2 0.3805 0.687694 0.000 0.784 0.192 0.008 0.016
#> SRR1700002 2 0.2209 0.797972 0.000 0.912 0.000 0.032 0.056
#> SRR1700001 2 0.2795 0.772366 0.000 0.872 0.028 0.000 0.100
#> SRR1700003 2 0.1569 0.813034 0.000 0.944 0.004 0.008 0.044
#> SRR1700004 5 0.1267 0.600331 0.000 0.024 0.004 0.012 0.960
#> SRR1700005 1 0.2230 0.683238 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0963 0.815853 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1700007 5 0.3707 0.540002 0.000 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1700008 5 0.2783 0.567507 0.000 0.012 0.004 0.116 0.868
#> SRR1700009 1 0.4510 0.553633 0.560 0.000 0.432 0.008 0.000
#> SRR1700010 2 0.3550 0.608150 0.000 0.760 0.000 0.004 0.236
#> SRR1700011 2 0.2690 0.712056 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1700013 2 0.4165 0.598374 0.000 0.672 0.000 0.008 0.320
#> SRR1700012 2 0.1892 0.807701 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1700014 5 0.3328 0.525293 0.000 0.004 0.176 0.008 0.812
#> SRR1700015 2 0.3816 0.602796 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1700016 1 0.5290 0.228361 0.560 0.000 0.044 0.392 0.004
#> SRR1700018 2 0.2891 0.717267 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1700017 5 0.2561 0.598569 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1700019 5 0.2813 0.601620 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1700020 5 0.1412 0.602771 0.000 0.036 0.004 0.008 0.952
#> SRR1700021 5 0.1831 0.576073 0.000 0.000 0.004 0.076 0.920
#> SRR1700023 5 0.1907 0.609755 0.000 0.044 0.000 0.028 0.928
#> SRR1700022 5 0.2284 0.599112 0.000 0.096 0.004 0.004 0.896
#> SRR1700024 5 0.1300 0.601371 0.000 0.028 0.000 0.016 0.956
#> SRR1700025 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700026 5 0.5229 0.378225 0.000 0.404 0.048 0.000 0.548
#> SRR1700027 2 0.2824 0.772876 0.000 0.864 0.020 0.000 0.116
#> SRR1700028 5 0.3109 0.581268 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1700029 3 0.0807 0.716032 0.000 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR1700030 5 0.3955 0.581015 0.000 0.064 0.004 0.128 0.804
#> SRR1700031 5 0.6332 0.432960 0.000 0.208 0.156 0.028 0.608
#> SRR1700032 2 0.0798 0.818955 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1700034 3 0.0162 0.713736 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.4815 0.481859 0.000 0.012 0.056 0.208 0.724
#> SRR1700033 3 0.4564 0.360260 0.000 0.004 0.600 0.008 0.388
#> SRR1700036 5 0.6086 0.418065 0.000 0.092 0.276 0.028 0.604
#> SRR1700037 5 0.4393 0.564495 0.000 0.020 0.100 0.088 0.792
#> SRR1700038 3 0.4315 0.401215 0.000 0.244 0.728 0.012 0.016
#> SRR1700039 5 0.3355 0.523112 0.000 0.000 0.012 0.184 0.804
#> SRR1700040 3 0.4245 0.529438 0.000 0.188 0.768 0.016 0.028
#> SRR1700041 2 0.5475 0.426815 0.000 0.604 0.336 0.028 0.032
#> SRR1700042 3 0.3086 0.640479 0.000 0.000 0.816 0.004 0.180
#> SRR1700043 3 0.8002 -0.132694 0.008 0.332 0.400 0.088 0.172
#> SRR1700045 3 0.4706 0.626491 0.000 0.032 0.724 0.224 0.020
#> SRR1700044 2 0.5278 0.646712 0.000 0.720 0.176 0.048 0.056
#> SRR1700046 3 0.2956 0.713486 0.000 0.004 0.848 0.140 0.008
#> SRR1700047 3 0.6191 0.070253 0.000 0.000 0.436 0.428 0.136
#> SRR1700048 3 0.0162 0.714771 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700049 5 0.6763 -0.170696 0.000 0.000 0.324 0.280 0.396
#> SRR1700050 3 0.4251 0.472241 0.000 0.000 0.624 0.372 0.004
#> SRR1700051 3 0.4779 0.411178 0.004 0.000 0.584 0.396 0.016
#> SRR1700052 3 0.0290 0.718194 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700053 4 0.7341 -0.000977 0.000 0.088 0.396 0.412 0.104
#> SRR1700054 3 0.4518 0.612285 0.000 0.048 0.732 0.216 0.004
#> SRR1700055 3 0.4030 0.512469 0.000 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1700056 3 0.1892 0.726499 0.000 0.000 0.916 0.080 0.004
#> SRR1700057 3 0.4503 0.528539 0.000 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1700058 3 0.1281 0.714768 0.000 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR1700059 3 0.3661 0.595873 0.000 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1700060 3 0.3157 0.689103 0.000 0.016 0.872 0.060 0.052
#> SRR1700061 3 0.4688 0.458793 0.000 0.004 0.616 0.364 0.016
#> SRR1700062 5 0.4288 0.300661 0.000 0.000 0.004 0.384 0.612
#> SRR1700063 3 0.1478 0.726013 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1700064 4 0.7010 0.168076 0.000 0.024 0.176 0.408 0.392
#> SRR1700065 3 0.4419 0.516241 0.000 0.008 0.644 0.344 0.004
#> SRR1700066 4 0.6488 -0.017773 0.000 0.160 0.004 0.428 0.408
#> SRR1700067 3 0.5967 0.099344 0.000 0.072 0.528 0.016 0.384
#> SRR1700068 4 0.7500 0.332600 0.000 0.044 0.280 0.420 0.256
#> SRR1700069 5 0.6569 -0.010185 0.000 0.032 0.096 0.408 0.464
#> SRR1700070 2 0.6612 0.250945 0.000 0.524 0.040 0.336 0.100
#> SRR1700071 3 0.1310 0.705247 0.000 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR1700072 3 0.3047 0.697360 0.004 0.000 0.832 0.160 0.004
#> SRR1700073 3 0.0404 0.716841 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700075 2 0.6315 -0.043593 0.000 0.452 0.008 0.420 0.120
#> SRR1700074 2 0.3736 0.729975 0.000 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1700076 2 0.5285 0.581051 0.000 0.692 0.108 0.192 0.008
#> SRR1700077 2 0.5076 0.709989 0.000 0.756 0.088 0.056 0.100
#> SRR1700078 5 0.4877 0.432821 0.000 0.000 0.072 0.236 0.692
#> SRR1700080 5 0.5637 0.234567 0.000 0.060 0.008 0.392 0.540
#> SRR1700079 5 0.3934 0.495957 0.000 0.016 0.000 0.244 0.740
#> SRR1700081 3 0.5128 0.558789 0.000 0.000 0.656 0.268 0.076
#> SRR1700082 2 0.2735 0.794066 0.000 0.880 0.000 0.036 0.084
#> SRR1700083 3 0.2787 0.681664 0.000 0.004 0.880 0.028 0.088
#> SRR1700084 2 0.6642 0.389202 0.000 0.580 0.184 0.200 0.036
#> SRR1700085 5 0.4364 0.572477 0.000 0.148 0.000 0.088 0.764
#> SRR1700086 5 0.4836 0.375376 0.000 0.036 0.000 0.336 0.628
#> SRR1700087 2 0.0703 0.816245 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700088 5 0.4304 -0.026852 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1700089 5 0.1732 0.608649 0.000 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1700091 2 0.4235 0.351593 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1700090 5 0.0794 0.599333 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1700092 5 0.2806 0.579164 0.000 0.152 0.000 0.004 0.844
#> SRR1700094 5 0.3508 0.488521 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1700093 5 0.1908 0.607777 0.000 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1700095 5 0.1956 0.582776 0.000 0.008 0.076 0.000 0.916
#> SRR1700096 5 0.1671 0.606550 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1700097 5 0.1740 0.608821 0.000 0.056 0.012 0.000 0.932
#> SRR1700098 2 0.4542 0.268803 0.000 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1700099 2 0.3612 0.639476 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1700100 2 0.3790 0.621900 0.000 0.724 0.004 0.000 0.272
#> SRR1700101 2 0.3857 0.581684 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1700102 2 0.4218 0.559770 0.000 0.660 0.000 0.008 0.332
#> SRR1700104 5 0.2230 0.599384 0.000 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1700103 5 0.1197 0.606427 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1700105 5 0.3551 0.518143 0.000 0.220 0.000 0.008 0.772
#> SRR1700106 5 0.2127 0.613278 0.000 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1700107 5 0.2813 0.584244 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1700108 5 0.1908 0.608259 0.000 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1700109 5 0.1671 0.608629 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1700110 5 0.1792 0.609174 0.000 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1700112 2 0.5050 0.242446 0.000 0.496 0.024 0.004 0.476
#> SRR1700111 5 0.4033 0.451006 0.000 0.024 0.212 0.004 0.760
#> SRR1700113 5 0.3774 0.526329 0.000 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1700114 2 0.4464 0.454902 0.000 0.584 0.000 0.008 0.408
#> SRR1700115 2 0.4304 0.153820 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1700116 5 0.1329 0.603320 0.000 0.032 0.008 0.004 0.956
#> SRR1700117 3 0.3009 0.679333 0.000 0.052 0.876 0.008 0.064
#> SRR1700119 5 0.3958 0.553296 0.000 0.176 0.044 0.000 0.780
#> SRR1700118 3 0.3328 0.640299 0.000 0.004 0.812 0.008 0.176
#> SRR1700120 5 0.1828 0.607547 0.000 0.032 0.004 0.028 0.936
#> SRR1700121 5 0.2180 0.600789 0.000 0.024 0.032 0.020 0.924
#> SRR1700122 5 0.5811 0.240361 0.000 0.000 0.316 0.116 0.568
#> SRR1700123 3 0.0000 0.715421 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700125 5 0.1202 0.604411 0.000 0.032 0.004 0.004 0.960
#> SRR1700126 3 0.4709 0.472937 0.000 0.200 0.728 0.004 0.068
#> SRR1700127 5 0.6283 0.414767 0.000 0.180 0.052 0.128 0.640
#> SRR1700124 3 0.6126 0.338294 0.000 0.092 0.540 0.352 0.016
#> SRR1700128 5 0.5167 0.195762 0.000 0.000 0.044 0.404 0.552
#> SRR1700129 5 0.5204 0.218572 0.000 0.000 0.048 0.392 0.560
#> SRR1700130 3 0.0671 0.721507 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1700132 4 0.6620 0.167622 0.000 0.004 0.184 0.412 0.400
#> SRR1700131 5 0.4088 0.440722 0.000 0.008 0.004 0.276 0.712
#> SRR1700133 4 0.6752 0.269147 0.000 0.000 0.316 0.404 0.280
#> SRR1700134 3 0.4570 0.486030 0.000 0.000 0.632 0.348 0.020
#> SRR1700135 3 0.3882 0.639303 0.000 0.000 0.756 0.224 0.020
#> SRR1700136 3 0.2813 0.695025 0.000 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1700137 3 0.3099 0.711758 0.000 0.000 0.848 0.124 0.028
#> SRR1700138 3 0.6346 0.039652 0.000 0.000 0.436 0.404 0.160
#> SRR1700140 3 0.5475 0.464736 0.000 0.000 0.596 0.320 0.084
#> SRR1700139 5 0.7876 0.087377 0.000 0.308 0.108 0.168 0.416
#> SRR1700141 5 0.4537 0.263961 0.000 0.000 0.012 0.396 0.592
#> SRR1700142 3 0.5702 0.427320 0.000 0.000 0.576 0.320 0.104
#> SRR1700143 3 0.4898 0.436135 0.000 0.000 0.592 0.376 0.032
#> SRR1700144 3 0.2267 0.716370 0.000 0.028 0.916 0.048 0.008
#> SRR1700145 3 0.4086 0.582304 0.000 0.000 0.704 0.284 0.012
#> SRR1700146 5 0.6936 0.237515 0.000 0.036 0.200 0.232 0.532
#> SRR1700147 3 0.4415 0.438075 0.000 0.000 0.604 0.388 0.008
#> SRR1700149 3 0.4029 0.550701 0.000 0.000 0.680 0.316 0.004
#> SRR1700148 4 0.7427 0.201107 0.000 0.056 0.168 0.400 0.376
#> SRR1700150 4 0.7129 0.280386 0.000 0.312 0.240 0.428 0.020
#> SRR1700152 4 0.7941 0.284092 0.000 0.304 0.096 0.396 0.204
#> SRR1700151 5 0.4597 0.228930 0.000 0.000 0.012 0.424 0.564
#> SRR1700153 5 0.5238 0.254423 0.000 0.028 0.012 0.396 0.564
#> SRR1700154 3 0.0162 0.716955 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700155 3 0.6051 0.390778 0.000 0.088 0.576 0.316 0.020
#> SRR1700156 3 0.6213 0.101611 0.000 0.000 0.452 0.408 0.140
#> SRR1700158 3 0.4303 0.642142 0.000 0.000 0.752 0.192 0.056
#> SRR1700159 5 0.3521 0.483096 0.000 0.000 0.004 0.232 0.764
#> SRR1700157 3 0.3906 0.576246 0.000 0.000 0.704 0.292 0.004
#> SRR1700160 5 0.6229 0.153033 0.000 0.000 0.320 0.164 0.516
#> SRR1700161 3 0.6179 0.371274 0.000 0.000 0.556 0.216 0.228
#> SRR1700162 5 0.4893 0.226260 0.000 0.000 0.028 0.404 0.568
#> SRR1700164 3 0.2358 0.717040 0.000 0.000 0.888 0.104 0.008
#> SRR1700163 3 0.1197 0.722627 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700165 5 0.5066 0.346505 0.000 0.000 0.240 0.084 0.676
#> SRR1700166 3 0.2054 0.723182 0.000 0.000 0.920 0.028 0.052
#> SRR1700168 5 0.2104 0.595238 0.000 0.024 0.060 0.000 0.916
#> SRR1700167 3 0.5584 0.306166 0.000 0.000 0.532 0.392 0.076
#> SRR1700170 3 0.4065 0.531155 0.000 0.016 0.720 0.000 0.264
#> SRR1700169 3 0.4955 0.622226 0.000 0.004 0.724 0.148 0.124
#> SRR1700171 3 0.3754 0.682305 0.000 0.000 0.816 0.084 0.100
#> SRR1700172 5 0.2665 0.595132 0.000 0.020 0.032 0.048 0.900
#> SRR1700174 2 0.6640 0.341890 0.000 0.500 0.120 0.028 0.352
#> SRR1700173 5 0.1493 0.603378 0.000 0.028 0.000 0.024 0.948
#> SRR1700175 3 0.4104 0.588079 0.000 0.000 0.748 0.032 0.220
#> SRR1700176 5 0.2130 0.571842 0.000 0.000 0.012 0.080 0.908
#> SRR1700178 2 0.0404 0.817966 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700177 5 0.5030 0.449833 0.000 0.000 0.104 0.200 0.696
#> SRR1700180 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700179 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700181 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700183 1 0.3424 0.562201 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1700182 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700184 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700186 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700187 1 0.4609 0.641505 0.744 0.000 0.152 0.104 0.000
#> SRR1700185 1 0.2891 0.590033 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1700188 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700192 3 0.5152 0.134446 0.012 0.392 0.572 0.000 0.024
#> SRR1700190 2 0.1557 0.797368 0.000 0.940 0.052 0.000 0.008
#> SRR1700191 4 0.4262 -0.422986 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1700189 1 0.4262 0.547927 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700195 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700194 1 0.3074 0.582595 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1700196 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700197 2 0.4713 0.628609 0.000 0.740 0.168 0.004 0.088
#> SRR1700198 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700199 2 0.0290 0.819189 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700200 2 0.0693 0.819134 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700201 2 0.0404 0.818817 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700202 3 0.4183 0.263159 0.000 0.324 0.668 0.000 0.008
#> SRR1700203 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700204 2 0.0579 0.818447 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700206 2 0.0693 0.819260 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700207 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700208 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700205 2 0.4575 0.404101 0.000 0.596 0.392 0.004 0.008
#> SRR1700209 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700210 2 0.2414 0.785436 0.000 0.900 0.080 0.008 0.012
#> SRR1700211 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700212 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700213 2 0.0579 0.818684 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700214 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700215 4 0.4283 -0.431310 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1700217 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700216 4 0.4306 -0.451626 0.492 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1700218 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700219 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700222 1 0.3424 0.679218 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700221 2 0.1628 0.811313 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1700223 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700224 2 0.2131 0.800812 0.000 0.920 0.056 0.008 0.016
#> SRR1700226 2 0.0451 0.819077 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700229 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700225 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700227 2 0.0404 0.818653 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700230 1 0.4851 0.562486 0.560 0.012 0.420 0.008 0.000
#> SRR1700231 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700228 2 0.0579 0.818447 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700232 2 0.0579 0.818684 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700233 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700234 2 0.4240 0.548350 0.000 0.684 0.304 0.008 0.004
#> SRR1700235 2 0.0854 0.820145 0.000 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR1700237 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700236 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700238 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700239 1 0.4262 0.547927 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0703 0.651623 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.5221 0.618422 0.000 0.696 0.004 0.172 0.128
#> SRR1700243 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700244 2 0.0290 0.819181 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700242 1 0.4545 0.555629 0.560 0.004 0.432 0.004 0.000
#> SRR1700246 1 0.6494 0.422236 0.560 0.208 0.220 0.008 0.004
#> SRR1700245 2 0.0451 0.818716 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700247 1 0.5520 0.574466 0.560 0.000 0.364 0.076 0.000
#> SRR1700249 1 0.0290 0.641272 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700248 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700251 2 0.0290 0.819063 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700252 2 0.0579 0.818447 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700253 2 0.0290 0.818170 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700256 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700254 1 0.0609 0.649027 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700257 2 0.0693 0.818092 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1700258 5 0.4219 0.411908 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1700259 5 0.1608 0.608457 0.000 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1700260 5 0.1732 0.607903 0.000 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1700261 5 0.3999 0.498090 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1700262 5 0.4256 0.397876 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1700263 5 0.4291 0.304873 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1700264 2 0.0162 0.818678 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700265 2 0.4437 0.227724 0.000 0.532 0.000 0.004 0.464
#> SRR1700266 2 0.1851 0.791601 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1700268 5 0.4196 0.458595 0.000 0.356 0.000 0.004 0.640
#> SRR1700270 2 0.1124 0.819040 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1700267 2 0.1251 0.813331 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1700271 2 0.2329 0.779332 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1700272 5 0.2966 0.577357 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1700273 2 0.1894 0.805495 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1700274 5 0.3336 0.576110 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1700277 2 0.1732 0.799665 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1700275 5 0.3561 0.554519 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1700276 2 0.4430 0.295876 0.000 0.540 0.000 0.004 0.456
#> SRR1700278 2 0.7181 0.347149 0.000 0.544 0.236 0.124 0.096
#> SRR1700279 5 0.6046 0.489323 0.000 0.088 0.208 0.052 0.652
#> SRR1700280 5 0.7335 0.349240 0.000 0.208 0.116 0.136 0.540
#> SRR1700281 2 0.0451 0.818827 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1700283 2 0.4415 0.140466 0.000 0.552 0.000 0.004 0.444
#> SRR1700282 5 0.3534 0.519387 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1700284 2 0.5275 0.623844 0.000 0.684 0.008 0.092 0.216
#> SRR1700285 5 0.5684 0.520039 0.000 0.220 0.080 0.032 0.668
#> SRR1700286 2 0.2930 0.699416 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1700287 5 0.3966 0.484584 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1700290 5 0.5470 0.242463 0.000 0.000 0.072 0.364 0.564
#> SRR1700289 5 0.6762 0.455711 0.000 0.200 0.108 0.092 0.600
#> SRR1700288 2 0.0609 0.820223 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700292 5 0.3395 0.505303 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1700291 2 0.6074 0.554596 0.000 0.656 0.040 0.160 0.144
#> SRR1700293 2 0.5519 0.645138 0.000 0.720 0.116 0.108 0.056
#> SRR1700294 4 0.7918 0.362009 0.000 0.284 0.208 0.412 0.096
#> SRR1700295 3 0.4524 0.499733 0.000 0.000 0.644 0.336 0.020
#> SRR1700297 5 0.5066 0.573783 0.000 0.068 0.064 0.112 0.756
#> SRR1700296 5 0.7758 0.160880 0.000 0.180 0.096 0.276 0.448
#> SRR1700298 4 0.7778 0.324182 0.000 0.332 0.224 0.376 0.068
#> SRR1700299 4 0.7191 0.214237 0.000 0.356 0.028 0.412 0.204
#> SRR1700300 2 0.6671 -0.165866 0.000 0.432 0.144 0.408 0.016
#> SRR1700302 5 0.5920 0.178446 0.000 0.044 0.032 0.400 0.524
#> SRR1700301 5 0.5232 0.264049 0.000 0.008 0.036 0.376 0.580
#> SRR1700303 2 0.7313 -0.132886 0.000 0.428 0.068 0.376 0.128
#> SRR1700304 3 0.6581 0.106925 0.000 0.300 0.524 0.160 0.016
#> SRR1700305 2 0.5472 0.232543 0.000 0.552 0.016 0.396 0.036
#> SRR1700306 4 0.6643 0.223753 0.000 0.000 0.224 0.404 0.372
#> SRR1700308 2 0.8001 0.089734 0.000 0.444 0.160 0.160 0.236
#> SRR1700307 3 0.4001 0.683348 0.000 0.048 0.820 0.104 0.028
#> SRR1700309 4 0.7432 0.263869 0.000 0.032 0.336 0.368 0.264
#> SRR1700310 4 0.7369 0.187752 0.000 0.296 0.032 0.412 0.260
#> SRR1700311 5 0.6998 -0.030070 0.000 0.132 0.040 0.412 0.416
#> SRR1700312 5 0.6271 0.318631 0.000 0.360 0.008 0.124 0.508
#> SRR1700313 4 0.7261 0.253345 0.000 0.288 0.276 0.412 0.024
#> SRR1700314 5 0.4928 0.206315 0.000 0.004 0.020 0.428 0.548
#> SRR1700315 4 0.6646 0.115659 0.000 0.000 0.380 0.396 0.224
#> SRR1700316 2 0.5470 0.553485 0.000 0.636 0.000 0.112 0.252
#> SRR1700317 2 0.3209 0.742887 0.000 0.812 0.000 0.008 0.180
#> SRR1700318 3 0.6350 -0.146303 0.000 0.000 0.420 0.160 0.420
#> SRR1700319 5 0.5288 0.172917 0.000 0.000 0.052 0.404 0.544
#> SRR1700320 5 0.5554 0.199211 0.000 0.052 0.008 0.408 0.532
#> SRR1700322 2 0.6160 0.028605 0.000 0.476 0.004 0.404 0.116
#> SRR1700321 2 0.4183 0.632373 0.000 0.712 0.008 0.008 0.272
#> SRR1700323 5 0.5771 0.337683 0.000 0.112 0.000 0.316 0.572
#> SRR1700324 2 0.6528 0.068263 0.000 0.472 0.008 0.364 0.156
#> SRR1700325 2 0.4586 0.018548 0.000 0.524 0.004 0.004 0.468
#> SRR1700326 5 0.3644 0.528773 0.008 0.004 0.180 0.008 0.800
#> SRR1700327 2 0.4555 0.109693 0.000 0.520 0.000 0.008 0.472
#> SRR1700329 2 0.6068 0.132170 0.000 0.468 0.004 0.104 0.424
#> SRR1700328 2 0.6072 0.393459 0.000 0.560 0.008 0.116 0.316
#> SRR1700330 3 0.3266 0.664898 0.000 0.000 0.796 0.200 0.004
#> SRR1700331 3 0.4890 0.563375 0.000 0.000 0.720 0.140 0.140
#> SRR1700332 2 0.5184 0.632685 0.000 0.704 0.060 0.024 0.212
#> SRR1700333 2 0.6057 0.539142 0.000 0.660 0.104 0.184 0.052
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.5746 0.69378 0.132 0.648 0.000 0.132 0.088 0.000
#> SRR1699875 2 0.0405 0.73313 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699876 5 0.5090 0.26487 0.028 0.392 0.008 0.020 0.552 0.000
#> SRR1699877 2 0.4671 0.72758 0.116 0.740 0.000 0.104 0.040 0.000
#> SRR1699879 2 0.4124 0.74405 0.128 0.776 0.000 0.072 0.024 0.000
#> SRR1699878 2 0.1367 0.74337 0.044 0.944 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.5504 0.68030 0.244 0.620 0.000 0.104 0.032 0.000
#> SRR1699881 5 0.6143 0.28562 0.080 0.388 0.000 0.064 0.468 0.000
#> SRR1699882 5 0.6532 -0.08859 0.092 0.400 0.000 0.092 0.416 0.000
#> SRR1699883 2 0.4196 0.74047 0.084 0.780 0.000 0.100 0.036 0.000
#> SRR1699884 2 0.4827 0.73082 0.096 0.728 0.000 0.128 0.048 0.000
#> SRR1699885 2 0.3744 0.74854 0.076 0.816 0.000 0.072 0.036 0.000
#> SRR1699886 2 0.5216 0.43061 0.000 0.612 0.256 0.004 0.128 0.000
#> SRR1699888 2 0.6097 0.69644 0.116 0.656 0.040 0.120 0.068 0.000
#> SRR1699889 5 0.1720 0.63473 0.000 0.040 0.032 0.000 0.928 0.000
#> SRR1699890 5 0.4254 0.35788 0.000 0.020 0.404 0.000 0.576 0.000
#> SRR1699887 2 0.2700 0.65263 0.004 0.836 0.000 0.004 0.156 0.000
#> SRR1699891 2 0.6071 -0.07323 0.000 0.452 0.252 0.004 0.292 0.000
#> SRR1699892 2 0.5879 0.42376 0.028 0.596 0.276 0.028 0.072 0.000
#> SRR1699893 3 0.2340 0.67490 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1699894 3 0.4362 0.32565 0.000 0.028 0.584 0.000 0.388 0.000
#> SRR1699895 5 0.4251 0.43078 0.000 0.028 0.348 0.000 0.624 0.000
#> SRR1699896 3 0.3547 0.33016 0.000 0.332 0.668 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699897 2 0.3782 0.63726 0.064 0.788 0.140 0.008 0.000 0.000
#> SRR1699898 3 0.1599 0.72934 0.024 0.000 0.940 0.028 0.008 0.000
#> SRR1699900 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699899 5 0.6060 0.41516 0.004 0.356 0.188 0.004 0.448 0.000
#> SRR1699902 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699901 3 0.0146 0.73583 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699903 5 0.4175 0.21615 0.000 0.000 0.464 0.012 0.524 0.000
#> SRR1699904 3 0.0547 0.73443 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1699905 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699906 3 0.0363 0.73619 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699907 3 0.0363 0.73585 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1699908 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699909 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699910 3 0.1610 0.72906 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1699911 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699912 3 0.2697 0.66626 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000 0.000
#> SRR1699913 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699914 3 0.0146 0.73595 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699915 3 0.2631 0.67932 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1699916 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699917 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699918 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699919 3 0.0632 0.73925 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1699920 3 0.1007 0.73938 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1699921 3 0.3151 0.60137 0.000 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1699922 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699923 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699924 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699925 6 0.0000 0.79227 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699926 3 0.1398 0.72353 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR1699927 3 0.0146 0.73629 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1699929 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699928 3 0.1493 0.73719 0.000 0.004 0.936 0.056 0.004 0.000
#> SRR1699930 3 0.4238 0.32053 0.000 0.028 0.628 0.000 0.344 0.000
#> SRR1699931 3 0.2092 0.66989 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699933 2 0.4130 0.57427 0.028 0.740 0.212 0.004 0.016 0.000
#> SRR1699932 5 0.4543 0.39268 0.000 0.040 0.384 0.000 0.576 0.000
#> SRR1699934 6 0.0000 0.79227 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1699935 5 0.3050 0.50728 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1699936 2 0.6590 0.56315 0.100 0.520 0.000 0.128 0.252 0.000
#> SRR1699937 2 0.4638 0.73526 0.080 0.744 0.000 0.128 0.048 0.000
#> SRR1699938 2 0.5280 0.71009 0.132 0.680 0.000 0.144 0.044 0.000
#> SRR1699940 2 0.6109 0.68658 0.148 0.608 0.000 0.144 0.100 0.000
#> SRR1699939 2 0.4221 0.74163 0.068 0.784 0.000 0.088 0.060 0.000
#> SRR1699941 5 0.6563 0.34124 0.164 0.252 0.000 0.072 0.512 0.000
#> SRR1699942 2 0.5912 0.68696 0.144 0.616 0.000 0.176 0.064 0.000
#> SRR1699943 2 0.5408 0.70166 0.132 0.668 0.000 0.152 0.048 0.000
#> SRR1699944 2 0.5280 0.71003 0.132 0.680 0.000 0.144 0.044 0.000
#> SRR1699945 5 0.6350 0.39678 0.104 0.244 0.000 0.100 0.552 0.000
#> SRR1699946 2 0.5340 0.70519 0.132 0.676 0.000 0.144 0.048 0.000
#> SRR1699947 2 0.5521 0.69834 0.132 0.660 0.000 0.152 0.056 0.000
#> SRR1699948 2 0.5340 0.70647 0.132 0.676 0.000 0.144 0.048 0.000
#> SRR1699949 5 0.6992 0.16340 0.132 0.288 0.000 0.132 0.448 0.000
#> SRR1699950 2 0.6790 0.46749 0.132 0.504 0.000 0.128 0.236 0.000
#> SRR1699951 2 0.6486 0.60243 0.136 0.564 0.000 0.136 0.164 0.000
#> SRR1699952 2 0.3190 0.74646 0.056 0.844 0.000 0.088 0.012 0.000
#> SRR1699953 2 0.4612 0.73893 0.128 0.740 0.000 0.100 0.032 0.000
#> SRR1699954 2 0.5675 0.71031 0.160 0.644 0.000 0.136 0.060 0.000
#> SRR1699955 2 0.4308 0.74539 0.088 0.768 0.000 0.112 0.032 0.000
#> SRR1699956 5 0.4521 0.60917 0.176 0.108 0.000 0.004 0.712 0.000
#> SRR1699957 2 0.3461 0.75293 0.152 0.804 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR1699959 5 0.4951 0.60589 0.040 0.112 0.136 0.000 0.712 0.000
#> SRR1699958 5 0.4198 0.59670 0.028 0.096 0.000 0.100 0.776 0.000
#> SRR1699960 2 0.6856 0.32091 0.084 0.404 0.000 0.152 0.360 0.000
#> SRR1699961 2 0.2641 0.74730 0.048 0.876 0.000 0.072 0.004 0.000
#> SRR1699962 2 0.6536 0.58325 0.120 0.544 0.000 0.120 0.216 0.000
#> SRR1699963 2 0.6228 0.63586 0.276 0.524 0.000 0.160 0.040 0.000
#> SRR1699964 2 0.4777 0.70029 0.156 0.720 0.000 0.092 0.032 0.000
#> SRR1699965 2 0.3174 0.75062 0.104 0.836 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1699966 2 0.5381 0.60920 0.100 0.676 0.000 0.064 0.160 0.000
#> SRR1699967 2 0.2741 0.75038 0.092 0.868 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1699968 5 0.6439 0.43538 0.196 0.296 0.000 0.036 0.472 0.000
#> SRR1699969 5 0.6004 0.53420 0.204 0.208 0.000 0.028 0.560 0.000
#> SRR1699971 2 0.3726 0.75577 0.092 0.812 0.000 0.072 0.024 0.000
#> SRR1699970 2 0.5820 0.68116 0.268 0.580 0.000 0.112 0.040 0.000
#> SRR1699972 2 0.6500 0.65815 0.172 0.592 0.104 0.116 0.016 0.000
#> SRR1699973 5 0.6894 0.35668 0.224 0.260 0.000 0.072 0.444 0.000
#> SRR1699974 2 0.5934 0.53878 0.192 0.636 0.108 0.040 0.024 0.000
#> SRR1699975 2 0.4572 0.58634 0.196 0.728 0.020 0.012 0.044 0.000
#> SRR1699976 2 0.5240 0.72357 0.216 0.660 0.000 0.088 0.036 0.000
#> SRR1699977 3 0.4958 0.53620 0.180 0.104 0.692 0.024 0.000 0.000
#> SRR1699978 3 0.0458 0.73167 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699979 2 0.4655 0.58844 0.200 0.716 0.004 0.024 0.056 0.000
#> SRR1699980 5 0.6504 0.51558 0.172 0.240 0.036 0.016 0.536 0.000
#> SRR1699981 5 0.7006 0.49268 0.176 0.096 0.088 0.072 0.568 0.000
#> SRR1699982 5 0.6391 0.39839 0.000 0.360 0.164 0.036 0.440 0.000
#> SRR1699983 5 0.5614 0.55292 0.196 0.176 0.000 0.020 0.608 0.000
#> SRR1699984 1 0.4479 0.43428 0.684 0.000 0.080 0.000 0.000 0.236
#> SRR1699985 2 0.4217 0.58638 0.180 0.744 0.004 0.004 0.068 0.000
#> SRR1699986 4 0.4449 0.67641 0.064 0.052 0.000 0.760 0.124 0.000
#> SRR1699988 2 0.3621 0.62745 0.160 0.788 0.000 0.004 0.048 0.000
#> SRR1699987 3 0.6956 0.32820 0.172 0.044 0.508 0.036 0.240 0.000
#> SRR1699989 2 0.4369 0.59576 0.180 0.744 0.004 0.020 0.052 0.000
#> SRR1699990 2 0.8324 -0.07018 0.196 0.332 0.052 0.236 0.184 0.000
#> SRR1699992 2 0.5145 0.58469 0.200 0.696 0.032 0.044 0.028 0.000
#> SRR1699991 3 0.2558 0.67342 0.156 0.004 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699993 4 0.3883 0.67776 0.012 0.000 0.024 0.744 0.220 0.000
#> SRR1699994 2 0.7088 0.50026 0.256 0.484 0.016 0.088 0.156 0.000
#> SRR1699995 4 0.3971 0.70296 0.000 0.000 0.068 0.748 0.184 0.000
#> SRR1699996 2 0.4707 0.72923 0.116 0.740 0.000 0.096 0.048 0.000
#> SRR1699997 5 0.3694 0.61712 0.156 0.048 0.000 0.008 0.788 0.000
#> SRR1699998 2 0.3512 0.64032 0.196 0.772 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1699999 3 0.1471 0.73788 0.004 0.000 0.932 0.064 0.000 0.000
#> SRR1700000 2 0.3758 0.64000 0.016 0.780 0.180 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700002 2 0.3933 0.65736 0.220 0.740 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1700001 2 0.6263 0.69191 0.156 0.624 0.020 0.108 0.092 0.000
#> SRR1700003 2 0.3155 0.74023 0.064 0.860 0.004 0.044 0.028 0.000
#> SRR1700004 5 0.2016 0.62283 0.024 0.016 0.000 0.040 0.920 0.000
#> SRR1700005 1 0.4476 0.36722 0.676 0.000 0.048 0.008 0.000 0.268
#> SRR1700006 2 0.3317 0.75039 0.012 0.836 0.000 0.072 0.080 0.000
#> SRR1700007 5 0.3547 0.59652 0.004 0.300 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR1700008 5 0.2841 0.56325 0.000 0.012 0.000 0.164 0.824 0.000
#> SRR1700009 1 0.3690 0.59517 0.684 0.000 0.308 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.5442 0.55226 0.064 0.636 0.000 0.060 0.240 0.000
#> SRR1700011 2 0.6366 0.62707 0.128 0.580 0.000 0.152 0.140 0.000
#> SRR1700013 2 0.3565 0.51605 0.004 0.716 0.000 0.004 0.276 0.000
#> SRR1700012 2 0.4299 0.74186 0.052 0.776 0.000 0.100 0.072 0.000
#> SRR1700014 5 0.5024 0.55889 0.120 0.004 0.160 0.020 0.696 0.000
#> SRR1700015 2 0.6816 0.50072 0.132 0.484 0.000 0.116 0.268 0.000
#> SRR1700016 1 0.3690 0.22973 0.684 0.000 0.008 0.308 0.000 0.000
#> SRR1700018 2 0.6265 0.65279 0.136 0.592 0.000 0.152 0.120 0.000
#> SRR1700017 5 0.2923 0.63901 0.052 0.060 0.000 0.020 0.868 0.000
#> SRR1700019 5 0.3107 0.62942 0.052 0.116 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1700020 5 0.1313 0.63644 0.028 0.004 0.000 0.016 0.952 0.000
#> SRR1700021 5 0.1556 0.60345 0.000 0.000 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1700023 5 0.4139 0.59950 0.200 0.024 0.000 0.032 0.744 0.000
#> SRR1700022 5 0.3188 0.62551 0.032 0.040 0.000 0.076 0.852 0.000
#> SRR1700024 5 0.3265 0.63312 0.068 0.008 0.000 0.088 0.836 0.000
#> SRR1700025 2 0.5261 0.70829 0.120 0.684 0.000 0.148 0.048 0.000
#> SRR1700026 5 0.5203 0.40635 0.008 0.380 0.032 0.024 0.556 0.000
#> SRR1700027 2 0.6656 0.65118 0.164 0.568 0.012 0.152 0.104 0.000
#> SRR1700028 5 0.3885 0.62372 0.064 0.180 0.000 0.000 0.756 0.000
#> SRR1700029 3 0.0798 0.73705 0.012 0.004 0.976 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700030 5 0.3631 0.56684 0.008 0.044 0.000 0.156 0.792 0.000
#> SRR1700031 5 0.6757 0.49238 0.228 0.080 0.148 0.012 0.532 0.000
#> SRR1700032 2 0.1977 0.74706 0.032 0.920 0.000 0.040 0.008 0.000
#> SRR1700034 3 0.0458 0.73651 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700035 5 0.5667 0.42887 0.172 0.016 0.008 0.184 0.620 0.000
#> SRR1700033 3 0.4852 0.35242 0.024 0.000 0.564 0.024 0.388 0.000
#> SRR1700036 5 0.7437 0.43384 0.072 0.092 0.220 0.112 0.504 0.000
#> SRR1700037 5 0.4345 0.57753 0.000 0.048 0.096 0.084 0.772 0.000
#> SRR1700038 3 0.5398 0.37714 0.008 0.188 0.676 0.076 0.052 0.000
#> SRR1700039 5 0.4940 0.48827 0.144 0.000 0.012 0.160 0.684 0.000
#> SRR1700040 3 0.4719 0.49267 0.100 0.216 0.680 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700041 2 0.4918 0.45823 0.088 0.632 0.276 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700042 3 0.3158 0.65856 0.020 0.000 0.812 0.004 0.164 0.000
#> SRR1700043 3 0.7252 0.03839 0.016 0.360 0.384 0.084 0.156 0.000
#> SRR1700045 3 0.5087 0.59405 0.148 0.028 0.688 0.136 0.000 0.000
#> SRR1700044 2 0.4789 0.61651 0.120 0.748 0.084 0.020 0.028 0.000
#> SRR1700046 3 0.3663 0.69331 0.072 0.004 0.796 0.128 0.000 0.000
#> SRR1700047 4 0.3786 0.67231 0.004 0.000 0.172 0.772 0.052 0.000
#> SRR1700048 3 0.0000 0.73556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700049 5 0.7487 -0.11433 0.140 0.000 0.292 0.236 0.332 0.000
#> SRR1700050 3 0.3851 0.17835 0.000 0.000 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR1700051 4 0.3468 0.54642 0.004 0.000 0.284 0.712 0.000 0.000
#> SRR1700052 3 0.0260 0.73726 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700053 4 0.5891 0.63690 0.096 0.048 0.176 0.652 0.028 0.000
#> SRR1700054 3 0.4253 0.51796 0.000 0.044 0.672 0.284 0.000 0.000
#> SRR1700055 3 0.3659 0.39525 0.000 0.000 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR1700056 3 0.2003 0.72669 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1700057 4 0.3728 0.47160 0.000 0.000 0.344 0.652 0.004 0.000
#> SRR1700058 3 0.2346 0.69121 0.124 0.000 0.868 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700059 3 0.3515 0.48586 0.000 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1700060 3 0.3733 0.63632 0.176 0.012 0.784 0.016 0.012 0.000
#> SRR1700061 4 0.3789 0.27748 0.000 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1700062 4 0.5142 0.21036 0.084 0.000 0.000 0.488 0.428 0.000
#> SRR1700063 3 0.2119 0.73314 0.036 0.000 0.904 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700064 4 0.3812 0.70815 0.000 0.008 0.072 0.788 0.132 0.000
#> SRR1700065 3 0.4366 0.16653 0.016 0.004 0.540 0.440 0.000 0.000
#> SRR1700066 4 0.4162 0.69386 0.028 0.044 0.000 0.760 0.168 0.000
#> SRR1700067 3 0.5943 0.20773 0.008 0.080 0.528 0.036 0.348 0.000
#> SRR1700068 4 0.4817 0.69857 0.008 0.016 0.152 0.720 0.104 0.000
#> SRR1700069 4 0.6086 0.61410 0.148 0.020 0.032 0.608 0.192 0.000
#> SRR1700070 2 0.5993 0.36057 0.188 0.536 0.004 0.260 0.012 0.000
#> SRR1700071 3 0.2092 0.69203 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700072 3 0.2703 0.68467 0.004 0.000 0.824 0.172 0.000 0.000
#> SRR1700073 3 0.0363 0.73614 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700075 4 0.5488 0.44840 0.144 0.264 0.000 0.584 0.008 0.000
#> SRR1700074 2 0.3913 0.66748 0.096 0.788 0.000 0.104 0.012 0.000
#> SRR1700076 2 0.4689 0.55398 0.004 0.696 0.092 0.204 0.004 0.000
#> SRR1700077 2 0.4194 0.62556 0.180 0.756 0.004 0.036 0.024 0.000
#> SRR1700078 5 0.5302 0.35468 0.044 0.000 0.064 0.256 0.636 0.000
#> SRR1700080 4 0.6227 0.30872 0.148 0.032 0.000 0.468 0.352 0.000
#> SRR1700079 5 0.4621 0.45931 0.052 0.024 0.000 0.224 0.700 0.000
#> SRR1700081 3 0.5598 0.52180 0.144 0.000 0.632 0.188 0.036 0.000
#> SRR1700082 2 0.4881 0.64468 0.256 0.664 0.000 0.052 0.028 0.000
#> SRR1700083 3 0.3558 0.64641 0.160 0.004 0.792 0.000 0.044 0.000
#> SRR1700084 2 0.6153 0.47482 0.056 0.624 0.140 0.160 0.020 0.000
#> SRR1700085 5 0.5545 0.57162 0.156 0.176 0.000 0.032 0.636 0.000
#> SRR1700086 5 0.6390 0.18405 0.176 0.040 0.000 0.296 0.488 0.000
#> SRR1700087 2 0.4999 0.72402 0.116 0.716 0.000 0.112 0.056 0.000
#> SRR1700088 5 0.6503 0.08074 0.072 0.280 0.000 0.140 0.508 0.000
#> SRR1700089 5 0.1176 0.63474 0.000 0.020 0.000 0.024 0.956 0.000
#> SRR1700091 5 0.6393 -0.09054 0.036 0.320 0.000 0.176 0.468 0.000
#> SRR1700090 5 0.1075 0.62942 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700092 5 0.3098 0.64054 0.004 0.120 0.000 0.040 0.836 0.000
#> SRR1700094 5 0.5193 0.48983 0.032 0.144 0.000 0.144 0.680 0.000
#> SRR1700093 5 0.1745 0.63662 0.000 0.020 0.000 0.056 0.924 0.000
#> SRR1700095 5 0.1434 0.61676 0.000 0.000 0.048 0.012 0.940 0.000
#> SRR1700096 5 0.0891 0.63203 0.000 0.008 0.000 0.024 0.968 0.000
#> SRR1700097 5 0.2174 0.64277 0.000 0.036 0.016 0.036 0.912 0.000
#> SRR1700098 5 0.5517 -0.00191 0.012 0.380 0.000 0.096 0.512 0.000
#> SRR1700099 2 0.6167 0.51306 0.052 0.516 0.000 0.112 0.320 0.000
#> SRR1700100 2 0.6559 0.44625 0.052 0.460 0.000 0.168 0.320 0.000
#> SRR1700101 2 0.5896 0.35531 0.016 0.468 0.000 0.132 0.384 0.000
#> SRR1700102 2 0.4943 0.35140 0.008 0.576 0.000 0.056 0.360 0.000
#> SRR1700104 5 0.3908 0.60122 0.020 0.068 0.000 0.120 0.792 0.000
#> SRR1700103 5 0.1408 0.63314 0.000 0.036 0.000 0.020 0.944 0.000
#> SRR1700105 5 0.3394 0.61491 0.000 0.200 0.000 0.024 0.776 0.000
#> SRR1700106 5 0.2653 0.64494 0.000 0.100 0.004 0.028 0.868 0.000
#> SRR1700107 5 0.2633 0.64424 0.000 0.104 0.000 0.032 0.864 0.000
#> SRR1700108 5 0.1398 0.63700 0.000 0.008 0.000 0.052 0.940 0.000
#> SRR1700109 5 0.1245 0.63539 0.000 0.016 0.000 0.032 0.952 0.000
#> SRR1700110 5 0.1649 0.64024 0.000 0.036 0.000 0.032 0.932 0.000
#> SRR1700112 2 0.4335 0.09338 0.000 0.508 0.000 0.020 0.472 0.000
#> SRR1700111 5 0.3680 0.51263 0.000 0.008 0.216 0.020 0.756 0.000
#> SRR1700113 5 0.3668 0.58503 0.004 0.328 0.000 0.000 0.668 0.000
#> SRR1700114 2 0.5768 0.25952 0.036 0.508 0.000 0.080 0.376 0.000
#> SRR1700115 5 0.6302 -0.04439 0.032 0.316 0.000 0.172 0.480 0.000
#> SRR1700116 5 0.1780 0.63058 0.004 0.024 0.004 0.036 0.932 0.000
#> SRR1700117 3 0.3291 0.69198 0.000 0.056 0.848 0.036 0.060 0.000
#> SRR1700119 5 0.3189 0.62883 0.000 0.184 0.000 0.020 0.796 0.000
#> SRR1700118 3 0.3561 0.64839 0.012 0.000 0.796 0.032 0.160 0.000
#> SRR1700120 5 0.2527 0.64179 0.008 0.056 0.004 0.040 0.892 0.000
#> SRR1700121 5 0.2036 0.63509 0.000 0.048 0.008 0.028 0.916 0.000
#> SRR1700122 5 0.5994 -0.13076 0.000 0.000 0.244 0.332 0.424 0.000
#> SRR1700123 3 0.0260 0.73620 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700125 5 0.1765 0.63275 0.000 0.052 0.000 0.024 0.924 0.000
#> SRR1700126 3 0.4834 0.49124 0.000 0.204 0.696 0.028 0.072 0.000
#> SRR1700127 5 0.5870 0.44942 0.000 0.128 0.044 0.236 0.592 0.000
#> SRR1700124 3 0.5073 0.03301 0.000 0.076 0.476 0.448 0.000 0.000
#> SRR1700128 4 0.2631 0.69043 0.000 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1700129 4 0.3088 0.69432 0.000 0.000 0.020 0.808 0.172 0.000
#> SRR1700130 3 0.0865 0.73836 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700132 4 0.3588 0.70720 0.000 0.000 0.060 0.788 0.152 0.000
#> SRR1700131 5 0.4032 0.16239 0.000 0.008 0.000 0.420 0.572 0.000
#> SRR1700133 4 0.3501 0.69774 0.000 0.000 0.116 0.804 0.080 0.000
#> SRR1700134 4 0.3578 0.44797 0.000 0.000 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1700135 4 0.3857 0.10867 0.000 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1700136 3 0.2941 0.65167 0.000 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR1700137 3 0.3490 0.60553 0.000 0.000 0.724 0.268 0.008 0.000
#> SRR1700138 4 0.3522 0.66421 0.000 0.000 0.172 0.784 0.044 0.000
#> SRR1700140 4 0.5604 0.37767 0.072 0.000 0.320 0.568 0.040 0.000
#> SRR1700139 5 0.8223 0.24677 0.088 0.312 0.092 0.184 0.324 0.000
#> SRR1700141 4 0.3854 0.23778 0.000 0.000 0.000 0.536 0.464 0.000
#> SRR1700142 4 0.4012 0.62267 0.000 0.000 0.176 0.748 0.076 0.000
#> SRR1700143 4 0.4731 0.22884 0.020 0.000 0.400 0.560 0.020 0.000
#> SRR1700144 3 0.2545 0.72884 0.028 0.028 0.892 0.052 0.000 0.000
#> SRR1700145 3 0.3872 0.36607 0.000 0.000 0.604 0.392 0.004 0.000
#> SRR1700146 4 0.5796 0.53386 0.004 0.008 0.176 0.560 0.252 0.000
#> SRR1700147 4 0.3747 0.28428 0.000 0.000 0.396 0.604 0.000 0.000
#> SRR1700149 3 0.3854 0.18651 0.000 0.000 0.536 0.464 0.000 0.000
#> SRR1700148 4 0.4457 0.71216 0.000 0.028 0.064 0.740 0.168 0.000
#> SRR1700150 4 0.3413 0.65880 0.000 0.108 0.080 0.812 0.000 0.000
#> SRR1700152 4 0.4859 0.63923 0.000 0.148 0.044 0.720 0.088 0.000
#> SRR1700151 4 0.2838 0.69002 0.004 0.000 0.000 0.808 0.188 0.000
#> SRR1700153 4 0.4554 0.63047 0.124 0.004 0.004 0.724 0.144 0.000
#> SRR1700154 3 0.0291 0.73696 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700155 4 0.4079 0.53688 0.000 0.032 0.288 0.680 0.000 0.000
#> SRR1700156 4 0.2942 0.67439 0.000 0.000 0.132 0.836 0.032 0.000
#> SRR1700158 3 0.4229 0.52105 0.000 0.000 0.668 0.292 0.040 0.000
#> SRR1700159 5 0.3351 0.40454 0.000 0.000 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1700157 3 0.3607 0.43466 0.000 0.000 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR1700160 5 0.6094 -0.16438 0.000 0.000 0.280 0.356 0.364 0.000
#> SRR1700161 3 0.5917 0.00102 0.000 0.000 0.404 0.388 0.208 0.000
#> SRR1700162 4 0.2823 0.68219 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700164 3 0.2597 0.70116 0.000 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1700163 3 0.1267 0.73563 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1700165 5 0.4944 0.39649 0.000 0.000 0.224 0.132 0.644 0.000
#> SRR1700166 3 0.3658 0.64046 0.000 0.000 0.752 0.216 0.032 0.000
#> SRR1700168 5 0.1364 0.63067 0.000 0.004 0.004 0.048 0.944 0.000
#> SRR1700167 4 0.3606 0.57079 0.000 0.000 0.256 0.728 0.016 0.000
#> SRR1700170 3 0.5135 0.44387 0.000 0.008 0.608 0.092 0.292 0.000
#> SRR1700169 3 0.4870 0.57139 0.000 0.004 0.668 0.208 0.120 0.000
#> SRR1700171 3 0.3469 0.68768 0.000 0.000 0.808 0.104 0.088 0.000
#> SRR1700172 5 0.2398 0.60659 0.000 0.020 0.000 0.104 0.876 0.000
#> SRR1700174 2 0.5559 0.22089 0.000 0.520 0.060 0.036 0.384 0.000
#> SRR1700173 5 0.1909 0.63231 0.004 0.052 0.000 0.024 0.920 0.000
#> SRR1700175 3 0.4307 0.56809 0.000 0.000 0.704 0.072 0.224 0.000
#> SRR1700176 5 0.3136 0.50031 0.000 0.000 0.004 0.228 0.768 0.000
#> SRR1700178 2 0.4982 0.71711 0.116 0.716 0.000 0.116 0.052 0.000
#> SRR1700177 5 0.4851 0.34412 0.000 0.000 0.096 0.272 0.632 0.000
#> SRR1700180 2 0.3999 0.74271 0.116 0.788 0.000 0.072 0.024 0.000
#> SRR1700179 2 0.5120 0.71392 0.128 0.700 0.000 0.124 0.048 0.000
#> SRR1700181 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700183 6 0.3531 0.57709 0.328 0.000 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1700182 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700184 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700186 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700187 1 0.5182 0.45419 0.684 0.000 0.076 0.056 0.000 0.184
#> SRR1700185 6 0.3756 0.45921 0.400 0.000 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1700188 2 0.4963 0.71721 0.116 0.716 0.000 0.120 0.048 0.000
#> SRR1700192 3 0.6923 0.05437 0.056 0.332 0.476 0.088 0.048 0.000
#> SRR1700190 2 0.5613 0.71274 0.116 0.692 0.032 0.112 0.048 0.000
#> SRR1700191 6 0.0000 0.79227 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1700189 1 0.3482 0.59290 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700195 2 0.4707 0.72748 0.116 0.740 0.000 0.096 0.048 0.000
#> SRR1700194 6 0.3706 0.50027 0.380 0.000 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1700196 2 0.4302 0.73752 0.116 0.768 0.000 0.084 0.032 0.000
#> SRR1700197 2 0.5509 0.62471 0.056 0.688 0.148 0.016 0.092 0.000
#> SRR1700198 2 0.0405 0.73112 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.1863 0.74822 0.004 0.920 0.000 0.060 0.016 0.000
#> SRR1700200 2 0.1536 0.74473 0.012 0.944 0.000 0.020 0.024 0.000
#> SRR1700201 2 0.4376 0.73573 0.112 0.760 0.000 0.100 0.028 0.000
#> SRR1700202 3 0.4364 0.30991 0.000 0.308 0.656 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700203 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0820 0.73668 0.016 0.972 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.3455 0.74916 0.088 0.828 0.000 0.068 0.016 0.000
#> SRR1700207 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700208 2 0.4882 0.71992 0.116 0.724 0.000 0.112 0.048 0.000
#> SRR1700205 2 0.5213 0.41925 0.000 0.544 0.384 0.048 0.024 0.000
#> SRR1700209 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.1788 0.70454 0.004 0.916 0.076 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700211 2 0.4796 0.72410 0.116 0.732 0.000 0.104 0.048 0.000
#> SRR1700212 2 0.1010 0.74183 0.004 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1700213 2 0.0436 0.73130 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700214 2 0.0436 0.73417 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700215 6 0.0458 0.79389 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1700217 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700216 6 0.1141 0.78555 0.052 0.000 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1700218 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.4641 0.48138 0.684 0.000 0.116 0.000 0.000 0.200
#> SRR1700220 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.1226 0.72248 0.004 0.952 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1700223 2 0.4360 0.73786 0.092 0.768 0.000 0.100 0.040 0.000
#> SRR1700224 2 0.1723 0.72393 0.004 0.932 0.048 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700226 2 0.3565 0.74623 0.112 0.816 0.000 0.056 0.016 0.000
#> SRR1700229 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700225 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700227 2 0.4712 0.72872 0.104 0.740 0.000 0.108 0.048 0.000
#> SRR1700230 1 0.3601 0.59433 0.684 0.000 0.312 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.3831 0.74602 0.092 0.804 0.000 0.080 0.024 0.000
#> SRR1700228 2 0.0405 0.73267 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700232 2 0.1138 0.74086 0.004 0.960 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1700233 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700234 2 0.3360 0.54915 0.000 0.732 0.264 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700235 2 0.1129 0.74010 0.004 0.964 0.008 0.012 0.012 0.000
#> SRR1700237 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700236 2 0.0291 0.72952 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.4539 0.73239 0.112 0.752 0.000 0.096 0.040 0.000
#> SRR1700239 1 0.3482 0.59290 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.3620 0.16094 0.648 0.000 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1700241 2 0.4268 0.58110 0.032 0.748 0.000 0.180 0.040 0.000
#> SRR1700243 2 0.4314 0.73864 0.096 0.772 0.000 0.092 0.040 0.000
#> SRR1700244 2 0.3078 0.74974 0.104 0.848 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR1700242 1 0.3482 0.59290 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.4653 0.47364 0.684 0.120 0.196 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.3108 0.75243 0.052 0.860 0.000 0.052 0.036 0.000
#> SRR1700247 1 0.4428 0.57242 0.684 0.000 0.244 0.072 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.3634 0.15083 0.644 0.000 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1700250 2 0.4923 0.71800 0.116 0.720 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700248 2 0.4562 0.73278 0.100 0.752 0.000 0.104 0.044 0.000
#> SRR1700251 2 0.4117 0.74334 0.060 0.788 0.000 0.104 0.048 0.000
#> SRR1700252 2 0.0984 0.74173 0.012 0.968 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1700253 2 0.4882 0.72023 0.112 0.724 0.000 0.116 0.048 0.000
#> SRR1700256 2 0.0405 0.73116 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.3499 0.22312 0.680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1700255 2 0.0405 0.73098 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0405 0.73098 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1700258 5 0.6577 0.22216 0.120 0.300 0.000 0.088 0.492 0.000
#> SRR1700259 5 0.0777 0.63700 0.004 0.024 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1700260 5 0.0260 0.63334 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1700261 5 0.4166 0.56432 0.028 0.324 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1700262 5 0.4829 0.36416 0.048 0.404 0.000 0.004 0.544 0.000
#> SRR1700263 5 0.4532 0.29596 0.024 0.464 0.000 0.004 0.508 0.000
#> SRR1700264 2 0.4645 0.72898 0.116 0.744 0.000 0.096 0.044 0.000
#> SRR1700265 2 0.5524 0.20712 0.040 0.476 0.000 0.048 0.436 0.000
#> SRR1700266 2 0.5582 0.70468 0.128 0.664 0.000 0.128 0.080 0.000
#> SRR1700268 5 0.4732 0.45922 0.048 0.360 0.000 0.004 0.588 0.000
#> SRR1700270 2 0.1710 0.74478 0.028 0.936 0.000 0.020 0.016 0.000
#> SRR1700267 2 0.1059 0.73165 0.016 0.964 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1700271 2 0.6265 0.66322 0.104 0.584 0.000 0.124 0.188 0.000
#> SRR1700272 5 0.3364 0.61236 0.012 0.088 0.000 0.068 0.832 0.000
#> SRR1700273 2 0.1555 0.71561 0.004 0.932 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1700274 5 0.3419 0.64958 0.012 0.180 0.000 0.016 0.792 0.000
#> SRR1700277 2 0.5351 0.72241 0.128 0.688 0.000 0.100 0.084 0.000
#> SRR1700275 5 0.3023 0.63139 0.000 0.212 0.000 0.004 0.784 0.000
#> SRR1700276 5 0.4663 -0.11066 0.004 0.472 0.000 0.032 0.492 0.000
#> SRR1700278 2 0.6238 0.40412 0.000 0.576 0.208 0.136 0.080 0.000
#> SRR1700279 5 0.5550 0.52300 0.000 0.104 0.200 0.052 0.644 0.000
#> SRR1700280 5 0.6587 0.44671 0.000 0.232 0.096 0.144 0.528 0.000
#> SRR1700281 2 0.2315 0.75020 0.084 0.892 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700283 2 0.5105 0.08481 0.068 0.500 0.000 0.004 0.428 0.000
#> SRR1700282 5 0.3411 0.61665 0.004 0.232 0.000 0.008 0.756 0.000
#> SRR1700284 2 0.4815 0.57307 0.080 0.736 0.004 0.048 0.132 0.000
#> SRR1700285 5 0.5739 0.57517 0.028 0.256 0.068 0.028 0.620 0.000
#> SRR1700286 2 0.5861 0.62930 0.132 0.624 0.000 0.068 0.176 0.000
#> SRR1700287 5 0.3636 0.56567 0.000 0.320 0.000 0.004 0.676 0.000
#> SRR1700290 4 0.4621 0.52885 0.000 0.000 0.056 0.612 0.332 0.000
#> SRR1700289 5 0.7562 0.36268 0.052 0.200 0.080 0.200 0.468 0.000
#> SRR1700288 2 0.1262 0.74306 0.020 0.956 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700292 5 0.3103 0.61576 0.000 0.208 0.000 0.008 0.784 0.000
#> SRR1700291 2 0.4902 0.53071 0.004 0.708 0.020 0.160 0.108 0.000
#> SRR1700293 2 0.4311 0.61678 0.004 0.780 0.088 0.088 0.040 0.000
#> SRR1700294 4 0.3836 0.67520 0.000 0.108 0.056 0.804 0.032 0.000
#> SRR1700295 4 0.3499 0.51291 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR1700297 5 0.4496 0.59187 0.000 0.096 0.040 0.108 0.756 0.000
#> SRR1700296 4 0.6607 0.29066 0.000 0.128 0.076 0.456 0.340 0.000
#> SRR1700298 4 0.5796 0.52898 0.000 0.232 0.144 0.592 0.032 0.000
#> SRR1700299 4 0.3782 0.66044 0.000 0.140 0.004 0.784 0.072 0.000
#> SRR1700300 4 0.3551 0.60752 0.000 0.192 0.036 0.772 0.000 0.000
#> SRR1700302 4 0.3827 0.63630 0.000 0.020 0.004 0.720 0.256 0.000
#> SRR1700301 4 0.4326 0.16266 0.000 0.008 0.008 0.492 0.492 0.000
#> SRR1700303 4 0.4557 0.58992 0.000 0.212 0.048 0.712 0.028 0.000
#> SRR1700304 3 0.6043 0.14782 0.000 0.240 0.488 0.264 0.008 0.000
#> SRR1700305 4 0.3782 0.31010 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1700306 4 0.3825 0.70853 0.000 0.000 0.072 0.768 0.160 0.000
#> SRR1700308 2 0.7479 0.09322 0.020 0.460 0.136 0.200 0.184 0.000
#> SRR1700307 3 0.4254 0.43382 0.000 0.028 0.656 0.312 0.004 0.000
#> SRR1700309 4 0.4597 0.69573 0.000 0.004 0.156 0.708 0.132 0.000
#> SRR1700310 4 0.4041 0.66495 0.000 0.136 0.004 0.764 0.096 0.000
#> SRR1700311 4 0.3445 0.69784 0.000 0.048 0.000 0.796 0.156 0.000
#> SRR1700312 5 0.6305 0.32244 0.048 0.404 0.008 0.092 0.448 0.000
#> SRR1700313 4 0.3834 0.64348 0.000 0.144 0.084 0.772 0.000 0.000
#> SRR1700314 4 0.2823 0.68079 0.000 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1700315 4 0.4154 0.68886 0.000 0.000 0.164 0.740 0.096 0.000
#> SRR1700316 2 0.4831 0.49695 0.008 0.680 0.000 0.108 0.204 0.000
#> SRR1700317 2 0.2838 0.66637 0.028 0.852 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1700318 4 0.6107 0.31207 0.000 0.000 0.332 0.372 0.296 0.000
#> SRR1700319 4 0.3168 0.69456 0.000 0.000 0.016 0.792 0.192 0.000
#> SRR1700320 4 0.3514 0.66633 0.000 0.020 0.000 0.752 0.228 0.000
#> SRR1700322 4 0.3606 0.54627 0.000 0.256 0.000 0.728 0.016 0.000
#> SRR1700321 2 0.3602 0.55370 0.004 0.744 0.004 0.008 0.240 0.000
#> SRR1700323 5 0.5902 0.07510 0.024 0.112 0.000 0.400 0.464 0.000
#> SRR1700324 4 0.5025 0.14854 0.000 0.444 0.004 0.492 0.060 0.000
#> SRR1700325 2 0.5036 -0.01651 0.012 0.484 0.004 0.036 0.464 0.000
#> SRR1700326 5 0.3325 0.59989 0.028 0.004 0.120 0.016 0.832 0.000
#> SRR1700327 2 0.4461 -0.05997 0.020 0.512 0.000 0.004 0.464 0.000
#> SRR1700329 2 0.6118 0.06549 0.036 0.500 0.004 0.108 0.352 0.000
#> SRR1700328 2 0.5030 0.31653 0.000 0.588 0.000 0.096 0.316 0.000
#> SRR1700330 3 0.3126 0.60952 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000 0.000
#> SRR1700331 3 0.4876 0.20059 0.000 0.000 0.564 0.368 0.068 0.000
#> SRR1700332 2 0.5120 0.55377 0.008 0.684 0.056 0.040 0.212 0.000
#> SRR1700333 2 0.4467 0.54844 0.000 0.720 0.056 0.204 0.020 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.989 0.995 0.1510 0.851 0.851
#> 3 3 0.405 0.728 0.862 2.5512 0.570 0.497
#> 4 4 0.347 0.499 0.722 0.1622 0.834 0.656
#> 5 5 0.433 0.437 0.672 0.1187 0.844 0.629
#> 6 6 0.519 0.639 0.743 0.0971 0.780 0.412
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699875 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699876 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699877 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699879 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699880 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699881 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699882 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699883 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699884 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699886 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699888 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699889 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699890 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699887 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699891 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699892 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699893 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699894 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699895 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699896 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699897 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699898 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699900 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699899 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699902 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699901 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699904 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699905 2 0.0376 0.993 0.004 0.996
#> SRR1699906 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699908 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699909 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699912 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699915 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699922 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699923 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699924 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699928 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699930 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699931 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699933 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699932 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699936 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699938 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699940 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699939 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699941 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699942 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699943 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699944 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699945 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699946 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699947 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699948 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699949 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699950 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699951 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699952 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699953 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699954 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699955 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699956 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699957 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699959 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699958 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699960 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699961 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699962 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699964 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699965 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699966 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699967 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699971 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699970 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699972 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699973 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699978 1 0.1414 0.965 0.980 0.020
#> SRR1699979 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699983 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699984 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1699985 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699987 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699993 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699994 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699995 1 0.0938 0.970 0.988 0.012
#> SRR1699996 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699997 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1699999 1 0.0672 0.973 0.992 0.008
#> SRR1700000 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700002 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700003 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700006 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700007 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700008 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700011 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700013 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700012 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700014 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700015 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700016 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700018 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700017 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700019 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700020 1 0.4815 0.887 0.896 0.104
#> SRR1700021 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700023 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700024 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700025 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700026 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700027 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700028 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700029 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700034 1 0.0672 0.973 0.992 0.008
#> SRR1700035 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700038 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700039 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700040 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700041 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700042 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700043 2 0.5946 0.827 0.144 0.856
#> SRR1700045 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700044 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700047 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700048 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700049 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700050 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700051 1 0.9754 0.327 0.592 0.408
#> SRR1700052 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700053 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700055 1 0.0672 0.973 0.992 0.008
#> SRR1700056 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700057 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700058 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700059 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700060 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700061 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700062 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700063 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700064 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700065 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700066 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700069 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700072 2 0.9552 0.379 0.376 0.624
#> SRR1700073 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700074 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700076 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700078 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700081 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700082 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700083 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700084 2 0.6148 0.816 0.152 0.848
#> SRR1700085 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700087 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700088 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700089 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700091 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700090 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700092 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700094 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700093 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700095 2 0.6531 0.793 0.168 0.832
#> SRR1700096 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700097 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700098 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700099 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700100 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700101 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700102 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700104 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700103 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700105 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700106 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700108 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700112 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700114 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700116 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700119 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700127 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700124 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700128 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700133 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700136 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700137 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700143 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700144 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700145 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700149 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700148 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700153 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700154 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700160 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700163 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700165 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700166 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700170 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700171 1 0.0376 0.974 0.996 0.004
#> SRR1700172 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700178 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700180 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700186 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700192 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.1414 0.964 0.980 0.020
#> SRR1700191 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700195 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700198 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700199 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700200 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700201 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700202 1 0.3114 0.935 0.944 0.056
#> SRR1700203 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700208 1 0.5178 0.873 0.884 0.116
#> SRR1700205 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700209 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700210 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700211 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700212 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700213 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700214 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700221 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700223 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700229 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700225 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700227 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700231 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700228 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700232 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700233 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700234 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700235 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700237 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700236 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700238 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700243 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700245 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700252 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700253 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.976 1.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700264 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700265 2 0.9896 0.187 0.440 0.560
#> SRR1700266 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700268 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700270 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700277 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700275 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700276 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700278 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700279 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700280 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700281 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700283 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700282 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700286 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700287 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700290 2 0.0376 0.993 0.004 0.996
#> SRR1700289 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700288 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700292 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700291 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700294 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700296 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700298 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700299 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700304 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700305 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700318 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700319 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700325 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700326 1 0.4562 0.895 0.904 0.096
#> SRR1700327 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700328 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700330 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700331 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700332 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1700333 2 0.0000 0.997 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699875 3 0.3752 0.7686 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699876 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699877 2 0.0237 0.8814 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699879 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699878 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699880 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699881 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699882 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.0237 0.8836 0.000 0.996 0.004
#> SRR1699884 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699885 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699886 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699888 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699889 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699890 2 0.0892 0.8826 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699887 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699891 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699892 2 0.6299 -0.2369 0.000 0.524 0.476
#> SRR1699893 2 0.5098 0.5941 0.000 0.752 0.248
#> SRR1699894 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699895 2 0.2066 0.8608 0.000 0.940 0.060
#> SRR1699896 2 0.3116 0.8157 0.000 0.892 0.108
#> SRR1699897 2 0.6302 -0.2557 0.000 0.520 0.480
#> SRR1699898 3 0.1163 0.7588 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699900 2 0.8649 0.0641 0.112 0.528 0.360
#> SRR1699899 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699902 3 0.6369 0.6320 0.016 0.316 0.668
#> SRR1699901 3 0.5678 0.6238 0.000 0.316 0.684
#> SRR1699903 2 0.3340 0.8060 0.000 0.880 0.120
#> SRR1699904 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699905 3 0.9712 0.3106 0.232 0.332 0.436
#> SRR1699906 2 0.2165 0.8618 0.000 0.936 0.064
#> SRR1699907 2 0.0892 0.8809 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699908 2 0.0892 0.8816 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699909 2 0.5254 0.6530 0.000 0.736 0.264
#> SRR1699910 3 0.6244 0.3535 0.000 0.440 0.560
#> SRR1699911 2 0.1411 0.8768 0.000 0.964 0.036
#> SRR1699912 2 0.1964 0.8573 0.000 0.944 0.056
#> SRR1699913 2 0.1031 0.8783 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699914 3 0.5706 0.6060 0.000 0.320 0.680
#> SRR1699915 2 0.4605 0.7365 0.000 0.796 0.204
#> SRR1699916 2 0.1031 0.8783 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699917 3 0.5706 0.6643 0.000 0.320 0.680
#> SRR1699918 3 0.5968 0.5693 0.000 0.364 0.636
#> SRR1699919 2 0.5529 0.5964 0.000 0.704 0.296
#> SRR1699920 3 0.6008 0.5141 0.000 0.372 0.628
#> SRR1699921 2 0.6140 0.2798 0.000 0.596 0.404
#> SRR1699922 2 0.0592 0.8822 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699923 3 0.5858 0.7103 0.020 0.240 0.740
#> SRR1699924 3 0.5216 0.6892 0.000 0.260 0.740
#> SRR1699925 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.2959 0.8324 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699927 2 0.3482 0.8134 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699929 2 0.5859 0.3429 0.000 0.656 0.344
#> SRR1699928 2 0.3482 0.8109 0.000 0.872 0.128
#> SRR1699930 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699931 2 0.5968 0.2758 0.000 0.636 0.364
#> SRR1699933 3 0.6267 0.4363 0.000 0.452 0.548
#> SRR1699932 2 0.0592 0.8822 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699934 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.4452 0.7041 0.000 0.808 0.192
#> SRR1699936 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699937 3 0.3752 0.7686 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699938 2 0.5397 0.5077 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699940 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699939 3 0.5785 0.6399 0.000 0.332 0.668
#> SRR1699941 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699942 3 0.3686 0.7693 0.000 0.140 0.860
#> SRR1699943 3 0.3879 0.7673 0.000 0.152 0.848
#> SRR1699944 3 0.3816 0.7683 0.000 0.148 0.852
#> SRR1699945 3 0.7228 0.5770 0.188 0.104 0.708
#> SRR1699946 3 0.3752 0.7686 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699947 3 0.3752 0.7686 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699948 2 0.4235 0.6988 0.000 0.824 0.176
#> SRR1699949 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699950 2 0.1289 0.8694 0.000 0.968 0.032
#> SRR1699951 3 0.3879 0.7686 0.000 0.152 0.848
#> SRR1699952 3 0.3816 0.7683 0.000 0.148 0.852
#> SRR1699953 2 0.3686 0.7568 0.000 0.860 0.140
#> SRR1699954 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699955 2 0.2796 0.8267 0.000 0.908 0.092
#> SRR1699956 3 0.2866 0.7628 0.008 0.076 0.916
#> SRR1699957 3 0.4178 0.7690 0.000 0.172 0.828
#> SRR1699959 3 0.4033 0.7652 0.008 0.136 0.856
#> SRR1699958 2 0.6062 0.1656 0.000 0.616 0.384
#> SRR1699960 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699961 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699962 2 0.5706 0.4390 0.000 0.680 0.320
#> SRR1699963 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699964 3 0.3879 0.7683 0.000 0.152 0.848
#> SRR1699965 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699966 3 0.4452 0.7685 0.000 0.192 0.808
#> SRR1699967 3 0.4842 0.7561 0.000 0.224 0.776
#> SRR1699968 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699969 3 0.3340 0.7740 0.000 0.120 0.880
#> SRR1699971 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699970 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699972 3 0.3686 0.7709 0.000 0.140 0.860
#> SRR1699973 3 0.3686 0.7699 0.000 0.140 0.860
#> SRR1699974 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699975 3 0.4235 0.7716 0.000 0.176 0.824
#> SRR1699976 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699977 3 0.3038 0.7814 0.000 0.104 0.896
#> SRR1699978 1 0.6252 0.4854 0.556 0.000 0.444
#> SRR1699979 3 0.3551 0.7705 0.000 0.132 0.868
#> SRR1699980 3 0.3412 0.7726 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699981 3 0.1163 0.7587 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699982 2 0.0592 0.8831 0.000 0.988 0.012
#> SRR1699983 3 0.3482 0.7786 0.000 0.128 0.872
#> SRR1699984 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1699985 3 0.5529 0.6847 0.000 0.296 0.704
#> SRR1699986 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699988 3 0.5178 0.7366 0.000 0.256 0.744
#> SRR1699987 3 0.2066 0.7694 0.000 0.060 0.940
#> SRR1699989 2 0.6154 0.1045 0.000 0.592 0.408
#> SRR1699990 3 0.3619 0.7822 0.000 0.136 0.864
#> SRR1699992 3 0.3482 0.7712 0.000 0.128 0.872
#> SRR1699991 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1699993 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1699994 3 0.1163 0.7566 0.000 0.028 0.972
#> SRR1699995 1 0.6302 0.3999 0.520 0.000 0.480
#> SRR1699996 3 0.6140 0.5479 0.000 0.404 0.596
#> SRR1699997 3 0.3192 0.7821 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699998 3 0.3752 0.7704 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699999 1 0.6095 0.5853 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700000 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700002 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700001 3 0.3551 0.7701 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700003 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700004 3 0.6235 0.4650 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700005 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5948 0.6215 0.000 0.360 0.640
#> SRR1700007 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700008 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700009 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700011 2 0.4452 0.7029 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700013 3 0.3879 0.7724 0.000 0.152 0.848
#> SRR1700012 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700014 3 0.6062 0.5594 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700015 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700016 1 0.0592 0.8834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700018 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700017 3 0.3551 0.7676 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700019 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700020 3 0.6148 0.1535 0.356 0.004 0.640
#> SRR1700021 2 0.0747 0.8826 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700023 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700022 3 0.3551 0.7704 0.000 0.132 0.868
#> SRR1700024 3 0.2356 0.7709 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700025 3 0.4346 0.7707 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700026 3 0.6111 0.5513 0.000 0.396 0.604
#> SRR1700027 3 0.3619 0.7697 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700028 3 0.5058 0.7430 0.000 0.244 0.756
#> SRR1700029 3 0.1529 0.7608 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700030 2 0.5678 0.4339 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700031 3 0.0983 0.7481 0.004 0.016 0.980
#> SRR1700032 3 0.3816 0.7703 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700034 1 0.6095 0.5853 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700035 2 0.6274 -0.0772 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700033 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700036 3 0.6215 0.4659 0.000 0.428 0.572
#> SRR1700037 2 0.1411 0.8747 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700038 3 0.6252 0.4246 0.000 0.444 0.556
#> SRR1700039 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700040 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700041 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700042 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700043 3 0.5092 0.5796 0.176 0.020 0.804
#> SRR1700045 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700044 3 0.4504 0.7649 0.000 0.196 0.804
#> SRR1700046 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700047 3 0.2448 0.7689 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700048 3 0.5529 0.6562 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700049 3 0.0592 0.7457 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700050 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700051 3 0.5497 0.3349 0.292 0.000 0.708
#> SRR1700052 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700053 3 0.2625 0.7708 0.000 0.084 0.916
#> SRR1700054 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700055 1 0.6095 0.5853 0.608 0.000 0.392
#> SRR1700056 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700057 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700058 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700059 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700060 3 0.0592 0.7457 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700061 3 0.1529 0.7631 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700062 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700063 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700064 3 0.1163 0.7586 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700065 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700066 3 0.0747 0.7500 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700067 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700068 3 0.1163 0.7586 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700069 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700070 3 0.1643 0.7653 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700071 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700072 3 0.5254 0.4012 0.264 0.000 0.736
#> SRR1700073 2 0.6079 0.3459 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700075 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700074 3 0.1411 0.7606 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700076 3 0.1163 0.7587 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700077 3 0.0892 0.7534 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700078 3 0.1031 0.7563 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700080 3 0.1289 0.7606 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700079 3 0.0592 0.7457 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700081 3 0.0592 0.7457 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700082 3 0.2448 0.7695 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700083 3 0.0592 0.7457 0.000 0.012 0.988
#> SRR1700084 3 0.1015 0.7433 0.008 0.012 0.980
#> SRR1700085 3 0.6309 0.2729 0.000 0.500 0.500
#> SRR1700086 3 0.1289 0.7605 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700087 3 0.6168 0.5333 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700088 3 0.5706 0.6731 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700089 3 0.6140 0.5498 0.000 0.404 0.596
#> SRR1700091 3 0.6291 0.4117 0.000 0.468 0.532
#> SRR1700090 3 0.6244 0.4577 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700092 2 0.5859 0.3054 0.000 0.656 0.344
#> SRR1700094 3 0.6267 0.4467 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700093 2 0.1643 0.8697 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700095 3 0.9888 0.2534 0.264 0.348 0.388
#> SRR1700096 3 0.6215 0.4992 0.000 0.428 0.572
#> SRR1700097 3 0.1643 0.7581 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700098 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700099 2 0.1643 0.8647 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700100 2 0.6215 -0.0245 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700101 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700102 2 0.2537 0.8359 0.000 0.920 0.080
#> SRR1700104 3 0.5138 0.7407 0.000 0.252 0.748
#> SRR1700103 3 0.5560 0.6941 0.000 0.300 0.700
#> SRR1700105 2 0.4504 0.6973 0.000 0.804 0.196
#> SRR1700106 2 0.5016 0.6152 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700107 3 0.6305 0.3457 0.000 0.484 0.516
#> SRR1700108 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700109 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700110 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700112 2 0.0592 0.8823 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700111 3 0.6168 0.5125 0.000 0.412 0.588
#> SRR1700113 2 0.1860 0.8656 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700114 2 0.6244 -0.0752 0.000 0.560 0.440
#> SRR1700115 2 0.1289 0.8742 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700116 3 0.6095 0.5484 0.000 0.392 0.608
#> SRR1700117 3 0.5431 0.6614 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700119 3 0.6302 0.3509 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700118 3 0.5397 0.6614 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700120 3 0.1289 0.7609 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700121 2 0.2625 0.8389 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700122 2 0.3752 0.7884 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700123 3 0.5397 0.6576 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700125 2 0.1643 0.8666 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700126 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700127 3 0.4654 0.7309 0.000 0.208 0.792
#> SRR1700124 3 0.4842 0.7183 0.000 0.224 0.776
#> SRR1700128 3 0.4702 0.7278 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700129 2 0.3816 0.7852 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700130 3 0.6225 0.3432 0.000 0.432 0.568
#> SRR1700132 3 0.1411 0.7622 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700131 3 0.1643 0.7641 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700133 3 0.6286 0.2434 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700134 2 0.4002 0.7768 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700135 3 0.5497 0.6413 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700136 3 0.1964 0.7675 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700137 3 0.5785 0.5815 0.000 0.332 0.668
#> SRR1700138 3 0.5591 0.6257 0.000 0.304 0.696
#> SRR1700140 3 0.5810 0.5757 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700139 3 0.4931 0.7132 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700141 2 0.5016 0.6917 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700142 3 0.0892 0.7536 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700143 3 0.1289 0.7605 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700144 3 0.1753 0.7658 0.000 0.048 0.952
#> SRR1700145 3 0.5706 0.6095 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700146 2 0.5621 0.5725 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700147 3 0.2711 0.7705 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700149 3 0.2448 0.7683 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700148 3 0.5016 0.7028 0.000 0.240 0.760
#> SRR1700150 2 0.5706 0.5421 0.000 0.680 0.320
#> SRR1700152 3 0.5098 0.6950 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700151 3 0.2448 0.7702 0.000 0.076 0.924
#> SRR1700153 3 0.5098 0.6955 0.000 0.248 0.752
#> SRR1700154 3 0.5216 0.6814 0.000 0.260 0.740
#> SRR1700155 3 0.5497 0.6444 0.000 0.292 0.708
#> SRR1700156 3 0.1411 0.7622 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700158 3 0.4931 0.7077 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700159 2 0.3686 0.7902 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700157 3 0.4235 0.7514 0.000 0.176 0.824
#> SRR1700160 3 0.5810 0.5744 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700161 3 0.6026 0.4933 0.000 0.376 0.624
#> SRR1700162 2 0.4002 0.7768 0.000 0.840 0.160
#> SRR1700164 3 0.9712 0.2993 0.232 0.332 0.436
#> SRR1700163 3 0.4702 0.7373 0.000 0.212 0.788
#> SRR1700165 3 0.5465 0.6483 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700166 3 0.6302 0.1727 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700168 2 0.1031 0.8786 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700167 3 0.5327 0.6646 0.000 0.272 0.728
#> SRR1700170 2 0.5497 0.5958 0.000 0.708 0.292
#> SRR1700169 3 0.6302 0.1718 0.000 0.480 0.520
#> SRR1700171 1 0.6140 0.5546 0.596 0.000 0.404
#> SRR1700172 3 0.6235 0.4193 0.000 0.436 0.564
#> SRR1700174 3 0.6062 0.5514 0.000 0.384 0.616
#> SRR1700173 3 0.5529 0.6448 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700175 2 0.5859 0.4870 0.000 0.656 0.344
#> SRR1700176 3 0.1163 0.7582 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700178 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700177 2 0.4291 0.7636 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700180 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700179 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700181 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700184 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700186 2 0.1643 0.8664 0.000 0.956 0.044
#> SRR1700187 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700192 1 0.0747 0.8827 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700190 1 0.4615 0.7546 0.836 0.144 0.020
#> SRR1700191 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700195 2 0.1529 0.8693 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700194 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.1289 0.8781 0.968 0.000 0.032
#> SRR1700198 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700199 2 0.0237 0.8836 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700200 2 0.0424 0.8826 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700201 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700202 1 0.6879 0.3963 0.616 0.360 0.024
#> SRR1700203 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700207 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700208 1 0.4840 0.7295 0.816 0.168 0.016
#> SRR1700205 2 0.0747 0.8826 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700209 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700210 2 0.3267 0.8166 0.000 0.884 0.116
#> SRR1700211 2 0.5098 0.5892 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700212 2 0.0237 0.8814 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700213 3 0.4346 0.7694 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700214 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700219 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700221 2 0.0424 0.8832 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700223 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700224 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700226 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.3619 0.7805 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700225 3 0.4346 0.7688 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700227 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.0747 0.8827 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700231 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.6079 0.1798 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700232 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.4605 0.6747 0.000 0.796 0.204
#> SRR1700234 2 0.5835 0.3734 0.000 0.660 0.340
#> SRR1700235 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700237 2 0.3551 0.7841 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700236 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0237 0.8836 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700239 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.2066 0.7693 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700243 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700244 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700242 1 0.0747 0.8827 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700246 1 0.1267 0.8799 0.972 0.004 0.024
#> SRR1700245 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700248 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700251 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700252 3 0.6286 0.4121 0.000 0.464 0.536
#> SRR1700253 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700256 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.8853 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700257 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700258 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700259 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700262 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700263 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.2959 0.8180 0.000 0.900 0.100
#> SRR1700265 1 0.7279 0.3316 0.588 0.376 0.036
#> SRR1700266 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.0424 0.8832 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700270 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700274 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700277 3 0.6244 0.4757 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700275 2 0.2448 0.8435 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700276 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700278 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700279 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700280 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700281 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700283 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700282 2 0.2448 0.8523 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700284 2 0.1031 0.8783 0.000 0.976 0.024
#> SRR1700285 2 0.0592 0.8831 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700286 2 0.0424 0.8823 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700287 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700290 3 0.9688 0.3053 0.228 0.332 0.440
#> SRR1700289 2 0.0592 0.8834 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700288 2 0.0000 0.8840 0.000 1.000 0.000
#> SRR1700292 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700291 2 0.0892 0.8816 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700293 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700294 2 0.3686 0.7902 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700295 3 0.6299 0.2265 0.000 0.476 0.524
#> SRR1700297 2 0.0747 0.8818 0.000 0.984 0.016
#> SRR1700296 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700298 2 0.3686 0.7829 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700299 2 0.4931 0.7034 0.000 0.768 0.232
#> SRR1700300 2 0.6302 0.0032 0.000 0.520 0.480
#> SRR1700302 2 0.3551 0.7942 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700301 2 0.1860 0.8606 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700303 2 0.1964 0.8600 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700304 2 0.1529 0.8755 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700305 2 0.3038 0.8313 0.000 0.896 0.104
#> SRR1700306 3 0.5988 0.5224 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700308 2 0.3752 0.7989 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700307 3 0.5706 0.6057 0.000 0.320 0.680
#> SRR1700309 3 0.5926 0.5366 0.000 0.356 0.644
#> SRR1700310 2 0.3686 0.7902 0.000 0.860 0.140
#> SRR1700311 2 0.4974 0.6963 0.000 0.764 0.236
#> SRR1700312 2 0.2356 0.8553 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700313 3 0.5810 0.5751 0.000 0.336 0.664
#> SRR1700314 3 0.5988 0.5102 0.000 0.368 0.632
#> SRR1700315 2 0.6267 0.1296 0.000 0.548 0.452
#> SRR1700316 2 0.6111 0.2010 0.000 0.604 0.396
#> SRR1700317 2 0.0592 0.8831 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700318 2 0.4842 0.6606 0.000 0.776 0.224
#> SRR1700319 2 0.6154 0.2994 0.000 0.592 0.408
#> SRR1700320 2 0.3619 0.7922 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700322 2 0.3551 0.8015 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700321 2 0.0237 0.8837 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700323 2 0.3816 0.7853 0.000 0.852 0.148
#> SRR1700324 2 0.1964 0.8659 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700325 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700326 1 0.7448 0.4083 0.616 0.332 0.052
#> SRR1700327 2 0.4062 0.7384 0.000 0.836 0.164
#> SRR1700329 2 0.1411 0.8716 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700328 2 0.5859 0.3492 0.000 0.656 0.344
#> SRR1700330 2 0.3879 0.7750 0.000 0.848 0.152
#> SRR1700331 2 0.1964 0.8665 0.000 0.944 0.056
#> SRR1700332 2 0.0424 0.8830 0.000 0.992 0.008
#> SRR1700333 2 0.1964 0.8628 0.000 0.944 0.056
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.1557 0.70899 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699875 3 0.2928 0.58311 0.000 0.108 0.880 0.012
#> SRR1699876 2 0.0336 0.72744 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699877 2 0.2466 0.67610 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1699879 2 0.0817 0.72238 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1699878 2 0.1867 0.69887 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1699880 3 0.2867 0.58568 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1699881 3 0.2987 0.58836 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1699882 2 0.0921 0.72116 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1699883 2 0.2081 0.68984 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1699884 2 0.0469 0.72525 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1699885 2 0.1557 0.70899 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1699886 2 0.2469 0.72314 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1699888 2 0.1022 0.72876 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1699889 2 0.3400 0.68066 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1699890 2 0.4304 0.65674 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1699887 2 0.0336 0.72744 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1699891 2 0.3356 0.68260 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1699892 2 0.5038 0.23100 0.000 0.652 0.336 0.012
#> SRR1699893 2 0.4907 0.67899 0.000 0.764 0.060 0.176
#> SRR1699894 2 0.3688 0.66579 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699895 2 0.3688 0.66579 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1699896 2 0.3945 0.68120 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR1699897 2 0.5057 0.21940 0.000 0.648 0.340 0.012
#> SRR1699898 3 0.6259 0.34350 0.000 0.084 0.616 0.300
#> SRR1699900 2 0.8349 0.10435 0.024 0.432 0.300 0.244
#> SRR1699899 2 0.2281 0.71775 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1699902 3 0.7740 -0.21627 0.000 0.236 0.416 0.348
#> SRR1699901 3 0.7870 -0.34555 0.000 0.288 0.388 0.324
#> SRR1699903 2 0.4037 0.67942 0.000 0.824 0.040 0.136
#> SRR1699904 2 0.4193 0.65918 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1699905 4 0.9171 0.20551 0.096 0.232 0.244 0.428
#> SRR1699906 2 0.3808 0.67713 0.000 0.812 0.012 0.176
#> SRR1699907 2 0.3982 0.65102 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR1699908 2 0.3626 0.67579 0.000 0.812 0.004 0.184
#> SRR1699909 2 0.5594 0.01597 0.000 0.520 0.020 0.460
#> SRR1699910 2 0.7146 -0.26672 0.000 0.456 0.132 0.412
#> SRR1699911 2 0.3726 0.66207 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1699912 2 0.3982 0.64997 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR1699913 2 0.3710 0.67054 0.000 0.804 0.004 0.192
#> SRR1699914 4 0.7188 0.62716 0.000 0.292 0.172 0.536
#> SRR1699915 2 0.5599 0.48240 0.000 0.672 0.052 0.276
#> SRR1699916 2 0.3626 0.67579 0.000 0.812 0.004 0.184
#> SRR1699917 3 0.7299 -0.28667 0.000 0.312 0.512 0.176
#> SRR1699918 2 0.7863 -0.50700 0.000 0.380 0.276 0.344
#> SRR1699919 2 0.4855 0.44174 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1699920 4 0.7012 0.50357 0.000 0.372 0.124 0.504
#> SRR1699921 2 0.5897 0.35062 0.000 0.588 0.044 0.368
#> SRR1699922 2 0.3908 0.65867 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR1699923 4 0.7716 0.29271 0.000 0.224 0.380 0.396
#> SRR1699924 4 0.7673 0.42647 0.000 0.216 0.368 0.416
#> SRR1699925 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.4088 0.64064 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1699927 2 0.4155 0.62620 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1699929 2 0.5950 0.55100 0.000 0.696 0.156 0.148
#> SRR1699928 2 0.4122 0.63559 0.000 0.760 0.004 0.236
#> SRR1699930 2 0.3400 0.67918 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1699931 2 0.5962 0.53596 0.000 0.692 0.180 0.128
#> SRR1699933 3 0.5408 -0.07650 0.000 0.488 0.500 0.012
#> SRR1699932 2 0.3583 0.67741 0.000 0.816 0.004 0.180
#> SRR1699934 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.2987 0.70789 0.000 0.880 0.016 0.104
#> SRR1699936 2 0.3398 0.69133 0.000 0.872 0.068 0.060
#> SRR1699937 3 0.3377 0.57609 0.000 0.140 0.848 0.012
#> SRR1699938 2 0.6003 0.03404 0.000 0.504 0.456 0.040
#> SRR1699940 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1699939 3 0.4720 0.36234 0.000 0.324 0.672 0.004
#> SRR1699941 3 0.2805 0.59002 0.000 0.100 0.888 0.012
#> SRR1699942 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1699943 3 0.3672 0.56353 0.000 0.164 0.824 0.012
#> SRR1699944 3 0.3577 0.56834 0.000 0.156 0.832 0.012
#> SRR1699945 3 0.5630 0.52161 0.052 0.096 0.772 0.080
#> SRR1699946 3 0.3047 0.58318 0.000 0.116 0.872 0.012
#> SRR1699947 3 0.3324 0.57775 0.000 0.136 0.852 0.012
#> SRR1699948 2 0.5791 0.38367 0.000 0.656 0.284 0.060
#> SRR1699949 2 0.3354 0.68986 0.000 0.872 0.084 0.044
#> SRR1699950 2 0.4880 0.57359 0.000 0.760 0.188 0.052
#> SRR1699951 3 0.4295 0.48801 0.000 0.240 0.752 0.008
#> SRR1699952 3 0.3306 0.56909 0.000 0.156 0.840 0.004
#> SRR1699953 2 0.4222 0.44727 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1699954 3 0.2987 0.58268 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1699955 2 0.3710 0.57950 0.000 0.804 0.192 0.004
#> SRR1699956 3 0.2131 0.58178 0.000 0.036 0.932 0.032
#> SRR1699957 3 0.4086 0.51131 0.000 0.216 0.776 0.008
#> SRR1699959 3 0.4352 0.55483 0.000 0.104 0.816 0.080
#> SRR1699958 2 0.3908 0.52246 0.000 0.784 0.212 0.004
#> SRR1699960 2 0.1305 0.71776 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1699961 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1699962 2 0.3945 0.52472 0.000 0.780 0.216 0.004
#> SRR1699963 3 0.3300 0.57649 0.000 0.144 0.848 0.008
#> SRR1699964 3 0.4212 0.52063 0.000 0.216 0.772 0.012
#> SRR1699965 2 0.3279 0.68310 0.000 0.872 0.096 0.032
#> SRR1699966 3 0.5003 0.34651 0.000 0.308 0.676 0.016
#> SRR1699967 3 0.4663 0.42876 0.000 0.272 0.716 0.012
#> SRR1699968 3 0.3658 0.57628 0.000 0.144 0.836 0.020
#> SRR1699969 3 0.4798 0.52033 0.000 0.052 0.768 0.180
#> SRR1699971 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1699970 3 0.2737 0.58838 0.000 0.104 0.888 0.008
#> SRR1699972 3 0.3161 0.57887 0.000 0.124 0.864 0.012
#> SRR1699973 3 0.5056 0.55619 0.000 0.164 0.760 0.076
#> SRR1699974 3 0.4304 0.48797 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1699975 3 0.6416 0.44911 0.000 0.200 0.648 0.152
#> SRR1699976 3 0.3142 0.58059 0.000 0.132 0.860 0.008
#> SRR1699977 3 0.6586 0.26463 0.000 0.156 0.628 0.216
#> SRR1699978 3 0.6798 0.14282 0.100 0.000 0.504 0.396
#> SRR1699979 3 0.2928 0.57300 0.000 0.012 0.880 0.108
#> SRR1699980 3 0.3667 0.57127 0.000 0.088 0.856 0.056
#> SRR1699981 3 0.4485 0.52346 0.000 0.028 0.772 0.200
#> SRR1699982 2 0.3498 0.68607 0.000 0.832 0.008 0.160
#> SRR1699983 3 0.5417 0.48686 0.000 0.088 0.732 0.180
#> SRR1699984 1 0.0188 0.91777 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1699985 2 0.6888 -0.30116 0.000 0.448 0.448 0.104
#> SRR1699986 3 0.4543 0.46186 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1699988 3 0.5487 0.11001 0.000 0.400 0.580 0.020
#> SRR1699987 3 0.4501 0.52185 0.000 0.024 0.764 0.212
#> SRR1699989 2 0.4552 0.55277 0.000 0.784 0.172 0.044
#> SRR1699990 3 0.5646 0.46023 0.000 0.088 0.708 0.204
#> SRR1699992 3 0.1743 0.58284 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1699991 3 0.2345 0.57495 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1699993 3 0.3649 0.52246 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1699994 3 0.4277 0.49105 0.000 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699995 3 0.6523 0.26232 0.088 0.000 0.564 0.348
#> SRR1699996 2 0.5378 -0.09205 0.000 0.540 0.448 0.012
#> SRR1699997 3 0.6488 0.31030 0.000 0.128 0.628 0.244
#> SRR1699998 3 0.4137 0.52211 0.000 0.208 0.780 0.012
#> SRR1699999 3 0.6949 0.19966 0.124 0.000 0.528 0.348
#> SRR1700000 3 0.2675 0.58789 0.000 0.100 0.892 0.008
#> SRR1700002 3 0.3219 0.58860 0.000 0.112 0.868 0.020
#> SRR1700001 3 0.1182 0.58523 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1700003 3 0.4225 0.54260 0.000 0.184 0.792 0.024
#> SRR1700004 2 0.7721 -0.35454 0.000 0.440 0.312 0.248
#> SRR1700005 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.5284 0.18309 0.000 0.368 0.616 0.016
#> SRR1700007 2 0.1356 0.72710 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1700008 3 0.5639 0.39808 0.000 0.040 0.636 0.324
#> SRR1700009 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700010 3 0.2987 0.58832 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1700011 2 0.3583 0.58663 0.000 0.816 0.180 0.004
#> SRR1700013 3 0.4059 0.51217 0.000 0.200 0.788 0.012
#> SRR1700012 3 0.2859 0.58778 0.000 0.112 0.880 0.008
#> SRR1700014 2 0.7906 -0.53733 0.000 0.356 0.344 0.300
#> SRR1700015 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1700016 1 0.4049 0.85937 0.780 0.000 0.008 0.212
#> SRR1700018 3 0.2867 0.58385 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1700017 3 0.2255 0.58867 0.000 0.068 0.920 0.012
#> SRR1700019 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700020 3 0.5986 0.34983 0.060 0.000 0.620 0.320
#> SRR1700021 2 0.4382 0.64707 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1700023 3 0.2928 0.58867 0.000 0.108 0.880 0.012
#> SRR1700022 3 0.1938 0.58802 0.000 0.052 0.936 0.012
#> SRR1700024 3 0.4932 0.49607 0.000 0.032 0.728 0.240
#> SRR1700025 3 0.4690 0.40173 0.000 0.276 0.712 0.012
#> SRR1700026 3 0.6568 0.14024 0.000 0.332 0.572 0.096
#> SRR1700027 3 0.2675 0.58633 0.000 0.100 0.892 0.008
#> SRR1700028 3 0.6058 0.13581 0.000 0.308 0.624 0.068
#> SRR1700029 3 0.3764 0.51012 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700030 2 0.5076 0.62052 0.000 0.756 0.072 0.172
#> SRR1700031 3 0.3266 0.56122 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700032 3 0.4838 0.46642 0.000 0.252 0.724 0.024
#> SRR1700034 3 0.6907 0.20674 0.120 0.000 0.532 0.348
#> SRR1700035 2 0.6987 0.12563 0.000 0.568 0.160 0.272
#> SRR1700033 3 0.3266 0.56022 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700036 2 0.7692 -0.32427 0.000 0.456 0.268 0.276
#> SRR1700037 2 0.3649 0.66761 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700038 2 0.7489 0.02099 0.000 0.492 0.296 0.212
#> SRR1700039 3 0.5060 0.38303 0.000 0.004 0.584 0.412
#> SRR1700040 3 0.2593 0.57609 0.000 0.004 0.892 0.104
#> SRR1700041 3 0.5233 0.42488 0.000 0.020 0.648 0.332
#> SRR1700042 3 0.4673 0.48860 0.000 0.008 0.700 0.292
#> SRR1700043 3 0.5093 0.34621 0.012 0.000 0.640 0.348
#> SRR1700045 3 0.5496 0.35699 0.000 0.024 0.604 0.372
#> SRR1700044 3 0.7636 -0.35967 0.000 0.248 0.468 0.284
#> SRR1700046 3 0.5865 0.36367 0.000 0.048 0.612 0.340
#> SRR1700047 4 0.6917 0.44043 0.000 0.144 0.288 0.568
#> SRR1700048 3 0.7806 -0.37672 0.000 0.260 0.408 0.332
#> SRR1700049 3 0.4790 0.42336 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1700050 3 0.5823 0.33474 0.000 0.044 0.608 0.348
#> SRR1700051 3 0.6355 0.29105 0.076 0.000 0.576 0.348
#> SRR1700052 3 0.4679 0.45639 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700053 4 0.7310 0.42726 0.000 0.160 0.360 0.480
#> SRR1700054 3 0.5600 0.37675 0.000 0.028 0.596 0.376
#> SRR1700055 3 0.7145 0.16380 0.144 0.000 0.508 0.348
#> SRR1700056 4 0.6149 -0.09035 0.000 0.048 0.472 0.480
#> SRR1700057 3 0.4454 0.47593 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1700058 3 0.5004 0.41545 0.000 0.004 0.604 0.392
#> SRR1700059 3 0.5453 0.34846 0.000 0.020 0.592 0.388
#> SRR1700060 3 0.4522 0.46325 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1700061 4 0.6859 0.24739 0.000 0.108 0.380 0.512
#> SRR1700062 3 0.4564 0.44849 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1700063 3 0.5138 0.40462 0.000 0.008 0.600 0.392
#> SRR1700064 3 0.6568 0.09215 0.000 0.080 0.512 0.408
#> SRR1700065 3 0.4746 0.43034 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1700066 3 0.4500 0.46421 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1700067 3 0.5738 0.21045 0.000 0.028 0.540 0.432
#> SRR1700068 3 0.6822 -0.01007 0.000 0.100 0.488 0.412
#> SRR1700069 3 0.4746 0.40302 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1700070 3 0.4797 0.50059 0.000 0.020 0.720 0.260
#> SRR1700071 3 0.4509 0.48248 0.000 0.004 0.708 0.288
#> SRR1700072 3 0.5626 0.34802 0.028 0.000 0.588 0.384
#> SRR1700073 2 0.5550 0.17885 0.000 0.552 0.020 0.428
#> SRR1700075 3 0.5682 0.36163 0.000 0.036 0.612 0.352
#> SRR1700074 3 0.3791 0.53596 0.000 0.004 0.796 0.200
#> SRR1700076 3 0.5075 0.38975 0.000 0.012 0.644 0.344
#> SRR1700077 3 0.4250 0.49393 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1700078 3 0.4605 0.42406 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1700080 3 0.4008 0.51397 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1700079 3 0.3764 0.54087 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1700081 3 0.4713 0.43932 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1700082 3 0.3444 0.54031 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700083 3 0.3444 0.54823 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1700084 3 0.4509 0.47013 0.004 0.000 0.708 0.288
#> SRR1700085 2 0.7128 0.04868 0.000 0.556 0.260 0.184
#> SRR1700086 3 0.4661 0.49551 0.000 0.016 0.728 0.256
#> SRR1700087 3 0.6155 0.06825 0.000 0.412 0.536 0.052
#> SRR1700088 3 0.5252 0.26589 0.000 0.336 0.644 0.020
#> SRR1700089 3 0.6575 0.15505 0.000 0.348 0.560 0.092
#> SRR1700091 2 0.5268 0.03990 0.000 0.592 0.396 0.012
#> SRR1700090 2 0.7472 -0.33047 0.000 0.428 0.396 0.176
#> SRR1700092 2 0.3300 0.62002 0.000 0.848 0.144 0.008
#> SRR1700094 2 0.6209 -0.06820 0.000 0.492 0.456 0.052
#> SRR1700093 2 0.3787 0.69451 0.000 0.840 0.036 0.124
#> SRR1700095 4 0.8598 -0.01697 0.084 0.140 0.288 0.488
#> SRR1700096 2 0.5402 -0.16916 0.000 0.516 0.472 0.012
#> SRR1700097 3 0.1389 0.57112 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1700098 2 0.1302 0.71516 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700099 2 0.1389 0.71316 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1700100 2 0.4214 0.53367 0.000 0.780 0.204 0.016
#> SRR1700101 2 0.0469 0.72546 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1700102 2 0.2593 0.67425 0.000 0.892 0.104 0.004
#> SRR1700104 3 0.5742 0.20505 0.000 0.368 0.596 0.036
#> SRR1700103 3 0.5615 0.17589 0.000 0.356 0.612 0.032
#> SRR1700105 2 0.4387 0.65985 0.000 0.776 0.024 0.200
#> SRR1700106 2 0.4701 0.64760 0.000 0.780 0.056 0.164
#> SRR1700107 2 0.5108 0.28670 0.000 0.672 0.308 0.020
#> SRR1700108 2 0.0817 0.72480 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700109 2 0.0779 0.72717 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1700110 2 0.0804 0.72654 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1700112 2 0.3626 0.67579 0.000 0.812 0.004 0.184
#> SRR1700111 3 0.7450 -0.36102 0.000 0.404 0.424 0.172
#> SRR1700113 2 0.2999 0.69851 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1700114 2 0.5035 0.46085 0.000 0.744 0.204 0.052
#> SRR1700115 2 0.1743 0.70802 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1700116 2 0.7910 -0.52808 0.000 0.360 0.332 0.308
#> SRR1700117 4 0.7659 0.48396 0.000 0.224 0.332 0.444
#> SRR1700119 2 0.7199 0.07301 0.000 0.552 0.232 0.216
#> SRR1700118 4 0.7760 0.53615 0.000 0.240 0.352 0.408
#> SRR1700120 3 0.6546 0.12309 0.000 0.080 0.524 0.396
#> SRR1700121 2 0.4204 0.66218 0.000 0.788 0.020 0.192
#> SRR1700122 2 0.5364 0.28625 0.000 0.592 0.016 0.392
#> SRR1700123 4 0.7293 0.61408 0.000 0.248 0.216 0.536
#> SRR1700125 2 0.3831 0.66202 0.000 0.792 0.004 0.204
#> SRR1700126 3 0.4452 0.51930 0.000 0.008 0.732 0.260
#> SRR1700127 4 0.7640 0.48966 0.000 0.212 0.356 0.432
#> SRR1700124 4 0.7506 0.57043 0.000 0.220 0.288 0.492
#> SRR1700128 4 0.7576 0.51165 0.000 0.204 0.344 0.452
#> SRR1700129 2 0.5678 0.05213 0.000 0.524 0.024 0.452
#> SRR1700130 4 0.6014 0.47462 0.000 0.360 0.052 0.588
#> SRR1700132 3 0.6929 -0.17365 0.000 0.108 0.448 0.444
#> SRR1700131 4 0.7065 0.27554 0.000 0.124 0.404 0.472
#> SRR1700133 4 0.5500 0.16065 0.000 0.464 0.016 0.520
#> SRR1700134 2 0.5738 0.12056 0.000 0.540 0.028 0.432
#> SRR1700135 4 0.7861 0.54129 0.000 0.284 0.324 0.392
#> SRR1700136 4 0.7154 0.23320 0.000 0.132 0.432 0.436
#> SRR1700137 4 0.6956 0.63095 0.000 0.288 0.148 0.564
#> SRR1700138 4 0.7551 0.59016 0.000 0.240 0.272 0.488
#> SRR1700140 4 0.6432 0.45779 0.000 0.372 0.076 0.552
#> SRR1700139 4 0.7490 0.57580 0.000 0.220 0.284 0.496
#> SRR1700141 2 0.5756 0.20316 0.000 0.568 0.032 0.400
#> SRR1700142 3 0.6443 0.18164 0.000 0.076 0.548 0.376
#> SRR1700143 3 0.6862 -0.02242 0.000 0.104 0.488 0.408
#> SRR1700144 4 0.7084 0.20725 0.000 0.124 0.436 0.440
#> SRR1700145 4 0.7045 0.62216 0.000 0.308 0.148 0.544
#> SRR1700146 2 0.5696 -0.05912 0.000 0.492 0.024 0.484
#> SRR1700147 4 0.7125 0.32982 0.000 0.132 0.392 0.476
#> SRR1700149 3 0.7187 -0.20071 0.000 0.136 0.440 0.424
#> SRR1700148 4 0.7527 0.55871 0.000 0.216 0.300 0.484
#> SRR1700150 4 0.5856 0.18147 0.000 0.464 0.032 0.504
#> SRR1700152 4 0.7439 0.58333 0.000 0.220 0.272 0.508
#> SRR1700151 4 0.7117 0.26746 0.000 0.128 0.424 0.448
#> SRR1700153 4 0.7540 0.55357 0.000 0.216 0.304 0.480
#> SRR1700154 4 0.7430 0.59254 0.000 0.228 0.260 0.512
#> SRR1700155 4 0.6833 0.62449 0.000 0.272 0.144 0.584
#> SRR1700156 4 0.6929 0.16872 0.000 0.108 0.444 0.448
#> SRR1700158 4 0.7256 0.56010 0.000 0.204 0.256 0.540
#> SRR1700159 2 0.5112 0.21049 0.000 0.560 0.004 0.436
#> SRR1700157 4 0.7404 0.46750 0.000 0.176 0.348 0.476
#> SRR1700160 4 0.6876 0.62958 0.000 0.288 0.140 0.572
#> SRR1700161 4 0.7121 0.62143 0.000 0.300 0.160 0.540
#> SRR1700162 2 0.5668 0.09509 0.000 0.532 0.024 0.444
#> SRR1700164 4 0.9172 0.22761 0.096 0.240 0.236 0.428
#> SRR1700163 4 0.7545 0.34894 0.000 0.188 0.396 0.416
#> SRR1700165 4 0.7497 0.59736 0.000 0.240 0.260 0.500
#> SRR1700166 4 0.5586 0.21672 0.000 0.452 0.020 0.528
#> SRR1700168 2 0.3791 0.66485 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR1700167 4 0.7344 0.58969 0.000 0.224 0.248 0.528
#> SRR1700170 2 0.5279 0.28478 0.000 0.588 0.012 0.400
#> SRR1700169 2 0.5693 -0.02011 0.000 0.504 0.024 0.472
#> SRR1700171 3 0.6885 0.11841 0.112 0.000 0.516 0.372
#> SRR1700172 2 0.7732 -0.39796 0.000 0.432 0.244 0.324
#> SRR1700174 2 0.7910 -0.52957 0.000 0.364 0.320 0.316
#> SRR1700173 4 0.7883 0.53099 0.000 0.292 0.328 0.380
#> SRR1700175 4 0.5859 0.17487 0.000 0.472 0.032 0.496
#> SRR1700176 3 0.6694 0.08740 0.000 0.092 0.516 0.392
#> SRR1700178 2 0.1474 0.71124 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1700177 2 0.4917 0.46217 0.000 0.656 0.008 0.336
#> SRR1700180 2 0.2466 0.67969 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1700179 2 0.1118 0.71854 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700181 2 0.1474 0.71124 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1700183 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.1302 0.71501 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700184 2 0.1557 0.70899 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700186 2 0.3542 0.69469 0.000 0.864 0.060 0.076
#> SRR1700187 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.1557 0.70899 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700192 1 0.5041 0.84049 0.728 0.000 0.040 0.232
#> SRR1700190 1 0.8806 0.61203 0.428 0.116 0.108 0.348
#> SRR1700191 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700193 2 0.2281 0.67966 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1700195 2 0.1940 0.69603 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700194 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.1118 0.71840 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700197 1 0.6799 0.77056 0.588 0.012 0.088 0.312
#> SRR1700198 2 0.1940 0.69603 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700199 2 0.2011 0.69300 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700200 2 0.3217 0.64903 0.000 0.860 0.012 0.128
#> SRR1700201 2 0.1118 0.71840 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700202 1 0.8481 0.48958 0.448 0.124 0.072 0.356
#> SRR1700203 2 0.1118 0.71860 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700204 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.1716 0.70407 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700207 2 0.0592 0.72435 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700208 1 0.8950 0.59590 0.416 0.124 0.116 0.344
#> SRR1700205 2 0.4431 0.64116 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1700209 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700210 2 0.3840 0.64352 0.000 0.844 0.052 0.104
#> SRR1700211 2 0.4673 0.59982 0.000 0.792 0.132 0.076
#> SRR1700212 2 0.2345 0.68146 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700213 3 0.4149 0.52990 0.000 0.168 0.804 0.028
#> SRR1700214 2 0.1867 0.69887 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700215 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0188 0.72593 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700216 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.1661 0.71041 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR1700219 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700222 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700221 2 0.1637 0.70656 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700223 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.1637 0.71064 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700226 2 0.0336 0.72557 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1700229 2 0.0376 0.72674 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700225 3 0.4718 0.36711 0.000 0.280 0.708 0.012
#> SRR1700227 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.4319 0.85329 0.760 0.000 0.012 0.228
#> SRR1700231 2 0.0188 0.72593 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700228 2 0.3402 0.60521 0.000 0.832 0.164 0.004
#> SRR1700232 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700233 2 0.1109 0.72277 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1700234 2 0.6992 0.27296 0.000 0.564 0.280 0.156
#> SRR1700235 2 0.1398 0.71587 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1700237 2 0.0376 0.72659 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700236 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.1867 0.69887 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700239 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.4344 0.50118 0.000 0.076 0.816 0.108
#> SRR1700243 2 0.1867 0.69887 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1700244 2 0.1637 0.71054 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1700242 1 0.4228 0.85335 0.760 0.000 0.008 0.232
#> SRR1700246 1 0.6883 0.74529 0.548 0.004 0.104 0.344
#> SRR1700245 2 0.0817 0.72276 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700247 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0188 0.72593 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700248 2 0.1940 0.69603 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700251 2 0.1940 0.69603 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1700252 2 0.5229 -0.00192 0.000 0.564 0.428 0.008
#> SRR1700253 2 0.1716 0.70856 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700256 2 0.1118 0.71853 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1700254 1 0.0000 0.91874 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.2149 0.68653 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1700257 2 0.1211 0.72008 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1700258 2 0.1792 0.70150 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1700259 2 0.0188 0.72608 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700260 2 0.0469 0.72531 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700261 2 0.1584 0.71837 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1700262 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700263 2 0.0376 0.72593 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1700264 2 0.2589 0.66483 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700265 2 0.9501 -0.12083 0.160 0.400 0.176 0.264
#> SRR1700266 2 0.0657 0.72623 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1700268 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700270 2 0.0707 0.72344 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700267 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.72607 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0592 0.72442 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700273 2 0.0469 0.72515 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1700274 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700277 3 0.5281 -0.01792 0.000 0.464 0.528 0.008
#> SRR1700275 2 0.2011 0.72260 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700276 2 0.2408 0.70701 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700278 2 0.4250 0.66115 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1700279 2 0.4406 0.64395 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700280 2 0.4331 0.65133 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1700281 2 0.0188 0.72607 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1700283 2 0.1716 0.72518 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1700282 2 0.4630 0.65910 0.000 0.732 0.016 0.252
#> SRR1700284 2 0.3751 0.66768 0.000 0.800 0.004 0.196
#> SRR1700285 2 0.3402 0.68524 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR1700286 2 0.2530 0.68167 0.000 0.896 0.100 0.004
#> SRR1700287 2 0.3024 0.69888 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1700290 4 0.9099 0.20028 0.096 0.224 0.236 0.444
#> SRR1700289 2 0.3105 0.69271 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR1700288 2 0.1557 0.71307 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1700292 2 0.3356 0.68209 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1700291 2 0.3710 0.67189 0.000 0.804 0.004 0.192
#> SRR1700293 2 0.3539 0.68015 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR1700294 2 0.5263 0.13020 0.000 0.544 0.008 0.448
#> SRR1700295 4 0.7789 0.17310 0.000 0.352 0.248 0.400
#> SRR1700297 2 0.3710 0.66977 0.000 0.804 0.004 0.192
#> SRR1700296 2 0.3649 0.66695 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1700298 2 0.3945 0.65620 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR1700299 2 0.5643 0.13330 0.000 0.548 0.024 0.428
#> SRR1700300 4 0.5872 0.42238 0.000 0.384 0.040 0.576
#> SRR1700302 2 0.4819 0.45469 0.000 0.652 0.004 0.344
#> SRR1700301 2 0.3870 0.65969 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1700303 2 0.3945 0.65054 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR1700304 2 0.5530 0.57802 0.000 0.632 0.032 0.336
#> SRR1700305 2 0.4123 0.64433 0.000 0.772 0.008 0.220
#> SRR1700306 4 0.6478 0.56509 0.000 0.336 0.088 0.576
#> SRR1700308 2 0.4630 0.59332 0.000 0.732 0.016 0.252
#> SRR1700307 4 0.7823 0.57154 0.000 0.320 0.272 0.408
#> SRR1700309 4 0.6733 0.59931 0.000 0.324 0.112 0.564
#> SRR1700310 2 0.5149 0.44187 0.000 0.648 0.016 0.336
#> SRR1700311 2 0.5774 -0.04677 0.000 0.508 0.028 0.464
#> SRR1700312 2 0.4105 0.67756 0.000 0.812 0.032 0.156
#> SRR1700313 4 0.6971 0.62860 0.000 0.276 0.156 0.568
#> SRR1700314 4 0.6140 0.51890 0.000 0.340 0.064 0.596
#> SRR1700315 4 0.5760 0.24053 0.000 0.448 0.028 0.524
#> SRR1700316 2 0.5939 0.45255 0.000 0.668 0.084 0.248
#> SRR1700317 2 0.3342 0.70340 0.000 0.868 0.032 0.100
#> SRR1700318 2 0.5949 0.59691 0.000 0.644 0.068 0.288
#> SRR1700319 2 0.5776 -0.03643 0.000 0.504 0.028 0.468
#> SRR1700320 2 0.4722 0.52913 0.000 0.692 0.008 0.300
#> SRR1700322 2 0.3978 0.66701 0.000 0.796 0.012 0.192
#> SRR1700321 2 0.2965 0.71336 0.000 0.892 0.036 0.072
#> SRR1700323 2 0.4606 0.58474 0.000 0.724 0.012 0.264
#> SRR1700324 2 0.3668 0.67333 0.000 0.808 0.004 0.188
#> SRR1700325 2 0.2408 0.70908 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1700326 4 0.8933 -0.37966 0.232 0.072 0.256 0.440
#> SRR1700327 2 0.2334 0.68739 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR1700329 2 0.3751 0.66768 0.000 0.800 0.004 0.196
#> SRR1700328 2 0.6810 0.37036 0.000 0.596 0.248 0.156
#> SRR1700330 2 0.5231 0.63047 0.000 0.676 0.028 0.296
#> SRR1700331 2 0.4053 0.64272 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1700332 2 0.3356 0.68209 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1700333 2 0.3649 0.66682 0.000 0.796 0.000 0.204
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699875 3 0.2362 0.640853 0.000 0.032 0.916 0.028 0.024
#> SRR1699876 2 0.3074 0.564288 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1699877 2 0.0963 0.563591 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699879 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699878 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1699880 3 0.3142 0.653377 0.000 0.032 0.856 0.108 0.004
#> SRR1699881 3 0.3340 0.647751 0.000 0.032 0.840 0.124 0.004
#> SRR1699882 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699883 2 0.1041 0.565864 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1699884 2 0.0963 0.583471 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1699885 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1699886 2 0.4126 0.497549 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1699888 2 0.3932 0.522788 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1699889 2 0.4885 0.469959 0.000 0.572 0.000 0.028 0.400
#> SRR1699890 2 0.4793 0.440568 0.000 0.544 0.020 0.000 0.436
#> SRR1699887 2 0.3480 0.553491 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1699891 2 0.4161 0.492739 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1699892 2 0.5542 0.197665 0.000 0.644 0.268 0.072 0.016
#> SRR1699893 2 0.5993 0.457097 0.000 0.600 0.104 0.016 0.280
#> SRR1699894 2 0.4359 0.480426 0.000 0.584 0.000 0.004 0.412
#> SRR1699895 2 0.5071 0.451880 0.000 0.548 0.004 0.028 0.420
#> SRR1699896 2 0.5144 0.490293 0.000 0.640 0.068 0.000 0.292
#> SRR1699897 2 0.5864 0.171392 0.000 0.616 0.272 0.096 0.016
#> SRR1699898 4 0.4288 0.561562 0.000 0.000 0.324 0.664 0.012
#> SRR1699900 5 0.6767 0.270171 0.000 0.280 0.236 0.008 0.476
#> SRR1699899 2 0.4030 0.512552 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1699902 3 0.8359 -0.288550 0.000 0.172 0.336 0.188 0.304
#> SRR1699901 4 0.8240 -0.260077 0.000 0.120 0.316 0.324 0.240
#> SRR1699903 2 0.6324 0.454200 0.000 0.564 0.060 0.056 0.320
#> SRR1699904 2 0.5524 0.411064 0.000 0.520 0.016 0.036 0.428
#> SRR1699905 5 0.8254 0.321454 0.004 0.140 0.220 0.220 0.416
#> SRR1699906 2 0.5718 0.445092 0.000 0.544 0.008 0.068 0.380
#> SRR1699907 2 0.5143 0.447944 0.000 0.544 0.004 0.032 0.420
#> SRR1699908 2 0.5304 0.452973 0.000 0.548 0.008 0.036 0.408
#> SRR1699909 2 0.6987 0.011349 0.000 0.372 0.008 0.260 0.360
#> SRR1699910 2 0.7794 -0.106611 0.000 0.384 0.084 0.348 0.184
#> SRR1699911 2 0.5361 0.445652 0.000 0.544 0.016 0.028 0.412
#> SRR1699912 2 0.5390 0.436528 0.000 0.532 0.008 0.040 0.420
#> SRR1699913 2 0.5318 0.444122 0.000 0.540 0.008 0.036 0.416
#> SRR1699914 4 0.6721 0.336128 0.000 0.144 0.072 0.604 0.180
#> SRR1699915 2 0.7408 0.110600 0.000 0.480 0.064 0.276 0.180
#> SRR1699916 2 0.5242 0.451532 0.000 0.548 0.008 0.032 0.412
#> SRR1699917 3 0.8050 0.027685 0.000 0.116 0.404 0.276 0.204
#> SRR1699918 4 0.8133 0.199173 0.000 0.192 0.160 0.424 0.224
#> SRR1699919 2 0.6679 0.183784 0.000 0.428 0.008 0.176 0.388
#> SRR1699920 4 0.7457 0.005699 0.000 0.192 0.088 0.512 0.208
#> SRR1699921 2 0.7875 0.017663 0.000 0.428 0.092 0.232 0.248
#> SRR1699922 2 0.5071 0.451689 0.000 0.548 0.004 0.028 0.420
#> SRR1699923 4 0.6814 0.030018 0.000 0.016 0.336 0.468 0.180
#> SRR1699924 4 0.5548 0.392372 0.000 0.020 0.228 0.668 0.084
#> SRR1699925 1 0.0162 0.913836 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.5524 0.416371 0.000 0.516 0.008 0.048 0.428
#> SRR1699927 2 0.6130 0.356146 0.000 0.480 0.008 0.100 0.412
#> SRR1699929 2 0.6714 0.335801 0.000 0.512 0.188 0.016 0.284
#> SRR1699928 2 0.5612 0.421795 0.000 0.520 0.012 0.048 0.420
#> SRR1699930 2 0.4885 0.468184 0.000 0.572 0.000 0.028 0.400
#> SRR1699931 2 0.6487 0.336495 0.000 0.532 0.192 0.008 0.268
#> SRR1699933 3 0.6839 -0.181133 0.000 0.368 0.412 0.008 0.212
#> SRR1699932 2 0.5311 0.447596 0.000 0.544 0.008 0.036 0.412
#> SRR1699934 1 0.0162 0.913836 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.4854 0.519999 0.000 0.680 0.060 0.000 0.260
#> SRR1699936 2 0.3474 0.481515 0.000 0.796 0.192 0.004 0.008
#> SRR1699937 3 0.2932 0.653583 0.000 0.032 0.864 0.104 0.000
#> SRR1699938 3 0.5524 0.026303 0.000 0.416 0.532 0.032 0.020
#> SRR1699940 3 0.3433 0.647463 0.000 0.032 0.832 0.132 0.004
#> SRR1699939 3 0.6207 0.403543 0.000 0.272 0.588 0.120 0.020
#> SRR1699941 3 0.4348 0.575608 0.000 0.032 0.744 0.216 0.008
#> SRR1699942 3 0.2654 0.654722 0.000 0.032 0.884 0.084 0.000
#> SRR1699943 3 0.3241 0.655638 0.000 0.036 0.856 0.100 0.008
#> SRR1699944 3 0.3161 0.654844 0.000 0.032 0.860 0.100 0.008
#> SRR1699945 3 0.4133 0.460463 0.000 0.012 0.744 0.012 0.232
#> SRR1699946 3 0.2868 0.654723 0.000 0.032 0.884 0.072 0.012
#> SRR1699947 3 0.3093 0.654761 0.000 0.032 0.872 0.080 0.016
#> SRR1699948 2 0.4645 0.202003 0.000 0.564 0.424 0.004 0.008
#> SRR1699949 2 0.2408 0.551008 0.000 0.892 0.092 0.016 0.000
#> SRR1699950 2 0.5363 0.205134 0.000 0.564 0.388 0.036 0.012
#> SRR1699951 3 0.4792 0.627967 0.000 0.084 0.752 0.148 0.016
#> SRR1699952 3 0.3548 0.654279 0.000 0.044 0.836 0.112 0.008
#> SRR1699953 2 0.5566 0.129758 0.000 0.520 0.416 0.060 0.004
#> SRR1699954 3 0.3733 0.544938 0.000 0.032 0.804 0.004 0.160
#> SRR1699955 2 0.5886 0.158463 0.000 0.540 0.368 0.084 0.008
#> SRR1699956 3 0.4078 0.553727 0.000 0.028 0.792 0.020 0.160
#> SRR1699957 3 0.4041 0.657788 0.000 0.064 0.816 0.100 0.020
#> SRR1699959 3 0.4010 0.542187 0.000 0.032 0.784 0.008 0.176
#> SRR1699958 2 0.5309 0.303041 0.000 0.668 0.244 0.080 0.008
#> SRR1699960 2 0.1372 0.575847 0.000 0.956 0.016 0.024 0.004
#> SRR1699961 3 0.3340 0.651316 0.000 0.032 0.840 0.124 0.004
#> SRR1699962 2 0.6473 0.107027 0.000 0.524 0.332 0.124 0.020
#> SRR1699963 3 0.4307 0.605300 0.000 0.040 0.768 0.180 0.012
#> SRR1699964 3 0.5631 0.580418 0.000 0.092 0.684 0.192 0.032
#> SRR1699965 2 0.4250 0.415019 0.000 0.720 0.252 0.028 0.000
#> SRR1699966 3 0.5479 0.598507 0.000 0.096 0.704 0.168 0.032
#> SRR1699967 3 0.4353 0.645826 0.000 0.100 0.792 0.092 0.016
#> SRR1699968 3 0.4471 0.593573 0.000 0.036 0.752 0.196 0.016
#> SRR1699969 4 0.5041 0.531545 0.000 0.016 0.328 0.632 0.024
#> SRR1699971 3 0.3151 0.630812 0.000 0.032 0.876 0.036 0.056
#> SRR1699970 3 0.3694 0.626700 0.000 0.032 0.796 0.172 0.000
#> SRR1699972 3 0.2990 0.605461 0.000 0.032 0.876 0.012 0.080
#> SRR1699973 3 0.5775 0.310240 0.000 0.048 0.596 0.324 0.032
#> SRR1699974 4 0.3934 0.576487 0.000 0.000 0.276 0.716 0.008
#> SRR1699975 4 0.5768 0.395467 0.000 0.036 0.388 0.544 0.032
#> SRR1699976 3 0.3962 0.633558 0.000 0.036 0.800 0.152 0.012
#> SRR1699977 4 0.5170 0.572241 0.000 0.012 0.296 0.648 0.044
#> SRR1699978 4 0.6191 0.011965 0.012 0.000 0.364 0.520 0.104
#> SRR1699979 4 0.5072 0.268999 0.000 0.020 0.456 0.516 0.008
#> SRR1699980 3 0.5456 0.061287 0.000 0.024 0.536 0.416 0.024
#> SRR1699981 4 0.4451 0.540926 0.000 0.000 0.340 0.644 0.016
#> SRR1699982 2 0.5338 0.461487 0.000 0.560 0.008 0.040 0.392
#> SRR1699983 4 0.5150 0.567686 0.000 0.024 0.296 0.652 0.028
#> SRR1699984 1 0.1243 0.897419 0.960 0.000 0.008 0.028 0.004
#> SRR1699985 4 0.6938 0.387140 0.000 0.232 0.156 0.556 0.056
#> SRR1699986 4 0.4000 0.587025 0.000 0.000 0.228 0.748 0.024
#> SRR1699988 3 0.5878 0.566473 0.000 0.136 0.664 0.172 0.028
#> SRR1699987 4 0.4384 0.549333 0.000 0.000 0.324 0.660 0.016
#> SRR1699989 2 0.6569 0.336602 0.000 0.628 0.108 0.168 0.096
#> SRR1699990 4 0.5338 0.564741 0.000 0.016 0.312 0.628 0.044
#> SRR1699992 3 0.5320 -0.007658 0.000 0.016 0.524 0.436 0.024
#> SRR1699991 3 0.5088 -0.090279 0.000 0.000 0.528 0.436 0.036
#> SRR1699993 4 0.5171 0.007011 0.000 0.000 0.456 0.504 0.040
#> SRR1699994 4 0.4165 0.559821 0.000 0.000 0.320 0.672 0.008
#> SRR1699995 4 0.6425 0.078672 0.028 0.000 0.316 0.548 0.108
#> SRR1699996 3 0.6685 0.364421 0.000 0.316 0.524 0.128 0.032
#> SRR1699997 4 0.5589 0.567345 0.000 0.040 0.280 0.640 0.040
#> SRR1699998 3 0.4580 0.606211 0.000 0.052 0.756 0.176 0.016
#> SRR1699999 4 0.6887 0.073053 0.060 0.000 0.304 0.528 0.108
#> SRR1700000 3 0.2937 0.633969 0.000 0.032 0.888 0.036 0.044
#> SRR1700002 3 0.4690 0.552483 0.000 0.036 0.724 0.224 0.016
#> SRR1700001 3 0.5606 0.086587 0.000 0.028 0.528 0.416 0.028
#> SRR1700003 3 0.5157 0.565131 0.000 0.052 0.712 0.204 0.032
#> SRR1700004 5 0.8561 0.171614 0.000 0.248 0.200 0.264 0.288
#> SRR1700005 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 3 0.4427 0.615141 0.000 0.144 0.780 0.056 0.020
#> SRR1700007 2 0.4135 0.521069 0.000 0.656 0.000 0.004 0.340
#> SRR1700008 4 0.4152 0.580531 0.000 0.000 0.296 0.692 0.012
#> SRR1700009 1 0.0162 0.914375 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700010 3 0.3463 0.647028 0.000 0.032 0.836 0.124 0.008
#> SRR1700011 2 0.6247 0.106645 0.000 0.508 0.372 0.108 0.012
#> SRR1700013 3 0.3679 0.657023 0.000 0.040 0.836 0.104 0.020
#> SRR1700012 3 0.3774 0.631183 0.000 0.032 0.808 0.152 0.008
#> SRR1700014 4 0.8041 0.319698 0.000 0.188 0.180 0.448 0.184
#> SRR1700015 3 0.3001 0.631042 0.000 0.032 0.884 0.032 0.052
#> SRR1700016 1 0.5266 0.776975 0.708 0.000 0.036 0.056 0.200
#> SRR1700018 3 0.2844 0.650093 0.000 0.032 0.888 0.064 0.016
#> SRR1700017 3 0.3288 0.638832 0.000 0.028 0.868 0.060 0.044
#> SRR1700019 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700020 3 0.6068 0.240427 0.000 0.000 0.532 0.328 0.140
#> SRR1700021 2 0.5246 0.424067 0.000 0.524 0.016 0.020 0.440
#> SRR1700023 3 0.4290 0.604818 0.000 0.032 0.768 0.184 0.016
#> SRR1700022 3 0.3378 0.630722 0.000 0.032 0.864 0.048 0.056
#> SRR1700024 4 0.4540 0.557629 0.000 0.000 0.320 0.656 0.024
#> SRR1700025 3 0.4544 0.627569 0.000 0.068 0.764 0.156 0.012
#> SRR1700026 3 0.6138 0.282807 0.000 0.208 0.596 0.008 0.188
#> SRR1700027 3 0.2861 0.641243 0.000 0.032 0.892 0.040 0.036
#> SRR1700028 3 0.6421 0.496247 0.000 0.084 0.620 0.220 0.076
#> SRR1700029 3 0.5012 0.150353 0.000 0.004 0.600 0.364 0.032
#> SRR1700030 2 0.6787 0.390487 0.000 0.524 0.052 0.104 0.320
#> SRR1700031 4 0.4639 0.492144 0.000 0.000 0.368 0.612 0.020
#> SRR1700032 3 0.5196 0.585229 0.000 0.068 0.716 0.188 0.028
#> SRR1700034 4 0.6828 0.094600 0.060 0.000 0.288 0.544 0.108
#> SRR1700035 2 0.7542 -0.037913 0.000 0.368 0.040 0.328 0.264
#> SRR1700033 4 0.4855 0.296074 0.000 0.000 0.424 0.552 0.024
#> SRR1700036 4 0.8100 0.047337 0.000 0.244 0.128 0.412 0.216
#> SRR1700037 2 0.4841 0.459862 0.000 0.560 0.000 0.024 0.416
#> SRR1700038 2 0.8228 -0.084375 0.000 0.348 0.216 0.128 0.308
#> SRR1700039 4 0.3381 0.592166 0.000 0.000 0.176 0.808 0.016
#> SRR1700040 3 0.4867 -0.115769 0.000 0.000 0.544 0.432 0.024
#> SRR1700041 4 0.4067 0.576773 0.000 0.000 0.300 0.692 0.008
#> SRR1700042 4 0.3969 0.572745 0.000 0.000 0.304 0.692 0.004
#> SRR1700043 3 0.6454 0.158316 0.004 0.000 0.488 0.340 0.168
#> SRR1700045 4 0.4058 0.611542 0.000 0.000 0.236 0.740 0.024
#> SRR1700044 4 0.6661 0.448392 0.000 0.048 0.340 0.520 0.092
#> SRR1700046 4 0.3814 0.593601 0.000 0.000 0.276 0.720 0.004
#> SRR1700047 4 0.3112 0.596469 0.000 0.000 0.100 0.856 0.044
#> SRR1700048 4 0.7365 -0.014584 0.000 0.040 0.364 0.396 0.200
#> SRR1700049 4 0.3476 0.575659 0.000 0.000 0.176 0.804 0.020
#> SRR1700050 4 0.4817 0.580255 0.000 0.000 0.300 0.656 0.044
#> SRR1700051 4 0.5981 0.048934 0.004 0.000 0.348 0.540 0.108
#> SRR1700052 4 0.3182 0.503273 0.000 0.000 0.124 0.844 0.032
#> SRR1700053 4 0.4832 0.616562 0.000 0.004 0.224 0.708 0.064
#> SRR1700054 4 0.3675 0.601763 0.000 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1700055 4 0.7010 0.116993 0.084 0.000 0.260 0.548 0.108
#> SRR1700056 4 0.3734 0.613836 0.000 0.000 0.168 0.796 0.036
#> SRR1700057 4 0.3961 0.583484 0.000 0.000 0.212 0.760 0.028
#> SRR1700058 4 0.3060 0.540787 0.000 0.000 0.128 0.848 0.024
#> SRR1700059 4 0.3944 0.612186 0.000 0.000 0.200 0.768 0.032
#> SRR1700060 4 0.3852 0.590288 0.000 0.000 0.220 0.760 0.020
#> SRR1700061 4 0.3197 0.608268 0.000 0.000 0.140 0.836 0.024
#> SRR1700062 4 0.3789 0.596806 0.000 0.000 0.224 0.760 0.016
#> SRR1700063 4 0.3326 0.570849 0.000 0.000 0.152 0.824 0.024
#> SRR1700064 4 0.4141 0.610967 0.000 0.000 0.236 0.736 0.028
#> SRR1700065 4 0.3527 0.584704 0.000 0.000 0.172 0.804 0.024
#> SRR1700066 4 0.3821 0.591100 0.000 0.000 0.216 0.764 0.020
#> SRR1700067 4 0.4352 0.611283 0.000 0.000 0.244 0.720 0.036
#> SRR1700068 4 0.4495 0.611152 0.000 0.000 0.244 0.712 0.044
#> SRR1700069 4 0.3750 0.607022 0.000 0.000 0.232 0.756 0.012
#> SRR1700070 4 0.5430 0.588838 0.000 0.016 0.268 0.652 0.064
#> SRR1700071 4 0.4401 0.548899 0.000 0.000 0.328 0.656 0.016
#> SRR1700072 4 0.5820 0.007267 0.000 0.000 0.376 0.524 0.100
#> SRR1700073 2 0.6989 0.064962 0.000 0.396 0.012 0.228 0.364
#> SRR1700075 4 0.4086 0.590626 0.000 0.000 0.284 0.704 0.012
#> SRR1700074 4 0.4482 0.529163 0.000 0.000 0.348 0.636 0.016
#> SRR1700076 4 0.4491 0.557748 0.000 0.000 0.328 0.652 0.020
#> SRR1700077 4 0.4540 0.538752 0.000 0.000 0.340 0.640 0.020
#> SRR1700078 4 0.4525 0.526728 0.000 0.000 0.360 0.624 0.016
#> SRR1700080 4 0.4384 0.551797 0.000 0.000 0.324 0.660 0.016
#> SRR1700079 4 0.4677 0.525566 0.000 0.000 0.300 0.664 0.036
#> SRR1700081 4 0.3675 0.587493 0.000 0.000 0.188 0.788 0.024
#> SRR1700082 4 0.4763 0.479726 0.000 0.020 0.360 0.616 0.004
#> SRR1700083 3 0.5230 -0.107609 0.000 0.000 0.504 0.452 0.044
#> SRR1700084 4 0.5696 0.079793 0.000 0.000 0.344 0.560 0.096
#> SRR1700085 4 0.7838 -0.030017 0.000 0.308 0.112 0.424 0.156
#> SRR1700086 4 0.4540 0.557725 0.000 0.000 0.320 0.656 0.024
#> SRR1700087 3 0.5008 0.388881 0.000 0.284 0.668 0.024 0.024
#> SRR1700088 3 0.4604 0.626802 0.000 0.124 0.776 0.076 0.024
#> SRR1700089 3 0.5448 0.324511 0.000 0.300 0.624 0.008 0.068
#> SRR1700091 3 0.6586 0.183030 0.000 0.412 0.440 0.132 0.016
#> SRR1700090 2 0.8409 -0.161239 0.000 0.348 0.260 0.172 0.220
#> SRR1700092 2 0.4179 0.471142 0.000 0.800 0.112 0.076 0.012
#> SRR1700094 3 0.5215 0.074633 0.000 0.444 0.520 0.008 0.028
#> SRR1700093 2 0.5760 0.489780 0.000 0.620 0.016 0.084 0.280
#> SRR1700095 5 0.6361 0.298627 0.004 0.068 0.268 0.056 0.604
#> SRR1700096 3 0.6721 0.349581 0.000 0.340 0.480 0.164 0.016
#> SRR1700097 3 0.5875 0.375726 0.000 0.016 0.636 0.228 0.120
#> SRR1700098 2 0.0162 0.582920 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700099 2 0.0693 0.582165 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1700100 2 0.4118 0.441988 0.000 0.788 0.160 0.040 0.012
#> SRR1700101 2 0.0451 0.582647 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1700102 2 0.3872 0.497883 0.000 0.816 0.116 0.060 0.008
#> SRR1700104 3 0.6303 0.499455 0.000 0.128 0.616 0.220 0.036
#> SRR1700103 3 0.5823 0.530275 0.000 0.120 0.644 0.220 0.016
#> SRR1700105 2 0.6212 0.446766 0.000 0.552 0.040 0.064 0.344
#> SRR1700106 2 0.6439 0.437760 0.000 0.564 0.044 0.088 0.304
#> SRR1700107 2 0.6782 0.180948 0.000 0.588 0.224 0.100 0.088
#> SRR1700108 2 0.1704 0.587156 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1700109 2 0.2621 0.581310 0.000 0.876 0.004 0.008 0.112
#> SRR1700110 2 0.1764 0.584408 0.000 0.940 0.012 0.012 0.036
#> SRR1700112 2 0.5311 0.447325 0.000 0.544 0.008 0.036 0.412
#> SRR1700111 5 0.8287 0.223987 0.000 0.256 0.304 0.124 0.316
#> SRR1700113 2 0.4401 0.521384 0.000 0.656 0.000 0.016 0.328
#> SRR1700114 2 0.6431 0.266710 0.000 0.612 0.152 0.196 0.040
#> SRR1700115 2 0.3089 0.560349 0.000 0.880 0.032 0.048 0.040
#> SRR1700116 4 0.7804 0.397815 0.000 0.176 0.208 0.480 0.136
#> SRR1700117 4 0.6437 0.343383 0.000 0.064 0.172 0.632 0.132
#> SRR1700119 2 0.8214 0.000779 0.000 0.364 0.148 0.180 0.308
#> SRR1700118 4 0.7008 0.437849 0.000 0.084 0.236 0.560 0.120
#> SRR1700120 4 0.4339 0.585065 0.000 0.000 0.296 0.684 0.020
#> SRR1700121 2 0.5981 0.438087 0.000 0.540 0.016 0.076 0.368
#> SRR1700122 2 0.6685 0.178608 0.000 0.408 0.008 0.176 0.408
#> SRR1700123 4 0.6043 0.471541 0.000 0.092 0.072 0.672 0.164
#> SRR1700125 2 0.5611 0.433740 0.000 0.528 0.008 0.056 0.408
#> SRR1700126 4 0.4744 0.440029 0.000 0.000 0.408 0.572 0.020
#> SRR1700127 4 0.5564 0.589049 0.000 0.064 0.224 0.676 0.036
#> SRR1700124 4 0.4973 0.612151 0.000 0.012 0.184 0.724 0.080
#> SRR1700128 4 0.5724 0.600363 0.000 0.020 0.248 0.644 0.088
#> SRR1700129 5 0.6902 -0.019625 0.000 0.352 0.008 0.232 0.408
#> SRR1700130 4 0.7232 -0.273092 0.000 0.288 0.020 0.396 0.296
#> SRR1700132 4 0.4622 0.612124 0.000 0.004 0.240 0.712 0.044
#> SRR1700131 4 0.4180 0.617015 0.000 0.000 0.220 0.744 0.036
#> SRR1700133 2 0.7042 -0.038430 0.000 0.364 0.008 0.300 0.328
#> SRR1700134 2 0.7058 -0.128296 0.000 0.340 0.008 0.316 0.336
#> SRR1700135 4 0.7106 0.513423 0.000 0.096 0.204 0.564 0.136
#> SRR1700136 4 0.4938 0.611316 0.000 0.008 0.240 0.696 0.056
#> SRR1700137 4 0.6722 0.372134 0.000 0.132 0.076 0.604 0.188
#> SRR1700138 4 0.6647 0.527094 0.000 0.084 0.152 0.620 0.144
#> SRR1700140 4 0.6226 0.129782 0.000 0.156 0.024 0.616 0.204
#> SRR1700139 4 0.5337 0.593996 0.000 0.036 0.140 0.724 0.100
#> SRR1700141 5 0.7039 0.070221 0.000 0.344 0.008 0.292 0.356
#> SRR1700142 4 0.4640 0.607225 0.000 0.000 0.256 0.696 0.048
#> SRR1700143 4 0.4394 0.613681 0.000 0.004 0.228 0.732 0.036
#> SRR1700144 4 0.4608 0.616243 0.000 0.008 0.212 0.732 0.048
#> SRR1700145 4 0.6957 0.218716 0.000 0.132 0.084 0.576 0.208
#> SRR1700146 5 0.7046 0.110564 0.000 0.328 0.008 0.304 0.360
#> SRR1700147 4 0.4832 0.614772 0.000 0.004 0.224 0.708 0.064
#> SRR1700149 4 0.4125 0.611735 0.000 0.000 0.172 0.772 0.056
#> SRR1700148 4 0.5418 0.607523 0.000 0.020 0.196 0.692 0.092
#> SRR1700150 5 0.6927 0.040652 0.000 0.352 0.004 0.284 0.360
#> SRR1700152 4 0.5706 0.583979 0.000 0.020 0.176 0.672 0.132
#> SRR1700151 4 0.5374 0.605535 0.000 0.008 0.264 0.652 0.076
#> SRR1700153 4 0.5482 0.607835 0.000 0.028 0.196 0.692 0.084
#> SRR1700154 4 0.5670 0.585494 0.000 0.028 0.172 0.684 0.116
#> SRR1700155 4 0.5976 0.483815 0.000 0.084 0.072 0.676 0.168
#> SRR1700156 4 0.4969 0.602578 0.000 0.004 0.264 0.676 0.056
#> SRR1700158 4 0.4607 0.518000 0.000 0.016 0.100 0.772 0.112
#> SRR1700159 5 0.6924 0.090509 0.000 0.324 0.004 0.292 0.380
#> SRR1700157 4 0.4878 0.615440 0.000 0.012 0.208 0.720 0.060
#> SRR1700160 4 0.6868 0.282753 0.000 0.148 0.064 0.576 0.212
#> SRR1700161 4 0.7434 0.120366 0.000 0.216 0.076 0.504 0.204
#> SRR1700162 2 0.7050 -0.094184 0.000 0.356 0.008 0.308 0.328
#> SRR1700164 5 0.8339 0.324855 0.004 0.156 0.224 0.212 0.404
#> SRR1700163 4 0.5780 0.378135 0.000 0.012 0.228 0.640 0.120
#> SRR1700165 4 0.6511 0.517832 0.000 0.108 0.128 0.640 0.124
#> SRR1700166 2 0.7030 -0.013574 0.000 0.368 0.008 0.288 0.336
#> SRR1700168 2 0.5377 0.444943 0.000 0.540 0.008 0.040 0.412
#> SRR1700167 4 0.4797 0.570441 0.000 0.020 0.116 0.760 0.104
#> SRR1700170 2 0.6684 0.224542 0.000 0.432 0.012 0.160 0.396
#> SRR1700169 2 0.6944 0.081795 0.000 0.392 0.008 0.244 0.356
#> SRR1700171 4 0.6997 -0.053067 0.040 0.000 0.368 0.456 0.136
#> SRR1700172 4 0.8154 -0.233801 0.000 0.284 0.100 0.324 0.292
#> SRR1700174 4 0.8083 0.221149 0.000 0.184 0.164 0.436 0.216
#> SRR1700173 4 0.7160 0.481652 0.000 0.132 0.192 0.564 0.112
#> SRR1700175 2 0.7172 -0.015940 0.000 0.368 0.016 0.268 0.348
#> SRR1700176 4 0.4482 0.606728 0.000 0.004 0.252 0.712 0.032
#> SRR1700178 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700177 2 0.6425 0.292980 0.000 0.460 0.008 0.136 0.396
#> SRR1700180 2 0.1281 0.564190 0.000 0.956 0.012 0.000 0.032
#> SRR1700179 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700181 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700183 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700184 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700186 2 0.4672 0.369209 0.016 0.676 0.296 0.004 0.008
#> SRR1700187 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700192 1 0.5206 0.675501 0.544 0.000 0.036 0.004 0.416
#> SRR1700190 5 0.6818 -0.575493 0.408 0.044 0.088 0.004 0.456
#> SRR1700191 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0290 0.913239 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700193 2 0.1082 0.569033 0.000 0.964 0.008 0.000 0.028
#> SRR1700195 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700194 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700197 1 0.5782 0.627001 0.488 0.000 0.076 0.004 0.432
#> SRR1700198 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700199 2 0.0955 0.567496 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1700200 2 0.2570 0.519981 0.000 0.888 0.028 0.000 0.084
#> SRR1700201 2 0.0404 0.579260 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700202 1 0.7936 0.145939 0.404 0.180 0.048 0.024 0.344
#> SRR1700203 2 0.0404 0.579212 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700204 2 0.0290 0.580376 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700206 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700207 2 0.0162 0.581351 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700208 5 0.7338 -0.504659 0.360 0.096 0.084 0.004 0.456
#> SRR1700205 2 0.5144 0.405140 0.000 0.520 0.024 0.008 0.448
#> SRR1700209 2 0.0451 0.583093 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700210 2 0.4452 0.505475 0.000 0.696 0.032 0.000 0.272
#> SRR1700211 2 0.4317 0.496137 0.000 0.764 0.076 0.000 0.160
#> SRR1700212 2 0.1638 0.567423 0.000 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1700213 3 0.3666 0.576291 0.000 0.032 0.824 0.012 0.132
#> SRR1700214 2 0.1341 0.581774 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1700215 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0162 0.582920 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700216 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.2157 0.564742 0.000 0.920 0.036 0.040 0.004
#> SRR1700219 2 0.0833 0.580820 0.000 0.976 0.004 0.016 0.004
#> SRR1700222 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0613 0.582797 0.000 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR1700221 2 0.0703 0.577645 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700223 2 0.0162 0.582770 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700224 2 0.2732 0.574019 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1700226 2 0.0290 0.580371 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700229 2 0.0992 0.578727 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1700225 3 0.4063 0.657004 0.000 0.056 0.812 0.112 0.020
#> SRR1700227 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.4971 0.732875 0.628 0.000 0.036 0.004 0.332
#> SRR1700231 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700228 2 0.5889 0.244807 0.000 0.624 0.260 0.096 0.020
#> SRR1700232 2 0.0404 0.581631 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1700233 2 0.1981 0.556540 0.000 0.920 0.064 0.000 0.016
#> SRR1700234 5 0.6519 0.162669 0.000 0.340 0.204 0.000 0.456
#> SRR1700235 2 0.2116 0.565737 0.000 0.924 0.040 0.028 0.008
#> SRR1700237 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700236 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700238 2 0.0865 0.570772 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1700239 1 0.0162 0.914375 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.5160 -0.221147 0.000 0.008 0.492 0.476 0.024
#> SRR1700243 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700244 2 0.1671 0.581337 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1700242 1 0.4973 0.709985 0.592 0.000 0.028 0.004 0.376
#> SRR1700246 5 0.5880 -0.624119 0.452 0.000 0.084 0.004 0.460
#> SRR1700245 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700247 1 0.0162 0.914375 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700249 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0162 0.581249 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700248 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700251 2 0.0794 0.575284 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1700252 3 0.5412 0.038022 0.000 0.444 0.512 0.020 0.024
#> SRR1700253 2 0.3074 0.565405 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1700256 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700254 1 0.0000 0.915047 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.1121 0.576228 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1700257 2 0.0451 0.583968 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700258 2 0.0703 0.573359 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1700259 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700260 2 0.0162 0.582398 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.2342 0.578094 0.000 0.916 0.020 0.024 0.040
#> SRR1700262 2 0.0932 0.585763 0.000 0.972 0.004 0.004 0.020
#> SRR1700263 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700264 2 0.4403 0.269584 0.000 0.608 0.384 0.008 0.000
#> SRR1700265 5 0.7379 -0.054174 0.152 0.132 0.172 0.000 0.544
#> SRR1700266 2 0.2179 0.543942 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1700268 2 0.0566 0.585482 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1700270 2 0.0609 0.575867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700267 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700271 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700272 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700273 2 0.0510 0.577819 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700274 2 0.0000 0.581947 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700277 3 0.5495 0.334211 0.000 0.292 0.632 0.016 0.060
#> SRR1700275 2 0.4527 0.488989 0.000 0.596 0.000 0.012 0.392
#> SRR1700276 2 0.3876 0.530651 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1700278 2 0.4752 0.466977 0.000 0.568 0.000 0.020 0.412
#> SRR1700279 2 0.4497 0.466219 0.000 0.568 0.008 0.000 0.424
#> SRR1700280 2 0.4481 0.470817 0.000 0.576 0.008 0.000 0.416
#> SRR1700281 2 0.0324 0.582970 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700283 2 0.4138 0.497353 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1700282 2 0.5459 0.460196 0.000 0.600 0.084 0.000 0.316
#> SRR1700284 2 0.5311 0.447325 0.000 0.544 0.008 0.036 0.412
#> SRR1700285 2 0.5289 0.457394 0.000 0.556 0.008 0.036 0.400
#> SRR1700286 2 0.3831 0.523437 0.000 0.824 0.112 0.048 0.016
#> SRR1700287 2 0.4808 0.472198 0.000 0.576 0.000 0.024 0.400
#> SRR1700290 5 0.8244 0.304766 0.004 0.132 0.220 0.232 0.412
#> SRR1700289 2 0.5146 0.490511 0.000 0.608 0.008 0.036 0.348
#> SRR1700288 2 0.1792 0.584089 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1700292 2 0.4876 0.470327 0.000 0.576 0.000 0.028 0.396
#> SRR1700291 2 0.5242 0.453176 0.000 0.548 0.008 0.032 0.412
#> SRR1700293 2 0.5155 0.460648 0.000 0.560 0.008 0.028 0.404
#> SRR1700294 2 0.6978 0.024807 0.000 0.376 0.008 0.256 0.360
#> SRR1700295 5 0.8391 0.389924 0.000 0.196 0.204 0.232 0.368
#> SRR1700297 2 0.5370 0.446741 0.000 0.544 0.008 0.040 0.408
#> SRR1700296 2 0.4833 0.462516 0.000 0.564 0.000 0.024 0.412
#> SRR1700298 2 0.5184 0.446235 0.000 0.544 0.008 0.028 0.420
#> SRR1700299 5 0.6960 -0.060482 0.000 0.368 0.008 0.248 0.376
#> SRR1700300 4 0.7013 -0.234480 0.000 0.268 0.012 0.428 0.292
#> SRR1700302 2 0.6491 0.263179 0.000 0.440 0.008 0.144 0.408
#> SRR1700301 2 0.5623 0.420218 0.000 0.520 0.008 0.056 0.416
#> SRR1700303 2 0.5830 0.397476 0.000 0.504 0.008 0.072 0.416
#> SRR1700304 5 0.6138 -0.210106 0.000 0.420 0.040 0.048 0.492
#> SRR1700305 2 0.5423 0.436772 0.000 0.532 0.012 0.036 0.420
#> SRR1700306 4 0.6148 0.354395 0.000 0.104 0.060 0.656 0.180
#> SRR1700308 2 0.6541 0.352093 0.000 0.496 0.016 0.136 0.352
#> SRR1700307 4 0.7662 0.395078 0.000 0.140 0.160 0.504 0.196
#> SRR1700309 4 0.6505 0.165071 0.000 0.168 0.028 0.584 0.220
#> SRR1700310 2 0.6684 0.180824 0.000 0.416 0.008 0.176 0.400
#> SRR1700311 2 0.7023 -0.005971 0.000 0.380 0.008 0.292 0.320
#> SRR1700312 2 0.5751 0.447179 0.000 0.548 0.008 0.072 0.372
#> SRR1700313 4 0.6811 0.239530 0.000 0.140 0.052 0.564 0.244
#> SRR1700314 4 0.6807 0.123408 0.000 0.168 0.040 0.556 0.236
#> SRR1700315 2 0.7048 -0.077786 0.000 0.356 0.008 0.332 0.304
#> SRR1700316 2 0.6971 0.250823 0.000 0.460 0.020 0.200 0.320
#> SRR1700317 2 0.5424 0.488655 0.000 0.600 0.008 0.056 0.336
#> SRR1700318 2 0.6815 0.229189 0.000 0.440 0.096 0.048 0.416
#> SRR1700319 2 0.7135 -0.057259 0.000 0.356 0.012 0.304 0.328
#> SRR1700320 2 0.6664 0.182338 0.000 0.412 0.008 0.172 0.408
#> SRR1700322 2 0.5821 0.423100 0.000 0.524 0.020 0.052 0.404
#> SRR1700321 2 0.5374 0.503695 0.000 0.632 0.008 0.064 0.296
#> SRR1700323 2 0.6713 0.233617 0.000 0.464 0.008 0.196 0.332
#> SRR1700324 2 0.5318 0.444122 0.000 0.540 0.008 0.036 0.416
#> SRR1700325 2 0.3969 0.532850 0.000 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR1700326 5 0.5976 -0.032750 0.136 0.028 0.184 0.000 0.652
#> SRR1700327 2 0.4308 0.503641 0.000 0.804 0.068 0.096 0.032
#> SRR1700329 2 0.5311 0.447325 0.000 0.544 0.008 0.036 0.412
#> SRR1700328 2 0.6767 0.217833 0.000 0.468 0.220 0.008 0.304
#> SRR1700330 2 0.6632 0.274851 0.000 0.452 0.064 0.060 0.424
#> SRR1700331 2 0.5508 0.429535 0.000 0.528 0.008 0.048 0.416
#> SRR1700332 2 0.4958 0.466122 0.000 0.568 0.000 0.032 0.400
#> SRR1700333 2 0.5086 0.460391 0.000 0.560 0.008 0.024 0.408
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 2 0.0909 0.84169 0.000 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1699875 6 0.2295 0.72552 0.000 0.032 0.020 0.028 0.008 0.912
#> SRR1699876 2 0.2066 0.79469 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072 0.000
#> SRR1699877 2 0.1728 0.82334 0.000 0.924 0.000 0.064 0.004 0.008
#> SRR1699879 2 0.0551 0.84568 0.000 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1699878 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1699880 6 0.2086 0.73584 0.000 0.008 0.064 0.012 0.004 0.912
#> SRR1699881 6 0.2417 0.73891 0.000 0.008 0.088 0.012 0.004 0.888
#> SRR1699882 2 0.0146 0.84493 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1699883 2 0.1049 0.83861 0.000 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1699884 2 0.0951 0.84401 0.000 0.968 0.000 0.020 0.008 0.004
#> SRR1699885 2 0.0806 0.84233 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1699886 2 0.4585 0.52010 0.000 0.692 0.000 0.116 0.192 0.000
#> SRR1699888 2 0.2842 0.75035 0.000 0.852 0.000 0.044 0.104 0.000
#> SRR1699889 5 0.5230 0.66136 0.000 0.324 0.000 0.100 0.572 0.004
#> SRR1699890 4 0.6290 0.15231 0.000 0.292 0.000 0.452 0.240 0.016
#> SRR1699887 2 0.2176 0.78790 0.000 0.896 0.000 0.024 0.080 0.000
#> SRR1699891 2 0.5408 -0.28725 0.000 0.476 0.000 0.116 0.408 0.000
#> SRR1699892 2 0.5254 0.54072 0.000 0.676 0.020 0.036 0.048 0.220
#> SRR1699893 5 0.5570 0.51655 0.000 0.400 0.004 0.064 0.508 0.024
#> SRR1699894 5 0.5653 0.50712 0.000 0.376 0.000 0.156 0.468 0.000
#> SRR1699895 5 0.5725 0.60510 0.000 0.280 0.000 0.208 0.512 0.000
#> SRR1699896 5 0.5762 0.47011 0.000 0.380 0.000 0.152 0.464 0.004
#> SRR1699897 2 0.5125 0.41129 0.000 0.632 0.024 0.020 0.028 0.296
#> SRR1699898 3 0.2887 0.77205 0.000 0.000 0.856 0.008 0.032 0.104
#> SRR1699900 4 0.7155 0.29847 0.000 0.176 0.000 0.420 0.284 0.120
#> SRR1699899 2 0.4720 -0.09059 0.000 0.560 0.000 0.052 0.388 0.000
#> SRR1699902 4 0.8154 0.49265 0.000 0.060 0.144 0.376 0.256 0.164
#> SRR1699901 5 0.7025 0.05382 0.000 0.016 0.180 0.140 0.528 0.136
#> SRR1699903 5 0.5132 0.72801 0.000 0.280 0.004 0.076 0.628 0.012
#> SRR1699904 5 0.5832 0.34589 0.000 0.180 0.004 0.324 0.492 0.000
#> SRR1699905 4 0.5788 0.50143 0.000 0.008 0.020 0.548 0.328 0.096
#> SRR1699906 5 0.4896 0.74477 0.000 0.256 0.000 0.064 0.660 0.020
#> SRR1699907 5 0.4626 0.72876 0.000 0.272 0.000 0.076 0.652 0.000
#> SRR1699908 5 0.4762 0.73202 0.000 0.272 0.000 0.076 0.648 0.004
#> SRR1699909 5 0.4415 0.71781 0.000 0.156 0.076 0.016 0.748 0.004
#> SRR1699910 4 0.7196 0.35119 0.000 0.092 0.104 0.472 0.296 0.036
#> SRR1699911 5 0.4843 0.72474 0.000 0.232 0.000 0.116 0.652 0.000
#> SRR1699912 5 0.3445 0.74465 0.000 0.260 0.000 0.008 0.732 0.000
#> SRR1699913 5 0.4130 0.74478 0.000 0.264 0.000 0.028 0.700 0.008
#> SRR1699914 5 0.4775 0.33467 0.000 0.020 0.256 0.028 0.680 0.016
#> SRR1699915 4 0.7190 0.19957 0.000 0.200 0.084 0.484 0.212 0.020
#> SRR1699916 5 0.4045 0.74000 0.000 0.268 0.000 0.028 0.700 0.004
#> SRR1699917 5 0.7129 0.38414 0.000 0.080 0.212 0.040 0.524 0.144
#> SRR1699918 5 0.5898 0.63663 0.000 0.088 0.188 0.032 0.648 0.044
#> SRR1699919 5 0.4420 0.73079 0.000 0.172 0.060 0.020 0.744 0.004
#> SRR1699920 5 0.4202 0.51678 0.000 0.024 0.116 0.040 0.792 0.028
#> SRR1699921 5 0.6152 0.31692 0.000 0.060 0.056 0.236 0.608 0.040
#> SRR1699922 5 0.4456 0.73803 0.000 0.268 0.000 0.064 0.668 0.000
#> SRR1699923 4 0.7692 0.33868 0.000 0.004 0.220 0.332 0.272 0.172
#> SRR1699924 3 0.5742 0.39469 0.000 0.000 0.516 0.028 0.364 0.092
#> SRR1699925 1 0.1007 0.96278 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.3914 0.75008 0.000 0.228 0.012 0.016 0.740 0.004
#> SRR1699927 5 0.3852 0.74995 0.000 0.240 0.016 0.012 0.732 0.000
#> SRR1699929 5 0.5771 0.67950 0.000 0.256 0.000 0.076 0.600 0.068
#> SRR1699928 5 0.4030 0.75087 0.000 0.236 0.024 0.008 0.728 0.004
#> SRR1699930 5 0.4634 0.71202 0.000 0.300 0.000 0.056 0.640 0.004
#> SRR1699931 5 0.6140 0.52472 0.000 0.336 0.000 0.068 0.512 0.084
#> SRR1699933 2 0.6337 0.08007 0.000 0.464 0.000 0.064 0.104 0.368
#> SRR1699932 5 0.4157 0.73363 0.000 0.276 0.000 0.032 0.688 0.004
#> SRR1699934 1 0.1007 0.96278 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1699935 2 0.5037 -0.24284 0.000 0.516 0.000 0.036 0.428 0.020
#> SRR1699936 2 0.2669 0.74753 0.000 0.836 0.000 0.008 0.000 0.156
#> SRR1699937 6 0.2604 0.74145 0.000 0.032 0.056 0.024 0.000 0.888
#> SRR1699938 6 0.4365 0.65167 0.000 0.188 0.036 0.024 0.008 0.744
#> SRR1699940 6 0.2909 0.73590 0.000 0.008 0.096 0.020 0.012 0.864
#> SRR1699939 6 0.4581 0.73502 0.000 0.120 0.080 0.024 0.016 0.760
#> SRR1699941 6 0.3393 0.73011 0.000 0.008 0.132 0.024 0.012 0.824
#> SRR1699942 6 0.1974 0.73468 0.000 0.012 0.048 0.020 0.000 0.920
#> SRR1699943 6 0.2664 0.74216 0.000 0.040 0.056 0.020 0.000 0.884
#> SRR1699944 6 0.2521 0.74087 0.000 0.032 0.056 0.020 0.000 0.892
#> SRR1699945 6 0.3184 0.62539 0.000 0.004 0.008 0.132 0.024 0.832
#> SRR1699946 6 0.2533 0.73065 0.000 0.032 0.028 0.032 0.008 0.900
#> SRR1699947 6 0.2825 0.73693 0.000 0.036 0.040 0.032 0.008 0.884
#> SRR1699948 6 0.4667 0.41117 0.000 0.380 0.016 0.016 0.004 0.584
#> SRR1699949 2 0.2804 0.74620 0.000 0.836 0.004 0.004 0.004 0.152
#> SRR1699950 6 0.5070 0.32750 0.000 0.412 0.016 0.024 0.012 0.536
#> SRR1699951 6 0.4121 0.75035 0.000 0.096 0.092 0.012 0.012 0.788
#> SRR1699952 6 0.3050 0.75342 0.000 0.048 0.076 0.012 0.004 0.860
#> SRR1699953 6 0.4819 0.56812 0.000 0.284 0.032 0.016 0.012 0.656
#> SRR1699954 6 0.2530 0.69794 0.000 0.024 0.004 0.052 0.024 0.896
#> SRR1699955 6 0.5298 0.45723 0.000 0.368 0.044 0.016 0.012 0.560
#> SRR1699956 6 0.2732 0.67018 0.000 0.008 0.024 0.076 0.012 0.880
#> SRR1699957 6 0.3140 0.75513 0.000 0.076 0.068 0.004 0.004 0.848
#> SRR1699959 6 0.3983 0.67604 0.000 0.060 0.020 0.084 0.024 0.812
#> SRR1699958 2 0.4667 0.47192 0.000 0.664 0.036 0.004 0.016 0.280
#> SRR1699960 2 0.0922 0.84132 0.000 0.968 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR1699961 6 0.2257 0.73694 0.000 0.008 0.068 0.012 0.008 0.904
#> SRR1699962 6 0.5655 0.53817 0.000 0.320 0.084 0.012 0.016 0.568
#> SRR1699963 6 0.3680 0.74647 0.000 0.044 0.116 0.012 0.012 0.816
#> SRR1699964 6 0.4337 0.74492 0.000 0.068 0.128 0.020 0.012 0.772
#> SRR1699965 2 0.4480 0.32762 0.000 0.604 0.012 0.008 0.008 0.368
#> SRR1699966 6 0.4160 0.74744 0.000 0.084 0.100 0.012 0.016 0.788
#> SRR1699967 6 0.3824 0.74439 0.000 0.104 0.056 0.016 0.012 0.812
#> SRR1699968 6 0.4190 0.73109 0.000 0.040 0.156 0.016 0.016 0.772
#> SRR1699969 3 0.5235 0.31131 0.000 0.020 0.584 0.028 0.020 0.348
#> SRR1699971 6 0.2074 0.71286 0.000 0.016 0.016 0.028 0.016 0.924
#> SRR1699970 6 0.2798 0.73472 0.000 0.008 0.120 0.012 0.004 0.856
#> SRR1699972 6 0.2783 0.71859 0.000 0.044 0.024 0.028 0.016 0.888
#> SRR1699973 6 0.5122 0.69905 0.000 0.048 0.200 0.036 0.020 0.696
#> SRR1699974 3 0.2764 0.75228 0.000 0.000 0.872 0.024 0.020 0.084
#> SRR1699975 6 0.5803 0.37409 0.000 0.024 0.396 0.036 0.036 0.508
#> SRR1699976 6 0.3255 0.74642 0.000 0.036 0.128 0.004 0.004 0.828
#> SRR1699977 3 0.4317 0.71199 0.000 0.008 0.760 0.032 0.036 0.164
#> SRR1699978 4 0.6683 0.41847 0.008 0.000 0.288 0.464 0.036 0.204
#> SRR1699979 6 0.4528 0.45901 0.000 0.004 0.364 0.020 0.008 0.604
#> SRR1699980 6 0.6190 0.18760 0.000 0.028 0.404 0.016 0.092 0.460
#> SRR1699981 3 0.2905 0.75411 0.000 0.000 0.836 0.008 0.012 0.144
#> SRR1699982 5 0.5002 0.70845 0.000 0.304 0.000 0.068 0.616 0.012
#> SRR1699983 3 0.6018 -0.18857 0.000 0.016 0.448 0.044 0.052 0.440
#> SRR1699984 1 0.2146 0.92625 0.908 0.000 0.024 0.060 0.008 0.000
#> SRR1699985 6 0.6817 0.34482 0.000 0.052 0.360 0.040 0.088 0.460
#> SRR1699986 3 0.2515 0.75411 0.000 0.000 0.888 0.016 0.024 0.072
#> SRR1699988 6 0.6371 0.64500 0.000 0.152 0.172 0.028 0.048 0.600
#> SRR1699987 3 0.3421 0.73454 0.000 0.000 0.804 0.020 0.016 0.160
#> SRR1699989 2 0.7723 -0.31734 0.000 0.340 0.064 0.048 0.336 0.212
#> SRR1699990 3 0.5830 0.20704 0.000 0.012 0.540 0.044 0.052 0.352
#> SRR1699992 6 0.4808 0.47537 0.000 0.008 0.352 0.032 0.008 0.600
#> SRR1699991 3 0.3572 0.69291 0.000 0.000 0.764 0.032 0.000 0.204
#> SRR1699993 3 0.4803 0.61857 0.000 0.000 0.680 0.048 0.032 0.240
#> SRR1699994 3 0.2796 0.75489 0.000 0.000 0.864 0.020 0.016 0.100
#> SRR1699995 4 0.6713 0.34141 0.008 0.000 0.348 0.440 0.048 0.156
#> SRR1699996 6 0.6662 0.51059 0.000 0.272 0.088 0.032 0.068 0.540
#> SRR1699997 3 0.5361 0.54765 0.000 0.012 0.656 0.040 0.056 0.236
#> SRR1699998 6 0.4050 0.74509 0.000 0.064 0.132 0.008 0.012 0.784
#> SRR1699999 4 0.6732 0.41204 0.012 0.000 0.296 0.464 0.036 0.192
#> SRR1700000 6 0.3083 0.71079 0.000 0.016 0.088 0.012 0.024 0.860
#> SRR1700002 6 0.4225 0.71624 0.000 0.024 0.176 0.028 0.012 0.760
#> SRR1700001 6 0.4602 0.45278 0.000 0.008 0.364 0.024 0.004 0.600
#> SRR1700003 6 0.4487 0.72926 0.000 0.044 0.164 0.024 0.016 0.752
#> SRR1700004 5 0.7058 0.63982 0.000 0.148 0.152 0.080 0.560 0.060
#> SRR1700005 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700006 6 0.4503 0.65711 0.000 0.200 0.028 0.020 0.020 0.732
#> SRR1700007 2 0.3504 0.60922 0.000 0.776 0.000 0.024 0.196 0.004
#> SRR1700008 3 0.2102 0.77301 0.000 0.000 0.908 0.012 0.012 0.068
#> SRR1700009 1 0.0547 0.97745 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700010 6 0.2370 0.73754 0.000 0.008 0.076 0.012 0.008 0.896
#> SRR1700011 6 0.5224 0.56241 0.000 0.304 0.060 0.008 0.016 0.612
#> SRR1700013 6 0.3636 0.74851 0.000 0.080 0.052 0.012 0.024 0.832
#> SRR1700012 6 0.2567 0.74047 0.000 0.012 0.100 0.004 0.008 0.876
#> SRR1700014 5 0.6813 0.58961 0.000 0.116 0.216 0.056 0.560 0.052
#> SRR1700015 6 0.2250 0.72243 0.000 0.020 0.028 0.020 0.016 0.916
#> SRR1700016 4 0.5169 0.00531 0.404 0.000 0.012 0.536 0.012 0.036
#> SRR1700018 6 0.1862 0.73013 0.000 0.008 0.044 0.016 0.004 0.928
#> SRR1700017 6 0.1793 0.72726 0.000 0.008 0.040 0.016 0.004 0.932
#> SRR1700019 2 0.0363 0.84457 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700020 4 0.6375 0.38432 0.000 0.000 0.224 0.428 0.020 0.328
#> SRR1700021 5 0.5497 0.65611 0.000 0.244 0.000 0.172 0.580 0.004
#> SRR1700023 6 0.3489 0.73848 0.000 0.020 0.132 0.020 0.008 0.820
#> SRR1700022 6 0.2659 0.72272 0.000 0.020 0.052 0.024 0.012 0.892
#> SRR1700024 3 0.3680 0.73250 0.000 0.000 0.796 0.016 0.040 0.148
#> SRR1700025 6 0.3604 0.75303 0.000 0.080 0.076 0.004 0.016 0.824
#> SRR1700026 6 0.6456 0.37539 0.000 0.260 0.008 0.100 0.084 0.548
#> SRR1700027 6 0.2545 0.73090 0.000 0.028 0.040 0.016 0.016 0.900
#> SRR1700028 6 0.7158 0.44131 0.000 0.120 0.140 0.024 0.200 0.516
#> SRR1700029 3 0.4650 0.59384 0.000 0.000 0.652 0.040 0.016 0.292
#> SRR1700030 5 0.6410 0.67713 0.000 0.272 0.032 0.088 0.560 0.048
#> SRR1700031 3 0.3871 0.71509 0.000 0.000 0.792 0.044 0.028 0.136
#> SRR1700032 6 0.4572 0.74113 0.000 0.080 0.128 0.024 0.012 0.756
#> SRR1700034 4 0.6796 0.39177 0.016 0.000 0.316 0.468 0.048 0.152
#> SRR1700035 5 0.6104 0.71737 0.000 0.148 0.100 0.072 0.648 0.032
#> SRR1700033 3 0.4054 0.71498 0.000 0.000 0.760 0.024 0.036 0.180
#> SRR1700036 5 0.6458 0.63803 0.000 0.120 0.196 0.044 0.596 0.044
#> SRR1700037 5 0.4327 0.73944 0.000 0.260 0.000 0.048 0.688 0.004
#> SRR1700038 5 0.5944 0.67303 0.000 0.140 0.040 0.072 0.668 0.080
#> SRR1700039 3 0.2263 0.76897 0.000 0.000 0.900 0.004 0.036 0.060
#> SRR1700040 3 0.4073 0.69084 0.000 0.000 0.732 0.028 0.016 0.224
#> SRR1700041 3 0.2011 0.77330 0.000 0.000 0.912 0.004 0.020 0.064
#> SRR1700042 3 0.2936 0.76137 0.000 0.000 0.852 0.016 0.020 0.112
#> SRR1700043 4 0.6458 0.33556 0.004 0.000 0.272 0.408 0.012 0.304
#> SRR1700045 3 0.2318 0.77138 0.000 0.000 0.904 0.020 0.028 0.048
#> SRR1700044 5 0.6471 -0.03059 0.000 0.012 0.404 0.028 0.416 0.140
#> SRR1700046 3 0.2002 0.77300 0.000 0.000 0.916 0.008 0.020 0.056
#> SRR1700047 3 0.4403 0.70311 0.000 0.000 0.740 0.040 0.180 0.040
#> SRR1700048 5 0.6576 0.26872 0.000 0.012 0.148 0.096 0.576 0.168
#> SRR1700049 3 0.2444 0.76144 0.000 0.000 0.892 0.012 0.028 0.068
#> SRR1700050 3 0.3895 0.75552 0.000 0.000 0.804 0.040 0.096 0.060
#> SRR1700051 4 0.6738 0.33023 0.008 0.000 0.348 0.440 0.052 0.152
#> SRR1700052 3 0.3397 0.74918 0.000 0.000 0.836 0.024 0.056 0.084
#> SRR1700053 3 0.4306 0.71020 0.000 0.000 0.752 0.040 0.168 0.040
#> SRR1700054 3 0.2553 0.77188 0.000 0.000 0.888 0.012 0.044 0.056
#> SRR1700055 4 0.6779 0.39008 0.016 0.000 0.320 0.468 0.048 0.148
#> SRR1700056 3 0.3920 0.73632 0.000 0.000 0.788 0.036 0.140 0.036
#> SRR1700057 3 0.2756 0.77162 0.000 0.000 0.876 0.020 0.032 0.072
#> SRR1700058 3 0.3291 0.74384 0.000 0.000 0.840 0.024 0.040 0.096
#> SRR1700059 3 0.3210 0.76687 0.000 0.000 0.852 0.032 0.068 0.048
#> SRR1700060 3 0.2375 0.75398 0.000 0.000 0.896 0.016 0.020 0.068
#> SRR1700061 3 0.3864 0.74703 0.000 0.000 0.800 0.032 0.116 0.052
#> SRR1700062 3 0.2444 0.76413 0.000 0.000 0.892 0.012 0.028 0.068
#> SRR1700063 3 0.2434 0.76724 0.000 0.000 0.892 0.008 0.036 0.064
#> SRR1700064 3 0.3282 0.76209 0.000 0.000 0.848 0.036 0.068 0.048
#> SRR1700065 3 0.2177 0.76547 0.000 0.000 0.908 0.008 0.032 0.052
#> SRR1700066 3 0.2307 0.75476 0.000 0.000 0.900 0.012 0.024 0.064
#> SRR1700067 3 0.2317 0.77375 0.000 0.000 0.900 0.020 0.016 0.064
#> SRR1700068 3 0.3823 0.75135 0.000 0.000 0.808 0.040 0.100 0.052
#> SRR1700069 3 0.1850 0.77485 0.000 0.000 0.924 0.008 0.016 0.052
#> SRR1700070 3 0.4739 0.69786 0.000 0.000 0.732 0.044 0.084 0.140
#> SRR1700071 3 0.2555 0.75898 0.000 0.000 0.876 0.020 0.008 0.096
#> SRR1700072 3 0.6733 -0.22653 0.004 0.000 0.380 0.352 0.032 0.232
#> SRR1700073 5 0.4794 0.66248 0.000 0.112 0.076 0.044 0.752 0.016
#> SRR1700075 3 0.2566 0.77273 0.000 0.000 0.888 0.020 0.028 0.064
#> SRR1700074 3 0.3048 0.73568 0.000 0.000 0.824 0.020 0.004 0.152
#> SRR1700076 3 0.3123 0.76252 0.000 0.000 0.840 0.012 0.032 0.116
#> SRR1700077 3 0.2686 0.75675 0.000 0.000 0.868 0.024 0.008 0.100
#> SRR1700078 3 0.2752 0.77032 0.000 0.000 0.864 0.012 0.020 0.104
#> SRR1700080 3 0.2425 0.75534 0.000 0.000 0.880 0.012 0.008 0.100
#> SRR1700079 3 0.3058 0.74628 0.000 0.000 0.848 0.024 0.020 0.108
#> SRR1700081 3 0.2340 0.75257 0.000 0.000 0.900 0.016 0.024 0.060
#> SRR1700082 6 0.4855 0.22172 0.000 0.004 0.456 0.020 0.016 0.504
#> SRR1700083 3 0.4274 0.66805 0.000 0.000 0.736 0.040 0.024 0.200
#> SRR1700084 3 0.5066 0.57066 0.000 0.000 0.696 0.100 0.040 0.164
#> SRR1700085 5 0.7279 0.47334 0.000 0.124 0.264 0.040 0.484 0.088
#> SRR1700086 3 0.2355 0.76267 0.000 0.000 0.876 0.004 0.008 0.112
#> SRR1700087 6 0.5170 0.44439 0.000 0.356 0.012 0.028 0.024 0.580
#> SRR1700088 6 0.3809 0.70527 0.000 0.152 0.036 0.012 0.008 0.792
#> SRR1700089 6 0.5538 0.39422 0.000 0.332 0.004 0.068 0.028 0.568
#> SRR1700091 6 0.5655 0.54047 0.000 0.320 0.084 0.012 0.016 0.568
#> SRR1700090 5 0.7273 0.56177 0.000 0.272 0.076 0.080 0.492 0.080
#> SRR1700092 2 0.5040 0.42917 0.000 0.640 0.032 0.008 0.032 0.288
#> SRR1700094 2 0.5537 0.37958 0.000 0.608 0.016 0.032 0.052 0.292
#> SRR1700093 5 0.5641 0.54856 0.000 0.400 0.008 0.056 0.508 0.028
#> SRR1700095 4 0.6565 0.51442 0.004 0.076 0.020 0.596 0.164 0.140
#> SRR1700096 6 0.6261 0.52879 0.000 0.304 0.092 0.024 0.036 0.544
#> SRR1700097 3 0.6237 0.19714 0.000 0.008 0.424 0.148 0.016 0.404
#> SRR1700098 2 0.0653 0.84483 0.000 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR1700099 2 0.1074 0.83577 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028 0.000
#> SRR1700100 2 0.4280 0.67844 0.000 0.772 0.024 0.016 0.040 0.148
#> SRR1700101 2 0.0508 0.84413 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700102 2 0.4644 0.23922 0.000 0.584 0.024 0.004 0.008 0.380
#> SRR1700104 6 0.5316 0.70645 0.000 0.144 0.104 0.032 0.020 0.700
#> SRR1700103 6 0.5663 0.66825 0.000 0.168 0.148 0.008 0.032 0.644
#> SRR1700105 5 0.5564 0.69545 0.000 0.296 0.008 0.092 0.588 0.016
#> SRR1700106 5 0.6120 0.66208 0.000 0.312 0.028 0.088 0.548 0.024
#> SRR1700107 2 0.6935 0.14054 0.000 0.492 0.036 0.044 0.284 0.144
#> SRR1700108 2 0.2734 0.73937 0.000 0.860 0.004 0.016 0.116 0.004
#> SRR1700109 2 0.2485 0.77492 0.000 0.884 0.000 0.024 0.084 0.008
#> SRR1700110 2 0.2487 0.79157 0.000 0.892 0.000 0.024 0.064 0.020
#> SRR1700112 5 0.4449 0.73350 0.000 0.272 0.000 0.052 0.672 0.004
#> SRR1700111 5 0.6387 0.63535 0.000 0.140 0.048 0.088 0.632 0.092
#> SRR1700113 5 0.5394 0.53538 0.000 0.412 0.004 0.060 0.508 0.016
#> SRR1700114 6 0.7095 0.44590 0.000 0.296 0.112 0.048 0.060 0.484
#> SRR1700115 2 0.4311 0.62554 0.000 0.760 0.008 0.012 0.148 0.072
#> SRR1700116 5 0.7060 0.54708 0.000 0.132 0.240 0.056 0.520 0.052
#> SRR1700117 3 0.5851 0.36175 0.000 0.008 0.472 0.048 0.424 0.048
#> SRR1700119 5 0.6543 0.69808 0.000 0.200 0.060 0.092 0.596 0.052
#> SRR1700118 5 0.6091 0.34240 0.000 0.024 0.296 0.044 0.568 0.068
#> SRR1700120 3 0.2479 0.77479 0.000 0.000 0.892 0.016 0.028 0.064
#> SRR1700121 5 0.5768 0.73693 0.000 0.244 0.024 0.088 0.620 0.024
#> SRR1700122 5 0.3877 0.74121 0.000 0.184 0.036 0.008 0.768 0.004
#> SRR1700123 5 0.4996 0.39664 0.000 0.028 0.288 0.028 0.644 0.012
#> SRR1700125 5 0.4110 0.74063 0.000 0.268 0.000 0.040 0.692 0.000
#> SRR1700126 3 0.3687 0.74247 0.000 0.000 0.788 0.016 0.032 0.164
#> SRR1700127 3 0.4145 0.70996 0.000 0.044 0.804 0.028 0.092 0.032
#> SRR1700124 3 0.4806 0.57234 0.000 0.000 0.644 0.040 0.292 0.024
#> SRR1700128 3 0.4771 0.63910 0.000 0.000 0.680 0.036 0.244 0.040
#> SRR1700129 5 0.3959 0.73792 0.000 0.176 0.052 0.004 0.764 0.004
#> SRR1700130 5 0.4532 0.63605 0.000 0.084 0.112 0.028 0.764 0.012
#> SRR1700132 3 0.4019 0.74531 0.000 0.000 0.792 0.040 0.112 0.056
#> SRR1700131 3 0.3893 0.74160 0.000 0.000 0.796 0.036 0.124 0.044
#> SRR1700133 5 0.4971 0.67810 0.000 0.132 0.092 0.036 0.728 0.012
#> SRR1700134 5 0.4530 0.74854 0.000 0.224 0.060 0.008 0.704 0.004
#> SRR1700135 3 0.6336 0.31827 0.000 0.044 0.492 0.056 0.372 0.036
#> SRR1700136 3 0.4467 0.70821 0.000 0.000 0.736 0.040 0.180 0.044
#> SRR1700137 5 0.4948 0.57510 0.000 0.068 0.180 0.028 0.712 0.012
#> SRR1700138 5 0.5591 0.14728 0.000 0.052 0.400 0.028 0.512 0.008
#> SRR1700140 3 0.5610 0.50488 0.000 0.028 0.580 0.048 0.324 0.020
#> SRR1700139 3 0.4775 0.63013 0.000 0.012 0.692 0.040 0.236 0.020
#> SRR1700141 5 0.4075 0.73742 0.000 0.176 0.060 0.004 0.756 0.004
#> SRR1700142 3 0.3836 0.75404 0.000 0.000 0.804 0.032 0.108 0.056
#> SRR1700143 3 0.3537 0.75128 0.000 0.000 0.824 0.032 0.104 0.040
#> SRR1700144 3 0.4091 0.72671 0.000 0.000 0.776 0.036 0.144 0.044
#> SRR1700145 5 0.3899 0.47584 0.000 0.008 0.128 0.040 0.800 0.024
#> SRR1700146 5 0.4105 0.72872 0.000 0.160 0.064 0.004 0.764 0.008
#> SRR1700147 3 0.4101 0.71133 0.000 0.000 0.768 0.040 0.160 0.032
#> SRR1700149 3 0.4734 0.68241 0.000 0.000 0.704 0.040 0.208 0.048
#> SRR1700148 3 0.4632 0.59039 0.000 0.000 0.656 0.040 0.288 0.016
#> SRR1700150 5 0.4146 0.72861 0.000 0.160 0.060 0.012 0.764 0.004
#> SRR1700152 5 0.5294 -0.06938 0.000 0.008 0.416 0.044 0.516 0.016
#> SRR1700151 3 0.4559 0.69529 0.000 0.000 0.724 0.040 0.192 0.044
#> SRR1700153 3 0.4871 0.60420 0.000 0.008 0.672 0.040 0.256 0.024
#> SRR1700154 5 0.5134 -0.21567 0.000 0.008 0.464 0.036 0.480 0.012
#> SRR1700155 5 0.5498 0.11732 0.000 0.020 0.348 0.040 0.568 0.024
#> SRR1700156 3 0.4449 0.72223 0.000 0.000 0.748 0.040 0.156 0.056
#> SRR1700158 3 0.5111 0.47445 0.000 0.000 0.552 0.032 0.384 0.032
#> SRR1700159 5 0.3926 0.73620 0.000 0.172 0.052 0.004 0.768 0.004
#> SRR1700157 3 0.4489 0.65332 0.000 0.000 0.704 0.040 0.232 0.024
#> SRR1700160 5 0.4912 0.58905 0.000 0.072 0.172 0.032 0.716 0.008
#> SRR1700161 5 0.5622 0.61501 0.000 0.124 0.188 0.028 0.648 0.012
#> SRR1700162 5 0.4449 0.74863 0.000 0.228 0.060 0.004 0.704 0.004
#> SRR1700164 4 0.5788 0.50143 0.000 0.008 0.020 0.548 0.328 0.096
#> SRR1700163 4 0.6918 0.38988 0.000 0.000 0.184 0.452 0.276 0.088
#> SRR1700165 3 0.5800 0.19672 0.000 0.060 0.476 0.028 0.424 0.012
#> SRR1700166 5 0.4846 0.67923 0.000 0.124 0.088 0.036 0.740 0.012
#> SRR1700168 5 0.4289 0.74140 0.000 0.264 0.000 0.044 0.688 0.004
#> SRR1700167 3 0.5376 0.42568 0.000 0.000 0.508 0.052 0.412 0.028
#> SRR1700170 5 0.4276 0.73262 0.000 0.172 0.036 0.032 0.756 0.004
#> SRR1700169 5 0.4723 0.70213 0.000 0.136 0.064 0.040 0.748 0.012
#> SRR1700171 4 0.6758 0.47652 0.024 0.000 0.228 0.504 0.032 0.212
#> SRR1700172 5 0.6065 0.70197 0.000 0.132 0.120 0.064 0.652 0.032
#> SRR1700174 5 0.6403 0.63655 0.000 0.108 0.188 0.056 0.608 0.040
#> SRR1700173 5 0.6345 0.49268 0.000 0.080 0.308 0.036 0.540 0.036
#> SRR1700175 5 0.4134 0.71170 0.000 0.140 0.080 0.008 0.768 0.004
#> SRR1700176 3 0.3320 0.76701 0.000 0.000 0.844 0.028 0.068 0.060
#> SRR1700178 2 0.1245 0.84024 0.000 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1700177 5 0.3865 0.74300 0.000 0.184 0.028 0.020 0.768 0.000
#> SRR1700180 2 0.1921 0.81851 0.000 0.916 0.000 0.052 0.000 0.032
#> SRR1700179 2 0.1296 0.84234 0.000 0.952 0.000 0.032 0.004 0.012
#> SRR1700181 2 0.1245 0.84024 0.000 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1700183 1 0.0547 0.97505 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.1245 0.84024 0.000 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1700184 2 0.1421 0.83888 0.000 0.944 0.000 0.028 0.000 0.028
#> SRR1700186 2 0.3543 0.68822 0.004 0.764 0.000 0.020 0.000 0.212
#> SRR1700187 1 0.0632 0.97579 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.1418 0.83744 0.000 0.944 0.000 0.032 0.000 0.024
#> SRR1700192 4 0.4984 0.06571 0.376 0.004 0.000 0.568 0.012 0.040
#> SRR1700190 4 0.6605 0.35149 0.184 0.096 0.000 0.576 0.016 0.128
#> SRR1700191 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.1152 0.96081 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1700193 2 0.1341 0.83752 0.000 0.948 0.000 0.028 0.000 0.024
#> SRR1700195 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700194 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.1049 0.84198 0.000 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1700197 4 0.5817 0.23795 0.276 0.024 0.004 0.596 0.012 0.088
#> SRR1700198 2 0.0909 0.84205 0.000 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1700199 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700200 2 0.3235 0.73545 0.000 0.832 0.000 0.124 0.024 0.020
#> SRR1700201 2 0.0405 0.84576 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700202 4 0.6987 0.40382 0.172 0.048 0.000 0.532 0.200 0.048
#> SRR1700203 2 0.0291 0.84507 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700204 2 0.0000 0.84481 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700206 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700207 2 0.0405 0.84577 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700208 4 0.6908 0.35308 0.168 0.152 0.000 0.544 0.016 0.120
#> SRR1700205 4 0.6325 0.27096 0.000 0.244 0.000 0.480 0.252 0.024
#> SRR1700209 2 0.0717 0.84223 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1700210 2 0.4543 0.67709 0.000 0.740 0.000 0.136 0.100 0.024
#> SRR1700211 2 0.4046 0.72804 0.000 0.796 0.000 0.084 0.072 0.048
#> SRR1700212 2 0.2384 0.81764 0.000 0.896 0.000 0.056 0.040 0.008
#> SRR1700213 6 0.4229 0.68388 0.000 0.104 0.016 0.056 0.032 0.792
#> SRR1700214 2 0.1138 0.83968 0.000 0.960 0.000 0.012 0.024 0.004
#> SRR1700215 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700217 2 0.0725 0.84174 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700218 2 0.3402 0.67990 0.000 0.784 0.008 0.008 0.004 0.196
#> SRR1700219 2 0.0436 0.84467 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.0653 0.84353 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700221 2 0.1036 0.84046 0.000 0.964 0.000 0.008 0.024 0.004
#> SRR1700223 2 0.0622 0.84307 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1700224 2 0.1923 0.80417 0.000 0.916 0.000 0.016 0.064 0.004
#> SRR1700226 2 0.0000 0.84481 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700229 2 0.0748 0.84411 0.000 0.976 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR1700225 6 0.3973 0.74523 0.000 0.104 0.060 0.016 0.016 0.804
#> SRR1700227 2 0.0405 0.84544 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700230 4 0.4815 0.04940 0.396 0.000 0.000 0.552 0.004 0.048
#> SRR1700231 2 0.0146 0.84493 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700228 2 0.5050 0.49018 0.000 0.656 0.036 0.016 0.024 0.268
#> SRR1700232 2 0.0146 0.84480 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700233 2 0.1268 0.83086 0.000 0.952 0.000 0.008 0.004 0.036
#> SRR1700234 4 0.7218 0.27052 0.000 0.328 0.000 0.368 0.196 0.108
#> SRR1700235 2 0.1242 0.84015 0.000 0.960 0.008 0.012 0.008 0.012
#> SRR1700237 2 0.0405 0.84620 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700236 2 0.0508 0.84397 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1700238 2 0.0363 0.84480 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0790 0.97192 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 3 0.3750 0.71604 0.000 0.004 0.764 0.004 0.028 0.200
#> SRR1700243 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700244 2 0.1194 0.84256 0.000 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1700242 4 0.4893 0.03365 0.396 0.000 0.000 0.552 0.012 0.040
#> SRR1700246 4 0.6149 0.31696 0.232 0.020 0.008 0.600 0.024 0.116
#> SRR1700245 2 0.0508 0.84528 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1700247 1 0.0790 0.97192 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.0146 0.84480 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700248 2 0.0692 0.84260 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700251 2 0.0777 0.84300 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1700252 2 0.5127 0.26541 0.000 0.572 0.004 0.024 0.036 0.364
#> SRR1700253 2 0.2591 0.79915 0.000 0.880 0.000 0.064 0.052 0.004
#> SRR1700256 2 0.0458 0.84401 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.98353 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.1321 0.84249 0.000 0.952 0.000 0.024 0.020 0.004
#> SRR1700257 2 0.0837 0.84421 0.000 0.972 0.000 0.020 0.004 0.004
#> SRR1700258 2 0.0909 0.84169 0.000 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1700259 2 0.0551 0.84522 0.000 0.984 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700260 2 0.0717 0.84481 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1700261 2 0.3941 0.72177 0.000 0.792 0.004 0.020 0.052 0.132
#> SRR1700262 2 0.0363 0.84464 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1700263 2 0.0551 0.84522 0.000 0.984 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700264 2 0.3738 0.56168 0.000 0.704 0.000 0.016 0.000 0.280
#> SRR1700265 4 0.7471 0.36505 0.076 0.252 0.000 0.484 0.088 0.100
#> SRR1700266 2 0.2878 0.73580 0.000 0.828 0.004 0.004 0.004 0.160
#> SRR1700268 2 0.1003 0.83554 0.000 0.964 0.000 0.004 0.028 0.004
#> SRR1700270 2 0.0146 0.84493 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700267 2 0.0520 0.84535 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1700271 2 0.0260 0.84467 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700272 2 0.0260 0.84467 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700273 2 0.0260 0.84540 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700274 2 0.0260 0.84467 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1700277 6 0.5459 0.28365 0.000 0.408 0.004 0.044 0.032 0.512
#> SRR1700275 2 0.4441 0.50169 0.000 0.700 0.000 0.092 0.208 0.000
#> SRR1700276 2 0.2500 0.76011 0.000 0.868 0.000 0.012 0.116 0.004
#> SRR1700278 5 0.5234 0.67336 0.000 0.300 0.000 0.124 0.576 0.000
#> SRR1700279 5 0.5949 0.50333 0.000 0.300 0.000 0.248 0.452 0.000
#> SRR1700280 2 0.6101 -0.06467 0.000 0.444 0.000 0.272 0.280 0.004
#> SRR1700281 2 0.0520 0.84414 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1700283 2 0.3829 0.61267 0.000 0.760 0.000 0.060 0.180 0.000
#> SRR1700282 5 0.6475 0.35073 0.000 0.372 0.000 0.224 0.380 0.024
#> SRR1700284 5 0.4110 0.74033 0.000 0.268 0.000 0.040 0.692 0.000
#> SRR1700285 5 0.5002 0.70874 0.000 0.304 0.000 0.068 0.616 0.012
#> SRR1700286 2 0.4800 0.01139 0.000 0.508 0.016 0.012 0.008 0.456
#> SRR1700287 5 0.4743 0.63338 0.000 0.364 0.000 0.048 0.584 0.004
#> SRR1700290 4 0.5776 0.50207 0.000 0.008 0.020 0.552 0.324 0.096
#> SRR1700289 5 0.5150 0.70351 0.000 0.308 0.000 0.072 0.604 0.016
#> SRR1700288 2 0.1124 0.83074 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036 0.000
#> SRR1700292 5 0.4628 0.66473 0.000 0.344 0.000 0.044 0.608 0.004
#> SRR1700291 5 0.5145 0.74550 0.000 0.252 0.012 0.072 0.652 0.012
#> SRR1700293 5 0.4688 0.72224 0.000 0.288 0.000 0.064 0.644 0.004
#> SRR1700294 5 0.4662 0.74781 0.000 0.208 0.064 0.016 0.708 0.004
#> SRR1700295 5 0.6112 -0.28770 0.000 0.016 0.036 0.400 0.476 0.072
#> SRR1700297 5 0.4268 0.73633 0.000 0.272 0.000 0.040 0.684 0.004
#> SRR1700296 5 0.4468 0.72234 0.000 0.288 0.000 0.048 0.660 0.004
#> SRR1700298 5 0.4022 0.74582 0.000 0.252 0.000 0.040 0.708 0.000
#> SRR1700299 5 0.4212 0.72814 0.000 0.164 0.056 0.016 0.760 0.004
#> SRR1700300 5 0.4384 0.58631 0.000 0.060 0.136 0.024 0.768 0.012
#> SRR1700302 5 0.4152 0.74855 0.000 0.212 0.040 0.008 0.736 0.004
#> SRR1700301 5 0.3405 0.73927 0.000 0.272 0.000 0.004 0.724 0.000
#> SRR1700303 5 0.3812 0.74268 0.000 0.268 0.004 0.016 0.712 0.000
#> SRR1700304 4 0.5875 0.42116 0.000 0.104 0.004 0.524 0.344 0.024
#> SRR1700305 5 0.3875 0.74807 0.000 0.260 0.008 0.016 0.716 0.000
#> SRR1700306 5 0.3993 0.47143 0.000 0.008 0.152 0.032 0.784 0.024
#> SRR1700308 5 0.4798 0.75345 0.000 0.236 0.020 0.036 0.692 0.016
#> SRR1700307 5 0.5043 0.58050 0.000 0.052 0.200 0.020 0.700 0.028
#> SRR1700309 5 0.4735 0.55309 0.000 0.052 0.152 0.032 0.744 0.020
#> SRR1700310 5 0.3867 0.74865 0.000 0.216 0.036 0.000 0.744 0.004
#> SRR1700311 5 0.4496 0.72759 0.000 0.176 0.084 0.008 0.728 0.004
#> SRR1700312 5 0.5033 0.73781 0.000 0.268 0.000 0.064 0.644 0.024
#> SRR1700313 5 0.4814 0.56218 0.000 0.052 0.180 0.028 0.724 0.016
#> SRR1700314 5 0.5539 0.38391 0.000 0.052 0.264 0.040 0.628 0.016
#> SRR1700315 5 0.4962 0.66424 0.000 0.120 0.108 0.032 0.728 0.012
#> SRR1700316 5 0.5945 0.72776 0.000 0.168 0.072 0.072 0.656 0.032
#> SRR1700317 5 0.5135 0.69301 0.000 0.324 0.000 0.036 0.600 0.040
#> SRR1700318 5 0.5755 0.43957 0.000 0.124 0.000 0.244 0.596 0.036
#> SRR1700319 5 0.4629 0.70000 0.000 0.136 0.080 0.028 0.748 0.008
#> SRR1700320 5 0.3858 0.74933 0.000 0.236 0.028 0.000 0.732 0.004
#> SRR1700322 5 0.5048 0.74997 0.000 0.236 0.016 0.072 0.668 0.008
#> SRR1700321 5 0.5138 0.67151 0.000 0.344 0.000 0.036 0.584 0.036
#> SRR1700323 5 0.4094 0.75055 0.000 0.252 0.028 0.004 0.712 0.004
#> SRR1700324 5 0.4737 0.74307 0.000 0.256 0.000 0.072 0.664 0.008
#> SRR1700325 2 0.4664 -0.39298 0.000 0.484 0.000 0.032 0.480 0.004
#> SRR1700326 4 0.6816 0.48127 0.060 0.084 0.000 0.592 0.124 0.140
#> SRR1700327 2 0.5856 0.03796 0.000 0.496 0.044 0.020 0.036 0.404
#> SRR1700329 5 0.4295 0.74413 0.000 0.264 0.000 0.032 0.692 0.012
#> SRR1700328 5 0.6101 0.60144 0.000 0.224 0.004 0.084 0.596 0.092
#> SRR1700330 5 0.5666 0.42247 0.000 0.128 0.000 0.260 0.588 0.024
#> SRR1700331 5 0.5105 0.72377 0.000 0.256 0.012 0.096 0.636 0.000
#> SRR1700332 5 0.4976 0.67375 0.000 0.324 0.000 0.076 0.596 0.004
#> SRR1700333 5 0.4214 0.73356 0.000 0.276 0.000 0.044 0.680 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 10169 rows and 459 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.839 0.903 0.958 0.4881 0.508 0.508
#> 3 3 0.507 0.682 0.839 0.3045 0.784 0.605
#> 4 4 0.459 0.604 0.783 0.0997 0.746 0.448
#> 5 5 0.468 0.367 0.584 0.0910 0.800 0.446
#> 6 6 0.494 0.443 0.647 0.0514 0.823 0.400
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1699874 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699875 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699876 1 0.0376 0.9336 0.996 0.004
#> SRR1699877 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699879 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699878 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699880 2 0.9129 0.4878 0.328 0.672
#> SRR1699881 2 0.2778 0.9306 0.048 0.952
#> SRR1699882 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699883 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699884 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699885 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699886 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699888 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699889 1 0.8081 0.6906 0.752 0.248
#> SRR1699890 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699887 1 0.0376 0.9336 0.996 0.004
#> SRR1699891 1 0.2948 0.9032 0.948 0.052
#> SRR1699892 1 0.9775 0.3568 0.588 0.412
#> SRR1699893 2 0.9754 0.2838 0.408 0.592
#> SRR1699894 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699895 1 0.2948 0.9032 0.948 0.052
#> SRR1699896 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699897 1 0.9491 0.4785 0.632 0.368
#> SRR1699898 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699900 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699899 1 0.5946 0.8203 0.856 0.144
#> SRR1699902 2 0.4022 0.8980 0.080 0.920
#> SRR1699901 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699903 2 0.0938 0.9626 0.012 0.988
#> SRR1699904 2 0.9775 0.2524 0.412 0.588
#> SRR1699905 2 0.4815 0.8700 0.104 0.896
#> SRR1699906 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699907 2 0.4161 0.8930 0.084 0.916
#> SRR1699908 2 0.1843 0.9492 0.028 0.972
#> SRR1699909 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699910 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699911 2 0.2603 0.9340 0.044 0.956
#> SRR1699912 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699913 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699914 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699915 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699916 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699917 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699918 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699919 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699920 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699921 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699922 1 1.0000 0.0926 0.504 0.496
#> SRR1699923 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699924 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699925 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699926 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699927 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699929 2 0.8207 0.6394 0.256 0.744
#> SRR1699928 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699930 1 0.9996 0.1209 0.512 0.488
#> SRR1699931 1 0.9710 0.4018 0.600 0.400
#> SRR1699933 1 0.6531 0.8000 0.832 0.168
#> SRR1699932 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699934 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699935 1 0.5519 0.8380 0.872 0.128
#> SRR1699936 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699937 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699938 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699940 2 0.5059 0.8628 0.112 0.888
#> SRR1699939 1 0.2043 0.9182 0.968 0.032
#> SRR1699941 2 0.0376 0.9686 0.004 0.996
#> SRR1699942 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699943 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699944 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699945 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699946 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699947 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699948 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699949 1 0.0672 0.9315 0.992 0.008
#> SRR1699950 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699951 1 0.6148 0.8146 0.848 0.152
#> SRR1699952 1 0.2778 0.9059 0.952 0.048
#> SRR1699953 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699954 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699955 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699956 1 0.9580 0.4229 0.620 0.380
#> SRR1699957 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699959 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699958 1 0.6048 0.8132 0.852 0.148
#> SRR1699960 1 0.2778 0.9055 0.952 0.048
#> SRR1699961 2 0.9944 0.1087 0.456 0.544
#> SRR1699962 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699963 2 0.1184 0.9593 0.016 0.984
#> SRR1699964 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699965 1 0.3584 0.8913 0.932 0.068
#> SRR1699966 2 0.0938 0.9626 0.012 0.988
#> SRR1699967 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1699968 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699969 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699971 1 0.3584 0.8900 0.932 0.068
#> SRR1699970 2 0.1184 0.9595 0.016 0.984
#> SRR1699972 1 0.6623 0.7927 0.828 0.172
#> SRR1699973 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699974 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699975 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699976 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699977 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699978 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699979 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699980 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699981 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699982 2 0.0376 0.9686 0.004 0.996
#> SRR1699983 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699984 2 0.2603 0.9349 0.044 0.956
#> SRR1699985 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699986 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699988 2 0.1633 0.9527 0.024 0.976
#> SRR1699987 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699989 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699990 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699992 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699991 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699993 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699994 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699995 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699996 2 0.7139 0.7433 0.196 0.804
#> SRR1699997 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1699998 2 0.1633 0.9527 0.024 0.976
#> SRR1699999 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700000 1 0.8955 0.5886 0.688 0.312
#> SRR1700002 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700001 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700003 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700004 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700005 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700006 1 0.6148 0.8083 0.848 0.152
#> SRR1700007 1 0.9427 0.4916 0.640 0.360
#> SRR1700008 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700009 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700010 2 0.5178 0.8566 0.116 0.884
#> SRR1700011 2 0.5946 0.8188 0.144 0.856
#> SRR1700013 1 0.8955 0.5910 0.688 0.312
#> SRR1700012 2 0.1184 0.9595 0.016 0.984
#> SRR1700014 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700015 1 0.1843 0.9196 0.972 0.028
#> SRR1700016 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700018 1 0.4939 0.8542 0.892 0.108
#> SRR1700017 1 1.0000 0.0420 0.500 0.500
#> SRR1700019 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700020 2 0.9000 0.5255 0.316 0.684
#> SRR1700021 1 0.2778 0.9062 0.952 0.048
#> SRR1700023 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700022 2 0.9044 0.5155 0.320 0.680
#> SRR1700024 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700025 1 0.9393 0.4807 0.644 0.356
#> SRR1700026 1 0.1633 0.9222 0.976 0.024
#> SRR1700027 1 0.9635 0.4008 0.612 0.388
#> SRR1700028 2 0.1184 0.9593 0.016 0.984
#> SRR1700029 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700030 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700031 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700032 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700034 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700035 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700033 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700036 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700037 2 0.1414 0.9561 0.020 0.980
#> SRR1700038 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700039 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700040 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700041 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700042 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700043 2 0.9393 0.4113 0.356 0.644
#> SRR1700045 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700044 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700046 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700047 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700048 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700049 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700050 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700051 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700052 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700053 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700054 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700055 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700056 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700057 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700058 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700059 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700060 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700061 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700062 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700063 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700064 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700065 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700066 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700067 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700068 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700069 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700070 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700071 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700072 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700073 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700075 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700074 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700076 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700077 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700078 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700080 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700079 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700081 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700082 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700083 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700084 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700085 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700086 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700087 1 0.0376 0.9335 0.996 0.004
#> SRR1700088 1 0.2423 0.9115 0.960 0.040
#> SRR1700089 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700091 2 0.8327 0.6230 0.264 0.736
#> SRR1700090 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700092 1 0.9983 0.1321 0.524 0.476
#> SRR1700094 1 0.1184 0.9269 0.984 0.016
#> SRR1700093 2 0.0938 0.9627 0.012 0.988
#> SRR1700095 1 0.0376 0.9335 0.996 0.004
#> SRR1700096 2 0.6623 0.7807 0.172 0.828
#> SRR1700097 2 0.7674 0.7015 0.224 0.776
#> SRR1700098 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700099 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700100 1 0.8267 0.6624 0.740 0.260
#> SRR1700101 1 0.1843 0.9195 0.972 0.028
#> SRR1700102 2 0.9922 0.1395 0.448 0.552
#> SRR1700104 2 0.1184 0.9593 0.016 0.984
#> SRR1700103 2 0.0672 0.9657 0.008 0.992
#> SRR1700105 2 0.4022 0.9008 0.080 0.920
#> SRR1700106 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700107 2 0.9944 0.1189 0.456 0.544
#> SRR1700108 1 0.3431 0.8937 0.936 0.064
#> SRR1700109 1 0.9866 0.3126 0.568 0.432
#> SRR1700110 2 0.7139 0.7450 0.196 0.804
#> SRR1700112 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700111 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700113 2 0.4161 0.8945 0.084 0.916
#> SRR1700114 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700115 2 0.6438 0.7927 0.164 0.836
#> SRR1700116 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700117 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700119 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700118 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700120 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700121 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700122 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700123 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700125 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700126 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700127 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700124 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700128 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700129 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700130 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700132 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700131 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700133 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700134 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700135 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700136 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700137 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700138 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700140 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700139 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700141 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700142 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700143 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700144 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700145 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700146 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700147 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700149 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700148 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700150 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700152 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700151 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700153 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700154 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700155 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700156 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700158 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700159 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700157 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700160 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700161 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700162 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700164 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700163 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700165 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700166 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700168 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700167 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700170 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700169 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700171 2 0.4022 0.9010 0.080 0.920
#> SRR1700172 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700174 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700173 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700175 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700176 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700178 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700177 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700180 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700179 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700181 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700183 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700182 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700184 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700186 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700188 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700192 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700190 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700191 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700193 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700195 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700194 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700196 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700197 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700198 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700199 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700200 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700201 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700202 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700203 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700204 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700206 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700207 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700208 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700205 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700209 1 0.7299 0.7517 0.796 0.204
#> SRR1700210 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700211 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700212 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700213 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700214 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700215 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700217 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700216 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700218 1 0.8608 0.6352 0.716 0.284
#> SRR1700219 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700222 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700220 1 0.4161 0.8774 0.916 0.084
#> SRR1700221 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700223 1 0.0938 0.9293 0.988 0.012
#> SRR1700224 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700226 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700229 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700225 1 0.8386 0.6638 0.732 0.268
#> SRR1700227 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700230 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700231 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700228 1 0.7299 0.7508 0.796 0.204
#> SRR1700232 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700233 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700234 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700235 1 0.4431 0.8735 0.908 0.092
#> SRR1700237 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700236 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700238 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700239 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700240 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700241 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700243 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700244 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700242 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700246 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700245 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700247 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700250 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700248 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700251 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700252 1 0.0672 0.9315 0.992 0.008
#> SRR1700253 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700256 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700254 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700255 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700257 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700258 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700259 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700260 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700261 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700262 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700263 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700264 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700265 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700266 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700268 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700270 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700267 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700271 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700272 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700273 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700274 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700277 1 0.0376 0.9336 0.996 0.004
#> SRR1700275 1 0.1633 0.9221 0.976 0.024
#> SRR1700276 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700278 1 0.0938 0.9293 0.988 0.012
#> SRR1700279 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700280 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700281 1 0.2603 0.9105 0.956 0.044
#> SRR1700283 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700282 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700284 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700285 2 0.3274 0.9187 0.060 0.940
#> SRR1700286 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700287 1 0.9686 0.4035 0.604 0.396
#> SRR1700290 2 0.4815 0.8705 0.104 0.896
#> SRR1700289 2 0.7528 0.7095 0.216 0.784
#> SRR1700288 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700292 1 0.9815 0.3397 0.580 0.420
#> SRR1700291 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700293 2 0.3584 0.9105 0.068 0.932
#> SRR1700294 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700295 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700297 2 0.1414 0.9557 0.020 0.980
#> SRR1700296 1 0.9983 0.1650 0.524 0.476
#> SRR1700298 2 0.2948 0.9265 0.052 0.948
#> SRR1700299 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700300 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700302 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700301 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700303 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700304 1 0.4161 0.8778 0.916 0.084
#> SRR1700305 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700306 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700308 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700307 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700309 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700310 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700311 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700312 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700313 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700314 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700315 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700316 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700317 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700318 1 0.9323 0.5142 0.652 0.348
#> SRR1700319 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700320 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700322 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700321 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700323 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700324 2 0.0376 0.9686 0.004 0.996
#> SRR1700325 1 0.5294 0.8462 0.880 0.120
#> SRR1700326 1 0.0000 0.9355 1.000 0.000
#> SRR1700327 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700329 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000
#> SRR1700328 1 0.7219 0.7561 0.800 0.200
#> SRR1700330 1 0.9608 0.4333 0.616 0.384
#> SRR1700331 2 0.2948 0.9264 0.052 0.948
#> SRR1700332 1 0.7219 0.7569 0.800 0.200
#> SRR1700333 1 0.9661 0.4136 0.608 0.392
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1699874 2 0.4291 0.69267 0.180 0.820 0.000
#> SRR1699875 2 0.1529 0.74693 0.040 0.960 0.000
#> SRR1699876 1 0.5486 0.65948 0.780 0.196 0.024
#> SRR1699877 2 0.6305 0.12037 0.484 0.516 0.000
#> SRR1699879 2 0.4346 0.68996 0.184 0.816 0.000
#> SRR1699878 2 0.4504 0.67961 0.196 0.804 0.000
#> SRR1699880 2 0.2711 0.72192 0.000 0.912 0.088
#> SRR1699881 2 0.4235 0.66629 0.000 0.824 0.176
#> SRR1699882 2 0.6154 0.34745 0.408 0.592 0.000
#> SRR1699883 2 0.6260 0.23621 0.448 0.552 0.000
#> SRR1699884 2 0.6045 0.41468 0.380 0.620 0.000
#> SRR1699885 2 0.4002 0.70576 0.160 0.840 0.000
#> SRR1699886 1 0.1411 0.78400 0.964 0.036 0.000
#> SRR1699888 1 0.3752 0.72228 0.856 0.144 0.000
#> SRR1699889 1 0.5406 0.67734 0.764 0.012 0.224
#> SRR1699890 1 0.0237 0.78827 0.996 0.004 0.000
#> SRR1699887 1 0.5292 0.68935 0.800 0.172 0.028
#> SRR1699891 1 0.2200 0.78337 0.940 0.004 0.056
#> SRR1699892 2 0.6624 0.61135 0.044 0.708 0.248
#> SRR1699893 1 0.6897 0.13068 0.548 0.016 0.436
#> SRR1699894 1 0.2173 0.78255 0.944 0.008 0.048
#> SRR1699895 1 0.2448 0.77211 0.924 0.000 0.076
#> SRR1699896 1 0.0661 0.78848 0.988 0.004 0.008
#> SRR1699897 2 0.4692 0.67782 0.012 0.820 0.168
#> SRR1699898 3 0.2356 0.82790 0.000 0.072 0.928
#> SRR1699900 1 0.1491 0.78995 0.968 0.016 0.016
#> SRR1699899 1 0.5202 0.72345 0.820 0.044 0.136
#> SRR1699902 3 0.4558 0.78947 0.044 0.100 0.856
#> SRR1699901 3 0.2625 0.82720 0.084 0.000 0.916
#> SRR1699903 3 0.4346 0.75253 0.184 0.000 0.816
#> SRR1699904 1 0.3816 0.72845 0.852 0.000 0.148
#> SRR1699905 1 0.5016 0.62564 0.760 0.000 0.240
#> SRR1699906 3 0.2625 0.82765 0.084 0.000 0.916
#> SRR1699907 1 0.5706 0.50448 0.680 0.000 0.320
#> SRR1699908 3 0.5835 0.51982 0.340 0.000 0.660
#> SRR1699909 3 0.4062 0.76764 0.164 0.000 0.836
#> SRR1699910 3 0.5098 0.67023 0.248 0.000 0.752
#> SRR1699911 1 0.5529 0.53841 0.704 0.000 0.296
#> SRR1699912 3 0.4887 0.69574 0.228 0.000 0.772
#> SRR1699913 3 0.3116 0.81186 0.108 0.000 0.892
#> SRR1699914 3 0.3192 0.80972 0.112 0.000 0.888
#> SRR1699915 3 0.6026 0.43948 0.376 0.000 0.624
#> SRR1699916 3 0.5706 0.55488 0.320 0.000 0.680
#> SRR1699917 3 0.1315 0.84734 0.008 0.020 0.972
#> SRR1699918 3 0.1031 0.84560 0.024 0.000 0.976
#> SRR1699919 3 0.5058 0.67481 0.244 0.000 0.756
#> SRR1699920 3 0.3686 0.78913 0.140 0.000 0.860
#> SRR1699921 3 0.5905 0.48981 0.352 0.000 0.648
#> SRR1699922 1 0.5465 0.57532 0.712 0.000 0.288
#> SRR1699923 3 0.4121 0.76405 0.168 0.000 0.832
#> SRR1699924 3 0.0661 0.84664 0.008 0.004 0.988
#> SRR1699925 1 0.1753 0.78056 0.952 0.000 0.048
#> SRR1699926 3 0.5810 0.52221 0.336 0.000 0.664
#> SRR1699927 3 0.5560 0.58796 0.300 0.000 0.700
#> SRR1699929 3 0.6302 0.09512 0.480 0.000 0.520
#> SRR1699928 3 0.4291 0.75152 0.180 0.000 0.820
#> SRR1699930 1 0.4399 0.70912 0.812 0.000 0.188
#> SRR1699931 1 0.7661 0.14470 0.504 0.044 0.452
#> SRR1699933 2 0.5408 0.70353 0.052 0.812 0.136
#> SRR1699932 3 0.5560 0.59187 0.300 0.000 0.700
#> SRR1699934 1 0.1129 0.78767 0.976 0.004 0.020
#> SRR1699935 1 0.5200 0.70009 0.796 0.020 0.184
#> SRR1699936 2 0.2537 0.73833 0.080 0.920 0.000
#> SRR1699937 2 0.0000 0.74660 0.000 1.000 0.000
#> SRR1699938 2 0.1411 0.74716 0.036 0.964 0.000
#> SRR1699940 2 0.2625 0.72330 0.000 0.916 0.084
#> SRR1699939 2 0.0892 0.74347 0.000 0.980 0.020
#> SRR1699941 2 0.4702 0.63480 0.000 0.788 0.212
#> SRR1699942 2 0.0424 0.74562 0.000 0.992 0.008
#> SRR1699943 2 0.1163 0.74785 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699944 2 0.0424 0.74723 0.008 0.992 0.000
#> SRR1699945 2 0.1031 0.74808 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699946 2 0.1289 0.74781 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699947 2 0.1289 0.74769 0.032 0.968 0.000
#> SRR1699948 2 0.1753 0.74559 0.048 0.952 0.000
#> SRR1699949 2 0.1585 0.74979 0.028 0.964 0.008
#> SRR1699950 2 0.1163 0.74814 0.028 0.972 0.000
#> SRR1699951 2 0.1529 0.73978 0.000 0.960 0.040
#> SRR1699952 2 0.0747 0.74435 0.000 0.984 0.016
#> SRR1699953 2 0.0892 0.74806 0.020 0.980 0.000
#> SRR1699954 2 0.1860 0.74598 0.052 0.948 0.000
#> SRR1699955 2 0.0983 0.74789 0.016 0.980 0.004
#> SRR1699956 2 0.1860 0.73599 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699957 2 0.1182 0.74715 0.012 0.976 0.012
#> SRR1699959 2 0.1585 0.74961 0.028 0.964 0.008
#> SRR1699958 2 0.2599 0.74391 0.016 0.932 0.052
#> SRR1699960 2 0.1781 0.74930 0.020 0.960 0.020
#> SRR1699961 2 0.2261 0.73015 0.000 0.932 0.068
#> SRR1699962 3 0.6260 0.23419 0.000 0.448 0.552
#> SRR1699963 2 0.4931 0.61580 0.000 0.768 0.232
#> SRR1699964 2 0.5397 0.55474 0.000 0.720 0.280
#> SRR1699965 2 0.1399 0.74522 0.004 0.968 0.028
#> SRR1699966 2 0.5363 0.56375 0.000 0.724 0.276
#> SRR1699967 2 0.1031 0.74808 0.024 0.976 0.000
#> SRR1699968 2 0.6305 -0.00328 0.000 0.516 0.484
#> SRR1699969 3 0.4887 0.69211 0.000 0.228 0.772
#> SRR1699971 2 0.1031 0.74279 0.000 0.976 0.024
#> SRR1699970 2 0.4178 0.66720 0.000 0.828 0.172
#> SRR1699972 2 0.1860 0.73692 0.000 0.948 0.052
#> SRR1699973 3 0.6308 0.08330 0.000 0.492 0.508
#> SRR1699974 3 0.5216 0.64812 0.000 0.260 0.740
#> SRR1699975 3 0.4605 0.72184 0.000 0.204 0.796
#> SRR1699976 2 0.4504 0.64770 0.000 0.804 0.196
#> SRR1699977 3 0.3412 0.79880 0.000 0.124 0.876
#> SRR1699978 3 0.1860 0.84012 0.052 0.000 0.948
#> SRR1699979 3 0.6291 0.17155 0.000 0.468 0.532
#> SRR1699980 3 0.4605 0.72178 0.000 0.204 0.796
#> SRR1699981 3 0.2165 0.83163 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699982 3 0.2448 0.83093 0.076 0.000 0.924
#> SRR1699983 3 0.3192 0.80623 0.000 0.112 0.888
#> SRR1699984 3 0.6793 0.70175 0.128 0.128 0.744
#> SRR1699985 3 0.2796 0.81786 0.000 0.092 0.908
#> SRR1699986 3 0.2165 0.83134 0.000 0.064 0.936
#> SRR1699988 3 0.6274 0.21216 0.000 0.456 0.544
#> SRR1699987 3 0.3752 0.78104 0.000 0.144 0.856
#> SRR1699989 3 0.1643 0.83880 0.000 0.044 0.956
#> SRR1699990 3 0.2796 0.81781 0.000 0.092 0.908
#> SRR1699992 3 0.6299 0.14427 0.000 0.476 0.524
#> SRR1699991 3 0.6154 0.35000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1699993 3 0.1989 0.84044 0.004 0.048 0.948
#> SRR1699994 3 0.5363 0.62384 0.000 0.276 0.724
#> SRR1699995 3 0.2356 0.82914 0.000 0.072 0.928
#> SRR1699996 2 0.6664 0.07875 0.008 0.528 0.464
#> SRR1699997 3 0.3116 0.80899 0.000 0.108 0.892
#> SRR1699998 2 0.5178 0.58857 0.000 0.744 0.256
#> SRR1699999 3 0.5465 0.60367 0.000 0.288 0.712
#> SRR1700000 2 0.3482 0.69725 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700002 2 0.5905 0.40938 0.000 0.648 0.352
#> SRR1700001 2 0.6215 0.20272 0.000 0.572 0.428
#> SRR1700003 2 0.6274 0.11184 0.000 0.544 0.456
#> SRR1700004 3 0.1877 0.84622 0.012 0.032 0.956
#> SRR1700005 1 0.0747 0.78517 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700006 2 0.2339 0.74286 0.012 0.940 0.048
#> SRR1700007 1 0.6445 0.52142 0.672 0.020 0.308
#> SRR1700008 3 0.2165 0.83126 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700009 1 0.0892 0.78731 0.980 0.000 0.020
#> SRR1700010 2 0.3412 0.70219 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700011 2 0.5098 0.59832 0.000 0.752 0.248
#> SRR1700013 2 0.3412 0.70270 0.000 0.876 0.124
#> SRR1700012 2 0.4399 0.65576 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700014 3 0.1289 0.84193 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700015 2 0.1411 0.74099 0.000 0.964 0.036
#> SRR1700016 1 0.4750 0.62165 0.784 0.216 0.000
#> SRR1700018 2 0.1289 0.74146 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700017 2 0.2261 0.73022 0.000 0.932 0.068
#> SRR1700019 1 0.6899 0.33741 0.612 0.364 0.024
#> SRR1700020 2 0.5016 0.60598 0.000 0.760 0.240
#> SRR1700021 1 0.2537 0.76789 0.920 0.000 0.080
#> SRR1700023 2 0.6079 0.32059 0.000 0.612 0.388
#> SRR1700022 2 0.3752 0.68979 0.000 0.856 0.144
#> SRR1700024 3 0.3340 0.80033 0.000 0.120 0.880
#> SRR1700025 2 0.2448 0.72763 0.000 0.924 0.076
#> SRR1700026 2 0.4902 0.74318 0.092 0.844 0.064
#> SRR1700027 2 0.2356 0.72976 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700028 3 0.5397 0.61279 0.000 0.280 0.720
#> SRR1700029 3 0.3752 0.78189 0.000 0.144 0.856
#> SRR1700030 3 0.2269 0.84624 0.040 0.016 0.944
#> SRR1700031 2 0.6299 0.03324 0.000 0.524 0.476
#> SRR1700032 2 0.6008 0.36161 0.000 0.628 0.372
#> SRR1700034 3 0.5968 0.45368 0.000 0.364 0.636
#> SRR1700035 3 0.1015 0.84700 0.012 0.008 0.980
#> SRR1700033 3 0.3816 0.77736 0.000 0.148 0.852
#> SRR1700036 3 0.1411 0.84166 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700037 3 0.6291 0.18855 0.468 0.000 0.532
#> SRR1700038 3 0.3038 0.81848 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700039 3 0.2878 0.81727 0.000 0.096 0.904
#> SRR1700040 3 0.4931 0.68702 0.000 0.232 0.768
#> SRR1700041 3 0.2165 0.83130 0.000 0.064 0.936
#> SRR1700042 3 0.2796 0.81813 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700043 3 0.6513 0.13279 0.004 0.476 0.520
#> SRR1700045 3 0.1163 0.84252 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700044 3 0.0983 0.84566 0.004 0.016 0.980
#> SRR1700046 3 0.1643 0.83840 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700047 3 0.0892 0.84590 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700048 3 0.2165 0.83746 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700049 3 0.2796 0.81806 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700050 3 0.0747 0.84487 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700051 3 0.0892 0.84590 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700052 3 0.0661 0.84620 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700053 3 0.0983 0.84665 0.016 0.004 0.980
#> SRR1700054 3 0.0892 0.84439 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700055 3 0.3038 0.81156 0.000 0.104 0.896
#> SRR1700056 3 0.1031 0.84608 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700057 3 0.1031 0.84366 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700058 3 0.1964 0.83457 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700059 3 0.0424 0.84567 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700060 3 0.2796 0.81771 0.000 0.092 0.908
#> SRR1700061 3 0.0892 0.84604 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700062 3 0.3619 0.78760 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700063 3 0.1411 0.84127 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700064 3 0.1031 0.84343 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700065 3 0.1289 0.84181 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700066 3 0.2711 0.82004 0.000 0.088 0.912
#> SRR1700067 3 0.0424 0.84595 0.000 0.008 0.992
#> SRR1700068 3 0.1031 0.84369 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700069 3 0.1411 0.84056 0.000 0.036 0.964
#> SRR1700070 3 0.2356 0.82763 0.000 0.072 0.928
#> SRR1700071 3 0.3619 0.78781 0.000 0.136 0.864
#> SRR1700072 3 0.1170 0.84789 0.016 0.008 0.976
#> SRR1700073 3 0.5327 0.63584 0.272 0.000 0.728
#> SRR1700075 3 0.1860 0.83619 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700074 3 0.5431 0.61070 0.000 0.284 0.716
#> SRR1700076 3 0.1643 0.83864 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700077 3 0.4346 0.74327 0.000 0.184 0.816
#> SRR1700078 3 0.1643 0.83872 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700080 3 0.4121 0.75919 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700079 3 0.4121 0.75926 0.000 0.168 0.832
#> SRR1700081 3 0.3267 0.80350 0.000 0.116 0.884
#> SRR1700082 3 0.6307 0.09525 0.000 0.488 0.512
#> SRR1700083 3 0.5621 0.56873 0.000 0.308 0.692
#> SRR1700084 3 0.4750 0.70824 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700085 3 0.1964 0.83562 0.000 0.056 0.944
#> SRR1700086 3 0.2959 0.81351 0.000 0.100 0.900
#> SRR1700087 2 0.1989 0.74725 0.048 0.948 0.004
#> SRR1700088 2 0.2050 0.74835 0.020 0.952 0.028
#> SRR1700089 2 0.3272 0.74596 0.080 0.904 0.016
#> SRR1700091 2 0.4399 0.65640 0.000 0.812 0.188
#> SRR1700090 3 0.1529 0.84217 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700092 2 0.6113 0.53144 0.012 0.688 0.300
#> SRR1700094 2 0.3375 0.75115 0.048 0.908 0.044
#> SRR1700093 3 0.2599 0.83513 0.016 0.052 0.932
#> SRR1700095 1 0.3253 0.78380 0.912 0.052 0.036
#> SRR1700096 2 0.6095 0.30888 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700097 2 0.6235 0.17857 0.000 0.564 0.436
#> SRR1700098 2 0.6359 0.36201 0.404 0.592 0.004
#> SRR1700099 2 0.5775 0.62284 0.260 0.728 0.012
#> SRR1700100 2 0.5036 0.72052 0.048 0.832 0.120
#> SRR1700101 2 0.3234 0.74824 0.072 0.908 0.020
#> SRR1700102 2 0.4291 0.66354 0.000 0.820 0.180
#> SRR1700104 2 0.6299 0.03624 0.000 0.524 0.476
#> SRR1700103 3 0.6204 0.30309 0.000 0.424 0.576
#> SRR1700105 3 0.5325 0.68958 0.248 0.004 0.748
#> SRR1700106 3 0.3481 0.83889 0.052 0.044 0.904
#> SRR1700107 3 0.7015 0.31993 0.024 0.392 0.584
#> SRR1700108 1 0.9340 0.29178 0.516 0.220 0.264
#> SRR1700109 3 0.6937 0.55215 0.272 0.048 0.680
#> SRR1700110 3 0.6588 0.63059 0.060 0.208 0.732
#> SRR1700112 3 0.1964 0.83824 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700111 3 0.1860 0.83949 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700113 3 0.5020 0.74717 0.192 0.012 0.796
#> SRR1700114 3 0.4750 0.70550 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700115 3 0.6396 0.51245 0.016 0.320 0.664
#> SRR1700116 3 0.1643 0.84044 0.000 0.044 0.956
#> SRR1700117 3 0.1529 0.84317 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700119 3 0.0747 0.84613 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700118 3 0.1163 0.84537 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700120 3 0.1289 0.84190 0.000 0.032 0.968
#> SRR1700121 3 0.1860 0.84079 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700122 3 0.3038 0.81447 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700123 3 0.1643 0.84199 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700125 3 0.2165 0.83510 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700126 3 0.1860 0.83640 0.000 0.052 0.948
#> SRR1700127 3 0.1031 0.84377 0.000 0.024 0.976
#> SRR1700124 3 0.0892 0.84590 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700128 3 0.1860 0.83969 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700129 3 0.2165 0.83535 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700130 3 0.2165 0.83510 0.064 0.000 0.936
#> SRR1700132 3 0.0892 0.84416 0.000 0.020 0.980
#> SRR1700131 3 0.0475 0.84631 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700133 3 0.4291 0.75368 0.180 0.000 0.820
#> SRR1700134 3 0.3038 0.81400 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700135 3 0.2261 0.83351 0.068 0.000 0.932
#> SRR1700136 3 0.0747 0.84493 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700137 3 0.1529 0.84271 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700138 3 0.1031 0.84552 0.024 0.000 0.976
#> SRR1700140 3 0.0592 0.84633 0.012 0.000 0.988
#> SRR1700139 3 0.0829 0.84670 0.012 0.004 0.984
#> SRR1700141 3 0.1964 0.83824 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700142 3 0.0747 0.84495 0.000 0.016 0.984
#> SRR1700143 3 0.1163 0.84267 0.000 0.028 0.972
#> SRR1700144 3 0.0237 0.84595 0.000 0.004 0.996
#> SRR1700145 3 0.2878 0.81954 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700146 3 0.1289 0.84446 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700147 3 0.0747 0.84632 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700149 3 0.1643 0.84185 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700148 3 0.1529 0.84308 0.040 0.000 0.960
#> SRR1700150 3 0.1163 0.84504 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700152 3 0.1643 0.84182 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700151 3 0.0237 0.84648 0.004 0.000 0.996
#> SRR1700153 3 0.0424 0.84650 0.008 0.000 0.992
#> SRR1700154 3 0.1411 0.84363 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700155 3 0.1289 0.84434 0.032 0.000 0.968
#> SRR1700156 3 0.0475 0.84633 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700158 3 0.1964 0.83872 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700159 3 0.2356 0.83155 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700157 3 0.0747 0.84613 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700160 3 0.1753 0.84119 0.048 0.000 0.952
#> SRR1700161 3 0.1411 0.84363 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700162 3 0.2959 0.81654 0.100 0.000 0.900
#> SRR1700164 1 0.5397 0.55090 0.720 0.000 0.280
#> SRR1700163 3 0.2878 0.81877 0.096 0.000 0.904
#> SRR1700165 3 0.0892 0.84590 0.020 0.000 0.980
#> SRR1700166 3 0.3038 0.81482 0.104 0.000 0.896
#> SRR1700168 3 0.3686 0.78878 0.140 0.000 0.860
#> SRR1700167 3 0.2066 0.83740 0.060 0.000 0.940
#> SRR1700170 3 0.3340 0.80464 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700169 3 0.2711 0.82454 0.088 0.000 0.912
#> SRR1700171 3 0.4556 0.82353 0.080 0.060 0.860
#> SRR1700172 3 0.0747 0.84613 0.016 0.000 0.984
#> SRR1700174 3 0.0661 0.84633 0.004 0.008 0.988
#> SRR1700173 3 0.0475 0.84633 0.004 0.004 0.992
#> SRR1700175 3 0.1964 0.83824 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700176 3 0.1529 0.83962 0.000 0.040 0.960
#> SRR1700178 2 0.4605 0.67223 0.204 0.796 0.000
#> SRR1700177 3 0.3412 0.80329 0.124 0.000 0.876
#> SRR1700180 2 0.6095 0.38377 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700179 2 0.4121 0.70062 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700181 2 0.4399 0.68630 0.188 0.812 0.000
#> SRR1700183 1 0.3941 0.69254 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700182 2 0.4346 0.68948 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700184 2 0.3752 0.71435 0.144 0.856 0.000
#> SRR1700186 2 0.3482 0.72130 0.128 0.872 0.000
#> SRR1700187 1 0.1411 0.77963 0.964 0.036 0.000
#> SRR1700185 1 0.0892 0.78478 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700188 2 0.3816 0.71247 0.148 0.852 0.000
#> SRR1700192 1 0.4796 0.63036 0.780 0.220 0.000
#> SRR1700190 2 0.4346 0.68983 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700191 1 0.1643 0.77700 0.956 0.044 0.000
#> SRR1700189 1 0.0892 0.78478 0.980 0.020 0.000
#> SRR1700193 2 0.5948 0.45247 0.360 0.640 0.000
#> SRR1700195 2 0.5926 0.46239 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700194 1 0.2066 0.76815 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700196 2 0.4062 0.70412 0.164 0.836 0.000
#> SRR1700197 2 0.4887 0.65073 0.228 0.772 0.000
#> SRR1700198 2 0.6026 0.42157 0.376 0.624 0.000
#> SRR1700199 1 0.6280 0.07483 0.540 0.460 0.000
#> SRR1700200 1 0.5327 0.54763 0.728 0.272 0.000
#> SRR1700201 2 0.4931 0.64287 0.232 0.768 0.000
#> SRR1700202 1 0.0424 0.78686 0.992 0.008 0.000
#> SRR1700203 1 0.6111 0.28565 0.604 0.396 0.000
#> SRR1700204 2 0.5529 0.56080 0.296 0.704 0.000
#> SRR1700206 2 0.5859 0.48390 0.344 0.656 0.000
#> SRR1700207 2 0.4291 0.69434 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700208 2 0.5926 0.46131 0.356 0.644 0.000
#> SRR1700205 1 0.0661 0.78825 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700209 2 0.9213 0.49197 0.236 0.536 0.228
#> SRR1700210 1 0.3482 0.72570 0.872 0.128 0.000
#> SRR1700211 1 0.6062 0.30708 0.616 0.384 0.000
#> SRR1700212 1 0.4796 0.62815 0.780 0.220 0.000
#> SRR1700213 2 0.2496 0.74410 0.068 0.928 0.004
#> SRR1700214 1 0.4062 0.69552 0.836 0.164 0.000
#> SRR1700215 1 0.1031 0.78623 0.976 0.000 0.024
#> SRR1700217 1 0.2066 0.77164 0.940 0.060 0.000
#> SRR1700216 1 0.1289 0.78458 0.968 0.000 0.032
#> SRR1700218 2 0.4589 0.66840 0.008 0.820 0.172
#> SRR1700219 1 0.6521 -0.07037 0.500 0.496 0.004
#> SRR1700222 1 0.0000 0.78770 1.000 0.000 0.000
#> SRR1700220 2 0.7647 0.20682 0.440 0.516 0.044
#> SRR1700221 1 0.3941 0.69672 0.844 0.156 0.000
#> SRR1700223 2 0.5733 0.51616 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700224 1 0.3267 0.74285 0.884 0.116 0.000
#> SRR1700226 2 0.6095 0.38672 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700229 2 0.3816 0.71297 0.148 0.852 0.000
#> SRR1700225 2 0.2625 0.72479 0.000 0.916 0.084
#> SRR1700227 2 0.3267 0.72632 0.116 0.884 0.000
#> SRR1700230 1 0.1163 0.78220 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700231 2 0.4605 0.67250 0.204 0.796 0.000
#> SRR1700228 2 0.5514 0.68699 0.044 0.800 0.156
#> SRR1700232 2 0.4291 0.69414 0.180 0.820 0.000
#> SRR1700233 2 0.4702 0.66523 0.212 0.788 0.000
#> SRR1700234 1 0.1989 0.77732 0.948 0.048 0.004
#> SRR1700235 2 0.5179 0.73101 0.088 0.832 0.080
#> SRR1700237 2 0.4121 0.70165 0.168 0.832 0.000
#> SRR1700236 2 0.6396 0.52476 0.320 0.664 0.016
#> SRR1700238 2 0.6168 0.33805 0.412 0.588 0.000
#> SRR1700239 1 0.2165 0.76527 0.936 0.064 0.000
#> SRR1700240 1 0.0661 0.78748 0.988 0.008 0.004
#> SRR1700241 3 0.2066 0.83316 0.000 0.060 0.940
#> SRR1700243 2 0.5810 0.49769 0.336 0.664 0.000
#> SRR1700244 1 0.5948 0.37719 0.640 0.360 0.000
#> SRR1700242 1 0.1964 0.76966 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700246 1 0.3340 0.72482 0.880 0.120 0.000
#> SRR1700245 2 0.3941 0.70801 0.156 0.844 0.000
#> SRR1700247 1 0.1753 0.77428 0.952 0.048 0.000
#> SRR1700249 1 0.1163 0.78192 0.972 0.028 0.000
#> SRR1700250 2 0.3686 0.71659 0.140 0.860 0.000
#> SRR1700248 2 0.5882 0.47469 0.348 0.652 0.000
#> SRR1700251 1 0.6180 0.22338 0.584 0.416 0.000
#> SRR1700252 2 0.2625 0.73836 0.084 0.916 0.000
#> SRR1700253 1 0.5058 0.60665 0.756 0.244 0.000
#> SRR1700256 2 0.6286 0.18906 0.464 0.536 0.000
#> SRR1700254 1 0.1289 0.78047 0.968 0.032 0.000
#> SRR1700255 1 0.5138 0.58765 0.748 0.252 0.000
#> SRR1700257 1 0.6225 0.17494 0.568 0.432 0.000
#> SRR1700258 2 0.6095 0.38658 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700259 2 0.4178 0.69930 0.172 0.828 0.000
#> SRR1700260 2 0.3412 0.72327 0.124 0.876 0.000
#> SRR1700261 3 0.4062 0.76376 0.000 0.164 0.836
#> SRR1700262 1 0.4629 0.67671 0.808 0.188 0.004
#> SRR1700263 2 0.3554 0.75157 0.064 0.900 0.036
#> SRR1700264 2 0.1753 0.74559 0.048 0.952 0.000
#> SRR1700265 1 0.4654 0.63812 0.792 0.208 0.000
#> SRR1700266 2 0.2261 0.74261 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700268 2 0.6518 0.13401 0.484 0.512 0.004
#> SRR1700270 2 0.5016 0.63429 0.240 0.760 0.000
#> SRR1700267 2 0.3816 0.71298 0.148 0.852 0.000
#> SRR1700271 2 0.4887 0.65033 0.228 0.772 0.000
#> SRR1700272 2 0.6286 0.18816 0.464 0.536 0.000
#> SRR1700273 2 0.4346 0.69082 0.184 0.816 0.000
#> SRR1700274 2 0.6410 0.31709 0.420 0.576 0.004
#> SRR1700277 2 0.2261 0.74271 0.068 0.932 0.000
#> SRR1700275 1 0.3678 0.77250 0.892 0.028 0.080
#> SRR1700276 1 0.1964 0.77656 0.944 0.056 0.000
#> SRR1700278 1 0.1860 0.77935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1700279 1 0.1643 0.78172 0.956 0.000 0.044
#> SRR1700280 1 0.0747 0.78743 0.984 0.000 0.016
#> SRR1700281 2 0.7388 0.66863 0.136 0.704 0.160
#> SRR1700283 1 0.3875 0.76952 0.888 0.068 0.044
#> SRR1700282 1 0.0661 0.78805 0.988 0.004 0.008
#> SRR1700284 3 0.2796 0.82275 0.092 0.000 0.908
#> SRR1700285 3 0.5560 0.59100 0.300 0.000 0.700
#> SRR1700286 3 0.6008 0.43127 0.000 0.372 0.628
#> SRR1700287 1 0.4750 0.68514 0.784 0.000 0.216
#> SRR1700290 1 0.5098 0.61397 0.752 0.000 0.248
#> SRR1700289 3 0.6267 0.21988 0.452 0.000 0.548
#> SRR1700288 1 0.5138 0.59774 0.748 0.252 0.000
#> SRR1700292 1 0.5016 0.65153 0.760 0.000 0.240
#> SRR1700291 3 0.4974 0.69081 0.236 0.000 0.764
#> SRR1700293 3 0.6308 0.08696 0.492 0.000 0.508
#> SRR1700294 3 0.6045 0.42736 0.380 0.000 0.620
#> SRR1700295 3 0.6274 0.22649 0.456 0.000 0.544
#> SRR1700297 3 0.6154 0.35745 0.408 0.000 0.592
#> SRR1700296 1 0.3816 0.72853 0.852 0.000 0.148
#> SRR1700298 1 0.6062 0.33065 0.616 0.000 0.384
#> SRR1700299 3 0.3551 0.79494 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700300 3 0.3816 0.78286 0.148 0.000 0.852
#> SRR1700302 3 0.6026 0.44044 0.376 0.000 0.624
#> SRR1700301 3 0.5926 0.48206 0.356 0.000 0.644
#> SRR1700303 3 0.6062 0.42096 0.384 0.000 0.616
#> SRR1700304 1 0.2878 0.75955 0.904 0.000 0.096
#> SRR1700305 3 0.4504 0.73704 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700306 3 0.4504 0.73656 0.196 0.000 0.804
#> SRR1700308 3 0.1163 0.84501 0.028 0.000 0.972
#> SRR1700307 3 0.1860 0.83984 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700309 3 0.3340 0.80428 0.120 0.000 0.880
#> SRR1700310 3 0.4887 0.69611 0.228 0.000 0.772
#> SRR1700311 3 0.4555 0.73035 0.200 0.000 0.800
#> SRR1700312 3 0.1860 0.84019 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700313 3 0.2356 0.83165 0.072 0.000 0.928
#> SRR1700314 3 0.1411 0.84363 0.036 0.000 0.964
#> SRR1700315 3 0.4002 0.77145 0.160 0.000 0.840
#> SRR1700316 3 0.1964 0.83989 0.056 0.000 0.944
#> SRR1700317 3 0.1643 0.84266 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700318 1 0.3551 0.73940 0.868 0.000 0.132
#> SRR1700319 3 0.3551 0.79528 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700320 3 0.3551 0.79534 0.132 0.000 0.868
#> SRR1700322 3 0.4842 0.70383 0.224 0.000 0.776
#> SRR1700321 3 0.1267 0.84666 0.024 0.004 0.972
#> SRR1700323 3 0.1643 0.84182 0.044 0.000 0.956
#> SRR1700324 3 0.5529 0.59756 0.296 0.000 0.704
#> SRR1700325 1 0.4802 0.72656 0.824 0.020 0.156
#> SRR1700326 1 0.0747 0.78517 0.984 0.016 0.000
#> SRR1700327 3 0.4750 0.70735 0.000 0.216 0.784
#> SRR1700329 3 0.1860 0.83979 0.052 0.000 0.948
#> SRR1700328 1 0.2959 0.76829 0.900 0.000 0.100
#> SRR1700330 1 0.3686 0.73408 0.860 0.000 0.140
#> SRR1700331 1 0.5560 0.53055 0.700 0.000 0.300
#> SRR1700332 1 0.3752 0.74282 0.856 0.000 0.144
#> SRR1700333 1 0.4121 0.72489 0.832 0.000 0.168
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1699874 2 0.3257 0.76081 0.004 0.844 0.000 0.152
#> SRR1699875 2 0.2946 0.75295 0.004 0.900 0.048 0.048
#> SRR1699876 4 0.4500 0.49142 0.032 0.192 0.000 0.776
#> SRR1699877 2 0.5387 0.68535 0.048 0.696 0.000 0.256
#> SRR1699879 2 0.3972 0.73740 0.008 0.788 0.000 0.204
#> SRR1699878 2 0.4408 0.72626 0.008 0.756 0.004 0.232
#> SRR1699880 2 0.5746 0.41112 0.004 0.600 0.368 0.028
#> SRR1699881 3 0.5607 -0.08635 0.000 0.484 0.496 0.020
#> SRR1699882 2 0.5284 0.66335 0.020 0.668 0.004 0.308
#> SRR1699883 2 0.5021 0.70670 0.036 0.724 0.000 0.240
#> SRR1699884 2 0.5937 0.53538 0.032 0.560 0.004 0.404
#> SRR1699885 2 0.4005 0.75298 0.008 0.808 0.008 0.176
#> SRR1699886 4 0.4589 0.52499 0.048 0.168 0.000 0.784
#> SRR1699888 4 0.5393 0.32410 0.044 0.268 0.000 0.688
#> SRR1699889 4 0.2844 0.65911 0.048 0.052 0.000 0.900
#> SRR1699890 4 0.5248 0.50477 0.088 0.164 0.000 0.748
#> SRR1699887 4 0.5188 0.38419 0.044 0.240 0.000 0.716
#> SRR1699891 4 0.3525 0.61010 0.040 0.100 0.000 0.860
#> SRR1699892 2 0.6058 0.51123 0.004 0.536 0.036 0.424
#> SRR1699893 4 0.2716 0.67920 0.028 0.052 0.008 0.912
#> SRR1699894 4 0.3323 0.64629 0.064 0.060 0.000 0.876
#> SRR1699895 4 0.2996 0.65987 0.064 0.044 0.000 0.892
#> SRR1699896 4 0.4387 0.54800 0.052 0.144 0.000 0.804
#> SRR1699897 2 0.5623 0.68392 0.004 0.676 0.044 0.276
#> SRR1699898 3 0.2466 0.73793 0.000 0.004 0.900 0.096
#> SRR1699900 4 0.5241 0.48350 0.044 0.184 0.016 0.756
#> SRR1699899 4 0.3986 0.57448 0.032 0.132 0.004 0.832
#> SRR1699902 4 0.4022 0.62542 0.000 0.096 0.068 0.836
#> SRR1699901 4 0.5083 0.54424 0.008 0.008 0.308 0.676
#> SRR1699903 4 0.2400 0.69737 0.012 0.028 0.032 0.928
#> SRR1699904 4 0.2053 0.68595 0.072 0.004 0.000 0.924
#> SRR1699905 4 0.2984 0.70231 0.084 0.000 0.028 0.888
#> SRR1699906 4 0.2923 0.70837 0.008 0.016 0.080 0.896
#> SRR1699907 4 0.1767 0.68712 0.044 0.012 0.000 0.944
#> SRR1699908 4 0.2221 0.69276 0.020 0.024 0.020 0.936
#> SRR1699909 4 0.3583 0.68328 0.000 0.004 0.180 0.816
#> SRR1699910 4 0.3760 0.70487 0.028 0.000 0.136 0.836
#> SRR1699911 4 0.1807 0.69540 0.052 0.000 0.008 0.940
#> SRR1699912 4 0.2076 0.71649 0.008 0.004 0.056 0.932
#> SRR1699913 4 0.2376 0.71127 0.000 0.016 0.068 0.916
#> SRR1699914 4 0.4360 0.62971 0.000 0.008 0.248 0.744
#> SRR1699915 4 0.3216 0.71991 0.044 0.000 0.076 0.880
#> SRR1699916 4 0.1962 0.70245 0.024 0.008 0.024 0.944
#> SRR1699917 4 0.4883 0.51777 0.000 0.016 0.288 0.696
#> SRR1699918 4 0.5203 0.43960 0.000 0.016 0.348 0.636
#> SRR1699919 4 0.2662 0.71532 0.016 0.000 0.084 0.900
#> SRR1699920 4 0.3289 0.69890 0.004 0.012 0.120 0.864
#> SRR1699921 4 0.3013 0.71865 0.032 0.000 0.080 0.888
#> SRR1699922 4 0.1452 0.69046 0.036 0.008 0.000 0.956
#> SRR1699923 4 0.4917 0.60183 0.008 0.016 0.248 0.728
#> SRR1699924 4 0.5149 0.46050 0.000 0.016 0.336 0.648
#> SRR1699925 1 0.0592 0.88514 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1699926 4 0.2840 0.72105 0.044 0.000 0.056 0.900
#> SRR1699927 4 0.1182 0.70912 0.016 0.000 0.016 0.968
#> SRR1699929 4 0.3048 0.66359 0.016 0.056 0.028 0.900
#> SRR1699928 4 0.2803 0.71205 0.012 0.008 0.080 0.900
#> SRR1699930 4 0.1888 0.68350 0.044 0.016 0.000 0.940
#> SRR1699931 4 0.4125 0.58985 0.016 0.128 0.024 0.832
#> SRR1699933 2 0.6308 0.59163 0.004 0.580 0.060 0.356
#> SRR1699932 4 0.1486 0.69927 0.024 0.008 0.008 0.960
#> SRR1699934 1 0.0336 0.88573 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1699935 4 0.3842 0.58761 0.036 0.128 0.000 0.836
#> SRR1699936 2 0.1174 0.75322 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1699937 2 0.2521 0.73544 0.000 0.912 0.064 0.024
#> SRR1699938 2 0.0992 0.74977 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR1699940 2 0.5147 0.19442 0.000 0.536 0.460 0.004
#> SRR1699939 2 0.1807 0.73367 0.008 0.940 0.052 0.000
#> SRR1699941 3 0.4543 0.40685 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1699942 2 0.2311 0.72260 0.004 0.916 0.076 0.004
#> SRR1699943 2 0.2010 0.74107 0.012 0.940 0.040 0.008
#> SRR1699944 2 0.1822 0.73886 0.004 0.944 0.044 0.008
#> SRR1699945 2 0.2861 0.70356 0.016 0.888 0.096 0.000
#> SRR1699946 2 0.2310 0.74840 0.004 0.928 0.040 0.028
#> SRR1699947 2 0.2317 0.73707 0.012 0.928 0.048 0.012
#> SRR1699948 2 0.0859 0.75185 0.008 0.980 0.004 0.008
#> SRR1699949 2 0.2546 0.76680 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR1699950 2 0.1930 0.76466 0.004 0.936 0.004 0.056
#> SRR1699951 2 0.1114 0.75113 0.004 0.972 0.016 0.008
#> SRR1699952 2 0.3491 0.72072 0.004 0.864 0.104 0.028
#> SRR1699953 2 0.1545 0.75962 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1699954 2 0.1863 0.74154 0.012 0.944 0.040 0.004
#> SRR1699955 2 0.1042 0.74543 0.008 0.972 0.020 0.000
#> SRR1699956 2 0.3992 0.64340 0.004 0.800 0.188 0.008
#> SRR1699957 2 0.3128 0.73922 0.004 0.888 0.076 0.032
#> SRR1699959 2 0.2981 0.72586 0.004 0.888 0.092 0.016
#> SRR1699958 2 0.3109 0.76786 0.004 0.880 0.016 0.100
#> SRR1699960 2 0.1639 0.76055 0.008 0.952 0.004 0.036
#> SRR1699961 2 0.4886 0.61063 0.004 0.744 0.224 0.028
#> SRR1699962 3 0.3545 0.63495 0.000 0.164 0.828 0.008
#> SRR1699963 3 0.5776 -0.05678 0.000 0.468 0.504 0.028
#> SRR1699964 3 0.5288 -0.00793 0.000 0.472 0.520 0.008
#> SRR1699965 2 0.2382 0.76828 0.004 0.912 0.004 0.080
#> SRR1699966 2 0.3105 0.71768 0.000 0.868 0.120 0.012
#> SRR1699967 2 0.3411 0.73285 0.008 0.876 0.084 0.032
#> SRR1699968 3 0.5508 0.47419 0.000 0.252 0.692 0.056
#> SRR1699969 3 0.3828 0.72498 0.000 0.068 0.848 0.084
#> SRR1699971 2 0.3943 0.69681 0.004 0.832 0.136 0.028
#> SRR1699970 3 0.5943 -0.04461 0.004 0.464 0.504 0.028
#> SRR1699972 2 0.5281 0.62662 0.004 0.728 0.220 0.048
#> SRR1699973 3 0.5592 0.23836 0.000 0.404 0.572 0.024
#> SRR1699974 3 0.1610 0.71872 0.000 0.032 0.952 0.016
#> SRR1699975 3 0.5491 0.56982 0.000 0.052 0.688 0.260
#> SRR1699976 2 0.6474 0.39893 0.004 0.560 0.368 0.068
#> SRR1699977 3 0.4716 0.67607 0.000 0.040 0.764 0.196
#> SRR1699978 3 0.4461 0.69050 0.016 0.012 0.788 0.184
#> SRR1699979 3 0.4636 0.58730 0.000 0.188 0.772 0.040
#> SRR1699980 3 0.5872 0.31995 0.000 0.040 0.576 0.384
#> SRR1699981 3 0.3497 0.71916 0.000 0.024 0.852 0.124
#> SRR1699982 4 0.2837 0.71061 0.012 0.016 0.068 0.904
#> SRR1699983 3 0.4567 0.60799 0.000 0.008 0.716 0.276
#> SRR1699984 3 0.5320 0.42914 0.288 0.012 0.684 0.016
#> SRR1699985 3 0.3900 0.70259 0.000 0.020 0.816 0.164
#> SRR1699986 3 0.0657 0.73359 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1699988 3 0.8017 -0.14254 0.004 0.336 0.384 0.276
#> SRR1699987 3 0.3367 0.73256 0.000 0.028 0.864 0.108
#> SRR1699989 4 0.4808 0.58289 0.000 0.028 0.236 0.736
#> SRR1699990 3 0.3862 0.70990 0.000 0.024 0.824 0.152
#> SRR1699992 3 0.3856 0.63963 0.000 0.136 0.832 0.032
#> SRR1699991 3 0.3308 0.67554 0.000 0.092 0.872 0.036
#> SRR1699993 3 0.1792 0.73746 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1699994 3 0.1820 0.71700 0.000 0.036 0.944 0.020
#> SRR1699995 3 0.1398 0.73586 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR1699996 2 0.7264 0.25751 0.000 0.460 0.392 0.148
#> SRR1699997 3 0.3024 0.70848 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1699998 2 0.6624 0.40567 0.004 0.556 0.360 0.080
#> SRR1699999 3 0.1543 0.72045 0.004 0.032 0.956 0.008
#> SRR1700000 2 0.5833 0.35088 0.004 0.572 0.396 0.028
#> SRR1700002 3 0.5582 0.29653 0.000 0.348 0.620 0.032
#> SRR1700001 3 0.4993 0.48252 0.000 0.260 0.712 0.028
#> SRR1700003 3 0.5392 0.43999 0.000 0.280 0.680 0.040
#> SRR1700004 3 0.5193 0.27382 0.000 0.008 0.580 0.412
#> SRR1700005 1 0.0592 0.88514 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700006 2 0.3858 0.72214 0.004 0.844 0.116 0.036
#> SRR1700007 4 0.3642 0.67297 0.024 0.076 0.028 0.872
#> SRR1700008 3 0.2334 0.73172 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1700009 1 0.2089 0.87103 0.932 0.020 0.000 0.048
#> SRR1700010 2 0.3990 0.66346 0.004 0.808 0.176 0.012
#> SRR1700011 2 0.3479 0.69045 0.000 0.840 0.148 0.012
#> SRR1700013 2 0.5421 0.22263 0.008 0.548 0.440 0.004
#> SRR1700012 3 0.5525 0.20719 0.004 0.388 0.592 0.016
#> SRR1700014 3 0.3710 0.67617 0.000 0.004 0.804 0.192
#> SRR1700015 2 0.5183 0.31303 0.008 0.584 0.408 0.000
#> SRR1700016 1 0.2814 0.83176 0.908 0.032 0.052 0.008
#> SRR1700018 2 0.5285 0.15052 0.008 0.524 0.468 0.000
#> SRR1700017 2 0.5290 0.12675 0.008 0.516 0.476 0.000
#> SRR1700019 2 0.6806 0.53391 0.096 0.580 0.008 0.316
#> SRR1700020 3 0.5300 0.34904 0.008 0.352 0.632 0.008
#> SRR1700021 4 0.4030 0.64871 0.156 0.012 0.012 0.820
#> SRR1700023 3 0.3726 0.58281 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1700022 3 0.5080 0.18869 0.004 0.420 0.576 0.000
#> SRR1700024 3 0.1109 0.73554 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1700025 2 0.4820 0.52913 0.000 0.692 0.296 0.012
#> SRR1700026 2 0.5060 0.52431 0.016 0.692 0.288 0.004
#> SRR1700027 2 0.5055 0.40756 0.008 0.624 0.368 0.000
#> SRR1700028 3 0.3679 0.72773 0.000 0.060 0.856 0.084
#> SRR1700029 3 0.3790 0.70537 0.000 0.016 0.820 0.164
#> SRR1700030 4 0.3625 0.70228 0.000 0.012 0.160 0.828
#> SRR1700031 3 0.2831 0.66920 0.000 0.120 0.876 0.004
#> SRR1700032 3 0.4769 0.43051 0.000 0.308 0.684 0.008
#> SRR1700034 3 0.1890 0.71451 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1700035 3 0.4985 0.05345 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1700033 3 0.0707 0.73444 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700036 4 0.4720 0.50411 0.000 0.004 0.324 0.672
#> SRR1700037 4 0.2983 0.72227 0.040 0.000 0.068 0.892
#> SRR1700038 4 0.4995 0.62099 0.032 0.000 0.248 0.720
#> SRR1700039 3 0.2593 0.72789 0.000 0.004 0.892 0.104
#> SRR1700040 3 0.1004 0.72975 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1700041 3 0.2401 0.73591 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR1700042 3 0.0707 0.73656 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1700043 3 0.4636 0.62892 0.008 0.132 0.804 0.056
#> SRR1700045 3 0.3166 0.72737 0.000 0.016 0.868 0.116
#> SRR1700044 3 0.3356 0.69718 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1700046 3 0.2266 0.73665 0.000 0.004 0.912 0.084
#> SRR1700047 3 0.4372 0.57707 0.004 0.000 0.728 0.268
#> SRR1700048 3 0.5004 0.34327 0.004 0.000 0.604 0.392
#> SRR1700049 3 0.1211 0.73809 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700050 3 0.3688 0.65782 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1700051 3 0.2654 0.72370 0.004 0.000 0.888 0.108
#> SRR1700052 3 0.2899 0.72981 0.004 0.004 0.880 0.112
#> SRR1700053 3 0.4188 0.61727 0.004 0.000 0.752 0.244
#> SRR1700054 3 0.2334 0.73569 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1700055 3 0.0524 0.73341 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1700056 3 0.4699 0.49229 0.004 0.000 0.676 0.320
#> SRR1700057 3 0.2814 0.71896 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1700058 3 0.1398 0.73476 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1700059 3 0.3870 0.66372 0.004 0.000 0.788 0.208
#> SRR1700060 3 0.0188 0.73400 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1700061 3 0.3157 0.70885 0.004 0.000 0.852 0.144
#> SRR1700062 3 0.1211 0.73735 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1700063 3 0.1824 0.73884 0.000 0.004 0.936 0.060
#> SRR1700064 3 0.2760 0.71637 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1700065 3 0.0921 0.73764 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1700066 3 0.0376 0.73330 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1700067 3 0.3105 0.70849 0.004 0.000 0.856 0.140
#> SRR1700068 3 0.2868 0.71391 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1700069 3 0.2530 0.73111 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1700070 3 0.1474 0.73716 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1700071 3 0.1004 0.72802 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1700072 3 0.1807 0.73964 0.008 0.000 0.940 0.052
#> SRR1700073 4 0.5639 0.50491 0.040 0.000 0.324 0.636
#> SRR1700075 3 0.1867 0.73704 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1700074 3 0.2399 0.70810 0.000 0.048 0.920 0.032
#> SRR1700076 3 0.2053 0.73522 0.000 0.004 0.924 0.072
#> SRR1700077 3 0.0592 0.72843 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1700078 3 0.1576 0.73738 0.004 0.000 0.948 0.048
#> SRR1700080 3 0.1174 0.72672 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1700079 3 0.0927 0.73137 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1700081 3 0.0469 0.73203 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1700082 3 0.3443 0.64419 0.000 0.136 0.848 0.016
#> SRR1700083 3 0.1722 0.71554 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1700084 3 0.1256 0.72258 0.000 0.028 0.964 0.008
#> SRR1700085 3 0.4889 0.40602 0.000 0.004 0.636 0.360
#> SRR1700086 3 0.1022 0.73824 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1700087 2 0.2040 0.73518 0.012 0.936 0.048 0.004
#> SRR1700088 2 0.4175 0.61550 0.016 0.784 0.200 0.000
#> SRR1700089 2 0.2559 0.73881 0.016 0.920 0.048 0.016
#> SRR1700091 2 0.2376 0.74068 0.000 0.916 0.068 0.016
#> SRR1700090 3 0.4511 0.58174 0.000 0.008 0.724 0.268
#> SRR1700092 2 0.5498 0.53618 0.000 0.680 0.272 0.048
#> SRR1700094 2 0.3509 0.72107 0.012 0.872 0.088 0.028
#> SRR1700093 4 0.6886 0.37070 0.008 0.088 0.368 0.536
#> SRR1700095 4 0.7984 0.25029 0.236 0.224 0.024 0.516
#> SRR1700096 3 0.5862 0.00461 0.000 0.484 0.484 0.032
#> SRR1700097 3 0.4380 0.64523 0.004 0.164 0.800 0.032
#> SRR1700098 2 0.6156 0.53746 0.048 0.576 0.004 0.372
#> SRR1700099 2 0.5412 0.59371 0.016 0.624 0.004 0.356
#> SRR1700100 2 0.3775 0.75998 0.016 0.864 0.040 0.080
#> SRR1700101 2 0.3798 0.75790 0.016 0.848 0.016 0.120
#> SRR1700102 2 0.3601 0.75489 0.000 0.860 0.056 0.084
#> SRR1700104 3 0.5195 0.53006 0.000 0.276 0.692 0.032
#> SRR1700103 3 0.4589 0.65820 0.000 0.168 0.784 0.048
#> SRR1700105 4 0.5529 0.64235 0.020 0.032 0.232 0.716
#> SRR1700106 4 0.4174 0.70301 0.000 0.044 0.140 0.816
#> SRR1700107 2 0.6809 0.24903 0.000 0.532 0.360 0.108
#> SRR1700108 4 0.7543 -0.03179 0.052 0.392 0.064 0.492
#> SRR1700109 4 0.4937 0.67805 0.012 0.100 0.092 0.796
#> SRR1700110 4 0.5723 0.53845 0.000 0.220 0.084 0.696
#> SRR1700112 4 0.3432 0.70525 0.008 0.004 0.140 0.848
#> SRR1700111 4 0.4252 0.63529 0.000 0.004 0.252 0.744
#> SRR1700113 4 0.3790 0.71582 0.012 0.040 0.088 0.860
#> SRR1700114 3 0.6310 0.55186 0.000 0.152 0.660 0.188
#> SRR1700115 4 0.7021 0.09405 0.000 0.400 0.120 0.480
#> SRR1700116 3 0.4673 0.54941 0.000 0.008 0.700 0.292
#> SRR1700117 4 0.5167 0.07612 0.004 0.000 0.488 0.508
#> SRR1700119 4 0.3873 0.65579 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1700118 3 0.4837 0.44442 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1700120 3 0.2520 0.73115 0.004 0.004 0.904 0.088
#> SRR1700121 4 0.3300 0.70242 0.008 0.000 0.144 0.848
#> SRR1700122 4 0.4720 0.60676 0.016 0.000 0.264 0.720
#> SRR1700123 4 0.5004 0.39396 0.004 0.000 0.392 0.604
#> SRR1700125 4 0.3810 0.67860 0.008 0.000 0.188 0.804
#> SRR1700126 3 0.1576 0.73535 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1700127 3 0.3626 0.68206 0.000 0.004 0.812 0.184
#> SRR1700124 3 0.4855 0.42900 0.004 0.000 0.644 0.352
#> SRR1700128 3 0.5028 0.30256 0.004 0.000 0.596 0.400
#> SRR1700129 4 0.4889 0.46551 0.004 0.000 0.360 0.636
#> SRR1700130 4 0.4262 0.63917 0.008 0.000 0.236 0.756
#> SRR1700132 3 0.3626 0.67972 0.004 0.000 0.812 0.184
#> SRR1700131 3 0.4198 0.63977 0.004 0.004 0.768 0.224
#> SRR1700133 4 0.4898 0.60851 0.024 0.000 0.260 0.716
#> SRR1700134 4 0.4194 0.64524 0.008 0.000 0.228 0.764
#> SRR1700135 4 0.5097 0.29053 0.004 0.000 0.428 0.568
#> SRR1700136 3 0.3801 0.64359 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1700137 4 0.5161 0.36973 0.008 0.000 0.400 0.592
#> SRR1700138 4 0.4898 0.32429 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1700140 3 0.4991 0.33700 0.004 0.000 0.608 0.388
#> SRR1700139 3 0.5080 0.24153 0.004 0.000 0.576 0.420
#> SRR1700141 4 0.5080 0.32064 0.004 0.000 0.420 0.576
#> SRR1700142 3 0.3266 0.69446 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1700143 3 0.3528 0.67593 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1700144 3 0.3306 0.69822 0.004 0.000 0.840 0.156
#> SRR1700145 4 0.4516 0.61944 0.012 0.000 0.252 0.736
#> SRR1700146 4 0.5080 0.32144 0.004 0.000 0.420 0.576
#> SRR1700147 3 0.4699 0.49464 0.004 0.000 0.676 0.320
#> SRR1700149 3 0.4872 0.41749 0.004 0.000 0.640 0.356
#> SRR1700148 3 0.4872 0.42122 0.004 0.000 0.640 0.356
#> SRR1700150 4 0.4477 0.55469 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1700152 3 0.5097 0.21841 0.004 0.000 0.568 0.428
#> SRR1700151 3 0.4372 0.58230 0.004 0.000 0.728 0.268
#> SRR1700153 3 0.4830 0.33162 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1700154 3 0.4936 0.38557 0.004 0.000 0.624 0.372
#> SRR1700155 3 0.5119 0.17017 0.004 0.000 0.556 0.440
#> SRR1700156 3 0.3751 0.66868 0.004 0.000 0.800 0.196
#> SRR1700158 3 0.5016 0.32167 0.004 0.000 0.600 0.396
#> SRR1700159 4 0.4746 0.56052 0.008 0.000 0.304 0.688
#> SRR1700157 3 0.4122 0.62586 0.004 0.000 0.760 0.236
#> SRR1700160 4 0.5016 0.38282 0.004 0.000 0.396 0.600
#> SRR1700161 4 0.4655 0.55218 0.004 0.000 0.312 0.684
#> SRR1700162 4 0.4360 0.62497 0.008 0.000 0.248 0.744
#> SRR1700164 4 0.5199 0.67877 0.144 0.000 0.100 0.756
#> SRR1700163 3 0.5691 0.01926 0.024 0.000 0.508 0.468
#> SRR1700165 4 0.5147 0.18731 0.004 0.000 0.460 0.536
#> SRR1700166 4 0.4737 0.62012 0.020 0.000 0.252 0.728
#> SRR1700168 4 0.4399 0.65868 0.020 0.000 0.212 0.768
#> SRR1700167 3 0.5143 0.11444 0.004 0.000 0.540 0.456
#> SRR1700170 4 0.4163 0.67460 0.020 0.000 0.188 0.792
#> SRR1700169 4 0.4284 0.64997 0.012 0.000 0.224 0.764
#> SRR1700171 3 0.4489 0.68407 0.144 0.004 0.804 0.048
#> SRR1700172 4 0.4382 0.57752 0.000 0.000 0.296 0.704
#> SRR1700174 3 0.5064 0.41065 0.004 0.004 0.632 0.360
#> SRR1700173 3 0.5064 0.40965 0.004 0.004 0.632 0.360
#> SRR1700175 4 0.4872 0.47816 0.004 0.000 0.356 0.640
#> SRR1700176 3 0.2530 0.72881 0.000 0.004 0.896 0.100
#> SRR1700178 2 0.2408 0.75769 0.036 0.920 0.000 0.044
#> SRR1700177 4 0.3161 0.70890 0.012 0.000 0.124 0.864
#> SRR1700180 2 0.3611 0.74756 0.080 0.860 0.000 0.060
#> SRR1700179 2 0.3196 0.75750 0.008 0.856 0.000 0.136
#> SRR1700181 2 0.2021 0.75833 0.024 0.936 0.000 0.040
#> SRR1700183 1 0.1211 0.86245 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1700182 2 0.3015 0.76324 0.024 0.884 0.000 0.092
#> SRR1700184 2 0.1510 0.75551 0.016 0.956 0.000 0.028
#> SRR1700186 2 0.0707 0.74764 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0657 0.88648 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700185 1 0.0657 0.88586 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700188 2 0.1911 0.75792 0.020 0.944 0.004 0.032
#> SRR1700192 1 0.6503 -0.05261 0.480 0.448 0.000 0.072
#> SRR1700190 2 0.2670 0.75773 0.040 0.908 0.000 0.052
#> SRR1700191 1 0.0376 0.88469 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700189 1 0.1510 0.87809 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1700193 2 0.3810 0.75268 0.060 0.848 0.000 0.092
#> SRR1700195 2 0.3372 0.74455 0.096 0.868 0.000 0.036
#> SRR1700194 1 0.0376 0.88469 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700196 2 0.3679 0.76035 0.016 0.840 0.004 0.140
#> SRR1700197 2 0.4343 0.53282 0.264 0.732 0.004 0.000
#> SRR1700198 2 0.3818 0.75691 0.048 0.844 0.000 0.108
#> SRR1700199 2 0.5340 0.72520 0.104 0.756 0.004 0.136
#> SRR1700200 2 0.6050 0.66189 0.112 0.676 0.000 0.212
#> SRR1700201 2 0.4121 0.74207 0.020 0.796 0.000 0.184
#> SRR1700202 1 0.6794 0.42702 0.556 0.116 0.000 0.328
#> SRR1700203 2 0.5806 0.61358 0.036 0.620 0.004 0.340
#> SRR1700204 2 0.4998 0.73353 0.040 0.760 0.008 0.192
#> SRR1700206 2 0.4428 0.74499 0.068 0.808 0.000 0.124
#> SRR1700207 2 0.3377 0.76012 0.012 0.848 0.000 0.140
#> SRR1700208 2 0.3873 0.74374 0.096 0.844 0.000 0.060
#> SRR1700205 4 0.6608 0.34445 0.204 0.168 0.000 0.628
#> SRR1700209 4 0.5967 -0.24285 0.012 0.428 0.020 0.540
#> SRR1700210 2 0.7346 0.53649 0.148 0.536 0.008 0.308
#> SRR1700211 2 0.7076 0.52316 0.268 0.584 0.008 0.140
#> SRR1700212 2 0.6664 0.59545 0.152 0.616 0.000 0.232
#> SRR1700213 2 0.4161 0.71939 0.012 0.836 0.112 0.040
#> SRR1700214 2 0.6520 0.52752 0.084 0.552 0.000 0.364
#> SRR1700215 1 0.0707 0.88340 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700217 4 0.6642 -0.24887 0.056 0.416 0.012 0.516
#> SRR1700216 1 0.0707 0.88340 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1700218 2 0.3464 0.76768 0.004 0.856 0.016 0.124
#> SRR1700219 2 0.5871 0.62178 0.028 0.624 0.012 0.336
#> SRR1700222 1 0.0779 0.88606 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1700220 2 0.5953 0.52433 0.020 0.548 0.012 0.420
#> SRR1700221 2 0.6873 0.58224 0.120 0.580 0.004 0.296
#> SRR1700223 2 0.5969 0.59460 0.028 0.600 0.012 0.360
#> SRR1700224 4 0.6355 -0.01809 0.076 0.348 0.000 0.576
#> SRR1700226 2 0.5572 0.66785 0.024 0.668 0.012 0.296
#> SRR1700229 2 0.4854 0.75088 0.016 0.780 0.032 0.172
#> SRR1700225 2 0.5020 0.66834 0.004 0.760 0.184 0.052
#> SRR1700227 2 0.3172 0.76697 0.004 0.872 0.012 0.112
#> SRR1700230 1 0.2565 0.85073 0.912 0.032 0.000 0.056
#> SRR1700231 2 0.4544 0.74490 0.012 0.780 0.016 0.192
#> SRR1700228 2 0.5265 0.71428 0.012 0.772 0.128 0.088
#> SRR1700232 2 0.5155 0.71128 0.016 0.720 0.016 0.248
#> SRR1700233 2 0.3749 0.75833 0.040 0.872 0.032 0.056
#> SRR1700234 1 0.5244 0.70286 0.764 0.124 0.004 0.108
#> SRR1700235 2 0.5200 0.70529 0.004 0.704 0.028 0.264
#> SRR1700237 2 0.3341 0.76502 0.012 0.880 0.024 0.084
#> SRR1700236 2 0.5826 0.58853 0.020 0.596 0.012 0.372
#> SRR1700238 2 0.4957 0.73542 0.040 0.764 0.008 0.188
#> SRR1700239 1 0.0804 0.88549 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1700240 1 0.0592 0.88514 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1700241 3 0.0895 0.73637 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1700243 2 0.4332 0.74676 0.040 0.800 0.000 0.160
#> SRR1700244 2 0.6186 0.55988 0.064 0.584 0.000 0.352
#> SRR1700242 1 0.0937 0.88161 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1700246 1 0.3570 0.79811 0.860 0.092 0.000 0.048
#> SRR1700245 2 0.4020 0.75881 0.008 0.820 0.016 0.156
#> SRR1700247 1 0.0524 0.88588 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1700249 1 0.0657 0.88648 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700250 2 0.4607 0.70048 0.004 0.716 0.004 0.276
#> SRR1700248 2 0.4589 0.73838 0.048 0.784 0.000 0.168
#> SRR1700251 2 0.5662 0.67720 0.072 0.692 0.000 0.236
#> SRR1700252 2 0.1617 0.76062 0.012 0.956 0.008 0.024
#> SRR1700253 2 0.6498 0.40769 0.072 0.488 0.000 0.440
#> SRR1700256 2 0.5188 0.69931 0.044 0.716 0.000 0.240
#> SRR1700254 1 0.0657 0.88648 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1700255 2 0.6140 0.64475 0.096 0.652 0.000 0.252
#> SRR1700257 2 0.5792 0.63540 0.056 0.648 0.000 0.296
#> SRR1700258 2 0.4071 0.74663 0.064 0.832 0.000 0.104
#> SRR1700259 2 0.3344 0.76071 0.020 0.868 0.004 0.108
#> SRR1700260 2 0.2392 0.76323 0.016 0.924 0.008 0.052
#> SRR1700261 4 0.5582 0.64339 0.000 0.136 0.136 0.728
#> SRR1700262 4 0.5888 0.27058 0.048 0.308 0.004 0.640
#> SRR1700263 2 0.2587 0.76483 0.008 0.916 0.020 0.056
#> SRR1700264 2 0.0804 0.74598 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1700265 1 0.5755 0.06825 0.528 0.444 0.000 0.028
#> SRR1700266 2 0.0937 0.75118 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR1700268 2 0.6471 0.67174 0.148 0.700 0.032 0.120
#> SRR1700270 2 0.2946 0.76247 0.048 0.900 0.004 0.048
#> SRR1700267 2 0.1911 0.75590 0.020 0.944 0.004 0.032
#> SRR1700271 2 0.3647 0.75381 0.016 0.832 0.000 0.152
#> SRR1700272 2 0.5067 0.69861 0.048 0.736 0.000 0.216
#> SRR1700273 2 0.2578 0.76154 0.036 0.912 0.000 0.052
#> SRR1700274 2 0.6101 0.62389 0.068 0.644 0.004 0.284
#> SRR1700277 2 0.2186 0.76102 0.012 0.932 0.008 0.048
#> SRR1700275 4 0.3734 0.63234 0.044 0.096 0.004 0.856
#> SRR1700276 4 0.7764 -0.09064 0.252 0.324 0.000 0.424
#> SRR1700278 4 0.3215 0.65610 0.092 0.032 0.000 0.876
#> SRR1700279 4 0.4417 0.60085 0.160 0.044 0.000 0.796
#> SRR1700280 4 0.5564 0.48549 0.216 0.076 0.000 0.708
#> SRR1700281 2 0.4600 0.72291 0.012 0.744 0.004 0.240
#> SRR1700283 4 0.4387 0.56199 0.052 0.144 0.000 0.804
#> SRR1700282 1 0.6801 0.44827 0.568 0.124 0.000 0.308
#> SRR1700284 4 0.1305 0.71995 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1700285 4 0.5512 0.55764 0.040 0.000 0.300 0.660
#> SRR1700286 4 0.6610 -0.26620 0.000 0.452 0.080 0.468
#> SRR1700287 4 0.2874 0.69162 0.064 0.020 0.012 0.904
#> SRR1700290 4 0.4710 0.69995 0.120 0.000 0.088 0.792
#> SRR1700289 4 0.1943 0.70070 0.032 0.008 0.016 0.944
#> SRR1700288 2 0.6683 0.44252 0.088 0.496 0.000 0.416
#> SRR1700292 4 0.2660 0.67689 0.056 0.036 0.000 0.908
#> SRR1700291 4 0.3554 0.70513 0.020 0.000 0.136 0.844
#> SRR1700293 4 0.2680 0.72204 0.036 0.004 0.048 0.912
#> SRR1700294 4 0.3877 0.71236 0.048 0.000 0.112 0.840
#> SRR1700295 4 0.3731 0.70714 0.036 0.000 0.120 0.844
#> SRR1700297 4 0.2722 0.72044 0.032 0.000 0.064 0.904
#> SRR1700296 4 0.2546 0.68882 0.092 0.000 0.008 0.900
#> SRR1700298 4 0.4956 0.70277 0.108 0.000 0.116 0.776
#> SRR1700299 4 0.5498 0.35659 0.020 0.000 0.404 0.576
#> SRR1700300 4 0.5403 0.47957 0.024 0.000 0.348 0.628
#> SRR1700302 4 0.3464 0.71498 0.032 0.000 0.108 0.860
#> SRR1700301 4 0.3523 0.71381 0.032 0.000 0.112 0.856
#> SRR1700303 4 0.2739 0.72073 0.036 0.000 0.060 0.904
#> SRR1700304 4 0.4564 0.43344 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1700305 4 0.4253 0.66792 0.016 0.000 0.208 0.776
#> SRR1700306 4 0.5645 0.44100 0.032 0.000 0.364 0.604
#> SRR1700308 4 0.5151 0.16915 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1700307 3 0.4509 0.55376 0.004 0.000 0.708 0.288
#> SRR1700309 4 0.4697 0.57740 0.008 0.000 0.296 0.696
#> SRR1700310 4 0.5169 0.60006 0.032 0.000 0.272 0.696
#> SRR1700311 4 0.5565 0.47991 0.032 0.000 0.344 0.624
#> SRR1700312 4 0.4964 0.43160 0.000 0.004 0.380 0.616
#> SRR1700313 3 0.5296 -0.04422 0.008 0.000 0.500 0.492
#> SRR1700314 3 0.4837 0.44192 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1700315 4 0.4988 0.58549 0.020 0.000 0.288 0.692
#> SRR1700316 4 0.5295 0.07463 0.008 0.000 0.488 0.504
#> SRR1700317 4 0.3428 0.70289 0.000 0.012 0.144 0.844
#> SRR1700318 4 0.4933 0.51676 0.296 0.000 0.016 0.688
#> SRR1700319 4 0.5085 0.55474 0.020 0.000 0.304 0.676
#> SRR1700320 4 0.4214 0.66708 0.016 0.000 0.204 0.780
#> SRR1700322 4 0.6197 0.19866 0.052 0.000 0.440 0.508
#> SRR1700321 4 0.4053 0.65295 0.004 0.000 0.228 0.768
#> SRR1700323 4 0.5150 0.38471 0.008 0.000 0.396 0.596
#> SRR1700324 4 0.4964 0.63484 0.032 0.000 0.244 0.724
#> SRR1700325 4 0.3353 0.65927 0.060 0.056 0.004 0.880
#> SRR1700326 1 0.3474 0.82576 0.868 0.064 0.000 0.068
#> SRR1700327 3 0.4235 0.71867 0.000 0.092 0.824 0.084
#> SRR1700329 4 0.3831 0.66871 0.004 0.000 0.204 0.792
#> SRR1700328 1 0.5293 0.64575 0.748 0.000 0.152 0.100
#> SRR1700330 4 0.4983 0.55625 0.272 0.000 0.024 0.704
#> SRR1700331 4 0.1661 0.69729 0.052 0.000 0.004 0.944
#> SRR1700332 4 0.2761 0.66024 0.048 0.048 0.000 0.904
#> SRR1700333 4 0.1940 0.68709 0.076 0.000 0.000 0.924
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1699874 2 0.4394 0.65289 0.000 0.764 0.100 0.000 0.136
#> SRR1699875 3 0.5645 -0.15155 0.000 0.376 0.540 0.000 0.084
#> SRR1699876 5 0.4558 0.42616 0.000 0.060 0.216 0.000 0.724
#> SRR1699877 2 0.6934 0.29043 0.004 0.376 0.308 0.000 0.312
#> SRR1699879 2 0.4234 0.65826 0.000 0.780 0.068 0.004 0.148
#> SRR1699878 2 0.6715 0.34627 0.000 0.424 0.292 0.000 0.284
#> SRR1699880 3 0.3844 0.43543 0.000 0.164 0.792 0.044 0.000
#> SRR1699881 3 0.5128 0.51611 0.000 0.112 0.712 0.168 0.008
#> SRR1699882 5 0.6698 -0.11288 0.000 0.260 0.316 0.000 0.424
#> SRR1699883 3 0.6910 -0.14515 0.004 0.284 0.388 0.000 0.324
#> SRR1699884 5 0.6631 -0.07295 0.000 0.236 0.324 0.000 0.440
#> SRR1699885 2 0.6635 0.33541 0.000 0.416 0.360 0.000 0.224
#> SRR1699886 5 0.4219 0.48443 0.000 0.072 0.156 0.000 0.772
#> SRR1699888 5 0.4519 0.44146 0.000 0.148 0.100 0.000 0.752
#> SRR1699889 5 0.2568 0.55505 0.000 0.016 0.048 0.032 0.904
#> SRR1699890 5 0.3168 0.55264 0.008 0.064 0.052 0.004 0.872
#> SRR1699887 5 0.4766 0.40775 0.000 0.072 0.220 0.000 0.708
#> SRR1699891 5 0.3632 0.50596 0.000 0.020 0.176 0.004 0.800
#> SRR1699892 3 0.5641 0.20826 0.000 0.088 0.556 0.000 0.356
#> SRR1699893 5 0.3895 0.52868 0.000 0.012 0.044 0.132 0.812
#> SRR1699894 5 0.2342 0.55260 0.000 0.020 0.024 0.040 0.916
#> SRR1699895 5 0.2151 0.55206 0.000 0.016 0.020 0.040 0.924
#> SRR1699896 5 0.5294 0.16428 0.000 0.056 0.380 0.000 0.564
#> SRR1699897 3 0.5600 0.24082 0.000 0.096 0.588 0.000 0.316
#> SRR1699898 3 0.4861 0.30204 0.000 0.000 0.548 0.428 0.024
#> SRR1699900 5 0.5538 0.04005 0.000 0.056 0.440 0.004 0.500
#> SRR1699899 5 0.4712 0.36624 0.000 0.048 0.268 0.000 0.684
#> SRR1699902 3 0.5434 0.13929 0.000 0.044 0.540 0.008 0.408
#> SRR1699901 3 0.5679 0.16860 0.004 0.008 0.540 0.052 0.396
#> SRR1699903 5 0.4653 0.32503 0.000 0.016 0.324 0.008 0.652
#> SRR1699904 5 0.2353 0.54791 0.000 0.004 0.028 0.060 0.908
#> SRR1699905 5 0.4599 0.51754 0.064 0.000 0.168 0.012 0.756
#> SRR1699906 5 0.4928 0.17195 0.000 0.016 0.412 0.008 0.564
#> SRR1699907 5 0.3211 0.52980 0.000 0.004 0.164 0.008 0.824
#> SRR1699908 5 0.4691 0.30263 0.000 0.020 0.340 0.004 0.636
#> SRR1699909 5 0.4787 0.51113 0.000 0.000 0.208 0.080 0.712
#> SRR1699910 5 0.4127 0.53380 0.000 0.000 0.136 0.080 0.784
#> SRR1699911 5 0.3219 0.55214 0.000 0.004 0.136 0.020 0.840
#> SRR1699912 5 0.3462 0.50281 0.000 0.000 0.196 0.012 0.792
#> SRR1699913 5 0.4524 0.40461 0.000 0.008 0.280 0.020 0.692
#> SRR1699914 5 0.5331 0.42779 0.000 0.000 0.268 0.092 0.640
#> SRR1699915 5 0.3452 0.50616 0.000 0.000 0.032 0.148 0.820
#> SRR1699916 5 0.4388 0.45262 0.000 0.008 0.244 0.024 0.724
#> SRR1699917 5 0.5368 0.00884 0.000 0.008 0.476 0.036 0.480
#> SRR1699918 3 0.5476 0.22265 0.000 0.000 0.544 0.068 0.388
#> SRR1699919 5 0.3812 0.50809 0.000 0.000 0.204 0.024 0.772
#> SRR1699920 5 0.4639 0.26617 0.000 0.000 0.368 0.020 0.612
#> SRR1699921 5 0.3752 0.54270 0.000 0.000 0.148 0.048 0.804
#> SRR1699922 5 0.4548 0.37066 0.000 0.012 0.300 0.012 0.676
#> SRR1699923 3 0.5185 0.23485 0.008 0.000 0.596 0.036 0.360
#> SRR1699924 3 0.5328 0.26146 0.000 0.000 0.584 0.064 0.352
#> SRR1699925 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699926 5 0.3579 0.54531 0.000 0.000 0.100 0.072 0.828
#> SRR1699927 5 0.3291 0.55168 0.000 0.000 0.120 0.040 0.840
#> SRR1699929 5 0.5547 0.00343 0.000 0.048 0.460 0.008 0.484
#> SRR1699928 5 0.4297 0.39183 0.000 0.000 0.288 0.020 0.692
#> SRR1699930 5 0.3297 0.55523 0.000 0.008 0.132 0.020 0.840
#> SRR1699931 3 0.5549 0.02972 0.000 0.056 0.480 0.004 0.460
#> SRR1699933 3 0.5590 0.25082 0.000 0.080 0.592 0.004 0.324
#> SRR1699932 5 0.3412 0.51952 0.000 0.008 0.172 0.008 0.812
#> SRR1699934 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1699935 5 0.3553 0.55621 0.000 0.024 0.128 0.016 0.832
#> SRR1699936 2 0.1173 0.63578 0.000 0.964 0.020 0.012 0.004
#> SRR1699937 2 0.4723 0.46739 0.000 0.612 0.368 0.008 0.012
#> SRR1699938 2 0.3282 0.63742 0.000 0.804 0.188 0.000 0.008
#> SRR1699940 3 0.6595 0.25866 0.000 0.296 0.488 0.212 0.004
#> SRR1699939 2 0.3840 0.60694 0.000 0.772 0.208 0.012 0.008
#> SRR1699941 3 0.5991 0.28532 0.000 0.096 0.476 0.424 0.004
#> SRR1699942 2 0.3875 0.59108 0.000 0.756 0.228 0.012 0.004
#> SRR1699943 2 0.3491 0.61639 0.000 0.768 0.228 0.000 0.004
#> SRR1699944 2 0.3647 0.60920 0.000 0.764 0.228 0.004 0.004
#> SRR1699945 2 0.3523 0.61922 0.000 0.824 0.140 0.032 0.004
#> SRR1699946 2 0.5003 0.40466 0.000 0.544 0.424 0.000 0.032
#> SRR1699947 2 0.4037 0.55783 0.000 0.704 0.288 0.004 0.004
#> SRR1699948 2 0.2536 0.65741 0.000 0.868 0.128 0.000 0.004
#> SRR1699949 2 0.1934 0.64868 0.000 0.932 0.020 0.008 0.040
#> SRR1699950 2 0.3667 0.65745 0.000 0.812 0.140 0.000 0.048
#> SRR1699951 2 0.2612 0.64985 0.000 0.868 0.124 0.008 0.000
#> SRR1699952 3 0.5006 -0.11184 0.000 0.408 0.564 0.008 0.020
#> SRR1699953 2 0.4830 0.58633 0.000 0.684 0.256 0.000 0.060
#> SRR1699954 2 0.3675 0.61177 0.000 0.772 0.216 0.004 0.008
#> SRR1699955 2 0.2249 0.64655 0.000 0.896 0.096 0.008 0.000
#> SRR1699956 2 0.5458 0.29365 0.000 0.552 0.380 0.068 0.000
#> SRR1699957 3 0.5028 0.18162 0.000 0.260 0.668 0.000 0.072
#> SRR1699959 2 0.5415 0.27515 0.000 0.508 0.448 0.020 0.024
#> SRR1699958 2 0.4097 0.60257 0.000 0.816 0.024 0.076 0.084
#> SRR1699960 2 0.2913 0.66718 0.000 0.876 0.080 0.004 0.040
#> SRR1699961 3 0.4167 0.28956 0.000 0.252 0.724 0.024 0.000
#> SRR1699962 3 0.5095 0.39338 0.000 0.036 0.592 0.368 0.004
#> SRR1699963 3 0.4221 0.50010 0.000 0.112 0.780 0.108 0.000
#> SRR1699964 3 0.6493 0.35116 0.000 0.248 0.492 0.260 0.000
#> SRR1699965 2 0.3216 0.66464 0.000 0.848 0.108 0.000 0.044
#> SRR1699966 2 0.5759 0.42554 0.000 0.576 0.344 0.064 0.016
#> SRR1699967 3 0.4885 -0.12231 0.000 0.400 0.572 0.000 0.028
#> SRR1699968 3 0.3674 0.53584 0.000 0.024 0.844 0.064 0.068
#> SRR1699969 3 0.5217 0.36522 0.000 0.004 0.588 0.364 0.044
#> SRR1699971 3 0.4464 0.16408 0.000 0.288 0.684 0.000 0.028
#> SRR1699970 3 0.4089 0.50560 0.000 0.100 0.804 0.088 0.008
#> SRR1699972 3 0.4010 0.36146 0.000 0.160 0.784 0.000 0.056
#> SRR1699973 3 0.6216 0.42677 0.000 0.180 0.536 0.284 0.000
#> SRR1699974 3 0.4264 0.40463 0.000 0.004 0.620 0.376 0.000
#> SRR1699975 3 0.4790 0.44562 0.000 0.024 0.732 0.040 0.204
#> SRR1699976 3 0.3479 0.43521 0.000 0.084 0.836 0.000 0.080
#> SRR1699977 3 0.3915 0.54115 0.000 0.004 0.812 0.088 0.096
#> SRR1699978 3 0.5606 0.51870 0.020 0.000 0.672 0.208 0.100
#> SRR1699979 3 0.3516 0.56037 0.000 0.020 0.812 0.164 0.004
#> SRR1699980 3 0.5063 0.40376 0.000 0.032 0.688 0.028 0.252
#> SRR1699981 3 0.3798 0.55778 0.000 0.000 0.808 0.128 0.064
#> SRR1699982 5 0.4164 0.44204 0.000 0.012 0.252 0.008 0.728
#> SRR1699983 3 0.5375 0.52168 0.000 0.000 0.668 0.156 0.176
#> SRR1699984 3 0.6545 0.28065 0.316 0.000 0.464 0.220 0.000
#> SRR1699985 3 0.4078 0.55375 0.000 0.000 0.784 0.148 0.068
#> SRR1699986 4 0.4015 0.15194 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1699988 3 0.4888 0.34601 0.000 0.048 0.676 0.004 0.272
#> SRR1699987 3 0.4193 0.50746 0.000 0.000 0.720 0.256 0.024
#> SRR1699989 3 0.5146 0.25538 0.000 0.036 0.608 0.008 0.348
#> SRR1699990 3 0.3906 0.56212 0.000 0.000 0.800 0.132 0.068
#> SRR1699992 3 0.3243 0.55029 0.000 0.004 0.812 0.180 0.004
#> SRR1699991 3 0.3266 0.54319 0.000 0.000 0.796 0.200 0.004
#> SRR1699993 4 0.5380 -0.17517 0.004 0.000 0.464 0.488 0.044
#> SRR1699994 3 0.3949 0.48082 0.000 0.004 0.696 0.300 0.000
#> SRR1699995 4 0.4025 0.25730 0.000 0.000 0.292 0.700 0.008
#> SRR1699996 3 0.5043 0.39332 0.000 0.072 0.736 0.028 0.164
#> SRR1699997 4 0.3991 0.49126 0.000 0.000 0.172 0.780 0.048
#> SRR1699998 3 0.4298 0.39520 0.000 0.108 0.788 0.008 0.096
#> SRR1699999 3 0.4528 0.29878 0.008 0.000 0.548 0.444 0.000
#> SRR1700000 3 0.3689 0.43457 0.000 0.144 0.816 0.032 0.008
#> SRR1700002 3 0.3533 0.53694 0.000 0.056 0.836 0.104 0.004
#> SRR1700001 3 0.4431 0.53065 0.000 0.052 0.732 0.216 0.000
#> SRR1700003 3 0.3673 0.55928 0.000 0.028 0.820 0.140 0.012
#> SRR1700004 4 0.5564 0.45705 0.000 0.028 0.056 0.648 0.268
#> SRR1700005 1 0.0162 0.88400 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700006 3 0.4896 0.15670 0.000 0.296 0.664 0.016 0.024
#> SRR1700007 5 0.4665 0.37189 0.000 0.048 0.000 0.260 0.692
#> SRR1700008 4 0.2344 0.55551 0.000 0.000 0.064 0.904 0.032
#> SRR1700009 1 0.4779 0.69853 0.772 0.036 0.000 0.100 0.092
#> SRR1700010 2 0.5350 0.48681 0.000 0.632 0.292 0.072 0.004
#> SRR1700011 2 0.5112 0.53134 0.000 0.680 0.240 0.076 0.004
#> SRR1700013 2 0.6211 0.12819 0.000 0.440 0.120 0.436 0.004
#> SRR1700012 3 0.4941 0.52624 0.000 0.080 0.708 0.208 0.004
#> SRR1700014 4 0.4054 0.56736 0.000 0.004 0.080 0.800 0.116
#> SRR1700015 2 0.6596 0.18108 0.000 0.492 0.220 0.284 0.004
#> SRR1700016 1 0.2837 0.80563 0.876 0.004 0.016 0.100 0.004
#> SRR1700018 2 0.6761 0.07212 0.000 0.432 0.228 0.336 0.004
#> SRR1700017 2 0.6882 -0.03724 0.000 0.380 0.260 0.356 0.004
#> SRR1700019 2 0.6706 0.16793 0.004 0.488 0.008 0.172 0.328
#> SRR1700020 4 0.6281 0.17075 0.000 0.304 0.144 0.544 0.008
#> SRR1700021 5 0.5446 0.19399 0.004 0.060 0.000 0.360 0.576
#> SRR1700023 3 0.5318 0.24463 0.000 0.040 0.496 0.460 0.004
#> SRR1700022 4 0.6922 -0.25004 0.000 0.280 0.356 0.360 0.004
#> SRR1700024 4 0.3838 0.30317 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1700025 2 0.6211 0.08723 0.000 0.444 0.432 0.120 0.004
#> SRR1700026 2 0.6885 0.23766 0.008 0.500 0.300 0.180 0.012
#> SRR1700027 2 0.6561 0.13773 0.000 0.468 0.344 0.184 0.004
#> SRR1700028 4 0.3746 0.54418 0.000 0.040 0.036 0.840 0.084
#> SRR1700029 4 0.5594 0.08328 0.000 0.004 0.400 0.532 0.064
#> SRR1700030 5 0.4749 0.41109 0.000 0.008 0.040 0.252 0.700
#> SRR1700031 4 0.4915 -0.06895 0.000 0.020 0.420 0.556 0.004
#> SRR1700032 3 0.5770 0.37087 0.000 0.080 0.528 0.388 0.004
#> SRR1700034 4 0.4714 -0.02266 0.000 0.012 0.408 0.576 0.004
#> SRR1700035 5 0.6476 0.06028 0.000 0.000 0.204 0.320 0.476
#> SRR1700033 4 0.3774 0.26014 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1700036 5 0.5822 0.26145 0.000 0.004 0.324 0.100 0.572
#> SRR1700037 5 0.3513 0.47788 0.000 0.000 0.020 0.180 0.800
#> SRR1700038 5 0.6280 0.31338 0.004 0.008 0.140 0.276 0.572
#> SRR1700039 4 0.3629 0.56316 0.000 0.004 0.092 0.832 0.072
#> SRR1700040 4 0.4596 -0.19994 0.000 0.004 0.496 0.496 0.004
#> SRR1700041 3 0.4525 0.41302 0.000 0.000 0.624 0.360 0.016
#> SRR1700042 4 0.4306 -0.17784 0.000 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1700043 3 0.3045 0.53102 0.016 0.012 0.888 0.048 0.036
#> SRR1700045 3 0.4203 0.54273 0.000 0.000 0.760 0.188 0.052
#> SRR1700044 3 0.5316 0.40086 0.000 0.000 0.588 0.348 0.064
#> SRR1700046 3 0.4270 0.45668 0.000 0.000 0.668 0.320 0.012
#> SRR1700047 3 0.6236 0.12985 0.000 0.000 0.456 0.400 0.144
#> SRR1700048 3 0.6459 0.25757 0.004 0.000 0.504 0.312 0.180
#> SRR1700049 4 0.4161 0.05470 0.000 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1700050 4 0.3695 0.48982 0.000 0.000 0.164 0.800 0.036
#> SRR1700051 4 0.4262 -0.03094 0.000 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1700052 3 0.4588 0.38983 0.000 0.000 0.604 0.380 0.016
#> SRR1700053 3 0.5781 0.33809 0.000 0.000 0.552 0.344 0.104
#> SRR1700054 3 0.4497 0.33064 0.000 0.000 0.568 0.424 0.008
#> SRR1700055 4 0.4383 -0.04211 0.000 0.000 0.424 0.572 0.004
#> SRR1700056 4 0.6111 0.38223 0.000 0.000 0.260 0.560 0.180
#> SRR1700057 3 0.5447 0.22015 0.000 0.000 0.500 0.440 0.060
#> SRR1700058 3 0.4084 0.45075 0.000 0.000 0.668 0.328 0.004
#> SRR1700059 3 0.5346 0.14458 0.000 0.000 0.496 0.452 0.052
#> SRR1700060 3 0.4305 0.21139 0.000 0.000 0.512 0.488 0.000
#> SRR1700061 3 0.4833 0.32736 0.000 0.000 0.564 0.412 0.024
#> SRR1700062 4 0.3913 0.21053 0.000 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1700063 3 0.4151 0.43546 0.000 0.000 0.652 0.344 0.004
#> SRR1700064 3 0.4971 0.23858 0.000 0.000 0.512 0.460 0.028
#> SRR1700065 4 0.4262 -0.04820 0.000 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1700066 4 0.4430 -0.11602 0.000 0.000 0.456 0.540 0.004
#> SRR1700067 4 0.4165 0.25012 0.000 0.000 0.320 0.672 0.008
#> SRR1700068 4 0.3983 0.18971 0.000 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1700069 3 0.5047 0.47820 0.000 0.000 0.652 0.284 0.064
#> SRR1700070 3 0.4166 0.43420 0.000 0.000 0.648 0.348 0.004
#> SRR1700071 3 0.4066 0.46073 0.000 0.000 0.672 0.324 0.004
#> SRR1700072 3 0.4722 0.38289 0.024 0.000 0.608 0.368 0.000
#> SRR1700073 4 0.4524 0.24042 0.000 0.004 0.004 0.572 0.420
#> SRR1700075 4 0.4403 -0.05035 0.000 0.000 0.436 0.560 0.004
#> SRR1700074 3 0.3814 0.50408 0.000 0.000 0.720 0.276 0.004
#> SRR1700076 3 0.4193 0.47609 0.000 0.000 0.684 0.304 0.012
#> SRR1700077 4 0.4595 -0.18938 0.000 0.004 0.488 0.504 0.004
#> SRR1700078 4 0.4109 0.27034 0.000 0.000 0.288 0.700 0.012
#> SRR1700080 3 0.4402 0.42961 0.000 0.000 0.636 0.352 0.012
#> SRR1700079 4 0.4249 -0.04391 0.000 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1700081 3 0.4242 0.32303 0.000 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1700082 3 0.4538 0.43257 0.000 0.012 0.636 0.348 0.004
#> SRR1700083 3 0.4299 0.37400 0.000 0.004 0.608 0.388 0.000
#> SRR1700084 3 0.4507 0.35127 0.000 0.004 0.580 0.412 0.004
#> SRR1700085 4 0.6482 0.28880 0.000 0.000 0.200 0.468 0.332
#> SRR1700086 3 0.4974 0.23046 0.000 0.000 0.508 0.464 0.028
#> SRR1700087 2 0.3488 0.53203 0.000 0.804 0.008 0.180 0.008
#> SRR1700088 2 0.4444 0.51492 0.000 0.756 0.064 0.176 0.004
#> SRR1700089 2 0.4386 0.47771 0.000 0.728 0.016 0.240 0.016
#> SRR1700091 2 0.6083 0.22089 0.000 0.528 0.008 0.360 0.104
#> SRR1700090 4 0.3880 0.49438 0.004 0.028 0.000 0.784 0.184
#> SRR1700092 4 0.6139 0.31913 0.000 0.260 0.016 0.596 0.128
#> SRR1700094 2 0.5201 0.35225 0.000 0.608 0.008 0.344 0.040
#> SRR1700093 4 0.5762 0.28804 0.000 0.100 0.004 0.588 0.308
#> SRR1700095 4 0.6917 0.14678 0.008 0.224 0.004 0.464 0.300
#> SRR1700096 4 0.5528 0.40511 0.000 0.204 0.020 0.680 0.096
#> SRR1700097 4 0.4256 0.47749 0.000 0.120 0.068 0.796 0.016
#> SRR1700098 2 0.6814 0.07239 0.000 0.452 0.008 0.224 0.316
#> SRR1700099 2 0.6445 0.22223 0.000 0.516 0.008 0.160 0.316
#> SRR1700100 2 0.5801 0.40772 0.000 0.620 0.008 0.256 0.116
#> SRR1700101 2 0.6567 0.24943 0.000 0.520 0.008 0.264 0.208
#> SRR1700102 2 0.6560 0.29721 0.000 0.540 0.016 0.272 0.172
#> SRR1700104 4 0.4657 0.46926 0.000 0.148 0.020 0.764 0.068
#> SRR1700103 4 0.4432 0.51159 0.000 0.092 0.032 0.796 0.080
#> SRR1700105 4 0.5469 0.21055 0.000 0.056 0.004 0.548 0.392
#> SRR1700106 4 0.5601 0.05182 0.000 0.060 0.004 0.476 0.460
#> SRR1700107 4 0.5864 0.36243 0.000 0.160 0.008 0.632 0.200
#> SRR1700108 4 0.6837 0.10355 0.000 0.196 0.012 0.444 0.348
#> SRR1700109 4 0.6126 0.09902 0.000 0.100 0.008 0.484 0.408
#> SRR1700110 4 0.6363 0.11187 0.000 0.144 0.004 0.468 0.384
#> SRR1700112 5 0.5215 0.03452 0.000 0.028 0.008 0.444 0.520
#> SRR1700111 4 0.4818 0.14119 0.000 0.020 0.000 0.520 0.460
#> SRR1700113 5 0.5425 0.00866 0.000 0.048 0.004 0.440 0.508
#> SRR1700114 4 0.4518 0.46898 0.000 0.044 0.012 0.748 0.196
#> SRR1700115 4 0.6262 0.17659 0.000 0.124 0.008 0.512 0.356
#> SRR1700116 4 0.3742 0.50314 0.000 0.020 0.004 0.788 0.188
#> SRR1700117 4 0.4260 0.41035 0.000 0.008 0.004 0.680 0.308
#> SRR1700119 5 0.4783 0.02899 0.000 0.012 0.004 0.452 0.532
#> SRR1700118 4 0.3995 0.54239 0.000 0.000 0.044 0.776 0.180
#> SRR1700120 4 0.2300 0.54810 0.000 0.000 0.072 0.904 0.024
#> SRR1700121 5 0.4915 0.10838 0.000 0.020 0.004 0.420 0.556
#> SRR1700122 5 0.4451 -0.06592 0.000 0.004 0.000 0.492 0.504
#> SRR1700123 4 0.4893 0.29462 0.000 0.008 0.016 0.580 0.396
#> SRR1700125 5 0.4907 -0.07529 0.000 0.024 0.000 0.484 0.492
#> SRR1700126 4 0.3123 0.41969 0.000 0.004 0.184 0.812 0.000
#> SRR1700127 4 0.2344 0.57121 0.000 0.000 0.032 0.904 0.064
#> SRR1700124 4 0.4325 0.53958 0.000 0.000 0.064 0.756 0.180
#> SRR1700128 4 0.4134 0.51276 0.000 0.000 0.032 0.744 0.224
#> SRR1700129 4 0.4310 0.30491 0.000 0.004 0.000 0.604 0.392
#> SRR1700130 5 0.5087 0.03398 0.000 0.012 0.016 0.456 0.516
#> SRR1700132 4 0.3058 0.55250 0.000 0.000 0.096 0.860 0.044
#> SRR1700131 4 0.2654 0.56817 0.000 0.000 0.032 0.884 0.084
#> SRR1700133 4 0.4593 0.10495 0.000 0.004 0.004 0.512 0.480
#> SRR1700134 5 0.4262 0.07761 0.000 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1700135 4 0.4849 0.35427 0.000 0.000 0.032 0.608 0.360
#> SRR1700136 4 0.3991 0.48606 0.000 0.000 0.172 0.780 0.048
#> SRR1700137 4 0.5219 0.26188 0.000 0.008 0.032 0.560 0.400
#> SRR1700138 4 0.6068 0.11286 0.000 0.000 0.120 0.452 0.428
#> SRR1700140 4 0.5013 0.53245 0.000 0.000 0.108 0.700 0.192
#> SRR1700139 4 0.4180 0.51300 0.000 0.000 0.036 0.744 0.220
#> SRR1700141 4 0.4270 0.38374 0.000 0.004 0.004 0.656 0.336
#> SRR1700142 4 0.3236 0.49155 0.000 0.000 0.152 0.828 0.020
#> SRR1700143 4 0.3395 0.55239 0.000 0.004 0.104 0.844 0.048
#> SRR1700144 4 0.4524 0.19207 0.000 0.000 0.336 0.644 0.020
#> SRR1700145 5 0.4425 0.03944 0.000 0.004 0.000 0.452 0.544
#> SRR1700146 4 0.4313 0.36840 0.000 0.000 0.008 0.636 0.356
#> SRR1700147 4 0.3921 0.56261 0.000 0.000 0.072 0.800 0.128
#> SRR1700149 4 0.3696 0.51717 0.000 0.000 0.016 0.772 0.212
#> SRR1700148 4 0.4138 0.54725 0.000 0.000 0.064 0.776 0.160
#> SRR1700150 5 0.4706 -0.07710 0.000 0.008 0.004 0.488 0.500
#> SRR1700152 4 0.4479 0.49723 0.000 0.004 0.036 0.720 0.240
#> SRR1700151 4 0.3741 0.56838 0.000 0.000 0.076 0.816 0.108
#> SRR1700153 4 0.4086 0.49707 0.000 0.000 0.024 0.736 0.240
#> SRR1700154 4 0.4666 0.53341 0.000 0.000 0.088 0.732 0.180
#> SRR1700155 4 0.4477 0.48719 0.000 0.000 0.040 0.708 0.252
#> SRR1700156 4 0.3432 0.52602 0.000 0.000 0.132 0.828 0.040
#> SRR1700158 4 0.4095 0.50465 0.000 0.004 0.024 0.752 0.220
#> SRR1700159 4 0.4425 0.18247 0.000 0.004 0.000 0.544 0.452
#> SRR1700157 4 0.4337 0.46162 0.000 0.000 0.204 0.744 0.052
#> SRR1700160 4 0.4645 0.31605 0.000 0.008 0.008 0.608 0.376
#> SRR1700161 4 0.4576 0.16764 0.000 0.004 0.004 0.536 0.456
#> SRR1700162 5 0.4294 -0.00157 0.000 0.000 0.000 0.468 0.532
#> SRR1700164 5 0.4730 0.12176 0.012 0.004 0.000 0.416 0.568
#> SRR1700163 4 0.3906 0.44016 0.000 0.000 0.004 0.704 0.292
#> SRR1700165 4 0.4218 0.39352 0.000 0.004 0.004 0.668 0.324
#> SRR1700166 5 0.4562 -0.07830 0.000 0.008 0.000 0.496 0.496
#> SRR1700168 4 0.5083 0.07240 0.000 0.020 0.008 0.492 0.480
#> SRR1700167 4 0.4127 0.42413 0.000 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR1700170 5 0.4949 0.04540 0.000 0.020 0.004 0.444 0.532
#> SRR1700169 5 0.4658 -0.06081 0.000 0.012 0.000 0.484 0.504
#> SRR1700171 4 0.4351 0.51774 0.068 0.016 0.076 0.816 0.024
#> SRR1700172 4 0.4964 0.12248 0.000 0.004 0.020 0.516 0.460
#> SRR1700174 4 0.3764 0.50768 0.000 0.008 0.008 0.772 0.212
#> SRR1700173 4 0.3700 0.48730 0.000 0.008 0.000 0.752 0.240
#> SRR1700175 4 0.4359 0.25527 0.000 0.004 0.000 0.584 0.412
#> SRR1700176 4 0.2193 0.52878 0.000 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1700178 2 0.1216 0.65207 0.000 0.960 0.020 0.000 0.020
#> SRR1700177 5 0.4689 0.16928 0.000 0.008 0.008 0.392 0.592
#> SRR1700180 2 0.1310 0.65136 0.000 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR1700179 2 0.1960 0.65527 0.000 0.928 0.020 0.004 0.048
#> SRR1700181 2 0.1461 0.65178 0.000 0.952 0.028 0.004 0.016
#> SRR1700183 1 0.0324 0.88305 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1700182 2 0.3234 0.66543 0.000 0.852 0.084 0.000 0.064
#> SRR1700184 2 0.1557 0.65526 0.000 0.940 0.052 0.000 0.008
#> SRR1700186 2 0.1732 0.65645 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1700187 1 0.0162 0.88383 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700185 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700188 2 0.3182 0.66573 0.000 0.844 0.124 0.000 0.032
#> SRR1700192 2 0.5284 0.10330 0.416 0.544 0.004 0.004 0.032
#> SRR1700190 2 0.1960 0.65833 0.000 0.928 0.048 0.004 0.020
#> SRR1700191 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700189 1 0.0727 0.87782 0.980 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR1700193 2 0.3317 0.66789 0.004 0.852 0.088 0.000 0.056
#> SRR1700195 2 0.4771 0.64723 0.028 0.752 0.168 0.000 0.052
#> SRR1700194 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.4869 0.61991 0.000 0.712 0.192 0.000 0.096
#> SRR1700197 2 0.4081 0.50639 0.172 0.784 0.012 0.032 0.000
#> SRR1700198 2 0.4548 0.64197 0.004 0.752 0.168 0.000 0.076
#> SRR1700199 2 0.7679 0.40972 0.120 0.436 0.324 0.000 0.120
#> SRR1700200 2 0.7653 0.42411 0.072 0.448 0.264 0.000 0.216
#> SRR1700201 2 0.4501 0.64536 0.000 0.756 0.128 0.000 0.116
#> SRR1700202 5 0.6897 -0.08293 0.404 0.088 0.012 0.036 0.460
#> SRR1700203 5 0.7068 -0.28692 0.004 0.344 0.288 0.004 0.360
#> SRR1700204 2 0.6352 0.47315 0.004 0.524 0.304 0.000 0.168
#> SRR1700206 2 0.4121 0.66155 0.000 0.788 0.112 0.000 0.100
#> SRR1700207 2 0.4657 0.63889 0.000 0.740 0.152 0.000 0.108
#> SRR1700208 2 0.3395 0.66479 0.012 0.852 0.092 0.000 0.044
#> SRR1700205 5 0.5680 0.46418 0.088 0.124 0.028 0.032 0.728
#> SRR1700209 5 0.6363 0.01876 0.000 0.144 0.384 0.004 0.468
#> SRR1700210 3 0.8217 0.00875 0.168 0.136 0.388 0.004 0.304
#> SRR1700211 1 0.8262 -0.19600 0.344 0.308 0.240 0.004 0.104
#> SRR1700212 2 0.7587 0.47105 0.084 0.472 0.176 0.000 0.268
#> SRR1700213 3 0.5475 0.01225 0.012 0.332 0.608 0.004 0.044
#> SRR1700214 5 0.7885 -0.23538 0.048 0.296 0.280 0.008 0.368
#> SRR1700215 1 0.0162 0.88429 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1700217 3 0.6342 0.08776 0.004 0.120 0.464 0.004 0.408
#> SRR1700216 1 0.0324 0.88343 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1700218 2 0.6608 0.42958 0.000 0.488 0.360 0.020 0.132
#> SRR1700219 5 0.6942 -0.30274 0.000 0.344 0.296 0.004 0.356
#> SRR1700222 1 0.0579 0.88096 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700220 5 0.7062 -0.15755 0.000 0.304 0.248 0.016 0.432
#> SRR1700221 3 0.8558 -0.24123 0.096 0.296 0.336 0.020 0.252
#> SRR1700223 5 0.6897 -0.18229 0.000 0.292 0.304 0.004 0.400
#> SRR1700224 5 0.7120 0.11479 0.052 0.124 0.320 0.004 0.500
#> SRR1700226 3 0.6685 0.00582 0.004 0.204 0.436 0.000 0.356
#> SRR1700229 3 0.6603 -0.08607 0.004 0.292 0.488 0.000 0.216
#> SRR1700225 3 0.4771 0.26287 0.000 0.224 0.712 0.004 0.060
#> SRR1700227 2 0.6133 0.40626 0.000 0.496 0.368 0.000 0.136
#> SRR1700230 1 0.4660 0.68851 0.772 0.028 0.132 0.000 0.068
#> SRR1700231 2 0.6578 0.31777 0.004 0.420 0.400 0.000 0.176
#> SRR1700228 3 0.6247 0.20106 0.020 0.220 0.640 0.020 0.100
#> SRR1700232 3 0.6724 -0.24003 0.000 0.356 0.392 0.000 0.252
#> SRR1700233 3 0.7242 -0.11214 0.080 0.304 0.508 0.004 0.104
#> SRR1700234 1 0.7408 0.29463 0.504 0.068 0.300 0.012 0.116
#> SRR1700235 3 0.6702 0.01348 0.000 0.248 0.512 0.012 0.228
#> SRR1700237 2 0.6243 0.30576 0.004 0.436 0.436 0.000 0.124
#> SRR1700236 3 0.6572 0.03623 0.000 0.176 0.432 0.004 0.388
#> SRR1700238 2 0.6794 0.32823 0.012 0.420 0.388 0.000 0.180
#> SRR1700239 1 0.0833 0.87789 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1700240 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700241 4 0.4236 0.20430 0.004 0.004 0.328 0.664 0.000
#> SRR1700243 2 0.5396 0.58777 0.000 0.656 0.220 0.000 0.124
#> SRR1700244 2 0.6009 0.45072 0.000 0.540 0.112 0.004 0.344
#> SRR1700242 1 0.1059 0.87255 0.968 0.008 0.020 0.000 0.004
#> SRR1700246 1 0.5595 0.54195 0.680 0.048 0.216 0.000 0.056
#> SRR1700245 2 0.6413 0.32257 0.000 0.432 0.396 0.000 0.172
#> SRR1700247 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700249 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700250 2 0.6179 0.51455 0.000 0.556 0.216 0.000 0.228
#> SRR1700248 2 0.5159 0.60886 0.000 0.688 0.188 0.000 0.124
#> SRR1700251 2 0.6002 0.58909 0.004 0.640 0.164 0.012 0.180
#> SRR1700252 2 0.3730 0.67140 0.000 0.820 0.136 0.016 0.028
#> SRR1700253 5 0.6592 -0.18831 0.004 0.388 0.128 0.012 0.468
#> SRR1700256 2 0.6555 0.47023 0.008 0.524 0.256 0.000 0.212
#> SRR1700254 1 0.0000 0.88504 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700255 2 0.7355 0.42810 0.032 0.456 0.228 0.004 0.280
#> SRR1700257 2 0.6103 0.50360 0.000 0.544 0.156 0.000 0.300
#> SRR1700258 2 0.1883 0.63625 0.000 0.932 0.008 0.012 0.048
#> SRR1700259 2 0.4127 0.56715 0.000 0.796 0.004 0.100 0.100
#> SRR1700260 2 0.4589 0.54687 0.000 0.764 0.008 0.124 0.104
#> SRR1700261 5 0.5624 0.24814 0.000 0.084 0.004 0.320 0.592
#> SRR1700262 5 0.5942 0.34786 0.000 0.192 0.004 0.192 0.612
#> SRR1700263 2 0.4801 0.55519 0.000 0.756 0.016 0.112 0.116
#> SRR1700264 2 0.2304 0.66223 0.000 0.892 0.100 0.008 0.000
#> SRR1700265 2 0.5292 0.04581 0.416 0.544 0.000 0.024 0.016
#> SRR1700266 2 0.1673 0.62151 0.000 0.944 0.016 0.032 0.008
#> SRR1700268 2 0.6912 0.02198 0.000 0.416 0.008 0.336 0.240
#> SRR1700270 2 0.4147 0.65977 0.004 0.788 0.156 0.004 0.048
#> SRR1700267 2 0.3071 0.59833 0.000 0.872 0.012 0.080 0.036
#> SRR1700271 2 0.2789 0.63937 0.000 0.880 0.008 0.020 0.092
#> SRR1700272 2 0.4799 0.52637 0.000 0.720 0.004 0.072 0.204
#> SRR1700273 2 0.2214 0.66246 0.000 0.916 0.052 0.004 0.028
#> SRR1700274 2 0.6304 0.22532 0.000 0.524 0.004 0.156 0.316
#> SRR1700277 2 0.2278 0.65093 0.000 0.916 0.044 0.032 0.008
#> SRR1700275 5 0.4263 0.45277 0.000 0.060 0.000 0.180 0.760
#> SRR1700276 5 0.7239 0.15462 0.032 0.352 0.008 0.156 0.452
#> SRR1700278 5 0.3039 0.55839 0.008 0.024 0.092 0.004 0.872
#> SRR1700279 5 0.4118 0.46615 0.012 0.032 0.000 0.176 0.780
#> SRR1700280 5 0.5348 0.48805 0.104 0.056 0.008 0.084 0.748
#> SRR1700281 2 0.6805 0.51093 0.000 0.560 0.124 0.056 0.260
#> SRR1700283 5 0.3418 0.55071 0.000 0.068 0.028 0.044 0.860
#> SRR1700282 5 0.8011 0.13404 0.328 0.112 0.004 0.156 0.400
#> SRR1700284 5 0.3495 0.52459 0.000 0.008 0.036 0.120 0.836
#> SRR1700285 5 0.4359 0.13498 0.000 0.000 0.004 0.412 0.584
#> SRR1700286 5 0.7273 -0.05817 0.000 0.168 0.380 0.044 0.408
#> SRR1700287 5 0.4148 0.42632 0.000 0.028 0.004 0.216 0.752
#> SRR1700290 5 0.4846 0.32791 0.012 0.020 0.004 0.292 0.672
#> SRR1700289 5 0.4096 0.50817 0.000 0.012 0.192 0.024 0.772
#> SRR1700288 5 0.7385 -0.06631 0.044 0.256 0.244 0.000 0.456
#> SRR1700292 5 0.3078 0.50662 0.000 0.016 0.004 0.132 0.848
#> SRR1700291 5 0.4132 0.40676 0.000 0.000 0.020 0.260 0.720
#> SRR1700293 5 0.5440 0.50403 0.000 0.024 0.092 0.188 0.696
#> SRR1700294 5 0.3961 0.42336 0.000 0.000 0.016 0.248 0.736
#> SRR1700295 5 0.4419 0.25654 0.000 0.008 0.004 0.344 0.644
#> SRR1700297 5 0.3814 0.36698 0.000 0.004 0.000 0.276 0.720
#> SRR1700296 5 0.2583 0.50969 0.000 0.004 0.000 0.132 0.864
#> SRR1700298 5 0.5620 0.43807 0.076 0.004 0.028 0.208 0.684
#> SRR1700299 4 0.5032 0.20963 0.000 0.000 0.032 0.520 0.448
#> SRR1700300 4 0.5051 0.08491 0.000 0.004 0.024 0.488 0.484
#> SRR1700302 5 0.3550 0.47345 0.000 0.000 0.020 0.184 0.796
#> SRR1700301 5 0.3476 0.49640 0.000 0.004 0.020 0.160 0.816
#> SRR1700303 5 0.4111 0.36896 0.000 0.008 0.004 0.280 0.708
#> SRR1700304 5 0.5340 0.36192 0.300 0.004 0.012 0.044 0.640
#> SRR1700305 5 0.5570 0.38457 0.000 0.008 0.080 0.292 0.620
#> SRR1700306 4 0.4744 0.16426 0.000 0.000 0.016 0.508 0.476
#> SRR1700308 5 0.6835 -0.05186 0.000 0.004 0.240 0.376 0.380
#> SRR1700307 4 0.6357 -0.03948 0.004 0.000 0.412 0.444 0.140
#> SRR1700309 5 0.5707 0.33587 0.000 0.008 0.096 0.280 0.616
#> SRR1700310 5 0.4639 0.26506 0.000 0.000 0.024 0.344 0.632
#> SRR1700311 4 0.4718 0.21632 0.000 0.000 0.016 0.540 0.444
#> SRR1700312 5 0.5716 0.20758 0.000 0.004 0.080 0.364 0.552
#> SRR1700313 4 0.6217 0.34228 0.000 0.000 0.164 0.520 0.316
#> SRR1700314 4 0.4662 0.54980 0.000 0.000 0.096 0.736 0.168
#> SRR1700315 5 0.4985 0.40235 0.000 0.000 0.076 0.244 0.680
#> SRR1700316 4 0.5550 0.28586 0.000 0.000 0.072 0.528 0.400
#> SRR1700317 5 0.4131 0.55423 0.000 0.004 0.144 0.064 0.788
#> SRR1700318 5 0.5273 0.40266 0.280 0.000 0.020 0.044 0.656
#> SRR1700319 5 0.4278 0.02203 0.000 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1700320 5 0.3970 0.41834 0.000 0.000 0.020 0.236 0.744
#> SRR1700322 4 0.4416 0.40961 0.008 0.000 0.008 0.668 0.316
#> SRR1700321 5 0.4730 0.10916 0.000 0.012 0.004 0.416 0.568
#> SRR1700323 4 0.4696 0.31219 0.000 0.004 0.012 0.584 0.400
#> SRR1700324 5 0.4709 0.23709 0.000 0.000 0.024 0.364 0.612
#> SRR1700325 5 0.4577 0.43294 0.000 0.048 0.008 0.208 0.736
#> SRR1700326 1 0.3682 0.75989 0.828 0.040 0.000 0.012 0.120
#> SRR1700327 4 0.4960 0.54115 0.000 0.028 0.124 0.752 0.096
#> SRR1700329 5 0.4434 0.25506 0.000 0.008 0.004 0.348 0.640
#> SRR1700328 1 0.4742 0.61687 0.732 0.004 0.004 0.200 0.060
#> SRR1700330 5 0.6052 0.38750 0.196 0.004 0.008 0.168 0.624
#> SRR1700331 5 0.2209 0.54889 0.000 0.000 0.032 0.056 0.912
#> SRR1700332 5 0.2507 0.55484 0.000 0.028 0.020 0.044 0.908
#> SRR1700333 5 0.3812 0.53523 0.000 0.008 0.048 0.128 0.816
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1699874 6 0.5753 0.38319 0.000 0.264 0.028 0.000 0.128 0.580
#> SRR1699875 2 0.6799 0.22122 0.000 0.440 0.324 0.000 0.080 0.156
#> SRR1699876 5 0.4167 0.58139 0.000 0.192 0.044 0.012 0.748 0.004
#> SRR1699877 2 0.6472 0.30484 0.000 0.516 0.056 0.000 0.240 0.188
#> SRR1699879 6 0.6431 0.26862 0.000 0.196 0.024 0.004 0.316 0.460
#> SRR1699878 2 0.7111 0.15876 0.000 0.372 0.080 0.000 0.312 0.236
#> SRR1699880 3 0.6128 0.36665 0.000 0.252 0.584 0.008 0.080 0.076
#> SRR1699881 3 0.5195 0.51637 0.000 0.096 0.704 0.004 0.056 0.140
#> SRR1699882 5 0.6259 0.20124 0.000 0.300 0.076 0.004 0.536 0.084
#> SRR1699883 2 0.6935 0.22748 0.004 0.408 0.092 0.000 0.364 0.132
#> SRR1699884 2 0.6036 0.10213 0.000 0.448 0.092 0.000 0.416 0.044
#> SRR1699885 2 0.6966 0.25211 0.000 0.480 0.116 0.000 0.196 0.208
#> SRR1699886 5 0.3147 0.65085 0.004 0.104 0.008 0.020 0.852 0.012
#> SRR1699888 5 0.5674 0.53434 0.000 0.224 0.004 0.084 0.632 0.056
#> SRR1699889 5 0.2806 0.65703 0.004 0.032 0.004 0.068 0.880 0.012
#> SRR1699890 5 0.3975 0.65352 0.008 0.116 0.000 0.064 0.796 0.016
#> SRR1699887 5 0.3089 0.63261 0.004 0.136 0.016 0.004 0.836 0.004
#> SRR1699891 5 0.3377 0.64237 0.004 0.104 0.024 0.024 0.840 0.004
#> SRR1699892 2 0.6417 0.25038 0.000 0.456 0.240 0.008 0.284 0.012
#> SRR1699893 5 0.5316 0.60697 0.000 0.052 0.032 0.188 0.692 0.036
#> SRR1699894 5 0.3411 0.65901 0.004 0.052 0.000 0.108 0.828 0.008
#> SRR1699895 5 0.2893 0.65977 0.004 0.048 0.000 0.080 0.864 0.004
#> SRR1699896 5 0.5420 0.39437 0.008 0.272 0.116 0.000 0.600 0.004
#> SRR1699897 2 0.6514 0.20289 0.000 0.424 0.272 0.008 0.284 0.012
#> SRR1699898 3 0.5821 0.55160 0.000 0.036 0.636 0.168 0.148 0.012
#> SRR1699900 2 0.6547 0.07063 0.008 0.424 0.152 0.020 0.388 0.008
#> SRR1699899 5 0.3827 0.59991 0.000 0.164 0.052 0.008 0.776 0.000
#> SRR1699902 2 0.6949 0.07639 0.000 0.352 0.264 0.044 0.336 0.004
#> SRR1699901 5 0.6842 0.16847 0.008 0.192 0.312 0.048 0.440 0.000
#> SRR1699903 5 0.4935 0.54257 0.000 0.164 0.116 0.016 0.700 0.004
#> SRR1699904 5 0.3528 0.64061 0.004 0.036 0.004 0.156 0.800 0.000
#> SRR1699905 5 0.6241 0.55597 0.024 0.192 0.056 0.116 0.612 0.000
#> SRR1699906 5 0.5230 0.48946 0.000 0.208 0.128 0.016 0.648 0.000
#> SRR1699907 5 0.3386 0.64141 0.000 0.124 0.032 0.020 0.824 0.000
#> SRR1699908 5 0.4681 0.54973 0.000 0.176 0.104 0.012 0.708 0.000
#> SRR1699909 5 0.6463 0.54824 0.000 0.192 0.076 0.188 0.544 0.000
#> SRR1699910 5 0.3824 0.66236 0.000 0.068 0.044 0.076 0.812 0.000
#> SRR1699911 5 0.4227 0.66083 0.008 0.104 0.036 0.064 0.788 0.000
#> SRR1699912 5 0.4177 0.62840 0.000 0.116 0.064 0.040 0.780 0.000
#> SRR1699913 5 0.5765 0.50910 0.000 0.236 0.076 0.076 0.612 0.000
#> SRR1699914 5 0.6517 0.55314 0.000 0.180 0.116 0.148 0.556 0.000
#> SRR1699915 5 0.3360 0.61953 0.008 0.016 0.004 0.168 0.804 0.000
#> SRR1699916 5 0.6176 0.49455 0.000 0.244 0.076 0.112 0.568 0.000
#> SRR1699917 5 0.7101 0.20395 0.000 0.280 0.232 0.072 0.412 0.004
#> SRR1699918 2 0.7344 -0.02227 0.000 0.312 0.296 0.084 0.304 0.004
#> SRR1699919 5 0.4017 0.62723 0.000 0.104 0.072 0.032 0.792 0.000
#> SRR1699920 5 0.5300 0.53295 0.000 0.180 0.124 0.032 0.664 0.000
#> SRR1699921 5 0.3734 0.65013 0.004 0.068 0.064 0.040 0.824 0.000
#> SRR1699922 5 0.4793 0.50576 0.004 0.260 0.064 0.008 0.664 0.000
#> SRR1699923 2 0.6901 0.13591 0.012 0.436 0.308 0.032 0.208 0.004
#> SRR1699924 5 0.7160 -0.02655 0.000 0.256 0.328 0.080 0.336 0.000
#> SRR1699925 1 0.1282 0.78110 0.956 0.004 0.004 0.000 0.024 0.012
#> SRR1699926 5 0.3186 0.66054 0.004 0.036 0.028 0.076 0.856 0.000
#> SRR1699927 5 0.3476 0.65981 0.000 0.088 0.032 0.048 0.832 0.000
#> SRR1699929 2 0.6106 0.13392 0.000 0.456 0.156 0.020 0.368 0.000
#> SRR1699928 5 0.4643 0.58311 0.000 0.152 0.096 0.024 0.728 0.000
#> SRR1699930 5 0.3003 0.65548 0.004 0.068 0.028 0.032 0.868 0.000
#> SRR1699931 2 0.6314 0.16728 0.000 0.456 0.176 0.020 0.344 0.004
#> SRR1699933 2 0.6695 0.21069 0.000 0.444 0.264 0.028 0.256 0.008
#> SRR1699932 5 0.3895 0.62805 0.000 0.132 0.048 0.028 0.792 0.000
#> SRR1699934 1 0.0725 0.78619 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1699935 5 0.4609 0.62732 0.004 0.088 0.072 0.044 0.776 0.016
#> SRR1699936 6 0.2615 0.53842 0.000 0.136 0.008 0.004 0.000 0.852
#> SRR1699937 2 0.6309 -0.03202 0.000 0.372 0.284 0.000 0.008 0.336
#> SRR1699938 6 0.5430 0.42227 0.000 0.260 0.128 0.000 0.012 0.600
#> SRR1699940 3 0.4746 0.42543 0.000 0.060 0.680 0.012 0.004 0.244
#> SRR1699939 6 0.6080 0.41264 0.000 0.128 0.280 0.004 0.036 0.552
#> SRR1699941 3 0.4572 0.53163 0.000 0.008 0.728 0.084 0.008 0.172
#> SRR1699942 6 0.5734 0.37991 0.000 0.196 0.264 0.000 0.004 0.536
#> SRR1699943 6 0.5966 0.28410 0.000 0.304 0.196 0.000 0.008 0.492
#> SRR1699944 6 0.6118 0.33234 0.000 0.244 0.256 0.000 0.012 0.488
#> SRR1699945 6 0.4754 0.48881 0.000 0.080 0.212 0.000 0.016 0.692
#> SRR1699946 3 0.6760 -0.18780 0.000 0.328 0.348 0.000 0.036 0.288
#> SRR1699947 6 0.6016 0.29376 0.000 0.220 0.320 0.000 0.004 0.456
#> SRR1699948 6 0.3855 0.47355 0.000 0.272 0.024 0.000 0.000 0.704
#> SRR1699949 6 0.4447 0.53533 0.000 0.156 0.020 0.004 0.072 0.748
#> SRR1699950 6 0.5787 0.43588 0.000 0.256 0.108 0.000 0.044 0.592
#> SRR1699951 6 0.5478 0.47483 0.000 0.168 0.184 0.000 0.020 0.628
#> SRR1699952 3 0.6275 0.10059 0.000 0.332 0.468 0.000 0.028 0.172
#> SRR1699953 6 0.6185 0.12064 0.000 0.392 0.144 0.000 0.028 0.436
#> SRR1699954 6 0.5695 0.39757 0.000 0.192 0.260 0.000 0.004 0.544
#> SRR1699955 6 0.3960 0.52633 0.000 0.176 0.072 0.000 0.000 0.752
#> SRR1699956 3 0.6397 0.07579 0.000 0.064 0.468 0.004 0.096 0.368
#> SRR1699957 3 0.6377 0.14971 0.000 0.336 0.488 0.000 0.100 0.076
#> SRR1699959 3 0.7110 0.11836 0.000 0.084 0.432 0.008 0.172 0.304
#> SRR1699958 6 0.6718 0.49757 0.000 0.172 0.040 0.108 0.092 0.588
#> SRR1699960 6 0.5610 0.49497 0.000 0.192 0.032 0.016 0.104 0.656
#> SRR1699961 3 0.5869 0.24124 0.000 0.324 0.540 0.000 0.040 0.096
#> SRR1699962 3 0.4471 0.61333 0.000 0.068 0.752 0.140 0.000 0.040
#> SRR1699963 3 0.5868 0.43388 0.000 0.236 0.624 0.024 0.044 0.072
#> SRR1699964 3 0.6370 0.38761 0.000 0.252 0.552 0.072 0.004 0.120
#> SRR1699965 6 0.4596 0.44256 0.000 0.304 0.052 0.000 0.004 0.640
#> SRR1699966 6 0.7607 0.20554 0.000 0.200 0.292 0.008 0.140 0.360
#> SRR1699967 2 0.6256 0.21038 0.000 0.456 0.368 0.000 0.036 0.140
#> SRR1699968 3 0.5559 0.48599 0.000 0.084 0.620 0.000 0.248 0.048
#> SRR1699969 3 0.5768 0.51791 0.000 0.008 0.632 0.064 0.220 0.076
#> SRR1699971 2 0.6779 0.11962 0.000 0.420 0.376 0.004 0.096 0.104
#> SRR1699970 3 0.4734 0.45041 0.000 0.240 0.684 0.000 0.028 0.048
#> SRR1699972 3 0.5803 0.06387 0.000 0.424 0.472 0.008 0.068 0.028
#> SRR1699973 3 0.6779 0.47175 0.000 0.128 0.596 0.076 0.064 0.136
#> SRR1699974 3 0.4010 0.62768 0.000 0.068 0.772 0.148 0.000 0.012
#> SRR1699975 3 0.6014 0.16614 0.000 0.324 0.472 0.008 0.196 0.000
#> SRR1699976 3 0.5627 0.17191 0.000 0.376 0.508 0.000 0.100 0.016
#> SRR1699977 3 0.6387 0.27140 0.000 0.328 0.492 0.072 0.108 0.000
#> SRR1699978 3 0.7771 0.39981 0.036 0.180 0.472 0.136 0.168 0.008
#> SRR1699979 3 0.5319 0.49945 0.000 0.208 0.668 0.032 0.084 0.008
#> SRR1699980 3 0.6160 0.12792 0.000 0.164 0.432 0.008 0.388 0.008
#> SRR1699981 3 0.4970 0.50502 0.000 0.132 0.692 0.012 0.160 0.004
#> SRR1699982 5 0.4407 0.58095 0.000 0.188 0.060 0.020 0.732 0.000
#> SRR1699983 3 0.5387 0.27696 0.000 0.072 0.540 0.012 0.372 0.004
#> SRR1699984 3 0.4665 0.32315 0.352 0.004 0.604 0.000 0.036 0.004
#> SRR1699985 3 0.4335 0.55690 0.000 0.176 0.744 0.024 0.056 0.000
#> SRR1699986 3 0.5546 0.26682 0.000 0.012 0.548 0.364 0.024 0.052
#> SRR1699988 3 0.6155 0.06645 0.004 0.332 0.408 0.000 0.256 0.000
#> SRR1699987 3 0.5868 0.53652 0.000 0.144 0.644 0.084 0.124 0.004
#> SRR1699989 2 0.6412 0.09006 0.000 0.352 0.308 0.012 0.328 0.000
#> SRR1699990 3 0.4887 0.51182 0.000 0.232 0.680 0.040 0.048 0.000
#> SRR1699992 3 0.3399 0.58378 0.000 0.140 0.816 0.000 0.024 0.020
#> SRR1699991 3 0.3350 0.58128 0.000 0.156 0.812 0.012 0.016 0.004
#> SRR1699993 3 0.5831 0.51164 0.004 0.004 0.616 0.124 0.220 0.032
#> SRR1699994 3 0.3115 0.62406 0.000 0.080 0.856 0.048 0.008 0.008
#> SRR1699995 3 0.5944 0.31656 0.000 0.000 0.560 0.292 0.056 0.092
#> SRR1699996 2 0.4718 0.47494 0.004 0.708 0.220 0.040 0.020 0.008
#> SRR1699997 4 0.4241 0.46000 0.000 0.004 0.332 0.644 0.004 0.016
#> SRR1699998 2 0.5120 0.14866 0.000 0.528 0.408 0.004 0.052 0.008
#> SRR1699999 3 0.4283 0.59871 0.008 0.028 0.792 0.112 0.012 0.048
#> SRR1700000 3 0.5578 0.33725 0.000 0.292 0.592 0.000 0.052 0.064
#> SRR1700002 3 0.5074 0.38437 0.000 0.320 0.616 0.024 0.020 0.020
#> SRR1700001 3 0.4506 0.55244 0.000 0.212 0.716 0.036 0.000 0.036
#> SRR1700003 3 0.5922 0.39531 0.000 0.312 0.564 0.064 0.048 0.012
#> SRR1700004 5 0.7311 -0.07521 0.004 0.012 0.124 0.376 0.376 0.108
#> SRR1700005 1 0.1639 0.78939 0.944 0.020 0.008 0.004 0.004 0.020
#> SRR1700006 2 0.5840 0.27535 0.000 0.540 0.340 0.008 0.028 0.084
#> SRR1700007 5 0.4896 0.51448 0.004 0.024 0.000 0.228 0.684 0.060
#> SRR1700008 4 0.5578 0.48793 0.000 0.004 0.248 0.620 0.032 0.096
#> SRR1700009 1 0.6157 0.56635 0.632 0.016 0.008 0.080 0.192 0.072
#> SRR1700010 2 0.6791 0.08632 0.000 0.436 0.256 0.028 0.012 0.268
#> SRR1700011 6 0.7013 0.17246 0.000 0.356 0.224 0.036 0.016 0.368
#> SRR1700013 4 0.7121 0.07630 0.000 0.092 0.204 0.384 0.000 0.320
#> SRR1700012 3 0.4276 0.54744 0.000 0.184 0.748 0.012 0.008 0.048
#> SRR1700014 4 0.6526 0.41015 0.000 0.008 0.268 0.536 0.104 0.084
#> SRR1700015 6 0.6069 0.07795 0.000 0.040 0.352 0.096 0.004 0.508
#> SRR1700016 1 0.6241 0.53724 0.636 0.000 0.148 0.032 0.080 0.104
#> SRR1700018 6 0.6149 -0.01230 0.000 0.028 0.388 0.108 0.008 0.468
#> SRR1700017 6 0.5550 -0.10567 0.000 0.004 0.444 0.072 0.016 0.464
#> SRR1700019 5 0.6795 0.28765 0.012 0.024 0.024 0.136 0.488 0.316
#> SRR1700020 6 0.6815 -0.02480 0.000 0.000 0.320 0.160 0.080 0.440
#> SRR1700021 5 0.5110 0.47449 0.020 0.008 0.004 0.236 0.672 0.060
#> SRR1700023 3 0.5272 0.51917 0.000 0.000 0.684 0.092 0.060 0.164
#> SRR1700022 3 0.5493 0.28282 0.000 0.004 0.540 0.056 0.028 0.372
#> SRR1700024 3 0.6123 0.26121 0.000 0.000 0.536 0.304 0.064 0.096
#> SRR1700025 3 0.6046 0.16940 0.000 0.256 0.496 0.004 0.004 0.240
#> SRR1700026 2 0.7262 0.11995 0.012 0.440 0.284 0.076 0.004 0.184
#> SRR1700027 3 0.6135 0.21751 0.000 0.144 0.504 0.032 0.000 0.320
#> SRR1700028 4 0.7020 0.38322 0.000 0.004 0.220 0.476 0.096 0.204
#> SRR1700029 3 0.6989 0.35476 0.000 0.036 0.484 0.184 0.260 0.036
#> SRR1700030 5 0.3542 0.61633 0.008 0.004 0.024 0.116 0.828 0.020
#> SRR1700031 3 0.4341 0.52615 0.000 0.004 0.712 0.216 0.000 0.068
#> SRR1700032 3 0.5337 0.58587 0.000 0.108 0.700 0.124 0.008 0.060
#> SRR1700034 3 0.5309 0.45858 0.000 0.000 0.644 0.220 0.024 0.112
#> SRR1700035 5 0.4693 0.57396 0.004 0.008 0.164 0.088 0.728 0.008
#> SRR1700033 3 0.5549 0.10970 0.000 0.004 0.488 0.424 0.024 0.060
#> SRR1700036 5 0.4630 0.56257 0.000 0.052 0.180 0.028 0.732 0.008
#> SRR1700037 5 0.3488 0.61760 0.012 0.016 0.004 0.144 0.816 0.008
#> SRR1700038 4 0.6789 0.31971 0.004 0.268 0.084 0.508 0.132 0.004
#> SRR1700039 4 0.7236 0.20824 0.000 0.004 0.312 0.404 0.168 0.112
#> SRR1700040 3 0.4130 0.49861 0.000 0.012 0.704 0.260 0.000 0.024
#> SRR1700041 3 0.5118 0.59921 0.000 0.120 0.680 0.180 0.008 0.012
#> SRR1700042 3 0.3754 0.56180 0.000 0.016 0.756 0.212 0.000 0.016
#> SRR1700043 3 0.5022 0.40589 0.004 0.312 0.624 0.004 0.036 0.020
#> SRR1700045 3 0.5531 0.55893 0.000 0.204 0.636 0.132 0.024 0.004
#> SRR1700044 3 0.5977 0.54966 0.000 0.224 0.560 0.196 0.012 0.008
#> SRR1700046 3 0.4404 0.63182 0.000 0.080 0.760 0.124 0.036 0.000
#> SRR1700047 3 0.5970 0.10007 0.000 0.008 0.440 0.108 0.428 0.016
#> SRR1700048 3 0.7488 0.31531 0.004 0.148 0.412 0.268 0.164 0.004
#> SRR1700049 3 0.4962 0.42459 0.000 0.004 0.656 0.268 0.028 0.044
#> SRR1700050 4 0.4588 0.43485 0.000 0.004 0.328 0.632 0.020 0.016
#> SRR1700051 3 0.4764 0.43823 0.000 0.004 0.668 0.268 0.036 0.024
#> SRR1700052 3 0.4630 0.59736 0.000 0.068 0.716 0.196 0.016 0.004
#> SRR1700053 3 0.5753 0.58110 0.000 0.088 0.656 0.168 0.080 0.008
#> SRR1700054 3 0.4503 0.56164 0.000 0.080 0.680 0.240 0.000 0.000
#> SRR1700055 3 0.5068 0.39151 0.000 0.016 0.612 0.324 0.016 0.032
#> SRR1700056 4 0.6269 0.10337 0.000 0.032 0.392 0.428 0.148 0.000
#> SRR1700057 3 0.5595 0.54364 0.000 0.012 0.636 0.120 0.212 0.020
#> SRR1700058 3 0.3761 0.63305 0.000 0.080 0.804 0.100 0.016 0.000
#> SRR1700059 3 0.5792 0.46131 0.000 0.020 0.576 0.232 0.172 0.000
#> SRR1700060 3 0.3708 0.56012 0.000 0.020 0.752 0.220 0.000 0.008
#> SRR1700061 3 0.5316 0.54783 0.000 0.120 0.640 0.224 0.008 0.008
#> SRR1700062 3 0.4983 0.01324 0.000 0.000 0.484 0.460 0.008 0.048
#> SRR1700063 3 0.4414 0.63248 0.000 0.080 0.756 0.132 0.032 0.000
#> SRR1700064 3 0.5330 0.56103 0.000 0.020 0.688 0.168 0.100 0.024
#> SRR1700065 3 0.4171 0.29053 0.000 0.004 0.604 0.380 0.000 0.012
#> SRR1700066 3 0.4231 0.51873 0.000 0.008 0.728 0.224 0.012 0.028
#> SRR1700067 3 0.4835 0.12602 0.000 0.000 0.536 0.420 0.020 0.024
#> SRR1700068 4 0.4721 0.02794 0.000 0.008 0.484 0.484 0.008 0.016
#> SRR1700069 3 0.4081 0.60479 0.000 0.044 0.788 0.028 0.132 0.008
#> SRR1700070 3 0.3976 0.63428 0.000 0.080 0.784 0.124 0.004 0.008
#> SRR1700071 3 0.3767 0.63258 0.000 0.088 0.804 0.096 0.008 0.004
#> SRR1700072 3 0.5078 0.61482 0.084 0.048 0.720 0.140 0.004 0.004
#> SRR1700073 4 0.4707 0.56794 0.000 0.016 0.024 0.708 0.220 0.032
#> SRR1700075 3 0.5196 0.40107 0.000 0.068 0.596 0.320 0.012 0.004
#> SRR1700074 3 0.4141 0.57181 0.000 0.204 0.740 0.040 0.000 0.016
#> SRR1700076 3 0.4912 0.60077 0.000 0.172 0.696 0.116 0.004 0.012
#> SRR1700077 3 0.4485 0.56265 0.000 0.028 0.732 0.200 0.012 0.028
#> SRR1700078 3 0.6819 0.17906 0.004 0.004 0.476 0.312 0.124 0.080
#> SRR1700080 3 0.4061 0.59950 0.000 0.016 0.804 0.032 0.100 0.048
#> SRR1700079 3 0.4870 0.55543 0.000 0.000 0.720 0.144 0.044 0.092
#> SRR1700081 3 0.3275 0.61821 0.000 0.036 0.816 0.144 0.000 0.004
#> SRR1700082 3 0.4286 0.62702 0.000 0.092 0.744 0.156 0.000 0.008
#> SRR1700083 3 0.2959 0.61937 0.000 0.012 0.872 0.064 0.012 0.040
#> SRR1700084 3 0.3963 0.61730 0.000 0.044 0.796 0.124 0.004 0.032
#> SRR1700085 5 0.6095 0.30902 0.004 0.000 0.284 0.128 0.548 0.036
#> SRR1700086 3 0.5779 0.53471 0.000 0.004 0.640 0.108 0.184 0.064
#> SRR1700087 6 0.4907 0.47472 0.000 0.092 0.012 0.228 0.000 0.668
#> SRR1700088 6 0.4642 0.53148 0.000 0.076 0.080 0.092 0.000 0.752
#> SRR1700089 6 0.4345 0.48074 0.000 0.060 0.020 0.180 0.000 0.740
#> SRR1700091 6 0.6123 0.17849 0.000 0.096 0.028 0.380 0.012 0.484
#> SRR1700090 4 0.3328 0.67711 0.000 0.016 0.052 0.856 0.024 0.052
#> SRR1700092 4 0.5534 0.44135 0.000 0.032 0.040 0.592 0.020 0.316
#> SRR1700094 6 0.5007 0.02381 0.000 0.044 0.012 0.440 0.000 0.504
#> SRR1700093 4 0.4903 0.59083 0.000 0.012 0.016 0.716 0.100 0.156
#> SRR1700095 4 0.6220 0.22714 0.000 0.024 0.008 0.468 0.128 0.372
#> SRR1700096 4 0.5161 0.54964 0.000 0.036 0.072 0.676 0.004 0.212
#> SRR1700097 4 0.6025 0.44184 0.000 0.016 0.208 0.548 0.004 0.224
#> SRR1700098 6 0.6931 0.10219 0.000 0.104 0.000 0.372 0.136 0.388
#> SRR1700099 6 0.7364 0.22447 0.000 0.164 0.000 0.328 0.156 0.352
#> SRR1700100 4 0.6069 0.06497 0.000 0.096 0.004 0.476 0.036 0.388
#> SRR1700101 6 0.5888 0.27317 0.000 0.068 0.000 0.324 0.064 0.544
#> SRR1700102 6 0.5649 0.12340 0.000 0.088 0.000 0.436 0.020 0.456
#> SRR1700104 4 0.4923 0.60383 0.000 0.020 0.120 0.708 0.004 0.148
#> SRR1700103 4 0.5772 0.51183 0.000 0.012 0.152 0.600 0.012 0.224
#> SRR1700105 4 0.3879 0.62064 0.000 0.024 0.000 0.800 0.096 0.080
#> SRR1700106 4 0.5065 0.54249 0.000 0.036 0.004 0.696 0.184 0.080
#> SRR1700107 4 0.5925 0.55081 0.000 0.032 0.048 0.640 0.076 0.204
#> SRR1700108 4 0.5321 0.53752 0.000 0.072 0.000 0.688 0.104 0.136
#> SRR1700109 4 0.5339 0.52130 0.000 0.044 0.000 0.672 0.160 0.124
#> SRR1700110 4 0.5426 0.50373 0.000 0.036 0.000 0.656 0.160 0.148
#> SRR1700112 4 0.4299 0.54468 0.000 0.028 0.000 0.728 0.212 0.032
#> SRR1700111 4 0.4086 0.61824 0.000 0.036 0.012 0.784 0.144 0.024
#> SRR1700113 4 0.5860 0.29273 0.000 0.028 0.008 0.532 0.348 0.084
#> SRR1700114 4 0.4057 0.66827 0.000 0.012 0.060 0.804 0.032 0.092
#> SRR1700115 4 0.4576 0.60060 0.000 0.036 0.008 0.756 0.068 0.132
#> SRR1700116 4 0.3115 0.66638 0.000 0.000 0.092 0.848 0.012 0.048
#> SRR1700117 4 0.2443 0.67761 0.000 0.008 0.024 0.904 0.040 0.024
#> SRR1700119 4 0.4681 0.56639 0.000 0.064 0.012 0.708 0.208 0.008
#> SRR1700118 4 0.3386 0.66991 0.000 0.032 0.124 0.824 0.020 0.000
#> SRR1700120 4 0.4526 0.53931 0.000 0.000 0.244 0.692 0.016 0.048
#> SRR1700121 4 0.4988 0.45562 0.000 0.048 0.004 0.648 0.276 0.024
#> SRR1700122 4 0.4062 0.55688 0.000 0.004 0.016 0.716 0.252 0.012
#> SRR1700123 4 0.4470 0.63658 0.000 0.052 0.052 0.752 0.144 0.000
#> SRR1700125 4 0.4557 0.50122 0.000 0.020 0.004 0.688 0.256 0.032
#> SRR1700126 4 0.4395 0.51519 0.000 0.028 0.268 0.688 0.008 0.008
#> SRR1700127 4 0.3189 0.61756 0.000 0.000 0.184 0.796 0.000 0.020
#> SRR1700124 4 0.4660 0.64444 0.000 0.012 0.168 0.712 0.108 0.000
#> SRR1700128 4 0.3756 0.66496 0.000 0.004 0.140 0.792 0.060 0.004
#> SRR1700129 4 0.2871 0.65621 0.000 0.000 0.024 0.852 0.116 0.008
#> SRR1700130 4 0.4562 0.61481 0.000 0.148 0.048 0.744 0.060 0.000
#> SRR1700132 4 0.3767 0.54790 0.000 0.000 0.260 0.720 0.004 0.016
#> SRR1700131 4 0.3436 0.63111 0.000 0.000 0.172 0.796 0.012 0.020
#> SRR1700133 4 0.3490 0.61445 0.000 0.024 0.008 0.808 0.152 0.008
#> SRR1700134 4 0.4108 0.58790 0.000 0.060 0.012 0.756 0.172 0.000
#> SRR1700135 4 0.4243 0.65624 0.000 0.032 0.076 0.772 0.120 0.000
#> SRR1700136 4 0.4289 0.56929 0.000 0.036 0.228 0.720 0.012 0.004
#> SRR1700137 4 0.4206 0.65234 0.000 0.036 0.068 0.776 0.120 0.000
#> SRR1700138 4 0.5940 0.52273 0.000 0.056 0.112 0.608 0.220 0.004
#> SRR1700140 4 0.3991 0.64753 0.000 0.032 0.164 0.776 0.024 0.004
#> SRR1700139 4 0.3745 0.66169 0.000 0.028 0.144 0.796 0.032 0.000
#> SRR1700141 4 0.3315 0.67591 0.000 0.000 0.068 0.832 0.092 0.008
#> SRR1700142 4 0.3853 0.49063 0.000 0.000 0.304 0.680 0.000 0.016
#> SRR1700143 4 0.3613 0.61570 0.000 0.024 0.196 0.772 0.008 0.000
#> SRR1700144 4 0.4569 0.24918 0.000 0.040 0.396 0.564 0.000 0.000
#> SRR1700145 4 0.4560 0.53979 0.000 0.048 0.020 0.696 0.236 0.000
#> SRR1700146 4 0.3378 0.67467 0.000 0.028 0.064 0.840 0.068 0.000
#> SRR1700147 4 0.3517 0.60936 0.000 0.012 0.204 0.772 0.012 0.000
#> SRR1700149 4 0.2708 0.66841 0.000 0.012 0.112 0.864 0.004 0.008
#> SRR1700148 4 0.3243 0.64388 0.000 0.028 0.156 0.812 0.004 0.000
#> SRR1700150 4 0.4314 0.64156 0.000 0.048 0.056 0.768 0.128 0.000
#> SRR1700152 4 0.4008 0.67154 0.000 0.028 0.120 0.788 0.064 0.000
#> SRR1700151 4 0.3756 0.56951 0.000 0.000 0.240 0.736 0.008 0.016
#> SRR1700153 4 0.2765 0.67411 0.000 0.004 0.104 0.864 0.024 0.004
#> SRR1700154 4 0.4158 0.65729 0.000 0.044 0.144 0.772 0.040 0.000
#> SRR1700155 4 0.3717 0.66999 0.000 0.044 0.108 0.816 0.028 0.004
#> SRR1700156 4 0.3866 0.57047 0.000 0.008 0.248 0.728 0.008 0.008
#> SRR1700158 4 0.3873 0.67973 0.000 0.020 0.104 0.804 0.068 0.004
#> SRR1700159 4 0.3257 0.62978 0.000 0.000 0.012 0.816 0.152 0.020
#> SRR1700157 4 0.4224 0.54123 0.000 0.036 0.256 0.700 0.008 0.000
#> SRR1700160 4 0.3296 0.66973 0.000 0.044 0.044 0.848 0.064 0.000
#> SRR1700161 4 0.3605 0.64458 0.000 0.056 0.020 0.816 0.108 0.000
#> SRR1700162 4 0.4214 0.51144 0.000 0.012 0.016 0.688 0.280 0.004
#> SRR1700164 4 0.5412 0.43388 0.028 0.040 0.000 0.636 0.268 0.028
#> SRR1700163 4 0.2860 0.68266 0.000 0.012 0.068 0.868 0.052 0.000
#> SRR1700165 4 0.2588 0.67736 0.000 0.004 0.040 0.888 0.060 0.008
#> SRR1700166 4 0.3803 0.61162 0.000 0.040 0.012 0.788 0.156 0.004
#> SRR1700168 4 0.3598 0.62015 0.000 0.040 0.000 0.816 0.116 0.028
#> SRR1700167 4 0.3868 0.66440 0.000 0.004 0.068 0.784 0.140 0.004
#> SRR1700170 4 0.4378 0.54145 0.000 0.048 0.000 0.724 0.208 0.020
#> SRR1700169 4 0.4199 0.58794 0.000 0.032 0.012 0.756 0.184 0.016
#> SRR1700171 4 0.7042 0.41025 0.052 0.004 0.248 0.516 0.036 0.144
#> SRR1700172 4 0.4446 0.58315 0.000 0.028 0.028 0.716 0.224 0.004
#> SRR1700174 4 0.2574 0.68143 0.000 0.024 0.080 0.884 0.004 0.008
#> SRR1700173 4 0.2357 0.68339 0.000 0.012 0.068 0.900 0.008 0.012
#> SRR1700175 4 0.3151 0.65387 0.000 0.012 0.020 0.848 0.108 0.012
#> SRR1700176 4 0.4003 0.54545 0.000 0.000 0.248 0.716 0.004 0.032
#> SRR1700178 6 0.4148 0.41160 0.000 0.344 0.000 0.016 0.004 0.636
#> SRR1700177 4 0.4737 0.44473 0.000 0.048 0.000 0.664 0.268 0.020
#> SRR1700180 6 0.4211 0.37960 0.000 0.364 0.000 0.016 0.004 0.616
#> SRR1700179 6 0.4289 0.42106 0.000 0.332 0.000 0.020 0.008 0.640
#> SRR1700181 6 0.4323 0.36479 0.000 0.376 0.000 0.020 0.004 0.600
#> SRR1700183 1 0.1546 0.79167 0.944 0.020 0.000 0.004 0.004 0.028
#> SRR1700182 2 0.3996 0.21544 0.000 0.636 0.000 0.008 0.004 0.352
#> SRR1700184 6 0.4114 0.21091 0.000 0.460 0.000 0.004 0.004 0.532
#> SRR1700186 6 0.4187 0.38115 0.000 0.356 0.016 0.004 0.000 0.624
#> SRR1700187 1 0.1964 0.78956 0.920 0.056 0.000 0.012 0.004 0.008
#> SRR1700185 1 0.0405 0.79059 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700188 2 0.4208 -0.02062 0.000 0.536 0.008 0.004 0.000 0.452
#> SRR1700192 6 0.6614 0.08929 0.356 0.188 0.000 0.028 0.008 0.420
#> SRR1700190 2 0.4567 0.05119 0.004 0.560 0.000 0.012 0.012 0.412
#> SRR1700191 1 0.0665 0.79095 0.980 0.008 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1700189 1 0.2501 0.77719 0.896 0.056 0.000 0.028 0.004 0.016
#> SRR1700193 6 0.4279 0.24397 0.000 0.436 0.000 0.004 0.012 0.548
#> SRR1700195 2 0.4692 0.40890 0.044 0.712 0.008 0.012 0.008 0.216
#> SRR1700194 1 0.0632 0.79538 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1700196 2 0.3840 0.38403 0.000 0.716 0.012 0.004 0.004 0.264
#> SRR1700197 6 0.6790 0.36091 0.200 0.244 0.004 0.040 0.012 0.500
#> SRR1700198 2 0.4097 0.36446 0.008 0.708 0.004 0.008 0.008 0.264
#> SRR1700199 2 0.3780 0.53641 0.072 0.824 0.020 0.008 0.004 0.072
#> SRR1700200 2 0.3992 0.53676 0.072 0.812 0.004 0.008 0.028 0.076
#> SRR1700201 2 0.3867 0.31574 0.000 0.688 0.000 0.012 0.004 0.296
#> SRR1700202 1 0.8335 0.15169 0.332 0.180 0.000 0.168 0.260 0.060
#> SRR1700203 2 0.2543 0.56893 0.004 0.904 0.012 0.024 0.032 0.024
#> SRR1700204 2 0.2951 0.53748 0.004 0.868 0.008 0.020 0.012 0.088
#> SRR1700206 2 0.5026 0.36823 0.028 0.684 0.004 0.056 0.004 0.224
#> SRR1700207 2 0.3648 0.40051 0.000 0.740 0.000 0.016 0.004 0.240
#> SRR1700208 2 0.4719 0.28795 0.020 0.656 0.000 0.020 0.012 0.292
#> SRR1700205 5 0.7476 0.27403 0.044 0.336 0.000 0.188 0.380 0.052
#> SRR1700209 2 0.3590 0.55499 0.000 0.828 0.052 0.044 0.076 0.000
#> SRR1700210 2 0.3933 0.54350 0.108 0.812 0.020 0.016 0.040 0.004
#> SRR1700211 2 0.5222 0.36465 0.260 0.652 0.004 0.048 0.008 0.028
#> SRR1700212 2 0.4816 0.48211 0.112 0.744 0.000 0.012 0.036 0.096
#> SRR1700213 2 0.5105 0.47046 0.032 0.692 0.212 0.004 0.012 0.048
#> SRR1700214 2 0.2825 0.55541 0.040 0.884 0.000 0.036 0.032 0.008
#> SRR1700215 1 0.0777 0.79557 0.972 0.024 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700217 2 0.3700 0.55752 0.012 0.836 0.052 0.020 0.072 0.008
#> SRR1700216 1 0.1049 0.79662 0.960 0.032 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1700218 2 0.4006 0.53654 0.000 0.808 0.044 0.056 0.008 0.084
#> SRR1700219 2 0.2569 0.56644 0.000 0.896 0.008 0.016 0.044 0.036
#> SRR1700222 1 0.1806 0.77509 0.908 0.088 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700220 2 0.3522 0.53914 0.000 0.836 0.004 0.044 0.080 0.036
#> SRR1700221 2 0.4176 0.51995 0.040 0.804 0.016 0.104 0.012 0.024
#> SRR1700223 2 0.2815 0.57096 0.000 0.884 0.020 0.016 0.056 0.024
#> SRR1700224 2 0.3427 0.55637 0.032 0.856 0.016 0.040 0.052 0.004
#> SRR1700226 2 0.3380 0.55855 0.000 0.832 0.056 0.000 0.096 0.016
#> SRR1700229 2 0.3127 0.56415 0.004 0.860 0.084 0.004 0.028 0.020
#> SRR1700225 2 0.4013 0.45971 0.000 0.712 0.260 0.016 0.004 0.008
#> SRR1700227 2 0.3041 0.55246 0.000 0.864 0.040 0.020 0.004 0.072
#> SRR1700230 1 0.4552 0.20938 0.504 0.472 0.000 0.008 0.008 0.008
#> SRR1700231 2 0.2932 0.56580 0.000 0.876 0.040 0.012 0.016 0.056
#> SRR1700228 2 0.4304 0.52111 0.020 0.768 0.160 0.036 0.008 0.008
#> SRR1700232 2 0.2924 0.57087 0.000 0.876 0.036 0.004 0.044 0.040
#> SRR1700233 2 0.3978 0.54266 0.056 0.816 0.076 0.024 0.000 0.028
#> SRR1700234 2 0.5273 0.43046 0.212 0.680 0.024 0.064 0.016 0.004
#> SRR1700235 2 0.3426 0.55708 0.000 0.840 0.080 0.052 0.024 0.004
#> SRR1700237 2 0.3607 0.53763 0.004 0.812 0.096 0.000 0.004 0.084
#> SRR1700236 2 0.3014 0.56130 0.000 0.856 0.048 0.012 0.084 0.000
#> SRR1700238 2 0.2279 0.57071 0.012 0.916 0.024 0.004 0.012 0.032
#> SRR1700239 1 0.3493 0.65527 0.756 0.228 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1700240 1 0.1067 0.79721 0.964 0.024 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1700241 4 0.6578 0.20422 0.024 0.112 0.340 0.492 0.008 0.024
#> SRR1700243 2 0.3369 0.47301 0.004 0.800 0.004 0.012 0.004 0.176
#> SRR1700244 2 0.4979 0.41736 0.004 0.712 0.000 0.048 0.068 0.168
#> SRR1700242 1 0.3273 0.67120 0.776 0.212 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1700246 1 0.5128 0.09856 0.500 0.444 0.024 0.000 0.028 0.004
#> SRR1700245 2 0.3451 0.55116 0.000 0.840 0.052 0.004 0.028 0.076
#> SRR1700247 1 0.1010 0.79671 0.960 0.036 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700249 1 0.1338 0.79691 0.952 0.032 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1700250 2 0.3760 0.52199 0.000 0.808 0.008 0.024 0.032 0.128
#> SRR1700248 2 0.3761 0.44462 0.004 0.768 0.000 0.032 0.004 0.192
#> SRR1700251 2 0.4336 0.46997 0.004 0.768 0.000 0.084 0.024 0.120
#> SRR1700252 2 0.4991 0.40706 0.004 0.716 0.020 0.080 0.012 0.168
#> SRR1700253 2 0.4828 0.47064 0.004 0.744 0.000 0.076 0.096 0.080
#> SRR1700256 2 0.3157 0.52003 0.000 0.832 0.012 0.004 0.016 0.136
#> SRR1700254 1 0.1010 0.79659 0.960 0.036 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1700255 2 0.3637 0.53600 0.032 0.836 0.000 0.024 0.028 0.080
#> SRR1700257 2 0.4434 0.47434 0.004 0.756 0.000 0.040 0.048 0.152
#> SRR1700258 6 0.3689 0.52383 0.000 0.192 0.000 0.020 0.016 0.772
#> SRR1700259 6 0.3982 0.52838 0.000 0.064 0.004 0.052 0.072 0.808
#> SRR1700260 6 0.5882 0.40413 0.004 0.040 0.020 0.092 0.200 0.644
#> SRR1700261 5 0.5127 0.48161 0.000 0.008 0.032 0.244 0.664 0.052
#> SRR1700262 5 0.5620 0.51997 0.000 0.040 0.000 0.192 0.632 0.136
#> SRR1700263 6 0.7096 0.36015 0.000 0.212 0.008 0.180 0.112 0.488
#> SRR1700264 6 0.4779 0.33487 0.000 0.368 0.060 0.000 0.000 0.572
#> SRR1700265 6 0.6691 0.16111 0.288 0.048 0.012 0.012 0.116 0.524
#> SRR1700266 6 0.3047 0.53895 0.000 0.144 0.012 0.004 0.008 0.832
#> SRR1700268 4 0.7770 -0.15816 0.000 0.236 0.020 0.320 0.112 0.312
#> SRR1700270 2 0.4303 0.29531 0.000 0.656 0.012 0.008 0.008 0.316
#> SRR1700267 6 0.5475 0.48424 0.000 0.212 0.004 0.148 0.012 0.624
#> SRR1700271 6 0.3927 0.52625 0.000 0.196 0.000 0.012 0.036 0.756
#> SRR1700272 6 0.5367 0.51145 0.000 0.132 0.000 0.072 0.112 0.684
#> SRR1700273 6 0.4916 0.16374 0.000 0.472 0.004 0.028 0.012 0.484
#> SRR1700274 6 0.6513 0.24555 0.000 0.076 0.000 0.132 0.288 0.504
#> SRR1700277 2 0.5724 0.11257 0.000 0.560 0.000 0.128 0.020 0.292
#> SRR1700275 5 0.5330 0.54668 0.000 0.064 0.000 0.212 0.660 0.064
#> SRR1700276 6 0.7933 0.19383 0.020 0.172 0.000 0.256 0.204 0.348
#> SRR1700278 5 0.5451 0.42572 0.016 0.364 0.000 0.072 0.544 0.004
#> SRR1700279 5 0.5132 0.57970 0.024 0.060 0.000 0.196 0.696 0.024
#> SRR1700280 5 0.5858 0.58599 0.052 0.096 0.000 0.164 0.660 0.028
#> SRR1700281 2 0.5180 0.40405 0.000 0.700 0.008 0.100 0.036 0.156
#> SRR1700283 5 0.6077 0.40930 0.000 0.348 0.000 0.136 0.488 0.028
#> SRR1700282 1 0.8288 -0.04385 0.300 0.084 0.000 0.224 0.300 0.092
#> SRR1700284 5 0.5029 0.60652 0.000 0.144 0.008 0.184 0.664 0.000
#> SRR1700285 5 0.5510 0.23353 0.000 0.028 0.028 0.372 0.548 0.024
#> SRR1700286 2 0.4947 0.51238 0.000 0.716 0.096 0.016 0.156 0.016
#> SRR1700287 5 0.4840 0.52594 0.012 0.028 0.000 0.244 0.684 0.032
#> SRR1700290 5 0.5413 0.49819 0.012 0.036 0.012 0.228 0.668 0.044
#> SRR1700289 5 0.5044 0.41297 0.004 0.360 0.036 0.020 0.580 0.000
#> SRR1700288 2 0.3939 0.51711 0.036 0.800 0.000 0.016 0.128 0.020
#> SRR1700292 5 0.4485 0.60960 0.000 0.068 0.000 0.184 0.728 0.020
#> SRR1700291 5 0.5612 0.19591 0.000 0.088 0.012 0.412 0.484 0.004
#> SRR1700293 2 0.6052 -0.11645 0.000 0.420 0.004 0.392 0.180 0.004
#> SRR1700294 5 0.5325 0.27434 0.000 0.108 0.000 0.392 0.500 0.000
#> SRR1700295 5 0.5259 0.34741 0.004 0.040 0.008 0.332 0.596 0.020
#> SRR1700297 5 0.5192 0.30088 0.004 0.044 0.000 0.372 0.560 0.020
#> SRR1700296 5 0.5032 0.59371 0.008 0.112 0.000 0.192 0.680 0.008
#> SRR1700298 5 0.7460 0.22521 0.088 0.260 0.004 0.300 0.344 0.004
#> SRR1700299 4 0.5303 0.59647 0.000 0.044 0.080 0.692 0.172 0.012
#> SRR1700300 4 0.6586 0.42197 0.000 0.200 0.044 0.540 0.200 0.016
#> SRR1700302 5 0.3719 0.59324 0.008 0.028 0.000 0.200 0.764 0.000
#> SRR1700301 5 0.4649 0.58469 0.004 0.084 0.004 0.192 0.712 0.004
#> SRR1700303 5 0.5301 0.08145 0.000 0.076 0.000 0.456 0.460 0.008
#> SRR1700304 5 0.7540 0.16470 0.280 0.204 0.000 0.116 0.388 0.012
#> SRR1700305 4 0.6463 0.37274 0.000 0.284 0.036 0.516 0.152 0.012
#> SRR1700306 5 0.5444 0.18578 0.004 0.012 0.028 0.388 0.540 0.028
#> SRR1700308 4 0.7065 0.20376 0.000 0.388 0.108 0.392 0.096 0.016
#> SRR1700307 3 0.6629 0.23729 0.000 0.140 0.452 0.356 0.036 0.016
#> SRR1700309 4 0.7084 -0.05977 0.000 0.272 0.056 0.352 0.316 0.004
#> SRR1700310 5 0.4935 0.29428 0.000 0.028 0.020 0.368 0.580 0.004
#> SRR1700311 4 0.5412 0.43799 0.000 0.032 0.036 0.612 0.300 0.020
#> SRR1700312 4 0.7423 0.10815 0.000 0.240 0.084 0.376 0.288 0.012
#> SRR1700313 4 0.6752 0.49969 0.000 0.220 0.136 0.544 0.084 0.016
#> SRR1700314 4 0.5844 0.49599 0.000 0.008 0.256 0.584 0.132 0.020
#> SRR1700315 5 0.6506 0.41014 0.000 0.136 0.060 0.292 0.508 0.004
#> SRR1700316 4 0.5824 0.59956 0.000 0.088 0.092 0.660 0.148 0.012
#> SRR1700317 5 0.5604 0.22832 0.000 0.448 0.024 0.076 0.452 0.000
#> SRR1700318 5 0.5170 0.60266 0.096 0.076 0.012 0.080 0.732 0.004
#> SRR1700319 5 0.5109 0.01379 0.000 0.012 0.024 0.452 0.496 0.016
#> SRR1700320 5 0.5038 0.46746 0.000 0.064 0.012 0.292 0.628 0.004
#> SRR1700322 4 0.6491 0.56333 0.004 0.132 0.076 0.620 0.136 0.032
#> SRR1700321 4 0.5467 0.07087 0.000 0.028 0.020 0.484 0.444 0.024
#> SRR1700323 4 0.5509 0.48020 0.000 0.012 0.064 0.612 0.284 0.028
#> SRR1700324 4 0.5978 0.41371 0.000 0.112 0.036 0.580 0.264 0.008
#> SRR1700325 5 0.6702 0.35996 0.000 0.236 0.000 0.292 0.428 0.044
#> SRR1700326 1 0.4652 0.43674 0.644 0.004 0.004 0.012 0.312 0.024
#> SRR1700327 4 0.7507 0.13310 0.000 0.004 0.284 0.340 0.256 0.116
#> SRR1700329 4 0.6129 0.15215 0.000 0.108 0.028 0.484 0.372 0.008
#> SRR1700328 1 0.5373 0.60128 0.656 0.140 0.004 0.184 0.008 0.008
#> SRR1700330 4 0.7719 -0.00191 0.208 0.176 0.000 0.364 0.244 0.008
#> SRR1700331 5 0.4256 0.63990 0.004 0.096 0.000 0.144 0.752 0.004
#> SRR1700332 5 0.5812 0.58417 0.000 0.236 0.000 0.172 0.572 0.020
#> SRR1700333 2 0.6325 -0.15334 0.004 0.424 0.000 0.320 0.244 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0