Date: 2019-12-26 00:56:42 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 4844 461
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ATC:pam | 2 | 1.000 | 0.969 | 0.987 | ** | |
| CV:NMF | 4 | 1.000 | 0.966 | 0.980 | ** | 2 |
| CV:kmeans | 2 | 0.991 | 0.957 | 0.967 | ** | |
| SD:skmeans | 6 | 0.973 | 0.933 | 0.965 | ** | 2,3 |
| ATC:kmeans | 2 | 0.973 | 0.951 | 0.980 | ** | |
| SD:kmeans | 3 | 0.968 | 0.938 | 0.961 | ** | |
| MAD:mclust | 3 | 0.966 | 0.930 | 0.969 | ** | |
| SD:mclust | 3 | 0.955 | 0.947 | 0.970 | ** | |
| CV:skmeans | 3 | 0.954 | 0.927 | 0.968 | ** | |
| MAD:skmeans | 6 | 0.935 | 0.891 | 0.945 | * | 2,3 |
| SD:NMF | 6 | 0.929 | 0.893 | 0.949 | * | 2,3,4,5 |
| ATC:NMF | 5 | 0.917 | 0.876 | 0.936 | * | 3,4 |
| ATC:skmeans | 5 | 0.913 | 0.874 | 0.946 | * | 2 |
| ATC:mclust | 3 | 0.913 | 0.922 | 0.961 | * | |
| MAD:NMF | 5 | 0.908 | 0.852 | 0.937 | * | |
| MAD:kmeans | 2 | 0.902 | 0.930 | 0.971 | * | |
| CV:pam | 2 | 0.872 | 0.936 | 0.969 | ||
| SD:pam | 2 | 0.851 | 0.916 | 0.964 | ||
| MAD:pam | 2 | 0.832 | 0.913 | 0.962 | ||
| ATC:hclust | 2 | 0.583 | 0.830 | 0.921 | ||
| SD:hclust | 2 | 0.491 | 0.822 | 0.906 | ||
| CV:hclust | 3 | 0.451 | 0.716 | 0.827 | ||
| CV:mclust | 2 | 0.416 | 0.805 | 0.878 | ||
| MAD:hclust | 2 | 0.370 | 0.770 | 0.864 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.950 0.951 0.979 0.487 0.515 0.515
#> CV:NMF 2 1.000 0.977 0.990 0.477 0.525 0.525
#> MAD:NMF 2 0.478 0.762 0.886 0.485 0.518 0.518
#> ATC:NMF 2 0.659 0.869 0.934 0.482 0.520 0.520
#> SD:skmeans 2 0.906 0.927 0.970 0.499 0.500 0.500
#> CV:skmeans 2 0.876 0.921 0.966 0.492 0.506 0.506
#> MAD:skmeans 2 0.968 0.947 0.978 0.501 0.499 0.499
#> ATC:skmeans 2 0.942 0.934 0.974 0.496 0.503 0.503
#> SD:mclust 2 0.563 0.849 0.898 0.468 0.533 0.533
#> CV:mclust 2 0.416 0.805 0.878 0.472 0.509 0.509
#> MAD:mclust 2 0.388 0.406 0.731 0.475 0.525 0.525
#> ATC:mclust 2 0.726 0.883 0.942 0.473 0.531 0.531
#> SD:kmeans 2 0.880 0.916 0.965 0.487 0.518 0.518
#> CV:kmeans 2 0.991 0.957 0.967 0.435 0.557 0.557
#> MAD:kmeans 2 0.902 0.930 0.971 0.498 0.501 0.501
#> ATC:kmeans 2 0.973 0.951 0.980 0.461 0.546 0.546
#> SD:pam 2 0.851 0.916 0.964 0.444 0.562 0.562
#> CV:pam 2 0.872 0.936 0.969 0.433 0.559 0.559
#> MAD:pam 2 0.832 0.913 0.962 0.488 0.508 0.508
#> ATC:pam 2 1.000 0.969 0.987 0.395 0.608 0.608
#> SD:hclust 2 0.491 0.822 0.906 0.485 0.503 0.503
#> CV:hclust 2 0.363 0.798 0.868 0.397 0.612 0.612
#> MAD:hclust 2 0.370 0.770 0.864 0.453 0.501 0.501
#> ATC:hclust 2 0.583 0.830 0.921 0.481 0.515 0.515
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 1.000 0.984 0.993 0.366 0.748 0.543
#> CV:NMF 3 0.757 0.953 0.940 0.369 0.777 0.588
#> MAD:NMF 3 0.890 0.885 0.950 0.373 0.709 0.490
#> ATC:NMF 3 0.945 0.938 0.973 0.378 0.715 0.501
#> SD:skmeans 3 0.944 0.931 0.972 0.318 0.746 0.537
#> CV:skmeans 3 0.954 0.927 0.968 0.355 0.725 0.506
#> MAD:skmeans 3 0.954 0.926 0.970 0.310 0.768 0.569
#> ATC:skmeans 3 0.868 0.893 0.954 0.288 0.805 0.631
#> SD:mclust 3 0.955 0.947 0.970 0.397 0.809 0.643
#> CV:mclust 3 0.482 0.752 0.851 0.256 0.574 0.389
#> MAD:mclust 3 0.966 0.930 0.969 0.388 0.762 0.567
#> ATC:mclust 3 0.913 0.922 0.961 0.370 0.747 0.554
#> SD:kmeans 3 0.968 0.938 0.961 0.333 0.745 0.546
#> CV:kmeans 3 0.682 0.823 0.888 0.462 0.739 0.546
#> MAD:kmeans 3 0.753 0.827 0.914 0.318 0.724 0.509
#> ATC:kmeans 3 0.602 0.740 0.866 0.413 0.720 0.523
#> SD:pam 3 0.687 0.817 0.900 0.269 0.878 0.786
#> CV:pam 3 0.557 0.722 0.842 0.216 0.931 0.877
#> MAD:pam 3 0.597 0.775 0.874 0.306 0.810 0.639
#> ATC:pam 3 0.750 0.876 0.937 0.375 0.860 0.769
#> SD:hclust 3 0.447 0.653 0.792 0.310 0.836 0.678
#> CV:hclust 3 0.451 0.716 0.827 0.574 0.716 0.541
#> MAD:hclust 3 0.382 0.645 0.791 0.330 0.870 0.745
#> ATC:hclust 3 0.484 0.683 0.805 0.273 0.823 0.670
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.964 0.951 0.973 0.0962 0.927 0.786
#> CV:NMF 4 1.000 0.966 0.980 0.1161 0.918 0.763
#> MAD:NMF 4 0.885 0.880 0.935 0.0989 0.895 0.703
#> ATC:NMF 4 0.928 0.909 0.952 0.0943 0.915 0.756
#> SD:skmeans 4 0.877 0.882 0.946 0.1279 0.834 0.565
#> CV:skmeans 4 0.819 0.812 0.916 0.0996 0.859 0.619
#> MAD:skmeans 4 0.808 0.752 0.893 0.1353 0.806 0.511
#> ATC:skmeans 4 0.866 0.853 0.934 0.1229 0.870 0.665
#> SD:mclust 4 0.757 0.836 0.818 0.1051 0.993 0.981
#> CV:mclust 4 0.683 0.765 0.880 0.2025 0.790 0.555
#> MAD:mclust 4 0.728 0.750 0.779 0.1058 0.900 0.719
#> ATC:mclust 4 0.842 0.851 0.918 0.1346 0.899 0.716
#> SD:kmeans 4 0.740 0.770 0.878 0.1425 0.838 0.575
#> CV:kmeans 4 0.654 0.677 0.819 0.1356 0.845 0.588
#> MAD:kmeans 4 0.784 0.833 0.901 0.1328 0.821 0.542
#> ATC:kmeans 4 0.802 0.873 0.927 0.1380 0.820 0.540
#> SD:pam 4 0.848 0.866 0.934 0.1602 0.867 0.717
#> CV:pam 4 0.588 0.728 0.845 0.1528 0.860 0.729
#> MAD:pam 4 0.726 0.782 0.887 0.1100 0.883 0.692
#> ATC:pam 4 0.632 0.684 0.867 0.1822 0.908 0.806
#> SD:hclust 4 0.532 0.510 0.742 0.1240 0.937 0.833
#> CV:hclust 4 0.545 0.528 0.761 0.1278 0.935 0.827
#> MAD:hclust 4 0.494 0.401 0.712 0.1333 0.953 0.886
#> ATC:hclust 4 0.501 0.541 0.685 0.1482 0.852 0.635
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.968 0.933 0.969 0.0355 0.956 0.844
#> CV:NMF 5 0.856 0.774 0.869 0.0507 0.983 0.938
#> MAD:NMF 5 0.908 0.852 0.937 0.0358 0.927 0.751
#> ATC:NMF 5 0.917 0.876 0.936 0.0491 0.938 0.784
#> SD:skmeans 5 0.880 0.893 0.935 0.0490 0.947 0.801
#> CV:skmeans 5 0.818 0.838 0.914 0.0619 0.877 0.597
#> MAD:skmeans 5 0.828 0.790 0.883 0.0536 0.928 0.735
#> ATC:skmeans 5 0.913 0.874 0.946 0.0670 0.921 0.737
#> SD:mclust 5 0.730 0.690 0.819 0.0787 0.861 0.599
#> CV:mclust 5 0.676 0.751 0.823 0.0546 0.916 0.718
#> MAD:mclust 5 0.784 0.818 0.892 0.0851 0.898 0.649
#> ATC:mclust 5 0.774 0.781 0.884 0.0654 0.912 0.685
#> SD:kmeans 5 0.744 0.552 0.698 0.0624 0.864 0.541
#> CV:kmeans 5 0.726 0.647 0.795 0.0796 0.848 0.524
#> MAD:kmeans 5 0.783 0.682 0.818 0.0600 0.919 0.699
#> ATC:kmeans 5 0.824 0.828 0.901 0.0622 0.942 0.781
#> SD:pam 5 0.715 0.773 0.888 0.1062 0.931 0.808
#> CV:pam 5 0.564 0.707 0.831 0.0802 0.964 0.909
#> MAD:pam 5 0.741 0.762 0.878 0.0601 0.950 0.833
#> ATC:pam 5 0.641 0.686 0.837 0.1006 0.936 0.836
#> SD:hclust 5 0.591 0.514 0.711 0.0609 0.841 0.571
#> CV:hclust 5 0.567 0.664 0.721 0.0698 0.858 0.596
#> MAD:hclust 5 0.554 0.587 0.659 0.0825 0.826 0.569
#> ATC:hclust 5 0.570 0.518 0.712 0.0821 0.875 0.605
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.929 0.893 0.949 0.0307 0.967 0.873
#> CV:NMF 6 0.828 0.766 0.847 0.0413 0.915 0.688
#> MAD:NMF 6 0.869 0.792 0.902 0.0483 0.928 0.727
#> ATC:NMF 6 0.838 0.720 0.863 0.0470 0.961 0.841
#> SD:skmeans 6 0.973 0.933 0.965 0.0491 0.933 0.716
#> CV:skmeans 6 0.839 0.813 0.901 0.0468 0.937 0.730
#> MAD:skmeans 6 0.935 0.891 0.945 0.0387 0.944 0.755
#> ATC:skmeans 6 0.851 0.763 0.870 0.0533 0.926 0.705
#> SD:mclust 6 0.729 0.580 0.777 0.0360 0.946 0.761
#> CV:mclust 6 0.707 0.622 0.749 0.0486 0.945 0.779
#> MAD:mclust 6 0.777 0.766 0.844 0.0346 0.972 0.861
#> ATC:mclust 6 0.779 0.729 0.821 0.0389 0.960 0.822
#> SD:kmeans 6 0.843 0.782 0.847 0.0419 0.912 0.629
#> CV:kmeans 6 0.750 0.717 0.803 0.0465 0.919 0.662
#> MAD:kmeans 6 0.829 0.759 0.822 0.0386 0.953 0.784
#> ATC:kmeans 6 0.815 0.654 0.805 0.0422 0.982 0.920
#> SD:pam 6 0.709 0.505 0.761 0.0741 0.875 0.595
#> CV:pam 6 0.569 0.635 0.791 0.0557 0.984 0.958
#> MAD:pam 6 0.765 0.734 0.861 0.0446 0.952 0.820
#> ATC:pam 6 0.735 0.740 0.881 0.0698 0.892 0.686
#> SD:hclust 6 0.646 0.620 0.717 0.0462 0.938 0.752
#> CV:hclust 6 0.585 0.595 0.759 0.0495 0.967 0.857
#> MAD:hclust 6 0.611 0.542 0.700 0.0511 0.951 0.809
#> ATC:hclust 6 0.618 0.550 0.718 0.0431 0.950 0.790
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 484, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 968, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1453, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1938, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2422, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 484, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 968, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1453, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1938, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2422, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 484)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 968)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1453)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1938)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2422)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.491 0.822 0.906 0.4855 0.503 0.503
#> 3 3 0.447 0.653 0.792 0.3099 0.836 0.678
#> 4 4 0.532 0.510 0.742 0.1240 0.937 0.833
#> 5 5 0.591 0.514 0.711 0.0609 0.841 0.571
#> 6 6 0.646 0.620 0.717 0.0462 0.938 0.752
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0672 0.91414 0.992 0.008
#> SRR1975008 2 0.5178 0.86190 0.116 0.884
#> SRR1975006 2 0.1633 0.88782 0.024 0.976
#> SRR1975005 1 0.9580 0.36143 0.620 0.380
#> SRR1975004 1 0.3733 0.88053 0.928 0.072
#> SRR1975003 2 0.6343 0.82986 0.160 0.840
#> SRR1975001 2 0.0672 0.88356 0.008 0.992
#> SRR1975002 2 0.0938 0.88403 0.012 0.988
#> SRR1974999 2 0.5629 0.84698 0.132 0.868
#> SRR1975000 1 0.0938 0.91321 0.988 0.012
#> SRR1974998 1 0.2236 0.90421 0.964 0.036
#> SRR1974997 1 0.9866 0.14617 0.568 0.432
#> SRR1974995 2 0.9608 0.48336 0.384 0.616
#> SRR1974996 1 0.1414 0.91086 0.980 0.020
#> SRR1974994 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.7815 0.70252 0.768 0.232
#> SRR1974992 1 0.9209 0.48975 0.664 0.336
#> SRR1974990 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.9988 0.22110 0.480 0.520
#> SRR1974991 1 0.9427 0.41991 0.640 0.360
#> SRR1974986 1 0.0376 0.91476 0.996 0.004
#> SRR1974987 2 0.9896 0.30594 0.440 0.560
#> SRR1974988 1 0.5294 0.83965 0.880 0.120
#> SRR1974984 1 0.9170 0.49168 0.668 0.332
#> SRR1974985 1 0.0672 0.91345 0.992 0.008
#> SRR1974983 2 0.2043 0.88626 0.032 0.968
#> SRR1974982 1 0.1414 0.91126 0.980 0.020
#> SRR1974981 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.1633 0.90928 0.976 0.024
#> SRR1974979 2 0.9922 0.28665 0.448 0.552
#> SRR1974978 1 0.0672 0.91418 0.992 0.008
#> SRR1974977 1 0.1184 0.91179 0.984 0.016
#> SRR1974976 2 0.9170 0.58872 0.332 0.668
#> SRR1974975 1 0.9608 0.35013 0.616 0.384
#> SRR1974974 2 0.4939 0.86504 0.108 0.892
#> SRR1974973 2 0.0376 0.88256 0.004 0.996
#> SRR1974972 1 0.6247 0.80033 0.844 0.156
#> SRR1974971 2 0.1843 0.88542 0.028 0.972
#> SRR1974970 1 0.5842 0.82060 0.860 0.140
#> SRR1974969 1 0.4690 0.85840 0.900 0.100
#> SRR1974968 2 0.8327 0.71028 0.264 0.736
#> SRR1974967 1 0.4562 0.86491 0.904 0.096
#> SRR1974965 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.5737 0.84825 0.136 0.864
#> SRR1974964 1 0.5629 0.82729 0.868 0.132
#> SRR1974963 1 0.4022 0.87638 0.920 0.080
#> SRR1974961 1 0.9323 0.45844 0.652 0.348
#> SRR1974962 2 0.0672 0.88349 0.008 0.992
#> SRR1974960 1 0.3733 0.88162 0.928 0.072
#> SRR1974959 1 0.2423 0.90185 0.960 0.040
#> SRR1974958 2 0.4562 0.87303 0.096 0.904
#> SRR1974957 2 0.9686 0.44922 0.396 0.604
#> SRR1974956 1 0.7376 0.73232 0.792 0.208
#> SRR1974955 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.5408 0.83870 0.876 0.124
#> SRR1974953 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974952 1 0.6247 0.80384 0.844 0.156
#> SRR1974949 1 0.6623 0.78030 0.828 0.172
#> SRR1974950 2 0.9909 0.30391 0.444 0.556
#> SRR1974951 2 0.9608 0.47449 0.384 0.616
#> SRR1974947 1 0.9944 0.09239 0.544 0.456
#> SRR1974948 2 0.3274 0.88232 0.060 0.940
#> SRR1974946 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.3584 0.88515 0.932 0.068
#> SRR1974944 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.1184 0.91178 0.984 0.016
#> SRR1974943 2 0.9732 0.41811 0.404 0.596
#> SRR1974941 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.2236 0.90312 0.964 0.036
#> SRR1974939 2 0.8499 0.68899 0.276 0.724
#> SRR1974938 1 0.4298 0.87192 0.912 0.088
#> SRR1974937 1 0.1414 0.91037 0.980 0.020
#> SRR1974936 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.2948 0.89535 0.948 0.052
#> SRR1974934 2 0.1184 0.88480 0.016 0.984
#> SRR1974933 2 0.9358 0.55242 0.352 0.648
#> SRR1974932 1 0.2948 0.89505 0.948 0.052
#> SRR1974931 1 0.1184 0.91178 0.984 0.016
#> SRR1974930 1 0.1184 0.91178 0.984 0.016
#> SRR1974929 1 0.0672 0.91382 0.992 0.008
#> SRR1974928 2 0.3114 0.88450 0.056 0.944
#> SRR1974927 1 0.3733 0.88243 0.928 0.072
#> SRR1974924 1 0.0672 0.91411 0.992 0.008
#> SRR1974925 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.3114 0.89293 0.944 0.056
#> SRR1974922 1 0.4022 0.87677 0.920 0.080
#> SRR1974921 1 0.1414 0.91031 0.980 0.020
#> SRR1974920 1 0.0376 0.91485 0.996 0.004
#> SRR1974919 1 0.2948 0.89493 0.948 0.052
#> SRR1974918 1 0.1843 0.90731 0.972 0.028
#> SRR1974917 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.2236 0.90390 0.964 0.036
#> SRR1974915 1 0.2778 0.89720 0.952 0.048
#> SRR1974914 2 0.9170 0.61392 0.332 0.668
#> SRR1974913 1 0.1414 0.91053 0.980 0.020
#> SRR1974911 1 0.1414 0.91034 0.980 0.020
#> SRR1974910 1 0.0672 0.91407 0.992 0.008
#> SRR1974908 2 0.0672 0.88349 0.008 0.992
#> SRR1974909 1 0.2603 0.89933 0.956 0.044
#> SRR1974906 2 0.9608 0.47073 0.384 0.616
#> SRR1974907 1 0.4298 0.87184 0.912 0.088
#> SRR1974905 1 0.2423 0.90139 0.960 0.040
#> SRR1974904 2 0.8443 0.69471 0.272 0.728
#> SRR1974903 1 0.2948 0.89498 0.948 0.052
#> SRR1974902 2 0.8713 0.66182 0.292 0.708
#> SRR1974901 1 0.4161 0.87344 0.916 0.084
#> SRR1974898 2 0.0672 0.88349 0.008 0.992
#> SRR1974900 2 0.4298 0.88239 0.088 0.912
#> SRR1974899 2 0.2603 0.88791 0.044 0.956
#> SRR1974897 2 0.0672 0.88349 0.008 0.992
#> SRR1974896 2 0.5842 0.85692 0.140 0.860
#> SRR1974893 2 0.4022 0.88008 0.080 0.920
#> SRR1974895 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.5842 0.85703 0.140 0.860
#> SRR1974892 2 0.9608 0.50610 0.384 0.616
#> SRR1974890 2 0.9815 0.41027 0.420 0.580
#> SRR1974891 2 0.7528 0.78819 0.216 0.784
#> SRR1974889 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.5294 0.86907 0.120 0.880
#> SRR1974886 2 0.6973 0.81477 0.188 0.812
#> SRR1974887 2 0.9922 0.33002 0.448 0.552
#> SRR1974885 2 0.9922 0.33002 0.448 0.552
#> SRR1974883 2 0.6623 0.83124 0.172 0.828
#> SRR1974884 2 0.2603 0.88781 0.044 0.956
#> SRR1974881 2 0.7453 0.79374 0.212 0.788
#> SRR1974882 2 0.7219 0.80453 0.200 0.800
#> SRR1974880 2 0.3274 0.89026 0.060 0.940
#> SRR1974879 2 0.5059 0.87258 0.112 0.888
#> SRR1974877 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.9393 0.56470 0.356 0.644
#> SRR1974878 2 0.9635 0.49573 0.388 0.612
#> SRR1974875 2 0.9922 0.33002 0.448 0.552
#> SRR1974874 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974871 2 0.1633 0.88855 0.024 0.976
#> SRR1974872 1 0.8443 0.62730 0.728 0.272
#> SRR1974869 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.2236 0.88707 0.036 0.964
#> SRR1974866 2 0.1843 0.88746 0.028 0.972
#> SRR1974867 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.7056 0.75172 0.808 0.192
#> SRR1974862 2 0.1184 0.88670 0.016 0.984
#> SRR1974863 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974858 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.5059 0.87355 0.112 0.888
#> SRR1974857 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.9710 0.26729 0.600 0.400
#> SRR1974854 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.9795 0.22467 0.584 0.416
#> SRR1974852 2 0.2948 0.89008 0.052 0.948
#> SRR1974849 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.9993 0.20094 0.484 0.516
#> SRR1974846 2 0.5294 0.87004 0.120 0.880
#> SRR1974847 1 0.3431 0.88481 0.936 0.064
#> SRR1974845 2 0.3431 0.88955 0.064 0.936
#> SRR1974844 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6712 0.77153 0.824 0.176
#> SRR1974842 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974839 2 0.3431 0.88920 0.064 0.936
#> SRR1974838 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.3114 0.88974 0.056 0.944
#> SRR1974834 2 0.3431 0.88920 0.064 0.936
#> SRR1974833 1 0.9710 0.26729 0.600 0.400
#> SRR1974831 2 0.3584 0.88895 0.068 0.932
#> SRR1974832 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.3584 0.88895 0.068 0.932
#> SRR1974824 1 0.2236 0.90298 0.964 0.036
#> SRR1974825 1 0.2423 0.90020 0.960 0.040
#> SRR1974822 1 0.7139 0.74086 0.804 0.196
#> SRR1974823 2 0.9795 0.36491 0.416 0.584
#> SRR1974820 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7883 0.67598 0.764 0.236
#> SRR1974815 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.8909 0.65905 0.308 0.692
#> SRR1974812 1 0.9580 0.34778 0.620 0.380
#> SRR1974810 1 0.4690 0.85416 0.900 0.100
#> SRR1974808 2 0.2236 0.88707 0.036 0.964
#> SRR1974811 1 0.4690 0.85416 0.900 0.100
#> SRR1974809 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.9129 0.50307 0.672 0.328
#> SRR1974806 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.3584 0.88895 0.068 0.932
#> SRR1974804 1 0.9248 0.45338 0.660 0.340
#> SRR1974803 1 0.7453 0.71701 0.788 0.212
#> SRR1974801 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.7602 0.70882 0.780 0.220
#> SRR1974799 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.2948 0.89008 0.052 0.948
#> SRR1974796 2 0.3733 0.88824 0.072 0.928
#> SRR1974795 2 0.3584 0.88895 0.068 0.932
#> SRR1974793 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.3431 0.88951 0.064 0.936
#> SRR1974791 2 0.3431 0.88920 0.064 0.936
#> SRR1974790 2 0.2948 0.89008 0.052 0.948
#> SRR1974789 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.4562 0.85886 0.904 0.096
#> SRR1974787 1 0.6801 0.76710 0.820 0.180
#> SRR1974784 2 0.2603 0.89110 0.044 0.956
#> SRR1974783 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.2236 0.90241 0.964 0.036
#> SRR1974782 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.2603 0.89110 0.044 0.956
#> SRR1974780 1 0.7815 0.69148 0.768 0.232
#> SRR1974779 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.7745 0.70030 0.772 0.228
#> SRR1974778 1 0.0376 0.91479 0.996 0.004
#> SRR1974774 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1843 0.88935 0.028 0.972
#> SRR1974770 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.3431 0.88920 0.064 0.936
#> SRR1974768 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.8267 0.64300 0.740 0.260
#> SRR1974766 2 0.0938 0.88548 0.012 0.988
#> SRR1974765 2 0.2948 0.89008 0.052 0.948
#> SRR1974764 2 0.0938 0.88548 0.012 0.988
#> SRR1974763 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0376 0.88286 0.004 0.996
#> SRR1974760 2 0.3584 0.88895 0.068 0.932
#> SRR1974759 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.2423 0.89034 0.040 0.960
#> SRR1974756 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974755 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.4431 0.88169 0.092 0.908
#> SRR1974751 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974750 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974752 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.8661 0.66799 0.288 0.712
#> SRR1974747 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.2948 0.89107 0.052 0.948
#> SRR1974745 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974743 2 0.4815 0.87711 0.104 0.896
#> SRR1974742 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.2236 0.89059 0.036 0.964
#> SRR1974739 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974741 2 0.3733 0.88787 0.072 0.928
#> SRR1974738 2 0.2778 0.89170 0.048 0.952
#> SRR1974737 2 0.5059 0.87355 0.112 0.888
#> SRR1974736 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974735 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.7745 0.77019 0.228 0.772
#> SRR1974733 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974732 2 0.6148 0.85022 0.152 0.848
#> SRR1974731 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974729 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0376 0.91487 0.996 0.004
#> SRR1974728 2 0.4815 0.87711 0.104 0.896
#> SRR1974725 2 0.8763 0.67621 0.296 0.704
#> SRR1974726 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974724 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.2948 0.88634 0.052 0.948
#> SRR1974723 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974722 2 0.6531 0.83854 0.168 0.832
#> SRR1974721 2 0.0672 0.88314 0.008 0.992
#> SRR1974720 2 0.7674 0.78183 0.224 0.776
#> SRR1974719 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.6048 0.84183 0.148 0.852
#> SRR1974717 2 0.3114 0.89105 0.056 0.944
#> SRR1974715 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974713 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.4939 0.86803 0.108 0.892
#> SRR1974711 2 0.4562 0.87572 0.096 0.904
#> SRR1974712 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.2423 0.88669 0.040 0.960
#> SRR1974707 1 0.9754 0.26927 0.592 0.408
#> SRR1974706 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.3431 0.88959 0.064 0.936
#> SRR1974702 1 0.2778 0.89573 0.952 0.048
#> SRR1974701 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974699 2 0.1843 0.88957 0.028 0.972
#> SRR1974698 2 0.5059 0.87355 0.112 0.888
#> SRR1974700 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.9970 0.23999 0.468 0.532
#> SRR1974696 2 0.5294 0.87048 0.120 0.880
#> SRR1974694 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.4298 0.87634 0.088 0.912
#> SRR1974693 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974692 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974690 2 0.2043 0.88947 0.032 0.968
#> SRR1974691 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974688 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974687 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0376 0.91477 0.996 0.004
#> SRR1974682 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974681 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.5519 0.86534 0.128 0.872
#> SRR1974680 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974677 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0938 0.88548 0.012 0.988
#> SRR1974668 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.8763 0.57834 0.704 0.296
#> SRR1974662 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.4022 0.88145 0.080 0.920
#> SRR1974660 1 0.0672 0.91395 0.992 0.008
#> SRR1974659 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.6712 0.77632 0.824 0.176
#> SRR1974654 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.4815 0.85241 0.896 0.104
#> SRR1974656 2 0.7815 0.75493 0.232 0.768
#> SRR1974650 2 0.5629 0.85139 0.132 0.868
#> SRR1974651 2 0.4562 0.88028 0.096 0.904
#> SRR1974652 1 0.7883 0.68625 0.764 0.236
#> SRR1974653 2 0.5294 0.86962 0.120 0.880
#> SRR1974648 2 0.9933 0.28130 0.452 0.548
#> SRR1974646 2 0.5294 0.85967 0.120 0.880
#> SRR1974649 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.4562 0.88028 0.096 0.904
#> SRR1974645 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.3733 0.88351 0.072 0.928
#> SRR1974640 2 0.5178 0.86362 0.116 0.884
#> SRR1974641 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.5294 0.86046 0.120 0.880
#> SRR1974634 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.4161 0.88453 0.084 0.916
#> SRR1974633 2 0.9608 0.46982 0.384 0.616
#> SRR1974632 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.6887 0.80894 0.184 0.816
#> SRR1974630 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.3431 0.88508 0.936 0.064
#> SRR1974624 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.2778 0.88644 0.048 0.952
#> SRR1974622 1 0.9983 0.00752 0.524 0.476
#> SRR1974620 2 0.5519 0.85413 0.128 0.872
#> SRR1974619 2 0.5178 0.86383 0.116 0.884
#> SRR1974621 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.9710 0.28366 0.600 0.400
#> SRR1974615 1 0.1633 0.90835 0.976 0.024
#> SRR1974618 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.9933 0.14392 0.548 0.452
#> SRR1974613 2 0.6343 0.83138 0.160 0.840
#> SRR1974612 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.2236 0.88689 0.036 0.964
#> SRR1974610 2 0.3114 0.89075 0.056 0.944
#> SRR1974609 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.9427 0.55475 0.360 0.640
#> SRR1974607 1 0.1414 0.90990 0.980 0.020
#> SRR1974606 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974605 2 0.9460 0.54793 0.364 0.636
#> SRR1974604 2 0.5178 0.87171 0.116 0.884
#> SRR1974603 1 1.0000 -0.08203 0.504 0.496
#> SRR1974602 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2236 0.89097 0.036 0.964
#> SRR1974601 2 0.2603 0.88768 0.044 0.956
#> SRR1974599 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0376 0.88276 0.004 0.996
#> SRR1974594 2 0.7674 0.78157 0.224 0.776
#> SRR1974593 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.1633 0.88823 0.024 0.976
#> SRR1974592 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.7815 0.77237 0.232 0.768
#> SRR1974590 2 0.1184 0.88652 0.016 0.984
#> SRR1974589 2 0.6531 0.83547 0.168 0.832
#> SRR1974587 2 0.7299 0.80081 0.204 0.796
#> SRR1974586 2 0.0376 0.88287 0.004 0.996
#> SRR1974585 2 0.7674 0.78157 0.224 0.776
#> SRR1974584 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.7602 0.78609 0.220 0.780
#> SRR1974578 2 0.7674 0.78157 0.224 0.776
#> SRR1974577 2 0.7883 0.73664 0.236 0.764
#> SRR1974579 2 0.7299 0.80081 0.204 0.796
#> SRR1974576 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974573 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974571 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974572 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974570 1 0.6247 0.79885 0.844 0.156
#> SRR1974568 1 0.3733 0.88078 0.928 0.072
#> SRR1974567 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974569 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974565 2 0.7745 0.77670 0.228 0.772
#> SRR1974564 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974560 1 0.6048 0.80929 0.852 0.148
#> SRR1974559 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974562 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974561 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974557 2 0.0000 0.88135 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974555 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
#> SRR1974554 1 0.9248 0.47708 0.660 0.340
#> SRR1974558 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0376 0.91488 0.996 0.004
#> SRR1974550 2 0.2236 0.88855 0.036 0.964
#> SRR1974549 2 0.2948 0.89051 0.052 0.948
#> SRR1974548 2 0.2948 0.89112 0.052 0.948
#> SRR1974547 2 0.9608 0.46283 0.384 0.616
#> SRR1974546 2 0.9988 0.15908 0.480 0.520
#> SRR1974545 2 0.2423 0.89000 0.040 0.960
#> SRR1974544 1 0.0000 0.91568 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.2778 0.89071 0.048 0.952
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 1 0.4654 0.79689 0.792 0.208 0.000
#> SRR1975008 3 0.5831 0.56898 0.008 0.284 0.708
#> SRR1975006 3 0.3267 0.73504 0.000 0.116 0.884
#> SRR1975005 1 0.9797 0.22620 0.404 0.356 0.240
#> SRR1975004 1 0.5919 0.75674 0.724 0.260 0.016
#> SRR1975003 3 0.6677 0.48564 0.024 0.324 0.652
#> SRR1975001 3 0.2537 0.74421 0.000 0.080 0.920
#> SRR1975002 3 0.3116 0.73170 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974999 3 0.6685 0.56842 0.048 0.244 0.708
#> SRR1975000 1 0.4702 0.79530 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974998 1 0.5406 0.78550 0.764 0.224 0.012
#> SRR1974997 2 0.7032 0.14940 0.368 0.604 0.028
#> SRR1974995 3 0.9522 0.05041 0.188 0.400 0.412
#> SRR1974996 1 0.4978 0.79202 0.780 0.216 0.004
#> SRR1974994 1 0.4504 0.80083 0.804 0.196 0.000
#> SRR1974993 1 0.8553 0.54802 0.552 0.336 0.112
#> SRR1974992 1 0.9537 0.32285 0.444 0.360 0.196
#> SRR1974990 1 0.4555 0.79930 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974989 2 0.6407 0.40403 0.272 0.700 0.028
#> SRR1974991 1 0.9707 0.27818 0.424 0.352 0.224
#> SRR1974986 1 0.4605 0.79777 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974987 2 0.9805 0.00586 0.240 0.396 0.364
#> SRR1974988 1 0.6527 0.69572 0.660 0.320 0.020
#> SRR1974984 1 0.9353 0.31543 0.444 0.388 0.168
#> SRR1974985 1 0.4834 0.79648 0.792 0.204 0.004
#> SRR1974983 3 0.3619 0.71884 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974982 1 0.5024 0.79040 0.776 0.220 0.004
#> SRR1974981 1 0.4555 0.79930 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974980 1 0.4842 0.78972 0.776 0.224 0.000
#> SRR1974979 2 0.9707 0.02946 0.228 0.432 0.340
#> SRR1974978 1 0.4702 0.79535 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974977 1 0.4750 0.79430 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974976 3 0.9068 0.11070 0.136 0.420 0.444
#> SRR1974975 1 0.9627 0.20136 0.400 0.396 0.204
#> SRR1974974 3 0.5884 0.57793 0.012 0.272 0.716
#> SRR1974973 3 0.1411 0.74655 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974972 1 0.7402 0.65142 0.624 0.324 0.052
#> SRR1974971 3 0.3116 0.73483 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974970 1 0.7065 0.67711 0.644 0.316 0.040
#> SRR1974969 1 0.6597 0.73655 0.696 0.268 0.036
#> SRR1974968 3 0.8100 0.24737 0.068 0.420 0.512
#> SRR1974967 1 0.6539 0.72377 0.684 0.288 0.028
#> SRR1974965 1 0.4605 0.79791 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974966 3 0.6313 0.51867 0.016 0.308 0.676
#> SRR1974964 1 0.6935 0.68719 0.652 0.312 0.036
#> SRR1974963 1 0.6129 0.73943 0.700 0.284 0.016
#> SRR1974961 1 0.9425 0.28595 0.432 0.392 0.176
#> SRR1974962 3 0.1753 0.74672 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974960 1 0.5797 0.74408 0.712 0.280 0.008
#> SRR1974959 1 0.5325 0.77316 0.748 0.248 0.004
#> SRR1974958 3 0.5404 0.60197 0.004 0.256 0.740
#> SRR1974957 2 0.9425 -0.04811 0.176 0.432 0.392
#> SRR1974956 1 0.8037 0.57928 0.572 0.352 0.076
#> SRR1974955 1 0.4555 0.79930 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974954 1 0.6880 0.69583 0.660 0.304 0.036
#> SRR1974953 3 0.1411 0.74777 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974952 1 0.7310 0.65716 0.628 0.324 0.048
#> SRR1974949 1 0.7513 0.62109 0.604 0.344 0.052
#> SRR1974950 2 0.9700 0.01311 0.224 0.428 0.348
#> SRR1974951 2 0.9364 -0.05360 0.168 0.432 0.400
#> SRR1974947 2 0.9858 0.01684 0.328 0.408 0.264
#> SRR1974948 3 0.4293 0.69905 0.004 0.164 0.832
#> SRR1974946 3 0.0000 0.73847 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.5992 0.75272 0.716 0.268 0.016
#> SRR1974944 1 0.4504 0.80083 0.804 0.196 0.000
#> SRR1974942 1 0.4750 0.79412 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974943 2 0.9674 -0.04283 0.212 0.396 0.392
#> SRR1974941 1 0.4702 0.79570 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974940 1 0.5285 0.77400 0.752 0.244 0.004
#> SRR1974939 3 0.8543 0.21806 0.096 0.408 0.496
#> SRR1974938 1 0.6082 0.73141 0.692 0.296 0.012
#> SRR1974937 1 0.4796 0.79276 0.780 0.220 0.000
#> SRR1974936 1 0.4555 0.79930 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974935 1 0.5618 0.76323 0.732 0.260 0.008
#> SRR1974934 3 0.3340 0.72741 0.000 0.120 0.880
#> SRR1974933 2 0.9108 -0.08044 0.140 0.444 0.416
#> SRR1974932 1 0.5580 0.76460 0.736 0.256 0.008
#> SRR1974931 1 0.4750 0.79412 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974930 1 0.4750 0.79412 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974929 1 0.4702 0.79479 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974928 3 0.4233 0.70502 0.004 0.160 0.836
#> SRR1974927 1 0.5919 0.74919 0.712 0.276 0.012
#> SRR1974924 1 0.4654 0.79673 0.792 0.208 0.000
#> SRR1974925 1 0.4555 0.79930 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974926 1 0.4504 0.80083 0.804 0.196 0.000
#> SRR1974923 1 0.6025 0.77214 0.740 0.232 0.028
#> SRR1974922 1 0.6019 0.73731 0.700 0.288 0.012
#> SRR1974921 1 0.4931 0.78482 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974920 1 0.4605 0.79854 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974919 1 0.5443 0.76423 0.736 0.260 0.004
#> SRR1974918 1 0.5016 0.78050 0.760 0.240 0.000
#> SRR1974917 3 0.0237 0.74027 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974916 1 0.5285 0.77567 0.752 0.244 0.004
#> SRR1974915 1 0.5404 0.76642 0.740 0.256 0.004
#> SRR1974914 2 0.6788 0.50461 0.136 0.744 0.120
#> SRR1974913 1 0.4978 0.79113 0.780 0.216 0.004
#> SRR1974911 1 0.4978 0.79301 0.780 0.216 0.004
#> SRR1974910 1 0.4654 0.79705 0.792 0.208 0.000
#> SRR1974908 3 0.2537 0.74107 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974909 1 0.5365 0.76962 0.744 0.252 0.004
#> SRR1974906 2 0.9522 -0.05736 0.188 0.408 0.404
#> SRR1974907 1 0.6082 0.73103 0.692 0.296 0.012
#> SRR1974905 1 0.5325 0.77205 0.748 0.248 0.004
#> SRR1974904 3 0.8363 0.23084 0.084 0.412 0.504
#> SRR1974903 1 0.5480 0.76159 0.732 0.264 0.004
#> SRR1974902 3 0.8671 0.19392 0.104 0.416 0.480
#> SRR1974901 1 0.6355 0.73789 0.696 0.280 0.024
#> SRR1974898 3 0.2878 0.73662 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974900 3 0.6282 0.39128 0.004 0.384 0.612
#> SRR1974899 3 0.4399 0.68014 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974897 3 0.2448 0.74119 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974896 2 0.6416 0.34712 0.008 0.616 0.376
#> SRR1974893 3 0.5517 0.60351 0.004 0.268 0.728
#> SRR1974895 3 0.0000 0.73847 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.6264 0.32971 0.004 0.616 0.380
#> SRR1974892 2 0.6295 0.47787 0.164 0.764 0.072
#> SRR1974890 2 0.5987 0.46264 0.208 0.756 0.036
#> SRR1974891 2 0.6737 0.46749 0.040 0.688 0.272
#> SRR1974889 3 0.0424 0.74221 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974888 2 0.6309 -0.06755 0.000 0.500 0.500
#> SRR1974886 2 0.6803 0.50973 0.040 0.680 0.280
#> SRR1974887 2 0.6067 0.43873 0.236 0.736 0.028
#> SRR1974885 2 0.6067 0.43873 0.236 0.736 0.028
#> SRR1974883 2 0.6448 0.34183 0.012 0.636 0.352
#> SRR1974884 3 0.4002 0.70606 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974881 2 0.6521 0.51534 0.040 0.712 0.248
#> SRR1974882 2 0.6562 0.51090 0.036 0.700 0.264
#> SRR1974880 3 0.5905 0.41292 0.000 0.352 0.648
#> SRR1974879 2 0.6305 0.01390 0.000 0.516 0.484
#> SRR1974877 3 0.0424 0.74221 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974876 2 0.6737 0.49072 0.156 0.744 0.100
#> SRR1974878 2 0.6138 0.47988 0.172 0.768 0.060
#> SRR1974875 2 0.6067 0.43873 0.236 0.736 0.028
#> SRR1974874 3 0.2878 0.73951 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974873 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974871 3 0.6140 0.10155 0.000 0.404 0.596
#> SRR1974872 1 0.7777 0.60510 0.676 0.160 0.164
#> SRR1974869 3 0.1860 0.74856 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974868 3 0.3038 0.74051 0.000 0.104 0.896
#> SRR1974870 3 0.3769 0.73656 0.016 0.104 0.880
#> SRR1974866 3 0.3845 0.73195 0.012 0.116 0.872
#> SRR1974867 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 3 0.1289 0.74719 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974864 1 0.6383 0.72378 0.768 0.128 0.104
#> SRR1974862 3 0.6154 0.06802 0.000 0.408 0.592
#> SRR1974863 3 0.0892 0.74359 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974860 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974861 3 0.0747 0.74402 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974859 2 0.5580 0.68064 0.008 0.736 0.256
#> SRR1974858 3 0.0892 0.74359 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974856 2 0.5335 0.68802 0.008 0.760 0.232
#> SRR1974857 3 0.1031 0.74542 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974855 2 0.7571 -0.05027 0.452 0.508 0.040
#> SRR1974854 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.7841 0.06693 0.480 0.468 0.052
#> SRR1974852 2 0.5431 0.65239 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974849 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7786 0.36966 0.332 0.600 0.068
#> SRR1974846 2 0.5202 0.69106 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974847 1 0.3112 0.82908 0.916 0.056 0.028
#> SRR1974845 2 0.5254 0.66435 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974844 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6100 0.73867 0.784 0.120 0.096
#> SRR1974842 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974839 2 0.5254 0.66471 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974838 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.5397 0.65619 0.000 0.720 0.280
#> SRR1974834 2 0.5254 0.66471 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974833 2 0.7571 -0.05027 0.452 0.508 0.040
#> SRR1974831 2 0.5216 0.66656 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974832 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 3 0.2165 0.75139 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974827 2 0.5216 0.66656 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974824 1 0.1832 0.84148 0.956 0.036 0.008
#> SRR1974825 1 0.2492 0.83982 0.936 0.048 0.016
#> SRR1974822 1 0.5687 0.68598 0.756 0.224 0.020
#> SRR1974823 3 0.9326 0.13364 0.396 0.164 0.440
#> SRR1974820 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.6880 0.57352 0.660 0.304 0.036
#> SRR1974815 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.7875 0.54636 0.200 0.664 0.136
#> SRR1974812 1 0.7948 0.19971 0.520 0.420 0.060
#> SRR1974810 1 0.3784 0.78788 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974808 3 0.3769 0.73695 0.016 0.104 0.880
#> SRR1974811 1 0.3784 0.78788 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974809 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.8271 0.48546 0.632 0.212 0.156
#> SRR1974806 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.5216 0.66656 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974804 1 0.7487 0.31430 0.552 0.408 0.040
#> SRR1974803 1 0.6161 0.62705 0.708 0.272 0.020
#> SRR1974801 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.6915 0.68377 0.736 0.140 0.124
#> SRR1974799 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 3 0.2959 0.74258 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974797 2 0.5465 0.65039 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974796 2 0.5178 0.66809 0.000 0.744 0.256
#> SRR1974795 2 0.5216 0.66656 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974793 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974792 2 0.5291 0.66293 0.000 0.732 0.268
#> SRR1974791 2 0.5254 0.66471 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974790 2 0.5431 0.65259 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974789 3 0.2959 0.74130 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974788 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974786 1 0.3967 0.80932 0.884 0.072 0.044
#> SRR1974787 1 0.6128 0.73746 0.780 0.136 0.084
#> SRR1974784 2 0.6045 0.52165 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974783 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.2269 0.84197 0.944 0.040 0.016
#> SRR1974782 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.6111 0.49445 0.000 0.604 0.396
#> SRR1974780 1 0.7102 0.67183 0.724 0.144 0.132
#> SRR1974779 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.6981 0.68175 0.732 0.132 0.136
#> SRR1974778 1 0.0475 0.85321 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974774 3 0.3752 0.71760 0.000 0.144 0.856
#> SRR1974773 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 3 0.5928 0.49168 0.008 0.296 0.696
#> SRR1974770 3 0.3816 0.71506 0.000 0.148 0.852
#> SRR1974769 2 0.5254 0.66471 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974768 3 0.4121 0.69887 0.000 0.168 0.832
#> SRR1974767 1 0.7509 0.63050 0.696 0.152 0.152
#> SRR1974766 3 0.4931 0.62296 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974765 2 0.5465 0.64969 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974764 3 0.4931 0.62296 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974763 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 3 0.4399 0.67674 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974760 2 0.5216 0.66656 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974759 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 3 0.4062 0.70232 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974757 2 0.6235 0.39962 0.000 0.564 0.436
#> SRR1974756 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974755 3 0.3816 0.71506 0.000 0.148 0.852
#> SRR1974753 2 0.5733 0.62970 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974751 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974750 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974752 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 3 0.9644 0.05769 0.256 0.276 0.468
#> SRR1974747 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974748 1 0.0237 0.85370 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.6225 0.44504 0.000 0.568 0.432
#> SRR1974745 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974743 2 0.5541 0.68186 0.008 0.740 0.252
#> SRR1974742 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974740 3 0.6305 -0.19836 0.000 0.484 0.516
#> SRR1974739 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974741 2 0.5982 0.62990 0.004 0.668 0.328
#> SRR1974738 2 0.6516 0.30563 0.004 0.516 0.480
#> SRR1974737 2 0.5420 0.68591 0.008 0.752 0.240
#> SRR1974736 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974735 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.9108 -0.10874 0.140 0.416 0.444
#> SRR1974733 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974732 2 0.5951 0.68408 0.040 0.764 0.196
#> SRR1974731 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974729 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0747 0.85236 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974728 2 0.5656 0.67727 0.008 0.728 0.264
#> SRR1974725 2 0.9063 0.47628 0.200 0.552 0.248
#> SRR1974726 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974724 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 3 0.4249 0.73390 0.028 0.108 0.864
#> SRR1974723 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974722 2 0.6586 0.67418 0.056 0.728 0.216
#> SRR1974721 3 0.3879 0.69874 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974720 2 0.8255 0.58251 0.128 0.620 0.252
#> SRR1974719 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 3 0.7360 0.56608 0.096 0.212 0.692
#> SRR1974717 2 0.6410 0.48477 0.004 0.576 0.420
#> SRR1974715 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974713 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.6595 0.63541 0.076 0.180 0.744
#> SRR1974711 3 0.6001 0.67076 0.052 0.176 0.772
#> SRR1974712 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.2165 0.74700 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974710 3 0.3987 0.73431 0.020 0.108 0.872
#> SRR1974707 1 0.9042 0.31313 0.544 0.176 0.280
#> SRR1974706 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.6330 0.53192 0.004 0.600 0.396
#> SRR1974702 1 0.2663 0.83784 0.932 0.044 0.024
#> SRR1974701 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974699 3 0.5968 0.27236 0.000 0.364 0.636
#> SRR1974698 2 0.5335 0.68838 0.008 0.760 0.232
#> SRR1974700 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.9402 0.09542 0.412 0.172 0.416
#> SRR1974696 2 0.7748 0.29768 0.048 0.500 0.452
#> SRR1974694 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974695 3 0.6098 0.65952 0.056 0.176 0.768
#> SRR1974693 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974692 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974690 2 0.6309 0.29318 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974691 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974689 2 0.5292 0.68949 0.008 0.764 0.228
#> SRR1974688 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974687 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0237 0.85354 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0592 0.85111 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974682 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974681 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.5366 0.69029 0.016 0.776 0.208
#> SRR1974680 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974677 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 3 0.3551 0.72669 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974675 3 0.1529 0.74810 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974674 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 3 0.1753 0.74881 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974671 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974672 3 0.0892 0.74359 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974670 3 0.0892 0.74359 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974669 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974667 3 0.4931 0.62296 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974668 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974666 3 0.2878 0.74277 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974664 3 0.0892 0.74359 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974665 3 0.3619 0.72382 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974663 1 0.8052 0.55645 0.652 0.152 0.196
#> SRR1974662 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.5688 0.67559 0.044 0.168 0.788
#> SRR1974660 1 0.0661 0.85255 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974659 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5804 0.74415 0.800 0.088 0.112
#> SRR1974654 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.4165 0.80461 0.876 0.076 0.048
#> SRR1974656 3 0.8076 0.46901 0.180 0.168 0.652
#> SRR1974650 3 0.7078 0.59977 0.088 0.200 0.712
#> SRR1974651 2 0.5588 0.67168 0.004 0.720 0.276
#> SRR1974652 1 0.7278 0.65750 0.712 0.152 0.136
#> SRR1974653 2 0.5156 0.69087 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974648 3 0.9370 0.10098 0.412 0.168 0.420
#> SRR1974646 3 0.6297 0.66431 0.060 0.184 0.756
#> SRR1974649 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.5553 0.67426 0.004 0.724 0.272
#> SRR1974645 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 3 0.3752 0.71760 0.000 0.144 0.856
#> SRR1974643 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.5466 0.68623 0.040 0.160 0.800
#> SRR1974640 3 0.6511 0.63808 0.072 0.180 0.748
#> SRR1974641 3 0.3686 0.72214 0.000 0.140 0.860
#> SRR1974639 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.6710 0.61757 0.072 0.196 0.732
#> SRR1974634 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.5845 0.65080 0.004 0.688 0.308
#> SRR1974633 3 0.9527 0.15753 0.332 0.204 0.464
#> SRR1974632 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.7785 0.53165 0.136 0.192 0.672
#> SRR1974630 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.3009 0.82930 0.920 0.052 0.028
#> SRR1974624 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 3 0.0000 0.73847 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974623 3 0.4618 0.71871 0.024 0.136 0.840
#> SRR1974622 1 0.9224 0.08100 0.480 0.160 0.360
#> SRR1974620 3 0.6783 0.62011 0.088 0.176 0.736
#> SRR1974619 3 0.7021 0.59426 0.076 0.216 0.708
#> SRR1974621 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.8050 0.12857 0.500 0.436 0.064
#> SRR1974615 1 0.1031 0.84639 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.9335 0.21192 0.492 0.184 0.324
#> SRR1974613 3 0.7297 0.57493 0.120 0.172 0.708
#> SRR1974612 1 0.0424 0.85325 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974611 3 0.3846 0.73698 0.016 0.108 0.876
#> SRR1974610 2 0.6215 0.46878 0.000 0.572 0.428
#> SRR1974609 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.9125 0.42243 0.268 0.540 0.192
#> SRR1974607 1 0.1399 0.84567 0.968 0.028 0.004
#> SRR1974606 3 0.3116 0.74014 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974605 2 0.9474 0.37487 0.272 0.496 0.232
#> SRR1974604 2 0.5202 0.69041 0.008 0.772 0.220
#> SRR1974603 1 0.9594 -0.01364 0.436 0.204 0.360
#> SRR1974602 1 0.0000 0.85419 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 3 0.5690 0.46880 0.004 0.288 0.708
#> SRR1974601 3 0.4413 0.72369 0.024 0.124 0.852
#> SRR1974599 3 0.2796 0.74293 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974598 3 0.2796 0.74293 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974596 3 0.3412 0.73828 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974594 2 0.6181 0.64881 0.072 0.772 0.156
#> SRR1974593 3 0.2711 0.74567 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974595 3 0.5988 0.19109 0.000 0.368 0.632
#> SRR1974592 3 0.2878 0.74329 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974591 3 0.2796 0.74293 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974588 2 0.6349 0.64281 0.080 0.764 0.156
#> SRR1974590 3 0.5465 0.44750 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974589 2 0.7274 0.60617 0.052 0.644 0.304
#> SRR1974587 2 0.6192 0.65461 0.060 0.764 0.176
#> SRR1974586 3 0.2711 0.74595 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974585 2 0.6181 0.64881 0.072 0.772 0.156
#> SRR1974584 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974583 3 0.2537 0.74817 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974582 3 0.2796 0.74293 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974581 3 0.1753 0.75078 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974580 2 0.6151 0.65065 0.068 0.772 0.160
#> SRR1974578 2 0.6181 0.64881 0.072 0.772 0.156
#> SRR1974577 3 0.8763 0.38377 0.216 0.196 0.588
#> SRR1974579 2 0.6192 0.65461 0.060 0.764 0.176
#> SRR1974576 3 0.1753 0.75078 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974575 3 0.2878 0.74329 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974574 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974573 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974571 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974572 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974570 1 0.5505 0.76476 0.816 0.096 0.088
#> SRR1974568 1 0.3155 0.81965 0.916 0.040 0.044
#> SRR1974567 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974566 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974569 2 0.5810 0.60846 0.000 0.664 0.336
#> SRR1974565 2 0.6266 0.64604 0.076 0.768 0.156
#> SRR1974564 2 0.6026 0.56671 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974560 1 0.5004 0.76017 0.840 0.072 0.088
#> SRR1974559 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974563 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974562 2 0.6026 0.56671 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974561 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974557 3 0.1163 0.74615 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974553 2 0.5785 0.61327 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974555 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974551 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974552 2 0.5835 0.61061 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974554 1 0.7979 0.47849 0.640 0.112 0.248
#> SRR1974558 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974556 1 0.0424 0.85184 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974550 3 0.4209 0.72332 0.016 0.128 0.856
#> SRR1974549 2 0.5760 0.61791 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974548 2 0.6057 0.60559 0.004 0.656 0.340
#> SRR1974547 3 0.9964 -0.05904 0.352 0.292 0.356
#> SRR1974546 1 0.9021 -0.08677 0.452 0.132 0.416
#> SRR1974545 2 0.6168 0.51589 0.000 0.588 0.412
#> SRR1974544 1 0.0237 0.85319 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974543 2 0.5810 0.60946 0.000 0.664 0.336
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 1 0.0336 0.49000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975008 2 0.7366 -0.20804 0.108 0.532 0.340 0.020
#> SRR1975006 2 0.4896 0.43285 0.012 0.732 0.244 0.012
#> SRR1975005 1 0.6924 -0.47109 0.600 0.128 0.264 0.008
#> SRR1975004 1 0.2124 0.39973 0.924 0.008 0.068 0.000
#> SRR1975003 2 0.7797 -0.42457 0.148 0.480 0.352 0.020
#> SRR1975001 2 0.4574 0.46977 0.008 0.768 0.208 0.016
#> SRR1975002 2 0.5053 0.41494 0.012 0.732 0.236 0.020
#> SRR1974999 2 0.7386 -0.21511 0.128 0.544 0.312 0.016
#> SRR1975000 1 0.0469 0.48642 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974998 1 0.1209 0.45983 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1974997 1 0.7845 -0.20290 0.428 0.004 0.224 0.344
#> SRR1974995 3 0.8226 0.83526 0.360 0.264 0.364 0.012
#> SRR1974996 1 0.0707 0.47745 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974994 1 0.0188 0.50009 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974993 1 0.5139 -0.02274 0.748 0.052 0.196 0.004
#> SRR1974992 1 0.6600 -0.37797 0.640 0.116 0.236 0.008
#> SRR1974990 1 0.0000 0.49677 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.8040 0.04162 0.348 0.008 0.240 0.404
#> SRR1974991 1 0.6757 -0.42504 0.620 0.120 0.252 0.008
#> SRR1974986 1 0.0188 0.49326 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974987 1 0.8192 -0.83855 0.412 0.228 0.344 0.016
#> SRR1974988 1 0.3542 0.31264 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1974984 1 0.6418 -0.37951 0.640 0.088 0.264 0.008
#> SRR1974985 1 0.0336 0.48952 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974983 2 0.5713 0.34531 0.032 0.692 0.256 0.020
#> SRR1974982 1 0.0817 0.47406 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.49677 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0817 0.47374 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974979 1 0.8045 -0.84161 0.420 0.192 0.372 0.016
#> SRR1974978 1 0.0469 0.48673 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974977 1 0.0592 0.48216 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974976 3 0.8368 0.87586 0.308 0.268 0.404 0.020
#> SRR1974975 1 0.6938 -0.45601 0.592 0.096 0.296 0.016
#> SRR1974974 2 0.7398 -0.17574 0.104 0.536 0.336 0.024
#> SRR1974973 2 0.3727 0.51926 0.004 0.824 0.164 0.008
#> SRR1974972 1 0.3743 0.18633 0.824 0.016 0.160 0.000
#> SRR1974971 2 0.5205 0.43263 0.024 0.740 0.216 0.020
#> SRR1974970 1 0.3626 0.23976 0.844 0.016 0.136 0.004
#> SRR1974969 1 0.2891 0.36060 0.896 0.020 0.080 0.004
#> SRR1974968 3 0.8389 0.79768 0.236 0.336 0.404 0.024
#> SRR1974967 1 0.2714 0.33696 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1974965 1 0.0188 0.49335 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974966 2 0.7466 -0.34548 0.120 0.500 0.364 0.016
#> SRR1974964 1 0.3523 0.26182 0.848 0.008 0.136 0.008
#> SRR1974963 1 0.2466 0.36515 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR1974961 1 0.6519 -0.41102 0.628 0.080 0.280 0.012
#> SRR1974962 2 0.4005 0.50425 0.008 0.808 0.176 0.008
#> SRR1974960 1 0.2149 0.38196 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974959 1 0.1474 0.43770 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974958 2 0.6979 -0.07461 0.092 0.576 0.316 0.016
#> SRR1974957 3 0.8315 0.85340 0.368 0.232 0.380 0.020
#> SRR1974956 1 0.4727 0.05394 0.772 0.028 0.192 0.008
#> SRR1974955 1 0.0000 0.49677 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.3217 0.28344 0.860 0.012 0.128 0.000
#> SRR1974953 2 0.3591 0.51974 0.000 0.824 0.168 0.008
#> SRR1974952 1 0.3903 0.19901 0.824 0.012 0.156 0.008
#> SRR1974949 1 0.4205 0.13871 0.804 0.016 0.172 0.008
#> SRR1974950 1 0.8067 -0.85142 0.416 0.196 0.372 0.016
#> SRR1974951 3 0.8250 0.86313 0.356 0.240 0.388 0.016
#> SRR1974947 1 0.7420 -0.65582 0.516 0.132 0.340 0.012
#> SRR1974948 2 0.5880 0.29851 0.048 0.676 0.264 0.012
#> SRR1974946 2 0.2773 0.55700 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974945 1 0.2197 0.39671 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1974944 1 0.0188 0.50009 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974942 1 0.0592 0.48308 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974943 1 0.8242 -0.88910 0.376 0.236 0.372 0.016
#> SRR1974941 1 0.0469 0.48662 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974940 1 0.1389 0.44227 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974939 3 0.8339 0.83491 0.252 0.320 0.408 0.020
#> SRR1974938 1 0.2469 0.34989 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974937 1 0.0707 0.47880 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.49677 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.1792 0.41557 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974934 2 0.5231 0.39831 0.016 0.720 0.244 0.020
#> SRR1974933 3 0.8415 0.87712 0.324 0.248 0.404 0.024
#> SRR1974932 1 0.1824 0.42047 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1974931 1 0.0592 0.48308 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974930 1 0.0592 0.48308 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974929 1 0.0469 0.48588 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974928 2 0.6215 0.30081 0.052 0.668 0.256 0.024
#> SRR1974927 1 0.2266 0.38457 0.912 0.004 0.084 0.000
#> SRR1974924 1 0.0336 0.48964 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.49677 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0188 0.50009 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974923 1 0.1854 0.44101 0.940 0.012 0.048 0.000
#> SRR1974922 1 0.2345 0.36556 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974921 1 0.1022 0.46372 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974920 1 0.0188 0.49413 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974919 1 0.1716 0.42158 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974918 1 0.1211 0.45508 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974917 2 0.2999 0.55199 0.000 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974916 1 0.1389 0.44378 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974915 1 0.1637 0.42701 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974914 4 0.9140 0.04340 0.236 0.084 0.268 0.412
#> SRR1974913 1 0.0707 0.47692 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974911 1 0.0707 0.47893 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974910 1 0.0336 0.49023 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974908 2 0.4682 0.45462 0.008 0.764 0.208 0.020
#> SRR1974909 1 0.1557 0.43174 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974906 3 0.8263 0.85665 0.356 0.244 0.384 0.016
#> SRR1974907 1 0.2469 0.35002 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974905 1 0.1474 0.43805 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974904 3 0.8329 0.81243 0.244 0.332 0.404 0.020
#> SRR1974903 1 0.1792 0.41587 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974902 3 0.8347 0.85390 0.264 0.304 0.412 0.020
#> SRR1974901 1 0.2611 0.36409 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1974898 2 0.4862 0.43253 0.008 0.744 0.228 0.020
#> SRR1974900 2 0.8138 0.07540 0.040 0.492 0.316 0.152
#> SRR1974899 2 0.6234 0.23448 0.040 0.640 0.296 0.024
#> SRR1974897 2 0.4682 0.45408 0.008 0.764 0.208 0.020
#> SRR1974896 4 0.9302 -0.15125 0.084 0.328 0.260 0.328
#> SRR1974893 2 0.7354 0.05143 0.064 0.560 0.324 0.052
#> SRR1974895 2 0.2334 0.57568 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR1974894 4 0.9320 -0.17557 0.084 0.320 0.272 0.324
#> SRR1974892 4 0.8937 0.04379 0.272 0.060 0.260 0.408
#> SRR1974890 4 0.8135 0.09346 0.300 0.012 0.260 0.428
#> SRR1974891 4 0.9570 -0.08358 0.136 0.216 0.280 0.368
#> SRR1974889 2 0.2999 0.54752 0.000 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974888 2 0.9126 -0.16280 0.080 0.400 0.292 0.228
#> SRR1974886 4 0.9469 0.05725 0.124 0.240 0.244 0.392
#> SRR1974887 4 0.8068 0.07336 0.312 0.008 0.264 0.416
#> SRR1974885 4 0.8068 0.07336 0.312 0.008 0.264 0.416
#> SRR1974883 4 0.9497 -0.21068 0.104 0.276 0.300 0.320
#> SRR1974884 2 0.6131 0.30287 0.040 0.668 0.264 0.028
#> SRR1974881 4 0.9488 -0.00443 0.132 0.208 0.272 0.388
#> SRR1974882 4 0.9483 0.04003 0.128 0.228 0.252 0.392
#> SRR1974880 2 0.7571 0.35516 0.028 0.580 0.164 0.228
#> SRR1974879 2 0.8998 -0.13133 0.064 0.388 0.312 0.236
#> SRR1974877 2 0.2999 0.54752 0.000 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974876 4 0.9054 0.05620 0.248 0.072 0.272 0.408
#> SRR1974878 4 0.8709 0.07295 0.276 0.044 0.260 0.420
#> SRR1974875 4 0.8068 0.07336 0.312 0.008 0.264 0.416
#> SRR1974874 2 0.3577 0.61275 0.000 0.832 0.012 0.156
#> SRR1974873 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974871 4 0.5290 0.02619 0.000 0.476 0.008 0.516
#> SRR1974872 1 0.8952 0.47316 0.432 0.120 0.324 0.124
#> SRR1974869 2 0.3652 0.61272 0.000 0.856 0.052 0.092
#> SRR1974868 2 0.4100 0.59447 0.000 0.832 0.092 0.076
#> SRR1974870 2 0.5035 0.59699 0.012 0.784 0.068 0.136
#> SRR1974866 2 0.5182 0.59451 0.012 0.772 0.068 0.148
#> SRR1974867 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974865 2 0.2329 0.61664 0.000 0.916 0.012 0.072
#> SRR1974864 1 0.8170 0.59077 0.488 0.076 0.344 0.092
#> SRR1974862 4 0.5143 0.12842 0.000 0.456 0.004 0.540
#> SRR1974863 2 0.2021 0.61107 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1974860 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974861 2 0.1913 0.60690 0.000 0.940 0.040 0.020
#> SRR1974859 4 0.1978 0.70472 0.004 0.068 0.000 0.928
#> SRR1974858 2 0.2021 0.61107 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1974856 4 0.1211 0.70936 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974857 2 0.2101 0.61280 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR1974855 4 0.7354 0.11735 0.388 0.000 0.160 0.452
#> SRR1974854 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974853 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974851 4 0.7573 0.07505 0.332 0.000 0.208 0.460
#> SRR1974852 4 0.5010 0.66746 0.000 0.108 0.120 0.772
#> SRR1974849 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974848 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974850 4 0.6938 0.36493 0.260 0.004 0.144 0.592
#> SRR1974846 4 0.1356 0.71168 0.008 0.032 0.000 0.960
#> SRR1974847 1 0.6521 0.70489 0.536 0.016 0.404 0.044
#> SRR1974845 4 0.5033 0.67469 0.008 0.088 0.120 0.784
#> SRR1974844 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974843 1 0.7940 0.60475 0.488 0.060 0.364 0.088
#> SRR1974842 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974841 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974840 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974839 4 0.4892 0.67517 0.004 0.088 0.120 0.788
#> SRR1974838 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974837 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974835 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974836 4 0.4953 0.66950 0.000 0.104 0.120 0.776
#> SRR1974834 4 0.4892 0.67517 0.004 0.088 0.120 0.788
#> SRR1974833 4 0.7354 0.11735 0.388 0.000 0.160 0.452
#> SRR1974831 4 0.4969 0.67637 0.008 0.084 0.120 0.788
#> SRR1974832 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974830 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974829 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974828 1 0.5105 0.73591 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1974826 2 0.2924 0.62035 0.000 0.884 0.016 0.100
#> SRR1974827 4 0.4969 0.67637 0.008 0.084 0.120 0.788
#> SRR1974824 1 0.6086 0.71897 0.548 0.008 0.412 0.032
#> SRR1974825 1 0.6110 0.71697 0.552 0.012 0.408 0.028
#> SRR1974822 1 0.7610 0.54756 0.460 0.000 0.320 0.220
#> SRR1974823 2 0.9694 0.08298 0.196 0.376 0.240 0.188
#> SRR1974820 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974818 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974819 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974817 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974816 1 0.7530 0.41550 0.492 0.000 0.236 0.272
#> SRR1974815 1 0.4925 0.73676 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974813 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974814 4 0.5212 0.58251 0.144 0.008 0.080 0.768
#> SRR1974812 4 0.7687 -0.09109 0.348 0.000 0.224 0.428
#> SRR1974810 1 0.7113 0.64503 0.484 0.000 0.384 0.132
#> SRR1974808 2 0.5063 0.59735 0.012 0.780 0.064 0.144
#> SRR1974811 1 0.7113 0.64503 0.484 0.000 0.384 0.132
#> SRR1974809 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974807 1 0.9383 0.38360 0.396 0.112 0.264 0.228
#> SRR1974806 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974805 4 0.4969 0.67637 0.008 0.084 0.120 0.788
#> SRR1974804 1 0.7647 0.15492 0.404 0.000 0.208 0.388
#> SRR1974803 1 0.7704 0.48253 0.452 0.000 0.284 0.264
#> SRR1974801 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974800 1 0.8507 0.55497 0.468 0.084 0.332 0.116
#> SRR1974799 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974798 2 0.4093 0.59394 0.000 0.832 0.096 0.072
#> SRR1974797 4 0.5066 0.66569 0.000 0.112 0.120 0.768
#> SRR1974796 4 0.4914 0.67793 0.008 0.084 0.116 0.792
#> SRR1974795 4 0.4969 0.67637 0.008 0.084 0.120 0.788
#> SRR1974793 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974794 2 0.4022 0.59377 0.000 0.836 0.096 0.068
#> SRR1974792 4 0.5156 0.67353 0.008 0.096 0.120 0.776
#> SRR1974791 4 0.4892 0.67517 0.004 0.088 0.120 0.788
#> SRR1974790 4 0.5010 0.66738 0.000 0.108 0.120 0.772
#> SRR1974789 2 0.4093 0.59270 0.000 0.832 0.096 0.072
#> SRR1974788 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974786 1 0.6954 0.68358 0.524 0.024 0.392 0.060
#> SRR1974787 1 0.8010 0.60837 0.492 0.052 0.348 0.108
#> SRR1974784 4 0.6374 0.54971 0.004 0.224 0.116 0.656
#> SRR1974783 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974785 1 0.5928 0.72009 0.560 0.012 0.408 0.020
#> SRR1974782 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974781 4 0.6521 0.52014 0.004 0.244 0.116 0.636
#> SRR1974780 1 0.8629 0.54079 0.464 0.096 0.324 0.116
#> SRR1974779 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974777 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974776 1 0.8540 0.54696 0.460 0.092 0.340 0.108
#> SRR1974778 1 0.5112 0.73457 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR1974774 2 0.4780 0.57955 0.000 0.788 0.096 0.116
#> SRR1974773 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974775 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974772 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974771 2 0.6583 0.45394 0.008 0.628 0.100 0.264
#> SRR1974770 2 0.4834 0.57952 0.000 0.784 0.096 0.120
#> SRR1974769 4 0.4892 0.67517 0.004 0.088 0.120 0.788
#> SRR1974768 2 0.5102 0.56804 0.000 0.764 0.100 0.136
#> SRR1974767 1 0.8876 0.50140 0.440 0.112 0.324 0.124
#> SRR1974766 2 0.5803 0.52596 0.000 0.700 0.104 0.196
#> SRR1974765 4 0.5174 0.66520 0.000 0.124 0.116 0.760
#> SRR1974764 2 0.5803 0.52596 0.000 0.700 0.104 0.196
#> SRR1974763 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974762 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974761 2 0.5339 0.55762 0.000 0.744 0.100 0.156
#> SRR1974760 4 0.4969 0.67637 0.008 0.084 0.120 0.788
#> SRR1974759 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974758 2 0.5051 0.57071 0.000 0.768 0.100 0.132
#> SRR1974757 4 0.6522 0.46579 0.000 0.280 0.112 0.608
#> SRR1974756 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974754 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974755 2 0.4834 0.57952 0.000 0.784 0.096 0.120
#> SRR1974753 4 0.2868 0.67491 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1974751 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974750 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974752 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974749 2 0.9390 0.12233 0.156 0.392 0.148 0.304
#> SRR1974747 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974748 1 0.4925 0.73664 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974746 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974744 4 0.4220 0.56106 0.000 0.248 0.004 0.748
#> SRR1974745 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974743 4 0.1637 0.70623 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974742 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974740 4 0.4819 0.39856 0.000 0.344 0.004 0.652
#> SRR1974739 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974741 4 0.3052 0.67592 0.000 0.136 0.004 0.860
#> SRR1974738 4 0.4917 0.42727 0.004 0.328 0.004 0.664
#> SRR1974737 4 0.1576 0.70871 0.004 0.048 0.000 0.948
#> SRR1974736 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974735 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974734 4 0.8199 0.13901 0.072 0.324 0.104 0.500
#> SRR1974733 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974732 4 0.2221 0.70896 0.020 0.024 0.020 0.936
#> SRR1974731 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974729 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974730 1 0.4916 0.73301 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974728 4 0.1867 0.70327 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974725 4 0.6949 0.54276 0.108 0.100 0.104 0.688
#> SRR1974726 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974724 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974727 2 0.5499 0.59171 0.024 0.764 0.076 0.136
#> SRR1974723 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974722 4 0.2940 0.69813 0.028 0.036 0.028 0.908
#> SRR1974721 2 0.4453 0.56379 0.000 0.744 0.012 0.244
#> SRR1974720 4 0.5321 0.63392 0.056 0.080 0.072 0.792
#> SRR1974719 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974718 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974716 2 0.7612 0.46050 0.060 0.592 0.100 0.248
#> SRR1974717 4 0.4155 0.57975 0.000 0.240 0.004 0.756
#> SRR1974715 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974713 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974714 2 0.6977 0.50890 0.032 0.636 0.100 0.232
#> SRR1974711 2 0.6901 0.52543 0.044 0.656 0.088 0.212
#> SRR1974712 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974709 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974708 2 0.3840 0.61298 0.000 0.844 0.052 0.104
#> SRR1974710 2 0.5387 0.59064 0.016 0.764 0.076 0.144
#> SRR1974707 1 0.9796 0.19158 0.340 0.216 0.264 0.180
#> SRR1974706 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974704 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974705 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974703 4 0.3908 0.61038 0.000 0.212 0.004 0.784
#> SRR1974702 1 0.6272 0.71440 0.556 0.016 0.396 0.032
#> SRR1974701 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974699 2 0.5285 0.14800 0.000 0.524 0.008 0.468
#> SRR1974698 4 0.1211 0.70908 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974700 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974697 2 0.9728 0.00225 0.276 0.352 0.188 0.184
#> SRR1974696 4 0.6510 0.35381 0.024 0.320 0.048 0.608
#> SRR1974694 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974695 2 0.6686 0.52999 0.032 0.664 0.088 0.216
#> SRR1974693 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974692 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974690 4 0.6523 0.40430 0.000 0.348 0.088 0.564
#> SRR1974691 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974689 4 0.1398 0.71041 0.004 0.040 0.000 0.956
#> SRR1974688 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974687 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974686 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974685 1 0.5236 0.73493 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974684 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974683 1 0.5452 0.73256 0.556 0.000 0.428 0.016
#> SRR1974682 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974681 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974679 4 0.1486 0.71061 0.008 0.024 0.008 0.960
#> SRR1974680 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974678 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974677 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974676 2 0.4608 0.58428 0.000 0.800 0.096 0.104
#> SRR1974675 2 0.3545 0.52700 0.000 0.828 0.164 0.008
#> SRR1974674 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974673 2 0.3587 0.61224 0.000 0.860 0.052 0.088
#> SRR1974671 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974672 2 0.2021 0.61107 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1974670 2 0.2021 0.61107 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1974669 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974667 2 0.5803 0.52596 0.000 0.700 0.104 0.196
#> SRR1974668 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974666 2 0.3948 0.59397 0.000 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974664 2 0.2021 0.61107 0.000 0.932 0.012 0.056
#> SRR1974665 2 0.4667 0.58282 0.000 0.796 0.096 0.108
#> SRR1974663 1 0.9125 0.43277 0.412 0.136 0.324 0.128
#> SRR1974662 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974661 2 0.6447 0.53909 0.028 0.676 0.076 0.220
#> SRR1974660 1 0.5269 0.73466 0.564 0.004 0.428 0.004
#> SRR1974659 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974658 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974657 1 0.8219 0.60944 0.468 0.084 0.364 0.084
#> SRR1974654 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974655 1 0.7406 0.66782 0.480 0.036 0.412 0.072
#> SRR1974656 2 0.8503 0.35200 0.132 0.540 0.116 0.212
#> SRR1974650 2 0.7438 0.48448 0.056 0.612 0.100 0.232
#> SRR1974651 4 0.2081 0.70058 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1974652 1 0.8661 0.52768 0.460 0.092 0.324 0.124
#> SRR1974653 4 0.1256 0.71115 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974648 2 0.9802 0.01936 0.248 0.348 0.212 0.192
#> SRR1974646 2 0.7319 0.50005 0.072 0.644 0.100 0.184
#> SRR1974649 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974647 4 0.2011 0.70221 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1974645 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974644 2 0.4780 0.57955 0.000 0.788 0.096 0.116
#> SRR1974643 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974642 2 0.6349 0.54360 0.024 0.684 0.080 0.212
#> SRR1974640 2 0.7147 0.50125 0.052 0.632 0.084 0.232
#> SRR1974641 2 0.4360 0.57303 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR1974639 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974638 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974635 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974636 2 0.7195 0.49646 0.044 0.624 0.096 0.236
#> SRR1974634 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974637 4 0.2704 0.68427 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1974633 2 0.9633 0.09435 0.212 0.384 0.164 0.240
#> SRR1974632 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974631 2 0.8184 0.40814 0.100 0.556 0.104 0.240
#> SRR1974630 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974629 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974628 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974627 1 0.6718 0.70508 0.524 0.024 0.408 0.044
#> SRR1974624 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974625 2 0.1576 0.59253 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1974623 2 0.5864 0.57156 0.020 0.724 0.072 0.184
#> SRR1974622 2 0.9872 -0.04899 0.288 0.288 0.248 0.176
#> SRR1974620 2 0.7371 0.49548 0.060 0.620 0.092 0.228
#> SRR1974619 2 0.7273 0.48427 0.044 0.608 0.092 0.256
#> SRR1974621 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974617 1 0.4925 0.73676 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974616 4 0.7621 -0.01244 0.344 0.000 0.212 0.444
#> SRR1974615 1 0.5724 0.72699 0.548 0.000 0.424 0.028
#> SRR1974618 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974614 1 0.9740 0.09802 0.352 0.252 0.232 0.164
#> SRR1974613 2 0.7794 0.45647 0.084 0.592 0.096 0.228
#> SRR1974612 1 0.4916 0.73586 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974611 2 0.5274 0.59473 0.016 0.768 0.064 0.152
#> SRR1974610 4 0.4313 0.55392 0.000 0.260 0.004 0.736
#> SRR1974609 1 0.4941 0.73580 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974608 4 0.7388 0.48265 0.140 0.068 0.148 0.644
#> SRR1974607 1 0.5799 0.72360 0.552 0.004 0.420 0.024
#> SRR1974606 2 0.4155 0.59357 0.000 0.828 0.100 0.072
#> SRR1974605 4 0.7946 0.43695 0.140 0.104 0.152 0.604
#> SRR1974604 4 0.1109 0.71091 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1974603 2 0.9909 -0.03881 0.284 0.288 0.236 0.192
#> SRR1974602 1 0.4933 0.73736 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974600 2 0.5643 0.33376 0.012 0.596 0.012 0.380
#> SRR1974601 2 0.5637 0.58350 0.016 0.744 0.080 0.160
#> SRR1974599 2 0.3745 0.59707 0.000 0.852 0.088 0.060
#> SRR1974598 2 0.3810 0.59554 0.000 0.848 0.092 0.060
#> SRR1974596 2 0.4354 0.59706 0.004 0.824 0.088 0.084
#> SRR1974594 4 0.3682 0.67467 0.084 0.008 0.044 0.864
#> SRR1974593 2 0.3271 0.61935 0.000 0.856 0.012 0.132
#> SRR1974595 2 0.6080 -0.03015 0.000 0.488 0.044 0.468
#> SRR1974592 2 0.3754 0.59901 0.000 0.852 0.084 0.064
#> SRR1974591 2 0.3810 0.59554 0.000 0.848 0.092 0.060
#> SRR1974588 4 0.3833 0.67166 0.088 0.008 0.048 0.856
#> SRR1974590 2 0.5835 0.30720 0.000 0.588 0.040 0.372
#> SRR1974589 4 0.5940 0.62562 0.064 0.160 0.040 0.736
#> SRR1974587 4 0.4024 0.67876 0.076 0.028 0.040 0.856
#> SRR1974586 2 0.3335 0.61908 0.000 0.856 0.016 0.128
#> SRR1974585 4 0.3682 0.67467 0.084 0.008 0.044 0.864
#> SRR1974584 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974583 2 0.3224 0.62031 0.000 0.864 0.016 0.120
#> SRR1974582 2 0.3810 0.59554 0.000 0.848 0.092 0.060
#> SRR1974581 2 0.2593 0.62337 0.000 0.904 0.016 0.080
#> SRR1974580 4 0.3743 0.67615 0.080 0.012 0.044 0.864
#> SRR1974578 4 0.3682 0.67467 0.084 0.008 0.044 0.864
#> SRR1974577 2 0.9005 0.26858 0.116 0.480 0.200 0.204
#> SRR1974579 4 0.4024 0.67876 0.076 0.028 0.040 0.856
#> SRR1974576 2 0.2593 0.62337 0.000 0.904 0.016 0.080
#> SRR1974575 2 0.3754 0.59901 0.000 0.852 0.084 0.064
#> SRR1974574 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974573 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974571 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974572 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974570 1 0.7755 0.62993 0.488 0.056 0.380 0.076
#> SRR1974568 1 0.7024 0.68000 0.516 0.024 0.396 0.064
#> SRR1974567 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974566 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974569 4 0.5675 0.64279 0.004 0.160 0.108 0.728
#> SRR1974565 4 0.3748 0.67209 0.088 0.008 0.044 0.860
#> SRR1974564 4 0.5906 0.62061 0.004 0.188 0.104 0.704
#> SRR1974560 1 0.7932 0.61774 0.468 0.060 0.388 0.084
#> SRR1974559 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974563 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974562 4 0.5906 0.62061 0.004 0.188 0.104 0.704
#> SRR1974561 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974557 2 0.2179 0.61414 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1974553 4 0.5631 0.64549 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974555 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974551 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974552 4 0.5631 0.64497 0.004 0.156 0.108 0.732
#> SRR1974554 1 0.9541 0.32586 0.348 0.212 0.312 0.128
#> SRR1974558 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974556 1 0.5466 0.72244 0.548 0.000 0.436 0.016
#> SRR1974550 2 0.5136 0.58922 0.004 0.752 0.056 0.188
#> SRR1974549 4 0.5530 0.65058 0.004 0.152 0.104 0.740
#> SRR1974548 4 0.5761 0.63941 0.004 0.168 0.108 0.720
#> SRR1974547 4 0.9814 0.03263 0.208 0.260 0.192 0.340
#> SRR1974546 2 0.9715 0.01569 0.256 0.356 0.228 0.160
#> SRR1974545 4 0.5932 0.58628 0.000 0.224 0.096 0.680
#> SRR1974544 1 0.5353 0.72418 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR1974543 4 0.5761 0.63918 0.004 0.168 0.108 0.720
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.4227 0.6096 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.6758 -0.3904 0.000 0.336 0.392 0.000 0.272
#> SRR1975006 2 0.6201 0.2928 0.000 0.552 0.232 0.000 0.216
#> SRR1975005 3 0.5737 0.3869 0.148 0.068 0.700 0.000 0.084
#> SRR1975004 3 0.4464 0.6547 0.356 0.004 0.632 0.000 0.008
#> SRR1975003 3 0.6636 -0.3684 0.000 0.284 0.452 0.000 0.264
#> SRR1975001 2 0.5984 0.3316 0.000 0.588 0.208 0.000 0.204
#> SRR1975002 2 0.6247 0.2723 0.000 0.544 0.228 0.000 0.228
#> SRR1974999 3 0.6789 -0.3727 0.004 0.360 0.408 0.000 0.228
#> SRR1975000 3 0.4367 0.6147 0.416 0.000 0.580 0.000 0.004
#> SRR1974998 3 0.4310 0.6339 0.392 0.000 0.604 0.000 0.004
#> SRR1974997 3 0.8553 -0.1223 0.232 0.000 0.312 0.228 0.228
#> SRR1974995 3 0.6451 -0.0567 0.052 0.136 0.620 0.000 0.192
#> SRR1974996 3 0.4201 0.6235 0.408 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.4249 0.5925 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.4855 0.5614 0.224 0.020 0.716 0.000 0.040
#> SRR1974992 3 0.5246 0.4273 0.152 0.064 0.732 0.000 0.052
#> SRR1974990 3 0.4242 0.5981 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.8422 -0.3432 0.152 0.000 0.312 0.264 0.272
#> SRR1974991 3 0.5396 0.4109 0.148 0.064 0.724 0.000 0.064
#> SRR1974986 3 0.4235 0.6040 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.5402 0.0405 0.036 0.120 0.720 0.000 0.124
#> SRR1974988 3 0.5426 0.6452 0.312 0.000 0.624 0.020 0.044
#> SRR1974984 3 0.5399 0.4375 0.164 0.044 0.716 0.000 0.076
#> SRR1974985 3 0.4227 0.6095 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.6439 0.2168 0.000 0.504 0.260 0.000 0.236
#> SRR1974982 3 0.4192 0.6265 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.4242 0.5981 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.4192 0.6263 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5310 0.0295 0.032 0.104 0.724 0.000 0.140
#> SRR1974978 3 0.4219 0.6141 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.4481 0.6152 0.416 0.000 0.576 0.000 0.008
#> SRR1974976 3 0.5268 -0.1527 0.000 0.112 0.668 0.000 0.220
#> SRR1974975 3 0.5529 0.3714 0.140 0.044 0.712 0.000 0.104
#> SRR1974974 3 0.6894 -0.3957 0.004 0.344 0.384 0.000 0.268
#> SRR1974973 2 0.5672 0.3842 0.000 0.632 0.180 0.000 0.188
#> SRR1974972 3 0.4622 0.6264 0.276 0.000 0.684 0.000 0.040
#> SRR1974971 2 0.6222 0.2946 0.000 0.548 0.236 0.000 0.216
#> SRR1974970 3 0.3934 0.6357 0.276 0.000 0.716 0.000 0.008
#> SRR1974969 3 0.4706 0.6544 0.344 0.004 0.632 0.000 0.020
#> SRR1974968 3 0.5952 -0.2716 0.000 0.164 0.584 0.000 0.252
#> SRR1974967 3 0.4709 0.6618 0.324 0.004 0.648 0.000 0.024
#> SRR1974965 3 0.4235 0.6041 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.6668 -0.3905 0.000 0.296 0.440 0.000 0.264
#> SRR1974964 3 0.4715 0.6471 0.300 0.008 0.668 0.000 0.024
#> SRR1974963 3 0.4418 0.6608 0.332 0.000 0.652 0.000 0.016
#> SRR1974961 3 0.4920 0.4089 0.140 0.028 0.752 0.000 0.080
#> SRR1974962 2 0.5848 0.3600 0.000 0.608 0.192 0.000 0.200
#> SRR1974960 3 0.4135 0.6599 0.340 0.000 0.656 0.000 0.004
#> SRR1974959 3 0.4505 0.6434 0.384 0.000 0.604 0.000 0.012
#> SRR1974958 2 0.6771 -0.0249 0.000 0.372 0.356 0.000 0.272
#> SRR1974957 3 0.5553 -0.0554 0.024 0.096 0.684 0.000 0.196
#> SRR1974956 3 0.4423 0.5792 0.232 0.004 0.728 0.000 0.036
#> SRR1974955 3 0.4242 0.5981 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.4360 0.6524 0.300 0.000 0.680 0.000 0.020
#> SRR1974953 2 0.5703 0.3803 0.000 0.628 0.184 0.000 0.188
#> SRR1974952 3 0.4957 0.6330 0.288 0.008 0.664 0.000 0.040
#> SRR1974949 3 0.4681 0.6093 0.260 0.004 0.696 0.000 0.040
#> SRR1974950 3 0.5390 0.0228 0.032 0.104 0.716 0.000 0.148
#> SRR1974951 3 0.5372 -0.0873 0.012 0.112 0.692 0.000 0.184
#> SRR1974947 3 0.5261 0.2335 0.084 0.048 0.736 0.000 0.132
#> SRR1974948 2 0.6590 0.1548 0.000 0.464 0.288 0.000 0.248
#> SRR1974946 2 0.4887 0.4490 0.000 0.720 0.132 0.000 0.148
#> SRR1974945 3 0.4402 0.6563 0.352 0.000 0.636 0.000 0.012
#> SRR1974944 3 0.4249 0.5925 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.4210 0.6171 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.6226 -0.0120 0.056 0.108 0.644 0.000 0.192
#> SRR1974941 3 0.4375 0.6098 0.420 0.000 0.576 0.000 0.004
#> SRR1974940 3 0.4114 0.6453 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.6005 -0.2268 0.008 0.152 0.608 0.000 0.232
#> SRR1974938 3 0.4306 0.6614 0.328 0.000 0.660 0.000 0.012
#> SRR1974937 3 0.4473 0.6182 0.412 0.000 0.580 0.000 0.008
#> SRR1974936 3 0.4242 0.5981 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.4341 0.6527 0.364 0.000 0.628 0.000 0.008
#> SRR1974934 2 0.6424 0.2247 0.000 0.508 0.240 0.000 0.252
#> SRR1974933 3 0.5644 -0.1375 0.012 0.120 0.660 0.000 0.208
#> SRR1974932 3 0.4060 0.6542 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.4359 0.6174 0.412 0.000 0.584 0.000 0.004
#> SRR1974930 3 0.4210 0.6171 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.4219 0.6143 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.6529 0.1916 0.000 0.476 0.296 0.000 0.228
#> SRR1974927 3 0.4252 0.6605 0.340 0.000 0.652 0.000 0.008
#> SRR1974924 3 0.4227 0.6101 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.4242 0.5981 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4249 0.5925 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.4657 0.6392 0.380 0.008 0.604 0.000 0.008
#> SRR1974922 3 0.4435 0.6610 0.336 0.000 0.648 0.000 0.016
#> SRR1974921 3 0.4331 0.6312 0.400 0.000 0.596 0.000 0.004
#> SRR1974920 3 0.4383 0.6036 0.424 0.000 0.572 0.000 0.004
#> SRR1974919 3 0.4225 0.6519 0.364 0.000 0.632 0.000 0.004
#> SRR1974918 3 0.4310 0.6369 0.392 0.000 0.604 0.000 0.004
#> SRR1974917 2 0.5162 0.4384 0.000 0.692 0.148 0.000 0.160
#> SRR1974916 3 0.4392 0.6448 0.380 0.000 0.612 0.000 0.008
#> SRR1974915 3 0.4074 0.6517 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1974914 5 0.8247 0.5822 0.036 0.040 0.332 0.248 0.344
#> SRR1974913 3 0.4473 0.6208 0.412 0.000 0.580 0.000 0.008
#> SRR1974911 3 0.4350 0.6210 0.408 0.000 0.588 0.000 0.004
#> SRR1974910 3 0.4227 0.6089 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.6085 0.3092 0.000 0.572 0.216 0.000 0.212
#> SRR1974909 3 0.4251 0.6488 0.372 0.000 0.624 0.000 0.004
#> SRR1974906 3 0.5895 -0.0534 0.036 0.108 0.664 0.000 0.192
#> SRR1974907 3 0.4508 0.6605 0.332 0.000 0.648 0.000 0.020
#> SRR1974905 3 0.4101 0.6476 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.6212 -0.2509 0.008 0.172 0.580 0.000 0.240
#> SRR1974903 3 0.4211 0.6531 0.360 0.000 0.636 0.000 0.004
#> SRR1974902 3 0.5898 -0.2097 0.008 0.140 0.620 0.000 0.232
#> SRR1974901 3 0.4418 0.6605 0.332 0.000 0.652 0.000 0.016
#> SRR1974898 2 0.6179 0.2896 0.000 0.556 0.228 0.000 0.216
#> SRR1974900 2 0.7991 -0.3187 0.000 0.340 0.276 0.080 0.304
#> SRR1974899 2 0.6671 0.1058 0.000 0.440 0.292 0.000 0.268
#> SRR1974897 2 0.6084 0.3108 0.000 0.572 0.220 0.000 0.208
#> SRR1974896 5 0.8497 0.7147 0.000 0.224 0.252 0.196 0.328
#> SRR1974893 2 0.7014 -0.0537 0.000 0.380 0.332 0.008 0.280
#> SRR1974895 2 0.4210 0.4860 0.000 0.780 0.096 0.000 0.124
#> SRR1974894 5 0.8491 0.7124 0.000 0.212 0.260 0.200 0.328
#> SRR1974892 3 0.8509 -0.5579 0.068 0.032 0.332 0.248 0.320
#> SRR1974890 3 0.8112 -0.4634 0.096 0.000 0.336 0.268 0.300
#> SRR1974891 5 0.8583 0.7491 0.008 0.148 0.280 0.228 0.336
#> SRR1974889 2 0.5159 0.4329 0.000 0.692 0.164 0.000 0.144
#> SRR1974888 5 0.8259 0.5250 0.000 0.260 0.288 0.120 0.332
#> SRR1974886 5 0.8460 0.7304 0.000 0.172 0.248 0.252 0.328
#> SRR1974887 3 0.8271 -0.4115 0.120 0.000 0.324 0.272 0.284
#> SRR1974885 3 0.8271 -0.4115 0.120 0.000 0.324 0.272 0.284
#> SRR1974883 5 0.8492 0.7264 0.004 0.180 0.272 0.188 0.356
#> SRR1974884 2 0.6552 0.1720 0.000 0.476 0.276 0.000 0.248
#> SRR1974881 5 0.8337 0.7395 0.000 0.140 0.284 0.240 0.336
#> SRR1974882 5 0.8393 0.7454 0.000 0.156 0.264 0.240 0.340
#> SRR1974880 2 0.7451 -0.0346 0.000 0.532 0.140 0.136 0.192
#> SRR1974879 5 0.8337 0.5655 0.000 0.252 0.284 0.136 0.328
#> SRR1974877 2 0.5198 0.4292 0.000 0.688 0.164 0.000 0.148
#> SRR1974876 3 0.8487 -0.6058 0.056 0.040 0.336 0.244 0.324
#> SRR1974878 3 0.8298 -0.5411 0.064 0.020 0.344 0.264 0.308
#> SRR1974875 3 0.8271 -0.4115 0.120 0.000 0.324 0.272 0.284
#> SRR1974874 2 0.2970 0.5207 0.000 0.828 0.000 0.168 0.004
#> SRR1974873 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974871 4 0.4287 0.0892 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1974872 1 0.7118 0.4784 0.628 0.060 0.072 0.080 0.160
#> SRR1974869 2 0.4241 0.5478 0.000 0.808 0.028 0.084 0.080
#> SRR1974868 2 0.4372 0.4830 0.000 0.712 0.004 0.024 0.260
#> SRR1974870 2 0.5653 0.5181 0.004 0.716 0.052 0.120 0.108
#> SRR1974866 2 0.5520 0.5196 0.000 0.716 0.048 0.128 0.108
#> SRR1974867 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2077 0.5534 0.000 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1974864 1 0.5904 0.6089 0.720 0.032 0.060 0.064 0.124
#> SRR1974862 4 0.4256 0.1822 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1974863 2 0.1830 0.5541 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974860 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974861 2 0.3317 0.5334 0.000 0.848 0.032 0.008 0.112
#> SRR1974859 4 0.1043 0.6212 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974858 2 0.1830 0.5541 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974856 4 0.0404 0.6281 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974857 2 0.1894 0.5532 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1974855 4 0.8175 -0.1144 0.324 0.000 0.152 0.360 0.164
#> SRR1974854 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.7566 -0.0374 0.400 0.000 0.084 0.376 0.140
#> SRR1974852 4 0.4982 0.4789 0.000 0.032 0.000 0.556 0.412
#> SRR1974849 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.7558 0.0489 0.224 0.000 0.120 0.508 0.148
#> SRR1974846 4 0.0324 0.6271 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974847 1 0.2852 0.7905 0.892 0.008 0.012 0.024 0.064
#> SRR1974845 4 0.4730 0.4835 0.000 0.012 0.004 0.568 0.416
#> SRR1974844 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.5563 0.6292 0.736 0.016 0.060 0.064 0.124
#> SRR1974842 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974839 4 0.4590 0.4840 0.000 0.012 0.000 0.568 0.420
#> SRR1974838 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.4909 0.4813 0.000 0.028 0.000 0.560 0.412
#> SRR1974834 4 0.4590 0.4840 0.000 0.012 0.000 0.568 0.420
#> SRR1974833 4 0.8175 -0.1144 0.324 0.000 0.152 0.360 0.164
#> SRR1974831 4 0.4637 0.4828 0.000 0.008 0.004 0.568 0.420
#> SRR1974832 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0162 0.8557 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974828 1 0.0162 0.8555 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974826 2 0.2731 0.5466 0.000 0.876 0.004 0.104 0.016
#> SRR1974827 4 0.4637 0.4828 0.000 0.008 0.004 0.568 0.420
#> SRR1974824 1 0.2053 0.8234 0.932 0.004 0.012 0.024 0.028
#> SRR1974825 1 0.2220 0.8138 0.920 0.004 0.008 0.016 0.052
#> SRR1974822 1 0.5542 0.5316 0.696 0.000 0.056 0.192 0.056
#> SRR1974823 1 0.8832 -0.1830 0.352 0.324 0.048 0.160 0.116
#> SRR1974820 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7137 0.2564 0.556 0.000 0.124 0.220 0.100
#> SRR1974815 1 0.0162 0.8543 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.5238 0.3850 0.168 0.000 0.016 0.712 0.104
#> SRR1974812 1 0.6927 0.1691 0.484 0.000 0.044 0.348 0.124
#> SRR1974810 1 0.4068 0.6978 0.816 0.000 0.036 0.108 0.040
#> SRR1974808 2 0.5609 0.5199 0.004 0.716 0.044 0.124 0.112
#> SRR1974811 1 0.4068 0.6978 0.816 0.000 0.036 0.108 0.040
#> SRR1974809 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.7348 0.4041 0.592 0.084 0.036 0.188 0.100
#> SRR1974806 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.4637 0.4828 0.000 0.008 0.004 0.568 0.420
#> SRR1974804 1 0.7685 0.0645 0.444 0.000 0.116 0.312 0.128
#> SRR1974803 1 0.6292 0.4234 0.632 0.000 0.076 0.216 0.076
#> SRR1974801 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.6226 0.5687 0.688 0.036 0.048 0.072 0.156
#> SRR1974799 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.4372 0.4861 0.000 0.712 0.004 0.024 0.260
#> SRR1974797 4 0.5044 0.4774 0.000 0.036 0.000 0.556 0.408
#> SRR1974796 4 0.4630 0.4842 0.000 0.008 0.004 0.572 0.416
#> SRR1974795 4 0.4637 0.4828 0.000 0.008 0.004 0.568 0.420
#> SRR1974793 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.4260 0.4886 0.000 0.720 0.004 0.020 0.256
#> SRR1974792 4 0.4767 0.4836 0.000 0.020 0.000 0.560 0.420
#> SRR1974791 4 0.4590 0.4840 0.000 0.012 0.000 0.568 0.420
#> SRR1974790 4 0.4982 0.4782 0.000 0.032 0.000 0.556 0.412
#> SRR1974789 2 0.4311 0.4841 0.000 0.712 0.004 0.020 0.264
#> SRR1974788 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974786 1 0.3730 0.7510 0.848 0.008 0.028 0.036 0.080
#> SRR1974787 1 0.5596 0.6366 0.740 0.024 0.052 0.072 0.112
#> SRR1974784 4 0.6211 0.3000 0.000 0.120 0.004 0.444 0.432
#> SRR1974783 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.2264 0.8100 0.920 0.008 0.024 0.004 0.044
#> SRR1974782 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.6414 0.2679 0.000 0.148 0.004 0.432 0.416
#> SRR1974780 1 0.6546 0.5532 0.676 0.048 0.064 0.076 0.136
#> SRR1974779 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.6396 0.5612 0.684 0.040 0.068 0.068 0.140
#> SRR1974778 1 0.0671 0.8488 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1974774 2 0.5098 0.4457 0.000 0.660 0.004 0.060 0.276
#> SRR1974773 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.6623 0.2295 0.008 0.512 0.004 0.168 0.308
#> SRR1974770 2 0.5156 0.4440 0.000 0.656 0.004 0.064 0.276
#> SRR1974769 4 0.4590 0.4840 0.000 0.012 0.000 0.568 0.420
#> SRR1974768 2 0.5330 0.4240 0.000 0.636 0.004 0.072 0.288
#> SRR1974767 1 0.6893 0.5137 0.648 0.056 0.064 0.084 0.148
#> SRR1974766 2 0.5836 0.3548 0.000 0.576 0.004 0.104 0.316
#> SRR1974765 4 0.5229 0.4749 0.000 0.048 0.000 0.548 0.404
#> SRR1974764 2 0.5836 0.3548 0.000 0.576 0.004 0.104 0.316
#> SRR1974763 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.5486 0.4122 0.000 0.624 0.004 0.084 0.288
#> SRR1974760 4 0.4637 0.4828 0.000 0.008 0.004 0.568 0.420
#> SRR1974759 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.5275 0.4291 0.000 0.640 0.004 0.068 0.288
#> SRR1974757 5 0.6578 -0.2773 0.000 0.176 0.004 0.400 0.420
#> SRR1974756 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.5156 0.4440 0.000 0.656 0.004 0.064 0.276
#> SRR1974753 4 0.2179 0.5907 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1974751 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974750 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.8945 -0.0610 0.232 0.308 0.024 0.276 0.160
#> SRR1974747 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974748 1 0.0324 0.8540 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3336 0.4835 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1974745 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974743 4 0.0880 0.6254 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974742 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974740 4 0.3913 0.3544 0.000 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974739 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974741 4 0.2230 0.5904 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974738 4 0.4240 0.3623 0.000 0.304 0.004 0.684 0.008
#> SRR1974737 4 0.0703 0.6270 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974736 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.8266 0.0360 0.100 0.276 0.040 0.460 0.124
#> SRR1974733 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.1372 0.6132 0.024 0.004 0.000 0.956 0.016
#> SRR1974731 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.1117 0.8405 0.964 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1974728 4 0.1121 0.6233 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974725 4 0.6336 0.3650 0.156 0.068 0.016 0.672 0.088
#> SRR1974726 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5928 0.5139 0.008 0.700 0.056 0.120 0.116
#> SRR1974723 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1695 0.6023 0.044 0.008 0.000 0.940 0.008
#> SRR1974721 2 0.3561 0.4422 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974720 4 0.4779 0.4961 0.092 0.056 0.016 0.792 0.044
#> SRR1974719 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.7947 0.3615 0.072 0.520 0.044 0.220 0.144
#> SRR1974717 4 0.3274 0.4929 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1974715 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.7563 0.4123 0.048 0.560 0.048 0.200 0.144
#> SRR1974711 2 0.7410 0.4343 0.036 0.584 0.068 0.180 0.132
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4404 0.5459 0.000 0.796 0.028 0.096 0.080
#> SRR1974710 2 0.5969 0.5110 0.008 0.696 0.056 0.128 0.112
#> SRR1974707 1 0.8426 0.2643 0.500 0.172 0.060 0.144 0.124
#> SRR1974706 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.3039 0.5194 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1974702 1 0.2273 0.8109 0.920 0.008 0.016 0.008 0.048
#> SRR1974701 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974699 2 0.4451 0.0632 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR1974698 4 0.0404 0.6280 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.8918 -0.1105 0.368 0.312 0.068 0.136 0.116
#> SRR1974696 4 0.6367 0.2406 0.040 0.280 0.016 0.604 0.060
#> SRR1974694 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974695 2 0.7196 0.4375 0.028 0.588 0.052 0.192 0.140
#> SRR1974693 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974692 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 4 0.6734 0.2191 0.000 0.292 0.000 0.416 0.292
#> SRR1974691 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974689 4 0.0404 0.6278 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0290 0.8536 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0566 0.8500 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974682 4 0.0290 0.6250 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0451 0.6234 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.4910 0.4548 0.000 0.672 0.004 0.048 0.276
#> SRR1974675 2 0.5597 0.3913 0.000 0.640 0.160 0.000 0.200
#> SRR1974674 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4378 0.5481 0.000 0.800 0.032 0.080 0.088
#> SRR1974671 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974672 2 0.1830 0.5541 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974670 2 0.1830 0.5541 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974669 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974667 2 0.5836 0.3548 0.000 0.576 0.004 0.104 0.316
#> SRR1974668 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974666 2 0.4194 0.4880 0.000 0.720 0.004 0.016 0.260
#> SRR1974664 2 0.1830 0.5541 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974665 2 0.4975 0.4512 0.000 0.668 0.004 0.052 0.276
#> SRR1974663 1 0.7422 0.4440 0.604 0.076 0.064 0.096 0.160
#> SRR1974662 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.6918 0.4467 0.020 0.604 0.044 0.188 0.144
#> SRR1974660 1 0.0613 0.8509 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5312 0.6600 0.764 0.052 0.028 0.064 0.092
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3595 0.7585 0.860 0.024 0.012 0.044 0.060
#> SRR1974656 2 0.8587 0.2959 0.144 0.480 0.060 0.172 0.144
#> SRR1974650 2 0.7877 0.3860 0.068 0.540 0.052 0.196 0.144
#> SRR1974651 4 0.1410 0.6167 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974652 1 0.6624 0.5381 0.664 0.036 0.064 0.092 0.144
#> SRR1974653 4 0.0162 0.6266 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974648 1 0.8960 -0.1210 0.364 0.304 0.064 0.152 0.116
#> SRR1974646 2 0.7492 0.4108 0.024 0.572 0.088 0.152 0.164
#> SRR1974649 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1341 0.6191 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.5098 0.4457 0.000 0.660 0.004 0.060 0.276
#> SRR1974643 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.6862 0.4554 0.016 0.612 0.052 0.180 0.140
#> SRR1974640 2 0.7575 0.4121 0.044 0.560 0.052 0.192 0.152
#> SRR1974641 2 0.3741 0.4485 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1974639 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.7621 0.3997 0.048 0.552 0.048 0.204 0.148
#> SRR1974634 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.2020 0.5995 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974633 2 0.9184 0.0655 0.276 0.316 0.048 0.208 0.152
#> SRR1974632 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.8441 0.3315 0.088 0.488 0.068 0.200 0.156
#> SRR1974630 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.2590 0.8019 0.908 0.012 0.008 0.028 0.044
#> SRR1974624 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.2974 0.5234 0.000 0.868 0.052 0.000 0.080
#> SRR1974623 2 0.6248 0.4862 0.004 0.656 0.048 0.156 0.136
#> SRR1974622 1 0.8737 0.1037 0.432 0.248 0.060 0.144 0.116
#> SRR1974620 2 0.7779 0.4054 0.056 0.548 0.056 0.192 0.148
#> SRR1974619 2 0.7691 0.3834 0.052 0.536 0.044 0.228 0.140
#> SRR1974621 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0162 0.8543 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.7203 0.0926 0.452 0.000 0.056 0.356 0.136
#> SRR1974615 1 0.0992 0.8403 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1974618 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.8903 0.1700 0.444 0.176 0.080 0.124 0.176
#> SRR1974613 2 0.8097 0.3741 0.088 0.524 0.052 0.188 0.148
#> SRR1974612 1 0.0566 0.8507 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974611 2 0.5720 0.5144 0.004 0.708 0.048 0.128 0.112
#> SRR1974610 4 0.3424 0.4715 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1974609 1 0.0162 0.8555 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974608 4 0.6972 0.2749 0.216 0.056 0.028 0.604 0.096
#> SRR1974607 1 0.1701 0.8312 0.944 0.000 0.012 0.016 0.028
#> SRR1974606 2 0.4491 0.4819 0.000 0.708 0.008 0.024 0.260
#> SRR1974605 4 0.7413 0.2196 0.212 0.072 0.032 0.572 0.112
#> SRR1974604 4 0.0000 0.6279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.9040 0.0357 0.396 0.212 0.056 0.152 0.184
#> SRR1974602 1 0.0000 0.8573 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.5337 0.2102 0.000 0.596 0.004 0.344 0.056
#> SRR1974601 2 0.6121 0.4971 0.004 0.672 0.052 0.144 0.128
#> SRR1974599 2 0.3890 0.4949 0.000 0.736 0.000 0.012 0.252
#> SRR1974598 2 0.4044 0.4928 0.000 0.732 0.004 0.012 0.252
#> SRR1974596 2 0.4523 0.4824 0.000 0.712 0.008 0.028 0.252
#> SRR1974594 4 0.4391 0.4967 0.008 0.000 0.060 0.768 0.164
#> SRR1974593 2 0.3257 0.5334 0.000 0.844 0.004 0.124 0.028
#> SRR1974595 2 0.6299 -0.0249 0.000 0.464 0.000 0.380 0.156
#> SRR1974592 2 0.3863 0.4957 0.000 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1974591 2 0.4017 0.4933 0.000 0.736 0.004 0.012 0.248
#> SRR1974588 4 0.4598 0.4897 0.016 0.000 0.060 0.760 0.164
#> SRR1974590 2 0.5906 0.1825 0.000 0.564 0.004 0.324 0.108
#> SRR1974589 4 0.6269 0.4001 0.008 0.156 0.040 0.656 0.140
#> SRR1974587 4 0.4653 0.4961 0.000 0.020 0.060 0.760 0.160
#> SRR1974586 2 0.3243 0.5361 0.000 0.848 0.004 0.116 0.032
#> SRR1974585 4 0.4391 0.4967 0.008 0.000 0.060 0.768 0.164
#> SRR1974584 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974583 2 0.3110 0.5395 0.000 0.856 0.004 0.112 0.028
#> SRR1974582 2 0.4017 0.4933 0.000 0.736 0.004 0.012 0.248
#> SRR1974581 2 0.2473 0.5513 0.000 0.896 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974580 4 0.4425 0.4974 0.004 0.004 0.060 0.768 0.164
#> SRR1974578 4 0.4391 0.4967 0.008 0.000 0.060 0.768 0.164
#> SRR1974577 2 0.8714 0.1421 0.188 0.400 0.028 0.144 0.240
#> SRR1974579 4 0.4653 0.4961 0.000 0.020 0.060 0.760 0.160
#> SRR1974576 2 0.2473 0.5513 0.000 0.896 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974575 2 0.3863 0.4957 0.000 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1974574 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974573 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974571 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974572 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974570 1 0.5151 0.6697 0.768 0.024 0.048 0.048 0.112
#> SRR1974568 1 0.3867 0.7526 0.848 0.016 0.032 0.044 0.060
#> SRR1974567 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974566 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974569 4 0.5735 0.4625 0.000 0.092 0.000 0.532 0.376
#> SRR1974565 4 0.4499 0.4924 0.012 0.000 0.060 0.764 0.164
#> SRR1974564 4 0.6021 0.4437 0.000 0.128 0.000 0.524 0.348
#> SRR1974560 1 0.5218 0.6730 0.776 0.052 0.044 0.064 0.064
#> SRR1974559 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974563 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974562 4 0.6021 0.4437 0.000 0.128 0.000 0.524 0.348
#> SRR1974561 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974557 2 0.1942 0.5542 0.000 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR1974553 4 0.5700 0.4638 0.000 0.088 0.000 0.532 0.380
#> SRR1974555 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974551 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974552 4 0.5726 0.4664 0.000 0.092 0.000 0.536 0.372
#> SRR1974554 1 0.7544 0.3900 0.580 0.192 0.052 0.092 0.084
#> SRR1974558 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974556 1 0.1865 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.008 0.032
#> SRR1974550 2 0.5768 0.5063 0.000 0.688 0.044 0.160 0.108
#> SRR1974549 4 0.5682 0.4709 0.000 0.088 0.000 0.540 0.372
#> SRR1974548 4 0.5951 0.4638 0.004 0.104 0.000 0.540 0.352
#> SRR1974547 1 0.8971 -0.2522 0.320 0.224 0.024 0.256 0.176
#> SRR1974546 1 0.8522 -0.0262 0.404 0.312 0.040 0.120 0.124
#> SRR1974545 4 0.6363 0.4073 0.000 0.192 0.000 0.504 0.304
#> SRR1974544 1 0.1822 0.8245 0.936 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR1974543 4 0.5812 0.4575 0.000 0.100 0.000 0.528 0.372
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.3265 0.7918 0.248 0.004 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.4137 0.6066 0.000 0.756 0.108 0.000 0.132 0.004
#> SRR1975006 2 0.4457 0.4938 0.000 0.632 0.024 0.000 0.332 0.012
#> SRR1975005 3 0.4947 0.3408 0.060 0.316 0.612 0.000 0.012 0.000
#> SRR1975004 3 0.3776 0.7883 0.196 0.048 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.4532 0.6084 0.000 0.720 0.164 0.000 0.108 0.008
#> SRR1975001 2 0.4570 0.4598 0.000 0.600 0.016 0.000 0.364 0.020
#> SRR1975002 2 0.4310 0.5109 0.000 0.656 0.016 0.000 0.312 0.016
#> SRR1974999 2 0.5510 0.5963 0.000 0.616 0.176 0.000 0.192 0.016
#> SRR1975000 3 0.3215 0.7956 0.240 0.004 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.3566 0.7957 0.224 0.024 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.9007 0.0751 0.176 0.152 0.332 0.168 0.016 0.156
#> SRR1974995 2 0.4872 0.3564 0.020 0.552 0.400 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974996 3 0.3298 0.7973 0.236 0.008 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.3175 0.7852 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.4425 0.6232 0.108 0.164 0.724 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974992 3 0.4704 0.4228 0.056 0.272 0.660 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974990 3 0.3151 0.7882 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.9018 -0.0631 0.108 0.184 0.304 0.204 0.016 0.184
#> SRR1974991 3 0.4851 0.3889 0.060 0.292 0.636 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974986 3 0.3126 0.7911 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.4775 -0.2135 0.004 0.456 0.500 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974988 3 0.4737 0.7388 0.152 0.064 0.744 0.020 0.004 0.016
#> SRR1974984 3 0.4914 0.4450 0.080 0.272 0.640 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974985 3 0.3101 0.7935 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.4395 0.5407 0.000 0.676 0.028 0.000 0.280 0.016
#> SRR1974982 3 0.3163 0.7981 0.232 0.004 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3151 0.7882 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.3271 0.7981 0.232 0.008 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.4452 0.2176 0.008 0.508 0.472 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974978 3 0.3076 0.7957 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.3420 0.7950 0.240 0.012 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.4290 0.4428 0.000 0.612 0.364 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974975 3 0.4683 0.3471 0.056 0.312 0.628 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974974 2 0.4240 0.6075 0.000 0.752 0.104 0.000 0.136 0.008
#> SRR1974973 2 0.4387 0.3850 0.000 0.572 0.004 0.000 0.404 0.020
#> SRR1974972 3 0.3822 0.7131 0.128 0.096 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.4797 0.4960 0.000 0.620 0.036 0.000 0.324 0.020
#> SRR1974970 3 0.3211 0.7262 0.120 0.056 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.3939 0.7740 0.180 0.068 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.4244 0.5470 0.000 0.680 0.280 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974967 3 0.3542 0.7661 0.160 0.052 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.3126 0.7913 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.4658 0.6111 0.000 0.700 0.168 0.000 0.128 0.004
#> SRR1974964 3 0.3694 0.7374 0.140 0.076 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.3456 0.7798 0.172 0.040 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.4210 0.3901 0.040 0.288 0.672 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.4446 0.4176 0.000 0.588 0.008 0.000 0.384 0.020
#> SRR1974960 3 0.2912 0.7831 0.172 0.012 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.3290 0.7978 0.208 0.016 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.4627 0.6038 0.000 0.716 0.108 0.000 0.164 0.012
#> SRR1974957 2 0.4305 0.3295 0.004 0.560 0.424 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974956 3 0.3908 0.6528 0.100 0.132 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.3151 0.7882 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.3336 0.7397 0.132 0.056 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.4579 0.3897 0.000 0.564 0.012 0.000 0.404 0.020
#> SRR1974952 3 0.3918 0.7078 0.124 0.108 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.3703 0.6812 0.104 0.108 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 2 0.4351 0.2338 0.004 0.516 0.468 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974951 2 0.4325 0.3625 0.000 0.568 0.412 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974947 3 0.4460 0.0949 0.024 0.404 0.568 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974948 2 0.4565 0.5563 0.000 0.680 0.052 0.000 0.256 0.012
#> SRR1974946 5 0.4466 -0.2276 0.000 0.476 0.004 0.000 0.500 0.020
#> SRR1974945 3 0.3377 0.7884 0.188 0.028 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3175 0.7852 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.3189 0.7955 0.236 0.004 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.5143 0.3055 0.028 0.528 0.416 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974941 3 0.3240 0.7940 0.244 0.004 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.2793 0.7954 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.4768 0.5204 0.004 0.628 0.316 0.000 0.044 0.008
#> SRR1974938 3 0.3248 0.7745 0.164 0.032 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.3394 0.7954 0.236 0.012 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.3151 0.7882 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.3200 0.7942 0.196 0.016 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.4341 0.5355 0.000 0.676 0.024 0.000 0.284 0.016
#> SRR1974933 2 0.4171 0.4198 0.000 0.604 0.380 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974932 3 0.2805 0.7913 0.184 0.004 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.3298 0.7954 0.236 0.008 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.3189 0.7955 0.236 0.004 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.3076 0.7954 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.4997 0.5498 0.000 0.640 0.072 0.000 0.272 0.016
#> SRR1974927 3 0.3279 0.7844 0.176 0.028 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.3101 0.7939 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.3151 0.7882 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.3175 0.7852 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.3906 0.7891 0.216 0.032 0.744 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974922 3 0.3210 0.7777 0.168 0.028 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.3342 0.7985 0.228 0.012 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.3265 0.7908 0.248 0.004 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.2838 0.7924 0.188 0.004 0.808 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.3287 0.7994 0.220 0.012 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.4465 0.2593 0.000 0.504 0.004 0.000 0.472 0.020
#> SRR1974916 3 0.3201 0.7977 0.208 0.012 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.2697 0.7926 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.8763 0.2412 0.020 0.268 0.268 0.184 0.048 0.212
#> SRR1974913 3 0.3298 0.7974 0.236 0.008 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.3394 0.7950 0.236 0.012 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.3101 0.7931 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.4570 0.4865 0.000 0.620 0.024 0.000 0.340 0.016
#> SRR1974909 3 0.2902 0.7950 0.196 0.004 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.4916 0.3455 0.016 0.548 0.408 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974907 3 0.3585 0.7739 0.172 0.048 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.2762 0.7951 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.4117 0.5293 0.000 0.672 0.296 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974903 3 0.2948 0.7921 0.188 0.008 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.4690 0.5012 0.004 0.624 0.328 0.000 0.036 0.008
#> SRR1974901 3 0.3354 0.7780 0.168 0.036 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.4428 0.5034 0.000 0.640 0.024 0.000 0.324 0.012
#> SRR1974900 2 0.7055 0.4884 0.000 0.532 0.112 0.056 0.232 0.068
#> SRR1974899 2 0.3890 0.5784 0.000 0.752 0.036 0.000 0.204 0.008
#> SRR1974897 2 0.4627 0.4891 0.000 0.620 0.028 0.000 0.336 0.016
#> SRR1974896 2 0.8446 0.3711 0.000 0.388 0.136 0.140 0.168 0.168
#> SRR1974893 2 0.4754 0.5926 0.000 0.700 0.080 0.000 0.200 0.020
#> SRR1974895 5 0.4379 -0.0381 0.000 0.400 0.004 0.000 0.576 0.020
#> SRR1974894 2 0.8321 0.3827 0.000 0.412 0.132 0.140 0.156 0.160
#> SRR1974892 3 0.8901 -0.2139 0.036 0.236 0.292 0.180 0.044 0.212
#> SRR1974890 3 0.8774 -0.1359 0.060 0.200 0.308 0.196 0.016 0.220
#> SRR1974891 2 0.8592 0.3567 0.000 0.348 0.192 0.168 0.116 0.176
#> SRR1974889 2 0.4564 0.2657 0.000 0.500 0.008 0.000 0.472 0.020
#> SRR1974888 2 0.7379 0.4852 0.000 0.536 0.108 0.088 0.160 0.108
#> SRR1974886 2 0.8808 0.3022 0.000 0.296 0.164 0.188 0.148 0.204
#> SRR1974887 3 0.8895 -0.1048 0.080 0.192 0.308 0.208 0.016 0.196
#> SRR1974885 3 0.8895 -0.1048 0.080 0.192 0.308 0.208 0.016 0.196
#> SRR1974883 2 0.8191 0.4072 0.000 0.432 0.160 0.128 0.124 0.156
#> SRR1974884 2 0.4395 0.5627 0.000 0.684 0.044 0.000 0.264 0.008
#> SRR1974881 2 0.8732 0.3323 0.000 0.312 0.192 0.180 0.124 0.192
#> SRR1974882 2 0.8661 0.3290 0.000 0.332 0.180 0.176 0.120 0.192
#> SRR1974880 5 0.7539 0.0350 0.000 0.252 0.076 0.088 0.476 0.108
#> SRR1974879 2 0.7719 0.4521 0.000 0.492 0.120 0.092 0.176 0.120
#> SRR1974877 2 0.4563 0.2756 0.000 0.504 0.008 0.000 0.468 0.020
#> SRR1974876 3 0.8957 -0.2504 0.036 0.240 0.272 0.176 0.048 0.228
#> SRR1974878 3 0.8819 -0.1970 0.032 0.212 0.304 0.196 0.040 0.216
#> SRR1974875 3 0.8895 -0.1048 0.080 0.192 0.308 0.208 0.016 0.196
#> SRR1974874 5 0.3246 0.5172 0.000 0.016 0.000 0.160 0.812 0.012
#> SRR1974873 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.4297 0.1538 0.000 0.004 0.000 0.532 0.452 0.012
#> SRR1974872 1 0.7164 0.5434 0.596 0.104 0.072 0.060 0.032 0.136
#> SRR1974869 5 0.5027 0.4907 0.000 0.088 0.016 0.076 0.740 0.080
#> SRR1974868 5 0.5211 0.4977 0.000 0.092 0.000 0.012 0.608 0.288
#> SRR1974870 5 0.6176 0.4678 0.000 0.112 0.032 0.096 0.648 0.112
#> SRR1974866 5 0.6119 0.4717 0.000 0.104 0.024 0.108 0.648 0.116
#> SRR1974867 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 5 0.2308 0.5310 0.000 0.016 0.000 0.076 0.896 0.012
#> SRR1974864 1 0.5898 0.6674 0.704 0.076 0.064 0.048 0.020 0.088
#> SRR1974862 4 0.4364 0.2239 0.000 0.008 0.000 0.556 0.424 0.012
#> SRR1974863 5 0.2036 0.5294 0.000 0.016 0.000 0.064 0.912 0.008
#> SRR1974860 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974861 5 0.4955 0.3748 0.000 0.212 0.004 0.004 0.668 0.112
#> SRR1974859 4 0.1151 0.7134 0.000 0.000 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR1974858 5 0.2036 0.5294 0.000 0.016 0.000 0.064 0.912 0.008
#> SRR1974856 4 0.0508 0.7246 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974857 5 0.2094 0.5287 0.000 0.016 0.000 0.068 0.908 0.008
#> SRR1974855 4 0.8544 0.0941 0.296 0.044 0.148 0.312 0.020 0.180
#> SRR1974854 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.7880 -0.0529 0.388 0.032 0.080 0.312 0.016 0.172
#> SRR1974852 6 0.4237 0.8856 0.000 0.000 0.000 0.396 0.020 0.584
#> SRR1974849 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.7914 0.2820 0.216 0.036 0.104 0.460 0.020 0.164
#> SRR1974846 4 0.0436 0.7264 0.000 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR1974847 1 0.3002 0.8158 0.880 0.024 0.032 0.016 0.004 0.044
#> SRR1974845 6 0.3899 0.8793 0.000 0.000 0.000 0.404 0.004 0.592
#> SRR1974844 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.5729 0.6712 0.708 0.076 0.060 0.052 0.008 0.096
#> SRR1974842 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.3899 0.8800 0.000 0.000 0.000 0.404 0.004 0.592
#> SRR1974838 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.4159 0.8848 0.000 0.000 0.000 0.396 0.016 0.588
#> SRR1974834 6 0.3899 0.8800 0.000 0.000 0.000 0.404 0.004 0.592
#> SRR1974833 4 0.8544 0.0941 0.296 0.044 0.148 0.312 0.020 0.180
#> SRR1974831 6 0.3765 0.8763 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1974832 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0405 0.8702 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974828 1 0.0146 0.8730 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974826 5 0.3087 0.5301 0.000 0.020 0.004 0.092 0.856 0.028
#> SRR1974827 6 0.3765 0.8763 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1974824 1 0.1976 0.8464 0.928 0.020 0.024 0.008 0.000 0.020
#> SRR1974825 1 0.2289 0.8385 0.916 0.020 0.016 0.012 0.004 0.032
#> SRR1974822 1 0.5666 0.5981 0.688 0.024 0.052 0.160 0.008 0.068
#> SRR1974823 1 0.8904 -0.1595 0.336 0.092 0.044 0.140 0.280 0.108
#> SRR1974820 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7207 0.3352 0.536 0.032 0.120 0.184 0.004 0.124
#> SRR1974815 1 0.0146 0.8731 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.5754 0.4387 0.160 0.024 0.040 0.672 0.004 0.100
#> SRR1974812 1 0.6925 0.1800 0.472 0.016 0.048 0.260 0.000 0.204
#> SRR1974810 1 0.4001 0.7423 0.812 0.012 0.032 0.096 0.004 0.044
#> SRR1974808 5 0.6179 0.4726 0.000 0.112 0.032 0.108 0.648 0.100
#> SRR1974811 1 0.4071 0.7382 0.808 0.012 0.036 0.096 0.004 0.044
#> SRR1974809 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.6939 0.5038 0.588 0.036 0.016 0.172 0.080 0.108
#> SRR1974806 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.3765 0.8763 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1974804 1 0.7989 0.1132 0.424 0.036 0.112 0.260 0.016 0.152
#> SRR1974803 1 0.6431 0.5086 0.624 0.020 0.068 0.176 0.016 0.096
#> SRR1974801 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.6359 0.6248 0.664 0.088 0.060 0.056 0.020 0.112
#> SRR1974799 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.5125 0.5018 0.000 0.088 0.000 0.008 0.604 0.300
#> SRR1974797 6 0.4246 0.8863 0.000 0.000 0.000 0.400 0.020 0.580
#> SRR1974796 6 0.3899 0.8733 0.000 0.000 0.004 0.404 0.000 0.592
#> SRR1974795 6 0.3765 0.8763 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1974793 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 5 0.5076 0.5030 0.000 0.088 0.000 0.008 0.616 0.288
#> SRR1974792 6 0.4002 0.8827 0.000 0.000 0.000 0.404 0.008 0.588
#> SRR1974791 6 0.3899 0.8800 0.000 0.000 0.000 0.404 0.004 0.592
#> SRR1974790 6 0.4168 0.8863 0.000 0.000 0.000 0.400 0.016 0.584
#> SRR1974789 5 0.5109 0.5006 0.000 0.088 0.000 0.008 0.608 0.296
#> SRR1974788 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974786 1 0.3962 0.7770 0.828 0.040 0.032 0.028 0.008 0.064
#> SRR1974787 1 0.5797 0.6763 0.712 0.060 0.060 0.056 0.020 0.092
#> SRR1974784 6 0.5167 0.7644 0.000 0.016 0.000 0.300 0.076 0.608
#> SRR1974783 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.2677 0.8218 0.892 0.040 0.032 0.000 0.008 0.028
#> SRR1974782 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.5398 0.7412 0.000 0.020 0.000 0.284 0.096 0.600
#> SRR1974780 1 0.6625 0.6082 0.648 0.088 0.068 0.060 0.028 0.108
#> SRR1974779 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.6465 0.6158 0.656 0.100 0.064 0.048 0.024 0.108
#> SRR1974778 1 0.0779 0.8662 0.976 0.008 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974774 5 0.5786 0.4821 0.000 0.096 0.000 0.036 0.552 0.316
#> SRR1974773 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 5 0.6601 0.2430 0.004 0.052 0.004 0.120 0.428 0.392
#> SRR1974770 5 0.5845 0.4825 0.000 0.096 0.000 0.040 0.548 0.316
#> SRR1974769 6 0.3899 0.8800 0.000 0.000 0.000 0.404 0.004 0.592
#> SRR1974768 5 0.5953 0.4689 0.000 0.092 0.000 0.048 0.532 0.328
#> SRR1974767 1 0.6944 0.5800 0.624 0.084 0.068 0.064 0.040 0.120
#> SRR1974766 5 0.6128 0.3860 0.000 0.084 0.000 0.060 0.476 0.380
#> SRR1974765 6 0.4428 0.8886 0.000 0.000 0.000 0.388 0.032 0.580
#> SRR1974764 5 0.6128 0.3860 0.000 0.084 0.000 0.060 0.476 0.380
#> SRR1974763 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0291 0.8718 0.992 0.004 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 5 0.5997 0.4514 0.000 0.088 0.000 0.052 0.520 0.340
#> SRR1974760 6 0.3765 0.8763 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1974759 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 5 0.5898 0.4733 0.000 0.092 0.000 0.044 0.536 0.328
#> SRR1974757 6 0.5500 0.6978 0.000 0.012 0.000 0.268 0.132 0.588
#> SRR1974756 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974755 5 0.5845 0.4825 0.000 0.096 0.000 0.040 0.548 0.316
#> SRR1974753 4 0.2218 0.6623 0.000 0.000 0.000 0.884 0.104 0.012
#> SRR1974751 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.8994 0.1329 0.224 0.064 0.028 0.252 0.260 0.172
#> SRR1974747 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0260 0.8721 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3314 0.5264 0.000 0.000 0.000 0.764 0.224 0.012
#> SRR1974745 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0972 0.7155 0.000 0.000 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1974742 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3835 0.4102 0.000 0.000 0.000 0.668 0.320 0.012
#> SRR1974739 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.2212 0.6532 0.000 0.000 0.000 0.880 0.112 0.008
#> SRR1974738 4 0.3934 0.4353 0.000 0.000 0.000 0.676 0.304 0.020
#> SRR1974737 4 0.0777 0.7199 0.000 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974736 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.8242 0.1409 0.096 0.068 0.040 0.440 0.256 0.100
#> SRR1974733 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974732 4 0.1282 0.7112 0.024 0.000 0.004 0.956 0.004 0.012
#> SRR1974731 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974729 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.1269 0.8587 0.956 0.012 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974728 4 0.1196 0.7111 0.000 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1974725 4 0.6246 0.4585 0.152 0.040 0.020 0.660 0.068 0.060
#> SRR1974726 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974724 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.6381 0.4667 0.004 0.112 0.036 0.104 0.640 0.104
#> SRR1974723 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.1440 0.6996 0.044 0.000 0.004 0.944 0.004 0.004
#> SRR1974721 5 0.3836 0.4876 0.000 0.012 0.000 0.252 0.724 0.012
#> SRR1974720 4 0.4699 0.5789 0.088 0.028 0.012 0.780 0.056 0.036
#> SRR1974719 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.8277 0.3887 0.060 0.112 0.036 0.192 0.460 0.140
#> SRR1974717 4 0.3259 0.5387 0.000 0.000 0.000 0.772 0.216 0.012
#> SRR1974715 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.7828 0.4168 0.032 0.120 0.036 0.176 0.504 0.132
#> SRR1974711 5 0.7660 0.4273 0.024 0.124 0.044 0.152 0.528 0.128
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.5209 0.4886 0.000 0.088 0.020 0.084 0.728 0.080
#> SRR1974710 5 0.6344 0.4638 0.000 0.124 0.028 0.108 0.628 0.112
#> SRR1974707 1 0.8304 0.3043 0.488 0.080 0.060 0.128 0.156 0.088
#> SRR1974706 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.3231 0.5792 0.000 0.008 0.000 0.800 0.180 0.012
#> SRR1974702 1 0.2670 0.8249 0.896 0.024 0.036 0.004 0.008 0.032
#> SRR1974701 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 5 0.4314 -0.0136 0.000 0.004 0.000 0.484 0.500 0.012
#> SRR1974698 4 0.0508 0.7246 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.8654 -0.1037 0.360 0.084 0.040 0.112 0.296 0.108
#> SRR1974696 4 0.6274 0.3897 0.040 0.028 0.020 0.592 0.268 0.052
#> SRR1974694 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.7394 0.4309 0.012 0.124 0.032 0.168 0.532 0.132
#> SRR1974693 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974690 6 0.6088 0.6143 0.000 0.004 0.000 0.284 0.264 0.448
#> SRR1974691 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0520 0.7255 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974688 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974687 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0260 0.8715 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0508 0.8686 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974682 4 0.0146 0.7279 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0260 0.7248 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 5 0.5645 0.4862 0.000 0.096 0.000 0.028 0.564 0.312
#> SRR1974675 2 0.4516 0.3666 0.000 0.552 0.008 0.000 0.420 0.020
#> SRR1974674 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.4980 0.4873 0.000 0.096 0.012 0.072 0.740 0.080
#> SRR1974671 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974672 5 0.2036 0.5294 0.000 0.016 0.000 0.064 0.912 0.008
#> SRR1974670 5 0.2036 0.5294 0.000 0.016 0.000 0.064 0.912 0.008
#> SRR1974669 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974667 5 0.6128 0.3860 0.000 0.084 0.000 0.060 0.476 0.380
#> SRR1974668 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974666 5 0.5015 0.5007 0.000 0.092 0.000 0.004 0.616 0.288
#> SRR1974664 5 0.2036 0.5294 0.000 0.016 0.000 0.064 0.912 0.008
#> SRR1974665 5 0.5711 0.4844 0.000 0.096 0.000 0.032 0.560 0.312
#> SRR1974663 1 0.7493 0.5150 0.572 0.100 0.064 0.084 0.044 0.136
#> SRR1974662 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.7173 0.4353 0.008 0.124 0.024 0.168 0.544 0.132
#> SRR1974660 1 0.0508 0.8696 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5370 0.7074 0.748 0.048 0.036 0.056 0.040 0.072
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3468 0.7966 0.856 0.016 0.028 0.028 0.012 0.060
#> SRR1974656 5 0.8617 0.3399 0.128 0.116 0.040 0.148 0.444 0.124
#> SRR1974650 5 0.8083 0.4108 0.052 0.116 0.040 0.168 0.492 0.132
#> SRR1974651 4 0.1411 0.7013 0.000 0.000 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1974652 1 0.6724 0.5967 0.636 0.080 0.060 0.080 0.024 0.120
#> SRR1974653 4 0.0000 0.7283 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.8795 -0.0991 0.356 0.080 0.044 0.124 0.276 0.120
#> SRR1974646 5 0.7758 0.4060 0.012 0.124 0.076 0.120 0.516 0.152
#> SRR1974649 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1349 0.7031 0.000 0.000 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1974645 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.5786 0.4821 0.000 0.096 0.000 0.036 0.552 0.316
#> SRR1974643 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.7023 0.4379 0.000 0.128 0.032 0.156 0.552 0.132
#> SRR1974640 5 0.7838 0.4184 0.032 0.120 0.040 0.168 0.508 0.132
#> SRR1974641 5 0.3947 0.4949 0.000 0.016 0.000 0.256 0.716 0.012
#> SRR1974639 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.7937 0.4099 0.036 0.120 0.032 0.180 0.488 0.144
#> SRR1974634 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.2113 0.6735 0.000 0.004 0.000 0.896 0.092 0.008
#> SRR1974633 5 0.9172 0.1967 0.260 0.092 0.048 0.180 0.296 0.124
#> SRR1974632 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.8647 0.3749 0.072 0.124 0.060 0.168 0.440 0.136
#> SRR1974630 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.2450 0.8321 0.908 0.012 0.020 0.020 0.004 0.036
#> SRR1974624 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 5 0.3915 0.2444 0.000 0.272 0.004 0.000 0.704 0.020
#> SRR1974623 5 0.6600 0.4582 0.000 0.120 0.024 0.136 0.596 0.124
#> SRR1974622 1 0.8628 0.1072 0.420 0.084 0.056 0.128 0.224 0.088
#> SRR1974620 5 0.8014 0.4116 0.044 0.124 0.036 0.168 0.492 0.136
#> SRR1974619 5 0.7946 0.4084 0.040 0.108 0.032 0.200 0.484 0.136
#> SRR1974621 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0291 0.8725 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974616 1 0.7119 0.1028 0.440 0.016 0.056 0.264 0.000 0.224
#> SRR1974615 1 0.0982 0.8616 0.968 0.000 0.004 0.020 0.004 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.8936 0.1871 0.416 0.116 0.076 0.096 0.148 0.148
#> SRR1974613 5 0.8298 0.3950 0.072 0.124 0.036 0.160 0.472 0.136
#> SRR1974612 1 0.0665 0.8683 0.980 0.008 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974611 5 0.6284 0.4728 0.000 0.112 0.036 0.112 0.640 0.100
#> SRR1974610 4 0.3394 0.5244 0.000 0.000 0.000 0.752 0.236 0.012
#> SRR1974609 1 0.0291 0.8718 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974608 4 0.6881 0.3705 0.212 0.044 0.032 0.588 0.056 0.068
#> SRR1974607 1 0.1817 0.8507 0.936 0.016 0.016 0.012 0.000 0.020
#> SRR1974606 5 0.5252 0.4979 0.000 0.096 0.000 0.012 0.604 0.288
#> SRR1974605 4 0.7432 0.3526 0.208 0.048 0.048 0.548 0.064 0.084
#> SRR1974604 4 0.0146 0.7270 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974603 1 0.9189 0.0564 0.372 0.104 0.076 0.120 0.168 0.160
#> SRR1974602 1 0.0000 0.8745 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 5 0.5494 0.2911 0.000 0.032 0.004 0.328 0.576 0.060
#> SRR1974601 5 0.6529 0.4571 0.000 0.112 0.028 0.128 0.608 0.124
#> SRR1974599 5 0.4700 0.5061 0.000 0.084 0.000 0.000 0.648 0.268
#> SRR1974598 5 0.4775 0.5036 0.000 0.084 0.000 0.000 0.632 0.284
#> SRR1974596 5 0.4978 0.5036 0.000 0.084 0.000 0.008 0.632 0.276
#> SRR1974594 4 0.5417 0.5313 0.008 0.056 0.044 0.704 0.024 0.164
#> SRR1974593 5 0.3549 0.5266 0.000 0.024 0.004 0.112 0.824 0.036
#> SRR1974595 5 0.6478 -0.1406 0.000 0.016 0.004 0.296 0.428 0.256
#> SRR1974592 5 0.4586 0.5077 0.000 0.076 0.000 0.000 0.660 0.264
#> SRR1974591 5 0.4757 0.5021 0.000 0.084 0.000 0.000 0.636 0.280
#> SRR1974588 4 0.5599 0.5241 0.016 0.056 0.044 0.696 0.024 0.164
#> SRR1974590 5 0.6221 0.1920 0.000 0.024 0.004 0.260 0.524 0.188
#> SRR1974589 4 0.6613 0.4408 0.008 0.052 0.032 0.600 0.160 0.148
#> SRR1974587 4 0.5479 0.5230 0.000 0.056 0.044 0.696 0.044 0.160
#> SRR1974586 5 0.3527 0.5266 0.000 0.024 0.004 0.104 0.828 0.040
#> SRR1974585 4 0.5417 0.5313 0.008 0.056 0.044 0.704 0.024 0.164
#> SRR1974584 1 0.1998 0.8440 0.928 0.016 0.028 0.004 0.004 0.020
#> SRR1974583 5 0.3412 0.5280 0.000 0.024 0.004 0.100 0.836 0.036
#> SRR1974582 5 0.4757 0.5021 0.000 0.084 0.000 0.000 0.636 0.280
#> SRR1974581 5 0.3078 0.5288 0.000 0.032 0.004 0.068 0.864 0.032
#> SRR1974580 4 0.5384 0.5303 0.004 0.056 0.044 0.704 0.028 0.164
#> SRR1974578 4 0.5417 0.5313 0.008 0.056 0.044 0.704 0.024 0.164
#> SRR1974577 5 0.8728 0.3052 0.188 0.072 0.028 0.116 0.356 0.240
#> SRR1974579 4 0.5479 0.5230 0.000 0.056 0.044 0.696 0.044 0.160
#> SRR1974576 5 0.3078 0.5288 0.000 0.032 0.004 0.068 0.864 0.032
#> SRR1974575 5 0.4606 0.5072 0.000 0.076 0.000 0.000 0.656 0.268
#> SRR1974574 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974573 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974571 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974572 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974570 1 0.5412 0.7040 0.740 0.064 0.052 0.036 0.024 0.084
#> SRR1974568 1 0.4015 0.7811 0.832 0.028 0.036 0.044 0.024 0.036
#> SRR1974567 1 0.2170 0.8401 0.920 0.020 0.028 0.004 0.004 0.024
#> SRR1974566 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974569 6 0.4911 0.8823 0.000 0.000 0.000 0.384 0.068 0.548
#> SRR1974565 4 0.5479 0.5331 0.012 0.056 0.044 0.704 0.024 0.160
#> SRR1974564 6 0.5278 0.8419 0.000 0.000 0.000 0.384 0.104 0.512
#> SRR1974560 1 0.5217 0.7181 0.760 0.044 0.044 0.052 0.040 0.060
#> SRR1974559 1 0.1998 0.8440 0.928 0.016 0.028 0.004 0.004 0.020
#> SRR1974563 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974562 6 0.5278 0.8419 0.000 0.000 0.000 0.384 0.104 0.512
#> SRR1974561 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974557 5 0.2123 0.5274 0.000 0.020 0.000 0.064 0.908 0.008
#> SRR1974553 6 0.4864 0.8850 0.000 0.000 0.000 0.384 0.064 0.552
#> SRR1974555 1 0.1998 0.8440 0.928 0.016 0.028 0.004 0.004 0.020
#> SRR1974551 1 0.1998 0.8440 0.928 0.016 0.028 0.004 0.004 0.020
#> SRR1974552 6 0.4919 0.8793 0.000 0.000 0.000 0.388 0.068 0.544
#> SRR1974554 1 0.7585 0.4511 0.560 0.068 0.048 0.080 0.156 0.088
#> SRR1974558 1 0.2170 0.8401 0.920 0.020 0.028 0.004 0.004 0.024
#> SRR1974556 1 0.2006 0.8445 0.928 0.012 0.032 0.008 0.004 0.016
#> SRR1974550 5 0.6392 0.4709 0.000 0.100 0.032 0.140 0.624 0.104
#> SRR1974549 6 0.4879 0.8793 0.000 0.000 0.000 0.392 0.064 0.544
#> SRR1974548 6 0.5196 0.8604 0.004 0.000 0.000 0.396 0.080 0.520
#> SRR1974547 1 0.8797 -0.1874 0.312 0.044 0.028 0.208 0.204 0.204
#> SRR1974546 1 0.8563 -0.0223 0.384 0.068 0.048 0.108 0.284 0.108
#> SRR1974545 6 0.5724 0.7491 0.000 0.000 0.000 0.376 0.168 0.456
#> SRR1974544 1 0.2170 0.8401 0.920 0.020 0.028 0.004 0.004 0.024
#> SRR1974543 6 0.4994 0.8774 0.000 0.000 0.000 0.380 0.076 0.544
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.880 0.916 0.965 0.4866 0.518 0.518
#> 3 3 0.968 0.938 0.961 0.3334 0.745 0.546
#> 4 4 0.740 0.770 0.878 0.1425 0.838 0.575
#> 5 5 0.744 0.552 0.698 0.0624 0.864 0.541
#> 6 6 0.843 0.782 0.847 0.0419 0.912 0.629
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975004 1 0.9661 0.3494 0.608 0.392
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1975000 1 0.4298 0.8944 0.912 0.088
#> SRR1974998 1 0.4298 0.8943 0.912 0.088
#> SRR1974997 1 0.5408 0.8545 0.876 0.124
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974996 1 0.4022 0.9027 0.920 0.080
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.7674 0.7164 0.224 0.776
#> SRR1974992 2 0.5294 0.8483 0.120 0.880
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.2236 0.9288 0.036 0.964
#> SRR1974986 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.0376 0.9679 0.996 0.004
#> SRR1974984 2 0.6531 0.7934 0.168 0.832
#> SRR1974985 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0938 0.9621 0.988 0.012
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0672 0.9651 0.992 0.008
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0376 0.9547 0.004 0.996
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.9286 0.4967 0.344 0.656
#> SRR1974969 2 0.3733 0.8965 0.072 0.928
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.8763 0.5951 0.296 0.704
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.9323 0.4854 0.348 0.652
#> SRR1974963 2 0.9998 0.0535 0.492 0.508
#> SRR1974961 2 0.3114 0.9111 0.056 0.944
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.3114 0.9261 0.944 0.056
#> SRR1974959 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.7815 0.7043 0.232 0.768
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.7299 0.7457 0.204 0.796
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.8813 0.5868 0.300 0.700
#> SRR1974949 2 0.8327 0.6526 0.264 0.736
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.7528 0.7256 0.784 0.216
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.3114 0.9260 0.944 0.056
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974938 1 0.9896 0.2043 0.560 0.440
#> SRR1974937 1 0.3431 0.9189 0.936 0.064
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.3879 0.9068 0.924 0.076
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974932 1 0.3879 0.9068 0.924 0.076
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974927 1 0.4939 0.8725 0.892 0.108
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.6048 0.8187 0.148 0.852
#> SRR1974922 2 0.9522 0.4298 0.372 0.628
#> SRR1974921 1 0.2603 0.9365 0.956 0.044
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.2236 0.9432 0.964 0.036
#> SRR1974918 1 0.3733 0.9108 0.928 0.072
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.2778 0.9331 0.952 0.048
#> SRR1974915 1 0.3584 0.9147 0.932 0.068
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.0376 0.9679 0.996 0.004
#> SRR1974911 1 0.3274 0.9224 0.940 0.060
#> SRR1974910 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.1843 0.9497 0.972 0.028
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.8499 0.6323 0.276 0.724
#> SRR1974905 1 0.2236 0.9432 0.964 0.036
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.9993 0.0827 0.484 0.516
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.7883 0.7001 0.236 0.764
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.3431 0.9188 0.936 0.064
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974875 1 0.4161 0.8989 0.916 0.084
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.7376 0.7463 0.208 0.792
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.4815 0.8662 0.104 0.896
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7815 0.6984 0.232 0.768
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.1184 0.9592 0.984 0.016
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.9129 0.5377 0.328 0.672
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.9635 0.3742 0.388 0.612
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0672 0.9516 0.008 0.992
#> SRR1974795 2 0.1184 0.9458 0.016 0.984
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.8661 0.6204 0.288 0.712
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0376 0.9678 0.996 0.004
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.7815 0.7125 0.232 0.768
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.9988 0.0300 0.520 0.480
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.6973 0.7727 0.188 0.812
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.9944 0.1664 0.456 0.544
#> SRR1974750 2 0.4939 0.8591 0.108 0.892
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.3114 0.9108 0.056 0.944
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974732 2 0.9795 0.2938 0.416 0.584
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974725 2 0.9977 0.1360 0.472 0.528
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.4298 0.8835 0.088 0.912
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974707 2 0.9635 0.3961 0.388 0.612
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.9087 0.5028 0.676 0.324
#> SRR1974701 2 0.9977 0.1091 0.472 0.528
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.9944 0.1622 0.544 0.456
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.8386 0.6405 0.732 0.268
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.6343 0.7979 0.160 0.840
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.8443 0.6288 0.272 0.728
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.6973 0.7718 0.188 0.812
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974656 2 0.9248 0.4910 0.340 0.660
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.8327 0.6301 0.736 0.264
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974648 2 0.9044 0.5348 0.320 0.680
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.6438 0.8004 0.836 0.164
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.3431 0.9029 0.064 0.936
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.0376 0.9679 0.996 0.004
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0376 0.9679 0.996 0.004
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.3879 0.8927 0.076 0.924
#> SRR1974613 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.9000 0.5413 0.684 0.316
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.3584 0.9150 0.932 0.068
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.7745 0.7185 0.228 0.772
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974565 1 0.9248 0.4918 0.660 0.340
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0376 0.9679 0.996 0.004
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.8661 0.6056 0.288 0.712
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9706 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9578 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.2165 0.926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1975008 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0237 0.963 0.004 0.000 0.996
#> SRR1975003 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.1163 0.953 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974998 3 0.1031 0.955 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974997 3 0.1031 0.955 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974995 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.1289 0.951 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974994 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.4974 0.714 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974989 3 0.2261 0.909 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974991 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.1860 0.937 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974987 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.1411 0.949 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974984 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974983 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974981 1 0.1163 0.955 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974980 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974979 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.2165 0.926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974977 3 0.1643 0.943 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974976 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.2448 0.893 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974972 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.2356 0.919 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974966 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.1163 0.953 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974959 3 0.1529 0.946 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974958 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.5733 0.494 0.676 0.000 0.324
#> SRR1974954 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.3038 0.922 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974945 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.2165 0.926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974943 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.2165 0.926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974940 3 0.1163 0.953 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974939 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.1163 0.953 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974936 3 0.2261 0.923 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974935 3 0.1411 0.948 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974934 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.1289 0.951 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974931 3 0.1860 0.937 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974930 3 0.2356 0.921 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974929 3 0.2066 0.930 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974928 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0424 0.961 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974924 3 0.4931 0.720 0.232 0.000 0.768
#> SRR1974925 3 0.6299 0.135 0.476 0.000 0.524
#> SRR1974926 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974920 3 0.2165 0.926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974919 3 0.1411 0.948 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974918 3 0.0892 0.957 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974917 3 0.5859 0.410 0.000 0.344 0.656
#> SRR1974916 3 0.1860 0.937 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974915 3 0.1289 0.951 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974914 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974913 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974911 3 0.1860 0.938 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974910 3 0.1964 0.934 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974908 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.1529 0.946 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974906 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.1643 0.943 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974904 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.1529 0.946 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974902 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.1289 0.938 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974896 3 0.1289 0.938 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974893 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.2261 0.951 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974894 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974890 3 0.0237 0.963 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974891 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.5859 0.568 0.000 0.656 0.344
#> SRR1974888 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974887 1 0.4887 0.689 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974885 3 0.2066 0.931 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974883 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 3 0.3192 0.853 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974882 3 0.4750 0.696 0.000 0.216 0.784
#> SRR1974880 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974879 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.5216 0.724 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974876 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974878 3 0.0000 0.964 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974875 3 0.1529 0.946 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974874 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 2 0.8587 0.571 0.176 0.604 0.220
#> SRR1974869 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974868 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974870 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974866 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974867 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.1529 0.955 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974860 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974861 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974859 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.1529 0.955 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974856 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0424 0.947 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974855 2 0.3941 0.864 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974854 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0424 0.975 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974852 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974849 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974844 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0237 0.979 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974842 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974838 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974834 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974833 1 0.1860 0.927 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974831 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974832 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1753 0.956 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974827 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974824 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.5028 0.850 0.132 0.828 0.040
#> SRR1974820 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974811 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974804 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974797 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974796 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974795 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974793 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974792 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974791 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974790 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974789 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974788 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974786 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.6621 0.712 0.228 0.720 0.052
#> SRR1974784 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974783 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1337 0.957 0.972 0.012 0.016
#> SRR1974782 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974780 2 0.6496 0.741 0.208 0.736 0.056
#> SRR1974779 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.7796 0.361 0.392 0.552 0.056
#> SRR1974778 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974773 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974770 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974769 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974768 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974767 2 0.6158 0.772 0.188 0.760 0.052
#> SRR1974766 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974765 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974764 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974763 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974760 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974759 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974757 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974756 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974753 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.2066 0.955 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974747 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.2448 0.889 0.076 0.924 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 2 0.0747 0.938 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974723 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.0237 0.944 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974717 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974711 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974712 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974710 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974707 2 0.4602 0.876 0.108 0.852 0.040
#> SRR1974706 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.8792 0.422 0.580 0.176 0.244
#> SRR1974701 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.6483 0.358 0.392 0.600 0.008
#> SRR1974696 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974693 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974691 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 2 0.3752 0.812 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974675 3 0.4002 0.784 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974674 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974671 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974672 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0237 0.947 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974669 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974667 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974668 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974666 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974664 2 0.1289 0.953 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974665 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974663 2 0.6424 0.771 0.180 0.752 0.068
#> SRR1974662 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974660 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0237 0.978 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974656 2 0.5891 0.758 0.200 0.764 0.036
#> SRR1974650 2 0.1860 0.956 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974651 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.7232 0.131 0.544 0.428 0.028
#> SRR1974653 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 2 0.5728 0.764 0.196 0.772 0.032
#> SRR1974646 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974649 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974643 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974640 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974641 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974634 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.6950 0.220 0.572 0.408 0.020
#> SRR1974632 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.2096 0.956 0.004 0.944 0.052
#> SRR1974630 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974623 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974622 1 0.1267 0.954 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974620 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974619 2 0.0237 0.947 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974621 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.2356 0.902 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.5058 0.747 0.000 0.756 0.244
#> SRR1974613 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974612 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974610 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.5058 0.668 0.244 0.756 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974605 2 0.5560 0.568 0.300 0.700 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.945 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974602 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974601 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974599 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974598 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974596 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974594 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974593 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974595 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974592 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974591 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974588 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974590 2 0.1860 0.956 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974589 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974587 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974586 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974585 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974584 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974582 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974581 2 0.2165 0.954 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974580 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974578 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974577 2 0.2066 0.955 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974579 2 0.0592 0.949 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974576 2 0.1860 0.956 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974575 2 0.2066 0.955 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974574 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974573 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974571 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974572 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974570 2 0.6258 0.760 0.196 0.752 0.052
#> SRR1974568 1 0.1031 0.958 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974569 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974565 2 0.0747 0.942 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974564 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974560 1 0.1289 0.949 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.1860 0.956 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974562 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974561 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974557 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974553 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974555 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974554 2 0.2550 0.939 0.040 0.936 0.024
#> SRR1974558 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974549 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974548 2 0.1411 0.954 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974547 2 0.1860 0.956 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974546 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974545 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974544 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.1964 0.956 0.000 0.944 0.056
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0336 0.96481 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1975008 3 0.0336 0.96447 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1975006 2 0.4454 0.55851 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0188 0.96754 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975001 2 0.3801 0.67212 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1975002 2 0.4103 0.63863 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1974999 3 0.4888 0.21400 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.1302 0.93038 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974989 3 0.3306 0.78951 0.000 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974991 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0188 0.96776 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974983 2 0.4624 0.50165 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1974982 3 0.0469 0.96128 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974981 1 0.4981 0.13870 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1974980 3 0.0188 0.96776 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0469 0.96128 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.1389 0.92447 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974973 2 0.3649 0.68399 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.4193 0.62408 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0921 0.94610 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974966 3 0.1474 0.91870 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.4250 0.61204 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.4643 0.41063 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.2814 0.82607 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.4164 0.63012 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.4356 0.58833 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1974946 2 0.2124 0.76129 0.000 0.932 0.040 0.028
#> SRR1974945 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.4948 0.22497 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1974942 3 0.0817 0.95011 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0921 0.94610 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0921 0.94610 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.4277 0.60583 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0336 0.96448 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974930 3 0.0921 0.94610 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974929 3 0.0469 0.96128 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974928 2 0.5000 0.08665 0.000 0.500 0.500 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1302 0.93008 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974925 3 0.2081 0.88504 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974926 1 0.4522 0.52238 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0188 0.96786 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974920 3 0.0921 0.94610 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.2589 0.73368 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1974916 3 0.0188 0.96776 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0188 0.96776 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974911 3 0.0469 0.96157 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974910 3 0.0188 0.96776 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974908 2 0.4164 0.62794 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.3873 0.66599 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1974900 2 0.4564 0.53035 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR1974899 2 0.4250 0.61295 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1974897 2 0.3649 0.68245 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974896 2 0.3626 0.69240 0.000 0.812 0.184 0.004
#> SRR1974893 3 0.0592 0.95732 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974895 2 0.2131 0.76222 0.000 0.932 0.036 0.032
#> SRR1974894 3 0.4999 -0.07669 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.0469 0.96045 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974889 2 0.2918 0.73164 0.000 0.876 0.116 0.008
#> SRR1974888 2 0.4948 0.27663 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1974886 2 0.5573 0.23909 0.000 0.604 0.028 0.368
#> SRR1974887 3 0.6027 0.62228 0.192 0.000 0.684 0.124
#> SRR1974885 3 0.1004 0.94862 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1974883 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.4522 0.54338 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974881 2 0.4011 0.67686 0.000 0.784 0.208 0.008
#> SRR1974882 2 0.3539 0.69803 0.000 0.820 0.176 0.004
#> SRR1974880 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974879 2 0.4356 0.58913 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1974877 2 0.2222 0.75488 0.000 0.924 0.060 0.016
#> SRR1974876 3 0.2021 0.90727 0.000 0.012 0.932 0.056
#> SRR1974878 3 0.0000 0.97040 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0376 0.96617 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974874 2 0.4382 0.57075 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974873 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974871 4 0.4817 0.29573 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974872 2 0.8719 0.07288 0.172 0.448 0.068 0.312
#> SRR1974869 2 0.1807 0.74093 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1974868 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974870 2 0.1938 0.74183 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1974866 2 0.2048 0.73511 0.000 0.928 0.008 0.064
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2760 0.73173 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974864 1 0.3333 0.84306 0.872 0.040 0.000 0.088
#> SRR1974862 2 0.4643 0.50337 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1974863 2 0.2149 0.74816 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974860 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974861 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974859 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974858 2 0.2216 0.74652 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974856 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974857 2 0.2469 0.74196 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974855 4 0.4428 0.69622 0.000 0.068 0.124 0.808
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.4507 0.62370 0.224 0.020 0.000 0.756
#> SRR1974852 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.1118 0.76788 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974846 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974847 1 0.1209 0.93695 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1974845 4 0.4040 0.70133 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.5785 0.48962 0.668 0.044 0.008 0.280
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974839 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.4040 0.70133 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974834 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974833 4 0.4464 0.63919 0.208 0.024 0.000 0.768
#> SRR1974831 4 0.3726 0.72680 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2011 0.74976 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974827 4 0.3764 0.72454 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974824 1 0.0779 0.94934 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1974825 1 0.0524 0.95496 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 4 0.7401 0.46567 0.164 0.320 0.004 0.512
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.2281 0.86731 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0817 0.75294 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974812 1 0.1118 0.93563 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974810 1 0.1978 0.89742 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1974808 2 0.1890 0.74004 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2032 0.91277 0.936 0.028 0.000 0.036
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.3726 0.72680 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974804 1 0.3801 0.69523 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.4700 0.72545 0.788 0.040 0.008 0.164
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974797 2 0.3569 0.64335 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974796 4 0.3726 0.72680 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974795 4 0.3764 0.72454 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1938 0.75823 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1974792 4 0.4040 0.70133 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974791 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974790 2 0.4999 -0.06711 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1974789 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974788 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974786 1 0.1520 0.93007 0.956 0.020 0.000 0.024
#> SRR1974787 4 0.7833 0.42323 0.248 0.260 0.008 0.484
#> SRR1974784 4 0.3764 0.72454 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.5182 0.69335 0.764 0.040 0.020 0.176
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.3837 0.71946 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1974780 4 0.8309 0.33799 0.208 0.320 0.028 0.444
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 4 0.8283 0.30269 0.364 0.224 0.020 0.392
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 4 0.5384 0.61835 0.000 0.324 0.028 0.648
#> SRR1974770 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974769 4 0.3764 0.72454 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974768 2 0.4872 0.54063 0.000 0.728 0.028 0.244
#> SRR1974767 4 0.7735 0.36059 0.184 0.340 0.008 0.468
#> SRR1974766 2 0.4993 0.51163 0.000 0.712 0.028 0.260
#> SRR1974765 4 0.4331 0.65328 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1974764 2 0.2214 0.76256 0.000 0.928 0.028 0.044
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974760 4 0.3764 0.72454 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974757 2 0.4989 0.00143 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974755 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974753 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974751 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974750 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.4857 0.62044 0.000 0.324 0.008 0.668
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.2345 0.77292 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1974745 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974743 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3266 0.71866 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1974739 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974741 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974738 4 0.3649 0.67862 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974737 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974736 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.4008 0.71125 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974733 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974732 4 0.2413 0.77272 0.020 0.064 0.000 0.916
#> SRR1974731 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974725 4 0.2589 0.75796 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1974726 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.2048 0.73511 0.000 0.928 0.008 0.064
#> SRR1974723 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974722 4 0.2011 0.77804 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1974721 2 0.4304 0.58591 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974720 4 0.2408 0.76722 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.5132 -0.06384 0.000 0.548 0.004 0.448
#> SRR1974717 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974715 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.5236 -0.00452 0.000 0.560 0.008 0.432
#> SRR1974711 2 0.5138 0.14973 0.000 0.600 0.008 0.392
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.1970 0.73731 0.000 0.932 0.008 0.060
#> SRR1974710 2 0.2342 0.72678 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR1974707 4 0.7256 0.38861 0.116 0.388 0.008 0.488
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974702 1 0.8501 0.28694 0.528 0.092 0.148 0.232
#> SRR1974701 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974699 4 0.4843 0.25882 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974698 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 4 0.5657 0.70753 0.120 0.160 0.000 0.720
#> SRR1974696 4 0.2530 0.76601 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.5138 0.14908 0.000 0.600 0.008 0.392
#> SRR1974693 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974692 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974690 2 0.4996 -0.04565 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974688 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.2466 0.76942 0.028 0.056 0.000 0.916
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.2081 0.77767 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974675 2 0.3444 0.69695 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.1635 0.74336 0.000 0.948 0.008 0.044
#> SRR1974671 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974672 2 0.2408 0.74342 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974670 2 0.2469 0.74196 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974669 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974667 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974668 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974666 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974664 2 0.2216 0.74652 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974665 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974663 4 0.7716 0.35733 0.180 0.344 0.008 0.468
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.4877 0.33429 0.000 0.664 0.008 0.328
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.2830 0.87805 0.900 0.040 0.000 0.060
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.5746 0.33538 0.612 0.040 0.000 0.348
#> SRR1974656 4 0.6602 0.33452 0.068 0.432 0.004 0.496
#> SRR1974650 2 0.5161 0.12175 0.000 0.592 0.008 0.400
#> SRR1974651 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974652 4 0.7381 0.34566 0.392 0.128 0.008 0.472
#> SRR1974653 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974648 4 0.6414 0.45727 0.060 0.392 0.004 0.544
#> SRR1974646 2 0.1890 0.73956 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2214 0.76233 0.000 0.928 0.028 0.044
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.5040 0.24049 0.000 0.628 0.008 0.364
#> SRR1974640 2 0.5203 0.06176 0.000 0.576 0.008 0.416
#> SRR1974641 2 0.3907 0.64155 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.5203 0.06176 0.000 0.576 0.008 0.416
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974633 4 0.7559 0.39907 0.356 0.172 0.004 0.468
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.5461 -0.19932 0.004 0.508 0.008 0.480
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.1398 0.93077 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1938 0.75823 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1974623 2 0.4360 0.51825 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR1974622 1 0.6188 0.13753 0.548 0.056 0.000 0.396
#> SRR1974620 2 0.5099 0.19021 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974619 4 0.4994 0.29081 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 4 0.4781 0.63219 0.212 0.036 0.000 0.752
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.5767 0.45393 0.000 0.660 0.060 0.280
#> SRR1974613 2 0.5288 -0.16180 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.2124 0.73418 0.000 0.924 0.008 0.068
#> SRR1974610 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.3279 0.74950 0.032 0.096 0.000 0.872
#> SRR1974607 1 0.1520 0.93053 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR1974606 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974605 4 0.3215 0.75178 0.032 0.092 0.000 0.876
#> SRR1974604 4 0.2149 0.77912 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974603 2 0.5281 -0.13160 0.000 0.528 0.008 0.464
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4994 -0.13804 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974601 2 0.4482 0.48729 0.000 0.728 0.008 0.264
#> SRR1974599 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974598 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974596 2 0.1975 0.75735 0.000 0.936 0.016 0.048
#> SRR1974594 4 0.3266 0.75406 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1974593 2 0.1940 0.74990 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974595 4 0.4103 0.69215 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1974592 2 0.2002 0.76129 0.000 0.936 0.020 0.044
#> SRR1974591 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974588 4 0.2973 0.76081 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1974590 2 0.1867 0.75073 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974589 4 0.2973 0.75879 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1974587 2 0.4925 0.05740 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1974586 2 0.1940 0.74990 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974585 4 0.2814 0.75711 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1557 0.75293 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974582 2 0.2124 0.76341 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1974581 2 0.2021 0.76248 0.000 0.936 0.024 0.040
#> SRR1974580 4 0.3528 0.73912 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974578 4 0.2647 0.76721 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1974577 2 0.4957 0.34593 0.000 0.668 0.012 0.320
#> SRR1974579 4 0.3486 0.74048 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974576 2 0.1637 0.75289 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974575 2 0.1722 0.75675 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR1974574 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974573 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974571 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974572 4 0.3975 0.70783 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1974570 4 0.7763 0.39675 0.200 0.312 0.008 0.480
#> SRR1974568 4 0.6061 0.34199 0.400 0.048 0.000 0.552
#> SRR1974567 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974569 4 0.4040 0.70133 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974565 4 0.2101 0.76310 0.012 0.060 0.000 0.928
#> SRR1974564 2 0.4941 0.14513 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1974560 4 0.6445 0.21956 0.444 0.068 0.000 0.488
#> SRR1974559 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 4 0.3801 0.72202 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974562 4 0.4331 0.64828 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1974561 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974557 2 0.2216 0.74652 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974553 4 0.4040 0.70133 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0188 0.96016 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974552 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974554 4 0.6248 0.65827 0.104 0.252 0.000 0.644
#> SRR1974558 1 0.0524 0.95504 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96309 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.4511 0.47941 0.000 0.724 0.008 0.268
#> SRR1974549 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1974548 4 0.3764 0.72989 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974547 4 0.4164 0.70633 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1974546 2 0.5296 -0.22354 0.000 0.500 0.008 0.492
#> SRR1974545 2 0.2973 0.69094 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1974544 1 0.2131 0.90993 0.932 0.036 0.000 0.032
#> SRR1974543 4 0.4008 0.70451 0.000 0.244 0.000 0.756
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.4197 0.756980 0.000 0.000 0.728 0.028 0.244
#> SRR1975006 5 0.6121 0.248895 0.000 0.032 0.084 0.288 0.596
#> SRR1975005 3 0.2561 0.865504 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1975004 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.3659 0.801158 0.000 0.000 0.768 0.012 0.220
#> SRR1975001 5 0.5988 0.232131 0.000 0.056 0.044 0.296 0.604
#> SRR1975002 5 0.6122 0.245194 0.000 0.044 0.068 0.288 0.600
#> SRR1974999 5 0.6505 0.113870 0.000 0.004 0.340 0.176 0.480
#> SRR1975000 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.2929 0.843933 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974996 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1043 0.910251 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974992 3 0.0880 0.913014 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974990 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.4082 0.746278 0.000 0.164 0.788 0.012 0.036
#> SRR1974991 3 0.1792 0.893008 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974986 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3388 0.823375 0.000 0.000 0.792 0.008 0.200
#> SRR1974988 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.1410 0.902749 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974985 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.6169 0.248769 0.000 0.032 0.088 0.288 0.592
#> SRR1974982 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3816 0.548242 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.2813 0.851457 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974978 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.3266 0.826685 0.000 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR1974975 3 0.2561 0.865013 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1974974 3 0.4573 0.719845 0.000 0.000 0.700 0.044 0.256
#> SRR1974973 5 0.5896 0.228555 0.000 0.052 0.040 0.304 0.604
#> SRR1974972 3 0.0609 0.916977 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974971 5 0.6109 0.247023 0.000 0.040 0.072 0.288 0.600
#> SRR1974970 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.3109 0.829811 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974967 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.4887 0.655309 0.000 0.000 0.660 0.052 0.288
#> SRR1974964 3 0.0404 0.919219 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974963 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.2329 0.875270 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974962 5 0.6124 0.249909 0.000 0.040 0.076 0.280 0.604
#> SRR1974960 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 5 0.6358 0.141081 0.000 0.000 0.328 0.180 0.492
#> SRR1974957 3 0.3074 0.832955 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974956 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0609 0.906495 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 5 0.5916 0.253881 0.000 0.020 0.088 0.284 0.608
#> SRR1974952 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0510 0.918152 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974950 3 0.3074 0.832803 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974951 3 0.3266 0.826685 0.000 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR1974947 3 0.2471 0.869299 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974948 5 0.6184 0.251012 0.000 0.036 0.088 0.276 0.600
#> SRR1974946 5 0.5542 0.115694 0.000 0.072 0.000 0.396 0.532
#> SRR1974945 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.4060 0.425568 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.2891 0.847060 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1974941 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.3109 0.829811 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974938 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 5 0.6109 0.247023 0.000 0.040 0.072 0.288 0.600
#> SRR1974933 3 0.3003 0.838586 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974932 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.6928 0.222514 0.000 0.028 0.260 0.200 0.512
#> SRR1974927 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0404 0.913353 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4302 0.064182 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 5 0.5817 0.202170 0.000 0.060 0.024 0.328 0.588
#> SRR1974916 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3243 0.840103 0.000 0.004 0.812 0.004 0.180
#> SRR1974913 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 5 0.6122 0.245194 0.000 0.044 0.068 0.288 0.600
#> SRR1974909 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.2929 0.844184 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974907 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.3109 0.829811 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974903 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.3109 0.829811 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974901 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 5 0.6096 0.238308 0.000 0.052 0.056 0.292 0.600
#> SRR1974900 5 0.6390 0.248408 0.000 0.040 0.100 0.276 0.584
#> SRR1974899 5 0.6290 0.245935 0.000 0.048 0.076 0.288 0.588
#> SRR1974897 5 0.6036 0.237872 0.000 0.052 0.052 0.292 0.604
#> SRR1974896 5 0.6157 0.225933 0.000 0.068 0.044 0.296 0.592
#> SRR1974893 3 0.4276 0.741718 0.000 0.000 0.716 0.028 0.256
#> SRR1974895 5 0.5542 0.115546 0.000 0.072 0.000 0.396 0.532
#> SRR1974894 5 0.7198 0.217416 0.000 0.036 0.236 0.248 0.480
#> SRR1974892 3 0.2280 0.877969 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974890 3 0.0510 0.918196 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974891 3 0.4284 0.767560 0.000 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974889 5 0.5787 0.207698 0.000 0.060 0.024 0.320 0.596
#> SRR1974888 5 0.6819 0.236328 0.000 0.032 0.172 0.260 0.536
#> SRR1974886 5 0.6680 0.021934 0.000 0.364 0.000 0.236 0.400
#> SRR1974887 3 0.3375 0.790140 0.056 0.104 0.840 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.0162 0.919652 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.3039 0.835799 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974884 5 0.6370 0.249017 0.000 0.036 0.108 0.268 0.588
#> SRR1974881 5 0.6191 0.221048 0.000 0.068 0.044 0.304 0.584
#> SRR1974882 5 0.5979 0.216117 0.000 0.060 0.036 0.312 0.592
#> SRR1974880 5 0.5658 0.096142 0.000 0.080 0.000 0.408 0.512
#> SRR1974879 5 0.6277 0.246506 0.000 0.044 0.080 0.288 0.588
#> SRR1974877 5 0.5705 0.206220 0.000 0.060 0.020 0.320 0.600
#> SRR1974876 3 0.5146 0.748717 0.000 0.088 0.708 0.012 0.192
#> SRR1974878 3 0.2329 0.876041 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974875 3 0.0000 0.922359 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.2989 0.115267 0.000 0.060 0.000 0.868 0.072
#> SRR1974873 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974871 4 0.3852 0.025729 0.000 0.220 0.000 0.760 0.020
#> SRR1974872 5 0.6993 0.393709 0.088 0.156 0.000 0.176 0.580
#> SRR1974869 5 0.5337 0.098032 0.000 0.052 0.000 0.440 0.508
#> SRR1974868 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974870 5 0.4908 0.235354 0.000 0.044 0.000 0.320 0.636
#> SRR1974866 5 0.4701 0.370068 0.000 0.060 0.000 0.236 0.704
#> SRR1974867 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.5616 -0.004449 0.000 0.076 0.000 0.512 0.412
#> SRR1974864 1 0.6687 0.169858 0.476 0.080 0.000 0.052 0.392
#> SRR1974862 4 0.4226 0.086355 0.000 0.084 0.000 0.776 0.140
#> SRR1974863 4 0.5992 0.016567 0.000 0.112 0.000 0.472 0.416
#> SRR1974860 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974861 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974859 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974858 4 0.5992 0.016567 0.000 0.112 0.000 0.472 0.416
#> SRR1974856 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974857 4 0.5840 0.008130 0.000 0.096 0.000 0.488 0.416
#> SRR1974855 2 0.4294 0.634372 0.000 0.788 0.112 0.092 0.008
#> SRR1974854 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.2719 0.638152 0.144 0.852 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974852 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.4484 0.442715 0.000 0.668 0.000 0.308 0.024
#> SRR1974846 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974847 1 0.4074 0.510348 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974845 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.7819 0.190096 0.336 0.124 0.000 0.132 0.408
#> SRR1974842 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974839 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974834 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974833 2 0.3319 0.669645 0.100 0.856 0.032 0.008 0.004
#> SRR1974831 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.6150 -0.012666 0.000 0.132 0.000 0.464 0.404
#> SRR1974827 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.2852 0.786818 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974825 1 0.3274 0.727513 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974822 1 0.0162 0.947449 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974823 5 0.7321 0.356529 0.076 0.200 0.000 0.200 0.524
#> SRR1974820 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.2026 0.880483 0.924 0.056 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974815 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.3990 0.466253 0.000 0.688 0.000 0.308 0.004
#> SRR1974812 1 0.2690 0.793982 0.844 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.4406 0.711167 0.768 0.016 0.000 0.044 0.172
#> SRR1974808 5 0.4430 0.371317 0.000 0.076 0.000 0.172 0.752
#> SRR1974811 1 0.0162 0.947449 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974809 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.5022 0.601546 0.688 0.044 0.000 0.016 0.252
#> SRR1974806 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.3734 0.648979 0.752 0.240 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974803 1 0.0162 0.947449 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.6869 0.144739 0.468 0.088 0.000 0.060 0.384
#> SRR1974799 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974797 2 0.4491 0.358007 0.000 0.652 0.000 0.328 0.020
#> SRR1974796 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974792 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974791 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974790 2 0.3280 0.607640 0.000 0.812 0.000 0.176 0.012
#> SRR1974789 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974788 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974786 1 0.4650 0.586939 0.684 0.032 0.000 0.004 0.280
#> SRR1974787 5 0.7676 0.329426 0.128 0.188 0.000 0.184 0.500
#> SRR1974784 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.7038 0.116379 0.460 0.096 0.000 0.068 0.376
#> SRR1974782 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974780 5 0.7554 0.348930 0.120 0.176 0.000 0.188 0.516
#> SRR1974779 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.7873 0.301628 0.164 0.184 0.000 0.176 0.476
#> SRR1974778 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974773 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.5567 0.426610 0.000 0.644 0.000 0.196 0.160
#> SRR1974770 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974769 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974768 2 0.6813 -0.175272 0.000 0.356 0.000 0.340 0.304
#> SRR1974767 5 0.7398 0.357152 0.096 0.188 0.000 0.188 0.528
#> SRR1974766 2 0.6824 -0.200735 0.000 0.340 0.000 0.340 0.320
#> SRR1974765 2 0.2329 0.690557 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974764 4 0.6184 0.033583 0.000 0.140 0.000 0.480 0.380
#> SRR1974763 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974760 2 0.0000 0.799580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 4 0.6239 -0.000842 0.000 0.144 0.000 0.452 0.404
#> SRR1974757 2 0.4119 0.530273 0.000 0.752 0.000 0.212 0.036
#> SRR1974756 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974755 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974753 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974751 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974750 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.6268 0.354919 0.000 0.228 0.000 0.232 0.540
#> SRR1974747 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.4171 -0.019210 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1974745 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974743 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.4435 -0.006102 0.000 0.336 0.000 0.648 0.016
#> SRR1974739 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974741 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974738 4 0.4508 -0.006989 0.000 0.332 0.000 0.648 0.020
#> SRR1974737 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974736 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.6367 0.227049 0.000 0.168 0.000 0.372 0.460
#> SRR1974733 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974732 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974731 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974725 4 0.6486 -0.065220 0.000 0.204 0.000 0.472 0.324
#> SRR1974726 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.4168 0.361898 0.000 0.044 0.000 0.200 0.756
#> SRR1974723 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974722 4 0.4533 -0.023696 0.000 0.448 0.000 0.544 0.008
#> SRR1974721 4 0.2654 0.103653 0.000 0.048 0.000 0.888 0.064
#> SRR1974720 4 0.4803 -0.035295 0.000 0.444 0.000 0.536 0.020
#> SRR1974719 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.5964 0.410430 0.000 0.180 0.000 0.232 0.588
#> SRR1974717 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974715 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.5964 0.410430 0.000 0.180 0.000 0.232 0.588
#> SRR1974711 5 0.5949 0.416059 0.000 0.172 0.000 0.240 0.588
#> SRR1974712 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.4967 0.316667 0.000 0.060 0.000 0.280 0.660
#> SRR1974710 5 0.4555 0.392276 0.000 0.068 0.000 0.200 0.732
#> SRR1974707 5 0.6972 0.383643 0.052 0.184 0.000 0.212 0.552
#> SRR1974706 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974702 5 0.8228 0.127190 0.364 0.132 0.036 0.080 0.388
#> SRR1974701 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974699 4 0.3710 0.056121 0.000 0.192 0.000 0.784 0.024
#> SRR1974698 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.7748 0.198974 0.092 0.224 0.000 0.224 0.460
#> SRR1974696 4 0.6130 -0.020596 0.000 0.180 0.000 0.556 0.264
#> SRR1974694 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.5918 0.421362 0.000 0.168 0.000 0.240 0.592
#> SRR1974693 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974692 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974690 2 0.3151 0.642624 0.000 0.836 0.000 0.144 0.020
#> SRR1974691 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974688 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974681 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.4420 -0.018371 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974675 5 0.5992 0.238058 0.000 0.048 0.052 0.296 0.604
#> SRR1974674 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 4 0.5857 -0.024054 0.000 0.096 0.000 0.460 0.444
#> SRR1974671 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974672 4 0.5757 0.004712 0.000 0.088 0.000 0.496 0.416
#> SRR1974670 4 0.5840 0.008130 0.000 0.096 0.000 0.488 0.416
#> SRR1974669 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974667 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974668 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974666 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974664 4 0.5992 0.016567 0.000 0.112 0.000 0.472 0.416
#> SRR1974665 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974663 5 0.7218 0.369140 0.080 0.188 0.000 0.188 0.544
#> SRR1974662 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.5752 0.424216 0.000 0.148 0.000 0.240 0.612
#> SRR1974660 1 0.0963 0.920993 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974659 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.6234 0.276262 0.520 0.064 0.000 0.036 0.380
#> SRR1974654 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.8015 0.198379 0.304 0.148 0.000 0.144 0.404
#> SRR1974656 5 0.6916 0.386337 0.052 0.176 0.000 0.212 0.560
#> SRR1974650 5 0.5941 0.418344 0.000 0.168 0.000 0.244 0.588
#> SRR1974651 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974652 5 0.8100 0.243233 0.220 0.184 0.000 0.164 0.432
#> SRR1974653 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974648 5 0.6860 0.384711 0.048 0.180 0.000 0.208 0.564
#> SRR1974646 5 0.4615 0.291895 0.000 0.048 0.000 0.252 0.700
#> SRR1974649 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 4 0.6194 0.035970 0.000 0.140 0.000 0.472 0.388
#> SRR1974643 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.5872 0.421988 0.000 0.168 0.000 0.232 0.600
#> SRR1974640 5 0.5904 0.415813 0.000 0.172 0.000 0.232 0.596
#> SRR1974641 4 0.3616 0.018021 0.000 0.032 0.000 0.804 0.164
#> SRR1974639 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.5964 0.410430 0.000 0.180 0.000 0.232 0.588
#> SRR1974634 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974633 5 0.7896 0.292518 0.176 0.164 0.000 0.188 0.472
#> SRR1974632 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.5975 0.403487 0.000 0.188 0.000 0.224 0.588
#> SRR1974630 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.4114 0.489377 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1974624 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 4 0.6021 0.019216 0.000 0.116 0.000 0.476 0.408
#> SRR1974623 5 0.5365 0.414705 0.000 0.116 0.000 0.228 0.656
#> SRR1974622 5 0.8050 0.208836 0.284 0.152 0.000 0.152 0.412
#> SRR1974620 5 0.5941 0.418265 0.000 0.168 0.000 0.244 0.588
#> SRR1974619 5 0.6108 0.383163 0.000 0.188 0.000 0.248 0.564
#> SRR1974621 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.2919 0.675971 0.104 0.868 0.000 0.004 0.024
#> SRR1974615 1 0.0162 0.947555 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.5980 0.423597 0.000 0.172 0.004 0.220 0.604
#> SRR1974613 5 0.5975 0.403487 0.000 0.188 0.000 0.224 0.588
#> SRR1974612 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.4429 0.386008 0.000 0.064 0.000 0.192 0.744
#> SRR1974610 4 0.4262 -0.015115 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.7175 -0.138257 0.016 0.276 0.000 0.380 0.328
#> SRR1974607 1 0.4227 0.600778 0.692 0.016 0.000 0.000 0.292
#> SRR1974606 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974605 4 0.6882 -0.127607 0.004 0.260 0.000 0.380 0.356
#> SRR1974604 4 0.4273 -0.014253 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974603 5 0.5975 0.403487 0.000 0.188 0.000 0.224 0.588
#> SRR1974602 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.6385 0.126019 0.000 0.472 0.000 0.352 0.176
#> SRR1974601 5 0.5775 0.422641 0.000 0.136 0.000 0.264 0.600
#> SRR1974599 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974598 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974596 4 0.6232 0.031335 0.000 0.148 0.000 0.480 0.372
#> SRR1974594 2 0.3141 0.667194 0.000 0.832 0.000 0.152 0.016
#> SRR1974593 4 0.6055 0.011166 0.000 0.120 0.000 0.472 0.408
#> SRR1974595 2 0.1121 0.769814 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974592 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974591 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974588 2 0.3452 0.656723 0.000 0.820 0.000 0.148 0.032
#> SRR1974590 4 0.6285 0.010846 0.000 0.152 0.000 0.456 0.392
#> SRR1974589 2 0.3098 0.670751 0.000 0.836 0.000 0.148 0.016
#> SRR1974587 2 0.6697 -0.057165 0.000 0.384 0.000 0.376 0.240
#> SRR1974586 4 0.6055 0.011166 0.000 0.120 0.000 0.472 0.408
#> SRR1974585 2 0.3194 0.667351 0.000 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1974584 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 4 0.6062 0.021244 0.000 0.120 0.000 0.464 0.416
#> SRR1974582 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974581 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974580 2 0.2280 0.707188 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974578 2 0.3535 0.640603 0.000 0.808 0.000 0.164 0.028
#> SRR1974577 5 0.6608 0.303985 0.000 0.300 0.000 0.244 0.456
#> SRR1974579 2 0.2864 0.685166 0.000 0.852 0.000 0.136 0.012
#> SRR1974576 4 0.6177 0.009046 0.000 0.136 0.000 0.464 0.400
#> SRR1974575 4 0.6132 0.039348 0.000 0.132 0.000 0.480 0.388
#> SRR1974574 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974573 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974571 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974572 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974570 5 0.7519 0.346944 0.108 0.188 0.000 0.188 0.516
#> SRR1974568 5 0.8129 0.092346 0.168 0.304 0.000 0.144 0.384
#> SRR1974567 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974569 2 0.0794 0.784262 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974565 2 0.3774 0.647159 0.008 0.808 0.000 0.152 0.032
#> SRR1974564 2 0.3819 0.530195 0.000 0.756 0.000 0.228 0.016
#> SRR1974560 5 0.8137 0.188455 0.268 0.184 0.000 0.144 0.404
#> SRR1974559 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0162 0.797476 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974562 2 0.1043 0.772741 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974561 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974557 4 0.5992 0.016567 0.000 0.112 0.000 0.472 0.416
#> SRR1974553 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0404 0.940046 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0162 0.800692 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974554 5 0.7505 0.188787 0.056 0.308 0.000 0.200 0.436
#> SRR1974558 1 0.2329 0.837790 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974556 1 0.0000 0.950562 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.5689 0.411304 0.000 0.136 0.000 0.248 0.616
#> SRR1974549 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974548 2 0.3521 0.677660 0.000 0.820 0.000 0.140 0.040
#> SRR1974547 5 0.6510 0.083817 0.000 0.380 0.000 0.192 0.428
#> SRR1974546 5 0.6030 0.395542 0.000 0.196 0.000 0.224 0.580
#> SRR1974545 2 0.4835 0.224762 0.000 0.592 0.000 0.380 0.028
#> SRR1974544 1 0.5689 0.354727 0.556 0.068 0.000 0.008 0.368
#> SRR1974543 2 0.0290 0.801151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975008 2 0.3982 -0.3738 0.000 0.536 0.460 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975006 2 0.0858 0.6404 0.000 0.968 0.004 0.000 0.028 0.000
#> SRR1975005 3 0.3769 0.6404 0.000 0.356 0.640 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975004 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975003 2 0.3869 -0.4590 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 2 0.0858 0.6408 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1975002 2 0.0858 0.6408 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974999 2 0.2709 0.4968 0.000 0.848 0.132 0.000 0.020 0.000
#> SRR1975000 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974998 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974997 3 0.0405 0.8737 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974995 3 0.3915 0.5807 0.000 0.412 0.584 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974996 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.2100 0.8256 0.000 0.112 0.884 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974992 3 0.1806 0.8386 0.000 0.088 0.908 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974990 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974989 3 0.4655 0.7287 0.000 0.108 0.744 0.120 0.016 0.012
#> SRR1974991 3 0.2805 0.7808 0.000 0.184 0.812 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974986 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974987 3 0.3847 0.5290 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974984 3 0.2482 0.8041 0.000 0.148 0.848 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974985 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974983 2 0.0993 0.6373 0.000 0.964 0.012 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974982 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974981 3 0.2520 0.7266 0.152 0.000 0.844 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974980 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974979 3 0.3756 0.6443 0.000 0.352 0.644 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974978 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974977 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974976 3 0.3851 0.5226 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.3601 0.6815 0.000 0.312 0.684 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974974 2 0.3854 -0.3814 0.000 0.536 0.464 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0858 0.6408 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974972 3 0.1219 0.8581 0.000 0.048 0.948 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974971 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974970 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974969 3 0.0291 0.8764 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974968 3 0.3847 0.5290 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974965 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974966 2 0.4192 -0.2622 0.000 0.572 0.412 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974964 3 0.0935 0.8649 0.000 0.032 0.964 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974963 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974961 3 0.3189 0.7435 0.000 0.236 0.760 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974962 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974960 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.2573 0.5291 0.000 0.864 0.112 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974957 3 0.3937 0.5664 0.000 0.424 0.572 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974956 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974955 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974954 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974953 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974952 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974949 3 0.1285 0.8563 0.000 0.052 0.944 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974950 3 0.3955 0.5513 0.000 0.436 0.560 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974951 3 0.3971 0.5350 0.000 0.448 0.548 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974947 3 0.3508 0.6989 0.000 0.292 0.704 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974948 2 0.0972 0.6383 0.000 0.964 0.008 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974946 2 0.4242 0.6945 0.000 0.736 0.000 0.000 0.136 0.128
#> SRR1974945 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3081 0.6401 0.220 0.000 0.776 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974943 3 0.3890 0.5947 0.000 0.400 0.596 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974941 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974940 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974939 3 0.3966 0.5409 0.000 0.444 0.552 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974938 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974937 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974936 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974935 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974933 3 0.3937 0.5664 0.000 0.424 0.572 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974930 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974929 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974928 2 0.2214 0.5549 0.000 0.888 0.096 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974925 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974926 3 0.3805 0.4570 0.328 0.000 0.664 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974923 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974922 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974921 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974920 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974919 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974917 2 0.1918 0.6592 0.000 0.904 0.000 0.000 0.088 0.008
#> SRR1974916 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974915 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.4406 0.5584 0.000 0.424 0.556 0.004 0.008 0.008
#> SRR1974913 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974911 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974910 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974908 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974909 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.3899 0.5899 0.000 0.404 0.592 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974907 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974905 3 0.0146 0.8766 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974904 3 0.3966 0.5409 0.000 0.444 0.552 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.8764 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.3950 0.5569 0.000 0.432 0.564 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974901 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974898 2 0.0858 0.6408 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974900 2 0.0665 0.6308 0.000 0.980 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974899 2 0.0777 0.6397 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974897 2 0.1003 0.6393 0.000 0.964 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974896 2 0.0551 0.6304 0.000 0.984 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974893 2 0.4147 -0.3236 0.000 0.552 0.436 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974895 2 0.4242 0.6945 0.000 0.736 0.000 0.000 0.136 0.128
#> SRR1974894 2 0.1542 0.5983 0.000 0.936 0.052 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974892 3 0.4000 0.6661 0.000 0.324 0.660 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974890 3 0.1900 0.8476 0.000 0.068 0.916 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974891 2 0.4308 -0.3864 0.000 0.532 0.452 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974889 2 0.1745 0.6550 0.000 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1974888 2 0.1692 0.6039 0.000 0.932 0.048 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974886 2 0.5382 0.5507 0.000 0.668 0.000 0.104 0.052 0.176
#> SRR1974887 3 0.2509 0.8286 0.024 0.012 0.908 0.028 0.012 0.016
#> SRR1974885 3 0.0779 0.8661 0.000 0.008 0.976 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974883 3 0.4296 0.5389 0.000 0.440 0.544 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974884 2 0.1176 0.6321 0.000 0.956 0.020 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974881 2 0.0665 0.6286 0.000 0.980 0.008 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974882 2 0.0405 0.6324 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974880 2 0.3878 0.6898 0.000 0.772 0.000 0.000 0.116 0.112
#> SRR1974879 2 0.0779 0.6297 0.000 0.976 0.008 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974877 2 0.1349 0.6497 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974876 3 0.5352 0.4535 0.000 0.444 0.480 0.008 0.008 0.060
#> SRR1974878 3 0.3714 0.7208 0.000 0.264 0.720 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974875 3 0.0984 0.8638 0.000 0.012 0.968 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974874 4 0.4305 0.6293 0.000 0.016 0.000 0.752 0.084 0.148
#> SRR1974873 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974871 4 0.3211 0.7158 0.000 0.000 0.000 0.824 0.056 0.120
#> SRR1974872 5 0.3425 0.8329 0.048 0.000 0.000 0.084 0.836 0.032
#> SRR1974869 2 0.5727 0.5609 0.000 0.456 0.000 0.004 0.396 0.144
#> SRR1974868 2 0.5729 0.7138 0.000 0.540 0.000 0.004 0.204 0.252
#> SRR1974870 5 0.4094 0.2256 0.000 0.264 0.000 0.004 0.700 0.032
#> SRR1974866 5 0.2133 0.7233 0.000 0.052 0.000 0.016 0.912 0.020
#> SRR1974867 1 0.0363 0.9687 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974865 2 0.6926 0.6610 0.000 0.480 0.000 0.112 0.236 0.172
#> SRR1974864 5 0.4475 0.7371 0.192 0.000 0.000 0.052 0.728 0.028
#> SRR1974862 4 0.5362 0.5439 0.000 0.084 0.000 0.684 0.088 0.144
#> SRR1974863 2 0.6157 0.7048 0.000 0.508 0.000 0.020 0.248 0.224
#> SRR1974860 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974861 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974859 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974858 2 0.6119 0.7055 0.000 0.516 0.000 0.020 0.248 0.216
#> SRR1974856 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974857 2 0.6446 0.6953 0.000 0.508 0.000 0.048 0.248 0.196
#> SRR1974855 6 0.6311 0.6519 0.000 0.004 0.128 0.256 0.060 0.552
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 6 0.4915 0.7581 0.100 0.000 0.000 0.180 0.024 0.696
#> SRR1974852 6 0.3189 0.8729 0.000 0.000 0.000 0.184 0.020 0.796
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5189 -0.4078 0.000 0.000 0.000 0.468 0.088 0.444
#> SRR1974846 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974847 5 0.3898 0.6214 0.296 0.000 0.000 0.000 0.684 0.020
#> SRR1974845 6 0.3269 0.8736 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.4492 0.7715 0.148 0.000 0.000 0.080 0.744 0.028
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974839 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.3189 0.8729 0.000 0.000 0.000 0.184 0.020 0.796
#> SRR1974834 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974833 6 0.5149 0.7895 0.040 0.000 0.048 0.184 0.024 0.704
#> SRR1974831 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.6054 0.6920 0.000 0.500 0.000 0.012 0.272 0.216
#> SRR1974827 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974824 1 0.3934 0.4848 0.676 0.000 0.000 0.000 0.304 0.020
#> SRR1974825 1 0.4305 0.0643 0.544 0.000 0.000 0.000 0.436 0.020
#> SRR1974822 1 0.0363 0.9690 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974823 5 0.2502 0.8381 0.012 0.000 0.000 0.084 0.884 0.020
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.2620 0.8747 0.892 0.000 0.004 0.048 0.032 0.024
#> SRR1974815 1 0.0146 0.9734 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.4184 -0.3989 0.000 0.000 0.000 0.504 0.012 0.484
#> SRR1974812 1 0.3673 0.6479 0.736 0.000 0.000 0.004 0.016 0.244
#> SRR1974810 1 0.5030 0.1962 0.576 0.000 0.000 0.044 0.360 0.020
#> SRR1974808 5 0.0914 0.7618 0.000 0.016 0.000 0.000 0.968 0.016
#> SRR1974811 1 0.0692 0.9601 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 5 0.4721 0.2105 0.464 0.000 0.000 0.004 0.496 0.036
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974804 1 0.4259 0.6704 0.752 0.000 0.000 0.072 0.016 0.160
#> SRR1974803 1 0.0725 0.9607 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.4466 0.7513 0.176 0.000 0.000 0.060 0.736 0.028
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.5750 0.7146 0.000 0.536 0.000 0.004 0.208 0.252
#> SRR1974797 6 0.1346 0.7223 0.000 0.016 0.000 0.024 0.008 0.952
#> SRR1974796 6 0.3269 0.8728 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974795 6 0.3269 0.8728 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974792 6 0.3212 0.8697 0.000 0.004 0.000 0.180 0.016 0.800
#> SRR1974791 6 0.3269 0.8728 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974790 6 0.2274 0.7952 0.000 0.012 0.000 0.088 0.008 0.892
#> SRR1974789 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974788 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974786 5 0.4474 0.3826 0.412 0.000 0.000 0.004 0.560 0.024
#> SRR1974787 5 0.3953 0.8184 0.080 0.000 0.000 0.084 0.800 0.036
#> SRR1974784 6 0.3329 0.8721 0.000 0.004 0.000 0.184 0.020 0.792
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 5 0.4459 0.7377 0.192 0.000 0.000 0.056 0.728 0.024
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.3329 0.8721 0.000 0.004 0.000 0.184 0.020 0.792
#> SRR1974780 5 0.3918 0.8227 0.072 0.004 0.000 0.084 0.808 0.032
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.4003 0.8151 0.088 0.000 0.000 0.080 0.796 0.036
#> SRR1974778 1 0.0458 0.9660 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974774 2 0.5724 0.7120 0.000 0.540 0.000 0.004 0.200 0.256
#> SRR1974773 1 0.0146 0.9733 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 5 0.7435 -0.1409 0.000 0.152 0.000 0.188 0.332 0.328
#> SRR1974770 2 0.5724 0.7120 0.000 0.540 0.000 0.004 0.200 0.256
#> SRR1974769 6 0.3345 0.8732 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974768 2 0.6365 0.5113 0.000 0.428 0.000 0.036 0.156 0.380
#> SRR1974767 5 0.3549 0.8303 0.056 0.000 0.000 0.084 0.828 0.032
#> SRR1974766 2 0.6364 0.5902 0.000 0.468 0.000 0.036 0.168 0.328
#> SRR1974765 6 0.2149 0.7942 0.000 0.004 0.000 0.080 0.016 0.900
#> SRR1974764 2 0.5745 0.7111 0.000 0.536 0.000 0.004 0.204 0.256
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0146 0.9733 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974761 2 0.5724 0.7120 0.000 0.540 0.000 0.004 0.200 0.256
#> SRR1974760 6 0.3269 0.8728 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.5989 0.6646 0.000 0.480 0.000 0.004 0.268 0.248
#> SRR1974757 6 0.2094 0.7632 0.000 0.024 0.000 0.064 0.004 0.908
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974755 2 0.5724 0.7120 0.000 0.540 0.000 0.004 0.200 0.256
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974750 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.3397 0.8248 0.000 0.036 0.000 0.092 0.836 0.036
#> SRR1974747 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974748 1 0.0547 0.9634 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0363 0.8936 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974745 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974743 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974742 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974740 4 0.1367 0.8496 0.000 0.000 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR1974739 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.1320 0.8555 0.000 0.000 0.000 0.948 0.016 0.036
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.2748 0.8233 0.000 0.008 0.000 0.120 0.856 0.016
#> SRR1974733 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974732 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974731 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0458 0.9660 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.4260 -0.1181 0.000 0.000 0.000 0.512 0.472 0.016
#> SRR1974726 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.1528 0.7489 0.000 0.028 0.000 0.012 0.944 0.016
#> SRR1974723 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974721 4 0.4897 0.5727 0.000 0.020 0.000 0.700 0.128 0.152
#> SRR1974720 4 0.0405 0.8990 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974719 1 0.0692 0.9601 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974718 1 0.0363 0.9687 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974716 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974711 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.3719 0.5254 0.000 0.148 0.000 0.012 0.792 0.048
#> SRR1974710 5 0.1952 0.8089 0.000 0.016 0.000 0.052 0.920 0.012
#> SRR1974707 5 0.2739 0.8386 0.008 0.008 0.000 0.084 0.876 0.024
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.4540 0.7565 0.168 0.004 0.000 0.060 0.740 0.028
#> SRR1974701 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974699 4 0.2510 0.7709 0.000 0.000 0.000 0.872 0.028 0.100
#> SRR1974698 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.3161 0.8350 0.032 0.004 0.000 0.092 0.852 0.020
#> SRR1974696 4 0.3288 0.5249 0.000 0.000 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1974694 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974695 5 0.2322 0.8298 0.000 0.008 0.000 0.072 0.896 0.024
#> SRR1974693 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974692 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974690 6 0.2325 0.7994 0.000 0.008 0.000 0.100 0.008 0.884
#> SRR1974691 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974689 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974688 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974687 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0146 0.9730 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0291 0.9713 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974682 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.5729 0.7138 0.000 0.540 0.000 0.004 0.204 0.252
#> SRR1974675 2 0.0858 0.6408 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.5828 0.6852 0.000 0.512 0.000 0.004 0.284 0.200
#> SRR1974671 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974672 2 0.6577 0.6848 0.000 0.508 0.000 0.068 0.248 0.176
#> SRR1974670 2 0.6414 0.6971 0.000 0.508 0.000 0.044 0.248 0.200
#> SRR1974669 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974667 2 0.5745 0.7111 0.000 0.536 0.000 0.004 0.204 0.256
#> SRR1974668 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974666 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974664 2 0.6260 0.7020 0.000 0.516 0.000 0.032 0.248 0.204
#> SRR1974665 2 0.5762 0.7100 0.000 0.532 0.000 0.004 0.204 0.260
#> SRR1974663 5 0.3293 0.8350 0.040 0.000 0.000 0.084 0.844 0.032
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.2262 0.8302 0.000 0.008 0.000 0.080 0.896 0.016
#> SRR1974660 1 0.1616 0.9150 0.932 0.000 0.000 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.4339 0.7224 0.208 0.000 0.000 0.036 0.728 0.028
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.4577 0.7718 0.144 0.000 0.000 0.084 0.740 0.032
#> SRR1974656 5 0.2545 0.8378 0.004 0.008 0.000 0.084 0.884 0.020
#> SRR1974650 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.4413 0.7905 0.120 0.000 0.000 0.084 0.760 0.036
#> SRR1974653 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974648 5 0.2545 0.8378 0.004 0.008 0.000 0.084 0.884 0.020
#> SRR1974646 5 0.3562 0.4721 0.000 0.176 0.000 0.004 0.784 0.036
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.5762 0.7100 0.000 0.532 0.000 0.004 0.204 0.260
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.2349 0.8357 0.000 0.008 0.000 0.080 0.892 0.020
#> SRR1974640 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974641 4 0.6228 0.3667 0.000 0.076 0.000 0.580 0.188 0.156
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0458 0.9660 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9042 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.3361 0.8361 0.040 0.004 0.000 0.084 0.844 0.028
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 5 0.3840 0.6401 0.284 0.000 0.000 0.000 0.696 0.020
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.5934 0.7096 0.000 0.516 0.000 0.008 0.244 0.232
#> SRR1974623 5 0.2136 0.8184 0.000 0.016 0.000 0.064 0.908 0.012
#> SRR1974622 5 0.4111 0.8001 0.112 0.000 0.000 0.084 0.780 0.024
#> SRR1974620 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974619 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0260 0.9712 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974616 6 0.4677 0.7940 0.056 0.000 0.000 0.168 0.048 0.728
#> SRR1974615 1 0.0717 0.9604 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.2563 0.8369 0.000 0.008 0.000 0.084 0.880 0.028
#> SRR1974613 5 0.2402 0.8365 0.000 0.008 0.000 0.084 0.888 0.020
#> SRR1974612 1 0.0458 0.9660 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974611 5 0.1275 0.7758 0.000 0.016 0.000 0.016 0.956 0.012
#> SRR1974610 4 0.0146 0.9010 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.3977 0.6447 0.004 0.000 0.000 0.284 0.692 0.020
#> SRR1974607 5 0.4426 0.4428 0.388 0.000 0.000 0.004 0.584 0.024
#> SRR1974606 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974605 5 0.4136 0.6886 0.004 0.000 0.000 0.248 0.708 0.040
#> SRR1974604 4 0.0146 0.9057 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974603 5 0.2485 0.8367 0.000 0.008 0.000 0.084 0.884 0.024
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 6 0.7032 0.2882 0.000 0.124 0.000 0.180 0.228 0.468
#> SRR1974601 5 0.2058 0.8251 0.000 0.008 0.000 0.072 0.908 0.012
#> SRR1974599 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974598 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974596 2 0.5813 0.7060 0.000 0.520 0.000 0.004 0.208 0.268
#> SRR1974594 6 0.4893 0.6734 0.000 0.000 0.000 0.356 0.072 0.572
#> SRR1974593 2 0.6054 0.7037 0.000 0.504 0.000 0.012 0.252 0.232
#> SRR1974595 6 0.2911 0.8493 0.000 0.000 0.000 0.144 0.024 0.832
#> SRR1974592 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974591 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974588 6 0.5147 0.6453 0.000 0.000 0.000 0.356 0.096 0.548
#> SRR1974590 2 0.6004 0.6724 0.000 0.468 0.000 0.004 0.228 0.300
#> SRR1974589 6 0.4882 0.6801 0.000 0.000 0.000 0.352 0.072 0.576
#> SRR1974587 6 0.7285 0.0903 0.000 0.140 0.000 0.196 0.248 0.416
#> SRR1974586 2 0.6071 0.7044 0.000 0.500 0.000 0.012 0.252 0.236
#> SRR1974585 6 0.4871 0.6859 0.000 0.000 0.000 0.348 0.072 0.580
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.5968 0.7089 0.000 0.508 0.000 0.008 0.240 0.244
#> SRR1974582 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974581 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974580 6 0.4736 0.6884 0.000 0.000 0.000 0.352 0.060 0.588
#> SRR1974578 6 0.5174 0.6236 0.000 0.000 0.000 0.368 0.096 0.536
#> SRR1974577 5 0.4811 0.4840 0.000 0.124 0.000 0.016 0.704 0.156
#> SRR1974579 6 0.4871 0.6839 0.000 0.000 0.000 0.348 0.072 0.580
#> SRR1974576 2 0.5985 0.7073 0.000 0.504 0.000 0.008 0.244 0.244
#> SRR1974575 2 0.5771 0.7153 0.000 0.532 0.000 0.004 0.212 0.252
#> SRR1974574 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974573 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974571 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974572 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974570 5 0.3757 0.8223 0.076 0.000 0.000 0.084 0.812 0.028
#> SRR1974568 5 0.4836 0.7673 0.088 0.000 0.000 0.080 0.736 0.096
#> SRR1974567 1 0.0260 0.9713 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974566 6 0.3269 0.8729 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974569 6 0.3202 0.8701 0.000 0.000 0.000 0.176 0.024 0.800
#> SRR1974565 6 0.5327 0.6206 0.004 0.000 0.000 0.360 0.100 0.536
#> SRR1974564 6 0.1942 0.7650 0.000 0.008 0.000 0.064 0.012 0.916
#> SRR1974560 5 0.4521 0.7804 0.124 0.000 0.000 0.084 0.752 0.040
#> SRR1974559 1 0.0405 0.9693 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974563 6 0.3418 0.8730 0.000 0.000 0.000 0.184 0.032 0.784
#> SRR1974562 6 0.3013 0.8463 0.000 0.004 0.000 0.140 0.024 0.832
#> SRR1974561 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974557 2 0.6116 0.7035 0.000 0.504 0.000 0.016 0.252 0.228
#> SRR1974553 6 0.3269 0.8729 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9754 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0405 0.9693 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974552 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974554 5 0.2831 0.8346 0.016 0.000 0.000 0.084 0.868 0.032
#> SRR1974558 1 0.3629 0.5864 0.724 0.000 0.000 0.000 0.260 0.016
#> SRR1974556 1 0.0260 0.9713 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974550 5 0.2803 0.7945 0.000 0.032 0.000 0.064 0.876 0.028
#> SRR1974549 6 0.3345 0.8738 0.000 0.000 0.000 0.184 0.028 0.788
#> SRR1974548 6 0.5121 0.6683 0.000 0.000 0.000 0.332 0.100 0.568
#> SRR1974547 5 0.3227 0.7967 0.000 0.000 0.000 0.084 0.828 0.088
#> SRR1974546 5 0.2290 0.8360 0.000 0.004 0.000 0.084 0.892 0.020
#> SRR1974545 6 0.1546 0.7071 0.000 0.016 0.000 0.020 0.020 0.944
#> SRR1974544 5 0.4002 0.6667 0.260 0.000 0.000 0.000 0.704 0.036
#> SRR1974543 6 0.3269 0.8729 0.000 0.000 0.000 0.184 0.024 0.792
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.906 0.927 0.970 0.4995 0.500 0.500
#> 3 3 0.944 0.931 0.972 0.3178 0.746 0.537
#> 4 4 0.877 0.882 0.946 0.1279 0.834 0.565
#> 5 5 0.880 0.893 0.935 0.0490 0.947 0.801
#> 6 6 0.973 0.933 0.965 0.0491 0.933 0.716
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1975004 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1975000 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974998 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974997 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974995 2 0.0938 0.9652 0.012 0.988
#> SRR1974996 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.9933 0.1800 0.548 0.452
#> SRR1974992 2 0.9954 0.1427 0.460 0.540
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.4690 0.8745 0.100 0.900
#> SRR1974991 2 0.8909 0.5487 0.308 0.692
#> SRR1974986 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.9850 0.2480 0.428 0.572
#> SRR1974985 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.0938 0.9652 0.012 0.988
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.2043 0.9464 0.032 0.968
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.6247 0.8029 0.156 0.844
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974970 1 0.0376 0.9586 0.996 0.004
#> SRR1974969 2 0.9795 0.2829 0.416 0.584
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974967 1 0.2948 0.9184 0.948 0.052
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974964 1 0.8267 0.6503 0.740 0.260
#> SRR1974963 1 0.0672 0.9555 0.992 0.008
#> SRR1974961 2 0.7674 0.7018 0.224 0.776
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974959 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1974956 1 0.8955 0.5517 0.688 0.312
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.4431 0.8809 0.908 0.092
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974952 1 0.5842 0.8257 0.860 0.140
#> SRR1974949 1 0.9635 0.3723 0.612 0.388
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0938 0.9651 0.012 0.988
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974938 1 0.0376 0.9586 0.996 0.004
#> SRR1974937 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1974932 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974927 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.7219 0.7523 0.800 0.200
#> SRR1974922 1 0.0376 0.9586 0.996 0.004
#> SRR1974921 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.4298 0.8879 0.088 0.912
#> SRR1974907 1 0.6048 0.8160 0.852 0.148
#> SRR1974905 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1974903 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974901 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974890 1 0.6247 0.8067 0.844 0.156
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.3584 0.9107 0.068 0.932
#> SRR1974875 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.9732 0.3180 0.404 0.596
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.7139 0.7565 0.804 0.196
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.5629 0.8382 0.868 0.132
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.1184 0.9615 0.016 0.984
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.4939 0.8640 0.892 0.108
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.8661 0.6098 0.712 0.288
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974796 1 0.9977 0.1417 0.528 0.472
#> SRR1974795 2 0.4690 0.8736 0.100 0.900
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.9170 0.5092 0.668 0.332
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.9833 0.2601 0.424 0.576
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2043 0.9358 0.968 0.032
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.9000 0.5319 0.316 0.684
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0376 0.9719 0.004 0.996
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.9044 0.5475 0.680 0.320
#> SRR1974750 1 0.9988 0.1137 0.520 0.480
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.3274 0.9172 0.060 0.940
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.9754 0.2809 0.408 0.592
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.9686 0.3719 0.604 0.396
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.2236 0.9330 0.964 0.036
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974722 1 0.9998 0.0407 0.508 0.492
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.1184 0.9613 0.016 0.984
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0938 0.9649 0.012 0.988
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974707 1 0.1414 0.9462 0.980 0.020
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.6247 0.8059 0.844 0.156
#> SRR1974701 1 0.8499 0.6311 0.724 0.276
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.8327 0.6523 0.736 0.264
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.7139 0.7558 0.804 0.196
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.9970 0.0796 0.468 0.532
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.9393 0.4702 0.644 0.356
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.7299 0.7424 0.796 0.204
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.8661 0.6107 0.712 0.288
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.9866 0.2717 0.568 0.432
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.9491 0.3996 0.368 0.632
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.6973 0.7569 0.188 0.812
#> SRR1974613 2 0.4431 0.8810 0.092 0.908
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2778 0.9223 0.952 0.048
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.1633 0.9540 0.024 0.976
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.1414 0.9576 0.020 0.980
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.9815 0.2722 0.420 0.580
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974565 1 0.4815 0.8675 0.896 0.104
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.5519 0.8426 0.872 0.128
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.1184 0.9612 0.016 0.984
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9617 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.1031 0.9541 0.000 0.024 0.976
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.4931 0.6944 0.232 0.000 0.768
#> SRR1974989 3 0.0747 0.9610 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974981 1 0.0892 0.9357 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974980 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.3879 0.8180 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.2537 0.8989 0.080 0.000 0.920
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.5529 0.5604 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.1031 0.9613 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.1031 0.9547 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.1411 0.9439 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974930 3 0.3267 0.8573 0.116 0.000 0.884
#> SRR1974929 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.6215 0.2571 0.428 0.000 0.572
#> SRR1974925 3 0.6215 0.2568 0.428 0.000 0.572
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974920 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.6302 0.0675 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974916 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974913 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974911 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974910 3 0.0237 0.9718 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.1031 0.9540 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0424 0.9680 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974897 3 0.3941 0.8132 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974896 3 0.3752 0.8284 0.000 0.144 0.856
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974894 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.4842 0.7046 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974887 1 0.0424 0.9461 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974885 3 0.6192 0.2796 0.420 0.000 0.580
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 3 0.4121 0.7979 0.000 0.168 0.832
#> SRR1974882 3 0.4504 0.7575 0.000 0.196 0.804
#> SRR1974880 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974879 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.4178 0.7846 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974876 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.9744 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.9758 0.0487 0.412 0.232 0.356
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974870 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974861 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 1 0.8505 0.4712 0.600 0.144 0.256
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.5835 0.5065 0.660 0.340 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0424 0.9750 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.1411 0.9214 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.6302 0.1272 0.520 0.480 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.4235 0.7766 0.176 0.824 0.000
#> SRR1974795 2 0.1643 0.9404 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974788 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.3551 0.8244 0.868 0.132 0.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 1 0.6228 0.4111 0.624 0.372 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0237 0.9494 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974770 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974767 2 0.6062 0.3593 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974766 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 1 0.6286 0.1818 0.536 0.464 0.000
#> SRR1974750 2 0.3551 0.8356 0.132 0.868 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.3340 0.8511 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.6308 0.0845 0.508 0.492 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.3752 0.8154 0.856 0.144 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.5948 0.4253 0.360 0.640 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.4233 0.7780 0.836 0.004 0.160
#> SRR1974701 1 0.6280 0.1943 0.540 0.460 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.4887 0.7065 0.772 0.228 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.4654 0.7367 0.792 0.208 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.4796 0.7025 0.220 0.780 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.5785 0.4762 0.332 0.668 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974675 3 0.4796 0.7196 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974667 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974668 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974666 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974663 1 0.1643 0.9138 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.4504 0.7533 0.804 0.196 0.000
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.6062 0.4071 0.616 0.384 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.6299 0.1293 0.524 0.476 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.6174 0.7300 0.168 0.768 0.064
#> SRR1974613 2 0.2537 0.9001 0.080 0.920 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2711 0.8725 0.912 0.088 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.1860 0.9319 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974598 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974596 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974591 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974581 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.0237 0.9794 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.6291 0.1380 0.532 0.468 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 1 0.4346 0.7694 0.816 0.184 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.2261 0.8921 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974546 2 0.1031 0.9601 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9528 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9814 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0707 0.9665 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1975006 2 0.1389 0.8962 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0921 0.9588 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1975001 2 0.0707 0.9155 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1975002 2 0.0817 0.9132 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974999 2 0.4661 0.4949 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0336 0.9774 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974989 3 0.3123 0.8043 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0188 0.9811 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.2081 0.8658 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.4661 0.4569 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0336 0.9776 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.2081 0.8981 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974973 2 0.0592 0.9176 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0921 0.9109 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0336 0.9774 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974966 3 0.3801 0.7094 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.1211 0.9026 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.4999 0.0712 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0469 0.9738 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0921 0.9109 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.1637 0.8870 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974946 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2814 0.8356 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0336 0.9774 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0921 0.9109 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0336 0.9774 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.4193 0.6513 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0592 0.9702 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974925 3 0.0469 0.9738 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974926 1 0.4992 0.0949 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0336 0.9208 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0817 0.9135 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0707 0.9155 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974900 2 0.2081 0.8663 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974899 2 0.1716 0.8840 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974897 2 0.0707 0.9155 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974896 2 0.0707 0.9155 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974893 3 0.2281 0.8855 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974895 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974894 2 0.4356 0.6097 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.2647 0.8555 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974889 2 0.0592 0.9176 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974888 2 0.3444 0.7602 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR1974886 2 0.3486 0.7305 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974887 1 0.5793 0.3798 0.600 0.000 0.360 0.040
#> SRR1974885 3 0.0672 0.9721 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.2149 0.8622 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1974881 2 0.0895 0.9161 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974882 2 0.0592 0.9177 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974880 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974879 2 0.1474 0.8940 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974877 2 0.0336 0.9208 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974876 3 0.1488 0.9461 0.000 0.032 0.956 0.012
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.9843 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974874 2 0.4898 0.3239 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1974873 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.4382 0.5590 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1974872 2 0.4103 0.6337 0.256 0.744 0.000 0.000
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974864 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.4624 0.4980 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1974863 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974860 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974861 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974859 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974856 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974855 4 0.3463 0.8104 0.096 0.000 0.040 0.864
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.4356 0.5776 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1974852 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0188 0.8758 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974846 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0188 0.9612 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974845 4 0.3688 0.7954 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974834 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974833 1 0.4985 0.0902 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974831 4 0.3486 0.8090 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974827 4 0.3486 0.8090 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.2345 0.8703 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.3486 0.8090 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974804 1 0.3569 0.7362 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974797 2 0.2814 0.8022 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974796 4 0.4206 0.8173 0.048 0.136 0.000 0.816
#> SRR1974795 4 0.3486 0.8090 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974792 4 0.3764 0.7867 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974791 4 0.3610 0.8020 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1974790 2 0.5000 -0.1600 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1974789 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974788 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.3907 0.6882 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR1974784 4 0.3528 0.8071 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.3528 0.8071 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974780 2 0.4804 0.3890 0.384 0.616 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2868 0.8250 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1867 0.8730 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974770 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974769 4 0.3569 0.8047 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1974768 2 0.2345 0.8424 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974767 2 0.4382 0.5768 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.1118 0.9047 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974765 4 0.4817 0.4971 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974764 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974760 4 0.3528 0.8071 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974757 2 0.4961 0.0342 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974753 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.1022 0.9113 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.1389 0.8563 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974745 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.2814 0.7953 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1974739 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.4790 0.3648 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1974737 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.5000 -0.0117 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1974733 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0188 0.8758 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974731 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.2480 0.8156 0.088 0.008 0.000 0.904
#> SRR1974726 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.4304 0.6092 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974720 4 0.0188 0.8763 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.2921 0.7902 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974717 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0672 0.9146 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.3400 0.7769 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.3743 0.7777 0.824 0.160 0.016 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.4948 0.1823 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1974698 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.4964 0.7148 0.764 0.068 0.000 0.168
#> SRR1974696 4 0.3123 0.7759 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 4 0.5000 0.1761 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0336 0.8731 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974675 2 0.0592 0.9176 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974672 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974670 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974669 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974667 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974668 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974666 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974664 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974665 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974663 1 0.4996 0.0423 0.516 0.484 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.4855 0.3512 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1974650 2 0.0592 0.9146 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974651 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.4941 0.2484 0.564 0.436 0.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.3801 0.7043 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0188 0.9206 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.1118 0.9348 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.4356 0.5668 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 2 0.3528 0.7261 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.3688 0.7154 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1118 0.8970 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974613 2 0.2149 0.8393 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.5004 0.2942 0.392 0.004 0.000 0.604
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974605 1 0.4948 0.2581 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1974604 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0188 0.9200 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2345 0.8400 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974598 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974596 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974594 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974595 4 0.3801 0.7830 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974592 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974591 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974588 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0469 0.9209 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974589 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.2408 0.8363 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974586 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974585 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974582 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974581 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974580 4 0.2704 0.8391 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1974578 4 0.0000 0.8783 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974579 4 0.0592 0.8749 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974576 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974575 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974574 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974573 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974571 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974572 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974570 2 0.4907 0.2901 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974569 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974565 4 0.0336 0.8731 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974564 2 0.4992 -0.0833 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1974560 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974562 4 0.3873 0.7721 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974561 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974557 2 0.0336 0.9228 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974553 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974554 1 0.1677 0.9228 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974548 4 0.4585 0.6189 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1974547 2 0.3354 0.8178 0.044 0.872 0.000 0.084
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9213 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0707 0.9164 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 4 0.3649 0.7995 0.000 0.204 0.000 0.796
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.2648 0.79937 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1975006 5 0.2769 0.87496 0.000 0.092 0.032 0.000 0.876
#> SRR1975005 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1975004 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.2852 0.77543 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1975001 5 0.2439 0.88396 0.000 0.120 0.004 0.000 0.876
#> SRR1975002 5 0.2574 0.88254 0.000 0.112 0.012 0.000 0.876
#> SRR1974999 5 0.4298 0.74129 0.000 0.060 0.184 0.000 0.756
#> SRR1975000 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974996 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974992 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0404 0.95036 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.3635 0.65709 0.000 0.000 0.748 0.248 0.004
#> SRR1974991 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974986 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0963 0.93072 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974988 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974985 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.3234 0.85703 0.000 0.084 0.064 0.000 0.852
#> SRR1974982 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3999 0.47807 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974978 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0510 0.94980 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974975 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974974 3 0.2891 0.76710 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1974973 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974972 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 5 0.2707 0.87843 0.000 0.100 0.024 0.000 0.876
#> SRR1974970 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974967 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.4138 0.36425 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1974964 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974962 5 0.2669 0.87999 0.000 0.104 0.020 0.000 0.876
#> SRR1974960 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 5 0.3508 0.66322 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1974957 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974956 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0609 0.94255 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 5 0.2676 0.87201 0.000 0.080 0.036 0.000 0.884
#> SRR1974952 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974951 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974947 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974948 5 0.2795 0.87722 0.000 0.100 0.028 0.000 0.872
#> SRR1974946 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974945 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2648 0.78457 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974941 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974938 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 5 0.2574 0.88248 0.000 0.112 0.012 0.000 0.876
#> SRR1974933 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974932 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0162 0.95785 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.4449 0.75568 0.000 0.080 0.168 0.000 0.752
#> SRR1974927 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1043 0.92212 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0510 0.94649 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4307 0.00594 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 5 0.2280 0.88411 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974916 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0865 0.94101 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1974913 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 5 0.2669 0.87999 0.000 0.104 0.020 0.000 0.876
#> SRR1974909 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974907 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974903 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974901 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974900 5 0.3307 0.86454 0.000 0.104 0.052 0.000 0.844
#> SRR1974899 5 0.2727 0.88199 0.000 0.116 0.016 0.000 0.868
#> SRR1974897 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974896 5 0.2561 0.88178 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974893 3 0.3837 0.54502 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1974895 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974894 5 0.4803 0.73247 0.000 0.096 0.184 0.000 0.720
#> SRR1974892 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.3366 0.71588 0.000 0.004 0.784 0.000 0.212
#> SRR1974889 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974888 5 0.3916 0.82258 0.000 0.092 0.104 0.000 0.804
#> SRR1974886 5 0.4989 0.77234 0.000 0.168 0.000 0.124 0.708
#> SRR1974887 1 0.4787 0.46400 0.640 0.000 0.324 0.036 0.000
#> SRR1974885 3 0.1549 0.91299 0.040 0.000 0.944 0.016 0.000
#> SRR1974883 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974884 5 0.3269 0.86193 0.000 0.096 0.056 0.000 0.848
#> SRR1974881 5 0.2763 0.87970 0.000 0.148 0.004 0.000 0.848
#> SRR1974882 5 0.2605 0.88035 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974880 5 0.2377 0.88425 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974879 5 0.2864 0.87948 0.000 0.112 0.024 0.000 0.864
#> SRR1974877 5 0.2329 0.88413 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974876 3 0.4854 0.55474 0.000 0.260 0.680 0.000 0.060
#> SRR1974878 3 0.0162 0.95962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974875 3 0.0000 0.96093 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.1270 0.91662 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974873 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0404 0.95490 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974872 5 0.4104 0.58095 0.220 0.032 0.000 0.000 0.748
#> SRR1974869 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974868 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974870 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974866 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 5 0.2536 0.88431 0.000 0.128 0.000 0.004 0.868
#> SRR1974864 1 0.3182 0.83710 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974862 4 0.3848 0.70371 0.000 0.040 0.000 0.788 0.172
#> SRR1974863 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974860 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974861 5 0.2424 0.88393 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974859 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974856 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974855 2 0.3694 0.81262 0.084 0.828 0.004 0.084 0.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.3488 0.74874 0.168 0.808 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974852 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.1671 0.89113 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0510 0.95430 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974845 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.3182 0.83710 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974834 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974833 2 0.3231 0.71943 0.196 0.800 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974831 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974827 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.4104 0.73023 0.748 0.032 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.3143 0.71242 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1974812 1 0.2690 0.80244 0.844 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974804 1 0.2790 0.86009 0.880 0.052 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2727 0.85927 0.868 0.016 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974797 2 0.0880 0.91197 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974796 2 0.1041 0.93983 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974795 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 5 0.2561 0.88222 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974792 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974791 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974790 2 0.0992 0.93656 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1974789 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974788 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974786 1 0.0963 0.93919 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974787 1 0.4714 0.55452 0.644 0.032 0.000 0.000 0.324
#> SRR1974784 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1831 0.90429 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974780 5 0.4794 0.36888 0.344 0.032 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.4380 0.66931 0.708 0.032 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 5 0.4302 0.35861 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1974770 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974769 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974768 5 0.4161 0.57627 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974767 5 0.4550 0.49883 0.276 0.036 0.000 0.000 0.688
#> SRR1974766 5 0.3983 0.67102 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR1974765 2 0.1012 0.93293 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1974764 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974760 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974757 2 0.0992 0.92082 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974753 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.4929 0.76706 0.000 0.136 0.000 0.148 0.716
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0290 0.95777 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974737 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.2409 0.87672 0.000 0.032 0.000 0.900 0.068
#> SRR1974733 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0404 0.95518 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974723 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.1851 0.87506 0.000 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974720 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.2067 0.79574 0.000 0.032 0.000 0.048 0.920
#> SRR1974717 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974711 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974710 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974707 1 0.4541 0.63373 0.680 0.032 0.000 0.000 0.288
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.3556 0.76828 0.808 0.020 0.004 0.000 0.168
#> SRR1974701 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0404 0.95400 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974698 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.6273 0.08812 0.480 0.032 0.000 0.420 0.068
#> SRR1974696 4 0.0703 0.94427 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974693 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0992 0.93666 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974675 5 0.2280 0.88411 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.1908 0.87696 0.000 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1974671 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974672 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974670 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974669 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974667 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974668 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974666 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974664 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974665 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974663 5 0.4822 0.34247 0.352 0.032 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3134 0.84092 0.848 0.032 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3182 0.83710 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974656 5 0.5044 -0.06992 0.464 0.032 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974650 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974651 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.3182 0.83710 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974653 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.5024 0.02761 0.440 0.032 0.000 0.000 0.528
#> SRR1974646 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974640 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974641 4 0.4166 0.45710 0.000 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.3694 0.78902 0.796 0.032 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.3769 0.62875 0.180 0.032 0.000 0.000 0.788
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974623 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974622 1 0.3182 0.83710 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974620 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974619 4 0.4808 0.53151 0.000 0.032 0.000 0.620 0.348
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.3612 0.62824 0.268 0.732 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.1469 0.81544 0.016 0.036 0.000 0.000 0.948
#> SRR1974613 5 0.1661 0.80925 0.024 0.036 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974610 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.2079 0.87986 0.064 0.020 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974605 4 0.1430 0.90516 0.052 0.004 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.96482 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.1996 0.80531 0.004 0.036 0.000 0.032 0.928
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 5 0.4242 0.46555 0.000 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1974601 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974599 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974598 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974596 5 0.3074 0.85109 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974594 2 0.2891 0.80061 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974593 5 0.2424 0.88389 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974595 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974592 5 0.2605 0.88126 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974591 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974588 2 0.2891 0.79893 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974590 5 0.2852 0.86697 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974589 2 0.2813 0.80826 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1974587 5 0.3496 0.83368 0.000 0.200 0.000 0.012 0.788
#> SRR1974586 5 0.2424 0.88389 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974585 2 0.2773 0.81266 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 5 0.2424 0.88389 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974582 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974581 5 0.2648 0.87985 0.000 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974580 2 0.1608 0.91232 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974578 2 0.3039 0.77832 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974577 5 0.3612 0.77742 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1974579 2 0.2516 0.84264 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1974576 5 0.2424 0.88389 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974575 5 0.2690 0.87827 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974574 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974573 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974571 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974572 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974570 5 0.4946 0.29828 0.368 0.036 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974568 1 0.2735 0.87145 0.880 0.084 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974567 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974569 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974565 2 0.2966 0.78704 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1974564 2 0.0992 0.93657 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1974560 1 0.3214 0.83955 0.844 0.036 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974559 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974562 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974561 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974557 5 0.2377 0.88400 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974553 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0290 0.95928 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974554 1 0.4696 0.72540 0.736 0.108 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974558 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974549 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974548 2 0.1915 0.91222 0.000 0.928 0.000 0.032 0.040
#> SRR1974547 2 0.2690 0.77645 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974546 5 0.0963 0.82473 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974545 2 0.0955 0.91650 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974544 1 0.0000 0.96571 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0880 0.94287 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.3565 0.5312 0.000 0.692 0.304 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975006 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975005 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.3899 0.2786 0.000 0.592 0.404 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975001 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975002 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974999 2 0.1010 0.9002 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0547 0.9594 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0363 0.9628 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.5315 0.3931 0.000 0.132 0.564 0.304 0.000 0.000
#> SRR1974991 3 0.0632 0.9575 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3288 0.6656 0.000 0.276 0.724 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0632 0.9575 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.2912 0.6966 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1267 0.9376 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.3563 0.5444 0.000 0.336 0.664 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.1007 0.9471 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 2 0.3717 0.3370 0.000 0.616 0.384 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.0363 0.9628 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.2597 0.8205 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.3699 0.4664 0.000 0.660 0.336 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974964 3 0.0260 0.9643 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0713 0.9556 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0291 0.9197 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974957 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0260 0.9644 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.1501 0.9253 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.2631 0.8157 0.000 0.180 0.820 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.1141 0.9425 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974946 2 0.0363 0.9225 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.1556 0.8834 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974933 3 0.1444 0.9285 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0935 0.9033 0.000 0.964 0.032 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0146 0.9643 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3854 0.1338 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0458 0.9231 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.3747 0.3000 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.1444 0.9286 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.1663 0.9149 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.1204 0.9400 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974900 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974899 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974897 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9210 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.2520 0.7819 0.000 0.844 0.152 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974895 2 0.0458 0.9231 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9210 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.1141 0.9433 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0458 0.9615 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 2 0.1267 0.8802 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974888 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974886 2 0.1418 0.9210 0.000 0.944 0.000 0.024 0.000 0.032
#> SRR1974887 1 0.2118 0.8621 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.0725 0.9520 0.012 0.000 0.976 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.2092 0.8801 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9210 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9210 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974880 2 0.0508 0.9235 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9210 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974876 2 0.1528 0.8847 0.000 0.936 0.048 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974878 3 0.1267 0.9376 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.0146 0.9793 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974872 5 0.0458 0.9399 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974869 5 0.1501 0.8805 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974868 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974870 5 0.1444 0.8833 0.000 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974866 5 0.0146 0.9422 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3378 0.8676 0.000 0.840 0.000 0.064 0.068 0.028
#> SRR1974864 5 0.2003 0.8527 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974862 4 0.2320 0.8235 0.000 0.132 0.000 0.864 0.004 0.000
#> SRR1974863 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974860 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974861 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974855 6 0.0984 0.9613 0.012 0.000 0.008 0.012 0.000 0.968
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 6 0.1007 0.9360 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974852 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.2003 0.8636 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0865 0.9494 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974845 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.1387 0.9005 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 6 0.1204 0.9216 0.056 0.000 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1974831 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974827 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 5 0.0458 0.9400 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.3409 0.5704 0.000 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974812 1 0.2260 0.8316 0.860 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.1649 0.9213 0.932 0.000 0.000 0.036 0.000 0.032
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.3684 0.4401 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974797 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974796 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974795 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974792 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974791 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974790 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974788 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974786 1 0.1814 0.8771 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974787 5 0.0632 0.9367 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974784 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.3620 0.4326 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974780 5 0.1168 0.9305 0.028 0.016 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.0865 0.9286 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2333 0.8919 0.000 0.884 0.000 0.000 0.024 0.092
#> SRR1974770 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974769 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.1616 0.9227 0.000 0.932 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR1974767 5 0.0547 0.9383 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974766 2 0.1549 0.9242 0.000 0.936 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR1974765 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974760 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974757 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.3885 0.7759 0.000 0.776 0.000 0.168 0.024 0.032
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.3864 0.0757 0.000 0.000 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.0363 0.9377 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0547 0.9637 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974711 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.1327 0.8929 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974710 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974707 5 0.0146 0.9434 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.3530 0.7428 0.792 0.152 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.3743 0.6614 0.252 0.000 0.000 0.024 0.724 0.000
#> SRR1974696 4 0.0363 0.9724 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.0146 0.9422 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.0146 0.9830 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974675 2 0.0146 0.9211 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.1957 0.8828 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974671 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974672 2 0.2401 0.9046 0.000 0.892 0.000 0.008 0.072 0.028
#> SRR1974670 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974669 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974667 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974668 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974666 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974664 2 0.2221 0.9067 0.000 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032
#> SRR1974665 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974663 5 0.0458 0.9399 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0146 0.9422 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.1556 0.8893 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.1387 0.9005 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974656 5 0.0260 0.9430 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974650 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.2219 0.8295 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.0547 0.9386 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974646 5 0.0363 0.9376 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974640 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.3168 0.7514 0.000 0.172 0.000 0.804 0.024 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.0937 0.9251 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0146 0.9434 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0260 0.9767 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1498 0.9268 0.000 0.940 0.000 0.000 0.028 0.032
#> SRR1974623 5 0.0260 0.9403 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974622 5 0.1141 0.9150 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1974620 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974619 5 0.0363 0.9392 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 6 0.2697 0.7366 0.188 0.000 0.000 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0146 0.9434 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974613 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.0146 0.9422 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.1141 0.9204 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974605 4 0.0547 0.9604 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9826 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4992 0.1335 0.000 0.472 0.000 0.000 0.068 0.460
#> SRR1974601 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974598 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974596 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974594 6 0.0632 0.9690 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974593 2 0.2164 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1974595 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974591 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974588 6 0.0865 0.9569 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974590 2 0.2197 0.9102 0.000 0.900 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR1974589 6 0.0458 0.9757 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974587 2 0.4999 0.4114 0.000 0.564 0.000 0.004 0.068 0.364
#> SRR1974586 2 0.2164 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1974585 6 0.0363 0.9783 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.2164 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1974582 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974581 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974580 6 0.0363 0.9789 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974578 6 0.1075 0.9445 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974577 2 0.4589 0.7035 0.000 0.696 0.000 0.000 0.132 0.172
#> SRR1974579 6 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974576 2 0.2164 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1974575 2 0.1418 0.9274 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974574 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974572 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 5 0.0547 0.9383 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974568 1 0.4539 0.5824 0.688 0.000 0.000 0.000 0.216 0.096
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974565 6 0.1082 0.9499 0.004 0.000 0.000 0.040 0.000 0.956
#> SRR1974564 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974560 5 0.2191 0.8455 0.120 0.000 0.000 0.000 0.876 0.004
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.2164 0.9072 0.000 0.900 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1974553 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0146 0.9800 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974552 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 5 0.0725 0.9369 0.012 0.000 0.000 0.000 0.976 0.012
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.0146 0.9422 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974549 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 6 0.0508 0.9756 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984
#> SRR1974547 5 0.0632 0.9308 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974546 5 0.0000 0.9433 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974545 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9838 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 6 0.0000 0.9865 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.851 0.916 0.964 0.4438 0.562 0.562
#> 3 3 0.687 0.817 0.900 0.2693 0.878 0.786
#> 4 4 0.848 0.866 0.934 0.1602 0.867 0.717
#> 5 5 0.715 0.773 0.888 0.1062 0.931 0.808
#> 6 6 0.709 0.505 0.761 0.0741 0.875 0.595
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0938 0.9470 0.988 0.012
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1975004 2 0.1633 0.9511 0.024 0.976
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974998 2 0.1184 0.9564 0.016 0.984
#> SRR1974997 2 0.4690 0.8822 0.100 0.900
#> SRR1974995 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974996 2 0.2236 0.9421 0.036 0.964
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.2236 0.9423 0.036 0.964
#> SRR1974992 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.2603 0.9349 0.044 0.956
#> SRR1974991 2 0.0938 0.9590 0.012 0.988
#> SRR1974986 1 0.9933 0.1755 0.548 0.452
#> SRR1974987 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974988 2 0.9686 0.3589 0.396 0.604
#> SRR1974984 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974985 1 0.4431 0.8823 0.908 0.092
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.5408 0.8504 0.876 0.124
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.8955 0.5750 0.688 0.312
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974977 2 0.8661 0.6038 0.288 0.712
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0672 0.9613 0.008 0.992
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.1843 0.9485 0.028 0.972
#> SRR1974969 2 0.0938 0.9590 0.012 0.988
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0672 0.9616 0.008 0.992
#> SRR1974963 2 0.7376 0.7486 0.208 0.792
#> SRR1974961 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.8327 0.6423 0.264 0.736
#> SRR1974959 1 0.9775 0.3122 0.588 0.412
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0672 0.9613 0.008 0.992
#> SRR1974956 2 0.0938 0.9593 0.012 0.988
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.1633 0.9515 0.024 0.976
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.1414 0.9541 0.020 0.980
#> SRR1974949 2 0.1843 0.9487 0.028 0.972
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.9087 0.5506 0.676 0.324
#> SRR1974943 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974940 2 0.2236 0.9425 0.036 0.964
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0672 0.9613 0.008 0.992
#> SRR1974937 2 0.2603 0.9358 0.044 0.956
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.8608 0.6315 0.716 0.284
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.1633 0.9516 0.024 0.976
#> SRR1974931 1 0.8763 0.5916 0.704 0.296
#> SRR1974930 1 0.2043 0.9320 0.968 0.032
#> SRR1974929 1 0.2778 0.9206 0.952 0.048
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.7815 0.7063 0.232 0.768
#> SRR1974924 1 0.1184 0.9441 0.984 0.016
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974922 2 0.0938 0.9590 0.012 0.988
#> SRR1974921 1 0.9754 0.3492 0.592 0.408
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.9129 0.5247 0.672 0.328
#> SRR1974918 2 0.1414 0.9542 0.020 0.980
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.5059 0.8620 0.888 0.112
#> SRR1974915 2 0.7376 0.7430 0.208 0.792
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.4690 0.8738 0.900 0.100
#> SRR1974911 2 0.9996 0.0242 0.488 0.512
#> SRR1974910 2 0.9909 0.2205 0.444 0.556
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.4161 0.8898 0.916 0.084
#> SRR1974906 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974907 2 0.0672 0.9613 0.008 0.992
#> SRR1974905 1 0.9000 0.5608 0.684 0.316
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.2236 0.9297 0.964 0.036
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.1633 0.9514 0.024 0.976
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.4939 0.8720 0.108 0.892
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.4298 0.8844 0.912 0.088
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974875 1 0.7056 0.7673 0.808 0.192
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.4690 0.8796 0.100 0.900
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974864 2 0.8144 0.6764 0.252 0.748
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.6531 0.8024 0.168 0.832
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.6148 0.8163 0.848 0.152
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.1633 0.9500 0.024 0.976
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.8608 0.6272 0.716 0.284
#> SRR1974831 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0672 0.9611 0.008 0.992
#> SRR1974824 1 0.1414 0.9415 0.980 0.020
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.9933 0.1706 0.452 0.548
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.4815 0.8677 0.896 0.104
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974807 2 1.0000 -0.0193 0.496 0.504
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0376 0.9632 0.004 0.996
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.8955 0.5477 0.312 0.688
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.1184 0.9555 0.016 0.984
#> SRR1974795 2 0.4431 0.8877 0.092 0.908
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974786 2 0.9998 0.0452 0.492 0.508
#> SRR1974787 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.4431 0.8925 0.092 0.908
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.2603 0.9360 0.044 0.956
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.1843 0.9486 0.028 0.972
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974767 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0376 0.9632 0.004 0.996
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.9732 0.3407 0.596 0.404
#> SRR1974750 2 0.8144 0.6702 0.252 0.748
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.5737 0.8390 0.136 0.864
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.2948 0.9264 0.052 0.948
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.9393 0.4521 0.356 0.644
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.1414 0.9534 0.020 0.980
#> SRR1974732 2 0.9944 0.1555 0.456 0.544
#> SRR1974731 2 0.1414 0.9530 0.020 0.980
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974725 2 0.5294 0.8623 0.120 0.880
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.4815 0.8742 0.104 0.896
#> SRR1974722 2 0.7139 0.7670 0.196 0.804
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0376 0.9633 0.004 0.996
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.1414 0.9530 0.020 0.980
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974707 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.7219 0.7616 0.200 0.800
#> SRR1974701 1 0.8555 0.6235 0.720 0.280
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.5408 0.8455 0.124 0.876
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.5059 0.8665 0.112 0.888
#> SRR1974692 2 0.1184 0.9562 0.016 0.984
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.6973 0.7727 0.812 0.188
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.6623 0.7969 0.172 0.828
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.8813 0.5876 0.700 0.300
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974657 2 0.9795 0.2975 0.416 0.584
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974655 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974656 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974652 2 0.5059 0.8706 0.112 0.888
#> SRR1974653 2 0.2948 0.9268 0.052 0.948
#> SRR1974648 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974633 2 0.3879 0.9049 0.076 0.924
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.6438 0.8025 0.836 0.164
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974622 2 0.0938 0.9590 0.012 0.988
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.9209 0.5128 0.664 0.336
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR1974613 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.6801 0.7857 0.180 0.820
#> SRR1974607 2 0.7602 0.7323 0.220 0.780
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974605 2 0.6887 0.7836 0.184 0.816
#> SRR1974604 2 0.5059 0.8669 0.112 0.888
#> SRR1974603 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.0376 0.9634 0.004 0.996
#> SRR1974568 2 0.0672 0.9614 0.008 0.992
#> SRR1974567 1 0.2778 0.9199 0.952 0.048
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.1414 0.9529 0.020 0.980
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974560 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974558 2 0.9988 0.0516 0.480 0.520
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9553 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
#> SRR1974544 2 0.2778 0.9332 0.048 0.952
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 1 0.5156 0.7344 0.776 0.008 0.216
#> SRR1975008 2 0.1411 0.8970 0.000 0.964 0.036
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 2 0.3193 0.8511 0.004 0.896 0.100
#> SRR1975004 2 0.5315 0.7220 0.012 0.772 0.216
#> SRR1975003 2 0.1289 0.8980 0.000 0.968 0.032
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974999 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1975000 2 0.5450 0.7139 0.012 0.760 0.228
#> SRR1974998 2 0.5292 0.7179 0.008 0.764 0.228
#> SRR1974997 2 0.6764 0.6571 0.060 0.716 0.224
#> SRR1974995 2 0.2537 0.8661 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974996 2 0.5360 0.7244 0.012 0.768 0.220
#> SRR1974994 1 0.2165 0.8503 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974993 2 0.5597 0.7151 0.020 0.764 0.216
#> SRR1974992 2 0.5360 0.7196 0.012 0.768 0.220
#> SRR1974990 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974989 2 0.6314 0.3326 0.004 0.604 0.392
#> SRR1974991 2 0.4834 0.7434 0.004 0.792 0.204
#> SRR1974986 1 0.9674 0.1511 0.440 0.336 0.224
#> SRR1974987 2 0.2301 0.8807 0.004 0.936 0.060
#> SRR1974988 2 0.9086 0.3428 0.228 0.552 0.220
#> SRR1974984 2 0.4634 0.7795 0.012 0.824 0.164
#> SRR1974985 1 0.6715 0.6738 0.716 0.056 0.228
#> SRR1974983 2 0.1289 0.8979 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974982 1 0.7222 0.6424 0.696 0.084 0.220
#> SRR1974981 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974980 1 0.9019 0.4049 0.560 0.216 0.224
#> SRR1974979 2 0.4062 0.7881 0.000 0.836 0.164
#> SRR1974978 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974977 2 0.9119 0.3349 0.228 0.548 0.224
#> SRR1974976 2 0.2796 0.8564 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974975 2 0.3267 0.8357 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974974 2 0.1753 0.8886 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974973 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974972 2 0.4931 0.7366 0.004 0.784 0.212
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974970 2 0.5360 0.7196 0.012 0.768 0.220
#> SRR1974969 2 0.2496 0.8762 0.004 0.928 0.068
#> SRR1974968 2 0.2261 0.8751 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974967 2 0.4842 0.7278 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974965 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974966 2 0.1163 0.9029 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974964 2 0.4750 0.7323 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974963 2 0.7380 0.6079 0.088 0.684 0.228
#> SRR1974961 2 0.3412 0.8282 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974962 2 0.0747 0.9063 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974960 2 0.8828 0.3970 0.192 0.580 0.228
#> SRR1974959 1 0.9674 0.0547 0.396 0.392 0.212
#> SRR1974958 2 0.0592 0.9064 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974957 2 0.3349 0.8402 0.004 0.888 0.108
#> SRR1974956 2 0.4978 0.7290 0.004 0.780 0.216
#> SRR1974955 1 0.4654 0.7473 0.792 0.000 0.208
#> SRR1974954 2 0.5247 0.7207 0.008 0.768 0.224
#> SRR1974953 2 0.0237 0.9072 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974952 2 0.5156 0.7308 0.008 0.776 0.216
#> SRR1974949 2 0.5360 0.7194 0.012 0.768 0.220
#> SRR1974950 2 0.3619 0.8207 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974951 2 0.1529 0.8935 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974947 2 0.2356 0.8728 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974948 2 0.0424 0.9074 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974946 2 0.0424 0.9075 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974945 2 0.4887 0.7253 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974944 1 0.4654 0.7473 0.792 0.000 0.208
#> SRR1974942 1 0.8717 0.4644 0.592 0.188 0.220
#> SRR1974943 2 0.1529 0.8937 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974941 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974940 2 0.5406 0.7179 0.012 0.764 0.224
#> SRR1974939 2 0.1031 0.9022 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974938 2 0.5070 0.7243 0.004 0.772 0.224
#> SRR1974937 2 0.5595 0.7111 0.016 0.756 0.228
#> SRR1974936 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974935 1 0.8638 0.4830 0.600 0.184 0.216
#> SRR1974934 2 0.0237 0.9077 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974933 2 0.4002 0.7996 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974932 2 0.5406 0.7157 0.012 0.764 0.224
#> SRR1974931 1 0.9371 0.2973 0.512 0.264 0.224
#> SRR1974930 1 0.5967 0.7129 0.752 0.032 0.216
#> SRR1974929 1 0.6188 0.7038 0.744 0.040 0.216
#> SRR1974928 2 0.0592 0.9064 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974927 2 0.8284 0.5014 0.148 0.628 0.224
#> SRR1974924 1 0.5406 0.7254 0.764 0.012 0.224
#> SRR1974925 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974926 1 0.4291 0.7696 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974923 2 0.1753 0.8941 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974922 2 0.5070 0.7243 0.004 0.772 0.224
#> SRR1974921 1 0.9052 0.4047 0.556 0.216 0.228
#> SRR1974920 1 0.4702 0.7438 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974919 1 0.9575 0.1885 0.464 0.320 0.216
#> SRR1974918 2 0.5292 0.7180 0.008 0.764 0.228
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 1 0.6437 0.6914 0.732 0.048 0.220
#> SRR1974915 2 0.8336 0.4959 0.152 0.624 0.224
#> SRR1974914 2 0.3116 0.8598 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974913 1 0.7101 0.6528 0.704 0.080 0.216
#> SRR1974911 1 0.9654 0.1891 0.452 0.320 0.228
#> SRR1974910 2 0.9394 0.2525 0.268 0.508 0.224
#> SRR1974908 2 0.0237 0.9078 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974909 1 0.7024 0.6551 0.704 0.072 0.224
#> SRR1974906 2 0.2878 0.8566 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974907 2 0.5115 0.7217 0.004 0.768 0.228
#> SRR1974905 1 0.9119 0.3830 0.548 0.224 0.228
#> SRR1974904 2 0.3412 0.8321 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974903 1 0.5687 0.7175 0.756 0.020 0.224
#> SRR1974902 2 0.1860 0.8887 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974901 2 0.5360 0.7208 0.012 0.768 0.220
#> SRR1974898 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974900 2 0.1163 0.9000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974899 2 0.0237 0.9076 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0237 0.9076 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974893 2 0.1411 0.8957 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974895 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974894 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974892 2 0.3340 0.8442 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974890 2 0.6688 0.5687 0.028 0.664 0.308
#> SRR1974891 2 0.2537 0.8677 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.1964 0.8901 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974886 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974887 3 0.5926 0.3169 0.356 0.000 0.644
#> SRR1974885 3 0.1860 0.6535 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974883 2 0.3192 0.8427 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974884 2 0.0424 0.9073 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974881 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974882 2 0.0747 0.9075 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974880 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974879 2 0.1411 0.9042 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.1411 0.9032 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974878 2 0.4452 0.7603 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974875 3 0.7462 0.1350 0.352 0.048 0.600
#> SRR1974874 2 0.2796 0.8450 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974873 3 0.5970 0.8602 0.060 0.160 0.780
#> SRR1974871 2 0.5016 0.6070 0.000 0.760 0.240
#> SRR1974872 2 0.1315 0.9008 0.020 0.972 0.008
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.0424 0.9071 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974867 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.1031 0.9033 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974864 2 0.6096 0.5180 0.280 0.704 0.016
#> SRR1974862 2 0.2878 0.8391 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974863 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0424 0.9073 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974859 3 0.4931 0.8686 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974858 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974856 3 0.4842 0.8696 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974857 2 0.1163 0.9012 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974855 2 0.1031 0.9067 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974854 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.6104 0.3752 0.648 0.004 0.348
#> SRR1974852 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974849 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 3 0.6728 0.8395 0.080 0.184 0.736
#> SRR1974846 3 0.4702 0.8716 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974847 1 0.4539 0.6978 0.836 0.148 0.016
#> SRR1974845 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974844 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.1636 0.8975 0.020 0.964 0.016
#> SRR1974842 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 3 0.5406 0.8749 0.020 0.200 0.780
#> SRR1974839 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974838 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974834 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974833 1 0.9054 -0.0791 0.460 0.136 0.404
#> SRR1974831 2 0.1129 0.9041 0.004 0.976 0.020
#> SRR1974832 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974827 2 0.1170 0.9044 0.008 0.976 0.016
#> SRR1974824 1 0.2031 0.8564 0.952 0.032 0.016
#> SRR1974825 1 0.0983 0.8782 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974822 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974820 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0747 0.8806 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974815 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 3 0.6222 0.8006 0.132 0.092 0.776
#> SRR1974812 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.5603 0.6999 0.804 0.060 0.136
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0592 0.8833 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974809 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.6954 0.0371 0.500 0.484 0.016
#> SRR1974806 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1031 0.9032 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974804 1 0.3816 0.7526 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974803 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.6427 0.3640 0.348 0.640 0.012
#> SRR1974799 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974797 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974796 2 0.1765 0.8917 0.004 0.956 0.040
#> SRR1974795 2 0.4015 0.8185 0.096 0.876 0.028
#> SRR1974793 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974792 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974791 2 0.0892 0.9048 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974790 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974789 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.6647 0.0905 0.540 0.452 0.008
#> SRR1974787 2 0.1620 0.8972 0.024 0.964 0.012
#> SRR1974784 2 0.0592 0.9074 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974783 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.2866 0.8585 0.076 0.916 0.008
#> SRR1974782 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.9077 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 2 0.1950 0.8883 0.040 0.952 0.008
#> SRR1974779 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.1751 0.8950 0.028 0.960 0.012
#> SRR1974778 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0237 0.9072 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974770 2 0.0424 0.9073 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974769 2 0.1529 0.8936 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974768 2 0.1031 0.9032 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974767 2 0.1315 0.9008 0.020 0.972 0.008
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.1163 0.9012 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974759 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974756 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 3 0.4887 0.8683 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.6308 -0.2950 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974751 3 0.6044 0.7434 0.172 0.056 0.772
#> SRR1974750 3 0.6234 0.8412 0.096 0.128 0.776
#> SRR1974752 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0747 0.9067 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974747 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.4654 0.6713 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974745 3 0.6250 0.8345 0.104 0.120 0.776
#> SRR1974743 3 0.4887 0.8683 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974742 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.3619 0.7896 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974739 3 0.5355 0.8698 0.032 0.168 0.800
#> SRR1974741 3 0.4974 0.8639 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974738 2 0.3412 0.8031 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974737 3 0.5291 0.8310 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974736 3 0.5944 0.8385 0.088 0.120 0.792
#> SRR1974735 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0592 0.9062 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974733 3 0.4629 0.8709 0.004 0.188 0.808
#> SRR1974732 3 0.6243 0.8375 0.100 0.124 0.776
#> SRR1974731 3 0.5406 0.8748 0.020 0.200 0.780
#> SRR1974729 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 3 0.4842 0.8697 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974725 2 0.8408 0.0509 0.100 0.556 0.344
#> SRR1974726 3 0.4702 0.8716 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974724 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0237 0.9072 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974723 3 0.6128 0.8497 0.084 0.136 0.780
#> SRR1974722 3 0.6325 0.8219 0.116 0.112 0.772
#> SRR1974721 2 0.2356 0.8658 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974720 3 0.5285 0.8589 0.004 0.244 0.752
#> SRR1974719 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0424 0.9070 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974717 3 0.4974 0.8639 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974715 3 0.5305 0.8742 0.020 0.192 0.788
#> SRR1974713 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0424 0.9067 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974710 2 0.0424 0.9067 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974707 2 0.1491 0.8996 0.016 0.968 0.016
#> SRR1974706 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 3 0.5650 0.7654 0.000 0.312 0.688
#> SRR1974702 2 0.4784 0.7025 0.200 0.796 0.004
#> SRR1974701 3 0.5955 0.7285 0.180 0.048 0.772
#> SRR1974699 3 0.5138 0.8410 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974698 3 0.4887 0.8683 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974700 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.4139 0.7690 0.124 0.860 0.016
#> SRR1974696 2 0.1643 0.8925 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974694 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974693 3 0.6148 0.8559 0.076 0.148 0.776
#> SRR1974692 3 0.5012 0.8736 0.008 0.204 0.788
#> SRR1974690 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974691 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 3 0.4702 0.8716 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974688 3 0.4796 0.8705 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974687 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0747 0.8798 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974682 3 0.5356 0.6821 0.196 0.020 0.784
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 3 0.6325 0.8262 0.112 0.116 0.772
#> SRR1974680 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 3 0.5891 0.7434 0.168 0.052 0.780
#> SRR1974677 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0424 0.9067 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974674 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0592 0.9067 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974672 2 0.0892 0.9050 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974670 2 0.1163 0.9012 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974669 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 2 0.1620 0.8993 0.012 0.964 0.024
#> SRR1974662 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974660 1 0.0592 0.8834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 2 0.6897 0.1607 0.436 0.548 0.016
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 2 0.1636 0.8975 0.020 0.964 0.016
#> SRR1974656 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974650 2 0.0592 0.9062 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974651 3 0.6235 0.5083 0.000 0.436 0.564
#> SRR1974652 2 0.3610 0.8306 0.096 0.888 0.016
#> SRR1974653 3 0.5384 0.8732 0.024 0.188 0.788
#> SRR1974648 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 3 0.6079 0.6327 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974645 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974640 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974641 2 0.1163 0.9012 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974639 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974634 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.6026 0.1644 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974633 2 0.3769 0.8084 0.104 0.880 0.016
#> SRR1974632 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974630 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.4539 0.7034 0.836 0.148 0.016
#> SRR1974624 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974623 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974622 2 0.0983 0.9044 0.004 0.980 0.016
#> SRR1974620 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974619 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974621 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.6832 0.2335 0.604 0.376 0.020
#> SRR1974615 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1491 0.8996 0.016 0.968 0.016
#> SRR1974613 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974612 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974610 2 0.5905 0.2964 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974609 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.9043 -0.2965 0.136 0.468 0.396
#> SRR1974607 2 0.5506 0.6598 0.220 0.764 0.016
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 3 0.9119 0.5451 0.148 0.368 0.484
#> SRR1974604 3 0.6087 0.8518 0.076 0.144 0.780
#> SRR1974603 2 0.0848 0.9058 0.008 0.984 0.008
#> SRR1974602 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974601 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974599 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974598 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974596 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974594 2 0.1163 0.9009 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974593 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974595 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974592 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974591 2 0.0592 0.9070 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974588 2 0.1031 0.9056 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974590 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974589 2 0.0892 0.9048 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974587 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974586 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974585 2 0.1529 0.9000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974584 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974582 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974581 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974580 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974578 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9073 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974576 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974575 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974574 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974573 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974571 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974572 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974570 2 0.0424 0.9070 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974568 2 0.0983 0.9044 0.004 0.980 0.016
#> SRR1974567 1 0.2165 0.8241 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974566 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974569 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974565 2 0.1411 0.9001 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974564 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974560 2 0.0592 0.9062 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974559 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974562 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974561 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974557 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974553 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974555 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974554 2 0.0747 0.9051 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974558 2 0.6701 0.2015 0.412 0.576 0.012
#> SRR1974556 1 0.0000 0.8917 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0892 0.9070 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974549 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974548 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974547 2 0.1289 0.9047 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974546 2 0.0592 0.9060 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974545 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974544 2 0.2096 0.8824 0.052 0.944 0.004
#> SRR1974543 2 0.0747 0.9062 0.000 0.984 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.1474 0.84235 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1975008 2 0.1824 0.90291 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1975006 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1975005 2 0.2973 0.82418 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1975004 3 0.4790 0.46608 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1975003 2 0.1902 0.90100 0.000 0.932 0.064 0.004
#> SRR1975001 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1975002 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974999 2 0.0376 0.93065 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1975000 3 0.1474 0.85424 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974998 3 0.1637 0.84701 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1974997 3 0.5172 0.37918 0.008 0.404 0.588 0.000
#> SRR1974995 2 0.3074 0.81825 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1974996 3 0.1389 0.85047 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974994 1 0.1792 0.89641 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974993 3 0.4855 0.40305 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974992 3 0.4730 0.48800 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1974990 3 0.1792 0.83248 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974989 2 0.6813 0.16285 0.000 0.516 0.104 0.380
#> SRR1974991 2 0.4941 0.18979 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR1974986 3 0.1584 0.85949 0.012 0.036 0.952 0.000
#> SRR1974987 2 0.2081 0.88505 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974988 3 0.2408 0.81440 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974984 2 0.4500 0.54289 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR1974985 3 0.1182 0.85461 0.016 0.016 0.968 0.000
#> SRR1974983 2 0.1824 0.90413 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1974982 3 0.1820 0.85457 0.036 0.020 0.944 0.000
#> SRR1974981 3 0.4040 0.63602 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1974980 3 0.1151 0.85741 0.008 0.024 0.968 0.000
#> SRR1974979 2 0.4605 0.49611 0.000 0.664 0.336 0.000
#> SRR1974978 3 0.1637 0.83794 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974977 3 0.1722 0.85556 0.008 0.048 0.944 0.000
#> SRR1974976 2 0.3355 0.80746 0.000 0.836 0.160 0.004
#> SRR1974975 2 0.3311 0.79126 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1974974 2 0.2401 0.87735 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1974973 2 0.0937 0.93201 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974972 3 0.4967 0.24005 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1974971 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974970 3 0.2216 0.82629 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974969 2 0.2469 0.86414 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1974968 2 0.3052 0.83976 0.000 0.860 0.136 0.004
#> SRR1974967 3 0.1716 0.84843 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1974965 3 0.1792 0.83248 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974966 2 0.1661 0.91688 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR1974964 3 0.4382 0.57205 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1974963 3 0.1118 0.85550 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974961 2 0.3649 0.75012 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974962 2 0.0779 0.92867 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974960 3 0.0921 0.85505 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974959 3 0.1854 0.85345 0.012 0.048 0.940 0.000
#> SRR1974958 2 0.1004 0.92555 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974957 2 0.3311 0.79264 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1974956 3 0.3837 0.66699 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1974955 3 0.2647 0.78236 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974954 3 0.3486 0.71248 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1974953 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974952 3 0.4817 0.42982 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1974949 3 0.4888 0.36888 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1974950 2 0.3801 0.72585 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1974951 2 0.1902 0.90094 0.000 0.932 0.064 0.004
#> SRR1974947 2 0.3024 0.82547 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1974948 2 0.0469 0.93180 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974946 2 0.1059 0.93188 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974945 3 0.0921 0.85505 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974944 3 0.2530 0.78814 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1974942 3 0.1677 0.84896 0.040 0.012 0.948 0.000
#> SRR1974943 2 0.1716 0.90254 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974941 3 0.1637 0.83794 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974940 3 0.1211 0.85752 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974939 2 0.1661 0.91047 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR1974938 3 0.1389 0.85595 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974937 3 0.1022 0.85572 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974936 3 0.1792 0.83248 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974935 3 0.1406 0.85848 0.016 0.024 0.960 0.000
#> SRR1974934 2 0.0376 0.93065 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974933 2 0.4193 0.65075 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR1974932 3 0.1474 0.85412 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974931 3 0.1388 0.85739 0.012 0.028 0.960 0.000
#> SRR1974930 3 0.1743 0.84167 0.056 0.004 0.940 0.000
#> SRR1974929 3 0.1545 0.85018 0.040 0.008 0.952 0.000
#> SRR1974928 2 0.0779 0.92857 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974927 3 0.1118 0.85767 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974924 3 0.1970 0.84097 0.060 0.008 0.932 0.000
#> SRR1974925 3 0.1716 0.83543 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974926 1 0.4981 0.08693 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1974923 2 0.1792 0.90918 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974922 3 0.2345 0.81682 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1974921 3 0.1059 0.85403 0.012 0.016 0.972 0.000
#> SRR1974920 3 0.1792 0.83248 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974919 3 0.1807 0.85379 0.008 0.052 0.940 0.000
#> SRR1974918 3 0.1211 0.85775 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974917 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974916 3 0.1510 0.85435 0.028 0.016 0.956 0.000
#> SRR1974915 3 0.1389 0.85587 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974914 2 0.3428 0.83563 0.000 0.844 0.144 0.012
#> SRR1974913 3 0.1807 0.84494 0.052 0.008 0.940 0.000
#> SRR1974911 3 0.1059 0.85403 0.012 0.016 0.972 0.000
#> SRR1974910 3 0.1174 0.85765 0.012 0.020 0.968 0.000
#> SRR1974908 2 0.1004 0.92901 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974909 3 0.1297 0.85610 0.020 0.016 0.964 0.000
#> SRR1974906 2 0.2814 0.83888 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1974907 3 0.1022 0.85667 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974905 3 0.1059 0.85403 0.012 0.016 0.972 0.000
#> SRR1974904 2 0.3610 0.75577 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974903 3 0.1722 0.84681 0.048 0.008 0.944 0.000
#> SRR1974902 2 0.2266 0.88448 0.000 0.912 0.084 0.004
#> SRR1974901 3 0.3219 0.74467 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1974898 2 0.1182 0.93095 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974900 2 0.1398 0.91672 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1974899 2 0.1305 0.92364 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974897 2 0.0927 0.93158 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1974896 2 0.0672 0.93270 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974893 2 0.1576 0.91138 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1974895 2 0.1510 0.92806 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974894 2 0.0927 0.93037 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1974892 2 0.3486 0.78992 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1974890 2 0.6663 0.07870 0.008 0.504 0.424 0.064
#> SRR1974891 2 0.2704 0.84825 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1974889 2 0.0804 0.93152 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974888 2 0.2741 0.87786 0.000 0.892 0.096 0.012
#> SRR1974886 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974887 4 0.6824 0.38602 0.324 0.000 0.120 0.556
#> SRR1974885 4 0.4936 0.43396 0.012 0.000 0.316 0.672
#> SRR1974883 2 0.3400 0.78395 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1974884 2 0.0895 0.92735 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974881 2 0.0336 0.93159 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974882 2 0.1174 0.93113 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974880 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974879 2 0.2060 0.92095 0.000 0.932 0.052 0.016
#> SRR1974877 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974876 2 0.1733 0.92227 0.000 0.948 0.024 0.028
#> SRR1974878 2 0.4817 0.35478 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1974875 3 0.4744 0.73557 0.080 0.012 0.808 0.100
#> SRR1974874 2 0.4375 0.77955 0.000 0.788 0.032 0.180
#> SRR1974873 4 0.0524 0.87712 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974871 2 0.5130 0.52442 0.000 0.652 0.016 0.332
#> SRR1974872 2 0.0188 0.93083 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974869 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974868 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974870 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974866 2 0.0376 0.93097 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2032 0.92203 0.000 0.936 0.028 0.036
#> SRR1974864 2 0.4867 0.65780 0.232 0.736 0.032 0.000
#> SRR1974862 2 0.4019 0.77089 0.000 0.792 0.012 0.196
#> SRR1974863 2 0.1510 0.92806 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974860 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974861 2 0.1174 0.93140 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974859 4 0.0336 0.88054 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974858 2 0.1510 0.92806 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974856 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974857 2 0.2032 0.92206 0.000 0.936 0.028 0.036
#> SRR1974855 2 0.1305 0.93123 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5215 0.53866 0.680 0.004 0.020 0.296
#> SRR1974852 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.3998 0.78120 0.012 0.076 0.060 0.852
#> SRR1974846 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974847 1 0.4057 0.71920 0.816 0.152 0.032 0.000
#> SRR1974845 2 0.0937 0.93154 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.1209 0.92202 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0336 0.88038 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974839 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974834 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974833 1 0.8190 0.28798 0.540 0.100 0.092 0.268
#> SRR1974831 2 0.1256 0.93037 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974827 2 0.1305 0.92742 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1974824 1 0.1624 0.92235 0.952 0.020 0.028 0.000
#> SRR1974825 1 0.1356 0.92994 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1302 0.93006 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0657 0.87637 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1974812 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.6113 0.63087 0.716 0.072 0.032 0.180
#> SRR1974808 2 0.0188 0.93164 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974811 1 0.0707 0.94848 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 2 0.5821 0.16791 0.432 0.536 0.032 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974804 1 0.3812 0.79257 0.832 0.000 0.028 0.140
#> SRR1974803 1 0.0817 0.94724 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.4295 0.65606 0.240 0.752 0.008 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1510 0.92806 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974797 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974796 2 0.1892 0.92251 0.004 0.944 0.016 0.036
#> SRR1974795 2 0.2797 0.88246 0.068 0.900 0.000 0.032
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1406 0.92976 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1974792 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974791 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974790 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974789 2 0.1406 0.92976 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1974788 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974786 2 0.4961 0.27089 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.0927 0.92870 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR1974784 2 0.0779 0.93301 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.1867 0.89602 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0524 0.93304 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974780 2 0.1109 0.92418 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.0804 0.92997 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0657 0.93214 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974769 2 0.1798 0.92291 0.000 0.944 0.016 0.040
#> SRR1974768 2 0.1022 0.92846 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974767 2 0.0188 0.93083 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974764 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.1004 0.93189 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974755 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974753 4 0.4560 0.51501 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1974751 4 0.0592 0.87125 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974750 4 0.0376 0.88050 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.1174 0.92732 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0188 0.96263 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.4713 0.47777 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974745 4 0.0524 0.87812 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1974743 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.4399 0.72758 0.000 0.760 0.016 0.224
#> SRR1974739 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974741 4 0.0469 0.87780 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974738 2 0.4122 0.71679 0.000 0.760 0.004 0.236
#> SRR1974737 4 0.1302 0.84953 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974736 4 0.0524 0.87712 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0707 0.92816 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974733 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974732 4 0.0376 0.88050 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1974731 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974725 2 0.7239 -0.07911 0.064 0.464 0.032 0.440
#> SRR1974726 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974722 4 0.0592 0.87125 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974721 2 0.3913 0.82110 0.000 0.824 0.028 0.148
#> SRR1974720 4 0.2385 0.83612 0.000 0.052 0.028 0.920
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0336 0.93064 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974717 4 0.0469 0.87778 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974715 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974710 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974707 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.2675 0.78773 0.000 0.100 0.008 0.892
#> SRR1974702 2 0.3355 0.79836 0.160 0.836 0.004 0.000
#> SRR1974701 4 0.0592 0.87125 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974699 4 0.2413 0.81874 0.000 0.064 0.020 0.916
#> SRR1974698 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.3581 0.80398 0.116 0.852 0.032 0.000
#> SRR1974696 2 0.3013 0.87500 0.000 0.888 0.032 0.080
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.1118 0.92358 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974693 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974692 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974690 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974688 4 0.0336 0.88048 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0336 0.95959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974682 4 0.0592 0.87125 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0469 0.87496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0657 0.87495 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0376 0.93109 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974675 2 0.0376 0.93109 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974671 2 0.1284 0.93042 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1974672 2 0.1733 0.92648 0.000 0.948 0.028 0.024
#> SRR1974670 2 0.2214 0.91791 0.000 0.928 0.028 0.044
#> SRR1974669 2 0.0804 0.93149 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974667 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974668 2 0.0524 0.93114 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974666 2 0.0188 0.93052 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974664 2 0.1297 0.93093 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1974665 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 2 0.1118 0.92229 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974660 1 0.0921 0.94134 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 2 0.5473 0.48969 0.324 0.644 0.032 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 2 0.1209 0.92202 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR1974656 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974650 2 0.0817 0.92666 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974651 4 0.3801 0.62333 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974652 2 0.3051 0.86189 0.088 0.884 0.028 0.000
#> SRR1974653 4 0.0188 0.88185 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974648 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974646 2 0.0657 0.93072 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.3356 0.69501 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974640 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974641 2 0.2032 0.91974 0.000 0.936 0.028 0.036
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4877 0.31573 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1974633 2 0.2483 0.88526 0.052 0.916 0.032 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.4540 0.64866 0.772 0.196 0.032 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0804 0.93149 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974623 2 0.1004 0.92647 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974622 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974620 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974619 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.5497 0.45537 0.668 0.296 0.032 0.004
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0779 0.92911 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974613 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974612 1 0.0188 0.96267 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974611 2 0.1209 0.92259 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1974610 4 0.5295 -0.00799 0.000 0.488 0.008 0.504
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.7667 0.16059 0.092 0.428 0.036 0.444
#> SRR1974607 2 0.4692 0.70943 0.212 0.756 0.032 0.000
#> SRR1974606 2 0.0188 0.93121 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974605 4 0.7074 0.48532 0.088 0.272 0.032 0.608
#> SRR1974604 4 0.0336 0.88054 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974603 2 0.0188 0.93083 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974601 2 0.0707 0.92807 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974599 2 0.1182 0.93095 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974598 2 0.1182 0.93095 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974596 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974594 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974593 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974595 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974592 2 0.1182 0.93095 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974591 2 0.1059 0.93236 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974588 2 0.1677 0.92619 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1974590 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974589 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974587 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974586 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974585 2 0.1584 0.92802 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974582 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974581 2 0.1182 0.93095 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974580 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974578 2 0.1174 0.93103 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974577 2 0.0000 0.93067 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974576 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974575 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974574 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974573 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974571 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974572 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974570 2 0.0188 0.93083 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974568 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974567 1 0.1302 0.90874 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974569 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974565 2 0.1677 0.92639 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1974564 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974560 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974562 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974561 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974557 2 0.1388 0.92816 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1974553 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974554 2 0.1022 0.92293 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974558 1 0.5861 0.02670 0.492 0.476 0.032 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96608 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.1305 0.92416 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974549 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974548 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974547 2 0.1854 0.92228 0.000 0.940 0.048 0.012
#> SRR1974546 2 0.0707 0.92809 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974545 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974544 2 0.0921 0.92702 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.1059 0.93093 0.000 0.972 0.016 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0290 0.8799 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.3214 0.7629 0.000 0.844 0.036 0.000 0.120
#> SRR1975006 2 0.3895 0.3727 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1975005 2 0.3193 0.7465 0.000 0.840 0.132 0.000 0.028
#> SRR1975004 3 0.4126 0.3187 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.3003 0.7633 0.000 0.864 0.044 0.000 0.092
#> SRR1975001 5 0.4171 0.6413 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1975002 2 0.2891 0.7010 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1974999 2 0.1124 0.8098 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1975000 3 0.0963 0.8678 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.1469 0.8598 0.000 0.036 0.948 0.000 0.016
#> SRR1974997 3 0.5193 0.2799 0.000 0.364 0.584 0.000 0.052
#> SRR1974995 2 0.2763 0.7412 0.000 0.848 0.148 0.000 0.004
#> SRR1974996 3 0.2825 0.7879 0.000 0.016 0.860 0.000 0.124
#> SRR1974994 1 0.1732 0.8821 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.4138 0.2886 0.000 0.384 0.616 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.4166 0.3653 0.000 0.348 0.648 0.000 0.004
#> SRR1974990 3 0.0609 0.8755 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.6292 0.0559 0.000 0.500 0.112 0.376 0.012
#> SRR1974991 2 0.4948 0.1981 0.000 0.536 0.436 0.000 0.028
#> SRR1974986 3 0.0451 0.8800 0.004 0.008 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.2580 0.7910 0.000 0.892 0.064 0.000 0.044
#> SRR1974988 3 0.1914 0.8367 0.000 0.060 0.924 0.000 0.016
#> SRR1974984 2 0.3913 0.4619 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0290 0.8799 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.3630 0.6579 0.000 0.780 0.016 0.000 0.204
#> SRR1974982 3 0.0566 0.8799 0.012 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3109 0.6845 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.8788 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.4402 0.4020 0.000 0.636 0.352 0.000 0.012
#> SRR1974978 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0404 0.8782 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.4025 0.6974 0.000 0.792 0.132 0.000 0.076
#> SRR1974975 2 0.2891 0.7101 0.000 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1974974 2 0.3281 0.7511 0.000 0.848 0.060 0.000 0.092
#> SRR1974973 2 0.4249 -0.0660 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974972 3 0.4867 0.1563 0.000 0.432 0.544 0.000 0.024
#> SRR1974971 2 0.2068 0.7808 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1974970 3 0.1121 0.8587 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974969 2 0.2905 0.7815 0.000 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR1974968 2 0.3631 0.7372 0.000 0.824 0.104 0.000 0.072
#> SRR1974967 3 0.1408 0.8580 0.000 0.044 0.948 0.000 0.008
#> SRR1974965 3 0.0609 0.8755 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.3970 0.6891 0.000 0.744 0.020 0.000 0.236
#> SRR1974964 3 0.3661 0.5023 0.000 0.276 0.724 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0992 0.8677 0.000 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1974961 2 0.3274 0.6546 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.2953 0.7678 0.000 0.844 0.012 0.000 0.144
#> SRR1974960 3 0.1608 0.8431 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974959 3 0.0404 0.8782 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.2864 0.7489 0.000 0.852 0.012 0.000 0.136
#> SRR1974957 2 0.2773 0.7235 0.000 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.3074 0.6493 0.000 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.1341 0.8457 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.3882 0.6629 0.000 0.168 0.788 0.000 0.044
#> SRR1974953 2 0.2516 0.7630 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974952 3 0.5202 0.3008 0.000 0.348 0.596 0.000 0.056
#> SRR1974949 3 0.4171 0.2655 0.000 0.396 0.604 0.000 0.000
#> SRR1974950 2 0.4481 0.6070 0.000 0.720 0.232 0.000 0.048
#> SRR1974951 2 0.1357 0.8096 0.000 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1974947 2 0.2648 0.7428 0.000 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.2127 0.7759 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974946 5 0.3003 0.8272 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974945 3 0.0404 0.8762 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974944 3 0.1197 0.8512 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0671 0.8770 0.016 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.1197 0.8101 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0290 0.8798 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.1648 0.8111 0.000 0.940 0.040 0.000 0.020
#> SRR1974938 3 0.0290 0.8798 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1571 0.8487 0.000 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR1974936 3 0.0609 0.8755 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0162 0.8798 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.2690 0.7257 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974933 2 0.4338 0.5452 0.000 0.696 0.280 0.000 0.024
#> SRR1974932 3 0.0290 0.8798 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.1087 0.8719 0.008 0.008 0.968 0.000 0.016
#> SRR1974930 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.2331 0.7858 0.000 0.900 0.020 0.000 0.080
#> SRR1974927 3 0.0162 0.8798 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0703 0.8730 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0510 0.8775 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.4302 0.0486 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.3413 0.7528 0.000 0.832 0.044 0.000 0.124
#> SRR1974922 3 0.1544 0.8341 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0162 0.8798 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0609 0.8755 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0451 0.8800 0.004 0.008 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0162 0.8798 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974917 5 0.3534 0.8274 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1974916 3 0.0290 0.8799 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0290 0.8798 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.3599 0.7377 0.000 0.824 0.140 0.016 0.020
#> SRR1974913 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0162 0.8784 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.8788 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.4060 0.2574 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974909 3 0.0324 0.8807 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.3193 0.7658 0.000 0.852 0.112 0.004 0.032
#> SRR1974907 3 0.0000 0.8788 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.8788 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.4522 0.6599 0.000 0.744 0.176 0.000 0.080
#> SRR1974903 3 0.0404 0.8791 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.3055 0.7887 0.000 0.864 0.064 0.000 0.072
#> SRR1974901 3 0.2471 0.7437 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.4101 0.3173 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974900 2 0.2784 0.7626 0.000 0.872 0.016 0.004 0.108
#> SRR1974899 2 0.4161 0.1246 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974897 5 0.4074 0.7150 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1974896 2 0.2077 0.7932 0.000 0.908 0.008 0.000 0.084
#> SRR1974893 2 0.2597 0.7712 0.000 0.884 0.024 0.000 0.092
#> SRR1974895 5 0.2773 0.8250 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974894 2 0.1216 0.8155 0.000 0.960 0.020 0.000 0.020
#> SRR1974892 2 0.3732 0.7059 0.000 0.792 0.176 0.000 0.032
#> SRR1974890 2 0.7536 0.0854 0.012 0.428 0.372 0.056 0.132
#> SRR1974891 2 0.2574 0.7724 0.000 0.876 0.112 0.000 0.012
#> SRR1974889 5 0.3143 0.8289 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974888 2 0.3584 0.7459 0.000 0.832 0.056 0.004 0.108
#> SRR1974886 2 0.1124 0.8126 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1974887 4 0.6043 0.3901 0.320 0.000 0.140 0.540 0.000
#> SRR1974885 4 0.4339 0.3975 0.012 0.000 0.336 0.652 0.000
#> SRR1974883 2 0.3760 0.6915 0.000 0.784 0.188 0.000 0.028
#> SRR1974884 2 0.3171 0.6968 0.000 0.816 0.008 0.000 0.176
#> SRR1974881 2 0.0451 0.8122 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974882 2 0.2170 0.8100 0.000 0.904 0.004 0.004 0.088
#> SRR1974880 2 0.3636 0.5884 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1974879 2 0.3565 0.7158 0.000 0.800 0.024 0.000 0.176
#> SRR1974877 5 0.3480 0.8311 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1974876 2 0.2006 0.8172 0.000 0.932 0.024 0.024 0.020
#> SRR1974878 2 0.4726 0.2957 0.000 0.580 0.400 0.000 0.020
#> SRR1974875 3 0.3850 0.7494 0.080 0.004 0.824 0.088 0.004
#> SRR1974874 5 0.3970 0.8216 0.000 0.224 0.000 0.024 0.752
#> SRR1974873 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 5 0.6248 0.5526 0.000 0.384 0.000 0.148 0.468
#> SRR1974872 2 0.0955 0.8110 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974869 5 0.3684 0.8176 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1974868 2 0.1478 0.7985 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974870 2 0.3586 0.4539 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1974866 2 0.2773 0.7359 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 5 0.2813 0.8281 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1974864 2 0.6122 0.4529 0.196 0.624 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974862 5 0.5641 0.7434 0.000 0.268 0.000 0.120 0.612
#> SRR1974863 5 0.2773 0.8250 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974860 5 0.4307 0.3826 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1974861 5 0.2891 0.8284 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974859 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 5 0.2773 0.8250 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974856 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 5 0.2813 0.8267 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1974855 2 0.1893 0.8179 0.000 0.928 0.024 0.000 0.048
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.4655 0.5014 0.660 0.004 0.000 0.312 0.024
#> SRR1974852 2 0.1270 0.8131 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4921 0.6723 0.008 0.056 0.016 0.744 0.176
#> SRR1974846 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.5346 0.5959 0.700 0.136 0.012 0.000 0.152
#> SRR1974845 2 0.1121 0.8157 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.3111 0.7412 0.004 0.840 0.012 0.000 0.144
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.1270 0.8131 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1197 0.8134 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974834 2 0.1270 0.8131 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974833 1 0.7866 0.2526 0.516 0.084 0.100 0.256 0.044
#> SRR1974831 2 0.1582 0.8169 0.000 0.944 0.000 0.028 0.028
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.3774 0.5050 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974827 2 0.1787 0.8130 0.004 0.936 0.000 0.044 0.016
#> SRR1974824 1 0.3408 0.8166 0.840 0.020 0.008 0.004 0.128
#> SRR1974825 1 0.3477 0.7966 0.824 0.008 0.012 0.004 0.152
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3012 0.8329 0.852 0.000 0.024 0.000 0.124
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0613 0.8705 0.004 0.004 0.000 0.984 0.008
#> SRR1974812 1 0.0510 0.9511 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974810 1 0.7085 0.4448 0.588 0.064 0.012 0.176 0.160
#> SRR1974808 2 0.0955 0.8157 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974811 1 0.2136 0.8820 0.904 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 2 0.6728 0.1435 0.320 0.500 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1270 0.8131 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974804 1 0.3463 0.7761 0.820 0.000 0.016 0.156 0.008
#> SRR1974803 1 0.1485 0.9226 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.4948 0.5056 0.224 0.700 0.004 0.000 0.072
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.4278 0.4244 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1974797 2 0.1043 0.8129 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974796 2 0.2142 0.8092 0.004 0.920 0.000 0.028 0.048
#> SRR1974795 2 0.3079 0.7774 0.064 0.876 0.000 0.044 0.016
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 5 0.2966 0.8329 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974792 2 0.1121 0.8133 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974791 2 0.1270 0.8131 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974790 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974789 5 0.4045 0.6818 0.000 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1974788 2 0.3109 0.6560 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1974786 2 0.4953 0.1329 0.440 0.532 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974787 2 0.2508 0.7921 0.004 0.896 0.012 0.004 0.084
#> SRR1974784 2 0.1413 0.8178 0.000 0.956 0.012 0.012 0.020
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.2166 0.7955 0.072 0.912 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1117 0.8178 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974780 2 0.2120 0.8070 0.020 0.924 0.004 0.004 0.048
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.2017 0.8068 0.008 0.924 0.004 0.004 0.060
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1410 0.8010 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0566 0.8120 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974770 2 0.1831 0.7985 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1974769 2 0.1981 0.8111 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048
#> SRR1974768 2 0.1502 0.8121 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974767 2 0.0865 0.8116 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1974766 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974765 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974764 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1205 0.8098 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974760 2 0.1560 0.8165 0.000 0.948 0.004 0.020 0.028
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0324 0.8118 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974757 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974753 4 0.4428 0.3647 0.000 0.284 0.004 0.692 0.020
#> SRR1974751 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.2095 0.8033 0.000 0.920 0.008 0.012 0.060
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0290 0.9569 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.5114 0.2805 0.000 0.608 0.000 0.340 0.052
#> SRR1974745 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.6127 -0.3849 0.000 0.456 0.000 0.128 0.416
#> SRR1974739 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0290 0.8726 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974738 2 0.5598 0.2400 0.000 0.612 0.000 0.112 0.276
#> SRR1974737 4 0.1043 0.8372 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.2052 0.7941 0.000 0.912 0.004 0.004 0.080
#> SRR1974733 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0404 0.8703 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974725 4 0.7646 0.0877 0.052 0.348 0.012 0.428 0.160
#> SRR1974726 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.1831 0.8078 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1974723 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 5 0.4301 0.8065 0.000 0.260 0.000 0.028 0.712
#> SRR1974720 4 0.3699 0.7401 0.000 0.036 0.012 0.824 0.128
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0932 0.8131 0.000 0.972 0.004 0.004 0.020
#> SRR1974717 4 0.0451 0.8703 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1974715 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974711 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.3336 0.6494 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1974710 2 0.0963 0.8121 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974707 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.2835 0.7658 0.000 0.080 0.004 0.880 0.036
#> SRR1974702 2 0.3088 0.6935 0.164 0.828 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974701 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 5 0.4886 -0.1283 0.000 0.016 0.004 0.468 0.512
#> SRR1974698 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.4431 0.6757 0.056 0.780 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974696 2 0.4361 0.7034 0.000 0.780 0.012 0.064 0.144
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.2833 0.7644 0.000 0.864 0.012 0.004 0.120
#> SRR1974693 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.1043 0.8126 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0290 0.9567 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1270 0.8094 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974675 2 0.4171 0.2329 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.3143 0.8253 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974671 5 0.3913 0.7436 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1974672 5 0.2852 0.8300 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974670 5 0.2690 0.8220 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974669 5 0.3305 0.8318 0.000 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1974667 2 0.1478 0.8041 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974668 2 0.4015 0.2972 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974666 2 0.3857 0.3994 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1974664 5 0.2891 0.8287 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974665 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974663 2 0.2783 0.7649 0.000 0.868 0.012 0.004 0.116
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974660 1 0.2660 0.8387 0.864 0.000 0.008 0.000 0.128
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 2 0.6607 0.2597 0.284 0.536 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 2 0.3280 0.7268 0.000 0.824 0.012 0.004 0.160
#> SRR1974656 2 0.3197 0.7329 0.000 0.832 0.012 0.004 0.152
#> SRR1974650 2 0.1991 0.7965 0.000 0.916 0.004 0.004 0.076
#> SRR1974651 4 0.3242 0.5371 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1974652 2 0.4591 0.6995 0.084 0.776 0.012 0.004 0.124
#> SRR1974653 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 2 0.3239 0.7299 0.000 0.828 0.012 0.004 0.156
#> SRR1974646 2 0.3398 0.5627 0.000 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.2773 0.6421 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974640 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974641 5 0.3957 0.8045 0.000 0.280 0.000 0.008 0.712
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4171 0.1144 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1974633 2 0.4160 0.6915 0.032 0.788 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.6002 0.4859 0.640 0.180 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 5 0.3074 0.8245 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974623 2 0.2522 0.7787 0.000 0.880 0.012 0.000 0.108
#> SRR1974622 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974620 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974619 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.6591 0.2470 0.540 0.280 0.012 0.004 0.164
#> SRR1974615 1 0.0162 0.9592 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1864 0.8002 0.000 0.924 0.004 0.004 0.068
#> SRR1974613 2 0.3154 0.7360 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974612 1 0.0566 0.9515 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974611 2 0.3197 0.7345 0.000 0.832 0.012 0.004 0.152
#> SRR1974610 2 0.6706 -0.3391 0.000 0.428 0.000 0.284 0.288
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.7954 0.0608 0.080 0.336 0.012 0.412 0.160
#> SRR1974607 2 0.5890 0.5036 0.204 0.636 0.012 0.000 0.148
#> SRR1974606 2 0.1544 0.7985 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974605 4 0.7326 0.3840 0.080 0.200 0.012 0.564 0.144
#> SRR1974604 4 0.0000 0.8795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.0566 0.8118 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.1124 0.8126 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1974601 2 0.2112 0.7949 0.000 0.908 0.004 0.004 0.084
#> SRR1974599 2 0.2020 0.7894 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974598 2 0.2377 0.7739 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974596 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974594 2 0.1124 0.8126 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1974593 2 0.1732 0.8038 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974595 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974592 2 0.2377 0.7742 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974591 2 0.3274 0.6539 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974588 2 0.2462 0.7911 0.000 0.880 0.008 0.000 0.112
#> SRR1974590 2 0.1205 0.8131 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974589 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974587 2 0.1121 0.8128 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974586 2 0.4171 0.1354 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1974585 2 0.2411 0.7980 0.000 0.884 0.008 0.000 0.108
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 5 0.4138 0.6279 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974582 2 0.1341 0.8113 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974581 2 0.2561 0.7584 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974580 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974578 2 0.1365 0.8148 0.000 0.952 0.004 0.004 0.040
#> SRR1974577 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974579 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974576 2 0.1205 0.8134 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974575 2 0.1043 0.8122 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974574 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974573 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974571 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974572 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974570 2 0.0162 0.8103 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974568 2 0.3154 0.7398 0.000 0.836 0.012 0.004 0.148
#> SRR1974567 1 0.1121 0.9099 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974569 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974565 2 0.1704 0.8135 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1974564 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974560 2 0.2833 0.7579 0.000 0.864 0.012 0.004 0.120
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.1043 0.8131 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974562 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974561 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974557 5 0.3895 0.7666 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1974553 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974554 2 0.3111 0.7391 0.000 0.840 0.012 0.004 0.144
#> SRR1974558 2 0.6512 0.0668 0.388 0.464 0.012 0.000 0.136
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9630 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.2563 0.7778 0.000 0.872 0.008 0.000 0.120
#> SRR1974549 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974548 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974547 2 0.3475 0.7411 0.000 0.804 0.012 0.004 0.180
#> SRR1974546 2 0.1991 0.7965 0.000 0.916 0.004 0.004 0.076
#> SRR1974545 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974544 2 0.1124 0.8126 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974543 2 0.0963 0.8124 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0146 0.87384 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975008 5 0.5507 0.21816 0.000 0.080 0.020 0.000 0.524 0.376
#> SRR1975006 2 0.5952 -0.11902 0.000 0.424 0.000 0.000 0.352 0.224
#> SRR1975005 5 0.4979 0.22002 0.000 0.004 0.064 0.000 0.556 0.376
#> SRR1975004 3 0.5308 0.29153 0.000 0.000 0.592 0.000 0.164 0.244
#> SRR1975003 5 0.5828 0.14813 0.000 0.076 0.040 0.000 0.472 0.412
#> SRR1975001 2 0.4043 0.61011 0.000 0.756 0.000 0.000 0.116 0.128
#> SRR1975002 5 0.5725 0.09587 0.000 0.164 0.000 0.000 0.420 0.416
#> SRR1974999 5 0.4417 0.19259 0.000 0.028 0.000 0.000 0.556 0.416
#> SRR1975000 3 0.1367 0.84583 0.000 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1974998 3 0.1334 0.85181 0.000 0.000 0.948 0.000 0.020 0.032
#> SRR1974997 6 0.4601 -0.00132 0.000 0.000 0.312 0.000 0.060 0.628
#> SRR1974995 5 0.5488 0.10602 0.000 0.000 0.128 0.000 0.476 0.396
#> SRR1974996 3 0.3446 0.60477 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974994 1 0.1949 0.86179 0.904 0.000 0.088 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974993 3 0.5029 0.27714 0.000 0.000 0.612 0.000 0.112 0.276
#> SRR1974992 3 0.4984 0.36489 0.000 0.000 0.632 0.000 0.124 0.244
#> SRR1974990 3 0.0146 0.87377 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 6 0.5126 0.14596 0.000 0.000 0.096 0.280 0.008 0.616
#> SRR1974991 3 0.6013 -0.26583 0.000 0.000 0.420 0.000 0.252 0.328
#> SRR1974986 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 5 0.4879 0.21415 0.000 0.020 0.028 0.000 0.548 0.404
#> SRR1974988 3 0.2664 0.74964 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974984 6 0.6080 0.05807 0.000 0.000 0.316 0.000 0.288 0.396
#> SRR1974985 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.5969 0.14522 0.000 0.156 0.012 0.000 0.452 0.380
#> SRR1974982 3 0.0146 0.87377 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3104 0.65401 0.204 0.000 0.788 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974980 3 0.0146 0.87396 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974979 6 0.5956 0.10855 0.000 0.000 0.324 0.000 0.236 0.440
#> SRR1974978 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 6 0.6603 -0.06238 0.000 0.068 0.132 0.000 0.396 0.404
#> SRR1974975 5 0.5764 0.03864 0.000 0.000 0.172 0.000 0.424 0.404
#> SRR1974974 5 0.6122 0.12276 0.000 0.076 0.064 0.000 0.448 0.412
#> SRR1974973 2 0.5940 0.05808 0.000 0.460 0.000 0.000 0.272 0.268
#> SRR1974972 3 0.5621 0.06551 0.000 0.000 0.528 0.000 0.184 0.288
#> SRR1974971 5 0.5099 0.16346 0.000 0.080 0.000 0.000 0.496 0.424
#> SRR1974970 3 0.0891 0.85687 0.000 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974969 5 0.4751 0.27451 0.000 0.000 0.076 0.000 0.624 0.300
#> SRR1974968 5 0.6227 0.08006 0.000 0.060 0.092 0.000 0.432 0.416
#> SRR1974967 3 0.1461 0.84473 0.000 0.000 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR1974965 3 0.0146 0.87377 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 5 0.1411 0.34610 0.000 0.060 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974964 3 0.4007 0.54303 0.000 0.000 0.728 0.000 0.052 0.220
#> SRR1974963 3 0.1196 0.85357 0.000 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1974961 6 0.5957 -0.00939 0.000 0.000 0.220 0.000 0.380 0.400
#> SRR1974962 5 0.4764 0.30184 0.000 0.080 0.000 0.000 0.628 0.292
#> SRR1974960 3 0.2740 0.78415 0.000 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1974959 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 5 0.5270 0.17922 0.000 0.100 0.000 0.000 0.496 0.404
#> SRR1974957 5 0.5586 0.06204 0.000 0.000 0.140 0.000 0.440 0.420
#> SRR1974956 3 0.3175 0.66364 0.000 0.000 0.808 0.000 0.028 0.164
#> SRR1974955 3 0.1226 0.84096 0.040 0.000 0.952 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974954 3 0.4526 0.60054 0.000 0.000 0.704 0.000 0.164 0.132
#> SRR1974953 5 0.5166 0.21537 0.000 0.092 0.000 0.000 0.524 0.384
#> SRR1974952 3 0.5379 0.32152 0.000 0.000 0.536 0.000 0.128 0.336
#> SRR1974949 3 0.5103 0.24729 0.000 0.000 0.604 0.000 0.120 0.276
#> SRR1974950 5 0.6213 0.03623 0.000 0.012 0.208 0.000 0.408 0.372
#> SRR1974951 5 0.5057 0.15193 0.000 0.016 0.044 0.000 0.528 0.412
#> SRR1974947 5 0.5701 0.04630 0.000 0.000 0.160 0.000 0.432 0.408
#> SRR1974948 5 0.5190 0.11742 0.000 0.088 0.000 0.000 0.464 0.448
#> SRR1974946 2 0.0458 0.67723 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974945 3 0.0713 0.86434 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974944 3 0.1010 0.84486 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.0291 0.87280 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974943 5 0.4703 0.16203 0.000 0.000 0.048 0.000 0.544 0.408
#> SRR1974941 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 5 0.5434 0.14077 0.000 0.032 0.052 0.000 0.508 0.408
#> SRR1974938 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.2048 0.79988 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974936 3 0.0146 0.87377 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 5 0.5611 0.11162 0.000 0.144 0.000 0.000 0.436 0.420
#> SRR1974933 5 0.6094 -0.01487 0.000 0.000 0.280 0.000 0.368 0.352
#> SRR1974932 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.1265 0.85387 0.008 0.000 0.948 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.5315 0.17173 0.000 0.072 0.012 0.000 0.508 0.408
#> SRR1974927 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0260 0.87172 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3997 0.02282 0.508 0.000 0.488 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974923 5 0.3172 0.35944 0.000 0.000 0.048 0.000 0.824 0.128
#> SRR1974922 3 0.1480 0.83221 0.000 0.000 0.940 0.000 0.020 0.040
#> SRR1974921 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0291 0.87197 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.2376 0.69702 0.000 0.888 0.000 0.000 0.044 0.068
#> SRR1974916 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 6 0.6070 0.01941 0.000 0.000 0.148 0.020 0.380 0.452
#> SRR1974913 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0363 0.87170 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.6061 -0.25705 0.000 0.372 0.000 0.000 0.260 0.368
#> SRR1974909 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 5 0.4757 0.28175 0.000 0.000 0.084 0.000 0.636 0.280
#> SRR1974907 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 5 0.5751 0.22226 0.000 0.024 0.128 0.000 0.568 0.280
#> SRR1974903 3 0.0000 0.87540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 5 0.5332 0.25234 0.000 0.036 0.052 0.000 0.580 0.332
#> SRR1974901 3 0.2445 0.75259 0.000 0.000 0.872 0.000 0.020 0.108
#> SRR1974898 6 0.5962 0.07971 0.000 0.348 0.000 0.000 0.228 0.424
#> SRR1974900 5 0.5262 0.17094 0.000 0.084 0.004 0.000 0.496 0.416
#> SRR1974899 2 0.5862 0.01216 0.000 0.464 0.000 0.000 0.324 0.212
#> SRR1974897 2 0.4718 0.53493 0.000 0.676 0.000 0.000 0.124 0.200
#> SRR1974896 5 0.5075 0.12686 0.000 0.064 0.004 0.000 0.480 0.452
#> SRR1974893 5 0.5209 0.19057 0.000 0.056 0.016 0.000 0.520 0.408
#> SRR1974895 2 0.0458 0.67723 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974894 5 0.4635 0.11883 0.000 0.012 0.020 0.000 0.524 0.444
#> SRR1974892 6 0.5719 0.01741 0.000 0.000 0.168 0.000 0.372 0.460
#> SRR1974890 6 0.5673 -0.05995 0.000 0.000 0.164 0.000 0.356 0.480
#> SRR1974891 5 0.5093 0.17407 0.000 0.000 0.084 0.000 0.528 0.388
#> SRR1974889 2 0.0909 0.68443 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1974888 5 0.5951 0.11136 0.000 0.088 0.040 0.000 0.444 0.428
#> SRR1974886 5 0.3869 0.00869 0.000 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1974887 4 0.5360 0.40578 0.308 0.000 0.136 0.556 0.000 0.000
#> SRR1974885 4 0.3898 0.41537 0.012 0.000 0.336 0.652 0.000 0.000
#> SRR1974883 5 0.5746 0.12133 0.000 0.000 0.188 0.000 0.488 0.324
#> SRR1974884 5 0.5684 0.13017 0.000 0.136 0.004 0.000 0.448 0.412
#> SRR1974881 5 0.4141 0.15235 0.000 0.000 0.012 0.000 0.556 0.432
#> SRR1974882 5 0.4513 0.11909 0.000 0.032 0.000 0.000 0.528 0.440
#> SRR1974880 6 0.5728 0.05174 0.000 0.180 0.000 0.000 0.336 0.484
#> SRR1974879 6 0.5739 -0.03571 0.000 0.132 0.008 0.000 0.392 0.468
#> SRR1974877 2 0.2488 0.70018 0.000 0.880 0.000 0.000 0.044 0.076
#> SRR1974876 6 0.4361 0.21384 0.000 0.000 0.016 0.036 0.248 0.700
#> SRR1974878 6 0.4422 0.21302 0.000 0.000 0.252 0.000 0.068 0.680
#> SRR1974875 3 0.3516 0.74510 0.076 0.000 0.824 0.088 0.004 0.008
#> SRR1974874 2 0.3648 0.66961 0.000 0.808 0.000 0.024 0.040 0.128
#> SRR1974873 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.6784 0.26886 0.000 0.456 0.000 0.128 0.100 0.316
#> SRR1974872 5 0.3706 0.26271 0.000 0.000 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974869 2 0.3464 0.67500 0.000 0.808 0.000 0.000 0.108 0.084
#> SRR1974868 5 0.5887 0.10043 0.000 0.204 0.000 0.000 0.432 0.364
#> SRR1974870 5 0.5675 0.13936 0.000 0.344 0.000 0.000 0.488 0.168
#> SRR1974866 5 0.5199 0.25534 0.000 0.120 0.000 0.000 0.580 0.300
#> SRR1974867 1 0.0405 0.95001 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974865 2 0.0713 0.68852 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974864 5 0.4438 0.00616 0.044 0.000 0.000 0.000 0.628 0.328
#> SRR1974862 2 0.4741 0.60477 0.000 0.740 0.000 0.120 0.068 0.072
#> SRR1974863 2 0.0000 0.67651 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.4834 0.49250 0.000 0.660 0.000 0.000 0.212 0.128
#> SRR1974861 2 0.0363 0.67730 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974859 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.67651 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0146 0.67652 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974855 6 0.3210 0.23776 0.000 0.000 0.028 0.000 0.168 0.804
#> SRR1974854 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5891 0.18522 0.436 0.000 0.000 0.140 0.012 0.412
#> SRR1974852 6 0.1007 0.31055 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974849 1 0.0260 0.95067 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974848 1 0.0405 0.95065 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974850 6 0.6250 -0.20343 0.020 0.000 0.004 0.184 0.296 0.496
#> SRR1974846 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 5 0.4475 -0.16945 0.412 0.000 0.000 0.000 0.556 0.032
#> SRR1974845 6 0.1387 0.30716 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974844 1 0.0146 0.95146 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974843 5 0.0937 0.36705 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974842 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974841 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974840 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.1007 0.31047 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974838 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974837 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974836 6 0.2941 0.24746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974834 6 0.1075 0.30856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974833 6 0.7307 -0.23743 0.360 0.000 0.068 0.060 0.096 0.416
#> SRR1974831 6 0.1838 0.29768 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068 0.916
#> SRR1974832 1 0.0405 0.95065 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974830 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 6 0.5862 0.07705 0.000 0.216 0.000 0.000 0.316 0.468
#> SRR1974827 6 0.2420 0.28952 0.004 0.000 0.000 0.032 0.076 0.888
#> SRR1974824 1 0.5294 0.37884 0.532 0.000 0.000 0.000 0.356 0.112
#> SRR1974825 1 0.4736 0.40231 0.552 0.000 0.000 0.000 0.396 0.052
#> SRR1974822 1 0.0458 0.94783 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974823 5 0.0146 0.36253 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974820 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974818 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974819 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 6 0.6081 -0.26627 0.376 0.000 0.004 0.000 0.220 0.400
#> SRR1974815 1 0.0405 0.94982 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974813 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974814 4 0.2146 0.82044 0.004 0.000 0.000 0.880 0.000 0.116
#> SRR1974812 1 0.3765 0.47709 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1974810 6 0.6277 -0.16537 0.204 0.000 0.000 0.016 0.380 0.400
#> SRR1974808 5 0.4219 0.22486 0.000 0.020 0.000 0.000 0.592 0.388
#> SRR1974811 1 0.5736 0.33424 0.492 0.000 0.000 0.000 0.188 0.320
#> SRR1974809 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974807 5 0.4252 0.04769 0.036 0.000 0.000 0.000 0.652 0.312
#> SRR1974806 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0713 0.30941 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974804 1 0.5080 0.62904 0.688 0.000 0.004 0.088 0.028 0.192
#> SRR1974803 1 0.2755 0.86061 0.880 0.000 0.028 0.000 0.056 0.036
#> SRR1974801 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974800 6 0.4653 0.05097 0.052 0.000 0.000 0.000 0.360 0.588
#> SRR1974799 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.5120 0.41567 0.000 0.628 0.000 0.000 0.176 0.196
#> SRR1974797 6 0.4389 0.05938 0.000 0.024 0.000 0.000 0.448 0.528
#> SRR1974796 6 0.1155 0.30957 0.004 0.000 0.000 0.004 0.036 0.956
#> SRR1974795 6 0.2632 0.28804 0.032 0.000 0.000 0.048 0.032 0.888
#> SRR1974793 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974794 2 0.0622 0.68145 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974792 6 0.1387 0.31095 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974791 6 0.0937 0.30995 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974790 6 0.3851 0.07821 0.000 0.000 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974789 2 0.3920 0.62587 0.000 0.768 0.000 0.000 0.120 0.112
#> SRR1974788 5 0.6120 0.05090 0.000 0.308 0.000 0.000 0.360 0.332
#> SRR1974786 1 0.5991 -0.25770 0.436 0.000 0.000 0.000 0.256 0.308
#> SRR1974787 5 0.3727 0.14129 0.000 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974784 6 0.2478 0.29382 0.000 0.000 0.012 0.024 0.076 0.888
#> SRR1974783 1 0.0146 0.95131 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974785 5 0.5205 0.15200 0.096 0.000 0.000 0.000 0.520 0.384
#> SRR1974782 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974781 6 0.3385 0.26135 0.000 0.000 0.000 0.032 0.180 0.788
#> SRR1974780 5 0.3136 0.35250 0.004 0.000 0.000 0.000 0.768 0.228
#> SRR1974779 1 0.0291 0.95101 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974777 1 0.0405 0.94982 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974776 5 0.3923 0.18079 0.004 0.000 0.000 0.000 0.580 0.416
#> SRR1974778 1 0.0405 0.94982 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974774 5 0.5746 0.11535 0.000 0.172 0.000 0.000 0.452 0.376
#> SRR1974773 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974775 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974772 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 5 0.4025 0.20450 0.000 0.000 0.000 0.008 0.576 0.416
#> SRR1974770 5 0.5621 0.10876 0.000 0.148 0.000 0.000 0.460 0.392
#> SRR1974769 6 0.1049 0.30926 0.000 0.000 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR1974768 6 0.4650 0.22914 0.000 0.000 0.000 0.104 0.220 0.676
#> SRR1974767 5 0.3620 0.27466 0.000 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974766 5 0.3804 0.18157 0.000 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1974765 6 0.3851 0.07688 0.000 0.000 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974764 5 0.3789 0.18894 0.000 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1974763 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.0405 0.95075 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974761 5 0.5118 0.15871 0.000 0.084 0.000 0.000 0.512 0.404
#> SRR1974760 6 0.2119 0.30091 0.000 0.000 0.008 0.036 0.044 0.912
#> SRR1974759 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974758 5 0.3923 0.18675 0.000 0.004 0.000 0.000 0.580 0.416
#> SRR1974757 6 0.3727 0.12434 0.000 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974756 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974754 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.4721 0.13884 0.000 0.048 0.000 0.000 0.532 0.420
#> SRR1974753 4 0.4655 0.40443 0.000 0.000 0.000 0.680 0.112 0.208
#> SRR1974751 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0146 0.95146 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974749 5 0.3528 0.32206 0.000 0.000 0.000 0.004 0.700 0.296
#> SRR1974747 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0692 0.94204 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 6 0.6858 0.10807 0.000 0.056 0.000 0.340 0.220 0.384
#> SRR1974745 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.6861 0.06863 0.000 0.412 0.000 0.096 0.136 0.356
#> SRR1974739 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0291 0.90566 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974738 6 0.7267 0.09911 0.000 0.280 0.000 0.104 0.240 0.376
#> SRR1974737 4 0.0937 0.86622 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974736 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974734 5 0.3023 0.35469 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974733 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0520 0.94835 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974728 4 0.0363 0.90385 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974725 5 0.5807 -0.22480 0.052 0.000 0.000 0.332 0.544 0.072
#> SRR1974726 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.4224 0.27862 0.000 0.028 0.000 0.000 0.632 0.340
#> SRR1974723 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.3908 0.66581 0.000 0.792 0.000 0.020 0.068 0.120
#> SRR1974720 4 0.3672 0.50595 0.000 0.000 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1974719 1 0.0717 0.94313 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974718 1 0.0405 0.94953 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974716 5 0.3578 0.28355 0.000 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974717 4 0.0508 0.90105 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974715 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974714 5 0.0713 0.36580 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974711 5 0.3782 0.19429 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR1974712 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974709 1 0.0146 0.95131 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974708 5 0.5536 0.20774 0.000 0.168 0.000 0.000 0.540 0.292
#> SRR1974710 5 0.3390 0.31558 0.000 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1974707 5 0.0260 0.35750 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974706 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974705 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.2972 0.75716 0.000 0.000 0.000 0.836 0.128 0.036
#> SRR1974702 6 0.5680 -0.04648 0.156 0.000 0.000 0.000 0.412 0.432
#> SRR1974701 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.6132 0.08169 0.000 0.472 0.000 0.384 0.084 0.060
#> SRR1974698 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.0692 0.34975 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1974696 5 0.1418 0.35414 0.000 0.000 0.000 0.024 0.944 0.032
#> SRR1974694 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.1610 0.37186 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974693 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.3890 0.13742 0.000 0.004 0.000 0.000 0.400 0.596
#> SRR1974691 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0260 0.94767 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0146 0.95077 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974676 5 0.5581 0.10166 0.000 0.140 0.000 0.000 0.452 0.408
#> SRR1974675 5 0.6112 0.03605 0.000 0.320 0.000 0.000 0.372 0.308
#> SRR1974674 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974673 2 0.0508 0.68585 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974671 2 0.3509 0.65622 0.000 0.804 0.000 0.000 0.084 0.112
#> SRR1974672 2 0.0937 0.69012 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974670 2 0.0260 0.67708 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974669 2 0.1480 0.69072 0.000 0.940 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR1974667 5 0.5472 0.08215 0.000 0.124 0.000 0.000 0.464 0.412
#> SRR1974668 2 0.6001 -0.14519 0.000 0.428 0.000 0.000 0.252 0.320
#> SRR1974666 2 0.6067 -0.26144 0.000 0.396 0.000 0.000 0.272 0.332
#> SRR1974664 2 0.0000 0.67651 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 5 0.4896 0.13005 0.000 0.032 0.000 0.016 0.528 0.424
#> SRR1974663 5 0.1863 0.37271 0.000 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974662 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0547 0.36519 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974660 1 0.3534 0.64791 0.716 0.000 0.000 0.000 0.276 0.008
#> SRR1974659 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0405 0.94982 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974657 5 0.4860 0.03221 0.128 0.000 0.000 0.000 0.656 0.216
#> SRR1974654 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974655 5 0.1267 0.31835 0.000 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974656 5 0.0547 0.35243 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974650 5 0.3023 0.35537 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974651 4 0.3377 0.57202 0.000 0.000 0.000 0.784 0.028 0.188
#> SRR1974652 5 0.2365 0.35562 0.040 0.000 0.000 0.000 0.888 0.072
#> SRR1974653 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.0790 0.34818 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974646 5 0.5509 0.18345 0.000 0.300 0.000 0.000 0.540 0.160
#> SRR1974649 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974647 4 0.2783 0.66962 0.000 0.000 0.000 0.836 0.016 0.148
#> SRR1974645 1 0.0405 0.95065 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974644 5 0.3774 0.19909 0.000 0.000 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR1974643 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974642 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974640 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974641 2 0.3787 0.67000 0.000 0.796 0.000 0.012 0.072 0.120
#> SRR1974639 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0520 0.94835 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974635 1 0.0260 0.95067 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974636 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974634 1 0.0405 0.95075 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974637 4 0.5237 0.15494 0.000 0.004 0.000 0.604 0.124 0.268
#> SRR1974633 5 0.2278 0.25159 0.004 0.000 0.000 0.000 0.868 0.128
#> SRR1974632 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974631 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974630 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974628 1 0.0000 0.95140 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 5 0.5022 -0.10412 0.076 0.000 0.000 0.000 0.528 0.396
#> SRR1974624 1 0.0260 0.95067 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974625 2 0.0000 0.67651 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 5 0.2257 0.37447 0.000 0.008 0.000 0.000 0.876 0.116
#> SRR1974622 5 0.0146 0.36281 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974620 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974619 5 0.0632 0.36358 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974621 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974617 1 0.0520 0.94835 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974616 5 0.5452 -0.14444 0.120 0.000 0.000 0.000 0.444 0.436
#> SRR1974615 1 0.0520 0.94835 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974618 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974614 5 0.3023 0.35661 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974613 5 0.0260 0.36402 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974612 1 0.2830 0.81725 0.836 0.000 0.000 0.000 0.020 0.144
#> SRR1974611 5 0.0692 0.36712 0.000 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1974610 6 0.7493 -0.02357 0.000 0.276 0.000 0.260 0.136 0.328
#> SRR1974609 1 0.0622 0.94800 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974608 5 0.4599 0.09901 0.056 0.000 0.000 0.252 0.680 0.012
#> SRR1974607 5 0.3803 0.19425 0.184 0.000 0.000 0.000 0.760 0.056
#> SRR1974606 5 0.5643 0.14039 0.000 0.156 0.000 0.000 0.476 0.368
#> SRR1974605 5 0.5611 -0.37731 0.084 0.000 0.000 0.436 0.460 0.020
#> SRR1974604 4 0.0000 0.91356 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.3672 0.25041 0.000 0.000 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1974602 1 0.0146 0.95114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 6 0.4086 0.05915 0.000 0.008 0.000 0.000 0.464 0.528
#> SRR1974601 5 0.2454 0.36952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974599 5 0.5779 0.08129 0.000 0.176 0.000 0.000 0.432 0.392
#> SRR1974598 5 0.5931 0.09253 0.000 0.216 0.000 0.000 0.424 0.360
#> SRR1974596 6 0.4264 -0.00327 0.000 0.016 0.000 0.000 0.484 0.500
#> SRR1974594 6 0.4089 0.05219 0.000 0.000 0.000 0.008 0.468 0.524
#> SRR1974593 6 0.4945 0.00972 0.000 0.064 0.000 0.000 0.452 0.484
#> SRR1974595 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974592 5 0.5893 0.08871 0.000 0.204 0.000 0.000 0.424 0.372
#> SRR1974591 5 0.6114 0.05150 0.000 0.304 0.000 0.000 0.368 0.328
#> SRR1974588 5 0.3592 0.23918 0.000 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1974590 6 0.4258 0.03941 0.000 0.016 0.000 0.000 0.468 0.516
#> SRR1974589 6 0.3854 0.06665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1974587 6 0.4337 0.00398 0.000 0.020 0.000 0.000 0.480 0.500
#> SRR1974586 6 0.5933 0.11765 0.000 0.348 0.000 0.000 0.220 0.432
#> SRR1974585 5 0.3727 0.19877 0.000 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974584 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974583 2 0.5001 0.38678 0.000 0.596 0.000 0.000 0.096 0.308
#> SRR1974582 5 0.4992 0.03154 0.000 0.068 0.000 0.000 0.468 0.464
#> SRR1974581 5 0.5998 0.07427 0.000 0.236 0.000 0.000 0.404 0.360
#> SRR1974580 6 0.3854 0.06665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1974578 6 0.3868 0.00534 0.000 0.000 0.000 0.000 0.492 0.508
#> SRR1974577 5 0.3797 0.18295 0.000 0.000 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1974579 6 0.3854 0.06665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1974576 6 0.4531 0.02780 0.000 0.032 0.000 0.000 0.464 0.504
#> SRR1974575 5 0.4097 0.02100 0.000 0.008 0.000 0.000 0.504 0.488
#> SRR1974574 6 0.3804 0.12873 0.000 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974573 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974571 6 0.3797 0.13213 0.000 0.000 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1974572 6 0.3765 0.14226 0.000 0.000 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1974570 5 0.3789 0.18894 0.000 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1974568 5 0.1075 0.35578 0.000 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974567 1 0.1418 0.90150 0.944 0.000 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974566 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974569 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974565 5 0.3868 0.01770 0.000 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974564 6 0.3838 0.09535 0.000 0.000 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1974560 5 0.2092 0.36583 0.000 0.000 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974559 1 0.0508 0.94913 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974563 6 0.3727 0.13539 0.000 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974562 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974561 6 0.3782 0.13708 0.000 0.000 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974557 2 0.3602 0.67195 0.000 0.796 0.000 0.000 0.088 0.116
#> SRR1974553 6 0.3817 0.12123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1974555 1 0.0291 0.95106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974551 1 0.0937 0.92101 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974552 6 0.3828 0.11022 0.000 0.000 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1974554 5 0.0790 0.36460 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974558 5 0.3674 0.15407 0.268 0.000 0.000 0.000 0.716 0.016
#> SRR1974556 1 0.0508 0.94966 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974550 5 0.3023 0.33916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974549 6 0.3789 0.13493 0.000 0.000 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1974548 6 0.3847 0.08148 0.000 0.000 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1974547 5 0.2135 0.33066 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974546 5 0.2854 0.35935 0.000 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974545 6 0.3817 0.12016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1974544 5 0.5061 0.09853 0.076 0.000 0.000 0.000 0.496 0.428
#> SRR1974543 6 0.3810 0.12543 0.000 0.000 0.000 0.000 0.428 0.572
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.563 0.849 0.898 0.4677 0.533 0.533
#> 3 3 0.955 0.947 0.970 0.3972 0.809 0.643
#> 4 4 0.757 0.836 0.818 0.1051 0.993 0.981
#> 5 5 0.730 0.690 0.819 0.0787 0.861 0.599
#> 6 6 0.729 0.580 0.777 0.0360 0.946 0.761
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975008 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975006 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975005 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975004 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975003 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975001 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975002 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974999 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1975000 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974998 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974997 2 0.2778 0.8380 0.048 0.952
#> SRR1974995 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974996 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974994 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974993 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974992 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974990 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974989 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974991 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974986 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974987 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974988 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974984 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974985 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974983 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974982 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974981 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974980 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974979 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974978 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974977 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974976 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974975 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974974 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974973 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974972 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974971 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974970 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974969 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974968 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974967 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974965 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974966 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974964 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974963 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974961 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974962 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974960 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974959 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974958 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974957 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974956 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974955 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974954 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974953 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974952 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974949 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974950 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974951 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974947 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974948 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974946 2 0.2236 0.8362 0.036 0.964
#> SRR1974945 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974944 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974942 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974943 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974941 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974940 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974939 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974938 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974937 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974936 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974935 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974934 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974933 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974932 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974931 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974930 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974929 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974928 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974927 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974924 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974925 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974926 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974923 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974922 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974921 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974920 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974919 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974918 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974917 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974916 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974915 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974914 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974913 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974911 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974910 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974908 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974909 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974906 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974907 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974905 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974904 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974903 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974902 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974901 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974898 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974900 2 0.1414 0.8330 0.020 0.980
#> SRR1974899 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974897 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974896 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974893 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974895 2 0.2778 0.8380 0.048 0.952
#> SRR1974894 2 0.0672 0.8297 0.008 0.992
#> SRR1974892 2 0.1184 0.8319 0.016 0.984
#> SRR1974890 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974891 2 0.1184 0.8320 0.016 0.984
#> SRR1974889 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974888 2 0.2043 0.8355 0.032 0.968
#> SRR1974886 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974887 2 0.1184 0.8317 0.016 0.984
#> SRR1974885 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974883 2 0.2423 0.8368 0.040 0.960
#> SRR1974884 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974881 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974882 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974880 2 0.0000 0.8269 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0672 0.8297 0.008 0.992
#> SRR1974877 2 0.2603 0.8374 0.044 0.956
#> SRR1974876 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974878 2 0.1633 0.8339 0.024 0.976
#> SRR1974875 2 0.0376 0.8284 0.004 0.996
#> SRR1974874 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974873 2 0.9170 0.6805 0.332 0.668
#> SRR1974871 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974872 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974870 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.9393 0.6509 0.356 0.644
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.9248 0.6718 0.340 0.660
#> SRR1974863 2 0.9323 0.6616 0.348 0.652
#> SRR1974860 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974861 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974859 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974858 2 0.7745 0.7588 0.228 0.772
#> SRR1974856 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974857 2 0.9393 0.6509 0.356 0.644
#> SRR1974855 2 0.2043 0.8340 0.032 0.968
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.9129 0.6851 0.328 0.672
#> SRR1974852 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.9286 0.6671 0.344 0.656
#> SRR1974846 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.7139 0.7905 0.196 0.804
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974839 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.7376 0.7839 0.208 0.792
#> SRR1974834 2 0.7674 0.7739 0.224 0.776
#> SRR1974833 2 0.2423 0.8345 0.040 0.960
#> SRR1974831 2 0.7528 0.7791 0.216 0.784
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.1414 0.9623 0.980 0.020
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.9460 0.6470 0.364 0.636
#> SRR1974827 2 0.7139 0.7905 0.196 0.804
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.9209 0.7025 0.336 0.664
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974812 2 0.9087 0.6940 0.324 0.676
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.7528 0.7791 0.216 0.784
#> SRR1974804 2 0.9129 0.6888 0.328 0.672
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2603 0.8331 0.044 0.956
#> SRR1974797 2 0.6623 0.8011 0.172 0.828
#> SRR1974796 2 0.6887 0.7958 0.184 0.816
#> SRR1974795 2 0.7139 0.7905 0.196 0.804
#> SRR1974793 1 0.9661 0.0152 0.608 0.392
#> SRR1974794 2 0.5946 0.8116 0.144 0.856
#> SRR1974792 2 0.6531 0.8026 0.168 0.832
#> SRR1974791 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974790 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974789 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974788 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.6438 0.8041 0.164 0.836
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.7139 0.7905 0.196 0.804
#> SRR1974780 1 0.3114 0.9131 0.944 0.056
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2043 0.8331 0.032 0.968
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.6148 0.7510 0.848 0.152
#> SRR1974771 2 0.7219 0.7908 0.200 0.800
#> SRR1974770 2 0.2603 0.8331 0.044 0.956
#> SRR1974769 2 0.7453 0.7815 0.212 0.788
#> SRR1974768 2 0.2778 0.8330 0.048 0.952
#> SRR1974767 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.4431 0.8256 0.092 0.908
#> SRR1974765 2 0.7528 0.7792 0.216 0.784
#> SRR1974764 2 0.5408 0.8175 0.124 0.876
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.3879 0.8290 0.076 0.924
#> SRR1974760 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.7376 0.7880 0.208 0.792
#> SRR1974757 2 0.7139 0.7905 0.196 0.804
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974755 2 0.5842 0.8125 0.140 0.860
#> SRR1974753 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974751 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974750 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.9732 0.6176 0.404 0.596
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.9323 0.6622 0.348 0.652
#> SRR1974745 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974743 2 0.9323 0.6622 0.348 0.652
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974739 2 0.9323 0.6623 0.348 0.652
#> SRR1974741 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974738 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974737 2 0.9248 0.6716 0.340 0.660
#> SRR1974736 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974732 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974731 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974725 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974722 2 0.9460 0.6429 0.364 0.636
#> SRR1974721 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974720 2 0.9909 0.5050 0.444 0.556
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974715 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974702 1 0.9896 -0.1508 0.560 0.440
#> SRR1974701 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974699 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974698 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974696 1 0.9286 0.2479 0.656 0.344
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974692 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974690 2 0.6623 0.8010 0.172 0.828
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974688 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.7219 0.6491 0.800 0.200
#> SRR1974682 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974675 2 0.2948 0.8384 0.052 0.948
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0938 0.9742 0.988 0.012
#> SRR1974671 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974672 2 0.9393 0.6509 0.356 0.644
#> SRR1974670 2 0.9358 0.6570 0.352 0.648
#> SRR1974669 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974667 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974668 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974666 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974664 2 0.7815 0.7565 0.232 0.768
#> SRR1974665 2 0.2778 0.8330 0.048 0.952
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2043 0.8340 0.032 0.968
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.9393 0.6509 0.356 0.644
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.7056 0.7989 0.192 0.808
#> SRR1974623 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.8443 0.7470 0.272 0.728
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.2043 0.9467 0.968 0.032
#> SRR1974614 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.5178 0.8198 0.116 0.884
#> SRR1974605 1 0.0672 0.9773 0.992 0.008
#> SRR1974604 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974603 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.8813 0.7131 0.300 0.700
#> SRR1974601 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974598 2 0.1843 0.8329 0.028 0.972
#> SRR1974596 2 0.2948 0.8326 0.052 0.948
#> SRR1974594 2 0.8713 0.7203 0.292 0.708
#> SRR1974593 2 0.8955 0.7013 0.312 0.688
#> SRR1974595 2 0.6623 0.8010 0.172 0.828
#> SRR1974592 2 0.5842 0.8126 0.140 0.860
#> SRR1974591 2 0.2236 0.8332 0.036 0.964
#> SRR1974588 2 0.9358 0.6572 0.352 0.648
#> SRR1974590 2 0.7139 0.7920 0.196 0.804
#> SRR1974589 2 0.9087 0.6890 0.324 0.676
#> SRR1974587 2 0.9323 0.6621 0.348 0.652
#> SRR1974586 2 0.9087 0.6892 0.324 0.676
#> SRR1974585 2 0.8608 0.7274 0.284 0.716
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.7139 0.7911 0.196 0.804
#> SRR1974582 2 0.3114 0.8321 0.056 0.944
#> SRR1974581 2 0.3733 0.8299 0.072 0.928
#> SRR1974580 2 0.8499 0.7345 0.276 0.724
#> SRR1974578 2 0.9323 0.6622 0.348 0.652
#> SRR1974577 2 0.9881 0.5496 0.436 0.564
#> SRR1974579 2 0.8955 0.7013 0.312 0.688
#> SRR1974576 2 0.8327 0.7451 0.264 0.736
#> SRR1974575 2 0.2423 0.8332 0.040 0.960
#> SRR1974574 2 0.7528 0.7792 0.216 0.784
#> SRR1974573 2 0.7528 0.7791 0.216 0.784
#> SRR1974571 2 0.7674 0.7740 0.224 0.776
#> SRR1974572 2 0.7674 0.7739 0.224 0.776
#> SRR1974570 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.7299 0.7861 0.204 0.796
#> SRR1974569 2 0.7299 0.7861 0.204 0.796
#> SRR1974565 2 0.9248 0.6716 0.340 0.660
#> SRR1974564 2 0.7056 0.7922 0.192 0.808
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.8813 0.7130 0.300 0.700
#> SRR1974562 2 0.7139 0.7903 0.196 0.804
#> SRR1974561 2 0.7376 0.7839 0.208 0.792
#> SRR1974557 2 0.9393 0.6509 0.356 0.644
#> SRR1974553 2 0.7815 0.7683 0.232 0.768
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.2778 0.9247 0.952 0.048
#> SRR1974552 2 0.8207 0.7508 0.256 0.744
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.7299 0.7861 0.204 0.796
#> SRR1974548 2 0.9323 0.6621 0.348 0.652
#> SRR1974547 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.7376 0.7839 0.208 0.792
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9869 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.7376 0.7839 0.208 0.792
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0237 0.991 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974999 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.4702 0.754 0.000 0.788 0.212
#> SRR1974995 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.4291 0.793 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974991 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0747 0.979 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974984 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.5016 0.714 0.000 0.760 0.240
#> SRR1974945 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.1753 0.945 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974923 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.4504 0.775 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974913 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.4702 0.715 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974900 2 0.4654 0.759 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974899 3 0.0592 0.984 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974897 3 0.0747 0.980 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974896 2 0.4605 0.764 0.000 0.796 0.204
#> SRR1974893 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.5968 0.480 0.000 0.636 0.364
#> SRR1974894 2 0.4605 0.764 0.000 0.796 0.204
#> SRR1974892 2 0.4654 0.759 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974890 2 0.4605 0.764 0.000 0.796 0.204
#> SRR1974891 2 0.4605 0.764 0.000 0.796 0.204
#> SRR1974889 3 0.4452 0.750 0.000 0.192 0.808
#> SRR1974888 2 0.4796 0.743 0.000 0.780 0.220
#> SRR1974886 2 0.1163 0.940 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974887 2 0.4121 0.807 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974885 2 0.4399 0.784 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974883 2 0.4702 0.754 0.000 0.788 0.212
#> SRR1974884 3 0.0237 0.991 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974881 2 0.4504 0.775 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974882 2 0.4504 0.775 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974880 2 0.3752 0.834 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974879 2 0.4702 0.754 0.000 0.788 0.212
#> SRR1974877 2 0.6095 0.415 0.000 0.608 0.392
#> SRR1974876 2 0.4504 0.775 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974878 2 0.4654 0.759 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974875 2 0.4452 0.780 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974874 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.1964 0.957 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974869 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.2625 0.944 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974866 1 0.2537 0.947 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.1289 0.962 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.0892 0.946 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974854 1 0.0424 0.963 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974852 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0592 0.963 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974845 2 0.0592 0.953 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0237 0.962 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974834 2 0.0592 0.953 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974833 2 0.0661 0.954 0.004 0.988 0.008
#> SRR1974831 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0424 0.963 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974828 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974826 2 0.1031 0.943 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974827 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974824 1 0.1289 0.962 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974825 1 0.0592 0.963 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974822 1 0.2165 0.954 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974823 1 0.1753 0.959 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.5929 0.591 0.676 0.320 0.004
#> SRR1974815 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 2 0.4346 0.768 0.184 0.816 0.000
#> SRR1974810 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974808 1 0.2356 0.951 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974811 1 0.1643 0.960 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974804 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1163 0.963 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974796 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974795 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974793 1 0.0892 0.963 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974791 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974790 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974784 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1031 0.963 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974780 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0592 0.963 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974771 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.1643 0.960 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1411 0.934 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974757 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.4750 0.706 0.216 0.784 0.000
#> SRR1974747 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.2356 0.951 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.1529 0.961 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974734 1 0.2878 0.933 0.904 0.096 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.2356 0.951 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.3879 0.876 0.848 0.152 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.1031 0.963 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974727 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.4121 0.777 0.168 0.832 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.6252 0.115 0.444 0.556 0.000
#> SRR1974719 1 0.0747 0.963 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.2066 0.956 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974711 1 0.2261 0.952 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974710 1 0.2625 0.944 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974707 1 0.1753 0.959 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974706 1 0.0424 0.963 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.4982 0.859 0.840 0.096 0.064
#> SRR1974701 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.1031 0.963 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974697 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974696 1 0.4931 0.766 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974694 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974695 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974691 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3482 0.903 0.872 0.128 0.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974675 3 0.0000 0.995 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.3340 0.912 0.880 0.120 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0237 0.956 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974666 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.1964 0.957 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.2625 0.944 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974656 1 0.2356 0.951 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974650 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1860 0.958 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974646 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1289 0.936 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974643 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974640 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.1860 0.958 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.1964 0.957 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0747 0.963 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974623 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974622 1 0.1529 0.961 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974620 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974619 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.3192 0.859 0.112 0.888 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974613 1 0.2356 0.951 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.3412 0.906 0.876 0.124 0.000
#> SRR1974607 1 0.1411 0.962 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.2537 0.946 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974592 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.6235 0.188 0.436 0.564 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974573 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974571 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974572 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974570 1 0.1643 0.960 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974568 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974567 1 0.1163 0.963 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974566 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974569 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974565 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974564 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974560 1 0.1964 0.957 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974559 1 0.1964 0.957 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974563 2 0.1643 0.927 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974562 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974561 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974557 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974553 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.962 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.2625 0.943 0.916 0.084 0.000
#> SRR1974552 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974554 1 0.2066 0.956 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974558 1 0.1289 0.962 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974556 1 0.1860 0.958 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974550 1 0.2448 0.949 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974549 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974548 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974547 1 0.2261 0.952 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974546 1 0.2066 0.956 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974545 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974544 1 0.1529 0.961 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974543 2 0.0424 0.956 0.008 0.992 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975006 3 0.0188 0.9918 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975002 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974997 2 0.7004 0.6756 0.000 0.580 0.220 NA
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974994 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974989 2 0.5817 0.8014 0.000 0.676 0.076 NA
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974988 3 0.0707 0.9786 0.000 0.000 0.980 NA
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974973 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974962 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974953 3 0.0188 0.9918 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974946 2 0.6446 0.5593 0.000 0.584 0.328 NA
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974934 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974926 3 0.2742 0.9079 0.008 0.008 0.900 NA
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974917 3 0.1151 0.9673 0.000 0.024 0.968 NA
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974914 2 0.6350 0.7775 0.000 0.636 0.112 NA
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974908 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974898 3 0.4008 0.7716 0.000 0.148 0.820 NA
#> SRR1974900 2 0.6917 0.6943 0.000 0.592 0.208 NA
#> SRR1974899 3 0.0524 0.9841 0.000 0.008 0.988 NA
#> SRR1974897 3 0.0376 0.9883 0.000 0.004 0.992 NA
#> SRR1974896 2 0.6465 0.7701 0.000 0.636 0.136 NA
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974895 2 0.6299 0.3478 0.000 0.520 0.420 NA
#> SRR1974894 2 0.6852 0.7125 0.000 0.600 0.192 NA
#> SRR1974892 2 0.6742 0.7380 0.000 0.608 0.160 NA
#> SRR1974890 2 0.6469 0.7705 0.000 0.628 0.124 NA
#> SRR1974891 2 0.6731 0.7411 0.000 0.608 0.156 NA
#> SRR1974889 3 0.3806 0.7703 0.000 0.156 0.824 NA
#> SRR1974888 2 0.7062 0.6689 0.000 0.572 0.224 NA
#> SRR1974886 2 0.3725 0.8725 0.000 0.812 0.008 NA
#> SRR1974887 2 0.5716 0.8054 0.000 0.680 0.068 NA
#> SRR1974885 2 0.6140 0.7882 0.000 0.652 0.096 NA
#> SRR1974883 2 0.6948 0.6914 0.000 0.588 0.208 NA
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9947 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR1974881 2 0.6209 0.7875 0.000 0.656 0.112 NA
#> SRR1974882 2 0.6238 0.7858 0.000 0.652 0.112 NA
#> SRR1974880 2 0.4761 0.8514 0.000 0.768 0.048 NA
#> SRR1974879 2 0.6785 0.7226 0.000 0.608 0.184 NA
#> SRR1974877 2 0.6337 0.2208 0.000 0.476 0.464 NA
#> SRR1974876 2 0.6323 0.7798 0.000 0.640 0.112 NA
#> SRR1974878 2 0.6885 0.7064 0.000 0.596 0.196 NA
#> SRR1974875 2 0.6373 0.7757 0.000 0.636 0.116 NA
#> SRR1974874 2 0.1940 0.8795 0.000 0.924 0.000 NA
#> SRR1974873 2 0.1716 0.8795 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974871 2 0.1716 0.8780 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974872 1 0.4253 0.7595 0.776 0.016 0.000 NA
#> SRR1974869 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974868 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974870 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974866 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974867 1 0.4679 0.7269 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974865 2 0.1940 0.8841 0.000 0.924 0.000 NA
#> SRR1974864 1 0.3908 0.7609 0.784 0.004 0.000 NA
#> SRR1974862 2 0.2081 0.8849 0.000 0.916 0.000 NA
#> SRR1974863 2 0.2469 0.8888 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974860 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974861 2 0.3172 0.8776 0.000 0.840 0.000 NA
#> SRR1974859 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974858 2 0.2704 0.8862 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR1974856 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974857 2 0.2345 0.8872 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1974855 2 0.3649 0.8637 0.000 0.796 0.000 NA
#> SRR1974854 1 0.3080 0.7694 0.880 0.024 0.000 NA
#> SRR1974853 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974851 2 0.2760 0.8679 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1974852 2 0.2469 0.8892 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974849 1 0.4697 0.7264 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974848 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974850 2 0.4194 0.8174 0.008 0.764 0.000 NA
#> SRR1974846 2 0.2081 0.8765 0.000 0.916 0.000 NA
#> SRR1974847 1 0.3726 0.7747 0.788 0.000 0.000 NA
#> SRR1974845 2 0.2345 0.8907 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1974844 1 0.4697 0.7264 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974843 1 0.4137 0.7605 0.780 0.012 0.000 NA
#> SRR1974842 1 0.2704 0.7736 0.876 0.000 0.000 NA
#> SRR1974841 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974840 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974839 2 0.2216 0.8892 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974838 1 0.4713 0.7265 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974837 1 0.2611 0.7725 0.896 0.008 0.000 NA
#> SRR1974835 1 0.4679 0.7269 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974836 2 0.2704 0.8885 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR1974834 2 0.2149 0.8920 0.000 0.912 0.000 NA
#> SRR1974833 2 0.3907 0.8576 0.000 0.768 0.000 NA
#> SRR1974831 2 0.2281 0.8897 0.000 0.904 0.000 NA
#> SRR1974832 1 0.4713 0.7265 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974830 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974829 1 0.3280 0.7633 0.860 0.016 0.000 NA
#> SRR1974828 1 0.3464 0.7618 0.860 0.032 0.000 NA
#> SRR1974826 2 0.4595 0.8180 0.040 0.776 0.000 NA
#> SRR1974827 2 0.2408 0.8892 0.000 0.896 0.000 NA
#> SRR1974824 1 0.3377 0.7735 0.848 0.012 0.000 NA
#> SRR1974825 1 0.4679 0.7622 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974822 1 0.3907 0.7570 0.836 0.044 0.000 NA
#> SRR1974823 1 0.4327 0.7572 0.768 0.016 0.000 NA
#> SRR1974820 1 0.4679 0.7298 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974818 1 0.4679 0.7269 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974819 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974817 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974816 1 0.7567 0.2847 0.484 0.276 0.000 NA
#> SRR1974815 1 0.4193 0.7529 0.732 0.000 0.000 NA
#> SRR1974813 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974814 2 0.1474 0.8809 0.000 0.948 0.000 NA
#> SRR1974812 2 0.6897 0.5466 0.180 0.592 0.000 NA
#> SRR1974810 1 0.5803 0.6983 0.700 0.104 0.000 NA
#> SRR1974808 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974811 1 0.2773 0.7707 0.900 0.028 0.000 NA
#> SRR1974809 1 0.4697 0.7275 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974807 1 0.4153 0.7626 0.820 0.048 0.000 NA
#> SRR1974806 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974805 2 0.2216 0.8901 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974804 2 0.6278 0.6498 0.120 0.652 0.000 NA
#> SRR1974803 1 0.5582 0.6702 0.728 0.136 0.000 NA
#> SRR1974801 1 0.4697 0.7263 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974800 1 0.3528 0.7666 0.808 0.000 0.000 NA
#> SRR1974799 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974798 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974797 2 0.2760 0.8862 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1974796 2 0.2868 0.8880 0.000 0.864 0.000 NA
#> SRR1974795 2 0.2469 0.8896 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974793 1 0.4898 0.7384 0.772 0.072 0.000 NA
#> SRR1974794 2 0.2921 0.8836 0.000 0.860 0.000 NA
#> SRR1974792 2 0.2921 0.8847 0.000 0.860 0.000 NA
#> SRR1974791 2 0.2530 0.8902 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974790 2 0.2647 0.8883 0.000 0.880 0.000 NA
#> SRR1974789 2 0.3074 0.8789 0.000 0.848 0.000 NA
#> SRR1974788 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974786 1 0.3486 0.7752 0.812 0.000 0.000 NA
#> SRR1974787 1 0.4095 0.7637 0.792 0.016 0.000 NA
#> SRR1974784 2 0.2814 0.8852 0.000 0.868 0.000 NA
#> SRR1974783 1 0.2081 0.7786 0.916 0.000 0.000 NA
#> SRR1974785 1 0.3569 0.7673 0.804 0.000 0.000 NA
#> SRR1974782 1 0.3400 0.7704 0.820 0.000 0.000 NA
#> SRR1974781 2 0.2408 0.8896 0.000 0.896 0.000 NA
#> SRR1974780 1 0.4098 0.7628 0.784 0.012 0.000 NA
#> SRR1974779 1 0.4382 0.7460 0.704 0.000 0.000 NA
#> SRR1974777 1 0.4164 0.7529 0.736 0.000 0.000 NA
#> SRR1974776 1 0.4253 0.7595 0.776 0.016 0.000 NA
#> SRR1974778 1 0.4164 0.7601 0.736 0.000 0.000 NA
#> SRR1974774 2 0.3311 0.8754 0.000 0.828 0.000 NA
#> SRR1974773 1 0.4697 0.7281 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974775 1 0.4713 0.7256 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974772 1 0.3913 0.7515 0.824 0.028 0.000 NA
#> SRR1974771 2 0.3870 0.8507 0.004 0.788 0.000 NA
#> SRR1974770 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974769 2 0.2530 0.8899 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974768 2 0.3569 0.8700 0.000 0.804 0.000 NA
#> SRR1974767 1 0.4290 0.7586 0.772 0.016 0.000 NA
#> SRR1974766 2 0.3569 0.8725 0.000 0.804 0.000 NA
#> SRR1974765 2 0.2408 0.8912 0.000 0.896 0.000 NA
#> SRR1974764 2 0.3801 0.8698 0.000 0.780 0.000 NA
#> SRR1974763 1 0.3123 0.7740 0.844 0.000 0.000 NA
#> SRR1974762 1 0.4431 0.7436 0.696 0.000 0.000 NA
#> SRR1974761 2 0.3219 0.8776 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974760 2 0.2589 0.8893 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1974759 1 0.4697 0.7275 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974758 2 0.3448 0.8746 0.004 0.828 0.000 NA
#> SRR1974757 2 0.2469 0.8890 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974756 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974754 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974755 2 0.3444 0.8747 0.000 0.816 0.000 NA
#> SRR1974753 2 0.1716 0.8776 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974751 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974750 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974752 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974749 2 0.7434 0.3745 0.256 0.512 0.000 NA
#> SRR1974747 1 0.5613 0.6778 0.724 0.120 0.000 NA
#> SRR1974748 1 0.2408 0.7783 0.896 0.000 0.000 NA
#> SRR1974746 1 0.4541 0.7333 0.796 0.060 0.000 NA
#> SRR1974744 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974745 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974743 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974742 1 0.5375 0.6918 0.744 0.116 0.000 NA
#> SRR1974740 2 0.1867 0.8779 0.000 0.928 0.000 NA
#> SRR1974739 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974741 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974738 2 0.2530 0.8788 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974737 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974736 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974735 1 0.4070 0.7473 0.824 0.044 0.000 NA
#> SRR1974734 1 0.6616 0.6418 0.624 0.156 0.000 NA
#> SRR1974733 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974732 2 0.3668 0.8343 0.004 0.808 0.000 NA
#> SRR1974731 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974729 1 0.5092 0.7097 0.764 0.096 0.000 NA
#> SRR1974730 1 0.4522 0.7430 0.680 0.000 0.000 NA
#> SRR1974728 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974725 1 0.6490 0.6391 0.640 0.156 0.000 NA
#> SRR1974726 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974724 1 0.3342 0.7655 0.868 0.032 0.000 NA
#> SRR1974727 1 0.5363 0.7383 0.720 0.064 0.000 NA
#> SRR1974723 2 0.1716 0.8780 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974722 2 0.7362 0.3884 0.256 0.524 0.000 NA
#> SRR1974721 2 0.1557 0.8827 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR1974720 1 0.7683 0.0487 0.400 0.384 0.000 NA
#> SRR1974719 1 0.2473 0.7814 0.908 0.012 0.000 NA
#> SRR1974718 1 0.4713 0.7256 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974716 1 0.5022 0.7482 0.736 0.044 0.000 NA
#> SRR1974717 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974715 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974713 1 0.4713 0.7265 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974714 1 0.4436 0.7561 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974711 1 0.4538 0.7548 0.760 0.024 0.000 NA
#> SRR1974712 1 0.4697 0.7263 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974709 1 0.4585 0.7359 0.668 0.000 0.000 NA
#> SRR1974708 1 0.4692 0.7528 0.756 0.032 0.000 NA
#> SRR1974710 1 0.4538 0.7548 0.760 0.024 0.000 NA
#> SRR1974707 1 0.4327 0.7572 0.768 0.016 0.000 NA
#> SRR1974706 1 0.3307 0.7680 0.868 0.028 0.000 NA
#> SRR1974704 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974705 1 0.4454 0.7457 0.692 0.000 0.000 NA
#> SRR1974703 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974702 1 0.6424 0.7054 0.696 0.032 0.092 NA
#> SRR1974701 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974699 2 0.1716 0.8776 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974698 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974700 1 0.3404 0.7658 0.864 0.032 0.000 NA
#> SRR1974697 1 0.6123 0.6825 0.676 0.132 0.000 NA
#> SRR1974696 1 0.7594 0.3793 0.480 0.264 0.000 NA
#> SRR1974694 1 0.5375 0.6918 0.744 0.116 0.000 NA
#> SRR1974695 1 0.5109 0.7457 0.736 0.052 0.000 NA
#> SRR1974693 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974692 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974690 2 0.2589 0.8866 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1974691 1 0.5266 0.7005 0.752 0.108 0.000 NA
#> SRR1974689 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974688 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974687 1 0.5423 0.6892 0.740 0.116 0.000 NA
#> SRR1974686 1 0.4356 0.7483 0.708 0.000 0.000 NA
#> SRR1974685 1 0.5326 0.6943 0.748 0.116 0.000 NA
#> SRR1974684 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974683 1 0.6381 0.5992 0.652 0.152 0.000 NA
#> SRR1974682 2 0.3311 0.8459 0.000 0.828 0.000 NA
#> SRR1974681 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974679 2 0.2589 0.8712 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1974680 1 0.3528 0.7681 0.808 0.000 0.000 NA
#> SRR1974678 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974677 1 0.4697 0.7264 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974676 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974675 3 0.0188 0.9920 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR1974674 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974673 1 0.5109 0.7444 0.744 0.060 0.000 NA
#> SRR1974671 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974672 2 0.2281 0.8862 0.000 0.904 0.000 NA
#> SRR1974670 2 0.2216 0.8873 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974669 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974667 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974668 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974666 2 0.3219 0.8767 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974664 2 0.2589 0.8881 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1974665 2 0.3123 0.8782 0.000 0.844 0.000 NA
#> SRR1974663 1 0.4327 0.7572 0.768 0.016 0.000 NA
#> SRR1974662 1 0.4697 0.7264 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974661 1 0.4868 0.7502 0.748 0.040 0.000 NA
#> SRR1974660 1 0.4103 0.7709 0.744 0.000 0.000 NA
#> SRR1974659 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974658 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974657 1 0.4175 0.7597 0.776 0.012 0.000 NA
#> SRR1974654 1 0.4679 0.7269 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974655 1 0.4175 0.7594 0.776 0.012 0.000 NA
#> SRR1974656 1 0.4436 0.7561 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974650 1 0.4781 0.7513 0.752 0.036 0.000 NA
#> SRR1974651 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974652 1 0.4095 0.7635 0.792 0.016 0.000 NA
#> SRR1974653 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974648 1 0.4199 0.7663 0.804 0.032 0.000 NA
#> SRR1974646 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974649 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974647 2 0.1716 0.8776 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974645 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974644 2 0.3444 0.8725 0.000 0.816 0.000 NA
#> SRR1974643 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974642 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974640 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974641 2 0.1302 0.8862 0.000 0.956 0.000 NA
#> SRR1974639 1 0.4679 0.7295 0.648 0.000 0.000 NA
#> SRR1974638 1 0.4585 0.7372 0.668 0.000 0.000 NA
#> SRR1974635 1 0.4713 0.7265 0.640 0.000 0.000 NA
#> SRR1974636 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974634 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974637 2 0.1637 0.8786 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974633 1 0.4290 0.7586 0.772 0.016 0.000 NA
#> SRR1974632 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974631 1 0.4436 0.7561 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974630 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974629 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974628 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974627 1 0.3942 0.7758 0.764 0.000 0.000 NA
#> SRR1974624 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974625 2 0.3504 0.8826 0.012 0.860 0.012 NA
#> SRR1974623 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974622 1 0.4327 0.7572 0.768 0.016 0.000 NA
#> SRR1974620 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974619 1 0.6189 0.6973 0.640 0.092 0.000 NA
#> SRR1974621 1 0.4382 0.7467 0.704 0.000 0.000 NA
#> SRR1974617 1 0.2197 0.7832 0.916 0.004 0.000 NA
#> SRR1974616 2 0.6635 0.5943 0.152 0.620 0.000 NA
#> SRR1974615 1 0.4697 0.7316 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974618 1 0.3443 0.7691 0.848 0.016 0.000 NA
#> SRR1974614 1 0.4436 0.7561 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974613 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974612 1 0.4134 0.7607 0.740 0.000 0.000 NA
#> SRR1974611 1 0.4635 0.7535 0.756 0.028 0.000 NA
#> SRR1974610 2 0.1792 0.8768 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974609 1 0.4697 0.7274 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR1974608 1 0.6695 0.6161 0.616 0.164 0.000 NA
#> SRR1974607 1 0.3495 0.7726 0.844 0.016 0.000 NA
#> SRR1974606 2 0.3172 0.8776 0.000 0.840 0.000 NA
#> SRR1974605 1 0.6461 0.6432 0.640 0.144 0.000 NA
#> SRR1974604 2 0.1716 0.8777 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR1974603 1 0.4599 0.7549 0.760 0.028 0.000 NA
#> SRR1974602 1 0.4730 0.7247 0.636 0.000 0.000 NA
#> SRR1974600 2 0.2814 0.8826 0.000 0.868 0.000 NA
#> SRR1974601 1 0.5593 0.7301 0.708 0.080 0.000 NA
#> SRR1974599 2 0.3123 0.8782 0.000 0.844 0.000 NA
#> SRR1974598 2 0.3172 0.8776 0.000 0.840 0.000 NA
#> SRR1974596 2 0.3024 0.8800 0.000 0.852 0.000 NA
#> SRR1974594 2 0.2704 0.8823 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR1974593 2 0.2814 0.8846 0.000 0.868 0.000 NA
#> SRR1974595 2 0.2704 0.8877 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR1974592 2 0.3219 0.8790 0.000 0.836 0.000 NA
#> SRR1974591 2 0.3123 0.8782 0.000 0.844 0.000 NA
#> SRR1974588 2 0.3636 0.8287 0.008 0.820 0.000 NA
#> SRR1974590 2 0.2530 0.8923 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974589 2 0.2281 0.8708 0.000 0.904 0.000 NA
#> SRR1974587 2 0.2589 0.8727 0.000 0.884 0.000 NA
#> SRR1974586 2 0.2149 0.8880 0.000 0.912 0.000 NA
#> SRR1974585 2 0.1792 0.8852 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR1974584 1 0.1637 0.7804 0.940 0.000 0.000 NA
#> SRR1974583 2 0.2704 0.8893 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR1974582 2 0.3123 0.8782 0.000 0.844 0.000 NA
#> SRR1974581 2 0.3074 0.8789 0.000 0.848 0.000 NA
#> SRR1974580 2 0.1118 0.8884 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR1974578 2 0.2868 0.8548 0.000 0.864 0.000 NA
#> SRR1974577 1 0.7752 0.1255 0.404 0.360 0.000 NA
#> SRR1974579 2 0.2760 0.8789 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1974576 2 0.2530 0.8876 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974575 2 0.3074 0.8789 0.000 0.848 0.000 NA
#> SRR1974574 2 0.2216 0.8894 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974573 2 0.2216 0.8894 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974571 2 0.2469 0.8895 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974572 2 0.2469 0.8895 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR1974570 1 0.4327 0.7572 0.768 0.016 0.000 NA
#> SRR1974568 1 0.4194 0.7638 0.800 0.028 0.000 NA
#> SRR1974567 1 0.2376 0.7750 0.916 0.016 0.000 NA
#> SRR1974566 2 0.2345 0.8894 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1974569 2 0.2408 0.8892 0.000 0.896 0.000 NA
#> SRR1974565 2 0.3768 0.8258 0.008 0.808 0.000 NA
#> SRR1974564 2 0.2530 0.8889 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974560 1 0.4436 0.7591 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974559 1 0.3205 0.7691 0.872 0.024 0.000 NA
#> SRR1974563 2 0.1389 0.8847 0.000 0.952 0.000 NA
#> SRR1974562 2 0.2530 0.8889 0.000 0.888 0.000 NA
#> SRR1974561 2 0.2408 0.8893 0.000 0.896 0.000 NA
#> SRR1974557 2 0.2868 0.8836 0.000 0.864 0.000 NA
#> SRR1974553 2 0.2216 0.8905 0.000 0.908 0.000 NA
#> SRR1974555 1 0.2216 0.7723 0.908 0.000 0.000 NA
#> SRR1974551 1 0.4633 0.7311 0.780 0.048 0.000 NA
#> SRR1974552 2 0.1637 0.8839 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR1974554 1 0.4576 0.7540 0.748 0.020 0.000 NA
#> SRR1974558 1 0.2988 0.7764 0.876 0.012 0.000 NA
#> SRR1974556 1 0.3501 0.7740 0.848 0.020 0.000 NA
#> SRR1974550 1 0.4692 0.7528 0.756 0.032 0.000 NA
#> SRR1974549 2 0.2345 0.8894 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1974548 2 0.2760 0.8611 0.000 0.872 0.000 NA
#> SRR1974547 1 0.4361 0.7599 0.772 0.020 0.000 NA
#> SRR1974546 1 0.4436 0.7561 0.764 0.020 0.000 NA
#> SRR1974545 2 0.2345 0.8924 0.000 0.900 0.000 NA
#> SRR1974544 1 0.3335 0.7740 0.856 0.016 0.000 NA
#> SRR1974543 2 0.2408 0.8893 0.000 0.896 0.000 NA
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0880 0.95287 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.2424 0.89344 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0963 0.95231 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.2690 0.87759 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.2813 0.86751 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.2020 0.91700 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.3435 0.54672 0.000 0.820 0.156 0.020 0.004
#> SRR1974995 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.0290 0.96209 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.2518 0.66090 0.000 0.896 0.016 0.080 0.008
#> SRR1974991 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.1043 0.95060 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0703 0.95545 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.1544 0.93586 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0609 0.95780 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0963 0.95105 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.2773 0.87133 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0404 0.96048 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.2648 0.88088 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.1121 0.94720 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.2329 0.90134 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.2690 0.87791 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.1544 0.93595 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0290 0.96191 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.2561 0.88701 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0404 0.96067 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0880 0.95325 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0290 0.96260 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.2690 0.87759 0.000 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.5119 0.22194 0.000 0.592 0.360 0.048 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0510 0.96047 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.2891 0.85978 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0794 0.95487 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.2377 0.89844 0.000 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.2741 0.86113 0.000 0.132 0.860 0.004 0.004
#> SRR1974923 3 0.0609 0.95803 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.2648 0.88088 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.1808 0.62582 0.000 0.936 0.040 0.020 0.004
#> SRR1974913 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.2813 0.86704 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0162 0.96304 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0162 0.96252 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0290 0.96186 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0290 0.96260 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.96270 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.3876 0.67466 0.000 0.316 0.684 0.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.3399 0.54180 0.000 0.812 0.168 0.020 0.000
#> SRR1974899 3 0.2852 0.86327 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.2891 0.86004 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.2754 0.60504 0.000 0.884 0.080 0.032 0.004
#> SRR1974893 3 0.1908 0.92208 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.5096 -0.07895 0.000 0.520 0.444 0.036 0.000
#> SRR1974894 2 0.2775 0.58855 0.000 0.876 0.100 0.020 0.004
#> SRR1974892 2 0.2349 0.59432 0.000 0.900 0.084 0.012 0.004
#> SRR1974890 2 0.2437 0.62330 0.000 0.904 0.060 0.032 0.004
#> SRR1974891 2 0.2349 0.59432 0.000 0.900 0.084 0.012 0.004
#> SRR1974889 3 0.3906 0.71199 0.000 0.292 0.704 0.004 0.000
#> SRR1974888 2 0.2833 0.57130 0.000 0.864 0.120 0.012 0.004
#> SRR1974886 2 0.3750 0.70782 0.000 0.756 0.000 0.232 0.012
#> SRR1974887 2 0.2635 0.66362 0.000 0.888 0.016 0.088 0.008
#> SRR1974885 2 0.2713 0.65171 0.000 0.888 0.036 0.072 0.004
#> SRR1974883 2 0.3280 0.52776 0.000 0.812 0.176 0.012 0.000
#> SRR1974884 3 0.2773 0.87066 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.2390 0.63366 0.000 0.908 0.044 0.044 0.004
#> SRR1974882 2 0.2387 0.63911 0.000 0.908 0.040 0.048 0.004
#> SRR1974880 2 0.3904 0.70809 0.000 0.764 0.012 0.216 0.008
#> SRR1974879 2 0.2972 0.58633 0.000 0.864 0.108 0.024 0.004
#> SRR1974877 3 0.4557 0.30492 0.000 0.476 0.516 0.008 0.000
#> SRR1974876 2 0.2075 0.63180 0.000 0.924 0.040 0.032 0.004
#> SRR1974878 2 0.2881 0.56972 0.000 0.860 0.124 0.012 0.004
#> SRR1974875 2 0.1990 0.63051 0.000 0.928 0.040 0.028 0.004
#> SRR1974874 4 0.1197 0.72702 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974873 4 0.0609 0.72426 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974871 4 0.0963 0.72641 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974872 5 0.3395 0.69147 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974869 5 0.3474 0.70479 0.192 0.008 0.000 0.004 0.796
#> SRR1974868 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974870 5 0.3039 0.70256 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974866 5 0.3318 0.70431 0.192 0.008 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974867 1 0.1270 0.86285 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974865 4 0.2929 0.70187 0.000 0.152 0.000 0.840 0.008
#> SRR1974864 5 0.3336 0.69650 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1974862 4 0.1671 0.71803 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974863 4 0.3671 0.63119 0.000 0.236 0.000 0.756 0.008
#> SRR1974860 2 0.3582 0.70946 0.000 0.768 0.000 0.224 0.008
#> SRR1974861 2 0.3809 0.69868 0.000 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR1974859 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.4025 0.55917 0.000 0.292 0.000 0.700 0.008
#> SRR1974856 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.3353 0.67726 0.000 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1974855 2 0.4227 0.51029 0.000 0.692 0.000 0.292 0.016
#> SRR1974854 5 0.4930 0.38302 0.388 0.032 0.000 0.000 0.580
#> SRR1974853 1 0.0609 0.85002 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974851 4 0.3355 0.69454 0.000 0.184 0.000 0.804 0.012
#> SRR1974852 4 0.4644 -0.04132 0.000 0.460 0.000 0.528 0.012
#> SRR1974849 1 0.1270 0.86261 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974848 1 0.0510 0.87400 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974850 4 0.5461 0.54521 0.004 0.240 0.000 0.652 0.104
#> SRR1974846 4 0.1121 0.71934 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974847 5 0.4126 0.56369 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974845 4 0.4644 0.07058 0.000 0.460 0.000 0.528 0.012
#> SRR1974844 1 0.0703 0.87443 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974843 5 0.3424 0.68776 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974842 5 0.4410 0.25944 0.440 0.004 0.000 0.000 0.556
#> SRR1974841 1 0.0404 0.87338 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974840 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 4 0.4617 0.06606 0.000 0.436 0.000 0.552 0.012
#> SRR1974838 1 0.0609 0.87550 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974837 5 0.4590 0.32706 0.420 0.012 0.000 0.000 0.568
#> SRR1974835 1 0.1197 0.86632 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974836 4 0.4470 0.30316 0.000 0.372 0.000 0.616 0.012
#> SRR1974834 4 0.4040 0.53611 0.000 0.276 0.000 0.712 0.012
#> SRR1974833 2 0.3835 0.63197 0.000 0.744 0.000 0.244 0.012
#> SRR1974831 4 0.4387 0.37417 0.000 0.348 0.000 0.640 0.012
#> SRR1974832 1 0.0609 0.86971 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974830 1 0.0162 0.86947 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974829 5 0.4822 0.44108 0.352 0.032 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974828 5 0.5309 0.46324 0.336 0.056 0.000 0.004 0.604
#> SRR1974826 4 0.5091 0.57412 0.000 0.244 0.000 0.672 0.084
#> SRR1974827 4 0.4617 0.09249 0.000 0.436 0.000 0.552 0.012
#> SRR1974824 5 0.4015 0.61813 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1974825 1 0.4262 -0.06503 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1974822 5 0.5178 0.54109 0.256 0.052 0.000 0.016 0.676
#> SRR1974823 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974820 1 0.1792 0.84565 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974818 1 0.1043 0.87313 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974819 1 0.0794 0.87513 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974817 1 0.0162 0.86997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 5 0.7483 0.39172 0.096 0.244 0.000 0.156 0.504
#> SRR1974815 1 0.3612 0.52570 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1974813 1 0.0880 0.87562 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974814 4 0.2358 0.71567 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008
#> SRR1974812 4 0.7762 0.17788 0.064 0.248 0.000 0.392 0.296
#> SRR1974810 5 0.5528 0.55556 0.204 0.096 0.000 0.020 0.680
#> SRR1974808 5 0.3039 0.70256 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974811 5 0.5325 0.51902 0.332 0.044 0.000 0.012 0.612
#> SRR1974809 1 0.1270 0.86692 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974807 5 0.4573 0.60028 0.228 0.024 0.000 0.020 0.728
#> SRR1974806 1 0.0290 0.87160 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974805 4 0.4416 0.40084 0.000 0.356 0.000 0.632 0.012
#> SRR1974804 4 0.6731 0.30225 0.008 0.256 0.000 0.488 0.248
#> SRR1974803 5 0.6006 0.52075 0.216 0.116 0.000 0.028 0.640
#> SRR1974801 1 0.0794 0.87397 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974800 5 0.3684 0.66571 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1974799 1 0.0000 0.86694 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3809 0.69902 0.000 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR1974797 2 0.4622 0.34357 0.000 0.548 0.000 0.440 0.012
#> SRR1974796 2 0.4617 0.35195 0.000 0.552 0.000 0.436 0.012
#> SRR1974795 4 0.4653 -0.10307 0.000 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR1974793 5 0.5534 0.47109 0.300 0.096 0.000 0.000 0.604
#> SRR1974794 2 0.4455 0.40076 0.000 0.588 0.000 0.404 0.008
#> SRR1974792 2 0.4582 0.42484 0.000 0.572 0.000 0.416 0.012
#> SRR1974791 2 0.4653 0.25281 0.000 0.516 0.000 0.472 0.012
#> SRR1974790 2 0.4659 0.16467 0.000 0.496 0.000 0.492 0.012
#> SRR1974789 2 0.3835 0.69439 0.000 0.732 0.000 0.260 0.008
#> SRR1974788 2 0.3700 0.70780 0.000 0.752 0.000 0.240 0.008
#> SRR1974786 5 0.4060 0.58369 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974787 5 0.3534 0.69016 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1974784 2 0.4528 0.34254 0.000 0.548 0.000 0.444 0.008
#> SRR1974783 1 0.4440 -0.18461 0.528 0.004 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974785 5 0.3661 0.67019 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1974782 1 0.3366 0.59101 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1974781 4 0.4546 0.01559 0.000 0.460 0.000 0.532 0.008
#> SRR1974780 5 0.3480 0.68879 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1974779 1 0.2377 0.77349 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974777 1 0.3424 0.57482 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1974776 5 0.3366 0.69296 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1974778 1 0.3612 0.55269 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1974774 2 0.3551 0.70929 0.000 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR1974773 1 0.1544 0.85825 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974775 1 0.0510 0.87400 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974772 5 0.5002 0.44777 0.344 0.044 0.000 0.000 0.612
#> SRR1974771 4 0.4878 0.29595 0.000 0.440 0.000 0.536 0.024
#> SRR1974770 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974769 4 0.4527 0.23040 0.000 0.392 0.000 0.596 0.012
#> SRR1974768 2 0.3421 0.70584 0.000 0.788 0.000 0.204 0.008
#> SRR1974767 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974766 2 0.3642 0.70610 0.000 0.760 0.000 0.232 0.008
#> SRR1974765 4 0.4152 0.49703 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR1974764 2 0.3700 0.67231 0.000 0.752 0.000 0.240 0.008
#> SRR1974763 1 0.4430 0.00796 0.540 0.004 0.000 0.000 0.456
#> SRR1974762 1 0.2813 0.73738 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974761 2 0.3809 0.69902 0.000 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR1974760 2 0.4659 0.16866 0.000 0.496 0.000 0.492 0.012
#> SRR1974759 1 0.1341 0.86618 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974758 4 0.4980 0.06666 0.000 0.484 0.000 0.488 0.028
#> SRR1974757 4 0.4562 -0.17513 0.000 0.492 0.000 0.500 0.008
#> SRR1974756 1 0.0290 0.87202 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974754 4 0.0162 0.72726 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974755 2 0.3809 0.69606 0.000 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR1974753 4 0.0794 0.72624 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0290 0.87160 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974749 4 0.7180 0.09188 0.024 0.216 0.000 0.392 0.368
#> SRR1974747 5 0.5604 0.51528 0.260 0.080 0.000 0.016 0.644
#> SRR1974748 1 0.3949 0.29828 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974746 5 0.5583 0.49641 0.284 0.076 0.000 0.012 0.628
#> SRR1974744 4 0.0703 0.72685 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0290 0.72647 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974742 5 0.5655 0.51243 0.260 0.084 0.000 0.016 0.640
#> SRR1974740 4 0.1197 0.72853 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.2929 0.70639 0.000 0.152 0.000 0.840 0.008
#> SRR1974737 4 0.0162 0.72693 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 5 0.5379 0.45494 0.324 0.064 0.000 0.004 0.608
#> SRR1974734 5 0.5617 0.56262 0.100 0.128 0.000 0.060 0.712
#> SRR1974733 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.2795 0.68601 0.000 0.100 0.000 0.872 0.028
#> SRR1974731 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 5 0.5729 0.49114 0.284 0.080 0.000 0.016 0.620
#> SRR1974730 1 0.3143 0.68432 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1974728 4 0.0609 0.72718 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974725 5 0.6100 0.53750 0.116 0.140 0.000 0.072 0.672
#> SRR1974726 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 5 0.5155 0.42746 0.352 0.052 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974727 5 0.4994 0.68222 0.184 0.052 0.000 0.032 0.732
#> SRR1974723 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.6897 0.10528 0.016 0.184 0.000 0.416 0.384
#> SRR1974721 4 0.2249 0.72120 0.000 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR1974720 5 0.6434 0.48442 0.076 0.148 0.000 0.136 0.640
#> SRR1974719 5 0.4825 0.48835 0.408 0.024 0.000 0.000 0.568
#> SRR1974718 1 0.1270 0.86376 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974716 5 0.4195 0.68885 0.188 0.036 0.000 0.008 0.768
#> SRR1974717 4 0.0703 0.72688 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0703 0.87516 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974714 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974711 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974712 1 0.0880 0.87306 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974709 1 0.1270 0.86358 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974708 5 0.3427 0.70485 0.192 0.012 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974710 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974707 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974706 5 0.5176 0.40455 0.380 0.048 0.000 0.000 0.572
#> SRR1974704 1 0.0880 0.87550 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974705 1 0.2127 0.79388 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974703 4 0.0703 0.72688 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974702 5 0.6454 0.59991 0.240 0.036 0.096 0.012 0.616
#> SRR1974701 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.1197 0.72854 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 5 0.5304 0.42637 0.384 0.056 0.000 0.000 0.560
#> SRR1974697 5 0.5927 0.56952 0.148 0.104 0.000 0.064 0.684
#> SRR1974696 5 0.6099 0.51047 0.076 0.176 0.000 0.084 0.664
#> SRR1974694 5 0.5632 0.51592 0.256 0.084 0.000 0.016 0.644
#> SRR1974695 5 0.4412 0.69676 0.192 0.040 0.000 0.012 0.756
#> SRR1974693 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 4 0.4562 -0.16622 0.000 0.496 0.000 0.496 0.008
#> SRR1974691 5 0.5626 0.51178 0.264 0.080 0.000 0.016 0.640
#> SRR1974689 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 5 0.5626 0.51178 0.264 0.080 0.000 0.016 0.640
#> SRR1974686 1 0.3143 0.66546 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1974685 5 0.5632 0.51592 0.256 0.084 0.000 0.016 0.644
#> SRR1974684 1 0.0290 0.86120 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974683 5 0.5910 0.52287 0.220 0.112 0.000 0.024 0.644
#> SRR1974682 4 0.2249 0.68638 0.000 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR1974681 1 0.0703 0.84610 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974679 4 0.1197 0.71542 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974680 1 0.3790 0.53211 0.724 0.004 0.000 0.000 0.272
#> SRR1974678 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.1121 0.86801 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974676 2 0.3783 0.70241 0.000 0.740 0.000 0.252 0.008
#> SRR1974675 3 0.2648 0.88088 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0404 0.87030 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974673 5 0.3876 0.70238 0.192 0.032 0.000 0.000 0.776
#> SRR1974671 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974672 4 0.3388 0.67361 0.000 0.200 0.000 0.792 0.008
#> SRR1974670 4 0.3093 0.69281 0.000 0.168 0.000 0.824 0.008
#> SRR1974669 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974667 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974668 2 0.3728 0.70676 0.000 0.748 0.000 0.244 0.008
#> SRR1974666 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974664 4 0.3934 0.58661 0.000 0.276 0.000 0.716 0.008
#> SRR1974665 2 0.3885 0.68504 0.000 0.724 0.000 0.268 0.008
#> SRR1974663 5 0.3143 0.70329 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974662 1 0.0794 0.87397 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974661 5 0.4305 0.69883 0.192 0.040 0.000 0.008 0.760
#> SRR1974660 1 0.4182 0.07103 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974659 1 0.0000 0.86694 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.1043 0.87034 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974657 5 0.3242 0.70185 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1974654 1 0.1121 0.87047 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974655 5 0.3274 0.70231 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1974656 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974650 5 0.3812 0.70506 0.196 0.020 0.000 0.004 0.780
#> SRR1974651 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.3636 0.67674 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1974653 4 0.0000 0.72697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.3661 0.67823 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1974646 5 0.3039 0.70256 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974649 1 0.0404 0.87359 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974647 4 0.0609 0.72718 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974645 1 0.0703 0.87536 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974644 2 0.3519 0.70843 0.000 0.776 0.000 0.216 0.008
#> SRR1974643 1 0.0703 0.87594 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974642 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974640 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974641 4 0.2707 0.70822 0.000 0.132 0.000 0.860 0.008
#> SRR1974639 1 0.0703 0.86291 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974638 1 0.2179 0.81444 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974635 1 0.0609 0.87368 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974636 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974634 1 0.0703 0.87516 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974637 4 0.0404 0.72767 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974633 5 0.3143 0.70430 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974632 1 0.0290 0.87132 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974631 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974630 1 0.0609 0.87508 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974629 1 0.0794 0.87531 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974628 1 0.0963 0.87484 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974627 5 0.4210 0.51618 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974624 1 0.0510 0.87469 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974625 4 0.5179 0.40307 0.004 0.352 0.000 0.600 0.044
#> SRR1974623 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974622 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974620 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974619 5 0.5554 0.65241 0.180 0.100 0.000 0.028 0.692
#> SRR1974621 1 0.2929 0.71231 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974617 5 0.4210 0.52092 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974616 4 0.7018 0.25474 0.016 0.260 0.000 0.452 0.272
#> SRR1974615 1 0.2230 0.79750 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974618 5 0.4613 0.40184 0.360 0.020 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974614 5 0.3266 0.70476 0.200 0.004 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974613 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974612 1 0.3305 0.64486 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1974611 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974610 4 0.0404 0.72745 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974609 1 0.1270 0.86633 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974608 5 0.5979 0.53965 0.128 0.152 0.000 0.048 0.672
#> SRR1974607 5 0.3949 0.63852 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1974606 2 0.3957 0.66825 0.000 0.712 0.000 0.280 0.008
#> SRR1974605 5 0.5949 0.54070 0.128 0.156 0.000 0.044 0.672
#> SRR1974604 4 0.0162 0.72693 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974603 5 0.3266 0.70510 0.200 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR1974602 1 0.0510 0.87486 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974600 4 0.3642 0.65584 0.000 0.232 0.000 0.760 0.008
#> SRR1974601 5 0.5216 0.67924 0.188 0.064 0.000 0.032 0.716
#> SRR1974599 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974598 2 0.3756 0.70531 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR1974596 2 0.4003 0.66293 0.000 0.704 0.000 0.288 0.008
#> SRR1974594 4 0.3596 0.68416 0.000 0.200 0.000 0.784 0.016
#> SRR1974593 4 0.3783 0.63016 0.000 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR1974595 2 0.4656 0.21687 0.000 0.508 0.000 0.480 0.012
#> SRR1974592 2 0.4046 0.64483 0.000 0.696 0.000 0.296 0.008
#> SRR1974591 2 0.3783 0.70232 0.000 0.740 0.000 0.252 0.008
#> SRR1974588 4 0.4204 0.66294 0.000 0.196 0.000 0.756 0.048
#> SRR1974590 4 0.4436 0.32192 0.000 0.396 0.000 0.596 0.008
#> SRR1974589 4 0.2843 0.70913 0.000 0.144 0.000 0.848 0.008
#> SRR1974587 4 0.3203 0.70088 0.000 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR1974586 4 0.3282 0.68593 0.000 0.188 0.000 0.804 0.008
#> SRR1974585 4 0.2909 0.70910 0.000 0.140 0.000 0.848 0.012
#> SRR1974584 1 0.4430 -0.20213 0.540 0.004 0.000 0.000 0.456
#> SRR1974583 4 0.4201 0.50816 0.000 0.328 0.000 0.664 0.008
#> SRR1974582 2 0.3783 0.70232 0.000 0.740 0.000 0.252 0.008
#> SRR1974581 2 0.4025 0.65213 0.000 0.700 0.000 0.292 0.008
#> SRR1974580 4 0.2798 0.70720 0.000 0.140 0.000 0.852 0.008
#> SRR1974578 4 0.3574 0.69369 0.000 0.168 0.000 0.804 0.028
#> SRR1974577 5 0.6631 0.32182 0.036 0.112 0.000 0.324 0.528
#> SRR1974579 4 0.3355 0.69541 0.000 0.184 0.000 0.804 0.012
#> SRR1974576 4 0.3835 0.61574 0.000 0.260 0.000 0.732 0.008
#> SRR1974575 2 0.4313 0.52437 0.000 0.636 0.000 0.356 0.008
#> SRR1974574 4 0.4402 0.35198 0.000 0.352 0.000 0.636 0.012
#> SRR1974573 4 0.4339 0.39299 0.000 0.336 0.000 0.652 0.012
#> SRR1974571 4 0.4387 0.36258 0.000 0.348 0.000 0.640 0.012
#> SRR1974572 4 0.4371 0.37308 0.000 0.344 0.000 0.644 0.012
#> SRR1974570 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974568 5 0.3669 0.63416 0.176 0.012 0.000 0.012 0.800
#> SRR1974567 5 0.4151 0.49503 0.344 0.004 0.000 0.000 0.652
#> SRR1974566 4 0.4494 0.27112 0.000 0.380 0.000 0.608 0.012
#> SRR1974569 4 0.4517 0.24682 0.000 0.388 0.000 0.600 0.012
#> SRR1974565 4 0.3621 0.68493 0.000 0.192 0.000 0.788 0.020
#> SRR1974564 4 0.4617 0.06148 0.000 0.436 0.000 0.552 0.012
#> SRR1974560 5 0.3452 0.69577 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1974559 5 0.3878 0.57483 0.236 0.016 0.000 0.000 0.748
#> SRR1974563 4 0.2864 0.70735 0.000 0.136 0.000 0.852 0.012
#> SRR1974562 4 0.4582 0.15311 0.000 0.416 0.000 0.572 0.012
#> SRR1974561 4 0.4494 0.27180 0.000 0.380 0.000 0.608 0.012
#> SRR1974557 4 0.3852 0.65694 0.000 0.220 0.000 0.760 0.020
#> SRR1974553 4 0.4213 0.45959 0.000 0.308 0.000 0.680 0.012
#> SRR1974555 5 0.4425 0.35972 0.392 0.008 0.000 0.000 0.600
#> SRR1974551 5 0.5163 0.54830 0.224 0.088 0.000 0.004 0.684
#> SRR1974552 4 0.3203 0.69539 0.000 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR1974554 5 0.3109 0.70408 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974558 5 0.4101 0.59157 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1974556 5 0.3966 0.63083 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1974550 5 0.3196 0.70395 0.192 0.004 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974549 4 0.4444 0.31898 0.000 0.364 0.000 0.624 0.012
#> SRR1974548 4 0.3203 0.70072 0.000 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR1974547 5 0.3424 0.69766 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974546 5 0.3074 0.70390 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974545 4 0.4444 0.38051 0.000 0.364 0.000 0.624 0.012
#> SRR1974544 5 0.3949 0.63514 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1974543 4 0.4470 0.29587 0.000 0.372 0.000 0.616 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1975008 3 0.1714 0.748839 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1975006 3 0.2762 0.517854 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1975005 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975004 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1975003 3 0.3446 0.082768 0.000 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1975001 6 0.3997 0.771975 0.000 0.004 0.488 0.000 0.000 0.508
#> SRR1975002 6 0.3986 0.808057 0.000 0.004 0.464 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974999 3 0.3747 -0.378474 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1975000 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974998 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974997 2 0.4410 0.364510 0.000 0.560 0.028 0.000 0.000 0.412
#> SRR1974995 3 0.0363 0.852010 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974996 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974994 3 0.0653 0.847280 0.000 0.004 0.980 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974993 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974990 3 0.0363 0.851573 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974989 2 0.3871 0.500809 0.000 0.676 0.000 0.016 0.000 0.308
#> SRR1974991 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974986 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974987 3 0.2340 0.649227 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974988 3 0.1719 0.772886 0.000 0.016 0.924 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974984 3 0.0146 0.854887 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974985 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974983 3 0.3464 0.046597 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1974982 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974981 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974980 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974979 3 0.2048 0.703828 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974978 3 0.0260 0.854092 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974977 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974976 3 0.3151 0.346604 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974975 3 0.0790 0.832794 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974974 3 0.2941 0.453691 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974973 6 0.4183 0.786588 0.000 0.012 0.480 0.000 0.000 0.508
#> SRR1974972 3 0.1075 0.821795 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974971 3 0.3857 -0.661786 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974970 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974969 3 0.0260 0.854518 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974968 3 0.3578 -0.101637 0.000 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1974967 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974965 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974966 3 0.3823 -0.543637 0.000 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974964 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974963 3 0.0260 0.854092 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974961 3 0.0363 0.851885 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974962 6 0.3999 0.752247 0.000 0.004 0.496 0.000 0.000 0.500
#> SRR1974960 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974959 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.3076 0.390735 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1974957 3 0.1863 0.732883 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974956 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974955 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974954 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974953 3 0.3995 -0.703169 0.000 0.004 0.516 0.000 0.000 0.480
#> SRR1974952 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974949 3 0.0458 0.849192 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974950 3 0.2527 0.602177 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974951 3 0.3795 -0.206557 0.000 0.004 0.632 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974947 3 0.0363 0.852010 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974948 3 0.3857 -0.659284 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974946 6 0.6143 0.612767 0.000 0.232 0.236 0.020 0.000 0.512
#> SRR1974945 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974942 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974943 3 0.0260 0.854518 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974941 3 0.0260 0.854092 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974940 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0790 0.837632 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974938 3 0.0363 0.851885 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974937 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974936 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974935 3 0.0260 0.853925 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974934 6 0.4169 0.812934 0.000 0.012 0.456 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974933 3 0.2883 0.485741 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1974932 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0458 0.851162 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974930 3 0.0458 0.851162 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974929 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974928 3 0.3817 -0.527161 0.000 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974927 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974924 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974925 3 0.0363 0.851573 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974926 3 0.4550 0.218628 0.000 0.084 0.676 0.000 0.000 0.240
#> SRR1974923 3 0.0458 0.852238 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974922 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974921 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974920 3 0.0603 0.848064 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974919 3 0.0260 0.853582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974918 3 0.0146 0.854520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974917 6 0.4097 0.760225 0.000 0.008 0.492 0.000 0.000 0.500
#> SRR1974916 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0146 0.854694 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974914 2 0.3986 0.435718 0.000 0.608 0.004 0.004 0.000 0.384
#> SRR1974913 3 0.0260 0.853214 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974911 3 0.0458 0.851162 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974910 3 0.0363 0.853320 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974908 6 0.4091 0.799582 0.000 0.008 0.472 0.000 0.000 0.520
#> SRR1974909 3 0.0146 0.854694 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974906 3 0.0790 0.838972 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974907 3 0.0260 0.853896 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974905 3 0.0146 0.854694 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974904 3 0.2941 0.460561 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974903 3 0.0363 0.851535 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974902 3 0.0547 0.848309 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974901 3 0.0000 0.854667 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 6 0.5223 0.750900 0.000 0.104 0.356 0.000 0.000 0.540
#> SRR1974900 2 0.4803 0.313464 0.000 0.528 0.044 0.004 0.000 0.424
#> SRR1974899 6 0.4250 0.812541 0.000 0.016 0.456 0.000 0.000 0.528
#> SRR1974897 6 0.4165 0.812733 0.000 0.012 0.452 0.000 0.000 0.536
#> SRR1974896 2 0.4280 0.393907 0.000 0.556 0.008 0.008 0.000 0.428
#> SRR1974893 3 0.3756 -0.393141 0.000 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974895 6 0.6194 0.577517 0.000 0.240 0.224 0.024 0.000 0.512
#> SRR1974894 2 0.4279 0.374096 0.000 0.548 0.012 0.004 0.000 0.436
#> SRR1974892 2 0.4051 0.380830 0.000 0.560 0.008 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974890 2 0.3841 0.434988 0.000 0.616 0.004 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974891 2 0.4051 0.380830 0.000 0.560 0.008 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974889 6 0.4838 0.784350 0.000 0.060 0.396 0.000 0.000 0.544
#> SRR1974888 2 0.4467 0.303367 0.000 0.508 0.028 0.000 0.000 0.464
#> SRR1974886 2 0.4030 0.575230 0.000 0.748 0.000 0.172 0.000 0.080
#> SRR1974887 2 0.4079 0.522430 0.000 0.680 0.000 0.032 0.000 0.288
#> SRR1974885 2 0.4088 0.504280 0.000 0.668 0.004 0.020 0.000 0.308
#> SRR1974883 2 0.4423 0.349920 0.000 0.552 0.028 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974884 6 0.3986 0.808253 0.000 0.004 0.464 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974881 2 0.4100 0.439836 0.000 0.600 0.004 0.008 0.000 0.388
#> SRR1974882 2 0.4254 0.474555 0.000 0.624 0.004 0.020 0.000 0.352
#> SRR1974880 2 0.3645 0.583953 0.000 0.784 0.000 0.152 0.000 0.064
#> SRR1974879 2 0.4284 0.368429 0.000 0.544 0.012 0.004 0.000 0.440
#> SRR1974877 6 0.5536 0.695336 0.000 0.164 0.300 0.000 0.000 0.536
#> SRR1974876 2 0.3954 0.442390 0.000 0.620 0.004 0.004 0.000 0.372
#> SRR1974878 2 0.4141 0.374931 0.000 0.556 0.012 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974875 2 0.3830 0.438872 0.000 0.620 0.004 0.000 0.000 0.376
#> SRR1974874 4 0.1890 0.687520 0.000 0.060 0.000 0.916 0.000 0.024
#> SRR1974873 4 0.0603 0.705813 0.000 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1974871 4 0.1003 0.704489 0.000 0.016 0.000 0.964 0.000 0.020
#> SRR1974872 5 0.2838 0.678033 0.188 0.004 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1974869 5 0.1672 0.728910 0.048 0.016 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1974868 2 0.2668 0.581150 0.000 0.828 0.000 0.168 0.004 0.000
#> SRR1974870 5 0.1500 0.730199 0.052 0.012 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974866 5 0.1672 0.729321 0.048 0.016 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1974867 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974865 4 0.3722 0.645723 0.000 0.196 0.000 0.764 0.004 0.036
#> SRR1974864 5 0.2793 0.673872 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1974862 4 0.2301 0.687214 0.000 0.096 0.000 0.884 0.000 0.020
#> SRR1974863 4 0.4346 0.547650 0.000 0.336 0.000 0.632 0.004 0.028
#> SRR1974860 2 0.2946 0.586251 0.000 0.824 0.000 0.160 0.004 0.012
#> SRR1974861 2 0.2810 0.586058 0.000 0.832 0.000 0.156 0.004 0.008
#> SRR1974859 4 0.0291 0.705096 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974858 4 0.4407 0.490677 0.000 0.380 0.000 0.592 0.004 0.024
#> SRR1974856 4 0.0291 0.705096 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974857 4 0.4183 0.594792 0.000 0.268 0.000 0.692 0.004 0.036
#> SRR1974855 2 0.4213 0.499246 0.000 0.744 0.000 0.160 0.004 0.092
#> SRR1974854 1 0.6579 0.059071 0.444 0.056 0.000 0.000 0.344 0.156
#> SRR1974853 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974851 4 0.5028 0.596278 0.000 0.236 0.000 0.648 0.008 0.108
#> SRR1974852 4 0.4736 0.334674 0.000 0.432 0.000 0.528 0.008 0.032
#> SRR1974849 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974848 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974850 4 0.6865 0.170082 0.000 0.364 0.000 0.396 0.080 0.160
#> SRR1974846 4 0.1434 0.691929 0.000 0.012 0.000 0.940 0.000 0.048
#> SRR1974847 5 0.3769 0.481679 0.356 0.004 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1974845 4 0.4893 0.339844 0.000 0.440 0.000 0.512 0.012 0.036
#> SRR1974844 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974843 5 0.2994 0.662414 0.208 0.004 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1974842 1 0.6307 0.186816 0.492 0.044 0.000 0.000 0.320 0.144
#> SRR1974841 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974840 4 0.0260 0.704099 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974839 4 0.4736 0.332565 0.000 0.432 0.000 0.528 0.008 0.032
#> SRR1974838 1 0.0363 0.795093 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974837 1 0.6427 0.106800 0.464 0.048 0.000 0.000 0.340 0.148
#> SRR1974835 1 0.0547 0.792871 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974836 4 0.4570 0.487426 0.000 0.352 0.000 0.608 0.008 0.032
#> SRR1974834 4 0.4359 0.574865 0.000 0.296 0.000 0.664 0.008 0.032
#> SRR1974833 2 0.3936 0.524849 0.000 0.772 0.000 0.140 0.004 0.084
#> SRR1974831 4 0.4583 0.515344 0.000 0.336 0.000 0.620 0.008 0.036
#> SRR1974832 1 0.0547 0.794621 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974830 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974829 1 0.6725 -0.011430 0.416 0.064 0.000 0.000 0.356 0.164
#> SRR1974828 1 0.6819 -0.018129 0.412 0.072 0.000 0.000 0.348 0.168
#> SRR1974826 4 0.6646 0.274169 0.000 0.344 0.000 0.452 0.092 0.112
#> SRR1974827 4 0.4672 0.418510 0.000 0.392 0.000 0.568 0.008 0.032
#> SRR1974824 5 0.4637 0.465853 0.360 0.020 0.000 0.000 0.600 0.020
#> SRR1974825 1 0.3995 -0.068360 0.516 0.004 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974822 5 0.6638 0.300025 0.320 0.072 0.000 0.000 0.464 0.144
#> SRR1974823 5 0.1398 0.729642 0.052 0.008 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974820 1 0.1523 0.778583 0.940 0.008 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1974818 1 0.0363 0.794681 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974819 1 0.0508 0.794997 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974817 1 0.0146 0.793003 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974816 2 0.8435 -0.241598 0.100 0.308 0.000 0.128 0.304 0.160
#> SRR1974815 1 0.2809 0.675005 0.824 0.004 0.000 0.000 0.168 0.004
#> SRR1974813 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974814 4 0.2882 0.693570 0.000 0.120 0.000 0.848 0.004 0.028
#> SRR1974812 2 0.8312 0.084681 0.060 0.344 0.000 0.244 0.156 0.196
#> SRR1974810 5 0.6838 0.386978 0.276 0.088 0.000 0.004 0.484 0.148
#> SRR1974808 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974811 5 0.6358 0.150915 0.400 0.048 0.000 0.000 0.424 0.128
#> SRR1974809 1 0.0547 0.792044 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974807 5 0.6482 0.403136 0.292 0.048 0.000 0.012 0.520 0.128
#> SRR1974806 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974805 4 0.4596 0.520680 0.000 0.340 0.000 0.616 0.008 0.036
#> SRR1974804 2 0.7201 -0.000647 0.000 0.404 0.000 0.300 0.128 0.168
#> SRR1974803 5 0.7327 0.301930 0.284 0.136 0.000 0.004 0.412 0.164
#> SRR1974801 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974800 5 0.3337 0.611917 0.260 0.004 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1974799 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974798 2 0.2738 0.576885 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004 0.000
#> SRR1974797 2 0.4690 -0.152571 0.000 0.512 0.000 0.452 0.008 0.028
#> SRR1974796 2 0.4690 -0.163123 0.000 0.512 0.000 0.452 0.008 0.028
#> SRR1974795 4 0.4758 0.261225 0.000 0.460 0.000 0.500 0.008 0.032
#> SRR1974793 1 0.6984 -0.055664 0.392 0.100 0.000 0.000 0.356 0.152
#> SRR1974794 2 0.3942 0.145302 0.000 0.624 0.000 0.368 0.004 0.004
#> SRR1974792 2 0.4623 0.050717 0.000 0.564 0.000 0.400 0.008 0.028
#> SRR1974791 4 0.4700 0.223210 0.000 0.476 0.000 0.488 0.008 0.028
#> SRR1974790 2 0.4761 -0.195690 0.000 0.492 0.000 0.468 0.008 0.032
#> SRR1974789 2 0.2805 0.569544 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004 0.000
#> SRR1974788 2 0.2773 0.583358 0.000 0.828 0.000 0.164 0.004 0.004
#> SRR1974786 5 0.3861 0.537302 0.316 0.004 0.000 0.000 0.672 0.008
#> SRR1974787 5 0.4413 0.659605 0.208 0.016 0.000 0.000 0.720 0.056
#> SRR1974784 2 0.4536 -0.210044 0.000 0.496 0.000 0.476 0.004 0.024
#> SRR1974783 1 0.5285 0.289128 0.584 0.016 0.000 0.000 0.320 0.080
#> SRR1974785 5 0.3405 0.598920 0.272 0.004 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1974782 1 0.2553 0.689486 0.848 0.000 0.000 0.000 0.144 0.008
#> SRR1974781 4 0.4571 0.348507 0.000 0.432 0.000 0.536 0.004 0.028
#> SRR1974780 5 0.4234 0.657898 0.208 0.016 0.000 0.000 0.732 0.044
#> SRR1974779 1 0.2001 0.744817 0.900 0.004 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1974777 1 0.3791 0.605715 0.760 0.008 0.000 0.000 0.200 0.032
#> SRR1974776 5 0.2902 0.671989 0.196 0.004 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1974778 1 0.3897 0.531240 0.712 0.016 0.000 0.000 0.264 0.008
#> SRR1974774 2 0.2714 0.591255 0.000 0.848 0.000 0.136 0.004 0.012
#> SRR1974773 1 0.1471 0.770750 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1974775 1 0.0458 0.793684 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974772 1 0.6853 -0.009219 0.412 0.080 0.000 0.000 0.348 0.160
#> SRR1974771 2 0.5048 0.281238 0.000 0.628 0.000 0.272 0.008 0.092
#> SRR1974770 2 0.2703 0.579154 0.000 0.824 0.000 0.172 0.004 0.000
#> SRR1974769 4 0.4582 0.473087 0.000 0.356 0.000 0.604 0.008 0.032
#> SRR1974768 2 0.2573 0.590791 0.000 0.856 0.000 0.132 0.004 0.008
#> SRR1974767 5 0.2101 0.725481 0.100 0.004 0.000 0.000 0.892 0.004
#> SRR1974766 2 0.2544 0.589283 0.000 0.852 0.000 0.140 0.004 0.004
#> SRR1974765 4 0.4555 0.534485 0.000 0.328 0.000 0.628 0.008 0.036
#> SRR1974764 2 0.3020 0.570143 0.000 0.824 0.000 0.156 0.008 0.012
#> SRR1974763 1 0.5975 0.277668 0.540 0.032 0.000 0.000 0.296 0.132
#> SRR1974762 1 0.2755 0.708748 0.844 0.004 0.000 0.000 0.140 0.012
#> SRR1974761 2 0.2738 0.576885 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004 0.000
#> SRR1974760 4 0.4818 0.257397 0.000 0.460 0.000 0.496 0.008 0.036
#> SRR1974759 1 0.0790 0.787600 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974758 2 0.4878 0.341731 0.000 0.640 0.000 0.292 0.028 0.040
#> SRR1974757 2 0.4763 -0.210682 0.000 0.480 0.000 0.480 0.008 0.032
#> SRR1974756 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974754 4 0.0146 0.704893 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.2913 0.569543 0.000 0.812 0.000 0.180 0.004 0.004
#> SRR1974753 4 0.1564 0.692451 0.000 0.040 0.000 0.936 0.000 0.024
#> SRR1974751 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974750 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974752 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974749 2 0.7920 0.072840 0.020 0.340 0.000 0.232 0.256 0.152
#> SRR1974747 5 0.7374 0.251769 0.288 0.152 0.000 0.000 0.380 0.180
#> SRR1974748 1 0.4295 0.478038 0.692 0.012 0.000 0.000 0.264 0.032
#> SRR1974746 1 0.7125 -0.130645 0.364 0.104 0.000 0.000 0.356 0.176
#> SRR1974744 4 0.0891 0.705448 0.000 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1974745 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974743 4 0.0260 0.704859 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.7353 0.255290 0.288 0.148 0.000 0.000 0.384 0.180
#> SRR1974740 4 0.1890 0.686126 0.000 0.060 0.000 0.916 0.000 0.024
#> SRR1974739 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974741 4 0.0405 0.705005 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974738 4 0.4465 0.624252 0.000 0.212 0.000 0.704 0.004 0.080
#> SRR1974737 4 0.0260 0.704859 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974735 1 0.6957 -0.027881 0.404 0.088 0.000 0.000 0.340 0.168
#> SRR1974734 5 0.6732 0.521863 0.116 0.156 0.000 0.016 0.568 0.144
#> SRR1974733 4 0.0291 0.705041 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974732 4 0.4931 0.555172 0.000 0.156 0.000 0.696 0.020 0.128
#> SRR1974731 4 0.0146 0.704893 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.7123 -0.106743 0.372 0.104 0.000 0.000 0.348 0.176
#> SRR1974730 1 0.2955 0.673915 0.816 0.004 0.000 0.000 0.172 0.008
#> SRR1974728 4 0.0993 0.700877 0.000 0.012 0.000 0.964 0.000 0.024
#> SRR1974725 5 0.6954 0.494871 0.124 0.184 0.000 0.016 0.536 0.140
#> SRR1974726 4 0.0146 0.704786 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974724 1 0.6722 0.052830 0.436 0.068 0.000 0.000 0.336 0.160
#> SRR1974727 5 0.2781 0.727146 0.044 0.036 0.000 0.004 0.884 0.032
#> SRR1974723 4 0.0363 0.703980 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974722 2 0.7798 0.005218 0.008 0.292 0.000 0.288 0.252 0.160
#> SRR1974721 4 0.2604 0.682202 0.000 0.096 0.000 0.872 0.004 0.028
#> SRR1974720 5 0.7694 0.438188 0.068 0.220 0.000 0.112 0.472 0.128
#> SRR1974719 5 0.6056 0.224550 0.404 0.036 0.000 0.000 0.452 0.108
#> SRR1974718 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974716 5 0.4675 0.664183 0.140 0.040 0.000 0.000 0.736 0.084
#> SRR1974717 4 0.0993 0.700436 0.000 0.012 0.000 0.964 0.000 0.024
#> SRR1974715 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974713 1 0.0767 0.789868 0.976 0.004 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974714 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974711 5 0.1398 0.729642 0.052 0.008 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974712 1 0.0363 0.794881 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974709 1 0.0935 0.786453 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974708 5 0.1672 0.729649 0.048 0.016 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1974710 5 0.1434 0.729475 0.048 0.012 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974707 5 0.1668 0.729416 0.060 0.008 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974706 1 0.6673 0.073037 0.444 0.064 0.000 0.000 0.332 0.160
#> SRR1974704 1 0.1078 0.787394 0.964 0.016 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974705 1 0.1745 0.761963 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1974703 4 0.1176 0.699254 0.000 0.024 0.000 0.956 0.000 0.020
#> SRR1974702 5 0.7254 0.470695 0.276 0.072 0.028 0.032 0.512 0.080
#> SRR1974701 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974699 4 0.1765 0.691361 0.000 0.052 0.000 0.924 0.000 0.024
#> SRR1974698 4 0.0547 0.702094 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974700 1 0.6779 0.046005 0.432 0.072 0.000 0.000 0.332 0.164
#> SRR1974697 5 0.6585 0.537601 0.132 0.124 0.000 0.016 0.588 0.140
#> SRR1974696 5 0.7244 0.460988 0.072 0.244 0.000 0.044 0.496 0.144
#> SRR1974694 5 0.7292 0.237762 0.304 0.136 0.000 0.000 0.384 0.176
#> SRR1974695 5 0.2034 0.727547 0.044 0.024 0.000 0.004 0.920 0.008
#> SRR1974693 4 0.0260 0.705013 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0363 0.703415 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974690 4 0.4532 0.272182 0.000 0.464 0.000 0.508 0.004 0.024
#> SRR1974691 5 0.7238 0.211413 0.320 0.124 0.000 0.000 0.380 0.176
#> SRR1974689 4 0.0458 0.703952 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974688 4 0.0146 0.704893 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974687 5 0.7309 0.232155 0.304 0.136 0.000 0.000 0.380 0.180
#> SRR1974686 1 0.4196 0.640062 0.772 0.024 0.000 0.000 0.120 0.084
#> SRR1974685 5 0.7248 0.298882 0.276 0.140 0.000 0.000 0.412 0.172
#> SRR1974684 1 0.0146 0.793029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974683 5 0.7492 0.303795 0.232 0.204 0.000 0.000 0.380 0.184
#> SRR1974682 4 0.3790 0.589589 0.000 0.116 0.000 0.780 0.000 0.104
#> SRR1974681 1 0.0260 0.786294 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974679 4 0.2527 0.669534 0.000 0.040 0.000 0.876 0.000 0.084
#> SRR1974680 1 0.3986 0.588044 0.748 0.012 0.000 0.000 0.204 0.036
#> SRR1974678 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974677 1 0.0458 0.794312 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974676 2 0.2632 0.582845 0.000 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000
#> SRR1974675 3 0.4097 -0.746419 0.000 0.008 0.504 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974674 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974673 5 0.1672 0.728157 0.048 0.016 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1974671 2 0.2884 0.584069 0.000 0.824 0.000 0.164 0.004 0.008
#> SRR1974672 4 0.4183 0.594792 0.000 0.268 0.000 0.692 0.004 0.036
#> SRR1974670 4 0.4023 0.621716 0.000 0.240 0.000 0.720 0.004 0.036
#> SRR1974669 2 0.2884 0.584069 0.000 0.824 0.000 0.164 0.004 0.008
#> SRR1974667 2 0.2668 0.581150 0.000 0.828 0.000 0.168 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.2884 0.584069 0.000 0.824 0.000 0.164 0.004 0.008
#> SRR1974666 2 0.2773 0.583693 0.000 0.828 0.000 0.164 0.004 0.004
#> SRR1974664 4 0.4423 0.511187 0.000 0.360 0.000 0.608 0.004 0.028
#> SRR1974665 2 0.2838 0.565199 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004 0.000
#> SRR1974663 5 0.2278 0.714567 0.128 0.004 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974662 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974661 5 0.2186 0.726662 0.048 0.036 0.000 0.000 0.908 0.008
#> SRR1974660 1 0.3741 0.421077 0.672 0.000 0.000 0.000 0.320 0.008
#> SRR1974659 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974658 1 0.0547 0.794743 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974657 5 0.2092 0.718934 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1974654 1 0.0458 0.793684 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974655 5 0.2491 0.697004 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1974656 5 0.1542 0.728779 0.052 0.008 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974650 5 0.2058 0.729726 0.048 0.024 0.000 0.000 0.916 0.012
#> SRR1974651 4 0.0458 0.702596 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974652 5 0.3775 0.645695 0.228 0.016 0.000 0.000 0.744 0.012
#> SRR1974653 4 0.0405 0.704783 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974648 5 0.4576 0.659540 0.176 0.020 0.000 0.000 0.724 0.080
#> SRR1974646 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974649 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974647 4 0.0692 0.701983 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1974645 1 0.0363 0.794881 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974644 2 0.3042 0.592498 0.000 0.836 0.000 0.128 0.004 0.032
#> SRR1974643 1 0.0363 0.794536 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974642 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974640 5 0.1578 0.728474 0.048 0.012 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974641 4 0.3388 0.674390 0.000 0.156 0.000 0.804 0.004 0.036
#> SRR1974639 1 0.0632 0.791535 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974638 1 0.1753 0.760545 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1974635 1 0.0547 0.793406 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974636 5 0.1578 0.728474 0.048 0.012 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974634 1 0.0363 0.794832 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974637 4 0.0291 0.705096 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974633 5 0.2048 0.718411 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974632 1 0.0508 0.795304 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974631 5 0.1542 0.728779 0.052 0.008 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974630 1 0.0260 0.794448 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974629 1 0.0260 0.790722 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974628 1 0.0363 0.794881 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974627 5 0.3996 0.415264 0.388 0.004 0.000 0.000 0.604 0.004
#> SRR1974624 1 0.0260 0.793950 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974625 4 0.6104 0.275626 0.004 0.372 0.000 0.488 0.096 0.040
#> SRR1974623 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974622 5 0.1668 0.729473 0.060 0.008 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974620 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974619 5 0.4733 0.666887 0.064 0.088 0.000 0.008 0.756 0.084
#> SRR1974621 1 0.3779 0.680149 0.808 0.024 0.000 0.000 0.092 0.076
#> SRR1974617 5 0.4643 0.458563 0.364 0.016 0.000 0.000 0.596 0.024
#> SRR1974616 2 0.7496 0.037781 0.004 0.380 0.000 0.280 0.148 0.188
#> SRR1974615 1 0.1556 0.746335 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974618 1 0.6669 0.036659 0.432 0.072 0.000 0.000 0.356 0.140
#> SRR1974614 5 0.2389 0.714278 0.128 0.008 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974613 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974612 1 0.2631 0.674905 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1974611 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974610 4 0.0692 0.703742 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1974609 1 0.0547 0.793052 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974608 5 0.7007 0.487714 0.124 0.188 0.000 0.016 0.528 0.144
#> SRR1974607 5 0.4729 0.560674 0.296 0.016 0.000 0.000 0.644 0.044
#> SRR1974606 2 0.3074 0.546753 0.000 0.792 0.000 0.200 0.004 0.004
#> SRR1974605 5 0.6871 0.502556 0.132 0.160 0.000 0.012 0.544 0.152
#> SRR1974604 4 0.0146 0.704893 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.1707 0.732570 0.056 0.012 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974602 1 0.0260 0.794338 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974600 4 0.4634 0.586563 0.000 0.300 0.000 0.640 0.004 0.056
#> SRR1974601 5 0.2407 0.721587 0.040 0.036 0.000 0.012 0.904 0.008
#> SRR1974599 2 0.2879 0.577741 0.000 0.816 0.000 0.176 0.004 0.004
#> SRR1974598 2 0.2738 0.576885 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004 0.000
#> SRR1974596 2 0.3380 0.482156 0.000 0.748 0.000 0.244 0.004 0.004
#> SRR1974594 4 0.5189 0.571759 0.000 0.276 0.000 0.612 0.008 0.104
#> SRR1974593 4 0.4640 0.538213 0.000 0.348 0.000 0.604 0.004 0.044
#> SRR1974595 4 0.4684 0.308244 0.000 0.444 0.000 0.520 0.008 0.028
#> SRR1974592 2 0.3189 0.485392 0.000 0.760 0.000 0.236 0.004 0.000
#> SRR1974591 2 0.2772 0.574032 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004 0.000
#> SRR1974588 4 0.5751 0.505549 0.000 0.272 0.000 0.572 0.024 0.132
#> SRR1974590 4 0.4381 0.356397 0.000 0.456 0.000 0.524 0.004 0.016
#> SRR1974589 4 0.4233 0.657709 0.000 0.180 0.000 0.736 0.004 0.080
#> SRR1974587 4 0.4720 0.596482 0.000 0.284 0.000 0.644 0.004 0.068
#> SRR1974586 4 0.4419 0.587077 0.000 0.304 0.000 0.652 0.004 0.040
#> SRR1974585 4 0.4258 0.652003 0.000 0.204 0.000 0.724 0.004 0.068
#> SRR1974584 1 0.5872 0.172643 0.520 0.028 0.000 0.000 0.340 0.112
#> SRR1974583 4 0.4452 0.465629 0.000 0.400 0.000 0.572 0.004 0.024
#> SRR1974582 2 0.2772 0.572638 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004 0.000
#> SRR1974581 2 0.3023 0.528050 0.000 0.784 0.000 0.212 0.004 0.000
#> SRR1974580 4 0.3274 0.684104 0.000 0.168 0.000 0.804 0.004 0.024
#> SRR1974578 4 0.5128 0.583944 0.000 0.240 0.000 0.636 0.008 0.116
#> SRR1974577 5 0.7475 0.356893 0.024 0.164 0.000 0.208 0.468 0.136
#> SRR1974579 4 0.4754 0.617141 0.000 0.236 0.000 0.668 0.004 0.092
#> SRR1974576 4 0.4492 0.551699 0.000 0.340 0.000 0.620 0.004 0.036
#> SRR1974575 2 0.3769 0.180382 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004 0.000
#> SRR1974574 4 0.4459 0.527215 0.000 0.320 0.000 0.640 0.008 0.032
#> SRR1974573 4 0.4428 0.537488 0.000 0.312 0.000 0.648 0.008 0.032
#> SRR1974571 4 0.4411 0.543058 0.000 0.308 0.000 0.652 0.008 0.032
#> SRR1974572 4 0.4411 0.541672 0.000 0.308 0.000 0.652 0.008 0.032
#> SRR1974570 5 0.1765 0.726191 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1974568 5 0.5356 0.584218 0.172 0.044 0.000 0.000 0.668 0.116
#> SRR1974567 5 0.5933 0.172493 0.400 0.024 0.000 0.000 0.460 0.116
#> SRR1974566 4 0.4545 0.493939 0.000 0.344 0.000 0.616 0.008 0.032
#> SRR1974569 4 0.4594 0.475119 0.000 0.360 0.000 0.600 0.008 0.032
#> SRR1974565 4 0.5697 0.490441 0.000 0.280 0.000 0.564 0.016 0.140
#> SRR1974564 4 0.4736 0.330825 0.000 0.432 0.000 0.528 0.008 0.032
#> SRR1974560 5 0.2454 0.727394 0.088 0.008 0.000 0.000 0.884 0.020
#> SRR1974559 5 0.5947 0.480509 0.236 0.052 0.000 0.000 0.588 0.124
#> SRR1974563 4 0.4327 0.652691 0.000 0.196 0.000 0.732 0.016 0.056
#> SRR1974562 4 0.4702 0.387167 0.000 0.408 0.000 0.552 0.008 0.032
#> SRR1974561 4 0.4594 0.469277 0.000 0.360 0.000 0.600 0.008 0.032
#> SRR1974557 4 0.4496 0.584303 0.000 0.308 0.000 0.644 0.004 0.044
#> SRR1974553 4 0.4359 0.561453 0.000 0.296 0.000 0.664 0.008 0.032
#> SRR1974555 1 0.6363 0.105731 0.464 0.044 0.000 0.000 0.348 0.144
#> SRR1974551 5 0.6781 0.389099 0.240 0.096 0.000 0.000 0.496 0.168
#> SRR1974552 4 0.4146 0.643666 0.000 0.232 0.000 0.720 0.008 0.040
#> SRR1974554 5 0.1219 0.729835 0.048 0.004 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1974558 5 0.4939 0.519519 0.320 0.016 0.000 0.000 0.612 0.052
#> SRR1974556 5 0.3977 0.667241 0.200 0.016 0.000 0.000 0.752 0.032
#> SRR1974550 5 0.1434 0.730146 0.048 0.012 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974549 4 0.4518 0.502151 0.000 0.336 0.000 0.624 0.008 0.032
#> SRR1974548 4 0.5241 0.545805 0.000 0.288 0.000 0.600 0.008 0.104
#> SRR1974547 5 0.2526 0.725898 0.096 0.004 0.000 0.000 0.876 0.024
#> SRR1974546 5 0.1477 0.728112 0.048 0.008 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1974545 4 0.4727 0.477305 0.000 0.376 0.000 0.580 0.012 0.032
#> SRR1974544 5 0.4547 0.617787 0.244 0.020 0.000 0.000 0.692 0.044
#> SRR1974543 4 0.4504 0.509889 0.000 0.332 0.000 0.628 0.008 0.032
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.950 0.951 0.979 0.4865 0.515 0.515
#> 3 3 1.000 0.984 0.993 0.3662 0.748 0.543
#> 4 4 0.964 0.951 0.973 0.0962 0.927 0.786
#> 5 5 0.968 0.933 0.969 0.0355 0.956 0.844
#> 6 6 0.929 0.893 0.949 0.0307 0.967 0.873
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3 4 5
There is also optional best \(k\) = 2 3 4 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975008 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975006 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975005 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975004 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975003 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975001 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975002 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974999 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1975000 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974998 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974997 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974995 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974996 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974992 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974990 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR1974991 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974986 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974987 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974984 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974985 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974983 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974979 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974976 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974975 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974974 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974973 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974972 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974971 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974970 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974969 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974968 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974967 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974965 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974966 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974964 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974963 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974961 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974962 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974960 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974959 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974958 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974957 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974956 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974953 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974952 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974949 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974950 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974951 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974947 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974948 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974946 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974945 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974943 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974939 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974938 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974937 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974934 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974933 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974932 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974931 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974928 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974927 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974922 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974921 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974917 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974914 1 0.6887 0.773 0.816 0.184
#> SRR1974913 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974908 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974906 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974907 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974905 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974904 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974902 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974901 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974898 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974900 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974899 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974897 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974896 1 0.4690 0.881 0.900 0.100
#> SRR1974893 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974895 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974894 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974892 1 0.0376 0.974 0.996 0.004
#> SRR1974890 1 0.5519 0.849 0.872 0.128
#> SRR1974891 1 0.0376 0.974 0.996 0.004
#> SRR1974889 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974888 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.6531 0.800 0.168 0.832
#> SRR1974883 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974884 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.9850 0.259 0.428 0.572
#> SRR1974882 2 0.5178 0.865 0.116 0.884
#> SRR1974880 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974879 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974877 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.9815 0.281 0.420 0.580
#> SRR1974878 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974875 1 0.8386 0.638 0.732 0.268
#> SRR1974874 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.4431 0.892 0.908 0.092
#> SRR1974868 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974870 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.8955 0.560 0.688 0.312
#> SRR1974867 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.1633 0.959 0.024 0.976
#> SRR1974861 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0938 0.969 0.012 0.988
#> SRR1974854 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.9552 0.413 0.624 0.376
#> SRR1974828 1 0.1184 0.965 0.984 0.016
#> SRR1974826 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974822 2 0.7453 0.733 0.212 0.788
#> SRR1974823 1 0.2236 0.948 0.964 0.036
#> SRR1974820 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7528 0.731 0.784 0.216
#> SRR1974815 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974812 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974810 2 0.8016 0.681 0.244 0.756
#> SRR1974808 1 0.0376 0.974 0.996 0.004
#> SRR1974811 1 0.0938 0.968 0.988 0.012
#> SRR1974809 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.9522 0.424 0.628 0.372
#> SRR1974806 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974804 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974803 2 0.6712 0.787 0.176 0.824
#> SRR1974801 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.3733 0.913 0.928 0.072
#> SRR1974784 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974780 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.8955 0.560 0.688 0.312
#> SRR1974771 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974747 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.8207 0.667 0.744 0.256
#> SRR1974744 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974742 2 0.3584 0.917 0.068 0.932
#> SRR1974740 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0376 0.974 0.996 0.004
#> SRR1974734 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974732 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.5629 0.846 0.868 0.132
#> SRR1974730 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974725 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5294 0.859 0.120 0.880
#> SRR1974723 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.2778 0.937 0.952 0.048
#> SRR1974718 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.7056 0.763 0.192 0.808
#> SRR1974717 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.5842 0.836 0.860 0.140
#> SRR1974710 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974701 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.2236 0.948 0.036 0.964
#> SRR1974696 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974694 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR1974695 2 0.9635 0.365 0.388 0.612
#> SRR1974693 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974691 2 0.9129 0.515 0.328 0.672
#> SRR1974689 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974687 2 0.2423 0.944 0.040 0.960
#> SRR1974686 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974685 2 0.0672 0.973 0.008 0.992
#> SRR1974684 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974675 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.8608 0.614 0.716 0.284
#> SRR1974671 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.9608 0.391 0.616 0.384
#> SRR1974660 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.1843 0.955 0.972 0.028
#> SRR1974650 1 0.7056 0.767 0.808 0.192
#> SRR1974651 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.2423 0.944 0.960 0.040
#> SRR1974646 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.8861 0.577 0.696 0.304
#> SRR1974641 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0672 0.971 0.992 0.008
#> SRR1974630 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974623 1 0.7815 0.706 0.768 0.232
#> SRR1974622 1 0.1414 0.962 0.980 0.020
#> SRR1974620 1 0.0672 0.971 0.992 0.008
#> SRR1974619 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.2236 0.948 0.964 0.036
#> SRR1974612 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974605 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.1414 0.962 0.980 0.020
#> SRR1974602 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.3584 0.917 0.068 0.932
#> SRR1974599 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.2948 0.933 0.052 0.948
#> SRR1974579 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.978 1.000 0.000
#> SRR1974568 2 0.7139 0.758 0.196 0.804
#> SRR1974567 1 0.1184 0.965 0.984 0.016
#> SRR1974566 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.8713 0.600 0.708 0.292
#> SRR1974559 2 0.5737 0.839 0.136 0.864
#> SRR1974563 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.1184 0.965 0.984 0.016
#> SRR1974551 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.9427 0.454 0.640 0.360
#> SRR1974558 1 0.2423 0.944 0.960 0.040
#> SRR1974556 1 0.2423 0.944 0.960 0.040
#> SRR1974550 2 0.8861 0.568 0.304 0.696
#> SRR1974549 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.9896 0.227 0.560 0.440
#> SRR1974546 1 0.3733 0.913 0.928 0.072
#> SRR1974545 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.1843 0.955 0.972 0.028
#> SRR1974543 2 0.0000 0.979 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.4002 0.807 0.160 0.000 0.840
#> SRR1974993 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 3 0.6045 0.384 0.000 0.380 0.620
#> SRR1974991 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974887 2 0.2261 0.922 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974885 3 0.2959 0.887 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974883 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974882 3 0.2165 0.929 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974880 2 0.2878 0.890 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974879 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974876 3 0.1163 0.967 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974878 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974875 3 0.0592 0.983 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974874 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.6260 0.187 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974861 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.1289 0.960 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974854 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974831 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 2 0.0424 0.982 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0592 0.984 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.1529 0.952 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974786 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1031 0.968 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974773 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0237 0.986 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0237 0.986 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974747 1 0.1411 0.959 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0424 0.988 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.4399 0.768 0.812 0.188 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.5859 0.473 0.656 0.344 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974701 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0237 0.991 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.1643 0.946 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974675 3 0.0000 0.994 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0424 0.983 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974672 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0747 0.975 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974667 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0424 0.983 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974666 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974643 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1643 0.946 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974623 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.2356 0.916 0.072 0.928 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.6079 0.367 0.388 0.612 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 2 0.5760 0.513 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 1 0.2959 0.888 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.1643 0.951 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.995 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.989 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0188 0.9917 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.2647 0.8427 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.5159 0.7322 0.000 0.156 0.756 0.088
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0188 0.9917 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0817 0.9737 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.0817 0.9737 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0921 0.9686 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974891 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974886 4 0.5250 0.0875 0.000 0.440 0.008 0.552
#> SRR1974887 2 0.6081 0.0871 0.000 0.484 0.472 0.044
#> SRR1974885 3 0.0376 0.9888 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.3311 0.7943 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1974882 3 0.0469 0.9846 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974880 4 0.6726 0.3394 0.000 0.100 0.364 0.536
#> SRR1974879 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.4933 0.2143 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1974878 3 0.0188 0.9917 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974875 3 0.0707 0.9785 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0188 0.9886 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0469 0.9169 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974852 2 0.2081 0.9180 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1474 0.9218 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.1867 0.9207 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.2149 0.9169 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974834 2 0.1867 0.9208 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974833 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.1792 0.9212 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0592 0.9786 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.2412 0.8728 0.008 0.084 0.000 0.908
#> SRR1974827 2 0.0592 0.9183 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.2408 0.8937 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.3726 0.7054 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974812 2 0.0707 0.9192 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1716 0.9216 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974804 4 0.4164 0.6112 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2647 0.8424 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974797 2 0.1940 0.9201 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974796 2 0.0921 0.9202 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974795 2 0.1211 0.9214 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974793 1 0.2216 0.9072 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0336 0.9165 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974792 2 0.1474 0.9219 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974791 2 0.1022 0.9207 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974790 2 0.1940 0.9201 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974789 2 0.2814 0.8340 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.0592 0.9183 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0188 0.9151 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974780 1 0.0188 0.9889 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.1792 0.9305 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.1940 0.9200 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.2281 0.9142 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0188 0.9151 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0336 0.9164 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.4609 0.7413 0.056 0.788 0.000 0.156
#> SRR1974747 1 0.3266 0.8024 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.2589 0.8705 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0921 0.9225 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.0469 0.9419 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0469 0.9817 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0336 0.9853 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.0592 0.9791 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.1792 0.9255 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.2011 0.9132 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.2281 0.9146 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.2921 0.8404 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 4 0.0469 0.9420 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2530 0.8594 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9949 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0188 0.9887 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0707 0.9109 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974666 2 0.0336 0.9131 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974664 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.1474 0.8976 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1576 0.8975 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 4 0.1520 0.9209 0.020 0.024 0.000 0.956
#> SRR1974623 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.4746 0.4246 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.0188 0.9152 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0817 0.9720 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.2760 0.8433 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974605 4 0.0707 0.9320 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9553 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.4898 0.2259 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1974601 1 0.0336 0.9853 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9136 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.2408 0.9108 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974594 2 0.3400 0.8427 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974593 4 0.4304 0.5764 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1974595 2 0.2281 0.9143 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974592 2 0.1716 0.9216 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974591 2 0.0188 0.9151 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974588 2 0.4193 0.7146 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974590 2 0.3801 0.7903 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974589 2 0.2704 0.8964 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974587 4 0.2760 0.8265 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974586 4 0.2921 0.8121 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1974585 2 0.2647 0.8995 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.3356 0.8469 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1974582 2 0.1389 0.9217 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974581 2 0.1637 0.9219 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974580 2 0.3074 0.8735 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974578 4 0.4817 0.3139 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974577 2 0.3569 0.7203 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.2647 0.8995 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974576 2 0.3024 0.8771 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974575 2 0.1792 0.9215 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974574 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974573 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974571 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974572 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974570 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.2469 0.9082 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974569 2 0.2469 0.9082 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974565 2 0.2814 0.8901 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974564 2 0.2216 0.9156 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0657 0.9780 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974563 2 0.2345 0.9126 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974562 2 0.2345 0.9126 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974561 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974557 4 0.1557 0.9055 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974553 2 0.2469 0.9082 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 2 0.2984 0.8617 0.084 0.888 0.000 0.028
#> SRR1974552 2 0.2345 0.9126 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.2408 0.9107 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974548 2 0.4040 0.7496 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974547 1 0.0188 0.9885 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.2345 0.9126 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9920 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.2469 0.9082 0.000 0.892 0.000 0.108
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.2124 0.85101 0.096 0.000 0.900 0.000 0.004
#> SRR1974993 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 5 0.0771 0.84396 0.000 0.000 0.020 0.004 0.976
#> SRR1974991 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.1197 0.94199 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974913 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0162 0.98590 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974891 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 4 0.4523 0.69292 0.000 0.148 0.036 0.776 0.040
#> SRR1974887 3 0.5375 0.25271 0.000 0.016 0.568 0.032 0.384
#> SRR1974885 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.3242 0.77078 0.000 0.012 0.816 0.000 0.172
#> SRR1974882 3 0.0404 0.97805 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974880 3 0.4966 0.26140 0.000 0.032 0.564 0.404 0.000
#> SRR1974879 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 5 0.3391 0.70281 0.000 0.012 0.188 0.000 0.800
#> SRR1974878 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.1478 0.92428 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974874 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.0963 0.95349 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974869 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974868 5 0.3109 0.84093 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974870 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0324 0.97168 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974867 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974865 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 5 0.0703 0.86260 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1974861 5 0.3177 0.83451 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1974859 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.4304 -0.04397 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1974854 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0404 0.96326 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974845 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974841 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0162 0.93391 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974831 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.1041 0.95380 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974828 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2763 0.75120 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1974827 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974825 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974823 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974820 1 0.0609 0.96473 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974818 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.2377 0.74091 0.128 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974815 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0404 0.96970 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974814 2 0.3913 0.48284 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1974812 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0880 0.95650 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974808 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974811 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974809 1 0.0703 0.96216 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974807 1 0.0794 0.95878 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974806 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.3796 0.52155 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1974803 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0963 0.95326 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974799 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.1502 0.87634 0.000 0.056 0.000 0.004 0.940
#> SRR1974797 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974793 5 0.2891 0.68333 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974794 5 0.4040 0.77016 0.000 0.260 0.000 0.016 0.724
#> SRR1974792 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 5 0.4270 0.81843 0.000 0.204 0.000 0.048 0.748
#> SRR1974788 5 0.0794 0.86480 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974786 1 0.0880 0.95643 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974787 1 0.0290 0.97196 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974784 2 0.1043 0.90100 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974783 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974785 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974781 2 0.1792 0.85294 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974780 1 0.3966 0.52958 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974779 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0794 0.95953 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974778 1 0.0510 0.96733 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974774 5 0.1792 0.88303 0.000 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1974773 1 0.1341 0.93555 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974775 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974772 1 0.4302 0.11019 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1974771 5 0.2813 0.86188 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1974770 5 0.2329 0.87939 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974769 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974768 5 0.0290 0.85281 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974767 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974766 5 0.1851 0.88330 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1974765 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974764 5 0.1671 0.88145 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1974763 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0880 0.95628 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974761 5 0.3177 0.83464 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1974760 2 0.0162 0.93382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974759 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974758 5 0.0880 0.86678 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974757 2 0.2179 0.81779 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974756 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974754 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.0290 0.85281 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974753 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0794 0.95938 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974749 5 0.1430 0.87533 0.000 0.052 0.000 0.004 0.944
#> SRR1974747 1 0.4270 0.52771 0.668 0.000 0.000 0.320 0.012
#> SRR1974748 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0290 0.97197 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974744 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.4548 0.70782 0.752 0.000 0.000 0.120 0.128
#> SRR1974740 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974734 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974730 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0324 0.97195 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974723 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0451 0.96910 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974717 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0290 0.97191 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974714 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974711 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974709 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974710 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974707 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974706 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974705 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.4249 0.30129 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974701 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.1892 0.89550 0.916 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1974696 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.2471 0.83159 0.864 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974695 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974693 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974689 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0451 0.97010 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974686 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974685 1 0.2732 0.79956 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 5 0.2068 0.88354 0.000 0.092 0.000 0.004 0.904
#> SRR1974675 3 0.0000 0.98947 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0566 0.96580 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974671 5 0.3274 0.82266 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1974672 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 5 0.3857 0.69475 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1974667 5 0.2561 0.87281 0.000 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974668 5 0.1965 0.88339 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1974666 5 0.3210 0.83060 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1974664 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 5 0.2516 0.87443 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1974663 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0451 0.96909 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974660 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974658 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0510 0.96733 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974655 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974656 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974650 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974651 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974653 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974646 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974647 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.2230 0.88100 0.000 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1974643 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974640 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974641 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974638 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974635 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974634 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974632 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974631 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974630 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 4 0.3635 0.67363 0.004 0.000 0.000 0.748 0.248
#> SRR1974623 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974622 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974620 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974619 4 0.4451 -0.00606 0.492 0.000 0.000 0.504 0.004
#> SRR1974621 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974617 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.3366 0.62901 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1974615 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.3774 0.61459 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974614 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974613 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974612 1 0.1410 0.93156 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974611 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974610 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974606 5 0.3579 0.85086 0.000 0.100 0.000 0.072 0.828
#> SRR1974605 4 0.0290 0.96530 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.97642 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974602 1 0.0162 0.97360 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 2 0.0162 0.93336 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974601 1 0.0566 0.96592 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974599 2 0.4268 -0.02391 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974598 5 0.4235 0.45070 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1974596 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0451 0.92647 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974595 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0162 0.93382 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974591 2 0.3983 0.36078 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1974588 2 0.0162 0.93336 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974590 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0566 0.92237 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974586 2 0.0865 0.91114 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974585 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974583 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0510 0.92404 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974581 2 0.0609 0.92069 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974580 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 2 0.3579 0.53506 0.240 0.756 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974567 1 0.3300 0.72598 0.792 0.204 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974566 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0955 0.95082 0.968 0.028 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974559 2 0.3123 0.63458 0.184 0.812 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974563 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974557 4 0.3452 0.63940 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.2179 0.86983 0.896 0.100 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974551 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.0324 0.97154 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974558 1 0.0451 0.96869 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974556 1 0.0000 0.97445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.3662 0.64821 0.744 0.252 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974549 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0162 0.93336 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974547 2 0.3949 0.42859 0.300 0.696 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974546 1 0.0162 0.97344 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974545 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0451 0.96865 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974543 2 0.0000 0.93677 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0260 0.9807 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.4141 0.2835 0.012 0.000 0.556 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974993 3 0.0146 0.9837 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.3468 0.6053 0.000 0.712 0.000 0.004 0.284 0.000
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0260 0.9805 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0146 0.9837 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0260 0.9810 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0146 0.9836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.1141 0.9376 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974942 3 0.0632 0.9664 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0260 0.9807 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974936 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974930 3 0.0363 0.9775 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974929 3 0.0146 0.9836 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0363 0.9770 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0146 0.9837 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0260 0.9798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3390 0.5731 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974911 3 0.0260 0.9808 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974910 3 0.0146 0.9838 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.2941 0.6067 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.3023 0.6876 0.000 0.232 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0146 0.9833 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.3330 0.5811 0.000 0.284 0.716 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.1444 0.9121 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.2568 0.7973 0.000 0.876 0.016 0.096 0.000 0.012
#> SRR1974887 2 0.1802 0.8151 0.000 0.916 0.072 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.1444 0.9121 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.1610 0.8044 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.2762 0.6457 0.000 0.804 0.196 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974880 2 0.4210 0.6618 0.000 0.756 0.120 0.116 0.008 0.000
#> SRR1974879 3 0.0547 0.9682 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.1845 0.8396 0.000 0.920 0.028 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974875 2 0.3860 0.1298 0.000 0.528 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.2793 0.7396 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974869 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974868 2 0.0458 0.8808 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974870 1 0.0146 0.9112 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974866 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974867 1 0.0790 0.9082 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974865 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0146 0.9114 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0363 0.8724 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974861 2 0.0458 0.8807 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 6 0.4284 0.6035 0.000 0.056 0.000 0.000 0.256 0.688
#> SRR1974854 1 0.1075 0.9069 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974853 1 0.0547 0.9126 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974851 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974852 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0260 0.9119 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974848 1 0.0146 0.9112 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974850 4 0.0146 0.9777 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0260 0.9105 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974845 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.1007 0.9061 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974843 1 0.0632 0.9097 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974842 1 0.3221 0.6697 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1974841 1 0.0937 0.9088 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0937 0.9091 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974837 1 0.0547 0.9131 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974835 1 0.0458 0.9103 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974836 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 6 0.0146 0.9259 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974831 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0937 0.9085 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974830 1 0.0790 0.9090 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974829 6 0.5371 0.1952 0.240 0.000 0.000 0.000 0.176 0.584
#> SRR1974828 1 0.1267 0.9019 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974826 6 0.5490 0.5256 0.024 0.040 0.000 0.236 0.048 0.652
#> SRR1974827 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0790 0.9060 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974825 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974822 1 0.1219 0.9049 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1974823 1 0.1007 0.8995 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974820 1 0.2300 0.8365 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974818 1 0.0146 0.9112 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974819 1 0.2527 0.8140 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1974817 1 0.1444 0.8964 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974816 5 0.3006 0.6365 0.064 0.092 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1974815 1 0.0363 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974813 1 0.3221 0.6520 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1974814 6 0.1444 0.8603 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974812 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974810 1 0.2730 0.7549 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974808 1 0.0790 0.9047 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974811 1 0.1267 0.9035 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974809 1 0.2996 0.6918 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1974807 1 0.2613 0.7654 0.848 0.140 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.0632 0.9090 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974805 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 6 0.3426 0.5777 0.000 0.000 0.000 0.276 0.004 0.720
#> SRR1974803 1 0.2255 0.8656 0.892 0.000 0.000 0.028 0.080 0.000
#> SRR1974801 1 0.0713 0.9090 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974800 1 0.3330 0.5623 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974799 1 0.1007 0.9062 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974798 2 0.0260 0.8799 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974797 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974796 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974795 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 5 0.2948 0.6322 0.060 0.092 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1974794 2 0.0713 0.8778 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974792 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974791 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974790 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0692 0.8805 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974788 2 0.0405 0.8794 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974786 1 0.2340 0.8246 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1974787 1 0.0458 0.9122 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974784 2 0.3101 0.6743 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1974783 1 0.0547 0.9097 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974785 1 0.0363 0.9111 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974782 1 0.2003 0.8696 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974781 6 0.3851 0.0813 0.000 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1974780 1 0.3547 0.4239 0.696 0.300 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974779 1 0.0713 0.9124 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974777 1 0.1267 0.9020 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974776 1 0.0865 0.9080 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974778 1 0.1501 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974774 2 0.0291 0.8772 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974773 1 0.2912 0.7722 0.816 0.012 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974775 1 0.0790 0.9085 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974772 2 0.3531 0.1169 0.328 0.672 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0363 0.8805 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974770 2 0.0603 0.8809 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1974769 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0632 0.8675 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974767 1 0.0713 0.9110 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974766 2 0.0260 0.8798 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974765 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0260 0.8798 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974763 1 0.1075 0.9072 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974762 5 0.4341 0.4366 0.412 0.024 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1974761 2 0.0547 0.8803 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974760 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0865 0.9084 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974758 2 0.0260 0.8798 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974757 2 0.3023 0.6870 0.000 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1974756 1 0.1714 0.8852 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0363 0.8724 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.4002 0.1367 0.588 0.008 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1974749 2 0.0405 0.8730 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974747 4 0.3776 0.5246 0.196 0.000 0.000 0.756 0.048 0.000
#> SRR1974748 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974746 1 0.2941 0.7429 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.5053 0.5792 0.088 0.028 0.000 0.208 0.676 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.2941 0.7446 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1974734 4 0.0363 0.9652 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.3151 0.6922 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9110 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.2300 0.8421 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974727 1 0.1007 0.8995 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0458 0.9103 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974718 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 1 0.1204 0.8940 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.3221 0.6670 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1974714 1 0.1141 0.8957 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974711 1 0.0260 0.9106 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974712 1 0.1663 0.8852 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974709 1 0.1007 0.9076 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974708 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974710 1 0.1075 0.8976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974707 1 0.0547 0.9082 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974706 1 0.1327 0.9009 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974704 1 0.2762 0.7792 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1974705 1 0.1141 0.9062 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.4756 0.4798 0.408 0.052 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.1663 0.8878 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974697 1 0.1625 0.8839 0.928 0.000 0.000 0.012 0.060 0.000
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.3672 0.2498 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.2053 0.8697 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.2875 0.8083 0.852 0.000 0.000 0.096 0.052 0.000
#> SRR1974686 1 0.1387 0.8985 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974685 1 0.3126 0.5583 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0937 0.9088 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974683 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.1327 0.9007 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0790 0.9101 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9110 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0260 0.8798 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9863 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.1141 0.9070 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974673 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974671 2 0.0632 0.8792 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974672 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0713 0.8778 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974667 2 0.0363 0.8805 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974668 2 0.0260 0.8798 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974666 2 0.0458 0.8808 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974664 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0291 0.8772 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974663 1 0.0363 0.9114 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974662 1 0.0458 0.9103 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974661 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974660 1 0.0458 0.9091 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974659 1 0.1610 0.8889 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974658 1 0.0937 0.9095 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974657 1 0.0260 0.9105 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974654 1 0.2048 0.8552 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974655 1 0.0790 0.9045 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974656 1 0.1075 0.8976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974650 1 0.1075 0.8976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0260 0.9116 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.1141 0.8966 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974646 1 0.0260 0.9121 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974649 1 0.1267 0.8990 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9110 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0520 0.8783 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974643 1 0.0713 0.9123 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974642 1 0.1075 0.8976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974640 1 0.1327 0.8892 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974641 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.1075 0.9045 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974638 1 0.0458 0.9103 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974635 1 0.0363 0.9123 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974636 1 0.1267 0.8925 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974634 1 0.2491 0.8178 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.1075 0.8976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974632 1 0.1957 0.8687 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974631 1 0.1141 0.8957 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974630 1 0.0547 0.9115 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974629 1 0.2219 0.8453 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974628 1 0.0363 0.9108 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974627 1 0.0363 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974624 1 0.0260 0.9112 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974625 4 0.4272 0.6744 0.036 0.040 0.000 0.752 0.172 0.000
#> SRR1974623 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974622 1 0.0790 0.9045 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974620 1 0.1267 0.8911 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974619 1 0.3618 0.6368 0.776 0.000 0.000 0.176 0.048 0.000
#> SRR1974621 1 0.1141 0.9025 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974617 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974616 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974615 1 0.0260 0.9105 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974618 5 0.3014 0.6842 0.132 0.036 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1974614 1 0.0458 0.9134 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974613 1 0.1204 0.8935 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974612 1 0.2340 0.8225 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1974611 1 0.0713 0.9059 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974608 4 0.1779 0.8627 0.064 0.000 0.000 0.920 0.016 0.000
#> SRR1974607 1 0.0363 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974606 2 0.0622 0.8765 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974605 4 0.0146 0.9766 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9824 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.0146 0.9109 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974602 1 0.2378 0.8307 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974600 6 0.0951 0.9133 0.000 0.004 0.000 0.008 0.020 0.968
#> SRR1974601 1 0.1219 0.8969 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048 0.000
#> SRR1974599 2 0.1267 0.8605 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974598 2 0.1075 0.8677 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974596 2 0.3161 0.7008 0.000 0.776 0.000 0.000 0.008 0.216
#> SRR1974594 6 0.1421 0.8966 0.000 0.028 0.000 0.000 0.028 0.944
#> SRR1974593 6 0.3368 0.7815 0.000 0.012 0.000 0.108 0.052 0.828
#> SRR1974595 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.2260 0.7939 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974591 2 0.1444 0.8522 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974588 6 0.0603 0.9195 0.000 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974590 6 0.0260 0.9240 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974589 6 0.0146 0.9260 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974587 6 0.1682 0.8834 0.000 0.000 0.000 0.020 0.052 0.928
#> SRR1974586 6 0.4507 0.5200 0.000 0.004 0.000 0.284 0.052 0.660
#> SRR1974585 6 0.0603 0.9178 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1974584 1 0.1863 0.8724 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974583 6 0.0603 0.9196 0.000 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974582 2 0.2378 0.7818 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974581 2 0.1814 0.8302 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974580 6 0.0405 0.9229 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004 0.988
#> SRR1974578 6 0.0858 0.9131 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1974577 6 0.5105 0.3520 0.240 0.096 0.000 0.000 0.016 0.648
#> SRR1974579 6 0.0806 0.9160 0.000 0.008 0.000 0.000 0.020 0.972
#> SRR1974576 6 0.3496 0.7581 0.000 0.140 0.000 0.004 0.052 0.804
#> SRR1974575 2 0.2823 0.7228 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1974574 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974572 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.9110 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 6 0.2867 0.7417 0.112 0.000 0.000 0.000 0.040 0.848
#> SRR1974567 1 0.4085 0.5979 0.736 0.000 0.000 0.000 0.072 0.192
#> SRR1974566 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974565 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974564 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.1594 0.8918 0.932 0.000 0.000 0.000 0.052 0.016
#> SRR1974559 6 0.1528 0.8641 0.048 0.000 0.000 0.000 0.016 0.936
#> SRR1974563 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974557 4 0.3464 0.4995 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1974553 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.4358 0.5617 0.716 0.000 0.000 0.000 0.100 0.184
#> SRR1974551 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974552 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.1531 0.8849 0.928 0.000 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1974558 1 0.2020 0.8709 0.896 0.000 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1974556 1 0.0363 0.9118 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974550 1 0.2571 0.8282 0.876 0.000 0.000 0.000 0.064 0.060
#> SRR1974549 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 6 0.0363 0.9229 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974547 6 0.4458 0.1699 0.352 0.000 0.000 0.000 0.040 0.608
#> SRR1974546 1 0.1327 0.8892 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974545 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.1152 0.9073 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974543 6 0.0000 0.9280 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.363 0.798 0.868 0.3970 0.612 0.612
#> 3 3 0.451 0.716 0.827 0.5737 0.716 0.541
#> 4 4 0.545 0.528 0.761 0.1278 0.935 0.827
#> 5 5 0.567 0.664 0.721 0.0698 0.858 0.596
#> 6 6 0.585 0.595 0.759 0.0495 0.967 0.857
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.7602 0.802 0.220 0.780
#> SRR1975008 2 0.6973 0.824 0.188 0.812
#> SRR1975006 2 0.6801 0.829 0.180 0.820
#> SRR1975005 2 0.7139 0.820 0.196 0.804
#> SRR1975004 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1975003 2 0.7139 0.819 0.196 0.804
#> SRR1975001 2 0.6623 0.831 0.172 0.828
#> SRR1975002 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974999 2 0.6623 0.833 0.172 0.828
#> SRR1975000 2 0.7376 0.814 0.208 0.792
#> SRR1974998 2 0.7602 0.802 0.220 0.780
#> SRR1974997 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974995 2 0.7056 0.822 0.192 0.808
#> SRR1974996 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974994 2 0.7950 0.784 0.240 0.760
#> SRR1974993 2 0.6887 0.827 0.184 0.816
#> SRR1974992 2 0.6801 0.829 0.180 0.820
#> SRR1974990 2 0.7602 0.802 0.220 0.780
#> SRR1974989 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974991 2 0.7056 0.824 0.192 0.808
#> SRR1974986 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974987 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974988 2 0.4939 0.852 0.108 0.892
#> SRR1974984 2 0.6973 0.826 0.188 0.812
#> SRR1974985 2 0.7376 0.814 0.208 0.792
#> SRR1974983 2 0.6887 0.826 0.184 0.816
#> SRR1974982 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974981 2 0.7883 0.788 0.236 0.764
#> SRR1974980 2 0.7453 0.810 0.212 0.788
#> SRR1974979 2 0.7139 0.819 0.196 0.804
#> SRR1974978 2 0.7602 0.802 0.220 0.780
#> SRR1974977 2 0.7602 0.803 0.220 0.780
#> SRR1974976 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974975 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974974 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974973 2 0.6887 0.827 0.184 0.816
#> SRR1974972 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974971 2 0.6048 0.840 0.148 0.852
#> SRR1974970 2 0.7299 0.815 0.204 0.796
#> SRR1974969 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974968 2 0.7139 0.820 0.196 0.804
#> SRR1974967 2 0.7299 0.815 0.204 0.796
#> SRR1974965 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974966 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974964 2 0.7056 0.823 0.192 0.808
#> SRR1974963 2 0.7056 0.823 0.192 0.808
#> SRR1974961 2 0.7139 0.821 0.196 0.804
#> SRR1974962 2 0.6973 0.824 0.188 0.812
#> SRR1974960 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974959 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974958 2 0.7056 0.823 0.192 0.808
#> SRR1974957 2 0.7139 0.819 0.196 0.804
#> SRR1974956 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974955 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974954 2 0.7299 0.815 0.204 0.796
#> SRR1974953 2 0.6801 0.829 0.180 0.820
#> SRR1974952 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974949 2 0.7139 0.821 0.196 0.804
#> SRR1974950 2 0.7139 0.819 0.196 0.804
#> SRR1974951 2 0.7056 0.823 0.192 0.808
#> SRR1974947 2 0.7139 0.819 0.196 0.804
#> SRR1974948 2 0.6887 0.826 0.184 0.816
#> SRR1974946 2 0.6438 0.835 0.164 0.836
#> SRR1974945 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974944 2 0.7883 0.788 0.236 0.764
#> SRR1974942 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974943 2 0.6973 0.827 0.188 0.812
#> SRR1974941 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974940 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974939 2 0.6973 0.827 0.188 0.812
#> SRR1974938 2 0.7299 0.815 0.204 0.796
#> SRR1974937 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974936 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974935 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974934 2 0.6887 0.827 0.184 0.816
#> SRR1974933 2 0.6887 0.827 0.184 0.816
#> SRR1974932 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974931 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974930 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974929 2 0.7453 0.810 0.212 0.788
#> SRR1974928 2 0.6887 0.826 0.184 0.816
#> SRR1974927 2 0.7299 0.815 0.204 0.796
#> SRR1974924 2 0.7883 0.788 0.236 0.764
#> SRR1974925 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974926 2 0.8713 0.717 0.292 0.708
#> SRR1974923 2 0.7453 0.811 0.212 0.788
#> SRR1974922 2 0.7139 0.821 0.196 0.804
#> SRR1974921 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974920 2 0.7745 0.795 0.228 0.772
#> SRR1974919 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974918 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974917 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974916 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974915 2 0.7376 0.812 0.208 0.792
#> SRR1974914 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974913 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974911 2 0.7602 0.803 0.220 0.780
#> SRR1974910 2 0.7674 0.799 0.224 0.776
#> SRR1974908 2 0.6887 0.826 0.184 0.816
#> SRR1974909 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974906 2 0.6623 0.834 0.172 0.828
#> SRR1974907 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974905 2 0.7528 0.806 0.216 0.784
#> SRR1974904 2 0.6973 0.825 0.188 0.812
#> SRR1974903 2 0.7219 0.818 0.200 0.800
#> SRR1974902 2 0.6973 0.826 0.188 0.812
#> SRR1974901 2 0.7453 0.809 0.212 0.788
#> SRR1974898 2 0.6531 0.834 0.168 0.832
#> SRR1974900 2 0.6247 0.838 0.156 0.844
#> SRR1974899 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974897 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974896 2 0.2603 0.862 0.044 0.956
#> SRR1974893 2 0.7056 0.823 0.192 0.808
#> SRR1974895 2 0.6531 0.834 0.168 0.832
#> SRR1974894 2 0.2423 0.862 0.040 0.960
#> SRR1974892 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974890 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974891 2 0.2043 0.863 0.032 0.968
#> SRR1974889 2 0.6712 0.830 0.176 0.824
#> SRR1974888 2 0.4298 0.855 0.088 0.912
#> SRR1974886 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974887 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974885 2 0.1843 0.862 0.028 0.972
#> SRR1974883 2 0.3584 0.858 0.068 0.932
#> SRR1974884 2 0.6801 0.828 0.180 0.820
#> SRR1974881 2 0.2236 0.862 0.036 0.964
#> SRR1974882 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974880 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974879 2 0.4161 0.856 0.084 0.916
#> SRR1974877 2 0.6247 0.837 0.156 0.844
#> SRR1974876 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974878 2 0.1184 0.863 0.016 0.984
#> SRR1974875 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974874 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974873 2 0.2423 0.845 0.040 0.960
#> SRR1974871 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974872 2 0.7883 0.739 0.236 0.764
#> SRR1974869 2 0.7602 0.765 0.220 0.780
#> SRR1974868 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974870 2 0.7674 0.757 0.224 0.776
#> SRR1974866 2 0.8081 0.721 0.248 0.752
#> SRR1974867 1 0.4815 0.856 0.896 0.104
#> SRR1974865 2 0.2043 0.850 0.032 0.968
#> SRR1974864 2 0.9491 0.476 0.368 0.632
#> SRR1974862 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974863 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1974860 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974861 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974859 2 0.2423 0.845 0.040 0.960
#> SRR1974858 2 0.2043 0.859 0.032 0.968
#> SRR1974856 2 0.2423 0.846 0.040 0.960
#> SRR1974857 2 0.2043 0.859 0.032 0.968
#> SRR1974855 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974854 1 0.2603 0.867 0.956 0.044
#> SRR1974853 1 0.3114 0.868 0.944 0.056
#> SRR1974851 2 0.1414 0.857 0.020 0.980
#> SRR1974852 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974849 1 0.3584 0.866 0.932 0.068
#> SRR1974848 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974850 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974846 2 0.2603 0.845 0.044 0.956
#> SRR1974847 1 0.9944 0.245 0.544 0.456
#> SRR1974845 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974844 1 0.2778 0.868 0.952 0.048
#> SRR1974843 2 0.8861 0.636 0.304 0.696
#> SRR1974842 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974841 1 0.2603 0.867 0.956 0.044
#> SRR1974840 2 0.2603 0.845 0.044 0.956
#> SRR1974839 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974838 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974837 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974835 1 0.3584 0.867 0.932 0.068
#> SRR1974836 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974834 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974833 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974831 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974832 1 0.2603 0.867 0.956 0.044
#> SRR1974830 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974829 1 0.7056 0.803 0.808 0.192
#> SRR1974828 1 0.2778 0.867 0.952 0.048
#> SRR1974826 2 0.0938 0.861 0.012 0.988
#> SRR1974827 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974824 1 0.4939 0.852 0.892 0.108
#> SRR1974825 1 0.9866 0.335 0.568 0.432
#> SRR1974822 1 0.8207 0.733 0.744 0.256
#> SRR1974823 1 0.9944 0.238 0.544 0.456
#> SRR1974820 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974818 1 0.2423 0.867 0.960 0.040
#> SRR1974819 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974817 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974816 2 0.4161 0.852 0.084 0.916
#> SRR1974815 1 0.3114 0.868 0.944 0.056
#> SRR1974813 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974814 2 0.3274 0.838 0.060 0.940
#> SRR1974812 2 0.8813 0.409 0.300 0.700
#> SRR1974810 1 0.8327 0.743 0.736 0.264
#> SRR1974808 2 0.7602 0.763 0.220 0.780
#> SRR1974811 1 0.7453 0.798 0.788 0.212
#> SRR1974809 1 0.8909 0.637 0.692 0.308
#> SRR1974807 1 0.7602 0.778 0.780 0.220
#> SRR1974806 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974805 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974804 2 0.0938 0.859 0.012 0.988
#> SRR1974803 1 0.8081 0.749 0.752 0.248
#> SRR1974801 1 0.3431 0.867 0.936 0.064
#> SRR1974800 2 0.7883 0.739 0.236 0.764
#> SRR1974799 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974798 2 0.1414 0.862 0.020 0.980
#> SRR1974797 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974796 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974795 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974793 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974794 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974792 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974791 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974790 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974789 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974788 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974786 2 0.7950 0.735 0.240 0.760
#> SRR1974787 2 0.8327 0.710 0.264 0.736
#> SRR1974784 2 0.0000 0.858 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.7139 0.792 0.804 0.196
#> SRR1974785 2 0.8955 0.651 0.312 0.688
#> SRR1974782 1 0.7299 0.785 0.796 0.204
#> SRR1974781 2 0.1414 0.862 0.020 0.980
#> SRR1974780 2 0.5178 0.832 0.116 0.884
#> SRR1974779 1 0.4161 0.859 0.916 0.084
#> SRR1974777 1 0.4298 0.859 0.912 0.088
#> SRR1974776 2 0.7950 0.734 0.240 0.760
#> SRR1974778 2 0.9833 0.314 0.424 0.576
#> SRR1974774 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974773 1 0.9491 0.527 0.632 0.368
#> SRR1974775 1 0.7602 0.775 0.780 0.220
#> SRR1974772 1 0.2423 0.867 0.960 0.040
#> SRR1974771 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974770 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974769 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974768 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974767 2 0.7745 0.753 0.228 0.772
#> SRR1974766 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974765 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974764 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974763 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974762 1 0.8144 0.733 0.748 0.252
#> SRR1974761 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974760 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974759 1 0.3114 0.868 0.944 0.056
#> SRR1974758 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974757 2 0.0000 0.858 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974754 2 0.2423 0.845 0.040 0.960
#> SRR1974755 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974753 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974751 2 0.3733 0.832 0.072 0.928
#> SRR1974750 2 0.3114 0.841 0.056 0.944
#> SRR1974752 1 0.5178 0.849 0.884 0.116
#> SRR1974749 2 0.4939 0.822 0.108 0.892
#> SRR1974747 1 0.5519 0.795 0.872 0.128
#> SRR1974748 1 0.8144 0.712 0.748 0.252
#> SRR1974746 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974744 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974745 2 0.3114 0.841 0.056 0.944
#> SRR1974743 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974742 1 0.4815 0.845 0.896 0.104
#> SRR1974740 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974739 2 0.2948 0.842 0.052 0.948
#> SRR1974741 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974738 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974737 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974736 2 0.2948 0.842 0.052 0.948
#> SRR1974735 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974734 2 0.6887 0.761 0.184 0.816
#> SRR1974733 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974732 2 0.7528 0.677 0.216 0.784
#> SRR1974731 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974729 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974730 1 0.7376 0.787 0.792 0.208
#> SRR1974728 2 0.2603 0.845 0.044 0.956
#> SRR1974725 2 0.7453 0.704 0.212 0.788
#> SRR1974726 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974724 1 0.2603 0.865 0.956 0.044
#> SRR1974727 2 0.7376 0.777 0.208 0.792
#> SRR1974723 2 0.2603 0.845 0.044 0.956
#> SRR1974722 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974721 2 0.2043 0.850 0.032 0.968
#> SRR1974720 2 0.2778 0.846 0.048 0.952
#> SRR1974719 1 0.9988 0.154 0.520 0.480
#> SRR1974718 1 0.7299 0.789 0.796 0.204
#> SRR1974716 2 0.8207 0.716 0.256 0.744
#> SRR1974717 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974715 2 0.2778 0.843 0.048 0.952
#> SRR1974713 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974714 1 0.9963 0.187 0.536 0.464
#> SRR1974711 2 0.7950 0.739 0.240 0.760
#> SRR1974712 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974709 1 0.3431 0.865 0.936 0.064
#> SRR1974708 2 0.7815 0.748 0.232 0.768
#> SRR1974710 2 0.7602 0.764 0.220 0.780
#> SRR1974707 2 0.8909 0.618 0.308 0.692
#> SRR1974706 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974704 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974705 1 0.2778 0.868 0.952 0.048
#> SRR1974703 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974702 2 0.7950 0.749 0.240 0.760
#> SRR1974701 2 0.2948 0.842 0.052 0.948
#> SRR1974699 2 0.2043 0.850 0.032 0.968
#> SRR1974698 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974700 1 0.2423 0.866 0.960 0.040
#> SRR1974697 1 0.9000 0.630 0.684 0.316
#> SRR1974696 2 0.4815 0.824 0.104 0.896
#> SRR1974694 1 0.5737 0.790 0.864 0.136
#> SRR1974695 2 0.8713 0.658 0.292 0.708
#> SRR1974693 2 0.2603 0.845 0.044 0.956
#> SRR1974692 2 0.2423 0.845 0.040 0.960
#> SRR1974690 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974691 1 0.5519 0.793 0.872 0.128
#> SRR1974689 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974688 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974687 1 0.5519 0.793 0.872 0.128
#> SRR1974686 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974685 1 0.5842 0.787 0.860 0.140
#> SRR1974684 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974683 1 0.7815 0.735 0.768 0.232
#> SRR1974682 2 0.5294 0.790 0.120 0.880
#> SRR1974681 1 0.2603 0.868 0.956 0.044
#> SRR1974679 2 0.3114 0.840 0.056 0.944
#> SRR1974680 1 0.6623 0.820 0.828 0.172
#> SRR1974678 2 0.3584 0.834 0.068 0.932
#> SRR1974677 1 0.2603 0.867 0.956 0.044
#> SRR1974676 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974675 2 0.6712 0.829 0.176 0.824
#> SRR1974674 1 0.2423 0.867 0.960 0.040
#> SRR1974673 2 0.7219 0.800 0.200 0.800
#> SRR1974671 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974672 2 0.2043 0.859 0.032 0.968
#> SRR1974670 2 0.2236 0.853 0.036 0.964
#> SRR1974669 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974667 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974668 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974666 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974664 2 0.2043 0.855 0.032 0.968
#> SRR1974665 2 0.1414 0.863 0.020 0.980
#> SRR1974663 2 0.8081 0.734 0.248 0.752
#> SRR1974662 1 0.2423 0.867 0.960 0.040
#> SRR1974661 2 0.8909 0.616 0.308 0.692
#> SRR1974660 1 0.7883 0.736 0.764 0.236
#> SRR1974659 1 0.3879 0.864 0.924 0.076
#> SRR1974658 1 0.3879 0.865 0.924 0.076
#> SRR1974657 1 0.9815 0.356 0.580 0.420
#> SRR1974654 1 0.5946 0.836 0.856 0.144
#> SRR1974655 1 0.9866 0.294 0.568 0.432
#> SRR1974656 1 0.9795 0.354 0.584 0.416
#> SRR1974650 2 0.8327 0.693 0.264 0.736
#> SRR1974651 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974652 2 0.8861 0.640 0.304 0.696
#> SRR1974653 2 0.2423 0.845 0.040 0.960
#> SRR1974648 1 0.7376 0.775 0.792 0.208
#> SRR1974646 2 0.7602 0.760 0.220 0.780
#> SRR1974649 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974647 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974645 1 0.2948 0.868 0.948 0.052
#> SRR1974644 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974643 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974642 2 0.8713 0.655 0.292 0.708
#> SRR1974640 2 0.9933 0.189 0.452 0.548
#> SRR1974641 2 0.2236 0.848 0.036 0.964
#> SRR1974639 1 0.3274 0.868 0.940 0.060
#> SRR1974638 1 0.8955 0.632 0.688 0.312
#> SRR1974635 1 0.3879 0.866 0.924 0.076
#> SRR1974636 2 0.8661 0.674 0.288 0.712
#> SRR1974634 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974637 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974633 1 0.9881 0.291 0.564 0.436
#> SRR1974632 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974631 2 0.9881 0.224 0.436 0.564
#> SRR1974630 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974629 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974628 1 0.4022 0.864 0.920 0.080
#> SRR1974627 1 0.9358 0.560 0.648 0.352
#> SRR1974624 1 0.3274 0.868 0.940 0.060
#> SRR1974625 2 0.6438 0.835 0.164 0.836
#> SRR1974623 2 0.8555 0.668 0.280 0.720
#> SRR1974622 1 0.8081 0.724 0.752 0.248
#> SRR1974620 2 0.9209 0.554 0.336 0.664
#> SRR1974619 2 0.8661 0.670 0.288 0.712
#> SRR1974621 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974617 1 0.3584 0.866 0.932 0.068
#> SRR1974616 2 0.8813 0.409 0.300 0.700
#> SRR1974615 1 0.8813 0.633 0.700 0.300
#> SRR1974618 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974614 2 0.7745 0.757 0.228 0.772
#> SRR1974613 2 0.9909 0.191 0.444 0.556
#> SRR1974612 1 0.9129 0.601 0.672 0.328
#> SRR1974611 2 0.8443 0.687 0.272 0.728
#> SRR1974610 2 0.2236 0.846 0.036 0.964
#> SRR1974609 1 0.4562 0.857 0.904 0.096
#> SRR1974608 1 0.6531 0.780 0.832 0.168
#> SRR1974607 1 0.9993 0.115 0.516 0.484
#> SRR1974606 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974605 2 0.9850 0.157 0.428 0.572
#> SRR1974604 2 0.2423 0.846 0.040 0.960
#> SRR1974603 2 0.7883 0.749 0.236 0.764
#> SRR1974602 1 0.2236 0.866 0.964 0.036
#> SRR1974600 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974601 2 0.7674 0.755 0.224 0.776
#> SRR1974599 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974598 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974596 2 0.0938 0.861 0.012 0.988
#> SRR1974594 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974593 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974595 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974592 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974591 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974588 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974590 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974589 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974587 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974586 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974585 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974584 1 0.3274 0.868 0.940 0.060
#> SRR1974583 2 0.1184 0.862 0.016 0.984
#> SRR1974582 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974581 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974580 2 0.0938 0.861 0.012 0.988
#> SRR1974578 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974577 2 0.1843 0.862 0.028 0.972
#> SRR1974579 2 0.0672 0.860 0.008 0.992
#> SRR1974576 2 0.0938 0.861 0.012 0.988
#> SRR1974575 2 0.0938 0.862 0.012 0.988
#> SRR1974574 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974573 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974571 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974572 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974570 2 0.7528 0.767 0.216 0.784
#> SRR1974568 1 0.9044 0.598 0.680 0.320
#> SRR1974567 1 0.5408 0.843 0.876 0.124
#> SRR1974566 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974569 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974565 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974564 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974560 1 1.0000 0.011 0.504 0.496
#> SRR1974559 1 0.5408 0.843 0.876 0.124
#> SRR1974563 2 0.0672 0.861 0.008 0.992
#> SRR1974562 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974561 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974557 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1974553 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974555 1 0.2423 0.867 0.960 0.040
#> SRR1974551 1 0.7056 0.804 0.808 0.192
#> SRR1974552 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974554 1 0.7139 0.785 0.804 0.196
#> SRR1974558 1 0.6247 0.818 0.844 0.156
#> SRR1974556 1 0.6343 0.822 0.840 0.160
#> SRR1974550 2 0.9087 0.576 0.324 0.676
#> SRR1974549 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974548 2 0.0672 0.859 0.008 0.992
#> SRR1974547 2 0.9833 0.292 0.424 0.576
#> SRR1974546 2 0.9129 0.570 0.328 0.672
#> SRR1974545 2 0.0376 0.859 0.004 0.996
#> SRR1974544 1 0.9491 0.516 0.632 0.368
#> SRR1974543 2 0.0672 0.859 0.008 0.992
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.1170 0.7978 0.016 0.008 0.976
#> SRR1975008 3 0.2066 0.8156 0.000 0.060 0.940
#> SRR1975006 3 0.2356 0.8126 0.000 0.072 0.928
#> SRR1975005 3 0.1860 0.8160 0.000 0.052 0.948
#> SRR1975004 3 0.1182 0.8038 0.012 0.012 0.976
#> SRR1975003 3 0.2066 0.8163 0.000 0.060 0.940
#> SRR1975001 3 0.2682 0.8099 0.004 0.076 0.920
#> SRR1975002 3 0.2356 0.8127 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974999 3 0.2866 0.8106 0.008 0.076 0.916
#> SRR1975000 3 0.1337 0.8037 0.012 0.016 0.972
#> SRR1974998 3 0.0829 0.7979 0.012 0.004 0.984
#> SRR1974997 2 0.3573 0.8310 0.004 0.876 0.120
#> SRR1974995 3 0.1860 0.8163 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974996 3 0.0983 0.7943 0.016 0.004 0.980
#> SRR1974994 3 0.1950 0.7792 0.040 0.008 0.952
#> SRR1974993 3 0.2356 0.8122 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974992 3 0.2356 0.8127 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974990 3 0.1170 0.7978 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974989 2 0.4465 0.7872 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974991 3 0.1860 0.8172 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974986 3 0.1015 0.8061 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974987 3 0.2261 0.8138 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974988 3 0.6442 0.2154 0.004 0.432 0.564
#> SRR1974984 3 0.2590 0.8122 0.004 0.072 0.924
#> SRR1974985 3 0.1636 0.8056 0.016 0.020 0.964
#> SRR1974983 3 0.2165 0.8146 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974982 3 0.1015 0.8060 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974981 3 0.1711 0.7824 0.032 0.008 0.960
#> SRR1974980 3 0.1491 0.8023 0.016 0.016 0.968
#> SRR1974979 3 0.2301 0.8164 0.004 0.060 0.936
#> SRR1974978 3 0.1170 0.7978 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974977 3 0.1337 0.7937 0.016 0.012 0.972
#> SRR1974976 3 0.2356 0.8124 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974975 3 0.1643 0.8163 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974974 3 0.2356 0.8124 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974973 3 0.2356 0.8130 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974972 3 0.1878 0.8162 0.004 0.044 0.952
#> SRR1974971 3 0.4139 0.7673 0.016 0.124 0.860
#> SRR1974970 3 0.1129 0.8106 0.004 0.020 0.976
#> SRR1974969 3 0.2096 0.8163 0.004 0.052 0.944
#> SRR1974968 3 0.1753 0.8163 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974967 3 0.1525 0.8141 0.004 0.032 0.964
#> SRR1974965 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974966 3 0.1647 0.8146 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974964 3 0.1964 0.8164 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974963 3 0.1643 0.8165 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974961 3 0.2096 0.8168 0.004 0.052 0.944
#> SRR1974962 3 0.2165 0.8150 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974960 3 0.0892 0.8119 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974959 3 0.1315 0.8094 0.008 0.020 0.972
#> SRR1974958 3 0.1964 0.8166 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974957 3 0.1643 0.8163 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974956 3 0.1529 0.8160 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974955 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974954 3 0.1525 0.8139 0.004 0.032 0.964
#> SRR1974953 3 0.2945 0.8071 0.004 0.088 0.908
#> SRR1974952 3 0.1832 0.8139 0.008 0.036 0.956
#> SRR1974949 3 0.1753 0.8170 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974950 3 0.1964 0.8163 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974951 3 0.1964 0.8168 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974947 3 0.1989 0.8166 0.004 0.048 0.948
#> SRR1974948 3 0.2165 0.8148 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974946 3 0.3129 0.8007 0.008 0.088 0.904
#> SRR1974945 3 0.1015 0.8053 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974944 3 0.1711 0.7824 0.032 0.008 0.960
#> SRR1974942 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974943 3 0.2200 0.8156 0.004 0.056 0.940
#> SRR1974941 3 0.1015 0.8020 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974940 3 0.0983 0.8093 0.004 0.016 0.980
#> SRR1974939 3 0.2860 0.8058 0.004 0.084 0.912
#> SRR1974938 3 0.1453 0.8099 0.008 0.024 0.968
#> SRR1974937 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974936 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974935 3 0.0848 0.8031 0.008 0.008 0.984
#> SRR1974934 3 0.2537 0.8090 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974933 3 0.2066 0.8164 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974932 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974931 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974930 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974929 3 0.1182 0.8025 0.012 0.012 0.976
#> SRR1974928 3 0.2261 0.8137 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974927 3 0.0829 0.8074 0.004 0.012 0.984
#> SRR1974924 3 0.1585 0.7865 0.028 0.008 0.964
#> SRR1974925 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974926 3 0.3670 0.7386 0.092 0.020 0.888
#> SRR1974923 3 0.1919 0.7990 0.020 0.024 0.956
#> SRR1974922 3 0.1031 0.8128 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974921 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974920 3 0.1315 0.7901 0.020 0.008 0.972
#> SRR1974919 3 0.1182 0.8035 0.012 0.012 0.976
#> SRR1974918 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974917 3 0.2448 0.8107 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974916 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974915 3 0.1170 0.8073 0.008 0.016 0.976
#> SRR1974914 2 0.4521 0.7830 0.004 0.816 0.180
#> SRR1974913 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974911 3 0.1337 0.7943 0.016 0.012 0.972
#> SRR1974910 3 0.1170 0.7924 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974908 3 0.2261 0.8137 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974909 3 0.1015 0.8056 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974906 3 0.3500 0.7842 0.004 0.116 0.880
#> SRR1974907 3 0.1399 0.8127 0.004 0.028 0.968
#> SRR1974905 3 0.1015 0.8011 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974904 3 0.1860 0.8170 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974903 3 0.1129 0.8108 0.004 0.020 0.976
#> SRR1974902 3 0.2261 0.8143 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974901 3 0.0848 0.8031 0.008 0.008 0.984
#> SRR1974898 3 0.3482 0.7724 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974900 3 0.6104 0.4213 0.004 0.348 0.648
#> SRR1974899 3 0.2356 0.8124 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974897 3 0.2356 0.8124 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974896 2 0.6505 0.1579 0.004 0.528 0.468
#> SRR1974893 3 0.2261 0.8137 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974895 3 0.3425 0.7852 0.004 0.112 0.884
#> SRR1974894 2 0.5754 0.6218 0.004 0.700 0.296
#> SRR1974892 2 0.4465 0.7873 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974890 2 0.4465 0.7873 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974891 2 0.5623 0.6424 0.004 0.716 0.280
#> SRR1974889 3 0.2448 0.8106 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974888 3 0.6410 0.2388 0.004 0.420 0.576
#> SRR1974886 2 0.4784 0.7633 0.004 0.796 0.200
#> SRR1974887 2 0.4413 0.8023 0.008 0.832 0.160
#> SRR1974885 2 0.4782 0.7961 0.016 0.820 0.164
#> SRR1974883 2 0.6280 0.1902 0.000 0.540 0.460
#> SRR1974884 3 0.2356 0.8124 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974881 2 0.6148 0.4831 0.004 0.640 0.356
#> SRR1974882 2 0.5201 0.7115 0.004 0.760 0.236
#> SRR1974880 2 0.5553 0.6568 0.004 0.724 0.272
#> SRR1974879 3 0.6244 0.1854 0.000 0.440 0.560
#> SRR1974877 3 0.3377 0.7959 0.012 0.092 0.896
#> SRR1974876 2 0.4575 0.7790 0.004 0.812 0.184
#> SRR1974878 2 0.4883 0.7494 0.004 0.788 0.208
#> SRR1974875 2 0.4413 0.8016 0.008 0.832 0.160
#> SRR1974874 2 0.3359 0.8267 0.084 0.900 0.016
#> SRR1974873 2 0.2711 0.8191 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974871 2 0.3325 0.8318 0.076 0.904 0.020
#> SRR1974872 2 0.9434 -0.0761 0.176 0.416 0.408
#> SRR1974869 3 0.9181 0.1281 0.148 0.404 0.448
#> SRR1974868 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974870 3 0.9336 0.0893 0.164 0.412 0.424
#> SRR1974866 3 0.9549 0.1071 0.192 0.396 0.412
#> SRR1974867 1 0.4609 0.8297 0.844 0.028 0.128
#> SRR1974865 2 0.3875 0.8347 0.068 0.888 0.044
#> SRR1974864 3 0.9989 0.0140 0.320 0.324 0.356
#> SRR1974862 2 0.3765 0.8278 0.084 0.888 0.028
#> SRR1974863 2 0.3692 0.8414 0.048 0.896 0.056
#> SRR1974860 2 0.4233 0.8060 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974861 2 0.4465 0.7928 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974859 2 0.2711 0.8191 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974858 2 0.3694 0.8395 0.052 0.896 0.052
#> SRR1974856 2 0.2945 0.8223 0.088 0.908 0.004
#> SRR1974857 2 0.3694 0.8395 0.052 0.896 0.052
#> SRR1974855 2 0.1950 0.8497 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974854 1 0.2625 0.8413 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974853 1 0.3193 0.8410 0.896 0.004 0.100
#> SRR1974851 2 0.2056 0.8456 0.024 0.952 0.024
#> SRR1974852 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974849 1 0.3771 0.8387 0.876 0.012 0.112
#> SRR1974848 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974850 2 0.1765 0.8487 0.004 0.956 0.040
#> SRR1974846 2 0.2796 0.8185 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974847 1 0.9424 0.4391 0.504 0.228 0.268
#> SRR1974845 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974844 1 0.3129 0.8424 0.904 0.008 0.088
#> SRR1974843 3 0.9823 0.1348 0.244 0.364 0.392
#> SRR1974842 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974841 1 0.2945 0.8421 0.908 0.004 0.088
#> SRR1974840 2 0.2878 0.8177 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974839 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974838 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974837 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974835 1 0.3573 0.8369 0.876 0.004 0.120
#> SRR1974836 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974834 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974833 2 0.1585 0.8474 0.008 0.964 0.028
#> SRR1974831 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974832 1 0.2860 0.8416 0.912 0.004 0.084
#> SRR1974830 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974829 1 0.6470 0.7730 0.760 0.148 0.092
#> SRR1974828 1 0.2711 0.8412 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974826 2 0.3784 0.8239 0.004 0.864 0.132
#> SRR1974827 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974824 1 0.4609 0.8300 0.844 0.028 0.128
#> SRR1974825 1 0.9385 0.4591 0.512 0.240 0.248
#> SRR1974822 1 0.7283 0.7350 0.708 0.176 0.116
#> SRR1974823 1 0.9598 0.3944 0.476 0.248 0.276
#> SRR1974820 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974818 1 0.2860 0.8415 0.912 0.004 0.084
#> SRR1974819 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974817 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974816 2 0.4379 0.8120 0.072 0.868 0.060
#> SRR1974815 1 0.3377 0.8422 0.896 0.012 0.092
#> SRR1974813 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974814 2 0.3607 0.8193 0.112 0.880 0.008
#> SRR1974812 2 0.6659 0.5054 0.304 0.668 0.028
#> SRR1974810 1 0.7136 0.7040 0.704 0.212 0.084
#> SRR1974808 3 0.9302 0.0808 0.160 0.416 0.424
#> SRR1974811 1 0.6573 0.7767 0.756 0.140 0.104
#> SRR1974809 1 0.8175 0.6549 0.632 0.132 0.236
#> SRR1974807 1 0.7058 0.7459 0.720 0.100 0.180
#> SRR1974806 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974805 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974804 2 0.1774 0.8463 0.016 0.960 0.024
#> SRR1974803 1 0.7108 0.7219 0.716 0.184 0.100
#> SRR1974801 1 0.3459 0.8420 0.892 0.012 0.096
#> SRR1974800 2 0.9434 -0.0761 0.176 0.416 0.408
#> SRR1974799 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974798 2 0.4465 0.7921 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974797 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974796 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974795 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974793 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974794 2 0.4293 0.8026 0.004 0.832 0.164
#> SRR1974792 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974791 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974790 2 0.1950 0.8481 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974789 2 0.4351 0.7999 0.004 0.828 0.168
#> SRR1974788 2 0.4233 0.8060 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974786 2 0.9492 -0.0641 0.184 0.416 0.400
#> SRR1974787 3 0.9626 0.1007 0.204 0.392 0.404
#> SRR1974784 2 0.3682 0.8301 0.008 0.876 0.116
#> SRR1974783 1 0.6239 0.7901 0.768 0.072 0.160
#> SRR1974785 3 0.9829 0.1571 0.248 0.352 0.400
#> SRR1974782 1 0.6458 0.7813 0.752 0.072 0.176
#> SRR1974781 2 0.3043 0.8422 0.008 0.908 0.084
#> SRR1974780 2 0.8043 0.4168 0.084 0.592 0.324
#> SRR1974779 1 0.3918 0.8280 0.856 0.004 0.140
#> SRR1974777 1 0.3983 0.8282 0.852 0.004 0.144
#> SRR1974776 2 0.9547 -0.0577 0.192 0.416 0.392
#> SRR1974778 1 0.9967 0.1239 0.364 0.296 0.340
#> SRR1974774 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974773 1 0.8853 0.5518 0.568 0.168 0.264
#> SRR1974775 1 0.6765 0.7502 0.724 0.068 0.208
#> SRR1974772 1 0.2711 0.8407 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974771 2 0.3983 0.8163 0.004 0.852 0.144
#> SRR1974770 2 0.4110 0.8109 0.004 0.844 0.152
#> SRR1974769 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974768 2 0.4110 0.8109 0.004 0.844 0.152
#> SRR1974767 3 0.9369 0.0978 0.168 0.408 0.424
#> SRR1974766 2 0.3983 0.8163 0.004 0.852 0.144
#> SRR1974765 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974764 2 0.4047 0.8136 0.004 0.848 0.148
#> SRR1974763 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974762 1 0.7304 0.7213 0.688 0.084 0.228
#> SRR1974761 2 0.4047 0.8136 0.004 0.848 0.148
#> SRR1974760 2 0.2063 0.8484 0.008 0.948 0.044
#> SRR1974759 1 0.3454 0.8405 0.888 0.008 0.104
#> SRR1974758 2 0.4110 0.8109 0.004 0.844 0.152
#> SRR1974757 2 0.3043 0.8418 0.008 0.908 0.084
#> SRR1974756 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974754 2 0.2711 0.8191 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974755 2 0.4110 0.8109 0.004 0.844 0.152
#> SRR1974753 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974751 2 0.3412 0.8063 0.124 0.876 0.000
#> SRR1974750 2 0.3116 0.8128 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974752 1 0.4960 0.8289 0.832 0.040 0.128
#> SRR1974749 2 0.7801 0.5300 0.088 0.636 0.276
#> SRR1974747 1 0.3031 0.7616 0.912 0.076 0.012
#> SRR1974748 1 0.7613 0.7146 0.680 0.116 0.204
#> SRR1974746 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974744 2 0.3359 0.8266 0.084 0.900 0.016
#> SRR1974745 2 0.3116 0.8141 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974743 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974742 1 0.3589 0.8111 0.900 0.052 0.048
#> SRR1974740 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974739 2 0.3038 0.8140 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974741 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974738 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974737 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974736 2 0.3038 0.8145 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974735 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974734 2 0.9156 0.4005 0.204 0.540 0.256
#> SRR1974733 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974732 2 0.5291 0.6545 0.268 0.732 0.000
#> SRR1974731 2 0.2625 0.8203 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974729 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974730 1 0.6595 0.7745 0.744 0.076 0.180
#> SRR1974728 2 0.2796 0.8185 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974725 2 0.7851 0.5776 0.256 0.644 0.100
#> SRR1974726 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974724 1 0.3043 0.8420 0.908 0.008 0.084
#> SRR1974727 3 0.9177 0.1408 0.148 0.400 0.452
#> SRR1974723 2 0.2878 0.8177 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974722 2 0.3043 0.8244 0.084 0.908 0.008
#> SRR1974721 2 0.3623 0.8340 0.072 0.896 0.032
#> SRR1974720 2 0.4586 0.8155 0.096 0.856 0.048
#> SRR1974719 1 0.9557 0.3913 0.484 0.248 0.268
#> SRR1974718 1 0.6562 0.7698 0.744 0.072 0.184
#> SRR1974716 2 0.9601 -0.0672 0.200 0.408 0.392
#> SRR1974717 2 0.3043 0.8244 0.084 0.908 0.008
#> SRR1974715 2 0.2959 0.8164 0.100 0.900 0.000
#> SRR1974713 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974714 1 0.9588 0.3443 0.460 0.216 0.324
#> SRR1974711 3 0.9457 0.1345 0.180 0.392 0.428
#> SRR1974712 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974709 1 0.3340 0.8358 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974708 3 0.9402 0.0874 0.172 0.412 0.416
#> SRR1974710 2 0.9336 -0.0752 0.164 0.420 0.416
#> SRR1974707 2 0.9870 -0.1081 0.256 0.380 0.364
#> SRR1974706 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974704 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974705 1 0.2878 0.8409 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974703 2 0.3207 0.8266 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974702 3 0.9402 0.0844 0.172 0.408 0.420
#> SRR1974701 2 0.3038 0.8140 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974699 2 0.3276 0.8331 0.068 0.908 0.024
#> SRR1974698 2 0.3043 0.8244 0.084 0.908 0.008
#> SRR1974700 1 0.2537 0.8397 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974697 1 0.8179 0.6604 0.640 0.152 0.208
#> SRR1974696 2 0.8137 0.5935 0.140 0.640 0.220
#> SRR1974694 1 0.3207 0.7578 0.904 0.084 0.012
#> SRR1974695 3 0.9775 0.1198 0.232 0.376 0.392
#> SRR1974693 2 0.2878 0.8177 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974692 2 0.2711 0.8191 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974690 2 0.1950 0.8481 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974691 1 0.2774 0.7614 0.920 0.072 0.008
#> SRR1974689 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974688 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974687 1 0.2774 0.7614 0.920 0.072 0.008
#> SRR1974686 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974685 1 0.3129 0.7516 0.904 0.088 0.008
#> SRR1974684 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974683 1 0.4700 0.6823 0.812 0.180 0.008
#> SRR1974682 2 0.4178 0.7707 0.172 0.828 0.000
#> SRR1974681 1 0.2796 0.8410 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974679 2 0.3116 0.8124 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974680 1 0.6034 0.7995 0.780 0.068 0.152
#> SRR1974678 2 0.3500 0.8073 0.116 0.880 0.004
#> SRR1974677 1 0.2796 0.8407 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974676 2 0.4233 0.8062 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974675 3 0.2625 0.8070 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974674 1 0.2711 0.8411 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974673 3 0.8762 0.1601 0.112 0.404 0.484
#> SRR1974671 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974672 2 0.3797 0.8404 0.052 0.892 0.056
#> SRR1974670 2 0.3983 0.8338 0.068 0.884 0.048
#> SRR1974669 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974667 2 0.3983 0.8163 0.004 0.852 0.144
#> SRR1974668 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974666 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974664 2 0.3983 0.8337 0.068 0.884 0.048
#> SRR1974665 2 0.4233 0.8062 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974663 3 0.9431 0.1132 0.176 0.400 0.424
#> SRR1974662 1 0.2860 0.8411 0.912 0.004 0.084
#> SRR1974661 3 0.9840 0.1366 0.248 0.364 0.388
#> SRR1974660 1 0.7272 0.7368 0.700 0.096 0.204
#> SRR1974659 1 0.3412 0.8342 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974658 1 0.3573 0.8365 0.876 0.004 0.120
#> SRR1974657 1 0.9248 0.4733 0.516 0.188 0.296
#> SRR1974654 1 0.5467 0.8179 0.816 0.072 0.112
#> SRR1974655 1 0.9346 0.4607 0.516 0.224 0.260
#> SRR1974656 1 0.9198 0.4931 0.528 0.192 0.280
#> SRR1974650 2 0.9658 -0.0216 0.212 0.420 0.368
#> SRR1974651 2 0.2860 0.8225 0.084 0.912 0.004
#> SRR1974652 3 0.9792 0.1693 0.240 0.352 0.408
#> SRR1974653 2 0.2711 0.8191 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974648 1 0.6757 0.7683 0.736 0.084 0.180
#> SRR1974646 3 0.9300 0.0921 0.160 0.412 0.428
#> SRR1974649 1 0.2796 0.8403 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974647 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974645 1 0.3207 0.8421 0.904 0.012 0.084
#> SRR1974644 2 0.4110 0.8109 0.004 0.844 0.152
#> SRR1974643 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974642 3 0.9773 0.1343 0.232 0.372 0.396
#> SRR1974640 1 0.9901 0.1969 0.396 0.276 0.328
#> SRR1974641 2 0.3947 0.8291 0.076 0.884 0.040
#> SRR1974639 1 0.3295 0.8419 0.896 0.008 0.096
#> SRR1974638 1 0.8231 0.6500 0.628 0.136 0.236
#> SRR1974635 1 0.3845 0.8387 0.872 0.012 0.116
#> SRR1974636 3 0.9741 0.1694 0.228 0.360 0.412
#> SRR1974634 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974637 2 0.3502 0.8278 0.084 0.896 0.020
#> SRR1974633 1 0.9379 0.4376 0.504 0.208 0.288
#> SRR1974632 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974631 1 0.9918 0.1567 0.384 0.276 0.340
#> SRR1974630 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974629 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974628 1 0.4209 0.8361 0.860 0.020 0.120
#> SRR1974627 1 0.8681 0.6011 0.596 0.188 0.216
#> SRR1974624 1 0.3539 0.8419 0.888 0.012 0.100
#> SRR1974625 3 0.3644 0.7759 0.004 0.124 0.872
#> SRR1974623 2 0.9755 -0.0746 0.228 0.396 0.376
#> SRR1974622 1 0.7398 0.7349 0.700 0.120 0.180
#> SRR1974620 3 0.9888 0.1313 0.272 0.328 0.400
#> SRR1974619 3 0.9786 0.1412 0.236 0.364 0.400
#> SRR1974621 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974617 1 0.3587 0.8418 0.892 0.020 0.088
#> SRR1974616 2 0.6659 0.5054 0.304 0.668 0.028
#> SRR1974615 1 0.8113 0.6747 0.644 0.144 0.212
#> SRR1974618 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974614 3 0.9259 0.1192 0.156 0.404 0.440
#> SRR1974613 1 0.9924 0.1757 0.392 0.288 0.320
#> SRR1974612 1 0.8343 0.6324 0.612 0.132 0.256
#> SRR1974611 3 0.9674 0.0975 0.212 0.392 0.396
#> SRR1974610 2 0.3207 0.8258 0.084 0.904 0.012
#> SRR1974609 1 0.4469 0.8350 0.852 0.028 0.120
#> SRR1974608 1 0.3682 0.7350 0.876 0.116 0.008
#> SRR1974607 1 0.9602 0.3386 0.460 0.220 0.320
#> SRR1974606 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974605 1 0.9298 0.1531 0.460 0.376 0.164
#> SRR1974604 2 0.2945 0.8223 0.088 0.908 0.004
#> SRR1974603 2 0.9434 -0.0720 0.176 0.416 0.408
#> SRR1974602 1 0.2625 0.8406 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974600 2 0.3784 0.8234 0.004 0.864 0.132
#> SRR1974601 2 0.9300 -0.0497 0.160 0.428 0.412
#> SRR1974599 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974598 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974596 2 0.4047 0.8137 0.004 0.848 0.148
#> SRR1974594 2 0.1878 0.8490 0.004 0.952 0.044
#> SRR1974593 2 0.2400 0.8473 0.004 0.932 0.064
#> SRR1974595 2 0.1950 0.8481 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974592 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974591 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974588 2 0.1989 0.8488 0.004 0.948 0.048
#> SRR1974590 2 0.1950 0.8481 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974589 2 0.2400 0.8473 0.004 0.932 0.064
#> SRR1974587 2 0.1878 0.8492 0.004 0.952 0.044
#> SRR1974586 2 0.3715 0.8264 0.004 0.868 0.128
#> SRR1974585 2 0.1832 0.8490 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974584 1 0.3454 0.8413 0.888 0.008 0.104
#> SRR1974583 2 0.4645 0.7891 0.008 0.816 0.176
#> SRR1974582 2 0.4172 0.8082 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974581 2 0.4233 0.8051 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974580 2 0.2590 0.8466 0.004 0.924 0.072
#> SRR1974578 2 0.1765 0.8487 0.004 0.956 0.040
#> SRR1974577 2 0.5036 0.7895 0.020 0.808 0.172
#> SRR1974579 2 0.1878 0.8492 0.004 0.952 0.044
#> SRR1974576 2 0.4047 0.8144 0.004 0.848 0.148
#> SRR1974575 2 0.4233 0.8048 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974574 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974573 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974571 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974572 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974570 3 0.9265 0.0849 0.156 0.416 0.428
#> SRR1974568 1 0.8117 0.6685 0.636 0.128 0.236
#> SRR1974567 1 0.4915 0.8260 0.832 0.036 0.132
#> SRR1974566 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974569 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974565 2 0.1832 0.8490 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974564 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974560 1 0.9653 0.3361 0.448 0.224 0.328
#> SRR1974559 1 0.4915 0.8260 0.832 0.036 0.132
#> SRR1974563 2 0.1999 0.8482 0.012 0.952 0.036
#> SRR1974562 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974561 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974557 2 0.4256 0.8368 0.036 0.868 0.096
#> SRR1974553 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974555 1 0.2711 0.8407 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974551 1 0.6291 0.7985 0.768 0.080 0.152
#> SRR1974552 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974554 1 0.6518 0.7841 0.752 0.080 0.168
#> SRR1974558 1 0.5730 0.8109 0.796 0.060 0.144
#> SRR1974556 1 0.5897 0.8056 0.792 0.076 0.132
#> SRR1974550 3 0.9888 0.1360 0.264 0.348 0.388
#> SRR1974549 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974548 2 0.3607 0.8315 0.008 0.880 0.112
#> SRR1974547 1 0.9971 0.0893 0.352 0.296 0.352
#> SRR1974546 3 0.9897 0.1360 0.268 0.344 0.388
#> SRR1974545 2 0.1832 0.8481 0.008 0.956 0.036
#> SRR1974544 1 0.8748 0.5832 0.584 0.172 0.244
#> SRR1974543 2 0.3771 0.8310 0.012 0.876 0.112
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.2281 0.8366 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1975008 3 0.2060 0.8588 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR1975006 3 0.2413 0.8489 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1975005 3 0.1635 0.8631 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1975004 3 0.2675 0.8386 0.000 0.008 0.892 0.100
#> SRR1975003 3 0.2142 0.8614 0.000 0.056 0.928 0.016
#> SRR1975001 3 0.3070 0.8319 0.016 0.068 0.896 0.020
#> SRR1975002 3 0.2489 0.8467 0.000 0.068 0.912 0.020
#> SRR1974999 3 0.2707 0.8462 0.008 0.068 0.908 0.016
#> SRR1975000 3 0.3048 0.8346 0.000 0.016 0.876 0.108
#> SRR1974998 3 0.2654 0.8293 0.000 0.004 0.888 0.108
#> SRR1974997 2 0.3548 0.6048 0.000 0.864 0.068 0.068
#> SRR1974995 3 0.2578 0.8677 0.000 0.052 0.912 0.036
#> SRR1974996 3 0.2589 0.8233 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974994 3 0.4365 0.7510 0.028 0.000 0.784 0.188
#> SRR1974993 3 0.2179 0.8557 0.000 0.064 0.924 0.012
#> SRR1974992 3 0.2300 0.8539 0.000 0.064 0.920 0.016
#> SRR1974990 3 0.2216 0.8389 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974989 2 0.4234 0.5514 0.000 0.816 0.132 0.052
#> SRR1974991 3 0.1635 0.8653 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1974986 3 0.2542 0.8501 0.000 0.012 0.904 0.084
#> SRR1974987 3 0.2179 0.8537 0.000 0.064 0.924 0.012
#> SRR1974988 3 0.6317 0.0767 0.008 0.412 0.536 0.044
#> SRR1974984 3 0.2489 0.8470 0.000 0.068 0.912 0.020
#> SRR1974985 3 0.2441 0.8525 0.004 0.012 0.916 0.068
#> SRR1974983 3 0.2222 0.8536 0.000 0.060 0.924 0.016
#> SRR1974982 3 0.2542 0.8499 0.000 0.012 0.904 0.084
#> SRR1974981 3 0.4054 0.7589 0.016 0.000 0.796 0.188
#> SRR1974980 3 0.2480 0.8451 0.000 0.008 0.904 0.088
#> SRR1974979 3 0.1975 0.8616 0.000 0.048 0.936 0.016
#> SRR1974978 3 0.2530 0.8232 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974977 3 0.3355 0.7913 0.000 0.004 0.836 0.160
#> SRR1974976 3 0.2413 0.8484 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1974975 3 0.1452 0.8648 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1974974 3 0.2413 0.8484 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1974973 3 0.2443 0.8499 0.000 0.060 0.916 0.024
#> SRR1974972 3 0.1452 0.8655 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1974971 3 0.4069 0.7562 0.020 0.116 0.840 0.024
#> SRR1974970 3 0.1297 0.8659 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1974969 3 0.2131 0.8640 0.000 0.036 0.932 0.032
#> SRR1974968 3 0.1635 0.8627 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1974967 3 0.1936 0.8668 0.000 0.028 0.940 0.032
#> SRR1974965 3 0.3400 0.7770 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974966 3 0.1356 0.8665 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1974964 3 0.1854 0.8618 0.000 0.048 0.940 0.012
#> SRR1974963 3 0.1635 0.8669 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1974961 3 0.1545 0.8658 0.000 0.040 0.952 0.008
#> SRR1974962 3 0.2256 0.8547 0.000 0.056 0.924 0.020
#> SRR1974960 3 0.1510 0.8673 0.000 0.028 0.956 0.016
#> SRR1974959 3 0.1610 0.8637 0.000 0.016 0.952 0.032
#> SRR1974958 3 0.1890 0.8601 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1974957 3 0.1452 0.8655 0.000 0.036 0.956 0.008
#> SRR1974956 3 0.1356 0.8652 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1974955 3 0.3444 0.7742 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974954 3 0.1724 0.8669 0.000 0.032 0.948 0.020
#> SRR1974953 3 0.2871 0.8363 0.000 0.072 0.896 0.032
#> SRR1974952 3 0.1109 0.8661 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1974949 3 0.1635 0.8648 0.000 0.044 0.948 0.008
#> SRR1974950 3 0.1854 0.8623 0.000 0.048 0.940 0.012
#> SRR1974951 3 0.1854 0.8627 0.000 0.048 0.940 0.012
#> SRR1974947 3 0.1677 0.8639 0.000 0.040 0.948 0.012
#> SRR1974948 3 0.2222 0.8548 0.000 0.060 0.924 0.016
#> SRR1974946 3 0.3572 0.7986 0.024 0.084 0.872 0.020
#> SRR1974945 3 0.1824 0.8531 0.000 0.004 0.936 0.060
#> SRR1974944 3 0.4012 0.7608 0.016 0.000 0.800 0.184
#> SRR1974942 3 0.3444 0.7742 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974943 3 0.2282 0.8597 0.000 0.052 0.924 0.024
#> SRR1974941 3 0.2401 0.8417 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR1974940 3 0.1888 0.8618 0.000 0.016 0.940 0.044
#> SRR1974939 3 0.2722 0.8431 0.000 0.064 0.904 0.032
#> SRR1974938 3 0.2002 0.8629 0.000 0.020 0.936 0.044
#> SRR1974937 3 0.3266 0.7857 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974936 3 0.3400 0.7767 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974935 3 0.2125 0.8492 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1974934 3 0.2563 0.8447 0.000 0.072 0.908 0.020
#> SRR1974933 3 0.1890 0.8615 0.000 0.056 0.936 0.008
#> SRR1974932 3 0.2053 0.8494 0.000 0.004 0.924 0.072
#> SRR1974931 3 0.3356 0.7799 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974930 3 0.3400 0.7767 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974929 3 0.2342 0.8469 0.000 0.008 0.912 0.080
#> SRR1974928 3 0.2335 0.8515 0.000 0.060 0.920 0.020
#> SRR1974927 3 0.1854 0.8595 0.000 0.012 0.940 0.048
#> SRR1974924 3 0.3937 0.7633 0.012 0.000 0.800 0.188
#> SRR1974925 3 0.3356 0.7801 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974926 3 0.5436 0.6955 0.060 0.004 0.724 0.212
#> SRR1974923 3 0.4114 0.7930 0.008 0.016 0.812 0.164
#> SRR1974922 3 0.1833 0.8675 0.000 0.032 0.944 0.024
#> SRR1974921 3 0.2125 0.8470 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1974920 3 0.3494 0.7800 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR1974919 3 0.2125 0.8470 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1974918 3 0.2053 0.8485 0.000 0.004 0.924 0.072
#> SRR1974917 3 0.2443 0.8482 0.000 0.060 0.916 0.024
#> SRR1974916 3 0.2125 0.8474 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR1974915 3 0.1545 0.8601 0.000 0.008 0.952 0.040
#> SRR1974914 2 0.4514 0.5479 0.000 0.800 0.136 0.064
#> SRR1974913 3 0.2197 0.8459 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1974911 3 0.3721 0.7789 0.004 0.004 0.816 0.176
#> SRR1974910 3 0.3356 0.7801 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974908 3 0.2256 0.8536 0.000 0.056 0.924 0.020
#> SRR1974909 3 0.1970 0.8553 0.000 0.008 0.932 0.060
#> SRR1974906 3 0.3556 0.7858 0.004 0.096 0.864 0.036
#> SRR1974907 3 0.2399 0.8645 0.000 0.032 0.920 0.048
#> SRR1974905 3 0.2266 0.8441 0.000 0.004 0.912 0.084
#> SRR1974904 3 0.1807 0.8625 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR1974903 3 0.1706 0.8633 0.000 0.016 0.948 0.036
#> SRR1974902 3 0.2466 0.8540 0.000 0.056 0.916 0.028
#> SRR1974901 3 0.1743 0.8542 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1974898 3 0.3404 0.7954 0.000 0.104 0.864 0.032
#> SRR1974900 3 0.5677 0.2866 0.000 0.332 0.628 0.040
#> SRR1974899 3 0.2413 0.8484 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1974897 3 0.2413 0.8484 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1974896 2 0.6265 0.0283 0.000 0.500 0.444 0.056
#> SRR1974893 3 0.2142 0.8589 0.000 0.056 0.928 0.016
#> SRR1974895 3 0.3787 0.7793 0.020 0.104 0.856 0.020
#> SRR1974894 2 0.5646 0.3643 0.000 0.672 0.272 0.056
#> SRR1974892 2 0.4462 0.5523 0.000 0.804 0.132 0.064
#> SRR1974890 2 0.4462 0.5523 0.000 0.804 0.132 0.064
#> SRR1974891 2 0.5520 0.3978 0.000 0.696 0.244 0.060
#> SRR1974889 3 0.2820 0.8389 0.008 0.068 0.904 0.020
#> SRR1974888 3 0.5856 0.1061 0.000 0.408 0.556 0.036
#> SRR1974886 2 0.4544 0.5236 0.000 0.788 0.164 0.048
#> SRR1974887 2 0.4535 0.5691 0.000 0.804 0.112 0.084
#> SRR1974885 2 0.4900 0.5576 0.004 0.788 0.116 0.092
#> SRR1974883 2 0.6130 0.0390 0.000 0.512 0.440 0.048
#> SRR1974884 3 0.2413 0.8484 0.000 0.064 0.916 0.020
#> SRR1974881 2 0.5866 0.2634 0.000 0.624 0.324 0.052
#> SRR1974882 2 0.5180 0.4675 0.000 0.740 0.196 0.064
#> SRR1974880 2 0.5417 0.4071 0.000 0.704 0.240 0.056
#> SRR1974879 3 0.5964 0.0517 0.000 0.424 0.536 0.040
#> SRR1974877 3 0.3864 0.7827 0.036 0.084 0.860 0.020
#> SRR1974876 2 0.4565 0.5450 0.000 0.796 0.140 0.064
#> SRR1974878 2 0.4849 0.5125 0.000 0.772 0.164 0.064
#> SRR1974875 2 0.4458 0.5672 0.000 0.808 0.116 0.076
#> SRR1974874 2 0.5110 0.5412 0.000 0.636 0.012 0.352
#> SRR1974873 2 0.4713 0.5351 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974871 2 0.5018 0.5504 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR1974872 2 0.9600 -0.7673 0.124 0.340 0.256 0.280
#> SRR1974869 2 0.9461 -0.7126 0.104 0.340 0.304 0.252
#> SRR1974868 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974870 2 0.9557 -0.7441 0.116 0.340 0.276 0.268
#> SRR1974866 2 0.9736 -0.8303 0.148 0.316 0.240 0.296
#> SRR1974867 1 0.3674 0.7428 0.868 0.020 0.028 0.084
#> SRR1974865 2 0.5389 0.5543 0.000 0.660 0.032 0.308
#> SRR1974864 1 0.9946 -0.7949 0.280 0.260 0.200 0.260
#> SRR1974862 2 0.5436 0.5360 0.000 0.620 0.024 0.356
#> SRR1974863 2 0.5172 0.5686 0.000 0.704 0.036 0.260
#> SRR1974860 2 0.3749 0.5473 0.000 0.840 0.128 0.032
#> SRR1974861 2 0.3958 0.5339 0.000 0.824 0.144 0.032
#> SRR1974859 2 0.4697 0.5373 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1974858 2 0.5256 0.5652 0.000 0.692 0.036 0.272
#> SRR1974856 2 0.4643 0.5436 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1974857 2 0.5282 0.5640 0.000 0.688 0.036 0.276
#> SRR1974855 2 0.2805 0.6164 0.000 0.888 0.012 0.100
#> SRR1974854 1 0.1109 0.7676 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974853 1 0.1661 0.7668 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1974851 2 0.3377 0.6040 0.012 0.848 0.000 0.140
#> SRR1974852 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974849 1 0.2966 0.7570 0.896 0.008 0.020 0.076
#> SRR1974848 1 0.0469 0.7655 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974850 2 0.2412 0.6205 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR1974846 2 0.4713 0.5354 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974847 1 0.9118 -0.2369 0.464 0.168 0.132 0.236
#> SRR1974845 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974844 1 0.1398 0.7679 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1974843 4 0.9927 0.8819 0.204 0.276 0.228 0.292
#> SRR1974842 1 0.0592 0.7672 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974841 1 0.0992 0.7688 0.976 0.004 0.008 0.012
#> SRR1974840 2 0.4746 0.5314 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1974839 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974838 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974837 1 0.0592 0.7652 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974835 1 0.2400 0.7620 0.924 0.004 0.028 0.044
#> SRR1974836 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974834 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974833 2 0.2773 0.6126 0.000 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974831 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974832 1 0.1209 0.7681 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1974830 1 0.0469 0.7655 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974829 1 0.4696 0.6545 0.796 0.136 0.004 0.064
#> SRR1974828 1 0.1396 0.7667 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR1974826 2 0.3873 0.5794 0.000 0.844 0.096 0.060
#> SRR1974827 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974824 1 0.3853 0.7324 0.848 0.016 0.020 0.116
#> SRR1974825 1 0.9176 -0.2667 0.452 0.176 0.128 0.244
#> SRR1974822 1 0.6366 0.5517 0.692 0.152 0.016 0.140
#> SRR1974823 1 0.9317 -0.3341 0.440 0.188 0.144 0.228
#> SRR1974820 1 0.0469 0.7655 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974818 1 0.0817 0.7683 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974819 1 0.0188 0.7654 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0469 0.7641 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974816 2 0.5059 0.5563 0.100 0.788 0.012 0.100
#> SRR1974815 1 0.2271 0.7659 0.928 0.008 0.012 0.052
#> SRR1974813 1 0.0188 0.7654 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974814 2 0.5026 0.5508 0.016 0.672 0.000 0.312
#> SRR1974812 2 0.5943 0.2001 0.280 0.656 0.004 0.060
#> SRR1974810 1 0.6728 0.4932 0.664 0.192 0.024 0.120
#> SRR1974808 2 0.9551 -0.7416 0.116 0.344 0.272 0.268
#> SRR1974811 1 0.6124 0.6241 0.716 0.112 0.020 0.152
#> SRR1974809 1 0.7718 0.3814 0.620 0.104 0.104 0.172
#> SRR1974807 1 0.6516 0.5750 0.716 0.088 0.076 0.120
#> SRR1974806 1 0.0592 0.7667 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974805 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974804 2 0.3157 0.6054 0.004 0.852 0.000 0.144
#> SRR1974803 1 0.6505 0.5394 0.684 0.164 0.020 0.132
#> SRR1974801 1 0.2010 0.7651 0.940 0.012 0.008 0.040
#> SRR1974800 2 0.9597 -0.7715 0.124 0.340 0.252 0.284
#> SRR1974799 1 0.0000 0.7652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3958 0.5326 0.000 0.824 0.144 0.032
#> SRR1974797 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974796 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974795 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974793 1 0.0469 0.7671 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974794 2 0.3803 0.5439 0.000 0.836 0.132 0.032
#> SRR1974792 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974791 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974790 2 0.1452 0.6144 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1974789 2 0.3856 0.5413 0.000 0.832 0.136 0.032
#> SRR1974788 2 0.3749 0.5473 0.000 0.840 0.128 0.032
#> SRR1974786 2 0.9716 -0.7864 0.148 0.340 0.248 0.264
#> SRR1974787 2 0.9821 -0.8437 0.164 0.308 0.248 0.280
#> SRR1974784 2 0.3243 0.5796 0.000 0.876 0.088 0.036
#> SRR1974783 1 0.5259 0.6693 0.768 0.032 0.036 0.164
#> SRR1974785 2 0.9988 -0.8464 0.244 0.272 0.232 0.252
#> SRR1974782 1 0.5522 0.6564 0.756 0.040 0.040 0.164
#> SRR1974781 2 0.2750 0.5979 0.004 0.908 0.056 0.032
#> SRR1974780 2 0.8254 -0.2475 0.056 0.536 0.204 0.204
#> SRR1974779 1 0.3128 0.7493 0.888 0.004 0.032 0.076
#> SRR1974777 1 0.3272 0.7479 0.884 0.008 0.032 0.076
#> SRR1974776 2 0.9730 -0.7898 0.152 0.340 0.244 0.264
#> SRR1974778 1 0.9879 -0.7102 0.316 0.228 0.192 0.264
#> SRR1974774 2 0.3694 0.5504 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974773 1 0.8644 0.0871 0.528 0.128 0.136 0.208
#> SRR1974775 1 0.6303 0.6016 0.720 0.056 0.072 0.152
#> SRR1974772 1 0.0592 0.7671 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974771 2 0.3485 0.5600 0.000 0.856 0.116 0.028
#> SRR1974770 2 0.3638 0.5529 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR1974769 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974768 2 0.3638 0.5529 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR1974767 2 0.9639 -0.7644 0.128 0.332 0.272 0.268
#> SRR1974766 2 0.3485 0.5600 0.000 0.856 0.116 0.028
#> SRR1974765 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974764 2 0.3542 0.5563 0.000 0.852 0.120 0.028
#> SRR1974763 1 0.0336 0.7647 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974762 1 0.6783 0.5482 0.684 0.056 0.092 0.168
#> SRR1974761 2 0.3542 0.5563 0.000 0.852 0.120 0.028
#> SRR1974760 2 0.1888 0.6127 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1974759 1 0.2125 0.7661 0.932 0.004 0.012 0.052
#> SRR1974758 2 0.3638 0.5529 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR1974757 2 0.2565 0.5977 0.000 0.912 0.056 0.032
#> SRR1974756 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974754 2 0.4713 0.5351 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974755 2 0.3638 0.5529 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR1974753 2 0.4990 0.5417 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR1974751 2 0.5125 0.5131 0.008 0.604 0.000 0.388
#> SRR1974750 2 0.4790 0.5231 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1974752 1 0.3882 0.7387 0.852 0.016 0.028 0.104
#> SRR1974749 2 0.7798 -0.0871 0.044 0.580 0.176 0.200
#> SRR1974747 1 0.4401 0.5940 0.724 0.004 0.000 0.272
#> SRR1974748 1 0.7168 0.4884 0.652 0.076 0.080 0.192
#> SRR1974746 1 0.1474 0.7591 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974744 2 0.5127 0.5394 0.000 0.632 0.012 0.356
#> SRR1974745 2 0.4950 0.5248 0.004 0.620 0.000 0.376
#> SRR1974743 2 0.4661 0.5417 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974742 1 0.3743 0.7046 0.824 0.016 0.000 0.160
#> SRR1974740 2 0.4990 0.5417 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR1974739 2 0.4776 0.5258 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1974741 2 0.4661 0.5417 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974738 2 0.4973 0.5440 0.000 0.644 0.008 0.348
#> SRR1974737 2 0.4990 0.5417 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR1974736 2 0.4776 0.5262 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1974735 1 0.0921 0.7631 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974734 2 0.9100 -0.3976 0.104 0.400 0.160 0.336
#> SRR1974733 2 0.4679 0.5399 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1974732 2 0.7012 0.3822 0.124 0.504 0.000 0.372
#> SRR1974731 2 0.4697 0.5375 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1974729 1 0.1474 0.7591 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974730 1 0.5998 0.6259 0.740 0.052 0.064 0.144
#> SRR1974728 2 0.4730 0.5330 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1974725 2 0.8306 0.2120 0.120 0.444 0.060 0.376
#> SRR1974726 2 0.4661 0.5417 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974724 1 0.1109 0.7681 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974727 2 0.9415 -0.6617 0.112 0.348 0.332 0.208
#> SRR1974723 2 0.4730 0.5339 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1974722 2 0.4855 0.5415 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974721 2 0.5233 0.5501 0.000 0.648 0.020 0.332
#> SRR1974720 2 0.6034 0.5028 0.008 0.592 0.036 0.364
#> SRR1974719 1 0.9423 -0.3957 0.412 0.192 0.140 0.256
#> SRR1974718 1 0.6342 0.5993 0.712 0.060 0.060 0.168
#> SRR1974716 2 0.9769 -0.8039 0.160 0.336 0.248 0.256
#> SRR1974717 2 0.4837 0.5427 0.000 0.648 0.004 0.348
#> SRR1974715 2 0.4761 0.5290 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1974713 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974714 1 0.9314 -0.3570 0.416 0.144 0.156 0.284
#> SRR1974711 2 0.9705 -0.7980 0.136 0.312 0.276 0.276
#> SRR1974712 1 0.0592 0.7667 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974709 1 0.2489 0.7616 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1974708 2 0.9666 -0.7736 0.132 0.328 0.268 0.272
#> SRR1974710 2 0.9581 -0.7499 0.120 0.340 0.268 0.272
#> SRR1974707 2 0.9892 -0.8891 0.196 0.296 0.220 0.288
#> SRR1974706 1 0.1389 0.7585 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974704 1 0.0592 0.7644 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974705 1 0.1305 0.7683 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1974703 2 0.4819 0.5450 0.000 0.652 0.004 0.344
#> SRR1974702 2 0.9679 -0.7581 0.136 0.328 0.284 0.252
#> SRR1974701 2 0.4776 0.5258 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1974699 2 0.4914 0.5567 0.000 0.676 0.012 0.312
#> SRR1974698 2 0.4837 0.5427 0.000 0.648 0.004 0.348
#> SRR1974700 1 0.1557 0.7584 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974697 1 0.7587 0.4050 0.596 0.084 0.072 0.248
#> SRR1974696 2 0.7963 0.0871 0.024 0.488 0.168 0.320
#> SRR1974694 1 0.4456 0.5855 0.716 0.004 0.000 0.280
#> SRR1974695 2 0.9906 -0.8822 0.192 0.296 0.236 0.276
#> SRR1974693 2 0.4746 0.5314 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1974692 2 0.4697 0.5373 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1974690 2 0.1452 0.6144 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1974691 1 0.4401 0.5950 0.724 0.004 0.000 0.272
#> SRR1974689 2 0.4661 0.5417 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974688 2 0.4661 0.5417 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974687 1 0.4401 0.5950 0.724 0.004 0.000 0.272
#> SRR1974686 1 0.1474 0.7591 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974685 1 0.4509 0.5761 0.708 0.004 0.000 0.288
#> SRR1974684 1 0.0707 0.7668 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974683 1 0.6033 0.4610 0.620 0.064 0.000 0.316
#> SRR1974682 2 0.6042 0.4709 0.048 0.560 0.000 0.392
#> SRR1974681 1 0.0921 0.7686 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974679 2 0.4790 0.5234 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1974680 1 0.5222 0.6829 0.792 0.056 0.044 0.108
#> SRR1974678 2 0.4991 0.5166 0.004 0.608 0.000 0.388
#> SRR1974677 1 0.1211 0.7667 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974676 2 0.3749 0.5486 0.000 0.840 0.128 0.032
#> SRR1974675 3 0.2596 0.8440 0.000 0.068 0.908 0.024
#> SRR1974674 1 0.0592 0.7670 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974673 3 0.9075 -0.6068 0.088 0.356 0.376 0.180
#> SRR1974671 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974672 2 0.5143 0.5697 0.000 0.708 0.036 0.256
#> SRR1974670 2 0.5475 0.5514 0.000 0.656 0.036 0.308
#> SRR1974669 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974667 2 0.3485 0.5600 0.000 0.856 0.116 0.028
#> SRR1974668 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974666 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974664 2 0.5453 0.5535 0.000 0.660 0.036 0.304
#> SRR1974665 2 0.3749 0.5486 0.000 0.840 0.128 0.032
#> SRR1974663 2 0.9751 -0.8089 0.148 0.320 0.260 0.272
#> SRR1974662 1 0.0779 0.7679 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1974661 4 0.9885 0.8869 0.192 0.280 0.224 0.304
#> SRR1974660 1 0.6879 0.5280 0.672 0.072 0.068 0.188
#> SRR1974659 1 0.2089 0.7666 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1974658 1 0.2441 0.7646 0.920 0.004 0.020 0.056
#> SRR1974657 1 0.8898 -0.1283 0.468 0.132 0.120 0.280
#> SRR1974654 1 0.4180 0.7259 0.848 0.044 0.028 0.080
#> SRR1974655 1 0.9017 -0.1883 0.468 0.148 0.128 0.256
#> SRR1974656 1 0.8681 -0.0357 0.492 0.124 0.108 0.276
#> SRR1974650 2 0.9754 -0.8092 0.164 0.344 0.228 0.264
#> SRR1974651 2 0.4679 0.5406 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1974652 4 0.9922 0.8869 0.196 0.264 0.244 0.296
#> SRR1974653 2 0.4713 0.5351 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974648 1 0.5951 0.6338 0.748 0.060 0.064 0.128
#> SRR1974646 2 0.9531 -0.7367 0.112 0.340 0.280 0.268
#> SRR1974649 1 0.0524 0.7665 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974647 2 0.4990 0.5417 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR1974645 1 0.1486 0.7692 0.960 0.008 0.008 0.024
#> SRR1974644 2 0.3638 0.5529 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR1974643 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974642 4 0.9896 0.8806 0.188 0.284 0.236 0.292
#> SRR1974640 1 0.9706 -0.6050 0.340 0.200 0.164 0.296
#> SRR1974641 2 0.5511 0.5429 0.000 0.636 0.032 0.332
#> SRR1974639 1 0.1878 0.7654 0.944 0.008 0.008 0.040
#> SRR1974638 1 0.7859 0.3364 0.604 0.104 0.104 0.188
#> SRR1974635 1 0.2923 0.7583 0.896 0.008 0.016 0.080
#> SRR1974636 4 0.9851 0.8607 0.168 0.276 0.260 0.296
#> SRR1974634 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974637 2 0.5220 0.5413 0.000 0.632 0.016 0.352
#> SRR1974633 1 0.8996 -0.1860 0.460 0.132 0.132 0.276
#> SRR1974632 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974631 1 0.9828 -0.6693 0.320 0.212 0.184 0.284
#> SRR1974630 1 0.0469 0.7659 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974629 1 0.0336 0.7641 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974628 1 0.3657 0.7431 0.864 0.024 0.016 0.096
#> SRR1974627 1 0.8270 0.1918 0.552 0.140 0.084 0.224
#> SRR1974624 1 0.2402 0.7645 0.924 0.012 0.012 0.052
#> SRR1974625 3 0.3964 0.7590 0.020 0.116 0.844 0.020
#> SRR1974623 2 0.9811 -0.8523 0.180 0.324 0.212 0.284
#> SRR1974622 1 0.6482 0.5683 0.704 0.064 0.064 0.168
#> SRR1974620 4 0.9951 0.8671 0.216 0.252 0.236 0.296
#> SRR1974619 4 0.9913 0.8816 0.196 0.280 0.232 0.292
#> SRR1974621 1 0.0469 0.7659 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974617 1 0.2510 0.7627 0.916 0.012 0.008 0.064
#> SRR1974616 2 0.5943 0.2001 0.280 0.656 0.004 0.060
#> SRR1974615 1 0.7387 0.4315 0.632 0.088 0.076 0.204
#> SRR1974618 1 0.0469 0.7671 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974614 2 0.9538 -0.7460 0.112 0.336 0.280 0.272
#> SRR1974613 1 0.9769 -0.6503 0.332 0.216 0.168 0.284
#> SRR1974612 1 0.7880 0.3317 0.592 0.084 0.112 0.212
#> SRR1974611 2 0.9825 -0.8509 0.168 0.312 0.240 0.280
#> SRR1974610 2 0.4990 0.5417 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR1974609 1 0.2604 0.7614 0.916 0.016 0.012 0.056
#> SRR1974608 1 0.5085 0.5497 0.676 0.020 0.000 0.304
#> SRR1974607 1 0.9512 -0.4426 0.396 0.176 0.160 0.268
#> SRR1974606 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974605 4 0.9206 0.2580 0.324 0.224 0.084 0.368
#> SRR1974604 2 0.4679 0.5400 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1974603 2 0.9693 -0.7722 0.144 0.344 0.252 0.260
#> SRR1974602 1 0.0188 0.7654 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 2 0.3873 0.5806 0.000 0.844 0.096 0.060
#> SRR1974601 2 0.9580 -0.7448 0.124 0.352 0.256 0.268
#> SRR1974599 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974598 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974596 2 0.3764 0.5616 0.000 0.844 0.116 0.040
#> SRR1974594 2 0.2412 0.6174 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR1974593 2 0.2385 0.6186 0.000 0.920 0.028 0.052
#> SRR1974595 2 0.1356 0.6152 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1974592 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974591 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974588 2 0.2342 0.6187 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR1974590 2 0.1356 0.6152 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1974589 2 0.2385 0.6186 0.000 0.920 0.028 0.052
#> SRR1974587 2 0.2271 0.6186 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1974586 2 0.3851 0.5863 0.004 0.852 0.088 0.056
#> SRR1974585 2 0.2737 0.6153 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR1974584 1 0.1675 0.7692 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR1974583 2 0.4597 0.5416 0.004 0.800 0.140 0.056
#> SRR1974582 2 0.3694 0.5493 0.000 0.844 0.124 0.032
#> SRR1974581 2 0.4100 0.5342 0.000 0.824 0.128 0.048
#> SRR1974580 2 0.2871 0.6196 0.000 0.896 0.032 0.072
#> SRR1974578 2 0.2334 0.6168 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR1974577 2 0.4606 0.5210 0.016 0.808 0.136 0.040
#> SRR1974579 2 0.2271 0.6186 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1974576 2 0.4037 0.5621 0.000 0.832 0.112 0.056
#> SRR1974575 2 0.3749 0.5447 0.000 0.840 0.128 0.032
#> SRR1974574 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974573 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974571 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974572 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974570 2 0.9457 -0.7149 0.104 0.348 0.292 0.256
#> SRR1974568 1 0.7304 0.4547 0.632 0.080 0.072 0.216
#> SRR1974567 1 0.3787 0.7305 0.856 0.020 0.020 0.104
#> SRR1974566 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974569 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974565 2 0.2737 0.6153 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR1974564 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974560 1 0.9425 -0.4003 0.412 0.164 0.160 0.264
#> SRR1974559 1 0.3787 0.7305 0.856 0.020 0.020 0.104
#> SRR1974563 2 0.1732 0.6139 0.004 0.948 0.008 0.040
#> SRR1974562 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974561 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974557 2 0.5690 0.5606 0.000 0.700 0.084 0.216
#> SRR1974553 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974555 1 0.0817 0.7683 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974551 1 0.5317 0.6798 0.772 0.060 0.024 0.144
#> SRR1974552 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974554 1 0.5675 0.6511 0.752 0.052 0.040 0.156
#> SRR1974558 1 0.4535 0.7035 0.816 0.032 0.024 0.128
#> SRR1974556 1 0.5010 0.6904 0.800 0.044 0.040 0.116
#> SRR1974550 4 0.9932 0.8834 0.208 0.268 0.228 0.296
#> SRR1974549 2 0.1545 0.6149 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974548 2 0.3851 0.5637 0.004 0.852 0.088 0.056
#> SRR1974547 1 0.9895 -0.7135 0.316 0.248 0.196 0.240
#> SRR1974546 4 0.9959 0.8790 0.220 0.268 0.228 0.284
#> SRR1974545 2 0.1677 0.6140 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1974544 1 0.8445 0.1450 0.556 0.148 0.124 0.172
#> SRR1974543 2 0.4077 0.5626 0.004 0.840 0.088 0.068
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.3090 0.80402 0.000 0.000 0.860 0.088 0.052
#> SRR1975008 3 0.2054 0.84110 0.000 0.028 0.920 0.000 0.052
#> SRR1975006 3 0.2359 0.83421 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1975005 3 0.1582 0.84667 0.000 0.028 0.944 0.000 0.028
#> SRR1975004 3 0.3450 0.80609 0.000 0.008 0.848 0.084 0.060
#> SRR1975003 3 0.2362 0.84510 0.000 0.040 0.912 0.008 0.040
#> SRR1975001 3 0.2853 0.81980 0.008 0.040 0.884 0.000 0.068
#> SRR1975002 3 0.2438 0.83276 0.000 0.040 0.900 0.000 0.060
#> SRR1974999 3 0.2504 0.83374 0.000 0.040 0.896 0.000 0.064
#> SRR1975000 3 0.3384 0.80440 0.000 0.004 0.848 0.088 0.060
#> SRR1974998 3 0.3373 0.80009 0.000 0.004 0.848 0.092 0.056
#> SRR1974997 2 0.5168 0.56541 0.000 0.748 0.060 0.076 0.116
#> SRR1974995 3 0.2499 0.85008 0.000 0.036 0.908 0.016 0.040
#> SRR1974996 3 0.3442 0.78863 0.000 0.000 0.836 0.104 0.060
#> SRR1974994 3 0.5546 0.67848 0.020 0.000 0.684 0.188 0.108
#> SRR1974993 3 0.2376 0.83629 0.000 0.044 0.904 0.000 0.052
#> SRR1974992 3 0.2237 0.84216 0.000 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1974990 3 0.3033 0.80643 0.000 0.000 0.864 0.084 0.052
#> SRR1974989 2 0.5864 0.54876 0.000 0.692 0.116 0.064 0.128
#> SRR1974991 3 0.1750 0.84697 0.000 0.028 0.936 0.000 0.036
#> SRR1974986 3 0.2609 0.83104 0.000 0.008 0.896 0.068 0.028
#> SRR1974987 3 0.2221 0.83833 0.000 0.036 0.912 0.000 0.052
#> SRR1974988 3 0.6616 0.24160 0.004 0.348 0.524 0.040 0.084
#> SRR1974984 3 0.2446 0.83309 0.000 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1974985 3 0.3245 0.82501 0.004 0.016 0.872 0.060 0.048
#> SRR1974983 3 0.2221 0.83690 0.000 0.036 0.912 0.000 0.052
#> SRR1974982 3 0.2582 0.82476 0.000 0.004 0.892 0.080 0.024
#> SRR1974981 3 0.5344 0.68322 0.008 0.000 0.688 0.188 0.116
#> SRR1974980 3 0.2983 0.81110 0.000 0.000 0.868 0.076 0.056
#> SRR1974979 3 0.1992 0.84333 0.000 0.032 0.924 0.000 0.044
#> SRR1974978 3 0.3719 0.77511 0.000 0.000 0.816 0.116 0.068
#> SRR1974977 3 0.4624 0.72312 0.000 0.000 0.740 0.164 0.096
#> SRR1974976 3 0.2359 0.83295 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1974975 3 0.1493 0.84697 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR1974974 3 0.2359 0.83295 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1974973 3 0.2426 0.83251 0.000 0.036 0.900 0.000 0.064
#> SRR1974972 3 0.1485 0.84767 0.000 0.020 0.948 0.000 0.032
#> SRR1974971 3 0.3962 0.75788 0.008 0.064 0.824 0.008 0.096
#> SRR1974970 3 0.1095 0.84720 0.000 0.012 0.968 0.008 0.012
#> SRR1974969 3 0.2171 0.84794 0.000 0.024 0.912 0.000 0.064
#> SRR1974968 3 0.1661 0.84551 0.000 0.024 0.940 0.000 0.036
#> SRR1974967 3 0.1612 0.84742 0.000 0.016 0.948 0.024 0.012
#> SRR1974965 3 0.4914 0.70046 0.000 0.000 0.712 0.180 0.108
#> SRR1974966 3 0.1211 0.84827 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR1974964 3 0.1830 0.84510 0.000 0.028 0.932 0.000 0.040
#> SRR1974963 3 0.1471 0.84879 0.000 0.020 0.952 0.004 0.024
#> SRR1974961 3 0.1668 0.84719 0.000 0.028 0.940 0.000 0.032
#> SRR1974962 3 0.2291 0.83638 0.000 0.036 0.908 0.000 0.056
#> SRR1974960 3 0.1413 0.84903 0.000 0.012 0.956 0.012 0.020
#> SRR1974959 3 0.1623 0.84456 0.000 0.016 0.948 0.020 0.016
#> SRR1974958 3 0.1992 0.84224 0.000 0.032 0.924 0.000 0.044
#> SRR1974957 3 0.1568 0.84670 0.000 0.020 0.944 0.000 0.036
#> SRR1974956 3 0.1310 0.84761 0.000 0.020 0.956 0.000 0.024
#> SRR1974955 3 0.4948 0.69705 0.000 0.000 0.708 0.184 0.108
#> SRR1974954 3 0.1299 0.84894 0.000 0.020 0.960 0.012 0.008
#> SRR1974953 3 0.2813 0.81871 0.000 0.040 0.876 0.000 0.084
#> SRR1974952 3 0.1399 0.84839 0.000 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1974949 3 0.1907 0.84630 0.000 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1974950 3 0.1915 0.84406 0.000 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR1974951 3 0.1915 0.84428 0.000 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR1974947 3 0.1648 0.84636 0.000 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1974948 3 0.2221 0.83820 0.000 0.036 0.912 0.000 0.052
#> SRR1974946 3 0.3340 0.79243 0.016 0.048 0.860 0.000 0.076
#> SRR1974945 3 0.2644 0.82772 0.000 0.008 0.896 0.060 0.036
#> SRR1974944 3 0.5299 0.68590 0.008 0.000 0.692 0.188 0.112
#> SRR1974942 3 0.4948 0.69705 0.000 0.000 0.708 0.184 0.108
#> SRR1974943 3 0.2234 0.84218 0.000 0.036 0.916 0.004 0.044
#> SRR1974941 3 0.3507 0.80502 0.000 0.008 0.844 0.088 0.060
#> SRR1974940 3 0.1891 0.84222 0.000 0.016 0.936 0.032 0.016
#> SRR1974939 3 0.2734 0.82777 0.000 0.052 0.892 0.008 0.048
#> SRR1974938 3 0.1710 0.84346 0.000 0.012 0.944 0.024 0.020
#> SRR1974937 3 0.4698 0.71566 0.000 0.000 0.732 0.172 0.096
#> SRR1974936 3 0.4901 0.70008 0.000 0.000 0.712 0.184 0.104
#> SRR1974935 3 0.3078 0.81784 0.000 0.008 0.872 0.056 0.064
#> SRR1974934 3 0.2681 0.83023 0.000 0.052 0.892 0.004 0.052
#> SRR1974933 3 0.1992 0.84527 0.000 0.032 0.924 0.000 0.044
#> SRR1974932 3 0.2299 0.82924 0.000 0.004 0.912 0.052 0.032
#> SRR1974931 3 0.4818 0.70663 0.000 0.000 0.720 0.180 0.100
#> SRR1974930 3 0.4852 0.70329 0.000 0.000 0.716 0.184 0.100
#> SRR1974929 3 0.2506 0.82800 0.000 0.008 0.904 0.052 0.036
#> SRR1974928 3 0.2291 0.83517 0.000 0.036 0.908 0.000 0.056
#> SRR1974927 3 0.1756 0.83934 0.000 0.008 0.940 0.036 0.016
#> SRR1974924 3 0.5266 0.68857 0.008 0.000 0.696 0.184 0.112
#> SRR1974925 3 0.4797 0.70982 0.000 0.000 0.724 0.172 0.104
#> SRR1974926 3 0.6343 0.61529 0.044 0.000 0.616 0.224 0.116
#> SRR1974923 3 0.4861 0.72937 0.008 0.000 0.736 0.160 0.096
#> SRR1974922 3 0.1518 0.84840 0.000 0.016 0.952 0.012 0.020
#> SRR1974921 3 0.2728 0.82032 0.000 0.004 0.888 0.068 0.040
#> SRR1974920 3 0.4844 0.70680 0.000 0.000 0.720 0.172 0.108
#> SRR1974919 3 0.2713 0.82400 0.000 0.004 0.888 0.072 0.036
#> SRR1974918 3 0.2353 0.82770 0.000 0.004 0.908 0.060 0.028
#> SRR1974917 3 0.2409 0.83106 0.000 0.032 0.900 0.000 0.068
#> SRR1974916 3 0.2264 0.82860 0.000 0.004 0.912 0.060 0.024
#> SRR1974915 3 0.1597 0.84061 0.000 0.008 0.948 0.024 0.020
#> SRR1974914 2 0.6104 0.52751 0.000 0.672 0.120 0.072 0.136
#> SRR1974913 3 0.2484 0.82442 0.000 0.004 0.900 0.068 0.028
#> SRR1974911 3 0.5042 0.71075 0.004 0.004 0.720 0.176 0.096
#> SRR1974910 3 0.4797 0.70971 0.000 0.000 0.724 0.172 0.104
#> SRR1974908 3 0.2209 0.83695 0.000 0.032 0.912 0.000 0.056
#> SRR1974909 3 0.2140 0.83706 0.000 0.012 0.924 0.040 0.024
#> SRR1974906 3 0.3542 0.77823 0.004 0.060 0.844 0.004 0.088
#> SRR1974907 3 0.1716 0.84674 0.000 0.016 0.944 0.024 0.016
#> SRR1974905 3 0.2853 0.81687 0.000 0.004 0.880 0.076 0.040
#> SRR1974904 3 0.1893 0.84441 0.000 0.024 0.928 0.000 0.048
#> SRR1974903 3 0.1498 0.84317 0.000 0.008 0.952 0.024 0.016
#> SRR1974902 3 0.2451 0.83712 0.000 0.036 0.904 0.004 0.056
#> SRR1974901 3 0.2193 0.83320 0.000 0.008 0.920 0.044 0.028
#> SRR1974898 3 0.3268 0.79621 0.000 0.080 0.856 0.004 0.060
#> SRR1974900 3 0.5766 0.40729 0.000 0.284 0.620 0.020 0.076
#> SRR1974899 3 0.2359 0.83295 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1974897 3 0.2359 0.83295 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1974896 3 0.7048 -0.11267 0.000 0.392 0.428 0.040 0.140
#> SRR1974893 3 0.2237 0.84150 0.000 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1974895 3 0.3634 0.77123 0.012 0.076 0.840 0.000 0.072
#> SRR1974894 2 0.6795 0.43225 0.000 0.556 0.260 0.048 0.136
#> SRR1974892 2 0.6115 0.52621 0.000 0.672 0.116 0.076 0.136
#> SRR1974890 2 0.6016 0.53039 0.000 0.680 0.112 0.072 0.136
#> SRR1974891 2 0.6873 0.42892 0.000 0.568 0.228 0.060 0.144
#> SRR1974889 3 0.2722 0.82480 0.008 0.040 0.892 0.000 0.060
#> SRR1974888 3 0.6336 0.26312 0.000 0.324 0.544 0.020 0.112
#> SRR1974886 2 0.6099 0.53229 0.000 0.660 0.152 0.048 0.140
#> SRR1974887 2 0.6120 0.52058 0.000 0.672 0.088 0.096 0.144
#> SRR1974885 2 0.6310 0.51271 0.000 0.656 0.092 0.108 0.144
#> SRR1974883 3 0.6780 -0.13421 0.000 0.412 0.432 0.028 0.128
#> SRR1974884 3 0.2359 0.83295 0.000 0.036 0.904 0.000 0.060
#> SRR1974881 2 0.6906 0.34546 0.000 0.508 0.312 0.040 0.140
#> SRR1974882 2 0.6655 0.46951 0.000 0.604 0.184 0.060 0.152
#> SRR1974880 2 0.6568 0.46045 0.000 0.588 0.228 0.040 0.144
#> SRR1974879 3 0.6484 0.19824 0.000 0.336 0.520 0.020 0.124
#> SRR1974877 3 0.3585 0.77445 0.016 0.052 0.844 0.000 0.088
#> SRR1974876 2 0.6090 0.52783 0.000 0.672 0.124 0.068 0.136
#> SRR1974878 2 0.6362 0.50351 0.000 0.644 0.152 0.068 0.136
#> SRR1974875 2 0.6043 0.52645 0.000 0.680 0.092 0.092 0.136
#> SRR1974874 4 0.5078 0.90528 0.000 0.464 0.008 0.508 0.020
#> SRR1974873 4 0.4803 0.92505 0.000 0.444 0.000 0.536 0.020
#> SRR1974871 4 0.5185 0.87854 0.000 0.472 0.016 0.496 0.016
#> SRR1974872 5 0.7165 0.77549 0.052 0.220 0.184 0.004 0.540
#> SRR1974869 5 0.7285 0.74329 0.040 0.208 0.228 0.008 0.516
#> SRR1974868 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974870 5 0.7061 0.76211 0.040 0.216 0.200 0.004 0.540
#> SRR1974866 5 0.7027 0.80077 0.068 0.200 0.152 0.004 0.576
#> SRR1974867 1 0.4125 0.74382 0.772 0.008 0.012 0.012 0.196
#> SRR1974865 2 0.5714 -0.78722 0.000 0.484 0.032 0.456 0.028
#> SRR1974864 5 0.7892 0.74170 0.196 0.152 0.132 0.012 0.508
#> SRR1974862 4 0.5337 0.89483 0.000 0.448 0.020 0.512 0.020
#> SRR1974863 2 0.5870 -0.67400 0.000 0.520 0.032 0.408 0.040
#> SRR1974860 2 0.4605 0.64690 0.000 0.768 0.104 0.012 0.116
#> SRR1974861 2 0.4795 0.63887 0.000 0.752 0.116 0.012 0.120
#> SRR1974859 4 0.4807 0.92603 0.000 0.448 0.000 0.532 0.020
#> SRR1974858 2 0.5810 -0.70002 0.000 0.516 0.028 0.416 0.040
#> SRR1974856 4 0.4731 0.92415 0.000 0.456 0.000 0.528 0.016
#> SRR1974857 2 0.5816 -0.71187 0.000 0.512 0.028 0.420 0.040
#> SRR1974855 2 0.4610 0.39607 0.000 0.756 0.008 0.156 0.080
#> SRR1974854 1 0.2569 0.79604 0.892 0.000 0.000 0.040 0.068
#> SRR1974853 1 0.2574 0.79048 0.876 0.000 0.000 0.012 0.112
#> SRR1974851 2 0.4923 0.28688 0.000 0.700 0.000 0.212 0.088
#> SRR1974852 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974849 1 0.3948 0.76158 0.788 0.004 0.008 0.020 0.180
#> SRR1974848 1 0.0566 0.79400 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974850 2 0.3859 0.50424 0.000 0.820 0.008 0.100 0.072
#> SRR1974846 4 0.4723 0.92656 0.000 0.448 0.000 0.536 0.016
#> SRR1974847 5 0.7314 0.38418 0.360 0.096 0.072 0.008 0.464
#> SRR1974845 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974844 1 0.2130 0.79740 0.908 0.000 0.000 0.012 0.080
#> SRR1974843 5 0.7509 0.79799 0.128 0.184 0.144 0.004 0.540
#> SRR1974842 1 0.0798 0.79716 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974841 1 0.1187 0.79866 0.964 0.004 0.004 0.004 0.024
#> SRR1974840 4 0.4787 0.92057 0.000 0.432 0.000 0.548 0.020
#> SRR1974839 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974838 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974837 1 0.1211 0.79693 0.960 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1974835 1 0.3379 0.77599 0.828 0.000 0.008 0.016 0.148
#> SRR1974836 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974834 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974833 2 0.4712 0.29592 0.000 0.736 0.004 0.180 0.080
#> SRR1974831 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974832 1 0.1990 0.79757 0.920 0.004 0.000 0.008 0.068
#> SRR1974830 1 0.0451 0.79308 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974829 1 0.5242 0.69467 0.744 0.104 0.000 0.060 0.092
#> SRR1974828 1 0.2308 0.79517 0.912 0.004 0.000 0.036 0.048
#> SRR1974826 2 0.5091 0.62881 0.000 0.756 0.092 0.060 0.092
#> SRR1974827 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974824 1 0.4280 0.73240 0.752 0.008 0.008 0.016 0.216
#> SRR1974825 5 0.7496 0.47818 0.308 0.092 0.072 0.024 0.504
#> SRR1974822 1 0.6962 0.48596 0.552 0.092 0.012 0.056 0.288
#> SRR1974823 5 0.7603 0.48351 0.316 0.112 0.084 0.012 0.476
#> SRR1974820 1 0.0693 0.79433 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974818 1 0.1281 0.79933 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974819 1 0.0566 0.79407 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974817 1 0.1281 0.79808 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974816 2 0.6406 0.19552 0.084 0.656 0.008 0.168 0.084
#> SRR1974815 1 0.3599 0.77727 0.820 0.004 0.004 0.024 0.148
#> SRR1974813 1 0.0566 0.79407 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974814 2 0.5044 -0.67546 0.000 0.504 0.000 0.464 0.032
#> SRR1974812 2 0.6306 0.31233 0.268 0.608 0.004 0.056 0.064
#> SRR1974810 1 0.7631 0.42252 0.508 0.152 0.016 0.068 0.256
#> SRR1974808 5 0.7126 0.76645 0.040 0.212 0.196 0.008 0.544
#> SRR1974811 1 0.6792 0.55597 0.568 0.084 0.008 0.060 0.280
#> SRR1974809 1 0.6856 0.23008 0.500 0.056 0.056 0.016 0.372
#> SRR1974807 1 0.6143 0.53464 0.640 0.044 0.052 0.016 0.248
#> SRR1974806 1 0.0693 0.79506 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974805 2 0.2313 0.61187 0.000 0.912 0.004 0.040 0.044
#> SRR1974804 2 0.5236 0.17950 0.004 0.688 0.004 0.220 0.084
#> SRR1974803 1 0.7402 0.48949 0.548 0.124 0.016 0.076 0.236
#> SRR1974801 1 0.2570 0.78858 0.880 0.004 0.000 0.008 0.108
#> SRR1974800 5 0.7138 0.77775 0.052 0.220 0.180 0.004 0.544
#> SRR1974799 1 0.0703 0.79576 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974798 2 0.4749 0.63904 0.000 0.756 0.116 0.012 0.116
#> SRR1974797 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974796 2 0.2313 0.61187 0.000 0.912 0.004 0.040 0.044
#> SRR1974795 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974793 1 0.0898 0.79685 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974794 2 0.4605 0.64672 0.000 0.768 0.104 0.012 0.116
#> SRR1974792 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974791 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974790 2 0.2075 0.61680 0.000 0.924 0.004 0.032 0.040
#> SRR1974789 2 0.4654 0.64496 0.000 0.764 0.108 0.012 0.116
#> SRR1974788 2 0.4605 0.64690 0.000 0.768 0.104 0.012 0.116
#> SRR1974786 5 0.7534 0.78289 0.072 0.220 0.168 0.012 0.528
#> SRR1974787 5 0.7622 0.80429 0.092 0.200 0.164 0.012 0.532
#> SRR1974784 2 0.3823 0.65502 0.000 0.832 0.064 0.020 0.084
#> SRR1974783 1 0.4782 0.62795 0.668 0.008 0.004 0.020 0.300
#> SRR1974785 5 0.8113 0.77329 0.156 0.192 0.148 0.016 0.488
#> SRR1974782 1 0.5005 0.63302 0.676 0.012 0.012 0.020 0.280
#> SRR1974781 2 0.3597 0.65427 0.004 0.852 0.040 0.024 0.080
#> SRR1974780 2 0.7074 -0.23362 0.020 0.444 0.144 0.012 0.380
#> SRR1974779 1 0.3697 0.75646 0.796 0.000 0.008 0.016 0.180
#> SRR1974777 1 0.3890 0.75258 0.788 0.004 0.008 0.016 0.184
#> SRR1974776 5 0.7454 0.78554 0.068 0.220 0.164 0.012 0.536
#> SRR1974778 5 0.7579 0.70485 0.216 0.152 0.108 0.004 0.520
#> SRR1974774 2 0.4550 0.64758 0.000 0.772 0.096 0.012 0.120
#> SRR1974773 1 0.7280 -0.13726 0.428 0.064 0.072 0.020 0.416
#> SRR1974775 1 0.5992 0.52024 0.604 0.024 0.040 0.020 0.312
#> SRR1974772 1 0.1195 0.79868 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1974771 2 0.4404 0.65037 0.000 0.788 0.092 0.016 0.104
#> SRR1974770 2 0.4503 0.64872 0.000 0.776 0.096 0.012 0.116
#> SRR1974769 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974768 2 0.4503 0.64872 0.000 0.776 0.096 0.012 0.116
#> SRR1974767 5 0.7227 0.77466 0.048 0.208 0.196 0.008 0.540
#> SRR1974766 2 0.4404 0.65037 0.000 0.788 0.092 0.016 0.104
#> SRR1974765 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974764 2 0.4354 0.65064 0.000 0.788 0.092 0.012 0.108
#> SRR1974763 1 0.0451 0.79102 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974762 1 0.6400 0.46481 0.576 0.028 0.044 0.032 0.320
#> SRR1974761 2 0.4455 0.64951 0.000 0.780 0.096 0.012 0.112
#> SRR1974760 2 0.2551 0.62031 0.000 0.904 0.012 0.040 0.044
#> SRR1974759 1 0.3297 0.78307 0.840 0.000 0.008 0.020 0.132
#> SRR1974758 2 0.4503 0.64872 0.000 0.776 0.096 0.012 0.116
#> SRR1974757 2 0.3331 0.64748 0.000 0.864 0.044 0.024 0.068
#> SRR1974756 1 0.0404 0.79192 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974754 4 0.4803 0.92505 0.000 0.444 0.000 0.536 0.020
#> SRR1974755 2 0.4503 0.64872 0.000 0.776 0.096 0.012 0.116
#> SRR1974753 4 0.4886 0.91480 0.000 0.468 0.004 0.512 0.016
#> SRR1974751 4 0.4798 0.88375 0.000 0.396 0.000 0.580 0.024
#> SRR1974750 4 0.4909 0.90027 0.000 0.412 0.000 0.560 0.028
#> SRR1974752 1 0.4190 0.73753 0.752 0.004 0.008 0.016 0.220
#> SRR1974749 2 0.6953 -0.00765 0.024 0.488 0.124 0.012 0.352
#> SRR1974747 1 0.5982 0.49317 0.552 0.000 0.000 0.312 0.136
#> SRR1974748 1 0.6729 0.26236 0.484 0.036 0.048 0.028 0.404
#> SRR1974746 1 0.3058 0.75195 0.860 0.000 0.000 0.096 0.044
#> SRR1974744 4 0.5069 0.91411 0.000 0.452 0.008 0.520 0.020
#> SRR1974745 4 0.4833 0.90541 0.000 0.412 0.000 0.564 0.024
#> SRR1974743 4 0.4818 0.92547 0.000 0.460 0.000 0.520 0.020
#> SRR1974742 1 0.5556 0.65706 0.660 0.004 0.000 0.184 0.152
#> SRR1974740 4 0.4886 0.91480 0.000 0.468 0.004 0.512 0.016
#> SRR1974739 4 0.4752 0.90485 0.000 0.412 0.000 0.568 0.020
#> SRR1974741 4 0.4650 0.91887 0.000 0.468 0.000 0.520 0.012
#> SRR1974738 4 0.4888 0.90949 0.000 0.472 0.004 0.508 0.016
#> SRR1974737 4 0.4886 0.91480 0.000 0.468 0.004 0.512 0.016
#> SRR1974736 4 0.4760 0.90824 0.000 0.416 0.000 0.564 0.020
#> SRR1974735 1 0.1943 0.77772 0.924 0.000 0.000 0.056 0.020
#> SRR1974734 5 0.8635 0.44517 0.040 0.264 0.104 0.180 0.412
#> SRR1974733 4 0.4811 0.92720 0.000 0.452 0.000 0.528 0.020
#> SRR1974732 4 0.6388 0.67934 0.068 0.324 0.000 0.556 0.052
#> SRR1974731 4 0.4807 0.92694 0.000 0.448 0.000 0.532 0.020
#> SRR1974729 1 0.3058 0.75195 0.860 0.000 0.000 0.096 0.044
#> SRR1974730 1 0.5638 0.59750 0.656 0.032 0.024 0.020 0.268
#> SRR1974728 4 0.4781 0.91715 0.000 0.428 0.000 0.552 0.020
#> SRR1974725 4 0.8218 0.42725 0.068 0.316 0.024 0.396 0.196
#> SRR1974726 4 0.4818 0.92638 0.000 0.460 0.000 0.520 0.020
#> SRR1974724 1 0.1278 0.79759 0.960 0.004 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974727 5 0.7457 0.66788 0.040 0.228 0.272 0.004 0.456
#> SRR1974723 4 0.4787 0.92101 0.000 0.432 0.000 0.548 0.020
#> SRR1974722 4 0.4743 0.91676 0.000 0.472 0.000 0.512 0.016
#> SRR1974721 4 0.5499 0.84983 0.000 0.472 0.020 0.480 0.028
#> SRR1974720 4 0.6104 0.79956 0.004 0.408 0.008 0.496 0.084
#> SRR1974719 5 0.7493 0.53850 0.280 0.104 0.076 0.020 0.520
#> SRR1974718 1 0.5960 0.47809 0.560 0.020 0.032 0.020 0.368
#> SRR1974716 5 0.7454 0.77941 0.080 0.232 0.164 0.004 0.520
#> SRR1974717 4 0.4740 0.92203 0.000 0.468 0.000 0.516 0.016
#> SRR1974715 4 0.4774 0.91479 0.000 0.424 0.000 0.556 0.020
#> SRR1974713 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974714 5 0.7061 0.52159 0.272 0.072 0.080 0.016 0.560
#> SRR1974711 5 0.7216 0.78565 0.056 0.184 0.200 0.008 0.552
#> SRR1974712 1 0.0693 0.79506 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974709 1 0.3394 0.77252 0.824 0.000 0.004 0.020 0.152
#> SRR1974708 5 0.7226 0.77960 0.056 0.216 0.188 0.004 0.536
#> SRR1974710 5 0.7180 0.76790 0.048 0.224 0.192 0.004 0.532
#> SRR1974707 5 0.7280 0.80681 0.096 0.176 0.148 0.008 0.572
#> SRR1974706 1 0.2813 0.76062 0.876 0.000 0.000 0.084 0.040
#> SRR1974704 1 0.1012 0.78951 0.968 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1974705 1 0.2006 0.79588 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR1974703 4 0.4886 0.91906 0.000 0.468 0.004 0.512 0.016
#> SRR1974702 5 0.7838 0.75757 0.068 0.228 0.204 0.016 0.484
#> SRR1974701 4 0.4752 0.90485 0.000 0.412 0.000 0.568 0.020
#> SRR1974699 2 0.5340 -0.81452 0.000 0.500 0.016 0.460 0.024
#> SRR1974698 4 0.4818 0.92609 0.000 0.460 0.000 0.520 0.020
#> SRR1974700 1 0.3112 0.75021 0.856 0.000 0.000 0.100 0.044
#> SRR1974697 1 0.6598 0.28233 0.484 0.032 0.024 0.048 0.412
#> SRR1974696 2 0.8471 0.07021 0.012 0.388 0.128 0.216 0.256
#> SRR1974694 1 0.6009 0.48329 0.544 0.000 0.000 0.320 0.136
#> SRR1974695 5 0.7382 0.80765 0.104 0.200 0.144 0.004 0.548
#> SRR1974693 4 0.4781 0.91796 0.000 0.428 0.000 0.552 0.020
#> SRR1974692 4 0.4807 0.92603 0.000 0.448 0.000 0.532 0.020
#> SRR1974690 2 0.2075 0.61680 0.000 0.924 0.004 0.032 0.040
#> SRR1974691 1 0.5982 0.49152 0.552 0.000 0.000 0.312 0.136
#> SRR1974689 4 0.4735 0.92496 0.000 0.460 0.000 0.524 0.016
#> SRR1974688 4 0.4735 0.92496 0.000 0.460 0.000 0.524 0.016
#> SRR1974687 1 0.5982 0.49152 0.552 0.000 0.000 0.312 0.136
#> SRR1974686 1 0.2946 0.75759 0.868 0.000 0.000 0.088 0.044
#> SRR1974685 1 0.6035 0.47416 0.536 0.000 0.000 0.328 0.136
#> SRR1974684 1 0.0912 0.79488 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1974683 1 0.6776 0.36584 0.456 0.024 0.000 0.380 0.140
#> SRR1974682 4 0.5101 0.81173 0.008 0.356 0.000 0.604 0.032
#> SRR1974681 1 0.1597 0.79937 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1974679 4 0.4752 0.90416 0.000 0.412 0.000 0.568 0.020
#> SRR1974680 1 0.5032 0.65969 0.676 0.024 0.004 0.020 0.276
#> SRR1974678 4 0.4808 0.89015 0.000 0.400 0.000 0.576 0.024
#> SRR1974677 1 0.2519 0.79124 0.884 0.000 0.000 0.016 0.100
#> SRR1974676 2 0.4554 0.64841 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974675 3 0.2645 0.82695 0.000 0.044 0.888 0.000 0.068
#> SRR1974674 1 0.0898 0.79731 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974673 5 0.7766 0.56811 0.036 0.248 0.316 0.012 0.388
#> SRR1974671 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974672 2 0.5842 -0.62424 0.000 0.536 0.032 0.392 0.040
#> SRR1974670 2 0.5783 -0.79111 0.000 0.480 0.032 0.456 0.032
#> SRR1974669 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974667 2 0.4404 0.65037 0.000 0.788 0.092 0.016 0.104
#> SRR1974668 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974666 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974664 2 0.5778 -0.78746 0.000 0.484 0.028 0.452 0.036
#> SRR1974665 2 0.4601 0.64730 0.000 0.768 0.100 0.012 0.120
#> SRR1974663 5 0.7373 0.79990 0.076 0.192 0.176 0.008 0.548
#> SRR1974662 1 0.1914 0.79897 0.924 0.000 0.000 0.016 0.060
#> SRR1974661 5 0.6787 0.79712 0.084 0.164 0.132 0.004 0.616
#> SRR1974660 1 0.6340 0.32766 0.504 0.028 0.036 0.024 0.408
#> SRR1974659 1 0.3170 0.78757 0.848 0.000 0.004 0.024 0.124
#> SRR1974658 1 0.3326 0.78100 0.836 0.004 0.004 0.016 0.140
#> SRR1974657 5 0.7288 0.40605 0.316 0.080 0.064 0.024 0.516
#> SRR1974654 1 0.4005 0.74324 0.796 0.020 0.016 0.004 0.164
#> SRR1974655 5 0.7281 0.41369 0.336 0.080 0.072 0.016 0.496
#> SRR1974656 5 0.6682 0.30448 0.348 0.060 0.044 0.016 0.532
#> SRR1974650 5 0.7394 0.79358 0.084 0.220 0.144 0.008 0.544
#> SRR1974651 4 0.4738 0.92162 0.000 0.464 0.000 0.520 0.016
#> SRR1974652 5 0.7502 0.79938 0.120 0.164 0.156 0.008 0.552
#> SRR1974653 4 0.4798 0.92373 0.000 0.440 0.000 0.540 0.020
#> SRR1974648 1 0.5649 0.60955 0.664 0.028 0.032 0.020 0.256
#> SRR1974646 5 0.7086 0.75829 0.040 0.216 0.204 0.004 0.536
#> SRR1974649 1 0.1471 0.79838 0.952 0.000 0.004 0.020 0.024
#> SRR1974647 4 0.4883 0.91927 0.000 0.464 0.004 0.516 0.016
#> SRR1974645 1 0.1918 0.79896 0.932 0.004 0.004 0.012 0.048
#> SRR1974644 2 0.4503 0.64872 0.000 0.776 0.096 0.012 0.116
#> SRR1974643 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974642 5 0.7021 0.80657 0.092 0.172 0.140 0.004 0.592
#> SRR1974640 5 0.7200 0.65887 0.204 0.108 0.088 0.016 0.584
#> SRR1974641 4 0.5576 0.83738 0.000 0.472 0.024 0.476 0.028
#> SRR1974639 1 0.2733 0.78685 0.872 0.004 0.000 0.012 0.112
#> SRR1974638 1 0.6740 0.13535 0.476 0.052 0.048 0.016 0.408
#> SRR1974635 1 0.3779 0.76738 0.800 0.008 0.004 0.016 0.172
#> SRR1974636 5 0.7540 0.80868 0.088 0.172 0.172 0.016 0.552
#> SRR1974634 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974637 4 0.5087 0.90958 0.000 0.456 0.012 0.516 0.016
#> SRR1974633 5 0.6859 0.42139 0.304 0.056 0.064 0.020 0.556
#> SRR1974632 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974631 5 0.7109 0.68895 0.172 0.108 0.100 0.016 0.604
#> SRR1974630 1 0.1216 0.79631 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1974629 1 0.0290 0.79062 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974628 1 0.4356 0.73672 0.752 0.008 0.012 0.016 0.212
#> SRR1974627 5 0.6831 0.08152 0.412 0.068 0.040 0.016 0.464
#> SRR1974624 1 0.3599 0.77788 0.820 0.004 0.004 0.024 0.148
#> SRR1974625 3 0.3810 0.75426 0.012 0.084 0.828 0.000 0.076
#> SRR1974623 5 0.7101 0.80440 0.088 0.200 0.132 0.004 0.576
#> SRR1974622 1 0.5662 0.48358 0.600 0.024 0.032 0.008 0.336
#> SRR1974620 5 0.6829 0.78250 0.092 0.136 0.140 0.008 0.624
#> SRR1974619 5 0.7172 0.80137 0.112 0.168 0.136 0.004 0.580
#> SRR1974621 1 0.1216 0.79631 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1974617 1 0.3265 0.78530 0.848 0.012 0.000 0.020 0.120
#> SRR1974616 2 0.6306 0.31233 0.268 0.608 0.004 0.056 0.064
#> SRR1974615 1 0.6173 0.30698 0.516 0.036 0.028 0.016 0.404
#> SRR1974618 1 0.0898 0.79685 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974614 5 0.7343 0.76194 0.048 0.220 0.204 0.008 0.520
#> SRR1974613 5 0.7204 0.68187 0.192 0.112 0.100 0.012 0.584
#> SRR1974612 1 0.6906 0.06671 0.440 0.056 0.044 0.024 0.436
#> SRR1974611 5 0.7227 0.80598 0.084 0.200 0.152 0.004 0.560
#> SRR1974610 4 0.4886 0.91480 0.000 0.468 0.004 0.512 0.016
#> SRR1974609 1 0.2237 0.79316 0.904 0.004 0.000 0.008 0.084
#> SRR1974608 1 0.6417 0.43507 0.496 0.004 0.000 0.336 0.164
#> SRR1974607 5 0.7399 0.56117 0.264 0.096 0.088 0.016 0.536
#> SRR1974606 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974605 5 0.8738 0.26648 0.224 0.136 0.024 0.240 0.376
#> SRR1974604 4 0.4738 0.92395 0.000 0.464 0.000 0.520 0.016
#> SRR1974603 5 0.7406 0.77680 0.068 0.224 0.168 0.008 0.532
#> SRR1974602 1 0.0451 0.79264 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974600 2 0.4840 0.63313 0.000 0.772 0.092 0.048 0.088
#> SRR1974601 5 0.7316 0.76523 0.056 0.232 0.172 0.008 0.532
#> SRR1974599 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974598 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974596 2 0.4824 0.64749 0.000 0.764 0.100 0.028 0.108
#> SRR1974594 2 0.4058 0.39043 0.000 0.796 0.008 0.144 0.052
#> SRR1974593 2 0.4153 0.50997 0.000 0.808 0.024 0.112 0.056
#> SRR1974595 2 0.2152 0.62661 0.000 0.920 0.004 0.032 0.044
#> SRR1974592 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974591 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974588 2 0.3857 0.43274 0.000 0.812 0.008 0.132 0.048
#> SRR1974590 2 0.2075 0.62553 0.000 0.924 0.004 0.032 0.040
#> SRR1974589 2 0.4153 0.50997 0.000 0.808 0.024 0.112 0.056
#> SRR1974587 2 0.4038 0.42446 0.000 0.800 0.008 0.136 0.056
#> SRR1974586 2 0.4866 0.62408 0.000 0.772 0.084 0.056 0.088
#> SRR1974585 2 0.4593 0.35063 0.000 0.756 0.008 0.160 0.076
#> SRR1974584 1 0.2511 0.79740 0.892 0.000 0.004 0.016 0.088
#> SRR1974583 2 0.5424 0.61227 0.000 0.720 0.132 0.040 0.108
#> SRR1974582 2 0.4554 0.64782 0.000 0.772 0.100 0.012 0.116
#> SRR1974581 2 0.4741 0.64048 0.000 0.756 0.104 0.012 0.128
#> SRR1974580 2 0.4449 0.49990 0.000 0.792 0.032 0.112 0.064
#> SRR1974578 2 0.3867 0.39150 0.000 0.804 0.004 0.144 0.048
#> SRR1974577 2 0.5321 0.62625 0.016 0.732 0.116 0.012 0.124
#> SRR1974579 2 0.4038 0.42446 0.000 0.800 0.008 0.136 0.056
#> SRR1974576 2 0.4919 0.64086 0.000 0.756 0.100 0.028 0.116
#> SRR1974575 2 0.4605 0.64609 0.000 0.768 0.104 0.012 0.116
#> SRR1974574 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974573 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974571 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974572 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974570 5 0.7244 0.74057 0.036 0.224 0.216 0.008 0.516
#> SRR1974568 1 0.5909 0.33206 0.520 0.040 0.020 0.008 0.412
#> SRR1974567 1 0.4334 0.71911 0.744 0.016 0.000 0.020 0.220
#> SRR1974566 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974569 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974565 2 0.4593 0.35063 0.000 0.756 0.008 0.160 0.076
#> SRR1974564 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974560 5 0.7318 0.53181 0.292 0.100 0.084 0.008 0.516
#> SRR1974559 1 0.4334 0.71911 0.744 0.016 0.000 0.020 0.220
#> SRR1974563 2 0.2308 0.61234 0.000 0.912 0.004 0.036 0.048
#> SRR1974562 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974561 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974557 2 0.6757 -0.11908 0.000 0.548 0.072 0.296 0.084
#> SRR1974553 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974555 1 0.1195 0.79896 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1974551 1 0.5336 0.64840 0.656 0.044 0.000 0.024 0.276
#> SRR1974552 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974554 1 0.5277 0.60256 0.636 0.020 0.012 0.016 0.316
#> SRR1974558 1 0.4657 0.67177 0.696 0.020 0.000 0.016 0.268
#> SRR1974556 1 0.4778 0.67376 0.712 0.016 0.020 0.008 0.244
#> SRR1974550 5 0.6957 0.79143 0.104 0.152 0.136 0.004 0.604
#> SRR1974549 2 0.2234 0.61432 0.000 0.916 0.004 0.036 0.044
#> SRR1974548 2 0.4404 0.64702 0.000 0.792 0.072 0.024 0.112
#> SRR1974547 5 0.7668 0.70535 0.200 0.156 0.112 0.008 0.524
#> SRR1974546 5 0.7066 0.79140 0.100 0.144 0.148 0.008 0.600
#> SRR1974545 2 0.2308 0.61708 0.000 0.912 0.004 0.036 0.048
#> SRR1974544 1 0.7417 -0.12552 0.420 0.084 0.072 0.016 0.408
#> SRR1974543 2 0.4510 0.63789 0.000 0.788 0.068 0.032 0.112
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.3081 0.26401 0.000 0.220 0.776 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975008 3 0.1483 0.67693 0.000 0.008 0.944 0.000 0.036 0.012
#> SRR1975006 3 0.1760 0.67100 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1975005 3 0.0909 0.67798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1975004 3 0.3109 0.26493 0.000 0.224 0.772 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975003 3 0.1700 0.67860 0.000 0.012 0.936 0.000 0.028 0.024
#> SRR1975001 3 0.2069 0.65350 0.000 0.004 0.908 0.000 0.068 0.020
#> SRR1975002 3 0.1844 0.66932 0.000 0.004 0.924 0.000 0.048 0.024
#> SRR1974999 3 0.1957 0.66837 0.000 0.008 0.920 0.000 0.048 0.024
#> SRR1975000 3 0.3189 0.20486 0.000 0.236 0.760 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974998 3 0.2996 0.23071 0.000 0.228 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 6 0.6611 0.63104 0.000 0.156 0.064 0.108 0.064 0.608
#> SRR1974995 3 0.2383 0.66936 0.000 0.052 0.900 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974996 3 0.3360 0.06564 0.000 0.264 0.732 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974994 3 0.4300 -0.77642 0.012 0.456 0.528 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974993 3 0.1716 0.67409 0.000 0.004 0.932 0.000 0.036 0.028
#> SRR1974992 3 0.1562 0.67724 0.000 0.004 0.940 0.000 0.032 0.024
#> SRR1974990 3 0.3023 0.29529 0.000 0.212 0.784 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974989 6 0.7378 0.58987 0.000 0.136 0.124 0.112 0.088 0.540
#> SRR1974991 3 0.1088 0.67944 0.000 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR1974986 3 0.2462 0.52653 0.000 0.132 0.860 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974987 3 0.1624 0.67521 0.000 0.004 0.936 0.000 0.040 0.020
#> SRR1974988 3 0.6832 0.00221 0.004 0.064 0.536 0.052 0.068 0.276
#> SRR1974984 3 0.1904 0.67045 0.000 0.004 0.924 0.004 0.048 0.020
#> SRR1974985 3 0.3007 0.48836 0.004 0.140 0.836 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974983 3 0.1624 0.67381 0.000 0.004 0.936 0.000 0.040 0.020
#> SRR1974982 3 0.2558 0.45906 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974981 3 0.3986 -0.75375 0.000 0.464 0.532 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974980 3 0.2994 0.32681 0.000 0.208 0.788 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974979 3 0.1390 0.67889 0.000 0.004 0.948 0.000 0.032 0.016
#> SRR1974978 3 0.3428 -0.15527 0.000 0.304 0.696 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.3717 -0.52031 0.000 0.384 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.1760 0.66992 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974975 3 0.0806 0.67625 0.000 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974974 3 0.1760 0.66992 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974973 3 0.1826 0.66874 0.000 0.004 0.924 0.000 0.052 0.020
#> SRR1974972 3 0.0976 0.67562 0.000 0.008 0.968 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974971 3 0.3244 0.56291 0.004 0.016 0.844 0.000 0.100 0.036
#> SRR1974970 3 0.1080 0.64748 0.000 0.032 0.960 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974969 3 0.2174 0.66047 0.000 0.036 0.912 0.000 0.036 0.016
#> SRR1974968 3 0.1218 0.67895 0.000 0.004 0.956 0.000 0.028 0.012
#> SRR1974967 3 0.1410 0.64307 0.000 0.044 0.944 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974965 3 0.3804 -0.63755 0.000 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0881 0.66939 0.000 0.012 0.972 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974964 3 0.1332 0.68007 0.000 0.008 0.952 0.000 0.028 0.012
#> SRR1974963 3 0.1262 0.67168 0.000 0.020 0.956 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974961 3 0.1059 0.67914 0.000 0.004 0.964 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974962 3 0.1693 0.67349 0.000 0.004 0.932 0.000 0.044 0.020
#> SRR1974960 3 0.1194 0.65408 0.000 0.032 0.956 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974959 3 0.1524 0.62217 0.000 0.060 0.932 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974958 3 0.1536 0.67912 0.000 0.004 0.940 0.000 0.040 0.016
#> SRR1974957 3 0.0951 0.67667 0.000 0.004 0.968 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974956 3 0.0622 0.67361 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974955 3 0.3817 -0.65893 0.000 0.432 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.1218 0.65866 0.000 0.028 0.956 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974953 3 0.2307 0.64778 0.000 0.012 0.900 0.000 0.064 0.024
#> SRR1974952 3 0.1078 0.67077 0.000 0.012 0.964 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974949 3 0.1313 0.67986 0.000 0.004 0.952 0.000 0.028 0.016
#> SRR1974950 3 0.1313 0.67900 0.000 0.004 0.952 0.000 0.028 0.016
#> SRR1974951 3 0.1313 0.67967 0.000 0.004 0.952 0.000 0.028 0.016
#> SRR1974947 3 0.1230 0.67835 0.000 0.008 0.956 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974948 3 0.1666 0.67473 0.000 0.008 0.936 0.000 0.036 0.020
#> SRR1974946 3 0.2485 0.61912 0.008 0.000 0.884 0.000 0.084 0.024
#> SRR1974945 3 0.2135 0.51055 0.000 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3854 -0.74429 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.3817 -0.65778 0.000 0.432 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.1749 0.66275 0.000 0.024 0.932 0.000 0.036 0.008
#> SRR1974941 3 0.2823 0.32150 0.000 0.204 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.1701 0.60875 0.000 0.072 0.920 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974939 3 0.2022 0.66004 0.000 0.008 0.916 0.000 0.052 0.024
#> SRR1974938 3 0.1588 0.61103 0.000 0.072 0.924 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974937 3 0.3737 -0.54813 0.000 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.3797 -0.62640 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.2491 0.43191 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.2077 0.66353 0.000 0.004 0.916 0.004 0.044 0.032
#> SRR1974933 3 0.1630 0.67833 0.000 0.016 0.940 0.000 0.024 0.020
#> SRR1974932 3 0.2003 0.53250 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.3774 -0.59550 0.000 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.3782 -0.60653 0.000 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.2278 0.51020 0.000 0.128 0.868 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974928 3 0.1693 0.67218 0.000 0.004 0.932 0.000 0.044 0.020
#> SRR1974927 3 0.1501 0.59314 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.4111 -0.75491 0.004 0.456 0.536 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974925 3 0.3804 -0.63814 0.000 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 2 0.5205 0.00000 0.032 0.472 0.472 0.008 0.012 0.004
#> SRR1974923 3 0.4328 -0.47665 0.004 0.352 0.620 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974922 3 0.1624 0.64720 0.000 0.044 0.936 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974921 3 0.2454 0.44540 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.3810 -0.65361 0.000 0.428 0.572 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.2558 0.46249 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974918 3 0.2092 0.51842 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.1801 0.66731 0.000 0.004 0.924 0.000 0.056 0.016
#> SRR1974916 3 0.2092 0.51953 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.1556 0.58876 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 6 0.7606 0.55614 0.000 0.160 0.128 0.120 0.084 0.508
#> SRR1974913 3 0.2178 0.50252 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.4224 -0.57580 0.004 0.384 0.600 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974910 3 0.3774 -0.59779 0.000 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.1605 0.67411 0.000 0.004 0.936 0.000 0.044 0.016
#> SRR1974909 3 0.1858 0.57576 0.000 0.092 0.904 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974906 3 0.2741 0.59447 0.000 0.008 0.868 0.000 0.092 0.032
#> SRR1974907 3 0.1606 0.63781 0.000 0.056 0.932 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974905 3 0.2597 0.40900 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.1503 0.68002 0.000 0.008 0.944 0.000 0.032 0.016
#> SRR1974903 3 0.1411 0.61490 0.000 0.060 0.936 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974902 3 0.1785 0.67334 0.000 0.008 0.928 0.000 0.048 0.016
#> SRR1974901 3 0.1814 0.55424 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.2722 0.61734 0.000 0.008 0.880 0.004 0.060 0.048
#> SRR1974900 3 0.5856 0.18784 0.000 0.044 0.644 0.048 0.052 0.212
#> SRR1974899 3 0.1760 0.66992 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974897 3 0.1760 0.66992 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974896 3 0.7599 -0.00754 0.000 0.116 0.448 0.064 0.092 0.280
#> SRR1974893 3 0.1492 0.67787 0.000 0.000 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1974895 3 0.2814 0.59132 0.004 0.000 0.864 0.000 0.080 0.052
#> SRR1974894 6 0.7837 0.42640 0.000 0.144 0.284 0.092 0.068 0.412
#> SRR1974892 6 0.7601 0.55591 0.000 0.164 0.124 0.120 0.084 0.508
#> SRR1974890 6 0.7543 0.55883 0.000 0.160 0.120 0.120 0.084 0.516
#> SRR1974891 6 0.7883 0.45249 0.000 0.136 0.252 0.104 0.076 0.432
#> SRR1974889 3 0.2033 0.66124 0.004 0.004 0.916 0.000 0.056 0.020
#> SRR1974888 3 0.6691 0.09535 0.000 0.080 0.568 0.052 0.068 0.232
#> SRR1974886 6 0.7622 0.55943 0.000 0.152 0.168 0.096 0.084 0.500
#> SRR1974887 6 0.7523 0.55188 0.000 0.180 0.092 0.128 0.088 0.512
#> SRR1974885 6 0.7644 0.53898 0.000 0.188 0.096 0.128 0.092 0.496
#> SRR1974883 3 0.7367 -0.01680 0.000 0.116 0.456 0.056 0.072 0.300
#> SRR1974884 3 0.1760 0.66992 0.000 0.004 0.928 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974881 6 0.7736 0.30159 0.000 0.120 0.336 0.080 0.076 0.388
#> SRR1974882 6 0.7894 0.49788 0.000 0.148 0.204 0.104 0.088 0.456
#> SRR1974880 6 0.7839 0.48738 0.000 0.108 0.244 0.096 0.104 0.448
#> SRR1974879 3 0.6912 0.07215 0.000 0.088 0.544 0.056 0.072 0.240
#> SRR1974877 3 0.2622 0.59665 0.004 0.000 0.868 0.000 0.104 0.024
#> SRR1974876 6 0.7611 0.55756 0.000 0.156 0.132 0.120 0.084 0.508
#> SRR1974878 6 0.7826 0.52656 0.000 0.156 0.164 0.120 0.084 0.476
#> SRR1974875 6 0.7473 0.55851 0.000 0.172 0.096 0.128 0.084 0.520
#> SRR1974874 4 0.2825 0.88929 0.000 0.000 0.012 0.844 0.008 0.136
#> SRR1974873 4 0.1958 0.89869 0.000 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100
#> SRR1974871 4 0.3010 0.87636 0.000 0.000 0.020 0.828 0.004 0.148
#> SRR1974872 5 0.5710 0.72366 0.020 0.004 0.164 0.012 0.644 0.156
#> SRR1974869 5 0.5946 0.69700 0.016 0.008 0.204 0.012 0.612 0.148
#> SRR1974868 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974870 5 0.5792 0.71254 0.016 0.008 0.176 0.012 0.636 0.152
#> SRR1974866 5 0.5370 0.75242 0.028 0.000 0.136 0.016 0.688 0.132
#> SRR1974867 1 0.4323 0.70896 0.728 0.028 0.016 0.004 0.220 0.004
#> SRR1974865 4 0.4094 0.81499 0.000 0.004 0.036 0.756 0.016 0.188
#> SRR1974864 5 0.6789 0.71973 0.156 0.012 0.116 0.016 0.588 0.112
#> SRR1974862 4 0.3124 0.87964 0.000 0.000 0.024 0.828 0.008 0.140
#> SRR1974863 4 0.4629 0.75440 0.000 0.004 0.036 0.708 0.032 0.220
#> SRR1974860 6 0.5899 0.68105 0.000 0.032 0.108 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974861 6 0.6072 0.67186 0.000 0.036 0.120 0.068 0.120 0.656
#> SRR1974859 4 0.1814 0.90013 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974858 4 0.4535 0.76923 0.000 0.004 0.032 0.716 0.032 0.216
#> SRR1974856 4 0.2212 0.90234 0.000 0.000 0.000 0.880 0.008 0.112
#> SRR1974857 4 0.4481 0.78013 0.000 0.004 0.032 0.724 0.032 0.208
#> SRR1974855 6 0.5713 0.48012 0.000 0.076 0.004 0.248 0.056 0.616
#> SRR1974854 1 0.2958 0.78790 0.864 0.060 0.000 0.016 0.060 0.000
#> SRR1974853 1 0.3042 0.77870 0.836 0.032 0.000 0.004 0.128 0.000
#> SRR1974851 6 0.5476 0.43482 0.000 0.120 0.000 0.212 0.032 0.636
#> SRR1974852 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974849 1 0.4220 0.72696 0.736 0.028 0.008 0.008 0.216 0.004
#> SRR1974848 1 0.1116 0.79234 0.960 0.008 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1974850 6 0.5127 0.61520 0.000 0.076 0.008 0.168 0.044 0.704
#> SRR1974846 4 0.1814 0.90073 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974847 5 0.6006 0.49980 0.276 0.012 0.060 0.012 0.596 0.044
#> SRR1974845 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974844 1 0.2658 0.79137 0.876 0.036 0.000 0.008 0.080 0.000
#> SRR1974843 5 0.5718 0.76061 0.068 0.004 0.120 0.012 0.680 0.116
#> SRR1974842 1 0.1341 0.79356 0.948 0.024 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974841 1 0.1554 0.79373 0.940 0.008 0.004 0.004 0.044 0.000
#> SRR1974840 4 0.1918 0.89355 0.000 0.008 0.000 0.904 0.000 0.088
#> SRR1974839 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974838 1 0.0951 0.78670 0.968 0.020 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974837 1 0.1257 0.79386 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974835 1 0.3807 0.75814 0.784 0.036 0.004 0.012 0.164 0.000
#> SRR1974836 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974834 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974833 6 0.5582 0.41770 0.000 0.076 0.004 0.268 0.040 0.612
#> SRR1974831 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974832 1 0.2307 0.79242 0.896 0.032 0.000 0.004 0.068 0.000
#> SRR1974830 1 0.0508 0.78966 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1974829 1 0.5504 0.68838 0.704 0.060 0.000 0.028 0.096 0.112
#> SRR1974828 1 0.2627 0.78515 0.884 0.064 0.000 0.016 0.036 0.000
#> SRR1974826 6 0.6006 0.69596 0.000 0.048 0.084 0.100 0.096 0.672
#> SRR1974827 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974824 1 0.4416 0.67587 0.684 0.028 0.008 0.008 0.272 0.000
#> SRR1974825 5 0.6010 0.57377 0.228 0.012 0.056 0.024 0.632 0.048
#> SRR1974822 1 0.6841 0.38353 0.480 0.056 0.004 0.052 0.348 0.060
#> SRR1974823 5 0.6788 0.55457 0.244 0.024 0.076 0.024 0.568 0.064
#> SRR1974820 1 0.0748 0.79074 0.976 0.004 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1974818 1 0.1364 0.79510 0.944 0.004 0.000 0.004 0.048 0.000
#> SRR1974819 1 0.1003 0.79027 0.964 0.020 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974817 1 0.1418 0.79446 0.944 0.024 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974816 6 0.7202 0.33176 0.080 0.072 0.004 0.252 0.072 0.520
#> SRR1974815 1 0.3832 0.75074 0.772 0.028 0.004 0.012 0.184 0.000
#> SRR1974813 1 0.1092 0.79102 0.960 0.020 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974814 4 0.4721 0.53600 0.000 0.048 0.000 0.592 0.004 0.356
#> SRR1974812 6 0.6018 0.39571 0.256 0.064 0.004 0.040 0.028 0.608
#> SRR1974810 1 0.7829 0.34319 0.440 0.092 0.012 0.052 0.280 0.124
#> SRR1974808 5 0.5719 0.71549 0.016 0.004 0.176 0.012 0.636 0.156
#> SRR1974811 1 0.7035 0.44325 0.496 0.076 0.008 0.036 0.308 0.076
#> SRR1974809 1 0.6392 0.03340 0.440 0.032 0.048 0.016 0.436 0.028
#> SRR1974807 1 0.5900 0.40255 0.568 0.020 0.040 0.012 0.328 0.032
#> SRR1974806 1 0.0767 0.79084 0.976 0.008 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1974805 6 0.2356 0.69398 0.000 0.044 0.004 0.048 0.004 0.900
#> SRR1974804 6 0.6103 0.31613 0.004 0.092 0.004 0.308 0.044 0.548
#> SRR1974803 1 0.7585 0.40539 0.476 0.100 0.008 0.064 0.268 0.084
#> SRR1974801 1 0.2846 0.77162 0.840 0.016 0.000 0.004 0.140 0.000
#> SRR1974800 5 0.5679 0.72619 0.020 0.004 0.160 0.012 0.648 0.156
#> SRR1974799 1 0.1168 0.79190 0.956 0.016 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974798 6 0.6083 0.67046 0.000 0.036 0.120 0.072 0.116 0.656
#> SRR1974797 6 0.2221 0.69881 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974796 6 0.2356 0.69398 0.000 0.044 0.004 0.048 0.004 0.900
#> SRR1974795 6 0.2290 0.69542 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974793 1 0.1515 0.79335 0.944 0.028 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1974794 6 0.5859 0.68412 0.000 0.032 0.108 0.072 0.112 0.676
#> SRR1974792 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974791 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974790 6 0.2194 0.70216 0.000 0.036 0.004 0.040 0.008 0.912
#> SRR1974789 6 0.6006 0.67900 0.000 0.036 0.112 0.072 0.116 0.664
#> SRR1974788 6 0.5899 0.68105 0.000 0.032 0.108 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974786 5 0.6084 0.73091 0.036 0.008 0.144 0.016 0.632 0.164
#> SRR1974787 5 0.6017 0.75092 0.036 0.012 0.144 0.016 0.648 0.144
#> SRR1974784 6 0.5204 0.71826 0.000 0.056 0.064 0.072 0.068 0.740
#> SRR1974783 1 0.4758 0.53475 0.596 0.032 0.000 0.016 0.356 0.000
#> SRR1974785 5 0.6912 0.73510 0.104 0.024 0.132 0.012 0.584 0.144
#> SRR1974782 1 0.4968 0.54744 0.616 0.032 0.008 0.008 0.328 0.008
#> SRR1974781 6 0.4542 0.72286 0.000 0.040 0.040 0.068 0.068 0.784
#> SRR1974780 5 0.7092 0.17397 0.008 0.024 0.132 0.048 0.436 0.352
#> SRR1974779 1 0.3917 0.72435 0.752 0.028 0.004 0.008 0.208 0.000
#> SRR1974777 1 0.4112 0.71607 0.740 0.028 0.004 0.008 0.216 0.004
#> SRR1974776 5 0.5916 0.73359 0.028 0.008 0.140 0.016 0.644 0.164
#> SRR1974778 5 0.6079 0.70518 0.144 0.004 0.088 0.024 0.656 0.084
#> SRR1974774 6 0.5882 0.68463 0.000 0.036 0.100 0.072 0.116 0.676
#> SRR1974773 5 0.6217 0.29474 0.364 0.020 0.052 0.012 0.516 0.036
#> SRR1974775 1 0.5836 0.38805 0.540 0.040 0.032 0.012 0.364 0.012
#> SRR1974772 1 0.1857 0.79447 0.924 0.044 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1974771 6 0.5679 0.69583 0.000 0.036 0.092 0.076 0.100 0.696
#> SRR1974770 6 0.5842 0.68669 0.000 0.036 0.100 0.072 0.112 0.680
#> SRR1974769 6 0.2290 0.69542 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974768 6 0.5842 0.68669 0.000 0.036 0.100 0.072 0.112 0.680
#> SRR1974767 5 0.5552 0.72132 0.016 0.000 0.176 0.012 0.644 0.152
#> SRR1974766 6 0.5679 0.69583 0.000 0.036 0.092 0.076 0.100 0.696
#> SRR1974765 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974764 6 0.5674 0.69509 0.000 0.036 0.096 0.072 0.100 0.696
#> SRR1974763 1 0.1116 0.78820 0.960 0.028 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974762 1 0.6031 0.34137 0.520 0.048 0.032 0.008 0.372 0.020
#> SRR1974761 6 0.5760 0.69123 0.000 0.036 0.100 0.072 0.104 0.688
#> SRR1974760 6 0.2677 0.70155 0.000 0.040 0.012 0.052 0.008 0.888
#> SRR1974759 1 0.3640 0.75923 0.796 0.028 0.008 0.008 0.160 0.000
#> SRR1974758 6 0.5842 0.68669 0.000 0.036 0.100 0.072 0.112 0.680
#> SRR1974757 6 0.4778 0.72054 0.000 0.048 0.048 0.084 0.052 0.768
#> SRR1974756 1 0.0837 0.78825 0.972 0.020 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974754 4 0.2006 0.89969 0.000 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104
#> SRR1974755 6 0.5882 0.68413 0.000 0.036 0.100 0.072 0.116 0.676
#> SRR1974753 4 0.2655 0.89221 0.000 0.000 0.008 0.848 0.004 0.140
#> SRR1974751 4 0.1923 0.87439 0.000 0.016 0.000 0.916 0.004 0.064
#> SRR1974750 4 0.2182 0.88222 0.000 0.020 0.000 0.900 0.004 0.076
#> SRR1974752 1 0.4670 0.68463 0.684 0.040 0.008 0.008 0.256 0.004
#> SRR1974749 6 0.7187 0.03463 0.016 0.024 0.100 0.060 0.396 0.404
#> SRR1974747 1 0.7474 0.37111 0.424 0.228 0.000 0.192 0.148 0.008
#> SRR1974748 5 0.5498 0.02145 0.396 0.032 0.032 0.004 0.528 0.008
#> SRR1974746 1 0.3782 0.72036 0.808 0.120 0.000 0.028 0.040 0.004
#> SRR1974744 4 0.2883 0.89405 0.000 0.000 0.012 0.844 0.012 0.132
#> SRR1974745 4 0.1643 0.88305 0.000 0.008 0.000 0.924 0.000 0.068
#> SRR1974743 4 0.2146 0.90178 0.000 0.000 0.000 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974742 1 0.6429 0.56709 0.568 0.172 0.000 0.112 0.148 0.000
#> SRR1974740 4 0.2615 0.89471 0.000 0.000 0.008 0.852 0.004 0.136
#> SRR1974739 4 0.2002 0.88469 0.000 0.012 0.000 0.908 0.004 0.076
#> SRR1974741 4 0.2278 0.89806 0.000 0.000 0.000 0.868 0.004 0.128
#> SRR1974738 4 0.2797 0.89066 0.000 0.004 0.008 0.844 0.004 0.140
#> SRR1974737 4 0.2655 0.89221 0.000 0.000 0.008 0.848 0.004 0.140
#> SRR1974736 4 0.1701 0.88479 0.000 0.008 0.000 0.920 0.000 0.072
#> SRR1974735 1 0.2224 0.76761 0.904 0.064 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1974734 5 0.7341 0.46650 0.024 0.008 0.084 0.256 0.484 0.144
#> SRR1974733 4 0.2149 0.90102 0.000 0.004 0.000 0.888 0.004 0.104
#> SRR1974732 4 0.3514 0.76306 0.040 0.096 0.000 0.828 0.000 0.036
#> SRR1974731 4 0.2101 0.90061 0.000 0.004 0.000 0.892 0.004 0.100
#> SRR1974729 1 0.3714 0.72333 0.812 0.120 0.000 0.028 0.036 0.004
#> SRR1974730 1 0.5302 0.52738 0.612 0.028 0.016 0.012 0.316 0.016
#> SRR1974728 4 0.1700 0.88999 0.000 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080
#> SRR1974725 4 0.6583 0.56553 0.032 0.072 0.016 0.608 0.200 0.072
#> SRR1974726 4 0.2146 0.90237 0.000 0.000 0.000 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974724 1 0.1401 0.79494 0.948 0.020 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1974727 5 0.6455 0.60685 0.016 0.008 0.260 0.016 0.532 0.168
#> SRR1974723 4 0.1753 0.89334 0.000 0.004 0.000 0.912 0.000 0.084
#> SRR1974722 4 0.2504 0.89684 0.000 0.000 0.004 0.856 0.004 0.136
#> SRR1974721 4 0.3606 0.86115 0.000 0.004 0.024 0.800 0.016 0.156
#> SRR1974720 4 0.3575 0.84068 0.000 0.000 0.012 0.816 0.080 0.092
#> SRR1974719 5 0.6125 0.58914 0.220 0.012 0.064 0.024 0.628 0.052
#> SRR1974718 1 0.5510 0.31100 0.496 0.032 0.024 0.008 0.432 0.008
#> SRR1974716 5 0.5940 0.72909 0.032 0.004 0.140 0.016 0.636 0.172
#> SRR1974717 4 0.2234 0.90027 0.000 0.000 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR1974715 4 0.1967 0.89110 0.000 0.012 0.000 0.904 0.000 0.084
#> SRR1974713 1 0.0951 0.78670 0.968 0.020 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974714 5 0.5258 0.60098 0.180 0.008 0.072 0.016 0.700 0.024
#> SRR1974711 5 0.5423 0.73468 0.016 0.000 0.180 0.016 0.664 0.124
#> SRR1974712 1 0.0767 0.79084 0.976 0.008 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1974709 1 0.3530 0.75557 0.800 0.028 0.004 0.008 0.160 0.000
#> SRR1974708 5 0.5917 0.73003 0.024 0.004 0.168 0.020 0.636 0.148
#> SRR1974710 5 0.5855 0.71921 0.020 0.004 0.172 0.016 0.632 0.156
#> SRR1974707 5 0.5649 0.76328 0.048 0.004 0.120 0.020 0.688 0.120
#> SRR1974706 1 0.3510 0.73478 0.832 0.096 0.000 0.028 0.040 0.004
#> SRR1974704 1 0.1225 0.78536 0.952 0.036 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974705 1 0.2425 0.78736 0.884 0.024 0.000 0.004 0.088 0.000
#> SRR1974703 4 0.2420 0.89950 0.000 0.000 0.004 0.864 0.004 0.128
#> SRR1974702 5 0.6373 0.69267 0.024 0.012 0.196 0.016 0.584 0.168
#> SRR1974701 4 0.2002 0.88469 0.000 0.012 0.000 0.908 0.004 0.076
#> SRR1974699 4 0.3593 0.84503 0.000 0.000 0.020 0.784 0.016 0.180
#> SRR1974698 4 0.2006 0.90140 0.000 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR1974700 1 0.3856 0.71807 0.804 0.120 0.000 0.032 0.040 0.004
#> SRR1974697 5 0.5927 -0.08933 0.416 0.020 0.020 0.044 0.488 0.012
#> SRR1974696 4 0.7519 -0.11938 0.000 0.008 0.108 0.348 0.304 0.232
#> SRR1974694 1 0.7508 0.36177 0.416 0.228 0.000 0.200 0.148 0.008
#> SRR1974695 5 0.5753 0.75605 0.040 0.004 0.120 0.024 0.676 0.136
#> SRR1974693 4 0.1866 0.89157 0.000 0.008 0.000 0.908 0.000 0.084
#> SRR1974692 4 0.1814 0.90013 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974690 6 0.2121 0.70299 0.000 0.032 0.004 0.040 0.008 0.916
#> SRR1974691 1 0.7487 0.36517 0.420 0.232 0.000 0.192 0.148 0.008
#> SRR1974689 4 0.2100 0.90197 0.000 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR1974688 4 0.2053 0.90166 0.000 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1974687 1 0.7487 0.36517 0.420 0.232 0.000 0.192 0.148 0.008
#> SRR1974686 1 0.3671 0.72949 0.820 0.104 0.000 0.028 0.044 0.004
#> SRR1974685 1 0.7539 0.35233 0.408 0.228 0.000 0.208 0.148 0.008
#> SRR1974684 1 0.0993 0.78875 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974683 1 0.7564 0.27301 0.356 0.212 0.000 0.300 0.124 0.008
#> SRR1974682 4 0.2146 0.83798 0.000 0.044 0.000 0.908 0.004 0.044
#> SRR1974681 1 0.1480 0.79523 0.940 0.020 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974679 4 0.1845 0.88202 0.000 0.008 0.000 0.916 0.004 0.072
#> SRR1974680 1 0.5278 0.56411 0.600 0.040 0.008 0.012 0.328 0.012
#> SRR1974678 4 0.1841 0.87546 0.000 0.008 0.000 0.920 0.008 0.064
#> SRR1974677 1 0.2913 0.77771 0.848 0.032 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1974676 6 0.5924 0.68265 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974675 3 0.2103 0.65950 0.000 0.012 0.912 0.000 0.056 0.020
#> SRR1974674 1 0.0951 0.79303 0.968 0.008 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1974673 5 0.6936 0.51292 0.016 0.016 0.308 0.020 0.456 0.184
#> SRR1974671 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974672 4 0.4788 0.73456 0.000 0.004 0.036 0.696 0.040 0.224
#> SRR1974670 4 0.4038 0.81635 0.000 0.000 0.036 0.756 0.020 0.188
#> SRR1974669 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974667 6 0.5679 0.69583 0.000 0.036 0.092 0.076 0.100 0.696
#> SRR1974668 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974666 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974664 4 0.4187 0.81526 0.000 0.004 0.032 0.752 0.024 0.188
#> SRR1974665 6 0.5963 0.68120 0.000 0.036 0.104 0.072 0.120 0.668
#> SRR1974663 5 0.5679 0.74427 0.024 0.008 0.152 0.016 0.668 0.132
#> SRR1974662 1 0.1972 0.79350 0.916 0.024 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1974661 5 0.4973 0.75927 0.032 0.004 0.116 0.012 0.736 0.100
#> SRR1974660 5 0.5241 -0.08501 0.424 0.028 0.024 0.004 0.516 0.004
#> SRR1974659 1 0.3236 0.77317 0.820 0.036 0.000 0.004 0.140 0.000
#> SRR1974658 1 0.3389 0.76187 0.800 0.032 0.000 0.004 0.164 0.000
#> SRR1974657 5 0.5399 0.52874 0.224 0.012 0.048 0.016 0.672 0.028
#> SRR1974654 1 0.3700 0.71290 0.768 0.008 0.012 0.004 0.204 0.004
#> SRR1974655 5 0.5939 0.51639 0.252 0.020 0.064 0.016 0.620 0.028
#> SRR1974656 5 0.5265 0.46583 0.260 0.008 0.032 0.020 0.656 0.024
#> SRR1974650 5 0.5905 0.74643 0.028 0.016 0.124 0.020 0.664 0.148
#> SRR1974651 4 0.2462 0.89706 0.000 0.000 0.004 0.860 0.004 0.132
#> SRR1974652 5 0.5690 0.76057 0.060 0.004 0.132 0.016 0.684 0.104
#> SRR1974653 4 0.1908 0.89752 0.000 0.004 0.000 0.900 0.000 0.096
#> SRR1974648 1 0.5574 0.52760 0.604 0.028 0.028 0.020 0.308 0.012
#> SRR1974646 5 0.5820 0.70880 0.016 0.008 0.180 0.012 0.632 0.152
#> SRR1974649 1 0.1552 0.79454 0.940 0.036 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974647 4 0.2531 0.89846 0.000 0.000 0.008 0.860 0.004 0.128
#> SRR1974645 1 0.1985 0.79272 0.916 0.008 0.004 0.008 0.064 0.000
#> SRR1974644 6 0.5842 0.68669 0.000 0.036 0.100 0.072 0.112 0.680
#> SRR1974643 1 0.0837 0.78682 0.972 0.020 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974642 5 0.4978 0.75909 0.028 0.000 0.116 0.020 0.732 0.104
#> SRR1974640 5 0.5107 0.67917 0.112 0.008 0.064 0.024 0.744 0.048
#> SRR1974641 4 0.3716 0.84415 0.000 0.000 0.028 0.780 0.016 0.176
#> SRR1974639 1 0.3120 0.77075 0.832 0.028 0.000 0.008 0.132 0.000
#> SRR1974638 5 0.5754 0.04760 0.420 0.016 0.032 0.012 0.496 0.024
#> SRR1974635 1 0.3814 0.74306 0.764 0.024 0.004 0.004 0.200 0.004
#> SRR1974636 5 0.5862 0.76128 0.040 0.012 0.148 0.020 0.672 0.108
#> SRR1974634 1 0.0837 0.78682 0.972 0.020 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974637 4 0.2765 0.89125 0.000 0.000 0.016 0.848 0.004 0.132
#> SRR1974633 5 0.5283 0.53596 0.220 0.012 0.052 0.016 0.680 0.020
#> SRR1974632 1 0.0951 0.78670 0.968 0.020 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974631 5 0.5030 0.69039 0.104 0.004 0.084 0.020 0.744 0.044
#> SRR1974630 1 0.1297 0.79179 0.948 0.040 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974629 1 0.0837 0.78682 0.972 0.020 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974628 1 0.4426 0.69525 0.704 0.032 0.012 0.008 0.244 0.000
#> SRR1974627 5 0.5692 0.32303 0.332 0.012 0.032 0.012 0.576 0.036
#> SRR1974624 1 0.3839 0.75895 0.784 0.028 0.004 0.012 0.168 0.004
#> SRR1974625 3 0.3070 0.57185 0.004 0.000 0.852 0.004 0.084 0.056
#> SRR1974623 5 0.5479 0.75579 0.040 0.004 0.112 0.016 0.696 0.132
#> SRR1974622 1 0.4863 0.38105 0.564 0.012 0.024 0.008 0.392 0.000
#> SRR1974620 5 0.4695 0.75110 0.036 0.000 0.120 0.016 0.756 0.072
#> SRR1974619 5 0.5645 0.76153 0.068 0.004 0.112 0.016 0.692 0.108
#> SRR1974621 1 0.1297 0.79179 0.948 0.040 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974617 1 0.3375 0.76851 0.808 0.024 0.000 0.012 0.156 0.000
#> SRR1974616 6 0.6018 0.39571 0.256 0.064 0.004 0.040 0.028 0.608
#> SRR1974615 5 0.5576 -0.11387 0.448 0.020 0.024 0.016 0.480 0.012
#> SRR1974618 1 0.1515 0.79335 0.944 0.028 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1974614 5 0.5897 0.71045 0.020 0.008 0.184 0.008 0.620 0.160
#> SRR1974613 5 0.5289 0.69070 0.120 0.004 0.080 0.024 0.724 0.048
#> SRR1974612 5 0.5674 0.18469 0.364 0.020 0.032 0.016 0.552 0.016
#> SRR1974611 5 0.5471 0.75292 0.028 0.004 0.132 0.016 0.688 0.132
#> SRR1974610 4 0.2655 0.89221 0.000 0.000 0.008 0.848 0.004 0.140
#> SRR1974609 1 0.2551 0.78093 0.872 0.012 0.000 0.004 0.108 0.004
#> SRR1974608 1 0.7693 0.31108 0.372 0.224 0.000 0.228 0.168 0.008
#> SRR1974607 5 0.5298 0.61527 0.192 0.004 0.068 0.004 0.684 0.048
#> SRR1974606 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974605 5 0.7388 0.26897 0.172 0.040 0.016 0.312 0.432 0.028
#> SRR1974604 4 0.2100 0.90251 0.000 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR1974603 5 0.5773 0.72152 0.024 0.004 0.144 0.016 0.648 0.164
#> SRR1974602 1 0.0806 0.78771 0.972 0.020 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974600 6 0.6006 0.69935 0.000 0.048 0.084 0.100 0.096 0.672
#> SRR1974601 5 0.5813 0.70854 0.012 0.008 0.152 0.020 0.640 0.168
#> SRR1974599 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974598 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974596 6 0.6096 0.68806 0.000 0.040 0.100 0.088 0.112 0.660
#> SRR1974594 6 0.5592 0.49990 0.000 0.080 0.008 0.240 0.040 0.632
#> SRR1974593 6 0.5686 0.60589 0.000 0.072 0.024 0.188 0.052 0.664
#> SRR1974595 6 0.2239 0.70796 0.000 0.028 0.004 0.040 0.016 0.912
#> SRR1974592 6 0.5858 0.68127 0.000 0.032 0.104 0.072 0.116 0.676
#> SRR1974591 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974588 6 0.5437 0.52565 0.000 0.076 0.008 0.232 0.036 0.648
#> SRR1974590 6 0.2239 0.70771 0.000 0.028 0.004 0.040 0.016 0.912
#> SRR1974589 6 0.5686 0.60589 0.000 0.072 0.024 0.188 0.052 0.664
#> SRR1974587 6 0.5523 0.51413 0.000 0.076 0.008 0.236 0.040 0.640
#> SRR1974586 6 0.6030 0.69270 0.000 0.048 0.076 0.116 0.092 0.668
#> SRR1974585 6 0.5786 0.46792 0.000 0.092 0.008 0.252 0.040 0.608
#> SRR1974584 1 0.3170 0.78453 0.844 0.040 0.004 0.008 0.104 0.000
#> SRR1974583 6 0.6349 0.66830 0.000 0.036 0.128 0.092 0.112 0.632
#> SRR1974582 6 0.5924 0.68165 0.000 0.036 0.104 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974581 6 0.5966 0.67905 0.000 0.032 0.100 0.072 0.132 0.664
#> SRR1974580 6 0.5891 0.57548 0.000 0.056 0.028 0.224 0.060 0.632
#> SRR1974578 6 0.5351 0.50280 0.000 0.072 0.004 0.244 0.036 0.644
#> SRR1974577 6 0.6497 0.65275 0.016 0.032 0.116 0.068 0.132 0.636
#> SRR1974579 6 0.5523 0.51413 0.000 0.076 0.008 0.236 0.040 0.640
#> SRR1974576 6 0.5985 0.69238 0.000 0.036 0.092 0.088 0.116 0.668
#> SRR1974575 6 0.5899 0.67942 0.000 0.032 0.108 0.072 0.116 0.672
#> SRR1974574 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974573 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974571 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974572 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974570 5 0.5901 0.69602 0.016 0.008 0.192 0.008 0.612 0.164
#> SRR1974568 5 0.5578 -0.17289 0.456 0.020 0.016 0.012 0.472 0.024
#> SRR1974567 1 0.4343 0.67744 0.704 0.032 0.000 0.012 0.248 0.004
#> SRR1974566 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974569 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974565 6 0.5786 0.46792 0.000 0.092 0.008 0.252 0.040 0.608
#> SRR1974564 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974560 5 0.6009 0.59324 0.224 0.012 0.072 0.012 0.628 0.052
#> SRR1974559 1 0.4343 0.67744 0.704 0.032 0.000 0.012 0.248 0.004
#> SRR1974563 6 0.2334 0.69653 0.000 0.044 0.004 0.040 0.008 0.904
#> SRR1974562 6 0.2290 0.69757 0.000 0.044 0.004 0.044 0.004 0.904
#> SRR1974561 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974557 4 0.6393 0.32263 0.000 0.008 0.072 0.520 0.088 0.312
#> SRR1974553 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974555 1 0.1780 0.79596 0.924 0.028 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974551 1 0.5441 0.57698 0.600 0.040 0.000 0.016 0.312 0.032
#> SRR1974552 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974554 1 0.5227 0.48758 0.568 0.024 0.012 0.016 0.372 0.008
#> SRR1974558 1 0.4719 0.61087 0.652 0.028 0.000 0.012 0.296 0.012
#> SRR1974556 1 0.4309 0.60620 0.668 0.012 0.016 0.004 0.300 0.000
#> SRR1974550 5 0.5277 0.75804 0.044 0.008 0.116 0.016 0.724 0.092
#> SRR1974549 6 0.2221 0.69721 0.000 0.044 0.004 0.040 0.004 0.908
#> SRR1974548 6 0.5087 0.69904 0.000 0.032 0.072 0.052 0.104 0.740
#> SRR1974547 5 0.6331 0.69886 0.148 0.004 0.096 0.024 0.632 0.096
#> SRR1974546 5 0.5015 0.75871 0.044 0.000 0.128 0.012 0.728 0.088
#> SRR1974545 6 0.2402 0.69925 0.000 0.044 0.008 0.044 0.004 0.900
#> SRR1974544 5 0.6778 0.27078 0.360 0.036 0.064 0.012 0.480 0.048
#> SRR1974543 6 0.4907 0.69208 0.000 0.048 0.068 0.036 0.092 0.756
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.991 0.957 0.967 0.4348 0.557 0.557
#> 3 3 0.682 0.823 0.888 0.4623 0.739 0.546
#> 4 4 0.654 0.677 0.819 0.1356 0.845 0.588
#> 5 5 0.726 0.647 0.795 0.0796 0.848 0.524
#> 6 6 0.750 0.717 0.803 0.0465 0.919 0.662
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.3879 0.91823 0.076 0.924
#> SRR1975008 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975006 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975005 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975004 2 0.2043 0.96348 0.032 0.968
#> SRR1975003 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975001 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975002 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974999 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1975000 2 0.2043 0.96339 0.032 0.968
#> SRR1974998 2 0.2423 0.95612 0.040 0.960
#> SRR1974997 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974995 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974996 2 0.3431 0.93170 0.064 0.936
#> SRR1974994 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974993 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974992 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974990 1 0.8207 0.72259 0.744 0.256
#> SRR1974989 2 0.1414 0.97320 0.020 0.980
#> SRR1974991 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974986 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974987 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974988 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974984 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974985 2 0.2423 0.95637 0.040 0.960
#> SRR1974983 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974982 2 0.3114 0.93956 0.056 0.944
#> SRR1974981 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974980 2 0.1184 0.97569 0.016 0.984
#> SRR1974979 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974978 2 0.9909 0.13676 0.444 0.556
#> SRR1974977 2 0.2043 0.96340 0.032 0.968
#> SRR1974976 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974975 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974974 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974973 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974972 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974971 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974970 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974969 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974968 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974967 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974965 1 0.3431 0.95210 0.936 0.064
#> SRR1974966 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974964 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974963 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974961 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974962 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974960 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974959 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974958 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974957 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974956 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974955 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974954 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974953 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974952 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974949 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974950 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974951 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974947 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974948 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974946 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974945 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974944 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974942 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974943 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974941 1 0.8016 0.74242 0.756 0.244
#> SRR1974940 2 0.1184 0.97578 0.016 0.984
#> SRR1974939 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974938 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974937 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974936 1 0.2778 0.96371 0.952 0.048
#> SRR1974935 2 0.2603 0.95243 0.044 0.956
#> SRR1974934 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974933 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974932 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974931 2 0.2043 0.96358 0.032 0.968
#> SRR1974930 1 0.2948 0.96122 0.948 0.052
#> SRR1974929 2 0.0938 0.97817 0.012 0.988
#> SRR1974928 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974927 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974924 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974925 1 0.2778 0.96371 0.952 0.048
#> SRR1974926 1 0.2423 0.96734 0.960 0.040
#> SRR1974923 2 0.2423 0.95605 0.040 0.960
#> SRR1974922 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974921 2 0.1843 0.96671 0.028 0.972
#> SRR1974920 1 0.2778 0.96371 0.952 0.048
#> SRR1974919 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974918 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974917 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974916 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974915 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974914 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974911 1 0.9044 0.60511 0.680 0.320
#> SRR1974910 2 0.7299 0.73864 0.204 0.796
#> SRR1974908 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974909 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974906 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974907 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974905 2 0.2043 0.96341 0.032 0.968
#> SRR1974904 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974903 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974902 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974901 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974898 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974900 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974899 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974897 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974896 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974895 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974894 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974892 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974891 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974888 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974886 2 0.1843 0.96840 0.028 0.972
#> SRR1974887 2 0.0672 0.97950 0.008 0.992
#> SRR1974885 2 0.1633 0.97231 0.024 0.976
#> SRR1974883 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974884 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974881 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974879 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974877 2 0.0376 0.98049 0.004 0.996
#> SRR1974876 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974878 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974874 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974873 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974871 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974872 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974869 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974868 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974870 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974866 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974867 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974865 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974864 1 0.9970 0.21025 0.532 0.468
#> SRR1974862 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974863 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974860 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974861 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974859 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974858 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974856 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974857 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974855 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974854 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974853 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974851 1 0.4161 0.93584 0.916 0.084
#> SRR1974852 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974849 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974848 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974850 2 0.1414 0.97320 0.020 0.980
#> SRR1974846 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974847 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974845 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974844 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974843 2 0.9170 0.48834 0.332 0.668
#> SRR1974842 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974841 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974840 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974839 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974838 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974837 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974835 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974836 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974834 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974833 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974831 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974832 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974830 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974829 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974828 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974826 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974827 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974824 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974825 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974822 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974823 1 0.6247 0.85841 0.844 0.156
#> SRR1974820 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974818 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974819 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974817 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974816 1 0.9580 0.48069 0.620 0.380
#> SRR1974815 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974813 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974814 2 0.6712 0.82002 0.176 0.824
#> SRR1974812 1 0.5408 0.89749 0.876 0.124
#> SRR1974810 1 0.2423 0.96736 0.960 0.040
#> SRR1974808 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974811 1 0.2778 0.96183 0.952 0.048
#> SRR1974809 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974807 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974806 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974805 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974804 1 0.6712 0.81598 0.824 0.176
#> SRR1974803 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974801 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974800 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974799 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974798 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974797 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974796 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974795 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974793 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974794 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974792 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974791 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974790 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974789 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974788 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974786 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974787 2 0.4562 0.89941 0.096 0.904
#> SRR1974784 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974783 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974785 2 0.2236 0.96352 0.036 0.964
#> SRR1974782 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974781 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974780 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974779 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974777 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974776 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974778 1 0.6148 0.86038 0.848 0.152
#> SRR1974774 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974773 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974775 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974772 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974771 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974770 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974769 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974768 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974767 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974766 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974765 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974764 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974763 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974762 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974761 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974760 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974759 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974758 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974757 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974756 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974754 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974755 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974753 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974751 1 1.0000 0.00592 0.504 0.496
#> SRR1974750 2 0.2778 0.95840 0.048 0.952
#> SRR1974752 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974749 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974747 1 0.0938 0.94674 0.988 0.012
#> SRR1974748 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974746 1 0.0938 0.95185 0.988 0.012
#> SRR1974744 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974745 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974743 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974742 1 0.0938 0.94674 0.988 0.012
#> SRR1974740 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974739 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974741 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974738 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974737 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974736 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974735 1 0.1633 0.96140 0.976 0.024
#> SRR1974734 2 0.2423 0.96242 0.040 0.960
#> SRR1974733 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974732 1 0.0672 0.93753 0.992 0.008
#> SRR1974731 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974729 1 0.1633 0.96140 0.976 0.024
#> SRR1974730 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974728 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974725 1 0.7299 0.75457 0.796 0.204
#> SRR1974726 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974724 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974727 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974723 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974722 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974721 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974720 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974719 1 0.4431 0.92111 0.908 0.092
#> SRR1974718 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974716 2 0.1184 0.97875 0.016 0.984
#> SRR1974717 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974715 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974713 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974714 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974711 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974712 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974709 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974708 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974710 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974707 1 0.9732 0.40886 0.596 0.404
#> SRR1974706 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974704 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974705 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974703 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974702 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974701 2 0.3274 0.95182 0.060 0.940
#> SRR1974699 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974698 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974700 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974697 1 0.1843 0.96441 0.972 0.028
#> SRR1974696 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974694 1 0.0672 0.94852 0.992 0.008
#> SRR1974695 2 0.6801 0.78500 0.180 0.820
#> SRR1974693 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974692 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974690 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974691 1 0.0938 0.94674 0.988 0.012
#> SRR1974689 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974688 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974687 1 0.0938 0.95185 0.988 0.012
#> SRR1974686 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974685 1 0.0672 0.94852 0.992 0.008
#> SRR1974684 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974683 1 0.0672 0.93753 0.992 0.008
#> SRR1974682 1 0.5842 0.83863 0.860 0.140
#> SRR1974681 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974679 2 0.2948 0.95645 0.052 0.948
#> SRR1974680 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974678 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974677 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974676 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974675 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974674 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974673 2 0.0672 0.98006 0.008 0.992
#> SRR1974671 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974672 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974670 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974669 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974667 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974668 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974666 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974664 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974665 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974663 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974662 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974661 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974660 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974659 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974658 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974657 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974654 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974655 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974656 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974650 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974651 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974652 2 0.4939 0.88411 0.108 0.892
#> SRR1974653 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974648 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974646 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974649 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974647 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974645 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974644 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974643 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974642 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974640 1 0.3431 0.94908 0.936 0.064
#> SRR1974641 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974639 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974638 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974635 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974636 2 0.3114 0.94446 0.056 0.944
#> SRR1974634 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974637 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974633 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974632 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974631 1 0.5059 0.90554 0.888 0.112
#> SRR1974630 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974629 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974628 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974627 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974624 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974625 2 0.0000 0.98021 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974622 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974620 2 0.2043 0.96672 0.032 0.968
#> SRR1974619 2 0.1184 0.97875 0.016 0.984
#> SRR1974621 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974617 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974616 1 0.7299 0.80359 0.796 0.204
#> SRR1974615 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974618 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974614 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974613 1 0.7056 0.81412 0.808 0.192
#> SRR1974612 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974611 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974610 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974609 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974608 1 0.0938 0.94674 0.988 0.012
#> SRR1974607 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974606 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974605 1 0.0938 0.94112 0.988 0.012
#> SRR1974604 2 0.2603 0.95974 0.044 0.956
#> SRR1974603 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974602 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974600 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974601 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974599 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974598 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974596 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974594 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974593 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974595 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974592 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974591 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974588 2 0.0672 0.97950 0.008 0.992
#> SRR1974590 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974589 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974587 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974586 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974585 2 0.0938 0.97834 0.012 0.988
#> SRR1974584 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974583 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974582 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974581 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974580 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974578 2 0.1843 0.96987 0.028 0.972
#> SRR1974577 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974579 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974576 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974575 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974574 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974573 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974571 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974572 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974570 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974568 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974567 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974566 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974569 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974565 2 0.0938 0.97834 0.012 0.988
#> SRR1974564 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974560 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974559 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974563 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974562 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974561 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974557 2 0.2423 0.96067 0.040 0.960
#> SRR1974553 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974555 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974551 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974552 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974554 1 0.2603 0.96485 0.956 0.044
#> SRR1974558 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974556 1 0.2236 0.97005 0.964 0.036
#> SRR1974550 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974549 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974548 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974547 2 0.2423 0.96015 0.040 0.960
#> SRR1974546 2 0.0938 0.97990 0.012 0.988
#> SRR1974545 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
#> SRR1974544 1 0.6712 0.82894 0.824 0.176
#> SRR1974543 2 0.0376 0.98075 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0661 0.8983 0.004 0.008 0.988
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974998 3 0.0661 0.8983 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974997 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.3607 0.7753 0.112 0.008 0.880
#> SRR1974989 2 0.5859 0.7612 0.000 0.656 0.344
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0661 0.8983 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.2680 0.8309 0.068 0.008 0.924
#> SRR1974977 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974965 3 0.5202 0.6340 0.220 0.008 0.772
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974959 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0237 0.9015 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974955 1 0.2945 0.8887 0.908 0.004 0.088
#> SRR1974954 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974945 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974944 1 0.0237 0.9664 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.6451 0.2842 0.384 0.008 0.608
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.3682 0.7699 0.116 0.008 0.876
#> SRR1974940 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974937 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974936 3 0.6180 0.4118 0.332 0.008 0.660
#> SRR1974935 3 0.0661 0.8983 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974931 3 0.0661 0.8983 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974930 3 0.5692 0.5555 0.268 0.008 0.724
#> SRR1974929 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974924 1 0.5202 0.7143 0.772 0.008 0.220
#> SRR1974925 3 0.5896 0.5046 0.292 0.008 0.700
#> SRR1974926 1 0.0237 0.9664 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974923 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974922 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974921 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974920 3 0.6018 0.4655 0.308 0.008 0.684
#> SRR1974919 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974918 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974917 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974915 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974914 3 0.1860 0.8589 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974913 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974911 3 0.3607 0.7748 0.112 0.008 0.880
#> SRR1974910 3 0.1170 0.8876 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.1860 0.8646 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0237 0.9005 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974894 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974892 3 0.0424 0.9005 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974890 3 0.5835 0.1849 0.000 0.340 0.660
#> SRR1974891 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.5835 0.7630 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974887 2 0.5216 0.7675 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974885 2 0.4504 0.7690 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974883 3 0.0237 0.9015 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.6308 0.4761 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974882 3 0.5948 0.1153 0.000 0.360 0.640
#> SRR1974880 2 0.5926 0.7500 0.000 0.644 0.356
#> SRR1974879 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974876 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974875 3 0.3619 0.7596 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974874 2 0.1753 0.7472 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974873 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974871 2 0.1753 0.7472 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974872 3 0.2356 0.8447 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974869 3 0.4121 0.7230 0.000 0.168 0.832
#> SRR1974868 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974870 3 0.2625 0.8324 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974866 3 0.4002 0.7364 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2066 0.7509 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974864 1 0.7283 0.0427 0.512 0.028 0.460
#> SRR1974862 2 0.1964 0.7498 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974863 2 0.3551 0.7668 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974860 2 0.6154 0.6703 0.000 0.592 0.408
#> SRR1974861 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974859 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974858 2 0.5760 0.7689 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974856 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974857 2 0.4842 0.7839 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974855 2 0.5591 0.7812 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.6451 0.1219 0.436 0.560 0.004
#> SRR1974852 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.4002 0.7773 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974846 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 3 0.7634 0.5709 0.232 0.100 0.668
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974839 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974834 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974833 2 0.5465 0.7866 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974831 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0237 0.9669 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.5859 0.7600 0.000 0.656 0.344
#> SRR1974827 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0592 0.9602 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.3141 0.8908 0.912 0.020 0.068
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.8040 0.3772 0.608 0.300 0.092
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.7244 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.6452 0.6242 0.712 0.252 0.036
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 3 0.4002 0.7364 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974811 1 0.0424 0.9642 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.5363 0.7873 0.000 0.724 0.276
#> SRR1974804 1 0.5797 0.6416 0.712 0.280 0.008
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 3 0.2796 0.8287 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974797 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974796 2 0.5363 0.7873 0.000 0.724 0.276
#> SRR1974795 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974792 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974791 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974790 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974789 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974788 2 0.6062 0.7142 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974786 3 0.2165 0.8566 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974787 3 0.7807 0.5420 0.144 0.184 0.672
#> SRR1974784 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 3 0.3846 0.7990 0.016 0.108 0.876
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.5465 0.7874 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974780 3 0.6154 -0.0847 0.000 0.408 0.592
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 3 0.2261 0.8528 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974778 1 0.5815 0.5519 0.692 0.004 0.304
#> SRR1974774 2 0.6079 0.7075 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.5810 0.7666 0.000 0.664 0.336
#> SRR1974770 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974769 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974768 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974767 3 0.3879 0.7489 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974766 2 0.5948 0.7439 0.000 0.640 0.360
#> SRR1974765 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974764 2 0.6026 0.7258 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0237 0.9664 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974761 2 0.5905 0.7521 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974760 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974757 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974755 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974753 2 0.1643 0.7470 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974751 2 0.1711 0.7407 0.008 0.960 0.032
#> SRR1974750 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.5733 0.7711 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.1753 0.7472 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974745 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974743 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974739 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974741 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974738 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974737 2 0.1643 0.7470 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974736 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974733 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974732 1 0.6180 0.4853 0.584 0.416 0.000
#> SRR1974731 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974725 2 0.7178 -0.1943 0.464 0.512 0.024
#> SRR1974726 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 3 0.5621 0.3639 0.000 0.308 0.692
#> SRR1974723 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974722 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974721 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974720 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974719 1 0.2492 0.9176 0.936 0.048 0.016
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 3 0.6521 -0.4185 0.004 0.496 0.500
#> SRR1974717 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974715 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.1399 0.9445 0.968 0.004 0.028
#> SRR1974711 3 0.4121 0.7232 0.000 0.168 0.832
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.4062 0.7299 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974710 3 0.3686 0.7717 0.000 0.140 0.860
#> SRR1974707 1 0.6839 0.4035 0.624 0.024 0.352
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974702 3 0.3879 0.7490 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974701 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974699 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974698 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974694 1 0.0237 0.9668 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974695 3 0.8593 0.4463 0.248 0.156 0.596
#> SRR1974693 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974692 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974690 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974688 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3192 0.8812 0.888 0.112 0.000
#> SRR1974682 2 0.6422 0.2566 0.324 0.660 0.016
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.1411 0.7448 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9024 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 3 0.4002 0.7364 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974671 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974672 2 0.2261 0.7528 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974670 2 0.3038 0.7607 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974669 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974667 2 0.6026 0.7258 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974668 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974666 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974664 2 0.4887 0.7779 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974665 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974663 3 0.3816 0.7548 0.000 0.148 0.852
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.4293 0.7411 0.004 0.164 0.832
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0237 0.9665 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 3 0.4062 0.7436 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974651 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974652 3 0.6892 0.6621 0.112 0.152 0.736
#> SRR1974653 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 3 0.4002 0.7364 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.6026 0.7258 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.3879 0.7611 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974640 1 0.1878 0.9286 0.952 0.004 0.044
#> SRR1974641 2 0.1753 0.7472 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.5119 0.7355 0.028 0.160 0.812
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.1753 0.7472 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.3272 0.8672 0.892 0.004 0.104
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0237 0.9664 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 3 0.6180 -0.1230 0.000 0.416 0.584
#> SRR1974623 3 0.4121 0.7373 0.000 0.168 0.832
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 3 0.4544 0.8072 0.056 0.084 0.860
#> SRR1974619 2 0.6018 0.7732 0.008 0.684 0.308
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.6541 0.6633 0.732 0.212 0.056
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.3686 0.7658 0.000 0.140 0.860
#> SRR1974613 1 0.4351 0.7862 0.828 0.004 0.168
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 3 0.4062 0.7436 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974610 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2066 0.9256 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974607 1 0.0237 0.9665 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974606 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974605 1 0.4750 0.7717 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974604 2 0.1529 0.7467 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974603 3 0.4178 0.7161 0.000 0.172 0.828
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.5706 0.7758 0.000 0.680 0.320
#> SRR1974601 3 0.4452 0.6776 0.000 0.192 0.808
#> SRR1974599 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974598 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974596 2 0.6026 0.7258 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974594 2 0.5138 0.7903 0.000 0.748 0.252
#> SRR1974593 2 0.5835 0.7632 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974595 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974592 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974591 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974588 2 0.4842 0.7881 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974590 2 0.5733 0.7705 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974589 2 0.5431 0.7886 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974587 2 0.5706 0.7768 0.000 0.680 0.320
#> SRR1974586 2 0.5733 0.7731 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974585 2 0.4842 0.7883 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974582 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974581 2 0.6045 0.7207 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974580 2 0.5591 0.7833 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974578 2 0.3619 0.7721 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974577 2 0.6062 0.7143 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974579 2 0.5254 0.7910 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974576 2 0.5785 0.7692 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974575 2 0.5835 0.7632 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974574 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974573 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974571 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974572 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974570 3 0.4002 0.7364 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974568 1 0.0237 0.9665 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974569 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974565 2 0.4409 0.7798 0.004 0.824 0.172
#> SRR1974564 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974560 1 0.0237 0.9665 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974562 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974561 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974557 2 0.5560 0.7864 0.000 0.700 0.300
#> SRR1974553 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0424 0.9643 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974552 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974554 1 0.0983 0.9535 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 3 0.4178 0.7308 0.000 0.172 0.828
#> SRR1974549 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974548 2 0.5529 0.7854 0.000 0.704 0.296
#> SRR1974547 3 0.7047 0.6038 0.084 0.204 0.712
#> SRR1974546 3 0.4062 0.7371 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974545 2 0.5465 0.7857 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974544 1 0.3889 0.8568 0.884 0.032 0.084
#> SRR1974543 2 0.5431 0.7880 0.000 0.716 0.284
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.3311 0.72838 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1975006 3 0.4500 0.55045 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1975005 3 0.0592 0.84495 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1975004 3 0.0188 0.84524 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975003 3 0.4277 0.60340 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1975001 3 0.4866 0.34759 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1975002 3 0.4730 0.45498 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1974999 3 0.4543 0.53808 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1975000 3 0.0188 0.84524 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.1637 0.82599 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1974995 3 0.0469 0.84598 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0469 0.84600 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.6993 0.57233 0.000 0.512 0.124 0.364
#> SRR1974991 3 0.0188 0.84699 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0817 0.84197 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974988 3 0.0592 0.84539 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974984 3 0.0707 0.84348 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974985 3 0.0188 0.84524 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974983 3 0.4585 0.52427 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.4454 0.57993 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1118 0.83559 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974978 3 0.0188 0.84472 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.4522 0.54603 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1974975 3 0.0469 0.84598 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974974 3 0.4500 0.55106 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1974973 3 0.4543 0.53754 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.4746 0.46654 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0707 0.84336 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0592 0.83427 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0188 0.84699 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0707 0.84341 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974962 3 0.4564 0.53180 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0592 0.84491 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974957 3 0.0469 0.84598 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.4866 0.16068 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.4564 0.53180 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0188 0.84699 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974950 3 0.0707 0.84336 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974951 3 0.0817 0.84161 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974947 3 0.0592 0.84491 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974948 3 0.4564 0.53051 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974946 3 0.4992 0.11952 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.4898 0.36531 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1974942 3 0.2408 0.73566 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1974943 3 0.0188 0.84699 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0592 0.84491 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.1557 0.78937 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.4564 0.53180 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974933 3 0.0469 0.84595 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0817 0.82611 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.4522 0.54446 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.4164 0.51473 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1974925 3 0.0469 0.83795 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974926 1 0.4103 0.66593 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1974923 3 0.0188 0.84524 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0188 0.84524 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974920 3 0.0817 0.82590 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.4543 0.53886 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.5573 0.40371 0.000 0.368 0.604 0.028
#> SRR1974913 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0188 0.84472 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974908 3 0.4564 0.53363 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.3123 0.74779 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0592 0.84484 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0469 0.84596 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.84736 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.4697 0.47608 0.000 0.356 0.644 0.000
#> SRR1974900 3 0.4713 0.47971 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1974899 3 0.4855 0.36477 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974897 3 0.4679 0.48372 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1974896 2 0.6413 0.23835 0.000 0.516 0.416 0.068
#> SRR1974893 3 0.1389 0.82851 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974895 3 0.4981 0.16186 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1974894 3 0.4543 0.54934 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1974892 3 0.1389 0.83258 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974890 3 0.7351 0.03017 0.000 0.264 0.524 0.212
#> SRR1974891 3 0.4277 0.61142 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1974889 3 0.4888 0.32963 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1974888 3 0.4477 0.56777 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1974886 2 0.6501 0.61044 0.000 0.588 0.096 0.316
#> SRR1974887 4 0.6700 0.25033 0.000 0.112 0.316 0.572
#> SRR1974885 4 0.5690 0.52128 0.000 0.096 0.196 0.708
#> SRR1974883 3 0.2216 0.80327 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974884 3 0.4624 0.50992 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1974881 2 0.7322 0.56994 0.000 0.532 0.224 0.244
#> SRR1974882 2 0.7299 0.56510 0.000 0.536 0.240 0.224
#> SRR1974880 2 0.6508 0.61899 0.000 0.600 0.104 0.296
#> SRR1974879 3 0.4661 0.50630 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1974877 3 0.4955 0.22826 0.000 0.444 0.556 0.000
#> SRR1974876 3 0.4624 0.52168 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1974878 3 0.2814 0.77583 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1974875 3 0.3205 0.74250 0.000 0.024 0.872 0.104
#> SRR1974874 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.4999 0.30442 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR1974869 2 0.5036 0.39210 0.000 0.696 0.280 0.024
#> SRR1974868 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974870 2 0.4999 0.30442 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR1974866 2 0.5228 0.33847 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974867 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.5016 -0.06630 0.000 0.396 0.004 0.600
#> SRR1974864 2 0.8077 -0.00562 0.360 0.408 0.220 0.012
#> SRR1974862 4 0.4746 0.06070 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1974863 4 0.5360 -0.22282 0.000 0.436 0.012 0.552
#> SRR1974860 2 0.6681 0.61679 0.000 0.588 0.120 0.292
#> SRR1974861 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974859 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.6627 0.51594 0.000 0.504 0.084 0.412
#> SRR1974856 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.5861 0.39769 0.000 0.488 0.032 0.480
#> SRR1974855 2 0.5310 0.44546 0.000 0.576 0.012 0.412
#> SRR1974854 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.7923 -0.23855 0.344 0.328 0.000 0.328
#> SRR1974852 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974849 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5028 0.10546 0.000 0.400 0.004 0.596
#> SRR1974846 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.4819 0.45523 0.000 0.652 0.004 0.344
#> SRR1974844 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.7663 0.21862 0.216 0.532 0.240 0.012
#> SRR1974842 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974838 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974834 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974833 2 0.4964 0.42943 0.000 0.616 0.004 0.380
#> SRR1974831 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974832 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0188 0.91465 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.5161 0.58542 0.000 0.676 0.024 0.300
#> SRR1974827 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974824 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.3908 0.80229 0.784 0.212 0.004 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.4477 0.72026 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7623 0.24256 0.440 0.380 0.004 0.176
#> SRR1974815 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.2216 0.76213 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1974812 1 0.7582 0.17613 0.488 0.320 0.004 0.188
#> SRR1974810 1 0.2345 0.87215 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.5228 0.33858 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974811 1 0.3486 0.82550 0.812 0.188 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.3649 0.81065 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0592 0.91099 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974804 1 0.6794 0.34009 0.584 0.136 0.000 0.280
#> SRR1974803 1 0.0188 0.91521 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.4999 0.30442 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR1974799 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.6528 0.61947 0.000 0.596 0.104 0.300
#> SRR1974797 2 0.4088 0.56558 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1974796 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974795 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974793 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974792 2 0.4608 0.50432 0.000 0.692 0.004 0.304
#> SRR1974791 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974790 2 0.4122 0.56309 0.000 0.760 0.004 0.236
#> SRR1974789 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974788 2 0.6558 0.61977 0.000 0.596 0.108 0.296
#> SRR1974786 2 0.5159 0.20480 0.000 0.624 0.364 0.012
#> SRR1974787 2 0.6718 0.39002 0.092 0.656 0.224 0.028
#> SRR1974784 2 0.4855 0.44074 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974783 1 0.0188 0.91520 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.5290 0.30512 0.008 0.656 0.324 0.012
#> SRR1974782 1 0.0817 0.90783 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.4677 0.50305 0.000 0.680 0.004 0.316
#> SRR1974780 2 0.4916 0.51875 0.000 0.760 0.184 0.056
#> SRR1974779 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0921 0.90613 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.5038 0.28446 0.000 0.652 0.336 0.012
#> SRR1974778 1 0.6538 0.62142 0.628 0.232 0.140 0.000
#> SRR1974774 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974773 1 0.3688 0.80791 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.2868 0.85243 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.6411 0.61541 0.000 0.600 0.092 0.308
#> SRR1974770 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974769 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974768 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974767 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974766 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974765 2 0.4855 0.44371 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974764 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974763 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.2053 0.88466 0.924 0.072 0.004 0.000
#> SRR1974761 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974760 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974759 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974757 2 0.4188 0.55591 0.000 0.752 0.004 0.244
#> SRR1974756 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974753 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.6578 0.55945 0.000 0.592 0.108 0.300
#> SRR1974747 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.3528 0.81875 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.3219 0.64426 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1974733 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.4040 0.54421 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1974731 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.1867 0.88618 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.4459 0.58400 0.032 0.188 0.000 0.780
#> SRR1974726 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5366 0.39803 0.000 0.684 0.276 0.040
#> SRR1974723 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.4868 0.77687 0.748 0.212 0.000 0.040
#> SRR1974718 1 0.1557 0.89394 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.5867 0.47463 0.004 0.696 0.216 0.084
#> SRR1974717 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.4290 0.79302 0.772 0.212 0.016 0.000
#> SRR1974711 2 0.5228 0.33858 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974712 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.5228 0.33858 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974710 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974707 1 0.7537 0.31066 0.468 0.360 0.168 0.004
#> SRR1974706 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.5233 0.29372 0.000 0.648 0.332 0.020
#> SRR1974701 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 4 0.0921 0.82351 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974694 1 0.0592 0.90738 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974695 2 0.7975 0.20949 0.212 0.516 0.248 0.024
#> SRR1974693 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.4122 0.56309 0.000 0.760 0.004 0.236
#> SRR1974691 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3444 0.75259 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974682 4 0.1474 0.79291 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1974681 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0188 0.91511 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974675 3 0.4605 0.51602 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.5430 0.38218 0.000 0.664 0.300 0.036
#> SRR1974671 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974672 4 0.4843 -0.04233 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974670 4 0.5112 -0.19934 0.000 0.436 0.004 0.560
#> SRR1974669 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974667 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974668 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974666 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974664 4 0.5768 -0.32521 0.000 0.456 0.028 0.516
#> SRR1974665 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974663 2 0.4999 0.30442 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR1974662 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.5793 0.31892 0.016 0.644 0.316 0.024
#> SRR1974660 1 0.3649 0.81039 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0336 0.91382 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974650 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974651 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 2 0.7007 0.28431 0.100 0.600 0.280 0.020
#> SRR1974653 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.5184 0.35203 0.000 0.672 0.304 0.024
#> SRR1974649 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.6497 0.61873 0.000 0.596 0.100 0.304
#> SRR1974643 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974640 1 0.4671 0.77608 0.752 0.220 0.028 0.000
#> SRR1974641 4 0.4522 0.22564 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1974639 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.6112 0.32133 0.032 0.640 0.304 0.024
#> SRR1974634 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.5533 0.73020 0.708 0.220 0.072 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.3908 0.80229 0.784 0.212 0.004 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.7241 0.58991 0.000 0.540 0.196 0.264
#> SRR1974623 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974622 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.6790 0.23437 0.076 0.584 0.324 0.016
#> SRR1974619 2 0.7461 0.45203 0.032 0.604 0.172 0.192
#> SRR1974621 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.7399 0.29755 0.532 0.280 0.004 0.184
#> SRR1974615 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.5090 0.31348 0.000 0.660 0.324 0.016
#> SRR1974613 1 0.6110 0.67648 0.660 0.240 0.100 0.000
#> SRR1974612 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974610 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2408 0.83925 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974607 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974605 4 0.7424 -0.12068 0.408 0.168 0.000 0.424
#> SRR1974604 4 0.0000 0.85683 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.5228 0.33858 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974602 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4980 0.57729 0.000 0.680 0.016 0.304
#> SRR1974601 2 0.5228 0.33858 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974599 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974598 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974596 2 0.5905 0.60418 0.000 0.636 0.060 0.304
#> SRR1974594 2 0.5119 0.39441 0.000 0.556 0.004 0.440
#> SRR1974593 2 0.5614 0.59594 0.000 0.652 0.044 0.304
#> SRR1974595 2 0.4655 0.49274 0.000 0.684 0.004 0.312
#> SRR1974592 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974591 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974588 2 0.4955 0.38620 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1974590 2 0.4770 0.58031 0.000 0.700 0.012 0.288
#> SRR1974589 2 0.5105 0.41104 0.000 0.564 0.004 0.432
#> SRR1974587 2 0.4814 0.56437 0.000 0.676 0.008 0.316
#> SRR1974586 2 0.5085 0.58160 0.000 0.676 0.020 0.304
#> SRR1974585 2 0.4955 0.38620 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1974584 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.6016 0.60926 0.000 0.632 0.068 0.300
#> SRR1974582 2 0.6280 0.61408 0.000 0.612 0.084 0.304
#> SRR1974581 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974580 2 0.5161 0.47356 0.000 0.592 0.008 0.400
#> SRR1974578 4 0.4817 0.14455 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974577 2 0.6548 0.61965 0.000 0.592 0.104 0.304
#> SRR1974579 2 0.5236 0.41181 0.000 0.560 0.008 0.432
#> SRR1974576 2 0.5277 0.58681 0.000 0.668 0.028 0.304
#> SRR1974575 2 0.6391 0.61661 0.000 0.604 0.092 0.304
#> SRR1974574 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974573 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974571 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974572 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974570 2 0.5137 0.36587 0.000 0.680 0.296 0.024
#> SRR1974568 1 0.3528 0.81796 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.1022 0.90391 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.4855 0.44362 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974569 2 0.4483 0.52320 0.000 0.712 0.004 0.284
#> SRR1974565 4 0.4961 -0.06277 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1974564 2 0.4088 0.56558 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1974560 1 0.3726 0.80496 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974562 2 0.4252 0.55131 0.000 0.744 0.004 0.252
#> SRR1974561 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974557 2 0.5352 0.52521 0.000 0.596 0.016 0.388
#> SRR1974553 2 0.4855 0.44362 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974555 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0469 0.91039 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.4699 0.48565 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1974554 1 0.3764 0.80206 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.3219 0.83450 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.91649 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.5228 0.33834 0.000 0.664 0.312 0.024
#> SRR1974549 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974548 2 0.5236 0.41558 0.000 0.560 0.008 0.432
#> SRR1974547 2 0.4792 0.48504 0.044 0.796 0.144 0.016
#> SRR1974546 2 0.5250 0.33050 0.000 0.660 0.316 0.024
#> SRR1974545 2 0.4088 0.56558 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1974544 1 0.5034 0.71998 0.700 0.280 0.012 0.008
#> SRR1974543 2 0.4872 0.43765 0.000 0.640 0.004 0.356
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1975008 3 0.5878 0.309051 0.000 0.336 0.548 0.000 0.116
#> SRR1975006 2 0.6034 0.060732 0.000 0.456 0.428 0.000 0.116
#> SRR1975005 3 0.3527 0.819214 0.000 0.056 0.828 0.000 0.116
#> SRR1975004 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1975003 3 0.6036 0.011412 0.000 0.432 0.452 0.000 0.116
#> SRR1975001 2 0.5932 0.234740 0.000 0.528 0.356 0.000 0.116
#> SRR1975002 2 0.6002 0.153905 0.000 0.492 0.392 0.000 0.116
#> SRR1974999 2 0.6032 0.065676 0.000 0.460 0.424 0.000 0.116
#> SRR1975000 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974998 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974997 3 0.4377 0.780454 0.000 0.108 0.776 0.004 0.112
#> SRR1974995 3 0.3085 0.841373 0.000 0.032 0.852 0.000 0.116
#> SRR1974996 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974994 1 0.1498 0.888423 0.952 0.000 0.024 0.016 0.008
#> SRR1974993 3 0.2824 0.848922 0.000 0.020 0.864 0.000 0.116
#> SRR1974992 3 0.2179 0.865033 0.000 0.004 0.896 0.000 0.100
#> SRR1974990 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974989 2 0.4565 0.551567 0.000 0.788 0.040 0.068 0.104
#> SRR1974991 3 0.2338 0.859501 0.000 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR1974986 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974987 3 0.4545 0.729635 0.000 0.132 0.752 0.000 0.116
#> SRR1974988 3 0.2835 0.857088 0.000 0.036 0.880 0.004 0.080
#> SRR1974984 3 0.3593 0.815922 0.000 0.060 0.824 0.000 0.116
#> SRR1974985 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974983 2 0.6024 0.106068 0.000 0.472 0.412 0.000 0.116
#> SRR1974982 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974981 3 0.4882 0.258978 0.388 0.000 0.588 0.012 0.012
#> SRR1974980 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974979 3 0.4169 0.771698 0.000 0.100 0.784 0.000 0.116
#> SRR1974978 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974977 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974976 2 0.6030 0.080322 0.000 0.464 0.420 0.000 0.116
#> SRR1974975 3 0.2984 0.847208 0.000 0.032 0.860 0.000 0.108
#> SRR1974974 2 0.6036 0.042928 0.000 0.452 0.432 0.000 0.116
#> SRR1974973 2 0.6030 0.085913 0.000 0.464 0.420 0.000 0.116
#> SRR1974972 3 0.1671 0.876077 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974971 2 0.6185 0.214721 0.000 0.504 0.348 0.000 0.148
#> SRR1974970 3 0.0162 0.891962 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974969 3 0.1792 0.876320 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974968 3 0.3608 0.816375 0.000 0.064 0.824 0.000 0.112
#> SRR1974967 3 0.0000 0.892412 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0833 0.885658 0.004 0.000 0.976 0.004 0.016
#> SRR1974966 3 0.1544 0.878598 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974964 3 0.2124 0.866834 0.000 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR1974963 3 0.1197 0.883694 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974961 3 0.3339 0.831539 0.000 0.048 0.840 0.000 0.112
#> SRR1974962 2 0.6030 0.079115 0.000 0.464 0.420 0.000 0.116
#> SRR1974960 3 0.0290 0.892494 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974959 3 0.0162 0.892659 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974958 3 0.2900 0.849160 0.000 0.028 0.864 0.000 0.108
#> SRR1974957 3 0.2864 0.848770 0.000 0.024 0.864 0.000 0.112
#> SRR1974956 3 0.1121 0.884680 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974955 3 0.3099 0.753888 0.132 0.000 0.848 0.008 0.012
#> SRR1974954 3 0.0162 0.892671 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974953 2 0.6021 0.115875 0.000 0.476 0.408 0.000 0.116
#> SRR1974952 3 0.1732 0.874960 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974949 3 0.1851 0.871734 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974950 3 0.3898 0.796248 0.000 0.080 0.804 0.000 0.116
#> SRR1974951 3 0.4010 0.786584 0.000 0.088 0.796 0.000 0.116
#> SRR1974947 3 0.3035 0.844076 0.000 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1974948 2 0.6028 0.095762 0.000 0.468 0.416 0.000 0.116
#> SRR1974946 2 0.5475 0.427382 0.000 0.644 0.232 0.000 0.124
#> SRR1974945 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974944 3 0.4486 0.505991 0.288 0.000 0.688 0.012 0.012
#> SRR1974942 3 0.1630 0.859887 0.036 0.000 0.944 0.004 0.016
#> SRR1974943 3 0.1671 0.876793 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974941 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974940 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974939 3 0.3064 0.843120 0.000 0.036 0.856 0.000 0.108
#> SRR1974938 3 0.0290 0.891497 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974937 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974936 3 0.0671 0.887887 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1974935 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974934 2 0.6021 0.114260 0.000 0.476 0.408 0.000 0.116
#> SRR1974933 3 0.2813 0.851408 0.000 0.024 0.868 0.000 0.108
#> SRR1974932 3 0.0290 0.892559 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974931 3 0.0510 0.890166 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974930 3 0.0671 0.887887 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1974929 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974928 2 0.6036 0.047542 0.000 0.452 0.432 0.000 0.116
#> SRR1974927 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974924 3 0.1836 0.852575 0.040 0.000 0.936 0.008 0.016
#> SRR1974925 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974926 1 0.5343 0.085998 0.492 0.000 0.468 0.016 0.024
#> SRR1974923 3 0.0510 0.890166 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974922 3 0.0404 0.890889 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974921 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974920 3 0.0671 0.888407 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974919 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974918 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974917 2 0.6032 0.067848 0.000 0.460 0.424 0.000 0.116
#> SRR1974916 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974915 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974914 2 0.6236 0.212780 0.000 0.512 0.360 0.008 0.120
#> SRR1974913 3 0.0290 0.892559 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974911 3 0.0510 0.890166 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974910 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974908 2 0.6017 0.125415 0.000 0.480 0.404 0.000 0.116
#> SRR1974909 3 0.0000 0.892412 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.5490 0.517361 0.000 0.248 0.636 0.000 0.116
#> SRR1974907 3 0.1544 0.878468 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974905 3 0.0404 0.892381 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974904 3 0.3216 0.837761 0.000 0.044 0.848 0.000 0.108
#> SRR1974903 3 0.0162 0.892659 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974902 3 0.3085 0.840472 0.000 0.032 0.852 0.000 0.116
#> SRR1974901 3 0.0162 0.892671 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974898 2 0.6032 0.161173 0.000 0.492 0.388 0.000 0.120
#> SRR1974900 2 0.6004 0.197643 0.000 0.508 0.372 0.000 0.120
#> SRR1974899 2 0.5825 0.305959 0.000 0.564 0.320 0.000 0.116
#> SRR1974897 2 0.5996 0.162563 0.000 0.496 0.388 0.000 0.116
#> SRR1974896 2 0.5338 0.474680 0.000 0.700 0.160 0.012 0.128
#> SRR1974893 3 0.4936 0.664598 0.000 0.172 0.712 0.000 0.116
#> SRR1974895 2 0.5535 0.410135 0.000 0.628 0.256 0.000 0.116
#> SRR1974894 2 0.6257 0.101017 0.000 0.468 0.400 0.004 0.128
#> SRR1974892 3 0.4519 0.769280 0.000 0.112 0.764 0.004 0.120
#> SRR1974890 2 0.6542 0.047911 0.000 0.460 0.412 0.028 0.100
#> SRR1974891 2 0.6273 0.006759 0.000 0.440 0.428 0.004 0.128
#> SRR1974889 2 0.5796 0.320832 0.000 0.572 0.312 0.000 0.116
#> SRR1974888 2 0.6249 0.132324 0.000 0.476 0.392 0.004 0.128
#> SRR1974886 2 0.3056 0.579170 0.000 0.876 0.012 0.056 0.056
#> SRR1974887 3 0.7577 0.026614 0.000 0.184 0.412 0.340 0.064
#> SRR1974885 4 0.6837 0.367419 0.000 0.148 0.312 0.508 0.032
#> SRR1974883 3 0.5589 0.573197 0.000 0.220 0.648 0.004 0.128
#> SRR1974884 2 0.6047 0.130640 0.000 0.480 0.400 0.000 0.120
#> SRR1974881 2 0.5041 0.518353 0.000 0.752 0.088 0.040 0.120
#> SRR1974882 2 0.5094 0.516445 0.000 0.748 0.092 0.040 0.120
#> SRR1974880 2 0.3385 0.567680 0.000 0.856 0.016 0.044 0.084
#> SRR1974879 2 0.6232 0.164412 0.000 0.488 0.380 0.004 0.128
#> SRR1974877 2 0.5732 0.344562 0.000 0.588 0.296 0.000 0.116
#> SRR1974876 2 0.6219 0.174710 0.000 0.496 0.372 0.004 0.128
#> SRR1974878 3 0.5927 0.466770 0.000 0.280 0.588 0.004 0.128
#> SRR1974875 3 0.3731 0.810365 0.000 0.068 0.844 0.040 0.048
#> SRR1974874 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974873 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974871 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974872 5 0.4812 0.566237 0.000 0.372 0.028 0.000 0.600
#> SRR1974869 2 0.4787 0.000194 0.000 0.608 0.028 0.000 0.364
#> SRR1974868 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974870 2 0.4990 -0.071298 0.000 0.580 0.036 0.000 0.384
#> SRR1974866 5 0.4734 0.573278 0.000 0.372 0.024 0.000 0.604
#> SRR1974867 1 0.0566 0.906732 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974865 2 0.4630 0.270937 0.000 0.588 0.000 0.396 0.016
#> SRR1974864 5 0.6211 0.613057 0.156 0.228 0.016 0.000 0.600
#> SRR1974862 2 0.4555 0.081898 0.000 0.520 0.000 0.472 0.008
#> SRR1974863 2 0.4437 0.413424 0.000 0.664 0.000 0.316 0.020
#> SRR1974860 2 0.2919 0.566560 0.000 0.888 0.024 0.044 0.044
#> SRR1974861 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974859 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974858 2 0.4000 0.512810 0.000 0.788 0.004 0.164 0.044
#> SRR1974856 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974857 2 0.4028 0.499942 0.000 0.768 0.000 0.192 0.040
#> SRR1974855 2 0.5759 0.430148 0.000 0.568 0.000 0.108 0.324
#> SRR1974854 1 0.0798 0.910507 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974853 1 0.0000 0.912220 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 5 0.8182 -0.132761 0.280 0.296 0.000 0.104 0.320
#> SRR1974852 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974849 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974848 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974850 2 0.6760 0.191487 0.000 0.400 0.000 0.284 0.316
#> SRR1974846 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974847 5 0.4420 0.337119 0.448 0.000 0.004 0.000 0.548
#> SRR1974845 2 0.5452 0.500372 0.000 0.616 0.000 0.092 0.292
#> SRR1974844 1 0.0290 0.911246 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974843 5 0.6150 0.608936 0.136 0.248 0.016 0.000 0.600
#> SRR1974842 1 0.0671 0.911700 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974841 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974840 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974839 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974838 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974837 1 0.0798 0.910707 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974835 1 0.0162 0.912036 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974836 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974834 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974833 2 0.5813 0.452427 0.000 0.560 0.000 0.112 0.328
#> SRR1974831 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974832 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974830 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974829 1 0.0451 0.910361 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974828 1 0.1018 0.906838 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974826 2 0.1996 0.580650 0.000 0.928 0.004 0.032 0.036
#> SRR1974827 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974824 1 0.0566 0.909344 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974825 5 0.4533 0.331388 0.448 0.000 0.000 0.008 0.544
#> SRR1974822 1 0.1195 0.900462 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1974823 5 0.5417 0.450295 0.360 0.048 0.004 0.004 0.584
#> SRR1974820 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974818 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974819 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974817 1 0.0404 0.912462 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974816 5 0.6651 0.472720 0.248 0.168 0.004 0.020 0.560
#> SRR1974815 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974813 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974814 4 0.2694 0.872025 0.000 0.076 0.000 0.884 0.040
#> SRR1974812 1 0.7969 -0.033820 0.356 0.264 0.000 0.080 0.300
#> SRR1974810 1 0.4446 0.169167 0.592 0.000 0.000 0.008 0.400
#> SRR1974808 5 0.4846 0.554327 0.000 0.384 0.028 0.000 0.588
#> SRR1974811 1 0.4911 -0.162100 0.504 0.008 0.000 0.012 0.476
#> SRR1974809 5 0.4450 0.241872 0.488 0.000 0.000 0.004 0.508
#> SRR1974807 1 0.1942 0.849292 0.920 0.000 0.000 0.012 0.068
#> SRR1974806 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974805 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974804 1 0.6966 0.387515 0.592 0.148 0.000 0.148 0.112
#> SRR1974803 1 0.1364 0.894513 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1974801 1 0.0162 0.912014 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974800 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974799 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974798 2 0.2591 0.575998 0.000 0.904 0.020 0.044 0.032
#> SRR1974797 2 0.4025 0.526283 0.000 0.700 0.000 0.008 0.292
#> SRR1974796 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974795 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974793 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974794 2 0.2124 0.586889 0.000 0.924 0.020 0.044 0.012
#> SRR1974792 2 0.4708 0.518299 0.000 0.668 0.000 0.040 0.292
#> SRR1974791 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974790 2 0.4025 0.526283 0.000 0.700 0.000 0.008 0.292
#> SRR1974789 2 0.2011 0.588587 0.000 0.928 0.020 0.044 0.008
#> SRR1974788 2 0.2124 0.586793 0.000 0.924 0.020 0.044 0.012
#> SRR1974786 5 0.4908 0.575630 0.000 0.356 0.036 0.000 0.608
#> SRR1974787 5 0.5248 0.589822 0.036 0.348 0.012 0.000 0.604
#> SRR1974784 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974783 1 0.0992 0.897235 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974785 5 0.4974 0.581448 0.008 0.364 0.024 0.000 0.604
#> SRR1974782 1 0.1764 0.857967 0.928 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR1974781 2 0.5140 0.517293 0.000 0.664 0.000 0.084 0.252
#> SRR1974780 5 0.4517 0.486593 0.000 0.436 0.008 0.000 0.556
#> SRR1974779 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974777 1 0.1638 0.858703 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1974776 5 0.4921 0.577180 0.000 0.360 0.036 0.000 0.604
#> SRR1974778 5 0.5431 0.480995 0.356 0.052 0.008 0.000 0.584
#> SRR1974774 2 0.2011 0.588575 0.000 0.928 0.020 0.044 0.008
#> SRR1974773 5 0.4449 0.253910 0.484 0.000 0.000 0.004 0.512
#> SRR1974775 1 0.4268 0.312879 0.648 0.000 0.000 0.008 0.344
#> SRR1974772 1 0.1117 0.904579 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974771 2 0.2173 0.584405 0.000 0.920 0.012 0.052 0.016
#> SRR1974770 2 0.1885 0.590012 0.000 0.932 0.020 0.044 0.004
#> SRR1974769 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974768 2 0.1885 0.590012 0.000 0.932 0.020 0.044 0.004
#> SRR1974767 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974766 2 0.1885 0.590698 0.000 0.932 0.020 0.044 0.004
#> SRR1974765 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974764 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974763 1 0.0671 0.911700 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974762 1 0.3519 0.622848 0.776 0.000 0.000 0.008 0.216
#> SRR1974761 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974760 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974759 1 0.0162 0.912036 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974758 2 0.2011 0.588621 0.000 0.928 0.020 0.044 0.008
#> SRR1974757 2 0.4003 0.527284 0.000 0.704 0.000 0.008 0.288
#> SRR1974756 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974754 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974755 2 0.2011 0.588575 0.000 0.928 0.020 0.044 0.008
#> SRR1974753 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974751 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974750 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974752 1 0.0566 0.907342 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974749 2 0.4893 -0.190980 0.000 0.568 0.000 0.028 0.404
#> SRR1974747 1 0.1117 0.904579 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974748 1 0.4656 -0.183585 0.508 0.000 0.000 0.012 0.480
#> SRR1974746 1 0.1018 0.906838 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974744 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974745 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974743 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974742 1 0.1012 0.904896 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1974740 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974739 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974741 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974738 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974737 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974736 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974735 1 0.1018 0.907503 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974734 4 0.4505 0.390125 0.000 0.012 0.000 0.604 0.384
#> SRR1974733 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974732 4 0.1913 0.873403 0.044 0.008 0.000 0.932 0.016
#> SRR1974731 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974729 1 0.1018 0.906838 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974730 1 0.3427 0.666030 0.796 0.000 0.000 0.012 0.192
#> SRR1974728 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974725 4 0.4238 0.416733 0.000 0.004 0.000 0.628 0.368
#> SRR1974726 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974724 1 0.0912 0.909330 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974727 2 0.4856 -0.087334 0.000 0.584 0.020 0.004 0.392
#> SRR1974723 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974722 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974721 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974720 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974719 5 0.5236 0.362446 0.432 0.020 0.000 0.016 0.532
#> SRR1974718 1 0.2997 0.740388 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR1974716 5 0.4505 0.564697 0.000 0.384 0.012 0.000 0.604
#> SRR1974717 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974715 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974713 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974714 5 0.4504 0.372939 0.428 0.000 0.008 0.000 0.564
#> SRR1974711 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974712 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974709 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974708 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974710 5 0.4874 0.573791 0.000 0.368 0.032 0.000 0.600
#> SRR1974707 5 0.6131 0.616969 0.216 0.180 0.008 0.000 0.596
#> SRR1974706 1 0.0912 0.908780 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974704 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.912220 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974702 5 0.5133 0.520302 0.000 0.388 0.044 0.000 0.568
#> SRR1974701 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974699 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974698 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974700 1 0.0912 0.908780 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974697 1 0.1117 0.903554 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974696 4 0.1211 0.935551 0.000 0.024 0.000 0.960 0.016
#> SRR1974694 1 0.1485 0.892599 0.948 0.000 0.000 0.032 0.020
#> SRR1974695 5 0.5866 0.604864 0.088 0.292 0.016 0.000 0.604
#> SRR1974693 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974692 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974690 2 0.4109 0.526874 0.000 0.700 0.000 0.012 0.288
#> SRR1974691 1 0.1117 0.904579 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974689 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974688 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974687 1 0.1117 0.904579 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974686 1 0.0912 0.908780 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974685 1 0.1012 0.904896 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1974684 1 0.0510 0.912268 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974683 1 0.4132 0.599888 0.720 0.000 0.000 0.260 0.020
#> SRR1974682 4 0.0898 0.932798 0.008 0.020 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974681 1 0.0162 0.912036 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974679 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974680 1 0.0451 0.910299 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974678 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974677 1 0.0162 0.911292 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974676 2 0.1885 0.590012 0.000 0.932 0.020 0.044 0.004
#> SRR1974675 2 0.6007 0.145416 0.000 0.488 0.396 0.000 0.116
#> SRR1974674 1 0.0404 0.912400 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974673 2 0.4703 0.260140 0.000 0.684 0.036 0.004 0.276
#> SRR1974671 2 0.1885 0.590109 0.000 0.932 0.020 0.044 0.004
#> SRR1974672 2 0.4582 0.219460 0.000 0.572 0.000 0.416 0.012
#> SRR1974670 2 0.4029 0.419215 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1974669 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974667 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974668 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974666 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974664 2 0.4725 0.453888 0.000 0.680 0.004 0.280 0.036
#> SRR1974665 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974663 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974662 1 0.0290 0.912447 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974661 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974660 1 0.4659 -0.228147 0.496 0.000 0.000 0.012 0.492
#> SRR1974659 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974658 1 0.0162 0.911292 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974657 5 0.4430 0.322031 0.456 0.000 0.000 0.004 0.540
#> SRR1974654 1 0.0566 0.907855 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974655 5 0.4572 0.329500 0.452 0.000 0.004 0.004 0.540
#> SRR1974656 5 0.4546 0.310715 0.460 0.000 0.000 0.008 0.532
#> SRR1974650 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974651 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974652 5 0.5713 0.598024 0.056 0.316 0.024 0.000 0.604
#> SRR1974653 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974648 1 0.0798 0.909326 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974646 2 0.4917 -0.165161 0.000 0.556 0.028 0.000 0.416
#> SRR1974649 1 0.0404 0.912462 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974647 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974645 1 0.0290 0.911246 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974644 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974643 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974642 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974640 5 0.5048 0.399181 0.412 0.020 0.004 0.004 0.560
#> SRR1974641 4 0.4278 0.147397 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1974639 1 0.0324 0.910812 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974638 5 0.4294 0.304454 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974635 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974636 5 0.5218 0.587046 0.020 0.352 0.024 0.000 0.604
#> SRR1974634 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974637 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974633 5 0.4680 0.329776 0.448 0.000 0.004 0.008 0.540
#> SRR1974632 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974631 5 0.5494 0.438170 0.388 0.044 0.012 0.000 0.556
#> SRR1974630 1 0.0404 0.912462 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974629 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974628 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974627 5 0.4549 0.303806 0.464 0.000 0.000 0.008 0.528
#> SRR1974624 1 0.0290 0.911031 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974625 2 0.4079 0.546053 0.000 0.812 0.028 0.044 0.116
#> SRR1974623 5 0.4800 0.576095 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974622 5 0.4546 0.310715 0.460 0.000 0.000 0.008 0.532
#> SRR1974620 5 0.5190 0.585180 0.012 0.352 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974619 5 0.4885 0.575064 0.008 0.372 0.012 0.004 0.604
#> SRR1974621 1 0.0566 0.911891 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974617 1 0.0290 0.911246 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974616 1 0.8010 -0.043515 0.344 0.240 0.000 0.088 0.328
#> SRR1974615 1 0.0404 0.910639 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974618 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974614 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974613 5 0.5934 0.476866 0.356 0.068 0.020 0.000 0.556
#> SRR1974612 5 0.4546 0.310715 0.460 0.000 0.000 0.008 0.532
#> SRR1974611 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974610 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974609 1 0.0404 0.910639 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974608 1 0.3495 0.735730 0.812 0.000 0.000 0.160 0.028
#> SRR1974607 5 0.4562 0.345109 0.444 0.000 0.004 0.004 0.548
#> SRR1974606 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974605 4 0.6957 -0.118522 0.248 0.008 0.000 0.384 0.360
#> SRR1974604 4 0.0880 0.950404 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974603 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974602 1 0.0510 0.912202 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974600 2 0.2227 0.581482 0.000 0.916 0.004 0.032 0.048
#> SRR1974601 5 0.4800 0.575072 0.000 0.368 0.028 0.000 0.604
#> SRR1974599 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974598 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974596 2 0.1913 0.590368 0.000 0.932 0.016 0.044 0.008
#> SRR1974594 2 0.5816 0.484824 0.000 0.588 0.000 0.132 0.280
#> SRR1974593 2 0.1739 0.581863 0.000 0.940 0.004 0.032 0.024
#> SRR1974595 2 0.5087 0.510864 0.000 0.644 0.000 0.064 0.292
#> SRR1974592 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974591 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974588 5 0.6219 -0.277974 0.000 0.424 0.000 0.140 0.436
#> SRR1974590 2 0.2569 0.580025 0.000 0.896 0.004 0.032 0.068
#> SRR1974589 2 0.5759 0.492932 0.000 0.596 0.000 0.128 0.276
#> SRR1974587 2 0.1990 0.581874 0.000 0.928 0.004 0.040 0.028
#> SRR1974586 2 0.1996 0.583826 0.000 0.928 0.004 0.032 0.036
#> SRR1974585 2 0.5852 0.486992 0.000 0.584 0.000 0.136 0.280
#> SRR1974584 1 0.0510 0.912268 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974583 2 0.1569 0.588247 0.000 0.948 0.012 0.032 0.008
#> SRR1974582 2 0.1626 0.590381 0.000 0.940 0.016 0.044 0.000
#> SRR1974581 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974580 2 0.5127 0.535441 0.000 0.692 0.004 0.092 0.212
#> SRR1974578 5 0.6755 -0.251244 0.000 0.360 0.000 0.264 0.376
#> SRR1974577 2 0.2026 0.587764 0.000 0.928 0.016 0.044 0.012
#> SRR1974579 2 0.5678 0.504392 0.000 0.612 0.000 0.128 0.260
#> SRR1974576 2 0.1646 0.583315 0.000 0.944 0.004 0.032 0.020
#> SRR1974575 2 0.1725 0.591195 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1974574 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974573 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974571 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974572 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974570 5 0.4900 0.396740 0.000 0.464 0.024 0.000 0.512
#> SRR1974568 5 0.4706 0.222019 0.492 0.000 0.004 0.008 0.496
#> SRR1974567 1 0.3093 0.700138 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR1974566 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974569 2 0.4708 0.518749 0.000 0.668 0.000 0.040 0.292
#> SRR1974565 2 0.6312 0.323520 0.000 0.452 0.000 0.156 0.392
#> SRR1974564 2 0.3884 0.527596 0.000 0.708 0.000 0.004 0.288
#> SRR1974560 5 0.4562 0.345109 0.444 0.000 0.004 0.004 0.548
#> SRR1974559 1 0.0566 0.912701 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974563 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974562 2 0.4485 0.522090 0.000 0.680 0.000 0.028 0.292
#> SRR1974561 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974557 2 0.2660 0.563203 0.000 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR1974553 2 0.5452 0.500218 0.000 0.616 0.000 0.092 0.292
#> SRR1974555 1 0.0671 0.911700 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974551 1 0.1393 0.894053 0.956 0.008 0.000 0.012 0.024
#> SRR1974552 2 0.5355 0.503576 0.000 0.624 0.000 0.084 0.292
#> SRR1974554 5 0.4811 0.361811 0.436 0.008 0.004 0.004 0.548
#> SRR1974558 1 0.4510 -0.021793 0.560 0.000 0.000 0.008 0.432
#> SRR1974556 1 0.0404 0.910639 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974550 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974549 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
#> SRR1974548 2 0.5617 0.510179 0.000 0.620 0.000 0.124 0.256
#> SRR1974547 5 0.4080 0.486075 0.016 0.212 0.012 0.000 0.760
#> SRR1974546 5 0.4862 0.577832 0.000 0.364 0.032 0.000 0.604
#> SRR1974545 2 0.3906 0.525750 0.000 0.704 0.000 0.004 0.292
#> SRR1974544 5 0.5403 0.436370 0.388 0.052 0.004 0.000 0.556
#> SRR1974543 2 0.5544 0.493819 0.000 0.608 0.000 0.100 0.292
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975008 2 0.4249 0.31571 0.000 0.640 0.328 0.000 0.032 0.000
#> SRR1975006 2 0.4151 0.44124 0.000 0.684 0.276 0.000 0.040 0.000
#> SRR1975005 3 0.4361 0.62115 0.000 0.308 0.648 0.000 0.044 0.000
#> SRR1975004 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975003 2 0.4127 0.42390 0.000 0.680 0.284 0.000 0.036 0.000
#> SRR1975001 2 0.4062 0.55902 0.000 0.744 0.192 0.000 0.060 0.004
#> SRR1975002 2 0.4091 0.52262 0.000 0.720 0.224 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974999 2 0.4168 0.47649 0.000 0.696 0.256 0.000 0.048 0.000
#> SRR1975000 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974998 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974997 3 0.6069 0.36644 0.000 0.412 0.448 0.000 0.096 0.044
#> SRR1974995 3 0.3897 0.68148 0.000 0.280 0.696 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974996 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974994 1 0.2404 0.80419 0.880 0.004 0.104 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974993 3 0.3841 0.70220 0.000 0.256 0.716 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974992 3 0.3348 0.74637 0.000 0.216 0.768 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974990 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974989 2 0.3796 0.54145 0.000 0.812 0.008 0.016 0.100 0.064
#> SRR1974991 3 0.3566 0.72784 0.000 0.236 0.744 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974986 3 0.0146 0.83448 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.4651 0.22347 0.000 0.476 0.484 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974988 3 0.4228 0.71882 0.000 0.228 0.708 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974984 3 0.4330 0.59367 0.000 0.332 0.632 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974985 3 0.0146 0.83448 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.4145 0.48425 0.000 0.700 0.252 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.83398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3974 0.61671 0.172 0.008 0.768 0.000 0.004 0.048
#> SRR1974980 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974979 3 0.4449 0.36611 0.000 0.440 0.532 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974978 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974977 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974976 2 0.4145 0.48356 0.000 0.700 0.252 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974975 3 0.3855 0.68916 0.000 0.272 0.704 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974974 2 0.4190 0.46908 0.000 0.692 0.260 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974973 2 0.4131 0.44989 0.000 0.688 0.272 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974972 3 0.2902 0.76672 0.000 0.196 0.800 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974971 2 0.4462 0.55791 0.000 0.712 0.152 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974970 3 0.1141 0.82738 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.3012 0.76653 0.000 0.196 0.796 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974968 3 0.4292 0.50345 0.000 0.388 0.588 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974967 3 0.0790 0.83215 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974966 3 0.2595 0.78696 0.000 0.160 0.836 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974964 3 0.3290 0.75168 0.000 0.208 0.776 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974963 3 0.2378 0.79266 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.4206 0.56769 0.000 0.356 0.620 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974962 2 0.4204 0.48261 0.000 0.696 0.252 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974960 3 0.0632 0.83346 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0865 0.83125 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.3956 0.66356 0.000 0.292 0.684 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974957 3 0.4094 0.62184 0.000 0.324 0.652 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974956 3 0.2178 0.80131 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.1893 0.78505 0.036 0.008 0.928 0.000 0.004 0.024
#> SRR1974954 3 0.0790 0.83241 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.4107 0.47854 0.000 0.700 0.256 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974952 3 0.2743 0.78256 0.000 0.164 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974949 3 0.3133 0.75471 0.000 0.212 0.780 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974950 3 0.4379 0.47809 0.000 0.396 0.576 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974951 3 0.4395 0.45848 0.000 0.404 0.568 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974947 3 0.4094 0.62133 0.000 0.324 0.652 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974948 2 0.4107 0.47876 0.000 0.700 0.256 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974946 2 0.3099 0.63287 0.000 0.848 0.084 0.000 0.060 0.008
#> SRR1974945 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974944 3 0.3184 0.68342 0.140 0.008 0.828 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974942 3 0.0798 0.82404 0.012 0.004 0.976 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974943 3 0.3003 0.77484 0.000 0.172 0.812 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974941 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974940 3 0.0146 0.83448 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.3936 0.67333 0.000 0.288 0.688 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974938 3 0.1863 0.81175 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0146 0.83412 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974936 3 0.0582 0.82914 0.004 0.004 0.984 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974935 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974934 2 0.4158 0.49545 0.000 0.704 0.244 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974933 3 0.4094 0.62220 0.000 0.324 0.652 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974932 3 0.0363 0.83436 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0146 0.83412 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974930 3 0.0436 0.83145 0.004 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974929 3 0.0000 0.83398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.4127 0.42592 0.000 0.680 0.284 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974927 3 0.0146 0.83448 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1363 0.80559 0.004 0.012 0.952 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974925 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974926 3 0.4752 0.45247 0.288 0.012 0.656 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974923 3 0.0146 0.83412 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974922 3 0.1444 0.82166 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974920 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974919 3 0.0000 0.83398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.83398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.4215 0.49415 0.000 0.700 0.244 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.83398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0260 0.83449 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.4351 0.54433 0.000 0.764 0.116 0.000 0.088 0.032
#> SRR1974913 3 0.0146 0.83448 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974910 3 0.0291 0.83373 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974908 2 0.4044 0.48005 0.000 0.704 0.256 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974909 3 0.0632 0.83357 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.4814 0.02036 0.000 0.532 0.412 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974907 3 0.2527 0.78502 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0146 0.83403 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974904 3 0.4206 0.56753 0.000 0.356 0.620 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974903 3 0.0632 0.83346 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.4011 0.65241 0.000 0.304 0.672 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974901 3 0.0632 0.83366 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.3980 0.53255 0.000 0.732 0.216 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974900 2 0.3974 0.52028 0.000 0.728 0.224 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974899 2 0.3742 0.59310 0.000 0.780 0.160 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974897 2 0.4091 0.52262 0.000 0.720 0.224 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974896 2 0.2360 0.61984 0.000 0.900 0.044 0.000 0.044 0.012
#> SRR1974893 2 0.4473 -0.23354 0.000 0.488 0.484 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974895 2 0.3427 0.63297 0.000 0.828 0.100 0.000 0.056 0.016
#> SRR1974894 2 0.3979 0.54234 0.000 0.772 0.160 0.000 0.052 0.016
#> SRR1974892 3 0.5933 0.32144 0.000 0.436 0.436 0.000 0.092 0.036
#> SRR1974890 2 0.6100 0.16678 0.000 0.568 0.272 0.004 0.092 0.064
#> SRR1974891 2 0.4053 0.51483 0.000 0.760 0.176 0.000 0.048 0.016
#> SRR1974889 2 0.3851 0.59315 0.000 0.776 0.160 0.000 0.056 0.008
#> SRR1974888 2 0.3836 0.52436 0.000 0.764 0.188 0.000 0.040 0.008
#> SRR1974886 2 0.4365 0.54198 0.000 0.760 0.004 0.016 0.116 0.104
#> SRR1974887 3 0.8597 0.13364 0.000 0.220 0.332 0.192 0.112 0.144
#> SRR1974885 3 0.8283 0.00253 0.000 0.172 0.316 0.316 0.112 0.084
#> SRR1974883 2 0.5113 -0.00912 0.000 0.556 0.372 0.000 0.060 0.012
#> SRR1974884 2 0.4142 0.51217 0.000 0.712 0.232 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974881 2 0.2100 0.61165 0.000 0.916 0.036 0.000 0.032 0.016
#> SRR1974882 2 0.2891 0.59039 0.000 0.872 0.036 0.000 0.060 0.032
#> SRR1974880 2 0.3960 0.58820 0.000 0.792 0.004 0.012 0.100 0.092
#> SRR1974879 2 0.3631 0.55599 0.000 0.792 0.160 0.000 0.036 0.012
#> SRR1974877 2 0.3548 0.63314 0.000 0.812 0.112 0.000 0.068 0.008
#> SRR1974876 2 0.3997 0.55472 0.000 0.780 0.140 0.000 0.060 0.020
#> SRR1974878 2 0.5493 0.14712 0.000 0.584 0.304 0.000 0.084 0.028
#> SRR1974875 3 0.6039 0.51889 0.000 0.284 0.560 0.004 0.108 0.044
#> SRR1974874 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974872 5 0.2489 0.71169 0.000 0.128 0.000 0.000 0.860 0.012
#> SRR1974869 5 0.4377 0.01001 0.000 0.436 0.000 0.000 0.540 0.024
#> SRR1974868 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974870 5 0.4335 -0.09735 0.000 0.472 0.000 0.000 0.508 0.020
#> SRR1974866 5 0.2266 0.73017 0.000 0.108 0.000 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974867 1 0.3153 0.86318 0.832 0.008 0.000 0.000 0.032 0.128
#> SRR1974865 2 0.5401 0.18127 0.000 0.476 0.000 0.444 0.052 0.028
#> SRR1974864 5 0.2699 0.74033 0.028 0.076 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974862 4 0.5274 -0.02572 0.000 0.428 0.000 0.500 0.048 0.024
#> SRR1974863 2 0.5549 0.44427 0.000 0.580 0.000 0.308 0.076 0.036
#> SRR1974860 2 0.4621 0.60735 0.000 0.724 0.004 0.008 0.120 0.144
#> SRR1974861 2 0.4937 0.58842 0.000 0.684 0.004 0.008 0.116 0.188
#> SRR1974859 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.5315 0.58938 0.000 0.692 0.004 0.120 0.132 0.052
#> SRR1974856 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.5695 0.55287 0.000 0.640 0.000 0.172 0.128 0.060
#> SRR1974855 6 0.6006 0.61918 0.000 0.296 0.000 0.032 0.136 0.536
#> SRR1974854 1 0.1511 0.90008 0.940 0.004 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1974853 1 0.2100 0.88808 0.884 0.004 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974851 6 0.3256 0.71724 0.032 0.024 0.000 0.040 0.040 0.864
#> SRR1974852 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974849 1 0.2631 0.87716 0.856 0.012 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1974848 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974850 6 0.6703 0.63110 0.000 0.212 0.000 0.144 0.120 0.524
#> SRR1974846 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 5 0.3795 0.64492 0.256 0.004 0.004 0.000 0.724 0.012
#> SRR1974845 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974844 1 0.2257 0.88907 0.876 0.008 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974843 5 0.3406 0.74102 0.076 0.072 0.004 0.000 0.836 0.012
#> SRR1974842 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974841 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974840 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974838 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974837 1 0.0665 0.89504 0.980 0.004 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974835 1 0.2261 0.88942 0.884 0.008 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1974836 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974834 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974833 6 0.5433 0.71898 0.000 0.216 0.000 0.040 0.100 0.644
#> SRR1974831 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974832 1 0.0692 0.89922 0.976 0.004 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974830 1 0.0405 0.89722 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974829 1 0.2278 0.88578 0.868 0.004 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974828 1 0.0951 0.89039 0.968 0.008 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974826 2 0.5324 0.38829 0.000 0.592 0.000 0.000 0.172 0.236
#> SRR1974827 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974824 1 0.2825 0.87823 0.844 0.012 0.000 0.000 0.008 0.136
#> SRR1974825 5 0.4854 0.59463 0.260 0.008 0.000 0.000 0.652 0.080
#> SRR1974822 1 0.3333 0.86792 0.820 0.012 0.000 0.000 0.032 0.136
#> SRR1974823 5 0.4348 0.68482 0.196 0.016 0.004 0.000 0.736 0.048
#> SRR1974820 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974818 1 0.0935 0.90026 0.964 0.004 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974819 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 5 0.6156 0.53635 0.072 0.096 0.000 0.012 0.604 0.216
#> SRR1974815 1 0.2445 0.88455 0.868 0.008 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974813 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974814 4 0.1757 0.88525 0.000 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1974812 6 0.2700 0.67309 0.072 0.012 0.000 0.016 0.016 0.884
#> SRR1974810 5 0.5829 0.17058 0.396 0.012 0.000 0.000 0.460 0.132
#> SRR1974808 5 0.2572 0.70370 0.000 0.136 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1974811 5 0.5567 0.51663 0.276 0.012 0.000 0.000 0.576 0.136
#> SRR1974809 5 0.5443 0.50776 0.284 0.008 0.000 0.000 0.580 0.128
#> SRR1974807 1 0.4467 0.76229 0.736 0.012 0.000 0.000 0.120 0.132
#> SRR1974806 1 0.0405 0.89722 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974805 6 0.3375 0.88540 0.000 0.136 0.000 0.040 0.008 0.816
#> SRR1974804 1 0.8093 0.17383 0.372 0.136 0.000 0.092 0.100 0.300
#> SRR1974803 1 0.4431 0.81190 0.752 0.028 0.000 0.000 0.084 0.136
#> SRR1974801 1 0.1700 0.89778 0.916 0.004 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974800 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974799 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974798 2 0.4686 0.60274 0.000 0.716 0.004 0.008 0.116 0.156
#> SRR1974797 6 0.2955 0.86131 0.000 0.172 0.000 0.008 0.004 0.816
#> SRR1974796 6 0.3375 0.88540 0.000 0.136 0.000 0.040 0.008 0.816
#> SRR1974795 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974793 1 0.0405 0.89722 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974794 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974792 6 0.3183 0.87122 0.000 0.164 0.000 0.016 0.008 0.812
#> SRR1974791 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974790 6 0.2955 0.86131 0.000 0.172 0.000 0.008 0.004 0.816
#> SRR1974789 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974788 2 0.4937 0.58842 0.000 0.684 0.004 0.008 0.116 0.188
#> SRR1974786 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974787 5 0.2711 0.73820 0.016 0.096 0.004 0.000 0.872 0.012
#> SRR1974784 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974783 1 0.3433 0.85456 0.816 0.012 0.000 0.000 0.040 0.132
#> SRR1974785 5 0.2218 0.73264 0.000 0.104 0.000 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974782 1 0.3917 0.81653 0.780 0.008 0.000 0.000 0.080 0.132
#> SRR1974781 6 0.4740 0.79532 0.000 0.228 0.000 0.040 0.040 0.692
#> SRR1974780 5 0.3457 0.57760 0.000 0.232 0.000 0.000 0.752 0.016
#> SRR1974779 1 0.2631 0.87716 0.856 0.012 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1974777 1 0.4117 0.79296 0.764 0.008 0.000 0.000 0.100 0.128
#> SRR1974776 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974778 5 0.3416 0.73423 0.144 0.036 0.004 0.000 0.812 0.004
#> SRR1974774 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974773 5 0.5426 0.51555 0.280 0.008 0.000 0.000 0.584 0.128
#> SRR1974775 1 0.5731 -0.10271 0.432 0.008 0.000 0.000 0.432 0.128
#> SRR1974772 1 0.0951 0.88904 0.968 0.008 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974771 2 0.5277 0.50725 0.000 0.616 0.000 0.004 0.156 0.224
#> SRR1974770 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974769 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974768 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974767 5 0.2312 0.72714 0.000 0.112 0.000 0.000 0.876 0.012
#> SRR1974766 2 0.5116 0.57327 0.000 0.664 0.004 0.008 0.132 0.192
#> SRR1974765 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974764 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974763 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.5782 0.16841 0.496 0.012 0.000 0.000 0.360 0.132
#> SRR1974761 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974760 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974759 1 0.1787 0.89772 0.920 0.008 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1974758 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974757 6 0.2948 0.84995 0.000 0.188 0.000 0.008 0.000 0.804
#> SRR1974756 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974754 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974753 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0260 0.95984 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974750 4 0.0260 0.95984 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974752 1 0.2920 0.87115 0.844 0.008 0.000 0.000 0.020 0.128
#> SRR1974749 5 0.4475 0.45311 0.000 0.220 0.000 0.000 0.692 0.088
#> SRR1974747 1 0.1332 0.88320 0.952 0.012 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974748 5 0.5455 0.49146 0.296 0.008 0.000 0.000 0.572 0.124
#> SRR1974746 1 0.1053 0.88871 0.964 0.012 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974744 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.3428 0.87069 0.820 0.020 0.000 0.000 0.032 0.128
#> SRR1974740 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0146 0.96173 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974735 1 0.1167 0.88783 0.960 0.012 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974734 5 0.4083 0.07688 0.000 0.008 0.000 0.460 0.532 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.1448 0.92479 0.000 0.016 0.000 0.948 0.024 0.012
#> SRR1974731 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.1053 0.88871 0.964 0.012 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974730 1 0.5484 0.45876 0.588 0.012 0.000 0.000 0.272 0.128
#> SRR1974728 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.4285 0.20268 0.000 0.008 0.000 0.552 0.432 0.008
#> SRR1974726 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0653 0.89410 0.980 0.004 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974727 5 0.4269 0.09378 0.000 0.412 0.000 0.000 0.568 0.020
#> SRR1974723 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974719 5 0.5714 0.58215 0.236 0.024 0.000 0.008 0.612 0.120
#> SRR1974718 1 0.5169 0.60429 0.648 0.012 0.000 0.000 0.212 0.128
#> SRR1974716 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974717 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974714 5 0.3651 0.65453 0.248 0.004 0.004 0.000 0.736 0.008
#> SRR1974711 5 0.2312 0.72714 0.000 0.112 0.000 0.000 0.876 0.012
#> SRR1974712 1 0.0405 0.89722 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974709 1 0.2588 0.87933 0.860 0.012 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1974708 5 0.2266 0.73017 0.000 0.108 0.000 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974710 5 0.2266 0.73017 0.000 0.108 0.000 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974707 5 0.2964 0.74184 0.076 0.056 0.004 0.000 0.860 0.004
#> SRR1974706 1 0.1053 0.88871 0.964 0.012 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974704 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974705 1 0.1753 0.89590 0.912 0.004 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974703 4 0.0146 0.96264 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.2613 0.69950 0.000 0.140 0.000 0.000 0.848 0.012
#> SRR1974701 4 0.0260 0.95984 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974699 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.1053 0.88871 0.964 0.012 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974697 1 0.3395 0.87083 0.820 0.020 0.000 0.000 0.028 0.132
#> SRR1974696 4 0.0717 0.94862 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016 0.000
#> SRR1974694 1 0.3950 0.86185 0.804 0.020 0.000 0.024 0.032 0.120
#> SRR1974695 5 0.2697 0.73928 0.020 0.088 0.004 0.000 0.876 0.012
#> SRR1974693 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0146 0.96264 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.3018 0.86544 0.000 0.168 0.000 0.012 0.004 0.816
#> SRR1974691 1 0.1332 0.88320 0.952 0.012 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974689 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.1332 0.88320 0.952 0.012 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974686 1 0.0870 0.89220 0.972 0.012 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974685 1 0.3042 0.88289 0.852 0.020 0.000 0.000 0.028 0.100
#> SRR1974684 1 0.0146 0.89762 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.6255 0.55026 0.556 0.020 0.000 0.268 0.028 0.128
#> SRR1974682 4 0.0622 0.95027 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000
#> SRR1974681 1 0.0858 0.90068 0.968 0.004 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974679 4 0.0260 0.95984 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974680 1 0.3060 0.86893 0.836 0.012 0.000 0.000 0.020 0.132
#> SRR1974678 4 0.0260 0.95984 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974677 1 0.2333 0.88370 0.872 0.004 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974676 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974675 2 0.4167 0.50689 0.000 0.708 0.236 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974674 1 0.0692 0.89925 0.976 0.004 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974673 2 0.3984 0.47703 0.000 0.648 0.000 0.000 0.336 0.016
#> SRR1974671 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974672 2 0.5638 0.29638 0.000 0.496 0.000 0.400 0.076 0.028
#> SRR1974670 2 0.5759 0.42131 0.000 0.560 0.000 0.316 0.072 0.052
#> SRR1974669 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974667 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974668 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974666 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974664 2 0.5277 0.49993 0.000 0.636 0.004 0.260 0.076 0.024
#> SRR1974665 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974663 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974662 1 0.1219 0.90054 0.948 0.004 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974661 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974660 5 0.5545 0.48971 0.296 0.012 0.000 0.000 0.568 0.124
#> SRR1974659 1 0.2355 0.88627 0.876 0.008 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR1974658 1 0.2488 0.88009 0.864 0.008 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1974657 5 0.4226 0.62199 0.264 0.004 0.000 0.000 0.692 0.040
#> SRR1974654 1 0.2039 0.89661 0.908 0.004 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR1974655 5 0.4677 0.60179 0.264 0.008 0.000 0.000 0.664 0.064
#> SRR1974656 5 0.5250 0.55346 0.264 0.008 0.000 0.000 0.612 0.116
#> SRR1974650 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974651 4 0.0146 0.96264 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.2569 0.73780 0.012 0.092 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974653 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.3237 0.87271 0.828 0.020 0.000 0.000 0.020 0.132
#> SRR1974646 5 0.4254 0.13112 0.000 0.404 0.000 0.000 0.576 0.020
#> SRR1974649 1 0.0146 0.89817 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974647 4 0.0000 0.96346 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.2118 0.89270 0.888 0.008 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974644 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974643 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974642 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974640 5 0.3682 0.67675 0.224 0.004 0.004 0.000 0.752 0.016
#> SRR1974641 4 0.5172 0.22242 0.000 0.352 0.000 0.572 0.056 0.020
#> SRR1974639 1 0.2333 0.88370 0.872 0.004 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974638 5 0.5449 0.53062 0.272 0.012 0.000 0.000 0.592 0.124
#> SRR1974635 1 0.2588 0.87933 0.860 0.012 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1974636 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974634 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974637 4 0.0260 0.96130 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.4844 0.60379 0.260 0.008 0.004 0.000 0.660 0.068
#> SRR1974632 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974631 5 0.3618 0.68848 0.212 0.012 0.004 0.000 0.764 0.008
#> SRR1974630 1 0.0000 0.89761 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974628 1 0.2544 0.88147 0.864 0.012 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974627 5 0.5358 0.53443 0.272 0.008 0.000 0.000 0.596 0.124
#> SRR1974624 1 0.2261 0.88975 0.884 0.008 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1974625 2 0.3768 0.62707 0.000 0.796 0.004 0.008 0.136 0.056
#> SRR1974623 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974622 5 0.5340 0.53914 0.268 0.008 0.000 0.000 0.600 0.124
#> SRR1974620 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974619 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974621 1 0.0000 0.89761 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.2113 0.89444 0.896 0.008 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR1974616 6 0.3310 0.63905 0.080 0.020 0.000 0.016 0.032 0.852
#> SRR1974615 1 0.2488 0.88271 0.864 0.008 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1974618 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974614 5 0.2266 0.73017 0.000 0.108 0.000 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974613 5 0.3593 0.71222 0.176 0.024 0.004 0.000 0.788 0.008
#> SRR1974612 5 0.5340 0.53914 0.268 0.008 0.000 0.000 0.600 0.124
#> SRR1974611 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974610 4 0.0146 0.96264 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.2308 0.89042 0.880 0.008 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1974608 1 0.5754 0.69660 0.652 0.020 0.000 0.164 0.032 0.132
#> SRR1974607 5 0.4094 0.64157 0.252 0.004 0.004 0.000 0.712 0.028
#> SRR1974606 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974605 5 0.7286 0.25017 0.160 0.016 0.000 0.332 0.404 0.088
#> SRR1974604 4 0.0146 0.96264 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.2312 0.72698 0.000 0.112 0.000 0.000 0.876 0.012
#> SRR1974602 1 0.0291 0.89696 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 2 0.5261 0.43227 0.000 0.620 0.000 0.004 0.160 0.216
#> SRR1974601 5 0.2402 0.71974 0.000 0.120 0.000 0.000 0.868 0.012
#> SRR1974599 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974598 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974596 2 0.4800 0.55781 0.000 0.696 0.004 0.008 0.100 0.192
#> SRR1974594 6 0.6091 0.68022 0.000 0.252 0.000 0.052 0.132 0.564
#> SRR1974593 2 0.5026 0.49062 0.000 0.656 0.000 0.004 0.160 0.180
#> SRR1974595 6 0.3206 0.87875 0.000 0.152 0.000 0.028 0.004 0.816
#> SRR1974592 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974591 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974588 6 0.6097 0.65503 0.000 0.180 0.000 0.060 0.172 0.588
#> SRR1974590 2 0.5219 0.38576 0.000 0.616 0.004 0.008 0.092 0.280
#> SRR1974589 6 0.5950 0.68967 0.000 0.260 0.000 0.044 0.124 0.572
#> SRR1974587 2 0.5742 0.29332 0.000 0.556 0.000 0.012 0.164 0.268
#> SRR1974586 2 0.5110 0.47133 0.000 0.644 0.000 0.004 0.160 0.192
#> SRR1974585 6 0.6125 0.68240 0.000 0.248 0.000 0.056 0.132 0.564
#> SRR1974584 1 0.1265 0.90093 0.948 0.008 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974583 2 0.4468 0.56731 0.000 0.724 0.004 0.004 0.088 0.180
#> SRR1974582 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974581 2 0.4965 0.58605 0.000 0.680 0.004 0.008 0.116 0.192
#> SRR1974580 6 0.5836 0.56018 0.000 0.328 0.000 0.020 0.128 0.524
#> SRR1974578 6 0.6792 0.60414 0.000 0.148 0.000 0.184 0.148 0.520
#> SRR1974577 2 0.4800 0.57940 0.000 0.680 0.000 0.004 0.124 0.192
#> SRR1974579 6 0.5984 0.67734 0.000 0.268 0.000 0.044 0.124 0.564
#> SRR1974576 2 0.5023 0.48870 0.000 0.656 0.000 0.004 0.156 0.184
#> SRR1974575 2 0.5005 0.58301 0.000 0.676 0.004 0.008 0.120 0.192
#> SRR1974574 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974573 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974571 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974572 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974570 5 0.3259 0.58977 0.000 0.216 0.000 0.000 0.772 0.012
#> SRR1974568 5 0.5216 0.51759 0.312 0.008 0.004 0.000 0.596 0.080
#> SRR1974567 1 0.5009 0.63891 0.672 0.012 0.000 0.000 0.188 0.128
#> SRR1974566 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974569 6 0.3277 0.87748 0.000 0.156 0.000 0.024 0.008 0.812
#> SRR1974565 6 0.6017 0.67099 0.000 0.192 0.000 0.072 0.132 0.604
#> SRR1974564 6 0.2955 0.86131 0.000 0.172 0.000 0.008 0.004 0.816
#> SRR1974560 5 0.4501 0.62418 0.256 0.004 0.004 0.000 0.684 0.052
#> SRR1974559 1 0.2020 0.89325 0.896 0.008 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974563 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974562 6 0.3128 0.86757 0.000 0.168 0.000 0.012 0.008 0.812
#> SRR1974561 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974557 2 0.6075 0.53791 0.000 0.608 0.000 0.100 0.116 0.176
#> SRR1974553 6 0.3385 0.88529 0.000 0.144 0.000 0.036 0.008 0.812
#> SRR1974555 1 0.0405 0.89685 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974551 1 0.2755 0.87539 0.844 0.012 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1974552 6 0.3352 0.88298 0.000 0.148 0.000 0.032 0.008 0.812
#> SRR1974554 5 0.3869 0.65944 0.240 0.004 0.004 0.000 0.732 0.020
#> SRR1974558 5 0.5763 0.25937 0.388 0.012 0.000 0.000 0.476 0.124
#> SRR1974556 1 0.2883 0.87648 0.844 0.012 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1974550 5 0.2361 0.73223 0.000 0.104 0.004 0.000 0.880 0.012
#> SRR1974549 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
#> SRR1974548 6 0.5915 0.69269 0.000 0.260 0.000 0.044 0.120 0.576
#> SRR1974547 5 0.2927 0.73384 0.020 0.064 0.004 0.000 0.872 0.040
#> SRR1974546 5 0.2313 0.73394 0.000 0.100 0.004 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974545 6 0.2955 0.85808 0.000 0.172 0.000 0.004 0.008 0.816
#> SRR1974544 5 0.3945 0.68528 0.212 0.008 0.004 0.000 0.748 0.028
#> SRR1974543 6 0.3414 0.88726 0.000 0.140 0.000 0.040 0.008 0.812
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.876 0.921 0.966 0.4919 0.506 0.506
#> 3 3 0.954 0.927 0.968 0.3549 0.725 0.506
#> 4 4 0.819 0.812 0.916 0.0996 0.859 0.619
#> 5 5 0.818 0.838 0.914 0.0619 0.877 0.597
#> 6 6 0.839 0.813 0.901 0.0468 0.937 0.730
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.8713 0.5873 0.292 0.708
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.9754 0.3045 0.408 0.592
#> SRR1974998 1 0.8813 0.5838 0.700 0.300
#> SRR1974997 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974996 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974986 1 0.9850 0.2927 0.572 0.428
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974985 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0672 0.9443 0.992 0.008
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0376 0.9470 0.996 0.004
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0376 0.9470 0.996 0.004
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974969 2 0.2043 0.9507 0.032 0.968
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.2043 0.9507 0.032 0.968
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0938 0.9676 0.012 0.988
#> SRR1974964 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.9732 0.3513 0.596 0.404
#> SRR1974959 2 0.5178 0.8621 0.116 0.884
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.0672 0.9708 0.008 0.992
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.1633 0.9576 0.024 0.976
#> SRR1974949 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.9933 0.2006 0.548 0.452
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.6438 0.8001 0.164 0.836
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974940 2 0.9427 0.4353 0.360 0.640
#> SRR1974939 2 0.3431 0.9198 0.064 0.936
#> SRR1974938 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974937 1 0.8386 0.6459 0.732 0.268
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.1843 0.9289 0.972 0.028
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.6801 0.7782 0.180 0.820
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0938 0.9413 0.988 0.012
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.5294 0.8572 0.120 0.880
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.5178 0.8483 0.884 0.116
#> SRR1974922 2 0.2043 0.9506 0.032 0.968
#> SRR1974921 1 0.0938 0.9412 0.988 0.012
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974919 2 0.6438 0.8000 0.164 0.836
#> SRR1974918 1 0.8016 0.6840 0.756 0.244
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0376 0.9470 0.996 0.004
#> SRR1974915 2 0.3584 0.9160 0.068 0.932
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.4431 0.8742 0.908 0.092
#> SRR1974911 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.3114 0.9280 0.056 0.944
#> SRR1974906 2 0.0938 0.9677 0.012 0.988
#> SRR1974907 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974905 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974903 2 0.3733 0.9116 0.072 0.928
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.2043 0.9507 0.032 0.968
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.8499 0.6451 0.724 0.276
#> SRR1974885 2 0.9998 -0.0490 0.492 0.508
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974875 1 0.8081 0.6900 0.752 0.248
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.2948 0.9316 0.052 0.948
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0672 0.9709 0.008 0.992
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.9896 0.2803 0.560 0.440
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0938 0.9415 0.988 0.012
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.8608 0.6316 0.716 0.284
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.1843 0.9293 0.972 0.028
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.9944 0.2208 0.544 0.456
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974786 2 0.8499 0.6170 0.276 0.724
#> SRR1974787 1 0.9775 0.3190 0.588 0.412
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.8144 0.6643 0.252 0.748
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.7815 0.6975 0.232 0.768
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.7674 0.7236 0.776 0.224
#> SRR1974750 1 0.4690 0.8665 0.900 0.100
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.4815 0.8717 0.104 0.896
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.8861 0.5388 0.304 0.696
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974739 1 0.9988 0.1482 0.520 0.480
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974736 1 1.0000 0.0876 0.504 0.496
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.9087 0.4950 0.324 0.676
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.2778 0.9341 0.048 0.952
#> SRR1974725 1 0.0672 0.9443 0.992 0.008
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974722 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.8386 0.6141 0.268 0.732
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.9922 0.2270 0.552 0.448
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.3431 0.9175 0.064 0.936
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.1414 0.9610 0.020 0.980
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.2236 0.9467 0.036 0.964
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974707 1 0.0672 0.9443 0.992 0.008
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.4815 0.8760 0.104 0.896
#> SRR1974701 1 0.6247 0.8080 0.844 0.156
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.2236 0.9458 0.036 0.964
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.2423 0.9195 0.960 0.040
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.7883 0.7067 0.764 0.236
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.8207 0.6770 0.744 0.256
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.6343 0.8067 0.160 0.840
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0672 0.9444 0.992 0.008
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.9944 0.2273 0.544 0.456
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.8955 0.5800 0.688 0.312
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0672 0.9444 0.992 0.008
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974623 1 0.9795 0.3447 0.584 0.416
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.6247 0.8095 0.844 0.156
#> SRR1974619 1 0.6712 0.7856 0.824 0.176
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.1184 0.9385 0.984 0.016
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.8608 0.6037 0.284 0.716
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.2423 0.9434 0.040 0.960
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0376 0.9739 0.004 0.996
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974588 1 0.8608 0.6317 0.716 0.284
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.6973 0.7589 0.188 0.812
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974578 1 0.9661 0.4114 0.608 0.392
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974565 1 0.7745 0.7187 0.772 0.228
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.7376 0.7482 0.792 0.208
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.8016 0.6918 0.756 0.244
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9496 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9770 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.1643 0.9281 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974989 2 0.0592 0.9684 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.1289 0.9388 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974977 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.2066 0.9132 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.0237 0.9617 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.5497 0.5866 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.1643 0.9275 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 1 0.6235 0.2373 0.564 0.000 0.436
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0892 0.9493 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974930 3 0.5926 0.4447 0.356 0.000 0.644
#> SRR1974929 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.2261 0.9040 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974925 3 0.1860 0.9207 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.2711 0.8855 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0424 0.9587 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.2959 0.8715 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974913 3 0.0424 0.9587 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974911 3 0.2878 0.8761 0.096 0.000 0.904
#> SRR1974910 3 0.0592 0.9557 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0237 0.9615 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.2711 0.8855 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974892 3 0.0424 0.9589 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974890 3 0.6309 -0.0179 0.000 0.496 0.504
#> SRR1974891 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0747 0.9666 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974887 2 0.6204 0.2279 0.424 0.576 0.000
#> SRR1974885 2 0.3678 0.8801 0.080 0.892 0.028
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.5948 0.4620 0.000 0.640 0.360
#> SRR1974882 2 0.6274 0.1852 0.000 0.544 0.456
#> SRR1974880 2 0.1031 0.9625 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974879 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974876 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974878 3 0.0747 0.9530 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974875 3 0.8700 0.4586 0.148 0.276 0.576
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974869 3 0.6168 0.2884 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974868 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974870 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974866 3 0.2955 0.8920 0.008 0.080 0.912
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974864 1 0.1031 0.9451 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0424 0.9701 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974860 2 0.2448 0.9210 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974861 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.1031 0.9625 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5835 0.5149 0.660 0.340 0.000
#> SRR1974852 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0424 0.9585 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974834 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974833 2 0.1163 0.9509 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0424 0.9701 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3879 0.8156 0.848 0.152 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.4399 0.7708 0.812 0.188 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 3 0.1753 0.9269 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.4796 0.7256 0.780 0.220 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 3 0.5560 0.5622 0.300 0.000 0.700
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1860 0.9441 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974797 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974792 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974791 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974790 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974789 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974788 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974786 3 0.0424 0.9593 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974787 1 0.6475 0.5756 0.692 0.280 0.028
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 3 0.3941 0.8041 0.156 0.000 0.844
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 2 0.4399 0.7798 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2165 0.9330 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974770 2 0.1860 0.9441 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974767 3 0.1643 0.9301 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974766 2 0.0747 0.9666 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974765 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974764 2 0.1163 0.9601 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1031 0.9624 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974760 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974757 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1643 0.9503 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.1643 0.9356 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.2537 0.8984 0.080 0.920 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.2261 0.9071 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.2537 0.8959 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5431 0.6182 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0237 0.9616 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.6701 0.2864 0.576 0.412 0.012
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 3 0.6905 0.1773 0.016 0.440 0.544
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.3966 0.8610 0.024 0.100 0.876
#> SRR1974710 3 0.0424 0.9590 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 3 0.1964 0.9193 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974701 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0592 0.9555 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974682 1 0.5621 0.5812 0.692 0.308 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 3 0.2356 0.9035 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974671 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974669 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974667 2 0.1643 0.9503 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974668 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974666 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974664 2 0.0892 0.9646 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974665 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974663 3 0.1163 0.9438 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.4291 0.7734 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.8039 0.1522 0.508 0.064 0.428
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0592 0.9553 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 3 0.1753 0.9266 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1031 0.9624 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.6267 0.1631 0.452 0.000 0.548
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.3816 0.8148 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.5733 0.5389 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974623 1 0.6420 0.5772 0.688 0.024 0.288
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.5882 0.4779 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974619 1 0.5016 0.6900 0.760 0.240 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.4452 0.7643 0.808 0.192 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.0000 0.9642 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974613 1 0.0592 0.9553 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 3 0.1774 0.9401 0.016 0.024 0.960
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974605 1 0.0424 0.9587 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 3 0.7378 0.2647 0.036 0.404 0.560
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974601 2 0.6026 0.4150 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974599 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974598 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974596 2 0.1529 0.9528 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0592 0.9684 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974595 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974592 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974591 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974588 2 0.0747 0.9611 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974590 2 0.0747 0.9666 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1643 0.9502 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974582 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974581 2 0.1753 0.9475 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.1643 0.9502 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974575 2 0.0747 0.9666 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974574 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974573 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974571 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 3 0.3686 0.8250 0.000 0.140 0.860
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974569 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974565 2 0.0424 0.9670 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974564 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974562 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974561 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974557 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974553 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.5756 0.7137 0.764 0.028 0.208
#> SRR1974549 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9715 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.5404 0.6566 0.740 0.004 0.256
#> SRR1974545 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9648 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0237 0.9715 0.000 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.2973 0.7623 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1975006 3 0.4679 0.4887 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1975005 3 0.0188 0.8687 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.4431 0.5710 0.000 0.304 0.696 0.000
#> SRR1975001 2 0.4643 0.4674 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1975002 3 0.4967 0.2331 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1974999 3 0.4543 0.5395 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.1302 0.8388 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974995 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.4730 0.4900 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1974991 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0336 0.8676 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.4790 0.4313 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.3311 0.7777 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974978 3 0.0336 0.8629 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.4624 0.5119 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR1974975 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974974 3 0.4564 0.5330 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1974973 3 0.4866 0.3728 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.4967 0.2369 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0592 0.8563 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0188 0.8687 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974962 3 0.4830 0.4025 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0188 0.8687 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974957 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 1 0.4985 0.2040 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.4817 0.4124 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0469 0.8658 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974951 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.4855 0.3834 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974946 2 0.3907 0.6777 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.4888 0.3584 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1974942 3 0.3942 0.5940 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.1940 0.7994 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.4746 0.4573 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1974933 3 0.0188 0.8687 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.2281 0.7730 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.4679 0.4886 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.4948 0.2867 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1974925 3 0.0336 0.8629 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974926 1 0.2345 0.8580 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.1022 0.8417 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.4730 0.4651 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.4761 0.4556 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0188 0.8670 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.4776 0.4396 0.000 0.376 0.624 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.1940 0.8222 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0336 0.8675 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.8697 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.4994 0.1310 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1974900 3 0.4992 0.1473 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1974899 2 0.4477 0.5426 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1974897 3 0.4996 0.1229 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1974896 2 0.3764 0.7015 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974893 3 0.0921 0.8567 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974895 2 0.4103 0.6419 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1974894 3 0.4500 0.5535 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1974892 3 0.0707 0.8601 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974890 3 0.5355 0.4249 0.000 0.360 0.620 0.020
#> SRR1974891 3 0.3942 0.6632 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1974889 2 0.4477 0.5430 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1974888 3 0.4500 0.5511 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1974886 2 0.2760 0.8026 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974887 4 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974885 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974883 3 0.0707 0.8615 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974884 3 0.4933 0.2955 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1974881 2 0.3172 0.7620 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1974882 2 0.3219 0.7993 0.000 0.868 0.112 0.020
#> SRR1974880 2 0.0336 0.8628 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974879 3 0.4877 0.3621 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1974877 2 0.4356 0.5799 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1974876 3 0.4790 0.4301 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1974878 3 0.2011 0.8196 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1974875 3 0.4977 0.0482 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.4500 0.5321 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR1974869 2 0.3444 0.7372 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR1974868 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974870 2 0.4008 0.6604 0.000 0.756 0.244 0.000
#> SRR1974866 2 0.3972 0.7108 0.008 0.788 0.204 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.4746 0.4939 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1974864 1 0.1042 0.9277 0.972 0.008 0.020 0.000
#> SRR1974862 2 0.4985 0.2458 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1974863 2 0.4406 0.6104 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974860 2 0.0707 0.8599 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974861 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.3764 0.7195 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.3837 0.7106 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974855 2 0.4277 0.5472 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.7588 0.3509 0.320 0.216 0.000 0.464
#> SRR1974852 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.2760 0.8271 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974834 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974833 4 0.6249 0.4883 0.072 0.336 0.000 0.592
#> SRR1974831 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0188 0.9474 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.1557 0.9017 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.4688 0.7480 0.792 0.128 0.000 0.080
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974812 1 0.4323 0.7115 0.776 0.204 0.000 0.020
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.3688 0.7092 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1974811 1 0.0336 0.9440 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.2149 0.8217 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974804 1 0.6082 -0.0165 0.480 0.044 0.000 0.476
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.7587 -0.1090 0.412 0.196 0.392 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974797 2 0.0188 0.8625 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974796 2 0.1867 0.8354 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974795 2 0.1716 0.8414 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974792 2 0.1389 0.8495 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974791 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974790 2 0.0336 0.8620 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974789 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974788 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974786 3 0.6111 0.3251 0.052 0.392 0.556 0.000
#> SRR1974787 2 0.4776 0.4418 0.376 0.624 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.2408 0.8065 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.6121 0.6153 0.164 0.680 0.156 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974780 2 0.0707 0.8598 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.5290 0.0217 0.008 0.516 0.476 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0336 0.8628 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974770 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974769 2 0.1716 0.8414 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974768 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974767 2 0.4072 0.6484 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1974766 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974765 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974764 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974760 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974757 2 0.0469 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.4624 0.5459 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1974747 1 0.0592 0.9378 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0707 0.9345 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.1022 0.9076 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.1637 0.8791 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.3852 0.7253 0.000 0.800 0.192 0.008
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.2469 0.8483 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.7458 0.2171 0.380 0.444 0.000 0.176
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.4182 0.7306 0.024 0.796 0.180 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4561 0.7304 0.036 0.788 0.172 0.004
#> SRR1974710 2 0.4382 0.5727 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.4477 0.5435 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.1637 0.8980 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974695 1 0.0188 0.9470 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0592 0.8602 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0188 0.9473 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4776 0.4017 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974675 3 0.4933 0.2955 0.000 0.432 0.568 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3764 0.6990 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974671 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974672 2 0.4679 0.5200 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1974670 2 0.4250 0.6488 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974669 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974667 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974668 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974666 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974664 2 0.4040 0.6852 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974665 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974663 2 0.5579 0.5971 0.060 0.688 0.252 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.3355 0.7758 0.836 0.004 0.160 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.8958 0.2165 0.472 0.260 0.148 0.120
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0376 0.9441 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.3726 0.7042 0.000 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.7536 0.2056 0.492 0.264 0.244 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.4972 0.2903 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.2021 0.8961 0.936 0.024 0.040 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.3172 0.7620 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1974623 2 0.6727 0.2887 0.384 0.520 0.096 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.4872 0.6225 0.728 0.028 0.244 0.000
#> SRR1974619 4 0.3672 0.7700 0.164 0.012 0.000 0.824
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.3893 0.7362 0.796 0.196 0.000 0.008
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.3907 0.6776 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974613 1 0.0657 0.9389 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.5663 0.5748 0.060 0.676 0.264 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.3942 0.6779 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974605 4 0.4643 0.4531 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9383 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.4378 0.7383 0.040 0.796 0.164 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.4578 0.7403 0.000 0.788 0.160 0.052
#> SRR1974599 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974598 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 4 0.4134 0.6739 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1974593 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.1474 0.8479 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974592 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974591 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974588 4 0.3942 0.7058 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974590 2 0.0188 0.8625 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974589 4 0.4948 0.3074 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1974587 2 0.0817 0.8577 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974586 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 4 0.4250 0.6501 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0336 0.8639 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974580 2 0.1867 0.8361 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974578 4 0.0188 0.9354 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974577 2 0.0188 0.8636 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974579 4 0.4961 0.2807 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1974576 2 0.0000 0.8626 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0188 0.8635 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974574 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974573 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974571 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974572 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974570 2 0.2921 0.7803 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974569 2 0.1302 0.8511 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974565 4 0.3726 0.7348 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974564 2 0.0336 0.8620 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974562 2 0.1022 0.8553 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974561 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974557 2 0.3528 0.7441 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974553 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.1557 0.8461 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.6897 0.2585 0.544 0.332 0.124 0.000
#> SRR1974549 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974548 2 0.3400 0.7152 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974547 1 0.3074 0.7990 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.7198 0.1849 0.520 0.320 0.160 0.000
#> SRR1974545 2 0.0188 0.8625 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9503 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.1637 0.8443 0.000 0.940 0.000 0.060
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 5 0.3837 0.5859 0.000 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1975006 5 0.3487 0.7245 0.000 0.008 0.212 0.000 0.780
#> SRR1975005 3 0.3305 0.7316 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 5 0.3689 0.6730 0.000 0.004 0.256 0.000 0.740
#> SRR1975001 5 0.2408 0.8015 0.000 0.016 0.092 0.000 0.892
#> SRR1975002 5 0.2997 0.7761 0.000 0.012 0.148 0.000 0.840
#> SRR1974999 5 0.3421 0.7324 0.000 0.008 0.204 0.000 0.788
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.2104 0.8680 0.000 0.060 0.916 0.000 0.024
#> SRR1974995 3 0.2329 0.8410 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0290 0.9611 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.2074 0.8568 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974992 3 0.1197 0.8916 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 5 0.6030 0.5077 0.000 0.140 0.000 0.316 0.544
#> SRR1974991 3 0.1410 0.8848 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3932 0.5346 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1974988 3 0.0290 0.9084 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974984 3 0.3586 0.6669 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.3421 0.7324 0.000 0.008 0.204 0.000 0.788
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.4227 0.2605 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.3752 0.6090 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 5 0.3333 0.7286 0.000 0.004 0.208 0.000 0.788
#> SRR1974975 3 0.2471 0.8307 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974974 5 0.3388 0.7364 0.000 0.008 0.200 0.000 0.792
#> SRR1974973 5 0.3700 0.6935 0.000 0.008 0.240 0.000 0.752
#> SRR1974972 3 0.0290 0.9083 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974971 5 0.2304 0.7992 0.000 0.008 0.100 0.000 0.892
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.1121 0.8939 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974968 3 0.3395 0.7069 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0290 0.9084 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974964 3 0.0963 0.8977 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.3143 0.7528 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1974962 5 0.3353 0.7402 0.000 0.008 0.196 0.000 0.796
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.2424 0.8335 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974957 3 0.2813 0.7963 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.2230 0.7945 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 5 0.3318 0.7438 0.000 0.008 0.192 0.000 0.800
#> SRR1974952 3 0.0290 0.9083 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974949 3 0.0963 0.8974 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974950 3 0.3612 0.6550 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974951 3 0.3480 0.6887 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974947 3 0.2377 0.8378 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974948 5 0.3551 0.7161 0.000 0.008 0.220 0.000 0.772
#> SRR1974946 5 0.2450 0.8092 0.000 0.052 0.048 0.000 0.900
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2605 0.7543 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.1270 0.8657 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.1121 0.8935 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.2020 0.8599 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0609 0.8949 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 5 0.3353 0.7403 0.000 0.008 0.196 0.000 0.796
#> SRR1974933 3 0.2329 0.8405 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0162 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.3642 0.7034 0.000 0.008 0.232 0.000 0.760
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.2127 0.8053 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4256 0.2085 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 5 0.2971 0.7706 0.000 0.008 0.156 0.000 0.836
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 5 0.4969 0.6129 0.000 0.056 0.292 0.000 0.652
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 5 0.3421 0.7329 0.000 0.008 0.204 0.000 0.788
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 5 0.4268 0.2308 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1974907 3 0.0162 0.9094 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.3274 0.7298 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.2732 0.8059 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9104 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 5 0.3596 0.7369 0.000 0.016 0.200 0.000 0.784
#> SRR1974900 5 0.3586 0.7473 0.000 0.020 0.188 0.000 0.792
#> SRR1974899 5 0.2864 0.7969 0.000 0.024 0.112 0.000 0.864
#> SRR1974897 5 0.2723 0.7903 0.000 0.012 0.124 0.000 0.864
#> SRR1974896 5 0.2694 0.8088 0.000 0.076 0.040 0.000 0.884
#> SRR1974893 3 0.4171 0.3573 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1974895 5 0.2522 0.8088 0.000 0.052 0.052 0.000 0.896
#> SRR1974894 5 0.4109 0.6257 0.000 0.012 0.288 0.000 0.700
#> SRR1974892 3 0.1893 0.8825 0.000 0.024 0.928 0.000 0.048
#> SRR1974890 3 0.6953 0.0299 0.000 0.268 0.416 0.008 0.308
#> SRR1974891 5 0.3861 0.6613 0.000 0.008 0.264 0.000 0.728
#> SRR1974889 5 0.3229 0.7898 0.000 0.032 0.128 0.000 0.840
#> SRR1974888 5 0.3809 0.6747 0.000 0.008 0.256 0.000 0.736
#> SRR1974886 5 0.5610 0.6657 0.000 0.184 0.000 0.176 0.640
#> SRR1974887 4 0.1442 0.9037 0.004 0.012 0.032 0.952 0.000
#> SRR1974885 4 0.0510 0.9279 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974883 3 0.4288 0.3773 0.000 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR1974884 5 0.3355 0.7502 0.000 0.012 0.184 0.000 0.804
#> SRR1974881 5 0.2712 0.8079 0.000 0.088 0.032 0.000 0.880
#> SRR1974882 5 0.2824 0.8072 0.000 0.096 0.032 0.000 0.872
#> SRR1974880 5 0.3209 0.7843 0.000 0.180 0.000 0.008 0.812
#> SRR1974879 5 0.3750 0.7044 0.000 0.012 0.232 0.000 0.756
#> SRR1974877 5 0.2450 0.8053 0.000 0.028 0.076 0.000 0.896
#> SRR1974876 5 0.3807 0.6952 0.000 0.012 0.240 0.000 0.748
#> SRR1974878 3 0.4380 0.3845 0.000 0.008 0.616 0.000 0.376
#> SRR1974875 3 0.3047 0.7618 0.004 0.000 0.832 0.160 0.004
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974869 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974868 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974870 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974866 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 5 0.5238 0.1677 0.000 0.044 0.000 0.476 0.480
#> SRR1974864 1 0.3508 0.7310 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974862 4 0.4800 0.2588 0.000 0.028 0.000 0.604 0.368
#> SRR1974863 5 0.5246 0.5000 0.000 0.060 0.000 0.344 0.596
#> SRR1974860 5 0.2280 0.7999 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974861 5 0.3003 0.7796 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 5 0.4069 0.7611 0.000 0.076 0.000 0.136 0.788
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 5 0.4806 0.6554 0.000 0.060 0.000 0.252 0.688
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.2966 0.7516 0.136 0.848 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4192 0.3119 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.1851 0.9059 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.2561 0.8561 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0609 0.9107 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0290 0.9614 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4126 0.2034 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0609 0.9556 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.3731 0.7797 0.800 0.160 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.4141 0.6488 0.728 0.248 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1851 0.8578 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974812 2 0.3366 0.6458 0.232 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974811 1 0.1544 0.9114 0.932 0.068 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0162 0.9642 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.5361 0.5849 0.668 0.188 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.3461 0.5792 0.224 0.000 0.004 0.000 0.772
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.2773 0.7888 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974788 5 0.2966 0.7815 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974786 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974787 5 0.5798 0.3168 0.336 0.108 0.000 0.000 0.556
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 5 0.1792 0.7591 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974780 5 0.1043 0.8012 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974778 1 0.2020 0.8957 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974774 5 0.3003 0.7797 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974773 1 0.0510 0.9579 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974775 1 0.0162 0.9642 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 5 0.3730 0.6781 0.000 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR1974770 5 0.3003 0.7797 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974768 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974767 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974766 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974764 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 5 0.2966 0.7815 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.5096 0.5192 0.000 0.072 0.000 0.656 0.272
#> SRR1974747 1 0.0510 0.9557 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0609 0.9528 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.2068 0.8868 0.904 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.5191 0.5022 0.244 0.012 0.000 0.064 0.680
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.1851 0.9058 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974711 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974710 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974707 1 0.3210 0.7813 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.0898 0.8017 0.000 0.008 0.020 0.000 0.972
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.1121 0.9335 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974695 1 0.2377 0.8723 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0162 0.9637 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3932 0.5270 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 5 0.3003 0.7797 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974675 5 0.3427 0.7440 0.000 0.012 0.192 0.000 0.796
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.0671 0.8018 0.000 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1974671 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974672 4 0.4855 0.0747 0.000 0.024 0.000 0.552 0.424
#> SRR1974670 5 0.5378 0.3945 0.000 0.060 0.000 0.392 0.548
#> SRR1974669 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974667 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974668 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974666 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974664 5 0.4706 0.6450 0.000 0.052 0.000 0.256 0.692
#> SRR1974665 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974663 5 0.0324 0.7975 0.004 0.000 0.004 0.000 0.992
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.4178 0.6584 0.696 0.000 0.008 0.004 0.292
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.1478 0.9251 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.1341 0.9309 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974656 1 0.0404 0.9601 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974650 5 0.4228 0.5676 0.216 0.000 0.004 0.032 0.748
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.2605 0.8532 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.3521 0.5715 0.232 0.000 0.004 0.000 0.764
#> SRR1974640 1 0.2074 0.8922 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974641 4 0.4374 0.5115 0.000 0.028 0.000 0.700 0.272
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0162 0.9642 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.4066 0.5851 0.672 0.000 0.004 0.000 0.324
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0703 0.9529 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.2020 0.8958 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0510 0.9580 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 5 0.2020 0.8030 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1974623 5 0.2930 0.6601 0.164 0.000 0.004 0.000 0.832
#> SRR1974622 1 0.0290 0.9622 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974620 1 0.4383 0.3826 0.572 0.000 0.004 0.000 0.424
#> SRR1974619 4 0.4049 0.7510 0.084 0.000 0.000 0.792 0.124
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.4171 0.3169 0.396 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974613 1 0.2763 0.8498 0.848 0.004 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974612 1 0.0162 0.9642 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974611 5 0.0451 0.7974 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.3177 0.7420 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1974607 1 0.1341 0.9313 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974606 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974605 4 0.4030 0.4281 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9415 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4227 0.0475 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974601 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974599 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974598 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974596 5 0.3074 0.7749 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974594 2 0.2124 0.8409 0.000 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR1974593 5 0.3661 0.6953 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974591 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974588 2 0.2020 0.8283 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974590 2 0.4268 -0.0705 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974589 2 0.0671 0.9142 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974587 2 0.4138 0.2044 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974586 5 0.4268 0.4095 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1974585 2 0.1124 0.8983 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 5 0.3143 0.7697 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974582 5 0.3074 0.7749 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974581 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974580 2 0.0451 0.9212 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974578 4 0.4307 0.0543 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1974577 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974579 2 0.0566 0.9190 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974576 5 0.3983 0.5985 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR1974575 5 0.3039 0.7778 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974570 5 0.0162 0.7985 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974568 1 0.0703 0.9500 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.2280 0.7988 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0404 0.9602 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974557 5 0.5602 0.6633 0.000 0.164 0.000 0.196 0.640
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.1478 0.9154 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.1341 0.9307 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9660 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.4288 0.2512 0.384 0.000 0.004 0.000 0.612
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974547 2 0.4609 0.6652 0.152 0.744 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974546 5 0.3969 0.4627 0.304 0.000 0.004 0.000 0.692
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0880 0.9474 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9283 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.4344 0.66470 0.000 0.716 0.188 0.000 0.096 0.000
#> SRR1975006 2 0.3740 0.74195 0.000 0.784 0.120 0.000 0.096 0.000
#> SRR1975005 3 0.4513 0.68227 0.000 0.212 0.692 0.000 0.096 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.3940 0.72660 0.000 0.764 0.140 0.000 0.096 0.000
#> SRR1975001 2 0.3514 0.75329 0.000 0.804 0.088 0.000 0.108 0.000
#> SRR1975002 2 0.3612 0.75095 0.000 0.796 0.100 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974999 2 0.3745 0.74292 0.000 0.784 0.116 0.000 0.100 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.4697 0.72839 0.000 0.192 0.712 0.000 0.028 0.068
#> SRR1974995 3 0.4037 0.73018 0.000 0.200 0.736 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.1141 0.90265 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.3871 0.76512 0.000 0.148 0.768 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974992 3 0.2842 0.82904 0.000 0.104 0.852 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.2386 0.77733 0.000 0.896 0.000 0.064 0.012 0.028
#> SRR1974991 3 0.3336 0.80056 0.000 0.132 0.812 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.5260 0.11603 0.000 0.440 0.464 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974988 3 0.2560 0.84482 0.000 0.092 0.872 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974984 3 0.4812 0.59889 0.000 0.264 0.640 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.3698 0.74452 0.000 0.788 0.116 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3607 0.41177 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5075 0.10324 0.000 0.456 0.468 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.3740 0.74178 0.000 0.784 0.120 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974975 3 0.3816 0.70981 0.000 0.240 0.728 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974974 2 0.3745 0.74395 0.000 0.784 0.116 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974973 2 0.3822 0.73670 0.000 0.776 0.128 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974972 3 0.2060 0.85446 0.000 0.084 0.900 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974971 2 0.3481 0.73786 0.000 0.792 0.048 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974970 3 0.0622 0.87982 0.000 0.012 0.980 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974969 3 0.1913 0.85879 0.000 0.080 0.908 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974968 3 0.4763 0.47616 0.000 0.344 0.592 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974967 3 0.0291 0.88196 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.1757 0.86069 0.000 0.076 0.916 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974964 3 0.2311 0.84421 0.000 0.104 0.880 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974963 3 0.1643 0.86359 0.000 0.068 0.924 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974961 3 0.4645 0.60076 0.000 0.276 0.648 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974962 2 0.3701 0.74614 0.000 0.788 0.112 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0291 0.88191 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974958 3 0.3834 0.71632 0.000 0.232 0.732 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974957 3 0.4215 0.67907 0.000 0.244 0.700 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974956 3 0.1010 0.87497 0.000 0.036 0.960 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974955 3 0.1501 0.80822 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0405 0.88135 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974953 2 0.3655 0.74680 0.000 0.792 0.112 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974952 3 0.2006 0.85597 0.000 0.080 0.904 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974949 3 0.2266 0.84435 0.000 0.108 0.880 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974950 3 0.4947 0.50152 0.000 0.316 0.596 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974951 3 0.5117 0.38474 0.000 0.360 0.548 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974947 3 0.4121 0.70883 0.000 0.220 0.720 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974948 2 0.3782 0.73878 0.000 0.780 0.124 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974946 2 0.2357 0.76743 0.000 0.872 0.012 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2135 0.74572 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.1204 0.83044 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.2060 0.85468 0.000 0.084 0.900 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.3156 0.78601 0.000 0.180 0.800 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974938 3 0.1003 0.87628 0.000 0.020 0.964 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.3701 0.74614 0.000 0.788 0.112 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974933 3 0.4002 0.67542 0.000 0.260 0.704 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0260 0.87657 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.3822 0.73612 0.000 0.776 0.128 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1387 0.82258 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3833 0.24332 0.556 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0146 0.88227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974922 3 0.0603 0.88004 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.3745 0.74402 0.000 0.784 0.116 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0146 0.88227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974914 2 0.2009 0.78028 0.000 0.908 0.068 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.3655 0.74680 0.000 0.792 0.112 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974909 3 0.0146 0.88227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974906 2 0.5223 0.27796 0.000 0.540 0.356 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974907 3 0.1643 0.86381 0.000 0.068 0.924 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.88250 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.4229 0.61849 0.000 0.292 0.668 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974903 3 0.0146 0.88227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974902 3 0.4110 0.69628 0.000 0.236 0.712 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974901 3 0.0291 0.88191 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974898 2 0.3655 0.74680 0.000 0.792 0.112 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974900 2 0.3657 0.74809 0.000 0.792 0.108 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974899 2 0.3567 0.75223 0.000 0.800 0.100 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974897 2 0.3612 0.75095 0.000 0.796 0.100 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974896 2 0.1297 0.78610 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974893 2 0.5213 0.05745 0.000 0.488 0.420 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974895 2 0.3088 0.76717 0.000 0.832 0.048 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974894 2 0.2956 0.76050 0.000 0.840 0.120 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974892 3 0.4566 0.35350 0.000 0.428 0.540 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974890 2 0.3405 0.71861 0.000 0.836 0.080 0.000 0.024 0.060
#> SRR1974891 2 0.3118 0.76372 0.000 0.836 0.092 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974889 2 0.3520 0.75345 0.000 0.804 0.100 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974888 2 0.3254 0.75382 0.000 0.820 0.124 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974886 2 0.2052 0.79390 0.000 0.912 0.000 0.004 0.028 0.056
#> SRR1974887 4 0.3994 0.78343 0.028 0.100 0.028 0.816 0.016 0.012
#> SRR1974885 4 0.2257 0.86012 0.000 0.060 0.020 0.904 0.016 0.000
#> SRR1974883 2 0.4214 0.52831 0.000 0.680 0.276 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974884 2 0.3657 0.74809 0.000 0.792 0.108 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974881 2 0.0508 0.78803 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974882 2 0.0508 0.78734 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974880 2 0.1682 0.79448 0.000 0.928 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR1974879 2 0.3261 0.75835 0.000 0.824 0.104 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974877 2 0.2726 0.76702 0.000 0.856 0.032 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974876 2 0.3159 0.76316 0.000 0.832 0.100 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974878 2 0.2988 0.69555 0.000 0.824 0.152 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974875 3 0.4975 0.64152 0.004 0.100 0.696 0.180 0.020 0.000
#> SRR1974874 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974872 5 0.2454 0.70286 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR1974869 5 0.3804 0.04831 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1974868 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974870 5 0.3647 0.27498 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1974866 5 0.0632 0.82002 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.4664 0.17344 0.000 0.488 0.000 0.476 0.032 0.004
#> SRR1974864 5 0.1501 0.81050 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974862 4 0.4333 0.24232 0.000 0.376 0.000 0.596 0.028 0.000
#> SRR1974863 2 0.4570 0.49314 0.000 0.608 0.000 0.352 0.032 0.008
#> SRR1974860 2 0.2384 0.79330 0.000 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1974861 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974859 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.4136 0.70501 0.000 0.748 0.000 0.192 0.040 0.020
#> SRR1974856 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.4374 0.62857 0.000 0.680 0.000 0.272 0.040 0.008
#> SRR1974855 6 0.1594 0.91388 0.000 0.052 0.000 0.000 0.016 0.932
#> SRR1974854 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 6 0.1643 0.86601 0.068 0.000 0.000 0.000 0.008 0.924
#> SRR1974852 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5153 0.26509 0.000 0.056 0.000 0.552 0.016 0.376
#> SRR1974846 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 5 0.3464 0.57027 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1974845 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.2300 0.76872 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 6 0.0508 0.94837 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974831 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0937 0.91697 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974828 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4620 0.24639 0.000 0.532 0.000 0.000 0.040 0.428
#> SRR1974827 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.3309 0.59796 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.5602 -0.06879 0.456 0.000 0.000 0.000 0.400 0.144
#> SRR1974820 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.4024 0.67028 0.744 0.008 0.000 0.020 0.012 0.216
#> SRR1974815 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.2178 0.80960 0.000 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974812 6 0.2996 0.63845 0.228 0.000 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1974810 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.1814 0.76886 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974811 1 0.1267 0.89917 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974809 1 0.0547 0.93602 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.4876 0.64361 0.716 0.008 0.000 0.120 0.016 0.140
#> SRR1974803 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.0820 0.82318 0.012 0.016 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2325 0.79358 0.000 0.892 0.000 0.000 0.048 0.060
#> SRR1974797 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974796 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974795 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974792 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974791 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974790 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974788 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974786 5 0.0790 0.81707 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974787 5 0.2308 0.80589 0.076 0.016 0.000 0.000 0.896 0.012
#> SRR1974784 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 5 0.1196 0.82010 0.008 0.040 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.0458 0.94625 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974780 2 0.4167 0.35605 0.000 0.612 0.000 0.000 0.368 0.020
#> SRR1974779 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0146 0.94739 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974776 5 0.1141 0.80913 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1974778 5 0.3076 0.68762 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1974774 2 0.2433 0.79287 0.000 0.884 0.000 0.000 0.044 0.072
#> SRR1974773 1 0.2003 0.84402 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974775 1 0.0547 0.93567 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.3620 0.70524 0.000 0.772 0.000 0.000 0.044 0.184
#> SRR1974770 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974769 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974767 5 0.1204 0.80677 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974766 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974765 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974763 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974760 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974757 6 0.1082 0.92660 0.000 0.040 0.000 0.000 0.004 0.956
#> SRR1974756 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974753 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.6494 0.16539 0.000 0.332 0.000 0.420 0.220 0.028
#> SRR1974747 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0458 0.93757 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0363 0.92703 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.3869 -0.23068 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.3985 0.70193 0.760 0.000 0.000 0.100 0.140 0.000
#> SRR1974718 1 0.0632 0.93208 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974716 5 0.2328 0.80754 0.020 0.044 0.000 0.032 0.904 0.000
#> SRR1974717 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.3330 0.62064 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1974711 5 0.1501 0.79221 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0790 0.81829 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974710 5 0.0632 0.82002 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974707 5 0.1814 0.79984 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 2 0.4172 0.31354 0.000 0.528 0.012 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0865 0.91957 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.2092 0.78550 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.0146 0.95308 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974691 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0146 0.94701 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3288 0.61412 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974675 2 0.3655 0.74680 0.000 0.792 0.112 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3151 0.69528 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1974671 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974672 4 0.4332 0.31660 0.000 0.352 0.000 0.616 0.032 0.000
#> SRR1974670 2 0.4616 0.46066 0.000 0.592 0.000 0.368 0.032 0.008
#> SRR1974669 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974667 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974668 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974666 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974664 2 0.4414 0.61512 0.000 0.672 0.000 0.280 0.040 0.008
#> SRR1974665 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974663 5 0.0632 0.82002 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.1398 0.81989 0.052 0.008 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974660 1 0.0363 0.94183 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.3851 0.20023 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3866 -0.00973 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974656 1 0.3330 0.58628 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974650 5 0.0837 0.82209 0.004 0.020 0.000 0.004 0.972 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.1863 0.79763 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 5 0.3151 0.54074 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974643 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0820 0.82436 0.012 0.016 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974640 5 0.2562 0.74923 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1974641 4 0.3797 0.50053 0.000 0.292 0.000 0.692 0.016 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.2003 0.84440 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.1701 0.81485 0.072 0.008 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.3515 0.50143 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.2527 0.75445 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.2883 0.71781 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.2402 0.76964 0.000 0.856 0.000 0.000 0.140 0.004
#> SRR1974623 5 0.0806 0.82332 0.008 0.020 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974622 1 0.2491 0.78495 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974620 5 0.1349 0.81765 0.056 0.004 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974619 5 0.2932 0.70073 0.016 0.000 0.000 0.164 0.820 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 6 0.3737 0.32491 0.392 0.000 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974615 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0790 0.81811 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974613 5 0.2527 0.75840 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1974612 1 0.1863 0.85711 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974611 5 0.0632 0.82002 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2762 0.73041 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1974607 5 0.3866 0.11064 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516 0.000
#> SRR1974606 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974605 4 0.3607 0.43316 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.93688 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.1444 0.79549 0.000 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4433 0.47271 0.000 0.616 0.000 0.000 0.040 0.344
#> SRR1974601 5 0.1444 0.79621 0.000 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974599 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974598 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974596 2 0.2221 0.79110 0.000 0.896 0.000 0.000 0.032 0.072
#> SRR1974594 6 0.3652 0.81624 0.000 0.120 0.000 0.056 0.016 0.808
#> SRR1974593 2 0.3149 0.74742 0.000 0.824 0.000 0.000 0.044 0.132
#> SRR1974595 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974591 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974588 6 0.2316 0.89968 0.000 0.040 0.000 0.040 0.016 0.904
#> SRR1974590 2 0.4344 0.49443 0.000 0.612 0.000 0.000 0.032 0.356
#> SRR1974589 6 0.2358 0.86383 0.000 0.108 0.000 0.000 0.016 0.876
#> SRR1974587 2 0.4420 0.42534 0.000 0.620 0.000 0.000 0.040 0.340
#> SRR1974586 2 0.3858 0.69020 0.000 0.740 0.000 0.000 0.044 0.216
#> SRR1974585 6 0.3421 0.80097 0.000 0.160 0.000 0.020 0.016 0.804
#> SRR1974584 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.2221 0.79110 0.000 0.896 0.000 0.000 0.032 0.072
#> SRR1974582 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974581 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974580 6 0.3037 0.79384 0.000 0.176 0.000 0.000 0.016 0.808
#> SRR1974578 4 0.4488 0.07464 0.000 0.008 0.000 0.508 0.016 0.468
#> SRR1974577 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974579 6 0.2975 0.83483 0.000 0.132 0.000 0.012 0.016 0.840
#> SRR1974576 2 0.3149 0.74583 0.000 0.824 0.000 0.000 0.044 0.132
#> SRR1974575 2 0.2365 0.79287 0.000 0.888 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR1974574 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974572 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 5 0.3023 0.58269 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1974568 1 0.1856 0.88924 0.920 0.000 0.000 0.000 0.048 0.032
#> SRR1974567 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974565 6 0.1785 0.90419 0.000 0.008 0.000 0.048 0.016 0.928
#> SRR1974564 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.3330 0.58233 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.5057 0.66487 0.000 0.668 0.000 0.228 0.032 0.072
#> SRR1974553 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.1387 0.89157 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974552 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 5 0.3823 0.28311 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1974558 1 0.0146 0.94740 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.95015 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.1124 0.82403 0.036 0.008 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974549 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 6 0.0717 0.94394 0.000 0.008 0.000 0.000 0.016 0.976
#> SRR1974547 5 0.3271 0.61468 0.008 0.000 0.000 0.000 0.760 0.232
#> SRR1974546 5 0.1088 0.82534 0.024 0.016 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974545 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.3482 0.50733 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1974543 6 0.0000 0.95608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.872 0.936 0.969 0.4326 0.559 0.559
#> 3 3 0.557 0.722 0.842 0.2156 0.931 0.877
#> 4 4 0.588 0.728 0.845 0.1528 0.860 0.729
#> 5 5 0.564 0.707 0.831 0.0802 0.964 0.909
#> 6 6 0.569 0.635 0.791 0.0557 0.984 0.958
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.3431 0.9197 0.064 0.936
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974998 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.8955 0.6269 0.688 0.312
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974986 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974985 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974982 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974980 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.9635 0.3255 0.388 0.612
#> SRR1974977 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974965 1 0.8267 0.6971 0.740 0.260
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0376 0.9355 0.996 0.004
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.7139 0.8028 0.804 0.196
#> SRR1974940 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974936 1 0.0376 0.9355 0.996 0.004
#> SRR1974935 2 0.8144 0.6527 0.252 0.748
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.8813 0.5485 0.300 0.700
#> SRR1974930 1 0.6438 0.8338 0.836 0.164
#> SRR1974929 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.4431 0.8924 0.908 0.092
#> SRR1974925 1 0.1414 0.9316 0.980 0.020
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.0672 0.9764 0.008 0.992
#> SRR1974922 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974920 1 0.8861 0.6380 0.696 0.304
#> SRR1974919 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974916 2 0.3584 0.9124 0.068 0.932
#> SRR1974915 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.2423 0.9439 0.040 0.960
#> SRR1974911 1 0.3584 0.9084 0.932 0.068
#> SRR1974910 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.3274 0.9219 0.060 0.940
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.1184 0.9690 0.016 0.984
#> SRR1974890 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.6973 0.8105 0.812 0.188
#> SRR1974885 1 0.8443 0.6937 0.728 0.272
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974875 1 0.6438 0.8295 0.836 0.164
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.6048 0.8494 0.852 0.148
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974864 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0938 0.9340 0.988 0.012
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.9522 0.5011 0.628 0.372
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.1633 0.9295 0.976 0.024
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0376 0.9355 0.996 0.004
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0376 0.9355 0.996 0.004
#> SRR1974825 1 0.8499 0.6929 0.724 0.276
#> SRR1974822 1 0.0938 0.9340 0.988 0.012
#> SRR1974823 1 0.6531 0.8319 0.832 0.168
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.9795 0.3919 0.584 0.416
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.7528 0.7782 0.784 0.216
#> SRR1974812 1 0.4431 0.8932 0.908 0.092
#> SRR1974810 1 0.5408 0.8702 0.876 0.124
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.5178 0.8769 0.884 0.116
#> SRR1974809 2 0.7376 0.7151 0.208 0.792
#> SRR1974807 1 0.0672 0.9349 0.992 0.008
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974803 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974800 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974786 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974787 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974784 2 0.1633 0.9611 0.024 0.976
#> SRR1974783 1 0.1414 0.9316 0.980 0.020
#> SRR1974785 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974782 1 0.7602 0.7729 0.780 0.220
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.7376 0.7877 0.792 0.208
#> SRR1974776 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974778 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974773 2 0.5946 0.8135 0.144 0.856
#> SRR1974775 1 0.8386 0.7058 0.732 0.268
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974762 2 0.9608 0.3227 0.384 0.616
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.5408 0.8701 0.876 0.124
#> SRR1974750 1 0.6247 0.8360 0.844 0.156
#> SRR1974752 1 0.6531 0.8318 0.832 0.168
#> SRR1974749 2 0.0672 0.9764 0.008 0.992
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.2948 0.9169 0.948 0.052
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.9209 0.4446 0.336 0.664
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.9710 0.2704 0.400 0.600
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974736 1 0.8016 0.7410 0.756 0.244
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.0938 0.9340 0.988 0.012
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.1414 0.9315 0.980 0.020
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.9983 0.2096 0.524 0.476
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.2043 0.9523 0.032 0.968
#> SRR1974719 1 0.8267 0.7179 0.740 0.260
#> SRR1974718 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.9998 -0.0997 0.492 0.508
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0672 0.9349 0.992 0.008
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974707 2 0.1633 0.9606 0.024 0.976
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974701 1 0.1414 0.9316 0.980 0.020
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0672 0.9349 0.992 0.008
#> SRR1974695 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0672 0.9348 0.992 0.008
#> SRR1974682 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.6712 0.8237 0.824 0.176
#> SRR1974680 1 0.1843 0.9285 0.972 0.028
#> SRR1974678 1 0.4161 0.8985 0.916 0.084
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.3584 0.9125 0.068 0.932
#> SRR1974660 1 0.1633 0.9301 0.976 0.024
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5737 0.8604 0.864 0.136
#> SRR1974654 1 0.4298 0.8951 0.912 0.088
#> SRR1974655 1 0.4690 0.8881 0.900 0.100
#> SRR1974656 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974652 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974640 1 0.5408 0.8703 0.876 0.124
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.3274 0.9125 0.940 0.060
#> SRR1974638 2 0.5178 0.8527 0.116 0.884
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.7376 0.7884 0.792 0.208
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.8608 0.6794 0.716 0.284
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.7139 0.8014 0.804 0.196
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.2948 0.9171 0.948 0.052
#> SRR1974620 2 0.8713 0.5478 0.292 0.708
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0376 0.9355 0.996 0.004
#> SRR1974616 1 0.6531 0.8318 0.832 0.168
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974613 1 0.9286 0.5667 0.656 0.344
#> SRR1974612 1 0.6801 0.8197 0.820 0.180
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0672 0.9349 0.992 0.008
#> SRR1974607 2 0.8499 0.5850 0.276 0.724
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.7745 0.7574 0.772 0.228
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.9686 0.2687 0.396 0.604
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974585 1 0.8144 0.7053 0.748 0.252
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974568 1 0.8144 0.7302 0.748 0.252
#> SRR1974567 1 0.2423 0.9227 0.960 0.040
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.5842 0.8263 0.140 0.860
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.2423 0.9232 0.960 0.040
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9359 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.2778 0.9367 0.048 0.952
#> SRR1974558 1 0.1184 0.9328 0.984 0.016
#> SRR1974556 1 0.0672 0.9349 0.992 0.008
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.1414 0.9651 0.020 0.980
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1974544 2 0.0672 0.9766 0.008 0.992
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 2 0.6819 0.63196 0.328 0.644 0.028
#> SRR1975008 2 0.0747 0.90817 0.016 0.984 0.000
#> SRR1975006 2 0.0592 0.90872 0.012 0.988 0.000
#> SRR1975005 2 0.0747 0.90791 0.016 0.984 0.000
#> SRR1975004 2 0.1643 0.90171 0.044 0.956 0.000
#> SRR1975003 2 0.1529 0.90252 0.040 0.960 0.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0747 0.90822 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974999 2 0.0592 0.90832 0.012 0.988 0.000
#> SRR1975000 2 0.2356 0.89514 0.072 0.928 0.000
#> SRR1974998 2 0.3030 0.88385 0.092 0.904 0.004
#> SRR1974997 2 0.4504 0.79576 0.196 0.804 0.000
#> SRR1974995 2 0.1289 0.90542 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974996 2 0.4887 0.78644 0.228 0.772 0.000
#> SRR1974994 3 0.1860 0.79229 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974993 2 0.0892 0.90763 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974992 2 0.1163 0.90496 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974990 1 0.7032 0.40057 0.676 0.272 0.052
#> SRR1974989 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974991 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974986 2 0.4654 0.79068 0.208 0.792 0.000
#> SRR1974987 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974988 2 0.1411 0.90152 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974984 2 0.0892 0.90718 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974985 2 0.5497 0.71973 0.292 0.708 0.000
#> SRR1974983 2 0.0747 0.90841 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974982 2 0.5560 0.70762 0.300 0.700 0.000
#> SRR1974981 3 0.6286 0.02284 0.464 0.000 0.536
#> SRR1974980 2 0.5058 0.77281 0.244 0.756 0.000
#> SRR1974979 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974978 1 0.8391 -0.04137 0.484 0.432 0.084
#> SRR1974977 2 0.5327 0.74094 0.272 0.728 0.000
#> SRR1974976 2 0.1031 0.90627 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974975 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974974 2 0.0892 0.90723 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974973 2 0.0592 0.90837 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974972 2 0.0592 0.90898 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974971 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974970 2 0.1753 0.90213 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974969 2 0.1753 0.90073 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974968 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974967 2 0.2261 0.89599 0.068 0.932 0.000
#> SRR1974965 1 0.8340 0.39152 0.620 0.236 0.144
#> SRR1974966 2 0.1031 0.90686 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974964 2 0.0237 0.90825 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974963 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974961 2 0.1031 0.90618 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974962 2 0.0592 0.90837 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974960 2 0.4931 0.78169 0.232 0.768 0.000
#> SRR1974959 2 0.0747 0.90791 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974958 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974957 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974956 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974955 1 0.6305 0.19658 0.516 0.000 0.484
#> SRR1974954 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974953 2 0.0747 0.90817 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974952 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974949 2 0.0592 0.90834 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974950 2 0.1643 0.90048 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974951 2 0.1163 0.90500 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974947 2 0.0747 0.90795 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974948 2 0.1289 0.90423 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974945 2 0.3686 0.85792 0.140 0.860 0.000
#> SRR1974944 3 0.3816 0.71467 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974942 1 0.5098 0.48532 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974943 2 0.2066 0.89709 0.060 0.940 0.000
#> SRR1974941 1 0.7147 0.51019 0.720 0.156 0.124
#> SRR1974940 2 0.4974 0.77876 0.236 0.764 0.000
#> SRR1974939 2 0.1289 0.90568 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974938 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974937 2 0.5098 0.76813 0.248 0.752 0.000
#> SRR1974936 1 0.5845 0.47376 0.688 0.004 0.308
#> SRR1974935 2 0.8625 0.46523 0.288 0.576 0.136
#> SRR1974934 2 0.1289 0.90445 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974933 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974932 2 0.5178 0.75850 0.256 0.744 0.000
#> SRR1974931 2 0.8209 0.13917 0.456 0.472 0.072
#> SRR1974930 1 0.7319 0.50547 0.708 0.128 0.164
#> SRR1974929 2 0.5621 0.69270 0.308 0.692 0.000
#> SRR1974928 2 0.0892 0.90737 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974927 2 0.1964 0.90074 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974924 1 0.7259 0.49688 0.680 0.072 0.248
#> SRR1974925 1 0.5036 0.50659 0.808 0.020 0.172
#> SRR1974926 1 0.6295 0.21412 0.528 0.000 0.472
#> SRR1974923 2 0.5327 0.74155 0.272 0.728 0.000
#> SRR1974922 2 0.3116 0.87692 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974921 2 0.1753 0.89974 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974920 1 0.9034 0.41948 0.552 0.260 0.188
#> SRR1974919 2 0.2878 0.88435 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974918 2 0.3752 0.85413 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974917 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974916 2 0.5098 0.76377 0.248 0.752 0.000
#> SRR1974915 2 0.2261 0.89604 0.068 0.932 0.000
#> SRR1974914 2 0.0237 0.90825 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974913 2 0.5733 0.67740 0.324 0.676 0.000
#> SRR1974911 1 0.5471 0.51572 0.812 0.060 0.128
#> SRR1974910 2 0.5722 0.71344 0.292 0.704 0.004
#> SRR1974908 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974909 2 0.1529 0.90239 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974906 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974907 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974905 2 0.5553 0.73777 0.272 0.724 0.004
#> SRR1974904 2 0.1163 0.90553 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974903 2 0.1163 0.90491 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974902 2 0.0892 0.90755 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974901 2 0.4605 0.80753 0.204 0.796 0.000
#> SRR1974898 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974900 2 0.0747 0.90822 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974899 2 0.0892 0.90708 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974897 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974896 2 0.0592 0.90871 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974893 2 0.1163 0.90485 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974895 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974894 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974892 2 0.5690 0.71564 0.288 0.708 0.004
#> SRR1974890 2 0.1529 0.90555 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974891 2 0.0747 0.90819 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974889 2 0.1289 0.90353 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974888 2 0.0747 0.90831 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974887 1 0.6470 0.49093 0.760 0.148 0.092
#> SRR1974885 1 0.6887 0.43774 0.720 0.204 0.076
#> SRR1974883 2 0.1529 0.90239 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974884 2 0.1411 0.90266 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974881 2 0.1289 0.90423 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974882 2 0.0892 0.90787 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.1289 0.90423 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974877 2 0.0424 0.90855 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974876 2 0.1411 0.90536 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974878 2 0.2625 0.88683 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974875 1 0.7509 0.47764 0.696 0.152 0.152
#> SRR1974874 2 0.2066 0.88082 0.060 0.940 0.000
#> SRR1974873 2 0.5785 0.65843 0.332 0.668 0.000
#> SRR1974871 2 0.3412 0.82829 0.124 0.876 0.000
#> SRR1974872 2 0.0237 0.90831 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974869 2 0.0237 0.90825 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974868 2 0.0424 0.90875 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974870 2 0.0424 0.90827 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974866 2 0.0592 0.90876 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974867 1 0.8798 0.37832 0.520 0.124 0.356
#> SRR1974865 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 2 0.5291 0.73307 0.268 0.732 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.1163 0.90004 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.3116 0.85197 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.4002 0.82946 0.160 0.840 0.000
#> SRR1974854 3 0.5363 0.52796 0.276 0.000 0.724
#> SRR1974853 3 0.6008 0.30819 0.372 0.000 0.628
#> SRR1974851 1 0.6482 0.49433 0.680 0.024 0.296
#> SRR1974852 2 0.0747 0.90725 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974849 1 0.6427 0.45280 0.640 0.012 0.348
#> SRR1974848 3 0.1964 0.79176 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974850 2 0.5216 0.72504 0.260 0.740 0.000
#> SRR1974846 2 0.3879 0.81394 0.152 0.848 0.000
#> SRR1974847 1 0.8040 0.40289 0.608 0.300 0.092
#> SRR1974845 2 0.0237 0.90803 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974844 3 0.3551 0.74821 0.132 0.000 0.868
#> SRR1974843 2 0.2448 0.88601 0.076 0.924 0.000
#> SRR1974842 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974841 3 0.0892 0.79332 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974840 2 0.6062 0.58536 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974839 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974838 3 0.1315 0.77414 0.020 0.008 0.972
#> SRR1974837 3 0.5926 0.33988 0.356 0.000 0.644
#> SRR1974835 1 0.6274 0.25072 0.544 0.000 0.456
#> SRR1974836 2 0.0892 0.90721 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974834 2 0.0424 0.90860 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974833 2 0.5291 0.72026 0.268 0.732 0.000
#> SRR1974831 2 0.3038 0.86821 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974832 3 0.5016 0.59566 0.240 0.000 0.760
#> SRR1974830 3 0.0237 0.79305 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974829 3 0.5882 0.36767 0.348 0.000 0.652
#> SRR1974828 3 0.6062 0.26886 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974826 2 0.0592 0.90820 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974827 2 0.3116 0.86511 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974824 1 0.6483 0.39821 0.600 0.008 0.392
#> SRR1974825 1 0.7872 0.47262 0.652 0.236 0.112
#> SRR1974822 1 0.6247 0.41525 0.620 0.004 0.376
#> SRR1974823 1 0.5696 0.50883 0.800 0.136 0.064
#> SRR1974820 3 0.1411 0.80052 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974818 1 0.6299 0.20792 0.524 0.000 0.476
#> SRR1974819 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974817 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974816 1 0.7505 0.30817 0.572 0.384 0.044
#> SRR1974815 1 0.6260 0.27644 0.552 0.000 0.448
#> SRR1974813 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974814 1 0.5892 0.47710 0.796 0.100 0.104
#> SRR1974812 1 0.7660 0.47168 0.612 0.064 0.324
#> SRR1974810 1 0.8202 0.51849 0.620 0.120 0.260
#> SRR1974808 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974811 1 0.7153 0.54093 0.708 0.092 0.200
#> SRR1974809 2 0.7156 0.40532 0.400 0.572 0.028
#> SRR1974807 1 0.6228 0.42182 0.624 0.004 0.372
#> SRR1974806 3 0.4178 0.69270 0.172 0.000 0.828
#> SRR1974805 2 0.5178 0.73369 0.256 0.744 0.000
#> SRR1974804 1 0.6798 0.37534 0.584 0.016 0.400
#> SRR1974803 1 0.6737 0.41023 0.600 0.016 0.384
#> SRR1974801 3 0.2796 0.77569 0.092 0.000 0.908
#> SRR1974800 2 0.0592 0.90851 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974799 3 0.0237 0.79317 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974798 2 0.0237 0.90825 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974797 2 0.0237 0.90803 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974796 2 0.5431 0.70781 0.284 0.716 0.000
#> SRR1974795 2 0.4178 0.81757 0.172 0.828 0.000
#> SRR1974793 3 0.3192 0.76778 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974794 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974791 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974786 2 0.0892 0.90909 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974787 2 0.1289 0.90464 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974784 2 0.6416 0.66663 0.304 0.676 0.020
#> SRR1974783 1 0.6369 0.48090 0.668 0.016 0.316
#> SRR1974785 2 0.1753 0.90159 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974782 1 0.7843 0.42277 0.668 0.140 0.192
#> SRR1974781 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 2 0.0237 0.90831 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974779 1 0.6468 0.29013 0.552 0.004 0.444
#> SRR1974777 1 0.8290 0.38241 0.632 0.164 0.204
#> SRR1974776 2 0.0592 0.90820 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974778 2 0.5254 0.72702 0.264 0.736 0.000
#> SRR1974774 2 0.0424 0.90850 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974773 2 0.5678 0.66456 0.316 0.684 0.000
#> SRR1974775 1 0.5982 0.45340 0.744 0.228 0.028
#> SRR1974772 1 0.6295 0.21138 0.528 0.000 0.472
#> SRR1974771 2 0.3941 0.83043 0.156 0.844 0.000
#> SRR1974770 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974769 2 0.3267 0.86072 0.116 0.884 0.000
#> SRR1974768 2 0.0424 0.90850 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974767 2 0.0424 0.90850 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.1031 0.90718 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974763 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974762 1 0.9830 0.22646 0.420 0.316 0.264
#> SRR1974761 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.0747 0.90814 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974759 3 0.6299 -0.06276 0.476 0.000 0.524
#> SRR1974758 2 0.0424 0.90863 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 3 0.0592 0.79804 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974754 2 0.3482 0.82457 0.128 0.872 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 1 0.6254 0.47444 0.756 0.056 0.188
#> SRR1974750 1 0.5020 0.43519 0.836 0.108 0.056
#> SRR1974752 1 0.8955 0.38276 0.524 0.144 0.332
#> SRR1974749 2 0.5397 0.70562 0.280 0.720 0.000
#> SRR1974747 1 0.6302 0.19103 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974748 1 0.7138 0.49304 0.644 0.044 0.312
#> SRR1974746 3 0.2261 0.78814 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974744 2 0.1529 0.89630 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974745 1 0.6244 -0.12147 0.560 0.440 0.000
#> SRR1974743 2 0.3551 0.82053 0.132 0.868 0.000
#> SRR1974742 1 0.6950 0.36047 0.572 0.020 0.408
#> SRR1974740 2 0.1964 0.88391 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974739 1 0.6608 -0.08847 0.560 0.432 0.008
#> SRR1974741 2 0.1964 0.88442 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974738 2 0.1964 0.88404 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974737 2 0.0237 0.90802 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974736 1 0.4683 0.43758 0.836 0.140 0.024
#> SRR1974735 3 0.1163 0.79929 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974734 2 0.5244 0.75290 0.240 0.756 0.004
#> SRR1974733 2 0.5529 0.69815 0.296 0.704 0.000
#> SRR1974732 1 0.5623 0.45186 0.716 0.004 0.280
#> SRR1974731 2 0.3412 0.83047 0.124 0.876 0.000
#> SRR1974729 3 0.1753 0.79698 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974730 1 0.6470 0.43848 0.632 0.012 0.356
#> SRR1974728 2 0.6095 0.57708 0.392 0.608 0.000
#> SRR1974725 1 0.7627 0.16052 0.528 0.428 0.044
#> SRR1974726 2 0.4842 0.76877 0.224 0.776 0.000
#> SRR1974724 3 0.1529 0.80024 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974727 2 0.0747 0.90648 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974723 2 0.6154 0.55242 0.408 0.592 0.000
#> SRR1974722 2 0.3038 0.85812 0.104 0.896 0.000
#> SRR1974721 2 0.2165 0.87812 0.064 0.936 0.000
#> SRR1974720 2 0.6062 0.58330 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974719 1 0.7139 0.46778 0.688 0.244 0.068
#> SRR1974718 1 0.6738 0.44620 0.624 0.020 0.356
#> SRR1974716 2 0.2165 0.89346 0.064 0.936 0.000
#> SRR1974717 2 0.5835 0.64931 0.340 0.660 0.000
#> SRR1974715 2 0.6062 0.58550 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974713 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974714 1 0.6745 0.07533 0.560 0.428 0.012
#> SRR1974711 2 0.0747 0.90778 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974712 3 0.0237 0.79305 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974709 1 0.6565 0.34881 0.576 0.008 0.416
#> SRR1974708 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974710 2 0.0592 0.90868 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974707 2 0.4654 0.78730 0.208 0.792 0.000
#> SRR1974706 3 0.0892 0.79831 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974704 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974705 3 0.6225 0.07551 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974703 2 0.2625 0.86876 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974702 2 0.0892 0.90720 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974701 1 0.4514 0.46759 0.832 0.012 0.156
#> SRR1974699 2 0.3116 0.84309 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974698 2 0.5988 0.60905 0.368 0.632 0.000
#> SRR1974700 3 0.6126 0.21958 0.400 0.000 0.600
#> SRR1974697 1 0.6244 0.28635 0.560 0.000 0.440
#> SRR1974696 2 0.3412 0.85909 0.124 0.876 0.000
#> SRR1974694 1 0.6451 0.27689 0.560 0.004 0.436
#> SRR1974695 2 0.2772 0.88563 0.080 0.916 0.004
#> SRR1974693 2 0.6111 0.56664 0.396 0.604 0.000
#> SRR1974692 2 0.5138 0.74817 0.252 0.748 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 3 0.2537 0.78123 0.080 0.000 0.920
#> SRR1974689 2 0.6111 0.56562 0.396 0.604 0.000
#> SRR1974688 2 0.3619 0.83083 0.136 0.864 0.000
#> SRR1974687 3 0.6280 -0.00806 0.460 0.000 0.540
#> SRR1974686 3 0.0747 0.79848 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974685 1 0.6280 0.23755 0.540 0.000 0.460
#> SRR1974684 3 0.3482 0.75009 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974683 1 0.6359 0.31000 0.592 0.004 0.404
#> SRR1974682 1 0.5325 0.44616 0.748 0.004 0.248
#> SRR1974681 3 0.2165 0.79364 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974679 1 0.6728 0.47794 0.736 0.080 0.184
#> SRR1974680 1 0.5817 0.50999 0.744 0.020 0.236
#> SRR1974678 1 0.5105 0.48265 0.828 0.048 0.124
#> SRR1974677 1 0.6307 0.17483 0.512 0.000 0.488
#> SRR1974676 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0747 0.90791 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974674 3 0.6305 -0.10964 0.484 0.000 0.516
#> SRR1974673 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0237 0.90831 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974663 2 0.0592 0.90869 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974662 3 0.2796 0.77379 0.092 0.000 0.908
#> SRR1974661 2 0.4808 0.80030 0.188 0.804 0.008
#> SRR1974660 1 0.6570 0.50202 0.680 0.028 0.292
#> SRR1974659 3 0.5706 0.42486 0.320 0.000 0.680
#> SRR1974658 1 0.6451 0.33427 0.560 0.004 0.436
#> SRR1974657 1 0.7915 0.52301 0.644 0.108 0.248
#> SRR1974654 3 0.7685 0.27783 0.344 0.060 0.596
#> SRR1974655 1 0.7590 0.51900 0.652 0.080 0.268
#> SRR1974656 1 0.6696 0.45903 0.632 0.020 0.348
#> SRR1974650 2 0.0424 0.90827 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974651 2 0.1031 0.90222 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974652 2 0.3116 0.86413 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974653 2 0.6045 0.59173 0.380 0.620 0.000
#> SRR1974648 1 0.6286 0.23165 0.536 0.000 0.464
#> SRR1974646 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974649 3 0.2356 0.79014 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974647 2 0.2537 0.86640 0.080 0.920 0.000
#> SRR1974645 1 0.6274 0.24822 0.544 0.000 0.456
#> SRR1974644 2 0.0747 0.90846 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974643 3 0.1411 0.79763 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974642 2 0.1289 0.90384 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974640 1 0.7849 0.52607 0.648 0.104 0.248
#> SRR1974641 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.7519 0.38307 0.568 0.044 0.388
#> SRR1974638 2 0.5988 0.56249 0.368 0.632 0.000
#> SRR1974635 1 0.6291 0.22302 0.532 0.000 0.468
#> SRR1974636 2 0.3340 0.86019 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974634 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974637 2 0.0237 0.90799 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974633 1 0.8508 0.49475 0.608 0.160 0.232
#> SRR1974632 3 0.0237 0.79572 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974631 1 0.8748 0.45515 0.584 0.244 0.172
#> SRR1974630 3 0.0424 0.79765 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974629 3 0.0237 0.79571 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974628 1 0.6235 0.29961 0.564 0.000 0.436
#> SRR1974627 1 0.7899 0.51555 0.664 0.144 0.192
#> SRR1974624 1 0.6244 0.27793 0.560 0.000 0.440
#> SRR1974625 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974623 2 0.1031 0.90762 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974622 1 0.7138 0.49514 0.644 0.044 0.312
#> SRR1974620 2 0.7585 0.60325 0.180 0.688 0.132
#> SRR1974619 2 0.4504 0.79701 0.196 0.804 0.000
#> SRR1974621 3 0.1411 0.80017 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974617 1 0.6483 0.26180 0.544 0.004 0.452
#> SRR1974616 1 0.8213 0.51827 0.632 0.140 0.228
#> SRR1974615 1 0.6267 0.25764 0.548 0.000 0.452
#> SRR1974618 3 0.1289 0.79862 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974614 2 0.0424 0.90838 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974613 1 0.8756 0.40266 0.540 0.332 0.128
#> SRR1974612 1 0.8153 0.51765 0.640 0.144 0.216
#> SRR1974611 2 0.0747 0.90838 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974610 2 0.1643 0.89157 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974609 3 0.6180 0.15891 0.416 0.000 0.584
#> SRR1974608 1 0.5882 0.43317 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974607 2 0.6442 0.38557 0.432 0.564 0.004
#> SRR1974606 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 1 0.7712 0.46800 0.676 0.196 0.128
#> SRR1974604 2 0.3816 0.81880 0.148 0.852 0.000
#> SRR1974603 2 0.0237 0.90831 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974602 3 0.0000 0.79393 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0592 0.90849 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974594 2 0.5650 0.68963 0.312 0.688 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0237 0.90824 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974588 2 0.6680 0.22297 0.484 0.508 0.008
#> SRR1974590 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.5254 0.72365 0.264 0.736 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 1 0.6731 0.50411 0.740 0.088 0.172
#> SRR1974584 1 0.5216 0.43299 0.740 0.000 0.260
#> SRR1974583 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0424 0.90885 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.4291 0.80769 0.180 0.820 0.000
#> SRR1974578 2 0.5733 0.66419 0.324 0.676 0.000
#> SRR1974577 2 0.5216 0.72504 0.260 0.740 0.000
#> SRR1974579 2 0.5138 0.73407 0.252 0.748 0.000
#> SRR1974576 2 0.0747 0.90942 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.1964 0.90018 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974573 2 0.4062 0.82745 0.164 0.836 0.000
#> SRR1974571 2 0.1643 0.90020 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974572 2 0.4346 0.80795 0.184 0.816 0.000
#> SRR1974570 2 0.0237 0.90831 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974568 1 0.6255 0.46812 0.748 0.204 0.048
#> SRR1974567 1 0.5355 0.50712 0.800 0.032 0.168
#> SRR1974566 2 0.0592 0.90816 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974569 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974565 2 0.7559 0.51545 0.336 0.608 0.056
#> SRR1974564 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.5173 0.51040 0.816 0.036 0.148
#> SRR1974559 1 0.6286 0.23165 0.536 0.000 0.464
#> SRR1974563 2 0.5327 0.71666 0.272 0.728 0.000
#> SRR1974562 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974561 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.90787 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974555 3 0.3551 0.73750 0.132 0.000 0.868
#> SRR1974551 1 0.6225 0.31398 0.568 0.000 0.432
#> SRR1974552 2 0.0424 0.90759 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974554 2 0.6744 0.64340 0.300 0.668 0.032
#> SRR1974558 1 0.4861 0.49536 0.808 0.012 0.180
#> SRR1974556 1 0.6033 0.41917 0.660 0.004 0.336
#> SRR1974550 2 0.4062 0.83185 0.164 0.836 0.000
#> SRR1974549 2 0.0892 0.90751 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974548 2 0.4750 0.77955 0.216 0.784 0.000
#> SRR1974547 2 0.5956 0.70993 0.264 0.720 0.016
#> SRR1974546 2 0.5138 0.73943 0.252 0.748 0.000
#> SRR1974545 2 0.0424 0.90827 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974544 2 0.5797 0.69687 0.280 0.712 0.008
#> SRR1974543 2 0.3816 0.83945 0.148 0.852 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 4 0.7042 0.62012 0.036 0.336 0.060 0.568
#> SRR1975008 2 0.0804 0.89594 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1975006 2 0.0657 0.89660 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1975005 2 0.1059 0.89420 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1975004 2 0.2484 0.87701 0.012 0.924 0.040 0.024
#> SRR1975003 2 0.2353 0.87803 0.008 0.928 0.040 0.024
#> SRR1975001 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0927 0.89511 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1974999 2 0.0804 0.89538 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1975000 2 0.3174 0.85861 0.008 0.892 0.048 0.052
#> SRR1974998 2 0.3385 0.84777 0.008 0.880 0.040 0.072
#> SRR1974997 2 0.4040 0.60137 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974995 2 0.1739 0.89029 0.008 0.952 0.024 0.016
#> SRR1974996 2 0.5230 0.62603 0.016 0.736 0.028 0.220
#> SRR1974994 3 0.2868 0.88503 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974993 2 0.1182 0.89380 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974992 2 0.1635 0.88483 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1974990 4 0.7427 0.64611 0.128 0.204 0.048 0.620
#> SRR1974989 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974991 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974986 2 0.4911 0.51306 0.008 0.704 0.008 0.280
#> SRR1974987 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974988 2 0.1211 0.88130 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974984 2 0.1042 0.89437 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1974985 2 0.6543 0.34986 0.028 0.616 0.048 0.308
#> SRR1974983 2 0.0927 0.89533 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1974982 4 0.5925 0.65841 0.008 0.304 0.044 0.644
#> SRR1974981 1 0.5123 0.61433 0.724 0.000 0.232 0.044
#> SRR1974980 2 0.5756 0.57824 0.016 0.704 0.048 0.232
#> SRR1974979 2 0.0469 0.89618 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974978 4 0.7336 0.64047 0.108 0.168 0.076 0.648
#> SRR1974977 2 0.6205 0.26233 0.008 0.596 0.048 0.348
#> SRR1974976 2 0.1388 0.89067 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1974975 2 0.2075 0.87956 0.004 0.936 0.044 0.016
#> SRR1974974 2 0.0779 0.89597 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974973 2 0.0524 0.89583 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974972 2 0.0779 0.89609 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974971 2 0.1913 0.88193 0.000 0.940 0.040 0.020
#> SRR1974970 2 0.2313 0.87630 0.000 0.924 0.044 0.032
#> SRR1974969 2 0.2529 0.87315 0.008 0.920 0.048 0.024
#> SRR1974968 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974967 2 0.2759 0.86372 0.000 0.904 0.044 0.052
#> SRR1974965 4 0.7406 0.58453 0.172 0.132 0.060 0.636
#> SRR1974966 2 0.1406 0.89156 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1974964 2 0.0336 0.89579 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974963 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974961 2 0.1004 0.89448 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974962 2 0.0524 0.89583 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974960 2 0.5090 0.61769 0.000 0.728 0.044 0.228
#> SRR1974959 2 0.1059 0.89430 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974958 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974957 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974956 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974955 1 0.2408 0.73956 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974954 2 0.2297 0.87633 0.004 0.928 0.044 0.024
#> SRR1974953 2 0.0804 0.89571 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1974952 2 0.2075 0.87956 0.004 0.936 0.044 0.016
#> SRR1974949 2 0.0804 0.89526 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1974950 2 0.2529 0.87248 0.008 0.920 0.048 0.024
#> SRR1974951 2 0.1388 0.89055 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR1974947 2 0.1174 0.89332 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974948 2 0.1452 0.88996 0.000 0.956 0.036 0.008
#> SRR1974946 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 2 0.4316 0.78748 0.008 0.824 0.048 0.120
#> SRR1974944 3 0.4103 0.75370 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR1974942 1 0.4934 0.58361 0.720 0.000 0.028 0.252
#> SRR1974943 2 0.3218 0.85961 0.032 0.896 0.044 0.028
#> SRR1974941 4 0.8268 0.29885 0.364 0.124 0.056 0.456
#> SRR1974940 2 0.5771 0.55613 0.016 0.696 0.044 0.244
#> SRR1974939 2 0.1624 0.88901 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1974938 2 0.1798 0.88435 0.000 0.944 0.040 0.016
#> SRR1974937 2 0.5760 0.47826 0.008 0.672 0.044 0.276
#> SRR1974936 1 0.4949 0.67923 0.760 0.000 0.060 0.180
#> SRR1974935 2 0.8214 0.09374 0.156 0.536 0.060 0.248
#> SRR1974934 2 0.1724 0.88618 0.000 0.948 0.032 0.020
#> SRR1974933 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974932 2 0.6027 0.34591 0.008 0.624 0.044 0.324
#> SRR1974931 4 0.7361 0.64460 0.128 0.196 0.048 0.628
#> SRR1974930 4 0.7901 0.28844 0.400 0.096 0.048 0.456
#> SRR1974929 4 0.6946 0.51148 0.040 0.396 0.040 0.524
#> SRR1974928 2 0.1284 0.89202 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1974927 2 0.2774 0.86904 0.004 0.908 0.044 0.044
#> SRR1974924 1 0.7475 0.47532 0.600 0.044 0.116 0.240
#> SRR1974925 1 0.6897 0.05881 0.472 0.016 0.064 0.448
#> SRR1974926 1 0.1557 0.75360 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974923 2 0.5885 0.40969 0.012 0.648 0.036 0.304
#> SRR1974922 2 0.3550 0.82490 0.000 0.860 0.044 0.096
#> SRR1974921 2 0.2632 0.87081 0.008 0.916 0.048 0.028
#> SRR1974920 1 0.8618 -0.02701 0.496 0.216 0.068 0.220
#> SRR1974919 2 0.3544 0.84155 0.008 0.872 0.044 0.076
#> SRR1974918 2 0.4199 0.78266 0.004 0.824 0.044 0.128
#> SRR1974917 2 0.0657 0.89551 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974916 2 0.5498 0.50323 0.000 0.680 0.048 0.272
#> SRR1974915 2 0.2944 0.86298 0.004 0.900 0.044 0.052
#> SRR1974914 2 0.0469 0.89569 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974913 4 0.7014 0.48889 0.036 0.396 0.048 0.520
#> SRR1974911 1 0.7395 -0.03088 0.464 0.044 0.060 0.432
#> SRR1974910 2 0.6478 0.01771 0.012 0.540 0.048 0.400
#> SRR1974908 2 0.0524 0.89570 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974909 2 0.2189 0.87862 0.004 0.932 0.044 0.020
#> SRR1974906 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974907 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974905 2 0.6546 0.08100 0.016 0.552 0.048 0.384
#> SRR1974904 2 0.1484 0.89209 0.004 0.960 0.020 0.016
#> SRR1974903 2 0.1584 0.88726 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1974902 2 0.0937 0.89545 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974901 2 0.5130 0.64789 0.004 0.740 0.044 0.212
#> SRR1974898 2 0.1798 0.88306 0.000 0.944 0.040 0.016
#> SRR1974900 2 0.0927 0.89511 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1974899 2 0.0779 0.89570 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974897 2 0.0376 0.89562 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974896 2 0.0657 0.89622 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974893 2 0.1584 0.88688 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1974895 2 0.0524 0.89570 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974894 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974892 4 0.6203 0.58209 0.008 0.368 0.044 0.580
#> SRR1974890 2 0.1677 0.88889 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1974891 2 0.1182 0.89346 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974889 2 0.1888 0.88058 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1974888 2 0.1059 0.89484 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1974886 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 4 0.6277 0.55268 0.196 0.116 0.008 0.680
#> SRR1974885 4 0.6043 0.56031 0.140 0.084 0.040 0.736
#> SRR1974883 2 0.2189 0.87862 0.004 0.932 0.044 0.020
#> SRR1974884 2 0.2002 0.87941 0.000 0.936 0.044 0.020
#> SRR1974881 2 0.1913 0.88139 0.000 0.940 0.040 0.020
#> SRR1974882 2 0.1174 0.89429 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974880 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.1610 0.88823 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1974877 2 0.0469 0.89588 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974876 2 0.2021 0.88211 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1974878 2 0.2542 0.85540 0.000 0.904 0.012 0.084
#> SRR1974875 4 0.7017 0.45900 0.252 0.076 0.044 0.628
#> SRR1974874 2 0.2216 0.84149 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974873 4 0.4837 0.46175 0.000 0.348 0.004 0.648
#> SRR1974871 2 0.4356 0.52403 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974872 2 0.0188 0.89529 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974869 2 0.0188 0.89525 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974868 2 0.1004 0.88932 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1974870 2 0.0712 0.89409 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1974866 2 0.0657 0.89506 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR1974867 1 0.7831 0.46673 0.588 0.108 0.228 0.076
#> SRR1974865 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 2 0.5929 0.27620 0.044 0.620 0.004 0.332
#> SRR1974862 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.1743 0.86779 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1974858 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.3791 0.69754 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR1974857 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.3494 0.73043 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR1974854 3 0.4967 0.36509 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1974853 1 0.4679 0.32668 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974851 1 0.5071 0.68483 0.772 0.016 0.044 0.168
#> SRR1974852 2 0.1617 0.88352 0.012 0.956 0.024 0.008
#> SRR1974849 1 0.2246 0.76225 0.928 0.004 0.016 0.052
#> SRR1974848 3 0.3528 0.84884 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1974850 4 0.4991 0.61544 0.004 0.388 0.000 0.608
#> SRR1974846 2 0.4837 0.41276 0.000 0.648 0.004 0.348
#> SRR1974847 1 0.8240 -0.23047 0.460 0.228 0.024 0.288
#> SRR1974845 2 0.0779 0.89042 0.004 0.980 0.016 0.000
#> SRR1974844 3 0.4804 0.75343 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR1974843 2 0.2457 0.85178 0.008 0.912 0.004 0.076
#> SRR1974842 3 0.2281 0.89047 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1974841 3 0.2799 0.88164 0.108 0.000 0.884 0.008
#> SRR1974840 4 0.3494 0.56349 0.000 0.172 0.004 0.824
#> SRR1974839 2 0.1296 0.88160 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR1974838 3 0.2597 0.86959 0.084 0.004 0.904 0.008
#> SRR1974837 1 0.4855 0.21464 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1974835 1 0.1635 0.76069 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1974836 2 0.1953 0.87799 0.012 0.944 0.032 0.012
#> SRR1974834 2 0.0657 0.89425 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974833 4 0.5024 0.65258 0.008 0.360 0.000 0.632
#> SRR1974831 2 0.3551 0.79771 0.004 0.860 0.028 0.108
#> SRR1974832 3 0.5040 0.57375 0.364 0.000 0.628 0.008
#> SRR1974830 3 0.2216 0.88508 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1974829 1 0.5957 0.13062 0.540 0.000 0.420 0.040
#> SRR1974828 1 0.4605 0.37578 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1974826 2 0.0712 0.89474 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1974827 2 0.3491 0.80153 0.004 0.864 0.028 0.104
#> SRR1974824 1 0.1863 0.76751 0.944 0.004 0.040 0.012
#> SRR1974825 1 0.7891 0.00622 0.524 0.188 0.024 0.264
#> SRR1974822 1 0.0707 0.76253 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974823 4 0.7711 0.28143 0.404 0.120 0.024 0.452
#> SRR1974820 3 0.3074 0.88455 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1974818 1 0.1867 0.75060 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974819 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974817 3 0.2081 0.88798 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974816 4 0.7182 0.61760 0.200 0.248 0.000 0.552
#> SRR1974815 1 0.1302 0.75879 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974813 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974814 4 0.4868 0.06210 0.304 0.000 0.012 0.684
#> SRR1974812 1 0.3861 0.74089 0.868 0.044 0.044 0.044
#> SRR1974810 1 0.2737 0.70703 0.888 0.104 0.000 0.008
#> SRR1974808 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974811 1 0.6500 0.47858 0.664 0.088 0.020 0.228
#> SRR1974809 4 0.6169 0.67279 0.068 0.296 0.004 0.632
#> SRR1974807 1 0.1191 0.76427 0.968 0.004 0.024 0.004
#> SRR1974806 3 0.4543 0.67552 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974805 4 0.5786 0.61287 0.004 0.380 0.028 0.588
#> SRR1974804 1 0.1114 0.76425 0.972 0.004 0.016 0.008
#> SRR1974803 1 0.1174 0.76410 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1974801 3 0.3893 0.85001 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1974800 2 0.0859 0.89451 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR1974799 3 0.2216 0.88517 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1974798 2 0.0336 0.89559 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974797 2 0.0779 0.89037 0.004 0.980 0.016 0.000
#> SRR1974796 4 0.6038 0.67066 0.016 0.312 0.036 0.636
#> SRR1974795 2 0.4987 0.56860 0.004 0.732 0.028 0.236
#> SRR1974793 3 0.4900 0.78453 0.236 0.000 0.732 0.032
#> SRR1974794 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0524 0.89338 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974791 2 0.1191 0.88410 0.004 0.968 0.024 0.004
#> SRR1974790 2 0.0188 0.89473 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 2 0.1182 0.89200 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1974787 2 0.1985 0.87541 0.040 0.940 0.004 0.016
#> SRR1974784 4 0.6009 0.67696 0.020 0.288 0.036 0.656
#> SRR1974783 1 0.2457 0.75076 0.912 0.008 0.004 0.076
#> SRR1974785 2 0.2310 0.87640 0.032 0.932 0.020 0.016
#> SRR1974782 4 0.8671 0.44165 0.252 0.100 0.144 0.504
#> SRR1974781 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974780 2 0.0188 0.89529 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974779 1 0.4093 0.72039 0.832 0.000 0.072 0.096
#> SRR1974777 4 0.8901 0.49471 0.180 0.136 0.180 0.504
#> SRR1974776 2 0.0859 0.89386 0.008 0.980 0.004 0.008
#> SRR1974778 2 0.5545 0.18699 0.020 0.612 0.004 0.364
#> SRR1974774 2 0.0376 0.89560 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974773 4 0.5999 0.57400 0.036 0.396 0.004 0.564
#> SRR1974775 4 0.6928 0.60063 0.204 0.184 0.004 0.608
#> SRR1974772 1 0.2281 0.73631 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974771 2 0.3681 0.72153 0.000 0.816 0.008 0.176
#> SRR1974770 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974769 2 0.4095 0.73988 0.004 0.820 0.028 0.148
#> SRR1974768 2 0.0376 0.89560 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974767 2 0.0376 0.89560 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974766 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.2049 0.87843 0.012 0.940 0.036 0.012
#> SRR1974764 2 0.0188 0.89522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974763 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974762 4 0.8167 0.62937 0.112 0.196 0.116 0.576
#> SRR1974761 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.1575 0.88064 0.004 0.956 0.028 0.012
#> SRR1974759 1 0.3074 0.68946 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974758 2 0.0376 0.89602 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974757 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974756 3 0.2530 0.89315 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1974754 2 0.4431 0.50589 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1974755 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0188 0.89498 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974751 1 0.5363 0.49919 0.612 0.012 0.004 0.372
#> SRR1974750 4 0.2530 0.41262 0.100 0.000 0.004 0.896
#> SRR1974752 4 0.9039 0.20337 0.316 0.104 0.156 0.424
#> SRR1974749 4 0.5186 0.66228 0.016 0.344 0.000 0.640
#> SRR1974747 1 0.1867 0.74944 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974748 1 0.1377 0.76206 0.964 0.020 0.008 0.008
#> SRR1974746 3 0.3528 0.85790 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1974744 2 0.1940 0.85825 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974745 4 0.1229 0.47847 0.008 0.020 0.004 0.968
#> SRR1974743 2 0.4564 0.45374 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1974742 1 0.0992 0.76520 0.976 0.012 0.004 0.008
#> SRR1974740 2 0.2408 0.82338 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974739 4 0.1543 0.49131 0.008 0.032 0.004 0.956
#> SRR1974741 2 0.2999 0.78432 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1974738 2 0.2125 0.85258 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1974737 2 0.0336 0.89463 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974736 4 0.4364 0.34011 0.180 0.024 0.004 0.792
#> SRR1974735 3 0.2589 0.89227 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974734 2 0.5036 0.46924 0.024 0.696 0.000 0.280
#> SRR1974733 4 0.4560 0.50940 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1974732 1 0.3681 0.68273 0.816 0.000 0.008 0.176
#> SRR1974731 2 0.4431 0.50324 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1974729 3 0.3444 0.86418 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1974730 1 0.0992 0.76112 0.976 0.004 0.008 0.012
#> SRR1974728 4 0.3583 0.56621 0.000 0.180 0.004 0.816
#> SRR1974725 4 0.7617 0.44536 0.292 0.208 0.004 0.496
#> SRR1974726 2 0.5155 0.09867 0.000 0.528 0.004 0.468
#> SRR1974724 3 0.3024 0.88769 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1974727 2 0.1356 0.88303 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR1974723 4 0.3052 0.56329 0.000 0.136 0.004 0.860
#> SRR1974722 2 0.3870 0.69025 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1974721 2 0.2469 0.82247 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974720 4 0.2796 0.57538 0.016 0.092 0.000 0.892
#> SRR1974719 1 0.7644 -0.31618 0.412 0.208 0.000 0.380
#> SRR1974718 1 0.0657 0.76399 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974716 2 0.2944 0.84807 0.044 0.900 0.004 0.052
#> SRR1974717 4 0.4950 0.45808 0.000 0.376 0.004 0.620
#> SRR1974715 4 0.3585 0.56716 0.004 0.164 0.004 0.828
#> SRR1974713 3 0.2081 0.88695 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974714 4 0.7423 0.65267 0.120 0.296 0.024 0.560
#> SRR1974711 2 0.1151 0.88923 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1974712 3 0.2216 0.88508 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1974709 1 0.1396 0.76584 0.960 0.004 0.032 0.004
#> SRR1974708 2 0.0657 0.89582 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974710 2 0.0859 0.89471 0.008 0.980 0.004 0.008
#> SRR1974707 2 0.4941 0.63757 0.044 0.760 0.004 0.192
#> SRR1974706 3 0.2814 0.88937 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974704 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974705 1 0.3311 0.67647 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974703 2 0.2999 0.79768 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1974702 2 0.1109 0.89329 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1974701 4 0.5168 -0.34311 0.492 0.000 0.004 0.504
#> SRR1974699 2 0.4304 0.53741 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974698 4 0.4372 0.53654 0.000 0.268 0.004 0.728
#> SRR1974700 1 0.4730 0.29664 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1974697 1 0.1209 0.76057 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974696 2 0.3636 0.74919 0.008 0.820 0.000 0.172
#> SRR1974694 1 0.1520 0.76064 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974695 2 0.2782 0.85034 0.024 0.904 0.004 0.068
#> SRR1974693 4 0.2714 0.55149 0.000 0.112 0.004 0.884
#> SRR1974692 2 0.5168 -0.03648 0.000 0.504 0.004 0.492
#> SRR1974690 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 3 0.4164 0.78760 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1974689 4 0.2164 0.52230 0.004 0.068 0.004 0.924
#> SRR1974688 2 0.4343 0.59049 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1974687 1 0.3610 0.63825 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974686 3 0.2921 0.88713 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1974685 1 0.1489 0.75657 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974684 3 0.4008 0.81085 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1974683 1 0.2271 0.74665 0.916 0.000 0.008 0.076
#> SRR1974682 1 0.4343 0.60168 0.732 0.000 0.004 0.264
#> SRR1974681 3 0.3852 0.86536 0.192 0.000 0.800 0.008
#> SRR1974679 1 0.5245 0.53274 0.660 0.016 0.004 0.320
#> SRR1974680 1 0.5525 0.43846 0.644 0.008 0.020 0.328
#> SRR1974678 4 0.5463 -0.32947 0.488 0.008 0.004 0.500
#> SRR1974677 1 0.2216 0.74183 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0804 0.89562 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974674 1 0.3610 0.64175 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974673 2 0.0524 0.89570 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974671 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974667 2 0.0188 0.89545 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974668 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0188 0.89529 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974663 2 0.0804 0.89581 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1974662 3 0.3972 0.84166 0.204 0.000 0.788 0.008
#> SRR1974661 2 0.4900 0.64298 0.032 0.760 0.008 0.200
#> SRR1974660 1 0.3965 0.72612 0.840 0.020 0.016 0.124
#> SRR1974659 1 0.4972 -0.03742 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974658 1 0.4419 0.70762 0.812 0.000 0.104 0.084
#> SRR1974657 1 0.3211 0.71628 0.884 0.084 0.008 0.024
#> SRR1974654 3 0.7782 0.36302 0.336 0.036 0.512 0.116
#> SRR1974655 1 0.2635 0.73029 0.908 0.072 0.004 0.016
#> SRR1974656 1 0.1174 0.76410 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1974650 2 0.0712 0.89409 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR1974651 2 0.1398 0.88181 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1974652 2 0.3172 0.80265 0.012 0.872 0.004 0.112
#> SRR1974653 4 0.3751 0.56578 0.000 0.196 0.004 0.800
#> SRR1974648 1 0.1389 0.75500 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974646 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974649 3 0.3710 0.86147 0.192 0.000 0.804 0.004
#> SRR1974647 2 0.2773 0.80839 0.000 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974645 1 0.1211 0.75868 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974644 2 0.1007 0.89440 0.008 0.976 0.008 0.008
#> SRR1974643 3 0.2760 0.88883 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1974642 2 0.1452 0.88363 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR1974640 1 0.3344 0.71298 0.876 0.092 0.008 0.024
#> SRR1974641 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.3444 0.74761 0.884 0.032 0.060 0.024
#> SRR1974638 4 0.5940 0.67208 0.052 0.304 0.004 0.640
#> SRR1974635 1 0.2921 0.69535 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1974636 2 0.3160 0.80235 0.008 0.868 0.004 0.120
#> SRR1974634 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974637 2 0.0657 0.89382 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974633 1 0.4581 0.64627 0.820 0.108 0.052 0.020
#> SRR1974632 3 0.2281 0.89210 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1974631 1 0.7328 0.30328 0.624 0.180 0.036 0.160
#> SRR1974630 3 0.2149 0.89069 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974629 3 0.2345 0.89200 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974628 1 0.1211 0.76196 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974627 1 0.5037 0.62802 0.800 0.112 0.040 0.048
#> SRR1974624 1 0.0817 0.76392 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 2 0.1247 0.89194 0.012 0.968 0.004 0.016
#> SRR1974622 1 0.2383 0.75752 0.924 0.024 0.004 0.048
#> SRR1974620 2 0.6396 0.39381 0.244 0.660 0.016 0.080
#> SRR1974619 2 0.4123 0.64134 0.008 0.772 0.000 0.220
#> SRR1974621 3 0.2868 0.89011 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974617 1 0.1209 0.76224 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR1974616 1 0.3781 0.68940 0.856 0.104 0.024 0.016
#> SRR1974615 1 0.1022 0.76063 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974618 3 0.3219 0.87649 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1974614 2 0.0524 0.89570 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974613 4 0.7830 0.43891 0.324 0.272 0.000 0.404
#> SRR1974612 1 0.3683 0.67137 0.856 0.112 0.016 0.016
#> SRR1974611 2 0.1114 0.89417 0.008 0.972 0.004 0.016
#> SRR1974610 2 0.1940 0.85492 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974609 1 0.3528 0.65355 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974608 1 0.1624 0.76092 0.952 0.000 0.020 0.028
#> SRR1974607 4 0.6530 0.67126 0.080 0.304 0.008 0.608
#> SRR1974606 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 4 0.7022 0.54735 0.252 0.144 0.008 0.596
#> SRR1974604 2 0.4819 0.42498 0.000 0.652 0.004 0.344
#> SRR1974603 2 0.0188 0.89529 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974602 3 0.2011 0.88738 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0707 0.89317 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974594 4 0.6333 0.66906 0.032 0.296 0.036 0.636
#> SRR1974593 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.1443 0.88048 0.004 0.960 0.028 0.008
#> SRR1974592 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0188 0.89501 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974588 4 0.5799 0.67770 0.048 0.292 0.004 0.656
#> SRR1974590 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 4 0.4920 0.64241 0.004 0.368 0.000 0.628
#> SRR1974587 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 4 0.6028 0.30681 0.324 0.028 0.020 0.628
#> SRR1974584 4 0.5947 0.24482 0.312 0.000 0.060 0.628
#> SRR1974583 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0524 0.89681 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974581 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.3649 0.67116 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1974578 4 0.5141 0.68135 0.032 0.268 0.000 0.700
#> SRR1974577 4 0.4920 0.64599 0.004 0.368 0.000 0.628
#> SRR1974579 4 0.5097 0.53709 0.004 0.428 0.000 0.568
#> SRR1974576 2 0.0779 0.89668 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974575 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.2860 0.86295 0.004 0.904 0.048 0.044
#> SRR1974573 2 0.5359 0.43353 0.004 0.680 0.028 0.288
#> SRR1974571 2 0.2400 0.86357 0.004 0.924 0.028 0.044
#> SRR1974572 2 0.4987 0.57002 0.004 0.732 0.028 0.236
#> SRR1974570 2 0.0188 0.89529 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974568 4 0.7108 0.55619 0.192 0.116 0.044 0.648
#> SRR1974567 4 0.5361 0.30604 0.344 0.016 0.004 0.636
#> SRR1974566 2 0.1443 0.88138 0.004 0.960 0.028 0.008
#> SRR1974569 2 0.1296 0.88160 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR1974565 4 0.6530 0.67248 0.084 0.272 0.012 0.632
#> SRR1974564 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 4 0.5250 0.31047 0.344 0.012 0.004 0.640
#> SRR1974559 1 0.1302 0.75655 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974563 4 0.5821 0.66506 0.008 0.332 0.032 0.628
#> SRR1974562 2 0.1191 0.88419 0.004 0.968 0.024 0.004
#> SRR1974561 2 0.1296 0.88160 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR1974557 2 0.0000 0.89467 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.1191 0.88408 0.004 0.968 0.024 0.004
#> SRR1974555 3 0.4193 0.76622 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1974551 1 0.1022 0.76037 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974552 2 0.1296 0.88160 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR1974554 4 0.6315 0.67411 0.076 0.300 0.004 0.620
#> SRR1974558 4 0.5253 0.24507 0.360 0.000 0.016 0.624
#> SRR1974556 1 0.6453 0.34924 0.560 0.000 0.080 0.360
#> SRR1974550 2 0.4301 0.69736 0.012 0.788 0.008 0.192
#> SRR1974549 2 0.1811 0.87717 0.004 0.948 0.028 0.020
#> SRR1974548 2 0.4773 0.48969 0.008 0.708 0.004 0.280
#> SRR1974547 2 0.6061 0.08012 0.036 0.584 0.008 0.372
#> SRR1974546 2 0.5366 -0.14370 0.012 0.548 0.000 0.440
#> SRR1974545 2 0.0524 0.89476 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR1974544 4 0.5892 0.67029 0.044 0.324 0.004 0.628
#> SRR1974543 2 0.4376 0.70702 0.004 0.796 0.028 0.172
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.4357 0.52441 0.016 0.228 0.740 0.012 0.004
#> SRR1975008 2 0.0865 0.86829 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1975006 2 0.1124 0.86880 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1975005 2 0.1740 0.86318 0.000 0.932 0.056 0.012 0.000
#> SRR1975004 2 0.3379 0.81570 0.016 0.828 0.148 0.008 0.000
#> SRR1975003 2 0.2956 0.82549 0.004 0.848 0.140 0.008 0.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.1809 0.86149 0.000 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR1974999 2 0.1331 0.86725 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1975000 2 0.3250 0.81080 0.004 0.820 0.168 0.008 0.000
#> SRR1974998 2 0.3704 0.78770 0.004 0.792 0.188 0.012 0.004
#> SRR1974997 2 0.4016 0.59283 0.000 0.716 0.272 0.012 0.000
#> SRR1974995 2 0.2295 0.85509 0.004 0.900 0.088 0.008 0.000
#> SRR1974996 2 0.4504 0.54402 0.008 0.648 0.336 0.008 0.000
#> SRR1974994 5 0.2166 0.86304 0.072 0.000 0.004 0.012 0.912
#> SRR1974993 2 0.2305 0.84890 0.000 0.896 0.092 0.012 0.000
#> SRR1974992 2 0.2304 0.84375 0.000 0.892 0.100 0.008 0.000
#> SRR1974990 3 0.3832 0.60570 0.068 0.100 0.824 0.004 0.004
#> SRR1974989 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974991 2 0.2771 0.82661 0.000 0.860 0.128 0.012 0.000
#> SRR1974986 2 0.4538 0.45720 0.004 0.636 0.348 0.012 0.000
#> SRR1974987 2 0.2864 0.82255 0.000 0.852 0.136 0.012 0.000
#> SRR1974988 2 0.1043 0.85684 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.1892 0.85630 0.000 0.916 0.080 0.004 0.000
#> SRR1974985 2 0.5242 0.22047 0.024 0.516 0.448 0.012 0.000
#> SRR1974983 2 0.1251 0.86685 0.000 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1974982 3 0.3129 0.58531 0.004 0.156 0.832 0.008 0.000
#> SRR1974981 1 0.5122 0.60913 0.688 0.000 0.112 0.000 0.200
#> SRR1974980 2 0.4710 0.49680 0.008 0.616 0.364 0.012 0.000
#> SRR1974979 2 0.1205 0.86674 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1974978 3 0.2948 0.56915 0.064 0.040 0.884 0.004 0.008
#> SRR1974977 3 0.4803 -0.11646 0.004 0.488 0.496 0.012 0.000
#> SRR1974976 2 0.1671 0.85988 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1974975 2 0.2953 0.81512 0.000 0.844 0.144 0.012 0.000
#> SRR1974974 2 0.0880 0.86853 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0609 0.86770 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974972 2 0.1408 0.86634 0.000 0.948 0.044 0.008 0.000
#> SRR1974971 2 0.2660 0.83005 0.000 0.864 0.128 0.008 0.000
#> SRR1974970 2 0.2953 0.82150 0.000 0.844 0.144 0.012 0.000
#> SRR1974969 2 0.3437 0.79190 0.004 0.808 0.176 0.012 0.000
#> SRR1974968 2 0.2771 0.82597 0.000 0.860 0.128 0.012 0.000
#> SRR1974967 2 0.3318 0.79353 0.000 0.808 0.180 0.012 0.000
#> SRR1974965 3 0.3909 0.53852 0.136 0.012 0.816 0.008 0.028
#> SRR1974966 2 0.2358 0.84480 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1974964 2 0.0451 0.86751 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1974963 2 0.3039 0.80777 0.000 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1974961 2 0.1410 0.86494 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0404 0.86649 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974960 2 0.4356 0.55180 0.000 0.648 0.340 0.012 0.000
#> SRR1974959 2 0.1557 0.86538 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1974958 2 0.3039 0.81075 0.000 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1974957 2 0.2929 0.81088 0.000 0.840 0.152 0.008 0.000
#> SRR1974956 2 0.3123 0.80359 0.000 0.828 0.160 0.012 0.000
#> SRR1974955 1 0.2629 0.75122 0.860 0.000 0.000 0.004 0.136
#> SRR1974954 2 0.3163 0.80268 0.000 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1974953 2 0.1282 0.86651 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1974952 2 0.2753 0.82422 0.000 0.856 0.136 0.008 0.000
#> SRR1974949 2 0.1697 0.85977 0.000 0.932 0.060 0.008 0.000
#> SRR1974950 2 0.3044 0.81945 0.004 0.840 0.148 0.008 0.000
#> SRR1974951 2 0.1638 0.86222 0.000 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1974947 2 0.1282 0.86717 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1974948 2 0.1410 0.86431 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 2 0.4170 0.69482 0.004 0.712 0.272 0.012 0.000
#> SRR1974944 5 0.4141 0.74557 0.208 0.000 0.012 0.020 0.760
#> SRR1974942 1 0.4516 0.56541 0.704 0.000 0.264 0.008 0.024
#> SRR1974943 2 0.3477 0.81718 0.024 0.828 0.140 0.008 0.000
#> SRR1974941 3 0.5392 0.49170 0.252 0.080 0.660 0.004 0.004
#> SRR1974940 2 0.4632 0.47912 0.004 0.608 0.376 0.012 0.000
#> SRR1974939 2 0.2189 0.85449 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1974938 2 0.2886 0.81739 0.000 0.844 0.148 0.008 0.000
#> SRR1974937 2 0.4238 0.44347 0.004 0.628 0.368 0.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.4442 0.61257 0.688 0.000 0.284 0.000 0.028
#> SRR1974935 2 0.6895 0.07893 0.132 0.468 0.372 0.012 0.016
#> SRR1974934 2 0.2304 0.84693 0.000 0.892 0.100 0.008 0.000
#> SRR1974933 2 0.2843 0.81856 0.000 0.848 0.144 0.008 0.000
#> SRR1974932 2 0.4787 0.23303 0.004 0.528 0.456 0.012 0.000
#> SRR1974931 3 0.3977 0.61172 0.080 0.100 0.812 0.000 0.008
#> SRR1974930 3 0.4709 0.39699 0.324 0.024 0.648 0.000 0.004
#> SRR1974929 3 0.4713 0.48146 0.028 0.284 0.680 0.008 0.000
#> SRR1974928 2 0.1571 0.86239 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1974927 2 0.3391 0.78805 0.000 0.800 0.188 0.012 0.000
#> SRR1974924 1 0.6391 0.43104 0.572 0.032 0.288 0.000 0.108
#> SRR1974925 3 0.5041 0.12787 0.428 0.008 0.544 0.000 0.020
#> SRR1974926 1 0.1341 0.78024 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974923 2 0.4782 0.24791 0.008 0.544 0.440 0.008 0.000
#> SRR1974922 2 0.3690 0.75545 0.000 0.764 0.224 0.012 0.000
#> SRR1974921 2 0.3475 0.78916 0.004 0.804 0.180 0.012 0.000
#> SRR1974920 1 0.6571 0.04994 0.468 0.100 0.408 0.012 0.012
#> SRR1974919 2 0.3815 0.75875 0.004 0.764 0.220 0.012 0.000
#> SRR1974918 2 0.3916 0.71150 0.000 0.732 0.256 0.012 0.000
#> SRR1974917 2 0.1557 0.86199 0.000 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1974916 2 0.4425 0.42422 0.000 0.600 0.392 0.008 0.000
#> SRR1974915 2 0.3462 0.78162 0.000 0.792 0.196 0.012 0.000
#> SRR1974914 2 0.0992 0.86750 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1974913 3 0.4832 0.46222 0.032 0.292 0.668 0.008 0.000
#> SRR1974911 3 0.4859 0.36476 0.332 0.024 0.636 0.000 0.008
#> SRR1974910 3 0.4727 0.24576 0.008 0.408 0.576 0.008 0.000
#> SRR1974908 2 0.1357 0.86430 0.000 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR1974909 2 0.3087 0.81272 0.004 0.836 0.152 0.008 0.000
#> SRR1974906 2 0.0404 0.86764 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974907 2 0.3039 0.80777 0.000 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1974905 3 0.5067 0.11844 0.016 0.436 0.536 0.012 0.000
#> SRR1974904 2 0.2304 0.84718 0.000 0.892 0.100 0.008 0.000
#> SRR1974903 2 0.2674 0.83220 0.000 0.868 0.120 0.012 0.000
#> SRR1974902 2 0.1205 0.86799 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1974901 2 0.4444 0.52441 0.000 0.624 0.364 0.012 0.000
#> SRR1974898 2 0.2358 0.84306 0.000 0.888 0.104 0.008 0.000
#> SRR1974900 2 0.1764 0.85982 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1974899 2 0.1282 0.86603 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1974897 2 0.1282 0.86544 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1974896 2 0.0566 0.86733 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1974893 2 0.2249 0.84791 0.000 0.896 0.096 0.008 0.000
#> SRR1974895 2 0.1502 0.86194 0.000 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1974894 2 0.3123 0.80359 0.000 0.828 0.160 0.012 0.000
#> SRR1974892 3 0.3578 0.57454 0.008 0.204 0.784 0.004 0.000
#> SRR1974890 2 0.1956 0.86114 0.000 0.916 0.076 0.008 0.000
#> SRR1974891 2 0.2189 0.85211 0.000 0.904 0.084 0.012 0.000
#> SRR1974889 2 0.2522 0.83813 0.000 0.880 0.108 0.012 0.000
#> SRR1974888 2 0.1484 0.86579 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 3 0.5645 0.56643 0.172 0.068 0.704 0.052 0.004
#> SRR1974885 3 0.4653 0.55061 0.104 0.040 0.792 0.056 0.008
#> SRR1974883 2 0.3111 0.81566 0.004 0.840 0.144 0.012 0.000
#> SRR1974884 2 0.2612 0.83211 0.000 0.868 0.124 0.008 0.000
#> SRR1974881 2 0.2612 0.83267 0.000 0.868 0.124 0.008 0.000
#> SRR1974882 2 0.1571 0.86451 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.2411 0.84282 0.000 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1974877 2 0.0510 0.86733 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.2864 0.82577 0.000 0.852 0.136 0.012 0.000
#> SRR1974878 2 0.3250 0.80239 0.004 0.820 0.168 0.008 0.000
#> SRR1974875 3 0.4587 0.55773 0.172 0.044 0.760 0.000 0.024
#> SRR1974874 2 0.1965 0.83548 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974873 4 0.4504 0.65623 0.000 0.084 0.168 0.748 0.000
#> SRR1974871 2 0.3999 0.47772 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1974872 2 0.0290 0.86639 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974869 2 0.0162 0.86549 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.1502 0.84920 0.004 0.940 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974870 2 0.0671 0.86526 0.004 0.980 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.0566 0.86748 0.004 0.984 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.7571 0.45220 0.564 0.080 0.096 0.044 0.216
#> SRR1974865 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 2 0.5159 0.17125 0.044 0.556 0.400 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.1478 0.85429 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.4644 0.06256 0.000 0.528 0.012 0.460 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.2929 0.72874 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR1974854 5 0.5513 0.33323 0.408 0.000 0.000 0.068 0.524
#> SRR1974853 1 0.5438 0.30780 0.592 0.000 0.004 0.064 0.340
#> SRR1974851 1 0.5685 0.57948 0.636 0.004 0.284 0.044 0.032
#> SRR1974852 2 0.2568 0.82129 0.004 0.888 0.092 0.000 0.016
#> SRR1974849 1 0.2046 0.78131 0.916 0.000 0.068 0.000 0.016
#> SRR1974848 5 0.2624 0.84156 0.116 0.000 0.000 0.012 0.872
#> SRR1974850 3 0.4030 0.54641 0.000 0.352 0.648 0.000 0.000
#> SRR1974846 4 0.3992 0.46265 0.000 0.268 0.012 0.720 0.000
#> SRR1974847 1 0.6510 -0.23631 0.444 0.196 0.360 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1168 0.85759 0.000 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR1974844 5 0.4935 0.76208 0.216 0.000 0.020 0.048 0.716
#> SRR1974843 2 0.2077 0.83459 0.008 0.908 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974842 5 0.2782 0.86088 0.048 0.000 0.000 0.072 0.880
#> SRR1974841 5 0.2312 0.86067 0.060 0.000 0.016 0.012 0.912
#> SRR1974840 4 0.4295 0.65285 0.000 0.044 0.216 0.740 0.000
#> SRR1974839 2 0.3191 0.79268 0.000 0.864 0.092 0.020 0.024
#> SRR1974838 5 0.1808 0.84762 0.044 0.000 0.008 0.012 0.936
#> SRR1974837 1 0.5550 0.12880 0.528 0.000 0.000 0.072 0.400
#> SRR1974835 1 0.1800 0.78614 0.932 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR1974836 2 0.3506 0.77573 0.000 0.836 0.124 0.016 0.024
#> SRR1974834 2 0.2122 0.84543 0.000 0.924 0.032 0.036 0.008
#> SRR1974833 3 0.3949 0.59321 0.004 0.300 0.696 0.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.4618 0.67200 0.000 0.748 0.192 0.036 0.024
#> SRR1974832 5 0.5494 0.56712 0.324 0.000 0.008 0.064 0.604
#> SRR1974830 5 0.1661 0.86253 0.036 0.000 0.000 0.024 0.940
#> SRR1974829 1 0.7410 0.01939 0.424 0.000 0.124 0.080 0.372
#> SRR1974828 1 0.5272 0.36567 0.620 0.000 0.000 0.072 0.308
#> SRR1974826 2 0.0771 0.86605 0.004 0.976 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.4512 0.70025 0.000 0.768 0.164 0.044 0.024
#> SRR1974824 1 0.1818 0.79011 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR1974825 1 0.6215 -0.00151 0.500 0.152 0.348 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0703 0.78599 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974823 3 0.5783 0.37889 0.372 0.084 0.540 0.000 0.004
#> SRR1974820 5 0.3309 0.85199 0.128 0.000 0.000 0.036 0.836
#> SRR1974818 1 0.1608 0.77815 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974819 5 0.1211 0.86207 0.024 0.000 0.000 0.016 0.960
#> SRR1974817 5 0.2388 0.85872 0.028 0.000 0.000 0.072 0.900
#> SRR1974816 3 0.5841 0.62239 0.180 0.212 0.608 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.1121 0.78433 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974813 5 0.1211 0.86148 0.024 0.000 0.000 0.016 0.960
#> SRR1974814 4 0.6912 0.34087 0.208 0.000 0.284 0.488 0.020
#> SRR1974812 1 0.5747 0.64910 0.684 0.020 0.216 0.048 0.032
#> SRR1974810 1 0.2304 0.72327 0.892 0.100 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0162 0.86515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.5743 0.36445 0.600 0.080 0.308 0.000 0.012
#> SRR1974809 3 0.4369 0.64321 0.052 0.208 0.740 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0865 0.78700 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1974806 5 0.5218 0.62704 0.296 0.000 0.000 0.072 0.632
#> SRR1974805 3 0.5423 0.47752 0.000 0.280 0.648 0.048 0.024
#> SRR1974804 1 0.1314 0.78779 0.960 0.004 0.008 0.004 0.024
#> SRR1974803 1 0.0865 0.78651 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974801 5 0.4025 0.83833 0.140 0.000 0.004 0.060 0.796
#> SRR1974800 2 0.1357 0.86667 0.004 0.948 0.048 0.000 0.000
#> SRR1974799 5 0.2344 0.85903 0.032 0.000 0.000 0.064 0.904
#> SRR1974798 2 0.0404 0.86717 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.1408 0.85244 0.000 0.948 0.044 0.000 0.008
#> SRR1974796 3 0.4638 0.53865 0.012 0.132 0.784 0.048 0.024
#> SRR1974795 2 0.5623 0.35316 0.000 0.604 0.324 0.048 0.024
#> SRR1974793 5 0.6208 0.70807 0.204 0.000 0.080 0.072 0.644
#> SRR1974794 2 0.0162 0.86565 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.1630 0.85188 0.000 0.944 0.036 0.004 0.016
#> SRR1974791 2 0.3068 0.80567 0.000 0.876 0.072 0.032 0.020
#> SRR1974790 2 0.0290 0.86500 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 2 0.1493 0.86661 0.028 0.948 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.2300 0.85209 0.040 0.908 0.052 0.000 0.000
#> SRR1974784 3 0.4109 0.54950 0.004 0.132 0.808 0.032 0.024
#> SRR1974783 1 0.1892 0.77239 0.916 0.000 0.080 0.000 0.004
#> SRR1974785 2 0.2792 0.84813 0.040 0.884 0.072 0.004 0.000
#> SRR1974782 3 0.6529 0.51427 0.228 0.060 0.604 0.000 0.108
#> SRR1974781 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974780 2 0.0162 0.86547 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.3924 0.73108 0.808 0.000 0.120 0.004 0.068
#> SRR1974777 3 0.7418 0.55085 0.128 0.116 0.588 0.024 0.144
#> SRR1974776 2 0.0771 0.86533 0.004 0.976 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974778 2 0.4588 0.20366 0.016 0.604 0.380 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0290 0.86591 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974773 3 0.4940 0.47852 0.032 0.392 0.576 0.000 0.000
#> SRR1974775 3 0.5109 0.62363 0.172 0.132 0.696 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.2304 0.76109 0.892 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR1974771 2 0.3160 0.71699 0.004 0.808 0.188 0.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0162 0.86515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.5135 0.57641 0.000 0.696 0.232 0.048 0.024
#> SRR1974768 2 0.0451 0.86675 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974767 2 0.0290 0.86591 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.3197 0.79730 0.000 0.852 0.116 0.008 0.024
#> SRR1974764 2 0.0162 0.86533 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 5 0.1106 0.86070 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974762 3 0.6762 0.60442 0.108 0.152 0.624 0.004 0.112
#> SRR1974761 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.4016 0.75198 0.000 0.816 0.112 0.048 0.024
#> SRR1974759 1 0.3321 0.71419 0.832 0.000 0.000 0.032 0.136
#> SRR1974758 2 0.0703 0.86785 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974756 5 0.2006 0.86638 0.072 0.000 0.000 0.012 0.916
#> SRR1974754 2 0.4227 0.27920 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0162 0.86563 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974751 4 0.4251 0.35182 0.316 0.000 0.012 0.672 0.000
#> SRR1974750 4 0.2864 0.69215 0.012 0.000 0.136 0.852 0.000
#> SRR1974752 3 0.8340 0.35496 0.252 0.092 0.472 0.052 0.132
#> SRR1974749 3 0.4157 0.61778 0.020 0.264 0.716 0.000 0.000
#> SRR1974747 1 0.1544 0.77892 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974748 1 0.1377 0.78354 0.956 0.020 0.020 0.000 0.004
#> SRR1974746 5 0.4313 0.81088 0.172 0.000 0.000 0.068 0.760
#> SRR1974744 2 0.2124 0.83669 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR1974745 4 0.2561 0.69170 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974743 4 0.4306 0.02192 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1974742 1 0.0727 0.78709 0.980 0.004 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974740 2 0.3074 0.74321 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1974739 4 0.2674 0.69542 0.000 0.004 0.140 0.856 0.000
#> SRR1974741 2 0.2813 0.77224 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1974738 2 0.1792 0.84429 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974737 2 0.0703 0.86523 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974736 4 0.2674 0.69253 0.004 0.000 0.140 0.856 0.000
#> SRR1974735 5 0.1942 0.86498 0.068 0.000 0.000 0.012 0.920
#> SRR1974734 2 0.5522 0.40404 0.024 0.652 0.264 0.060 0.000
#> SRR1974733 4 0.4768 0.63716 0.000 0.096 0.180 0.724 0.000
#> SRR1974732 1 0.3522 0.66671 0.780 0.000 0.004 0.212 0.004
#> SRR1974731 4 0.4440 0.14120 0.000 0.468 0.004 0.528 0.000
#> SRR1974729 5 0.4372 0.81086 0.172 0.000 0.000 0.072 0.756
#> SRR1974730 1 0.0771 0.78397 0.976 0.004 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.3513 0.68270 0.000 0.020 0.180 0.800 0.000
#> SRR1974725 3 0.8414 0.24801 0.272 0.160 0.332 0.236 0.000
#> SRR1974726 4 0.4297 0.58909 0.000 0.164 0.072 0.764 0.000
#> SRR1974724 5 0.2900 0.86460 0.108 0.000 0.000 0.028 0.864
#> SRR1974727 2 0.1331 0.85750 0.040 0.952 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.3081 0.69427 0.000 0.012 0.156 0.832 0.000
#> SRR1974722 2 0.4227 0.58429 0.000 0.692 0.016 0.292 0.000
#> SRR1974721 2 0.4126 0.36690 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1974720 3 0.5703 0.12127 0.024 0.044 0.564 0.368 0.000
#> SRR1974719 3 0.6519 0.34569 0.400 0.192 0.408 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0613 0.78538 0.984 0.004 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974716 2 0.2645 0.82982 0.044 0.888 0.068 0.000 0.000
#> SRR1974717 4 0.6268 0.29479 0.000 0.232 0.228 0.540 0.000
#> SRR1974715 4 0.2864 0.69960 0.000 0.012 0.136 0.852 0.000
#> SRR1974713 5 0.1106 0.86070 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974714 3 0.5147 0.62705 0.112 0.184 0.700 0.000 0.004
#> SRR1974711 2 0.1012 0.86397 0.020 0.968 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974712 5 0.1444 0.86120 0.040 0.000 0.000 0.012 0.948
#> SRR1974709 1 0.1408 0.78831 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR1974708 2 0.0771 0.86650 0.004 0.976 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974710 2 0.0671 0.86680 0.004 0.980 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974707 2 0.4168 0.64354 0.044 0.756 0.200 0.000 0.000
#> SRR1974706 5 0.2305 0.86468 0.092 0.000 0.000 0.012 0.896
#> SRR1974704 5 0.1106 0.86070 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974705 1 0.3282 0.69437 0.804 0.000 0.000 0.008 0.188
#> SRR1974703 2 0.3282 0.74828 0.000 0.804 0.008 0.188 0.000
#> SRR1974702 2 0.1121 0.86733 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974701 4 0.3159 0.66193 0.088 0.000 0.056 0.856 0.000
#> SRR1974699 2 0.4262 0.17725 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1974698 4 0.4075 0.67885 0.000 0.060 0.160 0.780 0.000
#> SRR1974700 1 0.4403 0.33538 0.608 0.000 0.000 0.008 0.384
#> SRR1974697 1 0.0794 0.78546 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974696 2 0.4980 0.63453 0.012 0.732 0.100 0.156 0.000
#> SRR1974694 1 0.1560 0.78586 0.948 0.000 0.004 0.028 0.020
#> SRR1974695 2 0.2535 0.83078 0.032 0.892 0.076 0.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.3807 0.63170 0.000 0.012 0.240 0.748 0.000
#> SRR1974692 4 0.5772 0.34119 0.000 0.296 0.120 0.584 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 5 0.4014 0.73034 0.256 0.000 0.000 0.016 0.728
#> SRR1974689 4 0.3612 0.64501 0.000 0.008 0.228 0.764 0.000
#> SRR1974688 2 0.4288 0.51970 0.000 0.664 0.012 0.324 0.000
#> SRR1974687 1 0.3847 0.66832 0.784 0.000 0.000 0.036 0.180
#> SRR1974686 5 0.3641 0.84793 0.120 0.000 0.000 0.060 0.820
#> SRR1974685 1 0.1282 0.78207 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974684 5 0.4736 0.76957 0.216 0.000 0.000 0.072 0.712
#> SRR1974683 1 0.2248 0.76269 0.900 0.000 0.000 0.088 0.012
#> SRR1974682 1 0.4114 0.42262 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1974681 5 0.4382 0.82795 0.176 0.000 0.004 0.060 0.760
#> SRR1974679 4 0.4273 0.03278 0.448 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974680 1 0.4511 0.39303 0.628 0.000 0.356 0.000 0.016
#> SRR1974678 4 0.3180 0.66904 0.076 0.000 0.068 0.856 0.000
#> SRR1974677 1 0.2077 0.77249 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1974676 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0865 0.86795 0.000 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.4162 0.65492 0.768 0.000 0.000 0.056 0.176
#> SRR1974673 2 0.0794 0.86728 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0162 0.86515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0609 0.86758 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0324 0.86634 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974663 2 0.0579 0.86783 0.008 0.984 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974662 5 0.3615 0.83238 0.156 0.000 0.000 0.036 0.808
#> SRR1974661 2 0.3961 0.65159 0.028 0.760 0.212 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.3541 0.73668 0.824 0.012 0.144 0.000 0.020
#> SRR1974659 1 0.5396 -0.02070 0.500 0.000 0.000 0.056 0.444
#> SRR1974658 1 0.3865 0.73752 0.808 0.000 0.092 0.000 0.100
#> SRR1974657 1 0.2867 0.73898 0.880 0.072 0.044 0.000 0.004
#> SRR1974654 5 0.7744 0.34592 0.308 0.028 0.156 0.044 0.464
#> SRR1974655 1 0.2514 0.75308 0.896 0.060 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0865 0.78651 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974650 2 0.0566 0.86567 0.004 0.984 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.1121 0.86103 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974652 2 0.2563 0.79531 0.008 0.872 0.120 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.3061 0.70084 0.000 0.020 0.136 0.844 0.000
#> SRR1974648 1 0.1197 0.78098 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974646 2 0.0162 0.86515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974649 5 0.4456 0.83038 0.152 0.000 0.008 0.072 0.768
#> SRR1974647 2 0.2424 0.80781 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974645 1 0.0963 0.78499 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974644 2 0.0955 0.86634 0.004 0.968 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974643 5 0.2069 0.86192 0.076 0.000 0.000 0.012 0.912
#> SRR1974642 2 0.1386 0.85878 0.016 0.952 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.2894 0.73166 0.876 0.084 0.036 0.000 0.004
#> SRR1974641 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.3263 0.76704 0.876 0.024 0.036 0.008 0.056
#> SRR1974638 3 0.4496 0.63398 0.056 0.216 0.728 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.3276 0.71062 0.836 0.000 0.000 0.032 0.132
#> SRR1974636 2 0.2824 0.79316 0.020 0.864 0.116 0.000 0.000
#> SRR1974634 5 0.1106 0.86070 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974637 2 0.0510 0.86600 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974633 1 0.4082 0.66555 0.816 0.088 0.080 0.004 0.012
#> SRR1974632 5 0.1597 0.86611 0.048 0.000 0.000 0.012 0.940
#> SRR1974631 1 0.5654 0.37324 0.628 0.148 0.224 0.000 0.000
#> SRR1974630 5 0.2473 0.86078 0.032 0.000 0.000 0.072 0.896
#> SRR1974629 5 0.1740 0.86479 0.056 0.000 0.000 0.012 0.932
#> SRR1974628 1 0.1043 0.78762 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974627 1 0.4280 0.63234 0.772 0.088 0.140 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0955 0.78868 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974625 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 2 0.1082 0.86442 0.008 0.964 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.2390 0.76992 0.896 0.020 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.5334 0.41838 0.244 0.652 0.104 0.000 0.000
#> SRR1974619 2 0.3727 0.64493 0.016 0.768 0.216 0.000 0.000
#> SRR1974621 5 0.3255 0.86091 0.100 0.000 0.000 0.052 0.848
#> SRR1974617 1 0.0880 0.78565 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974616 1 0.3966 0.72610 0.820 0.048 0.108 0.000 0.024
#> SRR1974615 1 0.0794 0.78607 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974618 5 0.4096 0.83119 0.144 0.000 0.000 0.072 0.784
#> SRR1974614 2 0.1124 0.86614 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1974613 3 0.6518 0.50379 0.276 0.240 0.484 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.3323 0.68239 0.844 0.100 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.1591 0.86546 0.004 0.940 0.052 0.004 0.000
#> SRR1974610 2 0.2020 0.83378 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974609 1 0.3231 0.68624 0.800 0.000 0.004 0.000 0.196
#> SRR1974608 1 0.1310 0.78592 0.956 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974607 3 0.5147 0.62093 0.068 0.264 0.664 0.004 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 3 0.5565 0.56166 0.244 0.092 0.652 0.012 0.000
#> SRR1974604 2 0.4861 0.19541 0.000 0.548 0.024 0.428 0.000
#> SRR1974603 2 0.0162 0.86547 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974602 5 0.1661 0.86313 0.024 0.000 0.000 0.036 0.940
#> SRR1974600 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0880 0.86268 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974594 3 0.3769 0.63839 0.032 0.180 0.788 0.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.2756 0.80997 0.000 0.880 0.092 0.004 0.024
#> SRR1974592 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0162 0.86515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974588 3 0.4461 0.63778 0.052 0.220 0.728 0.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 3 0.3928 0.59812 0.004 0.296 0.700 0.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0162 0.86565 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 3 0.4592 0.49048 0.244 0.016 0.716 0.000 0.024
#> SRR1974584 3 0.4674 0.45537 0.232 0.000 0.708 0.000 0.060
#> SRR1974583 2 0.0162 0.86565 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0566 0.86752 0.004 0.984 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.3177 0.67294 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1974578 3 0.5203 0.61429 0.028 0.212 0.704 0.056 0.000
#> SRR1974577 3 0.3884 0.60400 0.004 0.288 0.708 0.000 0.000
#> SRR1974579 3 0.4201 0.47758 0.000 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0880 0.86926 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.4761 0.70047 0.000 0.748 0.176 0.052 0.024
#> SRR1974573 2 0.5743 0.23141 0.000 0.568 0.360 0.048 0.024
#> SRR1974571 2 0.4381 0.71534 0.000 0.784 0.144 0.048 0.024
#> SRR1974572 2 0.5574 0.38345 0.000 0.616 0.312 0.048 0.024
#> SRR1974570 2 0.0162 0.86547 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974568 3 0.4153 0.55751 0.112 0.056 0.808 0.000 0.024
#> SRR1974567 3 0.4146 0.49873 0.268 0.012 0.716 0.000 0.004
#> SRR1974566 2 0.3966 0.74935 0.000 0.820 0.108 0.048 0.024
#> SRR1974569 2 0.2881 0.80184 0.000 0.876 0.092 0.008 0.024
#> SRR1974565 3 0.4923 0.62749 0.084 0.172 0.732 0.000 0.012
#> SRR1974564 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 3 0.3963 0.50582 0.256 0.008 0.732 0.000 0.004
#> SRR1974559 1 0.1282 0.78215 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1974563 3 0.4543 0.53244 0.000 0.160 0.768 0.048 0.024
#> SRR1974562 2 0.2540 0.81166 0.000 0.888 0.088 0.000 0.024
#> SRR1974561 2 0.3915 0.75209 0.000 0.824 0.104 0.048 0.024
#> SRR1974557 2 0.0000 0.86474 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.2521 0.82373 0.000 0.900 0.068 0.008 0.024
#> SRR1974555 5 0.4736 0.74913 0.216 0.000 0.000 0.072 0.712
#> SRR1974551 1 0.1386 0.78532 0.952 0.000 0.016 0.000 0.032
#> SRR1974552 2 0.3613 0.76771 0.000 0.840 0.104 0.032 0.024
#> SRR1974554 3 0.4933 0.63970 0.080 0.228 0.692 0.000 0.000
#> SRR1974558 3 0.4309 0.42442 0.308 0.000 0.676 0.000 0.016
#> SRR1974556 1 0.5981 0.28510 0.540 0.000 0.368 0.016 0.076
#> SRR1974550 2 0.3430 0.69207 0.004 0.776 0.220 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.4016 0.74717 0.000 0.816 0.112 0.048 0.024
#> SRR1974548 2 0.3969 0.48097 0.004 0.692 0.304 0.000 0.000
#> SRR1974547 2 0.5175 0.13810 0.040 0.584 0.372 0.000 0.004
#> SRR1974546 2 0.4410 -0.06024 0.004 0.556 0.440 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0566 0.86559 0.004 0.984 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974544 3 0.4522 0.62814 0.044 0.248 0.708 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.4929 0.57664 0.000 0.692 0.256 0.028 0.024
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.4464 0.42543 0.000 0.140 0.712 0.000 0.000 0.148
#> SRR1975008 2 0.0914 0.82475 0.000 0.968 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1975006 2 0.1168 0.82600 0.000 0.956 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR1975005 2 0.2201 0.81356 0.000 0.896 0.028 0.000 0.000 0.076
#> SRR1975004 2 0.4293 0.72962 0.000 0.740 0.144 0.000 0.004 0.112
#> SRR1975003 2 0.3978 0.73606 0.000 0.756 0.160 0.000 0.000 0.084
#> SRR1975001 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.1745 0.82073 0.000 0.924 0.020 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974999 2 0.1408 0.82457 0.000 0.944 0.020 0.000 0.000 0.036
#> SRR1975000 2 0.4085 0.72145 0.000 0.736 0.192 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974998 2 0.4597 0.69446 0.004 0.708 0.156 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974997 2 0.4478 0.56797 0.000 0.688 0.228 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974995 2 0.2625 0.80967 0.000 0.872 0.072 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974996 2 0.5414 0.43879 0.000 0.572 0.304 0.000 0.008 0.116
#> SRR1974994 1 0.0935 0.74545 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974993 2 0.2867 0.79114 0.000 0.848 0.040 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974992 2 0.2999 0.77714 0.000 0.836 0.124 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974990 3 0.3615 0.57449 0.004 0.044 0.832 0.000 0.048 0.072
#> SRR1974989 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974991 2 0.3869 0.74056 0.000 0.772 0.100 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974986 2 0.4996 0.41581 0.000 0.604 0.296 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974987 2 0.4140 0.71712 0.000 0.744 0.152 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974988 2 0.0937 0.81405 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.2660 0.80105 0.000 0.868 0.048 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974985 3 0.5939 -0.02270 0.000 0.408 0.432 0.000 0.012 0.148
#> SRR1974983 2 0.1297 0.82369 0.000 0.948 0.012 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974982 3 0.3215 0.53182 0.000 0.072 0.828 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974981 5 0.5197 0.57498 0.196 0.000 0.168 0.000 0.632 0.004
#> SRR1974980 2 0.5284 0.33810 0.000 0.508 0.388 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974979 2 0.1779 0.81818 0.000 0.920 0.016 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974978 3 0.2412 0.54518 0.004 0.012 0.892 0.000 0.012 0.080
#> SRR1974977 3 0.5492 0.11819 0.000 0.376 0.492 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974976 2 0.2384 0.81018 0.000 0.888 0.064 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974975 2 0.4162 0.71525 0.000 0.744 0.120 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974974 2 0.1074 0.82483 0.000 0.960 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974973 2 0.0622 0.82367 0.000 0.980 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974972 2 0.1657 0.82087 0.000 0.928 0.016 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974971 2 0.3612 0.75996 0.000 0.796 0.100 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974970 2 0.4318 0.70850 0.000 0.728 0.132 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974969 2 0.4757 0.65321 0.000 0.676 0.180 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974968 2 0.3953 0.73210 0.000 0.764 0.132 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974967 2 0.4752 0.65270 0.000 0.676 0.184 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974965 3 0.4344 0.54452 0.016 0.008 0.768 0.000 0.104 0.104
#> SRR1974966 2 0.3241 0.77811 0.000 0.824 0.064 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974964 2 0.0692 0.82529 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974963 2 0.4603 0.66672 0.000 0.696 0.156 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974961 2 0.1649 0.82320 0.000 0.932 0.032 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974962 2 0.0520 0.82311 0.000 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974960 2 0.5219 0.44918 0.000 0.568 0.316 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974959 2 0.1700 0.82290 0.000 0.928 0.024 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974958 2 0.4459 0.68980 0.000 0.712 0.156 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974957 2 0.4496 0.68020 0.000 0.708 0.156 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974956 2 0.4669 0.66150 0.000 0.688 0.164 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974955 5 0.2783 0.72757 0.148 0.000 0.000 0.000 0.836 0.016
#> SRR1974954 2 0.4662 0.66382 0.000 0.688 0.172 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974953 2 0.1480 0.82327 0.000 0.940 0.020 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974952 2 0.4237 0.71043 0.000 0.736 0.144 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974949 2 0.2491 0.79597 0.000 0.868 0.020 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974950 2 0.4253 0.71525 0.000 0.732 0.160 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974951 2 0.1934 0.81953 0.000 0.916 0.044 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974947 2 0.1789 0.82069 0.000 0.924 0.044 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974948 2 0.1500 0.82228 0.000 0.936 0.052 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974946 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 2 0.5382 0.50769 0.000 0.564 0.288 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974944 1 0.3602 0.71742 0.792 0.000 0.000 0.000 0.136 0.072
#> SRR1974942 5 0.4334 0.54225 0.016 0.000 0.268 0.000 0.688 0.028
#> SRR1974943 2 0.4238 0.73781 0.000 0.752 0.156 0.000 0.012 0.080
#> SRR1974941 3 0.4932 0.45222 0.000 0.032 0.684 0.000 0.216 0.068
#> SRR1974940 2 0.5603 0.26653 0.000 0.476 0.376 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974939 2 0.2629 0.80615 0.000 0.872 0.060 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974938 2 0.4237 0.71164 0.000 0.736 0.144 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974937 2 0.4419 0.39098 0.000 0.584 0.384 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974936 5 0.4210 0.54112 0.016 0.000 0.332 0.000 0.644 0.008
#> SRR1974935 2 0.7120 -0.00374 0.008 0.392 0.360 0.000 0.092 0.148
#> SRR1974934 2 0.2910 0.79579 0.000 0.852 0.080 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974933 2 0.4393 0.69652 0.000 0.720 0.140 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974932 3 0.5604 -0.01198 0.000 0.404 0.452 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974931 3 0.2649 0.58218 0.000 0.048 0.884 0.000 0.052 0.016
#> SRR1974930 3 0.4045 0.41542 0.000 0.004 0.700 0.000 0.268 0.028
#> SRR1974929 3 0.5132 0.39641 0.000 0.188 0.664 0.000 0.016 0.132
#> SRR1974928 2 0.2163 0.80606 0.000 0.892 0.092 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974927 2 0.4877 0.63563 0.000 0.660 0.192 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974924 5 0.5763 0.42359 0.104 0.020 0.328 0.000 0.544 0.004
#> SRR1974925 3 0.4861 0.19473 0.008 0.000 0.552 0.000 0.396 0.044
#> SRR1974926 5 0.1007 0.77207 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974923 2 0.5541 0.15352 0.000 0.472 0.392 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974922 2 0.4965 0.61999 0.000 0.644 0.216 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974921 2 0.4904 0.63260 0.000 0.656 0.196 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974920 5 0.6520 0.08042 0.004 0.048 0.372 0.000 0.440 0.136
#> SRR1974919 2 0.5068 0.59724 0.000 0.624 0.240 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974918 2 0.5084 0.56569 0.000 0.612 0.264 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974917 2 0.1858 0.81436 0.000 0.912 0.012 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974916 2 0.5313 0.27755 0.000 0.508 0.384 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974915 2 0.4821 0.64460 0.000 0.668 0.184 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974914 2 0.1007 0.82365 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974913 3 0.5023 0.36977 0.000 0.188 0.664 0.000 0.008 0.140
#> SRR1974911 3 0.3778 0.40573 0.000 0.000 0.708 0.000 0.272 0.020
#> SRR1974910 3 0.5276 0.21164 0.000 0.312 0.564 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974908 2 0.1812 0.81352 0.000 0.912 0.008 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974909 2 0.4316 0.70492 0.000 0.728 0.144 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974906 2 0.0692 0.82542 0.000 0.976 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974907 2 0.4603 0.66672 0.000 0.696 0.156 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974905 3 0.5729 0.17184 0.000 0.324 0.520 0.000 0.008 0.148
#> SRR1974904 2 0.3254 0.77414 0.000 0.820 0.056 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974903 2 0.3920 0.73777 0.000 0.768 0.112 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974902 2 0.1572 0.82460 0.000 0.936 0.028 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974901 2 0.5578 0.32487 0.000 0.492 0.360 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974898 2 0.3423 0.77026 0.000 0.812 0.100 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974900 2 0.2462 0.80142 0.000 0.876 0.028 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974899 2 0.1225 0.82385 0.000 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974897 2 0.1686 0.81781 0.000 0.924 0.012 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974896 2 0.0508 0.82324 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974893 2 0.2956 0.79102 0.000 0.848 0.064 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974895 2 0.2214 0.80355 0.000 0.888 0.016 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974894 2 0.4602 0.66995 0.000 0.696 0.160 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974892 3 0.3336 0.51863 0.000 0.132 0.812 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974890 2 0.2618 0.80775 0.000 0.872 0.052 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974891 2 0.2822 0.79249 0.000 0.852 0.040 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974889 2 0.3493 0.75472 0.000 0.800 0.136 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974888 2 0.2250 0.81459 0.000 0.896 0.040 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974886 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 3 0.4643 0.58571 0.004 0.060 0.756 0.036 0.136 0.008
#> SRR1974885 3 0.2929 0.57455 0.004 0.020 0.880 0.036 0.052 0.008
#> SRR1974883 2 0.4382 0.69599 0.000 0.720 0.156 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974884 2 0.3587 0.75286 0.000 0.792 0.140 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974881 2 0.3616 0.75577 0.000 0.792 0.132 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974882 2 0.2448 0.81110 0.000 0.884 0.052 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974880 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.3520 0.76857 0.000 0.804 0.100 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974877 2 0.0622 0.82381 0.000 0.980 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974876 2 0.3842 0.73999 0.000 0.768 0.156 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974878 2 0.4043 0.72703 0.000 0.756 0.128 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974875 3 0.2941 0.56189 0.012 0.012 0.848 0.000 0.124 0.004
#> SRR1974874 2 0.1765 0.79831 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.3356 0.67795 0.000 0.052 0.140 0.808 0.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.3634 0.48652 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1974872 2 0.0291 0.82187 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974869 2 0.0146 0.82083 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974868 2 0.1970 0.79607 0.000 0.900 0.092 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974870 2 0.0632 0.81983 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.0951 0.82402 0.000 0.968 0.020 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974867 5 0.7394 0.35353 0.104 0.048 0.124 0.000 0.496 0.228
#> SRR1974865 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 2 0.5588 0.05947 0.000 0.500 0.404 0.000 0.036 0.060
#> SRR1974862 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974859 2 0.1327 0.81506 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.4185 0.00451 0.000 0.496 0.012 0.492 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.2631 0.70102 0.000 0.820 0.180 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.6113 0.45799 0.356 0.000 0.000 0.000 0.296 0.348
#> SRR1974853 5 0.5934 0.10682 0.160 0.000 0.012 0.000 0.488 0.340
#> SRR1974851 5 0.6076 0.31624 0.000 0.000 0.152 0.020 0.464 0.364
#> SRR1974852 2 0.2692 0.75135 0.000 0.840 0.012 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974849 5 0.1812 0.77443 0.008 0.000 0.080 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974848 1 0.1204 0.73127 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974850 3 0.3619 0.44616 0.000 0.316 0.680 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974846 4 0.3259 0.48510 0.000 0.216 0.012 0.772 0.000 0.000
#> SRR1974847 5 0.5880 -0.12381 0.000 0.152 0.412 0.000 0.428 0.008
#> SRR1974845 2 0.1267 0.81125 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974844 1 0.5887 0.66603 0.512 0.000 0.020 0.000 0.132 0.336
#> SRR1974843 2 0.1765 0.79289 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.4410 0.68284 0.560 0.000 0.000 0.000 0.028 0.412
#> SRR1974841 1 0.1168 0.73896 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974840 4 0.3422 0.65711 0.000 0.036 0.176 0.788 0.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.3133 0.67917 0.000 0.780 0.000 0.008 0.000 0.212
#> SRR1974838 1 0.0547 0.73275 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974837 6 0.5929 -0.41310 0.212 0.000 0.000 0.000 0.380 0.408
#> SRR1974835 5 0.1995 0.77731 0.036 0.000 0.052 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974836 2 0.3672 0.52474 0.000 0.688 0.008 0.000 0.000 0.304
#> SRR1974834 2 0.2825 0.74434 0.000 0.844 0.008 0.012 0.000 0.136
#> SRR1974833 3 0.3673 0.53119 0.000 0.244 0.736 0.000 0.004 0.016
#> SRR1974831 2 0.5465 -0.01112 0.000 0.504 0.088 0.012 0.000 0.396
#> SRR1974832 1 0.6312 0.54399 0.468 0.000 0.020 0.000 0.264 0.248
#> SRR1974830 1 0.1285 0.74902 0.944 0.000 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1974829 6 0.5479 -0.35434 0.160 0.000 0.028 0.000 0.172 0.640
#> SRR1974828 5 0.5576 0.03275 0.144 0.000 0.000 0.000 0.480 0.376
#> SRR1974826 2 0.0858 0.82217 0.000 0.968 0.028 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974827 2 0.5244 0.29989 0.000 0.596 0.072 0.020 0.000 0.312
#> SRR1974824 5 0.1794 0.78175 0.040 0.000 0.036 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974825 5 0.5537 0.07761 0.000 0.116 0.408 0.000 0.472 0.004
#> SRR1974822 5 0.0458 0.77694 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974823 3 0.5494 0.36655 0.000 0.068 0.560 0.000 0.340 0.032
#> SRR1974820 1 0.5048 0.71778 0.616 0.000 0.000 0.000 0.120 0.264
#> SRR1974818 5 0.1462 0.76976 0.056 0.000 0.000 0.000 0.936 0.008
#> SRR1974819 1 0.3101 0.74105 0.756 0.000 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1974817 1 0.4010 0.68784 0.584 0.000 0.000 0.000 0.008 0.408
#> SRR1974816 3 0.4737 0.57142 0.000 0.160 0.680 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974815 5 0.0865 0.77476 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974813 1 0.0458 0.74396 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974814 4 0.7213 0.22177 0.000 0.000 0.176 0.384 0.120 0.320
#> SRR1974812 5 0.5974 0.27930 0.000 0.008 0.100 0.020 0.452 0.420
#> SRR1974810 5 0.2404 0.72971 0.000 0.080 0.036 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974808 2 0.0260 0.82144 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 5 0.5103 0.32292 0.004 0.064 0.372 0.000 0.556 0.004
#> SRR1974809 3 0.3456 0.58935 0.000 0.172 0.788 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974807 5 0.0622 0.77890 0.012 0.000 0.008 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974806 1 0.6149 0.52977 0.380 0.000 0.004 0.000 0.244 0.372
#> SRR1974805 6 0.6086 -0.15047 0.000 0.148 0.404 0.020 0.000 0.428
#> SRR1974804 5 0.0893 0.77901 0.016 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004
#> SRR1974803 5 0.0748 0.77788 0.016 0.004 0.004 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974801 1 0.5452 0.70353 0.588 0.000 0.024 0.000 0.088 0.300
#> SRR1974800 2 0.1723 0.82204 0.000 0.928 0.036 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974799 1 0.3862 0.69779 0.608 0.000 0.000 0.000 0.004 0.388
#> SRR1974798 2 0.0405 0.82288 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974797 2 0.1387 0.80685 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974796 3 0.4682 0.24632 0.000 0.016 0.548 0.020 0.000 0.416
#> SRR1974795 6 0.6223 0.24169 0.000 0.376 0.176 0.020 0.000 0.428
#> SRR1974793 6 0.7090 -0.55446 0.312 0.000 0.112 0.000 0.164 0.412
#> SRR1974794 2 0.0146 0.82105 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.2006 0.79088 0.000 0.892 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR1974791 2 0.3373 0.62072 0.000 0.744 0.000 0.008 0.000 0.248
#> SRR1974790 2 0.0363 0.82092 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974789 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 2 0.1802 0.82112 0.000 0.932 0.020 0.000 0.024 0.024
#> SRR1974787 2 0.3046 0.79068 0.000 0.860 0.076 0.000 0.032 0.032
#> SRR1974784 3 0.4555 0.36284 0.000 0.040 0.616 0.004 0.000 0.340
#> SRR1974783 5 0.2234 0.75792 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872 0.000
#> SRR1974785 2 0.2811 0.80726 0.000 0.872 0.076 0.000 0.020 0.032
#> SRR1974782 3 0.5169 0.49958 0.084 0.028 0.672 0.000 0.212 0.004
#> SRR1974781 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974780 2 0.0146 0.82074 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974779 5 0.4653 0.68816 0.036 0.000 0.156 0.000 0.732 0.076
#> SRR1974777 3 0.7091 0.37976 0.060 0.096 0.532 0.000 0.080 0.232
#> SRR1974776 2 0.0713 0.81997 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 2 0.4101 0.17784 0.000 0.580 0.408 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974774 2 0.0260 0.82126 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 3 0.4277 0.33671 0.000 0.356 0.616 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974775 3 0.3828 0.58650 0.000 0.100 0.776 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974772 5 0.2164 0.75446 0.068 0.000 0.000 0.000 0.900 0.032
#> SRR1974771 2 0.2933 0.68679 0.000 0.796 0.200 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974770 2 0.0291 0.82144 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974769 2 0.5817 -0.26203 0.000 0.444 0.108 0.020 0.000 0.428
#> SRR1974768 2 0.0405 0.82231 0.000 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974767 2 0.0260 0.82126 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0146 0.82070 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974765 2 0.3089 0.70967 0.000 0.800 0.008 0.004 0.000 0.188
#> SRR1974764 2 0.0405 0.82183 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974763 1 0.0000 0.73945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 3 0.6102 0.53763 0.128 0.124 0.640 0.000 0.092 0.016
#> SRR1974761 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974760 2 0.4648 0.31438 0.000 0.596 0.020 0.020 0.000 0.364
#> SRR1974759 5 0.3456 0.66384 0.040 0.000 0.000 0.000 0.788 0.172
#> SRR1974758 2 0.0790 0.82471 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974757 2 0.0146 0.82070 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974756 1 0.1075 0.73991 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974754 2 0.3810 0.33184 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.0146 0.82097 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.3240 0.47746 0.000 0.000 0.004 0.752 0.244 0.000
#> SRR1974750 4 0.0692 0.69894 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR1974752 3 0.7142 0.34556 0.068 0.064 0.540 0.000 0.192 0.136
#> SRR1974749 3 0.3510 0.56623 0.000 0.204 0.772 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974747 5 0.1391 0.77234 0.040 0.000 0.000 0.000 0.944 0.016
#> SRR1974748 5 0.1434 0.77370 0.000 0.012 0.048 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974746 1 0.5662 0.63871 0.476 0.000 0.000 0.000 0.160 0.364
#> SRR1974744 2 0.1908 0.80191 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0547 0.70000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.3862 -0.03295 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.1225 0.77835 0.012 0.000 0.036 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974740 2 0.2823 0.70427 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0547 0.70000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.2491 0.75159 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.1610 0.80518 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0632 0.82139 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0547 0.70000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0865 0.73892 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974734 2 0.4890 0.41373 0.000 0.648 0.276 0.056 0.020 0.000
#> SRR1974733 4 0.3694 0.66324 0.000 0.076 0.140 0.784 0.000 0.000
#> SRR1974732 5 0.3023 0.67150 0.000 0.000 0.004 0.212 0.784 0.000
#> SRR1974731 4 0.3971 0.10298 0.000 0.448 0.004 0.548 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.5765 0.59765 0.416 0.000 0.000 0.000 0.172 0.412
#> SRR1974730 5 0.1204 0.77342 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974728 4 0.2191 0.69826 0.000 0.004 0.120 0.876 0.000 0.000
#> SRR1974725 3 0.7304 0.22793 0.000 0.112 0.380 0.244 0.264 0.000
#> SRR1974726 4 0.3211 0.63035 0.000 0.120 0.056 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.4232 0.74609 0.732 0.000 0.000 0.000 0.100 0.168
#> SRR1974727 2 0.1794 0.80311 0.000 0.924 0.040 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974723 4 0.1610 0.70792 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.3797 0.57473 0.000 0.692 0.016 0.292 0.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.3789 0.26949 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1974720 3 0.4654 0.26658 0.000 0.028 0.612 0.344 0.016 0.000
#> SRR1974719 3 0.5756 0.28807 0.000 0.172 0.440 0.000 0.388 0.000
#> SRR1974718 5 0.1010 0.77523 0.004 0.000 0.036 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974716 2 0.2752 0.76911 0.000 0.856 0.108 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974717 4 0.5292 0.36397 0.000 0.220 0.180 0.600 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0790 0.70345 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.73945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.5304 0.57076 0.004 0.156 0.688 0.000 0.104 0.048
#> SRR1974711 2 0.1334 0.81603 0.000 0.948 0.020 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974712 1 0.0520 0.74321 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974709 5 0.1167 0.78189 0.020 0.000 0.012 0.000 0.960 0.008
#> SRR1974708 2 0.0891 0.82131 0.000 0.968 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974710 2 0.0603 0.82237 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974707 2 0.3874 0.59624 0.000 0.732 0.228 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974706 1 0.1806 0.73665 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1974704 1 0.0000 0.73945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 5 0.4179 0.67283 0.160 0.000 0.020 0.000 0.760 0.060
#> SRR1974703 2 0.2948 0.72724 0.000 0.804 0.008 0.188 0.000 0.000
#> SRR1974702 2 0.1367 0.82311 0.000 0.944 0.044 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974701 4 0.0622 0.69341 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR1974699 2 0.3854 0.18312 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.2706 0.70802 0.000 0.036 0.104 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974700 5 0.4728 0.22237 0.392 0.000 0.000 0.000 0.556 0.052
#> SRR1974697 5 0.0458 0.77694 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974696 2 0.4712 0.59934 0.000 0.716 0.100 0.164 0.020 0.000
#> SRR1974694 5 0.1346 0.77807 0.016 0.000 0.008 0.024 0.952 0.000
#> SRR1974695 2 0.2510 0.78502 0.000 0.872 0.100 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974693 4 0.2730 0.63834 0.000 0.000 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.4832 0.39803 0.000 0.244 0.108 0.648 0.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.4007 0.65765 0.728 0.000 0.000 0.000 0.220 0.052
#> SRR1974689 4 0.2772 0.65222 0.000 0.004 0.180 0.816 0.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.3998 0.48871 0.000 0.644 0.016 0.340 0.000 0.000
#> SRR1974687 5 0.4253 0.60361 0.108 0.000 0.000 0.000 0.732 0.160
#> SRR1974686 1 0.5268 0.69782 0.572 0.000 0.000 0.000 0.128 0.300
#> SRR1974685 5 0.0865 0.77257 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974684 1 0.5834 0.61943 0.468 0.000 0.000 0.000 0.204 0.328
#> SRR1974683 5 0.1866 0.75796 0.008 0.000 0.000 0.084 0.908 0.000
#> SRR1974682 5 0.3756 0.40083 0.000 0.000 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974681 1 0.5802 0.68078 0.520 0.000 0.020 0.000 0.120 0.340
#> SRR1974679 4 0.3789 0.10542 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1974680 5 0.4010 0.33944 0.008 0.000 0.408 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974678 4 0.0547 0.70000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974677 5 0.1995 0.76445 0.052 0.000 0.000 0.000 0.912 0.036
#> SRR1974676 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0692 0.82410 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974674 5 0.4304 0.61980 0.128 0.000 0.004 0.000 0.740 0.128
#> SRR1974673 2 0.0777 0.82355 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974671 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974672 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0405 0.82186 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974667 2 0.0865 0.82463 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974668 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974666 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974664 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0146 0.82074 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 2 0.0870 0.82482 0.000 0.972 0.004 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974662 1 0.4881 0.72837 0.640 0.000 0.004 0.000 0.088 0.268
#> SRR1974661 2 0.3791 0.60238 0.000 0.732 0.236 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974660 5 0.3020 0.72677 0.012 0.008 0.156 0.000 0.824 0.000
#> SRR1974659 5 0.6167 -0.16741 0.292 0.000 0.004 0.000 0.416 0.288
#> SRR1974658 5 0.3477 0.73238 0.080 0.000 0.092 0.000 0.820 0.008
#> SRR1974657 5 0.2918 0.74157 0.004 0.052 0.088 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974654 1 0.7922 0.27750 0.308 0.012 0.212 0.000 0.268 0.200
#> SRR1974655 5 0.2795 0.74703 0.000 0.044 0.100 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974656 5 0.0458 0.77694 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974650 2 0.0547 0.82053 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.1007 0.81809 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974652 2 0.2278 0.75776 0.000 0.868 0.128 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974653 4 0.1327 0.70847 0.000 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.0790 0.77405 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974646 2 0.0146 0.82037 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.5872 0.67254 0.516 0.000 0.024 0.000 0.120 0.340
#> SRR1974647 2 0.2178 0.77604 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1974645 5 0.0713 0.77523 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974644 2 0.0790 0.82028 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0632 0.74124 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974642 2 0.1297 0.81493 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974640 5 0.2857 0.72778 0.000 0.072 0.072 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974639 5 0.3838 0.74732 0.032 0.012 0.084 0.000 0.820 0.052
#> SRR1974638 3 0.3149 0.59263 0.000 0.132 0.824 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974635 5 0.3861 0.66878 0.060 0.000 0.012 0.000 0.784 0.144
#> SRR1974636 2 0.2592 0.75729 0.000 0.864 0.116 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974634 1 0.0000 0.73945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0458 0.82205 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.3635 0.70796 0.008 0.036 0.144 0.000 0.804 0.008
#> SRR1974632 1 0.1088 0.74719 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1974631 5 0.4859 0.47597 0.000 0.084 0.304 0.000 0.612 0.000
#> SRR1974630 1 0.3515 0.72179 0.676 0.000 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1974629 1 0.0632 0.73978 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974628 5 0.1124 0.78013 0.036 0.000 0.008 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974627 5 0.3745 0.66046 0.000 0.028 0.240 0.000 0.732 0.000
#> SRR1974624 5 0.1148 0.78005 0.016 0.000 0.020 0.000 0.960 0.004
#> SRR1974625 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 2 0.1010 0.81973 0.000 0.960 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974622 5 0.2846 0.75120 0.004 0.016 0.140 0.000 0.840 0.000
#> SRR1974620 2 0.5090 0.39368 0.000 0.640 0.112 0.000 0.240 0.008
#> SRR1974619 2 0.3287 0.63114 0.000 0.768 0.220 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974621 1 0.4136 0.74936 0.732 0.000 0.000 0.000 0.076 0.192
#> SRR1974617 5 0.0632 0.77606 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974616 5 0.3739 0.70348 0.000 0.036 0.024 0.000 0.796 0.144
#> SRR1974615 5 0.0632 0.77633 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974618 1 0.5583 0.62616 0.448 0.000 0.000 0.000 0.140 0.412
#> SRR1974614 2 0.1285 0.82161 0.000 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974613 3 0.5643 0.43170 0.000 0.216 0.536 0.000 0.248 0.000
#> SRR1974612 5 0.3196 0.71551 0.000 0.064 0.108 0.000 0.828 0.000
#> SRR1974611 2 0.2237 0.81375 0.000 0.896 0.036 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974610 2 0.1814 0.79753 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1974609 5 0.3073 0.67306 0.204 0.000 0.008 0.000 0.788 0.000
#> SRR1974608 5 0.0820 0.77855 0.016 0.000 0.000 0.012 0.972 0.000
#> SRR1974607 3 0.4177 0.55509 0.000 0.216 0.724 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974606 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974605 3 0.4491 0.55013 0.004 0.056 0.716 0.012 0.212 0.000
#> SRR1974604 2 0.4377 0.25665 0.000 0.540 0.024 0.436 0.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.0146 0.82074 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.3563 0.71870 0.664 0.000 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974600 2 0.0146 0.82125 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974601 2 0.0146 0.82152 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974599 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974598 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974596 2 0.1124 0.81873 0.000 0.956 0.036 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974594 3 0.3042 0.60472 0.000 0.100 0.852 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974593 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.3374 0.67579 0.000 0.772 0.020 0.000 0.000 0.208
#> SRR1974592 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974591 2 0.0405 0.82186 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974588 3 0.3346 0.59647 0.000 0.140 0.816 0.000 0.036 0.008
#> SRR1974590 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 3 0.3298 0.53968 0.000 0.236 0.756 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974587 2 0.0146 0.82105 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 3 0.4113 0.53179 0.016 0.020 0.764 0.000 0.180 0.020
#> SRR1974584 3 0.3746 0.50535 0.048 0.000 0.760 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974583 2 0.0146 0.82105 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0622 0.82326 0.000 0.980 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974581 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974580 2 0.2883 0.64752 0.000 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974578 3 0.4149 0.58475 0.000 0.152 0.772 0.048 0.024 0.004
#> SRR1974577 3 0.3076 0.53990 0.000 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 3 0.4110 0.34385 0.000 0.376 0.608 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974576 2 0.1088 0.82617 0.000 0.960 0.024 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974575 2 0.0260 0.82111 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974574 2 0.4699 0.13311 0.000 0.536 0.020 0.016 0.000 0.428
#> SRR1974573 6 0.6299 0.23630 0.000 0.356 0.196 0.020 0.000 0.428
#> SRR1974571 2 0.5087 0.03777 0.000 0.520 0.040 0.020 0.000 0.420
#> SRR1974572 6 0.6208 0.23596 0.000 0.384 0.172 0.020 0.000 0.424
#> SRR1974570 2 0.0146 0.82074 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 3 0.4097 0.51007 0.004 0.016 0.764 0.000 0.044 0.172
#> SRR1974567 3 0.3046 0.54491 0.000 0.012 0.800 0.000 0.188 0.000
#> SRR1974566 2 0.4362 0.25817 0.000 0.584 0.004 0.020 0.000 0.392
#> SRR1974569 2 0.2902 0.70418 0.000 0.800 0.000 0.004 0.000 0.196
#> SRR1974565 3 0.4339 0.58688 0.004 0.108 0.776 0.000 0.072 0.040
#> SRR1974564 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 3 0.2882 0.54714 0.000 0.008 0.812 0.000 0.180 0.000
#> SRR1974559 5 0.0865 0.77257 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974563 3 0.4769 0.22871 0.000 0.020 0.536 0.020 0.000 0.424
#> SRR1974562 2 0.2378 0.75056 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974561 2 0.4379 0.23016 0.000 0.576 0.004 0.020 0.000 0.400
#> SRR1974557 2 0.0000 0.81983 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.2664 0.72244 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974555 1 0.5657 0.61197 0.436 0.000 0.000 0.000 0.152 0.412
#> SRR1974551 5 0.1168 0.77550 0.028 0.000 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1974552 2 0.3955 0.43672 0.000 0.648 0.004 0.008 0.000 0.340
#> SRR1974554 3 0.3736 0.59482 0.000 0.156 0.776 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974558 3 0.3494 0.49433 0.012 0.000 0.736 0.000 0.252 0.000
#> SRR1974556 5 0.5761 0.23640 0.036 0.000 0.400 0.000 0.488 0.076
#> SRR1974550 2 0.3271 0.65841 0.000 0.760 0.232 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974549 2 0.4480 0.33673 0.000 0.608 0.016 0.016 0.000 0.360
#> SRR1974548 2 0.3601 0.47809 0.000 0.684 0.312 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974547 2 0.4976 0.10490 0.000 0.556 0.388 0.000 0.036 0.020
#> SRR1974546 2 0.4072 -0.03795 0.000 0.544 0.448 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974545 2 0.0547 0.82130 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 3 0.3455 0.58064 0.000 0.180 0.784 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974543 2 0.5760 0.08752 0.000 0.524 0.140 0.012 0.000 0.324
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.416 0.805 0.878 0.4717 0.509 0.509
#> 3 3 0.482 0.752 0.851 0.2556 0.574 0.389
#> 4 4 0.683 0.765 0.880 0.2025 0.790 0.555
#> 5 5 0.676 0.751 0.823 0.0546 0.916 0.718
#> 6 6 0.707 0.622 0.749 0.0486 0.945 0.779
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.0376 0.8608 0.004 0.996
#> SRR1974998 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.1414 0.8600 0.020 0.980
#> SRR1974995 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974994 2 0.1843 0.8585 0.028 0.972
#> SRR1974993 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974990 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974989 1 0.6438 0.8298 0.836 0.164
#> SRR1974991 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974986 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974985 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974982 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974981 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974980 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974977 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974965 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974955 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974944 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974942 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974941 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974940 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974936 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974935 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974930 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974929 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974924 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974925 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974926 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974923 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974922 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974920 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974919 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974916 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974915 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.1633 0.8584 0.024 0.976
#> SRR1974913 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974911 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974910 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974904 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0672 0.8606 0.008 0.992
#> SRR1974893 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0376 0.8609 0.004 0.996
#> SRR1974890 2 0.5842 0.8060 0.140 0.860
#> SRR1974891 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974886 1 0.4815 0.8460 0.896 0.104
#> SRR1974887 1 0.5408 0.8484 0.876 0.124
#> SRR1974885 1 0.4562 0.8439 0.904 0.096
#> SRR1974883 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.4161 0.8320 0.084 0.916
#> SRR1974882 2 0.4022 0.8360 0.080 0.920
#> SRR1974880 2 0.9944 0.0937 0.456 0.544
#> SRR1974879 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0376 0.8609 0.004 0.996
#> SRR1974878 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.9815 0.1950 0.420 0.580
#> SRR1974874 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974873 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974871 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974872 2 0.7056 0.8229 0.192 0.808
#> SRR1974869 2 0.6801 0.8295 0.180 0.820
#> SRR1974868 2 0.7602 0.8261 0.220 0.780
#> SRR1974870 2 0.6973 0.8252 0.188 0.812
#> SRR1974866 2 0.7139 0.8200 0.196 0.804
#> SRR1974867 1 0.4562 0.8769 0.904 0.096
#> SRR1974865 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974864 2 0.9970 0.2453 0.468 0.532
#> SRR1974862 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974863 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974860 2 0.6531 0.8344 0.168 0.832
#> SRR1974861 2 0.6623 0.8351 0.172 0.828
#> SRR1974859 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974858 1 0.4690 0.8577 0.900 0.100
#> SRR1974856 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974857 1 0.4022 0.8597 0.920 0.080
#> SRR1974855 2 0.9044 0.6608 0.320 0.680
#> SRR1974854 1 0.3431 0.8781 0.936 0.064
#> SRR1974853 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974851 2 0.8016 0.8131 0.244 0.756
#> SRR1974852 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974849 1 0.5059 0.8667 0.888 0.112
#> SRR1974848 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974850 1 0.0938 0.8659 0.988 0.012
#> SRR1974846 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974847 1 0.8327 0.6685 0.736 0.264
#> SRR1974845 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974844 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974843 2 0.9087 0.6453 0.324 0.676
#> SRR1974842 1 0.4161 0.8791 0.916 0.084
#> SRR1974841 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974840 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974839 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974838 1 0.4562 0.8765 0.904 0.096
#> SRR1974837 1 0.4022 0.8791 0.920 0.080
#> SRR1974835 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974836 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974834 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974833 1 0.9993 -0.1031 0.516 0.484
#> SRR1974831 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974832 1 0.6973 0.7922 0.812 0.188
#> SRR1974830 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974829 2 0.7950 0.8156 0.240 0.760
#> SRR1974828 1 0.3274 0.8772 0.940 0.060
#> SRR1974826 2 0.6973 0.8323 0.188 0.812
#> SRR1974827 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974824 1 0.5294 0.8612 0.880 0.120
#> SRR1974825 1 0.8327 0.6692 0.736 0.264
#> SRR1974822 1 0.4431 0.8777 0.908 0.092
#> SRR1974823 2 0.9427 0.6397 0.360 0.640
#> SRR1974820 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974818 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974819 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974817 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974816 1 0.6801 0.7871 0.820 0.180
#> SRR1974815 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974813 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974814 1 0.7376 0.7035 0.792 0.208
#> SRR1974812 2 0.8016 0.8131 0.244 0.756
#> SRR1974810 1 0.3584 0.8791 0.932 0.068
#> SRR1974808 2 0.6887 0.8275 0.184 0.816
#> SRR1974811 1 0.9686 0.3049 0.604 0.396
#> SRR1974809 1 0.5629 0.8517 0.868 0.132
#> SRR1974807 1 0.7674 0.7384 0.776 0.224
#> SRR1974806 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974805 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974804 1 0.3114 0.8566 0.944 0.056
#> SRR1974803 1 0.2603 0.8764 0.956 0.044
#> SRR1974801 1 0.4690 0.8745 0.900 0.100
#> SRR1974800 2 0.8443 0.7350 0.272 0.728
#> SRR1974799 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974798 2 0.6801 0.8348 0.180 0.820
#> SRR1974797 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974796 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974795 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974793 1 0.4562 0.8766 0.904 0.096
#> SRR1974794 2 0.6973 0.8347 0.188 0.812
#> SRR1974792 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974791 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974790 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974789 2 0.7299 0.8306 0.204 0.796
#> SRR1974788 2 0.6531 0.8344 0.168 0.832
#> SRR1974786 2 0.7602 0.7999 0.220 0.780
#> SRR1974787 2 0.7453 0.8075 0.212 0.788
#> SRR1974784 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974783 1 0.4562 0.8765 0.904 0.096
#> SRR1974785 2 0.9552 0.5307 0.376 0.624
#> SRR1974782 1 0.6973 0.7919 0.812 0.188
#> SRR1974781 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974780 2 0.6801 0.8319 0.180 0.820
#> SRR1974779 1 0.4690 0.8745 0.900 0.100
#> SRR1974777 1 0.4690 0.8747 0.900 0.100
#> SRR1974776 2 0.8016 0.7738 0.244 0.756
#> SRR1974778 2 0.9896 0.3449 0.440 0.560
#> SRR1974774 2 0.6623 0.8352 0.172 0.828
#> SRR1974773 1 0.6887 0.7963 0.816 0.184
#> SRR1974775 1 0.6048 0.8367 0.852 0.148
#> SRR1974772 1 0.2603 0.8763 0.956 0.044
#> SRR1974771 2 0.9286 0.6554 0.344 0.656
#> SRR1974770 2 0.6712 0.8335 0.176 0.824
#> SRR1974769 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974768 2 0.6801 0.8337 0.180 0.820
#> SRR1974767 2 0.7674 0.7960 0.224 0.776
#> SRR1974766 1 0.9460 0.3796 0.636 0.364
#> SRR1974765 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974764 2 0.9286 0.6524 0.344 0.656
#> SRR1974763 1 0.4562 0.8767 0.904 0.096
#> SRR1974762 1 0.9710 0.3134 0.600 0.400
#> SRR1974761 2 0.9170 0.6832 0.332 0.668
#> SRR1974760 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974759 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974758 2 0.7745 0.8166 0.228 0.772
#> SRR1974757 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974756 1 0.4562 0.8766 0.904 0.096
#> SRR1974754 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974755 2 0.7376 0.8282 0.208 0.792
#> SRR1974753 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974751 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974750 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974752 1 0.4562 0.8765 0.904 0.096
#> SRR1974749 1 0.3584 0.8750 0.932 0.068
#> SRR1974747 1 0.0000 0.8615 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.4431 0.8784 0.908 0.092
#> SRR1974746 1 0.0938 0.8672 0.988 0.012
#> SRR1974744 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974745 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974743 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974742 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974740 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974739 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974741 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974738 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974737 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974736 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974735 1 0.2043 0.8739 0.968 0.032
#> SRR1974734 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974733 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974732 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974731 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974729 1 0.1633 0.8717 0.976 0.024
#> SRR1974730 1 0.7674 0.7392 0.776 0.224
#> SRR1974728 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974725 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974726 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974724 1 0.3114 0.8771 0.944 0.056
#> SRR1974727 2 0.6712 0.8335 0.176 0.824
#> SRR1974723 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974722 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974721 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974720 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974719 1 0.1633 0.8718 0.976 0.024
#> SRR1974718 1 0.4022 0.8794 0.920 0.080
#> SRR1974716 1 0.9833 0.1725 0.576 0.424
#> SRR1974717 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974715 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974713 1 0.4690 0.8748 0.900 0.100
#> SRR1974714 2 0.9970 0.2465 0.468 0.532
#> SRR1974711 2 0.6712 0.8312 0.176 0.824
#> SRR1974712 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974709 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974708 2 0.6712 0.8312 0.176 0.824
#> SRR1974710 2 0.6887 0.8276 0.184 0.816
#> SRR1974707 2 0.9286 0.6043 0.344 0.656
#> SRR1974706 1 0.2423 0.8757 0.960 0.040
#> SRR1974704 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974705 1 0.4298 0.8788 0.912 0.088
#> SRR1974703 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974702 2 0.6887 0.8276 0.184 0.816
#> SRR1974701 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974699 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974698 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974700 1 0.2603 0.8763 0.956 0.044
#> SRR1974697 1 0.1843 0.8729 0.972 0.028
#> SRR1974696 1 0.1184 0.8639 0.984 0.016
#> SRR1974694 1 0.0000 0.8615 1.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.8081 0.6943 0.752 0.248
#> SRR1974693 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974692 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974690 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974691 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974689 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974688 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974687 1 0.0672 0.8655 0.992 0.008
#> SRR1974686 1 0.3431 0.8779 0.936 0.064
#> SRR1974685 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974684 1 0.4298 0.8788 0.912 0.088
#> SRR1974683 1 0.0000 0.8615 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974681 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974679 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974680 1 0.4298 0.8788 0.912 0.088
#> SRR1974678 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974677 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974676 2 0.7056 0.8343 0.192 0.808
#> SRR1974675 2 0.0000 0.8611 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974673 2 0.6623 0.8326 0.172 0.828
#> SRR1974671 2 0.6887 0.8350 0.184 0.816
#> SRR1974672 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974670 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974669 2 0.6712 0.8356 0.176 0.824
#> SRR1974667 2 0.7219 0.8299 0.200 0.800
#> SRR1974668 2 0.6623 0.8351 0.172 0.828
#> SRR1974666 2 0.6623 0.8351 0.172 0.828
#> SRR1974664 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974665 2 0.6973 0.8367 0.188 0.812
#> SRR1974663 2 0.7376 0.8106 0.208 0.792
#> SRR1974662 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974661 2 0.8763 0.7020 0.296 0.704
#> SRR1974660 1 0.6048 0.8369 0.852 0.148
#> SRR1974659 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974658 1 0.4815 0.8728 0.896 0.104
#> SRR1974657 1 0.6973 0.7916 0.812 0.188
#> SRR1974654 1 0.4562 0.8765 0.904 0.096
#> SRR1974655 1 0.6623 0.8108 0.828 0.172
#> SRR1974656 1 0.5737 0.8482 0.864 0.136
#> SRR1974650 2 0.8081 0.7756 0.248 0.752
#> SRR1974651 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974652 2 0.8955 0.6692 0.312 0.688
#> SRR1974653 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974648 1 0.3274 0.8772 0.940 0.060
#> SRR1974646 2 0.6801 0.8295 0.180 0.820
#> SRR1974649 1 0.4161 0.8792 0.916 0.084
#> SRR1974647 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974645 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974644 2 0.7674 0.8163 0.224 0.776
#> SRR1974643 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974642 2 0.6973 0.8256 0.188 0.812
#> SRR1974640 1 0.9866 0.1953 0.568 0.432
#> SRR1974641 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974639 1 0.5629 0.8518 0.868 0.132
#> SRR1974638 1 0.6712 0.8075 0.824 0.176
#> SRR1974635 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974636 2 0.7528 0.8034 0.216 0.784
#> SRR1974634 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974637 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974633 2 0.9795 0.4248 0.416 0.584
#> SRR1974632 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974631 1 0.9963 0.0556 0.536 0.464
#> SRR1974630 1 0.4161 0.8791 0.916 0.084
#> SRR1974629 1 0.6343 0.8259 0.840 0.160
#> SRR1974628 1 0.5178 0.8640 0.884 0.116
#> SRR1974627 1 0.7376 0.7631 0.792 0.208
#> SRR1974624 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974625 2 0.6247 0.8393 0.156 0.844
#> SRR1974623 2 0.7674 0.7955 0.224 0.776
#> SRR1974622 1 0.5519 0.8546 0.872 0.128
#> SRR1974620 2 0.7950 0.7784 0.240 0.760
#> SRR1974619 1 0.2778 0.8768 0.952 0.048
#> SRR1974621 1 0.4161 0.8791 0.916 0.084
#> SRR1974617 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974616 2 0.8499 0.7799 0.276 0.724
#> SRR1974615 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974618 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974614 2 0.7528 0.8035 0.216 0.784
#> SRR1974613 1 0.9963 0.0548 0.536 0.464
#> SRR1974612 1 0.7950 0.7125 0.760 0.240
#> SRR1974611 2 0.6801 0.8295 0.180 0.820
#> SRR1974610 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974609 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974608 1 0.0000 0.8615 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.6247 0.8285 0.844 0.156
#> SRR1974606 2 0.6801 0.8371 0.180 0.820
#> SRR1974605 1 0.0376 0.8637 0.996 0.004
#> SRR1974604 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR1974603 2 0.6887 0.8300 0.184 0.816
#> SRR1974602 1 0.4431 0.8783 0.908 0.092
#> SRR1974600 2 0.7602 0.8267 0.220 0.780
#> SRR1974601 2 0.7139 0.8261 0.196 0.804
#> SRR1974599 2 0.6801 0.8356 0.180 0.820
#> SRR1974598 2 0.6712 0.8354 0.176 0.824
#> SRR1974596 2 0.6973 0.8337 0.188 0.812
#> SRR1974594 1 0.6531 0.7587 0.832 0.168
#> SRR1974593 2 0.7299 0.8304 0.204 0.796
#> SRR1974595 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974592 2 0.6623 0.8351 0.172 0.828
#> SRR1974591 2 0.6712 0.8345 0.176 0.824
#> SRR1974588 1 0.9896 -0.0335 0.560 0.440
#> SRR1974590 2 0.7674 0.8253 0.224 0.776
#> SRR1974589 2 0.9833 0.5149 0.424 0.576
#> SRR1974587 2 0.9998 0.2114 0.492 0.508
#> SRR1974586 2 0.7376 0.8303 0.208 0.792
#> SRR1974585 1 0.9775 0.0655 0.588 0.412
#> SRR1974584 1 0.3584 0.8783 0.932 0.068
#> SRR1974583 2 0.6712 0.8333 0.176 0.824
#> SRR1974582 2 0.6973 0.8356 0.188 0.812
#> SRR1974581 2 0.6712 0.8356 0.176 0.824
#> SRR1974580 1 0.9988 -0.1946 0.520 0.480
#> SRR1974578 1 0.0000 0.8615 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.6887 0.8313 0.184 0.816
#> SRR1974579 1 0.9909 -0.0654 0.556 0.444
#> SRR1974576 2 0.7528 0.8211 0.216 0.784
#> SRR1974575 2 0.7883 0.8153 0.236 0.764
#> SRR1974574 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974573 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974571 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974572 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974570 2 0.8144 0.7628 0.252 0.748
#> SRR1974568 2 0.9552 0.5588 0.376 0.624
#> SRR1974567 1 0.9491 0.4122 0.632 0.368
#> SRR1974566 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974569 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974565 1 0.9661 0.1694 0.608 0.392
#> SRR1974564 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974560 2 1.0000 0.1339 0.496 0.504
#> SRR1974559 2 1.0000 0.1440 0.496 0.504
#> SRR1974563 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974562 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974561 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974557 1 0.4431 0.8445 0.908 0.092
#> SRR1974553 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974555 1 0.4298 0.8788 0.912 0.088
#> SRR1974551 2 0.8016 0.8131 0.244 0.756
#> SRR1974552 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974554 2 0.9954 0.2795 0.460 0.540
#> SRR1974558 1 0.6973 0.7913 0.812 0.188
#> SRR1974556 1 0.6247 0.8295 0.844 0.156
#> SRR1974550 2 0.7950 0.7779 0.240 0.760
#> SRR1974549 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974548 2 0.8909 0.7428 0.308 0.692
#> SRR1974547 2 0.8081 0.7808 0.248 0.752
#> SRR1974546 2 0.9170 0.6291 0.332 0.668
#> SRR1974545 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
#> SRR1974544 2 0.9635 0.5073 0.388 0.612
#> SRR1974543 2 0.7815 0.8219 0.232 0.768
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0237 0.94288 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974999 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.2448 0.85547 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974998 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 1 0.6936 0.33783 0.524 0.016 0.460
#> SRR1974995 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 1 0.6518 0.09350 0.512 0.004 0.484
#> SRR1974993 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 1 0.8762 0.53413 0.576 0.264 0.160
#> SRR1974991 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.6553 0.36097 0.324 0.020 0.656
#> SRR1974984 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.2878 0.84354 0.096 0.000 0.904
#> SRR1974980 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.1647 0.90433 0.036 0.004 0.960
#> SRR1974970 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0892 0.92751 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974954 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.1643 0.89877 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974945 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0592 0.93565 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974942 3 0.0424 0.93804 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974943 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0424 0.93790 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974930 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.1031 0.91911 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974925 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.7424 0.18041 0.364 0.044 0.592
#> SRR1974923 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 1 0.7293 0.25963 0.496 0.028 0.476
#> SRR1974913 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0661 0.93610 0.008 0.004 0.988
#> SRR1974900 3 0.3846 0.78879 0.108 0.016 0.876
#> SRR1974899 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.7240 -0.01008 0.432 0.028 0.540
#> SRR1974893 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 3 0.6262 0.48454 0.284 0.020 0.696
#> SRR1974892 3 0.7223 -0.00346 0.424 0.028 0.548
#> SRR1974890 1 0.7582 0.48838 0.572 0.048 0.380
#> SRR1974891 3 0.6579 0.36084 0.328 0.020 0.652
#> SRR1974889 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.6262 0.47965 0.284 0.020 0.696
#> SRR1974886 1 0.8918 0.49469 0.548 0.296 0.156
#> SRR1974887 1 0.8722 0.52323 0.576 0.272 0.152
#> SRR1974885 1 0.8777 0.50365 0.564 0.288 0.148
#> SRR1974883 3 0.7158 0.19000 0.372 0.032 0.596
#> SRR1974884 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 1 0.7476 0.43751 0.556 0.040 0.404
#> SRR1974882 1 0.7337 0.38062 0.540 0.032 0.428
#> SRR1974880 1 0.8380 0.59743 0.600 0.124 0.276
#> SRR1974879 3 0.5723 0.57917 0.240 0.016 0.744
#> SRR1974877 3 0.0592 0.93421 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974876 3 0.6896 0.11967 0.392 0.020 0.588
#> SRR1974878 3 0.6969 0.17837 0.380 0.024 0.596
#> SRR1974875 1 0.8698 0.52987 0.564 0.136 0.300
#> SRR1974874 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974873 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974871 2 0.1711 0.93448 0.008 0.960 0.032
#> SRR1974872 1 0.4539 0.76051 0.836 0.016 0.148
#> SRR1974869 1 0.4802 0.75747 0.824 0.020 0.156
#> SRR1974868 1 0.7999 0.68347 0.656 0.196 0.148
#> SRR1974870 1 0.4995 0.76007 0.824 0.032 0.144
#> SRR1974866 1 0.4261 0.76332 0.848 0.012 0.140
#> SRR1974867 1 0.1182 0.78200 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974865 2 0.5412 0.73129 0.172 0.796 0.032
#> SRR1974864 1 0.1031 0.78368 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974862 2 0.5119 0.76244 0.152 0.816 0.032
#> SRR1974863 2 0.5728 0.69121 0.196 0.772 0.032
#> SRR1974860 1 0.7670 0.70053 0.684 0.164 0.152
#> SRR1974861 1 0.7815 0.69279 0.672 0.180 0.148
#> SRR1974859 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974858 2 0.7471 -0.11863 0.448 0.516 0.036
#> SRR1974856 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974857 2 0.6684 0.48527 0.292 0.676 0.032
#> SRR1974855 1 0.5538 0.75662 0.808 0.060 0.132
#> SRR1974854 1 0.3690 0.77063 0.884 0.100 0.016
#> SRR1974853 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974851 1 0.6647 0.42488 0.592 0.396 0.012
#> SRR1974852 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974849 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974848 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974850 1 0.7860 0.63600 0.628 0.284 0.088
#> SRR1974846 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974847 1 0.1031 0.78367 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974845 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974844 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974843 1 0.2356 0.78311 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974842 1 0.1482 0.78219 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974841 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974840 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974839 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974838 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974837 1 0.2173 0.77802 0.944 0.048 0.008
#> SRR1974835 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974836 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974834 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974833 1 0.6111 0.75879 0.784 0.104 0.112
#> SRR1974831 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974832 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974830 1 0.0829 0.78169 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974829 1 0.4897 0.71147 0.812 0.172 0.016
#> SRR1974828 1 0.4121 0.73828 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974826 1 0.6486 0.74203 0.760 0.096 0.144
#> SRR1974827 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974824 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974825 1 0.1411 0.78464 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974822 1 0.3589 0.78753 0.900 0.048 0.052
#> SRR1974823 1 0.3359 0.76362 0.900 0.084 0.016
#> SRR1974820 1 0.0829 0.78169 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974818 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974819 1 0.0829 0.78099 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974817 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974816 1 0.5998 0.75838 0.788 0.084 0.128
#> SRR1974815 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974813 1 0.0829 0.78099 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974814 1 0.9069 0.32385 0.440 0.424 0.136
#> SRR1974812 1 0.5115 0.64836 0.768 0.228 0.004
#> SRR1974810 1 0.5815 0.76721 0.800 0.096 0.104
#> SRR1974808 1 0.4677 0.76502 0.840 0.028 0.132
#> SRR1974811 1 0.2703 0.77425 0.928 0.056 0.016
#> SRR1974809 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974807 1 0.2050 0.78679 0.952 0.020 0.028
#> SRR1974806 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974805 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974804 1 0.7741 0.68705 0.668 0.216 0.116
#> SRR1974803 1 0.5220 0.71589 0.780 0.208 0.012
#> SRR1974801 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974800 1 0.3349 0.77590 0.888 0.004 0.108
#> SRR1974799 1 0.0829 0.78099 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974798 1 0.7670 0.70053 0.684 0.164 0.152
#> SRR1974797 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974796 1 0.6577 0.39313 0.572 0.420 0.008
#> SRR1974795 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974793 1 0.0829 0.78186 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974794 1 0.7666 0.70076 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974792 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974791 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974790 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974789 1 0.7717 0.69788 0.680 0.172 0.148
#> SRR1974788 1 0.7666 0.70064 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974786 1 0.3816 0.76209 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974787 1 0.1315 0.78414 0.972 0.008 0.020
#> SRR1974784 1 0.7681 0.40450 0.540 0.412 0.048
#> SRR1974783 1 0.1905 0.78258 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974785 1 0.1289 0.78460 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974782 1 0.1163 0.78406 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974781 1 0.8983 0.35631 0.444 0.428 0.128
#> SRR1974780 1 0.4228 0.76145 0.844 0.008 0.148
#> SRR1974779 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974777 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974776 1 0.3116 0.77576 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974778 1 0.1163 0.78426 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974774 1 0.7509 0.70801 0.696 0.152 0.152
#> SRR1974773 1 0.0892 0.78301 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974775 1 0.0892 0.78301 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974772 1 0.5098 0.68041 0.752 0.248 0.000
#> SRR1974771 1 0.6448 0.75244 0.764 0.104 0.132
#> SRR1974770 1 0.7717 0.69788 0.680 0.172 0.148
#> SRR1974769 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974768 1 0.7615 0.70331 0.688 0.164 0.148
#> SRR1974767 1 0.3918 0.76489 0.856 0.004 0.140
#> SRR1974766 1 0.6583 0.74051 0.756 0.108 0.136
#> SRR1974765 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974764 1 0.7772 0.69826 0.672 0.196 0.132
#> SRR1974763 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974762 1 0.0892 0.78301 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974761 1 0.8113 0.67685 0.644 0.212 0.144
#> SRR1974760 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974759 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974758 1 0.7666 0.70077 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974757 1 0.8884 0.37407 0.460 0.420 0.120
#> SRR1974756 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974754 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974755 1 0.7717 0.70012 0.680 0.172 0.148
#> SRR1974753 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974751 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974750 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974752 1 0.0747 0.78226 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974749 1 0.6208 0.75146 0.776 0.136 0.088
#> SRR1974747 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974748 1 0.3375 0.78272 0.908 0.044 0.048
#> SRR1974746 1 0.5560 0.62686 0.700 0.300 0.000
#> SRR1974744 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974745 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974743 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974742 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974740 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974739 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974741 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974738 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974737 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974736 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974735 1 0.5327 0.65162 0.728 0.272 0.000
#> SRR1974734 1 0.5733 0.60390 0.676 0.324 0.000
#> SRR1974733 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974732 2 0.6881 0.40389 0.320 0.648 0.032
#> SRR1974731 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974729 1 0.5497 0.63466 0.708 0.292 0.000
#> SRR1974730 1 0.1399 0.78469 0.968 0.004 0.028
#> SRR1974728 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974725 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974726 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974724 1 0.4555 0.72045 0.800 0.200 0.000
#> SRR1974727 1 0.5777 0.74880 0.788 0.052 0.160
#> SRR1974723 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974722 2 0.2031 0.92699 0.016 0.952 0.032
#> SRR1974721 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974720 2 0.3889 0.85166 0.084 0.884 0.032
#> SRR1974719 1 0.5850 0.73014 0.772 0.188 0.040
#> SRR1974718 1 0.3263 0.78354 0.912 0.040 0.048
#> SRR1974716 1 0.4994 0.77020 0.836 0.052 0.112
#> SRR1974717 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974715 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974713 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974714 1 0.1163 0.78406 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974711 1 0.4228 0.76091 0.844 0.008 0.148
#> SRR1974712 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974709 1 0.0829 0.78169 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974708 1 0.4802 0.75578 0.824 0.020 0.156
#> SRR1974710 1 0.4802 0.75670 0.824 0.020 0.156
#> SRR1974707 1 0.2356 0.78262 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974706 1 0.5016 0.68352 0.760 0.240 0.000
#> SRR1974704 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974705 1 0.1482 0.78232 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974703 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974702 1 0.4663 0.75668 0.828 0.016 0.156
#> SRR1974701 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974699 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974698 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974700 1 0.5138 0.67120 0.748 0.252 0.000
#> SRR1974697 1 0.5560 0.62806 0.700 0.300 0.000
#> SRR1974696 1 0.6518 0.31886 0.512 0.484 0.004
#> SRR1974694 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974695 1 0.4110 0.76042 0.844 0.004 0.152
#> SRR1974693 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974692 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974690 1 0.8935 0.36697 0.452 0.424 0.124
#> SRR1974691 1 0.5678 0.61229 0.684 0.316 0.000
#> SRR1974689 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974688 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974687 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974686 1 0.3619 0.74533 0.864 0.136 0.000
#> SRR1974685 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974684 1 0.1182 0.78138 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974683 1 0.5905 0.57000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1974682 2 0.3337 0.87878 0.060 0.908 0.032
#> SRR1974681 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974679 2 0.1877 0.93080 0.012 0.956 0.032
#> SRR1974680 1 0.4253 0.77706 0.872 0.048 0.080
#> SRR1974678 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974677 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974676 1 0.7666 0.70064 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974675 3 0.0000 0.94609 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974673 1 0.5835 0.74763 0.784 0.052 0.164
#> SRR1974671 1 0.7766 0.69540 0.676 0.176 0.148
#> SRR1974672 2 0.5778 0.68933 0.200 0.768 0.032
#> SRR1974670 2 0.5467 0.72487 0.176 0.792 0.032
#> SRR1974669 1 0.7717 0.69788 0.680 0.172 0.148
#> SRR1974667 1 0.7717 0.69854 0.680 0.172 0.148
#> SRR1974668 1 0.7815 0.69347 0.672 0.180 0.148
#> SRR1974666 1 0.7670 0.70053 0.684 0.164 0.152
#> SRR1974664 2 0.7123 0.25456 0.364 0.604 0.032
#> SRR1974665 1 0.7825 0.69323 0.672 0.172 0.156
#> SRR1974663 1 0.3816 0.76209 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974662 1 0.0829 0.78099 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974661 1 0.4353 0.75927 0.836 0.008 0.156
#> SRR1974660 1 0.2152 0.78583 0.948 0.016 0.036
#> SRR1974659 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974658 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974657 1 0.1529 0.78461 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974654 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974655 1 0.4139 0.76947 0.860 0.016 0.124
#> SRR1974656 1 0.2339 0.78601 0.940 0.012 0.048
#> SRR1974650 1 0.4514 0.75882 0.832 0.012 0.156
#> SRR1974651 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974652 1 0.3619 0.76672 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974653 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974648 1 0.4452 0.72129 0.808 0.192 0.000
#> SRR1974646 1 0.5346 0.75336 0.808 0.040 0.152
#> SRR1974649 1 0.1877 0.78121 0.956 0.032 0.012
#> SRR1974647 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974645 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974644 1 0.7666 0.70128 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974643 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974642 1 0.3879 0.76030 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974640 1 0.2261 0.78321 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974641 2 0.4519 0.81485 0.116 0.852 0.032
#> SRR1974639 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974638 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974635 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974636 1 0.4110 0.76004 0.844 0.004 0.152
#> SRR1974634 1 0.0829 0.78186 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974637 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974633 1 0.3038 0.77700 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974632 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974631 1 0.1765 0.78552 0.956 0.004 0.040
#> SRR1974630 1 0.2446 0.77753 0.936 0.052 0.012
#> SRR1974629 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974628 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974627 1 0.1411 0.78464 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974624 1 0.0829 0.78169 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974625 1 0.7828 0.69162 0.672 0.160 0.168
#> SRR1974623 1 0.3482 0.76921 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974622 1 0.1711 0.78538 0.960 0.008 0.032
#> SRR1974620 1 0.3752 0.76332 0.856 0.000 0.144
#> SRR1974619 1 0.5585 0.72336 0.772 0.204 0.024
#> SRR1974621 1 0.2550 0.77652 0.932 0.056 0.012
#> SRR1974617 1 0.1620 0.78128 0.964 0.024 0.012
#> SRR1974616 1 0.4293 0.71261 0.832 0.164 0.004
#> SRR1974615 1 0.1620 0.78181 0.964 0.024 0.012
#> SRR1974618 1 0.0829 0.78186 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974614 1 0.3715 0.76934 0.868 0.004 0.128
#> SRR1974613 1 0.1411 0.78513 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974612 1 0.2400 0.78395 0.932 0.004 0.064
#> SRR1974611 1 0.3879 0.76030 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974610 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974609 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974608 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974607 1 0.3910 0.77517 0.876 0.020 0.104
#> SRR1974606 1 0.7766 0.69550 0.676 0.176 0.148
#> SRR1974605 1 0.5706 0.60841 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974604 2 0.1525 0.93790 0.004 0.964 0.032
#> SRR1974603 1 0.4195 0.76799 0.852 0.012 0.136
#> SRR1974602 1 0.1182 0.78211 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974600 1 0.8170 0.65621 0.624 0.256 0.120
#> SRR1974601 1 0.5295 0.75316 0.808 0.036 0.156
#> SRR1974599 1 0.7815 0.69279 0.672 0.180 0.148
#> SRR1974598 1 0.7862 0.69062 0.668 0.184 0.148
#> SRR1974596 1 0.8085 0.67758 0.648 0.204 0.148
#> SRR1974594 1 0.7605 0.70687 0.684 0.192 0.124
#> SRR1974593 1 0.7615 0.70562 0.688 0.164 0.148
#> SRR1974595 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974592 1 0.7766 0.69550 0.676 0.176 0.148
#> SRR1974591 1 0.7815 0.69279 0.672 0.180 0.148
#> SRR1974588 1 0.7966 0.67295 0.652 0.220 0.128
#> SRR1974590 1 0.8720 0.58614 0.560 0.304 0.136
#> SRR1974589 1 0.8719 0.54564 0.548 0.324 0.128
#> SRR1974587 1 0.8334 0.65506 0.616 0.248 0.136
#> SRR1974586 1 0.8098 0.67810 0.644 0.216 0.140
#> SRR1974585 1 0.8875 0.47618 0.508 0.364 0.128
#> SRR1974584 1 0.3043 0.76953 0.908 0.084 0.008
#> SRR1974583 1 0.7666 0.70064 0.684 0.168 0.148
#> SRR1974582 1 0.7988 0.68432 0.656 0.200 0.144
#> SRR1974581 1 0.7815 0.69279 0.672 0.180 0.148
#> SRR1974580 1 0.8567 0.60951 0.576 0.296 0.128
#> SRR1974578 1 0.6906 0.61141 0.644 0.324 0.032
#> SRR1974577 1 0.5295 0.75498 0.808 0.036 0.156
#> SRR1974579 1 0.8491 0.60562 0.588 0.284 0.128
#> SRR1974576 1 0.8192 0.67267 0.636 0.220 0.144
#> SRR1974575 1 0.7999 0.68404 0.656 0.196 0.148
#> SRR1974574 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974573 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974571 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974572 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974570 1 0.2280 0.78682 0.940 0.008 0.052
#> SRR1974568 1 0.2116 0.77761 0.948 0.040 0.012
#> SRR1974567 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974566 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974569 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974565 1 0.8659 0.55740 0.560 0.312 0.128
#> SRR1974564 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974560 1 0.1015 0.78113 0.980 0.008 0.012
#> SRR1974559 1 0.3120 0.76336 0.908 0.080 0.012
#> SRR1974563 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974562 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974561 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974557 1 0.8742 0.57535 0.556 0.308 0.136
#> SRR1974553 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974555 1 0.1482 0.78145 0.968 0.020 0.012
#> SRR1974551 1 0.5008 0.70443 0.804 0.180 0.016
#> SRR1974552 1 0.6577 0.39327 0.572 0.420 0.008
#> SRR1974554 1 0.0892 0.78319 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974558 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974556 1 0.0592 0.78131 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974550 1 0.2711 0.78048 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974549 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974548 1 0.8886 0.50550 0.516 0.352 0.132
#> SRR1974547 1 0.2998 0.77147 0.916 0.068 0.016
#> SRR1974546 1 0.0747 0.78259 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974545 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
#> SRR1974544 1 0.1182 0.78179 0.976 0.012 0.012
#> SRR1974543 1 0.6598 0.38399 0.564 0.428 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0188 0.9824 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0188 0.9824 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1975002 3 0.1059 0.9630 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.2335 0.8974 0.060 0.020 0.920 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.8219 0.4180 0.352 0.452 0.160 0.036
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.5539 0.5619 0.224 0.060 0.712 0.004
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.7725 0.6441 0.196 0.584 0.040 0.180
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 2 0.8633 0.4194 0.224 0.400 0.336 0.040
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.1978 0.8995 0.068 0.004 0.928 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0188 0.9824 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.2360 0.9090 0.052 0.020 0.924 0.004
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0657 0.9724 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0707 0.9631 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0469 0.9746 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0188 0.9824 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974946 3 0.3317 0.8300 0.112 0.012 0.868 0.008
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0592 0.9680 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974942 3 0.1151 0.9524 0.024 0.008 0.968 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0336 0.9773 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0188 0.9819 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974930 3 0.0188 0.9814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0707 0.9645 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 2 0.8321 0.5569 0.208 0.504 0.244 0.044
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.7980 0.5971 0.264 0.548 0.136 0.052
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0188 0.9814 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.3144 0.8763 0.016 0.072 0.892 0.020
#> SRR1974900 3 0.5719 0.4429 0.008 0.296 0.660 0.036
#> SRR1974899 3 0.0336 0.9792 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.7937 0.6119 0.216 0.556 0.188 0.040
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0336 0.9792 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974894 2 0.8537 0.4846 0.204 0.448 0.304 0.044
#> SRR1974892 2 0.8405 0.5439 0.252 0.496 0.204 0.048
#> SRR1974890 2 0.7752 0.6318 0.252 0.580 0.104 0.064
#> SRR1974891 2 0.8408 0.5051 0.196 0.464 0.300 0.040
#> SRR1974889 3 0.0188 0.9824 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974888 2 0.8370 0.5061 0.188 0.468 0.304 0.040
#> SRR1974886 2 0.7777 0.6392 0.172 0.576 0.040 0.212
#> SRR1974887 2 0.7868 0.5589 0.236 0.560 0.040 0.164
#> SRR1974885 2 0.7742 0.5827 0.212 0.580 0.040 0.168
#> SRR1974883 2 0.8251 0.5699 0.204 0.516 0.236 0.044
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.7238 0.6741 0.224 0.624 0.112 0.040
#> SRR1974882 2 0.7742 0.6281 0.252 0.576 0.120 0.052
#> SRR1974880 2 0.6185 0.7326 0.200 0.704 0.036 0.060
#> SRR1974879 2 0.8118 0.3285 0.140 0.420 0.404 0.036
#> SRR1974877 3 0.2231 0.9196 0.044 0.012 0.932 0.012
#> SRR1974876 2 0.8339 0.5261 0.268 0.488 0.204 0.040
#> SRR1974878 2 0.8437 0.5333 0.224 0.484 0.248 0.044
#> SRR1974875 2 0.7949 0.6252 0.244 0.572 0.100 0.084
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.3157 0.7264 0.852 0.144 0.004 0.000
#> SRR1974869 1 0.4188 0.5881 0.752 0.244 0.004 0.000
#> SRR1974868 2 0.3157 0.7819 0.144 0.852 0.004 0.000
#> SRR1974870 1 0.3402 0.7086 0.832 0.164 0.004 0.000
#> SRR1974866 1 0.2921 0.7339 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.0376 0.9425 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1974864 1 0.0921 0.8208 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0188 0.9456 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974863 4 0.1284 0.9201 0.012 0.024 0.000 0.964
#> SRR1974860 2 0.3306 0.7775 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1974861 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 4 0.6791 0.2009 0.120 0.316 0.000 0.564
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 4 0.4388 0.7368 0.060 0.132 0.000 0.808
#> SRR1974855 2 0.6253 0.4988 0.372 0.564 0.000 0.064
#> SRR1974854 1 0.5314 0.6119 0.748 0.144 0.000 0.108
#> SRR1974853 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.4864 0.7077 0.172 0.768 0.000 0.060
#> SRR1974852 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7509 0.2856 0.360 0.452 0.000 0.188
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0336 0.8290 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0592 0.7542 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1389 0.8092 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.1743 0.7966 0.940 0.004 0.000 0.056
#> SRR1974835 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.6432 0.4780 0.372 0.552 0.000 0.076
#> SRR1974831 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 2 0.6039 0.4928 0.348 0.596 0.000 0.056
#> SRR1974828 1 0.5653 0.5584 0.712 0.192 0.000 0.096
#> SRR1974826 2 0.5161 0.6448 0.300 0.676 0.000 0.024
#> SRR1974827 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.6525 0.3024 0.612 0.272 0.000 0.116
#> SRR1974823 1 0.4422 0.6008 0.736 0.256 0.000 0.008
#> SRR1974820 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.6924 0.2469 0.428 0.464 0.000 0.108
#> SRR1974815 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.6966 0.5154 0.288 0.576 0.004 0.132
#> SRR1974812 2 0.5298 0.6495 0.244 0.708 0.000 0.048
#> SRR1974810 1 0.6865 0.0445 0.524 0.364 0.000 0.112
#> SRR1974808 1 0.2921 0.7331 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.5773 0.3637 0.632 0.320 0.000 0.048
#> SRR1974809 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2111 0.7969 0.932 0.044 0.000 0.024
#> SRR1974806 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.7219 0.3253 0.364 0.488 0.000 0.148
#> SRR1974803 1 0.7432 0.0766 0.480 0.336 0.000 0.184
#> SRR1974801 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1940 0.7915 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3105 0.7822 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974797 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.1118 0.7611 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0188 0.8292 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974794 2 0.3257 0.7804 0.152 0.844 0.004 0.000
#> SRR1974792 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.3157 0.7819 0.144 0.852 0.004 0.000
#> SRR1974788 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974786 1 0.2976 0.7503 0.872 0.120 0.008 0.000
#> SRR1974787 1 0.3402 0.7035 0.832 0.164 0.000 0.004
#> SRR1974784 2 0.2915 0.7661 0.080 0.892 0.000 0.028
#> SRR1974783 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1716 0.8004 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.2125 0.7804 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR1974780 1 0.5064 0.3084 0.632 0.360 0.004 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2469 0.7651 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0592 0.8263 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.3583 0.7671 0.180 0.816 0.004 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.7526 0.0701 0.468 0.332 0.000 0.200
#> SRR1974771 2 0.5689 0.6290 0.300 0.656 0.004 0.040
#> SRR1974770 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974769 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.3306 0.7788 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1974767 1 0.2944 0.7428 0.868 0.128 0.004 0.000
#> SRR1974766 2 0.5384 0.6499 0.292 0.676 0.004 0.028
#> SRR1974765 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.3710 0.7602 0.192 0.804 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.3863 0.7697 0.176 0.812 0.004 0.008
#> SRR1974760 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.3494 0.7718 0.172 0.824 0.004 0.000
#> SRR1974757 2 0.1661 0.7726 0.052 0.944 0.000 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.3157 0.7819 0.144 0.852 0.004 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.6679 0.4883 0.360 0.552 0.004 0.084
#> SRR1974747 1 0.7810 -0.1078 0.384 0.364 0.000 0.252
#> SRR1974748 1 0.0336 0.8290 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.7795 -0.0478 0.404 0.344 0.000 0.252
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.7793 -0.0805 0.396 0.356 0.000 0.248
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.7669 0.0758 0.452 0.312 0.000 0.236
#> SRR1974734 2 0.7717 0.2394 0.344 0.424 0.000 0.232
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.7881 -0.0958 0.296 0.320 0.000 0.384
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.7766 -0.0406 0.412 0.344 0.000 0.244
#> SRR1974730 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.7784 -0.1019 0.392 0.364 0.000 0.244
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.7412 0.1706 0.504 0.296 0.000 0.200
#> SRR1974727 2 0.6486 0.4399 0.396 0.536 0.004 0.064
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.0779 0.9329 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974720 4 0.4635 0.7367 0.124 0.080 0.000 0.796
#> SRR1974719 1 0.7082 -0.1220 0.448 0.428 0.000 0.124
#> SRR1974718 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.6157 -0.0911 0.516 0.440 0.004 0.040
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0336 0.8292 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.4193 0.5484 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.4018 0.6223 0.772 0.224 0.004 0.000
#> SRR1974710 1 0.3355 0.7104 0.836 0.160 0.004 0.000
#> SRR1974707 1 0.1716 0.8004 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.7483 0.1815 0.496 0.288 0.000 0.216
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.3351 0.7204 0.844 0.148 0.008 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.7614 0.1188 0.468 0.300 0.000 0.232
#> SRR1974697 1 0.7756 -0.0474 0.412 0.348 0.000 0.240
#> SRR1974696 4 0.7846 -0.1025 0.296 0.300 0.000 0.404
#> SRR1974694 1 0.7808 -0.0955 0.388 0.360 0.000 0.252
#> SRR1974695 1 0.5521 0.3891 0.664 0.300 0.004 0.032
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.2197 0.7817 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR1974691 1 0.7803 -0.0720 0.396 0.352 0.000 0.252
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.7803 -0.0720 0.396 0.352 0.000 0.252
#> SRR1974686 1 0.1722 0.8009 0.944 0.008 0.000 0.048
#> SRR1974685 1 0.7810 -0.1078 0.384 0.364 0.000 0.252
#> SRR1974684 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.7810 -0.1078 0.384 0.364 0.000 0.252
#> SRR1974682 4 0.5292 0.6618 0.168 0.088 0.000 0.744
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0592 0.9345 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974680 1 0.0376 0.8288 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974675 3 0.0376 0.9796 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.5408 0.1273 0.576 0.408 0.016 0.000
#> SRR1974671 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974672 4 0.2002 0.8903 0.020 0.044 0.000 0.936
#> SRR1974670 4 0.0188 0.9456 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974669 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974667 2 0.3306 0.7789 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974666 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974664 4 0.4939 0.6888 0.064 0.156 0.004 0.776
#> SRR1974665 2 0.3236 0.7833 0.136 0.856 0.004 0.004
#> SRR1974663 1 0.2888 0.7467 0.872 0.124 0.004 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.4571 0.5608 0.736 0.252 0.004 0.008
#> SRR1974660 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0188 0.8293 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0336 0.8291 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.5827 -0.0276 0.536 0.436 0.004 0.024
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.1474 0.8067 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.7036 0.3079 0.576 0.216 0.000 0.208
#> SRR1974646 1 0.3710 0.6691 0.804 0.192 0.004 0.000
#> SRR1974649 1 0.0188 0.8290 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3539 0.7694 0.176 0.820 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.3306 0.7151 0.840 0.156 0.004 0.000
#> SRR1974640 1 0.0336 0.8292 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.0336 0.9413 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974639 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0188 0.8293 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.2773 0.7556 0.880 0.116 0.004 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.1022 0.8182 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0469 0.8279 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0376 0.8287 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974629 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.3969 0.7658 0.180 0.804 0.016 0.000
#> SRR1974623 1 0.2647 0.7553 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.2334 0.7800 0.908 0.088 0.004 0.000
#> SRR1974619 2 0.6963 0.2625 0.436 0.464 0.004 0.096
#> SRR1974621 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.6041 0.5276 0.332 0.608 0.000 0.060
#> SRR1974615 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0376 0.8289 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974614 1 0.2814 0.7412 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0707 0.8250 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.3626 0.6793 0.812 0.184 0.004 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.7810 -0.1078 0.384 0.364 0.000 0.252
#> SRR1974607 1 0.0592 0.8261 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.3052 0.7830 0.136 0.860 0.004 0.000
#> SRR1974605 1 0.7784 -0.1019 0.392 0.364 0.000 0.244
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9487 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.5139 0.2405 0.612 0.380 0.004 0.004
#> SRR1974602 1 0.0188 0.8296 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2999 0.7851 0.132 0.864 0.000 0.004
#> SRR1974601 1 0.5773 -0.1737 0.500 0.476 0.004 0.020
#> SRR1974599 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974598 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974596 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974594 2 0.6206 0.5864 0.280 0.632 0.000 0.088
#> SRR1974593 2 0.3710 0.7595 0.192 0.804 0.004 0.000
#> SRR1974595 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974591 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974588 2 0.5753 0.6339 0.248 0.680 0.000 0.072
#> SRR1974590 2 0.2999 0.7839 0.132 0.864 0.000 0.004
#> SRR1974589 2 0.4839 0.7047 0.200 0.756 0.000 0.044
#> SRR1974587 2 0.4230 0.7440 0.212 0.776 0.004 0.008
#> SRR1974586 2 0.3052 0.7849 0.136 0.860 0.000 0.004
#> SRR1974585 2 0.5970 0.6260 0.244 0.668 0.000 0.088
#> SRR1974584 1 0.0376 0.8287 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974583 2 0.3157 0.7821 0.144 0.852 0.004 0.000
#> SRR1974582 2 0.2921 0.7822 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.3105 0.7824 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974580 2 0.4364 0.7299 0.220 0.764 0.000 0.016
#> SRR1974578 2 0.7449 0.2959 0.356 0.464 0.000 0.180
#> SRR1974577 2 0.6027 0.4287 0.408 0.552 0.004 0.036
#> SRR1974579 2 0.5394 0.6707 0.228 0.712 0.000 0.060
#> SRR1974576 2 0.3538 0.7782 0.160 0.832 0.004 0.004
#> SRR1974575 2 0.3208 0.7810 0.148 0.848 0.004 0.000
#> SRR1974574 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.2868 0.7387 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.3088 0.7468 0.864 0.128 0.000 0.008
#> SRR1974567 1 0.0592 0.8246 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.6081 0.6095 0.260 0.652 0.000 0.088
#> SRR1974564 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.1661 0.8043 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR1974559 1 0.4956 0.6181 0.756 0.188 0.000 0.056
#> SRR1974563 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.6780 0.5802 0.296 0.588 0.004 0.112
#> SRR1974553 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 2 0.5878 0.5600 0.312 0.632 0.000 0.056
#> SRR1974552 2 0.0921 0.7578 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.1302 0.8098 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.8304 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.2345 0.7706 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.3494 0.7488 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR1974547 1 0.4328 0.5849 0.748 0.244 0.000 0.008
#> SRR1974546 1 0.2149 0.7807 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.2888 0.7522 0.872 0.124 0.000 0.004
#> SRR1974543 2 0.0469 0.7527 0.012 0.988 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.2732 0.8992 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1975008 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1975006 3 0.1082 0.9164 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1975005 3 0.0290 0.9142 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1975004 3 0.2179 0.9117 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1975003 3 0.0510 0.9125 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1975001 3 0.1608 0.8892 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1975002 3 0.3004 0.8450 0.000 0.008 0.864 0.020 0.108
#> SRR1974999 3 0.0703 0.9104 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1975000 3 0.3978 0.8744 0.016 0.036 0.804 0.000 0.144
#> SRR1974998 3 0.2648 0.9017 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974997 1 0.8442 -0.3514 0.360 0.356 0.148 0.028 0.108
#> SRR1974995 3 0.0162 0.9150 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974996 3 0.2648 0.9019 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974994 3 0.7153 0.4549 0.240 0.056 0.524 0.000 0.180
#> SRR1974993 3 0.0290 0.9142 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974992 3 0.0404 0.9163 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974990 3 0.3171 0.8899 0.000 0.008 0.816 0.000 0.176
#> SRR1974989 2 0.6613 0.4502 0.084 0.636 0.004 0.132 0.144
#> SRR1974991 3 0.0290 0.9158 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974986 3 0.2561 0.9041 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1974987 3 0.0510 0.9145 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974988 2 0.8820 0.2427 0.208 0.344 0.288 0.028 0.132
#> SRR1974984 3 0.0510 0.9161 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974985 3 0.2852 0.8965 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974983 3 0.0794 0.9093 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974982 3 0.2732 0.8999 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974981 3 0.4155 0.8608 0.032 0.012 0.776 0.000 0.180
#> SRR1974980 3 0.2732 0.8999 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974979 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974978 3 0.2813 0.8964 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974977 3 0.2773 0.8978 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1974976 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974975 3 0.0510 0.9147 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974974 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974973 3 0.1671 0.8876 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.2728 0.8587 0.048 0.016 0.896 0.000 0.040
#> SRR1974970 3 0.0963 0.9171 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974969 3 0.0510 0.9168 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974968 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974967 3 0.1792 0.9148 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974965 3 0.2732 0.8993 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974966 3 0.0404 0.9168 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974964 3 0.0162 0.9150 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974963 3 0.1043 0.9181 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974961 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974962 3 0.2179 0.8810 0.000 0.008 0.912 0.008 0.072
#> SRR1974960 3 0.2732 0.8995 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974959 3 0.2074 0.9124 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974958 3 0.0290 0.9142 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974957 3 0.0162 0.9150 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974956 3 0.0290 0.9158 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974955 3 0.3488 0.8835 0.008 0.008 0.804 0.000 0.180
#> SRR1974954 3 0.1544 0.9164 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974953 3 0.1764 0.8921 0.000 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR1974952 3 0.0162 0.9160 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974951 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974947 3 0.0510 0.9145 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974948 3 0.1732 0.8847 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974946 3 0.5210 0.6998 0.108 0.052 0.752 0.004 0.084
#> SRR1974945 3 0.2424 0.9078 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974944 3 0.3488 0.8835 0.008 0.008 0.804 0.000 0.180
#> SRR1974942 3 0.3697 0.8792 0.008 0.016 0.796 0.000 0.180
#> SRR1974943 3 0.1270 0.9177 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974941 3 0.2852 0.8947 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974940 3 0.2471 0.9060 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974939 3 0.0854 0.9142 0.004 0.008 0.976 0.000 0.012
#> SRR1974938 3 0.1197 0.9172 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974937 3 0.2813 0.8967 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974936 3 0.3209 0.8880 0.000 0.008 0.812 0.000 0.180
#> SRR1974935 3 0.2732 0.8993 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974934 3 0.0880 0.9080 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.2516 0.9054 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974931 3 0.3550 0.8804 0.000 0.020 0.796 0.000 0.184
#> SRR1974930 3 0.3086 0.8901 0.000 0.004 0.816 0.000 0.180
#> SRR1974929 3 0.2813 0.8964 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974928 3 0.0609 0.9119 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974927 3 0.2020 0.9126 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974924 3 0.3792 0.8753 0.020 0.008 0.792 0.000 0.180
#> SRR1974925 3 0.2773 0.8978 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1974926 2 0.9037 0.2950 0.204 0.360 0.248 0.044 0.144
#> SRR1974923 3 0.2930 0.8971 0.000 0.004 0.832 0.000 0.164
#> SRR1974922 3 0.2074 0.9126 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974921 3 0.2605 0.9030 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974920 3 0.2891 0.8932 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1974919 3 0.2605 0.9036 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974918 3 0.2719 0.9041 0.000 0.004 0.852 0.000 0.144
#> SRR1974917 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974916 3 0.2813 0.8964 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974915 3 0.2516 0.9061 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974914 2 0.7562 0.4521 0.164 0.580 0.044 0.076 0.136
#> SRR1974913 3 0.2773 0.8982 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1974911 3 0.3086 0.8899 0.000 0.004 0.816 0.000 0.180
#> SRR1974910 3 0.2732 0.8993 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974908 3 0.0963 0.9068 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974909 3 0.1965 0.9134 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974906 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974907 3 0.0794 0.9176 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974905 3 0.2648 0.9020 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974904 3 0.0162 0.9150 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974903 3 0.2020 0.9129 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974902 3 0.0162 0.9150 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974901 3 0.2074 0.9127 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974898 3 0.4805 0.7674 0.016 0.064 0.784 0.028 0.108
#> SRR1974900 3 0.6897 0.4284 0.012 0.240 0.572 0.036 0.140
#> SRR1974899 3 0.1831 0.8851 0.000 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR1974897 3 0.1270 0.8994 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974896 2 0.8429 0.3815 0.188 0.496 0.120 0.060 0.136
#> SRR1974893 3 0.0404 0.9133 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974895 3 0.2112 0.8786 0.000 0.004 0.908 0.004 0.084
#> SRR1974894 2 0.8814 0.2557 0.176 0.380 0.272 0.036 0.136
#> SRR1974892 2 0.8553 0.3740 0.192 0.480 0.132 0.060 0.136
#> SRR1974890 2 0.6731 0.4765 0.136 0.636 0.012 0.076 0.140
#> SRR1974891 2 0.8863 0.2520 0.176 0.380 0.268 0.040 0.136
#> SRR1974889 3 0.1956 0.8844 0.000 0.008 0.916 0.000 0.076
#> SRR1974888 2 0.8765 0.2325 0.172 0.372 0.288 0.032 0.136
#> SRR1974886 2 0.6654 0.3975 0.060 0.616 0.004 0.188 0.132
#> SRR1974887 2 0.6849 0.4520 0.104 0.616 0.004 0.132 0.144
#> SRR1974885 2 0.6785 0.4391 0.092 0.620 0.004 0.136 0.148
#> SRR1974883 2 0.8499 0.3306 0.184 0.456 0.192 0.032 0.136
#> SRR1974884 3 0.0963 0.9063 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974881 2 0.6907 0.4706 0.136 0.632 0.024 0.072 0.136
#> SRR1974882 2 0.6654 0.4765 0.132 0.644 0.012 0.076 0.136
#> SRR1974880 2 0.5331 0.4994 0.120 0.736 0.000 0.064 0.080
#> SRR1974879 3 0.8661 -0.1990 0.144 0.328 0.360 0.032 0.136
#> SRR1974877 3 0.4001 0.8105 0.048 0.020 0.832 0.012 0.088
#> SRR1974876 2 0.8620 0.3603 0.220 0.448 0.156 0.044 0.132
#> SRR1974878 2 0.8719 0.3400 0.188 0.444 0.184 0.048 0.136
#> SRR1974875 2 0.6997 0.4546 0.104 0.624 0.020 0.104 0.148
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0162 0.9565 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974872 1 0.2536 0.8277 0.868 0.128 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.3366 0.6662 0.768 0.232 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.2857 0.4365 0.112 0.868 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974870 1 0.3211 0.7746 0.824 0.164 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974866 1 0.2020 0.8504 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0162 0.9082 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.0898 0.9432 0.000 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1974864 1 0.0609 0.9050 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.1059 0.9407 0.004 0.008 0.000 0.968 0.020
#> SRR1974863 4 0.2032 0.9040 0.004 0.052 0.000 0.924 0.020
#> SRR1974860 2 0.3210 0.4379 0.132 0.844 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974861 2 0.3018 0.4400 0.116 0.860 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.5578 0.2456 0.032 0.368 0.000 0.572 0.028
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.4626 0.6294 0.028 0.224 0.000 0.728 0.020
#> SRR1974855 2 0.5963 0.4981 0.340 0.572 0.000 0.036 0.052
#> SRR1974854 1 0.7056 0.0880 0.536 0.260 0.000 0.064 0.140
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.5976 0.3571 0.136 0.652 0.000 0.028 0.184
#> SRR1974852 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974849 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7025 0.4878 0.160 0.580 0.000 0.164 0.096
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 5 0.4655 0.9871 0.012 0.476 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0963 0.8976 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.1892 0.8508 0.916 0.004 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0798 0.9453 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1974839 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.3996 0.7395 0.816 0.052 0.000 0.020 0.112
#> SRR1974835 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974834 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974833 2 0.6534 0.5046 0.336 0.536 0.000 0.056 0.072
#> SRR1974831 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974832 1 0.0162 0.9081 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 2 0.6634 0.3976 0.392 0.468 0.000 0.028 0.112
#> SRR1974828 1 0.6776 0.1055 0.544 0.296 0.000 0.060 0.100
#> SRR1974826 2 0.4033 0.4999 0.208 0.764 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974827 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0404 0.9073 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.7044 -0.1604 0.492 0.336 0.000 0.068 0.104
#> SRR1974823 1 0.3832 0.7335 0.796 0.172 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974820 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.7147 0.4809 0.360 0.464 0.000 0.076 0.100
#> SRR1974815 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.6597 0.4997 0.144 0.624 0.000 0.080 0.152
#> SRR1974812 2 0.7321 0.2936 0.276 0.432 0.000 0.032 0.260
#> SRR1974810 2 0.7234 0.4226 0.380 0.436 0.000 0.072 0.112
#> SRR1974808 1 0.2020 0.8512 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.5790 0.1960 0.592 0.328 0.000 0.032 0.048
#> SRR1974809 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2789 0.8212 0.880 0.092 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974806 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974804 2 0.7278 0.4870 0.176 0.548 0.000 0.100 0.176
#> SRR1974803 2 0.7838 0.4617 0.308 0.424 0.000 0.112 0.156
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1270 0.8874 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3067 0.4413 0.120 0.856 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974797 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974796 2 0.5303 -0.6310 0.048 0.576 0.000 0.004 0.372
#> SRR1974795 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974793 1 0.1251 0.8854 0.956 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974794 2 0.3099 0.4564 0.132 0.848 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974792 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974791 5 0.4656 0.9842 0.012 0.480 0.000 0.000 0.508
#> SRR1974790 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974789 2 0.3116 0.4449 0.124 0.852 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974788 2 0.3053 0.4384 0.128 0.852 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974786 1 0.1792 0.8653 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.1851 0.8618 0.912 0.088 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.5077 0.0263 0.088 0.696 0.000 0.004 0.212
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1043 0.8952 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.2712 0.3981 0.088 0.880 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974780 1 0.4047 0.4547 0.676 0.320 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974779 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.1608 0.8781 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0609 0.9048 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.3190 0.4488 0.140 0.840 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974773 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 2 0.7984 0.4599 0.248 0.440 0.000 0.140 0.172
#> SRR1974771 2 0.4074 0.5163 0.180 0.780 0.000 0.012 0.028
#> SRR1974770 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974769 5 0.4748 0.9473 0.016 0.492 0.000 0.000 0.492
#> SRR1974768 2 0.3059 0.4394 0.120 0.856 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974767 1 0.1544 0.8757 0.932 0.068 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.3734 0.5075 0.184 0.792 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974765 5 0.4658 0.9749 0.012 0.484 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974764 2 0.2894 0.4641 0.124 0.860 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974763 1 0.0451 0.9041 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2881 0.4792 0.124 0.860 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974760 5 0.4659 0.9711 0.012 0.488 0.000 0.000 0.500
#> SRR1974759 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2894 0.4555 0.124 0.860 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974757 2 0.4702 -0.0214 0.072 0.732 0.000 0.004 0.192
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0162 0.9568 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.5572 0.5295 0.196 0.692 0.000 0.060 0.052
#> SRR1974747 2 0.7966 0.4283 0.164 0.460 0.000 0.188 0.188
#> SRR1974748 1 0.0510 0.9056 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 2 0.8063 0.4313 0.184 0.444 0.000 0.184 0.188
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 2 0.7969 0.4323 0.168 0.460 0.000 0.184 0.188
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 2 0.8126 0.4293 0.220 0.428 0.000 0.172 0.180
#> SRR1974734 2 0.7068 0.4538 0.156 0.572 0.000 0.180 0.092
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.7894 0.3191 0.128 0.416 0.000 0.312 0.144
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 2 0.8063 0.4320 0.188 0.444 0.000 0.184 0.184
#> SRR1974730 1 0.0162 0.9081 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 2 0.7766 0.4438 0.168 0.492 0.000 0.184 0.156
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 2 0.7860 0.4392 0.300 0.424 0.000 0.108 0.168
#> SRR1974727 2 0.5741 0.4484 0.376 0.556 0.000 0.032 0.036
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1697 0.9061 0.008 0.000 0.000 0.932 0.060
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.5958 0.5631 0.072 0.172 0.000 0.676 0.080
#> SRR1974719 2 0.7291 0.4825 0.304 0.492 0.000 0.084 0.120
#> SRR1974718 1 0.0510 0.9047 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.6023 -0.2247 0.480 0.440 0.000 0.032 0.048
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0404 0.9035 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974714 1 0.0290 0.9076 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.3143 0.7123 0.796 0.204 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.2929 0.7575 0.820 0.180 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.2648 0.7969 0.848 0.152 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0880 0.9014 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 2 0.8126 0.4249 0.268 0.408 0.000 0.152 0.172
#> SRR1974704 1 0.1430 0.8750 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974705 1 0.0162 0.9070 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.2338 0.8386 0.884 0.112 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 2 0.8106 0.4314 0.232 0.428 0.000 0.168 0.172
#> SRR1974697 2 0.8041 0.4374 0.184 0.448 0.000 0.180 0.188
#> SRR1974696 2 0.7679 0.3688 0.140 0.440 0.000 0.316 0.104
#> SRR1974694 2 0.7966 0.4283 0.164 0.460 0.000 0.188 0.188
#> SRR1974695 1 0.5146 0.3611 0.648 0.300 0.000 0.016 0.036
#> SRR1974693 4 0.0290 0.9543 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.2853 0.3771 0.076 0.880 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974691 2 0.8016 0.4293 0.172 0.452 0.000 0.188 0.188
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 2 0.7994 0.4327 0.172 0.456 0.000 0.184 0.188
#> SRR1974686 1 0.4558 0.6792 0.776 0.136 0.000 0.024 0.064
#> SRR1974685 2 0.7966 0.4283 0.164 0.460 0.000 0.188 0.188
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.7966 0.4283 0.164 0.460 0.000 0.188 0.188
#> SRR1974682 4 0.6903 0.4216 0.096 0.196 0.000 0.588 0.120
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1697 0.9073 0.008 0.000 0.000 0.932 0.060
#> SRR1974680 1 0.1701 0.8770 0.936 0.048 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974678 4 0.0451 0.9530 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1974677 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.3067 0.4413 0.120 0.856 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974675 3 0.0955 0.9091 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.4356 0.3915 0.648 0.340 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.3067 0.4413 0.120 0.856 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974672 4 0.2720 0.8536 0.004 0.096 0.000 0.880 0.020
#> SRR1974670 4 0.1012 0.9400 0.000 0.012 0.000 0.968 0.020
#> SRR1974669 2 0.3116 0.4412 0.124 0.852 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974667 2 0.3005 0.4458 0.124 0.856 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974668 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974666 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974664 4 0.4421 0.6551 0.024 0.208 0.000 0.748 0.020
#> SRR1974665 2 0.2846 0.4447 0.120 0.864 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974663 1 0.1671 0.8716 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.3430 0.6699 0.776 0.220 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974660 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.1043 0.8958 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0880 0.8984 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.4709 0.1622 0.584 0.400 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1197 0.8933 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 2 0.8089 0.4105 0.348 0.352 0.000 0.132 0.168
#> SRR1974646 1 0.2891 0.7630 0.824 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.1124 0.8922 0.960 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2865 0.4627 0.132 0.856 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.2127 0.8410 0.892 0.108 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0510 0.9058 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.0609 0.9449 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.1792 0.8659 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0290 0.9054 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0510 0.9057 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0290 0.9071 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.1364 0.8870 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.3682 0.4479 0.140 0.824 0.012 0.016 0.008
#> SRR1974623 1 0.1851 0.8665 0.912 0.088 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0290 0.9083 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.1341 0.8847 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 2 0.6346 0.5179 0.272 0.596 0.000 0.068 0.064
#> SRR1974621 1 0.0324 0.9049 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.6444 0.4476 0.376 0.504 0.000 0.032 0.088
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.1956 0.8516 0.916 0.008 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974614 1 0.1671 0.8698 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0609 0.9050 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.2471 0.8083 0.864 0.136 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9587 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.7944 0.4294 0.164 0.464 0.000 0.188 0.184
#> SRR1974607 1 0.1270 0.8901 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.3005 0.4434 0.124 0.856 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974605 2 0.7849 0.4387 0.164 0.480 0.000 0.176 0.180
#> SRR1974604 4 0.0162 0.9565 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974603 1 0.3932 0.4468 0.672 0.328 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.3004 0.4461 0.108 0.864 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974601 1 0.4670 0.0247 0.548 0.440 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974599 2 0.3018 0.4400 0.116 0.860 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974598 2 0.3067 0.4413 0.120 0.856 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974596 2 0.2699 0.4290 0.100 0.880 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974594 2 0.5157 0.5129 0.156 0.736 0.000 0.060 0.048
#> SRR1974593 2 0.2865 0.4672 0.132 0.856 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974595 5 0.4655 0.9877 0.012 0.476 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974592 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974591 2 0.3067 0.4413 0.120 0.856 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974588 2 0.4736 0.5063 0.156 0.760 0.000 0.032 0.052
#> SRR1974590 2 0.2802 0.4295 0.100 0.876 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974589 2 0.3951 0.4947 0.140 0.808 0.000 0.020 0.032
#> SRR1974587 2 0.2722 0.4773 0.120 0.868 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974586 2 0.2856 0.4350 0.104 0.872 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974585 2 0.4885 0.5017 0.136 0.760 0.000 0.044 0.060
#> SRR1974584 1 0.0579 0.9041 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974583 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974582 2 0.2805 0.4347 0.108 0.872 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974581 2 0.2957 0.4394 0.120 0.860 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974580 2 0.3070 0.4758 0.112 0.860 0.000 0.012 0.016
#> SRR1974578 2 0.6719 0.4881 0.168 0.612 0.000 0.132 0.088
#> SRR1974577 2 0.5330 0.3843 0.424 0.532 0.000 0.008 0.036
#> SRR1974579 2 0.4242 0.4965 0.136 0.796 0.000 0.032 0.036
#> SRR1974576 2 0.2746 0.4500 0.112 0.872 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974575 2 0.2746 0.4415 0.112 0.872 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974574 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974573 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974571 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974572 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974570 1 0.1965 0.8579 0.904 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.2457 0.8578 0.900 0.076 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974567 1 0.0671 0.9054 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974566 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974569 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974565 2 0.4999 0.5078 0.148 0.748 0.000 0.040 0.064
#> SRR1974564 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974560 1 0.0510 0.9056 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.5439 0.5040 0.680 0.228 0.000 0.028 0.064
#> SRR1974563 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974562 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974561 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974557 2 0.6154 0.5145 0.132 0.664 0.000 0.140 0.064
#> SRR1974553 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974555 1 0.1041 0.8906 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974551 2 0.6607 0.4363 0.372 0.488 0.000 0.028 0.112
#> SRR1974552 5 0.4907 0.9335 0.024 0.484 0.000 0.000 0.492
#> SRR1974554 1 0.0404 0.9069 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0290 0.9077 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0162 0.9076 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.1410 0.8828 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974548 2 0.3170 0.4733 0.120 0.852 0.000 0.012 0.016
#> SRR1974547 1 0.3669 0.7352 0.800 0.176 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974546 1 0.0963 0.8997 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.4826 -0.9108 0.020 0.508 0.000 0.000 0.472
#> SRR1974544 1 0.1851 0.8656 0.912 0.088 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 5 0.4653 0.9932 0.012 0.472 0.000 0.000 0.516
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0260 0.62386 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975008 5 0.3868 0.12408 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1975006 3 0.3864 -0.09038 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1975005 3 0.3868 -0.10832 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1975004 3 0.2219 0.57781 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1975003 5 0.3857 0.23375 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1975001 5 0.3659 0.42178 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1975002 5 0.3489 0.43048 0.000 0.004 0.288 0.000 0.708 0.000
#> SRR1974999 5 0.3828 0.31373 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1975000 3 0.2711 0.58030 0.008 0.036 0.872 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974998 3 0.0713 0.62578 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974997 2 0.7454 0.43042 0.292 0.396 0.032 0.008 0.236 0.036
#> SRR1974995 3 0.3862 -0.03767 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1974996 3 0.0458 0.62555 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974994 3 0.4355 0.33660 0.128 0.068 0.764 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974993 3 0.3864 -0.05809 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974992 3 0.3851 0.02961 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974990 3 0.0547 0.60981 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974989 2 0.6171 0.52195 0.036 0.572 0.000 0.104 0.268 0.020
#> SRR1974991 3 0.3857 -0.00306 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974986 3 0.1141 0.62230 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974987 3 0.3868 -0.12822 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1974988 5 0.7845 -0.39012 0.156 0.344 0.084 0.012 0.368 0.036
#> SRR1974984 3 0.3862 -0.04695 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1974985 3 0.0790 0.62092 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974983 5 0.3838 0.29739 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974982 3 0.1141 0.62401 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974981 3 0.1010 0.59452 0.004 0.000 0.960 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974980 3 0.1007 0.62600 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974979 5 0.3868 0.14107 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1974978 3 0.0260 0.62142 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974977 3 0.0260 0.62139 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974976 5 0.3862 0.20467 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1974975 3 0.3864 -0.06291 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974974 5 0.3867 0.15825 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1974973 5 0.3634 0.42554 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1974972 3 0.3843 0.05468 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1974971 5 0.5443 0.31606 0.036 0.048 0.408 0.000 0.508 0.000
#> SRR1974970 3 0.3672 0.27756 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1974969 3 0.3747 0.19897 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1974968 5 0.3867 0.16165 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1974967 3 0.3198 0.46460 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974965 3 0.0363 0.62298 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974966 3 0.3823 0.10087 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974964 3 0.3860 -0.01728 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974963 3 0.3774 0.17645 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1974961 3 0.3866 -0.07126 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974962 5 0.4118 0.42828 0.000 0.028 0.312 0.000 0.660 0.000
#> SRR1974960 3 0.0547 0.62537 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974959 3 0.2491 0.56319 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974958 3 0.3851 0.02234 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974957 3 0.3847 0.03828 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974956 3 0.3833 0.07498 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974955 3 0.1010 0.59487 0.004 0.000 0.960 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974954 3 0.3531 0.35814 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974953 5 0.3769 0.42939 0.000 0.004 0.356 0.000 0.640 0.000
#> SRR1974952 3 0.3804 0.12992 0.000 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974949 3 0.3851 0.02406 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974950 3 0.3866 -0.06909 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974951 3 0.3868 -0.11252 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1974947 3 0.3866 -0.07354 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974948 5 0.3547 0.43634 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1974946 5 0.4907 0.37652 0.024 0.064 0.244 0.000 0.668 0.000
#> SRR1974945 3 0.1765 0.60462 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974944 3 0.0937 0.59203 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974942 3 0.1370 0.58202 0.004 0.012 0.948 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974943 3 0.3647 0.27891 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1974941 3 0.0363 0.61498 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974940 3 0.1075 0.62340 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974939 3 0.4976 -0.07314 0.020 0.032 0.520 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974938 3 0.3823 0.10086 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974937 3 0.0632 0.62103 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974936 3 0.0790 0.60017 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974935 3 0.0260 0.62377 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974934 5 0.3797 0.35264 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974933 3 0.3860 -0.02030 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974932 3 0.1501 0.61466 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974931 3 0.1850 0.58745 0.008 0.016 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974930 3 0.0790 0.60056 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974929 3 0.0146 0.61952 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974928 5 0.3857 0.24073 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1974927 3 0.2730 0.53833 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974924 3 0.1010 0.59290 0.000 0.004 0.960 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974925 3 0.0363 0.62312 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974926 2 0.7769 0.32643 0.116 0.388 0.244 0.012 0.232 0.008
#> SRR1974923 3 0.1265 0.61890 0.000 0.008 0.948 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974922 3 0.3198 0.45884 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974921 3 0.0790 0.62558 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974920 3 0.0458 0.61252 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974919 3 0.1327 0.61846 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974918 3 0.0865 0.62550 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974917 5 0.3847 0.27048 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1974916 3 0.0260 0.61740 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974915 3 0.2135 0.59179 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974914 2 0.7005 0.49999 0.108 0.452 0.004 0.044 0.352 0.040
#> SRR1974913 3 0.0790 0.62559 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974911 3 0.0858 0.60273 0.004 0.000 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.62115 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 5 0.3828 0.31263 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974909 3 0.3126 0.47698 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1974906 3 0.3995 -0.09637 0.004 0.000 0.516 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974907 3 0.3592 0.32313 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1974905 3 0.0146 0.62262 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974904 3 0.3854 0.00635 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1974903 3 0.2912 0.51860 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1974902 3 0.3857 -0.01400 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974901 3 0.2941 0.51087 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1974898 5 0.3751 0.37671 0.012 0.012 0.184 0.004 0.780 0.008
#> SRR1974900 5 0.5952 0.27030 0.008 0.160 0.148 0.016 0.640 0.028
#> SRR1974899 5 0.3714 0.43715 0.000 0.004 0.340 0.000 0.656 0.000
#> SRR1974897 5 0.3727 0.39687 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1974896 2 0.7290 0.46952 0.100 0.416 0.024 0.028 0.380 0.052
#> SRR1974893 5 0.3868 0.12212 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1974895 5 0.4028 0.43335 0.000 0.024 0.308 0.000 0.668 0.000
#> SRR1974894 5 0.7389 -0.38463 0.112 0.356 0.056 0.016 0.424 0.036
#> SRR1974892 2 0.7346 0.48533 0.132 0.432 0.024 0.032 0.344 0.036
#> SRR1974890 2 0.6492 0.50722 0.064 0.476 0.000 0.044 0.376 0.040
#> SRR1974891 5 0.7359 -0.42921 0.112 0.380 0.052 0.016 0.404 0.036
#> SRR1974889 5 0.3774 0.43946 0.000 0.008 0.328 0.000 0.664 0.000
#> SRR1974888 5 0.7472 -0.36958 0.112 0.352 0.064 0.016 0.420 0.036
#> SRR1974886 2 0.6719 0.51192 0.032 0.552 0.000 0.132 0.228 0.056
#> SRR1974887 2 0.5438 0.53406 0.036 0.644 0.000 0.048 0.252 0.020
#> SRR1974885 2 0.5570 0.52488 0.032 0.636 0.000 0.064 0.248 0.020
#> SRR1974883 2 0.7367 0.46357 0.120 0.412 0.044 0.016 0.368 0.040
#> SRR1974884 5 0.3810 0.33911 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1974881 2 0.6754 0.51513 0.076 0.468 0.000 0.044 0.360 0.052
#> SRR1974882 2 0.6487 0.51427 0.064 0.480 0.000 0.044 0.372 0.040
#> SRR1974880 2 0.7164 0.55233 0.068 0.504 0.000 0.036 0.172 0.220
#> SRR1974879 5 0.7322 -0.13509 0.084 0.280 0.088 0.016 0.496 0.036
#> SRR1974877 5 0.4117 0.41495 0.016 0.020 0.256 0.000 0.708 0.000
#> SRR1974876 2 0.7593 0.46420 0.136 0.396 0.060 0.016 0.356 0.036
#> SRR1974878 2 0.7316 0.45910 0.120 0.412 0.044 0.016 0.372 0.036
#> SRR1974875 2 0.5694 0.53754 0.052 0.612 0.000 0.048 0.272 0.016
#> SRR1974874 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0632 0.92977 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.4052 0.65573 0.708 0.260 0.012 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974869 1 0.4359 0.50740 0.652 0.312 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974868 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974870 1 0.4368 0.52235 0.640 0.328 0.012 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974866 1 0.3424 0.74004 0.772 0.204 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974867 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974865 4 0.1888 0.87940 0.004 0.068 0.000 0.916 0.012 0.000
#> SRR1974864 1 0.1462 0.87407 0.936 0.056 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974862 4 0.1888 0.87954 0.004 0.068 0.000 0.916 0.012 0.000
#> SRR1974863 4 0.2408 0.83585 0.004 0.108 0.000 0.876 0.012 0.000
#> SRR1974860 2 0.6489 0.50060 0.088 0.464 0.000 0.000 0.096 0.352
#> SRR1974861 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974859 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.5161 0.19982 0.016 0.376 0.000 0.564 0.020 0.024
#> SRR1974856 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.4169 0.58750 0.012 0.236 0.000 0.724 0.016 0.012
#> SRR1974855 2 0.5259 0.61263 0.188 0.676 0.000 0.000 0.056 0.080
#> SRR1974854 2 0.5065 0.31957 0.356 0.576 0.000 0.008 0.056 0.004
#> SRR1974853 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.5179 0.48824 0.080 0.624 0.000 0.004 0.012 0.280
#> SRR1974852 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974848 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.5184 0.58970 0.084 0.732 0.000 0.044 0.036 0.104
#> SRR1974846 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0508 0.88812 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974845 6 0.0260 0.93508 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974844 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1594 0.87340 0.932 0.052 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974842 1 0.1908 0.83427 0.900 0.096 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974841 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0820 0.92879 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012 0.000
#> SRR1974839 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.4466 0.47637 0.620 0.336 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.4221 0.61597 0.172 0.756 0.000 0.004 0.016 0.052
#> SRR1974831 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0146 0.88978 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 2 0.5220 0.52074 0.252 0.636 0.000 0.004 0.012 0.096
#> SRR1974828 2 0.5065 0.22787 0.404 0.532 0.000 0.004 0.056 0.004
#> SRR1974826 2 0.6362 0.57672 0.128 0.552 0.000 0.000 0.084 0.236
#> SRR1974827 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974825 1 0.0363 0.88847 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 2 0.4483 0.50465 0.288 0.664 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1974823 1 0.3668 0.67813 0.728 0.256 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974820 1 0.0260 0.88935 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0458 0.88566 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0547 0.88386 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.3751 0.60526 0.172 0.784 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1974815 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0260 0.88805 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.3210 0.58167 0.052 0.864 0.000 0.040 0.016 0.028
#> SRR1974812 2 0.5895 0.41244 0.172 0.552 0.000 0.004 0.012 0.260
#> SRR1974810 2 0.4102 0.58734 0.188 0.752 0.000 0.004 0.048 0.008
#> SRR1974808 1 0.3457 0.70705 0.752 0.232 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974811 2 0.4691 0.09224 0.464 0.504 0.000 0.004 0.020 0.008
#> SRR1974809 1 0.0508 0.88812 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974807 1 0.3154 0.75589 0.800 0.184 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.0260 0.88935 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 2 0.2952 0.58124 0.092 0.864 0.000 0.008 0.016 0.020
#> SRR1974803 2 0.4272 0.56777 0.140 0.768 0.000 0.024 0.064 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2664 0.81584 0.848 0.136 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974799 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.6576 0.49975 0.080 0.464 0.000 0.004 0.100 0.352
#> SRR1974797 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974796 6 0.3539 0.55790 0.024 0.220 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1974795 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.1588 0.85654 0.924 0.072 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974794 2 0.6441 0.50363 0.080 0.472 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974792 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974791 6 0.0260 0.93566 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974790 6 0.0146 0.93761 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974789 2 0.6441 0.50363 0.080 0.472 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974788 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974786 1 0.3134 0.78298 0.808 0.168 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974787 1 0.2362 0.82704 0.860 0.136 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974784 2 0.5160 0.25730 0.072 0.476 0.000 0.000 0.004 0.448
#> SRR1974783 1 0.0405 0.89026 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974785 1 0.2165 0.84402 0.884 0.108 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.6081 0.45213 0.072 0.452 0.000 0.000 0.064 0.412
#> SRR1974780 1 0.4780 0.26985 0.564 0.392 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1974779 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.3073 0.79172 0.816 0.164 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974778 1 0.0891 0.88495 0.968 0.024 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974774 2 0.6506 0.50744 0.096 0.472 0.000 0.000 0.092 0.340
#> SRR1974773 1 0.0363 0.88847 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0363 0.88847 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 2 0.4169 0.54902 0.096 0.788 0.000 0.032 0.080 0.004
#> SRR1974771 2 0.5668 0.59333 0.100 0.640 0.000 0.000 0.068 0.192
#> SRR1974770 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974769 6 0.1501 0.86802 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1974768 2 0.6480 0.50680 0.084 0.468 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974767 1 0.3168 0.77997 0.804 0.172 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974766 2 0.6230 0.57588 0.108 0.568 0.000 0.000 0.088 0.236
#> SRR1974765 6 0.0547 0.92304 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974764 2 0.6422 0.51722 0.084 0.484 0.000 0.000 0.096 0.336
#> SRR1974763 1 0.1204 0.87288 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0260 0.89031 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.6402 0.53122 0.084 0.504 0.000 0.000 0.100 0.312
#> SRR1974760 6 0.0458 0.92725 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974759 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.6418 0.51191 0.080 0.484 0.000 0.000 0.100 0.336
#> SRR1974757 6 0.5257 0.01504 0.044 0.344 0.000 0.000 0.036 0.576
#> SRR1974756 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0146 0.94165 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.6486 0.50293 0.084 0.464 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974753 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0260 0.93986 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974749 2 0.5021 0.61949 0.124 0.712 0.000 0.000 0.052 0.112
#> SRR1974747 2 0.4684 0.52674 0.084 0.760 0.000 0.064 0.084 0.008
#> SRR1974748 1 0.1524 0.87192 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974746 2 0.4450 0.53742 0.084 0.776 0.000 0.048 0.084 0.008
#> SRR1974744 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 2 0.4511 0.53521 0.084 0.772 0.000 0.052 0.084 0.008
#> SRR1974740 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0146 0.94134 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 2 0.4390 0.53833 0.088 0.776 0.000 0.048 0.084 0.004
#> SRR1974734 2 0.5610 0.56870 0.076 0.704 0.000 0.072 0.044 0.104
#> SRR1974733 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.5396 0.40326 0.040 0.648 0.000 0.232 0.076 0.004
#> SRR1974731 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 2 0.4390 0.53833 0.088 0.776 0.000 0.048 0.084 0.004
#> SRR1974730 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 2 0.4716 0.54689 0.084 0.768 0.000 0.064 0.060 0.024
#> SRR1974726 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 2 0.4367 0.54634 0.128 0.764 0.000 0.024 0.080 0.004
#> SRR1974727 2 0.5646 0.55015 0.276 0.596 0.000 0.000 0.048 0.080
#> SRR1974723 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1644 0.88969 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.4542 0.50390 0.024 0.332 0.000 0.628 0.016 0.000
#> SRR1974719 2 0.4301 0.58638 0.176 0.752 0.000 0.008 0.048 0.016
#> SRR1974718 1 0.1285 0.87463 0.944 0.052 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 2 0.4704 0.50887 0.300 0.648 0.000 0.004 0.028 0.020
#> SRR1974717 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.1007 0.87096 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0972 0.88640 0.964 0.028 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974711 1 0.4479 0.45711 0.624 0.336 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974712 1 0.0260 0.88935 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974708 1 0.4186 0.53297 0.656 0.312 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974710 1 0.4020 0.65798 0.716 0.252 0.004 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974707 1 0.2311 0.84441 0.880 0.104 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974706 2 0.4468 0.53690 0.100 0.768 0.000 0.044 0.084 0.004
#> SRR1974704 1 0.1444 0.85339 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0508 0.88829 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.3930 0.70720 0.744 0.216 0.012 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974701 4 0.0146 0.94134 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 2 0.4438 0.53708 0.092 0.772 0.000 0.048 0.084 0.004
#> SRR1974697 2 0.4390 0.53833 0.088 0.776 0.000 0.048 0.084 0.004
#> SRR1974696 2 0.5596 0.40671 0.044 0.616 0.000 0.280 0.032 0.028
#> SRR1974694 2 0.4628 0.52964 0.084 0.764 0.000 0.060 0.084 0.008
#> SRR1974695 2 0.4657 0.13931 0.456 0.508 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1974693 4 0.0146 0.94139 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.6149 -0.42234 0.056 0.424 0.000 0.000 0.088 0.432
#> SRR1974691 2 0.4570 0.53249 0.084 0.768 0.000 0.056 0.084 0.008
#> SRR1974689 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 2 0.4511 0.53521 0.084 0.772 0.000 0.052 0.084 0.008
#> SRR1974686 1 0.4872 0.39919 0.596 0.336 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1974685 2 0.4628 0.52964 0.084 0.764 0.000 0.060 0.084 0.008
#> SRR1974684 1 0.0260 0.88708 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.4979 0.52148 0.084 0.744 0.000 0.076 0.080 0.016
#> SRR1974682 4 0.5388 0.25186 0.028 0.424 0.000 0.496 0.052 0.000
#> SRR1974681 1 0.0291 0.88915 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974679 4 0.2070 0.87008 0.000 0.092 0.000 0.896 0.012 0.000
#> SRR1974680 1 0.2668 0.79690 0.828 0.168 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974678 4 0.0972 0.92291 0.000 0.028 0.000 0.964 0.008 0.000
#> SRR1974677 1 0.0146 0.89004 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974675 5 0.3937 0.34706 0.000 0.004 0.424 0.000 0.572 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.5582 -0.04763 0.468 0.448 0.020 0.000 0.052 0.012
#> SRR1974671 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974672 4 0.2794 0.78367 0.004 0.144 0.000 0.840 0.012 0.000
#> SRR1974670 4 0.1563 0.89078 0.000 0.056 0.000 0.932 0.012 0.000
#> SRR1974669 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974667 2 0.6441 0.50329 0.080 0.472 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974668 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974666 2 0.6441 0.50473 0.080 0.472 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974664 4 0.4152 0.57005 0.004 0.268 0.000 0.700 0.016 0.012
#> SRR1974665 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974663 1 0.3202 0.77597 0.800 0.176 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974662 1 0.0291 0.88915 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974661 1 0.4332 0.41439 0.616 0.352 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974660 1 0.0405 0.89040 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974659 1 0.0146 0.88881 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0603 0.88760 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974654 1 0.0458 0.88748 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.2350 0.83834 0.880 0.100 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974656 1 0.1700 0.86187 0.916 0.080 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974650 2 0.5157 0.25805 0.420 0.516 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR1974651 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.2790 0.81163 0.840 0.140 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 2 0.4875 0.55452 0.160 0.720 0.000 0.036 0.080 0.004
#> SRR1974646 1 0.4493 0.51372 0.644 0.312 0.008 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974649 1 0.1867 0.86182 0.916 0.064 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.6441 0.50501 0.080 0.472 0.000 0.000 0.100 0.348
#> SRR1974643 1 0.0363 0.88693 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.3758 0.67900 0.740 0.232 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974640 1 0.1701 0.86820 0.920 0.072 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974641 4 0.1225 0.90942 0.000 0.036 0.000 0.952 0.012 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0603 0.88698 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974635 1 0.0146 0.88965 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.3017 0.79234 0.816 0.164 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974634 1 0.0713 0.87932 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0146 0.94147 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0858 0.88703 0.968 0.028 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974632 1 0.0458 0.88557 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.1074 0.88599 0.960 0.028 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974630 1 0.0692 0.88804 0.976 0.020 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974629 1 0.1327 0.85878 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.88994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0260 0.88929 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974625 2 0.6661 0.50888 0.096 0.460 0.000 0.000 0.112 0.332
#> SRR1974623 1 0.3345 0.74293 0.776 0.204 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974622 1 0.0508 0.89049 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974620 1 0.2950 0.79905 0.828 0.148 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974619 2 0.3663 0.61000 0.156 0.792 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1974621 1 0.1320 0.87750 0.948 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974617 1 0.0291 0.88915 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974616 2 0.4924 0.55663 0.216 0.680 0.000 0.004 0.012 0.088
#> SRR1974615 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974618 1 0.2053 0.83076 0.888 0.108 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974614 1 0.3202 0.77463 0.800 0.176 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974613 1 0.1462 0.87522 0.936 0.056 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974612 1 0.0291 0.89040 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974611 1 0.3886 0.63430 0.708 0.264 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0146 0.89007 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974608 2 0.4870 0.52880 0.084 0.752 0.000 0.064 0.084 0.016
#> SRR1974607 1 0.2624 0.81990 0.856 0.124 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974606 2 0.6486 0.50323 0.084 0.464 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974605 2 0.4791 0.53801 0.084 0.760 0.000 0.056 0.080 0.020
#> SRR1974604 4 0.0000 0.94338 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.4804 0.18294 0.540 0.416 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1974602 1 0.0458 0.88467 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.6249 0.51211 0.088 0.492 0.000 0.000 0.072 0.348
#> SRR1974601 2 0.5345 0.34583 0.384 0.536 0.000 0.000 0.048 0.032
#> SRR1974599 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974598 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974596 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974594 2 0.4436 0.59517 0.068 0.760 0.000 0.008 0.024 0.140
#> SRR1974593 2 0.6401 0.51235 0.084 0.480 0.000 0.000 0.092 0.344
#> SRR1974595 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974591 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974588 2 0.4269 0.59593 0.080 0.760 0.000 0.004 0.012 0.144
#> SRR1974590 2 0.6346 0.49899 0.080 0.476 0.000 0.000 0.088 0.356
#> SRR1974589 2 0.5384 0.58324 0.080 0.660 0.000 0.004 0.044 0.212
#> SRR1974587 2 0.6069 0.52950 0.064 0.536 0.000 0.000 0.088 0.312
#> SRR1974586 2 0.6383 0.50176 0.080 0.472 0.000 0.000 0.092 0.356
#> SRR1974585 2 0.4089 0.59329 0.072 0.776 0.000 0.004 0.012 0.136
#> SRR1974584 1 0.1124 0.88212 0.956 0.036 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974583 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974582 2 0.6412 0.50103 0.080 0.472 0.000 0.000 0.096 0.352
#> SRR1974581 2 0.6447 0.50065 0.080 0.468 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974580 2 0.6114 0.55618 0.080 0.568 0.000 0.004 0.076 0.272
#> SRR1974578 2 0.4325 0.59166 0.088 0.784 0.000 0.020 0.020 0.088
#> SRR1974577 2 0.5276 0.54158 0.284 0.620 0.000 0.000 0.048 0.048
#> SRR1974579 2 0.4654 0.59418 0.080 0.720 0.000 0.000 0.024 0.176
#> SRR1974576 2 0.6369 0.50661 0.080 0.480 0.000 0.000 0.092 0.348
#> SRR1974575 2 0.6486 0.50293 0.084 0.464 0.000 0.000 0.100 0.352
#> SRR1974574 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974572 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.2912 0.77176 0.816 0.172 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974568 1 0.3130 0.78571 0.808 0.176 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1974567 1 0.0777 0.88668 0.972 0.024 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974566 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.4270 0.59451 0.076 0.764 0.000 0.004 0.016 0.140
#> SRR1974564 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.1219 0.87869 0.948 0.048 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974559 1 0.4536 0.13613 0.512 0.464 0.000 0.004 0.012 0.008
#> SRR1974563 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.5357 0.60330 0.072 0.724 0.000 0.096 0.040 0.068
#> SRR1974553 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.1625 0.85852 0.928 0.060 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974551 2 0.5217 0.53101 0.236 0.644 0.000 0.004 0.012 0.104
#> SRR1974552 6 0.1010 0.90795 0.004 0.036 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974554 1 0.1152 0.88108 0.952 0.044 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974558 1 0.0363 0.88879 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0632 0.88502 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.2907 0.80306 0.828 0.152 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974549 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.5806 0.55442 0.080 0.584 0.000 0.000 0.060 0.276
#> SRR1974547 1 0.3398 0.69973 0.740 0.252 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974546 1 0.1958 0.84900 0.896 0.100 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974545 6 0.1267 0.87451 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974544 1 0.2631 0.81696 0.840 0.152 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974543 6 0.0000 0.94151 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.977 0.990 0.4769 0.525 0.525
#> 3 3 0.757 0.953 0.940 0.3690 0.777 0.588
#> 4 4 1.000 0.966 0.980 0.1161 0.918 0.763
#> 5 5 0.856 0.774 0.869 0.0507 0.983 0.938
#> 6 6 0.828 0.766 0.847 0.0413 0.915 0.688
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975008 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975006 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975005 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975004 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975003 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975001 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975002 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974999 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1975000 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974998 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974997 1 0.1184 0.975 0.984 0.016
#> SRR1974995 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974996 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974992 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974990 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974991 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974986 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974987 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974984 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974985 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974983 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974979 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974976 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974975 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974974 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974973 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974972 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974971 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974970 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974969 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974968 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974967 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974965 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974966 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974964 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974963 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974961 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974962 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974960 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974959 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974958 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974957 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974956 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974953 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974952 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974949 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974950 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974951 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974947 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974948 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974946 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974945 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974943 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974939 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974938 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974937 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974934 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974933 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974932 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974931 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974928 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974927 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974922 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974921 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974917 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.2423 0.952 0.040 0.960
#> SRR1974913 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974908 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974906 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974907 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974905 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974904 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974902 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974901 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974898 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974900 1 0.3733 0.919 0.928 0.072
#> SRR1974899 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974897 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1974893 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974895 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974894 1 0.7056 0.768 0.808 0.192
#> SRR1974892 2 0.9963 0.128 0.464 0.536
#> SRR1974890 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974891 1 0.8016 0.684 0.756 0.244
#> SRR1974889 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974888 1 0.0938 0.979 0.988 0.012
#> SRR1974886 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974883 1 0.9129 0.521 0.672 0.328
#> SRR1974884 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974879 1 0.5408 0.859 0.876 0.124
#> SRR1974877 1 0.0376 0.986 0.996 0.004
#> SRR1974876 1 0.6973 0.771 0.812 0.188
#> SRR1974878 1 0.9460 0.438 0.636 0.364
#> SRR1974875 2 0.1633 0.968 0.024 0.976
#> SRR1974874 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974869 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974870 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.4298 0.902 0.912 0.088
#> SRR1974828 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.9922 0.178 0.448 0.552
#> SRR1974815 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974812 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974810 1 0.1184 0.975 0.984 0.016
#> SRR1974808 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.3274 0.932 0.940 0.060
#> SRR1974809 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974804 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974803 1 0.3879 0.915 0.924 0.076
#> SRR1974801 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974780 1 0.2423 0.953 0.960 0.040
#> SRR1974779 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.2236 0.956 0.964 0.036
#> SRR1974771 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974747 2 0.2043 0.960 0.032 0.968
#> SRR1974748 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.8813 0.580 0.700 0.300
#> SRR1974740 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.3584 0.922 0.068 0.932
#> SRR1974733 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974732 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974725 2 0.5408 0.855 0.124 0.876
#> SRR1974726 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.5294 0.865 0.880 0.120
#> SRR1974718 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0672 0.982 0.992 0.008
#> SRR1974717 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974701 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.8443 0.635 0.728 0.272
#> SRR1974695 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.6887 0.779 0.816 0.184
#> SRR1974689 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.4022 0.911 0.920 0.080
#> SRR1974686 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974685 2 0.7528 0.724 0.216 0.784
#> SRR1974684 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974675 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974623 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.5629 0.850 0.868 0.132
#> SRR1974621 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974605 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974601 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1974579 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974551 2 0.6712 0.786 0.176 0.824
#> SRR1974552 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0237 0.9798 0.004 0.000 0.996
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.1289 0.9503 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.2959 0.8814 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.1031 0.9592 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.1620 0.9453 0.024 0.964 0.012
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0237 0.9798 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.1031 0.9591 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.1015 0.9711 0.012 0.008 0.980
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.3340 0.8556 0.000 0.120 0.880
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0424 0.9761 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974900 3 0.1289 0.9525 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.3983 0.8313 0.004 0.144 0.852
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 3 0.2878 0.8858 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974892 3 0.3192 0.8660 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974890 3 0.4235 0.7970 0.000 0.176 0.824
#> SRR1974891 3 0.2796 0.8905 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.1163 0.9566 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974886 2 0.0892 0.9490 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974887 2 0.6432 0.2077 0.004 0.568 0.428
#> SRR1974885 2 0.6420 0.5706 0.024 0.688 0.288
#> SRR1974883 3 0.2772 0.9010 0.004 0.080 0.916
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.6912 0.4442 0.028 0.628 0.344
#> SRR1974882 3 0.4733 0.7665 0.004 0.196 0.800
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974879 3 0.2711 0.8953 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974877 3 0.0237 0.9799 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974876 3 0.2625 0.8997 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974878 3 0.3267 0.8610 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974875 3 0.3116 0.8728 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974874 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974873 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974871 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974872 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974869 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974866 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974867 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974865 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974864 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974862 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974863 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974860 2 0.0424 0.9504 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974859 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974858 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974856 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974857 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974853 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974851 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974848 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974850 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974847 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974843 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974842 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974841 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974840 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974837 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974835 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974830 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974829 1 0.3340 0.8471 0.880 0.120 0.000
#> SRR1974828 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974825 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974822 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974823 1 0.3500 0.9776 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974820 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974818 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974819 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974817 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974816 1 0.7091 0.6833 0.688 0.248 0.064
#> SRR1974815 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974813 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974814 2 0.3116 0.9338 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974812 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.3267 0.9778 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974808 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974811 1 0.3933 0.9530 0.880 0.028 0.092
#> SRR1974809 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974807 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974806 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.3573 0.9778 0.876 0.004 0.120
#> SRR1974801 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974800 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974799 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974798 2 0.1411 0.9465 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0592 0.9499 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974787 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974785 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974782 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 1 0.3695 0.9697 0.880 0.012 0.108
#> SRR1974779 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974777 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974776 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974778 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974775 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974772 1 0.3500 0.9776 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974762 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974758 2 0.0592 0.9500 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974754 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974755 2 0.0592 0.9499 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974753 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974751 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974750 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974752 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974749 2 0.1289 0.9473 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974747 1 0.1753 0.8146 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974748 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974746 1 0.2959 0.9626 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974744 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974745 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974743 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974742 1 0.0237 0.8552 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974740 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974739 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974741 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974738 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974737 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974736 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974735 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974734 1 0.6111 0.0461 0.604 0.396 0.000
#> SRR1974733 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974732 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974731 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974729 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974730 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974728 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974725 1 0.2959 0.7548 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974726 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974724 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974727 1 0.1860 0.9137 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974723 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974722 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974721 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974720 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974719 1 0.1643 0.9057 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974718 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974716 1 0.3267 0.9778 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974717 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974715 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974713 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974714 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974711 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974712 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974709 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974708 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974710 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974707 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974706 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974704 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974705 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974703 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974702 1 0.3619 0.9653 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974701 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974699 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974698 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974700 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974697 1 0.3682 0.9713 0.876 0.008 0.116
#> SRR1974696 2 0.3752 0.9162 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.8584 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974693 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974692 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0237 0.8628 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974689 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974688 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974687 1 0.1289 0.8930 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974686 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974685 1 0.0000 0.8584 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974683 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974682 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974681 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974679 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974680 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974678 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974677 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974676 2 0.0237 0.9508 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9836 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974673 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974670 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974662 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974661 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974660 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974659 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974658 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974657 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974654 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974655 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974656 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974650 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974651 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974652 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974653 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974648 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974646 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974649 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974647 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974645 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974642 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974640 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974641 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974639 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974638 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974635 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974636 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974634 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974637 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974633 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974632 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974631 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974630 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974629 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974628 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974627 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974624 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974625 2 0.3192 0.9331 0.112 0.888 0.000
#> SRR1974623 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974622 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974620 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974619 1 0.0892 0.8800 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974621 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974617 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974616 2 0.1411 0.9279 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974615 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974618 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974614 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974613 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974612 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974611 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974610 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974609 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974608 1 0.3267 0.7320 0.884 0.116 0.000
#> SRR1974607 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 2 0.6280 0.4178 0.460 0.540 0.000
#> SRR1974604 2 0.3340 0.9314 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974603 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974602 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.2537 0.9427 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.2711 0.9376 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974577 2 0.2625 0.8842 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974568 1 0.3500 0.9777 0.880 0.004 0.116
#> SRR1974567 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974559 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.3267 0.9323 0.116 0.884 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974551 1 0.4399 0.7774 0.812 0.188 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974558 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974556 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974550 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.3769 0.9657 0.880 0.016 0.104
#> SRR1974546 1 0.3340 0.9813 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974545 2 0.1411 0.9277 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974544 1 0.3607 0.9737 0.880 0.008 0.112
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9512 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.1004 0.968 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR1975003 3 0.0921 0.968 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1975001 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.2124 0.926 0.040 0.000 0.932 0.028
#> SRR1974998 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974997 3 0.1211 0.950 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0336 0.982 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974994 3 0.0779 0.969 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1974993 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.7031 0.423 0.000 0.140 0.324 0.536
#> SRR1974991 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0376 0.982 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974980 3 0.0469 0.980 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974979 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974976 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.1211 0.943 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974952 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0469 0.975 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974943 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974929 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974920 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0188 0.984 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0188 0.985 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974908 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.1474 0.937 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.3975 0.691 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1974891 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974886 4 0.4905 0.475 0.000 0.364 0.004 0.632
#> SRR1974887 3 0.4134 0.655 0.000 0.260 0.740 0.000
#> SRR1974885 3 0.5650 0.642 0.000 0.104 0.716 0.180
#> SRR1974883 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.6036 0.500 0.000 0.292 0.636 0.072
#> SRR1974882 3 0.2760 0.851 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1974880 2 0.4549 0.717 0.000 0.776 0.036 0.188
#> SRR1974879 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0336 0.982 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974876 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974878 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0188 0.984 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974874 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974873 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974871 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974872 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974869 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974868 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.1022 0.969 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974866 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974867 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974865 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974864 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974863 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974860 2 0.0921 0.956 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974861 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974858 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974856 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974857 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974855 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.3942 0.674 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1974846 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974847 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974843 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974839 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974837 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974830 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 2 0.4356 0.580 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1109 0.956 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1974827 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0188 0.987 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3668 0.769 0.808 0.188 0.000 0.004
#> SRR1974815 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974814 4 0.3400 0.813 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1974812 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974808 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974811 1 0.0707 0.973 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974803 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3219 0.792 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1974797 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974794 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.1792 0.915 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974788 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974787 1 0.0817 0.975 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974784 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974781 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974780 1 0.0469 0.981 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974778 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974775 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0188 0.987 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974770 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974766 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974765 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974764 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974763 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974761 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1557 0.928 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974757 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974754 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974755 2 0.1792 0.915 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974753 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974751 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974750 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974752 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.6752 0.412 0.280 0.588 0.000 0.132
#> SRR1974747 4 0.4253 0.720 0.208 0.016 0.000 0.776
#> SRR1974748 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974744 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974745 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974743 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974742 1 0.3266 0.804 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974740 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974739 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974741 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974738 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974737 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974736 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974735 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974734 4 0.1182 0.952 0.016 0.016 0.000 0.968
#> SRR1974733 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974732 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974731 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974729 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974730 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974725 4 0.0592 0.956 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974726 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974724 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974727 1 0.0707 0.976 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974723 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974722 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974721 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974720 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974719 1 0.0336 0.985 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974718 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0336 0.986 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974717 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974715 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974713 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974714 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974711 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974709 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0592 0.981 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974710 1 0.0707 0.978 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974707 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974705 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974702 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974701 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974699 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974698 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974700 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974697 1 0.2149 0.905 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974696 4 0.0707 0.960 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974694 1 0.4134 0.659 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974695 1 0.1022 0.969 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974693 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974692 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974690 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.2714 0.873 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR1974689 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974688 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974687 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974686 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.4804 0.392 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974684 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974682 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974681 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974680 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974677 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1118 0.948 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974675 3 0.0000 0.987 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974671 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974670 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974669 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 4 0.1022 0.970 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974665 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974660 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974650 1 0.0469 0.985 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974651 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974652 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974648 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974646 1 0.1022 0.969 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974649 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974645 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974642 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974640 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974641 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974639 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974638 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974634 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974637 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974633 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974631 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0336 0.986 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974628 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 4 0.1389 0.963 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974623 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974622 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974619 1 0.0336 0.985 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974621 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.0188 0.975 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974614 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0921 0.972 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974610 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974609 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.1151 0.962 0.008 0.024 0.000 0.968
#> SRR1974607 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 4 0.1975 0.920 0.048 0.016 0.000 0.936
#> SRR1974604 4 0.1118 0.974 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974603 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974601 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974599 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0921 0.956 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974595 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974590 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974586 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974585 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974582 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974578 4 0.4981 0.182 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1974577 2 0.0921 0.948 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0188 0.988 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974563 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974557 4 0.1302 0.967 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974553 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 2 0.1022 0.941 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0707 0.978 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974549 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0188 0.977 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974547 1 0.1209 0.959 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1974546 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0707 0.963 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974544 1 0.0000 0.990 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.980 0.000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.2563 0.8688 0.008 0.000 0.872 0.000 0.120
#> SRR1975003 3 0.2773 0.8290 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1975001 3 0.0451 0.9623 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.3146 0.8377 0.028 0.000 0.844 0.000 0.128
#> SRR1974998 3 0.0162 0.9671 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974997 3 0.1908 0.8896 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.1043 0.9440 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974996 3 0.1121 0.9413 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974994 3 0.2927 0.8403 0.040 0.000 0.868 0.000 0.092
#> SRR1974993 3 0.0162 0.9669 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.5932 0.1523 0.000 0.440 0.104 0.456 0.000
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0290 0.9644 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0162 0.9669 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.1331 0.9378 0.008 0.000 0.952 0.000 0.040
#> SRR1974980 3 0.1043 0.9443 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0162 0.9672 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.1704 0.8906 0.068 0.000 0.928 0.000 0.004
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0162 0.9669 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0880 0.9472 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.1074 0.9466 0.016 0.012 0.968 0.000 0.004
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0162 0.9669 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.0609 0.9580 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0162 0.9669 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0162 0.9671 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974929 3 0.0162 0.9672 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0162 0.9671 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0609 0.9580 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0162 0.9672 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974917 3 0.0162 0.9672 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3661 0.6491 0.000 0.276 0.724 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0451 0.9613 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.3999 0.5288 0.000 0.344 0.656 0.000 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.2813 0.7992 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0404 0.9612 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974890 2 0.4307 -0.1617 0.000 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.1121 0.9352 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.4256 0.0430 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974887 2 0.4307 -0.1731 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.6062 0.1614 0.000 0.416 0.464 0.120 0.000
#> SRR1974883 3 0.0609 0.9554 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.4818 -0.0629 0.000 0.520 0.460 0.020 0.000
#> SRR1974882 3 0.4297 0.2446 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1974880 2 0.4147 0.3666 0.000 0.776 0.048 0.172 0.004
#> SRR1974879 3 0.2561 0.8299 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.2293 0.8956 0.000 0.016 0.900 0.000 0.084
#> SRR1974876 3 0.2074 0.8755 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1974878 3 0.2179 0.8674 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.4192 0.4120 0.000 0.404 0.596 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.2516 0.8295 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974869 1 0.2561 0.8189 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974868 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 1 0.3561 0.7267 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974866 1 0.2813 0.8034 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974867 1 0.1908 0.8468 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974865 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0880 0.8593 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0703 0.5746 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.3730 0.4406 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1974854 1 0.0963 0.8615 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974853 1 0.1732 0.8531 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974851 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974852 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974849 1 0.0794 0.8614 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974848 1 0.1197 0.8604 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974850 2 0.4270 0.2400 0.000 0.668 0.000 0.320 0.012
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.1341 0.8540 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974845 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974844 1 0.2471 0.8306 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974843 1 0.1544 0.8625 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974842 1 0.2852 0.8044 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974841 1 0.1270 0.8632 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974838 1 0.2424 0.8326 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974837 1 0.1732 0.8638 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974835 1 0.1544 0.8548 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974836 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974834 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974833 2 0.4201 0.3612 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1974831 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974832 1 0.2561 0.8257 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974830 1 0.2773 0.8126 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974829 5 0.6508 0.0000 0.264 0.248 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974828 1 0.2280 0.8381 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974826 2 0.4449 0.2721 0.004 0.636 0.000 0.008 0.352
#> SRR1974827 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974824 1 0.2471 0.8250 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974825 1 0.0703 0.8613 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974822 1 0.2488 0.8315 0.872 0.004 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974823 1 0.1965 0.8464 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974820 1 0.2966 0.7957 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974818 1 0.0510 0.8622 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974819 1 0.2648 0.8192 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974817 1 0.0609 0.8615 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974816 1 0.5162 0.5686 0.692 0.160 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974815 1 0.1608 0.8503 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974813 1 0.2966 0.7957 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974814 4 0.5264 0.2149 0.000 0.052 0.000 0.556 0.392
#> SRR1974812 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974810 1 0.1270 0.8628 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974808 1 0.2561 0.8206 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974811 1 0.1408 0.8634 0.948 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974809 1 0.2852 0.8044 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974807 1 0.1965 0.8426 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974806 1 0.1732 0.8510 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974805 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974804 2 0.3602 0.5025 0.000 0.796 0.000 0.024 0.180
#> SRR1974803 1 0.2813 0.8047 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974801 1 0.2074 0.8433 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974800 1 0.2929 0.7995 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974799 1 0.2179 0.8407 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974798 2 0.2377 0.4753 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974797 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974796 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974795 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974793 1 0.2966 0.7957 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974794 2 0.0290 0.5858 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974792 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974791 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974790 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974789 2 0.1043 0.5635 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.2690 0.8183 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974787 1 0.3561 0.7572 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974784 2 0.3534 0.4593 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1974783 1 0.1851 0.8641 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974785 1 0.2230 0.8418 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974782 1 0.2020 0.8455 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974781 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974780 1 0.4088 0.6587 0.776 0.168 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974779 1 0.1544 0.8536 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974777 1 0.2813 0.8077 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974776 1 0.2891 0.8024 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1974778 1 0.2329 0.8390 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974774 2 0.0162 0.5860 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974773 1 0.2732 0.8154 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1974775 1 0.2377 0.8343 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974772 2 0.6066 -0.3114 0.424 0.456 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974771 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0290 0.5858 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974769 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974768 2 0.0609 0.5790 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974767 1 0.1410 0.8603 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974766 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974764 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.2329 0.8369 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974762 1 0.2929 0.7982 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974761 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974759 1 0.1608 0.8546 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974758 2 0.1365 0.5583 0.004 0.952 0.000 0.040 0.004
#> SRR1974757 2 0.4150 0.3751 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974756 1 0.2561 0.8258 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1282 0.5621 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.2690 0.8156 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974749 2 0.5131 0.1996 0.140 0.740 0.000 0.036 0.084
#> SRR1974747 4 0.2561 0.7462 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974748 1 0.1608 0.8500 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974746 1 0.2612 0.8333 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.5543 0.4946 0.640 0.000 0.000 0.224 0.136
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.2471 0.8307 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974734 4 0.0162 0.9603 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.2930 0.8083 0.832 0.000 0.000 0.004 0.164
#> SRR1974730 1 0.1121 0.8644 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0162 0.9609 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.2929 0.7982 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974727 1 0.3130 0.8202 0.856 0.000 0.000 0.048 0.096
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.1082 0.8619 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1974718 1 0.1908 0.8455 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974716 1 0.3274 0.7736 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.2966 0.7957 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974714 1 0.2471 0.8233 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974711 1 0.1608 0.8512 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974712 1 0.2773 0.8101 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974709 1 0.1732 0.8537 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974708 1 0.3242 0.7639 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1974710 1 0.3424 0.7372 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1974707 1 0.2230 0.8343 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974706 1 0.0880 0.8617 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974704 1 0.2424 0.8323 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974705 1 0.2179 0.8401 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.2929 0.8032 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.1197 0.8588 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974697 1 0.4686 0.6947 0.736 0.000 0.000 0.104 0.160
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 4 0.4227 0.1764 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974695 1 0.4060 0.5572 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974691 1 0.4907 0.4799 0.656 0.000 0.000 0.292 0.052
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.3011 0.7767 0.844 0.000 0.000 0.140 0.016
#> SRR1974686 1 0.1608 0.8544 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974685 4 0.3300 0.6294 0.204 0.000 0.000 0.792 0.004
#> SRR1974684 1 0.1270 0.8565 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974683 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.2690 0.8164 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0880 0.8612 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0794 0.8594 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974676 2 0.0865 0.5759 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9690 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.2179 0.8416 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974673 1 0.2966 0.7926 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974671 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.1478 0.8533 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974662 1 0.0404 0.8616 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974661 1 0.2891 0.7980 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1974660 1 0.1792 0.8464 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974659 1 0.1965 0.8494 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974658 1 0.2230 0.8400 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974657 1 0.2074 0.8398 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974654 1 0.2929 0.7982 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974655 1 0.2561 0.8202 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974656 1 0.2561 0.8193 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974650 1 0.2852 0.8032 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1341 0.8552 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.2561 0.8193 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974646 1 0.3774 0.6598 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974649 1 0.2561 0.8240 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0794 0.8611 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974644 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.1341 0.8637 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974642 1 0.2648 0.8147 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974640 1 0.2773 0.8064 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974641 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.2561 0.8250 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974638 1 0.0880 0.8619 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974635 1 0.1608 0.8562 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974636 1 0.2561 0.8193 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974634 1 0.2471 0.8301 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.2732 0.8147 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1974632 1 0.2929 0.7995 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974631 1 0.2424 0.8255 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974630 1 0.0703 0.8612 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974629 1 0.1851 0.8527 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974628 1 0.0880 0.8607 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974627 1 0.1792 0.8474 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974624 1 0.1341 0.8551 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974625 4 0.0854 0.9446 0.004 0.008 0.000 0.976 0.012
#> SRR1974623 1 0.2852 0.8012 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974622 1 0.2471 0.8233 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974620 1 0.2773 0.8061 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974619 1 0.2439 0.8316 0.876 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974621 1 0.1732 0.8508 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974617 1 0.1478 0.8521 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974616 2 0.4268 0.3307 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974615 1 0.1732 0.8480 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974618 1 0.2966 0.7957 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974614 1 0.1544 0.8519 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974613 1 0.2605 0.8168 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974612 1 0.1197 0.8628 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974611 1 0.3684 0.6946 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.1908 0.8489 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974608 4 0.1800 0.8969 0.020 0.000 0.000 0.932 0.048
#> SRR1974607 1 0.2377 0.8293 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974606 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 4 0.1877 0.8720 0.064 0.000 0.000 0.924 0.012
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9643 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.0880 0.8591 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974602 1 0.2471 0.8297 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974600 2 0.2424 0.5131 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974601 1 0.2605 0.8209 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974599 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.2074 0.5325 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974593 2 0.3586 0.3579 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1974595 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974592 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.2852 0.4718 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974590 2 0.3966 0.4091 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974589 2 0.1908 0.5447 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974587 2 0.2852 0.4710 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974586 2 0.2773 0.4817 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974585 2 0.0609 0.5816 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974584 1 0.1197 0.8561 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974583 2 0.2424 0.5172 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974582 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.1608 0.5541 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974578 2 0.6361 0.1225 0.000 0.508 0.000 0.296 0.196
#> SRR1974577 2 0.0404 0.5755 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.1965 0.5383 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974576 2 0.1908 0.5411 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974575 2 0.0000 0.5867 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974573 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974571 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974572 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974570 1 0.0880 0.8615 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974568 1 0.4269 0.6745 0.732 0.036 0.000 0.000 0.232
#> SRR1974567 1 0.0794 0.8632 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974566 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974569 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974565 2 0.1671 0.5708 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974564 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974560 1 0.3210 0.7667 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1974559 1 0.2773 0.8056 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974563 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974562 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974561 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974557 4 0.1671 0.8884 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974553 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974555 1 0.2074 0.8470 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974551 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974552 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974554 1 0.2471 0.8233 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974558 1 0.2424 0.8287 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974556 1 0.0794 0.8612 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974550 1 0.3999 0.5838 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1974549 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1974548 2 0.4307 0.2385 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1974547 1 0.4387 0.4718 0.640 0.012 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974546 1 0.2516 0.8217 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974545 2 0.4268 0.3331 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974544 1 0.1043 0.8598 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974543 2 0.4256 0.3476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.5704 0.6044 0.048 0.000 0.628 0.000 0.192 0.132
#> SRR1975003 3 0.4372 0.7283 0.000 0.008 0.728 0.000 0.184 0.080
#> SRR1975001 3 0.0717 0.9501 0.000 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.5869 0.5718 0.028 0.008 0.604 0.000 0.220 0.140
#> SRR1974998 3 0.2442 0.8890 0.000 0.000 0.884 0.000 0.048 0.068
#> SRR1974997 3 0.2912 0.8282 0.000 0.116 0.844 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974995 3 0.1984 0.9079 0.000 0.000 0.912 0.000 0.032 0.056
#> SRR1974996 3 0.3277 0.8347 0.000 0.000 0.824 0.000 0.084 0.092
#> SRR1974994 3 0.3726 0.7130 0.216 0.000 0.752 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.4941 0.6627 0.000 0.712 0.080 0.168 0.036 0.004
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0603 0.9515 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1049 0.9401 0.000 0.008 0.960 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974984 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974985 3 0.0405 0.9557 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974981 3 0.2741 0.8780 0.008 0.000 0.868 0.000 0.092 0.032
#> SRR1974980 3 0.3072 0.8488 0.000 0.000 0.840 0.000 0.076 0.084
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.1003 0.9454 0.000 0.000 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.2318 0.8807 0.044 0.000 0.892 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0622 0.9522 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974965 3 0.0146 0.9589 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974962 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.1779 0.9149 0.000 0.000 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.2002 0.9111 0.020 0.008 0.916 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974942 3 0.2129 0.9044 0.000 0.000 0.904 0.000 0.056 0.040
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974939 3 0.0363 0.9567 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0717 0.9507 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974936 3 0.0291 0.9574 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0458 0.9543 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0914 0.9468 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1974930 3 0.1334 0.9358 0.000 0.000 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1974929 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0993 0.9442 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.1082 0.9403 0.000 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1974920 3 0.0632 0.9507 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0603 0.9528 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.4299 0.4900 0.000 0.308 0.652 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.1572 0.9271 0.000 0.000 0.936 0.000 0.028 0.036
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0632 0.9501 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0146 0.9588 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0632 0.9497 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974900 3 0.1074 0.9409 0.000 0.012 0.960 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974899 3 0.0291 0.9573 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9598 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.4639 0.0584 0.000 0.448 0.512 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974893 3 0.0363 0.9555 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974895 3 0.0146 0.9587 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974894 3 0.3649 0.7103 0.000 0.196 0.764 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974892 3 0.1572 0.9227 0.000 0.028 0.936 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974890 2 0.4088 0.6108 0.000 0.716 0.240 0.000 0.040 0.004
#> SRR1974891 3 0.2070 0.9004 0.000 0.048 0.908 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974889 3 0.0146 0.9588 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974888 3 0.1225 0.9347 0.000 0.012 0.952 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974886 2 0.3562 0.7121 0.000 0.788 0.004 0.168 0.040 0.000
#> SRR1974887 2 0.3973 0.6212 0.000 0.728 0.232 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974885 2 0.5054 0.5363 0.000 0.632 0.288 0.036 0.044 0.000
#> SRR1974883 3 0.1367 0.9300 0.000 0.012 0.944 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974884 3 0.0260 0.9573 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974881 2 0.4405 0.5707 0.000 0.680 0.272 0.004 0.040 0.004
#> SRR1974882 2 0.3938 0.6229 0.000 0.728 0.228 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974880 2 0.3331 0.7836 0.000 0.848 0.028 0.084 0.032 0.008
#> SRR1974879 3 0.3642 0.7054 0.000 0.204 0.760 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974877 3 0.3787 0.8099 0.000 0.072 0.804 0.000 0.104 0.020
#> SRR1974876 3 0.3485 0.7723 0.000 0.152 0.800 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974878 3 0.3041 0.8156 0.000 0.128 0.832 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974875 2 0.4541 0.4196 0.000 0.596 0.360 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.2020 0.6859 0.896 0.000 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1974869 5 0.3774 0.7240 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1974868 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974870 5 0.5513 0.0898 0.392 0.000 0.000 0.000 0.476 0.132
#> SRR1974866 5 0.3634 0.7337 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1974867 1 0.1444 0.6864 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974865 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.3446 0.4208 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.1155 0.8495 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1974861 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 6 0.4664 0.6285 0.000 0.364 0.000 0.000 0.052 0.584
#> SRR1974854 1 0.2527 0.6350 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1974853 1 0.1663 0.6814 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974851 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974852 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974849 1 0.3446 0.4190 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974848 1 0.2527 0.6380 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1974850 2 0.4539 0.5736 0.000 0.668 0.000 0.268 0.060 0.004
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.3830 0.1508 0.620 0.000 0.000 0.000 0.376 0.004
#> SRR1974845 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974844 1 0.0692 0.6672 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974843 1 0.3468 0.4703 0.712 0.000 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1974842 1 0.1151 0.6517 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1974841 1 0.2597 0.6331 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974838 1 0.0865 0.6743 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974837 1 0.3885 0.3723 0.684 0.012 0.000 0.000 0.300 0.004
#> SRR1974835 1 0.2454 0.6513 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974836 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974834 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974833 6 0.3875 0.8033 0.004 0.280 0.000 0.000 0.016 0.700
#> SRR1974831 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974832 1 0.0458 0.6752 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974830 1 0.0508 0.6665 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974829 6 0.3412 0.7726 0.128 0.064 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974828 1 0.1714 0.6848 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974826 5 0.4921 -0.3530 0.000 0.420 0.000 0.000 0.516 0.064
#> SRR1974827 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974824 5 0.3854 0.6193 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1974825 1 0.3390 0.4555 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1974822 5 0.4341 0.6908 0.412 0.024 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1974823 1 0.4561 -0.2120 0.544 0.004 0.000 0.000 0.424 0.028
#> SRR1974820 1 0.1320 0.6362 0.948 0.000 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1974818 1 0.2969 0.5780 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1974819 1 0.0972 0.6633 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974817 1 0.2883 0.5926 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1974816 1 0.5938 0.2585 0.624 0.152 0.000 0.000 0.140 0.084
#> SRR1974815 1 0.3930 -0.1151 0.576 0.000 0.000 0.000 0.420 0.004
#> SRR1974813 1 0.1320 0.6362 0.948 0.000 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1974814 6 0.3922 0.4946 0.000 0.016 0.000 0.320 0.000 0.664
#> SRR1974812 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974810 1 0.3371 0.4548 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1974808 5 0.3915 0.7140 0.412 0.000 0.000 0.000 0.584 0.004
#> SRR1974811 1 0.3859 0.4587 0.692 0.000 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1974809 1 0.1391 0.6543 0.944 0.000 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1974807 5 0.4663 0.5536 0.472 0.032 0.000 0.000 0.492 0.004
#> SRR1974806 1 0.1556 0.6850 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974805 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974804 2 0.5415 -0.1548 0.000 0.488 0.000 0.040 0.040 0.432
#> SRR1974803 5 0.4141 0.7293 0.388 0.016 0.000 0.000 0.596 0.000
#> SRR1974801 1 0.1610 0.6837 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974800 1 0.1074 0.6699 0.960 0.000 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1974799 1 0.0713 0.6800 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974798 2 0.2058 0.8205 0.000 0.908 0.000 0.056 0.000 0.036
#> SRR1974797 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974796 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974795 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974793 1 0.1480 0.6283 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1974794 2 0.1010 0.8499 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974792 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974791 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974790 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974789 2 0.1320 0.8459 0.000 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1974788 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974786 1 0.0717 0.6720 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974787 5 0.5446 0.3864 0.336 0.004 0.000 0.000 0.540 0.120
#> SRR1974784 2 0.3727 0.1399 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974783 1 0.3050 0.5634 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1974785 1 0.1387 0.6857 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974782 1 0.1444 0.6816 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1974781 6 0.2697 0.9441 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974780 1 0.5480 0.1943 0.564 0.252 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1974779 1 0.2219 0.6654 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974777 1 0.0858 0.6616 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974776 1 0.1480 0.6444 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1974778 1 0.2100 0.6791 0.884 0.000 0.000 0.000 0.112 0.004
#> SRR1974774 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974773 1 0.1867 0.6550 0.916 0.000 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1974775 1 0.1327 0.6871 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974772 2 0.3483 0.7097 0.144 0.808 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1974771 2 0.1155 0.8499 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1974770 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974769 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974768 2 0.1075 0.8483 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974767 1 0.3198 0.5428 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974766 2 0.1010 0.8499 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974765 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974764 2 0.1010 0.8499 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974763 1 0.1267 0.6832 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974762 1 0.1391 0.6318 0.944 0.000 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1974761 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974760 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974759 1 0.2454 0.6525 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974758 2 0.1552 0.8433 0.000 0.940 0.000 0.020 0.004 0.036
#> SRR1974757 6 0.3737 0.6196 0.000 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974756 1 0.0632 0.6777 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1408 0.8441 0.000 0.944 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.1563 0.6624 0.932 0.000 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1974749 2 0.3157 0.7360 0.016 0.832 0.000 0.012 0.136 0.004
#> SRR1974747 4 0.0632 0.9549 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.3979 -0.2915 0.540 0.000 0.000 0.000 0.456 0.004
#> SRR1974746 1 0.1218 0.6806 0.956 0.000 0.000 0.012 0.028 0.004
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.3834 0.4318 0.768 0.000 0.000 0.184 0.036 0.012
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0603 0.6671 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974734 4 0.0547 0.9644 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.1149 0.6552 0.960 0.000 0.000 0.008 0.024 0.008
#> SRR1974730 1 0.2996 0.5723 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.1245 0.6402 0.952 0.000 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR1974727 1 0.5218 -0.4612 0.480 0.000 0.000 0.092 0.428 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.4058 0.3496 0.660 0.000 0.000 0.016 0.320 0.004
#> SRR1974718 5 0.3995 0.5301 0.480 0.000 0.000 0.000 0.516 0.004
#> SRR1974716 5 0.5209 0.5627 0.372 0.012 0.000 0.000 0.548 0.068
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.1528 0.6270 0.936 0.000 0.000 0.000 0.048 0.016
#> SRR1974714 5 0.3828 0.6825 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974711 1 0.3817 -0.2078 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974712 1 0.1320 0.6566 0.948 0.000 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1974709 1 0.2135 0.6705 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974708 5 0.3953 0.7072 0.328 0.000 0.000 0.000 0.656 0.016
#> SRR1974710 5 0.3977 0.6637 0.284 0.004 0.000 0.000 0.692 0.020
#> SRR1974707 5 0.3854 0.6000 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1974706 1 0.3489 0.4636 0.708 0.000 0.000 0.000 0.288 0.004
#> SRR1974704 1 0.0458 0.6814 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974705 1 0.1411 0.6865 0.936 0.000 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.1889 0.6336 0.920 0.000 0.004 0.000 0.056 0.020
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.2730 0.6213 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974697 5 0.5206 0.5996 0.284 0.000 0.000 0.128 0.588 0.000
#> SRR1974696 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974694 4 0.3424 0.7100 0.160 0.000 0.000 0.800 0.036 0.004
#> SRR1974695 5 0.3139 0.5341 0.160 0.000 0.000 0.000 0.812 0.028
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974691 4 0.4229 0.1434 0.436 0.000 0.000 0.548 0.016 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.4378 0.2349 0.632 0.000 0.000 0.328 0.040 0.000
#> SRR1974686 1 0.2300 0.6630 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974685 4 0.0777 0.9509 0.024 0.000 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR1974684 1 0.2378 0.6536 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974683 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.1010 0.6812 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.2823 0.6074 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.3390 0.4462 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1974676 2 0.1225 0.8475 0.000 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1974675 3 0.0458 0.9537 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974674 1 0.1152 0.6864 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974673 5 0.3819 0.7369 0.372 0.000 0.000 0.000 0.624 0.004
#> SRR1974671 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974672 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974667 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974668 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974666 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974664 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974663 1 0.3989 -0.3572 0.528 0.000 0.000 0.000 0.468 0.004
#> SRR1974662 1 0.2854 0.5975 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1974661 5 0.3756 0.7317 0.352 0.000 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1974660 5 0.3998 0.4965 0.492 0.000 0.000 0.000 0.504 0.004
#> SRR1974659 1 0.1910 0.6767 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974658 1 0.0937 0.6866 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974657 5 0.3971 0.6401 0.448 0.000 0.000 0.000 0.548 0.004
#> SRR1974654 1 0.0909 0.6548 0.968 0.000 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1974655 5 0.3881 0.7314 0.396 0.000 0.000 0.000 0.600 0.004
#> SRR1974656 5 0.3717 0.7378 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1974650 5 0.4004 0.7060 0.368 0.000 0.000 0.000 0.620 0.012
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.3966 -0.2204 0.552 0.000 0.000 0.000 0.444 0.004
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.3727 0.7353 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1974646 5 0.4209 0.4688 0.160 0.000 0.000 0.000 0.736 0.104
#> SRR1974649 1 0.1387 0.6866 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.3428 0.4184 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1974644 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974643 1 0.3221 0.5046 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1974642 5 0.3717 0.7365 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1974640 5 0.3795 0.7361 0.364 0.000 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1974641 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.1219 0.6788 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1974638 1 0.3163 0.5666 0.764 0.000 0.000 0.000 0.232 0.004
#> SRR1974635 1 0.2300 0.6620 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974636 5 0.3872 0.7350 0.392 0.000 0.000 0.000 0.604 0.004
#> SRR1974634 1 0.0713 0.6807 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.3797 0.7114 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974632 1 0.1225 0.6445 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1974631 5 0.3817 0.6836 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1974630 1 0.2996 0.5712 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1974629 1 0.1910 0.6783 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974628 1 0.3668 0.3368 0.668 0.000 0.000 0.000 0.328 0.004
#> SRR1974627 1 0.3869 -0.4856 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1974624 1 0.3852 0.1266 0.612 0.000 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR1974625 4 0.1180 0.9488 0.024 0.008 0.000 0.960 0.004 0.004
#> SRR1974623 5 0.3742 0.7293 0.348 0.000 0.000 0.000 0.648 0.004
#> SRR1974622 5 0.3789 0.7133 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974620 5 0.3727 0.7358 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1974619 5 0.4310 0.7212 0.404 0.000 0.000 0.016 0.576 0.004
#> SRR1974621 1 0.2092 0.6697 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974617 1 0.3833 -0.1916 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974616 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974615 1 0.3864 -0.4322 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974618 1 0.1480 0.6283 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1974614 1 0.3982 -0.3350 0.536 0.000 0.000 0.000 0.460 0.004
#> SRR1974613 5 0.3774 0.7266 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1974612 1 0.3601 0.4056 0.684 0.000 0.000 0.000 0.312 0.004
#> SRR1974611 5 0.4625 0.5434 0.216 0.000 0.000 0.000 0.680 0.104
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.3838 -0.3168 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR1974608 4 0.2053 0.8690 0.004 0.000 0.000 0.888 0.108 0.000
#> SRR1974607 5 0.3950 0.6845 0.432 0.000 0.000 0.000 0.564 0.004
#> SRR1974606 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974605 4 0.2365 0.8700 0.040 0.000 0.000 0.888 0.072 0.000
#> SRR1974604 4 0.0000 0.9810 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.3872 0.0736 0.604 0.000 0.000 0.000 0.392 0.004
#> SRR1974602 1 0.0935 0.6777 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974600 2 0.3354 0.7533 0.000 0.796 0.000 0.000 0.168 0.036
#> SRR1974601 5 0.4284 0.6758 0.440 0.000 0.000 0.012 0.544 0.004
#> SRR1974599 2 0.0865 0.8501 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974598 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974596 2 0.1082 0.8487 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974594 2 0.2527 0.7935 0.000 0.868 0.000 0.000 0.108 0.024
#> SRR1974593 2 0.4454 0.6710 0.000 0.692 0.000 0.000 0.224 0.084
#> SRR1974595 6 0.2597 0.9559 0.000 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974592 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974591 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974588 2 0.3122 0.7531 0.000 0.804 0.000 0.000 0.176 0.020
#> SRR1974590 6 0.3738 0.8061 0.000 0.280 0.000 0.000 0.016 0.704
#> SRR1974589 2 0.2697 0.7884 0.000 0.864 0.000 0.000 0.092 0.044
#> SRR1974587 2 0.3566 0.7108 0.000 0.752 0.000 0.000 0.224 0.024
#> SRR1974586 2 0.3189 0.7486 0.000 0.796 0.000 0.000 0.184 0.020
#> SRR1974585 2 0.1176 0.8387 0.000 0.956 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974584 1 0.3862 0.0587 0.608 0.000 0.000 0.000 0.388 0.004
#> SRR1974583 2 0.3235 0.7645 0.000 0.820 0.000 0.000 0.128 0.052
#> SRR1974582 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974581 2 0.0937 0.8491 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974580 2 0.1829 0.8207 0.000 0.920 0.000 0.000 0.056 0.024
#> SRR1974578 2 0.6248 0.4523 0.000 0.528 0.000 0.236 0.200 0.036
#> SRR1974577 2 0.1007 0.8472 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974579 2 0.1895 0.8160 0.000 0.912 0.000 0.000 0.072 0.016
#> SRR1974576 2 0.1779 0.8201 0.000 0.920 0.000 0.000 0.064 0.016
#> SRR1974575 2 0.1082 0.8487 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974574 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974573 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974571 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974572 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974570 1 0.3050 0.5676 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1974568 5 0.6203 0.3362 0.152 0.028 0.000 0.000 0.460 0.360
#> SRR1974567 1 0.3023 0.5690 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1974566 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974569 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974565 2 0.4011 0.5746 0.000 0.732 0.000 0.000 0.056 0.212
#> SRR1974564 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974560 5 0.4352 0.6925 0.324 0.012 0.000 0.000 0.644 0.020
#> SRR1974559 5 0.4419 0.7216 0.404 0.012 0.000 0.000 0.572 0.012
#> SRR1974563 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974562 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974561 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974557 4 0.2003 0.8591 0.000 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974553 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974555 1 0.4079 -0.0579 0.608 0.008 0.000 0.000 0.380 0.004
#> SRR1974551 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974552 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974554 5 0.3789 0.7137 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974558 5 0.3847 0.6399 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1974556 1 0.3198 0.5145 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974550 5 0.3103 0.5938 0.208 0.000 0.000 0.000 0.784 0.008
#> SRR1974549 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974548 6 0.4832 0.7696 0.000 0.244 0.000 0.000 0.108 0.648
#> SRR1974547 5 0.5801 0.4731 0.212 0.008 0.000 0.000 0.544 0.236
#> SRR1974546 5 0.3747 0.7316 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1974545 6 0.2491 0.9517 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974544 1 0.3482 0.3894 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1974543 6 0.2562 0.9597 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.370 0.770 0.864 0.4534 0.501 0.501
#> 3 3 0.382 0.645 0.791 0.3304 0.870 0.745
#> 4 4 0.494 0.401 0.712 0.1333 0.953 0.886
#> 5 5 0.554 0.587 0.659 0.0825 0.826 0.569
#> 6 6 0.611 0.542 0.700 0.0511 0.951 0.809
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1975008 2 0.7674 0.7675 0.224 0.776
#> SRR1975006 2 0.4815 0.7903 0.104 0.896
#> SRR1975005 1 0.5178 0.8260 0.884 0.116
#> SRR1975004 1 0.2423 0.8944 0.960 0.040
#> SRR1975003 2 0.9552 0.5818 0.376 0.624
#> SRR1975001 2 0.3114 0.7836 0.056 0.944
#> SRR1975002 2 0.5629 0.7871 0.132 0.868
#> SRR1974999 2 0.7674 0.7558 0.224 0.776
#> SRR1975000 1 0.1184 0.9081 0.984 0.016
#> SRR1974998 1 0.1184 0.9081 0.984 0.016
#> SRR1974997 1 0.4562 0.8362 0.904 0.096
#> SRR1974995 2 0.9993 0.3020 0.484 0.516
#> SRR1974996 1 0.0938 0.9102 0.988 0.012
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.3114 0.8849 0.944 0.056
#> SRR1974992 1 0.4022 0.8623 0.920 0.080
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974989 1 0.4939 0.8235 0.892 0.108
#> SRR1974991 1 0.4815 0.8391 0.896 0.104
#> SRR1974986 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974987 2 0.9732 0.5468 0.404 0.596
#> SRR1974988 1 0.1414 0.9062 0.980 0.020
#> SRR1974984 1 0.3879 0.8646 0.924 0.076
#> SRR1974985 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974983 2 0.4022 0.7874 0.080 0.920
#> SRR1974982 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974979 1 0.9522 0.2640 0.628 0.372
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974976 2 1.0000 0.2852 0.496 0.504
#> SRR1974975 1 0.6973 0.7209 0.812 0.188
#> SRR1974974 2 0.9000 0.6892 0.316 0.684
#> SRR1974973 2 0.2948 0.7819 0.052 0.948
#> SRR1974972 1 0.4022 0.8628 0.920 0.080
#> SRR1974971 2 0.4939 0.7853 0.108 0.892
#> SRR1974970 1 0.0938 0.9101 0.988 0.012
#> SRR1974969 1 0.1843 0.9023 0.972 0.028
#> SRR1974968 2 0.9933 0.4224 0.452 0.548
#> SRR1974967 1 0.1843 0.9027 0.972 0.028
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.7815 0.7474 0.232 0.768
#> SRR1974964 1 0.3114 0.8831 0.944 0.056
#> SRR1974963 1 0.2236 0.8958 0.964 0.036
#> SRR1974961 1 0.4562 0.8438 0.904 0.096
#> SRR1974962 2 0.2948 0.7819 0.052 0.948
#> SRR1974960 1 0.0938 0.9100 0.988 0.012
#> SRR1974959 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974958 2 0.5946 0.7828 0.144 0.856
#> SRR1974957 1 0.9491 0.2632 0.632 0.368
#> SRR1974956 1 0.2043 0.8996 0.968 0.032
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.2236 0.8973 0.964 0.036
#> SRR1974953 2 0.1843 0.7751 0.028 0.972
#> SRR1974952 1 0.1633 0.9048 0.976 0.024
#> SRR1974949 1 0.3274 0.8797 0.940 0.060
#> SRR1974950 1 0.9661 0.1827 0.608 0.392
#> SRR1974951 1 0.9795 0.0852 0.584 0.416
#> SRR1974947 1 0.7139 0.7127 0.804 0.196
#> SRR1974948 2 0.7453 0.7682 0.212 0.788
#> SRR1974946 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.2043 0.8994 0.968 0.032
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974943 1 0.8555 0.5447 0.720 0.280
#> SRR1974941 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974940 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974939 1 0.9833 0.0850 0.576 0.424
#> SRR1974938 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974937 1 0.0938 0.9097 0.988 0.012
#> SRR1974936 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974935 1 0.0672 0.9117 0.992 0.008
#> SRR1974934 2 0.5059 0.7848 0.112 0.888
#> SRR1974933 1 0.9710 0.1399 0.600 0.400
#> SRR1974932 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974928 2 0.5178 0.7854 0.116 0.884
#> SRR1974927 1 0.0672 0.9115 0.992 0.008
#> SRR1974924 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.2423 0.8953 0.960 0.040
#> SRR1974922 1 0.2043 0.9011 0.968 0.032
#> SRR1974921 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974918 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974917 2 0.1184 0.7692 0.016 0.984
#> SRR1974916 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974915 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974914 1 0.8499 0.5224 0.724 0.276
#> SRR1974913 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974908 2 0.2948 0.7816 0.052 0.948
#> SRR1974909 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974906 1 0.6438 0.7547 0.836 0.164
#> SRR1974907 1 0.0938 0.9102 0.988 0.012
#> SRR1974905 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974904 2 0.9922 0.4343 0.448 0.552
#> SRR1974903 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974902 1 0.9580 0.2350 0.620 0.380
#> SRR1974901 1 0.2948 0.8871 0.948 0.052
#> SRR1974898 2 0.3584 0.7856 0.068 0.932
#> SRR1974900 2 0.9000 0.6937 0.316 0.684
#> SRR1974899 2 0.5946 0.7880 0.144 0.856
#> SRR1974897 2 0.3431 0.7856 0.064 0.936
#> SRR1974896 2 0.9580 0.5998 0.380 0.620
#> SRR1974893 2 0.8861 0.7116 0.304 0.696
#> SRR1974895 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.9866 0.4936 0.432 0.568
#> SRR1974892 1 0.6343 0.7517 0.840 0.160
#> SRR1974890 1 0.6148 0.7617 0.848 0.152
#> SRR1974891 1 0.9850 -0.0206 0.572 0.428
#> SRR1974889 2 0.0938 0.7682 0.012 0.988
#> SRR1974888 2 0.9608 0.5796 0.384 0.616
#> SRR1974886 2 0.9954 0.4011 0.460 0.540
#> SRR1974887 1 0.6148 0.7615 0.848 0.152
#> SRR1974885 1 0.6148 0.7615 0.848 0.152
#> SRR1974883 1 0.9909 -0.0720 0.556 0.444
#> SRR1974884 2 0.5519 0.7881 0.128 0.872
#> SRR1974881 2 1.0000 0.2954 0.500 0.500
#> SRR1974882 2 0.9998 0.3175 0.492 0.508
#> SRR1974880 2 0.8861 0.6909 0.304 0.696
#> SRR1974879 2 0.9580 0.6104 0.380 0.620
#> SRR1974877 2 0.1414 0.7719 0.020 0.980
#> SRR1974876 1 0.8813 0.4540 0.700 0.300
#> SRR1974878 1 0.7528 0.6532 0.784 0.216
#> SRR1974875 1 0.6148 0.7615 0.848 0.152
#> SRR1974874 2 0.0672 0.7660 0.008 0.992
#> SRR1974873 2 0.9393 0.6987 0.356 0.644
#> SRR1974871 2 0.4161 0.7916 0.084 0.916
#> SRR1974872 1 0.5629 0.8012 0.868 0.132
#> SRR1974869 2 0.3431 0.7863 0.064 0.936
#> SRR1974868 2 0.1184 0.7695 0.016 0.984
#> SRR1974870 2 0.4431 0.7906 0.092 0.908
#> SRR1974866 2 0.4690 0.7917 0.100 0.900
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.2043 0.9008 0.968 0.032
#> SRR1974862 2 0.2043 0.7781 0.032 0.968
#> SRR1974863 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974861 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.9248 0.7171 0.340 0.660
#> SRR1974858 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.9286 0.7127 0.344 0.656
#> SRR1974857 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.4431 0.8415 0.908 0.092
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3431 0.8713 0.936 0.064
#> SRR1974852 2 0.9044 0.7362 0.320 0.680
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.6048 0.7638 0.852 0.148
#> SRR1974846 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974847 1 0.0938 0.9100 0.988 0.012
#> SRR1974845 2 0.9248 0.7158 0.340 0.660
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.2948 0.8852 0.948 0.052
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974839 2 0.9286 0.7115 0.344 0.656
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.9209 0.7199 0.336 0.664
#> SRR1974834 2 0.9170 0.7243 0.332 0.668
#> SRR1974833 1 0.4431 0.8433 0.908 0.092
#> SRR1974831 2 0.9286 0.7115 0.344 0.656
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1843 0.7757 0.028 0.972
#> SRR1974827 2 0.9286 0.7115 0.344 0.656
#> SRR1974824 1 0.0938 0.9097 0.988 0.012
#> SRR1974825 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974822 1 0.2236 0.8963 0.964 0.036
#> SRR1974823 1 0.9323 0.3061 0.652 0.348
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3584 0.8676 0.932 0.068
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.9933 -0.2191 0.548 0.452
#> SRR1974812 1 0.3733 0.8649 0.928 0.072
#> SRR1974810 1 0.0938 0.9095 0.988 0.012
#> SRR1974808 2 0.4939 0.7925 0.108 0.892
#> SRR1974811 1 0.0672 0.9111 0.992 0.008
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2778 0.8893 0.952 0.048
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.9323 0.7073 0.348 0.652
#> SRR1974804 1 0.3274 0.8747 0.940 0.060
#> SRR1974803 1 0.1843 0.9009 0.972 0.028
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1184 0.9081 0.984 0.016
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974797 2 0.8813 0.7529 0.300 0.700
#> SRR1974796 2 0.9358 0.7024 0.352 0.648
#> SRR1974795 2 0.9286 0.7115 0.344 0.656
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974792 2 0.9087 0.7329 0.324 0.676
#> SRR1974791 2 0.9286 0.7115 0.344 0.656
#> SRR1974790 2 0.8763 0.7560 0.296 0.704
#> SRR1974789 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974788 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974786 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974787 1 0.4431 0.8501 0.908 0.092
#> SRR1974784 2 0.9286 0.7142 0.344 0.656
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0376 0.9123 0.996 0.004
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.9087 0.7287 0.324 0.676
#> SRR1974780 1 0.3431 0.8775 0.936 0.064
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.4022 0.8622 0.920 0.080
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2423 0.7788 0.040 0.960
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.8267 0.7663 0.260 0.740
#> SRR1974770 2 0.2043 0.7765 0.032 0.968
#> SRR1974769 2 0.9248 0.7159 0.340 0.660
#> SRR1974768 2 0.3584 0.7850 0.068 0.932
#> SRR1974767 1 0.6343 0.7652 0.840 0.160
#> SRR1974766 2 0.4690 0.7911 0.100 0.900
#> SRR1974765 2 0.9044 0.7362 0.320 0.680
#> SRR1974764 2 0.3114 0.7835 0.056 0.944
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2778 0.7815 0.048 0.952
#> SRR1974760 2 0.9358 0.7024 0.352 0.648
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2236 0.7780 0.036 0.964
#> SRR1974757 2 0.8327 0.7759 0.264 0.736
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.9209 0.7212 0.336 0.664
#> SRR1974755 2 0.1843 0.7751 0.028 0.972
#> SRR1974753 2 0.8608 0.7617 0.284 0.716
#> SRR1974751 2 0.9491 0.6834 0.368 0.632
#> SRR1974750 2 0.9393 0.6984 0.356 0.644
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.9775 0.0983 0.588 0.412
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.6712 0.7950 0.176 0.824
#> SRR1974745 2 0.9393 0.6984 0.356 0.644
#> SRR1974743 2 0.9248 0.7172 0.340 0.660
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.6623 0.7955 0.172 0.828
#> SRR1974739 2 0.9427 0.6938 0.360 0.640
#> SRR1974741 2 0.8327 0.7740 0.264 0.736
#> SRR1974738 2 0.8499 0.7693 0.276 0.724
#> SRR1974737 2 0.9170 0.7251 0.332 0.668
#> SRR1974736 2 0.9393 0.6984 0.356 0.644
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.9323 0.6964 0.348 0.652
#> SRR1974733 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974732 1 0.9896 -0.1641 0.560 0.440
#> SRR1974731 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0672 0.9114 0.992 0.008
#> SRR1974728 2 0.8861 0.7500 0.304 0.696
#> SRR1974725 1 0.9661 0.0508 0.608 0.392
#> SRR1974726 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.6623 0.7911 0.172 0.828
#> SRR1974723 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974722 1 0.9993 -0.3432 0.516 0.484
#> SRR1974721 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974720 1 0.9977 -0.3034 0.528 0.472
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.9686 0.6098 0.396 0.604
#> SRR1974717 2 0.7950 0.7821 0.240 0.760
#> SRR1974715 2 0.9393 0.6984 0.356 0.644
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.8207 0.7637 0.256 0.744
#> SRR1974711 2 0.9000 0.7036 0.316 0.684
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.5059 0.7919 0.112 0.888
#> SRR1974710 2 0.5408 0.7941 0.124 0.876
#> SRR1974707 1 0.7376 0.6722 0.792 0.208
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.7219 0.7926 0.200 0.800
#> SRR1974702 1 0.1843 0.9026 0.972 0.028
#> SRR1974701 2 0.9460 0.6886 0.364 0.636
#> SRR1974699 2 0.6973 0.7939 0.188 0.812
#> SRR1974698 2 0.9209 0.7204 0.336 0.664
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.9850 -0.0280 0.572 0.428
#> SRR1974696 2 0.9580 0.6513 0.380 0.620
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.8813 0.7324 0.300 0.700
#> SRR1974693 2 0.9323 0.7082 0.348 0.652
#> SRR1974692 2 0.9323 0.7091 0.348 0.652
#> SRR1974690 2 0.8713 0.7587 0.292 0.708
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974688 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974682 2 0.9491 0.6834 0.368 0.632
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.9977 -0.2936 0.528 0.472
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.9460 0.6889 0.364 0.636
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1843 0.7751 0.028 0.972
#> SRR1974675 2 0.1843 0.7748 0.028 0.972
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.2948 0.7834 0.052 0.948
#> SRR1974671 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974672 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974667 2 0.3114 0.7835 0.056 0.944
#> SRR1974668 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974666 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974664 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.2423 0.7794 0.040 0.960
#> SRR1974663 1 0.5059 0.8265 0.888 0.112
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.8386 0.7534 0.268 0.732
#> SRR1974660 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3733 0.8693 0.928 0.072
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.2423 0.8928 0.960 0.040
#> SRR1974656 2 0.9815 0.5319 0.420 0.580
#> SRR1974650 2 0.9248 0.6862 0.340 0.660
#> SRR1974651 2 0.8267 0.7740 0.260 0.740
#> SRR1974652 1 0.4298 0.8536 0.912 0.088
#> SRR1974653 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974648 1 0.9833 -0.0249 0.576 0.424
#> SRR1974646 2 0.9608 0.5996 0.384 0.616
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.8267 0.7740 0.260 0.740
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3114 0.7834 0.056 0.944
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.7883 0.7704 0.236 0.764
#> SRR1974640 2 0.8386 0.7510 0.268 0.732
#> SRR1974641 2 0.1184 0.7708 0.016 0.984
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.9580 0.6405 0.380 0.620
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.8327 0.7733 0.264 0.736
#> SRR1974633 1 0.6048 0.7845 0.852 0.148
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.8909 0.7212 0.308 0.692
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.1843 0.9027 0.972 0.028
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.7608 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.7376 0.7772 0.208 0.792
#> SRR1974622 1 0.9815 -0.0038 0.580 0.420
#> SRR1974620 2 0.8443 0.7490 0.272 0.728
#> SRR1974619 2 0.7950 0.7686 0.240 0.760
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.4161 0.8521 0.916 0.084
#> SRR1974615 1 0.0376 0.9126 0.996 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.9427 0.2929 0.640 0.360
#> SRR1974613 2 0.9170 0.6883 0.332 0.668
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.6887 0.7844 0.184 0.816
#> SRR1974610 2 0.5059 0.7944 0.112 0.888
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.9087 0.3756 0.676 0.324
#> SRR1974607 1 0.0938 0.9093 0.988 0.012
#> SRR1974606 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974605 1 0.5408 0.8133 0.876 0.124
#> SRR1974604 2 0.9358 0.7034 0.352 0.648
#> SRR1974603 1 0.6712 0.7377 0.824 0.176
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.6887 0.7965 0.184 0.816
#> SRR1974601 2 0.7219 0.7835 0.200 0.800
#> SRR1974599 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974598 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974596 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974594 2 0.9896 0.5508 0.440 0.560
#> SRR1974593 2 0.1843 0.7757 0.028 0.972
#> SRR1974595 2 0.5629 0.7956 0.132 0.868
#> SRR1974592 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974591 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974588 2 0.9922 0.5320 0.448 0.552
#> SRR1974590 2 0.3733 0.7888 0.072 0.928
#> SRR1974589 2 0.8327 0.7736 0.264 0.736
#> SRR1974587 2 0.9754 0.6177 0.408 0.592
#> SRR1974586 2 0.1633 0.7742 0.024 0.976
#> SRR1974585 2 0.9795 0.6015 0.416 0.584
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1633 0.7742 0.024 0.976
#> SRR1974582 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974581 2 0.0938 0.7682 0.012 0.988
#> SRR1974580 2 0.9552 0.6708 0.376 0.624
#> SRR1974578 2 0.9850 0.5776 0.428 0.572
#> SRR1974577 2 0.7950 0.7834 0.240 0.760
#> SRR1974579 2 0.9754 0.6177 0.408 0.592
#> SRR1974576 2 0.0938 0.7682 0.012 0.988
#> SRR1974575 2 0.0672 0.7661 0.008 0.992
#> SRR1974574 2 0.8713 0.7572 0.292 0.708
#> SRR1974573 2 0.8661 0.7597 0.288 0.712
#> SRR1974571 2 0.8608 0.7621 0.284 0.716
#> SRR1974572 2 0.8661 0.7597 0.288 0.712
#> SRR1974570 1 0.3733 0.8680 0.928 0.072
#> SRR1974568 1 0.1184 0.9072 0.984 0.016
#> SRR1974567 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974566 2 0.8608 0.7621 0.284 0.716
#> SRR1974569 2 0.8443 0.7686 0.272 0.728
#> SRR1974565 2 0.9983 0.4624 0.476 0.524
#> SRR1974564 2 0.8499 0.7665 0.276 0.724
#> SRR1974560 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.8608 0.7621 0.284 0.716
#> SRR1974562 2 0.8499 0.7665 0.276 0.724
#> SRR1974561 2 0.8608 0.7621 0.284 0.716
#> SRR1974557 2 0.0672 0.7659 0.008 0.992
#> SRR1974553 2 0.8661 0.7597 0.288 0.712
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.8443 0.7688 0.272 0.728
#> SRR1974554 1 0.7056 0.6952 0.808 0.192
#> SRR1974558 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9132 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.7528 0.7789 0.216 0.784
#> SRR1974549 2 0.8661 0.7597 0.288 0.712
#> SRR1974548 2 0.8555 0.7698 0.280 0.720
#> SRR1974547 1 0.8327 0.5398 0.736 0.264
#> SRR1974546 1 0.6148 0.7567 0.848 0.152
#> SRR1974545 2 0.7883 0.7826 0.236 0.764
#> SRR1974544 1 0.0672 0.9112 0.992 0.008
#> SRR1974543 2 0.8499 0.7699 0.276 0.724
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 1 0.3669 0.85071 0.896 0.040 0.064
#> SRR1975008 3 0.8665 0.43149 0.124 0.324 0.552
#> SRR1975006 3 0.6487 0.65077 0.032 0.268 0.700
#> SRR1975005 1 0.6644 0.76534 0.752 0.108 0.140
#> SRR1975004 1 0.4925 0.83366 0.844 0.076 0.080
#> SRR1975003 3 0.9557 0.21063 0.248 0.268 0.484
#> SRR1975001 3 0.5397 0.66488 0.000 0.280 0.720
#> SRR1975002 3 0.7424 0.58212 0.060 0.300 0.640
#> SRR1974999 3 0.8233 0.47125 0.120 0.264 0.616
#> SRR1975000 1 0.4194 0.84762 0.876 0.060 0.064
#> SRR1974998 1 0.4194 0.84762 0.876 0.060 0.064
#> SRR1974997 1 0.6678 0.71482 0.724 0.216 0.060
#> SRR1974995 3 0.9829 0.06908 0.352 0.248 0.400
#> SRR1974996 1 0.4095 0.84889 0.880 0.056 0.064
#> SRR1974994 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974993 1 0.5416 0.82205 0.820 0.080 0.100
#> SRR1974992 1 0.6111 0.79455 0.784 0.104 0.112
#> SRR1974990 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974989 1 0.6895 0.68881 0.708 0.228 0.064
#> SRR1974991 1 0.6309 0.78198 0.772 0.100 0.128
#> SRR1974986 1 0.3780 0.84921 0.892 0.044 0.064
#> SRR1974987 3 0.9744 0.15059 0.300 0.256 0.444
#> SRR1974988 1 0.4658 0.83975 0.856 0.076 0.068
#> SRR1974984 1 0.5740 0.81021 0.804 0.096 0.100
#> SRR1974985 1 0.3780 0.85024 0.892 0.044 0.064
#> SRR1974983 3 0.5864 0.65089 0.008 0.288 0.704
#> SRR1974982 1 0.3780 0.84921 0.892 0.044 0.064
#> SRR1974981 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974980 1 0.3780 0.84921 0.892 0.044 0.064
#> SRR1974979 1 0.9598 0.23410 0.476 0.248 0.276
#> SRR1974978 1 0.3669 0.85112 0.896 0.040 0.064
#> SRR1974977 1 0.3780 0.84921 0.892 0.044 0.064
#> SRR1974976 1 0.9909 -0.20635 0.368 0.268 0.364
#> SRR1974975 1 0.7283 0.70170 0.708 0.116 0.176
#> SRR1974974 3 0.9190 0.31096 0.184 0.292 0.524
#> SRR1974973 3 0.5728 0.66524 0.008 0.272 0.720
#> SRR1974972 1 0.5731 0.80825 0.804 0.088 0.108
#> SRR1974971 3 0.6986 0.63157 0.056 0.256 0.688
#> SRR1974970 1 0.4477 0.84281 0.864 0.068 0.068
#> SRR1974969 1 0.4370 0.84540 0.868 0.056 0.076
#> SRR1974968 3 0.9939 0.06891 0.300 0.312 0.388
#> SRR1974967 1 0.4652 0.83988 0.856 0.064 0.080
#> SRR1974965 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974966 3 0.8742 0.41685 0.136 0.308 0.556
#> SRR1974964 1 0.5423 0.82132 0.820 0.096 0.084
#> SRR1974963 1 0.4887 0.83405 0.844 0.060 0.096
#> SRR1974961 1 0.6181 0.78932 0.780 0.116 0.104
#> SRR1974962 3 0.5692 0.66533 0.008 0.268 0.724
#> SRR1974960 1 0.4281 0.84488 0.872 0.056 0.072
#> SRR1974959 1 0.4189 0.84554 0.876 0.056 0.068
#> SRR1974958 3 0.7670 0.57034 0.068 0.312 0.620
#> SRR1974957 1 0.9528 0.25319 0.488 0.240 0.272
#> SRR1974956 1 0.4925 0.83414 0.844 0.080 0.076
#> SRR1974955 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974954 1 0.5096 0.83138 0.836 0.080 0.084
#> SRR1974953 3 0.5115 0.68954 0.004 0.228 0.768
#> SRR1974952 1 0.4749 0.83838 0.852 0.072 0.076
#> SRR1974949 1 0.5505 0.81790 0.816 0.096 0.088
#> SRR1974950 1 0.9698 0.16615 0.456 0.256 0.288
#> SRR1974951 1 0.9800 0.08790 0.432 0.268 0.300
#> SRR1974947 1 0.7775 0.66592 0.676 0.156 0.168
#> SRR1974948 3 0.8503 0.46445 0.120 0.304 0.576
#> SRR1974946 3 0.3116 0.65897 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974945 1 0.4477 0.84307 0.864 0.068 0.068
#> SRR1974944 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974942 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974943 1 0.8266 0.55930 0.624 0.136 0.240
#> SRR1974941 1 0.3764 0.84990 0.892 0.040 0.068
#> SRR1974940 1 0.3993 0.84776 0.884 0.052 0.064
#> SRR1974939 1 0.9573 0.14827 0.460 0.212 0.328
#> SRR1974938 1 0.4087 0.84653 0.880 0.052 0.068
#> SRR1974937 1 0.3888 0.84959 0.888 0.048 0.064
#> SRR1974936 1 0.3669 0.85071 0.896 0.040 0.064
#> SRR1974935 1 0.4179 0.84571 0.876 0.052 0.072
#> SRR1974934 3 0.6872 0.61170 0.044 0.276 0.680
#> SRR1974933 1 0.9725 0.13315 0.452 0.276 0.272
#> SRR1974932 1 0.4087 0.84653 0.880 0.052 0.068
#> SRR1974931 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974930 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974929 1 0.3669 0.85071 0.896 0.040 0.064
#> SRR1974928 3 0.6913 0.62876 0.056 0.248 0.696
#> SRR1974927 1 0.4384 0.84401 0.868 0.064 0.068
#> SRR1974924 1 0.3669 0.85071 0.896 0.040 0.064
#> SRR1974925 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974926 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974923 1 0.4642 0.84318 0.856 0.060 0.084
#> SRR1974922 1 0.4652 0.84032 0.856 0.064 0.080
#> SRR1974921 1 0.3649 0.85057 0.896 0.036 0.068
#> SRR1974920 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974919 1 0.4087 0.84653 0.880 0.052 0.068
#> SRR1974918 1 0.4288 0.84541 0.872 0.060 0.068
#> SRR1974917 3 0.4178 0.68932 0.000 0.172 0.828
#> SRR1974916 1 0.4087 0.84653 0.880 0.052 0.068
#> SRR1974915 1 0.4189 0.84583 0.876 0.056 0.068
#> SRR1974914 1 0.9054 0.28658 0.496 0.360 0.144
#> SRR1974913 1 0.3669 0.85083 0.896 0.040 0.064
#> SRR1974911 1 0.3554 0.85127 0.900 0.036 0.064
#> SRR1974910 1 0.3875 0.84930 0.888 0.044 0.068
#> SRR1974908 3 0.5404 0.67798 0.004 0.256 0.740
#> SRR1974909 1 0.4189 0.84554 0.876 0.056 0.068
#> SRR1974906 1 0.7396 0.70894 0.704 0.144 0.152
#> SRR1974907 1 0.4384 0.84447 0.868 0.064 0.068
#> SRR1974905 1 0.3983 0.84822 0.884 0.048 0.068
#> SRR1974904 3 0.9939 0.09140 0.312 0.300 0.388
#> SRR1974903 1 0.4087 0.84653 0.880 0.052 0.068
#> SRR1974902 1 0.9496 0.26857 0.492 0.232 0.276
#> SRR1974901 1 0.4995 0.83127 0.840 0.068 0.092
#> SRR1974898 3 0.5588 0.66501 0.004 0.276 0.720
#> SRR1974900 3 0.9438 0.26116 0.196 0.324 0.480
#> SRR1974899 3 0.6956 0.58982 0.040 0.300 0.660
#> SRR1974897 3 0.5397 0.66519 0.000 0.280 0.720
#> SRR1974896 3 0.9690 0.13002 0.220 0.356 0.424
#> SRR1974893 3 0.9192 0.31727 0.176 0.308 0.516
#> SRR1974895 3 0.3038 0.65721 0.000 0.104 0.896
#> SRR1974894 2 0.9850 0.00458 0.252 0.392 0.356
#> SRR1974892 1 0.8020 0.53570 0.604 0.308 0.088
#> SRR1974890 1 0.7944 0.55813 0.616 0.296 0.088
#> SRR1974891 1 0.9906 -0.11929 0.388 0.340 0.272
#> SRR1974889 3 0.3752 0.67697 0.000 0.144 0.856
#> SRR1974888 3 0.9653 0.16978 0.224 0.328 0.448
#> SRR1974886 2 0.9908 0.03427 0.276 0.392 0.332
#> SRR1974887 1 0.7949 0.54661 0.608 0.308 0.084
#> SRR1974885 1 0.7949 0.54661 0.608 0.308 0.084
#> SRR1974883 1 0.9942 -0.11066 0.380 0.332 0.288
#> SRR1974884 3 0.6771 0.62051 0.040 0.276 0.684
#> SRR1974881 2 0.9837 0.08001 0.284 0.424 0.292
#> SRR1974882 2 0.9887 0.07569 0.288 0.408 0.304
#> SRR1974880 3 0.9250 0.28932 0.184 0.304 0.512
#> SRR1974879 3 0.9645 0.08306 0.208 0.380 0.412
#> SRR1974877 3 0.4062 0.68346 0.000 0.164 0.836
#> SRR1974876 1 0.9201 0.25273 0.488 0.352 0.160
#> SRR1974878 1 0.8476 0.44097 0.560 0.332 0.108
#> SRR1974875 1 0.7949 0.54661 0.608 0.308 0.084
#> SRR1974874 3 0.5529 0.59521 0.000 0.296 0.704
#> SRR1974873 2 0.4121 0.66337 0.084 0.876 0.040
#> SRR1974871 3 0.6291 0.31645 0.000 0.468 0.532
#> SRR1974872 1 0.6001 0.71420 0.772 0.176 0.052
#> SRR1974869 3 0.6308 0.20599 0.000 0.492 0.508
#> SRR1974868 3 0.5158 0.69322 0.004 0.232 0.764
#> SRR1974870 2 0.6941 -0.09171 0.016 0.520 0.464
#> SRR1974866 2 0.6793 -0.07340 0.012 0.536 0.452
#> SRR1974867 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974865 3 0.5291 0.61423 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974864 1 0.2947 0.84667 0.920 0.060 0.020
#> SRR1974862 3 0.6111 0.46414 0.000 0.396 0.604
#> SRR1974863 3 0.5254 0.61629 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974860 3 0.4842 0.69626 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974861 3 0.3116 0.65897 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974859 2 0.4737 0.66276 0.084 0.852 0.064
#> SRR1974858 3 0.5254 0.61629 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974856 2 0.4642 0.66262 0.084 0.856 0.060
#> SRR1974857 3 0.5254 0.61629 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974855 1 0.5536 0.74363 0.776 0.200 0.024
#> SRR1974854 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974853 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974851 1 0.4663 0.79128 0.828 0.156 0.016
#> SRR1974852 2 0.4449 0.61293 0.040 0.860 0.100
#> SRR1974849 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974848 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974850 1 0.6284 0.58647 0.680 0.304 0.016
#> SRR1974846 2 0.4339 0.66352 0.084 0.868 0.048
#> SRR1974847 1 0.1129 0.86523 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974845 2 0.3947 0.61820 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974844 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974843 1 0.3181 0.84283 0.912 0.064 0.024
#> SRR1974842 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974841 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974840 2 0.4423 0.66400 0.088 0.864 0.048
#> SRR1974839 2 0.3947 0.61592 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974838 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974837 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974835 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974836 2 0.4121 0.61427 0.040 0.876 0.084
#> SRR1974834 2 0.4206 0.61373 0.040 0.872 0.088
#> SRR1974833 1 0.5610 0.74469 0.776 0.196 0.028
#> SRR1974831 2 0.3947 0.61592 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974832 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974830 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974829 1 0.1647 0.86386 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974828 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974826 3 0.6095 0.48786 0.000 0.392 0.608
#> SRR1974827 2 0.3947 0.61592 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974824 1 0.1989 0.85532 0.948 0.048 0.004
#> SRR1974825 1 0.0747 0.86493 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974822 1 0.2866 0.84882 0.916 0.076 0.008
#> SRR1974823 1 0.8718 0.06043 0.520 0.364 0.116
#> SRR1974820 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974818 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974819 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974817 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974816 1 0.4099 0.80437 0.852 0.140 0.008
#> SRR1974815 1 0.0424 0.86670 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974813 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974814 2 0.6651 0.44264 0.320 0.656 0.024
#> SRR1974812 1 0.4723 0.79056 0.824 0.160 0.016
#> SRR1974810 1 0.2651 0.85229 0.928 0.060 0.012
#> SRR1974808 2 0.7169 -0.05934 0.024 0.520 0.456
#> SRR1974811 1 0.1711 0.86355 0.960 0.032 0.008
#> SRR1974809 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974807 1 0.3234 0.84935 0.908 0.072 0.020
#> SRR1974806 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974805 2 0.4058 0.61656 0.044 0.880 0.076
#> SRR1974804 1 0.4602 0.79438 0.832 0.152 0.016
#> SRR1974803 1 0.3129 0.84399 0.904 0.088 0.008
#> SRR1974801 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974800 1 0.1647 0.86059 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974799 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974798 3 0.4796 0.69728 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974797 2 0.4779 0.59950 0.036 0.840 0.124
#> SRR1974796 2 0.4281 0.61567 0.056 0.872 0.072
#> SRR1974795 2 0.3947 0.61592 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974793 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974794 3 0.4750 0.70136 0.000 0.216 0.784
#> SRR1974792 2 0.4449 0.61474 0.040 0.860 0.100
#> SRR1974791 2 0.3947 0.61592 0.040 0.884 0.076
#> SRR1974790 2 0.4915 0.59685 0.036 0.832 0.132
#> SRR1974789 3 0.4796 0.70022 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974788 3 0.4842 0.69626 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974786 1 0.1643 0.85671 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974787 1 0.3888 0.82711 0.888 0.064 0.048
#> SRR1974784 2 0.5722 0.59441 0.068 0.800 0.132
#> SRR1974783 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974785 1 0.1163 0.86279 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974782 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974781 2 0.7444 0.45135 0.096 0.684 0.220
#> SRR1974780 1 0.3678 0.83153 0.892 0.080 0.028
#> SRR1974779 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974777 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974776 1 0.4676 0.80016 0.848 0.112 0.040
#> SRR1974778 1 0.0424 0.86612 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974774 3 0.5588 0.67137 0.004 0.276 0.720
#> SRR1974773 1 0.0424 0.86617 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974775 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974772 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974771 2 0.8836 -0.00959 0.120 0.492 0.388
#> SRR1974770 3 0.5291 0.67572 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974769 2 0.4035 0.61521 0.040 0.880 0.080
#> SRR1974768 3 0.5845 0.63601 0.004 0.308 0.688
#> SRR1974767 1 0.6122 0.71566 0.776 0.152 0.072
#> SRR1974766 3 0.7013 0.41345 0.020 0.432 0.548
#> SRR1974765 2 0.4174 0.61630 0.036 0.872 0.092
#> SRR1974764 3 0.6255 0.65215 0.016 0.300 0.684
#> SRR1974763 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974762 1 0.0424 0.86617 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974761 3 0.6161 0.66197 0.016 0.288 0.696
#> SRR1974760 2 0.4281 0.61567 0.056 0.872 0.072
#> SRR1974759 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974758 3 0.5363 0.67165 0.000 0.276 0.724
#> SRR1974757 2 0.6805 0.43348 0.044 0.688 0.268
#> SRR1974756 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974754 2 0.4921 0.66038 0.084 0.844 0.072
#> SRR1974755 3 0.5216 0.68066 0.000 0.260 0.740
#> SRR1974753 2 0.6062 0.62139 0.072 0.780 0.148
#> SRR1974751 2 0.4665 0.66147 0.100 0.852 0.048
#> SRR1974750 2 0.4423 0.66375 0.088 0.864 0.048
#> SRR1974752 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974749 1 0.9342 0.07177 0.484 0.336 0.180
#> SRR1974747 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974748 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974746 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974744 2 0.6794 0.35127 0.028 0.648 0.324
#> SRR1974745 2 0.4423 0.66375 0.088 0.864 0.048
#> SRR1974743 2 0.4836 0.66019 0.080 0.848 0.072
#> SRR1974742 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974740 2 0.6702 0.33786 0.024 0.648 0.328
#> SRR1974739 2 0.4316 0.66390 0.088 0.868 0.044
#> SRR1974741 2 0.5798 0.59449 0.044 0.780 0.176
#> SRR1974738 2 0.8048 0.48222 0.108 0.628 0.264
#> SRR1974737 2 0.4838 0.65960 0.076 0.848 0.076
#> SRR1974736 2 0.4423 0.66375 0.088 0.864 0.048
#> SRR1974735 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974734 2 0.8437 0.50096 0.180 0.620 0.200
#> SRR1974733 2 0.4443 0.66334 0.084 0.864 0.052
#> SRR1974732 2 0.7379 0.42118 0.336 0.616 0.048
#> SRR1974731 2 0.4443 0.66334 0.084 0.864 0.052
#> SRR1974729 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974730 1 0.0747 0.86627 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974728 2 0.5608 0.63939 0.072 0.808 0.120
#> SRR1974725 2 0.7325 0.36877 0.388 0.576 0.036
#> SRR1974726 2 0.4443 0.66334 0.084 0.864 0.052
#> SRR1974724 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974727 2 0.8324 0.21553 0.088 0.540 0.372
#> SRR1974723 2 0.4339 0.66352 0.084 0.868 0.048
#> SRR1974722 2 0.6880 0.46873 0.304 0.660 0.036
#> SRR1974721 3 0.5706 0.57440 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974720 2 0.6867 0.49361 0.288 0.672 0.040
#> SRR1974719 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974718 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974716 2 0.9081 0.40488 0.236 0.552 0.212
#> SRR1974717 2 0.6447 0.56624 0.060 0.744 0.196
#> SRR1974715 2 0.4423 0.66375 0.088 0.864 0.048
#> SRR1974713 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974714 2 0.8690 0.34434 0.132 0.560 0.308
#> SRR1974711 2 0.9485 0.24766 0.212 0.484 0.304
#> SRR1974712 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974709 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974708 2 0.7274 -0.04973 0.028 0.520 0.452
#> SRR1974710 2 0.7641 -0.00517 0.044 0.520 0.436
#> SRR1974707 1 0.6723 0.63193 0.724 0.212 0.064
#> SRR1974706 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974704 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974705 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974703 2 0.6730 0.45320 0.036 0.680 0.284
#> SRR1974702 1 0.1905 0.86028 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974701 2 0.4586 0.66272 0.096 0.856 0.048
#> SRR1974699 2 0.7037 0.34708 0.036 0.636 0.328
#> SRR1974698 2 0.4745 0.66202 0.080 0.852 0.068
#> SRR1974700 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974697 1 0.9228 -0.14396 0.464 0.380 0.156
#> SRR1974696 2 0.8339 0.50486 0.204 0.628 0.168
#> SRR1974694 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974695 2 0.8933 0.36555 0.168 0.556 0.276
#> SRR1974693 2 0.4544 0.66315 0.084 0.860 0.056
#> SRR1974692 2 0.4544 0.66374 0.084 0.860 0.056
#> SRR1974690 2 0.4848 0.59844 0.036 0.836 0.128
#> SRR1974691 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974689 2 0.4443 0.66334 0.084 0.864 0.052
#> SRR1974688 2 0.4443 0.66334 0.084 0.864 0.052
#> SRR1974687 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974686 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974685 1 0.0424 0.86673 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974684 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974683 1 0.0592 0.86695 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974682 2 0.4665 0.66147 0.100 0.852 0.048
#> SRR1974681 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974679 2 0.6762 0.48225 0.288 0.676 0.036
#> SRR1974680 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974678 2 0.4586 0.66246 0.096 0.856 0.048
#> SRR1974677 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974676 3 0.5138 0.68748 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974675 3 0.4796 0.68956 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974674 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974673 3 0.6291 0.26380 0.000 0.468 0.532
#> SRR1974671 3 0.4796 0.69711 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974672 3 0.5254 0.61629 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974670 3 0.5291 0.61204 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974669 3 0.4796 0.69711 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974667 3 0.6255 0.65215 0.016 0.300 0.684
#> SRR1974668 3 0.4842 0.69847 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974666 3 0.4796 0.69711 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974664 3 0.5254 0.61629 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974665 3 0.5404 0.68269 0.004 0.256 0.740
#> SRR1974663 1 0.5598 0.74962 0.800 0.148 0.052
#> SRR1974662 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974661 2 0.8777 0.36633 0.148 0.564 0.288
#> SRR1974660 1 0.0983 0.86483 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974659 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974658 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974657 1 0.3461 0.83640 0.900 0.076 0.024
#> SRR1974654 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974655 1 0.2703 0.84625 0.928 0.056 0.016
#> SRR1974656 2 0.9491 0.30353 0.292 0.488 0.220
#> SRR1974650 2 0.9276 0.33880 0.212 0.524 0.264
#> SRR1974651 2 0.6719 0.57830 0.068 0.728 0.204
#> SRR1974652 1 0.4636 0.80185 0.852 0.104 0.044
#> SRR1974653 2 0.4339 0.66352 0.084 0.868 0.048
#> SRR1974648 1 0.9118 -0.14602 0.468 0.388 0.144
#> SRR1974646 2 0.9836 0.18779 0.280 0.424 0.296
#> SRR1974649 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974647 2 0.6625 0.58660 0.068 0.736 0.196
#> SRR1974645 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974644 3 0.5864 0.66156 0.008 0.288 0.704
#> SRR1974643 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974642 2 0.8625 0.32536 0.124 0.560 0.316
#> SRR1974640 2 0.8703 0.36466 0.144 0.572 0.284
#> SRR1974641 3 0.6126 0.52370 0.004 0.352 0.644
#> SRR1974639 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974638 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974635 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974636 2 0.9020 0.41408 0.220 0.560 0.220
#> SRR1974634 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974637 2 0.6588 0.57663 0.060 0.732 0.208
#> SRR1974633 1 0.5787 0.74609 0.796 0.136 0.068
#> SRR1974632 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974631 2 0.8994 0.38297 0.184 0.556 0.260
#> SRR1974630 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974629 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974628 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974627 1 0.2152 0.85768 0.948 0.036 0.016
#> SRR1974624 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974625 3 0.3116 0.65897 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974623 2 0.8649 0.22419 0.112 0.528 0.360
#> SRR1974622 1 0.8998 -0.13893 0.472 0.396 0.132
#> SRR1974620 2 0.8777 0.36251 0.148 0.564 0.288
#> SRR1974619 2 0.8536 0.35392 0.124 0.576 0.300
#> SRR1974621 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974617 1 0.0424 0.86670 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974616 1 0.4897 0.77720 0.812 0.172 0.016
#> SRR1974615 1 0.1163 0.86499 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974618 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974614 1 0.8976 0.15096 0.532 0.316 0.152
#> SRR1974613 2 0.9182 0.35563 0.204 0.536 0.260
#> SRR1974612 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974611 2 0.8457 0.11521 0.092 0.512 0.396
#> SRR1974610 2 0.6647 -0.06659 0.008 0.540 0.452
#> SRR1974609 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974608 1 0.8261 0.08965 0.524 0.396 0.080
#> SRR1974607 1 0.3412 0.81079 0.876 0.124 0.000
#> SRR1974606 3 0.4887 0.69580 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974605 1 0.5174 0.77139 0.824 0.128 0.048
#> SRR1974604 2 0.4339 0.66352 0.084 0.868 0.048
#> SRR1974603 1 0.6895 0.62709 0.716 0.212 0.072
#> SRR1974602 1 0.0237 0.86684 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974600 2 0.7368 0.28292 0.044 0.604 0.352
#> SRR1974601 2 0.8330 0.24539 0.092 0.552 0.356
#> SRR1974599 3 0.4654 0.69848 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974598 3 0.4654 0.69848 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974596 3 0.4702 0.70081 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974594 2 0.5470 0.61296 0.168 0.796 0.036
#> SRR1974593 3 0.6359 0.45704 0.004 0.404 0.592
#> SRR1974595 2 0.6228 0.20953 0.004 0.624 0.372
#> SRR1974592 3 0.4702 0.70081 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974591 3 0.4654 0.69848 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974588 2 0.5526 0.60934 0.172 0.792 0.036
#> SRR1974590 2 0.6307 -0.15293 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974589 2 0.7640 0.51559 0.096 0.664 0.240
#> SRR1974587 2 0.5136 0.64049 0.132 0.824 0.044
#> SRR1974586 3 0.6168 0.45522 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974585 2 0.5047 0.63547 0.140 0.824 0.036
#> SRR1974584 1 0.3941 0.78481 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974583 3 0.6126 0.47104 0.000 0.400 0.600
#> SRR1974582 3 0.4654 0.69848 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974581 3 0.5591 0.60009 0.000 0.304 0.696
#> SRR1974580 2 0.5931 0.63553 0.124 0.792 0.084
#> SRR1974578 2 0.5295 0.62370 0.156 0.808 0.036
#> SRR1974577 2 0.8452 0.18798 0.104 0.556 0.340
#> SRR1974579 2 0.5136 0.64049 0.132 0.824 0.044
#> SRR1974576 3 0.5621 0.59555 0.000 0.308 0.692
#> SRR1974575 3 0.4796 0.70049 0.000 0.220 0.780
#> SRR1974574 2 0.3610 0.60484 0.016 0.888 0.096
#> SRR1974573 2 0.3690 0.60293 0.016 0.884 0.100
#> SRR1974571 2 0.3769 0.60029 0.016 0.880 0.104
#> SRR1974572 2 0.3690 0.60293 0.016 0.884 0.100
#> SRR1974570 1 0.4723 0.76356 0.824 0.160 0.016
#> SRR1974568 1 0.4235 0.76211 0.824 0.176 0.000
#> SRR1974567 1 0.4121 0.77170 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974566 2 0.3769 0.60029 0.016 0.880 0.104
#> SRR1974569 2 0.4059 0.58402 0.012 0.860 0.128
#> SRR1974565 2 0.5778 0.58195 0.200 0.768 0.032
#> SRR1974564 2 0.3995 0.59564 0.016 0.868 0.116
#> SRR1974560 1 0.4121 0.77170 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974559 1 0.3941 0.78481 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974563 2 0.3769 0.60029 0.016 0.880 0.104
#> SRR1974562 2 0.3995 0.59564 0.016 0.868 0.116
#> SRR1974561 2 0.3769 0.60029 0.016 0.880 0.104
#> SRR1974557 3 0.5465 0.60054 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974553 2 0.3690 0.60293 0.016 0.884 0.100
#> SRR1974555 1 0.3941 0.78481 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974551 1 0.3941 0.78481 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974552 2 0.3918 0.59112 0.012 0.868 0.120
#> SRR1974554 1 0.7308 0.48827 0.648 0.296 0.056
#> SRR1974558 1 0.4121 0.77170 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974556 1 0.3941 0.78481 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974550 2 0.8425 0.26035 0.100 0.552 0.348
#> SRR1974549 2 0.3690 0.60293 0.016 0.884 0.100
#> SRR1974548 2 0.4848 0.60762 0.036 0.836 0.128
#> SRR1974547 1 0.8113 0.33236 0.588 0.324 0.088
#> SRR1974546 1 0.6805 0.57063 0.688 0.268 0.044
#> SRR1974545 2 0.4968 0.52312 0.012 0.800 0.188
#> SRR1974544 1 0.4121 0.77170 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974543 2 0.4609 0.60343 0.028 0.844 0.128
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 1 0.0000 0.47569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.8450 0.53379 0.160 0.528 0.232 0.080
#> SRR1975006 2 0.6750 0.64073 0.056 0.668 0.212 0.064
#> SRR1975005 1 0.3833 0.34647 0.856 0.048 0.088 0.008
#> SRR1975004 1 0.1677 0.44067 0.948 0.012 0.040 0.000
#> SRR1975003 2 0.8832 0.34966 0.316 0.408 0.220 0.056
#> SRR1975001 2 0.6068 0.64367 0.012 0.684 0.232 0.072
#> SRR1975002 2 0.7564 0.60505 0.080 0.600 0.244 0.076
#> SRR1974999 2 0.8484 0.55009 0.172 0.516 0.240 0.072
#> SRR1975000 1 0.0895 0.46651 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974998 1 0.0779 0.46426 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974997 1 0.6627 0.25502 0.668 0.016 0.160 0.156
#> SRR1974995 1 0.8653 -0.30638 0.428 0.316 0.208 0.048
#> SRR1974996 1 0.0657 0.46657 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974994 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974993 1 0.2408 0.42108 0.920 0.016 0.060 0.004
#> SRR1974992 1 0.3166 0.37414 0.888 0.020 0.080 0.012
#> SRR1974990 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974989 1 0.6705 0.21781 0.660 0.016 0.152 0.172
#> SRR1974991 1 0.3626 0.36184 0.872 0.056 0.060 0.012
#> SRR1974986 1 0.0188 0.47417 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974987 2 0.8818 0.21192 0.356 0.372 0.220 0.052
#> SRR1974988 1 0.1305 0.45095 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974984 1 0.2750 0.39707 0.908 0.032 0.056 0.004
#> SRR1974985 1 0.0188 0.47417 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974983 2 0.6537 0.63714 0.032 0.668 0.228 0.072
#> SRR1974982 1 0.0188 0.47417 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974981 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974980 1 0.0188 0.47417 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974979 1 0.8070 -0.08385 0.568 0.200 0.168 0.064
#> SRR1974978 1 0.0336 0.47581 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974977 1 0.0188 0.47417 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974976 1 0.8759 -0.29084 0.432 0.312 0.196 0.060
#> SRR1974975 1 0.5059 0.26017 0.788 0.100 0.100 0.012
#> SRR1974974 2 0.8864 0.47265 0.252 0.448 0.232 0.068
#> SRR1974973 2 0.6349 0.64299 0.020 0.676 0.224 0.080
#> SRR1974972 1 0.3130 0.38577 0.896 0.040 0.052 0.012
#> SRR1974971 2 0.7256 0.62654 0.072 0.620 0.244 0.064
#> SRR1974970 1 0.1209 0.45406 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974969 1 0.1114 0.45951 0.972 0.008 0.016 0.004
#> SRR1974968 1 0.9035 -0.40071 0.388 0.312 0.232 0.068
#> SRR1974967 1 0.1452 0.45085 0.956 0.008 0.036 0.000
#> SRR1974965 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974966 2 0.8602 0.53281 0.172 0.500 0.252 0.076
#> SRR1974964 1 0.2474 0.41132 0.920 0.016 0.056 0.008
#> SRR1974963 1 0.1743 0.43608 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR1974961 1 0.3374 0.35928 0.880 0.028 0.080 0.012
#> SRR1974962 2 0.6318 0.64309 0.020 0.676 0.228 0.076
#> SRR1974960 1 0.1004 0.46282 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1974959 1 0.0817 0.46295 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974958 2 0.7724 0.60402 0.096 0.588 0.244 0.072
#> SRR1974957 1 0.7940 -0.09074 0.576 0.200 0.168 0.056
#> SRR1974956 1 0.1762 0.43596 0.944 0.004 0.048 0.004
#> SRR1974955 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974954 1 0.2156 0.43140 0.928 0.008 0.060 0.004
#> SRR1974953 2 0.5680 0.65244 0.008 0.712 0.216 0.064
#> SRR1974952 1 0.1639 0.44314 0.952 0.008 0.036 0.004
#> SRR1974949 1 0.2530 0.40293 0.912 0.008 0.072 0.008
#> SRR1974950 1 0.8257 -0.10533 0.540 0.212 0.188 0.060
#> SRR1974951 1 0.8493 -0.12801 0.516 0.212 0.204 0.068
#> SRR1974947 1 0.5344 0.22822 0.772 0.096 0.116 0.016
#> SRR1974948 2 0.8330 0.54367 0.152 0.544 0.224 0.080
#> SRR1974946 2 0.4290 0.65152 0.000 0.772 0.212 0.016
#> SRR1974945 1 0.1624 0.45584 0.952 0.020 0.028 0.000
#> SRR1974944 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974942 1 0.0336 0.47831 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974943 1 0.6384 0.10678 0.688 0.172 0.124 0.016
#> SRR1974941 1 0.0188 0.47399 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974940 1 0.0469 0.46994 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974939 1 0.8241 -0.13856 0.532 0.240 0.172 0.056
#> SRR1974938 1 0.0707 0.46527 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974937 1 0.0469 0.47376 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.47569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0895 0.46520 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1974934 2 0.7486 0.61896 0.064 0.600 0.252 0.084
#> SRR1974933 1 0.8438 -0.11893 0.528 0.212 0.188 0.072
#> SRR1974932 1 0.0707 0.46527 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974931 1 0.0336 0.47831 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974930 1 0.0336 0.47831 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.47569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.7274 0.62420 0.084 0.620 0.240 0.056
#> SRR1974927 1 0.1109 0.45679 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974924 1 0.0000 0.47569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974926 1 0.0188 0.47722 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974923 1 0.1985 0.45034 0.940 0.016 0.040 0.004
#> SRR1974922 1 0.1833 0.45033 0.944 0.024 0.032 0.000
#> SRR1974921 1 0.0336 0.47579 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974920 1 0.0336 0.47831 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974919 1 0.0707 0.46527 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974918 1 0.0817 0.46332 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974917 2 0.5327 0.65248 0.004 0.732 0.208 0.056
#> SRR1974916 1 0.0707 0.46527 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974915 1 0.0817 0.46292 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974914 1 0.8364 -0.10944 0.544 0.080 0.168 0.208
#> SRR1974913 1 0.0469 0.47399 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974911 1 0.0336 0.47831 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974910 1 0.0469 0.47435 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974908 2 0.6002 0.64809 0.012 0.688 0.232 0.068
#> SRR1974909 1 0.0817 0.46295 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974906 1 0.4843 0.26117 0.804 0.072 0.108 0.016
#> SRR1974907 1 0.1109 0.45673 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974905 1 0.0895 0.46988 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1974904 1 0.9094 -0.39729 0.376 0.332 0.216 0.076
#> SRR1974903 1 0.0707 0.46527 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974902 1 0.7948 -0.09869 0.576 0.192 0.176 0.056
#> SRR1974901 1 0.2400 0.43194 0.924 0.028 0.044 0.004
#> SRR1974898 2 0.6459 0.63924 0.020 0.652 0.256 0.072
#> SRR1974900 2 0.9161 0.44876 0.236 0.436 0.228 0.100
#> SRR1974899 2 0.7480 0.60458 0.084 0.612 0.232 0.072
#> SRR1974897 2 0.6255 0.64399 0.012 0.668 0.240 0.080
#> SRR1974896 2 0.9668 0.36037 0.264 0.364 0.216 0.156
#> SRR1974893 2 0.9064 0.46521 0.232 0.440 0.240 0.088
#> SRR1974895 2 0.4327 0.65083 0.000 0.768 0.216 0.016
#> SRR1974894 2 0.9774 0.25692 0.304 0.320 0.192 0.184
#> SRR1974892 1 0.7229 0.06685 0.636 0.040 0.136 0.188
#> SRR1974890 1 0.7156 0.08218 0.640 0.036 0.140 0.184
#> SRR1974891 1 0.9297 -0.22367 0.436 0.252 0.160 0.152
#> SRR1974889 2 0.4468 0.65659 0.000 0.752 0.232 0.016
#> SRR1974888 2 0.9411 0.36445 0.280 0.388 0.216 0.116
#> SRR1974886 1 0.9782 -0.39820 0.324 0.296 0.180 0.200
#> SRR1974887 1 0.7041 0.07642 0.644 0.032 0.128 0.196
#> SRR1974885 1 0.7041 0.07642 0.644 0.032 0.128 0.196
#> SRR1974883 1 0.9366 -0.21129 0.432 0.236 0.180 0.152
#> SRR1974884 2 0.7243 0.62233 0.076 0.636 0.216 0.072
#> SRR1974881 1 0.9771 -0.34266 0.344 0.268 0.176 0.212
#> SRR1974882 1 0.9778 -0.35110 0.344 0.264 0.176 0.216
#> SRR1974880 2 0.9037 0.44178 0.232 0.476 0.160 0.132
#> SRR1974879 2 0.9728 0.34362 0.260 0.360 0.200 0.180
#> SRR1974877 2 0.4706 0.65903 0.000 0.748 0.224 0.028
#> SRR1974876 1 0.8560 -0.11998 0.540 0.116 0.156 0.188
#> SRR1974878 1 0.7759 -0.02302 0.596 0.056 0.152 0.196
#> SRR1974875 1 0.7041 0.07642 0.644 0.032 0.128 0.196
#> SRR1974874 2 0.7325 0.39613 0.000 0.528 0.208 0.264
#> SRR1974873 4 0.2694 0.58693 0.016 0.024 0.044 0.916
#> SRR1974871 4 0.7119 -0.10231 0.000 0.432 0.128 0.440
#> SRR1974872 1 0.8259 0.02415 0.480 0.064 0.340 0.116
#> SRR1974869 4 0.7577 -0.00663 0.000 0.376 0.196 0.428
#> SRR1974868 2 0.2164 0.65991 0.004 0.924 0.004 0.068
#> SRR1974870 4 0.7937 0.07577 0.012 0.348 0.196 0.444
#> SRR1974866 4 0.7739 0.10637 0.004 0.332 0.208 0.456
#> SRR1974867 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974865 2 0.7276 0.42624 0.000 0.540 0.224 0.236
#> SRR1974864 1 0.6617 0.44634 0.576 0.020 0.352 0.052
#> SRR1974862 2 0.7521 0.21782 0.000 0.444 0.188 0.368
#> SRR1974863 2 0.7252 0.43030 0.000 0.544 0.224 0.232
#> SRR1974860 2 0.1637 0.66466 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974861 2 0.4267 0.65041 0.000 0.788 0.188 0.024
#> SRR1974859 4 0.3255 0.59076 0.016 0.048 0.044 0.892
#> SRR1974858 2 0.7226 0.44332 0.000 0.548 0.232 0.220
#> SRR1974856 4 0.3255 0.58854 0.016 0.044 0.048 0.892
#> SRR1974857 2 0.7252 0.43030 0.000 0.544 0.224 0.232
#> SRR1974855 1 0.6929 0.26598 0.620 0.008 0.192 0.180
#> SRR1974854 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974853 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974851 1 0.6833 0.35831 0.584 0.000 0.272 0.144
#> SRR1974852 4 0.6546 0.49779 0.012 0.176 0.144 0.668
#> SRR1974849 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974848 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974850 1 0.7593 -0.19416 0.476 0.000 0.236 0.288
#> SRR1974846 4 0.2895 0.58798 0.016 0.032 0.044 0.908
#> SRR1974847 1 0.5560 0.52558 0.608 0.004 0.368 0.020
#> SRR1974845 4 0.6255 0.50648 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974844 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974843 1 0.6701 0.44526 0.580 0.028 0.344 0.048
#> SRR1974842 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974841 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974840 4 0.3008 0.58682 0.020 0.032 0.044 0.904
#> SRR1974839 4 0.6255 0.50387 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974838 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974837 1 0.4889 0.55197 0.636 0.000 0.360 0.004
#> SRR1974835 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974836 4 0.6385 0.50215 0.012 0.160 0.144 0.684
#> SRR1974834 4 0.6385 0.49982 0.012 0.160 0.144 0.684
#> SRR1974833 1 0.7045 0.26252 0.616 0.012 0.196 0.176
#> SRR1974831 4 0.6255 0.50387 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974832 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974830 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974829 1 0.5582 0.52814 0.620 0.000 0.348 0.032
#> SRR1974828 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974826 2 0.7456 0.25588 0.000 0.460 0.180 0.360
#> SRR1974827 4 0.6255 0.50387 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974824 1 0.5980 0.49260 0.592 0.004 0.364 0.040
#> SRR1974825 1 0.5371 0.53249 0.616 0.000 0.364 0.020
#> SRR1974822 1 0.6376 0.47149 0.588 0.004 0.340 0.068
#> SRR1974823 3 0.9100 0.00000 0.276 0.064 0.352 0.308
#> SRR1974820 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974818 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974819 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974817 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974816 1 0.6827 0.37773 0.568 0.000 0.304 0.128
#> SRR1974815 1 0.5024 0.54913 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR1974813 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974814 4 0.6520 0.03007 0.176 0.016 0.132 0.676
#> SRR1974812 1 0.7027 0.34507 0.568 0.004 0.292 0.136
#> SRR1974810 1 0.6004 0.49940 0.616 0.004 0.332 0.048
#> SRR1974808 4 0.7936 0.10031 0.008 0.336 0.220 0.436
#> SRR1974811 1 0.5349 0.53474 0.640 0.000 0.336 0.024
#> SRR1974809 1 0.5040 0.54756 0.628 0.000 0.364 0.008
#> SRR1974807 1 0.6472 0.47770 0.604 0.016 0.324 0.056
#> SRR1974806 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974805 4 0.6255 0.50656 0.012 0.144 0.148 0.696
#> SRR1974804 1 0.6792 0.36790 0.588 0.000 0.272 0.140
#> SRR1974803 1 0.6299 0.46928 0.600 0.000 0.320 0.080
#> SRR1974801 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974800 1 0.5887 0.50594 0.600 0.004 0.360 0.036
#> SRR1974799 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974798 2 0.2048 0.66488 0.000 0.928 0.008 0.064
#> SRR1974797 4 0.6813 0.48463 0.012 0.196 0.152 0.640
#> SRR1974796 4 0.6527 0.50410 0.024 0.140 0.148 0.688
#> SRR1974795 4 0.6255 0.50387 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974793 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974794 2 0.2892 0.67105 0.000 0.896 0.036 0.068
#> SRR1974792 4 0.6546 0.50006 0.012 0.176 0.144 0.668
#> SRR1974791 4 0.6255 0.50387 0.012 0.148 0.144 0.696
#> SRR1974790 4 0.6880 0.48117 0.012 0.204 0.152 0.632
#> SRR1974789 2 0.2623 0.66985 0.000 0.908 0.028 0.064
#> SRR1974788 2 0.1637 0.66466 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974786 1 0.5769 0.49270 0.588 0.000 0.376 0.036
#> SRR1974787 1 0.7070 0.42205 0.580 0.048 0.320 0.052
#> SRR1974784 4 0.7600 0.45127 0.040 0.208 0.156 0.596
#> SRR1974783 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974785 1 0.5496 0.52075 0.604 0.000 0.372 0.024
#> SRR1974782 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974781 4 0.8450 0.28401 0.072 0.312 0.132 0.484
#> SRR1974780 1 0.6938 0.41697 0.568 0.036 0.344 0.052
#> SRR1974779 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974777 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974776 1 0.7576 0.30643 0.536 0.052 0.336 0.076
#> SRR1974778 1 0.5159 0.54270 0.624 0.000 0.364 0.012
#> SRR1974774 2 0.3366 0.63741 0.004 0.872 0.028 0.096
#> SRR1974773 1 0.4920 0.54792 0.628 0.000 0.368 0.004
#> SRR1974775 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974772 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974771 2 0.8474 0.14629 0.088 0.492 0.116 0.304
#> SRR1974770 2 0.3015 0.64206 0.000 0.884 0.024 0.092
#> SRR1974769 4 0.6299 0.50193 0.012 0.152 0.144 0.692
#> SRR1974768 2 0.3970 0.60619 0.004 0.836 0.036 0.124
#> SRR1974767 1 0.8228 0.11445 0.524 0.084 0.288 0.104
#> SRR1974766 2 0.6196 0.41648 0.016 0.668 0.064 0.252
#> SRR1974765 4 0.6345 0.50500 0.008 0.168 0.144 0.680
#> SRR1974764 2 0.4090 0.62126 0.008 0.836 0.040 0.116
#> SRR1974763 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974762 1 0.4920 0.54792 0.628 0.000 0.368 0.004
#> SRR1974761 2 0.3914 0.62978 0.008 0.848 0.040 0.104
#> SRR1974760 4 0.6527 0.50410 0.024 0.140 0.148 0.688
#> SRR1974759 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974758 2 0.3182 0.63831 0.000 0.876 0.028 0.096
#> SRR1974757 4 0.7713 0.27203 0.024 0.356 0.128 0.492
#> SRR1974756 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974754 4 0.3504 0.58937 0.016 0.056 0.048 0.880
#> SRR1974755 2 0.2882 0.64708 0.000 0.892 0.024 0.084
#> SRR1974753 4 0.4616 0.58523 0.016 0.124 0.048 0.812
#> SRR1974751 4 0.3303 0.57761 0.028 0.032 0.048 0.892
#> SRR1974750 4 0.3008 0.58594 0.020 0.032 0.044 0.904
#> SRR1974752 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974749 1 0.9844 -0.52939 0.340 0.216 0.204 0.240
#> SRR1974747 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974748 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974746 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974744 4 0.6283 0.40687 0.004 0.264 0.088 0.644
#> SRR1974745 4 0.3008 0.58594 0.020 0.032 0.044 0.904
#> SRR1974743 4 0.3410 0.59250 0.016 0.060 0.040 0.884
#> SRR1974742 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974740 4 0.6283 0.40006 0.004 0.264 0.088 0.644
#> SRR1974739 4 0.3094 0.58637 0.020 0.032 0.048 0.900
#> SRR1974741 4 0.4606 0.58460 0.004 0.100 0.088 0.808
#> SRR1974738 4 0.7660 0.45377 0.040 0.216 0.156 0.588
#> SRR1974737 4 0.3468 0.59236 0.012 0.052 0.056 0.880
#> SRR1974736 4 0.3008 0.58594 0.020 0.032 0.044 0.904
#> SRR1974735 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974734 4 0.8261 0.31037 0.088 0.168 0.180 0.564
#> SRR1974733 4 0.2990 0.58835 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974732 4 0.7374 -0.14005 0.200 0.040 0.140 0.620
#> SRR1974731 4 0.2990 0.58835 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974729 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974730 1 0.5024 0.54629 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR1974728 4 0.4100 0.59127 0.016 0.100 0.040 0.844
#> SRR1974725 4 0.7722 -0.33388 0.220 0.028 0.188 0.564
#> SRR1974726 4 0.2990 0.58835 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974724 1 0.4889 0.55189 0.636 0.000 0.360 0.004
#> SRR1974727 4 0.8228 0.27376 0.024 0.264 0.244 0.468
#> SRR1974723 4 0.2990 0.58885 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974722 4 0.6683 0.10545 0.168 0.032 0.120 0.680
#> SRR1974721 2 0.7453 0.34453 0.000 0.496 0.204 0.300
#> SRR1974720 4 0.6842 0.16875 0.144 0.032 0.156 0.668
#> SRR1974719 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974718 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974716 4 0.9155 0.02666 0.124 0.184 0.236 0.456
#> SRR1974717 4 0.5205 0.56170 0.012 0.156 0.064 0.768
#> SRR1974715 4 0.3008 0.58594 0.020 0.032 0.044 0.904
#> SRR1974713 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974714 4 0.8584 0.29470 0.052 0.220 0.256 0.472
#> SRR1974711 4 0.9106 0.04040 0.092 0.192 0.300 0.416
#> SRR1974712 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974709 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974708 4 0.8060 0.11136 0.016 0.336 0.204 0.444
#> SRR1974710 4 0.8275 0.12618 0.028 0.336 0.196 0.440
#> SRR1974707 1 0.8611 -0.28458 0.460 0.060 0.304 0.176
#> SRR1974706 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974704 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974705 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974703 4 0.6103 0.49091 0.004 0.192 0.116 0.688
#> SRR1974702 1 0.5810 0.51761 0.624 0.016 0.340 0.020
#> SRR1974701 4 0.3218 0.58053 0.028 0.032 0.044 0.896
#> SRR1974699 4 0.6365 0.40734 0.004 0.268 0.092 0.636
#> SRR1974698 4 0.3424 0.59220 0.016 0.048 0.052 0.884
#> SRR1974700 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974697 4 0.9597 -0.80585 0.268 0.124 0.264 0.344
#> SRR1974696 4 0.8207 0.27291 0.100 0.160 0.164 0.576
#> SRR1974694 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974695 4 0.8939 0.21974 0.084 0.204 0.256 0.456
#> SRR1974693 4 0.3081 0.58903 0.016 0.040 0.044 0.900
#> SRR1974692 4 0.3167 0.59068 0.016 0.040 0.048 0.896
#> SRR1974690 4 0.6813 0.48141 0.012 0.196 0.152 0.640
#> SRR1974691 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974689 4 0.2990 0.58835 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974688 4 0.2990 0.58835 0.016 0.036 0.044 0.904
#> SRR1974687 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974686 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974685 1 0.4990 0.55122 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974684 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974683 1 0.5110 0.54962 0.636 0.000 0.352 0.012
#> SRR1974682 4 0.3303 0.57761 0.028 0.032 0.048 0.892
#> SRR1974681 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974679 4 0.6364 0.16331 0.160 0.024 0.116 0.700
#> SRR1974680 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974678 4 0.3201 0.58092 0.024 0.032 0.048 0.896
#> SRR1974677 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974676 2 0.2742 0.65382 0.000 0.900 0.024 0.076
#> SRR1974675 2 0.5677 0.65215 0.008 0.708 0.224 0.060
#> SRR1974674 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974673 4 0.7627 -0.05909 0.000 0.388 0.204 0.408
#> SRR1974671 2 0.1743 0.66682 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1974672 2 0.7252 0.43030 0.000 0.544 0.224 0.232
#> SRR1974670 2 0.7277 0.42718 0.000 0.540 0.228 0.232
#> SRR1974669 2 0.1557 0.66556 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974667 2 0.4090 0.62126 0.008 0.836 0.040 0.116
#> SRR1974668 2 0.1743 0.66688 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1974666 2 0.1557 0.66556 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974664 2 0.7252 0.43030 0.000 0.544 0.224 0.232
#> SRR1974665 2 0.3013 0.64936 0.000 0.888 0.032 0.080
#> SRR1974663 1 0.8080 0.14653 0.504 0.060 0.328 0.108
#> SRR1974662 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974661 4 0.8515 0.28427 0.052 0.208 0.256 0.484
#> SRR1974660 1 0.5230 0.53829 0.620 0.004 0.368 0.008
#> SRR1974659 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974658 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974657 1 0.6771 0.42373 0.576 0.020 0.340 0.064
#> SRR1974654 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974655 1 0.6249 0.46775 0.584 0.008 0.360 0.048
#> SRR1974656 4 0.9384 -0.27684 0.156 0.164 0.260 0.420
#> SRR1974650 4 0.9246 0.06580 0.116 0.200 0.252 0.432
#> SRR1974651 4 0.5495 0.57366 0.008 0.120 0.120 0.752
#> SRR1974652 1 0.7464 0.32067 0.548 0.044 0.328 0.080
#> SRR1974653 4 0.2895 0.58798 0.016 0.032 0.044 0.908
#> SRR1974648 4 0.9477 -0.81031 0.252 0.108 0.288 0.352
#> SRR1974646 4 0.9677 -0.24427 0.156 0.216 0.268 0.360
#> SRR1974649 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974647 4 0.5387 0.57608 0.008 0.112 0.120 0.760
#> SRR1974645 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974644 2 0.3831 0.62992 0.004 0.848 0.040 0.108
#> SRR1974643 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974642 4 0.8554 0.30393 0.048 0.220 0.264 0.468
#> SRR1974640 4 0.8564 0.27601 0.056 0.200 0.264 0.480
#> SRR1974641 2 0.7529 0.29970 0.000 0.472 0.204 0.324
#> SRR1974639 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974638 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974635 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974636 4 0.9084 0.09127 0.116 0.188 0.232 0.464
#> SRR1974634 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974637 4 0.5495 0.57570 0.008 0.120 0.120 0.752
#> SRR1974633 1 0.8042 0.12947 0.500 0.056 0.336 0.108
#> SRR1974632 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974631 4 0.8663 0.20758 0.068 0.188 0.264 0.480
#> SRR1974630 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974629 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974628 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974627 1 0.5987 0.50468 0.600 0.016 0.360 0.024
#> SRR1974624 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974625 2 0.4253 0.65008 0.000 0.776 0.208 0.016
#> SRR1974623 4 0.8657 0.27128 0.048 0.252 0.252 0.448
#> SRR1974622 4 0.9258 -0.81992 0.244 0.084 0.312 0.360
#> SRR1974620 4 0.8632 0.27014 0.060 0.204 0.260 0.476
#> SRR1974619 4 0.8386 0.31538 0.044 0.212 0.252 0.492
#> SRR1974621 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974617 1 0.5024 0.54913 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR1974616 1 0.7088 0.32208 0.568 0.004 0.280 0.148
#> SRR1974615 1 0.5467 0.52477 0.612 0.000 0.364 0.024
#> SRR1974618 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974614 1 0.9574 -0.80473 0.324 0.120 0.312 0.244
#> SRR1974613 4 0.9010 0.11420 0.100 0.188 0.252 0.460
#> SRR1974612 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974611 4 0.8623 0.21366 0.048 0.296 0.212 0.444
#> SRR1974610 4 0.6778 0.22574 0.000 0.336 0.112 0.552
#> SRR1974609 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974608 4 0.9106 -0.78940 0.308 0.072 0.240 0.380
#> SRR1974607 1 0.6727 0.32463 0.520 0.000 0.384 0.096
#> SRR1974606 2 0.1716 0.66408 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974605 1 0.7694 0.21356 0.508 0.036 0.352 0.104
#> SRR1974604 4 0.2895 0.58798 0.016 0.032 0.044 0.908
#> SRR1974603 1 0.8728 -0.24424 0.456 0.080 0.312 0.152
#> SRR1974602 1 0.4905 0.55168 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1974600 4 0.7020 0.36195 0.012 0.276 0.120 0.592
#> SRR1974601 4 0.8483 0.28256 0.040 0.260 0.236 0.464
#> SRR1974599 2 0.2363 0.66761 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1974598 2 0.2363 0.66761 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1974596 2 0.2943 0.66467 0.000 0.892 0.032 0.076
#> SRR1974594 4 0.4912 0.48208 0.064 0.012 0.132 0.792
#> SRR1974593 2 0.7640 0.21837 0.004 0.444 0.180 0.372
#> SRR1974595 4 0.7058 0.34681 0.004 0.248 0.164 0.584
#> SRR1974592 2 0.2773 0.66620 0.000 0.900 0.028 0.072
#> SRR1974591 2 0.2363 0.66761 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1974588 4 0.5118 0.47035 0.072 0.016 0.128 0.784
#> SRR1974590 4 0.7296 0.15061 0.000 0.320 0.172 0.508
#> SRR1974589 4 0.7127 0.52331 0.044 0.164 0.140 0.652
#> SRR1974587 4 0.4663 0.53790 0.048 0.024 0.112 0.816
#> SRR1974586 2 0.7458 0.21089 0.000 0.444 0.176 0.380
#> SRR1974585 4 0.4641 0.52320 0.052 0.016 0.120 0.812
#> SRR1974584 1 0.7075 0.21092 0.488 0.000 0.384 0.128
#> SRR1974583 2 0.7469 0.23376 0.000 0.452 0.180 0.368
#> SRR1974582 2 0.2363 0.66761 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1974581 2 0.7304 0.42746 0.000 0.532 0.208 0.260
#> SRR1974580 4 0.5441 0.54250 0.044 0.048 0.136 0.772
#> SRR1974578 4 0.4657 0.50422 0.056 0.012 0.124 0.808
#> SRR1974577 2 0.8168 -0.11367 0.028 0.408 0.168 0.396
#> SRR1974579 4 0.4663 0.53790 0.048 0.024 0.112 0.816
#> SRR1974576 2 0.7325 0.42146 0.000 0.528 0.208 0.264
#> SRR1974575 2 0.2376 0.66794 0.000 0.916 0.016 0.068
#> SRR1974574 4 0.5945 0.52609 0.008 0.144 0.132 0.716
#> SRR1974573 4 0.5991 0.52413 0.008 0.148 0.132 0.712
#> SRR1974571 4 0.6036 0.52257 0.008 0.152 0.132 0.708
#> SRR1974572 4 0.5991 0.52413 0.008 0.148 0.132 0.712
#> SRR1974570 1 0.7421 0.15899 0.472 0.012 0.396 0.120
#> SRR1974568 1 0.7220 0.13192 0.472 0.000 0.384 0.144
#> SRR1974567 1 0.7156 0.16425 0.476 0.000 0.388 0.136
#> SRR1974566 4 0.6036 0.52257 0.008 0.152 0.132 0.708
#> SRR1974569 4 0.6277 0.51050 0.008 0.180 0.128 0.684
#> SRR1974565 4 0.5071 0.42318 0.080 0.004 0.144 0.772
#> SRR1974564 4 0.6206 0.52020 0.008 0.168 0.132 0.692
#> SRR1974560 1 0.7156 0.16425 0.476 0.000 0.388 0.136
#> SRR1974559 1 0.7075 0.21092 0.488 0.000 0.384 0.128
#> SRR1974563 4 0.6036 0.52257 0.008 0.152 0.132 0.708
#> SRR1974562 4 0.6206 0.52020 0.008 0.168 0.132 0.692
#> SRR1974561 4 0.6036 0.52257 0.008 0.152 0.132 0.708
#> SRR1974557 2 0.7366 0.40360 0.000 0.524 0.224 0.252
#> SRR1974553 4 0.5991 0.52413 0.008 0.148 0.132 0.712
#> SRR1974555 1 0.7075 0.21092 0.488 0.000 0.384 0.128
#> SRR1974551 1 0.7075 0.21092 0.488 0.000 0.384 0.128
#> SRR1974552 4 0.6170 0.52097 0.008 0.160 0.136 0.696
#> SRR1974554 1 0.9005 -0.56203 0.376 0.064 0.328 0.232
#> SRR1974558 1 0.7156 0.16425 0.476 0.000 0.388 0.136
#> SRR1974556 1 0.7075 0.21092 0.488 0.000 0.384 0.128
#> SRR1974550 4 0.8451 0.28827 0.036 0.256 0.248 0.460
#> SRR1974549 4 0.5991 0.52413 0.008 0.148 0.132 0.712
#> SRR1974548 4 0.6182 0.55073 0.016 0.144 0.132 0.708
#> SRR1974547 1 0.9338 -0.74925 0.344 0.088 0.304 0.264
#> SRR1974546 1 0.8689 -0.42329 0.416 0.048 0.324 0.212
#> SRR1974545 4 0.6724 0.46830 0.008 0.240 0.124 0.628
#> SRR1974544 1 0.7156 0.16425 0.476 0.000 0.388 0.136
#> SRR1974543 4 0.6179 0.54034 0.016 0.148 0.128 0.708
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0794 0.80799 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1975008 5 0.6746 0.66328 0.012 0.260 0.168 0.012 0.548
#> SRR1975006 5 0.6114 0.54145 0.020 0.392 0.056 0.008 0.524
#> SRR1975005 3 0.2828 0.73324 0.004 0.020 0.872 0.000 0.104
#> SRR1975004 3 0.1329 0.80723 0.008 0.004 0.956 0.000 0.032
#> SRR1975003 5 0.6587 0.62200 0.008 0.176 0.328 0.000 0.488
#> SRR1975001 5 0.5564 0.47936 0.020 0.412 0.016 0.012 0.540
#> SRR1975002 5 0.6361 0.61840 0.016 0.340 0.084 0.012 0.548
#> SRR1974999 5 0.6705 0.64653 0.008 0.284 0.176 0.008 0.524
#> SRR1975000 3 0.1300 0.81571 0.028 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR1974998 3 0.1117 0.81821 0.020 0.000 0.964 0.000 0.016
#> SRR1974997 3 0.7348 0.23057 0.220 0.012 0.552 0.144 0.072
#> SRR1974995 5 0.6003 0.39482 0.000 0.112 0.440 0.000 0.448
#> SRR1974996 3 0.1211 0.81811 0.024 0.000 0.960 0.000 0.016
#> SRR1974994 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1697 0.79549 0.008 0.000 0.932 0.000 0.060
#> SRR1974992 3 0.2289 0.75509 0.004 0.012 0.904 0.000 0.080
#> SRR1974990 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.7230 0.30474 0.196 0.008 0.564 0.160 0.072
#> SRR1974991 3 0.2881 0.74232 0.008 0.024 0.876 0.000 0.092
#> SRR1974986 3 0.0609 0.81290 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974987 5 0.6868 0.54318 0.008 0.188 0.368 0.004 0.432
#> SRR1974988 3 0.0865 0.81538 0.004 0.000 0.972 0.000 0.024
#> SRR1974984 3 0.2162 0.77682 0.008 0.012 0.916 0.000 0.064
#> SRR1974985 3 0.0794 0.80823 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.5754 0.53239 0.016 0.392 0.032 0.012 0.548
#> SRR1974982 3 0.0703 0.81081 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0703 0.81081 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5506 0.03101 0.000 0.068 0.584 0.004 0.344
#> SRR1974978 3 0.0703 0.81126 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0794 0.80871 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.6427 -0.42084 0.004 0.116 0.444 0.008 0.428
#> SRR1974975 3 0.3495 0.66823 0.000 0.028 0.812 0.000 0.160
#> SRR1974974 5 0.6872 0.64801 0.008 0.220 0.260 0.008 0.504
#> SRR1974973 5 0.5899 0.46899 0.028 0.416 0.020 0.016 0.520
#> SRR1974972 3 0.2262 0.78061 0.004 0.012 0.912 0.004 0.068
#> SRR1974971 5 0.6374 0.55619 0.020 0.368 0.072 0.012 0.528
#> SRR1974970 3 0.0404 0.81368 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974969 3 0.1471 0.81703 0.024 0.004 0.952 0.000 0.020
#> SRR1974968 5 0.6368 0.51259 0.004 0.124 0.400 0.004 0.468
#> SRR1974967 3 0.0609 0.81466 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974965 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974966 5 0.6640 0.66035 0.012 0.236 0.184 0.008 0.560
#> SRR1974964 3 0.1410 0.78477 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974963 3 0.0963 0.80691 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974961 3 0.2124 0.73827 0.000 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR1974962 5 0.5825 0.47262 0.024 0.416 0.020 0.016 0.524
#> SRR1974960 3 0.0451 0.81757 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974959 3 0.0000 0.81737 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 5 0.6432 0.62370 0.016 0.308 0.100 0.012 0.564
#> SRR1974957 3 0.5478 0.01932 0.004 0.068 0.592 0.000 0.336
#> SRR1974956 3 0.1041 0.80544 0.004 0.000 0.964 0.000 0.032
#> SRR1974955 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.1282 0.79896 0.004 0.000 0.952 0.000 0.044
#> SRR1974953 5 0.5818 0.31051 0.044 0.464 0.004 0.016 0.472
#> SRR1974952 3 0.0955 0.80623 0.004 0.000 0.968 0.000 0.028
#> SRR1974949 3 0.1478 0.78642 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974950 3 0.5490 -0.06783 0.000 0.072 0.556 0.000 0.372
#> SRR1974951 3 0.5638 -0.15803 0.000 0.068 0.532 0.004 0.396
#> SRR1974947 3 0.3772 0.62342 0.000 0.036 0.792 0.000 0.172
#> SRR1974948 5 0.6833 0.65959 0.012 0.288 0.164 0.012 0.524
#> SRR1974946 2 0.5929 0.17157 0.116 0.572 0.000 0.004 0.308
#> SRR1974945 3 0.0955 0.81551 0.004 0.000 0.968 0.000 0.028
#> SRR1974944 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.1043 0.79643 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.4717 0.47884 0.004 0.048 0.704 0.000 0.244
#> SRR1974941 3 0.0703 0.81068 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0510 0.81452 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.5839 -0.07804 0.000 0.080 0.544 0.008 0.368
#> SRR1974938 3 0.0162 0.81791 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1041 0.80738 0.032 0.000 0.964 0.000 0.004
#> SRR1974936 3 0.0794 0.80799 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0324 0.81834 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974934 5 0.6683 0.59154 0.028 0.348 0.068 0.024 0.532
#> SRR1974933 3 0.5760 -0.09203 0.000 0.072 0.544 0.008 0.376
#> SRR1974932 3 0.0162 0.81791 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.1043 0.79643 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.1043 0.79643 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0794 0.80799 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.6552 0.54014 0.020 0.388 0.084 0.012 0.496
#> SRR1974927 3 0.0566 0.81513 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974924 3 0.0794 0.80799 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0963 0.80138 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0880 0.80521 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.2313 0.80201 0.040 0.012 0.916 0.000 0.032
#> SRR1974922 3 0.1124 0.81182 0.004 0.000 0.960 0.000 0.036
#> SRR1974921 3 0.0703 0.81127 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.1043 0.79643 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0162 0.81791 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0579 0.81795 0.008 0.000 0.984 0.000 0.008
#> SRR1974917 2 0.5820 -0.18120 0.056 0.504 0.000 0.016 0.424
#> SRR1974916 3 0.0162 0.81791 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0324 0.81726 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974914 3 0.8014 0.23959 0.072 0.040 0.508 0.164 0.216
#> SRR1974913 3 0.0609 0.81331 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.1043 0.79643 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0794 0.80780 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974908 5 0.5789 0.44378 0.036 0.428 0.012 0.012 0.512
#> SRR1974909 3 0.0000 0.81737 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.3569 0.64167 0.004 0.028 0.816 0.000 0.152
#> SRR1974907 3 0.0566 0.81535 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974905 3 0.0566 0.81685 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1974904 5 0.6325 0.51900 0.004 0.120 0.392 0.004 0.480
#> SRR1974903 3 0.0162 0.81791 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.5510 0.07386 0.000 0.060 0.588 0.008 0.344
#> SRR1974901 3 0.1502 0.80170 0.004 0.000 0.940 0.000 0.056
#> SRR1974898 5 0.6105 0.48376 0.036 0.408 0.024 0.016 0.516
#> SRR1974900 5 0.7238 0.65264 0.008 0.216 0.252 0.028 0.496
#> SRR1974899 5 0.6372 0.62049 0.012 0.344 0.092 0.012 0.540
#> SRR1974897 5 0.5975 0.46228 0.032 0.420 0.020 0.016 0.512
#> SRR1974896 5 0.8161 0.60125 0.020 0.188 0.280 0.080 0.432
#> SRR1974893 5 0.6922 0.65998 0.008 0.228 0.240 0.012 0.512
#> SRR1974895 2 0.5904 0.18283 0.112 0.572 0.000 0.004 0.312
#> SRR1974894 5 0.8375 0.54092 0.016 0.164 0.312 0.120 0.388
#> SRR1974892 3 0.7348 0.45713 0.096 0.016 0.580 0.164 0.144
#> SRR1974890 3 0.7339 0.46784 0.108 0.016 0.584 0.160 0.132
#> SRR1974891 3 0.8376 -0.20778 0.028 0.144 0.432 0.116 0.280
#> SRR1974889 2 0.5844 -0.00547 0.092 0.544 0.000 0.004 0.360
#> SRR1974888 5 0.7578 0.61701 0.008 0.192 0.296 0.048 0.456
#> SRR1974886 5 0.8712 0.47097 0.024 0.176 0.324 0.140 0.336
#> SRR1974887 3 0.7227 0.47014 0.096 0.016 0.592 0.172 0.124
#> SRR1974885 3 0.7227 0.47014 0.096 0.016 0.592 0.172 0.124
#> SRR1974883 3 0.8094 -0.24810 0.040 0.092 0.432 0.096 0.340
#> SRR1974884 5 0.6358 0.60190 0.016 0.356 0.080 0.012 0.536
#> SRR1974881 5 0.8559 0.42572 0.024 0.132 0.344 0.152 0.348
#> SRR1974882 3 0.8605 -0.45378 0.024 0.140 0.348 0.152 0.336
#> SRR1974880 5 0.8200 0.51698 0.012 0.316 0.232 0.076 0.364
#> SRR1974879 5 0.8322 0.58880 0.016 0.200 0.276 0.100 0.408
#> SRR1974877 2 0.5774 -0.05466 0.084 0.544 0.000 0.004 0.368
#> SRR1974876 3 0.8205 0.21564 0.064 0.068 0.504 0.156 0.208
#> SRR1974878 3 0.7629 0.37910 0.080 0.028 0.556 0.164 0.172
#> SRR1974875 3 0.7227 0.47014 0.096 0.016 0.592 0.172 0.124
#> SRR1974874 2 0.8182 0.31364 0.160 0.404 0.000 0.256 0.180
#> SRR1974873 4 0.1845 0.59413 0.056 0.016 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974871 4 0.7649 0.01292 0.108 0.328 0.000 0.436 0.128
#> SRR1974872 1 0.7180 0.66922 0.568 0.032 0.256 0.088 0.056
#> SRR1974869 4 0.8224 0.12122 0.148 0.232 0.000 0.396 0.224
#> SRR1974868 2 0.1525 0.60050 0.000 0.948 0.004 0.036 0.012
#> SRR1974870 4 0.8266 0.18661 0.152 0.208 0.004 0.420 0.216
#> SRR1974866 4 0.8167 0.19951 0.168 0.196 0.000 0.420 0.216
#> SRR1974867 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.8172 0.35089 0.164 0.416 0.000 0.228 0.192
#> SRR1974864 1 0.5654 0.82163 0.608 0.004 0.324 0.032 0.032
#> SRR1974862 4 0.8116 -0.13898 0.140 0.340 0.000 0.356 0.164
#> SRR1974863 2 0.8157 0.35655 0.164 0.420 0.000 0.224 0.192
#> SRR1974860 2 0.1082 0.60161 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974861 2 0.5551 0.37959 0.104 0.664 0.000 0.012 0.220
#> SRR1974859 4 0.2459 0.59317 0.052 0.040 0.000 0.904 0.004
#> SRR1974858 2 0.8231 0.35914 0.164 0.404 0.000 0.216 0.216
#> SRR1974856 4 0.2409 0.59315 0.056 0.028 0.000 0.908 0.008
#> SRR1974857 2 0.8157 0.35655 0.164 0.420 0.000 0.224 0.192
#> SRR1974855 3 0.7288 -0.24767 0.336 0.008 0.456 0.168 0.032
#> SRR1974854 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.6945 0.63112 0.464 0.004 0.368 0.136 0.028
#> SRR1974852 4 0.7121 0.39500 0.084 0.192 0.000 0.560 0.164
#> SRR1974849 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.7590 0.28271 0.360 0.004 0.324 0.280 0.032
#> SRR1974846 4 0.2036 0.59360 0.056 0.024 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974847 1 0.4772 0.86594 0.624 0.000 0.352 0.012 0.012
#> SRR1974845 4 0.7025 0.40322 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974844 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.5856 0.81679 0.596 0.008 0.328 0.036 0.032
#> SRR1974842 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.2104 0.59381 0.060 0.024 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974839 4 0.7025 0.40081 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974838 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.4114 0.87554 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.7007 0.40034 0.084 0.180 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974834 4 0.7063 0.39751 0.084 0.188 0.000 0.568 0.160
#> SRR1974833 3 0.7365 -0.25540 0.340 0.012 0.452 0.164 0.032
#> SRR1974831 4 0.7025 0.40081 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974832 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.5033 0.85212 0.596 0.004 0.372 0.024 0.004
#> SRR1974828 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.8153 -0.15979 0.140 0.340 0.000 0.348 0.172
#> SRR1974827 4 0.7025 0.40081 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974824 1 0.5171 0.84028 0.616 0.000 0.336 0.040 0.008
#> SRR1974825 1 0.4482 0.86706 0.636 0.000 0.348 0.016 0.000
#> SRR1974822 1 0.5749 0.80539 0.580 0.004 0.348 0.052 0.016
#> SRR1974823 1 0.7945 0.09502 0.476 0.024 0.124 0.284 0.092
#> SRR1974820 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.6514 0.70260 0.512 0.004 0.352 0.116 0.016
#> SRR1974815 1 0.4251 0.87783 0.624 0.000 0.372 0.000 0.004
#> SRR1974813 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.5633 0.47050 0.188 0.008 0.100 0.688 0.016
#> SRR1974812 1 0.6921 0.65718 0.492 0.008 0.348 0.124 0.028
#> SRR1974810 1 0.5705 0.80641 0.560 0.004 0.376 0.044 0.016
#> SRR1974808 4 0.8326 0.20016 0.168 0.200 0.004 0.412 0.216
#> SRR1974811 1 0.5061 0.83479 0.580 0.000 0.388 0.020 0.012
#> SRR1974809 1 0.4238 0.87780 0.628 0.000 0.368 0.004 0.000
#> SRR1974807 1 0.6115 0.80658 0.552 0.012 0.364 0.048 0.024
#> SRR1974806 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.7039 0.40268 0.092 0.176 0.000 0.576 0.156
#> SRR1974804 1 0.6765 0.64790 0.476 0.004 0.368 0.132 0.020
#> SRR1974803 1 0.6020 0.77620 0.540 0.000 0.364 0.080 0.016
#> SRR1974801 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.5008 0.85695 0.620 0.000 0.344 0.024 0.012
#> SRR1974799 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1369 0.60579 0.008 0.956 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974797 4 0.7320 0.38083 0.088 0.212 0.000 0.532 0.168
#> SRR1974796 4 0.7326 0.40291 0.088 0.172 0.012 0.572 0.156
#> SRR1974795 4 0.7025 0.40081 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974793 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2430 0.60323 0.020 0.912 0.000 0.028 0.040
#> SRR1974792 4 0.7163 0.39619 0.088 0.196 0.000 0.556 0.160
#> SRR1974791 4 0.7025 0.40081 0.088 0.176 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974790 4 0.7336 0.37758 0.088 0.220 0.000 0.528 0.164
#> SRR1974789 2 0.2494 0.59284 0.016 0.908 0.000 0.032 0.044
#> SRR1974788 2 0.1082 0.60161 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1974786 1 0.4954 0.85126 0.628 0.000 0.336 0.028 0.008
#> SRR1974787 1 0.6298 0.79938 0.568 0.020 0.336 0.044 0.032
#> SRR1974784 4 0.8020 0.33603 0.088 0.236 0.024 0.488 0.164
#> SRR1974783 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.4749 0.86410 0.628 0.000 0.348 0.016 0.008
#> SRR1974782 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.8404 0.16941 0.084 0.328 0.048 0.408 0.132
#> SRR1974780 1 0.5966 0.80494 0.596 0.008 0.320 0.040 0.036
#> SRR1974779 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.6556 0.75714 0.584 0.024 0.296 0.052 0.044
#> SRR1974778 1 0.4341 0.87587 0.628 0.000 0.364 0.008 0.000
#> SRR1974774 2 0.2476 0.58938 0.012 0.904 0.000 0.064 0.020
#> SRR1974773 1 0.4088 0.87791 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974771 2 0.7911 0.23151 0.072 0.524 0.064 0.244 0.096
#> SRR1974770 2 0.2199 0.59441 0.008 0.916 0.000 0.060 0.016
#> SRR1974769 4 0.7007 0.40040 0.084 0.180 0.000 0.576 0.160
#> SRR1974768 2 0.3149 0.55143 0.008 0.864 0.004 0.100 0.024
#> SRR1974767 1 0.7502 0.67330 0.528 0.040 0.284 0.084 0.064
#> SRR1974766 2 0.5588 0.42680 0.024 0.696 0.008 0.192 0.080
#> SRR1974765 4 0.7031 0.40375 0.084 0.188 0.000 0.572 0.156
#> SRR1974764 2 0.3227 0.57515 0.016 0.868 0.004 0.084 0.028
#> SRR1974763 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.4088 0.87791 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.3027 0.58456 0.012 0.880 0.004 0.072 0.032
#> SRR1974760 4 0.7326 0.40291 0.088 0.172 0.012 0.572 0.156
#> SRR1974759 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2364 0.59142 0.008 0.908 0.000 0.064 0.020
#> SRR1974757 4 0.7765 0.13226 0.060 0.372 0.012 0.396 0.160
#> SRR1974756 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.2688 0.59162 0.056 0.036 0.000 0.896 0.012
#> SRR1974755 2 0.2060 0.59765 0.008 0.924 0.000 0.052 0.016
#> SRR1974753 4 0.3946 0.56561 0.052 0.108 0.000 0.820 0.020
#> SRR1974751 4 0.2396 0.59353 0.068 0.024 0.004 0.904 0.000
#> SRR1974750 4 0.2104 0.59389 0.060 0.024 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974752 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.9496 0.13345 0.280 0.228 0.228 0.200 0.064
#> SRR1974747 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974748 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.6075 0.41461 0.072 0.208 0.000 0.652 0.068
#> SRR1974745 4 0.2104 0.59389 0.060 0.024 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974743 4 0.2513 0.59152 0.048 0.040 0.000 0.904 0.008
#> SRR1974742 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.6158 0.40369 0.072 0.212 0.000 0.644 0.072
#> SRR1974739 4 0.2171 0.59501 0.064 0.024 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974741 4 0.4202 0.55904 0.076 0.060 0.000 0.816 0.048
#> SRR1974738 4 0.6855 0.46219 0.164 0.140 0.000 0.600 0.096
#> SRR1974737 4 0.2644 0.59116 0.060 0.036 0.000 0.896 0.008
#> SRR1974736 4 0.2104 0.59389 0.060 0.024 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974735 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.7371 0.46692 0.224 0.096 0.020 0.564 0.096
#> SRR1974733 4 0.2054 0.59369 0.052 0.028 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974732 4 0.6418 0.44046 0.236 0.020 0.092 0.624 0.028
#> SRR1974731 4 0.2054 0.59369 0.052 0.028 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974729 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.4251 0.87420 0.624 0.000 0.372 0.000 0.004
#> SRR1974728 4 0.3399 0.57781 0.048 0.080 0.000 0.856 0.016
#> SRR1974725 4 0.6723 0.40516 0.272 0.012 0.112 0.572 0.032
#> SRR1974726 4 0.2054 0.59369 0.052 0.028 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974724 1 0.4114 0.87605 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1974727 4 0.8119 0.30518 0.224 0.160 0.004 0.448 0.164
#> SRR1974723 4 0.2196 0.59399 0.056 0.024 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974722 4 0.5671 0.47809 0.176 0.020 0.104 0.692 0.008
#> SRR1974721 2 0.8193 0.25107 0.148 0.380 0.000 0.292 0.180
#> SRR1974720 4 0.5910 0.50433 0.204 0.016 0.076 0.676 0.028
#> SRR1974719 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.8346 0.36972 0.296 0.096 0.040 0.436 0.132
#> SRR1974717 4 0.4680 0.53841 0.060 0.124 0.000 0.776 0.040
#> SRR1974715 4 0.2104 0.59389 0.060 0.024 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974713 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.8233 0.34155 0.256 0.116 0.016 0.444 0.168
#> SRR1974711 4 0.8498 0.27860 0.320 0.092 0.032 0.380 0.176
#> SRR1974712 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974708 4 0.8313 0.20231 0.172 0.196 0.004 0.416 0.212
#> SRR1974710 4 0.8416 0.21324 0.168 0.204 0.008 0.412 0.208
#> SRR1974707 1 0.7753 0.57260 0.520 0.032 0.232 0.156 0.060
#> SRR1974706 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.5896 0.47688 0.092 0.148 0.000 0.688 0.072
#> SRR1974702 1 0.5385 0.83044 0.580 0.008 0.376 0.016 0.020
#> SRR1974701 4 0.2331 0.59401 0.064 0.024 0.004 0.908 0.000
#> SRR1974699 4 0.6128 0.41061 0.076 0.216 0.000 0.644 0.064
#> SRR1974698 4 0.2504 0.59246 0.064 0.032 0.000 0.900 0.004
#> SRR1974700 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.8629 -0.05296 0.404 0.056 0.128 0.308 0.104
#> SRR1974696 4 0.7392 0.47271 0.212 0.096 0.032 0.576 0.084
#> SRR1974694 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974695 4 0.8378 0.34608 0.280 0.104 0.028 0.428 0.160
#> SRR1974693 4 0.2214 0.59370 0.052 0.028 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974692 4 0.2196 0.59448 0.056 0.024 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974690 4 0.7336 0.37994 0.088 0.220 0.000 0.528 0.164
#> SRR1974691 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974689 4 0.2054 0.59369 0.052 0.028 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974688 4 0.2054 0.59369 0.052 0.028 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974687 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974686 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.4276 0.86970 0.616 0.000 0.380 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4380 0.86892 0.616 0.000 0.376 0.008 0.000
#> SRR1974682 4 0.2396 0.59353 0.068 0.024 0.004 0.904 0.000
#> SRR1974681 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.5323 0.49705 0.188 0.016 0.076 0.712 0.008
#> SRR1974680 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.2331 0.59375 0.064 0.024 0.004 0.908 0.000
#> SRR1974677 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1731 0.60298 0.008 0.940 0.000 0.040 0.012
#> SRR1974675 2 0.5788 -0.31032 0.048 0.472 0.004 0.012 0.464
#> SRR1974674 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974673 4 0.8285 0.08344 0.152 0.244 0.000 0.380 0.224
#> SRR1974671 2 0.1399 0.59603 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974672 2 0.8157 0.35655 0.164 0.420 0.000 0.224 0.192
#> SRR1974670 2 0.8176 0.35009 0.164 0.416 0.000 0.224 0.196
#> SRR1974669 2 0.1399 0.59491 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974667 2 0.3227 0.57515 0.016 0.868 0.004 0.084 0.028
#> SRR1974668 2 0.1356 0.60207 0.004 0.956 0.000 0.028 0.012
#> SRR1974666 2 0.1195 0.60157 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1974664 2 0.8176 0.35413 0.164 0.416 0.000 0.224 0.196
#> SRR1974665 2 0.2198 0.59968 0.012 0.920 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974663 1 0.7023 0.70046 0.572 0.032 0.268 0.080 0.048
#> SRR1974662 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.7938 0.35613 0.272 0.100 0.008 0.456 0.164
#> SRR1974660 1 0.4464 0.86958 0.632 0.000 0.356 0.004 0.008
#> SRR1974659 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5851 0.81029 0.600 0.008 0.320 0.052 0.020
#> SRR1974654 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.5261 0.83132 0.628 0.000 0.316 0.044 0.012
#> SRR1974656 4 0.8420 0.29947 0.344 0.076 0.052 0.392 0.136
#> SRR1974650 4 0.8581 0.33086 0.296 0.124 0.040 0.408 0.132
#> SRR1974651 4 0.4902 0.54676 0.104 0.072 0.000 0.768 0.056
#> SRR1974652 1 0.6725 0.75608 0.568 0.020 0.300 0.064 0.048
#> SRR1974653 4 0.2036 0.59360 0.056 0.024 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974648 1 0.8401 -0.06557 0.420 0.052 0.116 0.320 0.092
#> SRR1974646 4 0.9013 0.22083 0.328 0.132 0.060 0.332 0.148
#> SRR1974649 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.4776 0.55119 0.104 0.068 0.000 0.776 0.052
#> SRR1974645 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3011 0.57284 0.012 0.876 0.000 0.076 0.036
#> SRR1974643 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.8186 0.33171 0.264 0.112 0.012 0.436 0.176
#> SRR1974640 4 0.7898 0.35820 0.276 0.092 0.008 0.456 0.168
#> SRR1974641 2 0.8212 0.20623 0.144 0.360 0.000 0.312 0.184
#> SRR1974639 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.8321 0.37313 0.284 0.100 0.036 0.444 0.136
#> SRR1974634 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4852 0.54825 0.100 0.072 0.000 0.772 0.056
#> SRR1974633 1 0.6958 0.69569 0.576 0.024 0.260 0.096 0.044
#> SRR1974632 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.7892 0.36025 0.296 0.084 0.012 0.452 0.156
#> SRR1974630 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.5074 0.85273 0.624 0.008 0.340 0.020 0.008
#> SRR1974624 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.5828 0.24284 0.116 0.596 0.000 0.004 0.284
#> SRR1974623 4 0.8247 0.30914 0.244 0.124 0.008 0.424 0.200
#> SRR1974622 1 0.8096 -0.05743 0.436 0.032 0.108 0.328 0.096
#> SRR1974620 4 0.8032 0.35088 0.276 0.096 0.012 0.448 0.168
#> SRR1974619 4 0.7840 0.35466 0.264 0.104 0.004 0.464 0.164
#> SRR1974621 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.4251 0.87783 0.624 0.000 0.372 0.000 0.004
#> SRR1974616 1 0.7027 0.62646 0.476 0.008 0.352 0.136 0.028
#> SRR1974615 1 0.4523 0.86325 0.640 0.000 0.344 0.012 0.004
#> SRR1974618 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.8313 0.23174 0.488 0.044 0.144 0.216 0.108
#> SRR1974613 4 0.8012 0.34503 0.316 0.088 0.016 0.432 0.148
#> SRR1974612 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974611 4 0.8445 0.27267 0.204 0.160 0.012 0.420 0.204
#> SRR1974610 4 0.7109 0.27960 0.112 0.236 0.000 0.552 0.100
#> SRR1974609 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.8012 -0.06922 0.376 0.040 0.164 0.380 0.040
#> SRR1974607 1 0.5669 0.75705 0.632 0.000 0.272 0.080 0.016
#> SRR1974606 2 0.1281 0.60321 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1974605 1 0.6360 0.73137 0.604 0.012 0.264 0.096 0.024
#> SRR1974604 4 0.2036 0.59360 0.056 0.024 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974603 1 0.7853 0.57812 0.520 0.040 0.240 0.128 0.072
#> SRR1974602 1 0.4101 0.87961 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.7095 0.36363 0.100 0.208 0.004 0.576 0.112
#> SRR1974601 4 0.8044 0.30778 0.240 0.140 0.000 0.432 0.188
#> SRR1974599 2 0.1913 0.60604 0.020 0.936 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974598 2 0.1913 0.60604 0.020 0.936 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974596 2 0.2611 0.60670 0.028 0.904 0.000 0.040 0.028
#> SRR1974594 4 0.4731 0.57206 0.160 0.008 0.020 0.764 0.048
#> SRR1974593 4 0.8125 -0.11063 0.136 0.328 0.000 0.364 0.172
#> SRR1974595 4 0.7500 0.31651 0.136 0.200 0.000 0.524 0.140
#> SRR1974592 2 0.2355 0.60770 0.024 0.916 0.000 0.036 0.024
#> SRR1974591 2 0.1913 0.60604 0.020 0.936 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974588 4 0.4858 0.56930 0.164 0.008 0.024 0.756 0.048
#> SRR1974590 4 0.7783 0.18546 0.136 0.244 0.000 0.472 0.148
#> SRR1974589 4 0.6661 0.50454 0.152 0.104 0.012 0.644 0.088
#> SRR1974587 4 0.4387 0.58217 0.124 0.012 0.020 0.800 0.044
#> SRR1974586 4 0.8088 -0.11094 0.136 0.332 0.000 0.368 0.164
#> SRR1974585 4 0.4553 0.57994 0.136 0.008 0.020 0.784 0.052
#> SRR1974584 1 0.5889 0.71645 0.632 0.000 0.244 0.104 0.020
#> SRR1974583 4 0.8134 -0.13534 0.140 0.336 0.000 0.356 0.168
#> SRR1974582 2 0.1913 0.60604 0.020 0.936 0.000 0.020 0.024
#> SRR1974581 2 0.8037 0.37301 0.152 0.436 0.000 0.240 0.172
#> SRR1974580 4 0.5139 0.57347 0.148 0.020 0.016 0.748 0.068
#> SRR1974578 4 0.4541 0.57736 0.148 0.008 0.020 0.780 0.044
#> SRR1974577 2 0.8194 -0.05712 0.160 0.388 0.008 0.324 0.120
#> SRR1974579 4 0.4387 0.58217 0.124 0.012 0.020 0.800 0.044
#> SRR1974576 2 0.8074 0.36057 0.152 0.428 0.000 0.244 0.176
#> SRR1974575 2 0.2165 0.60941 0.016 0.924 0.000 0.036 0.024
#> SRR1974574 4 0.6734 0.44255 0.080 0.164 0.000 0.608 0.148
#> SRR1974573 4 0.6801 0.43783 0.080 0.168 0.000 0.600 0.152
#> SRR1974571 4 0.6832 0.43628 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974572 4 0.6801 0.43783 0.080 0.168 0.000 0.600 0.152
#> SRR1974570 1 0.6302 0.72496 0.620 0.008 0.244 0.096 0.032
#> SRR1974568 1 0.5963 0.69171 0.632 0.000 0.228 0.120 0.020
#> SRR1974567 1 0.5904 0.70141 0.636 0.000 0.232 0.112 0.020
#> SRR1974566 4 0.6832 0.43628 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974569 4 0.6902 0.42738 0.080 0.196 0.000 0.584 0.140
#> SRR1974565 4 0.4953 0.55840 0.188 0.004 0.024 0.736 0.048
#> SRR1974564 4 0.6832 0.43617 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974560 1 0.5904 0.70141 0.636 0.000 0.232 0.112 0.020
#> SRR1974559 1 0.5889 0.71645 0.632 0.000 0.244 0.104 0.020
#> SRR1974563 4 0.6832 0.43628 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974562 4 0.6832 0.43617 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974561 4 0.6832 0.43628 0.080 0.172 0.000 0.596 0.152
#> SRR1974557 2 0.8278 0.30913 0.164 0.388 0.000 0.244 0.204
#> SRR1974553 4 0.6801 0.43783 0.080 0.168 0.000 0.600 0.152
#> SRR1974555 1 0.5889 0.71645 0.632 0.000 0.244 0.104 0.020
#> SRR1974551 1 0.5889 0.71645 0.632 0.000 0.244 0.104 0.020
#> SRR1974552 4 0.6847 0.43983 0.084 0.172 0.000 0.596 0.148
#> SRR1974554 1 0.7673 0.46481 0.532 0.040 0.180 0.204 0.044
#> SRR1974558 1 0.5904 0.70141 0.636 0.000 0.232 0.112 0.020
#> SRR1974556 1 0.5889 0.71645 0.632 0.000 0.244 0.104 0.020
#> SRR1974550 4 0.8150 0.31334 0.244 0.136 0.004 0.432 0.184
#> SRR1974549 4 0.6801 0.43783 0.080 0.168 0.000 0.600 0.152
#> SRR1974548 4 0.6730 0.47570 0.100 0.132 0.004 0.628 0.136
#> SRR1974547 1 0.8019 0.32233 0.500 0.056 0.152 0.240 0.052
#> SRR1974546 1 0.7541 0.52275 0.540 0.032 0.200 0.184 0.044
#> SRR1974545 4 0.7050 0.39647 0.080 0.232 0.000 0.556 0.132
#> SRR1974544 1 0.5904 0.70141 0.636 0.000 0.232 0.112 0.020
#> SRR1974543 4 0.6785 0.46036 0.092 0.148 0.004 0.620 0.136
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.3126 0.83583 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 5 0.4885 0.68809 0.004 0.108 0.192 0.000 0.688 0.008
#> SRR1975006 5 0.5224 0.63640 0.000 0.232 0.084 0.000 0.652 0.032
#> SRR1975005 3 0.4390 0.75821 0.176 0.000 0.724 0.000 0.096 0.004
#> SRR1975004 3 0.3726 0.83039 0.216 0.000 0.752 0.000 0.028 0.004
#> SRR1975003 5 0.5393 0.60494 0.012 0.064 0.336 0.000 0.576 0.012
#> SRR1975001 5 0.4478 0.60296 0.000 0.252 0.028 0.000 0.692 0.028
#> SRR1975002 5 0.5079 0.67062 0.000 0.196 0.112 0.000 0.672 0.020
#> SRR1974999 5 0.4986 0.68148 0.000 0.148 0.188 0.000 0.660 0.004
#> SRR1975000 3 0.3298 0.83883 0.236 0.000 0.756 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974998 3 0.3245 0.83952 0.228 0.000 0.764 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974997 1 0.7999 -0.27517 0.392 0.008 0.320 0.092 0.084 0.104
#> SRR1974995 5 0.5554 0.37216 0.048 0.028 0.412 0.000 0.504 0.008
#> SRR1974996 3 0.3271 0.83994 0.232 0.000 0.760 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974994 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974993 3 0.3992 0.81385 0.196 0.004 0.752 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974992 3 0.3739 0.78621 0.176 0.000 0.768 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974990 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974989 1 0.8185 -0.33975 0.360 0.012 0.336 0.096 0.088 0.108
#> SRR1974991 3 0.4329 0.77141 0.180 0.000 0.728 0.000 0.088 0.004
#> SRR1974986 3 0.3076 0.83823 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 5 0.6579 0.49589 0.056 0.112 0.340 0.000 0.480 0.012
#> SRR1974988 3 0.3599 0.83340 0.212 0.004 0.764 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974984 3 0.3683 0.79966 0.184 0.000 0.768 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974985 3 0.3126 0.83635 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 5 0.4346 0.62712 0.000 0.232 0.036 0.000 0.712 0.020
#> SRR1974982 3 0.3240 0.83731 0.244 0.000 0.752 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974981 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974980 3 0.3101 0.83746 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5487 0.08969 0.060 0.020 0.548 0.000 0.364 0.008
#> SRR1974978 3 0.3101 0.83780 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.3265 0.83640 0.248 0.000 0.748 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974976 5 0.5428 0.35514 0.020 0.040 0.456 0.000 0.472 0.012
#> SRR1974975 3 0.5043 0.68097 0.164 0.000 0.664 0.000 0.164 0.008
#> SRR1974974 5 0.5336 0.66915 0.000 0.096 0.288 0.000 0.600 0.016
#> SRR1974973 5 0.4268 0.59769 0.000 0.256 0.028 0.000 0.700 0.016
#> SRR1974972 3 0.4201 0.79655 0.196 0.000 0.732 0.000 0.068 0.004
#> SRR1974971 5 0.5312 0.63546 0.000 0.228 0.088 0.000 0.648 0.036
#> SRR1974970 3 0.3370 0.83505 0.212 0.000 0.772 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974969 3 0.3596 0.83773 0.232 0.000 0.748 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974968 5 0.5147 0.47319 0.004 0.040 0.424 0.000 0.516 0.016
#> SRR1974967 3 0.3459 0.83514 0.212 0.000 0.768 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974965 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974966 5 0.5278 0.68517 0.004 0.108 0.200 0.000 0.664 0.024
#> SRR1974964 3 0.3768 0.80602 0.184 0.004 0.772 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974963 3 0.3602 0.82922 0.208 0.000 0.760 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974961 3 0.3681 0.76546 0.156 0.000 0.780 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974962 5 0.4339 0.59940 0.000 0.256 0.032 0.000 0.696 0.016
#> SRR1974960 3 0.3081 0.83784 0.220 0.000 0.776 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974959 3 0.3081 0.83780 0.220 0.000 0.776 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974958 5 0.4952 0.67539 0.000 0.184 0.116 0.000 0.684 0.016
#> SRR1974957 3 0.5136 0.07103 0.036 0.020 0.580 0.000 0.356 0.008
#> SRR1974956 3 0.3669 0.82817 0.208 0.000 0.760 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974955 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974954 3 0.3890 0.82387 0.204 0.000 0.752 0.000 0.036 0.008
#> SRR1974953 5 0.5070 0.50186 0.000 0.300 0.024 0.000 0.620 0.056
#> SRR1974952 3 0.3043 0.82701 0.200 0.000 0.792 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974949 3 0.3896 0.81040 0.196 0.000 0.748 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974950 3 0.5616 -0.01089 0.056 0.028 0.524 0.000 0.384 0.008
#> SRR1974951 3 0.5418 -0.10129 0.048 0.020 0.512 0.000 0.412 0.008
#> SRR1974947 3 0.5016 0.62941 0.136 0.008 0.664 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974948 5 0.5271 0.69042 0.000 0.152 0.196 0.000 0.640 0.012
#> SRR1974946 2 0.6464 -0.03576 0.000 0.440 0.052 0.000 0.368 0.140
#> SRR1974945 3 0.3753 0.83460 0.220 0.000 0.748 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974944 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.3360 0.82385 0.264 0.000 0.732 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974943 3 0.5805 0.49235 0.128 0.016 0.592 0.000 0.252 0.012
#> SRR1974941 3 0.3380 0.83781 0.244 0.000 0.748 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974940 3 0.3050 0.83884 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.5672 -0.02819 0.068 0.016 0.492 0.000 0.412 0.012
#> SRR1974938 3 0.2969 0.83804 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.3290 0.83263 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974936 3 0.3265 0.83550 0.248 0.000 0.748 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974935 3 0.3248 0.83873 0.224 0.000 0.768 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974934 5 0.5100 0.65573 0.000 0.216 0.096 0.004 0.668 0.016
#> SRR1974933 3 0.5742 -0.03505 0.060 0.024 0.512 0.004 0.392 0.008
#> SRR1974932 3 0.3109 0.83837 0.224 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974931 3 0.3360 0.82385 0.264 0.000 0.732 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974930 3 0.3360 0.82385 0.264 0.000 0.732 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974929 3 0.3126 0.83583 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 5 0.5484 0.62208 0.000 0.248 0.100 0.000 0.620 0.032
#> SRR1974927 3 0.3023 0.83475 0.212 0.000 0.784 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974924 3 0.3265 0.83550 0.248 0.000 0.748 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974925 3 0.3314 0.83083 0.256 0.000 0.740 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974926 3 0.3290 0.83362 0.252 0.000 0.744 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974923 3 0.4294 0.81189 0.256 0.004 0.700 0.000 0.032 0.008
#> SRR1974922 3 0.3558 0.83231 0.212 0.000 0.760 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974921 3 0.3101 0.83774 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.3337 0.82751 0.260 0.000 0.736 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974919 3 0.2969 0.83804 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.3221 0.83838 0.220 0.000 0.772 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974917 5 0.5509 0.40044 0.000 0.336 0.028 0.000 0.560 0.076
#> SRR1974916 3 0.3109 0.83837 0.224 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974915 3 0.2941 0.83732 0.220 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.8715 0.09284 0.132 0.036 0.400 0.096 0.220 0.116
#> SRR1974913 3 0.3076 0.83864 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.3360 0.82385 0.264 0.000 0.732 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974910 3 0.3265 0.83598 0.248 0.000 0.748 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974908 5 0.4994 0.56514 0.000 0.288 0.036 0.000 0.636 0.040
#> SRR1974909 3 0.2941 0.83740 0.220 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.5013 0.66788 0.140 0.008 0.696 0.000 0.144 0.012
#> SRR1974907 3 0.3161 0.83694 0.216 0.000 0.776 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974905 3 0.3302 0.83977 0.232 0.000 0.760 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974904 5 0.4972 0.48665 0.008 0.028 0.416 0.000 0.536 0.012
#> SRR1974903 3 0.2969 0.83804 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.5488 0.13089 0.072 0.008 0.536 0.000 0.372 0.012
#> SRR1974901 3 0.3924 0.82141 0.208 0.000 0.740 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974898 5 0.4752 0.59726 0.000 0.252 0.036 0.000 0.676 0.036
#> SRR1974900 5 0.5464 0.67151 0.000 0.104 0.268 0.004 0.608 0.016
#> SRR1974899 5 0.5010 0.67311 0.000 0.192 0.116 0.000 0.676 0.016
#> SRR1974897 5 0.4749 0.58680 0.000 0.264 0.036 0.000 0.668 0.032
#> SRR1974896 5 0.6770 0.61854 0.000 0.124 0.296 0.036 0.504 0.040
#> SRR1974893 5 0.5386 0.68077 0.004 0.108 0.244 0.000 0.628 0.016
#> SRR1974895 2 0.6455 0.00190 0.000 0.448 0.052 0.000 0.360 0.140
#> SRR1974894 5 0.7260 0.54867 0.004 0.108 0.324 0.056 0.456 0.052
#> SRR1974892 3 0.8482 0.29566 0.204 0.020 0.420 0.096 0.148 0.112
#> SRR1974890 3 0.8402 0.30564 0.208 0.020 0.432 0.104 0.132 0.104
#> SRR1974891 3 0.8193 -0.26619 0.076 0.088 0.364 0.060 0.360 0.052
#> SRR1974889 5 0.6175 0.18277 0.000 0.408 0.040 0.000 0.436 0.116
#> SRR1974888 5 0.6073 0.62519 0.004 0.084 0.296 0.016 0.568 0.032
#> SRR1974886 5 0.8189 0.48509 0.016 0.140 0.308 0.064 0.380 0.092
#> SRR1974887 3 0.8431 0.31664 0.208 0.020 0.428 0.096 0.128 0.120
#> SRR1974885 3 0.8431 0.31664 0.208 0.020 0.428 0.096 0.128 0.120
#> SRR1974883 3 0.7643 -0.31995 0.064 0.044 0.392 0.048 0.388 0.064
#> SRR1974884 5 0.4832 0.66274 0.000 0.216 0.092 0.000 0.680 0.012
#> SRR1974881 5 0.7994 0.44319 0.012 0.096 0.332 0.076 0.388 0.096
#> SRR1974882 5 0.7885 0.45392 0.008 0.100 0.340 0.076 0.388 0.088
#> SRR1974880 5 0.7576 0.52839 0.000 0.240 0.232 0.040 0.420 0.068
#> SRR1974879 5 0.6957 0.61088 0.000 0.124 0.304 0.040 0.484 0.048
#> SRR1974877 5 0.5811 0.22378 0.000 0.412 0.020 0.000 0.460 0.108
#> SRR1974876 3 0.8979 0.07022 0.144 0.072 0.376 0.080 0.224 0.104
#> SRR1974878 3 0.8609 0.23613 0.164 0.032 0.424 0.092 0.172 0.116
#> SRR1974875 3 0.8431 0.31664 0.208 0.020 0.428 0.096 0.128 0.120
#> SRR1974874 2 0.8149 0.18061 0.000 0.308 0.060 0.244 0.096 0.292
#> SRR1974873 4 0.0622 0.47637 0.012 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1974871 4 0.7279 0.15192 0.000 0.252 0.024 0.444 0.064 0.216
#> SRR1974872 1 0.5004 0.71265 0.744 0.016 0.024 0.076 0.016 0.124
#> SRR1974869 6 0.7486 -0.16606 0.000 0.152 0.024 0.348 0.100 0.376
#> SRR1974868 2 0.1419 0.64940 0.000 0.952 0.004 0.016 0.016 0.012
#> SRR1974870 4 0.7412 0.14784 0.000 0.132 0.028 0.372 0.096 0.372
#> SRR1974866 6 0.7256 -0.18960 0.000 0.132 0.024 0.372 0.084 0.388
#> SRR1974867 1 0.0146 0.87297 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974865 2 0.8131 0.22485 0.000 0.316 0.060 0.216 0.100 0.308
#> SRR1974864 1 0.2697 0.82662 0.888 0.000 0.012 0.032 0.012 0.056
#> SRR1974862 4 0.7829 0.01286 0.000 0.260 0.044 0.356 0.076 0.264
#> SRR1974863 2 0.8122 0.23198 0.000 0.320 0.060 0.212 0.100 0.308
#> SRR1974860 2 0.1003 0.64853 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020 0.000
#> SRR1974861 2 0.6242 0.29917 0.000 0.564 0.044 0.008 0.244 0.140
#> SRR1974859 4 0.0964 0.48334 0.012 0.016 0.000 0.968 0.000 0.004
#> SRR1974858 6 0.8241 -0.29668 0.000 0.304 0.060 0.204 0.124 0.308
#> SRR1974856 4 0.0870 0.48461 0.012 0.004 0.000 0.972 0.000 0.012
#> SRR1974857 2 0.8122 0.23198 0.000 0.320 0.060 0.212 0.100 0.308
#> SRR1974855 1 0.7189 0.22495 0.536 0.004 0.192 0.152 0.048 0.068
#> SRR1974854 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5363 0.63223 0.712 0.000 0.060 0.136 0.032 0.060
#> SRR1974852 6 0.6653 0.45710 0.000 0.172 0.016 0.384 0.024 0.404
#> SRR1974849 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.7193 0.25902 0.480 0.000 0.124 0.284 0.044 0.068
#> SRR1974846 4 0.0363 0.48048 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.1053 0.86361 0.964 0.000 0.004 0.012 0.000 0.020
#> SRR1974845 6 0.6554 0.45777 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974844 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.2700 0.82515 0.888 0.008 0.008 0.032 0.004 0.060
#> SRR1974842 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0458 0.48173 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.6554 0.45916 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974838 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0146 0.87221 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.6596 -0.48198 0.000 0.160 0.016 0.400 0.024 0.400
#> SRR1974834 6 0.6616 0.45921 0.000 0.164 0.016 0.392 0.024 0.404
#> SRR1974833 1 0.7166 0.23901 0.540 0.004 0.188 0.152 0.048 0.068
#> SRR1974831 6 0.6554 0.45916 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974832 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.1350 0.85337 0.952 0.000 0.008 0.020 0.000 0.020
#> SRR1974828 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.7839 -0.03925 0.000 0.264 0.036 0.316 0.084 0.300
#> SRR1974827 6 0.6554 0.45916 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974824 1 0.2366 0.83615 0.904 0.000 0.012 0.040 0.004 0.040
#> SRR1974825 1 0.0976 0.86387 0.968 0.000 0.008 0.016 0.000 0.008
#> SRR1974822 1 0.3859 0.78203 0.828 0.004 0.040 0.076 0.020 0.032
#> SRR1974823 1 0.7585 0.03899 0.428 0.020 0.036 0.280 0.036 0.200
#> SRR1974820 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.4351 0.71457 0.784 0.000 0.036 0.112 0.020 0.048
#> SRR1974815 1 0.0146 0.87304 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974813 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.4507 0.31931 0.200 0.000 0.024 0.732 0.024 0.020
#> SRR1974812 1 0.5003 0.67565 0.748 0.004 0.048 0.116 0.028 0.056
#> SRR1974810 1 0.3074 0.79085 0.868 0.000 0.036 0.064 0.016 0.016
#> SRR1974808 6 0.7461 -0.18822 0.004 0.132 0.032 0.364 0.080 0.388
#> SRR1974811 1 0.2074 0.83420 0.924 0.000 0.016 0.028 0.016 0.016
#> SRR1974809 1 0.0146 0.87295 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.3780 0.78749 0.836 0.008 0.028 0.060 0.016 0.052
#> SRR1974806 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.6679 0.45778 0.004 0.152 0.016 0.400 0.024 0.404
#> SRR1974804 1 0.5181 0.64591 0.724 0.000 0.060 0.132 0.024 0.060
#> SRR1974803 1 0.3929 0.75650 0.816 0.000 0.048 0.088 0.020 0.028
#> SRR1974801 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1434 0.85649 0.948 0.000 0.008 0.024 0.000 0.020
#> SRR1974799 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1223 0.65234 0.000 0.960 0.008 0.016 0.012 0.004
#> SRR1974797 6 0.6659 0.44845 0.000 0.192 0.012 0.364 0.024 0.408
#> SRR1974796 6 0.6903 0.45047 0.012 0.148 0.020 0.396 0.024 0.400
#> SRR1974795 6 0.6554 0.45916 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974793 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2618 0.64406 0.000 0.896 0.012 0.020 0.036 0.036
#> SRR1974792 6 0.6672 0.45530 0.000 0.176 0.016 0.384 0.024 0.400
#> SRR1974791 6 0.6554 0.45916 0.000 0.152 0.016 0.400 0.024 0.408
#> SRR1974790 6 0.6677 0.43973 0.000 0.196 0.012 0.368 0.024 0.400
#> SRR1974789 2 0.2489 0.63974 0.000 0.900 0.012 0.020 0.052 0.016
#> SRR1974788 2 0.0914 0.64979 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1974786 1 0.1498 0.85481 0.948 0.000 0.012 0.024 0.004 0.012
#> SRR1974787 1 0.2820 0.81669 0.880 0.012 0.004 0.036 0.004 0.064
#> SRR1974784 6 0.7540 0.39377 0.012 0.224 0.036 0.324 0.032 0.372
#> SRR1974783 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1140 0.86129 0.964 0.000 0.008 0.012 0.008 0.008
#> SRR1974782 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.8102 -0.26494 0.048 0.332 0.036 0.264 0.032 0.288
#> SRR1974780 1 0.3029 0.81689 0.876 0.008 0.012 0.028 0.016 0.060
#> SRR1974779 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.3922 0.77882 0.820 0.008 0.020 0.044 0.016 0.092
#> SRR1974778 1 0.0260 0.87156 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2179 0.63970 0.000 0.916 0.008 0.024 0.012 0.040
#> SRR1974773 1 0.0146 0.87308 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0436 0.86871 0.988 0.000 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974771 2 0.7612 0.21606 0.080 0.516 0.028 0.152 0.036 0.188
#> SRR1974770 2 0.1932 0.64336 0.000 0.928 0.008 0.024 0.008 0.032
#> SRR1974769 6 0.6576 0.45867 0.000 0.156 0.016 0.400 0.024 0.404
#> SRR1974768 2 0.2886 0.61151 0.000 0.872 0.012 0.052 0.004 0.060
#> SRR1974767 1 0.5042 0.71448 0.748 0.024 0.016 0.076 0.024 0.112
#> SRR1974766 2 0.5209 0.45960 0.000 0.700 0.016 0.112 0.024 0.148
#> SRR1974765 6 0.6571 0.45191 0.000 0.168 0.016 0.396 0.020 0.400
#> SRR1974764 2 0.2932 0.62803 0.000 0.876 0.012 0.040 0.016 0.056
#> SRR1974763 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0146 0.87308 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2570 0.63631 0.000 0.896 0.012 0.032 0.012 0.048
#> SRR1974760 6 0.6903 0.45047 0.012 0.148 0.020 0.396 0.024 0.400
#> SRR1974759 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1965 0.64126 0.000 0.924 0.008 0.024 0.004 0.040
#> SRR1974757 2 0.7087 -0.25658 0.000 0.364 0.024 0.248 0.028 0.336
#> SRR1974756 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1180 0.48479 0.012 0.012 0.000 0.960 0.000 0.016
#> SRR1974755 2 0.1772 0.64603 0.000 0.936 0.008 0.020 0.008 0.028
#> SRR1974753 4 0.2758 0.46884 0.012 0.080 0.000 0.872 0.000 0.036
#> SRR1974751 4 0.0713 0.47926 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0458 0.48156 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.8211 0.11771 0.432 0.224 0.044 0.136 0.024 0.140
#> SRR1974747 1 0.0696 0.86592 0.980 0.000 0.008 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974748 1 0.0291 0.87183 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.5320 0.36824 0.004 0.172 0.008 0.684 0.024 0.108
#> SRR1974745 4 0.0458 0.48156 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0976 0.48208 0.008 0.016 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1974742 1 0.0146 0.87204 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.5348 0.35976 0.000 0.176 0.012 0.676 0.024 0.112
#> SRR1974739 4 0.0603 0.48260 0.016 0.000 0.004 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.3181 0.45975 0.004 0.028 0.004 0.860 0.028 0.076
#> SRR1974738 4 0.6693 0.38512 0.052 0.112 0.016 0.616 0.048 0.156
#> SRR1974737 4 0.1269 0.48405 0.012 0.012 0.000 0.956 0.000 0.020
#> SRR1974736 4 0.0458 0.48156 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.7043 0.35566 0.092 0.064 0.024 0.576 0.044 0.200
#> SRR1974733 4 0.0508 0.48156 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.4896 0.29272 0.236 0.000 0.024 0.688 0.024 0.028
#> SRR1974731 4 0.0508 0.48156 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0458 0.87015 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974728 4 0.2226 0.47569 0.008 0.052 0.004 0.912 0.004 0.020
#> SRR1974725 4 0.5657 0.25827 0.264 0.004 0.032 0.628 0.028 0.044
#> SRR1974726 4 0.0508 0.48156 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0146 0.87265 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974727 4 0.7810 0.22024 0.052 0.092 0.032 0.408 0.068 0.348
#> SRR1974723 4 0.0508 0.48251 0.012 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.3884 0.32683 0.208 0.000 0.008 0.756 0.012 0.016
#> SRR1974721 2 0.8111 0.10830 0.000 0.288 0.056 0.288 0.092 0.276
#> SRR1974720 4 0.4891 0.36683 0.160 0.004 0.024 0.736 0.028 0.048
#> SRR1974719 1 0.0291 0.87183 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.7794 0.27258 0.128 0.064 0.028 0.444 0.044 0.292
#> SRR1974717 4 0.3606 0.44785 0.004 0.100 0.012 0.828 0.008 0.048
#> SRR1974715 4 0.0458 0.48156 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.7809 0.24569 0.072 0.080 0.028 0.416 0.064 0.340
#> SRR1974711 6 0.7995 -0.20509 0.172 0.044 0.024 0.332 0.060 0.368
#> SRR1974712 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 6 0.7415 -0.18977 0.004 0.128 0.028 0.368 0.084 0.388
#> SRR1974710 4 0.7753 0.16216 0.016 0.128 0.032 0.368 0.088 0.368
#> SRR1974707 1 0.5907 0.59544 0.664 0.020 0.016 0.164 0.032 0.104
#> SRR1974706 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0146 0.87204 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.5089 0.40116 0.004 0.116 0.016 0.720 0.020 0.124
#> SRR1974702 1 0.2362 0.83827 0.912 0.004 0.036 0.012 0.016 0.020
#> SRR1974701 4 0.0632 0.48125 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.5419 0.36594 0.004 0.184 0.016 0.680 0.024 0.092
#> SRR1974698 4 0.1223 0.48415 0.012 0.008 0.004 0.960 0.000 0.016
#> SRR1974700 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.7424 -0.07985 0.400 0.024 0.020 0.308 0.028 0.220
#> SRR1974696 4 0.6853 0.35990 0.112 0.060 0.016 0.592 0.040 0.180
#> SRR1974694 1 0.0696 0.86592 0.980 0.000 0.008 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974695 4 0.7919 0.24511 0.096 0.072 0.032 0.404 0.056 0.340
#> SRR1974693 4 0.0653 0.48285 0.012 0.004 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1974692 4 0.0798 0.48304 0.012 0.004 0.004 0.976 0.000 0.004
#> SRR1974690 6 0.6656 0.44522 0.000 0.192 0.012 0.360 0.024 0.412
#> SRR1974691 1 0.0696 0.86592 0.980 0.000 0.008 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974689 4 0.0508 0.48156 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0508 0.48156 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0696 0.86592 0.980 0.000 0.008 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974686 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0696 0.86592 0.980 0.000 0.008 0.004 0.004 0.004
#> SRR1974684 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0810 0.86474 0.976 0.000 0.008 0.004 0.004 0.008
#> SRR1974682 4 0.0713 0.47926 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.3940 0.34860 0.180 0.000 0.020 0.772 0.016 0.012
#> SRR1974680 1 0.0146 0.87204 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0632 0.47901 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1621 0.65079 0.000 0.944 0.008 0.020 0.012 0.016
#> SRR1974675 5 0.5303 0.48087 0.000 0.308 0.024 0.000 0.596 0.072
#> SRR1974674 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 6 0.7575 -0.15658 0.000 0.160 0.028 0.332 0.100 0.380
#> SRR1974671 2 0.1245 0.64287 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032 0.000
#> SRR1974672 2 0.8122 0.23198 0.000 0.320 0.060 0.212 0.100 0.308
#> SRR1974670 2 0.8147 0.22281 0.000 0.316 0.060 0.212 0.104 0.308
#> SRR1974669 2 0.1245 0.64225 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032 0.000
#> SRR1974667 2 0.2932 0.62803 0.000 0.876 0.012 0.040 0.016 0.056
#> SRR1974668 2 0.1148 0.64976 0.000 0.960 0.000 0.016 0.020 0.004
#> SRR1974666 2 0.1003 0.64981 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020 0.000
#> SRR1974664 2 0.8147 0.23026 0.000 0.316 0.060 0.212 0.104 0.308
#> SRR1974665 2 0.1877 0.64884 0.000 0.932 0.008 0.024 0.012 0.024
#> SRR1974663 1 0.4781 0.73081 0.760 0.012 0.024 0.072 0.016 0.116
#> SRR1974662 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.7592 0.24781 0.080 0.064 0.024 0.424 0.056 0.352
#> SRR1974660 1 0.0951 0.86592 0.968 0.000 0.008 0.004 0.000 0.020
#> SRR1974659 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.2817 0.81863 0.876 0.004 0.004 0.052 0.004 0.060
#> SRR1974654 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.2290 0.83728 0.908 0.004 0.012 0.044 0.000 0.032
#> SRR1974656 4 0.7968 0.18862 0.220 0.048 0.024 0.360 0.040 0.308
#> SRR1974650 4 0.8071 0.24001 0.140 0.076 0.028 0.400 0.048 0.308
#> SRR1974651 4 0.3953 0.45666 0.008 0.044 0.024 0.820 0.016 0.088
#> SRR1974652 1 0.4056 0.77648 0.812 0.012 0.020 0.052 0.012 0.092
#> SRR1974653 4 0.0363 0.48048 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.7614 -0.09132 0.396 0.036 0.020 0.308 0.032 0.208
#> SRR1974646 6 0.8530 -0.16281 0.244 0.080 0.028 0.292 0.056 0.300
#> SRR1974649 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.3822 0.45936 0.008 0.044 0.020 0.828 0.016 0.084
#> SRR1974645 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2862 0.62551 0.000 0.880 0.008 0.028 0.028 0.056
#> SRR1974643 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.7613 0.22854 0.072 0.072 0.024 0.400 0.056 0.376
#> SRR1974640 4 0.7556 0.24665 0.080 0.060 0.024 0.420 0.056 0.360
#> SRR1974641 4 0.8081 -0.09606 0.000 0.276 0.056 0.304 0.088 0.276
#> SRR1974639 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.7727 0.27651 0.112 0.064 0.028 0.456 0.048 0.292
#> SRR1974634 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.3748 0.45273 0.004 0.048 0.016 0.824 0.012 0.096
#> SRR1974633 1 0.4925 0.72203 0.756 0.024 0.012 0.096 0.024 0.088
#> SRR1974632 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.7852 0.24675 0.112 0.060 0.028 0.412 0.056 0.332
#> SRR1974630 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.1659 0.85406 0.940 0.008 0.004 0.020 0.000 0.028
#> SRR1974624 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.6446 0.09834 0.000 0.476 0.052 0.000 0.324 0.148
#> SRR1974623 6 0.7473 -0.24482 0.052 0.080 0.016 0.388 0.068 0.396
#> SRR1974622 1 0.7334 -0.06270 0.408 0.016 0.020 0.308 0.032 0.216
#> SRR1974620 4 0.7602 0.24167 0.080 0.064 0.024 0.412 0.056 0.364
#> SRR1974619 4 0.7416 0.24551 0.068 0.056 0.020 0.432 0.064 0.360
#> SRR1974621 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0146 0.87304 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974616 1 0.5321 0.64871 0.724 0.004 0.048 0.124 0.032 0.068
#> SRR1974615 1 0.1262 0.85890 0.956 0.000 0.008 0.016 0.000 0.020
#> SRR1974618 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.7201 0.27271 0.496 0.020 0.028 0.184 0.032 0.240
#> SRR1974613 4 0.7862 0.23057 0.136 0.060 0.024 0.396 0.048 0.336
#> SRR1974612 1 0.0146 0.87297 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974611 4 0.7676 0.19254 0.048 0.112 0.016 0.380 0.068 0.376
#> SRR1974610 4 0.6871 0.28012 0.004 0.156 0.036 0.556 0.052 0.196
#> SRR1974609 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.6818 -0.06774 0.420 0.028 0.020 0.416 0.028 0.088
#> SRR1974607 1 0.4237 0.75624 0.796 0.000 0.040 0.088 0.016 0.060
#> SRR1974606 2 0.1148 0.65163 0.000 0.960 0.000 0.020 0.016 0.004
#> SRR1974605 1 0.4442 0.74306 0.780 0.012 0.016 0.108 0.012 0.072
#> SRR1974604 4 0.0363 0.48048 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.5974 0.61574 0.664 0.024 0.032 0.116 0.016 0.148
#> SRR1974602 1 0.0000 0.87411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.6707 0.29397 0.004 0.148 0.024 0.560 0.052 0.212
#> SRR1974601 4 0.7610 0.21511 0.052 0.084 0.020 0.404 0.072 0.368
#> SRR1974599 2 0.2032 0.64895 0.000 0.920 0.000 0.020 0.024 0.036
#> SRR1974598 2 0.2032 0.64895 0.000 0.920 0.000 0.020 0.024 0.036
#> SRR1974596 2 0.2714 0.64570 0.000 0.888 0.008 0.032 0.020 0.052
#> SRR1974594 4 0.4647 0.41343 0.048 0.000 0.028 0.756 0.028 0.140
#> SRR1974593 4 0.7773 0.00375 0.000 0.252 0.032 0.332 0.084 0.300
#> SRR1974595 4 0.7175 0.09452 0.000 0.156 0.036 0.424 0.048 0.336
#> SRR1974592 2 0.2461 0.64851 0.000 0.900 0.004 0.028 0.020 0.048
#> SRR1974591 2 0.2032 0.64895 0.000 0.920 0.000 0.020 0.024 0.036
#> SRR1974588 4 0.4745 0.41233 0.052 0.000 0.028 0.748 0.028 0.144
#> SRR1974590 4 0.7451 0.16200 0.000 0.172 0.040 0.416 0.064 0.308
#> SRR1974589 4 0.6159 0.39369 0.012 0.076 0.028 0.652 0.064 0.168
#> SRR1974587 4 0.4178 0.43000 0.016 0.000 0.032 0.784 0.032 0.136
#> SRR1974586 4 0.7746 0.00734 0.000 0.256 0.032 0.336 0.080 0.296
#> SRR1974585 4 0.4345 0.42332 0.024 0.000 0.028 0.772 0.032 0.144
#> SRR1974584 1 0.4888 0.71675 0.748 0.000 0.048 0.112 0.020 0.072
#> SRR1974583 4 0.7804 -0.01746 0.000 0.260 0.036 0.324 0.080 0.300
#> SRR1974582 2 0.2032 0.64895 0.000 0.920 0.000 0.020 0.024 0.036
#> SRR1974581 2 0.7931 0.29266 0.000 0.352 0.052 0.192 0.092 0.312
#> SRR1974580 4 0.4907 0.41191 0.016 0.004 0.036 0.728 0.044 0.172
#> SRR1974578 4 0.4443 0.42399 0.040 0.000 0.028 0.772 0.028 0.132
#> SRR1974577 2 0.7446 -0.12631 0.080 0.340 0.000 0.256 0.012 0.312
#> SRR1974579 4 0.4178 0.43000 0.016 0.000 0.032 0.784 0.032 0.136
#> SRR1974576 2 0.7946 0.27969 0.000 0.344 0.052 0.196 0.092 0.316
#> SRR1974575 2 0.2116 0.65371 0.000 0.916 0.000 0.024 0.024 0.036
#> SRR1974574 4 0.6059 -0.34250 0.000 0.132 0.008 0.444 0.012 0.404
#> SRR1974573 4 0.6087 -0.35173 0.000 0.136 0.008 0.436 0.012 0.408
#> SRR1974571 4 0.6113 -0.35134 0.000 0.140 0.008 0.432 0.012 0.408
#> SRR1974572 4 0.6087 -0.35173 0.000 0.136 0.008 0.436 0.012 0.408
#> SRR1974570 1 0.4246 0.75625 0.792 0.000 0.028 0.076 0.016 0.088
#> SRR1974568 1 0.5102 0.69214 0.728 0.000 0.048 0.128 0.020 0.076
#> SRR1974567 1 0.5022 0.70164 0.736 0.000 0.048 0.120 0.020 0.076
#> SRR1974566 4 0.6113 -0.35134 0.000 0.140 0.008 0.432 0.012 0.408
#> SRR1974569 4 0.6164 -0.34232 0.000 0.164 0.008 0.424 0.008 0.396
#> SRR1974565 4 0.4961 0.39768 0.076 0.000 0.028 0.736 0.028 0.132
#> SRR1974564 4 0.6110 -0.33114 0.000 0.140 0.008 0.440 0.012 0.400
#> SRR1974560 1 0.5022 0.70164 0.736 0.000 0.048 0.120 0.020 0.076
#> SRR1974559 1 0.4888 0.71675 0.748 0.000 0.048 0.112 0.020 0.072
#> SRR1974563 4 0.6113 -0.35134 0.000 0.140 0.008 0.432 0.012 0.408
#> SRR1974562 4 0.6110 -0.33114 0.000 0.140 0.008 0.440 0.012 0.400
#> SRR1974561 4 0.6113 -0.35134 0.000 0.140 0.008 0.432 0.012 0.408
#> SRR1974557 6 0.8049 -0.26448 0.000 0.300 0.052 0.216 0.100 0.332
#> SRR1974553 4 0.6087 -0.35173 0.000 0.136 0.008 0.436 0.012 0.408
#> SRR1974555 1 0.4888 0.71675 0.748 0.000 0.048 0.112 0.020 0.072
#> SRR1974551 1 0.4888 0.71675 0.748 0.000 0.048 0.112 0.020 0.072
#> SRR1974552 4 0.6052 -0.32715 0.000 0.144 0.008 0.436 0.008 0.404
#> SRR1974554 1 0.7054 0.42240 0.556 0.028 0.048 0.196 0.024 0.148
#> SRR1974558 1 0.5022 0.70164 0.736 0.000 0.048 0.120 0.020 0.076
#> SRR1974556 1 0.4888 0.71675 0.748 0.000 0.048 0.112 0.020 0.072
#> SRR1974550 4 0.7647 0.22419 0.048 0.096 0.024 0.404 0.064 0.364
#> SRR1974549 4 0.6087 -0.35173 0.000 0.136 0.008 0.436 0.012 0.408
#> SRR1974548 4 0.6358 -0.17654 0.004 0.108 0.020 0.480 0.020 0.368
#> SRR1974547 1 0.7281 0.26749 0.500 0.028 0.044 0.240 0.020 0.168
#> SRR1974546 1 0.6522 0.49835 0.596 0.020 0.044 0.180 0.012 0.148
#> SRR1974545 4 0.6461 -0.25889 0.000 0.196 0.012 0.420 0.012 0.360
#> SRR1974544 1 0.5022 0.70164 0.736 0.000 0.048 0.120 0.020 0.076
#> SRR1974543 4 0.6271 -0.26580 0.000 0.120 0.020 0.460 0.016 0.384
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.902 0.930 0.971 0.4979 0.501 0.501
#> 3 3 0.753 0.827 0.914 0.3182 0.724 0.509
#> 4 4 0.784 0.833 0.901 0.1328 0.821 0.542
#> 5 5 0.783 0.682 0.818 0.0600 0.919 0.699
#> 6 6 0.829 0.759 0.822 0.0386 0.953 0.784
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.1184 0.9577 0.016 0.984
#> SRR1975004 1 0.5519 0.8546 0.872 0.128
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1975000 1 0.2423 0.9390 0.960 0.040
#> SRR1974998 1 0.1414 0.9537 0.980 0.020
#> SRR1974997 1 0.3114 0.9258 0.944 0.056
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974996 1 0.2423 0.9389 0.960 0.040
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.9686 0.3354 0.396 0.604
#> SRR1974992 2 0.6623 0.7821 0.172 0.828
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.9580 0.3850 0.380 0.620
#> SRR1974991 2 0.5629 0.8339 0.132 0.868
#> SRR1974986 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.8763 0.5784 0.296 0.704
#> SRR1974985 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.1633 0.9505 0.024 0.976
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974970 1 0.3274 0.9223 0.940 0.060
#> SRR1974969 2 1.0000 -0.0172 0.496 0.504
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974967 1 0.7453 0.7477 0.788 0.212
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.9998 0.0191 0.492 0.508
#> SRR1974963 1 0.6801 0.7925 0.820 0.180
#> SRR1974961 2 0.3274 0.9156 0.060 0.940
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.2603 0.9358 0.956 0.044
#> SRR1974959 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974956 1 0.9209 0.5135 0.664 0.336
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.9209 0.5182 0.664 0.336
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974952 1 0.4815 0.8800 0.896 0.104
#> SRR1974949 2 0.8267 0.6457 0.260 0.740
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.4815 0.8808 0.896 0.104
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974938 1 0.4690 0.8850 0.900 0.100
#> SRR1974937 1 0.1414 0.9537 0.980 0.020
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0376 0.9641 0.996 0.004
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974932 1 0.0938 0.9592 0.988 0.012
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974927 1 0.1184 0.9565 0.984 0.016
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.9393 0.4790 0.644 0.356
#> SRR1974922 1 0.5519 0.8549 0.872 0.128
#> SRR1974921 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.1414 0.9537 0.980 0.020
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.0672 0.9617 0.992 0.008
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974907 1 0.7883 0.7105 0.764 0.236
#> SRR1974905 1 0.0938 0.9591 0.988 0.012
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974901 1 0.5737 0.8464 0.864 0.136
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.7139 0.7449 0.196 0.804
#> SRR1974890 1 0.8443 0.6499 0.728 0.272
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0672 0.9650 0.008 0.992
#> SRR1974875 1 0.2423 0.9391 0.960 0.040
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.5408 0.8449 0.124 0.876
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.6712 0.7970 0.824 0.176
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.5946 0.8348 0.856 0.144
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.0672 0.9617 0.992 0.008
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.4690 0.8714 0.100 0.900
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974796 1 0.6973 0.7814 0.812 0.188
#> SRR1974795 2 0.8555 0.6026 0.280 0.720
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.9323 0.4572 0.348 0.652
#> SRR1974784 2 0.9170 0.4942 0.332 0.668
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1633 0.9504 0.976 0.024
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974780 1 0.9933 0.1763 0.548 0.452
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.9460 0.4468 0.636 0.364
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.0376 0.9684 0.004 0.996
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.3879 0.9084 0.924 0.076
#> SRR1974750 1 0.9954 0.1762 0.540 0.460
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.2778 0.9271 0.048 0.952
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.8909 0.5474 0.308 0.692
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.9732 0.3100 0.404 0.596
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.8909 0.5787 0.692 0.308
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.2778 0.9329 0.952 0.048
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974722 1 0.3584 0.9149 0.932 0.068
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.9710 0.3203 0.400 0.600
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974707 1 0.2778 0.9329 0.952 0.048
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.9993 0.0702 0.484 0.516
#> SRR1974701 1 0.4431 0.8927 0.908 0.092
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.4431 0.8931 0.908 0.092
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.7602 0.7339 0.780 0.220
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.7056 0.7743 0.808 0.192
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.6623 0.8032 0.828 0.172
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.6973 0.7807 0.812 0.188
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.1184 0.9569 0.984 0.016
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.9866 0.2667 0.568 0.432
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0376 0.9642 0.996 0.004
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.9775 0.2837 0.412 0.588
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974613 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.2778 0.9328 0.952 0.048
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0376 0.9684 0.004 0.996
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.9393 0.4546 0.356 0.644
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974565 1 0.3431 0.9187 0.936 0.064
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.1184 0.9561 0.984 0.016
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.3431 0.9113 0.064 0.936
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974546 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9666 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9720 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1975008 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975006 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975005 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975004 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1975003 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975001 3 0.2261 0.8330 0.000 0.068 0.932
#> SRR1975002 3 0.0592 0.8821 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974999 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975000 3 0.3038 0.8335 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974998 3 0.4399 0.7649 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974997 3 0.2625 0.8481 0.084 0.000 0.916
#> SRR1974995 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974996 3 0.4002 0.7901 0.160 0.000 0.840
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974992 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974990 1 0.3816 0.7882 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974989 3 0.0592 0.8833 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974991 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974986 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1974987 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974988 3 0.5254 0.6783 0.264 0.000 0.736
#> SRR1974984 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974985 3 0.5706 0.5950 0.320 0.000 0.680
#> SRR1974983 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974982 3 0.5926 0.5282 0.356 0.000 0.644
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.5560 0.6275 0.300 0.000 0.700
#> SRR1974979 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974978 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1974977 3 0.5621 0.6148 0.308 0.000 0.692
#> SRR1974976 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974975 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974974 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974973 3 0.3482 0.7615 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974972 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974971 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974970 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974969 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974968 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974967 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974965 1 0.4702 0.6881 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974966 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974964 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974963 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974961 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974962 3 0.0747 0.8795 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974960 3 0.3816 0.8001 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974959 3 0.4346 0.7690 0.184 0.000 0.816
#> SRR1974958 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974957 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974956 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974955 1 0.4887 0.6629 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974954 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974953 3 0.1163 0.8712 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974952 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974949 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974950 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974951 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974947 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974948 3 0.0424 0.8844 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974946 2 0.5678 0.6638 0.000 0.684 0.316
#> SRR1974945 3 0.1163 0.8783 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.5835 0.4048 0.660 0.000 0.340
#> SRR1974943 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974941 3 0.5706 0.5950 0.320 0.000 0.680
#> SRR1974940 3 0.4887 0.7229 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974939 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974938 3 0.0424 0.8852 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974937 3 0.5291 0.6722 0.268 0.000 0.732
#> SRR1974936 1 0.4504 0.7145 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974935 3 0.5431 0.6507 0.284 0.000 0.716
#> SRR1974934 3 0.0424 0.8844 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974933 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974932 3 0.4178 0.7801 0.172 0.000 0.828
#> SRR1974931 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1974930 1 0.3482 0.8188 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974929 3 0.5733 0.5881 0.324 0.000 0.676
#> SRR1974928 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974927 3 0.1163 0.8788 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974924 1 0.3879 0.7869 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974925 1 0.4178 0.7535 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0424 0.8856 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974922 3 0.0747 0.8830 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974921 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1974920 3 0.5733 0.5881 0.324 0.000 0.676
#> SRR1974919 3 0.5016 0.7077 0.240 0.000 0.760
#> SRR1974918 3 0.1753 0.8684 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974917 3 0.6308 -0.2345 0.000 0.492 0.508
#> SRR1974916 3 0.5560 0.6273 0.300 0.000 0.700
#> SRR1974915 3 0.3551 0.8125 0.132 0.000 0.868
#> SRR1974914 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974913 3 0.5560 0.6274 0.300 0.000 0.700
#> SRR1974911 3 0.5678 0.6016 0.316 0.000 0.684
#> SRR1974910 3 0.5650 0.6082 0.312 0.000 0.688
#> SRR1974908 3 0.0892 0.8769 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974909 3 0.4399 0.7652 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974906 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974907 3 0.0237 0.8862 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974905 3 0.5216 0.6829 0.260 0.000 0.740
#> SRR1974904 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974903 3 0.5497 0.6392 0.292 0.000 0.708
#> SRR1974902 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974901 3 0.0424 0.8855 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974898 3 0.1289 0.8675 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974900 3 0.1289 0.8675 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974899 3 0.0892 0.8767 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974897 3 0.3551 0.7551 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974896 3 0.1411 0.8639 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974893 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974895 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974894 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974892 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974890 3 0.0424 0.8856 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974891 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974889 2 0.6045 0.5536 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974888 3 0.0592 0.8821 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974886 2 0.5621 0.6732 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974887 1 0.2796 0.8601 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974885 1 0.5785 0.4369 0.668 0.000 0.332
#> SRR1974883 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974884 3 0.1031 0.8737 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974881 3 0.3941 0.7199 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974882 3 0.5706 0.3748 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974880 2 0.5650 0.6691 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974879 3 0.1163 0.8706 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974877 2 0.5760 0.6458 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974876 3 0.3116 0.7866 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974878 3 0.0237 0.8865 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974875 3 0.4555 0.7534 0.200 0.000 0.800
#> SRR1974874 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974873 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974871 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974872 3 0.7392 -0.1780 0.032 0.468 0.500
#> SRR1974869 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974868 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974870 2 0.1529 0.8766 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974866 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974863 2 0.0424 0.8812 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974860 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974861 2 0.5591 0.6746 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974859 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974858 2 0.0592 0.8810 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974856 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974857 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974855 1 0.9719 -0.0800 0.416 0.224 0.360
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0237 0.9503 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974852 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.6442 0.2588 0.564 0.432 0.004
#> SRR1974846 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.2261 0.8675 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0829 0.9409 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974839 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974834 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974833 1 0.0237 0.9503 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974831 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974827 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.5450 0.6698 0.228 0.760 0.012
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.6280 0.1086 0.460 0.540 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974797 2 0.2796 0.8558 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974796 2 0.5285 0.8022 0.112 0.824 0.064
#> SRR1974795 2 0.2998 0.8651 0.016 0.916 0.068
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.5098 0.7342 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974792 2 0.3686 0.8257 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974791 2 0.3192 0.8441 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974790 2 0.2711 0.8580 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974789 2 0.5560 0.6796 0.000 0.700 0.300
#> SRR1974788 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.3670 0.8207 0.092 0.888 0.020
#> SRR1974784 2 0.5473 0.8044 0.052 0.808 0.140
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.3234 0.8710 0.908 0.020 0.072
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.3482 0.8339 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974780 2 0.9598 0.3672 0.304 0.468 0.228
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.8370 0.2601 0.416 0.500 0.084
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.5058 0.7393 0.000 0.756 0.244
#> SRR1974770 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974769 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974768 2 0.5591 0.6755 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974767 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974766 2 0.5591 0.6768 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974765 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974764 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974760 2 0.3192 0.8441 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.5431 0.7014 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974757 2 0.4555 0.7789 0.000 0.800 0.200
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974755 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974753 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974751 2 0.6280 0.1051 0.460 0.540 0.000
#> SRR1974750 2 0.1399 0.8676 0.028 0.968 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.3030 0.8557 0.004 0.904 0.092
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974745 2 0.0829 0.8763 0.012 0.984 0.004
#> SRR1974743 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974739 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974741 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974738 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974737 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974736 2 0.0661 0.8782 0.008 0.988 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974733 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974732 2 0.4974 0.6533 0.236 0.764 0.000
#> SRR1974731 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974725 2 0.6247 0.3639 0.376 0.620 0.004
#> SRR1974726 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974723 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974722 2 0.5070 0.6726 0.224 0.772 0.004
#> SRR1974721 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974720 2 0.0475 0.8799 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0592 0.8815 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974717 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974715 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974711 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974710 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974707 1 0.6625 0.2146 0.552 0.440 0.008
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974702 3 0.3112 0.8391 0.096 0.004 0.900
#> SRR1974701 2 0.6244 0.1745 0.440 0.560 0.000
#> SRR1974699 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974698 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.6095 0.3625 0.608 0.392 0.000
#> SRR1974696 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0747 0.8813 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974693 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974692 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974690 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974688 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.5591 0.5716 0.696 0.304 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.4931 0.6880 0.212 0.784 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.3193 0.8123 0.100 0.896 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974675 3 0.4974 0.5767 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974671 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974672 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974670 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974669 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974667 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974668 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974666 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974664 2 0.0592 0.8810 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974665 2 0.5591 0.6768 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974663 2 0.7920 0.0204 0.468 0.476 0.056
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 2 0.6952 0.0263 0.480 0.504 0.016
#> SRR1974650 2 0.0747 0.8813 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974651 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974652 1 0.2860 0.8638 0.912 0.084 0.004
#> SRR1974653 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974648 2 0.5036 0.7398 0.172 0.808 0.020
#> SRR1974646 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.5650 0.6693 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974640 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974641 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0747 0.8813 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974633 1 0.3112 0.8492 0.900 0.096 0.004
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.3141 0.8406 0.068 0.912 0.020
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.5465 0.6937 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974623 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974622 1 0.5016 0.6772 0.760 0.240 0.000
#> SRR1974620 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974619 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0892 0.9348 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1031 0.8799 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974613 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974610 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.6280 0.1762 0.540 0.460 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.5497 0.6850 0.000 0.708 0.292
#> SRR1974605 1 0.5560 0.5758 0.700 0.300 0.000
#> SRR1974604 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974603 2 0.1129 0.8803 0.004 0.976 0.020
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974601 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974599 2 0.5591 0.6746 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974598 2 0.5621 0.6694 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974596 2 0.5254 0.7160 0.000 0.736 0.264
#> SRR1974594 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974593 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974595 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974592 2 0.5431 0.6982 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974591 2 0.5591 0.6746 0.000 0.696 0.304
#> SRR1974588 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974590 2 0.1289 0.8772 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974589 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974587 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974586 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974585 2 0.0592 0.8808 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0237 0.8809 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974582 2 0.5497 0.6891 0.000 0.708 0.292
#> SRR1974581 2 0.5363 0.7058 0.000 0.724 0.276
#> SRR1974580 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974578 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974577 2 0.3816 0.8185 0.000 0.852 0.148
#> SRR1974579 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974576 2 0.0237 0.8809 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974575 2 0.4750 0.7615 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974574 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974573 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974571 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974572 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974570 2 0.5580 0.6229 0.256 0.736 0.008
#> SRR1974568 1 0.5098 0.6646 0.752 0.248 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974569 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974565 2 0.4733 0.7144 0.196 0.800 0.004
#> SRR1974564 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974560 2 0.6521 -0.0249 0.496 0.500 0.004
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0424 0.8798 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974562 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974561 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974557 2 0.0237 0.8810 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974553 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974554 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9539 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974549 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974548 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974547 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974546 2 0.0424 0.8813 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974545 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974544 1 0.1289 0.9229 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974543 2 0.2165 0.8692 0.000 0.936 0.064
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1975008 3 0.4277 0.53867 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1975006 2 0.3356 0.81116 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.1389 0.90324 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1975001 2 0.2888 0.84728 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR1975002 2 0.3356 0.81116 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1974999 3 0.3837 0.65357 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1975000 3 0.0469 0.93797 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974998 3 0.1389 0.93009 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974997 3 0.0592 0.93750 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.1118 0.93398 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.2868 0.86244 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974989 3 0.1576 0.90292 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1974991 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1792 0.92165 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974983 2 0.3356 0.81116 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1974982 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974981 1 0.2345 0.86215 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974980 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974977 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974976 3 0.1022 0.91642 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.2345 0.84570 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1974973 2 0.2944 0.84535 0.000 0.868 0.128 0.004
#> SRR1974972 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.3569 0.79407 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.2589 0.88327 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974966 3 0.1389 0.90180 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.3356 0.81116 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1974960 3 0.1118 0.93377 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974959 3 0.1211 0.93275 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974958 2 0.4877 0.44204 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.2704 0.87504 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.3528 0.79647 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0188 0.93627 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.3266 0.81771 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1974946 2 0.2125 0.85941 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974945 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.4985 0.03373 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974942 3 0.2647 0.88181 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974940 3 0.1637 0.92551 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1978 0.92043 0.068 0.004 0.928 0.000
#> SRR1974936 3 0.2589 0.88327 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974935 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974934 2 0.3074 0.82964 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.1118 0.93384 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1974931 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974930 3 0.3219 0.83227 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1974929 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974928 2 0.4697 0.56147 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1974927 3 0.0188 0.93843 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974924 3 0.2704 0.87511 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1974925 3 0.2814 0.86665 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974926 1 0.0188 0.96316 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974923 3 0.0657 0.93403 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1974922 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974920 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974919 3 0.1637 0.92552 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.2924 0.85311 0.000 0.884 0.100 0.016
#> SRR1974916 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974915 3 0.0817 0.93619 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974914 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974911 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974910 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974908 2 0.2921 0.83728 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1974909 3 0.1389 0.93016 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.1716 0.92372 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974904 3 0.0188 0.93625 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974903 3 0.1940 0.91745 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.2868 0.83958 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1974900 2 0.3907 0.75266 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974899 2 0.2921 0.83728 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1974897 2 0.2773 0.85053 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974896 2 0.2647 0.84726 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1974893 3 0.3569 0.70658 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1974895 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974894 2 0.3649 0.78590 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.0817 0.92286 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974889 2 0.2334 0.85709 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR1974888 2 0.3837 0.76352 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1974886 2 0.2742 0.85342 0.000 0.900 0.076 0.024
#> SRR1974887 3 0.4323 0.79349 0.184 0.000 0.788 0.028
#> SRR1974885 3 0.2149 0.90810 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.3123 0.82681 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974881 2 0.2345 0.85549 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974882 2 0.2530 0.85234 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1974880 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974879 2 0.2973 0.83483 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1974877 2 0.2197 0.85913 0.000 0.916 0.080 0.004
#> SRR1974876 3 0.5220 0.66569 0.000 0.156 0.752 0.092
#> SRR1974878 3 0.0000 0.93850 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.1389 0.93044 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974874 2 0.4941 0.23784 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1974873 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974871 4 0.4985 0.12463 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1974872 4 0.5177 0.74904 0.012 0.104 0.104 0.780
#> SRR1974869 2 0.3610 0.71952 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974868 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974870 2 0.3311 0.75174 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974866 2 0.4994 0.10295 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3649 0.72219 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1974864 1 0.3307 0.84617 0.868 0.028 0.000 0.104
#> SRR1974862 2 0.3873 0.70889 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974863 2 0.2814 0.78797 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974860 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974861 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974859 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974858 2 0.3311 0.75531 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974856 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974857 2 0.3569 0.73064 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974855 4 0.6316 0.59161 0.072 0.020 0.236 0.672
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.4819 0.45316 0.652 0.004 0.000 0.344
#> SRR1974852 4 0.4422 0.70548 0.000 0.256 0.008 0.736
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0804 0.85193 0.012 0.008 0.000 0.980
#> SRR1974846 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974847 1 0.1284 0.93745 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1974845 4 0.4422 0.70548 0.000 0.256 0.008 0.736
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 4 0.6152 0.09997 0.464 0.032 0.008 0.496
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974839 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.4422 0.70548 0.000 0.256 0.008 0.736
#> SRR1974834 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974833 1 0.5580 0.06463 0.520 0.008 0.008 0.464
#> SRR1974831 4 0.3810 0.76958 0.000 0.188 0.008 0.804
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4679 0.48897 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1974827 4 0.4049 0.74947 0.000 0.212 0.008 0.780
#> SRR1974824 1 0.1109 0.94280 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974825 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 4 0.3009 0.81701 0.056 0.052 0.000 0.892
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0817 0.94578 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1677 0.85099 0.012 0.040 0.000 0.948
#> SRR1974812 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.2814 0.83264 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974808 4 0.4977 0.13940 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2281 0.87729 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.3810 0.76900 0.000 0.188 0.008 0.804
#> SRR1974804 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2124 0.91025 0.932 0.028 0.000 0.040
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974797 2 0.3810 0.69015 0.000 0.804 0.008 0.188
#> SRR1974796 4 0.3937 0.76711 0.000 0.188 0.012 0.800
#> SRR1974795 4 0.4059 0.75735 0.000 0.200 0.012 0.788
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2048 0.85676 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR1974792 4 0.4594 0.67504 0.000 0.280 0.008 0.712
#> SRR1974791 4 0.4567 0.68066 0.000 0.276 0.008 0.716
#> SRR1974790 2 0.3852 0.68968 0.000 0.800 0.008 0.192
#> SRR1974789 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974788 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974786 1 0.1284 0.93811 0.964 0.012 0.000 0.024
#> SRR1974787 4 0.2466 0.82467 0.004 0.096 0.000 0.900
#> SRR1974784 4 0.4465 0.75251 0.004 0.200 0.020 0.776
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.6671 0.31179 0.572 0.028 0.044 0.356
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.4422 0.70607 0.000 0.256 0.008 0.736
#> SRR1974780 4 0.5013 0.78404 0.072 0.076 0.044 0.808
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 4 0.4381 0.77656 0.108 0.060 0.008 0.824
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 4 0.5070 0.71045 0.000 0.192 0.060 0.748
#> SRR1974770 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974769 4 0.3893 0.76279 0.000 0.196 0.008 0.796
#> SRR1974768 2 0.5226 0.71779 0.000 0.744 0.076 0.180
#> SRR1974767 4 0.2593 0.82066 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR1974766 2 0.6098 0.53122 0.000 0.632 0.076 0.292
#> SRR1974765 4 0.5070 0.52758 0.000 0.372 0.008 0.620
#> SRR1974764 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974760 4 0.4262 0.72665 0.000 0.236 0.008 0.756
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974757 2 0.5038 0.49748 0.000 0.684 0.020 0.296
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974755 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974753 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974751 4 0.1406 0.85085 0.016 0.024 0.000 0.960
#> SRR1974750 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.1733 0.84252 0.000 0.028 0.024 0.948
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3024 0.80436 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974745 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974743 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3024 0.80711 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974739 4 0.1022 0.85366 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974741 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974738 4 0.2921 0.81570 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1974737 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974736 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.2281 0.82817 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1974733 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974732 4 0.1004 0.85233 0.004 0.024 0.000 0.972
#> SRR1974731 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974725 4 0.1305 0.84226 0.004 0.036 0.000 0.960
#> SRR1974726 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 4 0.4193 0.63757 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1974723 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974722 4 0.0336 0.84901 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974721 2 0.4925 0.26754 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1974720 4 0.0469 0.84833 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.2408 0.82168 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974717 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974715 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.3024 0.79123 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974711 4 0.2921 0.79796 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4961 0.21592 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1974710 4 0.4843 0.34173 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974707 4 0.3164 0.81566 0.052 0.064 0.000 0.884
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1211 0.85376 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974702 3 0.2894 0.89028 0.024 0.020 0.908 0.048
#> SRR1974701 4 0.1406 0.85085 0.016 0.024 0.000 0.960
#> SRR1974699 4 0.3610 0.75294 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1974698 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 4 0.1510 0.84066 0.016 0.028 0.000 0.956
#> SRR1974696 4 0.1940 0.83715 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 4 0.2868 0.80101 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1974693 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974692 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974690 2 0.5183 0.20029 0.000 0.584 0.008 0.408
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974688 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.1284 0.84779 0.024 0.012 0.000 0.964
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0817 0.85255 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974675 2 0.2999 0.84337 0.000 0.864 0.132 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3123 0.76144 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1974671 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974672 2 0.3569 0.73064 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974670 2 0.3266 0.75892 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974669 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974667 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974668 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974666 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974664 2 0.3311 0.75531 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974665 2 0.2271 0.85873 0.000 0.916 0.076 0.008
#> SRR1974663 4 0.3472 0.81395 0.024 0.100 0.008 0.868
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.3801 0.71101 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.4149 0.76596 0.804 0.028 0.000 0.168
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 4 0.5781 0.03773 0.484 0.028 0.000 0.488
#> SRR1974656 4 0.2593 0.82238 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR1974650 4 0.2760 0.80697 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974651 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974652 4 0.4406 0.70733 0.192 0.028 0.000 0.780
#> SRR1974653 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974648 4 0.2053 0.83541 0.004 0.072 0.000 0.924
#> SRR1974646 2 0.3528 0.73102 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3464 0.83503 0.000 0.868 0.076 0.056
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.3024 0.79119 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974640 4 0.2530 0.81718 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974641 2 0.4817 0.38194 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.2530 0.81718 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974633 4 0.4932 0.64310 0.240 0.032 0.000 0.728
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.2530 0.81718 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0672 0.95447 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1978 0.85792 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1974623 4 0.3764 0.71636 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974622 4 0.3243 0.79789 0.088 0.036 0.000 0.876
#> SRR1974620 4 0.2704 0.80975 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1974619 4 0.2149 0.82940 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.5151 0.09114 0.532 0.004 0.000 0.464
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 4 0.3172 0.78025 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1974613 4 0.2469 0.81950 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 4 0.4999 -0.00583 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1974610 4 0.1302 0.85359 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.1256 0.84136 0.008 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974607 1 0.4741 0.66391 0.744 0.028 0.000 0.228
#> SRR1974606 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974605 4 0.2214 0.82905 0.044 0.028 0.000 0.928
#> SRR1974604 4 0.1118 0.85388 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974603 4 0.2408 0.82168 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.2530 0.83093 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974601 4 0.3610 0.73685 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1974599 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974598 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974596 2 0.2722 0.85024 0.000 0.904 0.064 0.032
#> SRR1974594 4 0.1022 0.85300 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974593 2 0.4406 0.58535 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974595 4 0.5212 0.38118 0.000 0.420 0.008 0.572
#> SRR1974592 2 0.2053 0.85894 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1974591 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974588 4 0.0707 0.85290 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974590 2 0.2149 0.81285 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974589 4 0.1022 0.85300 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974587 4 0.3801 0.72545 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974586 2 0.4961 0.20506 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1974585 4 0.1118 0.85244 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.2149 0.81397 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974582 2 0.2125 0.85986 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1974581 2 0.2053 0.85894 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1974580 4 0.1474 0.84863 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974578 4 0.0707 0.85318 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974577 2 0.4282 0.78928 0.000 0.816 0.060 0.124
#> SRR1974579 4 0.1022 0.85300 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974576 2 0.3975 0.67804 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1974575 2 0.2335 0.85409 0.000 0.920 0.060 0.020
#> SRR1974574 4 0.4422 0.70548 0.000 0.256 0.008 0.736
#> SRR1974573 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974571 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974572 4 0.4360 0.71477 0.000 0.248 0.008 0.744
#> SRR1974570 4 0.3731 0.76944 0.120 0.036 0.000 0.844
#> SRR1974568 4 0.3812 0.75665 0.140 0.028 0.000 0.832
#> SRR1974567 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 4 0.4567 0.67970 0.000 0.276 0.008 0.716
#> SRR1974569 4 0.4990 0.54698 0.000 0.352 0.008 0.640
#> SRR1974565 4 0.0921 0.85281 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974564 2 0.3545 0.72229 0.000 0.828 0.008 0.164
#> SRR1974560 4 0.2965 0.80993 0.072 0.036 0.000 0.892
#> SRR1974559 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 4 0.2973 0.80446 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1974562 2 0.5273 0.02412 0.000 0.536 0.008 0.456
#> SRR1974561 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974557 2 0.4522 0.54943 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1974553 4 0.4482 0.69596 0.000 0.264 0.008 0.728
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 4 0.4769 0.62983 0.000 0.308 0.008 0.684
#> SRR1974554 4 0.1118 0.84140 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974558 1 0.0927 0.94844 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96657 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 4 0.3801 0.71101 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974549 4 0.4391 0.71027 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974548 4 0.1302 0.85319 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974547 4 0.1118 0.84140 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974546 4 0.1867 0.83527 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974545 2 0.3300 0.74429 0.000 0.848 0.008 0.144
#> SRR1974544 1 0.5780 -0.03831 0.496 0.028 0.000 0.476
#> SRR1974543 4 0.4422 0.70548 0.000 0.256 0.008 0.736
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.5519 0.304389 0.000 0.584 0.332 0.084 0.000
#> SRR1975006 2 0.2889 0.764739 0.000 0.872 0.044 0.084 0.000
#> SRR1975005 3 0.1915 0.897022 0.000 0.032 0.928 0.040 0.000
#> SRR1975004 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.5391 0.552212 0.000 0.300 0.616 0.084 0.000
#> SRR1975001 2 0.2077 0.778107 0.000 0.908 0.008 0.084 0.000
#> SRR1975002 2 0.3033 0.760172 0.000 0.864 0.052 0.084 0.000
#> SRR1974999 2 0.5663 0.209814 0.000 0.548 0.364 0.088 0.000
#> SRR1975000 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.3791 0.826490 0.000 0.112 0.812 0.076 0.000
#> SRR1974996 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1012 0.914715 0.000 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR1974992 3 0.0579 0.919199 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974990 3 0.0880 0.904889 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.2050 0.886117 0.000 0.008 0.920 0.064 0.008
#> SRR1974991 3 0.0798 0.917327 0.000 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR1974986 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.4504 0.763591 0.000 0.168 0.748 0.084 0.000
#> SRR1974988 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0579 0.919199 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974985 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.2962 0.762527 0.000 0.868 0.048 0.084 0.000
#> SRR1974982 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.4088 0.430082 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.3906 0.820138 0.000 0.112 0.804 0.084 0.000
#> SRR1974978 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.4647 0.744941 0.000 0.184 0.732 0.084 0.000
#> SRR1974975 3 0.3906 0.820138 0.000 0.112 0.804 0.084 0.000
#> SRR1974974 3 0.5645 0.371689 0.000 0.376 0.540 0.084 0.000
#> SRR1974973 2 0.2189 0.777132 0.000 0.904 0.012 0.084 0.000
#> SRR1974972 3 0.0693 0.918373 0.000 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR1974971 2 0.3297 0.751309 0.000 0.848 0.068 0.084 0.000
#> SRR1974970 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.4183 0.797904 0.000 0.136 0.780 0.084 0.000
#> SRR1974967 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0794 0.908083 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.4541 0.760106 0.000 0.172 0.744 0.084 0.000
#> SRR1974964 3 0.0693 0.918373 0.000 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR1974963 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.1106 0.913258 0.000 0.012 0.964 0.024 0.000
#> SRR1974962 2 0.2962 0.762527 0.000 0.868 0.048 0.084 0.000
#> SRR1974960 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.4612 0.622821 0.000 0.736 0.180 0.084 0.000
#> SRR1974957 3 0.3857 0.823461 0.000 0.108 0.808 0.084 0.000
#> SRR1974956 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0880 0.904889 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.3849 0.751305 0.000 0.832 0.060 0.084 0.024
#> SRR1974952 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0579 0.919199 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974950 3 0.3906 0.820138 0.000 0.112 0.804 0.084 0.000
#> SRR1974951 3 0.4428 0.772622 0.000 0.160 0.756 0.084 0.000
#> SRR1974947 3 0.3754 0.829354 0.000 0.100 0.816 0.084 0.000
#> SRR1974948 2 0.2889 0.764574 0.000 0.872 0.044 0.084 0.000
#> SRR1974946 2 0.0865 0.795190 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974945 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3895 0.519753 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0880 0.906505 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.3420 0.846226 0.000 0.076 0.840 0.084 0.000
#> SRR1974941 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.3906 0.820138 0.000 0.112 0.804 0.084 0.000
#> SRR1974938 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0324 0.919994 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974936 3 0.0794 0.908083 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.2654 0.770442 0.000 0.884 0.032 0.084 0.000
#> SRR1974933 3 0.3906 0.820138 0.000 0.112 0.804 0.084 0.000
#> SRR1974932 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.1121 0.895578 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.4779 0.598237 0.000 0.716 0.200 0.084 0.000
#> SRR1974927 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0880 0.905359 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0880 0.904889 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3039 0.754128 0.808 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.2278 0.789057 0.000 0.916 0.008 0.044 0.032
#> SRR1974916 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0324 0.920736 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3758 0.832994 0.000 0.096 0.816 0.088 0.000
#> SRR1974913 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.2482 0.773345 0.000 0.892 0.024 0.084 0.000
#> SRR1974909 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.3526 0.840217 0.000 0.096 0.832 0.072 0.000
#> SRR1974907 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.4002 0.813795 0.000 0.120 0.796 0.084 0.000
#> SRR1974903 3 0.0290 0.920672 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.3749 0.829318 0.000 0.104 0.816 0.080 0.000
#> SRR1974901 3 0.0290 0.920450 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.2482 0.773345 0.000 0.892 0.024 0.084 0.000
#> SRR1974900 2 0.3354 0.749074 0.000 0.844 0.068 0.088 0.000
#> SRR1974899 2 0.2482 0.773345 0.000 0.892 0.024 0.084 0.000
#> SRR1974897 2 0.2077 0.778132 0.000 0.908 0.008 0.084 0.000
#> SRR1974896 2 0.2011 0.778394 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1974893 2 0.5723 0.109320 0.000 0.520 0.392 0.088 0.000
#> SRR1974895 2 0.0566 0.795772 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974894 2 0.3090 0.760231 0.000 0.860 0.052 0.088 0.000
#> SRR1974892 3 0.1485 0.907355 0.000 0.020 0.948 0.032 0.000
#> SRR1974890 3 0.0798 0.917990 0.000 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR1974891 3 0.4786 0.732374 0.000 0.188 0.720 0.092 0.000
#> SRR1974889 2 0.1502 0.788187 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974888 2 0.3291 0.752633 0.000 0.848 0.064 0.088 0.000
#> SRR1974886 2 0.2685 0.788695 0.000 0.880 0.000 0.092 0.028
#> SRR1974887 3 0.2670 0.847100 0.080 0.000 0.888 0.028 0.004
#> SRR1974885 3 0.0794 0.908674 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.3962 0.818151 0.000 0.112 0.800 0.088 0.000
#> SRR1974884 2 0.2654 0.770223 0.000 0.884 0.032 0.084 0.000
#> SRR1974881 2 0.2286 0.775559 0.000 0.888 0.004 0.108 0.000
#> SRR1974882 2 0.2011 0.778301 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1974880 2 0.1809 0.792049 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1974879 2 0.2448 0.774097 0.000 0.892 0.020 0.088 0.000
#> SRR1974877 2 0.1410 0.786222 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974876 3 0.6504 0.215779 0.000 0.356 0.448 0.196 0.000
#> SRR1974878 3 0.2719 0.874188 0.000 0.048 0.884 0.068 0.000
#> SRR1974875 3 0.0579 0.919127 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974874 2 0.6805 -0.071557 0.000 0.372 0.000 0.316 0.312
#> SRR1974873 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974871 4 0.6635 0.103566 0.000 0.224 0.000 0.416 0.360
#> SRR1974872 5 0.1918 0.657576 0.012 0.016 0.012 0.020 0.940
#> SRR1974869 2 0.5215 0.418195 0.000 0.576 0.000 0.052 0.372
#> SRR1974868 2 0.2669 0.792157 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1974870 2 0.5043 0.478164 0.000 0.600 0.000 0.044 0.356
#> SRR1974866 5 0.4066 0.499595 0.000 0.188 0.000 0.044 0.768
#> SRR1974867 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.5699 0.525425 0.000 0.624 0.000 0.156 0.220
#> SRR1974864 5 0.4305 -0.069571 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974862 2 0.6396 0.346294 0.000 0.512 0.000 0.264 0.224
#> SRR1974863 2 0.4322 0.698673 0.000 0.768 0.000 0.088 0.144
#> SRR1974860 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974861 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974859 4 0.4302 0.381956 0.000 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974858 2 0.4559 0.681220 0.000 0.748 0.000 0.100 0.152
#> SRR1974856 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974857 2 0.5444 0.573621 0.000 0.656 0.000 0.140 0.204
#> SRR1974855 3 0.6692 -0.161986 0.008 0.000 0.436 0.376 0.180
#> SRR1974854 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5623 0.348516 0.596 0.000 0.000 0.300 0.104
#> SRR1974852 4 0.4810 0.519368 0.000 0.092 0.008 0.740 0.160
#> SRR1974849 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 5 0.4473 -0.244884 0.008 0.000 0.000 0.412 0.580
#> SRR1974846 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974847 1 0.3561 0.661006 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974845 4 0.4905 0.518487 0.000 0.088 0.008 0.728 0.176
#> SRR1974844 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.3509 0.489842 0.196 0.000 0.004 0.008 0.792
#> SRR1974842 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974839 4 0.4887 0.519580 0.000 0.084 0.008 0.728 0.180
#> SRR1974838 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.4810 0.518750 0.000 0.092 0.008 0.740 0.160
#> SRR1974834 4 0.4851 0.519893 0.000 0.084 0.008 0.732 0.176
#> SRR1974833 1 0.6686 -0.069464 0.448 0.000 0.020 0.396 0.136
#> SRR1974831 4 0.5113 0.512148 0.000 0.084 0.008 0.700 0.208
#> SRR1974832 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.6125 0.249564 0.000 0.500 0.000 0.136 0.364
#> SRR1974827 4 0.5083 0.513550 0.000 0.084 0.008 0.704 0.204
#> SRR1974824 1 0.3966 0.528362 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974825 1 0.1792 0.885841 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974822 1 0.0703 0.941653 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974823 5 0.1356 0.653128 0.028 0.004 0.000 0.012 0.956
#> SRR1974820 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1408 0.912037 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1974815 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.4305 0.384881 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974812 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.3814 0.620795 0.720 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR1974808 5 0.3921 0.512902 0.000 0.172 0.000 0.044 0.784
#> SRR1974811 1 0.0162 0.957740 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974809 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2929 0.776252 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974806 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.5113 0.512148 0.000 0.084 0.008 0.700 0.208
#> SRR1974804 1 0.0451 0.951119 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974803 1 0.0162 0.957740 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.4210 0.363709 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1974799 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974797 4 0.5445 0.213050 0.000 0.312 0.008 0.616 0.064
#> SRR1974796 4 0.5113 0.512148 0.000 0.084 0.008 0.700 0.208
#> SRR1974795 4 0.5113 0.512148 0.000 0.084 0.008 0.700 0.208
#> SRR1974793 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974792 4 0.4998 0.515719 0.000 0.104 0.008 0.724 0.164
#> SRR1974791 4 0.4869 0.519303 0.000 0.088 0.008 0.732 0.172
#> SRR1974790 4 0.5374 0.265803 0.000 0.296 0.008 0.632 0.064
#> SRR1974789 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974788 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974786 1 0.3039 0.756960 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1974787 5 0.1471 0.656849 0.004 0.020 0.000 0.024 0.952
#> SRR1974784 4 0.5083 0.512216 0.000 0.084 0.008 0.704 0.204
#> SRR1974783 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 5 0.5396 0.314733 0.352 0.000 0.044 0.012 0.592
#> SRR1974782 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.5083 0.513492 0.000 0.084 0.008 0.704 0.204
#> SRR1974780 5 0.2625 0.636285 0.020 0.016 0.012 0.044 0.908
#> SRR1974779 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.1949 0.648531 0.040 0.016 0.000 0.012 0.932
#> SRR1974778 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.2616 0.793603 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1974773 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 4 0.6399 0.408284 0.000 0.196 0.000 0.496 0.308
#> SRR1974770 2 0.2669 0.792157 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1974769 4 0.5083 0.513550 0.000 0.084 0.008 0.704 0.204
#> SRR1974768 2 0.4243 0.636569 0.000 0.712 0.000 0.264 0.024
#> SRR1974767 5 0.1173 0.661405 0.004 0.020 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974766 2 0.5188 0.449872 0.000 0.600 0.000 0.344 0.056
#> SRR1974765 4 0.4998 0.465010 0.000 0.164 0.008 0.724 0.104
#> SRR1974764 2 0.2722 0.793059 0.000 0.872 0.000 0.108 0.020
#> SRR1974763 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2505 0.795840 0.000 0.888 0.000 0.092 0.020
#> SRR1974760 4 0.5083 0.513492 0.000 0.084 0.008 0.704 0.204
#> SRR1974759 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2669 0.792157 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1974757 4 0.5607 0.274394 0.000 0.300 0.008 0.612 0.080
#> SRR1974756 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.4306 0.381140 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974755 2 0.2669 0.792157 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1974753 4 0.4306 0.375543 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974751 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974750 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974752 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.1764 0.625526 0.000 0.008 0.000 0.064 0.928
#> SRR1974747 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.5765 0.237442 0.000 0.088 0.000 0.488 0.424
#> SRR1974745 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974743 4 0.4305 0.381010 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974742 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 5 0.5457 -0.229349 0.000 0.060 0.000 0.460 0.480
#> SRR1974739 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974741 4 0.4297 0.381984 0.000 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1974738 5 0.5393 -0.216685 0.000 0.056 0.000 0.440 0.504
#> SRR1974737 4 0.4297 0.381984 0.000 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1974736 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974735 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.1557 0.634637 0.000 0.008 0.000 0.052 0.940
#> SRR1974733 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974732 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974731 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974729 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.4305 0.381010 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974725 5 0.2605 0.538028 0.000 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1974726 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974724 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.2850 0.600357 0.000 0.092 0.000 0.036 0.872
#> SRR1974723 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974722 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974721 5 0.6809 -0.015065 0.000 0.312 0.000 0.320 0.368
#> SRR1974720 5 0.4138 -0.039116 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1974719 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.0898 0.661185 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974717 4 0.4306 0.375772 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974715 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974713 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.1082 0.659667 0.000 0.028 0.000 0.008 0.964
#> SRR1974711 5 0.1364 0.655073 0.000 0.036 0.000 0.012 0.952
#> SRR1974712 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.4333 0.464988 0.000 0.212 0.000 0.048 0.740
#> SRR1974710 5 0.3327 0.557879 0.000 0.144 0.000 0.028 0.828
#> SRR1974707 5 0.1200 0.660416 0.008 0.016 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974706 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.4305 0.352409 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974702 3 0.6243 0.531705 0.020 0.048 0.608 0.036 0.288
#> SRR1974701 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974699 5 0.5733 -0.200382 0.000 0.084 0.000 0.440 0.476
#> SRR1974698 5 0.4307 -0.397717 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1974700 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.1300 0.640415 0.016 0.000 0.000 0.028 0.956
#> SRR1974696 5 0.1792 0.602661 0.000 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974694 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.1106 0.659409 0.000 0.024 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974693 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974692 4 0.4306 0.381140 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974690 4 0.4974 0.464059 0.000 0.184 0.008 0.720 0.088
#> SRR1974691 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974688 4 0.4307 0.383220 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974687 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974681 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974680 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.4307 0.380695 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974677 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974675 2 0.2550 0.775418 0.000 0.892 0.020 0.084 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4303 0.687377 0.000 0.752 0.000 0.056 0.192
#> SRR1974671 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974672 2 0.5619 0.547547 0.000 0.636 0.000 0.156 0.208
#> SRR1974670 2 0.4879 0.659026 0.000 0.720 0.000 0.124 0.156
#> SRR1974669 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974667 2 0.2616 0.793603 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1974668 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974666 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974664 2 0.4872 0.656540 0.000 0.720 0.000 0.120 0.160
#> SRR1974665 2 0.2873 0.783898 0.000 0.860 0.000 0.120 0.020
#> SRR1974663 5 0.1173 0.661464 0.004 0.020 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974662 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.2069 0.630002 0.000 0.076 0.000 0.012 0.912
#> SRR1974660 1 0.0510 0.948804 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974659 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.4227 0.166743 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1974654 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.3579 0.442915 0.240 0.000 0.000 0.004 0.756
#> SRR1974656 5 0.1173 0.661464 0.004 0.020 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974650 5 0.0992 0.660709 0.000 0.024 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974651 4 0.4294 0.380682 0.000 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR1974652 5 0.2864 0.551673 0.136 0.000 0.000 0.012 0.852
#> SRR1974653 4 0.4306 0.385190 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974648 5 0.1117 0.656522 0.000 0.016 0.000 0.020 0.964
#> SRR1974646 5 0.5314 -0.048533 0.000 0.420 0.000 0.052 0.528
#> SRR1974649 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.4300 0.370924 0.000 0.000 0.000 0.524 0.476
#> SRR1974645 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3039 0.766012 0.000 0.836 0.000 0.152 0.012
#> SRR1974643 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.1106 0.659409 0.000 0.024 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974640 5 0.0898 0.661185 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974641 2 0.6740 0.045779 0.000 0.412 0.000 0.284 0.304
#> SRR1974639 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0898 0.661185 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974634 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4738 0.341260 0.000 0.016 0.000 0.520 0.464
#> SRR1974633 5 0.2563 0.573209 0.120 0.000 0.000 0.008 0.872
#> SRR1974632 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0898 0.661031 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974630 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.3336 0.712410 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1974624 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.2448 0.795756 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974623 5 0.2236 0.628944 0.000 0.068 0.000 0.024 0.908
#> SRR1974622 5 0.1444 0.646696 0.040 0.000 0.000 0.012 0.948
#> SRR1974620 5 0.0865 0.661670 0.000 0.024 0.000 0.004 0.972
#> SRR1974619 5 0.0451 0.657599 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1974621 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.6040 0.264339 0.560 0.000 0.000 0.284 0.156
#> SRR1974615 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0955 0.661145 0.000 0.028 0.000 0.004 0.968
#> SRR1974613 5 0.0609 0.661851 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974612 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.3194 0.559496 0.000 0.148 0.000 0.020 0.832
#> SRR1974610 4 0.4961 0.324416 0.000 0.028 0.000 0.524 0.448
#> SRR1974609 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.1410 0.617823 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974607 5 0.4650 0.000923 0.468 0.000 0.000 0.012 0.520
#> SRR1974606 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974605 5 0.1522 0.628663 0.012 0.000 0.000 0.044 0.944
#> SRR1974604 4 0.4307 0.383917 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974603 5 0.0912 0.660084 0.000 0.016 0.000 0.012 0.972
#> SRR1974602 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 5 0.5777 -0.269750 0.000 0.088 0.000 0.444 0.468
#> SRR1974601 5 0.1872 0.641971 0.000 0.052 0.000 0.020 0.928
#> SRR1974599 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974598 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974596 2 0.2824 0.784287 0.000 0.864 0.000 0.116 0.020
#> SRR1974594 5 0.4627 -0.261065 0.000 0.012 0.000 0.444 0.544
#> SRR1974593 2 0.5923 0.402542 0.000 0.572 0.000 0.140 0.288
#> SRR1974595 4 0.4991 0.483376 0.000 0.144 0.008 0.728 0.120
#> SRR1974592 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974591 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974588 5 0.4390 -0.230996 0.000 0.004 0.000 0.428 0.568
#> SRR1974590 2 0.4558 0.701137 0.000 0.744 0.000 0.168 0.088
#> SRR1974589 5 0.4735 -0.280382 0.000 0.016 0.000 0.460 0.524
#> SRR1974587 5 0.6342 -0.128221 0.000 0.164 0.000 0.372 0.464
#> SRR1974586 2 0.6563 0.052069 0.000 0.436 0.000 0.208 0.356
#> SRR1974585 5 0.4731 -0.275865 0.000 0.016 0.000 0.456 0.528
#> SRR1974584 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.4307 0.727617 0.000 0.772 0.000 0.128 0.100
#> SRR1974582 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974581 2 0.2448 0.796156 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1974580 5 0.5178 -0.317085 0.000 0.040 0.000 0.480 0.480
#> SRR1974578 5 0.4227 -0.217795 0.000 0.000 0.000 0.420 0.580
#> SRR1974577 2 0.5045 0.664349 0.000 0.696 0.000 0.108 0.196
#> SRR1974579 5 0.4827 -0.292576 0.000 0.020 0.000 0.476 0.504
#> SRR1974576 2 0.5657 0.488392 0.000 0.616 0.000 0.128 0.256
#> SRR1974575 2 0.2722 0.788682 0.000 0.872 0.000 0.108 0.020
#> SRR1974574 4 0.4972 0.514499 0.000 0.096 0.008 0.724 0.172
#> SRR1974573 4 0.4974 0.517199 0.000 0.088 0.008 0.720 0.184
#> SRR1974571 4 0.4940 0.516907 0.000 0.088 0.008 0.724 0.180
#> SRR1974572 4 0.4887 0.517899 0.000 0.084 0.008 0.728 0.180
#> SRR1974570 5 0.1557 0.643615 0.052 0.000 0.000 0.008 0.940
#> SRR1974568 5 0.2012 0.631862 0.060 0.000 0.000 0.020 0.920
#> SRR1974567 1 0.0992 0.933660 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974566 4 0.4945 0.501839 0.000 0.116 0.008 0.732 0.144
#> SRR1974569 4 0.4955 0.491480 0.000 0.132 0.008 0.732 0.128
#> SRR1974565 5 0.4420 -0.251658 0.004 0.000 0.000 0.448 0.548
#> SRR1974564 4 0.5286 0.213150 0.000 0.316 0.008 0.624 0.052
#> SRR1974560 5 0.1331 0.648131 0.040 0.000 0.000 0.008 0.952
#> SRR1974559 1 0.0693 0.945043 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974563 4 0.4943 0.514850 0.000 0.076 0.008 0.716 0.200
#> SRR1974562 4 0.5070 0.478023 0.000 0.152 0.008 0.720 0.120
#> SRR1974561 4 0.4940 0.516907 0.000 0.088 0.008 0.724 0.180
#> SRR1974557 2 0.6103 0.361226 0.000 0.548 0.000 0.160 0.292
#> SRR1974553 4 0.4939 0.503877 0.000 0.112 0.008 0.732 0.148
#> SRR1974555 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.960932 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 4 0.5035 0.500361 0.000 0.124 0.008 0.724 0.144
#> SRR1974554 5 0.1043 0.639789 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974558 1 0.3551 0.710731 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR1974556 1 0.0162 0.957734 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974550 5 0.2645 0.614103 0.000 0.068 0.000 0.044 0.888
#> SRR1974549 4 0.4974 0.516969 0.000 0.088 0.008 0.720 0.184
#> SRR1974548 5 0.4937 -0.227287 0.000 0.028 0.000 0.428 0.544
#> SRR1974547 5 0.1043 0.642452 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974546 5 0.0798 0.660867 0.000 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1974545 4 0.5733 0.136700 0.000 0.332 0.008 0.580 0.080
#> SRR1974544 5 0.4371 0.349665 0.344 0.000 0.000 0.012 0.644
#> SRR1974543 4 0.4957 0.515861 0.000 0.092 0.008 0.724 0.176
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.7354 0.45819 0.000 0.368 0.164 0.000 0.156 0.312
#> SRR1975006 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1975005 3 0.2733 0.79207 0.000 0.000 0.864 0.000 0.056 0.080
#> SRR1975004 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.7335 0.13781 0.000 0.164 0.384 0.000 0.156 0.296
#> SRR1975001 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1975002 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974999 2 0.7516 0.39400 0.000 0.336 0.196 0.000 0.168 0.300
#> SRR1975000 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0767 0.85628 0.000 0.004 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974995 3 0.5389 0.53726 0.000 0.000 0.572 0.000 0.160 0.268
#> SRR1974996 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1334 0.84322 0.000 0.000 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1974992 3 0.0458 0.85847 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974990 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974989 3 0.3039 0.78879 0.000 0.004 0.868 0.052 0.028 0.048
#> SRR1974991 3 0.0603 0.85743 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974986 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.6513 0.40619 0.000 0.060 0.492 0.000 0.156 0.292
#> SRR1974988 3 0.0260 0.86038 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974984 3 0.0363 0.85930 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974982 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3915 0.23461 0.412 0.000 0.584 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5586 0.51274 0.000 0.004 0.552 0.000 0.160 0.284
#> SRR1974978 3 0.0146 0.86085 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974977 3 0.0146 0.86085 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974976 3 0.6828 0.34049 0.000 0.092 0.460 0.000 0.152 0.296
#> SRR1974975 3 0.5422 0.52660 0.000 0.000 0.564 0.000 0.160 0.276
#> SRR1974974 3 0.7502 -0.03172 0.000 0.216 0.336 0.000 0.152 0.296
#> SRR1974973 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974972 3 0.0806 0.85428 0.000 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974971 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974970 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974968 3 0.6045 0.47019 0.000 0.028 0.528 0.000 0.152 0.292
#> SRR1974967 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974965 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974966 3 0.6719 0.35272 0.000 0.076 0.464 0.000 0.156 0.304
#> SRR1974964 3 0.0717 0.85596 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974963 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974961 3 0.1257 0.84504 0.000 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974962 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974960 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.6492 0.61542 0.000 0.472 0.048 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974957 3 0.5422 0.52765 0.000 0.000 0.564 0.000 0.160 0.276
#> SRR1974956 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974952 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974949 3 0.0603 0.85718 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974950 3 0.5586 0.51274 0.000 0.004 0.552 0.000 0.160 0.284
#> SRR1974951 3 0.6548 0.40858 0.000 0.064 0.492 0.000 0.156 0.288
#> SRR1974947 3 0.5343 0.54483 0.000 0.000 0.580 0.000 0.156 0.264
#> SRR1974948 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974946 2 0.3612 0.69310 0.000 0.780 0.000 0.000 0.052 0.168
#> SRR1974945 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2933 0.64946 0.200 0.000 0.796 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974942 3 0.0291 0.85968 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974943 3 0.5124 0.58830 0.000 0.000 0.620 0.000 0.148 0.232
#> SRR1974941 3 0.0146 0.86085 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.5425 0.52051 0.000 0.000 0.560 0.000 0.156 0.284
#> SRR1974938 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974933 3 0.5570 0.51789 0.000 0.004 0.556 0.000 0.160 0.280
#> SRR1974932 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0692 0.84760 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974929 3 0.0146 0.86085 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974928 2 0.7147 0.53589 0.000 0.416 0.124 0.000 0.164 0.296
#> SRR1974927 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974924 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974925 3 0.0508 0.85350 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974926 1 0.3899 0.33106 0.592 0.000 0.404 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.4949 0.67581 0.000 0.644 0.000 0.004 0.104 0.248
#> SRR1974916 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974914 3 0.5672 0.53472 0.000 0.008 0.560 0.000 0.172 0.260
#> SRR1974913 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0146 0.86085 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974909 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.5269 0.56151 0.000 0.000 0.596 0.000 0.156 0.248
#> SRR1974907 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.5858 0.49518 0.000 0.016 0.540 0.000 0.160 0.284
#> SRR1974903 3 0.0000 0.86150 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.5354 0.54558 0.000 0.000 0.580 0.000 0.160 0.260
#> SRR1974901 3 0.0146 0.86119 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974898 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974900 2 0.5948 0.63289 0.000 0.496 0.012 0.000 0.168 0.324
#> SRR1974899 2 0.5866 0.63960 0.000 0.516 0.012 0.000 0.160 0.312
#> SRR1974897 2 0.5729 0.64068 0.000 0.516 0.004 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974896 2 0.5938 0.62850 0.000 0.500 0.012 0.000 0.168 0.320
#> SRR1974893 2 0.7372 0.45419 0.000 0.364 0.164 0.000 0.160 0.312
#> SRR1974895 2 0.2826 0.69684 0.000 0.844 0.000 0.000 0.028 0.128
#> SRR1974894 2 0.5952 0.62810 0.000 0.500 0.012 0.000 0.172 0.316
#> SRR1974892 3 0.2994 0.79378 0.000 0.004 0.852 0.000 0.064 0.080
#> SRR1974890 3 0.1562 0.83987 0.000 0.004 0.940 0.000 0.032 0.024
#> SRR1974891 3 0.6828 0.34147 0.000 0.080 0.448 0.000 0.168 0.304
#> SRR1974889 2 0.4934 0.67052 0.000 0.628 0.000 0.000 0.108 0.264
#> SRR1974888 2 0.6036 0.62757 0.000 0.488 0.016 0.000 0.168 0.328
#> SRR1974886 2 0.5364 0.65978 0.000 0.624 0.000 0.012 0.148 0.216
#> SRR1974887 3 0.3056 0.78846 0.052 0.004 0.876 0.016 0.024 0.028
#> SRR1974885 3 0.0810 0.85560 0.004 0.004 0.976 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974883 3 0.5719 0.48904 0.000 0.004 0.524 0.000 0.172 0.300
#> SRR1974884 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974881 2 0.5919 0.62802 0.000 0.516 0.012 0.000 0.176 0.296
#> SRR1974882 2 0.5941 0.63014 0.000 0.504 0.012 0.000 0.172 0.312
#> SRR1974880 2 0.5258 0.66380 0.000 0.596 0.000 0.000 0.152 0.252
#> SRR1974879 2 0.5938 0.63286 0.000 0.500 0.012 0.000 0.168 0.320
#> SRR1974877 2 0.5011 0.66853 0.000 0.620 0.000 0.000 0.116 0.264
#> SRR1974876 6 0.8090 -0.36064 0.000 0.252 0.248 0.024 0.176 0.300
#> SRR1974878 3 0.4955 0.63843 0.000 0.004 0.660 0.000 0.132 0.204
#> SRR1974875 3 0.1321 0.84373 0.000 0.004 0.952 0.000 0.024 0.020
#> SRR1974874 4 0.5582 0.33863 0.000 0.328 0.000 0.564 0.068 0.040
#> SRR1974873 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974871 4 0.5168 0.49286 0.000 0.252 0.000 0.648 0.060 0.040
#> SRR1974872 5 0.3503 0.86069 0.000 0.012 0.000 0.180 0.788 0.020
#> SRR1974869 2 0.5431 0.17671 0.000 0.520 0.000 0.044 0.396 0.040
#> SRR1974868 2 0.1074 0.67681 0.000 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1974870 5 0.5351 0.09902 0.000 0.424 0.000 0.036 0.500 0.040
#> SRR1974866 5 0.4889 0.71764 0.000 0.132 0.000 0.116 0.716 0.036
#> SRR1974867 1 0.0260 0.95461 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974865 2 0.5530 0.33853 0.000 0.580 0.000 0.312 0.068 0.040
#> SRR1974864 5 0.4593 0.69146 0.188 0.000 0.000 0.088 0.712 0.012
#> SRR1974862 4 0.5568 0.26167 0.000 0.364 0.000 0.536 0.064 0.036
#> SRR1974863 2 0.4454 0.60546 0.000 0.752 0.000 0.144 0.064 0.040
#> SRR1974860 2 0.0405 0.68526 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974861 2 0.0363 0.68644 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.81468 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.4768 0.57360 0.000 0.720 0.000 0.168 0.072 0.040
#> SRR1974856 4 0.0363 0.81893 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974857 2 0.5234 0.47934 0.000 0.652 0.000 0.236 0.072 0.040
#> SRR1974855 3 0.6540 -0.00696 0.000 0.004 0.472 0.320 0.044 0.160
#> SRR1974854 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5707 0.27985 0.580 0.000 0.000 0.236 0.016 0.168
#> SRR1974852 6 0.5227 0.89376 0.000 0.092 0.000 0.256 0.020 0.632
#> SRR1974849 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4810 0.49230 0.008 0.000 0.000 0.688 0.120 0.184
#> SRR1974846 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974847 1 0.4175 0.08232 0.524 0.000 0.000 0.000 0.464 0.012
#> SRR1974845 6 0.5204 0.89282 0.000 0.088 0.000 0.260 0.020 0.632
#> SRR1974844 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.4253 0.82661 0.064 0.000 0.000 0.172 0.748 0.016
#> SRR1974842 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974839 6 0.5234 0.89198 0.000 0.084 0.000 0.260 0.024 0.632
#> SRR1974838 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.5282 0.89499 0.000 0.092 0.000 0.252 0.024 0.632
#> SRR1974834 6 0.5305 0.89197 0.000 0.084 0.000 0.260 0.028 0.628
#> SRR1974833 1 0.7289 -0.28345 0.388 0.000 0.052 0.260 0.020 0.280
#> SRR1974831 6 0.5254 0.88931 0.000 0.084 0.000 0.264 0.024 0.628
#> SRR1974832 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.6282 0.43431 0.000 0.584 0.000 0.160 0.160 0.096
#> SRR1974827 6 0.5254 0.88931 0.000 0.084 0.000 0.264 0.024 0.628
#> SRR1974824 5 0.4279 0.21343 0.436 0.000 0.000 0.004 0.548 0.012
#> SRR1974825 1 0.2170 0.85449 0.888 0.000 0.000 0.000 0.100 0.012
#> SRR1974822 1 0.1036 0.93219 0.964 0.000 0.000 0.008 0.024 0.004
#> SRR1974823 5 0.3463 0.86825 0.008 0.004 0.000 0.204 0.776 0.008
#> SRR1974820 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1596 0.91937 0.944 0.000 0.004 0.012 0.020 0.020
#> SRR1974815 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1367 0.78763 0.000 0.000 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR1974812 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.4609 0.54465 0.684 0.000 0.000 0.060 0.244 0.012
#> SRR1974808 5 0.4303 0.77922 0.000 0.080 0.000 0.128 0.764 0.028
#> SRR1974811 1 0.0508 0.94943 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974809 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.3426 0.71640 0.784 0.000 0.000 0.012 0.192 0.012
#> SRR1974806 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.5254 0.88931 0.000 0.084 0.000 0.264 0.024 0.628
#> SRR1974804 1 0.0405 0.95243 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974803 1 0.0260 0.95461 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974801 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.4058 0.50898 0.320 0.000 0.000 0.004 0.660 0.016
#> SRR1974799 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974797 6 0.5074 0.73840 0.000 0.260 0.000 0.100 0.008 0.632
#> SRR1974796 6 0.5305 0.89055 0.000 0.084 0.000 0.260 0.028 0.628
#> SRR1974795 6 0.5254 0.88931 0.000 0.084 0.000 0.264 0.024 0.628
#> SRR1974793 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0508 0.68528 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974792 6 0.5281 0.88874 0.000 0.100 0.000 0.236 0.024 0.640
#> SRR1974791 6 0.5229 0.89376 0.000 0.096 0.000 0.248 0.020 0.636
#> SRR1974790 6 0.5225 0.75085 0.000 0.248 0.000 0.112 0.012 0.628
#> SRR1974789 2 0.0405 0.68514 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974788 2 0.0405 0.68526 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974786 1 0.4090 0.45481 0.652 0.000 0.000 0.004 0.328 0.016
#> SRR1974787 5 0.3680 0.86045 0.000 0.008 0.000 0.216 0.756 0.020
#> SRR1974784 6 0.5379 0.88325 0.000 0.092 0.000 0.244 0.032 0.632
#> SRR1974783 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 5 0.4606 0.70374 0.172 0.000 0.008 0.072 0.732 0.016
#> SRR1974782 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.5353 0.88635 0.000 0.092 0.000 0.252 0.028 0.628
#> SRR1974780 5 0.3787 0.86029 0.008 0.008 0.000 0.208 0.760 0.016
#> SRR1974779 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.3938 0.86232 0.020 0.008 0.000 0.192 0.764 0.016
#> SRR1974778 1 0.0508 0.94943 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974774 2 0.1225 0.67625 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1974773 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.7092 -0.47906 0.000 0.332 0.000 0.288 0.068 0.312
#> SRR1974770 2 0.1151 0.67543 0.000 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974769 6 0.5234 0.89198 0.000 0.084 0.000 0.260 0.024 0.632
#> SRR1974768 2 0.4488 0.51930 0.000 0.752 0.000 0.048 0.060 0.140
#> SRR1974767 5 0.3487 0.86939 0.000 0.012 0.000 0.200 0.776 0.012
#> SRR1974766 2 0.5348 0.28956 0.000 0.652 0.000 0.092 0.040 0.216
#> SRR1974765 6 0.5673 0.82748 0.000 0.168 0.000 0.172 0.036 0.624
#> SRR1974764 2 0.1856 0.67513 0.000 0.920 0.000 0.000 0.032 0.048
#> SRR1974763 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1151 0.67818 0.000 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974760 6 0.5259 0.89044 0.000 0.088 0.000 0.256 0.024 0.632
#> SRR1974759 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1225 0.67348 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1974757 6 0.5054 0.77020 0.000 0.232 0.000 0.124 0.004 0.640
#> SRR1974756 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0508 0.81825 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974755 2 0.1297 0.67430 0.000 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1974753 4 0.0405 0.81167 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974751 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974750 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.4012 0.82628 0.000 0.012 0.000 0.240 0.724 0.024
#> SRR1974747 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0363 0.95209 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974746 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3323 0.70063 0.000 0.104 0.000 0.836 0.028 0.032
#> SRR1974745 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974743 4 0.0146 0.81659 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3628 0.69526 0.000 0.084 0.000 0.824 0.052 0.040
#> SRR1974739 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974741 4 0.0146 0.81386 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974738 4 0.3475 0.70924 0.000 0.068 0.000 0.836 0.056 0.040
#> SRR1974737 4 0.0000 0.81468 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.3878 0.74102 0.000 0.008 0.000 0.320 0.668 0.004
#> SRR1974733 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974732 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974731 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974729 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0508 0.94943 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974728 4 0.0717 0.81580 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1974725 5 0.4062 0.53289 0.000 0.000 0.000 0.440 0.552 0.008
#> SRR1974726 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974724 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.3995 0.82342 0.000 0.032 0.000 0.172 0.768 0.028
#> SRR1974723 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974722 4 0.1245 0.80096 0.000 0.000 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1974721 4 0.5617 0.30721 0.000 0.340 0.000 0.552 0.068 0.040
#> SRR1974720 4 0.1908 0.74686 0.000 0.000 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR1974719 1 0.0622 0.94658 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974718 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.3292 0.86908 0.000 0.008 0.000 0.200 0.784 0.008
#> SRR1974717 4 0.0508 0.81025 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1974715 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974711 5 0.3219 0.86877 0.000 0.012 0.000 0.192 0.792 0.004
#> SRR1974712 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.4788 0.69771 0.000 0.152 0.000 0.096 0.720 0.032
#> SRR1974710 5 0.4081 0.81294 0.000 0.048 0.000 0.160 0.768 0.024
#> SRR1974707 5 0.3213 0.86947 0.008 0.004 0.000 0.204 0.784 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0964 0.80190 0.000 0.004 0.000 0.968 0.012 0.016
#> SRR1974702 5 0.6088 0.10892 0.004 0.004 0.300 0.024 0.540 0.128
#> SRR1974701 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974699 4 0.3708 0.68680 0.000 0.096 0.000 0.816 0.052 0.036
#> SRR1974698 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.3329 0.86190 0.008 0.000 0.000 0.220 0.768 0.004
#> SRR1974696 5 0.3684 0.77625 0.000 0.004 0.000 0.300 0.692 0.004
#> SRR1974694 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974693 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974692 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974690 6 0.5283 0.86125 0.000 0.144 0.000 0.208 0.012 0.636
#> SRR1974691 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974688 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974687 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0622 0.81766 0.000 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974681 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0820 0.68211 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1974675 2 0.5917 0.63966 0.000 0.508 0.012 0.000 0.168 0.312
#> SRR1974674 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4232 0.62758 0.000 0.764 0.000 0.040 0.152 0.044
#> SRR1974671 2 0.0291 0.68580 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974672 2 0.5422 0.39709 0.000 0.608 0.000 0.284 0.068 0.040
#> SRR1974670 2 0.4952 0.54348 0.000 0.696 0.000 0.192 0.072 0.040
#> SRR1974669 2 0.0405 0.68431 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974667 2 0.1297 0.67430 0.000 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1974668 2 0.0405 0.68526 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974666 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974664 2 0.5015 0.54430 0.000 0.692 0.000 0.192 0.072 0.044
#> SRR1974665 2 0.1434 0.66894 0.000 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1974663 5 0.3649 0.86772 0.004 0.008 0.000 0.204 0.768 0.016
#> SRR1974662 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.4092 0.85095 0.000 0.032 0.000 0.184 0.756 0.028
#> SRR1974660 1 0.1297 0.91860 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1974659 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.4533 0.73732 0.148 0.000 0.000 0.112 0.728 0.012
#> SRR1974654 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.4437 0.80113 0.088 0.000 0.000 0.168 0.732 0.012
#> SRR1974656 5 0.3463 0.86950 0.004 0.008 0.000 0.204 0.776 0.008
#> SRR1974650 5 0.3250 0.86941 0.000 0.012 0.000 0.196 0.788 0.004
#> SRR1974651 4 0.0622 0.80648 0.000 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1974652 5 0.4179 0.83929 0.048 0.000 0.000 0.192 0.744 0.016
#> SRR1974653 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974648 5 0.3213 0.86838 0.000 0.008 0.000 0.204 0.784 0.004
#> SRR1974646 5 0.4546 0.58299 0.000 0.240 0.000 0.036 0.696 0.028
#> SRR1974649 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0914 0.80161 0.000 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1974645 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.2594 0.66057 0.000 0.888 0.000 0.020 0.036 0.056
#> SRR1974643 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.3250 0.86941 0.000 0.012 0.000 0.196 0.788 0.004
#> SRR1974640 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974641 4 0.5736 0.15050 0.000 0.404 0.000 0.488 0.068 0.040
#> SRR1974639 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0363 0.95209 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974635 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974634 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.1622 0.78285 0.000 0.028 0.000 0.940 0.016 0.016
#> SRR1974633 5 0.4071 0.84385 0.048 0.004 0.000 0.184 0.756 0.008
#> SRR1974632 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974630 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.3927 0.44770 0.644 0.000 0.000 0.000 0.344 0.012
#> SRR1974624 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1901 0.68063 0.000 0.924 0.000 0.008 0.028 0.040
#> SRR1974623 5 0.3635 0.85538 0.000 0.032 0.000 0.180 0.780 0.008
#> SRR1974622 5 0.3594 0.86371 0.020 0.000 0.000 0.204 0.768 0.008
#> SRR1974620 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974619 5 0.3213 0.86824 0.000 0.008 0.000 0.204 0.784 0.004
#> SRR1974621 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.5786 0.34415 0.596 0.000 0.000 0.180 0.028 0.196
#> SRR1974615 1 0.0146 0.95695 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.3359 0.86991 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974613 5 0.3359 0.86959 0.000 0.012 0.000 0.196 0.784 0.008
#> SRR1974612 1 0.0508 0.94943 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974611 5 0.4169 0.80282 0.000 0.056 0.000 0.148 0.768 0.028
#> SRR1974610 4 0.2538 0.75058 0.000 0.048 0.000 0.892 0.040 0.020
#> SRR1974609 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.3411 0.85278 0.004 0.000 0.000 0.232 0.756 0.008
#> SRR1974607 5 0.4572 0.71487 0.168 0.000 0.000 0.092 0.724 0.016
#> SRR1974606 2 0.0363 0.68260 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974605 5 0.3533 0.84827 0.004 0.000 0.000 0.236 0.748 0.012
#> SRR1974604 4 0.0508 0.81969 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974603 5 0.3420 0.86874 0.000 0.012 0.000 0.204 0.776 0.008
#> SRR1974602 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.7033 0.18327 0.000 0.136 0.000 0.460 0.148 0.256
#> SRR1974601 5 0.3883 0.85152 0.000 0.024 0.000 0.196 0.760 0.020
#> SRR1974599 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974598 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974596 2 0.0891 0.67435 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974594 4 0.5176 0.34961 0.000 0.000 0.000 0.608 0.144 0.248
#> SRR1974593 2 0.5955 0.45574 0.000 0.616 0.000 0.188 0.108 0.088
#> SRR1974595 6 0.5677 0.87583 0.000 0.124 0.000 0.208 0.044 0.624
#> SRR1974592 2 0.0405 0.68431 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974591 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974588 4 0.5208 0.34738 0.000 0.000 0.000 0.604 0.148 0.248
#> SRR1974590 2 0.4624 0.57918 0.000 0.752 0.000 0.084 0.064 0.100
#> SRR1974589 4 0.5310 0.34246 0.000 0.004 0.000 0.604 0.144 0.248
#> SRR1974587 4 0.7475 0.18092 0.000 0.280 0.000 0.360 0.160 0.200
#> SRR1974586 2 0.6375 0.32070 0.000 0.544 0.000 0.252 0.116 0.088
#> SRR1974585 4 0.5278 0.33994 0.000 0.004 0.000 0.608 0.140 0.248
#> SRR1974584 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.4228 0.60367 0.000 0.784 0.000 0.060 0.076 0.080
#> SRR1974582 2 0.0508 0.68340 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974581 2 0.0405 0.68431 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974580 4 0.5486 0.29849 0.000 0.020 0.000 0.604 0.116 0.260
#> SRR1974578 4 0.5124 0.38160 0.000 0.000 0.000 0.620 0.148 0.232
#> SRR1974577 2 0.3680 0.55035 0.000 0.756 0.000 0.008 0.216 0.020
#> SRR1974579 4 0.5464 0.32769 0.000 0.008 0.000 0.592 0.148 0.252
#> SRR1974576 2 0.5203 0.55279 0.000 0.704 0.000 0.104 0.100 0.092
#> SRR1974575 2 0.0458 0.68191 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974574 6 0.5538 0.89162 0.000 0.084 0.000 0.244 0.048 0.624
#> SRR1974573 6 0.5501 0.89262 0.000 0.084 0.000 0.248 0.044 0.624
#> SRR1974571 6 0.5501 0.89262 0.000 0.084 0.000 0.248 0.044 0.624
#> SRR1974572 6 0.5501 0.89262 0.000 0.084 0.000 0.248 0.044 0.624
#> SRR1974570 5 0.3627 0.86759 0.012 0.004 0.000 0.200 0.772 0.012
#> SRR1974568 5 0.3507 0.85989 0.012 0.000 0.000 0.216 0.764 0.008
#> SRR1974567 1 0.1082 0.92032 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1974566 6 0.5567 0.89183 0.000 0.096 0.000 0.236 0.044 0.624
#> SRR1974569 6 0.5652 0.88143 0.000 0.116 0.000 0.216 0.044 0.624
#> SRR1974565 4 0.5156 0.35435 0.000 0.000 0.000 0.612 0.144 0.244
#> SRR1974564 6 0.5079 0.70572 0.000 0.288 0.000 0.080 0.012 0.620
#> SRR1974560 5 0.3450 0.86476 0.008 0.000 0.000 0.208 0.772 0.012
#> SRR1974559 1 0.0692 0.93999 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974563 6 0.5436 0.88872 0.000 0.080 0.000 0.256 0.040 0.624
#> SRR1974562 6 0.5663 0.87124 0.000 0.132 0.000 0.204 0.040 0.624
#> SRR1974561 6 0.5501 0.89262 0.000 0.084 0.000 0.248 0.044 0.624
#> SRR1974557 2 0.5496 0.42964 0.000 0.620 0.000 0.256 0.080 0.044
#> SRR1974553 6 0.5586 0.89012 0.000 0.100 0.000 0.232 0.044 0.624
#> SRR1974555 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.95936 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 6 0.5622 0.88875 0.000 0.100 0.000 0.228 0.048 0.624
#> SRR1974554 5 0.3213 0.86722 0.000 0.004 0.000 0.204 0.784 0.008
#> SRR1974558 1 0.4172 0.20390 0.564 0.000 0.000 0.004 0.424 0.008
#> SRR1974556 1 0.0146 0.95691 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974550 5 0.4020 0.83808 0.000 0.028 0.000 0.184 0.760 0.028
#> SRR1974549 6 0.5501 0.89262 0.000 0.084 0.000 0.248 0.044 0.624
#> SRR1974548 4 0.5991 0.29235 0.000 0.028 0.000 0.556 0.172 0.244
#> SRR1974547 5 0.3281 0.86758 0.000 0.004 0.000 0.200 0.784 0.012
#> SRR1974546 5 0.3359 0.86832 0.000 0.008 0.000 0.196 0.784 0.012
#> SRR1974545 6 0.5050 0.68121 0.000 0.288 0.000 0.064 0.020 0.628
#> SRR1974544 5 0.5103 0.67586 0.200 0.000 0.000 0.120 0.664 0.016
#> SRR1974543 6 0.5538 0.89162 0.000 0.084 0.000 0.244 0.048 0.624
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.968 0.947 0.978 0.5010 0.499 0.499
#> 3 3 0.954 0.926 0.970 0.3103 0.768 0.569
#> 4 4 0.808 0.752 0.893 0.1353 0.806 0.511
#> 5 5 0.828 0.790 0.883 0.0536 0.928 0.735
#> 6 6 0.935 0.891 0.945 0.0387 0.944 0.755
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.2778 0.9381 0.048 0.952
#> SRR1975004 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1975000 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974998 1 0.0376 0.9678 0.996 0.004
#> SRR1974997 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974996 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974993 1 0.8608 0.6207 0.716 0.284
#> SRR1974992 2 0.8909 0.5524 0.308 0.692
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974989 1 0.8608 0.6163 0.716 0.284
#> SRR1974991 2 0.6438 0.7976 0.164 0.836
#> SRR1974986 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.9909 0.1987 0.444 0.556
#> SRR1974985 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.2236 0.9504 0.036 0.964
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974970 1 0.0672 0.9648 0.992 0.008
#> SRR1974969 1 0.8327 0.6566 0.736 0.264
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974967 1 0.5294 0.8557 0.880 0.120
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974964 1 0.6438 0.8008 0.836 0.164
#> SRR1974963 1 0.1184 0.9587 0.984 0.016
#> SRR1974961 2 0.7376 0.7339 0.208 0.792
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974959 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974956 1 0.2948 0.9260 0.948 0.052
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974954 1 0.1843 0.9481 0.972 0.028
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974952 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974949 2 0.9983 0.0804 0.476 0.524
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.1633 0.9520 0.976 0.024
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974938 1 0.0376 0.9678 0.996 0.004
#> SRR1974937 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974932 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974931 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974927 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.7056 0.7654 0.808 0.192
#> SRR1974922 1 0.2423 0.9381 0.960 0.040
#> SRR1974921 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974907 1 0.3431 0.9161 0.936 0.064
#> SRR1974905 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974901 1 0.0938 0.9617 0.988 0.012
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.9491 0.4022 0.368 0.632
#> SRR1974890 1 0.2603 0.9345 0.956 0.044
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.1843 0.9582 0.028 0.972
#> SRR1974875 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.8813 0.5703 0.300 0.700
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.0938 0.9616 0.988 0.012
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0672 0.9767 0.008 0.992
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.2948 0.9340 0.052 0.948
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.2603 0.9338 0.956 0.044
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.8813 0.5596 0.300 0.700
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974796 1 0.1843 0.9484 0.972 0.028
#> SRR1974795 1 0.9970 0.1593 0.532 0.468
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.9552 0.4230 0.624 0.376
#> SRR1974784 1 0.9732 0.3539 0.596 0.404
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974780 1 0.8713 0.5927 0.708 0.292
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2948 0.9272 0.948 0.052
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.2236 0.9505 0.036 0.964
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974750 1 0.8555 0.6261 0.720 0.280
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.5178 0.8596 0.116 0.884
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974745 1 0.9881 0.2605 0.564 0.436
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.1633 0.9616 0.024 0.976
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974736 1 0.8861 0.5815 0.696 0.304
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.7950 0.6938 0.760 0.240
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0938 0.9729 0.012 0.988
#> SRR1974722 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974720 1 0.9881 0.2619 0.564 0.436
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.9686 0.3516 0.604 0.396
#> SRR1974701 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.4298 0.8904 0.912 0.088
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.2778 0.9307 0.952 0.048
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0376 0.9678 0.996 0.004
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.5408 0.8509 0.876 0.124
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.9129 0.5337 0.672 0.328
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.9983 0.1306 0.524 0.476
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974613 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0376 0.9678 0.996 0.004
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.2778 0.9383 0.048 0.952
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.9608 0.3758 0.384 0.616
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974565 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0376 0.9801 0.004 0.996
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.8207 0.6545 0.256 0.744
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.2948 0.9345 0.052 0.948
#> SRR1974546 2 0.1184 0.9695 0.016 0.984
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9708 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9837 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0592 0.9618 0.012 0.000 0.988
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.5465 0.6093 0.000 0.288 0.712
#> SRR1975002 3 0.1031 0.9532 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.5988 0.4301 0.632 0.000 0.368
#> SRR1974989 3 0.0237 0.9666 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0747 0.9592 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.1163 0.9497 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974983 3 0.0237 0.9661 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974982 3 0.2625 0.8932 0.084 0.000 0.916
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0592 0.9618 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0747 0.9592 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974977 3 0.0592 0.9618 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.5760 0.5291 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 1 0.6274 0.1810 0.544 0.000 0.456
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.1411 0.9443 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974960 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974959 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.6302 0.1061 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.2711 0.8980 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0747 0.9587 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974946 2 0.0424 0.9697 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0747 0.9475 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974942 1 0.6309 0.0283 0.504 0.000 0.496
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0747 0.9592 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974940 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0424 0.9644 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974936 1 0.6008 0.4182 0.628 0.000 0.372
#> SRR1974935 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974934 3 0.1643 0.9376 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974931 3 0.1031 0.9531 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974930 1 0.3192 0.8547 0.888 0.000 0.112
#> SRR1974929 3 0.1753 0.9313 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.2625 0.8854 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974925 1 0.6168 0.3185 0.588 0.000 0.412
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0592 0.9618 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974920 3 0.1289 0.9460 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974919 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.4002 0.7991 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974916 3 0.0424 0.9644 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974915 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974914 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974913 3 0.0424 0.9644 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974911 3 0.0747 0.9592 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974910 3 0.0592 0.9618 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974908 3 0.2796 0.8934 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974909 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.3412 0.8574 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974900 3 0.1643 0.9376 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974899 3 0.2356 0.9135 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974897 3 0.6307 0.0683 0.000 0.488 0.512
#> SRR1974896 3 0.3192 0.8713 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974894 3 0.0424 0.9638 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974892 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.1860 0.9301 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974888 3 0.1031 0.9529 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974886 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974887 1 0.0892 0.9440 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974885 1 0.5216 0.6457 0.740 0.000 0.260
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.1964 0.9277 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974881 3 0.4842 0.7225 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974882 3 0.6307 0.0753 0.000 0.488 0.512
#> SRR1974880 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974879 3 0.2711 0.8979 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974877 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974876 3 0.2537 0.9058 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9681 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974875 3 0.0237 0.9667 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 2 0.9361 0.0587 0.396 0.436 0.168
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974861 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 1 0.5167 0.7622 0.804 0.024 0.172
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.0237 0.9568 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0892 0.9569 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.2066 0.9072 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.0592 0.9504 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.2878 0.8774 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 1 0.2356 0.8940 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974795 2 0.5835 0.4793 0.340 0.660 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974792 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974788 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.4931 0.6922 0.768 0.232 0.000
#> SRR1974784 1 0.6309 0.0140 0.504 0.496 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 1 0.4047 0.8061 0.848 0.148 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974770 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.1163 0.9537 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974767 2 0.1964 0.9210 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974766 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974760 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974757 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 1 0.1753 0.9182 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974750 2 0.6309 -0.0152 0.500 0.500 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.2682 0.8995 0.076 0.920 0.004
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.4555 0.7418 0.200 0.800 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.5785 0.4982 0.332 0.668 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.5560 0.5723 0.700 0.300 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.0424 0.9537 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 1 0.1031 0.9406 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 2 0.6062 0.3690 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 3 0.4887 0.6947 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974701 1 0.2796 0.8746 0.908 0.092 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0237 0.9568 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.4399 0.7624 0.812 0.188 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.4002 0.7984 0.840 0.160 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974675 2 0.6235 0.2036 0.000 0.564 0.436
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974667 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974668 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974666 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.2711 0.8769 0.912 0.088 0.000
#> SRR1974650 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.5882 0.4673 0.652 0.348 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0592 0.9672 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.6302 0.0836 0.520 0.480 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.1643 0.9369 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974613 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0592 0.9507 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.3116 0.8635 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974598 2 0.0424 0.9697 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974596 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974591 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974581 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0237 0.9719 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 2 0.6111 0.3380 0.396 0.604 0.000
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 1 0.3340 0.8441 0.880 0.120 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0747 0.9474 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 2 0.4235 0.7784 0.176 0.824 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 2 0.1643 0.9334 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974546 2 0.0747 0.9607 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9600 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9736 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.4855 0.3557 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1975006 2 0.0592 0.7270 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.3975 0.6812 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1975001 2 0.0188 0.7314 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1975002 2 0.0592 0.7270 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974999 2 0.4679 0.3879 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0336 0.9587 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974989 3 0.0921 0.9424 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.2469 0.8621 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0592 0.7270 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.4697 0.4400 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.3356 0.7771 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.3975 0.6852 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1974973 2 0.0188 0.7314 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0817 0.7245 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0817 0.9477 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0336 0.9587 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974966 3 0.3975 0.6756 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0469 0.7288 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.4103 0.5162 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0336 0.9587 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.1211 0.7130 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0188 0.9625 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974951 3 0.1302 0.9302 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0469 0.7288 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3907 0.6963 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1974942 3 0.3356 0.7739 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1974943 3 0.0469 0.9561 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0336 0.9593 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0592 0.9520 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0336 0.7301 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974933 3 0.0188 0.9625 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.2814 0.8281 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.3400 0.6249 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1867 0.8964 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974925 3 0.0336 0.9587 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974926 1 0.2216 0.8785 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0592 0.9540 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0336 0.7301 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0469 0.9573 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0336 0.7301 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974900 2 0.1389 0.7080 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974899 2 0.0336 0.7301 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974897 2 0.0188 0.7314 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.4972 0.0807 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 2 0.1302 0.7156 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.4008 0.6770 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.0707 0.7253 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974886 2 0.0188 0.7316 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974887 3 0.4994 0.0819 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1974885 3 0.1302 0.9258 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.0469 0.7288 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0188 0.7314 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.0469 0.7288 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.4842 0.5869 0.000 0.760 0.192 0.048
#> SRR1974878 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.9651 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.4746 0.5298 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1974873 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974871 4 0.3764 0.6570 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974872 2 0.3257 0.6160 0.152 0.844 0.004 0.000
#> SRR1974869 2 0.4977 -0.1787 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1974868 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 2 0.1637 0.6892 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974866 4 0.4999 0.3043 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.4992 0.3448 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.4933 0.3849 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974863 2 0.4898 -0.0394 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1974860 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.4977 -0.1787 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1974856 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 4 0.4996 0.3251 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1974855 1 0.6483 0.4200 0.592 0.000 0.096 0.312
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3024 0.8083 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974852 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4250 0.5346 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1974846 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.4817 0.4981 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.4843 0.4921 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974834 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974833 1 0.3172 0.7919 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1974831 2 0.4888 0.4735 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4761 0.1120 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1974827 2 0.4817 0.4981 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 4 0.4907 0.3167 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.2973 0.6154 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.4941 -0.1055 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.5268 0.4822 0.012 0.592 0.000 0.396
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.4040 0.6026 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974796 2 0.7626 0.2491 0.204 0.412 0.000 0.384
#> SRR1974795 2 0.6168 0.4425 0.056 0.556 0.000 0.388
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.4804 0.5006 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1974791 2 0.4804 0.5006 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1974790 2 0.4356 0.5730 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974789 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.5188 0.5973 0.716 0.240 0.000 0.044
#> SRR1974784 2 0.5536 0.4812 0.024 0.592 0.000 0.384
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.4804 0.5006 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1974780 1 0.4431 0.5469 0.696 0.304 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2081 0.8820 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2647 0.6826 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974770 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974768 2 0.3074 0.6649 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974767 4 0.5392 0.3693 0.012 0.460 0.000 0.528
#> SRR1974766 2 0.1940 0.7044 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974765 2 0.4697 0.5261 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1974764 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.4817 0.4981 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.4661 0.5312 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 4 0.0188 0.7476 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974751 4 0.0188 0.7461 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974750 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.4244 0.5976 0.036 0.804 0.000 0.160
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3688 0.6620 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974745 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3907 0.6468 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1974739 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.4250 0.6137 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1974737 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.4431 0.5902 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1974733 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.3975 0.5962 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974726 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5000 -0.2830 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1974723 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.1940 0.7132 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1974721 4 0.4713 0.5373 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1974720 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.4817 0.5060 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974717 4 0.0188 0.7478 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974715 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.4817 0.5060 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974711 2 0.4981 -0.1899 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4985 -0.2025 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1974710 2 0.4985 -0.2025 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1974707 4 0.5921 0.2242 0.448 0.036 0.000 0.516
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.7449 0.2662 0.332 0.480 0.188 0.000
#> SRR1974701 4 0.0469 0.7413 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974699 4 0.3837 0.6521 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1974698 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.4643 0.4312 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1974696 4 0.3837 0.6521 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 4 0.4830 0.5012 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1974693 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.4830 0.4962 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.2814 0.6684 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0188 0.7314 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4730 0.1326 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1974671 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 4 0.4989 0.3545 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1974670 2 0.4977 -0.1787 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1974669 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.4996 -0.2495 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1974665 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.3428 0.7895 0.844 0.144 0.000 0.012
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.4817 0.5060 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 4 0.7084 0.4891 0.264 0.176 0.000 0.560
#> SRR1974650 4 0.4804 0.5101 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974651 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 4 0.6261 0.5391 0.080 0.312 0.000 0.608
#> SRR1974646 2 0.3801 0.4738 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0817 0.7260 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.4843 0.4966 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974640 4 0.4830 0.5012 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1974641 4 0.4855 0.4914 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.4817 0.5060 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.1211 0.7378 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.5990 0.5326 0.056 0.336 0.000 0.608
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 4 0.4933 0.4371 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974622 1 0.4072 0.6297 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974620 4 0.4843 0.4966 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974619 4 0.4761 0.5243 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.1389 0.9243 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.4916 -0.0752 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1974613 4 0.4804 0.5110 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.4981 -0.1922 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1974610 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.4746 0.4272 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 1 0.4713 0.3879 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974604 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.5522 0.3153 0.044 0.668 0.000 0.288
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.4193 0.5891 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1974601 4 0.4898 0.4653 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1974599 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.4994 -0.2401 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974595 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974592 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0817 0.7208 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974589 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 4 0.4643 0.5496 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1974586 4 0.4972 0.3907 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1974585 4 0.0188 0.7456 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.1389 0.7035 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974582 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 4 0.2281 0.6638 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1974578 4 0.0000 0.7485 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 4 0.0336 0.7433 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974576 2 0.4761 0.1070 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1974575 2 0.0000 0.7323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974573 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974571 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974572 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974570 1 0.7743 -0.1365 0.400 0.368 0.000 0.232
#> SRR1974568 1 0.1302 0.9279 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974569 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974565 4 0.0469 0.7408 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974564 2 0.4543 0.5502 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1974560 4 0.4998 0.1195 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.4907 0.4613 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1974562 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974561 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974557 2 0.4998 -0.2609 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1974553 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974554 4 0.4040 0.5897 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 4 0.4843 0.4966 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974549 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1974548 4 0.1474 0.7289 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974547 4 0.4605 0.6781 0.108 0.092 0.000 0.800
#> SRR1974546 4 0.5645 0.5183 0.032 0.364 0.000 0.604
#> SRR1974545 2 0.3907 0.6164 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9711 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.4855 0.4890 0.000 0.600 0.000 0.400
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.4294 -0.05525 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR1975006 2 0.1410 0.71833 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0162 0.93684 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.4287 0.25348 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1975001 2 0.0609 0.73850 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.1197 0.72578 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1974999 2 0.3752 0.45969 0.000 0.708 0.292 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.1197 0.89536 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.1885 0.89992 0.000 0.032 0.936 0.012 0.020
#> SRR1974991 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3895 0.55990 0.000 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.1341 0.72073 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.4171 0.34309 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1608 0.88608 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.4294 0.22893 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0404 0.93218 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.4210 0.36223 0.000 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0703 0.73699 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.1410 0.71812 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.3480 0.68040 0.000 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.1043 0.90359 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.4262 0.30650 0.000 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.1121 0.72783 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.3636 0.48079 0.000 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0290 0.93454 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.1121 0.89951 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.2344 0.69669 0.000 0.904 0.064 0.000 0.032
#> SRR1974952 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.1270 0.90346 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.3876 0.56807 0.000 0.316 0.684 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.1197 0.72558 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.3932 0.51559 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.3143 0.70678 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.1671 0.88168 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.1121 0.90960 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.1197 0.89605 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.1121 0.72778 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.1043 0.91266 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.3109 0.70745 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.2690 0.66179 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.2813 0.75221 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.1197 0.89536 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.2020 0.86166 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0510 0.92578 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.1041 0.72877 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1974916 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3452 0.68570 0.000 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0794 0.73538 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0290 0.93445 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.2891 0.77994 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0404 0.74120 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.1671 0.70662 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1974899 2 0.0880 0.73362 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974897 2 0.0290 0.74239 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0162 0.74340 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.3932 0.36334 0.000 0.672 0.328 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 2 0.1341 0.72242 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 2 0.4306 -0.11913 0.000 0.508 0.492 0.000 0.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.1341 0.72091 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 1 0.3816 0.55529 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.2690 0.77226 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0963 0.91601 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.1043 0.72985 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.0162 0.74409 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974882 2 0.0290 0.74239 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.0880 0.73362 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.3229 0.67207 0.000 0.840 0.128 0.000 0.032
#> SRR1974878 3 0.0404 0.93225 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.93901 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.3304 0.72702 0.000 0.168 0.000 0.816 0.016
#> SRR1974873 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.1478 0.84919 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974872 5 0.3391 0.78128 0.012 0.188 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974869 5 0.4795 0.73310 0.000 0.224 0.000 0.072 0.704
#> SRR1974868 2 0.0162 0.74409 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974870 5 0.4329 0.61690 0.000 0.312 0.000 0.016 0.672
#> SRR1974866 5 0.3888 0.83340 0.000 0.120 0.000 0.076 0.804
#> SRR1974867 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.4829 0.02046 0.000 0.500 0.000 0.480 0.020
#> SRR1974864 5 0.4256 0.34183 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1974862 4 0.4165 0.45955 0.000 0.320 0.000 0.672 0.008
#> SRR1974863 2 0.3284 0.65444 0.000 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR1974860 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.4029 0.55680 0.000 0.744 0.000 0.232 0.024
#> SRR1974856 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.4734 0.31795 0.000 0.604 0.000 0.372 0.024
#> SRR1974855 1 0.7010 0.29213 0.548 0.000 0.084 0.260 0.108
#> SRR1974854 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.2230 0.88450 0.912 0.000 0.000 0.044 0.044
#> SRR1974852 2 0.6477 0.34844 0.000 0.464 0.000 0.340 0.196
#> SRR1974849 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4040 0.54417 0.260 0.000 0.000 0.724 0.016
#> SRR1974846 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0290 0.97268 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974845 2 0.6469 0.35526 0.000 0.468 0.000 0.336 0.196
#> SRR1974844 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.3336 0.73390 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1974842 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.6477 0.34844 0.000 0.464 0.000 0.340 0.196
#> SRR1974838 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974834 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974833 1 0.3130 0.81787 0.856 0.000 0.000 0.048 0.096
#> SRR1974831 2 0.6523 0.27872 0.000 0.432 0.000 0.372 0.196
#> SRR1974832 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4372 0.61474 0.000 0.756 0.000 0.172 0.072
#> SRR1974827 2 0.6485 0.34156 0.000 0.460 0.000 0.344 0.196
#> SRR1974824 1 0.0290 0.97265 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974825 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 5 0.3812 0.81543 0.092 0.000 0.000 0.096 0.812
#> SRR1974820 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1792 0.84064 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974812 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.3780 0.83586 0.000 0.116 0.000 0.072 0.812
#> SRR1974811 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.6492 0.33351 0.000 0.456 0.000 0.348 0.196
#> SRR1974804 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2648 0.79197 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974799 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.5950 0.49946 0.000 0.592 0.000 0.220 0.188
#> SRR1974796 4 0.8457 -0.00567 0.212 0.264 0.000 0.336 0.188
#> SRR1974795 2 0.7029 0.31593 0.024 0.444 0.000 0.344 0.188
#> SRR1974793 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.6396 0.37729 0.000 0.488 0.000 0.324 0.188
#> SRR1974791 2 0.6439 0.36312 0.000 0.476 0.000 0.332 0.192
#> SRR1974790 2 0.6219 0.45159 0.000 0.544 0.000 0.260 0.196
#> SRR1974789 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0510 0.96466 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974787 5 0.4166 0.80222 0.144 0.052 0.000 0.012 0.792
#> SRR1974784 2 0.6756 0.35949 0.012 0.472 0.000 0.328 0.188
#> SRR1974783 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0880 0.94784 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974782 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.6396 0.37725 0.000 0.488 0.000 0.324 0.188
#> SRR1974780 5 0.4373 0.77063 0.160 0.080 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974779 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.3734 0.78478 0.168 0.036 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974778 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2423 0.71650 0.000 0.896 0.000 0.024 0.080
#> SRR1974770 2 0.0162 0.74409 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974769 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974768 2 0.1522 0.73430 0.000 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1974767 5 0.3906 0.84030 0.004 0.104 0.000 0.080 0.812
#> SRR1974766 2 0.1671 0.72675 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974765 2 0.6444 0.37883 0.000 0.484 0.000 0.316 0.200
#> SRR1974764 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.6433 0.35473 0.000 0.472 0.000 0.340 0.188
#> SRR1974759 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.5541 0.55912 0.000 0.648 0.000 0.164 0.188
#> SRR1974756 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.6307 0.19936 0.024 0.548 0.000 0.100 0.328
#> SRR1974747 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.1341 0.85669 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.1270 0.86010 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.2408 0.81159 0.000 0.092 0.000 0.892 0.016
#> SRR1974737 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.4656 0.26544 0.000 0.012 0.000 0.480 0.508
#> SRR1974733 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.4985 0.41003 0.076 0.000 0.000 0.680 0.244
#> SRR1974726 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.3780 0.83586 0.000 0.116 0.000 0.072 0.812
#> SRR1974723 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1478 0.83165 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974721 4 0.2358 0.80563 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008
#> SRR1974720 4 0.2020 0.79655 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974719 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.3950 0.82999 0.000 0.068 0.000 0.136 0.796
#> SRR1974717 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.3780 0.83910 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974711 5 0.3780 0.83586 0.000 0.116 0.000 0.072 0.812
#> SRR1974712 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.3828 0.83390 0.000 0.120 0.000 0.072 0.808
#> SRR1974710 5 0.3780 0.83586 0.000 0.116 0.000 0.072 0.812
#> SRR1974707 5 0.4079 0.81403 0.108 0.008 0.000 0.080 0.804
#> SRR1974706 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 2 0.6852 0.24446 0.300 0.468 0.220 0.000 0.012
#> SRR1974701 4 0.0162 0.89529 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974699 4 0.1544 0.84543 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.3911 0.79245 0.144 0.000 0.000 0.060 0.796
#> SRR1974696 5 0.4304 0.26752 0.000 0.000 0.000 0.484 0.516
#> SRR1974694 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.3780 0.83910 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974693 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.6430 0.37013 0.000 0.480 0.000 0.328 0.192
#> SRR1974691 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.2852 0.67864 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0771 0.73749 0.000 0.976 0.020 0.000 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.5104 0.30148 0.000 0.632 0.000 0.060 0.308
#> SRR1974671 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.4827 0.03349 0.000 0.504 0.000 0.476 0.020
#> SRR1974670 2 0.4193 0.52457 0.000 0.720 0.000 0.256 0.024
#> SRR1974669 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.4243 0.50950 0.000 0.712 0.000 0.264 0.024
#> SRR1974665 2 0.0162 0.74420 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974663 5 0.3928 0.79705 0.152 0.040 0.000 0.008 0.800
#> SRR1974662 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.3780 0.83910 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974660 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.3210 0.74797 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1974654 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.3242 0.74470 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1974656 5 0.4310 0.83700 0.064 0.044 0.000 0.084 0.808
#> SRR1974650 5 0.3780 0.83935 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974651 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.3305 0.73764 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1974653 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.4065 0.83917 0.016 0.056 0.000 0.120 0.808
#> SRR1974646 5 0.3794 0.81619 0.000 0.152 0.000 0.048 0.800
#> SRR1974649 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0404 0.74333 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974643 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.3806 0.84037 0.000 0.084 0.000 0.104 0.812
#> SRR1974640 5 0.3780 0.83910 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974641 4 0.4339 0.41994 0.000 0.336 0.000 0.652 0.012
#> SRR1974639 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.3767 0.83766 0.000 0.068 0.000 0.120 0.812
#> SRR1974634 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0404 0.89027 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974633 5 0.3177 0.75143 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1974632 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.4017 0.84014 0.016 0.056 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974630 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 5 0.3812 0.83954 0.000 0.096 0.000 0.092 0.812
#> SRR1974622 5 0.3752 0.79325 0.148 0.000 0.000 0.048 0.804
#> SRR1974620 5 0.3780 0.83910 0.000 0.072 0.000 0.116 0.812
#> SRR1974619 5 0.3003 0.78373 0.000 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974621 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.1942 0.89656 0.920 0.000 0.000 0.012 0.068
#> SRR1974615 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.3692 0.82619 0.000 0.136 0.000 0.052 0.812
#> SRR1974613 5 0.3734 0.83372 0.000 0.060 0.000 0.128 0.812
#> SRR1974612 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.3780 0.83586 0.000 0.116 0.000 0.072 0.812
#> SRR1974610 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.4594 0.67512 0.036 0.000 0.000 0.284 0.680
#> SRR1974607 1 0.0162 0.97654 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974606 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 5 0.4762 0.70590 0.236 0.000 0.000 0.064 0.700
#> SRR1974604 4 0.0000 0.89767 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.3998 0.83527 0.016 0.120 0.000 0.052 0.812
#> SRR1974602 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.5684 0.27158 0.000 0.340 0.000 0.564 0.096
#> SRR1974601 5 0.3812 0.84004 0.000 0.092 0.000 0.096 0.812
#> SRR1974599 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0404 0.74333 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974594 4 0.2329 0.82797 0.000 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974593 2 0.4243 0.52920 0.000 0.712 0.000 0.264 0.024
#> SRR1974595 2 0.6491 0.35155 0.000 0.464 0.000 0.336 0.200
#> SRR1974592 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 4 0.2377 0.82627 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974590 2 0.2873 0.68509 0.000 0.856 0.000 0.128 0.016
#> SRR1974589 4 0.2424 0.82329 0.000 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974587 4 0.4794 0.36559 0.000 0.344 0.000 0.624 0.032
#> SRR1974586 2 0.4882 0.16250 0.000 0.532 0.000 0.444 0.024
#> SRR1974585 4 0.3355 0.76284 0.000 0.012 0.000 0.804 0.184
#> SRR1974584 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.2685 0.69851 0.000 0.880 0.000 0.092 0.028
#> SRR1974582 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 4 0.5345 0.51649 0.000 0.196 0.000 0.668 0.136
#> SRR1974578 4 0.2377 0.82637 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974577 2 0.0703 0.73634 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974579 4 0.3106 0.80322 0.000 0.024 0.000 0.844 0.132
#> SRR1974576 2 0.3368 0.65880 0.000 0.820 0.000 0.156 0.024
#> SRR1974575 2 0.0000 0.74422 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974573 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974571 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974572 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974570 5 0.4236 0.82756 0.088 0.056 0.000 0.044 0.812
#> SRR1974568 5 0.4446 0.19465 0.476 0.000 0.000 0.004 0.520
#> SRR1974567 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974569 2 0.6491 0.35155 0.000 0.464 0.000 0.336 0.200
#> SRR1974565 4 0.2852 0.78347 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974564 2 0.6287 0.43422 0.000 0.528 0.000 0.276 0.196
#> SRR1974560 5 0.3988 0.75291 0.196 0.000 0.000 0.036 0.768
#> SRR1974559 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.6524 0.31059 0.000 0.444 0.000 0.356 0.200
#> SRR1974562 2 0.6491 0.35155 0.000 0.464 0.000 0.336 0.200
#> SRR1974561 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974557 2 0.4696 0.37832 0.000 0.616 0.000 0.360 0.024
#> SRR1974553 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974555 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.6491 0.35155 0.000 0.464 0.000 0.336 0.200
#> SRR1974554 5 0.2951 0.81107 0.028 0.000 0.000 0.112 0.860
#> SRR1974558 1 0.0162 0.97648 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974556 1 0.0000 0.98023 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.3791 0.83974 0.000 0.076 0.000 0.112 0.812
#> SRR1974549 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
#> SRR1974548 4 0.4317 0.70664 0.000 0.112 0.000 0.772 0.116
#> SRR1974547 5 0.2352 0.79921 0.008 0.004 0.000 0.092 0.896
#> SRR1974546 5 0.3454 0.83647 0.000 0.064 0.000 0.100 0.836
#> SRR1974545 2 0.6279 0.43957 0.000 0.532 0.000 0.268 0.200
#> SRR1974544 1 0.3857 0.48580 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1974543 2 0.6498 0.34458 0.000 0.460 0.000 0.340 0.200
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0146 0.876 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.1204 0.930 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.1501 0.829 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 2 0.0363 0.873 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.1610 0.911 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0790 0.944 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0547 0.949 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.2308 0.886 0.000 0.068 0.892 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974991 3 0.0632 0.948 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.2823 0.696 0.000 0.796 0.204 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0632 0.948 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.3330 0.589 0.284 0.000 0.716 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.2912 0.767 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.1863 0.804 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.1663 0.908 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 2 0.2135 0.781 0.000 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0713 0.946 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.3706 0.329 0.000 0.620 0.380 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.2135 0.780 0.000 0.872 0.128 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0632 0.948 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0865 0.941 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0146 0.876 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.1714 0.905 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0458 0.951 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.3023 0.742 0.000 0.232 0.768 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 2 0.3151 0.616 0.000 0.748 0.252 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.1444 0.919 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0291 0.879 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2597 0.752 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.2454 0.776 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.2562 0.826 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.2219 0.866 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0260 0.952 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.2793 0.788 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.1007 0.919 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0790 0.862 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0632 0.939 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3175 0.655 0.744 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0363 0.877 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.3810 0.188 0.000 0.572 0.428 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.1814 0.898 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.3860 0.188 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.1610 0.910 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.0291 0.879 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.1141 0.932 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0547 0.950 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 2 0.0632 0.867 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 2 0.0146 0.878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.1429 0.878 0.000 0.940 0.000 0.004 0.004 0.052
#> SRR1974887 1 0.3810 0.243 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974885 3 0.1501 0.884 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.2260 0.860 0.000 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.0458 0.879 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974882 2 0.0146 0.878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974880 2 0.0922 0.879 0.000 0.968 0.000 0.004 0.004 0.024
#> SRR1974879 2 0.0000 0.878 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 2 0.0146 0.878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974876 2 0.0632 0.879 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974878 3 0.1444 0.919 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.0000 0.957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.2555 0.855 0.000 0.064 0.000 0.888 0.032 0.016
#> SRR1974873 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974871 4 0.0520 0.951 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974872 5 0.0146 0.937 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974869 5 0.2809 0.750 0.000 0.168 0.000 0.004 0.824 0.004
#> SRR1974868 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974870 5 0.3240 0.627 0.000 0.244 0.000 0.004 0.752 0.000
#> SRR1974866 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.5238 0.128 0.000 0.468 0.000 0.464 0.044 0.024
#> SRR1974864 5 0.3769 0.470 0.356 0.000 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1974862 4 0.3196 0.747 0.000 0.156 0.000 0.816 0.020 0.008
#> SRR1974863 2 0.4463 0.715 0.000 0.732 0.000 0.188 0.044 0.036
#> SRR1974860 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974861 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974859 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974858 2 0.4681 0.669 0.000 0.700 0.000 0.220 0.048 0.032
#> SRR1974856 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974857 2 0.5161 0.430 0.000 0.572 0.000 0.356 0.044 0.028
#> SRR1974855 1 0.5046 0.125 0.520 0.000 0.028 0.028 0.000 0.424
#> SRR1974854 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.2593 0.807 0.844 0.000 0.000 0.008 0.000 0.148
#> SRR1974852 6 0.0146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974849 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5089 0.397 0.300 0.000 0.000 0.592 0.000 0.108
#> SRR1974846 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974847 1 0.0603 0.963 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974845 6 0.0260 0.921 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974844 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.1531 0.883 0.068 0.000 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974842 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974839 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974838 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.0260 0.921 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974834 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974833 1 0.3398 0.648 0.740 0.000 0.000 0.008 0.000 0.252
#> SRR1974831 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974832 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.6650 0.489 0.000 0.540 0.000 0.148 0.132 0.180
#> SRR1974827 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974824 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 5 0.0260 0.934 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1204 0.911 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974812 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974804 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2320 0.829 0.864 0.000 0.000 0.000 0.132 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974797 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974796 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974795 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974793 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974792 6 0.0146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974791 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974790 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974789 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974788 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974786 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 5 0.0603 0.930 0.016 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1974784 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974783 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0865 0.946 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974780 5 0.2272 0.874 0.040 0.056 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.0858 0.921 0.028 0.000 0.000 0.000 0.968 0.004
#> SRR1974778 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974773 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.3383 0.680 0.000 0.728 0.000 0.004 0.000 0.268
#> SRR1974770 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974769 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974768 2 0.1908 0.862 0.000 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR1974767 5 0.0146 0.937 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974766 2 0.2146 0.848 0.000 0.880 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1974765 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974764 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974763 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974760 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974759 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974757 6 0.0405 0.915 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR1974756 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974755 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974753 4 0.0146 0.959 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974751 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974750 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974752 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.6944 0.381 0.020 0.492 0.000 0.204 0.232 0.052
#> SRR1974747 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0520 0.951 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974745 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974743 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974742 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.0520 0.951 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974739 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974741 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974738 4 0.0951 0.940 0.000 0.004 0.000 0.968 0.020 0.008
#> SRR1974737 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974736 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974735 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.3838 0.130 0.000 0.000 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1974733 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974732 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974731 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974729 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974725 4 0.0551 0.954 0.004 0.000 0.000 0.984 0.008 0.004
#> SRR1974726 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974724 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.0291 0.960 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974721 4 0.1307 0.925 0.000 0.008 0.000 0.952 0.032 0.008
#> SRR1974720 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974719 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.0547 0.925 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974717 4 0.0000 0.961 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974711 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0146 0.936 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974710 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974707 5 0.0146 0.936 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0146 0.959 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974702 2 0.5311 0.465 0.280 0.612 0.092 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974701 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974699 4 0.0622 0.948 0.000 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974698 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.0547 0.928 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974696 4 0.3828 0.232 0.000 0.000 0.000 0.560 0.440 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974692 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974690 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974691 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974688 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974687 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0291 0.960 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974681 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974677 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974675 2 0.0146 0.878 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3807 0.470 0.000 0.628 0.000 0.004 0.368 0.000
#> SRR1974671 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974672 2 0.5138 0.283 0.000 0.520 0.000 0.416 0.044 0.020
#> SRR1974670 2 0.4785 0.616 0.000 0.668 0.000 0.260 0.044 0.028
#> SRR1974669 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974667 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974668 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974666 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974664 2 0.4785 0.614 0.000 0.668 0.000 0.260 0.044 0.028
#> SRR1974665 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974663 5 0.0508 0.932 0.012 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1974662 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.1219 0.903 0.048 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004
#> SRR1974654 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.1285 0.900 0.052 0.000 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1974656 5 0.0146 0.936 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974650 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974651 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974652 5 0.1411 0.892 0.060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974653 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974648 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974646 5 0.0632 0.920 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974645 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1471 0.876 0.000 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1974643 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974640 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.3385 0.740 0.000 0.156 0.000 0.808 0.020 0.016
#> SRR1974639 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0260 0.955 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974633 5 0.0935 0.917 0.032 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1974632 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0146 0.977 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1542 0.878 0.000 0.936 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1974623 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974622 5 0.0363 0.933 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974620 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974619 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.2668 0.787 0.828 0.000 0.000 0.004 0.000 0.168
#> SRR1974615 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0146 0.937 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974613 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974610 4 0.0146 0.959 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974609 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.2815 0.821 0.032 0.000 0.000 0.120 0.848 0.000
#> SRR1974607 1 0.0146 0.977 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974606 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974605 5 0.2946 0.764 0.160 0.000 0.000 0.012 0.824 0.004
#> SRR1974604 4 0.0146 0.964 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974603 5 0.0146 0.937 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974602 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 6 0.5464 0.586 0.000 0.088 0.000 0.244 0.040 0.628
#> SRR1974601 5 0.0146 0.936 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974599 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974598 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974596 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974594 6 0.3584 0.624 0.000 0.000 0.000 0.308 0.004 0.688
#> SRR1974593 2 0.5821 0.587 0.000 0.620 0.000 0.168 0.052 0.160
#> SRR1974595 6 0.0146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974592 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974591 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974588 6 0.3725 0.607 0.000 0.000 0.000 0.316 0.008 0.676
#> SRR1974590 2 0.4887 0.656 0.000 0.680 0.000 0.080 0.020 0.220
#> SRR1974589 6 0.3575 0.658 0.000 0.000 0.000 0.284 0.008 0.708
#> SRR1974587 6 0.6789 0.290 0.000 0.244 0.000 0.276 0.052 0.428
#> SRR1974586 2 0.6266 0.464 0.000 0.544 0.000 0.228 0.048 0.180
#> SRR1974585 6 0.2527 0.798 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1974584 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.4684 0.712 0.000 0.720 0.000 0.052 0.044 0.184
#> SRR1974582 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974581 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974580 6 0.3672 0.662 0.000 0.004 0.000 0.276 0.008 0.712
#> SRR1974578 6 0.3619 0.610 0.000 0.000 0.000 0.316 0.004 0.680
#> SRR1974577 2 0.2209 0.868 0.000 0.900 0.000 0.004 0.024 0.072
#> SRR1974579 6 0.3575 0.652 0.000 0.000 0.000 0.284 0.008 0.708
#> SRR1974576 2 0.5552 0.609 0.000 0.636 0.000 0.100 0.048 0.216
#> SRR1974575 2 0.1728 0.877 0.000 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1974574 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974573 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974571 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974572 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974570 5 0.0603 0.930 0.016 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1974568 5 0.3789 0.313 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974569 6 0.0260 0.921 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974565 6 0.3240 0.713 0.004 0.000 0.000 0.244 0.000 0.752
#> SRR1974564 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974560 5 0.1714 0.857 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974562 6 0.0146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974561 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974557 2 0.5765 0.455 0.000 0.560 0.000 0.316 0.056 0.068
#> SRR1974553 6 0.0146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974555 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974554 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974549 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974548 6 0.4172 0.636 0.000 0.000 0.000 0.280 0.040 0.680
#> SRR1974547 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974546 5 0.0000 0.938 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974545 6 0.0260 0.917 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974544 1 0.3409 0.552 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1974543 6 0.0363 0.922 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.832 0.913 0.962 0.4882 0.508 0.508
#> 3 3 0.597 0.775 0.874 0.3062 0.810 0.639
#> 4 4 0.726 0.782 0.887 0.1100 0.883 0.692
#> 5 5 0.741 0.762 0.878 0.0601 0.950 0.833
#> 6 6 0.765 0.734 0.861 0.0446 0.952 0.820
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.1184 0.95655 0.016 0.984
#> SRR1975003 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.8861 0.55554 0.304 0.696
#> SRR1974998 1 0.7139 0.78117 0.804 0.196
#> SRR1974997 1 0.6438 0.82098 0.836 0.164
#> SRR1974995 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.9460 0.40261 0.364 0.636
#> SRR1974994 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.3114 0.91996 0.056 0.944
#> SRR1974992 2 0.2603 0.93294 0.044 0.956
#> SRR1974990 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.9998 -0.02881 0.492 0.508
#> SRR1974991 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974986 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974985 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0672 0.94497 0.992 0.008
#> SRR1974979 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974977 1 0.2236 0.92856 0.964 0.036
#> SRR1974976 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.1414 0.95356 0.020 0.980
#> SRR1974971 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.7674 0.70052 0.224 0.776
#> SRR1974969 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.9170 0.48214 0.332 0.668
#> SRR1974965 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.1633 0.95026 0.024 0.976
#> SRR1974963 1 0.9996 0.10209 0.512 0.488
#> SRR1974961 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974960 1 0.4815 0.87804 0.896 0.104
#> SRR1974959 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.1184 0.95682 0.016 0.984
#> SRR1974955 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.7376 0.72741 0.208 0.792
#> SRR1974953 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.9608 0.36685 0.384 0.616
#> SRR1974949 2 0.0938 0.95996 0.012 0.988
#> SRR1974950 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974945 1 0.8861 0.61431 0.696 0.304
#> SRR1974944 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974940 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974938 1 0.7528 0.75502 0.784 0.216
#> SRR1974937 1 0.9044 0.58117 0.680 0.320
#> SRR1974936 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974935 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974932 1 0.0376 0.94703 0.996 0.004
#> SRR1974931 1 0.0376 0.94703 0.996 0.004
#> SRR1974930 1 0.0376 0.94703 0.996 0.004
#> SRR1974929 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974927 1 0.4161 0.89484 0.916 0.084
#> SRR1974924 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.0938 0.95978 0.012 0.988
#> SRR1974922 1 0.9775 0.36521 0.588 0.412
#> SRR1974921 1 0.0672 0.94491 0.992 0.008
#> SRR1974920 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974918 1 0.9866 0.29599 0.568 0.432
#> SRR1974917 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974915 1 0.5059 0.87157 0.888 0.112
#> SRR1974914 2 0.0376 0.96577 0.004 0.996
#> SRR1974913 1 0.0376 0.94699 0.996 0.004
#> SRR1974911 1 0.3431 0.90957 0.936 0.064
#> SRR1974910 1 0.1633 0.93592 0.976 0.024
#> SRR1974908 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.9795 0.24733 0.416 0.584
#> SRR1974905 1 0.2948 0.91786 0.948 0.052
#> SRR1974904 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974901 1 0.9754 0.37118 0.592 0.408
#> SRR1974898 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.9661 0.32320 0.392 0.608
#> SRR1974890 1 0.6148 0.83430 0.848 0.152
#> SRR1974891 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974887 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974885 1 0.0672 0.94497 0.992 0.008
#> SRR1974883 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.1414 0.95349 0.020 0.980
#> SRR1974875 1 0.4022 0.89726 0.920 0.080
#> SRR1974874 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0672 0.96288 0.008 0.992
#> SRR1974871 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.0672 0.96287 0.008 0.992
#> SRR1974869 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974855 1 0.5629 0.85259 0.868 0.132
#> SRR1974854 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.3584 0.90672 0.932 0.068
#> SRR1974846 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974843 2 0.9996 0.02853 0.488 0.512
#> SRR1974842 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.2423 0.93600 0.040 0.960
#> SRR1974839 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.1414 0.93813 0.980 0.020
#> SRR1974831 2 0.8081 0.66074 0.248 0.752
#> SRR1974832 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.1843 0.94652 0.028 0.972
#> SRR1974824 1 0.0672 0.94499 0.992 0.008
#> SRR1974825 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.5629 0.83268 0.132 0.868
#> SRR1974820 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.2948 0.91777 0.948 0.052
#> SRR1974812 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.5946 0.84043 0.856 0.144
#> SRR1974808 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2603 0.92328 0.956 0.044
#> SRR1974806 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.9983 0.02689 0.476 0.524
#> SRR1974804 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0938 0.94239 0.988 0.012
#> SRR1974799 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974796 1 0.3274 0.91218 0.940 0.060
#> SRR1974795 1 0.9248 0.54235 0.660 0.340
#> SRR1974793 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.6801 0.77978 0.820 0.180
#> SRR1974787 2 0.5737 0.82759 0.136 0.864
#> SRR1974784 1 0.9580 0.44712 0.620 0.380
#> SRR1974783 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.4161 0.89221 0.084 0.916
#> SRR1974782 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.2043 0.94305 0.032 0.968
#> SRR1974779 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.4298 0.88439 0.088 0.912
#> SRR1974778 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0672 0.96294 0.008 0.992
#> SRR1974770 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0376 0.96579 0.004 0.996
#> SRR1974767 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.8144 0.65406 0.252 0.748
#> SRR1974759 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 0.4939 0.87418 0.892 0.108
#> SRR1974750 1 0.7602 0.74956 0.780 0.220
#> SRR1974752 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0938 0.95977 0.012 0.988
#> SRR1974747 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974745 1 0.7056 0.78648 0.808 0.192
#> SRR1974743 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974739 1 0.8909 0.60567 0.692 0.308
#> SRR1974741 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974736 1 0.6247 0.82812 0.844 0.156
#> SRR1974735 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.6148 0.83200 0.848 0.152
#> SRR1974731 2 0.1414 0.95329 0.020 0.980
#> SRR1974729 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.7745 0.73793 0.772 0.228
#> SRR1974726 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.9522 0.37643 0.372 0.628
#> SRR1974722 1 0.5946 0.84174 0.856 0.144
#> SRR1974721 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974720 1 0.9491 0.47907 0.632 0.368
#> SRR1974719 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.6048 0.81086 0.148 0.852
#> SRR1974713 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974707 1 0.9129 0.56496 0.672 0.328
#> SRR1974706 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.1184 0.95664 0.016 0.984
#> SRR1974701 1 0.4939 0.87422 0.892 0.108
#> SRR1974699 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.6623 0.80974 0.828 0.172
#> SRR1974696 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0672 0.96285 0.008 0.992
#> SRR1974692 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.1414 0.95348 0.020 0.980
#> SRR1974688 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.5737 0.84812 0.864 0.136
#> SRR1974680 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.3879 0.90036 0.924 0.076
#> SRR1974677 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.6048 0.81151 0.148 0.852
#> SRR1974662 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.6247 0.82808 0.844 0.156
#> SRR1974654 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.6973 0.79177 0.812 0.188
#> SRR1974656 1 0.9286 0.53279 0.656 0.344
#> SRR1974650 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974652 2 0.6973 0.75825 0.188 0.812
#> SRR1974653 2 0.3114 0.91908 0.056 0.944
#> SRR1974648 2 0.9710 0.29439 0.400 0.600
#> SRR1974646 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.6973 0.79153 0.812 0.188
#> SRR1974632 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.3733 0.90211 0.072 0.928
#> SRR1974630 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0376 0.94703 0.996 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.7219 0.77665 0.800 0.200
#> SRR1974620 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0938 0.94278 0.988 0.012
#> SRR1974615 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974613 2 0.0672 0.96285 0.008 0.992
#> SRR1974612 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.6887 0.79674 0.816 0.184
#> SRR1974607 1 0.5059 0.87098 0.888 0.112
#> SRR1974606 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.6531 0.81592 0.832 0.168
#> SRR1974604 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.0672 0.96287 0.008 0.992
#> SRR1974568 1 0.8081 0.70906 0.752 0.248
#> SRR1974567 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.9993 -0.00673 0.484 0.516
#> SRR1974564 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974560 2 0.3733 0.90413 0.072 0.928
#> SRR1974559 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0938 0.95982 0.012 0.988
#> SRR1974562 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974558 1 0.5294 0.86371 0.880 0.120
#> SRR1974556 1 0.0000 0.94893 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974546 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
#> SRR1974544 2 0.7815 0.69334 0.232 0.768
#> SRR1974543 2 0.0000 0.96871 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 1 0.3192 0.8704 0.888 0.000 0.112
#> SRR1975008 2 0.0592 0.8836 0.000 0.988 0.012
#> SRR1975006 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 2 0.3267 0.7991 0.000 0.884 0.116
#> SRR1975004 2 0.6033 0.4492 0.004 0.660 0.336
#> SRR1975003 2 0.1411 0.8710 0.000 0.964 0.036
#> SRR1975001 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0424 0.8856 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974999 2 0.1031 0.8786 0.000 0.976 0.024
#> SRR1975000 3 0.7085 0.6959 0.096 0.188 0.716
#> SRR1974998 3 0.8236 0.0290 0.416 0.076 0.508
#> SRR1974997 1 0.7721 0.6492 0.680 0.152 0.168
#> SRR1974995 2 0.3879 0.7697 0.000 0.848 0.152
#> SRR1974996 3 0.5253 0.7463 0.020 0.188 0.792
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.5355 0.6964 0.036 0.804 0.160
#> SRR1974992 2 0.6905 0.1709 0.016 0.544 0.440
#> SRR1974990 1 0.2878 0.8710 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974989 2 0.9293 -0.0377 0.400 0.440 0.160
#> SRR1974991 2 0.6305 -0.0137 0.000 0.516 0.484
#> SRR1974986 1 0.3482 0.8629 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974987 2 0.4842 0.6487 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974988 1 0.3715 0.8620 0.868 0.004 0.128
#> SRR1974984 2 0.4750 0.6888 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974985 1 0.3619 0.8604 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974983 2 0.0592 0.8838 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974982 1 0.3412 0.8647 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974981 1 0.0592 0.9119 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974980 1 0.4645 0.8318 0.816 0.008 0.176
#> SRR1974979 2 0.0892 0.8781 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974978 1 0.3412 0.8647 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974977 1 0.4811 0.8386 0.828 0.024 0.148
#> SRR1974976 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 2 0.1529 0.8687 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974974 2 0.0237 0.8872 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974973 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.6302 0.1122 0.000 0.480 0.520
#> SRR1974971 2 0.0237 0.8872 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974970 3 0.9037 0.3638 0.136 0.392 0.472
#> SRR1974969 3 0.6204 0.4843 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974968 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.7365 0.6918 0.112 0.188 0.700
#> SRR1974965 1 0.2796 0.8724 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974966 3 0.6274 0.4583 0.000 0.456 0.544
#> SRR1974964 2 0.3851 0.7586 0.004 0.860 0.136
#> SRR1974963 3 0.5067 0.7455 0.052 0.116 0.832
#> SRR1974961 2 0.2796 0.8069 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974962 2 0.4178 0.7191 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974960 1 0.7189 0.6337 0.656 0.052 0.292
#> SRR1974959 1 0.3619 0.8604 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974958 2 0.0424 0.8857 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974957 2 0.0892 0.8804 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974956 2 0.6033 0.4926 0.004 0.660 0.336
#> SRR1974955 1 0.2959 0.8726 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974954 3 0.5305 0.7345 0.020 0.192 0.788
#> SRR1974953 2 0.4974 0.6010 0.000 0.764 0.236
#> SRR1974952 3 0.9001 0.4033 0.144 0.344 0.512
#> SRR1974949 2 0.3941 0.7569 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974950 2 0.2796 0.8307 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974951 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 2 0.1753 0.8506 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974948 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.8105 0.6295 0.196 0.156 0.648
#> SRR1974944 1 0.2878 0.8710 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974942 1 0.3340 0.8646 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974943 2 0.4002 0.7638 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974941 1 0.3412 0.8647 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974940 1 0.4121 0.8434 0.832 0.000 0.168
#> SRR1974939 2 0.3686 0.7719 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974938 1 0.9377 0.0654 0.448 0.172 0.380
#> SRR1974937 3 0.3805 0.7541 0.024 0.092 0.884
#> SRR1974936 1 0.3340 0.8667 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974935 1 0.4931 0.7934 0.768 0.000 0.232
#> SRR1974934 2 0.0424 0.8856 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974933 2 0.0237 0.8868 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974932 1 0.5902 0.6790 0.680 0.004 0.316
#> SRR1974931 1 0.5497 0.7246 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974930 1 0.2959 0.8761 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974929 1 0.3551 0.8625 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974928 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 1 0.6124 0.7616 0.744 0.036 0.220
#> SRR1974924 1 0.3412 0.8647 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974925 1 0.3116 0.8658 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974926 1 0.1289 0.9087 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974923 3 0.3340 0.7631 0.000 0.120 0.880
#> SRR1974922 3 0.8878 0.5853 0.208 0.216 0.576
#> SRR1974921 1 0.5529 0.7096 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974920 1 0.3752 0.8565 0.856 0.000 0.144
#> SRR1974919 1 0.3686 0.8588 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974918 1 0.9815 0.0558 0.420 0.256 0.324
#> SRR1974917 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 1 0.4842 0.7975 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974915 1 0.7676 0.4953 0.584 0.056 0.360
#> SRR1974914 2 0.3686 0.7910 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974913 1 0.3267 0.8656 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974911 1 0.6935 0.6314 0.652 0.036 0.312
#> SRR1974910 1 0.5062 0.8182 0.800 0.016 0.184
#> SRR1974908 2 0.3412 0.7927 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974909 1 0.3619 0.8603 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974906 2 0.4062 0.7379 0.000 0.836 0.164
#> SRR1974907 3 0.6447 0.7258 0.060 0.196 0.744
#> SRR1974905 1 0.6090 0.7300 0.716 0.020 0.264
#> SRR1974904 2 0.4887 0.6409 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974903 1 0.3619 0.8603 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974902 2 0.4931 0.6553 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974901 3 0.7165 0.6375 0.172 0.112 0.716
#> SRR1974898 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0747 0.8817 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974893 2 0.1411 0.8682 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974895 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.9768 0.2819 0.296 0.264 0.440
#> SRR1974890 3 0.7453 -0.0928 0.436 0.036 0.528
#> SRR1974891 2 0.5785 0.3460 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974889 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.0424 0.8862 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974887 1 0.3038 0.8726 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974885 1 0.4399 0.8096 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974883 2 0.6095 0.2662 0.000 0.608 0.392
#> SRR1974884 2 0.0237 0.8871 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974881 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.1031 0.8769 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974880 2 0.1753 0.8591 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974879 2 0.0592 0.8836 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974877 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.0747 0.8785 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974878 2 0.5397 0.6005 0.000 0.720 0.280
#> SRR1974875 1 0.5529 0.7308 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974874 3 0.5591 0.7176 0.000 0.304 0.696
#> SRR1974873 2 0.5588 0.5698 0.004 0.720 0.276
#> SRR1974871 2 0.0237 0.8872 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974872 2 0.5621 0.4315 0.000 0.692 0.308
#> SRR1974869 2 0.1031 0.8766 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974868 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.6260 -0.1746 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.5988 0.3854 0.632 0.000 0.368
#> SRR1974862 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974859 3 0.6008 0.5810 0.000 0.372 0.628
#> SRR1974858 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 3 0.6126 0.5257 0.000 0.400 0.600
#> SRR1974857 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 1 0.7351 0.6008 0.664 0.068 0.268
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3340 0.8591 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974852 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 3 0.6314 0.2458 0.392 0.004 0.604
#> SRR1974846 3 0.3941 0.7748 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974847 1 0.0237 0.9132 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974845 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974843 3 0.7978 0.7322 0.176 0.164 0.660
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 3 0.4968 0.7691 0.012 0.188 0.800
#> SRR1974839 2 0.4842 0.6836 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.1031 0.8786 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974833 1 0.3690 0.8663 0.884 0.016 0.100
#> SRR1974831 2 0.8793 0.1816 0.140 0.552 0.308
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974826 2 0.0892 0.8792 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974827 2 0.5363 0.5830 0.000 0.724 0.276
#> SRR1974824 1 0.6451 0.4084 0.608 0.008 0.384
#> SRR1974825 1 0.2165 0.8921 0.936 0.000 0.064
#> SRR1974822 1 0.3192 0.8584 0.888 0.000 0.112
#> SRR1974823 3 0.5305 0.7824 0.020 0.192 0.788
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974815 1 0.0592 0.9134 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.6008 0.5337 0.628 0.000 0.372
#> SRR1974812 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974810 1 0.6138 0.7386 0.768 0.060 0.172
#> SRR1974808 3 0.6291 0.4283 0.000 0.468 0.532
#> SRR1974811 1 0.0747 0.9130 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974809 1 0.0592 0.9134 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974807 1 0.4731 0.8140 0.840 0.032 0.128
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.9068 -0.0592 0.420 0.444 0.136
#> SRR1974804 1 0.0892 0.9120 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974803 1 0.1163 0.9091 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1950 0.8994 0.952 0.008 0.040
#> SRR1974799 1 0.0592 0.9134 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974798 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 1 0.4295 0.8511 0.864 0.032 0.104
#> SRR1974795 1 0.8082 0.3992 0.608 0.296 0.096
#> SRR1974793 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974794 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0592 0.8837 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974791 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.4521 0.7124 0.816 0.180 0.004
#> SRR1974787 3 0.5873 0.6934 0.004 0.312 0.684
#> SRR1974784 1 0.6865 0.3166 0.596 0.384 0.020
#> SRR1974783 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974785 2 0.3791 0.8048 0.060 0.892 0.048
#> SRR1974782 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974781 2 0.0237 0.8872 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 3 0.6204 0.5061 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974779 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.8135 -0.3521 0.068 0.484 0.448
#> SRR1974778 1 0.0424 0.9139 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974774 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974771 2 0.3116 0.8102 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974770 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.6280 -0.1606 0.000 0.540 0.460
#> SRR1974768 2 0.0592 0.8825 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974767 2 0.6204 0.0540 0.000 0.576 0.424
#> SRR1974766 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0237 0.8872 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.8939 0.0958 0.140 0.520 0.340
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 3 0.4931 0.7408 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974755 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974753 2 0.5706 0.5031 0.000 0.680 0.320
#> SRR1974751 1 0.5882 0.5805 0.652 0.000 0.348
#> SRR1974750 3 0.6952 0.2916 0.376 0.024 0.600
#> SRR1974752 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974749 3 0.5098 0.7629 0.000 0.248 0.752
#> SRR1974747 1 0.0592 0.9134 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974748 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0237 0.8871 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974745 3 0.6333 0.3842 0.332 0.012 0.656
#> SRR1974743 2 0.3686 0.7782 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974742 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974740 2 0.4178 0.7250 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974739 3 0.3889 0.7412 0.084 0.032 0.884
#> SRR1974741 2 0.4452 0.7211 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974738 3 0.6204 0.5401 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974737 2 0.3267 0.7977 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974736 3 0.6416 0.4585 0.304 0.020 0.676
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.5058 0.7644 0.000 0.244 0.756
#> SRR1974733 3 0.3412 0.7725 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974732 3 0.3610 0.7245 0.096 0.016 0.888
#> SRR1974731 2 0.6267 0.1218 0.000 0.548 0.452
#> SRR1974729 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 3 0.5291 0.7410 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974725 3 0.4137 0.7400 0.096 0.032 0.872
#> SRR1974726 3 0.3482 0.7733 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.6026 0.1795 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974723 3 0.4087 0.7601 0.052 0.068 0.880
#> SRR1974722 3 0.5406 0.5806 0.224 0.012 0.764
#> SRR1974721 2 0.2796 0.8177 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974720 3 0.4232 0.7479 0.084 0.044 0.872
#> SRR1974719 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974718 1 0.0424 0.9139 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974716 3 0.6267 0.4315 0.000 0.452 0.548
#> SRR1974717 3 0.3482 0.7733 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974715 3 0.4270 0.7747 0.024 0.116 0.860
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.4654 0.7755 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974711 2 0.3686 0.7776 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.6267 0.4792 0.000 0.452 0.548
#> SRR1974710 3 0.6252 0.5042 0.000 0.444 0.556
#> SRR1974707 3 0.5961 0.7726 0.096 0.112 0.792
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974703 3 0.5138 0.7366 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974702 2 0.1289 0.8749 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974701 1 0.5016 0.7497 0.760 0.000 0.240
#> SRR1974699 3 0.4291 0.7805 0.000 0.180 0.820
#> SRR1974698 3 0.3412 0.7725 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.5423 0.7644 0.096 0.084 0.820
#> SRR1974696 3 0.4399 0.7797 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974694 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974695 3 0.5560 0.7267 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974693 3 0.3412 0.7727 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974692 3 0.3412 0.7725 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974690 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974689 3 0.3192 0.7708 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974688 3 0.3619 0.7745 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974687 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974682 1 0.6307 0.2332 0.512 0.000 0.488
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 3 0.3995 0.7123 0.116 0.016 0.868
#> SRR1974680 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974678 1 0.5560 0.6677 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974677 1 0.0237 0.9142 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974676 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.3879 0.7485 0.000 0.848 0.152
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.2448 0.8344 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974671 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 3 0.5269 0.7813 0.016 0.200 0.784
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.4974 0.7674 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974660 1 0.2796 0.8738 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0592 0.9134 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974657 3 0.5710 0.7583 0.116 0.080 0.804
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 3 0.5815 0.7670 0.104 0.096 0.800
#> SRR1974656 3 0.5883 0.7733 0.092 0.112 0.796
#> SRR1974650 3 0.6140 0.5835 0.000 0.404 0.596
#> SRR1974651 2 0.3192 0.8006 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974652 3 0.5156 0.7778 0.008 0.216 0.776
#> SRR1974653 3 0.4346 0.7677 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974648 3 0.5915 0.7780 0.080 0.128 0.792
#> SRR1974646 2 0.0592 0.8833 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.6126 0.1511 0.000 0.600 0.400
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.5138 0.7596 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974640 3 0.4654 0.7755 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974641 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0424 0.9139 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.5254 0.7487 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.4291 0.7413 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974633 3 0.5811 0.7642 0.108 0.092 0.800
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.4883 0.7764 0.004 0.208 0.788
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974627 1 0.5845 0.5943 0.688 0.004 0.308
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974623 3 0.6045 0.6237 0.000 0.380 0.620
#> SRR1974622 3 0.5817 0.7690 0.100 0.100 0.800
#> SRR1974620 3 0.4702 0.7742 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974619 3 0.5016 0.7659 0.000 0.240 0.760
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974616 1 0.3459 0.8735 0.892 0.012 0.096
#> SRR1974615 1 0.0424 0.9139 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.6079 0.6043 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974613 3 0.4555 0.7774 0.000 0.200 0.800
#> SRR1974612 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974611 3 0.5926 0.6528 0.000 0.356 0.644
#> SRR1974610 3 0.5988 0.5971 0.000 0.368 0.632
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 3 0.5505 0.7669 0.096 0.088 0.816
#> SRR1974607 1 0.7820 0.4009 0.604 0.072 0.324
#> SRR1974606 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 3 0.6470 0.7471 0.148 0.092 0.760
#> SRR1974604 3 0.6079 0.5458 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974603 2 0.5529 0.5073 0.000 0.704 0.296
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 3 0.5327 0.7454 0.000 0.272 0.728
#> SRR1974599 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.5216 0.5633 0.000 0.740 0.260
#> SRR1974593 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974588 3 0.5098 0.7644 0.000 0.248 0.752
#> SRR1974590 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.1529 0.8656 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974587 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.6215 -0.0029 0.000 0.572 0.428
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9144 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.2165 0.8453 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974578 2 0.4654 0.6662 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974577 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.1031 0.8780 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974576 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.2711 0.8213 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974571 2 0.0424 0.8856 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974572 2 0.1289 0.8715 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974570 2 0.5098 0.5824 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974568 3 0.5954 0.7620 0.116 0.092 0.792
#> SRR1974567 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974566 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 3 0.6685 0.7628 0.048 0.244 0.708
#> SRR1974564 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 3 0.4834 0.7795 0.004 0.204 0.792
#> SRR1974559 1 0.1031 0.9112 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974563 2 0.5327 0.5590 0.000 0.728 0.272
#> SRR1974562 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0237 0.8871 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974553 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974551 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974552 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 3 0.5254 0.7521 0.000 0.264 0.736
#> SRR1974558 1 0.5889 0.7480 0.796 0.108 0.096
#> SRR1974556 1 0.0747 0.9127 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974550 3 0.5621 0.7110 0.000 0.308 0.692
#> SRR1974549 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0592 0.8837 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974547 3 0.4702 0.7742 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974546 3 0.5835 0.6697 0.000 0.340 0.660
#> SRR1974545 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 2 0.6044 0.6149 0.172 0.772 0.056
#> SRR1974543 2 0.0000 0.8886 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.2647 0.8723 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1975008 2 0.0336 0.8863 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1975006 2 0.0469 0.8863 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1975005 3 0.5028 0.3137 0.000 0.400 0.596 0.004
#> SRR1975004 3 0.3219 0.7352 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1975003 2 0.1174 0.8766 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR1975001 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1975002 2 0.0336 0.8865 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974999 2 0.0592 0.8833 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1975000 3 0.1114 0.8915 0.008 0.004 0.972 0.016
#> SRR1974998 3 0.1059 0.8940 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1974997 3 0.2307 0.9040 0.048 0.016 0.928 0.008
#> SRR1974995 2 0.5309 0.5597 0.000 0.700 0.256 0.044
#> SRR1974996 3 0.3255 0.8408 0.008 0.048 0.888 0.056
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1792 0.8731 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1974992 3 0.1297 0.8878 0.000 0.016 0.964 0.020
#> SRR1974990 3 0.2921 0.8565 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1974989 1 0.9193 -0.0512 0.360 0.312 0.076 0.252
#> SRR1974991 3 0.2996 0.8395 0.000 0.064 0.892 0.044
#> SRR1974986 3 0.2466 0.8889 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR1974987 2 0.3996 0.7651 0.000 0.836 0.060 0.104
#> SRR1974988 3 0.2197 0.8969 0.080 0.004 0.916 0.000
#> SRR1974984 3 0.2861 0.8456 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1974985 3 0.2053 0.8994 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974983 2 0.0895 0.8839 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974982 3 0.2530 0.8777 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1974981 1 0.3356 0.7531 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974980 3 0.2021 0.9029 0.056 0.000 0.932 0.012
#> SRR1974979 2 0.2281 0.8144 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1974978 3 0.1940 0.8972 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974977 3 0.2402 0.9042 0.052 0.012 0.924 0.012
#> SRR1974976 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 2 0.2799 0.8032 0.000 0.884 0.108 0.008
#> SRR1974974 2 0.0469 0.8832 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974973 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.1624 0.8857 0.000 0.020 0.952 0.028
#> SRR1974971 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.1585 0.8829 0.004 0.040 0.952 0.004
#> SRR1974969 2 0.7836 -0.3273 0.000 0.388 0.264 0.348
#> SRR1974968 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.1958 0.8846 0.008 0.028 0.944 0.020
#> SRR1974965 3 0.2868 0.8607 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974966 2 0.6087 -0.1203 0.000 0.540 0.048 0.412
#> SRR1974964 3 0.2216 0.8565 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974963 3 0.0992 0.8915 0.004 0.008 0.976 0.012
#> SRR1974961 3 0.4331 0.5638 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1974962 2 0.3056 0.8056 0.000 0.888 0.040 0.072
#> SRR1974960 3 0.1798 0.9035 0.040 0.000 0.944 0.016
#> SRR1974959 3 0.2048 0.9016 0.064 0.000 0.928 0.008
#> SRR1974958 2 0.0592 0.8862 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974957 2 0.2921 0.7681 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1974956 3 0.1510 0.8896 0.000 0.028 0.956 0.016
#> SRR1974955 3 0.3024 0.8486 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1974954 3 0.1059 0.8879 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1974953 2 0.4174 0.7095 0.000 0.816 0.044 0.140
#> SRR1974952 3 0.1247 0.8925 0.004 0.016 0.968 0.012
#> SRR1974949 3 0.2198 0.8693 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1974950 2 0.5137 0.5150 0.000 0.680 0.296 0.024
#> SRR1974951 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 2 0.4925 0.2473 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974945 3 0.1762 0.8931 0.012 0.020 0.952 0.016
#> SRR1974944 3 0.3266 0.8278 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1974942 3 0.1792 0.9002 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974943 2 0.4898 0.5665 0.000 0.716 0.260 0.024
#> SRR1974941 3 0.2281 0.8889 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1974940 3 0.2048 0.9016 0.064 0.000 0.928 0.008
#> SRR1974939 2 0.3128 0.8085 0.000 0.884 0.040 0.076
#> SRR1974938 3 0.1394 0.8971 0.012 0.016 0.964 0.008
#> SRR1974937 3 0.1909 0.8739 0.004 0.008 0.940 0.048
#> SRR1974936 3 0.2469 0.8812 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1974935 3 0.2089 0.9029 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR1974934 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974933 2 0.1474 0.8562 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974932 3 0.1624 0.9005 0.028 0.000 0.952 0.020
#> SRR1974931 3 0.3834 0.8552 0.076 0.000 0.848 0.076
#> SRR1974930 1 0.5105 0.1961 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1974929 3 0.1867 0.8992 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.2089 0.9029 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR1974924 3 0.2868 0.8575 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1974925 3 0.2345 0.8872 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974926 1 0.2408 0.8470 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974923 4 0.6729 0.5268 0.000 0.116 0.312 0.572
#> SRR1974922 3 0.2402 0.8747 0.012 0.052 0.924 0.012
#> SRR1974921 3 0.1820 0.9029 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR1974920 3 0.2197 0.8970 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974919 3 0.1902 0.9016 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR1974918 3 0.2188 0.8934 0.012 0.032 0.936 0.020
#> SRR1974917 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974916 3 0.2089 0.9029 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR1974915 3 0.1059 0.8940 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1974914 2 0.6075 0.4454 0.000 0.636 0.288 0.076
#> SRR1974913 3 0.2011 0.8964 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974911 3 0.1624 0.9006 0.028 0.000 0.952 0.020
#> SRR1974910 3 0.1722 0.9042 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR1974908 2 0.2411 0.8481 0.000 0.920 0.040 0.040
#> SRR1974909 3 0.2048 0.9016 0.064 0.000 0.928 0.008
#> SRR1974906 2 0.3439 0.7905 0.000 0.868 0.048 0.084
#> SRR1974907 3 0.1590 0.8902 0.008 0.028 0.956 0.008
#> SRR1974905 3 0.1820 0.9023 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR1974904 2 0.5717 0.4374 0.000 0.632 0.324 0.044
#> SRR1974903 3 0.2053 0.8992 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974902 2 0.5477 0.6076 0.000 0.728 0.180 0.092
#> SRR1974901 3 0.1443 0.8881 0.008 0.004 0.960 0.028
#> SRR1974898 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974900 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974899 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974897 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974896 2 0.0376 0.8865 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974893 2 0.0927 0.8775 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1974895 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.6990 0.6539 0.088 0.088 0.680 0.144
#> SRR1974890 3 0.7439 0.4596 0.252 0.016 0.568 0.164
#> SRR1974891 2 0.4900 0.5439 0.000 0.732 0.032 0.236
#> SRR1974889 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974888 2 0.0336 0.8870 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974886 2 0.0336 0.8862 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974887 1 0.4834 0.7577 0.784 0.000 0.120 0.096
#> SRR1974885 1 0.5113 0.5551 0.684 0.000 0.292 0.024
#> SRR1974883 3 0.6844 0.1475 0.000 0.396 0.500 0.104
#> SRR1974884 2 0.0188 0.8869 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974881 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0524 0.8842 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974880 2 0.1406 0.8744 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1974879 2 0.0524 0.8862 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974877 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974876 2 0.1209 0.8670 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1974878 3 0.3142 0.7660 0.000 0.132 0.860 0.008
#> SRR1974875 3 0.4711 0.7962 0.152 0.000 0.784 0.064
#> SRR1974874 4 0.5848 0.6433 0.000 0.336 0.048 0.616
#> SRR1974873 2 0.5297 0.1975 0.004 0.548 0.004 0.444
#> SRR1974871 2 0.1059 0.8819 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974872 2 0.4831 0.5984 0.000 0.752 0.040 0.208
#> SRR1974869 2 0.0804 0.8841 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1974868 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 2 0.5821 -0.1532 0.000 0.536 0.032 0.432
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974864 1 0.5452 0.3666 0.616 0.000 0.024 0.360
#> SRR1974862 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974863 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974860 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974861 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974859 4 0.3801 0.6516 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1974858 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974856 4 0.3356 0.6778 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1974857 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974855 1 0.6193 0.6310 0.680 0.012 0.084 0.224
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3725 0.7803 0.812 0.000 0.008 0.180
#> SRR1974852 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5010 0.4157 0.276 0.000 0.024 0.700
#> SRR1974846 4 0.1209 0.6874 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1974847 1 0.0188 0.9290 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974845 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 4 0.7874 0.6707 0.180 0.196 0.048 0.576
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1978 0.6947 0.000 0.068 0.004 0.928
#> SRR1974839 2 0.4562 0.6698 0.000 0.764 0.028 0.208
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0672 0.8842 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974833 1 0.4082 0.7927 0.820 0.008 0.020 0.152
#> SRR1974831 2 0.7550 0.1471 0.136 0.512 0.016 0.336
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974826 2 0.0524 0.8863 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974827 2 0.4775 0.6269 0.000 0.740 0.028 0.232
#> SRR1974824 1 0.5680 0.5544 0.684 0.008 0.044 0.264
#> SRR1974825 1 0.1743 0.8909 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1974822 1 0.2610 0.8560 0.900 0.000 0.012 0.088
#> SRR1974823 4 0.6079 0.7510 0.024 0.228 0.056 0.692
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0707 0.9209 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.5281 0.3301 0.528 0.000 0.008 0.464
#> SRR1974812 1 0.0336 0.9280 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974810 1 0.5664 0.6717 0.740 0.092 0.012 0.156
#> SRR1974808 2 0.5933 -0.0728 0.000 0.552 0.040 0.408
#> SRR1974811 1 0.0336 0.9280 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.3587 0.8267 0.876 0.052 0.016 0.056
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 1 0.7919 0.0121 0.432 0.392 0.020 0.156
#> SRR1974804 1 0.0469 0.9261 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974803 1 0.0672 0.9235 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1339 0.9072 0.964 0.008 0.004 0.024
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974797 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974796 1 0.4419 0.7652 0.792 0.004 0.028 0.176
#> SRR1974795 1 0.7221 0.4070 0.584 0.212 0.008 0.196
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974792 2 0.0336 0.8863 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974791 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974788 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974786 1 0.3583 0.7026 0.816 0.180 0.004 0.000
#> SRR1974787 4 0.6391 0.4683 0.004 0.412 0.056 0.528
#> SRR1974784 1 0.5538 0.2885 0.596 0.384 0.008 0.012
#> SRR1974783 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974785 2 0.2744 0.8183 0.064 0.908 0.008 0.020
#> SRR1974782 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974781 2 0.0376 0.8865 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974780 2 0.6074 -0.2392 0.000 0.500 0.044 0.456
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.7288 -0.1428 0.068 0.520 0.036 0.376
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974773 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974771 2 0.2737 0.8072 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR1974770 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.5982 -0.1238 0.000 0.524 0.040 0.436
#> SRR1974768 2 0.0895 0.8768 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1974767 2 0.5442 0.4293 0.000 0.672 0.040 0.288
#> SRR1974766 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974760 2 0.7375 0.0489 0.116 0.480 0.012 0.392
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.3074 0.6754 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1974755 2 0.0188 0.8867 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974753 2 0.4819 0.4682 0.000 0.652 0.004 0.344
#> SRR1974751 1 0.4955 0.3887 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974750 4 0.4855 0.2156 0.352 0.000 0.004 0.644
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.5358 0.7443 0.000 0.252 0.048 0.700
#> SRR1974747 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974748 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.1211 0.8660 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974745 4 0.4406 0.3513 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1974743 2 0.4356 0.5561 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974742 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974740 2 0.3636 0.7325 0.000 0.820 0.008 0.172
#> SRR1974739 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.4730 0.4181 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1974738 4 0.5716 0.4941 0.000 0.420 0.028 0.552
#> SRR1974737 2 0.4164 0.5936 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1974736 4 0.3942 0.4818 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.5328 0.7459 0.000 0.248 0.048 0.704
#> SRR1974733 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0336 0.6784 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974731 4 0.4981 0.0363 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.3636 0.7592 0.000 0.172 0.008 0.820
#> SRR1974725 4 0.1520 0.6996 0.000 0.024 0.020 0.956
#> SRR1974726 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5222 0.4302 0.000 0.688 0.032 0.280
#> SRR1974723 4 0.0188 0.6769 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974722 4 0.2654 0.6143 0.108 0.000 0.004 0.888
#> SRR1974721 2 0.1610 0.8663 0.000 0.952 0.016 0.032
#> SRR1974720 4 0.1798 0.6959 0.000 0.016 0.040 0.944
#> SRR1974719 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974718 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 2 0.6007 -0.0333 0.000 0.548 0.044 0.408
#> SRR1974717 4 0.0376 0.6804 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1974715 4 0.0336 0.6807 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.5321 0.7527 0.000 0.228 0.056 0.716
#> SRR1974711 2 0.2376 0.8366 0.000 0.916 0.016 0.068
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 4 0.5695 0.3543 0.000 0.476 0.024 0.500
#> SRR1974710 4 0.5744 0.4765 0.000 0.436 0.028 0.536
#> SRR1974707 4 0.6039 0.7642 0.040 0.176 0.060 0.724
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974703 4 0.2799 0.6977 0.000 0.108 0.008 0.884
#> SRR1974702 2 0.0779 0.8823 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974701 1 0.4790 0.5187 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974699 4 0.4127 0.7554 0.000 0.124 0.052 0.824
#> SRR1974698 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 4 0.5768 0.7584 0.044 0.144 0.060 0.752
#> SRR1974696 4 0.4677 0.7676 0.000 0.176 0.048 0.776
#> SRR1974694 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974695 4 0.5535 0.6991 0.000 0.304 0.040 0.656
#> SRR1974693 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.6776 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0592 0.6842 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974687 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974682 4 0.4866 0.0414 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0657 0.6752 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1974680 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974678 1 0.4967 0.3771 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974675 2 0.3037 0.8097 0.000 0.888 0.036 0.076
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.2224 0.8530 0.000 0.928 0.040 0.032
#> SRR1974671 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974672 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974670 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974669 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974667 2 0.0188 0.8870 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974666 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974664 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 4 0.6083 0.7531 0.032 0.224 0.048 0.696
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.5592 0.7296 0.000 0.264 0.056 0.680
#> SRR1974660 1 0.1767 0.8944 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974657 4 0.6742 0.7133 0.132 0.124 0.052 0.692
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 4 0.6436 0.7438 0.088 0.148 0.052 0.712
#> SRR1974656 4 0.5881 0.7657 0.036 0.176 0.056 0.732
#> SRR1974650 4 0.5681 0.5458 0.000 0.404 0.028 0.568
#> SRR1974651 2 0.4477 0.5075 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1974652 4 0.6144 0.7190 0.016 0.276 0.052 0.656
#> SRR1974653 4 0.1637 0.6897 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974648 4 0.5590 0.7629 0.012 0.208 0.056 0.724
#> SRR1974646 2 0.0469 0.8840 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.5137 0.0601 0.000 0.544 0.004 0.452
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.5599 0.7226 0.000 0.276 0.052 0.672
#> SRR1974640 4 0.5478 0.7395 0.000 0.248 0.056 0.696
#> SRR1974641 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.5812 0.6566 0.000 0.328 0.048 0.624
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.4511 0.5921 0.000 0.724 0.008 0.268
#> SRR1974633 4 0.6740 0.7345 0.104 0.148 0.056 0.692
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.5595 0.7454 0.004 0.240 0.056 0.700
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974627 1 0.5166 0.5542 0.688 0.004 0.020 0.288
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974623 4 0.5587 0.6011 0.000 0.372 0.028 0.600
#> SRR1974622 4 0.6352 0.7533 0.068 0.156 0.060 0.716
#> SRR1974620 4 0.5448 0.7426 0.000 0.244 0.056 0.700
#> SRR1974619 4 0.5404 0.7451 0.000 0.248 0.052 0.700
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974616 1 0.3658 0.8374 0.864 0.004 0.068 0.064
#> SRR1974615 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 4 0.6016 0.5182 0.000 0.412 0.044 0.544
#> SRR1974613 4 0.5321 0.7526 0.000 0.228 0.056 0.716
#> SRR1974612 1 0.0188 0.9297 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974611 4 0.5835 0.5971 0.000 0.372 0.040 0.588
#> SRR1974610 4 0.5195 0.6679 0.000 0.276 0.032 0.692
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.5410 0.7584 0.032 0.136 0.060 0.772
#> SRR1974607 1 0.7313 0.4518 0.636 0.112 0.056 0.196
#> SRR1974606 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 4 0.6277 0.7497 0.076 0.144 0.056 0.724
#> SRR1974604 4 0.4331 0.5556 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1974603 2 0.4589 0.6789 0.000 0.784 0.048 0.168
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9310 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 4 0.5546 0.7090 0.000 0.292 0.044 0.664
#> SRR1974599 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974598 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.4567 0.5817 0.000 0.740 0.016 0.244
#> SRR1974593 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974591 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974588 4 0.5203 0.7546 0.000 0.232 0.048 0.720
#> SRR1974590 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974589 2 0.1452 0.8656 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1974587 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.5620 -0.0048 0.000 0.560 0.024 0.416
#> SRR1974584 1 0.0336 0.9263 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974583 2 0.0592 0.8855 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0336 0.8868 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974580 2 0.1305 0.8689 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974578 2 0.4446 0.6447 0.000 0.776 0.028 0.196
#> SRR1974577 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.1388 0.8702 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1974576 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.2021 0.8504 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1974571 2 0.0469 0.8850 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974572 2 0.1059 0.8787 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1974570 2 0.4199 0.6919 0.000 0.804 0.032 0.164
#> SRR1974568 4 0.6720 0.7336 0.108 0.148 0.052 0.692
#> SRR1974567 1 0.0469 0.9259 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 4 0.5467 0.7672 0.020 0.196 0.044 0.740
#> SRR1974564 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 4 0.5927 0.7462 0.012 0.240 0.060 0.688
#> SRR1974559 1 0.0657 0.9239 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974563 2 0.4716 0.6434 0.000 0.764 0.040 0.196
#> SRR1974562 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0524 0.8869 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974553 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0469 0.9259 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974551 1 0.0469 0.9259 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 4 0.5742 0.6963 0.000 0.300 0.052 0.648
#> SRR1974558 1 0.5085 0.6931 0.788 0.136 0.028 0.048
#> SRR1974556 1 0.0469 0.9259 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974550 4 0.5614 0.6975 0.000 0.304 0.044 0.652
#> SRR1974549 2 0.0336 0.8856 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974548 2 0.0524 0.8852 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974547 4 0.5508 0.7361 0.000 0.252 0.056 0.692
#> SRR1974546 4 0.6139 0.5118 0.000 0.404 0.052 0.544
#> SRR1974545 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 2 0.5001 0.6232 0.180 0.768 0.012 0.040
#> SRR1974543 2 0.0000 0.8868 0.000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.1341 0.8991 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0671 0.8333 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1975006 2 0.1430 0.8312 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1975005 3 0.4835 0.2646 0.000 0.380 0.592 0.000 0.028
#> SRR1975004 3 0.2674 0.7763 0.000 0.140 0.856 0.000 0.004
#> SRR1975003 2 0.1605 0.8204 0.000 0.944 0.012 0.004 0.040
#> SRR1975001 2 0.2719 0.7846 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1975002 2 0.0865 0.8350 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1974999 2 0.0727 0.8295 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1975000 3 0.0162 0.9240 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0290 0.9246 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974997 3 0.1087 0.9165 0.000 0.008 0.968 0.016 0.008
#> SRR1974995 2 0.5457 0.4655 0.000 0.672 0.220 0.012 0.096
#> SRR1974996 3 0.2984 0.8217 0.000 0.032 0.860 0.000 0.108
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0451 0.9240 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974992 3 0.0324 0.9238 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974990 3 0.1851 0.8711 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.7469 0.3670 0.244 0.156 0.072 0.520 0.008
#> SRR1974991 3 0.2474 0.8737 0.000 0.040 0.908 0.012 0.040
#> SRR1974986 3 0.0963 0.9138 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.4118 0.6622 0.000 0.780 0.032 0.012 0.176
#> SRR1974988 3 0.0703 0.9201 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.1644 0.8943 0.000 0.048 0.940 0.004 0.008
#> SRR1974985 3 0.0404 0.9236 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.1671 0.8293 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974982 3 0.1270 0.9018 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.3109 0.7378 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0290 0.9242 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.2249 0.7963 0.000 0.896 0.096 0.000 0.008
#> SRR1974978 3 0.0404 0.9236 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0648 0.9254 0.004 0.004 0.984 0.004 0.004
#> SRR1974976 2 0.0162 0.8303 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974975 2 0.2905 0.7579 0.000 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR1974974 2 0.0566 0.8334 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974973 2 0.1124 0.8330 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974972 3 0.1059 0.9172 0.000 0.004 0.968 0.008 0.020
#> SRR1974971 2 0.0324 0.8295 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974970 3 0.0703 0.9182 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974969 5 0.7008 0.4566 0.000 0.352 0.236 0.012 0.400
#> SRR1974968 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.1588 0.9047 0.000 0.028 0.948 0.008 0.016
#> SRR1974965 3 0.2074 0.8536 0.104 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.4597 -0.1190 0.000 0.564 0.012 0.000 0.424
#> SRR1974964 3 0.0703 0.9184 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9242 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.3741 0.5672 0.000 0.264 0.732 0.000 0.004
#> SRR1974962 2 0.3109 0.6995 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1974960 3 0.0451 0.9252 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974959 3 0.0290 0.9242 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0703 0.8318 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974957 2 0.2843 0.7325 0.000 0.848 0.144 0.000 0.008
#> SRR1974956 3 0.0324 0.9248 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1974955 3 0.1792 0.8755 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0451 0.9242 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974953 2 0.3689 0.5876 0.000 0.740 0.004 0.000 0.256
#> SRR1974952 3 0.0566 0.9241 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974949 3 0.0609 0.9202 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974950 2 0.4919 0.4335 0.000 0.656 0.304 0.012 0.028
#> SRR1974951 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974947 2 0.4278 0.1821 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0510 0.8333 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974946 2 0.2763 0.7796 0.000 0.848 0.000 0.004 0.148
#> SRR1974945 3 0.1012 0.9184 0.000 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1974944 3 0.2179 0.8431 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0771 0.9222 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1974943 2 0.5263 0.4057 0.000 0.660 0.240 0.000 0.100
#> SRR1974941 3 0.1121 0.9084 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0290 0.9242 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.2969 0.7366 0.000 0.852 0.020 0.000 0.128
#> SRR1974938 3 0.0162 0.9241 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1925 0.9023 0.004 0.012 0.936 0.012 0.036
#> SRR1974936 3 0.1197 0.9059 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0324 0.9244 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974934 2 0.1124 0.8333 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974933 2 0.1341 0.8168 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0451 0.9235 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974931 3 0.3136 0.8488 0.072 0.000 0.868 0.008 0.052
#> SRR1974930 1 0.4278 0.1999 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0404 0.9236 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0324 0.8299 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974927 3 0.0162 0.9241 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974924 3 0.1608 0.8841 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0963 0.9148 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.2280 0.8355 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1974923 5 0.5928 0.5015 0.000 0.100 0.296 0.012 0.592
#> SRR1974922 3 0.1443 0.8997 0.000 0.044 0.948 0.004 0.004
#> SRR1974921 3 0.0486 0.9251 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR1974920 3 0.0609 0.9222 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9242 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0162 0.9241 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974917 2 0.2516 0.7894 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974916 3 0.0162 0.9241 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9242 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.5602 0.4136 0.000 0.620 0.288 0.084 0.008
#> SRR1974913 3 0.0510 0.9227 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0566 0.9248 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974910 3 0.0290 0.9251 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.3689 0.7136 0.000 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1974909 3 0.0290 0.9242 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.3366 0.7081 0.000 0.828 0.032 0.000 0.140
#> SRR1974907 3 0.0609 0.9200 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0324 0.9239 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974904 2 0.6225 0.3110 0.000 0.604 0.252 0.028 0.116
#> SRR1974903 3 0.0404 0.9236 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.4915 0.5523 0.000 0.724 0.168 0.004 0.104
#> SRR1974901 3 0.0566 0.9233 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1974898 2 0.0771 0.8341 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1974900 2 0.1704 0.8254 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1974899 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974897 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974896 2 0.0451 0.8308 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974893 2 0.1205 0.8170 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1974895 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974894 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.6763 0.6154 0.076 0.088 0.668 0.060 0.108
#> SRR1974890 3 0.7468 0.3927 0.192 0.020 0.544 0.056 0.188
#> SRR1974891 2 0.3814 0.4694 0.000 0.720 0.004 0.000 0.276
#> SRR1974889 2 0.2233 0.8110 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1974888 2 0.1043 0.8353 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974886 2 0.0451 0.8298 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974887 1 0.4641 0.7218 0.760 0.000 0.116 0.116 0.008
#> SRR1974885 1 0.4852 0.4597 0.624 0.000 0.348 0.012 0.016
#> SRR1974883 3 0.6190 0.0883 0.000 0.384 0.504 0.012 0.100
#> SRR1974884 2 0.0451 0.8316 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974881 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0865 0.8283 0.000 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1974880 2 0.2377 0.8042 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974879 2 0.1124 0.8338 0.000 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974877 2 0.2763 0.7817 0.000 0.848 0.000 0.004 0.148
#> SRR1974876 2 0.1983 0.8183 0.000 0.924 0.008 0.060 0.008
#> SRR1974878 3 0.3907 0.7596 0.000 0.108 0.824 0.028 0.040
#> SRR1974875 3 0.3558 0.7737 0.136 0.000 0.824 0.036 0.004
#> SRR1974874 5 0.4793 0.5860 0.000 0.260 0.000 0.056 0.684
#> SRR1974873 4 0.0451 0.8515 0.000 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1974871 2 0.3058 0.7965 0.000 0.860 0.000 0.044 0.096
#> SRR1974872 2 0.4546 0.4257 0.000 0.688 0.008 0.020 0.284
#> SRR1974869 2 0.2280 0.8096 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974868 2 0.1638 0.8246 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1974870 2 0.0609 0.8334 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974866 2 0.4359 0.0769 0.000 0.584 0.004 0.000 0.412
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2127 0.8090 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974864 1 0.4321 0.3563 0.600 0.000 0.004 0.000 0.396
#> SRR1974862 2 0.1410 0.8254 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974863 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974860 2 0.2629 0.7890 0.000 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1974861 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974859 4 0.1408 0.8392 0.000 0.044 0.000 0.948 0.008
#> SRR1974858 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974856 4 0.0955 0.8497 0.000 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1974857 2 0.2648 0.7804 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974855 1 0.6138 0.4959 0.616 0.000 0.028 0.244 0.112
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3631 0.7370 0.788 0.000 0.008 0.196 0.008
#> SRR1974852 2 0.1243 0.8253 0.000 0.960 0.004 0.028 0.008
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.6839 0.1994 0.224 0.000 0.008 0.440 0.328
#> SRR1974846 4 0.1116 0.8621 0.000 0.004 0.004 0.964 0.028
#> SRR1974847 1 0.0162 0.9271 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974845 2 0.1243 0.8253 0.000 0.960 0.004 0.028 0.008
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.6793 0.5213 0.260 0.136 0.008 0.032 0.564
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0324 0.8530 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974839 2 0.4816 0.6495 0.000 0.736 0.008 0.172 0.084
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0955 0.8271 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974834 2 0.1569 0.8234 0.000 0.948 0.008 0.032 0.012
#> SRR1974833 1 0.3988 0.7293 0.776 0.000 0.024 0.192 0.008
#> SRR1974831 4 0.6098 0.1246 0.016 0.408 0.012 0.512 0.052
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0771 0.8335 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974827 2 0.5772 0.4872 0.000 0.660 0.016 0.176 0.148
#> SRR1974824 1 0.5263 0.1671 0.492 0.008 0.012 0.012 0.476
#> SRR1974825 1 0.1788 0.8864 0.932 0.000 0.004 0.008 0.056
#> SRR1974822 1 0.3167 0.7926 0.820 0.000 0.004 0.004 0.172
#> SRR1974823 5 0.3190 0.7649 0.000 0.140 0.008 0.012 0.840
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1686 0.8967 0.944 0.000 0.020 0.028 0.008
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1200 0.8447 0.012 0.000 0.008 0.964 0.016
#> SRR1974812 1 0.0579 0.9216 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1974810 1 0.5489 0.6876 0.740 0.076 0.008 0.100 0.076
#> SRR1974808 2 0.4531 -0.0862 0.000 0.568 0.004 0.004 0.424
#> SRR1974811 1 0.0693 0.9192 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.4129 0.7930 0.832 0.048 0.016 0.032 0.072
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 1 0.8508 -0.1199 0.364 0.304 0.012 0.160 0.160
#> SRR1974804 1 0.0404 0.9240 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0451 0.9239 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1990 0.8849 0.928 0.004 0.000 0.028 0.040
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2068 0.8153 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1974797 2 0.1153 0.8308 0.000 0.964 0.004 0.024 0.008
#> SRR1974796 1 0.5633 0.5788 0.656 0.000 0.016 0.232 0.096
#> SRR1974795 1 0.6650 0.2656 0.524 0.160 0.008 0.300 0.008
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974792 2 0.1686 0.8212 0.000 0.944 0.008 0.028 0.020
#> SRR1974791 2 0.1243 0.8253 0.000 0.960 0.004 0.028 0.008
#> SRR1974790 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.2763 0.7796 0.000 0.848 0.000 0.004 0.148
#> SRR1974788 2 0.2068 0.8132 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1974786 1 0.3086 0.6970 0.816 0.180 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974787 5 0.6317 0.5019 0.036 0.408 0.016 0.036 0.504
#> SRR1974784 1 0.5556 0.2921 0.592 0.352 0.012 0.032 0.012
#> SRR1974783 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.2713 0.7915 0.068 0.896 0.008 0.008 0.020
#> SRR1974782 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1442 0.8243 0.000 0.952 0.004 0.032 0.012
#> SRR1974780 5 0.5367 0.3842 0.000 0.468 0.008 0.036 0.488
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.6760 -0.4253 0.096 0.444 0.008 0.028 0.424
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1043 0.8322 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974773 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2647 0.7861 0.000 0.892 0.008 0.024 0.076
#> SRR1974770 2 0.0404 0.8324 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974769 5 0.5611 0.4975 0.000 0.408 0.008 0.056 0.528
#> SRR1974768 2 0.1717 0.8223 0.000 0.936 0.004 0.052 0.008
#> SRR1974767 2 0.4974 0.1690 0.000 0.604 0.008 0.024 0.364
#> SRR1974766 2 0.1243 0.8258 0.000 0.960 0.004 0.028 0.008
#> SRR1974765 2 0.0162 0.8306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974764 2 0.0451 0.8318 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1608 0.8228 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974760 2 0.7553 0.1824 0.108 0.496 0.008 0.288 0.100
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0324 0.8314 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974757 2 0.1356 0.8259 0.000 0.956 0.004 0.028 0.012
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0955 0.8628 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1974755 2 0.1278 0.8300 0.000 0.960 0.004 0.020 0.016
#> SRR1974753 2 0.5552 0.3559 0.000 0.584 0.000 0.328 0.088
#> SRR1974751 4 0.0992 0.8607 0.008 0.000 0.000 0.968 0.024
#> SRR1974750 4 0.0162 0.8537 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.5253 0.7178 0.004 0.296 0.012 0.040 0.648
#> SRR1974747 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.3728 0.5864 0.000 0.748 0.000 0.244 0.008
#> SRR1974745 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974743 4 0.2563 0.7516 0.000 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR1974742 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.4493 0.6761 0.000 0.756 0.000 0.108 0.136
#> SRR1974739 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974741 4 0.1168 0.8478 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR1974738 2 0.5736 -0.4112 0.000 0.468 0.000 0.084 0.448
#> SRR1974737 4 0.3814 0.5037 0.000 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR1974736 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.5224 0.7204 0.000 0.276 0.000 0.080 0.644
#> SRR1974733 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974732 4 0.1892 0.8321 0.000 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1974731 4 0.0794 0.8628 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.4662 0.5766 0.000 0.168 0.000 0.736 0.096
#> SRR1974725 5 0.5691 0.1072 0.028 0.020 0.008 0.404 0.540
#> SRR1974726 4 0.0794 0.8629 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.4066 0.3376 0.000 0.672 0.004 0.000 0.324
#> SRR1974723 4 0.0865 0.8624 0.000 0.000 0.004 0.972 0.024
#> SRR1974722 4 0.0324 0.8550 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974721 2 0.2497 0.8079 0.000 0.880 0.004 0.004 0.112
#> SRR1974720 4 0.4801 0.3967 0.000 0.020 0.004 0.604 0.372
#> SRR1974719 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.4865 -0.1744 0.000 0.536 0.004 0.016 0.444
#> SRR1974717 4 0.1205 0.8595 0.000 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR1974715 4 0.0955 0.8623 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.3145 0.7649 0.000 0.136 0.008 0.012 0.844
#> SRR1974711 2 0.2672 0.7638 0.000 0.872 0.004 0.008 0.116
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4787 -0.2561 0.000 0.528 0.004 0.012 0.456
#> SRR1974710 2 0.4448 -0.3343 0.000 0.516 0.004 0.000 0.480
#> SRR1974707 5 0.3312 0.7625 0.000 0.132 0.012 0.016 0.840
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.2844 0.8107 0.000 0.028 0.004 0.876 0.092
#> SRR1974702 2 0.0854 0.8300 0.000 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR1974701 4 0.0898 0.8527 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1974699 4 0.5788 0.1119 0.000 0.076 0.004 0.480 0.440
#> SRR1974698 4 0.1908 0.8243 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.3312 0.7603 0.000 0.132 0.012 0.016 0.840
#> SRR1974696 5 0.5311 0.7180 0.000 0.184 0.008 0.116 0.692
#> SRR1974694 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.3790 0.7529 0.000 0.272 0.000 0.004 0.724
#> SRR1974693 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974692 4 0.1043 0.8599 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974690 2 0.0579 0.8321 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974688 4 0.0865 0.8630 0.000 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR1974687 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0703 0.8625 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1270 0.8534 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974680 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0880 0.8624 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1043 0.8323 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974675 2 0.3123 0.7224 0.000 0.812 0.004 0.000 0.184
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3398 0.7515 0.000 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1974671 2 0.2286 0.8057 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1974672 2 0.2719 0.7828 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1974670 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974669 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974667 2 0.0963 0.8328 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974668 2 0.1952 0.8165 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR1974666 2 0.2179 0.8106 0.000 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1974664 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974665 2 0.0162 0.8311 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974663 5 0.5823 0.7214 0.096 0.220 0.008 0.016 0.660
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.3596 0.7727 0.000 0.192 0.008 0.008 0.792
#> SRR1974660 1 0.1502 0.8914 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.5842 0.6068 0.196 0.112 0.012 0.012 0.668
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.5935 0.6390 0.176 0.136 0.012 0.012 0.664
#> SRR1974656 5 0.3145 0.7649 0.000 0.136 0.008 0.012 0.844
#> SRR1974650 5 0.4450 0.4121 0.000 0.488 0.004 0.000 0.508
#> SRR1974651 4 0.4114 0.3184 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1974652 5 0.6092 0.7186 0.048 0.280 0.012 0.040 0.620
#> SRR1974653 4 0.0162 0.8555 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974648 5 0.3292 0.7649 0.000 0.140 0.008 0.016 0.836
#> SRR1974646 2 0.0451 0.8318 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.6081 0.0183 0.000 0.400 0.000 0.476 0.124
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.3088 0.7698 0.000 0.164 0.004 0.004 0.828
#> SRR1974640 5 0.3190 0.7649 0.000 0.140 0.008 0.012 0.840
#> SRR1974641 2 0.2230 0.8034 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.4781 0.5996 0.000 0.388 0.008 0.012 0.592
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.5606 0.2708 0.000 0.548 0.004 0.380 0.068
#> SRR1974633 5 0.4354 0.7448 0.048 0.132 0.012 0.012 0.796
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.3190 0.7649 0.000 0.140 0.008 0.012 0.840
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.4713 0.5729 0.684 0.004 0.012 0.016 0.284
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.2806 0.7783 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974623 5 0.4912 0.4108 0.000 0.480 0.008 0.012 0.500
#> SRR1974622 5 0.3255 0.7629 0.000 0.136 0.012 0.012 0.840
#> SRR1974620 5 0.3145 0.7649 0.000 0.136 0.008 0.012 0.844
#> SRR1974619 5 0.4488 0.7611 0.000 0.212 0.004 0.048 0.736
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.4205 0.7978 0.820 0.004 0.068 0.072 0.036
#> SRR1974615 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.4528 0.4971 0.000 0.444 0.008 0.000 0.548
#> SRR1974613 5 0.3145 0.7649 0.000 0.136 0.008 0.012 0.844
#> SRR1974612 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.4410 0.5132 0.000 0.440 0.004 0.000 0.556
#> SRR1974610 5 0.6596 0.3269 0.000 0.236 0.000 0.308 0.456
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.3404 0.7525 0.000 0.124 0.012 0.024 0.840
#> SRR1974607 1 0.6773 0.0165 0.460 0.104 0.020 0.012 0.404
#> SRR1974606 2 0.0955 0.8335 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1974605 5 0.4812 0.7245 0.028 0.128 0.012 0.056 0.776
#> SRR1974604 4 0.0703 0.8510 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974603 2 0.4137 0.5401 0.000 0.732 0.008 0.012 0.248
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9292 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 5 0.4389 0.6491 0.000 0.368 0.004 0.004 0.624
#> SRR1974599 2 0.1892 0.8182 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1974598 2 0.1892 0.8182 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1974596 2 0.0162 0.8311 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974594 2 0.5996 0.1317 0.000 0.572 0.004 0.128 0.296
#> SRR1974593 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.1831 0.8200 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1974591 2 0.1892 0.8182 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1974588 5 0.3475 0.7641 0.000 0.180 0.004 0.012 0.804
#> SRR1974590 2 0.0609 0.8337 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974589 2 0.3242 0.6185 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1974587 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 5 0.4934 0.4526 0.000 0.432 0.004 0.020 0.544
#> SRR1974584 1 0.2929 0.7793 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974583 2 0.2424 0.7936 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974582 2 0.0404 0.8324 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974581 2 0.1892 0.8182 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1974580 2 0.1173 0.8263 0.000 0.964 0.004 0.012 0.020
#> SRR1974578 2 0.4264 0.2198 0.000 0.620 0.004 0.000 0.376
#> SRR1974577 2 0.0162 0.8293 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974579 2 0.3317 0.6501 0.000 0.804 0.004 0.004 0.188
#> SRR1974576 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.4016 0.5128 0.000 0.716 0.000 0.012 0.272
#> SRR1974571 2 0.2230 0.7577 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974572 2 0.3328 0.6665 0.000 0.812 0.004 0.008 0.176
#> SRR1974570 2 0.3642 0.5700 0.000 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR1974568 5 0.3795 0.7474 0.024 0.124 0.012 0.012 0.828
#> SRR1974567 1 0.3086 0.7781 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1974566 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 5 0.6178 0.5255 0.004 0.172 0.004 0.228 0.592
#> SRR1974564 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 5 0.3368 0.7606 0.004 0.132 0.012 0.012 0.840
#> SRR1974559 1 0.3086 0.7781 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1974563 2 0.4912 0.0828 0.000 0.572 0.008 0.016 0.404
#> SRR1974562 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0794 0.8263 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974557 2 0.1478 0.8272 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974553 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.3086 0.7781 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1974551 1 0.3086 0.7781 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1974552 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 5 0.3439 0.7690 0.000 0.188 0.008 0.004 0.800
#> SRR1974558 1 0.6230 0.4567 0.620 0.128 0.012 0.012 0.228
#> SRR1974556 1 0.3086 0.7781 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1974550 5 0.3461 0.7652 0.000 0.224 0.004 0.000 0.772
#> SRR1974549 2 0.2852 0.6783 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1974548 2 0.2930 0.6872 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1974547 5 0.3145 0.7649 0.000 0.136 0.008 0.012 0.844
#> SRR1974546 5 0.4088 0.7212 0.000 0.276 0.008 0.004 0.712
#> SRR1974545 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 2 0.6036 0.2707 0.176 0.596 0.004 0.000 0.224
#> SRR1974543 2 0.0000 0.8299 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0865 0.90332 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0820 0.82739 0.000 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1975006 2 0.1950 0.82423 0.000 0.912 0.000 0.000 0.024 0.064
#> SRR1975005 3 0.4591 0.31161 0.000 0.376 0.588 0.000 0.024 0.012
#> SRR1975004 3 0.2431 0.78047 0.000 0.132 0.860 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975003 2 0.1152 0.81780 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044 0.000
#> SRR1975001 2 0.3370 0.78246 0.000 0.812 0.000 0.000 0.064 0.124
#> SRR1975002 2 0.0717 0.82796 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1974999 2 0.0713 0.82428 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1975000 3 0.0146 0.91991 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974998 3 0.0520 0.91858 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974997 3 0.3323 0.73907 0.000 0.008 0.780 0.000 0.008 0.204
#> SRR1974995 2 0.5349 0.48984 0.000 0.644 0.208 0.000 0.124 0.024
#> SRR1974996 3 0.2450 0.82112 0.000 0.016 0.868 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0458 0.91768 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974992 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.1267 0.88103 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.8364 -0.00898 0.208 0.140 0.052 0.312 0.004 0.284
#> SRR1974991 3 0.2615 0.83954 0.000 0.028 0.876 0.000 0.088 0.008
#> SRR1974986 3 0.0777 0.90994 0.024 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974987 2 0.3976 0.65518 0.000 0.740 0.020 0.000 0.220 0.020
#> SRR1974988 3 0.0603 0.91538 0.016 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974984 3 0.1391 0.88876 0.000 0.040 0.944 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.2046 0.82575 0.000 0.908 0.000 0.000 0.032 0.060
#> SRR1974982 3 0.1010 0.90067 0.036 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974981 1 0.2941 0.65401 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.2604 0.80264 0.000 0.880 0.076 0.000 0.008 0.036
#> SRR1974978 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.0146 0.82374 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974975 2 0.2697 0.75901 0.000 0.864 0.092 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974974 2 0.0779 0.82791 0.000 0.976 0.008 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974973 2 0.1418 0.82769 0.000 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1974972 3 0.1141 0.89810 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974971 2 0.0260 0.82306 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974970 3 0.0458 0.91540 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 5 0.5893 0.37112 0.000 0.292 0.208 0.000 0.496 0.004
#> SRR1974968 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974967 3 0.1552 0.89441 0.000 0.020 0.940 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974965 3 0.1765 0.83904 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 5 0.4086 0.39149 0.000 0.464 0.008 0.000 0.528 0.000
#> SRR1974964 3 0.0547 0.91300 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.3240 0.58688 0.000 0.244 0.752 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974962 2 0.3175 0.71816 0.000 0.808 0.000 0.000 0.164 0.028
#> SRR1974960 3 0.0951 0.91353 0.004 0.000 0.968 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974959 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0820 0.82656 0.000 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974957 2 0.3222 0.73568 0.000 0.824 0.140 0.000 0.012 0.024
#> SRR1974956 3 0.0291 0.91991 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974955 3 0.1204 0.88547 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0405 0.91941 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974953 2 0.3933 0.57580 0.000 0.716 0.000 0.000 0.248 0.036
#> SRR1974952 3 0.0405 0.91928 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974949 3 0.0547 0.91307 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 2 0.5632 0.43250 0.000 0.596 0.280 0.000 0.056 0.068
#> SRR1974951 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974947 2 0.3966 0.22398 0.000 0.552 0.444 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974948 2 0.0622 0.82772 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974946 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974945 3 0.0603 0.91612 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974944 3 0.1556 0.85977 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0508 0.91771 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974943 2 0.4746 0.44295 0.000 0.660 0.236 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974941 3 0.0713 0.90867 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.2669 0.73058 0.000 0.836 0.008 0.000 0.156 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1714 0.86455 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974936 3 0.0935 0.90496 0.032 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974935 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.1320 0.82795 0.000 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR1974933 2 0.1204 0.81197 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0363 0.91854 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974931 3 0.3685 0.75735 0.080 0.000 0.796 0.000 0.120 0.004
#> SRR1974930 1 0.3828 0.24857 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0405 0.82471 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974927 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1411 0.87783 0.060 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974925 3 0.0458 0.91588 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.2234 0.79116 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974923 5 0.4025 0.52391 0.000 0.052 0.176 0.000 0.760 0.012
#> SRR1974922 3 0.1391 0.89058 0.000 0.040 0.944 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974921 3 0.0291 0.92034 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974920 3 0.0260 0.91933 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.3241 0.78939 0.000 0.824 0.000 0.000 0.064 0.112
#> SRR1974916 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.5910 0.43592 0.000 0.596 0.272 0.072 0.020 0.040
#> SRR1974913 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0508 0.91903 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974910 3 0.0146 0.91989 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.4387 0.73030 0.000 0.720 0.000 0.000 0.152 0.128
#> SRR1974909 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.3065 0.71568 0.000 0.820 0.028 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974907 3 0.0260 0.91857 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0260 0.91948 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974904 2 0.6317 0.34081 0.000 0.548 0.188 0.000 0.056 0.208
#> SRR1974903 3 0.0000 0.91997 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.4599 0.53511 0.000 0.696 0.164 0.000 0.140 0.000
#> SRR1974901 3 0.0777 0.91328 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974898 2 0.0692 0.82748 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974900 2 0.2129 0.82036 0.000 0.904 0.000 0.000 0.040 0.056
#> SRR1974899 2 0.3384 0.78115 0.000 0.812 0.000 0.000 0.068 0.120
#> SRR1974897 2 0.3522 0.77453 0.000 0.800 0.000 0.000 0.072 0.128
#> SRR1974896 2 0.0692 0.82636 0.000 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974893 2 0.1007 0.81233 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974895 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974894 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974892 3 0.6625 0.45383 0.060 0.028 0.560 0.000 0.120 0.232
#> SRR1974890 3 0.7156 0.19149 0.148 0.000 0.432 0.004 0.120 0.296
#> SRR1974891 2 0.3515 0.39153 0.000 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1974889 2 0.2542 0.81517 0.000 0.876 0.000 0.000 0.044 0.080
#> SRR1974888 2 0.1341 0.83006 0.000 0.948 0.000 0.000 0.028 0.024
#> SRR1974886 2 0.0363 0.82367 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974887 1 0.4977 0.60247 0.712 0.000 0.112 0.132 0.000 0.044
#> SRR1974885 1 0.4961 0.28335 0.564 0.000 0.368 0.000 0.064 0.004
#> SRR1974883 3 0.5780 0.15123 0.000 0.332 0.496 0.000 0.168 0.004
#> SRR1974884 2 0.0622 0.82655 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974881 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974882 2 0.0632 0.82016 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974880 2 0.2857 0.80657 0.000 0.856 0.000 0.000 0.072 0.072
#> SRR1974879 2 0.1168 0.82883 0.000 0.956 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1974877 2 0.3468 0.77747 0.000 0.804 0.000 0.000 0.068 0.128
#> SRR1974876 2 0.3224 0.76974 0.000 0.828 0.000 0.036 0.008 0.128
#> SRR1974878 3 0.4952 0.57595 0.000 0.084 0.652 0.000 0.012 0.252
#> SRR1974875 3 0.3328 0.79924 0.096 0.000 0.844 0.028 0.024 0.008
#> SRR1974874 5 0.4399 0.53707 0.000 0.156 0.000 0.004 0.728 0.112
#> SRR1974873 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.3424 0.79919 0.000 0.840 0.000 0.052 0.044 0.064
#> SRR1974872 2 0.5523 0.18853 0.000 0.540 0.000 0.000 0.296 0.164
#> SRR1974869 2 0.2618 0.81478 0.000 0.872 0.000 0.000 0.052 0.076
#> SRR1974868 2 0.1921 0.82229 0.000 0.916 0.000 0.000 0.032 0.052
#> SRR1974870 2 0.0603 0.82714 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1974866 5 0.4529 0.33720 0.000 0.460 0.000 0.000 0.508 0.032
#> SRR1974867 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2527 0.81282 0.000 0.876 0.000 0.000 0.040 0.084
#> SRR1974864 1 0.3810 0.20872 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974862 2 0.1528 0.82423 0.000 0.936 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR1974863 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974860 2 0.3412 0.77889 0.000 0.808 0.000 0.000 0.064 0.128
#> SRR1974861 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974859 4 0.0405 0.89893 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1974858 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974856 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.3439 0.77976 0.000 0.808 0.000 0.000 0.072 0.120
#> SRR1974855 1 0.6532 0.19734 0.492 0.000 0.004 0.160 0.048 0.296
#> SRR1974854 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.5056 0.49463 0.644 0.000 0.000 0.132 0.004 0.220
#> SRR1974852 2 0.3508 0.60801 0.000 0.704 0.000 0.000 0.004 0.292
#> SRR1974849 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 6 0.7603 0.03076 0.172 0.000 0.000 0.272 0.236 0.320
#> SRR1974846 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0146 0.91976 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974845 2 0.3337 0.64760 0.000 0.736 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR1974844 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974843 5 0.5259 0.52234 0.108 0.068 0.004 0.000 0.704 0.116
#> SRR1974842 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.5736 0.47942 0.000 0.576 0.000 0.076 0.052 0.296
#> SRR1974838 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.2964 0.70070 0.000 0.792 0.000 0.000 0.004 0.204
#> SRR1974834 2 0.3819 0.60804 0.000 0.700 0.000 0.000 0.020 0.280
#> SRR1974833 1 0.5419 0.35685 0.568 0.000 0.000 0.132 0.004 0.296
#> SRR1974831 2 0.7678 -0.06608 0.016 0.328 0.000 0.252 0.104 0.300
#> SRR1974832 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974826 2 0.1082 0.82624 0.000 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1974827 2 0.6247 0.36070 0.000 0.524 0.000 0.056 0.124 0.296
#> SRR1974824 6 0.4631 0.41757 0.052 0.000 0.000 0.000 0.352 0.596
#> SRR1974825 1 0.1757 0.84725 0.916 0.000 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1974822 1 0.5527 -0.16404 0.484 0.000 0.000 0.000 0.136 0.380
#> SRR1974823 5 0.1757 0.66695 0.000 0.076 0.000 0.000 0.916 0.008
#> SRR1974820 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3665 0.56755 0.696 0.000 0.004 0.000 0.004 0.296
#> SRR1974815 1 0.0458 0.91284 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974813 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0909 0.88482 0.012 0.000 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR1974812 1 0.1814 0.83535 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974810 1 0.5582 0.48253 0.644 0.012 0.000 0.024 0.116 0.204
#> SRR1974808 5 0.3854 0.37830 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1974811 1 0.1812 0.84770 0.912 0.000 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR1974809 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974807 1 0.4651 0.57218 0.700 0.004 0.000 0.000 0.124 0.172
#> SRR1974806 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.5963 0.36590 0.148 0.100 0.000 0.036 0.056 0.660
#> SRR1974804 1 0.0603 0.91038 0.980 0.000 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974803 1 0.0820 0.90318 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1974801 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3670 0.63136 0.736 0.000 0.000 0.000 0.024 0.240
#> SRR1974799 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974798 2 0.2762 0.80585 0.000 0.860 0.000 0.000 0.048 0.092
#> SRR1974797 2 0.2302 0.77454 0.000 0.872 0.000 0.000 0.008 0.120
#> SRR1974796 6 0.5709 0.02732 0.408 0.000 0.000 0.140 0.004 0.448
#> SRR1974795 1 0.6912 0.10392 0.468 0.100 0.000 0.136 0.004 0.292
#> SRR1974793 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974792 2 0.3710 0.60433 0.000 0.696 0.000 0.000 0.012 0.292
#> SRR1974791 2 0.3508 0.60801 0.000 0.704 0.000 0.000 0.004 0.292
#> SRR1974790 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974788 2 0.2672 0.80678 0.000 0.868 0.000 0.000 0.052 0.080
#> SRR1974786 1 0.2631 0.62345 0.820 0.180 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 5 0.4573 0.52412 0.000 0.196 0.000 0.000 0.692 0.112
#> SRR1974784 1 0.5844 0.20416 0.528 0.164 0.000 0.000 0.012 0.296
#> SRR1974783 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974785 2 0.2773 0.78685 0.064 0.868 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1974782 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974781 2 0.3808 0.61090 0.000 0.700 0.000 0.004 0.012 0.284
#> SRR1974780 5 0.5303 0.45184 0.000 0.332 0.000 0.000 0.548 0.120
#> SRR1974779 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974777 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.6973 0.27615 0.060 0.300 0.000 0.000 0.376 0.264
#> SRR1974778 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974774 2 0.1257 0.82813 0.000 0.952 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1974773 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974775 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974771 2 0.4364 0.66300 0.000 0.732 0.000 0.004 0.112 0.152
#> SRR1974770 2 0.0291 0.82511 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974769 6 0.5542 0.09393 0.000 0.280 0.000 0.004 0.156 0.560
#> SRR1974768 2 0.4023 0.62635 0.000 0.704 0.000 0.028 0.004 0.264
#> SRR1974767 2 0.4852 0.01059 0.000 0.492 0.000 0.000 0.452 0.056
#> SRR1974766 2 0.3103 0.69386 0.000 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR1974765 2 0.0405 0.82429 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974764 2 0.0260 0.82385 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2258 0.81654 0.000 0.896 0.000 0.000 0.044 0.060
#> SRR1974760 2 0.7286 0.26872 0.084 0.468 0.000 0.044 0.112 0.292
#> SRR1974759 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0260 0.82518 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974757 2 0.3615 0.60738 0.000 0.700 0.000 0.000 0.008 0.292
#> SRR1974756 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1957 0.79968 0.000 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974753 2 0.5054 0.40496 0.000 0.572 0.000 0.336 0.092 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.3885 0.56149 0.000 0.064 0.000 0.000 0.756 0.180
#> SRR1974747 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974748 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.3536 0.58524 0.000 0.736 0.000 0.252 0.004 0.008
#> SRR1974745 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.2060 0.80129 0.000 0.084 0.000 0.900 0.016 0.000
#> SRR1974742 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974740 2 0.4755 0.66572 0.000 0.736 0.000 0.088 0.124 0.052
#> SRR1974739 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0146 0.90213 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974738 5 0.4528 0.47335 0.000 0.404 0.000 0.028 0.564 0.004
#> SRR1974737 4 0.3288 0.48061 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.2669 0.67740 0.000 0.156 0.000 0.008 0.836 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.2219 0.77378 0.000 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.3752 0.61919 0.000 0.164 0.000 0.772 0.064 0.000
#> SRR1974725 5 0.3476 0.44537 0.000 0.004 0.000 0.260 0.732 0.004
#> SRR1974726 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.3727 0.18285 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1974723 4 0.0146 0.90313 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.1267 0.86252 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974721 2 0.2794 0.80186 0.000 0.860 0.000 0.000 0.080 0.060
#> SRR1974720 5 0.4083 0.03831 0.000 0.008 0.000 0.460 0.532 0.000
#> SRR1974719 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974716 5 0.3797 0.40056 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974717 4 0.0692 0.89149 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.1643 0.66459 0.000 0.068 0.000 0.000 0.924 0.008
#> SRR1974711 2 0.2631 0.73881 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.3872 0.49877 0.000 0.392 0.000 0.000 0.604 0.004
#> SRR1974710 5 0.3737 0.51083 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1974707 5 0.1531 0.66598 0.004 0.068 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 4 0.2100 0.80756 0.000 0.004 0.000 0.884 0.112 0.000
#> SRR1974702 2 0.0935 0.82362 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974701 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 5 0.5651 0.19043 0.000 0.052 0.000 0.400 0.500 0.048
#> SRR1974698 4 0.1387 0.85413 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.2653 0.61870 0.000 0.056 0.000 0.004 0.876 0.064
#> SRR1974696 5 0.2182 0.67307 0.000 0.076 0.000 0.020 0.900 0.004
#> SRR1974694 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974695 5 0.2793 0.65751 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1974693 4 0.0260 0.90080 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974692 4 0.0632 0.89000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974690 2 0.1806 0.80728 0.000 0.908 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR1974691 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974689 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974686 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974684 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974682 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1007 0.87277 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974680 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974678 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974676 2 0.1334 0.82795 0.000 0.948 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR1974675 2 0.3210 0.73613 0.000 0.812 0.000 0.000 0.152 0.036
#> SRR1974674 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4277 0.74098 0.000 0.732 0.000 0.000 0.144 0.124
#> SRR1974671 2 0.2923 0.79911 0.000 0.848 0.000 0.000 0.052 0.100
#> SRR1974672 2 0.3412 0.77795 0.000 0.808 0.000 0.000 0.064 0.128
#> SRR1974670 2 0.3522 0.77453 0.000 0.800 0.000 0.000 0.072 0.128
#> SRR1974669 2 0.3453 0.77628 0.000 0.804 0.000 0.000 0.064 0.132
#> SRR1974667 2 0.1225 0.82836 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1974668 2 0.2625 0.80807 0.000 0.872 0.000 0.000 0.056 0.072
#> SRR1974666 2 0.2672 0.80803 0.000 0.868 0.000 0.000 0.052 0.080
#> SRR1974664 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974665 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 5 0.2420 0.66916 0.000 0.076 0.000 0.000 0.884 0.040
#> SRR1974662 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.1863 0.67512 0.000 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1974660 1 0.2019 0.82888 0.900 0.000 0.000 0.000 0.088 0.012
#> SRR1974659 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974657 5 0.2486 0.62893 0.040 0.040 0.000 0.000 0.896 0.024
#> SRR1974654 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.2420 0.66475 0.008 0.068 0.000 0.000 0.892 0.032
#> SRR1974656 5 0.1531 0.66579 0.000 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974650 5 0.3607 0.55827 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1974651 4 0.3592 0.34214 0.000 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1974652 5 0.3508 0.62912 0.000 0.068 0.000 0.000 0.800 0.132
#> SRR1974653 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.1700 0.67139 0.000 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974646 2 0.0806 0.82435 0.000 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1974649 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.5673 0.03204 0.000 0.372 0.000 0.468 0.160 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.2135 0.67292 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1974640 5 0.1588 0.66570 0.000 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974641 2 0.2762 0.80640 0.000 0.860 0.000 0.000 0.048 0.092
#> SRR1974639 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974635 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.2664 0.65738 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.4968 0.36362 0.000 0.556 0.000 0.368 0.076 0.000
#> SRR1974633 5 0.1976 0.66010 0.008 0.060 0.000 0.000 0.916 0.016
#> SRR1974632 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.1588 0.66570 0.000 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974630 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974627 1 0.5393 0.12790 0.508 0.000 0.000 0.000 0.372 0.120
#> SRR1974624 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.3508 0.77360 0.000 0.800 0.000 0.000 0.068 0.132
#> SRR1974623 5 0.3446 0.57714 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692 0.000
#> SRR1974622 5 0.2046 0.64587 0.000 0.060 0.000 0.000 0.908 0.032
#> SRR1974620 5 0.1531 0.66579 0.000 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974619 5 0.2843 0.67605 0.000 0.116 0.000 0.000 0.848 0.036
#> SRR1974621 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974616 1 0.5447 0.44560 0.616 0.004 0.040 0.028 0.016 0.296
#> SRR1974615 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.3725 0.57993 0.000 0.316 0.000 0.000 0.676 0.008
#> SRR1974613 5 0.1531 0.66579 0.000 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974612 1 0.0146 0.92144 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974611 5 0.3371 0.60145 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708 0.000
#> SRR1974610 5 0.6213 0.41940 0.000 0.212 0.000 0.228 0.528 0.032
#> SRR1974609 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.4387 0.37139 0.000 0.056 0.000 0.008 0.704 0.232
#> SRR1974607 6 0.6068 0.46991 0.108 0.056 0.000 0.000 0.284 0.552
#> SRR1974606 2 0.0909 0.82867 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1974605 6 0.4990 0.23959 0.000 0.068 0.000 0.000 0.452 0.480
#> SRR1974604 4 0.0000 0.90509 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 2 0.4109 0.46661 0.000 0.648 0.000 0.000 0.328 0.024
#> SRR1974602 1 0.0000 0.92262 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974601 5 0.2697 0.66813 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974599 2 0.2506 0.81038 0.000 0.880 0.000 0.000 0.052 0.068
#> SRR1974598 2 0.2448 0.81172 0.000 0.884 0.000 0.000 0.052 0.064
#> SRR1974596 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 6 0.6389 0.39536 0.000 0.292 0.000 0.072 0.120 0.516
#> SRR1974593 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.2384 0.81336 0.000 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1974591 2 0.2448 0.81172 0.000 0.884 0.000 0.000 0.052 0.064
#> SRR1974588 6 0.5228 0.42882 0.000 0.120 0.000 0.000 0.308 0.572
#> SRR1974590 2 0.0622 0.82751 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974589 6 0.4569 0.33390 0.000 0.396 0.000 0.000 0.040 0.564
#> SRR1974587 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974585 6 0.5649 0.45209 0.000 0.192 0.000 0.008 0.228 0.572
#> SRR1974584 6 0.4500 0.43246 0.392 0.000 0.000 0.000 0.036 0.572
#> SRR1974583 2 0.3150 0.79156 0.000 0.832 0.000 0.000 0.064 0.104
#> SRR1974582 2 0.0291 0.82512 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974581 2 0.2448 0.81214 0.000 0.884 0.000 0.000 0.052 0.064
#> SRR1974580 2 0.1556 0.80892 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974578 6 0.5315 0.40263 0.000 0.304 0.000 0.000 0.132 0.564
#> SRR1974577 2 0.0146 0.82287 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974579 2 0.4882 -0.15215 0.000 0.512 0.000 0.000 0.060 0.428
#> SRR1974576 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974573 6 0.5112 0.38070 0.000 0.296 0.000 0.000 0.112 0.592
#> SRR1974571 2 0.4229 0.42249 0.000 0.668 0.000 0.000 0.040 0.292
#> SRR1974572 6 0.5034 0.21749 0.000 0.464 0.000 0.000 0.072 0.464
#> SRR1974570 2 0.3215 0.59187 0.000 0.756 0.000 0.000 0.240 0.004
#> SRR1974568 6 0.5095 0.41339 0.016 0.056 0.000 0.000 0.352 0.576
#> SRR1974567 6 0.4491 0.43512 0.388 0.000 0.000 0.000 0.036 0.576
#> SRR1974566 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 6 0.6231 0.44935 0.000 0.156 0.000 0.068 0.204 0.572
#> SRR1974564 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 6 0.4902 0.39265 0.004 0.060 0.000 0.000 0.364 0.572
#> SRR1974559 6 0.4543 0.44119 0.384 0.000 0.000 0.000 0.040 0.576
#> SRR1974563 6 0.5108 0.46325 0.000 0.164 0.000 0.000 0.208 0.628
#> SRR1974562 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.1967 0.79137 0.000 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR1974557 2 0.1745 0.82303 0.000 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR1974553 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974555 6 0.4491 0.43512 0.388 0.000 0.000 0.000 0.036 0.576
#> SRR1974551 6 0.4491 0.43512 0.388 0.000 0.000 0.000 0.036 0.576
#> SRR1974552 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974554 6 0.5366 0.40540 0.000 0.144 0.000 0.000 0.292 0.564
#> SRR1974558 6 0.6280 0.51680 0.176 0.080 0.000 0.000 0.168 0.576
#> SRR1974556 6 0.4491 0.43512 0.388 0.000 0.000 0.000 0.036 0.576
#> SRR1974550 5 0.2902 0.64097 0.000 0.196 0.000 0.000 0.800 0.004
#> SRR1974549 2 0.4592 -0.20911 0.000 0.496 0.000 0.000 0.036 0.468
#> SRR1974548 2 0.4350 0.38302 0.000 0.660 0.000 0.000 0.048 0.292
#> SRR1974547 6 0.4779 0.38482 0.000 0.060 0.000 0.000 0.368 0.572
#> SRR1974546 5 0.5328 -0.17483 0.000 0.104 0.000 0.000 0.456 0.440
#> SRR1974545 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 6 0.6334 0.52118 0.152 0.176 0.000 0.000 0.096 0.576
#> SRR1974543 2 0.0000 0.82344 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.388 0.406 0.731 0.4747 0.525 0.525
#> 3 3 0.966 0.930 0.969 0.3880 0.762 0.567
#> 4 4 0.728 0.750 0.779 0.1058 0.900 0.719
#> 5 5 0.784 0.818 0.892 0.0851 0.898 0.649
#> 6 6 0.777 0.766 0.844 0.0346 0.972 0.861
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975008 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975006 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975005 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975004 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975003 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975001 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975002 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974999 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1975000 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974998 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974997 1 0.9661 -0.1853 0.608 0.392
#> SRR1974995 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974996 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974994 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974993 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974992 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974990 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974989 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974991 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974986 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974987 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974988 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974984 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974985 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974983 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974982 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974981 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974980 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974979 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974978 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974977 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974976 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974975 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974974 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974973 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974972 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974971 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974970 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974969 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974968 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974967 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974965 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974966 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974964 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974963 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974961 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974962 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974960 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974959 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974958 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974957 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974956 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974955 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974954 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974953 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974952 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974949 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974950 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974951 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974947 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974948 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974946 1 0.9881 -0.3098 0.564 0.436
#> SRR1974945 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974944 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974942 1 0.9522 -0.1133 0.628 0.372
#> SRR1974943 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974941 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974940 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974939 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974938 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974937 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974936 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974935 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974934 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974933 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974932 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974931 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974930 1 0.9815 -0.1410 0.580 0.420
#> SRR1974929 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974928 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974927 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974924 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974925 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974926 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974923 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974922 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974921 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974920 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974919 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974918 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974917 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974916 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974915 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974914 2 0.9552 0.6456 0.376 0.624
#> SRR1974913 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974911 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974910 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974908 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974909 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974906 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974907 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974905 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974904 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974903 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974902 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974901 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974898 1 0.9710 -0.2095 0.600 0.400
#> SRR1974900 2 0.9954 0.5327 0.460 0.540
#> SRR1974899 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974897 1 0.9552 -0.1361 0.624 0.376
#> SRR1974896 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974893 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974895 2 0.9580 0.6425 0.380 0.620
#> SRR1974894 2 0.9608 0.6380 0.384 0.616
#> SRR1974892 2 0.9775 0.6056 0.412 0.588
#> SRR1974890 2 0.9896 0.5660 0.440 0.560
#> SRR1974891 2 0.9881 0.5717 0.436 0.564
#> SRR1974889 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974888 1 0.9608 -0.1606 0.616 0.384
#> SRR1974886 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974887 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974885 1 0.9896 -0.3200 0.560 0.440
#> SRR1974883 1 0.9522 -0.1235 0.628 0.372
#> SRR1974884 1 0.9522 -0.1235 0.628 0.372
#> SRR1974881 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974882 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974880 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974879 2 0.9580 0.6423 0.380 0.620
#> SRR1974877 1 0.9866 -0.2994 0.568 0.432
#> SRR1974876 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974878 1 0.9909 -0.3307 0.556 0.444
#> SRR1974875 2 0.9580 0.6420 0.380 0.620
#> SRR1974874 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.9754 0.5277 0.592 0.408
#> SRR1974869 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974868 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974870 1 0.9963 0.4794 0.536 0.464
#> SRR1974866 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974867 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974865 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974862 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974861 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974859 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974854 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974853 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974851 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974852 2 0.9129 0.6658 0.328 0.672
#> SRR1974849 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974848 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974850 2 0.0672 0.6149 0.008 0.992
#> SRR1974846 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974845 2 0.9358 0.6597 0.352 0.648
#> SRR1974844 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974843 1 0.9522 0.5689 0.628 0.372
#> SRR1974842 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974841 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974840 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.9000 0.6678 0.316 0.684
#> SRR1974838 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974837 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974835 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974836 2 0.8661 0.6703 0.288 0.712
#> SRR1974834 2 0.8081 0.6665 0.248 0.752
#> SRR1974833 2 0.9087 0.6666 0.324 0.676
#> SRR1974831 2 0.8909 0.6689 0.308 0.692
#> SRR1974832 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974830 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974829 1 0.9775 0.5353 0.588 0.412
#> SRR1974828 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974826 2 0.0938 0.6002 0.012 0.988
#> SRR1974827 2 0.9323 0.6609 0.348 0.652
#> SRR1974824 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974825 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974822 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974823 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974820 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974818 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974819 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974817 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974816 2 0.7528 0.1985 0.216 0.784
#> SRR1974815 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974813 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974814 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974812 2 0.1843 0.5764 0.028 0.972
#> SRR1974810 1 0.9552 0.5663 0.624 0.376
#> SRR1974808 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974811 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974809 1 0.9491 0.5707 0.632 0.368
#> SRR1974807 1 0.9686 0.5486 0.604 0.396
#> SRR1974806 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974805 2 0.8608 0.6706 0.284 0.716
#> SRR1974804 2 0.3431 0.5506 0.064 0.936
#> SRR1974803 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974801 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974800 1 0.9522 0.5689 0.628 0.372
#> SRR1974799 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974798 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974797 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974796 2 0.9087 0.6666 0.324 0.676
#> SRR1974795 2 0.9170 0.6649 0.332 0.668
#> SRR1974793 2 0.9970 -0.3901 0.468 0.532
#> SRR1974794 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974792 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974791 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974790 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974789 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974788 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974786 1 0.9580 0.5634 0.620 0.380
#> SRR1974787 1 0.9710 0.5465 0.600 0.400
#> SRR1974784 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974783 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974785 1 0.9580 0.4965 0.620 0.380
#> SRR1974782 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974781 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974780 1 0.9323 0.4261 0.652 0.348
#> SRR1974779 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974777 1 0.9580 0.5634 0.620 0.380
#> SRR1974776 1 0.9686 0.5501 0.604 0.396
#> SRR1974778 1 0.9491 0.5707 0.632 0.368
#> SRR1974774 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974773 1 0.9522 0.5689 0.628 0.372
#> SRR1974775 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974772 2 0.9754 -0.2922 0.408 0.592
#> SRR1974771 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974770 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974769 2 0.8499 0.6702 0.276 0.724
#> SRR1974768 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974767 1 0.9522 0.5689 0.628 0.372
#> SRR1974766 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974765 2 0.8763 0.6701 0.296 0.704
#> SRR1974764 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974763 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974762 1 0.9491 0.5706 0.632 0.368
#> SRR1974761 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974760 2 0.9393 0.6584 0.356 0.644
#> SRR1974759 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974758 2 0.9427 0.6570 0.360 0.640
#> SRR1974757 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974756 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974754 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974753 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974749 2 0.9044 0.2699 0.320 0.680
#> SRR1974747 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974748 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974746 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974744 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974740 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0376 0.6111 0.004 0.996
#> SRR1974737 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974734 1 0.9580 0.5633 0.620 0.380
#> SRR1974733 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974732 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974730 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974728 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.9580 0.5633 0.620 0.380
#> SRR1974726 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974727 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974723 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.4022 0.4700 0.080 0.920
#> SRR1974721 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.8713 -0.0444 0.292 0.708
#> SRR1974719 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974718 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974716 1 0.9635 0.5569 0.612 0.388
#> SRR1974717 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974714 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974711 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974712 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974709 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974708 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974710 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974707 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974706 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974704 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974705 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974703 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.9552 -0.0850 0.624 0.376
#> SRR1974701 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974697 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974696 1 0.9850 0.5211 0.572 0.428
#> SRR1974694 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974695 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974693 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.9286 0.6619 0.344 0.656
#> SRR1974691 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974689 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974686 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974685 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974684 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974683 2 0.9881 -0.3469 0.436 0.564
#> SRR1974682 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974679 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974678 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974676 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974675 1 0.9491 -0.1109 0.632 0.368
#> SRR1974674 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974673 1 0.9988 0.4600 0.520 0.480
#> SRR1974671 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974672 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974667 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974668 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974666 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974664 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974663 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974662 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974661 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974660 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974659 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974658 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974657 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974654 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974655 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974656 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974650 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974651 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.9580 0.5634 0.620 0.380
#> SRR1974653 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974646 1 0.9552 0.5662 0.624 0.376
#> SRR1974649 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974647 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974644 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974643 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974642 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974640 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974641 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974638 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974635 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974636 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974634 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974637 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974632 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974631 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974630 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974629 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974628 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974627 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974624 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974625 2 0.9460 0.6489 0.364 0.636
#> SRR1974623 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974622 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974620 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974619 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974621 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974617 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974616 2 0.5294 0.6311 0.120 0.880
#> SRR1974615 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974618 1 0.9491 0.5705 0.632 0.368
#> SRR1974614 1 0.9522 0.5689 0.628 0.372
#> SRR1974613 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974612 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974611 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974610 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974608 1 0.9552 0.5662 0.624 0.376
#> SRR1974607 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974606 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974605 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974604 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.9580 0.5634 0.620 0.380
#> SRR1974602 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974600 2 0.2778 0.6326 0.048 0.952
#> SRR1974601 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974599 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974598 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974596 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974594 2 0.2423 0.6303 0.040 0.960
#> SRR1974593 2 0.1184 0.6228 0.016 0.984
#> SRR1974595 2 0.9000 0.6679 0.316 0.684
#> SRR1974592 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974591 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974588 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.6438 0.6528 0.164 0.836
#> SRR1974589 2 0.1184 0.6229 0.016 0.984
#> SRR1974587 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.1184 0.6228 0.016 0.984
#> SRR1974585 2 0.2778 0.6327 0.048 0.952
#> SRR1974584 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974583 2 0.3274 0.6351 0.060 0.940
#> SRR1974582 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974581 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974580 2 0.3274 0.6351 0.060 0.940
#> SRR1974578 2 0.0672 0.6197 0.008 0.992
#> SRR1974577 2 0.8661 0.6580 0.288 0.712
#> SRR1974579 2 0.2778 0.6326 0.048 0.952
#> SRR1974576 2 0.2948 0.6334 0.052 0.948
#> SRR1974575 2 0.9460 0.6550 0.364 0.636
#> SRR1974574 2 0.8499 0.6702 0.276 0.724
#> SRR1974573 2 0.7950 0.6660 0.240 0.760
#> SRR1974571 2 0.8555 0.6705 0.280 0.720
#> SRR1974572 2 0.7139 0.6586 0.196 0.804
#> SRR1974570 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974568 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974567 1 0.9686 0.5490 0.604 0.396
#> SRR1974566 2 0.8661 0.6705 0.288 0.712
#> SRR1974569 2 0.8713 0.6704 0.292 0.708
#> SRR1974565 2 0.1184 0.6229 0.016 0.984
#> SRR1974564 2 0.9393 0.6584 0.356 0.644
#> SRR1974560 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974559 1 0.9608 0.5601 0.616 0.384
#> SRR1974563 2 0.2778 0.6329 0.048 0.952
#> SRR1974562 2 0.9087 0.6666 0.324 0.676
#> SRR1974561 2 0.8555 0.6704 0.280 0.720
#> SRR1974557 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.7950 0.6662 0.240 0.760
#> SRR1974555 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974551 2 0.9460 -0.2144 0.364 0.636
#> SRR1974552 2 0.8813 0.6698 0.300 0.700
#> SRR1974554 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974558 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974556 1 0.9460 0.5718 0.636 0.364
#> SRR1974550 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974549 2 0.8555 0.6704 0.280 0.720
#> SRR1974548 2 0.0000 0.6162 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974546 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974545 2 0.8861 0.6693 0.304 0.696
#> SRR1974544 1 0.9491 0.5712 0.632 0.368
#> SRR1974543 2 0.8016 0.6666 0.244 0.756
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.6180 0.3327 0.000 0.416 0.584
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.0747 0.9341 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.3116 0.8688 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.1289 0.9207 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.5178 0.6634 0.000 0.256 0.744
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.0983 0.9331 0.016 0.004 0.980
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.2774 0.8790 0.072 0.008 0.920
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.0237 0.9440 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.2050 0.9125 0.020 0.028 0.952
#> SRR1974923 3 0.0475 0.9423 0.004 0.004 0.992
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.1711 0.9174 0.008 0.032 0.960
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.6280 0.2009 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0592 0.9389 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974900 3 0.5497 0.6031 0.000 0.292 0.708
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0237 0.9446 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974896 3 0.6252 0.2522 0.000 0.444 0.556
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.4555 0.7442 0.000 0.200 0.800
#> SRR1974894 3 0.6215 0.2998 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974892 3 0.6062 0.4136 0.000 0.384 0.616
#> SRR1974890 3 0.6215 0.2996 0.000 0.428 0.572
#> SRR1974891 3 0.6204 0.3111 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974889 3 0.3116 0.8520 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974888 3 0.5138 0.6694 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974886 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974887 2 0.4575 0.7614 0.004 0.812 0.184
#> SRR1974885 3 0.7004 0.2721 0.020 0.428 0.552
#> SRR1974883 3 0.1964 0.9030 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974884 3 0.0424 0.9412 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974881 2 0.6225 0.1922 0.000 0.568 0.432
#> SRR1974882 2 0.5988 0.3871 0.000 0.632 0.368
#> SRR1974880 2 0.4750 0.7129 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974879 3 0.5291 0.6445 0.000 0.268 0.732
#> SRR1974877 3 0.3941 0.7992 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974876 2 0.5529 0.5610 0.000 0.704 0.296
#> SRR1974878 3 0.6111 0.3845 0.000 0.396 0.604
#> SRR1974875 3 0.6235 0.2764 0.000 0.436 0.564
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.2918 0.9344 0.924 0.032 0.044
#> SRR1974869 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974868 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974870 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974866 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0424 0.9739 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.1860 0.9322 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974861 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.2806 0.9198 0.032 0.928 0.040
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.3752 0.8141 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.1031 0.9709 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0237 0.9687 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974823 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.5953 0.6113 0.708 0.280 0.012
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.6045 0.4075 0.620 0.380 0.000
#> SRR1974810 1 0.1163 0.9699 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974808 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.1031 0.9709 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.6225 0.2565 0.568 0.432 0.000
#> SRR1974803 1 0.0424 0.9739 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1163 0.9699 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0592 0.9653 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974788 2 0.3551 0.8385 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974786 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974787 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1525 0.9668 0.964 0.032 0.004
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 1 0.1950 0.9581 0.952 0.040 0.008
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0424 0.9740 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974771 2 0.0892 0.9606 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974770 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974767 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974766 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.1163 0.9547 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.6566 0.4569 0.636 0.348 0.016
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.6062 0.3603 0.384 0.616 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.1860 0.9226 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.6008 0.3878 0.372 0.628 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 1 0.3941 0.8326 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974711 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974710 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974707 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 3 0.6518 0.7220 0.168 0.080 0.752
#> SRR1974701 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974696 1 0.1411 0.9656 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.1031 0.9709 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974682 2 0.0892 0.9550 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974675 3 0.1031 0.9278 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.1753 0.9549 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974671 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974667 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974668 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974666 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974663 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0747 0.9725 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0892 0.9718 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974656 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974650 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974646 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974640 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0592 0.9653 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974623 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974622 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974620 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974619 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.6676 0.0592 0.476 0.516 0.008
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974613 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974607 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974606 2 0.0747 0.9630 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974605 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974599 2 0.0892 0.9606 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974598 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974596 2 0.0592 0.9653 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0592 0.9653 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974591 2 0.1031 0.9580 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974588 2 0.0237 0.9688 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0892 0.9606 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974581 2 0.0424 0.9675 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.2947 0.9050 0.060 0.920 0.020
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0424 0.9675 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974568 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974567 1 0.1163 0.9699 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974559 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.3412 0.8733 0.876 0.124 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974558 1 0.1031 0.9709 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9751 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974546 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.1289 0.9687 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9717 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0188 0.9722 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0469 0.9681 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1975002 3 0.0804 0.9634 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.8126 0.6179 0.044 0.484 0.136 0.336
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.0188 0.9716 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.5906 0.7199 0.028 0.588 0.008 0.376
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0524 0.9676 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0188 0.9726 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0469 0.9683 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0188 0.9726 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0524 0.9682 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.1489 0.9388 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0188 0.9726 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0336 0.9704 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974946 3 0.7700 0.2521 0.040 0.316 0.536 0.108
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.1302 0.9375 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0188 0.9716 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.1362 0.9532 0.012 0.004 0.964 0.020
#> SRR1974933 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0188 0.9716 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974930 3 0.1022 0.9500 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0188 0.9716 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.3289 0.8521 0.120 0.004 0.864 0.012
#> SRR1974923 3 0.0817 0.9582 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.2831 0.8631 0.120 0.000 0.876 0.004
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.6800 0.6982 0.040 0.556 0.036 0.368
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0188 0.9716 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0469 0.9681 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9745 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.3541 0.8726 0.024 0.076 0.876 0.024
#> SRR1974900 2 0.8649 0.4553 0.040 0.420 0.252 0.288
#> SRR1974899 3 0.0336 0.9704 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974897 3 0.1471 0.9476 0.004 0.024 0.960 0.012
#> SRR1974896 2 0.7268 0.6783 0.036 0.528 0.068 0.368
#> SRR1974893 3 0.0336 0.9704 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974895 3 0.7916 0.1550 0.036 0.340 0.496 0.128
#> SRR1974894 2 0.7402 0.6713 0.040 0.520 0.072 0.368
#> SRR1974892 2 0.8044 0.6113 0.040 0.468 0.128 0.364
#> SRR1974890 2 0.7402 0.6699 0.040 0.520 0.072 0.368
#> SRR1974891 2 0.7512 0.6640 0.040 0.512 0.080 0.368
#> SRR1974889 3 0.3470 0.8823 0.040 0.052 0.884 0.024
#> SRR1974888 3 0.6652 0.5190 0.040 0.248 0.652 0.060
#> SRR1974886 2 0.5393 0.7311 0.008 0.608 0.008 0.376
#> SRR1974887 2 0.6153 0.7118 0.040 0.576 0.008 0.376
#> SRR1974885 2 0.7205 0.6801 0.080 0.548 0.028 0.344
#> SRR1974883 3 0.3470 0.8839 0.040 0.052 0.884 0.024
#> SRR1974884 3 0.1640 0.9471 0.020 0.012 0.956 0.012
#> SRR1974881 2 0.6191 0.7125 0.036 0.576 0.012 0.376
#> SRR1974882 2 0.6203 0.7116 0.036 0.572 0.012 0.380
#> SRR1974880 2 0.5829 0.7215 0.024 0.588 0.008 0.380
#> SRR1974879 2 0.8646 0.4586 0.040 0.388 0.224 0.348
#> SRR1974877 3 0.5922 0.6492 0.040 0.204 0.716 0.040
#> SRR1974876 2 0.6074 0.7146 0.036 0.580 0.008 0.376
#> SRR1974878 2 0.7885 0.6331 0.040 0.484 0.112 0.364
#> SRR1974875 2 0.6823 0.6941 0.040 0.548 0.036 0.376
#> SRR1974874 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974873 2 0.2401 0.7511 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR1974871 2 0.3306 0.7349 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1974872 1 0.4595 0.4679 0.776 0.000 0.184 0.040
#> SRR1974869 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974870 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 4 0.4804 0.9686 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974865 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974864 1 0.1474 0.7144 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974862 2 0.3196 0.7435 0.136 0.856 0.000 0.008
#> SRR1974863 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974860 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974861 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974859 2 0.3208 0.7407 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1974858 2 0.3355 0.7333 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1974856 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974855 2 0.6127 0.7168 0.040 0.584 0.008 0.368
#> SRR1974854 1 0.4998 -0.6704 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974853 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974851 2 0.2530 0.7497 0.100 0.896 0.000 0.004
#> SRR1974852 2 0.3873 0.7703 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974849 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974848 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974850 2 0.4319 0.6728 0.228 0.760 0.000 0.012
#> SRR1974846 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.3837 0.4405 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1974845 2 0.4164 0.7655 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1974844 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974843 1 0.1557 0.7111 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974842 4 0.4972 0.8317 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1974841 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974840 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.3873 0.7703 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974838 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974837 1 0.4866 -0.3299 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1974835 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974836 2 0.3764 0.7716 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1974834 2 0.3356 0.7736 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1974833 2 0.5250 0.7491 0.024 0.660 0.000 0.316
#> SRR1974831 2 0.3837 0.7706 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974832 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974830 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974829 1 0.4193 0.3564 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1974828 1 0.4730 -0.1246 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974826 2 0.3583 0.7147 0.180 0.816 0.000 0.004
#> SRR1974827 2 0.4250 0.7634 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974824 1 0.1867 0.7017 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974825 1 0.4277 0.2687 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1974822 1 0.0469 0.7361 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974823 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974818 4 0.4804 0.9686 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974819 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974817 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974816 1 0.5835 0.3621 0.656 0.280 0.000 0.064
#> SRR1974815 4 0.4866 0.9385 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974813 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974814 2 0.2921 0.7423 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.6607 0.0792 0.476 0.444 0.000 0.080
#> SRR1974810 1 0.1118 0.7266 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974808 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.4040 0.3695 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1974809 4 0.4855 0.9460 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1974807 1 0.2408 0.6721 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974806 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974805 2 0.3907 0.7700 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1974804 1 0.5901 0.0800 0.532 0.432 0.000 0.036
#> SRR1974803 1 0.3569 0.5361 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1974801 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974800 1 0.2345 0.6593 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974799 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974798 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974797 2 0.4277 0.7627 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974796 2 0.4193 0.7648 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974795 2 0.4103 0.7666 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1974793 1 0.4967 -0.5429 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1974794 2 0.4193 0.7686 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974792 2 0.4277 0.7628 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974791 2 0.4304 0.7621 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974790 2 0.4222 0.7642 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1974789 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974788 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974786 1 0.3257 0.5838 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1974787 1 0.1557 0.7111 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974784 2 0.4304 0.7620 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974783 1 0.5000 -0.6985 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1974785 1 0.3239 0.6466 0.880 0.000 0.052 0.068
#> SRR1974782 4 0.4955 0.8601 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1974781 2 0.4331 0.7612 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974780 1 0.2400 0.7038 0.928 0.028 0.012 0.032
#> SRR1974779 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974777 1 0.5510 -0.6748 0.504 0.000 0.016 0.480
#> SRR1974776 1 0.1890 0.7066 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1974778 1 0.4972 -0.5819 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1974774 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974773 1 0.4985 -0.6148 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974775 4 0.4843 0.9527 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1974772 1 0.4790 -0.2258 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974771 2 0.5598 0.7415 0.028 0.636 0.004 0.332
#> SRR1974770 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974769 2 0.3801 0.7709 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974768 2 0.5085 0.7345 0.000 0.616 0.008 0.376
#> SRR1974767 1 0.0592 0.7342 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974766 2 0.5085 0.7345 0.000 0.616 0.008 0.376
#> SRR1974765 2 0.3569 0.7727 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974764 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974763 4 0.4855 0.9458 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1974762 4 0.4985 0.8006 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974761 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974760 2 0.4250 0.7634 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974759 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974758 2 0.4955 0.7459 0.000 0.648 0.008 0.344
#> SRR1974757 2 0.4356 0.7603 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1974756 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974754 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974753 2 0.2760 0.7447 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.2921 0.7423 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974752 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974749 1 0.5933 0.1884 0.552 0.408 0.000 0.040
#> SRR1974747 1 0.4134 0.3806 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974748 4 0.4925 0.8980 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1974746 1 0.4522 0.1406 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1974744 2 0.3208 0.7394 0.148 0.848 0.000 0.004
#> SRR1974745 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.4250 0.3268 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1974740 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974739 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.4049 0.6957 0.212 0.780 0.000 0.008
#> SRR1974737 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974735 4 0.4998 0.7418 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974734 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.3356 0.7226 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974731 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.4585 0.0750 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974730 1 0.5000 -0.6939 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1974728 2 0.3257 0.7371 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974725 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.4989 -0.6161 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1974727 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974722 1 0.5000 -0.1436 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974720 1 0.3172 0.5424 0.840 0.160 0.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.4585 0.0213 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974718 4 0.4817 0.9622 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1974716 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.3257 0.7371 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974715 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974713 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974714 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974709 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974708 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 4 0.4817 0.9633 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1974704 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974705 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974703 2 0.3257 0.7371 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974702 3 0.7860 0.4464 0.268 0.136 0.552 0.044
#> SRR1974701 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.3306 0.7349 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1974698 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974700 4 0.4855 0.9463 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1974697 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 1 0.0336 0.7314 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.4072 0.4035 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974695 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.4040 0.7680 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974691 1 0.4500 0.1592 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1974689 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.3024 0.7394 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.4134 0.3808 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974686 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974685 1 0.3942 0.4470 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974684 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974683 1 0.3486 0.5405 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1974682 2 0.3266 0.7278 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1974681 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974679 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974680 4 0.4948 0.8694 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1974678 2 0.2921 0.7423 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974677 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974676 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974675 3 0.1209 0.9486 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1974674 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974673 1 0.0188 0.7346 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974672 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974670 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974669 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974667 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974668 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974666 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974664 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974665 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974663 1 0.1557 0.7111 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974662 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974661 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.4277 0.2798 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1974659 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974658 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974657 1 0.1022 0.7271 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974654 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974655 1 0.1022 0.7271 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974656 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1743 0.7093 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1974653 2 0.2973 0.7412 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974647 2 0.3257 0.7371 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974645 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974644 2 0.5085 0.7345 0.000 0.616 0.008 0.376
#> SRR1974643 4 0.4916 0.8974 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1974642 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974639 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974638 1 0.4948 -0.5070 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1974635 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974636 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974634 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974637 2 0.3157 0.7412 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR1974633 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974631 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974629 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974628 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974627 1 0.3873 0.4392 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1974624 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974625 2 0.3672 0.7556 0.012 0.864 0.032 0.092
#> SRR1974623 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974621 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974617 1 0.2868 0.6269 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974616 2 0.6570 0.4891 0.320 0.580 0.000 0.100
#> SRR1974615 1 0.4998 -0.6631 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974618 1 0.4933 -0.4647 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1974614 1 0.1022 0.7271 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974613 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 4 0.4989 0.7999 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1974611 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974609 4 0.4985 0.7864 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974608 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.1637 0.7101 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974606 2 0.4964 0.7355 0.000 0.616 0.004 0.380
#> SRR1974605 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.2921 0.7423 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.1557 0.7111 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974602 4 0.4790 0.9733 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974600 2 0.3257 0.7389 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974601 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974598 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974596 2 0.4920 0.7389 0.000 0.628 0.004 0.368
#> SRR1974594 2 0.3074 0.7371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974595 2 0.3801 0.7709 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974592 2 0.4624 0.7504 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1974591 2 0.5099 0.7342 0.000 0.612 0.008 0.380
#> SRR1974588 2 0.3172 0.7329 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.2722 0.7580 0.064 0.904 0.000 0.032
#> SRR1974589 2 0.3257 0.7389 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974587 2 0.3306 0.7349 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1974586 2 0.3529 0.7390 0.152 0.836 0.000 0.012
#> SRR1974585 2 0.2831 0.7465 0.120 0.876 0.000 0.004
#> SRR1974584 1 0.4713 -0.0778 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974583 2 0.3647 0.7403 0.152 0.832 0.000 0.016
#> SRR1974582 2 0.4964 0.7355 0.000 0.616 0.004 0.380
#> SRR1974581 2 0.4855 0.7455 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974580 2 0.3479 0.7426 0.148 0.840 0.000 0.012
#> SRR1974578 2 0.3123 0.7356 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.5760 0.6952 0.140 0.724 0.004 0.132
#> SRR1974579 2 0.3257 0.7389 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974576 2 0.3529 0.7390 0.152 0.836 0.000 0.012
#> SRR1974575 2 0.4872 0.7439 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1974574 2 0.3870 0.7722 0.004 0.788 0.000 0.208
#> SRR1974573 2 0.3791 0.7725 0.004 0.796 0.000 0.200
#> SRR1974571 2 0.3764 0.7713 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1974572 2 0.3583 0.7727 0.004 0.816 0.000 0.180
#> SRR1974570 1 0.0817 0.7309 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974568 1 0.0188 0.7379 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974567 1 0.3837 0.4753 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1974566 2 0.3649 0.7723 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1974569 2 0.3831 0.7724 0.004 0.792 0.000 0.204
#> SRR1974565 2 0.3123 0.7356 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.4040 0.7678 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1974560 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.2868 0.6179 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974563 2 0.4127 0.7513 0.124 0.824 0.000 0.052
#> SRR1974562 2 0.3801 0.7709 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974561 2 0.3945 0.7716 0.004 0.780 0.000 0.216
#> SRR1974557 2 0.3450 0.7354 0.156 0.836 0.000 0.008
#> SRR1974553 2 0.3539 0.7727 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1974555 1 0.4382 0.2516 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974551 1 0.5229 0.5187 0.748 0.084 0.000 0.168
#> SRR1974552 2 0.3801 0.7709 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974554 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.2216 0.6864 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974556 1 0.2216 0.6849 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974550 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.3908 0.7719 0.004 0.784 0.000 0.212
#> SRR1974548 2 0.3257 0.7371 0.152 0.844 0.000 0.004
#> SRR1974547 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.7389 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.3945 0.7718 0.004 0.780 0.000 0.216
#> SRR1974544 1 0.1867 0.7011 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974543 2 0.3668 0.7727 0.004 0.808 0.000 0.188
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.2179 0.907 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.2127 0.910 0.000 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0609 0.947 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.1608 0.930 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.2732 0.869 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.2773 0.866 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.1410 0.935 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.2609 0.800 0.000 0.896 0.052 0.048 0.004
#> SRR1974995 3 0.0703 0.946 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.1041 0.934 0.000 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR1974993 3 0.0162 0.950 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0162 0.950 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.1864 0.828 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR1974991 3 0.0290 0.949 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.1270 0.938 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0510 0.946 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.2471 0.889 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1544 0.932 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.1908 0.920 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0963 0.943 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.1908 0.919 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.2773 0.865 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.1478 0.932 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.1608 0.930 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0162 0.950 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.2329 0.898 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0162 0.950 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0794 0.938 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.1410 0.935 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0162 0.950 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.2471 0.890 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.1908 0.920 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.1341 0.937 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.2588 0.908 0.000 0.060 0.892 0.000 0.048
#> SRR1974952 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0703 0.947 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.1121 0.940 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.2424 0.892 0.000 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0609 0.947 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.2605 0.880 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.4118 0.369 0.000 0.660 0.336 0.004 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0963 0.933 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.2804 0.871 0.004 0.044 0.884 0.000 0.068
#> SRR1974943 3 0.1043 0.942 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.1197 0.939 0.000 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0880 0.935 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.2966 0.845 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.2471 0.890 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.1410 0.907 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974929 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.2377 0.896 0.000 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4298 0.702 0.000 0.060 0.756 0.000 0.184
#> SRR1974923 3 0.0510 0.943 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974922 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.4810 0.693 0.000 0.084 0.712 0.000 0.204
#> SRR1974916 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.1970 0.822 0.000 0.924 0.012 0.060 0.004
#> SRR1974913 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.2891 0.854 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0404 0.948 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0290 0.949 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.1965 0.917 0.000 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0609 0.947 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.950 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.3949 0.619 0.000 0.332 0.668 0.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.2445 0.750 0.000 0.884 0.108 0.004 0.004
#> SRR1974899 3 0.2732 0.869 0.000 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.3210 0.812 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.1059 0.798 0.000 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR1974893 3 0.2516 0.886 0.000 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.3209 0.676 0.000 0.812 0.180 0.008 0.000
#> SRR1974894 2 0.0932 0.793 0.000 0.972 0.020 0.004 0.004
#> SRR1974892 2 0.1492 0.786 0.000 0.948 0.040 0.008 0.004
#> SRR1974890 2 0.1757 0.817 0.000 0.936 0.012 0.048 0.004
#> SRR1974891 2 0.1461 0.808 0.000 0.952 0.016 0.028 0.004
#> SRR1974889 3 0.4126 0.523 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.4591 -0.137 0.000 0.516 0.476 0.004 0.004
#> SRR1974886 2 0.2488 0.843 0.000 0.872 0.004 0.124 0.000
#> SRR1974887 2 0.1864 0.828 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR1974885 2 0.5171 0.692 0.028 0.748 0.012 0.068 0.144
#> SRR1974883 3 0.4009 0.663 0.000 0.312 0.684 0.000 0.004
#> SRR1974884 3 0.3177 0.817 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.1924 0.827 0.000 0.924 0.008 0.064 0.004
#> SRR1974882 2 0.1864 0.836 0.000 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR1974880 2 0.2068 0.844 0.000 0.904 0.004 0.092 0.000
#> SRR1974879 2 0.2877 0.725 0.000 0.848 0.144 0.004 0.004
#> SRR1974877 2 0.4101 0.269 0.000 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.1990 0.827 0.000 0.920 0.008 0.068 0.004
#> SRR1974878 2 0.1644 0.782 0.000 0.940 0.048 0.008 0.004
#> SRR1974875 2 0.1970 0.822 0.000 0.924 0.012 0.060 0.004
#> SRR1974874 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974873 4 0.0671 0.889 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1974871 4 0.1557 0.887 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1974872 5 0.4121 0.760 0.100 0.000 0.112 0.000 0.788
#> SRR1974869 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974868 2 0.2233 0.846 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974870 5 0.1043 0.840 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974866 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974867 1 0.0609 0.907 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974865 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974864 5 0.2605 0.816 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974862 4 0.1557 0.887 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1974863 4 0.1704 0.883 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974860 2 0.2068 0.844 0.000 0.904 0.004 0.092 0.000
#> SRR1974861 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974859 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974858 4 0.2036 0.881 0.000 0.056 0.000 0.920 0.024
#> SRR1974856 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974857 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974855 2 0.3545 0.810 0.020 0.848 0.004 0.100 0.028
#> SRR1974854 1 0.3395 0.656 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974853 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.2645 0.847 0.008 0.096 0.000 0.884 0.012
#> SRR1974852 2 0.4297 0.350 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974849 1 0.0510 0.907 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974848 1 0.0162 0.913 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974850 4 0.6741 0.254 0.036 0.116 0.000 0.496 0.352
#> SRR1974846 4 0.0566 0.893 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1974847 1 0.4210 0.242 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1974845 2 0.4015 0.633 0.000 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.2852 0.801 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974842 1 0.2304 0.843 0.892 0.008 0.000 0.000 0.100
#> SRR1974841 1 0.0290 0.912 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974840 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974839 2 0.4307 0.254 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR1974838 1 0.0162 0.912 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974837 1 0.4528 -0.034 0.548 0.008 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974835 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.3707 0.533 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1974834 4 0.3274 0.669 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1974833 2 0.3519 0.757 0.000 0.776 0.000 0.216 0.008
#> SRR1974831 4 0.4182 0.167 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 5 0.4908 0.635 0.320 0.044 0.000 0.000 0.636
#> SRR1974828 5 0.4443 0.326 0.472 0.004 0.000 0.000 0.524
#> SRR1974826 4 0.2708 0.855 0.000 0.072 0.000 0.884 0.044
#> SRR1974827 2 0.3999 0.654 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1974824 5 0.2852 0.806 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974825 1 0.3796 0.560 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1974822 5 0.1341 0.838 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1974823 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974820 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0290 0.912 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974819 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.6230 0.687 0.192 0.112 0.004 0.044 0.648
#> SRR1974815 1 0.1043 0.897 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974813 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0324 0.891 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974812 5 0.7125 0.585 0.152 0.132 0.000 0.140 0.576
#> SRR1974810 5 0.2848 0.816 0.156 0.004 0.000 0.000 0.840
#> SRR1974808 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974811 5 0.3966 0.639 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1974809 1 0.1671 0.874 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974807 5 0.3461 0.765 0.224 0.004 0.000 0.000 0.772
#> SRR1974806 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.4219 0.095 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974804 5 0.6820 0.608 0.124 0.116 0.000 0.152 0.608
#> SRR1974803 5 0.3395 0.755 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974801 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.3305 0.763 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1974799 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974797 2 0.3857 0.703 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1974796 2 0.3949 0.671 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1974795 2 0.3932 0.678 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974793 5 0.5291 0.306 0.456 0.048 0.000 0.000 0.496
#> SRR1974794 2 0.4088 0.530 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1974792 2 0.3752 0.727 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1974791 2 0.3707 0.737 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974790 2 0.4045 0.627 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1974789 2 0.2389 0.842 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1974788 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974786 5 0.3895 0.647 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR1974787 5 0.2605 0.814 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974784 2 0.3816 0.711 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1974783 1 0.4101 0.310 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974785 5 0.3282 0.790 0.188 0.000 0.008 0.000 0.804
#> SRR1974782 1 0.3304 0.768 0.816 0.016 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974781 2 0.4074 0.621 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1974780 5 0.2763 0.812 0.148 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974779 1 0.0404 0.911 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974777 1 0.3266 0.733 0.796 0.000 0.004 0.000 0.200
#> SRR1974776 5 0.2773 0.806 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974778 1 0.3274 0.714 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974774 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974773 1 0.3816 0.529 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1974775 1 0.0794 0.902 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974772 5 0.5037 0.606 0.336 0.048 0.000 0.000 0.616
#> SRR1974771 2 0.3353 0.793 0.000 0.796 0.000 0.196 0.008
#> SRR1974770 2 0.2439 0.844 0.000 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR1974769 4 0.3366 0.650 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1974768 2 0.2890 0.830 0.000 0.836 0.004 0.160 0.000
#> SRR1974767 5 0.1851 0.834 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1974766 2 0.2674 0.839 0.000 0.856 0.004 0.140 0.000
#> SRR1974765 4 0.2516 0.790 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1974764 2 0.1892 0.841 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR1974763 1 0.1410 0.880 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974762 1 0.3242 0.709 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1974761 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974760 2 0.3932 0.677 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2674 0.831 0.000 0.856 0.004 0.140 0.000
#> SRR1974757 2 0.3480 0.774 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0566 0.893 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1974755 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974753 4 0.1331 0.890 0.000 0.040 0.000 0.952 0.008
#> SRR1974751 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974750 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974752 1 0.0794 0.903 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974749 5 0.5801 0.716 0.140 0.100 0.000 0.064 0.696
#> SRR1974747 5 0.4602 0.653 0.316 0.028 0.000 0.000 0.656
#> SRR1974748 1 0.1544 0.882 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974746 5 0.4630 0.518 0.396 0.016 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974744 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974745 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974743 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974742 5 0.4084 0.650 0.328 0.004 0.000 0.000 0.668
#> SRR1974740 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974739 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974741 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974738 4 0.4332 0.730 0.004 0.064 0.000 0.768 0.164
#> SRR1974737 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974736 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974735 1 0.2424 0.813 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974734 5 0.0794 0.839 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974733 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974732 4 0.3130 0.827 0.012 0.036 0.000 0.868 0.084
#> SRR1974731 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974729 5 0.4590 0.465 0.420 0.012 0.000 0.000 0.568
#> SRR1974730 1 0.1732 0.865 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974728 4 0.1430 0.888 0.000 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR1974725 5 0.0880 0.840 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974726 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974724 1 0.3661 0.569 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1974727 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974723 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974722 4 0.5820 0.132 0.024 0.044 0.000 0.496 0.436
#> SRR1974721 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974720 5 0.3455 0.748 0.024 0.020 0.000 0.112 0.844
#> SRR1974719 1 0.3586 0.626 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1974718 1 0.0290 0.911 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974716 5 0.0510 0.840 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974717 4 0.1628 0.885 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR1974715 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974713 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974711 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974712 1 0.0162 0.913 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974709 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974710 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974707 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974706 1 0.0290 0.911 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974704 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1557 0.887 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1974702 5 0.6831 0.410 0.056 0.104 0.316 0.000 0.524
#> SRR1974701 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974699 4 0.1628 0.885 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR1974698 4 0.0324 0.892 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974700 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.0794 0.841 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974696 5 0.1082 0.837 0.028 0.000 0.000 0.008 0.964
#> SRR1974694 5 0.4329 0.666 0.312 0.016 0.000 0.000 0.672
#> SRR1974695 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974693 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974692 4 0.0324 0.892 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974690 2 0.4268 0.435 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974691 5 0.4436 0.525 0.396 0.008 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974689 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974688 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974687 5 0.4108 0.671 0.308 0.008 0.000 0.000 0.684
#> SRR1974686 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 5 0.3707 0.708 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1974684 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 5 0.4394 0.743 0.220 0.048 0.000 0.000 0.732
#> SRR1974682 4 0.3304 0.805 0.004 0.052 0.000 0.852 0.092
#> SRR1974681 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1646 0.886 0.004 0.032 0.000 0.944 0.020
#> SRR1974680 1 0.2230 0.835 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974678 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974677 1 0.0290 0.911 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974676 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974675 3 0.2358 0.910 0.000 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR1974674 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974671 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974672 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974670 4 0.1768 0.881 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974669 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974667 2 0.2124 0.845 0.000 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR1974668 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974666 2 0.2179 0.845 0.000 0.896 0.004 0.100 0.000
#> SRR1974664 4 0.1956 0.877 0.000 0.076 0.000 0.916 0.008
#> SRR1974665 2 0.2389 0.844 0.000 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR1974663 5 0.2561 0.816 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974662 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974660 1 0.3612 0.628 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1974659 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0404 0.910 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974657 5 0.2074 0.831 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1974654 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.2280 0.826 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974656 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974650 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974651 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974652 5 0.2966 0.794 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974653 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974648 5 0.0510 0.841 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974646 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974649 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1484 0.888 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR1974645 1 0.0162 0.912 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974644 2 0.2286 0.842 0.000 0.888 0.004 0.108 0.000
#> SRR1974643 1 0.1671 0.873 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974642 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974640 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974641 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974639 1 0.0404 0.910 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974638 1 0.3177 0.729 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1974635 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974634 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.1557 0.887 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1974633 5 0.0703 0.842 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1974632 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974630 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0290 0.911 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974627 1 0.3966 0.473 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974624 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.5112 0.665 0.000 0.668 0.020 0.276 0.036
#> SRR1974623 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974622 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974620 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974619 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974621 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 5 0.3274 0.773 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1974616 5 0.7913 0.410 0.148 0.228 0.000 0.164 0.460
#> SRR1974615 1 0.2648 0.797 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974618 5 0.5230 0.322 0.452 0.044 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974614 5 0.2329 0.824 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974613 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974612 1 0.2471 0.824 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974611 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974610 4 0.0798 0.893 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR1974609 1 0.2127 0.840 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974608 5 0.0880 0.840 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974607 5 0.2690 0.814 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974606 2 0.2629 0.835 0.000 0.860 0.004 0.136 0.000
#> SRR1974605 5 0.0880 0.840 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974604 4 0.0162 0.892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974603 5 0.2471 0.819 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1974602 1 0.0000 0.913 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.1628 0.889 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR1974601 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974599 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974598 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974596 2 0.2763 0.837 0.000 0.848 0.004 0.148 0.000
#> SRR1974594 4 0.1653 0.885 0.004 0.028 0.000 0.944 0.024
#> SRR1974593 4 0.1892 0.878 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1974595 4 0.3895 0.444 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1974592 2 0.3366 0.775 0.000 0.784 0.004 0.212 0.000
#> SRR1974591 2 0.2233 0.845 0.000 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974588 4 0.1756 0.886 0.008 0.036 0.000 0.940 0.016
#> SRR1974590 4 0.2233 0.868 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004
#> SRR1974589 4 0.0451 0.891 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1974587 4 0.1809 0.883 0.000 0.060 0.000 0.928 0.012
#> SRR1974586 4 0.1704 0.883 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974585 4 0.1443 0.885 0.004 0.044 0.000 0.948 0.004
#> SRR1974584 5 0.4287 0.371 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1974583 4 0.2068 0.875 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR1974582 2 0.2338 0.843 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1974581 2 0.2930 0.818 0.000 0.832 0.004 0.164 0.000
#> SRR1974580 4 0.0794 0.886 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974578 4 0.1913 0.886 0.008 0.044 0.000 0.932 0.016
#> SRR1974577 2 0.7435 0.339 0.084 0.488 0.004 0.120 0.304
#> SRR1974579 4 0.1205 0.890 0.000 0.040 0.000 0.956 0.004
#> SRR1974576 4 0.1952 0.879 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004
#> SRR1974575 2 0.3266 0.799 0.000 0.796 0.004 0.200 0.000
#> SRR1974574 4 0.3074 0.711 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1974573 4 0.2424 0.797 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974571 4 0.2966 0.729 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1974572 4 0.2230 0.815 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974570 5 0.2280 0.826 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974568 5 0.1043 0.841 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974567 5 0.4235 0.630 0.336 0.008 0.000 0.000 0.656
#> SRR1974566 4 0.2690 0.769 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1974569 4 0.2648 0.774 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1974565 4 0.2162 0.871 0.008 0.064 0.000 0.916 0.012
#> SRR1974564 2 0.4171 0.556 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1974560 5 0.0609 0.841 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974559 5 0.2920 0.804 0.132 0.016 0.000 0.000 0.852
#> SRR1974563 4 0.1270 0.870 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1974562 4 0.3983 0.381 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1974561 4 0.3242 0.677 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1974557 4 0.1697 0.884 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974553 4 0.2230 0.815 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1974555 5 0.4836 0.588 0.356 0.032 0.000 0.000 0.612
#> SRR1974551 5 0.4677 0.758 0.184 0.048 0.000 0.020 0.748
#> SRR1974552 4 0.3534 0.607 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR1974554 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974558 5 0.3395 0.754 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974556 5 0.2471 0.823 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1974550 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974549 4 0.3003 0.723 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974548 4 0.1670 0.887 0.000 0.052 0.000 0.936 0.012
#> SRR1974547 5 0.0510 0.841 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974546 5 0.0290 0.840 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974545 4 0.3452 0.637 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1974544 5 0.3242 0.770 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1974543 4 0.2471 0.793 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 6 0.4246 0.6897 0.000 0.016 0.452 0.000 0.000 0.532
#> SRR1975006 6 0.4218 0.7323 0.000 0.016 0.428 0.000 0.000 0.556
#> SRR1975005 3 0.1267 0.8647 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1975004 3 0.0146 0.9005 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975003 6 0.4051 0.7224 0.000 0.008 0.432 0.000 0.000 0.560
#> SRR1975001 6 0.4652 0.8153 0.000 0.072 0.288 0.000 0.000 0.640
#> SRR1975002 6 0.4764 0.8073 0.000 0.088 0.272 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974999 6 0.3997 0.5911 0.000 0.004 0.488 0.000 0.000 0.508
#> SRR1975000 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.3194 0.6779 0.000 0.828 0.032 0.008 0.000 0.132
#> SRR1974995 3 0.2454 0.7096 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1974996 3 0.0146 0.9005 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974994 3 0.1140 0.8701 0.008 0.008 0.964 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974993 3 0.0632 0.8958 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974992 3 0.1610 0.8344 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974990 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0891 0.7791 0.000 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1974991 3 0.1204 0.8680 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974986 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3866 -0.5319 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1974988 3 0.2197 0.8069 0.000 0.056 0.900 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974984 3 0.0632 0.8923 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974985 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 6 0.4587 0.8113 0.000 0.048 0.356 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974982 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 6 0.3961 0.7100 0.000 0.004 0.440 0.000 0.000 0.556
#> SRR1974978 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974977 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 6 0.4141 0.7873 0.000 0.016 0.388 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974975 3 0.3819 -0.0841 0.000 0.004 0.624 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974974 6 0.4097 0.5952 0.000 0.008 0.488 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974973 6 0.4700 0.8153 0.000 0.076 0.288 0.000 0.000 0.636
#> SRR1974972 3 0.3720 0.4486 0.000 0.028 0.736 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974971 6 0.4084 0.7709 0.000 0.012 0.400 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974970 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974969 3 0.0458 0.8971 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974968 6 0.4508 0.7794 0.000 0.036 0.396 0.000 0.000 0.568
#> SRR1974967 3 0.0547 0.8974 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974965 3 0.0146 0.8986 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 6 0.3890 0.7675 0.000 0.004 0.400 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974964 3 0.1863 0.8043 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974963 3 0.0790 0.8900 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974961 3 0.1387 0.8552 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974962 6 0.4585 0.8197 0.000 0.060 0.308 0.000 0.000 0.632
#> SRR1974960 3 0.0458 0.8993 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974959 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974958 6 0.3955 0.7850 0.000 0.008 0.384 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974957 3 0.4047 -0.1706 0.000 0.012 0.604 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974956 3 0.0790 0.8894 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974955 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0547 0.8977 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974953 6 0.4787 0.7547 0.000 0.004 0.360 0.000 0.052 0.584
#> SRR1974952 3 0.0458 0.8994 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974949 3 0.3714 0.0954 0.000 0.004 0.656 0.000 0.000 0.340
#> SRR1974950 3 0.3998 -0.5644 0.000 0.004 0.504 0.000 0.000 0.492
#> SRR1974951 6 0.4518 0.8129 0.000 0.044 0.352 0.000 0.000 0.604
#> SRR1974947 3 0.3351 0.3419 0.000 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1974948 6 0.4601 0.8199 0.000 0.060 0.312 0.000 0.000 0.628
#> SRR1974946 6 0.4700 0.4230 0.000 0.340 0.060 0.000 0.000 0.600
#> SRR1974945 3 0.0458 0.8992 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974944 3 0.0260 0.8968 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.3746 0.6071 0.008 0.036 0.804 0.000 0.136 0.016
#> SRR1974943 3 0.2442 0.7349 0.000 0.004 0.852 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974941 3 0.0260 0.9006 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974940 3 0.0260 0.9005 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974939 3 0.2597 0.6776 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1974938 3 0.0547 0.8978 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974937 3 0.0291 0.8967 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974936 3 0.0146 0.8983 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0858 0.8914 0.000 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974934 6 0.4915 0.7974 0.000 0.108 0.260 0.000 0.000 0.632
#> SRR1974933 6 0.4408 0.8115 0.000 0.036 0.356 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974932 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.1349 0.8245 0.000 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974929 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 6 0.4463 0.7991 0.000 0.036 0.376 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974927 3 0.0547 0.8974 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974924 3 0.0291 0.8956 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974925 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.4771 0.4059 0.004 0.100 0.700 0.000 0.188 0.008
#> SRR1974923 3 0.3710 0.5775 0.000 0.004 0.788 0.000 0.144 0.064
#> SRR1974922 3 0.0547 0.8974 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974921 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0458 0.8992 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974918 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 6 0.5160 0.7245 0.000 0.004 0.284 0.000 0.108 0.604
#> SRR1974916 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974914 2 0.2020 0.7360 0.000 0.896 0.000 0.008 0.000 0.096
#> SRR1974913 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.8999 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 6 0.4764 0.8076 0.000 0.088 0.272 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974909 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974906 3 0.0937 0.8831 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974907 3 0.0632 0.8954 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974905 3 0.0458 0.8992 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974904 6 0.4066 0.7820 0.000 0.012 0.392 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974903 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974902 3 0.1610 0.8352 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974901 3 0.0363 0.9001 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974898 6 0.4999 0.7555 0.000 0.144 0.216 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974900 2 0.3999 0.5388 0.000 0.696 0.032 0.000 0.000 0.272
#> SRR1974899 6 0.4747 0.8154 0.000 0.080 0.288 0.000 0.000 0.632
#> SRR1974897 6 0.4874 0.7918 0.000 0.108 0.252 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974896 2 0.2854 0.6705 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1974893 6 0.4548 0.8199 0.000 0.056 0.312 0.000 0.000 0.632
#> SRR1974895 2 0.4427 0.4698 0.000 0.660 0.056 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974894 2 0.3161 0.6646 0.000 0.776 0.000 0.008 0.000 0.216
#> SRR1974892 2 0.3089 0.6718 0.000 0.800 0.008 0.004 0.000 0.188
#> SRR1974890 2 0.2346 0.7112 0.000 0.868 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR1974891 2 0.2848 0.6961 0.000 0.816 0.000 0.008 0.000 0.176
#> SRR1974889 6 0.5111 0.6695 0.000 0.224 0.152 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974888 6 0.5575 0.3355 0.000 0.400 0.140 0.000 0.000 0.460
#> SRR1974886 2 0.1753 0.8341 0.000 0.912 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1974887 2 0.1225 0.7859 0.000 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1974885 2 0.4069 0.6165 0.000 0.764 0.000 0.008 0.148 0.080
#> SRR1974883 2 0.5974 -0.2489 0.000 0.448 0.276 0.000 0.000 0.276
#> SRR1974884 6 0.4931 0.7857 0.000 0.116 0.248 0.000 0.000 0.636
#> SRR1974881 2 0.2134 0.7965 0.000 0.904 0.000 0.044 0.000 0.052
#> SRR1974882 2 0.2201 0.8250 0.000 0.896 0.000 0.076 0.000 0.028
#> SRR1974880 2 0.2094 0.8294 0.000 0.900 0.000 0.080 0.000 0.020
#> SRR1974879 2 0.3394 0.6245 0.000 0.752 0.012 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974877 6 0.4828 0.4700 0.000 0.320 0.076 0.000 0.000 0.604
#> SRR1974876 2 0.1461 0.7773 0.000 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR1974878 2 0.2933 0.6687 0.000 0.796 0.000 0.004 0.000 0.200
#> SRR1974875 2 0.2257 0.7173 0.000 0.876 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR1974874 4 0.1812 0.8407 0.000 0.008 0.000 0.912 0.000 0.080
#> SRR1974873 4 0.2433 0.8271 0.000 0.044 0.000 0.884 0.000 0.072
#> SRR1974871 4 0.1124 0.8591 0.000 0.008 0.000 0.956 0.000 0.036
#> SRR1974872 5 0.2712 0.8142 0.108 0.000 0.012 0.000 0.864 0.016
#> SRR1974869 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974868 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974870 5 0.1268 0.8326 0.008 0.004 0.000 0.000 0.952 0.036
#> SRR1974866 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974867 1 0.0291 0.9101 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974865 4 0.1866 0.8417 0.000 0.008 0.000 0.908 0.000 0.084
#> SRR1974864 5 0.2006 0.8203 0.104 0.000 0.000 0.000 0.892 0.004
#> SRR1974862 4 0.1700 0.8444 0.000 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080
#> SRR1974863 4 0.2660 0.8378 0.000 0.048 0.000 0.868 0.000 0.084
#> SRR1974860 2 0.1983 0.8280 0.000 0.908 0.000 0.072 0.000 0.020
#> SRR1974861 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.8588 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.2846 0.8341 0.000 0.060 0.000 0.856 0.000 0.084
#> SRR1974856 4 0.0000 0.8588 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.1913 0.8393 0.000 0.012 0.000 0.908 0.000 0.080
#> SRR1974855 2 0.2164 0.7798 0.008 0.916 0.000 0.012 0.020 0.044
#> SRR1974854 1 0.3345 0.7203 0.776 0.000 0.000 0.000 0.204 0.020
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.4273 0.7455 0.000 0.148 0.000 0.732 0.000 0.120
#> SRR1974852 2 0.5513 0.2890 0.000 0.476 0.000 0.392 0.000 0.132
#> SRR1974849 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974848 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974850 4 0.7153 0.4351 0.016 0.124 0.000 0.500 0.216 0.144
#> SRR1974846 4 0.0891 0.8587 0.000 0.008 0.000 0.968 0.000 0.024
#> SRR1974847 1 0.3862 0.3616 0.608 0.000 0.000 0.000 0.388 0.004
#> SRR1974845 2 0.5224 0.5690 0.000 0.588 0.000 0.280 0.000 0.132
#> SRR1974844 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974843 5 0.2346 0.8099 0.124 0.000 0.000 0.000 0.868 0.008
#> SRR1974842 1 0.2790 0.8052 0.844 0.000 0.000 0.000 0.132 0.024
#> SRR1974841 1 0.0405 0.9073 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974840 4 0.0405 0.8589 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1974839 2 0.5517 0.2734 0.000 0.472 0.000 0.396 0.000 0.132
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.4829 0.1481 0.544 0.004 0.000 0.000 0.404 0.048
#> SRR1974835 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974836 4 0.5207 0.4089 0.000 0.276 0.000 0.592 0.000 0.132
#> SRR1974834 4 0.4565 0.5867 0.000 0.220 0.000 0.684 0.000 0.096
#> SRR1974833 2 0.3325 0.7648 0.000 0.820 0.000 0.084 0.000 0.096
#> SRR1974831 4 0.5527 -0.0117 0.000 0.408 0.000 0.460 0.000 0.132
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 5 0.5106 0.6877 0.220 0.048 0.000 0.000 0.672 0.060
#> SRR1974828 5 0.4852 0.3246 0.420 0.004 0.000 0.000 0.528 0.048
#> SRR1974826 4 0.3149 0.8261 0.000 0.036 0.000 0.852 0.028 0.084
#> SRR1974827 2 0.5135 0.6103 0.000 0.608 0.000 0.260 0.000 0.132
#> SRR1974824 5 0.2520 0.8009 0.152 0.000 0.000 0.000 0.844 0.004
#> SRR1974825 1 0.3309 0.6304 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1974822 5 0.2144 0.8284 0.048 0.004 0.000 0.000 0.908 0.040
#> SRR1974823 5 0.1349 0.8306 0.004 0.000 0.000 0.000 0.940 0.056
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0291 0.9099 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.5616 0.7220 0.140 0.116 0.000 0.004 0.668 0.072
#> SRR1974815 1 0.1219 0.8885 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1049 0.8544 0.000 0.008 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR1974812 5 0.7408 0.5711 0.088 0.144 0.000 0.092 0.532 0.144
#> SRR1974810 5 0.3332 0.7884 0.144 0.000 0.000 0.000 0.808 0.048
#> SRR1974808 5 0.1753 0.8227 0.000 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1974811 5 0.3974 0.6398 0.296 0.000 0.000 0.000 0.680 0.024
#> SRR1974809 1 0.1531 0.8739 0.928 0.000 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1974807 5 0.3727 0.7570 0.188 0.004 0.000 0.000 0.768 0.040
#> SRR1974806 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974805 4 0.5535 -0.1299 0.000 0.432 0.000 0.436 0.000 0.132
#> SRR1974804 5 0.7388 0.5649 0.072 0.144 0.000 0.108 0.532 0.144
#> SRR1974803 5 0.3869 0.7554 0.184 0.008 0.000 0.000 0.764 0.044
#> SRR1974801 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974800 5 0.2743 0.7868 0.164 0.000 0.000 0.000 0.828 0.008
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.4809 0.6864 0.000 0.664 0.000 0.208 0.000 0.128
#> SRR1974796 2 0.4972 0.6330 0.000 0.628 0.000 0.256 0.000 0.116
#> SRR1974795 2 0.4972 0.6318 0.000 0.628 0.000 0.256 0.000 0.116
#> SRR1974793 5 0.5660 0.4250 0.364 0.072 0.000 0.000 0.528 0.036
#> SRR1974794 2 0.4107 0.6198 0.000 0.684 0.000 0.280 0.000 0.036
#> SRR1974792 2 0.4745 0.6927 0.000 0.672 0.000 0.204 0.000 0.124
#> SRR1974791 2 0.4834 0.6734 0.000 0.656 0.000 0.224 0.000 0.120
#> SRR1974790 2 0.5190 0.5899 0.000 0.596 0.000 0.272 0.000 0.132
#> SRR1974789 2 0.1866 0.8348 0.000 0.908 0.000 0.084 0.000 0.008
#> SRR1974788 2 0.1812 0.8325 0.000 0.912 0.000 0.080 0.000 0.008
#> SRR1974786 5 0.3802 0.6119 0.312 0.000 0.000 0.000 0.676 0.012
#> SRR1974787 5 0.2191 0.8110 0.120 0.000 0.000 0.000 0.876 0.004
#> SRR1974784 2 0.4746 0.6842 0.000 0.668 0.000 0.216 0.000 0.116
#> SRR1974783 1 0.4045 0.1501 0.564 0.000 0.000 0.000 0.428 0.008
#> SRR1974785 5 0.2692 0.7944 0.148 0.000 0.000 0.000 0.840 0.012
#> SRR1974782 1 0.3420 0.7186 0.776 0.012 0.000 0.000 0.204 0.008
#> SRR1974781 2 0.5065 0.6165 0.000 0.616 0.000 0.260 0.000 0.124
#> SRR1974780 5 0.2673 0.8039 0.132 0.004 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1974779 1 0.0291 0.9094 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974777 1 0.3420 0.7258 0.776 0.000 0.008 0.000 0.204 0.012
#> SRR1974776 5 0.2500 0.8147 0.116 0.004 0.000 0.000 0.868 0.012
#> SRR1974778 1 0.2883 0.7338 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1974774 2 0.1700 0.8333 0.000 0.916 0.000 0.080 0.000 0.004
#> SRR1974773 1 0.3707 0.5283 0.680 0.000 0.000 0.000 0.312 0.008
#> SRR1974775 1 0.0603 0.9043 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974772 5 0.5175 0.6820 0.224 0.068 0.000 0.000 0.664 0.044
#> SRR1974771 2 0.3168 0.8096 0.000 0.828 0.000 0.116 0.000 0.056
#> SRR1974770 2 0.1663 0.8348 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1974769 4 0.5034 0.5148 0.000 0.240 0.000 0.628 0.000 0.132
#> SRR1974768 2 0.1918 0.8344 0.000 0.904 0.000 0.088 0.000 0.008
#> SRR1974767 5 0.1434 0.8329 0.048 0.000 0.000 0.000 0.940 0.012
#> SRR1974766 2 0.1753 0.8349 0.000 0.912 0.000 0.084 0.000 0.004
#> SRR1974765 4 0.4552 0.6425 0.000 0.172 0.000 0.700 0.000 0.128
#> SRR1974764 2 0.1701 0.8310 0.000 0.920 0.000 0.072 0.000 0.008
#> SRR1974763 1 0.2121 0.8479 0.892 0.000 0.000 0.000 0.096 0.012
#> SRR1974762 1 0.3109 0.7029 0.772 0.000 0.000 0.000 0.224 0.004
#> SRR1974761 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.4977 0.6414 0.000 0.636 0.000 0.236 0.000 0.128
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2358 0.8254 0.000 0.876 0.000 0.108 0.000 0.016
#> SRR1974757 2 0.4668 0.6998 0.000 0.680 0.000 0.204 0.000 0.116
#> SRR1974756 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974754 4 0.0405 0.8590 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974755 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974753 4 0.1367 0.8547 0.000 0.012 0.000 0.944 0.000 0.044
#> SRR1974751 4 0.0547 0.8565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974750 4 0.0547 0.8565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974752 1 0.0547 0.9055 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974749 5 0.5398 0.7536 0.096 0.084 0.000 0.040 0.720 0.060
#> SRR1974747 5 0.5002 0.6806 0.232 0.040 0.000 0.000 0.672 0.056
#> SRR1974748 1 0.1471 0.8789 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1974746 5 0.4904 0.4759 0.364 0.016 0.000 0.000 0.580 0.040
#> SRR1974744 4 0.1049 0.8565 0.000 0.008 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR1974745 4 0.0291 0.8583 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974743 4 0.0291 0.8583 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974742 5 0.4376 0.6813 0.248 0.004 0.000 0.000 0.692 0.056
#> SRR1974740 4 0.1643 0.8461 0.000 0.008 0.000 0.924 0.000 0.068
#> SRR1974739 4 0.0291 0.8583 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974741 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974738 4 0.3520 0.7738 0.000 0.016 0.000 0.820 0.108 0.056
#> SRR1974737 4 0.0260 0.8584 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974736 4 0.0291 0.8583 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974735 1 0.3210 0.7674 0.804 0.000 0.000 0.000 0.168 0.028
#> SRR1974734 5 0.1769 0.8309 0.000 0.004 0.000 0.012 0.924 0.060
#> SRR1974733 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974732 4 0.2747 0.8347 0.000 0.020 0.000 0.868 0.016 0.096
#> SRR1974731 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974729 5 0.4815 0.3937 0.396 0.004 0.000 0.000 0.552 0.048
#> SRR1974730 1 0.1858 0.8627 0.904 0.000 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1974728 4 0.0717 0.8582 0.000 0.008 0.000 0.976 0.000 0.016
#> SRR1974725 5 0.1542 0.8323 0.008 0.000 0.000 0.004 0.936 0.052
#> SRR1974726 4 0.0291 0.8583 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974724 1 0.3841 0.6390 0.724 0.000 0.000 0.000 0.244 0.032
#> SRR1974727 5 0.1753 0.8227 0.000 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1974723 4 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974722 4 0.5651 0.3683 0.004 0.020 0.000 0.544 0.344 0.088
#> SRR1974721 4 0.1812 0.8407 0.000 0.008 0.000 0.912 0.000 0.080
#> SRR1974720 5 0.3297 0.7652 0.000 0.000 0.000 0.112 0.820 0.068
#> SRR1974719 1 0.3217 0.7079 0.768 0.000 0.000 0.000 0.224 0.008
#> SRR1974718 1 0.0692 0.9046 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974716 5 0.1226 0.8321 0.000 0.004 0.000 0.004 0.952 0.040
#> SRR1974717 4 0.0972 0.8567 0.000 0.008 0.000 0.964 0.000 0.028
#> SRR1974715 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974713 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974714 5 0.1644 0.8251 0.000 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1974711 5 0.1082 0.8303 0.000 0.004 0.000 0.000 0.956 0.040
#> SRR1974712 1 0.0260 0.9091 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974710 5 0.1588 0.8261 0.000 0.004 0.000 0.000 0.924 0.072
#> SRR1974707 5 0.1888 0.8302 0.012 0.004 0.000 0.000 0.916 0.068
#> SRR1974706 1 0.0405 0.9080 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1265 0.8533 0.000 0.008 0.000 0.948 0.000 0.044
#> SRR1974702 5 0.6332 0.4536 0.028 0.112 0.220 0.000 0.592 0.048
#> SRR1974701 4 0.0260 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974699 4 0.1333 0.8526 0.000 0.008 0.000 0.944 0.000 0.048
#> SRR1974698 4 0.0291 0.8591 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974700 1 0.1003 0.8991 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1974697 5 0.1297 0.8339 0.012 0.000 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1974696 5 0.1946 0.8296 0.000 0.004 0.000 0.012 0.912 0.072
#> SRR1974694 5 0.4871 0.6731 0.244 0.028 0.000 0.000 0.672 0.056
#> SRR1974695 5 0.1753 0.8228 0.000 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1974693 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974692 4 0.0291 0.8589 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974690 2 0.5341 0.5012 0.000 0.556 0.000 0.312 0.000 0.132
#> SRR1974691 5 0.4765 0.5034 0.352 0.004 0.000 0.000 0.592 0.052
#> SRR1974689 4 0.0260 0.8591 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.8588 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 5 0.4574 0.6417 0.276 0.008 0.000 0.000 0.664 0.052
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 5 0.4075 0.6983 0.240 0.000 0.000 0.000 0.712 0.048
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 5 0.5391 0.7148 0.172 0.072 0.000 0.004 0.680 0.072
#> SRR1974682 4 0.4128 0.7669 0.000 0.064 0.000 0.788 0.048 0.100
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1950 0.8494 0.000 0.024 0.000 0.912 0.000 0.064
#> SRR1974680 1 0.2553 0.8036 0.848 0.000 0.000 0.000 0.144 0.008
#> SRR1974678 4 0.0935 0.8531 0.000 0.004 0.000 0.964 0.000 0.032
#> SRR1974677 1 0.0291 0.9092 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974676 2 0.1556 0.8340 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974675 6 0.4004 0.8001 0.000 0.012 0.368 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 5 0.2001 0.8198 0.000 0.004 0.000 0.004 0.900 0.092
#> SRR1974671 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974672 4 0.1967 0.8402 0.000 0.012 0.000 0.904 0.000 0.084
#> SRR1974670 4 0.2724 0.8370 0.000 0.052 0.000 0.864 0.000 0.084
#> SRR1974669 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974664 4 0.2846 0.8342 0.000 0.060 0.000 0.856 0.000 0.084
#> SRR1974665 2 0.2121 0.8332 0.000 0.892 0.000 0.096 0.000 0.012
#> SRR1974663 5 0.1908 0.8213 0.096 0.000 0.000 0.000 0.900 0.004
#> SRR1974662 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974661 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974660 1 0.3528 0.5854 0.700 0.000 0.000 0.000 0.296 0.004
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.1714 0.8253 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908 0.000
#> SRR1974654 1 0.0291 0.9103 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974655 5 0.1610 0.8272 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974656 5 0.1588 0.8262 0.000 0.004 0.000 0.000 0.924 0.072
#> SRR1974650 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974651 4 0.0405 0.8594 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974652 5 0.2362 0.8025 0.136 0.000 0.000 0.000 0.860 0.004
#> SRR1974653 4 0.0146 0.8583 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974648 5 0.1168 0.8345 0.028 0.000 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1974646 5 0.1644 0.8249 0.000 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1584 0.8472 0.000 0.008 0.000 0.928 0.000 0.064
#> SRR1974645 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974644 2 0.1556 0.8337 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.2520 0.8051 0.844 0.000 0.000 0.000 0.152 0.004
#> SRR1974642 5 0.1644 0.8251 0.000 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1974640 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974641 4 0.1913 0.8393 0.000 0.012 0.000 0.908 0.000 0.080
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.2814 0.7769 0.820 0.000 0.000 0.000 0.172 0.008
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0806 0.8582 0.000 0.008 0.000 0.972 0.000 0.020
#> SRR1974633 5 0.1082 0.8345 0.040 0.000 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974630 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974627 1 0.3807 0.4177 0.628 0.000 0.000 0.000 0.368 0.004
#> SRR1974624 1 0.0146 0.9104 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974625 2 0.5868 0.5816 0.000 0.580 0.008 0.196 0.012 0.204
#> SRR1974623 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974622 5 0.1788 0.8266 0.004 0.004 0.000 0.000 0.916 0.076
#> SRR1974620 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974619 5 0.1753 0.8227 0.000 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 5 0.3345 0.7585 0.204 0.000 0.000 0.000 0.776 0.020
#> SRR1974616 5 0.7871 0.3341 0.092 0.288 0.000 0.084 0.412 0.124
#> SRR1974615 1 0.2597 0.7804 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974618 5 0.5073 0.4642 0.368 0.036 0.000 0.000 0.568 0.028
#> SRR1974614 5 0.1616 0.8336 0.048 0.000 0.000 0.000 0.932 0.020
#> SRR1974613 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974612 1 0.2092 0.8393 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974611 5 0.1588 0.8260 0.000 0.004 0.000 0.000 0.924 0.072
#> SRR1974610 4 0.0458 0.8592 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974609 1 0.2402 0.8188 0.856 0.000 0.000 0.000 0.140 0.004
#> SRR1974608 5 0.1429 0.8323 0.004 0.000 0.000 0.004 0.940 0.052
#> SRR1974607 5 0.2389 0.8057 0.128 0.000 0.000 0.000 0.864 0.008
#> SRR1974606 2 0.2121 0.8332 0.000 0.892 0.000 0.096 0.000 0.012
#> SRR1974605 5 0.1285 0.8322 0.004 0.000 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1974604 4 0.0405 0.8591 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1974603 5 0.2373 0.8277 0.084 0.004 0.000 0.000 0.888 0.024
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.2888 0.8382 0.000 0.056 0.000 0.852 0.000 0.092
#> SRR1974601 5 0.1806 0.8214 0.000 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1974599 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.2361 0.8321 0.000 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1974594 4 0.3265 0.8254 0.000 0.056 0.000 0.828 0.004 0.112
#> SRR1974593 4 0.2846 0.8345 0.000 0.060 0.000 0.856 0.000 0.084
#> SRR1974595 4 0.5421 0.2605 0.000 0.340 0.000 0.528 0.000 0.132
#> SRR1974592 2 0.2912 0.7758 0.000 0.816 0.000 0.172 0.000 0.012
#> SRR1974591 2 0.1610 0.8351 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1974588 4 0.1867 0.8542 0.000 0.020 0.000 0.916 0.000 0.064
#> SRR1974590 4 0.3159 0.8168 0.000 0.100 0.000 0.832 0.000 0.068
#> SRR1974589 4 0.1633 0.8576 0.000 0.024 0.000 0.932 0.000 0.044
#> SRR1974587 4 0.1913 0.8419 0.000 0.012 0.000 0.908 0.000 0.080
#> SRR1974586 4 0.2527 0.8408 0.000 0.040 0.000 0.876 0.000 0.084
#> SRR1974585 4 0.3206 0.8157 0.000 0.068 0.000 0.828 0.000 0.104
#> SRR1974584 5 0.4535 0.1514 0.484 0.000 0.000 0.000 0.484 0.032
#> SRR1974583 4 0.3464 0.8104 0.000 0.108 0.000 0.808 0.000 0.084
#> SRR1974582 2 0.1806 0.8344 0.000 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR1974581 2 0.2662 0.8166 0.000 0.856 0.000 0.120 0.000 0.024
#> SRR1974580 4 0.2688 0.8298 0.000 0.064 0.000 0.868 0.000 0.068
#> SRR1974578 4 0.2350 0.8500 0.000 0.036 0.000 0.888 0.000 0.076
#> SRR1974577 2 0.6629 0.3767 0.032 0.524 0.000 0.096 0.296 0.052
#> SRR1974579 4 0.2956 0.8308 0.000 0.064 0.000 0.848 0.000 0.088
#> SRR1974576 4 0.3118 0.8296 0.000 0.072 0.000 0.836 0.000 0.092
#> SRR1974575 2 0.2662 0.8187 0.000 0.856 0.000 0.120 0.000 0.024
#> SRR1974574 4 0.4845 0.5766 0.000 0.208 0.000 0.660 0.000 0.132
#> SRR1974573 4 0.4318 0.6823 0.000 0.140 0.000 0.728 0.000 0.132
#> SRR1974571 4 0.4896 0.5636 0.000 0.216 0.000 0.652 0.000 0.132
#> SRR1974572 4 0.4390 0.6729 0.000 0.148 0.000 0.720 0.000 0.132
#> SRR1974570 5 0.1524 0.8311 0.060 0.000 0.000 0.000 0.932 0.008
#> SRR1974568 5 0.1480 0.8340 0.020 0.000 0.000 0.000 0.940 0.040
#> SRR1974567 5 0.3999 0.6667 0.272 0.000 0.000 0.000 0.696 0.032
#> SRR1974566 4 0.4680 0.6197 0.000 0.184 0.000 0.684 0.000 0.132
#> SRR1974569 4 0.4558 0.6441 0.000 0.168 0.000 0.700 0.000 0.132
#> SRR1974565 4 0.3268 0.8185 0.000 0.076 0.000 0.824 0.000 0.100
#> SRR1974564 2 0.5366 0.4911 0.000 0.548 0.000 0.320 0.000 0.132
#> SRR1974560 5 0.0937 0.8321 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974559 5 0.3514 0.8087 0.080 0.040 0.000 0.000 0.832 0.048
#> SRR1974563 4 0.3321 0.7748 0.000 0.080 0.000 0.820 0.000 0.100
#> SRR1974562 4 0.5472 0.1419 0.000 0.364 0.000 0.504 0.000 0.132
#> SRR1974561 4 0.4920 0.5536 0.000 0.220 0.000 0.648 0.000 0.132
#> SRR1974557 4 0.2094 0.8431 0.000 0.020 0.000 0.900 0.000 0.080
#> SRR1974553 4 0.4316 0.6806 0.000 0.144 0.000 0.728 0.000 0.128
#> SRR1974555 5 0.4997 0.6102 0.292 0.028 0.000 0.000 0.632 0.048
#> SRR1974551 5 0.5844 0.7222 0.108 0.072 0.000 0.036 0.680 0.104
#> SRR1974552 4 0.5207 0.4366 0.000 0.276 0.000 0.592 0.000 0.132
#> SRR1974554 5 0.1644 0.8276 0.000 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1974558 5 0.3156 0.7719 0.180 0.000 0.000 0.000 0.800 0.020
#> SRR1974556 5 0.2901 0.8034 0.128 0.000 0.000 0.000 0.840 0.032
#> SRR1974550 5 0.1349 0.8284 0.000 0.004 0.000 0.000 0.940 0.056
#> SRR1974549 4 0.4783 0.5897 0.000 0.204 0.000 0.668 0.000 0.128
#> SRR1974548 4 0.1745 0.8471 0.000 0.012 0.000 0.920 0.000 0.068
#> SRR1974547 5 0.1411 0.8312 0.004 0.000 0.000 0.000 0.936 0.060
#> SRR1974546 5 0.1644 0.8253 0.000 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1974545 4 0.5029 0.4889 0.000 0.260 0.000 0.620 0.000 0.120
#> SRR1974544 5 0.2915 0.7676 0.184 0.000 0.000 0.000 0.808 0.008
#> SRR1974543 4 0.4421 0.6652 0.000 0.156 0.000 0.716 0.000 0.128
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.478 0.762 0.886 0.4846 0.518 0.518
#> 3 3 0.890 0.885 0.950 0.3731 0.709 0.490
#> 4 4 0.885 0.880 0.935 0.0989 0.895 0.703
#> 5 5 0.908 0.852 0.937 0.0358 0.927 0.751
#> 6 6 0.869 0.792 0.902 0.0483 0.928 0.727
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974998 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974994 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974990 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.5519 0.7940 0.128 0.872
#> SRR1974991 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974986 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974985 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974982 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974981 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974980 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974977 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974965 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974955 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974944 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974942 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974941 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974940 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974936 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974935 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974930 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974929 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974924 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974925 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974926 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974923 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974922 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974920 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974919 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974916 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974915 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.1633 0.8829 0.024 0.976
#> SRR1974913 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974911 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974910 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974904 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0376 0.8970 0.004 0.996
#> SRR1974893 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0376 0.8970 0.004 0.996
#> SRR1974889 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.9248 0.5182 0.340 0.660
#> SRR1974887 2 0.6531 0.7534 0.168 0.832
#> SRR1974885 2 0.1633 0.8829 0.024 0.976
#> SRR1974883 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.5408 0.7977 0.124 0.876
#> SRR1974882 2 0.7056 0.7283 0.192 0.808
#> SRR1974880 2 0.7139 0.7225 0.196 0.804
#> SRR1974879 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.5737 0.7861 0.136 0.864
#> SRR1974878 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.1414 0.8857 0.020 0.980
#> SRR1974874 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974873 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974871 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974872 2 0.0376 0.8967 0.004 0.996
#> SRR1974869 1 0.2948 0.8303 0.948 0.052
#> SRR1974868 2 0.8327 0.6378 0.264 0.736
#> SRR1974870 1 0.9491 0.5849 0.632 0.368
#> SRR1974866 1 0.4298 0.8192 0.912 0.088
#> SRR1974867 1 0.9896 0.4446 0.560 0.440
#> SRR1974865 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.9129 0.6402 0.672 0.328
#> SRR1974862 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974863 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.4815 0.8165 0.104 0.896
#> SRR1974861 2 0.8207 0.6483 0.256 0.744
#> SRR1974859 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974858 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974856 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974857 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.9996 0.0991 0.488 0.512
#> SRR1974854 1 0.8386 0.7056 0.732 0.268
#> SRR1974853 1 0.9427 0.5958 0.640 0.360
#> SRR1974851 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974852 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.9170 0.6365 0.668 0.332
#> SRR1974848 1 0.9044 0.6498 0.680 0.320
#> SRR1974850 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974846 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.9129 0.6410 0.672 0.328
#> SRR1974845 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.9933 0.4150 0.548 0.452
#> SRR1974843 2 0.9129 0.3619 0.328 0.672
#> SRR1974842 1 0.9754 0.5143 0.592 0.408
#> SRR1974841 1 0.8909 0.6637 0.692 0.308
#> SRR1974840 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974839 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.9833 0.4820 0.576 0.424
#> SRR1974837 1 0.7528 0.7506 0.784 0.216
#> SRR1974835 1 0.9552 0.5706 0.624 0.376
#> SRR1974836 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974834 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974833 1 0.4815 0.7706 0.896 0.104
#> SRR1974831 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974832 2 1.0000 -0.2687 0.496 0.504
#> SRR1974830 1 0.9608 0.5587 0.616 0.384
#> SRR1974829 1 0.4431 0.8192 0.908 0.092
#> SRR1974828 1 0.5946 0.7962 0.856 0.144
#> SRR1974826 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974827 1 0.2043 0.8234 0.968 0.032
#> SRR1974824 1 0.8267 0.7131 0.740 0.260
#> SRR1974825 1 0.9460 0.5900 0.636 0.364
#> SRR1974822 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.6973 0.7687 0.812 0.188
#> SRR1974820 2 0.9963 -0.1559 0.464 0.536
#> SRR1974818 1 0.8955 0.6590 0.688 0.312
#> SRR1974819 2 0.8443 0.5061 0.272 0.728
#> SRR1974817 1 0.9954 0.3943 0.540 0.460
#> SRR1974816 1 0.9944 0.4069 0.544 0.456
#> SRR1974815 1 0.8327 0.7091 0.736 0.264
#> SRR1974813 2 0.9358 0.2840 0.352 0.648
#> SRR1974814 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.1414 0.8374 0.980 0.020
#> SRR1974808 1 0.6343 0.7858 0.840 0.160
#> SRR1974811 1 0.8327 0.7108 0.736 0.264
#> SRR1974809 2 0.6048 0.7387 0.148 0.852
#> SRR1974807 1 0.3879 0.8243 0.924 0.076
#> SRR1974806 1 0.9044 0.6498 0.680 0.320
#> SRR1974805 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.2603 0.8323 0.956 0.044
#> SRR1974801 1 0.9522 0.5770 0.628 0.372
#> SRR1974800 2 0.8267 0.5343 0.260 0.740
#> SRR1974799 1 0.9815 0.4908 0.580 0.420
#> SRR1974798 2 0.9286 0.5101 0.344 0.656
#> SRR1974797 1 0.1414 0.8298 0.980 0.020
#> SRR1974796 1 0.0938 0.8339 0.988 0.012
#> SRR1974795 1 0.0938 0.8344 0.988 0.012
#> SRR1974793 2 0.3274 0.8473 0.060 0.940
#> SRR1974794 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974792 1 0.8661 0.4893 0.712 0.288
#> SRR1974791 1 0.6623 0.6916 0.828 0.172
#> SRR1974790 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974789 1 0.9209 0.3779 0.664 0.336
#> SRR1974788 2 0.6973 0.7317 0.188 0.812
#> SRR1974786 2 0.9323 0.3074 0.348 0.652
#> SRR1974787 1 0.7453 0.7528 0.788 0.212
#> SRR1974784 1 0.8608 0.5010 0.716 0.284
#> SRR1974783 1 0.9881 0.4445 0.564 0.436
#> SRR1974785 2 0.6712 0.6972 0.176 0.824
#> SRR1974782 2 0.9833 0.0119 0.424 0.576
#> SRR1974781 1 0.2423 0.8191 0.960 0.040
#> SRR1974780 2 0.8499 0.5029 0.276 0.724
#> SRR1974779 1 0.9087 0.6476 0.676 0.324
#> SRR1974777 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974776 2 0.9977 -0.1740 0.472 0.528
#> SRR1974778 2 0.3733 0.8347 0.072 0.928
#> SRR1974774 2 0.6801 0.7406 0.180 0.820
#> SRR1974773 2 0.2236 0.8701 0.036 0.964
#> SRR1974775 1 0.9491 0.5837 0.632 0.368
#> SRR1974772 2 0.9795 0.0401 0.416 0.584
#> SRR1974771 1 0.8016 0.5804 0.756 0.244
#> SRR1974770 2 0.9087 0.5480 0.324 0.676
#> SRR1974769 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.7219 0.7177 0.200 0.800
#> SRR1974767 1 0.7674 0.7432 0.776 0.224
#> SRR1974766 2 0.8443 0.6262 0.272 0.728
#> SRR1974765 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.5842 0.7821 0.140 0.860
#> SRR1974763 1 0.9209 0.6303 0.664 0.336
#> SRR1974762 2 0.4562 0.8096 0.096 0.904
#> SRR1974761 2 0.8081 0.6592 0.248 0.752
#> SRR1974760 1 0.6438 0.6990 0.836 0.164
#> SRR1974759 1 0.9661 0.5435 0.608 0.392
#> SRR1974758 2 0.9933 0.2865 0.452 0.548
#> SRR1974757 1 0.8327 0.5393 0.736 0.264
#> SRR1974756 1 0.9732 0.5237 0.596 0.404
#> SRR1974754 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.8763 0.5895 0.296 0.704
#> SRR1974753 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974751 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974750 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974752 2 0.3733 0.8346 0.072 0.928
#> SRR1974749 1 0.4298 0.7841 0.912 0.088
#> SRR1974747 1 0.2423 0.8337 0.960 0.040
#> SRR1974748 1 0.9710 0.5289 0.600 0.400
#> SRR1974746 1 0.7056 0.7688 0.808 0.192
#> SRR1974744 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974745 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974743 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.5519 0.8042 0.872 0.128
#> SRR1974740 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974739 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974741 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974738 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974737 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974736 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.9460 0.5898 0.636 0.364
#> SRR1974734 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974733 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974731 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.8327 0.7102 0.736 0.264
#> SRR1974730 1 0.9881 0.4548 0.564 0.436
#> SRR1974728 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974726 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.8555 0.6938 0.720 0.280
#> SRR1974727 1 0.3114 0.8294 0.944 0.056
#> SRR1974723 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974722 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974721 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974720 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.9209 0.6297 0.664 0.336
#> SRR1974718 1 0.9795 0.4979 0.584 0.416
#> SRR1974716 1 0.0672 0.8389 0.992 0.008
#> SRR1974717 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974715 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974713 2 0.2778 0.8588 0.048 0.952
#> SRR1974714 1 0.6801 0.7740 0.820 0.180
#> SRR1974711 1 0.8608 0.6895 0.716 0.284
#> SRR1974712 1 0.9983 0.3483 0.524 0.476
#> SRR1974709 2 0.9963 -0.1563 0.464 0.536
#> SRR1974708 1 0.4690 0.8146 0.900 0.100
#> SRR1974710 1 0.8144 0.7202 0.748 0.252
#> SRR1974707 1 0.7299 0.7577 0.796 0.204
#> SRR1974706 1 0.9661 0.5434 0.608 0.392
#> SRR1974704 2 0.9580 0.1863 0.380 0.620
#> SRR1974705 1 0.9754 0.5149 0.592 0.408
#> SRR1974703 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974702 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974701 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974699 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974698 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.9000 0.6550 0.684 0.316
#> SRR1974697 1 0.0938 0.8383 0.988 0.012
#> SRR1974696 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0672 0.8388 0.992 0.008
#> SRR1974695 1 0.0938 0.8383 0.988 0.012
#> SRR1974693 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974692 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974690 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.6712 0.7784 0.824 0.176
#> SRR1974689 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974688 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.5408 0.8045 0.876 0.124
#> SRR1974686 1 0.9866 0.4635 0.568 0.432
#> SRR1974685 1 0.2423 0.8332 0.960 0.040
#> SRR1974684 1 0.9732 0.5213 0.596 0.404
#> SRR1974683 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.9833 0.4812 0.576 0.424
#> SRR1974679 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.9850 0.4722 0.572 0.428
#> SRR1974678 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.9286 0.6188 0.656 0.344
#> SRR1974676 2 0.8813 0.5841 0.300 0.700
#> SRR1974675 2 0.0000 0.8997 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.9323 0.6157 0.652 0.348
#> SRR1974673 1 0.4815 0.8130 0.896 0.104
#> SRR1974671 2 0.7453 0.7039 0.212 0.788
#> SRR1974672 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974670 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.7883 0.6751 0.236 0.764
#> SRR1974667 2 0.7815 0.6810 0.232 0.768
#> SRR1974668 2 0.6623 0.7490 0.172 0.828
#> SRR1974666 2 0.7883 0.6748 0.236 0.764
#> SRR1974664 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.9248 0.5184 0.340 0.660
#> SRR1974663 1 0.9044 0.6519 0.680 0.320
#> SRR1974662 1 0.9460 0.5896 0.636 0.364
#> SRR1974661 1 0.5408 0.8046 0.876 0.124
#> SRR1974660 1 0.8661 0.6854 0.712 0.288
#> SRR1974659 1 0.9909 0.4349 0.556 0.444
#> SRR1974658 1 0.9909 0.4349 0.556 0.444
#> SRR1974657 1 0.8499 0.6978 0.724 0.276
#> SRR1974654 1 0.9286 0.6194 0.656 0.344
#> SRR1974655 1 0.7528 0.7490 0.784 0.216
#> SRR1974656 1 0.7056 0.7659 0.808 0.192
#> SRR1974650 1 0.2043 0.8349 0.968 0.032
#> SRR1974651 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974652 2 0.9896 -0.0455 0.440 0.560
#> SRR1974653 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.7056 0.7660 0.808 0.192
#> SRR1974646 1 0.6712 0.7761 0.824 0.176
#> SRR1974649 1 0.9732 0.5218 0.596 0.404
#> SRR1974647 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.9661 0.5443 0.608 0.392
#> SRR1974644 2 0.7950 0.6698 0.240 0.760
#> SRR1974643 1 0.9248 0.6244 0.660 0.340
#> SRR1974642 1 0.7299 0.7577 0.796 0.204
#> SRR1974640 1 0.5059 0.8098 0.888 0.112
#> SRR1974641 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.9998 0.3003 0.508 0.492
#> SRR1974638 1 0.9248 0.6251 0.660 0.340
#> SRR1974635 1 0.9286 0.6190 0.656 0.344
#> SRR1974636 1 0.4562 0.8160 0.904 0.096
#> SRR1974634 1 0.9775 0.5059 0.588 0.412
#> SRR1974637 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.7056 0.7659 0.808 0.192
#> SRR1974632 1 0.9775 0.5065 0.588 0.412
#> SRR1974631 1 0.6531 0.7810 0.832 0.168
#> SRR1974630 1 0.9427 0.5958 0.640 0.360
#> SRR1974629 1 0.9815 0.4901 0.580 0.420
#> SRR1974628 1 0.9580 0.5651 0.620 0.380
#> SRR1974627 1 0.8813 0.6725 0.700 0.300
#> SRR1974624 1 0.9710 0.5293 0.600 0.400
#> SRR1974625 1 0.9635 0.3895 0.612 0.388
#> SRR1974623 1 0.3114 0.8294 0.944 0.056
#> SRR1974622 1 0.5842 0.7961 0.860 0.140
#> SRR1974620 1 0.2948 0.8302 0.948 0.052
#> SRR1974619 1 0.0376 0.8392 0.996 0.004
#> SRR1974621 1 0.9580 0.5642 0.620 0.380
#> SRR1974617 1 0.5294 0.8060 0.880 0.120
#> SRR1974616 1 0.0938 0.8373 0.988 0.012
#> SRR1974615 1 0.8267 0.7130 0.740 0.260
#> SRR1974618 2 0.8499 0.4968 0.276 0.724
#> SRR1974614 1 0.9710 0.5302 0.600 0.400
#> SRR1974613 1 0.5629 0.8003 0.868 0.132
#> SRR1974612 2 0.5629 0.7608 0.132 0.868
#> SRR1974611 1 0.4939 0.8113 0.892 0.108
#> SRR1974610 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.8555 0.6937 0.720 0.280
#> SRR1974608 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.7299 0.7577 0.796 0.204
#> SRR1974606 1 0.9129 0.4150 0.672 0.328
#> SRR1974605 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974604 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.6148 0.7927 0.848 0.152
#> SRR1974602 1 0.9686 0.5363 0.604 0.396
#> SRR1974600 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.2778 0.8317 0.952 0.048
#> SRR1974599 2 0.9881 0.3262 0.436 0.564
#> SRR1974598 2 0.9000 0.5592 0.316 0.684
#> SRR1974596 1 0.5842 0.7267 0.860 0.140
#> SRR1974594 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974593 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974595 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974592 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.9944 0.2755 0.456 0.544
#> SRR1974588 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974590 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974589 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974587 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974586 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974585 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.7219 0.7607 0.800 0.200
#> SRR1974583 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974582 1 0.9775 0.1555 0.588 0.412
#> SRR1974581 1 0.1843 0.8252 0.972 0.028
#> SRR1974580 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974578 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974577 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974579 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974576 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974575 1 0.3274 0.8039 0.940 0.060
#> SRR1974574 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974573 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974571 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974572 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.8016 0.7266 0.756 0.244
#> SRR1974568 1 0.2236 0.8340 0.964 0.036
#> SRR1974567 1 0.6801 0.7740 0.820 0.180
#> SRR1974566 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974569 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974565 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974564 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974560 1 0.0376 0.8392 0.996 0.004
#> SRR1974559 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974563 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974562 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974561 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974557 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974553 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.6623 0.7791 0.828 0.172
#> SRR1974551 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974552 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.6973 0.7689 0.812 0.188
#> SRR1974556 1 0.5059 0.8096 0.888 0.112
#> SRR1974550 1 0.0938 0.8383 0.988 0.012
#> SRR1974549 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974548 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.4161 0.8203 0.916 0.084
#> SRR1974546 1 0.2236 0.8341 0.964 0.036
#> SRR1974545 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.7453 0.7520 0.788 0.212
#> SRR1974543 1 0.0000 0.8396 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.1031 0.92522 0.024 0.000 0.976
#> SRR1975008 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0592 0.93155 0.012 0.000 0.988
#> SRR1975005 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.1289 0.92021 0.032 0.000 0.968
#> SRR1975003 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.2448 0.88728 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974998 3 0.2066 0.90015 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974997 3 0.0237 0.93353 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974995 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.1031 0.92520 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974994 1 0.6079 0.35536 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974993 3 0.0424 0.93309 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974992 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.1031 0.92522 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974989 3 0.3267 0.84321 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974991 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.1411 0.91799 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974987 3 0.0424 0.93313 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974988 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0592 0.93155 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974985 3 0.2448 0.88657 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974983 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.1860 0.90711 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974981 3 0.4750 0.72374 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974980 3 0.1031 0.92543 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974979 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974977 3 0.0747 0.92947 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974976 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974975 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0592 0.93155 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974970 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0592 0.93155 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974968 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0424 0.93307 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974965 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974966 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974961 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974954 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974953 3 0.4452 0.75795 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974952 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.0237 0.93342 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974945 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.1529 0.91494 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974942 3 0.5216 0.65483 0.260 0.000 0.740
#> SRR1974943 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974939 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.5098 0.67298 0.248 0.000 0.752
#> SRR1974936 3 0.0592 0.93167 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974935 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.2448 0.88700 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974930 3 0.6204 0.27339 0.424 0.000 0.576
#> SRR1974929 3 0.1163 0.92289 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974928 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.4504 0.75281 0.196 0.000 0.804
#> SRR1974925 3 0.1964 0.90338 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974926 3 0.0424 0.93307 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974923 3 0.2261 0.89399 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974922 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974921 3 0.1860 0.90674 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974920 3 0.2448 0.88645 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974919 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974918 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974917 3 0.2066 0.90072 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974916 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974915 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974914 3 0.1031 0.92295 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974913 3 0.1031 0.92528 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974911 3 0.2066 0.90145 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974910 3 0.1643 0.91233 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974908 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0592 0.93156 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974906 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974907 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974905 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974904 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.1031 0.92521 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974902 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0237 0.93435 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974898 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.2066 0.89628 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974893 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0237 0.93342 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974894 3 0.0892 0.92544 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974892 3 0.0892 0.92504 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974890 3 0.1643 0.90872 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974891 3 0.1289 0.91737 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974889 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.0237 0.93342 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974886 2 0.6140 0.31617 0.000 0.596 0.404
#> SRR1974887 3 0.5138 0.66585 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974885 3 0.1643 0.90895 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974883 3 0.0424 0.93161 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974884 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 3 0.3192 0.84824 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974882 3 0.5216 0.65282 0.000 0.260 0.740
#> SRR1974880 3 0.5560 0.58180 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974879 3 0.0237 0.93349 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974877 3 0.0000 0.93490 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974876 3 0.3267 0.84345 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974878 3 0.0424 0.93161 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974875 3 0.2537 0.87925 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974874 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974872 1 0.1753 0.93527 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974869 1 0.1753 0.93869 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974868 3 0.6008 0.42312 0.000 0.372 0.628
#> SRR1974870 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.1289 0.95227 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0747 0.92048 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 3 0.3482 0.83086 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974861 3 0.6252 0.21320 0.000 0.444 0.556
#> SRR1974859 2 0.0747 0.92048 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974858 2 0.1163 0.91475 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974856 2 0.0592 0.92192 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974857 2 0.0892 0.91864 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974855 2 0.6489 0.15198 0.004 0.540 0.456
#> SRR1974854 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.1411 0.90940 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974846 2 0.1163 0.91457 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0237 0.92191 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974844 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0424 0.96959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974842 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0237 0.92191 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 2 0.1289 0.90837 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974831 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0237 0.97220 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974830 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1411 0.90977 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974827 2 0.0892 0.91488 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974824 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.1753 0.93830 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974823 1 0.0237 0.97248 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0424 0.96959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974817 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1163 0.95398 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974815 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0237 0.97220 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974814 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 2 0.1031 0.91658 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974810 1 0.0424 0.97042 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0592 0.96701 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974807 1 0.0592 0.96809 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974804 2 0.2356 0.87984 0.072 0.928 0.000
#> SRR1974803 1 0.0747 0.96493 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0237 0.97220 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.6302 0.06438 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974797 2 0.1031 0.91293 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974796 2 0.1031 0.91292 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974795 2 0.0592 0.91906 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974793 1 0.1753 0.93582 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974794 2 0.0747 0.91687 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974792 2 0.2796 0.85797 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974791 2 0.1643 0.89955 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974790 2 0.0747 0.91687 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974789 2 0.2711 0.86211 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974788 3 0.4887 0.70273 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974786 1 0.0237 0.97220 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974787 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.2448 0.87360 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974783 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0747 0.96415 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974782 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1163 0.91052 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974780 1 0.0592 0.96731 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974779 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.2066 0.92301 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974776 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0747 0.96406 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974774 3 0.5465 0.60428 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974773 1 0.1529 0.94299 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974775 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.1031 0.95756 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974771 2 0.2448 0.87318 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974770 2 0.5948 0.42969 0.000 0.640 0.360
#> SRR1974769 2 0.0237 0.92191 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974768 3 0.5706 0.54155 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974767 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.6260 0.18061 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974765 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 3 0.5529 0.58929 0.000 0.296 0.704
#> SRR1974763 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0747 0.96384 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974761 2 0.6309 0.00191 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974760 2 0.1163 0.91052 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974759 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.5835 0.47384 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974757 2 0.2537 0.86985 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974756 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0892 0.91878 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974755 2 0.6308 0.01676 0.000 0.508 0.492
#> SRR1974753 2 0.1289 0.91243 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974751 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974750 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974752 1 0.0592 0.96707 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974749 2 0.5377 0.79744 0.068 0.820 0.112
#> SRR1974747 1 0.0592 0.96773 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974745 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974743 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.1529 0.90651 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974739 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974741 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974738 2 0.1860 0.89732 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974737 2 0.0592 0.92190 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974736 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.6305 0.06521 0.516 0.484 0.000
#> SRR1974733 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974732 2 0.1643 0.90350 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974731 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.1964 0.89397 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974725 2 0.6204 0.25338 0.424 0.576 0.000
#> SRR1974726 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0237 0.97248 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974723 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974722 2 0.5216 0.64084 0.260 0.740 0.000
#> SRR1974721 2 0.0892 0.91871 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974720 2 0.4178 0.77095 0.172 0.828 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.3267 0.86532 0.884 0.116 0.000
#> SRR1974717 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974715 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974713 1 0.1163 0.95392 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974714 1 0.0747 0.96512 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0237 0.97222 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974708 1 0.0592 0.96777 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0424 0.96959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974705 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.3116 0.86947 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974701 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974699 2 0.1163 0.91460 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974698 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.4452 0.76460 0.808 0.192 0.000
#> SRR1974696 2 0.5216 0.63593 0.260 0.740 0.000
#> SRR1974694 1 0.0237 0.97259 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974695 1 0.4002 0.81008 0.840 0.160 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.1163 0.91457 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974690 2 0.0592 0.91879 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974691 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.1289 0.91220 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974688 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974687 1 0.0592 0.96773 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0592 0.96773 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.4605 0.73097 0.204 0.796 0.000
#> SRR1974682 2 0.2261 0.88348 0.068 0.932 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.1529 0.90651 0.040 0.960 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.6260 0.18012 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974675 3 0.2448 0.88698 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974674 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.3879 0.81969 0.848 0.152 0.000
#> SRR1974671 3 0.5733 0.53309 0.000 0.324 0.676
#> SRR1974672 2 0.1289 0.91213 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974670 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974669 3 0.5859 0.48849 0.000 0.344 0.656
#> SRR1974667 3 0.6180 0.29961 0.000 0.416 0.584
#> SRR1974668 3 0.4931 0.69663 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974666 3 0.6008 0.42200 0.000 0.372 0.628
#> SRR1974664 2 0.1753 0.90040 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974665 2 0.6095 0.34613 0.000 0.608 0.392
#> SRR1974663 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.2959 0.88452 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0237 0.97248 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974650 1 0.0424 0.97028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974651 2 0.1031 0.91675 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974652 1 0.0237 0.97220 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974653 2 0.0424 0.92277 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974648 1 0.0424 0.97028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0747 0.92036 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 3 0.6295 0.11349 0.000 0.472 0.528
#> SRR1974643 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.1163 0.95587 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974641 2 0.1860 0.89725 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974639 1 0.0424 0.96959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974638 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0424 0.97028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0237 0.97248 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 1 0.7319 0.65933 0.708 0.164 0.128
#> SRR1974623 1 0.1163 0.95559 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974622 1 0.0237 0.97248 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974620 1 0.0424 0.97028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974619 1 0.1643 0.94190 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.6308 0.05346 0.492 0.508 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0592 0.96689 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974614 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0424 0.97028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974612 1 0.0424 0.96959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974611 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.6079 0.35943 0.388 0.612 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.2625 0.86650 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974605 1 0.5905 0.46237 0.648 0.352 0.000
#> SRR1974604 2 0.1031 0.91672 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 1 0.0424 0.97033 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974599 2 0.5810 0.48529 0.000 0.664 0.336
#> SRR1974598 2 0.6302 0.06443 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974596 2 0.1163 0.91051 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974594 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0237 0.92322 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974595 2 0.0424 0.92079 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974592 2 0.1031 0.91292 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974591 2 0.4399 0.74250 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974588 2 0.0424 0.92266 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974590 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0592 0.92178 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.2537 0.86974 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974581 2 0.1163 0.91045 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974580 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.5621 0.53855 0.308 0.692 0.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.1163 0.91051 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974574 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.2878 0.88857 0.904 0.096 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0237 0.92191 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974560 1 0.1031 0.95880 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974559 1 0.5859 0.48230 0.656 0.344 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.1289 0.91238 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0237 0.97259 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974551 2 0.4121 0.77603 0.168 0.832 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 1 0.1411 0.94892 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.6095 0.36145 0.608 0.392 0.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.0237 0.92317 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974547 1 0.1529 0.94556 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974546 1 0.0892 0.96206 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.97447 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.92308 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975005 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975004 3 0.0188 0.9827 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0469 0.9794 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.3933 0.7285 0.792 0.008 0.200 0.000
#> SRR1974993 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 3 0.4999 0.1425 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0336 0.9796 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1743 0.9374 0.004 0.056 0.940 0.000
#> SRR1974984 3 0.0469 0.9779 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974985 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974983 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974982 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974981 3 0.0895 0.9653 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974964 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0376 0.9799 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974952 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974949 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974950 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974951 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974947 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974948 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0336 0.9796 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974942 3 0.0895 0.9635 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0376 0.9799 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974930 3 0.0779 0.9678 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974924 3 0.0657 0.9720 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1974925 3 0.0188 0.9829 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974926 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974923 3 0.0376 0.9799 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0524 0.9764 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.1118 0.9569 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0376 0.9801 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1974910 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974899 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.0707 0.9714 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.0336 0.9815 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974892 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974890 3 0.1389 0.9451 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974891 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974886 2 0.7502 0.3988 0.000 0.456 0.356 0.188
#> SRR1974887 2 0.3908 0.6571 0.000 0.784 0.212 0.004
#> SRR1974885 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974883 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.4040 0.6979 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1974882 3 0.1938 0.9262 0.000 0.012 0.936 0.052
#> SRR1974880 3 0.3557 0.8292 0.000 0.036 0.856 0.108
#> SRR1974879 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.9852 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974876 3 0.4830 0.4245 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1974878 3 0.0188 0.9840 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974875 3 0.2647 0.8663 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1974874 4 0.0188 0.8817 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974873 4 0.2216 0.8108 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1974871 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.0657 0.9555 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974869 4 0.5260 0.2776 0.424 0.004 0.004 0.568
#> SRR1974868 2 0.0817 0.8094 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974870 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974866 4 0.5097 0.2642 0.428 0.004 0.000 0.568
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974863 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.1940 0.7721 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974861 2 0.1510 0.8093 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1974859 4 0.0469 0.8804 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974858 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974856 4 0.0592 0.8790 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974857 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.3245 0.7731 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.4250 0.7690 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974852 2 0.4134 0.7824 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1974849 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.1474 0.8542 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974846 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.2760 0.8266 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974844 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0469 0.9569 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1637 0.8450 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974839 2 0.3873 0.8009 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.4103 0.7848 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1974834 2 0.3873 0.8008 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974833 2 0.1211 0.8255 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974831 2 0.3528 0.8151 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.2973 0.8430 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0376 0.9583 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974826 4 0.0895 0.8753 0.004 0.020 0.000 0.976
#> SRR1974827 2 0.1302 0.8263 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974824 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974825 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974823 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974820 1 0.0336 0.9582 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0336 0.9582 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.5985 0.5699 0.652 0.288 0.008 0.052
#> SRR1974815 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0469 0.9570 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.4998 0.3715 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1974812 2 0.2675 0.8290 0.008 0.892 0.000 0.100
#> SRR1974810 1 0.3205 0.8624 0.872 0.024 0.000 0.104
#> SRR1974808 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974811 1 0.0672 0.9557 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1974809 1 0.0817 0.9515 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.1109 0.9486 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.3726 0.8079 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974804 4 0.3400 0.6908 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1974803 1 0.1209 0.9441 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0707 0.9534 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1520 0.8167 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1974797 2 0.3975 0.7944 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1974796 2 0.2216 0.8292 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974795 2 0.2216 0.8290 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974793 1 0.4576 0.6790 0.728 0.260 0.012 0.000
#> SRR1974794 2 0.2814 0.8260 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974792 2 0.3764 0.8065 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1974791 2 0.1743 0.8280 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR1974790 2 0.4008 0.7922 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1974789 2 0.3942 0.8008 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1974788 2 0.2216 0.7621 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1974786 1 0.1211 0.9412 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0469 0.9570 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.1557 0.8275 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974783 1 0.0592 0.9553 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0336 0.9582 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0336 0.9582 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1118 0.8242 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974780 1 0.1661 0.9301 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0592 0.9555 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0469 0.9569 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1211 0.8017 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974773 1 0.0817 0.9513 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0336 0.9581 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974772 2 0.4500 0.4434 0.316 0.684 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1022 0.8208 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974770 2 0.0524 0.8134 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974769 2 0.3688 0.8099 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1974768 2 0.1985 0.7938 0.004 0.940 0.040 0.016
#> SRR1974767 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0336 0.8117 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974765 2 0.4304 0.7615 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974764 2 0.0817 0.8094 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974763 1 0.0188 0.9589 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0817 0.9511 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1510 0.8232 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR1974760 2 0.1211 0.8252 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0376 0.8108 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1974757 2 0.0817 0.8203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974756 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0188 0.8821 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974755 2 0.1082 0.8093 0.004 0.972 0.004 0.020
#> SRR1974753 4 0.0592 0.8805 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974751 4 0.0592 0.8788 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974750 4 0.0592 0.8790 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974752 1 0.0707 0.9535 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.3250 0.7845 0.016 0.892 0.040 0.052
#> SRR1974747 1 0.1798 0.9314 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1974748 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0524 0.9574 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974744 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0592 0.8790 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974743 4 0.0469 0.8807 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974742 1 0.1488 0.9400 0.956 0.032 0.000 0.012
#> SRR1974740 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974739 4 0.0188 0.8821 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974741 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974738 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0817 0.8748 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974736 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974735 1 0.0336 0.9582 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.3400 0.6988 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1974733 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0188 0.8817 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974731 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974729 1 0.0657 0.9559 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 4 0.2814 0.7488 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974726 4 0.0469 0.8804 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.1109 0.9447 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974723 4 0.0469 0.8807 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974722 4 0.4174 0.7101 0.140 0.044 0.000 0.816
#> SRR1974721 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974720 4 0.0592 0.8707 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974719 1 0.0376 0.9584 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.5016 0.3505 0.396 0.004 0.000 0.600
#> SRR1974717 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974713 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.4252 0.6535 0.744 0.004 0.000 0.252
#> SRR1974711 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974712 1 0.0469 0.9569 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.4053 0.6957 0.768 0.004 0.000 0.228
#> SRR1974710 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974707 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0188 0.8820 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974702 1 0.2125 0.9095 0.920 0.076 0.004 0.000
#> SRR1974701 4 0.0921 0.8721 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974699 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0188 0.8820 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 4 0.4741 0.5182 0.328 0.004 0.000 0.668
#> SRR1974696 4 0.1118 0.8536 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974694 1 0.1109 0.9460 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974695 4 0.5039 0.3459 0.404 0.004 0.000 0.592
#> SRR1974693 4 0.0921 0.8737 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974692 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.4193 0.7766 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974691 1 0.0376 0.9583 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974689 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0469 0.8804 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974687 1 0.2469 0.8746 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.1022 0.9458 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.5933 0.2311 0.552 0.040 0.000 0.408
#> SRR1974682 4 0.0336 0.8816 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0188 0.9590 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0817 0.8744 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974677 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1706 0.8060 0.000 0.948 0.036 0.016
#> SRR1974675 3 0.0188 0.9829 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 4 0.4976 0.4846 0.340 0.004 0.004 0.652
#> SRR1974671 2 0.1489 0.8028 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1974672 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0895 0.8116 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974667 2 0.0921 0.8078 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974668 2 0.1584 0.8030 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR1974666 2 0.1724 0.8062 0.000 0.948 0.032 0.020
#> SRR1974664 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0779 0.8135 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.4431 0.6146 0.252 0.004 0.004 0.740
#> SRR1974660 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974659 1 0.0336 0.9581 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974654 1 0.0336 0.9581 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974656 1 0.1489 0.9314 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR1974650 1 0.4088 0.6967 0.764 0.004 0.000 0.232
#> SRR1974651 4 0.0336 0.8815 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 4 0.0707 0.8769 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974648 1 0.1109 0.9447 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974646 1 0.0188 0.9589 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974649 1 0.0336 0.9581 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1042 0.8127 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1974643 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0657 0.9548 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974640 1 0.5297 0.1553 0.548 0.004 0.004 0.444
#> SRR1974641 4 0.0188 0.8821 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974639 1 0.0469 0.9569 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0657 0.9549 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0469 0.8809 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974633 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.1398 0.9347 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 1 0.5544 0.4736 0.640 0.332 0.008 0.020
#> SRR1974623 1 0.4372 0.6244 0.728 0.004 0.000 0.268
#> SRR1974622 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974620 1 0.2888 0.8473 0.872 0.004 0.000 0.124
#> SRR1974619 4 0.5060 0.3102 0.412 0.004 0.000 0.584
#> SRR1974621 1 0.0336 0.9581 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.0895 0.8046 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR1974615 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.2921 0.8489 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.2831 0.8532 0.876 0.004 0.000 0.120
#> SRR1974612 1 0.0779 0.9535 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1974611 1 0.0524 0.9564 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974610 4 0.0000 0.8820 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.3123 0.7332 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974607 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974606 2 0.2401 0.8183 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1974605 1 0.4992 0.0567 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1974604 4 0.0707 0.8769 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1974603 1 0.0188 0.9589 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.2530 0.7949 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1974601 1 0.3257 0.8160 0.844 0.004 0.000 0.152
#> SRR1974599 2 0.2089 0.8276 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1974598 2 0.1059 0.8178 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1974596 2 0.4164 0.7798 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1974594 4 0.3873 0.6187 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974593 4 0.1867 0.8364 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974595 2 0.4277 0.7652 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974592 2 0.3726 0.8081 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974591 2 0.1209 0.8240 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1974588 4 0.3172 0.7344 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1974590 4 0.4304 0.4799 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1974589 4 0.3837 0.6195 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1974587 4 0.1716 0.8439 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974586 4 0.1474 0.8542 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1974585 2 0.4817 0.5935 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974584 1 0.0376 0.9579 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974583 4 0.3266 0.7218 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1974582 2 0.3311 0.8199 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1974581 2 0.3400 0.8182 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974580 2 0.5000 0.3188 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1974578 4 0.3123 0.7383 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1974577 2 0.5102 0.6718 0.188 0.748 0.000 0.064
#> SRR1974579 4 0.4776 0.2025 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1974576 4 0.3444 0.6964 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1974575 2 0.3486 0.8164 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974574 2 0.4250 0.7691 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974573 2 0.4331 0.7570 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974571 2 0.4304 0.7611 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974572 2 0.4331 0.7570 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974570 1 0.0000 0.9595 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.2131 0.9150 0.932 0.032 0.000 0.036
#> SRR1974567 1 0.1743 0.9227 0.940 0.056 0.004 0.000
#> SRR1974566 2 0.4331 0.7570 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974569 2 0.4382 0.7469 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974565 2 0.4916 0.5205 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1974564 2 0.4103 0.7849 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1974560 1 0.1042 0.9490 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1974559 1 0.5809 0.5696 0.692 0.092 0.000 0.216
#> SRR1974563 2 0.4331 0.7570 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974562 2 0.4222 0.7725 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1974561 2 0.4277 0.7653 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974557 4 0.1118 0.8660 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1974553 2 0.4304 0.7611 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974555 1 0.2101 0.9127 0.928 0.060 0.000 0.012
#> SRR1974551 2 0.6448 0.6652 0.120 0.628 0.000 0.252
#> SRR1974552 2 0.4134 0.7821 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1974554 1 0.0657 0.9550 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1974558 1 0.0712 0.9553 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1974556 1 0.0188 0.9588 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974550 4 0.4995 0.4862 0.344 0.004 0.004 0.648
#> SRR1974549 2 0.4222 0.7725 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1974548 4 0.2921 0.7600 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1974547 1 0.1114 0.9500 0.972 0.016 0.004 0.008
#> SRR1974546 1 0.0844 0.9537 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1974545 2 0.4331 0.7570 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1974544 1 0.0336 0.9584 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.4304 0.7611 0.000 0.716 0.000 0.284
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.0609 0.96745 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974995 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.4535 0.65669 0.752 0.000 0.140 0.000 0.108
#> SRR1974993 3 0.0162 0.98066 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974992 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 5 0.1894 0.62065 0.000 0.008 0.072 0.000 0.920
#> SRR1974991 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0290 0.97767 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974987 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1270 0.93704 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974984 3 0.0162 0.98061 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974985 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0609 0.96183 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0162 0.97965 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0162 0.97934 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0162 0.98000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0671 0.96372 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1974916 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.0451 0.97416 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974913 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.0404 0.97401 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 3 0.0162 0.98050 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.0671 0.96657 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1974891 3 0.0162 0.98050 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 3 0.6817 0.13932 0.000 0.340 0.508 0.096 0.056
#> SRR1974887 3 0.6622 -0.07570 0.000 0.284 0.456 0.000 0.260
#> SRR1974885 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.3906 0.75149 0.000 0.068 0.800 0.000 0.132
#> SRR1974882 3 0.0898 0.95865 0.000 0.008 0.972 0.020 0.000
#> SRR1974880 3 0.2367 0.88417 0.000 0.020 0.904 0.072 0.004
#> SRR1974879 3 0.0162 0.98050 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 3 0.4976 0.11233 0.000 0.028 0.504 0.000 0.468
#> SRR1974878 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.1216 0.94735 0.000 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR1974874 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.0290 0.93770 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974871 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.1608 0.90299 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974869 1 0.3362 0.74407 0.812 0.004 0.004 0.176 0.004
#> SRR1974868 5 0.4297 0.21768 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1974870 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.2877 0.79101 0.848 0.004 0.000 0.144 0.004
#> SRR1974867 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974865 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974862 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 5 0.1168 0.64921 0.000 0.032 0.008 0.000 0.960
#> SRR1974861 5 0.4310 0.41221 0.000 0.392 0.004 0.000 0.604
#> SRR1974859 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0162 0.94037 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974856 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 5 0.2864 0.63440 0.000 0.064 0.008 0.044 0.884
#> SRR1974854 1 0.0290 0.93265 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974853 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974851 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974852 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974849 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.2179 0.81905 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974844 1 0.1197 0.91952 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974843 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974842 1 0.1197 0.91988 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974841 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0290 0.93265 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974835 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974836 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974834 2 0.0451 0.87597 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974833 2 0.2773 0.71953 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974831 2 0.0451 0.87597 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974832 1 0.0609 0.93045 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974830 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974829 1 0.4219 0.35205 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1974828 1 0.1270 0.91797 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974826 4 0.5015 0.29999 0.028 0.392 0.000 0.576 0.004
#> SRR1974827 2 0.0566 0.87516 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974824 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974825 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0162 0.93180 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974820 1 0.1410 0.91275 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974818 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974819 1 0.1410 0.91300 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974817 1 0.0162 0.93283 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 5 0.0609 0.64378 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974815 1 0.0162 0.93180 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.2773 0.81673 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974814 4 0.3123 0.71602 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1974812 2 0.0404 0.87384 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974810 4 0.6616 0.03061 0.344 0.000 0.000 0.432 0.224
#> SRR1974808 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974811 1 0.1410 0.91246 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974809 1 0.3561 0.68350 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1974807 1 0.1059 0.92629 0.968 0.004 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974806 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974805 2 0.0451 0.87597 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974804 4 0.3913 0.50103 0.000 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974803 1 0.1410 0.89609 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974801 1 0.0290 0.93258 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974800 1 0.3837 0.59792 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974799 1 0.0703 0.92923 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974798 2 0.4306 -0.15012 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1974797 2 0.0324 0.87592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974796 2 0.0404 0.87384 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974795 2 0.0451 0.87597 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974793 5 0.0963 0.64151 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974794 2 0.5102 0.16072 0.000 0.580 0.000 0.044 0.376
#> SRR1974792 2 0.0324 0.87592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974791 2 0.0771 0.87098 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974790 2 0.0324 0.87592 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974789 2 0.5805 0.32993 0.000 0.612 0.000 0.216 0.172
#> SRR1974788 5 0.2408 0.64800 0.000 0.092 0.016 0.000 0.892
#> SRR1974786 1 0.2605 0.83214 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974787 1 0.1121 0.92253 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974784 2 0.1270 0.83800 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974783 1 0.1121 0.92174 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974785 1 0.0510 0.93209 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974782 1 0.0963 0.92539 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974781 2 0.2074 0.78318 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974780 5 0.4443 0.00631 0.472 0.004 0.000 0.000 0.524
#> SRR1974779 1 0.0162 0.93283 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974777 1 0.0290 0.93265 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974776 1 0.1197 0.92030 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974778 1 0.1121 0.92160 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974774 5 0.3838 0.56062 0.000 0.280 0.004 0.000 0.716
#> SRR1974773 1 0.2516 0.84378 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974775 1 0.1341 0.91505 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974772 5 0.4221 0.56167 0.236 0.032 0.000 0.000 0.732
#> SRR1974771 2 0.4150 0.22450 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974770 5 0.4161 0.41395 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974769 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974768 5 0.0510 0.64611 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974767 1 0.1197 0.91975 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974766 5 0.4294 0.23817 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974765 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974764 5 0.4291 0.25076 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1974763 1 0.0162 0.93283 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.1608 0.90474 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974761 2 0.4210 0.14627 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1974760 2 0.0404 0.87277 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974759 1 0.0794 0.92806 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974758 5 0.4030 0.48215 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1974757 2 0.2605 0.72870 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974756 1 0.0290 0.93265 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974754 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.2179 0.64686 0.000 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR1974753 4 0.0162 0.94085 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974751 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.3586 0.67779 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1974749 5 0.3425 0.64077 0.000 0.112 0.004 0.044 0.840
#> SRR1974747 1 0.6072 0.34713 0.568 0.000 0.000 0.180 0.252
#> SRR1974748 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974746 1 0.1121 0.92161 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974744 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.4219 0.18230 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1974740 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.1121 0.92194 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974734 4 0.0404 0.92990 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.1197 0.91974 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974730 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 4 0.0162 0.93878 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974727 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974723 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0162 0.94085 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974721 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0703 0.92920 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974718 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.4593 0.00579 0.480 0.004 0.000 0.512 0.004
#> SRR1974717 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0963 0.92539 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974714 1 0.0486 0.92929 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974711 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.1410 0.91266 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974709 1 0.0609 0.93066 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974708 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974710 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974707 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974704 1 0.0794 0.92871 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974705 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974703 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.4161 0.25091 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1974701 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974697 1 0.3088 0.76512 0.828 0.004 0.000 0.164 0.004
#> SRR1974696 4 0.0324 0.93650 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1974694 1 0.2813 0.83611 0.868 0.000 0.000 0.108 0.024
#> SRR1974695 1 0.2339 0.84620 0.892 0.004 0.000 0.100 0.004
#> SRR1974693 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974691 1 0.1357 0.91943 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1974689 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.4298 0.45693 0.640 0.000 0.000 0.352 0.008
#> SRR1974686 1 0.0609 0.93045 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974685 1 0.1124 0.91705 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974684 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974683 4 0.2873 0.76336 0.120 0.000 0.000 0.860 0.020
#> SRR1974682 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0609 0.93045 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974679 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0404 0.93234 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974678 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 5 0.3861 0.55740 0.000 0.284 0.004 0.000 0.712
#> SRR1974675 3 0.0000 0.98361 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0880 0.92678 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974673 1 0.4059 0.56055 0.700 0.004 0.000 0.292 0.004
#> SRR1974671 2 0.4473 0.12368 0.000 0.580 0.008 0.000 0.412
#> SRR1974672 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.3949 0.38076 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974667 2 0.4287 -0.02995 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1974668 5 0.4063 0.55832 0.000 0.280 0.012 0.000 0.708
#> SRR1974666 2 0.4300 -0.07224 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1974664 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 5 0.4235 0.33687 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1974663 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974661 1 0.4414 0.39146 0.616 0.004 0.000 0.376 0.004
#> SRR1974660 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.1043 0.92347 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974658 1 0.0510 0.93142 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974657 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.1608 0.90482 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974655 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974650 1 0.1502 0.89898 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974651 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0162 0.93275 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974653 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974646 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.2074 0.87997 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974647 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.4307 0.14565 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974643 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974640 1 0.0833 0.92295 0.976 0.004 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974641 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0880 0.92645 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974638 1 0.0510 0.93147 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974635 1 0.0290 0.93274 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974636 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974634 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974637 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974632 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974631 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974630 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 5 0.5302 0.25389 0.392 0.012 0.000 0.032 0.564
#> SRR1974623 1 0.0613 0.92744 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974622 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974620 1 0.0324 0.93053 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974619 1 0.4538 0.24792 0.564 0.004 0.000 0.428 0.004
#> SRR1974621 1 0.0880 0.92650 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974617 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 5 0.1197 0.65090 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974615 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 5 0.3932 0.40283 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1974614 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0486 0.92940 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974612 1 0.2179 0.87111 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974611 1 0.0162 0.93181 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974610 4 0.0000 0.94369 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.4253 0.40273 0.332 0.004 0.000 0.660 0.004
#> SRR1974607 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 5 0.4615 0.57254 0.000 0.252 0.000 0.048 0.700
#> SRR1974605 1 0.4181 0.51691 0.676 0.004 0.000 0.316 0.004
#> SRR1974604 4 0.0162 0.94085 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974603 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0404 0.93217 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974600 2 0.0566 0.87259 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974601 1 0.2052 0.86833 0.912 0.004 0.000 0.080 0.004
#> SRR1974599 2 0.1544 0.82285 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974598 2 0.3074 0.65842 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1974596 2 0.0162 0.87344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974594 2 0.0451 0.87492 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974593 2 0.3906 0.47898 0.000 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1974595 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974592 2 0.0290 0.87173 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974591 2 0.2074 0.78525 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974588 2 0.0566 0.87259 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974590 2 0.0703 0.86610 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974589 2 0.0566 0.87409 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974587 2 0.3790 0.51175 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1974586 2 0.4310 0.30962 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1974585 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974584 1 0.2179 0.84561 0.896 0.100 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974583 2 0.0566 0.87259 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974582 2 0.0609 0.86454 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974581 2 0.0703 0.86152 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974580 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974578 2 0.0566 0.87308 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974577 2 0.0324 0.87380 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974579 2 0.0451 0.87492 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974576 2 0.0671 0.87076 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974575 2 0.0510 0.86753 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974574 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974573 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974571 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974572 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974570 1 0.0000 0.93264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974568 1 0.4420 0.18563 0.548 0.448 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974567 2 0.4341 0.18068 0.364 0.628 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974566 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974569 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974565 2 0.0451 0.87492 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974564 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974560 1 0.3333 0.69434 0.788 0.208 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974559 2 0.2497 0.69946 0.112 0.880 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974563 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974562 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974561 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974557 4 0.4118 0.47704 0.000 0.336 0.000 0.660 0.004
#> SRR1974553 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974555 2 0.3861 0.35237 0.284 0.712 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974551 2 0.0451 0.87492 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974552 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974554 1 0.2583 0.80553 0.864 0.132 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974558 1 0.3607 0.63150 0.752 0.244 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974556 1 0.0451 0.92909 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974550 1 0.2899 0.82762 0.872 0.096 0.000 0.028 0.004
#> SRR1974549 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974548 2 0.0671 0.86968 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974547 1 0.3861 0.55634 0.712 0.284 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974546 1 0.2233 0.84111 0.892 0.104 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974545 2 0.0451 0.87717 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974544 1 0.3266 0.70881 0.796 0.200 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974543 2 0.0290 0.87699 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0260 0.9819 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975008 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975006 3 0.0520 0.9807 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975005 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0458 0.9780 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1975003 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975001 3 0.0508 0.9791 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975002 3 0.0405 0.9813 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974999 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975000 3 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974998 3 0.0363 0.9797 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974997 3 0.0935 0.9637 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974995 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 5 0.4384 0.2784 0.036 0.000 0.348 0.000 0.616 0.000
#> SRR1974993 3 0.0405 0.9815 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974989 2 0.3421 0.6902 0.000 0.736 0.008 0.000 0.256 0.000
#> SRR1974991 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0865 0.9606 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974987 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1088 0.9606 0.000 0.024 0.960 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974984 3 0.0914 0.9693 0.000 0.016 0.968 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974985 3 0.0458 0.9773 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974983 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0363 0.9798 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974981 3 0.0458 0.9773 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974980 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974979 3 0.0291 0.9831 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0291 0.9836 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974975 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0291 0.9836 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974966 3 0.0146 0.9834 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974964 3 0.0405 0.9824 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0291 0.9836 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974962 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974960 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0146 0.9834 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974957 3 0.0405 0.9824 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0146 0.9834 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0909 0.9682 0.000 0.020 0.968 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0458 0.9773 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974942 3 0.0363 0.9812 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974943 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974938 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974937 3 0.0363 0.9812 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974936 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974933 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974931 3 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974930 3 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974929 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974928 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0260 0.9816 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974925 3 0.0458 0.9773 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974926 3 0.0260 0.9819 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974923 3 0.0146 0.9834 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974920 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.1333 0.9403 0.008 0.000 0.944 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.2969 0.7097 0.000 0.224 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0260 0.9819 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974911 3 0.0146 0.9834 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974910 3 0.0146 0.9832 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974908 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974909 3 0.0260 0.9819 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974906 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9840 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974900 3 0.0777 0.9699 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974899 3 0.0260 0.9826 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0520 0.9795 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974896 2 0.3819 0.4463 0.000 0.624 0.372 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974893 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974895 3 0.0935 0.9630 0.000 0.032 0.964 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974894 3 0.3043 0.7414 0.000 0.200 0.792 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974892 3 0.1387 0.9274 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974890 3 0.3547 0.4873 0.000 0.332 0.668 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.2431 0.8421 0.000 0.132 0.860 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974889 3 0.0520 0.9796 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974888 3 0.0405 0.9813 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974886 2 0.2342 0.8006 0.000 0.888 0.088 0.020 0.004 0.000
#> SRR1974887 2 0.3925 0.5286 0.000 0.656 0.332 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974885 3 0.0260 0.9828 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0508 0.9791 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974884 3 0.0146 0.9836 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.2562 0.7198 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.3774 0.5374 0.000 0.664 0.328 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974880 2 0.5664 0.3896 0.000 0.508 0.364 0.116 0.012 0.000
#> SRR1974879 3 0.2320 0.8460 0.000 0.132 0.864 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974877 3 0.0405 0.9813 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974876 2 0.2581 0.7618 0.000 0.856 0.128 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974878 3 0.0692 0.9730 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974875 2 0.3810 0.2937 0.000 0.572 0.428 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974874 4 0.0632 0.9117 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974873 4 0.1501 0.9056 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974871 4 0.0458 0.9146 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974872 1 0.2230 0.7569 0.892 0.024 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974869 1 0.2856 0.6775 0.856 0.000 0.000 0.076 0.068 0.000
#> SRR1974868 2 0.0291 0.8639 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974870 1 0.0547 0.7878 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974866 1 0.3285 0.6232 0.820 0.000 0.000 0.116 0.064 0.000
#> SRR1974867 1 0.1349 0.7819 0.940 0.004 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974865 4 0.0547 0.9133 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974864 1 0.0603 0.7952 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9175 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.1007 0.9012 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974860 2 0.1141 0.8467 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.8632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.1267 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974858 4 0.1267 0.8919 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974856 4 0.1141 0.9136 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974857 4 0.1075 0.8988 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1974855 5 0.4599 0.3802 0.000 0.016 0.008 0.124 0.744 0.108
#> SRR1974854 1 0.3330 0.4705 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974853 1 0.1957 0.7441 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974851 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974852 6 0.0260 0.9390 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974849 1 0.0713 0.7925 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974848 1 0.0547 0.7935 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974850 4 0.2852 0.8549 0.000 0.000 0.000 0.856 0.064 0.080
#> SRR1974846 4 0.0260 0.9179 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.7930 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.3944 -0.1065 0.568 0.004 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974843 1 0.0858 0.7930 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974842 5 0.3991 0.4333 0.472 0.004 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1974841 1 0.0865 0.7907 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974840 4 0.1327 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974839 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0790 0.7920 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974837 1 0.2003 0.7401 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974835 1 0.2416 0.6960 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1974836 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 6 0.0146 0.9403 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974831 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.2738 0.6628 0.820 0.004 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1974830 1 0.1663 0.7643 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974829 5 0.4460 0.6118 0.140 0.012 0.000 0.000 0.736 0.112
#> SRR1974828 1 0.3971 -0.1909 0.548 0.004 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR1974826 4 0.5155 0.1401 0.072 0.000 0.000 0.488 0.004 0.436
#> SRR1974827 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0458 0.7891 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974825 1 0.0260 0.7940 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974822 1 0.0146 0.7936 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974823 1 0.0865 0.7807 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974820 1 0.4095 -0.3254 0.512 0.008 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974818 1 0.1007 0.7876 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974819 5 0.3989 0.4490 0.468 0.004 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1974817 1 0.1204 0.7830 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974816 5 0.2112 0.5088 0.036 0.020 0.000 0.028 0.916 0.000
#> SRR1974815 1 0.0260 0.7939 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974813 5 0.3841 0.6023 0.380 0.004 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1974814 4 0.3652 0.5546 0.000 0.000 0.000 0.672 0.004 0.324
#> SRR1974812 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974810 5 0.6207 0.4882 0.272 0.008 0.000 0.284 0.436 0.000
#> SRR1974808 1 0.0937 0.7785 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974811 5 0.3999 0.3313 0.496 0.004 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1974809 5 0.4123 0.5544 0.420 0.012 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1974807 2 0.4161 -0.0580 0.448 0.540 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.1082 0.7884 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974805 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 4 0.4882 0.4490 0.000 0.000 0.000 0.576 0.072 0.352
#> SRR1974803 1 0.1918 0.7304 0.904 0.000 0.000 0.088 0.008 0.000
#> SRR1974801 1 0.1910 0.7484 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974800 1 0.4147 -0.1902 0.552 0.012 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974799 1 0.3728 0.2728 0.652 0.004 0.000 0.000 0.344 0.000
#> SRR1974798 2 0.0146 0.8639 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974797 6 0.0146 0.9409 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974796 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974795 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 5 0.2966 0.5417 0.076 0.076 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1974794 2 0.0692 0.8585 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1974792 6 0.1814 0.8513 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1974791 6 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974790 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.1003 0.8561 0.000 0.964 0.004 0.028 0.000 0.004
#> SRR1974788 2 0.0146 0.8630 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974786 1 0.4057 0.1063 0.600 0.012 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1974787 1 0.1049 0.7915 0.960 0.008 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974784 2 0.2320 0.8002 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1974783 1 0.1908 0.7546 0.900 0.004 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974785 1 0.1714 0.7647 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974782 1 0.3468 0.4663 0.712 0.004 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974781 2 0.3620 0.4667 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1974780 1 0.4584 -0.0330 0.512 0.452 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974779 1 0.0937 0.7902 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974777 1 0.2340 0.7059 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1974776 1 0.1320 0.7894 0.948 0.016 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974778 1 0.3421 0.5240 0.736 0.008 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1974774 2 0.0146 0.8630 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974773 1 0.4099 0.1173 0.612 0.016 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1974775 1 0.3833 -0.1548 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974772 2 0.3354 0.6441 0.128 0.812 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974771 2 0.0405 0.8632 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974770 2 0.0146 0.8630 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974769 6 0.0146 0.9409 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974768 2 0.1765 0.8213 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974767 1 0.1863 0.7538 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974766 2 0.0291 0.8629 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974765 6 0.0146 0.9409 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974764 2 0.0146 0.8630 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0937 0.7894 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974762 5 0.3699 0.6194 0.336 0.004 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1974761 2 0.0291 0.8639 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974760 6 0.0260 0.9392 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974759 1 0.3265 0.5352 0.748 0.004 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1974758 2 0.0146 0.8630 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974757 2 0.2146 0.8124 0.000 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR1974756 1 0.1152 0.7868 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974754 4 0.0865 0.9161 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974755 2 0.0260 0.8613 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974753 4 0.1501 0.9056 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974751 4 0.1327 0.9101 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974750 4 0.1444 0.9072 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974752 5 0.3741 0.6378 0.320 0.008 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1974749 2 0.0665 0.8605 0.008 0.980 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974747 5 0.5070 0.6157 0.208 0.012 0.000 0.120 0.660 0.000
#> SRR1974748 1 0.0632 0.7930 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974746 5 0.4093 0.4219 0.476 0.008 0.000 0.000 0.516 0.000
#> SRR1974744 4 0.0146 0.9177 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974745 4 0.1267 0.9115 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974743 4 0.0937 0.9156 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974742 5 0.3056 0.6341 0.140 0.016 0.000 0.012 0.832 0.000
#> SRR1974740 4 0.0458 0.9146 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974739 4 0.0146 0.9172 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974741 4 0.0363 0.9180 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974738 4 0.0632 0.9117 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974737 4 0.1444 0.9074 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974736 4 0.1327 0.9101 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974735 5 0.4018 0.5675 0.412 0.008 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974734 4 0.3278 0.6861 0.152 0.000 0.000 0.808 0.040 0.000
#> SRR1974733 4 0.0146 0.9172 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974732 4 0.0363 0.9156 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974731 4 0.1204 0.9127 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974729 5 0.4010 0.5721 0.408 0.008 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974730 1 0.0458 0.7937 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974728 4 0.0146 0.9172 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974725 4 0.0547 0.9134 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974726 4 0.0547 0.9177 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974724 1 0.3076 0.5649 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1974727 1 0.1219 0.7724 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048 0.000
#> SRR1974723 4 0.0260 0.9181 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974722 4 0.1501 0.9056 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974721 4 0.0458 0.9146 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974720 4 0.0363 0.9156 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974719 1 0.1082 0.7883 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974718 1 0.0146 0.7937 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 1 0.4204 0.4093 0.696 0.000 0.000 0.252 0.052 0.000
#> SRR1974717 4 0.0458 0.9146 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974715 4 0.1204 0.9127 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974713 1 0.3989 -0.2625 0.528 0.004 0.000 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974714 1 0.1719 0.7532 0.924 0.000 0.000 0.016 0.060 0.000
#> SRR1974711 1 0.0363 0.7904 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974712 5 0.4062 0.5177 0.440 0.008 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1974709 1 0.3717 0.1344 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1974708 1 0.2030 0.7386 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064 0.000
#> SRR1974710 1 0.1075 0.7739 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974707 1 0.0632 0.7861 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974706 1 0.2793 0.6410 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974704 1 0.3390 0.4432 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1974705 1 0.3499 0.3686 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1974703 4 0.0363 0.9156 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974702 5 0.4165 0.6425 0.292 0.028 0.004 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974701 4 0.1327 0.9101 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974699 4 0.0632 0.9117 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974698 4 0.0146 0.9172 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974700 1 0.2941 0.5994 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1974697 1 0.2801 0.6826 0.860 0.000 0.000 0.072 0.068 0.000
#> SRR1974696 4 0.1745 0.8777 0.020 0.000 0.000 0.924 0.056 0.000
#> SRR1974694 5 0.5929 0.4255 0.404 0.004 0.000 0.180 0.412 0.000
#> SRR1974695 1 0.2801 0.6826 0.860 0.000 0.000 0.072 0.068 0.000
#> SRR1974693 4 0.0937 0.9156 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974692 4 0.0146 0.9172 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974690 6 0.0260 0.9384 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974691 5 0.4446 0.4690 0.444 0.004 0.000 0.020 0.532 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9175 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.1387 0.9087 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974687 4 0.5529 -0.1993 0.412 0.000 0.000 0.456 0.132 0.000
#> SRR1974686 1 0.3428 0.4127 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1974685 1 0.2527 0.7080 0.868 0.000 0.000 0.108 0.024 0.000
#> SRR1974684 1 0.2178 0.7254 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974683 4 0.2302 0.7949 0.120 0.000 0.000 0.872 0.008 0.000
#> SRR1974682 4 0.1267 0.9115 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974681 1 0.3833 -0.1485 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9175 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.3672 0.2025 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1974678 4 0.1387 0.9087 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974677 1 0.0458 0.7937 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.8632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 3 0.0291 0.9830 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.3652 0.3423 0.672 0.004 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1974673 1 0.2801 0.6826 0.860 0.000 0.000 0.072 0.068 0.000
#> SRR1974671 2 0.0363 0.8634 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974672 4 0.0547 0.9134 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974670 4 0.0547 0.9133 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974669 2 0.0508 0.8634 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974667 2 0.0000 0.8632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0291 0.8632 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974666 2 0.0436 0.8642 0.000 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974664 4 0.0937 0.9038 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974665 2 0.0291 0.8639 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974663 1 0.0458 0.7891 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974662 1 0.1152 0.7863 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974661 1 0.3426 0.6047 0.808 0.000 0.000 0.124 0.068 0.000
#> SRR1974660 1 0.0260 0.7915 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974659 1 0.3966 -0.1706 0.552 0.004 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974658 1 0.3706 0.1462 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1974657 1 0.0146 0.7924 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974654 5 0.3923 0.5607 0.416 0.004 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1974655 1 0.0547 0.7878 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974656 1 0.1204 0.7689 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974650 1 0.1333 0.7699 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1974651 4 0.1267 0.9117 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974652 1 0.0458 0.7941 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974653 4 0.1444 0.9072 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1974648 1 0.1141 0.7715 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974646 1 0.0547 0.7909 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974649 5 0.4051 0.5352 0.432 0.008 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974647 4 0.1267 0.9115 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1974645 1 0.0547 0.7935 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974644 2 0.0363 0.8634 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974643 1 0.0547 0.7938 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974642 1 0.1141 0.7715 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974640 1 0.2250 0.7258 0.896 0.000 0.000 0.040 0.064 0.000
#> SRR1974641 4 0.0632 0.9177 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974639 1 0.3647 0.2377 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000
#> SRR1974638 1 0.2053 0.7440 0.888 0.004 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974635 1 0.1007 0.7884 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974636 1 0.1007 0.7762 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974634 1 0.2300 0.7101 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974637 4 0.1327 0.9101 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974633 1 0.0865 0.7806 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974632 1 0.2219 0.7196 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974631 1 0.1411 0.7632 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1974630 1 0.0937 0.7894 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974629 1 0.1327 0.7819 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974628 1 0.0458 0.7937 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.7930 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.1387 0.7767 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974625 5 0.6912 0.2831 0.224 0.356 0.004 0.048 0.368 0.000
#> SRR1974623 1 0.1970 0.7423 0.912 0.000 0.000 0.028 0.060 0.000
#> SRR1974622 1 0.0547 0.7878 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974620 1 0.1950 0.7428 0.912 0.000 0.000 0.024 0.064 0.000
#> SRR1974619 1 0.4067 0.4417 0.728 0.000 0.000 0.212 0.060 0.000
#> SRR1974621 1 0.3565 0.4007 0.692 0.004 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1974617 1 0.0146 0.7938 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974616 5 0.4926 0.3183 0.024 0.200 0.000 0.000 0.688 0.088
#> SRR1974615 1 0.0000 0.7930 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 5 0.2581 0.6162 0.128 0.016 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1974614 1 0.0458 0.7922 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974613 1 0.1267 0.7660 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974612 1 0.2494 0.7305 0.864 0.016 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974611 1 0.0937 0.7786 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974610 4 0.0458 0.9146 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.7930 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.4798 0.1237 0.564 0.000 0.000 0.376 0.060 0.000
#> SRR1974607 1 0.0260 0.7939 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974606 2 0.0405 0.8634 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974605 1 0.2512 0.7096 0.880 0.000 0.000 0.060 0.060 0.000
#> SRR1974604 4 0.1501 0.9056 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.7930 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.3330 0.4764 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974600 6 0.0405 0.9369 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR1974601 1 0.1970 0.7479 0.912 0.000 0.000 0.028 0.060 0.000
#> SRR1974599 2 0.1204 0.8472 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974598 2 0.0937 0.8543 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974596 2 0.3023 0.7110 0.000 0.784 0.000 0.000 0.004 0.212
#> SRR1974594 6 0.0777 0.9266 0.000 0.024 0.000 0.004 0.000 0.972
#> SRR1974593 4 0.4589 0.3459 0.000 0.008 0.000 0.580 0.028 0.384
#> SRR1974595 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.2663 0.8192 0.000 0.876 0.000 0.028 0.012 0.084
#> SRR1974591 2 0.1075 0.8510 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974588 6 0.0458 0.9340 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974590 6 0.0972 0.9174 0.000 0.008 0.000 0.028 0.000 0.964
#> SRR1974589 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 6 0.4031 0.6673 0.000 0.004 0.000 0.212 0.048 0.736
#> SRR1974586 4 0.4543 0.6675 0.000 0.024 0.000 0.712 0.052 0.212
#> SRR1974585 6 0.0458 0.9341 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974584 6 0.4004 0.2130 0.368 0.000 0.000 0.000 0.012 0.620
#> SRR1974583 6 0.1861 0.8937 0.000 0.016 0.000 0.036 0.020 0.928
#> SRR1974582 2 0.1753 0.8315 0.000 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR1974581 2 0.2402 0.7912 0.000 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1974580 6 0.0146 0.9409 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974578 6 0.0363 0.9367 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974577 6 0.3464 0.7486 0.108 0.084 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974579 6 0.0363 0.9364 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974576 6 0.5695 0.5713 0.000 0.128 0.000 0.172 0.060 0.640
#> SRR1974575 2 0.2697 0.7445 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1974574 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974572 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.0458 0.7950 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974568 6 0.2527 0.7038 0.168 0.000 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1974567 6 0.2595 0.7122 0.160 0.000 0.000 0.000 0.004 0.836
#> SRR1974566 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974565 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974564 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.4076 0.0493 0.540 0.000 0.000 0.000 0.008 0.452
#> SRR1974559 6 0.0146 0.9397 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974563 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974557 4 0.4698 0.4960 0.004 0.000 0.000 0.624 0.056 0.316
#> SRR1974553 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 6 0.0458 0.9281 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974551 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974552 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.1720 0.7612 0.928 0.000 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1974558 6 0.3819 0.2683 0.372 0.000 0.000 0.000 0.004 0.624
#> SRR1974556 1 0.0520 0.7939 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974550 1 0.2801 0.6826 0.860 0.000 0.000 0.072 0.068 0.000
#> SRR1974549 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.3487 0.5697 0.788 0.000 0.000 0.000 0.044 0.168
#> SRR1974546 1 0.1007 0.7762 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974545 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974544 6 0.4129 0.0573 0.424 0.000 0.000 0.000 0.012 0.564
#> SRR1974543 6 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.583 0.830 0.921 0.4807 0.515 0.515
#> 3 3 0.484 0.683 0.805 0.2734 0.823 0.670
#> 4 4 0.501 0.541 0.685 0.1482 0.852 0.635
#> 5 5 0.570 0.518 0.712 0.0821 0.875 0.605
#> 6 6 0.618 0.550 0.718 0.0431 0.950 0.790
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.5519 0.85128 0.872 0.128
#> SRR1975008 2 0.0672 0.91261 0.008 0.992
#> SRR1975006 2 0.1633 0.90878 0.024 0.976
#> SRR1975005 2 0.6247 0.80762 0.156 0.844
#> SRR1975004 1 0.6887 0.78883 0.816 0.184
#> SRR1975003 2 0.1843 0.90726 0.028 0.972
#> SRR1975001 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0376 0.91310 0.004 0.996
#> SRR1975000 1 0.6048 0.83130 0.852 0.148
#> SRR1974998 1 0.6438 0.81310 0.836 0.164
#> SRR1974997 2 0.6343 0.80499 0.160 0.840
#> SRR1974995 2 0.6531 0.79563 0.168 0.832
#> SRR1974996 1 0.7376 0.75571 0.792 0.208
#> SRR1974994 1 0.0376 0.91153 0.996 0.004
#> SRR1974993 2 0.8955 0.58122 0.312 0.688
#> SRR1974992 2 0.6247 0.80759 0.156 0.844
#> SRR1974990 1 0.3431 0.89502 0.936 0.064
#> SRR1974989 2 0.4562 0.86223 0.096 0.904
#> SRR1974991 2 0.6148 0.81136 0.152 0.848
#> SRR1974986 1 0.4815 0.87173 0.896 0.104
#> SRR1974987 2 0.5294 0.84286 0.120 0.880
#> SRR1974988 2 0.9087 0.55727 0.324 0.676
#> SRR1974984 2 0.6712 0.78770 0.176 0.824
#> SRR1974985 1 0.3274 0.89654 0.940 0.060
#> SRR1974983 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.3274 0.89663 0.940 0.060
#> SRR1974981 1 0.2603 0.90217 0.956 0.044
#> SRR1974980 1 0.3879 0.88863 0.924 0.076
#> SRR1974979 2 0.3274 0.88821 0.060 0.940
#> SRR1974978 1 0.7745 0.72753 0.772 0.228
#> SRR1974977 1 0.5946 0.83523 0.856 0.144
#> SRR1974976 2 0.2236 0.90353 0.036 0.964
#> SRR1974975 2 0.4562 0.86282 0.096 0.904
#> SRR1974974 2 0.0376 0.91310 0.004 0.996
#> SRR1974973 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.6887 0.77714 0.184 0.816
#> SRR1974971 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.9248 0.52200 0.340 0.660
#> SRR1974969 2 0.9427 0.47812 0.360 0.640
#> SRR1974968 2 0.0672 0.91261 0.008 0.992
#> SRR1974967 2 0.8909 0.58570 0.308 0.692
#> SRR1974965 1 0.4939 0.86702 0.892 0.108
#> SRR1974966 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.7815 0.71426 0.232 0.768
#> SRR1974963 2 0.9044 0.55993 0.320 0.680
#> SRR1974961 2 0.6973 0.77233 0.188 0.812
#> SRR1974962 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.9248 0.52467 0.340 0.660
#> SRR1974959 2 0.9983 0.11778 0.476 0.524
#> SRR1974958 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.2603 0.89879 0.044 0.956
#> SRR1974956 2 0.7528 0.73383 0.216 0.784
#> SRR1974955 1 0.5294 0.85895 0.880 0.120
#> SRR1974954 2 0.9209 0.53207 0.336 0.664
#> SRR1974953 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.8499 0.64601 0.276 0.724
#> SRR1974949 2 0.6048 0.81446 0.148 0.852
#> SRR1974950 2 0.2778 0.89583 0.048 0.952
#> SRR1974951 2 0.2043 0.90482 0.032 0.968
#> SRR1974947 2 0.5059 0.84948 0.112 0.888
#> SRR1974948 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.9815 0.31632 0.420 0.580
#> SRR1974944 1 0.2778 0.90074 0.952 0.048
#> SRR1974942 1 0.5408 0.85400 0.876 0.124
#> SRR1974943 2 0.4562 0.86418 0.096 0.904
#> SRR1974941 1 0.8443 0.65145 0.728 0.272
#> SRR1974940 1 0.9977 0.09240 0.528 0.472
#> SRR1974939 2 0.2236 0.90344 0.036 0.964
#> SRR1974938 2 0.9000 0.57310 0.316 0.684
#> SRR1974937 1 0.5519 0.85023 0.872 0.128
#> SRR1974936 1 0.5294 0.85771 0.880 0.120
#> SRR1974935 2 0.9580 0.42489 0.380 0.620
#> SRR1974934 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.2236 0.90260 0.036 0.964
#> SRR1974932 2 0.9977 0.13558 0.472 0.528
#> SRR1974931 1 0.5178 0.86082 0.884 0.116
#> SRR1974930 1 0.5059 0.86340 0.888 0.112
#> SRR1974929 1 0.8763 0.60767 0.704 0.296
#> SRR1974928 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.9170 0.54121 0.332 0.668
#> SRR1974924 1 0.3114 0.89777 0.944 0.056
#> SRR1974925 1 0.3733 0.89140 0.928 0.072
#> SRR1974926 1 0.3584 0.89279 0.932 0.068
#> SRR1974923 1 0.5737 0.84271 0.864 0.136
#> SRR1974922 2 0.9580 0.42512 0.380 0.620
#> SRR1974921 1 0.6343 0.81941 0.840 0.160
#> SRR1974920 1 0.3733 0.89038 0.928 0.072
#> SRR1974919 1 0.9977 0.09364 0.528 0.472
#> SRR1974918 2 0.9963 0.16937 0.464 0.536
#> SRR1974917 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.9710 0.34161 0.600 0.400
#> SRR1974915 2 0.9983 0.11753 0.476 0.524
#> SRR1974914 2 0.1414 0.90963 0.020 0.980
#> SRR1974913 1 0.9732 0.32997 0.596 0.404
#> SRR1974911 1 0.5519 0.85023 0.872 0.128
#> SRR1974910 1 0.5294 0.85857 0.880 0.120
#> SRR1974908 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.9993 0.08722 0.484 0.516
#> SRR1974906 2 0.4562 0.86405 0.096 0.904
#> SRR1974907 2 0.8608 0.63256 0.284 0.716
#> SRR1974905 1 0.8386 0.66071 0.732 0.268
#> SRR1974904 2 0.1843 0.90674 0.028 0.972
#> SRR1974903 1 0.9998 0.00888 0.508 0.492
#> SRR1974902 2 0.2236 0.90344 0.036 0.964
#> SRR1974901 2 0.9000 0.57004 0.316 0.684
#> SRR1974898 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0376 0.91309 0.004 0.996
#> SRR1974899 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0376 0.91304 0.004 0.996
#> SRR1974895 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974892 2 0.2948 0.89392 0.052 0.948
#> SRR1974890 2 0.3879 0.87858 0.076 0.924
#> SRR1974891 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974889 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974887 2 0.4815 0.85587 0.104 0.896
#> SRR1974885 2 0.4939 0.85262 0.108 0.892
#> SRR1974883 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974884 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974881 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974882 2 0.0376 0.91306 0.004 0.996
#> SRR1974880 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0376 0.91309 0.004 0.996
#> SRR1974877 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.2423 0.90116 0.040 0.960
#> SRR1974878 2 0.2043 0.90495 0.032 0.968
#> SRR1974875 2 0.4815 0.85587 0.104 0.896
#> SRR1974874 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974871 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.3114 0.90031 0.944 0.056
#> SRR1974869 2 0.0672 0.91236 0.008 0.992
#> SRR1974868 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.5178 0.84055 0.116 0.884
#> SRR1974866 2 0.3879 0.87396 0.076 0.924
#> SRR1974867 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.1843 0.90790 0.972 0.028
#> SRR1974862 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974858 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974857 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.7883 0.71208 0.236 0.764
#> SRR1974854 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 1.0000 0.03491 0.496 0.504
#> SRR1974852 2 0.0376 0.91298 0.004 0.996
#> SRR1974849 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7219 0.75902 0.200 0.800
#> SRR1974846 2 0.2236 0.90411 0.036 0.964
#> SRR1974847 1 0.0938 0.91048 0.988 0.012
#> SRR1974845 2 0.0376 0.91302 0.004 0.996
#> SRR1974844 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.2236 0.90595 0.964 0.036
#> SRR1974842 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974839 2 0.0376 0.91292 0.004 0.996
#> SRR1974838 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0376 0.91298 0.004 0.996
#> SRR1974834 2 0.1184 0.91147 0.016 0.984
#> SRR1974833 2 0.8081 0.69536 0.248 0.752
#> SRR1974831 2 0.1843 0.90736 0.028 0.972
#> SRR1974832 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.1184 0.91147 0.016 0.984
#> SRR1974824 1 0.2948 0.90136 0.948 0.052
#> SRR1974825 1 0.0376 0.91147 0.996 0.004
#> SRR1974822 1 0.3733 0.89231 0.928 0.072
#> SRR1974823 1 0.8207 0.69081 0.744 0.256
#> SRR1974820 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.5629 0.84623 0.868 0.132
#> SRR1974815 1 0.0938 0.91046 0.988 0.012
#> SRR1974813 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.6438 0.79885 0.164 0.836
#> SRR1974812 1 0.4690 0.87186 0.900 0.100
#> SRR1974810 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.5178 0.84057 0.116 0.884
#> SRR1974811 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.4562 0.87853 0.904 0.096
#> SRR1974806 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1843 0.90736 0.028 0.972
#> SRR1974804 2 1.0000 0.03445 0.496 0.504
#> SRR1974803 1 0.0376 0.91160 0.996 0.004
#> SRR1974801 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0376 0.91147 0.996 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.1633 0.90897 0.024 0.976
#> SRR1974795 2 0.1843 0.90736 0.028 0.972
#> SRR1974793 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0376 0.91302 0.004 0.996
#> SRR1974791 2 0.1184 0.91147 0.016 0.984
#> SRR1974790 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.2423 0.90499 0.960 0.040
#> SRR1974787 1 0.5408 0.85647 0.876 0.124
#> SRR1974784 2 0.0938 0.91184 0.012 0.988
#> SRR1974783 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.2236 0.90632 0.964 0.036
#> SRR1974782 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0376 0.91298 0.004 0.996
#> SRR1974780 1 0.5178 0.86351 0.884 0.116
#> SRR1974779 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2423 0.90499 0.960 0.040
#> SRR1974778 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.2603 0.89702 0.044 0.956
#> SRR1974770 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.1184 0.91147 0.016 0.984
#> SRR1974768 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.5178 0.86455 0.884 0.116
#> SRR1974766 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.1414 0.91047 0.020 0.980
#> SRR1974759 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974755 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974751 2 0.2423 0.90227 0.040 0.960
#> SRR1974750 2 0.1843 0.90742 0.028 0.972
#> SRR1974752 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.8327 0.65924 0.264 0.736
#> SRR1974747 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0376 0.91149 0.996 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0938 0.91209 0.012 0.988
#> SRR1974745 2 0.2043 0.90584 0.032 0.968
#> SRR1974743 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974742 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0938 0.91209 0.012 0.988
#> SRR1974739 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974741 2 0.1414 0.91018 0.020 0.980
#> SRR1974738 2 0.4022 0.87343 0.080 0.920
#> SRR1974737 2 0.1414 0.91023 0.020 0.980
#> SRR1974736 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974735 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.9970 0.10756 0.468 0.532
#> SRR1974733 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974732 1 0.9996 0.06526 0.512 0.488
#> SRR1974731 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974729 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.1414 0.91023 0.020 0.980
#> SRR1974725 1 0.9815 0.30996 0.580 0.420
#> SRR1974726 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974724 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.6623 0.78744 0.172 0.828
#> SRR1974723 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974722 2 0.8813 0.59320 0.300 0.700
#> SRR1974721 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.9087 0.54481 0.324 0.676
#> SRR1974719 1 0.0672 0.91099 0.992 0.008
#> SRR1974718 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.9944 0.16573 0.456 0.544
#> SRR1974717 2 0.1414 0.91018 0.020 0.980
#> SRR1974715 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974713 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.9460 0.46596 0.636 0.364
#> SRR1974711 2 0.7883 0.70507 0.236 0.764
#> SRR1974712 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.2948 0.89139 0.052 0.948
#> SRR1974710 2 0.5629 0.82476 0.132 0.868
#> SRR1974707 1 0.5059 0.86570 0.888 0.112
#> SRR1974706 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0938 0.91208 0.012 0.988
#> SRR1974702 1 0.7219 0.76694 0.800 0.200
#> SRR1974701 2 0.2423 0.90227 0.040 0.960
#> SRR1974699 2 0.0672 0.91266 0.008 0.992
#> SRR1974698 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974700 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.6148 0.82923 0.848 0.152
#> SRR1974696 2 0.6712 0.77969 0.176 0.824
#> SRR1974694 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.9044 0.55025 0.320 0.680
#> SRR1974693 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974692 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974690 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974688 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974687 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3114 0.89947 0.944 0.056
#> SRR1974682 1 0.9970 0.13231 0.532 0.468
#> SRR1974681 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.8443 0.64472 0.272 0.728
#> SRR1974680 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.2423 0.90227 0.040 0.960
#> SRR1974677 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.4022 0.88897 0.920 0.080
#> SRR1974662 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.9896 0.21506 0.440 0.560
#> SRR1974660 1 0.0376 0.91149 0.996 0.004
#> SRR1974659 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.1843 0.90771 0.972 0.028
#> SRR1974654 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.3431 0.89623 0.936 0.064
#> SRR1974656 1 0.7950 0.71367 0.760 0.240
#> SRR1974650 1 0.9983 0.11686 0.524 0.476
#> SRR1974651 2 0.1414 0.91020 0.020 0.980
#> SRR1974652 1 0.2948 0.90094 0.948 0.052
#> SRR1974653 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974648 1 0.6247 0.82494 0.844 0.156
#> SRR1974646 2 0.6048 0.81185 0.148 0.852
#> SRR1974649 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.1184 0.91126 0.016 0.984
#> SRR1974645 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.9833 0.27164 0.424 0.576
#> SRR1974640 2 0.9795 0.29611 0.416 0.584
#> SRR1974641 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.9993 0.05170 0.484 0.516
#> SRR1974634 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.1184 0.91130 0.016 0.984
#> SRR1974633 1 0.7528 0.75056 0.784 0.216
#> SRR1974632 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.9996 0.06370 0.512 0.488
#> SRR1974630 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.1633 0.90845 0.976 0.024
#> SRR1974624 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.9000 0.55481 0.316 0.684
#> SRR1974622 1 0.6973 0.78738 0.812 0.188
#> SRR1974620 2 0.9922 0.18888 0.448 0.552
#> SRR1974619 2 0.9552 0.41260 0.376 0.624
#> SRR1974621 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.4939 0.86628 0.892 0.108
#> SRR1974615 1 0.2603 0.90358 0.956 0.044
#> SRR1974618 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.8144 0.69416 0.748 0.252
#> SRR1974613 1 0.9996 0.06358 0.512 0.488
#> SRR1974612 1 0.0376 0.91149 0.996 0.004
#> SRR1974611 2 0.6531 0.78847 0.168 0.832
#> SRR1974610 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.8081 0.69931 0.752 0.248
#> SRR1974607 1 0.4022 0.88751 0.920 0.080
#> SRR1974606 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.7376 0.76177 0.792 0.208
#> SRR1974604 2 0.1633 0.90894 0.024 0.976
#> SRR1974603 1 0.5178 0.86632 0.884 0.116
#> SRR1974602 1 0.0000 0.91194 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.6048 0.80947 0.148 0.852
#> SRR1974599 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974593 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974590 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974586 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974584 1 0.2948 0.90115 0.948 0.052
#> SRR1974583 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974578 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974577 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974576 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974570 1 0.4562 0.87966 0.904 0.096
#> SRR1974568 1 0.5519 0.85362 0.872 0.128
#> SRR1974567 1 0.4161 0.88587 0.916 0.084
#> SRR1974566 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.0672 0.91292 0.008 0.992
#> SRR1974564 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.4690 0.87544 0.900 0.100
#> SRR1974559 1 0.2948 0.90115 0.948 0.052
#> SRR1974563 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.2948 0.90115 0.948 0.052
#> SRR1974551 1 0.2948 0.90115 0.948 0.052
#> SRR1974552 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.6438 0.81883 0.836 0.164
#> SRR1974558 1 0.4161 0.88587 0.916 0.084
#> SRR1974556 1 0.2948 0.90115 0.948 0.052
#> SRR1974550 2 0.5946 0.81844 0.144 0.856
#> SRR1974549 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.6801 0.80113 0.820 0.180
#> SRR1974546 1 0.8713 0.62764 0.708 0.292
#> SRR1974545 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.4161 0.88587 0.916 0.084
#> SRR1974543 2 0.0000 0.91307 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.7462 0.45534 0.352 0.048 0.600
#> SRR1975008 2 0.3619 0.84608 0.000 0.864 0.136
#> SRR1975006 2 0.4931 0.80014 0.000 0.768 0.232
#> SRR1975005 2 0.6587 0.51649 0.008 0.568 0.424
#> SRR1975004 3 0.7367 0.51039 0.292 0.060 0.648
#> SRR1975003 2 0.4605 0.81448 0.000 0.796 0.204
#> SRR1975001 2 0.2448 0.84890 0.000 0.924 0.076
#> SRR1975002 2 0.2448 0.84678 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974999 2 0.2711 0.85088 0.000 0.912 0.088
#> SRR1975000 3 0.6908 0.49030 0.308 0.036 0.656
#> SRR1974998 3 0.7327 0.49760 0.312 0.052 0.636
#> SRR1974997 2 0.6818 0.60108 0.024 0.628 0.348
#> SRR1974995 2 0.6553 0.53143 0.008 0.580 0.412
#> SRR1974996 3 0.8291 0.50778 0.320 0.100 0.580
#> SRR1974994 3 0.6307 0.12240 0.488 0.000 0.512
#> SRR1974993 3 0.7681 0.00550 0.048 0.412 0.540
#> SRR1974992 2 0.6598 0.50659 0.008 0.564 0.428
#> SRR1974990 3 0.6264 0.37250 0.380 0.004 0.616
#> SRR1974989 2 0.6066 0.74800 0.024 0.728 0.248
#> SRR1974991 2 0.6180 0.54650 0.000 0.584 0.416
#> SRR1974986 3 0.6252 0.43557 0.344 0.008 0.648
#> SRR1974987 2 0.6247 0.61217 0.004 0.620 0.376
#> SRR1974988 3 0.7736 0.05198 0.052 0.400 0.548
#> SRR1974984 2 0.6888 0.47541 0.016 0.552 0.432
#> SRR1974985 3 0.6045 0.36788 0.380 0.000 0.620
#> SRR1974983 2 0.2448 0.84890 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974982 3 0.6045 0.36808 0.380 0.000 0.620
#> SRR1974981 3 0.6111 0.33483 0.396 0.000 0.604
#> SRR1974980 3 0.6548 0.39360 0.372 0.012 0.616
#> SRR1974979 2 0.5178 0.77404 0.000 0.744 0.256
#> SRR1974978 3 0.7971 0.53464 0.280 0.096 0.624
#> SRR1974977 3 0.7091 0.48666 0.320 0.040 0.640
#> SRR1974976 2 0.4887 0.79706 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974975 2 0.5929 0.68281 0.004 0.676 0.320
#> SRR1974974 2 0.3267 0.84521 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974973 2 0.2448 0.84540 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974972 2 0.6786 0.44380 0.012 0.540 0.448
#> SRR1974971 2 0.2625 0.84968 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974970 3 0.7770 0.11574 0.056 0.384 0.560
#> SRR1974969 3 0.8201 0.12351 0.076 0.400 0.524
#> SRR1974968 2 0.3482 0.84717 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974967 3 0.7517 -0.01370 0.040 0.420 0.540
#> SRR1974965 3 0.6651 0.44884 0.340 0.020 0.640
#> SRR1974966 2 0.2625 0.84366 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974964 3 0.6825 -0.30256 0.012 0.488 0.500
#> SRR1974963 3 0.7777 0.01595 0.052 0.416 0.532
#> SRR1974961 2 0.6489 0.43912 0.004 0.540 0.456
#> SRR1974962 2 0.2448 0.84540 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974960 3 0.7866 0.10188 0.060 0.388 0.552
#> SRR1974959 3 0.7557 0.43923 0.080 0.264 0.656
#> SRR1974958 2 0.2711 0.84522 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974957 2 0.5098 0.78035 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974956 2 0.6816 0.35685 0.012 0.516 0.472
#> SRR1974955 3 0.6726 0.46217 0.332 0.024 0.644
#> SRR1974954 3 0.7610 0.09844 0.048 0.388 0.564
#> SRR1974953 2 0.3116 0.85165 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974952 3 0.7274 -0.16153 0.028 0.452 0.520
#> SRR1974949 2 0.6062 0.59957 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974950 2 0.4750 0.79749 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974951 2 0.4346 0.82312 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974947 2 0.5882 0.65291 0.000 0.652 0.348
#> SRR1974948 2 0.2625 0.84878 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974946 2 0.1411 0.84316 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974945 3 0.8134 0.31734 0.088 0.328 0.584
#> SRR1974944 3 0.6095 0.34185 0.392 0.000 0.608
#> SRR1974942 3 0.6677 0.46821 0.324 0.024 0.652
#> SRR1974943 2 0.5785 0.68990 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974941 3 0.8202 0.54740 0.260 0.120 0.620
#> SRR1974940 3 0.8300 0.51021 0.136 0.244 0.620
#> SRR1974939 2 0.4346 0.82383 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974938 3 0.7378 0.03135 0.036 0.404 0.560
#> SRR1974937 3 0.6651 0.47242 0.320 0.024 0.656
#> SRR1974936 3 0.6843 0.46504 0.332 0.028 0.640
#> SRR1974935 3 0.7980 0.23602 0.072 0.356 0.572
#> SRR1974934 2 0.2448 0.84540 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974933 2 0.4399 0.81698 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974932 3 0.8637 0.41926 0.128 0.308 0.564
#> SRR1974931 3 0.6579 0.45988 0.328 0.020 0.652
#> SRR1974930 3 0.6773 0.45146 0.340 0.024 0.636
#> SRR1974929 3 0.8001 0.56661 0.212 0.136 0.652
#> SRR1974928 2 0.2448 0.84917 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974927 3 0.7624 0.08502 0.048 0.392 0.560
#> SRR1974924 3 0.6062 0.36070 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974925 3 0.5988 0.38830 0.368 0.000 0.632
#> SRR1974926 3 0.6600 0.37598 0.384 0.012 0.604
#> SRR1974923 3 0.6742 0.48002 0.316 0.028 0.656
#> SRR1974922 3 0.8071 0.22826 0.076 0.360 0.564
#> SRR1974921 3 0.6601 0.49891 0.296 0.028 0.676
#> SRR1974920 3 0.6548 0.39523 0.372 0.012 0.616
#> SRR1974919 3 0.7923 0.51949 0.120 0.228 0.652
#> SRR1974918 3 0.7902 0.41930 0.092 0.280 0.628
#> SRR1974917 2 0.2356 0.84483 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974916 3 0.7862 0.57727 0.148 0.184 0.668
#> SRR1974915 3 0.8075 0.44084 0.104 0.276 0.620
#> SRR1974914 2 0.4172 0.84183 0.004 0.840 0.156
#> SRR1974913 3 0.7750 0.57855 0.140 0.184 0.676
#> SRR1974911 3 0.6651 0.47242 0.320 0.024 0.656
#> SRR1974910 3 0.6978 0.46144 0.336 0.032 0.632
#> SRR1974908 2 0.2356 0.84524 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974909 3 0.7951 0.45776 0.104 0.260 0.636
#> SRR1974906 2 0.5810 0.68664 0.000 0.664 0.336
#> SRR1974907 3 0.7353 -0.10650 0.032 0.436 0.532
#> SRR1974905 3 0.7884 0.55176 0.252 0.104 0.644
#> SRR1974904 2 0.3879 0.83447 0.000 0.848 0.152
#> SRR1974903 3 0.7880 0.48955 0.108 0.244 0.648
#> SRR1974902 2 0.4235 0.82581 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974901 3 0.7601 0.01396 0.044 0.416 0.540
#> SRR1974898 2 0.2261 0.84650 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974900 2 0.3192 0.84514 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974899 2 0.2959 0.84776 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974897 2 0.2261 0.84417 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974896 2 0.2711 0.85140 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974893 2 0.3412 0.84693 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974895 2 0.1529 0.84305 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974894 2 0.2878 0.85029 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974892 2 0.4473 0.83343 0.008 0.828 0.164
#> SRR1974890 2 0.5406 0.78767 0.012 0.764 0.224
#> SRR1974891 2 0.3412 0.84884 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974889 2 0.2165 0.84537 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974888 2 0.3038 0.84953 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974886 2 0.3038 0.85121 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974887 2 0.6217 0.72810 0.024 0.712 0.264
#> SRR1974885 2 0.6337 0.72280 0.028 0.708 0.264
#> SRR1974883 2 0.2878 0.85394 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974884 2 0.3116 0.84851 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974881 2 0.2625 0.85326 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974882 2 0.2959 0.85134 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974880 2 0.1529 0.84332 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974879 2 0.3116 0.84632 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974877 2 0.2261 0.84650 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974876 2 0.4228 0.84225 0.008 0.844 0.148
#> SRR1974878 2 0.4293 0.83930 0.004 0.832 0.164
#> SRR1974875 2 0.6217 0.72810 0.024 0.712 0.264
#> SRR1974874 2 0.1031 0.84608 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974873 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974871 2 0.1163 0.85087 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974872 1 0.6676 -0.02678 0.516 0.008 0.476
#> SRR1974869 2 0.4062 0.82103 0.000 0.836 0.164
#> SRR1974868 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974870 2 0.5905 0.58917 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974866 2 0.5465 0.69040 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974867 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.1031 0.84608 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974864 1 0.5621 0.50076 0.692 0.000 0.308
#> SRR1974862 2 0.1753 0.85441 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974863 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974860 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974861 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974859 2 0.4842 0.79417 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974858 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974856 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974857 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974855 2 0.7636 0.43823 0.048 0.556 0.396
#> SRR1974854 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 3 0.9924 0.37701 0.288 0.320 0.392
#> SRR1974852 2 0.3551 0.84404 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974849 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.7123 0.54609 0.032 0.604 0.364
#> SRR1974846 2 0.5016 0.78506 0.000 0.760 0.240
#> SRR1974847 1 0.4346 0.70911 0.816 0.000 0.184
#> SRR1974845 2 0.3340 0.84584 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974844 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6057 0.41745 0.656 0.004 0.340
#> SRR1974842 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974839 2 0.3619 0.84229 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974838 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.3116 0.84999 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974834 2 0.4062 0.83203 0.000 0.836 0.164
#> SRR1974833 2 0.7777 0.37143 0.052 0.532 0.416
#> SRR1974831 2 0.4575 0.82297 0.004 0.812 0.184
#> SRR1974832 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.1411 0.84821 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974827 2 0.4121 0.83062 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974824 1 0.5656 0.55760 0.712 0.004 0.284
#> SRR1974825 1 0.2537 0.83511 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974822 1 0.5815 0.52072 0.692 0.004 0.304
#> SRR1974823 3 0.8310 0.44421 0.312 0.104 0.584
#> SRR1974820 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7277 0.41594 0.660 0.060 0.280
#> SRR1974815 1 0.1860 0.85990 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974813 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.7153 0.63992 0.048 0.652 0.300
#> SRR1974812 1 0.7112 0.46422 0.680 0.060 0.260
#> SRR1974810 1 0.3038 0.80975 0.896 0.000 0.104
#> SRR1974808 2 0.5882 0.59709 0.000 0.652 0.348
#> SRR1974811 1 0.1643 0.86549 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974809 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.6969 0.28105 0.596 0.024 0.380
#> SRR1974806 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.4465 0.82691 0.004 0.820 0.176
#> SRR1974804 3 0.9904 0.38315 0.284 0.316 0.400
#> SRR1974803 1 0.2711 0.82787 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974801 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3116 0.80690 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974799 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1163 0.84691 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974797 2 0.2261 0.85536 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974796 2 0.4235 0.82799 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974795 2 0.4575 0.82297 0.004 0.812 0.184
#> SRR1974793 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1529 0.84479 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974792 2 0.3267 0.84735 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974791 2 0.4121 0.83062 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974790 2 0.2165 0.85564 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974789 2 0.1411 0.84480 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974788 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974786 1 0.6373 0.21300 0.588 0.004 0.408
#> SRR1974787 3 0.7672 0.18177 0.468 0.044 0.488
#> SRR1974784 2 0.3267 0.85071 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974783 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.6252 0.12057 0.556 0.000 0.444
#> SRR1974782 1 0.0237 0.89315 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974781 2 0.3267 0.85087 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974780 3 0.7758 0.18353 0.468 0.048 0.484
#> SRR1974779 1 0.0237 0.89315 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974777 1 0.0237 0.89315 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974776 1 0.6451 0.13113 0.560 0.004 0.436
#> SRR1974778 1 0.1529 0.86877 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974774 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974773 1 0.0237 0.89315 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974775 1 0.0237 0.89315 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974772 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.3610 0.85031 0.016 0.888 0.096
#> SRR1974770 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974769 2 0.4002 0.83482 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974768 2 0.1529 0.85461 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974767 3 0.7652 0.25582 0.444 0.044 0.512
#> SRR1974766 2 0.1753 0.85518 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974765 2 0.2261 0.85545 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974764 2 0.1289 0.85357 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974763 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.2066 0.85298 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974761 2 0.1289 0.85357 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974760 2 0.4178 0.82941 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974759 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1529 0.85503 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974757 2 0.2356 0.85665 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974756 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974755 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974753 2 0.4842 0.79463 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974751 2 0.5098 0.77893 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974750 2 0.4974 0.78710 0.000 0.764 0.236
#> SRR1974752 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.7956 0.29705 0.060 0.516 0.424
#> SRR1974747 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.1163 0.87861 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974746 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.3816 0.83764 0.000 0.852 0.148
#> SRR1974745 2 0.4974 0.78766 0.000 0.764 0.236
#> SRR1974743 2 0.4702 0.80168 0.000 0.788 0.212
#> SRR1974742 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.3551 0.84443 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974739 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974741 2 0.4235 0.82247 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974738 2 0.5291 0.73321 0.000 0.732 0.268
#> SRR1974737 2 0.4750 0.80084 0.000 0.784 0.216
#> SRR1974736 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974735 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.8668 0.43960 0.132 0.304 0.564
#> SRR1974733 2 0.4887 0.79335 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974732 3 0.9339 0.45403 0.188 0.316 0.496
#> SRR1974731 2 0.4887 0.79166 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974729 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.2537 0.83490 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974728 2 0.4796 0.79812 0.000 0.780 0.220
#> SRR1974725 3 0.8681 0.54044 0.188 0.216 0.596
#> SRR1974726 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974724 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.6721 0.51786 0.016 0.604 0.380
#> SRR1974723 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974722 2 0.8705 0.29021 0.116 0.524 0.360
#> SRR1974721 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974720 2 0.8404 0.07741 0.084 0.464 0.452
#> SRR1974719 1 0.1643 0.86717 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974718 1 0.0237 0.89321 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974716 3 0.8157 0.41861 0.096 0.308 0.596
#> SRR1974717 2 0.3551 0.84310 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974715 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974713 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.7815 0.53615 0.180 0.148 0.672
#> SRR1974711 2 0.7337 0.31276 0.032 0.540 0.428
#> SRR1974712 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.5098 0.74271 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974710 2 0.5988 0.55514 0.000 0.632 0.368
#> SRR1974707 1 0.6818 0.37694 0.628 0.024 0.348
#> SRR1974706 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.2959 0.85022 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974702 1 0.9021 -0.26209 0.452 0.132 0.416
#> SRR1974701 2 0.5098 0.77893 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974699 2 0.3192 0.85154 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974698 2 0.4504 0.81420 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974700 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.7476 0.00966 0.512 0.036 0.452
#> SRR1974696 2 0.6632 0.48115 0.012 0.596 0.392
#> SRR1974694 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 3 0.7627 0.04695 0.044 0.428 0.528
#> SRR1974693 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974692 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974690 2 0.2165 0.85501 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974691 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974688 2 0.4887 0.79249 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974687 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4645 0.72187 0.816 0.008 0.176
#> SRR1974682 3 1.0000 0.39227 0.332 0.332 0.336
#> SRR1974681 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.8188 0.36818 0.080 0.548 0.372
#> SRR1974680 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.5098 0.77893 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974677 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1289 0.85246 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974675 2 0.2448 0.84295 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974674 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.3619 0.83917 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974671 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974672 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974670 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974669 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974667 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974668 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974666 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974664 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974665 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974663 3 0.6654 0.18593 0.456 0.008 0.536
#> SRR1974662 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.8044 0.39427 0.088 0.312 0.600
#> SRR1974660 1 0.3192 0.79984 0.888 0.000 0.112
#> SRR1974659 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.4931 0.65130 0.768 0.000 0.232
#> SRR1974654 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.6082 0.50842 0.692 0.012 0.296
#> SRR1974656 3 0.8362 0.33620 0.384 0.088 0.528
#> SRR1974650 3 0.8408 0.53095 0.144 0.244 0.612
#> SRR1974651 2 0.3879 0.83350 0.000 0.848 0.152
#> SRR1974652 1 0.6432 0.16471 0.568 0.004 0.428
#> SRR1974653 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974648 1 0.7480 -0.00125 0.508 0.036 0.456
#> SRR1974646 2 0.6339 0.55598 0.008 0.632 0.360
#> SRR1974649 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.4178 0.82531 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974645 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1163 0.85292 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974643 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.8013 0.35563 0.080 0.332 0.588
#> SRR1974640 3 0.8034 0.33956 0.080 0.336 0.584
#> SRR1974641 2 0.1163 0.84766 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974639 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0592 0.88867 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974635 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.8258 0.46821 0.112 0.284 0.604
#> SRR1974634 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.3412 0.84702 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974633 3 0.7622 0.41344 0.332 0.060 0.608
#> SRR1974632 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.7997 0.52150 0.120 0.236 0.644
#> SRR1974630 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0592 0.88804 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974627 1 0.3573 0.79449 0.876 0.004 0.120
#> SRR1974624 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974623 3 0.7372 0.00403 0.032 0.448 0.520
#> SRR1974622 1 0.8069 -0.11981 0.476 0.064 0.460
#> SRR1974620 3 0.7481 0.41899 0.064 0.296 0.640
#> SRR1974619 3 0.8010 0.22617 0.068 0.384 0.548
#> SRR1974621 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.7199 0.45148 0.676 0.064 0.260
#> SRR1974615 1 0.4409 0.73360 0.824 0.004 0.172
#> SRR1974618 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.8925 0.41746 0.364 0.132 0.504
#> SRR1974613 3 0.8421 0.51247 0.140 0.252 0.608
#> SRR1974612 1 0.1860 0.86004 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974611 2 0.6498 0.48605 0.008 0.596 0.396
#> SRR1974610 2 0.1753 0.85405 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974609 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 3 0.8297 0.38558 0.348 0.092 0.560
#> SRR1974607 1 0.6521 0.42094 0.644 0.016 0.340
#> SRR1974606 2 0.1289 0.84409 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974605 3 0.7777 0.37194 0.364 0.060 0.576
#> SRR1974604 2 0.4931 0.78982 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974603 3 0.7032 0.39127 0.368 0.028 0.604
#> SRR1974602 1 0.0000 0.89559 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.1529 0.84957 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974601 2 0.6062 0.53181 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974599 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974598 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974596 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974594 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974593 2 0.1411 0.84821 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974595 2 0.1163 0.85258 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974592 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974591 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974588 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974590 2 0.1289 0.85050 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974589 2 0.1411 0.84821 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974587 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974586 2 0.1411 0.84821 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974585 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974584 3 0.6520 0.11111 0.488 0.004 0.508
#> SRR1974583 2 0.1031 0.84578 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974582 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974581 2 0.1289 0.84320 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974580 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974578 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974577 2 0.2448 0.85562 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974579 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974576 2 0.1031 0.84578 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974575 2 0.1411 0.84345 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974574 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974573 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974571 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974572 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974570 3 0.6832 0.37166 0.376 0.020 0.604
#> SRR1974568 3 0.7001 0.41704 0.340 0.032 0.628
#> SRR1974567 3 0.6247 0.34933 0.376 0.004 0.620
#> SRR1974566 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974569 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974565 2 0.3340 0.84738 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974564 2 0.2261 0.85476 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974560 3 0.6686 0.36661 0.372 0.016 0.612
#> SRR1974559 3 0.6520 0.11111 0.488 0.004 0.508
#> SRR1974563 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974562 2 0.2261 0.85476 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974561 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974557 2 0.0892 0.84430 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974553 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974555 3 0.6520 0.11111 0.488 0.004 0.508
#> SRR1974551 3 0.6520 0.11111 0.488 0.004 0.508
#> SRR1974552 2 0.2261 0.85476 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974554 3 0.7553 0.46109 0.320 0.060 0.620
#> SRR1974558 3 0.6247 0.34933 0.376 0.004 0.620
#> SRR1974556 3 0.6521 0.09832 0.492 0.004 0.504
#> SRR1974550 2 0.6079 0.54054 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974549 2 0.2165 0.85412 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974548 2 0.2448 0.85025 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974547 3 0.7724 0.48120 0.308 0.072 0.620
#> SRR1974546 3 0.8423 0.54469 0.228 0.156 0.616
#> SRR1974545 2 0.2165 0.85592 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974544 3 0.6247 0.34933 0.376 0.004 0.620
#> SRR1974543 2 0.1411 0.85488 0.000 0.964 0.036
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.7239 0.61127 0.144 0.004 0.528 0.324
#> SRR1975008 2 0.4188 0.59153 0.000 0.752 0.004 0.244
#> SRR1975006 2 0.5220 0.26884 0.000 0.568 0.008 0.424
#> SRR1975005 4 0.5764 0.41006 0.000 0.304 0.052 0.644
#> SRR1975004 3 0.7660 0.55338 0.120 0.024 0.488 0.368
#> SRR1975003 2 0.5217 0.39901 0.000 0.608 0.012 0.380
#> SRR1975001 2 0.2921 0.65581 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1975002 2 0.2589 0.65066 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974999 2 0.3311 0.64695 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1975000 3 0.7260 0.59140 0.124 0.008 0.516 0.352
#> SRR1974998 3 0.7211 0.58101 0.128 0.004 0.500 0.368
#> SRR1974997 4 0.6733 0.35996 0.004 0.344 0.092 0.560
#> SRR1974995 4 0.6215 0.38435 0.000 0.328 0.072 0.600
#> SRR1974996 3 0.7915 0.53273 0.136 0.028 0.456 0.380
#> SRR1974994 3 0.7357 0.57121 0.296 0.000 0.512 0.192
#> SRR1974993 4 0.5938 0.48884 0.000 0.168 0.136 0.696
#> SRR1974992 4 0.5697 0.42094 0.000 0.292 0.052 0.656
#> SRR1974990 3 0.7062 0.64022 0.176 0.000 0.564 0.260
#> SRR1974989 2 0.6316 -0.02435 0.004 0.476 0.048 0.472
#> SRR1974991 4 0.5827 0.39390 0.000 0.316 0.052 0.632
#> SRR1974986 3 0.7082 0.62535 0.152 0.000 0.540 0.308
#> SRR1974987 4 0.5756 0.29784 0.000 0.372 0.036 0.592
#> SRR1974988 4 0.6034 0.47794 0.000 0.164 0.148 0.688
#> SRR1974984 4 0.5791 0.43275 0.000 0.284 0.060 0.656
#> SRR1974985 3 0.7005 0.64124 0.172 0.000 0.572 0.256
#> SRR1974983 2 0.2921 0.65720 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974982 3 0.7005 0.64131 0.172 0.000 0.572 0.256
#> SRR1974981 3 0.7067 0.64249 0.188 0.000 0.568 0.244
#> SRR1974980 3 0.7187 0.63718 0.168 0.004 0.564 0.264
#> SRR1974979 2 0.5628 0.24390 0.000 0.556 0.024 0.420
#> SRR1974978 3 0.7595 0.49266 0.108 0.024 0.460 0.408
#> SRR1974977 3 0.7110 0.58404 0.120 0.004 0.516 0.360
#> SRR1974976 2 0.5161 0.32433 0.000 0.592 0.008 0.400
#> SRR1974975 4 0.5821 0.16511 0.000 0.432 0.032 0.536
#> SRR1974974 2 0.3831 0.61849 0.000 0.792 0.004 0.204
#> SRR1974973 2 0.2760 0.64800 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974972 4 0.5810 0.44744 0.000 0.276 0.064 0.660
#> SRR1974971 2 0.3172 0.64505 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974970 4 0.5767 0.44434 0.000 0.136 0.152 0.712
#> SRR1974969 4 0.7837 0.44906 0.024 0.220 0.216 0.540
#> SRR1974968 2 0.4456 0.56237 0.000 0.716 0.004 0.280
#> SRR1974967 4 0.6065 0.49501 0.000 0.176 0.140 0.684
#> SRR1974965 3 0.6991 0.61000 0.136 0.000 0.540 0.324
#> SRR1974966 2 0.2868 0.64831 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974964 4 0.5723 0.48618 0.000 0.220 0.084 0.696
#> SRR1974963 4 0.6115 0.48645 0.000 0.172 0.148 0.680
#> SRR1974961 4 0.5949 0.43050 0.000 0.288 0.068 0.644
#> SRR1974962 2 0.2647 0.64930 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974960 4 0.6309 0.46153 0.008 0.152 0.156 0.684
#> SRR1974959 4 0.6307 0.20536 0.012 0.076 0.256 0.656
#> SRR1974958 2 0.2868 0.64882 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974957 2 0.5493 0.16713 0.000 0.528 0.016 0.456
#> SRR1974956 4 0.6323 0.45451 0.000 0.272 0.100 0.628
#> SRR1974955 3 0.6966 0.60474 0.132 0.000 0.540 0.328
#> SRR1974954 4 0.5771 0.45175 0.000 0.144 0.144 0.712
#> SRR1974953 2 0.3172 0.64089 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974952 4 0.5783 0.50650 0.000 0.188 0.108 0.704
#> SRR1974949 4 0.6240 0.32385 0.000 0.368 0.064 0.568
#> SRR1974950 2 0.5352 0.34438 0.000 0.596 0.016 0.388
#> SRR1974951 2 0.5018 0.46709 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR1974947 4 0.5924 0.24447 0.000 0.404 0.040 0.556
#> SRR1974948 2 0.3024 0.64511 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974946 2 0.0707 0.67503 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974945 4 0.6580 0.34023 0.016 0.116 0.204 0.664
#> SRR1974944 3 0.7035 0.64274 0.184 0.000 0.572 0.244
#> SRR1974942 3 0.6953 0.60800 0.128 0.000 0.536 0.336
#> SRR1974943 4 0.5901 0.13459 0.000 0.432 0.036 0.532
#> SRR1974941 4 0.7723 -0.43459 0.104 0.032 0.424 0.440
#> SRR1974940 4 0.7390 0.13095 0.044 0.092 0.276 0.588
#> SRR1974939 2 0.5186 0.46051 0.000 0.640 0.016 0.344
#> SRR1974938 4 0.5758 0.47578 0.000 0.160 0.128 0.712
#> SRR1974937 3 0.6979 0.60329 0.128 0.000 0.528 0.344
#> SRR1974936 3 0.6897 0.60667 0.124 0.000 0.544 0.332
#> SRR1974935 4 0.6167 0.40123 0.004 0.124 0.188 0.684
#> SRR1974934 2 0.2647 0.65050 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974933 2 0.5038 0.46720 0.000 0.652 0.012 0.336
#> SRR1974932 4 0.7171 0.23653 0.040 0.100 0.236 0.624
#> SRR1974931 3 0.6925 0.61177 0.128 0.000 0.544 0.328
#> SRR1974930 3 0.7001 0.61962 0.140 0.000 0.544 0.316
#> SRR1974929 4 0.7383 -0.35071 0.064 0.040 0.432 0.464
#> SRR1974928 2 0.2868 0.65872 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974927 4 0.5760 0.45257 0.004 0.140 0.132 0.724
#> SRR1974924 3 0.7073 0.64200 0.180 0.000 0.564 0.256
#> SRR1974925 3 0.7023 0.63840 0.164 0.000 0.564 0.272
#> SRR1974926 3 0.7062 0.63830 0.176 0.000 0.564 0.260
#> SRR1974923 3 0.7002 0.60033 0.128 0.000 0.520 0.352
#> SRR1974922 4 0.6300 0.41121 0.004 0.132 0.192 0.672
#> SRR1974921 3 0.7034 0.56979 0.112 0.004 0.520 0.364
#> SRR1974920 3 0.7064 0.63599 0.164 0.000 0.556 0.280
#> SRR1974919 4 0.6444 0.08686 0.016 0.060 0.304 0.620
#> SRR1974918 4 0.6531 0.24649 0.020 0.084 0.240 0.656
#> SRR1974917 2 0.2281 0.64567 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974916 4 0.7262 -0.10584 0.044 0.060 0.356 0.540
#> SRR1974915 4 0.6360 0.22581 0.008 0.084 0.264 0.644
#> SRR1974914 2 0.4999 0.49345 0.000 0.660 0.012 0.328
#> SRR1974913 4 0.7043 -0.09693 0.040 0.052 0.352 0.556
#> SRR1974911 3 0.6991 0.60258 0.128 0.000 0.524 0.348
#> SRR1974910 3 0.7046 0.60918 0.136 0.000 0.524 0.340
#> SRR1974908 2 0.2647 0.65443 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974909 4 0.6434 0.19395 0.016 0.072 0.268 0.644
#> SRR1974906 4 0.5724 0.15688 0.000 0.424 0.028 0.548
#> SRR1974907 4 0.5650 0.50842 0.000 0.180 0.104 0.716
#> SRR1974905 3 0.7242 0.41712 0.076 0.024 0.456 0.444
#> SRR1974904 2 0.4844 0.52248 0.000 0.688 0.012 0.300
#> SRR1974903 4 0.6311 0.12839 0.016 0.056 0.292 0.636
#> SRR1974902 2 0.5130 0.48269 0.000 0.652 0.016 0.332
#> SRR1974901 4 0.6155 0.49372 0.000 0.176 0.148 0.676
#> SRR1974898 2 0.2647 0.65701 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974900 2 0.3791 0.63632 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR1974899 2 0.3494 0.63485 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR1974897 2 0.2589 0.65476 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974896 2 0.3400 0.65147 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1974893 2 0.3831 0.62327 0.000 0.792 0.004 0.204
#> SRR1974895 2 0.0707 0.67620 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974894 2 0.3610 0.64129 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974892 2 0.5614 0.44503 0.000 0.628 0.036 0.336
#> SRR1974890 2 0.6038 0.19310 0.000 0.532 0.044 0.424
#> SRR1974891 2 0.3945 0.63160 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR1974889 2 0.2469 0.65699 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974888 2 0.3539 0.64177 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR1974886 2 0.3764 0.64018 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1974887 2 0.6443 -0.04808 0.004 0.472 0.056 0.468
#> SRR1974885 4 0.6567 0.08566 0.008 0.456 0.056 0.480
#> SRR1974883 2 0.3688 0.64657 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1974884 2 0.3668 0.62758 0.000 0.808 0.004 0.188
#> SRR1974881 2 0.3726 0.64539 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1974882 2 0.3837 0.63330 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974880 2 0.1474 0.68302 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974879 2 0.3831 0.63650 0.000 0.792 0.004 0.204
#> SRR1974877 2 0.2345 0.65694 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974876 2 0.5252 0.47306 0.000 0.644 0.020 0.336
#> SRR1974878 2 0.5110 0.48825 0.000 0.656 0.016 0.328
#> SRR1974875 2 0.6443 -0.04808 0.004 0.472 0.056 0.468
#> SRR1974874 2 0.1576 0.67673 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1974873 4 0.5917 0.13192 0.000 0.444 0.036 0.520
#> SRR1974871 2 0.2125 0.67703 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1974872 3 0.7031 0.50652 0.348 0.000 0.520 0.132
#> SRR1974869 2 0.6851 0.31081 0.000 0.584 0.148 0.268
#> SRR1974868 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974870 2 0.7888 -0.02941 0.000 0.380 0.300 0.320
#> SRR1974866 2 0.7711 0.06752 0.000 0.444 0.248 0.308
#> SRR1974867 1 0.0188 0.91565 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974865 2 0.1576 0.67643 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1974864 1 0.6179 0.07185 0.552 0.000 0.392 0.056
#> SRR1974862 2 0.2197 0.67638 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1974863 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974860 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974861 2 0.0817 0.68067 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974859 4 0.5931 0.08938 0.000 0.460 0.036 0.504
#> SRR1974858 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974856 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974857 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974855 4 0.7432 0.41523 0.024 0.280 0.128 0.568
#> SRR1974854 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.8975 0.02801 0.256 0.108 0.168 0.468
#> SRR1974852 2 0.4920 0.42387 0.000 0.628 0.004 0.368
#> SRR1974849 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.7549 0.35827 0.020 0.308 0.136 0.536
#> SRR1974846 4 0.6120 0.15686 0.000 0.432 0.048 0.520
#> SRR1974847 1 0.4888 0.60411 0.740 0.000 0.224 0.036
#> SRR1974845 2 0.4855 0.45822 0.000 0.644 0.004 0.352
#> SRR1974844 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6315 -0.08764 0.508 0.000 0.432 0.060
#> SRR1974842 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.5917 0.13192 0.000 0.444 0.036 0.520
#> SRR1974839 2 0.4991 0.38976 0.000 0.608 0.004 0.388
#> SRR1974838 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.4761 0.49464 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1974834 2 0.5220 0.28394 0.000 0.568 0.008 0.424
#> SRR1974833 4 0.7456 0.43454 0.028 0.260 0.132 0.580
#> SRR1974831 2 0.5378 0.20819 0.000 0.540 0.012 0.448
#> SRR1974832 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2450 0.67228 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1974827 2 0.5229 0.27413 0.000 0.564 0.008 0.428
#> SRR1974824 1 0.5070 0.35563 0.620 0.000 0.372 0.008
#> SRR1974825 1 0.2704 0.80801 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974822 1 0.5387 0.25628 0.584 0.000 0.400 0.016
#> SRR1974823 3 0.5996 0.59585 0.188 0.012 0.708 0.092
#> SRR1974820 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7253 0.31456 0.608 0.020 0.200 0.172
#> SRR1974815 1 0.1940 0.86382 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.7900 0.26118 0.028 0.352 0.140 0.480
#> SRR1974812 1 0.6970 0.37435 0.628 0.016 0.212 0.144
#> SRR1974810 1 0.3324 0.77805 0.852 0.000 0.136 0.012
#> SRR1974808 2 0.7881 -0.02539 0.000 0.384 0.296 0.320
#> SRR1974811 1 0.1743 0.87213 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974809 1 0.0336 0.91369 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974807 1 0.5604 -0.02984 0.504 0.000 0.476 0.020
#> SRR1974806 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.5360 0.24432 0.000 0.552 0.012 0.436
#> SRR1974804 4 0.8957 0.02847 0.252 0.108 0.168 0.472
#> SRR1974803 1 0.2589 0.82207 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3208 0.77337 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1974799 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1118 0.68635 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974797 2 0.4008 0.61879 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1974796 2 0.5353 0.25129 0.000 0.556 0.012 0.432
#> SRR1974795 2 0.5378 0.20819 0.000 0.540 0.012 0.448
#> SRR1974793 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0921 0.68308 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974792 2 0.4837 0.46259 0.000 0.648 0.004 0.348
#> SRR1974791 2 0.5229 0.27413 0.000 0.564 0.008 0.428
#> SRR1974790 2 0.3942 0.62633 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1974789 2 0.1118 0.68451 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974788 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974786 3 0.6875 0.36957 0.420 0.000 0.476 0.104
#> SRR1974787 3 0.7512 0.54587 0.316 0.004 0.500 0.180
#> SRR1974784 2 0.4897 0.48882 0.000 0.660 0.008 0.332
#> SRR1974783 1 0.0336 0.91390 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974785 3 0.6735 0.44050 0.388 0.000 0.516 0.096
#> SRR1974782 1 0.0469 0.91129 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974781 2 0.4761 0.48721 0.000 0.664 0.004 0.332
#> SRR1974780 3 0.7517 0.55930 0.304 0.012 0.528 0.156
#> SRR1974779 1 0.0336 0.91308 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974777 1 0.0336 0.91308 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974776 3 0.6919 0.43385 0.388 0.000 0.500 0.112
#> SRR1974778 1 0.1970 0.86803 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1974774 2 0.2647 0.67928 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974773 1 0.0657 0.90739 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974775 1 0.0469 0.91033 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974772 1 0.0188 0.91580 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974771 2 0.4833 0.64081 0.008 0.776 0.040 0.176
#> SRR1974770 2 0.2345 0.68484 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974769 2 0.5183 0.32903 0.000 0.584 0.008 0.408
#> SRR1974768 2 0.2921 0.67285 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974767 3 0.7216 0.59840 0.272 0.008 0.568 0.152
#> SRR1974766 2 0.3024 0.66961 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1974765 2 0.4103 0.60612 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1974764 2 0.2814 0.67785 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974763 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.2563 0.84199 0.908 0.000 0.072 0.020
#> SRR1974761 2 0.2704 0.68076 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1974760 2 0.5236 0.26324 0.000 0.560 0.008 0.432
#> SRR1974759 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2868 0.67703 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974757 2 0.4053 0.62405 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1974756 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.5917 0.13192 0.000 0.444 0.036 0.520
#> SRR1974755 2 0.2760 0.67720 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974753 4 0.5933 0.08892 0.000 0.464 0.036 0.500
#> SRR1974751 4 0.6182 0.16696 0.000 0.428 0.052 0.520
#> SRR1974750 4 0.5982 0.15034 0.000 0.436 0.040 0.524
#> SRR1974752 1 0.0336 0.91369 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974749 3 0.8540 -0.16345 0.024 0.300 0.344 0.332
#> SRR1974747 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.1716 0.87225 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.5587 0.34294 0.000 0.600 0.028 0.372
#> SRR1974745 4 0.6187 0.15505 0.000 0.432 0.052 0.516
#> SRR1974743 2 0.5938 -0.04816 0.000 0.484 0.036 0.480
#> SRR1974742 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.5271 0.44050 0.000 0.656 0.024 0.320
#> SRR1974739 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974741 2 0.5744 0.15184 0.000 0.536 0.028 0.436
#> SRR1974738 2 0.7170 0.21551 0.000 0.540 0.172 0.288
#> SRR1974737 4 0.5938 0.03556 0.000 0.476 0.036 0.488
#> SRR1974736 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974735 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.7698 0.33641 0.044 0.136 0.580 0.240
#> SRR1974733 4 0.5928 0.08448 0.000 0.456 0.036 0.508
#> SRR1974732 3 0.8674 0.30750 0.116 0.120 0.500 0.264
#> SRR1974731 4 0.5931 0.09973 0.000 0.460 0.036 0.504
#> SRR1974729 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.2799 0.81661 0.884 0.000 0.108 0.008
#> SRR1974728 4 0.5928 0.09794 0.000 0.456 0.036 0.508
#> SRR1974725 3 0.7473 0.46762 0.084 0.088 0.628 0.200
#> SRR1974726 4 0.5917 0.13192 0.000 0.444 0.036 0.520
#> SRR1974724 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.7870 -0.06755 0.000 0.392 0.304 0.304
#> SRR1974723 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974722 4 0.9171 0.30495 0.092 0.292 0.208 0.408
#> SRR1974721 2 0.1398 0.67624 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1974720 4 0.8714 0.19267 0.044 0.224 0.356 0.376
#> SRR1974719 1 0.2125 0.85731 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1974718 1 0.0188 0.91564 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 3 0.7456 0.36679 0.044 0.108 0.596 0.252
#> SRR1974717 2 0.5452 0.34590 0.000 0.616 0.024 0.360
#> SRR1974715 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974713 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.4957 0.54768 0.060 0.004 0.772 0.164
#> SRR1974711 3 0.8243 -0.06916 0.012 0.320 0.384 0.284
#> SRR1974712 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.7458 0.16283 0.000 0.500 0.212 0.288
#> SRR1974710 2 0.7901 -0.04289 0.000 0.372 0.316 0.312
#> SRR1974707 1 0.5857 0.00289 0.508 0.004 0.464 0.024
#> SRR1974706 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.4857 0.44195 0.000 0.668 0.008 0.324
#> SRR1974702 3 0.8932 0.48583 0.324 0.052 0.360 0.264
#> SRR1974701 4 0.6182 0.16696 0.000 0.428 0.052 0.520
#> SRR1974699 2 0.4855 0.54640 0.000 0.712 0.020 0.268
#> SRR1974698 2 0.5853 0.05339 0.000 0.508 0.032 0.460
#> SRR1974700 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.6007 0.28431 0.408 0.000 0.548 0.044
#> SRR1974696 2 0.8061 -0.06959 0.004 0.360 0.336 0.300
#> SRR1974694 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 3 0.7778 0.17494 0.016 0.188 0.516 0.280
#> SRR1974693 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974692 4 0.5842 0.12318 0.000 0.448 0.032 0.520
#> SRR1974690 2 0.3837 0.63742 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974691 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.5925 0.11869 0.000 0.452 0.036 0.512
#> SRR1974688 4 0.5921 0.11826 0.000 0.448 0.036 0.516
#> SRR1974687 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4746 0.67704 0.776 0.000 0.168 0.056
#> SRR1974682 4 0.9795 -0.12165 0.292 0.160 0.240 0.308
#> SRR1974681 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.8660 0.31919 0.048 0.276 0.232 0.444
#> SRR1974680 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.6182 0.16696 0.000 0.428 0.052 0.520
#> SRR1974677 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2281 0.68556 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974675 2 0.2345 0.64120 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974674 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.6414 0.39909 0.000 0.636 0.124 0.240
#> SRR1974671 2 0.0921 0.68152 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974672 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974670 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974669 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974667 2 0.2760 0.67720 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974668 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974666 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974664 2 0.1305 0.67500 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1974665 2 0.2647 0.68009 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974663 3 0.6787 0.58085 0.288 0.004 0.592 0.116
#> SRR1974662 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.6598 0.35742 0.012 0.096 0.636 0.256
#> SRR1974660 1 0.3355 0.75970 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1974659 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.4836 0.47594 0.672 0.000 0.320 0.008
#> SRR1974654 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.5244 0.30093 0.600 0.000 0.388 0.012
#> SRR1974656 3 0.6611 0.51563 0.276 0.012 0.624 0.088
#> SRR1974650 3 0.6625 0.46388 0.044 0.068 0.672 0.216
#> SRR1974651 2 0.5310 0.24808 0.000 0.576 0.012 0.412
#> SRR1974652 3 0.6716 0.38119 0.404 0.000 0.504 0.092
#> SRR1974653 4 0.5987 0.14038 0.000 0.440 0.040 0.520
#> SRR1974648 3 0.6070 0.29367 0.404 0.000 0.548 0.048
#> SRR1974646 2 0.7877 -0.03329 0.000 0.388 0.312 0.300
#> SRR1974649 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.5550 0.18636 0.000 0.552 0.020 0.428
#> SRR1974645 1 0.0336 0.91343 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974644 2 0.2647 0.67967 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974643 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.6730 0.33898 0.012 0.104 0.624 0.260
#> SRR1974640 3 0.6806 0.33091 0.012 0.108 0.616 0.264
#> SRR1974641 2 0.1824 0.67933 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1974639 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0707 0.90562 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.7158 0.42154 0.048 0.092 0.632 0.228
#> SRR1974634 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.5047 0.46478 0.000 0.668 0.016 0.316
#> SRR1974633 3 0.5504 0.59251 0.204 0.004 0.724 0.068
#> SRR1974632 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.6217 0.45099 0.036 0.044 0.680 0.240
#> SRR1974630 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0469 0.91017 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974627 1 0.3539 0.74179 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0592 0.67700 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974623 3 0.7415 0.11760 0.000 0.216 0.512 0.272
#> SRR1974622 3 0.6000 0.39857 0.356 0.000 0.592 0.052
#> SRR1974620 3 0.6311 0.37591 0.008 0.088 0.656 0.248
#> SRR1974619 3 0.7349 0.24806 0.012 0.156 0.564 0.268
#> SRR1974621 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0336 0.91343 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974616 1 0.6990 0.37276 0.628 0.016 0.204 0.152
#> SRR1974615 1 0.4122 0.64918 0.760 0.000 0.236 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.8316 0.60644 0.248 0.044 0.504 0.204
#> SRR1974613 3 0.6562 0.45432 0.052 0.052 0.672 0.224
#> SRR1974612 1 0.2011 0.85601 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974611 3 0.7906 -0.16093 0.000 0.344 0.356 0.300
#> SRR1974610 2 0.2944 0.66132 0.000 0.868 0.004 0.128
#> SRR1974609 1 0.0188 0.91566 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974608 3 0.6757 0.54127 0.252 0.008 0.620 0.120
#> SRR1974607 1 0.5663 0.09769 0.536 0.000 0.440 0.024
#> SRR1974606 2 0.0817 0.68302 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974605 3 0.5774 0.57258 0.236 0.004 0.692 0.068
#> SRR1974604 4 0.5917 0.13192 0.000 0.444 0.036 0.520
#> SRR1974603 3 0.6346 0.66032 0.192 0.004 0.668 0.136
#> SRR1974602 1 0.0000 0.91781 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2593 0.66685 0.000 0.904 0.016 0.080
#> SRR1974601 2 0.7902 -0.05263 0.000 0.364 0.336 0.300
#> SRR1974599 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974598 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974596 2 0.0921 0.68145 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974594 2 0.4974 0.59089 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974593 2 0.2522 0.67204 0.000 0.908 0.016 0.076
#> SRR1974595 2 0.3052 0.67919 0.000 0.860 0.004 0.136
#> SRR1974592 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974591 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974588 2 0.4974 0.59089 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974590 2 0.1722 0.68335 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR1974589 2 0.2593 0.67100 0.000 0.904 0.016 0.080
#> SRR1974587 2 0.4939 0.59587 0.000 0.740 0.040 0.220
#> SRR1974586 2 0.2450 0.67228 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR1974585 2 0.4974 0.59089 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974584 3 0.5213 0.50808 0.328 0.000 0.652 0.020
#> SRR1974583 2 0.2089 0.67513 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1974582 2 0.0817 0.68203 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974581 2 0.0817 0.68207 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974580 2 0.4939 0.59587 0.000 0.740 0.040 0.220
#> SRR1974578 2 0.4974 0.59089 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974577 2 0.3626 0.66021 0.000 0.812 0.004 0.184
#> SRR1974579 2 0.4939 0.59587 0.000 0.740 0.040 0.220
#> SRR1974576 2 0.1888 0.67479 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1974575 2 0.1022 0.68410 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974574 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974573 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974571 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974572 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974570 3 0.6363 0.65318 0.200 0.008 0.672 0.120
#> SRR1974568 3 0.5192 0.64632 0.168 0.012 0.764 0.056
#> SRR1974567 3 0.5212 0.63909 0.192 0.000 0.740 0.068
#> SRR1974566 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974569 2 0.4088 0.61598 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR1974565 2 0.4974 0.59089 0.000 0.736 0.040 0.224
#> SRR1974564 2 0.4018 0.62818 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1974560 3 0.4880 0.63706 0.188 0.000 0.760 0.052
#> SRR1974559 3 0.5213 0.50808 0.328 0.000 0.652 0.020
#> SRR1974563 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974562 2 0.4053 0.62430 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1974561 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974557 2 0.1398 0.67600 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1974553 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974555 3 0.5213 0.50808 0.328 0.000 0.652 0.020
#> SRR1974551 3 0.5213 0.50808 0.328 0.000 0.652 0.020
#> SRR1974552 2 0.4155 0.61480 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974554 3 0.5414 0.65220 0.152 0.016 0.760 0.072
#> SRR1974558 3 0.5212 0.63909 0.192 0.000 0.740 0.068
#> SRR1974556 3 0.5233 0.50264 0.332 0.000 0.648 0.020
#> SRR1974550 2 0.7910 -0.06541 0.000 0.352 0.344 0.304
#> SRR1974549 2 0.4155 0.60972 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1974548 2 0.3958 0.65231 0.000 0.816 0.024 0.160
#> SRR1974547 3 0.5404 0.64906 0.140 0.016 0.764 0.080
#> SRR1974546 3 0.6000 0.58323 0.076 0.060 0.748 0.116
#> SRR1974545 2 0.3649 0.64575 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1974544 3 0.5212 0.63909 0.192 0.000 0.740 0.068
#> SRR1974543 2 0.3668 0.64994 0.000 0.808 0.004 0.188
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.3857 0.5730 0.052 0.000 0.832 0.088 0.028
#> SRR1975008 2 0.4636 0.5438 0.000 0.768 0.036 0.152 0.044
#> SRR1975006 2 0.6695 0.1957 0.000 0.556 0.076 0.292 0.076
#> SRR1975005 4 0.7839 0.2065 0.000 0.272 0.224 0.420 0.084
#> SRR1975004 3 0.3967 0.5710 0.032 0.024 0.844 0.064 0.036
#> SRR1975003 2 0.6289 0.3492 0.000 0.628 0.080 0.224 0.068
#> SRR1975001 2 0.2632 0.6182 0.000 0.892 0.004 0.072 0.032
#> SRR1975002 2 0.2193 0.6225 0.000 0.912 0.000 0.060 0.028
#> SRR1974999 2 0.3405 0.5961 0.000 0.848 0.012 0.104 0.036
#> SRR1975000 3 0.3508 0.5702 0.036 0.016 0.868 0.048 0.032
#> SRR1974998 3 0.4470 0.5768 0.044 0.008 0.800 0.112 0.036
#> SRR1974997 4 0.5838 0.5146 0.000 0.108 0.176 0.676 0.040
#> SRR1974995 4 0.7872 0.1811 0.000 0.308 0.236 0.380 0.076
#> SRR1974996 3 0.4779 0.5701 0.044 0.012 0.768 0.152 0.024
#> SRR1974994 3 0.4032 0.4152 0.192 0.000 0.772 0.004 0.032
#> SRR1974993 4 0.7448 -0.1509 0.000 0.140 0.392 0.396 0.072
#> SRR1974992 4 0.7832 0.1841 0.000 0.264 0.228 0.424 0.084
#> SRR1974990 3 0.2590 0.5366 0.060 0.000 0.900 0.012 0.028
#> SRR1974989 4 0.6309 0.4335 0.000 0.268 0.124 0.584 0.024
#> SRR1974991 4 0.7871 0.1985 0.000 0.292 0.220 0.404 0.084
#> SRR1974986 3 0.3681 0.5614 0.056 0.000 0.848 0.052 0.044
#> SRR1974987 4 0.7711 0.2025 0.000 0.348 0.192 0.388 0.072
#> SRR1974988 3 0.7394 0.1553 0.000 0.132 0.404 0.392 0.072
#> SRR1974984 4 0.7862 0.1818 0.000 0.264 0.236 0.416 0.084
#> SRR1974985 3 0.2778 0.5350 0.060 0.000 0.892 0.016 0.032
#> SRR1974983 2 0.2632 0.6197 0.000 0.892 0.004 0.072 0.032
#> SRR1974982 3 0.2606 0.5345 0.056 0.000 0.900 0.012 0.032
#> SRR1974981 3 0.2548 0.5244 0.072 0.000 0.896 0.004 0.028
#> SRR1974980 3 0.2987 0.5463 0.056 0.000 0.884 0.028 0.032
#> SRR1974979 2 0.7008 0.1720 0.000 0.532 0.112 0.284 0.072
#> SRR1974978 3 0.4551 0.5697 0.032 0.012 0.788 0.136 0.032
#> SRR1974977 3 0.3406 0.5750 0.032 0.004 0.860 0.084 0.020
#> SRR1974976 2 0.6560 0.2529 0.000 0.576 0.088 0.276 0.060
#> SRR1974975 2 0.7634 -0.1036 0.000 0.408 0.168 0.348 0.076
#> SRR1974974 2 0.3920 0.5788 0.000 0.820 0.024 0.116 0.040
#> SRR1974973 2 0.2284 0.6176 0.000 0.912 0.004 0.056 0.028
#> SRR1974972 4 0.7863 0.1474 0.000 0.256 0.256 0.408 0.080
#> SRR1974971 2 0.3018 0.6048 0.000 0.872 0.008 0.084 0.036
#> SRR1974970 3 0.7483 0.1805 0.000 0.128 0.412 0.376 0.084
#> SRR1974969 3 0.7464 0.1426 0.000 0.204 0.440 0.304 0.052
#> SRR1974968 2 0.5201 0.4868 0.000 0.712 0.036 0.200 0.052
#> SRR1974967 4 0.7473 -0.1212 0.000 0.144 0.388 0.396 0.072
#> SRR1974965 3 0.3079 0.5733 0.044 0.000 0.876 0.064 0.016
#> SRR1974966 2 0.2576 0.6183 0.000 0.900 0.008 0.056 0.036
#> SRR1974964 4 0.7793 0.0420 0.000 0.196 0.304 0.416 0.084
#> SRR1974963 3 0.7447 0.1116 0.000 0.140 0.400 0.388 0.072
#> SRR1974961 4 0.7924 0.1537 0.000 0.264 0.256 0.396 0.084
#> SRR1974962 2 0.2142 0.6191 0.000 0.920 0.004 0.048 0.028
#> SRR1974960 3 0.7476 0.1730 0.004 0.124 0.408 0.392 0.072
#> SRR1974959 3 0.6677 0.4121 0.000 0.080 0.560 0.288 0.072
#> SRR1974958 2 0.2562 0.6182 0.000 0.900 0.008 0.060 0.032
#> SRR1974957 2 0.7029 0.1136 0.000 0.508 0.108 0.316 0.068
#> SRR1974956 4 0.7919 0.0992 0.000 0.236 0.288 0.392 0.084
#> SRR1974955 3 0.2798 0.5739 0.044 0.000 0.888 0.060 0.008
#> SRR1974954 3 0.7448 0.1587 0.000 0.128 0.404 0.388 0.080
#> SRR1974953 2 0.3049 0.6034 0.000 0.872 0.012 0.084 0.032
#> SRR1974952 4 0.7610 -0.0500 0.000 0.156 0.352 0.412 0.080
#> SRR1974949 4 0.7808 0.2208 0.000 0.328 0.200 0.392 0.080
#> SRR1974950 2 0.6508 0.3022 0.000 0.600 0.088 0.244 0.068
#> SRR1974951 2 0.5903 0.4073 0.000 0.664 0.060 0.208 0.068
#> SRR1974947 2 0.7660 -0.1399 0.000 0.392 0.180 0.356 0.072
#> SRR1974948 2 0.2960 0.6113 0.000 0.876 0.008 0.080 0.036
#> SRR1974946 2 0.1764 0.6528 0.000 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR1974945 3 0.7299 0.3143 0.008 0.092 0.476 0.348 0.076
#> SRR1974944 3 0.2569 0.5244 0.068 0.000 0.896 0.004 0.032
#> SRR1974942 3 0.3135 0.5693 0.036 0.000 0.876 0.060 0.028
#> SRR1974943 2 0.7592 -0.1048 0.000 0.412 0.160 0.352 0.076
#> SRR1974941 3 0.4796 0.5597 0.028 0.008 0.752 0.180 0.032
#> SRR1974940 3 0.6455 0.4629 0.004 0.068 0.600 0.264 0.064
#> SRR1974939 2 0.6079 0.3735 0.000 0.632 0.068 0.244 0.056
#> SRR1974938 3 0.7616 0.1383 0.000 0.148 0.392 0.376 0.084
#> SRR1974937 3 0.2956 0.5707 0.036 0.000 0.884 0.060 0.020
#> SRR1974936 3 0.3048 0.5701 0.036 0.000 0.880 0.060 0.024
#> SRR1974935 3 0.7010 0.2540 0.000 0.088 0.460 0.380 0.072
#> SRR1974934 2 0.2067 0.6220 0.000 0.924 0.004 0.044 0.028
#> SRR1974933 2 0.5954 0.4060 0.000 0.652 0.068 0.224 0.056
#> SRR1974932 3 0.7013 0.3945 0.008 0.080 0.520 0.324 0.068
#> SRR1974931 3 0.2998 0.5657 0.036 0.000 0.884 0.052 0.028
#> SRR1974930 3 0.3238 0.5650 0.048 0.000 0.872 0.048 0.032
#> SRR1974929 3 0.4721 0.5398 0.004 0.040 0.764 0.160 0.032
#> SRR1974928 2 0.2437 0.6251 0.000 0.904 0.004 0.060 0.032
#> SRR1974927 3 0.7485 0.1661 0.000 0.128 0.408 0.380 0.084
#> SRR1974924 3 0.2844 0.5340 0.064 0.000 0.888 0.016 0.032
#> SRR1974925 3 0.2970 0.5449 0.060 0.000 0.884 0.028 0.028
#> SRR1974926 3 0.2672 0.5422 0.064 0.000 0.896 0.016 0.024
#> SRR1974923 3 0.3086 0.5726 0.036 0.000 0.876 0.068 0.020
#> SRR1974922 3 0.7113 0.2407 0.000 0.100 0.460 0.368 0.072
#> SRR1974921 3 0.3862 0.5708 0.036 0.000 0.828 0.104 0.032
#> SRR1974920 3 0.2467 0.5484 0.052 0.000 0.908 0.016 0.024
#> SRR1974919 3 0.6269 0.4678 0.004 0.056 0.600 0.284 0.056
#> SRR1974918 3 0.6717 0.3814 0.000 0.068 0.540 0.312 0.080
#> SRR1974917 2 0.2078 0.6155 0.000 0.924 0.004 0.036 0.036
#> SRR1974916 3 0.6226 0.5153 0.016 0.056 0.660 0.204 0.064
#> SRR1974915 3 0.6497 0.4113 0.000 0.060 0.560 0.308 0.072
#> SRR1974914 2 0.5712 0.2250 0.000 0.540 0.036 0.396 0.028
#> SRR1974913 3 0.6130 0.5156 0.016 0.052 0.660 0.216 0.056
#> SRR1974911 3 0.3048 0.5715 0.036 0.000 0.880 0.060 0.024
#> SRR1974910 3 0.3067 0.5725 0.040 0.000 0.876 0.068 0.016
#> SRR1974908 2 0.2264 0.6321 0.000 0.912 0.004 0.060 0.024
#> SRR1974909 3 0.6787 0.4159 0.004 0.076 0.548 0.304 0.068
#> SRR1974906 2 0.7662 -0.1330 0.000 0.396 0.164 0.360 0.080
#> SRR1974907 4 0.7640 -0.0758 0.000 0.160 0.360 0.400 0.080
#> SRR1974905 3 0.4599 0.5562 0.024 0.008 0.752 0.196 0.020
#> SRR1974904 2 0.5568 0.4523 0.000 0.688 0.048 0.204 0.060
#> SRR1974903 3 0.6514 0.4490 0.004 0.064 0.580 0.288 0.064
#> SRR1974902 2 0.5930 0.3942 0.000 0.644 0.068 0.240 0.048
#> SRR1974901 4 0.7421 -0.1223 0.000 0.136 0.392 0.400 0.072
#> SRR1974898 2 0.2484 0.6313 0.000 0.900 0.004 0.068 0.028
#> SRR1974900 2 0.4356 0.6034 0.000 0.768 0.024 0.180 0.028
#> SRR1974899 2 0.3470 0.6035 0.000 0.848 0.020 0.100 0.032
#> SRR1974897 2 0.1960 0.6336 0.000 0.928 0.004 0.048 0.020
#> SRR1974896 2 0.3853 0.6224 0.000 0.804 0.008 0.152 0.036
#> SRR1974893 2 0.4073 0.5846 0.000 0.800 0.020 0.144 0.036
#> SRR1974895 2 0.1831 0.6562 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1974894 2 0.4198 0.6065 0.000 0.776 0.008 0.172 0.044
#> SRR1974892 2 0.5942 0.0549 0.000 0.468 0.064 0.452 0.016
#> SRR1974890 4 0.6754 0.1467 0.000 0.408 0.096 0.452 0.044
#> SRR1974891 2 0.4568 0.5714 0.000 0.740 0.016 0.208 0.036
#> SRR1974889 2 0.2032 0.6345 0.000 0.924 0.004 0.052 0.020
#> SRR1974888 2 0.3790 0.6060 0.000 0.816 0.012 0.136 0.036
#> SRR1974886 2 0.4736 0.5691 0.000 0.720 0.012 0.224 0.044
#> SRR1974887 4 0.6433 0.4344 0.000 0.248 0.140 0.584 0.028
#> SRR1974885 4 0.6378 0.4547 0.000 0.232 0.144 0.596 0.028
#> SRR1974883 2 0.4578 0.5842 0.000 0.744 0.016 0.200 0.040
#> SRR1974884 2 0.3717 0.5927 0.000 0.836 0.024 0.100 0.040
#> SRR1974881 2 0.4498 0.5720 0.000 0.736 0.008 0.216 0.040
#> SRR1974882 2 0.4714 0.5606 0.000 0.712 0.008 0.236 0.044
#> SRR1974880 2 0.2416 0.6644 0.000 0.888 0.000 0.100 0.012
#> SRR1974879 2 0.4373 0.6012 0.000 0.760 0.020 0.192 0.028
#> SRR1974877 2 0.1934 0.6361 0.000 0.928 0.004 0.052 0.016
#> SRR1974876 2 0.5863 0.1713 0.000 0.508 0.048 0.420 0.024
#> SRR1974878 2 0.6118 0.2467 0.000 0.532 0.056 0.376 0.036
#> SRR1974875 4 0.6433 0.4344 0.000 0.248 0.140 0.584 0.028
#> SRR1974874 2 0.3355 0.6305 0.000 0.804 0.000 0.184 0.012
#> SRR1974873 4 0.3059 0.6052 0.000 0.108 0.004 0.860 0.028
#> SRR1974871 2 0.3690 0.6174 0.000 0.764 0.000 0.224 0.012
#> SRR1974872 3 0.6628 0.1244 0.232 0.000 0.540 0.016 0.212
#> SRR1974869 2 0.6439 0.0671 0.000 0.448 0.000 0.180 0.372
#> SRR1974868 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974870 5 0.6475 0.4368 0.000 0.244 0.012 0.192 0.552
#> SRR1974866 5 0.6351 0.3531 0.000 0.300 0.000 0.192 0.508
#> SRR1974867 1 0.0290 0.9134 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3427 0.6284 0.000 0.796 0.000 0.192 0.012
#> SRR1974864 1 0.6536 0.1113 0.480 0.000 0.332 0.004 0.184
#> SRR1974862 2 0.3890 0.5929 0.000 0.736 0.000 0.252 0.012
#> SRR1974863 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974860 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974861 2 0.1908 0.6582 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974859 4 0.2964 0.5993 0.000 0.120 0.000 0.856 0.024
#> SRR1974858 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974856 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974857 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974855 4 0.5519 0.4568 0.008 0.048 0.196 0.704 0.044
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.7631 -0.0303 0.228 0.008 0.200 0.496 0.068
#> SRR1974852 4 0.4030 0.2400 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5804 0.4981 0.012 0.048 0.128 0.712 0.100
#> SRR1974846 4 0.3272 0.6056 0.000 0.100 0.012 0.856 0.032
#> SRR1974847 1 0.4998 0.5996 0.700 0.000 0.196 0.000 0.104
#> SRR1974845 4 0.4126 0.1359 0.000 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6712 -0.0207 0.436 0.000 0.348 0.004 0.212
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.3059 0.6052 0.000 0.108 0.004 0.860 0.028
#> SRR1974839 4 0.4015 0.2342 0.000 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.4161 0.0940 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1974834 4 0.3838 0.4044 0.000 0.280 0.004 0.716 0.000
#> SRR1974833 4 0.5580 0.4188 0.012 0.040 0.208 0.696 0.044
#> SRR1974831 4 0.4089 0.4646 0.000 0.244 0.016 0.736 0.004
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0162 0.9151 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4409 0.6001 0.000 0.752 0.000 0.176 0.072
#> SRR1974827 4 0.3814 0.4105 0.000 0.276 0.004 0.720 0.000
#> SRR1974824 1 0.6064 0.3512 0.580 0.000 0.152 0.004 0.264
#> SRR1974825 1 0.3226 0.8042 0.852 0.000 0.088 0.000 0.060
#> SRR1974822 1 0.6262 0.2676 0.548 0.000 0.168 0.004 0.280
#> SRR1974823 5 0.5979 0.4476 0.124 0.000 0.224 0.020 0.632
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.6941 0.3597 0.568 0.000 0.224 0.136 0.072
#> SRR1974815 1 0.2209 0.8597 0.912 0.000 0.032 0.000 0.056
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.5594 0.5444 0.016 0.068 0.064 0.736 0.116
#> SRR1974812 1 0.6725 0.4302 0.600 0.000 0.208 0.104 0.088
#> SRR1974810 1 0.3735 0.7795 0.828 0.000 0.100 0.008 0.064
#> SRR1974808 5 0.6381 0.4348 0.000 0.240 0.008 0.196 0.556
#> SRR1974811 1 0.1970 0.8670 0.924 0.000 0.060 0.004 0.012
#> SRR1974809 1 0.0404 0.9116 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.6808 -0.0224 0.460 0.000 0.196 0.012 0.332
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.4146 0.4249 0.000 0.268 0.012 0.716 0.004
#> SRR1974804 4 0.7552 -0.0387 0.228 0.008 0.204 0.500 0.060
#> SRR1974803 1 0.3009 0.8274 0.876 0.000 0.064 0.008 0.052
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3543 0.7747 0.828 0.000 0.112 0.000 0.060
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2605 0.6571 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1974797 2 0.4300 0.3229 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1974796 4 0.4015 0.4313 0.000 0.264 0.008 0.724 0.004
#> SRR1974795 4 0.4089 0.4646 0.000 0.244 0.016 0.736 0.004
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.2329 0.6594 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974792 4 0.4171 0.0873 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1974791 4 0.3814 0.4105 0.000 0.276 0.004 0.720 0.000
#> SRR1974790 2 0.4294 0.3389 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974789 2 0.2471 0.6589 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974788 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974786 3 0.6759 0.0869 0.320 0.000 0.476 0.012 0.192
#> SRR1974787 3 0.7705 0.0559 0.208 0.000 0.456 0.084 0.252
#> SRR1974784 4 0.4499 0.0389 0.000 0.408 0.004 0.584 0.004
#> SRR1974783 1 0.0404 0.9117 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974785 3 0.6740 0.0491 0.272 0.000 0.484 0.008 0.236
#> SRR1974782 1 0.0510 0.9094 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974781 4 0.4192 0.0917 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1974780 3 0.7637 0.0823 0.216 0.000 0.468 0.080 0.236
#> SRR1974779 1 0.0404 0.9112 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0404 0.9112 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974776 3 0.6771 0.1037 0.268 0.000 0.508 0.016 0.208
#> SRR1974778 1 0.2104 0.8623 0.916 0.000 0.060 0.000 0.024
#> SRR1974774 2 0.3707 0.5930 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1974773 1 0.0609 0.9060 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0404 0.9104 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0162 0.9151 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974771 2 0.5693 0.4897 0.008 0.592 0.028 0.344 0.028
#> SRR1974770 2 0.3534 0.6150 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1974769 4 0.3949 0.3564 0.000 0.300 0.004 0.696 0.000
#> SRR1974768 2 0.3895 0.5570 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1974767 3 0.7264 0.0751 0.176 0.000 0.496 0.056 0.272
#> SRR1974766 2 0.3932 0.5482 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974765 2 0.4306 0.2782 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1974764 2 0.3949 0.5746 0.000 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.2429 0.8464 0.900 0.000 0.076 0.004 0.020
#> SRR1974761 2 0.3838 0.5951 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004
#> SRR1974760 4 0.3910 0.4174 0.000 0.272 0.008 0.720 0.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.3969 0.5723 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR1974757 2 0.4268 0.3760 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.3059 0.6052 0.000 0.108 0.004 0.860 0.028
#> SRR1974755 2 0.3730 0.5904 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1974753 4 0.3304 0.5992 0.000 0.128 0.004 0.840 0.028
#> SRR1974751 4 0.3265 0.6034 0.000 0.092 0.016 0.860 0.032
#> SRR1974750 4 0.3161 0.6058 0.000 0.100 0.008 0.860 0.032
#> SRR1974752 1 0.0404 0.9116 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.7992 0.4528 0.012 0.176 0.112 0.216 0.484
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.1872 0.8708 0.928 0.000 0.052 0.000 0.020
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.4360 0.3637 0.000 0.300 0.000 0.680 0.020
#> SRR1974745 4 0.3187 0.6044 0.000 0.096 0.008 0.860 0.036
#> SRR1974743 4 0.3284 0.5890 0.000 0.148 0.000 0.828 0.024
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.4675 0.1889 0.000 0.380 0.000 0.600 0.020
#> SRR1974739 4 0.3142 0.6049 0.000 0.108 0.004 0.856 0.032
#> SRR1974741 4 0.3942 0.5145 0.000 0.232 0.000 0.748 0.020
#> SRR1974738 2 0.7179 -0.0438 0.000 0.364 0.016 0.348 0.272
#> SRR1974737 4 0.3398 0.5883 0.000 0.144 0.004 0.828 0.024
#> SRR1974736 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.6651 0.5202 0.012 0.036 0.164 0.172 0.616
#> SRR1974733 4 0.3396 0.5956 0.000 0.136 0.004 0.832 0.028
#> SRR1974732 5 0.7780 0.4100 0.068 0.012 0.168 0.292 0.460
#> SRR1974731 4 0.3257 0.6010 0.000 0.124 0.004 0.844 0.028
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.3222 0.8014 0.852 0.000 0.108 0.004 0.036
#> SRR1974728 4 0.3257 0.6000 0.000 0.124 0.004 0.844 0.028
#> SRR1974725 5 0.6978 0.5012 0.040 0.020 0.196 0.152 0.592
#> SRR1974726 4 0.3059 0.6052 0.000 0.108 0.004 0.860 0.028
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.7020 0.3332 0.000 0.220 0.032 0.240 0.508
#> SRR1974723 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974722 4 0.6851 0.3135 0.044 0.032 0.128 0.628 0.168
#> SRR1974721 2 0.3318 0.6321 0.000 0.808 0.000 0.180 0.012
#> SRR1974720 4 0.7208 -0.1774 0.012 0.040 0.116 0.440 0.392
#> SRR1974719 1 0.2171 0.8569 0.912 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR1974718 1 0.0290 0.9132 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.5273 0.5600 0.004 0.024 0.116 0.124 0.732
#> SRR1974717 4 0.4703 0.3428 0.000 0.340 0.000 0.632 0.028
#> SRR1974715 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.4615 0.4983 0.020 0.000 0.212 0.032 0.736
#> SRR1974711 5 0.7587 0.5083 0.004 0.200 0.112 0.160 0.524
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.6498 0.1823 0.000 0.352 0.000 0.196 0.452
#> SRR1974710 5 0.6610 0.4512 0.000 0.236 0.020 0.192 0.552
#> SRR1974707 1 0.6646 0.0057 0.460 0.000 0.204 0.004 0.332
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.4588 0.2341 0.000 0.380 0.000 0.604 0.016
#> SRR1974702 3 0.8247 0.1612 0.244 0.016 0.448 0.172 0.120
#> SRR1974701 4 0.3265 0.6034 0.000 0.092 0.016 0.860 0.032
#> SRR1974699 4 0.4821 -0.1053 0.000 0.464 0.000 0.516 0.020
#> SRR1974698 4 0.3916 0.5562 0.000 0.188 0.004 0.780 0.028
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.6876 0.2862 0.364 0.000 0.200 0.012 0.424
#> SRR1974696 5 0.6909 0.4643 0.000 0.224 0.040 0.192 0.544
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.6041 0.5593 0.000 0.104 0.072 0.148 0.676
#> SRR1974693 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974692 4 0.3209 0.6035 0.000 0.120 0.004 0.848 0.028
#> SRR1974690 2 0.4283 0.3637 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.3351 0.5988 0.000 0.132 0.004 0.836 0.028
#> SRR1974688 4 0.2900 0.6039 0.000 0.108 0.000 0.864 0.028
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4923 0.6881 0.756 0.000 0.108 0.028 0.108
#> SRR1974682 4 0.8759 -0.1729 0.268 0.040 0.140 0.400 0.152
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.6757 0.3441 0.020 0.048 0.112 0.620 0.200
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.3265 0.6034 0.000 0.092 0.016 0.860 0.032
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.3395 0.6281 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1974675 2 0.1646 0.6170 0.000 0.944 0.004 0.020 0.032
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.6212 0.2436 0.000 0.516 0.000 0.160 0.324
#> SRR1974671 2 0.2230 0.6597 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1974672 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974670 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974669 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974667 2 0.3752 0.5863 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1974668 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974666 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974664 2 0.3242 0.6335 0.000 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR1974665 2 0.3730 0.5912 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1974663 3 0.6862 0.0709 0.180 0.004 0.520 0.020 0.276
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.5452 0.5625 0.000 0.052 0.120 0.104 0.724
#> SRR1974660 1 0.3806 0.7659 0.820 0.000 0.088 0.004 0.088
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5805 0.4909 0.640 0.000 0.160 0.008 0.192
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.6374 0.3059 0.560 0.000 0.164 0.012 0.264
#> SRR1974656 5 0.6894 0.4099 0.228 0.000 0.208 0.032 0.532
#> SRR1974650 5 0.5483 0.5324 0.012 0.008 0.176 0.104 0.700
#> SRR1974651 4 0.4350 0.4525 0.000 0.268 0.000 0.704 0.028
#> SRR1974652 3 0.7083 -0.0250 0.308 0.000 0.424 0.016 0.252
#> SRR1974653 4 0.3090 0.6058 0.000 0.104 0.004 0.860 0.032
#> SRR1974648 5 0.6952 0.2934 0.356 0.000 0.200 0.016 0.428
#> SRR1974646 5 0.7509 0.4213 0.000 0.264 0.072 0.188 0.476
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.4086 0.4947 0.000 0.240 0.000 0.736 0.024
#> SRR1974645 1 0.0290 0.9131 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.3730 0.5895 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.5988 0.5670 0.004 0.068 0.124 0.112 0.692
#> SRR1974640 5 0.5900 0.5664 0.004 0.068 0.116 0.112 0.700
#> SRR1974641 2 0.3596 0.6230 0.000 0.776 0.000 0.212 0.012
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0898 0.9015 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.4738 0.5578 0.004 0.020 0.120 0.084 0.772
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.4576 0.2143 0.000 0.376 0.000 0.608 0.016
#> SRR1974633 5 0.6531 0.4163 0.156 0.000 0.256 0.024 0.564
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.5144 0.5479 0.020 0.012 0.136 0.084 0.748
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0451 0.9110 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974627 1 0.4022 0.7402 0.796 0.000 0.100 0.000 0.104
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1892 0.6562 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1974623 5 0.6219 0.5537 0.000 0.120 0.072 0.148 0.660
#> SRR1974622 5 0.6958 0.3183 0.324 0.000 0.212 0.016 0.448
#> SRR1974620 5 0.5049 0.5623 0.000 0.032 0.116 0.104 0.748
#> SRR1974619 5 0.6191 0.5638 0.000 0.088 0.116 0.128 0.668
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0404 0.9115 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.6697 0.4296 0.600 0.000 0.212 0.108 0.080
#> SRR1974615 1 0.4675 0.6517 0.736 0.000 0.100 0.000 0.164
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.7983 -0.1758 0.144 0.024 0.408 0.068 0.356
#> SRR1974613 5 0.5500 0.5513 0.020 0.028 0.152 0.072 0.728
#> SRR1974612 1 0.2376 0.8517 0.904 0.000 0.052 0.000 0.044
#> SRR1974611 5 0.6367 0.4854 0.000 0.200 0.020 0.188 0.592
#> SRR1974610 2 0.4270 0.5196 0.000 0.668 0.000 0.320 0.012
#> SRR1974609 1 0.0162 0.9150 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.6892 0.4370 0.208 0.000 0.204 0.040 0.548
#> SRR1974607 1 0.6676 0.0833 0.484 0.000 0.200 0.008 0.308
#> SRR1974606 2 0.2280 0.6605 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974605 5 0.6705 0.3999 0.188 0.000 0.244 0.024 0.544
#> SRR1974604 4 0.3059 0.6052 0.000 0.108 0.004 0.860 0.028
#> SRR1974603 3 0.6562 0.0070 0.092 0.004 0.528 0.032 0.344
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9168 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4612 0.5881 0.000 0.736 0.000 0.180 0.084
#> SRR1974601 5 0.6489 0.4658 0.000 0.224 0.020 0.184 0.572
#> SRR1974599 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974598 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974596 2 0.2439 0.6598 0.000 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1974594 2 0.6024 0.3325 0.000 0.512 0.000 0.364 0.124
#> SRR1974593 2 0.4466 0.5961 0.000 0.748 0.000 0.176 0.076
#> SRR1974595 2 0.4235 0.5421 0.000 0.656 0.000 0.336 0.008
#> SRR1974592 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974591 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974588 2 0.6024 0.3325 0.000 0.512 0.000 0.364 0.124
#> SRR1974590 2 0.3810 0.6312 0.000 0.792 0.000 0.168 0.040
#> SRR1974589 2 0.4537 0.5902 0.000 0.740 0.000 0.184 0.076
#> SRR1974587 2 0.6015 0.3414 0.000 0.516 0.000 0.360 0.124
#> SRR1974586 2 0.4444 0.5972 0.000 0.748 0.000 0.180 0.072
#> SRR1974585 2 0.5986 0.3567 0.000 0.528 0.000 0.348 0.124
#> SRR1974584 5 0.6914 0.2164 0.232 0.000 0.372 0.008 0.388
#> SRR1974583 2 0.4049 0.6179 0.000 0.780 0.000 0.164 0.056
#> SRR1974582 2 0.2280 0.6593 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974581 2 0.2583 0.6565 0.000 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1974580 2 0.5975 0.3650 0.000 0.532 0.000 0.344 0.124
#> SRR1974578 2 0.6024 0.3325 0.000 0.512 0.000 0.364 0.124
#> SRR1974577 2 0.4264 0.5046 0.000 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR1974579 2 0.6015 0.3414 0.000 0.516 0.000 0.360 0.124
#> SRR1974576 2 0.3914 0.6221 0.000 0.788 0.000 0.164 0.048
#> SRR1974575 2 0.2377 0.6592 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974574 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974573 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974571 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974572 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974570 3 0.6347 -0.0298 0.084 0.004 0.536 0.024 0.352
#> SRR1974568 5 0.5887 0.2152 0.060 0.000 0.440 0.016 0.484
#> SRR1974567 3 0.6080 -0.1812 0.076 0.000 0.468 0.016 0.440
#> SRR1974566 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974569 2 0.4297 0.3266 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974565 2 0.6024 0.3325 0.000 0.512 0.000 0.364 0.124
#> SRR1974564 2 0.4283 0.3587 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974560 5 0.5996 0.1868 0.076 0.000 0.452 0.012 0.460
#> SRR1974559 5 0.6914 0.2164 0.232 0.000 0.372 0.008 0.388
#> SRR1974563 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974562 2 0.4287 0.3499 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974561 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974557 2 0.3264 0.6359 0.000 0.820 0.000 0.164 0.016
#> SRR1974553 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974555 5 0.6914 0.2164 0.232 0.000 0.372 0.008 0.388
#> SRR1974551 5 0.6914 0.2164 0.232 0.000 0.372 0.008 0.388
#> SRR1974552 2 0.4297 0.3260 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974554 5 0.5967 0.2607 0.056 0.000 0.412 0.024 0.508
#> SRR1974558 3 0.6080 -0.1812 0.076 0.000 0.468 0.016 0.440
#> SRR1974556 5 0.6927 0.2121 0.236 0.000 0.372 0.008 0.384
#> SRR1974550 5 0.5966 0.4601 0.000 0.228 0.004 0.164 0.604
#> SRR1974549 2 0.4304 0.3033 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974548 2 0.5461 0.4952 0.000 0.620 0.000 0.284 0.096
#> SRR1974547 5 0.5855 0.2754 0.044 0.000 0.404 0.028 0.524
#> SRR1974546 5 0.6271 0.3942 0.024 0.020 0.336 0.052 0.568
#> SRR1974545 2 0.4249 0.4003 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1974544 3 0.6080 -0.1812 0.076 0.000 0.468 0.016 0.440
#> SRR1974543 2 0.4375 0.4309 0.000 0.576 0.000 0.420 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 6 0.5101 0.35168 0.016 0.000 0.440 0.024 0.012 0.508
#> SRR1975008 2 0.4465 0.50971 0.000 0.668 0.284 0.040 0.004 0.004
#> SRR1975006 2 0.5551 -0.04019 0.000 0.448 0.444 0.100 0.004 0.004
#> SRR1975005 3 0.4741 0.64452 0.000 0.152 0.692 0.152 0.004 0.000
#> SRR1975004 3 0.4436 -0.23608 0.004 0.008 0.532 0.000 0.008 0.448
#> SRR1975003 2 0.5181 0.21577 0.000 0.516 0.416 0.056 0.004 0.008
#> SRR1975001 2 0.3454 0.62291 0.000 0.808 0.148 0.036 0.004 0.004
#> SRR1975002 2 0.2946 0.63073 0.000 0.848 0.120 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974999 2 0.4151 0.59599 0.000 0.756 0.172 0.060 0.008 0.004
#> SRR1975000 3 0.4770 -0.31895 0.004 0.008 0.492 0.008 0.012 0.476
#> SRR1974998 3 0.5205 -0.26933 0.008 0.004 0.476 0.032 0.012 0.468
#> SRR1974997 4 0.5736 0.45164 0.000 0.056 0.196 0.644 0.008 0.096
#> SRR1974995 3 0.5146 0.63256 0.000 0.188 0.668 0.128 0.004 0.012
#> SRR1974996 3 0.5474 -0.18693 0.004 0.000 0.460 0.072 0.012 0.452
#> SRR1974994 6 0.5833 0.42660 0.156 0.000 0.296 0.004 0.008 0.536
#> SRR1974993 3 0.4771 0.67813 0.000 0.056 0.728 0.152 0.000 0.064
#> SRR1974992 3 0.4741 0.64814 0.000 0.148 0.692 0.156 0.004 0.000
#> SRR1974990 6 0.4744 0.43406 0.024 0.000 0.384 0.004 0.012 0.576
#> SRR1974989 4 0.6476 0.49219 0.000 0.220 0.152 0.556 0.008 0.064
#> SRR1974991 3 0.4838 0.63903 0.000 0.168 0.680 0.148 0.004 0.000
#> SRR1974986 6 0.5085 0.37312 0.020 0.000 0.420 0.020 0.012 0.528
#> SRR1974987 3 0.5125 0.57856 0.000 0.232 0.632 0.132 0.004 0.000
#> SRR1974988 3 0.4911 0.67630 0.000 0.056 0.716 0.156 0.000 0.072
#> SRR1974984 3 0.5079 0.64976 0.000 0.152 0.680 0.152 0.004 0.012
#> SRR1974985 6 0.4764 0.43229 0.020 0.000 0.380 0.008 0.012 0.580
#> SRR1974983 2 0.3454 0.62436 0.000 0.808 0.148 0.036 0.004 0.004
#> SRR1974982 6 0.4773 0.43152 0.020 0.000 0.384 0.008 0.012 0.576
#> SRR1974981 6 0.4840 0.44065 0.032 0.000 0.368 0.004 0.012 0.584
#> SRR1974980 6 0.4729 0.42013 0.016 0.000 0.400 0.008 0.012 0.564
#> SRR1974979 3 0.5454 0.00767 0.000 0.432 0.460 0.104 0.004 0.000
#> SRR1974978 3 0.4924 -0.10645 0.004 0.000 0.532 0.044 0.004 0.416
#> SRR1974977 6 0.4980 0.28461 0.004 0.004 0.472 0.024 0.012 0.484
#> SRR1974976 2 0.5571 0.10279 0.000 0.464 0.412 0.120 0.000 0.004
#> SRR1974975 3 0.5570 0.46042 0.000 0.292 0.564 0.136 0.004 0.004
#> SRR1974974 2 0.4086 0.57158 0.000 0.728 0.220 0.048 0.000 0.004
#> SRR1974973 2 0.3151 0.62570 0.000 0.832 0.132 0.028 0.004 0.004
#> SRR1974972 3 0.4951 0.65482 0.000 0.152 0.688 0.148 0.004 0.008
#> SRR1974971 2 0.3706 0.61234 0.000 0.792 0.156 0.040 0.008 0.004
#> SRR1974970 3 0.4454 0.67525 0.000 0.048 0.764 0.128 0.004 0.056
#> SRR1974969 3 0.6264 0.61419 0.000 0.140 0.604 0.112 0.004 0.140
#> SRR1974968 2 0.5061 0.43808 0.000 0.612 0.308 0.068 0.008 0.004
#> SRR1974967 3 0.5137 0.67654 0.000 0.064 0.696 0.164 0.000 0.076
#> SRR1974965 6 0.4717 0.35756 0.008 0.000 0.452 0.012 0.012 0.516
#> SRR1974966 2 0.3270 0.62271 0.000 0.816 0.152 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974964 3 0.4909 0.67184 0.000 0.104 0.716 0.148 0.004 0.028
#> SRR1974963 3 0.4933 0.67301 0.000 0.060 0.716 0.152 0.000 0.072
#> SRR1974961 3 0.4530 0.65367 0.000 0.144 0.716 0.136 0.004 0.000
#> SRR1974962 2 0.3032 0.62699 0.000 0.840 0.128 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974960 3 0.4909 0.67034 0.000 0.036 0.716 0.164 0.004 0.080
#> SRR1974959 3 0.3809 0.57885 0.000 0.016 0.796 0.064 0.000 0.124
#> SRR1974958 2 0.3270 0.62079 0.000 0.816 0.152 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974957 3 0.5498 0.06754 0.000 0.408 0.464 0.128 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.5358 0.66462 0.000 0.132 0.676 0.152 0.004 0.036
#> SRR1974955 6 0.4719 0.35038 0.012 0.000 0.456 0.012 0.008 0.512
#> SRR1974954 3 0.4341 0.67673 0.000 0.040 0.760 0.144 0.000 0.056
#> SRR1974953 2 0.3674 0.60855 0.000 0.792 0.160 0.036 0.008 0.004
#> SRR1974952 3 0.4818 0.67869 0.000 0.068 0.728 0.156 0.004 0.044
#> SRR1974949 3 0.5666 0.56974 0.000 0.224 0.596 0.164 0.004 0.012
#> SRR1974950 2 0.5359 0.13583 0.000 0.488 0.424 0.080 0.004 0.004
#> SRR1974951 2 0.5009 0.32104 0.000 0.560 0.368 0.068 0.004 0.000
#> SRR1974947 3 0.5625 0.50554 0.000 0.272 0.576 0.140 0.004 0.008
#> SRR1974948 2 0.3669 0.61557 0.000 0.784 0.172 0.036 0.004 0.004
#> SRR1974946 2 0.1931 0.65609 0.000 0.924 0.028 0.040 0.004 0.004
#> SRR1974945 3 0.4691 0.63114 0.000 0.016 0.728 0.136 0.004 0.116
#> SRR1974944 6 0.4774 0.44100 0.028 0.000 0.368 0.004 0.012 0.588
#> SRR1974942 6 0.4626 0.34754 0.004 0.000 0.468 0.012 0.012 0.504
#> SRR1974943 3 0.5654 0.42189 0.000 0.296 0.560 0.132 0.004 0.008
#> SRR1974941 3 0.5175 0.01568 0.004 0.000 0.540 0.068 0.004 0.384
#> SRR1974940 3 0.4573 0.53218 0.000 0.016 0.720 0.084 0.000 0.180
#> SRR1974939 2 0.5165 0.24061 0.000 0.516 0.404 0.076 0.004 0.000
#> SRR1974938 3 0.4295 0.68019 0.000 0.052 0.768 0.132 0.000 0.048
#> SRR1974937 6 0.4630 0.33118 0.004 0.000 0.480 0.012 0.012 0.492
#> SRR1974936 6 0.4540 0.34220 0.004 0.000 0.472 0.008 0.012 0.504
#> SRR1974935 3 0.4610 0.64833 0.000 0.020 0.728 0.152 0.000 0.100
#> SRR1974934 2 0.2951 0.62903 0.000 0.844 0.128 0.020 0.004 0.004
#> SRR1974933 2 0.5125 0.34297 0.000 0.556 0.360 0.080 0.004 0.000
#> SRR1974932 3 0.4831 0.59549 0.000 0.016 0.720 0.112 0.008 0.144
#> SRR1974931 6 0.4538 0.34782 0.004 0.000 0.468 0.008 0.012 0.508
#> SRR1974930 6 0.4802 0.36580 0.012 0.000 0.448 0.012 0.012 0.516
#> SRR1974929 3 0.4872 0.17758 0.000 0.012 0.608 0.040 0.004 0.336
#> SRR1974928 2 0.3194 0.62837 0.000 0.824 0.144 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974927 3 0.4699 0.67712 0.000 0.048 0.744 0.136 0.004 0.068
#> SRR1974924 6 0.4734 0.43668 0.024 0.000 0.380 0.004 0.012 0.580
#> SRR1974925 6 0.4881 0.41795 0.020 0.000 0.392 0.012 0.012 0.564
#> SRR1974926 6 0.4855 0.42442 0.024 0.000 0.388 0.008 0.012 0.568
#> SRR1974923 6 0.4782 0.32032 0.004 0.000 0.472 0.020 0.012 0.492
#> SRR1974922 3 0.4688 0.64858 0.000 0.024 0.724 0.152 0.000 0.100
#> SRR1974921 6 0.4950 0.25551 0.012 0.000 0.476 0.024 0.008 0.480
#> SRR1974920 6 0.4827 0.41134 0.016 0.000 0.404 0.012 0.012 0.556
#> SRR1974919 3 0.4727 0.51589 0.000 0.008 0.704 0.096 0.004 0.188
#> SRR1974918 3 0.4036 0.60262 0.000 0.008 0.772 0.100 0.000 0.120
#> SRR1974917 2 0.2854 0.62708 0.000 0.860 0.108 0.012 0.016 0.004
#> SRR1974916 3 0.4796 0.41028 0.004 0.012 0.688 0.048 0.008 0.240
#> SRR1974915 3 0.4652 0.57671 0.000 0.008 0.720 0.116 0.004 0.152
#> SRR1974914 2 0.6300 0.24224 0.000 0.472 0.204 0.304 0.004 0.016
#> SRR1974913 3 0.4848 0.42185 0.004 0.008 0.684 0.060 0.008 0.236
#> SRR1974911 6 0.4630 0.32937 0.004 0.000 0.480 0.012 0.012 0.492
#> SRR1974910 6 0.4903 0.35051 0.004 0.000 0.444 0.028 0.012 0.512
#> SRR1974908 2 0.3032 0.63407 0.000 0.840 0.128 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974909 3 0.4204 0.56802 0.000 0.008 0.752 0.088 0.000 0.152
#> SRR1974906 3 0.5610 0.46393 0.000 0.276 0.576 0.136 0.004 0.008
#> SRR1974907 3 0.4471 0.67987 0.000 0.060 0.756 0.144 0.004 0.036
#> SRR1974905 3 0.5243 0.01672 0.000 0.004 0.532 0.064 0.008 0.392
#> SRR1974904 2 0.5042 0.38659 0.000 0.580 0.348 0.064 0.004 0.004
#> SRR1974903 3 0.4415 0.54472 0.000 0.008 0.736 0.080 0.004 0.172
#> SRR1974902 2 0.5147 0.28014 0.000 0.528 0.392 0.076 0.004 0.000
#> SRR1974901 3 0.4755 0.67406 0.000 0.048 0.724 0.164 0.000 0.064
#> SRR1974898 2 0.3225 0.63445 0.000 0.828 0.132 0.032 0.004 0.004
#> SRR1974900 2 0.4191 0.60994 0.000 0.732 0.180 0.088 0.000 0.000
#> SRR1974899 2 0.4055 0.59820 0.000 0.748 0.196 0.048 0.004 0.004
#> SRR1974897 2 0.2890 0.63749 0.000 0.852 0.120 0.016 0.008 0.004
#> SRR1974896 2 0.4151 0.61894 0.000 0.748 0.164 0.084 0.004 0.000
#> SRR1974893 2 0.4250 0.57613 0.000 0.720 0.224 0.048 0.004 0.004
#> SRR1974895 2 0.1826 0.65769 0.000 0.924 0.020 0.052 0.000 0.004
#> SRR1974894 2 0.4482 0.60045 0.000 0.712 0.188 0.096 0.004 0.000
#> SRR1974892 2 0.6455 0.05357 0.000 0.424 0.172 0.372 0.004 0.028
#> SRR1974890 4 0.6816 0.07845 0.000 0.348 0.252 0.364 0.008 0.028
#> SRR1974891 2 0.4729 0.57591 0.000 0.676 0.196 0.128 0.000 0.000
#> SRR1974889 2 0.2902 0.63854 0.000 0.852 0.116 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974888 2 0.4084 0.60567 0.000 0.744 0.200 0.048 0.004 0.004
#> SRR1974886 2 0.5182 0.55436 0.000 0.648 0.192 0.152 0.004 0.004
#> SRR1974887 4 0.6695 0.46031 0.000 0.196 0.184 0.540 0.012 0.068
#> SRR1974885 4 0.6645 0.48234 0.000 0.184 0.180 0.552 0.012 0.072
#> SRR1974883 2 0.4992 0.56801 0.000 0.668 0.200 0.124 0.004 0.004
#> SRR1974884 2 0.3817 0.58608 0.000 0.748 0.220 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974881 2 0.4899 0.56884 0.000 0.672 0.176 0.148 0.004 0.000
#> SRR1974882 2 0.5082 0.55239 0.000 0.648 0.188 0.160 0.004 0.000
#> SRR1974880 2 0.2322 0.66456 0.000 0.896 0.024 0.072 0.008 0.000
#> SRR1974879 2 0.4309 0.60801 0.000 0.724 0.172 0.104 0.000 0.000
#> SRR1974877 2 0.2765 0.64150 0.000 0.864 0.104 0.024 0.004 0.004
#> SRR1974876 2 0.6520 0.17061 0.000 0.448 0.188 0.332 0.008 0.024
#> SRR1974878 2 0.6402 0.27228 0.000 0.472 0.228 0.276 0.004 0.020
#> SRR1974875 4 0.6695 0.46031 0.000 0.196 0.184 0.540 0.012 0.068
#> SRR1974874 2 0.3139 0.61817 0.000 0.812 0.000 0.160 0.028 0.000
#> SRR1974873 4 0.1471 0.73509 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974871 2 0.3403 0.59164 0.000 0.768 0.000 0.212 0.020 0.000
#> SRR1974872 6 0.5360 0.38640 0.136 0.000 0.056 0.012 0.096 0.700
#> SRR1974869 5 0.6019 0.25684 0.000 0.388 0.012 0.128 0.464 0.008
#> SRR1974868 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974870 5 0.5273 0.58339 0.000 0.208 0.008 0.116 0.656 0.012
#> SRR1974866 5 0.5626 0.55545 0.000 0.240 0.012 0.124 0.612 0.012
#> SRR1974867 1 0.0260 0.91938 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974865 2 0.3175 0.61620 0.000 0.808 0.000 0.164 0.028 0.000
#> SRR1974864 6 0.5794 0.10445 0.424 0.000 0.020 0.008 0.080 0.468
#> SRR1974862 2 0.3720 0.56152 0.000 0.736 0.000 0.236 0.028 0.000
#> SRR1974863 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974860 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.1411 0.65803 0.000 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1974859 4 0.1812 0.73347 0.000 0.080 0.000 0.912 0.008 0.000
#> SRR1974858 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974856 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974857 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974855 4 0.4929 0.50110 0.000 0.020 0.092 0.716 0.012 0.160
#> SRR1974854 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.7259 0.07676 0.216 0.000 0.072 0.492 0.036 0.184
#> SRR1974852 4 0.4714 0.43427 0.000 0.324 0.032 0.628 0.008 0.008
#> SRR1974849 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5187 0.53618 0.000 0.012 0.072 0.720 0.076 0.120
#> SRR1974846 4 0.1606 0.73266 0.000 0.056 0.000 0.932 0.008 0.004
#> SRR1974847 1 0.4769 0.49047 0.636 0.000 0.012 0.004 0.040 0.308
#> SRR1974845 4 0.4992 0.32829 0.000 0.352 0.044 0.588 0.008 0.008
#> SRR1974844 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 6 0.5853 0.20153 0.364 0.000 0.028 0.000 0.104 0.504
#> SRR1974842 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1471 0.73509 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974839 4 0.4872 0.42450 0.000 0.316 0.044 0.624 0.008 0.008
#> SRR1974838 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.5025 0.29517 0.000 0.364 0.044 0.576 0.008 0.008
#> SRR1974834 4 0.4682 0.56510 0.000 0.244 0.048 0.688 0.012 0.008
#> SRR1974833 4 0.5065 0.46802 0.000 0.016 0.100 0.696 0.012 0.176
#> SRR1974831 4 0.4691 0.61786 0.000 0.204 0.048 0.716 0.012 0.020
#> SRR1974832 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0146 0.92077 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974828 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4259 0.57546 0.000 0.744 0.000 0.164 0.084 0.008
#> SRR1974827 4 0.4659 0.57050 0.000 0.240 0.048 0.692 0.012 0.008
#> SRR1974824 1 0.5707 0.33459 0.556 0.000 0.008 0.000 0.180 0.256
#> SRR1974825 1 0.3164 0.79516 0.832 0.000 0.004 0.000 0.044 0.120
#> SRR1974822 1 0.5878 0.26339 0.528 0.000 0.008 0.000 0.244 0.220
#> SRR1974823 5 0.5863 0.29545 0.096 0.004 0.012 0.012 0.544 0.332
#> SRR1974820 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.6671 0.30761 0.540 0.000 0.036 0.144 0.036 0.244
#> SRR1974815 1 0.1995 0.86616 0.912 0.000 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR1974813 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.4107 0.62040 0.016 0.028 0.004 0.808 0.088 0.056
#> SRR1974812 1 0.6364 0.38326 0.568 0.000 0.032 0.108 0.036 0.256
#> SRR1974810 1 0.3624 0.76449 0.804 0.000 0.012 0.004 0.036 0.144
#> SRR1974808 5 0.5141 0.58351 0.000 0.204 0.012 0.116 0.664 0.004
#> SRR1974811 1 0.1769 0.87511 0.924 0.000 0.004 0.000 0.012 0.060
#> SRR1974809 1 0.0547 0.91333 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974807 1 0.6325 -0.02737 0.436 0.000 0.008 0.004 0.276 0.276
#> SRR1974806 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.4874 0.58044 0.000 0.232 0.048 0.688 0.012 0.020
#> SRR1974804 4 0.7200 0.07868 0.216 0.000 0.076 0.492 0.028 0.188
#> SRR1974803 1 0.2647 0.82841 0.868 0.000 0.000 0.000 0.044 0.088
#> SRR1974801 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3384 0.75798 0.800 0.000 0.008 0.000 0.024 0.168
#> SRR1974799 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.2218 0.65266 0.000 0.884 0.012 0.104 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.4886 0.17046 0.000 0.500 0.032 0.456 0.008 0.004
#> SRR1974796 4 0.4768 0.58637 0.000 0.228 0.048 0.696 0.012 0.016
#> SRR1974795 4 0.4691 0.61786 0.000 0.204 0.048 0.716 0.012 0.020
#> SRR1974793 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1806 0.65602 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000 0.000
#> SRR1974792 4 0.5044 0.27637 0.000 0.372 0.044 0.568 0.008 0.008
#> SRR1974791 4 0.4659 0.57050 0.000 0.240 0.048 0.692 0.012 0.008
#> SRR1974790 2 0.4878 0.20191 0.000 0.512 0.032 0.444 0.008 0.004
#> SRR1974789 2 0.2020 0.65512 0.000 0.896 0.008 0.096 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974786 6 0.5800 0.34727 0.232 0.000 0.048 0.008 0.092 0.620
#> SRR1974787 6 0.6903 0.31675 0.148 0.000 0.060 0.080 0.132 0.580
#> SRR1974784 4 0.5243 0.23957 0.000 0.384 0.044 0.548 0.008 0.016
#> SRR1974783 1 0.0547 0.91328 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974785 6 0.5743 0.34755 0.180 0.000 0.040 0.008 0.132 0.640
#> SRR1974782 1 0.0632 0.91054 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974781 4 0.5079 0.26647 0.000 0.388 0.044 0.552 0.008 0.008
#> SRR1974780 6 0.6564 0.35091 0.136 0.000 0.064 0.064 0.120 0.616
#> SRR1974779 1 0.0547 0.91178 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974777 1 0.0547 0.91178 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974776 6 0.5546 0.37662 0.172 0.000 0.048 0.012 0.096 0.672
#> SRR1974778 1 0.2308 0.83770 0.880 0.000 0.008 0.000 0.004 0.108
#> SRR1974774 2 0.3784 0.56855 0.000 0.736 0.024 0.236 0.004 0.000
#> SRR1974773 1 0.0858 0.90435 0.968 0.000 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974775 1 0.0632 0.90945 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974772 1 0.0146 0.92085 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974771 2 0.5667 0.45527 0.000 0.600 0.040 0.296 0.028 0.036
#> SRR1974770 2 0.3593 0.59313 0.000 0.764 0.024 0.208 0.004 0.000
#> SRR1974769 4 0.4792 0.52722 0.000 0.264 0.048 0.668 0.012 0.008
#> SRR1974768 2 0.4014 0.52362 0.000 0.696 0.024 0.276 0.004 0.000
#> SRR1974767 6 0.6549 0.34390 0.108 0.000 0.064 0.064 0.148 0.616
#> SRR1974766 2 0.4127 0.51032 0.000 0.684 0.028 0.284 0.004 0.000
#> SRR1974765 2 0.4863 0.10361 0.000 0.484 0.024 0.476 0.008 0.008
#> SRR1974764 2 0.3950 0.54396 0.000 0.708 0.024 0.264 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.2214 0.84198 0.888 0.000 0.016 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974761 2 0.3858 0.56306 0.000 0.724 0.024 0.248 0.004 0.000
#> SRR1974760 4 0.4730 0.57525 0.000 0.236 0.048 0.692 0.012 0.012
#> SRR1974759 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.3971 0.53993 0.000 0.704 0.024 0.268 0.004 0.000
#> SRR1974757 2 0.4828 0.28745 0.000 0.552 0.032 0.404 0.008 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1471 0.73509 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974755 2 0.3809 0.56653 0.000 0.732 0.024 0.240 0.004 0.000
#> SRR1974753 4 0.1753 0.73318 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000
#> SRR1974751 4 0.1542 0.73050 0.000 0.052 0.000 0.936 0.004 0.008
#> SRR1974750 4 0.1555 0.73474 0.000 0.060 0.000 0.932 0.004 0.004
#> SRR1974752 1 0.0458 0.91557 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974749 5 0.7406 0.51997 0.000 0.140 0.052 0.140 0.520 0.148
#> SRR1974747 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.1863 0.87309 0.920 0.000 0.000 0.004 0.016 0.060
#> SRR1974746 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3674 0.55382 0.000 0.268 0.000 0.716 0.016 0.000
#> SRR1974745 4 0.1398 0.73161 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008 0.000
#> SRR1974743 4 0.2212 0.72577 0.000 0.112 0.000 0.880 0.008 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.4092 0.41793 0.000 0.344 0.000 0.636 0.020 0.000
#> SRR1974739 4 0.1471 0.73528 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974741 4 0.3110 0.67212 0.000 0.196 0.000 0.792 0.012 0.000
#> SRR1974738 4 0.6486 0.13080 0.000 0.312 0.000 0.348 0.324 0.016
#> SRR1974737 4 0.2006 0.72698 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004 0.000
#> SRR1974736 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.5957 0.51240 0.008 0.008 0.020 0.172 0.612 0.180
#> SRR1974733 4 0.1858 0.73086 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004 0.000
#> SRR1974732 5 0.7131 0.37181 0.064 0.000 0.012 0.316 0.412 0.196
#> SRR1974731 4 0.1753 0.73363 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.2989 0.78435 0.824 0.000 0.008 0.004 0.004 0.160
#> SRR1974728 4 0.1700 0.73374 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR1974725 5 0.6317 0.46542 0.032 0.004 0.012 0.152 0.568 0.232
#> SRR1974726 4 0.1531 0.73513 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.6452 0.52228 0.000 0.184 0.008 0.204 0.552 0.052
#> SRR1974723 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974722 4 0.5418 0.40801 0.036 0.000 0.024 0.696 0.100 0.144
#> SRR1974721 2 0.3027 0.62323 0.000 0.824 0.000 0.148 0.028 0.000
#> SRR1974720 4 0.6152 -0.17642 0.008 0.004 0.012 0.476 0.368 0.132
#> SRR1974719 1 0.2126 0.85916 0.904 0.000 0.004 0.000 0.020 0.072
#> SRR1974718 1 0.0363 0.91732 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974716 5 0.4729 0.58213 0.004 0.012 0.012 0.096 0.740 0.136
#> SRR1974717 4 0.3853 0.53275 0.000 0.304 0.000 0.680 0.016 0.000
#> SRR1974715 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.4163 0.44463 0.008 0.000 0.008 0.016 0.700 0.268
#> SRR1974711 5 0.6457 0.58531 0.000 0.168 0.016 0.092 0.596 0.128
#> SRR1974712 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.5807 0.44520 0.000 0.304 0.012 0.124 0.552 0.008
#> SRR1974710 5 0.5294 0.58939 0.000 0.204 0.008 0.112 0.660 0.016
#> SRR1974707 1 0.6274 -0.00423 0.436 0.000 0.012 0.000 0.296 0.256
#> SRR1974706 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.4078 0.45011 0.000 0.340 0.000 0.640 0.020 0.000
#> SRR1974702 6 0.7170 0.29194 0.164 0.012 0.092 0.144 0.032 0.556
#> SRR1974701 4 0.1542 0.73050 0.000 0.052 0.000 0.936 0.004 0.008
#> SRR1974699 4 0.4234 0.14743 0.000 0.440 0.000 0.544 0.016 0.000
#> SRR1974698 4 0.2482 0.70449 0.000 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.6439 0.11201 0.340 0.000 0.008 0.004 0.360 0.288
#> SRR1974696 5 0.5930 0.59679 0.000 0.176 0.012 0.120 0.636 0.056
#> SRR1974694 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.4744 0.62007 0.000 0.084 0.000 0.084 0.744 0.088
#> SRR1974693 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974692 4 0.1700 0.73480 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR1974690 2 0.4808 0.22965 0.000 0.524 0.028 0.436 0.008 0.004
#> SRR1974691 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.1866 0.73245 0.000 0.084 0.000 0.908 0.008 0.000
#> SRR1974688 4 0.1584 0.73501 0.000 0.064 0.000 0.928 0.008 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.4650 0.69187 0.748 0.000 0.004 0.040 0.080 0.128
#> SRR1974682 4 0.7593 -0.09193 0.260 0.008 0.016 0.440 0.120 0.156
#> SRR1974681 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.5536 0.42877 0.016 0.016 0.012 0.680 0.156 0.120
#> SRR1974680 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.1542 0.73050 0.000 0.052 0.000 0.936 0.004 0.008
#> SRR1974677 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.3409 0.61120 0.000 0.788 0.024 0.184 0.004 0.000
#> SRR1974675 2 0.2563 0.62973 0.000 0.872 0.108 0.008 0.008 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.5985 -0.02913 0.000 0.472 0.012 0.124 0.384 0.008
#> SRR1974671 2 0.1644 0.65760 0.000 0.920 0.004 0.076 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974670 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974669 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.3834 0.56195 0.000 0.728 0.024 0.244 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.2949 0.62522 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028 0.000
#> SRR1974665 2 0.3809 0.56673 0.000 0.732 0.024 0.240 0.004 0.000
#> SRR1974663 6 0.5711 0.35136 0.100 0.004 0.052 0.016 0.152 0.676
#> SRR1974662 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.3838 0.58576 0.000 0.024 0.008 0.044 0.808 0.116
#> SRR1974660 1 0.3573 0.75146 0.796 0.000 0.004 0.000 0.052 0.148
#> SRR1974659 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.5334 0.45499 0.608 0.000 0.008 0.000 0.132 0.252
#> SRR1974654 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.5989 0.30429 0.540 0.000 0.012 0.004 0.196 0.248
#> SRR1974656 5 0.6284 0.25549 0.208 0.000 0.008 0.012 0.488 0.284
#> SRR1974650 5 0.5045 0.51767 0.008 0.004 0.016 0.084 0.696 0.192
#> SRR1974651 4 0.3404 0.63107 0.000 0.224 0.000 0.760 0.016 0.000
#> SRR1974652 6 0.6201 0.28868 0.232 0.000 0.040 0.016 0.128 0.584
#> SRR1974653 4 0.1411 0.73481 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1974648 5 0.6441 0.11888 0.332 0.000 0.008 0.004 0.364 0.292
#> SRR1974646 5 0.6524 0.57167 0.000 0.212 0.024 0.112 0.580 0.072
#> SRR1974649 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.3110 0.66290 0.000 0.196 0.000 0.792 0.012 0.000
#> SRR1974645 1 0.0260 0.91872 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974644 2 0.3809 0.56447 0.000 0.732 0.024 0.240 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.4208 0.59994 0.000 0.044 0.004 0.052 0.784 0.116
#> SRR1974640 5 0.4130 0.59752 0.004 0.036 0.008 0.048 0.800 0.104
#> SRR1974641 2 0.3345 0.60649 0.000 0.788 0.000 0.184 0.028 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0891 0.90490 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974635 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.4230 0.57255 0.004 0.012 0.012 0.052 0.776 0.144
#> SRR1974634 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.3927 0.43685 0.000 0.344 0.000 0.644 0.012 0.000
#> SRR1974633 5 0.5934 0.28713 0.140 0.000 0.008 0.012 0.536 0.304
#> SRR1974632 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.3451 0.54801 0.016 0.000 0.004 0.028 0.820 0.132
#> SRR1974630 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0508 0.91504 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974627 1 0.3946 0.71337 0.764 0.000 0.000 0.004 0.068 0.164
#> SRR1974624 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.1738 0.65755 0.000 0.928 0.016 0.052 0.000 0.004
#> SRR1974623 5 0.4416 0.62015 0.000 0.096 0.000 0.080 0.768 0.056
#> SRR1974622 5 0.6450 0.16243 0.304 0.000 0.008 0.008 0.416 0.264
#> SRR1974620 5 0.3526 0.58658 0.000 0.020 0.000 0.040 0.816 0.124
#> SRR1974619 5 0.4701 0.61345 0.000 0.068 0.004 0.068 0.752 0.108
#> SRR1974621 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0363 0.91708 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974616 1 0.6383 0.38122 0.568 0.000 0.036 0.112 0.032 0.252
#> SRR1974615 1 0.4356 0.64913 0.724 0.000 0.000 0.000 0.140 0.136
#> SRR1974618 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 6 0.6811 0.09397 0.076 0.020 0.048 0.024 0.328 0.504
#> SRR1974613 5 0.3744 0.54958 0.008 0.008 0.004 0.028 0.796 0.156
#> SRR1974612 1 0.2492 0.83722 0.876 0.000 0.000 0.004 0.020 0.100
#> SRR1974611 5 0.5612 0.60280 0.000 0.172 0.012 0.108 0.664 0.044
#> SRR1974610 2 0.4101 0.47119 0.000 0.664 0.000 0.308 0.028 0.000
#> SRR1974609 1 0.0146 0.92063 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974608 5 0.6213 0.30906 0.192 0.000 0.008 0.016 0.520 0.264
#> SRR1974607 1 0.6234 0.08908 0.464 0.000 0.008 0.004 0.240 0.284
#> SRR1974606 2 0.1700 0.65806 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974605 5 0.6201 0.25622 0.168 0.000 0.012 0.012 0.508 0.300
#> SRR1974604 4 0.1471 0.73509 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974603 6 0.5155 0.27853 0.016 0.004 0.056 0.016 0.236 0.672
#> SRR1974602 1 0.0000 0.92265 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.4304 0.56973 0.000 0.736 0.000 0.160 0.100 0.004
#> SRR1974601 5 0.5309 0.59735 0.000 0.184 0.004 0.108 0.672 0.032
#> SRR1974599 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.1949 0.65721 0.000 0.904 0.004 0.088 0.004 0.000
#> SRR1974594 2 0.5875 0.22940 0.000 0.480 0.000 0.380 0.120 0.020
#> SRR1974593 2 0.4224 0.57519 0.000 0.744 0.000 0.156 0.096 0.004
#> SRR1974595 2 0.4179 0.48363 0.000 0.652 0.008 0.324 0.016 0.000
#> SRR1974592 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974588 2 0.5875 0.22940 0.000 0.480 0.000 0.380 0.120 0.020
#> SRR1974590 2 0.3573 0.61713 0.000 0.796 0.004 0.148 0.052 0.000
#> SRR1974589 2 0.4412 0.56495 0.000 0.732 0.000 0.160 0.100 0.008
#> SRR1974587 2 0.5870 0.23947 0.000 0.484 0.000 0.376 0.120 0.020
#> SRR1974586 2 0.4166 0.57717 0.000 0.748 0.000 0.160 0.088 0.004
#> SRR1974585 2 0.5851 0.26156 0.000 0.496 0.000 0.364 0.120 0.020
#> SRR1974584 6 0.6015 0.10353 0.192 0.000 0.004 0.008 0.284 0.512
#> SRR1974583 2 0.3782 0.60050 0.000 0.784 0.000 0.140 0.072 0.004
#> SRR1974582 2 0.1700 0.65687 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.2165 0.65185 0.000 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000
#> SRR1974580 2 0.5769 0.27819 0.000 0.504 0.000 0.360 0.120 0.016
#> SRR1974578 2 0.5875 0.22940 0.000 0.480 0.000 0.380 0.120 0.020
#> SRR1974577 2 0.4712 0.41536 0.000 0.600 0.020 0.360 0.012 0.008
#> SRR1974579 2 0.5870 0.23947 0.000 0.484 0.000 0.376 0.120 0.020
#> SRR1974576 2 0.3548 0.60767 0.000 0.796 0.000 0.136 0.068 0.000
#> SRR1974575 2 0.1858 0.65652 0.000 0.904 0.004 0.092 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974573 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974571 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974572 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974570 6 0.4948 0.25439 0.016 0.000 0.044 0.020 0.240 0.680
#> SRR1974568 6 0.4747 0.07402 0.016 0.000 0.012 0.012 0.368 0.592
#> SRR1974567 6 0.4966 0.15456 0.028 0.000 0.020 0.012 0.316 0.624
#> SRR1974566 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974569 2 0.4845 0.17465 0.000 0.504 0.024 0.456 0.012 0.004
#> SRR1974565 2 0.5875 0.22940 0.000 0.480 0.000 0.380 0.120 0.020
#> SRR1974564 2 0.4833 0.21505 0.000 0.520 0.024 0.440 0.012 0.004
#> SRR1974560 6 0.4795 0.11647 0.028 0.000 0.012 0.008 0.340 0.612
#> SRR1974559 6 0.6015 0.10353 0.192 0.000 0.004 0.008 0.284 0.512
#> SRR1974563 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974562 2 0.4836 0.20435 0.000 0.516 0.024 0.444 0.012 0.004
#> SRR1974561 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974557 2 0.3084 0.62816 0.000 0.832 0.004 0.132 0.032 0.000
#> SRR1974553 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974555 6 0.6015 0.10353 0.192 0.000 0.004 0.008 0.284 0.512
#> SRR1974551 6 0.6015 0.10353 0.192 0.000 0.004 0.008 0.284 0.512
#> SRR1974552 2 0.4845 0.17496 0.000 0.504 0.024 0.456 0.012 0.004
#> SRR1974554 6 0.4894 0.02062 0.016 0.000 0.012 0.016 0.396 0.560
#> SRR1974558 6 0.4966 0.15456 0.028 0.000 0.020 0.012 0.316 0.624
#> SRR1974556 6 0.6024 0.10609 0.196 0.000 0.004 0.008 0.280 0.512
#> SRR1974550 5 0.5137 0.59895 0.000 0.180 0.004 0.108 0.684 0.024
#> SRR1974549 2 0.4851 0.13120 0.000 0.488 0.024 0.472 0.012 0.004
#> SRR1974548 2 0.5437 0.44300 0.000 0.604 0.004 0.272 0.108 0.012
#> SRR1974547 6 0.4852 -0.01108 0.012 0.000 0.012 0.016 0.420 0.540
#> SRR1974546 5 0.5323 0.25207 0.004 0.012 0.012 0.036 0.516 0.420
#> SRR1974545 2 0.4660 0.26155 0.000 0.540 0.020 0.428 0.008 0.004
#> SRR1974544 6 0.4966 0.15456 0.028 0.000 0.020 0.012 0.316 0.624
#> SRR1974543 2 0.4943 0.32139 0.000 0.548 0.020 0.404 0.024 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.973 0.951 0.980 0.4607 0.546 0.546
#> 3 3 0.602 0.740 0.866 0.4130 0.720 0.523
#> 4 4 0.802 0.873 0.927 0.1380 0.820 0.540
#> 5 5 0.824 0.828 0.901 0.0622 0.942 0.781
#> 6 6 0.815 0.654 0.805 0.0422 0.982 0.920
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.9881 0.2169 0.564 0.436
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.2948 0.9295 0.052 0.948
#> SRR1974998 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0376 0.9724 0.004 0.996
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974986 1 0.6438 0.7971 0.836 0.164
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974985 1 0.0376 0.9820 0.996 0.004
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.1184 0.9709 0.984 0.016
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.9129 0.5064 0.672 0.328
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.9686 0.3506 0.396 0.604
#> SRR1974977 2 0.1414 0.9583 0.020 0.980
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974965 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974941 2 0.9833 0.2705 0.424 0.576
#> SRR1974940 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0376 0.9724 0.004 0.996
#> SRR1974936 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974935 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.8016 0.6802 0.244 0.756
#> SRR1974930 1 0.0376 0.9820 0.996 0.004
#> SRR1974929 2 0.9129 0.5201 0.328 0.672
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974923 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974922 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.9686 0.3570 0.396 0.604
#> SRR1974920 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974919 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974916 2 0.7745 0.7025 0.228 0.772
#> SRR1974915 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.9881 0.2377 0.436 0.564
#> SRR1974911 2 0.8713 0.5912 0.292 0.708
#> SRR1974910 2 0.8763 0.5824 0.296 0.704
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.0938 0.9655 0.012 0.988
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.9661 0.3747 0.392 0.608
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.8813 0.5699 0.700 0.300
#> SRR1974852 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974787 2 0.9896 0.2374 0.440 0.560
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.1184 0.9707 0.984 0.016
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.9732 0.3424 0.404 0.596
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.6048 0.8189 0.852 0.148
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.9608 0.3953 0.384 0.616
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.3733 0.9089 0.072 0.928
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.6343 0.8045 0.840 0.160
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.6438 0.8015 0.164 0.836
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.5178 0.8608 0.116 0.884
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0376 0.9820 0.996 0.004
#> SRR1974711 2 0.2778 0.9328 0.048 0.952
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0376 0.9724 0.004 0.996
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.9170 0.5174 0.332 0.668
#> SRR1974701 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.4431 0.8880 0.092 0.908
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.6623 0.7877 0.828 0.172
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.9608 0.3598 0.616 0.384
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974650 2 0.8207 0.6630 0.256 0.744
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.5519 0.8465 0.128 0.872
#> SRR1974640 2 0.0938 0.9657 0.012 0.988
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.9996 0.0718 0.488 0.512
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974620 2 0.4298 0.8921 0.088 0.912
#> SRR1974619 2 0.4562 0.8834 0.096 0.904
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.6531 0.7959 0.168 0.832
#> SRR1974613 1 0.3733 0.9127 0.928 0.072
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.6887 0.7739 0.184 0.816
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.1184 0.9622 0.016 0.984
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.0376 0.9820 0.996 0.004
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0938 0.9657 0.012 0.988
#> SRR1974546 2 0.3114 0.9250 0.056 0.944
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.9758 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1975008 2 0.5621 0.52798 0.000 0.692 0.308
#> SRR1975006 2 0.5706 0.50809 0.000 0.680 0.320
#> SRR1975005 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1975004 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1975003 2 0.5678 0.51519 0.000 0.684 0.316
#> SRR1975001 2 0.2711 0.80051 0.000 0.912 0.088
#> SRR1975002 2 0.3340 0.77348 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974999 2 0.5327 0.58440 0.000 0.728 0.272
#> SRR1975000 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974998 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974997 3 0.3551 0.72094 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974995 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974996 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974992 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974990 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974989 2 0.6274 0.23122 0.000 0.544 0.456
#> SRR1974991 3 0.3267 0.73356 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974986 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974987 2 0.6079 0.38820 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974988 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974984 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974985 3 0.3623 0.72942 0.072 0.032 0.896
#> SRR1974983 2 0.4062 0.72808 0.000 0.836 0.164
#> SRR1974982 3 0.3530 0.74245 0.032 0.068 0.900
#> SRR1974981 1 0.3551 0.81119 0.868 0.000 0.132
#> SRR1974980 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974979 2 0.5882 0.46053 0.000 0.652 0.348
#> SRR1974978 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974977 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974976 2 0.5760 0.49397 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974975 3 0.5926 0.37547 0.000 0.356 0.644
#> SRR1974974 2 0.5650 0.52154 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974973 2 0.2711 0.80044 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974972 3 0.4235 0.67789 0.000 0.176 0.824
#> SRR1974971 2 0.3551 0.76219 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974970 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974969 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974968 2 0.5760 0.49427 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974967 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974965 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974966 2 0.5465 0.55985 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974964 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974963 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974961 3 0.3551 0.72084 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974962 2 0.3192 0.78066 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974960 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974959 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974958 2 0.4931 0.64155 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974957 2 0.6111 0.37052 0.000 0.604 0.396
#> SRR1974956 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974955 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974954 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974953 2 0.3412 0.76978 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974952 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974949 3 0.3879 0.70228 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974950 2 0.5926 0.44590 0.000 0.644 0.356
#> SRR1974951 2 0.5650 0.52140 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974947 3 0.6244 0.14602 0.000 0.440 0.560
#> SRR1974948 2 0.3551 0.76225 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974946 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974945 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974944 1 0.6308 -0.03816 0.508 0.000 0.492
#> SRR1974942 3 0.3193 0.71022 0.100 0.004 0.896
#> SRR1974943 3 0.2959 0.74456 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974941 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974940 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974939 3 0.5948 0.36630 0.000 0.360 0.640
#> SRR1974938 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974937 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974936 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974935 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974934 2 0.3267 0.77718 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974933 2 0.5835 0.47371 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974932 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974931 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974930 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974929 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974928 2 0.3551 0.76219 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974927 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974924 3 0.4974 0.60427 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974925 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974926 3 0.5882 0.46646 0.348 0.000 0.652
#> SRR1974923 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974922 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974921 3 0.3030 0.74668 0.004 0.092 0.904
#> SRR1974920 3 0.3038 0.70723 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974919 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974918 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974917 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974916 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974915 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974914 2 0.5397 0.57344 0.000 0.720 0.280
#> SRR1974913 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974911 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974910 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974908 2 0.3267 0.77712 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974909 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974906 3 0.3038 0.74192 0.000 0.104 0.896
#> SRR1974907 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974905 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974904 2 0.5835 0.47371 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974903 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974902 3 0.6291 0.04256 0.000 0.468 0.532
#> SRR1974901 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974898 2 0.1964 0.82308 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974900 2 0.3482 0.76606 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974899 2 0.3267 0.77718 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974897 2 0.1163 0.83979 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974896 2 0.0747 0.84588 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974893 2 0.5497 0.55369 0.000 0.708 0.292
#> SRR1974895 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974894 2 0.3551 0.76217 0.000 0.868 0.132
#> SRR1974892 2 0.6062 0.39735 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974890 3 0.6274 0.06758 0.000 0.456 0.544
#> SRR1974891 2 0.3941 0.73684 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974889 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974888 2 0.3686 0.75406 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974886 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974887 3 0.5016 0.59346 0.000 0.240 0.760
#> SRR1974885 3 0.2878 0.74693 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974883 2 0.5733 0.50393 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974884 2 0.3816 0.74560 0.000 0.852 0.148
#> SRR1974881 2 0.0592 0.84769 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974882 2 0.2537 0.80655 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974880 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974879 2 0.3116 0.78416 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974877 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974876 2 0.4399 0.69913 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974878 2 0.6154 0.34164 0.000 0.592 0.408
#> SRR1974875 3 0.5497 0.50496 0.000 0.292 0.708
#> SRR1974874 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974873 2 0.4346 0.75933 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974871 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974872 3 0.3112 0.74664 0.004 0.096 0.900
#> SRR1974869 2 0.3116 0.81524 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974868 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974870 2 0.6305 0.04607 0.000 0.516 0.484
#> SRR1974866 2 0.6168 0.29844 0.000 0.588 0.412
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974864 1 0.3482 0.81174 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974862 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974863 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974860 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974861 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974859 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974858 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974856 2 0.4121 0.77495 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974857 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974855 3 0.3192 0.73004 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 3 0.6298 0.40148 0.388 0.004 0.608
#> SRR1974852 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 3 0.5706 0.49879 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974846 2 0.5178 0.66574 0.000 0.744 0.256
#> SRR1974847 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6111 0.22934 0.604 0.000 0.396
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.5835 0.50538 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974839 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974833 3 0.3267 0.74189 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974831 2 0.4002 0.72608 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974827 2 0.2537 0.80483 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974824 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 3 0.6468 0.24403 0.444 0.004 0.552
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 3 0.6204 0.34179 0.424 0.000 0.576
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974812 1 0.5363 0.55414 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974810 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.6307 0.03097 0.000 0.512 0.488
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0424 0.96042 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.4555 0.64257 0.000 0.800 0.200
#> SRR1974804 3 0.6215 0.33371 0.428 0.000 0.572
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2796 0.86241 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974797 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974796 2 0.3752 0.73261 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974795 2 0.3482 0.75389 0.000 0.872 0.128
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974792 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974791 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974790 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974789 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974788 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974786 1 0.5650 0.45705 0.688 0.000 0.312
#> SRR1974787 3 0.5803 0.57561 0.016 0.248 0.736
#> SRR1974784 2 0.1753 0.83154 0.000 0.952 0.048
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 3 0.6824 0.36701 0.408 0.016 0.576
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 3 0.4409 0.68997 0.004 0.172 0.824
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 3 0.6407 0.57193 0.272 0.028 0.700
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1643 0.83186 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974770 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974769 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974768 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974767 3 0.5553 0.55303 0.004 0.272 0.724
#> SRR1974766 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974765 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974764 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974760 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974757 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.3340 0.80913 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974755 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974753 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974751 3 0.6299 0.09456 0.000 0.476 0.524
#> SRR1974750 2 0.6309 0.00936 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974745 2 0.6309 0.00710 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974743 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974739 2 0.6026 0.41719 0.000 0.624 0.376
#> SRR1974741 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974738 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974737 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974736 2 0.6244 0.22220 0.000 0.560 0.440
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974733 2 0.3752 0.79501 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974732 3 0.6102 0.48058 0.320 0.008 0.672
#> SRR1974731 2 0.3686 0.79729 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.3879 0.78897 0.000 0.848 0.152
#> SRR1974725 3 0.6102 0.48058 0.320 0.008 0.672
#> SRR1974726 2 0.3267 0.81197 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.5926 0.45452 0.000 0.644 0.356
#> SRR1974723 2 0.5650 0.56735 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974722 3 0.5706 0.49874 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974721 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974720 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974717 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974715 2 0.4931 0.70195 0.000 0.768 0.232
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.6541 0.49912 0.304 0.024 0.672
#> SRR1974711 3 0.5733 0.49351 0.000 0.324 0.676
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.6305 0.07901 0.000 0.484 0.516
#> SRR1974710 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974707 1 0.6309 -0.09111 0.504 0.000 0.496
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974702 3 0.3030 0.74665 0.004 0.092 0.904
#> SRR1974701 3 0.6302 0.07871 0.000 0.480 0.520
#> SRR1974699 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974698 2 0.3412 0.80777 0.000 0.876 0.124
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.6235 0.31570 0.436 0.000 0.564
#> SRR1974696 3 0.5926 0.43569 0.000 0.356 0.644
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974693 2 0.4842 0.71247 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974692 2 0.3752 0.79501 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974690 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.3752 0.79501 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974688 2 0.3816 0.79207 0.000 0.852 0.148
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 3 0.6102 0.48062 0.320 0.008 0.672
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 3 0.6079 0.36440 0.000 0.388 0.612
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974675 2 0.2537 0.80649 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974671 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974672 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974670 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974669 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974667 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974668 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974666 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974664 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974665 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974663 3 0.6519 0.65828 0.132 0.108 0.760
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 3 0.6225 0.32495 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974656 3 0.6225 0.32495 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974650 3 0.5706 0.49874 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974651 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974652 3 0.6062 0.40323 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974653 2 0.4796 0.71821 0.000 0.780 0.220
#> SRR1974648 3 0.6267 0.27550 0.452 0.000 0.548
#> SRR1974646 2 0.5497 0.59079 0.000 0.708 0.292
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974640 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974641 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.6867 0.52565 0.040 0.288 0.672
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974633 1 0.5760 0.41542 0.672 0.000 0.328
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.6102 0.48058 0.320 0.008 0.672
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974623 3 0.5785 0.48085 0.000 0.332 0.668
#> SRR1974622 1 0.0592 0.95623 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974620 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974619 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 3 0.6215 0.33330 0.428 0.000 0.572
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.5431 0.54057 0.000 0.284 0.716
#> SRR1974613 3 0.6341 0.49038 0.312 0.016 0.672
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 3 0.5835 0.46652 0.000 0.340 0.660
#> SRR1974610 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 3 0.6225 0.31836 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974607 1 0.4399 0.71608 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974606 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974605 3 0.5956 0.47609 0.324 0.004 0.672
#> SRR1974604 2 0.4235 0.76743 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974603 3 0.5733 0.49351 0.000 0.324 0.676
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974601 3 0.5948 0.42841 0.000 0.360 0.640
#> SRR1974599 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974598 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974596 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974594 2 0.5431 0.61996 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974593 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974595 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974591 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974588 3 0.6045 0.38382 0.000 0.380 0.620
#> SRR1974590 2 0.2537 0.82613 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974589 2 0.3619 0.80025 0.000 0.864 0.136
#> SRR1974587 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974586 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974585 2 0.5291 0.64945 0.000 0.732 0.268
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.2796 0.82093 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974582 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974581 2 0.0424 0.84932 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974580 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974578 2 0.6274 0.17222 0.000 0.544 0.456
#> SRR1974577 2 0.0747 0.84636 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974579 2 0.4121 0.77487 0.000 0.832 0.168
#> SRR1974576 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974575 2 0.0237 0.84963 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974574 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 3 0.5706 0.49874 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974568 3 0.6129 0.47660 0.324 0.008 0.668
#> SRR1974567 3 0.6252 0.29647 0.444 0.000 0.556
#> SRR1974566 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974565 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974564 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974560 3 0.6318 0.44026 0.356 0.008 0.636
#> SRR1974559 1 0.2066 0.90396 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974563 2 0.2537 0.82598 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974562 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974557 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974553 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.4555 0.70365 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974552 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 3 0.6967 0.51732 0.288 0.044 0.668
#> SRR1974558 3 0.6225 0.32495 0.432 0.000 0.568
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96831 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 3 0.5926 0.43620 0.000 0.356 0.644
#> SRR1974549 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 2 0.2878 0.81919 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974547 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974546 3 0.5760 0.48799 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974545 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974544 3 0.6062 0.40313 0.384 0.000 0.616
#> SRR1974543 2 0.0000 0.84966 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1975008 2 0.1824 0.9062 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1975006 2 0.1576 0.9154 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1975003 2 0.4535 0.5782 0.000 0.704 0.292 0.004
#> SRR1975001 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1975002 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974999 2 0.0895 0.9401 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1975000 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974998 3 0.0336 0.9445 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974997 3 0.1716 0.8960 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0469 0.9436 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974989 3 0.5839 0.6405 0.000 0.200 0.696 0.104
#> SRR1974991 3 0.0336 0.9417 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974986 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974987 3 0.3052 0.8218 0.000 0.136 0.860 0.004
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974983 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974982 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974981 1 0.3498 0.8016 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR1974980 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974979 3 0.4283 0.6608 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1974978 3 0.0188 0.9450 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974977 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974976 2 0.4964 0.3762 0.000 0.616 0.380 0.004
#> SRR1974975 3 0.1792 0.8905 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1974974 2 0.0779 0.9416 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974973 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974972 3 0.0817 0.9294 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1974971 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0336 0.9446 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974968 2 0.5105 0.2164 0.000 0.564 0.432 0.004
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974966 2 0.2714 0.8539 0.000 0.884 0.112 0.004
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0469 0.9389 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974962 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0895 0.9391 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974957 3 0.3486 0.7679 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0657 0.9443 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0376 0.9422 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974950 3 0.3157 0.8129 0.000 0.144 0.852 0.004
#> SRR1974951 2 0.4155 0.6746 0.000 0.756 0.240 0.004
#> SRR1974947 3 0.2281 0.8628 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974948 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974946 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0804 0.9400 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1974942 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0188 0.9450 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974940 3 0.0188 0.9450 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974939 3 0.2944 0.8316 0.000 0.128 0.868 0.004
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974936 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974933 3 0.4509 0.6024 0.000 0.288 0.708 0.004
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974930 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974929 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974928 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1474 0.9133 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974925 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974926 3 0.1388 0.9233 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1974923 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974920 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974916 3 0.0469 0.9436 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.4546 0.6487 0.000 0.732 0.256 0.012
#> SRR1974913 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974911 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974910 3 0.0592 0.9425 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974908 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0376 0.9431 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0188 0.9450 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974904 3 0.3945 0.7285 0.000 0.216 0.780 0.004
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.3668 0.7645 0.000 0.188 0.808 0.004
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9460 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974900 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974899 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974897 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974896 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974893 2 0.0657 0.9438 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974895 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974894 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974892 3 0.5452 0.4178 0.000 0.360 0.616 0.024
#> SRR1974890 3 0.3873 0.8215 0.000 0.096 0.844 0.060
#> SRR1974891 2 0.0657 0.9438 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974889 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974888 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974886 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974887 3 0.3706 0.8300 0.000 0.040 0.848 0.112
#> SRR1974885 3 0.0817 0.9334 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974883 2 0.4991 0.3589 0.000 0.608 0.388 0.004
#> SRR1974884 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974881 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974882 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974880 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974879 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974877 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974876 2 0.0672 0.9459 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1974878 3 0.4482 0.6425 0.000 0.264 0.728 0.008
#> SRR1974875 3 0.3247 0.8517 0.000 0.060 0.880 0.060
#> SRR1974874 2 0.2469 0.8591 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1974873 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974871 2 0.2760 0.8377 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974872 4 0.3356 0.7879 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1974869 2 0.2266 0.8762 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1974868 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974870 4 0.6960 0.2527 0.000 0.420 0.112 0.468
#> SRR1974866 4 0.3570 0.8208 0.000 0.048 0.092 0.860
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0707 0.9382 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974864 1 0.4399 0.6932 0.768 0.000 0.020 0.212
#> SRR1974862 2 0.0707 0.9382 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974861 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974859 4 0.3479 0.7875 0.000 0.148 0.012 0.840
#> SRR1974858 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.3105 0.8042 0.000 0.120 0.012 0.868
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 4 0.3123 0.7780 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.1635 0.8224 0.008 0.000 0.044 0.948
#> SRR1974852 2 0.0817 0.9370 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.1576 0.8239 0.000 0.004 0.048 0.948
#> SRR1974846 4 0.2988 0.8070 0.000 0.112 0.012 0.876
#> SRR1974847 1 0.1637 0.9294 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974845 2 0.1356 0.9272 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 4 0.6758 0.2591 0.400 0.000 0.096 0.504
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.2928 0.8082 0.000 0.108 0.012 0.880
#> SRR1974839 2 0.1356 0.9274 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1474 0.9174 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974834 2 0.3271 0.8257 0.000 0.856 0.012 0.132
#> SRR1974833 4 0.3356 0.7580 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1974831 4 0.3529 0.7877 0.000 0.152 0.012 0.836
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0188 0.9464 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974827 2 0.5482 0.3450 0.000 0.608 0.024 0.368
#> SRR1974824 1 0.0592 0.9673 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974825 1 0.0188 0.9759 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974822 1 0.0921 0.9576 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974823 4 0.4083 0.8010 0.068 0.000 0.100 0.832
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 4 0.4688 0.7758 0.080 0.000 0.128 0.792
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0937 0.8167 0.000 0.012 0.012 0.976
#> SRR1974812 1 0.5100 0.7132 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1974810 1 0.0188 0.9759 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974808 4 0.3367 0.8204 0.000 0.028 0.108 0.864
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.2530 0.8774 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.3495 0.7994 0.000 0.140 0.016 0.844
#> SRR1974804 4 0.3820 0.8032 0.064 0.000 0.088 0.848
#> SRR1974803 1 0.0817 0.9609 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1059 0.9564 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974796 4 0.5506 0.1583 0.000 0.472 0.016 0.512
#> SRR1974795 2 0.5483 0.0935 0.000 0.536 0.016 0.448
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0188 0.9465 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974791 2 0.2402 0.8879 0.000 0.912 0.012 0.076
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974786 1 0.6299 0.3703 0.600 0.000 0.080 0.320
#> SRR1974787 4 0.2760 0.8184 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974784 2 0.4137 0.7097 0.000 0.780 0.012 0.208
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 4 0.4827 0.7719 0.092 0.000 0.124 0.784
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.2179 0.8985 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1974780 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 4 0.3501 0.8126 0.020 0.000 0.132 0.848
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.5478 0.0522 0.000 0.540 0.016 0.444
#> SRR1974770 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974769 2 0.2676 0.8723 0.000 0.896 0.012 0.092
#> SRR1974768 2 0.1888 0.9145 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1974767 4 0.2814 0.8172 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974766 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974765 2 0.0336 0.9447 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974764 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974760 2 0.2610 0.8767 0.000 0.900 0.012 0.088
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.3217 0.8005 0.000 0.128 0.012 0.860
#> SRR1974755 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974753 4 0.3937 0.7469 0.000 0.188 0.012 0.800
#> SRR1974751 4 0.2928 0.8082 0.000 0.108 0.012 0.880
#> SRR1974750 4 0.2928 0.8082 0.000 0.108 0.012 0.880
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.2469 0.8234 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.4941 0.3171 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1974745 4 0.2867 0.8092 0.000 0.104 0.012 0.884
#> SRR1974743 4 0.3672 0.7725 0.000 0.164 0.012 0.824
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.4643 0.5461 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1974739 4 0.2988 0.8070 0.000 0.112 0.012 0.876
#> SRR1974741 4 0.3764 0.7644 0.000 0.172 0.012 0.816
#> SRR1974738 4 0.3529 0.7851 0.000 0.152 0.012 0.836
#> SRR1974737 4 0.4175 0.7186 0.000 0.212 0.012 0.776
#> SRR1974736 4 0.2928 0.8082 0.000 0.108 0.012 0.880
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.1792 0.8243 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974733 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974732 4 0.1661 0.8243 0.004 0.000 0.052 0.944
#> SRR1974731 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974725 4 0.2944 0.8183 0.004 0.000 0.128 0.868
#> SRR1974726 4 0.3377 0.7936 0.000 0.140 0.012 0.848
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 4 0.3521 0.8214 0.000 0.052 0.084 0.864
#> SRR1974723 4 0.2988 0.8070 0.000 0.112 0.012 0.876
#> SRR1974722 4 0.1042 0.8196 0.000 0.008 0.020 0.972
#> SRR1974721 2 0.2921 0.8179 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974720 4 0.1557 0.8245 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974719 1 0.0188 0.9759 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.2704 0.8194 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974717 4 0.3725 0.7587 0.000 0.180 0.008 0.812
#> SRR1974715 4 0.3105 0.8042 0.000 0.120 0.012 0.868
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974711 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 4 0.3335 0.8206 0.000 0.020 0.120 0.860
#> SRR1974710 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974707 4 0.4163 0.7976 0.076 0.000 0.096 0.828
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.5110 0.4761 0.000 0.352 0.012 0.636
#> SRR1974702 4 0.4977 0.2605 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974701 4 0.2867 0.8092 0.000 0.104 0.012 0.884
#> SRR1974699 4 0.4877 0.4014 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1974698 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 4 0.3554 0.8082 0.020 0.000 0.136 0.844
#> SRR1974696 4 0.1978 0.8260 0.000 0.004 0.068 0.928
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974693 4 0.3105 0.8042 0.000 0.120 0.012 0.868
#> SRR1974692 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974688 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0188 0.8175 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0804 0.8162 0.000 0.008 0.012 0.980
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.2402 0.8145 0.000 0.076 0.012 0.912
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974675 2 0.0376 0.9472 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0188 0.9474 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974671 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974672 2 0.0592 0.9407 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974670 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974667 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974666 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974663 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974660 1 0.1118 0.9508 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3400 0.7963 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 4 0.4920 0.7640 0.088 0.000 0.136 0.776
#> SRR1974656 4 0.3554 0.8082 0.020 0.000 0.136 0.844
#> SRR1974650 4 0.2814 0.8172 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974651 4 0.3808 0.7607 0.000 0.176 0.012 0.812
#> SRR1974652 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974653 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974648 4 0.5042 0.7571 0.096 0.000 0.136 0.768
#> SRR1974646 4 0.6121 0.5623 0.000 0.308 0.072 0.620
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.4059 0.7327 0.000 0.200 0.012 0.788
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974640 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974641 2 0.0707 0.9382 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.2760 0.8184 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.4814 0.5415 0.000 0.676 0.008 0.316
#> SRR1974633 4 0.6426 0.4042 0.352 0.000 0.080 0.568
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.1302 0.9440 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974622 1 0.4679 0.4803 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1974620 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974619 4 0.2760 0.8184 0.000 0.000 0.128 0.872
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 4 0.5938 0.6858 0.168 0.000 0.136 0.696
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974613 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974610 4 0.4955 0.2338 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 4 0.3764 0.8088 0.040 0.000 0.116 0.844
#> SRR1974607 4 0.5105 0.5896 0.276 0.000 0.028 0.696
#> SRR1974606 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974605 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974604 4 0.3161 0.8025 0.000 0.124 0.012 0.864
#> SRR1974603 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0921 0.9334 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974601 4 0.2704 0.8194 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974599 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974598 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 4 0.3300 0.8023 0.000 0.144 0.008 0.848
#> SRR1974593 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974588 4 0.1635 0.8247 0.000 0.008 0.044 0.948
#> SRR1974590 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 4 0.3448 0.7873 0.000 0.168 0.004 0.828
#> SRR1974587 2 0.1474 0.9125 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974586 2 0.0469 0.9436 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974585 4 0.3401 0.7976 0.000 0.152 0.008 0.840
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9789 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0188 0.9479 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.1940 0.8884 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974578 4 0.2522 0.8174 0.000 0.076 0.016 0.908
#> SRR1974577 2 0.0817 0.9355 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974579 4 0.3545 0.7876 0.000 0.164 0.008 0.828
#> SRR1974576 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0707 0.9388 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974573 2 0.0707 0.9388 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974571 2 0.0592 0.9404 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974572 2 0.1022 0.9318 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974570 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974568 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974567 4 0.6928 0.4665 0.308 0.000 0.136 0.556
#> SRR1974566 2 0.0592 0.9404 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974569 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974565 4 0.1356 0.8235 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR1974564 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974560 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974559 1 0.3842 0.8201 0.836 0.000 0.036 0.128
#> SRR1974563 2 0.5285 -0.0169 0.000 0.524 0.008 0.468
#> SRR1974562 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974561 2 0.0707 0.9388 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974557 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0707 0.9388 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974555 1 0.0469 0.9703 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974551 1 0.4874 0.7233 0.764 0.000 0.056 0.180
#> SRR1974552 2 0.1118 0.9292 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974554 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974558 4 0.5533 0.7243 0.132 0.000 0.136 0.732
#> SRR1974556 1 0.0188 0.9761 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974550 4 0.2999 0.8172 0.000 0.004 0.132 0.864
#> SRR1974549 2 0.0817 0.9368 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974548 4 0.4746 0.5109 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1974547 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974546 4 0.2868 0.8157 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1974545 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974544 4 0.3052 0.8154 0.004 0.000 0.136 0.860
#> SRR1974543 2 0.0707 0.9388 0.000 0.980 0.000 0.020
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.2783 0.8314 0.000 0.868 0.012 0.116 0.004
#> SRR1975006 2 0.3073 0.8242 0.000 0.856 0.024 0.116 0.004
#> SRR1975005 3 0.1851 0.8941 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.4612 0.7262 0.000 0.756 0.124 0.116 0.004
#> SRR1975001 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1975002 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974999 2 0.2886 0.8279 0.000 0.864 0.016 0.116 0.004
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.2424 0.8228 0.000 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1974995 3 0.1502 0.9107 0.000 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.1732 0.8990 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 4 0.5256 0.1946 0.000 0.048 0.356 0.592 0.004
#> SRR1974991 3 0.2389 0.8724 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.3323 0.8449 0.000 0.036 0.844 0.116 0.004
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0404 0.9349 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.4339 0.5745 0.684 0.000 0.296 0.020 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.5159 0.6698 0.000 0.180 0.700 0.116 0.004
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.5828 0.4851 0.000 0.596 0.284 0.116 0.004
#> SRR1974975 3 0.2389 0.8724 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974974 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974973 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974972 3 0.1965 0.8887 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1974971 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.5708 0.5328 0.000 0.620 0.260 0.116 0.004
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.3323 0.8141 0.000 0.844 0.036 0.116 0.004
#> SRR1974964 3 0.0162 0.9385 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.1270 0.9151 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1974962 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.2548 0.8363 0.000 0.876 0.004 0.116 0.004
#> SRR1974957 3 0.4111 0.7934 0.000 0.084 0.796 0.116 0.004
#> SRR1974956 3 0.0162 0.9384 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0162 0.9385 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974953 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974952 3 0.0162 0.9385 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974949 3 0.2124 0.8861 0.000 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR1974950 3 0.3750 0.8196 0.000 0.060 0.820 0.116 0.004
#> SRR1974951 2 0.4657 0.7228 0.000 0.752 0.128 0.116 0.004
#> SRR1974947 3 0.2389 0.8724 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974948 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974946 2 0.1124 0.8617 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0671 0.9282 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.2389 0.8724 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.4425 0.7650 0.000 0.108 0.772 0.116 0.004
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974933 3 0.5593 0.5715 0.000 0.240 0.640 0.116 0.004
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.1774 0.8911 0.000 0.000 0.932 0.016 0.052
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0290 0.9339 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.5382 0.6574 0.000 0.680 0.172 0.144 0.004
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.2389 0.8724 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1974907 3 0.0162 0.9385 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.5159 0.6728 0.000 0.180 0.700 0.116 0.004
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.5125 0.6765 0.000 0.176 0.704 0.116 0.004
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9398 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974900 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974899 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974897 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974896 2 0.2338 0.8399 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1974893 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974895 2 0.1282 0.8597 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974894 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974892 3 0.6525 0.3877 0.000 0.260 0.512 0.224 0.004
#> SRR1974890 3 0.4146 0.7129 0.000 0.012 0.716 0.268 0.004
#> SRR1974891 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974889 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974888 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974886 2 0.1768 0.8536 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1974887 3 0.3934 0.5996 0.000 0.008 0.716 0.276 0.000
#> SRR1974885 3 0.0290 0.9354 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974883 2 0.5913 0.4515 0.000 0.576 0.304 0.116 0.004
#> SRR1974884 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974881 2 0.2338 0.8400 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1974882 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974880 2 0.1041 0.8628 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974879 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974877 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974876 2 0.2488 0.8380 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1974878 3 0.5474 0.6338 0.000 0.188 0.668 0.140 0.004
#> SRR1974875 3 0.3659 0.7265 0.000 0.012 0.768 0.220 0.000
#> SRR1974874 2 0.4626 0.3555 0.000 0.616 0.000 0.364 0.020
#> SRR1974873 4 0.3688 0.8326 0.000 0.060 0.000 0.816 0.124
#> SRR1974871 2 0.4894 0.0172 0.000 0.520 0.000 0.456 0.024
#> SRR1974872 5 0.1211 0.8870 0.000 0.000 0.016 0.024 0.960
#> SRR1974869 2 0.1908 0.8169 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974868 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 5 0.3039 0.6684 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974866 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3003 0.7119 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1974864 5 0.3877 0.6893 0.212 0.000 0.000 0.024 0.764
#> SRR1974862 2 0.3612 0.5888 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.3759 0.8220 0.000 0.092 0.000 0.816 0.092
#> SRR1974858 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.3622 0.8321 0.000 0.048 0.000 0.816 0.136
#> SRR1974857 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 4 0.5920 0.5763 0.000 0.000 0.252 0.588 0.160
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.4640 0.4830 0.016 0.000 0.000 0.584 0.400
#> SRR1974852 2 0.3300 0.7265 0.000 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4219 0.4849 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1974846 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974847 5 0.4181 0.6228 0.268 0.000 0.000 0.020 0.712
#> SRR1974845 2 0.3300 0.7260 0.000 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.2036 0.8558 0.056 0.000 0.000 0.024 0.920
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974839 2 0.3741 0.6386 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.3814 0.6192 0.000 0.720 0.000 0.276 0.004
#> SRR1974834 2 0.4299 0.3784 0.000 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR1974833 4 0.5796 0.4953 0.000 0.000 0.312 0.572 0.116
#> SRR1974831 4 0.4770 0.5195 0.000 0.320 0.000 0.644 0.036
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0162 0.8674 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974827 4 0.4555 0.0951 0.000 0.472 0.000 0.520 0.008
#> SRR1974824 1 0.4824 0.0170 0.512 0.000 0.000 0.020 0.468
#> SRR1974825 1 0.2079 0.8981 0.916 0.000 0.000 0.020 0.064
#> SRR1974822 1 0.4026 0.6408 0.736 0.000 0.000 0.020 0.244
#> SRR1974823 5 0.0671 0.8965 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.5072 0.6049 0.116 0.000 0.000 0.188 0.696
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.2966 0.7876 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974812 1 0.4639 0.4218 0.632 0.000 0.000 0.024 0.344
#> SRR1974810 1 0.2270 0.8840 0.904 0.000 0.000 0.020 0.076
#> SRR1974808 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974811 1 0.0609 0.9573 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.4752 0.2400 0.568 0.000 0.000 0.020 0.412
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.5066 0.4638 0.000 0.344 0.000 0.608 0.048
#> SRR1974804 5 0.5449 0.4565 0.104 0.000 0.000 0.264 0.632
#> SRR1974803 1 0.2012 0.9026 0.920 0.000 0.000 0.020 0.060
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.4890 0.0720 0.524 0.000 0.000 0.024 0.452
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.1121 0.8572 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974796 4 0.4546 0.1416 0.000 0.460 0.000 0.532 0.008
#> SRR1974795 4 0.4436 0.3490 0.000 0.396 0.000 0.596 0.008
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.1410 0.8511 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974791 2 0.4264 0.4103 0.000 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR1974790 2 0.1121 0.8572 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 5 0.4089 0.7184 0.180 0.000 0.016 0.024 0.780
#> SRR1974787 5 0.0880 0.8929 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974784 2 0.4359 0.3092 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1974783 1 0.0404 0.9627 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974785 5 0.1280 0.8900 0.008 0.000 0.008 0.024 0.960
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.4196 0.4587 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1974780 5 0.0865 0.8939 0.000 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 5 0.0865 0.8939 0.000 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1974778 1 0.0609 0.9573 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974774 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.5105 0.4797 0.000 0.660 0.000 0.264 0.076
#> SRR1974770 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.4251 0.4201 0.000 0.624 0.000 0.372 0.004
#> SRR1974768 2 0.3366 0.6455 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1974767 5 0.0865 0.8944 0.000 0.004 0.000 0.024 0.972
#> SRR1974766 2 0.0404 0.8662 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974765 2 0.1430 0.8528 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1974764 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.4310 0.3676 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974757 2 0.1270 0.8548 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.3719 0.8305 0.000 0.068 0.000 0.816 0.116
#> SRR1974755 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974753 4 0.3749 0.8158 0.000 0.104 0.000 0.816 0.080
#> SRR1974751 4 0.3531 0.8243 0.000 0.036 0.000 0.816 0.148
#> SRR1974750 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.2583 0.7488 0.000 0.004 0.000 0.132 0.864
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.1399 0.9341 0.952 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.5029 0.6213 0.000 0.292 0.000 0.648 0.060
#> SRR1974745 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974743 4 0.3754 0.8181 0.000 0.100 0.000 0.816 0.084
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.5203 0.6491 0.000 0.272 0.000 0.648 0.080
#> SRR1974739 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974741 4 0.3758 0.8201 0.000 0.096 0.000 0.816 0.088
#> SRR1974738 4 0.3688 0.8326 0.000 0.060 0.000 0.816 0.124
#> SRR1974737 4 0.3749 0.8158 0.000 0.104 0.000 0.816 0.080
#> SRR1974736 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.0794 0.8804 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974733 4 0.3647 0.8330 0.000 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR1974732 4 0.4300 0.2992 0.000 0.000 0.000 0.524 0.476
#> SRR1974731 4 0.3669 0.8330 0.000 0.056 0.000 0.816 0.128
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0609 0.9573 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974728 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974725 5 0.0404 0.8976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974726 4 0.3688 0.8326 0.000 0.060 0.000 0.816 0.124
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.0404 0.8931 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974723 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974722 4 0.3305 0.7366 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974721 2 0.4841 0.1761 0.000 0.560 0.000 0.416 0.024
#> SRR1974720 4 0.4273 0.3763 0.000 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974719 1 0.1216 0.9414 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1974718 1 0.0162 0.9679 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 5 0.0162 0.8975 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974717 4 0.3759 0.8219 0.000 0.092 0.000 0.816 0.092
#> SRR1974715 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974711 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974710 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974707 5 0.0771 0.8951 0.004 0.000 0.000 0.020 0.976
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.3719 0.8073 0.000 0.116 0.000 0.816 0.068
#> SRR1974702 5 0.5295 0.0242 0.000 0.000 0.464 0.048 0.488
#> SRR1974701 4 0.3359 0.8091 0.000 0.020 0.000 0.816 0.164
#> SRR1974699 4 0.5405 0.5461 0.000 0.328 0.000 0.596 0.076
#> SRR1974698 4 0.3688 0.8326 0.000 0.060 0.000 0.816 0.124
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.0290 0.8981 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974696 5 0.1121 0.8684 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974694 1 0.0162 0.9679 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974695 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974693 4 0.3622 0.8321 0.000 0.048 0.000 0.816 0.136
#> SRR1974692 4 0.3647 0.8330 0.000 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR1974690 2 0.1270 0.8544 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.3647 0.8330 0.000 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR1974688 4 0.3647 0.8330 0.000 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0609 0.9573 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974682 4 0.3003 0.7796 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.3003 0.7848 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.3565 0.8278 0.000 0.040 0.000 0.816 0.144
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.2389 0.8384 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.2516 0.7686 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974663 5 0.0865 0.8939 0.000 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974660 5 0.4829 0.0847 0.480 0.000 0.000 0.020 0.500
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.2505 0.8206 0.092 0.000 0.000 0.020 0.888
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.1216 0.8876 0.020 0.000 0.000 0.020 0.960
#> SRR1974656 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974650 5 0.0162 0.8975 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974651 4 0.3754 0.8181 0.000 0.100 0.000 0.816 0.084
#> SRR1974652 5 0.0865 0.8944 0.004 0.000 0.000 0.024 0.972
#> SRR1974653 4 0.3595 0.8309 0.000 0.044 0.000 0.816 0.140
#> SRR1974648 5 0.0794 0.8877 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974646 5 0.2377 0.7621 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.3749 0.8159 0.000 0.104 0.000 0.816 0.080
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0162 0.8676 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974640 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974641 2 0.3999 0.4447 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0162 0.9679 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0162 0.8975 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.3531 0.7847 0.000 0.148 0.000 0.816 0.036
#> SRR1974633 5 0.1872 0.8619 0.052 0.000 0.000 0.020 0.928
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 5 0.4339 0.5804 0.296 0.000 0.000 0.020 0.684
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974622 5 0.2331 0.8338 0.080 0.000 0.000 0.020 0.900
#> SRR1974620 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974619 5 0.0162 0.8975 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 5 0.2554 0.8415 0.072 0.000 0.000 0.036 0.892
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.0451 0.8981 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1974613 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974612 1 0.0609 0.9573 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974611 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974610 4 0.3904 0.7832 0.000 0.156 0.000 0.792 0.052
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.0290 0.8981 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974607 5 0.1216 0.8881 0.020 0.000 0.000 0.020 0.960
#> SRR1974606 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 5 0.0671 0.8965 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974604 4 0.3647 0.8330 0.000 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR1974603 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9703 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.2193 0.8261 0.000 0.912 0.000 0.060 0.028
#> SRR1974601 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974599 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 4 0.5976 0.4888 0.000 0.112 0.000 0.488 0.400
#> SRR1974593 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974595 2 0.1270 0.8544 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 5 0.3461 0.5795 0.000 0.004 0.000 0.224 0.772
#> SRR1974590 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974589 4 0.6088 0.5187 0.000 0.128 0.000 0.492 0.380
#> SRR1974587 2 0.2362 0.8156 0.000 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1974586 2 0.0451 0.8660 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974585 4 0.6094 0.5108 0.000 0.128 0.000 0.488 0.384
#> SRR1974584 1 0.0290 0.9653 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.2769 0.7950 0.000 0.876 0.000 0.092 0.032
#> SRR1974578 4 0.4604 0.4663 0.000 0.012 0.000 0.560 0.428
#> SRR1974577 2 0.0404 0.8656 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974579 4 0.6232 0.5405 0.000 0.152 0.000 0.492 0.356
#> SRR1974576 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.2763 0.7847 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1974573 2 0.2806 0.7811 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1974571 2 0.2674 0.7914 0.000 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1974572 2 0.3086 0.7525 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004
#> SRR1974570 5 0.0324 0.8979 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974568 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974567 5 0.1670 0.8643 0.052 0.000 0.000 0.012 0.936
#> SRR1974566 2 0.2629 0.7947 0.000 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1974569 2 0.1270 0.8544 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974565 5 0.4451 -0.2937 0.000 0.004 0.000 0.492 0.504
#> SRR1974564 2 0.1121 0.8572 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974560 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974559 5 0.4040 0.6148 0.276 0.000 0.000 0.012 0.712
#> SRR1974563 2 0.4403 0.3735 0.000 0.608 0.000 0.384 0.008
#> SRR1974562 2 0.1270 0.8544 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974561 2 0.2806 0.7811 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1974557 2 0.0000 0.8681 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.2763 0.7847 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1974555 1 0.2046 0.8967 0.916 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1974551 5 0.4014 0.6380 0.256 0.000 0.000 0.016 0.728
#> SRR1974552 2 0.3521 0.6854 0.000 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR1974554 5 0.0162 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974558 5 0.1251 0.8797 0.036 0.000 0.000 0.008 0.956
#> SRR1974556 1 0.1648 0.9239 0.940 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR1974550 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974549 2 0.2890 0.7734 0.000 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1974548 2 0.4219 0.6804 0.000 0.772 0.000 0.156 0.072
#> SRR1974547 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974546 5 0.0162 0.8985 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974545 2 0.1121 0.8572 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974544 5 0.0324 0.8989 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974543 2 0.2719 0.7882 0.000 0.852 0.000 0.144 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1975008 2 0.3747 0.30751 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1975006 2 0.4319 0.24029 0.000 0.576 0.024 0.000 0.000 0.400
#> SRR1975005 3 0.3409 0.20973 0.000 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1975004 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1975003 2 0.4388 0.22129 0.000 0.572 0.028 0.000 0.000 0.400
#> SRR1975001 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1975002 2 0.3647 0.36701 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974999 2 0.4084 0.27181 0.000 0.588 0.012 0.000 0.000 0.400
#> SRR1975000 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974998 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974997 3 0.2433 0.70497 0.000 0.000 0.884 0.072 0.000 0.044
#> SRR1974995 3 0.3101 0.40526 0.000 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1974996 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974994 1 0.0146 0.94127 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974993 3 0.0790 0.78916 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974992 3 0.3151 0.38176 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974990 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974989 4 0.6712 -0.37159 0.000 0.032 0.296 0.352 0.000 0.320
#> SRR1974991 3 0.3607 -0.01221 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974986 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974987 3 0.4978 -0.54347 0.000 0.072 0.532 0.000 0.000 0.396
#> SRR1974988 3 0.0713 0.79097 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974984 3 0.1957 0.69456 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1974985 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974983 2 0.3684 0.35254 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974982 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974981 3 0.6008 0.08360 0.372 0.000 0.492 0.016 0.012 0.108
#> SRR1974980 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974979 3 0.5554 -0.79528 0.000 0.136 0.456 0.000 0.000 0.408
#> SRR1974978 3 0.0260 0.80028 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974976 2 0.5698 -0.27375 0.000 0.440 0.160 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974975 3 0.3684 -0.12891 0.000 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974974 2 0.3756 0.29865 0.000 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974973 2 0.3647 0.36701 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974972 3 0.3288 0.30006 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1974971 2 0.3852 0.32328 0.000 0.612 0.004 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974970 3 0.0790 0.78916 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974969 3 0.0146 0.80010 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974968 2 0.4940 0.08897 0.000 0.532 0.068 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974967 3 0.0937 0.78450 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974965 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974966 2 0.4057 0.29407 0.000 0.600 0.012 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974964 3 0.1007 0.78163 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974963 3 0.0865 0.78698 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974961 3 0.2941 0.47637 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974962 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974960 3 0.0790 0.78916 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974959 3 0.0146 0.79883 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974958 2 0.3717 0.33096 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974957 3 0.4419 -0.35415 0.000 0.032 0.584 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974956 3 0.1141 0.77507 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974955 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974954 3 0.0865 0.78698 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974953 2 0.4123 0.28438 0.000 0.568 0.000 0.000 0.012 0.420
#> SRR1974952 3 0.0865 0.78698 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974949 3 0.3371 0.24299 0.000 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1974950 3 0.4736 -0.48083 0.000 0.052 0.552 0.000 0.000 0.396
#> SRR1974951 2 0.4453 0.20972 0.000 0.568 0.032 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974947 3 0.3717 -0.19119 0.000 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974948 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974946 2 0.0713 0.64159 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974945 3 0.0891 0.79537 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR1974944 3 0.1218 0.78027 0.000 0.000 0.956 0.012 0.004 0.028
#> SRR1974942 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974943 3 0.3607 -0.01225 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974941 3 0.0260 0.80028 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0405 0.80025 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974939 3 0.4911 -0.50416 0.000 0.068 0.548 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974938 3 0.0865 0.78698 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974937 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974936 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974935 3 0.0865 0.78698 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974934 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974933 6 0.5901 0.81558 0.000 0.204 0.388 0.000 0.000 0.408
#> SRR1974932 3 0.0000 0.79955 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974930 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974929 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974928 2 0.3684 0.35254 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974927 3 0.0363 0.79679 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974924 3 0.2231 0.72026 0.000 0.000 0.908 0.016 0.048 0.028
#> SRR1974925 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974926 3 0.0767 0.79689 0.004 0.000 0.976 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974923 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974922 3 0.0937 0.78450 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974921 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974920 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974919 3 0.0717 0.79800 0.000 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1974918 3 0.0146 0.80008 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.3672 0.35060 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974916 3 0.0520 0.80013 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1974915 3 0.0713 0.79097 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974914 2 0.5747 -0.07969 0.000 0.440 0.108 0.016 0.000 0.436
#> SRR1974913 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974911 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974910 3 0.0622 0.80017 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974908 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974909 3 0.0000 0.79955 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.3684 -0.12723 0.000 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974907 3 0.1204 0.77117 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974905 3 0.0405 0.80025 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1974904 3 0.5872 -0.83478 0.000 0.196 0.404 0.000 0.000 0.400
#> SRR1974903 3 0.0000 0.79955 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.5386 -0.68642 0.000 0.116 0.496 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974901 3 0.0937 0.78450 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974898 2 0.3607 0.37153 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974900 2 0.3647 0.37158 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1974899 2 0.3684 0.35254 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974897 2 0.3607 0.37815 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974896 2 0.3446 0.43190 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974893 2 0.3727 0.32309 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974895 2 0.1444 0.62097 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974894 2 0.3592 0.39014 0.000 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1974892 6 0.6537 0.81163 0.000 0.188 0.336 0.040 0.000 0.436
#> SRR1974890 3 0.5116 -0.52052 0.000 0.008 0.500 0.060 0.000 0.432
#> SRR1974891 2 0.3672 0.35946 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974889 2 0.3578 0.37641 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1974888 2 0.3672 0.35946 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974886 2 0.3330 0.49234 0.000 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974887 3 0.4147 0.37839 0.000 0.000 0.716 0.224 0.000 0.060
#> SRR1974885 3 0.1124 0.78417 0.000 0.000 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1974883 2 0.5856 -0.40914 0.000 0.404 0.192 0.000 0.000 0.404
#> SRR1974884 2 0.3717 0.33096 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1974881 2 0.3563 0.40954 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974882 2 0.3607 0.38535 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974880 2 0.1863 0.60534 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974879 2 0.3659 0.36585 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974877 2 0.3547 0.38910 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974876 2 0.3930 0.35602 0.000 0.576 0.000 0.004 0.000 0.420
#> SRR1974878 6 0.5578 0.71081 0.000 0.088 0.444 0.016 0.000 0.452
#> SRR1974875 3 0.4117 0.48582 0.000 0.004 0.752 0.084 0.000 0.160
#> SRR1974874 2 0.4348 0.21370 0.000 0.560 0.000 0.416 0.000 0.024
#> SRR1974873 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974871 4 0.4348 0.23108 0.000 0.416 0.000 0.560 0.000 0.024
#> SRR1974872 5 0.3104 0.80997 0.000 0.000 0.000 0.016 0.800 0.184
#> SRR1974869 2 0.4368 0.39365 0.000 0.672 0.000 0.000 0.272 0.056
#> SRR1974868 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 5 0.2197 0.78737 0.000 0.056 0.000 0.000 0.900 0.044
#> SRR1974866 5 0.1007 0.81970 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974867 1 0.1411 0.91972 0.936 0.000 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1974865 2 0.3619 0.50913 0.000 0.744 0.000 0.232 0.000 0.024
#> SRR1974864 5 0.5153 0.71810 0.112 0.000 0.000 0.016 0.652 0.220
#> SRR1974862 2 0.4241 0.31744 0.000 0.608 0.000 0.368 0.000 0.024
#> SRR1974863 2 0.0632 0.64458 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974860 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0146 0.64826 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974859 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974858 2 0.0632 0.64458 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974856 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974857 2 0.0632 0.64458 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974855 4 0.6506 0.35266 0.000 0.000 0.264 0.524 0.112 0.100
#> SRR1974854 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.6159 -0.03631 0.008 0.000 0.000 0.420 0.352 0.220
#> SRR1974852 2 0.4931 0.49664 0.000 0.592 0.000 0.084 0.000 0.324
#> SRR1974849 1 0.0937 0.93094 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974848 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.4915 0.26597 0.000 0.004 0.004 0.564 0.380 0.048
#> SRR1974846 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974847 5 0.5113 0.72185 0.108 0.000 0.000 0.016 0.656 0.220
#> SRR1974845 2 0.4974 0.49122 0.000 0.588 0.000 0.088 0.000 0.324
#> SRR1974844 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.3596 0.79294 0.008 0.000 0.000 0.016 0.760 0.216
#> SRR1974842 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974839 2 0.5346 0.45802 0.000 0.548 0.000 0.128 0.000 0.324
#> SRR1974838 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0146 0.94127 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974835 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.5245 0.46771 0.000 0.560 0.000 0.116 0.000 0.324
#> SRR1974834 2 0.5956 0.31430 0.000 0.440 0.000 0.236 0.000 0.324
#> SRR1974833 4 0.6443 0.22111 0.000 0.000 0.324 0.448 0.032 0.196
#> SRR1974831 4 0.6096 0.20045 0.000 0.244 0.000 0.436 0.004 0.316
#> SRR1974832 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0260 0.94054 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974828 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2608 0.61101 0.000 0.872 0.000 0.000 0.048 0.080
#> SRR1974827 2 0.6119 0.14029 0.000 0.364 0.000 0.312 0.000 0.324
#> SRR1974824 5 0.6221 0.34675 0.324 0.000 0.000 0.012 0.440 0.224
#> SRR1974825 1 0.4595 0.69766 0.696 0.000 0.000 0.012 0.068 0.224
#> SRR1974822 1 0.5850 0.43100 0.560 0.000 0.000 0.016 0.204 0.220
#> SRR1974823 5 0.2389 0.82827 0.000 0.000 0.000 0.008 0.864 0.128
#> SRR1974820 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.5890 0.68686 0.048 0.000 0.004 0.116 0.608 0.224
#> SRR1974815 1 0.1204 0.92367 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974813 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1049 0.85382 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032 0.000
#> SRR1974812 1 0.6143 0.26714 0.496 0.000 0.000 0.016 0.264 0.224
#> SRR1974810 1 0.4806 0.67698 0.684 0.000 0.000 0.016 0.080 0.220
#> SRR1974808 5 0.0937 0.82102 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974811 1 0.3454 0.77745 0.760 0.000 0.000 0.012 0.004 0.224
#> SRR1974809 1 0.1007 0.92996 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974807 1 0.6327 -0.09259 0.400 0.000 0.000 0.016 0.364 0.220
#> SRR1974806 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.6223 0.05329 0.000 0.292 0.000 0.376 0.004 0.328
#> SRR1974804 5 0.6576 0.59698 0.092 0.000 0.000 0.156 0.532 0.220
#> SRR1974803 1 0.4708 0.69188 0.692 0.000 0.000 0.016 0.072 0.220
#> SRR1974801 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 5 0.6233 0.41912 0.300 0.000 0.000 0.016 0.464 0.220
#> SRR1974799 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.3690 0.55723 0.000 0.700 0.000 0.012 0.000 0.288
#> SRR1974796 2 0.6110 0.16474 0.000 0.372 0.000 0.300 0.000 0.328
#> SRR1974795 4 0.6087 0.07634 0.000 0.292 0.000 0.392 0.000 0.316
#> SRR1974793 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0146 0.64826 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974792 2 0.4234 0.52990 0.000 0.644 0.000 0.032 0.000 0.324
#> SRR1974791 2 0.5942 0.32313 0.000 0.444 0.000 0.232 0.000 0.324
#> SRR1974790 2 0.3835 0.53993 0.000 0.668 0.000 0.012 0.000 0.320
#> SRR1974789 2 0.0146 0.64826 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974788 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 5 0.5138 0.71997 0.108 0.000 0.000 0.016 0.652 0.224
#> SRR1974787 5 0.3221 0.80790 0.000 0.000 0.000 0.020 0.792 0.188
#> SRR1974784 2 0.5956 0.31430 0.000 0.440 0.000 0.236 0.000 0.324
#> SRR1974783 1 0.2531 0.86511 0.856 0.000 0.000 0.012 0.000 0.132
#> SRR1974785 5 0.3487 0.79538 0.000 0.000 0.000 0.020 0.756 0.224
#> SRR1974782 1 0.1007 0.92949 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974781 2 0.5767 0.39525 0.000 0.484 0.000 0.192 0.000 0.324
#> SRR1974780 5 0.3136 0.80880 0.000 0.000 0.000 0.016 0.796 0.188
#> SRR1974779 1 0.1007 0.92949 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974777 1 0.1007 0.92949 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974776 5 0.3261 0.80228 0.000 0.000 0.000 0.016 0.780 0.204
#> SRR1974778 1 0.3314 0.78178 0.764 0.000 0.000 0.012 0.000 0.224
#> SRR1974774 2 0.0713 0.64781 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974773 1 0.1141 0.92626 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974775 1 0.1007 0.92998 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974772 1 0.0547 0.93811 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974771 2 0.6034 0.45797 0.000 0.556 0.000 0.152 0.036 0.256
#> SRR1974770 2 0.0790 0.64768 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974769 2 0.5879 0.35463 0.000 0.460 0.000 0.216 0.000 0.324
#> SRR1974768 2 0.4474 0.52925 0.000 0.708 0.000 0.172 0.000 0.120
#> SRR1974767 5 0.3003 0.81350 0.000 0.000 0.000 0.016 0.812 0.172
#> SRR1974766 2 0.2595 0.61944 0.000 0.836 0.000 0.004 0.000 0.160
#> SRR1974765 2 0.4062 0.53689 0.000 0.660 0.000 0.024 0.000 0.316
#> SRR1974764 2 0.1753 0.63959 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1974763 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.1610 0.90782 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974761 2 0.0458 0.64707 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974760 2 0.5983 0.29890 0.000 0.432 0.000 0.244 0.000 0.324
#> SRR1974759 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1757 0.64139 0.000 0.916 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR1974757 2 0.4094 0.53350 0.000 0.652 0.000 0.024 0.000 0.324
#> SRR1974756 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974755 2 0.1007 0.64675 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974753 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974751 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974750 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974752 1 0.0458 0.93907 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974749 5 0.2679 0.78113 0.000 0.000 0.000 0.096 0.864 0.040
#> SRR1974747 1 0.0146 0.94127 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974748 1 0.4542 0.70346 0.700 0.000 0.000 0.012 0.064 0.224
#> SRR1974746 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3187 0.68459 0.000 0.188 0.000 0.796 0.004 0.012
#> SRR1974745 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974743 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974742 1 0.1007 0.92949 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974740 4 0.3484 0.68030 0.000 0.188 0.000 0.784 0.012 0.016
#> SRR1974739 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974741 4 0.1088 0.85620 0.000 0.024 0.000 0.960 0.016 0.000
#> SRR1974738 4 0.1630 0.85190 0.000 0.016 0.000 0.940 0.024 0.020
#> SRR1974737 4 0.1074 0.85329 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1974736 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.1003 0.82231 0.000 0.000 0.000 0.020 0.964 0.016
#> SRR1974733 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974732 4 0.3819 0.49997 0.000 0.000 0.000 0.672 0.316 0.012
#> SRR1974731 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.3230 0.79438 0.776 0.000 0.000 0.012 0.000 0.212
#> SRR1974728 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974725 5 0.1806 0.83313 0.000 0.000 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1974726 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.1364 0.81446 0.000 0.004 0.000 0.004 0.944 0.048
#> SRR1974723 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974722 4 0.2214 0.78182 0.000 0.000 0.000 0.888 0.096 0.016
#> SRR1974721 2 0.4408 -0.00826 0.000 0.488 0.000 0.488 0.000 0.024
#> SRR1974720 4 0.3426 0.58668 0.000 0.000 0.000 0.720 0.276 0.004
#> SRR1974719 1 0.3984 0.74976 0.736 0.000 0.000 0.012 0.028 0.224
#> SRR1974718 1 0.2572 0.86169 0.852 0.000 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR1974716 5 0.0458 0.82833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974717 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974715 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0146 0.83177 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974711 5 0.0363 0.82922 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974712 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0458 0.93908 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974708 5 0.1007 0.81970 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974710 5 0.0547 0.82743 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974707 5 0.3003 0.81329 0.000 0.000 0.000 0.016 0.812 0.172
#> SRR1974706 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1124 0.84752 0.000 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000
#> SRR1974702 5 0.6338 0.29415 0.000 0.000 0.344 0.028 0.448 0.180
#> SRR1974701 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974699 4 0.3934 0.58812 0.000 0.256 0.000 0.716 0.008 0.020
#> SRR1974698 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.1387 0.83458 0.000 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974696 5 0.1408 0.81398 0.000 0.000 0.000 0.020 0.944 0.036
#> SRR1974694 1 0.0937 0.93158 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974695 5 0.0458 0.82833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974693 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974692 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974690 2 0.4011 0.54556 0.000 0.672 0.000 0.024 0.000 0.304
#> SRR1974691 1 0.0146 0.94127 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974689 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974688 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974687 1 0.0146 0.94127 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974686 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0865 0.93254 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974684 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.3187 0.81335 0.796 0.000 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1974682 4 0.1010 0.83814 0.000 0.000 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974681 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0937 0.84644 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1974680 1 0.1007 0.92949 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974678 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974677 1 0.0632 0.93676 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974676 2 0.0260 0.64801 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974675 2 0.3727 0.34780 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974674 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.2263 0.61243 0.000 0.896 0.000 0.000 0.048 0.056
#> SRR1974671 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.2573 0.59703 0.000 0.864 0.000 0.112 0.000 0.024
#> SRR1974670 2 0.0632 0.64458 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974669 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.1075 0.64642 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974668 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0632 0.64458 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974665 2 0.1075 0.64646 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974663 5 0.3071 0.81064 0.000 0.000 0.000 0.016 0.804 0.180
#> SRR1974662 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0632 0.82629 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974660 5 0.6104 0.46447 0.276 0.000 0.000 0.012 0.488 0.224
#> SRR1974659 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0458 0.93892 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974657 5 0.3865 0.78685 0.020 0.000 0.000 0.016 0.748 0.216
#> SRR1974654 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.3136 0.80791 0.000 0.000 0.000 0.016 0.796 0.188
#> SRR1974656 5 0.1387 0.83458 0.000 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1974650 5 0.0363 0.82922 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974651 4 0.1092 0.85880 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020 0.000
#> SRR1974652 5 0.3071 0.81064 0.000 0.000 0.000 0.016 0.804 0.180
#> SRR1974653 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974648 5 0.1753 0.83387 0.000 0.000 0.000 0.004 0.912 0.084
#> SRR1974646 5 0.2144 0.79510 0.000 0.040 0.000 0.004 0.908 0.048
#> SRR1974649 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1074 0.85329 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1974645 1 0.0363 0.93969 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974644 2 0.1444 0.64284 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974643 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0458 0.82833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974640 5 0.0547 0.82743 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974641 2 0.4230 0.32056 0.000 0.612 0.000 0.364 0.000 0.024
#> SRR1974639 1 0.0363 0.93969 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974638 1 0.2915 0.82373 0.808 0.000 0.000 0.008 0.000 0.184
#> SRR1974635 1 0.0632 0.93679 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974636 5 0.0260 0.82992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974634 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0937 0.84252 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.2932 0.81636 0.000 0.000 0.000 0.016 0.820 0.164
#> SRR1974632 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0865 0.83423 0.000 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974630 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0790 0.93416 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974627 5 0.5534 0.67316 0.156 0.000 0.000 0.016 0.608 0.220
#> SRR1974624 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0260 0.64769 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974623 5 0.0713 0.82512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974622 5 0.3386 0.80738 0.008 0.000 0.000 0.016 0.788 0.188
#> SRR1974620 5 0.0458 0.82833 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974619 5 0.0547 0.82743 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974621 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0547 0.93782 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974616 5 0.4081 0.77925 0.024 0.000 0.000 0.020 0.732 0.224
#> SRR1974615 1 0.2544 0.87048 0.864 0.000 0.000 0.012 0.004 0.120
#> SRR1974618 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.1700 0.83480 0.000 0.000 0.000 0.004 0.916 0.080
#> SRR1974613 5 0.0547 0.83355 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974612 1 0.3562 0.77328 0.756 0.000 0.000 0.012 0.008 0.224
#> SRR1974611 5 0.0632 0.82629 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974610 4 0.2587 0.77865 0.000 0.108 0.000 0.868 0.004 0.020
#> SRR1974609 1 0.0713 0.93554 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974608 5 0.1501 0.83443 0.000 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1974607 5 0.3543 0.79298 0.004 0.000 0.000 0.016 0.756 0.224
#> SRR1974606 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 5 0.2744 0.82182 0.000 0.000 0.000 0.016 0.840 0.144
#> SRR1974604 4 0.1088 0.86050 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024 0.000
#> SRR1974603 5 0.0937 0.83601 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974602 1 0.0000 0.94191 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.3854 0.59305 0.000 0.800 0.000 0.040 0.040 0.120
#> SRR1974601 5 0.0632 0.82629 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974599 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0146 0.64856 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974594 5 0.6913 0.03450 0.000 0.072 0.000 0.300 0.424 0.204
#> SRR1974593 2 0.2308 0.61975 0.000 0.892 0.000 0.000 0.040 0.068
#> SRR1974595 2 0.3917 0.55439 0.000 0.692 0.000 0.024 0.000 0.284
#> SRR1974592 2 0.0146 0.64826 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974591 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 5 0.3747 0.67767 0.000 0.000 0.000 0.112 0.784 0.104
#> SRR1974590 2 0.1007 0.64399 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974589 5 0.7388 -0.12108 0.000 0.124 0.000 0.308 0.344 0.224
#> SRR1974587 2 0.4038 0.58473 0.000 0.784 0.000 0.036 0.048 0.132
#> SRR1974586 2 0.2953 0.61105 0.000 0.864 0.000 0.020 0.040 0.076
#> SRR1974585 5 0.7262 -0.09351 0.000 0.104 0.000 0.308 0.364 0.224
#> SRR1974584 1 0.2587 0.87653 0.868 0.000 0.000 0.004 0.020 0.108
#> SRR1974583 2 0.0713 0.64496 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974582 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0146 0.64826 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974580 2 0.4793 0.55185 0.000 0.700 0.000 0.052 0.040 0.208
#> SRR1974578 5 0.5781 0.13476 0.000 0.004 0.000 0.344 0.488 0.164
#> SRR1974577 2 0.3547 0.59720 0.000 0.768 0.000 0.012 0.012 0.208
#> SRR1974579 4 0.7643 0.21132 0.000 0.192 0.000 0.312 0.272 0.224
#> SRR1974576 2 0.1564 0.63604 0.000 0.936 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR1974575 2 0.0000 0.64868 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.4578 0.51617 0.000 0.624 0.000 0.056 0.000 0.320
#> SRR1974573 2 0.4578 0.51617 0.000 0.624 0.000 0.056 0.000 0.320
#> SRR1974571 2 0.4408 0.52373 0.000 0.636 0.000 0.044 0.000 0.320
#> SRR1974572 2 0.4781 0.50441 0.000 0.608 0.000 0.072 0.000 0.320
#> SRR1974570 5 0.0458 0.83241 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974568 5 0.1141 0.83534 0.000 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974567 5 0.3178 0.81468 0.004 0.000 0.000 0.016 0.804 0.176
#> SRR1974566 2 0.4408 0.52373 0.000 0.636 0.000 0.044 0.000 0.320
#> SRR1974569 2 0.4078 0.53441 0.000 0.656 0.000 0.024 0.000 0.320
#> SRR1974565 5 0.5561 0.23703 0.000 0.000 0.000 0.308 0.528 0.164
#> SRR1974564 2 0.3608 0.56263 0.000 0.716 0.000 0.012 0.000 0.272
#> SRR1974560 5 0.1141 0.83515 0.000 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1974559 5 0.5166 0.69029 0.160 0.000 0.000 0.012 0.656 0.172
#> SRR1974563 2 0.5739 0.41912 0.000 0.500 0.000 0.160 0.004 0.336
#> SRR1974562 2 0.4078 0.53441 0.000 0.656 0.000 0.024 0.000 0.320
#> SRR1974561 2 0.4578 0.51617 0.000 0.624 0.000 0.056 0.000 0.320
#> SRR1974557 2 0.1010 0.64523 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1974553 2 0.4578 0.51617 0.000 0.624 0.000 0.056 0.000 0.320
#> SRR1974555 1 0.3988 0.79280 0.776 0.000 0.000 0.012 0.072 0.140
#> SRR1974551 5 0.5323 0.68462 0.152 0.000 0.000 0.012 0.632 0.204
#> SRR1974552 2 0.5042 0.48326 0.000 0.576 0.000 0.092 0.000 0.332
#> SRR1974554 5 0.0547 0.83289 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974558 5 0.2692 0.82479 0.000 0.000 0.000 0.012 0.840 0.148
#> SRR1974556 1 0.4769 0.67956 0.680 0.000 0.000 0.012 0.080 0.228
#> SRR1974550 5 0.1007 0.81968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1974549 2 0.4683 0.51053 0.000 0.616 0.000 0.064 0.000 0.320
#> SRR1974548 2 0.6533 0.41191 0.000 0.544 0.000 0.112 0.128 0.216
#> SRR1974547 5 0.0632 0.82844 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974546 5 0.0713 0.82825 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974545 2 0.3445 0.57318 0.000 0.744 0.000 0.012 0.000 0.244
#> SRR1974544 5 0.2357 0.83093 0.000 0.000 0.000 0.012 0.872 0.116
#> SRR1974543 2 0.4482 0.52043 0.000 0.628 0.000 0.048 0.000 0.324
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.942 0.934 0.974 0.4963 0.503 0.503
#> 3 3 0.868 0.893 0.954 0.2879 0.805 0.631
#> 4 4 0.866 0.853 0.934 0.1229 0.870 0.665
#> 5 5 0.913 0.874 0.946 0.0670 0.921 0.737
#> 6 6 0.851 0.763 0.870 0.0533 0.926 0.705
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975004 1 0.9323 0.48153 0.652 0.348
#> SRR1975003 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1975000 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974998 1 0.5178 0.85565 0.884 0.116
#> SRR1974997 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974996 1 0.5408 0.84672 0.876 0.124
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974986 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974988 1 0.9000 0.55615 0.684 0.316
#> SRR1974984 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974985 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974982 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974980 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974978 1 0.1414 0.94975 0.980 0.020
#> SRR1974977 1 0.1633 0.94635 0.976 0.024
#> SRR1974976 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0376 0.97512 0.004 0.996
#> SRR1974965 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.9993 0.02549 0.484 0.516
#> SRR1974959 1 0.7674 0.71809 0.776 0.224
#> SRR1974958 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.7056 0.74649 0.192 0.808
#> SRR1974944 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974942 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974941 1 0.3733 0.90193 0.928 0.072
#> SRR1974940 1 0.8443 0.63822 0.728 0.272
#> SRR1974939 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974937 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974936 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974935 2 0.9954 0.11594 0.460 0.540
#> SRR1974934 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.9522 0.38483 0.372 0.628
#> SRR1974931 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974930 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974929 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.1633 0.95587 0.024 0.976
#> SRR1974924 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974923 1 0.8443 0.63864 0.728 0.272
#> SRR1974922 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974921 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974920 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974919 1 0.7139 0.75649 0.804 0.196
#> SRR1974918 1 0.9795 0.31424 0.584 0.416
#> SRR1974917 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974916 1 0.0938 0.95623 0.988 0.012
#> SRR1974915 2 0.9954 0.11647 0.460 0.540
#> SRR1974914 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974913 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974911 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974910 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974909 1 0.7453 0.73409 0.788 0.212
#> SRR1974906 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974905 1 0.6973 0.76783 0.812 0.188
#> SRR1974904 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974903 1 0.1414 0.94973 0.980 0.020
#> SRR1974902 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.9996 0.00936 0.488 0.512
#> SRR1974885 1 0.9460 0.44952 0.636 0.364
#> SRR1974883 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.1843 0.95184 0.028 0.972
#> SRR1974874 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.0938 0.95622 0.988 0.012
#> SRR1974869 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.3733 0.90631 0.072 0.928
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0672 0.95937 0.992 0.008
#> SRR1974852 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.9044 0.52363 0.320 0.680
#> SRR1974846 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974833 1 0.8955 0.56472 0.688 0.312
#> SRR1974831 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.9732 0.34738 0.596 0.404
#> SRR1974812 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0376 0.97511 0.004 0.996
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974780 1 0.0938 0.95624 0.988 0.012
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.2778 0.92466 0.952 0.048
#> SRR1974766 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974751 1 1.0000 0.04577 0.504 0.496
#> SRR1974750 2 0.7453 0.71579 0.212 0.788
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0376 0.97512 0.004 0.996
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.9998 0.01311 0.492 0.508
#> SRR1974733 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974732 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974722 1 0.7602 0.71633 0.780 0.220
#> SRR1974721 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974720 1 0.1184 0.95342 0.984 0.016
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.9944 0.17326 0.544 0.456
#> SRR1974717 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.9710 0.31972 0.400 0.600
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.8713 0.57518 0.292 0.708
#> SRR1974707 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974702 1 0.4022 0.89330 0.920 0.080
#> SRR1974701 1 0.9427 0.45903 0.640 0.360
#> SRR1974699 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0376 0.96236 0.996 0.004
#> SRR1974693 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.7745 0.71044 0.772 0.228
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.1414 0.95991 0.020 0.980
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.5519 0.84136 0.128 0.872
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.3733 0.90143 0.928 0.072
#> SRR1974640 1 0.1184 0.95311 0.984 0.016
#> SRR1974641 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.4815 0.86737 0.104 0.896
#> SRR1974622 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0938 0.95626 0.988 0.012
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.7219 0.74640 0.800 0.200
#> SRR1974613 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974603 1 0.9427 0.44594 0.640 0.360
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.9996 0.02783 0.488 0.512
#> SRR1974568 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.1184 0.96373 0.016 0.984
#> SRR1974564 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974560 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.9881 0.23808 0.564 0.436
#> SRR1974545 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
#> SRR1974544 1 0.0000 0.96532 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.97881 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1975008 3 0.5397 0.6429 0.000 0.280 0.720
#> SRR1975006 3 0.5363 0.6495 0.000 0.276 0.724
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.5785 0.5461 0.000 0.332 0.668
#> SRR1975001 2 0.3879 0.8068 0.000 0.848 0.152
#> SRR1975002 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974999 3 0.6291 0.1756 0.000 0.468 0.532
#> SRR1975000 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974998 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974997 3 0.1529 0.8934 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.2537 0.8535 0.080 0.000 0.920
#> SRR1974989 2 0.6309 -0.0498 0.000 0.504 0.496
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974987 3 0.0592 0.9096 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0592 0.9095 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974983 2 0.5327 0.6226 0.000 0.728 0.272
#> SRR1974982 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974981 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974979 3 0.4399 0.7723 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974978 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974977 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974976 3 0.4605 0.7539 0.000 0.204 0.796
#> SRR1974975 3 0.0237 0.9134 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974974 3 0.5706 0.5702 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974973 2 0.3941 0.8020 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.4452 0.7556 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.4654 0.7487 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.2066 0.8720 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974966 3 0.6168 0.3551 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.4235 0.7772 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.6299 0.0349 0.000 0.524 0.476
#> SRR1974957 3 0.4002 0.7998 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.3412 0.8057 0.124 0.000 0.876
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.4504 0.7502 0.000 0.804 0.196
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.2878 0.8540 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974951 3 0.6095 0.4087 0.000 0.392 0.608
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974946 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.2625 0.8909 0.916 0.000 0.084
#> SRR1974942 3 0.3482 0.8017 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974943 3 0.0892 0.9054 0.000 0.020 0.980
#> SRR1974941 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.4346 0.7764 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974936 3 0.3038 0.8285 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974933 3 0.4555 0.7584 0.000 0.200 0.800
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974930 3 0.4654 0.6930 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974929 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974928 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.0892 0.9547 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974925 3 0.2066 0.8720 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974926 1 0.5363 0.6206 0.724 0.000 0.276
#> SRR1974923 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974920 3 0.2356 0.8611 0.072 0.000 0.928
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.2066 0.9024 0.000 0.940 0.060
#> SRR1974916 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.6295 0.0511 0.000 0.528 0.472
#> SRR1974913 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974911 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974910 3 0.0424 0.9119 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974908 2 0.4291 0.7718 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974904 3 0.4346 0.7766 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974903 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974902 3 0.4452 0.7677 0.000 0.192 0.808
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9149 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.2959 0.8637 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974900 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974899 2 0.4346 0.7665 0.000 0.816 0.184
#> SRR1974897 2 0.2625 0.8796 0.000 0.916 0.084
#> SRR1974896 2 0.1031 0.9332 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974893 3 0.6235 0.2836 0.000 0.436 0.564
#> SRR1974895 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974894 2 0.4291 0.7717 0.000 0.820 0.180
#> SRR1974892 3 0.6111 0.3983 0.000 0.396 0.604
#> SRR1974890 3 0.5098 0.6939 0.000 0.248 0.752
#> SRR1974891 2 0.4842 0.7066 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974889 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974888 2 0.4654 0.7324 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974886 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974887 3 0.4504 0.7632 0.000 0.196 0.804
#> SRR1974885 3 0.0237 0.9140 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974883 3 0.6168 0.3551 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974884 2 0.4399 0.7610 0.000 0.812 0.188
#> SRR1974881 2 0.0892 0.9363 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974882 2 0.3340 0.8428 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974880 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974879 2 0.4178 0.7820 0.000 0.828 0.172
#> SRR1974877 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974876 2 0.4702 0.7260 0.000 0.788 0.212
#> SRR1974878 3 0.4887 0.7223 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974875 3 0.4504 0.7632 0.000 0.196 0.804
#> SRR1974874 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.2448 0.8957 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974869 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974870 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974866 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974861 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974859 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974856 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.6818 0.3991 0.024 0.628 0.348
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.0424 0.9641 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974852 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.4931 0.6576 0.232 0.768 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974834 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974833 1 0.9390 0.0667 0.476 0.184 0.340
#> SRR1974831 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974827 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.6095 0.3618 0.392 0.608 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974797 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974796 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974795 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974792 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974791 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974790 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974789 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974788 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974784 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974780 1 0.0424 0.9646 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974770 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974769 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974768 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974767 1 0.2165 0.9062 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974766 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974765 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974764 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974760 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974757 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974753 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.5291 0.6098 0.268 0.732 0.000
#> SRR1974750 2 0.0237 0.9414 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.6140 0.2924 0.404 0.596 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.0424 0.9656 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 1 0.5431 0.6148 0.716 0.284 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 1 0.3482 0.8340 0.872 0.128 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.6307 0.0767 0.512 0.488 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 2 0.6095 0.3272 0.392 0.608 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974710 2 0.5291 0.6026 0.268 0.732 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.5431 0.5856 0.716 0.000 0.284
#> SRR1974701 2 0.6126 0.3438 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.2165 0.9077 0.936 0.064 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 1 0.0424 0.9656 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.6215 0.2402 0.572 0.428 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974675 2 0.3941 0.8020 0.000 0.844 0.156
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974671 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974672 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974669 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974667 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974668 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974666 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974664 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.2448 0.8664 0.076 0.924 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0237 0.9687 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.4062 0.7854 0.836 0.164 0.000
#> SRR1974640 1 0.1289 0.9424 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0237 0.9687 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974623 2 0.2625 0.8545 0.084 0.916 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0237 0.9687 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974619 1 0.3752 0.8119 0.856 0.144 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.3551 0.8252 0.868 0.132 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.5988 0.4360 0.632 0.368 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974601 2 0.0237 0.9411 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974599 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974598 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974596 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974594 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974595 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974592 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974591 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974588 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974589 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974582 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974581 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974580 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974579 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974575 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974574 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974573 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974571 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974572 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974570 2 0.6520 0.0080 0.488 0.508 0.004
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974569 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974565 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974562 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974561 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974557 2 0.0237 0.9442 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974553 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974548 2 0.0000 0.9437 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 1 0.1411 0.9375 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974546 1 0.6295 0.1344 0.528 0.472 0.000
#> SRR1974545 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9721 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.1557 0.8665 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1975006 2 0.0921 0.8875 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1975005 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.2469 0.8179 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1975001 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1975002 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974999 2 0.0707 0.8928 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.3108 0.8364 0.000 0.016 0.872 0.112
#> SRR1974995 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974990 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974989 2 0.6479 0.4399 0.000 0.636 0.140 0.224
#> SRR1974991 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.4992 0.0834 0.000 0.476 0.524 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974985 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974983 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.1637 0.9105 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.4977 0.1282 0.000 0.460 0.540 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.2345 0.8267 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974975 3 0.1022 0.9191 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974974 2 0.0921 0.8879 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974973 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974971 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.3172 0.7598 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974966 2 0.1302 0.8763 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974962 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.1022 0.8852 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974957 3 0.3610 0.7077 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974950 3 0.3610 0.7089 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1974951 2 0.2345 0.8257 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1974947 3 0.0336 0.9431 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974948 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.4277 0.5820 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1974942 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974943 3 0.1940 0.8693 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.4477 0.5309 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974933 2 0.4804 0.3816 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0336 0.9411 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.4925 0.2549 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1974925 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974926 3 0.3801 0.6654 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0188 0.9449 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.1118 0.8830 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0921 0.9241 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974907 3 0.0188 0.9461 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.4790 0.3907 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.4103 0.6219 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9479 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974900 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974899 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974897 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.0707 0.8928 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974892 2 0.4522 0.5333 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1974890 2 0.4994 0.0874 0.000 0.520 0.480 0.000
#> SRR1974891 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 3 0.4831 0.6078 0.000 0.016 0.704 0.280
#> SRR1974885 3 0.0188 0.9457 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974883 2 0.2647 0.8054 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1974884 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9044 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974878 2 0.4072 0.6398 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1974875 3 0.3933 0.7001 0.000 0.200 0.792 0.008
#> SRR1974874 2 0.4992 0.0139 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1974873 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974871 4 0.4356 0.6264 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1974872 1 0.2874 0.8810 0.904 0.064 0.012 0.020
#> SRR1974869 2 0.2530 0.8357 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1974868 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974870 2 0.1389 0.8764 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974866 2 0.4193 0.6463 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.4713 0.4038 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.4888 0.2517 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1974863 2 0.2281 0.8349 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974860 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974861 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974859 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974858 2 0.2011 0.8496 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974856 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974857 2 0.3569 0.7179 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974855 4 0.5428 0.6624 0.004 0.088 0.164 0.744
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.4277 0.6075 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1974852 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.1520 0.8538 0.020 0.024 0.000 0.956
#> SRR1974846 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974839 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974834 2 0.0469 0.9017 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974833 4 0.6734 0.4302 0.316 0.020 0.068 0.596
#> SRR1974831 4 0.4989 0.1905 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.2921 0.7880 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1974827 2 0.1940 0.8511 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.1211 0.9388 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1452 0.8658 0.008 0.036 0.000 0.956
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.2647 0.8317 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.2011 0.8486 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974797 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974796 2 0.1211 0.8828 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974795 2 0.3610 0.6967 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974792 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974791 2 0.1022 0.8888 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1974790 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974789 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974788 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974786 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.0817 0.9495 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974784 2 0.0817 0.8944 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974780 1 0.1151 0.9396 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974770 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974769 2 0.0921 0.8917 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974768 2 0.0707 0.8970 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974767 1 0.2563 0.8881 0.908 0.020 0.000 0.072
#> SRR1974766 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974765 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974764 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974760 2 0.1211 0.8828 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974757 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974755 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974753 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974751 4 0.1398 0.8691 0.004 0.040 0.000 0.956
#> SRR1974750 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.4898 0.3150 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3837 0.7239 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1974745 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974743 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3569 0.7575 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1974739 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974741 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974738 4 0.3219 0.7927 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1974737 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974736 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.3444 0.6884 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974733 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974732 4 0.1792 0.8081 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974731 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974725 1 0.3528 0.7748 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1974726 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.4103 0.6653 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1974723 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974722 4 0.2480 0.8023 0.088 0.008 0.000 0.904
#> SRR1974721 4 0.4907 0.3486 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1974720 4 0.0188 0.8316 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 4 0.4522 0.4597 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1974717 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974715 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974711 2 0.7744 0.0595 0.292 0.440 0.000 0.268
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.4222 0.6395 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1974710 2 0.7241 0.2830 0.196 0.540 0.000 0.264
#> SRR1974707 1 0.0707 0.9513 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.1389 0.8703 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974702 1 0.4974 0.6614 0.736 0.040 0.224 0.000
#> SRR1974701 4 0.1488 0.8623 0.012 0.032 0.000 0.956
#> SRR1974699 4 0.3942 0.7092 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974698 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974696 4 0.3024 0.7768 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.4761 0.4451 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974693 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974692 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974690 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974688 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.1557 0.8196 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0672 0.8433 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974675 2 0.0188 0.9033 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0817 0.8942 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974671 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974672 2 0.4605 0.4633 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1974670 2 0.3569 0.7179 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1974669 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974667 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974668 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974666 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974664 2 0.3528 0.7235 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974665 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974663 1 0.0707 0.9513 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.5894 0.3178 0.040 0.392 0.000 0.568
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0188 0.9603 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0707 0.9513 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974656 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974650 1 0.4907 0.3249 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974651 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974652 1 0.0707 0.9513 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974653 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974648 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974646 2 0.1389 0.8791 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.6334 0.3865 0.592 0.080 0.000 0.328
#> SRR1974640 1 0.4897 0.5167 0.660 0.008 0.000 0.332
#> SRR1974641 2 0.4998 -0.0452 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.4304 0.6209 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974633 1 0.1022 0.9439 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974623 2 0.5966 0.4581 0.060 0.624 0.000 0.316
#> SRR1974622 1 0.0707 0.9513 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974620 1 0.4382 0.5989 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974619 4 0.4866 0.2464 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.4824 0.7291 0.780 0.144 0.000 0.076
#> SRR1974613 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.4522 0.5550 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1974610 4 0.2281 0.8459 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974605 1 0.0921 0.9464 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974604 4 0.1302 0.8720 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974603 1 0.6850 0.4315 0.600 0.188 0.000 0.212
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.3801 0.6831 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1974601 2 0.4790 0.4233 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1974599 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974598 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974596 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974594 4 0.4888 0.3726 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1974593 2 0.3444 0.7343 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1974595 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974592 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974591 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974588 4 0.4605 0.4921 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1974590 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974589 4 0.4817 0.4333 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1974587 2 0.3837 0.6769 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974586 2 0.3837 0.6773 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1974585 4 0.4985 0.1963 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974582 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974581 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974580 2 0.3610 0.7128 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974578 4 0.4331 0.6306 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1974577 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974579 4 0.4948 0.2931 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1974576 2 0.0469 0.9016 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974575 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974574 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974573 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974571 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974572 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974570 2 0.6102 0.1567 0.420 0.532 0.000 0.048
#> SRR1974568 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974567 1 0.0469 0.9558 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974566 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974569 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974565 4 0.2469 0.8279 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1974564 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974560 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974559 1 0.0469 0.9558 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974563 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974562 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974561 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974557 2 0.3074 0.7746 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1974553 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0469 0.9558 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974552 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974554 1 0.1302 0.9359 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974558 1 0.1022 0.9440 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9624 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.4543 0.5445 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1974549 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974548 2 0.4193 0.6037 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1974547 1 0.4776 0.6201 0.712 0.016 0.000 0.272
#> SRR1974546 1 0.7576 0.0911 0.472 0.220 0.000 0.308
#> SRR1974545 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974544 1 0.1118 0.9414 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974543 2 0.0188 0.9053 0.000 0.996 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 2 0.1410 0.89287 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1975006 2 0.0404 0.93101 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 2 0.2424 0.81986 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.2771 0.82638 0.000 0.012 0.860 0.128 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.5110 0.57032 0.000 0.680 0.096 0.224 0.000
#> SRR1974991 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.4182 0.33510 0.000 0.400 0.600 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 1 0.0404 0.95675 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.4297 0.09234 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 2 0.1478 0.89020 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.1043 0.91211 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1974974 2 0.0162 0.93515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.3305 0.70005 0.000 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 2 0.1043 0.91070 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0794 0.92009 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.3210 0.69555 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.3177 0.70417 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1974951 2 0.2230 0.83720 0.000 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0404 0.94330 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 1 0.3895 0.52580 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.1544 0.87937 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.3895 0.52807 0.000 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 2 0.4210 0.30195 0.000 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 1 0.3366 0.66818 0.768 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 1 0.3999 0.48837 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.0162 0.93515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0609 0.93522 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.4256 0.22449 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.3586 0.62571 0.000 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.95431 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974893 2 0.0162 0.93515 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974892 2 0.3999 0.47714 0.000 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR1974890 2 0.4291 0.13959 0.000 0.536 0.464 0.000 0.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974887 3 0.4201 0.52483 0.000 0.008 0.664 0.328 0.000
#> SRR1974885 3 0.0162 0.95115 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974883 2 0.2424 0.82000 0.000 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974878 2 0.3932 0.50954 0.000 0.672 0.328 0.000 0.000
#> SRR1974875 3 0.3242 0.69001 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1974874 2 0.4305 0.05075 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1974873 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.3452 0.64062 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1974872 5 0.4604 0.35337 0.428 0.012 0.000 0.000 0.560
#> SRR1974869 2 0.4327 0.41604 0.000 0.632 0.000 0.008 0.360
#> SRR1974868 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 5 0.2970 0.69612 0.000 0.168 0.000 0.004 0.828
#> SRR1974866 5 0.0992 0.83853 0.000 0.024 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974867 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3684 0.60579 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1974864 1 0.0290 0.96213 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974862 2 0.4101 0.40918 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1974863 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974855 4 0.1882 0.88169 0.004 0.016 0.020 0.940 0.020
#> SRR1974854 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3582 0.68377 0.768 0.000 0.000 0.224 0.008
#> SRR1974852 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974849 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974844 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1671 0.89090 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974842 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974838 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974834 2 0.1041 0.92658 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1974833 4 0.4617 0.46408 0.304 0.000 0.004 0.668 0.024
#> SRR1974831 2 0.5049 -0.00836 0.000 0.484 0.000 0.484 0.032
#> SRR1974832 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0579 0.93281 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974827 2 0.2067 0.89283 0.000 0.920 0.000 0.048 0.032
#> SRR1974824 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 5 0.1544 0.83252 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974820 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974815 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0290 0.91313 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974812 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 5 0.0992 0.83853 0.000 0.024 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974811 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1992 0.89683 0.000 0.924 0.000 0.044 0.032
#> SRR1974804 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.0794 0.92971 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974796 2 0.1386 0.91952 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR1974795 2 0.3276 0.80162 0.000 0.836 0.000 0.132 0.032
#> SRR1974793 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974791 2 0.1168 0.92441 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1974790 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974789 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.3816 0.50738 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1974784 2 0.1041 0.92658 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1974783 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974780 1 0.3274 0.68103 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974779 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2127 0.85158 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974778 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0162 0.93592 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974770 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 2 0.1041 0.92658 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1974768 2 0.0162 0.93553 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974767 5 0.4294 0.24372 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974766 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974765 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974764 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974760 2 0.1281 0.92202 0.000 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1974759 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974757 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974756 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974753 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.4134 0.67548 0.000 0.044 0.000 0.196 0.760
#> SRR1974747 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3039 0.70901 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.2732 0.74913 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.2280 0.79754 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.3861 0.57171 0.008 0.000 0.000 0.264 0.728
#> SRR1974733 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.2612 0.80920 0.008 0.000 0.000 0.868 0.124
#> SRR1974731 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 5 0.2929 0.77277 0.152 0.000 0.000 0.008 0.840
#> SRR1974726 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.2136 0.78468 0.000 0.088 0.000 0.008 0.904
#> SRR1974723 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1732 0.82923 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974721 4 0.4219 0.27573 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974720 4 0.2020 0.83779 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974719 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.1012 0.84493 0.012 0.000 0.000 0.020 0.968
#> SRR1974717 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974711 5 0.0981 0.84525 0.008 0.012 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974712 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0992 0.83853 0.000 0.024 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974710 5 0.1087 0.84473 0.008 0.016 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974707 5 0.4126 0.48074 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974706 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 1 0.3132 0.74812 0.820 0.008 0.172 0.000 0.000
#> SRR1974701 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.3003 0.71421 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.1043 0.84684 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974696 5 0.3700 0.60218 0.000 0.008 0.000 0.240 0.752
#> SRR1974694 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.1018 0.84693 0.016 0.000 0.000 0.016 0.968
#> SRR1974693 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0609 0.93228 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974691 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0162 0.91516 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0451 0.93311 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974671 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.3336 0.69006 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1974670 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974663 5 0.4114 0.48919 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974662 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.1012 0.83844 0.000 0.012 0.000 0.020 0.968
#> SRR1974660 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3707 0.55321 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974654 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.4227 0.38665 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1974656 5 0.0963 0.84812 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974650 5 0.1012 0.84493 0.012 0.000 0.000 0.020 0.968
#> SRR1974651 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.4300 -0.06393 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1974653 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.1043 0.84684 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974646 5 0.4430 0.13061 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1974649 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.1095 0.84501 0.008 0.012 0.000 0.012 0.968
#> SRR1974640 5 0.1074 0.84802 0.016 0.004 0.000 0.012 0.968
#> SRR1974641 2 0.4306 0.03131 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.1012 0.84822 0.020 0.000 0.000 0.012 0.968
#> SRR1974634 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.3424 0.70227 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974632 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974630 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 5 0.1012 0.83915 0.000 0.020 0.000 0.012 0.968
#> SRR1974622 5 0.3895 0.59563 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR1974620 5 0.0992 0.84894 0.024 0.000 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974619 5 0.1012 0.84493 0.012 0.000 0.000 0.020 0.968
#> SRR1974621 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.3111 0.77655 0.144 0.012 0.000 0.004 0.840
#> SRR1974613 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974612 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 5 0.0992 0.83853 0.000 0.024 0.000 0.008 0.968
#> SRR1974610 4 0.0609 0.90287 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.1043 0.84684 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1974607 1 0.1270 0.91794 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974606 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974605 5 0.3366 0.70992 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1974604 4 0.0000 0.91960 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.1461 0.84788 0.028 0.016 0.000 0.004 0.952
#> SRR1974602 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.1012 0.92598 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1974601 5 0.1012 0.83915 0.000 0.020 0.000 0.012 0.968
#> SRR1974599 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974594 2 0.5450 0.06626 0.000 0.496 0.000 0.444 0.060
#> SRR1974593 2 0.0579 0.93281 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974595 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974592 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 5 0.3663 0.62725 0.000 0.016 0.000 0.208 0.776
#> SRR1974590 2 0.0290 0.93521 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974589 4 0.5238 0.01769 0.000 0.472 0.000 0.484 0.044
#> SRR1974587 2 0.1117 0.92546 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974586 2 0.1012 0.92444 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1974585 2 0.4846 0.33932 0.000 0.588 0.000 0.384 0.028
#> SRR1974584 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.0290 0.93439 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 2 0.1012 0.92777 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1974578 4 0.5288 0.55812 0.000 0.244 0.000 0.656 0.100
#> SRR1974577 2 0.0404 0.93396 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974579 2 0.4946 0.36390 0.000 0.596 0.000 0.368 0.036
#> SRR1974576 2 0.0579 0.93281 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974575 2 0.0000 0.93660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974574 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974573 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974571 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974572 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974570 5 0.0290 0.84160 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974568 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974567 1 0.2690 0.78721 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974566 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974569 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974565 4 0.3759 0.70319 0.000 0.016 0.000 0.764 0.220
#> SRR1974564 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974560 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974559 1 0.2773 0.77558 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974563 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974562 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974561 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974557 2 0.0451 0.93394 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974553 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974555 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.2648 0.79310 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974552 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974554 5 0.0880 0.84920 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1974558 5 0.4126 0.45904 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974556 1 0.0000 0.96951 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.0898 0.83931 0.000 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1974549 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974548 2 0.2260 0.88122 0.000 0.908 0.000 0.064 0.028
#> SRR1974547 5 0.0579 0.84343 0.008 0.000 0.000 0.008 0.984
#> SRR1974546 5 0.0579 0.84343 0.008 0.000 0.000 0.008 0.984
#> SRR1974545 2 0.0794 0.92971 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974544 5 0.3816 0.60812 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1974543 2 0.0880 0.92829 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975008 2 0.0146 0.6655 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975006 2 0.0146 0.6605 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.3684 0.6381 0.000 0.372 0.628 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1975003 2 0.0000 0.6632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 2 0.0937 0.6787 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1975002 2 0.0865 0.6780 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974999 2 0.0000 0.6632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974998 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974997 3 0.4158 0.7451 0.000 0.244 0.704 0.052 0.000 0.000
#> SRR1974995 3 0.3659 0.6483 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.8942 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.1863 0.8663 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.3647 0.6526 0.000 0.360 0.640 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974989 2 0.4264 0.5239 0.000 0.732 0.004 0.184 0.000 0.080
#> SRR1974991 3 0.3727 0.6157 0.000 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974987 2 0.1444 0.6117 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0865 0.8893 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.2941 0.7895 0.000 0.220 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974983 2 0.0632 0.6748 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974982 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974981 1 0.3668 0.5174 0.668 0.000 0.328 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974980 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974979 2 0.2234 0.5608 0.000 0.872 0.124 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974978 3 0.0000 0.8942 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974976 2 0.0146 0.6605 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 2 0.3857 -0.3240 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.6632 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 2 0.0937 0.6787 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974972 3 0.3620 0.6621 0.000 0.352 0.648 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 2 0.0632 0.6747 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974970 3 0.1501 0.8773 0.000 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.2378 0.8293 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 2 0.0260 0.6579 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.1444 0.8790 0.000 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974966 2 0.0363 0.6697 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974964 3 0.2664 0.8179 0.000 0.184 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.1863 0.8656 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.3659 0.6484 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 2 0.0865 0.6781 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974960 3 0.1007 0.8870 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0260 0.8938 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 2 0.0260 0.6678 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974957 2 0.3383 0.3057 0.000 0.728 0.268 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974956 3 0.2912 0.7950 0.000 0.216 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974954 3 0.2300 0.8442 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 2 0.1007 0.6750 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974952 3 0.2300 0.8434 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.3706 0.6270 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 2 0.2562 0.5098 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 2 0.0291 0.6638 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974947 3 0.3862 0.4508 0.000 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 2 0.0713 0.6761 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974946 2 0.4026 0.5746 0.000 0.636 0.000 0.000 0.016 0.348
#> SRR1974945 3 0.0937 0.8881 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.2902 0.6643 0.196 0.000 0.800 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974942 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974943 2 0.3869 -0.4053 0.000 0.500 0.500 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0260 0.8938 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0260 0.8938 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 2 0.2994 0.4527 0.000 0.788 0.208 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974938 3 0.1663 0.8726 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974936 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974935 3 0.0790 0.8897 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 2 0.0865 0.6781 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974933 2 0.1757 0.6139 0.000 0.916 0.076 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974932 3 0.0260 0.8941 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974930 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974929 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974928 2 0.0790 0.6773 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974927 3 0.0865 0.8893 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.3619 0.4763 0.316 0.000 0.680 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974925 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974926 3 0.3189 0.6021 0.236 0.000 0.760 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974923 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974922 3 0.1814 0.8681 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974920 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974919 3 0.0363 0.8933 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0146 0.8941 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 2 0.1088 0.6734 0.000 0.960 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR1974916 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974915 3 0.0458 0.8927 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.1501 0.6666 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974913 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974911 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974910 3 0.0146 0.8942 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974908 2 0.0937 0.6787 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974909 3 0.0260 0.8938 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 2 0.3843 -0.2850 0.000 0.548 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.2793 0.8071 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.8942 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 2 0.1327 0.6177 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.8942 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 2 0.3383 0.3176 0.000 0.728 0.268 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974901 3 0.1863 0.8657 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.0937 0.6787 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974900 2 0.1204 0.6783 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974899 2 0.0458 0.6717 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974897 2 0.1007 0.6788 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974896 2 0.2135 0.6622 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974893 2 0.0458 0.6716 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974895 2 0.3984 0.5812 0.000 0.648 0.000 0.000 0.016 0.336
#> SRR1974894 2 0.1007 0.6788 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974892 2 0.2480 0.5947 0.000 0.872 0.104 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974890 2 0.3971 0.4303 0.000 0.748 0.184 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974891 2 0.0937 0.6787 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974889 2 0.1141 0.6787 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974888 2 0.0790 0.6771 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974886 2 0.3448 0.6076 0.000 0.716 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR1974887 3 0.5726 0.5255 0.000 0.048 0.600 0.256 0.000 0.096
#> SRR1974885 3 0.1364 0.8858 0.000 0.048 0.944 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974883 2 0.0806 0.6709 0.000 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974884 2 0.0458 0.6716 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974881 2 0.2178 0.6616 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974882 2 0.1204 0.6785 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974880 2 0.4026 0.5746 0.000 0.636 0.000 0.000 0.016 0.348
#> SRR1974879 2 0.1007 0.6789 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974877 2 0.1267 0.6777 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974876 2 0.1910 0.6542 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1974878 2 0.1003 0.6549 0.000 0.964 0.020 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974875 3 0.4981 0.4178 0.000 0.436 0.496 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974874 4 0.6096 -0.1002 0.000 0.244 0.000 0.436 0.004 0.316
#> SRR1974873 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.5010 0.4343 0.000 0.172 0.000 0.644 0.000 0.184
#> SRR1974872 5 0.4310 0.1799 0.472 0.004 0.000 0.000 0.512 0.012
#> SRR1974869 2 0.5994 0.1654 0.000 0.384 0.000 0.000 0.384 0.232
#> SRR1974868 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974870 5 0.4011 0.5618 0.000 0.212 0.000 0.000 0.732 0.056
#> SRR1974866 5 0.0363 0.8355 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 6 0.6435 -0.0732 0.000 0.348 0.000 0.264 0.016 0.372
#> SRR1974864 1 0.0725 0.9511 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974862 4 0.6474 -0.2547 0.000 0.292 0.000 0.352 0.016 0.340
#> SRR1974863 2 0.4150 0.5364 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974860 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974861 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974859 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.4150 0.5364 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974856 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.4150 0.5364 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974855 4 0.4138 0.5941 0.004 0.020 0.008 0.700 0.000 0.268
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.3683 0.6945 0.768 0.000 0.000 0.184 0.000 0.048
#> SRR1974852 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0405 0.8893 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974846 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974845 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.1858 0.8831 0.912 0.000 0.000 0.000 0.076 0.012
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974834 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974833 4 0.5378 0.1723 0.084 0.000 0.008 0.460 0.000 0.448
#> SRR1974831 6 0.3376 0.5726 0.000 0.016 0.000 0.220 0.000 0.764
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.4755 0.3609 0.000 0.492 0.000 0.000 0.048 0.460
#> SRR1974827 6 0.1461 0.8599 0.000 0.044 0.000 0.016 0.000 0.940
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 5 0.1411 0.8216 0.060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974808 5 0.0363 0.8363 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.1265 0.8670 0.000 0.044 0.000 0.008 0.000 0.948
#> SRR1974804 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0363 0.9616 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974797 6 0.1444 0.8521 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1974796 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974795 6 0.1297 0.8623 0.000 0.040 0.000 0.012 0.000 0.948
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974792 6 0.1075 0.8714 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974791 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974790 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974789 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974788 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974786 1 0.0260 0.9644 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974787 1 0.3670 0.5443 0.704 0.000 0.000 0.000 0.284 0.012
#> SRR1974784 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0146 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974780 1 0.3693 0.6597 0.756 0.016 0.000 0.000 0.216 0.012
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2121 0.8588 0.892 0.000 0.000 0.000 0.096 0.012
#> SRR1974778 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.4099 0.5570 0.000 0.612 0.000 0.000 0.016 0.372
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.4253 0.4030 0.000 0.524 0.000 0.000 0.016 0.460
#> SRR1974770 2 0.4110 0.5528 0.000 0.608 0.000 0.000 0.016 0.376
#> SRR1974769 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974768 2 0.4297 0.4219 0.000 0.532 0.000 0.004 0.012 0.452
#> SRR1974767 1 0.4184 -0.0842 0.504 0.000 0.000 0.000 0.484 0.012
#> SRR1974766 2 0.4205 0.4885 0.000 0.564 0.000 0.000 0.016 0.420
#> SRR1974765 6 0.1141 0.8690 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1974764 2 0.4141 0.5386 0.000 0.596 0.000 0.000 0.016 0.388
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.4088 0.5604 0.000 0.616 0.000 0.000 0.016 0.368
#> SRR1974760 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.4121 0.5484 0.000 0.604 0.000 0.000 0.016 0.380
#> SRR1974757 6 0.1267 0.8627 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.4150 0.5335 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974753 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 5 0.4767 0.5961 0.000 0.088 0.000 0.200 0.696 0.016
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3370 0.6962 0.000 0.148 0.000 0.804 0.000 0.048
#> SRR1974745 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 4 0.3235 0.7228 0.000 0.128 0.000 0.820 0.000 0.052
#> SRR1974739 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.2812 0.7725 0.000 0.096 0.000 0.856 0.000 0.048
#> SRR1974737 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 5 0.3595 0.5102 0.000 0.000 0.000 0.288 0.704 0.008
#> SRR1974733 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.1908 0.8160 0.004 0.000 0.000 0.900 0.096 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974725 5 0.3144 0.7331 0.172 0.000 0.000 0.016 0.808 0.004
#> SRR1974726 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.2712 0.7382 0.000 0.088 0.000 0.000 0.864 0.048
#> SRR1974723 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1714 0.7902 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1974721 4 0.5592 0.1932 0.000 0.200 0.000 0.544 0.000 0.256
#> SRR1974720 4 0.1387 0.8445 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1974719 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 5 0.0291 0.8368 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1974717 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974711 5 0.0146 0.8373 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0458 0.8345 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974710 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974707 5 0.3862 0.4357 0.388 0.000 0.000 0.000 0.608 0.004
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0603 0.8819 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1974702 1 0.4079 0.7328 0.788 0.084 0.096 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974701 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.3806 0.6607 0.000 0.152 0.000 0.772 0.000 0.076
#> SRR1974698 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.1075 0.8273 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974696 5 0.3688 0.5561 0.000 0.000 0.000 0.256 0.724 0.020
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.2178 0.7779 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974675 2 0.1141 0.6788 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.4675 0.5011 0.000 0.560 0.000 0.000 0.048 0.392
#> SRR1974671 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974672 6 0.6366 -0.1260 0.000 0.372 0.000 0.232 0.016 0.380
#> SRR1974670 2 0.4150 0.5364 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974669 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974667 2 0.4168 0.5224 0.000 0.584 0.000 0.000 0.016 0.400
#> SRR1974668 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974666 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974664 2 0.4150 0.5364 0.000 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1974665 2 0.4176 0.5158 0.000 0.580 0.000 0.000 0.016 0.404
#> SRR1974663 5 0.4093 0.3926 0.404 0.000 0.000 0.000 0.584 0.012
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.3468 0.5577 0.712 0.000 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.3907 0.3889 0.408 0.000 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1974656 5 0.1152 0.8281 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1974650 5 0.0363 0.8342 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.4136 0.1254 0.560 0.000 0.000 0.000 0.428 0.012
#> SRR1974653 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.1285 0.8241 0.052 0.000 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1974646 5 0.6038 -0.1905 0.000 0.316 0.000 0.000 0.416 0.268
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.4168 0.5219 0.000 0.584 0.000 0.000 0.016 0.400
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974640 5 0.0260 0.8391 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974641 4 0.6386 -0.1722 0.000 0.248 0.000 0.404 0.016 0.332
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974633 5 0.3240 0.6780 0.244 0.000 0.000 0.000 0.752 0.004
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974623 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974622 5 0.3714 0.5370 0.340 0.000 0.000 0.000 0.656 0.004
#> SRR1974620 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974619 5 0.0458 0.8321 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 5 0.2446 0.7706 0.124 0.000 0.000 0.000 0.864 0.012
#> SRR1974613 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974612 1 0.0146 0.9676 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974611 5 0.0260 0.8365 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974610 4 0.2070 0.8028 0.000 0.008 0.000 0.892 0.000 0.100
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.1411 0.8203 0.060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974607 1 0.0937 0.9325 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974606 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974605 5 0.3290 0.6712 0.252 0.000 0.000 0.000 0.744 0.004
#> SRR1974604 4 0.0000 0.8959 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974603 5 0.0806 0.8369 0.020 0.000 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 6 0.5126 -0.1669 0.000 0.424 0.000 0.016 0.048 0.512
#> SRR1974601 5 0.0405 0.8353 0.000 0.004 0.000 0.000 0.988 0.008
#> SRR1974599 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974598 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974596 2 0.4121 0.5426 0.000 0.604 0.000 0.000 0.016 0.380
#> SRR1974594 6 0.4212 0.7270 0.000 0.084 0.000 0.080 0.052 0.784
#> SRR1974593 2 0.4779 0.3457 0.000 0.488 0.000 0.004 0.040 0.468
#> SRR1974595 6 0.1387 0.8571 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974592 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974591 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974588 5 0.5005 0.2576 0.000 0.012 0.000 0.048 0.544 0.396
#> SRR1974590 2 0.4264 0.3614 0.000 0.500 0.000 0.000 0.016 0.484
#> SRR1974589 6 0.4087 0.7339 0.000 0.080 0.000 0.084 0.044 0.792
#> SRR1974587 6 0.4788 0.3362 0.000 0.296 0.000 0.016 0.048 0.640
#> SRR1974586 2 0.4984 0.3283 0.000 0.480 0.000 0.008 0.048 0.464
#> SRR1974585 6 0.3904 0.7414 0.000 0.092 0.000 0.064 0.040 0.804
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.4385 0.4351 0.000 0.532 0.000 0.000 0.024 0.444
#> SRR1974582 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974581 2 0.4076 0.5640 0.000 0.620 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1974580 6 0.4129 0.5999 0.000 0.200 0.000 0.020 0.036 0.744
#> SRR1974578 6 0.5107 0.6393 0.000 0.060 0.000 0.180 0.068 0.692
#> SRR1974577 6 0.4238 -0.1823 0.000 0.444 0.000 0.000 0.016 0.540
#> SRR1974579 6 0.4090 0.7320 0.000 0.092 0.000 0.068 0.048 0.792
#> SRR1974576 2 0.4529 0.3827 0.000 0.508 0.000 0.000 0.032 0.460
#> SRR1974575 2 0.4110 0.5485 0.000 0.608 0.000 0.000 0.016 0.376
#> SRR1974574 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974573 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974571 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974572 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974570 5 0.0790 0.8290 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974568 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974567 1 0.2491 0.7780 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974566 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974569 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974565 6 0.5005 0.4112 0.000 0.000 0.000 0.248 0.124 0.628
#> SRR1974564 6 0.1204 0.8664 0.000 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1974560 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974559 1 0.2562 0.7663 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974563 6 0.0865 0.8677 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974562 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974561 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974557 2 0.4322 0.4119 0.000 0.528 0.000 0.000 0.020 0.452
#> SRR1974553 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.2378 0.7953 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974552 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974554 5 0.0458 0.8391 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974558 5 0.3756 0.3940 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 5 0.0260 0.8368 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974549 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1974548 6 0.4131 0.7133 0.000 0.116 0.000 0.048 0.052 0.784
#> SRR1974547 5 0.0363 0.8350 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974546 5 0.0000 0.8374 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974545 6 0.1663 0.8379 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1974544 5 0.3515 0.5578 0.324 0.000 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974543 6 0.1007 0.8738 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.969 0.987 0.3953 0.608 0.608
#> 3 3 0.750 0.876 0.937 0.3750 0.860 0.769
#> 4 4 0.632 0.684 0.867 0.1822 0.908 0.806
#> 5 5 0.641 0.686 0.837 0.1006 0.936 0.836
#> 6 6 0.735 0.740 0.881 0.0698 0.892 0.686
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974998 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974994 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974993 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.1633 0.961 0.976 0.024
#> SRR1974989 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974986 2 0.0376 0.985 0.004 0.996
#> SRR1974987 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974985 2 0.0376 0.985 0.004 0.996
#> SRR1974983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974982 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974981 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974980 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974977 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974965 2 0.9954 0.131 0.460 0.540
#> SRR1974966 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974955 1 0.9129 0.522 0.672 0.328
#> SRR1974954 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974944 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974942 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974943 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974941 2 0.0672 0.982 0.008 0.992
#> SRR1974940 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974936 2 0.5519 0.849 0.128 0.872
#> SRR1974935 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974930 2 0.2423 0.950 0.040 0.960
#> SRR1974929 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974924 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974925 1 0.0672 0.975 0.992 0.008
#> SRR1974926 1 0.0376 0.978 0.996 0.004
#> SRR1974923 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974922 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974920 2 0.8443 0.623 0.272 0.728
#> SRR1974919 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974916 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974915 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974911 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974910 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974904 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974874 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974872 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974869 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974870 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974866 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.8955 0.554 0.688 0.312
#> SRR1974862 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974858 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0376 0.985 0.004 0.996
#> SRR1974852 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.9977 0.112 0.528 0.472
#> SRR1974842 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974839 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974834 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974833 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974827 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974823 2 0.6623 0.789 0.172 0.828
#> SRR1974820 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1414 0.965 0.980 0.020
#> SRR1974815 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974812 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974808 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.8713 0.598 0.708 0.292
#> SRR1974803 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.2423 0.946 0.960 0.040
#> SRR1974799 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974795 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974786 2 0.9795 0.281 0.416 0.584
#> SRR1974787 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974784 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974785 2 0.6343 0.806 0.160 0.840
#> SRR1974782 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974776 2 0.7139 0.754 0.196 0.804
#> SRR1974778 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974768 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974767 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974764 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974734 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974732 2 0.0376 0.985 0.004 0.996
#> SRR1974731 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974725 2 0.1184 0.974 0.016 0.984
#> SRR1974726 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974720 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974716 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974714 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974711 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974708 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974710 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974707 2 0.9933 0.166 0.452 0.548
#> SRR1974706 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.1843 0.962 0.028 0.972
#> SRR1974701 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974697 2 0.6623 0.789 0.172 0.828
#> SRR1974696 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974695 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974682 2 0.2043 0.958 0.032 0.968
#> SRR1974681 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974673 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974663 2 0.1843 0.962 0.028 0.972
#> SRR1974662 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974661 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.1414 0.965 0.980 0.020
#> SRR1974654 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974655 2 0.4022 0.907 0.080 0.920
#> SRR1974656 2 0.6048 0.824 0.148 0.852
#> SRR1974650 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974652 2 0.0938 0.978 0.012 0.988
#> SRR1974653 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974648 2 0.8144 0.660 0.252 0.748
#> SRR1974646 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974642 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974640 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974636 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974633 1 0.2948 0.934 0.948 0.052
#> SRR1974632 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974631 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974623 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.4298 0.896 0.912 0.088
#> SRR1974620 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974619 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.7674 0.716 0.776 0.224
#> SRR1974615 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974614 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974613 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974611 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974608 2 0.6343 0.807 0.160 0.840
#> SRR1974607 2 0.9248 0.482 0.340 0.660
#> SRR1974606 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974605 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974603 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974601 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974593 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974595 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974588 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974590 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974587 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974586 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.1633 0.961 0.976 0.024
#> SRR1974583 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974578 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974577 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974579 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974576 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974575 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974573 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974571 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974572 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974570 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974568 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974567 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974566 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974569 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974565 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974560 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974559 1 0.5629 0.844 0.868 0.132
#> SRR1974563 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974562 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974561 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974557 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974553 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.7602 0.723 0.780 0.220
#> SRR1974552 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974554 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974558 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR1974550 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974549 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974548 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974547 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974546 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974545 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974544 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1974543 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1975008 3 0.1643 0.9007 0.000 0.044 0.956
#> SRR1975006 3 0.3752 0.8031 0.000 0.144 0.856
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.1529 0.9035 0.000 0.040 0.960
#> SRR1975001 2 0.3412 0.9035 0.000 0.876 0.124
#> SRR1975002 3 0.6235 0.0455 0.000 0.436 0.564
#> SRR1974999 3 0.0424 0.9226 0.000 0.008 0.992
#> SRR1975000 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974998 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974997 3 0.0237 0.9241 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974995 3 0.0237 0.9241 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974996 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974994 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 3 0.0237 0.9241 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 1 0.3886 0.8632 0.880 0.096 0.024
#> SRR1974989 3 0.2448 0.8730 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974991 3 0.1860 0.8966 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974986 3 0.3112 0.8604 0.004 0.096 0.900
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.1529 0.9046 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.3193 0.8567 0.004 0.100 0.896
#> SRR1974983 2 0.6062 0.5668 0.000 0.616 0.384
#> SRR1974982 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974981 1 0.0747 0.9572 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974980 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974979 3 0.4504 0.7314 0.000 0.196 0.804
#> SRR1974978 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974977 3 0.2625 0.8729 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.4605 0.7098 0.000 0.204 0.796
#> SRR1974973 3 0.0747 0.9195 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.1163 0.9115 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974970 3 0.2356 0.8821 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.2261 0.8852 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974965 3 0.8627 0.1518 0.392 0.104 0.504
#> SRR1974966 3 0.1753 0.8975 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974964 3 0.0237 0.9241 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974963 3 0.2537 0.8761 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0592 0.9206 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974960 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974959 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974958 3 0.0592 0.9213 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0424 0.9225 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974955 1 0.8395 0.3070 0.568 0.104 0.328
#> SRR1974954 3 0.1643 0.9019 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974953 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.2796 0.8649 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974951 3 0.2959 0.8480 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.4974 0.6552 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974946 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974945 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974944 1 0.1289 0.9448 0.968 0.032 0.000
#> SRR1974942 3 0.2165 0.8889 0.000 0.064 0.936
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.3193 0.8565 0.004 0.100 0.896
#> SRR1974940 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974937 3 0.0592 0.9208 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974936 3 0.5407 0.7714 0.076 0.104 0.820
#> SRR1974935 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974934 3 0.5905 0.3722 0.000 0.352 0.648
#> SRR1974933 3 0.1529 0.9035 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974932 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974931 3 0.0592 0.9206 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974930 3 0.3752 0.8455 0.020 0.096 0.884
#> SRR1974929 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974928 3 0.4399 0.7383 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974927 3 0.2625 0.8727 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974924 1 0.3038 0.8838 0.896 0.104 0.000
#> SRR1974925 1 0.3295 0.8807 0.896 0.096 0.008
#> SRR1974926 1 0.2945 0.8922 0.908 0.088 0.004
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974921 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974920 3 0.7085 0.5984 0.188 0.096 0.716
#> SRR1974919 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974918 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974917 3 0.6295 -0.1657 0.000 0.472 0.528
#> SRR1974916 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974915 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974914 3 0.2448 0.8726 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974913 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974911 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974910 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974908 2 0.3340 0.9046 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974909 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974905 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974904 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974903 3 0.2878 0.8625 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974902 3 0.2066 0.8874 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974901 3 0.2625 0.8727 0.000 0.084 0.916
#> SRR1974898 2 0.3116 0.9105 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974900 3 0.5465 0.5453 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974899 2 0.3116 0.9106 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974897 2 0.3340 0.9057 0.000 0.880 0.120
#> SRR1974896 2 0.5733 0.6879 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974893 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974895 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974894 3 0.5138 0.6239 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974892 3 0.1529 0.9036 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974890 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 3 0.2261 0.8802 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974889 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974888 3 0.5327 0.5825 0.000 0.272 0.728
#> SRR1974886 3 0.1031 0.9147 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974887 3 0.2066 0.8910 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974885 3 0.2356 0.8828 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974883 3 0.1163 0.9117 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974884 3 0.3267 0.8352 0.000 0.116 0.884
#> SRR1974881 3 0.5948 0.3457 0.000 0.360 0.640
#> SRR1974882 3 0.4974 0.6548 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974880 2 0.5098 0.7986 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974879 3 0.5760 0.4448 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974877 2 0.3267 0.9075 0.000 0.884 0.116
#> SRR1974876 3 0.4346 0.7399 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974878 3 0.1753 0.8979 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974875 3 0.2537 0.8759 0.000 0.080 0.920
#> SRR1974874 2 0.5529 0.7416 0.000 0.704 0.296
#> SRR1974873 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974871 3 0.4702 0.6977 0.000 0.212 0.788
#> SRR1974872 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974869 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974870 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974866 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974864 1 0.6047 0.4074 0.680 0.008 0.312
#> SRR1974862 2 0.6295 0.3685 0.000 0.528 0.472
#> SRR1974863 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974860 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974861 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974859 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974858 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974856 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974857 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974855 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 3 0.0661 0.9209 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974852 3 0.1289 0.9095 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974846 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974845 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.6672 0.0525 0.520 0.008 0.472
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974839 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974833 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974831 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974827 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974824 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974823 3 0.4589 0.7338 0.172 0.008 0.820
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.1031 0.9414 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974812 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974804 1 0.5529 0.4920 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.1529 0.9200 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974797 2 0.4842 0.8262 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974796 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974795 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974792 3 0.4605 0.7085 0.000 0.204 0.796
#> SRR1974791 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974790 3 0.4291 0.7512 0.000 0.180 0.820
#> SRR1974789 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974788 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974786 3 0.6565 0.2398 0.416 0.008 0.576
#> SRR1974787 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974784 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 3 0.4002 0.7603 0.160 0.000 0.840
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974780 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 3 0.4504 0.7042 0.196 0.000 0.804
#> SRR1974778 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974774 2 0.3752 0.8913 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974769 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974768 3 0.5138 0.6256 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974767 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974766 3 0.4654 0.7022 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974765 3 0.0424 0.9226 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974764 3 0.0592 0.9208 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.5016 0.8073 0.000 0.760 0.240
#> SRR1974760 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 3 0.2261 0.8834 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974757 3 0.4750 0.6912 0.000 0.216 0.784
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.5733 0.6879 0.000 0.676 0.324
#> SRR1974753 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974751 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 3 0.4399 0.7335 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974745 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 3 0.0592 0.9207 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974739 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974738 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974736 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974733 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 3 0.0661 0.9209 0.004 0.008 0.988
#> SRR1974731 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 3 0.1170 0.9152 0.016 0.008 0.976
#> SRR1974726 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974723 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974721 2 0.6305 0.2879 0.000 0.516 0.484
#> SRR1974720 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974717 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974711 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974710 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974707 3 0.6641 0.1668 0.448 0.008 0.544
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 3 0.1163 0.9105 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974701 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 3 0.4605 0.7085 0.000 0.204 0.796
#> SRR1974698 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.4589 0.7307 0.172 0.008 0.820
#> SRR1974696 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974693 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 3 0.3340 0.8252 0.000 0.120 0.880
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974682 3 0.1711 0.9031 0.032 0.008 0.960
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.3686 0.8937 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974675 3 0.3879 0.7859 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 3 0.0237 0.9242 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974671 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974672 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974670 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974669 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974667 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974668 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974666 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974664 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974665 2 0.6225 0.4505 0.000 0.568 0.432
#> SRR1974663 3 0.1163 0.9104 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974660 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.1170 0.9475 0.976 0.008 0.016
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 3 0.2955 0.8580 0.080 0.008 0.912
#> SRR1974656 3 0.4228 0.7682 0.148 0.008 0.844
#> SRR1974650 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974651 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 3 0.0829 0.9192 0.012 0.004 0.984
#> SRR1974653 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 3 0.5541 0.5923 0.252 0.008 0.740
#> SRR1974646 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 3 0.3941 0.7793 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974640 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974641 2 0.6252 0.4199 0.000 0.556 0.444
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 3 0.1163 0.9118 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974633 1 0.2280 0.9004 0.940 0.008 0.052
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974623 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974622 1 0.3129 0.8461 0.904 0.008 0.088
#> SRR1974620 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974619 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.5024 0.6270 0.776 0.004 0.220
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974613 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974610 3 0.1643 0.9006 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 3 0.4413 0.7497 0.160 0.008 0.832
#> SRR1974607 3 0.6229 0.4110 0.340 0.008 0.652
#> SRR1974606 2 0.3192 0.9091 0.000 0.888 0.112
#> SRR1974605 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974604 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974603 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9682 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974601 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974599 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974598 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974596 3 0.4931 0.6623 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974594 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974593 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974595 3 0.4654 0.7022 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974592 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974591 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974588 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974590 3 0.1753 0.8988 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974589 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974586 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974585 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.1585 0.9330 0.964 0.008 0.028
#> SRR1974583 2 0.4452 0.8571 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974582 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974581 2 0.3038 0.9117 0.000 0.896 0.104
#> SRR1974580 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974578 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974577 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974579 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974576 3 0.5327 0.5789 0.000 0.272 0.728
#> SRR1974575 3 0.4887 0.6693 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974574 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974572 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974568 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974567 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974566 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 3 0.1753 0.8977 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974565 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.6215 0.4571 0.000 0.572 0.428
#> SRR1974560 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974559 1 0.3965 0.7837 0.860 0.008 0.132
#> SRR1974563 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 3 0.0237 0.9240 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974557 3 0.6192 0.0930 0.000 0.420 0.580
#> SRR1974553 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974551 1 0.5247 0.6240 0.768 0.008 0.224
#> SRR1974552 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974558 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974556 1 0.0424 0.9635 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974550 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974549 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974547 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974546 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974545 3 0.5810 0.4143 0.000 0.336 0.664
#> SRR1974544 3 0.0424 0.9224 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974543 3 0.0000 0.9252 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.4382 0.56313 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1975008 4 0.1302 0.79844 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1975006 4 0.3172 0.71079 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1975005 4 0.0817 0.79933 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1975004 4 0.1716 0.77376 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1975003 4 0.1211 0.79998 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1975001 2 0.1118 0.84817 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1975002 4 0.4948 0.21711 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1974999 4 0.0336 0.80648 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1975000 3 0.4994 0.29738 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974998 4 0.4977 -0.16396 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974997 4 0.1022 0.79811 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974995 4 0.2149 0.74931 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974996 3 0.4994 0.26163 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974994 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 4 0.1940 0.76211 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974992 4 0.1302 0.78806 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1974990 3 0.4406 0.23708 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1974989 4 0.2402 0.77755 0.000 0.076 0.012 0.912
#> SRR1974991 4 0.3024 0.66960 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1974986 3 0.4477 0.55333 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1974987 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 4 0.4761 0.23207 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1974984 4 0.0336 0.80482 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974985 3 0.3837 0.56169 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1974983 2 0.4522 0.41119 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1974982 3 0.4040 0.57364 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974981 1 0.4008 0.69430 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1974980 3 0.4643 0.52484 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1974979 4 0.4459 0.64898 0.000 0.188 0.032 0.780
#> SRR1974978 3 0.4843 0.47021 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1974977 4 0.4697 0.18596 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1974976 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 4 0.3688 0.64923 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974973 4 0.0592 0.80687 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1974972 4 0.0188 0.80540 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974971 4 0.0921 0.80391 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974970 4 0.4103 0.46098 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1974969 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 4 0.4624 0.24001 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1974965 3 0.2926 0.41736 0.056 0.000 0.896 0.048
#> SRR1974966 4 0.1389 0.79676 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974964 4 0.2345 0.73678 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1974963 4 0.4522 0.31535 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1974961 4 0.0188 0.80540 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974962 4 0.0469 0.80613 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974960 4 0.4989 -0.18421 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1974959 3 0.4679 0.52256 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974958 4 0.0469 0.80704 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974957 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 4 0.2149 0.74927 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974955 3 0.3245 0.39965 0.100 0.000 0.872 0.028
#> SRR1974954 4 0.3311 0.63259 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1974953 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 4 0.4406 0.35226 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974949 4 0.0592 0.80271 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974950 4 0.4359 0.69213 0.000 0.084 0.100 0.816
#> SRR1974951 4 0.2345 0.76113 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1974947 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 4 0.3942 0.61456 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974946 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974945 4 0.4661 0.21251 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR1974944 1 0.4888 0.41241 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1974942 4 0.4967 -0.11168 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1974943 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.4585 0.54102 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974940 4 0.4977 -0.16423 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1974939 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 4 0.4406 0.35226 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974937 4 0.3074 0.66501 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974936 3 0.4155 0.52135 0.004 0.000 0.756 0.240
#> SRR1974935 4 0.4972 -0.15339 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1974934 4 0.4679 0.40459 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1974933 4 0.1211 0.79993 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974932 4 0.4585 0.26173 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1974931 4 0.1557 0.77972 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974930 3 0.4781 0.54299 0.004 0.000 0.660 0.336
#> SRR1974929 3 0.4961 0.36587 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1974928 4 0.3486 0.68031 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974927 4 0.4888 -0.00983 0.000 0.000 0.412 0.588
#> SRR1974924 3 0.3764 0.32934 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1974925 3 0.4500 0.21801 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1974926 3 0.4697 0.13660 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1974923 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 4 0.4500 0.30980 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1974921 3 0.4994 0.29780 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1974920 3 0.4387 0.54453 0.024 0.000 0.776 0.200
#> SRR1974919 3 0.4746 0.50473 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1974918 4 0.4981 -0.17515 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1974917 4 0.4998 0.00826 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1974916 3 0.4585 0.54295 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974915 3 0.4866 0.44938 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1974914 4 0.1940 0.77940 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1974913 3 0.4888 0.44173 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR1974911 4 0.4661 0.21651 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR1974910 4 0.4967 -0.14211 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1974908 2 0.0817 0.85690 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974909 3 0.4746 0.50143 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1974906 4 0.0188 0.80543 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974907 4 0.4406 0.35226 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974905 4 0.4972 -0.15339 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1974904 4 0.0188 0.80598 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974903 3 0.4356 0.56231 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1974902 4 0.1970 0.78906 0.000 0.060 0.008 0.932
#> SRR1974901 4 0.4585 0.26344 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1974898 2 0.0592 0.86328 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974900 4 0.4331 0.53287 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1974899 2 0.0469 0.86528 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974897 2 0.1118 0.84863 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974896 2 0.4454 0.44679 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1974893 4 0.0188 0.80598 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974895 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974894 4 0.4072 0.59176 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1974892 4 0.1211 0.79993 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1974890 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 4 0.1792 0.78503 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974889 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974888 4 0.4250 0.55111 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1974886 4 0.0817 0.80562 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974887 4 0.4072 0.52029 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974885 4 0.3610 0.59486 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1974883 4 0.0921 0.80393 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974884 4 0.2589 0.75314 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1974881 4 0.4713 0.39794 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1974882 4 0.3942 0.61285 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1974880 2 0.3528 0.65369 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1974879 4 0.4679 0.40398 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1974877 2 0.0707 0.86067 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974876 4 0.3444 0.67652 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1974878 4 0.1389 0.79699 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974875 4 0.3942 0.49862 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1974874 2 0.4222 0.53012 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1974873 4 0.1398 0.79848 0.000 0.004 0.040 0.956
#> SRR1974871 4 0.3726 0.64255 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1974872 4 0.4304 0.48904 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1974869 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974870 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974866 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974865 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974864 3 0.7708 0.41636 0.228 0.008 0.508 0.256
#> SRR1974862 2 0.4907 0.20958 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1974863 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974860 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974861 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974859 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974858 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974856 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974857 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974855 4 0.1557 0.79438 0.000 0.000 0.056 0.944
#> SRR1974854 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.5303 0.02279 0.004 0.004 0.448 0.544
#> SRR1974852 4 0.1022 0.80329 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974849 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.3688 0.63598 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1974846 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974847 1 0.5268 0.40589 0.540 0.008 0.452 0.000
#> SRR1974845 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974844 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 3 0.7239 0.43415 0.128 0.008 0.532 0.332
#> SRR1974842 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.1211 0.79847 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974839 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974838 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974834 4 0.0921 0.80268 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974833 4 0.3764 0.62604 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1974831 4 0.3528 0.65772 0.000 0.000 0.192 0.808
#> SRR1974832 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974827 4 0.3907 0.57925 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974824 1 0.4567 0.67821 0.716 0.008 0.276 0.000
#> SRR1974825 1 0.2198 0.87739 0.920 0.008 0.072 0.000
#> SRR1974822 1 0.5257 0.40568 0.548 0.008 0.444 0.000
#> SRR1974823 3 0.5590 0.17373 0.008 0.008 0.504 0.480
#> SRR1974820 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.5892 0.29262 0.512 0.008 0.460 0.020
#> SRR1974815 1 0.0707 0.91989 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.4406 0.48996 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1974812 1 0.4817 0.50196 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1974810 1 0.4539 0.65733 0.720 0.008 0.272 0.000
#> SRR1974808 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0804 0.92145 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.5183 0.46376 0.584 0.008 0.408 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.0921 0.80237 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974804 3 0.6152 -0.13988 0.436 0.004 0.520 0.040
#> SRR1974803 1 0.4328 0.69056 0.748 0.008 0.244 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.5657 0.54764 0.660 0.008 0.300 0.032
#> SRR1974799 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974797 2 0.3610 0.64189 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1974796 4 0.3837 0.59292 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974795 4 0.1867 0.77813 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974793 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974792 4 0.3649 0.65217 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974791 4 0.0336 0.80589 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974790 4 0.3444 0.68353 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1974789 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974788 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974786 3 0.6929 0.29098 0.108 0.000 0.452 0.440
#> SRR1974787 4 0.4543 0.42624 0.000 0.000 0.324 0.676
#> SRR1974784 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974783 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974785 4 0.4564 0.39026 0.000 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974782 1 0.0188 0.92936 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974781 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974780 4 0.4222 0.51168 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1974779 1 0.0469 0.92588 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974777 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974776 4 0.4277 0.49708 0.000 0.000 0.280 0.720
#> SRR1974778 1 0.2281 0.86651 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974774 2 0.1557 0.82964 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974773 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974771 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974770 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974769 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974768 4 0.4072 0.58975 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1974767 4 0.4072 0.54624 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974766 4 0.3688 0.64786 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974765 4 0.0336 0.80653 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974764 4 0.0469 0.80643 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974763 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0707 0.92059 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974761 2 0.3219 0.69126 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1974760 4 0.2921 0.71250 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1974759 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 4 0.1792 0.78771 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974757 4 0.3764 0.64253 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1974756 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974755 2 0.4406 0.46202 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974753 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974751 4 0.1389 0.79638 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974750 4 0.3172 0.71111 0.000 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974752 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.0336 0.80596 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974747 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.2918 0.84446 0.876 0.008 0.116 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3486 0.67135 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1974745 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974743 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974742 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974740 4 0.0469 0.80664 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974739 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974741 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974738 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974736 4 0.1792 0.78972 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1974735 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0817 0.80329 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1974733 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974732 3 0.5461 0.14656 0.004 0.008 0.508 0.480
#> SRR1974731 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974729 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.3219 0.78684 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1974728 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974725 4 0.5236 0.05960 0.000 0.008 0.432 0.560
#> SRR1974726 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974724 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974723 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974722 4 0.4331 0.50799 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974721 2 0.4994 0.03440 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1974720 4 0.1109 0.80258 0.000 0.004 0.028 0.968
#> SRR1974719 1 0.2281 0.86833 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974718 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974716 4 0.3569 0.63771 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1974717 4 0.0469 0.80512 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974715 4 0.1211 0.79825 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1974713 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 4 0.5203 0.11723 0.000 0.008 0.416 0.576
#> SRR1974711 4 0.2281 0.75684 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974712 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974710 4 0.1022 0.80104 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974707 3 0.6875 0.39619 0.088 0.008 0.540 0.364
#> SRR1974706 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 4 0.4008 0.56162 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1974701 4 0.1940 0.78289 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1974699 4 0.3649 0.65212 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1974698 4 0.1209 0.80040 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR1974700 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 3 0.7467 0.44317 0.152 0.008 0.508 0.332
#> SRR1974696 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0188 0.92936 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974695 4 0.2408 0.75661 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1974693 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974692 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974690 4 0.2647 0.74401 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1974691 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0921 0.80141 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1974688 4 0.1305 0.79855 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR1974687 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.1211 0.90796 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974682 3 0.6147 0.21535 0.032 0.008 0.504 0.456
#> SRR1974681 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.4897 0.39632 0.000 0.008 0.332 0.660
#> SRR1974680 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.3074 0.71951 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1974677 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1389 0.83748 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974675 4 0.3074 0.71314 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1974674 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 4 0.0188 0.80625 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974671 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974672 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974670 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974669 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974667 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974668 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974666 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974664 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974665 2 0.4817 0.27259 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1974663 4 0.4643 0.35221 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1974662 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.2271 0.75955 0.000 0.008 0.076 0.916
#> SRR1974660 1 0.4897 0.60765 0.660 0.008 0.332 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 3 0.5700 -0.27569 0.472 0.008 0.508 0.012
#> SRR1974654 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 3 0.5457 0.19739 0.004 0.008 0.516 0.472
#> SRR1974656 3 0.7073 0.38127 0.100 0.008 0.508 0.384
#> SRR1974650 4 0.4594 0.48782 0.000 0.008 0.280 0.712
#> SRR1974651 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 4 0.5016 0.18866 0.000 0.004 0.396 0.600
#> SRR1974653 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974648 4 0.7907 -0.32651 0.216 0.008 0.332 0.444
#> SRR1974646 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974645 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 4 0.3123 0.70759 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1974643 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.3196 0.71118 0.000 0.008 0.136 0.856
#> SRR1974640 4 0.2480 0.75131 0.000 0.008 0.088 0.904
#> SRR1974641 2 0.4907 0.20798 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1974639 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0188 0.92936 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.4511 0.51241 0.000 0.008 0.268 0.724
#> SRR1974634 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0921 0.80407 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1974633 3 0.6152 -0.23921 0.464 0.008 0.496 0.032
#> SRR1974632 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.5250 0.01600 0.000 0.008 0.440 0.552
#> SRR1974630 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.4955 0.59052 0.648 0.008 0.344 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974623 4 0.0188 0.80526 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974622 3 0.6658 -0.11244 0.420 0.008 0.508 0.064
#> SRR1974620 4 0.2859 0.73434 0.000 0.008 0.112 0.880
#> SRR1974619 4 0.2342 0.75891 0.000 0.008 0.080 0.912
#> SRR1974621 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0336 0.92750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974616 1 0.6515 0.34623 0.552 0.008 0.380 0.060
#> SRR1974615 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 4 0.4356 0.47354 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR1974613 4 0.5244 0.04803 0.000 0.008 0.436 0.556
#> SRR1974612 1 0.1302 0.90265 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974611 4 0.0376 0.80540 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1974610 4 0.1302 0.79834 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974609 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 3 0.7267 0.40069 0.120 0.008 0.500 0.372
#> SRR1974607 4 0.7403 -0.25600 0.168 0.000 0.380 0.452
#> SRR1974606 2 0.0592 0.86296 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974605 3 0.5290 0.17499 0.000 0.008 0.516 0.476
#> SRR1974604 4 0.1118 0.79836 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974603 4 0.1118 0.79940 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974602 1 0.0000 0.93107 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974601 4 0.0592 0.80472 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974599 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974598 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974596 4 0.3907 0.61794 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1974594 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974593 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974595 4 0.3688 0.64786 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1974592 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974591 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974588 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974590 4 0.1389 0.79823 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974589 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974586 4 0.0336 0.80632 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974585 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974584 1 0.4365 0.73896 0.784 0.000 0.188 0.028
#> SRR1974583 2 0.3123 0.70839 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1974582 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974581 2 0.0336 0.86738 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974580 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974578 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974577 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974579 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974576 4 0.4222 0.55408 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1974575 4 0.3873 0.62442 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974574 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974573 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974571 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974572 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974570 4 0.1118 0.79636 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974568 4 0.4049 0.55784 0.000 0.008 0.212 0.780
#> SRR1974567 4 0.3486 0.60929 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974566 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974569 4 0.1389 0.79690 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1974565 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.4916 0.19353 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1974560 4 0.3791 0.58333 0.000 0.004 0.200 0.796
#> SRR1974559 1 0.7011 0.43610 0.592 0.008 0.264 0.136
#> SRR1974563 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974562 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974561 4 0.0188 0.80587 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974557 4 0.4916 0.21763 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1974553 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974555 1 0.3486 0.77270 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1974551 1 0.6211 0.24567 0.488 0.000 0.460 0.052
#> SRR1974552 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974554 4 0.3893 0.58369 0.000 0.008 0.196 0.796
#> SRR1974558 4 0.3486 0.60929 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974556 1 0.3610 0.76466 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974550 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974549 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974548 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974547 4 0.3400 0.62323 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR1974546 4 0.0336 0.80577 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974545 4 0.4624 0.42728 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1974544 4 0.3486 0.60929 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974543 4 0.0000 0.80543 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.4823 0.68721 0.000 0.000 0.700 0.072 0.228
#> SRR1975008 4 0.1121 0.78183 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1975006 4 0.2732 0.73366 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1975005 4 0.1043 0.77303 0.000 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1975004 4 0.2020 0.73539 0.000 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1975003 4 0.1043 0.78251 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1975001 2 0.0794 0.83997 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1975002 4 0.4262 0.30934 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974999 4 0.0290 0.78446 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1975000 3 0.5275 0.69132 0.000 0.000 0.640 0.276 0.084
#> SRR1974998 3 0.3969 0.67546 0.000 0.000 0.692 0.304 0.004
#> SRR1974997 4 0.1341 0.77508 0.000 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974995 4 0.2377 0.70804 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1974996 3 0.6268 0.48243 0.000 0.000 0.484 0.360 0.156
#> SRR1974994 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 4 0.2329 0.71672 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1974992 4 0.1478 0.76054 0.000 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1974990 3 0.4953 0.55483 0.088 0.000 0.696 0.000 0.216
#> SRR1974989 4 0.3050 0.76661 0.000 0.076 0.024 0.876 0.024
#> SRR1974991 4 0.3003 0.62792 0.000 0.000 0.188 0.812 0.000
#> SRR1974986 3 0.5177 0.69888 0.000 0.000 0.676 0.104 0.220
#> SRR1974987 4 0.0290 0.78259 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974988 4 0.5865 0.01704 0.000 0.000 0.360 0.532 0.108
#> SRR1974984 4 0.0404 0.78185 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974985 3 0.4744 0.65793 0.000 0.000 0.692 0.056 0.252
#> SRR1974983 2 0.3876 0.47695 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1974982 3 0.4719 0.66234 0.000 0.000 0.696 0.056 0.248
#> SRR1974981 1 0.5394 0.41085 0.628 0.000 0.280 0.000 0.092
#> SRR1974980 3 0.5072 0.72455 0.000 0.000 0.696 0.116 0.188
#> SRR1974979 4 0.4031 0.70116 0.000 0.184 0.044 0.772 0.000
#> SRR1974978 3 0.5115 0.74480 0.000 0.000 0.696 0.168 0.136
#> SRR1974977 4 0.4304 -0.27690 0.000 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1974976 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 4 0.3177 0.70347 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1974973 4 0.0510 0.78495 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1974972 4 0.0162 0.78302 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974971 4 0.0794 0.78411 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974970 4 0.3876 0.36046 0.000 0.000 0.316 0.684 0.000
#> SRR1974969 4 0.0162 0.78309 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974968 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 4 0.4302 -0.25430 0.000 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1974965 3 0.4025 0.57698 0.000 0.000 0.700 0.008 0.292
#> SRR1974966 4 0.1197 0.78146 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974964 4 0.2471 0.70160 0.000 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1974963 4 0.4666 0.00653 0.000 0.000 0.412 0.572 0.016
#> SRR1974961 4 0.0290 0.78267 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974962 4 0.0404 0.78439 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974960 3 0.5297 0.59433 0.000 0.000 0.580 0.360 0.060
#> SRR1974959 3 0.5109 0.73743 0.000 0.000 0.696 0.132 0.172
#> SRR1974958 4 0.0404 0.78482 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974957 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 4 0.2516 0.69503 0.000 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1974955 3 0.3796 0.55961 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1974954 4 0.3305 0.57028 0.000 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1974953 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974952 4 0.4192 0.06126 0.000 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1974949 4 0.0794 0.77732 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974950 4 0.4226 0.67936 0.000 0.084 0.140 0.776 0.000
#> SRR1974951 4 0.2020 0.76371 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1974947 4 0.0162 0.78304 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974948 4 0.3395 0.68407 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 4 0.4278 -0.16450 0.000 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1974944 1 0.6431 -0.04560 0.436 0.000 0.388 0.000 0.176
#> SRR1974942 3 0.5652 0.55600 0.000 0.000 0.552 0.360 0.088
#> SRR1974943 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.5125 0.74071 0.000 0.000 0.696 0.156 0.148
#> SRR1974940 3 0.3949 0.67824 0.000 0.000 0.696 0.300 0.004
#> SRR1974939 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 4 0.4210 0.03370 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1974937 4 0.3838 0.44097 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR1974936 3 0.5115 0.70671 0.000 0.000 0.696 0.136 0.168
#> SRR1974935 3 0.3837 0.67150 0.000 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1974934 4 0.4030 0.51916 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1974933 4 0.1043 0.78241 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1974932 4 0.4273 -0.12423 0.000 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1974931 4 0.1908 0.74404 0.000 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1974930 3 0.5273 0.73281 0.000 0.000 0.680 0.160 0.160
#> SRR1974929 3 0.4994 0.73443 0.000 0.000 0.696 0.208 0.096
#> SRR1974928 4 0.3003 0.72149 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974927 3 0.4278 0.45669 0.000 0.000 0.548 0.452 0.000
#> SRR1974924 3 0.4905 0.55740 0.080 0.000 0.696 0.000 0.224
#> SRR1974925 3 0.4998 0.55266 0.104 0.000 0.700 0.000 0.196
#> SRR1974926 3 0.5283 0.50862 0.136 0.000 0.676 0.000 0.188
#> SRR1974923 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 4 0.4201 0.04866 0.000 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1974921 3 0.4719 0.71407 0.000 0.000 0.696 0.248 0.056
#> SRR1974920 3 0.4879 0.68962 0.000 0.000 0.696 0.076 0.228
#> SRR1974919 3 0.5083 0.74250 0.000 0.000 0.700 0.140 0.160
#> SRR1974918 3 0.3928 0.68009 0.000 0.000 0.700 0.296 0.004
#> SRR1974917 4 0.4305 0.03277 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1974916 3 0.5074 0.73883 0.000 0.000 0.700 0.132 0.168
#> SRR1974915 3 0.5067 0.74446 0.000 0.000 0.700 0.172 0.128
#> SRR1974914 4 0.1671 0.77317 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1974913 3 0.5083 0.74380 0.000 0.000 0.696 0.184 0.120
#> SRR1974911 4 0.4430 -0.17177 0.000 0.000 0.456 0.540 0.004
#> SRR1974910 3 0.3983 0.64121 0.000 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1974908 2 0.0510 0.84758 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974909 3 0.5083 0.74035 0.000 0.000 0.700 0.140 0.160
#> SRR1974906 4 0.0162 0.78306 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974907 4 0.4182 0.07826 0.000 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1974905 3 0.3837 0.67113 0.000 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1974904 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974903 3 0.4763 0.69298 0.000 0.000 0.712 0.076 0.212
#> SRR1974902 4 0.1809 0.77766 0.000 0.060 0.012 0.928 0.000
#> SRR1974901 4 0.4256 -0.07607 0.000 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1974898 2 0.0290 0.85436 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974900 4 0.3730 0.62947 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1974899 2 0.0162 0.85622 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974897 2 0.0794 0.84017 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974896 2 0.3837 0.48821 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974893 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 4 0.3508 0.67084 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1974892 4 0.1205 0.78238 0.000 0.040 0.004 0.956 0.000
#> SRR1974890 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974891 4 0.1544 0.77593 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 4 0.3661 0.64260 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1974886 4 0.0703 0.78477 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974887 3 0.5114 -0.24408 0.000 0.000 0.492 0.472 0.036
#> SRR1974885 4 0.3882 0.57545 0.000 0.000 0.224 0.756 0.020
#> SRR1974883 4 0.0794 0.78401 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974884 4 0.2280 0.75522 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974881 4 0.4060 0.51144 0.000 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1974882 4 0.3395 0.68353 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1974880 2 0.2966 0.66676 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1974879 4 0.4030 0.51963 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1974877 2 0.0404 0.85144 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974876 4 0.2966 0.71845 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1974878 4 0.1197 0.78133 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974875 4 0.3796 0.40191 0.000 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1974874 2 0.3636 0.55024 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1974873 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974871 4 0.3210 0.69318 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1974872 4 0.3934 0.61594 0.000 0.000 0.008 0.716 0.276
#> SRR1974869 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974866 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974865 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 5 0.2747 0.63439 0.060 0.000 0.004 0.048 0.888
#> SRR1974862 2 0.4210 0.30594 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.5341 0.55277 0.000 0.000 0.300 0.620 0.080
#> SRR1974858 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974857 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 4 0.2370 0.76977 0.000 0.000 0.040 0.904 0.056
#> SRR1974854 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 5 0.5083 0.25011 0.004 0.000 0.036 0.364 0.596
#> SRR1974852 4 0.0880 0.78400 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.5144 0.63565 0.000 0.000 0.132 0.692 0.176
#> SRR1974846 4 0.5422 0.54861 0.000 0.000 0.296 0.616 0.088
#> SRR1974847 5 0.3010 0.60909 0.172 0.000 0.004 0.000 0.824
#> SRR1974845 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.2819 0.63422 0.052 0.000 0.004 0.060 0.884
#> SRR1974842 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.5488 0.53786 0.000 0.000 0.300 0.608 0.092
#> SRR1974839 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974838 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974834 4 0.0794 0.78261 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974833 4 0.5191 0.63208 0.000 0.000 0.192 0.684 0.124
#> SRR1974831 4 0.3438 0.70811 0.000 0.000 0.020 0.808 0.172
#> SRR1974832 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974827 4 0.3398 0.67359 0.000 0.000 0.004 0.780 0.216
#> SRR1974824 5 0.3876 0.47373 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR1974825 1 0.3876 0.47646 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1974822 5 0.3366 0.58591 0.212 0.000 0.004 0.000 0.784
#> SRR1974823 5 0.2136 0.61510 0.008 0.000 0.000 0.088 0.904
#> SRR1974820 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.6024 0.40485 0.140 0.000 0.236 0.012 0.612
#> SRR1974815 1 0.1341 0.89048 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974813 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.6273 0.35466 0.000 0.000 0.172 0.512 0.316
#> SRR1974812 1 0.4448 0.00912 0.516 0.000 0.004 0.000 0.480
#> SRR1974810 5 0.4979 0.10610 0.480 0.000 0.028 0.000 0.492
#> SRR1974808 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.1197 0.89999 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974809 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 5 0.3838 0.54418 0.280 0.000 0.004 0.000 0.716
#> SRR1974806 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 4 0.0609 0.78347 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974804 5 0.6858 0.31217 0.248 0.000 0.264 0.012 0.476
#> SRR1974803 1 0.4449 -0.03645 0.512 0.000 0.004 0.000 0.484
#> SRR1974801 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.4800 -0.05541 0.508 0.000 0.004 0.012 0.476
#> SRR1974799 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.3109 0.63870 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974796 4 0.3300 0.68267 0.000 0.000 0.004 0.792 0.204
#> SRR1974795 4 0.1608 0.77041 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974793 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 4 0.3143 0.70458 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1974791 4 0.0290 0.78387 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974790 4 0.2966 0.72315 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 5 0.5911 0.22987 0.060 0.000 0.020 0.392 0.528
#> SRR1974787 4 0.4956 0.53432 0.000 0.000 0.048 0.636 0.316
#> SRR1974784 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974783 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974785 4 0.4389 0.46780 0.004 0.000 0.004 0.624 0.368
#> SRR1974782 1 0.0162 0.93850 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974781 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974780 4 0.3715 0.63578 0.000 0.000 0.004 0.736 0.260
#> SRR1974779 1 0.0609 0.92741 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974777 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974776 4 0.3957 0.61101 0.000 0.000 0.008 0.712 0.280
#> SRR1974778 1 0.2813 0.75686 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1974774 2 0.1197 0.82153 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974773 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974775 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974771 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974770 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974769 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974768 4 0.3970 0.67172 0.000 0.236 0.020 0.744 0.000
#> SRR1974767 4 0.3550 0.65596 0.000 0.000 0.004 0.760 0.236
#> SRR1974766 4 0.3177 0.70210 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1974765 4 0.0290 0.78454 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974764 4 0.0404 0.78464 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0609 0.92604 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974761 2 0.2732 0.68725 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974760 4 0.2516 0.73493 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1974759 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 4 0.1544 0.77398 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974757 4 0.3242 0.70050 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.5488 0.53820 0.000 0.000 0.300 0.608 0.092
#> SRR1974755 2 0.3774 0.50452 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1974753 4 0.4907 0.59316 0.000 0.000 0.292 0.656 0.052
#> SRR1974751 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974750 4 0.5640 0.52127 0.000 0.000 0.304 0.592 0.104
#> SRR1974752 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 4 0.0290 0.78393 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974747 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.4101 0.35423 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974746 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.3003 0.71535 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974745 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974743 4 0.4883 0.61984 0.000 0.004 0.260 0.684 0.052
#> SRR1974742 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974740 4 0.0404 0.78484 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974739 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974741 4 0.5049 0.58002 0.000 0.000 0.296 0.644 0.060
#> SRR1974738 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.4858 0.62530 0.000 0.004 0.256 0.688 0.052
#> SRR1974736 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974735 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.0703 0.78286 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974733 4 0.5289 0.58393 0.000 0.000 0.252 0.652 0.096
#> SRR1974732 5 0.3944 0.50320 0.000 0.000 0.200 0.032 0.768
#> SRR1974731 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974729 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.2848 0.75094 0.840 0.000 0.004 0.000 0.156
#> SRR1974728 4 0.5516 0.53777 0.000 0.000 0.296 0.608 0.096
#> SRR1974725 5 0.3366 0.47840 0.000 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1974726 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974724 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.5498 0.54204 0.000 0.000 0.292 0.612 0.096
#> SRR1974722 4 0.6009 0.49665 0.000 0.000 0.180 0.580 0.240
#> SRR1974721 2 0.4302 -0.04727 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974720 4 0.3608 0.70366 0.000 0.000 0.040 0.812 0.148
#> SRR1974719 1 0.3508 0.63063 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1974718 1 0.0404 0.93352 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974716 4 0.3160 0.69690 0.000 0.000 0.004 0.808 0.188
#> SRR1974717 4 0.3343 0.72422 0.000 0.000 0.172 0.812 0.016
#> SRR1974715 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974713 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.3661 0.41852 0.000 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1974711 4 0.1908 0.76029 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974712 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974710 4 0.0880 0.78193 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974707 5 0.2609 0.63233 0.052 0.000 0.004 0.048 0.896
#> SRR1974706 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974703 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 4 0.3750 0.65696 0.000 0.000 0.012 0.756 0.232
#> SRR1974701 4 0.5714 0.50134 0.000 0.000 0.312 0.580 0.108
#> SRR1974699 4 0.3143 0.70454 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1974698 4 0.5238 0.59233 0.000 0.000 0.260 0.652 0.088
#> SRR1974700 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.2409 0.62655 0.032 0.000 0.000 0.068 0.900
#> SRR1974696 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0162 0.93850 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974695 4 0.2732 0.71878 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1974693 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974692 4 0.5516 0.53792 0.000 0.000 0.296 0.608 0.096
#> SRR1974690 4 0.2280 0.75492 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1974691 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.5336 0.56325 0.000 0.000 0.288 0.628 0.084
#> SRR1974688 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974687 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974684 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.1205 0.90524 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1974682 5 0.5163 0.42746 0.000 0.000 0.296 0.068 0.636
#> SRR1974681 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 5 0.6749 0.20633 0.000 0.000 0.304 0.288 0.408
#> SRR1974680 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.5640 0.52127 0.000 0.000 0.304 0.592 0.104
#> SRR1974677 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1043 0.82958 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974675 4 0.2648 0.73907 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 4 0.0162 0.78375 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.4150 0.33226 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1974663 4 0.4390 0.32947 0.000 0.000 0.004 0.568 0.428
#> SRR1974662 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.3876 0.42443 0.000 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1974660 5 0.3636 0.55217 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1974659 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.2124 0.61499 0.096 0.000 0.004 0.000 0.900
#> SRR1974654 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.2193 0.60733 0.000 0.000 0.008 0.092 0.900
#> SRR1974656 5 0.2295 0.61470 0.008 0.000 0.004 0.088 0.900
#> SRR1974650 5 0.4448 0.00617 0.000 0.000 0.004 0.480 0.516
#> SRR1974651 4 0.3010 0.73099 0.000 0.000 0.172 0.824 0.004
#> SRR1974652 4 0.4562 0.09450 0.000 0.000 0.008 0.496 0.496
#> SRR1974653 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974648 5 0.4284 0.49344 0.040 0.000 0.000 0.224 0.736
#> SRR1974646 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.3086 0.72622 0.000 0.000 0.180 0.816 0.004
#> SRR1974645 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 4 0.2690 0.73608 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 4 0.4161 0.28096 0.000 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1974640 4 0.3983 0.37402 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974641 2 0.4227 0.22596 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0162 0.93850 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974635 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.4283 0.20916 0.000 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR1974634 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.3205 0.72739 0.000 0.004 0.176 0.816 0.004
#> SRR1974633 5 0.2784 0.62439 0.108 0.000 0.004 0.016 0.872
#> SRR1974632 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.2690 0.56814 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974630 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 5 0.3861 0.54128 0.284 0.000 0.004 0.000 0.712
#> SRR1974624 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 4 0.0290 0.78309 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974622 5 0.2189 0.62264 0.084 0.000 0.000 0.012 0.904
#> SRR1974620 4 0.4074 0.33578 0.000 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1974619 4 0.3876 0.43199 0.000 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1974621 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0290 0.93579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974616 5 0.6140 0.47455 0.260 0.000 0.080 0.044 0.616
#> SRR1974615 1 0.0162 0.93818 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974618 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 4 0.4166 0.49628 0.000 0.000 0.004 0.648 0.348
#> SRR1974613 5 0.3461 0.49345 0.000 0.000 0.004 0.224 0.772
#> SRR1974612 1 0.1121 0.90246 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974611 4 0.0880 0.77667 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974610 4 0.1121 0.78185 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.2305 0.61609 0.012 0.000 0.000 0.092 0.896
#> SRR1974607 5 0.5952 0.38425 0.136 0.000 0.000 0.304 0.560
#> SRR1974606 2 0.0290 0.85386 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974605 5 0.1628 0.60877 0.000 0.000 0.008 0.056 0.936
#> SRR1974604 4 0.5534 0.53316 0.000 0.000 0.300 0.604 0.096
#> SRR1974603 4 0.1043 0.78057 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974602 1 0.0000 0.94094 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974601 4 0.0609 0.78108 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974599 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 4 0.3366 0.68630 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1974594 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974593 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974595 4 0.3177 0.70210 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1974592 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974590 4 0.1197 0.78101 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974589 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974586 4 0.0290 0.78432 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1974585 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.4585 0.36146 0.628 0.000 0.000 0.020 0.352
#> SRR1974583 2 0.2648 0.70245 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974582 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.85841 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974578 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974577 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974579 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974576 4 0.3636 0.64579 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1974575 4 0.3336 0.68935 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1974574 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974573 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974571 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974572 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974570 4 0.1732 0.75872 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974568 4 0.4235 0.17920 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1974567 4 0.4030 0.37696 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974566 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974569 4 0.1197 0.78133 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1974565 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974564 2 0.4235 0.16720 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974560 4 0.4126 0.30743 0.000 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1974559 5 0.5870 0.47746 0.284 0.000 0.000 0.136 0.580
#> SRR1974563 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974561 4 0.0162 0.78384 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974557 4 0.4235 0.30401 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1974553 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974555 1 0.4030 0.40986 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1974551 5 0.4602 0.49453 0.316 0.000 0.000 0.028 0.656
#> SRR1974552 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974554 4 0.4150 0.28446 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974558 4 0.4030 0.37696 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1974556 1 0.4074 0.38890 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974550 4 0.0162 0.78331 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974549 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974548 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974547 4 0.3949 0.42112 0.000 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1974546 4 0.0609 0.78245 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974545 4 0.3983 0.54337 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1974544 4 0.4015 0.38636 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1974543 4 0.0000 0.78323 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 7.07e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 6 0.1007 8.41e-01 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1975006 6 0.2558 7.86e-01 0.000 0.156 0.000 0.000 0.004 0.840
#> SRR1975005 6 0.1327 8.21e-01 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1975004 6 0.2562 7.26e-01 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1975003 6 0.0937 8.42e-01 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1975001 2 0.0858 8.42e-01 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1975002 6 0.3828 3.04e-01 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1974999 6 0.0260 8.45e-01 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1975000 3 0.2838 6.83e-01 0.000 0.000 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR1974998 3 0.2491 7.05e-01 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974997 6 0.1745 8.22e-01 0.000 0.000 0.068 0.012 0.000 0.920
#> SRR1974995 6 0.2854 6.79e-01 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1974996 3 0.3448 5.48e-01 0.000 0.000 0.716 0.000 0.004 0.280
#> SRR1974994 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974993 6 0.3050 6.43e-01 0.000 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974992 6 0.2146 7.83e-01 0.000 0.000 0.116 0.000 0.004 0.880
#> SRR1974990 3 0.0260 7.03e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974989 6 0.2753 8.17e-01 0.000 0.072 0.000 0.048 0.008 0.872
#> SRR1974991 6 0.3323 6.05e-01 0.000 0.000 0.240 0.000 0.008 0.752
#> SRR1974986 3 0.0806 7.06e-01 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974987 6 0.0260 8.43e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974988 3 0.3847 2.10e-01 0.000 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1974984 6 0.0363 8.42e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974985 3 0.0405 7.05e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974983 2 0.3482 5.03e-01 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1974982 3 0.0146 7.06e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974981 1 0.4002 3.57e-01 0.588 0.000 0.404 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974980 3 0.0603 7.09e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1974979 6 0.3931 7.48e-01 0.000 0.172 0.048 0.000 0.012 0.768
#> SRR1974978 3 0.1204 7.31e-01 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974977 3 0.3789 4.74e-01 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1974976 6 0.0146 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974975 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 6 0.2854 7.43e-01 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1974973 6 0.0547 8.45e-01 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974972 6 0.0363 8.43e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974971 6 0.0713 8.44e-01 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974970 6 0.3695 2.50e-01 0.000 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974969 6 0.0458 8.43e-01 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974968 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.3828 4.16e-01 0.000 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1974965 3 0.0000 7.07e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 6 0.1219 8.40e-01 0.000 0.048 0.000 0.000 0.004 0.948
#> SRR1974964 6 0.2793 6.87e-01 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1974963 3 0.3961 3.75e-01 0.000 0.000 0.556 0.004 0.000 0.440
#> SRR1974961 6 0.0458 8.41e-01 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974962 6 0.0622 8.45e-01 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008 0.980
#> SRR1974960 3 0.3175 6.28e-01 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1974959 3 0.0790 7.26e-01 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974958 6 0.0363 8.45e-01 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974957 6 0.0260 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974956 6 0.2912 6.49e-01 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1974955 3 0.0000 7.07e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 6 0.3309 5.37e-01 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1974953 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 6 0.3866 -2.02e-01 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974949 6 0.1075 8.27e-01 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974950 6 0.4125 6.72e-01 0.000 0.080 0.184 0.000 0.000 0.736
#> SRR1974951 6 0.1958 8.17e-01 0.000 0.100 0.000 0.000 0.004 0.896
#> SRR1974947 6 0.0146 8.43e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974948 6 0.3050 7.15e-01 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974946 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.3867 3.05e-01 0.000 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974944 3 0.3923 1.56e-01 0.372 0.000 0.620 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974942 3 0.3863 5.81e-01 0.000 0.000 0.728 0.008 0.020 0.244
#> SRR1974943 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.1267 7.31e-01 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974940 3 0.2300 7.09e-01 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974939 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.3867 2.61e-01 0.000 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1974937 6 0.3756 3.48e-01 0.000 0.000 0.352 0.000 0.004 0.644
#> SRR1974936 3 0.2613 6.44e-01 0.000 0.000 0.848 0.000 0.140 0.012
#> SRR1974935 3 0.2491 7.03e-01 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974934 6 0.3620 5.28e-01 0.000 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1974933 6 0.1082 8.41e-01 0.000 0.040 0.000 0.000 0.004 0.956
#> SRR1974932 3 0.3810 4.27e-01 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1974931 6 0.2730 7.10e-01 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974930 3 0.2282 7.16e-01 0.000 0.000 0.888 0.000 0.024 0.088
#> SRR1974929 3 0.1444 7.30e-01 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974928 6 0.2697 7.68e-01 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974927 3 0.3531 5.81e-01 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1974924 3 0.0891 6.99e-01 0.008 0.000 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974925 3 0.0291 7.04e-01 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974926 3 0.0632 6.93e-01 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 6 0.0146 8.43e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974922 6 0.3867 -2.21e-01 0.000 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1974921 3 0.1863 7.23e-01 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1974920 3 0.0260 7.03e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974919 3 0.0713 7.25e-01 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974918 3 0.2362 7.12e-01 0.000 0.000 0.860 0.004 0.000 0.136
#> SRR1974917 6 0.3866 4.11e-02 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1974916 3 0.0547 7.21e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974915 3 0.0790 7.26e-01 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974914 6 0.1802 8.29e-01 0.000 0.072 0.000 0.000 0.012 0.916
#> SRR1974913 3 0.1267 7.31e-01 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974911 3 0.3810 4.32e-01 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1974910 3 0.2793 6.86e-01 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1974908 2 0.0458 8.50e-01 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974909 3 0.0260 7.14e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974906 6 0.0146 8.43e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974907 6 0.3868 -2.22e-01 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1974905 3 0.2491 7.02e-01 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974904 6 0.0291 8.44e-01 0.000 0.004 0.004 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974903 3 0.0000 7.07e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 6 0.1707 8.36e-01 0.000 0.056 0.012 0.000 0.004 0.928
#> SRR1974901 3 0.3857 3.37e-01 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1974898 2 0.0260 8.57e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974900 6 0.3351 6.47e-01 0.000 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR1974899 2 0.0146 8.59e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974897 2 0.0713 8.43e-01 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974896 2 0.3446 5.08e-01 0.000 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974893 6 0.0146 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974895 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 6 0.3151 6.98e-01 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR1974892 6 0.1196 8.41e-01 0.000 0.040 0.008 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974890 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974891 6 0.1531 8.32e-01 0.000 0.068 0.000 0.000 0.004 0.928
#> SRR1974889 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 6 0.3288 6.62e-01 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1974886 6 0.0777 8.45e-01 0.000 0.024 0.000 0.000 0.004 0.972
#> SRR1974887 6 0.5991 2.64e-02 0.000 0.000 0.256 0.308 0.000 0.436
#> SRR1974885 6 0.3924 5.89e-01 0.000 0.000 0.208 0.052 0.000 0.740
#> SRR1974883 6 0.0713 8.44e-01 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974884 6 0.2048 8.10e-01 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1974881 6 0.3647 5.17e-01 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974882 6 0.3050 7.15e-01 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1974880 2 0.2664 6.78e-01 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1974879 6 0.3620 5.30e-01 0.000 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1974877 2 0.0363 8.54e-01 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974876 6 0.2848 7.67e-01 0.000 0.176 0.000 0.000 0.008 0.816
#> SRR1974878 6 0.1367 8.40e-01 0.000 0.044 0.000 0.000 0.012 0.944
#> SRR1974875 6 0.3710 4.36e-01 0.000 0.000 0.292 0.012 0.000 0.696
#> SRR1974874 2 0.3490 5.65e-01 0.000 0.724 0.000 0.000 0.008 0.268
#> SRR1974873 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974871 6 0.2883 7.39e-01 0.000 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1974872 6 0.4079 6.97e-01 0.000 0.000 0.172 0.000 0.084 0.744
#> SRR1974869 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974868 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974870 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974866 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974867 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974864 5 0.4183 6.73e-01 0.048 0.000 0.140 0.000 0.772 0.040
#> SRR1974862 2 0.3899 3.63e-01 0.000 0.592 0.000 0.000 0.004 0.404
#> SRR1974863 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974860 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974861 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974859 4 0.2048 7.05e-01 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974858 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974857 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974855 6 0.2547 8.02e-01 0.000 0.000 0.036 0.080 0.004 0.880
#> SRR1974854 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 5 0.7360 2.79e-01 0.004 0.000 0.140 0.152 0.356 0.348
#> SRR1974852 6 0.0993 8.44e-01 0.000 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974849 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 6 0.5305 3.75e-01 0.000 0.000 0.096 0.328 0.008 0.568
#> SRR1974846 4 0.1444 7.76e-01 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974847 5 0.3792 6.69e-01 0.108 0.000 0.112 0.000 0.780 0.000
#> SRR1974845 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974844 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 5 0.4107 6.70e-01 0.032 0.000 0.140 0.000 0.776 0.052
#> SRR1974842 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0547 8.24e-01 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974839 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974838 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974834 6 0.0993 8.42e-01 0.000 0.000 0.024 0.000 0.012 0.964
#> SRR1974833 6 0.4910 3.65e-01 0.000 0.000 0.052 0.368 0.008 0.572
#> SRR1974831 6 0.3258 7.85e-01 0.000 0.000 0.100 0.040 0.020 0.840
#> SRR1974832 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974827 6 0.3630 7.56e-01 0.000 0.000 0.136 0.044 0.016 0.804
#> SRR1974824 5 0.3012 6.33e-01 0.196 0.000 0.000 0.008 0.796 0.000
#> SRR1974825 1 0.3448 5.70e-01 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280 0.000
#> SRR1974822 5 0.4906 6.15e-01 0.192 0.000 0.124 0.008 0.676 0.000
#> SRR1974823 5 0.0767 6.78e-01 0.004 0.000 0.008 0.000 0.976 0.012
#> SRR1974820 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 4 0.6876 3.88e-02 0.060 0.000 0.232 0.416 0.292 0.000
#> SRR1974815 1 0.2473 7.99e-01 0.856 0.000 0.000 0.008 0.136 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.2325 7.42e-01 0.000 0.000 0.100 0.884 0.008 0.008
#> SRR1974812 1 0.5469 7.25e-02 0.532 0.000 0.144 0.000 0.324 0.000
#> SRR1974810 1 0.5497 2.33e-01 0.556 0.000 0.140 0.004 0.300 0.000
#> SRR1974808 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974811 1 0.0865 9.25e-01 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 5 0.5508 3.84e-01 0.352 0.000 0.140 0.000 0.508 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 6 0.0622 8.44e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1974804 4 0.6968 1.61e-01 0.188 0.000 0.288 0.436 0.088 0.000
#> SRR1974803 1 0.5188 3.07e-01 0.588 0.000 0.124 0.000 0.288 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.5341 3.69e-01 0.612 0.000 0.140 0.000 0.240 0.008
#> SRR1974799 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974797 2 0.3043 6.46e-01 0.000 0.792 0.000 0.000 0.008 0.200
#> SRR1974796 6 0.2976 7.81e-01 0.000 0.000 0.124 0.012 0.020 0.844
#> SRR1974795 6 0.1225 8.39e-01 0.000 0.000 0.036 0.000 0.012 0.952
#> SRR1974793 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974792 6 0.3012 7.48e-01 0.000 0.196 0.000 0.000 0.008 0.796
#> SRR1974791 6 0.0622 8.44e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.012 0.980
#> SRR1974790 6 0.2912 7.74e-01 0.000 0.172 0.000 0.000 0.012 0.816
#> SRR1974789 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974786 6 0.6583 -2.45e-01 0.048 0.000 0.168 0.000 0.388 0.396
#> SRR1974787 6 0.5725 5.64e-01 0.000 0.000 0.140 0.132 0.080 0.648
#> SRR1974784 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974783 1 0.0146 9.56e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974785 6 0.5050 3.60e-01 0.004 0.000 0.076 0.000 0.348 0.572
#> SRR1974782 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974780 6 0.3883 7.20e-01 0.000 0.000 0.144 0.000 0.088 0.768
#> SRR1974779 1 0.0363 9.49e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 6 0.4326 6.89e-01 0.008 0.000 0.172 0.000 0.084 0.736
#> SRR1974778 1 0.2553 7.86e-01 0.848 0.000 0.008 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974774 2 0.1075 8.25e-01 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974773 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 6 0.0260 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974770 2 0.0146 8.58e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974769 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974768 6 0.3883 7.10e-01 0.000 0.220 0.000 0.024 0.012 0.744
#> SRR1974767 6 0.3532 7.43e-01 0.000 0.000 0.140 0.000 0.064 0.796
#> SRR1974766 6 0.2964 7.42e-01 0.000 0.204 0.000 0.000 0.004 0.792
#> SRR1974765 6 0.0622 8.45e-01 0.000 0.008 0.000 0.000 0.012 0.980
#> SRR1974764 6 0.0622 8.45e-01 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008 0.980
#> SRR1974763 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.2595 6.98e-01 0.000 0.836 0.000 0.000 0.004 0.160
#> SRR1974760 6 0.2199 8.11e-01 0.000 0.000 0.088 0.000 0.020 0.892
#> SRR1974759 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 6 0.1387 8.32e-01 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974757 6 0.3171 7.44e-01 0.000 0.204 0.000 0.000 0.012 0.784
#> SRR1974756 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0713 8.19e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974755 2 0.3390 5.26e-01 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1974753 4 0.3860 -6.03e-05 0.000 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1974751 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974750 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974752 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 6 0.0260 8.44e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974747 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.3547 4.79e-01 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 6 0.2664 7.63e-01 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974745 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974743 4 0.3971 1.30e-01 0.000 0.004 0.000 0.548 0.000 0.448
#> SRR1974742 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974740 6 0.0363 8.45e-01 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974739 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974741 4 0.3810 1.73e-01 0.000 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1974738 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.3999 -7.12e-02 0.000 0.004 0.000 0.500 0.000 0.496
#> SRR1974736 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974735 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 6 0.0622 8.43e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008 0.980
#> SRR1974733 4 0.1501 7.78e-01 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974732 4 0.2632 7.43e-01 0.000 0.000 0.076 0.880 0.032 0.012
#> SRR1974731 4 0.0547 8.24e-01 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974729 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.2263 8.29e-01 0.884 0.000 0.100 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974728 4 0.1075 8.03e-01 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974725 5 0.4800 5.41e-01 0.000 0.000 0.124 0.004 0.680 0.192
#> SRR1974726 4 0.0363 8.27e-01 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974724 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974723 4 0.0458 8.26e-01 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974722 4 0.2473 7.37e-01 0.000 0.000 0.104 0.876 0.008 0.012
#> SRR1974721 2 0.3864 -2.44e-02 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1974720 6 0.4078 4.51e-01 0.000 0.000 0.000 0.320 0.024 0.656
#> SRR1974719 1 0.2912 7.02e-01 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1974718 1 0.0146 9.56e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974716 6 0.3520 7.58e-01 0.000 0.000 0.096 0.000 0.100 0.804
#> SRR1974717 6 0.2996 7.14e-01 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1974715 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974713 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 5 0.2805 6.04e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.828 0.160
#> SRR1974711 6 0.1588 8.23e-01 0.000 0.000 0.072 0.000 0.004 0.924
#> SRR1974712 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974710 6 0.0547 8.43e-01 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974707 5 0.2213 6.84e-01 0.004 0.000 0.100 0.000 0.888 0.008
#> SRR1974706 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 6 0.3792 7.38e-01 0.004 0.000 0.160 0.016 0.032 0.788
#> SRR1974701 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974699 6 0.2964 7.43e-01 0.000 0.204 0.000 0.004 0.000 0.792
#> SRR1974698 4 0.2996 5.42e-01 0.000 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1974700 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 5 0.1411 6.81e-01 0.000 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974696 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974694 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 6 0.3071 7.49e-01 0.000 0.000 0.016 0.000 0.180 0.804
#> SRR1974693 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974692 4 0.0547 8.24e-01 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974690 6 0.2212 8.09e-01 0.000 0.112 0.000 0.000 0.008 0.880
#> SRR1974691 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.1141 7.99e-01 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974688 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974687 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0820 9.35e-01 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974682 4 0.0520 8.15e-01 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0291 8.22e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974680 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974677 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1196 8.30e-01 0.000 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1974675 6 0.2482 7.90e-01 0.000 0.148 0.000 0.000 0.004 0.848
#> SRR1974674 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 6 0.0146 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974671 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974672 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974667 2 0.0146 8.58e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974668 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974666 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974664 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.3965 3.31e-01 0.000 0.604 0.000 0.000 0.008 0.388
#> SRR1974663 6 0.5381 3.56e-01 0.000 0.000 0.144 0.000 0.296 0.560
#> SRR1974662 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 6 0.3351 5.45e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1974660 5 0.3202 6.47e-01 0.176 0.000 0.024 0.000 0.800 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 5 0.3023 6.75e-01 0.032 0.000 0.140 0.000 0.828 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.2278 6.75e-01 0.004 0.000 0.128 0.000 0.868 0.000
#> SRR1974656 5 0.1958 6.80e-01 0.000 0.000 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR1974650 6 0.5416 2.73e-01 0.000 0.000 0.140 0.000 0.316 0.544
#> SRR1974651 6 0.2730 7.52e-01 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1974652 6 0.5675 1.16e-01 0.000 0.000 0.168 0.000 0.344 0.488
#> SRR1974653 4 0.0260 8.28e-01 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974648 5 0.0865 6.72e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974646 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974649 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 6 0.2793 7.45e-01 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1974645 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 6 0.2593 7.88e-01 0.000 0.148 0.000 0.000 0.008 0.844
#> SRR1974643 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 6 0.3979 2.35e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1974640 6 0.3653 5.13e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.300 0.692
#> SRR1974641 2 0.3797 2.35e-01 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974639 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 6 0.4593 3.80e-01 0.000 0.000 0.044 0.000 0.380 0.576
#> SRR1974634 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 6 0.2994 7.36e-01 0.000 0.004 0.000 0.208 0.000 0.788
#> SRR1974633 5 0.3746 6.68e-01 0.080 0.000 0.140 0.000 0.780 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 5 0.1265 6.81e-01 0.000 0.000 0.044 0.000 0.948 0.008
#> SRR1974630 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 5 0.3934 5.83e-01 0.260 0.000 0.032 0.000 0.708 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974623 6 0.0146 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974622 5 0.0405 6.72e-01 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000
#> SRR1974620 6 0.4049 4.55e-01 0.000 0.000 0.020 0.000 0.332 0.648
#> SRR1974619 6 0.3309 5.61e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.280 0.720
#> SRR1974621 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 5 0.8265 2.94e-01 0.224 0.000 0.236 0.160 0.332 0.048
#> SRR1974615 1 0.0146 9.56e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 6 0.4267 6.71e-01 0.000 0.000 0.152 0.000 0.116 0.732
#> SRR1974613 5 0.3655 6.40e-01 0.000 0.000 0.096 0.000 0.792 0.112
#> SRR1974612 1 0.0717 9.37e-01 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974611 6 0.0790 8.36e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1974610 6 0.1265 8.40e-01 0.000 0.044 0.000 0.000 0.008 0.948
#> SRR1974609 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 5 0.0405 6.71e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1974607 5 0.3813 5.49e-01 0.020 0.000 0.000 0.008 0.736 0.236
#> SRR1974606 2 0.0260 8.57e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974605 5 0.2544 6.70e-01 0.000 0.000 0.140 0.004 0.852 0.004
#> SRR1974604 4 0.0363 8.27e-01 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974603 6 0.1418 8.35e-01 0.000 0.000 0.032 0.000 0.024 0.944
#> SRR1974602 1 0.0000 9.60e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974601 6 0.0458 8.42e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974599 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974598 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974596 6 0.3023 7.19e-01 0.000 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1974594 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974593 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974595 6 0.3110 7.46e-01 0.000 0.196 0.000 0.000 0.012 0.792
#> SRR1974592 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974591 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974588 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974590 6 0.1075 8.40e-01 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974589 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974587 6 0.0146 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974586 6 0.0260 8.44e-01 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974585 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974584 5 0.3827 5.19e-01 0.308 0.000 0.000 0.008 0.680 0.004
#> SRR1974583 2 0.2378 7.11e-01 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974582 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974581 2 0.0000 8.60e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974580 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974578 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974577 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974579 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974576 6 0.3244 6.72e-01 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1974575 6 0.3109 7.25e-01 0.000 0.224 0.000 0.000 0.004 0.772
#> SRR1974574 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974573 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974571 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974572 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974570 6 0.2178 7.84e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974568 5 0.3421 5.38e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.736 0.256
#> SRR1974567 5 0.3707 4.76e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR1974566 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974569 6 0.1225 8.42e-01 0.000 0.036 0.000 0.000 0.012 0.952
#> SRR1974565 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974564 2 0.4129 1.75e-01 0.000 0.564 0.000 0.000 0.012 0.424
#> SRR1974560 5 0.3634 4.96e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.696 0.296
#> SRR1974559 5 0.2685 6.49e-01 0.132 0.000 0.000 0.008 0.852 0.008
#> SRR1974563 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974562 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974561 6 0.0508 8.44e-01 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974557 6 0.4025 3.19e-01 0.000 0.416 0.000 0.000 0.008 0.576
#> SRR1974553 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974555 5 0.3707 5.12e-01 0.312 0.000 0.000 0.008 0.680 0.000
#> SRR1974551 5 0.3578 5.95e-01 0.220 0.000 0.008 0.008 0.760 0.004
#> SRR1974552 6 0.0260 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974554 5 0.3615 5.01e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.700 0.292
#> SRR1974558 5 0.3707 4.76e-01 0.000 0.000 0.000 0.008 0.680 0.312
#> SRR1974556 5 0.3707 5.12e-01 0.312 0.000 0.000 0.008 0.680 0.000
#> SRR1974550 6 0.0260 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974549 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1974548 6 0.0000 8.43e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974547 6 0.3999 -8.17e-02 0.000 0.000 0.000 0.004 0.496 0.500
#> SRR1974546 6 0.1863 8.15e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1974545 6 0.3867 5.63e-01 0.000 0.328 0.000 0.000 0.012 0.660
#> SRR1974544 5 0.3578 4.41e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1974543 6 0.0363 8.44e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.726 0.883 0.942 0.4733 0.531 0.531
#> 3 3 0.913 0.922 0.961 0.3700 0.747 0.554
#> 4 4 0.842 0.851 0.918 0.1346 0.899 0.716
#> 5 5 0.774 0.781 0.884 0.0654 0.912 0.685
#> 6 6 0.779 0.729 0.821 0.0389 0.960 0.822
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975008 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975006 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975005 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975004 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975003 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975001 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975002 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974999 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1975000 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974998 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974996 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974994 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974993 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974992 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974990 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974986 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974987 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974988 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974985 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974983 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974982 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974981 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974980 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974977 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974974 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974973 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974970 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974969 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974968 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974967 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974965 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974966 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974964 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974963 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974961 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974962 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974960 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974959 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974958 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974955 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974954 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974953 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974952 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974949 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974944 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974942 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974943 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974941 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974940 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974939 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974938 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974937 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974936 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974935 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974934 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974931 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974930 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974929 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974928 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974927 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974924 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974925 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974926 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974923 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974922 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974920 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974919 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974917 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974916 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974915 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974911 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974910 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974908 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974909 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974907 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974905 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974904 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974903 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974902 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974901 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974897 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974895 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974874 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974873 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974871 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974872 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974869 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974870 1 0.8327 0.5981 0.736 0.264
#> SRR1974866 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.3733 0.8775 0.072 0.928
#> SRR1974863 2 0.7139 0.7851 0.196 0.804
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974859 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974858 2 0.7815 0.7541 0.232 0.768
#> SRR1974856 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974857 2 0.8081 0.7387 0.248 0.752
#> SRR1974855 2 0.0672 0.9141 0.008 0.992
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.8267 0.7255 0.260 0.740
#> SRR1974852 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.8327 0.7202 0.264 0.736
#> SRR1974846 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974839 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974834 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974833 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974831 2 0.3114 0.8877 0.056 0.944
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974826 2 0.9635 0.4950 0.388 0.612
#> SRR1974827 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.8267 0.7255 0.260 0.740
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974812 1 0.5059 0.8507 0.888 0.112
#> SRR1974810 1 0.0938 0.9604 0.988 0.012
#> SRR1974808 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.3431 0.8826 0.064 0.936
#> SRR1974804 2 0.9608 0.5054 0.384 0.616
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974796 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974795 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974793 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974792 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974791 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974790 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974789 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.8713 0.5868 0.708 0.292
#> SRR1974787 1 0.9850 0.1198 0.572 0.428
#> SRR1974784 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.6438 0.7939 0.836 0.164
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974780 2 0.8081 0.6750 0.248 0.752
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974776 1 0.8909 0.5292 0.692 0.308
#> SRR1974778 1 0.2043 0.9443 0.968 0.032
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974769 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.6438 0.7769 0.836 0.164
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974765 2 0.1184 0.9102 0.016 0.984
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974761 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974760 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974757 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974753 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974751 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974750 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974749 2 0.8608 0.6878 0.284 0.716
#> SRR1974747 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974744 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974745 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974743 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974742 1 0.3733 0.8987 0.928 0.072
#> SRR1974740 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974739 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974741 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974738 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974737 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974736 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.8608 0.5517 0.716 0.284
#> SRR1974733 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974732 2 0.8909 0.6540 0.308 0.692
#> SRR1974731 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974729 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974725 1 0.3114 0.9169 0.944 0.056
#> SRR1974726 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.2043 0.9419 0.968 0.032
#> SRR1974723 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974722 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974721 2 0.8267 0.7255 0.260 0.740
#> SRR1974720 2 0.8813 0.6671 0.300 0.700
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974717 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974715 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.1414 0.9529 0.980 0.020
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974702 2 0.3431 0.8747 0.064 0.936
#> SRR1974701 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974699 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974698 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974696 1 0.7950 0.6460 0.760 0.240
#> SRR1974694 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974692 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974690 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974691 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974689 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974688 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974687 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.6148 0.7950 0.848 0.152
#> SRR1974682 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.6712 0.7585 0.824 0.176
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974672 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974670 2 0.7950 0.7462 0.240 0.760
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974664 2 0.8081 0.7387 0.248 0.752
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0376 0.9669 0.996 0.004
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974652 1 0.0376 0.9668 0.996 0.004
#> SRR1974653 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.6623 0.7654 0.828 0.172
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974623 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.8327 0.7204 0.264 0.736
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.1843 0.9456 0.972 0.028
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0672 0.9637 0.992 0.008
#> SRR1974610 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974605 1 0.0672 0.9638 0.992 0.008
#> SRR1974604 2 0.8207 0.7307 0.256 0.744
#> SRR1974603 1 0.2236 0.9380 0.964 0.036
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.8861 0.6605 0.304 0.696
#> SRR1974601 1 0.0376 0.9668 0.996 0.004
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974594 2 0.9998 0.1934 0.492 0.508
#> SRR1974593 2 0.8813 0.6666 0.300 0.700
#> SRR1974595 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974592 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974588 1 0.2603 0.9298 0.956 0.044
#> SRR1974590 2 0.0938 0.9123 0.012 0.988
#> SRR1974589 2 0.9460 0.5475 0.364 0.636
#> SRR1974587 1 0.9996 -0.1262 0.512 0.488
#> SRR1974586 2 0.9129 0.6189 0.328 0.672
#> SRR1974585 2 0.8955 0.6471 0.312 0.688
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.7528 0.7685 0.216 0.784
#> SRR1974582 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974581 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974580 2 0.8327 0.7207 0.264 0.736
#> SRR1974578 1 0.9954 -0.0126 0.540 0.460
#> SRR1974577 2 0.3274 0.8826 0.060 0.940
#> SRR1974579 2 0.9933 0.3256 0.452 0.548
#> SRR1974576 2 0.9044 0.6321 0.320 0.680
#> SRR1974575 2 0.0000 0.9169 0.000 1.000
#> SRR1974574 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974573 2 0.2236 0.8994 0.036 0.964
#> SRR1974571 2 0.1633 0.9060 0.024 0.976
#> SRR1974572 2 0.3114 0.8876 0.056 0.944
#> SRR1974570 1 0.2043 0.9418 0.968 0.032
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.1414 0.9081 0.020 0.980
#> SRR1974569 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974565 1 0.9850 0.1211 0.572 0.428
#> SRR1974564 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.8016 0.7430 0.244 0.756
#> SRR1974562 2 0.0376 0.9155 0.004 0.996
#> SRR1974561 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974557 2 0.8144 0.7350 0.252 0.748
#> SRR1974553 2 0.2778 0.8924 0.048 0.952
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.1184 0.9104 0.016 0.984
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974548 2 0.9933 0.3241 0.452 0.548
#> SRR1974547 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0672 0.9139 0.008 0.992
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.1633 0.9060 0.024 0.976
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0237 0.943 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975006 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0237 0.943 0.000 0.004 0.996
#> SRR1975001 3 0.6111 0.383 0.000 0.396 0.604
#> SRR1975002 3 0.6252 0.234 0.000 0.444 0.556
#> SRR1974999 3 0.1031 0.931 0.000 0.024 0.976
#> SRR1975000 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 2 0.2356 0.924 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974995 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.4261 0.808 0.140 0.012 0.848
#> SRR1974993 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.1289 0.960 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974991 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.4346 0.779 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974984 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.3941 0.814 0.000 0.156 0.844
#> SRR1974982 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.3192 0.862 0.000 0.112 0.888
#> SRR1974978 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.2356 0.895 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974975 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0424 0.941 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974973 3 0.5058 0.697 0.000 0.244 0.756
#> SRR1974972 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.2796 0.879 0.000 0.092 0.908
#> SRR1974970 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0747 0.936 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974964 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.5431 0.630 0.000 0.284 0.716
#> SRR1974960 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.1753 0.914 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974957 3 0.6309 0.025 0.000 0.496 0.504
#> SRR1974956 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.4002 0.809 0.000 0.160 0.840
#> SRR1974952 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0747 0.936 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974950 3 0.0237 0.943 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974951 3 0.2878 0.876 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974947 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.5178 0.679 0.000 0.256 0.744
#> SRR1974946 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974945 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0424 0.941 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974938 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.4399 0.777 0.000 0.188 0.812
#> SRR1974933 3 0.2878 0.876 0.000 0.096 0.904
#> SRR1974932 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.5178 0.680 0.000 0.256 0.744
#> SRR1974927 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.0237 0.943 0.000 0.004 0.996
#> SRR1974925 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.4802 0.786 0.156 0.020 0.824
#> SRR1974923 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.4452 0.775 0.000 0.192 0.808
#> SRR1974916 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 2 0.1289 0.960 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974913 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.4842 0.728 0.000 0.224 0.776
#> SRR1974909 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.945 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 2 0.4887 0.716 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974900 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974899 2 0.6286 0.113 0.000 0.536 0.464
#> SRR1974897 2 0.6079 0.360 0.000 0.612 0.388
#> SRR1974896 2 0.1411 0.957 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974893 3 0.2356 0.896 0.000 0.072 0.928
#> SRR1974895 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974894 2 0.2537 0.915 0.000 0.920 0.080
#> SRR1974892 2 0.1289 0.960 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974890 2 0.2796 0.902 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974891 2 0.1529 0.955 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974889 2 0.5465 0.603 0.000 0.712 0.288
#> SRR1974888 2 0.6295 0.074 0.000 0.528 0.472
#> SRR1974886 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974887 2 0.1529 0.954 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974885 2 0.3851 0.848 0.004 0.860 0.136
#> SRR1974883 3 0.6204 0.297 0.000 0.424 0.576
#> SRR1974884 3 0.5138 0.684 0.000 0.252 0.748
#> SRR1974881 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974882 2 0.1411 0.957 0.000 0.964 0.036
#> SRR1974880 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974879 2 0.1529 0.955 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974877 2 0.2165 0.933 0.000 0.936 0.064
#> SRR1974876 2 0.1289 0.960 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974878 2 0.5760 0.517 0.000 0.672 0.328
#> SRR1974875 2 0.4452 0.771 0.000 0.808 0.192
#> SRR1974874 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.5315 0.717 0.772 0.012 0.216
#> SRR1974869 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974868 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974870 1 0.3370 0.898 0.904 0.024 0.072
#> SRR1974866 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974863 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974860 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974861 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974859 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974856 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0424 0.962 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974855 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974854 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.6225 0.316 0.568 0.432 0.000
#> SRR1974852 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974849 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.6286 0.217 0.536 0.464 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974844 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974838 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974834 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974833 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974831 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 1 0.4702 0.767 0.788 0.212 0.000
#> SRR1974827 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974824 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0424 0.965 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974823 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.3941 0.835 0.844 0.156 0.000
#> SRR1974815 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974810 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974808 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974807 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974804 1 0.3267 0.877 0.884 0.116 0.000
#> SRR1974803 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974797 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974796 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974795 2 0.1031 0.963 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974793 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974794 2 0.1031 0.963 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974792 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974791 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974790 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974789 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974788 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974786 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974787 1 0.2796 0.901 0.908 0.092 0.000
#> SRR1974784 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974783 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0424 0.963 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974780 1 0.0983 0.959 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974779 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974778 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974774 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974773 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1129 0.963 0.004 0.976 0.020
#> SRR1974770 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974769 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974768 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974767 1 0.0892 0.961 0.980 0.020 0.000
#> SRR1974766 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974765 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974764 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974763 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974760 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974759 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974757 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974756 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974753 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.1163 0.957 0.972 0.028 0.000
#> SRR1974747 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0747 0.948 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.1411 0.951 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 1 0.4842 0.748 0.776 0.224 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.1289 0.932 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974721 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 1 0.5621 0.609 0.692 0.308 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974711 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974710 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974707 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 2 0.6441 0.602 0.276 0.696 0.028
#> SRR1974701 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974696 1 0.1411 0.951 0.964 0.036 0.000
#> SRR1974694 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974695 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974691 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0592 0.961 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974675 3 0.6045 0.423 0.000 0.380 0.620
#> SRR1974674 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.2414 0.936 0.940 0.040 0.020
#> SRR1974671 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974672 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974669 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974667 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974668 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974666 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974664 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974665 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974663 1 0.0424 0.965 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974656 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974650 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974646 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974643 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974640 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974623 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974622 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974620 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974619 1 0.0747 0.963 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.1315 0.954 0.972 0.020 0.008
#> SRR1974615 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974614 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974613 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974607 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974606 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974605 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 1 0.5098 0.714 0.752 0.248 0.000
#> SRR1974601 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974599 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974598 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974596 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974594 1 0.3686 0.853 0.860 0.140 0.000
#> SRR1974593 1 0.5760 0.573 0.672 0.328 0.000
#> SRR1974595 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974592 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974591 2 0.1163 0.962 0.000 0.972 0.028
#> SRR1974588 1 0.1031 0.959 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974590 2 0.2680 0.895 0.068 0.924 0.008
#> SRR1974589 1 0.4654 0.773 0.792 0.208 0.000
#> SRR1974587 1 0.3412 0.870 0.876 0.124 0.000
#> SRR1974586 1 0.5560 0.627 0.700 0.300 0.000
#> SRR1974585 1 0.4178 0.818 0.828 0.172 0.000
#> SRR1974584 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974583 2 0.6051 0.561 0.292 0.696 0.012
#> SRR1974582 2 0.1031 0.963 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974581 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974580 1 0.6169 0.489 0.636 0.360 0.004
#> SRR1974578 1 0.3482 0.866 0.872 0.128 0.000
#> SRR1974577 1 0.5722 0.627 0.704 0.292 0.004
#> SRR1974579 1 0.4346 0.805 0.816 0.184 0.000
#> SRR1974576 1 0.4974 0.734 0.764 0.236 0.000
#> SRR1974575 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974574 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974573 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974571 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974572 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974570 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974568 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974567 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974566 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974569 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974565 1 0.1964 0.934 0.944 0.056 0.000
#> SRR1974564 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974560 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974559 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974563 2 0.3272 0.847 0.104 0.892 0.004
#> SRR1974562 2 0.0892 0.964 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974561 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974557 2 0.0000 0.960 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974553 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974555 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974551 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974552 2 0.0829 0.963 0.004 0.984 0.012
#> SRR1974554 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974558 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974556 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974550 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974549 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974548 1 0.4235 0.814 0.824 0.176 0.000
#> SRR1974547 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974546 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974545 2 0.0747 0.964 0.000 0.984 0.016
#> SRR1974544 1 0.0592 0.964 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974543 2 0.0592 0.963 0.000 0.988 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.4985 0.1736 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1975002 3 0.4866 0.3724 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1974999 3 0.0921 0.9272 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.1109 0.9429 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.2174 0.8846 0.020 0.000 0.928 0.052
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.1661 0.9058 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.2973 0.8282 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1557 0.9066 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.1474 0.9101 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0188 0.9430 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974973 3 0.3219 0.8060 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.1389 0.9128 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.1022 0.9245 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.2868 0.8366 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0921 0.9270 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1974957 3 0.3942 0.7104 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.2011 0.8887 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0188 0.9430 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974950 3 0.0188 0.9430 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974951 3 0.2281 0.8720 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.4072 0.6908 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1974946 2 0.0524 0.9508 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.3311 0.8002 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1974933 3 0.2921 0.8306 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.4008 0.7048 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.2846 0.8706 0.028 0.012 0.908 0.052
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.1356 0.9209 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.0779 0.9480 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.4222 0.6565 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9453 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 2 0.3764 0.7321 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974900 2 0.0657 0.9495 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974899 2 0.4543 0.5179 0.000 0.676 0.324 0.000
#> SRR1974897 2 0.4454 0.5480 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1974896 2 0.1305 0.9394 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974893 3 0.1389 0.9131 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974895 2 0.0895 0.9468 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974894 2 0.1489 0.9345 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1974892 2 0.0376 0.9515 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1974890 2 0.1661 0.9287 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR1974891 2 0.0895 0.9463 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1974889 2 0.3801 0.7233 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1974888 3 0.5168 0.0588 0.000 0.496 0.500 0.004
#> SRR1974886 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974887 2 0.0524 0.9509 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1974885 2 0.3160 0.8879 0.008 0.892 0.060 0.040
#> SRR1974883 3 0.4741 0.5403 0.000 0.328 0.668 0.004
#> SRR1974884 3 0.3649 0.7573 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1974881 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974882 2 0.1004 0.9451 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1974880 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974879 2 0.0657 0.9496 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1974877 2 0.1305 0.9377 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1974876 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974878 3 0.5151 0.1557 0.000 0.464 0.532 0.004
#> SRR1974875 2 0.4155 0.6886 0.000 0.756 0.240 0.004
#> SRR1974874 2 0.1389 0.9445 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974873 2 0.1474 0.9437 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974871 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974872 4 0.7360 0.4568 0.192 0.004 0.260 0.544
#> SRR1974869 4 0.1970 0.8619 0.060 0.008 0.000 0.932
#> SRR1974868 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974870 4 0.2266 0.8597 0.084 0.000 0.004 0.912
#> SRR1974866 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974867 1 0.0336 0.8928 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974865 2 0.1389 0.9445 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974864 4 0.4999 0.1394 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1974862 2 0.1302 0.9451 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974863 2 0.1389 0.9453 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974860 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974861 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974859 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974858 2 0.1867 0.9371 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974856 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974857 2 0.1557 0.9461 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974855 2 0.2593 0.8720 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1974854 1 0.0707 0.8852 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974853 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 4 0.5524 0.5839 0.048 0.276 0.000 0.676
#> SRR1974852 2 0.0336 0.9520 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974849 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974848 1 0.0469 0.8916 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974850 4 0.5807 0.4639 0.044 0.344 0.000 0.612
#> SRR1974846 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974847 1 0.4907 0.2083 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974845 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974844 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974843 4 0.4817 0.4596 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1974842 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0469 0.8916 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974840 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974839 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974838 1 0.1389 0.8772 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974837 1 0.0469 0.8894 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974835 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974834 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974833 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974831 2 0.0817 0.9504 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974832 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.4837 0.4607 0.648 0.004 0.000 0.348
#> SRR1974828 1 0.1792 0.8643 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974826 4 0.2060 0.8347 0.016 0.052 0.000 0.932
#> SRR1974827 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974824 4 0.3123 0.8313 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1974825 1 0.2973 0.7914 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974822 4 0.3569 0.7848 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1974823 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974820 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 4 0.6790 0.5373 0.228 0.168 0.000 0.604
#> SRR1974815 1 0.4948 0.1275 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1974813 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.2647 0.8953 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974812 4 0.5138 0.4132 0.392 0.008 0.000 0.600
#> SRR1974810 4 0.5150 0.3908 0.396 0.008 0.000 0.596
#> SRR1974808 4 0.1867 0.8629 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1974811 1 0.3610 0.7371 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1974809 1 0.1211 0.8825 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974807 4 0.3975 0.7484 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1974806 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0592 0.9478 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974804 4 0.5031 0.6980 0.212 0.048 0.000 0.740
#> SRR1974803 4 0.5000 0.0624 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974801 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.3219 0.7786 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1974799 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974797 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974796 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974795 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974793 1 0.3528 0.7506 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1974794 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974792 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974791 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974790 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974789 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974788 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974786 1 0.4564 0.5123 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1974787 4 0.4123 0.7328 0.220 0.008 0.000 0.772
#> SRR1974784 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974783 1 0.0592 0.8910 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974785 4 0.4790 0.4785 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1974782 1 0.1211 0.8822 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974781 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974780 4 0.4632 0.6159 0.308 0.004 0.000 0.688
#> SRR1974779 1 0.0469 0.8912 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974777 1 0.2011 0.8607 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974776 4 0.4776 0.4797 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974778 1 0.2149 0.8553 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974774 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974773 1 0.0817 0.8886 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974775 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974772 1 0.0817 0.8875 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974771 2 0.3486 0.7653 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1974770 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974769 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974768 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974767 4 0.3528 0.7864 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974766 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974765 2 0.4720 0.4991 0.004 0.672 0.000 0.324
#> SRR1974764 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974763 1 0.0188 0.8932 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974762 1 0.1940 0.8621 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974761 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974760 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974757 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974755 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974753 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974751 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974750 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974752 1 0.2011 0.8597 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974749 4 0.3372 0.8443 0.096 0.036 0.000 0.868
#> SRR1974747 1 0.4990 0.4431 0.640 0.008 0.000 0.352
#> SRR1974748 1 0.2973 0.7913 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1974746 1 0.4897 0.4923 0.660 0.008 0.000 0.332
#> SRR1974744 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974745 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974743 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974742 1 0.5085 0.3887 0.616 0.008 0.000 0.376
#> SRR1974740 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974739 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974741 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974738 4 0.4955 0.0697 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1974737 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974736 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974735 1 0.0707 0.8852 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974734 4 0.1624 0.8447 0.020 0.028 0.000 0.952
#> SRR1974733 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974732 4 0.1820 0.8394 0.020 0.036 0.000 0.944
#> SRR1974731 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974729 1 0.4360 0.6572 0.744 0.008 0.000 0.248
#> SRR1974730 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974728 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974725 4 0.2060 0.8578 0.052 0.016 0.000 0.932
#> SRR1974726 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974724 1 0.0707 0.8852 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974727 4 0.2021 0.8600 0.056 0.012 0.000 0.932
#> SRR1974723 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974722 2 0.4088 0.7564 0.004 0.764 0.000 0.232
#> SRR1974721 2 0.2868 0.8815 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1974720 4 0.1706 0.8379 0.016 0.036 0.000 0.948
#> SRR1974719 1 0.4761 0.4005 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974718 1 0.0336 0.8927 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974716 4 0.1743 0.8587 0.056 0.004 0.000 0.940
#> SRR1974717 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974715 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974713 1 0.0817 0.8866 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974714 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974711 4 0.2216 0.8594 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0469 0.8923 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974708 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974710 4 0.1940 0.8632 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1974707 4 0.2081 0.8625 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1974706 1 0.0336 0.8911 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 2 0.1389 0.9445 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974702 2 0.6881 0.1861 0.120 0.540 0.000 0.340
#> SRR1974701 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974699 2 0.1940 0.9350 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974698 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974700 1 0.0707 0.8852 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974697 4 0.1792 0.8627 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974696 4 0.1833 0.8464 0.024 0.032 0.000 0.944
#> SRR1974694 1 0.4990 0.4431 0.640 0.008 0.000 0.352
#> SRR1974695 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974693 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974692 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974690 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974691 1 0.4814 0.5282 0.676 0.008 0.000 0.316
#> SRR1974689 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974688 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974687 1 0.4990 0.4431 0.640 0.008 0.000 0.352
#> SRR1974686 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.5085 0.3832 0.616 0.008 0.000 0.376
#> SRR1974684 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.5597 0.0457 0.516 0.020 0.000 0.464
#> SRR1974682 2 0.4252 0.7205 0.004 0.744 0.000 0.252
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.4053 0.7574 0.004 0.768 0.000 0.228
#> SRR1974680 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974678 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974677 1 0.0817 0.8865 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974676 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974675 3 0.5926 0.6589 0.000 0.192 0.692 0.116
#> SRR1974674 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974673 4 0.2089 0.8589 0.048 0.020 0.000 0.932
#> SRR1974671 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974672 2 0.1474 0.9439 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974670 2 0.1389 0.9453 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974669 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974667 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974668 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974666 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974664 2 0.1557 0.9438 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974665 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974663 4 0.4222 0.6906 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1974662 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974660 1 0.4977 0.0497 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0336 0.8926 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974657 4 0.3528 0.7911 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 4 0.3219 0.8252 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974656 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974650 4 0.1867 0.8625 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1974651 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974652 4 0.4103 0.7146 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1974653 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974648 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974646 4 0.2376 0.8622 0.068 0.016 0.000 0.916
#> SRR1974649 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974645 1 0.0188 0.8934 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974644 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974643 1 0.3726 0.7076 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1974642 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974640 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974641 2 0.1557 0.9428 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974639 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.4103 0.6394 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1974635 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974634 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.1474 0.9437 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974633 4 0.2216 0.8608 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1974632 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974630 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 4 0.4985 0.2346 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1974624 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974623 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974622 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974620 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974619 4 0.2053 0.8610 0.072 0.004 0.000 0.924
#> SRR1974621 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.4103 0.6378 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1974616 4 0.5444 0.6357 0.264 0.048 0.000 0.688
#> SRR1974615 1 0.3801 0.6963 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974618 1 0.3356 0.7701 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1974614 4 0.3219 0.8188 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1974613 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974612 1 0.1867 0.8613 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974611 4 0.1940 0.8631 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1974610 2 0.1637 0.9420 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974609 1 0.1940 0.8547 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974608 4 0.1978 0.8606 0.068 0.004 0.000 0.928
#> SRR1974607 4 0.2814 0.8421 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1974606 2 0.0707 0.9508 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1974605 4 0.2198 0.8594 0.072 0.008 0.000 0.920
#> SRR1974604 2 0.1474 0.9437 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974603 4 0.2714 0.8489 0.112 0.004 0.000 0.884
#> SRR1974602 1 0.0000 0.8934 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.2222 0.8276 0.016 0.060 0.000 0.924
#> SRR1974601 4 0.1902 0.8626 0.064 0.004 0.000 0.932
#> SRR1974599 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974598 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974596 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974594 4 0.1610 0.8422 0.016 0.032 0.000 0.952
#> SRR1974593 4 0.3443 0.7537 0.016 0.136 0.000 0.848
#> SRR1974595 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974592 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974591 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974588 4 0.1724 0.8507 0.032 0.020 0.000 0.948
#> SRR1974590 2 0.3688 0.7598 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1974589 4 0.1798 0.8386 0.016 0.040 0.000 0.944
#> SRR1974587 4 0.1510 0.8422 0.016 0.028 0.000 0.956
#> SRR1974586 4 0.3495 0.7371 0.016 0.140 0.000 0.844
#> SRR1974585 4 0.1798 0.8411 0.016 0.040 0.000 0.944
#> SRR1974584 4 0.4356 0.6823 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1974583 4 0.4364 0.6710 0.016 0.220 0.000 0.764
#> SRR1974582 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974581 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974580 4 0.2796 0.8139 0.016 0.092 0.000 0.892
#> SRR1974578 4 0.1610 0.8422 0.016 0.032 0.000 0.952
#> SRR1974577 4 0.2775 0.8251 0.020 0.084 0.000 0.896
#> SRR1974579 4 0.1610 0.8422 0.016 0.032 0.000 0.952
#> SRR1974576 4 0.2376 0.8303 0.016 0.068 0.000 0.916
#> SRR1974575 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974574 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974573 2 0.0921 0.9414 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974571 2 0.0592 0.9481 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1974572 2 0.1389 0.9270 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974570 4 0.2704 0.8446 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974568 4 0.2081 0.8622 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1974567 4 0.3528 0.8008 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974566 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974569 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974565 4 0.1624 0.8447 0.020 0.028 0.000 0.952
#> SRR1974564 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974560 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974559 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974563 4 0.5138 0.3897 0.008 0.392 0.000 0.600
#> SRR1974562 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974561 2 0.0188 0.9522 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974557 2 0.4164 0.7027 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1974553 2 0.1792 0.9107 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974555 4 0.4776 0.5231 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1974551 4 0.2469 0.8529 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1974552 2 0.4277 0.6114 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1974554 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974558 4 0.2469 0.8568 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1974556 4 0.3444 0.8086 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1974550 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974549 2 0.0921 0.9411 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974548 4 0.1510 0.8422 0.016 0.028 0.000 0.956
#> SRR1974547 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974546 4 0.2011 0.8630 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974545 2 0.0336 0.9512 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974544 4 0.3074 0.8340 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1974543 2 0.0921 0.9417 0.000 0.972 0.000 0.028
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0162 0.9581 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0510 0.9515 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.3123 0.8078 0.000 0.184 0.812 0.004 0.000
#> SRR1975002 3 0.3300 0.7874 0.000 0.204 0.792 0.004 0.000
#> SRR1974999 3 0.0510 0.9514 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.3888 0.7679 0.000 0.800 0.064 0.136 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.1074 0.9385 0.004 0.000 0.968 0.012 0.016
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.2798 0.8059 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0579 0.9515 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.2536 0.8668 0.000 0.128 0.868 0.004 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.1106 0.9403 0.000 0.012 0.964 0.024 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0510 0.9514 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.2674 0.8568 0.000 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.2179 0.8815 0.000 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0162 0.9581 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.2020 0.8915 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.2674 0.8557 0.000 0.140 0.856 0.004 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0162 0.9581 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0955 0.9393 0.000 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.2648 0.8483 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.2338 0.8807 0.000 0.112 0.884 0.004 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.2488 0.8704 0.000 0.124 0.872 0.004 0.000
#> SRR1974946 2 0.0451 0.8571 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0162 0.9581 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0510 0.9515 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.2583 0.8631 0.000 0.132 0.864 0.004 0.000
#> SRR1974933 3 0.2669 0.8794 0.000 0.104 0.876 0.020 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.2763 0.8480 0.000 0.148 0.848 0.004 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.1701 0.9203 0.000 0.016 0.944 0.012 0.028
#> SRR1974923 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0162 0.9581 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 2 0.2798 0.8101 0.000 0.852 0.008 0.140 0.000
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.2488 0.8704 0.000 0.124 0.872 0.004 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9600 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.3266 0.7915 0.000 0.200 0.796 0.004 0.000
#> SRR1974900 2 0.0579 0.8555 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1974899 3 0.2848 0.8402 0.000 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1974897 3 0.3231 0.7921 0.000 0.196 0.800 0.004 0.000
#> SRR1974896 2 0.2179 0.7762 0.000 0.896 0.100 0.004 0.000
#> SRR1974893 3 0.2020 0.8914 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1974895 2 0.1484 0.8303 0.000 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1974894 2 0.3783 0.5578 0.000 0.740 0.252 0.008 0.000
#> SRR1974892 2 0.2707 0.8129 0.000 0.860 0.008 0.132 0.000
#> SRR1974890 2 0.5283 0.5995 0.000 0.676 0.188 0.136 0.000
#> SRR1974891 2 0.1211 0.8397 0.000 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR1974889 3 0.3160 0.8072 0.000 0.188 0.808 0.004 0.000
#> SRR1974888 3 0.3487 0.7679 0.000 0.212 0.780 0.008 0.000
#> SRR1974886 2 0.0703 0.8579 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974887 2 0.2471 0.8109 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974885 2 0.4252 0.7636 0.000 0.784 0.064 0.144 0.008
#> SRR1974883 3 0.3304 0.8204 0.000 0.168 0.816 0.016 0.000
#> SRR1974884 3 0.2280 0.8773 0.000 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.0865 0.8582 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1974882 2 0.1331 0.8373 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1974880 2 0.0290 0.8574 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974879 2 0.0671 0.8488 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1974877 2 0.2068 0.7834 0.000 0.904 0.092 0.004 0.000
#> SRR1974876 2 0.2280 0.8193 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974878 3 0.5604 0.4952 0.000 0.240 0.628 0.132 0.000
#> SRR1974875 2 0.5901 0.4095 0.000 0.568 0.300 0.132 0.000
#> SRR1974874 4 0.4101 0.5544 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1974873 4 0.1894 0.9068 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR1974871 4 0.3336 0.7804 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1974872 1 0.8966 -0.0678 0.340 0.116 0.196 0.048 0.300
#> SRR1974869 5 0.1124 0.7962 0.004 0.000 0.000 0.036 0.960
#> SRR1974868 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974870 5 0.1883 0.7945 0.008 0.012 0.000 0.048 0.932
#> SRR1974866 5 0.0324 0.7986 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974867 1 0.1544 0.8460 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974865 4 0.4192 0.4749 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1974864 1 0.4114 0.4877 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1974862 2 0.4562 -0.2129 0.000 0.500 0.000 0.492 0.008
#> SRR1974863 2 0.4235 0.1138 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974860 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974861 2 0.0290 0.8574 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974859 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974858 2 0.3906 0.5149 0.000 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR1974856 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974857 2 0.4299 0.2635 0.000 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR1974855 2 0.3912 0.7498 0.004 0.768 0.000 0.208 0.020
#> SRR1974854 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974851 2 0.8007 -0.1169 0.120 0.400 0.000 0.176 0.304
#> SRR1974852 2 0.2462 0.8288 0.000 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1974849 1 0.0880 0.8547 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974848 1 0.0794 0.8553 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974850 2 0.7621 -0.0510 0.084 0.440 0.000 0.160 0.316
#> SRR1974846 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974847 1 0.3707 0.6530 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974845 2 0.2377 0.8146 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974844 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974843 1 0.4632 0.2754 0.540 0.000 0.000 0.012 0.448
#> SRR1974842 1 0.0162 0.8561 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974841 1 0.1121 0.8526 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974840 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974839 2 0.2377 0.8177 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974838 1 0.1908 0.8358 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1974837 1 0.0162 0.8556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974835 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974836 2 0.2329 0.8201 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974834 2 0.2377 0.8126 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974833 2 0.3098 0.8008 0.000 0.836 0.000 0.148 0.016
#> SRR1974831 2 0.4147 0.5766 0.000 0.676 0.000 0.316 0.008
#> SRR1974832 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974830 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974829 1 0.4314 0.6994 0.760 0.028 0.000 0.016 0.196
#> SRR1974828 1 0.2548 0.8003 0.876 0.004 0.000 0.004 0.116
#> SRR1974826 5 0.5210 0.6564 0.000 0.200 0.000 0.120 0.680
#> SRR1974827 2 0.2424 0.8118 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974824 5 0.2852 0.6789 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974825 1 0.2690 0.7959 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974822 5 0.4499 0.1928 0.408 0.004 0.000 0.004 0.584
#> SRR1974823 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974820 1 0.0290 0.8564 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974818 1 0.0510 0.8567 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974819 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 5 0.8280 0.2578 0.284 0.260 0.000 0.124 0.332
#> SRR1974815 5 0.4307 -0.1456 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1974813 1 0.0290 0.8568 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974814 4 0.1571 0.8711 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1974812 1 0.7007 0.1468 0.484 0.108 0.000 0.060 0.348
#> SRR1974810 1 0.5780 0.4796 0.616 0.068 0.000 0.024 0.292
#> SRR1974808 5 0.0566 0.7986 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1974811 1 0.2833 0.7938 0.852 0.004 0.000 0.004 0.140
#> SRR1974809 1 0.1270 0.8514 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974807 5 0.4278 0.0180 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1974806 1 0.0510 0.8564 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974805 2 0.2536 0.8119 0.000 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1974804 1 0.8185 -0.1911 0.344 0.192 0.000 0.132 0.332
#> SRR1974803 1 0.5005 0.4922 0.624 0.020 0.000 0.016 0.340
#> SRR1974801 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974800 1 0.3643 0.7202 0.776 0.004 0.000 0.008 0.212
#> SRR1974799 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974798 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974797 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974796 2 0.2424 0.8118 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974795 2 0.2886 0.8010 0.000 0.844 0.000 0.148 0.008
#> SRR1974793 1 0.5180 0.6352 0.700 0.024 0.000 0.056 0.220
#> SRR1974794 2 0.0609 0.8571 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974792 2 0.2127 0.8282 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974791 2 0.2424 0.8118 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974790 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974789 2 0.0510 0.8575 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974788 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974786 1 0.4601 0.6571 0.720 0.032 0.000 0.012 0.236
#> SRR1974787 5 0.8043 0.1866 0.336 0.176 0.000 0.120 0.368
#> SRR1974784 2 0.2424 0.8118 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974783 1 0.0880 0.8557 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974785 1 0.5914 0.3897 0.572 0.064 0.000 0.024 0.340
#> SRR1974782 1 0.1671 0.8421 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974781 2 0.2329 0.8133 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974780 1 0.7449 -0.0512 0.408 0.164 0.000 0.060 0.368
#> SRR1974779 1 0.1410 0.8480 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974777 1 0.1851 0.8373 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974776 1 0.6741 0.2785 0.524 0.104 0.000 0.048 0.324
#> SRR1974778 1 0.2230 0.8189 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974774 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974773 1 0.1341 0.8501 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974775 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974772 1 0.0609 0.8566 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974771 2 0.3467 0.7920 0.004 0.832 0.000 0.128 0.036
#> SRR1974770 2 0.0609 0.8583 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974769 2 0.2424 0.8138 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974768 2 0.2886 0.8010 0.000 0.844 0.000 0.148 0.008
#> SRR1974767 5 0.7381 0.2290 0.348 0.156 0.000 0.060 0.436
#> SRR1974766 2 0.2179 0.8264 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974765 2 0.3630 0.6428 0.000 0.780 0.000 0.016 0.204
#> SRR1974764 2 0.0794 0.8559 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974763 1 0.1121 0.8526 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974762 1 0.1965 0.8318 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1974761 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974760 2 0.2424 0.8118 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974759 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974758 2 0.1410 0.8463 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974757 2 0.2329 0.8178 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974756 1 0.0794 0.8559 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974754 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974755 2 0.1792 0.8398 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974753 4 0.1704 0.9098 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1974751 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974750 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974752 1 0.1851 0.8360 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1974749 5 0.7358 0.4807 0.224 0.192 0.000 0.072 0.512
#> SRR1974747 1 0.4181 0.7149 0.780 0.032 0.000 0.016 0.172
#> SRR1974748 1 0.2377 0.8146 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974746 1 0.4181 0.7149 0.780 0.032 0.000 0.016 0.172
#> SRR1974744 4 0.3177 0.8008 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1974745 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974743 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974742 1 0.4537 0.6800 0.744 0.036 0.000 0.016 0.204
#> SRR1974740 4 0.3210 0.7930 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1974739 4 0.1608 0.9102 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974741 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974738 4 0.6717 0.1073 0.000 0.364 0.000 0.388 0.248
#> SRR1974737 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974736 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974735 1 0.0162 0.8557 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974734 5 0.3804 0.7254 0.000 0.160 0.000 0.044 0.796
#> SRR1974733 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974732 5 0.6874 0.3802 0.016 0.192 0.000 0.332 0.460
#> SRR1974731 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974729 1 0.4104 0.7231 0.788 0.032 0.000 0.016 0.164
#> SRR1974730 1 0.1544 0.8464 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974728 4 0.1478 0.9090 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1974725 5 0.2965 0.7764 0.012 0.084 0.000 0.028 0.876
#> SRR1974726 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 5 0.3307 0.7620 0.000 0.104 0.000 0.052 0.844
#> SRR1974723 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974722 4 0.3527 0.7875 0.000 0.116 0.000 0.828 0.056
#> SRR1974721 4 0.3932 0.5914 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1974720 5 0.6738 0.3209 0.008 0.192 0.000 0.360 0.440
#> SRR1974719 1 0.4161 0.7134 0.772 0.024 0.000 0.016 0.188
#> SRR1974718 1 0.1197 0.8518 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974716 5 0.1725 0.7902 0.000 0.044 0.000 0.020 0.936
#> SRR1974717 4 0.1792 0.9026 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1974715 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974713 1 0.1478 0.8468 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1974714 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974711 5 0.1695 0.7953 0.008 0.008 0.000 0.044 0.940
#> SRR1974712 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974708 5 0.0671 0.7984 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974710 5 0.0324 0.7986 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974707 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974706 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 4 0.3487 0.7590 0.000 0.212 0.000 0.780 0.008
#> SRR1974702 2 0.5695 0.5672 0.076 0.696 0.000 0.060 0.168
#> SRR1974701 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974699 4 0.3796 0.6574 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1974698 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974700 1 0.0162 0.8557 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974697 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974696 5 0.4252 0.7150 0.000 0.172 0.000 0.064 0.764
#> SRR1974694 1 0.4181 0.7149 0.780 0.032 0.000 0.016 0.172
#> SRR1974695 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974693 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974692 4 0.1608 0.9102 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974690 2 0.1270 0.8515 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974691 1 0.4181 0.7149 0.780 0.032 0.000 0.016 0.172
#> SRR1974689 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974688 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974687 1 0.4181 0.7149 0.780 0.032 0.000 0.016 0.172
#> SRR1974686 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.4348 0.7066 0.768 0.032 0.000 0.020 0.180
#> SRR1974684 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974683 1 0.6278 0.3894 0.584 0.084 0.000 0.040 0.292
#> SRR1974682 4 0.2300 0.8264 0.000 0.052 0.000 0.908 0.040
#> SRR1974681 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.1965 0.8418 0.000 0.052 0.000 0.924 0.024
#> SRR1974680 1 0.0290 0.8566 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974678 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974677 1 0.1544 0.8448 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974676 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974675 3 0.4065 0.6846 0.000 0.264 0.720 0.016 0.000
#> SRR1974674 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974673 5 0.3758 0.7527 0.004 0.128 0.000 0.052 0.816
#> SRR1974671 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974672 4 0.4278 0.3620 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1974670 2 0.4287 -0.0581 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR1974669 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974667 2 0.0510 0.8583 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974668 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974666 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974664 2 0.4297 -0.0858 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1974665 2 0.2074 0.8304 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974663 5 0.6626 0.1696 0.388 0.080 0.000 0.048 0.484
#> SRR1974662 1 0.0162 0.8561 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974661 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974660 1 0.4015 0.5470 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974659 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974658 1 0.0404 0.8570 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974657 5 0.2561 0.7152 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1974654 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 5 0.3628 0.6119 0.216 0.000 0.000 0.012 0.772
#> SRR1974656 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974650 5 0.0671 0.7984 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980
#> SRR1974651 4 0.1608 0.9102 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1974652 5 0.5966 0.1858 0.392 0.032 0.000 0.048 0.528
#> SRR1974653 4 0.1544 0.9119 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1974648 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974646 5 0.3191 0.7729 0.004 0.084 0.000 0.052 0.860
#> SRR1974649 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.1732 0.9051 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1974645 1 0.1410 0.8483 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974644 2 0.2074 0.8305 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974643 1 0.3707 0.6459 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1974642 5 0.0324 0.7986 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974640 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974641 4 0.3684 0.7187 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1974639 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974638 1 0.3093 0.7722 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR1974635 1 0.0290 0.8566 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974636 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974634 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974637 4 0.1768 0.9090 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1974633 5 0.0290 0.7978 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1974632 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974631 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974630 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974629 1 0.0404 0.8569 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974628 1 0.1121 0.8524 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974627 1 0.4278 0.3066 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1974624 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974625 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974623 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974622 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974620 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974619 5 0.0798 0.7992 0.000 0.008 0.000 0.016 0.976
#> SRR1974621 1 0.0000 0.8548 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.3452 0.7045 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1974616 1 0.7733 -0.1331 0.376 0.208 0.000 0.068 0.348
#> SRR1974615 1 0.3242 0.7386 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1974618 1 0.4425 0.6811 0.740 0.008 0.000 0.036 0.216
#> SRR1974614 5 0.5482 0.4918 0.276 0.028 0.000 0.048 0.648
#> SRR1974613 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974612 1 0.3013 0.7738 0.832 0.000 0.000 0.008 0.160
#> SRR1974611 5 0.1569 0.7952 0.004 0.008 0.000 0.044 0.944
#> SRR1974610 4 0.3003 0.8146 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1974609 1 0.2280 0.8208 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974608 5 0.1280 0.7965 0.008 0.024 0.000 0.008 0.960
#> SRR1974607 5 0.2230 0.7319 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1974606 2 0.3053 0.7268 0.000 0.828 0.000 0.164 0.008
#> SRR1974605 5 0.3354 0.7834 0.028 0.044 0.000 0.064 0.864
#> SRR1974604 4 0.1894 0.9066 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR1974603 5 0.5397 0.6666 0.168 0.064 0.000 0.052 0.716
#> SRR1974602 1 0.0162 0.8562 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974600 5 0.5516 0.6220 0.000 0.220 0.000 0.136 0.644
#> SRR1974601 5 0.1682 0.7951 0.004 0.012 0.000 0.044 0.940
#> SRR1974599 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974598 2 0.0404 0.8579 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974596 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974594 5 0.4951 0.6738 0.000 0.196 0.000 0.100 0.704
#> SRR1974593 5 0.6206 0.3845 0.000 0.344 0.000 0.152 0.504
#> SRR1974595 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974592 2 0.0404 0.8574 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974591 2 0.0290 0.8574 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974588 5 0.3176 0.7708 0.000 0.080 0.000 0.064 0.856
#> SRR1974590 2 0.3586 0.7149 0.000 0.792 0.000 0.188 0.020
#> SRR1974589 5 0.5384 0.6419 0.000 0.196 0.000 0.140 0.664
#> SRR1974587 5 0.4901 0.6749 0.000 0.196 0.000 0.096 0.708
#> SRR1974586 5 0.6085 0.5341 0.000 0.212 0.000 0.216 0.572
#> SRR1974585 5 0.4923 0.6639 0.000 0.212 0.000 0.088 0.700
#> SRR1974584 5 0.3949 0.3939 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR1974583 2 0.5551 -0.1169 0.000 0.488 0.000 0.068 0.444
#> SRR1974582 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974581 2 0.0510 0.8575 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974580 5 0.5329 0.4883 0.000 0.336 0.000 0.068 0.596
#> SRR1974578 5 0.5013 0.6734 0.000 0.192 0.000 0.108 0.700
#> SRR1974577 5 0.5514 0.5675 0.016 0.296 0.000 0.060 0.628
#> SRR1974579 5 0.5148 0.6640 0.000 0.192 0.000 0.120 0.688
#> SRR1974576 5 0.5357 0.4777 0.000 0.344 0.000 0.068 0.588
#> SRR1974575 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974574 2 0.0404 0.8574 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974573 2 0.0693 0.8525 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1974571 2 0.0579 0.8560 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974572 2 0.0807 0.8552 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1974570 5 0.4811 0.6320 0.200 0.020 0.000 0.048 0.732
#> SRR1974568 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974567 5 0.3561 0.5372 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1974566 2 0.0579 0.8558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974569 2 0.0451 0.8550 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974565 5 0.4819 0.6824 0.000 0.192 0.000 0.092 0.716
#> SRR1974564 2 0.0510 0.8575 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974560 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974559 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974563 2 0.5329 0.2789 0.000 0.596 0.000 0.068 0.336
#> SRR1974562 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974561 2 0.0290 0.8571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974557 2 0.5516 0.4105 0.000 0.608 0.000 0.296 0.096
#> SRR1974553 2 0.0898 0.8485 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974555 5 0.4210 0.1654 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974551 5 0.1628 0.7759 0.056 0.000 0.000 0.008 0.936
#> SRR1974552 2 0.2795 0.7875 0.000 0.880 0.000 0.056 0.064
#> SRR1974554 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974558 5 0.0404 0.7966 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974556 5 0.3336 0.5997 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1974550 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974549 2 0.0290 0.8554 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974548 5 0.5180 0.6596 0.000 0.196 0.000 0.120 0.684
#> SRR1974547 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974546 5 0.0162 0.7985 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974545 2 0.0324 0.8559 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974544 5 0.2891 0.6640 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974543 2 0.0693 0.8527 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.2527 0.8603 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1975006 3 0.2340 0.8680 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1975005 3 0.0937 0.8939 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1975004 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.2838 0.8494 0.000 0.004 0.808 0.000 0.000 0.188
#> SRR1975001 3 0.4500 0.6792 0.000 0.036 0.572 0.000 0.000 0.392
#> SRR1975002 3 0.5325 0.5897 0.000 0.108 0.500 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974999 3 0.3448 0.7980 0.000 0.004 0.716 0.000 0.000 0.280
#> SRR1975000 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 2 0.4551 0.5461 0.000 0.676 0.036 0.020 0.000 0.268
#> SRR1974995 3 0.0713 0.8949 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974996 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.1334 0.8660 0.000 0.000 0.948 0.000 0.020 0.032
#> SRR1974993 3 0.1387 0.8901 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974992 3 0.1075 0.8931 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974990 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.2145 0.7224 0.000 0.900 0.000 0.028 0.000 0.072
#> SRR1974991 3 0.1610 0.8869 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974986 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.2416 0.8655 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1974988 3 0.3587 0.8139 0.000 0.040 0.772 0.000 0.000 0.188
#> SRR1974984 3 0.0363 0.8941 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974985 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.4049 0.7469 0.000 0.020 0.648 0.000 0.000 0.332
#> SRR1974982 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.2980 0.8466 0.000 0.008 0.800 0.000 0.000 0.192
#> SRR1974978 3 0.0260 0.8932 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974977 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.2793 0.8464 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1974975 3 0.2092 0.8762 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974974 3 0.2762 0.8480 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1974973 3 0.4769 0.6787 0.000 0.060 0.576 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974972 3 0.2178 0.8732 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1974971 3 0.4028 0.7562 0.000 0.024 0.668 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974970 3 0.0146 0.8927 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974969 3 0.0363 0.8929 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974968 3 0.2048 0.8776 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974967 3 0.0937 0.8939 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974965 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.3778 0.7864 0.000 0.020 0.708 0.000 0.000 0.272
#> SRR1974964 3 0.1075 0.8932 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1974963 3 0.1204 0.8919 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974961 3 0.0937 0.8938 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974962 3 0.4389 0.7019 0.000 0.032 0.596 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974960 3 0.0363 0.8941 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974959 3 0.1007 0.8934 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974958 3 0.2697 0.8498 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1974957 3 0.4663 0.7464 0.000 0.092 0.664 0.000 0.000 0.244
#> SRR1974956 3 0.0547 0.8942 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974955 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0458 0.8943 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974953 3 0.4667 0.7395 0.000 0.100 0.688 0.004 0.000 0.208
#> SRR1974952 3 0.0713 0.8943 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974949 3 0.2191 0.8769 0.000 0.004 0.876 0.000 0.000 0.120
#> SRR1974950 3 0.1610 0.8866 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1974951 3 0.3952 0.7651 0.000 0.020 0.672 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974947 3 0.1204 0.8926 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974948 3 0.4371 0.6882 0.000 0.028 0.580 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974946 2 0.3652 0.6330 0.000 0.720 0.016 0.000 0.000 0.264
#> SRR1974945 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0146 0.8909 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974943 3 0.1387 0.8868 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974941 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0260 0.8933 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974939 3 0.2219 0.8678 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1974938 3 0.1267 0.8921 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1974937 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0458 0.8940 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974934 3 0.4322 0.7058 0.000 0.028 0.600 0.000 0.000 0.372
#> SRR1974933 3 0.3756 0.7919 0.000 0.020 0.712 0.000 0.000 0.268
#> SRR1974932 3 0.0363 0.8937 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974931 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.4428 0.6870 0.000 0.032 0.580 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974927 3 0.0632 0.8946 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974924 3 0.0146 0.8909 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974925 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.1719 0.8526 0.004 0.000 0.932 0.000 0.032 0.032
#> SRR1974923 3 0.0547 0.8923 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974922 3 0.1141 0.8931 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974921 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0865 0.8944 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974918 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.2854 0.8376 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1974916 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.1007 0.8935 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974914 2 0.3424 0.6329 0.000 0.780 0.004 0.020 0.000 0.196
#> SRR1974913 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.4362 0.6920 0.000 0.028 0.584 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974909 3 0.1556 0.8873 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974906 3 0.1141 0.8901 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974907 3 0.0937 0.8942 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974905 3 0.0000 0.8922 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.2003 0.8786 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974903 3 0.0865 0.8943 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974902 3 0.2402 0.8700 0.000 0.004 0.856 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974901 3 0.0937 0.8944 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974898 3 0.5887 0.4177 0.000 0.200 0.408 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974900 2 0.3076 0.6132 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1974899 3 0.4872 0.6545 0.000 0.064 0.548 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974897 3 0.4926 0.6432 0.000 0.068 0.540 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974896 2 0.4180 0.4813 0.000 0.628 0.024 0.000 0.000 0.348
#> SRR1974893 3 0.4062 0.7565 0.000 0.024 0.660 0.000 0.000 0.316
#> SRR1974895 2 0.3658 0.6028 0.000 0.752 0.032 0.000 0.000 0.216
#> SRR1974894 2 0.5058 0.4386 0.000 0.600 0.108 0.000 0.000 0.292
#> SRR1974892 2 0.3688 0.5849 0.000 0.724 0.000 0.020 0.000 0.256
#> SRR1974890 2 0.5642 0.4063 0.000 0.560 0.112 0.020 0.000 0.308
#> SRR1974891 2 0.3584 0.5445 0.000 0.688 0.004 0.000 0.000 0.308
#> SRR1974889 3 0.5179 0.6124 0.000 0.092 0.516 0.000 0.000 0.392
#> SRR1974888 3 0.5449 0.5693 0.000 0.124 0.488 0.000 0.000 0.388
#> SRR1974886 2 0.0692 0.7374 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1974887 2 0.3013 0.6788 0.000 0.832 0.004 0.024 0.000 0.140
#> SRR1974885 2 0.5229 0.5268 0.016 0.652 0.040 0.024 0.004 0.264
#> SRR1974883 3 0.5406 0.5847 0.000 0.120 0.500 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974884 3 0.4649 0.6805 0.000 0.048 0.572 0.000 0.000 0.380
#> SRR1974881 2 0.3073 0.6357 0.000 0.788 0.000 0.008 0.000 0.204
#> SRR1974882 2 0.3314 0.5961 0.000 0.740 0.004 0.000 0.000 0.256
#> SRR1974880 2 0.2135 0.6947 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1974879 2 0.3653 0.5472 0.000 0.692 0.008 0.000 0.000 0.300
#> SRR1974877 2 0.4580 0.4566 0.000 0.612 0.052 0.000 0.000 0.336
#> SRR1974876 2 0.2783 0.6732 0.000 0.836 0.000 0.016 0.000 0.148
#> SRR1974878 2 0.6389 0.0160 0.000 0.356 0.280 0.012 0.000 0.352
#> SRR1974875 2 0.5934 0.3654 0.000 0.536 0.160 0.020 0.000 0.284
#> SRR1974874 4 0.4765 0.6373 0.000 0.172 0.000 0.676 0.000 0.152
#> SRR1974873 4 0.0909 0.8692 0.000 0.012 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR1974871 4 0.2901 0.7910 0.000 0.128 0.000 0.840 0.000 0.032
#> SRR1974872 1 0.7047 0.4594 0.544 0.036 0.124 0.004 0.212 0.080
#> SRR1974869 5 0.1219 0.8043 0.000 0.000 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1974868 2 0.0972 0.7368 0.000 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1974870 5 0.2840 0.7575 0.012 0.020 0.004 0.004 0.872 0.088
#> SRR1974866 5 0.0146 0.8209 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974867 1 0.1616 0.8580 0.932 0.000 0.000 0.000 0.048 0.020
#> SRR1974865 4 0.4915 0.6098 0.000 0.188 0.000 0.656 0.000 0.156
#> SRR1974864 1 0.3879 0.6444 0.688 0.000 0.000 0.000 0.292 0.020
#> SRR1974862 4 0.4827 0.5797 0.000 0.236 0.000 0.652 0.000 0.112
#> SRR1974863 4 0.5466 0.4684 0.000 0.212 0.000 0.572 0.000 0.216
#> SRR1974860 2 0.0603 0.7377 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1974861 2 0.2738 0.6654 0.000 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR1974859 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.6536 -0.1320 0.000 0.328 0.000 0.360 0.020 0.292
#> SRR1974856 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.6116 0.3032 0.000 0.228 0.000 0.504 0.016 0.252
#> SRR1974855 2 0.3713 0.6486 0.008 0.808 0.000 0.080 0.004 0.100
#> SRR1974854 1 0.0405 0.8585 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974853 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974851 2 0.8473 -0.3527 0.272 0.272 0.000 0.120 0.084 0.252
#> SRR1974852 2 0.2094 0.7220 0.000 0.900 0.000 0.020 0.000 0.080
#> SRR1974849 1 0.1387 0.8526 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974848 1 0.1806 0.8475 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1974850 6 0.7926 0.4533 0.112 0.288 0.000 0.120 0.076 0.404
#> SRR1974846 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.4009 0.6403 0.684 0.000 0.000 0.000 0.288 0.028
#> SRR1974845 2 0.1176 0.7337 0.000 0.956 0.000 0.024 0.000 0.020
#> SRR1974844 1 0.0260 0.8604 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974843 1 0.4378 0.5539 0.632 0.000 0.000 0.000 0.328 0.040
#> SRR1974842 1 0.1010 0.8596 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1974841 1 0.1714 0.8442 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974840 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.1088 0.7336 0.000 0.960 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1974838 1 0.1075 0.8615 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974837 1 0.0363 0.8616 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974835 1 0.1219 0.8585 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1974836 2 0.4064 0.4596 0.000 0.644 0.000 0.020 0.000 0.336
#> SRR1974834 2 0.2066 0.7175 0.000 0.904 0.000 0.024 0.000 0.072
#> SRR1974833 2 0.2052 0.7174 0.000 0.912 0.000 0.028 0.004 0.056
#> SRR1974831 2 0.3867 0.5472 0.000 0.748 0.000 0.200 0.000 0.052
#> SRR1974832 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974830 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974829 1 0.3678 0.7635 0.788 0.000 0.000 0.000 0.084 0.128
#> SRR1974828 1 0.1720 0.8454 0.928 0.000 0.000 0.000 0.032 0.040
#> SRR1974826 6 0.6049 0.7488 0.000 0.140 0.000 0.032 0.300 0.528
#> SRR1974827 2 0.1003 0.7351 0.000 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1974824 5 0.2980 0.6796 0.192 0.000 0.000 0.000 0.800 0.008
#> SRR1974825 1 0.2572 0.8183 0.852 0.000 0.000 0.000 0.136 0.012
#> SRR1974822 5 0.5077 0.2785 0.360 0.000 0.000 0.000 0.552 0.088
#> SRR1974823 5 0.0000 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0603 0.8610 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1974818 1 0.1471 0.8545 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1974819 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974817 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974816 1 0.8311 -0.0784 0.384 0.156 0.000 0.092 0.140 0.228
#> SRR1974815 1 0.4051 0.3243 0.560 0.000 0.000 0.000 0.432 0.008
#> SRR1974813 1 0.1152 0.8589 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1974814 4 0.2384 0.8183 0.000 0.064 0.000 0.888 0.000 0.048
#> SRR1974812 1 0.5620 0.5800 0.628 0.024 0.000 0.004 0.152 0.192
#> SRR1974810 1 0.4967 0.6301 0.664 0.004 0.000 0.000 0.172 0.160
#> SRR1974808 5 0.0937 0.8105 0.000 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974811 1 0.2740 0.8267 0.864 0.000 0.000 0.000 0.076 0.060
#> SRR1974809 1 0.1926 0.8534 0.912 0.000 0.000 0.000 0.068 0.020
#> SRR1974807 5 0.4269 0.1941 0.412 0.000 0.000 0.000 0.568 0.020
#> SRR1974806 1 0.1349 0.8562 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1974805 2 0.2581 0.6865 0.000 0.860 0.000 0.020 0.000 0.120
#> SRR1974804 1 0.7952 0.1264 0.432 0.080 0.000 0.108 0.144 0.236
#> SRR1974803 1 0.5171 0.4573 0.560 0.000 0.000 0.000 0.336 0.104
#> SRR1974801 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974800 1 0.3088 0.8113 0.832 0.000 0.000 0.000 0.120 0.048
#> SRR1974799 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974798 2 0.0858 0.7369 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1974797 2 0.0717 0.7374 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1974796 2 0.0993 0.7338 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1974795 2 0.1794 0.7207 0.000 0.924 0.000 0.040 0.000 0.036
#> SRR1974793 1 0.3812 0.7871 0.788 0.004 0.000 0.004 0.140 0.064
#> SRR1974794 2 0.3405 0.5594 0.000 0.724 0.000 0.004 0.000 0.272
#> SRR1974792 2 0.0458 0.7367 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974791 2 0.0891 0.7335 0.000 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1974790 2 0.1124 0.7354 0.000 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR1974789 2 0.3133 0.6199 0.000 0.780 0.000 0.008 0.000 0.212
#> SRR1974788 2 0.0692 0.7382 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1974786 1 0.3621 0.7732 0.788 0.004 0.000 0.000 0.160 0.048
#> SRR1974787 1 0.7684 0.2229 0.420 0.052 0.000 0.068 0.236 0.224
#> SRR1974784 2 0.0777 0.7336 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1974783 1 0.0935 0.8611 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1974785 1 0.4382 0.6573 0.692 0.004 0.000 0.004 0.256 0.044
#> SRR1974782 1 0.1528 0.8584 0.936 0.000 0.000 0.000 0.048 0.016
#> SRR1974781 2 0.0717 0.7345 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1974780 1 0.5874 0.5514 0.600 0.032 0.000 0.004 0.216 0.148
#> SRR1974779 1 0.1556 0.8494 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974777 1 0.1500 0.8597 0.936 0.000 0.000 0.000 0.052 0.012
#> SRR1974776 1 0.4976 0.6582 0.680 0.020 0.000 0.004 0.220 0.076
#> SRR1974778 1 0.2030 0.8526 0.908 0.000 0.000 0.000 0.064 0.028
#> SRR1974774 2 0.0935 0.7361 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1974773 1 0.1265 0.8596 0.948 0.000 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1974775 1 0.0000 0.8587 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.1088 0.8617 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1974771 2 0.5775 0.4156 0.084 0.632 0.000 0.024 0.032 0.228
#> SRR1974770 2 0.0520 0.7378 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1974769 2 0.2618 0.6965 0.000 0.860 0.000 0.024 0.000 0.116
#> SRR1974768 2 0.1713 0.7266 0.000 0.928 0.000 0.028 0.000 0.044
#> SRR1974767 1 0.6417 0.3006 0.476 0.028 0.000 0.004 0.308 0.184
#> SRR1974766 2 0.0603 0.7363 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1974765 6 0.4534 0.0753 0.000 0.472 0.000 0.000 0.032 0.496
#> SRR1974764 2 0.0363 0.7378 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974763 1 0.0458 0.8615 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974762 1 0.2046 0.8538 0.908 0.000 0.000 0.000 0.060 0.032
#> SRR1974761 2 0.0405 0.7372 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974760 2 0.0777 0.7336 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1974759 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974758 2 0.2118 0.7097 0.000 0.888 0.000 0.008 0.000 0.104
#> SRR1974757 2 0.0547 0.7359 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974756 1 0.0692 0.8615 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974754 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0508 0.7374 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1974753 4 0.0458 0.8738 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.2255 0.8468 0.892 0.000 0.000 0.000 0.080 0.028
#> SRR1974749 6 0.7775 0.2613 0.288 0.156 0.000 0.008 0.244 0.304
#> SRR1974747 1 0.3845 0.7410 0.772 0.000 0.000 0.000 0.088 0.140
#> SRR1974748 1 0.2446 0.8287 0.864 0.000 0.000 0.000 0.124 0.012
#> SRR1974746 1 0.3481 0.7653 0.804 0.000 0.000 0.000 0.072 0.124
#> SRR1974744 4 0.2513 0.7922 0.000 0.140 0.000 0.852 0.000 0.008
#> SRR1974745 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.4033 0.7384 0.760 0.004 0.000 0.000 0.080 0.156
#> SRR1974740 4 0.2473 0.7946 0.000 0.136 0.000 0.856 0.000 0.008
#> SRR1974739 4 0.0790 0.8702 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974738 6 0.7096 0.4541 0.000 0.196 0.000 0.284 0.100 0.420
#> SRR1974737 4 0.0547 0.8736 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0692 0.8551 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974734 6 0.4869 0.4753 0.000 0.024 0.000 0.020 0.456 0.500
#> SRR1974733 4 0.0458 0.8744 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974732 6 0.7080 0.5948 0.004 0.080 0.000 0.240 0.236 0.440
#> SRR1974731 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.3078 0.7887 0.836 0.000 0.000 0.000 0.056 0.108
#> SRR1974730 1 0.2006 0.8475 0.904 0.000 0.000 0.000 0.080 0.016
#> SRR1974728 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974725 5 0.4088 0.1528 0.008 0.008 0.000 0.000 0.636 0.348
#> SRR1974726 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0692 0.8552 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974727 5 0.4322 0.3199 0.000 0.032 0.000 0.008 0.672 0.288
#> SRR1974723 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.4723 0.6421 0.008 0.192 0.000 0.712 0.012 0.076
#> SRR1974721 4 0.4671 0.6472 0.000 0.160 0.000 0.688 0.000 0.152
#> SRR1974720 6 0.7146 0.6143 0.004 0.092 0.000 0.240 0.224 0.440
#> SRR1974719 1 0.3701 0.7778 0.788 0.000 0.000 0.000 0.112 0.100
#> SRR1974718 1 0.1908 0.8422 0.900 0.000 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1974716 5 0.3126 0.5295 0.000 0.000 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1974717 4 0.0603 0.8736 0.000 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1974715 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.1584 0.8564 0.928 0.000 0.000 0.000 0.064 0.008
#> SRR1974714 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974711 5 0.2039 0.7899 0.016 0.000 0.000 0.004 0.908 0.072
#> SRR1974712 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974709 1 0.0000 0.8587 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 5 0.0363 0.8208 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974710 5 0.0632 0.8162 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974707 5 0.1124 0.8091 0.036 0.000 0.000 0.000 0.956 0.008
#> SRR1974706 1 0.0363 0.8566 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974704 1 0.0363 0.8612 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974705 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 4 0.3563 0.7725 0.000 0.092 0.000 0.800 0.000 0.108
#> SRR1974702 2 0.6452 0.2138 0.192 0.572 0.000 0.004 0.100 0.132
#> SRR1974701 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.3513 0.7543 0.000 0.144 0.000 0.796 0.000 0.060
#> SRR1974698 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0458 0.8553 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974697 5 0.0146 0.8216 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974696 6 0.4910 0.5443 0.000 0.052 0.000 0.004 0.424 0.520
#> SRR1974694 1 0.3845 0.7413 0.772 0.000 0.000 0.000 0.088 0.140
#> SRR1974695 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974693 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0632 0.8722 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.1074 0.7377 0.000 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1974691 1 0.3616 0.7555 0.792 0.000 0.000 0.000 0.076 0.132
#> SRR1974689 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.3667 0.7490 0.788 0.000 0.000 0.000 0.080 0.132
#> SRR1974686 1 0.0260 0.8577 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974685 1 0.3845 0.7466 0.772 0.000 0.000 0.000 0.088 0.140
#> SRR1974684 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974683 1 0.5136 0.6346 0.664 0.008 0.000 0.004 0.144 0.180
#> SRR1974682 4 0.3517 0.7677 0.000 0.096 0.000 0.820 0.012 0.072
#> SRR1974681 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974679 4 0.3118 0.7813 0.000 0.092 0.000 0.836 0.000 0.072
#> SRR1974680 1 0.0146 0.8600 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974678 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.1863 0.8385 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974676 2 0.0891 0.7369 0.000 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1974675 3 0.6213 0.4999 0.000 0.232 0.540 0.004 0.028 0.196
#> SRR1974674 1 0.0291 0.8595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974673 5 0.3878 0.5581 0.000 0.056 0.000 0.004 0.764 0.176
#> SRR1974671 2 0.0935 0.7387 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1974672 4 0.4974 0.5966 0.000 0.192 0.000 0.648 0.000 0.160
#> SRR1974670 4 0.5325 0.5175 0.000 0.212 0.000 0.596 0.000 0.192
#> SRR1974669 2 0.2118 0.7199 0.000 0.888 0.000 0.008 0.000 0.104
#> SRR1974667 2 0.0622 0.7377 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1974668 2 0.0717 0.7380 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1974666 2 0.0777 0.7384 0.000 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1974664 4 0.5462 0.5102 0.000 0.200 0.000 0.592 0.004 0.204
#> SRR1974665 2 0.0692 0.7369 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1974663 1 0.5277 0.3550 0.536 0.012 0.000 0.004 0.388 0.060
#> SRR1974662 1 0.0692 0.8611 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1974661 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974660 1 0.3969 0.6052 0.668 0.000 0.000 0.000 0.312 0.020
#> SRR1974659 1 0.0000 0.8587 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0993 0.8619 0.964 0.000 0.000 0.000 0.024 0.012
#> SRR1974657 5 0.2949 0.7158 0.140 0.000 0.000 0.000 0.832 0.028
#> SRR1974654 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974655 5 0.3808 0.6217 0.228 0.000 0.000 0.000 0.736 0.036
#> SRR1974656 5 0.0000 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974650 5 0.0790 0.8137 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1974651 4 0.0725 0.8723 0.000 0.012 0.000 0.976 0.000 0.012
#> SRR1974652 1 0.5461 0.1747 0.480 0.016 0.000 0.004 0.436 0.064
#> SRR1974653 4 0.0363 0.8748 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974648 5 0.0260 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974646 5 0.4055 0.5432 0.000 0.076 0.000 0.008 0.764 0.152
#> SRR1974649 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974647 4 0.1168 0.8645 0.000 0.016 0.000 0.956 0.000 0.028
#> SRR1974645 1 0.1501 0.8513 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974644 2 0.0717 0.7375 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1974643 1 0.3071 0.7840 0.804 0.000 0.000 0.000 0.180 0.016
#> SRR1974642 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974640 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974641 4 0.3470 0.7521 0.000 0.152 0.000 0.796 0.000 0.052
#> SRR1974639 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974638 1 0.2445 0.8357 0.872 0.000 0.000 0.000 0.108 0.020
#> SRR1974635 1 0.1204 0.8561 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1974636 5 0.0000 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0291 0.8597 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974637 4 0.0993 0.8676 0.000 0.012 0.000 0.964 0.000 0.024
#> SRR1974633 5 0.1151 0.8116 0.032 0.000 0.000 0.000 0.956 0.012
#> SRR1974632 1 0.0291 0.8597 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974631 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974630 1 0.0146 0.8585 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974629 1 0.0260 0.8603 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974628 1 0.1327 0.8549 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974627 1 0.4318 0.2705 0.532 0.000 0.000 0.000 0.448 0.020
#> SRR1974624 1 0.0777 0.8612 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1974625 2 0.3584 0.5160 0.000 0.688 0.000 0.004 0.000 0.308
#> SRR1974623 5 0.0260 0.8214 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974622 5 0.0000 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974620 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974619 5 0.2278 0.7273 0.000 0.004 0.000 0.000 0.868 0.128
#> SRR1974621 1 0.0260 0.8577 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974617 1 0.3265 0.7069 0.748 0.000 0.000 0.000 0.248 0.004
#> SRR1974616 1 0.6961 0.2820 0.516 0.152 0.000 0.012 0.104 0.216
#> SRR1974615 1 0.3189 0.7233 0.760 0.000 0.000 0.000 0.236 0.004
#> SRR1974618 1 0.3049 0.8275 0.844 0.000 0.000 0.004 0.104 0.048
#> SRR1974614 5 0.5068 0.5545 0.240 0.012 0.000 0.004 0.656 0.088
#> SRR1974613 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974612 1 0.2309 0.8426 0.888 0.000 0.000 0.000 0.084 0.028
#> SRR1974611 5 0.1889 0.7819 0.000 0.020 0.000 0.004 0.920 0.056
#> SRR1974610 4 0.2250 0.8391 0.000 0.040 0.000 0.896 0.000 0.064
#> SRR1974609 1 0.2632 0.7969 0.832 0.000 0.000 0.000 0.164 0.004
#> SRR1974608 5 0.1910 0.7406 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1974607 5 0.3912 0.6693 0.164 0.000 0.000 0.000 0.760 0.076
#> SRR1974606 2 0.3412 0.6271 0.000 0.808 0.000 0.128 0.000 0.064
#> SRR1974605 5 0.4253 0.6127 0.072 0.000 0.000 0.004 0.728 0.196
#> SRR1974604 4 0.0717 0.8729 0.000 0.016 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR1974603 5 0.4481 0.6631 0.132 0.012 0.000 0.004 0.744 0.108
#> SRR1974602 1 0.0260 0.8577 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974600 6 0.6049 0.7489 0.000 0.140 0.000 0.032 0.300 0.528
#> SRR1974601 5 0.2265 0.7596 0.000 0.024 0.000 0.004 0.896 0.076
#> SRR1974599 2 0.1858 0.7236 0.000 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR1974598 2 0.1858 0.7164 0.000 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR1974596 2 0.3668 0.4835 0.000 0.668 0.000 0.004 0.000 0.328
#> SRR1974594 6 0.5804 0.7277 0.000 0.124 0.000 0.020 0.328 0.528
#> SRR1974593 6 0.6276 0.7468 0.000 0.172 0.000 0.040 0.268 0.520
#> SRR1974595 2 0.3714 0.4512 0.000 0.656 0.000 0.000 0.004 0.340
#> SRR1974592 2 0.3714 0.4599 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR1974591 2 0.2964 0.6315 0.000 0.792 0.000 0.004 0.000 0.204
#> SRR1974588 6 0.4467 0.3884 0.000 0.020 0.000 0.004 0.480 0.496
#> SRR1974590 6 0.5292 0.0468 0.000 0.452 0.000 0.060 0.016 0.472
#> SRR1974589 6 0.6049 0.7476 0.000 0.132 0.000 0.036 0.300 0.532
#> SRR1974587 6 0.5961 0.7419 0.000 0.132 0.000 0.028 0.312 0.528
#> SRR1974586 6 0.6425 0.7398 0.000 0.128 0.000 0.080 0.260 0.532
#> SRR1974585 6 0.5760 0.7418 0.000 0.148 0.000 0.012 0.304 0.536
#> SRR1974584 5 0.3528 0.5457 0.296 0.000 0.000 0.000 0.700 0.004
#> SRR1974583 6 0.5813 0.5640 0.000 0.312 0.000 0.012 0.152 0.524
#> SRR1974582 2 0.3405 0.5569 0.000 0.724 0.000 0.004 0.000 0.272
#> SRR1974581 2 0.3426 0.5483 0.000 0.720 0.000 0.004 0.000 0.276
#> SRR1974580 6 0.5880 0.7283 0.000 0.200 0.000 0.012 0.248 0.540
#> SRR1974578 6 0.5881 0.7164 0.000 0.108 0.000 0.032 0.332 0.528
#> SRR1974577 6 0.6047 0.7202 0.012 0.168 0.000 0.008 0.280 0.532
#> SRR1974579 6 0.5929 0.7273 0.000 0.116 0.000 0.032 0.324 0.528
#> SRR1974576 6 0.5805 0.7416 0.000 0.176 0.000 0.008 0.288 0.528
#> SRR1974575 2 0.3409 0.5176 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1974574 2 0.3742 0.4325 0.000 0.648 0.000 0.000 0.004 0.348
#> SRR1974573 2 0.4109 0.2637 0.000 0.576 0.000 0.000 0.012 0.412
#> SRR1974571 2 0.3945 0.3568 0.000 0.612 0.000 0.000 0.008 0.380
#> SRR1974572 2 0.4025 0.2618 0.000 0.576 0.000 0.000 0.008 0.416
#> SRR1974570 5 0.4305 0.6650 0.160 0.004 0.000 0.004 0.744 0.088
#> SRR1974568 5 0.0146 0.8216 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974567 5 0.3265 0.6113 0.248 0.000 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR1974566 2 0.4046 0.3845 0.000 0.620 0.000 0.004 0.008 0.368
#> SRR1974569 2 0.3833 0.4319 0.000 0.648 0.000 0.000 0.008 0.344
#> SRR1974565 6 0.5400 0.6439 0.000 0.084 0.000 0.012 0.380 0.524
#> SRR1974564 2 0.3565 0.5104 0.000 0.692 0.000 0.004 0.000 0.304
#> SRR1974560 5 0.0146 0.8216 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974559 5 0.0000 0.8217 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974563 6 0.5216 0.3310 0.000 0.400 0.000 0.008 0.072 0.520
#> SRR1974562 2 0.3699 0.4547 0.000 0.660 0.000 0.000 0.004 0.336
#> SRR1974561 2 0.3795 0.4034 0.000 0.632 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR1974557 6 0.6822 0.2491 0.000 0.312 0.000 0.320 0.040 0.328
#> SRR1974553 2 0.4067 0.1797 0.000 0.548 0.000 0.000 0.008 0.444
#> SRR1974555 5 0.3756 0.4012 0.352 0.000 0.000 0.000 0.644 0.004
#> SRR1974551 5 0.2263 0.7890 0.048 0.000 0.000 0.000 0.896 0.056
#> SRR1974552 2 0.4322 0.0840 0.000 0.512 0.000 0.008 0.008 0.472
#> SRR1974554 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974558 5 0.0713 0.8140 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1974556 5 0.3133 0.6537 0.212 0.000 0.000 0.000 0.780 0.008
#> SRR1974550 5 0.0146 0.8209 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974549 2 0.3756 0.4238 0.000 0.644 0.000 0.000 0.004 0.352
#> SRR1974548 6 0.6001 0.7465 0.000 0.132 0.000 0.032 0.304 0.532
#> SRR1974547 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974546 5 0.0260 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974545 2 0.3861 0.4201 0.000 0.640 0.000 0.000 0.008 0.352
#> SRR1974544 5 0.3071 0.6861 0.180 0.000 0.000 0.000 0.804 0.016
#> SRR1974543 2 0.4144 0.2869 0.000 0.580 0.000 0.004 0.008 0.408
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 4844 rows and 461 columns.
#> Top rows (484, 968, 1453, 1938, 2422) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.659 0.869 0.934 0.4821 0.520 0.520
#> 3 3 0.945 0.938 0.973 0.3780 0.715 0.501
#> 4 4 0.928 0.909 0.952 0.0943 0.915 0.756
#> 5 5 0.917 0.876 0.936 0.0491 0.938 0.784
#> 6 6 0.838 0.720 0.863 0.0470 0.961 0.841
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 3 4
There is also optional best \(k\) = 3 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1975007 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975008 2 0.2603 0.9283 0.044 0.956
#> SRR1975006 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975005 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975004 2 0.3114 0.9188 0.056 0.944
#> SRR1975003 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975001 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975002 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974999 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1975000 2 0.5737 0.8376 0.136 0.864
#> SRR1974998 2 0.0938 0.9480 0.012 0.988
#> SRR1974997 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974995 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974996 2 0.1414 0.9439 0.020 0.980
#> SRR1974994 2 0.3274 0.9155 0.060 0.940
#> SRR1974993 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974992 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974990 2 0.0938 0.9480 0.012 0.988
#> SRR1974989 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974991 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974986 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974987 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974988 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974984 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974985 2 0.1843 0.9393 0.028 0.972
#> SRR1974983 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974982 2 0.2236 0.9341 0.036 0.964
#> SRR1974981 2 0.3879 0.9012 0.076 0.924
#> SRR1974980 2 0.2236 0.9341 0.036 0.964
#> SRR1974979 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974978 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974977 2 0.1184 0.9461 0.016 0.984
#> SRR1974976 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974975 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974974 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974973 2 0.4815 0.8729 0.104 0.896
#> SRR1974972 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974971 2 0.2043 0.9368 0.032 0.968
#> SRR1974970 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974969 2 0.3114 0.9190 0.056 0.944
#> SRR1974968 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974967 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974965 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974966 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974964 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974963 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974961 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974962 2 0.2043 0.9369 0.032 0.968
#> SRR1974960 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974959 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974958 2 0.2948 0.9220 0.052 0.948
#> SRR1974957 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974956 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974955 2 0.1414 0.9440 0.020 0.980
#> SRR1974954 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974953 2 0.5737 0.8381 0.136 0.864
#> SRR1974952 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974949 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974950 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974951 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974947 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974948 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974946 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974945 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974944 2 0.3584 0.9085 0.068 0.932
#> SRR1974942 2 0.4022 0.8977 0.080 0.920
#> SRR1974943 2 0.4161 0.8936 0.084 0.916
#> SRR1974941 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974940 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974939 2 0.2603 0.9282 0.044 0.956
#> SRR1974938 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974937 2 0.4431 0.8855 0.092 0.908
#> SRR1974936 2 0.3879 0.9012 0.076 0.924
#> SRR1974935 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974934 2 0.1184 0.9460 0.016 0.984
#> SRR1974933 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974932 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974931 2 0.4815 0.8730 0.104 0.896
#> SRR1974930 2 0.3274 0.9155 0.060 0.940
#> SRR1974929 2 0.1414 0.9439 0.020 0.980
#> SRR1974928 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974927 2 0.1184 0.9461 0.016 0.984
#> SRR1974924 2 0.5737 0.8375 0.136 0.864
#> SRR1974925 2 0.0938 0.9479 0.012 0.988
#> SRR1974926 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974923 2 0.5408 0.8514 0.124 0.876
#> SRR1974922 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974921 2 0.1633 0.9418 0.024 0.976
#> SRR1974920 2 0.3274 0.9155 0.060 0.940
#> SRR1974919 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974918 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974917 2 0.4298 0.8895 0.088 0.912
#> SRR1974916 2 0.1184 0.9460 0.016 0.984
#> SRR1974915 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974914 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974913 2 0.1633 0.9417 0.024 0.976
#> SRR1974911 2 0.4161 0.8937 0.084 0.916
#> SRR1974910 2 0.2236 0.9341 0.036 0.964
#> SRR1974908 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974909 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974906 2 0.2423 0.9312 0.040 0.960
#> SRR1974907 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974905 2 0.1843 0.9393 0.028 0.972
#> SRR1974904 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974903 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974902 2 0.1843 0.9393 0.028 0.972
#> SRR1974901 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974898 2 0.1184 0.9461 0.016 0.984
#> SRR1974900 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974899 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974897 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974896 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974893 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974895 2 0.0376 0.9507 0.004 0.996
#> SRR1974894 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974892 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974890 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974891 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974889 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974888 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974887 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974885 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974883 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974884 2 0.0672 0.9495 0.008 0.992
#> SRR1974881 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974882 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974880 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974879 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974877 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974876 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974878 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974875 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974874 1 0.5178 0.8614 0.884 0.116
#> SRR1974873 1 0.9460 0.5529 0.636 0.364
#> SRR1974871 1 0.5294 0.8589 0.880 0.120
#> SRR1974872 2 0.9833 0.3007 0.424 0.576
#> SRR1974869 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974870 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974865 1 0.5519 0.8541 0.872 0.128
#> SRR1974864 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974862 1 0.8555 0.6983 0.720 0.280
#> SRR1974863 1 0.3733 0.8850 0.928 0.072
#> SRR1974860 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974861 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974859 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974858 1 0.2423 0.9002 0.960 0.040
#> SRR1974856 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974857 1 0.4815 0.8683 0.896 0.104
#> SRR1974855 2 0.6712 0.7580 0.176 0.824
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974851 1 0.7453 0.7867 0.788 0.212
#> SRR1974852 1 0.9710 0.4742 0.600 0.400
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974850 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974846 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974847 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.7056 0.7324 0.192 0.808
#> SRR1974844 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974840 1 0.7056 0.8059 0.808 0.192
#> SRR1974839 2 0.9358 0.3771 0.352 0.648
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974836 1 0.9552 0.5281 0.624 0.376
#> SRR1974834 1 0.9909 0.3584 0.556 0.444
#> SRR1974833 2 0.3733 0.8924 0.072 0.928
#> SRR1974831 1 0.9393 0.5687 0.644 0.356
#> SRR1974832 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974826 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974827 2 0.8443 0.5800 0.272 0.728
#> SRR1974824 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974816 1 0.7299 0.7950 0.796 0.204
#> SRR1974815 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974814 1 0.6973 0.8094 0.812 0.188
#> SRR1974812 1 0.6973 0.8096 0.812 0.188
#> SRR1974810 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.0376 0.9128 0.996 0.004
#> SRR1974807 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974805 1 0.9661 0.4927 0.608 0.392
#> SRR1974804 1 0.7219 0.7989 0.800 0.200
#> SRR1974803 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974797 2 0.6343 0.7823 0.160 0.840
#> SRR1974796 2 0.8144 0.6224 0.252 0.748
#> SRR1974795 2 0.6343 0.7822 0.160 0.840
#> SRR1974793 1 0.9209 0.6103 0.664 0.336
#> SRR1974794 2 0.9933 0.0157 0.452 0.548
#> SRR1974792 2 0.2043 0.9295 0.032 0.968
#> SRR1974791 2 0.2043 0.9295 0.032 0.968
#> SRR1974790 2 0.8144 0.6227 0.252 0.748
#> SRR1974789 2 0.5408 0.8328 0.124 0.876
#> SRR1974788 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974786 1 0.4022 0.8575 0.920 0.080
#> SRR1974787 1 0.1633 0.9072 0.976 0.024
#> SRR1974784 2 0.5946 0.8050 0.144 0.856
#> SRR1974783 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.5059 0.8468 0.112 0.888
#> SRR1974780 1 0.2423 0.8999 0.960 0.040
#> SRR1974779 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.2423 0.8941 0.960 0.040
#> SRR1974774 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974773 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974771 1 0.9983 0.2593 0.524 0.476
#> SRR1974770 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974769 1 0.9909 0.3584 0.556 0.444
#> SRR1974768 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974765 1 0.7745 0.7683 0.772 0.228
#> SRR1974764 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0672 0.9107 0.992 0.008
#> SRR1974761 2 0.0376 0.9488 0.004 0.996
#> SRR1974760 2 0.5519 0.8265 0.128 0.872
#> SRR1974759 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.0938 0.9444 0.012 0.988
#> SRR1974757 2 0.7815 0.6617 0.232 0.768
#> SRR1974756 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974754 1 0.7299 0.7950 0.796 0.204
#> SRR1974755 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974753 1 0.8499 0.7042 0.724 0.276
#> SRR1974751 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974750 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974752 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.2948 0.8949 0.948 0.052
#> SRR1974747 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974744 1 0.7299 0.7950 0.796 0.204
#> SRR1974745 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974743 1 0.7219 0.7989 0.800 0.200
#> SRR1974742 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974740 1 0.5737 0.8489 0.864 0.136
#> SRR1974739 1 0.7219 0.7990 0.800 0.200
#> SRR1974741 1 0.6247 0.8348 0.844 0.156
#> SRR1974738 1 0.6438 0.8287 0.836 0.164
#> SRR1974737 1 0.7602 0.7776 0.780 0.220
#> SRR1974736 1 0.7299 0.7951 0.796 0.204
#> SRR1974735 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974733 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974732 1 0.1414 0.9079 0.980 0.020
#> SRR1974731 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974729 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974728 1 0.5629 0.8515 0.868 0.132
#> SRR1974725 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974726 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974724 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974723 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974722 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974721 1 0.2948 0.8949 0.948 0.052
#> SRR1974720 1 0.1414 0.9081 0.980 0.020
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974717 1 0.5294 0.8589 0.880 0.120
#> SRR1974715 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974713 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974703 1 0.7528 0.7822 0.784 0.216
#> SRR1974702 2 0.9635 0.3718 0.388 0.612
#> SRR1974701 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974699 1 0.4298 0.8769 0.912 0.088
#> SRR1974698 1 0.6343 0.8318 0.840 0.160
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974696 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974693 1 0.7299 0.7952 0.796 0.204
#> SRR1974692 1 0.6887 0.8127 0.816 0.184
#> SRR1974690 2 0.9963 -0.0375 0.464 0.536
#> SRR1974691 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974689 1 0.5737 0.8488 0.864 0.136
#> SRR1974688 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.0672 0.9122 0.992 0.008
#> SRR1974682 1 0.5178 0.8614 0.884 0.116
#> SRR1974681 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974679 1 0.5178 0.8614 0.884 0.116
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974678 1 0.7219 0.7988 0.800 0.200
#> SRR1974677 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974675 2 0.3274 0.9170 0.060 0.940
#> SRR1974674 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974672 1 0.4690 0.8705 0.900 0.100
#> SRR1974670 1 0.5737 0.8490 0.864 0.136
#> SRR1974669 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974667 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974668 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974666 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974664 1 0.2423 0.9000 0.960 0.040
#> SRR1974665 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974663 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974651 1 0.7056 0.8059 0.808 0.192
#> SRR1974652 1 0.0376 0.9135 0.996 0.004
#> SRR1974653 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974648 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974647 1 0.7376 0.7910 0.792 0.208
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974643 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974641 1 0.7453 0.7867 0.788 0.212
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974637 1 0.8081 0.7431 0.752 0.248
#> SRR1974633 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974625 1 0.7376 0.7918 0.792 0.208
#> SRR1974623 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974616 1 0.7299 0.7956 0.796 0.204
#> SRR1974615 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.5178 0.8604 0.884 0.116
#> SRR1974614 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0672 0.9124 0.992 0.008
#> SRR1974611 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974610 1 0.5519 0.8541 0.872 0.128
#> SRR1974609 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.5059 0.8483 0.112 0.888
#> SRR1974605 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974604 1 0.9000 0.6412 0.684 0.316
#> SRR1974603 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974600 1 0.1184 0.9098 0.984 0.016
#> SRR1974601 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974598 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974596 2 0.9815 0.1763 0.420 0.580
#> SRR1974594 1 0.2423 0.9006 0.960 0.040
#> SRR1974593 1 0.2043 0.9042 0.968 0.032
#> SRR1974595 1 0.9922 0.3470 0.552 0.448
#> SRR1974592 1 0.9988 0.2456 0.520 0.480
#> SRR1974591 2 0.0000 0.9500 0.000 1.000
#> SRR1974588 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974590 1 0.5946 0.8442 0.856 0.144
#> SRR1974589 1 0.3431 0.8898 0.936 0.064
#> SRR1974587 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974586 1 0.0376 0.9131 0.996 0.004
#> SRR1974585 1 0.5519 0.8552 0.872 0.128
#> SRR1974584 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974583 1 0.1414 0.9085 0.980 0.020
#> SRR1974582 2 0.0672 0.9468 0.008 0.992
#> SRR1974581 2 0.1184 0.9418 0.016 0.984
#> SRR1974580 1 0.3431 0.8898 0.936 0.064
#> SRR1974578 1 0.2423 0.9003 0.960 0.040
#> SRR1974577 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974579 1 0.3274 0.8919 0.940 0.060
#> SRR1974576 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974575 2 0.9427 0.3527 0.360 0.640
#> SRR1974574 1 0.9710 0.4742 0.600 0.400
#> SRR1974573 1 0.9608 0.5107 0.616 0.384
#> SRR1974571 1 0.9686 0.4835 0.604 0.396
#> SRR1974572 1 0.9427 0.5609 0.640 0.360
#> SRR1974570 1 0.0938 0.9113 0.988 0.012
#> SRR1974568 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974566 1 0.9608 0.5107 0.616 0.384
#> SRR1974569 1 0.9710 0.4742 0.600 0.400
#> SRR1974565 1 0.3584 0.8876 0.932 0.068
#> SRR1974564 1 0.9775 0.4449 0.588 0.412
#> SRR1974560 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974563 1 0.9248 0.5989 0.660 0.340
#> SRR1974562 1 0.9775 0.4448 0.588 0.412
#> SRR1974561 1 0.9754 0.4548 0.592 0.408
#> SRR1974557 1 0.5059 0.8640 0.888 0.112
#> SRR1974553 1 0.8081 0.7433 0.752 0.248
#> SRR1974555 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974552 1 0.7602 0.7787 0.780 0.220
#> SRR1974554 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974549 1 0.9732 0.4646 0.596 0.404
#> SRR1974548 1 0.0376 0.9131 0.996 0.004
#> SRR1974547 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974545 1 0.9491 0.5448 0.632 0.368
#> SRR1974544 1 0.0000 0.9148 1.000 0.000
#> SRR1974543 1 0.9580 0.5195 0.620 0.380
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1975007 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974997 3 0.0747 0.964 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974995 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974994 3 0.2165 0.914 0.064 0.000 0.936
#> SRR1974993 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974989 2 0.4235 0.782 0.000 0.824 0.176
#> SRR1974991 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974953 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974948 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974942 3 0.1289 0.947 0.032 0.000 0.968
#> SRR1974943 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974924 3 0.2066 0.918 0.060 0.000 0.940
#> SRR1974925 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974914 3 0.4555 0.750 0.000 0.200 0.800
#> SRR1974913 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974900 3 0.4887 0.707 0.000 0.228 0.772
#> SRR1974899 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974896 3 0.0424 0.971 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974893 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974894 3 0.4346 0.773 0.000 0.184 0.816
#> SRR1974892 3 0.3412 0.852 0.000 0.124 0.876
#> SRR1974890 3 0.1411 0.946 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974891 3 0.0424 0.971 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974889 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974888 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974886 2 0.0892 0.947 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974887 2 0.2711 0.887 0.000 0.912 0.088
#> SRR1974885 3 0.1860 0.931 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974883 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974881 3 0.4605 0.744 0.000 0.204 0.796
#> SRR1974882 3 0.3551 0.842 0.000 0.132 0.868
#> SRR1974880 3 0.5760 0.507 0.000 0.328 0.672
#> SRR1974879 3 0.0747 0.964 0.000 0.016 0.984
#> SRR1974877 3 0.0424 0.971 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974876 3 0.5882 0.467 0.000 0.348 0.652
#> SRR1974878 3 0.0424 0.971 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974875 3 0.3116 0.871 0.000 0.108 0.892
#> SRR1974874 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974871 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 1 0.5529 0.581 0.704 0.000 0.296
#> SRR1974869 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.2959 0.874 0.000 0.900 0.100
#> SRR1974870 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 3 0.5859 0.476 0.000 0.344 0.656
#> SRR1974861 2 0.5810 0.510 0.000 0.664 0.336
#> SRR1974859 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 2 0.1753 0.921 0.048 0.952 0.000
#> SRR1974856 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974854 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974852 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974849 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974846 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974844 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974839 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974838 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974834 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974833 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974831 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974832 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 1 0.4178 0.785 0.828 0.172 0.000
#> SRR1974828 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 1 0.0237 0.976 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974827 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974824 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 2 0.6113 0.564 0.300 0.688 0.012
#> SRR1974815 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974812 2 0.0747 0.948 0.016 0.984 0.000
#> SRR1974810 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974808 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974809 1 0.1031 0.958 0.976 0.024 0.000
#> SRR1974807 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974804 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974803 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.5431 0.610 0.000 0.716 0.284
#> SRR1974797 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974796 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974795 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974793 1 0.7459 0.331 0.584 0.372 0.044
#> SRR1974794 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974792 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974791 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974790 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974789 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974788 2 0.6291 0.127 0.000 0.532 0.468
#> SRR1974786 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.4750 0.718 0.784 0.216 0.000
#> SRR1974784 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974783 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974780 1 0.1753 0.934 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974779 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0237 0.976 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974776 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974778 1 0.0592 0.969 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974774 2 0.5327 0.633 0.000 0.728 0.272
#> SRR1974773 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974770 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974769 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974768 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974767 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974766 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974765 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974764 2 0.3752 0.825 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974763 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974760 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974759 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.1529 0.932 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974757 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974756 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0592 0.952 0.000 0.988 0.012
#> SRR1974753 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.4291 0.773 0.820 0.180 0.000
#> SRR1974747 1 0.0424 0.973 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974748 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 1 0.1643 0.939 0.956 0.044 0.000
#> SRR1974740 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974733 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 2 0.0424 0.953 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974731 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974728 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974726 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974723 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974721 2 0.0237 0.956 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974720 2 0.1411 0.931 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974717 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 3 0.8822 0.333 0.136 0.324 0.540
#> SRR1974701 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 1 0.5098 0.667 0.752 0.248 0.000
#> SRR1974694 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974695 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974693 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974691 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 2 0.6008 0.410 0.372 0.628 0.000
#> SRR1974682 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.1529 0.931 0.000 0.960 0.040
#> SRR1974675 3 0.0000 0.977 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974671 2 0.6252 0.212 0.000 0.556 0.444
#> SRR1974672 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 2 0.3752 0.825 0.000 0.856 0.144
#> SRR1974667 2 0.1964 0.917 0.000 0.944 0.056
#> SRR1974668 2 0.2796 0.883 0.000 0.908 0.092
#> SRR1974666 2 0.4887 0.708 0.000 0.772 0.228
#> SRR1974664 2 0.1643 0.924 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974665 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974663 1 0.0747 0.965 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974662 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974653 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974643 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974641 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974635 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.6148 0.753 0.076 0.776 0.148
#> SRR1974623 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974621 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.5926 0.455 0.356 0.644 0.000
#> SRR1974615 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 1 0.4796 0.713 0.780 0.220 0.000
#> SRR1974614 1 0.0237 0.976 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974613 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974611 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974605 1 0.0592 0.969 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974604 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974602 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 2 0.3551 0.837 0.132 0.868 0.000
#> SRR1974601 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.2356 0.904 0.000 0.928 0.072
#> SRR1974598 2 0.4654 0.740 0.000 0.792 0.208
#> SRR1974596 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974594 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974593 2 0.5785 0.504 0.332 0.668 0.000
#> SRR1974595 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974592 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974591 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974588 1 0.5591 0.563 0.696 0.304 0.000
#> SRR1974590 2 0.0237 0.956 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974589 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974587 1 0.6008 0.408 0.628 0.372 0.000
#> SRR1974586 2 0.4235 0.778 0.176 0.824 0.000
#> SRR1974585 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974584 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974583 2 0.5098 0.669 0.248 0.752 0.000
#> SRR1974582 2 0.0424 0.955 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974581 2 0.0892 0.947 0.000 0.980 0.020
#> SRR1974580 2 0.0892 0.945 0.020 0.980 0.000
#> SRR1974578 2 0.2711 0.882 0.088 0.912 0.000
#> SRR1974577 1 0.5882 0.466 0.652 0.348 0.000
#> SRR1974579 2 0.1411 0.931 0.036 0.964 0.000
#> SRR1974576 1 0.6252 0.200 0.556 0.444 0.000
#> SRR1974575 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974574 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974573 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974571 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974572 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974570 1 0.1399 0.952 0.968 0.028 0.004
#> SRR1974568 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974567 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974566 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974569 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974565 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974564 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974560 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974559 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974563 2 0.0000 0.958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974562 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974561 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974557 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974553 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974555 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974551 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974552 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974554 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974558 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974556 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974548 2 0.4452 0.759 0.192 0.808 0.000
#> SRR1974547 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974546 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974545 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974544 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974543 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1975007 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.1004 0.96608 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1974995 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.0817 0.96194 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974989 2 0.5325 0.71958 0.000 0.744 0.096 0.160
#> SRR1974991 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0469 0.97878 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0336 0.98252 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1974946 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974932 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974916 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.4686 0.75820 0.000 0.144 0.788 0.068
#> SRR1974913 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.4188 0.79126 0.000 0.040 0.812 0.148
#> SRR1974899 3 0.0188 0.98561 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.3074 0.82796 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1974893 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.4137 0.74358 0.000 0.208 0.780 0.012
#> SRR1974892 3 0.2053 0.92117 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR1974890 3 0.2773 0.86896 0.000 0.116 0.880 0.004
#> SRR1974891 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0188 0.98561 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974886 4 0.7710 0.12430 0.000 0.224 0.368 0.408
#> SRR1974887 2 0.4224 0.80252 0.000 0.824 0.076 0.100
#> SRR1974885 3 0.0188 0.98561 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1974883 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.6277 0.06939 0.000 0.476 0.468 0.056
#> SRR1974882 3 0.2623 0.90497 0.000 0.064 0.908 0.028
#> SRR1974880 3 0.3245 0.88011 0.000 0.064 0.880 0.056
#> SRR1974879 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0469 0.97869 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1974876 2 0.6050 0.19309 0.000 0.524 0.432 0.044
#> SRR1974878 3 0.1302 0.95157 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1974875 3 0.3498 0.80724 0.000 0.160 0.832 0.008
#> SRR1974874 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974873 4 0.1557 0.87319 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1974871 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974872 1 0.4852 0.74172 0.776 0.152 0.072 0.000
#> SRR1974869 1 0.0336 0.97020 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974868 2 0.1940 0.86568 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974870 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974866 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974867 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974865 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974864 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0188 0.91877 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974863 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974860 2 0.2281 0.85529 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974861 2 0.2730 0.85588 0.000 0.896 0.016 0.088
#> SRR1974859 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974858 4 0.0524 0.91334 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1974856 4 0.0188 0.91821 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974857 4 0.0188 0.91871 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974855 2 0.5352 0.40787 0.000 0.596 0.016 0.388
#> SRR1974854 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.2760 0.86396 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1974852 2 0.1474 0.87968 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974849 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0188 0.91824 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974846 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974847 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974845 2 0.1118 0.87705 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974844 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974843 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974842 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974841 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974840 4 0.0336 0.91594 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974839 2 0.1940 0.87575 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974838 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974835 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.1302 0.87873 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974834 2 0.1302 0.87752 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974833 2 0.1637 0.87334 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1974831 2 0.1867 0.87955 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974832 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974830 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 2 0.5678 0.52405 0.316 0.640 0.000 0.044
#> SRR1974828 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974826 1 0.4204 0.74251 0.788 0.020 0.000 0.192
#> SRR1974827 2 0.1867 0.86741 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974824 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974825 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974823 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974820 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974818 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974817 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 4 0.7583 0.24101 0.280 0.240 0.000 0.480
#> SRR1974815 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974813 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974814 4 0.1792 0.86131 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1974812 2 0.2676 0.85407 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR1974810 1 0.0188 0.97192 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974808 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974811 1 0.0707 0.96080 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974809 1 0.1743 0.92862 0.940 0.056 0.000 0.004
#> SRR1974807 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974805 2 0.1867 0.87661 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974804 4 0.0817 0.90538 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1974803 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974801 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974800 1 0.0188 0.97210 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974799 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 2 0.1302 0.87721 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974797 2 0.1792 0.87593 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974796 2 0.1118 0.87721 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974795 2 0.0817 0.87471 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1974793 2 0.6766 0.33145 0.380 0.520 0.000 0.100
#> SRR1974794 2 0.2149 0.87082 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974792 2 0.1118 0.87703 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1974791 2 0.1302 0.87824 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974790 2 0.1557 0.87756 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974789 2 0.3172 0.84476 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1974788 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974786 1 0.0921 0.95436 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1974787 1 0.4086 0.71480 0.776 0.008 0.000 0.216
#> SRR1974784 2 0.1557 0.88030 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1974783 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974782 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974781 2 0.1211 0.87821 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974780 1 0.1042 0.95742 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR1974779 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0188 0.97197 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.1174 0.95410 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR1974778 1 0.2466 0.88314 0.900 0.096 0.004 0.000
#> SRR1974774 2 0.1474 0.87240 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1974773 1 0.0469 0.96735 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1974775 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974772 1 0.0707 0.96137 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1974771 2 0.1211 0.87553 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1974770 2 0.2011 0.86705 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974769 2 0.1867 0.87511 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974768 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974767 1 0.0188 0.97192 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974766 2 0.2011 0.86416 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974765 2 0.1940 0.86980 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974764 2 0.1792 0.87691 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1974763 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.0817 0.95855 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974761 2 0.1302 0.87675 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1974760 2 0.0921 0.87427 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1974759 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974758 2 0.2149 0.85975 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974757 2 0.1389 0.87621 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1974756 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974755 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974753 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974752 1 0.1716 0.92425 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1974749 1 0.4203 0.80634 0.824 0.068 0.000 0.108
#> SRR1974747 1 0.0336 0.96967 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974748 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974746 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974742 1 0.2596 0.89849 0.908 0.024 0.000 0.068
#> SRR1974740 4 0.0188 0.91865 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974739 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974735 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974734 4 0.4456 0.59158 0.280 0.004 0.000 0.716
#> SRR1974733 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974732 4 0.0188 0.91822 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974731 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974729 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974730 1 0.0376 0.97004 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974728 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974725 1 0.3945 0.71297 0.780 0.004 0.000 0.216
#> SRR1974726 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974724 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974727 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974722 4 0.1302 0.88586 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1974721 4 0.0376 0.91628 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1974720 4 0.0895 0.90210 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1974719 1 0.0188 0.97192 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974718 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974716 1 0.0336 0.97020 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974717 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974713 1 0.0188 0.97197 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974714 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974711 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974712 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974709 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974708 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974710 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974707 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974706 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974705 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974703 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974702 2 0.4155 0.80361 0.080 0.836 0.004 0.080
#> SRR1974701 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974696 4 0.4888 0.32604 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1974694 1 0.0469 0.96689 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974695 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974690 2 0.2589 0.86021 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1974691 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974685 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.5203 0.26866 0.576 0.008 0.000 0.416
#> SRR1974682 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974681 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974677 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974676 2 0.2149 0.87081 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974675 3 0.0000 0.98863 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974673 1 0.0672 0.96554 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1974671 2 0.2011 0.86524 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974672 4 0.0188 0.91865 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974670 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974669 2 0.1004 0.87327 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1974667 2 0.1867 0.86741 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974668 2 0.2149 0.86018 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1974666 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974664 4 0.0188 0.91865 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1974665 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974663 1 0.0336 0.96956 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974662 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974661 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974660 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974659 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974658 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974657 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974654 1 0.0188 0.97200 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974655 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974656 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974650 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974651 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974652 1 0.1722 0.93056 0.944 0.008 0.000 0.048
#> SRR1974653 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974648 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974646 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974649 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974647 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 2 0.1940 0.87164 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974643 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974642 1 0.0336 0.97020 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974640 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974641 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0188 0.97195 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974635 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.0336 0.97020 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1974634 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974637 4 0.0336 0.91520 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1974633 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974632 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974631 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974630 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974628 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974624 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.8329 0.39876 0.076 0.508 0.120 0.296
#> SRR1974623 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974622 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974620 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974619 1 0.0376 0.97051 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974621 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974617 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974616 2 0.2345 0.85249 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974615 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974618 2 0.6755 0.12202 0.448 0.460 0.000 0.092
#> SRR1974614 1 0.0188 0.97197 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974613 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974612 1 0.3320 0.86856 0.876 0.068 0.000 0.056
#> SRR1974611 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974610 4 0.0000 0.92099 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1974609 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974608 1 0.0188 0.97220 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1974607 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974606 4 0.4989 0.00741 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1974605 1 0.0779 0.96239 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1974604 4 0.0469 0.91309 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1974603 1 0.0376 0.97052 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1974602 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974600 4 0.2530 0.84223 0.004 0.100 0.000 0.896
#> SRR1974601 1 0.0000 0.97390 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974599 2 0.1004 0.87496 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1974598 2 0.0779 0.87208 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1974596 2 0.2647 0.83937 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1974594 4 0.5926 0.48938 0.060 0.308 0.000 0.632
#> SRR1974593 4 0.2530 0.84199 0.004 0.100 0.000 0.896
#> SRR1974595 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974592 2 0.2281 0.85892 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1974591 2 0.1867 0.87107 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974588 1 0.6248 0.49441 0.640 0.100 0.000 0.260
#> SRR1974590 4 0.2760 0.82251 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1974589 4 0.3024 0.80285 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1974587 4 0.6690 0.39029 0.352 0.100 0.000 0.548
#> SRR1974586 4 0.2742 0.84908 0.024 0.076 0.000 0.900
#> SRR1974585 2 0.4576 0.65256 0.012 0.728 0.000 0.260
#> SRR1974584 1 0.1610 0.94138 0.952 0.032 0.000 0.016
#> SRR1974583 4 0.6862 0.42073 0.312 0.128 0.000 0.560
#> SRR1974582 2 0.2345 0.85552 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1974581 2 0.1978 0.87593 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1974580 2 0.5237 0.44922 0.016 0.628 0.000 0.356
#> SRR1974578 4 0.4727 0.74281 0.108 0.100 0.000 0.792
#> SRR1974577 2 0.6462 0.42875 0.332 0.580 0.000 0.088
#> SRR1974579 4 0.4456 0.60569 0.004 0.280 0.000 0.716
#> SRR1974576 1 0.7125 0.01971 0.476 0.132 0.000 0.392
#> SRR1974575 2 0.2216 0.86113 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1974574 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974573 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974571 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974572 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974570 2 0.5113 0.59468 0.252 0.712 0.000 0.036
#> SRR1974568 1 0.3216 0.87186 0.880 0.076 0.000 0.044
#> SRR1974567 1 0.3464 0.85821 0.868 0.076 0.000 0.056
#> SRR1974566 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974569 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974565 2 0.5312 0.60987 0.040 0.692 0.000 0.268
#> SRR1974564 2 0.1867 0.87092 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974560 1 0.1042 0.95706 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1974559 1 0.2060 0.92429 0.932 0.052 0.000 0.016
#> SRR1974563 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974562 2 0.1867 0.87092 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1974561 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974557 4 0.2408 0.84088 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1974553 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974555 1 0.2402 0.90522 0.912 0.076 0.000 0.012
#> SRR1974551 1 0.4335 0.76549 0.796 0.168 0.000 0.036
#> SRR1974552 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974554 1 0.1388 0.94782 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1974558 1 0.1798 0.93473 0.944 0.040 0.000 0.016
#> SRR1974556 1 0.0817 0.96006 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1974550 1 0.0592 0.96536 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1974549 2 0.2011 0.86825 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1974548 4 0.4424 0.76706 0.088 0.100 0.000 0.812
#> SRR1974547 1 0.2450 0.90544 0.912 0.072 0.000 0.016
#> SRR1974546 1 0.1888 0.93162 0.940 0.044 0.000 0.016
#> SRR1974545 2 0.1940 0.86980 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1974544 1 0.3697 0.83999 0.852 0.100 0.000 0.048
#> SRR1974543 2 0.2081 0.86612 0.000 0.916 0.000 0.084
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1975007 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975008 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975006 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975002 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974999 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1975000 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974998 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974997 3 0.1831 0.9063 0.000 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR1974995 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974994 3 0.3632 0.6980 0.176 0.004 0.800 0.000 0.020
#> SRR1974993 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974989 5 0.1498 0.7622 0.000 0.016 0.024 0.008 0.952
#> SRR1974991 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974983 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974981 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974980 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974979 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974977 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974965 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974966 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974958 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0510 0.9639 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0290 0.9719 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974946 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974944 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974942 3 0.0162 0.9744 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974943 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974936 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974935 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974933 3 0.0162 0.9748 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974932 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974931 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974930 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974929 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974928 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974927 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974924 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974925 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974926 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974923 3 0.0290 0.9713 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974920 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974919 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.0579 0.9634 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1974916 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.4037 0.5954 0.000 0.004 0.704 0.004 0.288
#> SRR1974913 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974911 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974910 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974906 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974904 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.3523 0.8260 0.000 0.008 0.844 0.076 0.072
#> SRR1974899 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.3477 0.8027 0.000 0.056 0.832 0.000 0.112
#> SRR1974893 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.4266 0.7193 0.000 0.104 0.776 0.000 0.120
#> SRR1974892 3 0.2881 0.8394 0.000 0.012 0.860 0.004 0.124
#> SRR1974890 3 0.1764 0.9140 0.000 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR1974891 3 0.0290 0.9719 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1974889 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0404 0.9687 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1974886 3 0.6956 0.3862 0.000 0.100 0.588 0.176 0.136
#> SRR1974887 5 0.3937 0.6996 0.000 0.072 0.116 0.004 0.808
#> SRR1974885 3 0.0451 0.9686 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1974883 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 3 0.5790 0.0491 0.000 0.092 0.500 0.000 0.408
#> SRR1974882 3 0.2513 0.8579 0.000 0.008 0.876 0.000 0.116
#> SRR1974880 3 0.3124 0.8561 0.000 0.056 0.872 0.012 0.060
#> SRR1974879 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974877 3 0.0162 0.9748 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1974876 5 0.4972 0.4014 0.000 0.032 0.352 0.004 0.612
#> SRR1974878 3 0.1670 0.9226 0.000 0.012 0.936 0.000 0.052
#> SRR1974875 3 0.2707 0.8361 0.000 0.008 0.860 0.000 0.132
#> SRR1974874 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974873 4 0.1965 0.8691 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1974871 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974872 5 0.3534 0.5790 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1974869 1 0.1872 0.9179 0.928 0.052 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974868 5 0.3143 0.7189 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1974870 1 0.1117 0.9373 0.964 0.016 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974866 1 0.1568 0.9280 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974867 1 0.1043 0.9293 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974865 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974864 1 0.0162 0.9446 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974862 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974863 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974860 5 0.1410 0.7768 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974861 5 0.2891 0.7403 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1974859 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974858 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974855 5 0.5008 0.4530 0.000 0.040 0.004 0.324 0.632
#> SRR1974854 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974853 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974851 2 0.2358 0.8388 0.000 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1974852 2 0.2230 0.8315 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1974849 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974848 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974850 4 0.0162 0.9664 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.0324 0.9445 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974845 2 0.2329 0.8257 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1974844 1 0.0703 0.9377 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974843 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974842 1 0.0865 0.9365 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974841 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974840 4 0.0162 0.9657 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974839 2 0.2439 0.8276 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1974838 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974837 1 0.0671 0.9426 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974835 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974836 2 0.2286 0.8354 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1974834 2 0.2389 0.8312 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1974833 2 0.4390 0.2632 0.000 0.568 0.000 0.004 0.428
#> SRR1974831 2 0.2605 0.8057 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974832 1 0.0609 0.9393 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974830 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974829 5 0.4196 0.4170 0.356 0.004 0.000 0.000 0.640
#> SRR1974828 1 0.0609 0.9395 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974826 1 0.5857 0.5665 0.648 0.120 0.000 0.212 0.020
#> SRR1974827 2 0.4227 0.2857 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1974824 1 0.1485 0.9303 0.948 0.032 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974825 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974822 1 0.1485 0.9312 0.948 0.032 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974823 1 0.1117 0.9374 0.964 0.016 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974820 1 0.0771 0.9386 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974818 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974819 1 0.0703 0.9377 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974817 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974816 5 0.1628 0.7420 0.056 0.000 0.000 0.008 0.936
#> SRR1974815 1 0.1399 0.9318 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974813 1 0.1121 0.9267 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1974814 4 0.1410 0.9035 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1974812 5 0.4747 -0.0286 0.016 0.488 0.000 0.000 0.496
#> SRR1974810 1 0.0609 0.9398 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974808 1 0.1568 0.9281 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974811 1 0.0290 0.9441 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974809 1 0.4238 0.4303 0.628 0.004 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974807 1 0.0162 0.9446 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974806 1 0.0162 0.9443 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974805 2 0.2389 0.8308 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1974804 4 0.1915 0.9035 0.000 0.040 0.000 0.928 0.032
#> SRR1974803 1 0.0898 0.9400 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974801 1 0.0162 0.9441 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974800 1 0.3274 0.7304 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1974799 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974798 5 0.2536 0.7719 0.000 0.128 0.000 0.004 0.868
#> SRR1974797 2 0.2338 0.8332 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1974796 2 0.2516 0.8128 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1974795 2 0.2605 0.8065 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1974793 5 0.1410 0.7424 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1974794 5 0.4067 0.5912 0.000 0.300 0.000 0.008 0.692
#> SRR1974792 2 0.3305 0.7168 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1974791 2 0.2732 0.7940 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1974790 2 0.2389 0.8308 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1974789 5 0.5827 0.5111 0.000 0.300 0.000 0.124 0.576
#> SRR1974788 5 0.1197 0.7750 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974786 1 0.0794 0.9367 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1974787 1 0.4167 0.7416 0.788 0.004 0.000 0.072 0.136
#> SRR1974784 2 0.3196 0.7584 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR1974783 1 0.0290 0.9451 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974785 1 0.0324 0.9445 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974782 1 0.0566 0.9420 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974781 2 0.3048 0.7781 0.000 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1974780 1 0.4088 0.4262 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1974779 1 0.0290 0.9447 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974777 1 0.0162 0.9447 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974776 1 0.2648 0.8226 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1974778 1 0.1671 0.9012 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1974774 5 0.2471 0.7692 0.000 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1974773 1 0.1270 0.9216 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974775 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974772 1 0.0703 0.9390 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974771 5 0.3003 0.7361 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1974770 5 0.2629 0.7675 0.000 0.136 0.000 0.004 0.860
#> SRR1974769 2 0.2536 0.8222 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1974768 5 0.1205 0.7731 0.000 0.040 0.000 0.004 0.956
#> SRR1974767 1 0.0510 0.9415 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974766 5 0.2471 0.7670 0.000 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1974765 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974764 5 0.2732 0.7559 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1974763 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974762 1 0.1704 0.9070 0.928 0.004 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974761 5 0.3491 0.6952 0.000 0.228 0.000 0.004 0.768
#> SRR1974760 2 0.3143 0.7434 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1974759 1 0.0290 0.9435 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974758 5 0.2329 0.7725 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1974757 2 0.3816 0.5776 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1974756 1 0.0451 0.9434 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974754 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974755 5 0.1270 0.7755 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1974753 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974752 5 0.3999 0.4352 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656
#> SRR1974749 1 0.5152 0.3896 0.608 0.004 0.000 0.044 0.344
#> SRR1974747 1 0.0162 0.9441 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974748 1 0.0579 0.9434 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974746 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974744 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.4410 0.1760 0.440 0.000 0.000 0.004 0.556
#> SRR1974740 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974738 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974737 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974736 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974735 1 0.0290 0.9433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974734 4 0.3916 0.5441 0.256 0.012 0.000 0.732 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974729 1 0.0290 0.9433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974730 1 0.0451 0.9449 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974728 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974725 1 0.4870 0.6267 0.700 0.032 0.000 0.248 0.020
#> SRR1974726 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.0404 0.9425 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974727 1 0.1648 0.9262 0.940 0.040 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974723 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.0703 0.9478 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1974721 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974720 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974719 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974718 1 0.0324 0.9445 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974716 1 0.2429 0.9004 0.904 0.068 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974717 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974715 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974713 1 0.1430 0.9193 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1974714 1 0.1485 0.9298 0.948 0.032 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974711 1 0.1568 0.9281 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974712 1 0.0865 0.9365 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974709 1 0.0162 0.9441 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974708 1 0.1725 0.9234 0.936 0.044 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974710 1 0.1872 0.9181 0.928 0.052 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974707 1 0.0898 0.9400 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974706 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974704 1 0.0771 0.9386 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974705 1 0.0162 0.9442 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974703 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974702 5 0.1478 0.7418 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1974701 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974700 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974697 1 0.1648 0.9265 0.940 0.040 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974696 4 0.4880 0.4863 0.268 0.036 0.000 0.684 0.012
#> SRR1974694 1 0.0798 0.9419 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1974695 1 0.1800 0.9208 0.932 0.048 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974693 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974690 2 0.3395 0.7020 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1974691 1 0.0290 0.9433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974689 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974686 1 0.0290 0.9433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974685 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974684 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974683 1 0.5538 0.3843 0.596 0.000 0.000 0.312 0.092
#> SRR1974682 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.0162 0.9441 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974679 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974678 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974677 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974676 5 0.4252 0.6133 0.000 0.280 0.000 0.020 0.700
#> SRR1974675 3 0.0000 0.9777 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974674 1 0.0404 0.9422 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974673 1 0.2742 0.8897 0.892 0.068 0.020 0.000 0.020
#> SRR1974671 5 0.4118 0.5215 0.000 0.336 0.000 0.004 0.660
#> SRR1974672 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974669 5 0.4403 0.2630 0.000 0.436 0.000 0.004 0.560
#> SRR1974667 5 0.1732 0.7774 0.000 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1974668 5 0.1704 0.7780 0.000 0.068 0.000 0.004 0.928
#> SRR1974666 5 0.2011 0.7781 0.000 0.088 0.000 0.004 0.908
#> SRR1974664 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974665 5 0.2338 0.7746 0.000 0.112 0.000 0.004 0.884
#> SRR1974663 1 0.0290 0.9447 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974662 1 0.0324 0.9442 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974661 1 0.1648 0.9258 0.940 0.040 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974660 1 0.0693 0.9423 0.980 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974659 1 0.0771 0.9386 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974658 1 0.0290 0.9435 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974657 1 0.0566 0.9432 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974654 1 0.0963 0.9320 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974655 1 0.1216 0.9357 0.960 0.020 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974656 1 0.1216 0.9355 0.960 0.020 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974650 1 0.1399 0.9320 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974651 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974652 1 0.1502 0.9267 0.940 0.004 0.000 0.000 0.056
#> SRR1974653 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974648 1 0.0798 0.9412 0.976 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974646 1 0.1485 0.9308 0.948 0.032 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974649 1 0.1608 0.9057 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1974647 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974645 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974644 5 0.3039 0.7245 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1974643 1 0.0566 0.9432 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974642 1 0.1648 0.9265 0.940 0.040 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974640 1 0.1485 0.9298 0.948 0.032 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974641 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974639 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974638 1 0.0510 0.9418 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974635 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974636 1 0.1648 0.9258 0.940 0.040 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974634 1 0.0451 0.9433 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974637 4 0.0162 0.9659 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1974633 1 0.0898 0.9400 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974632 1 0.0510 0.9413 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974631 1 0.1568 0.9283 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974630 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974629 1 0.0324 0.9442 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974628 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974627 1 0.0566 0.9432 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974624 1 0.0000 0.9445 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974625 2 0.8787 -0.1861 0.036 0.316 0.092 0.292 0.264
#> SRR1974623 1 0.1568 0.9280 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974622 1 0.1399 0.9318 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974620 1 0.1725 0.9238 0.936 0.044 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974619 1 0.1725 0.9238 0.936 0.044 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974621 1 0.0880 0.9338 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1974617 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974616 5 0.1282 0.7528 0.044 0.004 0.000 0.000 0.952
#> SRR1974615 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974618 5 0.1544 0.7388 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1974614 1 0.0451 0.9442 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974613 1 0.1399 0.9318 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974612 1 0.4074 0.4487 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1974611 1 0.1399 0.9318 0.952 0.028 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974610 4 0.0000 0.9694 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1974609 1 0.0451 0.9440 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974608 1 0.1943 0.9151 0.924 0.056 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974607 1 0.1568 0.9281 0.944 0.036 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974606 5 0.4639 0.4216 0.000 0.024 0.000 0.344 0.632
#> SRR1974605 1 0.2180 0.9184 0.924 0.032 0.000 0.024 0.020
#> SRR1974604 4 0.0290 0.9625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1974603 1 0.1173 0.9395 0.964 0.020 0.000 0.004 0.012
#> SRR1974602 1 0.0290 0.9433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974600 2 0.2542 0.7913 0.020 0.904 0.000 0.056 0.020
#> SRR1974601 1 0.0898 0.9402 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974599 2 0.2536 0.8236 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1974598 2 0.3003 0.7647 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1974596 2 0.0992 0.8553 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1974594 2 0.0867 0.8406 0.008 0.976 0.000 0.008 0.008
#> SRR1974593 4 0.5029 0.3707 0.012 0.376 0.000 0.592 0.020
#> SRR1974595 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974592 2 0.1408 0.8589 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1974591 2 0.1638 0.8543 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1974588 2 0.1772 0.8143 0.032 0.940 0.000 0.008 0.020
#> SRR1974590 2 0.1956 0.8096 0.008 0.916 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974589 2 0.1377 0.8302 0.004 0.956 0.000 0.020 0.020
#> SRR1974587 2 0.2492 0.7885 0.048 0.908 0.000 0.024 0.020
#> SRR1974586 4 0.4322 0.6168 0.012 0.260 0.000 0.716 0.012
#> SRR1974585 2 0.0290 0.8474 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974584 2 0.3942 0.5138 0.232 0.748 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974583 2 0.1721 0.8228 0.020 0.944 0.000 0.016 0.020
#> SRR1974582 2 0.1408 0.8593 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1974581 2 0.1357 0.8587 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1974580 2 0.0854 0.8408 0.012 0.976 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974578 2 0.1904 0.8191 0.016 0.936 0.000 0.028 0.020
#> SRR1974577 2 0.0671 0.8422 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974579 2 0.0981 0.8394 0.008 0.972 0.000 0.012 0.008
#> SRR1974576 2 0.3604 0.7221 0.020 0.828 0.000 0.132 0.020
#> SRR1974575 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974574 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974573 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974571 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974572 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974570 2 0.0451 0.8502 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1974568 2 0.3632 0.6142 0.176 0.800 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974567 2 0.1568 0.8113 0.036 0.944 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974566 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974569 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974565 2 0.0740 0.8426 0.008 0.980 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974564 2 0.1638 0.8539 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1974560 1 0.4686 0.4129 0.596 0.384 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974559 2 0.4297 0.4143 0.288 0.692 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974563 2 0.1205 0.8588 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1974562 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974561 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974557 2 0.4464 0.2828 0.000 0.584 0.000 0.408 0.008
#> SRR1974553 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974555 2 0.3106 0.6702 0.140 0.840 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974551 2 0.1278 0.8298 0.016 0.960 0.000 0.004 0.020
#> SRR1974552 2 0.1124 0.8581 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1974554 1 0.4508 0.5357 0.648 0.332 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974558 2 0.3359 0.6361 0.164 0.816 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974556 1 0.4080 0.6757 0.728 0.252 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974550 1 0.2773 0.8622 0.868 0.112 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974549 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974548 2 0.1820 0.8185 0.020 0.940 0.000 0.020 0.020
#> SRR1974547 2 0.2616 0.7346 0.100 0.880 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974546 1 0.4803 0.2416 0.536 0.444 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974545 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1974544 2 0.1399 0.8189 0.028 0.952 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974543 2 0.1282 0.8594 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1975007 3 0.0508 0.95567 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012 0.000
#> SRR1975008 3 0.0146 0.95818 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975006 3 0.0146 0.95796 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975005 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975004 3 0.0935 0.94773 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1975003 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1975001 3 0.0806 0.94901 0.000 0.020 0.972 0.000 0.008 0.000
#> SRR1975002 3 0.0405 0.95673 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974999 3 0.0291 0.95751 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1975000 3 0.0858 0.95136 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974998 3 0.0405 0.95697 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974997 3 0.2945 0.80073 0.000 0.156 0.824 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974995 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974996 3 0.0405 0.95662 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974994 5 0.4341 0.19853 0.024 0.016 0.284 0.000 0.676 0.000
#> SRR1974993 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974992 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974990 3 0.0777 0.95180 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974989 2 0.0603 0.80589 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974991 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974986 3 0.0692 0.95349 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974987 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974988 3 0.0865 0.94029 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974984 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974985 3 0.0508 0.95609 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974983 3 0.0146 0.95796 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974982 3 0.0603 0.95446 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974981 3 0.3023 0.75859 0.000 0.004 0.784 0.000 0.212 0.000
#> SRR1974980 3 0.1644 0.91801 0.000 0.004 0.920 0.000 0.076 0.000
#> SRR1974979 3 0.0458 0.95354 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974978 3 0.0603 0.95492 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974977 3 0.0858 0.95008 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974976 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974975 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974974 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974973 3 0.0508 0.95669 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974972 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974971 3 0.0405 0.95668 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974970 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974969 3 0.0458 0.95679 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974968 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974967 3 0.0291 0.95743 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974965 3 0.1082 0.94355 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974966 3 0.0146 0.95816 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974964 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974963 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974961 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974962 3 0.0806 0.94972 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974960 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974959 3 0.0363 0.95710 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974958 3 0.0146 0.95816 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974957 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974956 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974955 3 0.0692 0.95319 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974954 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974953 3 0.0937 0.93855 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974952 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974949 3 0.0146 0.95795 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974950 3 0.0146 0.95795 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974951 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974947 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974948 3 0.0790 0.94372 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974946 3 0.0363 0.95589 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974945 3 0.0291 0.95743 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974944 3 0.2100 0.88325 0.000 0.004 0.884 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974942 3 0.1753 0.91338 0.000 0.004 0.912 0.000 0.084 0.000
#> SRR1974943 3 0.0363 0.95618 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974941 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974940 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974939 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974938 3 0.0146 0.95816 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974937 3 0.1152 0.94294 0.000 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974936 3 0.0777 0.95275 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974935 3 0.0146 0.95816 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974934 3 0.0146 0.95818 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974933 3 0.0291 0.95755 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974932 3 0.0146 0.95846 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974931 3 0.0692 0.95455 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974930 3 0.1806 0.90977 0.000 0.004 0.908 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974929 3 0.0777 0.95180 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974928 3 0.0405 0.95652 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974927 3 0.0260 0.95783 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974924 3 0.2520 0.83931 0.000 0.004 0.844 0.000 0.152 0.000
#> SRR1974925 3 0.1285 0.93506 0.000 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974926 3 0.1219 0.93747 0.000 0.004 0.948 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974923 3 0.1285 0.93787 0.000 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974922 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974921 3 0.0858 0.94996 0.000 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974920 3 0.1152 0.94114 0.000 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974919 3 0.0291 0.95743 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974918 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974917 3 0.1082 0.93962 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040 0.000
#> SRR1974916 3 0.0692 0.95384 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974915 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974914 3 0.3898 0.50459 0.000 0.336 0.652 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974913 3 0.0777 0.95165 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974911 3 0.0935 0.94920 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974910 3 0.1219 0.93956 0.000 0.004 0.948 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974908 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974909 3 0.0603 0.95524 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR1974906 3 0.0260 0.95733 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974907 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974905 3 0.0405 0.95662 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974904 3 0.0146 0.95795 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974903 3 0.0146 0.95831 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974902 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974901 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974898 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974900 3 0.3463 0.76850 0.000 0.160 0.800 0.032 0.008 0.000
#> SRR1974899 3 0.0547 0.95190 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974897 3 0.0260 0.95677 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974896 3 0.3923 0.40726 0.000 0.372 0.620 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974893 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974895 3 0.0260 0.95702 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974894 3 0.4894 0.26214 0.000 0.376 0.556 0.000 0.000 0.068
#> SRR1974892 3 0.3025 0.79704 0.000 0.156 0.820 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974890 3 0.3464 0.55971 0.000 0.312 0.688 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974891 3 0.0865 0.94052 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974889 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974888 3 0.0520 0.95510 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974886 2 0.5519 0.39304 0.000 0.540 0.340 0.112 0.004 0.004
#> SRR1974887 2 0.1572 0.79293 0.000 0.936 0.028 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974885 3 0.0363 0.95598 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974883 3 0.0547 0.95221 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974884 3 0.0000 0.95859 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974881 2 0.3464 0.50004 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974882 3 0.2933 0.75180 0.000 0.200 0.796 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974880 3 0.4432 0.40977 0.000 0.352 0.616 0.024 0.008 0.000
#> SRR1974879 3 0.0603 0.95225 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974877 3 0.0713 0.94776 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974876 2 0.2695 0.69977 0.000 0.844 0.144 0.000 0.008 0.004
#> SRR1974878 3 0.2333 0.85110 0.000 0.120 0.872 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974875 3 0.3807 0.43099 0.000 0.368 0.628 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974874 4 0.0260 0.95119 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974873 4 0.2260 0.81111 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1974871 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974872 2 0.3619 0.32402 0.316 0.680 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974869 1 0.2340 0.62122 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1974868 2 0.0777 0.81581 0.000 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1974870 1 0.1765 0.65275 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974866 1 0.2513 0.62188 0.852 0.000 0.000 0.008 0.140 0.000
#> SRR1974867 1 0.4186 0.41743 0.728 0.080 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974865 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974864 1 0.0260 0.66664 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974862 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974863 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974860 2 0.0520 0.81290 0.000 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1974861 2 0.1036 0.81579 0.000 0.964 0.008 0.000 0.004 0.024
#> SRR1974859 4 0.0260 0.95103 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1974858 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974856 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974857 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974855 2 0.6289 0.33996 0.000 0.412 0.004 0.276 0.304 0.004
#> SRR1974854 1 0.2969 0.49551 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1974853 1 0.3198 0.41986 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1974851 6 0.0862 0.89548 0.000 0.016 0.000 0.004 0.008 0.972
#> SRR1974852 6 0.0508 0.89552 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR1974849 1 0.2135 0.60347 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974848 1 0.2300 0.59197 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974850 4 0.2100 0.87105 0.000 0.004 0.000 0.884 0.112 0.000
#> SRR1974846 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974847 1 0.1500 0.66395 0.936 0.012 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974845 6 0.0547 0.89365 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1974844 5 0.4407 0.50171 0.480 0.024 0.000 0.000 0.496 0.000
#> SRR1974843 1 0.0713 0.66891 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974842 5 0.4093 0.61415 0.404 0.012 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1974841 1 0.3126 0.45738 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1974840 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974839 6 0.0363 0.89524 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974838 1 0.3409 0.34193 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1974837 1 0.3819 0.08228 0.624 0.000 0.000 0.000 0.372 0.004
#> SRR1974835 1 0.2730 0.53502 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1974836 6 0.0363 0.89524 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974834 6 0.0363 0.89524 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974833 6 0.4660 0.23149 0.000 0.416 0.000 0.000 0.044 0.540
#> SRR1974831 6 0.0603 0.89401 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1974832 1 0.3747 -0.03612 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1974830 1 0.3314 0.41962 0.740 0.004 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1974829 5 0.6080 0.53388 0.288 0.316 0.000 0.000 0.396 0.000
#> SRR1974828 1 0.3955 -0.25227 0.560 0.004 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1974826 5 0.6722 0.07860 0.324 0.000 0.000 0.308 0.336 0.032
#> SRR1974827 6 0.3782 0.44527 0.000 0.360 0.000 0.000 0.004 0.636
#> SRR1974824 1 0.1075 0.66675 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974825 1 0.0632 0.66304 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974822 1 0.0363 0.66765 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974823 1 0.0713 0.66919 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974820 1 0.4799 -0.07891 0.592 0.068 0.000 0.000 0.340 0.000
#> SRR1974818 1 0.1863 0.62396 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974819 5 0.4096 0.46471 0.484 0.008 0.000 0.000 0.508 0.000
#> SRR1974817 1 0.3244 0.40742 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1974816 2 0.4892 0.26062 0.048 0.560 0.000 0.008 0.384 0.000
#> SRR1974815 1 0.0632 0.66575 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974813 5 0.4763 0.63326 0.344 0.064 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1974814 4 0.0146 0.95195 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1974812 6 0.4973 0.32824 0.044 0.368 0.000 0.000 0.016 0.572
#> SRR1974810 1 0.1663 0.63613 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974808 1 0.2135 0.63617 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1974811 1 0.1806 0.63504 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1974809 5 0.5942 0.56464 0.356 0.220 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974807 1 0.0363 0.66597 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1974806 1 0.2562 0.56028 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974805 6 0.0363 0.89524 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1974804 4 0.3859 0.76258 0.000 0.016 0.000 0.772 0.176 0.036
#> SRR1974803 1 0.0865 0.66351 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974801 1 0.2854 0.51027 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1974800 1 0.5258 -0.01647 0.596 0.152 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1974799 1 0.3446 0.30366 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1974798 2 0.0862 0.81580 0.000 0.972 0.008 0.004 0.000 0.016
#> SRR1974797 6 0.0458 0.89464 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974796 6 0.0458 0.89474 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1974795 6 0.0713 0.89081 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1974793 5 0.5209 0.14737 0.092 0.416 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1974794 2 0.1371 0.81328 0.000 0.948 0.004 0.004 0.004 0.040
#> SRR1974792 6 0.2562 0.77021 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1974791 6 0.0865 0.88739 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1974790 6 0.1444 0.86534 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1974789 2 0.3438 0.75394 0.000 0.828 0.008 0.100 0.004 0.060
#> SRR1974788 2 0.0291 0.81125 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974786 1 0.2728 0.60996 0.860 0.040 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974787 1 0.4437 0.42860 0.716 0.188 0.000 0.004 0.092 0.000
#> SRR1974784 2 0.3866 0.00734 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1974783 1 0.2454 0.58774 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974785 1 0.1141 0.65425 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974782 5 0.3857 0.45872 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532 0.000
#> SRR1974781 6 0.3266 0.62302 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1974780 1 0.3817 -0.01279 0.568 0.432 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1974779 1 0.1387 0.64742 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974777 1 0.2697 0.54401 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1974776 1 0.3408 0.52720 0.800 0.152 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1974778 1 0.4662 0.29746 0.688 0.140 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974774 2 0.0603 0.81512 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974773 1 0.5309 -0.03164 0.596 0.176 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1974775 1 0.3595 0.32994 0.704 0.008 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1974772 1 0.4792 0.24873 0.668 0.132 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1974771 2 0.1082 0.81372 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974770 2 0.0603 0.81523 0.000 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974769 6 0.0632 0.89253 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1974768 2 0.0508 0.80892 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1974767 1 0.0865 0.66635 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974766 2 0.0692 0.81555 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974765 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974764 2 0.1285 0.80656 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1974763 1 0.3390 0.34950 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1974762 5 0.5227 0.53506 0.452 0.092 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974761 2 0.1124 0.81461 0.000 0.956 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1974760 6 0.1714 0.85136 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1974759 1 0.3052 0.49205 0.780 0.004 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1974758 2 0.0692 0.81596 0.000 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1974757 2 0.3833 0.16356 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR1974756 1 0.3756 0.16854 0.644 0.004 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974754 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974755 2 0.0291 0.81005 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1974753 4 0.0363 0.94675 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974751 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974750 4 0.0363 0.94893 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974752 5 0.6065 0.54114 0.280 0.316 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1974749 2 0.4731 0.06234 0.428 0.532 0.000 0.008 0.032 0.000
#> SRR1974747 1 0.3859 0.38728 0.720 0.012 0.000 0.012 0.256 0.000
#> SRR1974748 1 0.0260 0.66798 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1974746 5 0.4116 0.60568 0.416 0.012 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1974744 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974745 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974743 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974742 5 0.5792 0.55203 0.228 0.272 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1974740 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974739 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974741 4 0.0146 0.95258 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974738 4 0.0458 0.94529 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1974737 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974736 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974735 5 0.3955 0.57008 0.436 0.004 0.000 0.000 0.560 0.000
#> SRR1974734 4 0.4408 0.45447 0.292 0.000 0.000 0.656 0.052 0.000
#> SRR1974733 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974732 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974731 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974729 5 0.3756 0.62459 0.352 0.004 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1974730 1 0.1010 0.65891 0.960 0.004 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974728 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974725 1 0.4613 0.29853 0.660 0.000 0.000 0.260 0.080 0.000
#> SRR1974726 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974724 1 0.3864 -0.39109 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1974727 1 0.2925 0.60362 0.832 0.004 0.000 0.016 0.148 0.000
#> SRR1974723 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974722 4 0.1471 0.89591 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1974721 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974720 4 0.0291 0.95119 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1974719 1 0.0632 0.66304 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974718 1 0.0713 0.66914 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1974716 1 0.2196 0.64524 0.884 0.000 0.000 0.004 0.108 0.004
#> SRR1974717 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974715 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974713 5 0.4524 0.62791 0.320 0.052 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1974714 1 0.1910 0.64760 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974711 1 0.2092 0.63953 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1974712 5 0.4129 0.59781 0.424 0.012 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1974709 1 0.3986 -0.37391 0.532 0.004 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1974708 1 0.2362 0.62822 0.860 0.000 0.000 0.004 0.136 0.000
#> SRR1974710 1 0.2300 0.62428 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974707 1 0.1327 0.66249 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1974706 1 0.3499 0.27393 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320 0.000
#> SRR1974704 1 0.3989 -0.34306 0.528 0.004 0.000 0.000 0.468 0.000
#> SRR1974705 1 0.3797 -0.13724 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1974703 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974702 2 0.4945 0.27356 0.084 0.588 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1974701 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974699 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974698 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974700 1 0.3620 0.16347 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974697 1 0.1863 0.64904 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1974696 4 0.5553 0.35174 0.296 0.008 0.000 0.560 0.136 0.000
#> SRR1974694 1 0.4963 0.19734 0.648 0.004 0.000 0.112 0.236 0.000
#> SRR1974695 1 0.2300 0.62428 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974693 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974692 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974690 6 0.3151 0.66204 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR1974691 5 0.3961 0.56818 0.440 0.004 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1974689 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974688 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974687 1 0.3847 -0.25863 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974686 1 0.3804 -0.15228 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974685 1 0.2664 0.54776 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1974684 1 0.3428 0.31436 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1974683 4 0.6853 -0.02303 0.292 0.164 0.000 0.456 0.088 0.000
#> SRR1974682 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974681 1 0.3620 0.15947 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974679 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974680 1 0.3756 -0.04660 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1974678 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974677 1 0.0790 0.66030 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1974676 2 0.2146 0.80142 0.000 0.908 0.008 0.024 0.000 0.060
#> SRR1974675 3 0.0692 0.95140 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1974674 5 0.3864 0.50885 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1974673 1 0.2442 0.62142 0.852 0.000 0.004 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974671 2 0.1812 0.79492 0.000 0.912 0.008 0.000 0.000 0.080
#> SRR1974672 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974670 4 0.0363 0.94848 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1974669 2 0.2153 0.79140 0.000 0.900 0.008 0.004 0.004 0.084
#> SRR1974667 2 0.0508 0.81397 0.000 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1974668 2 0.0291 0.81125 0.000 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1974666 2 0.0665 0.81352 0.000 0.980 0.008 0.004 0.000 0.008
#> SRR1974664 4 0.0000 0.95384 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1974665 2 0.0458 0.81448 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1974663 1 0.2905 0.62290 0.856 0.048 0.004 0.000 0.092 0.000
#> SRR1974662 1 0.2823 0.51548 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1974661 1 0.2300 0.62428 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974660 1 0.1007 0.66683 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1974659 5 0.4264 0.48153 0.488 0.016 0.000 0.000 0.496 0.000
#> SRR1974658 5 0.3847 0.55556 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1974657 1 0.0865 0.66769 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974654 1 0.4326 0.17952 0.656 0.044 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1974655 1 0.1910 0.64720 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974656 1 0.1910 0.64777 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1974650 1 0.1957 0.64529 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974651 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974652 1 0.2308 0.65288 0.892 0.040 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974653 4 0.0146 0.95275 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974648 1 0.0146 0.66820 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974646 1 0.2726 0.62867 0.856 0.032 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1974649 1 0.5250 -0.30766 0.540 0.108 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974647 4 0.0291 0.95140 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1974645 1 0.1556 0.64183 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1974644 2 0.1082 0.81322 0.000 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1974643 1 0.2416 0.58480 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1974642 1 0.2219 0.63075 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1974640 1 0.2178 0.63345 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974641 4 0.0291 0.95128 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1974639 1 0.2823 0.51862 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1974638 1 0.2432 0.62028 0.876 0.024 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974635 1 0.2260 0.59334 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1974636 1 0.2300 0.62428 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974634 1 0.3866 -0.38136 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1974637 4 0.0363 0.94691 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974633 1 0.1267 0.66387 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1974632 5 0.3864 0.47197 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1974631 1 0.2300 0.62428 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1974630 1 0.2454 0.57304 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1974629 1 0.3847 -0.24716 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1974628 1 0.1387 0.64484 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1974627 1 0.0632 0.66864 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974624 1 0.2562 0.55862 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1974625 2 0.7639 0.53274 0.088 0.548 0.084 0.160 0.088 0.032
#> SRR1974623 1 0.2442 0.62209 0.852 0.000 0.000 0.004 0.144 0.000
#> SRR1974622 1 0.1141 0.66574 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1974620 1 0.2178 0.63371 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974619 1 0.2664 0.61908 0.848 0.000 0.000 0.016 0.136 0.000
#> SRR1974621 1 0.4118 0.06591 0.628 0.020 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1974617 1 0.0632 0.66301 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974616 2 0.3374 0.62200 0.020 0.772 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1974615 1 0.0146 0.66714 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1974618 5 0.5434 0.39644 0.144 0.312 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1974614 1 0.2537 0.63929 0.872 0.032 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1974613 1 0.1814 0.65053 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1974612 1 0.4236 0.22648 0.656 0.308 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974611 1 0.2178 0.63345 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1974610 4 0.0146 0.95305 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1974609 1 0.0632 0.66534 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1974608 1 0.2048 0.64080 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1974607 1 0.0865 0.66938 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1974606 2 0.3336 0.72051 0.000 0.812 0.000 0.132 0.056 0.000
#> SRR1974605 1 0.2979 0.61050 0.840 0.000 0.000 0.044 0.116 0.000
#> SRR1974604 4 0.0363 0.94677 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1974603 1 0.3233 0.59903 0.832 0.060 0.000 0.004 0.104 0.000
#> SRR1974602 1 0.3937 -0.17442 0.572 0.004 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1974600 6 0.3566 0.78182 0.000 0.000 0.000 0.096 0.104 0.800
#> SRR1974601 1 0.2909 0.60571 0.836 0.000 0.000 0.028 0.136 0.000
#> SRR1974599 2 0.4166 0.26112 0.000 0.584 0.004 0.004 0.004 0.404
#> SRR1974598 2 0.3881 0.28462 0.000 0.600 0.000 0.000 0.004 0.396
#> SRR1974596 6 0.2457 0.84953 0.000 0.084 0.000 0.000 0.036 0.880
#> SRR1974594 6 0.1663 0.86677 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1974593 4 0.6067 0.39226 0.016 0.000 0.000 0.512 0.264 0.208
#> SRR1974595 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974592 6 0.3744 0.62517 0.000 0.256 0.000 0.004 0.016 0.724
#> SRR1974591 6 0.3563 0.48064 0.000 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1974588 6 0.2504 0.83350 0.004 0.000 0.000 0.004 0.136 0.856
#> SRR1974590 6 0.2822 0.83548 0.000 0.000 0.000 0.040 0.108 0.852
#> SRR1974589 6 0.1588 0.87341 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072 0.924
#> SRR1974587 6 0.3279 0.80389 0.008 0.000 0.000 0.028 0.148 0.816
#> SRR1974586 4 0.4506 0.69273 0.016 0.000 0.000 0.724 0.184 0.076
#> SRR1974585 6 0.1141 0.88388 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1974584 6 0.1492 0.87053 0.036 0.000 0.000 0.000 0.024 0.940
#> SRR1974583 6 0.2806 0.81895 0.016 0.000 0.000 0.004 0.136 0.844
#> SRR1974582 6 0.3827 0.62481 0.000 0.256 0.000 0.004 0.020 0.720
#> SRR1974581 6 0.2886 0.79927 0.000 0.144 0.000 0.004 0.016 0.836
#> SRR1974580 6 0.1075 0.88513 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1974578 6 0.2815 0.83160 0.000 0.000 0.000 0.032 0.120 0.848
#> SRR1974577 6 0.0291 0.89594 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1974579 6 0.1267 0.88156 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1974576 6 0.5620 0.63521 0.068 0.004 0.000 0.108 0.156 0.664
#> SRR1974575 6 0.2730 0.78609 0.000 0.152 0.000 0.000 0.012 0.836
#> SRR1974574 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974573 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974571 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974572 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974570 6 0.0976 0.89344 0.008 0.008 0.000 0.000 0.016 0.968
#> SRR1974568 6 0.2875 0.81410 0.052 0.000 0.000 0.000 0.096 0.852
#> SRR1974567 6 0.0260 0.89451 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974566 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974569 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974565 6 0.0865 0.88856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1974564 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974560 1 0.5451 0.15894 0.532 0.000 0.000 0.000 0.140 0.328
#> SRR1974559 6 0.1575 0.87390 0.032 0.000 0.000 0.000 0.032 0.936
#> SRR1974563 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974562 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974561 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974557 6 0.3797 0.27446 0.000 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1974553 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974555 6 0.0260 0.89451 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974551 6 0.0405 0.89555 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1974552 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974554 1 0.4427 0.46156 0.716 0.000 0.000 0.000 0.148 0.136
#> SRR1974558 6 0.1934 0.86116 0.044 0.000 0.000 0.000 0.040 0.916
#> SRR1974556 1 0.3769 0.22838 0.640 0.000 0.000 0.000 0.004 0.356
#> SRR1974550 1 0.2558 0.61206 0.840 0.000 0.000 0.000 0.156 0.004
#> SRR1974549 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974548 6 0.1531 0.87540 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068 0.928
#> SRR1974547 6 0.5076 0.48590 0.248 0.000 0.000 0.000 0.132 0.620
#> SRR1974546 1 0.4243 0.47275 0.736 0.000 0.000 0.000 0.132 0.132
#> SRR1974545 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1974544 6 0.0260 0.89485 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1974543 6 0.0146 0.89632 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0