Date: 2019-12-26 01:12:56 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 430 384
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| ATC:mclust | 2 | 0.998 | 0.964 | 0.982 | ** | |
| SD:mclust | 3 | 0.979 | 0.925 | 0.966 | ** | 2 |
| MAD:skmeans | 2 | 0.971 | 0.961 | 0.982 | ** | |
| SD:skmeans | 2 | 0.962 | 0.964 | 0.983 | ** | |
| MAD:mclust | 2 | 0.946 | 0.946 | 0.977 | * | |
| SD:kmeans | 2 | 0.927 | 0.944 | 0.970 | * | |
| MAD:kmeans | 2 | 0.925 | 0.949 | 0.970 | * | |
| ATC:skmeans | 2 | 0.902 | 0.913 | 0.965 | * | |
| MAD:NMF | 2 | 0.901 | 0.941 | 0.972 | * | |
| ATC:NMF | 2 | 0.886 | 0.926 | 0.967 | ||
| SD:NMF | 2 | 0.850 | 0.926 | 0.965 | ||
| ATC:kmeans | 2 | 0.843 | 0.899 | 0.952 | ||
| MAD:pam | 2 | 0.518 | 0.822 | 0.911 | ||
| ATC:pam | 2 | 0.489 | 0.797 | 0.898 | ||
| SD:pam | 2 | 0.422 | 0.821 | 0.900 | ||
| CV:kmeans | 2 | 0.388 | 0.725 | 0.872 | ||
| CV:skmeans | 2 | 0.383 | 0.730 | 0.877 | ||
| ATC:hclust | 6 | 0.248 | 0.563 | 0.699 | ||
| CV:NMF | 3 | 0.175 | 0.517 | 0.709 | ||
| SD:hclust | 3 | 0.164 | 0.545 | 0.739 | ||
| CV:mclust | 3 | 0.158 | 0.570 | 0.782 | ||
| MAD:hclust | 3 | 0.145 | 0.637 | 0.739 | ||
| CV:pam | 2 | 0.065 | 0.598 | 0.781 | ||
| CV:hclust | 3 | 0.004 | 0.650 | 0.766 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.8499 0.926 0.965 0.4999 0.500 0.500
#> CV:NMF 2 0.4152 0.753 0.882 0.4340 0.584 0.584
#> MAD:NMF 2 0.9007 0.941 0.972 0.5005 0.500 0.500
#> ATC:NMF 2 0.8855 0.926 0.967 0.5000 0.500 0.500
#> SD:skmeans 2 0.9618 0.964 0.983 0.5016 0.499 0.499
#> CV:skmeans 2 0.3835 0.730 0.877 0.4990 0.501 0.501
#> MAD:skmeans 2 0.9713 0.961 0.982 0.5015 0.499 0.499
#> ATC:skmeans 2 0.9024 0.913 0.965 0.5016 0.499 0.499
#> SD:mclust 2 0.9608 0.951 0.978 0.5000 0.499 0.499
#> CV:mclust 2 0.0730 0.125 0.650 0.3163 0.847 0.847
#> MAD:mclust 2 0.9457 0.946 0.977 0.4996 0.499 0.499
#> ATC:mclust 2 0.9980 0.964 0.982 0.5005 0.499 0.499
#> SD:kmeans 2 0.9274 0.944 0.970 0.5013 0.499 0.499
#> CV:kmeans 2 0.3882 0.725 0.872 0.4818 0.511 0.511
#> MAD:kmeans 2 0.9249 0.949 0.970 0.4958 0.499 0.499
#> ATC:kmeans 2 0.8431 0.899 0.952 0.4961 0.499 0.499
#> SD:pam 2 0.4222 0.821 0.900 0.4886 0.501 0.501
#> CV:pam 2 0.0648 0.598 0.781 0.4825 0.500 0.500
#> MAD:pam 2 0.5182 0.822 0.911 0.4964 0.501 0.501
#> ATC:pam 2 0.4889 0.797 0.898 0.4769 0.509 0.509
#> SD:hclust 2 0.7519 0.942 0.941 0.1119 0.959 0.959
#> CV:hclust 2 0.0204 0.730 0.816 0.2682 0.915 0.915
#> MAD:hclust 2 0.4859 0.900 0.907 0.1461 0.959 0.959
#> ATC:hclust 2 1.0000 0.987 0.988 0.0588 0.959 0.959
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.66185 0.778 0.896 0.2546 0.870 0.742
#> CV:NMF 3 0.17498 0.517 0.709 0.4785 0.707 0.525
#> MAD:NMF 3 0.62824 0.757 0.882 0.2519 0.876 0.755
#> ATC:NMF 3 0.61523 0.732 0.868 0.3012 0.809 0.632
#> SD:skmeans 3 0.58342 0.708 0.859 0.3017 0.800 0.619
#> CV:skmeans 3 0.32384 0.342 0.663 0.3224 0.824 0.669
#> MAD:skmeans 3 0.61582 0.720 0.865 0.2978 0.806 0.629
#> ATC:skmeans 3 0.60721 0.741 0.875 0.3098 0.795 0.611
#> SD:mclust 3 0.97861 0.925 0.966 0.0566 0.970 0.940
#> CV:mclust 3 0.15840 0.570 0.782 0.2664 0.526 0.502
#> MAD:mclust 3 0.96785 0.925 0.967 0.0524 0.980 0.961
#> ATC:mclust 3 0.65669 0.725 0.861 0.2152 0.863 0.733
#> SD:kmeans 3 0.54679 0.666 0.822 0.2759 0.814 0.642
#> CV:kmeans 3 0.21957 0.399 0.657 0.3434 0.796 0.623
#> MAD:kmeans 3 0.58060 0.686 0.831 0.2882 0.819 0.649
#> ATC:kmeans 3 0.58641 0.663 0.815 0.2952 0.789 0.601
#> SD:pam 3 0.27807 0.509 0.688 0.2787 0.888 0.782
#> CV:pam 3 0.06792 0.561 0.708 0.1436 0.919 0.848
#> MAD:pam 3 0.33444 0.550 0.714 0.2653 0.959 0.920
#> ATC:pam 3 0.42542 0.525 0.748 0.2477 0.912 0.830
#> SD:hclust 3 0.16447 0.545 0.739 2.5148 0.582 0.564
#> CV:hclust 3 0.00427 0.650 0.766 0.3159 0.949 0.944
#> MAD:hclust 3 0.14511 0.637 0.739 1.8932 0.545 0.525
#> ATC:hclust 3 0.19597 0.454 0.759 4.4721 0.867 0.862
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.5671 0.644 0.774 0.0983 0.862 0.669
#> CV:NMF 4 0.2089 0.317 0.576 0.1437 0.914 0.774
#> MAD:NMF 4 0.5357 0.621 0.762 0.1038 0.874 0.698
#> ATC:NMF 4 0.5319 0.620 0.805 0.0824 0.923 0.791
#> SD:skmeans 4 0.6249 0.705 0.838 0.1438 0.813 0.524
#> CV:skmeans 4 0.3564 0.437 0.648 0.1283 0.755 0.451
#> MAD:skmeans 4 0.6613 0.723 0.852 0.1447 0.828 0.559
#> ATC:skmeans 4 0.6701 0.752 0.865 0.1397 0.786 0.472
#> SD:mclust 4 0.7017 0.616 0.842 0.1699 0.946 0.890
#> CV:mclust 4 0.0733 0.498 0.720 0.2360 0.931 0.886
#> MAD:mclust 4 0.6949 0.665 0.815 0.1700 0.929 0.855
#> ATC:mclust 4 0.6749 0.764 0.858 0.0460 0.935 0.848
#> SD:kmeans 4 0.5497 0.609 0.781 0.1262 0.848 0.612
#> CV:kmeans 4 0.2950 0.404 0.624 0.1268 0.724 0.390
#> MAD:kmeans 4 0.5672 0.663 0.779 0.1195 0.856 0.633
#> ATC:kmeans 4 0.5575 0.639 0.786 0.1251 0.836 0.589
#> SD:pam 4 0.3558 0.419 0.650 0.1190 0.871 0.712
#> CV:pam 4 0.1098 0.335 0.607 0.2045 0.874 0.748
#> MAD:pam 4 0.3684 0.359 0.608 0.1215 0.760 0.509
#> ATC:pam 4 0.3783 0.536 0.710 0.1131 0.896 0.770
#> SD:hclust 4 0.1233 0.599 0.719 0.2718 0.811 0.687
#> CV:hclust 4 0.0110 0.626 0.735 0.1609 0.970 0.965
#> MAD:hclust 4 0.1214 0.562 0.714 0.2150 0.938 0.881
#> ATC:hclust 4 0.1866 0.463 0.726 0.4467 0.777 0.733
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.4866 0.491 0.686 0.0701 0.927 0.785
#> CV:NMF 5 0.2585 0.221 0.478 0.0743 0.892 0.689
#> MAD:NMF 5 0.4631 0.497 0.661 0.0786 0.939 0.821
#> ATC:NMF 5 0.5323 0.592 0.770 0.0578 0.904 0.715
#> SD:skmeans 5 0.6415 0.590 0.762 0.0625 0.895 0.630
#> CV:skmeans 5 0.4081 0.367 0.601 0.0680 0.899 0.653
#> MAD:skmeans 5 0.6299 0.562 0.751 0.0610 0.916 0.697
#> ATC:skmeans 5 0.7013 0.696 0.832 0.0639 0.895 0.622
#> SD:mclust 5 0.6005 0.630 0.784 0.0957 0.890 0.758
#> CV:mclust 5 0.1370 0.470 0.683 0.1486 0.860 0.767
#> MAD:mclust 5 0.5569 0.608 0.767 0.0995 0.903 0.781
#> ATC:mclust 5 0.6591 0.695 0.781 0.0734 0.984 0.960
#> SD:kmeans 5 0.5650 0.490 0.721 0.0613 0.925 0.753
#> CV:kmeans 5 0.3622 0.371 0.598 0.0695 0.828 0.472
#> MAD:kmeans 5 0.5700 0.481 0.698 0.0642 0.931 0.770
#> ATC:kmeans 5 0.6149 0.632 0.765 0.0596 0.901 0.684
#> SD:pam 5 0.4153 0.334 0.617 0.0830 0.838 0.572
#> CV:pam 5 0.1643 0.321 0.567 0.1004 0.816 0.578
#> MAD:pam 5 0.4244 0.374 0.667 0.0669 0.880 0.620
#> ATC:pam 5 0.4164 0.417 0.645 0.1115 0.821 0.558
#> SD:hclust 5 0.1280 0.597 0.726 0.2058 0.897 0.793
#> CV:hclust 5 0.0398 0.440 0.669 0.2020 0.974 0.970
#> MAD:hclust 5 0.1408 0.612 0.723 0.1805 0.890 0.782
#> ATC:hclust 5 0.1943 0.438 0.685 0.1890 0.688 0.540
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.4810 0.428 0.629 0.0518 0.898 0.691
#> CV:NMF 6 0.3106 0.163 0.417 0.0454 0.870 0.569
#> MAD:NMF 6 0.4798 0.390 0.616 0.0512 0.931 0.787
#> ATC:NMF 6 0.5151 0.484 0.712 0.0326 0.973 0.905
#> SD:skmeans 6 0.6722 0.567 0.750 0.0416 0.889 0.556
#> CV:skmeans 6 0.4575 0.315 0.550 0.0422 0.933 0.717
#> MAD:skmeans 6 0.6670 0.587 0.743 0.0432 0.905 0.614
#> ATC:skmeans 6 0.7108 0.630 0.762 0.0389 0.925 0.666
#> SD:mclust 6 0.5524 0.432 0.699 0.0865 0.852 0.637
#> CV:mclust 6 0.2117 0.362 0.633 0.1686 0.822 0.660
#> MAD:mclust 6 0.5417 0.258 0.646 0.0755 0.806 0.535
#> ATC:mclust 6 0.7108 0.707 0.820 0.0895 0.822 0.568
#> SD:kmeans 6 0.5850 0.482 0.662 0.0419 0.919 0.703
#> CV:kmeans 6 0.4243 0.312 0.547 0.0427 0.918 0.672
#> MAD:kmeans 6 0.5831 0.448 0.655 0.0462 0.910 0.667
#> ATC:kmeans 6 0.6251 0.443 0.661 0.0406 0.916 0.709
#> SD:pam 6 0.4791 0.260 0.596 0.0528 0.805 0.394
#> CV:pam 6 0.2284 0.293 0.522 0.0632 0.937 0.795
#> MAD:pam 6 0.4706 0.370 0.614 0.0545 0.923 0.707
#> ATC:pam 6 0.4874 0.439 0.675 0.0673 0.874 0.577
#> SD:hclust 6 0.2293 0.523 0.704 0.1063 0.971 0.931
#> CV:hclust 6 0.0605 0.432 0.632 0.1110 0.929 0.916
#> MAD:hclust 6 0.2596 0.539 0.703 0.0979 0.962 0.910
#> ATC:hclust 6 0.2475 0.563 0.699 0.1851 0.838 0.645
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 43, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 86, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 129, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 172, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 215, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 43, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 86, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 129, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 172, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 215, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 43)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 86)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 129)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 172)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 215)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.752 0.942 0.941 0.112 0.959 0.959
#> 3 3 0.164 0.545 0.739 2.515 0.582 0.564
#> 4 4 0.123 0.599 0.719 0.272 0.811 0.687
#> 5 5 0.128 0.597 0.726 0.206 0.897 0.793
#> 6 6 0.229 0.523 0.704 0.106 0.971 0.931
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105278 1 0.4815 0.940 0.896 0.104
#> SRR2105275 1 0.7299 0.830 0.796 0.204
#> SRR2105276 1 0.7056 0.851 0.808 0.192
#> SRR2105273 1 0.4431 0.940 0.908 0.092
#> SRR2105274 1 0.4815 0.939 0.896 0.104
#> SRR2105271 1 0.4690 0.942 0.900 0.100
#> SRR2105272 1 0.4431 0.945 0.908 0.092
#> SRR2105269 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105270 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR2105267 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105268 1 0.0938 0.949 0.988 0.012
#> SRR2105265 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105266 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105263 1 0.1633 0.948 0.976 0.024
#> SRR2105264 1 0.1843 0.952 0.972 0.028
#> SRR2105261 1 0.6801 0.862 0.820 0.180
#> SRR2105262 1 0.6712 0.867 0.824 0.176
#> SRR2105357 1 0.4690 0.941 0.900 0.100
#> SRR2105358 1 0.4690 0.941 0.900 0.100
#> SRR2105439 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105440 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105509 1 0.1633 0.947 0.976 0.024
#> SRR2105510 1 0.1414 0.948 0.980 0.020
#> SRR2105507 1 0.4815 0.938 0.896 0.104
#> SRR2105508 1 0.4815 0.936 0.896 0.104
#> SRR2105505 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105506 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105503 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105504 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105501 1 0.1184 0.952 0.984 0.016
#> SRR2105502 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105499 1 0.4562 0.944 0.904 0.096
#> SRR2105500 1 0.4562 0.945 0.904 0.096
#> SRR2105497 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR2105498 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105495 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105496 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105493 1 0.1414 0.954 0.980 0.020
#> SRR2105494 1 0.1633 0.953 0.976 0.024
#> SRR2105491 1 0.1633 0.948 0.976 0.024
#> SRR2105492 1 0.1633 0.948 0.976 0.024
#> SRR2105489 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105490 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105487 1 0.4562 0.946 0.904 0.096
#> SRR2105488 1 0.4562 0.946 0.904 0.096
#> SRR2105485 1 0.4690 0.944 0.900 0.100
#> SRR2105486 1 0.4562 0.946 0.904 0.096
#> SRR2105483 1 0.2778 0.950 0.952 0.048
#> SRR2105484 1 0.2778 0.950 0.952 0.048
#> SRR2105481 1 0.4022 0.951 0.920 0.080
#> SRR2105482 1 0.4161 0.948 0.916 0.084
#> SRR2105479 1 0.3879 0.951 0.924 0.076
#> SRR2105480 1 0.3879 0.952 0.924 0.076
#> SRR2105477 1 0.1633 0.953 0.976 0.024
#> SRR2105478 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR2105475 1 0.2236 0.942 0.964 0.036
#> SRR2105476 1 0.2236 0.941 0.964 0.036
#> SRR2105473 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105474 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105471 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105472 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105469 1 0.4431 0.940 0.908 0.092
#> SRR2105470 1 0.4298 0.945 0.912 0.088
#> SRR2105467 1 0.4022 0.947 0.920 0.080
#> SRR2105468 1 0.4161 0.945 0.916 0.084
#> SRR2105465 1 0.3584 0.951 0.932 0.068
#> SRR2105466 1 0.3274 0.952 0.940 0.060
#> SRR2105463 1 0.3733 0.950 0.928 0.072
#> SRR2105464 1 0.3114 0.951 0.944 0.056
#> SRR2105461 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105462 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105459 1 0.1184 0.949 0.984 0.016
#> SRR2105460 1 0.1414 0.951 0.980 0.020
#> SRR2105457 1 0.5059 0.937 0.888 0.112
#> SRR2105458 1 0.5178 0.936 0.884 0.116
#> SRR2105455 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105456 1 0.4298 0.944 0.912 0.088
#> SRR2105453 1 0.4431 0.946 0.908 0.092
#> SRR2105454 1 0.4298 0.946 0.912 0.088
#> SRR2105451 1 0.2043 0.955 0.968 0.032
#> SRR2105452 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105449 1 0.4690 0.942 0.900 0.100
#> SRR2105450 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105447 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR2105448 1 0.1843 0.950 0.972 0.028
#> SRR2105445 1 0.4298 0.948 0.912 0.088
#> SRR2105446 1 0.4690 0.945 0.900 0.100
#> SRR2105443 1 0.4690 0.938 0.900 0.100
#> SRR2105444 1 0.3879 0.950 0.924 0.076
#> SRR2105441 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105442 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105437 1 0.4431 0.946 0.908 0.092
#> SRR2105438 1 0.4431 0.946 0.908 0.092
#> SRR2105435 1 0.4562 0.946 0.904 0.096
#> SRR2105436 1 0.4431 0.947 0.908 0.092
#> SRR2105433 1 0.3584 0.952 0.932 0.068
#> SRR2105434 1 0.3733 0.951 0.928 0.072
#> SRR2105431 1 0.4161 0.948 0.916 0.084
#> SRR2105432 1 0.4161 0.948 0.916 0.084
#> SRR2105429 1 0.4022 0.947 0.920 0.080
#> SRR2105430 1 0.3733 0.952 0.928 0.072
#> SRR2105427 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105428 1 0.1633 0.946 0.976 0.024
#> SRR2105425 1 0.1184 0.949 0.984 0.016
#> SRR2105426 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105421 1 0.4939 0.932 0.892 0.108
#> SRR2105422 1 0.4431 0.940 0.908 0.092
#> SRR2105423 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105424 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.4562 0.942 0.904 0.096
#> SRR2105420 1 0.3879 0.948 0.924 0.076
#> SRR2105415 1 0.3431 0.951 0.936 0.064
#> SRR2105416 1 0.3431 0.951 0.936 0.064
#> SRR2105417 1 0.3733 0.950 0.928 0.072
#> SRR2105418 1 0.3584 0.951 0.932 0.068
#> SRR2105413 1 0.1633 0.950 0.976 0.024
#> SRR2105414 1 0.1633 0.954 0.976 0.024
#> SRR2105409 1 0.0672 0.952 0.992 0.008
#> SRR2105410 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105411 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105412 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105407 1 0.5059 0.934 0.888 0.112
#> SRR2105408 1 0.5059 0.934 0.888 0.112
#> SRR2105403 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105404 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105405 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105406 1 0.4431 0.944 0.908 0.092
#> SRR2105401 1 0.1414 0.952 0.980 0.020
#> SRR2105402 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105399 1 0.5946 0.890 0.856 0.144
#> SRR2105400 1 0.6048 0.886 0.852 0.148
#> SRR2105397 1 0.5408 0.901 0.876 0.124
#> SRR2105398 1 0.5408 0.901 0.876 0.124
#> SRR2105395 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105396 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105393 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105394 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105389 1 0.5294 0.921 0.880 0.120
#> SRR2105390 1 0.4815 0.935 0.896 0.104
#> SRR2105391 1 0.4815 0.936 0.896 0.104
#> SRR2105392 1 0.4815 0.936 0.896 0.104
#> SRR2105385 1 0.4298 0.948 0.912 0.088
#> SRR2105386 1 0.4690 0.944 0.900 0.100
#> SRR2105387 1 0.4690 0.940 0.900 0.100
#> SRR2105388 1 0.4431 0.945 0.908 0.092
#> SRR2105381 1 0.3879 0.943 0.924 0.076
#> SRR2105382 1 0.2043 0.953 0.968 0.032
#> SRR2105383 1 0.0938 0.953 0.988 0.012
#> SRR2105384 1 0.1414 0.953 0.980 0.020
#> SRR2105379 1 0.1633 0.952 0.976 0.024
#> SRR2105380 1 0.1633 0.953 0.976 0.024
#> SRR2105377 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105378 1 0.0672 0.952 0.992 0.008
#> SRR2105375 1 0.4161 0.949 0.916 0.084
#> SRR2105376 1 0.4298 0.948 0.912 0.088
#> SRR2105373 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105374 1 0.4298 0.948 0.912 0.088
#> SRR2105371 1 0.4562 0.939 0.904 0.096
#> SRR2105372 1 0.4562 0.940 0.904 0.096
#> SRR2105369 1 0.4690 0.940 0.900 0.100
#> SRR2105370 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105367 1 0.3879 0.950 0.924 0.076
#> SRR2105368 1 0.4022 0.949 0.920 0.080
#> SRR2105365 1 0.1843 0.947 0.972 0.028
#> SRR2105366 1 0.2043 0.945 0.968 0.032
#> SRR2105363 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR2105364 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105361 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105362 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105359 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105360 1 0.4939 0.936 0.892 0.108
#> SRR2105355 1 0.4298 0.942 0.912 0.088
#> SRR2105356 1 0.4431 0.942 0.908 0.092
#> SRR2105353 1 0.7815 0.786 0.768 0.232
#> SRR2105354 1 0.5737 0.909 0.864 0.136
#> SRR2105351 1 0.1414 0.948 0.980 0.020
#> SRR2105352 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105349 1 0.2423 0.948 0.960 0.040
#> SRR2105350 1 0.1633 0.952 0.976 0.024
#> SRR2105345 1 0.0672 0.952 0.992 0.008
#> SRR2105346 1 0.0672 0.952 0.992 0.008
#> SRR2105347 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105348 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105343 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105344 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.4939 0.935 0.892 0.108
#> SRR2105342 1 0.4562 0.941 0.904 0.096
#> SRR2105339 1 0.5519 0.920 0.872 0.128
#> SRR2105340 1 0.5059 0.928 0.888 0.112
#> SRR2105335 1 0.4562 0.946 0.904 0.096
#> SRR2105336 1 0.4298 0.947 0.912 0.088
#> SRR2105337 1 0.4690 0.943 0.900 0.100
#> SRR2105338 1 0.4298 0.946 0.912 0.088
#> SRR2105331 1 0.1843 0.950 0.972 0.028
#> SRR2105332 1 0.1184 0.950 0.984 0.016
#> SRR2105333 1 0.1633 0.949 0.976 0.024
#> SRR2105334 1 0.2043 0.951 0.968 0.032
#> SRR2105329 1 0.2043 0.955 0.968 0.032
#> SRR2105330 1 0.2236 0.954 0.964 0.036
#> SRR2105327 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105328 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR2105325 1 0.7139 0.828 0.804 0.196
#> SRR2105326 1 0.7139 0.828 0.804 0.196
#> SRR2105323 1 0.4815 0.940 0.896 0.104
#> SRR2105324 1 0.4431 0.942 0.908 0.092
#> SRR2105319 1 0.4939 0.941 0.892 0.108
#> SRR2105320 1 0.4690 0.945 0.900 0.100
#> SRR2105321 1 0.7056 0.842 0.808 0.192
#> SRR2105322 1 0.7056 0.842 0.808 0.192
#> SRR2105317 1 0.1414 0.948 0.980 0.020
#> SRR2105318 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105315 1 0.2423 0.955 0.960 0.040
#> SRR2105316 1 0.1633 0.951 0.976 0.024
#> SRR2105313 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105314 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105311 1 0.6973 0.832 0.812 0.188
#> SRR2105312 1 0.6887 0.837 0.816 0.184
#> SRR2105307 1 0.3431 0.952 0.936 0.064
#> SRR2105308 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105309 1 0.5294 0.935 0.880 0.120
#> SRR2105310 1 0.4815 0.937 0.896 0.104
#> SRR2105305 1 0.4939 0.936 0.892 0.108
#> SRR2105306 1 0.4939 0.933 0.892 0.108
#> SRR2105303 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.2423 0.943 0.040 0.960
#> SRR2105301 1 0.2236 0.946 0.964 0.036
#> SRR2105302 1 0.2043 0.944 0.968 0.032
#> SRR2105299 1 0.4562 0.945 0.904 0.096
#> SRR2105300 1 0.3733 0.951 0.928 0.072
#> SRR2105297 1 0.2423 0.949 0.960 0.040
#> SRR2105298 1 0.2423 0.949 0.960 0.040
#> SRR2105295 1 0.1633 0.946 0.976 0.024
#> SRR2105296 1 0.1184 0.949 0.984 0.016
#> SRR2105293 1 0.5946 0.900 0.856 0.144
#> SRR2105294 1 0.4562 0.944 0.904 0.096
#> SRR2105291 1 0.4022 0.949 0.920 0.080
#> SRR2105292 1 0.3879 0.952 0.924 0.076
#> SRR2105289 1 0.5519 0.929 0.872 0.128
#> SRR2105290 1 0.4298 0.946 0.912 0.088
#> SRR2105287 1 0.4431 0.945 0.908 0.092
#> SRR2105288 1 0.4161 0.947 0.916 0.084
#> SRR2105285 1 0.1633 0.947 0.976 0.024
#> SRR2105286 1 0.1843 0.947 0.972 0.028
#> SRR2105283 1 0.2948 0.954 0.948 0.052
#> SRR2105284 1 0.2423 0.955 0.960 0.040
#> SRR2105281 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105282 1 0.0938 0.949 0.988 0.012
#> SRR2105259 1 0.5059 0.934 0.888 0.112
#> SRR2105260 1 0.5059 0.934 0.888 0.112
#> SRR2105279 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105280 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.3584 0.951 0.932 0.068
#> SRR2105258 1 0.3733 0.951 0.928 0.072
#> SRR2105253 1 0.1414 0.949 0.980 0.020
#> SRR2105254 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105255 1 0.4690 0.940 0.900 0.100
#> SRR2105256 1 0.4431 0.943 0.908 0.092
#> SRR2105251 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105252 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105249 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105250 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR2105247 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105248 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105245 1 0.5842 0.913 0.860 0.140
#> SRR2105246 1 0.5629 0.917 0.868 0.132
#> SRR2105243 1 0.4431 0.944 0.908 0.092
#> SRR2105244 1 0.3879 0.951 0.924 0.076
#> SRR2105241 1 0.4161 0.948 0.916 0.084
#> SRR2105242 1 0.3879 0.950 0.924 0.076
#> SRR2105239 1 0.4161 0.950 0.916 0.084
#> SRR2105240 1 0.3879 0.949 0.924 0.076
#> SRR2105237 1 0.2778 0.943 0.952 0.048
#> SRR2105238 1 0.2236 0.951 0.964 0.036
#> SRR2105235 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR2105236 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105233 1 0.2236 0.949 0.964 0.036
#> SRR2105234 1 0.2236 0.949 0.964 0.036
#> SRR2105231 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105232 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105227 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105228 1 0.3274 0.955 0.940 0.060
#> SRR2105225 1 0.4431 0.944 0.908 0.092
#> SRR2105226 1 0.4431 0.944 0.908 0.092
#> SRR2105229 1 0.5408 0.923 0.876 0.124
#> SRR2105230 1 0.5059 0.934 0.888 0.112
#> SRR2105219 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105220 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105221 1 0.1184 0.952 0.984 0.016
#> SRR2105222 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105223 1 0.4562 0.940 0.904 0.096
#> SRR2105224 1 0.4298 0.945 0.912 0.088
#> SRR2105217 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105218 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105215 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105216 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105213 1 0.5059 0.937 0.888 0.112
#> SRR2105214 1 0.5946 0.912 0.856 0.144
#> SRR2105211 1 0.4298 0.944 0.912 0.088
#> SRR2105212 1 0.4562 0.942 0.904 0.096
#> SRR2105209 1 0.4562 0.943 0.904 0.096
#> SRR2105210 1 0.4022 0.949 0.920 0.080
#> SRR2105207 1 0.4022 0.950 0.920 0.080
#> SRR2105208 1 0.3584 0.952 0.932 0.068
#> SRR2105205 1 0.1184 0.950 0.984 0.016
#> SRR2105206 1 0.1414 0.949 0.980 0.020
#> SRR2105201 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105202 1 0.0938 0.951 0.988 0.012
#> SRR2105203 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105204 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105199 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105200 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105197 1 0.4939 0.940 0.892 0.108
#> SRR2105198 1 0.5059 0.939 0.888 0.112
#> SRR2105195 1 0.3879 0.952 0.924 0.076
#> SRR2105196 1 0.3274 0.955 0.940 0.060
#> SRR2105193 1 0.3431 0.952 0.936 0.064
#> SRR2105194 1 0.3584 0.951 0.932 0.068
#> SRR2105191 1 0.4939 0.939 0.892 0.108
#> SRR2105192 1 0.4298 0.946 0.912 0.088
#> SRR2105189 1 0.1843 0.955 0.972 0.028
#> SRR2105190 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR2105187 1 0.3114 0.935 0.944 0.056
#> SRR2105188 1 0.2043 0.949 0.968 0.032
#> SRR2105179 1 0.4161 0.951 0.916 0.084
#> SRR2105180 1 0.3431 0.953 0.936 0.064
#> SRR2105183 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105184 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105185 1 0.2423 0.949 0.960 0.040
#> SRR2105186 1 0.2236 0.950 0.964 0.036
#> SRR2105181 1 0.4939 0.940 0.892 0.108
#> SRR2105182 1 0.4431 0.941 0.908 0.092
#> SRR2105177 1 0.2948 0.951 0.948 0.052
#> SRR2105178 1 0.2778 0.950 0.952 0.048
#> SRR2105171 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105172 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.3431 0.951 0.936 0.064
#> SRR2105176 1 0.3114 0.951 0.944 0.056
#> SRR2105173 1 0.1843 0.948 0.972 0.028
#> SRR2105174 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105169 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105170 1 0.0672 0.950 0.992 0.008
#> SRR2105167 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105168 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105165 1 0.3879 0.951 0.924 0.076
#> SRR2105166 1 0.3431 0.953 0.936 0.064
#> SRR2105163 1 0.6712 0.852 0.824 0.176
#> SRR2105164 1 0.6623 0.855 0.828 0.172
#> SRR2105161 1 0.3879 0.952 0.924 0.076
#> SRR2105162 1 0.3879 0.950 0.924 0.076
#> SRR2105155 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105156 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105157 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105158 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105159 1 0.4690 0.943 0.900 0.100
#> SRR2105160 1 0.3879 0.950 0.924 0.076
#> SRR2105153 1 0.0938 0.950 0.988 0.012
#> SRR2105154 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR2105151 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105152 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105149 1 0.4815 0.941 0.896 0.104
#> SRR2105150 1 0.4690 0.943 0.900 0.100
#> SRR2105147 2 0.7453 0.786 0.212 0.788
#> SRR2105148 2 0.7453 0.786 0.212 0.788
#> SRR2105143 1 0.4690 0.943 0.900 0.100
#> SRR2105144 1 0.3431 0.953 0.936 0.064
#> SRR2105145 1 0.3431 0.953 0.936 0.064
#> SRR2105146 1 0.3584 0.952 0.932 0.068
#> SRR2105141 1 0.1414 0.949 0.980 0.020
#> SRR2105142 1 0.1414 0.949 0.980 0.020
#> SRR2105139 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105140 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105137 1 0.1184 0.952 0.984 0.016
#> SRR2105138 1 0.0938 0.952 0.988 0.012
#> SRR2105135 1 0.0376 0.950 0.996 0.004
#> SRR2105136 1 0.0000 0.950 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.4690 0.942 0.900 0.100
#> SRR2105134 1 0.4690 0.942 0.900 0.100
#> SRR2105131 1 0.2778 0.955 0.952 0.048
#> SRR2105132 1 0.3114 0.955 0.944 0.056
#> SRR2105129 1 0.3114 0.951 0.944 0.056
#> SRR2105130 1 0.2778 0.950 0.952 0.048
#> SRR2105127 1 0.4298 0.947 0.912 0.088
#> SRR2105128 1 0.3431 0.951 0.936 0.064
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.6205 0.8044 0.656 0.336 0.008
#> SRR2105278 1 0.6155 0.8002 0.664 0.328 0.008
#> SRR2105275 1 0.8635 0.7441 0.532 0.356 0.112
#> SRR2105276 1 0.8280 0.7584 0.564 0.344 0.092
#> SRR2105273 1 0.6314 0.8267 0.604 0.392 0.004
#> SRR2105274 1 0.6793 0.7816 0.536 0.452 0.012
#> SRR2105271 1 0.6633 0.7817 0.548 0.444 0.008
#> SRR2105272 2 0.6804 -0.5018 0.460 0.528 0.012
#> SRR2105269 2 0.1399 0.7297 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105270 2 0.2400 0.7269 0.064 0.932 0.004
#> SRR2105267 2 0.1315 0.7285 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105268 2 0.1015 0.7279 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105265 2 0.0983 0.7285 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105266 2 0.0424 0.7272 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105263 2 0.2297 0.7270 0.036 0.944 0.020
#> SRR2105264 2 0.2269 0.7315 0.040 0.944 0.016
#> SRR2105261 2 0.8466 -0.6621 0.456 0.456 0.088
#> SRR2105262 2 0.8405 -0.6591 0.456 0.460 0.084
#> SRR2105357 1 0.5958 0.7788 0.692 0.300 0.008
#> SRR2105358 1 0.6200 0.7903 0.676 0.312 0.012
#> SRR2105439 2 0.3686 0.6747 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105440 2 0.3686 0.6726 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105509 2 0.2982 0.7203 0.056 0.920 0.024
#> SRR2105510 2 0.2804 0.7225 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105507 1 0.6713 0.8193 0.572 0.416 0.012
#> SRR2105508 1 0.6859 0.8132 0.564 0.420 0.016
#> SRR2105505 1 0.6476 0.7612 0.548 0.448 0.004
#> SRR2105506 1 0.6267 0.7430 0.548 0.452 0.000
#> SRR2105503 2 0.0848 0.7302 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105504 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105501 2 0.3112 0.7047 0.096 0.900 0.004
#> SRR2105502 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105499 1 0.6859 0.8093 0.564 0.420 0.016
#> SRR2105500 1 0.6754 0.7960 0.556 0.432 0.012
#> SRR2105497 2 0.1711 0.7329 0.032 0.960 0.008
#> SRR2105498 2 0.1832 0.7282 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105495 2 0.3293 0.7119 0.088 0.900 0.012
#> SRR2105496 2 0.2229 0.7300 0.044 0.944 0.012
#> SRR2105493 2 0.4634 0.6325 0.164 0.824 0.012
#> SRR2105494 2 0.4291 0.6523 0.152 0.840 0.008
#> SRR2105491 2 0.2636 0.7275 0.048 0.932 0.020
#> SRR2105492 2 0.2636 0.7275 0.048 0.932 0.020
#> SRR2105489 2 0.1163 0.7200 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105490 2 0.1031 0.7261 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105487 1 0.6422 0.7874 0.660 0.324 0.016
#> SRR2105488 1 0.6422 0.7874 0.660 0.324 0.016
#> SRR2105485 1 0.6540 0.8166 0.584 0.408 0.008
#> SRR2105486 1 0.6994 0.8069 0.556 0.424 0.020
#> SRR2105483 2 0.6053 0.4821 0.260 0.720 0.020
#> SRR2105484 2 0.6053 0.4821 0.260 0.720 0.020
#> SRR2105481 2 0.6954 -0.6310 0.484 0.500 0.016
#> SRR2105482 2 0.6678 -0.5372 0.480 0.512 0.008
#> SRR2105479 2 0.7256 -0.4951 0.440 0.532 0.028
#> SRR2105480 2 0.7309 -0.3772 0.416 0.552 0.032
#> SRR2105477 2 0.4618 0.6517 0.136 0.840 0.024
#> SRR2105478 2 0.3644 0.6812 0.124 0.872 0.004
#> SRR2105475 2 0.3237 0.7184 0.056 0.912 0.032
#> SRR2105476 2 0.3434 0.7136 0.064 0.904 0.032
#> SRR2105473 2 0.2878 0.7049 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105474 2 0.2165 0.7250 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105471 2 0.1399 0.7244 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105472 2 0.1129 0.7271 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105469 1 0.6688 0.8231 0.580 0.408 0.012
#> SRR2105470 1 0.6460 0.7940 0.556 0.440 0.004
#> SRR2105467 1 0.6434 0.8196 0.612 0.380 0.008
#> SRR2105468 1 0.6410 0.7982 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105465 2 0.6410 -0.2213 0.420 0.576 0.004
#> SRR2105466 2 0.6796 0.1164 0.368 0.612 0.020
#> SRR2105463 2 0.6696 0.2312 0.348 0.632 0.020
#> SRR2105464 2 0.6603 0.2759 0.332 0.648 0.020
#> SRR2105461 2 0.0237 0.7241 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.7245 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.1999 0.7299 0.036 0.952 0.012
#> SRR2105460 2 0.2446 0.7305 0.052 0.936 0.012
#> SRR2105457 1 0.6832 0.8277 0.604 0.376 0.020
#> SRR2105458 1 0.6865 0.8270 0.596 0.384 0.020
#> SRR2105455 1 0.6518 0.7088 0.512 0.484 0.004
#> SRR2105456 1 0.6513 0.7120 0.520 0.476 0.004
#> SRR2105453 1 0.6617 0.7700 0.600 0.388 0.012
#> SRR2105454 1 0.6548 0.7735 0.616 0.372 0.012
#> SRR2105451 2 0.4228 0.6480 0.148 0.844 0.008
#> SRR2105452 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105449 2 0.6809 -0.5617 0.464 0.524 0.012
#> SRR2105450 2 0.6664 -0.4844 0.464 0.528 0.008
#> SRR2105447 2 0.2448 0.7139 0.076 0.924 0.000
#> SRR2105448 2 0.2804 0.7221 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105445 2 0.6205 0.1211 0.336 0.656 0.008
#> SRR2105446 2 0.6811 -0.2755 0.404 0.580 0.016
#> SRR2105443 2 0.6803 0.2823 0.280 0.680 0.040
#> SRR2105444 2 0.6407 0.3360 0.272 0.700 0.028
#> SRR2105441 2 0.1860 0.7282 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105442 2 0.1964 0.7274 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105437 1 0.6407 0.7511 0.700 0.272 0.028
#> SRR2105438 1 0.6407 0.7511 0.700 0.272 0.028
#> SRR2105435 2 0.6944 -0.5828 0.468 0.516 0.016
#> SRR2105436 1 0.6359 0.8248 0.592 0.404 0.004
#> SRR2105433 2 0.6667 0.1756 0.368 0.616 0.016
#> SRR2105434 2 0.6386 -0.1521 0.412 0.584 0.004
#> SRR2105431 2 0.7075 -0.4513 0.484 0.496 0.020
#> SRR2105432 2 0.6905 -0.2832 0.440 0.544 0.016
#> SRR2105429 2 0.6056 0.4792 0.224 0.744 0.032
#> SRR2105430 2 0.4840 0.6055 0.168 0.816 0.016
#> SRR2105427 2 0.1620 0.7329 0.024 0.964 0.012
#> SRR2105428 2 0.2846 0.7253 0.056 0.924 0.020
#> SRR2105425 2 0.1751 0.7334 0.028 0.960 0.012
#> SRR2105426 2 0.2301 0.7302 0.060 0.936 0.004
#> SRR2105421 1 0.7526 0.7960 0.536 0.424 0.040
#> SRR2105422 1 0.7561 0.7642 0.516 0.444 0.040
#> SRR2105423 2 0.0592 0.7233 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105424 2 0.0424 0.7255 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105419 1 0.6763 0.8025 0.552 0.436 0.012
#> SRR2105420 1 0.6944 0.7582 0.516 0.468 0.016
#> SRR2105415 2 0.6661 -0.0594 0.400 0.588 0.012
#> SRR2105416 2 0.6686 0.1308 0.372 0.612 0.016
#> SRR2105417 2 0.6811 -0.1589 0.404 0.580 0.016
#> SRR2105418 2 0.6617 -0.0693 0.388 0.600 0.012
#> SRR2105413 2 0.2749 0.7239 0.064 0.924 0.012
#> SRR2105414 2 0.2680 0.7188 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105409 2 0.1529 0.7338 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105410 2 0.2096 0.7297 0.052 0.944 0.004
#> SRR2105411 2 0.0592 0.7270 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105412 2 0.0829 0.7308 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105407 1 0.6155 0.8021 0.664 0.328 0.008
#> SRR2105408 1 0.6381 0.8092 0.648 0.340 0.012
#> SRR2105403 1 0.5928 0.7731 0.696 0.296 0.008
#> SRR2105404 1 0.5928 0.7731 0.696 0.296 0.008
#> SRR2105405 1 0.6286 0.7409 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105406 1 0.6305 0.6779 0.516 0.484 0.000
#> SRR2105401 2 0.3043 0.7175 0.084 0.908 0.008
#> SRR2105402 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105399 2 0.6719 0.4977 0.160 0.744 0.096
#> SRR2105400 2 0.6775 0.4888 0.164 0.740 0.096
#> SRR2105397 2 0.7773 0.0472 0.316 0.612 0.072
#> SRR2105398 2 0.7773 0.0472 0.316 0.612 0.072
#> SRR2105395 2 0.1163 0.7311 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105396 2 0.1031 0.7218 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105393 2 0.0237 0.7274 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105394 2 0.0661 0.7264 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105389 1 0.7085 0.8064 0.612 0.356 0.032
#> SRR2105390 1 0.6470 0.8159 0.632 0.356 0.012
#> SRR2105391 1 0.6648 0.8186 0.620 0.364 0.016
#> SRR2105392 1 0.6648 0.8179 0.620 0.364 0.016
#> SRR2105385 1 0.6941 0.7434 0.520 0.464 0.016
#> SRR2105386 1 0.6654 0.7434 0.536 0.456 0.008
#> SRR2105387 2 0.6813 -0.5850 0.468 0.520 0.012
#> SRR2105388 1 0.6608 0.8030 0.560 0.432 0.008
#> SRR2105381 2 0.5180 0.6134 0.156 0.812 0.032
#> SRR2105382 2 0.3272 0.7105 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105383 2 0.2165 0.7276 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105384 2 0.2590 0.7242 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105379 2 0.3043 0.7178 0.084 0.908 0.008
#> SRR2105380 2 0.3183 0.7130 0.076 0.908 0.016
#> SRR2105377 2 0.3116 0.6923 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105378 2 0.3038 0.6977 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105375 2 0.6625 -0.4479 0.440 0.552 0.008
#> SRR2105376 2 0.6598 -0.3729 0.428 0.564 0.008
#> SRR2105373 1 0.6445 0.7822 0.672 0.308 0.020
#> SRR2105374 1 0.6507 0.7643 0.688 0.284 0.028
#> SRR2105371 1 0.6359 0.8174 0.628 0.364 0.008
#> SRR2105372 1 0.6811 0.8216 0.580 0.404 0.016
#> SRR2105369 1 0.6228 0.8249 0.624 0.372 0.004
#> SRR2105370 1 0.6410 0.8127 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105367 2 0.6647 -0.4517 0.452 0.540 0.008
#> SRR2105368 2 0.6659 -0.4899 0.460 0.532 0.008
#> SRR2105365 2 0.2434 0.7251 0.036 0.940 0.024
#> SRR2105366 2 0.2443 0.7240 0.032 0.940 0.028
#> SRR2105363 2 0.1643 0.7321 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105364 2 0.1529 0.7317 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105361 2 0.0747 0.7302 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105362 2 0.0592 0.7291 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105359 1 0.6735 0.8131 0.564 0.424 0.012
#> SRR2105360 1 0.6754 0.8041 0.556 0.432 0.012
#> SRR2105355 1 0.6617 0.8041 0.556 0.436 0.008
#> SRR2105356 1 0.6598 0.7982 0.564 0.428 0.008
#> SRR2105353 1 0.8863 0.7224 0.544 0.312 0.144
#> SRR2105354 1 0.7610 0.8201 0.564 0.388 0.048
#> SRR2105351 2 0.1170 0.7248 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105352 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105349 2 0.3637 0.7116 0.084 0.892 0.024
#> SRR2105350 2 0.1491 0.7326 0.016 0.968 0.016
#> SRR2105345 2 0.2261 0.7252 0.068 0.932 0.000
#> SRR2105346 2 0.1964 0.7241 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105347 2 0.3030 0.6981 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105348 2 0.3030 0.6981 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105343 2 0.0661 0.7272 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105344 2 0.1163 0.7321 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105341 1 0.6896 0.8220 0.588 0.392 0.020
#> SRR2105342 1 0.6879 0.8127 0.556 0.428 0.016
#> SRR2105339 1 0.7498 0.8124 0.548 0.412 0.040
#> SRR2105340 1 0.7329 0.8063 0.544 0.424 0.032
#> SRR2105335 1 0.6404 0.8160 0.644 0.344 0.012
#> SRR2105336 1 0.6753 0.8195 0.596 0.388 0.016
#> SRR2105337 1 0.6513 0.6826 0.520 0.476 0.004
#> SRR2105338 1 0.6309 0.6248 0.504 0.496 0.000
#> SRR2105331 2 0.2152 0.7298 0.036 0.948 0.016
#> SRR2105332 2 0.1711 0.7297 0.032 0.960 0.008
#> SRR2105333 2 0.2804 0.7253 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105334 2 0.2998 0.7224 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105329 2 0.4629 0.5924 0.188 0.808 0.004
#> SRR2105330 2 0.4723 0.6221 0.160 0.824 0.016
#> SRR2105327 2 0.1860 0.7295 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105328 2 0.1989 0.7285 0.048 0.948 0.004
#> SRR2105325 1 0.8679 0.7145 0.556 0.316 0.128
#> SRR2105326 1 0.8679 0.7145 0.556 0.316 0.128
#> SRR2105323 1 0.6814 0.8273 0.608 0.372 0.020
#> SRR2105324 1 0.6410 0.8114 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105319 1 0.6839 0.8149 0.624 0.352 0.024
#> SRR2105320 1 0.6899 0.8120 0.612 0.364 0.024
#> SRR2105321 1 0.8332 0.7451 0.580 0.316 0.104
#> SRR2105322 1 0.8332 0.7451 0.580 0.316 0.104
#> SRR2105317 2 0.2414 0.7270 0.040 0.940 0.020
#> SRR2105318 2 0.1337 0.7332 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105315 2 0.5763 0.3339 0.276 0.716 0.008
#> SRR2105316 2 0.2804 0.7256 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105313 2 0.1015 0.7319 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105314 2 0.1170 0.7308 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105311 1 0.8812 0.7013 0.516 0.360 0.124
#> SRR2105312 1 0.8836 0.6939 0.508 0.368 0.124
#> SRR2105307 2 0.6672 -0.5415 0.472 0.520 0.008
#> SRR2105308 2 0.6305 -0.5270 0.484 0.516 0.000
#> SRR2105309 1 0.6969 0.8299 0.596 0.380 0.024
#> SRR2105310 1 0.6647 0.8256 0.592 0.396 0.012
#> SRR2105305 1 0.6510 0.8223 0.624 0.364 0.012
#> SRR2105306 1 0.6824 0.8206 0.576 0.408 0.016
#> SRR2105303 2 0.0424 0.7274 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105304 3 0.1289 0.9292 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105301 2 0.3502 0.7192 0.084 0.896 0.020
#> SRR2105302 2 0.2806 0.7266 0.040 0.928 0.032
#> SRR2105299 2 0.7102 -0.3350 0.420 0.556 0.024
#> SRR2105300 2 0.6927 0.2339 0.296 0.664 0.040
#> SRR2105297 2 0.4521 0.5710 0.180 0.816 0.004
#> SRR2105298 2 0.4521 0.5710 0.180 0.816 0.004
#> SRR2105295 2 0.2743 0.7265 0.052 0.928 0.020
#> SRR2105296 2 0.2152 0.7310 0.036 0.948 0.016
#> SRR2105293 2 0.8142 -0.6603 0.464 0.468 0.068
#> SRR2105294 1 0.7289 0.7271 0.504 0.468 0.028
#> SRR2105291 2 0.6483 -0.4648 0.452 0.544 0.004
#> SRR2105292 2 0.6786 -0.4274 0.448 0.540 0.012
#> SRR2105289 1 0.7386 0.7534 0.508 0.460 0.032
#> SRR2105290 2 0.6309 -0.5538 0.496 0.504 0.000
#> SRR2105287 1 0.6299 0.6760 0.524 0.476 0.000
#> SRR2105288 2 0.6244 -0.2845 0.440 0.560 0.000
#> SRR2105285 2 0.2846 0.7229 0.056 0.924 0.020
#> SRR2105286 2 0.2636 0.7260 0.048 0.932 0.020
#> SRR2105283 2 0.5024 0.5083 0.220 0.776 0.004
#> SRR2105284 2 0.5122 0.5722 0.200 0.788 0.012
#> SRR2105281 2 0.1643 0.7301 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105282 2 0.1170 0.7301 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105259 1 0.6333 0.8029 0.656 0.332 0.012
#> SRR2105260 1 0.6497 0.8081 0.648 0.336 0.016
#> SRR2105279 2 0.0000 0.7245 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0237 0.7253 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105257 1 0.7067 0.6232 0.512 0.468 0.020
#> SRR2105258 1 0.7063 0.6354 0.516 0.464 0.020
#> SRR2105253 2 0.2492 0.7315 0.048 0.936 0.016
#> SRR2105254 2 0.1620 0.7323 0.024 0.964 0.012
#> SRR2105255 1 0.6314 0.8257 0.604 0.392 0.004
#> SRR2105256 1 0.6442 0.8022 0.564 0.432 0.004
#> SRR2105251 2 0.0848 0.7279 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105252 2 0.0848 0.7279 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105249 2 0.2537 0.7187 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105250 2 0.2796 0.7076 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105247 2 0.0237 0.7253 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105248 2 0.0829 0.7258 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105245 2 0.7585 -0.6595 0.476 0.484 0.040
#> SRR2105246 2 0.7752 -0.5998 0.456 0.496 0.048
#> SRR2105243 1 0.6672 0.7347 0.520 0.472 0.008
#> SRR2105244 2 0.7067 -0.6162 0.468 0.512 0.020
#> SRR2105241 2 0.6676 -0.5740 0.476 0.516 0.008
#> SRR2105242 2 0.6252 -0.3091 0.444 0.556 0.000
#> SRR2105239 1 0.6896 0.7872 0.588 0.392 0.020
#> SRR2105240 2 0.6664 -0.4431 0.464 0.528 0.008
#> SRR2105237 2 0.5069 0.6413 0.128 0.828 0.044
#> SRR2105238 2 0.4136 0.6831 0.116 0.864 0.020
#> SRR2105235 2 0.2356 0.7208 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105236 2 0.2165 0.7233 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105233 2 0.3141 0.7174 0.068 0.912 0.020
#> SRR2105234 2 0.3141 0.7174 0.068 0.912 0.020
#> SRR2105231 2 0.0237 0.7241 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105232 2 0.0848 0.7294 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105227 2 0.7353 -0.3716 0.396 0.568 0.036
#> SRR2105228 2 0.6359 -0.0218 0.364 0.628 0.008
#> SRR2105225 1 0.6489 0.7532 0.540 0.456 0.004
#> SRR2105226 1 0.6520 0.6472 0.508 0.488 0.004
#> SRR2105229 1 0.7487 0.8102 0.552 0.408 0.040
#> SRR2105230 1 0.6814 0.8276 0.608 0.372 0.020
#> SRR2105219 2 0.1315 0.7325 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105220 2 0.1711 0.7309 0.032 0.960 0.008
#> SRR2105221 2 0.3573 0.6948 0.120 0.876 0.004
#> SRR2105222 2 0.3573 0.6892 0.120 0.876 0.004
#> SRR2105223 1 0.6410 0.8055 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105224 1 0.6307 0.6855 0.512 0.488 0.000
#> SRR2105217 2 0.1170 0.7317 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105218 2 0.0983 0.7283 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105215 2 0.0237 0.7241 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105216 2 0.0424 0.7255 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105213 1 0.7295 0.6216 0.488 0.484 0.028
#> SRR2105214 1 0.8070 0.6632 0.472 0.464 0.064
#> SRR2105211 1 0.6442 0.8103 0.564 0.432 0.004
#> SRR2105212 1 0.6225 0.8080 0.568 0.432 0.000
#> SRR2105209 1 0.6235 0.7548 0.564 0.436 0.000
#> SRR2105210 2 0.6495 -0.4097 0.460 0.536 0.004
#> SRR2105207 2 0.6825 -0.5286 0.488 0.500 0.012
#> SRR2105208 2 0.6434 -0.0143 0.380 0.612 0.008
#> SRR2105205 2 0.2804 0.7277 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105206 2 0.3234 0.7232 0.072 0.908 0.020
#> SRR2105201 2 0.4121 0.6446 0.168 0.832 0.000
#> SRR2105202 2 0.3551 0.6738 0.132 0.868 0.000
#> SRR2105203 2 0.0237 0.7262 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105204 2 0.0475 0.7281 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105199 2 0.0592 0.7292 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105200 2 0.0892 0.7298 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105197 1 0.6313 0.7946 0.676 0.308 0.016
#> SRR2105198 1 0.6341 0.7969 0.672 0.312 0.016
#> SRR2105195 2 0.7043 -0.4635 0.448 0.532 0.020
#> SRR2105196 2 0.6282 0.2262 0.324 0.664 0.012
#> SRR2105193 2 0.6566 0.2154 0.348 0.636 0.016
#> SRR2105194 2 0.6865 0.0265 0.384 0.596 0.020
#> SRR2105191 1 0.4805 0.6057 0.812 0.176 0.012
#> SRR2105192 1 0.6548 0.7815 0.616 0.372 0.012
#> SRR2105189 2 0.3425 0.6873 0.112 0.884 0.004
#> SRR2105190 2 0.2116 0.7306 0.040 0.948 0.012
#> SRR2105187 2 0.5454 0.6115 0.152 0.804 0.044
#> SRR2105188 2 0.5508 0.5810 0.188 0.784 0.028
#> SRR2105179 2 0.6819 -0.5019 0.476 0.512 0.012
#> SRR2105180 2 0.6724 -0.2779 0.420 0.568 0.012
#> SRR2105183 2 0.0747 0.7299 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105184 2 0.0892 0.7208 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105185 2 0.3722 0.7092 0.088 0.888 0.024
#> SRR2105186 2 0.3183 0.7237 0.076 0.908 0.016
#> SRR2105181 1 0.6470 0.8141 0.632 0.356 0.012
#> SRR2105182 1 0.6008 0.8257 0.628 0.372 0.000
#> SRR2105177 2 0.6195 0.4563 0.276 0.704 0.020
#> SRR2105178 2 0.6016 0.4883 0.256 0.724 0.020
#> SRR2105171 2 0.0592 0.7282 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105172 2 0.0747 0.7299 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105175 2 0.6717 0.1984 0.352 0.628 0.020
#> SRR2105176 2 0.6717 0.1911 0.352 0.628 0.020
#> SRR2105173 2 0.2152 0.7291 0.036 0.948 0.016
#> SRR2105174 2 0.0829 0.7283 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105169 2 0.0747 0.7249 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105170 2 0.0983 0.7255 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105167 2 0.0592 0.7271 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105168 2 0.0592 0.7250 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105165 1 0.7029 0.7708 0.540 0.440 0.020
#> SRR2105166 1 0.7063 0.7301 0.516 0.464 0.020
#> SRR2105163 1 0.8472 0.7325 0.540 0.360 0.100
#> SRR2105164 1 0.8606 0.7312 0.528 0.364 0.108
#> SRR2105161 2 0.6798 -0.1599 0.400 0.584 0.016
#> SRR2105162 2 0.6345 -0.0595 0.400 0.596 0.004
#> SRR2105155 2 0.0424 0.7279 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105156 2 0.0747 0.7278 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105157 2 0.0892 0.7243 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105158 2 0.1399 0.7246 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105159 1 0.7360 0.7114 0.528 0.440 0.032
#> SRR2105160 2 0.7054 -0.4104 0.456 0.524 0.020
#> SRR2105153 2 0.0983 0.7237 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105154 2 0.1129 0.7247 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105151 2 0.0592 0.7301 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105152 2 0.0592 0.7281 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105149 1 0.7295 0.6482 0.488 0.484 0.028
#> SRR2105150 2 0.7188 -0.6389 0.484 0.492 0.024
#> SRR2105147 3 0.7091 0.7244 0.248 0.064 0.688
#> SRR2105148 3 0.7091 0.7244 0.248 0.064 0.688
#> SRR2105143 2 0.6617 -0.3863 0.436 0.556 0.008
#> SRR2105144 2 0.6451 -0.1247 0.384 0.608 0.008
#> SRR2105145 2 0.6738 0.2158 0.356 0.624 0.020
#> SRR2105146 2 0.6832 0.0547 0.376 0.604 0.020
#> SRR2105141 2 0.1905 0.7276 0.028 0.956 0.016
#> SRR2105142 2 0.1905 0.7276 0.028 0.956 0.016
#> SRR2105139 2 0.0592 0.7263 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105140 2 0.0892 0.7261 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105137 2 0.3340 0.6870 0.120 0.880 0.000
#> SRR2105138 2 0.3686 0.6697 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105135 2 0.0424 0.7253 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105136 2 0.0424 0.7241 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105133 1 0.6255 0.7721 0.684 0.300 0.016
#> SRR2105134 1 0.6284 0.7733 0.680 0.304 0.016
#> SRR2105131 2 0.6836 -0.2376 0.412 0.572 0.016
#> SRR2105132 2 0.6505 -0.5008 0.468 0.528 0.004
#> SRR2105129 2 0.6341 0.3832 0.312 0.672 0.016
#> SRR2105130 2 0.6053 0.4821 0.260 0.720 0.020
#> SRR2105127 1 0.6587 0.7504 0.568 0.424 0.008
#> SRR2105128 2 0.6495 -0.5038 0.460 0.536 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.5850 0.6780 0.100 0.188 0.708 0.004
#> SRR2105278 3 0.5922 0.6733 0.108 0.184 0.704 0.004
#> SRR2105275 3 0.8565 0.6713 0.140 0.268 0.504 0.088
#> SRR2105276 3 0.8402 0.6806 0.152 0.268 0.512 0.068
#> SRR2105273 3 0.5883 0.7657 0.060 0.300 0.640 0.000
#> SRR2105274 3 0.6374 0.7616 0.084 0.324 0.592 0.000
#> SRR2105271 3 0.6507 0.7620 0.080 0.328 0.588 0.004
#> SRR2105272 3 0.7659 0.5726 0.164 0.376 0.452 0.008
#> SRR2105269 2 0.1305 0.7494 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105270 2 0.2164 0.7498 0.004 0.924 0.068 0.004
#> SRR2105267 2 0.1356 0.7491 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105268 2 0.0992 0.7419 0.004 0.976 0.012 0.008
#> SRR2105265 2 0.0844 0.7399 0.004 0.980 0.012 0.004
#> SRR2105266 2 0.0804 0.7445 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR2105263 2 0.2975 0.7318 0.060 0.900 0.032 0.008
#> SRR2105264 2 0.2797 0.7389 0.056 0.908 0.028 0.008
#> SRR2105261 3 0.8089 0.6556 0.088 0.384 0.460 0.068
#> SRR2105262 3 0.8080 0.6587 0.092 0.384 0.460 0.064
#> SRR2105357 3 0.5982 0.6632 0.108 0.176 0.708 0.008
#> SRR2105358 3 0.5754 0.6766 0.092 0.176 0.724 0.008
#> SRR2105439 2 0.3962 0.6504 0.044 0.832 0.124 0.000
#> SRR2105440 2 0.3876 0.6504 0.040 0.836 0.124 0.000
#> SRR2105509 2 0.3183 0.7311 0.020 0.892 0.068 0.020
#> SRR2105510 2 0.2957 0.7373 0.016 0.900 0.068 0.016
#> SRR2105507 3 0.6326 0.7669 0.068 0.300 0.624 0.008
#> SRR2105508 3 0.6275 0.7625 0.072 0.304 0.620 0.004
#> SRR2105505 3 0.6664 0.7357 0.112 0.308 0.580 0.000
#> SRR2105506 3 0.6819 0.6886 0.124 0.312 0.564 0.000
#> SRR2105503 2 0.0927 0.7444 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR2105504 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105501 2 0.3389 0.7131 0.024 0.868 0.104 0.004
#> SRR2105502 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105499 3 0.6198 0.7665 0.044 0.312 0.628 0.016
#> SRR2105500 3 0.6245 0.7635 0.064 0.324 0.608 0.004
#> SRR2105497 2 0.2165 0.7490 0.024 0.936 0.032 0.008
#> SRR2105498 2 0.1722 0.7342 0.048 0.944 0.008 0.000
#> SRR2105495 2 0.3211 0.7271 0.024 0.884 0.084 0.008
#> SRR2105496 2 0.2529 0.7462 0.024 0.920 0.048 0.008
#> SRR2105493 2 0.4529 0.6004 0.024 0.776 0.196 0.004
#> SRR2105494 2 0.4190 0.6488 0.032 0.816 0.148 0.004
#> SRR2105491 2 0.3130 0.7297 0.052 0.896 0.040 0.012
#> SRR2105492 2 0.3130 0.7297 0.052 0.896 0.040 0.012
#> SRR2105489 2 0.1733 0.7164 0.028 0.948 0.024 0.000
#> SRR2105490 2 0.1411 0.7311 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105487 3 0.6959 0.6169 0.208 0.184 0.604 0.004
#> SRR2105488 3 0.6959 0.6169 0.208 0.184 0.604 0.004
#> SRR2105485 3 0.6589 0.7666 0.100 0.288 0.608 0.004
#> SRR2105486 3 0.6548 0.7650 0.072 0.308 0.608 0.012
#> SRR2105483 1 0.6741 0.9748 0.484 0.424 0.092 0.000
#> SRR2105484 1 0.6741 0.9748 0.484 0.424 0.092 0.000
#> SRR2105481 3 0.7349 0.6773 0.148 0.348 0.500 0.004
#> SRR2105482 3 0.7484 0.6264 0.160 0.364 0.472 0.004
#> SRR2105479 2 0.7708 -0.5856 0.188 0.408 0.400 0.004
#> SRR2105480 2 0.7923 -0.5753 0.208 0.412 0.372 0.008
#> SRR2105477 2 0.4805 0.6325 0.068 0.796 0.128 0.008
#> SRR2105478 2 0.3793 0.6839 0.044 0.844 0.112 0.000
#> SRR2105475 2 0.3204 0.7358 0.016 0.892 0.064 0.028
#> SRR2105476 2 0.3352 0.7310 0.016 0.884 0.072 0.028
#> SRR2105473 2 0.3245 0.7089 0.028 0.872 0.100 0.000
#> SRR2105474 2 0.2670 0.7344 0.024 0.904 0.072 0.000
#> SRR2105471 2 0.2174 0.6963 0.052 0.928 0.020 0.000
#> SRR2105472 2 0.2002 0.7075 0.044 0.936 0.020 0.000
#> SRR2105469 3 0.5822 0.7622 0.048 0.296 0.652 0.004
#> SRR2105470 3 0.6240 0.7630 0.076 0.320 0.604 0.000
#> SRR2105467 3 0.6449 0.7306 0.092 0.260 0.640 0.008
#> SRR2105468 3 0.6100 0.7431 0.084 0.272 0.644 0.000
#> SRR2105465 2 0.7658 -0.4796 0.212 0.416 0.372 0.000
#> SRR2105466 2 0.7823 -0.3970 0.280 0.412 0.308 0.000
#> SRR2105463 2 0.7914 -0.6099 0.360 0.400 0.236 0.004
#> SRR2105464 2 0.7714 -0.4630 0.316 0.440 0.244 0.000
#> SRR2105461 2 0.0188 0.7343 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.7354 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.2099 0.7488 0.008 0.936 0.044 0.012
#> SRR2105460 2 0.2186 0.7513 0.008 0.932 0.048 0.012
#> SRR2105457 3 0.6144 0.7571 0.052 0.276 0.656 0.016
#> SRR2105458 3 0.6042 0.7620 0.044 0.284 0.656 0.016
#> SRR2105455 3 0.6819 0.7466 0.112 0.348 0.540 0.000
#> SRR2105456 3 0.6894 0.7369 0.120 0.344 0.536 0.000
#> SRR2105453 3 0.6958 0.6659 0.184 0.232 0.584 0.000
#> SRR2105454 3 0.6969 0.6613 0.192 0.224 0.584 0.000
#> SRR2105451 2 0.4186 0.6436 0.024 0.808 0.164 0.004
#> SRR2105452 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105449 3 0.7004 0.6288 0.100 0.428 0.468 0.004
#> SRR2105450 3 0.7405 0.6152 0.144 0.400 0.452 0.004
#> SRR2105447 2 0.2271 0.7412 0.008 0.916 0.076 0.000
#> SRR2105448 2 0.2837 0.7398 0.012 0.904 0.068 0.016
#> SRR2105445 2 0.6077 0.1033 0.052 0.612 0.332 0.004
#> SRR2105446 2 0.6824 -0.3330 0.068 0.504 0.416 0.012
#> SRR2105443 2 0.6725 0.2210 0.052 0.616 0.296 0.036
#> SRR2105444 2 0.6343 0.2960 0.048 0.640 0.288 0.024
#> SRR2105441 2 0.2111 0.7404 0.024 0.932 0.044 0.000
#> SRR2105442 2 0.2142 0.7435 0.016 0.928 0.056 0.000
#> SRR2105437 3 0.6847 0.5599 0.252 0.140 0.604 0.004
#> SRR2105438 3 0.6847 0.5599 0.252 0.140 0.604 0.004
#> SRR2105435 3 0.7530 0.6457 0.144 0.400 0.448 0.008
#> SRR2105436 3 0.5896 0.7691 0.052 0.296 0.648 0.004
#> SRR2105433 2 0.7803 -0.5364 0.340 0.404 0.256 0.000
#> SRR2105434 3 0.7610 0.3661 0.200 0.400 0.400 0.000
#> SRR2105431 3 0.8031 0.3027 0.308 0.300 0.388 0.004
#> SRR2105432 3 0.8052 0.2441 0.292 0.340 0.364 0.004
#> SRR2105429 2 0.6160 0.4233 0.044 0.680 0.244 0.032
#> SRR2105430 2 0.4719 0.6240 0.032 0.792 0.160 0.016
#> SRR2105427 2 0.1821 0.7538 0.008 0.948 0.032 0.012
#> SRR2105428 2 0.2995 0.7433 0.020 0.900 0.064 0.016
#> SRR2105425 2 0.2010 0.7500 0.008 0.940 0.040 0.012
#> SRR2105426 2 0.2907 0.7444 0.032 0.900 0.064 0.004
#> SRR2105421 3 0.6622 0.7440 0.040 0.340 0.588 0.032
#> SRR2105422 3 0.6769 0.7250 0.044 0.360 0.564 0.032
#> SRR2105423 2 0.0779 0.7337 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105424 2 0.0657 0.7381 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105419 3 0.6264 0.7552 0.060 0.344 0.592 0.004
#> SRR2105420 3 0.5732 0.7449 0.028 0.364 0.604 0.004
#> SRR2105415 2 0.7896 -0.4537 0.296 0.368 0.336 0.000
#> SRR2105416 2 0.7883 -0.4048 0.316 0.384 0.300 0.000
#> SRR2105417 2 0.7815 -0.4386 0.256 0.392 0.352 0.000
#> SRR2105418 2 0.7627 -0.4329 0.204 0.408 0.388 0.000
#> SRR2105413 2 0.2716 0.7427 0.012 0.908 0.068 0.012
#> SRR2105414 2 0.2732 0.7340 0.012 0.904 0.076 0.008
#> SRR2105409 2 0.1733 0.7483 0.024 0.948 0.028 0.000
#> SRR2105410 2 0.2256 0.7474 0.020 0.924 0.056 0.000
#> SRR2105411 2 0.0927 0.7415 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR2105412 2 0.0992 0.7439 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR2105407 3 0.6124 0.7110 0.092 0.216 0.684 0.008
#> SRR2105408 3 0.6252 0.7158 0.088 0.224 0.676 0.012
#> SRR2105403 3 0.6212 0.6298 0.148 0.164 0.684 0.004
#> SRR2105404 3 0.6296 0.6320 0.152 0.168 0.676 0.004
#> SRR2105405 3 0.6500 0.7547 0.092 0.328 0.580 0.000
#> SRR2105406 3 0.6819 0.7102 0.112 0.348 0.540 0.000
#> SRR2105401 2 0.3071 0.7314 0.012 0.884 0.096 0.008
#> SRR2105402 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105399 2 0.6232 0.4855 0.024 0.708 0.168 0.100
#> SRR2105400 2 0.6273 0.4770 0.024 0.704 0.172 0.100
#> SRR2105397 2 0.7931 -0.0340 0.120 0.540 0.288 0.052
#> SRR2105398 2 0.7931 -0.0340 0.120 0.540 0.288 0.052
#> SRR2105395 2 0.1411 0.7453 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105396 2 0.1724 0.7325 0.032 0.948 0.020 0.000
#> SRR2105393 2 0.0376 0.7401 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR2105394 2 0.0817 0.7379 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.6116 0.7375 0.052 0.256 0.672 0.020
#> SRR2105390 3 0.5758 0.7502 0.048 0.264 0.680 0.008
#> SRR2105391 3 0.5758 0.7442 0.048 0.264 0.680 0.008
#> SRR2105392 3 0.5758 0.7448 0.048 0.264 0.680 0.008
#> SRR2105385 3 0.6719 0.7530 0.092 0.340 0.564 0.004
#> SRR2105386 3 0.6756 0.7487 0.096 0.336 0.564 0.004
#> SRR2105387 3 0.6705 0.6702 0.068 0.412 0.512 0.008
#> SRR2105388 3 0.6529 0.7670 0.088 0.308 0.600 0.004
#> SRR2105381 2 0.5065 0.6032 0.024 0.772 0.172 0.032
#> SRR2105382 2 0.3242 0.7311 0.016 0.884 0.084 0.016
#> SRR2105383 2 0.2739 0.7267 0.036 0.904 0.060 0.000
#> SRR2105384 2 0.3001 0.7219 0.036 0.896 0.064 0.004
#> SRR2105379 2 0.3272 0.7198 0.032 0.884 0.076 0.008
#> SRR2105380 2 0.3211 0.7204 0.040 0.892 0.056 0.012
#> SRR2105377 2 0.3142 0.6916 0.008 0.860 0.132 0.000
#> SRR2105378 2 0.3542 0.6861 0.028 0.852 0.120 0.000
#> SRR2105375 3 0.7316 0.5837 0.132 0.420 0.444 0.004
#> SRR2105376 3 0.7211 0.5367 0.120 0.432 0.444 0.004
#> SRR2105373 3 0.6594 0.6564 0.160 0.176 0.656 0.008
#> SRR2105374 3 0.6919 0.5867 0.244 0.152 0.600 0.004
#> SRR2105371 3 0.5734 0.7496 0.044 0.272 0.676 0.008
#> SRR2105372 3 0.6172 0.7596 0.060 0.296 0.636 0.008
#> SRR2105369 3 0.5767 0.7431 0.064 0.244 0.688 0.004
#> SRR2105370 3 0.5861 0.7630 0.060 0.296 0.644 0.000
#> SRR2105367 3 0.7362 0.5666 0.160 0.396 0.444 0.000
#> SRR2105368 3 0.7292 0.5929 0.152 0.388 0.460 0.000
#> SRR2105365 2 0.2928 0.7279 0.056 0.904 0.028 0.012
#> SRR2105366 2 0.3048 0.7267 0.056 0.900 0.028 0.016
#> SRR2105363 2 0.1913 0.7511 0.020 0.940 0.040 0.000
#> SRR2105364 2 0.1489 0.7528 0.004 0.952 0.044 0.000
#> SRR2105361 2 0.1151 0.7492 0.008 0.968 0.024 0.000
#> SRR2105362 2 0.1042 0.7488 0.008 0.972 0.020 0.000
#> SRR2105359 3 0.6063 0.7658 0.048 0.316 0.628 0.008
#> SRR2105360 3 0.5794 0.7631 0.040 0.320 0.636 0.004
#> SRR2105355 3 0.6005 0.7612 0.060 0.324 0.616 0.000
#> SRR2105356 3 0.6435 0.7593 0.080 0.312 0.604 0.004
#> SRR2105353 3 0.7984 0.6865 0.072 0.232 0.572 0.124
#> SRR2105354 3 0.6670 0.7582 0.064 0.280 0.628 0.028
#> SRR2105351 2 0.1762 0.7490 0.012 0.952 0.020 0.016
#> SRR2105352 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105349 2 0.3572 0.7254 0.020 0.872 0.084 0.024
#> SRR2105350 2 0.1182 0.7508 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR2105345 2 0.2699 0.7313 0.028 0.904 0.068 0.000
#> SRR2105346 2 0.2300 0.7406 0.016 0.920 0.064 0.000
#> SRR2105347 2 0.4332 0.5245 0.112 0.816 0.072 0.000
#> SRR2105348 2 0.4332 0.5245 0.112 0.816 0.072 0.000
#> SRR2105343 2 0.0672 0.7396 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR2105344 2 0.1022 0.7517 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105341 3 0.5905 0.7525 0.036 0.288 0.660 0.016
#> SRR2105342 3 0.6043 0.7654 0.048 0.312 0.632 0.008
#> SRR2105339 3 0.6980 0.7579 0.072 0.316 0.584 0.028
#> SRR2105340 3 0.6403 0.7602 0.052 0.324 0.608 0.016
#> SRR2105335 3 0.6427 0.6895 0.140 0.196 0.660 0.004
#> SRR2105336 3 0.6758 0.7146 0.156 0.240 0.604 0.000
#> SRR2105337 3 0.6636 0.7216 0.080 0.364 0.552 0.004
#> SRR2105338 3 0.6677 0.6941 0.092 0.384 0.524 0.000
#> SRR2105331 2 0.2197 0.7475 0.028 0.936 0.024 0.012
#> SRR2105332 2 0.1920 0.7487 0.028 0.944 0.024 0.004
#> SRR2105333 2 0.2911 0.7424 0.012 0.900 0.072 0.016
#> SRR2105334 2 0.3031 0.7371 0.016 0.896 0.072 0.016
#> SRR2105329 2 0.4704 0.5881 0.028 0.764 0.204 0.004
#> SRR2105330 2 0.4719 0.6314 0.032 0.792 0.160 0.016
#> SRR2105327 2 0.1854 0.7523 0.012 0.940 0.048 0.000
#> SRR2105328 2 0.2040 0.7513 0.012 0.936 0.048 0.004
#> SRR2105325 3 0.8958 0.6037 0.200 0.244 0.464 0.092
#> SRR2105326 3 0.8982 0.5986 0.204 0.244 0.460 0.092
#> SRR2105323 3 0.6028 0.7505 0.056 0.248 0.680 0.016
#> SRR2105324 3 0.5497 0.7626 0.032 0.296 0.668 0.004
#> SRR2105319 3 0.7048 0.6896 0.184 0.220 0.592 0.004
#> SRR2105320 3 0.7221 0.6534 0.196 0.212 0.584 0.008
#> SRR2105321 3 0.8518 0.6564 0.160 0.244 0.516 0.080
#> SRR2105322 3 0.8518 0.6564 0.160 0.244 0.516 0.080
#> SRR2105317 2 0.2441 0.7444 0.004 0.920 0.056 0.020
#> SRR2105318 2 0.1247 0.7498 0.004 0.968 0.016 0.012
#> SRR2105315 2 0.5421 0.1838 0.016 0.648 0.328 0.008
#> SRR2105316 2 0.2641 0.7466 0.012 0.912 0.064 0.012
#> SRR2105313 2 0.1114 0.7505 0.004 0.972 0.016 0.008
#> SRR2105314 2 0.1124 0.7458 0.012 0.972 0.012 0.004
#> SRR2105311 3 0.9080 0.5885 0.212 0.284 0.420 0.084
#> SRR2105312 3 0.9071 0.5739 0.204 0.296 0.416 0.084
#> SRR2105307 3 0.7362 0.5611 0.164 0.372 0.464 0.000
#> SRR2105308 3 0.7277 0.6014 0.156 0.360 0.484 0.000
#> SRR2105309 3 0.6170 0.7591 0.044 0.288 0.648 0.020
#> SRR2105310 3 0.5755 0.7598 0.040 0.288 0.664 0.008
#> SRR2105305 3 0.5600 0.7517 0.040 0.264 0.688 0.008
#> SRR2105306 3 0.5768 0.7586 0.044 0.300 0.652 0.004
#> SRR2105303 2 0.0657 0.7432 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105304 4 0.0336 0.9090 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105301 2 0.3489 0.7340 0.032 0.880 0.068 0.020
#> SRR2105302 2 0.2775 0.7432 0.012 0.912 0.044 0.032
#> SRR2105299 2 0.7051 -0.3701 0.076 0.480 0.428 0.016
#> SRR2105300 2 0.7136 0.0957 0.088 0.584 0.300 0.028
#> SRR2105297 2 0.6340 -0.7370 0.408 0.528 0.064 0.000
#> SRR2105298 2 0.6332 -0.7319 0.404 0.532 0.064 0.000
#> SRR2105295 2 0.2667 0.7442 0.008 0.912 0.060 0.020
#> SRR2105296 2 0.2262 0.7511 0.016 0.932 0.040 0.012
#> SRR2105293 3 0.8147 0.6222 0.136 0.388 0.436 0.040
#> SRR2105294 3 0.7207 0.7054 0.116 0.364 0.512 0.008
#> SRR2105291 3 0.6552 0.5896 0.076 0.440 0.484 0.000
#> SRR2105292 3 0.7358 0.5685 0.160 0.392 0.448 0.000
#> SRR2105289 3 0.6750 0.7494 0.056 0.344 0.576 0.024
#> SRR2105290 3 0.7033 0.6569 0.128 0.364 0.508 0.000
#> SRR2105287 3 0.6835 0.6873 0.124 0.316 0.560 0.000
#> SRR2105288 3 0.7480 0.4610 0.180 0.376 0.444 0.000
#> SRR2105285 2 0.2781 0.7401 0.008 0.904 0.072 0.016
#> SRR2105286 2 0.2587 0.7462 0.008 0.916 0.056 0.020
#> SRR2105283 2 0.5130 0.5277 0.044 0.740 0.212 0.004
#> SRR2105284 2 0.5240 0.5605 0.052 0.748 0.192 0.008
#> SRR2105281 2 0.1545 0.7514 0.008 0.952 0.040 0.000
#> SRR2105282 2 0.1394 0.7473 0.012 0.964 0.016 0.008
#> SRR2105259 3 0.6127 0.7089 0.084 0.216 0.688 0.012
#> SRR2105260 3 0.6244 0.7175 0.080 0.224 0.680 0.016
#> SRR2105279 2 0.0188 0.7367 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0188 0.7353 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105257 3 0.7468 0.6392 0.176 0.312 0.508 0.004
#> SRR2105258 3 0.7512 0.6402 0.180 0.316 0.500 0.004
#> SRR2105253 2 0.2307 0.7524 0.008 0.928 0.048 0.016
#> SRR2105254 2 0.1863 0.7538 0.004 0.944 0.040 0.012
#> SRR2105255 3 0.5690 0.7556 0.060 0.268 0.672 0.000
#> SRR2105256 3 0.5972 0.7630 0.064 0.304 0.632 0.000
#> SRR2105251 2 0.0967 0.7410 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR2105252 2 0.0967 0.7410 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR2105249 2 0.2450 0.7383 0.016 0.912 0.072 0.000
#> SRR2105250 2 0.3245 0.7009 0.028 0.872 0.100 0.000
#> SRR2105247 2 0.0524 0.7367 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105248 2 0.1022 0.7385 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.7447 0.6821 0.084 0.384 0.500 0.032
#> SRR2105246 3 0.7500 0.6659 0.076 0.388 0.496 0.040
#> SRR2105243 3 0.5941 0.7290 0.036 0.376 0.584 0.004
#> SRR2105244 3 0.6844 0.6882 0.104 0.396 0.500 0.000
#> SRR2105241 3 0.6968 0.6605 0.116 0.392 0.492 0.000
#> SRR2105242 3 0.7440 0.5022 0.172 0.388 0.440 0.000
#> SRR2105239 3 0.7760 0.5944 0.228 0.244 0.516 0.012
#> SRR2105240 3 0.7595 0.5572 0.176 0.360 0.460 0.004
#> SRR2105237 2 0.5156 0.6339 0.052 0.788 0.128 0.032
#> SRR2105238 2 0.4155 0.6880 0.032 0.836 0.116 0.016
#> SRR2105235 2 0.2124 0.7347 0.008 0.924 0.068 0.000
#> SRR2105236 2 0.2198 0.7366 0.008 0.920 0.072 0.000
#> SRR2105233 2 0.2966 0.7357 0.008 0.896 0.076 0.020
#> SRR2105234 2 0.2966 0.7357 0.008 0.896 0.076 0.020
#> SRR2105231 2 0.0188 0.7343 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0859 0.7470 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR2105227 2 0.7178 -0.4716 0.072 0.480 0.424 0.024
#> SRR2105228 2 0.6828 -0.3085 0.092 0.528 0.376 0.004
#> SRR2105225 3 0.6716 0.7543 0.112 0.320 0.568 0.000
#> SRR2105226 3 0.6897 0.6902 0.124 0.332 0.544 0.000
#> SRR2105229 3 0.6990 0.7566 0.080 0.312 0.584 0.024
#> SRR2105230 3 0.6067 0.7592 0.052 0.264 0.668 0.016
#> SRR2105219 2 0.1356 0.7525 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105220 2 0.1543 0.7489 0.008 0.956 0.032 0.004
#> SRR2105221 2 0.3907 0.6780 0.044 0.836 0.120 0.000
#> SRR2105222 2 0.3877 0.6804 0.048 0.840 0.112 0.000
#> SRR2105223 3 0.5993 0.7618 0.064 0.308 0.628 0.000
#> SRR2105224 3 0.6412 0.7412 0.080 0.348 0.572 0.000
#> SRR2105217 2 0.1707 0.7438 0.024 0.952 0.020 0.004
#> SRR2105218 2 0.1209 0.7375 0.032 0.964 0.004 0.000
#> SRR2105215 2 0.0657 0.7399 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105216 2 0.0657 0.7384 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105213 3 0.7872 0.6328 0.152 0.376 0.452 0.020
#> SRR2105214 3 0.8036 0.6738 0.128 0.360 0.472 0.040
#> SRR2105211 3 0.5908 0.7630 0.048 0.312 0.636 0.004
#> SRR2105212 3 0.5973 0.7616 0.056 0.332 0.612 0.000
#> SRR2105209 3 0.6945 0.7307 0.136 0.312 0.552 0.000
#> SRR2105210 3 0.7260 0.5528 0.148 0.388 0.464 0.000
#> SRR2105207 3 0.7571 0.6177 0.180 0.336 0.480 0.004
#> SRR2105208 2 0.7780 -0.4316 0.204 0.420 0.372 0.004
#> SRR2105205 2 0.2975 0.7416 0.032 0.900 0.060 0.008
#> SRR2105206 2 0.3135 0.7355 0.044 0.896 0.048 0.012
#> SRR2105201 2 0.4417 0.6071 0.044 0.796 0.160 0.000
#> SRR2105202 2 0.3803 0.6659 0.032 0.836 0.132 0.000
#> SRR2105203 2 0.0336 0.7414 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105204 2 0.0376 0.7403 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105199 2 0.0672 0.7432 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105200 2 0.1411 0.7371 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105197 3 0.6286 0.6741 0.132 0.176 0.684 0.008
#> SRR2105198 3 0.6353 0.6824 0.128 0.188 0.676 0.008
#> SRR2105195 3 0.7792 0.5660 0.164 0.408 0.416 0.012
#> SRR2105196 2 0.6865 0.0310 0.116 0.576 0.304 0.004
#> SRR2105193 2 0.7733 -0.3451 0.304 0.440 0.256 0.000
#> SRR2105194 2 0.7844 -0.3549 0.288 0.404 0.308 0.000
#> SRR2105191 3 0.6140 -0.1306 0.400 0.036 0.556 0.008
#> SRR2105192 3 0.7042 0.6646 0.180 0.224 0.592 0.004
#> SRR2105189 2 0.3344 0.7080 0.020 0.868 0.108 0.004
#> SRR2105190 2 0.2040 0.7526 0.004 0.936 0.048 0.012
#> SRR2105187 2 0.5736 0.5417 0.076 0.744 0.156 0.024
#> SRR2105188 2 0.5777 0.5263 0.088 0.728 0.172 0.012
#> SRR2105179 3 0.7699 0.6203 0.172 0.364 0.456 0.008
#> SRR2105180 2 0.7530 -0.4988 0.188 0.436 0.376 0.000
#> SRR2105183 2 0.0804 0.7415 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR2105184 2 0.1411 0.7325 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105185 2 0.4318 0.6702 0.060 0.836 0.088 0.016
#> SRR2105186 2 0.3777 0.6994 0.056 0.864 0.068 0.012
#> SRR2105181 3 0.6652 0.6985 0.136 0.212 0.644 0.008
#> SRR2105182 3 0.5198 0.7525 0.040 0.252 0.708 0.000
#> SRR2105177 1 0.7001 0.9337 0.464 0.420 0.116 0.000
#> SRR2105178 1 0.6788 0.9755 0.480 0.424 0.096 0.000
#> SRR2105171 2 0.0657 0.7446 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105172 2 0.0895 0.7461 0.004 0.976 0.020 0.000
#> SRR2105175 2 0.7777 -0.4241 0.304 0.428 0.268 0.000
#> SRR2105176 2 0.7784 -0.3657 0.280 0.428 0.292 0.000
#> SRR2105173 2 0.2196 0.7457 0.032 0.936 0.016 0.016
#> SRR2105174 2 0.1247 0.7452 0.016 0.968 0.012 0.004
#> SRR2105169 2 0.1004 0.7373 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR2105170 2 0.1388 0.7424 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR2105167 2 0.0524 0.7382 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105168 2 0.0927 0.7285 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR2105165 3 0.7149 0.7242 0.156 0.316 0.528 0.000
#> SRR2105166 3 0.7119 0.7107 0.140 0.352 0.508 0.000
#> SRR2105163 3 0.8696 0.6409 0.180 0.272 0.476 0.072
#> SRR2105164 3 0.8761 0.6448 0.192 0.268 0.468 0.072
#> SRR2105161 2 0.7847 -0.4915 0.220 0.416 0.360 0.004
#> SRR2105162 2 0.7695 -0.4299 0.220 0.408 0.372 0.000
#> SRR2105155 2 0.0524 0.7404 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR2105156 2 0.1297 0.7451 0.016 0.964 0.020 0.000
#> SRR2105157 2 0.1256 0.7386 0.028 0.964 0.008 0.000
#> SRR2105158 2 0.1677 0.7367 0.040 0.948 0.012 0.000
#> SRR2105159 3 0.7946 0.6327 0.208 0.320 0.460 0.012
#> SRR2105160 3 0.7780 0.4172 0.204 0.372 0.420 0.004
#> SRR2105153 2 0.1575 0.7400 0.028 0.956 0.012 0.004
#> SRR2105154 2 0.1575 0.7384 0.028 0.956 0.012 0.004
#> SRR2105151 2 0.0469 0.7441 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105152 2 0.0937 0.7348 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR2105149 3 0.6921 0.6470 0.056 0.408 0.512 0.024
#> SRR2105150 3 0.6836 0.6421 0.056 0.412 0.512 0.020
#> SRR2105147 4 0.6896 0.6853 0.108 0.044 0.180 0.668
#> SRR2105148 4 0.6896 0.6853 0.108 0.044 0.180 0.668
#> SRR2105143 3 0.7477 0.5807 0.152 0.416 0.428 0.004
#> SRR2105144 2 0.7387 -0.3957 0.144 0.468 0.384 0.004
#> SRR2105145 2 0.7776 -0.3795 0.340 0.412 0.248 0.000
#> SRR2105146 2 0.7855 -0.3698 0.300 0.400 0.300 0.000
#> SRR2105141 2 0.2245 0.7410 0.040 0.932 0.020 0.008
#> SRR2105142 2 0.2245 0.7410 0.040 0.932 0.020 0.008
#> SRR2105139 2 0.1042 0.7366 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR2105140 2 0.1520 0.7341 0.024 0.956 0.020 0.000
#> SRR2105137 2 0.3485 0.6894 0.028 0.856 0.116 0.000
#> SRR2105138 2 0.3863 0.6590 0.028 0.828 0.144 0.000
#> SRR2105135 2 0.0469 0.7363 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0657 0.7353 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105133 3 0.6149 0.6537 0.132 0.176 0.688 0.004
#> SRR2105134 3 0.6196 0.6518 0.136 0.176 0.684 0.004
#> SRR2105131 2 0.7009 -0.4403 0.072 0.464 0.448 0.016
#> SRR2105132 3 0.6790 0.6146 0.084 0.408 0.504 0.004
#> SRR2105129 2 0.7369 -0.7645 0.408 0.432 0.160 0.000
#> SRR2105130 1 0.6788 0.9752 0.480 0.424 0.096 0.000
#> SRR2105127 3 0.6954 0.6891 0.152 0.280 0.568 0.000
#> SRR2105128 3 0.6568 0.6238 0.080 0.408 0.512 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.4811 0.37823 0.028 0.052 0.760 0.004 0.156
#> SRR2105278 3 0.4934 0.38094 0.024 0.060 0.748 0.004 0.164
#> SRR2105275 3 0.8311 0.40008 0.088 0.136 0.504 0.068 0.204
#> SRR2105276 3 0.8207 0.42448 0.092 0.156 0.516 0.056 0.180
#> SRR2105273 3 0.6078 0.58188 0.072 0.152 0.672 0.000 0.104
#> SRR2105274 3 0.6377 0.57398 0.096 0.200 0.632 0.000 0.072
#> SRR2105271 3 0.6734 0.56930 0.108 0.196 0.604 0.000 0.092
#> SRR2105272 3 0.7955 0.16695 0.272 0.240 0.408 0.004 0.076
#> SRR2105269 2 0.1365 0.86677 0.004 0.952 0.040 0.004 0.000
#> SRR2105270 2 0.2354 0.86509 0.008 0.904 0.076 0.000 0.012
#> SRR2105267 2 0.1363 0.86463 0.004 0.956 0.032 0.004 0.004
#> SRR2105268 2 0.1248 0.86276 0.016 0.964 0.008 0.008 0.004
#> SRR2105265 2 0.0981 0.86163 0.012 0.972 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105266 2 0.1209 0.86603 0.012 0.964 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105263 2 0.4181 0.82449 0.076 0.824 0.032 0.008 0.060
#> SRR2105264 2 0.3905 0.83547 0.084 0.836 0.020 0.008 0.052
#> SRR2105261 3 0.8210 0.40970 0.084 0.252 0.488 0.056 0.120
#> SRR2105262 3 0.8224 0.41289 0.092 0.248 0.488 0.052 0.120
#> SRR2105357 3 0.4711 0.38993 0.012 0.056 0.760 0.008 0.164
#> SRR2105358 3 0.4703 0.44957 0.020 0.064 0.776 0.008 0.132
#> SRR2105439 2 0.4661 0.73609 0.040 0.776 0.128 0.000 0.056
#> SRR2105440 2 0.4586 0.74022 0.036 0.780 0.128 0.000 0.056
#> SRR2105509 2 0.3164 0.84863 0.016 0.876 0.076 0.020 0.012
#> SRR2105510 2 0.3000 0.85432 0.012 0.884 0.072 0.020 0.012
#> SRR2105507 3 0.5869 0.58952 0.072 0.156 0.688 0.000 0.084
#> SRR2105508 3 0.5723 0.58979 0.056 0.172 0.692 0.000 0.080
#> SRR2105505 3 0.6378 0.46768 0.152 0.132 0.644 0.000 0.072
#> SRR2105506 3 0.7162 0.39380 0.192 0.176 0.552 0.000 0.080
#> SRR2105503 2 0.1278 0.86745 0.020 0.960 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105504 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3582 0.83400 0.024 0.848 0.096 0.004 0.028
#> SRR2105502 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.6039 0.58798 0.056 0.192 0.676 0.012 0.064
#> SRR2105500 3 0.6313 0.58136 0.084 0.204 0.636 0.000 0.076
#> SRR2105497 2 0.2547 0.86861 0.028 0.912 0.036 0.012 0.012
#> SRR2105498 2 0.3256 0.84184 0.084 0.864 0.024 0.000 0.028
#> SRR2105495 2 0.3547 0.84018 0.016 0.852 0.092 0.008 0.032
#> SRR2105496 2 0.2917 0.86321 0.012 0.884 0.076 0.004 0.024
#> SRR2105493 2 0.5059 0.68995 0.024 0.720 0.196 0.000 0.060
#> SRR2105494 2 0.4467 0.74305 0.020 0.768 0.176 0.004 0.032
#> SRR2105491 2 0.4361 0.81968 0.068 0.820 0.040 0.016 0.056
#> SRR2105492 2 0.4361 0.81968 0.068 0.820 0.040 0.016 0.056
#> SRR2105489 2 0.2791 0.84714 0.072 0.888 0.004 0.004 0.032
#> SRR2105490 2 0.1925 0.86033 0.036 0.936 0.012 0.004 0.012
#> SRR2105487 3 0.6327 0.18285 0.092 0.044 0.596 0.000 0.268
#> SRR2105488 3 0.6327 0.18285 0.092 0.044 0.596 0.000 0.268
#> SRR2105485 3 0.5896 0.57984 0.072 0.148 0.688 0.000 0.092
#> SRR2105486 3 0.6029 0.58241 0.068 0.168 0.684 0.008 0.072
#> SRR2105483 1 0.3167 0.37671 0.836 0.148 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105484 1 0.3167 0.37671 0.836 0.148 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105481 3 0.7796 0.35403 0.220 0.208 0.476 0.004 0.092
#> SRR2105482 3 0.7444 0.21318 0.248 0.180 0.496 0.000 0.076
#> SRR2105479 3 0.8237 0.16956 0.260 0.236 0.388 0.004 0.112
#> SRR2105480 3 0.7704 0.15388 0.296 0.232 0.416 0.004 0.052
#> SRR2105477 2 0.5194 0.72954 0.040 0.740 0.152 0.004 0.064
#> SRR2105478 2 0.4455 0.79023 0.040 0.788 0.128 0.000 0.044
#> SRR2105475 2 0.3389 0.85302 0.024 0.872 0.060 0.024 0.020
#> SRR2105476 2 0.3407 0.85102 0.024 0.868 0.068 0.028 0.012
#> SRR2105473 2 0.3833 0.80716 0.032 0.828 0.108 0.000 0.032
#> SRR2105474 2 0.3419 0.83175 0.036 0.856 0.084 0.000 0.024
#> SRR2105471 2 0.2952 0.83465 0.088 0.872 0.004 0.000 0.036
#> SRR2105472 2 0.2670 0.84093 0.080 0.888 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105469 3 0.5345 0.59100 0.040 0.168 0.724 0.004 0.064
#> SRR2105470 3 0.5943 0.58129 0.100 0.192 0.664 0.000 0.044
#> SRR2105467 3 0.6159 0.49923 0.064 0.104 0.680 0.008 0.144
#> SRR2105468 3 0.6310 0.51294 0.088 0.140 0.656 0.000 0.116
#> SRR2105465 1 0.7584 0.23804 0.380 0.236 0.336 0.000 0.048
#> SRR2105466 1 0.7167 0.55165 0.504 0.208 0.244 0.000 0.044
#> SRR2105463 1 0.6471 0.56131 0.620 0.148 0.180 0.000 0.052
#> SRR2105464 1 0.6491 0.58856 0.564 0.208 0.212 0.000 0.016
#> SRR2105461 2 0.0162 0.85474 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0162 0.85547 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.1913 0.86585 0.000 0.932 0.044 0.016 0.008
#> SRR2105460 2 0.2260 0.86963 0.012 0.920 0.048 0.016 0.004
#> SRR2105457 3 0.5315 0.58809 0.024 0.160 0.736 0.020 0.060
#> SRR2105458 3 0.5514 0.59076 0.032 0.164 0.724 0.020 0.060
#> SRR2105455 3 0.6194 0.54647 0.100 0.228 0.628 0.000 0.044
#> SRR2105456 3 0.6527 0.52744 0.136 0.212 0.604 0.000 0.048
#> SRR2105453 3 0.6650 0.35890 0.160 0.076 0.616 0.000 0.148
#> SRR2105454 3 0.6453 0.36002 0.148 0.064 0.632 0.000 0.156
#> SRR2105451 2 0.4255 0.74485 0.016 0.772 0.180 0.000 0.032
#> SRR2105452 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.6976 0.40393 0.164 0.264 0.528 0.000 0.044
#> SRR2105450 3 0.7329 0.29524 0.232 0.240 0.480 0.000 0.048
#> SRR2105447 2 0.2429 0.85703 0.020 0.900 0.076 0.000 0.004
#> SRR2105448 2 0.2663 0.86300 0.012 0.900 0.064 0.016 0.008
#> SRR2105445 2 0.5835 0.20071 0.024 0.552 0.372 0.000 0.052
#> SRR2105446 3 0.6887 0.10220 0.040 0.432 0.436 0.012 0.080
#> SRR2105443 2 0.6641 0.35382 0.028 0.576 0.292 0.024 0.080
#> SRR2105444 2 0.6313 0.41381 0.028 0.596 0.288 0.012 0.076
#> SRR2105441 2 0.2618 0.85246 0.036 0.900 0.052 0.000 0.012
#> SRR2105442 2 0.2824 0.84655 0.028 0.888 0.068 0.000 0.016
#> SRR2105437 3 0.6008 0.07318 0.088 0.016 0.568 0.000 0.328
#> SRR2105438 3 0.6008 0.07318 0.088 0.016 0.568 0.000 0.328
#> SRR2105435 3 0.7378 0.39136 0.176 0.264 0.500 0.004 0.056
#> SRR2105436 3 0.5872 0.59212 0.080 0.156 0.688 0.000 0.076
#> SRR2105433 1 0.6626 0.58777 0.576 0.188 0.204 0.000 0.032
#> SRR2105434 1 0.7174 0.15603 0.376 0.236 0.368 0.000 0.020
#> SRR2105431 1 0.7894 0.36670 0.404 0.132 0.328 0.000 0.136
#> SRR2105432 1 0.7793 0.41435 0.420 0.156 0.320 0.000 0.104
#> SRR2105429 2 0.6302 0.47749 0.048 0.624 0.260 0.020 0.048
#> SRR2105430 2 0.4798 0.74286 0.032 0.764 0.160 0.012 0.032
#> SRR2105427 2 0.1892 0.87055 0.004 0.936 0.040 0.008 0.012
#> SRR2105428 2 0.3013 0.86437 0.020 0.888 0.060 0.016 0.016
#> SRR2105425 2 0.2333 0.87288 0.020 0.920 0.040 0.012 0.008
#> SRR2105426 2 0.3311 0.86224 0.048 0.868 0.064 0.004 0.016
#> SRR2105421 3 0.6345 0.57483 0.044 0.204 0.656 0.028 0.068
#> SRR2105422 3 0.6482 0.56060 0.044 0.224 0.636 0.028 0.068
#> SRR2105423 2 0.1220 0.86389 0.020 0.964 0.004 0.004 0.008
#> SRR2105424 2 0.0798 0.86151 0.016 0.976 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.5775 0.57914 0.056 0.220 0.672 0.004 0.048
#> SRR2105420 3 0.5903 0.56555 0.052 0.244 0.644 0.000 0.060
#> SRR2105415 1 0.7195 0.44258 0.464 0.156 0.332 0.000 0.048
#> SRR2105416 1 0.6782 0.54610 0.532 0.172 0.268 0.000 0.028
#> SRR2105417 1 0.7509 0.39966 0.444 0.180 0.312 0.000 0.064
#> SRR2105418 1 0.7443 0.33392 0.400 0.208 0.348 0.000 0.044
#> SRR2105413 2 0.2603 0.86271 0.004 0.900 0.068 0.016 0.012
#> SRR2105414 2 0.2976 0.84904 0.016 0.876 0.092 0.008 0.008
#> SRR2105409 2 0.2165 0.87053 0.024 0.924 0.036 0.000 0.016
#> SRR2105410 2 0.3033 0.86048 0.024 0.880 0.064 0.000 0.032
#> SRR2105411 2 0.1029 0.86376 0.008 0.972 0.008 0.004 0.008
#> SRR2105412 2 0.1347 0.86601 0.020 0.960 0.008 0.004 0.008
#> SRR2105407 3 0.4389 0.51730 0.004 0.084 0.788 0.008 0.116
#> SRR2105408 3 0.4460 0.53254 0.004 0.092 0.788 0.012 0.104
#> SRR2105403 3 0.5275 0.26496 0.028 0.044 0.696 0.004 0.228
#> SRR2105404 3 0.5380 0.26219 0.032 0.044 0.688 0.004 0.232
#> SRR2105405 3 0.6707 0.54995 0.148 0.188 0.600 0.000 0.064
#> SRR2105406 3 0.6676 0.46735 0.212 0.188 0.568 0.000 0.032
#> SRR2105401 2 0.3151 0.84980 0.012 0.868 0.096 0.012 0.012
#> SRR2105402 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.6015 0.60076 0.020 0.672 0.188 0.100 0.020
#> SRR2105400 2 0.6046 0.59235 0.020 0.668 0.192 0.100 0.020
#> SRR2105397 2 0.7785 0.00129 0.040 0.464 0.300 0.032 0.164
#> SRR2105398 2 0.7785 0.00129 0.040 0.464 0.300 0.032 0.164
#> SRR2105395 2 0.2052 0.86850 0.032 0.932 0.016 0.004 0.016
#> SRR2105396 2 0.2074 0.86353 0.056 0.924 0.008 0.004 0.008
#> SRR2105393 2 0.0867 0.86399 0.008 0.976 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105394 2 0.1386 0.86351 0.032 0.952 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105389 3 0.4880 0.56073 0.020 0.108 0.772 0.012 0.088
#> SRR2105390 3 0.5152 0.58228 0.028 0.128 0.736 0.000 0.108
#> SRR2105391 3 0.4531 0.57537 0.020 0.128 0.788 0.008 0.056
#> SRR2105392 3 0.4553 0.57607 0.024 0.128 0.788 0.008 0.052
#> SRR2105385 3 0.6479 0.55202 0.116 0.216 0.612 0.000 0.056
#> SRR2105386 3 0.6690 0.53931 0.128 0.204 0.600 0.000 0.068
#> SRR2105387 3 0.6408 0.48769 0.112 0.252 0.600 0.004 0.032
#> SRR2105388 3 0.6269 0.57607 0.112 0.184 0.644 0.000 0.060
#> SRR2105381 2 0.5117 0.71723 0.024 0.748 0.164 0.032 0.032
#> SRR2105382 2 0.3440 0.84997 0.028 0.864 0.076 0.012 0.020
#> SRR2105383 2 0.3085 0.83731 0.068 0.868 0.060 0.000 0.004
#> SRR2105384 2 0.3256 0.83422 0.064 0.864 0.060 0.000 0.012
#> SRR2105379 2 0.3323 0.85114 0.044 0.868 0.068 0.012 0.008
#> SRR2105380 2 0.3495 0.83284 0.072 0.852 0.064 0.004 0.008
#> SRR2105377 2 0.3774 0.78500 0.016 0.816 0.140 0.000 0.028
#> SRR2105378 2 0.4334 0.77185 0.044 0.796 0.124 0.000 0.036
#> SRR2105375 3 0.7790 0.24602 0.188 0.272 0.444 0.000 0.096
#> SRR2105376 3 0.7808 0.19329 0.204 0.264 0.440 0.000 0.092
#> SRR2105373 3 0.5444 0.25103 0.052 0.020 0.664 0.004 0.260
#> SRR2105374 3 0.6070 0.11494 0.100 0.016 0.576 0.000 0.308
#> SRR2105371 3 0.5045 0.57373 0.032 0.120 0.748 0.000 0.100
#> SRR2105372 3 0.5456 0.58979 0.036 0.152 0.712 0.000 0.100
#> SRR2105369 3 0.5493 0.58894 0.040 0.148 0.720 0.004 0.088
#> SRR2105370 3 0.5142 0.58341 0.048 0.168 0.732 0.000 0.052
#> SRR2105367 3 0.7810 0.14742 0.252 0.232 0.432 0.000 0.084
#> SRR2105368 3 0.7665 0.21036 0.236 0.232 0.456 0.000 0.076
#> SRR2105365 2 0.4057 0.82365 0.076 0.832 0.024 0.012 0.056
#> SRR2105366 2 0.4176 0.82222 0.076 0.828 0.028 0.016 0.052
#> SRR2105363 2 0.2326 0.86931 0.020 0.916 0.044 0.000 0.020
#> SRR2105364 2 0.1757 0.87145 0.004 0.936 0.048 0.000 0.012
#> SRR2105361 2 0.1267 0.86894 0.000 0.960 0.024 0.004 0.012
#> SRR2105362 2 0.1267 0.86884 0.000 0.960 0.024 0.004 0.012
#> SRR2105359 3 0.5585 0.59436 0.044 0.196 0.700 0.008 0.052
#> SRR2105360 3 0.5878 0.58280 0.056 0.208 0.672 0.004 0.060
#> SRR2105355 3 0.5315 0.59036 0.052 0.180 0.716 0.000 0.052
#> SRR2105356 3 0.6332 0.56427 0.140 0.188 0.628 0.000 0.044
#> SRR2105353 3 0.7041 0.51171 0.036 0.112 0.636 0.104 0.112
#> SRR2105354 3 0.6459 0.58225 0.052 0.160 0.656 0.016 0.116
#> SRR2105351 2 0.1903 0.87095 0.012 0.940 0.020 0.020 0.008
#> SRR2105352 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.3447 0.84614 0.028 0.860 0.084 0.020 0.008
#> SRR2105350 2 0.1517 0.87059 0.004 0.952 0.028 0.012 0.004
#> SRR2105345 2 0.3538 0.82277 0.056 0.848 0.080 0.000 0.016
#> SRR2105346 2 0.2790 0.85300 0.028 0.892 0.060 0.000 0.020
#> SRR2105347 2 0.5403 0.53211 0.244 0.672 0.060 0.000 0.024
#> SRR2105348 2 0.5403 0.53211 0.244 0.672 0.060 0.000 0.024
#> SRR2105343 2 0.0740 0.86050 0.008 0.980 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105344 2 0.1331 0.86991 0.008 0.952 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.4797 0.58511 0.016 0.156 0.760 0.008 0.060
#> SRR2105342 3 0.5915 0.59887 0.040 0.184 0.676 0.004 0.096
#> SRR2105339 3 0.6613 0.57061 0.056 0.208 0.632 0.020 0.084
#> SRR2105340 3 0.6386 0.58143 0.056 0.196 0.644 0.008 0.096
#> SRR2105335 3 0.5569 0.42274 0.076 0.052 0.704 0.000 0.168
#> SRR2105336 3 0.6971 0.45312 0.132 0.120 0.592 0.000 0.156
#> SRR2105337 3 0.6704 0.50233 0.152 0.208 0.588 0.000 0.052
#> SRR2105338 3 0.7020 0.45072 0.164 0.236 0.544 0.000 0.056
#> SRR2105331 2 0.2925 0.86403 0.032 0.896 0.024 0.012 0.036
#> SRR2105332 2 0.2855 0.86465 0.032 0.896 0.028 0.004 0.040
#> SRR2105333 2 0.3219 0.85648 0.028 0.876 0.068 0.016 0.012
#> SRR2105334 2 0.3052 0.85842 0.012 0.884 0.064 0.012 0.028
#> SRR2105329 2 0.4817 0.67381 0.020 0.724 0.224 0.008 0.024
#> SRR2105330 2 0.4721 0.74183 0.020 0.764 0.168 0.016 0.032
#> SRR2105327 2 0.2341 0.86769 0.020 0.912 0.056 0.000 0.012
#> SRR2105328 2 0.2445 0.86611 0.020 0.908 0.056 0.000 0.016
#> SRR2105325 3 0.8702 0.28108 0.132 0.116 0.448 0.068 0.236
#> SRR2105326 3 0.8717 0.27378 0.132 0.116 0.444 0.068 0.240
#> SRR2105323 3 0.5725 0.57973 0.048 0.140 0.716 0.012 0.084
#> SRR2105324 3 0.5623 0.58301 0.064 0.184 0.700 0.004 0.048
#> SRR2105319 3 0.6914 0.36546 0.128 0.072 0.568 0.000 0.232
#> SRR2105320 3 0.7297 0.28828 0.172 0.076 0.524 0.000 0.228
#> SRR2105321 3 0.8176 0.36297 0.084 0.120 0.496 0.056 0.244
#> SRR2105322 3 0.8176 0.36297 0.084 0.120 0.496 0.056 0.244
#> SRR2105317 2 0.2523 0.85958 0.008 0.904 0.064 0.020 0.004
#> SRR2105318 2 0.1475 0.86856 0.012 0.956 0.016 0.012 0.004
#> SRR2105315 2 0.5976 0.07809 0.028 0.556 0.368 0.008 0.040
#> SRR2105316 2 0.2597 0.86499 0.016 0.904 0.060 0.012 0.008
#> SRR2105313 2 0.1278 0.87048 0.004 0.960 0.020 0.000 0.016
#> SRR2105314 2 0.1441 0.86939 0.008 0.956 0.024 0.004 0.008
#> SRR2105311 3 0.9088 0.25136 0.172 0.160 0.400 0.064 0.204
#> SRR2105312 3 0.9111 0.23840 0.164 0.172 0.396 0.064 0.204
#> SRR2105307 3 0.7359 0.12297 0.304 0.184 0.460 0.000 0.052
#> SRR2105308 3 0.6946 0.27028 0.276 0.220 0.484 0.000 0.020
#> SRR2105309 3 0.5146 0.59144 0.012 0.184 0.732 0.024 0.048
#> SRR2105310 3 0.5111 0.59003 0.028 0.168 0.740 0.008 0.056
#> SRR2105305 3 0.4786 0.59147 0.020 0.152 0.764 0.008 0.056
#> SRR2105306 3 0.5214 0.58977 0.040 0.164 0.728 0.000 0.068
#> SRR2105303 2 0.0727 0.86130 0.004 0.980 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105304 4 0.0000 0.83738 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3565 0.85126 0.032 0.860 0.072 0.016 0.020
#> SRR2105302 2 0.2709 0.86319 0.008 0.900 0.052 0.032 0.008
#> SRR2105299 3 0.6654 0.16964 0.032 0.408 0.472 0.008 0.080
#> SRR2105300 2 0.6914 0.14573 0.036 0.520 0.340 0.020 0.084
#> SRR2105297 1 0.4756 0.33065 0.704 0.240 0.004 0.000 0.052
#> SRR2105298 1 0.4743 0.33028 0.700 0.248 0.004 0.000 0.048
#> SRR2105295 2 0.2604 0.86435 0.016 0.904 0.056 0.020 0.004
#> SRR2105296 2 0.2313 0.86819 0.024 0.920 0.040 0.008 0.008
#> SRR2105293 3 0.8515 0.35062 0.152 0.224 0.448 0.032 0.144
#> SRR2105294 3 0.7305 0.46926 0.136 0.220 0.548 0.004 0.092
#> SRR2105291 3 0.7110 0.37482 0.136 0.268 0.528 0.000 0.068
#> SRR2105292 3 0.7643 0.16802 0.264 0.224 0.444 0.000 0.068
#> SRR2105289 3 0.6659 0.55862 0.092 0.216 0.624 0.024 0.044
#> SRR2105290 3 0.7145 0.32136 0.248 0.212 0.500 0.000 0.040
#> SRR2105287 3 0.6956 0.40450 0.204 0.152 0.572 0.000 0.072
#> SRR2105288 3 0.7104 -0.01115 0.344 0.220 0.416 0.000 0.020
#> SRR2105285 2 0.3000 0.85591 0.012 0.884 0.072 0.012 0.020
#> SRR2105286 2 0.2659 0.86377 0.008 0.904 0.052 0.016 0.020
#> SRR2105283 2 0.5677 0.57292 0.072 0.668 0.224 0.000 0.036
#> SRR2105284 2 0.5485 0.61849 0.032 0.684 0.228 0.004 0.052
#> SRR2105281 2 0.1990 0.87114 0.028 0.928 0.040 0.000 0.004
#> SRR2105282 2 0.1679 0.86940 0.020 0.948 0.016 0.012 0.004
#> SRR2105259 3 0.4401 0.51763 0.004 0.084 0.792 0.012 0.108
#> SRR2105260 3 0.4458 0.53531 0.004 0.092 0.792 0.016 0.096
#> SRR2105279 2 0.0404 0.85710 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0162 0.85530 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105257 3 0.7504 0.19147 0.264 0.112 0.496 0.000 0.128
#> SRR2105258 3 0.7466 0.18750 0.272 0.120 0.496 0.000 0.112
#> SRR2105253 2 0.2346 0.87050 0.008 0.916 0.052 0.016 0.008
#> SRR2105254 2 0.2246 0.87222 0.020 0.920 0.048 0.008 0.004
#> SRR2105255 3 0.5023 0.58177 0.056 0.136 0.752 0.000 0.056
#> SRR2105256 3 0.5555 0.58115 0.068 0.172 0.704 0.000 0.056
#> SRR2105251 2 0.1814 0.86376 0.024 0.940 0.004 0.004 0.028
#> SRR2105252 2 0.1814 0.86376 0.024 0.940 0.004 0.004 0.028
#> SRR2105249 2 0.2936 0.83930 0.024 0.872 0.096 0.000 0.008
#> SRR2105250 2 0.4032 0.79023 0.048 0.820 0.100 0.000 0.032
#> SRR2105247 2 0.1082 0.86306 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105248 2 0.1364 0.86432 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105245 3 0.7988 0.40987 0.100 0.272 0.484 0.028 0.116
#> SRR2105246 3 0.8045 0.40671 0.112 0.268 0.484 0.032 0.104
#> SRR2105243 3 0.5777 0.55815 0.088 0.232 0.656 0.004 0.020
#> SRR2105244 3 0.7200 0.48698 0.136 0.236 0.540 0.000 0.088
#> SRR2105241 3 0.7090 0.41155 0.208 0.228 0.520 0.000 0.044
#> SRR2105242 3 0.7514 0.00488 0.320 0.208 0.420 0.000 0.052
#> SRR2105239 3 0.7904 -0.01922 0.144 0.096 0.424 0.008 0.328
#> SRR2105240 3 0.7683 0.13797 0.284 0.200 0.440 0.000 0.076
#> SRR2105237 2 0.5172 0.75169 0.044 0.752 0.148 0.020 0.036
#> SRR2105238 2 0.4139 0.81134 0.020 0.812 0.128 0.016 0.024
#> SRR2105235 2 0.2666 0.84874 0.020 0.892 0.076 0.000 0.012
#> SRR2105236 2 0.2770 0.84447 0.020 0.888 0.076 0.000 0.016
#> SRR2105233 2 0.2991 0.85307 0.008 0.880 0.080 0.024 0.008
#> SRR2105234 2 0.2991 0.85307 0.008 0.880 0.080 0.024 0.008
#> SRR2105231 2 0.0566 0.85842 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105232 2 0.1087 0.86643 0.016 0.968 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105227 3 0.7434 0.33207 0.100 0.340 0.480 0.020 0.060
#> SRR2105228 2 0.7334 -0.46212 0.180 0.400 0.376 0.000 0.044
#> SRR2105225 3 0.6890 0.52566 0.176 0.168 0.584 0.000 0.072
#> SRR2105226 3 0.7382 0.39244 0.224 0.196 0.508 0.000 0.072
#> SRR2105229 3 0.6767 0.56220 0.056 0.224 0.612 0.020 0.088
#> SRR2105230 3 0.5932 0.59942 0.028 0.164 0.684 0.012 0.112
#> SRR2105219 2 0.1492 0.87124 0.008 0.948 0.040 0.004 0.000
#> SRR2105220 2 0.1644 0.86855 0.008 0.940 0.048 0.004 0.000
#> SRR2105221 2 0.4780 0.76593 0.052 0.772 0.120 0.000 0.056
#> SRR2105222 2 0.4864 0.75699 0.060 0.768 0.116 0.000 0.056
#> SRR2105223 3 0.5827 0.57769 0.104 0.172 0.680 0.000 0.044
#> SRR2105224 3 0.6357 0.54540 0.112 0.204 0.628 0.000 0.056
#> SRR2105217 2 0.2492 0.86298 0.040 0.912 0.016 0.004 0.028
#> SRR2105218 2 0.2152 0.86004 0.044 0.920 0.004 0.000 0.032
#> SRR2105215 2 0.0727 0.86032 0.012 0.980 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105216 2 0.1087 0.86349 0.008 0.968 0.008 0.000 0.016
#> SRR2105213 3 0.8319 0.30411 0.208 0.228 0.428 0.012 0.124
#> SRR2105214 3 0.8275 0.40642 0.140 0.248 0.468 0.032 0.112
#> SRR2105211 3 0.5622 0.58573 0.028 0.216 0.680 0.004 0.072
#> SRR2105212 3 0.5521 0.58117 0.044 0.224 0.680 0.000 0.052
#> SRR2105209 3 0.6846 0.45860 0.160 0.124 0.604 0.000 0.112
#> SRR2105210 3 0.7381 0.10429 0.288 0.196 0.464 0.000 0.052
#> SRR2105207 3 0.7584 0.22126 0.288 0.172 0.460 0.000 0.080
#> SRR2105208 1 0.7586 0.32743 0.388 0.220 0.340 0.000 0.052
#> SRR2105205 2 0.3804 0.84359 0.040 0.844 0.072 0.004 0.040
#> SRR2105206 2 0.3925 0.84127 0.068 0.840 0.052 0.008 0.032
#> SRR2105201 2 0.5029 0.67785 0.036 0.736 0.172 0.000 0.056
#> SRR2105202 2 0.4439 0.74843 0.036 0.784 0.140 0.000 0.040
#> SRR2105203 2 0.0404 0.86135 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0613 0.85997 0.008 0.984 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105199 2 0.0968 0.86489 0.012 0.972 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105200 2 0.1988 0.85986 0.048 0.928 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105197 3 0.5622 0.42694 0.044 0.056 0.688 0.004 0.208
#> SRR2105198 3 0.5493 0.41705 0.032 0.060 0.704 0.008 0.196
#> SRR2105195 3 0.7929 0.25361 0.244 0.252 0.428 0.008 0.068
#> SRR2105196 2 0.7289 -0.25351 0.212 0.440 0.312 0.000 0.036
#> SRR2105193 1 0.7386 0.53016 0.496 0.204 0.236 0.000 0.064
#> SRR2105194 1 0.7682 0.48867 0.456 0.212 0.252 0.000 0.080
#> SRR2105191 5 0.4958 0.00000 0.060 0.004 0.252 0.000 0.684
#> SRR2105192 3 0.6612 0.34931 0.144 0.064 0.612 0.000 0.180
#> SRR2105189 2 0.3446 0.82624 0.044 0.844 0.104 0.000 0.008
#> SRR2105190 2 0.2220 0.87112 0.016 0.920 0.052 0.008 0.004
#> SRR2105187 2 0.5992 0.62740 0.032 0.676 0.184 0.012 0.096
#> SRR2105188 2 0.6137 0.57608 0.044 0.652 0.204 0.004 0.096
#> SRR2105179 3 0.7834 0.29336 0.228 0.236 0.452 0.004 0.080
#> SRR2105180 3 0.7706 0.02137 0.280 0.256 0.404 0.000 0.060
#> SRR2105183 2 0.0898 0.86345 0.020 0.972 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1442 0.86001 0.032 0.952 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105185 2 0.4755 0.77053 0.088 0.788 0.084 0.016 0.024
#> SRR2105186 2 0.4189 0.82111 0.076 0.828 0.048 0.016 0.032
#> SRR2105181 3 0.5570 0.44686 0.064 0.076 0.712 0.000 0.148
#> SRR2105182 3 0.5279 0.58511 0.032 0.128 0.728 0.000 0.112
#> SRR2105177 1 0.4237 0.40559 0.784 0.160 0.036 0.000 0.020
#> SRR2105178 1 0.3320 0.39522 0.828 0.152 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105171 2 0.0932 0.86512 0.004 0.972 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105172 2 0.1405 0.86799 0.020 0.956 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105175 1 0.6632 0.55919 0.568 0.196 0.208 0.000 0.028
#> SRR2105176 1 0.6938 0.54830 0.524 0.212 0.232 0.000 0.032
#> SRR2105173 2 0.2792 0.86561 0.040 0.900 0.012 0.012 0.036
#> SRR2105174 2 0.1554 0.86713 0.024 0.952 0.012 0.004 0.008
#> SRR2105169 2 0.1978 0.86230 0.044 0.928 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105170 2 0.2309 0.86413 0.036 0.920 0.012 0.004 0.028
#> SRR2105167 2 0.1074 0.86318 0.016 0.968 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105168 2 0.1124 0.86137 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105165 3 0.7360 0.46594 0.188 0.176 0.536 0.000 0.100
#> SRR2105166 3 0.7463 0.45742 0.184 0.196 0.520 0.000 0.100
#> SRR2105163 3 0.8358 0.36697 0.152 0.116 0.500 0.052 0.180
#> SRR2105164 3 0.8506 0.34856 0.160 0.120 0.484 0.056 0.180
#> SRR2105161 1 0.7827 0.19942 0.368 0.212 0.344 0.000 0.076
#> SRR2105162 1 0.7860 0.37795 0.384 0.232 0.308 0.000 0.076
#> SRR2105155 2 0.0854 0.86263 0.008 0.976 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105156 2 0.1377 0.86647 0.020 0.956 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105157 2 0.1652 0.86412 0.040 0.944 0.004 0.004 0.008
#> SRR2105158 2 0.2665 0.85683 0.052 0.900 0.008 0.004 0.036
#> SRR2105159 3 0.8312 0.20286 0.240 0.160 0.408 0.004 0.188
#> SRR2105160 3 0.8242 -0.23237 0.312 0.220 0.340 0.000 0.128
#> SRR2105153 2 0.2313 0.86325 0.040 0.920 0.008 0.008 0.024
#> SRR2105154 2 0.2552 0.85782 0.048 0.908 0.008 0.008 0.028
#> SRR2105151 2 0.0671 0.86389 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR2105152 2 0.1041 0.86277 0.032 0.964 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.6820 0.38379 0.052 0.336 0.536 0.024 0.052
#> SRR2105150 3 0.6809 0.37739 0.056 0.340 0.532 0.020 0.052
#> SRR2105147 4 0.6505 0.33344 0.036 0.016 0.164 0.640 0.144
#> SRR2105148 4 0.6505 0.33344 0.036 0.016 0.164 0.640 0.144
#> SRR2105143 3 0.7320 0.23711 0.268 0.248 0.448 0.000 0.036
#> SRR2105144 3 0.7698 -0.07010 0.284 0.308 0.364 0.004 0.040
#> SRR2105145 1 0.7352 0.51624 0.504 0.212 0.220 0.000 0.064
#> SRR2105146 1 0.7550 0.46542 0.460 0.220 0.256 0.000 0.064
#> SRR2105141 2 0.3124 0.85409 0.048 0.884 0.016 0.012 0.040
#> SRR2105142 2 0.3124 0.85409 0.048 0.884 0.016 0.012 0.040
#> SRR2105139 2 0.1202 0.86283 0.032 0.960 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105140 2 0.1757 0.86277 0.048 0.936 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105137 2 0.4425 0.76093 0.036 0.788 0.132 0.000 0.044
#> SRR2105138 2 0.5055 0.70448 0.048 0.744 0.152 0.000 0.056
#> SRR2105135 2 0.0771 0.86045 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105136 2 0.0992 0.86078 0.024 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105133 3 0.5095 0.29364 0.036 0.032 0.716 0.004 0.212
#> SRR2105134 3 0.5168 0.28747 0.040 0.032 0.712 0.004 0.212
#> SRR2105131 3 0.7176 0.21167 0.024 0.340 0.476 0.016 0.144
#> SRR2105132 3 0.6874 0.37510 0.080 0.268 0.556 0.000 0.096
#> SRR2105129 1 0.5365 0.50179 0.712 0.164 0.096 0.000 0.028
#> SRR2105130 1 0.3320 0.39510 0.828 0.152 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105127 3 0.6778 0.39522 0.124 0.112 0.612 0.000 0.152
#> SRR2105128 3 0.7198 0.37422 0.124 0.268 0.524 0.000 0.084
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 3 0.5162 -0.07733 0.008 0.020 0.588 0.000 0.344 0.040
#> SRR2105278 3 0.5455 -0.11632 0.012 0.020 0.560 0.000 0.356 0.052
#> SRR2105275 3 0.7290 -0.06347 0.040 0.064 0.476 0.040 0.328 0.052
#> SRR2105276 3 0.7184 0.01375 0.044 0.080 0.480 0.032 0.328 0.036
#> SRR2105273 3 0.4951 0.36281 0.028 0.064 0.716 0.000 0.176 0.016
#> SRR2105274 3 0.5425 0.45441 0.064 0.104 0.692 0.000 0.132 0.008
#> SRR2105271 3 0.6321 0.45186 0.084 0.108 0.624 0.000 0.156 0.028
#> SRR2105272 3 0.7652 0.09190 0.268 0.136 0.424 0.004 0.148 0.020
#> SRR2105269 2 0.1621 0.86627 0.008 0.944 0.028 0.004 0.012 0.004
#> SRR2105270 2 0.2486 0.86867 0.016 0.900 0.048 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105267 2 0.1476 0.86668 0.008 0.948 0.028 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105268 2 0.1096 0.86271 0.020 0.964 0.004 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105265 2 0.0984 0.86314 0.012 0.968 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105266 2 0.1262 0.86594 0.016 0.956 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105263 2 0.4528 0.80660 0.056 0.768 0.020 0.000 0.032 0.124
#> SRR2105264 2 0.4328 0.82574 0.064 0.792 0.024 0.004 0.020 0.096
#> SRR2105261 3 0.7678 0.23904 0.036 0.200 0.480 0.040 0.204 0.040
#> SRR2105262 3 0.7748 0.25243 0.056 0.192 0.484 0.036 0.196 0.036
#> SRR2105357 3 0.5285 -0.07618 0.004 0.020 0.588 0.004 0.336 0.048
#> SRR2105358 3 0.5286 0.03012 0.008 0.024 0.636 0.004 0.276 0.052
#> SRR2105439 2 0.4951 0.74846 0.028 0.744 0.080 0.000 0.112 0.036
#> SRR2105440 2 0.4825 0.75188 0.024 0.752 0.076 0.000 0.112 0.036
#> SRR2105509 2 0.3537 0.84820 0.008 0.848 0.072 0.016 0.024 0.032
#> SRR2105510 2 0.3216 0.85498 0.008 0.868 0.056 0.012 0.028 0.028
#> SRR2105507 3 0.4996 0.39477 0.044 0.064 0.732 0.000 0.140 0.020
#> SRR2105508 3 0.4572 0.42221 0.024 0.080 0.756 0.000 0.128 0.012
#> SRR2105505 3 0.6665 0.25556 0.140 0.048 0.580 0.000 0.184 0.048
#> SRR2105506 3 0.7287 0.28670 0.180 0.100 0.516 0.000 0.164 0.040
#> SRR2105503 2 0.2076 0.87199 0.016 0.920 0.012 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105504 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3809 0.84702 0.032 0.828 0.084 0.004 0.016 0.036
#> SRR2105502 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.5714 0.45171 0.048 0.096 0.700 0.008 0.112 0.036
#> SRR2105500 3 0.5992 0.45803 0.076 0.108 0.656 0.000 0.136 0.024
#> SRR2105497 2 0.2710 0.87186 0.028 0.892 0.036 0.004 0.004 0.036
#> SRR2105498 2 0.3794 0.84220 0.076 0.824 0.024 0.000 0.016 0.060
#> SRR2105495 2 0.3795 0.84804 0.016 0.828 0.076 0.004 0.056 0.020
#> SRR2105496 2 0.2993 0.87048 0.012 0.876 0.060 0.004 0.032 0.016
#> SRR2105493 2 0.5548 0.71766 0.036 0.692 0.148 0.000 0.084 0.040
#> SRR2105494 2 0.4835 0.76930 0.020 0.748 0.108 0.004 0.100 0.020
#> SRR2105491 2 0.4978 0.79529 0.060 0.756 0.040 0.012 0.024 0.108
#> SRR2105492 2 0.4978 0.79529 0.060 0.756 0.040 0.012 0.024 0.108
#> SRR2105489 2 0.2998 0.84927 0.064 0.856 0.008 0.000 0.000 0.072
#> SRR2105490 2 0.2113 0.86534 0.032 0.920 0.012 0.000 0.008 0.028
#> SRR2105487 5 0.6089 0.64471 0.064 0.016 0.408 0.000 0.472 0.040
#> SRR2105488 5 0.6089 0.64471 0.064 0.016 0.408 0.000 0.472 0.040
#> SRR2105485 3 0.5994 0.38832 0.056 0.080 0.656 0.000 0.164 0.044
#> SRR2105486 3 0.6124 0.39230 0.056 0.080 0.644 0.004 0.180 0.036
#> SRR2105483 1 0.1838 0.33173 0.928 0.040 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105484 1 0.1838 0.33173 0.928 0.040 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105481 3 0.7606 0.30409 0.216 0.124 0.472 0.004 0.152 0.032
#> SRR2105482 3 0.7568 0.10326 0.264 0.100 0.440 0.000 0.160 0.036
#> SRR2105479 3 0.7906 0.17086 0.240 0.152 0.408 0.004 0.168 0.028
#> SRR2105480 3 0.7418 0.08311 0.300 0.116 0.424 0.004 0.144 0.012
#> SRR2105477 2 0.5612 0.75073 0.032 0.704 0.120 0.004 0.076 0.064
#> SRR2105478 2 0.4764 0.80861 0.020 0.760 0.100 0.000 0.052 0.068
#> SRR2105475 2 0.3484 0.85289 0.016 0.856 0.052 0.012 0.024 0.040
#> SRR2105476 2 0.3524 0.85144 0.016 0.852 0.060 0.012 0.020 0.040
#> SRR2105473 2 0.4375 0.80646 0.032 0.792 0.084 0.000 0.056 0.036
#> SRR2105474 2 0.3809 0.83586 0.032 0.828 0.076 0.000 0.032 0.032
#> SRR2105471 2 0.3675 0.82988 0.080 0.820 0.012 0.000 0.008 0.080
#> SRR2105472 2 0.3362 0.83839 0.076 0.840 0.008 0.000 0.008 0.068
#> SRR2105469 3 0.4172 0.42150 0.004 0.084 0.776 0.000 0.120 0.016
#> SRR2105470 3 0.5195 0.46705 0.064 0.108 0.720 0.000 0.096 0.012
#> SRR2105467 3 0.6363 0.16449 0.040 0.052 0.588 0.004 0.252 0.064
#> SRR2105468 3 0.6661 0.21492 0.060 0.064 0.576 0.000 0.224 0.076
#> SRR2105465 1 0.7465 0.22581 0.388 0.132 0.348 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105466 1 0.6858 0.56197 0.536 0.092 0.252 0.000 0.084 0.036
#> SRR2105463 1 0.5403 0.54668 0.680 0.048 0.144 0.000 0.124 0.004
#> SRR2105464 1 0.5738 0.59775 0.656 0.084 0.172 0.000 0.080 0.008
#> SRR2105461 2 0.0551 0.85508 0.008 0.984 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105462 2 0.0810 0.85793 0.004 0.976 0.008 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105459 2 0.2029 0.86724 0.008 0.928 0.028 0.008 0.008 0.020
#> SRR2105460 2 0.2374 0.86899 0.012 0.908 0.048 0.008 0.004 0.020
#> SRR2105457 3 0.5476 0.38080 0.024 0.096 0.696 0.008 0.152 0.024
#> SRR2105458 3 0.5724 0.38292 0.024 0.100 0.684 0.012 0.148 0.032
#> SRR2105455 3 0.5663 0.46445 0.108 0.108 0.684 0.000 0.084 0.016
#> SRR2105456 3 0.5853 0.45446 0.132 0.104 0.664 0.000 0.084 0.016
#> SRR2105453 3 0.6925 -0.10614 0.144 0.016 0.464 0.000 0.312 0.064
#> SRR2105454 3 0.6770 -0.10724 0.128 0.012 0.484 0.000 0.308 0.068
#> SRR2105451 2 0.4624 0.76830 0.024 0.748 0.156 0.000 0.052 0.020
#> SRR2105452 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.6682 0.40390 0.184 0.148 0.564 0.000 0.088 0.016
#> SRR2105450 3 0.6941 0.25949 0.256 0.120 0.508 0.000 0.100 0.016
#> SRR2105447 2 0.2997 0.86433 0.020 0.872 0.068 0.000 0.020 0.020
#> SRR2105448 2 0.2656 0.86495 0.016 0.892 0.060 0.008 0.004 0.020
#> SRR2105445 2 0.6140 0.33752 0.028 0.540 0.316 0.000 0.096 0.020
#> SRR2105446 2 0.7114 -0.09437 0.024 0.416 0.352 0.004 0.160 0.044
#> SRR2105443 2 0.6583 0.45266 0.012 0.564 0.252 0.020 0.108 0.044
#> SRR2105444 2 0.6256 0.51146 0.012 0.588 0.244 0.008 0.104 0.044
#> SRR2105441 2 0.3028 0.85616 0.032 0.876 0.044 0.000 0.024 0.024
#> SRR2105442 2 0.3396 0.85017 0.024 0.852 0.068 0.000 0.032 0.024
#> SRR2105437 5 0.5511 0.72954 0.056 0.000 0.356 0.000 0.548 0.040
#> SRR2105438 5 0.5511 0.72954 0.056 0.000 0.356 0.000 0.548 0.040
#> SRR2105435 3 0.7348 0.38519 0.184 0.152 0.496 0.004 0.148 0.016
#> SRR2105436 3 0.5704 0.42346 0.060 0.084 0.680 0.000 0.148 0.028
#> SRR2105433 1 0.6228 0.57786 0.608 0.084 0.192 0.000 0.104 0.012
#> SRR2105434 1 0.7211 0.18223 0.412 0.128 0.356 0.000 0.076 0.028
#> SRR2105431 1 0.7409 0.39035 0.432 0.052 0.252 0.000 0.224 0.040
#> SRR2105432 1 0.7403 0.47425 0.452 0.076 0.252 0.000 0.188 0.032
#> SRR2105429 2 0.6532 0.49466 0.064 0.592 0.232 0.016 0.072 0.024
#> SRR2105430 2 0.4910 0.75253 0.032 0.740 0.156 0.008 0.040 0.024
#> SRR2105427 2 0.2127 0.87231 0.012 0.924 0.032 0.008 0.012 0.012
#> SRR2105428 2 0.3035 0.86492 0.012 0.876 0.048 0.004 0.020 0.040
#> SRR2105425 2 0.2261 0.87416 0.016 0.916 0.036 0.004 0.008 0.020
#> SRR2105426 2 0.3294 0.86660 0.044 0.856 0.056 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105421 3 0.5791 0.38955 0.012 0.112 0.664 0.020 0.168 0.024
#> SRR2105422 3 0.5961 0.38042 0.008 0.132 0.644 0.024 0.168 0.024
#> SRR2105423 2 0.1167 0.86693 0.020 0.960 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105424 2 0.1065 0.86258 0.020 0.964 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105419 3 0.5341 0.46690 0.040 0.124 0.708 0.000 0.104 0.024
#> SRR2105420 3 0.5493 0.43698 0.028 0.152 0.688 0.000 0.100 0.032
#> SRR2105415 1 0.7017 0.48580 0.492 0.072 0.272 0.000 0.140 0.024
#> SRR2105416 1 0.6486 0.56068 0.576 0.080 0.216 0.000 0.112 0.016
#> SRR2105417 1 0.7128 0.42402 0.464 0.092 0.304 0.000 0.116 0.024
#> SRR2105418 1 0.7118 0.39403 0.448 0.100 0.328 0.000 0.100 0.024
#> SRR2105413 2 0.2850 0.86147 0.008 0.884 0.060 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105414 2 0.3542 0.84877 0.012 0.832 0.096 0.000 0.016 0.044
#> SRR2105409 2 0.2880 0.86959 0.020 0.884 0.036 0.000 0.024 0.036
#> SRR2105410 2 0.3304 0.86231 0.024 0.860 0.044 0.000 0.024 0.048
#> SRR2105411 2 0.1078 0.86630 0.016 0.964 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105412 2 0.1223 0.86705 0.016 0.960 0.008 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105407 3 0.4981 0.16691 0.000 0.048 0.660 0.004 0.260 0.028
#> SRR2105408 3 0.4951 0.20478 0.000 0.052 0.680 0.004 0.232 0.032
#> SRR2105403 3 0.5839 -0.16017 0.004 0.008 0.500 0.000 0.352 0.136
#> SRR2105404 3 0.5952 -0.17424 0.008 0.008 0.488 0.000 0.360 0.136
#> SRR2105405 3 0.5968 0.44971 0.112 0.096 0.668 0.000 0.092 0.032
#> SRR2105406 3 0.6389 0.42171 0.200 0.108 0.596 0.000 0.076 0.020
#> SRR2105401 2 0.3211 0.84894 0.012 0.852 0.096 0.004 0.008 0.028
#> SRR2105402 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.6143 0.62533 0.008 0.640 0.188 0.088 0.040 0.036
#> SRR2105400 2 0.6171 0.61683 0.008 0.636 0.192 0.088 0.040 0.036
#> SRR2105397 2 0.7609 0.15202 0.024 0.452 0.212 0.020 0.232 0.060
#> SRR2105398 2 0.7609 0.15202 0.024 0.452 0.212 0.020 0.232 0.060
#> SRR2105395 2 0.2066 0.87060 0.024 0.920 0.012 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105396 2 0.2186 0.86698 0.036 0.908 0.008 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105393 2 0.1509 0.86589 0.012 0.948 0.008 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105394 2 0.1899 0.86468 0.032 0.928 0.008 0.000 0.004 0.028
#> SRR2105389 3 0.4425 0.28058 0.000 0.036 0.736 0.008 0.196 0.024
#> SRR2105390 3 0.4463 0.34806 0.004 0.052 0.748 0.000 0.164 0.032
#> SRR2105391 3 0.3764 0.33729 0.000 0.040 0.792 0.000 0.148 0.020
#> SRR2105392 3 0.3621 0.33809 0.000 0.036 0.808 0.000 0.132 0.024
#> SRR2105385 3 0.5936 0.46379 0.108 0.128 0.648 0.000 0.108 0.008
#> SRR2105386 3 0.6374 0.45989 0.112 0.124 0.612 0.000 0.136 0.016
#> SRR2105387 3 0.5956 0.45844 0.140 0.132 0.648 0.004 0.068 0.008
#> SRR2105388 3 0.5938 0.40137 0.100 0.088 0.660 0.000 0.132 0.020
#> SRR2105381 2 0.5049 0.73414 0.016 0.728 0.168 0.024 0.040 0.024
#> SRR2105382 2 0.3591 0.85015 0.024 0.844 0.076 0.008 0.016 0.032
#> SRR2105383 2 0.3477 0.84772 0.056 0.844 0.064 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105384 2 0.3630 0.84507 0.056 0.836 0.068 0.000 0.020 0.020
#> SRR2105379 2 0.3666 0.85300 0.044 0.844 0.056 0.008 0.016 0.032
#> SRR2105380 2 0.4122 0.82658 0.080 0.808 0.064 0.004 0.016 0.028
#> SRR2105377 2 0.4303 0.80006 0.024 0.788 0.104 0.000 0.060 0.024
#> SRR2105378 2 0.4742 0.78594 0.044 0.768 0.088 0.000 0.064 0.036
#> SRR2105375 3 0.7699 0.21603 0.212 0.184 0.420 0.000 0.164 0.020
#> SRR2105376 3 0.7591 0.19065 0.224 0.176 0.436 0.000 0.144 0.020
#> SRR2105373 3 0.5463 -0.54353 0.036 0.000 0.488 0.000 0.428 0.048
#> SRR2105374 5 0.5734 0.70673 0.072 0.000 0.372 0.000 0.516 0.040
#> SRR2105371 3 0.4272 0.31357 0.012 0.032 0.764 0.000 0.164 0.028
#> SRR2105372 3 0.4569 0.37941 0.020 0.056 0.752 0.000 0.152 0.020
#> SRR2105369 3 0.4772 0.39102 0.008 0.064 0.748 0.000 0.120 0.060
#> SRR2105370 3 0.5185 0.42823 0.044 0.096 0.728 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105367 3 0.7610 0.10044 0.276 0.144 0.400 0.000 0.164 0.016
#> SRR2105368 3 0.7477 0.16424 0.260 0.148 0.424 0.000 0.156 0.012
#> SRR2105365 2 0.4551 0.79935 0.064 0.772 0.020 0.004 0.024 0.116
#> SRR2105366 2 0.4660 0.79797 0.064 0.768 0.024 0.008 0.020 0.116
#> SRR2105363 2 0.2709 0.87080 0.020 0.892 0.044 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105364 2 0.2135 0.87443 0.004 0.916 0.044 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105361 2 0.1406 0.86887 0.008 0.952 0.020 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105362 2 0.1406 0.86912 0.008 0.952 0.020 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105359 3 0.4841 0.44362 0.028 0.088 0.756 0.004 0.100 0.024
#> SRR2105360 3 0.5078 0.44602 0.028 0.112 0.728 0.004 0.112 0.016
#> SRR2105355 3 0.4441 0.44449 0.028 0.088 0.768 0.000 0.108 0.008
#> SRR2105356 3 0.5668 0.45690 0.112 0.092 0.684 0.000 0.096 0.016
#> SRR2105353 3 0.6247 0.16831 0.004 0.044 0.620 0.092 0.204 0.036
#> SRR2105354 3 0.6087 0.33275 0.020 0.088 0.632 0.012 0.208 0.040
#> SRR2105351 2 0.2138 0.87316 0.016 0.924 0.016 0.016 0.004 0.024
#> SRR2105352 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.3881 0.84528 0.024 0.832 0.072 0.012 0.028 0.032
#> SRR2105350 2 0.1785 0.87224 0.000 0.936 0.028 0.008 0.012 0.016
#> SRR2105345 2 0.3992 0.82567 0.056 0.816 0.064 0.000 0.048 0.016
#> SRR2105346 2 0.3198 0.85387 0.032 0.864 0.060 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105347 2 0.6168 0.53585 0.228 0.608 0.064 0.000 0.028 0.072
#> SRR2105348 2 0.5947 0.56099 0.228 0.624 0.064 0.000 0.024 0.060
#> SRR2105343 2 0.0893 0.86122 0.004 0.972 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105344 2 0.1761 0.87091 0.008 0.936 0.032 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105341 3 0.3749 0.36283 0.004 0.048 0.812 0.000 0.112 0.024
#> SRR2105342 3 0.5173 0.44095 0.036 0.088 0.720 0.000 0.132 0.024
#> SRR2105339 3 0.5837 0.39213 0.028 0.104 0.668 0.020 0.164 0.016
#> SRR2105340 3 0.5593 0.40954 0.028 0.100 0.684 0.004 0.156 0.028
#> SRR2105335 3 0.5868 -0.16109 0.056 0.024 0.540 0.000 0.352 0.028
#> SRR2105336 3 0.6867 0.02074 0.112 0.060 0.516 0.000 0.276 0.036
#> SRR2105337 3 0.6083 0.44663 0.144 0.112 0.640 0.000 0.088 0.016
#> SRR2105338 3 0.6774 0.42772 0.168 0.132 0.556 0.000 0.132 0.012
#> SRR2105331 2 0.3021 0.86357 0.020 0.872 0.028 0.008 0.004 0.068
#> SRR2105332 2 0.2810 0.86582 0.016 0.876 0.016 0.000 0.012 0.080
#> SRR2105333 2 0.3227 0.85974 0.016 0.864 0.060 0.004 0.016 0.040
#> SRR2105334 2 0.3244 0.86019 0.016 0.864 0.060 0.004 0.020 0.036
#> SRR2105329 2 0.4696 0.68826 0.012 0.700 0.232 0.000 0.032 0.024
#> SRR2105330 2 0.4613 0.76846 0.016 0.756 0.152 0.008 0.048 0.020
#> SRR2105327 2 0.2752 0.87221 0.020 0.888 0.052 0.000 0.016 0.024
#> SRR2105328 2 0.2979 0.86996 0.016 0.876 0.052 0.000 0.020 0.036
#> SRR2105325 3 0.7499 -0.26712 0.072 0.048 0.400 0.044 0.392 0.044
#> SRR2105326 5 0.7499 0.12702 0.072 0.048 0.396 0.044 0.396 0.044
#> SRR2105323 3 0.5821 0.36674 0.020 0.084 0.668 0.008 0.172 0.048
#> SRR2105324 3 0.5516 0.42934 0.036 0.108 0.700 0.000 0.116 0.040
#> SRR2105319 3 0.6365 -0.37735 0.104 0.028 0.444 0.000 0.404 0.020
#> SRR2105320 3 0.6815 -0.35946 0.144 0.036 0.412 0.000 0.384 0.024
#> SRR2105321 3 0.7009 -0.21216 0.036 0.048 0.452 0.032 0.380 0.052
#> SRR2105322 3 0.7009 -0.21216 0.036 0.048 0.452 0.032 0.380 0.052
#> SRR2105317 2 0.2890 0.86084 0.008 0.884 0.056 0.016 0.012 0.024
#> SRR2105318 2 0.1654 0.86812 0.004 0.944 0.012 0.008 0.008 0.024
#> SRR2105315 2 0.5969 -0.03308 0.004 0.480 0.408 0.004 0.056 0.048
#> SRR2105316 2 0.2842 0.86663 0.016 0.888 0.048 0.008 0.012 0.028
#> SRR2105313 2 0.1862 0.87283 0.012 0.932 0.032 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105314 2 0.1592 0.87163 0.012 0.944 0.024 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105311 3 0.8299 -0.10973 0.100 0.096 0.380 0.044 0.324 0.056
#> SRR2105312 3 0.8339 -0.09171 0.100 0.108 0.376 0.044 0.320 0.052
#> SRR2105307 3 0.7149 0.10866 0.284 0.104 0.476 0.000 0.112 0.024
#> SRR2105308 3 0.6884 0.20167 0.300 0.120 0.488 0.000 0.072 0.020
#> SRR2105309 3 0.5228 0.40455 0.004 0.104 0.708 0.016 0.144 0.024
#> SRR2105310 3 0.5255 0.41203 0.028 0.092 0.720 0.004 0.128 0.028
#> SRR2105305 3 0.3927 0.39503 0.000 0.072 0.800 0.004 0.104 0.020
#> SRR2105306 3 0.4080 0.40991 0.020 0.068 0.796 0.000 0.104 0.012
#> SRR2105303 2 0.1235 0.86416 0.008 0.960 0.008 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105304 4 0.0000 0.80804 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3800 0.85366 0.036 0.840 0.056 0.012 0.028 0.028
#> SRR2105302 2 0.3043 0.86179 0.012 0.880 0.048 0.020 0.016 0.024
#> SRR2105299 2 0.7032 -0.19901 0.020 0.384 0.360 0.004 0.204 0.028
#> SRR2105300 2 0.7051 0.25423 0.024 0.500 0.248 0.012 0.180 0.036
#> SRR2105297 1 0.4629 0.18619 0.744 0.104 0.000 0.000 0.040 0.112
#> SRR2105298 1 0.4672 0.18488 0.740 0.112 0.000 0.000 0.040 0.108
#> SRR2105295 2 0.2890 0.86406 0.016 0.888 0.044 0.012 0.016 0.024
#> SRR2105296 2 0.2586 0.86856 0.024 0.900 0.040 0.008 0.004 0.024
#> SRR2105293 3 0.8187 0.21482 0.136 0.148 0.436 0.028 0.216 0.036
#> SRR2105294 3 0.7112 0.32739 0.132 0.132 0.528 0.004 0.188 0.016
#> SRR2105291 3 0.7321 0.32197 0.152 0.180 0.504 0.000 0.136 0.028
#> SRR2105292 3 0.7512 0.10629 0.284 0.120 0.432 0.000 0.136 0.028
#> SRR2105289 3 0.5690 0.46662 0.060 0.132 0.684 0.016 0.104 0.004
#> SRR2105290 3 0.7060 0.26802 0.240 0.108 0.512 0.000 0.116 0.024
#> SRR2105287 3 0.7353 0.27226 0.192 0.076 0.512 0.000 0.160 0.060
#> SRR2105288 3 0.7231 -0.06620 0.372 0.124 0.396 0.000 0.080 0.028
#> SRR2105285 2 0.3230 0.85929 0.016 0.868 0.056 0.008 0.024 0.028
#> SRR2105286 2 0.2705 0.86347 0.008 0.892 0.048 0.004 0.016 0.032
#> SRR2105283 2 0.6119 0.63459 0.060 0.640 0.180 0.000 0.076 0.044
#> SRR2105284 2 0.5652 0.66397 0.024 0.664 0.176 0.004 0.112 0.020
#> SRR2105281 2 0.2497 0.87442 0.024 0.904 0.032 0.000 0.020 0.020
#> SRR2105282 2 0.1938 0.87223 0.024 0.928 0.016 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105259 3 0.4894 0.17932 0.000 0.048 0.676 0.004 0.244 0.028
#> SRR2105260 3 0.5033 0.20356 0.000 0.052 0.680 0.008 0.228 0.032
#> SRR2105279 2 0.0912 0.85804 0.012 0.972 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105280 2 0.0551 0.85711 0.008 0.984 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105257 3 0.7682 -0.07921 0.248 0.064 0.400 0.000 0.240 0.048
#> SRR2105258 3 0.7636 -0.05393 0.252 0.064 0.388 0.000 0.256 0.040
#> SRR2105253 2 0.2628 0.87152 0.016 0.900 0.040 0.012 0.008 0.024
#> SRR2105254 2 0.2389 0.87379 0.024 0.912 0.028 0.004 0.016 0.016
#> SRR2105255 3 0.4797 0.39077 0.032 0.076 0.744 0.000 0.132 0.016
#> SRR2105256 3 0.5517 0.43935 0.064 0.096 0.704 0.000 0.108 0.028
#> SRR2105251 2 0.2345 0.86571 0.024 0.908 0.012 0.004 0.004 0.048
#> SRR2105252 2 0.2327 0.86702 0.020 0.908 0.012 0.004 0.004 0.052
#> SRR2105249 2 0.3234 0.84894 0.024 0.856 0.072 0.000 0.040 0.008
#> SRR2105250 2 0.4168 0.80763 0.052 0.800 0.096 0.000 0.024 0.028
#> SRR2105247 2 0.1616 0.86642 0.020 0.940 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105248 2 0.2263 0.86583 0.036 0.908 0.008 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105245 3 0.7744 0.31671 0.104 0.204 0.472 0.024 0.176 0.020
#> SRR2105246 3 0.7776 0.33179 0.088 0.204 0.492 0.028 0.152 0.036
#> SRR2105243 3 0.5409 0.47585 0.080 0.140 0.700 0.000 0.064 0.016
#> SRR2105244 3 0.6887 0.41168 0.136 0.140 0.556 0.000 0.148 0.020
#> SRR2105241 3 0.6487 0.38950 0.212 0.116 0.580 0.000 0.072 0.020
#> SRR2105242 3 0.7363 -0.09209 0.336 0.100 0.408 0.000 0.132 0.024
#> SRR2105239 3 0.7811 -0.29532 0.092 0.020 0.308 0.004 0.284 0.292
#> SRR2105240 3 0.7538 0.00452 0.316 0.100 0.412 0.000 0.136 0.036
#> SRR2105237 2 0.5179 0.77498 0.024 0.740 0.108 0.008 0.068 0.052
#> SRR2105238 2 0.4203 0.82725 0.012 0.800 0.096 0.004 0.048 0.040
#> SRR2105235 2 0.2655 0.85708 0.016 0.888 0.064 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105236 2 0.3079 0.84932 0.032 0.872 0.048 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105233 2 0.3202 0.85236 0.008 0.864 0.072 0.012 0.016 0.028
#> SRR2105234 2 0.3202 0.85236 0.008 0.864 0.072 0.012 0.016 0.028
#> SRR2105231 2 0.1396 0.86318 0.012 0.952 0.008 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105232 2 0.1592 0.86959 0.016 0.944 0.012 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105227 3 0.7160 0.35516 0.096 0.240 0.528 0.012 0.096 0.028
#> SRR2105228 3 0.7482 0.14512 0.168 0.328 0.392 0.000 0.084 0.028
#> SRR2105225 3 0.6356 0.37561 0.144 0.076 0.604 0.000 0.160 0.016
#> SRR2105226 3 0.6945 0.34173 0.212 0.100 0.532 0.000 0.136 0.020
#> SRR2105229 3 0.6383 0.36941 0.028 0.144 0.616 0.016 0.168 0.028
#> SRR2105230 3 0.5789 0.37635 0.020 0.080 0.660 0.012 0.196 0.032
#> SRR2105219 2 0.1514 0.87265 0.012 0.944 0.036 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105220 2 0.2067 0.87245 0.008 0.924 0.036 0.004 0.020 0.008
#> SRR2105221 2 0.5197 0.77276 0.040 0.736 0.092 0.000 0.076 0.056
#> SRR2105222 2 0.5438 0.75502 0.052 0.720 0.092 0.000 0.076 0.060
#> SRR2105223 3 0.5195 0.45792 0.064 0.092 0.724 0.000 0.104 0.016
#> SRR2105224 3 0.6221 0.46225 0.108 0.108 0.644 0.000 0.108 0.032
#> SRR2105217 2 0.3111 0.85894 0.036 0.868 0.020 0.004 0.008 0.064
#> SRR2105218 2 0.2847 0.85586 0.036 0.872 0.012 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105215 2 0.1223 0.86163 0.016 0.960 0.008 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105216 2 0.1262 0.86388 0.016 0.956 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105213 3 0.8157 0.26285 0.192 0.156 0.420 0.012 0.180 0.040
#> SRR2105214 3 0.7840 0.31775 0.120 0.168 0.480 0.028 0.180 0.024
#> SRR2105211 3 0.5454 0.42290 0.012 0.144 0.680 0.000 0.128 0.036
#> SRR2105212 3 0.5332 0.42010 0.020 0.148 0.688 0.000 0.124 0.020
#> SRR2105209 3 0.7267 0.21918 0.124 0.080 0.512 0.000 0.228 0.056
#> SRR2105210 3 0.7354 0.01319 0.300 0.108 0.432 0.000 0.140 0.020
#> SRR2105207 3 0.7678 0.14971 0.264 0.092 0.420 0.000 0.184 0.040
#> SRR2105208 1 0.7357 0.41385 0.428 0.092 0.316 0.000 0.136 0.028
#> SRR2105205 2 0.4178 0.84328 0.024 0.808 0.060 0.004 0.028 0.076
#> SRR2105206 2 0.4305 0.83460 0.052 0.804 0.056 0.008 0.016 0.064
#> SRR2105201 2 0.5306 0.69879 0.024 0.704 0.096 0.000 0.144 0.032
#> SRR2105202 2 0.4748 0.76242 0.036 0.760 0.084 0.000 0.096 0.024
#> SRR2105203 2 0.0603 0.86311 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105204 2 0.0767 0.86155 0.004 0.976 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105199 2 0.1533 0.86655 0.016 0.948 0.012 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105200 2 0.2441 0.86347 0.044 0.904 0.016 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105197 3 0.5565 -0.31655 0.016 0.024 0.488 0.000 0.432 0.040
#> SRR2105198 3 0.5857 -0.32999 0.016 0.044 0.476 0.000 0.424 0.040
#> SRR2105195 3 0.8036 0.22320 0.196 0.168 0.436 0.004 0.140 0.056
#> SRR2105196 2 0.7811 -0.38424 0.224 0.328 0.324 0.000 0.088 0.036
#> SRR2105193 1 0.7129 0.52071 0.512 0.100 0.252 0.000 0.092 0.044
#> SRR2105194 1 0.7229 0.50526 0.484 0.096 0.272 0.000 0.112 0.036
#> SRR2105191 6 0.4319 0.00000 0.000 0.000 0.108 0.000 0.168 0.724
#> SRR2105192 3 0.6800 -0.19090 0.124 0.012 0.460 0.000 0.336 0.068
#> SRR2105189 2 0.3943 0.83472 0.040 0.812 0.100 0.000 0.020 0.028
#> SRR2105190 2 0.2432 0.87152 0.020 0.908 0.036 0.004 0.008 0.024
#> SRR2105187 2 0.6518 0.63609 0.036 0.624 0.100 0.004 0.136 0.100
#> SRR2105188 2 0.6537 0.60472 0.036 0.616 0.148 0.004 0.124 0.072
#> SRR2105179 3 0.8060 0.22366 0.204 0.160 0.420 0.000 0.152 0.064
#> SRR2105180 3 0.7853 -0.00340 0.284 0.152 0.392 0.000 0.132 0.040
#> SRR2105183 2 0.1230 0.86345 0.028 0.956 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105184 2 0.1729 0.86633 0.036 0.936 0.012 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105185 2 0.4761 0.78076 0.104 0.768 0.068 0.012 0.024 0.024
#> SRR2105186 2 0.4330 0.82790 0.052 0.808 0.048 0.012 0.024 0.056
#> SRR2105181 3 0.5869 -0.13327 0.048 0.036 0.548 0.000 0.344 0.024
#> SRR2105182 3 0.4811 0.33074 0.004 0.064 0.708 0.000 0.196 0.028
#> SRR2105177 1 0.3541 0.35124 0.848 0.044 0.036 0.000 0.044 0.028
#> SRR2105178 1 0.2135 0.35045 0.916 0.044 0.004 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105171 2 0.1344 0.86677 0.012 0.956 0.012 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105172 2 0.1630 0.87159 0.024 0.940 0.020 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105175 1 0.6301 0.53826 0.588 0.116 0.216 0.000 0.068 0.012
#> SRR2105176 1 0.6187 0.57440 0.588 0.092 0.224 0.000 0.092 0.004
#> SRR2105173 2 0.2937 0.86557 0.028 0.880 0.012 0.008 0.012 0.060
#> SRR2105174 2 0.1743 0.86804 0.024 0.936 0.008 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105169 2 0.2285 0.86376 0.028 0.900 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR2105170 2 0.2444 0.86562 0.028 0.892 0.012 0.000 0.000 0.068
#> SRR2105167 2 0.1406 0.86509 0.016 0.952 0.008 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105168 2 0.1452 0.86379 0.032 0.948 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105165 3 0.6661 0.31891 0.140 0.092 0.576 0.000 0.172 0.020
#> SRR2105166 3 0.6659 0.32518 0.152 0.100 0.556 0.000 0.184 0.008
#> SRR2105163 3 0.7570 -0.05887 0.084 0.052 0.472 0.032 0.300 0.060
#> SRR2105164 3 0.7710 -0.08439 0.096 0.056 0.452 0.036 0.308 0.052
#> SRR2105161 1 0.7633 0.28818 0.372 0.100 0.344 0.000 0.148 0.036
#> SRR2105162 1 0.7535 0.44627 0.428 0.104 0.288 0.000 0.148 0.032
#> SRR2105155 2 0.1431 0.86525 0.008 0.952 0.016 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105156 2 0.1616 0.86779 0.028 0.940 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105157 2 0.2050 0.86820 0.032 0.920 0.008 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105158 2 0.3069 0.85263 0.028 0.860 0.012 0.000 0.012 0.088
#> SRR2105159 3 0.7215 -0.05848 0.212 0.060 0.404 0.000 0.308 0.016
#> SRR2105160 1 0.7817 0.29183 0.336 0.112 0.320 0.000 0.204 0.028
#> SRR2105153 2 0.2715 0.86426 0.024 0.892 0.016 0.004 0.012 0.052
#> SRR2105154 2 0.2898 0.85820 0.024 0.880 0.012 0.004 0.016 0.064
#> SRR2105151 2 0.1344 0.86594 0.008 0.956 0.012 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105152 2 0.1375 0.86440 0.028 0.952 0.008 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105149 3 0.6944 0.26753 0.020 0.288 0.504 0.016 0.132 0.040
#> SRR2105150 3 0.6934 0.27017 0.024 0.288 0.504 0.012 0.132 0.040
#> SRR2105147 4 0.6187 0.31754 0.004 0.008 0.136 0.600 0.204 0.048
#> SRR2105148 4 0.6187 0.31754 0.004 0.008 0.136 0.600 0.204 0.048
#> SRR2105143 3 0.7380 0.23120 0.256 0.148 0.456 0.000 0.120 0.020
#> SRR2105144 3 0.7822 -0.07435 0.312 0.204 0.360 0.004 0.088 0.032
#> SRR2105145 1 0.7326 0.50496 0.508 0.112 0.228 0.000 0.096 0.056
#> SRR2105146 1 0.7035 0.47519 0.500 0.108 0.276 0.000 0.084 0.032
#> SRR2105141 2 0.3185 0.85439 0.032 0.864 0.012 0.008 0.012 0.072
#> SRR2105142 2 0.3185 0.85439 0.032 0.864 0.012 0.008 0.012 0.072
#> SRR2105139 2 0.1921 0.86578 0.032 0.928 0.004 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105140 2 0.2265 0.86547 0.044 0.912 0.012 0.000 0.012 0.020
#> SRR2105137 2 0.4813 0.77185 0.036 0.756 0.112 0.000 0.064 0.032
#> SRR2105138 2 0.5904 0.69822 0.048 0.680 0.104 0.000 0.096 0.072
#> SRR2105135 2 0.1109 0.86043 0.016 0.964 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105136 2 0.1549 0.86272 0.024 0.944 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105133 3 0.5368 -0.37679 0.024 0.012 0.500 0.000 0.432 0.032
#> SRR2105134 3 0.5434 -0.38456 0.028 0.012 0.496 0.000 0.432 0.032
#> SRR2105131 3 0.7669 0.08099 0.016 0.296 0.376 0.008 0.220 0.084
#> SRR2105132 3 0.7296 0.15665 0.060 0.196 0.492 0.000 0.204 0.048
#> SRR2105129 1 0.4693 0.49049 0.768 0.064 0.084 0.000 0.064 0.020
#> SRR2105130 1 0.2051 0.34514 0.920 0.044 0.004 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105127 3 0.7187 0.03844 0.084 0.060 0.504 0.000 0.264 0.088
#> SRR2105128 3 0.7552 0.27964 0.096 0.204 0.492 0.000 0.144 0.064
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.927 0.944 0.970 0.5013 0.499 0.499
#> 3 3 0.547 0.666 0.822 0.2759 0.814 0.642
#> 4 4 0.550 0.609 0.781 0.1262 0.848 0.612
#> 5 5 0.565 0.490 0.721 0.0613 0.925 0.753
#> 6 6 0.585 0.482 0.662 0.0419 0.919 0.703
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105278 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105275 1 0.0938 0.968 0.988 0.012
#> SRR2105276 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105273 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105274 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105269 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105270 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105267 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105268 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105263 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105261 1 0.9963 0.119 0.536 0.464
#> SRR2105262 1 0.6247 0.820 0.844 0.156
#> SRR2105357 1 0.0938 0.969 0.988 0.012
#> SRR2105358 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105439 2 0.2043 0.954 0.032 0.968
#> SRR2105440 2 0.2043 0.954 0.032 0.968
#> SRR2105509 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105510 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105507 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105508 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105505 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105506 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105503 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.5629 0.861 0.132 0.868
#> SRR2105501 2 0.1414 0.964 0.020 0.980
#> SRR2105502 2 0.3274 0.935 0.060 0.940
#> SRR2105499 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR2105497 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105498 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105495 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105496 2 0.0672 0.968 0.008 0.992
#> SRR2105493 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105494 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR2105491 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105489 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105490 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105487 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105485 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105484 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105481 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105479 1 0.0672 0.972 0.992 0.008
#> SRR2105480 1 0.0672 0.972 0.992 0.008
#> SRR2105477 2 0.0672 0.968 0.008 0.992
#> SRR2105478 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105475 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105476 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105473 2 0.3879 0.915 0.076 0.924
#> SRR2105474 2 0.2423 0.948 0.040 0.960
#> SRR2105471 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105472 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105469 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105470 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR2105468 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105465 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR2105466 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105463 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105464 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105461 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105459 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105460 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105457 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105458 1 0.1184 0.967 0.984 0.016
#> SRR2105455 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105456 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105453 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105454 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105451 2 0.2236 0.955 0.036 0.964
#> SRR2105452 2 0.7139 0.780 0.196 0.804
#> SRR2105449 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105450 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105447 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105448 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105445 1 0.9795 0.273 0.584 0.416
#> SRR2105446 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105443 2 0.6973 0.791 0.188 0.812
#> SRR2105444 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR2105441 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105442 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105437 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105438 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105435 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105436 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105433 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105434 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105431 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105432 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105429 2 0.5737 0.857 0.136 0.864
#> SRR2105430 2 0.2423 0.951 0.040 0.960
#> SRR2105427 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105428 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105425 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105426 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105421 1 0.5737 0.845 0.864 0.136
#> SRR2105422 1 0.1633 0.961 0.976 0.024
#> SRR2105423 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105424 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105419 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105420 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105415 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105416 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105417 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105418 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105413 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105414 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105409 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105411 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105407 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105408 1 0.1184 0.967 0.984 0.016
#> SRR2105403 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105404 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105405 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105406 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105401 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105402 2 0.7139 0.780 0.196 0.804
#> SRR2105399 2 0.6887 0.796 0.184 0.816
#> SRR2105400 2 0.5946 0.847 0.144 0.856
#> SRR2105397 2 0.7453 0.756 0.212 0.788
#> SRR2105398 2 0.7950 0.712 0.240 0.760
#> SRR2105395 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105396 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105393 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105394 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105389 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105390 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105391 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105392 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105385 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105388 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105381 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR2105382 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR2105383 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105384 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105379 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105380 2 0.1414 0.960 0.020 0.980
#> SRR2105377 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105378 2 0.1414 0.962 0.020 0.980
#> SRR2105375 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR2105376 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105373 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105374 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105371 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105372 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105369 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105370 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105368 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105365 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105361 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105360 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105355 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105356 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0938 0.968 0.988 0.012
#> SRR2105354 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105351 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.7139 0.780 0.196 0.804
#> SRR2105349 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105350 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105346 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105347 2 0.2043 0.954 0.032 0.968
#> SRR2105348 2 0.2423 0.948 0.040 0.960
#> SRR2105343 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105342 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105339 1 0.0938 0.968 0.988 0.012
#> SRR2105340 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105335 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR2105337 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105331 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105332 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105334 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105329 2 0.3733 0.926 0.072 0.928
#> SRR2105330 2 0.2043 0.959 0.032 0.968
#> SRR2105327 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105328 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105325 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105326 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105323 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105324 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105322 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105317 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105318 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105315 2 0.6531 0.816 0.168 0.832
#> SRR2105316 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105313 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105314 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.4562 0.893 0.904 0.096
#> SRR2105312 1 0.7219 0.758 0.800 0.200
#> SRR2105307 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105308 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR2105309 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105310 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105305 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105306 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105303 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.2778 0.945 0.048 0.952
#> SRR2105301 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105302 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105299 1 0.9000 0.537 0.684 0.316
#> SRR2105300 2 0.8499 0.653 0.276 0.724
#> SRR2105297 2 0.8713 0.605 0.292 0.708
#> SRR2105298 2 0.7950 0.701 0.240 0.760
#> SRR2105295 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105296 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105293 1 0.1184 0.967 0.984 0.016
#> SRR2105294 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105292 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105289 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105290 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105287 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105288 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105285 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105286 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105283 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR2105284 2 0.2603 0.946 0.044 0.956
#> SRR2105281 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105282 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105259 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105260 1 0.1414 0.964 0.980 0.020
#> SRR2105279 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105280 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105257 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105258 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105253 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105254 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105250 2 0.2603 0.945 0.044 0.956
#> SRR2105247 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105248 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105245 1 0.7056 0.774 0.808 0.192
#> SRR2105246 1 0.9522 0.433 0.628 0.372
#> SRR2105243 1 0.0672 0.972 0.992 0.008
#> SRR2105244 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR2105241 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105242 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105239 1 0.0672 0.972 0.992 0.008
#> SRR2105240 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105237 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105238 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105235 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105236 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105233 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105234 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105231 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105232 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105227 1 0.2043 0.959 0.968 0.032
#> SRR2105228 1 0.1633 0.967 0.976 0.024
#> SRR2105225 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105229 1 0.5178 0.870 0.884 0.116
#> SRR2105230 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105219 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105220 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.1414 0.962 0.020 0.980
#> SRR2105222 2 0.2043 0.954 0.032 0.968
#> SRR2105223 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0376 0.972 0.996 0.004
#> SRR2105217 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105218 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105215 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105216 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105213 1 0.4022 0.917 0.920 0.080
#> SRR2105214 1 0.7883 0.704 0.764 0.236
#> SRR2105211 1 0.1184 0.967 0.984 0.016
#> SRR2105212 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105210 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105207 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105208 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105205 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105206 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105201 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105202 2 0.2236 0.951 0.036 0.964
#> SRR2105203 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105199 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105200 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105197 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105198 1 0.2778 0.940 0.952 0.048
#> SRR2105195 1 0.0672 0.972 0.992 0.008
#> SRR2105196 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR2105193 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105194 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105191 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105189 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105190 2 0.0938 0.966 0.012 0.988
#> SRR2105187 2 0.1184 0.964 0.016 0.984
#> SRR2105188 2 0.1633 0.960 0.024 0.976
#> SRR2105179 1 0.0938 0.971 0.988 0.012
#> SRR2105180 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105183 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105184 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105185 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105186 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105181 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105182 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105177 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105178 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105171 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105175 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105176 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105173 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105169 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105170 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105167 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105168 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105165 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.1184 0.967 0.984 0.016
#> SRR2105164 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105161 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105162 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105155 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105156 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105157 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105158 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105159 1 0.0672 0.970 0.992 0.008
#> SRR2105160 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105153 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.968 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105152 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105149 1 0.8144 0.672 0.748 0.252
#> SRR2105150 1 0.6712 0.791 0.824 0.176
#> SRR2105147 2 0.8909 0.586 0.308 0.692
#> SRR2105148 2 0.8909 0.586 0.308 0.692
#> SRR2105143 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR2105144 1 0.2948 0.943 0.948 0.052
#> SRR2105145 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105146 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105141 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105142 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105139 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105140 2 0.0672 0.967 0.008 0.992
#> SRR2105137 2 0.3274 0.930 0.060 0.940
#> SRR2105138 2 0.6531 0.810 0.168 0.832
#> SRR2105135 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105136 2 0.0376 0.968 0.004 0.996
#> SRR2105133 1 0.0376 0.971 0.996 0.004
#> SRR2105134 1 0.0000 0.972 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9286 0.508 0.344 0.656
#> SRR2105132 1 0.6623 0.803 0.828 0.172
#> SRR2105129 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105130 1 0.1184 0.971 0.984 0.016
#> SRR2105127 1 0.3584 0.927 0.932 0.068
#> SRR2105128 1 0.5408 0.865 0.876 0.124
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.6180 0.25469 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105278 3 0.6280 0.12722 0.460 0.000 0.540
#> SRR2105275 3 0.5678 0.52501 0.316 0.000 0.684
#> SRR2105276 3 0.6095 0.45180 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105273 1 0.6302 -0.02288 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105274 1 0.4504 0.65736 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105271 1 0.6204 0.21812 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105272 1 0.1163 0.73781 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105269 2 0.2448 0.89117 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105270 2 0.1753 0.90143 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105267 2 0.2066 0.89647 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105268 2 0.0424 0.90525 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105265 2 0.0424 0.90525 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105266 2 0.0592 0.90468 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105263 2 0.2569 0.89565 0.032 0.936 0.032
#> SRR2105264 2 0.1753 0.89525 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105261 3 0.4689 0.56344 0.052 0.096 0.852
#> SRR2105262 3 0.5346 0.60669 0.152 0.040 0.808
#> SRR2105357 3 0.4351 0.61541 0.168 0.004 0.828
#> SRR2105358 3 0.5926 0.40825 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105439 2 0.4565 0.83654 0.076 0.860 0.064
#> SRR2105440 2 0.4569 0.84012 0.072 0.860 0.068
#> SRR2105509 2 0.5678 0.68912 0.000 0.684 0.316
#> SRR2105510 2 0.5706 0.68450 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105507 3 0.6309 0.10003 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105508 3 0.6126 0.40052 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105505 1 0.5098 0.61674 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105506 1 0.4002 0.68909 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105503 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.5785 0.21369 0.000 0.332 0.668
#> SRR2105501 2 0.1765 0.90406 0.004 0.956 0.040
#> SRR2105502 3 0.6126 -0.02589 0.000 0.400 0.600
#> SRR2105499 3 0.6305 0.12767 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105500 1 0.6299 0.04939 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105497 2 0.0237 0.90537 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105498 2 0.1031 0.90189 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105495 2 0.2537 0.88780 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105496 2 0.2301 0.88968 0.004 0.936 0.060
#> SRR2105493 2 0.3183 0.87946 0.016 0.908 0.076
#> SRR2105494 2 0.3181 0.87350 0.024 0.912 0.064
#> SRR2105491 2 0.3764 0.87752 0.040 0.892 0.068
#> SRR2105492 2 0.3112 0.88316 0.056 0.916 0.028
#> SRR2105489 2 0.0747 0.90380 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105490 2 0.1289 0.89973 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105487 1 0.5905 0.36603 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105488 1 0.4291 0.65200 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105485 3 0.6299 0.05247 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105486 3 0.6307 0.03630 0.488 0.000 0.512
#> SRR2105483 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105484 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105481 1 0.5178 0.51015 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105482 1 0.1031 0.73798 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105479 1 0.5905 0.27247 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105480 1 0.2878 0.71063 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105477 2 0.3272 0.88244 0.004 0.892 0.104
#> SRR2105478 2 0.2550 0.88791 0.012 0.932 0.056
#> SRR2105475 2 0.5650 0.69511 0.000 0.688 0.312
#> SRR2105476 2 0.5560 0.71105 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105473 2 0.6229 0.73169 0.172 0.764 0.064
#> SRR2105474 2 0.5212 0.80582 0.108 0.828 0.064
#> SRR2105471 2 0.0747 0.90380 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105472 2 0.0892 0.90295 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105469 3 0.6079 0.42770 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105470 1 0.6126 0.29360 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105467 1 0.6291 0.16699 0.532 0.000 0.468
#> SRR2105468 1 0.5397 0.58305 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105465 1 0.1950 0.73887 0.952 0.008 0.040
#> SRR2105466 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105463 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105464 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105461 2 0.0424 0.90525 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105462 2 0.0475 0.90573 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105459 2 0.4654 0.80691 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105460 2 0.4346 0.82544 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105457 3 0.4504 0.61968 0.196 0.000 0.804
#> SRR2105458 3 0.3941 0.62310 0.156 0.000 0.844
#> SRR2105455 1 0.5591 0.52774 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105456 1 0.4974 0.62354 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105453 1 0.4842 0.64150 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105454 1 0.4796 0.64065 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105451 2 0.4291 0.83407 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105452 3 0.5363 0.36333 0.000 0.276 0.724
#> SRR2105449 1 0.2448 0.72407 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105450 1 0.1411 0.73670 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105447 2 0.5291 0.74781 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105448 2 0.3482 0.86432 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105445 3 0.4281 0.59560 0.072 0.056 0.872
#> SRR2105446 3 0.6235 0.19971 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105443 3 0.5692 0.37579 0.008 0.268 0.724
#> SRR2105444 2 0.7953 0.42188 0.068 0.564 0.368
#> SRR2105441 2 0.1905 0.89676 0.028 0.956 0.016
#> SRR2105442 2 0.1860 0.89049 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105437 1 0.6180 0.11816 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105438 1 0.6192 0.10258 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105435 3 0.6244 0.34107 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105436 3 0.6309 0.09827 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105433 1 0.0475 0.73509 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105434 1 0.0475 0.73549 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105431 1 0.0237 0.73617 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.0237 0.73617 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105429 2 0.8071 0.47291 0.076 0.564 0.360
#> SRR2105430 2 0.5873 0.68594 0.004 0.684 0.312
#> SRR2105427 2 0.2878 0.88004 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105428 2 0.2959 0.87961 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105425 2 0.2261 0.89360 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105426 2 0.0747 0.90380 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105421 3 0.4469 0.60796 0.120 0.028 0.852
#> SRR2105422 3 0.4293 0.61773 0.164 0.004 0.832
#> SRR2105423 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105419 3 0.6126 0.37660 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105420 3 0.5733 0.51838 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105415 1 0.0424 0.73351 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105416 1 0.0983 0.72693 0.980 0.004 0.016
#> SRR2105417 1 0.1860 0.73887 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105418 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105413 2 0.5678 0.69007 0.000 0.684 0.316
#> SRR2105414 2 0.5327 0.74489 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105409 2 0.0592 0.90450 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105410 2 0.1491 0.90127 0.016 0.968 0.016
#> SRR2105411 2 0.0237 0.90559 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105412 2 0.0829 0.90514 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105407 3 0.3816 0.61913 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105408 3 0.3619 0.61865 0.136 0.000 0.864
#> SRR2105403 3 0.6095 0.32732 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105404 3 0.6154 0.28107 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105405 1 0.4842 0.63598 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105406 1 0.3983 0.70183 0.852 0.004 0.144
#> SRR2105401 2 0.6062 0.57980 0.000 0.616 0.384
#> SRR2105402 3 0.5678 0.25986 0.000 0.316 0.684
#> SRR2105399 3 0.5678 0.28041 0.000 0.316 0.684
#> SRR2105400 3 0.5859 0.19868 0.000 0.344 0.656
#> SRR2105397 3 0.5744 0.51203 0.072 0.128 0.800
#> SRR2105398 3 0.5407 0.52801 0.076 0.104 0.820
#> SRR2105395 2 0.0237 0.90537 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105396 2 0.0892 0.90295 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105393 2 0.0661 0.90546 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105394 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.4291 0.62155 0.180 0.000 0.820
#> SRR2105390 3 0.5216 0.58217 0.260 0.000 0.740
#> SRR2105391 3 0.4291 0.62217 0.180 0.000 0.820
#> SRR2105392 3 0.4452 0.61942 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105385 1 0.6180 0.21343 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105386 1 0.6291 0.05188 0.532 0.000 0.468
#> SRR2105387 1 0.5058 0.61664 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105388 1 0.3816 0.70011 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105381 2 0.6062 0.58172 0.000 0.616 0.384
#> SRR2105382 2 0.5397 0.73308 0.000 0.720 0.280
#> SRR2105383 2 0.2703 0.89018 0.056 0.928 0.016
#> SRR2105384 2 0.2749 0.88569 0.064 0.924 0.012
#> SRR2105379 2 0.4796 0.78961 0.000 0.780 0.220
#> SRR2105380 2 0.5507 0.79785 0.136 0.808 0.056
#> SRR2105377 2 0.2703 0.88282 0.016 0.928 0.056
#> SRR2105378 2 0.4790 0.82491 0.096 0.848 0.056
#> SRR2105375 1 0.4351 0.69530 0.828 0.004 0.168
#> SRR2105376 1 0.3573 0.72045 0.876 0.004 0.120
#> SRR2105373 3 0.6045 0.38972 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105374 1 0.6026 0.27125 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105371 3 0.5327 0.58069 0.272 0.000 0.728
#> SRR2105372 3 0.5760 0.52475 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105369 1 0.6309 -0.03267 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105370 1 0.6204 0.24022 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105367 1 0.2537 0.71134 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105368 1 0.1529 0.71823 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105365 2 0.4709 0.85515 0.056 0.852 0.092
#> SRR2105366 2 0.2810 0.89224 0.036 0.928 0.036
#> SRR2105363 2 0.0747 0.90500 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105364 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105361 2 0.0237 0.90510 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105362 2 0.0237 0.90510 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105359 3 0.5988 0.45931 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105360 3 0.6154 0.37556 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105355 3 0.5968 0.47549 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105356 1 0.5621 0.52266 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105353 3 0.4575 0.61892 0.184 0.004 0.812
#> SRR2105354 3 0.6140 0.42592 0.404 0.000 0.596
#> SRR2105351 2 0.2165 0.89349 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105352 3 0.5678 0.25986 0.000 0.316 0.684
#> SRR2105349 2 0.5138 0.76273 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105350 2 0.1031 0.90414 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105345 2 0.1877 0.89645 0.032 0.956 0.012
#> SRR2105346 2 0.1525 0.89866 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105347 2 0.5061 0.73646 0.208 0.784 0.008
#> SRR2105348 2 0.5618 0.66308 0.260 0.732 0.008
#> SRR2105343 2 0.1163 0.90390 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105344 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.5216 0.58846 0.260 0.000 0.740
#> SRR2105342 3 0.6008 0.44227 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105339 3 0.4834 0.61666 0.204 0.004 0.792
#> SRR2105340 3 0.5591 0.56654 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105335 1 0.6192 0.28920 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105336 1 0.4291 0.69216 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105337 1 0.5397 0.56025 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105338 1 0.1289 0.73795 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105331 2 0.1529 0.90105 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105332 2 0.0237 0.90510 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105333 2 0.5291 0.74953 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105334 2 0.4178 0.83369 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105329 3 0.5156 0.46490 0.008 0.216 0.776
#> SRR2105330 2 0.5656 0.71078 0.004 0.712 0.284
#> SRR2105327 2 0.5138 0.75625 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105328 2 0.5058 0.76470 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105325 3 0.5968 0.46748 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105326 3 0.6062 0.45683 0.384 0.000 0.616
#> SRR2105323 3 0.5216 0.54430 0.260 0.000 0.740
#> SRR2105324 3 0.6299 0.11311 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105319 1 0.5397 0.48002 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105320 1 0.1860 0.73378 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105321 3 0.6180 0.43133 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105322 3 0.6295 0.32972 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105317 2 0.5138 0.76594 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105318 2 0.2537 0.88981 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105315 3 0.6393 0.48304 0.048 0.216 0.736
#> SRR2105316 2 0.3816 0.85207 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105313 2 0.3752 0.85613 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105314 2 0.0892 0.90501 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105311 3 0.6570 0.47389 0.308 0.024 0.668
#> SRR2105312 3 0.6906 0.46621 0.324 0.032 0.644
#> SRR2105307 1 0.3715 0.71386 0.868 0.004 0.128
#> SRR2105308 1 0.4033 0.70189 0.856 0.008 0.136
#> SRR2105309 3 0.4504 0.61905 0.196 0.000 0.804
#> SRR2105310 3 0.5529 0.54639 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105305 3 0.4654 0.61552 0.208 0.000 0.792
#> SRR2105306 3 0.5706 0.53437 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105303 2 0.0424 0.90534 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105304 3 0.6154 -0.05720 0.000 0.408 0.592
#> SRR2105301 2 0.5465 0.72463 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105302 2 0.2959 0.87890 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105299 3 0.3272 0.60482 0.080 0.016 0.904
#> SRR2105300 3 0.4591 0.53724 0.032 0.120 0.848
#> SRR2105297 1 0.6286 0.00904 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105298 1 0.6521 -0.08719 0.504 0.492 0.004
#> SRR2105295 2 0.5465 0.72493 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105296 2 0.3482 0.86119 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105293 3 0.6140 0.43096 0.404 0.000 0.596
#> SRR2105294 1 0.5216 0.50517 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105291 1 0.4796 0.64637 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105292 1 0.0592 0.73761 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105289 3 0.5621 0.55076 0.308 0.000 0.692
#> SRR2105290 1 0.2066 0.74010 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105287 1 0.3983 0.69566 0.852 0.004 0.144
#> SRR2105288 1 0.2590 0.73236 0.924 0.004 0.072
#> SRR2105285 2 0.5138 0.76471 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105286 2 0.2625 0.88791 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105283 2 0.2651 0.88262 0.012 0.928 0.060
#> SRR2105284 2 0.4035 0.85960 0.040 0.880 0.080
#> SRR2105281 2 0.1170 0.90597 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105282 2 0.0848 0.90600 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105259 3 0.3686 0.61924 0.140 0.000 0.860
#> SRR2105260 3 0.3482 0.61800 0.128 0.000 0.872
#> SRR2105279 2 0.0237 0.90546 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105280 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105257 1 0.1411 0.73774 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105258 1 0.0592 0.73761 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105253 2 0.1411 0.90233 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105254 2 0.1129 0.90578 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105255 3 0.6291 0.14817 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105256 1 0.6274 0.13336 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105251 2 0.0424 0.90535 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105252 2 0.0424 0.90535 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105249 2 0.2414 0.89472 0.020 0.940 0.040
#> SRR2105250 2 0.5588 0.78960 0.124 0.808 0.068
#> SRR2105247 2 0.0237 0.90537 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.8069 0.53611 0.244 0.120 0.636
#> SRR2105246 3 0.8339 0.48255 0.168 0.204 0.628
#> SRR2105243 1 0.6045 0.35405 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105244 1 0.5591 0.49017 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105241 1 0.4002 0.69600 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105242 1 0.0424 0.73701 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105239 1 0.5016 0.62113 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105240 1 0.1411 0.74112 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105237 2 0.6154 0.56564 0.000 0.592 0.408
#> SRR2105238 2 0.3619 0.87235 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105235 2 0.2492 0.89464 0.016 0.936 0.048
#> SRR2105236 2 0.1774 0.90012 0.024 0.960 0.016
#> SRR2105233 2 0.5529 0.71508 0.000 0.704 0.296
#> SRR2105234 2 0.5497 0.72039 0.000 0.708 0.292
#> SRR2105231 2 0.0237 0.90546 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105232 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105227 3 0.6669 0.22611 0.468 0.008 0.524
#> SRR2105228 1 0.5298 0.68382 0.804 0.032 0.164
#> SRR2105225 1 0.5810 0.45162 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105226 1 0.3816 0.70671 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105229 3 0.3031 0.60130 0.076 0.012 0.912
#> SRR2105230 3 0.5591 0.55347 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105219 2 0.1643 0.90077 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105220 2 0.0747 0.90560 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105221 2 0.4288 0.84701 0.068 0.872 0.060
#> SRR2105222 2 0.5497 0.78916 0.124 0.812 0.064
#> SRR2105223 1 0.6295 0.03648 0.528 0.000 0.472
#> SRR2105224 1 0.5560 0.53269 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105217 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105215 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105216 2 0.0237 0.90546 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105213 3 0.7685 0.50578 0.344 0.060 0.596
#> SRR2105214 3 0.8230 0.52570 0.224 0.144 0.632
#> SRR2105211 3 0.4605 0.61926 0.204 0.000 0.796
#> SRR2105212 3 0.6225 0.28752 0.432 0.000 0.568
#> SRR2105209 1 0.4702 0.66241 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105210 1 0.0424 0.73701 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105207 1 0.1860 0.74154 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105208 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105205 2 0.4178 0.83268 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105206 2 0.3083 0.89041 0.024 0.916 0.060
#> SRR2105201 2 0.4288 0.84985 0.060 0.872 0.068
#> SRR2105202 2 0.4902 0.82195 0.092 0.844 0.064
#> SRR2105203 2 0.0892 0.90552 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105204 2 0.0237 0.90559 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105199 2 0.0592 0.90566 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105200 2 0.0892 0.90295 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105197 3 0.4750 0.60265 0.216 0.000 0.784
#> SRR2105198 3 0.4575 0.61278 0.184 0.004 0.812
#> SRR2105195 1 0.5178 0.57171 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105196 1 0.1031 0.71994 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105193 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105194 1 0.0237 0.73617 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105191 3 0.6274 0.13049 0.456 0.000 0.544
#> SRR2105192 1 0.3879 0.69898 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105189 2 0.3879 0.84840 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105190 2 0.1860 0.89891 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105187 2 0.5406 0.79847 0.012 0.764 0.224
#> SRR2105188 2 0.4665 0.84294 0.048 0.852 0.100
#> SRR2105179 1 0.3752 0.68546 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105180 1 0.0892 0.73796 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105183 2 0.0892 0.90295 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105184 2 0.1163 0.90094 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105185 2 0.1129 0.90600 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105186 2 0.0661 0.90589 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105181 3 0.5785 0.45825 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105182 3 0.6008 0.40307 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105177 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105178 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105171 2 0.0237 0.90510 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105172 2 0.0237 0.90559 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105175 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105176 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105173 2 0.0424 0.90535 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105174 2 0.0000 0.90535 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105170 2 0.1163 0.90092 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105167 2 0.0592 0.90450 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105168 2 0.0829 0.90514 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105165 1 0.5621 0.38379 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105166 1 0.5497 0.42406 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105163 3 0.5835 0.47669 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105164 3 0.6095 0.44298 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105161 1 0.0829 0.73747 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105162 1 0.0237 0.73366 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105155 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105156 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105157 2 0.0237 0.90581 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105158 2 0.0237 0.90546 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105159 1 0.5291 0.49110 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105160 1 0.1163 0.73782 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105153 2 0.0747 0.90518 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105154 2 0.0592 0.90549 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105151 2 0.0983 0.90444 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105152 2 0.0983 0.90444 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105149 3 0.3722 0.59786 0.088 0.024 0.888
#> SRR2105150 3 0.3377 0.60485 0.092 0.012 0.896
#> SRR2105147 3 0.4865 0.52657 0.032 0.136 0.832
#> SRR2105148 3 0.4865 0.52657 0.032 0.136 0.832
#> SRR2105143 1 0.3445 0.72615 0.896 0.016 0.088
#> SRR2105144 1 0.4056 0.66022 0.876 0.092 0.032
#> SRR2105145 1 0.0747 0.73831 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105146 1 0.0892 0.73800 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105141 2 0.3941 0.84524 0.000 0.844 0.156
#> SRR2105142 2 0.3116 0.87378 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105139 2 0.0424 0.90501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105140 2 0.1031 0.90189 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105137 2 0.4902 0.82238 0.092 0.844 0.064
#> SRR2105138 2 0.6678 0.68313 0.208 0.728 0.064
#> SRR2105135 2 0.0829 0.90514 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105136 2 0.0747 0.90380 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105133 3 0.5882 0.44524 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105134 1 0.6308 0.01809 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105131 2 0.8602 0.14359 0.100 0.492 0.408
#> SRR2105132 1 0.7661 0.45894 0.684 0.172 0.144
#> SRR2105129 1 0.0424 0.73085 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105130 1 0.0424 0.73085 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105127 1 0.6159 0.61895 0.756 0.048 0.196
#> SRR2105128 1 0.6765 0.55931 0.724 0.068 0.208
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.3521 0.6808 0.052 0.000 0.864 0.084
#> SRR2105278 3 0.3547 0.6800 0.064 0.000 0.864 0.072
#> SRR2105275 3 0.7554 0.4453 0.212 0.000 0.472 0.316
#> SRR2105276 3 0.7790 0.3666 0.272 0.000 0.424 0.304
#> SRR2105273 3 0.4720 0.5952 0.264 0.000 0.720 0.016
#> SRR2105274 1 0.4500 0.5206 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105271 3 0.4857 0.5002 0.324 0.000 0.668 0.008
#> SRR2105272 1 0.0937 0.7952 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105269 2 0.4356 0.4830 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105270 2 0.3583 0.6995 0.000 0.816 0.004 0.180
#> SRR2105267 2 0.4331 0.4933 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105268 2 0.1716 0.7979 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105265 2 0.0817 0.8104 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105266 2 0.0336 0.8123 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105263 2 0.4253 0.6872 0.016 0.776 0.000 0.208
#> SRR2105264 2 0.2593 0.7888 0.016 0.904 0.000 0.080
#> SRR2105261 4 0.5446 0.1934 0.004 0.020 0.340 0.636
#> SRR2105262 3 0.6307 0.4531 0.056 0.004 0.564 0.376
#> SRR2105357 3 0.3335 0.6869 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR2105358 3 0.3550 0.6852 0.044 0.000 0.860 0.096
#> SRR2105439 2 0.4728 0.6795 0.004 0.800 0.104 0.092
#> SRR2105440 2 0.4606 0.6846 0.004 0.808 0.100 0.088
#> SRR2105509 4 0.4855 0.6076 0.000 0.352 0.004 0.644
#> SRR2105510 4 0.4713 0.6002 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105507 3 0.5108 0.5135 0.308 0.000 0.672 0.020
#> SRR2105508 3 0.4959 0.6549 0.196 0.000 0.752 0.052
#> SRR2105505 1 0.6079 0.1035 0.492 0.000 0.464 0.044
#> SRR2105506 1 0.4252 0.6367 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105503 2 0.2011 0.8014 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105504 4 0.4919 0.5218 0.000 0.076 0.152 0.772
#> SRR2105501 2 0.3462 0.7577 0.004 0.860 0.020 0.116
#> SRR2105502 4 0.4901 0.5740 0.000 0.112 0.108 0.780
#> SRR2105499 3 0.4508 0.6798 0.184 0.000 0.780 0.036
#> SRR2105500 3 0.4361 0.6552 0.208 0.000 0.772 0.020
#> SRR2105497 2 0.1118 0.8130 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105498 2 0.1940 0.8027 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105495 2 0.4663 0.7115 0.000 0.788 0.064 0.148
#> SRR2105496 2 0.4411 0.7205 0.000 0.812 0.080 0.108
#> SRR2105493 2 0.5361 0.6484 0.000 0.744 0.108 0.148
#> SRR2105494 2 0.5067 0.6598 0.000 0.768 0.116 0.116
#> SRR2105491 2 0.5543 0.0145 0.020 0.556 0.000 0.424
#> SRR2105492 2 0.4983 0.5399 0.024 0.704 0.000 0.272
#> SRR2105489 2 0.1792 0.7987 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105490 2 0.1824 0.8009 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR2105487 3 0.6027 0.5222 0.244 0.000 0.664 0.092
#> SRR2105488 3 0.6626 0.2862 0.384 0.000 0.528 0.088
#> SRR2105485 3 0.3758 0.6983 0.104 0.000 0.848 0.048
#> SRR2105486 3 0.3958 0.7002 0.112 0.000 0.836 0.052
#> SRR2105483 1 0.0469 0.7955 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105484 1 0.0469 0.7955 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105481 1 0.5398 0.1571 0.580 0.000 0.404 0.016
#> SRR2105482 1 0.0895 0.7976 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105479 1 0.6194 0.5122 0.668 0.000 0.200 0.132
#> SRR2105480 1 0.2845 0.7646 0.896 0.000 0.076 0.028
#> SRR2105477 2 0.6111 0.5713 0.000 0.652 0.092 0.256
#> SRR2105478 2 0.5050 0.7019 0.000 0.764 0.084 0.152
#> SRR2105475 4 0.4624 0.6153 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105476 4 0.4643 0.6126 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105473 2 0.5275 0.6636 0.032 0.788 0.092 0.088
#> SRR2105474 2 0.5317 0.6744 0.016 0.772 0.084 0.128
#> SRR2105471 2 0.1637 0.8012 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105472 2 0.1637 0.8012 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105469 3 0.4312 0.7003 0.132 0.000 0.812 0.056
#> SRR2105470 3 0.4977 0.1412 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR2105467 3 0.4300 0.6730 0.088 0.000 0.820 0.092
#> SRR2105468 3 0.6098 0.3819 0.292 0.000 0.632 0.076
#> SRR2105465 1 0.2164 0.7878 0.924 0.004 0.068 0.004
#> SRR2105466 1 0.0188 0.7960 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105463 1 0.0188 0.7960 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105464 1 0.0188 0.7960 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105461 2 0.1557 0.8026 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105462 2 0.0817 0.8096 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105459 4 0.4994 0.3837 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105460 2 0.5000 -0.3273 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105457 3 0.3818 0.7123 0.048 0.000 0.844 0.108
#> SRR2105458 3 0.3962 0.7054 0.028 0.000 0.820 0.152
#> SRR2105455 1 0.5174 0.4280 0.620 0.000 0.368 0.012
#> SRR2105456 1 0.4164 0.6254 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105453 1 0.6610 0.1199 0.468 0.000 0.452 0.080
#> SRR2105454 3 0.6605 -0.0419 0.440 0.000 0.480 0.080
#> SRR2105451 2 0.5220 0.6685 0.000 0.752 0.092 0.156
#> SRR2105452 4 0.4880 0.4690 0.000 0.052 0.188 0.760
#> SRR2105449 1 0.2949 0.7547 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR2105450 1 0.1004 0.7945 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105447 4 0.5119 0.4828 0.000 0.440 0.004 0.556
#> SRR2105448 2 0.4967 -0.1658 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105445 3 0.3128 0.6831 0.004 0.004 0.864 0.128
#> SRR2105446 3 0.3697 0.6828 0.048 0.000 0.852 0.100
#> SRR2105443 4 0.6083 0.4981 0.000 0.112 0.216 0.672
#> SRR2105444 2 0.8444 -0.1807 0.024 0.376 0.248 0.352
#> SRR2105441 2 0.1305 0.8072 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR2105442 2 0.2125 0.7969 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105437 3 0.6426 0.4900 0.272 0.000 0.620 0.108
#> SRR2105438 3 0.6426 0.4900 0.272 0.000 0.620 0.108
#> SRR2105435 3 0.5657 0.6402 0.244 0.000 0.688 0.068
#> SRR2105436 3 0.4012 0.6817 0.184 0.000 0.800 0.016
#> SRR2105433 1 0.0188 0.7960 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105434 1 0.0779 0.7976 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105431 1 0.0188 0.7959 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.0188 0.7959 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105429 4 0.6787 0.6276 0.040 0.280 0.056 0.624
#> SRR2105430 4 0.5383 0.6225 0.004 0.308 0.024 0.664
#> SRR2105427 2 0.3975 0.5835 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105428 2 0.4331 0.4900 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105425 2 0.4193 0.5409 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105426 2 0.1389 0.8103 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105421 3 0.5659 0.4894 0.032 0.000 0.600 0.368
#> SRR2105422 3 0.5883 0.5858 0.060 0.000 0.640 0.300
#> SRR2105423 2 0.0469 0.8133 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105424 2 0.0000 0.8126 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.3842 0.7044 0.128 0.000 0.836 0.036
#> SRR2105420 3 0.4055 0.7108 0.108 0.000 0.832 0.060
#> SRR2105415 1 0.0895 0.7893 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105416 1 0.0779 0.7910 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105417 1 0.1978 0.7831 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105418 1 0.0188 0.7960 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105413 4 0.4761 0.6194 0.000 0.332 0.004 0.664
#> SRR2105414 4 0.5112 0.4880 0.000 0.436 0.004 0.560
#> SRR2105409 2 0.1398 0.8114 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105410 2 0.2480 0.7908 0.000 0.904 0.008 0.088
#> SRR2105411 2 0.0707 0.8123 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105412 2 0.0469 0.8115 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105407 3 0.2867 0.7129 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR2105408 3 0.2988 0.7095 0.012 0.000 0.876 0.112
#> SRR2105403 3 0.3634 0.6855 0.048 0.000 0.856 0.096
#> SRR2105404 3 0.3652 0.6850 0.052 0.000 0.856 0.092
#> SRR2105405 1 0.4155 0.6448 0.756 0.000 0.240 0.004
#> SRR2105406 1 0.3626 0.7036 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR2105401 4 0.4978 0.6227 0.000 0.324 0.012 0.664
#> SRR2105402 4 0.5007 0.4968 0.000 0.068 0.172 0.760
#> SRR2105399 4 0.5719 0.5751 0.000 0.132 0.152 0.716
#> SRR2105400 4 0.5677 0.5897 0.000 0.140 0.140 0.720
#> SRR2105397 4 0.6869 0.2705 0.052 0.048 0.280 0.620
#> SRR2105398 4 0.6247 0.3370 0.044 0.036 0.244 0.676
#> SRR2105395 2 0.1716 0.8017 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105396 2 0.1637 0.8012 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105393 2 0.0469 0.8120 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105394 2 0.1557 0.8053 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105389 3 0.3048 0.7134 0.016 0.000 0.876 0.108
#> SRR2105390 3 0.3088 0.7175 0.052 0.000 0.888 0.060
#> SRR2105391 3 0.3587 0.7125 0.040 0.000 0.856 0.104
#> SRR2105392 3 0.3525 0.7133 0.040 0.000 0.860 0.100
#> SRR2105385 3 0.5138 0.3788 0.392 0.000 0.600 0.008
#> SRR2105386 3 0.4343 0.5886 0.264 0.000 0.732 0.004
#> SRR2105387 1 0.4567 0.6087 0.716 0.000 0.276 0.008
#> SRR2105388 1 0.4621 0.5763 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR2105381 4 0.5113 0.6367 0.000 0.264 0.032 0.704
#> SRR2105382 4 0.4697 0.5944 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105383 2 0.2412 0.7897 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR2105384 2 0.2593 0.7983 0.016 0.904 0.000 0.080
#> SRR2105379 4 0.4996 0.3534 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105380 2 0.6663 0.3228 0.144 0.612 0.000 0.244
#> SRR2105377 2 0.3312 0.7618 0.000 0.876 0.052 0.072
#> SRR2105378 2 0.4664 0.7157 0.016 0.812 0.056 0.116
#> SRR2105375 1 0.5987 0.5386 0.656 0.016 0.288 0.040
#> SRR2105376 1 0.4599 0.6758 0.760 0.000 0.212 0.028
#> SRR2105373 3 0.3392 0.6968 0.056 0.000 0.872 0.072
#> SRR2105374 3 0.6323 0.4968 0.272 0.000 0.628 0.100
#> SRR2105371 3 0.3464 0.7120 0.076 0.000 0.868 0.056
#> SRR2105372 3 0.3652 0.7092 0.092 0.000 0.856 0.052
#> SRR2105369 3 0.3718 0.6832 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR2105370 3 0.4018 0.6385 0.224 0.000 0.772 0.004
#> SRR2105367 1 0.4842 0.6555 0.760 0.000 0.192 0.048
#> SRR2105368 1 0.2943 0.7454 0.892 0.000 0.076 0.032
#> SRR2105365 4 0.5933 0.3073 0.036 0.464 0.000 0.500
#> SRR2105366 2 0.5085 0.4752 0.020 0.676 0.000 0.304
#> SRR2105363 2 0.1867 0.7914 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105364 2 0.1211 0.8062 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105361 2 0.1211 0.8056 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105362 2 0.0336 0.8127 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105359 3 0.4237 0.6940 0.152 0.000 0.808 0.040
#> SRR2105360 3 0.4423 0.6742 0.176 0.000 0.788 0.036
#> SRR2105355 3 0.4789 0.6766 0.172 0.000 0.772 0.056
#> SRR2105356 1 0.5060 0.3370 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR2105353 3 0.5519 0.6224 0.052 0.000 0.684 0.264
#> SRR2105354 3 0.5011 0.6835 0.160 0.000 0.764 0.076
#> SRR2105351 2 0.4679 0.1971 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105352 4 0.5007 0.4968 0.000 0.068 0.172 0.760
#> SRR2105349 4 0.4843 0.5516 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR2105350 2 0.2704 0.7536 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105345 2 0.0817 0.8124 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105346 2 0.0592 0.8132 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105347 2 0.4055 0.7089 0.108 0.832 0.000 0.060
#> SRR2105348 2 0.4907 0.6089 0.176 0.764 0.000 0.060
#> SRR2105343 2 0.3907 0.6052 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105344 2 0.0188 0.8128 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105341 3 0.3900 0.7129 0.072 0.000 0.844 0.084
#> SRR2105342 3 0.3962 0.7046 0.124 0.000 0.832 0.044
#> SRR2105339 3 0.5035 0.6672 0.052 0.000 0.744 0.204
#> SRR2105340 3 0.5911 0.6498 0.112 0.000 0.692 0.196
#> SRR2105335 3 0.4491 0.6665 0.140 0.000 0.800 0.060
#> SRR2105336 3 0.6319 0.0872 0.436 0.000 0.504 0.060
#> SRR2105337 1 0.4950 0.4014 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR2105338 1 0.1743 0.7920 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR2105331 2 0.4222 0.6243 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105332 2 0.2149 0.8010 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105333 4 0.4830 0.5619 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105334 4 0.4998 0.3372 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR2105329 3 0.6548 0.3898 0.000 0.104 0.592 0.304
#> SRR2105330 2 0.7168 0.1975 0.000 0.556 0.208 0.236
#> SRR2105327 4 0.4955 0.4616 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105328 4 0.4941 0.4708 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105325 3 0.7818 0.3573 0.264 0.000 0.404 0.332
#> SRR2105326 3 0.7820 0.3585 0.276 0.000 0.412 0.312
#> SRR2105323 3 0.3647 0.7026 0.040 0.000 0.852 0.108
#> SRR2105324 3 0.3806 0.6922 0.156 0.000 0.824 0.020
#> SRR2105319 3 0.6067 0.3849 0.376 0.000 0.572 0.052
#> SRR2105320 1 0.3598 0.7336 0.848 0.000 0.124 0.028
#> SRR2105321 3 0.7628 0.4211 0.268 0.000 0.472 0.260
#> SRR2105322 3 0.7726 0.2747 0.368 0.000 0.404 0.228
#> SRR2105317 4 0.4994 0.3826 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105318 2 0.4564 0.3718 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105315 3 0.6768 0.4073 0.004 0.140 0.616 0.240
#> SRR2105316 2 0.4643 0.3301 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105313 2 0.4888 0.0517 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105314 2 0.2081 0.7877 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105311 4 0.7199 0.1285 0.216 0.000 0.232 0.552
#> SRR2105312 4 0.7168 0.1392 0.236 0.000 0.208 0.556
#> SRR2105307 1 0.3668 0.7011 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR2105308 1 0.3721 0.7083 0.816 0.004 0.176 0.004
#> SRR2105309 3 0.3435 0.7149 0.036 0.000 0.864 0.100
#> SRR2105310 3 0.3435 0.7132 0.100 0.000 0.864 0.036
#> SRR2105305 3 0.3991 0.7095 0.048 0.000 0.832 0.120
#> SRR2105306 3 0.3899 0.7057 0.108 0.000 0.840 0.052
#> SRR2105303 2 0.0469 0.8126 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105304 4 0.4901 0.5710 0.000 0.108 0.112 0.780
#> SRR2105301 4 0.4776 0.5832 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105302 2 0.4830 0.1073 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105299 3 0.3257 0.6791 0.004 0.000 0.844 0.152
#> SRR2105300 3 0.5404 0.5404 0.000 0.052 0.700 0.248
#> SRR2105297 1 0.6202 0.3685 0.612 0.312 0.000 0.076
#> SRR2105298 1 0.6202 0.3700 0.612 0.312 0.000 0.076
#> SRR2105295 4 0.4855 0.5511 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105296 2 0.4948 -0.2036 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105293 3 0.7921 0.2510 0.324 0.000 0.348 0.328
#> SRR2105294 1 0.5078 0.5127 0.700 0.000 0.272 0.028
#> SRR2105291 1 0.5525 0.4919 0.644 0.008 0.328 0.020
#> SRR2105292 1 0.0188 0.7964 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105289 3 0.6691 0.5626 0.236 0.000 0.612 0.152
#> SRR2105290 1 0.2466 0.7777 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105287 1 0.3681 0.7127 0.816 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105288 1 0.2466 0.7707 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105285 4 0.4996 0.3694 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105286 2 0.4103 0.5650 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105283 2 0.5387 0.6699 0.012 0.764 0.096 0.128
#> SRR2105284 2 0.5300 0.6534 0.004 0.760 0.112 0.124
#> SRR2105281 2 0.1867 0.7915 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105282 2 0.1792 0.7913 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105259 3 0.3105 0.7117 0.012 0.000 0.868 0.120
#> SRR2105260 3 0.3047 0.7119 0.012 0.000 0.872 0.116
#> SRR2105279 2 0.0336 0.8126 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105280 2 0.0188 0.8126 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105257 1 0.3447 0.7430 0.852 0.000 0.128 0.020
#> SRR2105258 1 0.0524 0.7972 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105253 2 0.2868 0.7426 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105254 2 0.2281 0.7803 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105255 3 0.2909 0.7084 0.092 0.000 0.888 0.020
#> SRR2105256 3 0.3925 0.6750 0.176 0.000 0.808 0.016
#> SRR2105251 2 0.1867 0.8011 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105252 2 0.2408 0.7922 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105249 2 0.2300 0.7984 0.000 0.920 0.016 0.064
#> SRR2105250 2 0.3849 0.7442 0.008 0.856 0.052 0.084
#> SRR2105247 2 0.1211 0.8103 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105248 2 0.1867 0.8002 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105245 3 0.8296 0.3123 0.208 0.024 0.404 0.364
#> SRR2105246 4 0.8652 -0.0534 0.140 0.076 0.344 0.440
#> SRR2105243 3 0.5193 0.2745 0.412 0.000 0.580 0.008
#> SRR2105244 1 0.5112 0.1842 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR2105241 1 0.3494 0.7294 0.824 0.000 0.172 0.004
#> SRR2105242 1 0.0336 0.7965 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105239 1 0.4914 0.5322 0.676 0.000 0.312 0.012
#> SRR2105240 1 0.1398 0.7938 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105237 4 0.5078 0.6324 0.000 0.272 0.028 0.700
#> SRR2105238 2 0.6187 0.5361 0.000 0.656 0.108 0.236
#> SRR2105235 2 0.3080 0.7816 0.000 0.880 0.024 0.096
#> SRR2105236 2 0.1557 0.8072 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105233 4 0.4776 0.5836 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105234 4 0.4790 0.5791 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105231 2 0.1792 0.8008 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105232 2 0.1389 0.8079 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105227 3 0.6726 0.1601 0.428 0.008 0.496 0.068
#> SRR2105228 1 0.4824 0.7183 0.784 0.028 0.168 0.020
#> SRR2105225 3 0.5402 0.0923 0.472 0.000 0.516 0.012
#> SRR2105226 1 0.3718 0.7213 0.820 0.000 0.168 0.012
#> SRR2105229 3 0.4917 0.5483 0.004 0.004 0.664 0.328
#> SRR2105230 3 0.3885 0.7136 0.092 0.000 0.844 0.064
#> SRR2105219 2 0.4040 0.5837 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105220 2 0.1389 0.8064 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105221 2 0.5430 0.6636 0.008 0.756 0.104 0.132
#> SRR2105222 2 0.5789 0.6524 0.024 0.744 0.088 0.144
#> SRR2105223 3 0.4453 0.6188 0.244 0.000 0.744 0.012
#> SRR2105224 1 0.4981 0.1619 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR2105217 2 0.2408 0.7905 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105218 2 0.1716 0.8017 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105215 2 0.0336 0.8131 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105216 2 0.0188 0.8128 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105213 3 0.8121 0.2986 0.292 0.008 0.400 0.300
#> SRR2105214 3 0.8600 0.2464 0.184 0.048 0.388 0.380
#> SRR2105211 3 0.3899 0.7132 0.052 0.000 0.840 0.108
#> SRR2105212 3 0.3625 0.6856 0.160 0.000 0.828 0.012
#> SRR2105209 1 0.5599 0.4401 0.616 0.000 0.352 0.032
#> SRR2105210 1 0.0592 0.7975 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105207 1 0.2644 0.7829 0.908 0.000 0.060 0.032
#> SRR2105208 1 0.0336 0.7959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105205 4 0.4955 0.3450 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105206 2 0.4988 0.5783 0.020 0.692 0.000 0.288
#> SRR2105201 2 0.4364 0.6959 0.000 0.816 0.092 0.092
#> SRR2105202 2 0.4811 0.6797 0.008 0.800 0.100 0.092
#> SRR2105203 2 0.2408 0.7757 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105204 2 0.0469 0.8120 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105199 2 0.1022 0.8086 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105200 2 0.1474 0.8047 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105197 3 0.3082 0.6938 0.032 0.000 0.884 0.084
#> SRR2105198 3 0.4224 0.6753 0.044 0.000 0.812 0.144
#> SRR2105195 1 0.5343 0.5774 0.708 0.000 0.240 0.052
#> SRR2105196 1 0.1516 0.7895 0.960 0.016 0.008 0.016
#> SRR2105193 1 0.0469 0.7961 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105194 1 0.0469 0.7960 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105191 3 0.3687 0.6801 0.064 0.000 0.856 0.080
#> SRR2105192 3 0.6609 -0.0246 0.448 0.000 0.472 0.080
#> SRR2105189 2 0.4720 0.3764 0.000 0.672 0.004 0.324
#> SRR2105190 2 0.3726 0.6452 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105187 4 0.6758 0.1832 0.004 0.424 0.080 0.492
#> SRR2105188 2 0.6139 0.6165 0.008 0.696 0.120 0.176
#> SRR2105179 1 0.3810 0.6884 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR2105180 1 0.3198 0.7489 0.880 0.000 0.080 0.040
#> SRR2105183 2 0.0188 0.8128 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105184 2 0.1637 0.8012 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105185 2 0.2704 0.7754 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105186 2 0.2081 0.7965 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105181 3 0.3176 0.6939 0.036 0.000 0.880 0.084
#> SRR2105182 3 0.2644 0.7078 0.060 0.000 0.908 0.032
#> SRR2105177 1 0.0336 0.7959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105178 1 0.0469 0.7955 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105171 2 0.0817 0.8115 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105172 2 0.0336 0.8120 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105175 1 0.0336 0.7959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105176 1 0.0336 0.7959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105173 2 0.3569 0.7201 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105174 2 0.0921 0.8150 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105169 2 0.1474 0.8083 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105170 2 0.1716 0.7996 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105167 2 0.0592 0.8133 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105168 2 0.0336 0.8120 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105165 1 0.5724 0.0627 0.548 0.000 0.424 0.028
#> SRR2105166 1 0.5511 0.2897 0.620 0.000 0.352 0.028
#> SRR2105163 4 0.7798 -0.2823 0.248 0.000 0.364 0.388
#> SRR2105164 4 0.7910 -0.3124 0.304 0.000 0.344 0.352
#> SRR2105161 1 0.0707 0.7957 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105162 1 0.0336 0.7959 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105155 2 0.0707 0.8145 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105156 2 0.0469 0.8131 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105157 2 0.2216 0.7948 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105158 2 0.2345 0.7911 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105159 1 0.5494 0.5699 0.716 0.000 0.208 0.076
#> SRR2105160 1 0.0927 0.7935 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105153 2 0.3400 0.7276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105154 2 0.3266 0.7417 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105151 2 0.0707 0.8103 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105152 2 0.0336 0.8120 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105149 3 0.6370 0.2870 0.044 0.008 0.492 0.456
#> SRR2105150 3 0.5655 0.3735 0.012 0.008 0.548 0.432
#> SRR2105147 4 0.5131 0.3093 0.012 0.016 0.260 0.712
#> SRR2105148 4 0.5131 0.3093 0.012 0.016 0.260 0.712
#> SRR2105143 1 0.2660 0.7810 0.908 0.008 0.072 0.012
#> SRR2105144 1 0.3742 0.7509 0.868 0.064 0.052 0.016
#> SRR2105145 1 0.0895 0.7956 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105146 1 0.0469 0.7960 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105141 4 0.4843 0.4817 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR2105142 4 0.4985 0.3230 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105139 2 0.1211 0.8156 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105140 2 0.1302 0.8075 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105137 2 0.4352 0.6850 0.000 0.816 0.104 0.080
#> SRR2105138 2 0.6621 0.5968 0.052 0.700 0.104 0.144
#> SRR2105135 2 0.0188 0.8124 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105136 2 0.0469 0.8131 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105133 3 0.3399 0.6855 0.040 0.000 0.868 0.092
#> SRR2105134 3 0.4359 0.6594 0.100 0.000 0.816 0.084
#> SRR2105131 3 0.7801 0.0526 0.008 0.288 0.484 0.220
#> SRR2105132 3 0.8725 0.3092 0.252 0.140 0.500 0.108
#> SRR2105129 1 0.0336 0.7961 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105130 1 0.0469 0.7955 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105127 3 0.7778 0.0228 0.404 0.052 0.464 0.080
#> SRR2105128 1 0.8081 0.0879 0.436 0.044 0.400 0.120
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.4644 -0.1129 0.012 0.000 0.528 0.000 0.460
#> SRR2105278 3 0.4731 -0.1222 0.016 0.000 0.528 0.000 0.456
#> SRR2105275 3 0.6778 0.4029 0.108 0.000 0.556 0.060 0.276
#> SRR2105276 3 0.6857 0.3952 0.132 0.000 0.548 0.052 0.268
#> SRR2105273 3 0.2962 0.5881 0.084 0.000 0.868 0.000 0.048
#> SRR2105274 3 0.4674 0.2485 0.416 0.000 0.568 0.000 0.016
#> SRR2105271 3 0.4169 0.5559 0.116 0.000 0.784 0.000 0.100
#> SRR2105272 1 0.2437 0.7857 0.904 0.000 0.032 0.004 0.060
#> SRR2105269 4 0.5115 0.2384 0.000 0.480 0.000 0.484 0.036
#> SRR2105270 2 0.5260 0.3176 0.000 0.604 0.000 0.332 0.064
#> SRR2105267 2 0.4622 -0.1152 0.000 0.548 0.000 0.440 0.012
#> SRR2105268 2 0.2536 0.6705 0.000 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR2105265 2 0.1018 0.7189 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105266 2 0.0451 0.7178 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105263 2 0.5755 0.4839 0.016 0.640 0.000 0.244 0.100
#> SRR2105264 2 0.4494 0.6633 0.020 0.784 0.000 0.108 0.088
#> SRR2105261 4 0.6203 -0.0683 0.000 0.000 0.396 0.464 0.140
#> SRR2105262 3 0.5257 0.5154 0.020 0.000 0.716 0.104 0.160
#> SRR2105357 3 0.4865 -0.1146 0.004 0.000 0.536 0.016 0.444
#> SRR2105358 3 0.4774 -0.0951 0.012 0.000 0.540 0.004 0.444
#> SRR2105439 2 0.4794 0.4545 0.004 0.656 0.000 0.032 0.308
#> SRR2105440 2 0.4734 0.4449 0.000 0.652 0.000 0.036 0.312
#> SRR2105509 4 0.4206 0.6364 0.000 0.288 0.000 0.696 0.016
#> SRR2105510 4 0.4269 0.6315 0.000 0.300 0.000 0.684 0.016
#> SRR2105507 3 0.3459 0.5733 0.116 0.000 0.832 0.000 0.052
#> SRR2105508 3 0.2344 0.5915 0.064 0.000 0.904 0.000 0.032
#> SRR2105505 1 0.6683 -0.1221 0.436 0.000 0.292 0.000 0.272
#> SRR2105506 1 0.3944 0.6819 0.788 0.000 0.160 0.000 0.052
#> SRR2105503 2 0.4036 0.6630 0.000 0.788 0.000 0.144 0.068
#> SRR2105504 4 0.5189 0.3989 0.000 0.036 0.064 0.724 0.176
#> SRR2105501 2 0.4901 0.5656 0.000 0.716 0.004 0.196 0.084
#> SRR2105502 4 0.5078 0.4150 0.000 0.044 0.048 0.732 0.176
#> SRR2105499 3 0.3497 0.5791 0.040 0.000 0.852 0.024 0.084
#> SRR2105500 3 0.3572 0.5688 0.068 0.000 0.844 0.012 0.076
#> SRR2105497 2 0.2332 0.7148 0.004 0.904 0.000 0.076 0.016
#> SRR2105498 2 0.3423 0.6932 0.016 0.856 0.000 0.068 0.060
#> SRR2105495 2 0.5405 0.4959 0.000 0.660 0.000 0.136 0.204
#> SRR2105496 2 0.5299 0.5135 0.000 0.668 0.000 0.120 0.212
#> SRR2105493 2 0.6102 0.3088 0.000 0.520 0.000 0.140 0.340
#> SRR2105494 2 0.5810 0.3291 0.000 0.544 0.004 0.088 0.364
#> SRR2105491 2 0.6511 0.2435 0.020 0.544 0.000 0.292 0.144
#> SRR2105492 2 0.6194 0.4169 0.020 0.608 0.000 0.228 0.144
#> SRR2105489 2 0.2914 0.6950 0.000 0.872 0.000 0.052 0.076
#> SRR2105490 2 0.2589 0.7051 0.008 0.900 0.000 0.044 0.048
#> SRR2105487 5 0.5953 0.3834 0.120 0.000 0.304 0.004 0.572
#> SRR2105488 5 0.6680 0.4337 0.252 0.000 0.240 0.008 0.500
#> SRR2105485 3 0.4541 0.3030 0.032 0.000 0.680 0.000 0.288
#> SRR2105486 3 0.4503 0.3517 0.040 0.000 0.704 0.000 0.256
#> SRR2105483 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.6108 0.3736 0.316 0.000 0.548 0.004 0.132
#> SRR2105482 1 0.1740 0.8039 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR2105479 3 0.7220 0.2529 0.336 0.000 0.420 0.028 0.216
#> SRR2105480 1 0.6082 0.4512 0.616 0.000 0.224 0.016 0.144
#> SRR2105477 5 0.7012 -0.2765 0.008 0.340 0.000 0.276 0.376
#> SRR2105478 2 0.6620 0.3291 0.004 0.460 0.000 0.196 0.340
#> SRR2105475 4 0.3885 0.6434 0.000 0.268 0.000 0.724 0.008
#> SRR2105476 4 0.3741 0.6433 0.000 0.264 0.000 0.732 0.004
#> SRR2105473 2 0.5388 0.4302 0.012 0.620 0.000 0.052 0.316
#> SRR2105474 2 0.5537 0.4588 0.008 0.620 0.000 0.076 0.296
#> SRR2105471 2 0.2751 0.7004 0.004 0.888 0.000 0.052 0.056
#> SRR2105472 2 0.2679 0.7016 0.004 0.892 0.000 0.048 0.056
#> SRR2105469 3 0.1914 0.5931 0.032 0.000 0.932 0.004 0.032
#> SRR2105470 3 0.4054 0.4799 0.248 0.000 0.732 0.000 0.020
#> SRR2105467 3 0.5083 -0.0993 0.028 0.000 0.540 0.004 0.428
#> SRR2105468 3 0.6346 -0.2777 0.160 0.000 0.436 0.000 0.404
#> SRR2105465 1 0.1822 0.7994 0.936 0.004 0.036 0.000 0.024
#> SRR2105466 1 0.0290 0.8102 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105463 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.1608 0.7055 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105462 2 0.0609 0.7176 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105459 4 0.4464 0.5060 0.000 0.408 0.000 0.584 0.008
#> SRR2105460 4 0.4481 0.4788 0.000 0.416 0.000 0.576 0.008
#> SRR2105457 3 0.2408 0.5614 0.000 0.000 0.892 0.016 0.092
#> SRR2105458 3 0.3130 0.5571 0.000 0.000 0.856 0.048 0.096
#> SRR2105455 3 0.5142 0.2278 0.392 0.000 0.564 0.000 0.044
#> SRR2105456 1 0.4592 0.5134 0.644 0.000 0.332 0.000 0.024
#> SRR2105453 5 0.6519 0.3543 0.352 0.000 0.200 0.000 0.448
#> SRR2105454 5 0.6526 0.3729 0.344 0.000 0.204 0.000 0.452
#> SRR2105451 2 0.6044 0.4449 0.000 0.608 0.008 0.172 0.212
#> SRR2105452 4 0.5471 0.3621 0.000 0.028 0.096 0.700 0.176
#> SRR2105449 1 0.5611 0.5041 0.652 0.000 0.244 0.016 0.088
#> SRR2105450 1 0.3008 0.7595 0.868 0.000 0.092 0.004 0.036
#> SRR2105447 4 0.5311 0.5031 0.000 0.396 0.012 0.560 0.032
#> SRR2105448 2 0.4977 -0.2132 0.000 0.500 0.000 0.472 0.028
#> SRR2105445 3 0.5496 -0.2242 0.000 0.004 0.476 0.052 0.468
#> SRR2105446 3 0.4816 -0.1792 0.008 0.000 0.500 0.008 0.484
#> SRR2105443 4 0.6921 0.2624 0.000 0.060 0.116 0.532 0.292
#> SRR2105444 5 0.8123 -0.1069 0.012 0.220 0.072 0.316 0.380
#> SRR2105441 2 0.2570 0.6895 0.000 0.888 0.000 0.028 0.084
#> SRR2105442 2 0.3142 0.7062 0.004 0.864 0.000 0.076 0.056
#> SRR2105437 5 0.6366 0.3038 0.164 0.000 0.244 0.016 0.576
#> SRR2105438 5 0.6397 0.3034 0.168 0.000 0.244 0.016 0.572
#> SRR2105435 3 0.4643 0.5683 0.088 0.000 0.784 0.040 0.088
#> SRR2105436 3 0.3012 0.5752 0.036 0.000 0.860 0.000 0.104
#> SRR2105433 1 0.0162 0.8102 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0771 0.8092 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105431 1 0.1041 0.8049 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105432 1 0.0671 0.8106 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105429 4 0.6303 0.5929 0.012 0.292 0.024 0.592 0.080
#> SRR2105430 4 0.5467 0.5913 0.008 0.296 0.004 0.632 0.060
#> SRR2105427 2 0.4836 0.3365 0.000 0.652 0.000 0.304 0.044
#> SRR2105428 2 0.4980 -0.2142 0.000 0.488 0.000 0.484 0.028
#> SRR2105425 2 0.4608 0.3199 0.000 0.640 0.000 0.336 0.024
#> SRR2105426 2 0.3183 0.7107 0.008 0.856 0.000 0.108 0.028
#> SRR2105421 3 0.3691 0.5580 0.000 0.000 0.820 0.104 0.076
#> SRR2105422 3 0.3588 0.5697 0.008 0.000 0.836 0.052 0.104
#> SRR2105423 2 0.0671 0.7179 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105424 2 0.0290 0.7180 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105419 3 0.2423 0.5718 0.024 0.000 0.896 0.000 0.080
#> SRR2105420 3 0.2086 0.5913 0.020 0.000 0.924 0.008 0.048
#> SRR2105415 1 0.0162 0.8102 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.2228 0.7895 0.912 0.000 0.048 0.000 0.040
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.4289 0.6412 0.000 0.272 0.008 0.708 0.012
#> SRR2105414 4 0.4687 0.5924 0.000 0.336 0.000 0.636 0.028
#> SRR2105409 2 0.2450 0.7222 0.000 0.900 0.000 0.048 0.052
#> SRR2105410 2 0.3992 0.6772 0.000 0.796 0.000 0.080 0.124
#> SRR2105411 2 0.1121 0.7148 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105412 2 0.0451 0.7174 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105407 3 0.3123 0.4894 0.000 0.000 0.828 0.012 0.160
#> SRR2105408 3 0.3789 0.3993 0.000 0.000 0.760 0.016 0.224
#> SRR2105403 3 0.4752 -0.0723 0.012 0.000 0.556 0.004 0.428
#> SRR2105404 3 0.4758 -0.0808 0.012 0.000 0.552 0.004 0.432
#> SRR2105405 1 0.4180 0.6471 0.744 0.000 0.220 0.000 0.036
#> SRR2105406 1 0.3366 0.7169 0.828 0.000 0.140 0.000 0.032
#> SRR2105401 4 0.4790 0.6383 0.000 0.284 0.008 0.676 0.032
#> SRR2105402 4 0.5471 0.3621 0.000 0.028 0.096 0.700 0.176
#> SRR2105399 4 0.6031 0.5355 0.000 0.112 0.132 0.680 0.076
#> SRR2105400 4 0.5730 0.5812 0.000 0.132 0.096 0.704 0.068
#> SRR2105397 4 0.6796 0.0171 0.020 0.016 0.096 0.440 0.428
#> SRR2105398 4 0.6657 0.0839 0.020 0.012 0.092 0.472 0.404
#> SRR2105395 2 0.2708 0.7067 0.000 0.884 0.000 0.072 0.044
#> SRR2105396 2 0.2196 0.7125 0.004 0.916 0.000 0.056 0.024
#> SRR2105393 2 0.0898 0.7189 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105394 2 0.2304 0.7089 0.000 0.908 0.000 0.044 0.048
#> SRR2105389 3 0.2563 0.5757 0.000 0.000 0.872 0.008 0.120
#> SRR2105390 3 0.2339 0.5853 0.004 0.000 0.892 0.004 0.100
#> SRR2105391 3 0.0865 0.5827 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105392 3 0.1205 0.5790 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105385 3 0.3318 0.5505 0.180 0.000 0.808 0.000 0.012
#> SRR2105386 3 0.2707 0.5765 0.100 0.000 0.876 0.000 0.024
#> SRR2105387 1 0.5237 0.5250 0.628 0.000 0.300 0.000 0.072
#> SRR2105388 1 0.5091 0.5515 0.676 0.000 0.236 0.000 0.088
#> SRR2105381 4 0.5088 0.6415 0.000 0.268 0.012 0.672 0.048
#> SRR2105382 4 0.4920 0.5829 0.000 0.308 0.000 0.644 0.048
#> SRR2105383 2 0.2291 0.7054 0.012 0.908 0.000 0.072 0.008
#> SRR2105384 2 0.3003 0.7091 0.020 0.872 0.000 0.092 0.016
#> SRR2105379 4 0.5376 0.3499 0.000 0.424 0.000 0.520 0.056
#> SRR2105380 2 0.6567 0.3947 0.092 0.604 0.000 0.228 0.076
#> SRR2105377 2 0.4441 0.5409 0.000 0.720 0.000 0.044 0.236
#> SRR2105378 2 0.4860 0.5499 0.004 0.704 0.000 0.064 0.228
#> SRR2105375 1 0.6574 0.2961 0.536 0.012 0.244 0.000 0.208
#> SRR2105376 1 0.5744 0.5315 0.648 0.000 0.160 0.008 0.184
#> SRR2105373 3 0.4807 -0.0369 0.008 0.000 0.520 0.008 0.464
#> SRR2105374 5 0.6514 0.2820 0.168 0.000 0.268 0.016 0.548
#> SRR2105371 3 0.1864 0.5906 0.004 0.000 0.924 0.004 0.068
#> SRR2105372 3 0.1329 0.5899 0.004 0.000 0.956 0.008 0.032
#> SRR2105369 3 0.2595 0.5587 0.032 0.000 0.888 0.000 0.080
#> SRR2105370 3 0.3575 0.5427 0.056 0.000 0.824 0.000 0.120
#> SRR2105367 1 0.5066 0.4968 0.672 0.000 0.064 0.004 0.260
#> SRR2105368 1 0.2498 0.7601 0.888 0.004 0.004 0.004 0.100
#> SRR2105365 4 0.6751 0.2006 0.028 0.424 0.000 0.424 0.124
#> SRR2105366 2 0.6147 0.4073 0.024 0.608 0.000 0.252 0.116
#> SRR2105363 2 0.3291 0.6791 0.000 0.840 0.000 0.120 0.040
#> SRR2105364 2 0.2104 0.7152 0.000 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR2105361 2 0.2067 0.7150 0.000 0.920 0.000 0.048 0.032
#> SRR2105362 2 0.1750 0.7186 0.000 0.936 0.000 0.036 0.028
#> SRR2105359 3 0.1907 0.5903 0.028 0.000 0.928 0.000 0.044
#> SRR2105360 3 0.2519 0.5924 0.036 0.000 0.900 0.004 0.060
#> SRR2105355 3 0.2353 0.5935 0.060 0.000 0.908 0.004 0.028
#> SRR2105356 3 0.4668 0.3497 0.352 0.000 0.624 0.000 0.024
#> SRR2105353 3 0.3694 0.5457 0.000 0.000 0.796 0.032 0.172
#> SRR2105354 3 0.3973 0.5548 0.036 0.000 0.792 0.008 0.164
#> SRR2105351 2 0.4506 0.3460 0.000 0.676 0.000 0.296 0.028
#> SRR2105352 4 0.5471 0.3621 0.000 0.028 0.096 0.700 0.176
#> SRR2105349 4 0.4249 0.6160 0.000 0.296 0.000 0.688 0.016
#> SRR2105350 2 0.3934 0.5209 0.000 0.740 0.000 0.244 0.016
#> SRR2105345 2 0.2388 0.6954 0.000 0.900 0.000 0.028 0.072
#> SRR2105346 2 0.1822 0.7116 0.004 0.936 0.000 0.024 0.036
#> SRR2105347 2 0.5224 0.5527 0.156 0.732 0.000 0.060 0.052
#> SRR2105348 2 0.5389 0.4651 0.224 0.688 0.000 0.044 0.044
#> SRR2105343 2 0.3969 0.3760 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR2105344 2 0.1251 0.7184 0.000 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR2105341 3 0.0865 0.5836 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105342 3 0.1216 0.5874 0.020 0.000 0.960 0.000 0.020
#> SRR2105339 3 0.2358 0.5815 0.000 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR2105340 3 0.4597 0.5255 0.028 0.000 0.732 0.020 0.220
#> SRR2105335 3 0.5276 -0.0695 0.048 0.000 0.516 0.000 0.436
#> SRR2105336 5 0.6805 0.2980 0.316 0.000 0.312 0.000 0.372
#> SRR2105337 3 0.4793 0.1673 0.436 0.000 0.544 0.000 0.020
#> SRR2105338 1 0.2769 0.7682 0.876 0.000 0.092 0.000 0.032
#> SRR2105331 2 0.5066 0.3441 0.000 0.608 0.000 0.344 0.048
#> SRR2105332 2 0.4131 0.6683 0.004 0.788 0.000 0.144 0.064
#> SRR2105333 4 0.4040 0.6364 0.000 0.276 0.000 0.712 0.012
#> SRR2105334 4 0.5289 0.3926 0.004 0.428 0.000 0.528 0.040
#> SRR2105329 4 0.7999 -0.2263 0.000 0.080 0.288 0.336 0.296
#> SRR2105330 2 0.8185 -0.1464 0.000 0.364 0.204 0.304 0.128
#> SRR2105327 4 0.5036 0.4310 0.000 0.404 0.000 0.560 0.036
#> SRR2105328 4 0.4949 0.4430 0.000 0.396 0.000 0.572 0.032
#> SRR2105325 3 0.7044 0.3767 0.152 0.000 0.532 0.056 0.260
#> SRR2105326 3 0.6987 0.3787 0.152 0.000 0.536 0.052 0.260
#> SRR2105323 3 0.4930 0.3477 0.004 0.000 0.676 0.052 0.268
#> SRR2105324 3 0.3238 0.5288 0.028 0.000 0.836 0.000 0.136
#> SRR2105319 3 0.6743 0.0700 0.188 0.000 0.412 0.008 0.392
#> SRR2105320 1 0.5985 0.4939 0.632 0.000 0.148 0.016 0.204
#> SRR2105321 3 0.6540 0.4153 0.120 0.000 0.576 0.040 0.264
#> SRR2105322 3 0.6959 0.3846 0.156 0.000 0.536 0.048 0.260
#> SRR2105317 4 0.4366 0.6117 0.000 0.320 0.000 0.664 0.016
#> SRR2105318 2 0.4656 -0.2698 0.000 0.508 0.000 0.480 0.012
#> SRR2105315 3 0.6783 0.2091 0.000 0.072 0.572 0.252 0.104
#> SRR2105316 2 0.4829 -0.2621 0.000 0.496 0.000 0.484 0.020
#> SRR2105313 4 0.4827 0.3062 0.000 0.476 0.000 0.504 0.020
#> SRR2105314 2 0.3203 0.6331 0.000 0.820 0.000 0.168 0.012
#> SRR2105311 3 0.8308 0.2027 0.152 0.000 0.372 0.228 0.248
#> SRR2105312 3 0.8294 0.2127 0.156 0.000 0.380 0.220 0.244
#> SRR2105307 1 0.3609 0.7136 0.816 0.000 0.148 0.004 0.032
#> SRR2105308 1 0.3467 0.7240 0.832 0.000 0.128 0.004 0.036
#> SRR2105309 3 0.2110 0.5620 0.000 0.000 0.912 0.016 0.072
#> SRR2105310 3 0.2629 0.5542 0.012 0.000 0.880 0.004 0.104
#> SRR2105305 3 0.1278 0.5849 0.004 0.000 0.960 0.016 0.020
#> SRR2105306 3 0.1471 0.5924 0.024 0.000 0.952 0.004 0.020
#> SRR2105303 2 0.1251 0.7205 0.000 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR2105304 4 0.5078 0.4150 0.000 0.044 0.048 0.732 0.176
#> SRR2105301 4 0.4788 0.6179 0.004 0.308 0.004 0.660 0.024
#> SRR2105302 2 0.4900 -0.2016 0.000 0.512 0.000 0.464 0.024
#> SRR2105299 3 0.5604 -0.2447 0.000 0.000 0.468 0.072 0.460
#> SRR2105300 5 0.7532 0.3786 0.000 0.060 0.260 0.224 0.456
#> SRR2105297 1 0.5693 0.4759 0.688 0.188 0.000 0.064 0.060
#> SRR2105298 1 0.5756 0.4642 0.680 0.196 0.000 0.064 0.060
#> SRR2105295 4 0.3837 0.6280 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR2105296 2 0.4650 -0.2218 0.000 0.520 0.000 0.468 0.012
#> SRR2105293 3 0.7206 0.3718 0.164 0.000 0.520 0.064 0.252
#> SRR2105294 3 0.6816 0.2674 0.348 0.000 0.448 0.012 0.192
#> SRR2105291 3 0.6419 -0.0274 0.444 0.008 0.448 0.016 0.084
#> SRR2105292 1 0.0404 0.8104 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105289 3 0.3844 0.5867 0.068 0.000 0.836 0.032 0.064
#> SRR2105290 1 0.3037 0.7749 0.860 0.000 0.100 0.000 0.040
#> SRR2105287 1 0.3832 0.7339 0.824 0.000 0.104 0.012 0.060
#> SRR2105288 1 0.2899 0.7671 0.880 0.000 0.076 0.008 0.036
#> SRR2105285 4 0.4444 0.5688 0.000 0.364 0.000 0.624 0.012
#> SRR2105286 2 0.4494 0.1590 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR2105283 2 0.6735 0.3631 0.032 0.528 0.004 0.116 0.320
#> SRR2105284 2 0.6577 0.3099 0.008 0.504 0.004 0.152 0.332
#> SRR2105281 2 0.2077 0.6934 0.000 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR2105282 2 0.1571 0.7065 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR2105259 3 0.3456 0.4641 0.000 0.000 0.800 0.016 0.184
#> SRR2105260 3 0.3224 0.4902 0.000 0.000 0.824 0.016 0.160
#> SRR2105279 2 0.0807 0.7196 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105280 2 0.0451 0.7180 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105257 1 0.3731 0.6800 0.800 0.000 0.040 0.000 0.160
#> SRR2105258 1 0.1041 0.8088 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR2105253 2 0.4161 0.4532 0.000 0.704 0.000 0.280 0.016
#> SRR2105254 2 0.3318 0.6149 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR2105255 3 0.3449 0.4943 0.024 0.000 0.812 0.000 0.164
#> SRR2105256 3 0.3821 0.4931 0.052 0.000 0.800 0.000 0.148
#> SRR2105251 2 0.3543 0.6809 0.000 0.828 0.000 0.112 0.060
#> SRR2105252 2 0.4367 0.6059 0.000 0.748 0.000 0.192 0.060
#> SRR2105249 2 0.3323 0.6720 0.000 0.844 0.000 0.056 0.100
#> SRR2105250 2 0.4251 0.5792 0.004 0.756 0.000 0.040 0.200
#> SRR2105247 2 0.2193 0.7166 0.000 0.912 0.000 0.060 0.028
#> SRR2105248 2 0.2989 0.6991 0.000 0.868 0.000 0.072 0.060
#> SRR2105245 3 0.7375 0.3967 0.068 0.040 0.552 0.076 0.264
#> SRR2105246 3 0.8490 0.2561 0.044 0.112 0.464 0.164 0.216
#> SRR2105243 3 0.4028 0.5162 0.192 0.000 0.768 0.000 0.040
#> SRR2105244 3 0.5191 0.4679 0.252 0.000 0.660 0.000 0.088
#> SRR2105241 1 0.4622 0.5667 0.684 0.000 0.276 0.000 0.040
#> SRR2105242 1 0.0451 0.8110 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105239 3 0.6179 0.0432 0.428 0.000 0.460 0.008 0.104
#> SRR2105240 1 0.2139 0.7913 0.916 0.000 0.052 0.000 0.032
#> SRR2105237 4 0.4730 0.6286 0.000 0.188 0.008 0.736 0.068
#> SRR2105238 2 0.6801 0.0287 0.000 0.376 0.000 0.316 0.308
#> SRR2105235 2 0.3898 0.6425 0.000 0.804 0.000 0.080 0.116
#> SRR2105236 2 0.2853 0.6873 0.000 0.876 0.000 0.052 0.072
#> SRR2105233 4 0.4088 0.6324 0.000 0.304 0.000 0.688 0.008
#> SRR2105234 4 0.3969 0.6313 0.000 0.304 0.000 0.692 0.004
#> SRR2105231 2 0.2446 0.7147 0.000 0.900 0.000 0.056 0.044
#> SRR2105232 2 0.1893 0.7156 0.000 0.928 0.000 0.048 0.024
#> SRR2105227 3 0.6466 0.4857 0.160 0.016 0.648 0.040 0.136
#> SRR2105228 1 0.7227 0.4226 0.548 0.040 0.280 0.040 0.092
#> SRR2105225 3 0.4800 0.4359 0.272 0.000 0.676 0.000 0.052
#> SRR2105226 1 0.4254 0.7126 0.772 0.000 0.148 0.000 0.080
#> SRR2105229 3 0.3794 0.5664 0.000 0.000 0.800 0.048 0.152
#> SRR2105230 3 0.2909 0.5771 0.012 0.000 0.848 0.000 0.140
#> SRR2105219 2 0.4752 0.0424 0.000 0.568 0.000 0.412 0.020
#> SRR2105220 2 0.3577 0.6439 0.000 0.808 0.000 0.160 0.032
#> SRR2105221 2 0.5855 0.4015 0.008 0.564 0.000 0.088 0.340
#> SRR2105222 2 0.6120 0.4142 0.020 0.556 0.000 0.088 0.336
#> SRR2105223 3 0.2079 0.5862 0.064 0.000 0.916 0.000 0.020
#> SRR2105224 3 0.4451 0.3276 0.340 0.000 0.644 0.000 0.016
#> SRR2105217 2 0.3921 0.6584 0.000 0.800 0.000 0.128 0.072
#> SRR2105218 2 0.2661 0.7000 0.000 0.888 0.000 0.056 0.056
#> SRR2105215 2 0.0324 0.7182 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105216 2 0.0807 0.7207 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105213 3 0.7253 0.4032 0.116 0.008 0.540 0.076 0.260
#> SRR2105214 3 0.7779 0.3789 0.076 0.044 0.532 0.108 0.240
#> SRR2105211 3 0.2409 0.5839 0.012 0.000 0.908 0.020 0.060
#> SRR2105212 3 0.2848 0.5659 0.028 0.000 0.868 0.000 0.104
#> SRR2105209 1 0.6753 -0.0154 0.456 0.000 0.280 0.004 0.260
#> SRR2105210 1 0.0510 0.8106 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105207 1 0.3437 0.7529 0.832 0.000 0.048 0.000 0.120
#> SRR2105208 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.5949 0.3810 0.008 0.376 0.000 0.528 0.088
#> SRR2105206 2 0.6133 0.3199 0.012 0.560 0.000 0.316 0.112
#> SRR2105201 2 0.4786 0.4473 0.000 0.652 0.000 0.040 0.308
#> SRR2105202 2 0.4716 0.4494 0.000 0.656 0.000 0.036 0.308
#> SRR2105203 2 0.3086 0.6042 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004
#> SRR2105204 2 0.0566 0.7179 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105199 2 0.1408 0.7171 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR2105200 2 0.2157 0.7132 0.004 0.920 0.000 0.040 0.036
#> SRR2105197 5 0.4555 0.0993 0.008 0.000 0.472 0.000 0.520
#> SRR2105198 5 0.5071 0.1599 0.012 0.000 0.440 0.016 0.532
#> SRR2105195 1 0.6835 0.1261 0.484 0.000 0.368 0.056 0.092
#> SRR2105196 1 0.2626 0.7792 0.908 0.012 0.028 0.012 0.040
#> SRR2105193 1 0.0162 0.8098 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105194 1 0.0162 0.8098 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105191 3 0.4889 -0.1444 0.016 0.000 0.504 0.004 0.476
#> SRR2105192 5 0.6525 0.4264 0.252 0.000 0.264 0.000 0.484
#> SRR2105189 2 0.5234 -0.1886 0.000 0.496 0.000 0.460 0.044
#> SRR2105190 2 0.4555 0.2786 0.000 0.636 0.000 0.344 0.020
#> SRR2105187 4 0.6972 0.2307 0.004 0.240 0.004 0.384 0.368
#> SRR2105188 5 0.6596 -0.2468 0.004 0.392 0.000 0.180 0.424
#> SRR2105179 1 0.4830 0.4450 0.648 0.000 0.316 0.004 0.032
#> SRR2105180 1 0.2813 0.7337 0.868 0.000 0.024 0.000 0.108
#> SRR2105183 2 0.0613 0.7182 0.004 0.984 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105184 2 0.2387 0.7067 0.004 0.908 0.000 0.040 0.048
#> SRR2105185 2 0.4002 0.6656 0.000 0.796 0.008 0.152 0.044
#> SRR2105186 2 0.3961 0.6751 0.008 0.812 0.000 0.108 0.072
#> SRR2105181 3 0.4538 -0.0670 0.008 0.000 0.540 0.000 0.452
#> SRR2105182 3 0.3756 0.4412 0.008 0.000 0.744 0.000 0.248
#> SRR2105177 1 0.0162 0.8083 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.2136 0.6981 0.000 0.904 0.000 0.088 0.008
#> SRR2105172 2 0.0912 0.7178 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105175 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0162 0.8098 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.4808 0.5248 0.004 0.696 0.000 0.248 0.052
#> SRR2105174 2 0.1041 0.7222 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105169 2 0.2659 0.7080 0.000 0.888 0.000 0.060 0.052
#> SRR2105170 2 0.3320 0.6941 0.012 0.860 0.000 0.068 0.060
#> SRR2105167 2 0.0579 0.7194 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105168 2 0.0324 0.7180 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105165 3 0.6274 0.4070 0.264 0.000 0.564 0.008 0.164
#> SRR2105166 3 0.6415 0.3864 0.276 0.000 0.540 0.008 0.176
#> SRR2105163 3 0.7241 0.3712 0.156 0.000 0.528 0.076 0.240
#> SRR2105164 3 0.7297 0.3625 0.156 0.000 0.516 0.076 0.252
#> SRR2105161 1 0.0609 0.8091 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0798 0.7199 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105156 2 0.0798 0.7183 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105157 2 0.3791 0.6690 0.000 0.812 0.000 0.112 0.076
#> SRR2105158 2 0.4359 0.6446 0.004 0.776 0.000 0.128 0.092
#> SRR2105159 1 0.7130 -0.1042 0.412 0.000 0.372 0.028 0.188
#> SRR2105160 1 0.2795 0.7645 0.884 0.000 0.028 0.008 0.080
#> SRR2105153 2 0.5013 0.5176 0.000 0.684 0.000 0.232 0.084
#> SRR2105154 2 0.4883 0.5595 0.000 0.708 0.000 0.200 0.092
#> SRR2105151 2 0.0798 0.7191 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105152 2 0.0451 0.7174 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105149 3 0.6146 0.2723 0.028 0.000 0.556 0.340 0.076
#> SRR2105150 3 0.5452 0.3554 0.000 0.000 0.616 0.292 0.092
#> SRR2105147 4 0.6075 0.1697 0.000 0.008 0.140 0.588 0.264
#> SRR2105148 4 0.6110 0.1697 0.000 0.008 0.144 0.584 0.264
#> SRR2105143 1 0.3445 0.7786 0.860 0.000 0.060 0.032 0.048
#> SRR2105144 1 0.3665 0.7554 0.860 0.024 0.024 0.036 0.056
#> SRR2105145 1 0.1018 0.8061 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR2105146 1 0.0566 0.8095 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105141 4 0.5410 0.4832 0.000 0.344 0.000 0.584 0.072
#> SRR2105142 4 0.5529 0.3395 0.000 0.420 0.000 0.512 0.068
#> SRR2105139 2 0.0703 0.7204 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105140 2 0.2032 0.7160 0.004 0.924 0.000 0.052 0.020
#> SRR2105137 2 0.4623 0.4631 0.000 0.664 0.000 0.032 0.304
#> SRR2105138 2 0.6781 0.3448 0.052 0.504 0.000 0.096 0.348
#> SRR2105135 2 0.0290 0.7172 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105136 2 0.0566 0.7199 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105133 3 0.4562 -0.1751 0.008 0.000 0.500 0.000 0.492
#> SRR2105134 5 0.4907 0.1458 0.024 0.000 0.488 0.000 0.488
#> SRR2105131 5 0.8123 0.3066 0.000 0.240 0.188 0.152 0.420
#> SRR2105132 5 0.8509 0.4596 0.136 0.104 0.244 0.056 0.460
#> SRR2105129 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.8100 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 5 0.7501 0.4041 0.328 0.028 0.228 0.008 0.408
#> SRR2105128 5 0.8601 0.4321 0.288 0.056 0.224 0.056 0.376
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.4088 0.4860 0.004 0.004 0.436 0.000 0.556 0.000
#> SRR2105278 5 0.3955 0.4918 0.004 0.000 0.436 0.000 0.560 0.000
#> SRR2105275 4 0.7356 0.2295 0.052 0.024 0.336 0.352 0.236 0.000
#> SRR2105276 4 0.7402 0.2543 0.072 0.016 0.332 0.352 0.228 0.000
#> SRR2105273 3 0.4167 0.5589 0.040 0.000 0.784 0.080 0.096 0.000
#> SRR2105274 3 0.5034 0.4041 0.304 0.008 0.628 0.036 0.024 0.000
#> SRR2105271 3 0.5420 0.4949 0.088 0.012 0.688 0.052 0.160 0.000
#> SRR2105272 1 0.4464 0.7325 0.768 0.008 0.032 0.084 0.108 0.000
#> SRR2105269 2 0.4522 0.6274 0.000 0.616 0.000 0.016 0.020 0.348
#> SRR2105270 2 0.5449 0.3125 0.000 0.528 0.000 0.032 0.056 0.384
#> SRR2105267 2 0.4256 0.5689 0.000 0.564 0.000 0.004 0.012 0.420
#> SRR2105268 6 0.3595 0.3369 0.000 0.288 0.000 0.000 0.008 0.704
#> SRR2105265 6 0.1391 0.6772 0.000 0.040 0.000 0.000 0.016 0.944
#> SRR2105266 6 0.0909 0.6820 0.000 0.020 0.000 0.000 0.012 0.968
#> SRR2105263 6 0.6590 0.0954 0.020 0.348 0.000 0.084 0.064 0.484
#> SRR2105264 6 0.5155 0.5968 0.020 0.132 0.000 0.056 0.068 0.724
#> SRR2105261 2 0.7347 -0.3568 0.000 0.368 0.348 0.180 0.092 0.012
#> SRR2105262 3 0.6855 0.3398 0.036 0.108 0.576 0.144 0.136 0.000
#> SRR2105357 5 0.4300 0.4710 0.000 0.008 0.444 0.008 0.540 0.000
#> SRR2105358 5 0.4122 0.4456 0.004 0.004 0.472 0.000 0.520 0.000
#> SRR2105439 6 0.5711 0.4193 0.000 0.124 0.000 0.032 0.248 0.596
#> SRR2105440 6 0.5711 0.4193 0.000 0.124 0.000 0.032 0.248 0.596
#> SRR2105509 2 0.3863 0.7128 0.000 0.712 0.000 0.028 0.000 0.260
#> SRR2105510 2 0.3834 0.7127 0.000 0.708 0.000 0.024 0.000 0.268
#> SRR2105507 3 0.4275 0.5601 0.060 0.000 0.780 0.072 0.088 0.000
#> SRR2105508 3 0.3409 0.5834 0.036 0.000 0.840 0.064 0.060 0.000
#> SRR2105505 5 0.6561 0.3948 0.204 0.008 0.368 0.020 0.400 0.000
#> SRR2105506 1 0.5117 0.5917 0.668 0.004 0.212 0.016 0.100 0.000
#> SRR2105503 6 0.4342 0.5331 0.000 0.208 0.000 0.032 0.032 0.728
#> SRR2105504 4 0.4561 0.3249 0.000 0.392 0.016 0.576 0.000 0.016
#> SRR2105501 6 0.5730 0.1476 0.000 0.368 0.008 0.028 0.068 0.528
#> SRR2105502 4 0.4486 0.3196 0.000 0.396 0.012 0.576 0.000 0.016
#> SRR2105499 3 0.3858 0.5303 0.016 0.028 0.816 0.040 0.100 0.000
#> SRR2105500 3 0.3910 0.5333 0.028 0.028 0.808 0.020 0.116 0.000
#> SRR2105497 6 0.3043 0.6486 0.000 0.140 0.000 0.008 0.020 0.832
#> SRR2105498 6 0.4263 0.6449 0.020 0.088 0.000 0.040 0.056 0.796
#> SRR2105495 6 0.6119 0.2732 0.000 0.304 0.000 0.032 0.148 0.516
#> SRR2105496 6 0.6120 0.3106 0.000 0.272 0.000 0.032 0.164 0.532
#> SRR2105493 6 0.6767 0.1491 0.000 0.288 0.004 0.032 0.276 0.400
#> SRR2105494 6 0.6567 0.2517 0.000 0.204 0.004 0.032 0.304 0.456
#> SRR2105491 6 0.6814 0.1277 0.020 0.308 0.000 0.132 0.056 0.484
#> SRR2105492 6 0.6600 0.1913 0.020 0.300 0.000 0.108 0.056 0.516
#> SRR2105489 6 0.3380 0.6492 0.000 0.080 0.000 0.044 0.036 0.840
#> SRR2105490 6 0.2224 0.6709 0.000 0.064 0.000 0.020 0.012 0.904
#> SRR2105487 5 0.5107 0.5731 0.072 0.012 0.160 0.044 0.712 0.000
#> SRR2105488 5 0.5754 0.5595 0.144 0.008 0.152 0.048 0.648 0.000
#> SRR2105485 3 0.4393 0.0126 0.008 0.012 0.632 0.008 0.340 0.000
#> SRR2105486 3 0.4613 0.0163 0.008 0.016 0.632 0.016 0.328 0.000
#> SRR2105483 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105484 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105481 3 0.7310 0.1547 0.268 0.008 0.436 0.160 0.128 0.000
#> SRR2105482 1 0.4424 0.7447 0.776 0.012 0.060 0.040 0.112 0.000
#> SRR2105479 3 0.7874 -0.1740 0.276 0.016 0.300 0.268 0.140 0.000
#> SRR2105480 1 0.6777 0.2548 0.548 0.016 0.200 0.148 0.088 0.000
#> SRR2105477 2 0.6929 0.1859 0.000 0.452 0.000 0.084 0.260 0.204
#> SRR2105478 2 0.7240 -0.0697 0.004 0.356 0.000 0.076 0.256 0.308
#> SRR2105475 2 0.3641 0.7136 0.000 0.732 0.000 0.020 0.000 0.248
#> SRR2105476 2 0.3791 0.7127 0.000 0.732 0.000 0.032 0.000 0.236
#> SRR2105473 6 0.5930 0.4084 0.000 0.136 0.000 0.036 0.260 0.568
#> SRR2105474 6 0.6003 0.4318 0.000 0.164 0.000 0.032 0.244 0.560
#> SRR2105471 6 0.2917 0.6595 0.000 0.072 0.000 0.028 0.032 0.868
#> SRR2105472 6 0.2841 0.6604 0.000 0.072 0.000 0.028 0.028 0.872
#> SRR2105469 3 0.2401 0.5816 0.020 0.000 0.900 0.044 0.036 0.000
#> SRR2105470 3 0.4121 0.5253 0.136 0.008 0.784 0.028 0.044 0.000
#> SRR2105467 3 0.4807 -0.4501 0.012 0.008 0.488 0.016 0.476 0.000
#> SRR2105468 5 0.5595 0.4693 0.060 0.012 0.428 0.016 0.484 0.000
#> SRR2105465 1 0.2471 0.7783 0.888 0.004 0.056 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105466 1 0.0508 0.7887 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105463 1 0.0551 0.7868 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105464 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105461 6 0.1958 0.6545 0.000 0.100 0.000 0.000 0.004 0.896
#> SRR2105462 6 0.1701 0.6724 0.000 0.072 0.000 0.000 0.008 0.920
#> SRR2105459 2 0.3903 0.7013 0.000 0.680 0.000 0.012 0.004 0.304
#> SRR2105460 2 0.3668 0.6822 0.000 0.668 0.000 0.000 0.004 0.328
#> SRR2105457 3 0.2800 0.5234 0.004 0.008 0.860 0.016 0.112 0.000
#> SRR2105458 3 0.3354 0.5134 0.000 0.020 0.824 0.028 0.128 0.000
#> SRR2105455 3 0.5531 0.3772 0.260 0.012 0.628 0.036 0.064 0.000
#> SRR2105456 1 0.5641 0.2479 0.484 0.012 0.428 0.024 0.052 0.000
#> SRR2105453 5 0.6028 0.5119 0.204 0.012 0.208 0.012 0.564 0.000
#> SRR2105454 5 0.6115 0.5275 0.188 0.012 0.244 0.012 0.544 0.000
#> SRR2105451 6 0.6622 0.0654 0.000 0.368 0.008 0.036 0.164 0.424
#> SRR2105452 4 0.4890 0.3597 0.000 0.368 0.044 0.576 0.000 0.012
#> SRR2105449 1 0.6688 0.3125 0.524 0.008 0.260 0.104 0.104 0.000
#> SRR2105450 1 0.4036 0.7254 0.796 0.008 0.120 0.040 0.036 0.000
#> SRR2105447 2 0.4076 0.7136 0.000 0.704 0.008 0.012 0.008 0.268
#> SRR2105448 2 0.4594 0.6216 0.000 0.600 0.000 0.008 0.032 0.360
#> SRR2105445 5 0.6281 0.4734 0.000 0.132 0.376 0.032 0.456 0.004
#> SRR2105446 5 0.5418 0.5238 0.000 0.052 0.396 0.024 0.524 0.004
#> SRR2105443 2 0.5934 0.3613 0.000 0.640 0.040 0.076 0.204 0.040
#> SRR2105444 2 0.6979 0.2949 0.004 0.472 0.016 0.072 0.316 0.120
#> SRR2105441 6 0.4198 0.5903 0.000 0.128 0.000 0.020 0.084 0.768
#> SRR2105442 6 0.4268 0.6417 0.004 0.148 0.000 0.020 0.064 0.764
#> SRR2105437 5 0.5654 0.3062 0.104 0.008 0.052 0.180 0.656 0.000
#> SRR2105438 5 0.5624 0.3120 0.104 0.008 0.052 0.176 0.660 0.000
#> SRR2105435 3 0.5317 0.5315 0.044 0.040 0.716 0.064 0.136 0.000
#> SRR2105436 3 0.3938 0.5264 0.020 0.012 0.788 0.028 0.152 0.000
#> SRR2105433 1 0.0982 0.7882 0.968 0.004 0.004 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105434 1 0.1410 0.7871 0.944 0.000 0.004 0.008 0.044 0.000
#> SRR2105431 1 0.2007 0.7782 0.916 0.004 0.000 0.044 0.036 0.000
#> SRR2105432 1 0.1644 0.7840 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040 0.000
#> SRR2105429 2 0.5650 0.6606 0.008 0.672 0.008 0.048 0.092 0.172
#> SRR2105430 2 0.4911 0.6781 0.000 0.700 0.000 0.044 0.064 0.192
#> SRR2105427 6 0.5000 -0.2661 0.000 0.464 0.000 0.020 0.032 0.484
#> SRR2105428 2 0.4729 0.6027 0.000 0.640 0.000 0.032 0.024 0.304
#> SRR2105425 6 0.4748 -0.2426 0.000 0.444 0.000 0.008 0.032 0.516
#> SRR2105426 6 0.3395 0.6726 0.000 0.124 0.000 0.004 0.056 0.816
#> SRR2105421 3 0.4530 0.5409 0.004 0.072 0.768 0.084 0.072 0.000
#> SRR2105422 3 0.4692 0.5240 0.008 0.044 0.752 0.120 0.076 0.000
#> SRR2105423 6 0.0922 0.6821 0.000 0.024 0.000 0.004 0.004 0.968
#> SRR2105424 6 0.0363 0.6829 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR2105419 3 0.2368 0.5428 0.008 0.004 0.888 0.008 0.092 0.000
#> SRR2105420 3 0.2426 0.5872 0.012 0.004 0.896 0.020 0.068 0.000
#> SRR2105415 1 0.0862 0.7883 0.972 0.004 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105416 1 0.0767 0.7866 0.976 0.004 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105417 1 0.2290 0.7770 0.892 0.000 0.020 0.004 0.084 0.000
#> SRR2105418 1 0.0260 0.7879 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105413 2 0.3817 0.7129 0.000 0.720 0.000 0.028 0.000 0.252
#> SRR2105414 2 0.3978 0.7158 0.000 0.700 0.000 0.032 0.000 0.268
#> SRR2105409 6 0.3883 0.6384 0.000 0.144 0.000 0.028 0.040 0.788
#> SRR2105410 6 0.5498 0.5698 0.004 0.180 0.000 0.068 0.080 0.668
#> SRR2105411 6 0.1444 0.6671 0.000 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR2105412 6 0.0993 0.6797 0.000 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR2105407 3 0.3692 0.3174 0.000 0.008 0.736 0.012 0.244 0.000
#> SRR2105408 3 0.3874 0.2170 0.000 0.008 0.704 0.012 0.276 0.000
#> SRR2105403 3 0.4310 -0.4262 0.000 0.004 0.512 0.012 0.472 0.000
#> SRR2105404 3 0.4443 -0.4456 0.004 0.004 0.500 0.012 0.480 0.000
#> SRR2105405 1 0.5815 0.4075 0.532 0.012 0.356 0.024 0.076 0.000
#> SRR2105406 1 0.4825 0.6463 0.704 0.012 0.200 0.012 0.072 0.000
#> SRR2105401 2 0.4230 0.7073 0.000 0.716 0.004 0.056 0.000 0.224
#> SRR2105402 4 0.4890 0.3597 0.000 0.368 0.044 0.576 0.000 0.012
#> SRR2105399 2 0.5493 0.5089 0.000 0.656 0.052 0.180 0.000 0.112
#> SRR2105400 2 0.5270 0.5478 0.000 0.668 0.032 0.176 0.000 0.124
#> SRR2105397 2 0.6727 -0.1625 0.008 0.424 0.028 0.236 0.304 0.000
#> SRR2105398 2 0.6516 -0.1238 0.004 0.472 0.028 0.236 0.260 0.000
#> SRR2105395 6 0.3014 0.6705 0.000 0.084 0.000 0.012 0.048 0.856
#> SRR2105396 6 0.2126 0.6792 0.000 0.072 0.000 0.004 0.020 0.904
#> SRR2105393 6 0.1074 0.6855 0.000 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960
#> SRR2105394 6 0.2703 0.6661 0.000 0.080 0.000 0.028 0.016 0.876
#> SRR2105389 3 0.4548 0.4709 0.000 0.004 0.712 0.164 0.120 0.000
#> SRR2105390 3 0.4157 0.5393 0.000 0.008 0.760 0.100 0.132 0.000
#> SRR2105391 3 0.1924 0.5642 0.000 0.004 0.920 0.028 0.048 0.000
#> SRR2105392 3 0.2065 0.5596 0.000 0.004 0.912 0.032 0.052 0.000
#> SRR2105385 3 0.3824 0.5618 0.120 0.008 0.808 0.036 0.028 0.000
#> SRR2105386 3 0.2583 0.5710 0.044 0.008 0.896 0.020 0.032 0.000
#> SRR2105387 1 0.6494 0.2965 0.468 0.012 0.360 0.044 0.116 0.000
#> SRR2105388 1 0.6570 0.3847 0.508 0.016 0.284 0.036 0.156 0.000
#> SRR2105381 2 0.4238 0.7127 0.000 0.720 0.000 0.036 0.016 0.228
#> SRR2105382 2 0.3594 0.7035 0.000 0.768 0.000 0.020 0.008 0.204
#> SRR2105383 6 0.2930 0.6533 0.020 0.104 0.000 0.000 0.020 0.856
#> SRR2105384 6 0.3393 0.6552 0.028 0.124 0.000 0.000 0.024 0.824
#> SRR2105379 2 0.5132 0.6342 0.004 0.628 0.000 0.028 0.048 0.292
#> SRR2105380 6 0.6861 0.2048 0.080 0.284 0.000 0.064 0.052 0.520
#> SRR2105377 6 0.5277 0.4974 0.000 0.128 0.000 0.032 0.172 0.668
#> SRR2105378 6 0.5457 0.5167 0.000 0.160 0.000 0.032 0.160 0.648
#> SRR2105375 1 0.7091 0.2213 0.444 0.016 0.196 0.032 0.300 0.012
#> SRR2105376 1 0.6224 0.4626 0.548 0.016 0.108 0.036 0.292 0.000
#> SRR2105373 5 0.5289 0.4445 0.008 0.004 0.260 0.108 0.620 0.000
#> SRR2105374 5 0.5733 0.3025 0.104 0.004 0.068 0.176 0.648 0.000
#> SRR2105371 3 0.3260 0.5764 0.000 0.004 0.832 0.072 0.092 0.000
#> SRR2105372 3 0.2519 0.5837 0.008 0.000 0.888 0.056 0.048 0.000
#> SRR2105369 3 0.2680 0.5019 0.012 0.008 0.876 0.012 0.092 0.000
#> SRR2105370 3 0.4135 0.4011 0.040 0.012 0.772 0.016 0.160 0.000
#> SRR2105367 1 0.5824 0.3454 0.528 0.016 0.092 0.012 0.352 0.000
#> SRR2105368 1 0.3548 0.7189 0.796 0.004 0.016 0.016 0.168 0.000
#> SRR2105365 2 0.6466 0.3057 0.020 0.468 0.000 0.076 0.056 0.380
#> SRR2105366 6 0.6386 0.2019 0.020 0.316 0.000 0.076 0.060 0.528
#> SRR2105363 6 0.4464 0.3762 0.000 0.280 0.000 0.016 0.032 0.672
#> SRR2105364 6 0.2586 0.6566 0.000 0.100 0.000 0.000 0.032 0.868
#> SRR2105361 6 0.2618 0.6438 0.000 0.116 0.000 0.000 0.024 0.860
#> SRR2105362 6 0.1951 0.6755 0.000 0.076 0.000 0.000 0.016 0.908
#> SRR2105359 3 0.2982 0.5830 0.016 0.012 0.872 0.036 0.064 0.000
#> SRR2105360 3 0.3916 0.5849 0.032 0.004 0.804 0.052 0.108 0.000
#> SRR2105355 3 0.2915 0.5840 0.048 0.000 0.872 0.044 0.036 0.000
#> SRR2105356 3 0.4921 0.4545 0.212 0.004 0.692 0.028 0.064 0.000
#> SRR2105353 3 0.6041 0.2062 0.008 0.016 0.548 0.264 0.164 0.000
#> SRR2105354 3 0.5948 0.2097 0.012 0.004 0.548 0.244 0.192 0.000
#> SRR2105351 6 0.4273 0.1583 0.000 0.324 0.000 0.016 0.012 0.648
#> SRR2105352 4 0.4890 0.3597 0.000 0.368 0.044 0.576 0.000 0.012
#> SRR2105349 2 0.3457 0.7154 0.000 0.752 0.000 0.016 0.000 0.232
#> SRR2105350 6 0.4377 -0.1724 0.000 0.436 0.000 0.000 0.024 0.540
#> SRR2105345 6 0.4291 0.5815 0.000 0.132 0.000 0.028 0.076 0.764
#> SRR2105346 6 0.2934 0.6352 0.000 0.112 0.000 0.000 0.044 0.844
#> SRR2105347 6 0.4988 0.5774 0.088 0.128 0.000 0.020 0.032 0.732
#> SRR2105348 6 0.5279 0.4891 0.188 0.096 0.000 0.016 0.020 0.680
#> SRR2105343 6 0.4045 0.1854 0.000 0.336 0.000 0.008 0.008 0.648
#> SRR2105344 6 0.1707 0.6761 0.000 0.056 0.000 0.012 0.004 0.928
#> SRR2105341 3 0.1780 0.5675 0.004 0.004 0.932 0.024 0.036 0.000
#> SRR2105342 3 0.1129 0.5715 0.012 0.004 0.964 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105339 3 0.4683 0.4980 0.008 0.008 0.724 0.148 0.112 0.000
#> SRR2105340 3 0.6714 0.0701 0.032 0.012 0.472 0.260 0.224 0.000
#> SRR2105335 5 0.5239 0.5173 0.024 0.008 0.368 0.036 0.564 0.000
#> SRR2105336 5 0.6430 0.4866 0.172 0.012 0.256 0.032 0.528 0.000
#> SRR2105337 3 0.5809 0.3105 0.320 0.008 0.564 0.048 0.060 0.000
#> SRR2105338 1 0.3854 0.7363 0.808 0.008 0.116 0.036 0.032 0.000
#> SRR2105331 2 0.5655 0.2500 0.004 0.472 0.000 0.044 0.044 0.436
#> SRR2105332 6 0.5507 0.4232 0.008 0.272 0.000 0.040 0.060 0.620
#> SRR2105333 2 0.3651 0.7141 0.000 0.752 0.000 0.016 0.008 0.224
#> SRR2105334 2 0.4116 0.6943 0.000 0.684 0.000 0.016 0.012 0.288
#> SRR2105329 2 0.7245 0.0959 0.000 0.484 0.236 0.040 0.180 0.060
#> SRR2105330 2 0.7281 0.3219 0.000 0.492 0.116 0.044 0.092 0.256
#> SRR2105327 2 0.4302 0.6772 0.000 0.684 0.000 0.024 0.016 0.276
#> SRR2105328 2 0.4269 0.6946 0.000 0.708 0.000 0.032 0.016 0.244
#> SRR2105325 4 0.7661 0.2904 0.108 0.020 0.320 0.352 0.200 0.000
#> SRR2105326 4 0.7673 0.2915 0.108 0.020 0.320 0.348 0.204 0.000
#> SRR2105323 3 0.5192 0.1045 0.000 0.024 0.616 0.068 0.292 0.000
#> SRR2105324 3 0.3496 0.4289 0.012 0.008 0.804 0.016 0.160 0.000
#> SRR2105319 5 0.6545 0.1564 0.092 0.008 0.132 0.204 0.564 0.000
#> SRR2105320 1 0.6867 0.1039 0.392 0.008 0.044 0.196 0.360 0.000
#> SRR2105321 4 0.7440 0.2597 0.084 0.016 0.344 0.352 0.204 0.000
#> SRR2105322 4 0.7585 0.2779 0.108 0.016 0.328 0.352 0.196 0.000
#> SRR2105317 2 0.3586 0.7097 0.000 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR2105318 2 0.4246 0.5880 0.000 0.576 0.000 0.008 0.008 0.408
#> SRR2105315 3 0.6898 0.0717 0.000 0.336 0.476 0.044 0.076 0.068
#> SRR2105316 2 0.4114 0.6469 0.000 0.628 0.000 0.008 0.008 0.356
#> SRR2105313 2 0.4437 0.6542 0.000 0.620 0.000 0.020 0.012 0.348
#> SRR2105314 6 0.3555 0.3563 0.000 0.280 0.000 0.000 0.008 0.712
#> SRR2105311 4 0.8163 0.3187 0.108 0.068 0.300 0.340 0.184 0.000
#> SRR2105312 4 0.8181 0.3190 0.116 0.068 0.296 0.344 0.176 0.000
#> SRR2105307 1 0.4619 0.6712 0.728 0.008 0.172 0.012 0.080 0.000
#> SRR2105308 1 0.4354 0.6945 0.760 0.008 0.148 0.004 0.072 0.008
#> SRR2105309 3 0.2466 0.5126 0.000 0.008 0.872 0.008 0.112 0.000
#> SRR2105310 3 0.2967 0.5054 0.004 0.008 0.840 0.012 0.136 0.000
#> SRR2105305 3 0.1944 0.5673 0.000 0.016 0.924 0.024 0.036 0.000
#> SRR2105306 3 0.1434 0.5810 0.020 0.000 0.948 0.024 0.008 0.000
#> SRR2105303 6 0.1633 0.6814 0.000 0.044 0.000 0.000 0.024 0.932
#> SRR2105304 4 0.4486 0.3196 0.000 0.396 0.012 0.576 0.000 0.016
#> SRR2105301 2 0.3716 0.7157 0.000 0.732 0.000 0.012 0.008 0.248
#> SRR2105302 2 0.4329 0.5865 0.000 0.576 0.000 0.012 0.008 0.404
#> SRR2105299 5 0.6074 0.5246 0.000 0.132 0.308 0.036 0.524 0.000
#> SRR2105300 5 0.7258 0.3432 0.004 0.312 0.124 0.056 0.460 0.044
#> SRR2105297 1 0.5596 0.5491 0.696 0.076 0.000 0.048 0.044 0.136
#> SRR2105298 1 0.5641 0.5368 0.688 0.076 0.000 0.044 0.044 0.148
#> SRR2105295 2 0.3915 0.7123 0.000 0.704 0.000 0.020 0.004 0.272
#> SRR2105296 2 0.4293 0.6105 0.000 0.584 0.000 0.004 0.016 0.396
#> SRR2105293 3 0.7751 -0.2977 0.116 0.024 0.336 0.332 0.192 0.000
#> SRR2105294 3 0.7905 -0.1059 0.220 0.016 0.344 0.244 0.176 0.000
#> SRR2105291 3 0.7112 0.2074 0.308 0.028 0.472 0.040 0.140 0.012
#> SRR2105292 1 0.2570 0.7827 0.896 0.012 0.032 0.012 0.048 0.000
#> SRR2105289 3 0.4420 0.5836 0.028 0.028 0.784 0.064 0.096 0.000
#> SRR2105290 1 0.3931 0.7461 0.800 0.008 0.112 0.016 0.064 0.000
#> SRR2105287 1 0.5060 0.6807 0.716 0.016 0.136 0.024 0.108 0.000
#> SRR2105288 1 0.2663 0.7754 0.884 0.008 0.024 0.004 0.076 0.004
#> SRR2105285 2 0.3360 0.7138 0.000 0.732 0.000 0.004 0.000 0.264
#> SRR2105286 2 0.4274 0.5298 0.000 0.560 0.000 0.008 0.008 0.424
#> SRR2105283 6 0.7211 0.1538 0.028 0.280 0.000 0.032 0.284 0.376
#> SRR2105284 6 0.6865 0.1630 0.000 0.268 0.004 0.040 0.292 0.396
#> SRR2105281 6 0.2605 0.6487 0.000 0.108 0.000 0.000 0.028 0.864
#> SRR2105282 6 0.2333 0.6603 0.000 0.092 0.000 0.000 0.024 0.884
#> SRR2105259 3 0.3692 0.3019 0.000 0.008 0.736 0.012 0.244 0.000
#> SRR2105260 3 0.3479 0.3732 0.000 0.008 0.768 0.012 0.212 0.000
#> SRR2105279 6 0.0603 0.6835 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR2105280 6 0.0508 0.6840 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR2105257 1 0.5172 0.4478 0.612 0.004 0.064 0.016 0.304 0.000
#> SRR2105258 1 0.2828 0.7764 0.872 0.000 0.036 0.020 0.072 0.000
#> SRR2105253 6 0.4732 -0.3199 0.000 0.476 0.000 0.020 0.016 0.488
#> SRR2105254 6 0.4313 0.0764 0.000 0.372 0.000 0.004 0.020 0.604
#> SRR2105255 3 0.3304 0.3663 0.004 0.008 0.804 0.012 0.172 0.000
#> SRR2105256 3 0.4075 0.2881 0.024 0.008 0.744 0.012 0.212 0.000
#> SRR2105251 6 0.3819 0.6135 0.000 0.152 0.000 0.028 0.032 0.788
#> SRR2105252 6 0.4522 0.4987 0.000 0.236 0.000 0.028 0.036 0.700
#> SRR2105249 6 0.4792 0.5502 0.000 0.172 0.000 0.028 0.088 0.712
#> SRR2105250 6 0.5017 0.5284 0.000 0.140 0.000 0.028 0.136 0.696
#> SRR2105247 6 0.2342 0.6810 0.000 0.088 0.000 0.004 0.020 0.888
#> SRR2105248 6 0.3203 0.6570 0.000 0.088 0.000 0.032 0.032 0.848
#> SRR2105245 3 0.7920 -0.2282 0.056 0.044 0.336 0.328 0.224 0.012
#> SRR2105246 3 0.8770 -0.0947 0.040 0.104 0.360 0.240 0.188 0.068
#> SRR2105243 3 0.4164 0.5439 0.100 0.012 0.796 0.036 0.056 0.000
#> SRR2105244 3 0.6342 0.4421 0.164 0.016 0.608 0.084 0.128 0.000
#> SRR2105241 1 0.5755 0.4740 0.592 0.008 0.284 0.040 0.076 0.000
#> SRR2105242 1 0.1180 0.7899 0.960 0.004 0.008 0.004 0.024 0.000
#> SRR2105239 3 0.7117 0.0950 0.352 0.016 0.408 0.072 0.152 0.000
#> SRR2105240 1 0.3234 0.7640 0.848 0.004 0.044 0.016 0.088 0.000
#> SRR2105237 2 0.3595 0.6633 0.000 0.820 0.008 0.020 0.032 0.120
#> SRR2105238 2 0.6271 0.3374 0.000 0.516 0.000 0.032 0.220 0.232
#> SRR2105235 6 0.4777 0.5541 0.000 0.156 0.000 0.032 0.092 0.720
#> SRR2105236 6 0.4542 0.5689 0.000 0.148 0.000 0.028 0.084 0.740
#> SRR2105233 2 0.3834 0.7135 0.000 0.708 0.000 0.024 0.000 0.268
#> SRR2105234 2 0.3855 0.7119 0.000 0.704 0.000 0.024 0.000 0.272
#> SRR2105231 6 0.2752 0.6617 0.000 0.104 0.000 0.012 0.020 0.864
#> SRR2105232 6 0.2537 0.6726 0.000 0.088 0.000 0.008 0.024 0.880
#> SRR2105227 3 0.7620 0.3746 0.100 0.060 0.528 0.128 0.168 0.016
#> SRR2105228 1 0.7804 0.3130 0.444 0.040 0.280 0.044 0.152 0.040
#> SRR2105225 3 0.5856 0.4291 0.204 0.008 0.628 0.052 0.108 0.000
#> SRR2105226 1 0.5853 0.6232 0.636 0.012 0.184 0.044 0.124 0.000
#> SRR2105229 3 0.5916 0.3868 0.000 0.036 0.588 0.180 0.196 0.000
#> SRR2105230 3 0.4802 0.5041 0.008 0.004 0.668 0.068 0.252 0.000
#> SRR2105219 2 0.4967 0.5202 0.000 0.528 0.000 0.020 0.032 0.420
#> SRR2105220 6 0.4622 0.2197 0.000 0.332 0.000 0.024 0.020 0.624
#> SRR2105221 6 0.6826 0.3299 0.008 0.196 0.000 0.048 0.296 0.452
#> SRR2105222 6 0.6745 0.3801 0.004 0.188 0.000 0.056 0.280 0.472
#> SRR2105223 3 0.2118 0.5671 0.036 0.008 0.920 0.016 0.020 0.000
#> SRR2105224 3 0.4448 0.4097 0.216 0.012 0.724 0.024 0.024 0.000
#> SRR2105217 6 0.4302 0.5689 0.000 0.184 0.000 0.036 0.036 0.744
#> SRR2105218 6 0.2971 0.6592 0.000 0.076 0.000 0.032 0.028 0.864
#> SRR2105215 6 0.0603 0.6839 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR2105216 6 0.1151 0.6821 0.000 0.032 0.000 0.000 0.012 0.956
#> SRR2105213 3 0.7691 -0.1504 0.064 0.032 0.368 0.332 0.196 0.008
#> SRR2105214 3 0.7938 -0.1024 0.040 0.040 0.388 0.288 0.212 0.032
#> SRR2105211 3 0.2002 0.5704 0.000 0.028 0.920 0.012 0.040 0.000
#> SRR2105212 3 0.2809 0.5261 0.008 0.012 0.872 0.020 0.088 0.000
#> SRR2105209 5 0.6832 0.2305 0.316 0.012 0.260 0.024 0.388 0.000
#> SRR2105210 1 0.1484 0.7890 0.944 0.004 0.004 0.008 0.040 0.000
#> SRR2105207 1 0.4815 0.6923 0.712 0.012 0.028 0.048 0.200 0.000
#> SRR2105208 1 0.0405 0.7875 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105205 2 0.5096 0.6394 0.004 0.676 0.000 0.044 0.052 0.224
#> SRR2105206 2 0.6127 0.3231 0.016 0.492 0.000 0.056 0.052 0.384
#> SRR2105201 6 0.5711 0.4193 0.000 0.124 0.000 0.032 0.248 0.596
#> SRR2105202 6 0.5779 0.4148 0.000 0.132 0.000 0.032 0.248 0.588
#> SRR2105203 6 0.3349 0.4170 0.000 0.244 0.000 0.008 0.000 0.748
#> SRR2105204 6 0.0458 0.6832 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR2105199 6 0.0713 0.6821 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR2105200 6 0.1707 0.6780 0.000 0.056 0.000 0.012 0.004 0.928
#> SRR2105197 5 0.5261 0.5240 0.012 0.012 0.256 0.080 0.640 0.000
#> SRR2105198 5 0.5539 0.5387 0.020 0.028 0.220 0.080 0.652 0.000
#> SRR2105195 1 0.7027 0.0812 0.448 0.032 0.348 0.084 0.088 0.000
#> SRR2105196 1 0.3162 0.7714 0.876 0.032 0.036 0.020 0.024 0.012
#> SRR2105193 1 0.0622 0.7885 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105194 1 0.0837 0.7859 0.972 0.004 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105191 5 0.4459 0.5393 0.012 0.000 0.384 0.016 0.588 0.000
#> SRR2105192 5 0.5524 0.5726 0.120 0.012 0.228 0.012 0.628 0.000
#> SRR2105189 2 0.4686 0.6429 0.000 0.652 0.004 0.020 0.028 0.296
#> SRR2105190 2 0.4727 0.5588 0.000 0.560 0.000 0.016 0.024 0.400
#> SRR2105187 2 0.6753 0.3400 0.004 0.524 0.000 0.160 0.216 0.096
#> SRR2105188 5 0.7394 -0.1806 0.004 0.284 0.000 0.096 0.348 0.268
#> SRR2105179 1 0.5950 0.3476 0.552 0.016 0.328 0.044 0.060 0.000
#> SRR2105180 1 0.4386 0.6758 0.764 0.020 0.044 0.020 0.152 0.000
#> SRR2105183 6 0.0291 0.6843 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105184 6 0.2257 0.6716 0.000 0.060 0.000 0.016 0.020 0.904
#> SRR2105185 6 0.4134 0.6097 0.000 0.172 0.004 0.032 0.028 0.764
#> SRR2105186 6 0.4409 0.6022 0.000 0.144 0.000 0.052 0.048 0.756
#> SRR2105181 5 0.4740 0.5077 0.000 0.008 0.368 0.040 0.584 0.000
#> SRR2105182 3 0.4597 0.1393 0.004 0.012 0.608 0.020 0.356 0.000
#> SRR2105177 1 0.0665 0.7864 0.980 0.004 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105178 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105171 6 0.2809 0.5606 0.000 0.168 0.000 0.004 0.004 0.824
#> SRR2105172 6 0.0146 0.6833 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR2105175 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105176 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105173 6 0.5197 0.2901 0.000 0.324 0.000 0.040 0.040 0.596
#> SRR2105174 6 0.2456 0.6783 0.000 0.076 0.000 0.008 0.028 0.888
#> SRR2105169 6 0.3309 0.6700 0.000 0.076 0.000 0.028 0.052 0.844
#> SRR2105170 6 0.3907 0.6520 0.012 0.080 0.000 0.032 0.060 0.816
#> SRR2105167 6 0.0000 0.6840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105168 6 0.0146 0.6833 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR2105165 3 0.7059 0.1499 0.172 0.004 0.496 0.176 0.152 0.000
#> SRR2105166 3 0.7366 0.0569 0.204 0.008 0.448 0.200 0.140 0.000
#> SRR2105163 3 0.7696 -0.3034 0.124 0.024 0.344 0.344 0.164 0.000
#> SRR2105164 4 0.7584 0.2763 0.112 0.016 0.328 0.356 0.188 0.000
#> SRR2105161 1 0.0870 0.7888 0.972 0.000 0.012 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105162 1 0.0291 0.7865 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105155 6 0.1649 0.6779 0.000 0.036 0.000 0.000 0.032 0.932
#> SRR2105156 6 0.0000 0.6840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105157 6 0.4790 0.5650 0.004 0.172 0.000 0.048 0.052 0.724
#> SRR2105158 6 0.5429 0.5167 0.016 0.196 0.000 0.052 0.060 0.676
#> SRR2105159 3 0.7895 -0.2092 0.236 0.012 0.292 0.288 0.172 0.000
#> SRR2105160 1 0.3028 0.7529 0.856 0.004 0.004 0.072 0.064 0.000
#> SRR2105153 6 0.5476 0.3393 0.000 0.292 0.000 0.056 0.052 0.600
#> SRR2105154 6 0.5292 0.4288 0.000 0.252 0.000 0.056 0.052 0.640
#> SRR2105151 6 0.1657 0.6796 0.000 0.040 0.000 0.012 0.012 0.936
#> SRR2105152 6 0.0146 0.6833 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR2105149 3 0.6814 0.1916 0.028 0.316 0.488 0.056 0.112 0.000
#> SRR2105150 3 0.6435 0.2510 0.000 0.264 0.532 0.100 0.104 0.000
#> SRR2105147 4 0.5592 0.3759 0.000 0.232 0.060 0.628 0.080 0.000
#> SRR2105148 4 0.5592 0.3759 0.000 0.232 0.060 0.628 0.080 0.000
#> SRR2105143 1 0.4460 0.7406 0.776 0.032 0.060 0.020 0.112 0.000
#> SRR2105144 1 0.4532 0.7389 0.784 0.032 0.032 0.016 0.112 0.024
#> SRR2105145 1 0.1346 0.7871 0.952 0.000 0.008 0.024 0.016 0.000
#> SRR2105146 1 0.1065 0.7879 0.964 0.000 0.008 0.020 0.008 0.000
#> SRR2105141 2 0.5180 0.6327 0.004 0.668 0.000 0.048 0.052 0.228
#> SRR2105142 2 0.5001 0.6472 0.000 0.660 0.000 0.040 0.048 0.252
#> SRR2105139 6 0.1528 0.6862 0.000 0.048 0.000 0.000 0.016 0.936
#> SRR2105140 6 0.1921 0.6858 0.000 0.052 0.000 0.000 0.032 0.916
#> SRR2105137 6 0.5628 0.4329 0.000 0.124 0.000 0.032 0.232 0.612
#> SRR2105138 6 0.6823 0.3759 0.008 0.196 0.000 0.052 0.276 0.468
#> SRR2105135 6 0.0146 0.6833 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR2105136 6 0.0260 0.6852 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR2105133 5 0.4331 0.5659 0.000 0.012 0.340 0.016 0.632 0.000
#> SRR2105134 5 0.4105 0.5705 0.004 0.008 0.344 0.004 0.640 0.000
#> SRR2105131 5 0.7985 0.1827 0.000 0.268 0.168 0.024 0.340 0.200
#> SRR2105132 5 0.6985 0.5520 0.056 0.072 0.200 0.012 0.576 0.084
#> SRR2105129 1 0.0862 0.7866 0.972 0.004 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105130 1 0.0551 0.7857 0.984 0.004 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105127 5 0.6639 0.5242 0.164 0.016 0.272 0.012 0.516 0.020
#> SRR2105128 5 0.8078 0.5015 0.152 0.084 0.248 0.028 0.440 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.962 0.964 0.983 0.5016 0.499 0.499
#> 3 3 0.583 0.708 0.859 0.3017 0.800 0.619
#> 4 4 0.625 0.705 0.838 0.1438 0.813 0.524
#> 5 5 0.642 0.590 0.762 0.0625 0.895 0.630
#> 6 6 0.672 0.567 0.750 0.0416 0.889 0.556
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105273 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105261 1 0.9522 0.409 0.628 0.372
#> SRR2105262 1 0.4939 0.878 0.892 0.108
#> SRR2105357 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105440 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105509 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.3274 0.928 0.060 0.940
#> SRR2105501 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105502 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105499 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105494 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105491 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105489 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105478 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105475 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR2105474 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105471 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105455 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105452 2 0.6438 0.811 0.164 0.836
#> SRR2105449 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105445 1 0.9286 0.472 0.656 0.344
#> SRR2105446 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105443 2 0.5842 0.842 0.140 0.860
#> SRR2105444 2 0.7299 0.756 0.204 0.796
#> SRR2105441 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.3733 0.917 0.072 0.928
#> SRR2105430 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105427 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105421 1 0.3274 0.931 0.940 0.060
#> SRR2105422 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105423 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105402 2 0.6438 0.811 0.164 0.836
#> SRR2105399 2 0.5946 0.836 0.144 0.856
#> SRR2105400 2 0.4161 0.904 0.084 0.916
#> SRR2105397 2 0.6801 0.790 0.180 0.820
#> SRR2105398 2 0.7219 0.761 0.200 0.800
#> SRR2105395 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105382 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105383 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105379 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105380 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105377 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105375 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105376 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.6438 0.811 0.164 0.836
#> SRR2105349 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105348 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105343 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR2105330 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR2105327 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105325 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.6973 0.776 0.188 0.812
#> SRR2105316 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.2043 0.958 0.968 0.032
#> SRR2105312 1 0.4690 0.887 0.900 0.100
#> SRR2105307 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105301 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105302 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.7950 0.685 0.760 0.240
#> SRR2105300 2 0.7219 0.761 0.200 0.800
#> SRR2105297 2 0.7602 0.729 0.220 0.780
#> SRR2105298 2 0.6343 0.816 0.160 0.840
#> SRR2105295 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105294 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105292 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.0938 0.972 0.012 0.988
#> SRR2105284 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105281 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105247 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.6148 0.822 0.848 0.152
#> SRR2105246 1 0.8861 0.567 0.696 0.304
#> SRR2105243 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105238 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105235 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.0672 0.979 0.992 0.008
#> SRR2105228 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105225 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.2236 0.954 0.964 0.036
#> SRR2105230 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105222 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR2105223 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.2043 0.958 0.968 0.032
#> SRR2105214 1 0.7219 0.753 0.800 0.200
#> SRR2105211 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105206 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105201 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105202 2 0.1184 0.969 0.016 0.984
#> SRR2105203 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0938 0.976 0.988 0.012
#> SRR2105195 1 0.0672 0.979 0.992 0.008
#> SRR2105196 1 0.0938 0.976 0.988 0.012
#> SRR2105193 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105190 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105188 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR2105179 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105186 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105181 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105164 1 0.0376 0.982 0.996 0.004
#> SRR2105161 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.5629 0.849 0.868 0.132
#> SRR2105150 1 0.4161 0.905 0.916 0.084
#> SRR2105147 2 0.8955 0.562 0.312 0.688
#> SRR2105148 2 0.9209 0.510 0.336 0.664
#> SRR2105143 1 0.0938 0.976 0.988 0.012
#> SRR2105144 1 0.2948 0.938 0.948 0.052
#> SRR2105145 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105138 2 0.5294 0.865 0.120 0.880
#> SRR2105135 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9129 0.523 0.328 0.672
#> SRR2105132 1 0.6712 0.788 0.824 0.176
#> SRR2105129 1 0.1184 0.972 0.984 0.016
#> SRR2105130 1 0.0672 0.979 0.992 0.008
#> SRR2105127 1 0.2423 0.950 0.960 0.040
#> SRR2105128 1 0.6438 0.805 0.836 0.164
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.6026 0.2868 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105278 3 0.6260 0.0657 0.448 0.000 0.552
#> SRR2105275 3 0.4702 0.6238 0.212 0.000 0.788
#> SRR2105276 3 0.5058 0.5992 0.244 0.000 0.756
#> SRR2105273 3 0.6286 0.0562 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105274 1 0.4291 0.7468 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105271 1 0.5948 0.4916 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105272 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105269 2 0.1289 0.8968 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105270 2 0.0424 0.9020 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105267 2 0.0592 0.9020 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.2496 0.8726 0.068 0.928 0.004
#> SRR2105264 2 0.2625 0.8643 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105261 3 0.1878 0.6969 0.004 0.044 0.952
#> SRR2105262 3 0.2116 0.7051 0.040 0.012 0.948
#> SRR2105357 3 0.1964 0.7021 0.056 0.000 0.944
#> SRR2105358 3 0.5591 0.4451 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105439 2 0.3649 0.8523 0.068 0.896 0.036
#> SRR2105440 2 0.2926 0.8721 0.040 0.924 0.036
#> SRR2105509 2 0.5465 0.6899 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105510 2 0.5529 0.6790 0.000 0.704 0.296
#> SRR2105507 3 0.6280 0.0763 0.460 0.000 0.540
#> SRR2105508 3 0.5650 0.4729 0.312 0.000 0.688
#> SRR2105505 1 0.4974 0.6973 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105506 1 0.4605 0.7250 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.5216 0.5114 0.000 0.260 0.740
#> SRR2105501 2 0.4139 0.8500 0.016 0.860 0.124
#> SRR2105502 3 0.6204 0.0534 0.000 0.424 0.576
#> SRR2105499 3 0.6235 0.1404 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105500 1 0.6274 0.2578 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105497 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.1289 0.8945 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105495 2 0.1765 0.8882 0.004 0.956 0.040
#> SRR2105496 2 0.1950 0.8888 0.008 0.952 0.040
#> SRR2105493 2 0.2651 0.8747 0.012 0.928 0.060
#> SRR2105494 2 0.2804 0.8730 0.016 0.924 0.060
#> SRR2105491 2 0.4146 0.8532 0.080 0.876 0.044
#> SRR2105492 2 0.3120 0.8626 0.080 0.908 0.012
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0592 0.9006 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105487 1 0.6026 0.2951 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105488 1 0.4235 0.6962 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105485 3 0.6309 -0.1472 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105486 3 0.6309 -0.1466 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105483 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.4452 0.6674 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105482 1 0.0424 0.8070 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105479 1 0.5397 0.4918 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105480 1 0.1031 0.8029 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105477 2 0.2982 0.8784 0.024 0.920 0.056
#> SRR2105478 2 0.2793 0.8812 0.028 0.928 0.044
#> SRR2105475 2 0.5497 0.6847 0.000 0.708 0.292
#> SRR2105476 2 0.5431 0.6953 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105473 2 0.4563 0.8123 0.112 0.852 0.036
#> SRR2105474 2 0.4256 0.8278 0.096 0.868 0.036
#> SRR2105471 2 0.0237 0.9029 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105472 2 0.0237 0.9027 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105469 3 0.5397 0.5338 0.280 0.000 0.720
#> SRR2105470 1 0.5859 0.5379 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105467 1 0.6215 0.3655 0.572 0.000 0.428
#> SRR2105468 1 0.5016 0.6949 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105465 1 0.1411 0.8074 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105466 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.4062 0.8199 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105460 2 0.4931 0.7567 0.000 0.768 0.232
#> SRR2105457 3 0.0747 0.7068 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105458 3 0.0592 0.7062 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105455 1 0.5327 0.6551 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105456 1 0.4796 0.7084 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105453 1 0.4796 0.7158 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105454 1 0.4796 0.7157 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105451 2 0.5465 0.7132 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105452 3 0.3752 0.6392 0.000 0.144 0.856
#> SRR2105449 1 0.0592 0.8055 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105450 1 0.0424 0.8061 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105447 2 0.5465 0.6911 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105448 2 0.3551 0.8441 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105445 3 0.0892 0.7064 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105446 3 0.6192 0.1698 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105443 3 0.2878 0.6667 0.000 0.096 0.904
#> SRR2105444 3 0.8858 0.3442 0.136 0.332 0.532
#> SRR2105441 2 0.0892 0.8982 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105442 2 0.1289 0.8932 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105437 1 0.6286 -0.0501 0.536 0.000 0.464
#> SRR2105438 1 0.6286 -0.0524 0.536 0.000 0.464
#> SRR2105435 3 0.5948 0.4617 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105436 3 0.6244 0.1343 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105433 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105434 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105431 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 3 0.8793 -0.0976 0.112 0.436 0.452
#> SRR2105430 2 0.6773 0.5780 0.024 0.636 0.340
#> SRR2105427 2 0.4750 0.7713 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105428 2 0.4002 0.8216 0.000 0.840 0.160
#> SRR2105425 2 0.2878 0.8674 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105426 2 0.0237 0.9029 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105421 3 0.1585 0.7049 0.028 0.008 0.964
#> SRR2105422 3 0.1647 0.7046 0.036 0.004 0.960
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.5529 0.4771 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105420 3 0.4121 0.6437 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105415 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0237 0.8045 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105417 1 0.0892 0.8082 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.5591 0.6673 0.000 0.696 0.304
#> SRR2105414 2 0.5560 0.6743 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.1015 0.8988 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 3 0.0592 0.7062 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105408 3 0.0592 0.7062 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105403 3 0.5905 0.3471 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105404 3 0.5988 0.3100 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105405 1 0.4605 0.7240 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105406 1 0.4178 0.7500 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105401 2 0.6295 0.3027 0.000 0.528 0.472
#> SRR2105402 3 0.4452 0.6001 0.000 0.192 0.808
#> SRR2105399 3 0.4504 0.5980 0.000 0.196 0.804
#> SRR2105400 3 0.4654 0.5871 0.000 0.208 0.792
#> SRR2105397 3 0.4007 0.6812 0.084 0.036 0.880
#> SRR2105398 3 0.3272 0.6906 0.080 0.016 0.904
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0424 0.9017 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.0592 0.7062 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105390 3 0.3340 0.6763 0.120 0.000 0.880
#> SRR2105391 3 0.0747 0.7068 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105392 3 0.1031 0.7069 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105385 1 0.6008 0.4614 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105386 1 0.6168 0.3772 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105387 1 0.4399 0.7372 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105388 1 0.4002 0.7577 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105381 2 0.6180 0.4513 0.000 0.584 0.416
#> SRR2105382 2 0.6062 0.6919 0.016 0.708 0.276
#> SRR2105383 2 0.1860 0.8824 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105384 2 0.3686 0.8048 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105379 2 0.5812 0.7125 0.012 0.724 0.264
#> SRR2105380 2 0.7153 0.6774 0.200 0.708 0.092
#> SRR2105377 2 0.1877 0.8890 0.012 0.956 0.032
#> SRR2105378 2 0.3713 0.8483 0.076 0.892 0.032
#> SRR2105375 1 0.4521 0.7516 0.816 0.004 0.180
#> SRR2105376 1 0.2537 0.7987 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105373 3 0.5706 0.4341 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105374 1 0.6095 0.2205 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105371 3 0.3116 0.6871 0.108 0.000 0.892
#> SRR2105372 3 0.4235 0.6448 0.176 0.000 0.824
#> SRR2105369 1 0.6308 0.1372 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105370 1 0.6008 0.4894 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105367 1 0.1643 0.7943 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105368 1 0.0747 0.8007 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105365 2 0.4339 0.8488 0.084 0.868 0.048
#> SRR2105366 2 0.2680 0.8721 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105363 2 0.0424 0.9027 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.5529 0.4989 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105360 3 0.5859 0.4049 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105355 3 0.5291 0.5540 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105356 1 0.5560 0.6178 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105353 3 0.1289 0.7047 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105354 3 0.5291 0.5659 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105351 2 0.1964 0.8876 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105352 3 0.4504 0.5965 0.000 0.196 0.804
#> SRR2105349 2 0.5178 0.7298 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.1878 0.8858 0.044 0.952 0.004
#> SRR2105346 2 0.1031 0.8966 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105347 2 0.4834 0.7274 0.204 0.792 0.004
#> SRR2105348 2 0.4555 0.7351 0.200 0.800 0.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.2625 0.6978 0.084 0.000 0.916
#> SRR2105342 3 0.5678 0.4517 0.316 0.000 0.684
#> SRR2105339 3 0.1289 0.7047 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105340 3 0.3619 0.6799 0.136 0.000 0.864
#> SRR2105335 1 0.6026 0.4703 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105336 1 0.3879 0.7645 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105337 1 0.4605 0.7310 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105338 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105331 2 0.3038 0.8628 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105332 2 0.0892 0.8986 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105333 2 0.5291 0.7154 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105334 2 0.4178 0.8134 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105329 3 0.1289 0.7000 0.000 0.032 0.968
#> SRR2105330 3 0.6432 -0.0129 0.004 0.428 0.568
#> SRR2105327 2 0.5431 0.6958 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105328 2 0.5431 0.6958 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105325 3 0.4974 0.6020 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105326 3 0.4974 0.6020 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105323 3 0.4842 0.5753 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105324 3 0.6305 -0.0803 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105319 1 0.5138 0.6117 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105320 1 0.0747 0.8068 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105321 3 0.4974 0.6091 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105322 3 0.5591 0.5518 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105317 2 0.4931 0.7554 0.000 0.768 0.232
#> SRR2105318 2 0.1289 0.8963 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105315 3 0.3412 0.6451 0.000 0.124 0.876
#> SRR2105316 2 0.4750 0.7712 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105313 2 0.3116 0.8607 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105311 3 0.5158 0.6045 0.232 0.004 0.764
#> SRR2105312 3 0.5378 0.6004 0.236 0.008 0.756
#> SRR2105307 1 0.4178 0.7505 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105308 1 0.4399 0.7365 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105309 3 0.0747 0.7068 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105310 3 0.4452 0.6097 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105305 3 0.1031 0.7070 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105306 3 0.4399 0.6354 0.188 0.000 0.812
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.5968 0.2552 0.000 0.364 0.636
#> SRR2105301 2 0.5497 0.6847 0.000 0.708 0.292
#> SRR2105302 2 0.1964 0.8877 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105299 3 0.0237 0.7031 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105300 3 0.1647 0.6976 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105297 1 0.6204 0.2070 0.576 0.424 0.000
#> SRR2105298 1 0.6295 0.0741 0.528 0.472 0.000
#> SRR2105295 2 0.5291 0.7154 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105296 2 0.4062 0.8201 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105293 3 0.5365 0.5962 0.252 0.004 0.744
#> SRR2105294 1 0.4121 0.6928 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105291 1 0.3573 0.7847 0.876 0.004 0.120
#> SRR2105292 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.3752 0.6747 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105290 1 0.1411 0.8076 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105287 1 0.3752 0.7687 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105288 1 0.1964 0.8035 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105285 2 0.5327 0.7119 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105286 2 0.3038 0.8619 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105283 2 0.4807 0.8223 0.092 0.848 0.060
#> SRR2105284 2 0.3889 0.8472 0.032 0.884 0.084
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.0592 0.7062 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105260 3 0.0424 0.7054 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.0747 0.8064 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105258 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0237 0.9032 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 3 0.6244 0.0916 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105256 1 0.6225 0.3447 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0237 0.9030 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105249 2 0.1877 0.8891 0.012 0.956 0.032
#> SRR2105250 2 0.4217 0.8266 0.100 0.868 0.032
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.6247 0.6209 0.212 0.044 0.744
#> SRR2105246 3 0.7148 0.5965 0.176 0.108 0.716
#> SRR2105243 1 0.5465 0.6311 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105244 1 0.4178 0.7526 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105241 1 0.2711 0.7964 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105242 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105239 1 0.4062 0.7641 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105240 1 0.0892 0.8078 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105237 2 0.6309 0.2691 0.000 0.504 0.496
#> SRR2105238 2 0.5024 0.7854 0.004 0.776 0.220
#> SRR2105235 2 0.1267 0.8953 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105236 2 0.1015 0.8988 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105233 2 0.5431 0.6953 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105234 2 0.5431 0.6953 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.6308 -0.0314 0.492 0.000 0.508
#> SRR2105228 1 0.2711 0.7958 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105225 1 0.5138 0.6812 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105226 1 0.3412 0.7802 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105229 3 0.0237 0.7042 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105230 3 0.4346 0.6511 0.184 0.000 0.816
#> SRR2105219 2 0.1163 0.8978 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105220 2 0.0237 0.9032 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105221 2 0.3554 0.8568 0.064 0.900 0.036
#> SRR2105222 2 0.4256 0.8278 0.096 0.868 0.036
#> SRR2105223 1 0.6308 0.1151 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105224 1 0.5016 0.6913 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.6501 0.5237 0.316 0.020 0.664
#> SRR2105214 3 0.5850 0.6372 0.188 0.040 0.772
#> SRR2105211 3 0.1529 0.7069 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105212 3 0.5988 0.3290 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105209 1 0.4062 0.7621 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0424 0.8053 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105208 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.6443 0.7205 0.040 0.720 0.240
#> SRR2105206 2 0.5000 0.8316 0.044 0.832 0.124
#> SRR2105201 2 0.2689 0.8769 0.032 0.932 0.036
#> SRR2105202 2 0.3456 0.8588 0.060 0.904 0.036
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0237 0.9027 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105197 3 0.3619 0.6829 0.136 0.000 0.864
#> SRR2105198 3 0.3116 0.6971 0.108 0.000 0.892
#> SRR2105195 1 0.4452 0.6890 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105196 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105193 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105194 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105191 3 0.6180 0.1795 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105192 1 0.3879 0.7686 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105189 2 0.5138 0.7403 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105190 2 0.2711 0.8708 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105187 2 0.7536 0.6186 0.064 0.632 0.304
#> SRR2105188 2 0.5662 0.7876 0.100 0.808 0.092
#> SRR2105179 1 0.1860 0.8032 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105180 1 0.0747 0.8036 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0237 0.9027 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105185 2 0.0592 0.9022 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105186 2 0.0983 0.8999 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105181 3 0.5016 0.5525 0.240 0.000 0.760
#> SRR2105182 3 0.5431 0.4813 0.284 0.000 0.716
#> SRR2105177 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105176 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0237 0.9030 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.1163 0.8962 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.5733 0.4105 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105166 1 0.5058 0.5823 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105163 3 0.5016 0.6001 0.240 0.000 0.760
#> SRR2105164 3 0.5254 0.5810 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105161 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0983 0.8998 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105159 1 0.4931 0.5772 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105160 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105153 2 0.0237 0.9030 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105154 2 0.0424 0.9026 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.1399 0.7056 0.028 0.004 0.968
#> SRR2105150 3 0.0661 0.7053 0.008 0.004 0.988
#> SRR2105147 3 0.2846 0.6933 0.020 0.056 0.924
#> SRR2105148 3 0.2846 0.6933 0.020 0.056 0.924
#> SRR2105143 1 0.2400 0.8026 0.932 0.004 0.064
#> SRR2105144 1 0.2569 0.7945 0.936 0.032 0.032
#> SRR2105145 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105146 1 0.0237 0.8063 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105141 2 0.4629 0.7975 0.004 0.808 0.188
#> SRR2105142 2 0.3412 0.8497 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0237 0.9027 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105137 2 0.4174 0.8318 0.092 0.872 0.036
#> SRR2105138 2 0.5921 0.6941 0.212 0.756 0.032
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9035 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.5254 0.5214 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105134 3 0.6305 -0.0521 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105131 3 0.8000 0.0823 0.064 0.408 0.528
#> SRR2105132 1 0.5810 0.6574 0.796 0.132 0.072
#> SRR2105129 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.8060 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.4978 0.7174 0.780 0.004 0.216
#> SRR2105128 1 0.5803 0.6996 0.760 0.028 0.212
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.1356 0.800967 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR2105278 3 0.1724 0.799000 0.020 0.000 0.948 0.032
#> SRR2105275 3 0.6869 0.545552 0.224 0.000 0.596 0.180
#> SRR2105276 3 0.7170 0.460483 0.288 0.000 0.540 0.172
#> SRR2105273 3 0.3448 0.734963 0.168 0.000 0.828 0.004
#> SRR2105274 1 0.4564 0.521913 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105271 3 0.4790 0.334047 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 4 0.3688 0.700082 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR2105270 4 0.5764 -0.003326 0.000 0.452 0.028 0.520
#> SRR2105267 4 0.4431 0.573328 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105268 2 0.4543 0.576270 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105265 2 0.2149 0.862696 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105266 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105263 2 0.5453 0.130044 0.020 0.592 0.000 0.388
#> SRR2105264 2 0.1182 0.855358 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR2105261 4 0.4605 0.440858 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR2105262 3 0.5465 0.343526 0.020 0.000 0.588 0.392
#> SRR2105357 3 0.1022 0.801235 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105358 3 0.1209 0.801098 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR2105439 2 0.3858 0.836204 0.000 0.844 0.056 0.100
#> SRR2105440 2 0.3858 0.836204 0.000 0.844 0.056 0.100
#> SRR2105509 4 0.1452 0.795806 0.000 0.036 0.008 0.956
#> SRR2105510 4 0.1452 0.796279 0.000 0.036 0.008 0.956
#> SRR2105507 3 0.4511 0.593120 0.268 0.000 0.724 0.008
#> SRR2105508 3 0.3377 0.752753 0.140 0.000 0.848 0.012
#> SRR2105505 1 0.4978 0.493959 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR2105506 1 0.4134 0.660925 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105503 2 0.3528 0.710312 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105504 4 0.2179 0.773808 0.000 0.012 0.064 0.924
#> SRR2105501 2 0.5751 0.263942 0.004 0.528 0.020 0.448
#> SRR2105502 4 0.1488 0.790059 0.000 0.012 0.032 0.956
#> SRR2105499 3 0.2198 0.803290 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR2105500 3 0.3355 0.737963 0.160 0.000 0.836 0.004
#> SRR2105497 2 0.2125 0.838778 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105498 2 0.0524 0.859511 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105495 2 0.5184 0.753341 0.000 0.732 0.056 0.212
#> SRR2105496 2 0.4259 0.826694 0.000 0.816 0.056 0.128
#> SRR2105493 2 0.5172 0.768521 0.000 0.744 0.068 0.188
#> SRR2105494 2 0.4022 0.828421 0.000 0.836 0.068 0.096
#> SRR2105491 4 0.5632 0.607406 0.036 0.340 0.000 0.624
#> SRR2105492 4 0.5784 0.472076 0.032 0.412 0.000 0.556
#> SRR2105489 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105490 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105487 3 0.5389 0.507537 0.308 0.000 0.660 0.032
#> SRR2105488 1 0.5861 0.004666 0.488 0.000 0.480 0.032
#> SRR2105485 3 0.2060 0.797187 0.052 0.000 0.932 0.016
#> SRR2105486 3 0.2101 0.800278 0.060 0.000 0.928 0.012
#> SRR2105483 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.4679 0.356971 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR2105482 1 0.0188 0.819682 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105479 1 0.4037 0.711012 0.824 0.000 0.136 0.040
#> SRR2105480 1 0.0336 0.817952 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105477 2 0.6399 0.278801 0.004 0.568 0.064 0.364
#> SRR2105478 2 0.4880 0.705681 0.000 0.760 0.052 0.188
#> SRR2105475 4 0.1109 0.796299 0.000 0.028 0.004 0.968
#> SRR2105476 4 0.1389 0.796588 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR2105473 2 0.3229 0.843823 0.000 0.880 0.048 0.072
#> SRR2105474 2 0.2399 0.833631 0.000 0.920 0.048 0.032
#> SRR2105471 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105472 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105469 3 0.2635 0.798293 0.076 0.000 0.904 0.020
#> SRR2105470 3 0.4955 0.129359 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR2105467 3 0.2699 0.781583 0.068 0.000 0.904 0.028
#> SRR2105468 3 0.5600 -0.167859 0.468 0.000 0.512 0.020
#> SRR2105465 1 0.1389 0.813635 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.3400 0.805019 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105462 2 0.2704 0.845016 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105459 4 0.1792 0.794628 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR2105460 4 0.1716 0.794628 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105457 3 0.1302 0.807944 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105458 3 0.1389 0.807085 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105455 1 0.4477 0.599160 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR2105456 1 0.3975 0.679552 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105453 1 0.5746 0.453158 0.572 0.000 0.396 0.032
#> SRR2105454 1 0.5746 0.453793 0.572 0.000 0.396 0.032
#> SRR2105451 2 0.6465 0.406681 0.000 0.556 0.080 0.364
#> SRR2105452 4 0.2859 0.739931 0.000 0.008 0.112 0.880
#> SRR2105449 1 0.0469 0.817599 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105447 4 0.1716 0.797814 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105448 4 0.2469 0.790928 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR2105445 3 0.1302 0.801281 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105446 3 0.1610 0.799750 0.016 0.000 0.952 0.032
#> SRR2105443 4 0.3074 0.710089 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR2105444 4 0.7115 0.642674 0.080 0.096 0.156 0.668
#> SRR2105441 2 0.2125 0.867948 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR2105442 2 0.0336 0.860123 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105437 3 0.5247 0.559384 0.284 0.000 0.684 0.032
#> SRR2105438 3 0.5222 0.565631 0.280 0.000 0.688 0.032
#> SRR2105435 3 0.4549 0.713699 0.188 0.000 0.776 0.036
#> SRR2105436 3 0.2149 0.801535 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 4 0.5362 0.762862 0.072 0.116 0.032 0.780
#> SRR2105430 4 0.3135 0.789399 0.012 0.092 0.012 0.884
#> SRR2105427 4 0.4872 0.488418 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR2105428 4 0.2831 0.771430 0.000 0.120 0.004 0.876
#> SRR2105425 4 0.4382 0.610492 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105426 2 0.0592 0.857927 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105421 3 0.4722 0.564685 0.008 0.000 0.692 0.300
#> SRR2105422 3 0.4511 0.728742 0.040 0.000 0.784 0.176
#> SRR2105423 2 0.1867 0.867173 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105424 2 0.1716 0.868000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105419 3 0.1284 0.810590 0.024 0.000 0.964 0.012
#> SRR2105420 3 0.1488 0.810727 0.012 0.000 0.956 0.032
#> SRR2105415 1 0.0188 0.818745 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105416 1 0.0188 0.818745 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105417 1 0.1118 0.816032 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.1398 0.795840 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR2105414 4 0.1389 0.796094 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR2105409 2 0.1637 0.871013 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105410 2 0.1510 0.852389 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR2105411 2 0.2704 0.848424 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105412 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105407 3 0.0469 0.809440 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105408 3 0.0592 0.808519 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105403 3 0.1356 0.800967 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR2105404 3 0.1488 0.800310 0.012 0.000 0.956 0.032
#> SRR2105405 1 0.4040 0.671143 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR2105406 1 0.3688 0.712251 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105401 4 0.1297 0.792428 0.000 0.016 0.020 0.964
#> SRR2105402 4 0.2988 0.741012 0.000 0.012 0.112 0.876
#> SRR2105399 4 0.2805 0.749957 0.000 0.012 0.100 0.888
#> SRR2105400 4 0.2542 0.761575 0.000 0.012 0.084 0.904
#> SRR2105397 4 0.5932 0.618470 0.088 0.016 0.176 0.720
#> SRR2105398 4 0.5018 0.651924 0.088 0.000 0.144 0.768
#> SRR2105395 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105396 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105393 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105394 2 0.0469 0.865134 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105389 3 0.1211 0.808589 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105390 3 0.1151 0.810683 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR2105391 3 0.1211 0.808589 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105392 3 0.1211 0.808589 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105385 3 0.4605 0.497346 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR2105386 3 0.3610 0.698073 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR2105387 1 0.3873 0.694784 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105388 1 0.4103 0.671503 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105381 4 0.1406 0.794908 0.000 0.024 0.016 0.960
#> SRR2105382 4 0.2654 0.789155 0.004 0.108 0.000 0.888
#> SRR2105383 2 0.3249 0.831153 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR2105384 2 0.2610 0.861537 0.012 0.900 0.000 0.088
#> SRR2105379 4 0.4220 0.726079 0.004 0.248 0.000 0.748
#> SRR2105380 4 0.7137 0.556489 0.160 0.304 0.000 0.536
#> SRR2105377 2 0.3216 0.846046 0.000 0.880 0.044 0.076
#> SRR2105378 2 0.2227 0.843299 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR2105375 1 0.3873 0.716299 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105376 1 0.3400 0.751282 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105373 3 0.1356 0.802492 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR2105374 3 0.5141 0.582846 0.268 0.000 0.700 0.032
#> SRR2105371 3 0.1610 0.810326 0.016 0.000 0.952 0.032
#> SRR2105372 3 0.1913 0.807854 0.040 0.000 0.940 0.020
#> SRR2105369 3 0.1867 0.800301 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR2105370 3 0.3356 0.711631 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR2105367 1 0.3335 0.759734 0.856 0.000 0.128 0.016
#> SRR2105368 1 0.1822 0.801407 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR2105365 4 0.5143 0.713146 0.036 0.256 0.000 0.708
#> SRR2105366 4 0.5467 0.577062 0.024 0.364 0.000 0.612
#> SRR2105363 2 0.3688 0.772422 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105364 2 0.2081 0.863648 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105361 2 0.2216 0.863299 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105362 2 0.2081 0.866242 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105359 3 0.2174 0.806599 0.052 0.000 0.928 0.020
#> SRR2105360 3 0.2730 0.791042 0.088 0.000 0.896 0.016
#> SRR2105355 3 0.3166 0.774522 0.116 0.000 0.868 0.016
#> SRR2105356 1 0.4830 0.449126 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR2105353 3 0.3142 0.769614 0.008 0.000 0.860 0.132
#> SRR2105354 3 0.3048 0.787056 0.108 0.000 0.876 0.016
#> SRR2105351 4 0.4431 0.639325 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105352 4 0.2928 0.743706 0.000 0.012 0.108 0.880
#> SRR2105349 4 0.1637 0.798242 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR2105350 4 0.4948 0.203039 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105345 2 0.2197 0.867294 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR2105346 2 0.1716 0.867724 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105347 2 0.1471 0.852289 0.024 0.960 0.004 0.012
#> SRR2105348 2 0.1489 0.847763 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR2105343 4 0.4406 0.568157 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR2105344 2 0.2281 0.861113 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105341 3 0.1356 0.810067 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR2105342 3 0.1722 0.807520 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR2105339 3 0.2988 0.781047 0.012 0.000 0.876 0.112
#> SRR2105340 3 0.4992 0.726688 0.132 0.000 0.772 0.096
#> SRR2105335 3 0.2611 0.783551 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR2105336 1 0.4877 0.441478 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR2105337 1 0.4164 0.660141 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105338 1 0.0188 0.819854 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105331 4 0.4008 0.732517 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR2105332 2 0.1792 0.837400 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105333 4 0.1474 0.797259 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105334 4 0.3400 0.771387 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR2105329 4 0.5167 -0.061105 0.000 0.004 0.488 0.508
#> SRR2105330 4 0.6350 0.436616 0.000 0.092 0.296 0.612
#> SRR2105327 4 0.3942 0.735657 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105328 4 0.3873 0.741901 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105325 3 0.7138 0.483004 0.268 0.000 0.552 0.180
#> SRR2105326 3 0.6992 0.488591 0.280 0.000 0.564 0.156
#> SRR2105323 3 0.1118 0.806352 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105324 3 0.2149 0.792388 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105319 1 0.4977 0.108872 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR2105320 1 0.1557 0.804528 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105321 3 0.6517 0.525458 0.288 0.000 0.604 0.108
#> SRR2105322 3 0.6780 0.277993 0.416 0.000 0.488 0.096
#> SRR2105317 4 0.2081 0.788061 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR2105318 4 0.3356 0.732784 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR2105315 3 0.4978 0.406227 0.000 0.004 0.612 0.384
#> SRR2105316 4 0.2973 0.762080 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105313 4 0.2530 0.782545 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR2105314 2 0.4713 0.495559 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105311 4 0.7499 0.266055 0.244 0.000 0.256 0.500
#> SRR2105312 4 0.7105 0.403097 0.256 0.000 0.184 0.560
#> SRR2105307 1 0.3688 0.713264 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105308 1 0.3873 0.691323 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105309 3 0.1209 0.810114 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR2105310 3 0.0895 0.811055 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR2105305 3 0.1389 0.807085 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105306 3 0.2089 0.806009 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR2105303 2 0.1474 0.871060 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105304 4 0.1584 0.788643 0.000 0.012 0.036 0.952
#> SRR2105301 4 0.2611 0.796034 0.000 0.096 0.008 0.896
#> SRR2105302 4 0.3266 0.762986 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105299 3 0.2149 0.790553 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105300 3 0.4699 0.523838 0.000 0.004 0.676 0.320
#> SRR2105297 2 0.5132 0.146600 0.448 0.548 0.000 0.004
#> SRR2105298 2 0.5097 0.208793 0.428 0.568 0.000 0.004
#> SRR2105295 4 0.1302 0.795506 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR2105296 4 0.3907 0.735594 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR2105293 1 0.7882 -0.150016 0.368 0.000 0.348 0.284
#> SRR2105294 1 0.3400 0.693572 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105291 1 0.4160 0.733369 0.792 0.012 0.192 0.004
#> SRR2105292 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.5998 0.603212 0.212 0.000 0.680 0.108
#> SRR2105290 1 0.1022 0.816993 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105287 1 0.3266 0.749104 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105288 1 0.1557 0.810970 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105285 4 0.1824 0.796040 0.000 0.060 0.004 0.936
#> SRR2105286 4 0.2469 0.779847 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR2105283 2 0.4266 0.805388 0.040 0.848 0.056 0.056
#> SRR2105284 2 0.3828 0.819317 0.000 0.848 0.084 0.068
#> SRR2105281 2 0.3444 0.789366 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105282 2 0.3444 0.789366 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105259 3 0.0707 0.810127 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105260 3 0.0707 0.810127 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105279 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105280 2 0.1716 0.868000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105257 1 0.1389 0.814152 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 4 0.4564 0.509436 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105254 2 0.4643 0.531909 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105255 3 0.1302 0.807654 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR2105256 3 0.2760 0.763923 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR2105251 2 0.2647 0.786941 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105252 2 0.4643 0.324446 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105249 2 0.3464 0.848119 0.000 0.860 0.032 0.108
#> SRR2105250 2 0.3647 0.843726 0.000 0.852 0.040 0.108
#> SRR2105247 2 0.0592 0.859353 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105248 2 0.0336 0.859387 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105245 4 0.8002 -0.003459 0.276 0.004 0.324 0.396
#> SRR2105246 4 0.8131 0.315196 0.220 0.028 0.252 0.500
#> SRR2105243 1 0.4985 0.242754 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR2105244 1 0.4679 0.464103 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR2105241 1 0.2011 0.803689 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.3486 0.744629 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105240 1 0.0921 0.817411 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105237 4 0.1722 0.787909 0.000 0.048 0.008 0.944
#> SRR2105238 4 0.5309 0.635801 0.000 0.164 0.092 0.744
#> SRR2105235 2 0.4595 0.793838 0.000 0.776 0.040 0.184
#> SRR2105236 2 0.2345 0.864252 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105233 4 0.1398 0.795840 0.000 0.040 0.004 0.956
#> SRR2105234 4 0.1302 0.795506 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR2105231 2 0.0921 0.857818 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105232 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105227 1 0.6296 0.373221 0.548 0.000 0.388 0.064
#> SRR2105228 1 0.2216 0.795744 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105225 3 0.5167 -0.034654 0.488 0.000 0.508 0.004
#> SRR2105226 1 0.2814 0.771662 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105229 3 0.3074 0.760134 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105230 3 0.2494 0.805716 0.048 0.000 0.916 0.036
#> SRR2105219 4 0.3610 0.711360 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR2105220 2 0.4483 0.639649 0.000 0.712 0.004 0.284
#> SRR2105221 2 0.2660 0.827544 0.000 0.908 0.056 0.036
#> SRR2105222 2 0.2494 0.831932 0.000 0.916 0.048 0.036
#> SRR2105223 3 0.2814 0.764720 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR2105224 1 0.4877 0.411727 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR2105217 2 0.2704 0.783482 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105218 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105215 2 0.1118 0.869067 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105216 2 0.1716 0.867724 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105213 1 0.7547 0.237856 0.488 0.000 0.276 0.236
#> SRR2105214 4 0.8180 0.065477 0.268 0.012 0.308 0.412
#> SRR2105211 3 0.1576 0.807733 0.004 0.000 0.948 0.048
#> SRR2105212 3 0.2053 0.801362 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR2105209 1 0.4222 0.673905 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.1022 0.813109 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.3757 0.781606 0.020 0.152 0.000 0.828
#> SRR2105206 4 0.4831 0.754773 0.040 0.208 0.000 0.752
#> SRR2105201 2 0.3899 0.835838 0.000 0.840 0.052 0.108
#> SRR2105202 2 0.3996 0.832819 0.000 0.836 0.060 0.104
#> SRR2105203 2 0.4916 0.314057 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105204 2 0.1716 0.868000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105199 2 0.2760 0.840634 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105200 2 0.0188 0.862756 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105197 3 0.2036 0.799988 0.032 0.000 0.936 0.032
#> SRR2105198 3 0.3323 0.783521 0.060 0.000 0.876 0.064
#> SRR2105195 1 0.4253 0.739375 0.820 0.004 0.132 0.044
#> SRR2105196 1 0.0188 0.818944 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105193 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 3 0.1833 0.798951 0.024 0.000 0.944 0.032
#> SRR2105192 1 0.5766 0.417153 0.564 0.000 0.404 0.032
#> SRR2105189 4 0.2610 0.786808 0.000 0.088 0.012 0.900
#> SRR2105190 4 0.3726 0.707672 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR2105187 4 0.5547 0.715475 0.020 0.196 0.048 0.736
#> SRR2105188 2 0.3920 0.800763 0.012 0.856 0.076 0.056
#> SRR2105179 1 0.2216 0.797927 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105180 1 0.1940 0.795747 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105183 2 0.1637 0.868462 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105184 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105185 2 0.3907 0.635903 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105186 2 0.1792 0.833470 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105181 3 0.1022 0.801235 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105182 3 0.1297 0.808360 0.016 0.000 0.964 0.020
#> SRR2105177 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.3266 0.810428 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105172 2 0.1867 0.866243 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105175 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 4 0.4994 0.281608 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105174 2 0.1637 0.871030 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105169 2 0.0336 0.861014 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105170 2 0.0188 0.859991 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105167 2 0.1557 0.868894 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105168 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105165 3 0.5132 0.287594 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR2105166 1 0.4977 0.000423 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR2105163 3 0.7594 0.402375 0.260 0.000 0.480 0.260
#> SRR2105164 3 0.7823 0.273710 0.320 0.000 0.408 0.272
#> SRR2105161 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.1716 0.869255 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105156 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105157 2 0.3356 0.712113 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105158 2 0.1792 0.836051 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105159 1 0.3598 0.734603 0.848 0.000 0.124 0.028
#> SRR2105160 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105153 4 0.4981 0.367012 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105154 2 0.4907 0.042944 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105151 2 0.1867 0.866243 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105152 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105149 3 0.5865 0.452215 0.048 0.000 0.612 0.340
#> SRR2105150 3 0.4905 0.459903 0.004 0.000 0.632 0.364
#> SRR2105147 4 0.4764 0.615962 0.032 0.000 0.220 0.748
#> SRR2105148 4 0.4764 0.615962 0.032 0.000 0.220 0.748
#> SRR2105143 1 0.2636 0.804390 0.916 0.020 0.052 0.012
#> SRR2105144 1 0.3408 0.745549 0.860 0.120 0.016 0.004
#> SRR2105145 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105141 4 0.2973 0.785243 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105142 4 0.2973 0.785325 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105139 2 0.1940 0.870280 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105140 2 0.0469 0.862931 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105137 2 0.3716 0.839252 0.000 0.852 0.052 0.096
#> SRR2105138 2 0.3189 0.822745 0.020 0.896 0.048 0.036
#> SRR2105135 2 0.1792 0.866834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105136 2 0.1302 0.869469 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105133 3 0.1022 0.801235 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105134 3 0.2483 0.788879 0.052 0.000 0.916 0.032
#> SRR2105131 3 0.7487 0.250365 0.008 0.164 0.520 0.308
#> SRR2105132 1 0.8532 0.122954 0.412 0.120 0.392 0.076
#> SRR2105129 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.819883 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.6439 0.408619 0.544 0.016 0.400 0.040
#> SRR2105128 1 0.7097 0.496178 0.572 0.016 0.308 0.104
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.4219 0.49546 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105278 5 0.4219 0.49546 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105275 3 0.6082 0.47578 0.076 0.000 0.556 0.024 0.344
#> SRR2105276 3 0.6253 0.46893 0.084 0.000 0.544 0.028 0.344
#> SRR2105273 3 0.2628 0.62240 0.028 0.000 0.884 0.000 0.088
#> SRR2105274 3 0.4849 0.40279 0.360 0.000 0.608 0.000 0.032
#> SRR2105271 3 0.5546 0.47212 0.172 0.000 0.648 0.000 0.180
#> SRR2105272 1 0.2516 0.79958 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105269 4 0.1270 0.79517 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR2105270 4 0.5327 0.54327 0.000 0.216 0.000 0.664 0.120
#> SRR2105267 4 0.2690 0.73485 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR2105268 2 0.4273 0.26775 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR2105265 2 0.1908 0.79934 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105266 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105263 2 0.6165 0.20775 0.020 0.552 0.000 0.336 0.092
#> SRR2105264 2 0.2429 0.76872 0.020 0.900 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105261 4 0.5996 0.31503 0.000 0.000 0.316 0.548 0.136
#> SRR2105262 3 0.6355 0.44424 0.016 0.000 0.584 0.184 0.216
#> SRR2105357 5 0.4235 0.49619 0.000 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105358 5 0.4235 0.49446 0.000 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105439 2 0.5513 0.30298 0.000 0.524 0.000 0.068 0.408
#> SRR2105440 2 0.5513 0.30345 0.000 0.524 0.000 0.068 0.408
#> SRR2105509 4 0.0451 0.79875 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR2105510 4 0.0290 0.79885 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105507 3 0.3215 0.61813 0.056 0.000 0.852 0.000 0.092
#> SRR2105508 3 0.1981 0.62268 0.016 0.000 0.920 0.000 0.064
#> SRR2105505 1 0.6351 0.23414 0.516 0.000 0.280 0.000 0.204
#> SRR2105506 1 0.3639 0.71048 0.792 0.000 0.184 0.000 0.024
#> SRR2105503 2 0.4355 0.58752 0.000 0.732 0.000 0.224 0.044
#> SRR2105504 4 0.2228 0.76757 0.000 0.000 0.048 0.912 0.040
#> SRR2105501 4 0.6190 0.00409 0.004 0.400 0.004 0.488 0.104
#> SRR2105502 4 0.1549 0.78543 0.000 0.000 0.016 0.944 0.040
#> SRR2105499 3 0.3787 0.53444 0.020 0.000 0.800 0.012 0.168
#> SRR2105500 3 0.4811 0.47990 0.084 0.000 0.744 0.012 0.160
#> SRR2105497 2 0.1918 0.79325 0.000 0.928 0.000 0.036 0.036
#> SRR2105498 2 0.1670 0.78243 0.012 0.936 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105495 2 0.6401 0.21797 0.000 0.448 0.000 0.172 0.380
#> SRR2105496 2 0.5965 0.27987 0.000 0.496 0.000 0.112 0.392
#> SRR2105493 5 0.6127 -0.11429 0.000 0.416 0.000 0.128 0.456
#> SRR2105494 2 0.5457 0.18854 0.000 0.480 0.000 0.060 0.460
#> SRR2105491 4 0.6585 0.28170 0.020 0.388 0.000 0.468 0.124
#> SRR2105492 2 0.6469 0.13279 0.020 0.516 0.000 0.344 0.120
#> SRR2105489 2 0.1043 0.78881 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105490 2 0.0609 0.79296 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105487 5 0.4390 0.50651 0.084 0.000 0.156 0.000 0.760
#> SRR2105488 5 0.5472 0.49324 0.208 0.000 0.140 0.000 0.652
#> SRR2105485 3 0.4862 0.04407 0.032 0.000 0.604 0.000 0.364
#> SRR2105486 3 0.4797 0.22974 0.044 0.000 0.660 0.000 0.296
#> SRR2105483 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.6420 -0.02045 0.448 0.000 0.376 0.000 0.176
#> SRR2105482 1 0.1965 0.81607 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR2105479 1 0.6794 -0.02017 0.432 0.000 0.320 0.004 0.244
#> SRR2105480 1 0.4835 0.62143 0.724 0.000 0.120 0.000 0.156
#> SRR2105477 5 0.6245 0.17981 0.000 0.220 0.000 0.236 0.544
#> SRR2105478 5 0.5883 0.00712 0.000 0.388 0.000 0.104 0.508
#> SRR2105475 4 0.0510 0.79627 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105476 4 0.0671 0.79654 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR2105473 2 0.5352 0.30440 0.000 0.536 0.000 0.056 0.408
#> SRR2105474 2 0.4310 0.34887 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR2105471 2 0.0703 0.79182 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105472 2 0.0794 0.79140 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105469 3 0.1012 0.61469 0.012 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR2105470 3 0.4054 0.51494 0.248 0.000 0.732 0.000 0.020
#> SRR2105467 5 0.4390 0.48916 0.004 0.000 0.428 0.000 0.568
#> SRR2105468 5 0.6294 0.43070 0.156 0.000 0.376 0.000 0.468
#> SRR2105465 1 0.0865 0.83160 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR2105466 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.2929 0.75023 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105462 2 0.2561 0.77508 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105459 4 0.0703 0.79863 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR2105460 4 0.0510 0.79854 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2105457 3 0.2648 0.53453 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105458 3 0.2971 0.53866 0.000 0.000 0.836 0.008 0.156
#> SRR2105455 3 0.4658 -0.04285 0.484 0.000 0.504 0.000 0.012
#> SRR2105456 1 0.4181 0.61563 0.712 0.000 0.268 0.000 0.020
#> SRR2105453 5 0.6510 0.41348 0.296 0.000 0.224 0.000 0.480
#> SRR2105454 5 0.6433 0.43759 0.268 0.000 0.228 0.000 0.504
#> SRR2105451 2 0.6816 0.23807 0.000 0.456 0.012 0.196 0.336
#> SRR2105452 4 0.2569 0.75515 0.000 0.000 0.068 0.892 0.040
#> SRR2105449 1 0.4069 0.72095 0.788 0.000 0.076 0.000 0.136
#> SRR2105450 1 0.1282 0.82989 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR2105447 4 0.1197 0.79778 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR2105448 4 0.1557 0.80258 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR2105445 5 0.4210 0.50329 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR2105446 5 0.4219 0.49861 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105443 4 0.5396 0.42048 0.000 0.000 0.072 0.588 0.340
#> SRR2105444 5 0.5297 0.32940 0.012 0.020 0.036 0.244 0.688
#> SRR2105441 2 0.2569 0.79194 0.000 0.892 0.000 0.068 0.040
#> SRR2105442 2 0.1197 0.78628 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105437 5 0.3289 0.40270 0.108 0.000 0.048 0.000 0.844
#> SRR2105438 5 0.3485 0.40229 0.124 0.000 0.048 0.000 0.828
#> SRR2105435 3 0.5823 0.53452 0.120 0.000 0.644 0.016 0.220
#> SRR2105436 3 0.3883 0.54179 0.036 0.000 0.780 0.000 0.184
#> SRR2105433 1 0.0162 0.83405 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105434 1 0.0162 0.83453 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105431 1 0.0880 0.83229 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105432 1 0.0609 0.83413 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105429 4 0.5066 0.70946 0.028 0.056 0.012 0.752 0.152
#> SRR2105430 4 0.3183 0.74329 0.000 0.016 0.000 0.828 0.156
#> SRR2105427 4 0.3561 0.60491 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR2105428 4 0.0510 0.79914 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2105425 4 0.3980 0.55777 0.000 0.284 0.000 0.708 0.008
#> SRR2105426 2 0.1041 0.79119 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105421 3 0.3215 0.60592 0.000 0.000 0.852 0.056 0.092
#> SRR2105422 3 0.3002 0.61054 0.000 0.000 0.856 0.028 0.116
#> SRR2105423 2 0.1608 0.80353 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105424 2 0.1478 0.80332 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105419 3 0.2648 0.53753 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105420 3 0.1851 0.61897 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105415 1 0.0162 0.83397 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.2540 0.81136 0.888 0.000 0.024 0.000 0.088
#> SRR2105418 1 0.0290 0.83441 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105413 4 0.0290 0.79769 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105414 4 0.0510 0.79627 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105409 2 0.1701 0.80494 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR2105410 2 0.2280 0.75528 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR2105411 2 0.2690 0.76622 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105412 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105407 3 0.3143 0.48115 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105408 3 0.3480 0.39211 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105403 5 0.4249 0.48017 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR2105404 5 0.4235 0.49088 0.000 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105405 1 0.3877 0.68368 0.764 0.000 0.212 0.000 0.024
#> SRR2105406 1 0.3264 0.73630 0.820 0.000 0.164 0.000 0.016
#> SRR2105401 4 0.0609 0.79592 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105402 4 0.2569 0.75515 0.000 0.000 0.068 0.892 0.040
#> SRR2105399 4 0.2504 0.75750 0.000 0.000 0.064 0.896 0.040
#> SRR2105400 4 0.2370 0.76349 0.000 0.000 0.056 0.904 0.040
#> SRR2105397 5 0.5749 -0.05537 0.008 0.004 0.060 0.376 0.552
#> SRR2105398 5 0.5806 -0.24302 0.008 0.000 0.068 0.448 0.476
#> SRR2105395 2 0.1121 0.78761 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105396 2 0.0609 0.79272 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105393 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105394 2 0.1106 0.79607 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105389 3 0.2377 0.61549 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105390 3 0.2074 0.62017 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105391 3 0.1121 0.60209 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105392 3 0.1341 0.59708 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105385 3 0.3760 0.56970 0.188 0.000 0.784 0.000 0.028
#> SRR2105386 3 0.2770 0.59978 0.076 0.000 0.880 0.000 0.044
#> SRR2105387 1 0.4406 0.74377 0.764 0.000 0.128 0.000 0.108
#> SRR2105388 1 0.5008 0.68256 0.708 0.000 0.152 0.000 0.140
#> SRR2105381 4 0.1682 0.79475 0.000 0.012 0.004 0.940 0.044
#> SRR2105382 4 0.3176 0.77228 0.000 0.064 0.000 0.856 0.080
#> SRR2105383 2 0.2818 0.77921 0.012 0.856 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105384 2 0.2912 0.79444 0.028 0.876 0.000 0.088 0.008
#> SRR2105379 4 0.4535 0.71394 0.000 0.160 0.000 0.748 0.092
#> SRR2105380 4 0.7773 0.17926 0.108 0.368 0.000 0.384 0.140
#> SRR2105377 2 0.4768 0.50871 0.000 0.656 0.000 0.040 0.304
#> SRR2105378 2 0.3942 0.57924 0.000 0.728 0.000 0.012 0.260
#> SRR2105375 1 0.5336 0.62557 0.648 0.000 0.100 0.000 0.252
#> SRR2105376 1 0.4869 0.69718 0.712 0.000 0.096 0.000 0.192
#> SRR2105373 5 0.4497 0.25097 0.008 0.000 0.424 0.000 0.568
#> SRR2105374 5 0.4926 0.37767 0.152 0.000 0.132 0.000 0.716
#> SRR2105371 3 0.1478 0.62096 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105372 3 0.0794 0.61759 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105369 3 0.3203 0.52509 0.012 0.000 0.820 0.000 0.168
#> SRR2105370 3 0.4914 0.44901 0.108 0.000 0.712 0.000 0.180
#> SRR2105367 1 0.4318 0.57902 0.688 0.000 0.020 0.000 0.292
#> SRR2105368 1 0.1851 0.79626 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105365 4 0.5857 0.61512 0.024 0.240 0.000 0.640 0.096
#> SRR2105366 2 0.6439 -0.12353 0.020 0.452 0.000 0.424 0.104
#> SRR2105363 2 0.3816 0.60180 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105364 2 0.1792 0.80066 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105361 2 0.1965 0.79963 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR2105362 2 0.1671 0.80426 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105359 3 0.1608 0.61826 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105360 3 0.2583 0.61856 0.004 0.000 0.864 0.000 0.132
#> SRR2105355 3 0.1725 0.62164 0.044 0.000 0.936 0.000 0.020
#> SRR2105356 3 0.4356 0.39260 0.340 0.000 0.648 0.000 0.012
#> SRR2105353 3 0.3318 0.59510 0.000 0.000 0.800 0.008 0.192
#> SRR2105354 3 0.3700 0.57296 0.008 0.000 0.752 0.000 0.240
#> SRR2105351 4 0.4430 0.44474 0.000 0.360 0.000 0.628 0.012
#> SRR2105352 4 0.2569 0.75515 0.000 0.000 0.068 0.892 0.040
#> SRR2105349 4 0.1469 0.79957 0.000 0.016 0.000 0.948 0.036
#> SRR2105350 4 0.3928 0.51555 0.000 0.296 0.000 0.700 0.004
#> SRR2105345 2 0.1981 0.80174 0.000 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR2105346 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105347 2 0.1872 0.77636 0.052 0.928 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105348 2 0.2367 0.76495 0.072 0.904 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105343 4 0.4182 0.23343 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR2105344 2 0.1792 0.80241 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105341 3 0.1410 0.59852 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105342 3 0.0510 0.61148 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105339 3 0.2536 0.61257 0.004 0.000 0.868 0.000 0.128
#> SRR2105340 3 0.4474 0.52498 0.012 0.000 0.652 0.004 0.332
#> SRR2105335 5 0.5019 0.23077 0.032 0.000 0.436 0.000 0.532
#> SRR2105336 1 0.6172 0.30388 0.500 0.000 0.144 0.000 0.356
#> SRR2105337 1 0.4972 0.46302 0.620 0.000 0.336 0.000 0.044
#> SRR2105338 1 0.0865 0.83509 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105331 4 0.3710 0.75498 0.000 0.144 0.000 0.808 0.048
#> SRR2105332 2 0.3325 0.74754 0.008 0.856 0.000 0.080 0.056
#> SRR2105333 4 0.1018 0.80052 0.000 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR2105334 4 0.3076 0.78438 0.008 0.088 0.000 0.868 0.036
#> SRR2105329 4 0.6561 -0.21068 0.000 0.000 0.204 0.424 0.372
#> SRR2105330 4 0.6648 0.20606 0.000 0.028 0.140 0.536 0.296
#> SRR2105327 4 0.3565 0.74160 0.000 0.176 0.000 0.800 0.024
#> SRR2105328 4 0.3734 0.74125 0.000 0.168 0.000 0.796 0.036
#> SRR2105325 3 0.6403 0.47048 0.128 0.000 0.552 0.020 0.300
#> SRR2105326 3 0.6382 0.47075 0.124 0.000 0.552 0.020 0.304
#> SRR2105323 3 0.4655 0.20941 0.000 0.000 0.644 0.028 0.328
#> SRR2105324 3 0.3745 0.47812 0.024 0.000 0.780 0.000 0.196
#> SRR2105319 5 0.6702 -0.13199 0.344 0.000 0.248 0.000 0.408
#> SRR2105320 1 0.4612 0.68865 0.712 0.000 0.056 0.000 0.232
#> SRR2105321 3 0.5659 0.48531 0.080 0.000 0.572 0.004 0.344
#> SRR2105322 3 0.5975 0.47987 0.092 0.000 0.564 0.012 0.332
#> SRR2105317 4 0.0404 0.79867 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR2105318 4 0.1908 0.77764 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR2105315 3 0.6264 0.12014 0.000 0.000 0.452 0.400 0.148
#> SRR2105316 4 0.1478 0.79103 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR2105313 4 0.2249 0.78044 0.000 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR2105314 2 0.4150 0.41925 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR2105311 3 0.8287 0.29393 0.156 0.000 0.372 0.200 0.272
#> SRR2105312 3 0.8330 0.27800 0.156 0.000 0.360 0.212 0.272
#> SRR2105307 1 0.3456 0.71801 0.800 0.000 0.184 0.000 0.016
#> SRR2105308 1 0.3098 0.74865 0.836 0.000 0.148 0.000 0.016
#> SRR2105309 3 0.2648 0.53303 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105310 3 0.2891 0.51836 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105305 3 0.1270 0.59907 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105306 3 0.0510 0.61770 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105303 2 0.1357 0.80593 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR2105304 4 0.1469 0.78647 0.000 0.000 0.016 0.948 0.036
#> SRR2105301 4 0.2344 0.79494 0.000 0.064 0.000 0.904 0.032
#> SRR2105302 4 0.2233 0.78237 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004
#> SRR2105299 5 0.4639 0.51762 0.000 0.000 0.368 0.020 0.612
#> SRR2105300 5 0.5970 0.49583 0.000 0.000 0.228 0.184 0.588
#> SRR2105297 1 0.5119 0.38083 0.592 0.360 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105298 1 0.5151 0.30878 0.560 0.396 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105295 4 0.0510 0.79919 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2105296 4 0.3123 0.75503 0.000 0.160 0.000 0.828 0.012
#> SRR2105293 3 0.6982 0.44713 0.132 0.000 0.516 0.052 0.300
#> SRR2105294 3 0.6759 0.19143 0.348 0.000 0.384 0.000 0.268
#> SRR2105291 1 0.5598 0.53799 0.632 0.008 0.268 0.000 0.092
#> SRR2105292 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.3985 0.61136 0.036 0.000 0.812 0.024 0.128
#> SRR2105290 1 0.1399 0.83265 0.952 0.000 0.028 0.000 0.020
#> SRR2105287 1 0.3317 0.77491 0.840 0.000 0.116 0.000 0.044
#> SRR2105288 1 0.1281 0.82777 0.956 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR2105285 4 0.0609 0.80053 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR2105286 4 0.0880 0.80060 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105283 5 0.6118 -0.07533 0.072 0.452 0.000 0.020 0.456
#> SRR2105284 5 0.5236 -0.14069 0.000 0.464 0.000 0.044 0.492
#> SRR2105281 2 0.3003 0.74013 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105282 2 0.2966 0.74222 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105259 3 0.3242 0.45330 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105260 3 0.3242 0.45330 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105279 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105280 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105257 1 0.3229 0.77147 0.840 0.000 0.032 0.000 0.128
#> SRR2105258 1 0.0955 0.83361 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105253 4 0.2605 0.73623 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR2105254 2 0.4549 0.18832 0.000 0.528 0.000 0.464 0.008
#> SRR2105255 3 0.3724 0.47413 0.020 0.000 0.776 0.000 0.204
#> SRR2105256 3 0.4918 0.42371 0.100 0.000 0.708 0.000 0.192
#> SRR2105251 2 0.2850 0.75175 0.000 0.872 0.000 0.092 0.036
#> SRR2105252 2 0.4477 0.53259 0.000 0.708 0.000 0.252 0.040
#> SRR2105249 2 0.4237 0.70544 0.000 0.772 0.000 0.076 0.152
#> SRR2105250 2 0.4930 0.59549 0.000 0.684 0.000 0.072 0.244
#> SRR2105247 2 0.1012 0.79996 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105248 2 0.1041 0.79129 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105245 3 0.7643 0.36317 0.060 0.016 0.444 0.132 0.348
#> SRR2105246 3 0.9027 0.23251 0.084 0.092 0.336 0.160 0.328
#> SRR2105243 3 0.4787 0.32841 0.364 0.000 0.608 0.000 0.028
#> SRR2105244 3 0.6100 0.40466 0.308 0.000 0.540 0.000 0.152
#> SRR2105241 1 0.3141 0.79085 0.852 0.000 0.108 0.000 0.040
#> SRR2105242 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.6000 0.47036 0.572 0.000 0.268 0.000 0.160
#> SRR2105240 1 0.1965 0.82472 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR2105237 4 0.1661 0.79217 0.000 0.036 0.000 0.940 0.024
#> SRR2105238 4 0.5019 0.12324 0.000 0.024 0.004 0.536 0.436
#> SRR2105235 2 0.5490 0.59820 0.000 0.652 0.000 0.148 0.200
#> SRR2105236 2 0.2597 0.79296 0.000 0.884 0.000 0.092 0.024
#> SRR2105233 4 0.0290 0.79885 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105234 4 0.0290 0.79885 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105231 2 0.1211 0.79760 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105232 2 0.1364 0.79092 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR2105227 3 0.6449 0.47814 0.184 0.000 0.568 0.016 0.232
#> SRR2105228 1 0.4807 0.74762 0.752 0.004 0.092 0.008 0.144
#> SRR2105225 3 0.5798 0.32538 0.336 0.000 0.556 0.000 0.108
#> SRR2105226 1 0.4104 0.76319 0.788 0.000 0.088 0.000 0.124
#> SRR2105229 3 0.4657 0.55749 0.000 0.000 0.668 0.036 0.296
#> SRR2105230 3 0.4047 0.54846 0.004 0.000 0.676 0.000 0.320
#> SRR2105219 4 0.1341 0.79685 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR2105220 4 0.4731 0.04627 0.000 0.456 0.000 0.528 0.016
#> SRR2105221 2 0.4549 0.23308 0.000 0.528 0.000 0.008 0.464
#> SRR2105222 2 0.4256 0.28685 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR2105223 3 0.2376 0.60147 0.044 0.000 0.904 0.000 0.052
#> SRR2105224 3 0.5220 0.06794 0.440 0.000 0.516 0.000 0.044
#> SRR2105217 2 0.3413 0.71059 0.000 0.832 0.000 0.124 0.044
#> SRR2105218 2 0.0880 0.79059 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105215 2 0.1341 0.80388 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105216 2 0.1544 0.80498 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105213 3 0.7720 0.30545 0.244 0.004 0.392 0.048 0.312
#> SRR2105214 3 0.8012 0.34038 0.060 0.028 0.420 0.156 0.336
#> SRR2105211 3 0.1908 0.59075 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105212 3 0.3359 0.53104 0.020 0.000 0.816 0.000 0.164
#> SRR2105209 1 0.5602 0.51885 0.640 0.000 0.164 0.000 0.196
#> SRR2105210 1 0.0162 0.83449 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105207 1 0.2674 0.80255 0.856 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR2105208 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.3733 0.76101 0.016 0.080 0.000 0.836 0.068
#> SRR2105206 4 0.4671 0.73583 0.028 0.104 0.000 0.776 0.092
#> SRR2105201 2 0.5562 0.29845 0.000 0.520 0.000 0.072 0.408
#> SRR2105202 2 0.5562 0.29951 0.000 0.520 0.000 0.072 0.408
#> SRR2105203 2 0.4278 0.23520 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR2105204 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105199 2 0.2424 0.78358 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105200 2 0.0912 0.79736 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105197 5 0.3969 0.44341 0.004 0.000 0.304 0.000 0.692
#> SRR2105198 5 0.3764 0.49642 0.008 0.000 0.212 0.008 0.772
#> SRR2105195 1 0.5551 0.62678 0.700 0.000 0.160 0.032 0.108
#> SRR2105196 1 0.1197 0.82350 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105193 1 0.0290 0.83394 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105194 1 0.0510 0.83347 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105191 5 0.4310 0.51002 0.004 0.000 0.392 0.000 0.604
#> SRR2105192 5 0.5747 0.48337 0.212 0.000 0.168 0.000 0.620
#> SRR2105189 4 0.0807 0.80033 0.000 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR2105190 4 0.1544 0.79284 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR2105187 4 0.6780 0.24634 0.012 0.152 0.004 0.420 0.412
#> SRR2105188 5 0.4499 0.05716 0.000 0.408 0.004 0.004 0.584
#> SRR2105179 1 0.2645 0.80436 0.888 0.000 0.068 0.000 0.044
#> SRR2105180 1 0.3048 0.69704 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR2105183 2 0.1478 0.80320 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105184 2 0.0703 0.79182 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105185 2 0.3325 0.75614 0.000 0.856 0.008 0.080 0.056
#> SRR2105186 2 0.2144 0.77830 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR2105181 5 0.4182 0.47203 0.000 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105182 3 0.3837 0.43493 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105177 1 0.0162 0.83405 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.3177 0.72426 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105172 2 0.1608 0.80214 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105175 1 0.0290 0.83367 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105176 1 0.0162 0.83405 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.5238 -0.06721 0.000 0.480 0.000 0.476 0.044
#> SRR2105174 2 0.2270 0.80306 0.000 0.904 0.000 0.076 0.020
#> SRR2105169 2 0.1484 0.78746 0.000 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR2105170 2 0.1270 0.78503 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105167 2 0.1478 0.80320 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105168 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105165 3 0.5790 0.50171 0.200 0.000 0.616 0.000 0.184
#> SRR2105166 3 0.5950 0.48724 0.220 0.000 0.592 0.000 0.188
#> SRR2105163 3 0.6742 0.46221 0.164 0.000 0.548 0.032 0.256
#> SRR2105164 3 0.6707 0.46278 0.148 0.000 0.544 0.032 0.276
#> SRR2105161 1 0.0693 0.83284 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105162 1 0.0162 0.83434 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.1478 0.80320 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105156 2 0.1704 0.80341 0.000 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105157 2 0.2790 0.76000 0.000 0.880 0.000 0.068 0.052
#> SRR2105158 2 0.3400 0.73767 0.004 0.848 0.000 0.072 0.076
#> SRR2105159 1 0.6738 -0.15765 0.380 0.000 0.364 0.000 0.256
#> SRR2105160 1 0.2411 0.80481 0.884 0.000 0.008 0.000 0.108
#> SRR2105153 2 0.5519 0.06564 0.000 0.520 0.000 0.412 0.068
#> SRR2105154 2 0.5252 0.39461 0.000 0.632 0.000 0.292 0.076
#> SRR2105151 2 0.1608 0.80214 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105152 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105149 4 0.7116 -0.08706 0.036 0.000 0.392 0.412 0.160
#> SRR2105150 3 0.6144 0.26575 0.000 0.000 0.512 0.344 0.144
#> SRR2105147 4 0.5722 0.48550 0.008 0.000 0.088 0.600 0.304
#> SRR2105148 4 0.5722 0.48550 0.008 0.000 0.088 0.600 0.304
#> SRR2105143 1 0.3600 0.79894 0.836 0.004 0.028 0.012 0.120
#> SRR2105144 1 0.3586 0.78984 0.848 0.048 0.024 0.000 0.080
#> SRR2105145 1 0.0992 0.83044 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105146 1 0.0898 0.83169 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR2105141 4 0.3449 0.76410 0.012 0.068 0.000 0.852 0.068
#> SRR2105142 4 0.3272 0.76929 0.008 0.072 0.000 0.860 0.060
#> SRR2105139 2 0.2233 0.80566 0.000 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR2105140 2 0.0798 0.79823 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105137 2 0.5623 0.34210 0.004 0.540 0.000 0.068 0.388
#> SRR2105138 2 0.4510 0.28539 0.008 0.560 0.000 0.000 0.432
#> SRR2105135 2 0.1544 0.80250 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105136 2 0.1410 0.80373 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105133 5 0.4060 0.52080 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105134 5 0.4251 0.51898 0.004 0.000 0.372 0.000 0.624
#> SRR2105131 5 0.7180 0.48135 0.000 0.104 0.132 0.208 0.556
#> SRR2105132 5 0.7622 0.53303 0.104 0.112 0.168 0.040 0.576
#> SRR2105129 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.83412 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 5 0.7107 0.39586 0.316 0.020 0.232 0.000 0.432
#> SRR2105128 5 0.7950 0.39722 0.288 0.012 0.252 0.052 0.396
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.3360 0.52614 0.000 0.000 0.004 0.264 0.732 0.000
#> SRR2105278 5 0.3512 0.51715 0.000 0.000 0.008 0.272 0.720 0.000
#> SRR2105275 3 0.0520 0.66753 0.008 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105276 3 0.0603 0.66972 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105273 5 0.4510 0.24585 0.020 0.000 0.416 0.008 0.556 0.000
#> SRR2105274 5 0.6031 0.07071 0.344 0.000 0.252 0.000 0.404 0.000
#> SRR2105271 5 0.5130 0.38524 0.100 0.000 0.296 0.004 0.600 0.000
#> SRR2105272 1 0.2664 0.75492 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.1644 0.79768 0.000 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR2105270 2 0.4423 0.28353 0.000 0.552 0.000 0.420 0.000 0.028
#> SRR2105267 2 0.3210 0.73026 0.000 0.812 0.000 0.152 0.000 0.036
#> SRR2105268 6 0.6012 0.31709 0.000 0.364 0.000 0.240 0.000 0.396
#> SRR2105265 6 0.3934 0.66966 0.000 0.008 0.000 0.376 0.000 0.616
#> SRR2105266 6 0.3769 0.68389 0.000 0.004 0.000 0.356 0.000 0.640
#> SRR2105263 6 0.3263 0.49771 0.000 0.116 0.040 0.012 0.000 0.832
#> SRR2105264 6 0.1341 0.60652 0.000 0.000 0.028 0.024 0.000 0.948
#> SRR2105261 2 0.5421 0.21546 0.000 0.544 0.352 0.012 0.092 0.000
#> SRR2105262 3 0.5280 0.48141 0.016 0.116 0.664 0.008 0.196 0.000
#> SRR2105357 5 0.3973 0.49696 0.000 0.012 0.008 0.296 0.684 0.000
#> SRR2105358 5 0.3421 0.52671 0.000 0.008 0.000 0.256 0.736 0.000
#> SRR2105439 4 0.1075 0.65610 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105440 4 0.1141 0.65425 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105509 2 0.0632 0.80311 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105510 2 0.0713 0.80307 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105507 5 0.4599 0.21918 0.024 0.000 0.428 0.008 0.540 0.000
#> SRR2105508 5 0.3984 0.30892 0.000 0.000 0.396 0.008 0.596 0.000
#> SRR2105505 5 0.5016 0.11557 0.392 0.000 0.000 0.076 0.532 0.000
#> SRR2105506 1 0.3545 0.67281 0.748 0.000 0.008 0.008 0.236 0.000
#> SRR2105503 6 0.2625 0.65308 0.000 0.056 0.000 0.072 0.000 0.872
#> SRR2105504 2 0.0881 0.79758 0.000 0.972 0.012 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105501 4 0.5560 0.15524 0.000 0.400 0.004 0.488 0.004 0.104
#> SRR2105502 2 0.0508 0.79966 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.2359 0.61553 0.004 0.024 0.052 0.016 0.904 0.000
#> SRR2105500 5 0.1895 0.61940 0.024 0.012 0.020 0.012 0.932 0.000
#> SRR2105497 6 0.2845 0.69956 0.000 0.008 0.008 0.148 0.000 0.836
#> SRR2105498 6 0.1152 0.64825 0.000 0.004 0.000 0.044 0.000 0.952
#> SRR2105495 4 0.3068 0.63744 0.000 0.088 0.000 0.840 0.000 0.072
#> SRR2105496 4 0.1713 0.65497 0.000 0.028 0.000 0.928 0.000 0.044
#> SRR2105493 4 0.2534 0.66281 0.000 0.032 0.012 0.896 0.008 0.052
#> SRR2105494 4 0.1082 0.66023 0.000 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105491 6 0.4066 0.36246 0.000 0.064 0.204 0.000 0.000 0.732
#> SRR2105492 6 0.3620 0.41312 0.000 0.044 0.184 0.000 0.000 0.772
#> SRR2105489 6 0.0937 0.65434 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105490 6 0.3151 0.69979 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR2105487 5 0.6443 0.17339 0.024 0.000 0.216 0.356 0.404 0.000
#> SRR2105488 5 0.7017 0.12661 0.164 0.000 0.096 0.368 0.372 0.000
#> SRR2105485 5 0.1194 0.61562 0.000 0.008 0.004 0.032 0.956 0.000
#> SRR2105486 5 0.1149 0.61622 0.000 0.008 0.008 0.024 0.960 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.5050 0.38260 0.348 0.000 0.572 0.004 0.076 0.000
#> SRR2105482 1 0.2573 0.78919 0.864 0.000 0.112 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105479 3 0.3109 0.62994 0.224 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105480 3 0.3993 0.12700 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105477 4 0.5792 0.44757 0.000 0.064 0.036 0.532 0.008 0.360
#> SRR2105478 4 0.4915 0.43574 0.000 0.020 0.016 0.540 0.008 0.416
#> SRR2105475 2 0.0458 0.80272 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105476 2 0.0405 0.80232 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105473 4 0.1327 0.65812 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105474 4 0.2219 0.64116 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105471 6 0.2003 0.68773 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR2105472 6 0.1910 0.68591 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR2105469 5 0.4146 0.45072 0.012 0.004 0.304 0.008 0.672 0.000
#> SRR2105470 5 0.5606 0.35865 0.192 0.000 0.220 0.008 0.580 0.000
#> SRR2105467 5 0.3213 0.55578 0.000 0.008 0.004 0.204 0.784 0.000
#> SRR2105468 5 0.4958 0.49807 0.108 0.000 0.008 0.224 0.660 0.000
#> SRR2105465 1 0.0951 0.81911 0.968 0.000 0.008 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 6 0.4913 0.66728 0.000 0.092 0.000 0.296 0.000 0.612
#> SRR2105462 6 0.4210 0.68923 0.000 0.028 0.000 0.336 0.000 0.636
#> SRR2105459 2 0.1444 0.79706 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0937 0.80257 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105457 5 0.2164 0.61297 0.000 0.012 0.060 0.020 0.908 0.000
#> SRR2105458 5 0.2487 0.60982 0.000 0.024 0.064 0.020 0.892 0.000
#> SRR2105455 1 0.5968 -0.00431 0.432 0.004 0.132 0.012 0.420 0.000
#> SRR2105456 1 0.4518 0.48298 0.624 0.000 0.032 0.008 0.336 0.000
#> SRR2105453 5 0.6258 0.25139 0.268 0.000 0.008 0.316 0.408 0.000
#> SRR2105454 5 0.6206 0.28784 0.256 0.000 0.008 0.304 0.432 0.000
#> SRR2105451 4 0.3543 0.63640 0.000 0.084 0.020 0.836 0.012 0.048
#> SRR2105452 2 0.1251 0.79370 0.000 0.956 0.012 0.008 0.024 0.000
#> SRR2105449 1 0.3601 0.51193 0.684 0.000 0.312 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105450 1 0.1564 0.81042 0.936 0.000 0.040 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105447 2 0.2302 0.77515 0.000 0.872 0.008 0.120 0.000 0.000
#> SRR2105448 2 0.2673 0.79594 0.000 0.880 0.012 0.064 0.000 0.044
#> SRR2105445 4 0.4403 -0.21927 0.000 0.008 0.012 0.520 0.460 0.000
#> SRR2105446 5 0.4086 0.27217 0.000 0.008 0.000 0.464 0.528 0.000
#> SRR2105443 2 0.5501 0.49955 0.000 0.632 0.120 0.216 0.032 0.000
#> SRR2105444 4 0.6706 0.26787 0.000 0.160 0.244 0.528 0.044 0.024
#> SRR2105441 4 0.3409 0.14737 0.000 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105442 6 0.3330 0.60274 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR2105437 3 0.6868 0.17129 0.064 0.000 0.436 0.240 0.260 0.000
#> SRR2105438 3 0.7017 0.20071 0.084 0.000 0.432 0.240 0.244 0.000
#> SRR2105435 5 0.5629 0.42808 0.104 0.024 0.204 0.020 0.648 0.000
#> SRR2105436 5 0.2220 0.61181 0.016 0.004 0.060 0.012 0.908 0.000
#> SRR2105433 1 0.0146 0.81781 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0260 0.81887 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0937 0.81410 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0937 0.81506 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.5071 0.64543 0.016 0.692 0.196 0.016 0.000 0.080
#> SRR2105430 2 0.3876 0.72552 0.000 0.772 0.108 0.000 0.000 0.120
#> SRR2105427 2 0.4234 0.49950 0.000 0.644 0.000 0.324 0.000 0.032
#> SRR2105428 2 0.1814 0.78757 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR2105425 2 0.5629 0.43674 0.000 0.560 0.012 0.136 0.000 0.292
#> SRR2105426 6 0.2714 0.68374 0.000 0.004 0.012 0.136 0.000 0.848
#> SRR2105421 3 0.5483 -0.03590 0.000 0.096 0.464 0.008 0.432 0.000
#> SRR2105422 3 0.5016 -0.04442 0.000 0.044 0.488 0.012 0.456 0.000
#> SRR2105423 6 0.3288 0.70706 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR2105424 6 0.3634 0.68666 0.000 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105419 5 0.2149 0.60349 0.000 0.004 0.104 0.004 0.888 0.000
#> SRR2105420 5 0.3804 0.40756 0.000 0.000 0.336 0.008 0.656 0.000
#> SRR2105415 1 0.0146 0.81831 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.2575 0.79142 0.872 0.000 0.100 0.004 0.024 0.000
#> SRR2105418 1 0.0260 0.81854 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0547 0.80286 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105414 2 0.0260 0.80151 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105409 6 0.4262 0.35240 0.000 0.016 0.000 0.476 0.000 0.508
#> SRR2105410 4 0.3864 0.13507 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105411 6 0.4062 0.69824 0.000 0.024 0.000 0.316 0.000 0.660
#> SRR2105412 6 0.3706 0.67008 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105407 5 0.1760 0.61719 0.000 0.004 0.048 0.020 0.928 0.000
#> SRR2105408 5 0.1767 0.61733 0.000 0.012 0.036 0.020 0.932 0.000
#> SRR2105403 5 0.2994 0.55378 0.000 0.004 0.000 0.208 0.788 0.000
#> SRR2105404 5 0.3101 0.53365 0.000 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR2105405 1 0.4130 0.61705 0.700 0.000 0.028 0.008 0.264 0.000
#> SRR2105406 1 0.3262 0.71067 0.788 0.000 0.008 0.008 0.196 0.000
#> SRR2105401 2 0.0363 0.80002 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105402 2 0.1251 0.79370 0.000 0.956 0.012 0.008 0.024 0.000
#> SRR2105399 2 0.0951 0.79549 0.000 0.968 0.004 0.008 0.020 0.000
#> SRR2105400 2 0.0767 0.79729 0.000 0.976 0.004 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105397 3 0.5610 0.33379 0.000 0.236 0.564 0.196 0.004 0.000
#> SRR2105398 3 0.5228 0.28070 0.000 0.312 0.580 0.104 0.004 0.000
#> SRR2105395 6 0.2243 0.68518 0.000 0.004 0.004 0.112 0.000 0.880
#> SRR2105396 6 0.3221 0.69961 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105393 6 0.3578 0.69274 0.000 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105394 6 0.2491 0.70309 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR2105389 3 0.4195 0.04847 0.000 0.004 0.548 0.008 0.440 0.000
#> SRR2105390 5 0.3930 0.26220 0.000 0.000 0.420 0.004 0.576 0.000
#> SRR2105391 5 0.3691 0.49484 0.000 0.008 0.260 0.008 0.724 0.000
#> SRR2105392 5 0.3704 0.52014 0.000 0.008 0.232 0.016 0.744 0.000
#> SRR2105385 5 0.5103 0.43306 0.108 0.004 0.244 0.004 0.640 0.000
#> SRR2105386 5 0.4013 0.51827 0.040 0.000 0.212 0.008 0.740 0.000
#> SRR2105387 1 0.4381 0.71702 0.732 0.000 0.128 0.004 0.136 0.000
#> SRR2105388 1 0.4930 0.66859 0.676 0.000 0.136 0.008 0.180 0.000
#> SRR2105381 2 0.1780 0.80503 0.000 0.932 0.028 0.028 0.000 0.012
#> SRR2105382 2 0.3374 0.72063 0.000 0.772 0.020 0.000 0.000 0.208
#> SRR2105383 6 0.4921 0.66571 0.008 0.064 0.000 0.320 0.000 0.608
#> SRR2105384 6 0.5012 0.66624 0.032 0.040 0.000 0.308 0.000 0.620
#> SRR2105379 2 0.5384 0.50312 0.000 0.532 0.084 0.012 0.000 0.372
#> SRR2105380 6 0.5851 0.27586 0.060 0.124 0.180 0.004 0.000 0.632
#> SRR2105377 4 0.2001 0.63958 0.000 0.000 0.004 0.900 0.004 0.092
#> SRR2105378 4 0.2340 0.58878 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105375 1 0.6206 0.53545 0.564 0.000 0.184 0.040 0.208 0.004
#> SRR2105376 1 0.5516 0.61298 0.628 0.000 0.192 0.024 0.156 0.000
#> SRR2105373 5 0.6281 0.09470 0.012 0.000 0.376 0.228 0.384 0.000
#> SRR2105374 3 0.7184 0.19704 0.104 0.000 0.412 0.248 0.236 0.000
#> SRR2105371 5 0.3955 0.34669 0.000 0.000 0.384 0.008 0.608 0.000
#> SRR2105372 5 0.3804 0.41998 0.000 0.000 0.336 0.008 0.656 0.000
#> SRR2105369 5 0.1584 0.61850 0.000 0.000 0.064 0.008 0.928 0.000
#> SRR2105370 5 0.1346 0.61855 0.016 0.000 0.024 0.008 0.952 0.000
#> SRR2105367 1 0.5759 0.59377 0.648 0.000 0.096 0.120 0.136 0.000
#> SRR2105368 1 0.2240 0.79631 0.908 0.000 0.016 0.044 0.032 0.000
#> SRR2105365 6 0.4683 0.05071 0.000 0.320 0.064 0.000 0.000 0.616
#> SRR2105366 6 0.2875 0.51450 0.000 0.096 0.052 0.000 0.000 0.852
#> SRR2105363 4 0.6024 -0.25039 0.000 0.248 0.000 0.404 0.000 0.348
#> SRR2105364 6 0.4057 0.66157 0.000 0.012 0.000 0.388 0.000 0.600
#> SRR2105361 6 0.4353 0.65317 0.000 0.020 0.004 0.388 0.000 0.588
#> SRR2105362 6 0.4100 0.66121 0.000 0.008 0.004 0.388 0.000 0.600
#> SRR2105359 5 0.4045 0.42603 0.000 0.008 0.336 0.008 0.648 0.000
#> SRR2105360 5 0.4225 0.15116 0.004 0.000 0.480 0.008 0.508 0.000
#> SRR2105355 5 0.4826 0.40426 0.048 0.004 0.316 0.008 0.624 0.000
#> SRR2105356 5 0.6080 0.20411 0.340 0.000 0.204 0.008 0.448 0.000
#> SRR2105353 3 0.2871 0.53777 0.000 0.000 0.804 0.004 0.192 0.000
#> SRR2105354 3 0.2668 0.56800 0.000 0.000 0.828 0.004 0.168 0.000
#> SRR2105351 6 0.5930 0.30723 0.000 0.324 0.008 0.180 0.000 0.488
#> SRR2105352 2 0.1251 0.79370 0.000 0.956 0.012 0.008 0.024 0.000
#> SRR2105349 2 0.1524 0.80128 0.000 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR2105350 2 0.5249 0.43554 0.000 0.600 0.000 0.156 0.000 0.244
#> SRR2105345 4 0.3390 0.15491 0.000 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105346 6 0.3869 0.50390 0.000 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105347 6 0.4775 0.51928 0.064 0.000 0.000 0.348 0.000 0.588
#> SRR2105348 6 0.5042 0.56853 0.100 0.000 0.000 0.308 0.000 0.592
#> SRR2105343 6 0.4778 0.29135 0.000 0.424 0.000 0.052 0.000 0.524
#> SRR2105344 6 0.3699 0.69448 0.000 0.004 0.000 0.336 0.000 0.660
#> SRR2105341 5 0.3947 0.50118 0.000 0.012 0.256 0.016 0.716 0.000
#> SRR2105342 5 0.3555 0.47634 0.000 0.000 0.280 0.008 0.712 0.000
#> SRR2105339 3 0.3878 0.33504 0.000 0.004 0.668 0.008 0.320 0.000
#> SRR2105340 3 0.1285 0.65089 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR2105335 5 0.5208 0.46037 0.020 0.000 0.156 0.160 0.664 0.000
#> SRR2105336 1 0.6990 0.16440 0.400 0.000 0.168 0.092 0.340 0.000
#> SRR2105337 1 0.5434 0.41025 0.564 0.000 0.132 0.004 0.300 0.000
#> SRR2105338 1 0.0717 0.81722 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105331 2 0.4593 0.49190 0.000 0.556 0.012 0.020 0.000 0.412
#> SRR2105332 6 0.1382 0.60997 0.000 0.036 0.008 0.008 0.000 0.948
#> SRR2105333 2 0.0993 0.80602 0.000 0.964 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR2105334 2 0.3837 0.72522 0.000 0.752 0.000 0.052 0.000 0.196
#> SRR2105329 2 0.5757 0.27762 0.000 0.528 0.004 0.276 0.192 0.000
#> SRR2105330 2 0.5446 0.03934 0.000 0.472 0.000 0.428 0.092 0.008
#> SRR2105327 2 0.3695 0.72571 0.000 0.776 0.004 0.044 0.000 0.176
#> SRR2105328 2 0.4020 0.71874 0.000 0.760 0.028 0.028 0.000 0.184
#> SRR2105325 3 0.2170 0.67893 0.100 0.000 0.888 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105326 3 0.2019 0.68004 0.088 0.000 0.900 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105323 5 0.1909 0.60485 0.000 0.052 0.004 0.024 0.920 0.000
#> SRR2105324 5 0.1026 0.61937 0.004 0.012 0.008 0.008 0.968 0.000
#> SRR2105319 3 0.5261 0.51023 0.148 0.000 0.684 0.048 0.120 0.000
#> SRR2105320 1 0.4446 0.31955 0.532 0.000 0.444 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105321 3 0.0622 0.66873 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105322 3 0.0891 0.67235 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105317 2 0.0865 0.80267 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105318 2 0.1863 0.79727 0.000 0.920 0.000 0.036 0.000 0.044
#> SRR2105315 2 0.5310 0.00765 0.000 0.472 0.032 0.040 0.456 0.000
#> SRR2105316 2 0.1563 0.79923 0.000 0.932 0.000 0.056 0.000 0.012
#> SRR2105313 2 0.2680 0.77847 0.000 0.868 0.000 0.076 0.000 0.056
#> SRR2105314 6 0.5935 0.41453 0.000 0.300 0.000 0.244 0.000 0.456
#> SRR2105311 3 0.2592 0.67636 0.116 0.016 0.864 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105312 3 0.2389 0.67411 0.128 0.008 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.3381 0.69655 0.772 0.000 0.008 0.008 0.212 0.000
#> SRR2105308 1 0.3065 0.73313 0.812 0.000 0.008 0.008 0.172 0.000
#> SRR2105309 5 0.2195 0.61142 0.000 0.012 0.068 0.016 0.904 0.000
#> SRR2105310 5 0.1555 0.61842 0.000 0.008 0.040 0.012 0.940 0.000
#> SRR2105305 5 0.3736 0.49225 0.000 0.008 0.268 0.008 0.716 0.000
#> SRR2105306 5 0.3756 0.44281 0.000 0.004 0.316 0.004 0.676 0.000
#> SRR2105303 6 0.3758 0.69972 0.000 0.008 0.000 0.324 0.000 0.668
#> SRR2105304 2 0.0622 0.79884 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3237 0.77849 0.000 0.836 0.008 0.056 0.000 0.100
#> SRR2105302 2 0.3272 0.75377 0.000 0.824 0.004 0.124 0.000 0.048
#> SRR2105299 4 0.5403 -0.16289 0.000 0.044 0.036 0.500 0.420 0.000
#> SRR2105300 4 0.5961 0.24020 0.000 0.248 0.016 0.536 0.200 0.000
#> SRR2105297 1 0.4392 0.50433 0.628 0.000 0.000 0.040 0.000 0.332
#> SRR2105298 1 0.4601 0.50388 0.628 0.000 0.000 0.060 0.000 0.312
#> SRR2105295 2 0.1007 0.80326 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.4455 0.68556 0.000 0.712 0.000 0.128 0.000 0.160
#> SRR2105293 3 0.1958 0.68075 0.100 0.004 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105294 3 0.2743 0.66373 0.164 0.000 0.828 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105291 1 0.6578 0.43820 0.544 0.000 0.216 0.084 0.152 0.004
#> SRR2105292 1 0.0146 0.81875 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105289 3 0.5591 -0.07118 0.052 0.032 0.468 0.004 0.444 0.000
#> SRR2105290 1 0.0858 0.81788 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR2105287 1 0.3079 0.77228 0.836 0.000 0.028 0.008 0.128 0.000
#> SRR2105288 1 0.1226 0.81472 0.952 0.000 0.004 0.004 0.040 0.000
#> SRR2105285 2 0.0865 0.80403 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105286 2 0.1408 0.80504 0.000 0.944 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR2105283 4 0.3659 0.64342 0.068 0.008 0.012 0.832 0.008 0.072
#> SRR2105284 4 0.2507 0.66039 0.000 0.000 0.040 0.884 0.004 0.072
#> SRR2105281 6 0.5240 0.61400 0.000 0.132 0.000 0.284 0.000 0.584
#> SRR2105282 6 0.5084 0.63350 0.000 0.124 0.000 0.264 0.000 0.612
#> SRR2105259 5 0.1777 0.61885 0.000 0.012 0.032 0.024 0.932 0.000
#> SRR2105260 5 0.1838 0.61673 0.000 0.012 0.040 0.020 0.928 0.000
#> SRR2105279 6 0.3607 0.68771 0.000 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105280 6 0.3684 0.69593 0.000 0.004 0.000 0.332 0.000 0.664
#> SRR2105257 1 0.3710 0.75326 0.812 0.000 0.024 0.064 0.100 0.000
#> SRR2105258 1 0.1391 0.81639 0.944 0.000 0.040 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105253 2 0.3375 0.74629 0.000 0.816 0.000 0.088 0.000 0.096
#> SRR2105254 6 0.5922 0.31575 0.000 0.340 0.000 0.220 0.000 0.440
#> SRR2105255 5 0.1116 0.62029 0.004 0.000 0.028 0.008 0.960 0.000
#> SRR2105256 5 0.0862 0.61963 0.008 0.000 0.016 0.004 0.972 0.000
#> SRR2105251 6 0.2361 0.68531 0.000 0.012 0.004 0.104 0.000 0.880
#> SRR2105252 6 0.1788 0.62717 0.000 0.040 0.004 0.028 0.000 0.928
#> SRR2105249 4 0.3163 0.35653 0.000 0.004 0.000 0.764 0.000 0.232
#> SRR2105250 4 0.2178 0.56632 0.000 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105247 6 0.3136 0.71319 0.000 0.004 0.000 0.228 0.000 0.768
#> SRR2105248 6 0.1267 0.66669 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR2105245 3 0.0922 0.66385 0.004 0.004 0.968 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105246 3 0.3140 0.63779 0.004 0.052 0.864 0.008 0.012 0.060
#> SRR2105243 5 0.5687 0.32631 0.284 0.000 0.160 0.008 0.548 0.000
#> SRR2105244 3 0.5989 0.19079 0.248 0.000 0.432 0.000 0.320 0.000
#> SRR2105241 1 0.3196 0.76926 0.836 0.000 0.064 0.004 0.096 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.5579 0.34093 0.500 0.004 0.368 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105240 1 0.1930 0.81156 0.916 0.000 0.048 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105237 2 0.1082 0.80372 0.000 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR2105238 4 0.4069 0.22989 0.000 0.376 0.000 0.612 0.008 0.004
#> SRR2105235 4 0.3588 0.50091 0.000 0.044 0.000 0.776 0.000 0.180
#> SRR2105236 4 0.3468 0.25244 0.000 0.008 0.000 0.728 0.000 0.264
#> SRR2105233 2 0.0865 0.80267 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105234 2 0.0865 0.80267 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105231 6 0.2809 0.70426 0.000 0.004 0.004 0.168 0.000 0.824
#> SRR2105232 6 0.2234 0.69315 0.000 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872
#> SRR2105227 3 0.4751 0.59002 0.112 0.036 0.748 0.004 0.096 0.004
#> SRR2105228 1 0.4883 0.63135 0.656 0.008 0.272 0.004 0.056 0.004
#> SRR2105225 1 0.6326 -0.03751 0.356 0.000 0.340 0.008 0.296 0.000
#> SRR2105226 1 0.4033 0.73439 0.756 0.000 0.168 0.004 0.072 0.000
#> SRR2105229 3 0.3986 0.53922 0.000 0.036 0.756 0.016 0.192 0.000
#> SRR2105230 5 0.4076 0.25897 0.000 0.000 0.396 0.012 0.592 0.000
#> SRR2105219 2 0.2212 0.78358 0.000 0.880 0.000 0.112 0.000 0.008
#> SRR2105220 2 0.5472 0.15345 0.000 0.464 0.000 0.412 0.000 0.124
#> SRR2105221 4 0.3276 0.60949 0.004 0.000 0.000 0.764 0.004 0.228
#> SRR2105222 4 0.3023 0.60202 0.000 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105223 5 0.3230 0.53392 0.012 0.000 0.212 0.000 0.776 0.000
#> SRR2105224 5 0.4558 0.31341 0.348 0.000 0.032 0.008 0.612 0.000
#> SRR2105217 6 0.1692 0.65248 0.000 0.012 0.008 0.048 0.000 0.932
#> SRR2105218 6 0.1806 0.67810 0.000 0.000 0.004 0.088 0.000 0.908
#> SRR2105215 6 0.3515 0.69824 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105216 6 0.3647 0.68315 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105213 3 0.2208 0.67695 0.052 0.000 0.908 0.004 0.032 0.004
#> SRR2105214 3 0.1979 0.66836 0.012 0.024 0.928 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105211 5 0.3840 0.52102 0.000 0.024 0.228 0.008 0.740 0.000
#> SRR2105212 5 0.1806 0.61073 0.000 0.000 0.088 0.004 0.908 0.000
#> SRR2105209 1 0.5701 0.27392 0.516 0.000 0.032 0.080 0.372 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.4142 0.73483 0.764 0.000 0.160 0.024 0.052 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.3847 0.60419 0.000 0.644 0.008 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105206 2 0.4646 0.54263 0.000 0.580 0.032 0.008 0.000 0.380
#> SRR2105201 4 0.1075 0.65610 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105202 4 0.1075 0.65610 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105203 6 0.5731 0.48010 0.000 0.276 0.000 0.212 0.000 0.512
#> SRR2105204 6 0.3912 0.69036 0.000 0.012 0.000 0.340 0.000 0.648
#> SRR2105199 6 0.4344 0.69423 0.000 0.044 0.000 0.304 0.000 0.652
#> SRR2105200 6 0.3390 0.69880 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105197 5 0.5635 0.30464 0.000 0.000 0.256 0.208 0.536 0.000
#> SRR2105198 5 0.6412 0.12953 0.000 0.016 0.320 0.264 0.400 0.000
#> SRR2105195 1 0.6298 0.39331 0.584 0.048 0.232 0.012 0.120 0.004
#> SRR2105196 1 0.2066 0.78230 0.904 0.000 0.024 0.000 0.000 0.072
#> SRR2105193 1 0.0363 0.81744 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0458 0.81733 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.4087 0.49633 0.000 0.000 0.036 0.276 0.688 0.000
#> SRR2105192 5 0.7075 0.25199 0.168 0.000 0.108 0.308 0.416 0.000
#> SRR2105189 2 0.2046 0.80102 0.000 0.908 0.000 0.060 0.000 0.032
#> SRR2105190 2 0.2706 0.77491 0.000 0.860 0.000 0.104 0.000 0.036
#> SRR2105187 6 0.7403 -0.34412 0.000 0.124 0.184 0.336 0.004 0.352
#> SRR2105188 4 0.4935 0.50997 0.000 0.000 0.064 0.604 0.008 0.324
#> SRR2105179 1 0.3253 0.70603 0.788 0.000 0.020 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105180 1 0.3888 0.68710 0.780 0.000 0.004 0.108 0.108 0.000
#> SRR2105183 6 0.3684 0.67567 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105184 6 0.3023 0.69705 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR2105185 6 0.3487 0.59267 0.000 0.016 0.100 0.060 0.000 0.824
#> SRR2105186 6 0.1738 0.60623 0.000 0.004 0.052 0.016 0.000 0.928
#> SRR2105181 5 0.4862 0.48991 0.000 0.012 0.088 0.228 0.672 0.000
#> SRR2105182 5 0.2618 0.57542 0.000 0.000 0.116 0.024 0.860 0.000
#> SRR2105177 1 0.0146 0.81781 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 6 0.4996 0.64953 0.000 0.100 0.000 0.296 0.000 0.604
#> SRR2105172 6 0.3659 0.68010 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105175 1 0.0146 0.81781 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0146 0.81781 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 6 0.3973 0.42596 0.000 0.232 0.004 0.036 0.000 0.728
#> SRR2105174 6 0.3534 0.70767 0.000 0.008 0.000 0.276 0.000 0.716
#> SRR2105169 6 0.1075 0.65496 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR2105170 6 0.1267 0.65656 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR2105167 6 0.3659 0.67878 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105168 6 0.3672 0.67679 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105165 3 0.5035 0.52817 0.168 0.000 0.640 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105166 3 0.4358 0.61079 0.184 0.000 0.716 0.000 0.100 0.000
#> SRR2105163 3 0.2442 0.66645 0.144 0.000 0.852 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105164 3 0.2191 0.67543 0.120 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105161 1 0.0713 0.81311 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0260 0.81813 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 6 0.3684 0.67483 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105156 6 0.3672 0.67949 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105157 6 0.0508 0.62551 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR2105158 6 0.0806 0.61296 0.000 0.008 0.020 0.000 0.000 0.972
#> SRR2105159 3 0.2597 0.65896 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.2191 0.78206 0.876 0.000 0.120 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105153 6 0.2983 0.49438 0.000 0.136 0.032 0.000 0.000 0.832
#> SRR2105154 6 0.2333 0.56265 0.000 0.060 0.040 0.004 0.000 0.896
#> SRR2105151 6 0.3945 0.66652 0.000 0.008 0.000 0.380 0.000 0.612
#> SRR2105152 6 0.3647 0.68109 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105149 2 0.5998 0.29957 0.056 0.536 0.048 0.016 0.344 0.000
#> SRR2105150 2 0.5620 0.16433 0.000 0.516 0.092 0.020 0.372 0.000
#> SRR2105147 3 0.4253 0.12321 0.000 0.412 0.572 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105148 3 0.4253 0.12321 0.000 0.412 0.572 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105143 1 0.3374 0.77468 0.824 0.004 0.132 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105144 1 0.3075 0.77607 0.844 0.000 0.120 0.020 0.012 0.004
#> SRR2105145 1 0.1075 0.80857 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0865 0.81303 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.4251 0.58874 0.000 0.624 0.028 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105142 2 0.3953 0.61899 0.000 0.656 0.016 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105139 6 0.3431 0.70816 0.000 0.016 0.000 0.228 0.000 0.756
#> SRR2105140 6 0.3221 0.70179 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105137 4 0.1141 0.65425 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105138 4 0.3189 0.59687 0.000 0.000 0.004 0.760 0.000 0.236
#> SRR2105135 6 0.3647 0.68152 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105136 6 0.3634 0.68484 0.000 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105133 5 0.4786 0.38042 0.000 0.000 0.064 0.352 0.584 0.000
#> SRR2105134 5 0.4356 0.39470 0.000 0.000 0.032 0.360 0.608 0.000
#> SRR2105131 4 0.6139 0.22634 0.000 0.188 0.000 0.472 0.324 0.016
#> SRR2105132 4 0.5760 -0.06065 0.076 0.000 0.008 0.456 0.440 0.020
#> SRR2105129 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.81833 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 5 0.5927 0.31067 0.264 0.000 0.000 0.272 0.464 0.000
#> SRR2105128 5 0.6572 0.28937 0.232 0.036 0.000 0.288 0.444 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.422 0.821 0.900 0.4886 0.501 0.501
#> 3 3 0.278 0.509 0.688 0.2787 0.888 0.782
#> 4 4 0.356 0.419 0.650 0.1190 0.871 0.712
#> 5 5 0.415 0.334 0.617 0.0830 0.838 0.572
#> 6 6 0.479 0.260 0.596 0.0528 0.805 0.394
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.4562 0.8604 0.904 0.096
#> SRR2105278 1 0.2043 0.8611 0.968 0.032
#> SRR2105275 1 0.8443 0.7218 0.728 0.272
#> SRR2105276 1 0.3733 0.8635 0.928 0.072
#> SRR2105273 1 0.0672 0.8517 0.992 0.008
#> SRR2105274 1 0.0376 0.8498 0.996 0.004
#> SRR2105271 1 0.1184 0.8562 0.984 0.016
#> SRR2105272 1 0.0376 0.8501 0.996 0.004
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0376 0.9230 0.004 0.996
#> SRR2105263 2 0.1633 0.9185 0.024 0.976
#> SRR2105264 2 0.1843 0.9180 0.028 0.972
#> SRR2105261 2 0.6623 0.7694 0.172 0.828
#> SRR2105262 2 0.8386 0.5930 0.268 0.732
#> SRR2105357 2 0.9881 0.1002 0.436 0.564
#> SRR2105358 1 0.6438 0.8332 0.836 0.164
#> SRR2105439 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105440 2 0.0376 0.9233 0.004 0.996
#> SRR2105509 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0938 0.9211 0.012 0.988
#> SRR2105507 1 0.1414 0.8557 0.980 0.020
#> SRR2105508 1 0.4690 0.8588 0.900 0.100
#> SRR2105505 1 0.5842 0.8514 0.860 0.140
#> SRR2105506 1 0.2236 0.8593 0.964 0.036
#> SRR2105503 2 0.0672 0.9232 0.008 0.992
#> SRR2105504 2 0.2043 0.9140 0.032 0.968
#> SRR2105501 2 0.5629 0.8278 0.132 0.868
#> SRR2105502 2 0.1633 0.9176 0.024 0.976
#> SRR2105499 1 0.6148 0.8409 0.848 0.152
#> SRR2105500 1 0.5842 0.8488 0.860 0.140
#> SRR2105497 2 0.2236 0.9141 0.036 0.964
#> SRR2105498 2 0.7602 0.7159 0.220 0.780
#> SRR2105495 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.1633 0.9185 0.024 0.976
#> SRR2105493 2 0.3114 0.8996 0.056 0.944
#> SRR2105494 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR2105491 2 0.0938 0.9225 0.012 0.988
#> SRR2105492 2 0.2423 0.9109 0.040 0.960
#> SRR2105489 2 0.0376 0.9229 0.004 0.996
#> SRR2105490 2 0.3274 0.8967 0.060 0.940
#> SRR2105487 1 0.9710 0.4637 0.600 0.400
#> SRR2105488 1 0.8555 0.7037 0.720 0.280
#> SRR2105485 1 0.5737 0.8472 0.864 0.136
#> SRR2105486 1 0.5737 0.8479 0.864 0.136
#> SRR2105483 1 0.3584 0.8577 0.932 0.068
#> SRR2105484 1 0.1843 0.8574 0.972 0.028
#> SRR2105481 1 0.0938 0.8540 0.988 0.012
#> SRR2105482 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.6801 0.8117 0.820 0.180
#> SRR2105480 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.3431 0.8939 0.064 0.936
#> SRR2105478 2 0.4690 0.8628 0.100 0.900
#> SRR2105475 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR2105476 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR2105473 2 0.2603 0.9062 0.044 0.956
#> SRR2105474 2 0.4815 0.8559 0.104 0.896
#> SRR2105471 2 0.5059 0.8524 0.112 0.888
#> SRR2105472 2 0.1184 0.9196 0.016 0.984
#> SRR2105469 1 0.7299 0.8131 0.796 0.204
#> SRR2105470 1 0.5946 0.8489 0.856 0.144
#> SRR2105467 1 0.4562 0.8631 0.904 0.096
#> SRR2105468 1 0.2423 0.8629 0.960 0.040
#> SRR2105465 1 0.7745 0.7701 0.772 0.228
#> SRR2105466 1 0.8555 0.6910 0.720 0.280
#> SRR2105463 1 0.2236 0.8578 0.964 0.036
#> SRR2105464 1 0.1633 0.8570 0.976 0.024
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.8207 0.7475 0.744 0.256
#> SRR2105458 1 0.9427 0.5870 0.640 0.360
#> SRR2105455 1 0.7528 0.8016 0.784 0.216
#> SRR2105456 1 0.1633 0.8575 0.976 0.024
#> SRR2105453 1 0.2236 0.8603 0.964 0.036
#> SRR2105454 1 0.3274 0.8628 0.940 0.060
#> SRR2105451 2 0.3879 0.8840 0.076 0.924
#> SRR2105452 2 0.4431 0.8677 0.092 0.908
#> SRR2105449 1 0.6801 0.8154 0.820 0.180
#> SRR2105450 1 0.1843 0.8584 0.972 0.028
#> SRR2105447 2 0.2778 0.9072 0.048 0.952
#> SRR2105448 2 0.1633 0.9182 0.024 0.976
#> SRR2105445 2 0.7674 0.6771 0.224 0.776
#> SRR2105446 2 0.9933 -0.0106 0.452 0.548
#> SRR2105443 2 0.4562 0.8660 0.096 0.904
#> SRR2105444 2 0.5629 0.8262 0.132 0.868
#> SRR2105441 2 0.0376 0.9230 0.004 0.996
#> SRR2105442 2 0.3431 0.8944 0.064 0.936
#> SRR2105437 1 0.2603 0.8626 0.956 0.044
#> SRR2105438 1 0.2236 0.8622 0.964 0.036
#> SRR2105435 1 0.4690 0.8619 0.900 0.100
#> SRR2105436 1 0.3114 0.8632 0.944 0.056
#> SRR2105433 1 0.2603 0.8623 0.956 0.044
#> SRR2105434 1 0.2043 0.8577 0.968 0.032
#> SRR2105431 1 0.0376 0.8501 0.996 0.004
#> SRR2105432 1 0.0376 0.8501 0.996 0.004
#> SRR2105429 2 0.9323 0.4097 0.348 0.652
#> SRR2105430 2 0.4562 0.8688 0.096 0.904
#> SRR2105427 2 0.0376 0.9231 0.004 0.996
#> SRR2105428 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.3584 0.8928 0.068 0.932
#> SRR2105426 2 0.6247 0.8076 0.156 0.844
#> SRR2105421 2 0.9710 0.2152 0.400 0.600
#> SRR2105422 2 0.9491 0.3366 0.368 0.632
#> SRR2105423 2 0.0672 0.9228 0.008 0.992
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.7139 0.8114 0.804 0.196
#> SRR2105420 1 0.9970 0.3224 0.532 0.468
#> SRR2105415 1 0.1414 0.8570 0.980 0.020
#> SRR2105416 1 0.1414 0.8566 0.980 0.020
#> SRR2105417 1 0.5408 0.8549 0.876 0.124
#> SRR2105418 1 0.2778 0.8614 0.952 0.048
#> SRR2105413 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.1184 0.9215 0.016 0.984
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0672 0.9225 0.008 0.992
#> SRR2105407 1 0.7056 0.8118 0.808 0.192
#> SRR2105408 1 0.8909 0.6747 0.692 0.308
#> SRR2105403 1 0.7745 0.7822 0.772 0.228
#> SRR2105404 1 0.2603 0.8607 0.956 0.044
#> SRR2105405 1 0.3274 0.8622 0.940 0.060
#> SRR2105406 1 0.5737 0.8445 0.864 0.136
#> SRR2105401 2 0.0672 0.9228 0.008 0.992
#> SRR2105402 2 0.3733 0.8844 0.072 0.928
#> SRR2105399 2 0.3431 0.8944 0.064 0.936
#> SRR2105400 2 0.2948 0.9018 0.052 0.948
#> SRR2105397 2 0.6438 0.7950 0.164 0.836
#> SRR2105398 2 0.6887 0.7619 0.184 0.816
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.3879 0.8835 0.076 0.924
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.6148 0.8372 0.848 0.152
#> SRR2105390 1 0.3584 0.8598 0.932 0.068
#> SRR2105391 1 0.7883 0.7794 0.764 0.236
#> SRR2105392 1 0.6148 0.8360 0.848 0.152
#> SRR2105385 1 0.5737 0.8503 0.864 0.136
#> SRR2105386 1 0.3431 0.8645 0.936 0.064
#> SRR2105387 1 0.7745 0.7774 0.772 0.228
#> SRR2105388 1 0.1414 0.8550 0.980 0.020
#> SRR2105381 2 0.2043 0.9151 0.032 0.968
#> SRR2105382 2 0.1414 0.9193 0.020 0.980
#> SRR2105383 2 0.5519 0.8368 0.128 0.872
#> SRR2105384 2 0.8016 0.6685 0.244 0.756
#> SRR2105379 2 0.1843 0.9164 0.028 0.972
#> SRR2105380 2 0.7056 0.7494 0.192 0.808
#> SRR2105377 2 0.0938 0.9222 0.012 0.988
#> SRR2105378 2 0.4690 0.8634 0.100 0.900
#> SRR2105375 1 0.9754 0.4217 0.592 0.408
#> SRR2105376 1 0.8499 0.6980 0.724 0.276
#> SRR2105373 1 0.2236 0.8610 0.964 0.036
#> SRR2105374 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.3114 0.8605 0.944 0.056
#> SRR2105372 1 0.3431 0.8605 0.936 0.064
#> SRR2105369 1 0.0376 0.8500 0.996 0.004
#> SRR2105370 1 0.0938 0.8532 0.988 0.012
#> SRR2105367 1 0.9608 0.5186 0.616 0.384
#> SRR2105368 1 0.9129 0.5998 0.672 0.328
#> SRR2105365 2 0.0672 0.9225 0.008 0.992
#> SRR2105366 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0376 0.9230 0.004 0.996
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0376 0.9234 0.004 0.996
#> SRR2105359 1 0.5737 0.8487 0.864 0.136
#> SRR2105360 1 0.4690 0.8601 0.900 0.100
#> SRR2105355 1 0.8016 0.7690 0.756 0.244
#> SRR2105356 1 0.1184 0.8555 0.984 0.016
#> SRR2105353 1 0.6623 0.8291 0.828 0.172
#> SRR2105354 1 0.0672 0.8519 0.992 0.008
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.3879 0.8808 0.076 0.924
#> SRR2105349 2 0.0376 0.9231 0.004 0.996
#> SRR2105350 2 0.0376 0.9230 0.004 0.996
#> SRR2105345 2 0.1414 0.9197 0.020 0.980
#> SRR2105346 2 0.0672 0.9219 0.008 0.992
#> SRR2105347 2 0.8499 0.6143 0.276 0.724
#> SRR2105348 2 0.6048 0.8093 0.148 0.852
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.6531 0.8286 0.832 0.168
#> SRR2105342 1 0.5059 0.8571 0.888 0.112
#> SRR2105339 1 0.6801 0.8245 0.820 0.180
#> SRR2105340 1 0.4562 0.8594 0.904 0.096
#> SRR2105335 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.5629 0.8459 0.868 0.132
#> SRR2105338 1 0.2236 0.8596 0.964 0.036
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.2603 0.9086 0.044 0.956
#> SRR2105333 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR2105334 2 0.2423 0.9111 0.040 0.960
#> SRR2105329 2 0.6048 0.8030 0.148 0.852
#> SRR2105330 2 0.5294 0.8429 0.120 0.880
#> SRR2105327 2 0.2423 0.9123 0.040 0.960
#> SRR2105328 2 0.3114 0.9019 0.056 0.944
#> SRR2105325 1 0.3584 0.8643 0.932 0.068
#> SRR2105326 1 0.2043 0.8596 0.968 0.032
#> SRR2105323 2 0.9909 0.0408 0.444 0.556
#> SRR2105324 1 0.8016 0.7721 0.756 0.244
#> SRR2105319 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.1414 0.8567 0.980 0.020
#> SRR2105322 1 0.0938 0.8536 0.988 0.012
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.6247 0.7922 0.156 0.844
#> SRR2105316 2 0.0938 0.9225 0.012 0.988
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.9635 0.5200 0.612 0.388
#> SRR2105312 1 0.9795 0.4427 0.584 0.416
#> SRR2105307 1 0.5178 0.8544 0.884 0.116
#> SRR2105308 1 0.7815 0.7763 0.768 0.232
#> SRR2105309 1 0.8955 0.6727 0.688 0.312
#> SRR2105310 1 0.5629 0.8451 0.868 0.132
#> SRR2105305 1 0.7056 0.8087 0.808 0.192
#> SRR2105306 1 0.5178 0.8521 0.884 0.116
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.1184 0.9205 0.016 0.984
#> SRR2105301 2 0.3584 0.8911 0.068 0.932
#> SRR2105302 2 0.0672 0.9230 0.008 0.992
#> SRR2105299 2 0.7219 0.7289 0.200 0.800
#> SRR2105300 2 0.6247 0.8030 0.156 0.844
#> SRR2105297 2 0.9635 0.3341 0.388 0.612
#> SRR2105298 2 0.9795 0.2392 0.416 0.584
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.8327 0.7336 0.736 0.264
#> SRR2105294 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.7815 0.7881 0.768 0.232
#> SRR2105292 1 0.3431 0.8615 0.936 0.064
#> SRR2105289 1 0.5842 0.8504 0.860 0.140
#> SRR2105290 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.3879 0.8627 0.924 0.076
#> SRR2105288 1 0.3879 0.8563 0.924 0.076
#> SRR2105285 2 0.1414 0.9201 0.020 0.980
#> SRR2105286 2 0.1414 0.9200 0.020 0.980
#> SRR2105283 2 0.6247 0.7998 0.156 0.844
#> SRR2105284 2 0.3584 0.8927 0.068 0.932
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.7950 0.7680 0.760 0.240
#> SRR2105260 1 0.9983 0.2825 0.524 0.476
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.5408 0.8507 0.876 0.124
#> SRR2105258 1 0.2423 0.8597 0.960 0.040
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.1843 0.8592 0.972 0.028
#> SRR2105256 1 0.0938 0.8537 0.988 0.012
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0376 0.9230 0.004 0.996
#> SRR2105250 2 0.2043 0.9142 0.032 0.968
#> SRR2105247 2 0.1633 0.9181 0.024 0.976
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.9427 0.5779 0.640 0.360
#> SRR2105246 1 0.9850 0.3861 0.572 0.428
#> SRR2105243 1 0.4562 0.8592 0.904 0.096
#> SRR2105244 1 0.6712 0.8289 0.824 0.176
#> SRR2105241 1 0.4431 0.8585 0.908 0.092
#> SRR2105242 1 0.0938 0.8537 0.988 0.012
#> SRR2105239 1 0.6247 0.8423 0.844 0.156
#> SRR2105240 1 0.0672 0.8515 0.992 0.008
#> SRR2105237 2 0.2236 0.9131 0.036 0.964
#> SRR2105238 2 0.2778 0.9059 0.048 0.952
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.2778 0.9032 0.048 0.952
#> SRR2105233 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0672 0.9223 0.008 0.992
#> SRR2105227 2 0.9988 -0.0659 0.480 0.520
#> SRR2105228 1 0.9993 0.1895 0.516 0.484
#> SRR2105225 1 0.1633 0.8586 0.976 0.024
#> SRR2105226 1 0.0376 0.8500 0.996 0.004
#> SRR2105229 1 0.9922 0.3625 0.552 0.448
#> SRR2105230 1 0.2778 0.8631 0.952 0.048
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.6048 0.8186 0.148 0.852
#> SRR2105222 2 0.5946 0.8157 0.144 0.856
#> SRR2105223 1 0.4298 0.8624 0.912 0.088
#> SRR2105224 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0376 0.9233 0.004 0.996
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.9795 0.4810 0.584 0.416
#> SRR2105214 1 0.9580 0.5725 0.620 0.380
#> SRR2105211 2 0.9954 -0.0500 0.460 0.540
#> SRR2105212 1 0.8443 0.7405 0.728 0.272
#> SRR2105209 1 0.0938 0.8544 0.988 0.012
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.9580 0.5008 0.620 0.380
#> SRR2105208 1 0.3733 0.8607 0.928 0.072
#> SRR2105205 2 0.5294 0.8418 0.120 0.880
#> SRR2105206 2 0.5737 0.8280 0.136 0.864
#> SRR2105201 2 0.2603 0.9092 0.044 0.956
#> SRR2105202 2 0.1633 0.9195 0.024 0.976
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0376 0.9235 0.004 0.996
#> SRR2105197 1 0.7219 0.8053 0.800 0.200
#> SRR2105198 2 0.9944 0.0148 0.456 0.544
#> SRR2105195 1 0.8763 0.6803 0.704 0.296
#> SRR2105196 1 0.8955 0.6346 0.688 0.312
#> SRR2105193 1 0.4298 0.8548 0.912 0.088
#> SRR2105194 1 0.0000 0.8478 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.8207 0.7577 0.744 0.256
#> SRR2105192 1 0.0376 0.8500 0.996 0.004
#> SRR2105189 2 0.2043 0.9140 0.032 0.968
#> SRR2105190 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.4022 0.8810 0.080 0.920
#> SRR2105188 2 0.7528 0.7260 0.216 0.784
#> SRR2105179 1 0.4939 0.8583 0.892 0.108
#> SRR2105180 1 0.3431 0.8612 0.936 0.064
#> SRR2105183 2 0.1843 0.9166 0.028 0.972
#> SRR2105184 2 0.2043 0.9139 0.032 0.968
#> SRR2105185 2 0.1414 0.9194 0.020 0.980
#> SRR2105186 2 0.2423 0.9098 0.040 0.960
#> SRR2105181 1 0.8386 0.7258 0.732 0.268
#> SRR2105182 1 0.4562 0.8570 0.904 0.096
#> SRR2105177 1 0.7056 0.7923 0.808 0.192
#> SRR2105178 1 0.2948 0.8587 0.948 0.052
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.6438 0.8208 0.836 0.164
#> SRR2105176 1 0.0672 0.8518 0.992 0.008
#> SRR2105173 2 0.0376 0.9233 0.004 0.996
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0376 0.9223 0.004 0.996
#> SRR2105170 2 0.4161 0.8820 0.084 0.916
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.1633 0.8578 0.976 0.024
#> SRR2105166 1 0.0938 0.8540 0.988 0.012
#> SRR2105163 1 0.9970 0.2887 0.532 0.468
#> SRR2105164 1 0.6531 0.8341 0.832 0.168
#> SRR2105161 1 0.6148 0.8415 0.848 0.152
#> SRR2105162 1 0.6531 0.8180 0.832 0.168
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.8144 0.7452 0.748 0.252
#> SRR2105160 1 0.6148 0.8314 0.848 0.152
#> SRR2105153 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.2778 0.9053 0.048 0.952
#> SRR2105152 2 0.0376 0.9223 0.004 0.996
#> SRR2105149 1 0.9710 0.5049 0.600 0.400
#> SRR2105150 1 0.9988 0.2464 0.520 0.480
#> SRR2105147 2 0.8207 0.6335 0.256 0.744
#> SRR2105148 2 0.8955 0.5036 0.312 0.688
#> SRR2105143 1 0.8861 0.6630 0.696 0.304
#> SRR2105144 1 0.8207 0.7270 0.744 0.256
#> SRR2105145 1 0.8386 0.7071 0.732 0.268
#> SRR2105146 1 0.0376 0.8502 0.996 0.004
#> SRR2105141 2 0.0376 0.9229 0.004 0.996
#> SRR2105142 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.2603 0.9080 0.044 0.956
#> SRR2105137 2 0.3733 0.8917 0.072 0.928
#> SRR2105138 2 0.7745 0.7085 0.228 0.772
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9232 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.6887 0.8227 0.816 0.184
#> SRR2105134 1 0.2778 0.8636 0.952 0.048
#> SRR2105131 2 0.5842 0.8162 0.140 0.860
#> SRR2105132 1 0.9491 0.5308 0.632 0.368
#> SRR2105129 1 0.6148 0.8283 0.848 0.152
#> SRR2105130 1 0.5629 0.8412 0.868 0.132
#> SRR2105127 1 0.6048 0.8472 0.852 0.148
#> SRR2105128 1 0.7674 0.7935 0.776 0.224
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.445 0.44018 0.856 0.032 0.112
#> SRR2105278 1 0.378 0.41790 0.864 0.004 0.132
#> SRR2105275 1 0.894 0.18556 0.544 0.156 0.300
#> SRR2105276 1 0.642 0.36871 0.708 0.032 0.260
#> SRR2105273 1 0.484 0.34354 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105274 1 0.576 0.19484 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105271 1 0.551 0.38870 0.764 0.016 0.220
#> SRR2105272 1 0.596 0.22686 0.672 0.004 0.324
#> SRR2105269 2 0.496 0.83349 0.008 0.792 0.200
#> SRR2105270 2 0.304 0.84908 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105267 2 0.450 0.83806 0.000 0.804 0.196
#> SRR2105268 2 0.236 0.84675 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105265 2 0.382 0.84723 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105266 2 0.210 0.83453 0.004 0.944 0.052
#> SRR2105263 2 0.412 0.82587 0.000 0.832 0.168
#> SRR2105264 2 0.254 0.84125 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105261 2 0.904 0.60552 0.204 0.556 0.240
#> SRR2105262 2 0.843 0.49283 0.260 0.604 0.136
#> SRR2105357 1 0.964 0.08398 0.460 0.308 0.232
#> SRR2105358 1 0.425 0.43981 0.872 0.048 0.080
#> SRR2105439 2 0.429 0.84553 0.004 0.832 0.164
#> SRR2105440 2 0.497 0.84162 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105509 2 0.536 0.82929 0.020 0.784 0.196
#> SRR2105510 2 0.564 0.82495 0.020 0.760 0.220
#> SRR2105507 1 0.529 0.35441 0.764 0.008 0.228
#> SRR2105508 1 0.563 0.41373 0.780 0.032 0.188
#> SRR2105505 1 0.825 0.07517 0.528 0.080 0.392
#> SRR2105506 1 0.652 -0.23522 0.512 0.004 0.484
#> SRR2105503 2 0.475 0.84391 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105504 2 0.834 0.67229 0.096 0.560 0.344
#> SRR2105501 2 0.639 0.76042 0.124 0.768 0.108
#> SRR2105502 2 0.749 0.72236 0.052 0.608 0.340
#> SRR2105499 1 0.417 0.45738 0.868 0.028 0.104
#> SRR2105500 1 0.556 0.44277 0.808 0.064 0.128
#> SRR2105497 2 0.321 0.83350 0.008 0.900 0.092
#> SRR2105498 2 0.719 0.67451 0.080 0.696 0.224
#> SRR2105495 2 0.295 0.84931 0.004 0.908 0.088
#> SRR2105496 2 0.287 0.84237 0.008 0.916 0.076
#> SRR2105493 2 0.554 0.83107 0.052 0.804 0.144
#> SRR2105494 2 0.500 0.82836 0.028 0.820 0.152
#> SRR2105491 2 0.545 0.83317 0.012 0.760 0.228
#> SRR2105492 2 0.507 0.79564 0.012 0.792 0.196
#> SRR2105489 2 0.355 0.83941 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105490 2 0.429 0.76542 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105487 1 0.923 -0.01056 0.428 0.152 0.420
#> SRR2105488 3 0.903 0.12713 0.428 0.132 0.440
#> SRR2105485 1 0.587 0.44744 0.784 0.056 0.160
#> SRR2105486 1 0.420 0.46056 0.864 0.024 0.112
#> SRR2105483 3 0.681 0.39271 0.404 0.016 0.580
#> SRR2105484 3 0.656 0.37324 0.416 0.008 0.576
#> SRR2105481 1 0.516 0.33909 0.764 0.004 0.232
#> SRR2105482 1 0.630 -0.19481 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105479 1 0.940 -0.10659 0.464 0.180 0.356
#> SRR2105480 1 0.634 0.09152 0.596 0.004 0.400
#> SRR2105477 2 0.713 0.71730 0.116 0.720 0.164
#> SRR2105478 2 0.653 0.80729 0.092 0.756 0.152
#> SRR2105475 2 0.382 0.84838 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105476 2 0.388 0.84782 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105473 2 0.619 0.71036 0.016 0.692 0.292
#> SRR2105474 2 0.522 0.71740 0.012 0.780 0.208
#> SRR2105471 2 0.578 0.80682 0.032 0.768 0.200
#> SRR2105472 2 0.394 0.78377 0.000 0.844 0.156
#> SRR2105469 1 0.865 0.24050 0.580 0.144 0.276
#> SRR2105470 1 0.706 0.31275 0.632 0.036 0.332
#> SRR2105467 1 0.557 0.41490 0.784 0.032 0.184
#> SRR2105468 1 0.576 0.29789 0.716 0.008 0.276
#> SRR2105465 1 0.901 -0.23759 0.460 0.132 0.408
#> SRR2105466 3 0.897 0.38589 0.348 0.140 0.512
#> SRR2105463 3 0.646 0.34623 0.440 0.004 0.556
#> SRR2105464 3 0.629 0.29056 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105461 2 0.304 0.84838 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105462 2 0.312 0.84689 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105459 2 0.493 0.82796 0.000 0.768 0.232
#> SRR2105460 2 0.424 0.83634 0.000 0.824 0.176
#> SRR2105457 1 0.600 0.38283 0.780 0.064 0.156
#> SRR2105458 1 0.745 0.29492 0.700 0.144 0.156
#> SRR2105455 1 0.891 0.17760 0.560 0.168 0.272
#> SRR2105456 1 0.655 0.12250 0.616 0.012 0.372
#> SRR2105453 1 0.729 -0.25427 0.508 0.028 0.464
#> SRR2105454 3 0.746 0.34902 0.440 0.036 0.524
#> SRR2105451 2 0.801 0.72374 0.100 0.624 0.276
#> SRR2105452 2 0.953 0.50237 0.196 0.448 0.356
#> SRR2105449 3 0.936 0.23191 0.396 0.168 0.436
#> SRR2105450 1 0.658 -0.02881 0.572 0.008 0.420
#> SRR2105447 2 0.685 0.81125 0.060 0.708 0.232
#> SRR2105448 2 0.517 0.84457 0.016 0.792 0.192
#> SRR2105445 2 0.920 0.51292 0.268 0.532 0.200
#> SRR2105446 1 0.916 0.08750 0.492 0.352 0.156
#> SRR2105443 2 0.867 0.66342 0.184 0.596 0.220
#> SRR2105444 2 0.836 0.67929 0.148 0.620 0.232
#> SRR2105441 2 0.385 0.85468 0.004 0.860 0.136
#> SRR2105442 2 0.385 0.81100 0.016 0.876 0.108
#> SRR2105437 1 0.623 0.18366 0.652 0.008 0.340
#> SRR2105438 1 0.682 0.16103 0.628 0.024 0.348
#> SRR2105435 1 0.626 0.41522 0.752 0.052 0.196
#> SRR2105436 1 0.423 0.44814 0.872 0.044 0.084
#> SRR2105433 1 0.699 0.08161 0.592 0.024 0.384
#> SRR2105434 1 0.652 -0.22517 0.500 0.004 0.496
#> SRR2105431 3 0.621 0.33393 0.428 0.000 0.572
#> SRR2105432 3 0.645 0.34794 0.436 0.004 0.560
#> SRR2105429 2 0.986 0.12133 0.260 0.404 0.336
#> SRR2105430 2 0.691 0.77673 0.120 0.736 0.144
#> SRR2105427 2 0.458 0.84018 0.004 0.812 0.184
#> SRR2105428 2 0.382 0.84833 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105425 2 0.564 0.83701 0.016 0.752 0.232
#> SRR2105426 2 0.521 0.81477 0.052 0.824 0.124
#> SRR2105421 2 0.993 0.19159 0.344 0.376 0.280
#> SRR2105422 2 0.998 0.11298 0.344 0.356 0.300
#> SRR2105423 2 0.463 0.84542 0.004 0.808 0.188
#> SRR2105424 2 0.460 0.84446 0.000 0.796 0.204
#> SRR2105419 1 0.731 0.40140 0.684 0.080 0.236
#> SRR2105420 1 0.897 0.18218 0.560 0.256 0.184
#> SRR2105415 3 0.663 0.35673 0.440 0.008 0.552
#> SRR2105416 3 0.674 0.36135 0.428 0.012 0.560
#> SRR2105417 1 0.833 -0.14634 0.484 0.080 0.436
#> SRR2105418 3 0.739 0.41868 0.380 0.040 0.580
#> SRR2105413 2 0.573 0.82678 0.020 0.752 0.228
#> SRR2105414 2 0.564 0.83427 0.036 0.784 0.180
#> SRR2105409 2 0.334 0.84901 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105410 2 0.341 0.84326 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105411 2 0.236 0.84048 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105412 2 0.288 0.84176 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105407 1 0.383 0.44028 0.888 0.036 0.076
#> SRR2105408 1 0.600 0.38325 0.784 0.072 0.144
#> SRR2105403 1 0.621 0.41588 0.768 0.068 0.164
#> SRR2105404 1 0.364 0.44449 0.872 0.004 0.124
#> SRR2105405 1 0.733 0.12320 0.612 0.044 0.344
#> SRR2105406 1 0.814 -0.24239 0.480 0.068 0.452
#> SRR2105401 2 0.610 0.81516 0.040 0.752 0.208
#> SRR2105402 2 0.935 0.54541 0.176 0.472 0.352
#> SRR2105399 2 0.761 0.74567 0.148 0.688 0.164
#> SRR2105400 2 0.788 0.73826 0.128 0.660 0.212
#> SRR2105397 2 0.920 0.57161 0.192 0.528 0.280
#> SRR2105398 2 0.967 0.48558 0.264 0.464 0.272
#> SRR2105395 2 0.263 0.84348 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105396 2 0.410 0.80885 0.060 0.880 0.060
#> SRR2105393 2 0.348 0.85116 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105394 2 0.186 0.83032 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105389 1 0.354 0.43930 0.888 0.012 0.100
#> SRR2105390 1 0.227 0.45206 0.944 0.016 0.040
#> SRR2105391 1 0.574 0.42041 0.804 0.092 0.104
#> SRR2105392 1 0.329 0.44104 0.900 0.012 0.088
#> SRR2105385 1 0.719 0.37598 0.696 0.080 0.224
#> SRR2105386 1 0.696 0.30041 0.684 0.052 0.264
#> SRR2105387 3 0.891 0.27645 0.400 0.124 0.476
#> SRR2105388 1 0.569 0.29197 0.724 0.008 0.268
#> SRR2105381 2 0.718 0.78701 0.084 0.700 0.216
#> SRR2105382 2 0.296 0.84460 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105383 2 0.578 0.77254 0.032 0.768 0.200
#> SRR2105384 2 0.774 0.60725 0.136 0.676 0.188
#> SRR2105379 2 0.489 0.83606 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105380 2 0.719 0.69939 0.052 0.656 0.292
#> SRR2105377 2 0.541 0.83693 0.012 0.764 0.224
#> SRR2105378 2 0.659 0.70085 0.044 0.712 0.244
#> SRR2105375 3 0.939 0.05677 0.368 0.176 0.456
#> SRR2105376 3 0.891 0.24342 0.332 0.140 0.528
#> SRR2105373 1 0.494 0.43169 0.824 0.028 0.148
#> SRR2105374 1 0.595 0.14773 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105371 1 0.350 0.45355 0.880 0.004 0.116
#> SRR2105372 1 0.304 0.45528 0.908 0.008 0.084
#> SRR2105369 1 0.327 0.43475 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105370 1 0.450 0.39559 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105367 3 0.927 0.30969 0.268 0.208 0.524
#> SRR2105368 3 0.946 0.32347 0.248 0.252 0.500
#> SRR2105365 2 0.288 0.84631 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105366 2 0.435 0.84802 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105363 2 0.435 0.84803 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105364 2 0.466 0.84789 0.016 0.828 0.156
#> SRR2105361 2 0.475 0.83406 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105362 2 0.475 0.83271 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105359 1 0.534 0.45040 0.816 0.052 0.132
#> SRR2105360 1 0.412 0.45871 0.868 0.024 0.108
#> SRR2105355 1 0.870 0.23969 0.592 0.180 0.228
#> SRR2105356 1 0.573 0.24283 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105353 1 0.535 0.41578 0.808 0.040 0.152
#> SRR2105354 1 0.280 0.43919 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105351 2 0.304 0.84854 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105352 2 0.926 0.56437 0.168 0.488 0.344
#> SRR2105349 2 0.403 0.84523 0.008 0.856 0.136
#> SRR2105350 2 0.345 0.85062 0.008 0.888 0.104
#> SRR2105345 2 0.364 0.82502 0.004 0.872 0.124
#> SRR2105346 2 0.382 0.78999 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105347 2 0.603 0.63916 0.024 0.732 0.244
#> SRR2105348 2 0.651 0.59077 0.024 0.676 0.300
#> SRR2105343 2 0.475 0.83831 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105344 2 0.312 0.84803 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105341 1 0.374 0.44030 0.892 0.036 0.072
#> SRR2105342 1 0.409 0.45532 0.876 0.036 0.088
#> SRR2105339 1 0.547 0.42199 0.812 0.060 0.128
#> SRR2105340 1 0.493 0.44393 0.820 0.024 0.156
#> SRR2105335 1 0.565 0.21605 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105336 1 0.599 0.10155 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105337 1 0.864 0.20374 0.596 0.168 0.236
#> SRR2105338 1 0.669 0.08785 0.612 0.016 0.372
#> SRR2105331 2 0.375 0.85350 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105332 2 0.361 0.82695 0.008 0.880 0.112
#> SRR2105333 2 0.304 0.84649 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105334 2 0.478 0.84174 0.004 0.796 0.200
#> SRR2105329 2 0.891 0.65430 0.176 0.564 0.260
#> SRR2105330 2 0.700 0.73186 0.160 0.728 0.112
#> SRR2105327 2 0.414 0.85027 0.016 0.860 0.124
#> SRR2105328 2 0.477 0.84186 0.052 0.848 0.100
#> SRR2105325 1 0.577 0.39170 0.748 0.020 0.232
#> SRR2105326 1 0.493 0.40256 0.784 0.004 0.212
#> SRR2105323 1 0.973 0.02214 0.428 0.340 0.232
#> SRR2105324 1 0.818 0.29689 0.636 0.140 0.224
#> SRR2105319 1 0.581 0.19291 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105320 1 0.631 -0.21216 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105321 1 0.533 0.35465 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105322 1 0.575 0.31344 0.700 0.004 0.296
#> SRR2105317 2 0.554 0.81988 0.012 0.752 0.236
#> SRR2105318 2 0.447 0.84033 0.004 0.820 0.176
#> SRR2105315 2 0.834 0.58684 0.256 0.612 0.132
#> SRR2105316 2 0.491 0.83738 0.008 0.796 0.196
#> SRR2105313 2 0.412 0.84861 0.000 0.832 0.168
#> SRR2105314 2 0.465 0.83810 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105311 1 0.910 0.20241 0.516 0.160 0.324
#> SRR2105312 1 0.947 0.10945 0.456 0.188 0.356
#> SRR2105307 1 0.767 -0.25194 0.488 0.044 0.468
#> SRR2105308 3 0.839 0.29923 0.428 0.084 0.488
#> SRR2105309 1 0.817 0.27063 0.640 0.148 0.212
#> SRR2105310 1 0.385 0.45753 0.876 0.016 0.108
#> SRR2105305 1 0.406 0.42821 0.860 0.012 0.128
#> SRR2105306 1 0.199 0.45263 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105303 2 0.207 0.84155 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105304 2 0.779 0.70383 0.064 0.588 0.348
#> SRR2105301 2 0.497 0.82698 0.012 0.800 0.188
#> SRR2105302 2 0.388 0.85122 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105299 2 0.843 0.51416 0.292 0.588 0.120
#> SRR2105300 2 0.860 0.54747 0.284 0.580 0.136
#> SRR2105297 3 0.864 0.17306 0.100 0.440 0.460
#> SRR2105298 3 0.897 0.22622 0.128 0.408 0.464
#> SRR2105295 2 0.510 0.82029 0.000 0.752 0.248
#> SRR2105296 2 0.424 0.84492 0.000 0.824 0.176
#> SRR2105293 1 0.919 0.05638 0.428 0.148 0.424
#> SRR2105294 1 0.571 0.24461 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105291 1 0.900 0.10699 0.520 0.148 0.332
#> SRR2105292 3 0.757 0.37871 0.376 0.048 0.576
#> SRR2105289 1 0.692 0.37960 0.720 0.080 0.200
#> SRR2105290 1 0.614 0.01725 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105287 1 0.765 -0.24124 0.512 0.044 0.444
#> SRR2105288 1 0.714 -0.13136 0.540 0.024 0.436
#> SRR2105285 2 0.578 0.83403 0.032 0.768 0.200
#> SRR2105286 2 0.517 0.83830 0.016 0.792 0.192
#> SRR2105283 2 0.696 0.73274 0.052 0.684 0.264
#> SRR2105284 2 0.603 0.81990 0.068 0.780 0.152
#> SRR2105281 2 0.440 0.84409 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105282 2 0.196 0.84220 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105259 1 0.589 0.38391 0.796 0.096 0.108
#> SRR2105260 1 0.847 0.23182 0.616 0.208 0.176
#> SRR2105279 2 0.207 0.83430 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105280 2 0.312 0.84993 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105257 1 0.792 -0.18762 0.488 0.056 0.456
#> SRR2105258 3 0.624 0.32644 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105253 2 0.196 0.84397 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105254 2 0.199 0.84143 0.004 0.948 0.048
#> SRR2105255 1 0.216 0.44549 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105256 1 0.254 0.44446 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105251 2 0.226 0.84631 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105252 2 0.280 0.84729 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105249 2 0.296 0.84578 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105250 2 0.392 0.83910 0.016 0.872 0.112
#> SRR2105247 2 0.426 0.84725 0.012 0.848 0.140
#> SRR2105248 2 0.263 0.83703 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105245 1 0.959 0.12565 0.468 0.224 0.308
#> SRR2105246 1 0.888 0.02182 0.464 0.416 0.120
#> SRR2105243 1 0.772 0.23091 0.620 0.072 0.308
#> SRR2105244 1 0.883 0.16719 0.560 0.152 0.288
#> SRR2105241 1 0.779 0.21839 0.632 0.084 0.284
#> SRR2105242 1 0.676 -0.06655 0.552 0.012 0.436
#> SRR2105239 1 0.795 0.30467 0.636 0.104 0.260
#> SRR2105240 1 0.652 -0.20889 0.500 0.004 0.496
#> SRR2105237 2 0.689 0.80481 0.076 0.720 0.204
#> SRR2105238 2 0.646 0.82117 0.072 0.752 0.176
#> SRR2105235 2 0.388 0.84321 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105236 2 0.355 0.82846 0.036 0.900 0.064
#> SRR2105233 2 0.429 0.83750 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105234 2 0.435 0.83668 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105231 2 0.418 0.85170 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105232 2 0.369 0.84520 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105227 2 0.999 -0.13053 0.320 0.348 0.332
#> SRR2105228 2 0.998 -0.32695 0.320 0.368 0.312
#> SRR2105225 1 0.626 0.25904 0.668 0.012 0.320
#> SRR2105226 1 0.611 0.07478 0.604 0.000 0.396
#> SRR2105229 1 0.839 0.23425 0.616 0.148 0.236
#> SRR2105230 1 0.327 0.44589 0.892 0.004 0.104
#> SRR2105219 2 0.418 0.83925 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105220 2 0.348 0.85023 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105221 2 0.617 0.73319 0.080 0.776 0.144
#> SRR2105222 2 0.611 0.53637 0.012 0.688 0.300
#> SRR2105223 1 0.563 0.42425 0.792 0.044 0.164
#> SRR2105224 1 0.522 0.29917 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105217 2 0.186 0.84139 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105218 2 0.207 0.83383 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105215 2 0.445 0.84654 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105216 2 0.226 0.84219 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105213 1 0.994 0.03840 0.380 0.284 0.336
#> SRR2105214 1 0.964 0.11205 0.468 0.276 0.256
#> SRR2105211 1 0.903 0.16726 0.552 0.260 0.188
#> SRR2105212 1 0.685 0.36473 0.740 0.136 0.124
#> SRR2105209 1 0.614 0.22898 0.684 0.012 0.304
#> SRR2105210 3 0.630 0.27595 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105207 3 0.953 0.27133 0.264 0.248 0.488
#> SRR2105208 3 0.768 0.43272 0.360 0.056 0.584
#> SRR2105205 2 0.649 0.77087 0.032 0.700 0.268
#> SRR2105206 2 0.617 0.75724 0.080 0.776 0.144
#> SRR2105201 2 0.462 0.81840 0.024 0.840 0.136
#> SRR2105202 2 0.541 0.78377 0.016 0.772 0.212
#> SRR2105203 2 0.319 0.84719 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105204 2 0.369 0.84677 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105199 2 0.455 0.84759 0.000 0.800 0.200
#> SRR2105200 2 0.465 0.82512 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105197 1 0.621 0.42370 0.756 0.052 0.192
#> SRR2105198 1 0.959 0.13409 0.476 0.244 0.280
#> SRR2105195 1 0.933 0.08565 0.516 0.216 0.268
#> SRR2105196 1 0.965 -0.00952 0.464 0.292 0.244
#> SRR2105193 3 0.759 0.21877 0.476 0.040 0.484
#> SRR2105194 1 0.631 -0.17771 0.512 0.000 0.488
#> SRR2105191 1 0.798 0.34905 0.636 0.108 0.256
#> SRR2105192 1 0.634 0.03424 0.596 0.004 0.400
#> SRR2105189 2 0.533 0.84306 0.024 0.792 0.184
#> SRR2105190 2 0.226 0.84633 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105187 2 0.788 0.75105 0.100 0.640 0.260
#> SRR2105188 2 0.937 0.43062 0.188 0.488 0.324
#> SRR2105179 1 0.818 0.13622 0.584 0.092 0.324
#> SRR2105180 1 0.798 -0.20920 0.500 0.060 0.440
#> SRR2105183 2 0.294 0.83350 0.012 0.916 0.072
#> SRR2105184 2 0.441 0.81586 0.008 0.832 0.160
#> SRR2105185 2 0.423 0.84702 0.004 0.836 0.160
#> SRR2105186 2 0.429 0.83333 0.004 0.832 0.164
#> SRR2105181 1 0.706 0.29654 0.724 0.164 0.112
#> SRR2105182 1 0.313 0.45868 0.904 0.008 0.088
#> SRR2105177 3 0.829 0.44101 0.320 0.100 0.580
#> SRR2105178 3 0.623 0.34153 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105171 2 0.440 0.84181 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105172 2 0.445 0.84246 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105175 3 0.875 0.42153 0.320 0.132 0.548
#> SRR2105176 1 0.631 -0.20790 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105173 2 0.303 0.85144 0.004 0.904 0.092
#> SRR2105174 2 0.207 0.83961 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105169 2 0.341 0.84859 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105170 2 0.511 0.72078 0.008 0.780 0.212
#> SRR2105167 2 0.296 0.84810 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105168 2 0.327 0.84304 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105165 1 0.520 0.36965 0.772 0.008 0.220
#> SRR2105166 1 0.588 0.21924 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105163 1 0.949 0.14673 0.480 0.208 0.312
#> SRR2105164 1 0.688 0.31214 0.648 0.032 0.320
#> SRR2105161 3 0.761 0.34623 0.388 0.048 0.564
#> SRR2105162 3 0.728 0.44292 0.292 0.056 0.652
#> SRR2105155 2 0.216 0.83643 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105156 2 0.186 0.82911 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105157 2 0.362 0.84881 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105158 2 0.236 0.83707 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105159 3 0.898 -0.03313 0.428 0.128 0.444
#> SRR2105160 3 0.748 0.36785 0.356 0.048 0.596
#> SRR2105153 2 0.369 0.84407 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105154 2 0.388 0.84683 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105151 2 0.445 0.84422 0.032 0.856 0.112
#> SRR2105152 2 0.254 0.84037 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105149 1 0.864 0.25257 0.600 0.188 0.212
#> SRR2105150 1 0.904 0.16791 0.556 0.204 0.240
#> SRR2105147 3 0.994 -0.14444 0.328 0.288 0.384
#> SRR2105148 3 0.995 -0.14629 0.328 0.292 0.380
#> SRR2105143 3 0.926 0.26495 0.376 0.160 0.464
#> SRR2105144 3 0.857 0.39428 0.288 0.132 0.580
#> SRR2105145 1 0.972 -0.22639 0.392 0.220 0.388
#> SRR2105146 1 0.664 -0.09201 0.544 0.008 0.448
#> SRR2105141 2 0.341 0.85181 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105142 2 0.245 0.84313 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105139 2 0.263 0.84714 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105140 2 0.337 0.82780 0.024 0.904 0.072
#> SRR2105137 2 0.512 0.75051 0.012 0.788 0.200
#> SRR2105138 2 0.782 0.49343 0.072 0.604 0.324
#> SRR2105135 2 0.341 0.84845 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105136 2 0.288 0.84245 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105133 1 0.629 0.40387 0.768 0.080 0.152
#> SRR2105134 1 0.653 0.28950 0.704 0.036 0.260
#> SRR2105131 2 0.903 0.63182 0.188 0.552 0.260
#> SRR2105132 3 0.946 0.15998 0.372 0.184 0.444
#> SRR2105129 3 0.791 0.32522 0.452 0.056 0.492
#> SRR2105130 3 0.794 0.44735 0.332 0.076 0.592
#> SRR2105127 1 0.798 0.12115 0.572 0.072 0.356
#> SRR2105128 1 0.900 0.07651 0.532 0.156 0.312
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.415 0.53240 0.156 0.016 0.816 0.012
#> SRR2105278 3 0.398 0.48897 0.220 0.000 0.776 0.004
#> SRR2105275 3 0.760 0.38005 0.240 0.168 0.568 0.024
#> SRR2105276 3 0.642 0.42822 0.236 0.052 0.672 0.040
#> SRR2105273 3 0.488 0.13618 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR2105274 1 0.513 0.23593 0.552 0.000 0.444 0.004
#> SRR2105271 3 0.589 0.28356 0.364 0.012 0.600 0.024
#> SRR2105272 3 0.585 -0.08978 0.460 0.000 0.508 0.032
#> SRR2105269 2 0.358 0.57509 0.000 0.832 0.012 0.156
#> SRR2105270 2 0.440 0.57991 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR2105267 2 0.316 0.56611 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR2105268 2 0.425 0.57686 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105265 2 0.413 0.58685 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105266 2 0.509 0.52251 0.004 0.572 0.000 0.424
#> SRR2105263 2 0.623 0.47580 0.052 0.572 0.004 0.372
#> SRR2105264 2 0.547 0.54905 0.024 0.612 0.000 0.364
#> SRR2105261 2 0.599 0.31148 0.020 0.700 0.220 0.060
#> SRR2105262 2 0.867 0.23220 0.068 0.484 0.248 0.200
#> SRR2105357 3 0.768 0.19634 0.040 0.280 0.560 0.120
#> SRR2105358 3 0.353 0.56085 0.044 0.056 0.880 0.020
#> SRR2105439 2 0.593 0.54024 0.040 0.632 0.008 0.320
#> SRR2105440 2 0.559 0.52982 0.032 0.672 0.008 0.288
#> SRR2105509 2 0.322 0.55960 0.000 0.860 0.012 0.128
#> SRR2105510 2 0.316 0.54790 0.000 0.872 0.020 0.108
#> SRR2105507 3 0.487 0.14338 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR2105508 3 0.612 0.33274 0.312 0.040 0.632 0.016
#> SRR2105505 1 0.760 0.32233 0.556 0.076 0.308 0.060
#> SRR2105506 1 0.364 0.61309 0.820 0.008 0.172 0.000
#> SRR2105503 2 0.407 0.58352 0.004 0.792 0.008 0.196
#> SRR2105504 2 0.728 -0.32526 0.044 0.460 0.052 0.444
#> SRR2105501 2 0.687 0.47298 0.016 0.592 0.088 0.304
#> SRR2105502 2 0.715 -0.31673 0.048 0.456 0.040 0.456
#> SRR2105499 3 0.427 0.55435 0.124 0.032 0.828 0.016
#> SRR2105500 3 0.572 0.52679 0.176 0.068 0.736 0.020
#> SRR2105497 2 0.526 0.52669 0.004 0.612 0.008 0.376
#> SRR2105498 2 0.799 0.26738 0.108 0.476 0.048 0.368
#> SRR2105495 2 0.437 0.59645 0.000 0.728 0.004 0.268
#> SRR2105496 2 0.542 0.55516 0.012 0.628 0.008 0.352
#> SRR2105493 2 0.587 0.52778 0.008 0.644 0.040 0.308
#> SRR2105494 2 0.606 0.51793 0.048 0.628 0.008 0.316
#> SRR2105491 2 0.580 0.56365 0.040 0.696 0.020 0.244
#> SRR2105492 2 0.741 0.32845 0.108 0.472 0.016 0.404
#> SRR2105489 2 0.594 0.49892 0.024 0.544 0.008 0.424
#> SRR2105490 4 0.742 -0.17666 0.136 0.368 0.008 0.488
#> SRR2105487 3 0.814 0.10328 0.380 0.084 0.460 0.076
#> SRR2105488 1 0.724 0.11512 0.504 0.052 0.400 0.044
#> SRR2105485 3 0.683 0.51289 0.200 0.080 0.668 0.052
#> SRR2105486 3 0.542 0.51436 0.188 0.036 0.748 0.028
#> SRR2105483 1 0.192 0.61051 0.944 0.004 0.028 0.024
#> SRR2105484 1 0.192 0.61076 0.944 0.004 0.028 0.024
#> SRR2105481 3 0.495 0.27062 0.376 0.004 0.620 0.000
#> SRR2105482 1 0.369 0.59555 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105479 1 0.839 0.28984 0.492 0.096 0.316 0.096
#> SRR2105480 1 0.541 0.42674 0.604 0.008 0.380 0.008
#> SRR2105477 2 0.825 0.26570 0.084 0.512 0.100 0.304
#> SRR2105478 2 0.776 0.34331 0.024 0.528 0.156 0.292
#> SRR2105475 2 0.381 0.59561 0.000 0.804 0.008 0.188
#> SRR2105476 2 0.354 0.59604 0.000 0.828 0.008 0.164
#> SRR2105473 2 0.816 0.01932 0.216 0.404 0.016 0.364
#> SRR2105474 4 0.737 -0.16443 0.160 0.416 0.000 0.424
#> SRR2105471 2 0.690 0.39455 0.088 0.532 0.008 0.372
#> SRR2105472 4 0.720 -0.23970 0.120 0.408 0.004 0.468
#> SRR2105469 3 0.807 0.18130 0.312 0.164 0.492 0.032
#> SRR2105470 3 0.699 -0.04217 0.452 0.064 0.464 0.020
#> SRR2105467 3 0.597 0.36509 0.296 0.032 0.652 0.020
#> SRR2105468 3 0.591 0.00128 0.464 0.012 0.508 0.016
#> SRR2105465 1 0.696 0.53468 0.656 0.084 0.208 0.052
#> SRR2105466 1 0.504 0.61375 0.792 0.056 0.128 0.024
#> SRR2105463 1 0.328 0.62862 0.872 0.000 0.096 0.032
#> SRR2105464 1 0.255 0.62167 0.900 0.000 0.092 0.008
#> SRR2105461 2 0.437 0.58898 0.000 0.728 0.004 0.268
#> SRR2105462 2 0.508 0.57223 0.000 0.616 0.008 0.376
#> SRR2105459 2 0.303 0.57035 0.000 0.868 0.008 0.124
#> SRR2105460 2 0.345 0.58899 0.000 0.836 0.008 0.156
#> SRR2105457 3 0.495 0.55243 0.060 0.116 0.800 0.024
#> SRR2105458 3 0.596 0.49390 0.036 0.184 0.724 0.056
#> SRR2105455 1 0.825 0.06948 0.420 0.140 0.396 0.044
#> SRR2105456 1 0.544 0.34039 0.588 0.012 0.396 0.004
#> SRR2105453 1 0.453 0.58038 0.776 0.004 0.196 0.024
#> SRR2105454 1 0.417 0.60623 0.824 0.004 0.132 0.040
#> SRR2105451 2 0.665 0.48270 0.028 0.664 0.092 0.216
#> SRR2105452 4 0.835 0.32174 0.044 0.332 0.164 0.460
#> SRR2105449 1 0.832 0.34575 0.532 0.104 0.264 0.100
#> SRR2105450 1 0.513 0.47054 0.668 0.008 0.316 0.008
#> SRR2105447 2 0.406 0.56176 0.004 0.832 0.040 0.124
#> SRR2105448 2 0.401 0.58342 0.000 0.800 0.016 0.184
#> SRR2105445 2 0.788 0.21170 0.024 0.520 0.280 0.176
#> SRR2105446 3 0.913 -0.11426 0.100 0.352 0.380 0.168
#> SRR2105443 2 0.646 0.40435 0.004 0.660 0.176 0.160
#> SRR2105444 2 0.655 0.42582 0.040 0.700 0.124 0.136
#> SRR2105441 2 0.457 0.60598 0.008 0.716 0.000 0.276
#> SRR2105442 2 0.613 0.44177 0.032 0.524 0.008 0.436
#> SRR2105437 3 0.609 0.03943 0.444 0.004 0.516 0.036
#> SRR2105438 3 0.608 0.05404 0.440 0.004 0.520 0.036
#> SRR2105435 3 0.630 0.46872 0.248 0.060 0.668 0.024
#> SRR2105436 3 0.407 0.50203 0.196 0.004 0.792 0.008
#> SRR2105433 1 0.508 0.42756 0.644 0.012 0.344 0.000
#> SRR2105434 1 0.325 0.61729 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR2105431 1 0.249 0.61601 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR2105432 1 0.252 0.60968 0.912 0.000 0.064 0.024
#> SRR2105429 2 0.924 -0.02400 0.168 0.428 0.276 0.128
#> SRR2105430 2 0.661 0.38188 0.004 0.644 0.184 0.168
#> SRR2105427 2 0.326 0.57700 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR2105428 2 0.393 0.59428 0.000 0.792 0.008 0.200
#> SRR2105425 2 0.505 0.54855 0.020 0.772 0.036 0.172
#> SRR2105426 2 0.705 0.43026 0.056 0.552 0.036 0.356
#> SRR2105421 2 0.749 -0.05424 0.052 0.492 0.396 0.060
#> SRR2105422 2 0.730 -0.06037 0.052 0.504 0.396 0.048
#> SRR2105423 2 0.502 0.54980 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR2105424 2 0.465 0.55438 0.000 0.684 0.004 0.312
#> SRR2105419 3 0.738 0.43715 0.272 0.112 0.584 0.032
#> SRR2105420 3 0.764 0.37952 0.080 0.256 0.588 0.076
#> SRR2105415 1 0.247 0.62062 0.908 0.000 0.080 0.012
#> SRR2105416 1 0.222 0.61348 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR2105417 1 0.624 0.51353 0.680 0.108 0.204 0.008
#> SRR2105418 1 0.261 0.61277 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR2105413 2 0.424 0.54921 0.000 0.800 0.032 0.168
#> SRR2105414 2 0.351 0.58137 0.004 0.860 0.024 0.112
#> SRR2105409 2 0.454 0.58300 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105410 2 0.503 0.55092 0.004 0.596 0.000 0.400
#> SRR2105411 2 0.489 0.54569 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105412 2 0.507 0.52824 0.000 0.580 0.004 0.416
#> SRR2105407 3 0.199 0.55539 0.024 0.016 0.944 0.016
#> SRR2105408 3 0.249 0.55492 0.004 0.048 0.920 0.028
#> SRR2105403 3 0.598 0.50999 0.140 0.080 0.740 0.040
#> SRR2105404 3 0.526 0.43039 0.272 0.004 0.696 0.028
#> SRR2105405 1 0.631 0.31340 0.556 0.040 0.392 0.012
#> SRR2105406 1 0.519 0.60542 0.760 0.032 0.184 0.024
#> SRR2105401 2 0.328 0.55204 0.000 0.872 0.032 0.096
#> SRR2105402 4 0.836 0.33129 0.044 0.352 0.160 0.444
#> SRR2105399 2 0.632 0.44538 0.000 0.660 0.156 0.184
#> SRR2105400 2 0.455 0.49162 0.000 0.804 0.100 0.096
#> SRR2105397 2 0.695 0.18878 0.028 0.640 0.220 0.112
#> SRR2105398 2 0.658 0.07376 0.004 0.588 0.320 0.088
#> SRR2105395 2 0.476 0.54745 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105396 4 0.638 -0.43529 0.004 0.468 0.052 0.476
#> SRR2105393 2 0.506 0.57133 0.000 0.648 0.012 0.340
#> SRR2105394 2 0.494 0.48566 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR2105389 3 0.151 0.55303 0.020 0.012 0.960 0.008
#> SRR2105390 3 0.190 0.54826 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR2105391 3 0.478 0.54607 0.072 0.112 0.804 0.012
#> SRR2105392 3 0.172 0.55242 0.028 0.008 0.952 0.012
#> SRR2105385 3 0.642 0.26084 0.352 0.028 0.588 0.032
#> SRR2105386 3 0.615 -0.04670 0.460 0.032 0.500 0.008
#> SRR2105387 1 0.675 0.46936 0.676 0.100 0.184 0.040
#> SRR2105388 3 0.562 0.07247 0.428 0.004 0.552 0.016
#> SRR2105381 2 0.436 0.54818 0.000 0.808 0.056 0.136
#> SRR2105382 2 0.434 0.56109 0.004 0.732 0.000 0.264
#> SRR2105383 2 0.705 0.44955 0.056 0.552 0.036 0.356
#> SRR2105384 2 0.830 0.25253 0.096 0.496 0.088 0.320
#> SRR2105379 2 0.379 0.57794 0.016 0.844 0.012 0.128
#> SRR2105380 2 0.683 0.41765 0.140 0.652 0.020 0.188
#> SRR2105377 2 0.512 0.56867 0.016 0.700 0.008 0.276
#> SRR2105378 2 0.775 0.19371 0.176 0.436 0.008 0.380
#> SRR2105375 3 0.914 0.05592 0.360 0.184 0.364 0.092
#> SRR2105376 1 0.773 0.27903 0.548 0.048 0.300 0.104
#> SRR2105373 3 0.527 0.44233 0.264 0.020 0.704 0.012
#> SRR2105374 1 0.544 0.30083 0.560 0.000 0.424 0.016
#> SRR2105371 3 0.390 0.52404 0.164 0.000 0.816 0.020
#> SRR2105372 3 0.348 0.53432 0.148 0.000 0.840 0.012
#> SRR2105369 3 0.412 0.45370 0.236 0.000 0.760 0.004
#> SRR2105370 3 0.509 0.33870 0.336 0.008 0.652 0.004
#> SRR2105367 1 0.720 0.45014 0.668 0.116 0.124 0.092
#> SRR2105368 1 0.741 0.41069 0.652 0.128 0.100 0.120
#> SRR2105365 2 0.526 0.56436 0.020 0.672 0.004 0.304
#> SRR2105366 2 0.426 0.59225 0.008 0.792 0.012 0.188
#> SRR2105363 2 0.465 0.59080 0.000 0.704 0.008 0.288
#> SRR2105364 2 0.534 0.58123 0.004 0.672 0.024 0.300
#> SRR2105361 2 0.416 0.56804 0.000 0.768 0.008 0.224
#> SRR2105362 2 0.394 0.58669 0.000 0.800 0.012 0.188
#> SRR2105359 3 0.506 0.56075 0.132 0.060 0.788 0.020
#> SRR2105360 3 0.357 0.56391 0.100 0.028 0.864 0.008
#> SRR2105355 3 0.825 0.30968 0.256 0.224 0.488 0.032
#> SRR2105356 1 0.499 0.26251 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR2105353 3 0.414 0.55993 0.056 0.064 0.852 0.028
#> SRR2105354 3 0.317 0.53661 0.116 0.000 0.868 0.016
#> SRR2105351 2 0.419 0.58492 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105352 4 0.823 0.33063 0.044 0.368 0.140 0.448
#> SRR2105349 2 0.363 0.57836 0.000 0.828 0.012 0.160
#> SRR2105350 2 0.482 0.58241 0.000 0.692 0.012 0.296
#> SRR2105345 2 0.590 0.49937 0.048 0.604 0.000 0.348
#> SRR2105346 2 0.649 0.37051 0.072 0.492 0.000 0.436
#> SRR2105347 4 0.773 -0.06599 0.180 0.352 0.008 0.460
#> SRR2105348 4 0.830 0.07840 0.280 0.304 0.016 0.400
#> SRR2105343 2 0.385 0.58225 0.000 0.808 0.012 0.180
#> SRR2105344 2 0.476 0.56338 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105341 3 0.190 0.54794 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR2105342 3 0.440 0.52300 0.168 0.012 0.800 0.020
#> SRR2105339 3 0.474 0.56505 0.108 0.080 0.804 0.008
#> SRR2105340 3 0.508 0.49684 0.192 0.024 0.760 0.024
#> SRR2105335 1 0.541 0.03912 0.500 0.000 0.488 0.012
#> SRR2105336 1 0.531 0.44163 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR2105337 3 0.830 0.04598 0.372 0.108 0.452 0.068
#> SRR2105338 1 0.556 0.33043 0.584 0.024 0.392 0.000
#> SRR2105331 2 0.437 0.60438 0.004 0.748 0.004 0.244
#> SRR2105332 2 0.636 0.51878 0.044 0.564 0.012 0.380
#> SRR2105333 2 0.372 0.58207 0.008 0.812 0.000 0.180
#> SRR2105334 2 0.393 0.59604 0.016 0.820 0.004 0.160
#> SRR2105329 2 0.563 0.38336 0.012 0.744 0.148 0.096
#> SRR2105330 2 0.626 0.48528 0.004 0.668 0.112 0.216
#> SRR2105327 2 0.449 0.59199 0.004 0.732 0.004 0.260
#> SRR2105328 2 0.612 0.52698 0.000 0.612 0.068 0.320
#> SRR2105325 3 0.544 0.43937 0.220 0.024 0.728 0.028
#> SRR2105326 3 0.464 0.45457 0.208 0.004 0.764 0.024
#> SRR2105323 3 0.727 0.01942 0.040 0.444 0.460 0.056
#> SRR2105324 3 0.781 0.37432 0.260 0.128 0.564 0.048
#> SRR2105319 1 0.570 0.10722 0.492 0.000 0.484 0.024
#> SRR2105320 1 0.421 0.55354 0.772 0.000 0.216 0.012
#> SRR2105321 3 0.532 0.25668 0.352 0.000 0.628 0.020
#> SRR2105322 3 0.576 0.00309 0.444 0.000 0.528 0.028
#> SRR2105317 2 0.354 0.52886 0.000 0.852 0.028 0.120
#> SRR2105318 2 0.349 0.58419 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105315 2 0.694 0.29337 0.008 0.616 0.212 0.164
#> SRR2105316 2 0.304 0.55570 0.004 0.876 0.008 0.112
#> SRR2105313 2 0.381 0.60429 0.000 0.804 0.008 0.188
#> SRR2105314 2 0.428 0.56717 0.000 0.764 0.012 0.224
#> SRR2105311 3 0.797 0.40136 0.168 0.204 0.572 0.056
#> SRR2105312 3 0.872 0.28605 0.268 0.164 0.484 0.084
#> SRR2105307 1 0.676 0.48140 0.636 0.060 0.264 0.040
#> SRR2105308 1 0.561 0.58082 0.748 0.056 0.168 0.028
#> SRR2105309 3 0.617 0.47402 0.056 0.228 0.688 0.028
#> SRR2105310 3 0.274 0.55347 0.096 0.012 0.892 0.000
#> SRR2105305 3 0.159 0.55369 0.024 0.004 0.956 0.016
#> SRR2105306 3 0.266 0.54614 0.088 0.004 0.900 0.008
#> SRR2105303 2 0.472 0.58065 0.000 0.672 0.004 0.324
#> SRR2105304 4 0.721 0.27212 0.044 0.452 0.048 0.456
#> SRR2105301 2 0.499 0.58113 0.036 0.772 0.016 0.176
#> SRR2105302 2 0.439 0.60784 0.000 0.740 0.008 0.252
#> SRR2105299 2 0.776 0.23782 0.008 0.496 0.272 0.224
#> SRR2105300 2 0.741 0.22628 0.012 0.564 0.248 0.176
#> SRR2105297 1 0.728 0.00288 0.556 0.152 0.008 0.284
#> SRR2105298 1 0.688 0.14852 0.596 0.116 0.008 0.280
#> SRR2105295 2 0.299 0.53515 0.000 0.876 0.012 0.112
#> SRR2105296 2 0.335 0.58724 0.000 0.836 0.004 0.160
#> SRR2105293 3 0.822 0.19693 0.348 0.184 0.440 0.028
#> SRR2105294 1 0.527 0.23357 0.536 0.000 0.456 0.008
#> SRR2105291 1 0.799 0.17429 0.460 0.112 0.384 0.044
#> SRR2105292 1 0.430 0.61318 0.808 0.012 0.160 0.020
#> SRR2105289 3 0.664 0.29248 0.328 0.080 0.584 0.008
#> SRR2105290 1 0.430 0.51676 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105287 1 0.503 0.60984 0.768 0.036 0.180 0.016
#> SRR2105288 1 0.482 0.56551 0.736 0.004 0.240 0.020
#> SRR2105285 2 0.467 0.55668 0.000 0.780 0.052 0.168
#> SRR2105286 2 0.407 0.57800 0.016 0.836 0.024 0.124
#> SRR2105283 2 0.730 0.44073 0.120 0.620 0.040 0.220
#> SRR2105284 2 0.602 0.57283 0.024 0.688 0.048 0.240
#> SRR2105281 2 0.409 0.59070 0.000 0.776 0.008 0.216
#> SRR2105282 2 0.485 0.55339 0.004 0.644 0.000 0.352
#> SRR2105259 3 0.452 0.52475 0.016 0.136 0.812 0.036
#> SRR2105260 3 0.616 0.44280 0.024 0.220 0.692 0.064
#> SRR2105279 2 0.491 0.50247 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105280 2 0.488 0.57975 0.000 0.664 0.008 0.328
#> SRR2105257 1 0.553 0.57090 0.716 0.020 0.232 0.032
#> SRR2105258 1 0.334 0.62202 0.860 0.000 0.120 0.020
#> SRR2105253 2 0.410 0.57128 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105254 2 0.433 0.56331 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105255 3 0.361 0.53512 0.144 0.004 0.840 0.012
#> SRR2105256 3 0.384 0.52352 0.168 0.000 0.816 0.016
#> SRR2105251 2 0.470 0.56856 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105252 2 0.490 0.57033 0.000 0.660 0.008 0.332
#> SRR2105249 2 0.463 0.58192 0.000 0.688 0.004 0.308
#> SRR2105250 2 0.559 0.54473 0.008 0.608 0.016 0.368
#> SRR2105247 2 0.559 0.54300 0.004 0.568 0.016 0.412
#> SRR2105248 2 0.528 0.51577 0.004 0.560 0.004 0.432
#> SRR2105245 3 0.847 0.34962 0.208 0.224 0.508 0.060
#> SRR2105246 3 0.902 0.11196 0.104 0.320 0.424 0.152
#> SRR2105243 1 0.723 0.17781 0.480 0.064 0.424 0.032
#> SRR2105244 3 0.816 -0.05328 0.412 0.088 0.428 0.072
#> SRR2105241 1 0.710 0.19011 0.492 0.056 0.420 0.032
#> SRR2105242 1 0.466 0.51521 0.708 0.004 0.284 0.004
#> SRR2105239 3 0.722 0.28068 0.340 0.096 0.544 0.020
#> SRR2105240 1 0.447 0.58312 0.760 0.000 0.220 0.020
#> SRR2105237 2 0.494 0.54651 0.004 0.780 0.072 0.144
#> SRR2105238 2 0.550 0.55014 0.000 0.704 0.064 0.232
#> SRR2105235 2 0.405 0.58774 0.000 0.780 0.008 0.212
#> SRR2105236 2 0.586 0.50473 0.004 0.588 0.032 0.376
#> SRR2105233 2 0.248 0.58189 0.000 0.904 0.008 0.088
#> SRR2105234 2 0.222 0.58331 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105231 2 0.474 0.59298 0.000 0.668 0.004 0.328
#> SRR2105232 2 0.467 0.56050 0.008 0.700 0.000 0.292
#> SRR2105227 2 0.919 -0.13740 0.256 0.400 0.260 0.084
#> SRR2105228 2 0.946 -0.18701 0.320 0.352 0.212 0.116
#> SRR2105225 1 0.578 0.24330 0.532 0.008 0.444 0.016
#> SRR2105226 1 0.508 0.46312 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR2105229 3 0.517 0.50878 0.032 0.156 0.776 0.036
#> SRR2105230 3 0.353 0.52383 0.148 0.004 0.840 0.008
#> SRR2105219 2 0.271 0.58365 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR2105220 2 0.443 0.59949 0.000 0.720 0.004 0.276
#> SRR2105221 2 0.778 0.34944 0.076 0.500 0.060 0.364
#> SRR2105222 2 0.788 -0.08116 0.284 0.368 0.000 0.348
#> SRR2105223 3 0.583 0.38090 0.280 0.040 0.668 0.012
#> SRR2105224 3 0.498 -0.01010 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR2105217 2 0.468 0.57215 0.004 0.680 0.000 0.316
#> SRR2105218 2 0.513 0.49235 0.000 0.552 0.004 0.444
#> SRR2105215 2 0.472 0.57240 0.000 0.708 0.012 0.280
#> SRR2105216 2 0.482 0.54920 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR2105213 2 0.925 -0.34660 0.308 0.332 0.284 0.076
#> SRR2105214 2 0.892 -0.43383 0.288 0.340 0.324 0.048
#> SRR2105211 3 0.801 0.26724 0.060 0.296 0.532 0.112
#> SRR2105212 3 0.767 0.45578 0.136 0.156 0.624 0.084
#> SRR2105209 1 0.551 0.16530 0.508 0.016 0.476 0.000
#> SRR2105210 1 0.247 0.62306 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR2105207 1 0.837 0.31382 0.564 0.128 0.172 0.136
#> SRR2105208 1 0.259 0.60448 0.920 0.012 0.032 0.036
#> SRR2105205 2 0.658 0.50929 0.056 0.648 0.036 0.260
#> SRR2105206 2 0.662 0.48464 0.040 0.636 0.048 0.276
#> SRR2105201 2 0.640 0.49026 0.036 0.528 0.016 0.420
#> SRR2105202 2 0.667 0.44146 0.068 0.532 0.008 0.392
#> SRR2105203 2 0.407 0.57941 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105204 2 0.440 0.57695 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR2105199 2 0.448 0.56511 0.000 0.712 0.004 0.284
#> SRR2105200 2 0.667 0.44616 0.056 0.492 0.012 0.440
#> SRR2105197 3 0.474 0.53925 0.140 0.044 0.800 0.016
#> SRR2105198 3 0.801 0.38344 0.112 0.248 0.564 0.076
#> SRR2105195 3 0.906 0.13884 0.328 0.208 0.388 0.076
#> SRR2105196 3 0.947 0.17466 0.236 0.204 0.412 0.148
#> SRR2105193 1 0.426 0.59134 0.792 0.012 0.188 0.008
#> SRR2105194 1 0.335 0.60466 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR2105191 3 0.778 0.43988 0.220 0.124 0.592 0.064
#> SRR2105192 1 0.509 0.39976 0.640 0.000 0.348 0.012
#> SRR2105189 2 0.518 0.54886 0.004 0.744 0.052 0.200
#> SRR2105190 2 0.430 0.58428 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105187 2 0.679 0.36041 0.032 0.672 0.132 0.164
#> SRR2105188 2 0.962 -0.10763 0.160 0.384 0.240 0.216
#> SRR2105179 1 0.712 0.19540 0.488 0.052 0.424 0.036
#> SRR2105180 1 0.628 0.55258 0.668 0.028 0.252 0.052
#> SRR2105183 2 0.540 0.48163 0.008 0.560 0.004 0.428
#> SRR2105184 2 0.686 0.34473 0.088 0.480 0.004 0.428
#> SRR2105185 2 0.411 0.59841 0.008 0.788 0.004 0.200
#> SRR2105186 2 0.689 0.45030 0.068 0.520 0.016 0.396
#> SRR2105181 3 0.659 0.49267 0.128 0.116 0.704 0.052
#> SRR2105182 3 0.363 0.53580 0.136 0.004 0.844 0.016
#> SRR2105177 1 0.321 0.60247 0.896 0.044 0.036 0.024
#> SRR2105178 1 0.189 0.61330 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR2105171 2 0.455 0.58107 0.000 0.732 0.012 0.256
#> SRR2105172 2 0.448 0.54678 0.000 0.712 0.004 0.284
#> SRR2105175 1 0.527 0.57168 0.788 0.040 0.112 0.060
#> SRR2105176 1 0.325 0.61336 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR2105173 2 0.472 0.59395 0.000 0.692 0.008 0.300
#> SRR2105174 2 0.471 0.54311 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105169 2 0.448 0.58828 0.004 0.712 0.000 0.284
#> SRR2105170 4 0.747 -0.08025 0.180 0.368 0.000 0.452
#> SRR2105167 2 0.485 0.55414 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105168 2 0.543 0.51449 0.016 0.568 0.000 0.416
#> SRR2105165 3 0.524 0.24560 0.372 0.008 0.616 0.004
#> SRR2105166 1 0.516 0.19837 0.516 0.000 0.480 0.004
#> SRR2105163 3 0.834 0.36174 0.208 0.212 0.524 0.056
#> SRR2105164 3 0.743 0.36341 0.272 0.072 0.592 0.064
#> SRR2105161 1 0.423 0.62794 0.840 0.036 0.100 0.024
#> SRR2105162 1 0.302 0.60577 0.900 0.016 0.060 0.024
#> SRR2105155 2 0.468 0.54041 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105156 2 0.487 0.51941 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105157 2 0.474 0.56894 0.004 0.696 0.004 0.296
#> SRR2105158 2 0.530 0.49923 0.012 0.580 0.000 0.408
#> SRR2105159 1 0.836 -0.06411 0.416 0.124 0.400 0.060
#> SRR2105160 1 0.529 0.58692 0.772 0.032 0.152 0.044
#> SRR2105153 2 0.397 0.58469 0.004 0.792 0.004 0.200
#> SRR2105154 2 0.409 0.60083 0.004 0.780 0.004 0.212
#> SRR2105151 2 0.559 0.53649 0.000 0.600 0.028 0.372
#> SRR2105152 2 0.541 0.50680 0.020 0.604 0.000 0.376
#> SRR2105149 3 0.808 0.40627 0.112 0.272 0.544 0.072
#> SRR2105150 3 0.706 0.41178 0.052 0.288 0.604 0.056
#> SRR2105147 4 0.887 0.16998 0.060 0.260 0.252 0.428
#> SRR2105148 4 0.890 0.15587 0.064 0.248 0.256 0.432
#> SRR2105143 1 0.790 0.44451 0.604 0.156 0.152 0.088
#> SRR2105144 1 0.697 0.51296 0.676 0.068 0.160 0.096
#> SRR2105145 1 0.837 0.38093 0.548 0.116 0.224 0.112
#> SRR2105146 1 0.463 0.53362 0.720 0.000 0.268 0.012
#> SRR2105141 2 0.448 0.59151 0.008 0.748 0.004 0.240
#> SRR2105142 2 0.494 0.57532 0.008 0.700 0.008 0.284
#> SRR2105139 2 0.524 0.56672 0.004 0.616 0.008 0.372
#> SRR2105140 2 0.580 0.46027 0.008 0.512 0.016 0.464
#> SRR2105137 2 0.686 0.37561 0.092 0.512 0.004 0.392
#> SRR2105138 4 0.896 0.05840 0.248 0.336 0.056 0.360
#> SRR2105135 2 0.445 0.57813 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105136 2 0.538 0.51374 0.016 0.588 0.000 0.396
#> SRR2105133 3 0.569 0.51894 0.164 0.068 0.744 0.024
#> SRR2105134 3 0.557 0.21014 0.404 0.016 0.576 0.004
#> SRR2105131 2 0.654 0.28608 0.008 0.656 0.204 0.132
#> SRR2105132 1 0.894 0.19747 0.468 0.164 0.264 0.104
#> SRR2105129 1 0.468 0.62239 0.804 0.036 0.140 0.020
#> SRR2105130 1 0.276 0.60165 0.912 0.012 0.028 0.048
#> SRR2105127 1 0.733 0.31155 0.528 0.068 0.364 0.040
#> SRR2105128 1 0.870 0.08230 0.412 0.136 0.372 0.080
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.6175 0.53691 0.104 0.020 0.696 0.112 0.068
#> SRR2105278 3 0.5859 0.51477 0.168 0.000 0.676 0.116 0.040
#> SRR2105275 3 0.7972 0.40497 0.164 0.076 0.540 0.056 0.164
#> SRR2105276 3 0.5947 0.48513 0.128 0.012 0.704 0.060 0.096
#> SRR2105273 3 0.5210 0.18044 0.384 0.000 0.576 0.028 0.012
#> SRR2105274 1 0.5048 0.14605 0.516 0.004 0.460 0.012 0.008
#> SRR2105271 3 0.5741 0.37105 0.300 0.008 0.624 0.032 0.036
#> SRR2105272 3 0.5585 0.13626 0.388 0.000 0.552 0.044 0.016
#> SRR2105269 5 0.4147 0.31393 0.000 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR2105270 5 0.4397 -0.06935 0.000 0.432 0.000 0.004 0.564
#> SRR2105267 5 0.3816 0.31902 0.000 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR2105268 2 0.3861 0.39265 0.000 0.712 0.000 0.004 0.284
#> SRR2105265 2 0.4288 0.16453 0.000 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR2105266 2 0.2674 0.49619 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR2105263 2 0.4653 0.43300 0.024 0.680 0.000 0.008 0.288
#> SRR2105264 2 0.5124 0.40902 0.036 0.636 0.000 0.012 0.316
#> SRR2105261 5 0.7333 0.33227 0.012 0.236 0.132 0.072 0.548
#> SRR2105262 2 0.8524 0.02664 0.052 0.444 0.164 0.088 0.252
#> SRR2105357 5 0.7669 -0.12910 0.024 0.048 0.372 0.132 0.424
#> SRR2105358 3 0.5031 0.54882 0.020 0.000 0.740 0.124 0.116
#> SRR2105439 2 0.5123 0.10770 0.028 0.492 0.000 0.004 0.476
#> SRR2105440 5 0.4426 0.13910 0.004 0.380 0.000 0.004 0.612
#> SRR2105509 5 0.4207 0.35990 0.000 0.276 0.008 0.008 0.708
#> SRR2105510 5 0.3086 0.37045 0.000 0.180 0.004 0.000 0.816
#> SRR2105507 3 0.5493 0.20417 0.376 0.000 0.568 0.040 0.016
#> SRR2105508 3 0.6605 0.37274 0.264 0.000 0.580 0.092 0.064
#> SRR2105505 1 0.7304 0.28800 0.512 0.008 0.284 0.056 0.140
#> SRR2105506 1 0.3441 0.59825 0.824 0.004 0.148 0.024 0.000
#> SRR2105503 5 0.4480 0.06488 0.004 0.400 0.000 0.004 0.592
#> SRR2105504 4 0.3250 0.84965 0.000 0.008 0.004 0.820 0.168
#> SRR2105501 2 0.5959 0.24096 0.032 0.540 0.032 0.008 0.388
#> SRR2105502 4 0.3488 0.83549 0.000 0.008 0.008 0.804 0.180
#> SRR2105499 3 0.5338 0.54404 0.112 0.000 0.736 0.092 0.060
#> SRR2105500 3 0.6136 0.54269 0.132 0.020 0.696 0.064 0.088
#> SRR2105497 2 0.2818 0.48933 0.000 0.860 0.004 0.008 0.128
#> SRR2105498 2 0.4898 0.45538 0.060 0.760 0.024 0.008 0.148
#> SRR2105495 2 0.4415 0.30366 0.000 0.604 0.000 0.008 0.388
#> SRR2105496 2 0.3962 0.45538 0.012 0.744 0.000 0.004 0.240
#> SRR2105493 5 0.4307 -0.22131 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR2105494 5 0.4936 -0.22125 0.012 0.460 0.004 0.004 0.520
#> SRR2105491 2 0.5636 0.10629 0.032 0.508 0.008 0.012 0.440
#> SRR2105492 2 0.6017 0.38547 0.076 0.600 0.008 0.016 0.300
#> SRR2105489 2 0.4339 0.36224 0.012 0.652 0.000 0.000 0.336
#> SRR2105490 2 0.4424 0.42958 0.084 0.768 0.000 0.004 0.144
#> SRR2105487 3 0.8172 0.21768 0.316 0.044 0.440 0.072 0.128
#> SRR2105488 1 0.7182 -0.04851 0.448 0.016 0.400 0.056 0.080
#> SRR2105485 3 0.7197 0.49674 0.160 0.012 0.592 0.100 0.136
#> SRR2105486 3 0.6461 0.48388 0.180 0.008 0.644 0.108 0.060
#> SRR2105483 1 0.1728 0.59912 0.940 0.036 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105484 1 0.1750 0.59881 0.936 0.036 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105481 3 0.5283 0.33451 0.348 0.000 0.604 0.020 0.028
#> SRR2105482 1 0.3877 0.57608 0.764 0.000 0.212 0.024 0.000
#> SRR2105479 1 0.7943 0.19109 0.428 0.188 0.312 0.044 0.028
#> SRR2105480 1 0.5404 0.39662 0.604 0.000 0.336 0.048 0.012
#> SRR2105477 2 0.6765 0.26780 0.056 0.528 0.080 0.004 0.332
#> SRR2105478 2 0.6425 0.00291 0.008 0.460 0.136 0.000 0.396
#> SRR2105475 2 0.4589 0.17096 0.000 0.520 0.004 0.004 0.472
#> SRR2105476 5 0.4449 -0.00115 0.000 0.388 0.004 0.004 0.604
#> SRR2105473 2 0.6246 0.22789 0.192 0.536 0.000 0.000 0.272
#> SRR2105474 2 0.4169 0.45193 0.116 0.784 0.000 0.000 0.100
#> SRR2105471 2 0.4658 0.35159 0.028 0.672 0.000 0.004 0.296
#> SRR2105472 2 0.4433 0.43345 0.076 0.764 0.000 0.004 0.156
#> SRR2105469 3 0.8749 0.22053 0.300 0.068 0.400 0.100 0.132
#> SRR2105470 3 0.6429 0.01348 0.432 0.004 0.452 0.016 0.096
#> SRR2105467 3 0.6875 0.36934 0.288 0.004 0.552 0.080 0.076
#> SRR2105468 3 0.6303 0.07639 0.436 0.004 0.464 0.076 0.020
#> SRR2105465 1 0.6523 0.53214 0.656 0.092 0.172 0.024 0.056
#> SRR2105466 1 0.3899 0.61137 0.836 0.032 0.096 0.024 0.012
#> SRR2105463 1 0.2866 0.62035 0.884 0.020 0.076 0.020 0.000
#> SRR2105464 1 0.2209 0.61353 0.912 0.000 0.056 0.032 0.000
#> SRR2105461 2 0.4298 0.28429 0.000 0.640 0.000 0.008 0.352
#> SRR2105462 2 0.4341 0.31864 0.000 0.628 0.000 0.008 0.364
#> SRR2105459 5 0.4313 0.23594 0.000 0.356 0.000 0.008 0.636
#> SRR2105460 5 0.4434 0.11598 0.000 0.460 0.000 0.004 0.536
#> SRR2105457 3 0.5680 0.53574 0.032 0.000 0.680 0.096 0.192
#> SRR2105458 3 0.7068 0.42954 0.016 0.040 0.548 0.124 0.272
#> SRR2105455 3 0.7933 -0.05130 0.396 0.072 0.396 0.040 0.096
#> SRR2105456 1 0.5312 0.29900 0.568 0.000 0.388 0.028 0.016
#> SRR2105453 1 0.4798 0.51616 0.716 0.004 0.224 0.052 0.004
#> SRR2105454 1 0.4036 0.57158 0.796 0.004 0.152 0.044 0.004
#> SRR2105451 5 0.5790 0.31989 0.028 0.228 0.056 0.016 0.672
#> SRR2105452 4 0.2819 0.86090 0.000 0.004 0.060 0.884 0.052
#> SRR2105449 1 0.7935 0.26375 0.468 0.188 0.264 0.048 0.032
#> SRR2105450 1 0.5087 0.43457 0.636 0.000 0.320 0.028 0.016
#> SRR2105447 5 0.4725 0.32652 0.000 0.280 0.036 0.004 0.680
#> SRR2105448 5 0.4695 -0.00499 0.000 0.464 0.004 0.008 0.524
#> SRR2105445 5 0.7502 0.27139 0.024 0.160 0.176 0.076 0.564
#> SRR2105446 5 0.9113 0.18219 0.068 0.208 0.244 0.112 0.368
#> SRR2105443 5 0.6841 0.25128 0.000 0.284 0.144 0.040 0.532
#> SRR2105444 5 0.6850 0.22287 0.012 0.320 0.152 0.012 0.504
#> SRR2105441 2 0.4443 0.12386 0.004 0.524 0.000 0.000 0.472
#> SRR2105442 2 0.2574 0.49182 0.012 0.876 0.000 0.000 0.112
#> SRR2105437 3 0.6800 0.26851 0.308 0.000 0.536 0.072 0.084
#> SRR2105438 3 0.6477 0.23353 0.336 0.000 0.540 0.072 0.052
#> SRR2105435 3 0.6190 0.50486 0.196 0.032 0.672 0.048 0.052
#> SRR2105436 3 0.3543 0.52411 0.136 0.000 0.828 0.024 0.012
#> SRR2105433 1 0.5146 0.40737 0.628 0.012 0.332 0.020 0.008
#> SRR2105434 1 0.2984 0.60026 0.856 0.000 0.124 0.016 0.004
#> SRR2105431 1 0.1818 0.60785 0.932 0.000 0.044 0.024 0.000
#> SRR2105432 1 0.2110 0.59551 0.912 0.000 0.072 0.016 0.000
#> SRR2105429 5 0.8510 0.22274 0.152 0.160 0.200 0.032 0.456
#> SRR2105430 2 0.6850 -0.07269 0.000 0.416 0.192 0.012 0.380
#> SRR2105427 5 0.3861 0.31309 0.000 0.284 0.000 0.004 0.712
#> SRR2105428 5 0.4478 0.12777 0.000 0.360 0.004 0.008 0.628
#> SRR2105425 5 0.4862 0.30161 0.012 0.336 0.012 0.004 0.636
#> SRR2105426 2 0.4191 0.45612 0.032 0.772 0.012 0.000 0.184
#> SRR2105421 5 0.7914 0.27999 0.024 0.108 0.252 0.116 0.500
#> SRR2105422 5 0.8268 0.20534 0.044 0.152 0.328 0.064 0.412
#> SRR2105423 2 0.4489 0.07659 0.000 0.572 0.000 0.008 0.420
#> SRR2105424 2 0.4410 0.04942 0.000 0.556 0.000 0.004 0.440
#> SRR2105419 3 0.7614 0.39890 0.264 0.004 0.464 0.060 0.208
#> SRR2105420 3 0.8433 0.34975 0.080 0.088 0.452 0.096 0.284
#> SRR2105415 1 0.2804 0.60817 0.892 0.016 0.068 0.020 0.004
#> SRR2105416 1 0.1728 0.60194 0.940 0.000 0.036 0.020 0.004
#> SRR2105417 1 0.6263 0.48033 0.636 0.008 0.192 0.024 0.140
#> SRR2105418 1 0.2414 0.59108 0.900 0.000 0.080 0.012 0.008
#> SRR2105413 5 0.3934 0.30913 0.000 0.244 0.000 0.016 0.740
#> SRR2105414 5 0.4928 0.13362 0.000 0.428 0.020 0.004 0.548
#> SRR2105409 5 0.4403 -0.04003 0.000 0.436 0.000 0.004 0.560
#> SRR2105410 2 0.4580 0.18552 0.004 0.532 0.000 0.004 0.460
#> SRR2105411 2 0.4067 0.42353 0.000 0.692 0.000 0.008 0.300
#> SRR2105412 2 0.4067 0.37581 0.000 0.692 0.000 0.008 0.300
#> SRR2105407 3 0.3924 0.55178 0.004 0.000 0.808 0.120 0.068
#> SRR2105408 3 0.5121 0.54229 0.000 0.008 0.716 0.144 0.132
#> SRR2105403 3 0.6946 0.47553 0.124 0.004 0.608 0.128 0.136
#> SRR2105404 3 0.6809 0.43066 0.260 0.004 0.564 0.128 0.044
#> SRR2105405 1 0.5966 0.27293 0.536 0.008 0.388 0.016 0.052
#> SRR2105406 1 0.5012 0.58502 0.744 0.024 0.180 0.032 0.020
#> SRR2105401 5 0.4030 0.34861 0.000 0.248 0.008 0.008 0.736
#> SRR2105402 4 0.2929 0.85519 0.000 0.008 0.068 0.880 0.044
#> SRR2105399 5 0.7130 0.14949 0.000 0.376 0.076 0.096 0.452
#> SRR2105400 5 0.5656 0.36578 0.000 0.216 0.032 0.080 0.672
#> SRR2105397 5 0.7800 0.20413 0.016 0.240 0.256 0.044 0.444
#> SRR2105398 5 0.6910 0.23717 0.000 0.168 0.312 0.028 0.492
#> SRR2105395 2 0.3196 0.47937 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR2105396 2 0.3915 0.46826 0.004 0.788 0.024 0.004 0.180
#> SRR2105393 2 0.4440 0.19137 0.000 0.528 0.000 0.004 0.468
#> SRR2105394 2 0.2439 0.48806 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR2105389 3 0.4223 0.55798 0.012 0.008 0.804 0.124 0.052
#> SRR2105390 3 0.3191 0.55164 0.060 0.000 0.868 0.060 0.012
#> SRR2105391 3 0.6847 0.52981 0.080 0.040 0.652 0.132 0.096
#> SRR2105392 3 0.4182 0.55515 0.024 0.000 0.804 0.120 0.052
#> SRR2105385 3 0.6242 0.28178 0.316 0.052 0.584 0.036 0.012
#> SRR2105386 3 0.5596 -0.01993 0.444 0.004 0.504 0.012 0.036
#> SRR2105387 1 0.6714 0.43661 0.624 0.008 0.164 0.064 0.140
#> SRR2105388 3 0.5608 0.15533 0.364 0.004 0.576 0.040 0.016
#> SRR2105381 5 0.4977 0.07767 0.000 0.444 0.008 0.016 0.532
#> SRR2105382 2 0.4270 0.34727 0.000 0.656 0.004 0.004 0.336
#> SRR2105383 2 0.5653 0.28629 0.024 0.560 0.024 0.008 0.384
#> SRR2105384 2 0.6026 0.38459 0.064 0.660 0.060 0.004 0.212
#> SRR2105379 5 0.4619 0.21974 0.004 0.396 0.004 0.004 0.592
#> SRR2105380 2 0.7061 0.03389 0.144 0.460 0.016 0.016 0.364
#> SRR2105377 5 0.4206 0.18977 0.016 0.288 0.000 0.000 0.696
#> SRR2105378 2 0.6009 0.22322 0.136 0.544 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105375 3 0.8782 0.13478 0.312 0.064 0.344 0.064 0.216
#> SRR2105376 1 0.7445 0.20171 0.516 0.040 0.308 0.072 0.064
#> SRR2105373 3 0.5657 0.47574 0.236 0.016 0.676 0.040 0.032
#> SRR2105374 1 0.6059 0.11351 0.512 0.000 0.404 0.044 0.040
#> SRR2105371 3 0.3976 0.52938 0.124 0.000 0.812 0.048 0.016
#> SRR2105372 3 0.3971 0.53602 0.124 0.000 0.804 0.068 0.004
#> SRR2105369 3 0.5305 0.45821 0.204 0.000 0.680 0.112 0.004
#> SRR2105370 3 0.5481 0.32190 0.324 0.000 0.608 0.056 0.012
#> SRR2105367 1 0.6836 0.44198 0.636 0.096 0.116 0.016 0.136
#> SRR2105368 1 0.6363 0.45573 0.664 0.176 0.092 0.024 0.044
#> SRR2105365 2 0.4342 0.42761 0.012 0.724 0.000 0.016 0.248
#> SRR2105366 5 0.5084 -0.04012 0.020 0.484 0.000 0.008 0.488
#> SRR2105363 2 0.4446 0.08433 0.000 0.520 0.000 0.004 0.476
#> SRR2105364 2 0.4403 0.26021 0.000 0.560 0.004 0.000 0.436
#> SRR2105361 5 0.4273 0.10250 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR2105362 5 0.4294 0.07314 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR2105359 3 0.5971 0.56023 0.124 0.004 0.696 0.088 0.088
#> SRR2105360 3 0.4626 0.56955 0.072 0.004 0.792 0.092 0.040
#> SRR2105355 3 0.9137 0.27078 0.248 0.056 0.336 0.120 0.240
#> SRR2105356 1 0.5114 0.16409 0.512 0.000 0.456 0.028 0.004
#> SRR2105353 3 0.4836 0.55251 0.028 0.024 0.788 0.064 0.096
#> SRR2105354 3 0.3816 0.53254 0.100 0.000 0.828 0.056 0.016
#> SRR2105351 2 0.3969 0.34852 0.000 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR2105352 4 0.3065 0.87261 0.000 0.008 0.048 0.872 0.072
#> SRR2105349 2 0.4594 0.09707 0.000 0.508 0.004 0.004 0.484
#> SRR2105350 2 0.3752 0.40532 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105345 2 0.4058 0.47112 0.024 0.740 0.000 0.000 0.236
#> SRR2105346 2 0.3934 0.46835 0.016 0.740 0.000 0.000 0.244
#> SRR2105347 2 0.4017 0.42545 0.128 0.800 0.000 0.004 0.068
#> SRR2105348 2 0.5982 0.27429 0.240 0.620 0.008 0.004 0.128
#> SRR2105343 5 0.4166 0.27752 0.000 0.348 0.000 0.004 0.648
#> SRR2105344 2 0.4047 0.40816 0.000 0.676 0.000 0.004 0.320
#> SRR2105341 3 0.2960 0.55471 0.036 0.000 0.876 0.080 0.008
#> SRR2105342 3 0.4906 0.50811 0.160 0.012 0.752 0.064 0.012
#> SRR2105339 3 0.6541 0.56615 0.088 0.048 0.684 0.088 0.092
#> SRR2105340 3 0.5185 0.51649 0.144 0.004 0.744 0.064 0.044
#> SRR2105335 3 0.5514 0.14938 0.420 0.000 0.528 0.036 0.016
#> SRR2105336 1 0.5370 0.26855 0.544 0.000 0.408 0.040 0.008
#> SRR2105337 3 0.8276 0.11931 0.304 0.148 0.432 0.076 0.040
#> SRR2105338 1 0.5445 0.23989 0.536 0.004 0.420 0.024 0.016
#> SRR2105331 2 0.4758 0.18774 0.008 0.560 0.000 0.008 0.424
#> SRR2105332 2 0.4425 0.47385 0.040 0.716 0.000 0.000 0.244
#> SRR2105333 2 0.4390 0.21255 0.000 0.568 0.000 0.004 0.428
#> SRR2105334 5 0.4803 -0.04887 0.012 0.484 0.000 0.004 0.500
#> SRR2105329 5 0.5351 0.38420 0.012 0.100 0.080 0.056 0.752
#> SRR2105330 2 0.5495 0.21786 0.008 0.512 0.024 0.012 0.444
#> SRR2105327 2 0.3885 0.39698 0.008 0.724 0.000 0.000 0.268
#> SRR2105328 2 0.4082 0.45173 0.016 0.768 0.016 0.000 0.200
#> SRR2105325 3 0.5746 0.50494 0.108 0.012 0.724 0.072 0.084
#> SRR2105326 3 0.4929 0.51371 0.080 0.008 0.780 0.068 0.064
#> SRR2105323 5 0.7934 0.02831 0.024 0.076 0.336 0.128 0.436
#> SRR2105324 3 0.8453 0.39681 0.228 0.064 0.480 0.116 0.112
#> SRR2105319 3 0.5929 0.18450 0.380 0.000 0.540 0.052 0.028
#> SRR2105320 1 0.5026 0.43352 0.688 0.000 0.244 0.060 0.008
#> SRR2105321 3 0.5367 0.40291 0.248 0.000 0.672 0.056 0.024
#> SRR2105322 3 0.5764 0.23623 0.336 0.000 0.584 0.060 0.020
#> SRR2105317 5 0.3988 0.34780 0.000 0.252 0.000 0.016 0.732
#> SRR2105318 5 0.4356 0.30582 0.000 0.340 0.000 0.012 0.648
#> SRR2105315 5 0.7199 0.23395 0.020 0.260 0.128 0.044 0.548
#> SRR2105316 5 0.3333 0.34184 0.000 0.208 0.000 0.004 0.788
#> SRR2105313 5 0.4273 0.11471 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR2105314 5 0.3969 0.23705 0.000 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR2105311 3 0.7819 0.42613 0.104 0.068 0.544 0.064 0.220
#> SRR2105312 3 0.8521 0.32443 0.204 0.140 0.468 0.044 0.144
#> SRR2105307 1 0.7099 0.44775 0.600 0.052 0.216 0.088 0.044
#> SRR2105308 1 0.5693 0.55722 0.704 0.048 0.184 0.016 0.048
#> SRR2105309 3 0.7194 0.43984 0.048 0.020 0.528 0.104 0.300
#> SRR2105310 3 0.3864 0.56029 0.052 0.004 0.840 0.072 0.032
#> SRR2105305 3 0.4083 0.55959 0.012 0.008 0.812 0.124 0.044
#> SRR2105306 3 0.3897 0.54496 0.064 0.000 0.820 0.104 0.012
#> SRR2105303 2 0.3837 0.42218 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR2105304 4 0.3203 0.84545 0.000 0.012 0.000 0.820 0.168
#> SRR2105301 2 0.5232 0.08305 0.028 0.492 0.008 0.000 0.472
#> SRR2105302 2 0.4262 0.28237 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR2105299 5 0.7840 0.04811 0.008 0.364 0.152 0.080 0.396
#> SRR2105300 5 0.7140 0.21554 0.008 0.256 0.184 0.032 0.520
#> SRR2105297 1 0.5465 0.24122 0.568 0.376 0.000 0.012 0.044
#> SRR2105298 1 0.5215 0.28286 0.592 0.352 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105295 5 0.3662 0.34813 0.000 0.252 0.000 0.004 0.744
#> SRR2105296 5 0.3876 0.27606 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR2105293 3 0.7815 0.28234 0.296 0.024 0.452 0.044 0.184
#> SRR2105294 1 0.5624 0.09380 0.496 0.004 0.452 0.032 0.016
#> SRR2105291 1 0.7341 0.17819 0.472 0.048 0.356 0.020 0.104
#> SRR2105292 1 0.3704 0.59966 0.820 0.004 0.144 0.016 0.016
#> SRR2105289 3 0.7600 0.27065 0.288 0.052 0.520 0.060 0.080
#> SRR2105290 1 0.4546 0.47406 0.688 0.000 0.284 0.020 0.008
#> SRR2105287 1 0.4429 0.60312 0.780 0.008 0.156 0.012 0.044
#> SRR2105288 1 0.4879 0.49915 0.680 0.004 0.280 0.016 0.020
#> SRR2105285 5 0.4568 0.29492 0.000 0.288 0.020 0.008 0.684
#> SRR2105286 5 0.4416 0.29065 0.000 0.316 0.008 0.008 0.668
#> SRR2105283 5 0.6486 0.11634 0.088 0.360 0.028 0.004 0.520
#> SRR2105284 5 0.5445 -0.05122 0.016 0.420 0.024 0.004 0.536
#> SRR2105281 5 0.4497 0.17612 0.000 0.424 0.000 0.008 0.568
#> SRR2105282 2 0.3318 0.47507 0.000 0.800 0.000 0.008 0.192
#> SRR2105259 3 0.5802 0.50192 0.004 0.008 0.648 0.128 0.212
#> SRR2105260 3 0.6611 0.33841 0.004 0.012 0.500 0.140 0.344
#> SRR2105279 2 0.2488 0.49027 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR2105280 2 0.4088 0.37694 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR2105257 1 0.5231 0.50562 0.680 0.032 0.260 0.016 0.012
#> SRR2105258 1 0.2964 0.60661 0.856 0.000 0.120 0.024 0.000
#> SRR2105253 2 0.4473 0.29739 0.000 0.580 0.000 0.008 0.412
#> SRR2105254 2 0.3949 0.38204 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR2105255 3 0.4500 0.54146 0.100 0.000 0.784 0.096 0.020
#> SRR2105256 3 0.4773 0.51242 0.156 0.000 0.748 0.084 0.012
#> SRR2105251 2 0.3949 0.40119 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR2105252 2 0.3730 0.40558 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR2105249 2 0.4443 0.16761 0.000 0.524 0.000 0.004 0.472
#> SRR2105250 2 0.4546 0.26074 0.008 0.532 0.000 0.000 0.460
#> SRR2105247 2 0.4691 0.28873 0.004 0.604 0.008 0.004 0.380
#> SRR2105248 2 0.2629 0.49829 0.000 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR2105245 3 0.7595 0.41150 0.144 0.060 0.544 0.032 0.220
#> SRR2105246 2 0.7749 -0.03428 0.080 0.416 0.396 0.044 0.064
#> SRR2105243 1 0.6867 0.12964 0.452 0.068 0.424 0.024 0.032
#> SRR2105244 3 0.7754 0.01038 0.380 0.132 0.412 0.032 0.044
#> SRR2105241 1 0.6645 0.15170 0.460 0.068 0.428 0.028 0.016
#> SRR2105242 1 0.4419 0.47207 0.700 0.000 0.276 0.012 0.012
#> SRR2105239 3 0.7436 0.33789 0.300 0.032 0.516 0.052 0.100
#> SRR2105240 1 0.3996 0.56102 0.768 0.004 0.208 0.008 0.012
#> SRR2105237 5 0.5884 0.08413 0.000 0.436 0.060 0.016 0.488
#> SRR2105238 2 0.5487 0.06546 0.000 0.492 0.044 0.008 0.456
#> SRR2105235 5 0.4561 0.06722 0.000 0.488 0.000 0.008 0.504
#> SRR2105236 2 0.3957 0.42431 0.008 0.712 0.000 0.000 0.280
#> SRR2105233 5 0.4367 0.15058 0.000 0.416 0.000 0.004 0.580
#> SRR2105234 5 0.4367 0.16670 0.000 0.416 0.000 0.004 0.580
#> SRR2105231 2 0.4451 0.15417 0.004 0.504 0.000 0.000 0.492
#> SRR2105232 2 0.4520 0.27390 0.008 0.644 0.000 0.008 0.340
#> SRR2105227 5 0.9244 0.15282 0.196 0.224 0.244 0.040 0.296
#> SRR2105228 1 0.9155 0.02090 0.288 0.264 0.212 0.032 0.204
#> SRR2105225 3 0.6082 -0.01064 0.444 0.000 0.464 0.076 0.016
#> SRR2105226 1 0.5349 0.42190 0.608 0.000 0.332 0.052 0.008
#> SRR2105229 3 0.5633 0.50885 0.008 0.052 0.712 0.064 0.164
#> SRR2105230 3 0.4027 0.54627 0.068 0.004 0.832 0.056 0.040
#> SRR2105219 5 0.4262 0.05718 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR2105220 5 0.4227 -0.06827 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR2105221 2 0.5908 0.41075 0.072 0.644 0.032 0.004 0.248
#> SRR2105222 2 0.6219 0.29399 0.212 0.548 0.000 0.000 0.240
#> SRR2105223 3 0.5954 0.35653 0.264 0.000 0.628 0.060 0.048
#> SRR2105224 3 0.5421 0.02792 0.448 0.000 0.504 0.040 0.008
#> SRR2105217 2 0.3752 0.43683 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105218 2 0.2488 0.46829 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR2105215 2 0.4367 0.17300 0.000 0.580 0.000 0.004 0.416
#> SRR2105216 2 0.4084 0.42982 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR2105213 5 0.8526 -0.19982 0.244 0.044 0.272 0.060 0.380
#> SRR2105214 3 0.8598 0.20555 0.188 0.068 0.368 0.052 0.324
#> SRR2105211 5 0.8294 -0.06119 0.044 0.096 0.340 0.108 0.412
#> SRR2105212 3 0.7804 0.44157 0.124 0.080 0.576 0.080 0.140
#> SRR2105209 3 0.5536 -0.09110 0.476 0.012 0.480 0.016 0.016
#> SRR2105210 1 0.2629 0.61469 0.880 0.004 0.104 0.012 0.000
#> SRR2105207 1 0.7950 0.27875 0.528 0.148 0.204 0.048 0.072
#> SRR2105208 1 0.2082 0.59747 0.928 0.044 0.012 0.012 0.004
#> SRR2105205 5 0.5461 0.02315 0.044 0.404 0.004 0.004 0.544
#> SRR2105206 2 0.5467 0.30671 0.016 0.576 0.024 0.008 0.376
#> SRR2105201 2 0.4753 0.32759 0.004 0.580 0.008 0.004 0.404
#> SRR2105202 2 0.5286 0.25216 0.024 0.520 0.008 0.004 0.444
#> SRR2105203 2 0.4403 0.22935 0.000 0.608 0.000 0.008 0.384
#> SRR2105204 2 0.4557 0.03846 0.000 0.516 0.000 0.008 0.476
#> SRR2105199 5 0.4562 0.01361 0.000 0.496 0.000 0.008 0.496
#> SRR2105200 2 0.4934 0.22582 0.020 0.544 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105197 3 0.5355 0.52492 0.076 0.016 0.756 0.060 0.092
#> SRR2105198 3 0.7321 0.37488 0.060 0.032 0.520 0.076 0.312
#> SRR2105195 3 0.8856 0.15716 0.292 0.100 0.332 0.040 0.236
#> SRR2105196 3 0.8554 0.19647 0.200 0.260 0.412 0.036 0.092
#> SRR2105193 1 0.4377 0.57235 0.776 0.004 0.168 0.036 0.016
#> SRR2105194 1 0.2796 0.59664 0.868 0.000 0.116 0.008 0.008
#> SRR2105191 3 0.8012 0.41531 0.220 0.012 0.456 0.084 0.228
#> SRR2105192 1 0.5561 0.31545 0.596 0.000 0.340 0.036 0.028
#> SRR2105189 5 0.4207 0.30838 0.000 0.276 0.008 0.008 0.708
#> SRR2105190 2 0.4367 0.30475 0.000 0.580 0.000 0.004 0.416
#> SRR2105187 5 0.5840 0.31787 0.016 0.188 0.080 0.028 0.688
#> SRR2105188 5 0.8641 0.14156 0.136 0.236 0.220 0.020 0.388
#> SRR2105179 1 0.6747 0.10378 0.444 0.092 0.428 0.012 0.024
#> SRR2105180 1 0.5642 0.51420 0.676 0.064 0.224 0.032 0.004
#> SRR2105183 2 0.1768 0.49088 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR2105184 2 0.5026 0.37181 0.068 0.684 0.000 0.004 0.244
#> SRR2105185 2 0.4522 0.17339 0.000 0.552 0.000 0.008 0.440
#> SRR2105186 2 0.5239 0.42792 0.056 0.668 0.008 0.004 0.264
#> SRR2105181 3 0.7235 0.49608 0.092 0.088 0.632 0.076 0.112
#> SRR2105182 3 0.3086 0.53794 0.068 0.000 0.876 0.036 0.020
#> SRR2105177 1 0.2639 0.60661 0.908 0.032 0.032 0.020 0.008
#> SRR2105178 1 0.0955 0.60283 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR2105171 5 0.4359 0.16149 0.000 0.412 0.000 0.004 0.584
#> SRR2105172 5 0.4555 0.03930 0.000 0.472 0.000 0.008 0.520
#> SRR2105175 1 0.4457 0.55912 0.800 0.088 0.084 0.020 0.008
#> SRR2105176 1 0.3107 0.60933 0.864 0.000 0.096 0.032 0.008
#> SRR2105173 2 0.4196 0.36559 0.000 0.640 0.004 0.000 0.356
#> SRR2105174 2 0.3074 0.47502 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR2105169 2 0.4088 0.24413 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR2105170 2 0.4747 0.43567 0.124 0.744 0.004 0.000 0.128
#> SRR2105167 2 0.4227 0.24040 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105168 2 0.4276 0.29588 0.000 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR2105165 3 0.5075 0.28038 0.360 0.000 0.604 0.016 0.020
#> SRR2105166 1 0.5136 0.16757 0.528 0.000 0.440 0.024 0.008
#> SRR2105163 3 0.8127 0.41597 0.180 0.080 0.500 0.040 0.200
#> SRR2105164 3 0.6724 0.45207 0.196 0.016 0.620 0.048 0.120
#> SRR2105161 1 0.4064 0.61343 0.832 0.012 0.080 0.028 0.048
#> SRR2105162 1 0.2072 0.59971 0.928 0.020 0.036 0.016 0.000
#> SRR2105155 2 0.3074 0.47794 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR2105156 2 0.3430 0.47953 0.000 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR2105157 2 0.3762 0.38792 0.004 0.748 0.000 0.004 0.244
#> SRR2105158 2 0.2597 0.49187 0.004 0.872 0.000 0.004 0.120
#> SRR2105159 3 0.7913 0.21848 0.320 0.052 0.464 0.052 0.112
#> SRR2105160 1 0.5612 0.51219 0.712 0.020 0.180 0.048 0.040
#> SRR2105153 2 0.4426 0.20735 0.004 0.612 0.000 0.004 0.380
#> SRR2105154 2 0.4440 0.00261 0.000 0.528 0.000 0.004 0.468
#> SRR2105151 2 0.4310 0.33848 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR2105152 2 0.3196 0.42653 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR2105149 3 0.7307 0.38368 0.088 0.032 0.468 0.040 0.372
#> SRR2105150 3 0.6574 0.32936 0.032 0.028 0.512 0.044 0.384
#> SRR2105147 4 0.3452 0.82252 0.008 0.004 0.124 0.840 0.024
#> SRR2105148 4 0.3610 0.81121 0.012 0.004 0.136 0.828 0.020
#> SRR2105143 1 0.7278 0.44360 0.592 0.076 0.144 0.024 0.164
#> SRR2105144 1 0.6373 0.49928 0.664 0.120 0.136 0.008 0.072
#> SRR2105145 1 0.7438 0.38012 0.536 0.188 0.212 0.028 0.036
#> SRR2105146 1 0.4946 0.51857 0.688 0.004 0.256 0.048 0.004
#> SRR2105141 2 0.4359 0.23984 0.004 0.584 0.000 0.000 0.412
#> SRR2105142 2 0.4015 0.39163 0.004 0.708 0.000 0.004 0.284
#> SRR2105139 2 0.4135 0.41999 0.000 0.656 0.000 0.004 0.340
#> SRR2105140 2 0.2707 0.48651 0.000 0.860 0.008 0.000 0.132
#> SRR2105137 2 0.4633 0.44425 0.036 0.696 0.000 0.004 0.264
#> SRR2105138 2 0.7400 0.18861 0.256 0.488 0.048 0.004 0.204
#> SRR2105135 5 0.4446 -0.05942 0.000 0.476 0.000 0.004 0.520
#> SRR2105136 2 0.3949 0.40562 0.000 0.696 0.000 0.004 0.300
#> SRR2105133 3 0.6216 0.52823 0.120 0.040 0.700 0.052 0.088
#> SRR2105134 3 0.6532 0.31302 0.340 0.004 0.540 0.064 0.052
#> SRR2105131 5 0.5269 0.38492 0.012 0.108 0.072 0.052 0.756
#> SRR2105132 1 0.8216 0.16656 0.452 0.088 0.248 0.024 0.188
#> SRR2105129 1 0.4139 0.60718 0.812 0.024 0.128 0.020 0.016
#> SRR2105130 1 0.2610 0.59507 0.904 0.036 0.024 0.036 0.000
#> SRR2105127 1 0.6922 0.23853 0.508 0.028 0.356 0.028 0.080
#> SRR2105128 3 0.7754 -0.01136 0.376 0.052 0.384 0.012 0.176
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.462 0.35597 0.036 0.004 0.388 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105278 5 0.526 0.34219 0.088 0.000 0.388 0.000 0.520 0.004
#> SRR2105275 5 0.344 0.51782 0.088 0.012 0.016 0.000 0.840 0.044
#> SRR2105276 5 0.332 0.48779 0.040 0.004 0.108 0.000 0.836 0.012
#> SRR2105273 3 0.395 0.51201 0.204 0.000 0.740 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105274 3 0.413 0.42466 0.284 0.000 0.680 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105271 5 0.642 -0.06097 0.212 0.016 0.356 0.000 0.412 0.004
#> SRR2105272 5 0.547 0.25214 0.304 0.000 0.152 0.000 0.544 0.000
#> SRR2105269 6 0.505 0.20576 0.000 0.352 0.036 0.016 0.008 0.588
#> SRR2105270 2 0.463 0.22316 0.000 0.704 0.024 0.028 0.012 0.232
#> SRR2105267 6 0.541 0.17736 0.000 0.388 0.036 0.032 0.008 0.536
#> SRR2105268 2 0.439 0.06185 0.000 0.500 0.016 0.004 0.000 0.480
#> SRR2105265 6 0.411 0.25312 0.000 0.260 0.012 0.016 0.004 0.708
#> SRR2105266 2 0.416 0.25044 0.000 0.624 0.004 0.008 0.004 0.360
#> SRR2105263 2 0.599 0.26797 0.036 0.632 0.012 0.056 0.032 0.232
#> SRR2105264 2 0.596 0.26848 0.028 0.632 0.012 0.064 0.032 0.232
#> SRR2105261 6 0.739 0.11672 0.004 0.232 0.192 0.000 0.148 0.424
#> SRR2105262 2 0.683 0.17425 0.044 0.588 0.128 0.004 0.160 0.076
#> SRR2105357 5 0.742 0.26818 0.008 0.148 0.260 0.000 0.424 0.160
#> SRR2105358 5 0.477 0.36246 0.004 0.012 0.396 0.000 0.564 0.024
#> SRR2105439 6 0.578 0.26905 0.036 0.256 0.020 0.032 0.024 0.632
#> SRR2105440 6 0.428 0.30356 0.000 0.176 0.032 0.028 0.008 0.756
#> SRR2105509 6 0.575 0.14142 0.000 0.432 0.044 0.016 0.032 0.476
#> SRR2105510 6 0.582 0.17046 0.000 0.388 0.052 0.028 0.020 0.512
#> SRR2105507 3 0.487 0.50362 0.212 0.000 0.656 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105508 3 0.325 0.53722 0.116 0.000 0.828 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105505 3 0.759 0.02021 0.364 0.060 0.400 0.012 0.104 0.060
#> SRR2105506 1 0.364 0.55644 0.764 0.004 0.204 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105503 6 0.520 0.26181 0.004 0.292 0.004 0.048 0.024 0.628
#> SRR2105504 4 0.215 0.88963 0.000 0.060 0.024 0.908 0.000 0.008
#> SRR2105501 2 0.452 0.30394 0.008 0.764 0.080 0.016 0.008 0.124
#> SRR2105502 4 0.215 0.88120 0.000 0.072 0.016 0.904 0.000 0.008
#> SRR2105499 3 0.416 0.37223 0.024 0.000 0.728 0.000 0.224 0.024
#> SRR2105500 3 0.612 0.16016 0.072 0.064 0.548 0.000 0.308 0.008
#> SRR2105497 2 0.423 0.24706 0.000 0.596 0.004 0.008 0.004 0.388
#> SRR2105498 2 0.577 0.25644 0.052 0.584 0.032 0.012 0.008 0.312
#> SRR2105495 2 0.414 0.31147 0.000 0.728 0.012 0.016 0.012 0.232
#> SRR2105496 2 0.447 0.33540 0.016 0.740 0.012 0.028 0.008 0.196
#> SRR2105493 2 0.478 0.27660 0.000 0.720 0.028 0.032 0.024 0.196
#> SRR2105494 2 0.533 0.22569 0.012 0.664 0.012 0.024 0.048 0.240
#> SRR2105491 6 0.687 0.02764 0.024 0.384 0.020 0.040 0.084 0.448
#> SRR2105492 2 0.654 0.19030 0.068 0.544 0.000 0.052 0.048 0.288
#> SRR2105489 6 0.574 0.04181 0.012 0.420 0.004 0.036 0.036 0.492
#> SRR2105490 6 0.610 0.00799 0.080 0.380 0.004 0.028 0.012 0.496
#> SRR2105487 5 0.553 0.48854 0.184 0.044 0.048 0.028 0.688 0.008
#> SRR2105488 5 0.575 0.25778 0.388 0.012 0.036 0.040 0.520 0.004
#> SRR2105485 3 0.565 0.42322 0.052 0.048 0.684 0.004 0.172 0.040
#> SRR2105486 3 0.366 0.50237 0.052 0.008 0.820 0.000 0.104 0.016
#> SRR2105483 1 0.082 0.61709 0.972 0.000 0.000 0.016 0.012 0.000
#> SRR2105484 1 0.132 0.61740 0.952 0.000 0.004 0.024 0.020 0.000
#> SRR2105481 3 0.583 0.36401 0.216 0.000 0.480 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105482 1 0.517 0.44775 0.612 0.000 0.240 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105479 1 0.776 0.17719 0.388 0.144 0.196 0.012 0.256 0.004
#> SRR2105480 1 0.641 0.25456 0.488 0.004 0.284 0.028 0.196 0.000
#> SRR2105477 2 0.643 0.24409 0.048 0.624 0.008 0.036 0.132 0.152
#> SRR2105478 6 0.741 0.04877 0.008 0.332 0.028 0.040 0.208 0.384
#> SRR2105475 2 0.423 0.25936 0.000 0.724 0.012 0.016 0.016 0.232
#> SRR2105476 2 0.431 0.21213 0.000 0.736 0.028 0.012 0.016 0.208
#> SRR2105473 6 0.637 0.19040 0.176 0.168 0.008 0.024 0.028 0.596
#> SRR2105474 2 0.663 0.10679 0.140 0.460 0.004 0.028 0.016 0.352
#> SRR2105471 6 0.508 0.20670 0.040 0.216 0.004 0.012 0.036 0.692
#> SRR2105472 6 0.604 0.06275 0.072 0.324 0.004 0.020 0.028 0.552
#> SRR2105469 3 0.688 0.39897 0.192 0.072 0.564 0.004 0.136 0.032
#> SRR2105470 3 0.477 0.43990 0.276 0.004 0.656 0.000 0.056 0.008
#> SRR2105467 3 0.453 0.49441 0.116 0.004 0.744 0.004 0.124 0.008
#> SRR2105468 3 0.582 0.32762 0.292 0.004 0.540 0.008 0.156 0.000
#> SRR2105465 1 0.597 0.49664 0.616 0.096 0.236 0.008 0.028 0.016
#> SRR2105466 1 0.405 0.58991 0.788 0.020 0.144 0.008 0.036 0.004
#> SRR2105463 1 0.380 0.61077 0.792 0.000 0.152 0.020 0.032 0.004
#> SRR2105464 1 0.328 0.61696 0.836 0.000 0.108 0.020 0.036 0.000
#> SRR2105461 6 0.472 -0.00520 0.000 0.460 0.024 0.012 0.000 0.504
#> SRR2105462 2 0.438 0.10540 0.000 0.548 0.012 0.000 0.008 0.432
#> SRR2105459 2 0.536 -0.05969 0.000 0.472 0.040 0.016 0.012 0.460
#> SRR2105460 6 0.498 0.14701 0.000 0.404 0.036 0.012 0.004 0.544
#> SRR2105457 5 0.569 0.33368 0.020 0.024 0.384 0.000 0.524 0.048
#> SRR2105458 5 0.674 0.26202 0.000 0.096 0.372 0.004 0.428 0.100
#> SRR2105455 3 0.597 0.41173 0.248 0.060 0.620 0.008 0.032 0.032
#> SRR2105456 3 0.457 0.31914 0.344 0.000 0.612 0.004 0.040 0.000
#> SRR2105453 1 0.462 0.55218 0.708 0.000 0.104 0.000 0.180 0.008
#> SRR2105454 1 0.388 0.59208 0.788 0.000 0.084 0.004 0.120 0.004
#> SRR2105451 2 0.754 -0.06790 0.032 0.412 0.080 0.032 0.076 0.368
#> SRR2105452 4 0.222 0.89784 0.000 0.012 0.084 0.896 0.008 0.000
#> SRR2105449 1 0.788 0.15707 0.392 0.168 0.232 0.012 0.188 0.008
#> SRR2105450 3 0.530 0.17537 0.384 0.004 0.540 0.016 0.056 0.000
#> SRR2105447 2 0.580 -0.07336 0.000 0.480 0.068 0.028 0.008 0.416
#> SRR2105448 2 0.508 0.12275 0.000 0.568 0.024 0.012 0.020 0.376
#> SRR2105445 2 0.811 -0.03796 0.016 0.312 0.232 0.004 0.200 0.236
#> SRR2105446 3 0.787 -0.05640 0.028 0.344 0.352 0.008 0.152 0.116
#> SRR2105443 2 0.669 0.06941 0.000 0.532 0.080 0.008 0.148 0.232
#> SRR2105444 2 0.699 0.03833 0.012 0.488 0.044 0.012 0.176 0.268
#> SRR2105441 6 0.526 0.13630 0.008 0.396 0.012 0.040 0.004 0.540
#> SRR2105442 2 0.453 0.25597 0.020 0.628 0.000 0.012 0.004 0.336
#> SRR2105437 5 0.263 0.51688 0.092 0.000 0.032 0.004 0.872 0.000
#> SRR2105438 5 0.379 0.50100 0.168 0.000 0.036 0.016 0.780 0.000
#> SRR2105435 3 0.632 0.23044 0.132 0.016 0.476 0.008 0.360 0.008
#> SRR2105436 3 0.507 0.29418 0.080 0.000 0.576 0.004 0.340 0.000
#> SRR2105433 1 0.501 0.01753 0.492 0.000 0.452 0.004 0.048 0.004
#> SRR2105434 1 0.409 0.52336 0.728 0.000 0.220 0.000 0.048 0.004
#> SRR2105431 1 0.189 0.62204 0.924 0.000 0.012 0.016 0.048 0.000
#> SRR2105432 1 0.177 0.62129 0.924 0.000 0.004 0.012 0.060 0.000
#> SRR2105429 5 0.849 0.02042 0.128 0.288 0.068 0.008 0.320 0.188
#> SRR2105430 2 0.641 0.08589 0.004 0.524 0.016 0.012 0.232 0.212
#> SRR2105427 6 0.514 0.22780 0.000 0.344 0.036 0.028 0.004 0.588
#> SRR2105428 2 0.500 0.10758 0.000 0.624 0.036 0.012 0.016 0.312
#> SRR2105425 6 0.588 0.17752 0.004 0.368 0.064 0.032 0.008 0.524
#> SRR2105426 2 0.456 0.23392 0.016 0.612 0.004 0.004 0.008 0.356
#> SRR2105421 6 0.780 0.09994 0.020 0.136 0.328 0.008 0.140 0.368
#> SRR2105422 6 0.826 -0.04716 0.036 0.168 0.192 0.004 0.296 0.304
#> SRR2105423 6 0.270 0.32304 0.000 0.144 0.008 0.000 0.004 0.844
#> SRR2105424 6 0.256 0.33009 0.000 0.120 0.008 0.008 0.000 0.864
#> SRR2105419 3 0.758 0.34406 0.196 0.088 0.492 0.004 0.168 0.052
#> SRR2105420 3 0.722 0.05754 0.024 0.204 0.472 0.004 0.240 0.056
#> SRR2105415 1 0.222 0.62650 0.912 0.000 0.032 0.012 0.040 0.004
#> SRR2105416 1 0.123 0.61840 0.960 0.000 0.012 0.012 0.012 0.004
#> SRR2105417 1 0.730 0.38145 0.532 0.104 0.164 0.016 0.164 0.020
#> SRR2105418 1 0.156 0.62431 0.940 0.000 0.012 0.008 0.040 0.000
#> SRR2105413 2 0.529 0.01733 0.000 0.580 0.036 0.016 0.020 0.348
#> SRR2105414 2 0.511 -0.05663 0.000 0.496 0.036 0.016 0.004 0.448
#> SRR2105409 6 0.544 0.07060 0.000 0.444 0.028 0.032 0.012 0.484
#> SRR2105410 2 0.606 0.07036 0.000 0.508 0.032 0.052 0.032 0.376
#> SRR2105411 2 0.438 0.13222 0.000 0.572 0.004 0.008 0.008 0.408
#> SRR2105412 6 0.431 -0.00357 0.000 0.488 0.004 0.012 0.000 0.496
#> SRR2105407 5 0.407 0.33446 0.000 0.004 0.424 0.004 0.568 0.000
#> SRR2105408 5 0.495 0.38048 0.000 0.020 0.376 0.004 0.572 0.028
#> SRR2105403 3 0.221 0.46554 0.008 0.000 0.900 0.004 0.080 0.008
#> SRR2105404 3 0.484 0.34278 0.112 0.008 0.696 0.004 0.180 0.000
#> SRR2105405 3 0.431 0.31504 0.352 0.000 0.624 0.004 0.016 0.004
#> SRR2105406 1 0.574 0.45716 0.604 0.020 0.284 0.004 0.064 0.024
#> SRR2105401 2 0.567 -0.09491 0.000 0.488 0.060 0.016 0.016 0.420
#> SRR2105402 4 0.232 0.89511 0.000 0.012 0.084 0.892 0.012 0.000
#> SRR2105399 2 0.697 0.11980 0.000 0.564 0.088 0.064 0.092 0.192
#> SRR2105400 2 0.726 -0.07022 0.000 0.444 0.128 0.044 0.064 0.320
#> SRR2105397 5 0.706 0.06965 0.016 0.204 0.028 0.020 0.484 0.248
#> SRR2105398 5 0.669 0.13797 0.000 0.200 0.040 0.012 0.496 0.252
#> SRR2105395 2 0.458 0.17099 0.000 0.544 0.004 0.016 0.008 0.428
#> SRR2105396 2 0.507 0.16626 0.000 0.564 0.028 0.020 0.008 0.380
#> SRR2105393 6 0.427 0.20272 0.000 0.336 0.012 0.004 0.008 0.640
#> SRR2105394 2 0.418 0.09984 0.000 0.496 0.000 0.012 0.000 0.492
#> SRR2105389 5 0.356 0.45765 0.000 0.000 0.276 0.004 0.716 0.004
#> SRR2105390 3 0.403 0.23228 0.008 0.000 0.572 0.000 0.420 0.000
#> SRR2105391 3 0.415 0.38974 0.008 0.024 0.740 0.004 0.216 0.008
#> SRR2105392 3 0.421 -0.03628 0.000 0.004 0.560 0.004 0.428 0.004
#> SRR2105385 3 0.408 0.52325 0.180 0.004 0.748 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105386 3 0.381 0.48219 0.228 0.000 0.736 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105387 1 0.670 0.48219 0.612 0.080 0.128 0.004 0.124 0.052
#> SRR2105388 3 0.489 0.49902 0.176 0.000 0.660 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105381 2 0.503 0.07712 0.000 0.580 0.028 0.008 0.020 0.364
#> SRR2105382 2 0.275 0.33039 0.000 0.856 0.000 0.016 0.008 0.120
#> SRR2105383 2 0.485 0.24762 0.016 0.692 0.016 0.008 0.028 0.240
#> SRR2105384 2 0.620 0.20388 0.064 0.556 0.060 0.008 0.008 0.304
#> SRR2105379 6 0.552 0.04418 0.000 0.460 0.036 0.020 0.020 0.464
#> SRR2105380 2 0.737 0.08848 0.116 0.484 0.028 0.028 0.056 0.288
#> SRR2105377 6 0.586 0.19705 0.004 0.332 0.032 0.040 0.028 0.564
#> SRR2105378 6 0.680 0.13573 0.160 0.252 0.012 0.036 0.016 0.524
#> SRR2105375 5 0.737 0.35215 0.232 0.076 0.040 0.004 0.496 0.152
#> SRR2105376 1 0.601 0.16026 0.480 0.020 0.016 0.012 0.416 0.056
#> SRR2105373 5 0.551 0.38399 0.160 0.004 0.264 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105374 5 0.571 0.19489 0.352 0.000 0.136 0.008 0.504 0.000
#> SRR2105371 3 0.474 0.36470 0.052 0.000 0.600 0.004 0.344 0.000
#> SRR2105372 3 0.401 0.45399 0.040 0.000 0.728 0.004 0.228 0.000
#> SRR2105369 3 0.255 0.50012 0.048 0.000 0.876 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105370 3 0.421 0.54152 0.144 0.000 0.748 0.000 0.104 0.004
#> SRR2105367 1 0.624 0.51803 0.648 0.076 0.024 0.008 0.132 0.112
#> SRR2105368 1 0.573 0.53122 0.688 0.128 0.020 0.008 0.104 0.052
#> SRR2105365 2 0.513 0.29905 0.016 0.684 0.004 0.048 0.024 0.224
#> SRR2105366 6 0.639 0.00142 0.008 0.432 0.028 0.048 0.044 0.440
#> SRR2105363 6 0.450 0.23923 0.000 0.284 0.024 0.008 0.012 0.672
#> SRR2105364 2 0.485 0.12103 0.000 0.536 0.008 0.016 0.016 0.424
#> SRR2105361 6 0.460 0.31395 0.000 0.192 0.020 0.048 0.012 0.728
#> SRR2105362 6 0.553 0.18427 0.000 0.328 0.032 0.048 0.012 0.580
#> SRR2105359 3 0.632 -0.04668 0.088 0.012 0.464 0.004 0.396 0.036
#> SRR2105360 5 0.425 0.34234 0.020 0.000 0.404 0.000 0.576 0.000
#> SRR2105355 3 0.808 0.09291 0.164 0.064 0.440 0.004 0.176 0.152
#> SRR2105356 1 0.615 -0.02692 0.424 0.004 0.276 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105353 5 0.435 0.47020 0.016 0.008 0.240 0.000 0.712 0.024
#> SRR2105354 5 0.455 0.11431 0.040 0.000 0.388 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105351 2 0.471 0.16340 0.000 0.568 0.020 0.008 0.008 0.396
#> SRR2105352 4 0.226 0.89951 0.000 0.016 0.080 0.896 0.008 0.000
#> SRR2105349 2 0.469 0.17577 0.000 0.672 0.028 0.016 0.012 0.272
#> SRR2105350 2 0.368 0.30018 0.000 0.692 0.000 0.004 0.004 0.300
#> SRR2105345 2 0.489 0.26846 0.012 0.616 0.000 0.036 0.008 0.328
#> SRR2105346 2 0.504 0.19362 0.016 0.592 0.000 0.044 0.004 0.344
#> SRR2105347 2 0.614 0.08383 0.092 0.480 0.004 0.028 0.008 0.388
#> SRR2105348 6 0.646 0.09963 0.244 0.208 0.004 0.004 0.028 0.512
#> SRR2105343 6 0.499 0.25721 0.000 0.276 0.052 0.016 0.008 0.648
#> SRR2105344 2 0.433 -0.02602 0.000 0.500 0.008 0.000 0.008 0.484
#> SRR2105341 3 0.376 0.17370 0.000 0.000 0.644 0.004 0.352 0.000
#> SRR2105342 3 0.360 0.49079 0.056 0.000 0.796 0.004 0.144 0.000
#> SRR2105339 5 0.623 0.27443 0.032 0.044 0.396 0.004 0.484 0.040
#> SRR2105340 3 0.501 0.16807 0.040 0.008 0.484 0.000 0.464 0.004
#> SRR2105335 5 0.596 0.12344 0.320 0.000 0.240 0.000 0.440 0.000
#> SRR2105336 1 0.610 0.08751 0.384 0.000 0.312 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105337 3 0.515 0.48256 0.172 0.092 0.696 0.008 0.032 0.000
#> SRR2105338 3 0.439 0.36553 0.312 0.000 0.648 0.004 0.036 0.000
#> SRR2105331 2 0.487 0.14747 0.000 0.564 0.008 0.016 0.020 0.392
#> SRR2105332 2 0.578 0.27011 0.032 0.588 0.004 0.040 0.028 0.308
#> SRR2105333 2 0.302 0.28084 0.000 0.816 0.000 0.012 0.004 0.168
#> SRR2105334 2 0.528 0.13934 0.016 0.628 0.024 0.028 0.008 0.296
#> SRR2105329 6 0.667 0.11095 0.000 0.376 0.144 0.004 0.056 0.420
#> SRR2105330 2 0.338 0.32741 0.000 0.848 0.056 0.008 0.024 0.064
#> SRR2105327 2 0.485 0.21639 0.004 0.616 0.012 0.024 0.008 0.336
#> SRR2105328 2 0.436 0.29188 0.000 0.672 0.020 0.000 0.020 0.288
#> SRR2105325 5 0.312 0.51729 0.056 0.004 0.072 0.012 0.856 0.000
#> SRR2105326 5 0.340 0.50772 0.048 0.004 0.096 0.016 0.836 0.000
#> SRR2105323 3 0.796 -0.13074 0.008 0.136 0.368 0.016 0.236 0.236
#> SRR2105324 3 0.760 -0.14208 0.172 0.060 0.400 0.004 0.320 0.044
#> SRR2105319 5 0.468 0.39986 0.240 0.000 0.096 0.000 0.664 0.000
#> SRR2105320 1 0.424 0.25927 0.540 0.000 0.016 0.000 0.444 0.000
#> SRR2105321 5 0.532 0.22948 0.136 0.000 0.264 0.000 0.596 0.004
#> SRR2105322 5 0.576 -0.20179 0.148 0.000 0.412 0.004 0.436 0.000
#> SRR2105317 6 0.512 0.18579 0.000 0.352 0.036 0.020 0.008 0.584
#> SRR2105318 2 0.556 -0.11775 0.000 0.460 0.056 0.016 0.012 0.456
#> SRR2105315 2 0.651 0.03798 0.000 0.512 0.244 0.016 0.024 0.204
#> SRR2105316 2 0.540 -0.07685 0.000 0.532 0.044 0.024 0.008 0.392
#> SRR2105313 6 0.510 0.02559 0.000 0.472 0.024 0.008 0.020 0.476
#> SRR2105314 6 0.463 0.28073 0.000 0.236 0.028 0.028 0.008 0.700
#> SRR2105311 5 0.426 0.52457 0.076 0.028 0.036 0.020 0.812 0.028
#> SRR2105312 5 0.654 0.44027 0.152 0.080 0.072 0.020 0.636 0.040
#> SRR2105307 1 0.651 0.45561 0.580 0.040 0.240 0.008 0.100 0.032
#> SRR2105308 1 0.466 0.55471 0.720 0.036 0.204 0.004 0.004 0.032
#> SRR2105309 3 0.638 0.03124 0.004 0.068 0.556 0.000 0.236 0.136
#> SRR2105310 3 0.434 0.05758 0.024 0.000 0.564 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105305 5 0.444 0.29211 0.000 0.008 0.448 0.004 0.532 0.008
#> SRR2105306 3 0.395 0.21560 0.016 0.004 0.684 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105303 2 0.414 0.27906 0.000 0.656 0.004 0.020 0.000 0.320
#> SRR2105304 4 0.206 0.87784 0.000 0.072 0.012 0.908 0.000 0.008
#> SRR2105301 2 0.570 0.16068 0.012 0.600 0.032 0.024 0.028 0.304
#> SRR2105302 2 0.473 0.03223 0.000 0.488 0.012 0.012 0.008 0.480
#> SRR2105299 2 0.656 0.12677 0.004 0.548 0.188 0.004 0.196 0.060
#> SRR2105300 2 0.757 0.04038 0.012 0.460 0.136 0.012 0.232 0.148
#> SRR2105297 1 0.600 0.38045 0.644 0.084 0.012 0.048 0.016 0.196
#> SRR2105298 1 0.561 0.36568 0.640 0.052 0.004 0.048 0.012 0.244
#> SRR2105295 6 0.546 0.11271 0.000 0.412 0.044 0.016 0.016 0.512
#> SRR2105296 2 0.523 -0.07116 0.000 0.504 0.044 0.012 0.008 0.432
#> SRR2105293 5 0.582 0.45852 0.192 0.044 0.040 0.000 0.656 0.068
#> SRR2105294 5 0.610 0.02196 0.312 0.000 0.248 0.004 0.436 0.000
#> SRR2105291 3 0.612 0.24588 0.352 0.032 0.536 0.020 0.040 0.020
#> SRR2105292 1 0.415 0.61777 0.780 0.008 0.068 0.008 0.132 0.004
#> SRR2105289 3 0.701 0.40900 0.188 0.040 0.552 0.004 0.152 0.064
#> SRR2105290 1 0.468 0.09418 0.528 0.000 0.428 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105287 1 0.549 0.57635 0.684 0.036 0.172 0.004 0.088 0.016
#> SRR2105288 1 0.467 0.16317 0.532 0.008 0.436 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105285 2 0.563 -0.03183 0.000 0.540 0.048 0.012 0.032 0.368
#> SRR2105286 2 0.481 -0.08061 0.000 0.556 0.020 0.008 0.012 0.404
#> SRR2105283 2 0.718 0.01217 0.076 0.460 0.028 0.012 0.088 0.336
#> SRR2105284 2 0.580 0.20340 0.004 0.624 0.040 0.048 0.028 0.256
#> SRR2105281 6 0.488 0.18256 0.000 0.400 0.036 0.008 0.004 0.552
#> SRR2105282 2 0.364 0.27985 0.000 0.676 0.000 0.004 0.000 0.320
#> SRR2105259 5 0.546 0.38389 0.000 0.028 0.340 0.004 0.568 0.060
#> SRR2105260 5 0.683 0.28144 0.000 0.120 0.340 0.004 0.444 0.092
#> SRR2105279 2 0.459 0.12732 0.000 0.516 0.004 0.020 0.004 0.456
#> SRR2105280 6 0.453 0.18893 0.000 0.296 0.008 0.028 0.008 0.660
#> SRR2105257 1 0.543 0.24202 0.528 0.008 0.392 0.008 0.060 0.004
#> SRR2105258 1 0.367 0.61347 0.804 0.000 0.084 0.008 0.104 0.000
#> SRR2105253 2 0.263 0.33709 0.000 0.880 0.008 0.024 0.004 0.084
#> SRR2105254 2 0.221 0.34526 0.000 0.892 0.000 0.012 0.004 0.092
#> SRR2105255 3 0.422 0.27278 0.032 0.004 0.676 0.000 0.288 0.000
#> SRR2105256 3 0.400 0.47112 0.044 0.000 0.736 0.004 0.216 0.000
#> SRR2105251 2 0.477 0.01756 0.000 0.520 0.000 0.028 0.012 0.440
#> SRR2105252 6 0.426 0.07044 0.000 0.416 0.000 0.008 0.008 0.568
#> SRR2105249 2 0.496 0.14798 0.000 0.600 0.016 0.032 0.008 0.344
#> SRR2105250 2 0.545 0.08392 0.020 0.564 0.016 0.036 0.004 0.360
#> SRR2105247 6 0.499 0.09686 0.004 0.388 0.024 0.008 0.012 0.564
#> SRR2105248 2 0.495 0.16360 0.000 0.492 0.008 0.024 0.012 0.464
#> SRR2105245 5 0.608 0.47264 0.100 0.076 0.096 0.000 0.668 0.060
#> SRR2105246 2 0.714 -0.03473 0.032 0.420 0.304 0.004 0.216 0.024
#> SRR2105243 3 0.519 0.40144 0.284 0.024 0.632 0.000 0.052 0.008
#> SRR2105244 3 0.683 0.36833 0.220 0.108 0.516 0.004 0.152 0.000
#> SRR2105241 3 0.499 0.37845 0.304 0.024 0.628 0.004 0.040 0.000
#> SRR2105242 1 0.453 0.01912 0.500 0.000 0.468 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105239 3 0.658 0.37958 0.140 0.020 0.520 0.000 0.280 0.040
#> SRR2105240 1 0.465 0.32169 0.588 0.000 0.360 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105237 2 0.670 0.06358 0.000 0.500 0.044 0.020 0.144 0.292
#> SRR2105238 6 0.558 0.10039 0.000 0.404 0.012 0.008 0.076 0.500
#> SRR2105235 6 0.445 0.22613 0.000 0.352 0.020 0.012 0.000 0.616
#> SRR2105236 2 0.367 0.31443 0.000 0.788 0.020 0.016 0.004 0.172
#> SRR2105233 2 0.522 0.01043 0.000 0.552 0.040 0.032 0.000 0.376
#> SRR2105234 2 0.523 -0.03118 0.000 0.504 0.040 0.020 0.004 0.432
#> SRR2105231 6 0.539 0.18281 0.000 0.340 0.008 0.052 0.024 0.576
#> SRR2105232 6 0.426 0.15316 0.000 0.336 0.016 0.004 0.004 0.640
#> SRR2105227 6 0.866 -0.07298 0.160 0.160 0.120 0.000 0.260 0.300
#> SRR2105228 2 0.900 -0.14100 0.208 0.244 0.224 0.004 0.144 0.176
#> SRR2105225 5 0.596 0.19258 0.280 0.004 0.232 0.000 0.484 0.000
#> SRR2105226 3 0.589 -0.05443 0.404 0.004 0.420 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105229 5 0.329 0.50768 0.000 0.020 0.156 0.000 0.812 0.012
#> SRR2105230 5 0.391 0.46510 0.040 0.000 0.212 0.000 0.744 0.004
#> SRR2105219 2 0.458 0.04107 0.000 0.596 0.020 0.016 0.000 0.368
#> SRR2105220 2 0.521 0.05201 0.000 0.552 0.020 0.044 0.004 0.380
#> SRR2105221 2 0.616 0.26666 0.036 0.640 0.056 0.028 0.032 0.208
#> SRR2105222 2 0.741 0.01985 0.256 0.412 0.008 0.044 0.024 0.256
#> SRR2105223 3 0.337 0.53417 0.092 0.000 0.824 0.004 0.080 0.000
#> SRR2105224 3 0.462 0.46302 0.236 0.000 0.680 0.004 0.080 0.000
#> SRR2105217 2 0.439 0.21330 0.000 0.608 0.000 0.020 0.008 0.364
#> SRR2105218 6 0.434 0.04022 0.000 0.356 0.008 0.004 0.012 0.620
#> SRR2105215 6 0.440 0.22838 0.000 0.264 0.008 0.024 0.012 0.692
#> SRR2105216 2 0.432 0.25536 0.000 0.668 0.004 0.028 0.004 0.296
#> SRR2105213 3 0.890 0.01407 0.148 0.188 0.308 0.008 0.220 0.128
#> SRR2105214 3 0.833 0.10508 0.076 0.172 0.384 0.004 0.236 0.128
#> SRR2105211 3 0.716 0.05215 0.008 0.212 0.500 0.004 0.128 0.148
#> SRR2105212 3 0.621 0.40728 0.040 0.112 0.620 0.004 0.196 0.028
#> SRR2105209 1 0.629 -0.13366 0.396 0.004 0.340 0.000 0.256 0.004
#> SRR2105210 1 0.369 0.60661 0.796 0.004 0.116 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105207 1 0.678 0.35394 0.524 0.148 0.032 0.012 0.264 0.020
#> SRR2105208 1 0.130 0.61902 0.948 0.000 0.004 0.004 0.044 0.000
#> SRR2105205 2 0.561 0.18840 0.044 0.660 0.028 0.020 0.020 0.228
#> SRR2105206 2 0.377 0.33751 0.020 0.836 0.024 0.016 0.024 0.080
#> SRR2105201 2 0.545 0.06724 0.008 0.520 0.028 0.016 0.016 0.412
#> SRR2105202 2 0.542 0.03668 0.020 0.508 0.016 0.016 0.012 0.428
#> SRR2105203 6 0.440 0.16712 0.000 0.360 0.016 0.012 0.000 0.612
#> SRR2105204 6 0.409 0.27402 0.000 0.292 0.008 0.012 0.004 0.684
#> SRR2105199 6 0.337 0.33397 0.000 0.180 0.012 0.008 0.004 0.796
#> SRR2105200 6 0.479 0.19140 0.012 0.276 0.008 0.012 0.024 0.668
#> SRR2105197 5 0.292 0.51195 0.040 0.000 0.104 0.000 0.852 0.004
#> SRR2105198 5 0.392 0.52179 0.024 0.024 0.068 0.008 0.828 0.048
#> SRR2105195 5 0.859 0.25115 0.244 0.156 0.104 0.016 0.376 0.104
#> SRR2105196 5 0.797 0.28632 0.160 0.260 0.080 0.036 0.436 0.028
#> SRR2105193 1 0.459 0.38583 0.628 0.004 0.328 0.000 0.036 0.004
#> SRR2105194 1 0.382 0.55247 0.760 0.000 0.192 0.004 0.044 0.000
#> SRR2105191 3 0.758 0.05825 0.128 0.064 0.380 0.004 0.368 0.056
#> SRR2105192 1 0.561 0.35755 0.548 0.000 0.164 0.000 0.284 0.004
#> SRR2105189 6 0.552 0.15051 0.000 0.444 0.036 0.020 0.020 0.480
#> SRR2105190 2 0.334 0.31071 0.000 0.800 0.012 0.008 0.004 0.176
#> SRR2105187 6 0.753 0.14017 0.012 0.332 0.040 0.052 0.148 0.416
#> SRR2105188 5 0.804 0.01526 0.072 0.176 0.020 0.048 0.408 0.276
#> SRR2105179 3 0.534 0.36987 0.300 0.072 0.600 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105180 1 0.622 0.40104 0.564 0.044 0.264 0.012 0.116 0.000
#> SRR2105183 2 0.405 0.20120 0.000 0.560 0.000 0.008 0.000 0.432
#> SRR2105184 6 0.505 0.16217 0.060 0.256 0.004 0.012 0.008 0.660
#> SRR2105185 2 0.486 0.14383 0.000 0.596 0.020 0.020 0.008 0.356
#> SRR2105186 6 0.641 -0.06579 0.036 0.428 0.004 0.048 0.044 0.440
#> SRR2105181 5 0.560 0.45788 0.052 0.044 0.264 0.000 0.624 0.016
#> SRR2105182 5 0.429 0.27642 0.028 0.000 0.360 0.000 0.612 0.000
#> SRR2105177 1 0.226 0.62766 0.908 0.020 0.008 0.000 0.056 0.008
#> SRR2105178 1 0.141 0.61736 0.952 0.004 0.008 0.016 0.020 0.000
#> SRR2105171 6 0.449 0.31449 0.000 0.236 0.028 0.016 0.012 0.708
#> SRR2105172 6 0.232 0.32472 0.000 0.132 0.004 0.000 0.000 0.864
#> SRR2105175 1 0.426 0.60997 0.780 0.080 0.020 0.004 0.112 0.004
#> SRR2105176 1 0.375 0.59905 0.800 0.000 0.132 0.024 0.044 0.000
#> SRR2105173 2 0.482 0.26782 0.000 0.628 0.020 0.024 0.008 0.320
#> SRR2105174 2 0.367 0.30043 0.000 0.704 0.000 0.012 0.000 0.284
#> SRR2105169 6 0.497 0.01931 0.000 0.472 0.016 0.016 0.012 0.484
#> SRR2105170 2 0.632 0.15487 0.112 0.516 0.004 0.044 0.004 0.320
#> SRR2105167 6 0.506 0.11673 0.000 0.408 0.016 0.024 0.012 0.540
#> SRR2105168 6 0.397 0.13982 0.000 0.344 0.004 0.000 0.008 0.644
#> SRR2105165 3 0.485 0.49280 0.204 0.000 0.660 0.000 0.136 0.000
#> SRR2105166 3 0.573 0.15870 0.384 0.000 0.448 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105163 5 0.793 0.22529 0.132 0.076 0.220 0.004 0.456 0.112
#> SRR2105164 5 0.583 0.46057 0.120 0.032 0.120 0.016 0.684 0.028
#> SRR2105161 1 0.496 0.59980 0.764 0.024 0.100 0.024 0.036 0.052
#> SRR2105162 1 0.208 0.62088 0.912 0.000 0.008 0.024 0.056 0.000
#> SRR2105155 2 0.406 0.28506 0.000 0.660 0.000 0.016 0.004 0.320
#> SRR2105156 2 0.418 0.05228 0.000 0.504 0.012 0.000 0.000 0.484
#> SRR2105157 2 0.487 0.11844 0.000 0.524 0.012 0.016 0.012 0.436
#> SRR2105158 2 0.483 0.23754 0.000 0.580 0.000 0.040 0.012 0.368
#> SRR2105159 5 0.552 0.45415 0.204 0.008 0.040 0.020 0.676 0.052
#> SRR2105160 1 0.523 0.48908 0.628 0.008 0.020 0.024 0.300 0.020
#> SRR2105153 6 0.524 0.05941 0.000 0.420 0.024 0.020 0.016 0.520
#> SRR2105154 6 0.512 0.09532 0.000 0.400 0.028 0.012 0.016 0.544
#> SRR2105151 2 0.489 0.09813 0.000 0.548 0.012 0.024 0.008 0.408
#> SRR2105152 6 0.419 0.12637 0.004 0.308 0.004 0.012 0.004 0.668
#> SRR2105149 3 0.813 -0.04120 0.052 0.136 0.380 0.004 0.276 0.152
#> SRR2105150 5 0.687 0.41615 0.016 0.128 0.144 0.012 0.580 0.120
#> SRR2105147 4 0.403 0.81585 0.008 0.012 0.060 0.784 0.136 0.000
#> SRR2105148 4 0.366 0.82163 0.012 0.000 0.060 0.804 0.124 0.000
#> SRR2105143 1 0.765 0.37567 0.476 0.172 0.216 0.008 0.084 0.044
#> SRR2105144 1 0.632 0.51013 0.624 0.044 0.036 0.004 0.128 0.164
#> SRR2105145 1 0.714 0.13635 0.416 0.168 0.348 0.024 0.036 0.008
#> SRR2105146 1 0.555 0.25852 0.516 0.000 0.384 0.024 0.076 0.000
#> SRR2105141 2 0.465 0.26077 0.000 0.688 0.032 0.016 0.012 0.252
#> SRR2105142 2 0.316 0.32907 0.000 0.808 0.000 0.012 0.008 0.172
#> SRR2105139 2 0.469 0.03359 0.000 0.508 0.020 0.004 0.008 0.460
#> SRR2105140 6 0.483 -0.05545 0.000 0.408 0.012 0.016 0.012 0.552
#> SRR2105137 2 0.480 0.29988 0.020 0.720 0.004 0.044 0.016 0.196
#> SRR2105138 1 0.818 -0.25789 0.308 0.288 0.012 0.052 0.068 0.272
#> SRR2105135 6 0.427 0.24803 0.000 0.324 0.016 0.012 0.000 0.648
#> SRR2105136 6 0.425 0.15916 0.000 0.356 0.004 0.008 0.008 0.624
#> SRR2105133 5 0.502 0.46429 0.084 0.012 0.240 0.004 0.660 0.000
#> SRR2105134 5 0.569 0.43045 0.244 0.004 0.148 0.008 0.592 0.004
#> SRR2105131 2 0.683 -0.12038 0.008 0.408 0.136 0.012 0.040 0.396
#> SRR2105132 1 0.767 -0.04545 0.400 0.088 0.040 0.020 0.360 0.092
#> SRR2105129 1 0.374 0.58288 0.788 0.012 0.172 0.004 0.016 0.008
#> SRR2105130 1 0.132 0.61843 0.952 0.000 0.004 0.020 0.024 0.000
#> SRR2105127 3 0.629 0.30152 0.320 0.024 0.552 0.020 0.044 0.040
#> SRR2105128 3 0.595 0.44194 0.200 0.096 0.640 0.016 0.008 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.961 0.951 0.978 0.5000 0.499 0.499
#> 3 3 0.979 0.925 0.966 0.0566 0.970 0.940
#> 4 4 0.702 0.616 0.842 0.1699 0.946 0.890
#> 5 5 0.600 0.630 0.784 0.0957 0.890 0.758
#> 6 6 0.552 0.432 0.699 0.0865 0.852 0.637
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.1184 0.9564 0.016 0.984
#> SRR2105264 2 0.0938 0.9586 0.012 0.988
#> SRR2105261 1 0.7056 0.7514 0.808 0.192
#> SRR2105262 1 0.0938 0.9804 0.988 0.012
#> SRR2105357 1 0.0376 0.9874 0.996 0.004
#> SRR2105358 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105440 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105509 2 0.0376 0.9628 0.004 0.996
#> SRR2105510 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.6801 0.7989 0.180 0.820
#> SRR2105501 2 0.2603 0.9371 0.044 0.956
#> SRR2105502 2 0.6531 0.8138 0.168 0.832
#> SRR2105499 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0376 0.9874 0.996 0.004
#> SRR2105497 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.0672 0.9606 0.008 0.992
#> SRR2105494 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR2105491 2 0.2423 0.9403 0.040 0.960
#> SRR2105492 2 0.2043 0.9461 0.032 0.968
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.2236 0.9433 0.036 0.964
#> SRR2105478 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105475 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105474 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.5519 0.8594 0.128 0.872
#> SRR2105452 2 0.6973 0.7887 0.188 0.812
#> SRR2105449 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.2948 0.9304 0.052 0.948
#> SRR2105448 2 0.0938 0.9586 0.012 0.988
#> SRR2105445 1 0.9170 0.4705 0.668 0.332
#> SRR2105446 1 0.2603 0.9480 0.956 0.044
#> SRR2105443 2 0.8081 0.7022 0.248 0.752
#> SRR2105444 2 0.9608 0.4324 0.384 0.616
#> SRR2105441 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.7376 0.7619 0.208 0.792
#> SRR2105430 2 0.5294 0.8680 0.120 0.880
#> SRR2105427 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR2105426 2 0.0672 0.9608 0.008 0.992
#> SRR2105421 1 0.0376 0.9874 0.996 0.004
#> SRR2105422 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR2105414 2 0.1633 0.9512 0.024 0.976
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.1414 0.9538 0.020 0.980
#> SRR2105402 2 0.6973 0.7887 0.188 0.812
#> SRR2105399 2 0.6801 0.7989 0.180 0.820
#> SRR2105400 2 0.6712 0.8035 0.176 0.824
#> SRR2105397 2 0.9977 0.1730 0.472 0.528
#> SRR2105398 2 0.9866 0.3012 0.432 0.568
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.4298 0.8990 0.088 0.912
#> SRR2105382 2 0.4022 0.9063 0.080 0.920
#> SRR2105383 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105379 2 0.1633 0.9512 0.024 0.976
#> SRR2105380 2 0.5059 0.8770 0.112 0.888
#> SRR2105377 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105375 1 0.1414 0.9729 0.980 0.020
#> SRR2105376 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0376 0.9874 0.996 0.004
#> SRR2105368 1 0.1184 0.9767 0.984 0.016
#> SRR2105365 2 0.2778 0.9339 0.048 0.952
#> SRR2105366 2 0.1843 0.9486 0.028 0.972
#> SRR2105363 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.6973 0.7887 0.188 0.812
#> SRR2105349 2 0.0672 0.9607 0.008 0.992
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.8207 0.6896 0.256 0.744
#> SRR2105330 2 0.6531 0.8149 0.168 0.832
#> SRR2105327 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0376 0.9628 0.004 0.996
#> SRR2105325 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.9393 0.4902 0.356 0.644
#> SRR2105316 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.6438 0.8185 0.164 0.836
#> SRR2105301 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.5629 0.8394 0.868 0.132
#> SRR2105300 1 1.0000 -0.0762 0.500 0.500
#> SRR2105297 2 0.1184 0.9565 0.016 0.984
#> SRR2105298 2 0.0376 0.9628 0.004 0.996
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105292 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.4815 0.8843 0.104 0.896
#> SRR2105284 2 0.4298 0.8997 0.088 0.912
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105246 1 0.3733 0.9175 0.928 0.072
#> SRR2105243 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.3584 0.9173 0.068 0.932
#> SRR2105238 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105228 1 0.1633 0.9690 0.976 0.024
#> SRR2105225 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0672 0.9839 0.992 0.008
#> SRR2105230 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105222 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105223 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105214 1 0.0938 0.9804 0.988 0.012
#> SRR2105211 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.1843 0.9485 0.028 0.972
#> SRR2105206 2 0.2603 0.9372 0.044 0.956
#> SRR2105201 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0938 0.9804 0.988 0.012
#> SRR2105195 1 0.0938 0.9804 0.988 0.012
#> SRR2105196 1 0.1184 0.9767 0.984 0.016
#> SRR2105193 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105190 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.2043 0.9463 0.032 0.968
#> SRR2105188 2 0.4298 0.8984 0.088 0.912
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.1843 0.9481 0.028 0.972
#> SRR2105186 2 0.0672 0.9608 0.008 0.992
#> SRR2105181 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.3733 0.9171 0.928 0.072
#> SRR2105150 1 0.2603 0.9485 0.956 0.044
#> SRR2105147 2 0.9983 0.1602 0.476 0.524
#> SRR2105148 2 0.9998 0.1023 0.492 0.508
#> SRR2105143 1 0.0376 0.9873 0.996 0.004
#> SRR2105144 1 0.3274 0.9311 0.940 0.060
#> SRR2105145 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.1414 0.9537 0.020 0.980
#> SRR2105142 2 0.0938 0.9585 0.012 0.988
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.0938 0.9586 0.012 0.988
#> SRR2105138 2 0.0376 0.9628 0.004 0.996
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9646 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.8327 0.6681 0.264 0.736
#> SRR2105132 1 0.2948 0.9406 0.948 0.052
#> SRR2105129 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.9906 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0938 0.9803 0.988 0.012
#> SRR2105128 1 0.2778 0.9458 0.952 0.048
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105278 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105275 1 0.0424 0.9622 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105276 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105269 2 0.0747 0.9572 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105270 2 0.1031 0.9530 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105267 2 0.0592 0.9587 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105268 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0892 0.9530 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105264 2 0.0661 0.9576 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105261 1 0.2926 0.9053 0.924 0.036 0.040
#> SRR2105262 1 0.0475 0.9625 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105357 1 0.2590 0.9208 0.924 0.004 0.072
#> SRR2105358 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105439 2 0.1315 0.9502 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105440 2 0.1315 0.9502 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105509 2 0.1031 0.9536 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105510 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105507 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105508 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105505 1 0.0892 0.9592 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105506 1 0.0237 0.9637 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105501 2 0.2550 0.9019 0.056 0.932 0.012
#> SRR2105502 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105499 1 0.0892 0.9602 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105500 1 0.0592 0.9630 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105497 2 0.0848 0.9561 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105498 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.1267 0.9510 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105496 2 0.1267 0.9510 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105493 2 0.1636 0.9435 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105494 2 0.1636 0.9435 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105491 2 0.1832 0.9384 0.008 0.956 0.036
#> SRR2105492 2 0.2173 0.9267 0.008 0.944 0.048
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105487 1 0.2356 0.9219 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105488 1 0.2448 0.9213 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105485 1 0.1289 0.9532 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105486 1 0.1289 0.9521 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105483 1 0.2261 0.9104 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105484 1 0.2537 0.8961 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0892 0.9554 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105480 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105477 2 0.2050 0.9321 0.028 0.952 0.020
#> SRR2105478 2 0.1015 0.9541 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105475 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105476 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105473 2 0.1315 0.9502 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105474 2 0.1315 0.9502 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.0424 0.9630 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105470 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105467 1 0.1860 0.9399 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105468 1 0.1753 0.9431 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105465 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105466 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105463 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105464 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105461 2 0.0592 0.9586 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105460 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105457 1 0.0892 0.9590 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105458 1 0.2066 0.9320 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105455 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105454 1 0.2356 0.9219 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105451 2 0.4683 0.7694 0.140 0.836 0.024
#> SRR2105452 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105449 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0983 0.9514 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105448 2 0.0237 0.9604 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105445 1 0.6872 0.3965 0.680 0.276 0.044
#> SRR2105446 1 0.2939 0.9126 0.916 0.012 0.072
#> SRR2105443 2 0.6698 0.4669 0.280 0.684 0.036
#> SRR2105444 2 0.7192 0.1581 0.412 0.560 0.028
#> SRR2105441 2 0.0661 0.9588 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105442 2 0.0237 0.9604 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105437 1 0.1964 0.9351 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105438 1 0.1964 0.9351 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105435 1 0.0424 0.9629 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105436 1 0.0424 0.9628 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105433 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105429 2 0.4784 0.6720 0.200 0.796 0.004
#> SRR2105430 2 0.2176 0.9260 0.032 0.948 0.020
#> SRR2105427 2 0.0747 0.9575 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105428 2 0.0747 0.9575 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105425 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105426 2 0.0237 0.9604 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105421 1 0.0592 0.9623 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105422 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.0592 0.9619 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105420 1 0.0747 0.9608 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105415 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105417 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105413 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105414 2 0.0829 0.9569 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105409 2 0.0237 0.9605 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105410 2 0.0661 0.9582 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 1 0.2261 0.9280 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105408 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105403 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105404 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105405 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105406 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105401 2 0.0829 0.9581 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105402 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105399 2 0.5740 0.7537 0.100 0.804 0.096
#> SRR2105400 2 0.4745 0.8233 0.068 0.852 0.080
#> SRR2105397 1 0.7824 0.1201 0.564 0.376 0.060
#> SRR2105398 1 0.7767 0.0526 0.536 0.412 0.052
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105391 1 0.0892 0.9591 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105392 1 0.0747 0.9606 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105385 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105386 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105387 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105388 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105381 2 0.1765 0.9273 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105382 2 0.1337 0.9477 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105383 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105379 2 0.0661 0.9567 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105380 2 0.3886 0.8346 0.096 0.880 0.024
#> SRR2105377 2 0.1129 0.9527 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105378 2 0.1170 0.9526 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105375 1 0.1491 0.9494 0.968 0.016 0.016
#> SRR2105376 1 0.0424 0.9628 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105373 1 0.0747 0.9603 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105374 1 0.1529 0.9466 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105371 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105372 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105369 1 0.0747 0.9606 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105370 1 0.0592 0.9619 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105367 1 0.1525 0.9491 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105368 1 0.0829 0.9603 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105365 2 0.1525 0.9425 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105366 2 0.1399 0.9453 0.004 0.968 0.028
#> SRR2105363 2 0.0237 0.9605 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105360 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105355 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105356 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105353 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105354 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105352 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105349 2 0.0661 0.9582 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.0661 0.9588 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105346 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105347 2 0.0661 0.9581 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105348 2 0.0848 0.9573 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.0424 0.9631 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105342 1 0.0592 0.9619 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105339 1 0.0424 0.9634 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105340 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105335 1 0.0592 0.9626 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105336 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0424 0.9591 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105333 2 0.0829 0.9580 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105329 2 0.6183 0.5728 0.236 0.732 0.032
#> SRR2105330 2 0.4045 0.8252 0.104 0.872 0.024
#> SRR2105327 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105328 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105325 1 0.0424 0.9622 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105326 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105323 1 0.2448 0.9213 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105324 1 0.0747 0.9600 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105321 1 0.0424 0.9625 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105322 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105317 2 0.0592 0.9589 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105318 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105315 2 0.6772 0.4086 0.304 0.664 0.032
#> SRR2105316 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105313 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105311 1 0.1163 0.9498 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105312 1 0.1289 0.9469 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105307 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.1529 0.9484 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105310 1 0.0892 0.9590 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105305 1 0.0747 0.9606 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105306 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.1647 0.8473 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105301 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 1 0.4569 0.8229 0.860 0.068 0.072
#> SRR2105300 1 0.7674 -0.0530 0.484 0.472 0.044
#> SRR2105297 2 0.8434 0.1642 0.336 0.560 0.104
#> SRR2105298 2 0.8262 0.2552 0.304 0.592 0.104
#> SRR2105295 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105296 2 0.0237 0.9606 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105293 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105294 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0237 0.9637 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105292 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105289 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0237 0.9637 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105288 1 0.0237 0.9637 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105285 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105286 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105283 2 0.5053 0.7246 0.164 0.812 0.024
#> SRR2105284 2 0.4280 0.7973 0.124 0.856 0.020
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105260 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 1 0.0592 0.9619 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105256 1 0.0592 0.9619 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0424 0.9599 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105250 2 0.1491 0.9467 0.016 0.968 0.016
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 1 0.0592 0.9616 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105246 1 0.2229 0.9113 0.944 0.044 0.012
#> SRR2105243 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.2063 0.9375 0.008 0.948 0.044
#> SRR2105238 2 0.1453 0.9488 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105235 2 0.0661 0.9582 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105236 2 0.0475 0.9595 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105233 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105234 2 0.0424 0.9601 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105228 1 0.0237 0.9632 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105225 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105226 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105229 1 0.1860 0.9403 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105230 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105219 2 0.0592 0.9589 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105220 2 0.0592 0.9586 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105221 2 0.1482 0.9471 0.012 0.968 0.020
#> SRR2105222 2 0.1482 0.9471 0.012 0.968 0.020
#> SRR2105223 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105224 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 1 0.0592 0.9606 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105214 1 0.1585 0.9445 0.964 0.008 0.028
#> SRR2105211 1 0.0747 0.9608 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105212 1 0.0747 0.9606 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105208 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105205 2 0.0983 0.9545 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105206 2 0.1620 0.9447 0.012 0.964 0.024
#> SRR2105201 2 0.1315 0.9502 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105202 2 0.1453 0.9484 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105197 1 0.2261 0.9255 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105198 1 0.2496 0.9219 0.928 0.004 0.068
#> SRR2105195 1 0.1129 0.9527 0.976 0.004 0.020
#> SRR2105196 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105193 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105194 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105191 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105192 1 0.2356 0.9219 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105189 2 0.0475 0.9598 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105190 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105187 2 0.2176 0.9276 0.032 0.948 0.020
#> SRR2105188 2 0.3722 0.8491 0.088 0.888 0.024
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9638 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.1636 0.9396 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105186 2 0.0747 0.9544 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105181 1 0.2356 0.9219 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105182 1 0.1163 0.9557 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105177 1 0.0424 0.9624 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105178 1 0.2066 0.9191 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105176 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105166 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105163 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105164 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105161 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105162 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105160 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105153 2 0.0424 0.9590 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105154 2 0.0237 0.9604 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 1 0.3009 0.9093 0.920 0.028 0.052
#> SRR2105150 1 0.1950 0.9442 0.952 0.008 0.040
#> SRR2105147 3 0.6950 0.1754 0.476 0.016 0.508
#> SRR2105148 3 0.6952 0.1622 0.480 0.016 0.504
#> SRR2105143 1 0.0475 0.9626 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105144 1 0.0747 0.9546 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105145 1 0.0747 0.9580 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105146 1 0.0424 0.9622 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105141 2 0.1399 0.9455 0.004 0.968 0.028
#> SRR2105142 2 0.0983 0.9531 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.2434 0.9203 0.036 0.940 0.024
#> SRR2105138 2 0.3325 0.8697 0.076 0.904 0.020
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9613 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105134 1 0.2448 0.9209 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105131 2 0.6124 0.5932 0.220 0.744 0.036
#> SRR2105132 1 0.3993 0.8650 0.884 0.052 0.064
#> SRR2105129 1 0.0237 0.9634 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105130 1 0.1860 0.9276 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105127 1 0.2269 0.9368 0.944 0.016 0.040
#> SRR2105128 1 0.4458 0.8229 0.864 0.080 0.056
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 1 0.5168 -0.7695 0.500 0.000 0.496 0.004
#> SRR2105278 3 0.5000 0.7499 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR2105275 1 0.4252 0.5530 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105276 1 0.4431 0.5306 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105273 1 0.0707 0.5552 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105274 1 0.2589 0.5808 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105271 1 0.1118 0.5544 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105272 1 0.4564 0.5190 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105269 2 0.0657 0.9492 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105270 2 0.1109 0.9479 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105267 2 0.0817 0.9493 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105268 2 0.0817 0.9495 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105265 2 0.1302 0.9452 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105266 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105263 2 0.1389 0.9453 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105264 2 0.1209 0.9451 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR2105261 1 0.6811 -0.1579 0.588 0.268 0.144 0.000
#> SRR2105262 1 0.3803 0.4099 0.836 0.032 0.132 0.000
#> SRR2105357 3 0.5336 0.7537 0.492 0.004 0.500 0.004
#> SRR2105358 3 0.5168 0.7553 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105439 2 0.2125 0.9270 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR2105440 2 0.2053 0.9297 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR2105509 2 0.0804 0.9488 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR2105510 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105507 1 0.1474 0.5694 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105508 1 0.0336 0.5463 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105505 1 0.4304 -0.1394 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105506 1 0.2921 0.3932 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105503 2 0.0817 0.9488 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105504 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105501 2 0.1724 0.9364 0.020 0.948 0.032 0.000
#> SRR2105502 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105499 1 0.2334 0.4569 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR2105500 1 0.4049 0.1114 0.780 0.008 0.212 0.000
#> SRR2105497 2 0.0844 0.9507 0.004 0.980 0.012 0.004
#> SRR2105498 2 0.0336 0.9499 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105495 2 0.1305 0.9425 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105496 2 0.1398 0.9423 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR2105493 2 0.1675 0.9399 0.004 0.948 0.044 0.004
#> SRR2105494 2 0.1930 0.9317 0.004 0.936 0.056 0.004
#> SRR2105491 2 0.2474 0.9215 0.016 0.920 0.056 0.008
#> SRR2105492 2 0.2553 0.9180 0.016 0.916 0.060 0.008
#> SRR2105489 2 0.0921 0.9484 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105490 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105487 3 0.4989 0.7069 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105488 3 0.4888 0.6101 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR2105485 1 0.4916 -0.6260 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR2105486 1 0.4925 -0.6402 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR2105483 1 0.4713 0.4963 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR2105484 1 0.4730 0.4922 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105481 1 0.3801 0.5656 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR2105482 1 0.3356 0.5768 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105479 1 0.4584 0.5298 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR2105480 1 0.4564 0.5162 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105477 2 0.1585 0.9416 0.004 0.952 0.040 0.004
#> SRR2105478 2 0.1585 0.9404 0.004 0.952 0.040 0.004
#> SRR2105475 2 0.0895 0.9469 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105476 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105473 2 0.2125 0.9270 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR2105474 2 0.1978 0.9292 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR2105471 2 0.1022 0.9478 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105472 2 0.1211 0.9458 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105469 1 0.1716 0.4972 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105470 1 0.0707 0.5415 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105467 1 0.4972 -0.6985 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR2105468 1 0.4877 -0.5885 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR2105465 1 0.3681 0.5745 0.816 0.008 0.176 0.000
#> SRR2105466 1 0.4500 0.5272 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105463 1 0.4679 0.5036 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR2105464 1 0.4697 0.5000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105461 2 0.0921 0.9486 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105462 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105459 2 0.0817 0.9496 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105460 2 0.0817 0.9491 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105457 1 0.4522 -0.3061 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR2105458 1 0.5150 -0.5830 0.596 0.008 0.396 0.000
#> SRR2105455 1 0.0592 0.5382 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105456 1 0.1302 0.5540 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105453 1 0.5151 -0.7211 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR2105454 1 0.5137 -0.6988 0.544 0.000 0.452 0.004
#> SRR2105451 2 0.3241 0.8798 0.072 0.884 0.040 0.004
#> SRR2105452 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105449 1 0.4134 0.5542 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105450 1 0.4304 0.5469 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105447 2 0.1174 0.9466 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR2105448 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105445 1 0.7654 -0.4062 0.464 0.252 0.284 0.000
#> SRR2105446 1 0.5168 -0.7696 0.500 0.004 0.496 0.000
#> SRR2105443 2 0.5172 0.6619 0.188 0.744 0.068 0.000
#> SRR2105444 2 0.6260 0.5035 0.244 0.656 0.096 0.004
#> SRR2105441 2 0.1576 0.9437 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR2105442 2 0.0188 0.9490 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105437 3 0.4992 -0.2158 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR2105438 3 0.5151 -0.1947 0.464 0.000 0.532 0.004
#> SRR2105435 1 0.3074 0.3538 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105436 1 0.2589 0.4233 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105433 1 0.4543 0.5215 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR2105434 1 0.4008 0.5583 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105431 1 0.4605 0.5158 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105432 1 0.4564 0.5222 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105429 2 0.4017 0.7942 0.128 0.828 0.044 0.000
#> SRR2105430 2 0.1296 0.9451 0.004 0.964 0.028 0.004
#> SRR2105427 2 0.1004 0.9499 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105428 2 0.0895 0.9474 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105425 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105426 2 0.0779 0.9475 0.004 0.980 0.016 0.000
#> SRR2105421 1 0.2859 0.4026 0.880 0.008 0.112 0.000
#> SRR2105422 1 0.0921 0.5359 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105423 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105424 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105419 1 0.3610 0.1871 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105420 1 0.3610 0.1800 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105415 1 0.4304 0.5484 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105416 1 0.4356 0.5434 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105417 1 0.2814 0.5719 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105418 1 0.4697 0.5000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105413 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105414 2 0.1004 0.9463 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105409 2 0.1209 0.9487 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105410 2 0.1004 0.9483 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105411 2 0.1022 0.9484 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105412 2 0.1118 0.9472 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105407 1 0.5168 -0.7626 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR2105408 3 0.5168 0.7553 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105403 3 0.5168 0.7553 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105404 1 0.5167 -0.7645 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR2105405 1 0.1302 0.5524 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105406 1 0.1557 0.5532 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105401 2 0.1109 0.9456 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105402 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105399 2 0.4785 0.7961 0.108 0.812 0.028 0.052
#> SRR2105400 2 0.4071 0.8457 0.084 0.852 0.028 0.036
#> SRR2105397 2 0.7750 0.0896 0.260 0.500 0.232 0.008
#> SRR2105398 2 0.7264 0.2281 0.272 0.552 0.172 0.004
#> SRR2105395 2 0.1022 0.9479 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105396 2 0.1211 0.9464 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105393 2 0.1118 0.9478 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105394 2 0.1302 0.9447 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105389 1 0.2530 0.4209 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105390 1 0.2281 0.4555 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR2105391 1 0.4713 -0.4372 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR2105392 1 0.4624 -0.3684 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR2105385 1 0.1118 0.5650 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105386 1 0.0469 0.5423 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105387 1 0.0707 0.5465 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105388 1 0.1389 0.5431 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105381 2 0.1520 0.9406 0.020 0.956 0.024 0.000
#> SRR2105382 2 0.0921 0.9462 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105383 2 0.1022 0.9489 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105384 2 0.1109 0.9494 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR2105379 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105380 2 0.2363 0.9159 0.024 0.920 0.056 0.000
#> SRR2105377 2 0.1978 0.9321 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR2105378 2 0.2053 0.9287 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR2105375 1 0.5279 0.0728 0.736 0.072 0.192 0.000
#> SRR2105376 1 0.3982 0.3012 0.776 0.004 0.220 0.000
#> SRR2105373 1 0.3219 0.3576 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105374 1 0.4985 0.2341 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR2105371 1 0.0817 0.5395 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105372 1 0.0336 0.5463 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105369 1 0.2921 0.3679 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105370 1 0.3024 0.3695 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105367 1 0.5626 -0.4580 0.588 0.028 0.384 0.000
#> SRR2105368 1 0.5793 -0.0846 0.580 0.036 0.384 0.000
#> SRR2105365 2 0.2198 0.9254 0.000 0.920 0.072 0.008
#> SRR2105366 2 0.1824 0.9367 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR2105363 2 0.0524 0.9494 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105364 2 0.0336 0.9491 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105361 2 0.1118 0.9475 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105362 2 0.1022 0.9483 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105359 1 0.1940 0.4751 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105360 1 0.0817 0.5310 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105355 1 0.0817 0.5348 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105356 1 0.0592 0.5452 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105353 1 0.0817 0.5542 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105354 1 0.1211 0.5656 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105351 2 0.0817 0.9493 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105352 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105349 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105350 2 0.0469 0.9503 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105345 2 0.1489 0.9446 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR2105346 2 0.1302 0.9473 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105347 2 0.1302 0.9442 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105348 2 0.1211 0.9469 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105343 2 0.1022 0.9472 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105344 2 0.1302 0.9453 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105341 1 0.2345 0.4418 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR2105342 1 0.1867 0.4817 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105339 1 0.0592 0.5412 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105340 1 0.1867 0.5743 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105335 1 0.3074 0.3626 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105336 1 0.2760 0.4858 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105337 1 0.0921 0.5642 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105338 1 0.3801 0.5685 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR2105331 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105332 2 0.0707 0.9496 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105333 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105334 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105329 2 0.4866 0.7335 0.156 0.780 0.060 0.004
#> SRR2105330 2 0.2774 0.9069 0.044 0.908 0.044 0.004
#> SRR2105327 2 0.0707 0.9467 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105328 2 0.0817 0.9463 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105325 1 0.4608 0.5268 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR2105326 1 0.4655 0.5227 0.684 0.000 0.312 0.004
#> SRR2105323 1 0.4998 -0.7601 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR2105324 1 0.4564 -0.3352 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105319 1 0.3688 0.5696 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105320 1 0.4454 0.5313 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR2105321 1 0.4193 0.5491 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105322 1 0.4477 0.5250 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR2105317 2 0.0657 0.9494 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105318 2 0.0469 0.9500 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105315 2 0.5772 0.6160 0.116 0.708 0.176 0.000
#> SRR2105316 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105313 2 0.0895 0.9468 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105314 2 0.0707 0.9493 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105311 1 0.4677 0.5214 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR2105312 1 0.4677 0.5200 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR2105307 1 0.1302 0.5538 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105308 1 0.1716 0.5500 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105309 1 0.5070 -0.6107 0.580 0.000 0.416 0.004
#> SRR2105310 1 0.4804 -0.5180 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105305 1 0.3356 0.2689 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105306 1 0.0921 0.5313 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105303 2 0.0592 0.9487 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105304 4 0.0188 0.8474 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105301 2 0.0817 0.9463 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105302 2 0.0707 0.9495 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105299 3 0.6673 0.6892 0.460 0.072 0.464 0.004
#> SRR2105300 2 0.7525 0.1052 0.180 0.496 0.320 0.004
#> SRR2105297 2 0.5819 0.6493 0.152 0.740 0.084 0.024
#> SRR2105298 2 0.5168 0.7239 0.132 0.784 0.060 0.024
#> SRR2105295 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105296 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105293 1 0.4356 0.5369 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105294 1 0.4193 0.5499 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105291 1 0.1867 0.4988 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105292 1 0.3764 0.5699 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105289 1 0.1211 0.5518 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105290 1 0.2760 0.5795 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105287 1 0.1940 0.5429 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105288 1 0.1792 0.5688 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105285 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105286 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105283 2 0.3272 0.8828 0.052 0.884 0.060 0.004
#> SRR2105284 2 0.3029 0.8908 0.048 0.896 0.052 0.004
#> SRR2105281 2 0.1211 0.9458 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105282 2 0.0469 0.9500 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105259 3 0.5168 0.7553 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105260 1 0.5168 -0.7645 0.504 0.004 0.492 0.000
#> SRR2105279 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105280 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105257 1 0.3400 0.5442 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105258 1 0.4193 0.5535 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105253 2 0.0469 0.9476 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105254 2 0.0592 0.9485 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105255 1 0.4193 -0.0818 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105256 1 0.3486 0.2453 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105251 2 0.1302 0.9467 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105252 2 0.1118 0.9480 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105249 2 0.1824 0.9361 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR2105250 2 0.2053 0.9287 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR2105247 2 0.1022 0.9495 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105248 2 0.0817 0.9486 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105245 1 0.3074 0.5781 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105246 1 0.4417 0.4898 0.820 0.084 0.092 0.004
#> SRR2105243 1 0.1022 0.5349 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105244 1 0.1940 0.5739 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105241 1 0.2589 0.5807 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105242 1 0.3688 0.5709 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105239 1 0.2216 0.5768 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105240 1 0.2530 0.5693 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105237 2 0.1732 0.9408 0.004 0.948 0.040 0.008
#> SRR2105238 2 0.1675 0.9394 0.004 0.948 0.044 0.004
#> SRR2105235 2 0.1398 0.9445 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR2105236 2 0.1489 0.9457 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR2105233 2 0.0592 0.9472 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105234 2 0.0707 0.9483 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105231 2 0.1118 0.9493 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105232 2 0.0817 0.9490 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105227 1 0.1767 0.5605 0.944 0.012 0.044 0.000
#> SRR2105228 1 0.2892 0.5619 0.896 0.036 0.068 0.000
#> SRR2105225 1 0.0469 0.5519 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105226 1 0.2011 0.5777 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105229 1 0.4456 -0.1626 0.716 0.004 0.280 0.000
#> SRR2105230 1 0.1302 0.5293 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105219 2 0.0657 0.9494 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105220 2 0.0779 0.9489 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105221 2 0.1675 0.9360 0.004 0.948 0.044 0.004
#> SRR2105222 2 0.1847 0.9318 0.004 0.940 0.052 0.004
#> SRR2105223 1 0.0336 0.5463 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105224 1 0.0921 0.5552 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105217 2 0.0817 0.9500 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105218 2 0.1118 0.9469 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105215 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105216 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105213 1 0.3257 0.5781 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR2105214 1 0.3560 0.5735 0.844 0.012 0.140 0.004
#> SRR2105211 1 0.4372 -0.1207 0.728 0.004 0.268 0.000
#> SRR2105212 1 0.4560 -0.2361 0.700 0.004 0.296 0.000
#> SRR2105209 1 0.1637 0.5521 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105210 1 0.3649 0.5720 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR2105207 1 0.3975 0.5618 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105208 1 0.4585 0.5196 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR2105205 2 0.1022 0.9450 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105206 2 0.1109 0.9451 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR2105201 2 0.2125 0.9270 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR2105202 2 0.2125 0.9270 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR2105203 2 0.1022 0.9481 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105204 2 0.1302 0.9447 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105199 2 0.1211 0.9464 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105200 2 0.1302 0.9470 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105197 3 0.5167 0.7246 0.488 0.000 0.508 0.004
#> SRR2105198 3 0.5672 0.7461 0.468 0.016 0.512 0.004
#> SRR2105195 1 0.4095 0.5684 0.804 0.024 0.172 0.000
#> SRR2105196 1 0.5106 0.5358 0.720 0.040 0.240 0.000
#> SRR2105193 1 0.4624 0.5096 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR2105194 1 0.4713 0.4940 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR2105191 1 0.5000 -0.7640 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR2105192 1 0.5147 -0.6498 0.536 0.000 0.460 0.004
#> SRR2105189 2 0.1004 0.9464 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105190 2 0.0592 0.9489 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105187 2 0.2076 0.9307 0.008 0.932 0.056 0.004
#> SRR2105188 2 0.3222 0.8899 0.036 0.884 0.076 0.004
#> SRR2105179 1 0.3123 0.5804 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105180 1 0.4304 0.5394 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105183 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105184 2 0.1118 0.9472 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105185 2 0.1629 0.9396 0.024 0.952 0.024 0.000
#> SRR2105186 2 0.1004 0.9487 0.004 0.972 0.024 0.000
#> SRR2105181 1 0.4994 -0.7490 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR2105182 1 0.4543 -0.3275 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR2105177 1 0.4605 0.5139 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105178 1 0.4730 0.4922 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105171 2 0.1022 0.9483 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105172 2 0.1118 0.9474 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105175 1 0.4585 0.5193 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR2105176 1 0.4697 0.4975 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105173 2 0.1022 0.9490 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105174 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105169 2 0.0921 0.9476 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105170 2 0.0592 0.9505 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105167 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105168 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105165 1 0.4483 0.5381 0.712 0.000 0.284 0.004
#> SRR2105166 1 0.4331 0.5365 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR2105163 1 0.4250 0.5465 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105164 1 0.4431 0.5294 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105161 1 0.4500 0.5261 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105162 1 0.4643 0.5091 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR2105155 2 0.1211 0.9461 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105156 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105157 2 0.0921 0.9488 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105158 2 0.1557 0.9417 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105159 1 0.4477 0.5240 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR2105160 1 0.4585 0.5163 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR2105153 2 0.1211 0.9482 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105154 2 0.1118 0.9478 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105151 2 0.1211 0.9463 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105152 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105149 1 0.6756 -0.4969 0.564 0.096 0.336 0.004
#> SRR2105150 1 0.6295 -0.2964 0.616 0.088 0.296 0.000
#> SRR2105147 4 0.7258 0.2217 0.336 0.020 0.100 0.544
#> SRR2105148 4 0.7271 0.2081 0.340 0.020 0.100 0.540
#> SRR2105143 1 0.3464 0.5710 0.860 0.032 0.108 0.000
#> SRR2105144 1 0.3935 0.4886 0.840 0.100 0.060 0.000
#> SRR2105145 1 0.4605 0.5121 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105146 1 0.4679 0.4995 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR2105141 2 0.1398 0.9416 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR2105142 2 0.1022 0.9451 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105139 2 0.1118 0.9465 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105140 2 0.1211 0.9458 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105137 2 0.1978 0.9292 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR2105138 2 0.2706 0.9061 0.024 0.908 0.064 0.004
#> SRR2105135 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105136 2 0.1389 0.9436 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105133 1 0.5168 -0.7695 0.500 0.000 0.496 0.004
#> SRR2105134 3 0.5000 0.7471 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR2105131 2 0.4830 0.7546 0.044 0.780 0.168 0.008
#> SRR2105132 3 0.6926 0.6372 0.392 0.112 0.496 0.000
#> SRR2105129 1 0.4522 0.5264 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR2105130 1 0.4730 0.4922 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105127 1 0.5938 -0.7413 0.488 0.036 0.476 0.000
#> SRR2105128 3 0.6857 0.6527 0.404 0.104 0.492 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.1117 0.63623 0.020 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR2105278 3 0.1117 0.63707 0.020 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR2105275 1 0.4350 0.57982 0.764 0.000 0.084 0.000 NA
#> SRR2105276 1 0.3810 0.57230 0.788 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR2105273 1 0.5598 0.32478 0.544 0.000 0.376 0.000 NA
#> SRR2105274 1 0.5414 0.48824 0.624 0.000 0.284 0.000 NA
#> SRR2105271 1 0.4744 0.32108 0.572 0.000 0.408 0.000 NA
#> SRR2105272 1 0.3102 0.60775 0.860 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105269 2 0.1965 0.86954 0.000 0.904 0.000 0.000 NA
#> SRR2105270 2 0.3039 0.81130 0.000 0.808 0.000 0.000 NA
#> SRR2105267 2 0.0609 0.88227 0.000 0.980 0.000 0.000 NA
#> SRR2105268 2 0.0955 0.88192 0.000 0.968 0.004 0.000 NA
#> SRR2105265 2 0.0992 0.87961 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105266 2 0.0992 0.87961 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105263 2 0.3790 0.75165 0.004 0.744 0.004 0.000 NA
#> SRR2105264 2 0.3366 0.78734 0.004 0.784 0.000 0.000 NA
#> SRR2105261 3 0.7520 0.21010 0.276 0.200 0.460 0.000 NA
#> SRR2105262 1 0.5668 0.15255 0.492 0.016 0.448 0.000 NA
#> SRR2105357 3 0.1106 0.63485 0.012 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR2105358 3 0.1012 0.63409 0.012 0.000 0.968 0.000 NA
#> SRR2105439 2 0.3707 0.72922 0.000 0.716 0.000 0.000 NA
#> SRR2105440 2 0.3707 0.72987 0.000 0.716 0.000 0.000 NA
#> SRR2105509 2 0.1043 0.88166 0.000 0.960 0.000 0.000 NA
#> SRR2105510 2 0.1121 0.88203 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105507 1 0.5406 0.35607 0.572 0.000 0.360 0.000 NA
#> SRR2105508 1 0.5476 0.29887 0.544 0.000 0.388 0.000 NA
#> SRR2105505 3 0.3462 0.60237 0.196 0.000 0.792 0.000 NA
#> SRR2105506 3 0.5027 0.41715 0.304 0.000 0.640 0.000 NA
#> SRR2105503 2 0.0955 0.88155 0.000 0.968 0.004 0.000 NA
#> SRR2105504 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105501 2 0.3080 0.84944 0.008 0.844 0.008 0.000 NA
#> SRR2105502 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105499 3 0.4648 0.01899 0.464 0.000 0.524 0.000 NA
#> SRR2105500 3 0.4874 0.26028 0.388 0.008 0.588 0.000 NA
#> SRR2105497 2 0.1410 0.87842 0.000 0.940 0.000 0.000 NA
#> SRR2105498 2 0.2719 0.84051 0.004 0.852 0.000 0.000 NA
#> SRR2105495 2 0.3636 0.74236 0.000 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105496 2 0.3636 0.73978 0.000 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105493 2 0.3861 0.72838 0.000 0.712 0.004 0.000 NA
#> SRR2105494 2 0.3661 0.73171 0.000 0.724 0.000 0.000 NA
#> SRR2105491 2 0.4359 0.69208 0.020 0.704 0.004 0.000 NA
#> SRR2105492 2 0.4410 0.68914 0.016 0.700 0.008 0.000 NA
#> SRR2105489 2 0.2416 0.86173 0.000 0.888 0.012 0.000 NA
#> SRR2105490 2 0.1484 0.87845 0.000 0.944 0.008 0.000 NA
#> SRR2105487 3 0.2513 0.57089 0.116 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR2105488 3 0.3388 0.45141 0.200 0.000 0.792 0.000 NA
#> SRR2105485 3 0.2304 0.63783 0.100 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR2105486 3 0.2233 0.63750 0.104 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR2105483 1 0.3399 0.52834 0.812 0.000 0.012 0.004 NA
#> SRR2105484 1 0.3684 0.53174 0.800 0.000 0.024 0.004 NA
#> SRR2105481 1 0.4098 0.59027 0.780 0.000 0.156 0.000 NA
#> SRR2105482 1 0.3565 0.59938 0.800 0.000 0.176 0.000 NA
#> SRR2105479 1 0.3413 0.59448 0.832 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR2105480 1 0.2848 0.60005 0.868 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105477 2 0.4360 0.72839 0.024 0.692 0.000 0.000 NA
#> SRR2105478 2 0.3857 0.73458 0.000 0.688 0.000 0.000 NA
#> SRR2105475 2 0.1341 0.87855 0.000 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105476 2 0.1478 0.87823 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105473 2 0.3707 0.72862 0.000 0.716 0.000 0.000 NA
#> SRR2105474 2 0.3684 0.73083 0.000 0.720 0.000 0.000 NA
#> SRR2105471 2 0.2136 0.86750 0.000 0.904 0.008 0.000 NA
#> SRR2105472 2 0.2358 0.86006 0.000 0.888 0.008 0.000 NA
#> SRR2105469 1 0.5295 0.10981 0.488 0.000 0.464 0.000 NA
#> SRR2105470 1 0.4610 0.26328 0.556 0.000 0.432 0.000 NA
#> SRR2105467 3 0.1331 0.64267 0.040 0.000 0.952 0.000 NA
#> SRR2105468 3 0.2017 0.64214 0.080 0.000 0.912 0.000 NA
#> SRR2105465 1 0.5319 0.55078 0.664 0.004 0.240 0.000 NA
#> SRR2105466 1 0.3238 0.55983 0.836 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105463 1 0.3264 0.53804 0.820 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR2105464 1 0.3203 0.53483 0.820 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105461 2 0.0771 0.88058 0.000 0.976 0.004 0.000 NA
#> SRR2105462 2 0.0992 0.87992 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105459 2 0.0703 0.88172 0.000 0.976 0.000 0.000 NA
#> SRR2105460 2 0.1043 0.88086 0.000 0.960 0.000 0.000 NA
#> SRR2105457 3 0.4348 0.42066 0.316 0.000 0.668 0.000 NA
#> SRR2105458 3 0.4052 0.56815 0.204 0.004 0.764 0.000 NA
#> SRR2105455 1 0.4760 0.32367 0.564 0.000 0.416 0.000 NA
#> SRR2105456 1 0.5663 0.38564 0.532 0.000 0.384 0.000 NA
#> SRR2105453 3 0.1774 0.63716 0.052 0.000 0.932 0.000 NA
#> SRR2105454 3 0.1981 0.63249 0.064 0.000 0.920 0.000 NA
#> SRR2105451 2 0.4888 0.70659 0.004 0.676 0.048 0.000 NA
#> SRR2105452 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105449 1 0.3182 0.61236 0.844 0.000 0.124 0.000 NA
#> SRR2105450 1 0.3056 0.60021 0.864 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR2105447 2 0.1877 0.87625 0.000 0.924 0.012 0.000 NA
#> SRR2105448 2 0.1544 0.87597 0.000 0.932 0.000 0.000 NA
#> SRR2105445 3 0.6083 0.34011 0.016 0.156 0.620 0.000 NA
#> SRR2105446 3 0.1588 0.63367 0.016 0.008 0.948 0.000 NA
#> SRR2105443 2 0.6797 0.41102 0.020 0.520 0.220 0.000 NA
#> SRR2105444 2 0.7524 0.28785 0.064 0.468 0.232 0.000 NA
#> SRR2105441 2 0.2773 0.82634 0.000 0.836 0.000 0.000 NA
#> SRR2105442 2 0.0865 0.88389 0.000 0.972 0.004 0.000 NA
#> SRR2105437 1 0.6047 0.07456 0.480 0.000 0.400 0.000 NA
#> SRR2105438 1 0.6158 0.08969 0.480 0.000 0.384 0.000 NA
#> SRR2105435 3 0.4949 0.08439 0.444 0.004 0.532 0.000 NA
#> SRR2105436 3 0.4803 0.09082 0.444 0.000 0.536 0.000 NA
#> SRR2105433 1 0.2864 0.55615 0.852 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105434 1 0.4469 0.55913 0.756 0.000 0.096 0.000 NA
#> SRR2105431 1 0.3495 0.55811 0.816 0.000 0.032 0.000 NA
#> SRR2105432 1 0.3106 0.56580 0.844 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR2105429 2 0.4461 0.77586 0.032 0.792 0.108 0.000 NA
#> SRR2105430 2 0.2644 0.86643 0.012 0.888 0.012 0.000 NA
#> SRR2105427 2 0.1851 0.86870 0.000 0.912 0.000 0.000 NA
#> SRR2105428 2 0.2230 0.85646 0.000 0.884 0.000 0.000 NA
#> SRR2105425 2 0.1341 0.87846 0.000 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105426 2 0.1478 0.87888 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105421 3 0.5246 0.03330 0.448 0.004 0.512 0.000 NA
#> SRR2105422 1 0.5261 0.25415 0.528 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR2105423 2 0.1168 0.88017 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105424 2 0.0992 0.88024 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105419 3 0.4736 0.20505 0.404 0.000 0.576 0.000 NA
#> SRR2105420 3 0.4674 0.18122 0.416 0.000 0.568 0.000 NA
#> SRR2105415 1 0.2946 0.59260 0.868 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR2105416 1 0.3944 0.54156 0.788 0.000 0.052 0.000 NA
#> SRR2105417 1 0.5487 0.50235 0.620 0.000 0.280 0.000 NA
#> SRR2105418 1 0.3093 0.53611 0.824 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR2105413 2 0.1571 0.87809 0.000 0.936 0.000 0.004 NA
#> SRR2105414 2 0.1478 0.87794 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105409 2 0.1628 0.87682 0.000 0.936 0.008 0.000 NA
#> SRR2105410 2 0.3013 0.82542 0.000 0.832 0.008 0.000 NA
#> SRR2105411 2 0.0955 0.88182 0.000 0.968 0.004 0.000 NA
#> SRR2105412 2 0.0865 0.88045 0.000 0.972 0.004 0.000 NA
#> SRR2105407 3 0.1568 0.64063 0.036 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR2105408 3 0.1195 0.63347 0.012 0.000 0.960 0.000 NA
#> SRR2105403 3 0.1106 0.63387 0.012 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR2105404 3 0.1399 0.63840 0.028 0.000 0.952 0.000 NA
#> SRR2105405 1 0.5499 0.35194 0.532 0.000 0.400 0.000 NA
#> SRR2105406 1 0.5812 0.38919 0.528 0.000 0.372 0.000 NA
#> SRR2105401 2 0.2020 0.87093 0.000 0.900 0.000 0.000 NA
#> SRR2105402 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105399 2 0.4969 0.75165 0.004 0.768 0.112 0.052 NA
#> SRR2105400 2 0.4428 0.78714 0.004 0.804 0.096 0.040 NA
#> SRR2105397 2 0.8017 -0.00308 0.116 0.368 0.340 0.000 NA
#> SRR2105398 2 0.8083 0.04917 0.140 0.392 0.304 0.000 NA
#> SRR2105395 2 0.1331 0.88178 0.000 0.952 0.008 0.000 NA
#> SRR2105396 2 0.0992 0.88215 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105393 2 0.0898 0.88008 0.000 0.972 0.008 0.000 NA
#> SRR2105394 2 0.1331 0.87954 0.000 0.952 0.008 0.000 NA
#> SRR2105389 3 0.5509 0.28979 0.360 0.000 0.564 0.000 NA
#> SRR2105390 3 0.5668 0.10467 0.416 0.000 0.504 0.000 NA
#> SRR2105391 3 0.4119 0.58184 0.212 0.000 0.752 0.000 NA
#> SRR2105392 3 0.4129 0.58708 0.204 0.000 0.756 0.000 NA
#> SRR2105385 1 0.5181 0.38333 0.588 0.000 0.360 0.000 NA
#> SRR2105386 1 0.4958 0.31464 0.568 0.000 0.400 0.000 NA
#> SRR2105387 1 0.4924 0.30664 0.552 0.000 0.420 0.000 NA
#> SRR2105388 1 0.4996 0.30310 0.548 0.000 0.420 0.000 NA
#> SRR2105381 2 0.2429 0.86878 0.004 0.900 0.020 0.000 NA
#> SRR2105382 2 0.2349 0.86761 0.012 0.900 0.004 0.000 NA
#> SRR2105383 2 0.0880 0.88240 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105384 2 0.1197 0.88333 0.000 0.952 0.000 0.000 NA
#> SRR2105379 2 0.2017 0.87087 0.008 0.912 0.000 0.000 NA
#> SRR2105380 2 0.4183 0.78311 0.084 0.780 0.000 0.000 NA
#> SRR2105377 2 0.3508 0.75822 0.000 0.748 0.000 0.000 NA
#> SRR2105378 2 0.3636 0.73922 0.000 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105375 3 0.6042 0.22999 0.368 0.052 0.544 0.000 NA
#> SRR2105376 3 0.5046 -0.01119 0.468 0.000 0.500 0.000 NA
#> SRR2105373 3 0.5272 0.40431 0.308 0.000 0.620 0.000 NA
#> SRR2105374 1 0.5721 0.06147 0.492 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR2105371 1 0.5568 0.22691 0.516 0.000 0.412 0.000 NA
#> SRR2105372 1 0.5556 0.25428 0.524 0.000 0.404 0.000 NA
#> SRR2105369 3 0.4890 0.42764 0.332 0.000 0.628 0.000 NA
#> SRR2105370 3 0.4800 0.36553 0.368 0.000 0.604 0.000 NA
#> SRR2105367 3 0.5136 0.35925 0.352 0.020 0.608 0.000 NA
#> SRR2105368 1 0.5792 0.18697 0.528 0.028 0.404 0.000 NA
#> SRR2105365 2 0.4111 0.70230 0.008 0.708 0.004 0.000 NA
#> SRR2105366 2 0.3992 0.70657 0.004 0.712 0.004 0.000 NA
#> SRR2105363 2 0.0880 0.88165 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105364 2 0.0794 0.88232 0.000 0.972 0.000 0.000 NA
#> SRR2105361 2 0.0898 0.88165 0.000 0.972 0.008 0.000 NA
#> SRR2105362 2 0.0865 0.88275 0.000 0.972 0.004 0.000 NA
#> SRR2105359 3 0.4905 -0.04890 0.476 0.000 0.500 0.000 NA
#> SRR2105360 1 0.4882 0.22782 0.532 0.000 0.444 0.000 NA
#> SRR2105355 1 0.5513 0.24110 0.524 0.000 0.408 0.000 NA
#> SRR2105356 1 0.5000 0.32836 0.576 0.000 0.388 0.000 NA
#> SRR2105353 1 0.5793 0.34877 0.548 0.000 0.348 0.000 NA
#> SRR2105354 1 0.5323 0.45436 0.624 0.000 0.296 0.000 NA
#> SRR2105351 2 0.1732 0.87232 0.000 0.920 0.000 0.000 NA
#> SRR2105352 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105349 2 0.1608 0.87525 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105350 2 0.0566 0.88163 0.000 0.984 0.004 0.000 NA
#> SRR2105345 2 0.2970 0.82270 0.000 0.828 0.004 0.000 NA
#> SRR2105346 2 0.1270 0.88009 0.000 0.948 0.000 0.000 NA
#> SRR2105347 2 0.1965 0.86481 0.000 0.904 0.000 0.000 NA
#> SRR2105348 2 0.2130 0.87088 0.000 0.908 0.012 0.000 NA
#> SRR2105343 2 0.0963 0.88242 0.000 0.964 0.000 0.000 NA
#> SRR2105344 2 0.0798 0.88139 0.000 0.976 0.008 0.000 NA
#> SRR2105341 3 0.5325 0.08687 0.428 0.000 0.520 0.000 NA
#> SRR2105342 3 0.5178 -0.07004 0.476 0.000 0.484 0.000 NA
#> SRR2105339 1 0.5414 0.27390 0.528 0.000 0.412 0.000 NA
#> SRR2105340 1 0.5126 0.46682 0.636 0.000 0.300 0.000 NA
#> SRR2105335 3 0.5043 0.36483 0.356 0.000 0.600 0.000 NA
#> SRR2105336 3 0.5314 0.18420 0.420 0.000 0.528 0.000 NA
#> SRR2105337 1 0.4527 0.36310 0.596 0.000 0.392 0.000 NA
#> SRR2105338 1 0.3203 0.60571 0.820 0.000 0.168 0.000 NA
#> SRR2105331 2 0.1197 0.87938 0.000 0.952 0.000 0.000 NA
#> SRR2105332 2 0.1608 0.87465 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105333 2 0.1197 0.87847 0.000 0.952 0.000 0.000 NA
#> SRR2105334 2 0.1478 0.87624 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105329 2 0.6486 0.47919 0.012 0.540 0.172 0.000 NA
#> SRR2105330 2 0.4775 0.72046 0.008 0.688 0.036 0.000 NA
#> SRR2105327 2 0.1270 0.87848 0.000 0.948 0.000 0.000 NA
#> SRR2105328 2 0.1608 0.87531 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105325 1 0.4031 0.56561 0.772 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR2105326 1 0.3958 0.56712 0.776 0.000 0.040 0.000 NA
#> SRR2105323 3 0.1648 0.64294 0.040 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR2105324 3 0.4114 0.50325 0.272 0.000 0.712 0.000 NA
#> SRR2105319 1 0.4238 0.58125 0.776 0.000 0.136 0.000 NA
#> SRR2105320 1 0.3791 0.59005 0.812 0.000 0.076 0.000 NA
#> SRR2105321 1 0.4028 0.57315 0.776 0.000 0.048 0.000 NA
#> SRR2105322 1 0.3694 0.57186 0.796 0.000 0.032 0.000 NA
#> SRR2105317 2 0.0880 0.88218 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105318 2 0.0510 0.88173 0.000 0.984 0.000 0.000 NA
#> SRR2105315 2 0.6797 0.42103 0.020 0.520 0.220 0.000 NA
#> SRR2105316 2 0.1197 0.88082 0.000 0.952 0.000 0.000 NA
#> SRR2105313 2 0.1121 0.87946 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105314 2 0.0510 0.88137 0.000 0.984 0.000 0.000 NA
#> SRR2105311 1 0.4199 0.56313 0.764 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105312 1 0.4021 0.57084 0.780 0.000 0.052 0.000 NA
#> SRR2105307 1 0.5697 0.40392 0.548 0.000 0.360 0.000 NA
#> SRR2105308 1 0.5988 0.38932 0.516 0.000 0.364 0.000 NA
#> SRR2105309 3 0.3476 0.60129 0.176 0.000 0.804 0.000 NA
#> SRR2105310 3 0.3759 0.56484 0.220 0.000 0.764 0.000 NA
#> SRR2105305 3 0.5086 0.23299 0.396 0.000 0.564 0.000 NA
#> SRR2105306 1 0.5283 0.17670 0.508 0.000 0.444 0.000 NA
#> SRR2105303 2 0.0771 0.88264 0.000 0.976 0.004 0.000 NA
#> SRR2105304 4 0.0000 0.86132 0.000 0.000 0.000 1.000 NA
#> SRR2105301 2 0.1608 0.87636 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105302 2 0.1121 0.88013 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105299 3 0.3455 0.57008 0.020 0.060 0.856 0.000 NA
#> SRR2105300 3 0.7110 -0.11327 0.020 0.376 0.388 0.000 NA
#> SRR2105297 2 0.7216 0.37568 0.196 0.548 0.044 0.012 NA
#> SRR2105298 2 0.6845 0.49488 0.160 0.600 0.044 0.012 NA
#> SRR2105295 2 0.1121 0.88075 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105296 2 0.1410 0.87648 0.000 0.940 0.000 0.000 NA
#> SRR2105293 1 0.3723 0.58408 0.804 0.000 0.044 0.000 NA
#> SRR2105294 1 0.3301 0.61038 0.848 0.000 0.072 0.000 NA
#> SRR2105291 1 0.4855 0.23118 0.544 0.004 0.436 0.000 NA
#> SRR2105292 1 0.3477 0.60889 0.824 0.000 0.136 0.000 NA
#> SRR2105289 1 0.4774 0.29644 0.556 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR2105290 1 0.4777 0.51847 0.664 0.000 0.292 0.000 NA
#> SRR2105287 1 0.5557 0.21298 0.472 0.000 0.460 0.000 NA
#> SRR2105288 1 0.5630 0.45436 0.580 0.000 0.324 0.000 NA
#> SRR2105285 2 0.1270 0.88085 0.000 0.948 0.000 0.000 NA
#> SRR2105286 2 0.1478 0.87668 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105283 2 0.4843 0.69802 0.008 0.676 0.036 0.000 NA
#> SRR2105284 2 0.4914 0.69220 0.008 0.672 0.040 0.000 NA
#> SRR2105281 2 0.0865 0.88096 0.000 0.972 0.004 0.000 NA
#> SRR2105282 2 0.0898 0.88106 0.000 0.972 0.008 0.000 NA
#> SRR2105259 3 0.0912 0.63480 0.012 0.000 0.972 0.000 NA
#> SRR2105260 3 0.1399 0.64218 0.028 0.000 0.952 0.000 NA
#> SRR2105279 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105280 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105257 1 0.4797 0.44742 0.660 0.000 0.296 0.000 NA
#> SRR2105258 1 0.3644 0.59967 0.824 0.000 0.080 0.000 NA
#> SRR2105253 2 0.1043 0.88074 0.000 0.960 0.000 0.000 NA
#> SRR2105254 2 0.0880 0.88302 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105255 3 0.4054 0.56109 0.248 0.000 0.732 0.000 NA
#> SRR2105256 3 0.4360 0.49495 0.300 0.000 0.680 0.000 NA
#> SRR2105251 2 0.1628 0.87934 0.000 0.936 0.008 0.000 NA
#> SRR2105252 2 0.1571 0.87761 0.000 0.936 0.004 0.000 NA
#> SRR2105249 2 0.3534 0.75446 0.000 0.744 0.000 0.000 NA
#> SRR2105250 2 0.3684 0.73503 0.000 0.720 0.000 0.000 NA
#> SRR2105247 2 0.1408 0.88196 0.000 0.948 0.008 0.000 NA
#> SRR2105248 2 0.2077 0.87105 0.000 0.908 0.008 0.000 NA
#> SRR2105245 1 0.4980 0.53903 0.676 0.000 0.252 0.000 NA
#> SRR2105246 1 0.6816 0.37787 0.556 0.092 0.276 0.000 NA
#> SRR2105243 1 0.4781 0.29199 0.552 0.000 0.428 0.000 NA
#> SRR2105244 1 0.4497 0.43681 0.632 0.000 0.352 0.000 NA
#> SRR2105241 1 0.4465 0.50578 0.672 0.000 0.304 0.000 NA
#> SRR2105242 1 0.3719 0.60287 0.816 0.000 0.116 0.000 NA
#> SRR2105239 1 0.4524 0.45694 0.644 0.000 0.336 0.000 NA
#> SRR2105240 1 0.5681 0.51525 0.604 0.000 0.276 0.000 NA
#> SRR2105237 2 0.3388 0.81376 0.000 0.792 0.008 0.000 NA
#> SRR2105238 2 0.3684 0.73814 0.000 0.720 0.000 0.000 NA
#> SRR2105235 2 0.3612 0.74580 0.000 0.732 0.000 0.000 NA
#> SRR2105236 2 0.3074 0.80432 0.000 0.804 0.000 0.000 NA
#> SRR2105233 2 0.1121 0.88153 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105234 2 0.1043 0.88086 0.000 0.960 0.000 0.000 NA
#> SRR2105231 2 0.1251 0.88188 0.000 0.956 0.008 0.000 NA
#> SRR2105232 2 0.1124 0.88142 0.000 0.960 0.004 0.000 NA
#> SRR2105227 1 0.4999 0.42162 0.616 0.008 0.348 0.000 NA
#> SRR2105228 1 0.5701 0.45378 0.616 0.044 0.304 0.000 NA
#> SRR2105225 1 0.5284 0.33285 0.568 0.000 0.376 0.000 NA
#> SRR2105226 1 0.5452 0.49601 0.616 0.000 0.292 0.000 NA
#> SRR2105229 3 0.4883 0.33451 0.348 0.004 0.620 0.000 NA
#> SRR2105230 1 0.5168 0.16992 0.508 0.000 0.452 0.000 NA
#> SRR2105219 2 0.0703 0.88192 0.000 0.976 0.000 0.000 NA
#> SRR2105220 2 0.1908 0.86507 0.000 0.908 0.000 0.000 NA
#> SRR2105221 2 0.3707 0.72993 0.000 0.716 0.000 0.000 NA
#> SRR2105222 2 0.3707 0.72932 0.000 0.716 0.000 0.000 NA
#> SRR2105223 1 0.5423 0.30210 0.548 0.000 0.388 0.000 NA
#> SRR2105224 1 0.5360 0.36490 0.556 0.000 0.384 0.000 NA
#> SRR2105217 2 0.2179 0.85951 0.000 0.888 0.000 0.000 NA
#> SRR2105218 2 0.1952 0.87174 0.000 0.912 0.004 0.000 NA
#> SRR2105215 2 0.1082 0.87973 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105216 2 0.1168 0.87999 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105213 1 0.5032 0.54962 0.692 0.000 0.228 0.004 NA
#> SRR2105214 1 0.5450 0.52502 0.664 0.012 0.252 0.004 NA
#> SRR2105211 3 0.4733 0.34348 0.348 0.000 0.624 0.000 NA
#> SRR2105212 3 0.4371 0.39768 0.344 0.000 0.644 0.000 NA
#> SRR2105209 1 0.4717 0.35744 0.584 0.000 0.396 0.000 NA
#> SRR2105210 1 0.4065 0.59664 0.772 0.000 0.180 0.000 NA
#> SRR2105207 1 0.3194 0.60743 0.832 0.000 0.148 0.000 NA
#> SRR2105208 1 0.2864 0.57187 0.864 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR2105205 2 0.2389 0.85747 0.004 0.880 0.000 0.000 NA
#> SRR2105206 2 0.3010 0.82680 0.004 0.824 0.000 0.000 NA
#> SRR2105201 2 0.3730 0.72854 0.000 0.712 0.000 0.000 NA
#> SRR2105202 2 0.3730 0.72854 0.000 0.712 0.000 0.000 NA
#> SRR2105203 2 0.0955 0.88101 0.000 0.968 0.004 0.000 NA
#> SRR2105204 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105199 2 0.0898 0.88006 0.000 0.972 0.008 0.000 NA
#> SRR2105200 2 0.1041 0.88173 0.000 0.964 0.004 0.000 NA
#> SRR2105197 3 0.2448 0.61008 0.088 0.000 0.892 0.000 NA
#> SRR2105198 3 0.3009 0.60496 0.080 0.016 0.876 0.000 NA
#> SRR2105195 1 0.4270 0.59305 0.764 0.008 0.188 0.000 NA
#> SRR2105196 1 0.4058 0.59384 0.820 0.036 0.096 0.000 NA
#> SRR2105193 1 0.3236 0.55578 0.828 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105194 1 0.3421 0.54984 0.816 0.000 0.016 0.004 NA
#> SRR2105191 3 0.1216 0.63694 0.020 0.000 0.960 0.000 NA
#> SRR2105192 3 0.2669 0.60936 0.104 0.000 0.876 0.000 NA
#> SRR2105189 2 0.2074 0.86942 0.000 0.896 0.000 0.000 NA
#> SRR2105190 2 0.0794 0.88231 0.000 0.972 0.000 0.000 NA
#> SRR2105187 2 0.4271 0.77617 0.012 0.724 0.012 0.000 NA
#> SRR2105188 2 0.5526 0.62777 0.012 0.596 0.056 0.000 NA
#> SRR2105179 1 0.4080 0.55459 0.728 0.000 0.252 0.000 NA
#> SRR2105180 1 0.3535 0.59636 0.808 0.000 0.164 0.000 NA
#> SRR2105183 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105184 2 0.0992 0.88048 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105185 2 0.2588 0.86363 0.008 0.884 0.008 0.000 NA
#> SRR2105186 2 0.3048 0.81384 0.000 0.820 0.004 0.000 NA
#> SRR2105181 3 0.1568 0.64295 0.036 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR2105182 3 0.3381 0.60900 0.176 0.000 0.808 0.000 NA
#> SRR2105177 1 0.3399 0.53611 0.812 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105178 1 0.3289 0.52994 0.816 0.000 0.008 0.004 NA
#> SRR2105171 2 0.0865 0.88307 0.000 0.972 0.004 0.000 NA
#> SRR2105172 2 0.0992 0.88059 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105175 1 0.2625 0.57089 0.876 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR2105176 1 0.3250 0.53328 0.820 0.000 0.008 0.004 NA
#> SRR2105173 2 0.1478 0.87709 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105174 2 0.1168 0.88209 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105169 2 0.1697 0.87853 0.000 0.932 0.008 0.000 NA
#> SRR2105170 2 0.2890 0.82481 0.000 0.836 0.004 0.000 NA
#> SRR2105167 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105168 2 0.1168 0.87953 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105165 1 0.3459 0.59242 0.832 0.000 0.052 0.000 NA
#> SRR2105166 1 0.3238 0.58887 0.836 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105163 1 0.4317 0.57696 0.764 0.000 0.076 0.000 NA
#> SRR2105164 1 0.3991 0.57535 0.780 0.000 0.048 0.000 NA
#> SRR2105161 1 0.1549 0.59794 0.944 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR2105162 1 0.3123 0.53913 0.828 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105155 2 0.1168 0.87970 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105156 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105157 2 0.3421 0.78845 0.000 0.788 0.008 0.000 NA
#> SRR2105158 2 0.4015 0.72574 0.004 0.724 0.008 0.000 NA
#> SRR2105159 1 0.2740 0.59709 0.876 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105160 1 0.2540 0.59292 0.888 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR2105153 2 0.3123 0.81076 0.000 0.812 0.004 0.000 NA
#> SRR2105154 2 0.3550 0.75797 0.000 0.760 0.004 0.000 NA
#> SRR2105151 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105152 2 0.0992 0.87953 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105149 3 0.6105 0.45348 0.232 0.080 0.636 0.000 NA
#> SRR2105150 3 0.6148 0.36304 0.320 0.056 0.576 0.000 NA
#> SRR2105147 4 0.8157 0.33964 0.188 0.024 0.208 0.480 NA
#> SRR2105148 4 0.8124 0.31976 0.192 0.020 0.212 0.476 NA
#> SRR2105143 1 0.6128 0.48821 0.592 0.036 0.296 0.000 NA
#> SRR2105144 1 0.7174 0.36498 0.540 0.144 0.236 0.000 NA
#> SRR2105145 1 0.3284 0.57025 0.828 0.000 0.024 0.000 NA
#> SRR2105146 1 0.3194 0.56289 0.832 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105141 2 0.3585 0.77061 0.004 0.772 0.004 0.000 NA
#> SRR2105142 2 0.3048 0.81367 0.000 0.820 0.004 0.000 NA
#> SRR2105139 2 0.1082 0.88013 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105140 2 0.0992 0.87961 0.000 0.968 0.008 0.000 NA
#> SRR2105137 2 0.3814 0.72851 0.000 0.720 0.004 0.000 NA
#> SRR2105138 2 0.4445 0.71573 0.004 0.700 0.024 0.000 NA
#> SRR2105135 2 0.1168 0.87924 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105136 2 0.1082 0.87911 0.000 0.964 0.008 0.000 NA
#> SRR2105133 3 0.1117 0.63524 0.016 0.000 0.964 0.000 NA
#> SRR2105134 3 0.1399 0.63628 0.028 0.000 0.952 0.000 NA
#> SRR2105131 2 0.6106 0.55267 0.004 0.584 0.176 0.000 NA
#> SRR2105132 3 0.3831 0.45404 0.048 0.112 0.824 0.000 NA
#> SRR2105129 1 0.3656 0.53965 0.800 0.000 0.032 0.000 NA
#> SRR2105130 1 0.3242 0.53168 0.816 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105127 3 0.2584 0.61920 0.052 0.040 0.900 0.000 NA
#> SRR2105128 3 0.3919 0.51781 0.056 0.108 0.820 0.000 NA
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.3695 0.79498 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR2105278 5 0.3684 0.79349 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR2105275 3 0.5647 0.10371 0.184 0.000 0.584 0.000 0.220 0.012
#> SRR2105276 3 0.6027 0.03699 0.208 0.000 0.536 0.000 0.236 0.020
#> SRR2105273 3 0.3707 0.53450 0.100 0.000 0.796 0.000 0.100 0.004
#> SRR2105274 3 0.4443 0.40728 0.232 0.000 0.696 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105271 3 0.2942 0.55162 0.132 0.000 0.836 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105272 1 0.5568 0.48247 0.492 0.000 0.380 0.000 0.124 0.004
#> SRR2105269 2 0.3190 0.54707 0.000 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR2105270 2 0.3996 0.13022 0.004 0.636 0.000 0.000 0.008 0.352
#> SRR2105267 2 0.1958 0.66549 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR2105268 2 0.1349 0.67794 0.004 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105265 2 0.0405 0.67599 0.004 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105266 2 0.0870 0.67338 0.012 0.972 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105263 2 0.5124 0.33436 0.012 0.592 0.000 0.000 0.072 0.324
#> SRR2105264 2 0.4661 0.42635 0.012 0.644 0.000 0.000 0.044 0.300
#> SRR2105261 3 0.6737 0.21052 0.060 0.124 0.604 0.000 0.116 0.096
#> SRR2105262 3 0.4679 0.51576 0.104 0.012 0.752 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105357 5 0.4150 0.78868 0.000 0.000 0.392 0.000 0.592 0.016
#> SRR2105358 5 0.3684 0.79355 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR2105439 2 0.4665 -0.22656 0.024 0.552 0.000 0.000 0.012 0.412
#> SRR2105440 2 0.4582 -0.22908 0.024 0.552 0.000 0.000 0.008 0.416
#> SRR2105509 2 0.3779 0.55408 0.008 0.708 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR2105510 2 0.4022 0.53112 0.016 0.688 0.000 0.000 0.008 0.288
#> SRR2105507 3 0.3946 0.51818 0.136 0.000 0.772 0.000 0.088 0.004
#> SRR2105508 3 0.3277 0.54858 0.092 0.000 0.824 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105505 3 0.4735 -0.51021 0.048 0.000 0.520 0.000 0.432 0.000
#> SRR2105506 3 0.5417 0.07934 0.164 0.000 0.568 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105503 2 0.1802 0.67897 0.000 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR2105504 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.4978 0.25498 0.020 0.576 0.024 0.000 0.008 0.372
#> SRR2105502 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.3324 0.48083 0.060 0.000 0.824 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105500 3 0.3821 0.41941 0.048 0.004 0.792 0.000 0.144 0.012
#> SRR2105497 2 0.3093 0.64411 0.012 0.816 0.000 0.000 0.008 0.164
#> SRR2105498 2 0.3139 0.61600 0.000 0.816 0.000 0.000 0.032 0.152
#> SRR2105495 2 0.4465 -0.29848 0.020 0.504 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR2105496 2 0.4565 -0.33432 0.020 0.496 0.000 0.000 0.008 0.476
#> SRR2105493 2 0.4855 -0.32164 0.020 0.504 0.004 0.000 0.016 0.456
#> SRR2105494 2 0.4820 -0.26712 0.024 0.532 0.004 0.000 0.012 0.428
#> SRR2105491 2 0.5980 0.16193 0.036 0.464 0.004 0.000 0.084 0.412
#> SRR2105492 2 0.6013 0.16519 0.032 0.472 0.008 0.000 0.084 0.404
#> SRR2105489 2 0.2468 0.63379 0.008 0.880 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR2105490 2 0.1307 0.67000 0.008 0.952 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR2105487 5 0.5057 0.71606 0.096 0.000 0.324 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105488 5 0.5428 0.62353 0.168 0.000 0.264 0.000 0.568 0.000
#> SRR2105485 5 0.3998 0.67195 0.004 0.000 0.492 0.000 0.504 0.000
#> SRR2105486 3 0.3868 -0.66428 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR2105483 1 0.1910 0.72704 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.1910 0.72704 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.4675 0.28005 0.224 0.000 0.672 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105482 3 0.4355 -0.04299 0.420 0.000 0.556 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105479 3 0.6208 -0.25676 0.364 0.000 0.416 0.000 0.208 0.012
#> SRR2105480 1 0.5663 0.53890 0.524 0.000 0.316 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105477 6 0.4719 0.47391 0.032 0.400 0.004 0.000 0.004 0.560
#> SRR2105478 6 0.4827 0.43160 0.016 0.420 0.000 0.000 0.028 0.536
#> SRR2105475 2 0.4178 0.50361 0.016 0.660 0.000 0.004 0.004 0.316
#> SRR2105476 2 0.3946 0.53156 0.008 0.680 0.000 0.004 0.004 0.304
#> SRR2105473 2 0.4747 -0.22881 0.024 0.548 0.000 0.000 0.016 0.412
#> SRR2105474 2 0.4719 -0.20007 0.024 0.564 0.000 0.000 0.016 0.396
#> SRR2105471 2 0.2110 0.64755 0.004 0.900 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR2105472 2 0.2605 0.63148 0.012 0.876 0.000 0.000 0.020 0.092
#> SRR2105469 3 0.2527 0.51923 0.040 0.000 0.876 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105470 3 0.2892 0.55070 0.136 0.000 0.840 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105467 5 0.3993 0.78774 0.008 0.000 0.400 0.000 0.592 0.000
#> SRR2105468 5 0.4192 0.76870 0.016 0.000 0.412 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105465 1 0.4323 0.28086 0.508 0.008 0.476 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105466 1 0.2994 0.77527 0.788 0.000 0.208 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105463 1 0.2996 0.77212 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.2941 0.77360 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0935 0.67899 0.004 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105462 2 0.0653 0.67620 0.004 0.980 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105459 2 0.3109 0.60819 0.000 0.772 0.000 0.000 0.004 0.224
#> SRR2105460 2 0.3536 0.57869 0.008 0.736 0.000 0.000 0.004 0.252
#> SRR2105457 3 0.3437 0.23022 0.004 0.000 0.752 0.000 0.236 0.008
#> SRR2105458 3 0.4625 -0.10905 0.008 0.004 0.652 0.000 0.296 0.040
#> SRR2105455 3 0.3533 0.52024 0.192 0.004 0.780 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105456 3 0.4066 0.43808 0.272 0.000 0.692 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105453 5 0.4493 0.77466 0.040 0.000 0.364 0.000 0.596 0.000
#> SRR2105454 5 0.4575 0.77353 0.048 0.000 0.352 0.000 0.600 0.000
#> SRR2105451 6 0.5430 0.54894 0.024 0.376 0.048 0.000 0.008 0.544
#> SRR2105452 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.4648 -0.23616 0.444 0.000 0.520 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105450 1 0.4168 0.57270 0.584 0.000 0.400 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105447 2 0.4091 0.52956 0.012 0.684 0.008 0.000 0.004 0.292
#> SRR2105448 2 0.3790 0.56603 0.016 0.716 0.000 0.000 0.004 0.264
#> SRR2105445 6 0.6807 -0.34150 0.020 0.024 0.376 0.000 0.192 0.388
#> SRR2105446 5 0.5032 0.77397 0.016 0.000 0.396 0.000 0.544 0.044
#> SRR2105443 6 0.6466 0.61221 0.016 0.228 0.196 0.000 0.028 0.532
#> SRR2105444 6 0.7253 0.51583 0.056 0.180 0.236 0.000 0.044 0.484
#> SRR2105441 2 0.3659 0.36908 0.012 0.752 0.000 0.000 0.012 0.224
#> SRR2105442 2 0.1426 0.67806 0.008 0.948 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105437 5 0.5714 0.07021 0.188 0.000 0.228 0.000 0.572 0.012
#> SRR2105438 5 0.5647 0.07018 0.184 0.000 0.220 0.000 0.584 0.012
#> SRR2105435 3 0.3543 0.49858 0.064 0.008 0.820 0.000 0.104 0.004
#> SRR2105436 3 0.3130 0.45514 0.048 0.000 0.828 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105433 1 0.2730 0.77675 0.808 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.2996 0.75089 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.3508 0.73807 0.704 0.000 0.292 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105432 1 0.3742 0.68903 0.648 0.000 0.348 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105429 2 0.6410 0.27127 0.084 0.560 0.088 0.000 0.012 0.256
#> SRR2105430 2 0.4613 0.49578 0.036 0.644 0.004 0.000 0.008 0.308
#> SRR2105427 2 0.3452 0.52445 0.004 0.736 0.000 0.000 0.004 0.256
#> SRR2105428 2 0.3852 0.29818 0.000 0.612 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR2105425 2 0.3644 0.58207 0.008 0.732 0.000 0.000 0.008 0.252
#> SRR2105426 2 0.3502 0.62817 0.012 0.788 0.004 0.000 0.012 0.184
#> SRR2105421 3 0.3550 0.51309 0.072 0.004 0.828 0.000 0.080 0.016
#> SRR2105422 3 0.2978 0.56404 0.084 0.000 0.856 0.000 0.052 0.008
#> SRR2105423 2 0.0551 0.67639 0.004 0.984 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105424 2 0.0405 0.67395 0.008 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105419 3 0.3318 0.39607 0.032 0.000 0.796 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105420 3 0.3482 0.44119 0.040 0.000 0.816 0.000 0.128 0.016
#> SRR2105415 1 0.3887 0.67487 0.632 0.000 0.360 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105416 1 0.3515 0.71723 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.4262 0.23859 0.508 0.000 0.476 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105418 1 0.2454 0.76681 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.3809 0.53268 0.004 0.684 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR2105414 2 0.4027 0.51376 0.012 0.672 0.000 0.000 0.008 0.308
#> SRR2105409 2 0.1327 0.65304 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105410 2 0.3826 0.34308 0.012 0.736 0.000 0.000 0.016 0.236
#> SRR2105411 2 0.0632 0.68051 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105412 2 0.0665 0.67625 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105407 5 0.3797 0.77279 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105408 5 0.3747 0.78874 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR2105403 5 0.3684 0.79310 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR2105404 5 0.3684 0.79318 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR2105405 3 0.4130 0.46154 0.260 0.000 0.696 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105406 3 0.4193 0.31465 0.352 0.000 0.624 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105401 2 0.4368 0.35243 0.016 0.592 0.000 0.000 0.008 0.384
#> SRR2105402 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.6774 0.13014 0.024 0.520 0.108 0.048 0.008 0.292
#> SRR2105400 2 0.6360 0.28170 0.024 0.568 0.096 0.040 0.004 0.268
#> SRR2105397 6 0.7829 0.43304 0.072 0.160 0.216 0.000 0.100 0.452
#> SRR2105398 6 0.7892 0.38900 0.060 0.160 0.252 0.000 0.108 0.420
#> SRR2105395 2 0.1138 0.67960 0.004 0.960 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105396 2 0.0922 0.67443 0.004 0.968 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105393 2 0.0603 0.67518 0.004 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105394 2 0.1149 0.67473 0.008 0.960 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105389 3 0.3950 0.14841 0.024 0.000 0.708 0.000 0.264 0.004
#> SRR2105390 3 0.3979 0.23585 0.032 0.000 0.720 0.000 0.244 0.004
#> SRR2105391 3 0.3607 -0.26087 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR2105392 3 0.3934 -0.38609 0.008 0.000 0.616 0.000 0.376 0.000
#> SRR2105385 3 0.3023 0.53588 0.120 0.000 0.836 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105386 3 0.2826 0.56321 0.092 0.000 0.856 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105387 3 0.3078 0.51430 0.192 0.000 0.796 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105388 3 0.4038 0.49929 0.216 0.000 0.728 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105381 2 0.4813 0.49304 0.028 0.656 0.024 0.000 0.008 0.284
#> SRR2105382 2 0.4390 0.51953 0.032 0.664 0.000 0.004 0.004 0.296
#> SRR2105383 2 0.2051 0.67097 0.004 0.896 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR2105384 2 0.2196 0.66511 0.004 0.884 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105379 2 0.4016 0.54634 0.020 0.684 0.000 0.000 0.004 0.292
#> SRR2105380 2 0.5406 0.38585 0.128 0.596 0.004 0.000 0.004 0.268
#> SRR2105377 2 0.4601 -0.15261 0.024 0.584 0.000 0.000 0.012 0.380
#> SRR2105378 2 0.4628 -0.17861 0.024 0.572 0.000 0.000 0.012 0.392
#> SRR2105375 3 0.5313 0.46462 0.112 0.028 0.712 0.000 0.112 0.036
#> SRR2105376 3 0.4952 0.46935 0.188 0.000 0.664 0.000 0.144 0.004
#> SRR2105373 3 0.4746 -0.32300 0.040 0.000 0.532 0.000 0.424 0.004
#> SRR2105374 5 0.5807 0.08891 0.204 0.000 0.272 0.000 0.520 0.004
#> SRR2105371 3 0.3324 0.51250 0.060 0.000 0.824 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105372 3 0.3546 0.52294 0.076 0.000 0.808 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105369 3 0.4118 -0.09464 0.028 0.000 0.660 0.000 0.312 0.000
#> SRR2105370 3 0.4368 0.02989 0.048 0.000 0.656 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105367 3 0.5965 0.31837 0.144 0.004 0.608 0.000 0.196 0.048
#> SRR2105368 3 0.6360 0.11332 0.312 0.004 0.512 0.000 0.116 0.056
#> SRR2105365 2 0.5654 0.20590 0.024 0.492 0.000 0.000 0.084 0.400
#> SRR2105366 2 0.5539 0.22359 0.020 0.504 0.000 0.000 0.080 0.396
#> SRR2105363 2 0.2655 0.64996 0.004 0.848 0.000 0.000 0.008 0.140
#> SRR2105364 2 0.1429 0.67617 0.004 0.940 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105361 2 0.0405 0.67364 0.004 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105362 2 0.1268 0.68212 0.004 0.952 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105359 3 0.2527 0.48980 0.032 0.000 0.880 0.000 0.084 0.004
#> SRR2105360 3 0.2420 0.55961 0.076 0.000 0.884 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105355 3 0.2511 0.53625 0.056 0.000 0.880 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105356 3 0.3083 0.54644 0.132 0.000 0.828 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105353 3 0.3548 0.52524 0.068 0.000 0.812 0.000 0.112 0.008
#> SRR2105354 3 0.4304 0.46439 0.128 0.000 0.740 0.000 0.128 0.004
#> SRR2105351 2 0.2958 0.64244 0.008 0.824 0.000 0.000 0.008 0.160
#> SRR2105352 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.3875 0.55391 0.016 0.700 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR2105350 2 0.1644 0.67601 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105345 2 0.3599 0.36541 0.020 0.756 0.000 0.000 0.004 0.220
#> SRR2105346 2 0.1296 0.66114 0.004 0.948 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105347 2 0.2803 0.59646 0.012 0.856 0.000 0.000 0.016 0.116
#> SRR2105348 2 0.2704 0.61990 0.008 0.876 0.004 0.004 0.016 0.092
#> SRR2105343 2 0.1267 0.68149 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105344 2 0.0508 0.67877 0.004 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105341 3 0.2504 0.41382 0.004 0.000 0.856 0.000 0.136 0.004
#> SRR2105342 3 0.2784 0.47157 0.028 0.000 0.848 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105339 3 0.2201 0.56054 0.048 0.000 0.900 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105340 3 0.3395 0.50202 0.132 0.000 0.808 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105335 3 0.4666 -0.36678 0.048 0.000 0.564 0.000 0.388 0.000
#> SRR2105336 3 0.5560 -0.10227 0.140 0.000 0.536 0.000 0.320 0.004
#> SRR2105337 3 0.3168 0.50618 0.192 0.000 0.792 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105338 3 0.4366 -0.13026 0.428 0.000 0.548 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105331 2 0.3571 0.59331 0.008 0.744 0.000 0.000 0.008 0.240
#> SRR2105332 2 0.2973 0.64441 0.004 0.836 0.000 0.000 0.024 0.136
#> SRR2105333 2 0.3767 0.55917 0.012 0.708 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR2105334 2 0.3764 0.57470 0.012 0.724 0.000 0.000 0.008 0.256
#> SRR2105329 6 0.6478 0.64187 0.016 0.228 0.144 0.000 0.052 0.560
#> SRR2105330 6 0.5067 0.51838 0.012 0.368 0.040 0.000 0.008 0.572
#> SRR2105327 2 0.3767 0.55971 0.012 0.708 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR2105328 2 0.4160 0.54122 0.024 0.684 0.000 0.000 0.008 0.284
#> SRR2105325 3 0.5908 0.05759 0.184 0.000 0.556 0.000 0.240 0.020
#> SRR2105326 3 0.5956 0.05044 0.192 0.000 0.548 0.000 0.240 0.020
#> SRR2105323 5 0.4526 0.74231 0.000 0.000 0.456 0.000 0.512 0.032
#> SRR2105324 3 0.3799 0.10671 0.020 0.000 0.704 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105319 3 0.5299 0.19818 0.228 0.000 0.612 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105320 3 0.5843 -0.09688 0.300 0.000 0.516 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105321 3 0.6070 0.05132 0.220 0.000 0.528 0.000 0.232 0.020
#> SRR2105322 3 0.6161 -0.02088 0.236 0.000 0.508 0.000 0.236 0.020
#> SRR2105317 2 0.2980 0.62548 0.000 0.800 0.000 0.000 0.008 0.192
#> SRR2105318 2 0.1958 0.67035 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR2105315 6 0.6735 0.62216 0.008 0.300 0.084 0.000 0.116 0.492
#> SRR2105316 2 0.3915 0.53748 0.012 0.696 0.000 0.000 0.008 0.284
#> SRR2105313 2 0.3521 0.57231 0.004 0.724 0.000 0.000 0.004 0.268
#> SRR2105314 2 0.2051 0.67261 0.004 0.896 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR2105311 3 0.6027 0.02780 0.208 0.000 0.536 0.000 0.236 0.020
#> SRR2105312 3 0.6122 0.00858 0.220 0.000 0.516 0.000 0.244 0.020
#> SRR2105307 3 0.4263 0.25825 0.376 0.000 0.600 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105308 3 0.4444 0.13488 0.436 0.000 0.536 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105309 3 0.4052 -0.23878 0.000 0.000 0.628 0.000 0.356 0.016
#> SRR2105310 3 0.3789 -0.11957 0.004 0.000 0.668 0.000 0.324 0.004
#> SRR2105305 3 0.3018 0.39766 0.012 0.000 0.816 0.000 0.168 0.004
#> SRR2105306 3 0.2237 0.52791 0.036 0.000 0.896 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105303 2 0.0937 0.68043 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105304 4 0.0000 0.87418 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.4171 0.54386 0.024 0.688 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR2105302 2 0.2809 0.64347 0.004 0.824 0.000 0.000 0.004 0.168
#> SRR2105299 5 0.6920 0.54765 0.020 0.032 0.360 0.000 0.396 0.192
#> SRR2105300 6 0.7556 0.46120 0.020 0.164 0.180 0.000 0.184 0.452
#> SRR2105297 2 0.6905 0.01634 0.252 0.508 0.020 0.004 0.048 0.168
#> SRR2105298 2 0.6712 0.07482 0.232 0.540 0.020 0.004 0.044 0.160
#> SRR2105295 2 0.3650 0.56314 0.008 0.716 0.000 0.000 0.004 0.272
#> SRR2105296 2 0.3357 0.60470 0.008 0.764 0.000 0.000 0.004 0.224
#> SRR2105293 3 0.5992 0.01885 0.236 0.000 0.532 0.000 0.216 0.016
#> SRR2105294 3 0.5843 -0.15784 0.340 0.000 0.480 0.000 0.176 0.004
#> SRR2105291 3 0.3877 0.49396 0.208 0.000 0.748 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105292 3 0.3997 -0.35131 0.488 0.000 0.508 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105289 3 0.3370 0.54829 0.140 0.000 0.812 0.000 0.044 0.004
#> SRR2105290 3 0.4076 0.23833 0.364 0.000 0.620 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105287 3 0.4011 0.48955 0.212 0.000 0.732 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105288 3 0.4184 0.12210 0.408 0.000 0.576 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105285 2 0.3788 0.54704 0.012 0.704 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR2105286 2 0.3488 0.58472 0.008 0.744 0.000 0.000 0.004 0.244
#> SRR2105283 6 0.5514 0.55457 0.052 0.376 0.032 0.000 0.004 0.536
#> SRR2105284 6 0.5695 0.58364 0.036 0.348 0.040 0.000 0.020 0.556
#> SRR2105281 2 0.1333 0.68026 0.008 0.944 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105282 2 0.1462 0.68132 0.008 0.936 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105259 5 0.3993 0.78863 0.000 0.000 0.400 0.000 0.592 0.008
#> SRR2105260 5 0.4555 0.76028 0.000 0.000 0.424 0.000 0.540 0.036
#> SRR2105279 2 0.0665 0.67486 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105280 2 0.0653 0.67385 0.012 0.980 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105257 3 0.5670 -0.06314 0.392 0.000 0.452 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105258 1 0.4428 0.58399 0.580 0.000 0.388 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105253 2 0.2882 0.63561 0.000 0.812 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR2105254 2 0.2553 0.65276 0.000 0.848 0.000 0.000 0.008 0.144
#> SRR2105255 3 0.4192 -0.42296 0.016 0.000 0.572 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105256 3 0.4300 -0.22693 0.028 0.000 0.608 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105251 2 0.1726 0.67731 0.012 0.932 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR2105252 2 0.1882 0.67857 0.012 0.920 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR2105249 2 0.4581 -0.11257 0.024 0.592 0.000 0.000 0.012 0.372
#> SRR2105250 2 0.4665 -0.22403 0.024 0.552 0.000 0.000 0.012 0.412
#> SRR2105247 2 0.1268 0.68140 0.004 0.952 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105248 2 0.2467 0.64554 0.012 0.884 0.000 0.000 0.016 0.088
#> SRR2105245 3 0.5377 0.32822 0.268 0.004 0.620 0.000 0.088 0.020
#> SRR2105246 3 0.6607 0.29121 0.244 0.076 0.568 0.000 0.060 0.052
#> SRR2105243 3 0.3207 0.55702 0.124 0.000 0.828 0.000 0.044 0.004
#> SRR2105244 3 0.3404 0.46563 0.224 0.000 0.760 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105241 3 0.3979 0.22130 0.360 0.000 0.628 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105242 1 0.4018 0.53920 0.580 0.000 0.412 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105239 3 0.3592 0.45002 0.240 0.000 0.740 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105240 3 0.4333 -0.17148 0.468 0.000 0.512 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105237 6 0.4195 0.27416 0.000 0.440 0.008 0.000 0.004 0.548
#> SRR2105238 6 0.4141 0.40588 0.012 0.432 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR2105235 2 0.4473 -0.14502 0.020 0.576 0.000 0.000 0.008 0.396
#> SRR2105236 2 0.3702 0.26305 0.012 0.720 0.000 0.000 0.004 0.264
#> SRR2105233 2 0.3788 0.55376 0.012 0.704 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR2105234 2 0.3779 0.56152 0.008 0.708 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR2105231 2 0.1349 0.67997 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR2105232 2 0.1624 0.67984 0.012 0.936 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105227 3 0.4163 0.47798 0.212 0.016 0.740 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105228 3 0.4688 0.35564 0.280 0.028 0.664 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105225 3 0.2999 0.55391 0.112 0.000 0.840 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105226 3 0.4229 0.44330 0.220 0.000 0.712 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105229 3 0.4118 0.34036 0.016 0.016 0.768 0.000 0.172 0.028
#> SRR2105230 3 0.1838 0.52870 0.016 0.000 0.916 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105219 2 0.2402 0.65139 0.000 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR2105220 2 0.3043 0.50713 0.004 0.796 0.000 0.000 0.004 0.196
#> SRR2105221 2 0.5075 -0.24063 0.032 0.540 0.004 0.000 0.020 0.404
#> SRR2105222 2 0.4889 -0.22578 0.024 0.544 0.000 0.000 0.024 0.408
#> SRR2105223 3 0.3468 0.54783 0.088 0.000 0.816 0.000 0.092 0.004
#> SRR2105224 3 0.3892 0.51754 0.188 0.000 0.752 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105217 2 0.3282 0.62161 0.012 0.808 0.000 0.000 0.016 0.164
#> SRR2105218 2 0.2252 0.65514 0.016 0.900 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR2105215 2 0.0870 0.67514 0.012 0.972 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105216 2 0.0405 0.67552 0.008 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105213 3 0.5552 0.27177 0.248 0.008 0.604 0.000 0.132 0.008
#> SRR2105214 3 0.5832 0.29445 0.264 0.012 0.588 0.000 0.116 0.020
#> SRR2105211 3 0.4032 0.28165 0.020 0.004 0.740 0.000 0.220 0.016
#> SRR2105212 3 0.3959 0.18609 0.020 0.000 0.724 0.000 0.244 0.012
#> SRR2105209 3 0.3487 0.52552 0.168 0.000 0.788 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105210 1 0.4185 0.30134 0.496 0.000 0.492 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105207 3 0.4818 -0.02393 0.364 0.000 0.572 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105208 1 0.3563 0.70272 0.664 0.000 0.336 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.4723 0.45715 0.024 0.612 0.000 0.000 0.024 0.340
#> SRR2105206 2 0.5162 0.37489 0.028 0.560 0.004 0.000 0.032 0.376
#> SRR2105201 2 0.4665 -0.22656 0.024 0.552 0.000 0.000 0.012 0.412
#> SRR2105202 2 0.4665 -0.22656 0.024 0.552 0.000 0.000 0.012 0.412
#> SRR2105203 2 0.1010 0.68103 0.004 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105204 2 0.0551 0.67639 0.004 0.984 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105199 2 0.0692 0.67737 0.004 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105200 2 0.1036 0.67308 0.004 0.964 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105197 5 0.4110 0.75954 0.016 0.000 0.376 0.000 0.608 0.000
#> SRR2105198 5 0.5531 0.71112 0.032 0.012 0.372 0.000 0.544 0.040
#> SRR2105195 3 0.5430 0.20155 0.284 0.008 0.608 0.000 0.084 0.016
#> SRR2105196 1 0.5892 0.39049 0.452 0.032 0.448 0.000 0.044 0.024
#> SRR2105193 1 0.3318 0.77058 0.796 0.000 0.172 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105194 1 0.3513 0.73897 0.796 0.000 0.144 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105191 5 0.3852 0.79606 0.004 0.000 0.384 0.000 0.612 0.000
#> SRR2105192 5 0.4947 0.73203 0.088 0.000 0.316 0.000 0.596 0.000
#> SRR2105189 2 0.3841 0.37865 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105190 2 0.2845 0.63560 0.004 0.820 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR2105187 6 0.5001 0.38841 0.020 0.368 0.004 0.000 0.032 0.576
#> SRR2105188 6 0.5907 0.58057 0.036 0.300 0.028 0.000 0.056 0.580
#> SRR2105179 3 0.3923 0.10328 0.372 0.000 0.620 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105180 3 0.4594 -0.37670 0.476 0.000 0.488 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105183 2 0.0653 0.67385 0.012 0.980 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105184 2 0.0984 0.67273 0.012 0.968 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105185 2 0.4223 0.56645 0.028 0.704 0.004 0.000 0.008 0.256
#> SRR2105186 2 0.4783 0.44202 0.032 0.640 0.000 0.000 0.028 0.300
#> SRR2105181 5 0.3847 0.75341 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR2105182 3 0.4165 -0.58744 0.012 0.000 0.536 0.000 0.452 0.000
#> SRR2105177 1 0.2092 0.73789 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.1957 0.73204 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0653 0.67663 0.004 0.980 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105172 2 0.0665 0.67463 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105175 1 0.2994 0.77599 0.788 0.000 0.208 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105176 1 0.2402 0.75716 0.856 0.000 0.140 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105173 2 0.3043 0.64975 0.012 0.828 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR2105174 2 0.0951 0.67804 0.004 0.968 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR2105169 2 0.1850 0.67330 0.008 0.924 0.000 0.000 0.016 0.052
#> SRR2105170 2 0.3306 0.58655 0.008 0.820 0.000 0.000 0.036 0.136
#> SRR2105167 2 0.0665 0.67212 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105168 2 0.0665 0.67296 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105165 3 0.5827 -0.03636 0.268 0.000 0.532 0.000 0.192 0.008
#> SRR2105166 3 0.5914 -0.07790 0.280 0.000 0.512 0.000 0.200 0.008
#> SRR2105163 3 0.5690 0.12294 0.192 0.000 0.588 0.000 0.204 0.016
#> SRR2105164 3 0.6012 0.01639 0.220 0.000 0.528 0.000 0.236 0.016
#> SRR2105161 1 0.3684 0.68519 0.664 0.000 0.332 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105162 1 0.2491 0.76919 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0767 0.67283 0.008 0.976 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105156 2 0.0653 0.67385 0.012 0.980 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105157 2 0.4280 0.47210 0.012 0.716 0.000 0.000 0.044 0.228
#> SRR2105158 2 0.5053 0.32380 0.016 0.612 0.000 0.000 0.064 0.308
#> SRR2105159 3 0.5640 -0.29540 0.416 0.000 0.460 0.000 0.116 0.008
#> SRR2105160 1 0.3840 0.72520 0.696 0.000 0.284 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105153 2 0.4702 0.43430 0.016 0.640 0.000 0.000 0.040 0.304
#> SRR2105154 2 0.5033 0.32877 0.012 0.572 0.000 0.000 0.056 0.360
#> SRR2105151 2 0.0767 0.67345 0.008 0.976 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105152 2 0.0665 0.67296 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105149 3 0.6038 0.10667 0.024 0.064 0.640 0.000 0.176 0.096
#> SRR2105150 3 0.4943 0.34890 0.024 0.052 0.720 0.000 0.176 0.028
#> SRR2105147 4 0.7502 0.50593 0.076 0.028 0.236 0.500 0.136 0.024
#> SRR2105148 4 0.7439 0.49842 0.076 0.024 0.244 0.500 0.132 0.024
#> SRR2105143 3 0.5219 0.13695 0.376 0.012 0.560 0.000 0.028 0.024
#> SRR2105144 3 0.6535 -0.16711 0.404 0.068 0.444 0.000 0.028 0.056
#> SRR2105145 1 0.4375 0.74369 0.728 0.000 0.192 0.000 0.068 0.012
#> SRR2105146 1 0.3837 0.74225 0.752 0.000 0.196 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105141 2 0.5344 0.27923 0.024 0.520 0.000 0.000 0.056 0.400
#> SRR2105142 2 0.4939 0.40990 0.016 0.600 0.000 0.000 0.048 0.336
#> SRR2105139 2 0.0881 0.67495 0.008 0.972 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105140 2 0.0881 0.67313 0.012 0.972 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105137 2 0.4672 -0.23278 0.024 0.548 0.000 0.000 0.012 0.416
#> SRR2105138 2 0.5070 -0.25157 0.024 0.536 0.012 0.000 0.016 0.412
#> SRR2105135 2 0.0508 0.67509 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105136 2 0.0767 0.67460 0.012 0.976 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105133 5 0.3737 0.79397 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR2105134 5 0.3717 0.79294 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR2105131 6 0.6334 0.62332 0.012 0.300 0.056 0.000 0.096 0.536
#> SRR2105132 5 0.6269 0.64648 0.044 0.080 0.272 0.000 0.572 0.032
#> SRR2105129 1 0.2219 0.75036 0.864 0.000 0.136 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.1957 0.73204 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 5 0.5449 0.74476 0.052 0.032 0.348 0.000 0.564 0.004
#> SRR2105128 5 0.6659 0.62327 0.020 0.060 0.292 0.000 0.516 0.112
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.850 0.926 0.965 0.4999 0.500 0.500
#> 3 3 0.662 0.778 0.896 0.2546 0.870 0.742
#> 4 4 0.567 0.644 0.774 0.0983 0.862 0.669
#> 5 5 0.487 0.491 0.686 0.0701 0.927 0.785
#> 6 6 0.481 0.428 0.629 0.0518 0.898 0.691
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.6048 0.835 0.148 0.852
#> SRR2105264 2 0.5842 0.845 0.140 0.860
#> SRR2105261 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105262 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105357 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105358 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105440 2 0.1184 0.958 0.016 0.984
#> SRR2105509 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105507 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105506 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105504 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105501 2 0.1414 0.956 0.020 0.980
#> SRR2105502 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105497 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105498 2 0.2236 0.944 0.036 0.964
#> SRR2105495 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.5946 0.839 0.144 0.856
#> SRR2105494 2 0.2603 0.939 0.044 0.956
#> SRR2105491 2 0.6623 0.805 0.172 0.828
#> SRR2105492 2 0.6438 0.815 0.164 0.836
#> SRR2105489 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105486 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.9044 0.541 0.680 0.320
#> SRR2105484 1 0.8267 0.660 0.740 0.260
#> SRR2105481 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.3584 0.918 0.068 0.932
#> SRR2105478 2 0.2948 0.933 0.052 0.948
#> SRR2105475 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105474 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105465 1 0.1184 0.955 0.984 0.016
#> SRR2105466 1 0.3733 0.910 0.928 0.072
#> SRR2105463 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105461 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105455 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105456 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105454 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105451 2 0.6973 0.782 0.188 0.812
#> SRR2105452 1 0.9460 0.448 0.636 0.364
#> SRR2105449 1 0.1843 0.946 0.972 0.028
#> SRR2105450 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105448 2 0.1414 0.956 0.020 0.980
#> SRR2105445 1 0.1184 0.955 0.984 0.016
#> SRR2105446 1 0.4815 0.878 0.896 0.104
#> SRR2105443 1 0.9954 0.164 0.540 0.460
#> SRR2105444 1 0.9970 0.118 0.532 0.468
#> SRR2105441 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.2948 0.928 0.948 0.052
#> SRR2105434 1 0.2423 0.937 0.960 0.040
#> SRR2105431 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105432 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.8861 0.584 0.304 0.696
#> SRR2105430 2 0.1633 0.953 0.024 0.976
#> SRR2105427 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105428 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105426 2 0.1184 0.958 0.016 0.984
#> SRR2105421 1 0.3114 0.924 0.944 0.056
#> SRR2105422 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105414 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105409 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105411 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105406 1 0.1184 0.955 0.984 0.016
#> SRR2105401 2 0.5059 0.874 0.112 0.888
#> SRR2105402 2 0.6148 0.829 0.152 0.848
#> SRR2105399 2 0.6973 0.777 0.188 0.812
#> SRR2105400 2 0.3584 0.916 0.068 0.932
#> SRR2105397 1 0.8499 0.634 0.724 0.276
#> SRR2105398 1 0.4815 0.878 0.896 0.104
#> SRR2105395 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.5519 0.859 0.128 0.872
#> SRR2105382 2 0.2236 0.945 0.036 0.964
#> SRR2105383 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105379 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105380 2 0.9427 0.460 0.360 0.640
#> SRR2105377 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105378 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105375 1 0.2236 0.941 0.964 0.036
#> SRR2105376 1 0.1843 0.947 0.972 0.028
#> SRR2105373 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105368 1 0.3879 0.907 0.924 0.076
#> SRR2105365 2 0.6148 0.829 0.152 0.848
#> SRR2105366 2 0.6048 0.836 0.148 0.852
#> SRR2105363 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.3114 0.929 0.056 0.944
#> SRR2105349 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.2423 0.941 0.040 0.960
#> SRR2105332 2 0.1184 0.958 0.016 0.984
#> SRR2105333 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105334 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105329 1 0.8713 0.606 0.708 0.292
#> SRR2105330 2 0.9909 0.205 0.444 0.556
#> SRR2105327 2 0.1633 0.953 0.024 0.976
#> SRR2105328 2 0.1633 0.953 0.024 0.976
#> SRR2105325 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.7139 0.766 0.804 0.196
#> SRR2105324 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105319 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105315 1 0.9248 0.508 0.660 0.340
#> SRR2105316 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105313 2 0.0376 0.964 0.004 0.996
#> SRR2105314 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105308 1 0.7528 0.746 0.784 0.216
#> SRR2105309 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105310 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.1633 0.953 0.024 0.976
#> SRR2105302 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105300 1 0.7745 0.716 0.772 0.228
#> SRR2105297 2 0.4022 0.906 0.080 0.920
#> SRR2105298 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105295 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.4298 0.894 0.912 0.088
#> SRR2105292 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105288 1 0.3431 0.919 0.936 0.064
#> SRR2105285 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105286 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.5408 0.864 0.124 0.876
#> SRR2105284 2 0.8443 0.647 0.272 0.728
#> SRR2105281 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.4022 0.901 0.920 0.080
#> SRR2105246 1 0.6247 0.817 0.844 0.156
#> SRR2105243 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105244 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.9129 0.533 0.328 0.672
#> SRR2105238 2 0.4690 0.888 0.100 0.900
#> SRR2105235 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.1414 0.952 0.980 0.020
#> SRR2105228 1 0.7376 0.753 0.792 0.208
#> SRR2105225 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105230 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.1843 0.950 0.028 0.972
#> SRR2105222 2 0.0938 0.961 0.012 0.988
#> SRR2105223 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105214 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR2105211 1 0.0672 0.959 0.992 0.008
#> SRR2105212 1 0.2778 0.931 0.952 0.048
#> SRR2105209 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0938 0.957 0.988 0.012
#> SRR2105205 2 0.6801 0.797 0.180 0.820
#> SRR2105206 2 0.8955 0.572 0.312 0.688
#> SRR2105201 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105203 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.1633 0.949 0.976 0.024
#> SRR2105195 1 0.1633 0.950 0.976 0.024
#> SRR2105196 1 0.3431 0.917 0.936 0.064
#> SRR2105193 1 0.1633 0.949 0.976 0.024
#> SRR2105194 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.1184 0.958 0.016 0.984
#> SRR2105190 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.8909 0.583 0.308 0.692
#> SRR2105188 2 0.8327 0.658 0.264 0.736
#> SRR2105179 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.1184 0.958 0.016 0.984
#> SRR2105186 2 0.0672 0.962 0.008 0.992
#> SRR2105181 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.8813 0.585 0.700 0.300
#> SRR2105178 1 0.6247 0.817 0.844 0.156
#> SRR2105171 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.3431 0.917 0.936 0.064
#> SRR2105176 1 0.1414 0.952 0.980 0.020
#> SRR2105173 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.2778 0.931 0.952 0.048
#> SRR2105155 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0938 0.961 0.012 0.988
#> SRR2105151 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.0376 0.961 0.996 0.004
#> SRR2105150 1 0.1843 0.946 0.972 0.028
#> SRR2105147 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105148 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105143 1 0.6973 0.778 0.812 0.188
#> SRR2105144 2 0.6801 0.792 0.180 0.820
#> SRR2105145 1 0.2043 0.943 0.968 0.032
#> SRR2105146 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.2423 0.941 0.040 0.960
#> SRR2105142 2 0.0938 0.960 0.012 0.988
#> SRR2105139 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.2043 0.948 0.032 0.968
#> SRR2105138 2 0.2423 0.942 0.040 0.960
#> SRR2105135 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.965 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.9815 0.293 0.580 0.420
#> SRR2105132 1 0.5294 0.860 0.880 0.120
#> SRR2105129 1 0.2043 0.943 0.968 0.032
#> SRR2105130 1 0.6801 0.786 0.820 0.180
#> SRR2105127 1 0.5408 0.856 0.876 0.124
#> SRR2105128 1 0.9000 0.562 0.684 0.316
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105275 3 0.0424 0.801204 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105276 3 0.2711 0.787384 0.088 0.000 0.912
#> SRR2105273 1 0.2537 0.826492 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105274 1 0.5098 0.671040 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105271 1 0.4399 0.764971 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105272 3 0.3816 0.743782 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105269 2 0.1031 0.920506 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105270 2 0.1163 0.918289 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.6215 0.275649 0.000 0.572 0.428
#> SRR2105264 2 0.5785 0.512530 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105261 1 0.6984 0.545954 0.656 0.040 0.304
#> SRR2105262 1 0.4473 0.773130 0.828 0.008 0.164
#> SRR2105357 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.2711 0.871351 0.088 0.912 0.000
#> SRR2105440 2 0.4346 0.765491 0.184 0.816 0.000
#> SRR2105509 2 0.0237 0.929609 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105510 2 0.0424 0.927954 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105507 1 0.5529 0.604876 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105508 1 0.4062 0.766864 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105505 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0237 0.929614 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105504 2 0.2796 0.869882 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105501 2 0.3116 0.848246 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105502 2 0.3619 0.827298 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105499 1 0.4974 0.707840 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105500 1 0.2681 0.823720 0.932 0.040 0.028
#> SRR2105497 2 0.4399 0.747300 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105498 2 0.1529 0.909675 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105495 2 0.4452 0.754729 0.192 0.808 0.000
#> SRR2105496 2 0.1964 0.898198 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105493 2 0.5810 0.530613 0.336 0.664 0.000
#> SRR2105494 2 0.5363 0.636659 0.276 0.724 0.000
#> SRR2105491 3 0.0592 0.798188 0.000 0.012 0.988
#> SRR2105492 3 0.2796 0.763199 0.000 0.092 0.908
#> SRR2105489 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105487 1 0.0424 0.841812 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105488 1 0.3038 0.799593 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105485 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.1289 0.837365 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105483 3 0.3886 0.766415 0.024 0.096 0.880
#> SRR2105484 3 0.2774 0.779736 0.008 0.072 0.920
#> SRR2105481 3 0.6215 0.201448 0.428 0.000 0.572
#> SRR2105482 1 0.4796 0.720589 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105479 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105480 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105477 2 0.1950 0.907737 0.008 0.952 0.040
#> SRR2105478 2 0.2590 0.884984 0.004 0.924 0.072
#> SRR2105475 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105473 2 0.1031 0.920640 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105474 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.0237 0.842735 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105470 1 0.1753 0.837596 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105467 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.8025 0.189221 0.516 0.064 0.420
#> SRR2105466 3 0.8264 0.374655 0.356 0.088 0.556
#> SRR2105463 3 0.6235 0.171221 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105464 3 0.5737 0.633712 0.256 0.012 0.732
#> SRR2105461 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.4629 0.741476 0.808 0.004 0.188
#> SRR2105456 1 0.4605 0.723357 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105453 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.6225 0.298123 0.432 0.568 0.000
#> SRR2105452 3 0.9550 0.321333 0.196 0.368 0.436
#> SRR2105449 3 0.4293 0.746078 0.164 0.004 0.832
#> SRR2105450 1 0.5650 0.598501 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105447 2 0.1964 0.894189 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105448 2 0.0424 0.927789 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105445 1 0.1411 0.824879 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105446 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105443 1 0.4002 0.688469 0.840 0.160 0.000
#> SRR2105444 1 0.6825 0.000319 0.496 0.492 0.012
#> SRR2105441 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105437 1 0.5431 0.584917 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105438 1 0.6244 0.190231 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105435 1 0.4351 0.770083 0.828 0.004 0.168
#> SRR2105436 1 0.1031 0.841612 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105433 3 0.4068 0.778421 0.120 0.016 0.864
#> SRR2105434 1 0.7526 0.199971 0.536 0.040 0.424
#> SRR2105431 1 0.6386 0.357112 0.584 0.004 0.412
#> SRR2105432 1 0.5905 0.501337 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105429 2 0.8080 0.471014 0.128 0.640 0.232
#> SRR2105430 2 0.2261 0.889656 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105427 2 0.1031 0.920736 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105425 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105426 2 0.1525 0.913031 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105421 1 0.2796 0.818699 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105422 1 0.3607 0.806788 0.880 0.008 0.112
#> SRR2105423 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.1129 0.840017 0.976 0.004 0.020
#> SRR2105415 1 0.4974 0.698779 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105416 1 0.5397 0.640025 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105417 1 0.4002 0.772815 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105418 3 0.6235 0.210255 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105413 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105414 2 0.0747 0.924493 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.0237 0.929580 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105411 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.2066 0.831639 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105406 1 0.2651 0.830828 0.928 0.012 0.060
#> SRR2105401 2 0.5016 0.684308 0.240 0.760 0.000
#> SRR2105402 2 0.5677 0.750405 0.124 0.804 0.072
#> SRR2105399 2 0.5706 0.547682 0.320 0.680 0.000
#> SRR2105400 2 0.3267 0.840397 0.116 0.884 0.000
#> SRR2105397 1 0.8917 0.276010 0.568 0.244 0.188
#> SRR2105398 1 0.5191 0.712347 0.828 0.112 0.060
#> SRR2105395 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 1 0.0237 0.842571 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105390 1 0.1289 0.841854 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105391 1 0.0237 0.842571 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105392 1 0.0237 0.842571 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105385 1 0.6168 0.393225 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105386 1 0.3551 0.792953 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105387 1 0.3573 0.802732 0.876 0.004 0.120
#> SRR2105388 1 0.0237 0.842561 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105381 2 0.2680 0.878599 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105382 2 0.1860 0.901769 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105383 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105379 2 0.5254 0.640876 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105380 3 0.5621 0.529247 0.000 0.308 0.692
#> SRR2105377 2 0.1163 0.918447 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105375 1 0.2384 0.817559 0.936 0.056 0.008
#> SRR2105376 1 0.0661 0.842451 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105373 1 0.0237 0.842307 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105374 1 0.3482 0.791281 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105371 1 0.1031 0.841880 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105372 1 0.1411 0.839333 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105369 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0237 0.842561 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105367 1 0.1015 0.842562 0.980 0.008 0.012
#> SRR2105368 1 0.6208 0.648575 0.768 0.164 0.068
#> SRR2105365 3 0.5835 0.435440 0.000 0.340 0.660
#> SRR2105366 3 0.6180 0.243390 0.000 0.416 0.584
#> SRR2105363 2 0.1031 0.920666 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.0237 0.842561 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105360 1 0.2165 0.830896 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105355 1 0.0747 0.842812 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105356 1 0.3267 0.802566 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105353 3 0.6305 0.042454 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105354 1 0.6154 0.363639 0.592 0.000 0.408
#> SRR2105351 2 0.1031 0.919826 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105352 2 0.6962 0.276662 0.020 0.568 0.412
#> SRR2105349 2 0.0424 0.927920 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105350 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0237 0.842773 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105339 1 0.5363 0.635231 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105340 1 0.6095 0.398611 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105335 1 0.0424 0.842927 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105336 1 0.0424 0.841957 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105337 1 0.5760 0.565347 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105338 1 0.5810 0.543897 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105331 2 0.2959 0.859721 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105332 2 0.1031 0.920223 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105333 2 0.0237 0.929501 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105334 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105329 1 0.3340 0.737584 0.880 0.120 0.000
#> SRR2105330 2 0.6291 0.164999 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105327 2 0.0475 0.928563 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105328 2 0.0424 0.928223 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105325 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105326 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105323 1 0.1411 0.825301 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.6126 0.377677 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105320 1 0.6204 0.325953 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105321 3 0.4887 0.669914 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105322 3 0.3038 0.780193 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105317 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105315 1 0.4504 0.631104 0.804 0.196 0.000
#> SRR2105316 2 0.0747 0.924565 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105313 2 0.0592 0.926076 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105314 2 0.0592 0.926295 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105311 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105312 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105307 1 0.3116 0.809112 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105308 1 0.6653 0.671261 0.752 0.136 0.112
#> SRR2105309 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.1860 0.834430 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105303 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.2448 0.882584 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105302 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 1 0.0592 0.838678 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105300 1 0.5254 0.516657 0.736 0.264 0.000
#> SRR2105297 2 0.1964 0.898566 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105298 2 0.0237 0.929515 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105295 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105293 3 0.0747 0.801526 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105294 3 0.2356 0.795506 0.072 0.000 0.928
#> SRR2105291 1 0.2878 0.816992 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105292 1 0.2796 0.818372 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105289 1 0.2066 0.832150 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105290 1 0.4750 0.710837 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105287 1 0.1781 0.837344 0.960 0.020 0.020
#> SRR2105288 1 0.5810 0.741730 0.796 0.072 0.132
#> SRR2105285 2 0.1163 0.918138 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105283 2 0.3267 0.841558 0.116 0.884 0.000
#> SRR2105284 2 0.6140 0.380777 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105281 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.1411 0.841903 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105258 1 0.6280 0.256035 0.540 0.000 0.460
#> SRR2105253 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0237 0.929601 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105250 2 0.1529 0.910677 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.3340 0.772616 0.120 0.000 0.880
#> SRR2105246 3 0.6630 0.670948 0.220 0.056 0.724
#> SRR2105243 1 0.1163 0.840980 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105244 1 0.6079 0.424621 0.612 0.000 0.388
#> SRR2105241 1 0.5760 0.545996 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105242 1 0.5431 0.621497 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105239 1 0.4750 0.724363 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105240 1 0.5465 0.640518 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105237 2 0.6217 0.621798 0.264 0.712 0.024
#> SRR2105238 2 0.5650 0.577775 0.312 0.688 0.000
#> SRR2105235 2 0.0747 0.924657 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.6735 0.280219 0.564 0.012 0.424
#> SRR2105228 1 0.9153 0.239363 0.524 0.300 0.176
#> SRR2105225 1 0.1031 0.842971 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105226 1 0.3482 0.800881 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105229 1 0.1163 0.842419 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105230 1 0.1031 0.843068 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105219 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105220 2 0.0424 0.928134 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105221 2 0.1411 0.913216 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105222 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105223 1 0.4062 0.774709 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105224 1 0.4235 0.759402 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105217 2 0.3038 0.857433 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105218 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.1411 0.801400 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105214 3 0.4121 0.731931 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105211 1 0.0237 0.842571 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105212 1 0.0237 0.841953 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105209 1 0.1031 0.842621 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105210 1 0.5497 0.605976 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105207 3 0.6813 0.045299 0.468 0.012 0.520
#> SRR2105208 3 0.6621 0.556613 0.284 0.032 0.684
#> SRR2105205 2 0.5760 0.518079 0.000 0.672 0.328
#> SRR2105206 2 0.6307 0.066247 0.000 0.512 0.488
#> SRR2105201 2 0.3879 0.805086 0.152 0.848 0.000
#> SRR2105202 2 0.3192 0.848467 0.112 0.888 0.000
#> SRR2105203 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105197 1 0.2959 0.801432 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105198 1 0.3134 0.812278 0.916 0.032 0.052
#> SRR2105195 3 0.4485 0.755315 0.136 0.020 0.844
#> SRR2105196 3 0.3148 0.794567 0.048 0.036 0.916
#> SRR2105193 3 0.1964 0.799412 0.056 0.000 0.944
#> SRR2105194 3 0.0424 0.800845 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105191 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.1647 0.911298 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105190 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105187 3 0.7069 0.032193 0.020 0.472 0.508
#> SRR2105188 2 0.4475 0.839613 0.072 0.864 0.064
#> SRR2105179 3 0.5497 0.569708 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105180 1 0.6192 0.362989 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105183 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.3752 0.813420 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105186 2 0.5365 0.659384 0.004 0.744 0.252
#> SRR2105181 1 0.2066 0.827370 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105182 1 0.0237 0.841953 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105177 3 0.4443 0.782642 0.084 0.052 0.864
#> SRR2105178 3 0.3850 0.790024 0.088 0.028 0.884
#> SRR2105171 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 3 0.0592 0.801274 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105176 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105173 2 0.1643 0.907658 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105174 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.5098 0.617874 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105166 3 0.0892 0.802251 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105163 3 0.0237 0.800158 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105164 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105161 3 0.2301 0.797596 0.060 0.004 0.936
#> SRR2105162 3 0.0892 0.801871 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105155 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0747 0.924324 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105158 2 0.4654 0.733108 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105159 3 0.0237 0.800198 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105160 3 0.0747 0.802263 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105153 2 0.2261 0.889024 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105154 2 0.5926 0.466714 0.000 0.644 0.356
#> SRR2105151 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 1 0.1411 0.838923 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105150 1 0.4569 0.761571 0.860 0.072 0.068
#> SRR2105147 3 0.3752 0.753833 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105148 3 0.3941 0.744179 0.156 0.000 0.844
#> SRR2105143 3 0.9623 0.276807 0.336 0.216 0.448
#> SRR2105144 2 0.5986 0.610136 0.240 0.736 0.024
#> SRR2105145 3 0.0237 0.800055 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105146 3 0.0000 0.798888 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105141 3 0.4796 0.659918 0.000 0.220 0.780
#> SRR2105142 2 0.4555 0.744716 0.000 0.800 0.200
#> SRR2105139 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.5291 0.644305 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105138 2 0.0424 0.928381 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105135 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.930976 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.842196 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.5431 0.482866 0.716 0.284 0.000
#> SRR2105132 1 0.4002 0.684959 0.840 0.160 0.000
#> SRR2105129 3 0.6924 0.322041 0.400 0.020 0.580
#> SRR2105130 3 0.7757 0.619085 0.224 0.112 0.664
#> SRR2105127 1 0.1860 0.812038 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105128 1 0.4062 0.679281 0.836 0.164 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.1211 0.67978 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105278 3 0.2469 0.67655 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105275 4 0.2670 0.67417 0.052 0.000 0.040 0.908
#> SRR2105276 4 0.4477 0.63265 0.108 0.000 0.084 0.808
#> SRR2105273 1 0.4941 0.50443 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR2105274 1 0.4567 0.67105 0.716 0.000 0.276 0.008
#> SRR2105271 1 0.5105 0.66642 0.696 0.000 0.276 0.028
#> SRR2105272 1 0.5364 0.40964 0.652 0.000 0.028 0.320
#> SRR2105269 2 0.1388 0.89768 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR2105270 2 0.2124 0.87775 0.008 0.924 0.068 0.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.89538 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105268 2 0.0469 0.89896 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0336 0.89679 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0336 0.89772 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.5548 0.42596 0.032 0.628 0.000 0.340
#> SRR2105264 2 0.4776 0.72809 0.060 0.776 0.000 0.164
#> SRR2105261 3 0.7804 0.34237 0.292 0.020 0.516 0.172
#> SRR2105262 3 0.6448 0.26878 0.316 0.000 0.592 0.092
#> SRR2105357 3 0.1305 0.67958 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR2105358 3 0.1474 0.67958 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR2105439 2 0.3245 0.84008 0.028 0.872 0.100 0.000
#> SRR2105440 2 0.4137 0.73078 0.012 0.780 0.208 0.000
#> SRR2105509 2 0.1411 0.89933 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105510 2 0.1388 0.89808 0.012 0.960 0.028 0.000
#> SRR2105507 1 0.4088 0.68307 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR2105508 1 0.4677 0.62331 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR2105505 3 0.5070 0.34495 0.372 0.000 0.620 0.008
#> SRR2105506 1 0.4624 0.62101 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR2105503 2 0.1743 0.89449 0.056 0.940 0.000 0.004
#> SRR2105504 2 0.4004 0.77770 0.024 0.812 0.000 0.164
#> SRR2105501 2 0.4300 0.79482 0.088 0.820 0.092 0.000
#> SRR2105502 2 0.4290 0.77188 0.036 0.800 0.000 0.164
#> SRR2105499 3 0.6558 -0.09611 0.452 0.000 0.472 0.076
#> SRR2105500 3 0.5811 0.09284 0.468 0.012 0.508 0.012
#> SRR2105497 2 0.4098 0.75099 0.204 0.784 0.000 0.012
#> SRR2105498 2 0.4055 0.80776 0.108 0.832 0.000 0.060
#> SRR2105495 2 0.4348 0.73043 0.024 0.780 0.196 0.000
#> SRR2105496 2 0.2843 0.85704 0.020 0.892 0.088 0.000
#> SRR2105493 2 0.6015 0.12983 0.032 0.512 0.452 0.004
#> SRR2105494 3 0.5506 0.00347 0.016 0.472 0.512 0.000
#> SRR2105491 4 0.1722 0.68152 0.048 0.008 0.000 0.944
#> SRR2105492 4 0.4015 0.64081 0.052 0.116 0.000 0.832
#> SRR2105489 2 0.2266 0.87902 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR2105490 2 0.0817 0.89911 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105487 3 0.2399 0.66947 0.048 0.000 0.920 0.032
#> SRR2105488 3 0.3463 0.65170 0.040 0.000 0.864 0.096
#> SRR2105485 3 0.2589 0.67386 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR2105486 3 0.3790 0.66724 0.164 0.000 0.820 0.016
#> SRR2105483 1 0.5596 0.44342 0.708 0.044 0.012 0.236
#> SRR2105484 1 0.5050 0.41045 0.704 0.028 0.000 0.268
#> SRR2105481 1 0.7824 0.32096 0.404 0.000 0.268 0.328
#> SRR2105482 1 0.5478 0.64034 0.628 0.000 0.344 0.028
#> SRR2105479 4 0.2408 0.67058 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR2105480 4 0.2868 0.65665 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR2105477 2 0.6408 0.55263 0.008 0.660 0.224 0.108
#> SRR2105478 2 0.5909 0.69389 0.024 0.732 0.160 0.084
#> SRR2105475 2 0.0779 0.89976 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105476 2 0.1042 0.89977 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR2105473 2 0.2480 0.86623 0.008 0.904 0.088 0.000
#> SRR2105474 2 0.1182 0.90153 0.016 0.968 0.016 0.000
#> SRR2105471 2 0.2915 0.86810 0.088 0.892 0.004 0.016
#> SRR2105472 2 0.1557 0.89409 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.4996 0.38221 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR2105470 1 0.4857 0.65653 0.668 0.000 0.324 0.008
#> SRR2105467 3 0.2868 0.65379 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR2105468 3 0.3400 0.64346 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR2105465 1 0.4413 0.68951 0.812 0.008 0.140 0.040
#> SRR2105466 1 0.4793 0.68105 0.800 0.008 0.112 0.080
#> SRR2105463 1 0.5831 0.59559 0.708 0.004 0.096 0.192
#> SRR2105464 1 0.5784 0.59743 0.700 0.000 0.100 0.200
#> SRR2105461 2 0.0188 0.89620 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0336 0.89704 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0592 0.89858 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0336 0.89713 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105457 3 0.3610 0.58664 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR2105458 3 0.2011 0.67974 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR2105455 1 0.4240 0.68732 0.784 0.004 0.200 0.012
#> SRR2105456 1 0.3945 0.68597 0.780 0.000 0.216 0.004
#> SRR2105453 3 0.3486 0.65299 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR2105454 3 0.3052 0.67195 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR2105451 2 0.5808 0.23397 0.032 0.544 0.424 0.000
#> SRR2105452 1 0.9166 -0.17498 0.336 0.292 0.068 0.304
#> SRR2105449 1 0.5585 0.57476 0.712 0.000 0.084 0.204
#> SRR2105450 1 0.5690 0.68790 0.700 0.000 0.216 0.084
#> SRR2105447 2 0.4077 0.82222 0.068 0.840 0.088 0.004
#> SRR2105448 2 0.1677 0.89580 0.012 0.948 0.040 0.000
#> SRR2105445 3 0.3583 0.67833 0.092 0.040 0.864 0.004
#> SRR2105446 3 0.2149 0.67842 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105443 3 0.4815 0.59547 0.056 0.136 0.796 0.012
#> SRR2105444 3 0.6629 0.37192 0.080 0.280 0.624 0.016
#> SRR2105441 2 0.2021 0.89342 0.056 0.932 0.012 0.000
#> SRR2105442 2 0.1118 0.89788 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105437 3 0.4244 0.59235 0.032 0.000 0.800 0.168
#> SRR2105438 3 0.5200 0.49749 0.036 0.000 0.700 0.264
#> SRR2105435 3 0.6077 0.45709 0.260 0.004 0.660 0.076
#> SRR2105436 3 0.4707 0.56807 0.204 0.000 0.760 0.036
#> SRR2105433 1 0.5267 0.57378 0.740 0.000 0.076 0.184
#> SRR2105434 1 0.3850 0.69016 0.804 0.004 0.188 0.004
#> SRR2105431 1 0.7034 0.57825 0.548 0.008 0.336 0.108
#> SRR2105432 1 0.5393 0.68328 0.688 0.000 0.268 0.044
#> SRR2105429 2 0.8610 0.17235 0.076 0.496 0.260 0.168
#> SRR2105430 2 0.4267 0.82755 0.072 0.840 0.016 0.072
#> SRR2105427 2 0.1975 0.88813 0.016 0.936 0.048 0.000
#> SRR2105428 2 0.2089 0.88824 0.020 0.932 0.048 0.000
#> SRR2105425 2 0.1489 0.90057 0.044 0.952 0.004 0.000
#> SRR2105426 2 0.1637 0.89687 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR2105421 1 0.5284 0.59370 0.616 0.000 0.368 0.016
#> SRR2105422 1 0.4819 0.63092 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR2105423 2 0.1716 0.89061 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0592 0.90006 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.4761 0.25458 0.332 0.000 0.664 0.004
#> SRR2105420 3 0.5428 0.21549 0.380 0.000 0.600 0.020
#> SRR2105415 3 0.6537 -0.13037 0.424 0.000 0.500 0.076
#> SRR2105416 1 0.7048 0.42281 0.512 0.012 0.388 0.088
#> SRR2105417 1 0.4382 0.67017 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105418 1 0.5201 0.69043 0.752 0.004 0.180 0.064
#> SRR2105413 2 0.1724 0.89756 0.020 0.948 0.032 0.000
#> SRR2105414 2 0.1388 0.90065 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR2105409 2 0.0927 0.90163 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR2105410 2 0.0779 0.90108 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR2105411 2 0.1792 0.88659 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.1792 0.88871 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105407 3 0.1824 0.68186 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR2105408 3 0.1576 0.68125 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR2105403 3 0.3105 0.66639 0.140 0.000 0.856 0.004
#> SRR2105404 3 0.2868 0.66778 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR2105405 1 0.4677 0.65352 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR2105406 1 0.4250 0.67272 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105401 2 0.5220 0.71219 0.092 0.752 0.156 0.000
#> SRR2105402 2 0.6310 0.66705 0.068 0.728 0.080 0.124
#> SRR2105399 2 0.7054 0.17592 0.096 0.496 0.400 0.008
#> SRR2105400 2 0.5135 0.68069 0.036 0.728 0.232 0.004
#> SRR2105397 3 0.8035 0.40091 0.112 0.100 0.584 0.204
#> SRR2105398 3 0.4576 0.62929 0.064 0.028 0.828 0.080
#> SRR2105395 2 0.0336 0.89778 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0817 0.90049 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.1118 0.90098 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.1022 0.90079 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.4057 0.65092 0.160 0.000 0.812 0.028
#> SRR2105390 3 0.4375 0.62730 0.180 0.000 0.788 0.032
#> SRR2105391 3 0.3893 0.62161 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR2105392 3 0.2944 0.66135 0.128 0.000 0.868 0.004
#> SRR2105385 1 0.5923 0.66557 0.696 0.000 0.176 0.128
#> SRR2105386 1 0.5040 0.56739 0.628 0.000 0.364 0.008
#> SRR2105387 1 0.3831 0.68953 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR2105388 1 0.5000 0.41771 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR2105381 2 0.4703 0.78130 0.068 0.816 0.096 0.020
#> SRR2105382 2 0.2174 0.88241 0.020 0.928 0.000 0.052
#> SRR2105383 2 0.3501 0.83004 0.132 0.848 0.020 0.000
#> SRR2105384 2 0.3505 0.85447 0.088 0.864 0.048 0.000
#> SRR2105379 2 0.4364 0.81611 0.080 0.828 0.008 0.084
#> SRR2105380 2 0.7316 -0.14988 0.132 0.444 0.004 0.420
#> SRR2105377 2 0.2473 0.86851 0.012 0.908 0.080 0.000
#> SRR2105378 2 0.0657 0.90001 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105375 3 0.5578 0.51565 0.220 0.044 0.720 0.016
#> SRR2105376 3 0.4148 0.62661 0.156 0.016 0.816 0.012
#> SRR2105373 3 0.2737 0.67424 0.104 0.000 0.888 0.008
#> SRR2105374 3 0.4050 0.63120 0.036 0.000 0.820 0.144
#> SRR2105371 3 0.5517 0.00854 0.412 0.000 0.568 0.020
#> SRR2105372 1 0.5143 0.44972 0.540 0.000 0.456 0.004
#> SRR2105369 3 0.4855 0.03444 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR2105370 3 0.4925 -0.13001 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105367 3 0.4754 0.59796 0.228 0.008 0.748 0.016
#> SRR2105368 3 0.8142 -0.09831 0.388 0.144 0.432 0.036
#> SRR2105365 4 0.5937 0.08449 0.036 0.472 0.000 0.492
#> SRR2105366 4 0.5977 0.21009 0.040 0.432 0.000 0.528
#> SRR2105363 2 0.1767 0.89502 0.044 0.944 0.012 0.000
#> SRR2105364 2 0.1305 0.90182 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR2105361 2 0.0524 0.89771 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105362 2 0.1174 0.90025 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR2105359 3 0.4907 -0.04535 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105360 1 0.4730 0.61166 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105355 1 0.4907 0.54249 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR2105356 1 0.4564 0.64602 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105353 3 0.7851 -0.12543 0.288 0.000 0.400 0.312
#> SRR2105354 3 0.7235 -0.14000 0.356 0.000 0.492 0.152
#> SRR2105351 2 0.1356 0.90083 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR2105352 4 0.6473 0.40377 0.044 0.352 0.020 0.584
#> SRR2105349 2 0.2519 0.88711 0.036 0.924 0.020 0.020
#> SRR2105350 2 0.1406 0.89939 0.024 0.960 0.016 0.000
#> SRR2105345 2 0.1211 0.89972 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105346 2 0.0469 0.89753 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105347 2 0.2795 0.87196 0.088 0.896 0.012 0.004
#> SRR2105348 2 0.2760 0.85443 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR2105343 2 0.1118 0.89786 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0921 0.90148 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.4072 0.44894 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR2105342 1 0.4941 0.44228 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR2105339 3 0.6214 -0.10631 0.472 0.000 0.476 0.052
#> SRR2105340 3 0.7077 0.08900 0.316 0.000 0.536 0.148
#> SRR2105335 3 0.2124 0.67615 0.068 0.000 0.924 0.008
#> SRR2105336 3 0.3978 0.62196 0.192 0.000 0.796 0.012
#> SRR2105337 1 0.5343 0.68508 0.708 0.000 0.240 0.052
#> SRR2105338 1 0.5968 0.67730 0.664 0.000 0.252 0.084
#> SRR2105331 2 0.3128 0.85527 0.040 0.884 0.000 0.076
#> SRR2105332 2 0.1059 0.90002 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR2105333 2 0.2521 0.87902 0.064 0.912 0.024 0.000
#> SRR2105334 2 0.0804 0.89977 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR2105329 3 0.3749 0.60759 0.032 0.128 0.840 0.000
#> SRR2105330 2 0.6777 0.24565 0.088 0.532 0.376 0.004
#> SRR2105327 2 0.1821 0.89772 0.032 0.948 0.012 0.008
#> SRR2105328 2 0.1943 0.89621 0.032 0.944 0.008 0.016
#> SRR2105325 4 0.1929 0.68037 0.036 0.000 0.024 0.940
#> SRR2105326 4 0.2385 0.67649 0.028 0.000 0.052 0.920
#> SRR2105323 3 0.3695 0.67459 0.156 0.016 0.828 0.000
#> SRR2105324 1 0.4888 0.48192 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105319 3 0.7110 0.42425 0.236 0.000 0.564 0.200
#> SRR2105320 3 0.6567 0.40717 0.104 0.000 0.588 0.308
#> SRR2105321 4 0.6683 0.37527 0.176 0.000 0.204 0.620
#> SRR2105322 4 0.5624 0.55522 0.172 0.000 0.108 0.720
#> SRR2105317 2 0.1406 0.89915 0.016 0.960 0.024 0.000
#> SRR2105318 2 0.0469 0.89809 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105315 3 0.6607 0.50451 0.144 0.196 0.652 0.008
#> SRR2105316 2 0.0817 0.90128 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105313 2 0.1543 0.89983 0.008 0.956 0.032 0.004
#> SRR2105314 2 0.0524 0.89717 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105311 4 0.1302 0.67849 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR2105312 4 0.1389 0.67819 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR2105307 1 0.4500 0.65183 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105308 1 0.4328 0.68293 0.748 0.008 0.244 0.000
#> SRR2105309 3 0.2053 0.68304 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR2105310 3 0.2760 0.65881 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR2105305 3 0.3982 0.54699 0.220 0.000 0.776 0.004
#> SRR2105306 1 0.4950 0.59850 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR2105303 2 0.0469 0.89903 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.0707 0.90057 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.1911 0.89725 0.020 0.944 0.004 0.032
#> SRR2105302 2 0.0469 0.89786 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105299 3 0.3070 0.68176 0.068 0.020 0.896 0.016
#> SRR2105300 3 0.5338 0.55081 0.060 0.164 0.760 0.016
#> SRR2105297 2 0.6607 0.42835 0.308 0.600 0.008 0.084
#> SRR2105298 2 0.4666 0.73556 0.200 0.768 0.028 0.004
#> SRR2105295 2 0.0336 0.89587 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0779 0.89953 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR2105293 4 0.4719 0.63602 0.180 0.000 0.048 0.772
#> SRR2105294 4 0.5383 0.45834 0.292 0.000 0.036 0.672
#> SRR2105291 1 0.5655 0.60025 0.604 0.004 0.368 0.024
#> SRR2105292 1 0.5165 0.40778 0.512 0.000 0.484 0.004
#> SRR2105289 1 0.4605 0.62381 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105290 1 0.4382 0.66497 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105287 1 0.4673 0.67447 0.748 0.008 0.232 0.012
#> SRR2105288 1 0.4059 0.68714 0.788 0.012 0.200 0.000
#> SRR2105285 2 0.4090 0.80614 0.032 0.824 0.140 0.004
#> SRR2105286 2 0.2214 0.88923 0.028 0.928 0.044 0.000
#> SRR2105283 2 0.6411 0.45854 0.092 0.600 0.308 0.000
#> SRR2105284 3 0.6188 0.23218 0.028 0.396 0.560 0.016
#> SRR2105281 2 0.2021 0.89597 0.040 0.936 0.024 0.000
#> SRR2105282 2 0.1022 0.90127 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.1109 0.67763 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR2105260 3 0.1637 0.68139 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR2105279 2 0.0336 0.89679 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0336 0.89679 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105257 3 0.5558 0.33486 0.364 0.000 0.608 0.028
#> SRR2105258 1 0.6281 0.68316 0.656 0.000 0.216 0.128
#> SRR2105253 2 0.0000 0.89538 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0188 0.89695 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105255 3 0.3942 0.52851 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR2105256 3 0.4624 0.31487 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR2105251 2 0.0336 0.89814 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.1637 0.89339 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.1398 0.90035 0.040 0.956 0.004 0.000
#> SRR2105250 2 0.1733 0.89901 0.024 0.948 0.028 0.000
#> SRR2105247 2 0.1356 0.90051 0.032 0.960 0.008 0.000
#> SRR2105248 2 0.0592 0.89866 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105245 4 0.6819 0.26563 0.312 0.000 0.124 0.564
#> SRR2105246 1 0.5121 0.66184 0.764 0.000 0.116 0.120
#> SRR2105243 1 0.4991 0.59491 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR2105244 1 0.5386 0.67569 0.708 0.000 0.236 0.056
#> SRR2105241 1 0.4831 0.68740 0.752 0.000 0.208 0.040
#> SRR2105242 1 0.4797 0.69081 0.720 0.000 0.260 0.020
#> SRR2105239 1 0.6329 0.48594 0.588 0.004 0.344 0.064
#> SRR2105240 1 0.5253 0.69675 0.740 0.004 0.200 0.056
#> SRR2105237 3 0.6115 -0.02263 0.016 0.472 0.492 0.020
#> SRR2105238 3 0.5231 0.27580 0.012 0.384 0.604 0.000
#> SRR2105235 2 0.1042 0.89887 0.008 0.972 0.020 0.000
#> SRR2105236 2 0.0592 0.89951 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105233 2 0.1042 0.89958 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR2105234 2 0.0524 0.89737 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105231 2 0.1042 0.90178 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR2105232 2 0.2149 0.87841 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.5514 0.65527 0.712 0.012 0.236 0.040
#> SRR2105228 1 0.5460 0.61263 0.744 0.096 0.156 0.004
#> SRR2105225 1 0.5353 0.42185 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR2105226 1 0.5013 0.67210 0.688 0.000 0.292 0.020
#> SRR2105229 3 0.3308 0.66407 0.092 0.000 0.872 0.036
#> SRR2105230 3 0.2542 0.67442 0.084 0.000 0.904 0.012
#> SRR2105219 2 0.0336 0.89704 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105220 2 0.0927 0.89995 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR2105221 2 0.4406 0.74402 0.028 0.780 0.192 0.000
#> SRR2105222 2 0.0927 0.89977 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR2105223 1 0.5127 0.58097 0.632 0.000 0.356 0.012
#> SRR2105224 1 0.5026 0.66274 0.672 0.000 0.312 0.016
#> SRR2105217 2 0.2319 0.88780 0.040 0.924 0.000 0.036
#> SRR2105218 2 0.1109 0.90081 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR2105215 2 0.1022 0.89988 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0707 0.89959 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105213 4 0.5378 0.13849 0.448 0.000 0.012 0.540
#> SRR2105214 1 0.5420 0.55169 0.724 0.008 0.048 0.220
#> SRR2105211 3 0.4976 0.32181 0.340 0.004 0.652 0.004
#> SRR2105212 1 0.5151 0.30568 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR2105209 3 0.4632 0.51834 0.308 0.000 0.688 0.004
#> SRR2105210 1 0.5093 0.65330 0.640 0.000 0.348 0.012
#> SRR2105207 1 0.7640 0.15162 0.432 0.000 0.356 0.212
#> SRR2105208 1 0.7808 0.32151 0.560 0.052 0.116 0.272
#> SRR2105205 2 0.4996 0.68359 0.056 0.752 0.000 0.192
#> SRR2105206 2 0.6111 0.20906 0.052 0.556 0.000 0.392
#> SRR2105201 2 0.4549 0.72561 0.036 0.776 0.188 0.000
#> SRR2105202 2 0.4485 0.73639 0.028 0.772 0.200 0.000
#> SRR2105203 2 0.0592 0.89978 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0592 0.89895 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0707 0.90069 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.1661 0.89753 0.052 0.944 0.004 0.000
#> SRR2105197 3 0.4301 0.64460 0.064 0.000 0.816 0.120
#> SRR2105198 3 0.4593 0.63656 0.096 0.016 0.820 0.068
#> SRR2105195 4 0.7412 0.42992 0.256 0.020 0.148 0.576
#> SRR2105196 1 0.7498 -0.08953 0.472 0.044 0.068 0.416
#> SRR2105193 1 0.5334 0.45133 0.680 0.000 0.036 0.284
#> SRR2105194 1 0.4933 0.16843 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR2105191 3 0.2401 0.68205 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR2105192 3 0.1474 0.67926 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR2105189 2 0.4071 0.81463 0.064 0.832 0.104 0.000
#> SRR2105190 2 0.1406 0.89845 0.024 0.960 0.016 0.000
#> SRR2105187 4 0.7921 0.28136 0.036 0.380 0.120 0.464
#> SRR2105188 3 0.7779 0.03359 0.048 0.432 0.436 0.084
#> SRR2105179 1 0.7085 0.38233 0.544 0.000 0.156 0.300
#> SRR2105180 3 0.5744 0.56759 0.108 0.000 0.708 0.184
#> SRR2105183 2 0.1302 0.89754 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1302 0.89546 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.5028 0.36055 0.400 0.596 0.000 0.004
#> SRR2105186 2 0.3182 0.86169 0.096 0.876 0.000 0.028
#> SRR2105181 3 0.3205 0.67956 0.104 0.000 0.872 0.024
#> SRR2105182 3 0.3208 0.67713 0.148 0.000 0.848 0.004
#> SRR2105177 1 0.5579 0.59614 0.752 0.016 0.088 0.144
#> SRR2105178 1 0.6096 0.40724 0.632 0.008 0.052 0.308
#> SRR2105171 2 0.1807 0.89578 0.052 0.940 0.008 0.000
#> SRR2105172 2 0.0188 0.89701 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105175 4 0.5353 0.25944 0.432 0.000 0.012 0.556
#> SRR2105176 4 0.4999 0.05233 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR2105173 2 0.3271 0.83357 0.132 0.856 0.000 0.012
#> SRR2105174 2 0.0592 0.89896 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.1302 0.89715 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.1716 0.89346 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.0921 0.90031 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0707 0.90044 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.7146 0.21525 0.456 0.000 0.132 0.412
#> SRR2105166 4 0.5070 0.32846 0.372 0.000 0.008 0.620
#> SRR2105163 4 0.3117 0.67759 0.092 0.000 0.028 0.880
#> SRR2105164 4 0.1970 0.68157 0.060 0.000 0.008 0.932
#> SRR2105161 1 0.4542 0.50883 0.752 0.000 0.020 0.228
#> SRR2105162 1 0.4837 0.33131 0.648 0.000 0.004 0.348
#> SRR2105155 2 0.0000 0.89538 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.89538 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.1042 0.90098 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105158 2 0.2949 0.85028 0.024 0.888 0.000 0.088
#> SRR2105159 1 0.5511 -0.11896 0.500 0.000 0.016 0.484
#> SRR2105160 1 0.5607 0.17523 0.560 0.004 0.016 0.420
#> SRR2105153 2 0.2032 0.89475 0.036 0.936 0.000 0.028
#> SRR2105154 2 0.4671 0.69520 0.028 0.752 0.000 0.220
#> SRR2105151 2 0.0469 0.89721 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0707 0.89877 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.3812 0.65411 0.140 0.000 0.832 0.028
#> SRR2105150 3 0.5233 0.63201 0.148 0.028 0.776 0.048
#> SRR2105147 4 0.4638 0.60445 0.060 0.000 0.152 0.788
#> SRR2105148 4 0.4711 0.60133 0.064 0.000 0.152 0.784
#> SRR2105143 1 0.5838 0.64479 0.756 0.044 0.104 0.096
#> SRR2105144 1 0.7349 0.23732 0.540 0.276 0.180 0.004
#> SRR2105145 1 0.4730 0.30976 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR2105146 1 0.4713 0.31688 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR2105141 4 0.5519 0.53559 0.052 0.264 0.000 0.684
#> SRR2105142 2 0.4462 0.76155 0.064 0.804 0.000 0.132
#> SRR2105139 2 0.0188 0.89563 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0336 0.89783 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.4793 0.70344 0.040 0.756 0.204 0.000
#> SRR2105138 2 0.1082 0.90073 0.004 0.972 0.020 0.004
#> SRR2105135 2 0.3649 0.75526 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.1302 0.89689 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.1489 0.67885 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR2105134 3 0.1211 0.67769 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105131 3 0.5416 0.45426 0.048 0.260 0.692 0.000
#> SRR2105132 3 0.4541 0.59176 0.060 0.144 0.796 0.000
#> SRR2105129 1 0.4712 0.68983 0.800 0.008 0.132 0.060
#> SRR2105130 1 0.5223 0.59814 0.764 0.012 0.060 0.164
#> SRR2105127 1 0.5838 0.37838 0.524 0.032 0.444 0.000
#> SRR2105128 1 0.6584 0.31181 0.568 0.096 0.336 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.1012 0.57807 0.020 0.000 0.012 0.000 0.968
#> SRR2105278 5 0.1893 0.58111 0.048 0.000 0.024 0.000 0.928
#> SRR2105275 4 0.4686 0.60565 0.052 0.000 0.112 0.780 0.056
#> SRR2105276 4 0.6218 0.55048 0.096 0.000 0.264 0.604 0.036
#> SRR2105273 3 0.6511 0.57329 0.172 0.000 0.468 0.004 0.356
#> SRR2105274 3 0.6982 0.48096 0.316 0.000 0.460 0.020 0.204
#> SRR2105271 1 0.6983 0.14019 0.524 0.000 0.208 0.036 0.232
#> SRR2105272 1 0.6601 0.17056 0.524 0.000 0.148 0.308 0.020
#> SRR2105269 2 0.2152 0.84051 0.032 0.924 0.012 0.000 0.032
#> SRR2105270 2 0.2536 0.80602 0.000 0.868 0.004 0.000 0.128
#> SRR2105267 2 0.0693 0.82814 0.008 0.980 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105268 2 0.0324 0.82609 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0510 0.82960 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.1430 0.83725 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.4954 0.53857 0.024 0.652 0.016 0.308 0.000
#> SRR2105264 2 0.4425 0.67476 0.040 0.716 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105261 5 0.7992 -0.00435 0.160 0.008 0.320 0.096 0.416
#> SRR2105262 5 0.7120 -0.01092 0.148 0.000 0.324 0.048 0.480
#> SRR2105357 5 0.1408 0.58291 0.008 0.000 0.044 0.000 0.948
#> SRR2105358 5 0.1195 0.57957 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960
#> SRR2105439 2 0.4495 0.73615 0.024 0.752 0.028 0.000 0.196
#> SRR2105440 2 0.4906 0.60021 0.036 0.664 0.008 0.000 0.292
#> SRR2105509 2 0.2417 0.83722 0.040 0.912 0.032 0.000 0.016
#> SRR2105510 2 0.1948 0.83828 0.008 0.932 0.036 0.000 0.024
#> SRR2105507 3 0.7206 0.43368 0.344 0.000 0.404 0.024 0.228
#> SRR2105508 3 0.6649 0.54436 0.268 0.000 0.448 0.000 0.284
#> SRR2105505 5 0.5606 0.18392 0.380 0.004 0.068 0.000 0.548
#> SRR2105506 1 0.6363 0.08953 0.468 0.004 0.144 0.000 0.384
#> SRR2105503 2 0.3106 0.82910 0.116 0.856 0.008 0.020 0.000
#> SRR2105504 2 0.3995 0.78307 0.008 0.816 0.064 0.108 0.004
#> SRR2105501 2 0.6145 0.64572 0.092 0.660 0.072 0.000 0.176
#> SRR2105502 2 0.4955 0.72307 0.024 0.748 0.136 0.092 0.000
#> SRR2105499 5 0.7796 -0.04145 0.336 0.000 0.216 0.072 0.376
#> SRR2105500 5 0.6747 0.09048 0.364 0.000 0.216 0.004 0.416
#> SRR2105497 2 0.5208 0.70830 0.128 0.728 0.120 0.024 0.000
#> SRR2105498 2 0.5187 0.70674 0.180 0.704 0.008 0.108 0.000
#> SRR2105495 2 0.4548 0.67641 0.008 0.708 0.028 0.000 0.256
#> SRR2105496 2 0.3622 0.77660 0.008 0.804 0.016 0.000 0.172
#> SRR2105493 2 0.6049 0.25882 0.016 0.504 0.076 0.000 0.404
#> SRR2105494 5 0.5290 0.07654 0.020 0.412 0.020 0.000 0.548
#> SRR2105491 4 0.2673 0.61708 0.048 0.028 0.024 0.900 0.000
#> SRR2105492 4 0.3399 0.58676 0.048 0.080 0.016 0.856 0.000
#> SRR2105489 2 0.4083 0.76184 0.228 0.744 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.1965 0.83320 0.096 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105487 5 0.4168 0.56681 0.072 0.000 0.076 0.036 0.816
#> SRR2105488 5 0.4316 0.56596 0.068 0.000 0.044 0.080 0.808
#> SRR2105485 5 0.4599 0.55151 0.156 0.000 0.100 0.000 0.744
#> SRR2105486 5 0.4916 0.54747 0.160 0.004 0.056 0.028 0.752
#> SRR2105483 1 0.5370 0.25909 0.652 0.012 0.052 0.280 0.004
#> SRR2105484 1 0.4777 0.31152 0.708 0.012 0.040 0.240 0.000
#> SRR2105481 4 0.8234 -0.02582 0.224 0.000 0.140 0.384 0.252
#> SRR2105482 5 0.7517 -0.52114 0.352 0.000 0.248 0.040 0.360
#> SRR2105479 4 0.2654 0.61313 0.064 0.000 0.048 0.888 0.000
#> SRR2105480 4 0.3281 0.61420 0.060 0.000 0.092 0.848 0.000
#> SRR2105477 2 0.7186 0.32142 0.040 0.500 0.024 0.096 0.340
#> SRR2105478 2 0.6765 0.41631 0.032 0.540 0.020 0.080 0.328
#> SRR2105475 2 0.2100 0.83656 0.016 0.924 0.048 0.000 0.012
#> SRR2105476 2 0.1569 0.83567 0.008 0.944 0.044 0.004 0.000
#> SRR2105473 2 0.4430 0.67438 0.020 0.708 0.008 0.000 0.264
#> SRR2105474 2 0.3517 0.82180 0.072 0.840 0.000 0.004 0.084
#> SRR2105471 2 0.5124 0.68171 0.288 0.664 0.016 0.024 0.008
#> SRR2105472 2 0.3840 0.77956 0.208 0.772 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105469 5 0.6600 -0.58117 0.212 0.000 0.380 0.000 0.408
#> SRR2105470 1 0.6982 -0.32840 0.392 0.000 0.336 0.008 0.264
#> SRR2105467 5 0.3159 0.55077 0.088 0.000 0.056 0.000 0.856
#> SRR2105468 5 0.3731 0.53229 0.112 0.000 0.072 0.000 0.816
#> SRR2105465 1 0.6133 0.34924 0.660 0.012 0.196 0.032 0.100
#> SRR2105466 1 0.6717 0.32605 0.608 0.004 0.208 0.072 0.108
#> SRR2105463 1 0.6562 0.44362 0.636 0.004 0.084 0.172 0.104
#> SRR2105464 1 0.6780 0.43733 0.620 0.012 0.104 0.192 0.072
#> SRR2105461 2 0.1205 0.83674 0.040 0.956 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.1386 0.83739 0.032 0.952 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0932 0.83230 0.004 0.972 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105460 2 0.0579 0.82946 0.008 0.984 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105457 5 0.4751 0.48879 0.152 0.000 0.116 0.000 0.732
#> SRR2105458 5 0.2595 0.58169 0.080 0.000 0.032 0.000 0.888
#> SRR2105455 1 0.6148 0.16375 0.552 0.000 0.268 0.000 0.180
#> SRR2105456 1 0.6577 -0.13225 0.484 0.000 0.312 0.004 0.200
#> SRR2105453 5 0.4567 0.48350 0.232 0.004 0.044 0.000 0.720
#> SRR2105454 5 0.3318 0.54054 0.180 0.000 0.012 0.000 0.808
#> SRR2105451 2 0.5699 0.51519 0.016 0.612 0.072 0.000 0.300
#> SRR2105452 3 0.7744 0.02072 0.108 0.240 0.520 0.112 0.020
#> SRR2105449 1 0.6873 0.39735 0.580 0.000 0.184 0.172 0.064
#> SRR2105450 1 0.6962 0.37285 0.588 0.000 0.180 0.120 0.112
#> SRR2105447 2 0.5374 0.66578 0.064 0.696 0.208 0.000 0.032
#> SRR2105448 2 0.1913 0.84015 0.020 0.936 0.024 0.000 0.020
#> SRR2105445 5 0.3816 0.58074 0.056 0.044 0.060 0.000 0.840
#> SRR2105446 5 0.1648 0.57645 0.040 0.000 0.020 0.000 0.940
#> SRR2105443 5 0.5431 0.52283 0.036 0.092 0.144 0.004 0.724
#> SRR2105444 5 0.7395 0.36825 0.052 0.212 0.168 0.020 0.548
#> SRR2105441 2 0.5054 0.70087 0.244 0.692 0.008 0.004 0.052
#> SRR2105442 2 0.3123 0.79184 0.184 0.812 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105437 5 0.5759 0.49901 0.040 0.000 0.120 0.152 0.688
#> SRR2105438 5 0.6192 0.37716 0.032 0.000 0.100 0.264 0.604
#> SRR2105435 5 0.7698 0.14828 0.300 0.004 0.204 0.060 0.432
#> SRR2105436 5 0.5665 0.39005 0.072 0.000 0.212 0.040 0.676
#> SRR2105433 1 0.6650 0.42030 0.620 0.004 0.160 0.156 0.060
#> SRR2105434 1 0.5412 0.38084 0.700 0.000 0.172 0.020 0.108
#> SRR2105431 1 0.7063 0.32562 0.516 0.008 0.072 0.080 0.324
#> SRR2105432 1 0.6315 0.30770 0.596 0.004 0.168 0.012 0.220
#> SRR2105429 2 0.9280 -0.13672 0.084 0.344 0.264 0.116 0.192
#> SRR2105430 2 0.7455 0.55384 0.188 0.588 0.092 0.084 0.048
#> SRR2105427 2 0.1960 0.83610 0.020 0.928 0.004 0.000 0.048
#> SRR2105428 2 0.2444 0.83132 0.012 0.904 0.016 0.000 0.068
#> SRR2105425 2 0.2912 0.83571 0.088 0.876 0.028 0.000 0.008
#> SRR2105426 2 0.3217 0.82922 0.120 0.852 0.016 0.004 0.008
#> SRR2105421 3 0.6164 0.56946 0.152 0.000 0.520 0.000 0.328
#> SRR2105422 3 0.6661 0.56155 0.228 0.004 0.476 0.000 0.292
#> SRR2105423 2 0.2818 0.83038 0.132 0.856 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.1549 0.83972 0.040 0.944 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105419 5 0.5889 -0.10618 0.124 0.000 0.280 0.004 0.592
#> SRR2105420 5 0.6320 -0.37508 0.136 0.000 0.400 0.004 0.460
#> SRR2105415 5 0.7723 -0.19734 0.380 0.016 0.120 0.072 0.412
#> SRR2105416 1 0.7083 0.38591 0.560 0.016 0.052 0.112 0.260
#> SRR2105417 1 0.6666 0.12539 0.508 0.004 0.220 0.004 0.264
#> SRR2105418 1 0.5729 0.37074 0.676 0.000 0.136 0.024 0.164
#> SRR2105413 2 0.2807 0.83538 0.032 0.892 0.056 0.000 0.020
#> SRR2105414 2 0.2644 0.83504 0.016 0.896 0.068 0.000 0.020
#> SRR2105409 2 0.1788 0.83979 0.056 0.932 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105410 2 0.2568 0.84167 0.036 0.912 0.012 0.020 0.020
#> SRR2105411 2 0.2068 0.83659 0.092 0.904 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.3224 0.80629 0.160 0.824 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105407 5 0.2157 0.58138 0.036 0.000 0.040 0.004 0.920
#> SRR2105408 5 0.1082 0.57936 0.008 0.000 0.028 0.000 0.964
#> SRR2105403 5 0.2514 0.56372 0.060 0.000 0.044 0.000 0.896
#> SRR2105404 5 0.2221 0.55798 0.052 0.000 0.036 0.000 0.912
#> SRR2105405 1 0.6739 -0.32248 0.400 0.000 0.336 0.000 0.264
#> SRR2105406 1 0.6525 -0.08446 0.484 0.000 0.264 0.000 0.252
#> SRR2105401 2 0.6330 0.64654 0.080 0.652 0.124 0.000 0.144
#> SRR2105402 2 0.6123 0.55946 0.008 0.644 0.220 0.028 0.100
#> SRR2105399 5 0.7552 0.17154 0.100 0.352 0.120 0.000 0.428
#> SRR2105400 2 0.6587 0.51526 0.060 0.576 0.092 0.000 0.272
#> SRR2105397 5 0.8345 0.31408 0.068 0.084 0.232 0.128 0.488
#> SRR2105398 5 0.6034 0.47696 0.052 0.012 0.216 0.056 0.664
#> SRR2105395 2 0.0992 0.83359 0.024 0.968 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.1671 0.83744 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.2992 0.82938 0.068 0.868 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.1281 0.83541 0.032 0.956 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105389 5 0.4893 0.28468 0.044 0.000 0.264 0.008 0.684
#> SRR2105390 5 0.5491 0.27138 0.080 0.000 0.276 0.008 0.636
#> SRR2105391 5 0.5006 0.02650 0.048 0.000 0.328 0.000 0.624
#> SRR2105392 5 0.3847 0.44535 0.036 0.000 0.180 0.000 0.784
#> SRR2105385 3 0.7655 0.32088 0.312 0.000 0.448 0.120 0.120
#> SRR2105386 3 0.6957 0.53459 0.264 0.000 0.448 0.012 0.276
#> SRR2105387 1 0.5750 0.25666 0.616 0.000 0.228 0.000 0.156
#> SRR2105388 5 0.6040 -0.22784 0.372 0.000 0.124 0.000 0.504
#> SRR2105381 2 0.5433 0.69114 0.060 0.720 0.152 0.000 0.068
#> SRR2105382 2 0.2800 0.82551 0.016 0.892 0.040 0.052 0.000
#> SRR2105383 2 0.6205 0.39161 0.416 0.496 0.052 0.004 0.032
#> SRR2105384 2 0.6672 0.45429 0.352 0.520 0.056 0.004 0.068
#> SRR2105379 2 0.3530 0.81975 0.060 0.856 0.044 0.040 0.000
#> SRR2105380 2 0.7668 -0.01891 0.108 0.424 0.128 0.340 0.000
#> SRR2105377 2 0.4282 0.76023 0.024 0.776 0.028 0.000 0.172
#> SRR2105378 2 0.2196 0.83725 0.024 0.916 0.004 0.000 0.056
#> SRR2105375 1 0.6607 0.14080 0.456 0.028 0.072 0.012 0.432
#> SRR2105376 5 0.6518 0.22930 0.312 0.008 0.152 0.004 0.524
#> SRR2105373 5 0.3992 0.55234 0.080 0.000 0.124 0.000 0.796
#> SRR2105374 5 0.4743 0.54998 0.036 0.000 0.072 0.120 0.772
#> SRR2105371 3 0.6114 0.54628 0.132 0.000 0.492 0.000 0.376
#> SRR2105372 3 0.6443 0.55587 0.180 0.000 0.444 0.000 0.376
#> SRR2105369 5 0.5900 -0.04638 0.188 0.000 0.212 0.000 0.600
#> SRR2105370 5 0.6489 -0.24774 0.240 0.000 0.268 0.000 0.492
#> SRR2105367 5 0.5337 0.19588 0.376 0.012 0.028 0.004 0.580
#> SRR2105368 1 0.7016 0.34258 0.548 0.052 0.044 0.048 0.308
#> SRR2105365 2 0.5257 0.12307 0.024 0.488 0.012 0.476 0.000
#> SRR2105366 4 0.5151 0.25666 0.040 0.364 0.004 0.592 0.000
#> SRR2105363 2 0.2214 0.84353 0.052 0.916 0.028 0.000 0.004
#> SRR2105364 2 0.3242 0.80318 0.172 0.816 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.1124 0.83356 0.004 0.960 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.1251 0.83662 0.000 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR2105359 5 0.6594 -0.02652 0.388 0.000 0.180 0.004 0.428
#> SRR2105360 3 0.6749 0.52433 0.288 0.000 0.408 0.000 0.304
#> SRR2105355 3 0.6657 0.54089 0.232 0.000 0.416 0.000 0.352
#> SRR2105356 1 0.6785 -0.37113 0.376 0.000 0.340 0.000 0.284
#> SRR2105353 3 0.7359 0.40541 0.080 0.000 0.480 0.132 0.308
#> SRR2105354 5 0.7440 -0.44520 0.096 0.000 0.376 0.108 0.420
#> SRR2105351 2 0.2067 0.84121 0.048 0.920 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105352 2 0.6657 0.21627 0.008 0.504 0.132 0.344 0.012
#> SRR2105349 2 0.4646 0.79366 0.064 0.808 0.048 0.052 0.028
#> SRR2105350 2 0.2792 0.83495 0.084 0.884 0.016 0.000 0.016
#> SRR2105345 2 0.4054 0.79795 0.144 0.800 0.040 0.000 0.016
#> SRR2105346 2 0.1892 0.83663 0.080 0.916 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105347 2 0.5029 0.68554 0.288 0.664 0.024 0.000 0.024
#> SRR2105348 2 0.4696 0.61434 0.360 0.616 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105343 2 0.1430 0.83697 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0865 0.82938 0.004 0.972 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105341 5 0.5309 0.08215 0.092 0.000 0.264 0.000 0.644
#> SRR2105342 3 0.6642 0.55359 0.228 0.000 0.420 0.000 0.352
#> SRR2105339 3 0.6680 0.31496 0.124 0.000 0.436 0.024 0.416
#> SRR2105340 3 0.7079 0.36764 0.080 0.000 0.424 0.084 0.412
#> SRR2105335 5 0.1996 0.57523 0.032 0.000 0.036 0.004 0.928
#> SRR2105336 5 0.4181 0.52608 0.132 0.000 0.076 0.004 0.788
#> SRR2105337 3 0.6826 0.48935 0.308 0.000 0.492 0.020 0.180
#> SRR2105338 1 0.7579 0.14433 0.492 0.000 0.228 0.092 0.188
#> SRR2105331 2 0.4501 0.78837 0.060 0.788 0.016 0.128 0.008
#> SRR2105332 2 0.1808 0.83300 0.008 0.936 0.012 0.044 0.000
#> SRR2105333 2 0.4238 0.80448 0.056 0.824 0.060 0.008 0.052
#> SRR2105334 2 0.2312 0.83966 0.044 0.916 0.032 0.004 0.004
#> SRR2105329 5 0.3730 0.54498 0.016 0.104 0.048 0.000 0.832
#> SRR2105330 2 0.6752 0.37224 0.036 0.532 0.112 0.004 0.316
#> SRR2105327 2 0.2492 0.82974 0.016 0.900 0.076 0.004 0.004
#> SRR2105328 2 0.2339 0.83602 0.028 0.912 0.052 0.000 0.008
#> SRR2105325 4 0.2958 0.62072 0.020 0.000 0.076 0.880 0.024
#> SRR2105326 4 0.3572 0.61562 0.024 0.000 0.084 0.848 0.044
#> SRR2105323 5 0.3806 0.57669 0.072 0.008 0.096 0.000 0.824
#> SRR2105324 5 0.6744 -0.41795 0.356 0.000 0.260 0.000 0.384
#> SRR2105319 5 0.7490 0.20128 0.116 0.000 0.124 0.260 0.500
#> SRR2105320 5 0.6135 0.22416 0.032 0.000 0.060 0.392 0.516
#> SRR2105321 3 0.7767 -0.00974 0.088 0.000 0.412 0.324 0.176
#> SRR2105322 4 0.7029 0.41941 0.108 0.000 0.264 0.544 0.084
#> SRR2105317 2 0.1498 0.83753 0.008 0.952 0.024 0.000 0.016
#> SRR2105318 2 0.1121 0.83408 0.044 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105315 5 0.7219 0.21587 0.040 0.208 0.272 0.000 0.480
#> SRR2105316 2 0.2188 0.84018 0.024 0.924 0.028 0.000 0.024
#> SRR2105313 2 0.2737 0.84164 0.040 0.900 0.016 0.004 0.040
#> SRR2105314 2 0.1582 0.83827 0.028 0.944 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105311 4 0.1281 0.61567 0.032 0.000 0.012 0.956 0.000
#> SRR2105312 4 0.2142 0.61930 0.048 0.000 0.028 0.920 0.004
#> SRR2105307 1 0.6582 -0.05277 0.440 0.000 0.216 0.000 0.344
#> SRR2105308 1 0.6155 0.12991 0.556 0.000 0.252 0.000 0.192
#> SRR2105309 5 0.2249 0.56989 0.008 0.000 0.096 0.000 0.896
#> SRR2105310 5 0.3535 0.54394 0.088 0.000 0.080 0.000 0.832
#> SRR2105305 5 0.4983 0.16199 0.064 0.000 0.272 0.000 0.664
#> SRR2105306 3 0.6678 0.54517 0.256 0.000 0.432 0.000 0.312
#> SRR2105303 2 0.1774 0.84183 0.052 0.932 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.1924 0.83666 0.008 0.924 0.064 0.004 0.000
#> SRR2105301 2 0.2927 0.83508 0.040 0.892 0.040 0.024 0.004
#> SRR2105302 2 0.1251 0.83506 0.008 0.956 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105299 5 0.2903 0.58601 0.028 0.012 0.044 0.020 0.896
#> SRR2105300 5 0.5807 0.48202 0.044 0.152 0.056 0.032 0.716
#> SRR2105297 1 0.7399 0.08047 0.508 0.288 0.036 0.144 0.024
#> SRR2105298 1 0.6388 -0.11746 0.508 0.400 0.036 0.020 0.036
#> SRR2105295 2 0.0609 0.82703 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.1310 0.83593 0.020 0.956 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105293 4 0.6321 0.49177 0.088 0.000 0.352 0.532 0.028
#> SRR2105294 4 0.6388 0.44939 0.128 0.000 0.296 0.556 0.020
#> SRR2105291 3 0.6174 0.53357 0.208 0.000 0.556 0.000 0.236
#> SRR2105292 5 0.6814 -0.47814 0.272 0.000 0.288 0.004 0.436
#> SRR2105289 1 0.6472 -0.19791 0.432 0.000 0.384 0.000 0.184
#> SRR2105290 1 0.5919 0.20154 0.600 0.000 0.140 0.004 0.256
#> SRR2105287 1 0.5517 0.40125 0.700 0.004 0.132 0.016 0.148
#> SRR2105288 1 0.5029 0.42432 0.752 0.016 0.108 0.008 0.116
#> SRR2105285 2 0.6416 0.63417 0.080 0.640 0.168 0.000 0.112
#> SRR2105286 2 0.4561 0.77371 0.164 0.764 0.052 0.000 0.020
#> SRR2105283 2 0.7028 0.39740 0.060 0.528 0.084 0.012 0.316
#> SRR2105284 5 0.6297 0.19544 0.020 0.364 0.084 0.004 0.528
#> SRR2105281 2 0.4222 0.79979 0.144 0.792 0.044 0.000 0.020
#> SRR2105282 2 0.0671 0.83034 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105259 5 0.2068 0.58167 0.004 0.000 0.092 0.000 0.904
#> SRR2105260 5 0.2079 0.58687 0.020 0.000 0.064 0.000 0.916
#> SRR2105279 2 0.1831 0.83587 0.076 0.920 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.1792 0.83543 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105257 5 0.6030 0.28358 0.216 0.000 0.144 0.016 0.624
#> SRR2105258 1 0.7785 0.11524 0.460 0.000 0.232 0.100 0.208
#> SRR2105253 2 0.0579 0.82994 0.008 0.984 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0162 0.82496 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105255 5 0.3631 0.48698 0.104 0.000 0.072 0.000 0.824
#> SRR2105256 5 0.5537 0.22481 0.192 0.000 0.160 0.000 0.648
#> SRR2105251 2 0.1444 0.83675 0.040 0.948 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.3351 0.81457 0.148 0.828 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105249 2 0.4267 0.78525 0.180 0.772 0.020 0.000 0.028
#> SRR2105250 2 0.4473 0.78076 0.116 0.768 0.004 0.000 0.112
#> SRR2105247 2 0.2291 0.83830 0.036 0.908 0.056 0.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.1582 0.83598 0.028 0.944 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105245 4 0.7196 0.41960 0.228 0.000 0.152 0.540 0.080
#> SRR2105246 1 0.6795 0.03345 0.496 0.000 0.360 0.064 0.080
#> SRR2105243 3 0.6586 0.54236 0.236 0.000 0.460 0.000 0.304
#> SRR2105244 3 0.7619 0.42188 0.300 0.000 0.444 0.076 0.180
#> SRR2105241 3 0.6886 0.37244 0.380 0.000 0.432 0.020 0.168
#> SRR2105242 1 0.7047 0.05778 0.512 0.000 0.216 0.036 0.236
#> SRR2105239 3 0.6919 -0.07535 0.408 0.000 0.416 0.028 0.148
#> SRR2105240 1 0.5873 0.38814 0.672 0.000 0.064 0.068 0.196
#> SRR2105237 2 0.6603 0.10972 0.024 0.452 0.028 0.052 0.444
#> SRR2105238 5 0.4804 0.24142 0.016 0.364 0.008 0.000 0.612
#> SRR2105235 2 0.2522 0.83868 0.028 0.904 0.012 0.000 0.056
#> SRR2105236 2 0.1082 0.83354 0.028 0.964 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105233 2 0.1605 0.83681 0.012 0.944 0.040 0.000 0.004
#> SRR2105234 2 0.0451 0.82617 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.1894 0.83958 0.072 0.920 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.3724 0.78464 0.204 0.776 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.5931 -0.02311 0.436 0.000 0.460 0.000 0.104
#> SRR2105228 1 0.6193 0.37162 0.656 0.048 0.200 0.008 0.088
#> SRR2105225 5 0.6982 -0.45427 0.336 0.000 0.264 0.008 0.392
#> SRR2105226 1 0.6982 -0.35925 0.384 0.000 0.348 0.008 0.260
#> SRR2105229 5 0.5022 0.50594 0.044 0.000 0.252 0.016 0.688
#> SRR2105230 5 0.3314 0.57239 0.020 0.000 0.124 0.012 0.844
#> SRR2105219 2 0.0579 0.83025 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105220 2 0.2269 0.84044 0.028 0.920 0.020 0.000 0.032
#> SRR2105221 2 0.6338 0.49989 0.084 0.576 0.032 0.004 0.304
#> SRR2105222 2 0.3131 0.81657 0.028 0.860 0.008 0.000 0.104
#> SRR2105223 3 0.6904 0.56199 0.260 0.000 0.436 0.008 0.296
#> SRR2105224 1 0.7223 -0.35383 0.344 0.000 0.320 0.016 0.320
#> SRR2105217 2 0.4169 0.80347 0.060 0.808 0.024 0.108 0.000
#> SRR2105218 2 0.2237 0.83731 0.084 0.904 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105215 2 0.2166 0.84091 0.072 0.912 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105216 2 0.1211 0.83483 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105213 4 0.6674 0.31890 0.280 0.000 0.184 0.520 0.016
#> SRR2105214 3 0.6977 0.18647 0.328 0.000 0.484 0.152 0.036
#> SRR2105211 5 0.6156 -0.07534 0.224 0.000 0.216 0.000 0.560
#> SRR2105212 3 0.6616 0.46328 0.216 0.000 0.404 0.000 0.380
#> SRR2105209 1 0.6634 -0.01076 0.432 0.004 0.144 0.008 0.412
#> SRR2105210 1 0.6517 0.22286 0.536 0.000 0.116 0.028 0.320
#> SRR2105207 1 0.8102 0.20387 0.384 0.004 0.096 0.208 0.308
#> SRR2105208 1 0.6721 0.23471 0.584 0.024 0.032 0.272 0.088
#> SRR2105205 2 0.5740 0.55595 0.044 0.640 0.020 0.280 0.016
#> SRR2105206 2 0.5979 0.15799 0.068 0.488 0.016 0.428 0.000
#> SRR2105201 2 0.5089 0.61262 0.028 0.664 0.024 0.000 0.284
#> SRR2105202 2 0.5903 0.43821 0.064 0.552 0.020 0.000 0.364
#> SRR2105203 2 0.1485 0.83810 0.020 0.948 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.1628 0.83732 0.056 0.936 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.2678 0.83607 0.100 0.880 0.016 0.004 0.000
#> SRR2105200 2 0.4982 0.72779 0.244 0.700 0.036 0.004 0.016
#> SRR2105197 5 0.4182 0.56073 0.076 0.000 0.028 0.084 0.812
#> SRR2105198 5 0.5396 0.52929 0.148 0.000 0.064 0.064 0.724
#> SRR2105195 4 0.7541 0.24806 0.348 0.000 0.096 0.432 0.124
#> SRR2105196 1 0.6860 0.01794 0.500 0.012 0.052 0.368 0.068
#> SRR2105193 1 0.6424 0.20733 0.532 0.000 0.132 0.320 0.016
#> SRR2105194 4 0.5794 0.20178 0.384 0.000 0.096 0.520 0.000
#> SRR2105191 5 0.2735 0.58466 0.084 0.000 0.036 0.000 0.880
#> SRR2105192 5 0.1568 0.58095 0.036 0.000 0.020 0.000 0.944
#> SRR2105189 2 0.7308 0.51121 0.156 0.560 0.060 0.016 0.208
#> SRR2105190 2 0.3713 0.82087 0.068 0.844 0.032 0.000 0.056
#> SRR2105187 2 0.8385 -0.11588 0.024 0.364 0.088 0.340 0.184
#> SRR2105188 5 0.8504 0.16563 0.032 0.272 0.204 0.088 0.404
#> SRR2105179 1 0.7871 0.22456 0.452 0.000 0.236 0.200 0.112
#> SRR2105180 5 0.5684 0.46457 0.080 0.000 0.032 0.220 0.668
#> SRR2105183 2 0.2865 0.81878 0.132 0.856 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105184 2 0.2753 0.82032 0.136 0.856 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.6642 0.31943 0.264 0.520 0.204 0.012 0.000
#> SRR2105186 2 0.5586 0.74148 0.156 0.708 0.076 0.060 0.000
#> SRR2105181 5 0.3483 0.58275 0.088 0.000 0.032 0.028 0.852
#> SRR2105182 5 0.3401 0.56508 0.064 0.000 0.096 0.000 0.840
#> SRR2105177 1 0.6755 0.41360 0.628 0.008 0.144 0.140 0.080
#> SRR2105178 1 0.5696 0.22060 0.628 0.012 0.028 0.300 0.032
#> SRR2105171 2 0.4056 0.77892 0.196 0.772 0.024 0.004 0.004
#> SRR2105172 2 0.1041 0.83382 0.032 0.964 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105175 4 0.5954 0.25757 0.400 0.000 0.076 0.512 0.012
#> SRR2105176 4 0.5310 0.13142 0.448 0.000 0.040 0.508 0.004
#> SRR2105173 2 0.4964 0.75343 0.172 0.740 0.036 0.052 0.000
#> SRR2105174 2 0.1490 0.83766 0.032 0.952 0.008 0.004 0.004
#> SRR2105169 2 0.2054 0.83784 0.072 0.916 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105170 2 0.2457 0.83859 0.076 0.900 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105167 2 0.2193 0.83819 0.092 0.900 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.1774 0.83958 0.052 0.932 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.7284 -0.07290 0.136 0.000 0.416 0.388 0.060
#> SRR2105166 4 0.6692 0.18868 0.148 0.000 0.396 0.440 0.016
#> SRR2105163 4 0.5937 0.51872 0.052 0.000 0.284 0.616 0.048
#> SRR2105164 4 0.3752 0.61868 0.016 0.000 0.200 0.780 0.004
#> SRR2105161 1 0.6417 0.34015 0.584 0.004 0.208 0.192 0.012
#> SRR2105162 1 0.5686 0.01049 0.516 0.004 0.032 0.428 0.020
#> SRR2105155 2 0.0162 0.82586 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0404 0.82810 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.1306 0.83263 0.016 0.960 0.016 0.008 0.000
#> SRR2105158 2 0.2583 0.80917 0.004 0.864 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105159 4 0.6720 0.30251 0.328 0.000 0.168 0.488 0.016
#> SRR2105160 1 0.5770 0.00339 0.528 0.000 0.080 0.388 0.004
#> SRR2105153 2 0.3384 0.82307 0.060 0.848 0.004 0.088 0.000
#> SRR2105154 2 0.4715 0.62519 0.032 0.672 0.004 0.292 0.000
#> SRR2105151 2 0.1750 0.83744 0.028 0.936 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.2193 0.83559 0.092 0.900 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105149 5 0.6407 0.48615 0.136 0.004 0.192 0.040 0.628
#> SRR2105150 5 0.6603 0.49009 0.148 0.008 0.156 0.056 0.632
#> SRR2105147 4 0.6081 0.52101 0.040 0.000 0.228 0.636 0.096
#> SRR2105148 4 0.5988 0.52239 0.032 0.000 0.236 0.636 0.096
#> SRR2105143 1 0.5689 0.44359 0.732 0.016 0.100 0.068 0.084
#> SRR2105144 1 0.6874 0.33896 0.604 0.132 0.128 0.000 0.136
#> SRR2105145 1 0.6817 0.01252 0.348 0.000 0.308 0.344 0.000
#> SRR2105146 4 0.6786 -0.05837 0.324 0.000 0.292 0.384 0.000
#> SRR2105141 4 0.4343 0.49390 0.044 0.176 0.012 0.768 0.000
#> SRR2105142 2 0.5815 0.58436 0.056 0.660 0.044 0.236 0.004
#> SRR2105139 2 0.0794 0.83218 0.028 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.1124 0.83508 0.036 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.4037 0.77439 0.028 0.796 0.020 0.000 0.156
#> SRR2105138 2 0.3270 0.81565 0.044 0.852 0.004 0.000 0.100
#> SRR2105135 2 0.4733 0.57550 0.348 0.624 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.2389 0.82640 0.116 0.880 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105133 5 0.1885 0.58325 0.020 0.000 0.044 0.004 0.932
#> SRR2105134 5 0.0912 0.57872 0.016 0.000 0.012 0.000 0.972
#> SRR2105131 5 0.6198 0.42216 0.052 0.216 0.096 0.000 0.636
#> SRR2105132 5 0.4455 0.52277 0.044 0.128 0.040 0.000 0.788
#> SRR2105129 1 0.6632 0.34065 0.608 0.000 0.208 0.084 0.100
#> SRR2105130 1 0.5717 0.41236 0.680 0.004 0.072 0.208 0.036
#> SRR2105127 1 0.7079 0.08321 0.412 0.040 0.144 0.000 0.404
#> SRR2105128 1 0.7731 0.18750 0.444 0.100 0.160 0.000 0.296
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.3659 0.58893 0.012 0.000 0.224 0.000 0.752 0.012
#> SRR2105278 5 0.4238 0.59488 0.048 0.000 0.200 0.000 0.736 0.016
#> SRR2105275 4 0.5874 0.34963 0.028 0.000 0.044 0.652 0.100 0.176
#> SRR2105276 4 0.7171 0.19315 0.076 0.000 0.068 0.496 0.080 0.280
#> SRR2105273 3 0.3574 0.55602 0.032 0.000 0.824 0.000 0.096 0.048
#> SRR2105274 3 0.4025 0.52053 0.092 0.000 0.796 0.012 0.012 0.088
#> SRR2105271 3 0.7022 0.04530 0.388 0.000 0.412 0.032 0.092 0.076
#> SRR2105272 1 0.7700 0.11553 0.336 0.000 0.260 0.280 0.016 0.108
#> SRR2105269 2 0.2445 0.74432 0.040 0.892 0.000 0.000 0.060 0.008
#> SRR2105270 2 0.2794 0.70918 0.004 0.840 0.000 0.000 0.144 0.012
#> SRR2105267 2 0.0653 0.71904 0.004 0.980 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105268 2 0.1780 0.73711 0.028 0.932 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105265 2 0.1755 0.74181 0.032 0.932 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105266 2 0.1003 0.72942 0.020 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105263 2 0.4602 0.45057 0.020 0.668 0.000 0.284 0.016 0.012
#> SRR2105264 2 0.5128 0.40445 0.076 0.600 0.000 0.312 0.000 0.012
#> SRR2105261 5 0.8667 -0.00355 0.116 0.008 0.228 0.100 0.332 0.216
#> SRR2105262 3 0.7741 0.11265 0.084 0.000 0.376 0.072 0.348 0.120
#> SRR2105357 5 0.3770 0.60948 0.020 0.000 0.156 0.000 0.788 0.036
#> SRR2105358 5 0.3761 0.58895 0.020 0.000 0.228 0.000 0.744 0.008
#> SRR2105439 2 0.4999 0.61418 0.036 0.704 0.020 0.000 0.200 0.040
#> SRR2105440 2 0.5030 0.53457 0.024 0.664 0.028 0.000 0.260 0.024
#> SRR2105509 2 0.3165 0.74212 0.040 0.864 0.008 0.000 0.036 0.052
#> SRR2105510 2 0.3162 0.73649 0.020 0.852 0.000 0.000 0.064 0.064
#> SRR2105507 3 0.3725 0.52422 0.092 0.000 0.824 0.012 0.048 0.024
#> SRR2105508 3 0.2918 0.54833 0.020 0.000 0.868 0.000 0.064 0.048
#> SRR2105505 3 0.6807 0.24878 0.220 0.000 0.440 0.000 0.280 0.060
#> SRR2105506 3 0.5699 0.36304 0.260 0.000 0.584 0.000 0.132 0.024
#> SRR2105503 2 0.3479 0.74564 0.124 0.824 0.000 0.028 0.016 0.008
#> SRR2105504 2 0.4961 0.66054 0.040 0.744 0.016 0.080 0.004 0.116
#> SRR2105501 2 0.7550 0.18658 0.120 0.504 0.108 0.000 0.192 0.076
#> SRR2105502 2 0.5802 0.57421 0.072 0.668 0.016 0.076 0.004 0.164
#> SRR2105499 1 0.8580 0.18797 0.320 0.000 0.204 0.096 0.228 0.152
#> SRR2105500 1 0.7613 0.06838 0.348 0.004 0.252 0.004 0.276 0.116
#> SRR2105497 2 0.5584 0.60104 0.104 0.688 0.124 0.016 0.000 0.068
#> SRR2105498 2 0.5960 0.46889 0.232 0.596 0.012 0.132 0.000 0.028
#> SRR2105495 2 0.4590 0.56462 0.032 0.688 0.012 0.000 0.256 0.012
#> SRR2105496 2 0.3945 0.65157 0.028 0.748 0.008 0.000 0.212 0.004
#> SRR2105493 2 0.5784 0.20004 0.020 0.516 0.012 0.000 0.376 0.076
#> SRR2105494 5 0.4983 0.02038 0.012 0.424 0.008 0.000 0.528 0.028
#> SRR2105491 4 0.3625 0.40498 0.048 0.044 0.000 0.840 0.016 0.052
#> SRR2105492 4 0.3452 0.39206 0.036 0.068 0.000 0.848 0.016 0.032
#> SRR2105489 2 0.5094 0.51721 0.348 0.580 0.000 0.004 0.008 0.060
#> SRR2105490 2 0.3274 0.73677 0.168 0.804 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105487 5 0.4090 0.60069 0.016 0.000 0.144 0.004 0.776 0.060
#> SRR2105488 5 0.4713 0.60889 0.032 0.008 0.128 0.044 0.764 0.024
#> SRR2105485 5 0.6539 0.45525 0.172 0.000 0.140 0.000 0.556 0.132
#> SRR2105486 5 0.6806 0.43980 0.180 0.000 0.184 0.008 0.532 0.096
#> SRR2105483 1 0.6344 0.29098 0.476 0.004 0.200 0.300 0.000 0.020
#> SRR2105484 1 0.6122 0.36888 0.560 0.000 0.192 0.208 0.000 0.040
#> SRR2105481 4 0.7915 -0.02530 0.112 0.000 0.332 0.364 0.128 0.064
#> SRR2105482 3 0.5448 0.53692 0.104 0.000 0.692 0.040 0.144 0.020
#> SRR2105479 4 0.2879 0.45251 0.072 0.000 0.016 0.868 0.000 0.044
#> SRR2105480 4 0.2393 0.45414 0.064 0.000 0.004 0.892 0.000 0.040
#> SRR2105477 5 0.6867 -0.15122 0.036 0.396 0.000 0.116 0.412 0.040
#> SRR2105478 2 0.6725 -0.00230 0.064 0.428 0.000 0.112 0.384 0.012
#> SRR2105475 2 0.3622 0.72371 0.048 0.820 0.000 0.000 0.032 0.100
#> SRR2105476 2 0.2197 0.74175 0.044 0.900 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105473 2 0.5160 0.43857 0.056 0.596 0.000 0.000 0.324 0.024
#> SRR2105474 2 0.4142 0.68219 0.072 0.752 0.000 0.000 0.168 0.008
#> SRR2105471 2 0.6214 0.26697 0.408 0.460 0.000 0.032 0.020 0.080
#> SRR2105472 2 0.4710 0.61724 0.288 0.652 0.000 0.008 0.004 0.048
#> SRR2105469 3 0.2715 0.55512 0.028 0.000 0.872 0.000 0.088 0.012
#> SRR2105470 3 0.4565 0.52239 0.144 0.000 0.748 0.004 0.072 0.032
#> SRR2105467 5 0.4890 0.45469 0.044 0.000 0.316 0.000 0.620 0.020
#> SRR2105468 5 0.5001 0.42259 0.044 0.000 0.380 0.000 0.560 0.016
#> SRR2105465 3 0.5916 0.16152 0.340 0.012 0.556 0.032 0.016 0.044
#> SRR2105466 3 0.5647 0.26314 0.260 0.016 0.624 0.072 0.004 0.024
#> SRR2105463 1 0.7149 0.28439 0.416 0.000 0.328 0.184 0.040 0.032
#> SRR2105464 1 0.7686 0.29241 0.392 0.004 0.316 0.176 0.040 0.072
#> SRR2105461 2 0.2404 0.74852 0.112 0.872 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105462 2 0.2255 0.74562 0.088 0.892 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105459 2 0.3091 0.74320 0.044 0.856 0.004 0.000 0.012 0.084
#> SRR2105460 2 0.0665 0.72162 0.008 0.980 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105457 5 0.6805 0.39821 0.184 0.000 0.216 0.000 0.500 0.100
#> SRR2105458 5 0.5850 0.53030 0.112 0.000 0.228 0.000 0.604 0.056
#> SRR2105455 3 0.4592 0.38665 0.260 0.000 0.680 0.000 0.032 0.028
#> SRR2105456 3 0.3840 0.48765 0.152 0.000 0.792 0.008 0.020 0.028
#> SRR2105453 5 0.6331 0.39563 0.172 0.000 0.284 0.000 0.504 0.040
#> SRR2105454 5 0.5403 0.51323 0.080 0.000 0.292 0.000 0.600 0.028
#> SRR2105451 2 0.6413 0.33729 0.020 0.580 0.080 0.000 0.232 0.088
#> SRR2105452 6 0.8271 0.27361 0.096 0.192 0.312 0.072 0.004 0.324
#> SRR2105449 1 0.7303 0.25748 0.444 0.000 0.312 0.136 0.064 0.044
#> SRR2105450 1 0.7565 0.33804 0.464 0.000 0.260 0.100 0.060 0.116
#> SRR2105447 2 0.6554 0.29267 0.052 0.552 0.064 0.000 0.056 0.276
#> SRR2105448 2 0.3803 0.73965 0.056 0.828 0.016 0.000 0.060 0.040
#> SRR2105445 5 0.5278 0.57159 0.008 0.052 0.260 0.000 0.644 0.036
#> SRR2105446 5 0.3876 0.58650 0.012 0.000 0.244 0.000 0.728 0.016
#> SRR2105443 5 0.6443 0.40849 0.024 0.144 0.084 0.000 0.608 0.140
#> SRR2105444 5 0.7075 0.25283 0.052 0.176 0.072 0.008 0.568 0.124
#> SRR2105441 2 0.5750 0.57530 0.236 0.628 0.012 0.000 0.068 0.056
#> SRR2105442 2 0.3608 0.67222 0.248 0.736 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105437 5 0.5554 0.49694 0.020 0.000 0.048 0.152 0.684 0.096
#> SRR2105438 5 0.5534 0.36833 0.028 0.000 0.016 0.260 0.628 0.068
#> SRR2105435 1 0.7252 0.20388 0.420 0.000 0.068 0.032 0.340 0.140
#> SRR2105436 5 0.8086 0.23619 0.136 0.000 0.216 0.060 0.404 0.184
#> SRR2105433 1 0.7727 0.36410 0.444 0.000 0.244 0.124 0.048 0.140
#> SRR2105434 1 0.5861 0.17700 0.504 0.000 0.384 0.004 0.052 0.056
#> SRR2105431 1 0.7731 0.09577 0.388 0.000 0.316 0.076 0.164 0.056
#> SRR2105432 3 0.5952 0.36622 0.264 0.000 0.580 0.016 0.120 0.020
#> SRR2105429 6 0.9072 0.20130 0.148 0.144 0.020 0.164 0.204 0.320
#> SRR2105430 2 0.8062 -0.19323 0.216 0.388 0.000 0.108 0.060 0.228
#> SRR2105427 2 0.3137 0.73745 0.020 0.856 0.012 0.000 0.092 0.020
#> SRR2105428 2 0.3822 0.67044 0.032 0.772 0.000 0.000 0.180 0.016
#> SRR2105425 2 0.4758 0.69554 0.168 0.728 0.016 0.000 0.016 0.072
#> SRR2105426 2 0.4026 0.72851 0.144 0.780 0.040 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105421 3 0.5271 0.53191 0.056 0.000 0.688 0.000 0.120 0.136
#> SRR2105422 3 0.3653 0.55073 0.024 0.000 0.816 0.000 0.100 0.060
#> SRR2105423 2 0.3301 0.73149 0.188 0.788 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105424 2 0.3512 0.73978 0.140 0.808 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR2105419 3 0.5273 0.41625 0.036 0.000 0.608 0.000 0.300 0.056
#> SRR2105420 3 0.5278 0.50446 0.028 0.000 0.664 0.004 0.208 0.096
#> SRR2105415 1 0.8205 0.09456 0.344 0.008 0.272 0.056 0.236 0.084
#> SRR2105416 1 0.7542 0.38198 0.476 0.000 0.200 0.128 0.160 0.036
#> SRR2105417 3 0.5389 0.44773 0.180 0.004 0.672 0.000 0.100 0.044
#> SRR2105418 3 0.6901 0.02294 0.380 0.004 0.440 0.032 0.088 0.056
#> SRR2105413 2 0.4878 0.67894 0.096 0.740 0.016 0.000 0.032 0.116
#> SRR2105414 2 0.5017 0.63956 0.064 0.708 0.004 0.000 0.052 0.172
#> SRR2105409 2 0.2415 0.74790 0.032 0.904 0.004 0.000 0.024 0.036
#> SRR2105410 2 0.3432 0.74260 0.056 0.852 0.000 0.040 0.032 0.020
#> SRR2105411 2 0.2976 0.74987 0.128 0.844 0.004 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105412 2 0.3855 0.66199 0.276 0.704 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105407 5 0.3759 0.58773 0.008 0.000 0.216 0.000 0.752 0.024
#> SRR2105408 5 0.4209 0.58481 0.008 0.000 0.232 0.000 0.716 0.044
#> SRR2105403 5 0.4767 0.51739 0.020 0.000 0.316 0.000 0.628 0.036
#> SRR2105404 5 0.3973 0.53037 0.008 0.000 0.296 0.000 0.684 0.012
#> SRR2105405 3 0.3158 0.54334 0.060 0.000 0.856 0.000 0.052 0.032
#> SRR2105406 3 0.3687 0.50247 0.164 0.000 0.788 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105401 2 0.7664 0.22323 0.132 0.492 0.068 0.000 0.172 0.136
#> SRR2105402 2 0.6730 0.18485 0.028 0.536 0.116 0.008 0.040 0.272
#> SRR2105399 5 0.7904 -0.02267 0.156 0.216 0.048 0.000 0.428 0.152
#> SRR2105400 2 0.8089 -0.28151 0.164 0.332 0.036 0.000 0.288 0.180
#> SRR2105397 5 0.8001 0.06203 0.024 0.072 0.088 0.100 0.452 0.264
#> SRR2105398 5 0.5361 0.44521 0.012 0.008 0.072 0.016 0.660 0.232
#> SRR2105395 2 0.1863 0.74086 0.044 0.920 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105396 2 0.2457 0.74823 0.056 0.896 0.008 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105393 2 0.4715 0.68203 0.164 0.712 0.016 0.000 0.000 0.108
#> SRR2105394 2 0.1858 0.74213 0.076 0.912 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105389 3 0.5607 -0.06175 0.000 0.000 0.448 0.000 0.408 0.144
#> SRR2105390 3 0.6381 -0.03846 0.032 0.000 0.432 0.000 0.364 0.172
#> SRR2105391 3 0.5229 0.32641 0.008 0.000 0.608 0.000 0.276 0.108
#> SRR2105392 5 0.5505 0.21163 0.004 0.000 0.408 0.000 0.476 0.112
#> SRR2105385 3 0.6959 0.31703 0.120 0.000 0.560 0.136 0.032 0.152
#> SRR2105386 3 0.5780 0.48814 0.088 0.000 0.644 0.008 0.068 0.192
#> SRR2105387 3 0.5544 0.09513 0.420 0.000 0.488 0.000 0.032 0.060
#> SRR2105388 3 0.6873 0.28297 0.260 0.000 0.460 0.000 0.200 0.080
#> SRR2105381 2 0.5748 0.49402 0.012 0.664 0.116 0.000 0.064 0.144
#> SRR2105382 2 0.4189 0.71216 0.024 0.804 0.016 0.056 0.008 0.092
#> SRR2105383 1 0.5579 0.00719 0.596 0.304 0.020 0.000 0.024 0.056
#> SRR2105384 1 0.6258 -0.07413 0.472 0.368 0.000 0.000 0.060 0.100
#> SRR2105379 2 0.5123 0.68278 0.088 0.744 0.052 0.028 0.004 0.084
#> SRR2105380 2 0.7379 -0.20082 0.100 0.408 0.072 0.360 0.000 0.060
#> SRR2105377 2 0.5337 0.59500 0.044 0.676 0.016 0.000 0.208 0.056
#> SRR2105378 2 0.2947 0.73997 0.032 0.864 0.000 0.000 0.080 0.024
#> SRR2105375 1 0.6984 0.24592 0.476 0.008 0.188 0.008 0.268 0.052
#> SRR2105376 5 0.7009 -0.06815 0.348 0.000 0.104 0.000 0.396 0.152
#> SRR2105373 5 0.5458 0.35739 0.008 0.000 0.380 0.012 0.532 0.068
#> SRR2105374 5 0.6208 0.53745 0.020 0.000 0.144 0.156 0.620 0.060
#> SRR2105371 3 0.5127 0.49465 0.004 0.000 0.652 0.004 0.136 0.204
#> SRR2105372 3 0.3395 0.55421 0.004 0.000 0.816 0.000 0.124 0.056
#> SRR2105369 3 0.5104 0.42973 0.052 0.000 0.628 0.000 0.288 0.032
#> SRR2105370 3 0.6917 0.39273 0.120 0.000 0.476 0.000 0.256 0.148
#> SRR2105367 5 0.7331 0.06176 0.328 0.016 0.192 0.004 0.396 0.064
#> SRR2105368 1 0.8175 0.32212 0.444 0.056 0.212 0.036 0.184 0.068
#> SRR2105365 4 0.5178 -0.14004 0.040 0.444 0.000 0.492 0.000 0.024
#> SRR2105366 4 0.4701 -0.03623 0.016 0.352 0.000 0.608 0.012 0.012
#> SRR2105363 2 0.3704 0.74561 0.064 0.836 0.040 0.000 0.036 0.024
#> SRR2105364 2 0.4453 0.68908 0.208 0.724 0.012 0.000 0.008 0.048
#> SRR2105361 2 0.1364 0.73098 0.012 0.952 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105362 2 0.2494 0.74641 0.032 0.900 0.004 0.000 0.028 0.036
#> SRR2105359 3 0.7410 0.06963 0.292 0.000 0.336 0.000 0.252 0.120
#> SRR2105360 3 0.3994 0.54531 0.072 0.000 0.796 0.000 0.096 0.036
#> SRR2105355 3 0.3003 0.55427 0.016 0.000 0.852 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105356 3 0.3850 0.52781 0.140 0.000 0.792 0.000 0.032 0.036
#> SRR2105353 3 0.6994 0.31738 0.020 0.000 0.492 0.064 0.172 0.252
#> SRR2105354 3 0.6333 0.48865 0.016 0.000 0.612 0.096 0.160 0.116
#> SRR2105351 2 0.3718 0.73776 0.084 0.812 0.004 0.000 0.012 0.088
#> SRR2105352 2 0.7515 -0.21609 0.048 0.428 0.036 0.304 0.012 0.172
#> SRR2105349 2 0.6933 0.43438 0.176 0.568 0.008 0.040 0.056 0.152
#> SRR2105350 2 0.5700 0.59030 0.200 0.640 0.004 0.000 0.056 0.100
#> SRR2105345 2 0.4830 0.70442 0.136 0.740 0.012 0.000 0.040 0.072
#> SRR2105346 2 0.2728 0.74167 0.100 0.864 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105347 2 0.5525 0.37089 0.412 0.504 0.000 0.004 0.044 0.036
#> SRR2105348 1 0.5155 -0.24756 0.504 0.432 0.020 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105343 2 0.2231 0.74667 0.068 0.900 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105344 2 0.2900 0.74483 0.044 0.860 0.008 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105341 3 0.5230 0.25099 0.004 0.000 0.552 0.000 0.352 0.092
#> SRR2105342 3 0.4356 0.55029 0.032 0.000 0.764 0.000 0.112 0.092
#> SRR2105339 3 0.7784 0.23736 0.116 0.000 0.384 0.028 0.204 0.268
#> SRR2105340 3 0.6857 0.35575 0.016 0.000 0.488 0.052 0.176 0.268
#> SRR2105335 5 0.4879 0.55338 0.004 0.000 0.248 0.008 0.664 0.076
#> SRR2105336 5 0.5363 0.40831 0.036 0.000 0.364 0.008 0.560 0.032
#> SRR2105337 3 0.4539 0.52119 0.080 0.000 0.764 0.016 0.024 0.116
#> SRR2105338 3 0.7613 0.06404 0.296 0.000 0.432 0.128 0.064 0.080
#> SRR2105331 2 0.4826 0.68854 0.072 0.748 0.000 0.120 0.016 0.044
#> SRR2105332 2 0.1970 0.74118 0.028 0.920 0.000 0.044 0.000 0.008
#> SRR2105333 2 0.5952 0.54197 0.096 0.636 0.004 0.000 0.152 0.112
#> SRR2105334 2 0.5058 0.62095 0.124 0.672 0.000 0.000 0.016 0.188
#> SRR2105329 5 0.6135 0.51613 0.040 0.120 0.120 0.000 0.652 0.068
#> SRR2105330 2 0.7731 -0.16260 0.056 0.396 0.096 0.000 0.320 0.132
#> SRR2105327 2 0.4119 0.70688 0.040 0.788 0.008 0.004 0.024 0.136
#> SRR2105328 2 0.4378 0.70270 0.044 0.768 0.012 0.008 0.016 0.152
#> SRR2105325 4 0.3063 0.43914 0.016 0.000 0.004 0.860 0.040 0.080
#> SRR2105326 4 0.3575 0.43244 0.036 0.000 0.000 0.828 0.060 0.076
#> SRR2105323 5 0.5556 0.56998 0.108 0.004 0.168 0.000 0.664 0.056
#> SRR2105324 3 0.6042 0.44648 0.168 0.000 0.588 0.000 0.192 0.052
#> SRR2105319 3 0.7750 0.11891 0.032 0.000 0.340 0.320 0.220 0.088
#> SRR2105320 4 0.7574 -0.05003 0.032 0.000 0.176 0.404 0.300 0.088
#> SRR2105321 3 0.7581 0.03023 0.012 0.000 0.384 0.256 0.116 0.232
#> SRR2105322 4 0.7013 0.22420 0.020 0.000 0.248 0.504 0.084 0.144
#> SRR2105317 2 0.1938 0.74374 0.004 0.920 0.000 0.000 0.040 0.036
#> SRR2105318 2 0.3436 0.74517 0.128 0.812 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR2105315 5 0.8190 -0.15823 0.036 0.220 0.264 0.000 0.312 0.168
#> SRR2105316 2 0.2415 0.74774 0.036 0.904 0.004 0.000 0.024 0.032
#> SRR2105313 2 0.3644 0.75017 0.076 0.832 0.008 0.000 0.048 0.036
#> SRR2105314 2 0.3306 0.74440 0.080 0.848 0.008 0.000 0.016 0.048
#> SRR2105311 4 0.0976 0.45606 0.016 0.000 0.000 0.968 0.008 0.008
#> SRR2105312 4 0.1293 0.45482 0.016 0.000 0.004 0.956 0.004 0.020
#> SRR2105307 3 0.4765 0.50857 0.160 0.000 0.708 0.000 0.116 0.016
#> SRR2105308 3 0.4936 0.32061 0.292 0.000 0.632 0.000 0.016 0.060
#> SRR2105309 5 0.5678 0.50271 0.032 0.000 0.264 0.000 0.592 0.112
#> SRR2105310 5 0.6888 0.34453 0.152 0.000 0.292 0.000 0.456 0.100
#> SRR2105305 3 0.6039 0.10164 0.024 0.000 0.476 0.000 0.364 0.136
#> SRR2105306 3 0.3350 0.55670 0.036 0.000 0.844 0.000 0.056 0.064
#> SRR2105303 2 0.3362 0.73760 0.096 0.824 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR2105304 2 0.3141 0.73384 0.048 0.836 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR2105301 2 0.3876 0.74203 0.076 0.828 0.016 0.008 0.044 0.028
#> SRR2105302 2 0.2351 0.74349 0.036 0.900 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR2105299 5 0.4738 0.60899 0.024 0.016 0.156 0.004 0.744 0.056
#> SRR2105300 5 0.5612 0.46719 0.052 0.120 0.036 0.012 0.712 0.068
#> SRR2105297 1 0.7088 0.17468 0.564 0.200 0.044 0.124 0.040 0.028
#> SRR2105298 1 0.5998 0.05641 0.608 0.268 0.020 0.016 0.044 0.044
#> SRR2105295 2 0.1714 0.73477 0.016 0.936 0.024 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105296 2 0.2344 0.74498 0.052 0.896 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105293 4 0.7761 0.19149 0.048 0.000 0.276 0.392 0.076 0.208
#> SRR2105294 4 0.6186 0.35141 0.088 0.000 0.224 0.588 0.004 0.096
#> SRR2105291 3 0.5974 0.45188 0.068 0.008 0.628 0.004 0.084 0.208
#> SRR2105292 3 0.4331 0.55287 0.048 0.000 0.764 0.004 0.148 0.036
#> SRR2105289 3 0.6255 0.26928 0.292 0.000 0.512 0.000 0.040 0.156
#> SRR2105290 3 0.5666 0.12493 0.428 0.000 0.472 0.000 0.040 0.060
#> SRR2105287 1 0.6961 0.34629 0.524 0.008 0.244 0.012 0.124 0.088
#> SRR2105288 1 0.5837 0.31025 0.552 0.000 0.316 0.000 0.048 0.084
#> SRR2105285 2 0.7712 -0.32865 0.208 0.328 0.008 0.000 0.156 0.300
#> SRR2105286 2 0.6289 0.31570 0.344 0.488 0.004 0.000 0.040 0.124
#> SRR2105283 5 0.6601 -0.08221 0.080 0.392 0.028 0.000 0.448 0.052
#> SRR2105284 5 0.5377 0.03693 0.012 0.368 0.012 0.000 0.552 0.056
#> SRR2105281 2 0.6150 0.46828 0.296 0.548 0.004 0.000 0.064 0.088
#> SRR2105282 2 0.1577 0.73724 0.036 0.940 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105259 5 0.4614 0.60061 0.028 0.000 0.168 0.000 0.728 0.076
#> SRR2105260 5 0.3959 0.60954 0.024 0.000 0.140 0.000 0.784 0.052
#> SRR2105279 2 0.3861 0.72494 0.168 0.772 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR2105280 2 0.2212 0.74485 0.112 0.880 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105257 3 0.5856 0.32816 0.036 0.000 0.576 0.036 0.312 0.040
#> SRR2105258 3 0.5443 0.48954 0.120 0.000 0.704 0.092 0.064 0.020
#> SRR2105253 2 0.2137 0.74388 0.048 0.912 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105254 2 0.0914 0.72394 0.016 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105255 5 0.5054 0.23724 0.024 0.000 0.436 0.000 0.508 0.032
#> SRR2105256 3 0.6054 -0.06084 0.088 0.000 0.436 0.000 0.428 0.048
#> SRR2105251 2 0.2126 0.74477 0.072 0.904 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105252 2 0.4131 0.65298 0.272 0.688 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105249 2 0.5160 0.63146 0.256 0.652 0.008 0.000 0.024 0.060
#> SRR2105250 2 0.5438 0.57983 0.164 0.644 0.008 0.000 0.172 0.012
#> SRR2105247 2 0.3754 0.73655 0.108 0.808 0.008 0.000 0.008 0.068
#> SRR2105248 2 0.2712 0.74469 0.088 0.864 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105245 4 0.7866 0.15649 0.088 0.004 0.312 0.404 0.072 0.120
#> SRR2105246 3 0.6706 0.31571 0.180 0.000 0.584 0.088 0.036 0.112
#> SRR2105243 3 0.4687 0.55425 0.048 0.000 0.740 0.000 0.128 0.084
#> SRR2105244 3 0.6605 0.37241 0.136 0.000 0.580 0.100 0.016 0.168
#> SRR2105241 3 0.6621 0.28723 0.240 0.000 0.500 0.016 0.028 0.216
#> SRR2105242 3 0.5837 0.41307 0.240 0.000 0.628 0.040 0.052 0.040
#> SRR2105239 3 0.7396 0.03591 0.264 0.000 0.344 0.004 0.096 0.292
#> SRR2105240 3 0.6641 -0.06999 0.400 0.000 0.436 0.088 0.044 0.032
#> SRR2105237 5 0.6036 0.01871 0.028 0.360 0.000 0.044 0.524 0.044
#> SRR2105238 5 0.4551 0.21984 0.016 0.312 0.016 0.000 0.648 0.008
#> SRR2105235 2 0.4099 0.72497 0.048 0.804 0.020 0.000 0.096 0.032
#> SRR2105236 2 0.2681 0.75022 0.048 0.888 0.004 0.000 0.020 0.040
#> SRR2105233 2 0.4582 0.66907 0.072 0.732 0.004 0.000 0.020 0.172
#> SRR2105234 2 0.1659 0.73486 0.020 0.940 0.004 0.000 0.008 0.028
#> SRR2105231 2 0.3980 0.72403 0.152 0.772 0.000 0.004 0.004 0.068
#> SRR2105232 2 0.4587 0.60513 0.296 0.640 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105227 3 0.7301 0.10839 0.264 0.000 0.412 0.004 0.108 0.212
#> SRR2105228 1 0.6901 0.15261 0.412 0.028 0.396 0.000 0.060 0.104
#> SRR2105225 3 0.5759 0.53666 0.120 0.000 0.664 0.008 0.124 0.084
#> SRR2105226 3 0.4798 0.53584 0.108 0.000 0.756 0.020 0.052 0.064
#> SRR2105229 5 0.5974 0.37137 0.032 0.000 0.116 0.004 0.552 0.296
#> SRR2105230 5 0.5160 0.56233 0.040 0.000 0.176 0.000 0.684 0.100
#> SRR2105219 2 0.1616 0.73877 0.012 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020
#> SRR2105220 2 0.3254 0.74960 0.072 0.848 0.000 0.000 0.028 0.052
#> SRR2105221 2 0.6324 0.17178 0.092 0.464 0.000 0.000 0.372 0.072
#> SRR2105222 2 0.3716 0.72181 0.044 0.812 0.008 0.000 0.120 0.016
#> SRR2105223 3 0.3874 0.54636 0.060 0.000 0.816 0.004 0.056 0.064
#> SRR2105224 3 0.5101 0.52989 0.116 0.000 0.724 0.016 0.104 0.040
#> SRR2105217 2 0.5010 0.67036 0.108 0.716 0.000 0.132 0.004 0.040
#> SRR2105218 2 0.3053 0.73599 0.168 0.812 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105215 2 0.3834 0.72059 0.144 0.772 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105216 2 0.1819 0.73745 0.032 0.932 0.004 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105213 4 0.6872 0.23052 0.108 0.004 0.356 0.444 0.008 0.080
#> SRR2105214 3 0.6677 0.27422 0.172 0.000 0.560 0.136 0.008 0.124
#> SRR2105211 3 0.5635 0.11373 0.040 0.004 0.528 0.000 0.376 0.052
#> SRR2105212 3 0.6707 0.42781 0.120 0.000 0.528 0.000 0.160 0.192
#> SRR2105209 1 0.7865 0.12443 0.344 0.008 0.220 0.008 0.280 0.140
#> SRR2105210 3 0.6023 0.36723 0.284 0.000 0.560 0.012 0.120 0.024
#> SRR2105207 1 0.8525 0.13150 0.332 0.004 0.120 0.176 0.272 0.096
#> SRR2105208 1 0.7061 0.33726 0.520 0.004 0.088 0.256 0.100 0.032
#> SRR2105205 2 0.6453 0.13275 0.060 0.516 0.004 0.340 0.044 0.036
#> SRR2105206 4 0.6311 -0.10582 0.100 0.336 0.004 0.508 0.004 0.048
#> SRR2105201 2 0.5478 0.40465 0.008 0.600 0.048 0.000 0.304 0.040
#> SRR2105202 2 0.5900 0.13068 0.084 0.460 0.008 0.000 0.424 0.024
#> SRR2105203 2 0.2454 0.74845 0.088 0.884 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR2105204 2 0.2979 0.74331 0.116 0.840 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105199 2 0.3453 0.72886 0.164 0.792 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105200 2 0.5043 0.38729 0.424 0.520 0.000 0.000 0.032 0.024
#> SRR2105197 5 0.5151 0.59876 0.056 0.000 0.108 0.064 0.736 0.036
#> SRR2105198 5 0.5623 0.54697 0.100 0.004 0.064 0.056 0.712 0.064
#> SRR2105195 1 0.7333 0.12587 0.412 0.000 0.024 0.332 0.144 0.088
#> SRR2105196 1 0.7321 0.20199 0.440 0.004 0.048 0.340 0.080 0.088
#> SRR2105193 4 0.7591 -0.01153 0.252 0.004 0.308 0.340 0.012 0.084
#> SRR2105194 4 0.5516 0.23696 0.268 0.000 0.124 0.592 0.000 0.016
#> SRR2105191 5 0.5064 0.58170 0.040 0.000 0.216 0.000 0.676 0.068
#> SRR2105192 5 0.3651 0.58646 0.008 0.000 0.224 0.000 0.752 0.016
#> SRR2105189 2 0.7960 -0.28619 0.216 0.324 0.020 0.000 0.276 0.164
#> SRR2105190 2 0.5899 0.55455 0.152 0.632 0.000 0.000 0.112 0.104
#> SRR2105187 2 0.7472 -0.27803 0.016 0.396 0.000 0.284 0.212 0.092
#> SRR2105188 5 0.7054 -0.04262 0.024 0.164 0.000 0.080 0.512 0.220
#> SRR2105179 1 0.8546 0.17120 0.344 0.004 0.232 0.132 0.088 0.200
#> SRR2105180 5 0.7222 0.41256 0.072 0.004 0.148 0.216 0.520 0.040
#> SRR2105183 2 0.3652 0.71307 0.196 0.768 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105184 2 0.3281 0.70151 0.200 0.784 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105185 2 0.6816 0.00122 0.156 0.460 0.308 0.004 0.000 0.072
#> SRR2105186 2 0.6581 0.52268 0.188 0.596 0.016 0.068 0.012 0.120
#> SRR2105181 5 0.5034 0.58531 0.020 0.000 0.228 0.024 0.684 0.044
#> SRR2105182 5 0.5674 0.52881 0.056 0.000 0.268 0.000 0.600 0.076
#> SRR2105177 1 0.7178 0.21031 0.448 0.012 0.356 0.084 0.040 0.060
#> SRR2105178 1 0.6060 0.27372 0.548 0.004 0.088 0.320 0.016 0.024
#> SRR2105171 2 0.4545 0.65404 0.240 0.688 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR2105172 2 0.2306 0.74835 0.092 0.888 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105175 4 0.6967 0.20429 0.272 0.008 0.192 0.472 0.008 0.048
#> SRR2105176 4 0.5261 0.20448 0.304 0.000 0.076 0.600 0.000 0.020
#> SRR2105173 2 0.5453 0.61432 0.224 0.672 0.024 0.020 0.020 0.040
#> SRR2105174 2 0.1599 0.74075 0.028 0.940 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105169 2 0.2765 0.74820 0.132 0.848 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105170 2 0.1843 0.74087 0.060 0.924 0.004 0.004 0.004 0.004
#> SRR2105167 2 0.3017 0.73691 0.108 0.840 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105168 2 0.3366 0.74061 0.128 0.824 0.004 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105165 3 0.6632 -0.06895 0.040 0.000 0.432 0.400 0.028 0.100
#> SRR2105166 4 0.6637 0.21965 0.056 0.000 0.356 0.460 0.012 0.116
#> SRR2105163 4 0.6285 0.36507 0.052 0.000 0.228 0.592 0.024 0.104
#> SRR2105164 4 0.5335 0.42228 0.064 0.000 0.080 0.708 0.016 0.132
#> SRR2105161 3 0.6641 0.11214 0.256 0.004 0.504 0.188 0.004 0.044
#> SRR2105162 4 0.6231 -0.00838 0.344 0.000 0.156 0.476 0.012 0.012
#> SRR2105155 2 0.0964 0.72415 0.016 0.968 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105156 2 0.0951 0.72658 0.020 0.968 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105157 2 0.1850 0.73955 0.052 0.924 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR2105158 2 0.3301 0.68268 0.024 0.788 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR2105159 4 0.7969 0.24589 0.204 0.004 0.240 0.408 0.052 0.092
#> SRR2105160 4 0.7186 0.02030 0.372 0.004 0.140 0.396 0.016 0.072
#> SRR2105153 2 0.4029 0.70817 0.052 0.784 0.000 0.132 0.000 0.032
#> SRR2105154 2 0.4532 0.42245 0.032 0.620 0.000 0.340 0.008 0.000
#> SRR2105151 2 0.2595 0.74809 0.044 0.888 0.004 0.000 0.008 0.056
#> SRR2105152 2 0.2673 0.74384 0.132 0.852 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105149 5 0.7429 0.22086 0.220 0.004 0.096 0.016 0.456 0.208
#> SRR2105150 5 0.7794 0.18420 0.236 0.016 0.080 0.032 0.444 0.192
#> SRR2105147 4 0.6376 0.16723 0.008 0.000 0.040 0.532 0.152 0.268
#> SRR2105148 4 0.6352 0.15913 0.008 0.000 0.032 0.524 0.164 0.272
#> SRR2105143 1 0.6959 0.34407 0.528 0.020 0.288 0.068 0.040 0.056
#> SRR2105144 1 0.6358 0.26959 0.640 0.064 0.108 0.000 0.068 0.120
#> SRR2105145 3 0.6752 -0.09144 0.144 0.000 0.416 0.372 0.004 0.064
#> SRR2105146 3 0.5747 -0.01874 0.072 0.000 0.472 0.424 0.004 0.028
#> SRR2105141 4 0.3451 0.38791 0.052 0.076 0.004 0.840 0.000 0.028
#> SRR2105142 2 0.7219 0.02972 0.104 0.472 0.008 0.284 0.012 0.120
#> SRR2105139 2 0.1578 0.73643 0.048 0.936 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105140 2 0.2547 0.74714 0.112 0.868 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105137 2 0.4941 0.61894 0.016 0.720 0.112 0.000 0.136 0.016
#> SRR2105138 2 0.3913 0.73247 0.032 0.824 0.024 0.008 0.088 0.024
#> SRR2105135 2 0.6065 0.46032 0.208 0.588 0.144 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105136 2 0.2581 0.74347 0.120 0.860 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105133 5 0.3168 0.59328 0.000 0.000 0.192 0.000 0.792 0.016
#> SRR2105134 5 0.3081 0.58458 0.000 0.000 0.220 0.000 0.776 0.004
#> SRR2105131 5 0.7064 0.31526 0.064 0.180 0.124 0.000 0.556 0.076
#> SRR2105132 5 0.5375 0.58112 0.052 0.084 0.132 0.000 0.708 0.024
#> SRR2105129 3 0.6328 0.05653 0.360 0.004 0.504 0.072 0.024 0.036
#> SRR2105130 1 0.6721 0.31514 0.448 0.004 0.336 0.172 0.012 0.028
#> SRR2105127 3 0.7014 0.32597 0.208 0.040 0.516 0.000 0.188 0.048
#> SRR2105128 3 0.7917 -0.03774 0.292 0.060 0.380 0.000 0.180 0.088
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.02040 0.730 0.816 0.268 0.915 0.915
#> 3 3 0.00427 0.650 0.766 0.316 0.949 0.944
#> 4 4 0.01103 0.626 0.735 0.161 0.970 0.965
#> 5 5 0.03981 0.440 0.669 0.202 0.974 0.970
#> 6 6 0.06053 0.432 0.632 0.111 0.929 0.916
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 2 0.722 0.77743 0.200 0.800
#> SRR2105278 2 0.802 0.71407 0.244 0.756
#> SRR2105275 2 0.827 0.69872 0.260 0.740
#> SRR2105276 2 0.706 0.80959 0.192 0.808
#> SRR2105273 2 0.662 0.81628 0.172 0.828
#> SRR2105274 2 0.653 0.81737 0.168 0.832
#> SRR2105271 2 0.730 0.80392 0.204 0.796
#> SRR2105272 2 0.850 0.66975 0.276 0.724
#> SRR2105269 2 0.358 0.80558 0.068 0.932
#> SRR2105270 2 0.373 0.81902 0.072 0.928
#> SRR2105267 2 0.327 0.80529 0.060 0.940
#> SRR2105268 2 0.295 0.81034 0.052 0.948
#> SRR2105265 2 0.373 0.81582 0.072 0.928
#> SRR2105266 2 0.373 0.82053 0.072 0.928
#> SRR2105263 2 0.958 0.37032 0.380 0.620
#> SRR2105264 2 0.821 0.72322 0.256 0.744
#> SRR2105261 2 0.574 0.82961 0.136 0.864
#> SRR2105262 2 0.506 0.82375 0.112 0.888
#> SRR2105357 2 0.430 0.82294 0.088 0.912
#> SRR2105358 2 0.738 0.77459 0.208 0.792
#> SRR2105439 2 0.802 0.74780 0.244 0.756
#> SRR2105440 2 0.634 0.82439 0.160 0.840
#> SRR2105509 2 0.416 0.80500 0.084 0.916
#> SRR2105510 2 0.402 0.81213 0.080 0.920
#> SRR2105507 2 0.753 0.76570 0.216 0.784
#> SRR2105508 2 0.563 0.82782 0.132 0.868
#> SRR2105505 2 0.767 0.75643 0.224 0.776
#> SRR2105506 2 0.839 0.67470 0.268 0.732
#> SRR2105503 2 0.552 0.82550 0.128 0.872
#> SRR2105504 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105501 2 0.416 0.81255 0.084 0.916
#> SRR2105502 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105499 2 0.781 0.76198 0.232 0.768
#> SRR2105500 2 0.662 0.81165 0.172 0.828
#> SRR2105497 2 0.662 0.81684 0.172 0.828
#> SRR2105498 2 0.634 0.81667 0.160 0.840
#> SRR2105495 2 0.402 0.82035 0.080 0.920
#> SRR2105496 2 0.506 0.82969 0.112 0.888
#> SRR2105493 2 0.402 0.81807 0.080 0.920
#> SRR2105494 2 0.402 0.81987 0.080 0.920
#> SRR2105491 2 0.808 0.71918 0.248 0.752
#> SRR2105492 2 0.788 0.72814 0.236 0.764
#> SRR2105489 2 0.745 0.76436 0.212 0.788
#> SRR2105490 2 0.506 0.82538 0.112 0.888
#> SRR2105487 2 0.891 0.55464 0.308 0.692
#> SRR2105488 2 0.814 0.71043 0.252 0.748
#> SRR2105485 2 0.552 0.82768 0.128 0.872
#> SRR2105486 2 0.595 0.81891 0.144 0.856
#> SRR2105483 1 0.904 0.80479 0.680 0.320
#> SRR2105484 1 0.886 0.79386 0.696 0.304
#> SRR2105481 2 0.900 0.55547 0.316 0.684
#> SRR2105482 2 0.753 0.76368 0.216 0.784
#> SRR2105479 2 0.895 0.63289 0.312 0.688
#> SRR2105480 2 0.775 0.76042 0.228 0.772
#> SRR2105477 2 0.697 0.79413 0.188 0.812
#> SRR2105478 2 0.653 0.81258 0.168 0.832
#> SRR2105475 2 0.402 0.81336 0.080 0.920
#> SRR2105476 2 0.443 0.81846 0.092 0.908
#> SRR2105473 2 0.584 0.82234 0.140 0.860
#> SRR2105474 2 0.469 0.82785 0.100 0.900
#> SRR2105471 2 0.921 0.42440 0.336 0.664
#> SRR2105472 2 0.821 0.66948 0.256 0.744
#> SRR2105469 2 0.506 0.82381 0.112 0.888
#> SRR2105470 2 0.625 0.82045 0.156 0.844
#> SRR2105467 2 0.781 0.76408 0.232 0.768
#> SRR2105468 2 0.760 0.74793 0.220 0.780
#> SRR2105465 2 0.917 0.45400 0.332 0.668
#> SRR2105466 2 0.775 0.75371 0.228 0.772
#> SRR2105463 2 0.963 0.14460 0.388 0.612
#> SRR2105464 2 0.998 -0.31059 0.472 0.528
#> SRR2105461 2 0.402 0.80854 0.080 0.920
#> SRR2105462 2 0.327 0.81119 0.060 0.940
#> SRR2105459 2 0.430 0.81685 0.088 0.912
#> SRR2105460 2 0.343 0.81161 0.064 0.936
#> SRR2105457 2 0.430 0.82286 0.088 0.912
#> SRR2105458 2 0.494 0.82183 0.108 0.892
#> SRR2105455 2 0.402 0.82388 0.080 0.920
#> SRR2105456 2 0.443 0.82385 0.092 0.908
#> SRR2105453 2 0.833 0.65086 0.264 0.736
#> SRR2105454 2 0.917 0.47293 0.332 0.668
#> SRR2105451 2 0.416 0.81962 0.084 0.916
#> SRR2105452 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105449 2 0.671 0.78961 0.176 0.824
#> SRR2105450 2 0.814 0.74231 0.252 0.748
#> SRR2105447 2 0.311 0.80565 0.056 0.944
#> SRR2105448 2 0.416 0.82182 0.084 0.916
#> SRR2105445 2 0.373 0.82130 0.072 0.928
#> SRR2105446 2 0.469 0.82474 0.100 0.900
#> SRR2105443 2 0.456 0.82172 0.096 0.904
#> SRR2105444 2 0.388 0.82473 0.076 0.924
#> SRR2105441 2 0.563 0.82700 0.132 0.868
#> SRR2105442 2 0.563 0.82955 0.132 0.868
#> SRR2105437 1 0.943 0.80266 0.640 0.360
#> SRR2105438 1 0.943 0.80001 0.640 0.360
#> SRR2105435 2 0.781 0.74814 0.232 0.768
#> SRR2105436 2 0.494 0.82610 0.108 0.892
#> SRR2105433 1 1.000 0.50507 0.504 0.496
#> SRR2105434 2 0.795 0.72607 0.240 0.760
#> SRR2105431 1 0.978 0.73698 0.588 0.412
#> SRR2105432 1 0.997 0.61200 0.532 0.468
#> SRR2105429 2 0.871 0.62456 0.292 0.708
#> SRR2105430 2 0.563 0.82743 0.132 0.868
#> SRR2105427 2 0.358 0.81116 0.068 0.932
#> SRR2105428 2 0.416 0.82270 0.084 0.916
#> SRR2105425 2 0.595 0.81573 0.144 0.856
#> SRR2105426 2 0.541 0.82959 0.124 0.876
#> SRR2105421 2 0.430 0.81607 0.088 0.912
#> SRR2105422 2 0.482 0.82478 0.104 0.896
#> SRR2105423 2 0.456 0.82145 0.096 0.904
#> SRR2105424 2 0.456 0.82777 0.096 0.904
#> SRR2105419 2 0.529 0.82891 0.120 0.880
#> SRR2105420 2 0.358 0.81403 0.068 0.932
#> SRR2105415 2 0.981 -0.01173 0.420 0.580
#> SRR2105416 2 0.987 -0.00021 0.432 0.568
#> SRR2105417 2 0.963 0.16025 0.388 0.612
#> SRR2105418 2 0.943 0.40597 0.360 0.640
#> SRR2105413 2 0.388 0.80215 0.076 0.924
#> SRR2105414 2 0.388 0.81743 0.076 0.924
#> SRR2105409 2 0.722 0.78053 0.200 0.800
#> SRR2105410 2 0.827 0.69732 0.260 0.740
#> SRR2105411 2 0.343 0.81181 0.064 0.936
#> SRR2105412 2 0.506 0.82721 0.112 0.888
#> SRR2105407 2 0.443 0.82369 0.092 0.908
#> SRR2105408 2 0.563 0.82672 0.132 0.868
#> SRR2105403 2 0.689 0.81624 0.184 0.816
#> SRR2105404 2 0.644 0.80006 0.164 0.836
#> SRR2105405 2 0.416 0.82266 0.084 0.916
#> SRR2105406 2 0.634 0.81143 0.160 0.840
#> SRR2105401 2 0.402 0.81330 0.080 0.920
#> SRR2105402 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105399 2 0.402 0.81733 0.080 0.920
#> SRR2105400 2 0.373 0.81299 0.072 0.928
#> SRR2105397 2 0.469 0.82293 0.100 0.900
#> SRR2105398 2 0.494 0.82359 0.108 0.892
#> SRR2105395 2 0.706 0.80523 0.192 0.808
#> SRR2105396 2 0.605 0.82400 0.148 0.852
#> SRR2105393 2 0.494 0.82894 0.108 0.892
#> SRR2105394 2 0.482 0.82557 0.104 0.896
#> SRR2105389 2 0.605 0.82713 0.148 0.852
#> SRR2105390 2 0.625 0.82009 0.156 0.844
#> SRR2105391 2 0.443 0.82132 0.092 0.908
#> SRR2105392 2 0.574 0.82758 0.136 0.864
#> SRR2105385 2 0.795 0.76621 0.240 0.760
#> SRR2105386 2 0.469 0.82973 0.100 0.900
#> SRR2105387 2 0.506 0.82989 0.112 0.888
#> SRR2105388 2 0.518 0.82480 0.116 0.884
#> SRR2105381 2 0.416 0.81927 0.084 0.916
#> SRR2105382 2 0.506 0.82481 0.112 0.888
#> SRR2105383 2 0.327 0.82169 0.060 0.940
#> SRR2105384 2 0.430 0.82007 0.088 0.912
#> SRR2105379 2 0.456 0.81560 0.096 0.904
#> SRR2105380 2 0.552 0.82511 0.128 0.872
#> SRR2105377 2 0.722 0.78870 0.200 0.800
#> SRR2105378 2 0.722 0.78234 0.200 0.800
#> SRR2105375 2 0.605 0.82149 0.148 0.852
#> SRR2105376 2 0.714 0.78812 0.196 0.804
#> SRR2105373 2 0.808 0.72961 0.248 0.752
#> SRR2105374 1 0.983 0.71833 0.576 0.424
#> SRR2105371 2 0.402 0.82278 0.080 0.920
#> SRR2105372 2 0.443 0.82496 0.092 0.908
#> SRR2105369 2 0.482 0.82216 0.104 0.896
#> SRR2105370 2 0.529 0.82742 0.120 0.880
#> SRR2105367 2 0.781 0.72602 0.232 0.768
#> SRR2105368 2 0.921 0.44128 0.336 0.664
#> SRR2105365 2 0.821 0.70614 0.256 0.744
#> SRR2105366 2 0.781 0.75630 0.232 0.768
#> SRR2105363 2 0.494 0.82441 0.108 0.892
#> SRR2105364 2 0.388 0.82754 0.076 0.924
#> SRR2105361 2 0.494 0.82280 0.108 0.892
#> SRR2105362 2 0.482 0.83013 0.104 0.896
#> SRR2105359 2 0.469 0.82734 0.100 0.900
#> SRR2105360 2 0.518 0.82757 0.116 0.884
#> SRR2105355 2 0.518 0.82783 0.116 0.884
#> SRR2105356 2 0.615 0.82052 0.152 0.848
#> SRR2105353 2 0.680 0.80754 0.180 0.820
#> SRR2105354 2 0.706 0.81526 0.192 0.808
#> SRR2105351 2 0.605 0.82521 0.148 0.852
#> SRR2105352 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105349 2 0.494 0.82098 0.108 0.892
#> SRR2105350 2 0.402 0.82294 0.080 0.920
#> SRR2105345 2 0.552 0.82744 0.128 0.872
#> SRR2105346 2 0.443 0.82693 0.092 0.908
#> SRR2105347 2 0.767 0.75033 0.224 0.776
#> SRR2105348 2 0.625 0.80270 0.156 0.844
#> SRR2105343 2 0.327 0.80545 0.060 0.940
#> SRR2105344 2 0.443 0.82488 0.092 0.908
#> SRR2105341 2 0.689 0.79467 0.184 0.816
#> SRR2105342 2 0.482 0.82538 0.104 0.896
#> SRR2105339 2 0.529 0.82900 0.120 0.880
#> SRR2105340 2 0.625 0.82252 0.156 0.844
#> SRR2105335 2 0.925 0.40373 0.340 0.660
#> SRR2105336 2 0.913 0.50353 0.328 0.672
#> SRR2105337 2 0.653 0.81505 0.168 0.832
#> SRR2105338 2 0.738 0.79224 0.208 0.792
#> SRR2105331 2 0.795 0.71437 0.240 0.760
#> SRR2105332 2 0.767 0.75428 0.224 0.776
#> SRR2105333 2 0.430 0.81944 0.088 0.912
#> SRR2105334 2 0.343 0.82028 0.064 0.936
#> SRR2105329 2 0.482 0.82325 0.104 0.896
#> SRR2105330 2 0.494 0.82692 0.108 0.892
#> SRR2105327 2 0.343 0.81557 0.064 0.936
#> SRR2105328 2 0.416 0.82559 0.084 0.916
#> SRR2105325 2 0.891 0.62802 0.308 0.692
#> SRR2105326 2 0.900 0.62591 0.316 0.684
#> SRR2105323 2 0.541 0.82503 0.124 0.876
#> SRR2105324 2 0.482 0.82751 0.104 0.896
#> SRR2105319 2 0.961 0.31572 0.384 0.616
#> SRR2105320 2 0.975 0.14117 0.408 0.592
#> SRR2105321 2 0.827 0.70895 0.260 0.740
#> SRR2105322 2 0.839 0.67346 0.268 0.732
#> SRR2105317 2 0.373 0.79979 0.072 0.928
#> SRR2105318 2 0.388 0.81910 0.076 0.924
#> SRR2105315 2 0.388 0.81177 0.076 0.924
#> SRR2105316 2 0.327 0.81499 0.060 0.940
#> SRR2105313 2 0.358 0.81023 0.068 0.932
#> SRR2105314 2 0.416 0.82099 0.084 0.916
#> SRR2105311 2 0.839 0.71460 0.268 0.732
#> SRR2105312 2 0.821 0.72377 0.256 0.744
#> SRR2105307 2 0.939 0.33237 0.356 0.644
#> SRR2105308 2 0.595 0.82090 0.144 0.856
#> SRR2105309 2 0.416 0.80942 0.084 0.916
#> SRR2105310 2 0.469 0.82236 0.100 0.900
#> SRR2105305 2 0.552 0.82569 0.128 0.872
#> SRR2105306 2 0.416 0.82236 0.084 0.916
#> SRR2105303 2 0.430 0.82022 0.088 0.912
#> SRR2105304 2 0.343 0.78809 0.064 0.936
#> SRR2105301 2 0.706 0.80659 0.192 0.808
#> SRR2105302 2 0.443 0.82357 0.092 0.908
#> SRR2105299 2 0.662 0.81591 0.172 0.828
#> SRR2105300 2 0.443 0.82779 0.092 0.908
#> SRR2105297 1 0.969 0.77715 0.604 0.396
#> SRR2105298 1 0.891 0.79891 0.692 0.308
#> SRR2105295 2 0.416 0.80835 0.084 0.916
#> SRR2105296 2 0.552 0.82737 0.128 0.872
#> SRR2105293 2 0.689 0.79706 0.184 0.816
#> SRR2105294 2 0.788 0.76222 0.236 0.764
#> SRR2105291 2 0.552 0.81003 0.128 0.872
#> SRR2105292 2 0.855 0.67636 0.280 0.720
#> SRR2105289 2 0.563 0.82733 0.132 0.868
#> SRR2105290 2 0.653 0.80530 0.168 0.832
#> SRR2105287 2 0.958 0.16956 0.380 0.620
#> SRR2105288 2 0.802 0.70645 0.244 0.756
#> SRR2105285 2 0.456 0.82810 0.096 0.904
#> SRR2105286 2 0.430 0.82621 0.088 0.912
#> SRR2105283 2 0.689 0.79555 0.184 0.816
#> SRR2105284 2 0.605 0.82671 0.148 0.852
#> SRR2105281 2 0.494 0.82789 0.108 0.892
#> SRR2105282 2 0.430 0.82248 0.088 0.912
#> SRR2105259 2 0.373 0.81835 0.072 0.928
#> SRR2105260 2 0.529 0.82938 0.120 0.880
#> SRR2105279 2 0.529 0.82359 0.120 0.880
#> SRR2105280 2 0.443 0.82501 0.092 0.908
#> SRR2105257 2 0.943 0.39115 0.360 0.640
#> SRR2105258 2 0.969 0.15402 0.396 0.604
#> SRR2105253 2 0.494 0.82607 0.108 0.892
#> SRR2105254 2 0.416 0.81527 0.084 0.916
#> SRR2105255 2 0.456 0.82468 0.096 0.904
#> SRR2105256 2 0.689 0.80872 0.184 0.816
#> SRR2105251 2 0.714 0.77289 0.196 0.804
#> SRR2105252 2 0.680 0.80326 0.180 0.820
#> SRR2105249 2 0.469 0.82265 0.100 0.900
#> SRR2105250 2 0.552 0.82239 0.128 0.872
#> SRR2105247 2 0.494 0.82486 0.108 0.892
#> SRR2105248 2 0.775 0.76982 0.228 0.772
#> SRR2105245 2 0.753 0.76197 0.216 0.784
#> SRR2105246 2 0.605 0.82990 0.148 0.852
#> SRR2105243 2 0.430 0.82622 0.088 0.912
#> SRR2105244 2 0.753 0.77772 0.216 0.784
#> SRR2105241 2 0.697 0.81110 0.188 0.812
#> SRR2105242 2 0.839 0.70777 0.268 0.732
#> SRR2105239 2 0.833 0.55547 0.264 0.736
#> SRR2105240 2 0.904 0.55417 0.320 0.680
#> SRR2105237 2 0.469 0.82166 0.100 0.900
#> SRR2105238 2 0.482 0.82280 0.104 0.896
#> SRR2105235 2 0.443 0.82641 0.092 0.908
#> SRR2105236 2 0.494 0.82791 0.108 0.892
#> SRR2105233 2 0.430 0.81356 0.088 0.912
#> SRR2105234 2 0.358 0.80641 0.068 0.932
#> SRR2105231 2 0.615 0.82217 0.152 0.848
#> SRR2105232 2 0.518 0.82815 0.116 0.884
#> SRR2105227 2 0.605 0.82364 0.148 0.852
#> SRR2105228 2 0.482 0.82882 0.104 0.896
#> SRR2105225 2 0.653 0.80352 0.168 0.832
#> SRR2105226 2 0.671 0.79707 0.176 0.824
#> SRR2105229 2 0.563 0.82785 0.132 0.868
#> SRR2105230 2 0.552 0.82365 0.128 0.872
#> SRR2105219 2 0.767 0.68837 0.224 0.776
#> SRR2105220 2 0.541 0.82971 0.124 0.876
#> SRR2105221 2 0.881 0.51925 0.300 0.700
#> SRR2105222 2 0.876 0.62050 0.296 0.704
#> SRR2105223 2 0.767 0.76794 0.224 0.776
#> SRR2105224 2 0.760 0.76305 0.220 0.780
#> SRR2105217 2 0.955 0.20497 0.376 0.624
#> SRR2105218 2 0.653 0.81713 0.168 0.832
#> SRR2105215 2 0.814 0.60676 0.252 0.748
#> SRR2105216 2 0.373 0.81921 0.072 0.928
#> SRR2105213 2 0.886 0.49767 0.304 0.696
#> SRR2105214 2 0.430 0.82714 0.088 0.912
#> SRR2105211 2 0.946 0.32131 0.364 0.636
#> SRR2105212 2 0.456 0.82577 0.096 0.904
#> SRR2105209 2 0.844 0.63921 0.272 0.728
#> SRR2105210 2 0.814 0.72849 0.252 0.748
#> SRR2105207 1 0.988 0.65842 0.564 0.436
#> SRR2105208 2 0.871 0.62793 0.292 0.708
#> SRR2105205 2 0.921 0.37808 0.336 0.664
#> SRR2105206 2 0.821 0.73675 0.256 0.744
#> SRR2105201 2 0.814 0.65000 0.252 0.748
#> SRR2105202 2 0.671 0.79612 0.176 0.824
#> SRR2105203 2 0.563 0.81738 0.132 0.868
#> SRR2105204 2 0.358 0.82115 0.068 0.932
#> SRR2105199 2 0.767 0.71435 0.224 0.776
#> SRR2105200 2 0.753 0.76858 0.216 0.784
#> SRR2105197 2 0.895 0.48882 0.312 0.688
#> SRR2105198 2 0.925 0.37238 0.340 0.660
#> SRR2105195 2 0.949 0.24884 0.368 0.632
#> SRR2105196 2 0.850 0.70161 0.276 0.724
#> SRR2105193 1 0.969 0.73272 0.604 0.396
#> SRR2105194 2 0.983 -0.05434 0.424 0.576
#> SRR2105191 2 0.871 0.46129 0.292 0.708
#> SRR2105192 2 0.999 -0.43040 0.480 0.520
#> SRR2105189 2 0.714 0.73965 0.196 0.804
#> SRR2105190 2 0.430 0.82591 0.088 0.912
#> SRR2105187 2 0.932 0.31430 0.348 0.652
#> SRR2105188 2 0.909 0.58633 0.324 0.676
#> SRR2105179 2 0.973 0.07982 0.404 0.596
#> SRR2105180 2 0.988 -0.11948 0.436 0.564
#> SRR2105183 2 0.662 0.80025 0.172 0.828
#> SRR2105184 2 0.644 0.81174 0.164 0.836
#> SRR2105185 2 0.714 0.76711 0.196 0.804
#> SRR2105186 2 0.689 0.80161 0.184 0.816
#> SRR2105181 2 0.866 0.58003 0.288 0.712
#> SRR2105182 2 0.714 0.79343 0.196 0.804
#> SRR2105177 1 0.973 0.67275 0.596 0.404
#> SRR2105178 1 0.871 0.78170 0.708 0.292
#> SRR2105171 2 0.518 0.82763 0.116 0.884
#> SRR2105172 2 0.494 0.82747 0.108 0.892
#> SRR2105175 1 0.983 0.71506 0.576 0.424
#> SRR2105176 1 0.913 0.80767 0.672 0.328
#> SRR2105173 2 0.653 0.79975 0.168 0.832
#> SRR2105174 2 0.518 0.82666 0.116 0.884
#> SRR2105169 2 0.625 0.82560 0.156 0.844
#> SRR2105170 2 0.795 0.72974 0.240 0.760
#> SRR2105167 2 0.430 0.82469 0.088 0.912
#> SRR2105168 2 0.518 0.82351 0.116 0.884
#> SRR2105165 2 0.855 0.67284 0.280 0.720
#> SRR2105166 2 0.871 0.67432 0.292 0.708
#> SRR2105163 2 0.795 0.77076 0.240 0.760
#> SRR2105164 2 0.781 0.76143 0.232 0.768
#> SRR2105161 2 0.987 -0.01683 0.432 0.568
#> SRR2105162 2 0.921 0.47839 0.336 0.664
#> SRR2105155 2 0.506 0.82648 0.112 0.888
#> SRR2105156 2 0.373 0.82530 0.072 0.928
#> SRR2105157 2 0.730 0.77936 0.204 0.796
#> SRR2105158 2 0.730 0.77365 0.204 0.796
#> SRR2105159 2 0.946 0.24267 0.364 0.636
#> SRR2105160 2 0.808 0.74757 0.248 0.752
#> SRR2105153 2 0.518 0.82497 0.116 0.884
#> SRR2105154 2 0.625 0.81481 0.156 0.844
#> SRR2105151 2 0.706 0.79482 0.192 0.808
#> SRR2105152 2 0.402 0.82322 0.080 0.920
#> SRR2105149 2 0.605 0.82110 0.148 0.852
#> SRR2105150 2 0.541 0.82314 0.124 0.876
#> SRR2105147 2 0.327 0.79374 0.060 0.940
#> SRR2105148 2 0.327 0.79374 0.060 0.940
#> SRR2105143 2 0.855 0.65001 0.280 0.720
#> SRR2105144 2 0.541 0.81830 0.124 0.876
#> SRR2105145 2 0.999 -0.36531 0.480 0.520
#> SRR2105146 2 0.917 0.55820 0.332 0.668
#> SRR2105141 2 0.689 0.80531 0.184 0.816
#> SRR2105142 2 0.605 0.81324 0.148 0.852
#> SRR2105139 2 0.416 0.82509 0.084 0.916
#> SRR2105140 2 0.482 0.82922 0.104 0.896
#> SRR2105137 2 0.494 0.81909 0.108 0.892
#> SRR2105138 2 0.767 0.75046 0.224 0.776
#> SRR2105135 2 0.388 0.82301 0.076 0.924
#> SRR2105136 2 0.443 0.82180 0.092 0.908
#> SRR2105133 2 0.615 0.81751 0.152 0.848
#> SRR2105134 2 0.662 0.80459 0.172 0.828
#> SRR2105131 2 0.680 0.80936 0.180 0.820
#> SRR2105132 2 0.795 0.72173 0.240 0.760
#> SRR2105129 2 0.999 -0.44224 0.480 0.520
#> SRR2105130 1 0.943 0.80255 0.640 0.360
#> SRR2105127 2 0.886 0.56329 0.304 0.696
#> SRR2105128 2 0.689 0.78779 0.184 0.816
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 2 0.618 0.71066 0.260 0.716 0.024
#> SRR2105278 2 0.718 0.60599 0.304 0.648 0.048
#> SRR2105275 2 0.675 0.54884 0.336 0.640 0.024
#> SRR2105276 2 0.590 0.73311 0.232 0.744 0.024
#> SRR2105273 2 0.630 0.75386 0.192 0.752 0.056
#> SRR2105274 2 0.541 0.77537 0.200 0.780 0.020
#> SRR2105271 2 0.586 0.74482 0.228 0.748 0.024
#> SRR2105272 2 0.718 0.56339 0.304 0.648 0.048
#> SRR2105269 2 0.300 0.77418 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105270 2 0.333 0.78529 0.076 0.904 0.020
#> SRR2105267 2 0.280 0.77368 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105268 2 0.300 0.77381 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105265 2 0.338 0.78377 0.092 0.896 0.012
#> SRR2105266 2 0.327 0.78910 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105263 2 0.757 -0.03571 0.456 0.504 0.040
#> SRR2105264 2 0.687 0.65111 0.276 0.680 0.044
#> SRR2105261 2 0.454 0.79598 0.148 0.836 0.016
#> SRR2105262 2 0.454 0.79235 0.148 0.836 0.016
#> SRR2105357 2 0.383 0.79230 0.124 0.868 0.008
#> SRR2105358 2 0.599 0.71429 0.284 0.704 0.012
#> SRR2105439 2 0.726 0.65957 0.224 0.692 0.084
#> SRR2105440 2 0.563 0.77112 0.188 0.780 0.032
#> SRR2105509 2 0.295 0.76812 0.060 0.920 0.020
#> SRR2105510 2 0.286 0.77756 0.084 0.912 0.004
#> SRR2105507 2 0.774 0.60302 0.204 0.672 0.124
#> SRR2105508 2 0.512 0.79363 0.160 0.812 0.028
#> SRR2105505 2 0.645 0.68283 0.252 0.712 0.036
#> SRR2105506 2 0.689 0.56098 0.340 0.632 0.028
#> SRR2105503 2 0.499 0.79227 0.144 0.824 0.032
#> SRR2105504 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105501 2 0.327 0.78150 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105502 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105499 2 0.670 0.67810 0.268 0.692 0.040
#> SRR2105500 2 0.544 0.77330 0.192 0.784 0.024
#> SRR2105497 2 0.587 0.76599 0.160 0.784 0.056
#> SRR2105498 2 0.571 0.75649 0.204 0.768 0.028
#> SRR2105495 2 0.350 0.78920 0.084 0.896 0.020
#> SRR2105496 2 0.414 0.79700 0.116 0.864 0.020
#> SRR2105493 2 0.377 0.79477 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105494 2 0.338 0.78391 0.092 0.896 0.012
#> SRR2105491 2 0.714 0.52210 0.312 0.644 0.044
#> SRR2105492 2 0.694 0.55572 0.312 0.652 0.036
#> SRR2105489 2 0.641 0.69635 0.248 0.716 0.036
#> SRR2105490 2 0.447 0.79334 0.164 0.828 0.008
#> SRR2105487 2 0.764 0.40744 0.336 0.604 0.060
#> SRR2105488 2 0.701 0.61268 0.308 0.652 0.040
#> SRR2105485 2 0.474 0.79311 0.152 0.828 0.020
#> SRR2105486 2 0.501 0.78447 0.180 0.804 0.016
#> SRR2105483 1 0.639 0.17904 0.764 0.148 0.088
#> SRR2105484 1 0.595 0.02946 0.792 0.116 0.092
#> SRR2105481 2 0.735 0.39221 0.368 0.592 0.040
#> SRR2105482 2 0.626 0.72494 0.244 0.724 0.032
#> SRR2105479 2 0.697 0.51384 0.356 0.616 0.028
#> SRR2105480 2 0.631 0.64598 0.308 0.676 0.016
#> SRR2105477 2 0.615 0.72191 0.244 0.728 0.028
#> SRR2105478 2 0.568 0.75793 0.212 0.764 0.024
#> SRR2105475 2 0.280 0.77662 0.060 0.924 0.016
#> SRR2105476 2 0.321 0.78374 0.084 0.904 0.012
#> SRR2105473 2 0.569 0.77242 0.184 0.780 0.036
#> SRR2105474 2 0.442 0.79660 0.132 0.848 0.020
#> SRR2105471 2 0.818 0.02730 0.392 0.532 0.076
#> SRR2105472 2 0.745 0.55412 0.292 0.644 0.064
#> SRR2105469 2 0.406 0.79340 0.128 0.860 0.012
#> SRR2105470 2 0.501 0.78772 0.180 0.804 0.016
#> SRR2105467 2 0.670 0.69213 0.280 0.684 0.036
#> SRR2105468 2 0.613 0.69521 0.284 0.700 0.016
#> SRR2105465 2 0.800 0.21171 0.360 0.568 0.072
#> SRR2105466 2 0.602 0.68661 0.288 0.700 0.012
#> SRR2105463 2 0.820 -0.29349 0.444 0.484 0.072
#> SRR2105464 1 0.808 0.47850 0.520 0.412 0.068
#> SRR2105461 2 0.290 0.77487 0.064 0.920 0.016
#> SRR2105462 2 0.329 0.78223 0.088 0.900 0.012
#> SRR2105459 2 0.343 0.78120 0.064 0.904 0.032
#> SRR2105460 2 0.285 0.77550 0.056 0.924 0.020
#> SRR2105457 2 0.416 0.79317 0.144 0.848 0.008
#> SRR2105458 2 0.355 0.78553 0.132 0.868 0.000
#> SRR2105455 2 0.321 0.78797 0.092 0.900 0.008
#> SRR2105456 2 0.357 0.79131 0.120 0.876 0.004
#> SRR2105453 2 0.754 0.47431 0.304 0.632 0.064
#> SRR2105454 2 0.770 0.14002 0.420 0.532 0.048
#> SRR2105451 2 0.336 0.78941 0.084 0.900 0.016
#> SRR2105452 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105449 2 0.590 0.73277 0.232 0.744 0.024
#> SRR2105450 2 0.611 0.66435 0.300 0.688 0.012
#> SRR2105447 2 0.285 0.77433 0.056 0.924 0.020
#> SRR2105448 2 0.350 0.78826 0.084 0.896 0.020
#> SRR2105445 2 0.336 0.78792 0.084 0.900 0.016
#> SRR2105446 2 0.375 0.79385 0.120 0.872 0.008
#> SRR2105443 2 0.354 0.78955 0.100 0.888 0.012
#> SRR2105444 2 0.377 0.79044 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105441 2 0.480 0.78907 0.156 0.824 0.020
#> SRR2105442 2 0.478 0.79097 0.164 0.820 0.016
#> SRR2105437 1 0.698 0.38450 0.708 0.220 0.072
#> SRR2105438 1 0.687 0.35024 0.724 0.196 0.080
#> SRR2105435 2 0.636 0.69021 0.280 0.696 0.024
#> SRR2105436 2 0.460 0.79028 0.152 0.832 0.016
#> SRR2105433 1 0.776 0.57177 0.564 0.380 0.056
#> SRR2105434 2 0.706 0.59838 0.300 0.656 0.044
#> SRR2105431 1 0.745 0.51399 0.652 0.280 0.068
#> SRR2105432 1 0.794 0.55779 0.592 0.332 0.076
#> SRR2105429 2 0.691 0.53388 0.324 0.644 0.032
#> SRR2105430 2 0.524 0.78937 0.168 0.804 0.028
#> SRR2105427 2 0.296 0.77628 0.080 0.912 0.008
#> SRR2105428 2 0.361 0.78964 0.096 0.888 0.016
#> SRR2105425 2 0.455 0.78053 0.140 0.840 0.020
#> SRR2105426 2 0.448 0.79614 0.128 0.848 0.024
#> SRR2105421 2 0.303 0.78953 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105422 2 0.385 0.79146 0.136 0.860 0.004
#> SRR2105423 2 0.407 0.79213 0.120 0.864 0.016
#> SRR2105424 2 0.385 0.79193 0.108 0.876 0.016
#> SRR2105419 2 0.433 0.79670 0.144 0.844 0.012
#> SRR2105420 2 0.367 0.78882 0.092 0.888 0.020
#> SRR2105415 2 0.834 -0.35236 0.460 0.460 0.080
#> SRR2105416 1 0.783 0.27133 0.496 0.452 0.052
#> SRR2105417 2 0.817 -0.18431 0.420 0.508 0.072
#> SRR2105418 2 0.782 0.01103 0.444 0.504 0.052
#> SRR2105413 2 0.287 0.77133 0.076 0.916 0.008
#> SRR2105414 2 0.280 0.77820 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105409 2 0.655 0.69754 0.240 0.716 0.044
#> SRR2105410 2 0.733 0.50428 0.344 0.612 0.044
#> SRR2105411 2 0.313 0.77882 0.088 0.904 0.008
#> SRR2105412 2 0.439 0.79591 0.148 0.840 0.012
#> SRR2105407 2 0.361 0.79080 0.112 0.880 0.008
#> SRR2105408 2 0.459 0.79199 0.120 0.848 0.032
#> SRR2105403 2 0.615 0.75603 0.204 0.752 0.044
#> SRR2105404 2 0.493 0.76219 0.212 0.784 0.004
#> SRR2105405 2 0.377 0.79534 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105406 2 0.560 0.75987 0.216 0.764 0.020
#> SRR2105401 2 0.304 0.77907 0.084 0.908 0.008
#> SRR2105402 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105399 2 0.337 0.78450 0.072 0.904 0.024
#> SRR2105400 2 0.285 0.77634 0.068 0.920 0.012
#> SRR2105397 2 0.404 0.79080 0.104 0.872 0.024
#> SRR2105398 2 0.412 0.78906 0.108 0.868 0.024
#> SRR2105395 2 0.564 0.75688 0.232 0.752 0.016
#> SRR2105396 2 0.451 0.79047 0.156 0.832 0.012
#> SRR2105393 2 0.464 0.79403 0.104 0.852 0.044
#> SRR2105394 2 0.368 0.79165 0.116 0.876 0.008
#> SRR2105389 2 0.540 0.78582 0.180 0.792 0.028
#> SRR2105390 2 0.527 0.78169 0.200 0.784 0.016
#> SRR2105391 2 0.404 0.78998 0.104 0.872 0.024
#> SRR2105392 2 0.429 0.79500 0.152 0.840 0.008
#> SRR2105385 2 0.687 0.68588 0.264 0.688 0.048
#> SRR2105386 2 0.406 0.79607 0.128 0.860 0.012
#> SRR2105387 2 0.494 0.79254 0.148 0.824 0.028
#> SRR2105388 2 0.423 0.79227 0.148 0.844 0.008
#> SRR2105381 2 0.383 0.79055 0.100 0.880 0.020
#> SRR2105382 2 0.397 0.79240 0.100 0.876 0.024
#> SRR2105383 2 0.344 0.79165 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105384 2 0.428 0.79157 0.132 0.852 0.016
#> SRR2105379 2 0.389 0.78794 0.096 0.880 0.024
#> SRR2105380 2 0.428 0.79259 0.132 0.852 0.016
#> SRR2105377 2 0.659 0.72581 0.208 0.732 0.060
#> SRR2105378 2 0.642 0.70250 0.260 0.708 0.032
#> SRR2105375 2 0.561 0.77763 0.196 0.776 0.028
#> SRR2105376 2 0.594 0.74690 0.224 0.748 0.028
#> SRR2105373 2 0.736 0.58191 0.304 0.640 0.056
#> SRR2105374 1 0.733 0.46459 0.672 0.256 0.072
#> SRR2105371 2 0.344 0.78973 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105372 2 0.335 0.78905 0.108 0.888 0.004
#> SRR2105369 2 0.406 0.79241 0.112 0.868 0.020
#> SRR2105370 2 0.433 0.79552 0.144 0.844 0.012
#> SRR2105367 2 0.685 0.62075 0.300 0.664 0.036
#> SRR2105368 2 0.774 0.24284 0.376 0.568 0.056
#> SRR2105365 2 0.716 0.50700 0.332 0.628 0.040
#> SRR2105366 2 0.684 0.61463 0.284 0.676 0.040
#> SRR2105363 2 0.400 0.79316 0.116 0.868 0.016
#> SRR2105364 2 0.392 0.79498 0.120 0.868 0.012
#> SRR2105361 2 0.329 0.78976 0.096 0.896 0.008
#> SRR2105362 2 0.399 0.79472 0.108 0.872 0.020
#> SRR2105359 2 0.410 0.79582 0.140 0.852 0.008
#> SRR2105360 2 0.414 0.79394 0.116 0.864 0.020
#> SRR2105355 2 0.441 0.79509 0.140 0.844 0.016
#> SRR2105356 2 0.504 0.78809 0.172 0.808 0.020
#> SRR2105353 2 0.606 0.75617 0.196 0.760 0.044
#> SRR2105354 2 0.555 0.77974 0.212 0.768 0.020
#> SRR2105351 2 0.445 0.79111 0.152 0.836 0.012
#> SRR2105352 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105349 2 0.421 0.79123 0.128 0.856 0.016
#> SRR2105350 2 0.354 0.79036 0.100 0.888 0.012
#> SRR2105345 2 0.448 0.79346 0.136 0.844 0.020
#> SRR2105346 2 0.406 0.79568 0.112 0.868 0.020
#> SRR2105347 2 0.677 0.66659 0.276 0.684 0.040
#> SRR2105348 2 0.589 0.73971 0.220 0.752 0.028
#> SRR2105343 2 0.270 0.77469 0.056 0.928 0.016
#> SRR2105344 2 0.369 0.78714 0.100 0.884 0.016
#> SRR2105341 2 0.619 0.73116 0.216 0.744 0.040
#> SRR2105342 2 0.420 0.79447 0.136 0.852 0.012
#> SRR2105339 2 0.452 0.79644 0.116 0.852 0.032
#> SRR2105340 2 0.536 0.78309 0.196 0.784 0.020
#> SRR2105335 2 0.765 0.16264 0.400 0.552 0.048
#> SRR2105336 2 0.749 0.31186 0.380 0.576 0.044
#> SRR2105337 2 0.532 0.76736 0.204 0.780 0.016
#> SRR2105338 2 0.634 0.71601 0.264 0.708 0.028
#> SRR2105331 2 0.733 0.58009 0.256 0.672 0.072
#> SRR2105332 2 0.697 0.62684 0.276 0.676 0.048
#> SRR2105333 2 0.380 0.78956 0.092 0.884 0.024
#> SRR2105334 2 0.268 0.78269 0.076 0.920 0.004
#> SRR2105329 2 0.392 0.78974 0.120 0.868 0.012
#> SRR2105330 2 0.421 0.79222 0.120 0.860 0.020
#> SRR2105327 2 0.336 0.78896 0.084 0.900 0.016
#> SRR2105328 2 0.353 0.79033 0.108 0.884 0.008
#> SRR2105325 2 0.741 0.35917 0.384 0.576 0.040
#> SRR2105326 2 0.746 0.42013 0.372 0.584 0.044
#> SRR2105323 2 0.454 0.79057 0.148 0.836 0.016
#> SRR2105324 2 0.440 0.79532 0.116 0.856 0.028
#> SRR2105319 2 0.818 0.05469 0.424 0.504 0.072
#> SRR2105320 1 0.799 0.27825 0.488 0.452 0.060
#> SRR2105321 2 0.688 0.60278 0.304 0.660 0.036
#> SRR2105322 2 0.702 0.50904 0.344 0.624 0.032
#> SRR2105317 2 0.275 0.76730 0.064 0.924 0.012
#> SRR2105318 2 0.368 0.78950 0.080 0.892 0.028
#> SRR2105315 2 0.364 0.78178 0.084 0.892 0.024
#> SRR2105316 2 0.285 0.78019 0.068 0.920 0.012
#> SRR2105313 2 0.300 0.78252 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105314 2 0.346 0.78422 0.076 0.900 0.024
#> SRR2105311 2 0.721 0.56291 0.308 0.644 0.048
#> SRR2105312 2 0.693 0.60130 0.296 0.664 0.040
#> SRR2105307 2 0.820 0.13615 0.376 0.544 0.080
#> SRR2105308 2 0.533 0.78393 0.184 0.792 0.024
#> SRR2105309 2 0.344 0.77982 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105310 2 0.413 0.78845 0.132 0.856 0.012
#> SRR2105305 2 0.435 0.79275 0.128 0.852 0.020
#> SRR2105306 2 0.361 0.79132 0.112 0.880 0.008
#> SRR2105303 2 0.346 0.78913 0.096 0.892 0.012
#> SRR2105304 2 0.206 0.75267 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105301 2 0.617 0.74555 0.224 0.740 0.036
#> SRR2105302 2 0.362 0.79479 0.104 0.884 0.012
#> SRR2105299 2 0.573 0.74909 0.216 0.760 0.024
#> SRR2105300 2 0.397 0.79623 0.100 0.876 0.024
#> SRR2105297 1 0.742 0.40010 0.680 0.232 0.088
#> SRR2105298 1 0.586 0.07362 0.796 0.120 0.084
#> SRR2105295 2 0.346 0.77610 0.076 0.900 0.024
#> SRR2105296 2 0.461 0.79055 0.128 0.844 0.028
#> SRR2105293 2 0.622 0.72244 0.240 0.728 0.032
#> SRR2105294 2 0.648 0.71483 0.244 0.716 0.040
#> SRR2105291 2 0.588 0.74895 0.148 0.788 0.064
#> SRR2105292 2 0.697 0.64630 0.288 0.668 0.044
#> SRR2105289 2 0.468 0.79346 0.140 0.836 0.024
#> SRR2105290 2 0.536 0.76455 0.220 0.768 0.012
#> SRR2105287 2 0.797 -0.26284 0.436 0.504 0.060
#> SRR2105288 2 0.662 0.60404 0.316 0.660 0.024
#> SRR2105285 2 0.354 0.79572 0.100 0.888 0.012
#> SRR2105286 2 0.407 0.79361 0.120 0.864 0.016
#> SRR2105283 2 0.640 0.71301 0.236 0.724 0.040
#> SRR2105284 2 0.469 0.79397 0.168 0.820 0.012
#> SRR2105281 2 0.468 0.79483 0.132 0.840 0.028
#> SRR2105282 2 0.385 0.78732 0.108 0.876 0.016
#> SRR2105259 2 0.338 0.78283 0.092 0.896 0.012
#> SRR2105260 2 0.441 0.79440 0.124 0.852 0.024
#> SRR2105279 2 0.449 0.79444 0.108 0.856 0.036
#> SRR2105280 2 0.338 0.79061 0.100 0.892 0.008
#> SRR2105257 2 0.794 0.07403 0.416 0.524 0.060
#> SRR2105258 1 0.828 0.34683 0.468 0.456 0.076
#> SRR2105253 2 0.428 0.79632 0.124 0.856 0.020
#> SRR2105254 2 0.318 0.78272 0.076 0.908 0.016
#> SRR2105255 2 0.399 0.79580 0.124 0.864 0.012
#> SRR2105256 2 0.561 0.77786 0.196 0.776 0.028
#> SRR2105251 2 0.598 0.72727 0.228 0.744 0.028
#> SRR2105252 2 0.544 0.76363 0.192 0.784 0.024
#> SRR2105249 2 0.389 0.79197 0.096 0.880 0.024
#> SRR2105250 2 0.491 0.78387 0.184 0.804 0.012
#> SRR2105247 2 0.407 0.79549 0.120 0.864 0.016
#> SRR2105248 2 0.634 0.71050 0.264 0.708 0.028
#> SRR2105245 2 0.626 0.69778 0.244 0.724 0.032
#> SRR2105246 2 0.494 0.79784 0.148 0.824 0.028
#> SRR2105243 2 0.400 0.79620 0.116 0.868 0.016
#> SRR2105244 2 0.656 0.69118 0.264 0.700 0.036
#> SRR2105241 2 0.648 0.72666 0.244 0.716 0.040
#> SRR2105242 2 0.700 0.55420 0.340 0.628 0.032
#> SRR2105239 2 0.909 -0.27511 0.152 0.504 0.344
#> SRR2105240 2 0.779 0.32691 0.368 0.572 0.060
#> SRR2105237 2 0.427 0.79394 0.116 0.860 0.024
#> SRR2105238 2 0.329 0.78489 0.088 0.900 0.012
#> SRR2105235 2 0.362 0.79348 0.104 0.884 0.012
#> SRR2105236 2 0.377 0.79428 0.112 0.876 0.012
#> SRR2105233 2 0.303 0.78061 0.076 0.912 0.012
#> SRR2105234 2 0.270 0.77130 0.056 0.928 0.016
#> SRR2105231 2 0.557 0.77301 0.184 0.784 0.032
#> SRR2105232 2 0.434 0.79519 0.120 0.856 0.024
#> SRR2105227 2 0.518 0.78559 0.156 0.812 0.032
#> SRR2105228 2 0.383 0.79588 0.124 0.868 0.008
#> SRR2105225 2 0.533 0.76957 0.184 0.792 0.024
#> SRR2105226 2 0.545 0.75502 0.228 0.760 0.012
#> SRR2105229 2 0.480 0.79479 0.156 0.824 0.020
#> SRR2105230 2 0.472 0.79169 0.160 0.824 0.016
#> SRR2105219 2 0.716 0.59425 0.136 0.720 0.144
#> SRR2105220 2 0.462 0.79668 0.136 0.840 0.024
#> SRR2105221 2 0.851 0.34762 0.264 0.596 0.140
#> SRR2105222 2 0.694 0.41288 0.404 0.576 0.020
#> SRR2105223 2 0.738 0.66647 0.244 0.676 0.080
#> SRR2105224 2 0.610 0.73135 0.252 0.724 0.024
#> SRR2105217 2 0.955 -0.28419 0.292 0.480 0.228
#> SRR2105218 2 0.583 0.75897 0.204 0.764 0.032
#> SRR2105215 2 0.765 0.46382 0.124 0.680 0.196
#> SRR2105216 2 0.296 0.78304 0.080 0.912 0.008
#> SRR2105213 2 0.888 0.16408 0.268 0.564 0.168
#> SRR2105214 2 0.454 0.79673 0.124 0.848 0.028
#> SRR2105211 2 0.928 -0.10717 0.216 0.524 0.260
#> SRR2105212 2 0.499 0.79335 0.144 0.824 0.032
#> SRR2105209 2 0.808 0.46412 0.176 0.652 0.172
#> SRR2105210 2 0.670 0.68059 0.268 0.692 0.040
#> SRR2105207 3 0.853 0.81238 0.196 0.192 0.612
#> SRR2105208 2 0.746 0.48439 0.352 0.600 0.048
#> SRR2105205 2 0.909 0.03318 0.268 0.544 0.188
#> SRR2105206 2 0.708 0.57911 0.336 0.628 0.036
#> SRR2105201 2 0.826 0.38714 0.168 0.636 0.196
#> SRR2105202 2 0.576 0.75624 0.208 0.764 0.028
#> SRR2105203 2 0.533 0.77526 0.120 0.820 0.060
#> SRR2105204 2 0.355 0.78623 0.080 0.896 0.024
#> SRR2105199 2 0.736 0.59945 0.172 0.704 0.124
#> SRR2105200 2 0.625 0.71682 0.232 0.732 0.036
#> SRR2105197 2 0.826 0.32931 0.284 0.604 0.112
#> SRR2105198 2 0.734 0.20449 0.392 0.572 0.036
#> SRR2105195 2 0.942 -0.20880 0.312 0.488 0.200
#> SRR2105196 2 0.688 0.51380 0.388 0.592 0.020
#> SRR2105193 3 0.945 0.60294 0.336 0.192 0.472
#> SRR2105194 1 0.781 0.43352 0.516 0.432 0.052
#> SRR2105191 2 0.912 -0.31981 0.148 0.484 0.368
#> SRR2105192 1 0.810 0.57043 0.540 0.388 0.072
#> SRR2105189 2 0.679 0.66418 0.124 0.744 0.132
#> SRR2105190 2 0.344 0.78871 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105187 2 0.884 0.08437 0.308 0.548 0.144
#> SRR2105188 2 0.739 0.46057 0.356 0.600 0.044
#> SRR2105179 2 0.973 -0.41383 0.316 0.440 0.244
#> SRR2105180 1 0.799 0.35424 0.492 0.448 0.060
#> SRR2105183 2 0.609 0.73038 0.124 0.784 0.092
#> SRR2105184 2 0.558 0.76898 0.204 0.772 0.024
#> SRR2105185 2 0.716 0.61800 0.144 0.720 0.136
#> SRR2105186 2 0.612 0.73471 0.220 0.744 0.036
#> SRR2105181 2 0.834 0.43258 0.236 0.620 0.144
#> SRR2105182 2 0.618 0.74550 0.236 0.732 0.032
#> SRR2105177 3 0.822 0.81128 0.176 0.184 0.640
#> SRR2105178 1 0.566 -0.00915 0.808 0.104 0.088
#> SRR2105171 2 0.466 0.79539 0.124 0.844 0.032
#> SRR2105172 2 0.420 0.79304 0.136 0.852 0.012
#> SRR2105175 1 0.979 -0.32419 0.392 0.236 0.372
#> SRR2105176 1 0.641 0.13977 0.764 0.144 0.092
#> SRR2105173 2 0.550 0.75961 0.208 0.772 0.020
#> SRR2105174 2 0.481 0.79283 0.140 0.832 0.028
#> SRR2105169 2 0.546 0.77448 0.204 0.776 0.020
#> SRR2105170 2 0.663 0.62052 0.300 0.672 0.028
#> SRR2105167 2 0.375 0.79328 0.096 0.884 0.020
#> SRR2105168 2 0.466 0.79222 0.156 0.828 0.016
#> SRR2105165 2 0.712 0.45511 0.364 0.604 0.032
#> SRR2105166 2 0.672 0.56380 0.352 0.628 0.020
#> SRR2105163 2 0.693 0.67555 0.260 0.688 0.052
#> SRR2105164 2 0.657 0.65343 0.292 0.680 0.028
#> SRR2105161 1 0.773 0.41684 0.516 0.436 0.048
#> SRR2105162 2 0.785 0.17280 0.412 0.532 0.056
#> SRR2105155 2 0.448 0.79308 0.128 0.848 0.024
#> SRR2105156 2 0.319 0.79269 0.100 0.896 0.004
#> SRR2105157 2 0.636 0.70180 0.232 0.728 0.040
#> SRR2105158 2 0.634 0.69624 0.240 0.724 0.036
#> SRR2105159 2 0.889 -0.27713 0.388 0.488 0.124
#> SRR2105160 2 0.673 0.69473 0.260 0.696 0.044
#> SRR2105153 2 0.511 0.78859 0.144 0.820 0.036
#> SRR2105154 2 0.558 0.75878 0.204 0.772 0.024
#> SRR2105151 2 0.614 0.73326 0.212 0.748 0.040
#> SRR2105152 2 0.364 0.79215 0.124 0.872 0.004
#> SRR2105149 2 0.518 0.78406 0.164 0.808 0.028
#> SRR2105150 2 0.410 0.78815 0.140 0.852 0.008
#> SRR2105147 2 0.245 0.75898 0.052 0.936 0.012
#> SRR2105148 2 0.245 0.75898 0.052 0.936 0.012
#> SRR2105143 2 0.792 0.45152 0.316 0.604 0.080
#> SRR2105144 2 0.457 0.78573 0.160 0.828 0.012
#> SRR2105145 1 0.863 0.54179 0.532 0.356 0.112
#> SRR2105146 2 0.780 0.27892 0.392 0.552 0.056
#> SRR2105141 2 0.601 0.72932 0.220 0.748 0.032
#> SRR2105142 2 0.546 0.75875 0.184 0.788 0.028
#> SRR2105139 2 0.385 0.79453 0.108 0.876 0.016
#> SRR2105140 2 0.518 0.79226 0.164 0.808 0.028
#> SRR2105137 2 0.409 0.78748 0.100 0.872 0.028
#> SRR2105138 2 0.618 0.71443 0.260 0.716 0.024
#> SRR2105135 2 0.296 0.79055 0.080 0.912 0.008
#> SRR2105136 2 0.400 0.78953 0.116 0.868 0.016
#> SRR2105133 2 0.506 0.77861 0.184 0.800 0.016
#> SRR2105134 2 0.538 0.75526 0.236 0.756 0.008
#> SRR2105131 2 0.528 0.77704 0.180 0.796 0.024
#> SRR2105132 2 0.669 0.61887 0.308 0.664 0.028
#> SRR2105129 1 0.835 0.54835 0.508 0.408 0.084
#> SRR2105130 1 0.679 0.37750 0.728 0.196 0.076
#> SRR2105127 2 0.782 0.37994 0.356 0.580 0.064
#> SRR2105128 2 0.560 0.74819 0.216 0.764 0.020
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 2 0.597 0.69473 0.256 0.676 0.056 0.012
#> SRR2105278 2 0.707 0.57676 0.276 0.604 0.092 0.028
#> SRR2105275 2 0.646 0.46881 0.348 0.584 0.056 0.012
#> SRR2105276 2 0.537 0.73156 0.240 0.716 0.032 0.012
#> SRR2105273 2 0.624 0.73117 0.180 0.712 0.052 0.056
#> SRR2105274 2 0.534 0.75815 0.220 0.732 0.028 0.020
#> SRR2105271 2 0.587 0.71624 0.224 0.692 0.080 0.004
#> SRR2105272 2 0.654 0.55301 0.320 0.608 0.036 0.036
#> SRR2105269 2 0.289 0.76651 0.072 0.900 0.020 0.008
#> SRR2105270 2 0.332 0.77631 0.076 0.884 0.016 0.024
#> SRR2105267 2 0.274 0.76889 0.064 0.908 0.020 0.008
#> SRR2105268 2 0.298 0.76434 0.076 0.896 0.012 0.016
#> SRR2105265 2 0.324 0.77774 0.092 0.880 0.020 0.008
#> SRR2105266 2 0.303 0.77791 0.072 0.896 0.016 0.016
#> SRR2105263 1 0.740 0.20384 0.456 0.436 0.076 0.032
#> SRR2105264 2 0.634 0.62422 0.288 0.640 0.048 0.024
#> SRR2105261 2 0.437 0.78708 0.168 0.800 0.024 0.008
#> SRR2105262 2 0.417 0.78462 0.168 0.808 0.012 0.012
#> SRR2105357 2 0.395 0.78607 0.124 0.840 0.024 0.012
#> SRR2105358 2 0.600 0.70845 0.260 0.672 0.056 0.012
#> SRR2105439 2 0.775 0.51241 0.220 0.596 0.116 0.068
#> SRR2105440 2 0.609 0.74237 0.160 0.728 0.068 0.044
#> SRR2105509 2 0.273 0.75971 0.076 0.904 0.008 0.012
#> SRR2105510 2 0.274 0.76618 0.084 0.900 0.008 0.008
#> SRR2105507 2 0.780 0.48841 0.216 0.596 0.080 0.108
#> SRR2105508 2 0.474 0.78640 0.164 0.788 0.036 0.012
#> SRR2105505 2 0.663 0.64515 0.244 0.652 0.076 0.028
#> SRR2105506 2 0.636 0.53477 0.352 0.584 0.056 0.008
#> SRR2105503 2 0.505 0.78294 0.132 0.792 0.044 0.032
#> SRR2105504 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105501 2 0.327 0.77558 0.080 0.884 0.024 0.012
#> SRR2105502 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105499 2 0.641 0.67024 0.244 0.664 0.068 0.024
#> SRR2105500 2 0.547 0.76393 0.176 0.752 0.044 0.028
#> SRR2105497 2 0.595 0.72875 0.176 0.728 0.060 0.036
#> SRR2105498 2 0.569 0.73885 0.180 0.736 0.064 0.020
#> SRR2105495 2 0.331 0.78122 0.088 0.880 0.016 0.016
#> SRR2105496 2 0.397 0.78987 0.124 0.840 0.020 0.016
#> SRR2105493 2 0.389 0.78859 0.100 0.852 0.036 0.012
#> SRR2105494 2 0.357 0.77898 0.088 0.868 0.036 0.008
#> SRR2105491 2 0.683 0.45639 0.320 0.584 0.080 0.016
#> SRR2105492 2 0.651 0.48947 0.328 0.596 0.064 0.012
#> SRR2105489 2 0.629 0.65012 0.256 0.660 0.068 0.016
#> SRR2105490 2 0.447 0.78558 0.152 0.804 0.036 0.008
#> SRR2105487 2 0.755 0.20758 0.356 0.508 0.112 0.024
#> SRR2105488 2 0.666 0.60283 0.296 0.612 0.076 0.016
#> SRR2105485 2 0.466 0.78569 0.140 0.800 0.052 0.008
#> SRR2105486 2 0.471 0.77798 0.188 0.776 0.024 0.012
#> SRR2105483 1 0.739 -0.02047 0.640 0.080 0.184 0.096
#> SRR2105484 1 0.691 -0.08755 0.672 0.060 0.180 0.088
#> SRR2105481 2 0.713 0.32157 0.348 0.548 0.080 0.024
#> SRR2105482 2 0.565 0.71654 0.248 0.700 0.032 0.020
#> SRR2105479 2 0.708 0.43579 0.320 0.572 0.084 0.024
#> SRR2105480 2 0.585 0.61238 0.320 0.636 0.036 0.008
#> SRR2105477 2 0.582 0.69842 0.252 0.684 0.056 0.008
#> SRR2105478 2 0.544 0.73434 0.232 0.716 0.044 0.008
#> SRR2105475 2 0.236 0.76594 0.064 0.920 0.012 0.004
#> SRR2105476 2 0.306 0.77254 0.088 0.888 0.008 0.016
#> SRR2105473 2 0.552 0.75882 0.196 0.736 0.052 0.016
#> SRR2105474 2 0.441 0.79009 0.128 0.820 0.036 0.016
#> SRR2105471 2 0.806 -0.20031 0.372 0.460 0.128 0.040
#> SRR2105472 2 0.690 0.51120 0.300 0.596 0.084 0.020
#> SRR2105469 2 0.424 0.78767 0.124 0.828 0.036 0.012
#> SRR2105470 2 0.487 0.77969 0.192 0.768 0.024 0.016
#> SRR2105467 2 0.721 0.58023 0.272 0.592 0.112 0.024
#> SRR2105468 2 0.620 0.67770 0.276 0.656 0.044 0.024
#> SRR2105465 2 0.777 0.10969 0.348 0.512 0.088 0.052
#> SRR2105466 2 0.592 0.65300 0.276 0.660 0.060 0.004
#> SRR2105463 1 0.822 0.36786 0.424 0.400 0.128 0.048
#> SRR2105464 1 0.787 0.44850 0.492 0.356 0.112 0.040
#> SRR2105461 2 0.274 0.76551 0.064 0.908 0.020 0.008
#> SRR2105462 2 0.299 0.77580 0.100 0.884 0.004 0.012
#> SRR2105459 2 0.310 0.77049 0.072 0.892 0.008 0.028
#> SRR2105460 2 0.276 0.76919 0.064 0.908 0.012 0.016
#> SRR2105457 2 0.405 0.78771 0.144 0.820 0.036 0.000
#> SRR2105458 2 0.357 0.77715 0.132 0.848 0.016 0.004
#> SRR2105455 2 0.319 0.77928 0.096 0.880 0.016 0.008
#> SRR2105456 2 0.316 0.78245 0.124 0.864 0.012 0.000
#> SRR2105453 2 0.735 0.46043 0.272 0.596 0.080 0.052
#> SRR2105454 2 0.756 0.06153 0.412 0.468 0.084 0.036
#> SRR2105451 2 0.334 0.78338 0.084 0.880 0.024 0.012
#> SRR2105452 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105449 2 0.542 0.73316 0.232 0.720 0.032 0.016
#> SRR2105450 2 0.598 0.65727 0.292 0.652 0.044 0.012
#> SRR2105447 2 0.278 0.76842 0.072 0.904 0.008 0.016
#> SRR2105448 2 0.339 0.78032 0.080 0.880 0.024 0.016
#> SRR2105445 2 0.343 0.78397 0.104 0.868 0.008 0.020
#> SRR2105446 2 0.358 0.78779 0.124 0.852 0.020 0.004
#> SRR2105443 2 0.330 0.78151 0.096 0.876 0.020 0.008
#> SRR2105444 2 0.378 0.78467 0.112 0.852 0.024 0.012
#> SRR2105441 2 0.492 0.77843 0.148 0.788 0.048 0.016
#> SRR2105442 2 0.437 0.78289 0.168 0.800 0.024 0.008
#> SRR2105437 1 0.704 0.18619 0.644 0.128 0.196 0.032
#> SRR2105438 1 0.668 0.17550 0.672 0.112 0.188 0.028
#> SRR2105435 2 0.607 0.69907 0.240 0.684 0.056 0.020
#> SRR2105436 2 0.383 0.78330 0.152 0.828 0.004 0.016
#> SRR2105433 1 0.861 0.38817 0.460 0.328 0.128 0.084
#> SRR2105434 2 0.663 0.60780 0.284 0.628 0.060 0.028
#> SRR2105431 1 0.799 0.31761 0.572 0.220 0.144 0.064
#> SRR2105432 1 0.782 0.39602 0.560 0.260 0.136 0.044
#> SRR2105429 2 0.676 0.46107 0.336 0.580 0.064 0.020
#> SRR2105430 2 0.441 0.78534 0.160 0.804 0.024 0.012
#> SRR2105427 2 0.253 0.76672 0.080 0.908 0.008 0.004
#> SRR2105428 2 0.304 0.77976 0.112 0.876 0.004 0.008
#> SRR2105425 2 0.464 0.76983 0.144 0.804 0.032 0.020
#> SRR2105426 2 0.418 0.78911 0.132 0.828 0.024 0.016
#> SRR2105421 2 0.328 0.78106 0.088 0.880 0.024 0.008
#> SRR2105422 2 0.406 0.78700 0.124 0.832 0.040 0.004
#> SRR2105423 2 0.393 0.78429 0.128 0.836 0.032 0.004
#> SRR2105424 2 0.346 0.78296 0.116 0.860 0.020 0.004
#> SRR2105419 2 0.432 0.78891 0.140 0.816 0.036 0.008
#> SRR2105420 2 0.353 0.78181 0.088 0.872 0.024 0.016
#> SRR2105415 1 0.819 0.36048 0.448 0.380 0.120 0.052
#> SRR2105416 1 0.790 0.32868 0.452 0.400 0.108 0.040
#> SRR2105417 2 0.812 -0.12476 0.372 0.468 0.092 0.068
#> SRR2105418 2 0.761 -0.03027 0.428 0.452 0.076 0.044
#> SRR2105413 2 0.303 0.76379 0.072 0.896 0.016 0.016
#> SRR2105414 2 0.273 0.76674 0.092 0.896 0.008 0.004
#> SRR2105409 2 0.630 0.66330 0.232 0.680 0.056 0.032
#> SRR2105410 2 0.666 0.46951 0.348 0.568 0.076 0.008
#> SRR2105411 2 0.309 0.77612 0.092 0.884 0.020 0.004
#> SRR2105412 2 0.395 0.78750 0.144 0.828 0.024 0.004
#> SRR2105407 2 0.328 0.78191 0.104 0.872 0.020 0.004
#> SRR2105408 2 0.446 0.78508 0.104 0.828 0.044 0.024
#> SRR2105403 2 0.646 0.70327 0.180 0.688 0.108 0.024
#> SRR2105404 2 0.528 0.74634 0.200 0.744 0.044 0.012
#> SRR2105405 2 0.428 0.78781 0.112 0.832 0.040 0.016
#> SRR2105406 2 0.561 0.74204 0.216 0.716 0.060 0.008
#> SRR2105401 2 0.296 0.77091 0.084 0.892 0.004 0.020
#> SRR2105402 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105399 2 0.335 0.77579 0.072 0.884 0.028 0.016
#> SRR2105400 2 0.227 0.76446 0.076 0.916 0.000 0.008
#> SRR2105397 2 0.388 0.78372 0.104 0.852 0.028 0.016
#> SRR2105398 2 0.395 0.78222 0.108 0.848 0.024 0.020
#> SRR2105395 2 0.602 0.73085 0.220 0.696 0.068 0.016
#> SRR2105396 2 0.427 0.78521 0.168 0.804 0.020 0.008
#> SRR2105393 2 0.486 0.78304 0.112 0.808 0.032 0.048
#> SRR2105394 2 0.313 0.78329 0.128 0.864 0.004 0.004
#> SRR2105389 2 0.510 0.77731 0.184 0.764 0.028 0.024
#> SRR2105390 2 0.514 0.76708 0.216 0.740 0.036 0.008
#> SRR2105391 2 0.440 0.78307 0.100 0.832 0.044 0.024
#> SRR2105392 2 0.472 0.78745 0.136 0.804 0.040 0.020
#> SRR2105385 2 0.650 0.64283 0.272 0.640 0.068 0.020
#> SRR2105386 2 0.344 0.78889 0.136 0.848 0.016 0.000
#> SRR2105387 2 0.460 0.78539 0.152 0.800 0.036 0.012
#> SRR2105388 2 0.430 0.78750 0.136 0.816 0.044 0.004
#> SRR2105381 2 0.406 0.78414 0.096 0.848 0.036 0.020
#> SRR2105382 2 0.405 0.78682 0.108 0.844 0.028 0.020
#> SRR2105383 2 0.356 0.78571 0.104 0.864 0.020 0.012
#> SRR2105384 2 0.401 0.78323 0.128 0.836 0.024 0.012
#> SRR2105379 2 0.407 0.78271 0.104 0.844 0.036 0.016
#> SRR2105380 2 0.428 0.78395 0.144 0.816 0.032 0.008
#> SRR2105377 2 0.642 0.71596 0.200 0.692 0.044 0.064
#> SRR2105378 2 0.610 0.68336 0.264 0.664 0.060 0.012
#> SRR2105375 2 0.516 0.76210 0.212 0.744 0.028 0.016
#> SRR2105376 2 0.563 0.74552 0.212 0.724 0.040 0.024
#> SRR2105373 2 0.748 0.40893 0.284 0.556 0.140 0.020
#> SRR2105374 1 0.697 0.27507 0.640 0.180 0.160 0.020
#> SRR2105371 2 0.355 0.78421 0.096 0.868 0.016 0.020
#> SRR2105372 2 0.338 0.78210 0.116 0.864 0.012 0.008
#> SRR2105369 2 0.372 0.78502 0.100 0.860 0.024 0.016
#> SRR2105370 2 0.406 0.78783 0.140 0.828 0.012 0.020
#> SRR2105367 2 0.626 0.62446 0.300 0.636 0.040 0.024
#> SRR2105368 2 0.693 0.27697 0.380 0.536 0.060 0.024
#> SRR2105365 2 0.683 0.44235 0.332 0.580 0.064 0.024
#> SRR2105366 2 0.626 0.57679 0.300 0.628 0.064 0.008
#> SRR2105363 2 0.401 0.78385 0.120 0.840 0.024 0.016
#> SRR2105364 2 0.361 0.78652 0.116 0.856 0.020 0.008
#> SRR2105361 2 0.356 0.78448 0.104 0.864 0.020 0.012
#> SRR2105362 2 0.383 0.78701 0.100 0.856 0.020 0.024
#> SRR2105359 2 0.402 0.78974 0.156 0.820 0.016 0.008
#> SRR2105360 2 0.402 0.78725 0.128 0.836 0.016 0.020
#> SRR2105355 2 0.455 0.78793 0.116 0.820 0.040 0.024
#> SRR2105356 2 0.428 0.78027 0.180 0.792 0.028 0.000
#> SRR2105353 2 0.563 0.74111 0.212 0.724 0.040 0.024
#> SRR2105354 2 0.528 0.77183 0.196 0.748 0.040 0.016
#> SRR2105351 2 0.438 0.77848 0.156 0.804 0.036 0.004
#> SRR2105352 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105349 2 0.414 0.78614 0.140 0.824 0.028 0.008
#> SRR2105350 2 0.378 0.78329 0.084 0.864 0.028 0.024
#> SRR2105345 2 0.407 0.78749 0.140 0.828 0.016 0.016
#> SRR2105346 2 0.401 0.78909 0.112 0.844 0.024 0.020
#> SRR2105347 2 0.610 0.64698 0.304 0.640 0.036 0.020
#> SRR2105348 2 0.510 0.74540 0.228 0.736 0.016 0.020
#> SRR2105343 2 0.299 0.77169 0.064 0.900 0.020 0.016
#> SRR2105344 2 0.360 0.77832 0.100 0.864 0.012 0.024
#> SRR2105341 2 0.625 0.68526 0.220 0.684 0.076 0.020
#> SRR2105342 2 0.368 0.78392 0.132 0.844 0.020 0.004
#> SRR2105339 2 0.458 0.78873 0.132 0.812 0.036 0.020
#> SRR2105340 2 0.484 0.77429 0.192 0.760 0.048 0.000
#> SRR2105335 2 0.788 -0.06365 0.384 0.472 0.096 0.048
#> SRR2105336 2 0.671 0.36068 0.384 0.544 0.052 0.020
#> SRR2105337 2 0.530 0.74571 0.220 0.732 0.036 0.012
#> SRR2105338 2 0.589 0.69789 0.272 0.672 0.040 0.016
#> SRR2105331 2 0.725 0.52061 0.244 0.620 0.076 0.060
#> SRR2105332 2 0.629 0.57247 0.316 0.620 0.048 0.016
#> SRR2105333 2 0.378 0.78390 0.112 0.852 0.024 0.012
#> SRR2105334 2 0.266 0.77144 0.080 0.904 0.004 0.012
#> SRR2105329 2 0.385 0.78111 0.124 0.844 0.020 0.012
#> SRR2105330 2 0.385 0.78398 0.116 0.848 0.016 0.020
#> SRR2105327 2 0.313 0.77886 0.060 0.896 0.028 0.016
#> SRR2105328 2 0.332 0.78029 0.104 0.872 0.016 0.008
#> SRR2105325 2 0.685 0.27101 0.396 0.520 0.072 0.012
#> SRR2105326 2 0.705 0.33428 0.368 0.532 0.084 0.016
#> SRR2105323 2 0.485 0.78007 0.140 0.796 0.044 0.020
#> SRR2105324 2 0.448 0.78809 0.124 0.820 0.032 0.024
#> SRR2105319 2 0.800 -0.16978 0.420 0.428 0.104 0.048
#> SRR2105320 1 0.695 0.34124 0.528 0.388 0.060 0.024
#> SRR2105321 2 0.683 0.48472 0.320 0.584 0.080 0.016
#> SRR2105322 2 0.695 0.38650 0.356 0.552 0.072 0.020
#> SRR2105317 2 0.259 0.75840 0.068 0.912 0.008 0.012
#> SRR2105318 2 0.361 0.78101 0.076 0.872 0.036 0.016
#> SRR2105315 2 0.331 0.77385 0.088 0.880 0.016 0.016
#> SRR2105316 2 0.278 0.77355 0.080 0.900 0.016 0.004
#> SRR2105313 2 0.313 0.77726 0.072 0.892 0.024 0.012
#> SRR2105314 2 0.357 0.77761 0.084 0.872 0.020 0.024
#> SRR2105311 2 0.694 0.45297 0.320 0.584 0.068 0.028
#> SRR2105312 2 0.673 0.53299 0.296 0.612 0.068 0.024
#> SRR2105307 2 0.821 0.01865 0.316 0.488 0.152 0.044
#> SRR2105308 2 0.493 0.77599 0.188 0.768 0.028 0.016
#> SRR2105309 2 0.337 0.77322 0.092 0.876 0.020 0.012
#> SRR2105310 2 0.374 0.78007 0.124 0.848 0.016 0.012
#> SRR2105305 2 0.445 0.78340 0.116 0.824 0.040 0.020
#> SRR2105306 2 0.338 0.78288 0.108 0.868 0.016 0.008
#> SRR2105303 2 0.369 0.78257 0.092 0.864 0.028 0.016
#> SRR2105304 2 0.214 0.74641 0.052 0.932 0.008 0.008
#> SRR2105301 2 0.546 0.72223 0.268 0.692 0.032 0.008
#> SRR2105302 2 0.374 0.78626 0.096 0.860 0.032 0.012
#> SRR2105299 2 0.525 0.73800 0.236 0.720 0.040 0.004
#> SRR2105300 2 0.386 0.79047 0.104 0.852 0.032 0.012
#> SRR2105297 1 0.824 0.19304 0.572 0.160 0.168 0.100
#> SRR2105298 1 0.672 -0.05172 0.680 0.064 0.192 0.064
#> SRR2105295 2 0.342 0.77378 0.076 0.880 0.016 0.028
#> SRR2105296 2 0.418 0.78254 0.140 0.824 0.020 0.016
#> SRR2105293 2 0.622 0.69119 0.244 0.676 0.052 0.028
#> SRR2105294 2 0.610 0.66962 0.276 0.660 0.044 0.020
#> SRR2105291 2 0.677 0.64281 0.148 0.692 0.096 0.064
#> SRR2105292 2 0.644 0.61542 0.300 0.628 0.040 0.032
#> SRR2105289 2 0.440 0.78692 0.136 0.816 0.036 0.012
#> SRR2105290 2 0.528 0.75613 0.228 0.728 0.032 0.012
#> SRR2105287 2 0.821 -0.34456 0.388 0.436 0.128 0.048
#> SRR2105288 2 0.665 0.58188 0.288 0.620 0.072 0.020
#> SRR2105285 2 0.322 0.78462 0.100 0.876 0.020 0.004
#> SRR2105286 2 0.366 0.78382 0.120 0.852 0.020 0.008
#> SRR2105283 2 0.601 0.69501 0.256 0.676 0.052 0.016
#> SRR2105284 2 0.421 0.78808 0.172 0.804 0.012 0.012
#> SRR2105281 2 0.436 0.78710 0.140 0.816 0.032 0.012
#> SRR2105282 2 0.362 0.78021 0.108 0.860 0.020 0.012
#> SRR2105259 2 0.338 0.77886 0.108 0.868 0.008 0.016
#> SRR2105260 2 0.415 0.78538 0.124 0.832 0.032 0.012
#> SRR2105279 2 0.433 0.78570 0.124 0.824 0.012 0.040
#> SRR2105280 2 0.304 0.78107 0.112 0.876 0.008 0.004
#> SRR2105257 2 0.791 -0.25545 0.408 0.436 0.124 0.032
#> SRR2105258 1 0.829 0.41205 0.436 0.384 0.124 0.056
#> SRR2105253 2 0.420 0.78894 0.124 0.828 0.040 0.008
#> SRR2105254 2 0.293 0.77483 0.068 0.900 0.024 0.008
#> SRR2105255 2 0.365 0.78943 0.136 0.844 0.012 0.008
#> SRR2105256 2 0.504 0.77235 0.192 0.760 0.036 0.012
#> SRR2105251 2 0.544 0.71249 0.248 0.708 0.032 0.012
#> SRR2105252 2 0.475 0.75914 0.204 0.764 0.024 0.008
#> SRR2105249 2 0.378 0.78214 0.104 0.856 0.024 0.016
#> SRR2105250 2 0.478 0.77918 0.168 0.784 0.036 0.012
#> SRR2105247 2 0.402 0.78726 0.128 0.836 0.020 0.016
#> SRR2105248 2 0.579 0.64160 0.296 0.648 0.056 0.000
#> SRR2105245 2 0.600 0.68720 0.240 0.688 0.052 0.020
#> SRR2105246 2 0.470 0.78954 0.164 0.788 0.040 0.008
#> SRR2105243 2 0.421 0.78951 0.104 0.836 0.048 0.012
#> SRR2105244 2 0.646 0.65373 0.256 0.652 0.072 0.020
#> SRR2105241 2 0.617 0.71164 0.240 0.680 0.056 0.024
#> SRR2105242 2 0.649 0.53264 0.344 0.588 0.052 0.016
#> SRR2105239 3 0.782 0.32311 0.084 0.224 0.592 0.100
#> SRR2105240 2 0.694 0.34487 0.372 0.540 0.068 0.020
#> SRR2105237 2 0.413 0.78661 0.108 0.840 0.036 0.016
#> SRR2105238 2 0.321 0.77694 0.084 0.884 0.024 0.008
#> SRR2105235 2 0.366 0.78674 0.096 0.864 0.024 0.016
#> SRR2105236 2 0.385 0.78614 0.108 0.852 0.020 0.020
#> SRR2105233 2 0.312 0.77282 0.084 0.888 0.016 0.012
#> SRR2105234 2 0.235 0.76193 0.056 0.924 0.008 0.012
#> SRR2105231 2 0.524 0.76778 0.180 0.760 0.036 0.024
#> SRR2105232 2 0.429 0.78875 0.124 0.828 0.024 0.024
#> SRR2105227 2 0.549 0.75958 0.168 0.752 0.060 0.020
#> SRR2105228 2 0.363 0.78808 0.128 0.848 0.020 0.004
#> SRR2105225 2 0.479 0.77155 0.180 0.776 0.036 0.008
#> SRR2105226 2 0.519 0.73972 0.244 0.720 0.028 0.008
#> SRR2105229 2 0.477 0.78718 0.152 0.792 0.044 0.012
#> SRR2105230 2 0.460 0.78627 0.160 0.796 0.032 0.012
#> SRR2105219 2 0.693 0.58166 0.100 0.684 0.076 0.140
#> SRR2105220 2 0.449 0.78960 0.132 0.816 0.028 0.024
#> SRR2105221 2 0.834 0.30423 0.220 0.552 0.120 0.108
#> SRR2105222 2 0.706 0.41076 0.356 0.544 0.080 0.020
#> SRR2105223 2 0.727 0.56458 0.260 0.600 0.108 0.032
#> SRR2105224 2 0.569 0.71286 0.268 0.684 0.032 0.016
#> SRR2105217 2 0.952 -0.39824 0.260 0.396 0.148 0.196
#> SRR2105218 2 0.527 0.75647 0.212 0.736 0.044 0.008
#> SRR2105215 2 0.735 0.43487 0.100 0.640 0.072 0.188
#> SRR2105216 2 0.278 0.76938 0.072 0.904 0.008 0.016
#> SRR2105213 2 0.875 0.04861 0.240 0.500 0.100 0.160
#> SRR2105214 2 0.465 0.78671 0.144 0.804 0.024 0.028
#> SRR2105211 2 0.929 -0.27280 0.152 0.448 0.220 0.180
#> SRR2105212 2 0.470 0.78751 0.140 0.804 0.028 0.028
#> SRR2105209 2 0.871 0.10626 0.172 0.528 0.164 0.136
#> SRR2105210 2 0.643 0.65004 0.272 0.648 0.048 0.032
#> SRR2105207 4 0.570 0.52069 0.088 0.092 0.052 0.768
#> SRR2105208 2 0.688 0.43762 0.372 0.548 0.048 0.032
#> SRR2105205 2 0.895 -0.13239 0.224 0.472 0.096 0.208
#> SRR2105206 2 0.666 0.51127 0.348 0.572 0.068 0.012
#> SRR2105201 2 0.806 0.33433 0.160 0.576 0.072 0.192
#> SRR2105202 2 0.564 0.74292 0.204 0.728 0.044 0.024
#> SRR2105203 2 0.510 0.76281 0.124 0.792 0.032 0.052
#> SRR2105204 2 0.347 0.77996 0.092 0.872 0.024 0.012
#> SRR2105199 2 0.720 0.57293 0.156 0.660 0.072 0.112
#> SRR2105200 2 0.546 0.72121 0.232 0.712 0.052 0.004
#> SRR2105197 2 0.813 0.29092 0.248 0.556 0.100 0.096
#> SRR2105198 2 0.689 0.17262 0.396 0.520 0.068 0.016
#> SRR2105195 2 0.931 -0.29895 0.252 0.428 0.128 0.192
#> SRR2105196 2 0.629 0.48358 0.396 0.548 0.052 0.004
#> SRR2105193 4 0.839 0.43262 0.236 0.108 0.116 0.540
#> SRR2105194 1 0.799 0.44044 0.456 0.376 0.136 0.032
#> SRR2105191 3 0.769 0.32012 0.080 0.208 0.608 0.104
#> SRR2105192 1 0.803 0.39704 0.504 0.300 0.164 0.032
#> SRR2105189 2 0.657 0.65870 0.108 0.712 0.068 0.112
#> SRR2105190 2 0.316 0.78115 0.096 0.880 0.020 0.004
#> SRR2105187 2 0.860 -0.05851 0.292 0.488 0.092 0.128
#> SRR2105188 2 0.658 0.43009 0.388 0.548 0.044 0.020
#> SRR2105179 3 0.960 0.10372 0.268 0.292 0.320 0.120
#> SRR2105180 1 0.752 0.44121 0.504 0.372 0.092 0.032
#> SRR2105183 2 0.578 0.73611 0.100 0.760 0.044 0.096
#> SRR2105184 2 0.534 0.74401 0.232 0.724 0.024 0.020
#> SRR2105185 2 0.695 0.57452 0.124 0.676 0.056 0.144
#> SRR2105186 2 0.598 0.68983 0.236 0.684 0.072 0.008
#> SRR2105181 2 0.854 0.22209 0.208 0.536 0.148 0.108
#> SRR2105182 2 0.583 0.74223 0.224 0.708 0.040 0.028
#> SRR2105177 4 0.434 0.52963 0.072 0.100 0.004 0.824
#> SRR2105178 1 0.662 -0.11338 0.692 0.048 0.172 0.088
#> SRR2105171 2 0.457 0.78648 0.116 0.820 0.032 0.032
#> SRR2105172 2 0.399 0.78675 0.136 0.832 0.024 0.008
#> SRR2105175 4 0.909 0.01994 0.300 0.168 0.104 0.428
#> SRR2105176 1 0.722 0.00319 0.656 0.084 0.172 0.088
#> SRR2105173 2 0.588 0.72712 0.200 0.716 0.064 0.020
#> SRR2105174 2 0.507 0.78140 0.148 0.784 0.040 0.028
#> SRR2105169 2 0.559 0.76409 0.192 0.736 0.052 0.020
#> SRR2105170 2 0.626 0.60837 0.304 0.632 0.044 0.020
#> SRR2105167 2 0.330 0.78387 0.096 0.876 0.008 0.020
#> SRR2105168 2 0.413 0.78652 0.176 0.804 0.012 0.008
#> SRR2105165 2 0.694 0.40418 0.336 0.568 0.076 0.020
#> SRR2105166 2 0.668 0.52309 0.344 0.580 0.052 0.024
#> SRR2105163 2 0.640 0.63631 0.280 0.644 0.044 0.032
#> SRR2105164 2 0.595 0.64166 0.300 0.648 0.040 0.012
#> SRR2105161 1 0.752 0.41870 0.488 0.372 0.124 0.016
#> SRR2105162 2 0.732 -0.00776 0.432 0.464 0.076 0.028
#> SRR2105155 2 0.460 0.78268 0.108 0.820 0.048 0.024
#> SRR2105156 2 0.294 0.78225 0.096 0.888 0.008 0.008
#> SRR2105157 2 0.635 0.66445 0.212 0.684 0.080 0.024
#> SRR2105158 2 0.632 0.64154 0.240 0.664 0.084 0.012
#> SRR2105159 2 0.904 -0.41314 0.332 0.416 0.120 0.132
#> SRR2105160 2 0.600 0.68425 0.268 0.660 0.068 0.004
#> SRR2105153 2 0.525 0.77662 0.148 0.776 0.040 0.036
#> SRR2105154 2 0.537 0.74726 0.212 0.736 0.024 0.028
#> SRR2105151 2 0.655 0.67119 0.200 0.684 0.072 0.044
#> SRR2105152 2 0.327 0.78332 0.128 0.860 0.008 0.004
#> SRR2105149 2 0.490 0.77639 0.160 0.784 0.040 0.016
#> SRR2105150 2 0.396 0.78078 0.152 0.820 0.028 0.000
#> SRR2105147 2 0.264 0.75355 0.064 0.912 0.012 0.012
#> SRR2105148 2 0.264 0.75355 0.064 0.912 0.012 0.012
#> SRR2105143 2 0.783 0.37539 0.292 0.548 0.104 0.056
#> SRR2105144 2 0.421 0.77975 0.172 0.804 0.012 0.012
#> SRR2105145 1 0.875 0.34805 0.480 0.272 0.160 0.088
#> SRR2105146 2 0.768 0.10494 0.380 0.484 0.104 0.032
#> SRR2105141 2 0.583 0.70427 0.232 0.700 0.052 0.016
#> SRR2105142 2 0.528 0.73806 0.196 0.744 0.052 0.008
#> SRR2105139 2 0.395 0.78762 0.096 0.852 0.036 0.016
#> SRR2105140 2 0.457 0.78669 0.160 0.796 0.036 0.008
#> SRR2105137 2 0.375 0.78050 0.088 0.864 0.024 0.024
#> SRR2105138 2 0.590 0.69305 0.268 0.676 0.032 0.024
#> SRR2105135 2 0.309 0.78362 0.092 0.884 0.020 0.004
#> SRR2105136 2 0.341 0.77928 0.120 0.860 0.004 0.016
#> SRR2105133 2 0.487 0.76933 0.168 0.780 0.040 0.012
#> SRR2105134 2 0.540 0.74820 0.228 0.724 0.028 0.020
#> SRR2105131 2 0.546 0.75284 0.204 0.736 0.040 0.020
#> SRR2105132 2 0.701 0.56115 0.276 0.608 0.088 0.028
#> SRR2105129 1 0.827 0.39688 0.480 0.332 0.132 0.056
#> SRR2105130 1 0.728 0.24968 0.648 0.128 0.164 0.060
#> SRR2105127 2 0.823 0.21822 0.296 0.508 0.140 0.056
#> SRR2105128 2 0.539 0.73630 0.228 0.724 0.032 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 2 0.656 0.32421 0.080 0.544 0.336 0.016 0.024
#> SRR2105278 2 0.699 0.11410 0.088 0.508 0.348 0.032 0.024
#> SRR2105275 2 0.674 0.15115 0.160 0.516 0.300 0.000 0.024
#> SRR2105276 2 0.586 0.60698 0.112 0.664 0.200 0.016 0.008
#> SRR2105273 2 0.619 0.56018 0.040 0.632 0.260 0.024 0.044
#> SRR2105274 2 0.551 0.62743 0.096 0.684 0.204 0.008 0.008
#> SRR2105271 2 0.645 0.48267 0.076 0.600 0.272 0.012 0.040
#> SRR2105272 2 0.705 0.23784 0.120 0.536 0.292 0.036 0.016
#> SRR2105269 2 0.353 0.66975 0.016 0.832 0.136 0.008 0.008
#> SRR2105270 2 0.353 0.67820 0.020 0.836 0.128 0.008 0.008
#> SRR2105267 2 0.302 0.66447 0.008 0.864 0.112 0.012 0.004
#> SRR2105268 2 0.269 0.66498 0.004 0.864 0.128 0.004 0.000
#> SRR2105265 2 0.370 0.67937 0.024 0.824 0.136 0.004 0.012
#> SRR2105266 2 0.316 0.67633 0.004 0.852 0.124 0.008 0.012
#> SRR2105263 2 0.777 -0.65734 0.320 0.324 0.316 0.020 0.020
#> SRR2105264 2 0.680 0.41185 0.124 0.572 0.260 0.016 0.028
#> SRR2105261 2 0.496 0.68048 0.032 0.720 0.220 0.012 0.016
#> SRR2105262 2 0.436 0.68171 0.036 0.752 0.204 0.004 0.004
#> SRR2105357 2 0.472 0.67645 0.024 0.760 0.176 0.020 0.020
#> SRR2105358 2 0.634 0.46043 0.084 0.576 0.304 0.004 0.032
#> SRR2105439 2 0.760 -0.23696 0.084 0.476 0.340 0.036 0.064
#> SRR2105440 2 0.616 0.51415 0.044 0.640 0.252 0.032 0.032
#> SRR2105509 2 0.269 0.65227 0.004 0.884 0.096 0.008 0.008
#> SRR2105510 2 0.273 0.66063 0.004 0.876 0.108 0.004 0.008
#> SRR2105507 2 0.779 -0.01933 0.076 0.488 0.308 0.084 0.044
#> SRR2105508 2 0.448 0.68055 0.024 0.740 0.220 0.004 0.012
#> SRR2105505 2 0.675 0.18814 0.072 0.524 0.348 0.012 0.044
#> SRR2105506 2 0.667 0.10544 0.136 0.508 0.336 0.008 0.012
#> SRR2105503 2 0.510 0.66428 0.040 0.712 0.220 0.020 0.008
#> SRR2105504 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105501 2 0.350 0.67601 0.008 0.844 0.116 0.012 0.020
#> SRR2105502 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105499 2 0.649 0.40364 0.100 0.584 0.280 0.016 0.020
#> SRR2105500 2 0.500 0.61697 0.044 0.688 0.256 0.004 0.008
#> SRR2105497 2 0.617 0.58840 0.084 0.656 0.212 0.024 0.024
#> SRR2105498 2 0.561 0.61724 0.096 0.680 0.204 0.008 0.012
#> SRR2105495 2 0.359 0.68201 0.020 0.836 0.124 0.012 0.008
#> SRR2105496 2 0.396 0.68946 0.028 0.788 0.176 0.004 0.004
#> SRR2105493 2 0.413 0.68763 0.024 0.788 0.168 0.004 0.016
#> SRR2105494 2 0.373 0.68089 0.012 0.812 0.156 0.004 0.016
#> SRR2105491 2 0.703 0.11969 0.192 0.508 0.272 0.008 0.020
#> SRR2105492 2 0.689 0.22746 0.164 0.528 0.280 0.012 0.016
#> SRR2105489 2 0.681 0.35568 0.116 0.568 0.268 0.012 0.036
#> SRR2105490 2 0.415 0.67864 0.028 0.752 0.216 0.000 0.004
#> SRR2105487 2 0.801 -0.48616 0.196 0.408 0.320 0.020 0.056
#> SRR2105488 2 0.682 0.33189 0.088 0.536 0.320 0.008 0.048
#> SRR2105485 2 0.497 0.67106 0.044 0.736 0.188 0.004 0.028
#> SRR2105486 2 0.481 0.66161 0.024 0.720 0.228 0.004 0.024
#> SRR2105483 1 0.564 0.31366 0.712 0.060 0.172 0.040 0.016
#> SRR2105484 1 0.552 0.25569 0.724 0.040 0.156 0.068 0.012
#> SRR2105481 2 0.745 -0.24683 0.200 0.484 0.260 0.004 0.052
#> SRR2105482 2 0.615 0.55743 0.112 0.648 0.204 0.008 0.028
#> SRR2105479 2 0.724 0.00368 0.172 0.484 0.304 0.008 0.032
#> SRR2105480 2 0.631 0.41350 0.148 0.572 0.268 0.004 0.008
#> SRR2105477 2 0.632 0.56320 0.100 0.636 0.220 0.016 0.028
#> SRR2105478 2 0.583 0.62032 0.072 0.668 0.224 0.016 0.020
#> SRR2105475 2 0.268 0.66386 0.008 0.880 0.104 0.004 0.004
#> SRR2105476 2 0.344 0.67031 0.024 0.852 0.104 0.012 0.008
#> SRR2105473 2 0.585 0.61867 0.072 0.672 0.216 0.012 0.028
#> SRR2105474 2 0.457 0.68630 0.036 0.764 0.176 0.008 0.016
#> SRR2105471 2 0.834 -0.57015 0.240 0.392 0.272 0.024 0.072
#> SRR2105472 2 0.728 0.23877 0.160 0.540 0.240 0.016 0.044
#> SRR2105469 2 0.453 0.67718 0.028 0.748 0.204 0.004 0.016
#> SRR2105470 2 0.530 0.66453 0.060 0.692 0.228 0.008 0.012
#> SRR2105467 2 0.746 -0.00563 0.084 0.476 0.348 0.024 0.068
#> SRR2105468 2 0.634 0.40097 0.076 0.568 0.320 0.008 0.028
#> SRR2105465 2 0.845 -0.59713 0.196 0.380 0.316 0.036 0.072
#> SRR2105466 2 0.629 0.36056 0.128 0.576 0.280 0.012 0.004
#> SRR2105463 2 0.872 -0.71893 0.308 0.316 0.260 0.044 0.072
#> SRR2105464 1 0.800 -0.53724 0.356 0.296 0.292 0.028 0.028
#> SRR2105461 2 0.327 0.66757 0.008 0.844 0.132 0.008 0.008
#> SRR2105462 2 0.324 0.67731 0.016 0.844 0.132 0.004 0.004
#> SRR2105459 2 0.302 0.66775 0.004 0.852 0.132 0.008 0.004
#> SRR2105460 2 0.269 0.66208 0.004 0.888 0.088 0.012 0.008
#> SRR2105457 2 0.448 0.67910 0.024 0.740 0.220 0.004 0.012
#> SRR2105458 2 0.348 0.67665 0.008 0.808 0.176 0.004 0.004
#> SRR2105455 2 0.389 0.68600 0.012 0.796 0.172 0.004 0.016
#> SRR2105456 2 0.348 0.68028 0.024 0.820 0.152 0.004 0.000
#> SRR2105453 2 0.747 0.01647 0.120 0.528 0.272 0.036 0.044
#> SRR2105454 3 0.791 0.53174 0.212 0.360 0.368 0.036 0.024
#> SRR2105451 2 0.350 0.68320 0.024 0.836 0.128 0.008 0.004
#> SRR2105452 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105449 2 0.601 0.58089 0.112 0.652 0.208 0.008 0.020
#> SRR2105450 2 0.626 0.47264 0.108 0.580 0.292 0.012 0.008
#> SRR2105447 2 0.320 0.66505 0.008 0.860 0.108 0.012 0.012
#> SRR2105448 2 0.361 0.68315 0.012 0.836 0.124 0.016 0.012
#> SRR2105445 2 0.389 0.68415 0.008 0.808 0.152 0.008 0.024
#> SRR2105446 2 0.395 0.68631 0.024 0.784 0.184 0.004 0.004
#> SRR2105443 2 0.320 0.67761 0.020 0.848 0.124 0.008 0.000
#> SRR2105444 2 0.389 0.68210 0.024 0.808 0.152 0.008 0.008
#> SRR2105441 2 0.518 0.64767 0.044 0.716 0.204 0.004 0.032
#> SRR2105442 2 0.463 0.67448 0.048 0.744 0.196 0.008 0.004
#> SRR2105437 1 0.699 0.30539 0.596 0.068 0.240 0.044 0.052
#> SRR2105438 1 0.659 0.30605 0.612 0.052 0.256 0.044 0.036
#> SRR2105435 2 0.625 0.48825 0.124 0.612 0.240 0.008 0.016
#> SRR2105436 2 0.433 0.67688 0.028 0.756 0.204 0.008 0.004
#> SRR2105433 1 0.774 -0.26226 0.424 0.268 0.260 0.024 0.024
#> SRR2105434 2 0.684 0.32391 0.120 0.556 0.280 0.032 0.012
#> SRR2105431 1 0.786 0.39550 0.472 0.140 0.300 0.040 0.048
#> SRR2105432 1 0.783 0.11824 0.424 0.192 0.320 0.044 0.020
#> SRR2105429 2 0.745 -0.03822 0.168 0.488 0.292 0.024 0.028
#> SRR2105430 2 0.408 0.68289 0.032 0.780 0.180 0.004 0.004
#> SRR2105427 2 0.300 0.66837 0.008 0.860 0.120 0.004 0.008
#> SRR2105428 2 0.346 0.68292 0.016 0.812 0.168 0.004 0.000
#> SRR2105425 2 0.515 0.63935 0.048 0.724 0.192 0.004 0.032
#> SRR2105426 2 0.440 0.68741 0.040 0.780 0.160 0.008 0.012
#> SRR2105421 2 0.398 0.68495 0.020 0.792 0.172 0.004 0.012
#> SRR2105422 2 0.423 0.68620 0.024 0.776 0.176 0.000 0.024
#> SRR2105423 2 0.468 0.68026 0.028 0.760 0.176 0.008 0.028
#> SRR2105424 2 0.305 0.67897 0.008 0.856 0.124 0.004 0.008
#> SRR2105419 2 0.426 0.68365 0.036 0.764 0.192 0.004 0.004
#> SRR2105420 2 0.354 0.67988 0.012 0.824 0.144 0.000 0.020
#> SRR2105415 3 0.863 0.28953 0.292 0.264 0.332 0.032 0.080
#> SRR2105416 3 0.782 0.54801 0.296 0.316 0.344 0.024 0.020
#> SRR2105417 2 0.805 -0.57864 0.228 0.396 0.308 0.040 0.028
#> SRR2105418 2 0.789 -0.58374 0.228 0.360 0.356 0.020 0.036
#> SRR2105413 2 0.317 0.66155 0.004 0.856 0.116 0.008 0.016
#> SRR2105414 2 0.317 0.66316 0.016 0.856 0.116 0.008 0.004
#> SRR2105409 2 0.662 0.48227 0.120 0.628 0.196 0.028 0.028
#> SRR2105410 2 0.699 0.15637 0.176 0.512 0.284 0.012 0.016
#> SRR2105411 2 0.311 0.67886 0.020 0.840 0.140 0.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.402 0.68410 0.020 0.780 0.188 0.008 0.004
#> SRR2105407 2 0.376 0.68504 0.024 0.812 0.152 0.008 0.004
#> SRR2105408 2 0.416 0.68420 0.020 0.772 0.192 0.004 0.012
#> SRR2105403 2 0.661 0.36448 0.036 0.576 0.300 0.024 0.064
#> SRR2105404 2 0.562 0.59779 0.068 0.684 0.216 0.012 0.020
#> SRR2105405 2 0.466 0.67515 0.008 0.744 0.204 0.016 0.028
#> SRR2105406 2 0.574 0.54491 0.060 0.628 0.288 0.008 0.016
#> SRR2105401 2 0.317 0.66999 0.000 0.836 0.148 0.008 0.008
#> SRR2105402 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105399 2 0.319 0.67337 0.004 0.844 0.136 0.008 0.008
#> SRR2105400 2 0.252 0.65956 0.000 0.884 0.104 0.008 0.004
#> SRR2105397 2 0.393 0.68212 0.016 0.792 0.176 0.004 0.012
#> SRR2105398 2 0.407 0.68398 0.016 0.792 0.168 0.008 0.016
#> SRR2105395 2 0.617 0.59743 0.080 0.632 0.248 0.016 0.024
#> SRR2105396 2 0.497 0.66984 0.052 0.716 0.216 0.004 0.012
#> SRR2105393 2 0.495 0.68025 0.032 0.772 0.132 0.036 0.028
#> SRR2105394 2 0.428 0.68927 0.036 0.788 0.156 0.012 0.008
#> SRR2105389 2 0.495 0.63830 0.016 0.676 0.276 0.000 0.032
#> SRR2105390 2 0.505 0.65030 0.044 0.684 0.256 0.000 0.016
#> SRR2105391 2 0.409 0.67952 0.016 0.796 0.160 0.008 0.020
#> SRR2105392 2 0.458 0.67925 0.024 0.736 0.220 0.004 0.016
#> SRR2105385 2 0.696 0.35020 0.132 0.548 0.276 0.020 0.024
#> SRR2105386 2 0.384 0.68552 0.024 0.792 0.176 0.000 0.008
#> SRR2105387 2 0.466 0.67615 0.028 0.744 0.204 0.008 0.016
#> SRR2105388 2 0.433 0.68211 0.032 0.756 0.200 0.012 0.000
#> SRR2105381 2 0.401 0.68174 0.012 0.792 0.172 0.008 0.016
#> SRR2105382 2 0.410 0.68466 0.040 0.808 0.132 0.008 0.012
#> SRR2105383 2 0.373 0.68521 0.032 0.828 0.124 0.004 0.012
#> SRR2105384 2 0.440 0.67995 0.024 0.768 0.184 0.008 0.016
#> SRR2105379 2 0.432 0.67949 0.032 0.780 0.168 0.012 0.008
#> SRR2105380 2 0.462 0.67632 0.060 0.756 0.172 0.008 0.004
#> SRR2105377 2 0.650 0.53092 0.060 0.616 0.252 0.052 0.020
#> SRR2105378 2 0.616 0.49649 0.108 0.608 0.256 0.000 0.028
#> SRR2105375 2 0.592 0.61356 0.048 0.660 0.240 0.024 0.028
#> SRR2105376 2 0.588 0.58880 0.056 0.636 0.272 0.024 0.012
#> SRR2105373 2 0.767 -0.37211 0.080 0.436 0.372 0.024 0.088
#> SRR2105374 1 0.720 0.41809 0.548 0.112 0.272 0.032 0.036
#> SRR2105371 2 0.381 0.68381 0.004 0.804 0.164 0.012 0.016
#> SRR2105372 2 0.375 0.68608 0.012 0.804 0.164 0.000 0.020
#> SRR2105369 2 0.413 0.68760 0.020 0.792 0.164 0.008 0.016
#> SRR2105370 2 0.425 0.68137 0.020 0.772 0.188 0.008 0.012
#> SRR2105367 2 0.642 0.33784 0.116 0.564 0.296 0.004 0.020
#> SRR2105368 2 0.713 -0.30811 0.232 0.448 0.300 0.004 0.016
#> SRR2105365 2 0.720 0.16314 0.192 0.520 0.248 0.020 0.020
#> SRR2105366 2 0.679 0.35834 0.156 0.560 0.252 0.012 0.020
#> SRR2105363 2 0.445 0.66884 0.032 0.756 0.196 0.004 0.012
#> SRR2105364 2 0.400 0.68440 0.028 0.800 0.156 0.004 0.012
#> SRR2105361 2 0.381 0.68324 0.016 0.804 0.160 0.000 0.020
#> SRR2105362 2 0.348 0.68502 0.012 0.824 0.152 0.004 0.008
#> SRR2105359 2 0.435 0.68450 0.024 0.756 0.204 0.004 0.012
#> SRR2105360 2 0.466 0.68817 0.032 0.752 0.188 0.004 0.024
#> SRR2105355 2 0.490 0.66765 0.016 0.716 0.232 0.016 0.020
#> SRR2105356 2 0.410 0.66992 0.020 0.744 0.232 0.004 0.000
#> SRR2105353 2 0.602 0.57397 0.068 0.644 0.248 0.020 0.020
#> SRR2105354 2 0.544 0.64848 0.068 0.684 0.220 0.000 0.028
#> SRR2105351 2 0.467 0.66409 0.076 0.748 0.168 0.000 0.008
#> SRR2105352 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105349 2 0.469 0.68394 0.048 0.756 0.176 0.008 0.012
#> SRR2105350 2 0.360 0.68402 0.008 0.812 0.164 0.012 0.004
#> SRR2105345 2 0.436 0.68175 0.020 0.768 0.188 0.012 0.012
#> SRR2105346 2 0.392 0.68727 0.020 0.800 0.164 0.008 0.008
#> SRR2105347 2 0.650 0.43068 0.124 0.580 0.268 0.016 0.012
#> SRR2105348 2 0.563 0.59025 0.076 0.680 0.216 0.020 0.008
#> SRR2105343 2 0.325 0.66656 0.016 0.864 0.096 0.012 0.012
#> SRR2105344 2 0.328 0.67901 0.008 0.832 0.148 0.012 0.000
#> SRR2105341 2 0.654 0.37516 0.048 0.564 0.320 0.016 0.052
#> SRR2105342 2 0.419 0.68105 0.028 0.772 0.188 0.004 0.008
#> SRR2105339 2 0.467 0.68366 0.028 0.756 0.184 0.008 0.024
#> SRR2105340 2 0.483 0.66375 0.068 0.712 0.216 0.000 0.004
#> SRR2105335 2 0.849 -0.58330 0.204 0.392 0.296 0.048 0.060
#> SRR2105336 2 0.731 -0.24386 0.188 0.468 0.308 0.020 0.016
#> SRR2105337 2 0.541 0.61000 0.084 0.676 0.228 0.004 0.008
#> SRR2105338 2 0.585 0.55631 0.108 0.632 0.244 0.016 0.000
#> SRR2105331 2 0.734 0.32697 0.136 0.568 0.216 0.044 0.036
#> SRR2105332 2 0.653 0.38185 0.156 0.568 0.256 0.012 0.008
#> SRR2105333 2 0.411 0.68098 0.028 0.804 0.144 0.012 0.012
#> SRR2105334 2 0.248 0.66559 0.008 0.892 0.092 0.008 0.000
#> SRR2105329 2 0.420 0.68168 0.020 0.792 0.160 0.012 0.016
#> SRR2105330 2 0.351 0.67928 0.016 0.832 0.136 0.004 0.012
#> SRR2105327 2 0.315 0.67801 0.008 0.848 0.132 0.008 0.004
#> SRR2105328 2 0.358 0.67925 0.008 0.828 0.140 0.012 0.012
#> SRR2105325 2 0.718 -0.24147 0.212 0.452 0.312 0.008 0.016
#> SRR2105326 2 0.727 -0.14452 0.208 0.468 0.292 0.008 0.024
#> SRR2105323 2 0.533 0.63726 0.036 0.688 0.240 0.008 0.028
#> SRR2105324 2 0.499 0.66967 0.036 0.724 0.208 0.004 0.028
#> SRR2105319 2 0.810 -0.62737 0.240 0.348 0.344 0.044 0.024
#> SRR2105320 3 0.756 0.53961 0.304 0.324 0.340 0.028 0.004
#> SRR2105321 2 0.723 0.05838 0.148 0.504 0.292 0.004 0.052
#> SRR2105322 2 0.746 -0.02658 0.172 0.488 0.284 0.012 0.044
#> SRR2105317 2 0.275 0.65319 0.004 0.884 0.092 0.008 0.012
#> SRR2105318 2 0.360 0.68057 0.016 0.824 0.144 0.004 0.012
#> SRR2105315 2 0.325 0.67403 0.000 0.828 0.156 0.008 0.008
#> SRR2105316 2 0.278 0.67211 0.004 0.868 0.116 0.000 0.012
#> SRR2105313 2 0.337 0.67879 0.004 0.828 0.152 0.008 0.008
#> SRR2105314 2 0.380 0.68025 0.004 0.804 0.164 0.008 0.020
#> SRR2105311 2 0.732 0.13272 0.192 0.508 0.256 0.020 0.024
#> SRR2105312 2 0.694 0.25825 0.168 0.536 0.264 0.012 0.020
#> SRR2105307 2 0.811 -0.62203 0.216 0.364 0.344 0.020 0.056
#> SRR2105308 2 0.465 0.66224 0.020 0.708 0.256 0.008 0.008
#> SRR2105309 2 0.355 0.67186 0.004 0.820 0.152 0.004 0.020
#> SRR2105310 2 0.418 0.68212 0.012 0.780 0.180 0.008 0.020
#> SRR2105305 2 0.507 0.65207 0.032 0.728 0.200 0.012 0.028
#> SRR2105306 2 0.338 0.68253 0.000 0.820 0.160 0.004 0.016
#> SRR2105303 2 0.388 0.68120 0.016 0.812 0.148 0.012 0.012
#> SRR2105304 2 0.227 0.63999 0.004 0.904 0.084 0.004 0.004
#> SRR2105301 2 0.608 0.56006 0.080 0.624 0.264 0.020 0.012
#> SRR2105302 2 0.427 0.68889 0.020 0.808 0.124 0.020 0.028
#> SRR2105299 2 0.574 0.58855 0.096 0.648 0.240 0.004 0.012
#> SRR2105300 2 0.423 0.69034 0.024 0.804 0.136 0.016 0.020
#> SRR2105297 1 0.727 0.35507 0.604 0.120 0.168 0.068 0.040
#> SRR2105298 1 0.548 0.29123 0.720 0.044 0.180 0.032 0.024
#> SRR2105295 2 0.336 0.67132 0.004 0.840 0.132 0.016 0.008
#> SRR2105296 2 0.468 0.68049 0.048 0.776 0.144 0.012 0.020
#> SRR2105293 2 0.661 0.50844 0.104 0.612 0.232 0.032 0.020
#> SRR2105294 2 0.661 0.49044 0.136 0.604 0.220 0.016 0.024
#> SRR2105291 2 0.663 0.27629 0.008 0.556 0.308 0.036 0.092
#> SRR2105292 2 0.696 0.22958 0.132 0.532 0.296 0.020 0.020
#> SRR2105289 2 0.495 0.67131 0.044 0.736 0.192 0.008 0.020
#> SRR2105290 2 0.526 0.62380 0.064 0.668 0.256 0.000 0.012
#> SRR2105287 2 0.860 -0.67184 0.296 0.344 0.256 0.056 0.048
#> SRR2105288 2 0.676 0.25162 0.136 0.528 0.308 0.008 0.020
#> SRR2105285 2 0.350 0.68713 0.024 0.836 0.128 0.004 0.008
#> SRR2105286 2 0.365 0.68367 0.008 0.808 0.168 0.008 0.008
#> SRR2105283 2 0.631 0.48703 0.116 0.608 0.248 0.008 0.020
#> SRR2105284 2 0.455 0.67414 0.024 0.732 0.228 0.008 0.008
#> SRR2105281 2 0.447 0.68388 0.044 0.772 0.160 0.000 0.024
#> SRR2105282 2 0.356 0.67974 0.012 0.808 0.172 0.004 0.004
#> SRR2105259 2 0.367 0.68226 0.012 0.820 0.148 0.012 0.008
#> SRR2105260 2 0.341 0.67989 0.004 0.824 0.156 0.008 0.008
#> SRR2105279 2 0.503 0.67332 0.056 0.756 0.144 0.036 0.008
#> SRR2105280 2 0.350 0.68382 0.016 0.816 0.160 0.000 0.008
#> SRR2105257 3 0.835 0.50354 0.264 0.312 0.340 0.028 0.056
#> SRR2105258 2 0.871 -0.73851 0.304 0.316 0.264 0.040 0.076
#> SRR2105253 2 0.427 0.68680 0.028 0.788 0.160 0.012 0.012
#> SRR2105254 2 0.293 0.67236 0.020 0.864 0.112 0.000 0.004
#> SRR2105255 2 0.393 0.68759 0.016 0.784 0.188 0.008 0.004
#> SRR2105256 2 0.490 0.64817 0.020 0.692 0.264 0.008 0.016
#> SRR2105251 2 0.577 0.57761 0.100 0.648 0.232 0.000 0.020
#> SRR2105252 2 0.552 0.63426 0.064 0.692 0.212 0.008 0.024
#> SRR2105249 2 0.379 0.68394 0.020 0.828 0.124 0.008 0.020
#> SRR2105250 2 0.527 0.64431 0.040 0.708 0.216 0.016 0.020
#> SRR2105247 2 0.479 0.68085 0.036 0.760 0.168 0.012 0.024
#> SRR2105248 2 0.655 0.37077 0.112 0.556 0.300 0.004 0.028
#> SRR2105245 2 0.639 0.51661 0.112 0.604 0.248 0.004 0.032
#> SRR2105246 2 0.507 0.67609 0.036 0.712 0.224 0.016 0.012
#> SRR2105243 2 0.469 0.67715 0.032 0.768 0.160 0.008 0.032
#> SRR2105244 2 0.645 0.43729 0.116 0.596 0.252 0.004 0.032
#> SRR2105241 2 0.671 0.48304 0.092 0.580 0.272 0.012 0.044
#> SRR2105242 2 0.707 0.22578 0.144 0.516 0.300 0.016 0.024
#> SRR2105239 5 0.599 0.21758 0.024 0.120 0.132 0.028 0.696
#> SRR2105240 2 0.763 -0.22146 0.156 0.440 0.344 0.032 0.028
#> SRR2105237 2 0.432 0.68474 0.040 0.788 0.152 0.008 0.012
#> SRR2105238 2 0.310 0.67287 0.004 0.852 0.128 0.008 0.008
#> SRR2105235 2 0.393 0.69047 0.016 0.800 0.164 0.008 0.012
#> SRR2105236 2 0.424 0.67985 0.036 0.784 0.164 0.012 0.004
#> SRR2105233 2 0.376 0.67052 0.016 0.828 0.128 0.016 0.012
#> SRR2105234 2 0.263 0.65505 0.008 0.892 0.084 0.012 0.004
#> SRR2105231 2 0.553 0.64796 0.060 0.688 0.220 0.012 0.020
#> SRR2105232 2 0.444 0.68565 0.024 0.764 0.188 0.008 0.016
#> SRR2105227 2 0.562 0.59776 0.048 0.684 0.216 0.004 0.048
#> SRR2105228 2 0.396 0.68586 0.016 0.780 0.192 0.004 0.008
#> SRR2105225 2 0.518 0.64273 0.068 0.724 0.184 0.012 0.012
#> SRR2105226 2 0.610 0.52787 0.076 0.616 0.276 0.016 0.016
#> SRR2105229 2 0.484 0.68233 0.032 0.744 0.192 0.012 0.020
#> SRR2105230 2 0.486 0.67008 0.028 0.728 0.212 0.004 0.028
#> SRR2105219 2 0.724 0.34048 0.048 0.616 0.156 0.104 0.076
#> SRR2105220 2 0.466 0.68768 0.016 0.748 0.200 0.016 0.020
#> SRR2105221 2 0.838 -0.07332 0.100 0.508 0.196 0.096 0.100
#> SRR2105222 2 0.714 -0.01524 0.184 0.472 0.316 0.012 0.016
#> SRR2105223 2 0.706 0.08898 0.048 0.488 0.372 0.024 0.068
#> SRR2105224 2 0.559 0.56926 0.072 0.648 0.260 0.020 0.000
#> SRR2105217 2 0.952 -0.57283 0.144 0.340 0.240 0.156 0.120
#> SRR2105218 2 0.556 0.61939 0.064 0.668 0.244 0.016 0.008
#> SRR2105215 2 0.770 0.14758 0.072 0.568 0.144 0.164 0.052
#> SRR2105216 2 0.286 0.66779 0.016 0.876 0.096 0.012 0.000
#> SRR2105213 2 0.905 -0.40383 0.152 0.416 0.224 0.112 0.096
#> SRR2105214 2 0.446 0.68297 0.020 0.752 0.204 0.020 0.004
#> SRR2105211 2 0.923 -0.50062 0.064 0.368 0.216 0.160 0.192
#> SRR2105212 2 0.478 0.67645 0.016 0.724 0.228 0.016 0.016
#> SRR2105209 2 0.880 -0.45271 0.048 0.376 0.296 0.108 0.172
#> SRR2105210 2 0.673 0.35531 0.128 0.564 0.272 0.012 0.024
#> SRR2105207 4 0.481 0.49050 0.056 0.052 0.056 0.800 0.036
#> SRR2105208 2 0.731 0.03590 0.172 0.496 0.288 0.020 0.024
#> SRR2105205 2 0.910 -0.41605 0.128 0.408 0.216 0.164 0.084
#> SRR2105206 2 0.698 0.30873 0.168 0.528 0.272 0.016 0.016
#> SRR2105201 2 0.815 -0.21384 0.024 0.464 0.248 0.176 0.088
#> SRR2105202 2 0.556 0.57745 0.048 0.664 0.256 0.008 0.024
#> SRR2105203 2 0.547 0.63311 0.028 0.716 0.188 0.044 0.024
#> SRR2105204 2 0.402 0.68286 0.012 0.792 0.172 0.012 0.012
#> SRR2105199 2 0.762 0.27109 0.064 0.572 0.200 0.076 0.088
#> SRR2105200 2 0.606 0.46646 0.064 0.612 0.284 0.004 0.036
#> SRR2105197 2 0.852 -0.25958 0.112 0.468 0.244 0.080 0.096
#> SRR2105198 2 0.759 -0.37023 0.240 0.452 0.264 0.024 0.020
#> SRR2105195 2 0.951 -0.55213 0.148 0.352 0.228 0.140 0.132
#> SRR2105196 2 0.679 0.24251 0.168 0.516 0.296 0.012 0.008
#> SRR2105193 4 0.800 0.44174 0.200 0.072 0.124 0.536 0.068
#> SRR2105194 1 0.802 -0.52224 0.372 0.304 0.264 0.024 0.036
#> SRR2105191 5 0.523 0.17265 0.020 0.096 0.112 0.020 0.752
#> SRR2105192 1 0.811 -0.04491 0.380 0.204 0.340 0.028 0.048
#> SRR2105189 2 0.679 0.49864 0.028 0.640 0.164 0.104 0.064
#> SRR2105190 2 0.338 0.68204 0.024 0.840 0.128 0.004 0.004
#> SRR2105187 2 0.884 -0.45628 0.168 0.428 0.228 0.108 0.068
#> SRR2105188 2 0.746 -0.07598 0.156 0.464 0.328 0.020 0.032
#> SRR2105179 5 0.915 0.05266 0.152 0.216 0.196 0.060 0.376
#> SRR2105180 1 0.789 -0.56435 0.336 0.308 0.308 0.028 0.020
#> SRR2105183 2 0.646 0.55241 0.044 0.664 0.176 0.076 0.040
#> SRR2105184 2 0.576 0.58274 0.068 0.640 0.268 0.012 0.012
#> SRR2105185 2 0.738 0.31240 0.044 0.592 0.184 0.112 0.068
#> SRR2105186 2 0.621 0.51644 0.092 0.624 0.244 0.004 0.036
#> SRR2105181 2 0.858 -0.28883 0.084 0.456 0.244 0.076 0.140
#> SRR2105182 2 0.566 0.58771 0.052 0.628 0.296 0.016 0.008
#> SRR2105177 4 0.415 0.52740 0.052 0.068 0.060 0.820 0.000
#> SRR2105178 1 0.520 0.22661 0.736 0.028 0.164 0.064 0.008
#> SRR2105171 2 0.523 0.67443 0.028 0.736 0.176 0.028 0.032
#> SRR2105172 2 0.425 0.68430 0.008 0.756 0.212 0.008 0.016
#> SRR2105175 4 0.887 0.18738 0.280 0.104 0.144 0.400 0.072
#> SRR2105176 1 0.568 0.33585 0.712 0.060 0.164 0.052 0.012
#> SRR2105173 2 0.590 0.57549 0.084 0.660 0.224 0.016 0.016
#> SRR2105174 2 0.515 0.66809 0.056 0.704 0.216 0.000 0.024
#> SRR2105169 2 0.543 0.64602 0.064 0.688 0.224 0.008 0.016
#> SRR2105170 2 0.664 0.38617 0.156 0.568 0.248 0.024 0.004
#> SRR2105167 2 0.378 0.68466 0.008 0.800 0.172 0.016 0.004
#> SRR2105168 2 0.447 0.68350 0.024 0.752 0.204 0.008 0.012
#> SRR2105165 2 0.733 -0.16362 0.208 0.476 0.280 0.012 0.024
#> SRR2105166 2 0.677 0.26232 0.132 0.520 0.320 0.020 0.008
#> SRR2105163 2 0.664 0.42191 0.108 0.576 0.276 0.016 0.024
#> SRR2105164 2 0.629 0.45516 0.120 0.584 0.276 0.004 0.016
#> SRR2105161 3 0.835 0.36542 0.308 0.268 0.340 0.028 0.056
#> SRR2105162 2 0.753 -0.51265 0.276 0.400 0.292 0.020 0.012
#> SRR2105155 2 0.499 0.64893 0.032 0.740 0.188 0.020 0.020
#> SRR2105156 2 0.364 0.68336 0.028 0.820 0.144 0.004 0.004
#> SRR2105157 2 0.636 0.52390 0.136 0.632 0.196 0.012 0.024
#> SRR2105158 2 0.652 0.46726 0.148 0.604 0.216 0.012 0.020
#> SRR2105159 2 0.917 -0.64071 0.224 0.336 0.264 0.108 0.068
#> SRR2105160 2 0.594 0.49306 0.096 0.600 0.288 0.000 0.016
#> SRR2105153 2 0.525 0.66180 0.048 0.712 0.208 0.012 0.020
#> SRR2105154 2 0.573 0.60995 0.096 0.664 0.220 0.012 0.008
#> SRR2105151 2 0.696 0.31257 0.112 0.576 0.252 0.024 0.036
#> SRR2105152 2 0.378 0.68269 0.016 0.800 0.172 0.008 0.004
#> SRR2105149 2 0.502 0.67046 0.032 0.728 0.204 0.012 0.024
#> SRR2105150 2 0.395 0.67516 0.012 0.768 0.208 0.000 0.012
#> SRR2105147 2 0.264 0.64602 0.008 0.888 0.092 0.004 0.008
#> SRR2105148 2 0.264 0.64602 0.008 0.888 0.092 0.004 0.008
#> SRR2105143 2 0.767 -0.13080 0.148 0.480 0.300 0.028 0.044
#> SRR2105144 2 0.440 0.66443 0.012 0.724 0.248 0.004 0.012
#> SRR2105145 1 0.908 0.14986 0.376 0.184 0.260 0.100 0.080
#> SRR2105146 2 0.777 -0.37141 0.228 0.416 0.304 0.016 0.036
#> SRR2105141 2 0.609 0.56485 0.096 0.640 0.228 0.004 0.032
#> SRR2105142 2 0.553 0.62077 0.092 0.700 0.180 0.004 0.024
#> SRR2105139 2 0.429 0.68611 0.028 0.792 0.152 0.016 0.012
#> SRR2105140 2 0.464 0.68268 0.032 0.752 0.192 0.012 0.012
#> SRR2105137 2 0.414 0.67946 0.024 0.796 0.156 0.016 0.008
#> SRR2105138 2 0.579 0.45593 0.064 0.604 0.312 0.016 0.004
#> SRR2105135 2 0.377 0.68515 0.028 0.828 0.124 0.008 0.012
#> SRR2105136 2 0.332 0.67774 0.012 0.828 0.152 0.008 0.000
#> SRR2105133 2 0.537 0.62486 0.048 0.688 0.232 0.004 0.028
#> SRR2105134 2 0.578 0.58406 0.068 0.648 0.256 0.008 0.020
#> SRR2105131 2 0.608 0.54476 0.068 0.632 0.260 0.016 0.024
#> SRR2105132 2 0.736 0.09683 0.136 0.504 0.300 0.020 0.040
#> SRR2105129 1 0.812 -0.18513 0.384 0.260 0.288 0.036 0.032
#> SRR2105130 1 0.641 0.43043 0.632 0.080 0.232 0.028 0.028
#> SRR2105127 2 0.824 -0.53109 0.168 0.388 0.348 0.048 0.048
#> SRR2105128 2 0.601 0.51508 0.068 0.604 0.300 0.012 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 2 0.646 -0.05029 0.060 0.440 0.016 0.000 0.408 NA
#> SRR2105278 5 0.691 0.26957 0.072 0.396 0.008 0.012 0.416 NA
#> SRR2105275 2 0.698 0.01159 0.144 0.460 0.012 0.004 0.316 NA
#> SRR2105276 2 0.616 0.55484 0.100 0.612 0.004 0.012 0.212 NA
#> SRR2105273 2 0.659 0.41425 0.044 0.544 0.024 0.020 0.300 NA
#> SRR2105274 2 0.565 0.60290 0.072 0.628 0.016 0.000 0.248 NA
#> SRR2105271 2 0.671 0.36037 0.068 0.524 0.024 0.004 0.296 NA
#> SRR2105272 2 0.696 0.15190 0.140 0.480 0.012 0.016 0.308 NA
#> SRR2105269 2 0.325 0.65858 0.008 0.824 0.000 0.008 0.144 NA
#> SRR2105270 2 0.367 0.66697 0.012 0.808 0.012 0.004 0.144 NA
#> SRR2105267 2 0.312 0.65563 0.004 0.840 0.008 0.004 0.128 NA
#> SRR2105268 2 0.278 0.65577 0.004 0.852 0.008 0.000 0.128 NA
#> SRR2105265 2 0.389 0.67154 0.012 0.784 0.012 0.004 0.168 NA
#> SRR2105266 2 0.329 0.66685 0.008 0.828 0.004 0.000 0.128 NA
#> SRR2105263 1 0.785 -0.34731 0.292 0.292 0.008 0.008 0.280 NA
#> SRR2105264 2 0.667 0.43225 0.116 0.548 0.016 0.012 0.260 NA
#> SRR2105261 2 0.473 0.67034 0.024 0.700 0.008 0.008 0.236 NA
#> SRR2105262 2 0.415 0.67492 0.028 0.740 0.008 0.000 0.212 NA
#> SRR2105357 2 0.465 0.65772 0.020 0.732 0.020 0.008 0.196 NA
#> SRR2105358 2 0.622 0.34200 0.072 0.504 0.016 0.000 0.360 NA
#> SRR2105439 2 0.811 -0.46613 0.048 0.388 0.056 0.032 0.296 NA
#> SRR2105440 2 0.634 0.43685 0.028 0.584 0.016 0.020 0.252 NA
#> SRR2105509 2 0.257 0.63653 0.000 0.880 0.012 0.004 0.092 NA
#> SRR2105510 2 0.316 0.65129 0.004 0.840 0.008 0.004 0.124 NA
#> SRR2105507 2 0.803 -0.18401 0.064 0.416 0.020 0.088 0.300 NA
#> SRR2105508 2 0.486 0.66297 0.020 0.684 0.020 0.000 0.244 NA
#> SRR2105505 2 0.707 -0.20243 0.068 0.416 0.028 0.004 0.384 NA
#> SRR2105506 2 0.671 -0.13998 0.140 0.440 0.004 0.004 0.360 NA
#> SRR2105503 2 0.553 0.65088 0.056 0.680 0.016 0.020 0.200 NA
#> SRR2105504 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105501 2 0.364 0.66821 0.008 0.816 0.012 0.008 0.132 NA
#> SRR2105502 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105499 2 0.690 0.29312 0.116 0.504 0.024 0.012 0.300 NA
#> SRR2105500 2 0.528 0.60651 0.040 0.644 0.008 0.004 0.268 NA
#> SRR2105497 2 0.654 0.48831 0.080 0.584 0.016 0.028 0.244 NA
#> SRR2105498 2 0.560 0.61338 0.084 0.660 0.008 0.008 0.204 NA
#> SRR2105495 2 0.395 0.67386 0.012 0.788 0.004 0.008 0.152 NA
#> SRR2105496 2 0.448 0.67955 0.036 0.748 0.008 0.012 0.180 NA
#> SRR2105493 2 0.444 0.67487 0.020 0.740 0.020 0.000 0.192 NA
#> SRR2105494 2 0.360 0.67554 0.016 0.784 0.008 0.000 0.184 NA
#> SRR2105491 2 0.710 0.15966 0.144 0.480 0.004 0.016 0.280 NA
#> SRR2105492 2 0.676 0.22274 0.160 0.492 0.004 0.004 0.280 NA
#> SRR2105489 2 0.685 0.28583 0.096 0.512 0.020 0.008 0.296 NA
#> SRR2105490 2 0.445 0.66293 0.028 0.704 0.012 0.000 0.244 NA
#> SRR2105487 5 0.807 0.49494 0.148 0.312 0.024 0.012 0.348 NA
#> SRR2105488 2 0.676 0.05300 0.088 0.432 0.020 0.000 0.388 NA
#> SRR2105485 2 0.529 0.62405 0.032 0.656 0.020 0.000 0.248 NA
#> SRR2105486 2 0.500 0.62428 0.024 0.652 0.012 0.000 0.276 NA
#> SRR2105483 1 0.517 0.23878 0.740 0.036 0.012 0.028 0.120 NA
#> SRR2105484 1 0.433 0.19999 0.792 0.024 0.004 0.040 0.108 NA
#> SRR2105481 2 0.747 -0.27409 0.172 0.440 0.012 0.004 0.256 NA
#> SRR2105482 2 0.609 0.53403 0.120 0.600 0.016 0.000 0.224 NA
#> SRR2105479 2 0.699 -0.00687 0.184 0.452 0.008 0.004 0.296 NA
#> SRR2105480 2 0.625 0.40635 0.148 0.548 0.000 0.004 0.256 NA
#> SRR2105477 2 0.624 0.51263 0.104 0.580 0.012 0.000 0.244 NA
#> SRR2105478 2 0.596 0.58224 0.068 0.620 0.012 0.008 0.240 NA
#> SRR2105475 2 0.293 0.65666 0.008 0.844 0.004 0.000 0.132 NA
#> SRR2105476 2 0.344 0.66011 0.016 0.836 0.008 0.008 0.112 NA
#> SRR2105473 2 0.586 0.60673 0.068 0.640 0.020 0.008 0.224 NA
#> SRR2105474 2 0.434 0.67468 0.024 0.748 0.012 0.004 0.192 NA
#> SRR2105471 2 0.852 -0.57781 0.220 0.332 0.052 0.016 0.256 NA
#> SRR2105472 2 0.738 0.16296 0.140 0.488 0.020 0.012 0.248 NA
#> SRR2105469 2 0.466 0.65855 0.020 0.704 0.012 0.000 0.228 NA
#> SRR2105470 2 0.511 0.65793 0.060 0.680 0.008 0.004 0.224 NA
#> SRR2105467 5 0.734 0.42055 0.064 0.360 0.040 0.004 0.412 NA
#> SRR2105468 2 0.618 0.23981 0.076 0.492 0.016 0.000 0.376 NA
#> SRR2105465 2 0.831 -0.61476 0.176 0.316 0.040 0.008 0.304 NA
#> SRR2105466 2 0.642 0.22139 0.140 0.488 0.004 0.000 0.324 NA
#> SRR2105463 1 0.860 -0.27353 0.276 0.256 0.052 0.016 0.272 NA
#> SRR2105464 1 0.770 -0.26541 0.360 0.248 0.012 0.012 0.288 NA
#> SRR2105461 2 0.344 0.66290 0.004 0.820 0.008 0.008 0.140 NA
#> SRR2105462 2 0.342 0.66511 0.012 0.820 0.004 0.004 0.140 NA
#> SRR2105459 2 0.294 0.65822 0.000 0.848 0.004 0.012 0.124 NA
#> SRR2105460 2 0.302 0.64744 0.004 0.860 0.004 0.012 0.096 NA
#> SRR2105457 2 0.465 0.66357 0.012 0.684 0.008 0.004 0.260 NA
#> SRR2105458 2 0.351 0.66707 0.004 0.776 0.000 0.004 0.200 NA
#> SRR2105455 2 0.427 0.67708 0.024 0.764 0.016 0.004 0.172 NA
#> SRR2105456 2 0.344 0.67084 0.020 0.808 0.000 0.004 0.156 NA
#> SRR2105453 2 0.759 -0.15044 0.104 0.472 0.032 0.016 0.268 NA
#> SRR2105454 5 0.763 0.44668 0.188 0.272 0.004 0.016 0.408 NA
#> SRR2105451 2 0.351 0.67219 0.008 0.804 0.004 0.004 0.160 NA
#> SRR2105452 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105449 2 0.616 0.55037 0.100 0.600 0.012 0.004 0.232 NA
#> SRR2105450 2 0.622 0.41673 0.116 0.532 0.016 0.000 0.308 NA
#> SRR2105447 2 0.309 0.65348 0.000 0.840 0.016 0.008 0.128 NA
#> SRR2105448 2 0.374 0.67140 0.012 0.808 0.012 0.008 0.140 NA
#> SRR2105445 2 0.408 0.67325 0.004 0.764 0.012 0.004 0.180 NA
#> SRR2105446 2 0.437 0.67221 0.020 0.740 0.008 0.004 0.200 NA
#> SRR2105443 2 0.332 0.67047 0.016 0.820 0.004 0.004 0.148 NA
#> SRR2105444 2 0.383 0.67334 0.028 0.772 0.012 0.000 0.184 NA
#> SRR2105441 2 0.525 0.62797 0.040 0.696 0.016 0.004 0.192 NA
#> SRR2105442 2 0.432 0.66726 0.048 0.740 0.004 0.000 0.192 NA
#> SRR2105437 1 0.666 0.19929 0.504 0.036 0.004 0.008 0.200 NA
#> SRR2105438 1 0.648 0.21484 0.524 0.028 0.004 0.008 0.196 NA
#> SRR2105435 2 0.665 0.42701 0.128 0.560 0.016 0.016 0.240 NA
#> SRR2105436 2 0.432 0.66728 0.024 0.732 0.008 0.000 0.212 NA
#> SRR2105433 1 0.749 0.02626 0.460 0.220 0.004 0.028 0.208 NA
#> SRR2105434 2 0.692 0.29289 0.116 0.504 0.012 0.020 0.296 NA
#> SRR2105431 1 0.777 0.31433 0.440 0.096 0.008 0.032 0.220 NA
#> SRR2105432 1 0.770 0.24092 0.408 0.156 0.008 0.024 0.300 NA
#> SRR2105429 2 0.749 -0.12035 0.148 0.420 0.012 0.012 0.312 NA
#> SRR2105430 2 0.425 0.67364 0.032 0.744 0.004 0.004 0.200 NA
#> SRR2105427 2 0.273 0.65559 0.004 0.856 0.012 0.000 0.124 NA
#> SRR2105428 2 0.353 0.67347 0.004 0.780 0.004 0.000 0.192 NA
#> SRR2105425 2 0.570 0.59595 0.032 0.664 0.024 0.008 0.200 NA
#> SRR2105426 2 0.455 0.67681 0.040 0.752 0.012 0.004 0.164 NA
#> SRR2105421 2 0.424 0.67277 0.008 0.748 0.012 0.000 0.188 NA
#> SRR2105422 2 0.429 0.67528 0.024 0.760 0.020 0.000 0.172 NA
#> SRR2105423 2 0.451 0.67070 0.024 0.748 0.012 0.004 0.176 NA
#> SRR2105424 2 0.299 0.66706 0.004 0.840 0.000 0.004 0.132 NA
#> SRR2105419 2 0.443 0.66912 0.036 0.716 0.004 0.000 0.224 NA
#> SRR2105420 2 0.383 0.66956 0.012 0.804 0.016 0.000 0.128 NA
#> SRR2105415 5 0.845 -0.02774 0.240 0.196 0.036 0.008 0.304 NA
#> SRR2105416 5 0.745 0.30033 0.324 0.224 0.016 0.008 0.372 NA
#> SRR2105417 5 0.794 0.47042 0.208 0.312 0.000 0.028 0.320 NA
#> SRR2105418 5 0.814 0.44863 0.220 0.304 0.028 0.028 0.344 NA
#> SRR2105413 2 0.307 0.64895 0.000 0.836 0.004 0.004 0.132 NA
#> SRR2105414 2 0.327 0.65756 0.008 0.832 0.008 0.004 0.132 NA
#> SRR2105409 2 0.682 0.43288 0.104 0.568 0.024 0.012 0.220 NA
#> SRR2105410 2 0.671 0.12843 0.196 0.464 0.004 0.012 0.300 NA
#> SRR2105411 2 0.339 0.66770 0.020 0.820 0.008 0.000 0.140 NA
#> SRR2105412 2 0.391 0.67456 0.028 0.772 0.012 0.000 0.180 NA
#> SRR2105407 2 0.373 0.67592 0.024 0.792 0.004 0.004 0.164 NA
#> SRR2105408 2 0.424 0.67310 0.012 0.736 0.008 0.004 0.216 NA
#> SRR2105403 2 0.679 0.00307 0.016 0.476 0.028 0.012 0.324 NA
#> SRR2105404 2 0.587 0.53788 0.056 0.612 0.020 0.004 0.264 NA
#> SRR2105405 2 0.513 0.64044 0.020 0.684 0.012 0.008 0.224 NA
#> SRR2105406 2 0.602 0.44486 0.068 0.560 0.020 0.000 0.312 NA
#> SRR2105401 2 0.312 0.65687 0.000 0.824 0.008 0.004 0.152 NA
#> SRR2105402 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105399 2 0.308 0.66054 0.004 0.832 0.004 0.004 0.144 NA
#> SRR2105400 2 0.301 0.64704 0.000 0.844 0.000 0.012 0.120 NA
#> SRR2105397 2 0.408 0.67037 0.016 0.756 0.004 0.004 0.196 NA
#> SRR2105398 2 0.388 0.67254 0.012 0.764 0.008 0.004 0.200 NA
#> SRR2105395 2 0.586 0.57987 0.084 0.620 0.012 0.000 0.232 NA
#> SRR2105396 2 0.512 0.65553 0.064 0.676 0.004 0.008 0.228 NA
#> SRR2105393 2 0.503 0.66932 0.020 0.736 0.024 0.024 0.156 NA
#> SRR2105394 2 0.391 0.67844 0.028 0.792 0.004 0.004 0.148 NA
#> SRR2105389 2 0.562 0.58941 0.028 0.608 0.028 0.000 0.288 NA
#> SRR2105390 2 0.512 0.63743 0.036 0.652 0.016 0.000 0.268 NA
#> SRR2105391 2 0.425 0.66469 0.012 0.744 0.012 0.004 0.204 NA
#> SRR2105392 2 0.461 0.66628 0.012 0.704 0.020 0.008 0.240 NA
#> SRR2105385 2 0.666 0.28082 0.108 0.500 0.016 0.000 0.312 NA
#> SRR2105386 2 0.423 0.67568 0.024 0.740 0.012 0.000 0.208 NA
#> SRR2105387 2 0.469 0.66889 0.028 0.716 0.000 0.008 0.204 NA
#> SRR2105388 2 0.453 0.67236 0.032 0.720 0.004 0.004 0.216 NA
#> SRR2105381 2 0.427 0.66938 0.012 0.756 0.016 0.004 0.184 NA
#> SRR2105382 2 0.412 0.67558 0.028 0.792 0.012 0.008 0.136 NA
#> SRR2105383 2 0.413 0.67450 0.028 0.772 0.004 0.004 0.164 NA
#> SRR2105384 2 0.413 0.66879 0.024 0.736 0.012 0.000 0.220 NA
#> SRR2105379 2 0.436 0.66853 0.012 0.760 0.012 0.008 0.168 NA
#> SRR2105380 2 0.486 0.65974 0.056 0.720 0.016 0.008 0.188 NA
#> SRR2105377 2 0.690 0.49059 0.036 0.572 0.040 0.044 0.236 NA
#> SRR2105378 2 0.642 0.46723 0.092 0.552 0.020 0.004 0.284 NA
#> SRR2105375 2 0.602 0.57445 0.044 0.592 0.028 0.012 0.288 NA
#> SRR2105376 2 0.556 0.53977 0.064 0.600 0.004 0.012 0.300 NA
#> SRR2105373 5 0.742 0.49575 0.060 0.332 0.020 0.008 0.396 NA
#> SRR2105374 1 0.716 0.32774 0.476 0.072 0.008 0.008 0.228 NA
#> SRR2105371 2 0.368 0.67429 0.008 0.796 0.000 0.008 0.156 NA
#> SRR2105372 2 0.397 0.67479 0.016 0.772 0.008 0.000 0.176 NA
#> SRR2105369 2 0.391 0.67681 0.012 0.784 0.008 0.000 0.156 NA
#> SRR2105370 2 0.413 0.66988 0.032 0.756 0.008 0.000 0.188 NA
#> SRR2105367 2 0.676 0.22932 0.116 0.500 0.020 0.012 0.316 NA
#> SRR2105368 2 0.737 -0.37418 0.216 0.380 0.016 0.004 0.324 NA
#> SRR2105365 2 0.706 0.16524 0.196 0.480 0.004 0.008 0.240 NA
#> SRR2105366 2 0.643 0.35572 0.160 0.532 0.004 0.004 0.260 NA
#> SRR2105363 2 0.494 0.64776 0.024 0.704 0.012 0.008 0.212 NA
#> SRR2105364 2 0.433 0.67360 0.024 0.748 0.016 0.000 0.188 NA
#> SRR2105361 2 0.388 0.67241 0.012 0.784 0.016 0.000 0.164 NA
#> SRR2105362 2 0.349 0.67370 0.008 0.800 0.004 0.000 0.164 NA
#> SRR2105359 2 0.477 0.65608 0.028 0.708 0.012 0.000 0.212 NA
#> SRR2105360 2 0.442 0.67761 0.020 0.744 0.012 0.000 0.184 NA
#> SRR2105355 2 0.519 0.62990 0.016 0.656 0.012 0.008 0.260 NA
#> SRR2105356 2 0.411 0.65175 0.028 0.716 0.000 0.000 0.244 NA
#> SRR2105353 2 0.620 0.56420 0.052 0.616 0.020 0.016 0.232 NA
#> SRR2105354 2 0.555 0.63652 0.068 0.664 0.020 0.004 0.212 NA
#> SRR2105351 2 0.463 0.65057 0.060 0.716 0.000 0.004 0.200 NA
#> SRR2105352 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105349 2 0.452 0.67400 0.036 0.744 0.008 0.004 0.180 NA
#> SRR2105350 2 0.369 0.67475 0.008 0.792 0.004 0.008 0.168 NA
#> SRR2105345 2 0.495 0.65661 0.032 0.704 0.012 0.004 0.208 NA
#> SRR2105346 2 0.405 0.67710 0.016 0.764 0.012 0.000 0.184 NA
#> SRR2105347 2 0.664 0.36748 0.124 0.528 0.012 0.008 0.280 NA
#> SRR2105348 2 0.606 0.55485 0.076 0.620 0.016 0.016 0.236 NA
#> SRR2105343 2 0.343 0.65278 0.008 0.840 0.016 0.004 0.100 NA
#> SRR2105344 2 0.330 0.66784 0.004 0.824 0.008 0.008 0.144 NA
#> SRR2105341 2 0.687 0.05131 0.044 0.448 0.020 0.008 0.364 NA
#> SRR2105342 2 0.433 0.67049 0.024 0.744 0.008 0.000 0.192 NA
#> SRR2105339 2 0.493 0.65947 0.036 0.712 0.020 0.004 0.200 NA
#> SRR2105340 2 0.513 0.64129 0.068 0.668 0.008 0.000 0.232 NA
#> SRR2105335 2 0.845 -0.59272 0.144 0.320 0.024 0.032 0.300 NA
#> SRR2105336 2 0.739 -0.28173 0.176 0.404 0.004 0.012 0.316 NA
#> SRR2105337 2 0.549 0.57275 0.076 0.624 0.012 0.000 0.264 NA
#> SRR2105338 2 0.582 0.54606 0.096 0.596 0.000 0.008 0.264 NA
#> SRR2105331 2 0.744 0.27706 0.108 0.524 0.016 0.044 0.216 NA
#> SRR2105332 2 0.657 0.37767 0.152 0.536 0.004 0.016 0.256 NA
#> SRR2105333 2 0.394 0.66848 0.016 0.780 0.008 0.000 0.164 NA
#> SRR2105334 2 0.324 0.66330 0.016 0.848 0.004 0.004 0.100 NA
#> SRR2105329 2 0.400 0.66879 0.016 0.780 0.016 0.008 0.168 NA
#> SRR2105330 2 0.351 0.67153 0.012 0.796 0.012 0.000 0.172 NA
#> SRR2105327 2 0.310 0.66709 0.008 0.836 0.004 0.000 0.132 NA
#> SRR2105328 2 0.330 0.66939 0.008 0.824 0.008 0.004 0.144 NA
#> SRR2105325 2 0.749 -0.30806 0.172 0.380 0.008 0.004 0.324 NA
#> SRR2105326 2 0.742 -0.23601 0.164 0.404 0.004 0.004 0.296 NA
#> SRR2105323 2 0.537 0.59981 0.012 0.636 0.016 0.000 0.252 NA
#> SRR2105324 2 0.522 0.65359 0.044 0.684 0.024 0.000 0.212 NA
#> SRR2105319 5 0.806 0.40015 0.196 0.264 0.008 0.028 0.372 NA
#> SRR2105320 5 0.788 0.38640 0.276 0.272 0.008 0.020 0.332 NA
#> SRR2105321 2 0.726 -0.07678 0.120 0.436 0.024 0.000 0.320 NA
#> SRR2105322 2 0.737 -0.10155 0.140 0.428 0.024 0.000 0.308 NA
#> SRR2105317 2 0.250 0.64023 0.000 0.872 0.016 0.004 0.108 NA
#> SRR2105318 2 0.347 0.66992 0.004 0.804 0.008 0.004 0.164 NA
#> SRR2105315 2 0.341 0.66490 0.000 0.808 0.008 0.012 0.160 NA
#> SRR2105316 2 0.334 0.66167 0.004 0.820 0.004 0.004 0.144 NA
#> SRR2105313 2 0.391 0.67001 0.008 0.784 0.012 0.012 0.168 NA
#> SRR2105314 2 0.380 0.67079 0.004 0.792 0.012 0.008 0.160 NA
#> SRR2105311 2 0.733 0.14892 0.168 0.476 0.008 0.020 0.252 NA
#> SRR2105312 2 0.675 0.23520 0.172 0.496 0.004 0.012 0.276 NA
#> SRR2105307 5 0.791 0.38892 0.192 0.244 0.016 0.016 0.408 NA
#> SRR2105308 2 0.434 0.64797 0.032 0.692 0.000 0.004 0.264 NA
#> SRR2105309 2 0.347 0.66303 0.004 0.804 0.012 0.000 0.160 NA
#> SRR2105310 2 0.383 0.67281 0.012 0.764 0.016 0.000 0.200 NA
#> SRR2105305 2 0.548 0.58766 0.032 0.656 0.016 0.004 0.232 NA
#> SRR2105306 2 0.364 0.67191 0.000 0.788 0.008 0.004 0.172 NA
#> SRR2105303 2 0.396 0.66892 0.008 0.784 0.008 0.008 0.160 NA
#> SRR2105304 2 0.253 0.62537 0.000 0.876 0.000 0.004 0.096 NA
#> SRR2105301 2 0.588 0.54790 0.060 0.584 0.000 0.016 0.292 NA
#> SRR2105302 2 0.395 0.67755 0.008 0.788 0.004 0.012 0.152 NA
#> SRR2105299 2 0.588 0.56545 0.084 0.600 0.000 0.004 0.252 NA
#> SRR2105300 2 0.425 0.67932 0.016 0.760 0.008 0.008 0.180 NA
#> SRR2105297 1 0.719 0.27839 0.568 0.084 0.020 0.036 0.140 NA
#> SRR2105298 1 0.465 0.24699 0.764 0.028 0.016 0.012 0.136 NA
#> SRR2105295 2 0.363 0.66611 0.004 0.812 0.008 0.008 0.136 NA
#> SRR2105296 2 0.454 0.67244 0.044 0.764 0.012 0.008 0.144 NA
#> SRR2105293 2 0.675 0.46858 0.088 0.560 0.012 0.024 0.248 NA
#> SRR2105294 2 0.648 0.48811 0.116 0.580 0.012 0.008 0.224 NA
#> SRR2105291 2 0.741 -0.26261 0.008 0.412 0.084 0.024 0.348 NA
#> SRR2105292 2 0.709 0.10718 0.140 0.476 0.012 0.012 0.296 NA
#> SRR2105289 2 0.515 0.64950 0.036 0.692 0.012 0.004 0.208 NA
#> SRR2105290 2 0.528 0.59268 0.044 0.616 0.008 0.000 0.300 NA
#> SRR2105287 5 0.843 0.28889 0.244 0.260 0.008 0.032 0.268 NA
#> SRR2105288 2 0.687 0.08281 0.164 0.456 0.024 0.004 0.324 NA
#> SRR2105285 2 0.389 0.67754 0.012 0.792 0.016 0.000 0.148 NA
#> SRR2105286 2 0.392 0.67503 0.016 0.768 0.004 0.000 0.184 NA
#> SRR2105283 2 0.647 0.47630 0.096 0.560 0.016 0.000 0.252 NA
#> SRR2105284 2 0.434 0.65628 0.036 0.712 0.012 0.004 0.236 NA
#> SRR2105281 2 0.487 0.67219 0.032 0.728 0.028 0.000 0.172 NA
#> SRR2105282 2 0.345 0.66546 0.008 0.808 0.012 0.008 0.160 NA
#> SRR2105259 2 0.384 0.67225 0.008 0.792 0.016 0.008 0.160 NA
#> SRR2105260 2 0.348 0.67150 0.004 0.804 0.008 0.008 0.164 NA
#> SRR2105279 2 0.533 0.65045 0.024 0.700 0.008 0.024 0.176 NA
#> SRR2105280 2 0.347 0.67411 0.012 0.804 0.004 0.000 0.160 NA
#> SRR2105257 5 0.787 0.09609 0.252 0.184 0.008 0.008 0.372 NA
#> SRR2105258 5 0.870 0.07782 0.272 0.192 0.036 0.032 0.304 NA
#> SRR2105253 2 0.438 0.67566 0.024 0.756 0.008 0.008 0.176 NA
#> SRR2105254 2 0.326 0.66479 0.012 0.832 0.004 0.004 0.132 NA
#> SRR2105255 2 0.444 0.66141 0.024 0.728 0.008 0.000 0.208 NA
#> SRR2105256 2 0.515 0.62002 0.032 0.648 0.012 0.004 0.276 NA
#> SRR2105251 2 0.594 0.56490 0.080 0.624 0.020 0.004 0.232 NA
#> SRR2105252 2 0.532 0.61585 0.056 0.668 0.012 0.004 0.228 NA
#> SRR2105249 2 0.397 0.67479 0.020 0.804 0.016 0.004 0.124 NA
#> SRR2105250 2 0.518 0.63394 0.044 0.676 0.008 0.004 0.228 NA
#> SRR2105247 2 0.508 0.66810 0.036 0.716 0.028 0.004 0.180 NA
#> SRR2105248 2 0.656 0.31354 0.084 0.520 0.012 0.004 0.308 NA
#> SRR2105245 2 0.646 0.49105 0.084 0.564 0.016 0.008 0.268 NA
#> SRR2105246 2 0.504 0.65593 0.020 0.676 0.016 0.008 0.248 NA
#> SRR2105243 2 0.462 0.66772 0.020 0.736 0.012 0.004 0.184 NA
#> SRR2105244 2 0.658 0.33979 0.120 0.540 0.016 0.000 0.260 NA
#> SRR2105241 2 0.680 0.41669 0.076 0.520 0.032 0.004 0.296 NA
#> SRR2105242 2 0.700 0.18745 0.144 0.480 0.012 0.004 0.288 NA
#> SRR2105239 3 0.518 0.24237 0.012 0.084 0.740 0.012 0.072 NA
#> SRR2105240 2 0.736 -0.21224 0.172 0.412 0.012 0.020 0.332 NA
#> SRR2105237 2 0.454 0.67384 0.032 0.756 0.020 0.008 0.164 NA
#> SRR2105238 2 0.332 0.66928 0.008 0.820 0.004 0.004 0.148 NA
#> SRR2105235 2 0.402 0.68148 0.012 0.764 0.012 0.008 0.192 NA
#> SRR2105236 2 0.444 0.66742 0.032 0.748 0.012 0.000 0.176 NA
#> SRR2105233 2 0.399 0.66298 0.012 0.784 0.008 0.008 0.160 NA
#> SRR2105234 2 0.280 0.64329 0.004 0.868 0.000 0.012 0.096 NA
#> SRR2105231 2 0.559 0.64113 0.060 0.664 0.016 0.012 0.216 NA
#> SRR2105232 2 0.503 0.67390 0.028 0.712 0.028 0.004 0.192 NA
#> SRR2105227 2 0.641 0.53915 0.052 0.608 0.048 0.004 0.212 NA
#> SRR2105228 2 0.425 0.67586 0.016 0.744 0.004 0.008 0.204 NA
#> SRR2105225 2 0.576 0.59307 0.056 0.628 0.004 0.008 0.240 NA
#> SRR2105226 2 0.623 0.46287 0.092 0.564 0.016 0.008 0.288 NA
#> SRR2105229 2 0.487 0.66572 0.028 0.700 0.008 0.008 0.224 NA
#> SRR2105230 2 0.523 0.62732 0.024 0.648 0.024 0.004 0.272 NA
#> SRR2105219 2 0.731 0.22958 0.020 0.560 0.048 0.100 0.176 NA
#> SRR2105220 2 0.423 0.67862 0.012 0.744 0.004 0.008 0.204 NA
#> SRR2105221 2 0.855 -0.32386 0.060 0.412 0.068 0.080 0.248 NA
#> SRR2105222 2 0.696 -0.18128 0.176 0.392 0.004 0.008 0.372 NA
#> SRR2105223 5 0.736 0.27829 0.036 0.384 0.060 0.024 0.412 NA
#> SRR2105224 2 0.555 0.54321 0.076 0.608 0.000 0.008 0.280 NA
#> SRR2105217 2 0.968 -0.58680 0.108 0.256 0.112 0.148 0.232 NA
#> SRR2105218 2 0.540 0.58854 0.060 0.624 0.000 0.008 0.276 NA
#> SRR2105215 2 0.780 0.07726 0.060 0.524 0.032 0.156 0.136 NA
#> SRR2105216 2 0.325 0.65969 0.016 0.848 0.012 0.004 0.104 NA
#> SRR2105213 2 0.926 -0.51412 0.136 0.320 0.064 0.096 0.240 NA
#> SRR2105214 2 0.478 0.66942 0.028 0.704 0.016 0.012 0.228 NA
#> SRR2105211 2 0.939 -0.55620 0.052 0.300 0.176 0.132 0.208 NA
#> SRR2105212 2 0.466 0.66746 0.016 0.708 0.000 0.020 0.224 NA
#> SRR2105209 5 0.899 0.29959 0.028 0.264 0.140 0.092 0.304 NA
#> SRR2105210 2 0.697 0.22824 0.136 0.488 0.016 0.008 0.296 NA
#> SRR2105207 4 0.448 0.48489 0.016 0.024 0.048 0.788 0.020 NA
#> SRR2105208 2 0.719 -0.09007 0.160 0.432 0.028 0.016 0.336 NA
#> SRR2105205 2 0.917 -0.46211 0.088 0.348 0.060 0.160 0.204 NA
#> SRR2105206 2 0.668 0.32401 0.164 0.512 0.004 0.008 0.264 NA
#> SRR2105201 2 0.859 -0.47145 0.012 0.352 0.076 0.156 0.252 NA
#> SRR2105202 2 0.578 0.55181 0.052 0.620 0.012 0.004 0.256 NA
#> SRR2105203 2 0.544 0.62609 0.016 0.692 0.016 0.036 0.188 NA
#> SRR2105204 2 0.414 0.67389 0.020 0.768 0.008 0.008 0.176 NA
#> SRR2105199 2 0.780 0.14631 0.040 0.508 0.068 0.052 0.204 NA
#> SRR2105200 2 0.615 0.44192 0.072 0.568 0.020 0.000 0.288 NA
#> SRR2105197 2 0.865 -0.41652 0.064 0.376 0.064 0.060 0.240 NA
#> SRR2105198 2 0.779 -0.38043 0.164 0.396 0.008 0.012 0.264 NA
#> SRR2105195 2 0.961 -0.56622 0.112 0.264 0.096 0.120 0.228 NA
#> SRR2105196 2 0.646 0.20411 0.172 0.472 0.000 0.000 0.312 NA
#> SRR2105193 4 0.739 0.44817 0.144 0.036 0.048 0.560 0.060 NA
#> SRR2105194 1 0.752 -0.27072 0.392 0.252 0.020 0.008 0.272 NA
#> SRR2105191 3 0.488 0.19472 0.004 0.052 0.748 0.008 0.084 NA
#> SRR2105192 1 0.773 0.17687 0.344 0.148 0.012 0.004 0.332 NA
#> SRR2105189 2 0.720 0.40753 0.012 0.572 0.068 0.084 0.164 NA
#> SRR2105190 2 0.329 0.67164 0.016 0.812 0.000 0.008 0.160 NA
#> SRR2105187 2 0.901 -0.50845 0.100 0.340 0.044 0.096 0.196 NA
#> SRR2105188 2 0.751 -0.23573 0.124 0.380 0.012 0.012 0.360 NA
#> SRR2105179 3 0.914 0.10678 0.120 0.144 0.356 0.044 0.172 NA
#> SRR2105180 1 0.775 -0.32350 0.332 0.252 0.016 0.008 0.308 NA
#> SRR2105183 2 0.658 0.49428 0.020 0.616 0.024 0.072 0.180 NA
#> SRR2105184 2 0.575 0.56873 0.092 0.600 0.024 0.004 0.272 NA
#> SRR2105185 2 0.750 0.24618 0.024 0.540 0.056 0.100 0.192 NA
#> SRR2105186 2 0.634 0.43568 0.092 0.568 0.016 0.004 0.268 NA
#> SRR2105181 2 0.877 -0.47376 0.056 0.352 0.100 0.060 0.280 NA
#> SRR2105182 2 0.587 0.53517 0.072 0.580 0.020 0.012 0.304 NA
#> SRR2105177 4 0.284 0.52802 0.036 0.040 0.004 0.888 0.016 NA
#> SRR2105178 1 0.396 0.17321 0.808 0.012 0.008 0.040 0.116 NA
#> SRR2105171 2 0.517 0.66441 0.020 0.712 0.020 0.020 0.184 NA
#> SRR2105172 2 0.408 0.67488 0.016 0.752 0.008 0.000 0.200 NA
#> SRR2105175 4 0.866 0.20205 0.216 0.056 0.036 0.380 0.120 NA
#> SRR2105176 1 0.492 0.27013 0.756 0.040 0.012 0.036 0.124 NA
#> SRR2105173 2 0.606 0.52690 0.088 0.612 0.008 0.004 0.224 NA
#> SRR2105174 2 0.512 0.66278 0.040 0.700 0.032 0.000 0.196 NA
#> SRR2105169 2 0.541 0.62128 0.052 0.660 0.016 0.000 0.228 NA
#> SRR2105170 2 0.673 0.37216 0.144 0.540 0.008 0.024 0.248 NA
#> SRR2105167 2 0.381 0.67421 0.012 0.788 0.004 0.016 0.168 NA
#> SRR2105168 2 0.453 0.66301 0.016 0.712 0.012 0.004 0.232 NA
#> SRR2105165 2 0.762 -0.36245 0.192 0.376 0.012 0.008 0.316 NA
#> SRR2105166 2 0.661 0.24810 0.128 0.488 0.004 0.008 0.324 NA
#> SRR2105163 2 0.688 0.31211 0.112 0.512 0.020 0.012 0.292 NA
#> SRR2105164 2 0.632 0.44288 0.108 0.564 0.016 0.004 0.268 NA
#> SRR2105161 5 0.798 0.12418 0.276 0.216 0.016 0.000 0.300 NA
#> SRR2105162 2 0.750 -0.49227 0.284 0.336 0.008 0.008 0.296 NA
#> SRR2105155 2 0.507 0.62691 0.020 0.692 0.008 0.008 0.212 NA
#> SRR2105156 2 0.375 0.67425 0.028 0.788 0.004 0.000 0.164 NA
#> SRR2105157 2 0.675 0.50257 0.104 0.580 0.028 0.012 0.212 NA
#> SRR2105158 2 0.650 0.46082 0.136 0.568 0.016 0.008 0.232 NA
#> SRR2105159 2 0.910 -0.59731 0.208 0.312 0.036 0.104 0.224 NA
#> SRR2105160 2 0.621 0.38724 0.088 0.516 0.012 0.000 0.340 NA
#> SRR2105153 2 0.555 0.64632 0.068 0.672 0.028 0.012 0.204 NA
#> SRR2105154 2 0.580 0.57136 0.084 0.612 0.008 0.012 0.260 NA
#> SRR2105151 2 0.724 0.22694 0.088 0.528 0.020 0.028 0.240 NA
#> SRR2105152 2 0.393 0.67318 0.008 0.772 0.012 0.004 0.184 NA
#> SRR2105149 2 0.540 0.64969 0.040 0.676 0.020 0.012 0.220 NA
#> SRR2105150 2 0.399 0.66417 0.016 0.728 0.004 0.000 0.240 NA
#> SRR2105147 2 0.286 0.63116 0.004 0.864 0.004 0.004 0.100 NA
#> SRR2105148 2 0.286 0.63116 0.004 0.864 0.004 0.004 0.100 NA
#> SRR2105143 2 0.811 -0.40340 0.116 0.384 0.048 0.024 0.324 NA
#> SRR2105144 2 0.482 0.65182 0.028 0.696 0.016 0.008 0.236 NA
#> SRR2105145 1 0.898 0.25063 0.340 0.152 0.036 0.076 0.192 NA
#> SRR2105146 2 0.777 -0.39495 0.188 0.352 0.004 0.016 0.316 NA
#> SRR2105141 2 0.595 0.52738 0.096 0.588 0.016 0.000 0.268 NA
#> SRR2105142 2 0.521 0.60573 0.080 0.668 0.008 0.000 0.220 NA
#> SRR2105139 2 0.436 0.67308 0.024 0.744 0.000 0.008 0.188 NA
#> SRR2105140 2 0.470 0.66881 0.024 0.712 0.008 0.004 0.216 NA
#> SRR2105137 2 0.434 0.66693 0.000 0.744 0.012 0.012 0.188 NA
#> SRR2105138 2 0.625 0.40492 0.088 0.556 0.012 0.004 0.292 NA
#> SRR2105135 2 0.407 0.67544 0.016 0.776 0.000 0.008 0.156 NA
#> SRR2105136 2 0.340 0.66735 0.004 0.808 0.004 0.004 0.160 NA
#> SRR2105133 2 0.593 0.55289 0.048 0.604 0.024 0.004 0.272 NA
#> SRR2105134 2 0.586 0.53318 0.060 0.584 0.012 0.000 0.292 NA
#> SRR2105131 2 0.643 0.40108 0.040 0.556 0.028 0.012 0.296 NA
#> SRR2105132 2 0.765 -0.20488 0.132 0.412 0.028 0.024 0.336 NA
#> SRR2105129 1 0.769 0.11788 0.420 0.196 0.012 0.016 0.260 NA
#> SRR2105130 1 0.598 0.34497 0.636 0.040 0.016 0.016 0.220 NA
#> SRR2105127 5 0.816 0.43856 0.168 0.264 0.024 0.012 0.364 NA
#> SRR2105128 2 0.609 0.46685 0.088 0.556 0.016 0.004 0.308 NA
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.388 0.725 0.872 0.4818 0.511 0.511
#> 3 3 0.220 0.399 0.657 0.3434 0.796 0.623
#> 4 4 0.295 0.404 0.624 0.1268 0.724 0.390
#> 5 5 0.362 0.371 0.598 0.0695 0.828 0.472
#> 6 6 0.424 0.312 0.547 0.0427 0.918 0.672
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.9460 0.5341 0.636 0.364
#> SRR2105278 1 0.8861 0.6267 0.696 0.304
#> SRR2105275 1 0.9129 0.5177 0.672 0.328
#> SRR2105276 1 0.4815 0.7796 0.896 0.104
#> SRR2105273 2 0.8207 0.6221 0.256 0.744
#> SRR2105274 1 0.4562 0.7966 0.904 0.096
#> SRR2105271 1 0.9393 0.5631 0.644 0.356
#> SRR2105272 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105269 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.1184 0.8713 0.016 0.984
#> SRR2105267 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0672 0.8733 0.008 0.992
#> SRR2105265 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105266 2 0.2423 0.8580 0.040 0.960
#> SRR2105263 1 0.9170 0.5029 0.668 0.332
#> SRR2105264 1 0.2043 0.8028 0.968 0.032
#> SRR2105261 2 0.8207 0.6303 0.256 0.744
#> SRR2105262 2 0.7674 0.6521 0.224 0.776
#> SRR2105357 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105358 1 0.9933 0.3331 0.548 0.452
#> SRR2105439 2 0.3274 0.8471 0.060 0.940
#> SRR2105440 2 0.2236 0.8624 0.036 0.964
#> SRR2105509 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105507 2 0.8661 0.5645 0.288 0.712
#> SRR2105508 2 0.3431 0.8480 0.064 0.936
#> SRR2105505 1 0.9248 0.5735 0.660 0.340
#> SRR2105506 1 0.7056 0.7396 0.808 0.192
#> SRR2105503 2 0.7745 0.6653 0.228 0.772
#> SRR2105504 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105502 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.2423 0.8061 0.960 0.040
#> SRR2105500 1 0.8016 0.7004 0.756 0.244
#> SRR2105497 2 0.8016 0.6305 0.244 0.756
#> SRR2105498 1 0.9993 0.1079 0.516 0.484
#> SRR2105495 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.2948 0.8551 0.052 0.948
#> SRR2105493 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105494 2 0.1414 0.8702 0.020 0.980
#> SRR2105491 1 0.7299 0.6923 0.796 0.204
#> SRR2105492 1 0.2043 0.8015 0.968 0.032
#> SRR2105489 1 0.9775 0.3283 0.588 0.412
#> SRR2105490 1 0.9358 0.5597 0.648 0.352
#> SRR2105487 1 0.1843 0.8061 0.972 0.028
#> SRR2105488 1 0.3879 0.7982 0.924 0.076
#> SRR2105485 2 0.9170 0.3961 0.332 0.668
#> SRR2105486 1 0.8661 0.6494 0.712 0.288
#> SRR2105483 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105484 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105481 1 0.6247 0.7729 0.844 0.156
#> SRR2105482 1 0.1843 0.8064 0.972 0.028
#> SRR2105479 1 0.8016 0.6491 0.756 0.244
#> SRR2105480 1 0.0672 0.8036 0.992 0.008
#> SRR2105477 1 0.7453 0.7106 0.788 0.212
#> SRR2105478 1 0.9552 0.4315 0.624 0.376
#> SRR2105475 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105473 1 0.8555 0.6545 0.720 0.280
#> SRR2105474 1 0.9460 0.5352 0.636 0.364
#> SRR2105471 1 0.1633 0.8061 0.976 0.024
#> SRR2105472 1 0.2423 0.8052 0.960 0.040
#> SRR2105469 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105470 1 0.9896 0.3721 0.560 0.440
#> SRR2105467 1 0.6973 0.7565 0.812 0.188
#> SRR2105468 1 0.9044 0.6067 0.680 0.320
#> SRR2105465 1 0.8661 0.6492 0.712 0.288
#> SRR2105466 1 0.1414 0.8057 0.980 0.020
#> SRR2105463 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105464 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105461 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105457 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105458 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105455 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105456 2 0.5946 0.7605 0.144 0.856
#> SRR2105453 1 0.8909 0.6238 0.692 0.308
#> SRR2105454 1 0.7056 0.7395 0.808 0.192
#> SRR2105451 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105452 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105449 1 0.2423 0.8003 0.960 0.040
#> SRR2105450 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105447 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105445 2 0.0376 0.8741 0.004 0.996
#> SRR2105446 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105443 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105444 2 0.8909 0.4637 0.308 0.692
#> SRR2105441 2 0.9286 0.3848 0.344 0.656
#> SRR2105442 1 0.4690 0.7923 0.900 0.100
#> SRR2105437 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105438 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105435 2 0.9866 0.1149 0.432 0.568
#> SRR2105436 1 0.8608 0.6533 0.716 0.284
#> SRR2105433 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105434 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105431 1 0.0672 0.8042 0.992 0.008
#> SRR2105432 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105429 1 0.8555 0.6263 0.720 0.280
#> SRR2105430 2 0.9608 0.3042 0.384 0.616
#> SRR2105427 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.1843 0.8650 0.028 0.972
#> SRR2105425 2 0.1184 0.8722 0.016 0.984
#> SRR2105426 2 0.6247 0.7665 0.156 0.844
#> SRR2105421 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105422 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105419 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105420 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105415 1 0.1184 0.8053 0.984 0.016
#> SRR2105416 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105417 1 0.7528 0.7291 0.784 0.216
#> SRR2105418 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105413 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.9833 0.2462 0.424 0.576
#> SRR2105410 1 0.1633 0.8058 0.976 0.024
#> SRR2105411 2 0.3114 0.8494 0.056 0.944
#> SRR2105412 2 0.6531 0.7354 0.168 0.832
#> SRR2105407 2 0.1184 0.8704 0.016 0.984
#> SRR2105408 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105403 2 0.2778 0.8523 0.048 0.952
#> SRR2105404 2 0.9393 0.3208 0.356 0.644
#> SRR2105405 2 0.0938 0.8727 0.012 0.988
#> SRR2105406 1 0.9460 0.5342 0.636 0.364
#> SRR2105401 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105402 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105399 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105400 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105397 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105398 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105395 2 0.8443 0.5947 0.272 0.728
#> SRR2105396 2 1.0000 -0.1813 0.496 0.504
#> SRR2105393 2 0.2423 0.8621 0.040 0.960
#> SRR2105394 2 0.0672 0.8736 0.008 0.992
#> SRR2105389 2 0.2043 0.8643 0.032 0.968
#> SRR2105390 2 0.9580 0.3934 0.380 0.620
#> SRR2105391 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105392 2 0.1184 0.8702 0.016 0.984
#> SRR2105385 1 0.6623 0.7312 0.828 0.172
#> SRR2105386 2 0.8443 0.6002 0.272 0.728
#> SRR2105387 2 0.4690 0.8241 0.100 0.900
#> SRR2105388 1 0.9933 0.3365 0.548 0.452
#> SRR2105381 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105382 2 0.2603 0.8550 0.044 0.956
#> SRR2105383 2 0.6887 0.7175 0.184 0.816
#> SRR2105384 1 0.9087 0.6020 0.676 0.324
#> SRR2105379 2 0.4022 0.8290 0.080 0.920
#> SRR2105380 2 0.9286 0.4502 0.344 0.656
#> SRR2105377 2 0.8608 0.5199 0.284 0.716
#> SRR2105378 1 0.1843 0.8069 0.972 0.028
#> SRR2105375 2 0.9963 -0.0487 0.464 0.536
#> SRR2105376 1 0.9427 0.5381 0.640 0.360
#> SRR2105373 1 0.7745 0.7223 0.772 0.228
#> SRR2105374 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105371 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105372 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105369 2 0.0672 0.8734 0.008 0.992
#> SRR2105370 1 1.0000 0.1905 0.500 0.500
#> SRR2105367 1 0.7674 0.7162 0.776 0.224
#> SRR2105368 1 0.1633 0.8059 0.976 0.024
#> SRR2105365 1 0.9552 0.4011 0.624 0.376
#> SRR2105366 1 0.9552 0.4081 0.624 0.376
#> SRR2105363 2 0.0938 0.8724 0.012 0.988
#> SRR2105364 2 0.2423 0.8620 0.040 0.960
#> SRR2105361 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0376 0.8739 0.004 0.996
#> SRR2105359 2 0.9209 0.3973 0.336 0.664
#> SRR2105360 2 0.0376 0.8741 0.004 0.996
#> SRR2105355 2 0.1843 0.8666 0.028 0.972
#> SRR2105356 2 0.9954 -0.0519 0.460 0.540
#> SRR2105353 2 0.7674 0.6634 0.224 0.776
#> SRR2105354 1 0.9044 0.5851 0.680 0.320
#> SRR2105351 2 0.5294 0.7973 0.120 0.880
#> SRR2105352 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105349 2 0.2423 0.8581 0.040 0.960
#> SRR2105350 2 0.2236 0.8641 0.036 0.964
#> SRR2105345 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105346 2 0.9580 0.2639 0.380 0.620
#> SRR2105347 1 0.3431 0.8006 0.936 0.064
#> SRR2105348 1 0.6887 0.7457 0.816 0.184
#> SRR2105343 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105341 2 0.4161 0.8337 0.084 0.916
#> SRR2105342 2 0.4298 0.8205 0.088 0.912
#> SRR2105339 2 0.5059 0.8058 0.112 0.888
#> SRR2105340 2 0.9933 0.1558 0.452 0.548
#> SRR2105335 1 0.7883 0.7149 0.764 0.236
#> SRR2105336 1 0.2236 0.8057 0.964 0.036
#> SRR2105337 1 1.0000 0.0383 0.504 0.496
#> SRR2105338 1 0.1633 0.8066 0.976 0.024
#> SRR2105331 2 0.9209 0.4670 0.336 0.664
#> SRR2105332 1 0.9922 0.1916 0.552 0.448
#> SRR2105333 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105330 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105327 2 0.0672 0.8732 0.008 0.992
#> SRR2105328 2 0.2236 0.8611 0.036 0.964
#> SRR2105325 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105326 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105323 2 0.1633 0.8679 0.024 0.976
#> SRR2105324 2 0.7299 0.6717 0.204 0.796
#> SRR2105319 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105320 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105321 1 0.9933 0.1955 0.548 0.452
#> SRR2105322 1 0.1184 0.8039 0.984 0.016
#> SRR2105317 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105316 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105311 2 0.9635 0.3430 0.388 0.612
#> SRR2105312 1 0.9323 0.4708 0.652 0.348
#> SRR2105307 1 0.7745 0.7142 0.772 0.228
#> SRR2105308 1 0.9358 0.5512 0.648 0.352
#> SRR2105309 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105310 2 0.8608 0.5285 0.284 0.716
#> SRR2105305 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105306 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.7139 0.7151 0.196 0.804
#> SRR2105302 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105299 2 0.9170 0.4832 0.332 0.668
#> SRR2105300 2 0.5178 0.7968 0.116 0.884
#> SRR2105297 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105298 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105295 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.5842 0.7705 0.140 0.860
#> SRR2105293 2 0.9000 0.5081 0.316 0.684
#> SRR2105294 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105291 2 0.4431 0.8214 0.092 0.908
#> SRR2105292 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105289 2 0.0376 0.8740 0.004 0.996
#> SRR2105290 1 0.5408 0.7799 0.876 0.124
#> SRR2105287 1 0.7219 0.7353 0.800 0.200
#> SRR2105288 1 0.1184 0.8056 0.984 0.016
#> SRR2105285 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0376 0.8739 0.004 0.996
#> SRR2105283 2 0.9954 0.0975 0.460 0.540
#> SRR2105284 1 0.9580 0.5030 0.620 0.380
#> SRR2105281 2 0.3733 0.8407 0.072 0.928
#> SRR2105282 2 0.1414 0.8703 0.020 0.980
#> SRR2105259 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105260 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0672 0.8734 0.008 0.992
#> SRR2105257 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105258 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105253 2 0.1633 0.8684 0.024 0.976
#> SRR2105254 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105255 2 0.9170 0.4041 0.332 0.668
#> SRR2105256 1 0.9661 0.4791 0.608 0.392
#> SRR2105251 2 0.3879 0.8394 0.076 0.924
#> SRR2105252 2 0.5059 0.8101 0.112 0.888
#> SRR2105249 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105250 1 0.9795 0.4264 0.584 0.416
#> SRR2105247 2 0.5294 0.7948 0.120 0.880
#> SRR2105248 1 0.9580 0.4027 0.620 0.380
#> SRR2105245 1 0.7883 0.6884 0.764 0.236
#> SRR2105246 2 0.3584 0.8399 0.068 0.932
#> SRR2105243 2 0.4562 0.8173 0.096 0.904
#> SRR2105244 1 0.8813 0.5945 0.700 0.300
#> SRR2105241 2 0.9993 -0.0174 0.484 0.516
#> SRR2105242 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105239 2 0.4431 0.8252 0.092 0.908
#> SRR2105240 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105237 2 0.1184 0.8703 0.016 0.984
#> SRR2105238 2 0.0672 0.8732 0.008 0.992
#> SRR2105235 2 0.1414 0.8698 0.020 0.980
#> SRR2105236 2 0.9000 0.4464 0.316 0.684
#> SRR2105233 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.7602 0.6825 0.220 0.780
#> SRR2105232 2 0.9635 0.3445 0.388 0.612
#> SRR2105227 2 0.8713 0.5593 0.292 0.708
#> SRR2105228 2 0.7602 0.6518 0.220 0.780
#> SRR2105225 2 0.9358 0.3502 0.352 0.648
#> SRR2105226 1 0.7745 0.7180 0.772 0.228
#> SRR2105229 2 0.0672 0.8735 0.008 0.992
#> SRR2105230 1 0.8608 0.6522 0.716 0.284
#> SRR2105219 2 0.0376 0.8726 0.004 0.996
#> SRR2105220 2 0.1843 0.8667 0.028 0.972
#> SRR2105221 1 0.9896 0.3637 0.560 0.440
#> SRR2105222 1 0.0672 0.8042 0.992 0.008
#> SRR2105223 1 0.9580 0.4785 0.620 0.380
#> SRR2105224 1 0.3274 0.8031 0.940 0.060
#> SRR2105217 1 0.7528 0.6746 0.784 0.216
#> SRR2105218 1 0.6048 0.7672 0.852 0.148
#> SRR2105215 2 0.4161 0.8320 0.084 0.916
#> SRR2105216 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.9522 0.4219 0.628 0.372
#> SRR2105214 2 0.9248 0.4556 0.340 0.660
#> SRR2105211 2 0.1843 0.8677 0.028 0.972
#> SRR2105212 2 0.1414 0.8710 0.020 0.980
#> SRR2105209 1 0.7528 0.7378 0.784 0.216
#> SRR2105210 1 0.1184 0.8056 0.984 0.016
#> SRR2105207 1 0.7883 0.6841 0.764 0.236
#> SRR2105208 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105205 2 0.9044 0.5034 0.320 0.680
#> SRR2105206 1 0.9000 0.5370 0.684 0.316
#> SRR2105201 2 0.6247 0.7559 0.156 0.844
#> SRR2105202 1 0.9944 0.3249 0.544 0.456
#> SRR2105203 2 0.0672 0.8731 0.008 0.992
#> SRR2105204 2 0.0672 0.8736 0.008 0.992
#> SRR2105199 2 0.7815 0.6387 0.232 0.768
#> SRR2105200 1 0.7219 0.7336 0.800 0.200
#> SRR2105197 1 0.9732 0.4510 0.596 0.404
#> SRR2105198 1 0.5178 0.7839 0.884 0.116
#> SRR2105195 1 0.5737 0.7572 0.864 0.136
#> SRR2105196 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105193 1 0.0000 0.8013 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105191 2 0.2423 0.8609 0.040 0.960
#> SRR2105192 1 0.1843 0.8059 0.972 0.028
#> SRR2105189 2 0.0672 0.8726 0.008 0.992
#> SRR2105190 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105187 1 0.9983 0.1308 0.524 0.476
#> SRR2105188 1 0.2778 0.8040 0.952 0.048
#> SRR2105179 1 0.3431 0.8024 0.936 0.064
#> SRR2105180 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105183 2 0.4161 0.8316 0.084 0.916
#> SRR2105184 1 0.2423 0.8049 0.960 0.040
#> SRR2105185 2 0.0376 0.8726 0.004 0.996
#> SRR2105186 1 0.6801 0.7529 0.820 0.180
#> SRR2105181 1 0.8661 0.6515 0.712 0.288
#> SRR2105182 1 0.9170 0.5913 0.668 0.332
#> SRR2105177 1 0.6148 0.7468 0.848 0.152
#> SRR2105178 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105171 2 0.0672 0.8735 0.008 0.992
#> SRR2105172 2 0.3584 0.8416 0.068 0.932
#> SRR2105175 1 0.0000 0.8013 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105173 2 0.6712 0.7402 0.176 0.824
#> SRR2105174 2 0.8661 0.5645 0.288 0.712
#> SRR2105169 2 0.7299 0.7016 0.204 0.796
#> SRR2105170 1 0.1184 0.8047 0.984 0.016
#> SRR2105167 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.6048 0.7614 0.148 0.852
#> SRR2105165 1 0.2778 0.7993 0.952 0.048
#> SRR2105166 1 0.0672 0.8037 0.992 0.008
#> SRR2105163 2 0.8813 0.5376 0.300 0.700
#> SRR2105164 1 0.7602 0.6824 0.780 0.220
#> SRR2105161 1 0.4022 0.7894 0.920 0.080
#> SRR2105162 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105155 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.2948 0.8530 0.052 0.948
#> SRR2105157 2 0.9983 0.0765 0.476 0.524
#> SRR2105158 1 0.9323 0.4668 0.652 0.348
#> SRR2105159 1 0.2778 0.7989 0.952 0.048
#> SRR2105160 1 0.0672 0.8042 0.992 0.008
#> SRR2105153 2 0.9866 0.2222 0.432 0.568
#> SRR2105154 1 0.7376 0.6875 0.792 0.208
#> SRR2105151 2 0.4562 0.8290 0.096 0.904
#> SRR2105152 2 0.1633 0.8682 0.024 0.976
#> SRR2105149 2 0.1633 0.8669 0.024 0.976
#> SRR2105150 2 0.9170 0.3982 0.332 0.668
#> SRR2105147 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105148 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105143 1 0.7602 0.7374 0.780 0.220
#> SRR2105144 1 0.9170 0.5851 0.668 0.332
#> SRR2105145 1 0.0672 0.8041 0.992 0.008
#> SRR2105146 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105141 2 0.9358 0.4303 0.352 0.648
#> SRR2105142 2 0.9209 0.4679 0.336 0.664
#> SRR2105139 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.3114 0.8551 0.056 0.944
#> SRR2105137 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105138 1 0.5519 0.7785 0.872 0.128
#> SRR2105135 2 0.0000 0.8745 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0376 0.8739 0.004 0.996
#> SRR2105133 2 0.9087 0.4258 0.324 0.676
#> SRR2105134 1 0.9044 0.6016 0.680 0.320
#> SRR2105131 2 0.2603 0.8590 0.044 0.956
#> SRR2105132 1 0.2948 0.8038 0.948 0.052
#> SRR2105129 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105130 1 0.0376 0.8034 0.996 0.004
#> SRR2105127 1 0.6712 0.7524 0.824 0.176
#> SRR2105128 1 0.8909 0.6196 0.692 0.308
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.8786 0.27772 0.424 0.112 0.464
#> SRR2105278 1 0.7969 -0.16579 0.508 0.060 0.432
#> SRR2105275 1 0.9431 0.28120 0.424 0.176 0.400
#> SRR2105276 1 0.7832 0.39042 0.496 0.052 0.452
#> SRR2105273 3 0.8213 0.16879 0.088 0.344 0.568
#> SRR2105274 1 0.7748 -0.06527 0.500 0.048 0.452
#> SRR2105271 3 0.9787 0.40141 0.320 0.252 0.428
#> SRR2105272 1 0.1411 0.53676 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105269 2 0.2625 0.69320 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105270 2 0.6359 0.54868 0.008 0.628 0.364
#> SRR2105267 2 0.1860 0.69534 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105268 2 0.6111 0.50808 0.000 0.604 0.396
#> SRR2105265 2 0.5848 0.61743 0.012 0.720 0.268
#> SRR2105266 2 0.7284 0.51718 0.044 0.620 0.336
#> SRR2105263 1 0.9306 0.28796 0.480 0.172 0.348
#> SRR2105264 1 0.6294 0.49191 0.692 0.020 0.288
#> SRR2105261 2 0.8891 0.05965 0.120 0.448 0.432
#> SRR2105262 3 0.8009 -0.08005 0.064 0.412 0.524
#> SRR2105357 2 0.4702 0.67939 0.000 0.788 0.212
#> SRR2105358 3 0.8935 0.38497 0.352 0.136 0.512
#> SRR2105439 2 0.7558 0.42383 0.044 0.556 0.400
#> SRR2105440 2 0.7589 0.45448 0.052 0.588 0.360
#> SRR2105509 2 0.1643 0.68631 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105510 2 0.1529 0.68557 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105507 2 0.9281 0.26361 0.204 0.520 0.276
#> SRR2105508 2 0.6396 0.48550 0.016 0.664 0.320
#> SRR2105505 3 0.9266 0.30717 0.420 0.156 0.424
#> SRR2105506 1 0.7785 -0.11755 0.528 0.052 0.420
#> SRR2105503 2 0.8336 0.42297 0.152 0.624 0.224
#> SRR2105504 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105501 2 0.4555 0.67835 0.000 0.800 0.200
#> SRR2105502 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105499 1 0.6632 0.08095 0.596 0.012 0.392
#> SRR2105500 3 0.7464 0.28242 0.400 0.040 0.560
#> SRR2105497 2 0.8987 0.18782 0.192 0.560 0.248
#> SRR2105498 1 0.9970 -0.18806 0.372 0.312 0.316
#> SRR2105495 2 0.4605 0.68180 0.000 0.796 0.204
#> SRR2105496 2 0.6818 0.55657 0.024 0.628 0.348
#> SRR2105493 2 0.3879 0.70296 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105494 2 0.6192 0.48095 0.000 0.580 0.420
#> SRR2105491 1 0.8071 0.39555 0.548 0.072 0.380
#> SRR2105492 1 0.6252 0.46554 0.648 0.008 0.344
#> SRR2105489 3 0.9896 -0.05529 0.360 0.264 0.376
#> SRR2105490 3 0.9229 0.41212 0.336 0.168 0.496
#> SRR2105487 1 0.5541 0.39986 0.740 0.008 0.252
#> SRR2105488 1 0.6667 0.10418 0.616 0.016 0.368
#> SRR2105485 3 0.9491 0.35820 0.220 0.292 0.488
#> SRR2105486 3 0.8892 0.28939 0.440 0.120 0.440
#> SRR2105483 1 0.0592 0.52614 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105484 1 0.0892 0.52401 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105481 1 0.8842 0.32947 0.452 0.116 0.432
#> SRR2105482 1 0.5815 0.43356 0.692 0.004 0.304
#> SRR2105479 1 0.8878 0.35047 0.492 0.124 0.384
#> SRR2105480 1 0.6339 0.46158 0.632 0.008 0.360
#> SRR2105477 1 0.9098 0.32138 0.456 0.140 0.404
#> SRR2105478 3 0.9266 -0.28653 0.420 0.156 0.424
#> SRR2105475 2 0.2625 0.69848 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105476 2 0.2860 0.68796 0.004 0.912 0.084
#> SRR2105473 3 0.8342 0.24898 0.460 0.080 0.460
#> SRR2105474 3 0.9392 0.37155 0.392 0.172 0.436
#> SRR2105471 1 0.5737 0.46710 0.732 0.012 0.256
#> SRR2105472 1 0.6730 0.46399 0.680 0.036 0.284
#> SRR2105469 2 0.4931 0.65304 0.000 0.768 0.232
#> SRR2105470 3 0.9248 0.43986 0.296 0.188 0.516
#> SRR2105467 3 0.7636 0.18664 0.396 0.048 0.556
#> SRR2105468 1 0.8889 -0.27197 0.452 0.120 0.428
#> SRR2105465 1 0.8744 -0.26069 0.448 0.108 0.444
#> SRR2105466 1 0.4741 0.45809 0.828 0.020 0.152
#> SRR2105463 1 0.2261 0.53268 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105464 1 0.0592 0.52868 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105461 2 0.1411 0.69077 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105462 2 0.5656 0.62511 0.008 0.728 0.264
#> SRR2105459 2 0.3038 0.69710 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105460 2 0.0747 0.68035 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105457 2 0.5254 0.66872 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105458 2 0.3816 0.69442 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105455 2 0.3038 0.70053 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105456 2 0.7990 0.36749 0.064 0.532 0.404
#> SRR2105453 3 0.7814 0.26113 0.436 0.052 0.512
#> SRR2105454 1 0.7156 -0.01252 0.572 0.028 0.400
#> SRR2105451 2 0.4750 0.68211 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105452 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105449 1 0.5595 0.46681 0.756 0.016 0.228
#> SRR2105450 1 0.6244 0.00505 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105447 2 0.3038 0.70197 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105448 2 0.3412 0.70026 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105445 2 0.6667 0.52557 0.016 0.616 0.368
#> SRR2105446 2 0.6798 0.49211 0.016 0.584 0.400
#> SRR2105443 2 0.3482 0.70320 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105444 3 0.8610 0.17038 0.116 0.336 0.548
#> SRR2105441 3 0.9048 0.45279 0.268 0.184 0.548
#> SRR2105442 1 0.7453 -0.11668 0.528 0.036 0.436
#> SRR2105437 1 0.2959 0.54012 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105438 1 0.3482 0.53635 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105435 3 0.9644 0.40754 0.276 0.256 0.468
#> SRR2105436 3 0.8710 0.34526 0.380 0.112 0.508
#> SRR2105433 1 0.3129 0.53803 0.904 0.008 0.088
#> SRR2105434 1 0.4575 0.51730 0.812 0.004 0.184
#> SRR2105431 1 0.1289 0.53060 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105432 1 0.1860 0.53920 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105429 3 0.9483 -0.00607 0.364 0.188 0.448
#> SRR2105430 3 0.9061 0.11949 0.148 0.348 0.504
#> SRR2105427 2 0.2165 0.69013 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105428 2 0.5845 0.61957 0.004 0.688 0.308
#> SRR2105425 2 0.6742 0.56780 0.028 0.656 0.316
#> SRR2105426 2 0.8440 0.31026 0.088 0.492 0.420
#> SRR2105421 2 0.3267 0.70214 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105422 2 0.5016 0.63037 0.000 0.760 0.240
#> SRR2105423 2 0.1964 0.68334 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105424 2 0.5178 0.65012 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105419 2 0.3686 0.68114 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105420 2 0.4750 0.68684 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105415 1 0.3686 0.51115 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105416 1 0.3340 0.47066 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105417 1 0.7553 0.30363 0.620 0.060 0.320
#> SRR2105418 1 0.3412 0.46138 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105413 2 0.2448 0.69413 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105414 2 0.3116 0.69982 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105409 3 0.9895 0.15727 0.284 0.312 0.404
#> SRR2105410 1 0.6451 0.47574 0.684 0.024 0.292
#> SRR2105411 2 0.6869 0.57538 0.048 0.688 0.264
#> SRR2105412 2 0.8280 0.29863 0.080 0.516 0.404
#> SRR2105407 2 0.4351 0.69850 0.004 0.828 0.168
#> SRR2105408 2 0.5016 0.65678 0.000 0.760 0.240
#> SRR2105403 2 0.6255 0.58357 0.016 0.684 0.300
#> SRR2105404 2 0.9777 -0.19511 0.280 0.440 0.280
#> SRR2105405 2 0.6969 0.52100 0.024 0.596 0.380
#> SRR2105406 3 0.8509 0.33642 0.392 0.096 0.512
#> SRR2105401 2 0.1163 0.68516 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105402 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105399 2 0.3038 0.70067 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105400 2 0.0592 0.68562 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105397 2 0.5327 0.50395 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105398 2 0.6079 0.45388 0.000 0.612 0.388
#> SRR2105395 2 0.9371 0.02822 0.172 0.452 0.376
#> SRR2105396 3 0.9386 0.41611 0.244 0.244 0.512
#> SRR2105393 3 0.7295 -0.31059 0.028 0.480 0.492
#> SRR2105394 2 0.4811 0.69573 0.024 0.828 0.148
#> SRR2105389 2 0.6675 0.39533 0.012 0.584 0.404
#> SRR2105390 3 0.8694 0.21465 0.152 0.268 0.580
#> SRR2105391 2 0.4346 0.65392 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105392 2 0.6247 0.43590 0.004 0.620 0.376
#> SRR2105385 1 0.7984 0.37027 0.496 0.060 0.444
#> SRR2105386 2 0.9151 0.13319 0.144 0.436 0.420
#> SRR2105387 2 0.7186 0.55484 0.040 0.624 0.336
#> SRR2105388 3 0.9833 0.42771 0.332 0.256 0.412
#> SRR2105381 2 0.3551 0.68138 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105382 2 0.5627 0.62134 0.032 0.780 0.188
#> SRR2105383 3 0.9070 0.24872 0.164 0.308 0.528
#> SRR2105384 3 0.8688 0.36455 0.372 0.112 0.516
#> SRR2105379 2 0.5229 0.60123 0.068 0.828 0.104
#> SRR2105380 3 0.9916 -0.06618 0.288 0.316 0.396
#> SRR2105377 3 0.8971 0.21031 0.144 0.336 0.520
#> SRR2105378 1 0.6189 0.21944 0.632 0.004 0.364
#> SRR2105375 3 0.9151 0.43368 0.228 0.228 0.544
#> SRR2105376 3 0.8045 0.27348 0.432 0.064 0.504
#> SRR2105373 3 0.8402 0.00789 0.376 0.092 0.532
#> SRR2105374 1 0.4452 0.52390 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105371 2 0.4399 0.69044 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105372 2 0.4399 0.62938 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105369 2 0.5115 0.64781 0.004 0.768 0.228
#> SRR2105370 3 0.9175 0.44133 0.244 0.216 0.540
#> SRR2105367 1 0.7637 0.13615 0.640 0.076 0.284
#> SRR2105368 1 0.4128 0.48224 0.856 0.012 0.132
#> SRR2105365 1 0.9515 0.26765 0.480 0.216 0.304
#> SRR2105366 1 0.9641 0.24587 0.456 0.228 0.316
#> SRR2105363 2 0.6473 0.56206 0.020 0.668 0.312
#> SRR2105364 2 0.7430 0.38371 0.036 0.540 0.424
#> SRR2105361 2 0.1031 0.68698 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105362 2 0.5919 0.64325 0.012 0.712 0.276
#> SRR2105359 3 0.8464 0.33472 0.132 0.272 0.596
#> SRR2105360 2 0.5591 0.52341 0.000 0.696 0.304
#> SRR2105355 2 0.6047 0.57062 0.008 0.680 0.312
#> SRR2105356 3 0.9045 0.39965 0.192 0.256 0.552
#> SRR2105353 2 0.8743 0.11128 0.116 0.512 0.372
#> SRR2105354 3 0.9746 -0.08484 0.320 0.244 0.436
#> SRR2105351 2 0.7876 0.33351 0.080 0.612 0.308
#> SRR2105352 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105349 2 0.3141 0.68469 0.020 0.912 0.068
#> SRR2105350 2 0.7329 0.41050 0.032 0.544 0.424
#> SRR2105345 2 0.5541 0.66472 0.008 0.740 0.252
#> SRR2105346 3 0.9233 0.43451 0.268 0.204 0.528
#> SRR2105347 1 0.5698 0.29937 0.736 0.012 0.252
#> SRR2105348 1 0.7913 -0.21376 0.492 0.056 0.452
#> SRR2105343 2 0.1529 0.67889 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105344 2 0.5529 0.61614 0.000 0.704 0.296
#> SRR2105341 2 0.6905 0.37923 0.016 0.544 0.440
#> SRR2105342 2 0.7378 0.42208 0.036 0.560 0.404
#> SRR2105339 2 0.7741 0.41226 0.056 0.568 0.376
#> SRR2105340 3 0.9433 0.00548 0.260 0.236 0.504
#> SRR2105335 3 0.8824 -0.23083 0.364 0.124 0.512
#> SRR2105336 1 0.6075 0.42616 0.676 0.008 0.316
#> SRR2105337 3 0.9773 -0.09229 0.340 0.240 0.420
#> SRR2105338 1 0.6482 0.50045 0.680 0.024 0.296
#> SRR2105331 2 0.9358 0.04790 0.312 0.496 0.192
#> SRR2105332 1 0.9724 0.11929 0.448 0.300 0.252
#> SRR2105333 2 0.1163 0.68372 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105334 2 0.3192 0.70239 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105329 2 0.3340 0.70230 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105330 2 0.5896 0.63094 0.008 0.700 0.292
#> SRR2105327 2 0.2945 0.69494 0.004 0.908 0.088
#> SRR2105328 2 0.5384 0.66480 0.024 0.788 0.188
#> SRR2105325 1 0.5968 0.46109 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105326 1 0.5905 0.46575 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105323 2 0.7974 0.23466 0.060 0.504 0.436
#> SRR2105324 3 0.8872 0.20824 0.140 0.324 0.536
#> SRR2105319 1 0.5754 0.49863 0.700 0.004 0.296
#> SRR2105320 1 0.3340 0.54004 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105321 3 0.9434 -0.27904 0.408 0.176 0.416
#> SRR2105322 1 0.6608 0.45698 0.628 0.016 0.356
#> SRR2105317 2 0.2165 0.69403 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105318 2 0.3941 0.69851 0.000 0.844 0.156
#> SRR2105315 2 0.2625 0.69910 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105316 2 0.2625 0.69868 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105313 2 0.3551 0.70495 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105314 2 0.5098 0.67209 0.000 0.752 0.248
#> SRR2105311 1 0.9925 0.16700 0.384 0.280 0.336
#> SRR2105312 1 0.9154 0.31763 0.468 0.148 0.384
#> SRR2105307 1 0.8054 -0.02466 0.568 0.076 0.356
#> SRR2105308 3 0.8135 0.27077 0.448 0.068 0.484
#> SRR2105309 2 0.2878 0.69897 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105310 3 0.8985 0.28897 0.160 0.300 0.540
#> SRR2105305 2 0.3879 0.68129 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105306 2 0.5291 0.65015 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105303 2 0.4291 0.67803 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105304 2 0.1163 0.67850 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105301 2 0.8826 0.05582 0.116 0.472 0.412
#> SRR2105302 2 0.3879 0.69205 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105299 3 0.9663 0.03808 0.236 0.308 0.456
#> SRR2105300 2 0.7564 0.58461 0.068 0.636 0.296
#> SRR2105297 1 0.2096 0.51135 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105298 1 0.3192 0.47106 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105295 2 0.1529 0.68381 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105296 2 0.8069 0.46081 0.120 0.636 0.244
#> SRR2105293 3 0.9855 0.01961 0.252 0.364 0.384
#> SRR2105294 1 0.5706 0.50239 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105291 2 0.6813 0.32027 0.012 0.520 0.468
#> SRR2105292 1 0.3412 0.52233 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105289 2 0.5578 0.65849 0.012 0.748 0.240
#> SRR2105290 3 0.6823 0.10132 0.484 0.012 0.504
#> SRR2105287 1 0.7292 -0.17833 0.500 0.028 0.472
#> SRR2105288 1 0.5138 0.32510 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105285 2 0.4002 0.67907 0.000 0.840 0.160
#> SRR2105286 2 0.5859 0.61501 0.000 0.656 0.344
#> SRR2105283 3 0.9659 0.19368 0.220 0.340 0.440
#> SRR2105284 3 0.8880 0.31032 0.416 0.120 0.464
#> SRR2105281 3 0.8889 -0.06117 0.120 0.428 0.452
#> SRR2105282 2 0.6818 0.52022 0.024 0.628 0.348
#> SRR2105259 2 0.4750 0.66655 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105260 2 0.5465 0.63921 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105279 2 0.3340 0.70313 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105280 2 0.5929 0.60054 0.004 0.676 0.320
#> SRR2105257 1 0.2796 0.53264 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105258 1 0.2537 0.54030 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105253 2 0.4475 0.69470 0.016 0.840 0.144
#> SRR2105254 2 0.4002 0.68801 0.000 0.840 0.160
#> SRR2105255 3 0.8979 0.06104 0.128 0.420 0.452
#> SRR2105256 3 0.8688 0.29585 0.436 0.104 0.460
#> SRR2105251 2 0.7138 0.52261 0.044 0.644 0.312
#> SRR2105252 2 0.7681 0.38431 0.048 0.540 0.412
#> SRR2105249 2 0.4521 0.68937 0.004 0.816 0.180
#> SRR2105250 3 0.8526 0.36257 0.376 0.100 0.524
#> SRR2105247 2 0.6937 0.51673 0.048 0.680 0.272
#> SRR2105248 1 0.9181 0.30358 0.448 0.148 0.404
#> SRR2105245 1 0.9266 0.28288 0.424 0.156 0.420
#> SRR2105246 2 0.7175 0.36731 0.032 0.592 0.376
#> SRR2105243 2 0.7819 0.34423 0.052 0.508 0.440
#> SRR2105244 3 0.9147 -0.08566 0.412 0.144 0.444
#> SRR2105241 3 0.9653 0.19170 0.224 0.328 0.448
#> SRR2105242 1 0.5623 0.51604 0.716 0.004 0.280
#> SRR2105239 2 0.7181 0.26577 0.028 0.564 0.408
#> SRR2105240 1 0.1964 0.51728 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105237 2 0.2229 0.68832 0.012 0.944 0.044
#> SRR2105238 2 0.5859 0.56253 0.000 0.656 0.344
#> SRR2105235 2 0.6994 0.48859 0.028 0.612 0.360
#> SRR2105236 3 0.9767 0.29743 0.244 0.328 0.428
#> SRR2105233 2 0.1643 0.68560 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105234 2 0.1163 0.67932 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105231 2 0.8752 0.45193 0.148 0.568 0.284
#> SRR2105232 3 0.9512 0.04505 0.188 0.384 0.428
#> SRR2105227 2 0.8470 0.37651 0.104 0.552 0.344
#> SRR2105228 3 0.8173 -0.11657 0.072 0.420 0.508
#> SRR2105225 3 0.8573 0.12290 0.104 0.372 0.524
#> SRR2105226 1 0.8884 0.00653 0.460 0.120 0.420
#> SRR2105229 2 0.5859 0.55249 0.000 0.656 0.344
#> SRR2105230 1 0.8173 -0.12036 0.508 0.072 0.420
#> SRR2105219 2 0.3340 0.70403 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105220 2 0.6675 0.49563 0.012 0.584 0.404
#> SRR2105221 3 0.9120 0.31063 0.340 0.156 0.504
#> SRR2105222 1 0.4796 0.35871 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105223 3 0.8985 0.07886 0.216 0.220 0.564
#> SRR2105224 3 0.7392 -0.18174 0.468 0.032 0.500
#> SRR2105217 1 0.8347 0.37712 0.512 0.084 0.404
#> SRR2105218 3 0.7990 -0.29617 0.404 0.064 0.532
#> SRR2105215 3 0.7674 -0.28619 0.044 0.472 0.484
#> SRR2105216 2 0.3941 0.69331 0.000 0.844 0.156
#> SRR2105213 3 0.8737 -0.31526 0.428 0.108 0.464
#> SRR2105214 3 0.9561 0.08099 0.216 0.316 0.468
#> SRR2105211 2 0.5831 0.64962 0.008 0.708 0.284
#> SRR2105212 2 0.7049 0.43474 0.020 0.528 0.452
#> SRR2105209 3 0.6869 0.17551 0.264 0.048 0.688
#> SRR2105210 1 0.5363 0.47568 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105207 1 0.8891 0.31530 0.448 0.120 0.432
#> SRR2105208 1 0.2261 0.53675 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105205 2 0.9863 -0.07446 0.284 0.416 0.300
#> SRR2105206 1 0.9008 0.32893 0.500 0.140 0.360
#> SRR2105201 3 0.8547 0.09999 0.104 0.364 0.532
#> SRR2105202 3 0.9077 0.40888 0.340 0.152 0.508
#> SRR2105203 2 0.4399 0.65297 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105204 2 0.5618 0.65287 0.008 0.732 0.260
#> SRR2105199 3 0.8571 0.16322 0.112 0.340 0.548
#> SRR2105200 1 0.8066 -0.14719 0.528 0.068 0.404
#> SRR2105197 3 0.8643 0.30400 0.212 0.188 0.600
#> SRR2105198 1 0.7727 0.38062 0.600 0.064 0.336
#> SRR2105195 1 0.7534 0.41667 0.532 0.040 0.428
#> SRR2105196 1 0.3941 0.53696 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105193 1 0.2356 0.52569 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105194 1 0.1163 0.52982 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105191 2 0.6333 0.44069 0.012 0.656 0.332
#> SRR2105192 1 0.6155 0.17992 0.664 0.008 0.328
#> SRR2105189 2 0.3826 0.70420 0.008 0.868 0.124
#> SRR2105190 2 0.4235 0.68938 0.000 0.824 0.176
#> SRR2105187 3 0.9696 -0.20640 0.360 0.220 0.420
#> SRR2105188 3 0.6518 -0.37558 0.484 0.004 0.512
#> SRR2105179 1 0.7363 0.45063 0.588 0.040 0.372
#> SRR2105180 1 0.1289 0.53460 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105183 2 0.7641 0.34008 0.044 0.520 0.436
#> SRR2105184 1 0.6973 0.13271 0.564 0.020 0.416
#> SRR2105185 2 0.4654 0.64799 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105186 1 0.8070 0.31430 0.472 0.064 0.464
#> SRR2105181 3 0.8673 0.00954 0.252 0.160 0.588
#> SRR2105182 3 0.9290 0.35455 0.372 0.164 0.464
#> SRR2105177 1 0.7467 0.44068 0.624 0.056 0.320
#> SRR2105178 1 0.1411 0.51850 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105171 2 0.6155 0.58309 0.008 0.664 0.328
#> SRR2105172 2 0.7901 0.29046 0.056 0.504 0.440
#> SRR2105175 1 0.4974 0.51612 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105176 1 0.0592 0.52696 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105173 2 0.8592 0.40627 0.116 0.552 0.332
#> SRR2105174 2 0.8886 0.37741 0.188 0.572 0.240
#> SRR2105169 2 0.8153 0.51048 0.128 0.632 0.240
#> SRR2105170 1 0.5147 0.48524 0.800 0.020 0.180
#> SRR2105167 2 0.5810 0.59517 0.000 0.664 0.336
#> SRR2105168 2 0.7652 0.33710 0.044 0.512 0.444
#> SRR2105165 1 0.7263 0.42538 0.568 0.032 0.400
#> SRR2105166 1 0.6228 0.46803 0.624 0.004 0.372
#> SRR2105163 3 0.9810 -0.01013 0.240 0.372 0.388
#> SRR2105164 1 0.8595 0.36174 0.496 0.100 0.404
#> SRR2105161 1 0.6793 0.48328 0.672 0.036 0.292
#> SRR2105162 1 0.0237 0.52963 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.3816 0.69653 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105156 2 0.6814 0.49444 0.020 0.608 0.372
#> SRR2105157 1 0.9901 0.14359 0.384 0.268 0.348
#> SRR2105158 1 0.9329 0.29224 0.488 0.180 0.332
#> SRR2105159 1 0.6935 0.45372 0.604 0.024 0.372
#> SRR2105160 1 0.5115 0.52834 0.768 0.004 0.228
#> SRR2105153 1 0.9956 -0.00802 0.360 0.352 0.288
#> SRR2105154 1 0.8514 0.38042 0.528 0.100 0.372
#> SRR2105151 2 0.8260 0.31514 0.076 0.492 0.432
#> SRR2105152 2 0.6448 0.55268 0.016 0.656 0.328
#> SRR2105149 2 0.6113 0.62532 0.012 0.688 0.300
#> SRR2105150 3 0.9172 0.20048 0.156 0.356 0.488
#> SRR2105147 2 0.1411 0.67745 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105148 2 0.1411 0.67745 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105143 3 0.7858 0.22935 0.364 0.064 0.572
#> SRR2105144 3 0.8454 0.29270 0.432 0.088 0.480
#> SRR2105145 1 0.5517 0.50593 0.728 0.004 0.268
#> SRR2105146 1 0.5785 0.47274 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105141 2 0.9657 -0.03690 0.300 0.460 0.240
#> SRR2105142 2 0.8848 0.16550 0.284 0.560 0.156
#> SRR2105139 2 0.4452 0.69234 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105140 2 0.6769 0.52179 0.016 0.592 0.392
#> SRR2105137 2 0.4931 0.66676 0.004 0.784 0.212
#> SRR2105138 1 0.7782 0.11135 0.652 0.100 0.248
#> SRR2105135 2 0.4346 0.70319 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105136 2 0.5247 0.66409 0.008 0.768 0.224
#> SRR2105133 3 0.9624 0.40809 0.256 0.272 0.472
#> SRR2105134 1 0.7824 -0.14678 0.504 0.052 0.444
#> SRR2105131 2 0.6487 0.62026 0.032 0.700 0.268
#> SRR2105132 1 0.6339 0.13613 0.632 0.008 0.360
#> SRR2105129 1 0.2200 0.51510 0.940 0.004 0.056
#> SRR2105130 1 0.1031 0.52125 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105127 1 0.7578 -0.15237 0.500 0.040 0.460
#> SRR2105128 1 0.8550 -0.23772 0.492 0.096 0.412
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 2 0.7788 0.15142 0.360 0.500 0.092 0.048
#> SRR2105278 1 0.6127 0.16981 0.524 0.436 0.032 0.008
#> SRR2105275 3 0.3410 0.59932 0.040 0.016 0.884 0.060
#> SRR2105276 3 0.4105 0.58444 0.100 0.052 0.840 0.008
#> SRR2105273 3 0.9151 0.15120 0.092 0.292 0.412 0.204
#> SRR2105274 2 0.7481 0.19750 0.292 0.516 0.188 0.004
#> SRR2105271 2 0.9516 0.40457 0.224 0.404 0.148 0.224
#> SRR2105272 1 0.4720 0.57565 0.720 0.016 0.264 0.000
#> SRR2105269 4 0.4305 0.61629 0.012 0.160 0.020 0.808
#> SRR2105270 2 0.6188 0.21464 0.040 0.596 0.012 0.352
#> SRR2105267 4 0.2760 0.62853 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR2105268 2 0.5248 0.39458 0.024 0.716 0.012 0.248
#> SRR2105265 2 0.5334 -0.09399 0.004 0.508 0.004 0.484
#> SRR2105266 2 0.5560 0.27945 0.028 0.644 0.004 0.324
#> SRR2105263 3 0.7220 0.53279 0.232 0.100 0.624 0.044
#> SRR2105264 3 0.6943 0.35130 0.348 0.108 0.540 0.004
#> SRR2105261 3 0.8138 0.34874 0.032 0.252 0.508 0.208
#> SRR2105262 2 0.7060 0.36611 0.036 0.620 0.088 0.256
#> SRR2105357 4 0.5045 0.55333 0.004 0.304 0.012 0.680
#> SRR2105358 2 0.6775 0.37849 0.280 0.624 0.060 0.036
#> SRR2105439 2 0.5865 0.41228 0.040 0.696 0.024 0.240
#> SRR2105440 2 0.6232 0.33843 0.048 0.632 0.016 0.304
#> SRR2105509 4 0.1209 0.62209 0.004 0.032 0.000 0.964
#> SRR2105510 4 0.0895 0.62105 0.000 0.020 0.004 0.976
#> SRR2105507 3 0.9629 0.01951 0.124 0.296 0.316 0.264
#> SRR2105508 4 0.8149 0.34170 0.040 0.160 0.300 0.500
#> SRR2105505 1 0.8687 -0.09993 0.400 0.392 0.100 0.108
#> SRR2105506 1 0.5481 0.43963 0.672 0.296 0.016 0.016
#> SRR2105503 4 0.9346 0.12004 0.112 0.200 0.300 0.388
#> SRR2105504 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105501 4 0.5580 0.50215 0.016 0.336 0.012 0.636
#> SRR2105502 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105499 2 0.7407 -0.09431 0.424 0.440 0.128 0.008
#> SRR2105500 2 0.6071 0.42781 0.240 0.676 0.076 0.008
#> SRR2105497 3 0.7906 0.26501 0.068 0.072 0.460 0.400
#> SRR2105498 2 0.9248 0.03530 0.188 0.424 0.272 0.116
#> SRR2105495 4 0.5869 0.31880 0.016 0.428 0.012 0.544
#> SRR2105496 2 0.5979 0.30276 0.024 0.652 0.028 0.296
#> SRR2105493 4 0.5345 0.57310 0.012 0.292 0.016 0.680
#> SRR2105494 2 0.5331 0.39988 0.024 0.716 0.016 0.244
#> SRR2105491 3 0.4591 0.56418 0.148 0.020 0.804 0.028
#> SRR2105492 3 0.4916 0.50363 0.252 0.020 0.724 0.004
#> SRR2105489 3 0.8513 0.47383 0.144 0.224 0.532 0.100
#> SRR2105490 2 0.5667 0.53759 0.188 0.736 0.028 0.048
#> SRR2105487 1 0.7371 0.54344 0.548 0.228 0.220 0.004
#> SRR2105488 1 0.6141 0.30705 0.560 0.392 0.044 0.004
#> SRR2105485 2 0.6898 0.52707 0.148 0.680 0.056 0.116
#> SRR2105486 2 0.7690 0.26613 0.348 0.520 0.064 0.068
#> SRR2105483 1 0.3545 0.62553 0.828 0.008 0.164 0.000
#> SRR2105484 1 0.3450 0.62945 0.836 0.008 0.156 0.000
#> SRR2105481 3 0.5730 0.59167 0.132 0.036 0.756 0.076
#> SRR2105482 1 0.7042 0.45042 0.572 0.188 0.240 0.000
#> SRR2105479 3 0.5140 0.55145 0.200 0.016 0.752 0.032
#> SRR2105480 3 0.4088 0.52396 0.232 0.004 0.764 0.000
#> SRR2105477 3 0.5951 0.58232 0.104 0.088 0.752 0.056
#> SRR2105478 3 0.5319 0.59462 0.096 0.076 0.788 0.040
#> SRR2105475 4 0.3539 0.61238 0.000 0.176 0.004 0.820
#> SRR2105476 4 0.3088 0.61458 0.000 0.128 0.008 0.864
#> SRR2105473 2 0.6048 0.22322 0.384 0.576 0.012 0.028
#> SRR2105474 2 0.7234 0.48722 0.232 0.628 0.064 0.076
#> SRR2105471 1 0.7323 0.32223 0.484 0.164 0.352 0.000
#> SRR2105472 3 0.7843 0.04468 0.344 0.200 0.448 0.008
#> SRR2105469 4 0.7413 0.44475 0.028 0.276 0.120 0.576
#> SRR2105470 2 0.7157 0.52266 0.160 0.664 0.096 0.080
#> SRR2105467 2 0.7819 0.11342 0.340 0.468 0.180 0.012
#> SRR2105468 2 0.7480 0.08777 0.412 0.476 0.072 0.040
#> SRR2105465 2 0.8016 0.06968 0.412 0.436 0.100 0.052
#> SRR2105466 1 0.5950 0.60689 0.716 0.084 0.184 0.016
#> SRR2105463 1 0.4808 0.60980 0.736 0.028 0.236 0.000
#> SRR2105464 1 0.3725 0.62393 0.812 0.008 0.180 0.000
#> SRR2105461 4 0.2053 0.62889 0.000 0.072 0.004 0.924
#> SRR2105462 4 0.5463 0.15325 0.008 0.488 0.004 0.500
#> SRR2105459 4 0.4053 0.59105 0.000 0.228 0.004 0.768
#> SRR2105460 4 0.0376 0.61783 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105457 4 0.7097 0.35704 0.040 0.348 0.056 0.556
#> SRR2105458 4 0.4574 0.60029 0.008 0.208 0.016 0.768
#> SRR2105455 4 0.4941 0.61903 0.004 0.184 0.048 0.764
#> SRR2105456 2 0.6313 0.29135 0.020 0.632 0.048 0.300
#> SRR2105453 2 0.5473 0.14126 0.408 0.576 0.012 0.004
#> SRR2105454 1 0.4908 0.48583 0.692 0.292 0.016 0.000
#> SRR2105451 4 0.5666 0.30242 0.004 0.460 0.016 0.520
#> SRR2105452 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105449 1 0.7549 0.26701 0.508 0.200 0.288 0.004
#> SRR2105450 2 0.6737 0.13261 0.368 0.532 0.100 0.000
#> SRR2105447 4 0.4773 0.56190 0.004 0.280 0.008 0.708
#> SRR2105448 4 0.5563 0.50170 0.008 0.336 0.020 0.636
#> SRR2105445 2 0.5585 0.28520 0.012 0.652 0.020 0.316
#> SRR2105446 2 0.5883 0.33675 0.024 0.668 0.028 0.280
#> SRR2105443 4 0.5464 0.60981 0.012 0.220 0.044 0.724
#> SRR2105444 2 0.5486 0.50781 0.040 0.772 0.060 0.128
#> SRR2105441 2 0.5391 0.53276 0.208 0.732 0.008 0.052
#> SRR2105442 2 0.6644 0.26442 0.344 0.572 0.076 0.008
#> SRR2105437 1 0.5186 0.45451 0.640 0.016 0.344 0.000
#> SRR2105438 1 0.5040 0.40044 0.628 0.008 0.364 0.000
#> SRR2105435 2 0.7704 0.52083 0.212 0.604 0.072 0.112
#> SRR2105436 2 0.6473 0.46637 0.244 0.660 0.072 0.024
#> SRR2105433 1 0.4728 0.61643 0.752 0.032 0.216 0.000
#> SRR2105434 1 0.6262 0.58580 0.660 0.132 0.208 0.000
#> SRR2105431 1 0.4175 0.61449 0.784 0.016 0.200 0.000
#> SRR2105432 1 0.4485 0.57413 0.740 0.012 0.248 0.000
#> SRR2105429 3 0.8531 0.35428 0.140 0.284 0.496 0.080
#> SRR2105430 3 0.7852 0.12413 0.036 0.388 0.464 0.112
#> SRR2105427 4 0.2401 0.62328 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR2105428 2 0.6558 0.11284 0.024 0.564 0.040 0.372
#> SRR2105425 2 0.6983 -0.05771 0.048 0.492 0.032 0.428
#> SRR2105426 2 0.8433 0.39317 0.096 0.544 0.152 0.208
#> SRR2105421 4 0.5155 0.61660 0.020 0.200 0.028 0.752
#> SRR2105422 4 0.7087 0.48250 0.016 0.240 0.136 0.608
#> SRR2105423 4 0.4301 0.63144 0.000 0.120 0.064 0.816
#> SRR2105424 4 0.5951 0.30715 0.024 0.432 0.008 0.536
#> SRR2105419 4 0.5985 0.56638 0.032 0.188 0.060 0.720
#> SRR2105420 4 0.6482 0.39930 0.024 0.404 0.032 0.540
#> SRR2105415 1 0.5332 0.63139 0.736 0.080 0.184 0.000
#> SRR2105416 1 0.3533 0.64756 0.864 0.056 0.080 0.000
#> SRR2105417 1 0.7885 0.50861 0.564 0.200 0.196 0.040
#> SRR2105418 1 0.4104 0.64721 0.832 0.080 0.088 0.000
#> SRR2105413 4 0.2530 0.62167 0.004 0.100 0.000 0.896
#> SRR2105414 4 0.4295 0.58982 0.000 0.240 0.008 0.752
#> SRR2105409 3 0.8117 0.13221 0.060 0.388 0.452 0.100
#> SRR2105410 3 0.7684 -0.04324 0.408 0.164 0.420 0.008
#> SRR2105411 4 0.6103 0.12361 0.024 0.476 0.012 0.488
#> SRR2105412 2 0.6088 0.43306 0.048 0.688 0.028 0.236
#> SRR2105407 4 0.6051 0.59321 0.016 0.224 0.068 0.692
#> SRR2105408 4 0.6038 0.32977 0.024 0.416 0.012 0.548
#> SRR2105403 4 0.7446 0.17353 0.048 0.412 0.060 0.480
#> SRR2105404 4 0.8767 -0.21594 0.240 0.356 0.044 0.360
#> SRR2105405 2 0.7862 -0.05914 0.060 0.484 0.080 0.376
#> SRR2105406 2 0.5446 0.37366 0.280 0.684 0.028 0.008
#> SRR2105401 4 0.0804 0.62132 0.000 0.012 0.008 0.980
#> SRR2105402 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105399 4 0.3444 0.61291 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR2105400 4 0.0921 0.62174 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105397 4 0.6850 0.32704 0.024 0.064 0.336 0.576
#> SRR2105398 4 0.8437 0.12499 0.020 0.292 0.316 0.372
#> SRR2105395 3 0.8314 0.53430 0.080 0.156 0.548 0.216
#> SRR2105396 2 0.7259 0.51123 0.148 0.660 0.088 0.104
#> SRR2105393 2 0.6040 0.40669 0.040 0.708 0.044 0.208
#> SRR2105394 4 0.7431 0.37645 0.016 0.336 0.124 0.524
#> SRR2105389 4 0.9149 0.12250 0.068 0.272 0.320 0.340
#> SRR2105390 3 0.8026 0.46126 0.100 0.216 0.580 0.104
#> SRR2105391 4 0.6622 0.52110 0.028 0.176 0.116 0.680
#> SRR2105392 4 0.8154 0.26730 0.036 0.156 0.336 0.472
#> SRR2105385 3 0.6176 0.52445 0.200 0.116 0.680 0.004
#> SRR2105386 2 0.9369 0.18076 0.140 0.416 0.268 0.176
#> SRR2105387 2 0.7763 0.15887 0.056 0.532 0.088 0.324
#> SRR2105388 2 0.6714 0.52585 0.196 0.664 0.024 0.116
#> SRR2105381 4 0.5662 0.59506 0.020 0.192 0.056 0.732
#> SRR2105382 4 0.7540 0.44817 0.008 0.248 0.208 0.536
#> SRR2105383 2 0.4828 0.53397 0.120 0.792 0.004 0.084
#> SRR2105384 2 0.4949 0.52020 0.200 0.760 0.024 0.016
#> SRR2105379 4 0.4473 0.55030 0.008 0.028 0.168 0.796
#> SRR2105380 3 0.6522 0.58680 0.072 0.048 0.692 0.188
#> SRR2105377 2 0.7301 0.49009 0.120 0.656 0.080 0.144
#> SRR2105378 1 0.7345 0.33249 0.484 0.348 0.168 0.000
#> SRR2105375 2 0.7427 0.46688 0.120 0.616 0.216 0.048
#> SRR2105376 2 0.6020 0.22479 0.360 0.596 0.036 0.008
#> SRR2105373 3 0.8945 0.11481 0.236 0.312 0.392 0.060
#> SRR2105374 1 0.5016 0.30259 0.600 0.004 0.396 0.000
#> SRR2105371 4 0.6837 0.56757 0.016 0.268 0.100 0.616
#> SRR2105372 4 0.6132 0.52785 0.008 0.144 0.148 0.700
#> SRR2105369 4 0.7745 0.40602 0.032 0.292 0.136 0.540
#> SRR2105370 2 0.6770 0.52685 0.116 0.700 0.092 0.092
#> SRR2105367 1 0.7509 0.43732 0.552 0.296 0.128 0.024
#> SRR2105368 1 0.6027 0.61729 0.700 0.132 0.164 0.004
#> SRR2105365 3 0.7250 0.54398 0.196 0.092 0.644 0.068
#> SRR2105366 3 0.6903 0.55302 0.208 0.040 0.656 0.096
#> SRR2105363 2 0.5595 0.13629 0.012 0.576 0.008 0.404
#> SRR2105364 2 0.5512 0.45440 0.036 0.732 0.024 0.208
#> SRR2105361 4 0.3113 0.63391 0.004 0.108 0.012 0.876
#> SRR2105362 4 0.7643 0.25929 0.028 0.420 0.104 0.448
#> SRR2105359 2 0.6958 0.47233 0.088 0.680 0.152 0.080
#> SRR2105360 4 0.8036 0.29808 0.024 0.172 0.336 0.468
#> SRR2105355 4 0.8445 0.30701 0.064 0.312 0.144 0.480
#> SRR2105356 2 0.7408 0.49946 0.144 0.640 0.152 0.064
#> SRR2105353 3 0.7310 0.26456 0.052 0.048 0.496 0.404
#> SRR2105354 3 0.7796 0.52153 0.100 0.124 0.616 0.160
#> SRR2105351 3 0.7534 0.34693 0.016 0.148 0.536 0.300
#> SRR2105352 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105349 4 0.4680 0.62695 0.008 0.124 0.064 0.804
#> SRR2105350 2 0.5628 0.42054 0.040 0.708 0.016 0.236
#> SRR2105345 4 0.5537 0.31750 0.012 0.440 0.004 0.544
#> SRR2105346 2 0.4351 0.54312 0.100 0.832 0.016 0.052
#> SRR2105347 1 0.5949 0.51649 0.644 0.288 0.068 0.000
#> SRR2105348 2 0.6380 0.27073 0.364 0.576 0.048 0.012
#> SRR2105343 4 0.1256 0.62019 0.000 0.008 0.028 0.964
#> SRR2105344 2 0.5759 0.11801 0.020 0.584 0.008 0.388
#> SRR2105341 4 0.9039 0.18207 0.096 0.316 0.168 0.420
#> SRR2105342 2 0.7684 0.19771 0.040 0.540 0.108 0.312
#> SRR2105339 4 0.9097 0.18867 0.068 0.280 0.272 0.380
#> SRR2105340 3 0.6304 0.56066 0.064 0.124 0.728 0.084
#> SRR2105335 3 0.7003 0.53403 0.136 0.124 0.676 0.064
#> SRR2105336 1 0.7620 0.35802 0.456 0.220 0.324 0.000
#> SRR2105337 3 0.6412 0.59819 0.072 0.104 0.724 0.100
#> SRR2105338 3 0.6834 0.45534 0.252 0.080 0.636 0.032
#> SRR2105331 3 0.8168 0.46649 0.100 0.076 0.512 0.312
#> SRR2105332 3 0.8445 0.47781 0.188 0.176 0.544 0.092
#> SRR2105333 4 0.1022 0.62256 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105334 4 0.4230 0.60786 0.008 0.212 0.004 0.776
#> SRR2105329 4 0.4218 0.62202 0.008 0.184 0.012 0.796
#> SRR2105330 2 0.6319 0.03161 0.024 0.544 0.024 0.408
#> SRR2105327 4 0.4693 0.63204 0.008 0.156 0.044 0.792
#> SRR2105328 4 0.7935 0.38293 0.016 0.292 0.204 0.488
#> SRR2105325 3 0.3852 0.54049 0.192 0.008 0.800 0.000
#> SRR2105326 3 0.4088 0.50733 0.232 0.004 0.764 0.000
#> SRR2105323 2 0.7733 0.34780 0.112 0.560 0.048 0.280
#> SRR2105324 2 0.4786 0.53466 0.072 0.816 0.028 0.084
#> SRR2105319 3 0.5017 0.46773 0.252 0.024 0.720 0.004
#> SRR2105320 1 0.5169 0.53283 0.696 0.032 0.272 0.000
#> SRR2105321 3 0.3699 0.59928 0.052 0.020 0.872 0.056
#> SRR2105322 3 0.3808 0.54994 0.160 0.012 0.824 0.004
#> SRR2105317 4 0.1792 0.62222 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR2105318 4 0.5563 0.49215 0.008 0.336 0.020 0.636
#> SRR2105315 4 0.3903 0.63133 0.008 0.156 0.012 0.824
#> SRR2105316 4 0.3837 0.60055 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105313 4 0.4601 0.60281 0.004 0.256 0.008 0.732
#> SRR2105314 4 0.5576 0.28925 0.012 0.484 0.004 0.500
#> SRR2105311 3 0.6727 0.57200 0.148 0.020 0.664 0.168
#> SRR2105312 3 0.4738 0.56149 0.172 0.012 0.784 0.032
#> SRR2105307 1 0.6313 0.51126 0.672 0.244 0.052 0.032
#> SRR2105308 2 0.5542 0.30114 0.328 0.644 0.016 0.012
#> SRR2105309 4 0.3969 0.61954 0.000 0.180 0.016 0.804
#> SRR2105310 2 0.4955 0.53161 0.088 0.804 0.024 0.084
#> SRR2105305 4 0.5879 0.54159 0.016 0.248 0.048 0.688
#> SRR2105306 4 0.7024 0.40644 0.004 0.360 0.112 0.524
#> SRR2105303 4 0.5472 0.58592 0.028 0.224 0.024 0.724
#> SRR2105304 4 0.0376 0.61660 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR2105301 3 0.7585 0.48626 0.060 0.096 0.592 0.252
#> SRR2105302 4 0.6734 0.46593 0.016 0.340 0.068 0.576
#> SRR2105299 3 0.7145 0.55300 0.076 0.140 0.668 0.116
#> SRR2105300 2 0.8395 0.08097 0.036 0.440 0.192 0.332
#> SRR2105297 1 0.4017 0.64662 0.828 0.044 0.128 0.000
#> SRR2105298 1 0.4104 0.64983 0.832 0.080 0.088 0.000
#> SRR2105295 4 0.2940 0.63442 0.008 0.088 0.012 0.892
#> SRR2105296 4 0.8663 0.16948 0.032 0.328 0.284 0.356
#> SRR2105293 3 0.7570 0.57537 0.100 0.084 0.624 0.192
#> SRR2105294 3 0.5560 0.23530 0.392 0.024 0.584 0.000
#> SRR2105291 2 0.9152 0.07762 0.076 0.360 0.332 0.232
#> SRR2105292 1 0.6338 0.57992 0.644 0.120 0.236 0.000
#> SRR2105289 4 0.6756 0.34254 0.024 0.392 0.048 0.536
#> SRR2105290 2 0.6659 0.09501 0.400 0.512 0.088 0.000
#> SRR2105287 2 0.6157 0.03560 0.440 0.516 0.040 0.004
#> SRR2105288 1 0.5328 0.59137 0.724 0.212 0.064 0.000
#> SRR2105285 4 0.4589 0.58157 0.024 0.188 0.008 0.780
#> SRR2105286 2 0.6599 0.32013 0.020 0.636 0.076 0.268
#> SRR2105283 2 0.7286 0.47115 0.088 0.660 0.128 0.124
#> SRR2105284 2 0.7236 0.28383 0.348 0.548 0.044 0.060
#> SRR2105281 2 0.5889 0.47282 0.080 0.712 0.012 0.196
#> SRR2105282 2 0.5577 0.23447 0.016 0.612 0.008 0.364
#> SRR2105259 4 0.5475 0.55724 0.024 0.236 0.024 0.716
#> SRR2105260 2 0.6361 -0.09317 0.032 0.500 0.016 0.452
#> SRR2105279 4 0.5134 0.52284 0.004 0.300 0.016 0.680
#> SRR2105280 2 0.5866 0.29462 0.016 0.656 0.032 0.296
#> SRR2105257 1 0.4833 0.61341 0.740 0.032 0.228 0.000
#> SRR2105258 1 0.4737 0.57561 0.728 0.020 0.252 0.000
#> SRR2105253 4 0.7402 0.45728 0.024 0.312 0.112 0.552
#> SRR2105254 4 0.5361 0.44208 0.004 0.344 0.016 0.636
#> SRR2105255 2 0.9408 0.22645 0.132 0.416 0.232 0.220
#> SRR2105256 2 0.6117 0.31822 0.344 0.608 0.028 0.020
#> SRR2105251 2 0.8680 -0.05688 0.032 0.348 0.300 0.320
#> SRR2105252 2 0.8682 0.19980 0.048 0.440 0.272 0.240
#> SRR2105249 4 0.6371 0.36135 0.020 0.396 0.032 0.552
#> SRR2105250 2 0.5240 0.49726 0.228 0.728 0.008 0.036
#> SRR2105247 4 0.8413 0.26402 0.024 0.264 0.296 0.416
#> SRR2105248 3 0.4880 0.59738 0.060 0.104 0.808 0.028
#> SRR2105245 3 0.5511 0.59308 0.108 0.044 0.776 0.072
#> SRR2105246 3 0.7244 0.00165 0.004 0.124 0.452 0.420
#> SRR2105243 2 0.8506 0.08192 0.056 0.468 0.168 0.308
#> SRR2105244 3 0.8491 0.33625 0.184 0.272 0.488 0.056
#> SRR2105241 3 0.8684 0.36191 0.084 0.216 0.504 0.196
#> SRR2105242 3 0.6353 0.33563 0.320 0.072 0.604 0.004
#> SRR2105239 3 0.7832 0.25795 0.024 0.152 0.504 0.320
#> SRR2105240 1 0.5256 0.64841 0.732 0.064 0.204 0.000
#> SRR2105237 4 0.2825 0.63317 0.012 0.056 0.024 0.908
#> SRR2105238 2 0.5838 0.10434 0.016 0.560 0.012 0.412
#> SRR2105235 2 0.6330 0.21598 0.024 0.592 0.032 0.352
#> SRR2105236 2 0.5995 0.50214 0.112 0.708 0.008 0.172
#> SRR2105233 4 0.2335 0.62066 0.000 0.060 0.020 0.920
#> SRR2105234 4 0.0524 0.61852 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR2105231 2 0.8051 0.21412 0.040 0.532 0.172 0.256
#> SRR2105232 2 0.9138 0.30751 0.136 0.452 0.260 0.152
#> SRR2105227 4 0.9513 0.12537 0.112 0.284 0.256 0.348
#> SRR2105228 2 0.7266 0.42206 0.048 0.640 0.132 0.180
#> SRR2105225 2 0.8872 0.28656 0.088 0.476 0.236 0.200
#> SRR2105226 1 0.9166 0.09795 0.348 0.324 0.256 0.072
#> SRR2105229 4 0.8320 0.38656 0.032 0.252 0.240 0.476
#> SRR2105230 2 0.7743 -0.00471 0.392 0.464 0.116 0.028
#> SRR2105219 4 0.6690 0.46369 0.028 0.324 0.052 0.596
#> SRR2105220 2 0.6339 0.34744 0.060 0.652 0.020 0.268
#> SRR2105221 2 0.9003 0.22636 0.256 0.432 0.236 0.076
#> SRR2105222 1 0.4663 0.63691 0.788 0.148 0.064 0.000
#> SRR2105223 3 0.7740 0.48470 0.116 0.164 0.620 0.100
#> SRR2105224 3 0.7928 0.20595 0.284 0.248 0.460 0.008
#> SRR2105217 3 0.4939 0.58064 0.112 0.068 0.800 0.020
#> SRR2105218 3 0.6698 0.47185 0.096 0.272 0.620 0.012
#> SRR2105215 2 0.6574 0.40397 0.052 0.680 0.060 0.208
#> SRR2105216 4 0.4990 0.45910 0.000 0.352 0.008 0.640
#> SRR2105213 3 0.6266 0.55298 0.152 0.108 0.712 0.028
#> SRR2105214 3 0.7713 0.53525 0.096 0.172 0.620 0.112
#> SRR2105211 4 0.8735 0.33415 0.080 0.328 0.148 0.444
#> SRR2105212 2 0.6151 0.38520 0.060 0.688 0.024 0.228
#> SRR2105209 3 0.7555 0.12364 0.148 0.392 0.452 0.008
#> SRR2105210 1 0.7269 0.23512 0.488 0.156 0.356 0.000
#> SRR2105207 3 0.6591 0.57787 0.168 0.084 0.696 0.052
#> SRR2105208 1 0.4867 0.59022 0.736 0.032 0.232 0.000
#> SRR2105205 3 0.7699 0.51975 0.088 0.068 0.576 0.268
#> SRR2105206 3 0.6317 0.54414 0.212 0.072 0.688 0.028
#> SRR2105201 2 0.5672 0.50112 0.072 0.768 0.052 0.108
#> SRR2105202 2 0.5578 0.48617 0.220 0.720 0.016 0.044
#> SRR2105203 4 0.7689 0.43283 0.032 0.184 0.208 0.576
#> SRR2105204 2 0.6222 -0.12988 0.008 0.504 0.036 0.452
#> SRR2105199 2 0.5895 0.51480 0.072 0.756 0.064 0.108
#> SRR2105200 2 0.6860 0.04582 0.448 0.480 0.032 0.040
#> SRR2105197 3 0.9244 0.07227 0.128 0.324 0.396 0.152
#> SRR2105198 3 0.7944 -0.10276 0.352 0.196 0.440 0.012
#> SRR2105195 3 0.5110 0.55356 0.172 0.056 0.764 0.008
#> SRR2105196 1 0.6000 0.41658 0.592 0.052 0.356 0.000
#> SRR2105193 1 0.5090 0.60262 0.728 0.044 0.228 0.000
#> SRR2105194 1 0.3978 0.62906 0.796 0.012 0.192 0.000
#> SRR2105191 4 0.7676 0.25158 0.040 0.100 0.336 0.524
#> SRR2105192 1 0.4360 0.54872 0.744 0.248 0.008 0.000
#> SRR2105189 4 0.6325 0.53248 0.036 0.216 0.060 0.688
#> SRR2105190 4 0.5334 0.42398 0.004 0.364 0.012 0.620
#> SRR2105187 3 0.4813 0.59636 0.068 0.048 0.820 0.064
#> SRR2105188 3 0.6979 0.41395 0.176 0.220 0.600 0.004
#> SRR2105179 3 0.6212 0.52067 0.168 0.092 0.712 0.028
#> SRR2105180 1 0.3933 0.61218 0.792 0.008 0.200 0.000
#> SRR2105183 2 0.6370 0.41032 0.036 0.672 0.052 0.240
#> SRR2105184 2 0.7529 0.19592 0.320 0.508 0.164 0.008
#> SRR2105185 4 0.7337 0.53027 0.028 0.192 0.168 0.612
#> SRR2105186 3 0.7490 0.37445 0.204 0.244 0.544 0.008
#> SRR2105181 3 0.8063 0.40715 0.128 0.212 0.576 0.084
#> SRR2105182 2 0.8449 0.37314 0.256 0.524 0.124 0.096
#> SRR2105177 3 0.7417 0.34793 0.320 0.128 0.536 0.016
#> SRR2105178 1 0.3335 0.64070 0.856 0.016 0.128 0.000
#> SRR2105171 2 0.7380 -0.05855 0.048 0.488 0.056 0.408
#> SRR2105172 2 0.5562 0.40394 0.020 0.712 0.032 0.236
#> SRR2105175 1 0.5570 0.09583 0.540 0.020 0.440 0.000
#> SRR2105176 1 0.3591 0.62482 0.824 0.008 0.168 0.000
#> SRR2105173 4 0.9204 0.13866 0.092 0.320 0.204 0.384
#> SRR2105174 4 0.9166 0.07523 0.104 0.360 0.168 0.368
#> SRR2105169 2 0.8958 -0.03574 0.064 0.376 0.216 0.344
#> SRR2105170 1 0.7477 0.29245 0.500 0.324 0.172 0.004
#> SRR2105167 2 0.5497 0.06111 0.008 0.572 0.008 0.412
#> SRR2105168 2 0.6178 0.44943 0.032 0.712 0.076 0.180
#> SRR2105165 3 0.4974 0.53522 0.224 0.040 0.736 0.000
#> SRR2105166 3 0.4599 0.50107 0.248 0.016 0.736 0.000
#> SRR2105163 3 0.6157 0.58108 0.084 0.024 0.708 0.184
#> SRR2105164 3 0.4542 0.56962 0.144 0.020 0.808 0.028
#> SRR2105161 3 0.6065 0.37896 0.332 0.028 0.620 0.020
#> SRR2105162 1 0.3768 0.61640 0.808 0.008 0.184 0.000
#> SRR2105155 4 0.5788 0.52620 0.020 0.296 0.024 0.660
#> SRR2105156 2 0.5796 0.28996 0.012 0.640 0.028 0.320
#> SRR2105157 3 0.6173 0.59691 0.072 0.084 0.740 0.104
#> SRR2105158 3 0.6828 0.55559 0.188 0.092 0.672 0.048
#> SRR2105159 3 0.5751 0.55469 0.236 0.052 0.700 0.012
#> SRR2105160 3 0.6079 -0.11417 0.464 0.044 0.492 0.000
#> SRR2105153 3 0.8919 0.51337 0.176 0.132 0.500 0.192
#> SRR2105154 3 0.4574 0.57877 0.136 0.044 0.808 0.012
#> SRR2105151 2 0.5881 0.45806 0.056 0.732 0.036 0.176
#> SRR2105152 2 0.5562 0.25141 0.008 0.616 0.016 0.360
#> SRR2105149 4 0.7477 0.26917 0.048 0.392 0.064 0.496
#> SRR2105150 2 0.5994 0.52896 0.080 0.744 0.048 0.128
#> SRR2105147 4 0.0524 0.61632 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR2105148 4 0.0524 0.61632 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR2105143 2 0.7729 0.14624 0.276 0.500 0.216 0.008
#> SRR2105144 2 0.5290 0.31950 0.324 0.656 0.012 0.008
#> SRR2105145 3 0.5355 0.24083 0.408 0.008 0.580 0.004
#> SRR2105146 3 0.4584 0.43827 0.300 0.004 0.696 0.000
#> SRR2105141 3 0.7238 0.36828 0.100 0.012 0.464 0.424
#> SRR2105142 4 0.7738 -0.02347 0.112 0.036 0.336 0.516
#> SRR2105139 4 0.6658 0.30770 0.020 0.428 0.044 0.508
#> SRR2105140 2 0.6884 0.23939 0.052 0.596 0.040 0.312
#> SRR2105137 4 0.5355 0.38278 0.004 0.408 0.008 0.580
#> SRR2105138 1 0.7272 0.46123 0.612 0.256 0.068 0.064
#> SRR2105135 4 0.6281 0.33260 0.008 0.436 0.040 0.516
#> SRR2105136 2 0.6266 -0.12023 0.012 0.488 0.032 0.468
#> SRR2105133 2 0.7910 0.41571 0.252 0.568 0.068 0.112
#> SRR2105134 1 0.6015 0.15126 0.512 0.452 0.032 0.004
#> SRR2105131 4 0.7582 0.30899 0.036 0.364 0.092 0.508
#> SRR2105132 1 0.6285 0.44926 0.624 0.284 0.092 0.000
#> SRR2105129 1 0.4050 0.64289 0.808 0.024 0.168 0.000
#> SRR2105130 1 0.3377 0.63646 0.848 0.012 0.140 0.000
#> SRR2105127 1 0.6796 0.36099 0.592 0.316 0.072 0.020
#> SRR2105128 2 0.6587 0.03198 0.460 0.480 0.016 0.044
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.6323 0.48398 0.120 0.212 0.016 0.020 0.632
#> SRR2105278 5 0.6616 0.27056 0.292 0.252 0.000 0.000 0.456
#> SRR2105275 3 0.3630 0.61210 0.036 0.004 0.852 0.032 0.076
#> SRR2105276 3 0.4141 0.59441 0.060 0.016 0.812 0.004 0.108
#> SRR2105273 5 0.7789 0.28398 0.016 0.096 0.264 0.128 0.496
#> SRR2105274 5 0.7829 0.43832 0.112 0.280 0.144 0.004 0.460
#> SRR2105271 5 0.8648 0.29054 0.108 0.300 0.056 0.128 0.408
#> SRR2105272 1 0.3867 0.62090 0.804 0.004 0.144 0.000 0.048
#> SRR2105269 4 0.5544 0.49552 0.000 0.300 0.040 0.628 0.032
#> SRR2105270 2 0.4686 0.53457 0.008 0.760 0.004 0.148 0.080
#> SRR2105267 4 0.4478 0.55580 0.000 0.240 0.016 0.724 0.020
#> SRR2105268 2 0.3062 0.53637 0.000 0.868 0.004 0.080 0.048
#> SRR2105265 2 0.5351 0.43323 0.000 0.644 0.008 0.280 0.068
#> SRR2105266 2 0.5055 0.53006 0.004 0.720 0.008 0.188 0.080
#> SRR2105263 3 0.6144 0.54434 0.264 0.080 0.620 0.008 0.028
#> SRR2105264 3 0.6976 0.37390 0.392 0.088 0.452 0.000 0.068
#> SRR2105261 3 0.7534 0.35676 0.012 0.228 0.536 0.128 0.096
#> SRR2105262 2 0.7391 0.39531 0.004 0.532 0.076 0.184 0.204
#> SRR2105357 4 0.6277 0.27193 0.000 0.352 0.004 0.504 0.140
#> SRR2105358 5 0.5413 0.45260 0.068 0.272 0.000 0.012 0.648
#> SRR2105439 2 0.4709 0.52641 0.008 0.780 0.020 0.080 0.112
#> SRR2105440 2 0.5442 0.48345 0.004 0.676 0.004 0.108 0.208
#> SRR2105509 4 0.1990 0.64154 0.000 0.068 0.004 0.920 0.008
#> SRR2105510 4 0.1788 0.64346 0.000 0.056 0.004 0.932 0.008
#> SRR2105507 3 0.9243 0.02425 0.072 0.292 0.328 0.132 0.176
#> SRR2105508 5 0.7991 0.11303 0.012 0.048 0.292 0.296 0.352
#> SRR2105505 5 0.6948 0.47434 0.168 0.204 0.028 0.020 0.580
#> SRR2105506 1 0.6425 0.25373 0.520 0.140 0.012 0.000 0.328
#> SRR2105503 3 0.9273 0.22231 0.084 0.216 0.368 0.208 0.124
#> SRR2105504 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105501 4 0.6089 0.31375 0.000 0.408 0.020 0.500 0.072
#> SRR2105502 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105499 5 0.7947 0.37505 0.216 0.256 0.104 0.000 0.424
#> SRR2105500 5 0.6982 0.24386 0.088 0.400 0.068 0.000 0.444
#> SRR2105497 3 0.7735 0.43246 0.088 0.024 0.488 0.300 0.100
#> SRR2105498 2 0.7903 0.19049 0.208 0.484 0.228 0.044 0.036
#> SRR2105495 2 0.5617 0.31835 0.000 0.592 0.008 0.328 0.072
#> SRR2105496 2 0.4337 0.54541 0.004 0.808 0.036 0.100 0.052
#> SRR2105493 4 0.6290 0.29414 0.000 0.400 0.012 0.480 0.108
#> SRR2105494 2 0.4297 0.52763 0.004 0.796 0.008 0.088 0.104
#> SRR2105491 3 0.4156 0.57240 0.164 0.004 0.784 0.004 0.044
#> SRR2105492 3 0.4919 0.50951 0.304 0.000 0.652 0.004 0.040
#> SRR2105489 3 0.7921 0.44881 0.076 0.196 0.532 0.044 0.152
#> SRR2105490 2 0.3827 0.46860 0.060 0.840 0.016 0.008 0.076
#> SRR2105487 1 0.7315 0.29557 0.436 0.056 0.152 0.000 0.356
#> SRR2105488 5 0.6259 0.09401 0.376 0.132 0.004 0.000 0.488
#> SRR2105485 2 0.5898 -0.22727 0.032 0.496 0.000 0.040 0.432
#> SRR2105486 5 0.6907 0.43449 0.124 0.316 0.008 0.032 0.520
#> SRR2105483 1 0.1697 0.63906 0.932 0.000 0.060 0.000 0.008
#> SRR2105484 1 0.1168 0.64351 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR2105481 3 0.6079 0.59200 0.116 0.004 0.664 0.040 0.176
#> SRR2105482 1 0.7833 0.21588 0.424 0.088 0.208 0.000 0.280
#> SRR2105479 3 0.5172 0.56750 0.224 0.000 0.692 0.012 0.072
#> SRR2105480 3 0.4666 0.55181 0.284 0.000 0.676 0.000 0.040
#> SRR2105477 3 0.5138 0.58247 0.076 0.056 0.768 0.012 0.088
#> SRR2105478 3 0.4769 0.59324 0.092 0.048 0.784 0.004 0.072
#> SRR2105475 4 0.4134 0.51934 0.000 0.284 0.004 0.704 0.008
#> SRR2105476 4 0.4155 0.61886 0.000 0.180 0.032 0.776 0.012
#> SRR2105473 2 0.7111 -0.20612 0.280 0.440 0.004 0.012 0.264
#> SRR2105474 2 0.7150 0.32957 0.144 0.628 0.068 0.056 0.104
#> SRR2105471 3 0.8020 -0.16819 0.356 0.124 0.356 0.000 0.164
#> SRR2105472 3 0.8273 0.13922 0.256 0.204 0.412 0.008 0.120
#> SRR2105469 4 0.7062 0.32263 0.000 0.148 0.044 0.484 0.324
#> SRR2105470 5 0.7269 0.28960 0.048 0.412 0.060 0.040 0.440
#> SRR2105467 5 0.6130 0.49714 0.096 0.140 0.080 0.004 0.680
#> SRR2105468 5 0.7115 0.44438 0.180 0.216 0.024 0.024 0.556
#> SRR2105465 1 0.8547 -0.28375 0.308 0.304 0.048 0.048 0.292
#> SRR2105466 1 0.5906 0.52420 0.652 0.024 0.096 0.004 0.224
#> SRR2105463 1 0.4761 0.61965 0.760 0.020 0.136 0.000 0.084
#> SRR2105464 1 0.1901 0.64525 0.928 0.004 0.056 0.000 0.012
#> SRR2105461 4 0.3380 0.64151 0.000 0.124 0.008 0.840 0.028
#> SRR2105462 2 0.4805 0.40483 0.000 0.648 0.000 0.312 0.040
#> SRR2105459 4 0.4807 0.21241 0.000 0.448 0.000 0.532 0.020
#> SRR2105460 4 0.1197 0.64025 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR2105457 4 0.6962 0.02286 0.004 0.208 0.008 0.412 0.368
#> SRR2105458 4 0.5532 0.53805 0.000 0.156 0.000 0.648 0.196
#> SRR2105455 4 0.6565 0.42274 0.000 0.264 0.068 0.584 0.084
#> SRR2105456 2 0.6270 0.46055 0.000 0.652 0.064 0.140 0.144
#> SRR2105453 2 0.7182 -0.23122 0.312 0.408 0.012 0.004 0.264
#> SRR2105454 1 0.5752 0.42813 0.628 0.100 0.012 0.000 0.260
#> SRR2105451 2 0.5855 0.36927 0.000 0.620 0.036 0.284 0.060
#> SRR2105452 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105449 1 0.7631 0.17973 0.476 0.168 0.260 0.000 0.096
#> SRR2105450 5 0.7914 0.39050 0.228 0.300 0.084 0.000 0.388
#> SRR2105447 2 0.4800 -0.12228 0.000 0.508 0.004 0.476 0.012
#> SRR2105448 2 0.5841 0.10548 0.000 0.524 0.048 0.404 0.024
#> SRR2105445 2 0.5876 0.52059 0.000 0.660 0.028 0.192 0.120
#> SRR2105446 2 0.6423 0.29060 0.008 0.564 0.004 0.172 0.252
#> SRR2105443 4 0.6510 0.48486 0.000 0.308 0.032 0.548 0.112
#> SRR2105444 2 0.4040 0.52224 0.004 0.832 0.044 0.060 0.060
#> SRR2105441 2 0.6060 0.08789 0.072 0.572 0.004 0.020 0.332
#> SRR2105442 2 0.6765 0.10500 0.252 0.556 0.040 0.000 0.152
#> SRR2105437 1 0.5243 0.48753 0.668 0.004 0.244 0.000 0.084
#> SRR2105438 1 0.4916 0.50181 0.708 0.004 0.212 0.000 0.076
#> SRR2105435 2 0.8003 0.16629 0.084 0.496 0.060 0.084 0.276
#> SRR2105436 5 0.6754 0.24470 0.048 0.420 0.076 0.004 0.452
#> SRR2105433 1 0.4062 0.60982 0.796 0.016 0.152 0.000 0.036
#> SRR2105434 1 0.6762 0.53720 0.596 0.084 0.208 0.000 0.112
#> SRR2105431 1 0.3206 0.63979 0.864 0.004 0.084 0.004 0.044
#> SRR2105432 1 0.3090 0.61618 0.860 0.000 0.104 0.004 0.032
#> SRR2105429 3 0.7991 0.21624 0.080 0.300 0.456 0.024 0.140
#> SRR2105430 2 0.7191 0.10962 0.004 0.432 0.400 0.064 0.100
#> SRR2105427 4 0.3210 0.63372 0.000 0.152 0.008 0.832 0.008
#> SRR2105428 2 0.5082 0.52256 0.004 0.740 0.036 0.168 0.052
#> SRR2105425 2 0.7763 0.28814 0.008 0.476 0.084 0.268 0.164
#> SRR2105426 2 0.7595 0.41203 0.028 0.568 0.160 0.096 0.148
#> SRR2105421 4 0.6606 0.48962 0.000 0.212 0.024 0.564 0.200
#> SRR2105422 4 0.7139 0.26193 0.000 0.104 0.076 0.484 0.336
#> SRR2105423 4 0.5861 0.47275 0.000 0.252 0.084 0.636 0.028
#> SRR2105424 2 0.6235 0.36880 0.000 0.556 0.008 0.292 0.144
#> SRR2105419 4 0.6099 0.46209 0.004 0.084 0.028 0.616 0.268
#> SRR2105420 2 0.6881 0.30831 0.000 0.524 0.032 0.268 0.176
#> SRR2105415 1 0.4906 0.63683 0.764 0.040 0.100 0.000 0.096
#> SRR2105416 1 0.2956 0.65286 0.884 0.020 0.036 0.000 0.060
#> SRR2105417 1 0.8134 0.33792 0.444 0.116 0.196 0.008 0.236
#> SRR2105418 1 0.3872 0.64703 0.836 0.060 0.040 0.000 0.064
#> SRR2105413 4 0.3697 0.62428 0.000 0.180 0.008 0.796 0.016
#> SRR2105414 4 0.5171 0.16138 0.000 0.456 0.000 0.504 0.040
#> SRR2105409 2 0.7380 0.15626 0.072 0.464 0.368 0.020 0.076
#> SRR2105410 1 0.7675 0.04080 0.424 0.184 0.316 0.000 0.076
#> SRR2105411 2 0.6341 0.42591 0.016 0.580 0.012 0.296 0.096
#> SRR2105412 2 0.4726 0.53462 0.000 0.768 0.024 0.120 0.088
#> SRR2105407 4 0.7169 0.46244 0.008 0.196 0.036 0.528 0.232
#> SRR2105408 2 0.6526 0.18908 0.000 0.452 0.000 0.344 0.204
#> SRR2105403 5 0.6772 0.14431 0.004 0.236 0.000 0.324 0.436
#> SRR2105404 5 0.8283 0.29864 0.104 0.232 0.012 0.236 0.416
#> SRR2105405 5 0.7581 0.10341 0.008 0.304 0.040 0.212 0.436
#> SRR2105406 5 0.6638 0.33254 0.128 0.420 0.020 0.000 0.432
#> SRR2105401 4 0.2608 0.64665 0.000 0.088 0.004 0.888 0.020
#> SRR2105402 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105399 4 0.4546 0.50867 0.000 0.304 0.000 0.668 0.028
#> SRR2105400 4 0.1732 0.64049 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR2105397 4 0.6919 0.07053 0.000 0.060 0.392 0.456 0.092
#> SRR2105398 3 0.8304 -0.13439 0.000 0.276 0.300 0.300 0.124
#> SRR2105395 3 0.7329 0.52279 0.032 0.076 0.596 0.140 0.156
#> SRR2105396 2 0.5022 0.53278 0.044 0.788 0.056 0.048 0.064
#> SRR2105393 2 0.5032 0.51541 0.008 0.760 0.072 0.032 0.128
#> SRR2105394 2 0.7215 0.30749 0.004 0.520 0.124 0.284 0.068
#> SRR2105389 5 0.8477 0.17545 0.016 0.096 0.264 0.272 0.352
#> SRR2105390 3 0.7489 0.23260 0.036 0.128 0.492 0.032 0.312
#> SRR2105391 4 0.6625 0.30970 0.004 0.076 0.048 0.532 0.340
#> SRR2105392 5 0.7504 0.08154 0.004 0.036 0.216 0.356 0.388
#> SRR2105385 3 0.7035 0.49900 0.192 0.016 0.528 0.016 0.248
#> SRR2105386 5 0.8767 0.29447 0.056 0.264 0.236 0.072 0.372
#> SRR2105387 2 0.6817 0.50154 0.016 0.632 0.096 0.092 0.164
#> SRR2105388 2 0.5562 0.50308 0.076 0.752 0.036 0.064 0.072
#> SRR2105381 4 0.6784 0.52052 0.000 0.240 0.088 0.580 0.092
#> SRR2105382 2 0.7816 -0.00572 0.008 0.356 0.252 0.340 0.044
#> SRR2105383 2 0.4824 0.45795 0.024 0.760 0.012 0.040 0.164
#> SRR2105384 2 0.4449 0.41128 0.036 0.784 0.016 0.012 0.152
#> SRR2105379 4 0.5540 0.50054 0.012 0.040 0.212 0.696 0.040
#> SRR2105380 3 0.6356 0.60593 0.100 0.036 0.692 0.104 0.068
#> SRR2105377 2 0.7494 0.29113 0.032 0.540 0.100 0.068 0.260
#> SRR2105378 5 0.8290 0.14250 0.300 0.208 0.144 0.000 0.348
#> SRR2105375 2 0.7700 -0.00860 0.056 0.492 0.200 0.016 0.236
#> SRR2105376 5 0.6725 0.32625 0.208 0.384 0.004 0.000 0.404
#> SRR2105373 5 0.6789 0.36202 0.080 0.076 0.228 0.012 0.604
#> SRR2105374 1 0.4865 0.44287 0.684 0.000 0.252 0.000 0.064
#> SRR2105371 4 0.7744 0.39663 0.000 0.260 0.100 0.460 0.180
#> SRR2105372 4 0.6155 0.45088 0.000 0.052 0.088 0.636 0.224
#> SRR2105369 4 0.7418 0.13057 0.000 0.200 0.044 0.396 0.360
#> SRR2105370 5 0.6626 0.26675 0.008 0.432 0.048 0.056 0.456
#> SRR2105367 1 0.8343 0.17060 0.408 0.188 0.140 0.008 0.256
#> SRR2105368 1 0.5383 0.61859 0.728 0.044 0.152 0.004 0.072
#> SRR2105365 3 0.6131 0.56157 0.248 0.040 0.644 0.040 0.028
#> SRR2105366 3 0.5768 0.56715 0.236 0.028 0.672 0.032 0.032
#> SRR2105363 2 0.5382 0.46828 0.000 0.644 0.000 0.252 0.104
#> SRR2105364 2 0.4535 0.51785 0.000 0.776 0.016 0.084 0.124
#> SRR2105361 4 0.4592 0.57405 0.000 0.232 0.016 0.724 0.028
#> SRR2105362 2 0.8231 0.15420 0.004 0.408 0.132 0.260 0.196
#> SRR2105359 5 0.6491 0.32474 0.012 0.424 0.048 0.040 0.476
#> SRR2105360 4 0.8233 0.04421 0.000 0.128 0.316 0.340 0.216
#> SRR2105355 5 0.7462 0.14679 0.008 0.116 0.072 0.340 0.464
#> SRR2105356 2 0.7013 -0.14982 0.028 0.520 0.064 0.048 0.340
#> SRR2105353 3 0.5979 0.50194 0.020 0.000 0.632 0.224 0.124
#> SRR2105354 3 0.7508 0.43858 0.076 0.020 0.516 0.104 0.284
#> SRR2105351 3 0.6718 0.45741 0.000 0.156 0.612 0.148 0.084
#> SRR2105352 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105349 4 0.6591 0.53210 0.004 0.228 0.100 0.608 0.060
#> SRR2105350 2 0.2889 0.53121 0.000 0.872 0.000 0.084 0.044
#> SRR2105345 2 0.5511 0.12077 0.004 0.524 0.000 0.416 0.056
#> SRR2105346 2 0.4180 0.46639 0.024 0.800 0.044 0.000 0.132
#> SRR2105347 1 0.6961 0.31582 0.528 0.288 0.056 0.000 0.128
#> SRR2105348 2 0.6331 0.13777 0.268 0.596 0.028 0.004 0.104
#> SRR2105343 4 0.3375 0.64494 0.000 0.072 0.048 0.860 0.020
#> SRR2105344 2 0.3609 0.52527 0.000 0.816 0.004 0.148 0.032
#> SRR2105341 5 0.7920 0.29215 0.040 0.140 0.060 0.268 0.492
#> SRR2105342 5 0.7039 0.18639 0.004 0.364 0.040 0.124 0.468
#> SRR2105339 5 0.9096 0.13850 0.044 0.156 0.184 0.300 0.316
#> SRR2105340 3 0.6898 0.40334 0.048 0.056 0.564 0.036 0.296
#> SRR2105335 3 0.6273 0.52487 0.064 0.036 0.632 0.020 0.248
#> SRR2105336 1 0.8186 0.27735 0.352 0.112 0.284 0.000 0.252
#> SRR2105337 3 0.6672 0.57658 0.052 0.064 0.664 0.072 0.148
#> SRR2105338 3 0.7619 0.36785 0.268 0.076 0.508 0.016 0.132
#> SRR2105331 3 0.8017 0.54002 0.148 0.052 0.512 0.224 0.064
#> SRR2105332 3 0.7242 0.47950 0.216 0.200 0.536 0.020 0.028
#> SRR2105333 4 0.1571 0.64042 0.000 0.060 0.004 0.936 0.000
#> SRR2105334 4 0.5122 0.42584 0.004 0.376 0.004 0.588 0.028
#> SRR2105329 4 0.5823 0.50636 0.000 0.260 0.008 0.616 0.116
#> SRR2105330 2 0.6264 0.39911 0.000 0.584 0.016 0.256 0.144
#> SRR2105327 4 0.6799 0.35781 0.000 0.320 0.132 0.512 0.036
#> SRR2105328 2 0.7726 0.25071 0.008 0.464 0.236 0.232 0.060
#> SRR2105325 3 0.5137 0.54610 0.228 0.000 0.676 0.000 0.096
#> SRR2105326 3 0.5441 0.49435 0.280 0.000 0.624 0.000 0.096
#> SRR2105323 5 0.6778 0.39700 0.016 0.248 0.016 0.156 0.564
#> SRR2105324 2 0.5190 0.11827 0.012 0.604 0.000 0.032 0.352
#> SRR2105319 3 0.5969 0.45368 0.244 0.008 0.608 0.000 0.140
#> SRR2105320 1 0.4505 0.56725 0.760 0.004 0.152 0.000 0.084
#> SRR2105321 3 0.3272 0.60476 0.036 0.004 0.868 0.016 0.076
#> SRR2105322 3 0.4199 0.57662 0.160 0.000 0.772 0.000 0.068
#> SRR2105317 4 0.2411 0.64160 0.000 0.108 0.000 0.884 0.008
#> SRR2105318 4 0.5920 0.10483 0.000 0.448 0.020 0.476 0.056
#> SRR2105315 4 0.5692 0.46809 0.000 0.308 0.012 0.604 0.076
#> SRR2105316 4 0.5028 0.25738 0.000 0.420 0.008 0.552 0.020
#> SRR2105313 4 0.6133 0.45332 0.000 0.328 0.012 0.552 0.108
#> SRR2105314 2 0.5767 0.33010 0.000 0.612 0.016 0.292 0.080
#> SRR2105311 3 0.5638 0.59014 0.172 0.000 0.692 0.100 0.036
#> SRR2105312 3 0.4770 0.57946 0.200 0.000 0.736 0.032 0.032
#> SRR2105307 1 0.6882 0.15502 0.484 0.104 0.028 0.012 0.372
#> SRR2105308 2 0.6358 -0.15081 0.168 0.548 0.008 0.000 0.276
#> SRR2105309 4 0.5405 0.56954 0.000 0.200 0.004 0.672 0.124
#> SRR2105310 2 0.5088 0.01642 0.004 0.588 0.008 0.020 0.380
#> SRR2105305 4 0.6052 0.51031 0.000 0.128 0.016 0.612 0.244
#> SRR2105306 2 0.7790 0.08806 0.000 0.392 0.088 0.344 0.176
#> SRR2105303 4 0.6498 0.49366 0.000 0.272 0.040 0.576 0.112
#> SRR2105304 4 0.0486 0.63253 0.000 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR2105301 3 0.7496 0.49887 0.032 0.116 0.588 0.140 0.124
#> SRR2105302 2 0.6669 0.10112 0.000 0.500 0.100 0.360 0.040
#> SRR2105299 3 0.6317 0.46609 0.024 0.040 0.596 0.040 0.300
#> SRR2105300 2 0.7567 0.42852 0.020 0.564 0.152 0.156 0.108
#> SRR2105297 1 0.2331 0.65768 0.920 0.016 0.032 0.004 0.028
#> SRR2105298 1 0.3396 0.65520 0.864 0.048 0.040 0.000 0.048
#> SRR2105295 4 0.4341 0.62070 0.000 0.136 0.056 0.788 0.020
#> SRR2105296 2 0.7732 0.21363 0.040 0.444 0.352 0.124 0.040
#> SRR2105293 3 0.6838 0.61184 0.096 0.064 0.664 0.088 0.088
#> SRR2105294 3 0.6374 0.24661 0.400 0.008 0.476 0.004 0.112
#> SRR2105291 5 0.8151 0.40004 0.020 0.148 0.180 0.160 0.492
#> SRR2105292 1 0.6713 0.45997 0.556 0.032 0.168 0.000 0.244
#> SRR2105289 2 0.7060 -0.03731 0.000 0.392 0.016 0.368 0.224
#> SRR2105290 5 0.7663 0.34877 0.236 0.316 0.056 0.000 0.392
#> SRR2105287 1 0.7910 -0.17613 0.344 0.284 0.048 0.008 0.316
#> SRR2105288 1 0.5681 0.51335 0.688 0.084 0.044 0.000 0.184
#> SRR2105285 4 0.5473 0.54103 0.000 0.276 0.016 0.644 0.064
#> SRR2105286 2 0.5514 0.50209 0.004 0.732 0.108 0.088 0.068
#> SRR2105283 2 0.6520 0.42567 0.052 0.656 0.152 0.020 0.120
#> SRR2105284 2 0.7419 -0.21076 0.144 0.484 0.032 0.024 0.316
#> SRR2105281 2 0.4973 0.47287 0.020 0.752 0.008 0.068 0.152
#> SRR2105282 2 0.4325 0.53272 0.000 0.756 0.000 0.180 0.064
#> SRR2105259 4 0.6061 0.49772 0.000 0.168 0.012 0.616 0.204
#> SRR2105260 2 0.6654 0.23582 0.000 0.488 0.008 0.308 0.196
#> SRR2105279 2 0.5527 0.03410 0.000 0.480 0.012 0.468 0.040
#> SRR2105280 2 0.3846 0.53348 0.000 0.816 0.036 0.132 0.016
#> SRR2105257 1 0.4866 0.61313 0.728 0.004 0.168 0.000 0.100
#> SRR2105258 1 0.4017 0.62462 0.800 0.004 0.128 0.000 0.068
#> SRR2105253 2 0.7625 0.19627 0.008 0.476 0.144 0.296 0.076
#> SRR2105254 2 0.4807 0.10816 0.000 0.532 0.000 0.448 0.020
#> SRR2105255 5 0.7166 0.45244 0.016 0.188 0.072 0.136 0.588
#> SRR2105256 2 0.6784 -0.31663 0.172 0.444 0.008 0.004 0.372
#> SRR2105251 2 0.7660 0.20827 0.004 0.424 0.352 0.136 0.084
#> SRR2105252 2 0.8027 0.13248 0.008 0.384 0.352 0.096 0.160
#> SRR2105249 2 0.6321 0.22402 0.000 0.552 0.056 0.336 0.056
#> SRR2105250 2 0.5667 0.23189 0.072 0.656 0.004 0.020 0.248
#> SRR2105247 2 0.7882 0.11001 0.008 0.364 0.352 0.220 0.056
#> SRR2105248 3 0.4213 0.61135 0.040 0.044 0.828 0.016 0.072
#> SRR2105245 3 0.5124 0.59276 0.040 0.060 0.780 0.044 0.076
#> SRR2105246 3 0.8146 0.15343 0.004 0.120 0.396 0.304 0.176
#> SRR2105243 5 0.8360 0.12381 0.012 0.300 0.100 0.220 0.368
#> SRR2105244 3 0.8561 0.08306 0.160 0.116 0.352 0.028 0.344
#> SRR2105241 3 0.8687 0.02380 0.060 0.112 0.376 0.116 0.336
#> SRR2105242 3 0.6918 0.29772 0.340 0.048 0.512 0.008 0.092
#> SRR2105239 3 0.7935 0.32076 0.008 0.108 0.476 0.232 0.176
#> SRR2105240 1 0.4093 0.64883 0.816 0.024 0.088 0.000 0.072
#> SRR2105237 4 0.4518 0.63735 0.004 0.132 0.020 0.784 0.060
#> SRR2105238 2 0.6132 0.42364 0.000 0.576 0.004 0.252 0.168
#> SRR2105235 2 0.6016 0.47547 0.000 0.600 0.004 0.216 0.180
#> SRR2105236 2 0.5157 0.47972 0.032 0.752 0.008 0.084 0.124
#> SRR2105233 4 0.3224 0.62883 0.000 0.080 0.044 0.864 0.012
#> SRR2105234 4 0.1243 0.63857 0.000 0.028 0.008 0.960 0.004
#> SRR2105231 2 0.6915 0.49886 0.080 0.652 0.132 0.076 0.060
#> SRR2105232 2 0.7763 0.30321 0.060 0.504 0.256 0.028 0.152
#> SRR2105227 5 0.9035 0.23979 0.056 0.124 0.216 0.224 0.380
#> SRR2105228 2 0.7059 -0.03151 0.004 0.472 0.044 0.120 0.360
#> SRR2105225 5 0.8411 0.27424 0.016 0.316 0.176 0.116 0.376
#> SRR2105226 5 0.8833 0.35460 0.172 0.176 0.196 0.040 0.416
#> SRR2105229 5 0.8400 -0.01263 0.000 0.180 0.192 0.296 0.332
#> SRR2105230 5 0.7201 0.44976 0.176 0.212 0.036 0.020 0.556
#> SRR2105219 2 0.7187 -0.02960 0.000 0.420 0.064 0.400 0.116
#> SRR2105220 2 0.5473 0.53460 0.004 0.716 0.028 0.108 0.144
#> SRR2105221 5 0.8421 0.32465 0.112 0.296 0.140 0.032 0.420
#> SRR2105222 1 0.5026 0.58686 0.740 0.068 0.032 0.000 0.160
#> SRR2105223 3 0.7026 0.22378 0.056 0.032 0.468 0.044 0.400
#> SRR2105224 5 0.8357 -0.01642 0.204 0.132 0.320 0.004 0.340
#> SRR2105217 3 0.4971 0.57672 0.052 0.028 0.752 0.008 0.160
#> SRR2105218 3 0.7006 0.40816 0.064 0.256 0.556 0.004 0.120
#> SRR2105215 2 0.5946 0.48314 0.008 0.676 0.084 0.040 0.192
#> SRR2105216 2 0.4658 0.18695 0.000 0.576 0.000 0.408 0.016
#> SRR2105213 3 0.7136 0.51360 0.144 0.028 0.532 0.020 0.276
#> SRR2105214 3 0.7111 0.53101 0.064 0.132 0.632 0.056 0.116
#> SRR2105211 5 0.8307 -0.02243 0.012 0.292 0.092 0.228 0.376
#> SRR2105212 2 0.5819 0.47507 0.008 0.660 0.028 0.068 0.236
#> SRR2105209 5 0.7063 0.25630 0.048 0.144 0.272 0.004 0.532
#> SRR2105210 1 0.7445 0.31066 0.496 0.096 0.272 0.000 0.136
#> SRR2105207 3 0.7345 0.55064 0.156 0.048 0.572 0.032 0.192
#> SRR2105208 1 0.4218 0.60452 0.784 0.016 0.160 0.000 0.040
#> SRR2105205 3 0.7645 0.55135 0.112 0.024 0.560 0.168 0.136
#> SRR2105206 3 0.5468 0.56279 0.252 0.044 0.672 0.008 0.024
#> SRR2105201 2 0.5866 0.29644 0.004 0.596 0.040 0.036 0.324
#> SRR2105202 2 0.5948 0.09422 0.072 0.600 0.000 0.028 0.300
#> SRR2105203 4 0.8434 0.15942 0.000 0.220 0.240 0.352 0.188
#> SRR2105204 2 0.6276 0.38774 0.000 0.608 0.076 0.260 0.056
#> SRR2105199 2 0.6169 0.28342 0.004 0.580 0.056 0.040 0.320
#> SRR2105200 2 0.7671 -0.19992 0.312 0.424 0.032 0.016 0.216
#> SRR2105197 5 0.7905 0.25723 0.048 0.116 0.248 0.072 0.516
#> SRR2105198 3 0.8421 -0.11417 0.292 0.120 0.356 0.008 0.224
#> SRR2105195 3 0.6459 0.54552 0.160 0.008 0.596 0.016 0.220
#> SRR2105196 1 0.6762 0.31744 0.552 0.036 0.252 0.000 0.160
#> SRR2105193 1 0.5289 0.58624 0.736 0.032 0.100 0.004 0.128
#> SRR2105194 1 0.2482 0.63898 0.892 0.000 0.084 0.000 0.024
#> SRR2105191 4 0.6758 0.20084 0.004 0.008 0.200 0.500 0.288
#> SRR2105192 1 0.5752 0.49046 0.668 0.116 0.024 0.000 0.192
#> SRR2105189 4 0.6895 0.40074 0.008 0.300 0.052 0.544 0.096
#> SRR2105190 2 0.4968 0.05690 0.000 0.516 0.000 0.456 0.028
#> SRR2105187 3 0.5628 0.59058 0.076 0.008 0.716 0.048 0.152
#> SRR2105188 3 0.7136 0.45070 0.128 0.116 0.568 0.000 0.188
#> SRR2105179 3 0.6889 0.49381 0.124 0.028 0.568 0.020 0.260
#> SRR2105180 1 0.2628 0.63927 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR2105183 2 0.6476 0.43926 0.000 0.596 0.036 0.144 0.224
#> SRR2105184 2 0.7833 0.05804 0.156 0.508 0.136 0.008 0.192
#> SRR2105185 4 0.8103 0.30373 0.000 0.196 0.160 0.432 0.212
#> SRR2105186 3 0.7414 0.38990 0.116 0.228 0.536 0.004 0.116
#> SRR2105181 5 0.6566 -0.03700 0.024 0.028 0.344 0.060 0.544
#> SRR2105182 5 0.7371 0.47018 0.080 0.260 0.076 0.032 0.552
#> SRR2105177 3 0.7561 0.37439 0.284 0.060 0.480 0.008 0.168
#> SRR2105178 1 0.0854 0.64714 0.976 0.004 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105171 2 0.7797 0.29340 0.016 0.504 0.100 0.248 0.132
#> SRR2105172 2 0.4906 0.51635 0.000 0.764 0.040 0.096 0.100
#> SRR2105175 1 0.5666 0.23612 0.604 0.000 0.296 0.004 0.096
#> SRR2105176 1 0.1251 0.64357 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR2105173 2 0.9001 0.09095 0.028 0.328 0.240 0.236 0.168
#> SRR2105174 2 0.8985 0.19082 0.084 0.400 0.192 0.236 0.088
#> SRR2105169 2 0.8692 0.26613 0.052 0.432 0.240 0.168 0.108
#> SRR2105170 1 0.6776 0.17760 0.492 0.356 0.112 0.000 0.040
#> SRR2105167 2 0.4485 0.48578 0.000 0.732 0.008 0.224 0.036
#> SRR2105168 2 0.4918 0.51590 0.000 0.764 0.084 0.044 0.108
#> SRR2105165 3 0.6483 0.48324 0.296 0.004 0.508 0.000 0.192
#> SRR2105166 3 0.5458 0.51636 0.304 0.004 0.616 0.000 0.076
#> SRR2105163 3 0.6987 0.57188 0.116 0.004 0.596 0.180 0.104
#> SRR2105164 3 0.4937 0.57975 0.176 0.000 0.720 0.004 0.100
#> SRR2105161 3 0.5561 0.39292 0.376 0.008 0.568 0.008 0.040
#> SRR2105162 1 0.1608 0.63887 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR2105155 4 0.6193 0.15423 0.000 0.400 0.008 0.484 0.108
#> SRR2105156 2 0.3715 0.52650 0.004 0.812 0.008 0.156 0.020
#> SRR2105157 3 0.5767 0.61587 0.104 0.052 0.736 0.044 0.064
#> SRR2105158 3 0.6047 0.57740 0.208 0.080 0.664 0.012 0.036
#> SRR2105159 3 0.5775 0.57899 0.192 0.008 0.656 0.004 0.140
#> SRR2105160 1 0.6636 0.26927 0.504 0.016 0.344 0.004 0.132
#> SRR2105153 3 0.8155 0.55681 0.148 0.120 0.544 0.088 0.100
#> SRR2105154 3 0.4940 0.60149 0.152 0.024 0.752 0.004 0.068
#> SRR2105151 2 0.3400 0.53660 0.004 0.868 0.040 0.052 0.036
#> SRR2105152 2 0.3754 0.52173 0.000 0.796 0.008 0.176 0.020
#> SRR2105149 2 0.8121 0.07477 0.016 0.372 0.064 0.332 0.216
#> SRR2105150 2 0.5874 0.03834 0.012 0.556 0.004 0.064 0.364
#> SRR2105147 4 0.0693 0.62971 0.000 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105148 4 0.0727 0.63074 0.000 0.004 0.012 0.980 0.004
#> SRR2105143 5 0.8373 0.35596 0.132 0.332 0.160 0.012 0.364
#> SRR2105144 2 0.6364 -0.07813 0.232 0.560 0.008 0.000 0.200
#> SRR2105145 3 0.5602 0.14029 0.464 0.004 0.472 0.000 0.060
#> SRR2105146 3 0.5341 0.36361 0.376 0.000 0.564 0.000 0.060
#> SRR2105141 3 0.7158 0.43966 0.148 0.004 0.448 0.364 0.036
#> SRR2105142 3 0.8364 0.25616 0.140 0.072 0.372 0.368 0.048
#> SRR2105139 2 0.6291 0.36973 0.000 0.612 0.060 0.252 0.076
#> SRR2105140 2 0.5365 0.53668 0.008 0.744 0.048 0.112 0.088
#> SRR2105137 2 0.5376 0.20289 0.000 0.544 0.004 0.404 0.048
#> SRR2105138 1 0.7593 0.33270 0.544 0.200 0.040 0.044 0.172
#> SRR2105135 2 0.6741 0.30638 0.000 0.520 0.028 0.304 0.148
#> SRR2105136 2 0.5722 0.46570 0.000 0.676 0.052 0.208 0.064
#> SRR2105133 5 0.6746 0.44101 0.060 0.260 0.008 0.088 0.584
#> SRR2105134 5 0.7074 0.21722 0.308 0.228 0.020 0.000 0.444
#> SRR2105131 5 0.7856 0.03487 0.004 0.280 0.052 0.328 0.336
#> SRR2105132 5 0.6566 -0.02634 0.420 0.072 0.048 0.000 0.460
#> SRR2105129 1 0.3697 0.64767 0.832 0.008 0.088 0.000 0.072
#> SRR2105130 1 0.1661 0.64762 0.940 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR2105127 5 0.6308 0.11007 0.376 0.076 0.024 0.004 0.520
#> SRR2105128 1 0.7884 -0.16240 0.352 0.352 0.024 0.028 0.244
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.2730 0.34284 0.028 0.012 0.004 0.004 0.884 0.068
#> SRR2105278 5 0.5437 0.36229 0.160 0.088 0.000 0.004 0.680 0.068
#> SRR2105275 3 0.3338 0.51244 0.008 0.000 0.800 0.012 0.004 0.176
#> SRR2105276 3 0.4730 0.47855 0.020 0.024 0.688 0.004 0.012 0.252
#> SRR2105273 5 0.7861 -0.19289 0.008 0.032 0.208 0.084 0.384 0.284
#> SRR2105274 5 0.7767 0.13348 0.084 0.132 0.104 0.000 0.472 0.208
#> SRR2105271 5 0.8087 0.26908 0.056 0.204 0.028 0.120 0.472 0.120
#> SRR2105272 1 0.5101 0.63521 0.700 0.004 0.176 0.000 0.068 0.052
#> SRR2105269 4 0.5992 0.37003 0.004 0.336 0.020 0.536 0.012 0.092
#> SRR2105270 2 0.5654 0.55021 0.000 0.680 0.012 0.096 0.124 0.088
#> SRR2105267 4 0.4283 0.48647 0.000 0.252 0.000 0.696 0.004 0.048
#> SRR2105268 2 0.3628 0.54632 0.000 0.820 0.000 0.036 0.100 0.044
#> SRR2105265 2 0.6021 0.43677 0.000 0.592 0.008 0.248 0.100 0.052
#> SRR2105266 2 0.5722 0.53080 0.004 0.656 0.000 0.160 0.092 0.088
#> SRR2105263 3 0.5214 0.48222 0.196 0.088 0.680 0.008 0.000 0.028
#> SRR2105264 3 0.6300 0.37392 0.296 0.044 0.556 0.000 0.064 0.040
#> SRR2105261 3 0.7234 0.17634 0.008 0.256 0.496 0.048 0.040 0.152
#> SRR2105262 2 0.7533 0.35701 0.000 0.456 0.044 0.144 0.260 0.096
#> SRR2105357 4 0.6883 0.23216 0.000 0.284 0.000 0.444 0.196 0.076
#> SRR2105358 5 0.3260 0.36712 0.028 0.068 0.000 0.000 0.848 0.056
#> SRR2105439 2 0.4858 0.53546 0.004 0.732 0.000 0.064 0.140 0.060
#> SRR2105440 2 0.6450 0.37222 0.004 0.500 0.000 0.088 0.324 0.084
#> SRR2105509 4 0.1972 0.59294 0.000 0.056 0.000 0.916 0.004 0.024
#> SRR2105510 4 0.2467 0.60690 0.000 0.088 0.000 0.884 0.012 0.016
#> SRR2105507 3 0.8962 -0.15365 0.048 0.284 0.312 0.068 0.128 0.160
#> SRR2105508 5 0.8530 -0.28403 0.008 0.044 0.236 0.176 0.272 0.264
#> SRR2105505 5 0.5536 0.34241 0.052 0.056 0.016 0.036 0.720 0.120
#> SRR2105506 5 0.6169 -0.13282 0.416 0.064 0.000 0.004 0.448 0.068
#> SRR2105503 3 0.8820 0.05292 0.076 0.244 0.364 0.168 0.044 0.104
#> SRR2105504 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105501 2 0.6809 -0.06290 0.008 0.424 0.012 0.400 0.076 0.080
#> SRR2105502 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105499 5 0.6842 0.30236 0.136 0.080 0.088 0.000 0.596 0.100
#> SRR2105500 5 0.4819 0.36293 0.016 0.180 0.008 0.000 0.712 0.084
#> SRR2105497 3 0.7926 0.23506 0.056 0.064 0.512 0.188 0.064 0.116
#> SRR2105498 2 0.7340 0.20701 0.172 0.472 0.268 0.040 0.032 0.016
#> SRR2105495 2 0.5976 0.38459 0.000 0.564 0.004 0.296 0.064 0.072
#> SRR2105496 2 0.4380 0.56027 0.008 0.796 0.016 0.068 0.036 0.076
#> SRR2105493 4 0.7012 0.11543 0.008 0.368 0.000 0.388 0.068 0.168
#> SRR2105494 2 0.5161 0.53123 0.008 0.708 0.000 0.064 0.156 0.064
#> SRR2105491 3 0.4023 0.51175 0.100 0.000 0.756 0.000 0.000 0.144
#> SRR2105492 3 0.5045 0.45095 0.244 0.004 0.636 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105489 3 0.7412 0.28166 0.056 0.188 0.476 0.008 0.036 0.236
#> SRR2105490 2 0.5001 0.48524 0.036 0.732 0.020 0.004 0.152 0.056
#> SRR2105487 5 0.7018 0.10734 0.248 0.024 0.120 0.000 0.512 0.096
#> SRR2105488 5 0.4321 0.34533 0.172 0.020 0.012 0.000 0.756 0.040
#> SRR2105485 5 0.5822 0.32466 0.012 0.312 0.000 0.048 0.572 0.056
#> SRR2105486 5 0.5642 0.36953 0.040 0.208 0.000 0.024 0.656 0.072
#> SRR2105483 1 0.1615 0.66733 0.928 0.004 0.064 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105484 1 0.0865 0.66634 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.6857 0.46597 0.084 0.016 0.588 0.044 0.068 0.200
#> SRR2105482 5 0.8105 -0.00765 0.292 0.044 0.208 0.000 0.328 0.128
#> SRR2105479 3 0.4629 0.50723 0.168 0.000 0.736 0.008 0.024 0.064
#> SRR2105480 3 0.4061 0.48424 0.248 0.000 0.716 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105477 3 0.5890 0.46473 0.040 0.072 0.624 0.004 0.020 0.240
#> SRR2105478 3 0.5662 0.48138 0.056 0.052 0.652 0.000 0.024 0.216
#> SRR2105475 4 0.4564 0.27654 0.000 0.396 0.000 0.572 0.020 0.012
#> SRR2105476 4 0.5020 0.55160 0.000 0.228 0.020 0.680 0.012 0.060
#> SRR2105473 2 0.7365 -0.17460 0.192 0.368 0.000 0.008 0.332 0.100
#> SRR2105474 2 0.6585 0.35838 0.112 0.620 0.028 0.008 0.120 0.112
#> SRR2105471 3 0.8601 -0.01643 0.256 0.112 0.280 0.000 0.116 0.236
#> SRR2105472 3 0.8067 0.15052 0.172 0.236 0.312 0.004 0.016 0.260
#> SRR2105469 4 0.7840 0.02938 0.000 0.128 0.028 0.384 0.252 0.208
#> SRR2105470 5 0.6675 0.32790 0.028 0.200 0.036 0.024 0.592 0.120
#> SRR2105467 5 0.4224 0.27958 0.044 0.004 0.032 0.004 0.780 0.136
#> SRR2105468 5 0.4347 0.35591 0.048 0.052 0.012 0.004 0.792 0.092
#> SRR2105465 5 0.8490 0.24059 0.240 0.220 0.044 0.016 0.340 0.140
#> SRR2105466 1 0.6570 0.52147 0.584 0.008 0.112 0.004 0.172 0.120
#> SRR2105463 1 0.5919 0.59995 0.656 0.020 0.156 0.000 0.088 0.080
#> SRR2105464 1 0.2611 0.67178 0.876 0.000 0.092 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105461 4 0.3725 0.60811 0.000 0.140 0.000 0.792 0.008 0.060
#> SRR2105462 2 0.5196 0.43903 0.000 0.644 0.000 0.256 0.056 0.044
#> SRR2105459 2 0.5375 -0.05279 0.000 0.468 0.004 0.456 0.016 0.056
#> SRR2105460 4 0.1845 0.60150 0.000 0.072 0.000 0.916 0.008 0.004
#> SRR2105457 5 0.6867 -0.00389 0.004 0.108 0.004 0.272 0.500 0.112
#> SRR2105458 4 0.6292 0.40377 0.000 0.148 0.000 0.552 0.236 0.064
#> SRR2105455 4 0.7017 0.26385 0.000 0.296 0.064 0.496 0.092 0.052
#> SRR2105456 2 0.7510 0.43092 0.008 0.532 0.080 0.100 0.180 0.100
#> SRR2105453 5 0.6927 0.24098 0.276 0.320 0.000 0.000 0.352 0.052
#> SRR2105454 1 0.5654 0.34019 0.544 0.060 0.000 0.000 0.348 0.048
#> SRR2105451 2 0.5750 0.45011 0.000 0.648 0.020 0.208 0.056 0.068
#> SRR2105452 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105449 1 0.7996 0.06446 0.372 0.140 0.312 0.000 0.076 0.100
#> SRR2105450 5 0.6977 0.34079 0.168 0.168 0.056 0.000 0.552 0.056
#> SRR2105447 2 0.5011 0.18816 0.004 0.564 0.004 0.384 0.012 0.032
#> SRR2105448 2 0.6139 0.37792 0.000 0.580 0.036 0.276 0.036 0.072
#> SRR2105445 2 0.6057 0.52607 0.000 0.616 0.000 0.132 0.144 0.108
#> SRR2105446 2 0.7142 0.11949 0.000 0.408 0.004 0.120 0.332 0.136
#> SRR2105443 4 0.7371 0.33535 0.000 0.300 0.036 0.440 0.076 0.148
#> SRR2105444 2 0.5122 0.48392 0.004 0.700 0.020 0.028 0.200 0.048
#> SRR2105441 5 0.6087 0.09076 0.048 0.392 0.004 0.012 0.492 0.052
#> SRR2105442 2 0.7096 0.14708 0.164 0.488 0.028 0.000 0.256 0.064
#> SRR2105437 1 0.6418 0.37649 0.492 0.000 0.276 0.000 0.040 0.192
#> SRR2105438 1 0.6219 0.40190 0.528 0.000 0.256 0.000 0.036 0.180
#> SRR2105435 5 0.7776 0.12597 0.080 0.328 0.040 0.036 0.428 0.088
#> SRR2105436 5 0.6365 0.32682 0.064 0.240 0.028 0.004 0.592 0.072
#> SRR2105433 1 0.4196 0.64271 0.772 0.012 0.156 0.000 0.036 0.024
#> SRR2105434 1 0.7501 0.42795 0.488 0.056 0.212 0.000 0.156 0.088
#> SRR2105431 1 0.3995 0.65491 0.804 0.008 0.100 0.000 0.032 0.056
#> SRR2105432 1 0.4684 0.61721 0.732 0.004 0.140 0.000 0.020 0.104
#> SRR2105429 3 0.7424 0.14280 0.052 0.300 0.368 0.000 0.028 0.252
#> SRR2105430 2 0.7131 0.00505 0.012 0.456 0.272 0.016 0.036 0.208
#> SRR2105427 4 0.4145 0.58267 0.000 0.208 0.000 0.736 0.012 0.044
#> SRR2105428 2 0.5368 0.54742 0.008 0.712 0.008 0.120 0.092 0.060
#> SRR2105425 2 0.7891 0.37919 0.004 0.452 0.044 0.160 0.176 0.164
#> SRR2105426 2 0.6613 0.50155 0.004 0.616 0.088 0.044 0.148 0.100
#> SRR2105421 4 0.7617 0.34097 0.004 0.168 0.024 0.464 0.140 0.200
#> SRR2105422 4 0.7805 -0.13646 0.000 0.072 0.048 0.352 0.308 0.220
#> SRR2105423 4 0.6362 0.31452 0.000 0.312 0.100 0.516 0.004 0.068
#> SRR2105424 2 0.6984 0.39721 0.000 0.488 0.004 0.224 0.180 0.104
#> SRR2105419 4 0.7018 0.19902 0.004 0.044 0.020 0.484 0.244 0.204
#> SRR2105420 2 0.7702 0.27111 0.004 0.452 0.028 0.212 0.132 0.172
#> SRR2105415 1 0.5168 0.64698 0.716 0.016 0.076 0.000 0.144 0.048
#> SRR2105416 1 0.2544 0.67538 0.888 0.004 0.028 0.000 0.072 0.008
#> SRR2105417 1 0.7989 0.31998 0.420 0.064 0.136 0.000 0.236 0.144
#> SRR2105418 1 0.3708 0.66172 0.832 0.028 0.024 0.000 0.080 0.036
#> SRR2105413 4 0.4391 0.57356 0.000 0.196 0.000 0.732 0.040 0.032
#> SRR2105414 2 0.5801 0.13881 0.000 0.504 0.004 0.388 0.040 0.064
#> SRR2105409 2 0.6163 0.17681 0.004 0.468 0.384 0.016 0.008 0.120
#> SRR2105410 3 0.8358 0.10768 0.244 0.152 0.372 0.000 0.124 0.108
#> SRR2105411 2 0.7214 0.38763 0.008 0.496 0.028 0.272 0.116 0.080
#> SRR2105412 2 0.4689 0.55349 0.008 0.760 0.000 0.084 0.080 0.068
#> SRR2105407 4 0.8016 0.23822 0.004 0.168 0.048 0.420 0.228 0.132
#> SRR2105408 5 0.7122 -0.18027 0.000 0.320 0.000 0.280 0.328 0.072
#> SRR2105403 5 0.7008 0.07690 0.000 0.132 0.000 0.200 0.480 0.188
#> SRR2105404 5 0.7668 0.09385 0.044 0.104 0.000 0.244 0.444 0.164
#> SRR2105405 5 0.7801 -0.07557 0.000 0.204 0.028 0.112 0.360 0.296
#> SRR2105406 5 0.6797 0.30505 0.052 0.256 0.008 0.000 0.480 0.204
#> SRR2105401 4 0.3994 0.60828 0.000 0.104 0.008 0.804 0.040 0.044
#> SRR2105402 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105399 4 0.5046 0.42605 0.004 0.328 0.000 0.604 0.016 0.048
#> SRR2105400 4 0.2062 0.60529 0.000 0.088 0.000 0.900 0.004 0.008
#> SRR2105397 4 0.7551 -0.06500 0.004 0.068 0.304 0.400 0.028 0.196
#> SRR2105398 5 0.8907 -0.17632 0.000 0.196 0.216 0.220 0.228 0.140
#> SRR2105395 3 0.7837 0.29493 0.028 0.088 0.528 0.092 0.120 0.144
#> SRR2105396 2 0.5428 0.52990 0.048 0.736 0.036 0.020 0.088 0.072
#> SRR2105393 2 0.4873 0.52562 0.008 0.728 0.012 0.008 0.136 0.108
#> SRR2105394 2 0.6742 0.45223 0.004 0.564 0.088 0.172 0.012 0.160
#> SRR2105389 5 0.8639 -0.23699 0.004 0.084 0.208 0.152 0.316 0.236
#> SRR2105390 3 0.7880 -0.20767 0.012 0.120 0.328 0.008 0.232 0.300
#> SRR2105391 4 0.7079 -0.08204 0.000 0.028 0.024 0.392 0.284 0.272
#> SRR2105392 6 0.8000 0.20426 0.000 0.028 0.144 0.212 0.304 0.312
#> SRR2105385 3 0.7310 0.30918 0.128 0.016 0.496 0.004 0.152 0.204
#> SRR2105386 5 0.8656 -0.19202 0.044 0.164 0.204 0.020 0.296 0.272
#> SRR2105387 2 0.7131 0.43249 0.004 0.556 0.096 0.048 0.116 0.180
#> SRR2105388 2 0.5750 0.51841 0.060 0.708 0.012 0.048 0.068 0.104
#> SRR2105381 4 0.7510 0.38593 0.004 0.240 0.076 0.496 0.080 0.104
#> SRR2105382 2 0.7872 0.26682 0.012 0.440 0.180 0.228 0.032 0.108
#> SRR2105383 2 0.4697 0.47666 0.016 0.708 0.000 0.000 0.184 0.092
#> SRR2105384 2 0.5133 0.36863 0.020 0.668 0.008 0.004 0.240 0.060
#> SRR2105379 4 0.5786 0.42077 0.000 0.088 0.168 0.660 0.016 0.068
#> SRR2105380 3 0.5211 0.48306 0.080 0.008 0.736 0.044 0.024 0.108
#> SRR2105377 2 0.7185 0.16190 0.028 0.424 0.016 0.028 0.348 0.156
#> SRR2105378 5 0.7678 0.22495 0.216 0.108 0.080 0.000 0.480 0.116
#> SRR2105375 2 0.8071 0.03002 0.036 0.416 0.140 0.016 0.256 0.136
#> SRR2105376 5 0.5782 0.36741 0.080 0.200 0.004 0.000 0.636 0.080
#> SRR2105373 5 0.6250 -0.05485 0.008 0.008 0.140 0.012 0.496 0.336
#> SRR2105374 1 0.6098 0.35456 0.524 0.000 0.268 0.000 0.024 0.184
#> SRR2105371 4 0.8464 0.03129 0.000 0.244 0.072 0.284 0.140 0.260
#> SRR2105372 4 0.7358 0.11427 0.000 0.040 0.072 0.480 0.192 0.216
#> SRR2105369 5 0.8078 -0.16314 0.004 0.112 0.032 0.288 0.308 0.256
#> SRR2105370 5 0.6465 0.27164 0.000 0.284 0.012 0.040 0.520 0.144
#> SRR2105367 1 0.8542 0.05471 0.320 0.160 0.080 0.004 0.276 0.160
#> SRR2105368 1 0.6177 0.59562 0.656 0.056 0.120 0.000 0.072 0.096
#> SRR2105365 3 0.5164 0.50114 0.176 0.080 0.700 0.024 0.000 0.020
#> SRR2105366 3 0.4616 0.50920 0.176 0.032 0.740 0.032 0.000 0.020
#> SRR2105363 2 0.6446 0.48948 0.004 0.576 0.004 0.200 0.140 0.076
#> SRR2105364 2 0.5378 0.50781 0.004 0.672 0.008 0.036 0.208 0.072
#> SRR2105361 4 0.5373 0.49402 0.000 0.236 0.008 0.648 0.028 0.080
#> SRR2105362 2 0.8582 0.06117 0.000 0.308 0.120 0.200 0.256 0.116
#> SRR2105359 5 0.7121 0.15856 0.004 0.260 0.028 0.024 0.424 0.260
#> SRR2105360 4 0.8693 -0.20456 0.000 0.112 0.232 0.304 0.172 0.180
#> SRR2105355 5 0.7693 -0.12639 0.000 0.068 0.044 0.216 0.380 0.292
#> SRR2105356 5 0.7487 0.21496 0.012 0.352 0.044 0.032 0.384 0.176
#> SRR2105353 3 0.6961 0.24093 0.004 0.012 0.520 0.192 0.076 0.196
#> SRR2105354 3 0.7684 -0.01135 0.032 0.004 0.400 0.072 0.264 0.228
#> SRR2105351 3 0.6593 0.32587 0.004 0.148 0.604 0.068 0.032 0.144
#> SRR2105352 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105349 4 0.7085 0.43166 0.004 0.252 0.100 0.520 0.032 0.092
#> SRR2105350 2 0.3845 0.52656 0.000 0.800 0.000 0.032 0.120 0.048
#> SRR2105345 2 0.6551 0.29049 0.000 0.488 0.000 0.308 0.124 0.080
#> SRR2105346 2 0.5347 0.45340 0.024 0.640 0.000 0.000 0.220 0.116
#> SRR2105347 1 0.7478 0.22903 0.460 0.252 0.032 0.000 0.140 0.116
#> SRR2105348 2 0.6828 0.14186 0.244 0.520 0.008 0.008 0.160 0.060
#> SRR2105343 4 0.3240 0.59666 0.000 0.092 0.056 0.840 0.000 0.012
#> SRR2105344 2 0.4760 0.54981 0.004 0.744 0.000 0.124 0.064 0.064
#> SRR2105341 5 0.7744 -0.10906 0.012 0.056 0.056 0.160 0.436 0.280
#> SRR2105342 5 0.7643 0.05833 0.008 0.216 0.024 0.088 0.440 0.224
#> SRR2105339 6 0.9246 0.23479 0.028 0.120 0.160 0.188 0.248 0.256
#> SRR2105340 3 0.7062 0.04708 0.016 0.028 0.432 0.012 0.196 0.316
#> SRR2105335 3 0.7138 0.32326 0.036 0.016 0.468 0.024 0.152 0.304
#> SRR2105336 6 0.8640 -0.17706 0.228 0.108 0.232 0.000 0.136 0.296
#> SRR2105337 3 0.6937 0.32178 0.024 0.088 0.540 0.028 0.052 0.268
#> SRR2105338 3 0.7720 0.37030 0.172 0.072 0.508 0.008 0.112 0.128
#> SRR2105331 3 0.7437 0.42729 0.140 0.088 0.564 0.124 0.028 0.056
#> SRR2105332 3 0.5918 0.39947 0.164 0.216 0.592 0.004 0.004 0.020
#> SRR2105333 4 0.2196 0.60569 0.000 0.108 0.004 0.884 0.004 0.000
#> SRR2105334 4 0.6238 0.34430 0.004 0.336 0.008 0.524 0.064 0.064
#> SRR2105329 4 0.6863 0.40088 0.000 0.244 0.008 0.512 0.124 0.112
#> SRR2105330 2 0.7312 0.38000 0.004 0.480 0.016 0.184 0.220 0.096
#> SRR2105327 2 0.7487 -0.03086 0.000 0.376 0.128 0.368 0.040 0.088
#> SRR2105328 2 0.7468 0.34859 0.008 0.496 0.200 0.176 0.032 0.088
#> SRR2105325 3 0.5025 0.48963 0.112 0.000 0.672 0.000 0.016 0.200
#> SRR2105326 3 0.5493 0.44030 0.156 0.000 0.624 0.000 0.020 0.200
#> SRR2105323 5 0.5339 0.23047 0.000 0.092 0.004 0.096 0.700 0.108
#> SRR2105324 5 0.4896 0.20392 0.000 0.384 0.004 0.016 0.568 0.028
#> SRR2105319 3 0.6635 0.40141 0.140 0.004 0.512 0.000 0.076 0.268
#> SRR2105320 1 0.5582 0.49714 0.624 0.000 0.152 0.000 0.028 0.196
#> SRR2105321 3 0.4112 0.50400 0.028 0.004 0.740 0.004 0.008 0.216
#> SRR2105322 3 0.4490 0.51604 0.080 0.008 0.712 0.000 0.000 0.200
#> SRR2105317 4 0.2592 0.60384 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR2105318 2 0.6059 0.12161 0.000 0.484 0.012 0.388 0.028 0.088
#> SRR2105315 4 0.5817 0.44798 0.000 0.276 0.000 0.576 0.040 0.108
#> SRR2105316 2 0.5911 0.02908 0.000 0.452 0.004 0.432 0.036 0.076
#> SRR2105313 4 0.6802 0.40070 0.004 0.276 0.004 0.504 0.092 0.120
#> SRR2105314 2 0.6545 0.38355 0.000 0.548 0.008 0.244 0.096 0.104
#> SRR2105311 3 0.4377 0.52227 0.144 0.008 0.756 0.080 0.000 0.012
#> SRR2105312 3 0.3755 0.51376 0.172 0.000 0.780 0.016 0.000 0.032
#> SRR2105307 1 0.7341 0.16924 0.448 0.076 0.008 0.016 0.288 0.164
#> SRR2105308 2 0.6677 -0.25325 0.124 0.412 0.004 0.004 0.400 0.056
#> SRR2105309 4 0.6026 0.52988 0.000 0.148 0.004 0.628 0.128 0.092
#> SRR2105310 5 0.5763 0.21448 0.008 0.376 0.008 0.016 0.524 0.068
#> SRR2105305 4 0.6739 0.29761 0.000 0.080 0.008 0.528 0.220 0.164
#> SRR2105306 2 0.8426 0.05159 0.004 0.336 0.068 0.268 0.136 0.188
#> SRR2105303 4 0.7173 0.26512 0.004 0.316 0.016 0.452 0.092 0.120
#> SRR2105304 4 0.0893 0.56364 0.000 0.004 0.004 0.972 0.004 0.016
#> SRR2105301 3 0.7283 0.34242 0.028 0.084 0.552 0.120 0.028 0.188
#> SRR2105302 2 0.6746 0.42236 0.004 0.584 0.092 0.196 0.036 0.088
#> SRR2105299 3 0.7072 0.08180 0.016 0.028 0.444 0.020 0.164 0.328
#> SRR2105300 2 0.7326 0.45023 0.016 0.576 0.096 0.088 0.104 0.120
#> SRR2105297 1 0.2744 0.67834 0.888 0.016 0.052 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105298 1 0.2504 0.67367 0.904 0.024 0.028 0.000 0.024 0.020
#> SRR2105295 4 0.5087 0.48979 0.000 0.208 0.060 0.680 0.000 0.052
#> SRR2105296 2 0.6746 0.22184 0.016 0.480 0.336 0.056 0.004 0.108
#> SRR2105293 3 0.6354 0.49920 0.088 0.040 0.668 0.056 0.036 0.112
#> SRR2105294 3 0.6881 0.29045 0.280 0.000 0.468 0.000 0.116 0.136
#> SRR2105291 5 0.8067 -0.17169 0.004 0.088 0.132 0.084 0.356 0.336
#> SRR2105292 5 0.7189 -0.24888 0.356 0.000 0.172 0.000 0.356 0.116
#> SRR2105289 2 0.8032 -0.08319 0.000 0.296 0.020 0.284 0.188 0.212
#> SRR2105290 5 0.7082 0.35064 0.120 0.188 0.040 0.000 0.544 0.108
#> SRR2105287 5 0.7723 0.16531 0.304 0.200 0.008 0.012 0.368 0.108
#> SRR2105288 1 0.5783 0.45574 0.608 0.060 0.016 0.000 0.268 0.048
#> SRR2105285 4 0.6569 0.44648 0.004 0.240 0.012 0.560 0.112 0.072
#> SRR2105286 2 0.6141 0.51233 0.004 0.664 0.084 0.072 0.128 0.048
#> SRR2105283 2 0.6564 0.48212 0.040 0.624 0.056 0.012 0.136 0.132
#> SRR2105284 5 0.6693 0.33143 0.056 0.268 0.008 0.032 0.552 0.084
#> SRR2105281 2 0.5101 0.47995 0.012 0.700 0.004 0.024 0.192 0.068
#> SRR2105282 2 0.5024 0.54870 0.012 0.728 0.000 0.136 0.060 0.064
#> SRR2105259 4 0.6648 0.30226 0.000 0.136 0.004 0.512 0.268 0.080
#> SRR2105260 5 0.6986 -0.14321 0.004 0.348 0.000 0.220 0.372 0.056
#> SRR2105279 4 0.5710 -0.14337 0.000 0.452 0.004 0.452 0.044 0.048
#> SRR2105280 2 0.4026 0.55503 0.004 0.808 0.004 0.072 0.036 0.076
#> SRR2105257 1 0.6341 0.59515 0.592 0.004 0.168 0.000 0.124 0.112
#> SRR2105258 1 0.5160 0.62375 0.692 0.000 0.164 0.000 0.052 0.092
#> SRR2105253 2 0.7078 0.40498 0.008 0.552 0.100 0.144 0.024 0.172
#> SRR2105254 2 0.5719 0.25881 0.000 0.520 0.016 0.384 0.024 0.056
#> SRR2105255 5 0.6698 0.09548 0.008 0.068 0.052 0.048 0.556 0.268
#> SRR2105256 5 0.6355 0.33735 0.048 0.340 0.004 0.004 0.500 0.104
#> SRR2105251 2 0.6780 0.23855 0.004 0.516 0.244 0.060 0.008 0.168
#> SRR2105252 2 0.7878 0.17547 0.008 0.428 0.232 0.068 0.056 0.208
#> SRR2105249 2 0.5924 0.47092 0.004 0.648 0.024 0.180 0.036 0.108
#> SRR2105250 2 0.6064 0.08496 0.048 0.480 0.000 0.012 0.400 0.060
#> SRR2105247 2 0.7652 0.21011 0.012 0.432 0.260 0.124 0.012 0.160
#> SRR2105248 3 0.4999 0.49726 0.016 0.064 0.712 0.004 0.020 0.184
#> SRR2105245 3 0.5278 0.48214 0.024 0.072 0.704 0.020 0.008 0.172
#> SRR2105246 3 0.8263 -0.14700 0.004 0.100 0.372 0.260 0.076 0.188
#> SRR2105243 6 0.8466 0.13366 0.000 0.268 0.072 0.144 0.228 0.288
#> SRR2105244 5 0.8430 -0.08410 0.108 0.068 0.288 0.012 0.344 0.180
#> SRR2105241 6 0.8654 0.23968 0.020 0.096 0.288 0.076 0.216 0.304
#> SRR2105242 3 0.7738 0.22331 0.248 0.036 0.420 0.000 0.112 0.184
#> SRR2105239 3 0.8062 0.06648 0.000 0.140 0.420 0.160 0.068 0.212
#> SRR2105240 1 0.4826 0.65597 0.732 0.016 0.124 0.000 0.112 0.016
#> SRR2105237 4 0.5167 0.58706 0.004 0.152 0.008 0.712 0.040 0.084
#> SRR2105238 2 0.7033 0.25561 0.000 0.380 0.000 0.232 0.316 0.072
#> SRR2105235 2 0.6723 0.48827 0.000 0.548 0.008 0.144 0.192 0.108
#> SRR2105236 2 0.5854 0.49069 0.020 0.676 0.008 0.060 0.144 0.092
#> SRR2105233 4 0.4169 0.57917 0.000 0.148 0.028 0.776 0.008 0.040
#> SRR2105234 4 0.2099 0.60282 0.000 0.080 0.004 0.904 0.004 0.008
#> SRR2105231 2 0.6387 0.49490 0.032 0.648 0.140 0.044 0.028 0.108
#> SRR2105232 2 0.7850 0.32500 0.052 0.488 0.160 0.012 0.160 0.128
#> SRR2105227 6 0.9133 0.25842 0.036 0.096 0.204 0.132 0.232 0.300
#> SRR2105228 2 0.8042 -0.15173 0.004 0.320 0.040 0.096 0.312 0.228
#> SRR2105225 5 0.8138 -0.10054 0.004 0.196 0.116 0.044 0.320 0.320
#> SRR2105226 5 0.8900 0.00701 0.100 0.136 0.104 0.044 0.348 0.268
#> SRR2105229 6 0.8815 0.24827 0.000 0.152 0.148 0.188 0.236 0.276
#> SRR2105230 5 0.4025 0.35284 0.060 0.028 0.012 0.004 0.812 0.084
#> SRR2105219 2 0.7443 0.23313 0.008 0.440 0.028 0.256 0.052 0.216
#> SRR2105220 2 0.5534 0.53149 0.000 0.656 0.004 0.048 0.192 0.100
#> SRR2105221 6 0.8203 0.03766 0.036 0.188 0.076 0.032 0.304 0.364
#> SRR2105222 1 0.4978 0.56599 0.696 0.048 0.008 0.000 0.208 0.040
#> SRR2105223 3 0.7138 -0.15150 0.008 0.016 0.376 0.024 0.296 0.280
#> SRR2105224 5 0.8056 -0.10998 0.112 0.052 0.320 0.000 0.328 0.188
#> SRR2105217 3 0.5231 0.44337 0.040 0.024 0.620 0.004 0.008 0.304
#> SRR2105218 3 0.7095 0.23426 0.036 0.280 0.436 0.000 0.028 0.220
#> SRR2105215 2 0.6366 0.46049 0.012 0.572 0.004 0.036 0.168 0.208
#> SRR2105216 2 0.5189 0.29806 0.000 0.580 0.000 0.340 0.020 0.060
#> SRR2105213 3 0.6954 0.19879 0.092 0.008 0.436 0.008 0.092 0.364
#> SRR2105214 3 0.7196 0.38568 0.048 0.128 0.560 0.032 0.040 0.192
#> SRR2105211 6 0.8261 0.19834 0.024 0.228 0.024 0.112 0.264 0.348
#> SRR2105212 2 0.6791 0.37660 0.008 0.536 0.020 0.052 0.256 0.128
#> SRR2105209 6 0.7409 0.11634 0.024 0.072 0.140 0.008 0.360 0.396
#> SRR2105210 1 0.7549 0.28941 0.408 0.032 0.260 0.000 0.228 0.072
#> SRR2105207 3 0.7073 0.40237 0.136 0.028 0.508 0.012 0.048 0.268
#> SRR2105208 1 0.6139 0.58159 0.632 0.032 0.168 0.000 0.048 0.120
#> SRR2105205 3 0.7340 0.36788 0.072 0.032 0.544 0.116 0.032 0.204
#> SRR2105206 3 0.5164 0.49377 0.212 0.064 0.680 0.008 0.000 0.036
#> SRR2105201 2 0.6793 0.15824 0.008 0.416 0.000 0.032 0.236 0.308
#> SRR2105202 5 0.5814 0.20304 0.024 0.384 0.000 0.024 0.516 0.052
#> SRR2105203 6 0.8407 0.15106 0.012 0.252 0.188 0.212 0.028 0.308
#> SRR2105204 2 0.5354 0.51931 0.004 0.700 0.016 0.152 0.032 0.096
#> SRR2105199 2 0.7035 0.17342 0.012 0.424 0.004 0.036 0.264 0.260
#> SRR2105200 5 0.8137 0.23167 0.216 0.308 0.032 0.012 0.328 0.104
#> SRR2105197 6 0.7693 0.14218 0.012 0.084 0.120 0.040 0.348 0.396
#> SRR2105198 3 0.8490 0.14943 0.120 0.084 0.328 0.004 0.192 0.272
#> SRR2105195 3 0.6487 0.38124 0.088 0.008 0.552 0.004 0.084 0.264
#> SRR2105196 1 0.7364 0.23910 0.388 0.016 0.268 0.000 0.260 0.068
#> SRR2105193 1 0.5352 0.57282 0.688 0.032 0.044 0.004 0.032 0.200
#> SRR2105194 1 0.2925 0.66432 0.856 0.000 0.104 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105191 4 0.7545 -0.19706 0.008 0.004 0.112 0.400 0.208 0.268
#> SRR2105192 1 0.5929 0.44351 0.572 0.048 0.012 0.000 0.300 0.068
#> SRR2105189 4 0.7321 0.28291 0.016 0.304 0.028 0.436 0.032 0.184
#> SRR2105190 2 0.5207 0.21147 0.004 0.524 0.000 0.412 0.040 0.020
#> SRR2105187 3 0.6403 0.43280 0.072 0.020 0.528 0.032 0.016 0.332
#> SRR2105188 3 0.7853 0.24939 0.064 0.060 0.408 0.004 0.204 0.260
#> SRR2105179 3 0.7576 0.16238 0.060 0.044 0.392 0.012 0.128 0.364
#> SRR2105180 1 0.4050 0.66676 0.796 0.000 0.088 0.000 0.056 0.060
#> SRR2105183 2 0.7503 0.36746 0.008 0.476 0.020 0.104 0.196 0.196
#> SRR2105184 2 0.8051 0.00406 0.144 0.408 0.080 0.004 0.272 0.092
#> SRR2105185 6 0.7768 -0.02669 0.008 0.156 0.068 0.344 0.048 0.376
#> SRR2105186 3 0.7759 0.22581 0.040 0.200 0.408 0.000 0.096 0.256
#> SRR2105181 6 0.6786 0.20833 0.016 0.012 0.184 0.016 0.308 0.464
#> SRR2105182 5 0.6347 0.32450 0.028 0.132 0.036 0.032 0.648 0.124
#> SRR2105177 3 0.7675 0.25211 0.300 0.044 0.368 0.004 0.048 0.236
#> SRR2105178 1 0.0891 0.66943 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105171 2 0.8113 0.35950 0.008 0.464 0.104 0.128 0.176 0.120
#> SRR2105172 2 0.4880 0.52963 0.004 0.736 0.000 0.068 0.120 0.072
#> SRR2105175 1 0.5683 0.31890 0.572 0.000 0.264 0.004 0.008 0.152
#> SRR2105176 1 0.0790 0.66749 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 3 0.9139 -0.22966 0.032 0.260 0.276 0.176 0.164 0.092
#> SRR2105174 2 0.8359 0.37803 0.048 0.480 0.120 0.148 0.120 0.084
#> SRR2105169 2 0.8490 0.26446 0.032 0.436 0.196 0.120 0.132 0.084
#> SRR2105170 2 0.6962 0.06436 0.384 0.416 0.128 0.004 0.036 0.032
#> SRR2105167 2 0.5127 0.51727 0.000 0.700 0.004 0.160 0.040 0.096
#> SRR2105168 2 0.5094 0.53929 0.004 0.724 0.020 0.024 0.088 0.140
#> SRR2105165 3 0.6771 0.40392 0.240 0.000 0.508 0.004 0.084 0.164
#> SRR2105166 3 0.4822 0.46231 0.224 0.000 0.688 0.000 0.032 0.056
#> SRR2105163 3 0.6183 0.43264 0.076 0.000 0.660 0.104 0.068 0.092
#> SRR2105164 3 0.4321 0.49676 0.088 0.000 0.776 0.000 0.056 0.080
#> SRR2105161 3 0.5630 0.34074 0.312 0.008 0.576 0.012 0.004 0.088
#> SRR2105162 1 0.2058 0.66767 0.908 0.000 0.072 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105155 2 0.6869 0.00755 0.004 0.400 0.004 0.396 0.084 0.112
#> SRR2105156 2 0.3768 0.55407 0.000 0.812 0.000 0.096 0.036 0.056
#> SRR2105157 3 0.5231 0.52559 0.048 0.060 0.736 0.024 0.012 0.120
#> SRR2105158 3 0.4734 0.52429 0.160 0.056 0.740 0.004 0.008 0.032
#> SRR2105159 3 0.5671 0.51839 0.172 0.012 0.664 0.000 0.060 0.092
#> SRR2105160 1 0.7463 0.11714 0.368 0.028 0.352 0.000 0.076 0.176
#> SRR2105153 3 0.7407 0.43484 0.128 0.124 0.576 0.048 0.048 0.076
#> SRR2105154 3 0.4858 0.53237 0.084 0.028 0.724 0.000 0.008 0.156
#> SRR2105151 2 0.4130 0.55333 0.016 0.816 0.028 0.024 0.032 0.084
#> SRR2105152 2 0.4463 0.53963 0.004 0.764 0.004 0.140 0.048 0.040
#> SRR2105149 2 0.8247 0.01091 0.008 0.304 0.052 0.272 0.276 0.088
#> SRR2105150 5 0.5801 0.27388 0.012 0.352 0.004 0.024 0.544 0.064
#> SRR2105147 4 0.1096 0.56098 0.000 0.004 0.004 0.964 0.008 0.020
#> SRR2105148 4 0.0982 0.56233 0.000 0.004 0.004 0.968 0.004 0.020
#> SRR2105143 5 0.8163 0.21333 0.144 0.192 0.128 0.000 0.428 0.108
#> SRR2105144 2 0.6942 -0.02055 0.160 0.468 0.012 0.000 0.292 0.068
#> SRR2105145 3 0.5999 0.09305 0.376 0.000 0.472 0.000 0.024 0.128
#> SRR2105146 3 0.5663 0.32253 0.264 0.000 0.560 0.000 0.008 0.168
#> SRR2105141 3 0.7310 0.24799 0.116 0.036 0.464 0.316 0.016 0.052
#> SRR2105142 3 0.8428 0.05917 0.096 0.116 0.384 0.292 0.028 0.084
#> SRR2105139 2 0.5579 0.50461 0.004 0.676 0.028 0.136 0.016 0.140
#> SRR2105140 2 0.5121 0.55162 0.008 0.724 0.036 0.040 0.028 0.164
#> SRR2105137 2 0.5395 0.25971 0.000 0.540 0.000 0.376 0.044 0.040
#> SRR2105138 1 0.7881 0.24729 0.468 0.204 0.040 0.028 0.188 0.072
#> SRR2105135 2 0.7486 0.37055 0.004 0.480 0.024 0.216 0.132 0.144
#> SRR2105136 2 0.4638 0.52783 0.004 0.752 0.016 0.132 0.012 0.084
#> SRR2105133 5 0.4262 0.34454 0.024 0.060 0.000 0.044 0.800 0.072
#> SRR2105134 5 0.5338 0.33855 0.180 0.064 0.012 0.000 0.688 0.056
#> SRR2105131 5 0.7959 -0.02987 0.004 0.180 0.024 0.264 0.376 0.152
#> SRR2105132 5 0.5731 0.21290 0.292 0.012 0.028 0.000 0.588 0.080
#> SRR2105129 1 0.4076 0.66196 0.796 0.004 0.104 0.000 0.044 0.052
#> SRR2105130 1 0.1917 0.67485 0.928 0.004 0.036 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105127 5 0.5778 0.13499 0.328 0.012 0.008 0.000 0.540 0.112
#> SRR2105128 2 0.7664 -0.26653 0.276 0.344 0.008 0.008 0.272 0.092
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.383 0.730 0.877 0.4990 0.501 0.501
#> 3 3 0.324 0.342 0.663 0.3224 0.824 0.669
#> 4 4 0.356 0.437 0.648 0.1283 0.755 0.451
#> 5 5 0.408 0.367 0.601 0.0680 0.899 0.653
#> 6 6 0.457 0.315 0.550 0.0422 0.933 0.717
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.8555 0.6320 0.720 0.280
#> SRR2105278 1 0.7602 0.7059 0.780 0.220
#> SRR2105275 1 0.5737 0.7781 0.864 0.136
#> SRR2105276 1 0.1184 0.8406 0.984 0.016
#> SRR2105273 1 0.9427 0.4915 0.640 0.360
#> SRR2105274 1 0.2236 0.8398 0.964 0.036
#> SRR2105271 1 0.8909 0.6032 0.692 0.308
#> SRR2105272 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.1184 0.8588 0.016 0.984
#> SRR2105267 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.5059 0.8032 0.112 0.888
#> SRR2105263 1 0.7219 0.7066 0.800 0.200
#> SRR2105264 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105261 2 0.9635 0.3607 0.388 0.612
#> SRR2105262 2 0.9754 0.2733 0.408 0.592
#> SRR2105357 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105358 1 0.9866 0.3135 0.568 0.432
#> SRR2105439 2 0.4939 0.8062 0.108 0.892
#> SRR2105440 2 0.4690 0.8097 0.100 0.900
#> SRR2105509 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105507 2 0.9358 0.4654 0.352 0.648
#> SRR2105508 2 0.7376 0.7165 0.208 0.792
#> SRR2105505 1 0.8861 0.5914 0.696 0.304
#> SRR2105506 1 0.6531 0.7598 0.832 0.168
#> SRR2105503 2 0.9248 0.4874 0.340 0.660
#> SRR2105504 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105502 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.0376 0.8411 0.996 0.004
#> SRR2105500 1 0.4022 0.8259 0.920 0.080
#> SRR2105497 2 0.8955 0.5372 0.312 0.688
#> SRR2105498 1 0.8207 0.6484 0.744 0.256
#> SRR2105495 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.3879 0.8381 0.076 0.924
#> SRR2105493 2 0.0376 0.8594 0.004 0.996
#> SRR2105494 2 0.3584 0.8387 0.068 0.932
#> SRR2105491 1 0.2948 0.8289 0.948 0.052
#> SRR2105492 1 0.0376 0.8408 0.996 0.004
#> SRR2105489 1 0.8661 0.5669 0.712 0.288
#> SRR2105490 1 0.7376 0.7352 0.792 0.208
#> SRR2105487 1 0.0376 0.8412 0.996 0.004
#> SRR2105488 1 0.2778 0.8363 0.952 0.048
#> SRR2105485 2 0.9833 0.1925 0.424 0.576
#> SRR2105486 1 0.5946 0.7866 0.856 0.144
#> SRR2105483 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.2236 0.8403 0.964 0.036
#> SRR2105482 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105479 1 0.3733 0.8204 0.928 0.072
#> SRR2105480 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105477 1 0.5629 0.7814 0.868 0.132
#> SRR2105478 1 0.5946 0.7803 0.856 0.144
#> SRR2105475 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0376 0.8595 0.004 0.996
#> SRR2105473 1 0.8016 0.6748 0.756 0.244
#> SRR2105474 1 0.8608 0.6206 0.716 0.284
#> SRR2105471 1 0.0938 0.8414 0.988 0.012
#> SRR2105472 1 0.0938 0.8414 0.988 0.012
#> SRR2105469 2 0.1414 0.8568 0.020 0.980
#> SRR2105470 1 0.9044 0.5782 0.680 0.320
#> SRR2105467 1 0.1843 0.8399 0.972 0.028
#> SRR2105468 1 0.6887 0.7497 0.816 0.184
#> SRR2105465 1 0.6887 0.7520 0.816 0.184
#> SRR2105466 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0376 0.8414 0.996 0.004
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0672 0.8596 0.008 0.992
#> SRR2105459 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105457 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105458 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105455 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105456 2 0.8443 0.6074 0.272 0.728
#> SRR2105453 1 0.7528 0.7117 0.784 0.216
#> SRR2105454 1 0.6148 0.7740 0.848 0.152
#> SRR2105451 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105452 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105449 1 0.0938 0.8403 0.988 0.012
#> SRR2105450 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0376 0.8595 0.004 0.996
#> SRR2105445 2 0.0938 0.8597 0.012 0.988
#> SRR2105446 2 0.2603 0.8499 0.044 0.956
#> SRR2105443 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105444 2 0.9795 0.2131 0.416 0.584
#> SRR2105441 2 0.9963 0.0796 0.464 0.536
#> SRR2105442 1 0.1633 0.8412 0.976 0.024
#> SRR2105437 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.9686 0.3924 0.604 0.396
#> SRR2105436 1 0.3733 0.8246 0.928 0.072
#> SRR2105433 1 0.0376 0.8414 0.996 0.004
#> SRR2105434 1 0.0376 0.8411 0.996 0.004
#> SRR2105431 1 0.0376 0.8412 0.996 0.004
#> SRR2105432 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105429 1 0.6623 0.7422 0.828 0.172
#> SRR2105430 1 0.9881 0.2961 0.564 0.436
#> SRR2105427 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.4562 0.8185 0.096 0.904
#> SRR2105425 2 0.1414 0.8589 0.020 0.980
#> SRR2105426 2 0.9552 0.4067 0.376 0.624
#> SRR2105421 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105422 2 0.1184 0.8593 0.016 0.984
#> SRR2105423 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0672 0.8594 0.008 0.992
#> SRR2105419 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105420 2 0.1633 0.8579 0.024 0.976
#> SRR2105415 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.5408 0.8046 0.876 0.124
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105409 1 0.9963 0.0991 0.536 0.464
#> SRR2105410 1 0.0938 0.8416 0.988 0.012
#> SRR2105411 2 0.2948 0.8451 0.052 0.948
#> SRR2105412 2 0.8499 0.5879 0.276 0.724
#> SRR2105407 2 0.2603 0.8486 0.044 0.956
#> SRR2105408 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105403 2 0.4690 0.8080 0.100 0.900
#> SRR2105404 2 0.9710 0.2639 0.400 0.600
#> SRR2105405 2 0.1843 0.8568 0.028 0.972
#> SRR2105406 1 0.8861 0.5888 0.696 0.304
#> SRR2105401 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105402 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105399 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105400 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105397 2 0.0672 0.8599 0.008 0.992
#> SRR2105398 2 0.3584 0.8351 0.068 0.932
#> SRR2105395 2 0.9795 0.3113 0.416 0.584
#> SRR2105396 1 0.9460 0.4910 0.636 0.364
#> SRR2105393 2 0.2423 0.8525 0.040 0.960
#> SRR2105394 2 0.1633 0.8570 0.024 0.976
#> SRR2105389 2 0.7376 0.7296 0.208 0.792
#> SRR2105390 1 0.9358 0.4409 0.648 0.352
#> SRR2105391 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105392 2 0.4562 0.8264 0.096 0.904
#> SRR2105385 1 0.3431 0.8251 0.936 0.064
#> SRR2105386 2 1.0000 0.0541 0.496 0.504
#> SRR2105387 2 0.5629 0.7963 0.132 0.868
#> SRR2105388 1 0.9775 0.3597 0.588 0.412
#> SRR2105381 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105382 2 0.5842 0.7730 0.140 0.860
#> SRR2105383 2 0.7299 0.7099 0.204 0.796
#> SRR2105384 1 0.9000 0.5776 0.684 0.316
#> SRR2105379 2 0.5737 0.7775 0.136 0.864
#> SRR2105380 1 0.9993 0.0285 0.516 0.484
#> SRR2105377 2 0.9323 0.4144 0.348 0.652
#> SRR2105378 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105375 1 0.9170 0.5674 0.668 0.332
#> SRR2105376 1 0.8955 0.5741 0.688 0.312
#> SRR2105373 1 0.4161 0.8258 0.916 0.084
#> SRR2105374 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105371 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105372 2 0.1184 0.8581 0.016 0.984
#> SRR2105369 2 0.1633 0.8563 0.024 0.976
#> SRR2105370 1 0.9977 0.1846 0.528 0.472
#> SRR2105367 1 0.6148 0.7764 0.848 0.152
#> SRR2105368 1 0.0376 0.8414 0.996 0.004
#> SRR2105365 1 0.8813 0.5408 0.700 0.300
#> SRR2105366 1 0.8661 0.5649 0.712 0.288
#> SRR2105363 2 0.0938 0.8591 0.012 0.988
#> SRR2105364 2 0.6438 0.7599 0.164 0.836
#> SRR2105361 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.3879 0.8314 0.076 0.924
#> SRR2105359 2 0.9944 0.0916 0.456 0.544
#> SRR2105360 2 0.3431 0.8385 0.064 0.936
#> SRR2105355 2 0.5408 0.7882 0.124 0.876
#> SRR2105356 1 0.9896 0.2865 0.560 0.440
#> SRR2105353 2 0.8861 0.5592 0.304 0.696
#> SRR2105354 1 0.3584 0.8303 0.932 0.068
#> SRR2105351 2 0.8327 0.6264 0.264 0.736
#> SRR2105352 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105349 2 0.5294 0.7940 0.120 0.880
#> SRR2105350 2 0.3114 0.8459 0.056 0.944
#> SRR2105345 2 0.0938 0.8589 0.012 0.988
#> SRR2105346 2 0.9963 0.0624 0.464 0.536
#> SRR2105347 1 0.1843 0.8393 0.972 0.028
#> SRR2105348 1 0.5408 0.7990 0.876 0.124
#> SRR2105343 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105341 2 0.7883 0.6894 0.236 0.764
#> SRR2105342 2 0.7528 0.6780 0.216 0.784
#> SRR2105339 2 0.8955 0.5442 0.312 0.688
#> SRR2105340 1 0.6887 0.7399 0.816 0.184
#> SRR2105335 1 0.5737 0.7943 0.864 0.136
#> SRR2105336 1 0.0376 0.8414 0.996 0.004
#> SRR2105337 1 0.8713 0.5734 0.708 0.292
#> SRR2105338 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105331 2 0.9522 0.4169 0.372 0.628
#> SRR2105332 1 0.9686 0.3084 0.604 0.396
#> SRR2105333 2 0.0376 0.8594 0.004 0.996
#> SRR2105334 2 0.0376 0.8595 0.004 0.996
#> SRR2105329 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105330 2 0.2948 0.8466 0.052 0.948
#> SRR2105327 2 0.0938 0.8583 0.012 0.988
#> SRR2105328 2 0.4562 0.8132 0.096 0.904
#> SRR2105325 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105323 2 0.1843 0.8557 0.028 0.972
#> SRR2105324 2 0.8909 0.5104 0.308 0.692
#> SRR2105319 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.7674 0.6829 0.776 0.224
#> SRR2105322 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105316 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105311 2 0.9954 0.1746 0.460 0.540
#> SRR2105312 1 0.7139 0.7085 0.804 0.196
#> SRR2105307 1 0.4431 0.8175 0.908 0.092
#> SRR2105308 1 0.8955 0.5731 0.688 0.312
#> SRR2105309 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105310 2 0.9427 0.3883 0.360 0.640
#> SRR2105305 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105306 2 0.0672 0.8593 0.008 0.992
#> SRR2105303 2 0.0938 0.8585 0.012 0.988
#> SRR2105304 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.9209 0.5153 0.336 0.664
#> SRR2105302 2 0.0938 0.8592 0.012 0.988
#> SRR2105299 2 0.9963 0.1739 0.464 0.536
#> SRR2105300 2 0.7219 0.7128 0.200 0.800
#> SRR2105297 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105298 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105295 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.7602 0.6891 0.220 0.780
#> SRR2105293 2 0.9881 0.2551 0.436 0.564
#> SRR2105294 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105291 2 0.7815 0.6734 0.232 0.768
#> SRR2105292 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105289 2 0.1184 0.8589 0.016 0.984
#> SRR2105290 1 0.2043 0.8385 0.968 0.032
#> SRR2105287 1 0.5178 0.8066 0.884 0.116
#> SRR2105288 1 0.0376 0.8414 0.996 0.004
#> SRR2105285 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.3733 0.8391 0.072 0.928
#> SRR2105283 1 0.9661 0.3296 0.608 0.392
#> SRR2105284 1 0.9087 0.5579 0.676 0.324
#> SRR2105281 2 0.4939 0.8114 0.108 0.892
#> SRR2105282 2 0.1843 0.8561 0.028 0.972
#> SRR2105259 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105260 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.2603 0.8490 0.044 0.956
#> SRR2105257 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.3879 0.8298 0.076 0.924
#> SRR2105254 2 0.0376 0.8593 0.004 0.996
#> SRR2105255 1 0.9996 0.1318 0.512 0.488
#> SRR2105256 1 0.9209 0.5332 0.664 0.336
#> SRR2105251 2 0.6801 0.7492 0.180 0.820
#> SRR2105252 2 0.8016 0.6543 0.244 0.756
#> SRR2105249 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105250 1 0.9580 0.4389 0.620 0.380
#> SRR2105247 2 0.7745 0.6817 0.228 0.772
#> SRR2105248 1 0.8443 0.6005 0.728 0.272
#> SRR2105245 1 0.2778 0.8351 0.952 0.048
#> SRR2105246 2 0.7950 0.6431 0.240 0.760
#> SRR2105243 2 0.7674 0.6681 0.224 0.776
#> SRR2105244 1 0.4022 0.8204 0.920 0.080
#> SRR2105241 1 0.8207 0.6595 0.744 0.256
#> SRR2105242 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105239 2 0.8144 0.6387 0.252 0.748
#> SRR2105240 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.1414 0.8565 0.020 0.980
#> SRR2105238 2 0.1414 0.8570 0.020 0.980
#> SRR2105235 2 0.1633 0.8554 0.024 0.976
#> SRR2105236 2 0.9909 0.1329 0.444 0.556
#> SRR2105233 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.8207 0.6422 0.256 0.744
#> SRR2105232 2 0.9988 0.1030 0.480 0.520
#> SRR2105227 2 0.9686 0.3693 0.396 0.604
#> SRR2105228 2 0.9323 0.4228 0.348 0.652
#> SRR2105225 1 0.9933 0.2635 0.548 0.452
#> SRR2105226 1 0.5946 0.7828 0.856 0.144
#> SRR2105229 2 0.3114 0.8448 0.056 0.944
#> SRR2105230 1 0.6148 0.7770 0.848 0.152
#> SRR2105219 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.2778 0.8489 0.048 0.952
#> SRR2105221 1 0.9209 0.5400 0.664 0.336
#> SRR2105222 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105223 1 0.5408 0.7964 0.876 0.124
#> SRR2105224 1 0.0938 0.8408 0.988 0.012
#> SRR2105217 1 0.5842 0.7681 0.860 0.140
#> SRR2105218 1 0.2778 0.8373 0.952 0.048
#> SRR2105215 2 0.2778 0.8489 0.048 0.952
#> SRR2105216 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.5946 0.7718 0.856 0.144
#> SRR2105214 1 0.9963 0.1229 0.536 0.464
#> SRR2105211 2 0.4161 0.8239 0.084 0.916
#> SRR2105212 2 0.5408 0.8060 0.124 0.876
#> SRR2105209 1 0.4939 0.8100 0.892 0.108
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.6712 0.7546 0.824 0.176
#> SRR2105208 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105205 2 0.9460 0.4360 0.364 0.636
#> SRR2105206 1 0.7056 0.7163 0.808 0.192
#> SRR2105201 2 0.6712 0.7404 0.176 0.824
#> SRR2105202 1 0.9954 0.2292 0.540 0.460
#> SRR2105203 2 0.0938 0.8591 0.012 0.988
#> SRR2105204 2 0.1414 0.8576 0.020 0.980
#> SRR2105199 2 0.8443 0.5927 0.272 0.728
#> SRR2105200 1 0.6438 0.7657 0.836 0.164
#> SRR2105197 1 0.9580 0.4429 0.620 0.380
#> SRR2105198 1 0.3584 0.8295 0.932 0.068
#> SRR2105195 1 0.2778 0.8340 0.952 0.048
#> SRR2105196 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105193 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105191 2 0.5178 0.8018 0.116 0.884
#> SRR2105192 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.1633 0.8552 0.024 0.976
#> SRR2105190 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105187 1 0.9170 0.5188 0.668 0.332
#> SRR2105188 1 0.0672 0.8413 0.992 0.008
#> SRR2105179 1 0.1414 0.8413 0.980 0.020
#> SRR2105180 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.5629 0.7876 0.132 0.868
#> SRR2105184 1 0.1184 0.8413 0.984 0.016
#> SRR2105185 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105186 1 0.3584 0.8306 0.932 0.068
#> SRR2105181 1 0.5408 0.8055 0.876 0.124
#> SRR2105182 1 0.6973 0.7446 0.812 0.188
#> SRR2105177 1 0.3274 0.8286 0.940 0.060
#> SRR2105178 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0376 0.8594 0.004 0.996
#> SRR2105172 2 0.4022 0.8292 0.080 0.920
#> SRR2105175 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.8909 0.5608 0.308 0.692
#> SRR2105174 2 0.9491 0.4301 0.368 0.632
#> SRR2105169 2 0.9087 0.5257 0.324 0.676
#> SRR2105170 1 0.0672 0.8412 0.992 0.008
#> SRR2105167 2 0.1414 0.8573 0.020 0.980
#> SRR2105168 2 0.7219 0.7100 0.200 0.800
#> SRR2105165 1 0.0376 0.8413 0.996 0.004
#> SRR2105166 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105163 2 0.9635 0.3817 0.388 0.612
#> SRR2105164 1 0.1843 0.8378 0.972 0.028
#> SRR2105161 1 0.2043 0.8372 0.968 0.032
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.2236 0.8521 0.036 0.964
#> SRR2105157 1 0.9815 0.2420 0.580 0.420
#> SRR2105158 1 0.7950 0.6481 0.760 0.240
#> SRR2105159 1 0.0938 0.8413 0.988 0.012
#> SRR2105160 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105153 1 0.9988 0.0316 0.520 0.480
#> SRR2105154 1 0.4298 0.8088 0.912 0.088
#> SRR2105151 2 0.7950 0.6920 0.240 0.760
#> SRR2105152 2 0.0938 0.8593 0.012 0.988
#> SRR2105149 2 0.3584 0.8338 0.068 0.932
#> SRR2105150 2 0.9661 0.2930 0.392 0.608
#> SRR2105147 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105148 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105143 1 0.4815 0.8201 0.896 0.104
#> SRR2105144 1 0.9000 0.5666 0.684 0.316
#> SRR2105145 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.9686 0.3602 0.396 0.604
#> SRR2105142 2 0.9775 0.3180 0.412 0.588
#> SRR2105139 2 0.0938 0.8585 0.012 0.988
#> SRR2105140 2 0.6148 0.7708 0.152 0.848
#> SRR2105137 2 0.0000 0.8596 0.000 1.000
#> SRR2105138 1 0.3879 0.8242 0.924 0.076
#> SRR2105135 2 0.0376 0.8593 0.004 0.996
#> SRR2105136 2 0.0376 0.8598 0.004 0.996
#> SRR2105133 2 0.9922 0.1110 0.448 0.552
#> SRR2105134 1 0.7056 0.7426 0.808 0.192
#> SRR2105131 2 0.3431 0.8396 0.064 0.936
#> SRR2105132 1 0.0376 0.8415 0.996 0.004
#> SRR2105129 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.8408 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.4562 0.8143 0.904 0.096
#> SRR2105128 1 0.8443 0.6388 0.728 0.272
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.9147 0.05534 0.496 0.156 0.348
#> SRR2105278 1 0.6520 0.08659 0.508 0.004 0.488
#> SRR2105275 3 0.6683 -0.06975 0.496 0.008 0.496
#> SRR2105276 1 0.6521 0.05609 0.500 0.004 0.496
#> SRR2105273 3 0.9734 0.17950 0.260 0.292 0.448
#> SRR2105274 1 0.5986 0.30475 0.736 0.024 0.240
#> SRR2105271 1 0.9358 0.02648 0.516 0.240 0.244
#> SRR2105272 1 0.2165 0.37121 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105269 2 0.2625 0.74823 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105270 2 0.6617 0.56064 0.012 0.600 0.388
#> SRR2105267 2 0.0747 0.74073 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105268 2 0.6600 0.56937 0.012 0.604 0.384
#> SRR2105265 2 0.3043 0.74590 0.008 0.908 0.084
#> SRR2105266 2 0.8504 0.51121 0.172 0.612 0.216
#> SRR2105263 1 0.8236 0.03714 0.508 0.076 0.416
#> SRR2105264 1 0.5397 0.24118 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105261 3 0.9715 0.20810 0.220 0.380 0.400
#> SRR2105262 2 0.9899 -0.04098 0.320 0.400 0.280
#> SRR2105357 2 0.4413 0.74721 0.024 0.852 0.124
#> SRR2105358 1 0.7838 0.07173 0.488 0.052 0.460
#> SRR2105439 2 0.9086 0.34177 0.144 0.484 0.372
#> SRR2105440 2 0.9141 0.32827 0.212 0.544 0.244
#> SRR2105509 2 0.0892 0.74164 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105510 2 0.0892 0.74168 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105507 2 0.9560 0.04500 0.324 0.464 0.212
#> SRR2105508 2 0.8058 0.21348 0.072 0.552 0.376
#> SRR2105505 1 0.9338 0.03170 0.504 0.196 0.300
#> SRR2105506 1 0.6813 0.10192 0.520 0.012 0.468
#> SRR2105503 2 0.9394 0.14124 0.268 0.508 0.224
#> SRR2105504 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105501 2 0.4654 0.71767 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105502 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105499 1 0.5431 0.26767 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105500 1 0.6888 0.13314 0.552 0.016 0.432
#> SRR2105497 2 0.9892 -0.18511 0.340 0.392 0.268
#> SRR2105498 1 0.8171 0.13195 0.644 0.172 0.184
#> SRR2105495 2 0.2959 0.74854 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105496 2 0.7446 0.62581 0.076 0.664 0.260
#> SRR2105493 2 0.2496 0.75142 0.004 0.928 0.068
#> SRR2105494 2 0.6769 0.56095 0.016 0.592 0.392
#> SRR2105491 1 0.6823 0.05520 0.504 0.012 0.484
#> SRR2105492 1 0.6299 0.07606 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105489 1 0.8898 0.00839 0.500 0.128 0.372
#> SRR2105490 3 0.7997 -0.05096 0.468 0.060 0.472
#> SRR2105487 1 0.3686 0.35668 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105488 1 0.6019 0.25932 0.700 0.012 0.288
#> SRR2105485 3 0.8570 -0.00403 0.428 0.096 0.476
#> SRR2105486 1 0.8158 0.12460 0.556 0.080 0.364
#> SRR2105483 1 0.1289 0.38065 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105484 1 0.1289 0.37966 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105481 3 0.7584 -0.03622 0.472 0.040 0.488
#> SRR2105482 1 0.4978 0.34266 0.780 0.004 0.216
#> SRR2105479 1 0.6520 0.06123 0.508 0.004 0.488
#> SRR2105480 1 0.6295 0.07856 0.528 0.000 0.472
#> SRR2105477 1 0.7883 0.05052 0.516 0.056 0.428
#> SRR2105478 1 0.7377 0.06164 0.516 0.032 0.452
#> SRR2105475 2 0.1860 0.74504 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105476 2 0.2878 0.74422 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105473 1 0.7484 0.08645 0.504 0.036 0.460
#> SRR2105474 1 0.9013 0.05433 0.524 0.152 0.324
#> SRR2105471 1 0.5982 0.28633 0.668 0.004 0.328
#> SRR2105472 1 0.5884 0.29904 0.716 0.012 0.272
#> SRR2105469 2 0.3112 0.72700 0.004 0.900 0.096
#> SRR2105470 1 0.8814 0.08087 0.548 0.140 0.312
#> SRR2105467 1 0.7499 0.19892 0.592 0.048 0.360
#> SRR2105468 1 0.7715 0.10105 0.524 0.048 0.428
#> SRR2105465 1 0.8093 0.09935 0.516 0.068 0.416
#> SRR2105466 1 0.2200 0.37922 0.940 0.004 0.056
#> SRR2105463 1 0.2066 0.37770 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105464 1 0.0424 0.38089 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105461 2 0.0592 0.74120 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105462 2 0.5792 0.70320 0.036 0.772 0.192
#> SRR2105459 2 0.2711 0.74493 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105460 2 0.0000 0.73744 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105457 2 0.2945 0.75236 0.004 0.908 0.088
#> SRR2105458 2 0.1031 0.74279 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105455 2 0.1878 0.74947 0.004 0.952 0.044
#> SRR2105456 2 0.9050 0.23341 0.296 0.536 0.168
#> SRR2105453 1 0.6309 0.08031 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105454 1 0.6676 0.09805 0.516 0.008 0.476
#> SRR2105451 2 0.2356 0.74882 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105452 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105449 1 0.4409 0.33661 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105450 1 0.5363 0.27561 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105447 2 0.3879 0.73639 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105448 2 0.3784 0.74407 0.004 0.864 0.132
#> SRR2105445 2 0.5692 0.66494 0.008 0.724 0.268
#> SRR2105446 2 0.7775 0.57859 0.076 0.620 0.304
#> SRR2105443 2 0.4062 0.74182 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105444 3 0.8436 0.06168 0.324 0.108 0.568
#> SRR2105441 3 0.8450 -0.01149 0.428 0.088 0.484
#> SRR2105442 1 0.6045 0.18621 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105437 1 0.2066 0.37199 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105438 1 0.3482 0.34022 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105435 1 0.9873 -0.13816 0.404 0.328 0.268
#> SRR2105436 1 0.7128 0.23469 0.664 0.052 0.284
#> SRR2105433 1 0.3038 0.36237 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105434 1 0.3573 0.37337 0.876 0.004 0.120
#> SRR2105431 1 0.1163 0.38049 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105432 1 0.1289 0.37882 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105429 1 0.8869 0.04243 0.496 0.124 0.380
#> SRR2105430 3 0.9135 0.19515 0.208 0.248 0.544
#> SRR2105427 2 0.2448 0.74796 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105428 2 0.6633 0.68569 0.060 0.728 0.212
#> SRR2105425 2 0.6803 0.64827 0.040 0.680 0.280
#> SRR2105426 2 0.9494 0.10698 0.184 0.412 0.404
#> SRR2105421 2 0.1525 0.74305 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105422 2 0.4413 0.67230 0.008 0.832 0.160
#> SRR2105423 2 0.1529 0.74274 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105424 2 0.2063 0.74886 0.008 0.948 0.044
#> SRR2105419 2 0.2165 0.74082 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105420 2 0.3337 0.74227 0.032 0.908 0.060
#> SRR2105415 1 0.2959 0.37940 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105416 1 0.4178 0.33613 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105417 1 0.8173 0.14754 0.508 0.072 0.420
#> SRR2105418 1 0.4121 0.33590 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105413 2 0.3116 0.74783 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105414 2 0.2356 0.75002 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105409 1 0.9846 -0.09410 0.420 0.276 0.304
#> SRR2105410 1 0.4172 0.33559 0.840 0.004 0.156
#> SRR2105411 2 0.5722 0.68732 0.084 0.804 0.112
#> SRR2105412 3 0.9956 0.05046 0.288 0.352 0.360
#> SRR2105407 2 0.4930 0.74472 0.044 0.836 0.120
#> SRR2105408 2 0.2625 0.75275 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105403 2 0.6561 0.65033 0.100 0.756 0.144
#> SRR2105404 2 0.8587 0.04338 0.400 0.500 0.100
#> SRR2105405 2 0.6407 0.66416 0.028 0.700 0.272
#> SRR2105406 1 0.6825 0.08055 0.496 0.012 0.492
#> SRR2105401 2 0.1289 0.74501 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105402 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105399 2 0.2878 0.74587 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105400 2 0.0424 0.73948 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105397 2 0.6314 0.34183 0.004 0.604 0.392
#> SRR2105398 3 0.6505 -0.30035 0.004 0.468 0.528
#> SRR2105395 3 0.9684 0.12015 0.352 0.220 0.428
#> SRR2105396 1 0.9439 -0.01886 0.444 0.180 0.376
#> SRR2105393 2 0.7121 0.49390 0.024 0.548 0.428
#> SRR2105394 2 0.3272 0.74188 0.016 0.904 0.080
#> SRR2105389 2 0.7890 0.23968 0.056 0.512 0.432
#> SRR2105390 3 0.9167 0.08078 0.392 0.148 0.460
#> SRR2105391 2 0.3267 0.71212 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105392 2 0.6543 0.39630 0.016 0.640 0.344
#> SRR2105385 1 0.6518 0.07002 0.512 0.004 0.484
#> SRR2105386 1 0.9649 -0.14603 0.404 0.388 0.208
#> SRR2105387 2 0.7677 0.63092 0.092 0.656 0.252
#> SRR2105388 1 0.9042 0.02855 0.500 0.144 0.356
#> SRR2105381 2 0.4047 0.74171 0.004 0.848 0.148
#> SRR2105382 2 0.7163 0.54327 0.144 0.720 0.136
#> SRR2105383 3 0.9546 0.12242 0.312 0.216 0.472
#> SRR2105384 3 0.6952 -0.07993 0.480 0.016 0.504
#> SRR2105379 2 0.4413 0.69112 0.104 0.860 0.036
#> SRR2105380 3 0.7919 -0.02623 0.464 0.056 0.480
#> SRR2105377 2 0.9955 -0.10571 0.304 0.380 0.316
#> SRR2105378 1 0.4682 0.34085 0.804 0.004 0.192
#> SRR2105375 3 0.8571 0.05338 0.340 0.112 0.548
#> SRR2105376 1 0.6309 0.08389 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105373 1 0.8784 0.10544 0.512 0.120 0.368
#> SRR2105374 1 0.5363 0.24465 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105371 2 0.4062 0.72659 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105372 2 0.4974 0.58571 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105369 2 0.3752 0.72717 0.020 0.884 0.096
#> SRR2105370 3 0.8460 -0.02091 0.440 0.088 0.472
#> SRR2105367 1 0.7557 0.19854 0.656 0.080 0.264
#> SRR2105368 1 0.4399 0.33002 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105365 1 0.8784 0.01083 0.496 0.116 0.388
#> SRR2105366 1 0.7828 0.03783 0.500 0.052 0.448
#> SRR2105363 2 0.6546 0.64641 0.044 0.716 0.240
#> SRR2105364 2 0.9336 0.19571 0.164 0.424 0.412
#> SRR2105361 2 0.0592 0.73894 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105362 2 0.6758 0.61245 0.072 0.728 0.200
#> SRR2105359 3 0.7987 0.07674 0.292 0.092 0.616
#> SRR2105360 2 0.6357 0.42280 0.012 0.652 0.336
#> SRR2105355 2 0.7226 0.56262 0.076 0.688 0.236
#> SRR2105356 3 0.8350 0.01229 0.380 0.088 0.532
#> SRR2105353 3 0.9751 0.18151 0.252 0.308 0.440
#> SRR2105354 3 0.8069 -0.00981 0.460 0.064 0.476
#> SRR2105351 3 0.9936 0.17915 0.280 0.348 0.372
#> SRR2105352 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105349 2 0.3967 0.72958 0.072 0.884 0.044
#> SRR2105350 2 0.7841 0.37418 0.052 0.480 0.468
#> SRR2105345 2 0.5506 0.70418 0.016 0.764 0.220
#> SRR2105346 3 0.8403 -0.02300 0.448 0.084 0.468
#> SRR2105347 1 0.6008 0.21865 0.664 0.004 0.332
#> SRR2105348 1 0.6813 0.09791 0.520 0.012 0.468
#> SRR2105343 2 0.1411 0.73721 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105344 2 0.5365 0.69288 0.004 0.744 0.252
#> SRR2105341 2 0.8526 0.42361 0.120 0.572 0.308
#> SRR2105342 2 0.8437 0.45246 0.180 0.620 0.200
#> SRR2105339 2 0.9268 0.26304 0.172 0.492 0.336
#> SRR2105340 3 0.7979 -0.00124 0.440 0.060 0.500
#> SRR2105335 3 0.9106 0.12968 0.284 0.180 0.536
#> SRR2105336 1 0.4842 0.32864 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105337 3 0.8743 0.02611 0.440 0.108 0.452
#> SRR2105338 1 0.5158 0.27800 0.764 0.004 0.232
#> SRR2105331 1 0.9820 -0.10446 0.428 0.296 0.276
#> SRR2105332 1 0.9339 -0.02133 0.496 0.188 0.316
#> SRR2105333 2 0.1129 0.74356 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105334 2 0.3573 0.74572 0.004 0.876 0.120
#> SRR2105329 2 0.1964 0.75042 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105330 2 0.6449 0.69535 0.056 0.740 0.204
#> SRR2105327 2 0.3045 0.74341 0.020 0.916 0.064
#> SRR2105328 2 0.6939 0.59767 0.072 0.712 0.216
#> SRR2105325 1 0.6305 0.06832 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105326 1 0.6299 0.07638 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105323 2 0.7622 0.54979 0.080 0.648 0.272
#> SRR2105324 3 0.9234 0.06894 0.364 0.160 0.476
#> SRR2105319 1 0.6045 0.15501 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105320 1 0.4452 0.30902 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105321 3 0.7187 -0.05069 0.480 0.024 0.496
#> SRR2105322 1 0.6305 0.06898 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105317 2 0.2356 0.74527 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105318 2 0.3551 0.74197 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105315 2 0.0892 0.74258 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105316 2 0.1643 0.74708 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105313 2 0.3551 0.74927 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105314 2 0.4291 0.73047 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105311 1 0.7993 0.01928 0.484 0.060 0.456
#> SRR2105312 1 0.7295 0.03966 0.492 0.028 0.480
#> SRR2105307 1 0.7391 0.20745 0.636 0.056 0.308
#> SRR2105308 3 0.6309 -0.10312 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105309 2 0.1289 0.74365 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105310 3 0.9417 0.05164 0.384 0.176 0.440
#> SRR2105305 2 0.1753 0.73969 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105306 2 0.4645 0.68487 0.008 0.816 0.176
#> SRR2105303 2 0.3983 0.73350 0.004 0.852 0.144
#> SRR2105304 2 0.0237 0.73721 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105301 3 0.9535 0.17134 0.264 0.248 0.488
#> SRR2105302 2 0.4575 0.73370 0.004 0.812 0.184
#> SRR2105299 3 0.8852 0.06153 0.396 0.120 0.484
#> SRR2105300 2 0.7909 0.58734 0.148 0.664 0.188
#> SRR2105297 1 0.2878 0.36515 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105298 1 0.4931 0.30412 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105295 2 0.0592 0.73907 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105296 2 0.9247 0.22551 0.276 0.524 0.200
#> SRR2105293 3 0.8519 0.04847 0.396 0.096 0.508
#> SRR2105294 1 0.5882 0.18963 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105291 3 0.7962 -0.14473 0.060 0.428 0.512
#> SRR2105292 1 0.2537 0.37843 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105289 2 0.6341 0.68174 0.032 0.716 0.252
#> SRR2105290 1 0.6432 0.15296 0.568 0.004 0.428
#> SRR2105287 1 0.6495 0.11236 0.536 0.004 0.460
#> SRR2105288 1 0.5178 0.28860 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105285 2 0.4887 0.70662 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105286 2 0.7130 0.50964 0.024 0.544 0.432
#> SRR2105283 3 0.9613 0.05302 0.228 0.308 0.464
#> SRR2105284 1 0.9004 0.04916 0.488 0.136 0.376
#> SRR2105281 3 0.9228 -0.16636 0.156 0.380 0.464
#> SRR2105282 2 0.7419 0.59022 0.088 0.680 0.232
#> SRR2105259 2 0.4178 0.72975 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105260 2 0.3686 0.74144 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105279 2 0.1529 0.74911 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105280 2 0.7902 0.58637 0.092 0.628 0.280
#> SRR2105257 1 0.2796 0.37367 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105258 1 0.2625 0.36258 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105253 2 0.4095 0.73600 0.056 0.880 0.064
#> SRR2105254 2 0.0747 0.73995 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105255 2 0.9907 -0.13084 0.324 0.396 0.280
#> SRR2105256 1 0.6521 0.08108 0.504 0.004 0.492
#> SRR2105251 2 0.8342 0.28309 0.080 0.464 0.456
#> SRR2105252 3 0.7993 -0.20337 0.060 0.456 0.484
#> SRR2105249 2 0.4235 0.72922 0.000 0.824 0.176
#> SRR2105250 3 0.6683 -0.09324 0.492 0.008 0.500
#> SRR2105247 2 0.8966 0.34447 0.184 0.560 0.256
#> SRR2105248 1 0.7394 0.04447 0.496 0.032 0.472
#> SRR2105245 3 0.8185 0.00850 0.428 0.072 0.500
#> SRR2105246 2 0.7758 0.05565 0.048 0.484 0.468
#> SRR2105243 2 0.9008 0.39176 0.164 0.540 0.296
#> SRR2105244 1 0.7346 0.13690 0.592 0.040 0.368
#> SRR2105241 1 0.9614 -0.07758 0.436 0.208 0.356
#> SRR2105242 1 0.5588 0.26470 0.720 0.004 0.276
#> SRR2105239 3 0.8395 0.16272 0.096 0.356 0.548
#> SRR2105240 1 0.1753 0.37747 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105237 2 0.0475 0.73818 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105238 2 0.5635 0.71680 0.036 0.784 0.180
#> SRR2105235 2 0.5318 0.68947 0.016 0.780 0.204
#> SRR2105236 1 0.9043 -0.00257 0.468 0.136 0.396
#> SRR2105233 2 0.2448 0.74659 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105234 2 0.0000 0.73744 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.8210 0.47794 0.240 0.628 0.132
#> SRR2105232 2 0.9974 -0.10168 0.308 0.368 0.324
#> SRR2105227 2 0.9724 0.10067 0.268 0.452 0.280
#> SRR2105228 3 0.9871 0.14908 0.308 0.280 0.412
#> SRR2105225 3 0.9187 0.18728 0.196 0.272 0.532
#> SRR2105226 1 0.8525 0.17103 0.600 0.148 0.252
#> SRR2105229 2 0.5690 0.61271 0.004 0.708 0.288
#> SRR2105230 1 0.8457 0.11524 0.544 0.100 0.356
#> SRR2105219 2 0.2448 0.75203 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105220 2 0.7529 0.57440 0.060 0.624 0.316
#> SRR2105221 1 0.8983 0.03497 0.444 0.128 0.428
#> SRR2105222 1 0.4346 0.32943 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105223 3 0.8466 0.03814 0.400 0.092 0.508
#> SRR2105224 1 0.5404 0.30019 0.740 0.004 0.256
#> SRR2105217 1 0.6682 0.05960 0.504 0.008 0.488
#> SRR2105218 3 0.6994 -0.05605 0.424 0.020 0.556
#> SRR2105215 2 0.8425 0.46323 0.100 0.552 0.348
#> SRR2105216 2 0.2356 0.74957 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105213 1 0.6948 0.05881 0.512 0.016 0.472
#> SRR2105214 3 0.7685 0.05309 0.344 0.060 0.596
#> SRR2105211 2 0.5036 0.72455 0.048 0.832 0.120
#> SRR2105212 2 0.7841 0.60642 0.092 0.636 0.272
#> SRR2105209 3 0.7032 -0.05668 0.368 0.028 0.604
#> SRR2105210 1 0.5465 0.31918 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105207 3 0.7993 -0.02432 0.456 0.060 0.484
#> SRR2105208 1 0.1753 0.37892 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105205 1 0.9931 -0.12435 0.392 0.308 0.300
#> SRR2105206 1 0.8033 0.04400 0.512 0.064 0.424
#> SRR2105201 3 0.9776 0.09095 0.252 0.316 0.432
#> SRR2105202 3 0.7188 -0.08142 0.484 0.024 0.492
#> SRR2105203 2 0.4409 0.69793 0.004 0.824 0.172
#> SRR2105204 2 0.5659 0.69187 0.012 0.740 0.248
#> SRR2105199 3 0.9579 -0.03231 0.200 0.368 0.432
#> SRR2105200 1 0.7112 0.12124 0.552 0.024 0.424
#> SRR2105197 3 0.9537 0.14138 0.256 0.256 0.488
#> SRR2105198 1 0.6769 0.26832 0.652 0.028 0.320
#> SRR2105195 1 0.6641 0.08897 0.544 0.008 0.448
#> SRR2105196 1 0.3412 0.35271 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105193 1 0.2356 0.37582 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105194 1 0.0892 0.38149 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105191 2 0.6143 0.53784 0.024 0.720 0.256
#> SRR2105192 1 0.6267 0.12782 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105189 2 0.4121 0.74466 0.024 0.868 0.108
#> SRR2105190 2 0.2400 0.75145 0.004 0.932 0.064
#> SRR2105187 3 0.8675 0.03483 0.420 0.104 0.476
#> SRR2105188 3 0.6308 -0.13446 0.492 0.000 0.508
#> SRR2105179 1 0.6627 0.17626 0.644 0.020 0.336
#> SRR2105180 1 0.1031 0.37861 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105183 2 0.8641 0.42509 0.160 0.592 0.248
#> SRR2105184 1 0.5864 0.27527 0.704 0.008 0.288
#> SRR2105185 2 0.4605 0.62306 0.000 0.796 0.204
#> SRR2105186 1 0.6804 0.13501 0.528 0.012 0.460
#> SRR2105181 3 0.9159 0.07338 0.328 0.164 0.508
#> SRR2105182 1 0.9050 0.08224 0.536 0.168 0.296
#> SRR2105177 1 0.6313 0.20320 0.676 0.016 0.308
#> SRR2105178 1 0.1163 0.38051 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105171 2 0.6404 0.61749 0.012 0.644 0.344
#> SRR2105172 2 0.9065 0.33620 0.144 0.492 0.364
#> SRR2105175 1 0.5968 0.16593 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105176 1 0.0747 0.38111 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105173 2 0.8677 0.29156 0.288 0.572 0.140
#> SRR2105174 2 0.7666 0.43943 0.288 0.636 0.076
#> SRR2105169 2 0.9223 0.21667 0.272 0.528 0.200
#> SRR2105170 1 0.3112 0.37260 0.900 0.004 0.096
#> SRR2105167 2 0.5741 0.71447 0.036 0.776 0.188
#> SRR2105168 2 0.9290 0.28642 0.164 0.464 0.372
#> SRR2105165 1 0.6299 0.07593 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105166 1 0.6126 0.13980 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105163 3 0.9022 0.07790 0.384 0.136 0.480
#> SRR2105164 1 0.6520 0.05975 0.508 0.004 0.488
#> SRR2105161 1 0.6345 0.13483 0.596 0.004 0.400
#> SRR2105162 1 0.0592 0.37998 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105155 2 0.0592 0.74058 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105156 2 0.7153 0.59406 0.048 0.652 0.300
#> SRR2105157 1 0.8814 -0.00336 0.480 0.116 0.404
#> SRR2105158 1 0.8243 0.03369 0.504 0.076 0.420
#> SRR2105159 1 0.6302 0.07615 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105160 1 0.5397 0.24752 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105153 1 0.9161 -0.03309 0.464 0.148 0.388
#> SRR2105154 1 0.7186 0.04785 0.500 0.024 0.476
#> SRR2105151 2 0.9776 0.10967 0.232 0.384 0.384
#> SRR2105152 2 0.7180 0.60719 0.060 0.672 0.268
#> SRR2105149 2 0.6203 0.70738 0.056 0.760 0.184
#> SRR2105150 3 0.9811 0.07615 0.376 0.240 0.384
#> SRR2105147 2 0.1643 0.73463 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105148 2 0.1529 0.73564 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105143 1 0.6521 0.23621 0.644 0.016 0.340
#> SRR2105144 1 0.6308 0.08807 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105145 1 0.5178 0.26020 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105146 1 0.6260 0.09953 0.552 0.000 0.448
#> SRR2105141 1 0.9877 -0.10548 0.408 0.276 0.316
#> SRR2105142 1 0.9431 -0.12622 0.424 0.400 0.176
#> SRR2105139 2 0.3340 0.74787 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105140 2 0.7477 0.61483 0.068 0.648 0.284
#> SRR2105137 2 0.1411 0.74619 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105138 1 0.6585 0.26897 0.736 0.064 0.200
#> SRR2105135 2 0.2496 0.75379 0.004 0.928 0.068
#> SRR2105136 2 0.4602 0.73478 0.016 0.832 0.152
#> SRR2105133 1 0.9623 -0.02353 0.448 0.216 0.336
#> SRR2105134 1 0.7641 0.09939 0.520 0.044 0.436
#> SRR2105131 2 0.7639 0.62033 0.088 0.656 0.256
#> SRR2105132 1 0.5461 0.29109 0.748 0.008 0.244
#> SRR2105129 1 0.1529 0.37879 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105130 1 0.2066 0.37512 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105127 1 0.8071 0.14415 0.564 0.076 0.360
#> SRR2105128 1 0.7740 0.07201 0.508 0.048 0.444
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 1 0.4855 0.50992 0.784 0.156 0.052 0.008
#> SRR2105278 1 0.3801 0.51769 0.780 0.220 0.000 0.000
#> SRR2105275 4 0.2643 0.66866 0.024 0.028 0.028 0.920
#> SRR2105276 4 0.3938 0.64493 0.064 0.084 0.004 0.848
#> SRR2105273 1 0.9653 -0.13822 0.316 0.132 0.244 0.308
#> SRR2105274 1 0.6563 0.54885 0.656 0.140 0.008 0.196
#> SRR2105271 1 0.7703 0.32637 0.584 0.132 0.236 0.048
#> SRR2105272 1 0.5080 0.39402 0.576 0.004 0.000 0.420
#> SRR2105269 3 0.5065 0.51010 0.016 0.268 0.708 0.008
#> SRR2105270 2 0.7094 0.34967 0.124 0.532 0.340 0.004
#> SRR2105267 3 0.2760 0.60426 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105268 2 0.6147 0.52477 0.112 0.664 0.224 0.000
#> SRR2105265 3 0.5850 0.00351 0.032 0.456 0.512 0.000
#> SRR2105266 2 0.7110 0.25055 0.128 0.460 0.412 0.000
#> SRR2105263 4 0.4858 0.65661 0.052 0.084 0.048 0.816
#> SRR2105264 4 0.5400 0.27482 0.372 0.020 0.000 0.608
#> SRR2105261 4 0.8169 0.38759 0.056 0.172 0.228 0.544
#> SRR2105262 2 0.9348 0.28914 0.136 0.412 0.280 0.172
#> SRR2105357 3 0.5240 0.54153 0.024 0.284 0.688 0.004
#> SRR2105358 1 0.5373 0.43963 0.716 0.240 0.032 0.012
#> SRR2105439 2 0.6488 0.53265 0.128 0.648 0.220 0.004
#> SRR2105440 2 0.7388 0.39064 0.192 0.504 0.304 0.000
#> SRR2105509 3 0.0469 0.61370 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105510 3 0.0592 0.61600 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105507 4 0.9356 0.16199 0.104 0.232 0.276 0.388
#> SRR2105508 3 0.8230 0.41756 0.100 0.124 0.564 0.212
#> SRR2105505 1 0.6191 0.49841 0.708 0.188 0.072 0.032
#> SRR2105506 1 0.3625 0.55645 0.828 0.160 0.012 0.000
#> SRR2105503 4 0.8279 0.11616 0.052 0.128 0.400 0.420
#> SRR2105504 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105501 3 0.5429 0.53157 0.072 0.208 0.720 0.000
#> SRR2105502 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105499 1 0.4100 0.61286 0.816 0.036 0.000 0.148
#> SRR2105500 1 0.4894 0.48664 0.748 0.220 0.008 0.024
#> SRR2105497 3 0.7623 -0.13621 0.088 0.036 0.440 0.436
#> SRR2105498 4 0.8567 0.35759 0.144 0.284 0.080 0.492
#> SRR2105495 3 0.5691 0.19500 0.028 0.408 0.564 0.000
#> SRR2105496 2 0.5644 0.51274 0.048 0.696 0.248 0.008
#> SRR2105493 3 0.5215 0.59523 0.052 0.204 0.740 0.004
#> SRR2105494 2 0.7325 0.28009 0.092 0.524 0.360 0.024
#> SRR2105491 4 0.1593 0.66379 0.004 0.016 0.024 0.956
#> SRR2105492 4 0.2246 0.65440 0.052 0.016 0.004 0.928
#> SRR2105489 4 0.7316 0.60288 0.096 0.164 0.088 0.652
#> SRR2105490 2 0.6013 0.41919 0.324 0.628 0.016 0.032
#> SRR2105487 1 0.4163 0.61044 0.792 0.020 0.000 0.188
#> SRR2105488 1 0.3312 0.62934 0.876 0.052 0.000 0.072
#> SRR2105485 1 0.7207 0.10177 0.492 0.396 0.100 0.012
#> SRR2105486 1 0.5952 0.55190 0.736 0.160 0.060 0.044
#> SRR2105483 1 0.4990 0.48052 0.640 0.008 0.000 0.352
#> SRR2105484 1 0.4535 0.51972 0.704 0.004 0.000 0.292
#> SRR2105481 4 0.4093 0.66927 0.080 0.028 0.040 0.852
#> SRR2105482 1 0.5623 0.50490 0.660 0.048 0.000 0.292
#> SRR2105479 4 0.3702 0.65509 0.100 0.012 0.028 0.860
#> SRR2105480 4 0.2589 0.64639 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR2105477 4 0.4937 0.64666 0.032 0.112 0.052 0.804
#> SRR2105478 4 0.4134 0.65238 0.024 0.100 0.032 0.844
#> SRR2105475 3 0.3583 0.57466 0.004 0.180 0.816 0.000
#> SRR2105476 3 0.3304 0.60699 0.008 0.120 0.864 0.008
#> SRR2105473 1 0.5231 0.43873 0.676 0.296 0.028 0.000
#> SRR2105474 2 0.7713 0.43558 0.276 0.564 0.112 0.048
#> SRR2105471 1 0.7733 0.28268 0.452 0.204 0.004 0.340
#> SRR2105472 4 0.8071 0.15417 0.260 0.320 0.008 0.412
#> SRR2105469 3 0.6011 0.55373 0.048 0.172 0.728 0.052
#> SRR2105470 1 0.8061 0.29967 0.548 0.252 0.144 0.056
#> SRR2105467 1 0.5886 0.53374 0.732 0.156 0.020 0.092
#> SRR2105468 1 0.4795 0.53487 0.776 0.184 0.020 0.020
#> SRR2105465 1 0.5856 0.60211 0.744 0.148 0.036 0.072
#> SRR2105466 1 0.5088 0.52488 0.688 0.024 0.000 0.288
#> SRR2105463 1 0.5250 0.28953 0.552 0.008 0.000 0.440
#> SRR2105464 1 0.4800 0.48295 0.656 0.004 0.000 0.340
#> SRR2105461 3 0.2469 0.61528 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105462 2 0.6094 0.28848 0.048 0.536 0.416 0.000
#> SRR2105459 3 0.4910 0.48556 0.020 0.276 0.704 0.000
#> SRR2105460 3 0.0336 0.61259 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105457 3 0.5510 0.58859 0.120 0.132 0.744 0.004
#> SRR2105458 3 0.3253 0.62119 0.016 0.100 0.876 0.008
#> SRR2105455 3 0.3909 0.60984 0.016 0.128 0.840 0.016
#> SRR2105456 2 0.8333 0.26824 0.100 0.468 0.352 0.080
#> SRR2105453 1 0.4454 0.42683 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.2714 0.57389 0.884 0.112 0.000 0.004
#> SRR2105451 3 0.6027 0.28322 0.036 0.408 0.552 0.004
#> SRR2105452 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105449 4 0.6101 -0.12283 0.464 0.036 0.004 0.496
#> SRR2105450 1 0.4686 0.61826 0.788 0.068 0.000 0.144
#> SRR2105447 3 0.5174 0.31597 0.012 0.368 0.620 0.000
#> SRR2105448 3 0.5583 0.40404 0.024 0.320 0.648 0.008
#> SRR2105445 2 0.6626 0.24967 0.088 0.528 0.384 0.000
#> SRR2105446 3 0.7466 0.15045 0.136 0.404 0.452 0.008
#> SRR2105443 3 0.5496 0.49876 0.028 0.288 0.676 0.008
#> SRR2105444 2 0.7357 0.49168 0.272 0.596 0.056 0.076
#> SRR2105441 2 0.5407 0.14190 0.484 0.504 0.012 0.000
#> SRR2105442 1 0.6510 0.29919 0.540 0.380 0.000 0.080
#> SRR2105437 1 0.5126 0.37460 0.552 0.004 0.000 0.444
#> SRR2105438 4 0.4996 -0.22383 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR2105435 1 0.8537 0.14318 0.528 0.176 0.208 0.088
#> SRR2105436 1 0.5831 0.56577 0.732 0.168 0.020 0.080
#> SRR2105433 1 0.4843 0.36480 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105434 1 0.5695 0.50638 0.640 0.028 0.008 0.324
#> SRR2105431 1 0.5040 0.48186 0.628 0.008 0.000 0.364
#> SRR2105432 1 0.4898 0.40503 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR2105429 4 0.8590 0.29722 0.180 0.308 0.056 0.456
#> SRR2105430 4 0.7792 -0.03030 0.024 0.424 0.128 0.424
#> SRR2105427 3 0.3142 0.60513 0.008 0.132 0.860 0.000
#> SRR2105428 3 0.7299 -0.12544 0.096 0.432 0.456 0.016
#> SRR2105425 3 0.7789 0.25478 0.128 0.324 0.516 0.032
#> SRR2105426 2 0.9298 0.45769 0.240 0.428 0.212 0.120
#> SRR2105421 3 0.3966 0.61716 0.032 0.096 0.852 0.020
#> SRR2105422 3 0.5986 0.57337 0.072 0.120 0.748 0.060
#> SRR2105423 3 0.4378 0.56804 0.000 0.164 0.796 0.040
#> SRR2105424 3 0.5195 0.47577 0.032 0.276 0.692 0.000
#> SRR2105419 3 0.5432 0.58052 0.072 0.136 0.768 0.024
#> SRR2105420 3 0.6694 0.51320 0.076 0.284 0.620 0.020
#> SRR2105415 1 0.4560 0.50883 0.700 0.004 0.000 0.296
#> SRR2105416 1 0.4049 0.57385 0.780 0.008 0.000 0.212
#> SRR2105417 1 0.6967 0.45715 0.616 0.108 0.020 0.256
#> SRR2105418 1 0.4761 0.60297 0.764 0.044 0.000 0.192
#> SRR2105413 3 0.3143 0.61255 0.024 0.100 0.876 0.000
#> SRR2105414 3 0.3810 0.58109 0.008 0.188 0.804 0.000
#> SRR2105409 2 0.6984 -0.09340 0.028 0.464 0.052 0.456
#> SRR2105410 4 0.6587 0.18908 0.324 0.100 0.000 0.576
#> SRR2105411 3 0.6840 0.04297 0.072 0.392 0.524 0.012
#> SRR2105412 2 0.5942 0.58565 0.156 0.708 0.132 0.004
#> SRR2105407 3 0.5157 0.60803 0.016 0.184 0.760 0.040
#> SRR2105408 3 0.6079 0.50987 0.060 0.280 0.652 0.008
#> SRR2105403 3 0.7362 0.42630 0.144 0.272 0.568 0.016
#> SRR2105404 3 0.8255 -0.11591 0.372 0.240 0.372 0.016
#> SRR2105405 3 0.8346 0.34716 0.208 0.264 0.488 0.040
#> SRR2105406 1 0.5371 0.40126 0.616 0.364 0.000 0.020
#> SRR2105401 3 0.1109 0.61971 0.004 0.028 0.968 0.000
#> SRR2105402 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105399 3 0.3937 0.57389 0.012 0.188 0.800 0.000
#> SRR2105400 3 0.0817 0.61269 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105397 3 0.6516 0.32148 0.016 0.052 0.580 0.352
#> SRR2105398 3 0.8886 0.15265 0.072 0.208 0.444 0.276
#> SRR2105395 4 0.6961 0.57237 0.104 0.036 0.212 0.648
#> SRR2105396 2 0.7508 0.44224 0.304 0.564 0.080 0.052
#> SRR2105393 2 0.6067 0.55471 0.124 0.704 0.164 0.008
#> SRR2105394 2 0.7219 0.23504 0.012 0.484 0.404 0.100
#> SRR2105389 3 0.9390 0.26012 0.200 0.140 0.424 0.236
#> SRR2105390 4 0.8068 0.49346 0.152 0.152 0.104 0.592
#> SRR2105391 3 0.6422 0.53888 0.100 0.160 0.704 0.036
#> SRR2105392 3 0.7837 0.45118 0.076 0.132 0.600 0.192
#> SRR2105385 4 0.5277 0.57732 0.204 0.048 0.008 0.740
#> SRR2105386 3 0.9408 -0.06096 0.184 0.124 0.360 0.332
#> SRR2105387 2 0.7668 0.29745 0.100 0.504 0.360 0.036
#> SRR2105388 2 0.6336 0.40633 0.304 0.616 0.076 0.004
#> SRR2105381 3 0.6051 0.56983 0.064 0.136 0.740 0.060
#> SRR2105382 3 0.7902 0.20836 0.040 0.124 0.512 0.324
#> SRR2105383 2 0.6295 0.50896 0.296 0.616 0.088 0.000
#> SRR2105384 2 0.5110 0.35554 0.352 0.636 0.012 0.000
#> SRR2105379 3 0.5251 0.54895 0.036 0.040 0.776 0.148
#> SRR2105380 4 0.4289 0.66406 0.076 0.012 0.076 0.836
#> SRR2105377 2 0.8332 0.40558 0.344 0.412 0.220 0.024
#> SRR2105378 1 0.5371 0.59908 0.732 0.080 0.000 0.188
#> SRR2105375 2 0.9269 0.24055 0.300 0.400 0.108 0.192
#> SRR2105376 1 0.4188 0.49534 0.752 0.244 0.000 0.004
#> SRR2105373 1 0.7977 0.34310 0.552 0.152 0.048 0.248
#> SRR2105374 4 0.4920 0.18263 0.368 0.004 0.000 0.628
#> SRR2105371 3 0.7085 0.53950 0.068 0.248 0.628 0.056
#> SRR2105372 3 0.4984 0.57998 0.012 0.132 0.788 0.068
#> SRR2105369 3 0.6323 0.54521 0.068 0.200 0.696 0.036
#> SRR2105370 2 0.7420 -0.01186 0.428 0.464 0.072 0.036
#> SRR2105367 1 0.6231 0.59473 0.720 0.132 0.032 0.116
#> SRR2105368 1 0.6301 0.53478 0.636 0.104 0.000 0.260
#> SRR2105365 4 0.4206 0.66517 0.052 0.028 0.072 0.848
#> SRR2105366 4 0.3047 0.66514 0.040 0.012 0.048 0.900
#> SRR2105363 3 0.7007 -0.19893 0.116 0.432 0.452 0.000
#> SRR2105364 2 0.6224 0.57639 0.144 0.668 0.188 0.000
#> SRR2105361 3 0.2124 0.62439 0.008 0.068 0.924 0.000
#> SRR2105362 3 0.8439 0.41299 0.152 0.172 0.556 0.120
#> SRR2105359 1 0.8628 0.00434 0.444 0.348 0.120 0.088
#> SRR2105360 3 0.7780 0.36678 0.048 0.108 0.544 0.300
#> SRR2105355 3 0.7727 0.44983 0.152 0.184 0.604 0.060
#> SRR2105356 1 0.7550 0.24436 0.516 0.364 0.056 0.064
#> SRR2105353 4 0.7685 0.40023 0.096 0.052 0.296 0.556
#> SRR2105354 4 0.6419 0.59118 0.156 0.072 0.060 0.712
#> SRR2105351 4 0.7309 0.42667 0.032 0.096 0.296 0.576
#> SRR2105352 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105349 3 0.5342 0.58112 0.044 0.092 0.788 0.076
#> SRR2105350 2 0.6058 0.55016 0.136 0.684 0.180 0.000
#> SRR2105345 3 0.6299 0.34079 0.080 0.320 0.600 0.000
#> SRR2105346 2 0.5226 0.50138 0.276 0.696 0.020 0.008
#> SRR2105347 1 0.6867 0.41436 0.552 0.324 0.000 0.124
#> SRR2105348 2 0.5478 0.25705 0.404 0.580 0.008 0.008
#> SRR2105343 3 0.2021 0.61961 0.000 0.040 0.936 0.024
#> SRR2105344 2 0.5920 0.43005 0.052 0.612 0.336 0.000
#> SRR2105341 3 0.8441 0.36454 0.248 0.184 0.508 0.060
#> SRR2105342 3 0.8627 0.25023 0.228 0.256 0.464 0.052
#> SRR2105339 3 0.9073 0.28769 0.180 0.152 0.484 0.184
#> SRR2105340 4 0.5971 0.61966 0.080 0.104 0.064 0.752
#> SRR2105335 4 0.7169 0.55187 0.164 0.108 0.068 0.660
#> SRR2105336 1 0.6848 0.46959 0.592 0.160 0.000 0.248
#> SRR2105337 4 0.5250 0.65561 0.056 0.116 0.040 0.788
#> SRR2105338 4 0.5833 0.29443 0.328 0.040 0.004 0.628
#> SRR2105331 4 0.6863 0.52007 0.048 0.048 0.292 0.612
#> SRR2105332 4 0.6156 0.61025 0.044 0.148 0.080 0.728
#> SRR2105333 3 0.1576 0.61640 0.000 0.048 0.948 0.004
#> SRR2105334 3 0.4656 0.58017 0.056 0.160 0.784 0.000
#> SRR2105329 3 0.3108 0.62349 0.016 0.112 0.872 0.000
#> SRR2105330 3 0.6960 0.35131 0.116 0.296 0.580 0.008
#> SRR2105327 3 0.3961 0.61841 0.008 0.096 0.848 0.048
#> SRR2105328 3 0.8212 0.14360 0.024 0.256 0.472 0.248
#> SRR2105325 4 0.1302 0.65519 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR2105326 4 0.1389 0.65233 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR2105323 3 0.8105 0.24455 0.256 0.244 0.480 0.020
#> SRR2105324 2 0.7048 0.30972 0.388 0.512 0.088 0.012
#> SRR2105319 4 0.4194 0.57422 0.172 0.028 0.000 0.800
#> SRR2105320 1 0.4972 0.32456 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR2105321 4 0.3224 0.66575 0.040 0.036 0.028 0.896
#> SRR2105322 4 0.1229 0.65955 0.020 0.008 0.004 0.968
#> SRR2105317 3 0.2921 0.60239 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105318 3 0.4391 0.51844 0.008 0.252 0.740 0.000
#> SRR2105315 3 0.3940 0.60660 0.020 0.152 0.824 0.004
#> SRR2105316 3 0.3324 0.61883 0.012 0.136 0.852 0.000
#> SRR2105313 3 0.5339 0.60393 0.064 0.168 0.756 0.012
#> SRR2105314 3 0.6055 0.35056 0.052 0.372 0.576 0.000
#> SRR2105311 4 0.3840 0.66663 0.024 0.012 0.116 0.848
#> SRR2105312 4 0.2368 0.66332 0.032 0.008 0.032 0.928
#> SRR2105307 1 0.5916 0.60933 0.740 0.144 0.032 0.084
#> SRR2105308 1 0.4786 0.44878 0.688 0.304 0.004 0.004
#> SRR2105309 3 0.3504 0.62248 0.012 0.116 0.860 0.012
#> SRR2105310 1 0.6497 -0.04346 0.496 0.444 0.052 0.008
#> SRR2105305 3 0.4686 0.59155 0.020 0.148 0.800 0.032
#> SRR2105306 3 0.6437 0.54690 0.020 0.220 0.672 0.088
#> SRR2105303 3 0.5095 0.59479 0.092 0.120 0.780 0.008
#> SRR2105304 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 4 0.6078 0.58125 0.024 0.084 0.176 0.716
#> SRR2105302 3 0.5990 0.35558 0.008 0.352 0.604 0.036
#> SRR2105299 4 0.6444 0.61033 0.080 0.124 0.076 0.720
#> SRR2105300 3 0.8375 0.11529 0.084 0.348 0.468 0.100
#> SRR2105297 1 0.4804 0.54458 0.708 0.016 0.000 0.276
#> SRR2105298 1 0.5200 0.60616 0.744 0.072 0.000 0.184
#> SRR2105295 3 0.1807 0.61681 0.000 0.052 0.940 0.008
#> SRR2105296 4 0.8093 0.08676 0.012 0.308 0.244 0.436
#> SRR2105293 4 0.5894 0.64418 0.084 0.040 0.128 0.748
#> SRR2105294 4 0.5570 0.08766 0.440 0.020 0.000 0.540
#> SRR2105291 3 0.9539 0.19674 0.248 0.192 0.400 0.160
#> SRR2105292 1 0.4635 0.53773 0.720 0.012 0.000 0.268
#> SRR2105289 3 0.7258 0.38713 0.100 0.312 0.564 0.024
#> SRR2105290 1 0.3372 0.61025 0.868 0.096 0.000 0.036
#> SRR2105287 1 0.4635 0.49504 0.720 0.268 0.000 0.012
#> SRR2105288 1 0.4037 0.61610 0.824 0.040 0.000 0.136
#> SRR2105285 3 0.5050 0.54103 0.068 0.176 0.756 0.000
#> SRR2105286 2 0.7900 0.32635 0.064 0.508 0.344 0.084
#> SRR2105283 2 0.7604 0.54920 0.184 0.624 0.084 0.108
#> SRR2105284 1 0.6277 0.46455 0.684 0.200 0.104 0.012
#> SRR2105281 2 0.7034 0.54963 0.220 0.576 0.204 0.000
#> SRR2105282 2 0.6276 0.38337 0.064 0.556 0.380 0.000
#> SRR2105259 3 0.5922 0.57194 0.116 0.160 0.716 0.008
#> SRR2105260 3 0.5930 0.53353 0.072 0.248 0.676 0.004
#> SRR2105279 3 0.5149 0.29836 0.016 0.336 0.648 0.000
#> SRR2105280 2 0.4974 0.52739 0.040 0.736 0.224 0.000
#> SRR2105257 1 0.5465 0.42081 0.588 0.020 0.000 0.392
#> SRR2105258 1 0.5345 0.35489 0.560 0.012 0.000 0.428
#> SRR2105253 3 0.6505 0.35029 0.012 0.312 0.608 0.068
#> SRR2105254 3 0.4277 0.45937 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR2105255 1 0.8975 -0.00963 0.420 0.216 0.292 0.072
#> SRR2105256 1 0.4632 0.45191 0.688 0.308 0.000 0.004
#> SRR2105251 2 0.8471 0.25000 0.028 0.416 0.252 0.304
#> SRR2105252 2 0.9509 0.20180 0.108 0.328 0.304 0.260
#> SRR2105249 2 0.5576 0.17955 0.020 0.536 0.444 0.000
#> SRR2105250 2 0.5000 0.05602 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR2105247 4 0.8450 -0.13252 0.020 0.292 0.332 0.356
#> SRR2105248 4 0.3187 0.67347 0.024 0.052 0.028 0.896
#> SRR2105245 4 0.4481 0.63909 0.024 0.124 0.032 0.820
#> SRR2105246 3 0.7283 0.13321 0.000 0.148 0.432 0.420
#> SRR2105243 3 0.8841 0.20191 0.176 0.308 0.440 0.076
#> SRR2105244 4 0.7693 0.15717 0.376 0.072 0.056 0.496
#> SRR2105241 4 0.9234 0.26746 0.248 0.104 0.224 0.424
#> SRR2105242 4 0.5165 0.23587 0.352 0.008 0.004 0.636
#> SRR2105239 4 0.7712 0.20295 0.012 0.180 0.304 0.504
#> SRR2105240 1 0.4522 0.50352 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105237 3 0.1706 0.62271 0.016 0.036 0.948 0.000
#> SRR2105238 3 0.6245 0.45154 0.096 0.268 0.636 0.000
#> SRR2105235 2 0.6214 0.29998 0.064 0.576 0.360 0.000
#> SRR2105236 2 0.6561 0.40695 0.344 0.564 0.092 0.000
#> SRR2105233 3 0.2480 0.61474 0.000 0.088 0.904 0.008
#> SRR2105234 3 0.0000 0.61286 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.8198 0.36507 0.028 0.488 0.252 0.232
#> SRR2105232 2 0.9299 0.26703 0.212 0.408 0.108 0.272
#> SRR2105227 3 0.9317 0.21879 0.172 0.160 0.444 0.224
#> SRR2105228 2 0.8847 0.35906 0.272 0.440 0.224 0.064
#> SRR2105225 2 0.9719 0.15594 0.260 0.360 0.172 0.208
#> SRR2105226 1 0.8559 0.40977 0.500 0.212 0.064 0.224
#> SRR2105229 3 0.8702 0.41650 0.116 0.208 0.520 0.156
#> SRR2105230 1 0.3543 0.57783 0.868 0.092 0.032 0.008
#> SRR2105219 3 0.5047 0.51245 0.004 0.256 0.716 0.024
#> SRR2105220 2 0.6934 0.46672 0.164 0.580 0.256 0.000
#> SRR2105221 1 0.7176 0.47755 0.636 0.224 0.076 0.064
#> SRR2105222 1 0.4501 0.58308 0.764 0.024 0.000 0.212
#> SRR2105223 4 0.7775 0.45819 0.228 0.144 0.048 0.580
#> SRR2105224 4 0.6780 0.08802 0.416 0.096 0.000 0.488
#> SRR2105217 4 0.3474 0.66232 0.012 0.092 0.024 0.872
#> SRR2105218 4 0.6797 0.35464 0.108 0.356 0.000 0.536
#> SRR2105215 2 0.6848 0.51516 0.140 0.632 0.216 0.012
#> SRR2105216 3 0.5130 0.37819 0.016 0.332 0.652 0.000
#> SRR2105213 4 0.5646 0.61201 0.160 0.068 0.024 0.748
#> SRR2105214 4 0.7436 0.56008 0.108 0.160 0.088 0.644
#> SRR2105211 3 0.7621 0.51996 0.128 0.220 0.600 0.052
#> SRR2105212 2 0.7098 0.33576 0.140 0.580 0.272 0.008
#> SRR2105209 1 0.7790 0.37258 0.536 0.208 0.020 0.236
#> SRR2105210 1 0.5728 0.40369 0.600 0.036 0.000 0.364
#> SRR2105207 4 0.4923 0.66831 0.088 0.052 0.048 0.812
#> SRR2105208 1 0.5498 0.42586 0.576 0.020 0.000 0.404
#> SRR2105205 4 0.6184 0.56329 0.040 0.028 0.272 0.660
#> SRR2105206 4 0.2894 0.66714 0.024 0.020 0.048 0.908
#> SRR2105201 2 0.6422 0.52387 0.248 0.632 0.120 0.000
#> SRR2105202 1 0.5497 0.09577 0.524 0.460 0.016 0.000
#> SRR2105203 3 0.6515 0.40485 0.000 0.248 0.624 0.128
#> SRR2105204 2 0.6198 0.29198 0.020 0.560 0.396 0.024
#> SRR2105199 2 0.6382 0.56512 0.196 0.664 0.136 0.004
#> SRR2105200 1 0.4851 0.53976 0.748 0.220 0.004 0.028
#> SRR2105197 1 0.9308 0.14629 0.420 0.124 0.188 0.268
#> SRR2105198 1 0.7719 0.28281 0.476 0.148 0.016 0.360
#> SRR2105195 4 0.4814 0.62887 0.176 0.024 0.020 0.780
#> SRR2105196 1 0.5244 0.30570 0.556 0.008 0.000 0.436
#> SRR2105193 1 0.5250 0.51291 0.660 0.024 0.000 0.316
#> SRR2105194 1 0.4454 0.49847 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR2105191 3 0.5688 0.57377 0.028 0.088 0.756 0.128
#> SRR2105192 1 0.3266 0.58510 0.868 0.108 0.000 0.024
#> SRR2105189 3 0.4845 0.56437 0.028 0.204 0.760 0.008
#> SRR2105190 3 0.4632 0.40591 0.004 0.308 0.688 0.000
#> SRR2105187 4 0.4014 0.66740 0.016 0.048 0.084 0.852
#> SRR2105188 4 0.6141 0.41762 0.312 0.072 0.000 0.616
#> SRR2105179 4 0.6058 0.41855 0.280 0.036 0.024 0.660
#> SRR2105180 1 0.4679 0.46999 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR2105183 2 0.7635 0.41259 0.160 0.500 0.328 0.012
#> SRR2105184 1 0.7305 0.42501 0.560 0.268 0.008 0.164
#> SRR2105185 3 0.6017 0.56577 0.020 0.180 0.716 0.084
#> SRR2105186 4 0.7584 0.29279 0.236 0.248 0.004 0.512
#> SRR2105181 1 0.8266 0.01710 0.460 0.076 0.096 0.368
#> SRR2105182 1 0.5889 0.51784 0.732 0.164 0.080 0.024
#> SRR2105177 4 0.5667 0.53650 0.240 0.060 0.004 0.696
#> SRR2105178 1 0.4454 0.51216 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR2105171 3 0.7744 0.18160 0.084 0.356 0.508 0.052
#> SRR2105172 2 0.5599 0.54600 0.072 0.700 0.228 0.000
#> SRR2105175 4 0.4053 0.51837 0.228 0.004 0.000 0.768
#> SRR2105176 1 0.4655 0.50358 0.684 0.004 0.000 0.312
#> SRR2105173 3 0.8717 0.18158 0.104 0.144 0.500 0.252
#> SRR2105174 3 0.9340 0.02160 0.124 0.224 0.424 0.228
#> SRR2105169 2 0.9672 0.21366 0.148 0.324 0.316 0.212
#> SRR2105170 4 0.7732 -0.14432 0.380 0.228 0.000 0.392
#> SRR2105167 2 0.5865 0.40591 0.048 0.612 0.340 0.000
#> SRR2105168 2 0.6058 0.56348 0.072 0.736 0.144 0.048
#> SRR2105165 4 0.4245 0.62785 0.116 0.064 0.000 0.820
#> SRR2105166 4 0.3873 0.56846 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR2105163 4 0.5528 0.64472 0.084 0.024 0.128 0.764
#> SRR2105164 4 0.2530 0.64799 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR2105161 4 0.4114 0.56332 0.200 0.004 0.008 0.788
#> SRR2105162 1 0.4713 0.47965 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR2105155 3 0.4562 0.54555 0.028 0.208 0.764 0.000
#> SRR2105156 2 0.5359 0.47769 0.028 0.680 0.288 0.004
#> SRR2105157 4 0.3341 0.67280 0.012 0.024 0.084 0.880
#> SRR2105158 4 0.4439 0.66129 0.084 0.040 0.040 0.836
#> SRR2105159 4 0.4512 0.64992 0.148 0.040 0.008 0.804
#> SRR2105160 1 0.6024 0.23466 0.500 0.032 0.004 0.464
#> SRR2105153 4 0.6689 0.62548 0.108 0.048 0.152 0.692
#> SRR2105154 4 0.3379 0.67115 0.036 0.052 0.024 0.888
#> SRR2105151 2 0.5522 0.58344 0.148 0.732 0.120 0.000
#> SRR2105152 2 0.5512 0.47943 0.040 0.660 0.300 0.000
#> SRR2105149 3 0.6454 0.53984 0.148 0.112 0.704 0.036
#> SRR2105150 1 0.7367 0.04847 0.516 0.320 0.160 0.004
#> SRR2105147 3 0.0707 0.61675 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105148 3 0.0592 0.61612 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105143 1 0.7048 0.57584 0.616 0.180 0.012 0.192
#> SRR2105144 1 0.5070 0.36509 0.620 0.372 0.000 0.008
#> SRR2105145 4 0.4509 0.38434 0.288 0.004 0.000 0.708
#> SRR2105146 4 0.2011 0.64163 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR2105141 4 0.6509 0.45829 0.068 0.008 0.340 0.584
#> SRR2105142 3 0.7299 -0.13490 0.088 0.020 0.460 0.432
#> SRR2105139 2 0.5812 0.33938 0.012 0.600 0.368 0.020
#> SRR2105140 2 0.6618 0.49800 0.068 0.660 0.236 0.036
#> SRR2105137 3 0.5097 0.21790 0.004 0.428 0.568 0.000
#> SRR2105138 1 0.6489 0.60940 0.708 0.100 0.048 0.144
#> SRR2105135 3 0.6305 0.29694 0.032 0.372 0.576 0.020
#> SRR2105136 2 0.5605 0.44150 0.020 0.648 0.320 0.012
#> SRR2105133 1 0.6911 0.29383 0.620 0.208 0.164 0.008
#> SRR2105134 1 0.3749 0.57339 0.840 0.128 0.000 0.032
#> SRR2105131 3 0.7708 0.41097 0.176 0.220 0.572 0.032
#> SRR2105132 1 0.2797 0.62248 0.900 0.032 0.000 0.068
#> SRR2105129 1 0.4594 0.53291 0.712 0.008 0.000 0.280
#> SRR2105130 1 0.4699 0.51788 0.676 0.004 0.000 0.320
#> SRR2105127 1 0.4273 0.59774 0.840 0.088 0.020 0.052
#> SRR2105128 1 0.4857 0.46758 0.668 0.324 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.6106 0.12742 0.372 0.064 0.012 0.012 0.540
#> SRR2105278 1 0.6254 0.18124 0.480 0.152 0.000 0.000 0.368
#> SRR2105275 3 0.2390 0.61094 0.084 0.000 0.896 0.000 0.020
#> SRR2105276 3 0.2069 0.60021 0.012 0.012 0.924 0.000 0.052
#> SRR2105273 5 0.7863 0.41026 0.124 0.024 0.152 0.164 0.536
#> SRR2105274 1 0.6023 0.30423 0.620 0.036 0.064 0.004 0.276
#> SRR2105271 1 0.8732 -0.09191 0.396 0.144 0.028 0.192 0.240
#> SRR2105272 1 0.3912 0.53504 0.752 0.000 0.228 0.000 0.020
#> SRR2105269 4 0.5642 0.54052 0.004 0.208 0.032 0.684 0.072
#> SRR2105270 2 0.6859 0.28094 0.028 0.524 0.004 0.296 0.148
#> SRR2105267 4 0.3698 0.60030 0.000 0.104 0.012 0.832 0.052
#> SRR2105268 2 0.5157 0.53044 0.008 0.712 0.000 0.152 0.128
#> SRR2105265 2 0.6732 0.20748 0.008 0.460 0.012 0.388 0.132
#> SRR2105266 2 0.7126 0.45353 0.076 0.548 0.000 0.224 0.152
#> SRR2105263 3 0.5956 0.57350 0.224 0.052 0.668 0.028 0.028
#> SRR2105264 1 0.5647 0.01009 0.548 0.016 0.388 0.000 0.048
#> SRR2105261 3 0.7993 0.38045 0.068 0.096 0.548 0.180 0.108
#> SRR2105262 2 0.9215 0.19462 0.100 0.340 0.080 0.256 0.224
#> SRR2105357 4 0.5745 0.50788 0.004 0.252 0.000 0.620 0.124
#> SRR2105358 5 0.6250 0.26195 0.288 0.120 0.004 0.012 0.576
#> SRR2105439 2 0.5681 0.48840 0.024 0.696 0.012 0.084 0.184
#> SRR2105440 2 0.7060 0.38824 0.040 0.504 0.000 0.176 0.280
#> SRR2105509 4 0.1281 0.60502 0.000 0.032 0.000 0.956 0.012
#> SRR2105510 4 0.0671 0.60208 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR2105507 3 0.9936 -0.02323 0.216 0.160 0.228 0.224 0.172
#> SRR2105508 4 0.7456 -0.04508 0.048 0.008 0.148 0.412 0.384
#> SRR2105505 5 0.6840 0.04369 0.400 0.072 0.012 0.044 0.472
#> SRR2105506 1 0.5698 0.41328 0.632 0.084 0.016 0.000 0.268
#> SRR2105503 3 0.9174 0.24576 0.128 0.116 0.356 0.296 0.104
#> SRR2105504 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105501 4 0.5708 0.52062 0.004 0.204 0.004 0.652 0.136
#> SRR2105502 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105499 1 0.5270 0.43983 0.684 0.028 0.048 0.000 0.240
#> SRR2105500 1 0.7361 -0.02959 0.412 0.196 0.032 0.004 0.356
#> SRR2105497 4 0.7927 -0.10402 0.192 0.016 0.328 0.408 0.056
#> SRR2105498 1 0.9001 -0.26659 0.300 0.260 0.296 0.060 0.084
#> SRR2105495 4 0.6657 -0.00149 0.000 0.392 0.004 0.412 0.192
#> SRR2105496 2 0.5280 0.54893 0.024 0.752 0.024 0.120 0.080
#> SRR2105493 4 0.6444 0.50245 0.012 0.196 0.004 0.580 0.208
#> SRR2105494 2 0.6770 0.24467 0.012 0.512 0.004 0.284 0.188
#> SRR2105491 3 0.2054 0.60512 0.072 0.004 0.916 0.000 0.008
#> SRR2105492 3 0.3525 0.58096 0.184 0.008 0.800 0.000 0.008
#> SRR2105489 3 0.7559 0.51877 0.132 0.136 0.592 0.088 0.052
#> SRR2105490 2 0.5571 0.42301 0.208 0.680 0.016 0.004 0.092
#> SRR2105487 1 0.6179 0.49105 0.616 0.024 0.136 0.000 0.224
#> SRR2105488 1 0.5216 0.37958 0.596 0.012 0.032 0.000 0.360
#> SRR2105485 2 0.7951 -0.14414 0.208 0.364 0.004 0.076 0.348
#> SRR2105486 1 0.8026 0.04303 0.416 0.164 0.032 0.052 0.336
#> SRR2105483 1 0.3088 0.56355 0.828 0.004 0.164 0.000 0.004
#> SRR2105484 1 0.1908 0.58029 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.6099 0.56691 0.204 0.000 0.644 0.040 0.112
#> SRR2105482 1 0.4543 0.57275 0.780 0.020 0.112 0.000 0.088
#> SRR2105479 3 0.5260 0.55699 0.288 0.000 0.652 0.024 0.036
#> SRR2105480 3 0.4086 0.55782 0.284 0.000 0.704 0.000 0.012
#> SRR2105477 3 0.3949 0.59718 0.060 0.040 0.844 0.016 0.040
#> SRR2105478 3 0.3885 0.60480 0.048 0.028 0.848 0.020 0.056
#> SRR2105475 4 0.3922 0.58182 0.000 0.180 0.000 0.780 0.040
#> SRR2105476 4 0.3546 0.59984 0.000 0.112 0.024 0.840 0.024
#> SRR2105473 1 0.7029 0.22919 0.480 0.328 0.008 0.020 0.164
#> SRR2105474 2 0.7220 0.44009 0.172 0.616 0.064 0.068 0.080
#> SRR2105471 3 0.7701 -0.11075 0.376 0.144 0.384 0.000 0.096
#> SRR2105472 3 0.7821 0.19385 0.252 0.228 0.448 0.008 0.064
#> SRR2105469 4 0.5431 0.24616 0.000 0.028 0.020 0.548 0.404
#> SRR2105470 5 0.8328 0.23779 0.316 0.124 0.040 0.096 0.424
#> SRR2105467 5 0.5876 0.31415 0.344 0.020 0.048 0.008 0.580
#> SRR2105468 5 0.6417 0.06792 0.380 0.092 0.004 0.020 0.504
#> SRR2105465 1 0.6095 0.43365 0.652 0.136 0.012 0.016 0.184
#> SRR2105466 1 0.3427 0.57138 0.844 0.004 0.056 0.000 0.096
#> SRR2105463 1 0.3821 0.50438 0.764 0.000 0.216 0.000 0.020
#> SRR2105464 1 0.2563 0.57572 0.872 0.000 0.120 0.000 0.008
#> SRR2105461 4 0.3593 0.60701 0.000 0.096 0.012 0.840 0.052
#> SRR2105462 2 0.5934 0.45038 0.020 0.620 0.000 0.260 0.100
#> SRR2105459 4 0.5302 0.42102 0.000 0.344 0.000 0.592 0.064
#> SRR2105460 4 0.0162 0.60013 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR2105457 4 0.5934 0.44464 0.020 0.068 0.004 0.596 0.312
#> SRR2105458 4 0.4841 0.55658 0.000 0.084 0.000 0.708 0.208
#> SRR2105455 4 0.4258 0.58375 0.000 0.128 0.008 0.788 0.076
#> SRR2105456 2 0.8535 0.29640 0.076 0.408 0.040 0.236 0.240
#> SRR2105453 1 0.6275 0.28856 0.516 0.308 0.000 0.000 0.176
#> SRR2105454 1 0.5071 0.41767 0.660 0.048 0.008 0.000 0.284
#> SRR2105451 4 0.6881 0.05167 0.004 0.412 0.024 0.428 0.132
#> SRR2105452 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105449 1 0.5731 0.32295 0.604 0.028 0.316 0.000 0.052
#> SRR2105450 1 0.4902 0.49407 0.740 0.040 0.040 0.000 0.180
#> SRR2105447 4 0.5261 0.27317 0.000 0.424 0.000 0.528 0.048
#> SRR2105448 4 0.5425 0.46351 0.008 0.308 0.012 0.632 0.040
#> SRR2105445 2 0.7123 0.39563 0.008 0.460 0.012 0.232 0.288
#> SRR2105446 2 0.7659 0.03343 0.028 0.336 0.008 0.312 0.316
#> SRR2105443 4 0.6463 0.49631 0.000 0.240 0.032 0.588 0.140
#> SRR2105444 2 0.7040 0.35471 0.128 0.596 0.056 0.020 0.200
#> SRR2105441 2 0.7066 0.11193 0.256 0.420 0.004 0.008 0.312
#> SRR2105442 1 0.6367 0.07041 0.452 0.432 0.020 0.000 0.096
#> SRR2105437 1 0.5049 0.32527 0.560 0.004 0.408 0.000 0.028
#> SRR2105438 1 0.4821 0.18248 0.516 0.000 0.464 0.000 0.020
#> SRR2105435 1 0.8563 -0.12837 0.408 0.204 0.024 0.120 0.244
#> SRR2105436 1 0.6612 0.02992 0.484 0.144 0.000 0.016 0.356
#> SRR2105433 1 0.2864 0.53478 0.852 0.000 0.136 0.000 0.012
#> SRR2105434 1 0.4351 0.58172 0.776 0.020 0.164 0.000 0.040
#> SRR2105431 1 0.3366 0.53973 0.784 0.000 0.212 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.4243 0.50056 0.712 0.000 0.264 0.000 0.024
#> SRR2105429 3 0.8202 0.33893 0.160 0.172 0.520 0.064 0.084
#> SRR2105430 3 0.7536 0.10371 0.032 0.360 0.464 0.076 0.068
#> SRR2105427 4 0.3256 0.59173 0.000 0.148 0.004 0.832 0.016
#> SRR2105428 2 0.7343 0.07304 0.048 0.448 0.024 0.388 0.092
#> SRR2105425 4 0.8407 0.14167 0.052 0.240 0.048 0.412 0.248
#> SRR2105426 2 0.8579 0.37193 0.136 0.500 0.096 0.124 0.144
#> SRR2105421 4 0.4419 0.57288 0.000 0.044 0.004 0.740 0.212
#> SRR2105422 4 0.5781 0.16657 0.004 0.032 0.024 0.492 0.448
#> SRR2105423 4 0.5088 0.56594 0.004 0.108 0.048 0.760 0.080
#> SRR2105424 4 0.6164 0.44141 0.008 0.212 0.000 0.592 0.188
#> SRR2105419 4 0.5088 0.35530 0.020 0.008 0.004 0.588 0.380
#> SRR2105420 4 0.6988 0.28838 0.012 0.212 0.004 0.460 0.312
#> SRR2105415 1 0.3077 0.58170 0.864 0.008 0.100 0.000 0.028
#> SRR2105416 1 0.1653 0.58938 0.944 0.004 0.024 0.000 0.028
#> SRR2105417 1 0.7499 0.30696 0.468 0.032 0.240 0.012 0.248
#> SRR2105418 1 0.3829 0.59252 0.828 0.016 0.060 0.000 0.096
#> SRR2105413 4 0.4045 0.59224 0.004 0.136 0.000 0.796 0.064
#> SRR2105414 4 0.4635 0.54254 0.000 0.232 0.004 0.716 0.048
#> SRR2105409 2 0.7358 0.02401 0.052 0.432 0.408 0.028 0.080
#> SRR2105410 1 0.6190 0.02890 0.468 0.060 0.444 0.004 0.024
#> SRR2105411 4 0.7176 0.00521 0.036 0.328 0.004 0.472 0.160
#> SRR2105412 2 0.4999 0.54011 0.048 0.776 0.012 0.072 0.092
#> SRR2105407 4 0.5944 0.57506 0.020 0.140 0.024 0.692 0.124
#> SRR2105408 4 0.6309 0.36032 0.000 0.208 0.000 0.528 0.264
#> SRR2105403 5 0.6550 0.19264 0.020 0.140 0.000 0.312 0.528
#> SRR2105404 5 0.7959 0.31564 0.208 0.104 0.000 0.272 0.416
#> SRR2105405 5 0.6856 0.21116 0.032 0.100 0.028 0.256 0.584
#> SRR2105406 5 0.7103 0.11779 0.332 0.224 0.020 0.000 0.424
#> SRR2105401 4 0.1836 0.60970 0.000 0.032 0.000 0.932 0.036
#> SRR2105402 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105399 4 0.4922 0.53760 0.000 0.256 0.004 0.684 0.056
#> SRR2105400 4 0.1356 0.60197 0.000 0.028 0.004 0.956 0.012
#> SRR2105397 4 0.6835 0.22642 0.004 0.044 0.360 0.496 0.096
#> SRR2105398 4 0.8575 0.14009 0.012 0.176 0.240 0.388 0.184
#> SRR2105395 3 0.7031 0.39408 0.044 0.012 0.568 0.228 0.148
#> SRR2105396 2 0.7385 0.39299 0.244 0.564 0.044 0.064 0.084
#> SRR2105393 2 0.6084 0.50377 0.024 0.656 0.028 0.064 0.228
#> SRR2105394 2 0.7708 0.37863 0.008 0.484 0.148 0.272 0.088
#> SRR2105389 5 0.7914 0.24413 0.060 0.032 0.144 0.296 0.468
#> SRR2105390 3 0.7630 0.03340 0.096 0.024 0.428 0.068 0.384
#> SRR2105391 4 0.5245 0.17858 0.004 0.004 0.028 0.524 0.440
#> SRR2105392 4 0.6607 -0.02239 0.008 0.004 0.140 0.432 0.416
#> SRR2105385 3 0.7045 0.39734 0.336 0.004 0.448 0.016 0.196
#> SRR2105386 5 0.8684 0.20336 0.284 0.036 0.152 0.132 0.396
#> SRR2105387 2 0.8428 0.21007 0.060 0.388 0.044 0.312 0.196
#> SRR2105388 2 0.7087 0.33421 0.260 0.568 0.020 0.068 0.084
#> SRR2105381 4 0.6010 0.55748 0.004 0.064 0.076 0.676 0.180
#> SRR2105382 4 0.8346 0.31466 0.080 0.112 0.232 0.492 0.084
#> SRR2105383 2 0.5756 0.44745 0.132 0.656 0.004 0.008 0.200
#> SRR2105384 2 0.5159 0.40174 0.180 0.700 0.004 0.000 0.116
#> SRR2105379 4 0.5351 0.52520 0.036 0.004 0.184 0.716 0.060
#> SRR2105380 3 0.6276 0.56135 0.232 0.004 0.628 0.092 0.044
#> SRR2105377 2 0.8725 0.12519 0.140 0.352 0.052 0.108 0.348
#> SRR2105378 1 0.5419 0.51033 0.728 0.036 0.108 0.004 0.124
#> SRR2105375 2 0.9177 0.09946 0.216 0.388 0.172 0.072 0.152
#> SRR2105376 1 0.6646 0.21012 0.484 0.180 0.004 0.004 0.328
#> SRR2105373 5 0.6756 0.38385 0.216 0.008 0.180 0.024 0.572
#> SRR2105374 3 0.4746 -0.01340 0.480 0.000 0.504 0.000 0.016
#> SRR2105371 4 0.7747 0.34289 0.008 0.152 0.084 0.468 0.288
#> SRR2105372 4 0.4982 0.36933 0.000 0.008 0.032 0.636 0.324
#> SRR2105369 5 0.6218 -0.01331 0.012 0.060 0.016 0.416 0.496
#> SRR2105370 5 0.7417 0.15215 0.148 0.344 0.016 0.036 0.456
#> SRR2105367 1 0.7293 0.47223 0.584 0.088 0.152 0.016 0.160
#> SRR2105368 1 0.5281 0.53490 0.684 0.032 0.240 0.000 0.044
#> SRR2105365 3 0.5475 0.58016 0.204 0.012 0.700 0.064 0.020
#> SRR2105366 3 0.4727 0.59208 0.180 0.004 0.752 0.044 0.020
#> SRR2105363 2 0.7291 0.24343 0.036 0.400 0.000 0.368 0.196
#> SRR2105364 2 0.5926 0.52380 0.036 0.676 0.008 0.088 0.192
#> SRR2105361 4 0.3869 0.60866 0.000 0.084 0.012 0.824 0.080
#> SRR2105362 4 0.8067 0.19576 0.040 0.104 0.084 0.444 0.328
#> SRR2105359 5 0.7781 0.29825 0.128 0.220 0.080 0.036 0.536
#> SRR2105360 4 0.6961 0.22194 0.004 0.020 0.244 0.512 0.220
#> SRR2105355 5 0.5806 0.17572 0.012 0.036 0.020 0.352 0.580
#> SRR2105356 5 0.8607 0.17903 0.220 0.308 0.048 0.064 0.360
#> SRR2105353 3 0.6930 0.32999 0.088 0.000 0.544 0.280 0.088
#> SRR2105354 3 0.7773 0.32525 0.196 0.004 0.460 0.080 0.260
#> SRR2105351 3 0.7512 0.36455 0.068 0.072 0.552 0.252 0.056
#> SRR2105352 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105349 4 0.5075 0.58707 0.060 0.076 0.060 0.780 0.024
#> SRR2105350 2 0.4296 0.53213 0.016 0.808 0.008 0.096 0.072
#> SRR2105345 4 0.6660 0.28985 0.008 0.312 0.008 0.516 0.156
#> SRR2105346 2 0.5813 0.46513 0.080 0.660 0.028 0.004 0.228
#> SRR2105347 1 0.6725 0.37548 0.548 0.300 0.080 0.000 0.072
#> SRR2105348 2 0.5886 0.37255 0.244 0.644 0.024 0.004 0.084
#> SRR2105343 4 0.2256 0.60781 0.000 0.032 0.032 0.920 0.016
#> SRR2105344 2 0.4781 0.52785 0.000 0.728 0.004 0.188 0.080
#> SRR2105341 5 0.7329 0.34023 0.092 0.044 0.052 0.248 0.564
#> SRR2105342 5 0.6480 0.30500 0.024 0.140 0.012 0.208 0.616
#> SRR2105339 4 0.9094 -0.16550 0.192 0.060 0.116 0.320 0.312
#> SRR2105340 3 0.6986 0.36348 0.152 0.004 0.536 0.040 0.268
#> SRR2105335 3 0.6526 0.43991 0.124 0.016 0.620 0.028 0.212
#> SRR2105336 1 0.7105 0.35995 0.484 0.064 0.336 0.000 0.116
#> SRR2105337 3 0.5988 0.55477 0.084 0.028 0.696 0.032 0.160
#> SRR2105338 1 0.5904 0.04415 0.508 0.032 0.424 0.004 0.032
#> SRR2105331 3 0.7646 0.46425 0.144 0.044 0.512 0.264 0.036
#> SRR2105332 3 0.7153 0.54766 0.188 0.120 0.600 0.064 0.028
#> SRR2105333 4 0.1990 0.60400 0.000 0.068 0.004 0.920 0.008
#> SRR2105334 4 0.4686 0.56910 0.000 0.160 0.000 0.736 0.104
#> SRR2105329 4 0.3934 0.61076 0.000 0.076 0.000 0.800 0.124
#> SRR2105330 4 0.7362 0.10720 0.032 0.328 0.000 0.400 0.240
#> SRR2105327 4 0.5376 0.58921 0.004 0.140 0.044 0.732 0.080
#> SRR2105328 4 0.7924 0.29631 0.020 0.220 0.212 0.480 0.068
#> SRR2105325 3 0.3551 0.60412 0.136 0.000 0.820 0.000 0.044
#> SRR2105326 3 0.3734 0.57595 0.168 0.000 0.796 0.000 0.036
#> SRR2105323 5 0.6298 0.30522 0.048 0.064 0.004 0.292 0.592
#> SRR2105324 5 0.7274 -0.08625 0.128 0.388 0.000 0.064 0.420
#> SRR2105319 3 0.5086 0.49359 0.228 0.004 0.688 0.000 0.080
#> SRR2105320 1 0.4585 0.36369 0.628 0.000 0.352 0.000 0.020
#> SRR2105321 3 0.1996 0.60820 0.032 0.000 0.928 0.004 0.036
#> SRR2105322 3 0.2006 0.60758 0.072 0.000 0.916 0.000 0.012
#> SRR2105317 4 0.3197 0.59856 0.000 0.140 0.000 0.836 0.024
#> SRR2105318 4 0.5750 0.49852 0.004 0.244 0.020 0.652 0.080
#> SRR2105315 4 0.5343 0.56794 0.000 0.156 0.012 0.700 0.132
#> SRR2105316 4 0.3234 0.61015 0.000 0.084 0.000 0.852 0.064
#> SRR2105313 4 0.5818 0.54813 0.004 0.172 0.000 0.628 0.196
#> SRR2105314 4 0.6650 0.28450 0.000 0.324 0.008 0.480 0.188
#> SRR2105311 3 0.4970 0.60648 0.136 0.000 0.744 0.100 0.020
#> SRR2105312 3 0.4061 0.59200 0.188 0.000 0.776 0.024 0.012
#> SRR2105307 1 0.6176 0.43452 0.648 0.052 0.024 0.040 0.236
#> SRR2105308 1 0.6240 0.22624 0.488 0.360 0.000 0.000 0.152
#> SRR2105309 4 0.3904 0.60080 0.000 0.052 0.000 0.792 0.156
#> SRR2105310 5 0.7327 0.11411 0.168 0.332 0.000 0.052 0.448
#> SRR2105305 4 0.4898 0.39094 0.000 0.032 0.004 0.632 0.332
#> SRR2105306 4 0.6791 0.39768 0.004 0.112 0.048 0.560 0.276
#> SRR2105303 4 0.6067 0.56435 0.016 0.112 0.040 0.688 0.144
#> SRR2105304 4 0.0000 0.59897 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 3 0.6193 0.50283 0.036 0.036 0.680 0.176 0.072
#> SRR2105302 4 0.5850 0.43645 0.000 0.312 0.032 0.600 0.056
#> SRR2105299 3 0.6322 0.39506 0.064 0.004 0.612 0.060 0.260
#> SRR2105300 4 0.8944 0.06533 0.092 0.324 0.084 0.356 0.144
#> SRR2105297 1 0.3299 0.59711 0.848 0.004 0.108 0.000 0.040
#> SRR2105298 1 0.3826 0.59529 0.832 0.052 0.092 0.000 0.024
#> SRR2105295 4 0.2673 0.60710 0.000 0.044 0.020 0.900 0.036
#> SRR2105296 3 0.7485 0.23480 0.008 0.160 0.504 0.264 0.064
#> SRR2105293 3 0.7394 0.53355 0.160 0.032 0.584 0.156 0.068
#> SRR2105294 1 0.4854 0.23362 0.648 0.000 0.308 0.000 0.044
#> SRR2105291 5 0.7777 0.37616 0.076 0.052 0.124 0.192 0.556
#> SRR2105292 1 0.3798 0.56964 0.808 0.000 0.128 0.000 0.064
#> SRR2105289 4 0.7627 0.18356 0.028 0.300 0.012 0.408 0.252
#> SRR2105290 1 0.5361 0.42330 0.664 0.084 0.008 0.000 0.244
#> SRR2105287 1 0.7293 0.23417 0.468 0.256 0.040 0.000 0.236
#> SRR2105288 1 0.2971 0.57985 0.880 0.032 0.016 0.000 0.072
#> SRR2105285 4 0.5510 0.53564 0.012 0.184 0.012 0.700 0.092
#> SRR2105286 2 0.6687 0.15722 0.008 0.528 0.044 0.344 0.076
#> SRR2105283 2 0.7327 0.44428 0.116 0.600 0.160 0.032 0.092
#> SRR2105284 1 0.7482 0.10543 0.440 0.212 0.000 0.052 0.296
#> SRR2105281 2 0.6924 0.47600 0.104 0.608 0.004 0.140 0.144
#> SRR2105282 2 0.5988 0.50654 0.024 0.632 0.000 0.232 0.112
#> SRR2105259 4 0.5703 0.54300 0.012 0.104 0.004 0.660 0.220
#> SRR2105260 4 0.6062 0.48849 0.008 0.156 0.000 0.600 0.236
#> SRR2105279 4 0.5068 0.24706 0.000 0.364 0.000 0.592 0.044
#> SRR2105280 2 0.3265 0.54978 0.004 0.860 0.008 0.096 0.032
#> SRR2105257 1 0.4781 0.51254 0.728 0.004 0.188 0.000 0.080
#> SRR2105258 1 0.3929 0.51959 0.764 0.000 0.208 0.000 0.028
#> SRR2105253 4 0.7514 0.37284 0.020 0.236 0.112 0.544 0.088
#> SRR2105254 4 0.5515 0.43508 0.000 0.268 0.000 0.624 0.108
#> SRR2105255 5 0.7348 0.43304 0.144 0.036 0.052 0.188 0.580
#> SRR2105256 1 0.6724 0.16975 0.460 0.296 0.004 0.000 0.240
#> SRR2105251 2 0.8001 0.19227 0.012 0.380 0.340 0.204 0.064
#> SRR2105252 3 0.9232 -0.15373 0.044 0.228 0.308 0.248 0.172
#> SRR2105249 2 0.6452 0.16149 0.000 0.512 0.036 0.368 0.084
#> SRR2105250 2 0.6488 0.19180 0.284 0.512 0.000 0.004 0.200
#> SRR2105247 3 0.8185 -0.20687 0.016 0.304 0.352 0.268 0.060
#> SRR2105248 3 0.3651 0.61645 0.092 0.028 0.848 0.008 0.024
#> SRR2105245 3 0.3730 0.59061 0.032 0.052 0.852 0.008 0.056
#> SRR2105246 3 0.7912 -0.04768 0.000 0.088 0.380 0.324 0.208
#> SRR2105243 5 0.8094 0.24012 0.052 0.140 0.072 0.232 0.504
#> SRR2105244 1 0.7716 -0.03212 0.420 0.020 0.228 0.028 0.304
#> SRR2105241 5 0.8594 0.09200 0.240 0.012 0.268 0.132 0.348
#> SRR2105242 3 0.5225 0.08972 0.424 0.016 0.540 0.000 0.020
#> SRR2105239 3 0.8339 0.05093 0.008 0.136 0.412 0.240 0.204
#> SRR2105240 1 0.2886 0.58720 0.864 0.004 0.116 0.000 0.016
#> SRR2105237 4 0.1728 0.60855 0.000 0.020 0.004 0.940 0.036
#> SRR2105238 4 0.6280 0.46402 0.024 0.156 0.000 0.608 0.212
#> SRR2105235 2 0.6697 0.42465 0.004 0.504 0.004 0.248 0.240
#> SRR2105236 2 0.6218 0.41575 0.168 0.652 0.004 0.040 0.136
#> SRR2105233 4 0.3539 0.60007 0.000 0.092 0.028 0.848 0.032
#> SRR2105234 4 0.0290 0.59963 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105231 2 0.8310 0.38716 0.044 0.460 0.252 0.168 0.076
#> SRR2105232 2 0.8710 0.27594 0.192 0.436 0.184 0.040 0.148
#> SRR2105227 4 0.9164 -0.13963 0.204 0.044 0.164 0.324 0.264
#> SRR2105228 5 0.8606 0.04552 0.112 0.348 0.048 0.124 0.368
#> SRR2105225 5 0.8491 0.33500 0.068 0.136 0.176 0.124 0.496
#> SRR2105226 1 0.8830 -0.05438 0.348 0.092 0.208 0.048 0.304
#> SRR2105229 5 0.8224 0.01395 0.032 0.060 0.184 0.332 0.392
#> SRR2105230 1 0.5562 0.22893 0.532 0.020 0.020 0.008 0.420
#> SRR2105219 4 0.5756 0.39419 0.000 0.324 0.012 0.588 0.076
#> SRR2105220 2 0.7461 0.39437 0.048 0.476 0.008 0.172 0.296
#> SRR2105221 1 0.7934 0.04764 0.440 0.204 0.016 0.060 0.280
#> SRR2105222 1 0.2901 0.60016 0.888 0.020 0.048 0.000 0.044
#> SRR2105223 5 0.7563 0.00333 0.184 0.012 0.356 0.036 0.412
#> SRR2105224 1 0.7043 0.06968 0.488 0.020 0.208 0.004 0.280
#> SRR2105217 3 0.3751 0.60696 0.044 0.052 0.852 0.008 0.044
#> SRR2105218 3 0.7050 0.33987 0.132 0.288 0.520 0.000 0.060
#> SRR2105215 2 0.7252 0.46644 0.044 0.536 0.020 0.128 0.272
#> SRR2105216 4 0.5663 0.28224 0.000 0.384 0.000 0.532 0.084
#> SRR2105213 3 0.6922 0.48784 0.264 0.004 0.504 0.016 0.212
#> SRR2105214 3 0.7587 0.50279 0.164 0.112 0.584 0.048 0.092
#> SRR2105211 5 0.7614 -0.20433 0.040 0.112 0.036 0.400 0.412
#> SRR2105212 2 0.7405 0.28599 0.044 0.472 0.016 0.132 0.336
#> SRR2105209 5 0.8555 0.23311 0.264 0.132 0.204 0.016 0.384
#> SRR2105210 1 0.4571 0.55672 0.760 0.008 0.152 0.000 0.080
#> SRR2105207 3 0.6336 0.58512 0.216 0.036 0.652 0.040 0.056
#> SRR2105208 1 0.3988 0.51159 0.732 0.000 0.252 0.000 0.016
#> SRR2105205 3 0.6762 0.49792 0.120 0.008 0.576 0.256 0.040
#> SRR2105206 3 0.4662 0.58865 0.188 0.004 0.752 0.032 0.024
#> SRR2105201 2 0.6339 0.36419 0.056 0.528 0.000 0.052 0.364
#> SRR2105202 2 0.7083 0.09562 0.252 0.424 0.000 0.016 0.308
#> SRR2105203 4 0.6901 0.44525 0.004 0.156 0.136 0.608 0.096
#> SRR2105204 2 0.5780 0.40086 0.000 0.632 0.032 0.272 0.064
#> SRR2105199 2 0.6369 0.45255 0.048 0.584 0.004 0.068 0.296
#> SRR2105200 1 0.7015 0.42729 0.572 0.232 0.084 0.004 0.108
#> SRR2105197 5 0.8712 0.29547 0.172 0.068 0.236 0.088 0.436
#> SRR2105198 3 0.6783 -0.09129 0.380 0.048 0.476 0.000 0.096
#> SRR2105195 3 0.6223 0.47806 0.360 0.024 0.540 0.004 0.072
#> SRR2105196 1 0.4498 0.47528 0.736 0.008 0.216 0.000 0.040
#> SRR2105193 1 0.3892 0.58485 0.820 0.024 0.120 0.000 0.036
#> SRR2105194 1 0.2189 0.58095 0.904 0.000 0.084 0.000 0.012
#> SRR2105191 4 0.6090 0.35299 0.004 0.016 0.096 0.596 0.288
#> SRR2105192 1 0.5648 0.45756 0.668 0.068 0.036 0.000 0.228
#> SRR2105189 4 0.5500 0.53317 0.024 0.224 0.000 0.676 0.076
#> SRR2105190 4 0.5268 0.44218 0.008 0.312 0.000 0.628 0.052
#> SRR2105187 3 0.4313 0.62488 0.076 0.012 0.820 0.052 0.040
#> SRR2105188 3 0.6742 0.24854 0.324 0.036 0.516 0.000 0.124
#> SRR2105179 3 0.7233 0.33014 0.360 0.020 0.460 0.024 0.136
#> SRR2105180 1 0.2886 0.56067 0.844 0.000 0.148 0.000 0.008
#> SRR2105183 2 0.7477 0.36129 0.020 0.436 0.016 0.224 0.304
#> SRR2105184 1 0.7580 0.15149 0.428 0.360 0.124 0.004 0.084
#> SRR2105185 4 0.6597 0.42506 0.000 0.104 0.068 0.600 0.228
#> SRR2105186 3 0.7813 0.29780 0.232 0.180 0.480 0.004 0.104
#> SRR2105181 5 0.7994 0.11514 0.252 0.012 0.320 0.052 0.364
#> SRR2105182 5 0.7904 0.18132 0.380 0.156 0.020 0.060 0.384
#> SRR2105177 3 0.6907 0.33167 0.404 0.052 0.460 0.008 0.076
#> SRR2105178 1 0.1965 0.58300 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR2105171 4 0.7780 0.19902 0.024 0.284 0.044 0.464 0.184
#> SRR2105172 2 0.4989 0.54127 0.024 0.764 0.012 0.076 0.124
#> SRR2105175 3 0.4815 0.16194 0.480 0.008 0.504 0.000 0.008
#> SRR2105176 1 0.2020 0.57541 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR2105173 4 0.9136 0.09517 0.160 0.104 0.172 0.424 0.140
#> SRR2105174 4 0.9105 0.16072 0.144 0.192 0.164 0.416 0.084
#> SRR2105169 2 0.9639 0.16899 0.172 0.308 0.164 0.244 0.112
#> SRR2105170 1 0.6765 0.29670 0.536 0.236 0.204 0.000 0.024
#> SRR2105167 2 0.5397 0.52201 0.032 0.700 0.000 0.196 0.072
#> SRR2105168 2 0.6348 0.51877 0.048 0.688 0.088 0.044 0.132
#> SRR2105165 3 0.6361 0.46545 0.284 0.000 0.544 0.008 0.164
#> SRR2105166 3 0.4893 0.43535 0.404 0.000 0.568 0.000 0.028
#> SRR2105163 3 0.6617 0.53179 0.176 0.000 0.616 0.136 0.072
#> SRR2105164 3 0.4615 0.56598 0.252 0.000 0.700 0.000 0.048
#> SRR2105161 3 0.4955 0.42268 0.328 0.000 0.632 0.004 0.036
#> SRR2105162 1 0.2966 0.55194 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR2105155 4 0.5569 0.43461 0.000 0.228 0.000 0.636 0.136
#> SRR2105156 2 0.4503 0.54428 0.008 0.768 0.000 0.140 0.084
#> SRR2105157 3 0.4767 0.62458 0.080 0.020 0.792 0.080 0.028
#> SRR2105158 3 0.6129 0.56755 0.252 0.052 0.640 0.024 0.032
#> SRR2105159 3 0.5691 0.56966 0.200 0.032 0.684 0.004 0.080
#> SRR2105160 1 0.5433 0.27938 0.540 0.016 0.412 0.000 0.032
#> SRR2105153 3 0.8298 0.48920 0.208 0.056 0.492 0.164 0.080
#> SRR2105154 3 0.4318 0.61629 0.144 0.036 0.792 0.004 0.024
#> SRR2105151 2 0.3904 0.53587 0.056 0.848 0.024 0.028 0.044
#> SRR2105152 2 0.4155 0.55002 0.008 0.804 0.004 0.116 0.068
#> SRR2105149 4 0.7344 0.43695 0.100 0.104 0.016 0.568 0.212
#> SRR2105150 5 0.8302 0.18250 0.208 0.268 0.004 0.132 0.388
#> SRR2105147 4 0.0451 0.60140 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105148 4 0.0451 0.60140 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105143 1 0.7198 0.39524 0.584 0.128 0.088 0.012 0.188
#> SRR2105144 1 0.6315 0.19147 0.452 0.420 0.008 0.000 0.120
#> SRR2105145 3 0.5256 0.21432 0.420 0.008 0.540 0.000 0.032
#> SRR2105146 3 0.3835 0.52323 0.244 0.000 0.744 0.000 0.012
#> SRR2105141 4 0.7002 -0.14996 0.176 0.000 0.376 0.424 0.024
#> SRR2105142 4 0.7757 0.03763 0.240 0.024 0.252 0.452 0.032
#> SRR2105139 2 0.6391 0.43649 0.004 0.612 0.064 0.252 0.068
#> SRR2105140 2 0.6679 0.53177 0.056 0.668 0.056 0.128 0.092
#> SRR2105137 4 0.6274 -0.08245 0.000 0.420 0.000 0.432 0.148
#> SRR2105138 1 0.4966 0.54696 0.768 0.132 0.020 0.024 0.056
#> SRR2105135 4 0.6991 0.11029 0.000 0.324 0.024 0.464 0.188
#> SRR2105136 2 0.5720 0.50853 0.012 0.684 0.032 0.212 0.060
#> SRR2105133 5 0.7224 0.33438 0.284 0.096 0.004 0.092 0.524
#> SRR2105134 1 0.5914 0.22010 0.500 0.052 0.016 0.004 0.428
#> SRR2105131 4 0.7765 0.23125 0.040 0.164 0.028 0.448 0.320
#> SRR2105132 1 0.4471 0.42039 0.684 0.020 0.004 0.000 0.292
#> SRR2105129 1 0.2504 0.59698 0.900 0.004 0.064 0.000 0.032
#> SRR2105130 1 0.2733 0.59072 0.872 0.004 0.112 0.000 0.012
#> SRR2105127 1 0.5417 0.24473 0.544 0.028 0.004 0.012 0.412
#> SRR2105128 1 0.6303 0.30958 0.540 0.328 0.016 0.000 0.116
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.5098 0.414732 0.152 0.016 0.000 0.144 0.684 0.004
#> SRR2105278 5 0.5634 0.402396 0.284 0.000 0.000 0.048 0.592 0.076
#> SRR2105275 3 0.3431 0.520730 0.044 0.004 0.816 0.132 0.004 0.000
#> SRR2105276 3 0.3404 0.514764 0.020 0.000 0.824 0.132 0.016 0.008
#> SRR2105273 4 0.7552 0.412305 0.068 0.120 0.116 0.500 0.196 0.000
#> SRR2105274 1 0.6938 0.154367 0.488 0.000 0.044 0.244 0.200 0.024
#> SRR2105271 1 0.8901 -0.340543 0.288 0.184 0.020 0.100 0.284 0.124
#> SRR2105272 1 0.4033 0.552212 0.768 0.000 0.168 0.032 0.032 0.000
#> SRR2105269 2 0.5683 0.491549 0.000 0.648 0.028 0.084 0.028 0.212
#> SRR2105270 6 0.6957 0.326107 0.000 0.232 0.008 0.076 0.200 0.484
#> SRR2105267 2 0.4046 0.552415 0.000 0.784 0.004 0.068 0.016 0.128
#> SRR2105268 6 0.6953 0.440416 0.000 0.132 0.012 0.120 0.216 0.520
#> SRR2105265 6 0.7068 0.275841 0.000 0.324 0.004 0.096 0.156 0.420
#> SRR2105266 6 0.7576 0.404646 0.052 0.184 0.000 0.092 0.196 0.476
#> SRR2105263 3 0.6288 0.514737 0.252 0.040 0.592 0.072 0.004 0.040
#> SRR2105264 1 0.5096 0.156250 0.592 0.000 0.332 0.064 0.008 0.004
#> SRR2105261 3 0.8207 0.282187 0.068 0.160 0.488 0.144 0.048 0.092
#> SRR2105262 5 0.9391 -0.158366 0.076 0.172 0.068 0.200 0.284 0.200
#> SRR2105357 2 0.6662 0.401908 0.000 0.520 0.000 0.100 0.228 0.152
#> SRR2105358 5 0.5030 0.440459 0.116 0.004 0.000 0.092 0.724 0.064
#> SRR2105439 6 0.6294 0.414437 0.020 0.064 0.004 0.088 0.220 0.604
#> SRR2105440 6 0.7027 0.279213 0.004 0.116 0.000 0.120 0.348 0.412
#> SRR2105509 2 0.1692 0.561944 0.000 0.940 0.008 0.020 0.008 0.024
#> SRR2105510 2 0.2307 0.564444 0.000 0.908 0.004 0.044 0.016 0.028
#> SRR2105507 4 0.9470 0.287466 0.144 0.176 0.168 0.316 0.072 0.124
#> SRR2105508 4 0.7023 0.400424 0.028 0.312 0.092 0.484 0.080 0.004
#> SRR2105505 5 0.6804 0.426238 0.240 0.028 0.004 0.156 0.532 0.040
#> SRR2105506 1 0.5874 0.127400 0.520 0.000 0.000 0.060 0.356 0.064
#> SRR2105503 3 0.8698 0.240214 0.128 0.248 0.372 0.132 0.024 0.096
#> SRR2105504 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.6462 0.482011 0.000 0.596 0.012 0.132 0.116 0.144
#> SRR2105502 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 1 0.6110 0.079082 0.500 0.004 0.028 0.092 0.368 0.008
#> SRR2105500 5 0.6962 0.455205 0.232 0.000 0.032 0.084 0.532 0.120
#> SRR2105497 2 0.7752 -0.121592 0.160 0.372 0.268 0.188 0.004 0.008
#> SRR2105498 1 0.8500 -0.209112 0.340 0.044 0.240 0.100 0.028 0.248
#> SRR2105495 6 0.7199 0.088650 0.000 0.356 0.000 0.144 0.140 0.360
#> SRR2105496 6 0.4927 0.493649 0.008 0.048 0.016 0.096 0.076 0.756
#> SRR2105493 2 0.6716 0.414412 0.000 0.512 0.000 0.228 0.100 0.160
#> SRR2105494 6 0.7598 0.326035 0.004 0.172 0.004 0.176 0.240 0.404
#> SRR2105491 3 0.2595 0.558545 0.084 0.000 0.872 0.044 0.000 0.000
#> SRR2105492 3 0.3243 0.532751 0.208 0.000 0.780 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105489 3 0.8163 0.398859 0.180 0.044 0.464 0.148 0.032 0.132
#> SRR2105490 6 0.6126 0.294948 0.176 0.000 0.004 0.052 0.176 0.592
#> SRR2105487 1 0.6609 0.220853 0.456 0.000 0.152 0.036 0.344 0.012
#> SRR2105488 5 0.4912 0.100196 0.432 0.000 0.008 0.044 0.516 0.000
#> SRR2105485 5 0.6761 0.331047 0.060 0.028 0.000 0.132 0.540 0.240
#> SRR2105486 5 0.6487 0.474475 0.224 0.024 0.004 0.088 0.588 0.072
#> SRR2105483 1 0.2009 0.579848 0.904 0.000 0.084 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105484 1 0.1124 0.577371 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105481 3 0.7069 0.373311 0.192 0.020 0.476 0.260 0.048 0.004
#> SRR2105482 1 0.4514 0.564391 0.772 0.000 0.056 0.092 0.072 0.008
#> SRR2105479 3 0.5717 0.473485 0.308 0.024 0.572 0.088 0.008 0.000
#> SRR2105480 3 0.4941 0.432627 0.360 0.000 0.572 0.064 0.004 0.000
#> SRR2105477 3 0.4908 0.527001 0.064 0.016 0.760 0.108 0.020 0.032
#> SRR2105478 3 0.4729 0.520298 0.044 0.012 0.776 0.100 0.032 0.036
#> SRR2105475 2 0.4459 0.539915 0.000 0.744 0.000 0.052 0.040 0.164
#> SRR2105476 2 0.3893 0.561981 0.000 0.812 0.020 0.052 0.016 0.100
#> SRR2105473 1 0.7059 -0.011426 0.456 0.008 0.004 0.060 0.268 0.204
#> SRR2105474 6 0.8002 0.298672 0.176 0.064 0.044 0.100 0.108 0.508
#> SRR2105471 3 0.7930 0.003092 0.336 0.000 0.364 0.088 0.088 0.124
#> SRR2105472 3 0.7789 0.220044 0.244 0.004 0.412 0.096 0.032 0.212
#> SRR2105469 2 0.6403 -0.029033 0.004 0.464 0.000 0.332 0.172 0.028
#> SRR2105470 5 0.7955 0.404738 0.228 0.036 0.032 0.160 0.460 0.084
#> SRR2105467 5 0.6289 0.233301 0.188 0.008 0.024 0.252 0.528 0.000
#> SRR2105468 5 0.6213 0.451247 0.216 0.004 0.000 0.128 0.584 0.068
#> SRR2105465 1 0.7162 0.277494 0.552 0.012 0.028 0.136 0.176 0.096
#> SRR2105466 1 0.4070 0.545307 0.796 0.000 0.040 0.104 0.056 0.004
#> SRR2105463 1 0.3890 0.562812 0.812 0.000 0.104 0.036 0.036 0.012
#> SRR2105464 1 0.2002 0.579103 0.908 0.000 0.076 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105461 2 0.4074 0.560974 0.000 0.792 0.000 0.068 0.044 0.096
#> SRR2105462 6 0.6119 0.400621 0.004 0.256 0.000 0.068 0.096 0.576
#> SRR2105459 2 0.5908 0.355025 0.000 0.536 0.000 0.060 0.072 0.332
#> SRR2105460 2 0.0665 0.553819 0.000 0.980 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR2105457 2 0.6490 0.233938 0.004 0.480 0.000 0.152 0.320 0.044
#> SRR2105458 2 0.5379 0.462508 0.000 0.652 0.000 0.084 0.216 0.048
#> SRR2105455 2 0.5754 0.513920 0.000 0.684 0.036 0.092 0.060 0.128
#> SRR2105456 6 0.8828 0.201047 0.056 0.248 0.036 0.208 0.128 0.324
#> SRR2105453 1 0.6654 -0.028295 0.436 0.000 0.000 0.040 0.272 0.252
#> SRR2105454 1 0.5379 0.210074 0.564 0.000 0.000 0.036 0.348 0.052
#> SRR2105451 6 0.7502 0.090179 0.000 0.332 0.016 0.180 0.104 0.368
#> SRR2105452 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105449 1 0.5613 0.434179 0.672 0.000 0.188 0.064 0.036 0.040
#> SRR2105450 1 0.5397 0.340960 0.620 0.000 0.016 0.060 0.284 0.020
#> SRR2105447 2 0.6110 0.282981 0.000 0.508 0.008 0.068 0.056 0.360
#> SRR2105448 2 0.7212 0.358289 0.004 0.520 0.040 0.100 0.100 0.236
#> SRR2105445 6 0.7532 0.331412 0.000 0.212 0.000 0.180 0.244 0.364
#> SRR2105446 5 0.7878 -0.083204 0.012 0.200 0.000 0.196 0.328 0.264
#> SRR2105443 2 0.6737 0.365245 0.004 0.492 0.008 0.160 0.048 0.288
#> SRR2105444 6 0.7836 0.257386 0.068 0.032 0.032 0.160 0.256 0.452
#> SRR2105441 5 0.6526 0.207737 0.140 0.000 0.000 0.060 0.456 0.344
#> SRR2105442 1 0.6990 -0.060346 0.420 0.000 0.024 0.040 0.172 0.344
#> SRR2105437 1 0.5822 0.266196 0.500 0.000 0.396 0.044 0.052 0.008
#> SRR2105438 1 0.5670 0.223188 0.500 0.000 0.404 0.056 0.036 0.004
#> SRR2105435 5 0.8708 0.271139 0.268 0.084 0.024 0.128 0.352 0.144
#> SRR2105436 5 0.7389 0.321691 0.292 0.020 0.016 0.112 0.468 0.092
#> SRR2105433 1 0.3196 0.562486 0.848 0.000 0.096 0.036 0.016 0.004
#> SRR2105434 1 0.4354 0.581535 0.780 0.000 0.108 0.020 0.072 0.020
#> SRR2105431 1 0.3536 0.546466 0.784 0.000 0.184 0.020 0.012 0.000
#> SRR2105432 1 0.4228 0.485218 0.704 0.000 0.252 0.032 0.012 0.000
#> SRR2105429 3 0.8291 0.301662 0.124 0.044 0.460 0.124 0.052 0.196
#> SRR2105430 6 0.7292 -0.024162 0.020 0.020 0.388 0.120 0.056 0.396
#> SRR2105427 2 0.4391 0.547394 0.000 0.752 0.004 0.052 0.028 0.164
#> SRR2105428 6 0.7933 0.174599 0.008 0.312 0.040 0.108 0.148 0.384
#> SRR2105425 2 0.8397 0.194355 0.012 0.416 0.076 0.148 0.164 0.184
#> SRR2105426 6 0.8672 0.335897 0.080 0.100 0.108 0.148 0.108 0.456
#> SRR2105421 2 0.4737 0.468263 0.000 0.696 0.000 0.216 0.064 0.024
#> SRR2105422 2 0.6617 -0.087769 0.000 0.436 0.004 0.344 0.176 0.040
#> SRR2105423 2 0.5417 0.510804 0.000 0.700 0.056 0.100 0.016 0.128
#> SRR2105424 2 0.7393 0.162483 0.000 0.404 0.000 0.172 0.232 0.192
#> SRR2105419 2 0.5925 0.184083 0.008 0.524 0.000 0.292 0.172 0.004
#> SRR2105420 2 0.7585 0.076421 0.000 0.352 0.012 0.320 0.120 0.196
#> SRR2105415 1 0.3486 0.578096 0.836 0.000 0.064 0.044 0.056 0.000
#> SRR2105416 1 0.2102 0.559982 0.908 0.000 0.012 0.012 0.068 0.000
#> SRR2105417 1 0.7871 0.243847 0.444 0.012 0.168 0.116 0.228 0.032
#> SRR2105418 1 0.3417 0.558252 0.844 0.000 0.040 0.016 0.084 0.016
#> SRR2105413 2 0.4601 0.555886 0.000 0.760 0.008 0.084 0.040 0.108
#> SRR2105414 2 0.6147 0.419418 0.000 0.584 0.000 0.088 0.108 0.220
#> SRR2105409 6 0.7535 0.042521 0.036 0.024 0.384 0.100 0.064 0.392
#> SRR2105410 3 0.6836 0.051768 0.384 0.000 0.440 0.044 0.068 0.064
#> SRR2105411 2 0.8195 -0.109839 0.032 0.384 0.020 0.156 0.132 0.276
#> SRR2105412 6 0.6079 0.464903 0.028 0.068 0.016 0.112 0.100 0.676
#> SRR2105407 2 0.7432 0.357606 0.012 0.496 0.012 0.140 0.172 0.168
#> SRR2105408 5 0.7275 -0.106123 0.000 0.304 0.000 0.136 0.388 0.172
#> SRR2105403 5 0.7121 -0.109621 0.000 0.228 0.000 0.236 0.432 0.104
#> SRR2105404 5 0.8266 -0.003949 0.108 0.244 0.000 0.220 0.352 0.076
#> SRR2105405 4 0.7582 0.238317 0.012 0.168 0.012 0.408 0.304 0.096
#> SRR2105406 5 0.7522 0.364066 0.288 0.000 0.004 0.172 0.372 0.164
#> SRR2105401 2 0.2937 0.564841 0.000 0.876 0.008 0.056 0.028 0.032
#> SRR2105402 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.5288 0.489717 0.000 0.652 0.000 0.088 0.036 0.224
#> SRR2105400 2 0.0964 0.556945 0.000 0.968 0.000 0.012 0.004 0.016
#> SRR2105397 2 0.6580 0.110331 0.000 0.492 0.292 0.172 0.024 0.020
#> SRR2105398 2 0.8601 -0.062715 0.000 0.328 0.232 0.164 0.168 0.108
#> SRR2105395 3 0.7400 0.261247 0.044 0.180 0.496 0.220 0.048 0.012
#> SRR2105396 6 0.7777 0.248239 0.220 0.032 0.056 0.104 0.084 0.504
#> SRR2105393 6 0.6510 0.442750 0.012 0.028 0.028 0.144 0.200 0.588
#> SRR2105394 6 0.7343 0.393381 0.004 0.248 0.128 0.084 0.040 0.496
#> SRR2105389 4 0.8391 0.397808 0.028 0.196 0.108 0.392 0.232 0.044
#> SRR2105390 4 0.7763 0.190574 0.076 0.036 0.332 0.412 0.120 0.024
#> SRR2105391 2 0.5738 -0.184065 0.000 0.428 0.004 0.424 0.144 0.000
#> SRR2105392 4 0.6823 0.331466 0.008 0.364 0.068 0.440 0.116 0.004
#> SRR2105385 1 0.7603 -0.302745 0.308 0.000 0.304 0.284 0.088 0.016
#> SRR2105386 4 0.8362 0.362467 0.208 0.104 0.080 0.436 0.148 0.024
#> SRR2105387 6 0.8459 0.343687 0.032 0.184 0.060 0.184 0.116 0.424
#> SRR2105388 6 0.7320 0.275751 0.216 0.036 0.012 0.100 0.108 0.528
#> SRR2105381 2 0.6066 0.519094 0.000 0.668 0.064 0.116 0.080 0.072
#> SRR2105382 2 0.8034 0.226425 0.064 0.468 0.212 0.156 0.028 0.072
#> SRR2105383 6 0.6292 0.360570 0.084 0.028 0.004 0.056 0.220 0.608
#> SRR2105384 6 0.5993 0.170283 0.164 0.000 0.004 0.032 0.216 0.584
#> SRR2105379 2 0.4971 0.448543 0.012 0.704 0.204 0.056 0.016 0.008
#> SRR2105380 3 0.6840 0.439009 0.192 0.100 0.552 0.140 0.004 0.012
#> SRR2105377 5 0.8653 -0.041628 0.108 0.080 0.016 0.200 0.320 0.276
#> SRR2105378 1 0.7053 0.335380 0.552 0.000 0.108 0.104 0.188 0.048
#> SRR2105375 6 0.8899 -0.054780 0.128 0.020 0.152 0.116 0.268 0.316
#> SRR2105376 5 0.5808 0.322996 0.332 0.000 0.000 0.032 0.536 0.100
#> SRR2105373 4 0.7226 0.246516 0.128 0.024 0.100 0.468 0.280 0.000
#> SRR2105374 1 0.5057 0.192802 0.528 0.000 0.412 0.044 0.016 0.000
#> SRR2105371 2 0.7909 0.061364 0.000 0.348 0.048 0.324 0.100 0.180
#> SRR2105372 2 0.4897 0.224497 0.000 0.604 0.012 0.332 0.052 0.000
#> SRR2105369 4 0.6771 0.164535 0.000 0.360 0.000 0.392 0.192 0.056
#> SRR2105370 5 0.7816 0.224462 0.052 0.032 0.028 0.276 0.420 0.192
#> SRR2105367 1 0.7393 0.370538 0.552 0.016 0.128 0.080 0.164 0.060
#> SRR2105368 1 0.5418 0.524102 0.688 0.000 0.180 0.040 0.064 0.028
#> SRR2105365 3 0.5905 0.525596 0.224 0.060 0.632 0.064 0.004 0.016
#> SRR2105366 3 0.5378 0.541271 0.220 0.060 0.652 0.068 0.000 0.000
#> SRR2105363 6 0.7645 0.304728 0.008 0.276 0.000 0.136 0.228 0.352
#> SRR2105364 6 0.6496 0.434786 0.012 0.064 0.016 0.088 0.236 0.584
#> SRR2105361 2 0.4562 0.559317 0.000 0.764 0.004 0.096 0.060 0.076
#> SRR2105362 2 0.8629 -0.018106 0.020 0.340 0.072 0.252 0.212 0.104
#> SRR2105359 5 0.7770 0.090640 0.040 0.036 0.040 0.332 0.404 0.148
#> SRR2105360 2 0.7549 -0.021454 0.000 0.420 0.172 0.268 0.120 0.020
#> SRR2105355 4 0.6145 0.363921 0.000 0.288 0.000 0.456 0.248 0.008
#> SRR2105356 5 0.8612 0.206543 0.136 0.036 0.028 0.268 0.304 0.228
#> SRR2105353 3 0.6997 0.095779 0.060 0.268 0.472 0.184 0.016 0.000
#> SRR2105354 3 0.7989 0.063675 0.172 0.040 0.344 0.328 0.112 0.004
#> SRR2105351 3 0.7501 0.237394 0.036 0.168 0.516 0.196 0.032 0.052
#> SRR2105352 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.6112 0.531035 0.044 0.688 0.056 0.096 0.028 0.088
#> SRR2105350 6 0.5966 0.442827 0.004 0.100 0.000 0.084 0.188 0.624
#> SRR2105345 2 0.7379 0.211338 0.000 0.464 0.016 0.136 0.160 0.224
#> SRR2105346 6 0.6141 0.381348 0.044 0.000 0.016 0.108 0.244 0.588
#> SRR2105347 1 0.6933 0.249041 0.520 0.000 0.040 0.056 0.128 0.256
#> SRR2105348 6 0.6783 0.153624 0.248 0.000 0.020 0.056 0.156 0.520
#> SRR2105343 2 0.2195 0.561294 0.000 0.912 0.036 0.024 0.000 0.028
#> SRR2105344 6 0.6216 0.498756 0.000 0.132 0.008 0.100 0.144 0.616
#> SRR2105341 4 0.7636 0.336718 0.036 0.176 0.016 0.404 0.320 0.048
#> SRR2105342 4 0.6886 0.200412 0.000 0.120 0.008 0.416 0.372 0.084
#> SRR2105339 4 0.8463 0.360649 0.112 0.276 0.060 0.404 0.092 0.056
#> SRR2105340 4 0.6925 0.013276 0.124 0.016 0.380 0.424 0.048 0.008
#> SRR2105335 3 0.6891 0.375580 0.060 0.024 0.584 0.200 0.100 0.032
#> SRR2105336 1 0.7321 0.227427 0.416 0.000 0.348 0.092 0.108 0.036
#> SRR2105337 3 0.6844 0.361364 0.080 0.044 0.556 0.260 0.032 0.028
#> SRR2105338 1 0.6481 0.070945 0.440 0.008 0.416 0.084 0.032 0.020
#> SRR2105331 3 0.7882 0.330580 0.164 0.256 0.424 0.104 0.004 0.048
#> SRR2105332 3 0.7024 0.512224 0.232 0.072 0.552 0.056 0.008 0.080
#> SRR2105333 2 0.2575 0.567358 0.000 0.880 0.000 0.044 0.004 0.072
#> SRR2105334 2 0.5761 0.497078 0.000 0.632 0.000 0.068 0.112 0.188
#> SRR2105329 2 0.6221 0.476220 0.000 0.588 0.000 0.136 0.184 0.092
#> SRR2105330 6 0.7941 0.143757 0.016 0.268 0.008 0.112 0.276 0.320
#> SRR2105327 2 0.6226 0.524221 0.008 0.648 0.044 0.068 0.064 0.168
#> SRR2105328 2 0.8361 0.082010 0.008 0.360 0.160 0.132 0.064 0.276
#> SRR2105325 3 0.4791 0.536608 0.148 0.000 0.724 0.100 0.024 0.004
#> SRR2105326 3 0.4883 0.511496 0.172 0.000 0.712 0.084 0.028 0.004
#> SRR2105323 5 0.6321 0.037715 0.008 0.164 0.000 0.236 0.552 0.040
#> SRR2105324 5 0.6173 0.253819 0.048 0.032 0.000 0.076 0.596 0.248
#> SRR2105319 3 0.5958 0.390792 0.244 0.000 0.592 0.112 0.048 0.004
#> SRR2105320 1 0.4680 0.452499 0.680 0.000 0.252 0.040 0.028 0.000
#> SRR2105321 3 0.2806 0.514336 0.016 0.000 0.844 0.136 0.004 0.000
#> SRR2105322 3 0.3118 0.550444 0.092 0.000 0.836 0.072 0.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.3029 0.563803 0.000 0.840 0.000 0.036 0.004 0.120
#> SRR2105318 2 0.5794 0.490802 0.004 0.652 0.012 0.060 0.076 0.196
#> SRR2105315 2 0.5923 0.494523 0.000 0.632 0.004 0.104 0.084 0.176
#> SRR2105316 2 0.4513 0.562287 0.000 0.760 0.000 0.076 0.060 0.104
#> SRR2105313 2 0.6480 0.462066 0.000 0.560 0.000 0.172 0.108 0.160
#> SRR2105314 2 0.7481 0.110046 0.000 0.392 0.004 0.144 0.200 0.260
#> SRR2105311 3 0.5745 0.516136 0.152 0.152 0.636 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105312 3 0.4400 0.542794 0.228 0.012 0.708 0.052 0.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.6837 0.233040 0.544 0.012 0.024 0.172 0.212 0.036
#> SRR2105308 1 0.7050 -0.155156 0.384 0.000 0.000 0.072 0.248 0.296
#> SRR2105309 2 0.5689 0.504695 0.000 0.656 0.000 0.112 0.132 0.100
#> SRR2105310 5 0.6201 0.333418 0.052 0.016 0.000 0.132 0.604 0.196
#> SRR2105305 2 0.5908 0.269593 0.000 0.556 0.000 0.240 0.184 0.020
#> SRR2105306 2 0.7047 0.234152 0.000 0.476 0.016 0.288 0.100 0.120
#> SRR2105303 2 0.6465 0.509755 0.000 0.628 0.056 0.104 0.080 0.132
#> SRR2105304 2 0.0260 0.548577 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 3 0.7405 0.343813 0.052 0.128 0.548 0.188 0.040 0.044
#> SRR2105302 2 0.6839 0.359855 0.000 0.504 0.040 0.112 0.048 0.296
#> SRR2105299 3 0.6823 0.022915 0.040 0.048 0.464 0.380 0.048 0.020
#> SRR2105300 2 0.9216 -0.052931 0.080 0.300 0.064 0.132 0.160 0.264
#> SRR2105297 1 0.2689 0.581760 0.888 0.000 0.056 0.016 0.032 0.008
#> SRR2105298 1 0.3723 0.553810 0.832 0.000 0.048 0.012 0.056 0.052
#> SRR2105295 2 0.3308 0.559930 0.000 0.848 0.048 0.048 0.000 0.056
#> SRR2105296 3 0.7571 0.250595 0.016 0.212 0.492 0.108 0.024 0.148
#> SRR2105293 3 0.6922 0.489412 0.136 0.096 0.588 0.140 0.020 0.020
#> SRR2105294 1 0.4926 0.328723 0.656 0.000 0.240 0.096 0.008 0.000
#> SRR2105291 4 0.7174 0.409685 0.048 0.116 0.052 0.560 0.200 0.024
#> SRR2105292 1 0.4323 0.561695 0.776 0.000 0.072 0.060 0.092 0.000
#> SRR2105289 2 0.7727 0.022049 0.004 0.300 0.000 0.232 0.172 0.292
#> SRR2105290 1 0.6827 0.166402 0.508 0.000 0.028 0.100 0.292 0.072
#> SRR2105287 1 0.7362 0.035735 0.452 0.000 0.024 0.100 0.272 0.152
#> SRR2105288 1 0.3839 0.517715 0.808 0.000 0.016 0.040 0.120 0.016
#> SRR2105285 2 0.5831 0.507038 0.000 0.648 0.004 0.084 0.144 0.120
#> SRR2105286 6 0.7638 0.284024 0.004 0.248 0.072 0.084 0.116 0.476
#> SRR2105283 6 0.7859 0.339514 0.088 0.024 0.148 0.072 0.156 0.512
#> SRR2105284 5 0.7949 0.324020 0.308 0.036 0.012 0.132 0.392 0.120
#> SRR2105281 6 0.7244 0.382494 0.048 0.092 0.004 0.108 0.220 0.528
#> SRR2105282 6 0.6382 0.488444 0.008 0.196 0.004 0.104 0.092 0.596
#> SRR2105259 2 0.6219 0.427744 0.000 0.584 0.004 0.156 0.196 0.060
#> SRR2105260 2 0.6937 0.181221 0.000 0.384 0.000 0.108 0.376 0.132
#> SRR2105279 2 0.6186 0.228430 0.000 0.548 0.008 0.072 0.072 0.300
#> SRR2105280 6 0.3908 0.500014 0.016 0.072 0.012 0.048 0.024 0.828
#> SRR2105257 1 0.4822 0.551852 0.740 0.000 0.120 0.076 0.060 0.004
#> SRR2105258 1 0.4060 0.538651 0.768 0.000 0.156 0.060 0.016 0.000
#> SRR2105253 2 0.8176 0.258141 0.024 0.448 0.108 0.136 0.060 0.224
#> SRR2105254 2 0.6063 0.302000 0.000 0.540 0.000 0.068 0.084 0.308
#> SRR2105255 4 0.7305 0.221910 0.044 0.128 0.028 0.432 0.348 0.020
#> SRR2105256 5 0.7341 0.290698 0.308 0.000 0.000 0.108 0.336 0.248
#> SRR2105251 6 0.8416 0.122331 0.028 0.152 0.316 0.160 0.028 0.316
#> SRR2105252 3 0.9180 -0.063566 0.040 0.212 0.304 0.184 0.084 0.176
#> SRR2105249 6 0.6823 0.168776 0.000 0.344 0.028 0.112 0.052 0.464
#> SRR2105250 6 0.6679 -0.115253 0.200 0.004 0.004 0.028 0.340 0.424
#> SRR2105247 3 0.7970 -0.125945 0.004 0.272 0.320 0.140 0.016 0.248
#> SRR2105248 3 0.3608 0.543768 0.048 0.000 0.840 0.064 0.020 0.028
#> SRR2105245 3 0.4241 0.519449 0.028 0.020 0.800 0.092 0.004 0.056
#> SRR2105246 4 0.7697 0.277405 0.000 0.288 0.276 0.336 0.044 0.056
#> SRR2105243 4 0.8289 0.244340 0.032 0.180 0.024 0.392 0.240 0.132
#> SRR2105244 1 0.8334 -0.134332 0.344 0.020 0.180 0.280 0.148 0.028
#> SRR2105241 4 0.8649 0.370972 0.156 0.096 0.220 0.392 0.112 0.024
#> SRR2105242 1 0.5849 0.124203 0.460 0.000 0.432 0.072 0.028 0.008
#> SRR2105239 3 0.8241 -0.092565 0.016 0.216 0.360 0.264 0.036 0.108
#> SRR2105240 1 0.3367 0.589296 0.832 0.000 0.116 0.020 0.028 0.004
#> SRR2105237 2 0.3933 0.566061 0.004 0.824 0.016 0.064 0.056 0.036
#> SRR2105238 2 0.7276 0.136713 0.012 0.400 0.000 0.084 0.320 0.184
#> SRR2105235 6 0.7699 0.318434 0.004 0.184 0.004 0.180 0.252 0.376
#> SRR2105236 6 0.6427 0.274860 0.120 0.012 0.000 0.096 0.180 0.592
#> SRR2105233 2 0.3703 0.561634 0.000 0.820 0.036 0.040 0.004 0.100
#> SRR2105234 2 0.1096 0.556035 0.000 0.964 0.004 0.008 0.004 0.020
#> SRR2105231 6 0.8221 0.361194 0.016 0.124 0.248 0.092 0.092 0.428
#> SRR2105232 6 0.8907 0.235304 0.136 0.036 0.212 0.112 0.128 0.376
#> SRR2105227 4 0.9019 0.286351 0.136 0.296 0.116 0.296 0.120 0.036
#> SRR2105228 5 0.8681 0.066487 0.060 0.096 0.028 0.256 0.284 0.276
#> SRR2105225 4 0.8629 0.245579 0.060 0.068 0.096 0.424 0.208 0.144
#> SRR2105226 4 0.9131 0.022617 0.268 0.048 0.188 0.272 0.160 0.064
#> SRR2105229 4 0.8193 0.334920 0.004 0.252 0.136 0.380 0.176 0.052
#> SRR2105230 5 0.6027 0.323619 0.340 0.012 0.016 0.092 0.532 0.008
#> SRR2105219 2 0.6744 0.397726 0.000 0.536 0.016 0.136 0.076 0.236
#> SRR2105220 6 0.7286 0.382887 0.020 0.104 0.004 0.132 0.260 0.480
#> SRR2105221 1 0.8692 -0.250023 0.280 0.028 0.048 0.280 0.244 0.120
#> SRR2105222 1 0.2889 0.567061 0.876 0.000 0.012 0.036 0.064 0.012
#> SRR2105223 4 0.7198 0.330597 0.136 0.016 0.232 0.488 0.128 0.000
#> SRR2105224 1 0.7587 0.058588 0.440 0.000 0.136 0.236 0.164 0.024
#> SRR2105217 3 0.4159 0.541482 0.036 0.000 0.784 0.124 0.004 0.052
#> SRR2105218 3 0.7737 0.257901 0.108 0.004 0.448 0.124 0.052 0.264
#> SRR2105215 6 0.7208 0.398973 0.012 0.068 0.008 0.184 0.260 0.468
#> SRR2105216 2 0.6703 0.122458 0.000 0.432 0.000 0.100 0.108 0.360
#> SRR2105213 3 0.7750 0.220269 0.280 0.020 0.332 0.296 0.056 0.016
#> SRR2105214 3 0.8107 0.364043 0.128 0.052 0.484 0.192 0.044 0.100
#> SRR2105211 4 0.8186 -0.000528 0.020 0.272 0.016 0.324 0.244 0.124
#> SRR2105212 6 0.7040 0.290939 0.008 0.056 0.004 0.192 0.300 0.440
#> SRR2105209 4 0.8151 -0.036322 0.136 0.000 0.180 0.336 0.296 0.052
#> SRR2105210 1 0.5066 0.535800 0.708 0.000 0.156 0.044 0.088 0.004
#> SRR2105207 3 0.7138 0.531500 0.192 0.044 0.552 0.152 0.028 0.032
#> SRR2105208 1 0.4051 0.531874 0.740 0.000 0.220 0.012 0.020 0.008
#> SRR2105205 3 0.6846 0.372116 0.112 0.256 0.508 0.116 0.008 0.000
#> SRR2105206 3 0.5350 0.538207 0.220 0.036 0.672 0.056 0.008 0.008
#> SRR2105201 6 0.6893 0.229939 0.008 0.028 0.004 0.232 0.352 0.376
#> SRR2105202 5 0.6208 0.249676 0.128 0.000 0.004 0.036 0.512 0.320
#> SRR2105203 2 0.7595 0.285389 0.000 0.488 0.164 0.160 0.048 0.140
#> SRR2105204 6 0.6684 0.378673 0.012 0.264 0.040 0.080 0.044 0.560
#> SRR2105199 6 0.7405 0.330965 0.016 0.064 0.020 0.156 0.288 0.456
#> SRR2105200 1 0.7174 0.242699 0.524 0.008 0.056 0.036 0.204 0.172
#> SRR2105197 5 0.8979 -0.012154 0.072 0.088 0.184 0.244 0.344 0.068
#> SRR2105198 3 0.7464 0.100224 0.276 0.000 0.452 0.108 0.128 0.036
#> SRR2105195 3 0.7259 0.445135 0.260 0.024 0.488 0.148 0.072 0.008
#> SRR2105196 1 0.5408 0.432132 0.668 0.000 0.176 0.060 0.096 0.000
#> SRR2105193 1 0.4220 0.583996 0.800 0.000 0.080 0.064 0.032 0.024
#> SRR2105194 1 0.1757 0.578365 0.928 0.000 0.052 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105191 2 0.7291 -0.107306 0.004 0.440 0.100 0.244 0.208 0.004
#> SRR2105192 1 0.5484 0.258404 0.576 0.000 0.020 0.028 0.340 0.036
#> SRR2105189 2 0.6817 0.461126 0.032 0.588 0.012 0.132 0.064 0.172
#> SRR2105190 2 0.5544 0.445439 0.000 0.628 0.000 0.064 0.068 0.240
#> SRR2105187 3 0.5538 0.535924 0.052 0.060 0.712 0.136 0.020 0.020
#> SRR2105188 3 0.7256 0.322215 0.232 0.000 0.496 0.124 0.120 0.028
#> SRR2105179 3 0.7819 0.257891 0.312 0.024 0.380 0.196 0.068 0.020
#> SRR2105180 1 0.2918 0.583298 0.864 0.000 0.084 0.020 0.032 0.000
#> SRR2105183 6 0.7859 0.284127 0.008 0.180 0.016 0.128 0.316 0.352
#> SRR2105184 1 0.8027 0.073078 0.400 0.000 0.108 0.080 0.140 0.272
#> SRR2105185 2 0.7470 0.181363 0.000 0.472 0.068 0.268 0.084 0.108
#> SRR2105186 3 0.7868 0.251848 0.260 0.000 0.404 0.136 0.040 0.160
#> SRR2105181 4 0.8200 0.176937 0.104 0.032 0.240 0.356 0.252 0.016
#> SRR2105182 5 0.7784 0.305860 0.196 0.032 0.024 0.188 0.476 0.084
#> SRR2105177 3 0.7202 0.291105 0.368 0.004 0.400 0.152 0.032 0.044
#> SRR2105178 1 0.1049 0.579578 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105171 2 0.8563 0.058935 0.008 0.360 0.072 0.168 0.196 0.196
#> SRR2105172 6 0.5748 0.476340 0.012 0.080 0.012 0.068 0.144 0.684
#> SRR2105175 1 0.4707 0.220061 0.584 0.000 0.360 0.056 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.1511 0.580817 0.940 0.000 0.044 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105173 2 0.9287 -0.093420 0.140 0.360 0.116 0.180 0.120 0.084
#> SRR2105174 2 0.9160 0.106781 0.092 0.368 0.180 0.108 0.080 0.172
#> SRR2105169 6 0.9666 0.090280 0.120 0.188 0.164 0.176 0.084 0.268
#> SRR2105170 1 0.6300 0.379245 0.596 0.000 0.152 0.036 0.028 0.188
#> SRR2105167 6 0.5753 0.502574 0.012 0.156 0.000 0.080 0.088 0.664
#> SRR2105168 6 0.6352 0.488044 0.004 0.048 0.068 0.112 0.124 0.644
#> SRR2105165 3 0.6521 0.352418 0.332 0.004 0.416 0.228 0.020 0.000
#> SRR2105166 1 0.5542 -0.220706 0.460 0.000 0.440 0.088 0.008 0.004
#> SRR2105163 3 0.6719 0.383997 0.168 0.140 0.532 0.160 0.000 0.000
#> SRR2105164 3 0.5582 0.460043 0.252 0.000 0.576 0.164 0.008 0.000
#> SRR2105161 3 0.4780 0.264767 0.356 0.000 0.596 0.036 0.008 0.004
#> SRR2105162 1 0.2400 0.570912 0.872 0.000 0.116 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105155 2 0.6784 0.380012 0.000 0.536 0.004 0.160 0.128 0.172
#> SRR2105156 6 0.5291 0.510120 0.000 0.136 0.000 0.084 0.088 0.692
#> SRR2105157 3 0.4872 0.548311 0.064 0.068 0.760 0.088 0.008 0.012
#> SRR2105158 3 0.5636 0.532034 0.240 0.024 0.628 0.092 0.000 0.016
#> SRR2105159 3 0.6096 0.532340 0.212 0.000 0.612 0.104 0.056 0.016
#> SRR2105160 1 0.6158 0.368570 0.544 0.000 0.308 0.080 0.060 0.008
#> SRR2105153 3 0.8144 0.430530 0.220 0.128 0.460 0.108 0.036 0.048
#> SRR2105154 3 0.4844 0.550969 0.164 0.000 0.712 0.092 0.000 0.032
#> SRR2105151 6 0.4282 0.478979 0.028 0.012 0.008 0.060 0.096 0.796
#> SRR2105152 6 0.4617 0.507063 0.000 0.100 0.000 0.060 0.088 0.752
#> SRR2105149 2 0.7613 0.273157 0.072 0.464 0.012 0.152 0.260 0.040
#> SRR2105150 5 0.7185 0.357957 0.072 0.104 0.000 0.116 0.556 0.152
#> SRR2105147 2 0.0767 0.549333 0.000 0.976 0.008 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105148 2 0.0912 0.550222 0.000 0.972 0.008 0.012 0.004 0.004
#> SRR2105143 1 0.7486 0.218903 0.492 0.004 0.036 0.152 0.212 0.104
#> SRR2105144 1 0.6829 -0.043625 0.424 0.000 0.012 0.032 0.220 0.312
#> SRR2105145 1 0.5537 0.001799 0.468 0.000 0.444 0.064 0.020 0.004
#> SRR2105146 3 0.4766 0.353822 0.320 0.000 0.616 0.060 0.004 0.000
#> SRR2105141 2 0.7020 -0.104039 0.188 0.424 0.296 0.092 0.000 0.000
#> SRR2105142 2 0.7660 0.016672 0.212 0.428 0.232 0.104 0.012 0.012
#> SRR2105139 6 0.6490 0.445045 0.004 0.208 0.028 0.116 0.052 0.592
#> SRR2105140 6 0.6959 0.474236 0.028 0.084 0.028 0.156 0.108 0.596
#> SRR2105137 2 0.6651 -0.087317 0.000 0.400 0.000 0.140 0.068 0.392
#> SRR2105138 1 0.5325 0.468309 0.704 0.016 0.000 0.044 0.108 0.128
#> SRR2105135 6 0.8060 0.221475 0.000 0.300 0.044 0.184 0.132 0.340
#> SRR2105136 6 0.5223 0.517026 0.012 0.128 0.016 0.092 0.028 0.724
#> SRR2105133 5 0.6102 0.398262 0.116 0.048 0.000 0.144 0.648 0.044
#> SRR2105134 5 0.5650 0.274629 0.348 0.004 0.016 0.052 0.560 0.020
#> SRR2105131 2 0.8156 0.046632 0.020 0.336 0.020 0.192 0.308 0.124
#> SRR2105132 1 0.5584 0.086045 0.508 0.000 0.012 0.088 0.388 0.004
#> SRR2105129 1 0.3193 0.569959 0.860 0.000 0.048 0.040 0.048 0.004
#> SRR2105130 1 0.2128 0.581314 0.908 0.000 0.056 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105127 1 0.6608 -0.102525 0.424 0.004 0.016 0.140 0.392 0.024
#> SRR2105128 1 0.6723 0.127420 0.500 0.000 0.004 0.068 0.176 0.252
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.0648 0.598 0.781 0.4825 0.500 0.500
#> 3 3 0.0679 0.561 0.708 0.1436 0.919 0.848
#> 4 4 0.1098 0.335 0.607 0.2045 0.874 0.748
#> 5 5 0.1643 0.321 0.567 0.1004 0.816 0.578
#> 6 6 0.2284 0.293 0.522 0.0632 0.937 0.795
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.9996 -0.11614 0.512 0.488
#> SRR2105278 2 0.9000 0.63765 0.316 0.684
#> SRR2105275 1 0.9686 0.33283 0.604 0.396
#> SRR2105276 1 0.6801 0.73564 0.820 0.180
#> SRR2105273 1 0.4939 0.76805 0.892 0.108
#> SRR2105274 1 0.1843 0.74820 0.972 0.028
#> SRR2105271 2 0.8207 0.67457 0.256 0.744
#> SRR2105272 1 0.4939 0.75553 0.892 0.108
#> SRR2105269 2 0.1633 0.71104 0.024 0.976
#> SRR2105270 2 0.9608 0.43869 0.384 0.616
#> SRR2105267 2 0.1414 0.71033 0.020 0.980
#> SRR2105268 2 0.7815 0.69189 0.232 0.768
#> SRR2105265 2 0.6148 0.72228 0.152 0.848
#> SRR2105266 2 0.9044 0.57284 0.320 0.680
#> SRR2105263 1 0.9970 -0.15942 0.532 0.468
#> SRR2105264 1 0.6712 0.70699 0.824 0.176
#> SRR2105261 2 0.4690 0.72887 0.100 0.900
#> SRR2105262 2 0.9323 0.44383 0.348 0.652
#> SRR2105357 2 0.1414 0.70862 0.020 0.980
#> SRR2105358 1 0.9635 0.44217 0.612 0.388
#> SRR2105439 2 0.8081 0.66273 0.248 0.752
#> SRR2105440 1 0.9866 0.33871 0.568 0.432
#> SRR2105509 2 0.1633 0.70993 0.024 0.976
#> SRR2105510 2 0.0672 0.70351 0.008 0.992
#> SRR2105507 1 0.2948 0.75663 0.948 0.052
#> SRR2105508 1 0.7815 0.69110 0.768 0.232
#> SRR2105505 1 0.7376 0.71978 0.792 0.208
#> SRR2105506 1 0.6343 0.74441 0.840 0.160
#> SRR2105503 2 0.5737 0.73235 0.136 0.864
#> SRR2105504 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105501 2 0.9358 0.56004 0.352 0.648
#> SRR2105502 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105499 1 0.6343 0.74638 0.840 0.160
#> SRR2105500 2 0.7602 0.69734 0.220 0.780
#> SRR2105497 1 0.5842 0.73255 0.860 0.140
#> SRR2105498 2 0.9996 0.26486 0.488 0.512
#> SRR2105495 1 0.9635 0.45645 0.612 0.388
#> SRR2105496 2 0.8608 0.66017 0.284 0.716
#> SRR2105493 1 0.5737 0.76726 0.864 0.136
#> SRR2105494 1 0.7139 0.75051 0.804 0.196
#> SRR2105491 1 0.9963 -0.06497 0.536 0.464
#> SRR2105492 1 0.3114 0.75764 0.944 0.056
#> SRR2105489 1 0.7376 0.73219 0.792 0.208
#> SRR2105490 2 0.7299 0.71156 0.204 0.796
#> SRR2105487 2 0.9460 0.55062 0.364 0.636
#> SRR2105488 1 0.9896 0.28432 0.560 0.440
#> SRR2105485 2 0.9522 0.43291 0.372 0.628
#> SRR2105486 1 0.9248 0.56499 0.660 0.340
#> SRR2105483 1 0.3114 0.75735 0.944 0.056
#> SRR2105484 1 0.1184 0.74044 0.984 0.016
#> SRR2105481 1 0.6148 0.76066 0.848 0.152
#> SRR2105482 1 0.4815 0.76820 0.896 0.104
#> SRR2105479 2 0.9963 0.36511 0.464 0.536
#> SRR2105480 1 0.0672 0.73836 0.992 0.008
#> SRR2105477 2 0.6343 0.73088 0.160 0.840
#> SRR2105478 2 0.8909 0.65235 0.308 0.692
#> SRR2105475 2 0.6801 0.71804 0.180 0.820
#> SRR2105476 2 0.5519 0.72518 0.128 0.872
#> SRR2105473 1 0.8327 0.66632 0.736 0.264
#> SRR2105474 1 0.6801 0.75460 0.820 0.180
#> SRR2105471 1 0.8207 0.67870 0.744 0.256
#> SRR2105472 2 0.9922 0.15041 0.448 0.552
#> SRR2105469 2 0.7950 0.68993 0.240 0.760
#> SRR2105470 1 0.6247 0.75347 0.844 0.156
#> SRR2105467 1 0.8909 0.50523 0.692 0.308
#> SRR2105468 1 0.8499 0.63218 0.724 0.276
#> SRR2105465 1 0.6148 0.76287 0.848 0.152
#> SRR2105466 1 0.2423 0.75131 0.960 0.040
#> SRR2105463 1 0.8955 0.49028 0.688 0.312
#> SRR2105464 1 0.0376 0.73585 0.996 0.004
#> SRR2105461 2 0.2236 0.71404 0.036 0.964
#> SRR2105462 1 0.9998 0.11837 0.508 0.492
#> SRR2105459 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105460 2 0.1414 0.70921 0.020 0.980
#> SRR2105457 2 0.6623 0.72387 0.172 0.828
#> SRR2105458 2 0.3733 0.72677 0.072 0.928
#> SRR2105455 2 0.4815 0.72220 0.104 0.896
#> SRR2105456 1 0.9866 0.17684 0.568 0.432
#> SRR2105453 2 0.9850 0.42069 0.428 0.572
#> SRR2105454 1 0.9998 0.09754 0.508 0.492
#> SRR2105451 2 0.9580 0.48770 0.380 0.620
#> SRR2105452 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105449 1 0.9866 0.02933 0.568 0.432
#> SRR2105450 1 0.2043 0.75159 0.968 0.032
#> SRR2105447 2 0.9933 0.18051 0.452 0.548
#> SRR2105448 2 0.4431 0.72554 0.092 0.908
#> SRR2105445 1 0.9580 0.47258 0.620 0.380
#> SRR2105446 2 0.2603 0.71907 0.044 0.956
#> SRR2105443 2 0.8763 0.64024 0.296 0.704
#> SRR2105444 1 0.8081 0.69369 0.752 0.248
#> SRR2105441 1 0.7950 0.70334 0.760 0.240
#> SRR2105442 2 0.5737 0.72370 0.136 0.864
#> SRR2105437 1 0.1843 0.74562 0.972 0.028
#> SRR2105438 1 0.2423 0.75162 0.960 0.040
#> SRR2105435 1 0.4815 0.76645 0.896 0.104
#> SRR2105436 1 0.5408 0.76581 0.876 0.124
#> SRR2105433 1 0.6531 0.72745 0.832 0.168
#> SRR2105434 2 0.9732 0.49354 0.404 0.596
#> SRR2105431 1 0.5519 0.76518 0.872 0.128
#> SRR2105432 1 0.5294 0.75847 0.880 0.120
#> SRR2105429 1 0.6048 0.76048 0.852 0.148
#> SRR2105430 2 0.6438 0.71750 0.164 0.836
#> SRR2105427 2 0.9552 0.50939 0.376 0.624
#> SRR2105428 2 0.7453 0.69686 0.212 0.788
#> SRR2105425 2 0.9635 0.41543 0.388 0.612
#> SRR2105426 2 0.7139 0.72030 0.196 0.804
#> SRR2105421 2 0.5946 0.71871 0.144 0.856
#> SRR2105422 1 1.0000 0.07516 0.504 0.496
#> SRR2105423 2 0.8443 0.65788 0.272 0.728
#> SRR2105424 2 0.3733 0.71963 0.072 0.928
#> SRR2105419 2 0.6438 0.72286 0.164 0.836
#> SRR2105420 2 0.9491 0.51125 0.368 0.632
#> SRR2105415 1 0.7299 0.70136 0.796 0.204
#> SRR2105416 1 0.1184 0.74085 0.984 0.016
#> SRR2105417 1 0.9993 0.06987 0.516 0.484
#> SRR2105418 1 0.3584 0.76010 0.932 0.068
#> SRR2105413 2 0.4690 0.72813 0.100 0.900
#> SRR2105414 2 0.6887 0.70975 0.184 0.816
#> SRR2105409 2 0.9881 0.27940 0.436 0.564
#> SRR2105410 1 0.9491 0.47254 0.632 0.368
#> SRR2105411 2 0.9491 0.42094 0.368 0.632
#> SRR2105412 2 0.9661 0.37211 0.392 0.608
#> SRR2105407 2 0.9393 0.52187 0.356 0.644
#> SRR2105408 2 0.2948 0.71722 0.052 0.948
#> SRR2105403 1 1.0000 0.15698 0.504 0.496
#> SRR2105404 2 0.7674 0.68066 0.224 0.776
#> SRR2105405 2 0.9044 0.58460 0.320 0.680
#> SRR2105406 1 0.7745 0.69745 0.772 0.228
#> SRR2105401 2 0.0938 0.70345 0.012 0.988
#> SRR2105402 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105399 2 0.2948 0.71958 0.052 0.948
#> SRR2105400 2 0.0938 0.70454 0.012 0.988
#> SRR2105397 2 0.3733 0.72423 0.072 0.928
#> SRR2105398 2 0.9248 0.59738 0.340 0.660
#> SRR2105395 1 0.8443 0.64201 0.728 0.272
#> SRR2105396 1 0.5737 0.76462 0.864 0.136
#> SRR2105393 2 0.6343 0.72959 0.160 0.840
#> SRR2105394 2 0.9850 0.16796 0.428 0.572
#> SRR2105389 1 0.4939 0.76756 0.892 0.108
#> SRR2105390 1 0.6048 0.75949 0.852 0.148
#> SRR2105391 1 0.7602 0.72325 0.780 0.220
#> SRR2105392 2 0.9983 0.00729 0.476 0.524
#> SRR2105385 1 0.1184 0.74253 0.984 0.016
#> SRR2105386 1 0.3879 0.75841 0.924 0.076
#> SRR2105387 2 0.3733 0.71807 0.072 0.928
#> SRR2105388 2 0.9732 0.32712 0.404 0.596
#> SRR2105381 2 0.3733 0.71635 0.072 0.928
#> SRR2105382 1 0.7745 0.70660 0.772 0.228
#> SRR2105383 2 0.9580 0.40837 0.380 0.620
#> SRR2105384 2 0.7950 0.69358 0.240 0.760
#> SRR2105379 2 0.5059 0.72978 0.112 0.888
#> SRR2105380 1 0.2043 0.75113 0.968 0.032
#> SRR2105377 2 0.8909 0.64016 0.308 0.692
#> SRR2105378 1 0.4562 0.76782 0.904 0.096
#> SRR2105375 2 0.9963 0.19932 0.464 0.536
#> SRR2105376 2 0.9552 0.52735 0.376 0.624
#> SRR2105373 1 0.4431 0.76788 0.908 0.092
#> SRR2105374 1 0.0672 0.73654 0.992 0.008
#> SRR2105371 2 0.9522 0.54299 0.372 0.628
#> SRR2105372 2 0.6438 0.71064 0.164 0.836
#> SRR2105369 1 0.6623 0.75912 0.828 0.172
#> SRR2105370 1 0.8207 0.66893 0.744 0.256
#> SRR2105367 2 0.9248 0.58070 0.340 0.660
#> SRR2105368 1 0.5737 0.75292 0.864 0.136
#> SRR2105365 2 0.9988 0.16445 0.480 0.520
#> SRR2105366 1 0.7883 0.70039 0.764 0.236
#> SRR2105363 2 0.7815 0.69538 0.232 0.768
#> SRR2105364 2 0.8713 0.65869 0.292 0.708
#> SRR2105361 2 0.0376 0.70242 0.004 0.996
#> SRR2105362 2 0.3733 0.72364 0.072 0.928
#> SRR2105359 1 0.8386 0.66435 0.732 0.268
#> SRR2105360 1 0.9661 0.43412 0.608 0.392
#> SRR2105355 1 0.8955 0.59092 0.688 0.312
#> SRR2105356 2 0.9933 0.19590 0.452 0.548
#> SRR2105353 1 0.9922 0.27695 0.552 0.448
#> SRR2105354 1 0.7453 0.73144 0.788 0.212
#> SRR2105351 1 0.7453 0.71628 0.788 0.212
#> SRR2105352 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105349 2 0.9393 0.53677 0.356 0.644
#> SRR2105350 2 0.5629 0.72255 0.132 0.868
#> SRR2105345 1 0.9954 0.24341 0.540 0.460
#> SRR2105346 1 0.9710 0.41512 0.600 0.400
#> SRR2105347 1 0.5059 0.75980 0.888 0.112
#> SRR2105348 1 0.7602 0.72350 0.780 0.220
#> SRR2105343 2 0.8763 0.61798 0.296 0.704
#> SRR2105344 2 0.5059 0.73302 0.112 0.888
#> SRR2105341 1 0.7299 0.73190 0.796 0.204
#> SRR2105342 1 0.9170 0.59866 0.668 0.332
#> SRR2105339 1 0.6973 0.72461 0.812 0.188
#> SRR2105340 1 0.4022 0.76275 0.920 0.080
#> SRR2105335 1 0.5408 0.76727 0.876 0.124
#> SRR2105336 1 0.3879 0.76609 0.924 0.076
#> SRR2105337 1 0.8713 0.59009 0.708 0.292
#> SRR2105338 1 0.4161 0.75726 0.916 0.084
#> SRR2105331 2 0.9608 0.51484 0.384 0.616
#> SRR2105332 1 0.7139 0.67848 0.804 0.196
#> SRR2105333 2 0.6531 0.70528 0.168 0.832
#> SRR2105334 2 0.7528 0.70515 0.216 0.784
#> SRR2105329 2 0.8207 0.67190 0.256 0.744
#> SRR2105330 2 0.8386 0.67063 0.268 0.732
#> SRR2105327 2 0.9983 0.15524 0.476 0.524
#> SRR2105328 2 1.0000 0.14430 0.496 0.504
#> SRR2105325 1 0.1184 0.74215 0.984 0.016
#> SRR2105326 1 0.0672 0.73673 0.992 0.008
#> SRR2105323 2 0.5519 0.73208 0.128 0.872
#> SRR2105324 2 0.8443 0.67809 0.272 0.728
#> SRR2105319 1 0.1843 0.74569 0.972 0.028
#> SRR2105320 1 0.1184 0.74175 0.984 0.016
#> SRR2105321 1 0.8608 0.54164 0.716 0.284
#> SRR2105322 1 0.2236 0.75015 0.964 0.036
#> SRR2105317 2 0.1633 0.71198 0.024 0.976
#> SRR2105318 2 0.2423 0.71747 0.040 0.960
#> SRR2105315 2 0.1843 0.71212 0.028 0.972
#> SRR2105316 2 0.9954 0.08123 0.460 0.540
#> SRR2105313 2 0.4939 0.73321 0.108 0.892
#> SRR2105314 2 0.2948 0.71991 0.052 0.948
#> SRR2105311 2 0.9358 0.56001 0.352 0.648
#> SRR2105312 1 0.9833 0.19573 0.576 0.424
#> SRR2105307 2 0.9909 0.40306 0.444 0.556
#> SRR2105308 2 0.9358 0.50961 0.352 0.648
#> SRR2105309 2 0.1633 0.71004 0.024 0.976
#> SRR2105310 1 0.9933 0.16935 0.548 0.452
#> SRR2105305 1 0.9635 0.48644 0.612 0.388
#> SRR2105306 2 0.9866 0.25995 0.432 0.568
#> SRR2105303 2 0.8386 0.68072 0.268 0.732
#> SRR2105304 2 0.0376 0.70255 0.004 0.996
#> SRR2105301 1 0.6531 0.75628 0.832 0.168
#> SRR2105302 2 0.8813 0.63070 0.300 0.700
#> SRR2105299 1 0.7056 0.74942 0.808 0.192
#> SRR2105300 2 0.9000 0.62917 0.316 0.684
#> SRR2105297 1 0.3274 0.75569 0.940 0.060
#> SRR2105298 1 0.4562 0.76187 0.904 0.096
#> SRR2105295 2 0.4022 0.72398 0.080 0.920
#> SRR2105296 2 0.9209 0.55477 0.336 0.664
#> SRR2105293 1 0.9775 0.33452 0.588 0.412
#> SRR2105294 1 0.0672 0.73778 0.992 0.008
#> SRR2105291 1 0.3584 0.76367 0.932 0.068
#> SRR2105292 1 0.6712 0.70897 0.824 0.176
#> SRR2105289 1 0.9922 0.27831 0.552 0.448
#> SRR2105290 1 0.5294 0.76492 0.880 0.120
#> SRR2105287 1 0.9580 0.46041 0.620 0.380
#> SRR2105288 1 0.1843 0.75077 0.972 0.028
#> SRR2105285 2 0.2778 0.71576 0.048 0.952
#> SRR2105286 2 0.5178 0.72895 0.116 0.884
#> SRR2105283 2 0.9866 0.40561 0.432 0.568
#> SRR2105284 1 0.6048 0.75979 0.852 0.148
#> SRR2105281 1 0.9286 0.51378 0.656 0.344
#> SRR2105282 2 0.8144 0.67472 0.252 0.748
#> SRR2105259 2 0.6438 0.72649 0.164 0.836
#> SRR2105260 2 0.3584 0.71636 0.068 0.932
#> SRR2105279 2 0.2423 0.71845 0.040 0.960
#> SRR2105280 2 0.4939 0.72982 0.108 0.892
#> SRR2105257 1 0.1184 0.74125 0.984 0.016
#> SRR2105258 1 0.5408 0.75347 0.876 0.124
#> SRR2105253 2 1.0000 0.13486 0.496 0.504
#> SRR2105254 2 0.6343 0.71916 0.160 0.840
#> SRR2105255 2 0.4298 0.72818 0.088 0.912
#> SRR2105256 1 0.7139 0.73499 0.804 0.196
#> SRR2105251 2 0.9522 0.50478 0.372 0.628
#> SRR2105252 2 0.3114 0.72372 0.056 0.944
#> SRR2105249 2 0.2236 0.71072 0.036 0.964
#> SRR2105250 2 1.0000 -0.12002 0.496 0.504
#> SRR2105247 2 0.8861 0.61889 0.304 0.696
#> SRR2105248 2 1.0000 0.18096 0.500 0.500
#> SRR2105245 2 0.9983 0.10107 0.476 0.524
#> SRR2105246 1 0.4562 0.76479 0.904 0.096
#> SRR2105243 1 0.9286 0.57251 0.656 0.344
#> SRR2105244 2 0.9996 0.21684 0.488 0.512
#> SRR2105241 1 0.4815 0.75784 0.896 0.104
#> SRR2105242 1 0.4431 0.77117 0.908 0.092
#> SRR2105239 2 0.9323 0.50282 0.348 0.652
#> SRR2105240 1 0.1184 0.74227 0.984 0.016
#> SRR2105237 2 0.9732 0.45271 0.404 0.596
#> SRR2105238 2 0.5294 0.72931 0.120 0.880
#> SRR2105235 1 1.0000 -0.10534 0.504 0.496
#> SRR2105236 1 0.7815 0.72022 0.768 0.232
#> SRR2105233 2 0.8081 0.65524 0.248 0.752
#> SRR2105234 2 0.1843 0.71336 0.028 0.972
#> SRR2105231 2 0.4431 0.73052 0.092 0.908
#> SRR2105232 2 0.9522 0.55754 0.372 0.628
#> SRR2105227 2 0.9977 0.28672 0.472 0.528
#> SRR2105228 1 0.8763 0.62796 0.704 0.296
#> SRR2105225 2 0.9996 -0.04689 0.488 0.512
#> SRR2105226 1 0.8443 0.65775 0.728 0.272
#> SRR2105229 1 0.7950 0.70727 0.760 0.240
#> SRR2105230 1 0.6801 0.75549 0.820 0.180
#> SRR2105219 2 0.9087 0.58517 0.324 0.676
#> SRR2105220 1 0.9954 0.22923 0.540 0.460
#> SRR2105221 1 0.2948 0.75592 0.948 0.052
#> SRR2105222 1 0.4690 0.76801 0.900 0.100
#> SRR2105223 1 0.3431 0.75991 0.936 0.064
#> SRR2105224 1 0.4562 0.76269 0.904 0.096
#> SRR2105217 1 0.9896 0.10074 0.560 0.440
#> SRR2105218 1 0.9460 0.46727 0.636 0.364
#> SRR2105215 1 0.9988 0.00547 0.520 0.480
#> SRR2105216 2 0.0938 0.70611 0.012 0.988
#> SRR2105213 1 0.4939 0.76348 0.892 0.108
#> SRR2105214 1 0.7745 0.71037 0.772 0.228
#> SRR2105211 2 0.9460 0.49631 0.364 0.636
#> SRR2105212 2 0.6887 0.71820 0.184 0.816
#> SRR2105209 1 0.5408 0.76661 0.876 0.124
#> SRR2105210 1 0.7815 0.66402 0.768 0.232
#> SRR2105207 2 0.9954 0.32497 0.460 0.540
#> SRR2105208 1 0.6887 0.73513 0.816 0.184
#> SRR2105205 1 0.9608 0.23632 0.616 0.384
#> SRR2105206 1 0.2778 0.75501 0.952 0.048
#> SRR2105201 1 0.7602 0.71703 0.780 0.220
#> SRR2105202 2 0.3733 0.71936 0.072 0.928
#> SRR2105203 1 0.9732 0.45956 0.596 0.404
#> SRR2105204 2 0.0938 0.70521 0.012 0.988
#> SRR2105199 2 0.8763 0.57546 0.296 0.704
#> SRR2105200 2 0.9909 0.23391 0.444 0.556
#> SRR2105197 2 0.9732 0.30888 0.404 0.596
#> SRR2105198 1 0.6343 0.75620 0.840 0.160
#> SRR2105195 1 0.9866 0.06859 0.568 0.432
#> SRR2105196 1 0.2043 0.74982 0.968 0.032
#> SRR2105193 1 0.4431 0.75781 0.908 0.092
#> SRR2105194 1 0.0376 0.73516 0.996 0.004
#> SRR2105191 2 0.8386 0.67371 0.268 0.732
#> SRR2105192 1 0.3584 0.76147 0.932 0.068
#> SRR2105189 2 0.2043 0.71007 0.032 0.968
#> SRR2105190 2 0.4022 0.72584 0.080 0.920
#> SRR2105187 2 0.9393 0.57186 0.356 0.644
#> SRR2105188 1 0.6531 0.74642 0.832 0.168
#> SRR2105179 1 0.4562 0.76555 0.904 0.096
#> SRR2105180 1 0.0376 0.73682 0.996 0.004
#> SRR2105183 2 1.0000 0.08839 0.500 0.500
#> SRR2105184 1 0.6623 0.75538 0.828 0.172
#> SRR2105185 2 0.9000 0.54379 0.316 0.684
#> SRR2105186 1 0.9944 0.20113 0.544 0.456
#> SRR2105181 1 0.5737 0.75830 0.864 0.136
#> SRR2105182 1 0.5737 0.76331 0.864 0.136
#> SRR2105177 1 0.3274 0.76552 0.940 0.060
#> SRR2105178 1 0.0000 0.73433 1.000 0.000
#> SRR2105171 1 0.9754 0.42408 0.592 0.408
#> SRR2105172 2 0.6973 0.69750 0.188 0.812
#> SRR2105175 1 0.1843 0.74584 0.972 0.028
#> SRR2105176 1 0.0000 0.73433 1.000 0.000
#> SRR2105173 1 0.4815 0.76364 0.896 0.104
#> SRR2105174 1 0.9248 0.49327 0.660 0.340
#> SRR2105169 2 0.9850 0.38262 0.428 0.572
#> SRR2105170 1 0.8443 0.57903 0.728 0.272
#> SRR2105167 2 0.9686 0.33306 0.396 0.604
#> SRR2105168 2 0.6623 0.70860 0.172 0.828
#> SRR2105165 1 0.4815 0.76646 0.896 0.104
#> SRR2105166 1 0.3584 0.75575 0.932 0.068
#> SRR2105163 1 0.6438 0.74665 0.836 0.164
#> SRR2105164 1 0.2236 0.75187 0.964 0.036
#> SRR2105161 1 0.6438 0.75655 0.836 0.164
#> SRR2105162 1 0.3584 0.76410 0.932 0.068
#> SRR2105155 1 0.9661 0.42524 0.608 0.392
#> SRR2105156 1 0.9000 0.61893 0.684 0.316
#> SRR2105157 1 0.4431 0.75825 0.908 0.092
#> SRR2105158 1 0.8081 0.63741 0.752 0.248
#> SRR2105159 1 0.7602 0.69056 0.780 0.220
#> SRR2105160 1 0.8813 0.62054 0.700 0.300
#> SRR2105153 1 0.9970 -0.09965 0.532 0.468
#> SRR2105154 1 0.9866 0.12572 0.568 0.432
#> SRR2105151 2 0.9996 0.10361 0.488 0.512
#> SRR2105152 2 0.1184 0.70598 0.016 0.984
#> SRR2105149 1 0.7602 0.71853 0.780 0.220
#> SRR2105150 1 0.9922 0.14830 0.552 0.448
#> SRR2105147 2 0.4022 0.72421 0.080 0.920
#> SRR2105148 2 0.2423 0.71427 0.040 0.960
#> SRR2105143 1 0.5294 0.76507 0.880 0.120
#> SRR2105144 2 0.9963 0.16159 0.464 0.536
#> SRR2105145 1 0.2778 0.75049 0.952 0.048
#> SRR2105146 1 0.1633 0.74382 0.976 0.024
#> SRR2105141 2 0.9129 0.59513 0.328 0.672
#> SRR2105142 1 0.9866 0.08976 0.568 0.432
#> SRR2105139 2 0.7528 0.71853 0.216 0.784
#> SRR2105140 1 0.8016 0.70703 0.756 0.244
#> SRR2105137 2 0.8016 0.62946 0.244 0.756
#> SRR2105138 1 0.7299 0.73953 0.796 0.204
#> SRR2105135 2 0.9491 0.43836 0.368 0.632
#> SRR2105136 2 0.2423 0.71588 0.040 0.960
#> SRR2105133 2 0.6801 0.72647 0.180 0.820
#> SRR2105134 1 0.9427 0.51533 0.640 0.360
#> SRR2105131 2 0.7815 0.66006 0.232 0.768
#> SRR2105132 1 0.6343 0.73817 0.840 0.160
#> SRR2105129 1 0.2948 0.75686 0.948 0.052
#> SRR2105130 1 0.6148 0.73627 0.848 0.152
#> SRR2105127 1 0.4161 0.76461 0.916 0.084
#> SRR2105128 1 0.7528 0.72490 0.784 0.216
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 2 0.879 0.24050 0.436 0.452 0.112
#> SRR2105278 2 0.832 0.59818 0.276 0.604 0.120
#> SRR2105275 1 0.884 0.28501 0.536 0.328 0.136
#> SRR2105276 1 0.674 0.70371 0.744 0.156 0.100
#> SRR2105273 1 0.517 0.74068 0.832 0.092 0.076
#> SRR2105274 1 0.219 0.72317 0.948 0.024 0.028
#> SRR2105271 2 0.671 0.64950 0.228 0.716 0.056
#> SRR2105272 1 0.581 0.72825 0.800 0.092 0.108
#> SRR2105269 2 0.454 0.57009 0.016 0.836 0.148
#> SRR2105270 2 0.700 0.48160 0.340 0.628 0.032
#> SRR2105267 2 0.391 0.58398 0.020 0.876 0.104
#> SRR2105268 2 0.732 0.67789 0.164 0.708 0.128
#> SRR2105265 2 0.666 0.65306 0.128 0.752 0.120
#> SRR2105266 2 0.740 0.50681 0.324 0.624 0.052
#> SRR2105263 1 0.826 -0.18979 0.492 0.432 0.076
#> SRR2105264 1 0.606 0.67643 0.776 0.160 0.064
#> SRR2105261 2 0.582 0.66089 0.104 0.800 0.096
#> SRR2105262 2 0.790 0.45307 0.312 0.608 0.080
#> SRR2105357 2 0.255 0.59837 0.012 0.932 0.056
#> SRR2105358 1 0.817 0.41198 0.552 0.368 0.080
#> SRR2105439 2 0.796 0.63512 0.232 0.648 0.120
#> SRR2105440 1 0.780 0.28722 0.520 0.428 0.052
#> SRR2105509 3 0.554 0.86481 0.008 0.252 0.740
#> SRR2105510 2 0.334 0.56775 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105507 1 0.478 0.73547 0.840 0.036 0.124
#> SRR2105508 1 0.734 0.64271 0.684 0.232 0.084
#> SRR2105505 1 0.651 0.71815 0.756 0.156 0.088
#> SRR2105506 1 0.632 0.72505 0.772 0.108 0.120
#> SRR2105503 2 0.673 0.66655 0.120 0.748 0.132
#> SRR2105504 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105501 2 0.815 0.55520 0.332 0.580 0.088
#> SRR2105502 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105499 1 0.641 0.71270 0.764 0.144 0.092
#> SRR2105500 2 0.699 0.66285 0.180 0.724 0.096
#> SRR2105497 1 0.658 0.69673 0.756 0.136 0.108
#> SRR2105498 2 0.839 0.35619 0.432 0.484 0.084
#> SRR2105495 1 0.726 0.48107 0.592 0.372 0.036
#> SRR2105496 2 0.854 0.61514 0.248 0.600 0.152
#> SRR2105493 1 0.500 0.73610 0.832 0.124 0.044
#> SRR2105494 1 0.616 0.71503 0.760 0.188 0.052
#> SRR2105491 1 0.894 -0.03319 0.484 0.388 0.128
#> SRR2105492 1 0.438 0.73508 0.868 0.064 0.068
#> SRR2105489 1 0.678 0.71899 0.732 0.188 0.080
#> SRR2105490 2 0.663 0.65403 0.104 0.752 0.144
#> SRR2105487 2 0.838 0.56166 0.284 0.596 0.120
#> SRR2105488 1 0.863 0.22692 0.472 0.428 0.100
#> SRR2105485 2 0.701 0.45046 0.324 0.640 0.036
#> SRR2105486 1 0.804 0.52082 0.624 0.272 0.104
#> SRR2105483 1 0.514 0.72714 0.828 0.052 0.120
#> SRR2105484 1 0.227 0.71456 0.944 0.016 0.040
#> SRR2105481 1 0.499 0.73100 0.824 0.144 0.032
#> SRR2105482 1 0.561 0.72775 0.808 0.120 0.072
#> SRR2105479 2 0.738 0.38598 0.452 0.516 0.032
#> SRR2105480 1 0.210 0.71412 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105477 2 0.777 0.66987 0.148 0.676 0.176
#> SRR2105478 2 0.868 0.58996 0.280 0.576 0.144
#> SRR2105475 2 0.673 0.69497 0.172 0.740 0.088
#> SRR2105476 2 0.629 0.65134 0.136 0.772 0.092
#> SRR2105473 1 0.846 0.55669 0.612 0.232 0.156
#> SRR2105474 1 0.632 0.72022 0.772 0.124 0.104
#> SRR2105471 1 0.761 0.64895 0.688 0.168 0.144
#> SRR2105472 1 0.946 -0.02767 0.424 0.396 0.180
#> SRR2105469 2 0.818 0.63177 0.208 0.640 0.152
#> SRR2105470 1 0.663 0.71829 0.752 0.144 0.104
#> SRR2105467 1 0.700 0.38222 0.628 0.340 0.032
#> SRR2105468 1 0.774 0.64300 0.668 0.216 0.116
#> SRR2105465 1 0.499 0.72921 0.824 0.144 0.032
#> SRR2105466 1 0.245 0.72025 0.936 0.012 0.052
#> SRR2105463 1 0.735 0.39827 0.632 0.316 0.052
#> SRR2105464 1 0.277 0.71749 0.916 0.004 0.080
#> SRR2105461 2 0.564 0.51508 0.020 0.760 0.220
#> SRR2105462 2 0.799 -0.07480 0.456 0.484 0.060
#> SRR2105459 2 0.343 0.57786 0.004 0.884 0.112
#> SRR2105460 2 0.423 0.54970 0.004 0.836 0.160
#> SRR2105457 2 0.568 0.67970 0.212 0.764 0.024
#> SRR2105458 2 0.238 0.63086 0.056 0.936 0.008
#> SRR2105455 2 0.684 0.63016 0.144 0.740 0.116
#> SRR2105456 1 0.875 -0.03544 0.488 0.400 0.112
#> SRR2105453 2 0.884 0.34829 0.392 0.488 0.120
#> SRR2105454 1 0.869 0.11378 0.448 0.448 0.104
#> SRR2105451 2 0.731 0.49349 0.360 0.600 0.040
#> SRR2105452 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105449 1 0.874 -0.17602 0.464 0.428 0.108
#> SRR2105450 1 0.243 0.72536 0.940 0.036 0.024
#> SRR2105447 2 0.849 0.23433 0.412 0.496 0.092
#> SRR2105448 2 0.534 0.64077 0.092 0.824 0.084
#> SRR2105445 1 0.836 0.37197 0.528 0.384 0.088
#> SRR2105446 2 0.414 0.62828 0.032 0.872 0.096
#> SRR2105443 2 0.725 0.61195 0.300 0.648 0.052
#> SRR2105444 1 0.665 0.67561 0.712 0.240 0.048
#> SRR2105441 1 0.730 0.66383 0.688 0.228 0.084
#> SRR2105442 2 0.559 0.66108 0.096 0.812 0.092
#> SRR2105437 1 0.285 0.71979 0.924 0.020 0.056
#> SRR2105438 1 0.274 0.71987 0.928 0.020 0.052
#> SRR2105435 1 0.412 0.73753 0.868 0.108 0.024
#> SRR2105436 1 0.471 0.73648 0.844 0.120 0.036
#> SRR2105433 1 0.468 0.70057 0.836 0.140 0.024
#> SRR2105434 2 0.795 0.59304 0.308 0.608 0.084
#> SRR2105431 1 0.519 0.73347 0.828 0.112 0.060
#> SRR2105432 1 0.550 0.73552 0.816 0.096 0.088
#> SRR2105429 1 0.511 0.73146 0.820 0.144 0.036
#> SRR2105430 2 0.623 0.68792 0.172 0.764 0.064
#> SRR2105427 2 0.802 0.49429 0.388 0.544 0.068
#> SRR2105428 2 0.654 0.67677 0.196 0.740 0.064
#> SRR2105425 2 0.811 0.41408 0.312 0.596 0.092
#> SRR2105426 2 0.659 0.68265 0.180 0.744 0.076
#> SRR2105421 2 0.659 0.65528 0.116 0.756 0.128
#> SRR2105422 1 0.829 0.21877 0.512 0.408 0.080
#> SRR2105423 2 0.858 0.62270 0.240 0.600 0.160
#> SRR2105424 2 0.436 0.61800 0.052 0.868 0.080
#> SRR2105419 2 0.503 0.66914 0.132 0.828 0.040
#> SRR2105420 2 0.726 0.50506 0.332 0.624 0.044
#> SRR2105415 1 0.540 0.67712 0.792 0.180 0.028
#> SRR2105416 1 0.323 0.72185 0.908 0.020 0.072
#> SRR2105417 2 0.833 0.12201 0.440 0.480 0.080
#> SRR2105418 1 0.500 0.73080 0.840 0.072 0.088
#> SRR2105413 2 0.497 0.64295 0.100 0.840 0.060
#> SRR2105414 2 0.711 0.65749 0.168 0.720 0.112
#> SRR2105409 2 0.894 0.23028 0.368 0.500 0.132
#> SRR2105410 1 0.829 0.46891 0.604 0.280 0.116
#> SRR2105411 2 0.792 0.42997 0.316 0.604 0.080
#> SRR2105412 2 0.794 0.37450 0.364 0.568 0.068
#> SRR2105407 2 0.915 0.40905 0.348 0.496 0.156
#> SRR2105408 2 0.540 0.61644 0.060 0.816 0.124
#> SRR2105403 2 0.767 -0.17145 0.476 0.480 0.044
#> SRR2105404 2 0.594 0.64834 0.224 0.748 0.028
#> SRR2105405 2 0.781 0.56585 0.268 0.640 0.092
#> SRR2105406 1 0.700 0.68044 0.716 0.200 0.084
#> SRR2105401 2 0.426 0.57237 0.012 0.848 0.140
#> SRR2105402 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105399 2 0.445 0.60349 0.032 0.856 0.112
#> SRR2105400 2 0.452 0.53042 0.004 0.816 0.180
#> SRR2105397 2 0.685 0.53711 0.060 0.708 0.232
#> SRR2105398 2 0.754 0.55944 0.332 0.612 0.056
#> SRR2105395 1 0.765 0.65062 0.672 0.220 0.108
#> SRR2105396 1 0.432 0.73226 0.860 0.112 0.028
#> SRR2105393 2 0.686 0.67710 0.128 0.740 0.132
#> SRR2105394 2 0.911 0.07495 0.424 0.436 0.140
#> SRR2105389 1 0.542 0.73444 0.820 0.080 0.100
#> SRR2105390 1 0.481 0.73266 0.832 0.140 0.028
#> SRR2105391 1 0.579 0.71406 0.772 0.192 0.036
#> SRR2105392 2 0.874 -0.00278 0.436 0.456 0.108
#> SRR2105385 1 0.195 0.71479 0.952 0.008 0.040
#> SRR2105386 1 0.290 0.72310 0.920 0.064 0.016
#> SRR2105387 2 0.527 0.62692 0.044 0.816 0.140
#> SRR2105388 2 0.837 0.29483 0.388 0.524 0.088
#> SRR2105381 2 0.516 0.59981 0.040 0.820 0.140
#> SRR2105382 1 0.511 0.67634 0.768 0.228 0.004
#> SRR2105383 2 0.771 0.35432 0.348 0.592 0.060
#> SRR2105384 2 0.770 0.66806 0.212 0.672 0.116
#> SRR2105379 2 0.497 0.62830 0.060 0.840 0.100
#> SRR2105380 1 0.315 0.73012 0.916 0.044 0.040
#> SRR2105377 2 0.778 0.66098 0.208 0.668 0.124
#> SRR2105378 1 0.401 0.73572 0.880 0.084 0.036
#> SRR2105375 2 0.823 0.30335 0.384 0.536 0.080
#> SRR2105376 2 0.827 0.52573 0.316 0.584 0.100
#> SRR2105373 1 0.517 0.74046 0.832 0.076 0.092
#> SRR2105374 1 0.236 0.71459 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105371 2 0.749 0.56700 0.340 0.608 0.052
#> SRR2105372 2 0.570 0.66693 0.148 0.796 0.056
#> SRR2105369 1 0.535 0.72562 0.796 0.176 0.028
#> SRR2105370 1 0.592 0.66097 0.724 0.260 0.016
#> SRR2105367 2 0.768 0.59795 0.252 0.656 0.092
#> SRR2105368 1 0.625 0.72069 0.776 0.116 0.108
#> SRR2105365 2 0.853 0.31314 0.376 0.524 0.100
#> SRR2105366 1 0.749 0.64914 0.676 0.232 0.092
#> SRR2105363 2 0.726 0.68124 0.216 0.696 0.088
#> SRR2105364 2 0.813 0.60784 0.284 0.612 0.104
#> SRR2105361 2 0.238 0.59061 0.008 0.936 0.056
#> SRR2105362 2 0.529 0.64646 0.064 0.824 0.112
#> SRR2105359 1 0.738 0.59793 0.660 0.272 0.068
#> SRR2105360 1 0.819 0.38232 0.572 0.340 0.088
#> SRR2105355 1 0.651 0.58021 0.688 0.284 0.028
#> SRR2105356 2 0.873 0.24213 0.388 0.500 0.112
#> SRR2105353 1 0.856 0.29373 0.488 0.416 0.096
#> SRR2105354 1 0.694 0.70415 0.724 0.188 0.088
#> SRR2105351 1 0.652 0.69108 0.752 0.168 0.080
#> SRR2105352 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105349 2 0.869 0.56133 0.308 0.560 0.132
#> SRR2105350 2 0.608 0.66432 0.128 0.784 0.088
#> SRR2105345 1 0.931 0.25138 0.480 0.348 0.172
#> SRR2105346 1 0.853 0.42885 0.548 0.344 0.108
#> SRR2105347 1 0.565 0.72605 0.808 0.108 0.084
#> SRR2105348 1 0.686 0.72344 0.740 0.128 0.132
#> SRR2105343 2 0.716 0.54675 0.332 0.628 0.040
#> SRR2105344 2 0.616 0.64886 0.092 0.780 0.128
#> SRR2105341 1 0.637 0.72554 0.764 0.152 0.084
#> SRR2105342 1 0.788 0.58381 0.640 0.260 0.100
#> SRR2105339 1 0.516 0.69592 0.820 0.140 0.040
#> SRR2105340 1 0.346 0.73311 0.904 0.036 0.060
#> SRR2105335 1 0.464 0.74223 0.848 0.116 0.036
#> SRR2105336 1 0.468 0.73733 0.848 0.040 0.112
#> SRR2105337 1 0.760 0.53024 0.660 0.252 0.088
#> SRR2105338 1 0.292 0.72438 0.924 0.032 0.044
#> SRR2105331 2 0.809 0.56195 0.308 0.600 0.092
#> SRR2105332 1 0.681 0.65030 0.732 0.184 0.084
#> SRR2105333 2 0.752 0.50360 0.116 0.688 0.196
#> SRR2105334 2 0.630 0.69171 0.164 0.764 0.072
#> SRR2105329 2 0.778 0.63564 0.256 0.648 0.096
#> SRR2105330 2 0.833 0.65506 0.248 0.616 0.136
#> SRR2105327 2 0.799 0.11205 0.456 0.484 0.060
#> SRR2105328 1 0.867 -0.12470 0.480 0.416 0.104
#> SRR2105325 1 0.203 0.71172 0.952 0.016 0.032
#> SRR2105326 1 0.175 0.71366 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105323 2 0.594 0.66718 0.120 0.792 0.088
#> SRR2105324 2 0.822 0.65944 0.212 0.636 0.152
#> SRR2105319 1 0.350 0.72731 0.880 0.004 0.116
#> SRR2105320 1 0.329 0.72099 0.900 0.012 0.088
#> SRR2105321 1 0.754 0.47449 0.652 0.272 0.076
#> SRR2105322 1 0.293 0.72669 0.924 0.036 0.040
#> SRR2105317 2 0.708 -0.13094 0.024 0.564 0.412
#> SRR2105318 2 0.415 0.62463 0.044 0.876 0.080
#> SRR2105315 2 0.391 0.60535 0.020 0.876 0.104
#> SRR2105316 2 0.745 0.04851 0.436 0.528 0.036
#> SRR2105313 2 0.549 0.66125 0.104 0.816 0.080
#> SRR2105314 2 0.274 0.60971 0.020 0.928 0.052
#> SRR2105311 2 0.841 0.59807 0.264 0.604 0.132
#> SRR2105312 1 0.907 0.05510 0.472 0.388 0.140
#> SRR2105307 2 0.884 0.46357 0.368 0.508 0.124
#> SRR2105308 2 0.784 0.51200 0.292 0.624 0.084
#> SRR2105309 2 0.435 0.58466 0.020 0.852 0.128
#> SRR2105310 1 0.723 0.20959 0.544 0.428 0.028
#> SRR2105305 1 0.831 0.43490 0.544 0.368 0.088
#> SRR2105306 2 0.902 0.19363 0.416 0.452 0.132
#> SRR2105303 2 0.721 0.64849 0.252 0.680 0.068
#> SRR2105304 3 0.440 0.94053 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105301 1 0.630 0.71033 0.764 0.164 0.072
#> SRR2105302 2 0.691 0.58390 0.308 0.656 0.036
#> SRR2105299 1 0.649 0.73102 0.760 0.144 0.096
#> SRR2105300 2 0.841 0.63105 0.244 0.612 0.144
#> SRR2105297 1 0.419 0.72997 0.876 0.068 0.056
#> SRR2105298 1 0.509 0.73514 0.836 0.076 0.088
#> SRR2105295 2 0.634 0.47332 0.028 0.708 0.264
#> SRR2105296 2 0.807 0.53833 0.276 0.620 0.104
#> SRR2105293 1 0.855 0.34030 0.532 0.364 0.104
#> SRR2105294 1 0.207 0.71624 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105291 1 0.353 0.73789 0.900 0.068 0.032
#> SRR2105292 1 0.747 0.64335 0.696 0.176 0.128
#> SRR2105289 1 0.846 0.30683 0.544 0.356 0.100
#> SRR2105290 1 0.459 0.73215 0.848 0.120 0.032
#> SRR2105287 1 0.877 0.36289 0.516 0.364 0.120
#> SRR2105288 1 0.230 0.72628 0.944 0.020 0.036
#> SRR2105285 2 0.494 0.61054 0.056 0.840 0.104
#> SRR2105286 2 0.542 0.65793 0.084 0.820 0.096
#> SRR2105283 2 0.894 0.49155 0.300 0.544 0.156
#> SRR2105284 1 0.525 0.73840 0.828 0.096 0.076
#> SRR2105281 1 0.804 0.43988 0.600 0.312 0.088
#> SRR2105282 2 0.782 0.65660 0.212 0.664 0.124
#> SRR2105259 2 0.543 0.66118 0.120 0.816 0.064
#> SRR2105260 2 0.372 0.60803 0.024 0.888 0.088
#> SRR2105279 2 0.505 0.57290 0.024 0.812 0.164
#> SRR2105280 2 0.531 0.67629 0.124 0.820 0.056
#> SRR2105257 1 0.249 0.72087 0.936 0.016 0.048
#> SRR2105258 1 0.611 0.71471 0.784 0.104 0.112
#> SRR2105253 1 0.879 -0.19174 0.460 0.428 0.112
#> SRR2105254 2 0.640 0.68733 0.192 0.748 0.060
#> SRR2105255 2 0.474 0.65155 0.084 0.852 0.064
#> SRR2105256 1 0.652 0.71005 0.752 0.168 0.080
#> SRR2105251 2 0.831 0.45488 0.368 0.544 0.088
#> SRR2105252 2 0.425 0.64094 0.048 0.872 0.080
#> SRR2105249 2 0.439 0.58317 0.012 0.840 0.148
#> SRR2105250 1 0.821 0.17026 0.468 0.460 0.072
#> SRR2105247 2 0.688 0.58649 0.304 0.660 0.036
#> SRR2105248 1 0.852 -0.19623 0.472 0.436 0.092
#> SRR2105245 2 0.832 0.18307 0.424 0.496 0.080
#> SRR2105246 1 0.459 0.72715 0.856 0.048 0.096
#> SRR2105243 1 0.748 0.56933 0.640 0.296 0.064
#> SRR2105244 2 0.813 0.32584 0.440 0.492 0.068
#> SRR2105241 1 0.380 0.72193 0.892 0.052 0.056
#> SRR2105242 1 0.558 0.74616 0.812 0.104 0.084
#> SRR2105239 2 0.753 0.48107 0.316 0.624 0.060
#> SRR2105240 1 0.210 0.71597 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105237 2 0.816 0.51120 0.348 0.568 0.084
#> SRR2105238 2 0.604 0.65312 0.100 0.788 0.112
#> SRR2105235 1 0.878 -0.16419 0.468 0.420 0.112
#> SRR2105236 1 0.669 0.71977 0.748 0.148 0.104
#> SRR2105233 2 0.852 0.62405 0.228 0.608 0.164
#> SRR2105234 2 0.487 0.56944 0.028 0.828 0.144
#> SRR2105231 2 0.463 0.63870 0.056 0.856 0.088
#> SRR2105232 2 0.864 0.50596 0.344 0.540 0.116
#> SRR2105227 2 0.787 0.35829 0.420 0.524 0.056
#> SRR2105228 1 0.731 0.63439 0.684 0.236 0.080
#> SRR2105225 2 0.884 0.01301 0.432 0.452 0.116
#> SRR2105226 1 0.734 0.63050 0.676 0.248 0.076
#> SRR2105229 1 0.605 0.64637 0.720 0.260 0.020
#> SRR2105230 1 0.579 0.73273 0.784 0.168 0.048
#> SRR2105219 2 0.771 0.55914 0.332 0.604 0.064
#> SRR2105220 1 0.807 0.10564 0.468 0.468 0.064
#> SRR2105221 1 0.218 0.72269 0.948 0.020 0.032
#> SRR2105222 1 0.639 0.72714 0.768 0.116 0.116
#> SRR2105223 1 0.270 0.72404 0.928 0.056 0.016
#> SRR2105224 1 0.498 0.73905 0.840 0.096 0.064
#> SRR2105217 1 0.895 -0.07013 0.476 0.396 0.128
#> SRR2105218 1 0.865 0.40308 0.576 0.284 0.140
#> SRR2105215 1 0.767 0.05205 0.500 0.456 0.044
#> SRR2105216 2 0.341 0.60655 0.028 0.904 0.068
#> SRR2105213 1 0.596 0.72345 0.792 0.100 0.108
#> SRR2105214 1 0.728 0.65943 0.708 0.176 0.116
#> SRR2105211 2 0.769 0.50385 0.316 0.616 0.068
#> SRR2105212 2 0.733 0.67292 0.156 0.708 0.136
#> SRR2105209 1 0.557 0.73805 0.812 0.108 0.080
#> SRR2105210 1 0.710 0.60202 0.692 0.240 0.068
#> SRR2105207 2 0.940 0.39442 0.344 0.472 0.184
#> SRR2105208 1 0.726 0.69664 0.712 0.164 0.124
#> SRR2105205 1 0.782 0.14151 0.564 0.376 0.060
#> SRR2105206 1 0.315 0.73017 0.916 0.048 0.036
#> SRR2105201 1 0.788 0.64486 0.668 0.172 0.160
#> SRR2105202 2 0.466 0.62827 0.048 0.852 0.100
#> SRR2105203 1 0.831 0.48272 0.576 0.324 0.100
#> SRR2105204 2 0.245 0.59630 0.012 0.936 0.052
#> SRR2105199 2 0.730 0.57864 0.252 0.676 0.072
#> SRR2105200 2 0.841 0.21929 0.380 0.528 0.092
#> SRR2105197 2 0.884 0.27969 0.352 0.520 0.128
#> SRR2105198 1 0.543 0.73733 0.820 0.088 0.092
#> SRR2105195 1 0.798 -0.12767 0.500 0.440 0.060
#> SRR2105196 1 0.256 0.72352 0.936 0.028 0.036
#> SRR2105193 1 0.547 0.73002 0.808 0.052 0.140
#> SRR2105194 1 0.116 0.70987 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105191 2 0.741 0.63615 0.256 0.668 0.076
#> SRR2105192 1 0.454 0.73452 0.860 0.084 0.056
#> SRR2105189 2 0.486 0.56428 0.012 0.808 0.180
#> SRR2105190 2 0.518 0.64389 0.084 0.832 0.084
#> SRR2105187 2 0.762 0.57531 0.348 0.596 0.056
#> SRR2105188 1 0.564 0.71574 0.788 0.172 0.040
#> SRR2105179 1 0.475 0.74046 0.852 0.072 0.076
#> SRR2105180 1 0.245 0.71435 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105183 1 0.884 -0.19198 0.452 0.432 0.116
#> SRR2105184 1 0.646 0.72774 0.764 0.124 0.112
#> SRR2105185 2 0.811 0.48125 0.312 0.596 0.092
#> SRR2105186 1 0.875 0.21165 0.492 0.396 0.112
#> SRR2105181 1 0.550 0.73102 0.804 0.148 0.048
#> SRR2105182 1 0.507 0.72923 0.828 0.128 0.044
#> SRR2105177 1 0.479 0.73841 0.848 0.056 0.096
#> SRR2105178 1 0.207 0.71417 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105171 1 0.831 0.31340 0.500 0.420 0.080
#> SRR2105172 2 0.713 0.67176 0.192 0.712 0.096
#> SRR2105175 1 0.374 0.72586 0.892 0.036 0.072
#> SRR2105176 1 0.141 0.70933 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105173 1 0.377 0.73026 0.888 0.084 0.028
#> SRR2105174 1 0.696 0.45560 0.648 0.316 0.036
#> SRR2105169 2 0.862 0.30313 0.420 0.480 0.100
#> SRR2105170 1 0.738 0.52299 0.672 0.252 0.076
#> SRR2105167 2 0.755 0.26765 0.372 0.580 0.048
#> SRR2105168 2 0.676 0.67380 0.148 0.744 0.108
#> SRR2105165 1 0.456 0.73672 0.856 0.100 0.044
#> SRR2105166 1 0.305 0.72575 0.916 0.064 0.020
#> SRR2105163 1 0.697 0.70060 0.728 0.168 0.104
#> SRR2105164 1 0.365 0.73054 0.896 0.036 0.068
#> SRR2105161 1 0.588 0.73364 0.796 0.112 0.092
#> SRR2105162 1 0.547 0.73092 0.816 0.072 0.112
#> SRR2105155 1 0.752 0.37872 0.588 0.364 0.048
#> SRR2105156 1 0.763 0.61742 0.668 0.232 0.100
#> SRR2105157 1 0.461 0.73463 0.856 0.092 0.052
#> SRR2105158 1 0.687 0.62090 0.724 0.196 0.080
#> SRR2105159 1 0.829 0.56613 0.624 0.236 0.140
#> SRR2105160 1 0.823 0.58412 0.608 0.280 0.112
#> SRR2105153 2 0.884 0.30573 0.424 0.460 0.116
#> SRR2105154 1 0.864 0.04825 0.500 0.396 0.104
#> SRR2105151 1 0.828 -0.11469 0.464 0.460 0.076
#> SRR2105152 2 0.441 0.60050 0.016 0.844 0.140
#> SRR2105149 1 0.635 0.69645 0.744 0.204 0.052
#> SRR2105150 1 0.704 0.07328 0.532 0.448 0.020
#> SRR2105147 3 0.566 0.85844 0.012 0.248 0.740
#> SRR2105148 3 0.621 0.72635 0.004 0.368 0.628
#> SRR2105143 1 0.570 0.72884 0.800 0.136 0.064
#> SRR2105144 2 0.830 0.12957 0.412 0.508 0.080
#> SRR2105145 1 0.336 0.72781 0.900 0.016 0.084
#> SRR2105146 1 0.223 0.71462 0.944 0.012 0.044
#> SRR2105141 2 0.807 0.60085 0.284 0.616 0.100
#> SRR2105142 1 0.787 0.08453 0.552 0.388 0.060
#> SRR2105139 2 0.689 0.68853 0.212 0.716 0.072
#> SRR2105140 1 0.665 0.65667 0.712 0.240 0.048
#> SRR2105137 2 0.730 0.58477 0.228 0.688 0.084
#> SRR2105138 1 0.687 0.71265 0.736 0.160 0.104
#> SRR2105135 2 0.908 0.35489 0.340 0.508 0.152
#> SRR2105136 2 0.433 0.61276 0.036 0.864 0.100
#> SRR2105133 2 0.639 0.68392 0.148 0.764 0.088
#> SRR2105134 1 0.783 0.50058 0.592 0.340 0.068
#> SRR2105131 2 0.681 0.61971 0.220 0.716 0.064
#> SRR2105132 1 0.608 0.72310 0.784 0.128 0.088
#> SRR2105129 1 0.255 0.72626 0.936 0.040 0.024
#> SRR2105130 1 0.662 0.69128 0.748 0.164 0.088
#> SRR2105127 1 0.448 0.73637 0.864 0.068 0.068
#> SRR2105128 1 0.678 0.69353 0.744 0.140 0.116
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 1 0.928 -0.26359 0.352 0.344 0.208 0.096
#> SRR2105278 2 0.825 0.24343 0.152 0.472 0.332 0.044
#> SRR2105275 3 0.891 0.19507 0.344 0.216 0.380 0.060
#> SRR2105276 1 0.675 0.32703 0.540 0.060 0.384 0.016
#> SRR2105273 1 0.458 0.56296 0.820 0.064 0.100 0.016
#> SRR2105274 1 0.194 0.55187 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105271 2 0.739 0.22318 0.132 0.548 0.304 0.016
#> SRR2105272 1 0.543 0.53999 0.728 0.032 0.220 0.020
#> SRR2105269 2 0.595 0.50208 0.008 0.716 0.144 0.132
#> SRR2105270 2 0.790 0.13979 0.272 0.500 0.212 0.016
#> SRR2105267 2 0.512 0.51056 0.012 0.780 0.076 0.132
#> SRR2105268 2 0.894 0.31834 0.092 0.408 0.348 0.152
#> SRR2105265 2 0.762 0.50953 0.072 0.624 0.152 0.152
#> SRR2105266 2 0.682 0.26496 0.284 0.616 0.072 0.028
#> SRR2105263 1 0.839 -0.25535 0.344 0.316 0.324 0.016
#> SRR2105264 1 0.654 0.48088 0.660 0.148 0.184 0.008
#> SRR2105261 2 0.649 0.51613 0.072 0.712 0.144 0.072
#> SRR2105262 3 0.804 0.11172 0.124 0.388 0.448 0.040
#> SRR2105357 2 0.405 0.49890 0.004 0.824 0.144 0.028
#> SRR2105358 1 0.860 0.03846 0.468 0.292 0.180 0.060
#> SRR2105439 2 0.865 0.27611 0.148 0.500 0.260 0.092
#> SRR2105440 1 0.858 -0.15322 0.416 0.308 0.240 0.036
#> SRR2105509 4 0.381 0.80684 0.000 0.140 0.028 0.832
#> SRR2105510 2 0.471 0.50778 0.000 0.788 0.072 0.140
#> SRR2105507 1 0.560 0.55846 0.760 0.032 0.140 0.068
#> SRR2105508 1 0.680 0.38291 0.636 0.232 0.116 0.016
#> SRR2105505 1 0.779 0.37295 0.580 0.168 0.208 0.044
#> SRR2105506 1 0.675 0.51607 0.680 0.064 0.188 0.068
#> SRR2105503 2 0.763 0.49839 0.096 0.632 0.144 0.128
#> SRR2105504 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105501 2 0.757 0.38408 0.276 0.580 0.076 0.068
#> SRR2105502 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105499 1 0.691 0.39624 0.584 0.088 0.312 0.016
#> SRR2105500 2 0.625 0.46249 0.048 0.656 0.272 0.024
#> SRR2105497 1 0.685 0.45628 0.628 0.092 0.256 0.024
#> SRR2105498 2 0.854 0.16351 0.296 0.432 0.236 0.036
#> SRR2105495 1 0.694 0.23237 0.556 0.348 0.080 0.016
#> SRR2105496 2 0.918 0.34117 0.136 0.420 0.304 0.140
#> SRR2105493 1 0.500 0.54899 0.792 0.092 0.104 0.012
#> SRR2105494 1 0.629 0.51586 0.704 0.092 0.176 0.028
#> SRR2105491 3 0.830 0.17638 0.348 0.212 0.416 0.024
#> SRR2105492 1 0.593 0.27880 0.560 0.020 0.408 0.012
#> SRR2105489 1 0.716 0.41429 0.588 0.144 0.256 0.012
#> SRR2105490 2 0.763 0.45242 0.056 0.564 0.292 0.088
#> SRR2105487 3 0.787 0.30689 0.164 0.328 0.488 0.020
#> SRR2105488 1 0.834 -0.14880 0.380 0.288 0.316 0.016
#> SRR2105485 2 0.716 0.16996 0.256 0.600 0.124 0.020
#> SRR2105486 1 0.760 0.37133 0.608 0.224 0.084 0.084
#> SRR2105483 3 0.589 -0.12822 0.464 0.020 0.508 0.008
#> SRR2105484 1 0.456 0.36165 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105481 1 0.468 0.56554 0.812 0.100 0.076 0.012
#> SRR2105482 1 0.650 0.32254 0.568 0.072 0.356 0.004
#> SRR2105479 2 0.720 0.06501 0.412 0.464 0.120 0.004
#> SRR2105480 1 0.412 0.51480 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR2105477 2 0.805 0.22566 0.052 0.440 0.404 0.104
#> SRR2105478 2 0.825 0.22807 0.160 0.488 0.308 0.044
#> SRR2105475 2 0.713 0.49731 0.152 0.668 0.096 0.084
#> SRR2105476 2 0.655 0.51322 0.092 0.716 0.088 0.104
#> SRR2105473 3 0.875 0.15285 0.384 0.124 0.400 0.092
#> SRR2105474 1 0.695 0.52359 0.684 0.076 0.128 0.112
#> SRR2105471 1 0.859 0.26520 0.536 0.156 0.192 0.116
#> SRR2105472 3 0.865 0.34850 0.148 0.192 0.532 0.128
#> SRR2105469 2 0.872 0.44675 0.144 0.528 0.160 0.168
#> SRR2105470 1 0.662 0.47395 0.668 0.116 0.196 0.020
#> SRR2105467 1 0.699 0.18018 0.564 0.156 0.280 0.000
#> SRR2105468 1 0.774 0.34652 0.564 0.136 0.260 0.040
#> SRR2105465 1 0.567 0.48324 0.724 0.096 0.176 0.004
#> SRR2105466 1 0.366 0.55443 0.864 0.016 0.096 0.024
#> SRR2105463 1 0.733 -0.07488 0.444 0.156 0.400 0.000
#> SRR2105464 1 0.451 0.47846 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR2105461 2 0.583 0.47908 0.012 0.676 0.044 0.268
#> SRR2105462 2 0.793 -0.20209 0.380 0.432 0.172 0.016
#> SRR2105459 2 0.603 0.49304 0.000 0.684 0.192 0.124
#> SRR2105460 2 0.487 0.50299 0.000 0.776 0.076 0.148
#> SRR2105457 2 0.522 0.49228 0.172 0.764 0.044 0.020
#> SRR2105458 2 0.316 0.51197 0.036 0.896 0.052 0.016
#> SRR2105455 2 0.678 0.49424 0.084 0.696 0.084 0.136
#> SRR2105456 1 0.914 -0.13764 0.408 0.320 0.164 0.108
#> SRR2105453 3 0.870 0.09626 0.224 0.340 0.392 0.044
#> SRR2105454 3 0.686 0.38266 0.144 0.248 0.604 0.004
#> SRR2105451 2 0.795 0.08111 0.272 0.492 0.220 0.016
#> SRR2105452 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105449 2 0.838 -0.13665 0.340 0.344 0.300 0.016
#> SRR2105450 1 0.248 0.54717 0.904 0.008 0.088 0.000
#> SRR2105447 2 0.906 -0.15657 0.344 0.368 0.216 0.072
#> SRR2105448 2 0.568 0.51257 0.048 0.768 0.084 0.100
#> SRR2105445 3 0.841 0.23462 0.356 0.268 0.356 0.020
#> SRR2105446 2 0.583 0.50927 0.028 0.736 0.168 0.068
#> SRR2105443 2 0.734 0.40187 0.256 0.596 0.032 0.116
#> SRR2105444 1 0.750 0.35726 0.592 0.208 0.172 0.028
#> SRR2105441 1 0.703 0.39766 0.604 0.164 0.224 0.008
#> SRR2105442 2 0.570 0.47730 0.056 0.700 0.236 0.008
#> SRR2105437 1 0.556 0.30260 0.580 0.016 0.400 0.004
#> SRR2105438 1 0.531 0.38361 0.652 0.008 0.328 0.012
#> SRR2105435 1 0.336 0.56409 0.876 0.084 0.036 0.004
#> SRR2105436 1 0.456 0.55556 0.796 0.064 0.140 0.000
#> SRR2105433 1 0.457 0.52430 0.808 0.116 0.072 0.004
#> SRR2105434 2 0.795 0.18826 0.248 0.480 0.260 0.012
#> SRR2105431 1 0.716 0.39924 0.592 0.096 0.284 0.028
#> SRR2105432 1 0.677 0.46319 0.620 0.084 0.276 0.020
#> SRR2105429 1 0.515 0.56103 0.780 0.136 0.068 0.016
#> SRR2105430 2 0.694 0.46427 0.124 0.664 0.172 0.040
#> SRR2105427 2 0.852 0.09080 0.384 0.404 0.160 0.052
#> SRR2105428 2 0.650 0.48160 0.184 0.676 0.124 0.016
#> SRR2105425 2 0.796 0.00637 0.212 0.504 0.264 0.020
#> SRR2105426 2 0.591 0.48929 0.116 0.724 0.148 0.012
#> SRR2105421 2 0.763 0.50189 0.096 0.632 0.144 0.128
#> SRR2105422 1 0.838 0.08233 0.476 0.332 0.124 0.068
#> SRR2105423 2 0.817 0.43665 0.196 0.560 0.068 0.176
#> SRR2105424 2 0.588 0.50464 0.020 0.736 0.140 0.104
#> SRR2105419 2 0.544 0.47311 0.096 0.760 0.132 0.012
#> SRR2105420 2 0.716 0.27802 0.244 0.600 0.140 0.016
#> SRR2105415 1 0.541 0.49643 0.740 0.108 0.152 0.000
#> SRR2105416 1 0.454 0.50472 0.720 0.008 0.272 0.000
#> SRR2105417 3 0.780 0.38624 0.228 0.276 0.488 0.008
#> SRR2105418 1 0.618 0.19098 0.488 0.040 0.468 0.004
#> SRR2105413 2 0.377 0.51320 0.048 0.872 0.036 0.044
#> SRR2105414 2 0.822 0.43784 0.120 0.580 0.140 0.160
#> SRR2105409 3 0.834 0.25249 0.220 0.352 0.404 0.024
#> SRR2105410 1 0.854 0.12615 0.496 0.232 0.212 0.060
#> SRR2105411 3 0.871 0.06867 0.184 0.364 0.396 0.056
#> SRR2105412 2 0.842 0.03601 0.280 0.484 0.188 0.048
#> SRR2105407 2 0.914 0.21305 0.252 0.444 0.196 0.108
#> SRR2105408 2 0.675 0.48679 0.012 0.648 0.180 0.160
#> SRR2105403 1 0.899 -0.23468 0.360 0.316 0.268 0.056
#> SRR2105404 2 0.700 0.30342 0.188 0.612 0.192 0.008
#> SRR2105405 2 0.842 0.05293 0.164 0.416 0.376 0.044
#> SRR2105406 1 0.750 0.38858 0.600 0.188 0.180 0.032
#> SRR2105401 2 0.613 0.50148 0.004 0.692 0.160 0.144
#> SRR2105402 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105399 2 0.595 0.49725 0.008 0.716 0.136 0.140
#> SRR2105400 2 0.494 0.48894 0.004 0.756 0.040 0.200
#> SRR2105397 2 0.693 0.49192 0.020 0.640 0.140 0.200
#> SRR2105398 2 0.694 0.32105 0.324 0.584 0.040 0.052
#> SRR2105395 1 0.768 0.18603 0.492 0.148 0.344 0.016
#> SRR2105396 1 0.356 0.55523 0.872 0.072 0.048 0.008
#> SRR2105393 2 0.804 0.47468 0.080 0.568 0.236 0.116
#> SRR2105394 1 0.934 -0.12582 0.380 0.328 0.140 0.152
#> SRR2105389 1 0.597 0.54108 0.732 0.052 0.168 0.048
#> SRR2105390 1 0.496 0.54092 0.780 0.076 0.140 0.004
#> SRR2105391 1 0.620 0.50887 0.704 0.180 0.096 0.020
#> SRR2105392 2 0.894 -0.18339 0.312 0.380 0.252 0.056
#> SRR2105385 1 0.277 0.55168 0.880 0.004 0.116 0.000
#> SRR2105386 1 0.180 0.54098 0.948 0.016 0.032 0.004
#> SRR2105387 2 0.626 0.34823 0.004 0.560 0.384 0.052
#> SRR2105388 2 0.925 -0.00907 0.292 0.408 0.192 0.108
#> SRR2105381 2 0.453 0.50418 0.004 0.776 0.196 0.024
#> SRR2105382 1 0.454 0.50350 0.768 0.208 0.020 0.004
#> SRR2105383 2 0.797 -0.08179 0.220 0.464 0.304 0.012
#> SRR2105384 2 0.889 0.31614 0.152 0.480 0.256 0.112
#> SRR2105379 2 0.571 0.48938 0.048 0.752 0.152 0.048
#> SRR2105380 1 0.434 0.55232 0.784 0.012 0.196 0.008
#> SRR2105377 2 0.776 0.29933 0.124 0.492 0.356 0.028
#> SRR2105378 1 0.472 0.53442 0.768 0.032 0.196 0.004
#> SRR2105375 2 0.826 -0.14037 0.224 0.416 0.340 0.020
#> SRR2105376 3 0.825 0.06704 0.196 0.388 0.392 0.024
#> SRR2105373 1 0.597 0.54406 0.704 0.044 0.220 0.032
#> SRR2105374 1 0.455 0.48578 0.732 0.000 0.256 0.012
#> SRR2105371 2 0.723 0.33176 0.304 0.580 0.076 0.040
#> SRR2105372 2 0.713 0.37503 0.112 0.644 0.200 0.044
#> SRR2105369 1 0.485 0.55480 0.796 0.116 0.080 0.008
#> SRR2105370 1 0.607 0.44238 0.680 0.244 0.060 0.016
#> SRR2105367 3 0.751 0.28573 0.104 0.344 0.524 0.028
#> SRR2105368 1 0.748 0.10078 0.440 0.096 0.440 0.024
#> SRR2105365 3 0.690 0.40047 0.132 0.220 0.632 0.016
#> SRR2105366 1 0.772 0.14560 0.496 0.156 0.332 0.016
#> SRR2105363 2 0.808 0.49087 0.160 0.592 0.112 0.136
#> SRR2105364 2 0.789 0.38093 0.244 0.568 0.132 0.056
#> SRR2105361 2 0.457 0.43560 0.004 0.748 0.236 0.012
#> SRR2105362 2 0.678 0.41578 0.024 0.592 0.320 0.064
#> SRR2105359 1 0.758 0.16520 0.544 0.288 0.148 0.020
#> SRR2105360 1 0.842 0.03015 0.488 0.272 0.192 0.048
#> SRR2105355 1 0.621 0.41166 0.660 0.264 0.060 0.016
#> SRR2105356 2 0.889 -0.15471 0.348 0.388 0.200 0.064
#> SRR2105353 3 0.837 0.33794 0.292 0.280 0.408 0.020
#> SRR2105354 1 0.654 0.50530 0.660 0.148 0.184 0.008
#> SRR2105351 1 0.593 0.50396 0.724 0.164 0.096 0.016
#> SRR2105352 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105349 2 0.780 0.36225 0.276 0.564 0.092 0.068
#> SRR2105350 2 0.633 0.51416 0.112 0.728 0.064 0.096
#> SRR2105345 1 0.963 -0.34787 0.308 0.264 0.304 0.124
#> SRR2105346 1 0.827 -0.07018 0.432 0.212 0.332 0.024
#> SRR2105347 1 0.664 0.39522 0.648 0.056 0.256 0.040
#> SRR2105348 1 0.755 0.39224 0.588 0.108 0.256 0.048
#> SRR2105343 2 0.683 0.36043 0.280 0.616 0.080 0.024
#> SRR2105344 2 0.753 0.50652 0.048 0.616 0.172 0.164
#> SRR2105341 1 0.633 0.54049 0.712 0.136 0.120 0.032
#> SRR2105342 1 0.794 0.31122 0.576 0.148 0.216 0.060
#> SRR2105339 1 0.424 0.53253 0.824 0.136 0.020 0.020
#> SRR2105340 1 0.401 0.56753 0.856 0.032 0.080 0.032
#> SRR2105335 1 0.429 0.57074 0.828 0.080 0.088 0.004
#> SRR2105336 1 0.595 0.52186 0.684 0.024 0.252 0.040
#> SRR2105337 1 0.689 0.39246 0.652 0.224 0.048 0.076
#> SRR2105338 1 0.220 0.54711 0.936 0.012 0.024 0.028
#> SRR2105331 2 0.822 0.31573 0.208 0.540 0.196 0.056
#> SRR2105332 1 0.700 0.39391 0.600 0.144 0.248 0.008
#> SRR2105333 2 0.613 0.46815 0.100 0.712 0.020 0.168
#> SRR2105334 2 0.603 0.52648 0.124 0.744 0.076 0.056
#> SRR2105329 2 0.763 0.43062 0.212 0.612 0.088 0.088
#> SRR2105330 2 0.855 0.41080 0.184 0.524 0.208 0.084
#> SRR2105327 2 0.818 -0.14362 0.372 0.408 0.200 0.020
#> SRR2105328 1 0.868 -0.18483 0.420 0.332 0.196 0.052
#> SRR2105325 1 0.284 0.54174 0.884 0.004 0.108 0.004
#> SRR2105326 1 0.389 0.52152 0.804 0.000 0.184 0.012
#> SRR2105323 2 0.737 0.50151 0.056 0.624 0.216 0.104
#> SRR2105324 3 0.884 -0.22587 0.128 0.356 0.416 0.100
#> SRR2105319 1 0.423 0.55170 0.804 0.004 0.168 0.024
#> SRR2105320 1 0.502 0.47948 0.684 0.004 0.300 0.012
#> SRR2105321 1 0.807 0.14437 0.512 0.184 0.272 0.032
#> SRR2105322 1 0.466 0.45815 0.724 0.008 0.264 0.004
#> SRR2105317 2 0.767 -0.00320 0.012 0.440 0.148 0.400
#> SRR2105318 2 0.660 0.43236 0.024 0.652 0.244 0.080
#> SRR2105315 2 0.333 0.51415 0.004 0.876 0.032 0.088
#> SRR2105316 2 0.816 -0.19782 0.320 0.412 0.256 0.012
#> SRR2105313 2 0.536 0.50440 0.040 0.776 0.136 0.048
#> SRR2105314 2 0.429 0.50181 0.004 0.808 0.156 0.032
#> SRR2105311 2 0.772 0.39009 0.156 0.592 0.204 0.048
#> SRR2105312 3 0.752 0.35472 0.232 0.176 0.572 0.020
#> SRR2105307 3 0.895 0.09522 0.216 0.340 0.380 0.064
#> SRR2105308 2 0.795 0.01846 0.156 0.468 0.352 0.024
#> SRR2105309 2 0.510 0.50873 0.008 0.768 0.060 0.164
#> SRR2105310 1 0.711 0.05330 0.488 0.424 0.056 0.032
#> SRR2105305 1 0.883 -0.19732 0.376 0.244 0.332 0.048
#> SRR2105306 2 0.929 -0.06152 0.352 0.364 0.156 0.128
#> SRR2105303 2 0.704 0.40438 0.184 0.632 0.164 0.020
#> SRR2105304 4 0.172 0.91505 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105301 1 0.629 0.50839 0.712 0.088 0.164 0.036
#> SRR2105302 2 0.634 0.37921 0.252 0.656 0.080 0.012
#> SRR2105299 1 0.750 0.40496 0.580 0.108 0.272 0.040
#> SRR2105300 2 0.893 0.32022 0.204 0.464 0.244 0.088
#> SRR2105297 1 0.527 0.37309 0.656 0.024 0.320 0.000
#> SRR2105298 1 0.662 0.28422 0.532 0.044 0.404 0.020
#> SRR2105295 2 0.596 0.45437 0.016 0.624 0.028 0.332
#> SRR2105296 2 0.791 0.04170 0.144 0.488 0.340 0.028
#> SRR2105293 3 0.784 0.27486 0.332 0.228 0.436 0.004
#> SRR2105294 1 0.407 0.53861 0.792 0.008 0.196 0.004
#> SRR2105291 1 0.334 0.56776 0.884 0.052 0.056 0.008
#> SRR2105292 3 0.639 0.11788 0.360 0.064 0.572 0.004
#> SRR2105289 1 0.805 0.18220 0.520 0.292 0.044 0.144
#> SRR2105290 1 0.514 0.55373 0.788 0.080 0.112 0.020
#> SRR2105287 3 0.840 0.25859 0.336 0.220 0.416 0.028
#> SRR2105288 1 0.299 0.55887 0.892 0.008 0.084 0.016
#> SRR2105285 2 0.629 0.51421 0.044 0.720 0.144 0.092
#> SRR2105286 2 0.466 0.51080 0.040 0.808 0.132 0.020
#> SRR2105283 3 0.708 0.34075 0.136 0.256 0.596 0.012
#> SRR2105284 1 0.536 0.55949 0.788 0.084 0.080 0.048
#> SRR2105281 1 0.870 0.03922 0.492 0.224 0.208 0.076
#> SRR2105282 2 0.856 0.46347 0.124 0.544 0.168 0.164
#> SRR2105259 2 0.622 0.45212 0.064 0.692 0.216 0.028
#> SRR2105260 2 0.577 0.47957 0.012 0.692 0.248 0.048
#> SRR2105279 2 0.674 0.49762 0.012 0.648 0.192 0.148
#> SRR2105280 2 0.578 0.50651 0.092 0.760 0.104 0.044
#> SRR2105257 1 0.345 0.54690 0.828 0.000 0.168 0.004
#> SRR2105258 1 0.711 0.16459 0.460 0.060 0.452 0.028
#> SRR2105253 1 0.866 -0.21047 0.412 0.376 0.076 0.136
#> SRR2105254 2 0.699 0.49220 0.152 0.672 0.120 0.056
#> SRR2105255 2 0.635 0.51703 0.064 0.704 0.184 0.048
#> SRR2105256 1 0.669 0.49078 0.672 0.100 0.196 0.032
#> SRR2105251 2 0.876 0.22044 0.280 0.480 0.140 0.100
#> SRR2105252 2 0.595 0.42196 0.012 0.636 0.316 0.036
#> SRR2105249 2 0.534 0.49273 0.000 0.744 0.100 0.156
#> SRR2105250 1 0.830 -0.21077 0.364 0.364 0.256 0.016
#> SRR2105247 2 0.658 0.38336 0.224 0.652 0.112 0.012
#> SRR2105248 3 0.872 0.27477 0.344 0.248 0.368 0.040
#> SRR2105245 3 0.946 0.29728 0.296 0.272 0.332 0.100
#> SRR2105246 1 0.416 0.56209 0.848 0.040 0.028 0.084
#> SRR2105243 1 0.774 0.36213 0.600 0.220 0.088 0.092
#> SRR2105244 2 0.792 0.01187 0.400 0.424 0.156 0.020
#> SRR2105241 1 0.219 0.54632 0.932 0.044 0.004 0.020
#> SRR2105242 1 0.582 0.56363 0.736 0.060 0.172 0.032
#> SRR2105239 2 0.823 -0.19654 0.200 0.432 0.344 0.024
#> SRR2105240 1 0.205 0.55004 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR2105237 2 0.847 0.22106 0.244 0.456 0.264 0.036
#> SRR2105238 2 0.724 0.47872 0.044 0.628 0.220 0.108
#> SRR2105235 1 0.858 -0.11411 0.432 0.356 0.064 0.148
#> SRR2105236 1 0.662 0.53107 0.704 0.136 0.100 0.060
#> SRR2105233 2 0.862 0.38755 0.172 0.532 0.112 0.184
#> SRR2105234 2 0.539 0.50574 0.008 0.756 0.088 0.148
#> SRR2105231 2 0.579 0.40166 0.024 0.672 0.280 0.024
#> SRR2105232 2 0.838 0.23132 0.248 0.476 0.240 0.036
#> SRR2105227 2 0.860 0.07094 0.296 0.396 0.276 0.032
#> SRR2105228 1 0.769 0.39676 0.620 0.168 0.132 0.080
#> SRR2105225 1 0.954 -0.20339 0.360 0.288 0.228 0.124
#> SRR2105226 1 0.826 0.31186 0.544 0.212 0.180 0.064
#> SRR2105229 1 0.539 0.47996 0.720 0.224 0.052 0.004
#> SRR2105230 1 0.581 0.54273 0.720 0.140 0.136 0.004
#> SRR2105219 2 0.699 0.32628 0.336 0.572 0.044 0.048
#> SRR2105220 3 0.817 0.28898 0.320 0.300 0.372 0.008
#> SRR2105221 1 0.139 0.54186 0.964 0.012 0.016 0.008
#> SRR2105222 3 0.619 0.12406 0.368 0.016 0.584 0.032
#> SRR2105223 1 0.275 0.55573 0.908 0.032 0.056 0.004
#> SRR2105224 1 0.448 0.56823 0.808 0.088 0.104 0.000
#> SRR2105217 3 0.885 0.20016 0.364 0.180 0.388 0.068
#> SRR2105218 1 0.886 0.16195 0.500 0.220 0.124 0.156
#> SRR2105215 2 0.771 -0.15582 0.412 0.412 0.168 0.008
#> SRR2105216 2 0.373 0.49612 0.000 0.848 0.108 0.044
#> SRR2105213 1 0.624 0.48511 0.648 0.064 0.276 0.012
#> SRR2105214 1 0.766 0.40600 0.628 0.152 0.124 0.096
#> SRR2105211 2 0.758 0.06196 0.224 0.512 0.260 0.004
#> SRR2105212 2 0.786 0.28667 0.084 0.504 0.352 0.060
#> SRR2105209 1 0.644 0.51534 0.668 0.068 0.236 0.028
#> SRR2105210 3 0.686 0.15611 0.404 0.080 0.508 0.008
#> SRR2105207 3 0.609 0.33820 0.076 0.148 0.732 0.044
#> SRR2105208 1 0.725 0.25098 0.500 0.080 0.396 0.024
#> SRR2105205 1 0.794 -0.06670 0.488 0.288 0.208 0.016
#> SRR2105206 1 0.423 0.53708 0.804 0.024 0.168 0.004
#> SRR2105201 1 0.797 0.32991 0.568 0.068 0.240 0.124
#> SRR2105202 2 0.591 0.46047 0.024 0.652 0.300 0.024
#> SRR2105203 1 0.913 -0.06593 0.420 0.224 0.268 0.088
#> SRR2105204 2 0.486 0.44712 0.008 0.764 0.196 0.032
#> SRR2105199 2 0.804 0.20395 0.156 0.508 0.300 0.036
#> SRR2105200 2 0.840 -0.31185 0.240 0.404 0.332 0.024
#> SRR2105197 3 0.829 0.24490 0.152 0.320 0.480 0.048
#> SRR2105198 1 0.685 0.49638 0.672 0.064 0.192 0.072
#> SRR2105195 1 0.810 -0.29377 0.388 0.224 0.376 0.012
#> SRR2105196 1 0.308 0.55529 0.884 0.032 0.084 0.000
#> SRR2105193 1 0.605 0.49961 0.672 0.036 0.264 0.028
#> SRR2105194 1 0.202 0.54728 0.932 0.000 0.056 0.012
#> SRR2105191 2 0.788 0.30081 0.216 0.568 0.172 0.044
#> SRR2105192 1 0.526 0.53430 0.728 0.060 0.212 0.000
#> SRR2105189 2 0.501 0.50644 0.000 0.772 0.120 0.108
#> SRR2105190 2 0.566 0.52139 0.028 0.760 0.104 0.108
#> SRR2105187 2 0.862 -0.11902 0.260 0.360 0.348 0.032
#> SRR2105188 1 0.680 0.36079 0.588 0.100 0.304 0.008
#> SRR2105179 1 0.522 0.57153 0.788 0.036 0.120 0.056
#> SRR2105180 1 0.475 0.46691 0.688 0.000 0.304 0.008
#> SRR2105183 2 0.843 0.11930 0.384 0.420 0.056 0.140
#> SRR2105184 1 0.752 0.47064 0.620 0.100 0.208 0.072
#> SRR2105185 2 0.942 -0.04437 0.256 0.368 0.272 0.104
#> SRR2105186 1 0.884 -0.15296 0.408 0.280 0.260 0.052
#> SRR2105181 1 0.620 0.40991 0.612 0.076 0.312 0.000
#> SRR2105182 1 0.385 0.56001 0.860 0.088 0.028 0.024
#> SRR2105177 1 0.580 0.49027 0.652 0.032 0.304 0.012
#> SRR2105178 1 0.470 0.35692 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105171 1 0.806 -0.11301 0.408 0.364 0.216 0.012
#> SRR2105172 2 0.833 0.43068 0.140 0.568 0.168 0.124
#> SRR2105175 1 0.525 0.28414 0.552 0.000 0.440 0.008
#> SRR2105176 1 0.354 0.51403 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR2105173 1 0.256 0.55416 0.920 0.040 0.032 0.008
#> SRR2105174 1 0.561 0.33513 0.664 0.300 0.016 0.020
#> SRR2105169 2 0.839 -0.06657 0.364 0.396 0.212 0.028
#> SRR2105170 1 0.716 0.37652 0.624 0.216 0.132 0.028
#> SRR2105167 2 0.794 -0.09005 0.268 0.480 0.240 0.012
#> SRR2105168 3 0.700 -0.09821 0.056 0.368 0.544 0.032
#> SRR2105165 1 0.522 0.38886 0.664 0.016 0.316 0.004
#> SRR2105166 1 0.384 0.54509 0.836 0.036 0.128 0.000
#> SRR2105163 1 0.727 0.38997 0.576 0.100 0.296 0.028
#> SRR2105164 1 0.516 0.52552 0.700 0.024 0.272 0.004
#> SRR2105161 1 0.730 0.42208 0.608 0.124 0.236 0.032
#> SRR2105162 1 0.601 0.24816 0.516 0.016 0.452 0.016
#> SRR2105155 1 0.804 0.18949 0.544 0.260 0.144 0.052
#> SRR2105156 1 0.670 0.45449 0.660 0.176 0.016 0.148
#> SRR2105157 1 0.496 0.56491 0.788 0.080 0.124 0.008
#> SRR2105158 1 0.727 0.27862 0.544 0.140 0.308 0.008
#> SRR2105159 3 0.588 0.39131 0.216 0.056 0.708 0.020
#> SRR2105160 3 0.843 0.27567 0.312 0.236 0.424 0.028
#> SRR2105153 2 0.889 0.14316 0.352 0.416 0.120 0.112
#> SRR2105154 3 0.817 0.28194 0.324 0.172 0.472 0.032
#> SRR2105151 2 0.869 -0.13633 0.340 0.396 0.220 0.044
#> SRR2105152 2 0.593 0.50925 0.004 0.700 0.196 0.100
#> SRR2105149 1 0.579 0.53057 0.736 0.164 0.080 0.020
#> SRR2105150 1 0.660 0.06220 0.540 0.392 0.056 0.012
#> SRR2105147 4 0.383 0.77171 0.004 0.204 0.000 0.792
#> SRR2105148 4 0.448 0.65475 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR2105143 1 0.660 0.15062 0.504 0.052 0.432 0.012
#> SRR2105144 2 0.784 -0.17711 0.332 0.436 0.228 0.004
#> SRR2105145 1 0.444 0.55546 0.816 0.028 0.136 0.020
#> SRR2105146 1 0.299 0.54981 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR2105141 2 0.737 0.38341 0.196 0.608 0.168 0.028
#> SRR2105142 1 0.745 -0.06465 0.480 0.396 0.104 0.020
#> SRR2105139 2 0.700 0.49552 0.168 0.668 0.056 0.108
#> SRR2105140 1 0.640 0.48630 0.712 0.156 0.080 0.052
#> SRR2105137 2 0.822 0.00707 0.156 0.436 0.372 0.036
#> SRR2105138 1 0.710 0.50068 0.660 0.104 0.176 0.060
#> SRR2105135 2 0.931 -0.06549 0.232 0.360 0.316 0.092
#> SRR2105136 2 0.645 0.46625 0.020 0.676 0.208 0.096
#> SRR2105133 2 0.618 0.48061 0.092 0.688 0.208 0.012
#> SRR2105134 1 0.726 0.34370 0.572 0.304 0.096 0.028
#> SRR2105131 2 0.725 0.08865 0.096 0.500 0.388 0.016
#> SRR2105132 1 0.614 0.52460 0.696 0.084 0.204 0.016
#> SRR2105129 1 0.394 0.50371 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR2105130 3 0.646 0.00765 0.416 0.052 0.524 0.008
#> SRR2105127 1 0.412 0.56927 0.844 0.056 0.088 0.012
#> SRR2105128 1 0.725 0.44947 0.652 0.060 0.140 0.148
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 2 0.821 0.042639 0.152 0.424 0.288 0.012 0.124
#> SRR2105278 2 0.868 0.115767 0.236 0.416 0.100 0.044 0.204
#> SRR2105275 1 0.801 0.472062 0.520 0.116 0.180 0.028 0.156
#> SRR2105276 1 0.766 0.238329 0.456 0.040 0.356 0.052 0.096
#> SRR2105273 3 0.418 0.543379 0.052 0.028 0.828 0.016 0.076
#> SRR2105274 3 0.191 0.518846 0.032 0.000 0.932 0.004 0.032
#> SRR2105271 5 0.696 0.227935 0.076 0.328 0.076 0.004 0.516
#> SRR2105272 3 0.577 0.473829 0.244 0.004 0.656 0.032 0.064
#> SRR2105269 2 0.680 0.376345 0.068 0.544 0.004 0.076 0.308
#> SRR2105270 5 0.823 0.183742 0.112 0.280 0.220 0.004 0.384
#> SRR2105267 2 0.333 0.489386 0.012 0.848 0.004 0.016 0.120
#> SRR2105268 5 0.714 0.148929 0.072 0.380 0.040 0.032 0.476
#> SRR2105265 2 0.665 0.468632 0.124 0.652 0.052 0.028 0.144
#> SRR2105266 2 0.664 0.151814 0.004 0.488 0.244 0.000 0.264
#> SRR2105263 1 0.675 0.423804 0.528 0.232 0.224 0.004 0.012
#> SRR2105264 3 0.649 0.494546 0.136 0.156 0.644 0.008 0.056
#> SRR2105261 2 0.705 0.407301 0.120 0.560 0.060 0.008 0.252
#> SRR2105262 5 0.691 0.354651 0.176 0.180 0.056 0.004 0.584
#> SRR2105357 2 0.528 0.343957 0.044 0.564 0.000 0.004 0.388
#> SRR2105358 3 0.830 0.082928 0.088 0.208 0.436 0.024 0.244
#> SRR2105439 5 0.731 0.199618 0.044 0.352 0.100 0.024 0.480
#> SRR2105440 5 0.780 0.229076 0.056 0.160 0.368 0.016 0.400
#> SRR2105509 4 0.500 0.696247 0.012 0.208 0.000 0.712 0.068
#> SRR2105510 2 0.384 0.479991 0.028 0.788 0.000 0.004 0.180
#> SRR2105507 3 0.542 0.532028 0.100 0.096 0.748 0.032 0.024
#> SRR2105508 3 0.553 0.446067 0.056 0.012 0.628 0.004 0.300
#> SRR2105505 3 0.711 0.306776 0.084 0.044 0.480 0.020 0.372
#> SRR2105506 3 0.688 0.487782 0.128 0.100 0.644 0.028 0.100
#> SRR2105503 2 0.524 0.488187 0.052 0.760 0.084 0.012 0.092
#> SRR2105504 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105501 2 0.615 0.440342 0.032 0.652 0.232 0.028 0.056
#> SRR2105502 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105499 3 0.826 0.245456 0.220 0.088 0.468 0.032 0.192
#> SRR2105500 2 0.659 0.445656 0.116 0.656 0.024 0.056 0.148
#> SRR2105497 3 0.770 0.383532 0.160 0.128 0.544 0.016 0.152
#> SRR2105498 2 0.762 0.220601 0.180 0.484 0.256 0.004 0.076
#> SRR2105495 3 0.711 0.294883 0.052 0.120 0.548 0.012 0.268
#> SRR2105496 2 0.771 0.266185 0.148 0.540 0.116 0.016 0.180
#> SRR2105493 3 0.493 0.537694 0.036 0.068 0.764 0.004 0.128
#> SRR2105494 3 0.660 0.491430 0.092 0.048 0.620 0.016 0.224
#> SRR2105491 1 0.668 0.494119 0.628 0.104 0.196 0.016 0.056
#> SRR2105492 1 0.589 0.436624 0.580 0.000 0.312 0.008 0.100
#> SRR2105489 3 0.750 0.336055 0.200 0.032 0.476 0.016 0.276
#> SRR2105490 2 0.733 0.369815 0.212 0.552 0.032 0.032 0.172
#> SRR2105487 1 0.752 0.121086 0.440 0.092 0.084 0.012 0.372
#> SRR2105488 5 0.873 0.092725 0.160 0.124 0.332 0.036 0.348
#> SRR2105485 5 0.741 0.185107 0.020 0.304 0.228 0.012 0.436
#> SRR2105486 3 0.633 0.427224 0.048 0.300 0.584 0.004 0.064
#> SRR2105483 1 0.517 0.502001 0.688 0.020 0.248 0.004 0.040
#> SRR2105484 1 0.474 0.338926 0.564 0.000 0.420 0.004 0.012
#> SRR2105481 3 0.462 0.537273 0.076 0.056 0.796 0.004 0.068
#> SRR2105482 3 0.735 0.101956 0.256 0.008 0.440 0.020 0.276
#> SRR2105479 2 0.689 0.103837 0.168 0.416 0.400 0.008 0.008
#> SRR2105480 3 0.478 0.219866 0.396 0.000 0.584 0.004 0.016
#> SRR2105477 2 0.736 0.036683 0.404 0.416 0.024 0.028 0.128
#> SRR2105478 2 0.854 0.072847 0.220 0.396 0.116 0.020 0.248
#> SRR2105475 2 0.649 0.452917 0.056 0.632 0.128 0.004 0.180
#> SRR2105476 2 0.440 0.516353 0.028 0.808 0.068 0.008 0.088
#> SRR2105473 5 0.894 0.020324 0.260 0.160 0.240 0.024 0.316
#> SRR2105474 3 0.642 0.505746 0.156 0.156 0.640 0.008 0.040
#> SRR2105471 3 0.757 0.091759 0.264 0.264 0.432 0.012 0.028
#> SRR2105472 1 0.792 0.094577 0.432 0.160 0.080 0.012 0.316
#> SRR2105469 2 0.608 0.426296 0.056 0.700 0.104 0.020 0.120
#> SRR2105470 3 0.684 0.480116 0.128 0.052 0.632 0.028 0.160
#> SRR2105467 3 0.794 0.146577 0.156 0.116 0.504 0.016 0.208
#> SRR2105468 3 0.830 0.287455 0.220 0.104 0.472 0.032 0.172
#> SRR2105465 3 0.479 0.509446 0.040 0.016 0.716 0.000 0.228
#> SRR2105466 3 0.398 0.497403 0.152 0.020 0.804 0.004 0.020
#> SRR2105463 1 0.776 0.381561 0.460 0.108 0.308 0.008 0.116
#> SRR2105464 3 0.513 0.019975 0.456 0.004 0.516 0.008 0.016
#> SRR2105461 2 0.386 0.485454 0.028 0.832 0.008 0.108 0.024
#> SRR2105462 5 0.673 0.333039 0.012 0.156 0.344 0.004 0.484
#> SRR2105459 2 0.511 0.273305 0.020 0.592 0.000 0.016 0.372
#> SRR2105460 2 0.533 0.397820 0.004 0.648 0.000 0.080 0.268
#> SRR2105457 2 0.646 0.455758 0.020 0.624 0.156 0.016 0.184
#> SRR2105458 2 0.549 0.421064 0.008 0.652 0.024 0.036 0.280
#> SRR2105455 2 0.511 0.488122 0.020 0.776 0.060 0.076 0.068
#> SRR2105456 2 0.809 0.083313 0.092 0.416 0.324 0.016 0.152
#> SRR2105453 5 0.903 0.230849 0.184 0.284 0.156 0.040 0.336
#> SRR2105454 5 0.688 0.144984 0.296 0.044 0.064 0.032 0.564
#> SRR2105451 5 0.680 0.367310 0.016 0.216 0.212 0.008 0.548
#> SRR2105452 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105449 3 0.902 -0.182732 0.276 0.268 0.284 0.032 0.140
#> SRR2105450 3 0.347 0.496284 0.124 0.004 0.840 0.012 0.020
#> SRR2105447 5 0.868 0.266507 0.108 0.216 0.288 0.028 0.360
#> SRR2105448 2 0.422 0.500130 0.032 0.816 0.040 0.008 0.104
#> SRR2105445 5 0.583 0.414022 0.040 0.036 0.268 0.012 0.644
#> SRR2105446 2 0.592 0.345134 0.056 0.540 0.012 0.008 0.384
#> SRR2105443 2 0.615 0.398929 0.012 0.624 0.220 0.008 0.136
#> SRR2105444 3 0.685 0.312973 0.060 0.060 0.508 0.012 0.360
#> SRR2105441 3 0.744 0.417694 0.108 0.088 0.564 0.024 0.216
#> SRR2105442 2 0.754 0.316082 0.156 0.468 0.044 0.016 0.316
#> SRR2105437 1 0.563 0.431885 0.576 0.000 0.348 0.008 0.068
#> SRR2105438 1 0.516 0.379140 0.600 0.000 0.360 0.016 0.024
#> SRR2105435 3 0.277 0.536880 0.032 0.056 0.896 0.004 0.012
#> SRR2105436 3 0.500 0.548365 0.068 0.052 0.772 0.008 0.100
#> SRR2105433 3 0.407 0.492060 0.104 0.104 0.792 0.000 0.000
#> SRR2105434 2 0.824 0.207762 0.272 0.420 0.200 0.016 0.092
#> SRR2105431 3 0.694 0.034526 0.300 0.008 0.460 0.004 0.228
#> SRR2105432 3 0.681 0.077847 0.392 0.016 0.472 0.020 0.100
#> SRR2105429 3 0.533 0.534737 0.088 0.084 0.752 0.008 0.068
#> SRR2105430 2 0.759 0.364622 0.144 0.540 0.104 0.012 0.200
#> SRR2105427 3 0.733 -0.235015 0.016 0.304 0.376 0.004 0.300
#> SRR2105428 2 0.674 0.435263 0.044 0.604 0.156 0.008 0.188
#> SRR2105425 5 0.716 0.356549 0.052 0.196 0.188 0.008 0.556
#> SRR2105426 2 0.687 0.418987 0.064 0.588 0.092 0.012 0.244
#> SRR2105421 2 0.593 0.433161 0.036 0.692 0.088 0.016 0.168
#> SRR2105422 3 0.813 0.051143 0.072 0.288 0.412 0.016 0.212
#> SRR2105423 2 0.653 0.444893 0.036 0.660 0.176 0.072 0.056
#> SRR2105424 2 0.466 0.493845 0.072 0.784 0.016 0.012 0.116
#> SRR2105419 2 0.628 0.274033 0.012 0.516 0.068 0.016 0.388
#> SRR2105420 5 0.775 -0.041839 0.036 0.364 0.208 0.016 0.376
#> SRR2105415 3 0.548 0.369640 0.232 0.060 0.676 0.000 0.032
#> SRR2105416 3 0.633 0.290434 0.284 0.012 0.584 0.012 0.108
#> SRR2105417 5 0.742 0.350083 0.184 0.084 0.132 0.024 0.576
#> SRR2105418 1 0.543 0.505141 0.684 0.004 0.232 0.028 0.052
#> SRR2105413 2 0.533 0.442707 0.020 0.680 0.020 0.024 0.256
#> SRR2105414 2 0.605 0.233204 0.012 0.588 0.096 0.004 0.300
#> SRR2105409 5 0.849 0.292545 0.232 0.128 0.152 0.036 0.452
#> SRR2105410 3 0.847 0.140834 0.180 0.256 0.400 0.012 0.152
#> SRR2105411 5 0.673 0.399388 0.076 0.148 0.064 0.052 0.660
#> SRR2105412 5 0.771 0.294112 0.040 0.296 0.252 0.008 0.404
#> SRR2105407 2 0.770 0.228081 0.104 0.540 0.224 0.028 0.104
#> SRR2105408 2 0.443 0.478985 0.072 0.792 0.004 0.016 0.116
#> SRR2105403 5 0.725 0.447773 0.040 0.168 0.252 0.012 0.528
#> SRR2105404 2 0.847 0.010717 0.104 0.372 0.148 0.032 0.344
#> SRR2105405 5 0.774 0.388568 0.084 0.216 0.128 0.032 0.540
#> SRR2105406 3 0.719 0.371166 0.132 0.024 0.520 0.028 0.296
#> SRR2105401 2 0.443 0.399298 0.008 0.728 0.004 0.020 0.240
#> SRR2105402 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105399 2 0.399 0.487794 0.076 0.828 0.004 0.020 0.072
#> SRR2105400 2 0.182 0.482005 0.000 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR2105397 2 0.516 0.484387 0.044 0.772 0.028 0.060 0.096
#> SRR2105398 2 0.679 0.321479 0.032 0.544 0.308 0.012 0.104
#> SRR2105395 3 0.857 0.076270 0.256 0.120 0.388 0.020 0.216
#> SRR2105396 3 0.268 0.537188 0.004 0.012 0.884 0.004 0.096
#> SRR2105393 2 0.777 0.327750 0.116 0.524 0.076 0.036 0.248
#> SRR2105394 2 0.725 -0.068573 0.036 0.460 0.328 0.004 0.172
#> SRR2105389 3 0.667 0.512493 0.100 0.088 0.672 0.044 0.096
#> SRR2105390 3 0.594 0.491616 0.068 0.092 0.712 0.016 0.112
#> SRR2105391 3 0.596 0.499103 0.036 0.064 0.648 0.008 0.244
#> SRR2105392 5 0.824 0.312871 0.096 0.248 0.260 0.008 0.388
#> SRR2105385 3 0.367 0.517046 0.164 0.004 0.808 0.004 0.020
#> SRR2105386 3 0.088 0.504837 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105387 5 0.628 0.144682 0.120 0.340 0.000 0.012 0.528
#> SRR2105388 5 0.690 0.339358 0.012 0.320 0.220 0.000 0.448
#> SRR2105381 2 0.571 0.477750 0.096 0.712 0.012 0.036 0.144
#> SRR2105382 3 0.422 0.522051 0.008 0.120 0.792 0.000 0.080
#> SRR2105383 5 0.520 0.441983 0.016 0.120 0.144 0.000 0.720
#> SRR2105384 2 0.745 0.241671 0.236 0.516 0.112 0.000 0.136
#> SRR2105379 2 0.655 0.281047 0.040 0.488 0.032 0.028 0.412
#> SRR2105380 3 0.531 0.486300 0.152 0.020 0.728 0.008 0.092
#> SRR2105377 2 0.851 0.022504 0.156 0.408 0.088 0.044 0.304
#> SRR2105378 3 0.531 0.443360 0.144 0.000 0.688 0.004 0.164
#> SRR2105375 5 0.641 0.445933 0.092 0.088 0.140 0.012 0.668
#> SRR2105376 1 0.894 -0.067831 0.292 0.276 0.136 0.028 0.268
#> SRR2105373 3 0.664 0.454528 0.232 0.056 0.620 0.024 0.068
#> SRR2105374 3 0.519 -0.016963 0.468 0.004 0.500 0.004 0.024
#> SRR2105371 2 0.763 0.285848 0.048 0.500 0.268 0.024 0.160
#> SRR2105372 5 0.653 0.085108 0.028 0.400 0.076 0.008 0.488
#> SRR2105369 3 0.465 0.548374 0.048 0.036 0.780 0.004 0.132
#> SRR2105370 3 0.573 0.473316 0.056 0.024 0.648 0.008 0.264
#> SRR2105367 5 0.725 0.088355 0.364 0.100 0.072 0.004 0.460
#> SRR2105368 3 0.747 -0.183724 0.332 0.004 0.360 0.024 0.280
#> SRR2105365 1 0.664 0.095922 0.468 0.044 0.048 0.016 0.424
#> SRR2105366 5 0.719 0.002504 0.140 0.028 0.376 0.012 0.444
#> SRR2105363 2 0.627 0.417351 0.020 0.636 0.132 0.012 0.200
#> SRR2105364 2 0.800 0.371021 0.076 0.528 0.200 0.052 0.144
#> SRR2105361 5 0.437 0.110418 0.008 0.332 0.000 0.004 0.656
#> SRR2105362 5 0.640 0.213187 0.052 0.352 0.024 0.024 0.548
#> SRR2105359 3 0.523 0.143397 0.012 0.016 0.512 0.004 0.456
#> SRR2105360 3 0.810 0.046701 0.096 0.260 0.404 0.004 0.236
#> SRR2105355 3 0.701 0.465529 0.036 0.180 0.620 0.060 0.104
#> SRR2105356 2 0.850 -0.191716 0.076 0.308 0.284 0.024 0.308
#> SRR2105353 5 0.809 0.248198 0.212 0.076 0.192 0.032 0.488
#> SRR2105354 3 0.695 0.494433 0.152 0.140 0.620 0.020 0.068
#> SRR2105351 3 0.664 0.490020 0.044 0.136 0.656 0.036 0.128
#> SRR2105352 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105349 2 0.655 0.391643 0.036 0.616 0.244 0.024 0.080
#> SRR2105350 2 0.560 0.502752 0.044 0.732 0.092 0.016 0.116
#> SRR2105345 5 0.911 0.322351 0.104 0.168 0.224 0.100 0.404
#> SRR2105346 3 0.866 0.022865 0.160 0.104 0.392 0.044 0.300
#> SRR2105347 3 0.725 0.260758 0.176 0.080 0.584 0.016 0.144
#> SRR2105348 3 0.810 0.301510 0.176 0.100 0.512 0.036 0.176
#> SRR2105343 2 0.696 0.377840 0.024 0.568 0.244 0.024 0.140
#> SRR2105344 2 0.572 0.452064 0.088 0.704 0.032 0.012 0.164
#> SRR2105341 3 0.604 0.537046 0.096 0.080 0.696 0.008 0.120
#> SRR2105342 3 0.745 0.168050 0.044 0.152 0.464 0.012 0.328
#> SRR2105339 3 0.374 0.530028 0.012 0.112 0.832 0.004 0.040
#> SRR2105340 3 0.415 0.538750 0.060 0.028 0.812 0.000 0.100
#> SRR2105335 3 0.477 0.534906 0.132 0.056 0.776 0.012 0.024
#> SRR2105336 3 0.726 0.222203 0.312 0.052 0.524 0.032 0.080
#> SRR2105337 3 0.564 0.435220 0.048 0.284 0.640 0.012 0.016
#> SRR2105338 3 0.137 0.509994 0.004 0.024 0.956 0.000 0.016
#> SRR2105331 2 0.709 0.348360 0.188 0.552 0.192 0.000 0.068
#> SRR2105332 3 0.704 0.276915 0.296 0.128 0.516 0.000 0.060
#> SRR2105333 2 0.739 0.427543 0.008 0.560 0.100 0.172 0.160
#> SRR2105334 2 0.625 0.469327 0.020 0.636 0.108 0.016 0.220
#> SRR2105329 2 0.664 0.318224 0.020 0.568 0.192 0.004 0.216
#> SRR2105330 2 0.696 0.382460 0.072 0.600 0.168 0.008 0.152
#> SRR2105327 5 0.757 0.314956 0.044 0.208 0.336 0.004 0.408
#> SRR2105328 2 0.811 -0.031871 0.068 0.372 0.372 0.024 0.164
#> SRR2105325 3 0.390 0.452127 0.192 0.000 0.780 0.008 0.020
#> SRR2105326 3 0.527 0.331739 0.308 0.004 0.640 0.020 0.028
#> SRR2105323 2 0.655 0.364527 0.056 0.572 0.036 0.024 0.312
#> SRR2105324 5 0.851 0.134159 0.196 0.308 0.092 0.028 0.376
#> SRR2105319 3 0.504 0.506694 0.164 0.032 0.752 0.028 0.024
#> SRR2105320 3 0.529 0.087154 0.448 0.000 0.512 0.008 0.032
#> SRR2105321 3 0.831 -0.093862 0.284 0.116 0.416 0.016 0.168
#> SRR2105322 3 0.554 0.013979 0.412 0.004 0.532 0.004 0.048
#> SRR2105317 4 0.738 -0.066512 0.020 0.264 0.004 0.360 0.352
#> SRR2105318 5 0.516 0.087126 0.012 0.396 0.012 0.008 0.572
#> SRR2105315 2 0.394 0.465058 0.016 0.768 0.000 0.008 0.208
#> SRR2105316 5 0.515 0.445560 0.000 0.112 0.204 0.000 0.684
#> SRR2105313 2 0.602 0.375831 0.028 0.564 0.028 0.020 0.360
#> SRR2105314 2 0.540 0.381311 0.028 0.588 0.004 0.016 0.364
#> SRR2105311 2 0.663 0.440897 0.216 0.620 0.108 0.032 0.024
#> SRR2105312 1 0.706 0.449216 0.620 0.112 0.132 0.020 0.116
#> SRR2105307 1 0.854 0.134719 0.392 0.284 0.140 0.020 0.164
#> SRR2105308 5 0.658 0.431686 0.080 0.144 0.096 0.020 0.660
#> SRR2105309 2 0.363 0.477084 0.016 0.816 0.000 0.016 0.152
#> SRR2105310 3 0.727 0.122345 0.032 0.316 0.472 0.008 0.172
#> SRR2105305 5 0.796 0.338161 0.052 0.156 0.296 0.036 0.460
#> SRR2105306 2 0.774 -0.235064 0.024 0.364 0.304 0.016 0.292
#> SRR2105303 2 0.784 0.286659 0.068 0.480 0.144 0.024 0.284
#> SRR2105304 4 0.183 0.827827 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR2105301 3 0.682 0.464324 0.124 0.128 0.628 0.008 0.112
#> SRR2105302 2 0.714 0.389644 0.080 0.560 0.228 0.004 0.128
#> SRR2105299 3 0.800 0.270957 0.192 0.052 0.448 0.028 0.280
#> SRR2105300 2 0.837 0.295982 0.128 0.492 0.152 0.044 0.184
#> SRR2105297 1 0.679 0.264957 0.440 0.032 0.420 0.004 0.104
#> SRR2105298 1 0.566 0.464861 0.620 0.008 0.300 0.008 0.064
#> SRR2105295 2 0.540 0.429360 0.012 0.676 0.008 0.244 0.060
#> SRR2105296 5 0.604 0.428836 0.084 0.120 0.092 0.008 0.696
#> SRR2105293 5 0.860 0.246725 0.192 0.124 0.224 0.032 0.428
#> SRR2105294 3 0.526 0.424007 0.276 0.036 0.664 0.004 0.020
#> SRR2105291 3 0.367 0.538107 0.064 0.016 0.856 0.020 0.044
#> SRR2105292 1 0.669 0.484268 0.596 0.028 0.212 0.012 0.152
#> SRR2105289 3 0.669 0.240048 0.004 0.312 0.500 0.008 0.176
#> SRR2105290 3 0.544 0.526199 0.100 0.028 0.732 0.012 0.128
#> SRR2105287 1 0.846 0.012445 0.320 0.060 0.268 0.032 0.320
#> SRR2105288 3 0.356 0.523232 0.052 0.008 0.860 0.024 0.056
#> SRR2105285 2 0.597 0.481256 0.080 0.700 0.036 0.028 0.156
#> SRR2105286 2 0.662 0.455835 0.096 0.628 0.028 0.036 0.212
#> SRR2105283 1 0.817 -0.102490 0.388 0.136 0.072 0.036 0.368
#> SRR2105284 3 0.537 0.552226 0.068 0.048 0.744 0.012 0.128
#> SRR2105281 3 0.753 -0.064024 0.028 0.168 0.412 0.020 0.372
#> SRR2105282 2 0.645 0.390412 0.080 0.656 0.100 0.008 0.156
#> SRR2105259 5 0.737 -0.220570 0.092 0.416 0.044 0.028 0.420
#> SRR2105260 2 0.675 0.316852 0.112 0.536 0.012 0.024 0.316
#> SRR2105279 2 0.556 0.466084 0.064 0.704 0.008 0.036 0.188
#> SRR2105280 2 0.609 0.388356 0.020 0.592 0.084 0.004 0.300
#> SRR2105257 3 0.513 0.352606 0.324 0.004 0.632 0.008 0.032
#> SRR2105258 1 0.652 0.443418 0.612 0.072 0.244 0.008 0.064
#> SRR2105253 2 0.641 0.112695 0.020 0.508 0.376 0.004 0.092
#> SRR2105254 2 0.678 0.363184 0.024 0.568 0.128 0.016 0.264
#> SRR2105255 2 0.627 0.470586 0.068 0.648 0.048 0.016 0.220
#> SRR2105256 3 0.715 0.468220 0.092 0.068 0.608 0.040 0.192
#> SRR2105251 2 0.794 0.145506 0.092 0.460 0.248 0.008 0.192
#> SRR2105252 5 0.627 0.109512 0.100 0.352 0.004 0.012 0.532
#> SRR2105249 2 0.307 0.492373 0.056 0.880 0.004 0.012 0.048
#> SRR2105250 5 0.843 0.273441 0.104 0.204 0.308 0.016 0.368
#> SRR2105247 2 0.773 0.252429 0.064 0.460 0.192 0.008 0.276
#> SRR2105248 1 0.887 0.320190 0.368 0.180 0.248 0.028 0.176
#> SRR2105245 1 0.883 -0.001411 0.308 0.208 0.176 0.016 0.292
#> SRR2105246 3 0.360 0.538253 0.032 0.112 0.840 0.008 0.008
#> SRR2105243 3 0.677 0.411540 0.032 0.188 0.572 0.004 0.204
#> SRR2105244 3 0.816 -0.149013 0.112 0.356 0.364 0.008 0.160
#> SRR2105241 3 0.165 0.514022 0.020 0.032 0.944 0.000 0.004
#> SRR2105242 3 0.556 0.515022 0.152 0.044 0.720 0.008 0.076
#> SRR2105239 5 0.770 0.370766 0.228 0.160 0.124 0.000 0.488
#> SRR2105240 3 0.190 0.514316 0.056 0.012 0.928 0.000 0.004
#> SRR2105237 2 0.879 0.141018 0.124 0.400 0.168 0.044 0.264
#> SRR2105238 2 0.656 0.371982 0.112 0.612 0.036 0.012 0.228
#> SRR2105235 2 0.672 0.059999 0.004 0.436 0.404 0.012 0.144
#> SRR2105236 3 0.589 0.540476 0.032 0.124 0.700 0.016 0.128
#> SRR2105233 2 0.716 0.210849 0.016 0.540 0.148 0.036 0.260
#> SRR2105234 2 0.445 0.436386 0.012 0.736 0.004 0.020 0.228
#> SRR2105231 5 0.594 0.000634 0.060 0.368 0.008 0.012 0.552
#> SRR2105232 2 0.872 0.134694 0.196 0.392 0.200 0.020 0.192
#> SRR2105227 2 0.879 0.000778 0.208 0.288 0.236 0.008 0.260
#> SRR2105228 3 0.705 0.405386 0.048 0.128 0.560 0.012 0.252
#> SRR2105225 3 0.845 -0.175455 0.128 0.284 0.316 0.004 0.268
#> SRR2105226 3 0.772 0.309278 0.192 0.060 0.452 0.008 0.288
#> SRR2105229 3 0.576 0.527700 0.036 0.092 0.712 0.016 0.144
#> SRR2105230 3 0.707 0.476281 0.100 0.076 0.612 0.028 0.184
#> SRR2105219 2 0.570 0.382517 0.008 0.612 0.312 0.012 0.056
#> SRR2105220 5 0.694 0.432147 0.096 0.068 0.224 0.016 0.596
#> SRR2105221 3 0.074 0.502419 0.004 0.008 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105222 1 0.728 0.451089 0.504 0.028 0.220 0.012 0.236
#> SRR2105223 3 0.238 0.526994 0.028 0.000 0.912 0.012 0.048
#> SRR2105224 3 0.419 0.542943 0.064 0.064 0.828 0.016 0.028
#> SRR2105217 1 0.891 0.286242 0.304 0.152 0.296 0.024 0.224
#> SRR2105218 3 0.735 0.248687 0.076 0.352 0.460 0.004 0.108
#> SRR2105215 3 0.877 -0.147647 0.108 0.252 0.376 0.036 0.228
#> SRR2105216 2 0.443 0.346781 0.004 0.612 0.000 0.004 0.380
#> SRR2105213 3 0.660 0.412882 0.216 0.012 0.580 0.012 0.180
#> SRR2105214 3 0.760 0.408616 0.052 0.180 0.548 0.036 0.184
#> SRR2105211 5 0.765 0.416325 0.060 0.216 0.200 0.016 0.508
#> SRR2105212 5 0.813 0.123146 0.156 0.364 0.048 0.044 0.388
#> SRR2105209 3 0.724 0.426040 0.212 0.076 0.592 0.040 0.080
#> SRR2105210 1 0.846 0.294567 0.356 0.076 0.272 0.024 0.272
#> SRR2105207 1 0.725 0.269913 0.556 0.120 0.036 0.036 0.252
#> SRR2105208 1 0.767 -0.038071 0.404 0.060 0.396 0.020 0.120
#> SRR2105205 3 0.814 0.041828 0.164 0.272 0.440 0.012 0.112
#> SRR2105206 3 0.502 0.376079 0.248 0.032 0.696 0.004 0.020
#> SRR2105201 3 0.810 0.376553 0.120 0.168 0.532 0.048 0.132
#> SRR2105202 5 0.627 -0.198902 0.088 0.444 0.012 0.004 0.452
#> SRR2105203 3 0.865 -0.123605 0.132 0.216 0.336 0.016 0.300
#> SRR2105204 5 0.482 -0.052043 0.012 0.404 0.000 0.008 0.576
#> SRR2105199 5 0.808 0.077016 0.160 0.300 0.100 0.012 0.428
#> SRR2105200 5 0.801 0.104460 0.332 0.108 0.144 0.008 0.408
#> SRR2105197 5 0.813 0.296631 0.200 0.220 0.092 0.020 0.468
#> SRR2105198 3 0.662 0.485650 0.092 0.064 0.628 0.012 0.204
#> SRR2105195 5 0.859 -0.209192 0.284 0.136 0.272 0.008 0.300
#> SRR2105196 3 0.356 0.500357 0.140 0.012 0.828 0.004 0.016
#> SRR2105193 3 0.695 0.413919 0.236 0.104 0.584 0.012 0.064
#> SRR2105194 3 0.302 0.498373 0.136 0.000 0.848 0.012 0.004
#> SRR2105191 2 0.814 0.046733 0.080 0.408 0.152 0.024 0.336
#> SRR2105192 3 0.580 0.424409 0.244 0.000 0.636 0.016 0.104
#> SRR2105189 2 0.521 0.488028 0.080 0.740 0.000 0.048 0.132
#> SRR2105190 2 0.422 0.496536 0.044 0.800 0.008 0.012 0.136
#> SRR2105187 5 0.898 0.252873 0.184 0.252 0.180 0.032 0.352
#> SRR2105188 3 0.762 -0.149992 0.360 0.036 0.428 0.024 0.152
#> SRR2105179 3 0.551 0.533863 0.148 0.092 0.720 0.008 0.032
#> SRR2105180 1 0.516 0.043352 0.500 0.000 0.468 0.008 0.024
#> SRR2105183 2 0.671 0.192749 0.052 0.532 0.332 0.004 0.080
#> SRR2105184 3 0.755 0.283256 0.284 0.148 0.496 0.016 0.056
#> SRR2105185 5 0.749 0.388489 0.020 0.224 0.156 0.060 0.540
#> SRR2105186 3 0.855 -0.101237 0.152 0.164 0.376 0.016 0.292
#> SRR2105181 3 0.765 0.249383 0.240 0.076 0.508 0.012 0.164
#> SRR2105182 3 0.353 0.538302 0.032 0.100 0.848 0.004 0.016
#> SRR2105177 3 0.637 0.189235 0.388 0.036 0.520 0.036 0.020
#> SRR2105178 1 0.422 0.401355 0.632 0.000 0.364 0.004 0.000
#> SRR2105171 5 0.695 0.222616 0.044 0.096 0.360 0.008 0.492
#> SRR2105172 2 0.667 0.299225 0.032 0.552 0.120 0.004 0.292
#> SRR2105175 1 0.527 0.424863 0.604 0.000 0.344 0.008 0.044
#> SRR2105176 3 0.436 0.218049 0.360 0.000 0.632 0.004 0.004
#> SRR2105173 3 0.185 0.521267 0.008 0.036 0.936 0.000 0.020
#> SRR2105174 3 0.534 0.398769 0.008 0.276 0.660 0.012 0.044
#> SRR2105169 2 0.836 -0.178796 0.076 0.328 0.304 0.016 0.276
#> SRR2105170 3 0.649 0.396817 0.148 0.220 0.600 0.004 0.028
#> SRR2105167 5 0.657 0.432029 0.020 0.208 0.188 0.004 0.580
#> SRR2105168 5 0.616 0.363664 0.148 0.124 0.016 0.036 0.676
#> SRR2105165 3 0.659 0.115418 0.300 0.020 0.552 0.008 0.120
#> SRR2105166 3 0.489 0.440600 0.200 0.028 0.736 0.008 0.028
#> SRR2105163 3 0.800 0.210509 0.252 0.080 0.472 0.020 0.176
#> SRR2105164 3 0.593 0.337422 0.356 0.012 0.568 0.016 0.048
#> SRR2105161 3 0.771 0.130738 0.304 0.068 0.472 0.016 0.140
#> SRR2105162 1 0.468 0.493714 0.736 0.000 0.204 0.016 0.044
#> SRR2105155 3 0.778 0.237239 0.024 0.176 0.484 0.052 0.264
#> SRR2105156 3 0.529 0.503601 0.004 0.244 0.672 0.004 0.076
#> SRR2105157 3 0.538 0.531995 0.116 0.056 0.752 0.020 0.056
#> SRR2105158 3 0.787 0.051171 0.320 0.136 0.436 0.008 0.100
#> SRR2105159 1 0.618 0.438285 0.644 0.016 0.104 0.020 0.216
#> SRR2105160 5 0.778 -0.072294 0.364 0.040 0.200 0.016 0.380
#> SRR2105153 2 0.814 0.186811 0.096 0.452 0.308 0.040 0.104
#> SRR2105154 1 0.875 0.307075 0.412 0.144 0.176 0.036 0.232
#> SRR2105151 5 0.708 0.415461 0.016 0.164 0.264 0.024 0.532
#> SRR2105152 2 0.577 0.373421 0.076 0.604 0.000 0.016 0.304
#> SRR2105149 3 0.532 0.543683 0.020 0.140 0.744 0.028 0.068
#> SRR2105150 3 0.674 0.155763 0.028 0.344 0.520 0.012 0.096
#> SRR2105147 4 0.394 0.698471 0.000 0.052 0.000 0.788 0.160
#> SRR2105148 4 0.526 0.557261 0.000 0.144 0.000 0.680 0.176
#> SRR2105143 3 0.790 -0.082711 0.184 0.080 0.380 0.004 0.352
#> SRR2105144 5 0.877 0.241132 0.136 0.224 0.304 0.020 0.316
#> SRR2105145 3 0.552 0.487463 0.164 0.100 0.708 0.008 0.020
#> SRR2105146 3 0.394 0.492161 0.176 0.008 0.792 0.016 0.008
#> SRR2105141 2 0.758 0.390426 0.132 0.564 0.164 0.020 0.120
#> SRR2105142 3 0.733 0.056132 0.060 0.380 0.448 0.012 0.100
#> SRR2105139 2 0.568 0.483126 0.024 0.700 0.116 0.008 0.152
#> SRR2105140 3 0.564 0.511596 0.016 0.148 0.688 0.004 0.144
#> SRR2105137 5 0.756 0.376692 0.060 0.200 0.072 0.092 0.576
#> SRR2105138 3 0.709 0.495577 0.132 0.108 0.612 0.016 0.132
#> SRR2105135 5 0.822 0.333112 0.064 0.264 0.144 0.056 0.472
#> SRR2105136 2 0.510 0.202142 0.020 0.528 0.004 0.004 0.444
#> SRR2105133 2 0.747 0.346706 0.084 0.512 0.072 0.028 0.304
#> SRR2105134 3 0.797 0.366488 0.084 0.220 0.504 0.028 0.164
#> SRR2105131 5 0.587 0.383416 0.072 0.192 0.052 0.004 0.680
#> SRR2105132 3 0.625 0.501949 0.176 0.032 0.668 0.024 0.100
#> SRR2105129 3 0.545 0.257691 0.256 0.000 0.636 0.000 0.108
#> SRR2105130 1 0.621 0.506020 0.628 0.012 0.208 0.012 0.140
#> SRR2105127 3 0.414 0.543762 0.088 0.068 0.820 0.012 0.012
#> SRR2105128 3 0.644 0.413060 0.012 0.188 0.580 0.004 0.216
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 2 0.7028 -0.185953 0.020 0.356 0.248 0.000 0.348 0.028
#> SRR2105278 5 0.6476 0.286703 0.076 0.292 0.068 0.000 0.540 0.024
#> SRR2105275 1 0.7809 0.345090 0.508 0.072 0.128 0.012 0.152 0.128
#> SRR2105276 1 0.7811 0.291430 0.396 0.024 0.240 0.008 0.240 0.092
#> SRR2105273 3 0.4555 0.530189 0.028 0.020 0.780 0.012 0.112 0.048
#> SRR2105274 3 0.2001 0.508769 0.012 0.000 0.912 0.000 0.068 0.008
#> SRR2105271 6 0.7014 0.314300 0.076 0.272 0.064 0.000 0.072 0.516
#> SRR2105272 3 0.6228 0.439360 0.204 0.004 0.588 0.008 0.156 0.040
#> SRR2105269 2 0.6943 0.341683 0.016 0.496 0.008 0.060 0.128 0.292
#> SRR2105270 5 0.7721 -0.042761 0.008 0.208 0.160 0.000 0.336 0.288
#> SRR2105267 2 0.3462 0.487955 0.000 0.836 0.008 0.020 0.040 0.096
#> SRR2105268 6 0.6728 0.238412 0.008 0.256 0.028 0.000 0.276 0.432
#> SRR2105265 2 0.7011 0.422210 0.064 0.588 0.032 0.028 0.152 0.136
#> SRR2105266 2 0.6539 0.160821 0.000 0.448 0.216 0.000 0.036 0.300
#> SRR2105263 1 0.7447 0.327656 0.476 0.184 0.196 0.000 0.116 0.028
#> SRR2105264 3 0.6407 0.505949 0.096 0.152 0.632 0.004 0.076 0.040
#> SRR2105261 2 0.7044 0.346297 0.104 0.508 0.048 0.000 0.068 0.272
#> SRR2105262 6 0.7026 0.194360 0.060 0.140 0.024 0.000 0.328 0.448
#> SRR2105357 2 0.5592 0.301467 0.000 0.516 0.000 0.004 0.136 0.344
#> SRR2105358 3 0.8204 -0.095616 0.028 0.192 0.324 0.004 0.188 0.264
#> SRR2105439 6 0.7306 0.261336 0.024 0.268 0.080 0.000 0.176 0.452
#> SRR2105440 6 0.7559 0.085650 0.008 0.132 0.316 0.000 0.192 0.352
#> SRR2105509 4 0.4658 0.637340 0.008 0.200 0.000 0.716 0.016 0.060
#> SRR2105510 2 0.4216 0.476278 0.024 0.752 0.000 0.000 0.048 0.176
#> SRR2105507 3 0.5477 0.522721 0.092 0.072 0.712 0.004 0.100 0.020
#> SRR2105508 3 0.5920 0.414410 0.044 0.012 0.580 0.008 0.052 0.304
#> SRR2105505 3 0.7129 0.261496 0.060 0.024 0.452 0.000 0.168 0.296
#> SRR2105506 3 0.6658 0.466571 0.076 0.064 0.596 0.004 0.200 0.060
#> SRR2105503 2 0.5598 0.471649 0.024 0.700 0.068 0.004 0.128 0.076
#> SRR2105504 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.6066 0.436626 0.016 0.612 0.216 0.000 0.104 0.052
#> SRR2105502 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.8234 0.208575 0.152 0.068 0.404 0.004 0.224 0.148
#> SRR2105500 2 0.5414 0.383881 0.020 0.576 0.020 0.000 0.344 0.040
#> SRR2105497 3 0.7840 0.327308 0.096 0.096 0.468 0.004 0.228 0.108
#> SRR2105498 2 0.7377 0.090853 0.120 0.432 0.224 0.000 0.216 0.008
#> SRR2105495 3 0.6784 0.318996 0.004 0.116 0.536 0.016 0.076 0.252
#> SRR2105496 2 0.7417 0.206993 0.040 0.464 0.104 0.000 0.272 0.120
#> SRR2105493 3 0.5147 0.523794 0.012 0.064 0.720 0.000 0.072 0.132
#> SRR2105494 3 0.6309 0.444874 0.016 0.040 0.580 0.000 0.192 0.172
#> SRR2105491 1 0.6973 0.395110 0.576 0.076 0.132 0.000 0.144 0.072
#> SRR2105492 1 0.6092 0.448431 0.600 0.000 0.196 0.000 0.104 0.100
#> SRR2105489 3 0.7905 0.288752 0.212 0.032 0.408 0.004 0.120 0.224
#> SRR2105490 2 0.6930 0.315939 0.088 0.508 0.028 0.004 0.292 0.080
#> SRR2105487 1 0.7048 0.200350 0.532 0.056 0.048 0.000 0.176 0.188
#> SRR2105488 5 0.8098 0.129485 0.048 0.088 0.268 0.004 0.332 0.260
#> SRR2105485 6 0.6677 0.205086 0.004 0.252 0.176 0.000 0.064 0.504
#> SRR2105486 3 0.6420 0.390033 0.028 0.288 0.556 0.004 0.072 0.052
#> SRR2105483 1 0.6012 0.427754 0.564 0.008 0.188 0.000 0.224 0.016
#> SRR2105484 1 0.4516 0.467696 0.668 0.000 0.260 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105481 3 0.5072 0.516424 0.036 0.040 0.736 0.000 0.124 0.064
#> SRR2105482 3 0.7929 0.005514 0.176 0.012 0.356 0.004 0.220 0.232
#> SRR2105479 2 0.6689 0.058908 0.176 0.392 0.388 0.000 0.036 0.008
#> SRR2105480 3 0.5024 0.199027 0.416 0.004 0.528 0.000 0.044 0.008
#> SRR2105477 2 0.7911 -0.154090 0.264 0.320 0.020 0.008 0.292 0.096
#> SRR2105478 2 0.8680 0.023392 0.220 0.308 0.088 0.004 0.152 0.228
#> SRR2105475 2 0.6516 0.442453 0.000 0.560 0.128 0.000 0.156 0.156
#> SRR2105476 2 0.4738 0.513893 0.008 0.756 0.068 0.000 0.084 0.084
#> SRR2105473 5 0.8398 0.229873 0.180 0.108 0.192 0.000 0.384 0.136
#> SRR2105474 3 0.6263 0.507326 0.084 0.148 0.624 0.000 0.124 0.020
#> SRR2105471 3 0.8131 -0.043184 0.252 0.232 0.344 0.004 0.136 0.032
#> SRR2105472 1 0.7955 0.100409 0.372 0.128 0.064 0.004 0.100 0.332
#> SRR2105469 2 0.6195 0.368996 0.012 0.648 0.088 0.012 0.120 0.120
#> SRR2105470 3 0.6363 0.418075 0.044 0.028 0.572 0.004 0.268 0.084
#> SRR2105467 3 0.8197 0.022165 0.124 0.088 0.428 0.004 0.204 0.152
#> SRR2105468 5 0.8379 -0.097899 0.120 0.088 0.328 0.008 0.328 0.128
#> SRR2105465 3 0.5163 0.501754 0.020 0.012 0.688 0.000 0.096 0.184
#> SRR2105466 3 0.3913 0.470676 0.212 0.016 0.752 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105463 1 0.8373 0.258909 0.348 0.112 0.272 0.000 0.160 0.108
#> SRR2105464 1 0.5733 0.422764 0.568 0.000 0.296 0.004 0.112 0.020
#> SRR2105461 2 0.3154 0.484447 0.000 0.848 0.004 0.104 0.024 0.020
#> SRR2105462 6 0.6874 0.238971 0.008 0.136 0.312 0.000 0.080 0.464
#> SRR2105459 2 0.5482 0.141078 0.004 0.520 0.000 0.008 0.088 0.380
#> SRR2105460 2 0.6116 0.290329 0.000 0.532 0.000 0.088 0.068 0.312
#> SRR2105457 2 0.5957 0.467166 0.000 0.624 0.132 0.000 0.092 0.152
#> SRR2105458 2 0.5333 0.417441 0.000 0.636 0.024 0.048 0.020 0.272
#> SRR2105455 2 0.5758 0.442560 0.008 0.696 0.028 0.068 0.084 0.116
#> SRR2105456 2 0.7605 -0.007344 0.016 0.344 0.304 0.000 0.240 0.096
#> SRR2105453 5 0.8264 0.139236 0.068 0.208 0.096 0.004 0.340 0.284
#> SRR2105454 5 0.6539 0.160925 0.152 0.020 0.024 0.000 0.480 0.324
#> SRR2105451 6 0.6169 0.352761 0.004 0.164 0.192 0.004 0.044 0.592
#> SRR2105452 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105449 5 0.8317 0.192625 0.156 0.232 0.224 0.004 0.340 0.044
#> SRR2105450 3 0.3732 0.493298 0.120 0.004 0.808 0.000 0.052 0.016
#> SRR2105447 6 0.8638 0.028529 0.052 0.164 0.240 0.012 0.240 0.292
#> SRR2105448 2 0.3705 0.496360 0.008 0.828 0.032 0.000 0.064 0.068
#> SRR2105445 6 0.5724 0.331127 0.008 0.032 0.172 0.008 0.124 0.656
#> SRR2105446 2 0.6889 0.302688 0.052 0.468 0.012 0.000 0.192 0.276
#> SRR2105443 2 0.5599 0.418938 0.000 0.632 0.216 0.004 0.032 0.116
#> SRR2105444 3 0.6611 0.249607 0.012 0.048 0.452 0.000 0.124 0.364
#> SRR2105441 3 0.7319 0.294454 0.040 0.064 0.496 0.004 0.228 0.168
#> SRR2105442 2 0.7758 0.259888 0.112 0.412 0.032 0.004 0.156 0.284
#> SRR2105437 1 0.5405 0.473859 0.640 0.000 0.200 0.000 0.136 0.024
#> SRR2105438 1 0.5159 0.477608 0.672 0.000 0.192 0.000 0.108 0.028
#> SRR2105435 3 0.3113 0.527720 0.004 0.040 0.860 0.004 0.080 0.012
#> SRR2105436 3 0.4881 0.538859 0.008 0.032 0.724 0.000 0.156 0.080
#> SRR2105433 3 0.4332 0.486128 0.108 0.088 0.772 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105434 2 0.8128 0.073106 0.228 0.396 0.164 0.004 0.164 0.044
#> SRR2105431 1 0.7276 0.240186 0.380 0.008 0.336 0.000 0.092 0.184
#> SRR2105432 1 0.7023 0.294379 0.436 0.012 0.332 0.000 0.140 0.080
#> SRR2105429 3 0.5519 0.515658 0.120 0.068 0.708 0.000 0.056 0.048
#> SRR2105430 2 0.7733 0.363106 0.104 0.492 0.100 0.000 0.136 0.168
#> SRR2105427 6 0.7365 0.132481 0.008 0.224 0.340 0.004 0.072 0.352
#> SRR2105428 2 0.6423 0.429194 0.020 0.584 0.140 0.000 0.056 0.200
#> SRR2105425 6 0.7320 0.312067 0.032 0.152 0.160 0.000 0.144 0.512
#> SRR2105426 2 0.7267 0.359049 0.036 0.488 0.072 0.000 0.176 0.228
#> SRR2105421 2 0.5691 0.426495 0.004 0.664 0.076 0.004 0.084 0.168
#> SRR2105422 3 0.7820 0.008486 0.008 0.288 0.340 0.004 0.160 0.200
#> SRR2105423 2 0.6406 0.456216 0.024 0.644 0.164 0.076 0.052 0.040
#> SRR2105424 2 0.4202 0.490785 0.004 0.760 0.012 0.000 0.160 0.064
#> SRR2105419 2 0.5844 0.213329 0.000 0.472 0.060 0.004 0.044 0.420
#> SRR2105420 6 0.7551 -0.029780 0.032 0.332 0.196 0.000 0.072 0.368
#> SRR2105415 3 0.6033 0.387189 0.168 0.048 0.640 0.000 0.116 0.028
#> SRR2105416 3 0.6187 0.189709 0.176 0.000 0.456 0.008 0.352 0.008
#> SRR2105417 6 0.6133 0.298219 0.096 0.036 0.096 0.004 0.104 0.664
#> SRR2105418 1 0.6365 0.429598 0.560 0.000 0.152 0.008 0.228 0.052
#> SRR2105413 2 0.4963 0.440698 0.000 0.680 0.024 0.016 0.040 0.240
#> SRR2105414 2 0.5669 0.155967 0.000 0.536 0.096 0.000 0.024 0.344
#> SRR2105409 6 0.8484 0.149315 0.180 0.120 0.108 0.008 0.184 0.400
#> SRR2105410 3 0.8268 0.181057 0.152 0.232 0.392 0.000 0.124 0.100
#> SRR2105411 6 0.7055 0.210628 0.016 0.100 0.044 0.044 0.272 0.524
#> SRR2105412 6 0.7436 0.238709 0.012 0.276 0.240 0.000 0.088 0.384
#> SRR2105407 2 0.7919 0.202883 0.088 0.464 0.204 0.004 0.148 0.092
#> SRR2105408 2 0.4250 0.467764 0.000 0.720 0.004 0.004 0.224 0.048
#> SRR2105403 6 0.6694 0.300724 0.000 0.128 0.216 0.008 0.104 0.544
#> SRR2105404 2 0.8659 -0.103319 0.028 0.316 0.148 0.040 0.264 0.204
#> SRR2105405 6 0.7509 0.269289 0.028 0.180 0.108 0.004 0.200 0.480
#> SRR2105406 3 0.7285 0.300973 0.088 0.024 0.476 0.000 0.184 0.228
#> SRR2105401 2 0.4990 0.324721 0.004 0.648 0.004 0.008 0.064 0.272
#> SRR2105402 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.3442 0.483141 0.000 0.824 0.004 0.016 0.124 0.032
#> SRR2105400 2 0.1369 0.477128 0.000 0.952 0.000 0.016 0.016 0.016
#> SRR2105397 2 0.5518 0.474094 0.040 0.724 0.028 0.032 0.120 0.056
#> SRR2105398 2 0.6480 0.336316 0.024 0.528 0.296 0.000 0.040 0.112
#> SRR2105395 3 0.8506 -0.029707 0.176 0.072 0.308 0.000 0.200 0.244
#> SRR2105396 3 0.2588 0.524624 0.000 0.008 0.876 0.000 0.024 0.092
#> SRR2105393 2 0.7130 0.294406 0.024 0.464 0.052 0.004 0.292 0.164
#> SRR2105394 2 0.7541 -0.022423 0.016 0.420 0.256 0.000 0.128 0.180
#> SRR2105389 3 0.6241 0.473001 0.036 0.040 0.608 0.004 0.228 0.084
#> SRR2105390 3 0.6395 0.430650 0.044 0.076 0.624 0.000 0.160 0.096
#> SRR2105391 3 0.6862 0.380083 0.020 0.072 0.544 0.012 0.100 0.252
#> SRR2105392 6 0.8476 0.122815 0.072 0.176 0.180 0.008 0.180 0.384
#> SRR2105385 3 0.4409 0.500910 0.168 0.004 0.748 0.004 0.064 0.012
#> SRR2105386 3 0.0632 0.489509 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105387 6 0.6644 0.334721 0.100 0.208 0.004 0.004 0.128 0.556
#> SRR2105388 6 0.5974 0.339062 0.004 0.300 0.176 0.000 0.008 0.512
#> SRR2105381 2 0.5700 0.471244 0.048 0.644 0.000 0.004 0.172 0.132
#> SRR2105382 3 0.4661 0.510366 0.008 0.116 0.756 0.000 0.048 0.072
#> SRR2105383 6 0.5747 0.332505 0.008 0.080 0.096 0.000 0.156 0.660
#> SRR2105384 2 0.8096 0.055435 0.164 0.412 0.100 0.000 0.232 0.092
#> SRR2105379 2 0.7360 0.190118 0.056 0.404 0.028 0.020 0.112 0.380
#> SRR2105380 3 0.5903 0.448858 0.136 0.020 0.636 0.004 0.180 0.024
#> SRR2105377 2 0.7757 -0.011515 0.020 0.320 0.064 0.012 0.308 0.276
#> SRR2105378 3 0.5927 0.333524 0.172 0.000 0.608 0.004 0.040 0.176
#> SRR2105375 6 0.6844 0.201298 0.040 0.056 0.096 0.000 0.312 0.496
#> SRR2105376 5 0.6731 0.358297 0.124 0.164 0.068 0.004 0.596 0.044
#> SRR2105373 3 0.7297 0.330347 0.208 0.048 0.496 0.004 0.196 0.048
#> SRR2105374 1 0.4793 0.416592 0.640 0.004 0.300 0.004 0.048 0.004
#> SRR2105371 2 0.7397 0.294890 0.044 0.472 0.256 0.000 0.080 0.148
#> SRR2105372 6 0.6007 0.189172 0.004 0.364 0.056 0.004 0.056 0.516
#> SRR2105369 3 0.4817 0.541703 0.008 0.040 0.748 0.004 0.120 0.080
#> SRR2105370 3 0.5824 0.432879 0.020 0.020 0.600 0.000 0.100 0.260
#> SRR2105367 5 0.7695 0.101015 0.216 0.060 0.048 0.000 0.340 0.336
#> SRR2105368 3 0.7763 -0.238184 0.288 0.000 0.296 0.004 0.220 0.192
#> SRR2105365 1 0.6767 0.108034 0.392 0.024 0.016 0.000 0.200 0.368
#> SRR2105366 6 0.6718 0.122111 0.136 0.020 0.312 0.004 0.036 0.492
#> SRR2105363 2 0.5827 0.407086 0.008 0.624 0.116 0.008 0.024 0.220
#> SRR2105364 2 0.7246 0.352352 0.024 0.496 0.188 0.004 0.212 0.076
#> SRR2105361 6 0.4695 0.324265 0.000 0.208 0.000 0.000 0.116 0.676
#> SRR2105362 6 0.5561 0.364047 0.008 0.244 0.008 0.004 0.120 0.616
#> SRR2105359 3 0.5108 0.136827 0.008 0.004 0.492 0.000 0.048 0.448
#> SRR2105360 3 0.8005 -0.036891 0.032 0.216 0.364 0.000 0.240 0.148
#> SRR2105355 3 0.7347 0.427005 0.020 0.140 0.568 0.056 0.100 0.116
#> SRR2105356 5 0.8544 0.149957 0.060 0.240 0.248 0.004 0.288 0.160
#> SRR2105353 6 0.7838 0.159651 0.132 0.064 0.120 0.008 0.192 0.484
#> SRR2105354 3 0.7216 0.467076 0.076 0.136 0.552 0.004 0.168 0.064
#> SRR2105351 3 0.6731 0.416999 0.028 0.112 0.584 0.000 0.140 0.136
#> SRR2105352 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.7129 0.361521 0.032 0.532 0.216 0.004 0.124 0.092
#> SRR2105350 2 0.4981 0.499497 0.020 0.740 0.076 0.000 0.048 0.116
#> SRR2105345 6 0.8677 0.023318 0.016 0.116 0.172 0.088 0.280 0.328
#> SRR2105346 5 0.7014 0.172515 0.036 0.056 0.340 0.000 0.452 0.116
#> SRR2105347 3 0.7135 0.247057 0.108 0.056 0.516 0.000 0.248 0.072
#> SRR2105348 3 0.7420 0.285614 0.088 0.068 0.480 0.004 0.280 0.080
#> SRR2105343 2 0.7023 0.384044 0.004 0.532 0.232 0.040 0.056 0.136
#> SRR2105344 2 0.5541 0.452263 0.032 0.684 0.032 0.000 0.092 0.160
#> SRR2105341 3 0.5981 0.524213 0.052 0.052 0.668 0.004 0.156 0.068
#> SRR2105342 3 0.6961 0.041302 0.008 0.144 0.408 0.000 0.076 0.364
#> SRR2105339 3 0.4024 0.524348 0.012 0.104 0.804 0.000 0.044 0.036
#> SRR2105340 3 0.4758 0.521987 0.072 0.016 0.760 0.000 0.060 0.092
#> SRR2105335 3 0.5119 0.519324 0.064 0.060 0.728 0.000 0.128 0.020
#> SRR2105336 3 0.7600 -0.070027 0.284 0.040 0.400 0.004 0.220 0.052
#> SRR2105337 3 0.5900 0.427767 0.056 0.264 0.604 0.000 0.056 0.020
#> SRR2105338 3 0.1148 0.495524 0.004 0.016 0.960 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105331 2 0.7346 0.330556 0.156 0.536 0.160 0.004 0.084 0.060
#> SRR2105332 3 0.8056 0.225520 0.228 0.108 0.428 0.008 0.172 0.056
#> SRR2105333 2 0.7087 0.425949 0.004 0.556 0.088 0.168 0.040 0.144
#> SRR2105334 2 0.6080 0.456426 0.000 0.604 0.108 0.000 0.100 0.188
#> SRR2105329 2 0.6913 0.244357 0.004 0.492 0.152 0.000 0.104 0.248
#> SRR2105330 2 0.6714 0.394703 0.020 0.576 0.132 0.000 0.156 0.116
#> SRR2105327 6 0.6839 0.252494 0.004 0.156 0.272 0.000 0.084 0.484
#> SRR2105328 3 0.7880 -0.079889 0.048 0.328 0.360 0.004 0.080 0.180
#> SRR2105325 3 0.4492 0.421142 0.216 0.000 0.712 0.000 0.052 0.020
#> SRR2105326 3 0.5666 0.317675 0.288 0.004 0.580 0.000 0.108 0.020
#> SRR2105323 2 0.6349 0.325187 0.008 0.496 0.024 0.000 0.304 0.168
#> SRR2105324 5 0.7251 0.262643 0.036 0.212 0.072 0.004 0.512 0.164
#> SRR2105319 3 0.5297 0.483546 0.180 0.016 0.684 0.000 0.096 0.024
#> SRR2105320 1 0.6066 0.304645 0.500 0.000 0.328 0.004 0.152 0.016
#> SRR2105321 3 0.8345 -0.172377 0.292 0.084 0.332 0.000 0.152 0.140
#> SRR2105322 3 0.6269 -0.075980 0.392 0.000 0.444 0.000 0.116 0.048
#> SRR2105317 6 0.7728 0.144747 0.004 0.224 0.004 0.300 0.144 0.324
#> SRR2105318 6 0.5115 0.272234 0.008 0.260 0.000 0.000 0.104 0.628
#> SRR2105315 2 0.3809 0.471907 0.008 0.780 0.004 0.004 0.028 0.176
#> SRR2105316 6 0.3274 0.416580 0.000 0.080 0.096 0.000 0.000 0.824
#> SRR2105313 2 0.6464 0.300993 0.008 0.464 0.024 0.000 0.180 0.324
#> SRR2105314 2 0.5214 0.390089 0.000 0.576 0.000 0.000 0.120 0.304
#> SRR2105311 2 0.6511 0.407456 0.212 0.596 0.084 0.016 0.080 0.012
#> SRR2105312 5 0.6996 -0.222932 0.408 0.056 0.056 0.008 0.416 0.056
#> SRR2105307 5 0.7486 0.117875 0.296 0.172 0.068 0.004 0.428 0.032
#> SRR2105308 6 0.6350 0.277187 0.044 0.068 0.064 0.000 0.224 0.600
#> SRR2105309 2 0.3401 0.477529 0.000 0.820 0.004 0.012 0.028 0.136
#> SRR2105310 3 0.6909 0.179783 0.012 0.288 0.464 0.000 0.056 0.180
#> SRR2105305 6 0.7953 0.189179 0.008 0.128 0.240 0.032 0.176 0.416
#> SRR2105306 2 0.7681 -0.197769 0.008 0.332 0.288 0.016 0.072 0.284
#> SRR2105303 2 0.7855 0.232310 0.040 0.400 0.140 0.000 0.148 0.272
#> SRR2105304 4 0.0363 0.869142 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105301 3 0.7006 0.419871 0.120 0.096 0.568 0.000 0.160 0.056
#> SRR2105302 2 0.6905 0.399229 0.028 0.540 0.216 0.000 0.080 0.136
#> SRR2105299 3 0.8127 0.096995 0.220 0.040 0.348 0.000 0.148 0.244
#> SRR2105300 2 0.8020 0.273276 0.056 0.440 0.140 0.004 0.188 0.172
#> SRR2105297 1 0.6739 0.257309 0.356 0.020 0.336 0.000 0.280 0.008
#> SRR2105298 1 0.5468 0.456188 0.676 0.004 0.152 0.000 0.112 0.056
#> SRR2105295 2 0.5786 0.419498 0.008 0.616 0.008 0.256 0.032 0.080
#> SRR2105296 6 0.4197 0.402908 0.052 0.060 0.044 0.000 0.036 0.808
#> SRR2105293 6 0.8162 0.119091 0.096 0.116 0.096 0.008 0.284 0.400
#> SRR2105294 3 0.5858 0.409735 0.260 0.028 0.604 0.004 0.092 0.012
#> SRR2105291 3 0.3932 0.525837 0.072 0.012 0.824 0.008 0.052 0.032
#> SRR2105292 1 0.6460 0.263427 0.456 0.008 0.120 0.008 0.380 0.028
#> SRR2105289 3 0.7055 0.126487 0.004 0.304 0.424 0.000 0.080 0.188
#> SRR2105290 3 0.5784 0.492126 0.112 0.016 0.672 0.000 0.116 0.084
#> SRR2105287 1 0.8163 -0.045419 0.280 0.028 0.180 0.000 0.248 0.264
#> SRR2105288 3 0.3680 0.514748 0.032 0.004 0.824 0.000 0.088 0.052
#> SRR2105285 2 0.5526 0.473000 0.024 0.636 0.024 0.000 0.252 0.064
#> SRR2105286 2 0.6671 0.451698 0.092 0.584 0.020 0.004 0.116 0.184
#> SRR2105283 5 0.7951 0.148942 0.264 0.072 0.044 0.004 0.328 0.288
#> SRR2105284 3 0.5211 0.542249 0.032 0.028 0.728 0.004 0.112 0.096
#> SRR2105281 6 0.7193 0.077932 0.012 0.148 0.368 0.004 0.076 0.392
#> SRR2105282 2 0.6178 0.393461 0.012 0.628 0.104 0.000 0.128 0.128
#> SRR2105259 6 0.6962 -0.117289 0.008 0.292 0.020 0.008 0.324 0.348
#> SRR2105260 2 0.6150 0.226686 0.008 0.436 0.004 0.000 0.368 0.184
#> SRR2105279 2 0.5107 0.427763 0.000 0.632 0.008 0.012 0.284 0.064
#> SRR2105280 2 0.5527 0.393284 0.020 0.596 0.072 0.000 0.012 0.300
#> SRR2105257 3 0.5815 0.080826 0.392 0.004 0.484 0.000 0.104 0.016
#> SRR2105258 1 0.6417 0.413791 0.596 0.040 0.168 0.000 0.160 0.036
#> SRR2105253 2 0.6019 0.166025 0.020 0.508 0.356 0.000 0.012 0.104
#> SRR2105254 2 0.7329 0.212348 0.004 0.444 0.100 0.012 0.156 0.284
#> SRR2105255 2 0.6534 0.435749 0.036 0.564 0.036 0.000 0.228 0.136
#> SRR2105256 3 0.6190 0.412396 0.020 0.036 0.548 0.000 0.304 0.092
#> SRR2105251 2 0.7844 0.190849 0.096 0.448 0.224 0.000 0.076 0.156
#> SRR2105252 6 0.6837 0.200607 0.048 0.248 0.004 0.000 0.260 0.440
#> SRR2105249 2 0.3002 0.491264 0.028 0.864 0.000 0.000 0.068 0.040
#> SRR2105250 3 0.8164 -0.237213 0.032 0.160 0.280 0.000 0.272 0.256
#> SRR2105247 2 0.7570 0.254530 0.040 0.436 0.144 0.000 0.100 0.280
#> SRR2105248 1 0.8409 0.233618 0.388 0.136 0.156 0.000 0.124 0.196
#> SRR2105245 1 0.8805 0.059667 0.288 0.188 0.124 0.004 0.140 0.256
#> SRR2105246 3 0.3794 0.529370 0.012 0.096 0.824 0.016 0.044 0.008
#> SRR2105243 3 0.6618 0.386057 0.004 0.176 0.556 0.000 0.112 0.152
#> SRR2105244 3 0.8288 -0.208600 0.100 0.308 0.316 0.000 0.188 0.088
#> SRR2105241 3 0.1649 0.500911 0.040 0.008 0.936 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105242 3 0.6094 0.489776 0.104 0.024 0.660 0.004 0.100 0.108
#> SRR2105239 6 0.6950 0.278976 0.140 0.128 0.068 0.000 0.084 0.580
#> SRR2105240 3 0.2444 0.504238 0.028 0.012 0.892 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105237 5 0.6907 0.151694 0.012 0.284 0.132 0.020 0.508 0.044
#> SRR2105238 2 0.5329 0.253103 0.004 0.520 0.024 0.000 0.408 0.044
#> SRR2105235 2 0.7163 0.093072 0.012 0.408 0.364 0.008 0.068 0.140
#> SRR2105236 3 0.5587 0.528818 0.020 0.112 0.688 0.000 0.056 0.124
#> SRR2105233 2 0.7073 0.150579 0.000 0.480 0.124 0.024 0.084 0.288
#> SRR2105234 2 0.5065 0.373704 0.004 0.668 0.004 0.004 0.112 0.208
#> SRR2105231 6 0.5822 0.131246 0.020 0.312 0.004 0.000 0.116 0.548
#> SRR2105232 2 0.8744 0.096819 0.108 0.316 0.148 0.004 0.204 0.220
#> SRR2105227 5 0.8626 0.111862 0.116 0.180 0.184 0.000 0.340 0.180
#> SRR2105228 3 0.7443 0.230982 0.020 0.116 0.448 0.004 0.132 0.280
#> SRR2105225 3 0.8610 -0.118119 0.128 0.256 0.280 0.000 0.104 0.232
#> SRR2105226 3 0.7904 0.265649 0.124 0.068 0.404 0.000 0.116 0.288
#> SRR2105229 3 0.5767 0.508348 0.020 0.092 0.672 0.000 0.072 0.144
#> SRR2105230 3 0.6473 0.439506 0.036 0.052 0.540 0.004 0.308 0.060
#> SRR2105219 2 0.5728 0.400308 0.016 0.608 0.284 0.008 0.028 0.056
#> SRR2105220 6 0.6698 0.317785 0.044 0.056 0.128 0.004 0.176 0.592
#> SRR2105221 3 0.0767 0.489872 0.004 0.008 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105222 1 0.7987 0.221904 0.336 0.024 0.160 0.004 0.312 0.164
#> SRR2105223 3 0.2895 0.523261 0.016 0.000 0.868 0.000 0.064 0.052
#> SRR2105224 3 0.4173 0.527006 0.044 0.048 0.804 0.004 0.088 0.012
#> SRR2105217 1 0.8853 0.169470 0.252 0.100 0.248 0.004 0.208 0.188
#> SRR2105218 3 0.7468 0.202111 0.076 0.324 0.432 0.000 0.096 0.072
#> SRR2105215 3 0.8040 -0.145635 0.024 0.236 0.340 0.000 0.208 0.192
#> SRR2105216 2 0.4435 0.326294 0.000 0.580 0.004 0.000 0.024 0.392
#> SRR2105213 3 0.6917 0.372728 0.192 0.000 0.524 0.008 0.124 0.152
#> SRR2105214 3 0.7896 0.241671 0.036 0.144 0.440 0.008 0.144 0.228
#> SRR2105211 6 0.7055 0.380686 0.036 0.152 0.152 0.004 0.096 0.560
#> SRR2105212 6 0.7871 0.146099 0.088 0.288 0.048 0.000 0.204 0.372
#> SRR2105209 3 0.7027 0.444126 0.108 0.048 0.564 0.008 0.200 0.072
#> SRR2105210 5 0.7839 0.033531 0.204 0.036 0.172 0.004 0.444 0.140
#> SRR2105207 5 0.6288 0.001185 0.408 0.048 0.012 0.004 0.460 0.068
#> SRR2105208 3 0.7607 -0.028178 0.296 0.032 0.332 0.004 0.288 0.048
#> SRR2105205 3 0.8368 -0.000626 0.108 0.244 0.384 0.004 0.156 0.104
#> SRR2105206 3 0.6052 0.264927 0.248 0.024 0.600 0.000 0.088 0.040
#> SRR2105201 3 0.7031 0.260644 0.020 0.116 0.492 0.004 0.288 0.080
#> SRR2105202 5 0.6917 -0.068847 0.020 0.324 0.012 0.004 0.372 0.268
#> SRR2105203 3 0.8607 -0.153516 0.080 0.224 0.284 0.004 0.136 0.272
#> SRR2105204 6 0.5100 0.169817 0.000 0.260 0.000 0.000 0.128 0.612
#> SRR2105199 5 0.7297 0.019735 0.016 0.208 0.060 0.004 0.420 0.292
#> SRR2105200 1 0.7907 -0.046692 0.368 0.072 0.100 0.000 0.128 0.332
#> SRR2105197 5 0.7705 0.202124 0.104 0.116 0.056 0.004 0.452 0.268
#> SRR2105198 3 0.6882 0.435215 0.100 0.036 0.556 0.000 0.100 0.208
#> SRR2105195 5 0.8783 0.002189 0.232 0.084 0.192 0.004 0.256 0.232
#> SRR2105196 3 0.3353 0.490301 0.156 0.008 0.808 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105193 3 0.6898 0.337760 0.260 0.056 0.532 0.008 0.116 0.028
#> SRR2105194 3 0.3807 0.450230 0.228 0.000 0.740 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105191 2 0.8119 -0.030678 0.032 0.344 0.108 0.016 0.176 0.324
#> SRR2105192 3 0.6208 0.395551 0.120 0.000 0.552 0.004 0.272 0.052
#> SRR2105189 2 0.5231 0.488615 0.044 0.732 0.004 0.028 0.088 0.104
#> SRR2105190 2 0.4688 0.481553 0.016 0.748 0.008 0.008 0.084 0.136
#> SRR2105187 6 0.8563 0.090163 0.120 0.144 0.132 0.012 0.188 0.404
#> SRR2105188 3 0.7744 -0.261384 0.308 0.012 0.324 0.004 0.244 0.108
#> SRR2105179 3 0.5606 0.521059 0.116 0.092 0.692 0.000 0.080 0.020
#> SRR2105180 1 0.5789 0.335231 0.520 0.000 0.324 0.000 0.144 0.012
#> SRR2105183 2 0.7065 0.146061 0.032 0.464 0.308 0.000 0.140 0.056
#> SRR2105184 3 0.7924 0.260137 0.224 0.124 0.448 0.004 0.140 0.060
#> SRR2105185 6 0.6097 0.378912 0.004 0.184 0.064 0.072 0.032 0.644
#> SRR2105186 3 0.8210 -0.044764 0.116 0.136 0.348 0.004 0.076 0.320
#> SRR2105181 3 0.7555 0.245394 0.188 0.056 0.456 0.004 0.244 0.052
#> SRR2105182 3 0.3221 0.525891 0.024 0.080 0.848 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105177 3 0.7226 0.152648 0.300 0.024 0.436 0.004 0.188 0.048
#> SRR2105178 1 0.4355 0.474245 0.724 0.000 0.208 0.000 0.052 0.016
#> SRR2105171 6 0.6464 0.233397 0.020 0.080 0.312 0.000 0.064 0.524
#> SRR2105172 2 0.7082 0.227634 0.008 0.472 0.088 0.000 0.216 0.216
#> SRR2105175 1 0.6262 0.431603 0.540 0.004 0.200 0.000 0.224 0.032
#> SRR2105176 3 0.4523 -0.045562 0.452 0.000 0.516 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105173 3 0.2102 0.512742 0.004 0.032 0.920 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105174 3 0.5155 0.392402 0.008 0.272 0.644 0.000 0.032 0.044
#> SRR2105169 6 0.8066 0.152188 0.048 0.292 0.244 0.004 0.084 0.328
#> SRR2105170 3 0.6737 0.428349 0.072 0.216 0.564 0.008 0.124 0.016
#> SRR2105167 6 0.6266 0.403233 0.020 0.140 0.144 0.004 0.064 0.628
#> SRR2105168 6 0.5635 0.066766 0.040 0.048 0.004 0.000 0.412 0.496
#> SRR2105165 3 0.7364 -0.014090 0.216 0.016 0.468 0.000 0.132 0.168
#> SRR2105166 3 0.5204 0.436883 0.184 0.016 0.696 0.000 0.068 0.036
#> SRR2105163 3 0.8520 0.050525 0.172 0.064 0.352 0.008 0.232 0.172
#> SRR2105164 3 0.6474 0.304510 0.312 0.008 0.500 0.004 0.144 0.032
#> SRR2105161 1 0.7498 0.139555 0.388 0.044 0.352 0.000 0.076 0.140
#> SRR2105162 1 0.2670 0.432221 0.884 0.000 0.052 0.000 0.044 0.020
#> SRR2105155 3 0.7930 0.101162 0.000 0.112 0.408 0.056 0.168 0.256
#> SRR2105156 3 0.4788 0.484752 0.000 0.248 0.668 0.000 0.012 0.072
#> SRR2105157 3 0.5808 0.509564 0.128 0.040 0.688 0.004 0.084 0.056
#> SRR2105158 3 0.8397 -0.053083 0.268 0.120 0.352 0.000 0.140 0.120
#> SRR2105159 1 0.6722 0.212105 0.440 0.016 0.044 0.004 0.380 0.116
#> SRR2105160 1 0.7425 0.142160 0.372 0.020 0.152 0.000 0.100 0.356
#> SRR2105153 2 0.8053 0.162005 0.036 0.360 0.256 0.000 0.192 0.156
#> SRR2105154 1 0.8358 0.214399 0.372 0.076 0.116 0.004 0.212 0.220
#> SRR2105151 6 0.6245 0.354568 0.032 0.108 0.244 0.000 0.032 0.584
#> SRR2105152 2 0.6834 0.282144 0.036 0.480 0.004 0.016 0.176 0.288
#> SRR2105149 3 0.5087 0.539350 0.012 0.128 0.732 0.004 0.060 0.064
#> SRR2105150 3 0.6172 0.150505 0.000 0.340 0.504 0.000 0.096 0.060
#> SRR2105147 4 0.3602 0.685829 0.000 0.056 0.000 0.784 0.000 0.160
#> SRR2105148 4 0.4824 0.512749 0.000 0.136 0.000 0.680 0.004 0.180
#> SRR2105143 5 0.7925 0.150063 0.100 0.040 0.288 0.000 0.348 0.224
#> SRR2105144 5 0.8345 0.130065 0.048 0.196 0.268 0.000 0.296 0.192
#> SRR2105145 3 0.6062 0.448911 0.176 0.096 0.636 0.000 0.072 0.020
#> SRR2105146 3 0.4282 0.468009 0.244 0.008 0.712 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105141 2 0.7007 0.419495 0.144 0.576 0.124 0.004 0.044 0.108
#> SRR2105142 3 0.7317 0.116797 0.080 0.344 0.428 0.000 0.052 0.096
#> SRR2105139 2 0.4942 0.482541 0.008 0.712 0.108 0.000 0.020 0.152
#> SRR2105140 3 0.5326 0.500593 0.000 0.156 0.668 0.000 0.036 0.140
#> SRR2105137 6 0.7737 0.195875 0.016 0.144 0.024 0.128 0.220 0.468
#> SRR2105138 3 0.6854 0.453381 0.060 0.064 0.548 0.004 0.256 0.068
#> SRR2105135 6 0.7991 0.302626 0.048 0.168 0.104 0.028 0.168 0.484
#> SRR2105136 2 0.5084 0.138216 0.016 0.504 0.000 0.000 0.044 0.436
#> SRR2105133 2 0.7059 0.252041 0.024 0.424 0.056 0.000 0.348 0.148
#> SRR2105134 3 0.7293 0.313791 0.024 0.164 0.492 0.000 0.208 0.112
#> SRR2105131 6 0.4256 0.407272 0.040 0.092 0.028 0.008 0.028 0.804
#> SRR2105132 3 0.6429 0.479712 0.132 0.016 0.612 0.008 0.164 0.068
#> SRR2105129 3 0.5909 -0.059460 0.356 0.000 0.512 0.000 0.040 0.092
#> SRR2105130 1 0.5940 0.385610 0.600 0.008 0.092 0.004 0.256 0.040
#> SRR2105127 3 0.4365 0.537032 0.044 0.064 0.784 0.000 0.096 0.012
#> SRR2105128 3 0.6366 0.336939 0.004 0.180 0.520 0.000 0.036 0.260
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.0730 0.125 0.650 0.316 0.847 0.847
#> 3 3 0.1584 0.570 0.782 0.266 0.526 0.502
#> 4 4 0.0733 0.498 0.720 0.236 0.931 0.886
#> 5 5 0.1370 0.470 0.683 0.149 0.860 0.767
#> 6 6 0.2117 0.362 0.633 0.169 0.822 0.660
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.753 0.37330 0.784 0.216
#> SRR2105278 1 0.625 0.47897 0.844 0.156
#> SRR2105275 1 0.662 0.45133 0.828 0.172
#> SRR2105276 1 0.327 0.51099 0.940 0.060
#> SRR2105273 1 0.518 0.48624 0.884 0.116
#> SRR2105274 1 0.760 0.32804 0.780 0.220
#> SRR2105271 1 0.975 -0.56115 0.592 0.408
#> SRR2105272 1 0.456 0.50006 0.904 0.096
#> SRR2105269 1 0.955 -0.35281 0.624 0.376
#> SRR2105270 2 0.997 0.94895 0.468 0.532
#> SRR2105267 1 0.994 -0.73659 0.544 0.456
#> SRR2105268 2 0.998 0.95379 0.476 0.524
#> SRR2105265 1 1.000 -0.90697 0.504 0.496
#> SRR2105266 2 0.996 0.94161 0.464 0.536
#> SRR2105263 1 0.443 0.50338 0.908 0.092
#> SRR2105264 1 0.456 0.50914 0.904 0.096
#> SRR2105261 1 0.584 0.44271 0.860 0.140
#> SRR2105262 1 0.992 -0.73675 0.552 0.448
#> SRR2105357 1 0.998 -0.84825 0.524 0.476
#> SRR2105358 1 0.871 0.09965 0.708 0.292
#> SRR2105439 1 0.988 -0.67873 0.564 0.436
#> SRR2105440 1 1.000 -0.89837 0.508 0.492
#> SRR2105509 1 0.981 0.03717 0.580 0.420
#> SRR2105510 1 0.904 -0.03714 0.680 0.320
#> SRR2105507 1 0.671 0.46628 0.824 0.176
#> SRR2105508 1 0.469 0.47678 0.900 0.100
#> SRR2105505 1 0.844 0.23024 0.728 0.272
#> SRR2105506 1 0.730 0.42030 0.796 0.204
#> SRR2105503 1 0.714 0.38181 0.804 0.196
#> SRR2105504 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105501 2 0.997 0.94895 0.468 0.532
#> SRR2105502 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105499 1 0.775 0.35875 0.772 0.228
#> SRR2105500 1 0.943 -0.33003 0.640 0.360
#> SRR2105497 1 0.373 0.51486 0.928 0.072
#> SRR2105498 1 0.839 0.36987 0.732 0.268
#> SRR2105495 1 0.990 -0.70227 0.560 0.440
#> SRR2105496 1 0.998 -0.81976 0.528 0.472
#> SRR2105493 1 0.995 -0.77991 0.540 0.460
#> SRR2105494 2 1.000 0.93522 0.492 0.508
#> SRR2105491 1 0.541 0.48576 0.876 0.124
#> SRR2105492 1 0.518 0.48958 0.884 0.116
#> SRR2105489 1 0.327 0.50447 0.940 0.060
#> SRR2105490 1 0.891 -0.04108 0.692 0.308
#> SRR2105487 1 0.482 0.51585 0.896 0.104
#> SRR2105488 1 0.745 0.34776 0.788 0.212
#> SRR2105485 1 0.996 -0.74147 0.536 0.464
#> SRR2105486 1 0.921 -0.17020 0.664 0.336
#> SRR2105483 1 0.814 0.38242 0.748 0.252
#> SRR2105484 1 0.909 0.31940 0.676 0.324
#> SRR2105481 1 0.402 0.51186 0.920 0.080
#> SRR2105482 1 0.574 0.46207 0.864 0.136
#> SRR2105479 1 0.430 0.50424 0.912 0.088
#> SRR2105480 1 0.494 0.49424 0.892 0.108
#> SRR2105477 1 0.311 0.51615 0.944 0.056
#> SRR2105478 1 0.327 0.51409 0.940 0.060
#> SRR2105475 2 1.000 0.87271 0.500 0.500
#> SRR2105476 1 0.680 0.40316 0.820 0.180
#> SRR2105473 1 0.876 0.02531 0.704 0.296
#> SRR2105474 1 0.866 0.05767 0.712 0.288
#> SRR2105471 1 0.456 0.50683 0.904 0.096
#> SRR2105472 1 0.416 0.51210 0.916 0.084
#> SRR2105469 1 0.917 -0.16182 0.668 0.332
#> SRR2105470 1 0.939 -0.29066 0.644 0.356
#> SRR2105467 1 0.653 0.46893 0.832 0.168
#> SRR2105468 1 0.745 0.38869 0.788 0.212
#> SRR2105465 1 0.921 -0.20455 0.664 0.336
#> SRR2105466 1 0.584 0.49491 0.860 0.140
#> SRR2105463 1 0.430 0.51293 0.912 0.088
#> SRR2105464 1 0.644 0.45930 0.836 0.164
#> SRR2105461 1 0.963 -0.39739 0.612 0.388
#> SRR2105462 2 0.999 0.94868 0.480 0.520
#> SRR2105459 1 0.998 -0.83818 0.524 0.476
#> SRR2105460 1 0.961 -0.35357 0.616 0.384
#> SRR2105457 1 0.997 -0.81516 0.532 0.468
#> SRR2105458 1 1.000 -0.90039 0.508 0.492
#> SRR2105455 1 0.966 -0.46016 0.608 0.392
#> SRR2105456 1 0.990 -0.70321 0.560 0.440
#> SRR2105453 1 0.913 -0.13770 0.672 0.328
#> SRR2105454 1 0.605 0.47922 0.852 0.148
#> SRR2105451 2 1.000 0.92886 0.496 0.504
#> SRR2105452 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105449 1 0.552 0.50076 0.872 0.128
#> SRR2105450 1 0.808 0.30979 0.752 0.248
#> SRR2105447 1 1.000 -0.87433 0.512 0.488
#> SRR2105448 1 0.991 -0.71477 0.556 0.444
#> SRR2105445 2 1.000 0.93700 0.492 0.508
#> SRR2105446 1 0.999 -0.85278 0.520 0.480
#> SRR2105443 1 1.000 -0.87165 0.504 0.496
#> SRR2105444 2 0.999 0.95264 0.480 0.520
#> SRR2105441 1 0.943 -0.30431 0.640 0.360
#> SRR2105442 1 0.808 0.21315 0.752 0.248
#> SRR2105437 1 0.714 0.43082 0.804 0.196
#> SRR2105438 1 0.722 0.42923 0.800 0.200
#> SRR2105435 1 0.900 -0.06081 0.684 0.316
#> SRR2105436 1 0.904 -0.06481 0.680 0.320
#> SRR2105433 1 0.443 0.50990 0.908 0.092
#> SRR2105434 1 0.430 0.48933 0.912 0.088
#> SRR2105431 1 0.634 0.45803 0.840 0.160
#> SRR2105432 1 0.615 0.46861 0.848 0.152
#> SRR2105429 1 0.456 0.50241 0.904 0.096
#> SRR2105430 1 0.730 0.33577 0.796 0.204
#> SRR2105427 1 1.000 -0.87845 0.508 0.492
#> SRR2105428 1 0.990 -0.69122 0.560 0.440
#> SRR2105425 1 0.996 -0.80143 0.536 0.464
#> SRR2105426 1 0.929 -0.20689 0.656 0.344
#> SRR2105421 1 1.000 -0.91194 0.504 0.496
#> SRR2105422 1 0.932 -0.24409 0.652 0.348
#> SRR2105423 1 0.671 0.39338 0.824 0.176
#> SRR2105424 2 0.998 0.95416 0.472 0.528
#> SRR2105419 1 0.895 -0.06613 0.688 0.312
#> SRR2105420 1 0.996 -0.80357 0.536 0.464
#> SRR2105415 1 0.388 0.51532 0.924 0.076
#> SRR2105416 1 0.605 0.47205 0.852 0.148
#> SRR2105417 1 0.671 0.41499 0.824 0.176
#> SRR2105418 1 0.518 0.49327 0.884 0.116
#> SRR2105413 1 0.994 -0.73675 0.544 0.456
#> SRR2105414 2 0.998 0.95216 0.472 0.528
#> SRR2105409 1 0.518 0.50449 0.884 0.116
#> SRR2105410 1 0.574 0.50812 0.864 0.136
#> SRR2105411 1 1.000 -0.90685 0.504 0.496
#> SRR2105412 2 0.999 0.94482 0.484 0.516
#> SRR2105407 1 0.939 -0.29707 0.644 0.356
#> SRR2105408 2 1.000 0.91553 0.500 0.500
#> SRR2105403 1 0.900 0.02520 0.684 0.316
#> SRR2105404 1 0.925 -0.10801 0.660 0.340
#> SRR2105405 1 0.963 -0.45044 0.612 0.388
#> SRR2105406 1 0.904 -0.05556 0.680 0.320
#> SRR2105401 1 0.936 -0.17309 0.648 0.352
#> SRR2105402 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105399 2 0.998 0.95113 0.476 0.524
#> SRR2105400 1 0.988 -0.65630 0.564 0.436
#> SRR2105397 1 0.653 0.46080 0.832 0.168
#> SRR2105398 1 0.969 -0.35317 0.604 0.396
#> SRR2105395 1 0.388 0.51231 0.924 0.076
#> SRR2105396 1 0.969 -0.50449 0.604 0.396
#> SRR2105393 1 0.996 -0.79512 0.536 0.464
#> SRR2105394 1 0.936 -0.26872 0.648 0.352
#> SRR2105389 1 0.615 0.41728 0.848 0.152
#> SRR2105390 1 0.327 0.51226 0.940 0.060
#> SRR2105391 1 0.689 0.42155 0.816 0.184
#> SRR2105392 1 0.469 0.47526 0.900 0.100
#> SRR2105385 1 0.456 0.50948 0.904 0.096
#> SRR2105386 1 0.730 0.40451 0.796 0.204
#> SRR2105387 1 0.985 -0.65494 0.572 0.428
#> SRR2105388 1 0.990 -0.69418 0.560 0.440
#> SRR2105381 1 0.844 0.16724 0.728 0.272
#> SRR2105382 1 0.574 0.45630 0.864 0.136
#> SRR2105383 1 0.958 -0.40190 0.620 0.380
#> SRR2105384 1 0.973 -0.52646 0.596 0.404
#> SRR2105379 1 0.224 0.51423 0.964 0.036
#> SRR2105380 1 0.327 0.51439 0.940 0.060
#> SRR2105377 1 0.999 -0.87407 0.516 0.484
#> SRR2105378 1 0.671 0.42957 0.824 0.176
#> SRR2105375 1 0.943 -0.32620 0.640 0.360
#> SRR2105376 1 0.939 -0.29856 0.644 0.356
#> SRR2105373 1 0.529 0.50845 0.880 0.120
#> SRR2105374 1 0.584 0.47644 0.860 0.140
#> SRR2105371 1 0.929 -0.21008 0.656 0.344
#> SRR2105372 1 0.909 -0.08717 0.676 0.324
#> SRR2105369 1 0.975 -0.55976 0.592 0.408
#> SRR2105370 1 0.985 -0.63046 0.572 0.428
#> SRR2105367 1 0.808 0.27228 0.752 0.248
#> SRR2105368 1 0.311 0.51399 0.944 0.056
#> SRR2105365 1 0.456 0.50221 0.904 0.096
#> SRR2105366 1 0.430 0.50577 0.912 0.088
#> SRR2105363 1 0.981 -0.60217 0.580 0.420
#> SRR2105364 2 0.997 0.94925 0.468 0.532
#> SRR2105361 1 0.983 -0.62662 0.576 0.424
#> SRR2105362 1 0.994 -0.76345 0.544 0.456
#> SRR2105359 1 0.949 -0.36204 0.632 0.368
#> SRR2105360 1 0.844 0.13581 0.728 0.272
#> SRR2105355 1 0.904 -0.09594 0.680 0.320
#> SRR2105356 1 0.993 -0.73646 0.548 0.452
#> SRR2105353 1 0.224 0.51357 0.964 0.036
#> SRR2105354 1 0.343 0.51436 0.936 0.064
#> SRR2105351 1 0.242 0.50806 0.960 0.040
#> SRR2105352 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105349 1 0.886 0.04763 0.696 0.304
#> SRR2105350 1 0.999 -0.85367 0.516 0.484
#> SRR2105345 1 0.993 -0.74106 0.548 0.452
#> SRR2105346 1 1.000 -0.90260 0.504 0.496
#> SRR2105347 1 0.615 0.43746 0.848 0.152
#> SRR2105348 1 0.662 0.45032 0.828 0.172
#> SRR2105343 1 0.722 0.34679 0.800 0.200
#> SRR2105344 2 0.998 0.95263 0.472 0.528
#> SRR2105341 1 0.689 0.41080 0.816 0.184
#> SRR2105342 1 0.932 -0.26260 0.652 0.348
#> SRR2105339 1 0.722 0.34700 0.800 0.200
#> SRR2105340 1 0.278 0.51492 0.952 0.048
#> SRR2105335 1 0.327 0.51176 0.940 0.060
#> SRR2105336 1 0.373 0.51191 0.928 0.072
#> SRR2105337 1 0.327 0.51533 0.940 0.060
#> SRR2105338 1 0.327 0.51043 0.940 0.060
#> SRR2105331 1 0.430 0.50871 0.912 0.088
#> SRR2105332 1 0.456 0.50467 0.904 0.096
#> SRR2105333 1 0.671 0.44419 0.824 0.176
#> SRR2105334 2 0.999 0.93882 0.484 0.516
#> SRR2105329 1 0.985 -0.64116 0.572 0.428
#> SRR2105330 1 0.996 -0.79726 0.536 0.464
#> SRR2105327 1 0.895 -0.06027 0.688 0.312
#> SRR2105328 1 0.861 0.10794 0.716 0.284
#> SRR2105325 1 0.697 0.43953 0.812 0.188
#> SRR2105326 1 0.634 0.46224 0.840 0.160
#> SRR2105323 1 0.949 -0.36226 0.632 0.368
#> SRR2105324 2 1.000 0.91496 0.500 0.500
#> SRR2105319 1 0.541 0.48587 0.876 0.124
#> SRR2105320 1 0.595 0.47361 0.856 0.144
#> SRR2105321 1 0.680 0.44366 0.820 0.180
#> SRR2105322 1 0.518 0.49095 0.884 0.116
#> SRR2105317 1 0.929 0.02650 0.656 0.344
#> SRR2105318 2 0.998 0.95393 0.476 0.524
#> SRR2105315 1 1.000 -0.89689 0.508 0.492
#> SRR2105316 2 0.997 0.94843 0.468 0.532
#> SRR2105313 1 0.996 -0.78787 0.536 0.464
#> SRR2105314 2 0.999 0.95235 0.480 0.520
#> SRR2105311 1 0.482 0.49598 0.896 0.104
#> SRR2105312 1 0.482 0.49622 0.896 0.104
#> SRR2105307 1 0.662 0.40084 0.828 0.172
#> SRR2105308 1 0.925 -0.20005 0.660 0.340
#> SRR2105309 1 0.966 -0.36609 0.608 0.392
#> SRR2105310 1 1.000 -0.88345 0.512 0.488
#> SRR2105305 1 0.900 0.01310 0.684 0.316
#> SRR2105306 1 1.000 -0.91309 0.500 0.500
#> SRR2105303 1 0.891 -0.03163 0.692 0.308
#> SRR2105304 1 0.995 0.20160 0.540 0.460
#> SRR2105301 1 0.358 0.50011 0.932 0.068
#> SRR2105302 1 0.980 -0.59080 0.584 0.416
#> SRR2105299 1 0.278 0.51477 0.952 0.048
#> SRR2105300 1 0.955 -0.37807 0.624 0.376
#> SRR2105297 1 0.697 0.44300 0.812 0.188
#> SRR2105298 1 0.775 0.39428 0.772 0.228
#> SRR2105295 1 0.788 0.30156 0.764 0.236
#> SRR2105296 1 0.469 0.48190 0.900 0.100
#> SRR2105293 1 0.163 0.51205 0.976 0.024
#> SRR2105294 1 0.430 0.50733 0.912 0.088
#> SRR2105291 1 0.625 0.42665 0.844 0.156
#> SRR2105292 1 0.506 0.51276 0.888 0.112
#> SRR2105289 1 0.988 -0.67299 0.564 0.436
#> SRR2105290 1 0.871 0.04925 0.708 0.292
#> SRR2105287 1 0.781 0.28040 0.768 0.232
#> SRR2105288 1 0.388 0.51467 0.924 0.076
#> SRR2105285 1 0.990 -0.68513 0.560 0.440
#> SRR2105286 1 0.992 -0.73323 0.552 0.448
#> SRR2105283 1 0.802 0.23220 0.756 0.244
#> SRR2105284 1 0.988 -0.69093 0.564 0.436
#> SRR2105281 1 0.999 -0.86240 0.516 0.484
#> SRR2105282 2 0.999 0.95386 0.480 0.520
#> SRR2105259 1 0.971 -0.47895 0.600 0.400
#> SRR2105260 2 0.999 0.95288 0.480 0.520
#> SRR2105279 1 0.985 -0.59755 0.572 0.428
#> SRR2105280 1 0.983 -0.61477 0.576 0.424
#> SRR2105257 1 0.518 0.50649 0.884 0.116
#> SRR2105258 1 0.482 0.49628 0.896 0.104
#> SRR2105253 1 0.881 0.00166 0.700 0.300
#> SRR2105254 1 0.981 -0.60970 0.580 0.420
#> SRR2105255 1 0.891 -0.04459 0.692 0.308
#> SRR2105256 1 0.966 -0.48723 0.608 0.392
#> SRR2105251 1 0.605 0.43819 0.852 0.148
#> SRR2105252 1 0.975 -0.55440 0.592 0.408
#> SRR2105249 1 0.985 -0.63992 0.572 0.428
#> SRR2105250 1 0.833 0.16443 0.736 0.264
#> SRR2105247 1 0.343 0.50173 0.936 0.064
#> SRR2105248 1 0.343 0.51064 0.936 0.064
#> SRR2105245 1 0.260 0.51303 0.956 0.044
#> SRR2105246 1 0.563 0.45504 0.868 0.132
#> SRR2105243 1 0.995 -0.76076 0.540 0.460
#> SRR2105244 1 0.722 0.45503 0.800 0.200
#> SRR2105241 1 0.541 0.49247 0.876 0.124
#> SRR2105242 1 0.242 0.51367 0.960 0.040
#> SRR2105239 1 0.506 0.49061 0.888 0.112
#> SRR2105240 1 0.529 0.50726 0.880 0.120
#> SRR2105237 1 0.913 -0.11588 0.672 0.328
#> SRR2105238 2 0.998 0.95187 0.472 0.528
#> SRR2105235 2 1.000 0.91891 0.500 0.500
#> SRR2105236 1 0.996 -0.79165 0.536 0.464
#> SRR2105233 1 0.722 0.41671 0.800 0.200
#> SRR2105234 1 0.839 0.16995 0.732 0.268
#> SRR2105231 1 0.891 -0.02575 0.692 0.308
#> SRR2105232 1 0.730 0.36754 0.796 0.204
#> SRR2105227 1 0.595 0.43835 0.856 0.144
#> SRR2105228 1 0.999 -0.85350 0.516 0.484
#> SRR2105225 1 0.909 -0.11013 0.676 0.324
#> SRR2105226 1 0.653 0.42743 0.832 0.168
#> SRR2105229 1 0.615 0.43450 0.848 0.152
#> SRR2105230 1 0.760 0.28928 0.780 0.220
#> SRR2105219 1 0.999 -0.81769 0.520 0.480
#> SRR2105220 2 1.000 0.91632 0.500 0.500
#> SRR2105221 1 0.900 -0.05192 0.684 0.316
#> SRR2105222 1 0.541 0.48388 0.876 0.124
#> SRR2105223 1 0.343 0.51494 0.936 0.064
#> SRR2105224 1 0.697 0.47335 0.812 0.188
#> SRR2105217 1 0.469 0.49785 0.900 0.100
#> SRR2105218 1 0.373 0.50048 0.928 0.072
#> SRR2105215 1 0.992 -0.72645 0.552 0.448
#> SRR2105216 2 0.998 0.95127 0.476 0.524
#> SRR2105213 1 0.416 0.51127 0.916 0.084
#> SRR2105214 1 0.402 0.49757 0.920 0.080
#> SRR2105211 1 0.978 -0.48978 0.588 0.412
#> SRR2105212 1 1.000 -0.91071 0.504 0.496
#> SRR2105209 1 0.730 0.39686 0.796 0.204
#> SRR2105210 1 0.224 0.51031 0.964 0.036
#> SRR2105207 1 0.388 0.51405 0.924 0.076
#> SRR2105208 1 0.456 0.50633 0.904 0.096
#> SRR2105205 1 0.430 0.50320 0.912 0.088
#> SRR2105206 1 0.443 0.50744 0.908 0.092
#> SRR2105201 1 0.993 -0.74271 0.548 0.452
#> SRR2105202 1 0.978 -0.55845 0.588 0.412
#> SRR2105203 1 0.795 0.28742 0.760 0.240
#> SRR2105204 1 0.961 -0.43445 0.616 0.384
#> SRR2105199 1 0.998 -0.82116 0.528 0.472
#> SRR2105200 1 0.788 0.26753 0.764 0.236
#> SRR2105197 1 0.946 -0.18655 0.636 0.364
#> SRR2105198 1 0.469 0.50580 0.900 0.100
#> SRR2105195 1 0.482 0.50151 0.896 0.104
#> SRR2105196 1 0.518 0.50919 0.884 0.116
#> SRR2105193 1 0.552 0.48900 0.872 0.128
#> SRR2105194 1 0.605 0.47139 0.852 0.148
#> SRR2105191 1 0.518 0.49135 0.884 0.116
#> SRR2105192 1 0.506 0.50065 0.888 0.112
#> SRR2105189 1 0.963 -0.44343 0.612 0.388
#> SRR2105190 2 0.999 0.94926 0.484 0.516
#> SRR2105187 1 0.482 0.49906 0.896 0.104
#> SRR2105188 1 0.327 0.51049 0.940 0.060
#> SRR2105179 1 0.430 0.50976 0.912 0.088
#> SRR2105180 1 0.506 0.49167 0.888 0.112
#> SRR2105183 2 1.000 0.91470 0.500 0.500
#> SRR2105184 1 0.529 0.45428 0.880 0.120
#> SRR2105185 1 0.900 -0.05174 0.684 0.316
#> SRR2105186 1 0.327 0.49766 0.940 0.060
#> SRR2105181 1 0.388 0.51331 0.924 0.076
#> SRR2105182 1 0.738 0.35373 0.792 0.208
#> SRR2105177 1 0.443 0.51315 0.908 0.092
#> SRR2105178 1 0.900 0.32606 0.684 0.316
#> SRR2105171 1 0.995 -0.78557 0.540 0.460
#> SRR2105172 1 0.997 -0.79990 0.532 0.468
#> SRR2105175 1 0.552 0.48358 0.872 0.128
#> SRR2105176 1 0.753 0.41577 0.784 0.216
#> SRR2105173 1 0.788 0.33947 0.764 0.236
#> SRR2105174 1 0.827 0.28760 0.740 0.260
#> SRR2105169 1 0.795 0.28767 0.760 0.240
#> SRR2105170 1 0.653 0.48841 0.832 0.168
#> SRR2105167 2 0.998 0.95152 0.472 0.528
#> SRR2105168 1 0.995 -0.77470 0.540 0.460
#> SRR2105165 1 0.430 0.50543 0.912 0.088
#> SRR2105166 1 0.430 0.50431 0.912 0.088
#> SRR2105163 1 0.506 0.49424 0.888 0.112
#> SRR2105164 1 0.482 0.49559 0.896 0.104
#> SRR2105161 1 0.456 0.49951 0.904 0.096
#> SRR2105162 1 0.574 0.47965 0.864 0.136
#> SRR2105155 1 0.988 -0.68596 0.564 0.436
#> SRR2105156 1 0.999 -0.85733 0.516 0.484
#> SRR2105157 1 0.402 0.50713 0.920 0.080
#> SRR2105158 1 0.443 0.50070 0.908 0.092
#> SRR2105159 1 0.456 0.50612 0.904 0.096
#> SRR2105160 1 0.443 0.51244 0.908 0.092
#> SRR2105153 1 0.430 0.51159 0.912 0.088
#> SRR2105154 1 0.469 0.49734 0.900 0.100
#> SRR2105151 1 0.900 -0.07222 0.684 0.316
#> SRR2105152 1 1.000 -0.87015 0.512 0.488
#> SRR2105149 1 0.943 -0.29148 0.640 0.360
#> SRR2105150 2 0.998 0.95170 0.476 0.524
#> SRR2105147 1 0.904 0.31645 0.680 0.320
#> SRR2105148 1 0.827 0.37727 0.740 0.260
#> SRR2105143 1 0.788 0.25408 0.764 0.236
#> SRR2105144 1 0.949 -0.34100 0.632 0.368
#> SRR2105145 1 0.506 0.49167 0.888 0.112
#> SRR2105146 1 0.552 0.48353 0.872 0.128
#> SRR2105141 1 0.469 0.49817 0.900 0.100
#> SRR2105142 1 0.574 0.50661 0.864 0.136
#> SRR2105139 1 0.981 -0.60865 0.580 0.420
#> SRR2105140 1 0.990 -0.68771 0.560 0.440
#> SRR2105137 1 0.993 -0.73018 0.548 0.452
#> SRR2105138 1 0.795 0.25695 0.760 0.240
#> SRR2105135 1 1.000 -0.89372 0.508 0.492
#> SRR2105136 1 0.994 -0.76191 0.544 0.456
#> SRR2105133 1 0.929 -0.16823 0.656 0.344
#> SRR2105134 1 0.814 0.22083 0.748 0.252
#> SRR2105131 1 0.981 -0.61053 0.580 0.420
#> SRR2105132 1 0.552 0.47670 0.872 0.128
#> SRR2105129 1 0.584 0.48952 0.860 0.140
#> SRR2105130 1 0.753 0.41458 0.784 0.216
#> SRR2105127 1 0.689 0.38367 0.816 0.184
#> SRR2105128 1 0.932 -0.21474 0.652 0.348
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 2 0.6931 0.43364 0.328 0.640 0.032
#> SRR2105278 2 0.7744 -0.00914 0.448 0.504 0.048
#> SRR2105275 1 0.6161 0.64938 0.696 0.288 0.016
#> SRR2105276 1 0.6667 0.53989 0.616 0.368 0.016
#> SRR2105273 2 0.6713 0.16843 0.416 0.572 0.012
#> SRR2105274 2 0.6228 0.36090 0.372 0.624 0.004
#> SRR2105271 2 0.5493 0.63401 0.232 0.756 0.012
#> SRR2105272 1 0.3845 0.60621 0.872 0.116 0.012
#> SRR2105269 2 0.1636 0.73676 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105270 2 0.0983 0.73518 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105267 2 0.1482 0.73860 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105268 2 0.0661 0.73486 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105265 2 0.0661 0.73619 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105266 2 0.1170 0.74281 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105263 1 0.6404 0.60167 0.644 0.344 0.012
#> SRR2105264 1 0.6102 0.63829 0.672 0.320 0.008
#> SRR2105261 2 0.5656 0.53957 0.284 0.712 0.004
#> SRR2105262 2 0.3989 0.73480 0.124 0.864 0.012
#> SRR2105357 2 0.3459 0.72888 0.096 0.892 0.012
#> SRR2105358 2 0.6229 0.54599 0.280 0.700 0.020
#> SRR2105439 2 0.4345 0.72058 0.136 0.848 0.016
#> SRR2105440 2 0.3112 0.74792 0.056 0.916 0.028
#> SRR2105509 2 0.3771 0.68868 0.012 0.876 0.112
#> SRR2105510 2 0.0983 0.73676 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105507 2 0.5529 0.46982 0.296 0.704 0.000
#> SRR2105508 2 0.6143 0.52029 0.304 0.684 0.012
#> SRR2105505 2 0.6282 0.48328 0.324 0.664 0.012
#> SRR2105506 1 0.7471 0.16880 0.516 0.448 0.036
#> SRR2105503 2 0.4682 0.65357 0.192 0.804 0.004
#> SRR2105504 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105501 2 0.0747 0.73466 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105502 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105499 2 0.6724 0.18065 0.420 0.568 0.012
#> SRR2105500 2 0.6388 0.54229 0.284 0.692 0.024
#> SRR2105497 2 0.6654 -0.12783 0.456 0.536 0.008
#> SRR2105498 2 0.5928 0.49525 0.296 0.696 0.008
#> SRR2105495 2 0.1170 0.73521 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105496 2 0.1999 0.74296 0.036 0.952 0.012
#> SRR2105493 2 0.1015 0.73957 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105494 2 0.1170 0.73798 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105491 1 0.5360 0.66748 0.768 0.220 0.012
#> SRR2105492 1 0.5247 0.66836 0.768 0.224 0.008
#> SRR2105489 2 0.6881 0.16366 0.388 0.592 0.020
#> SRR2105490 2 0.5731 0.64350 0.228 0.752 0.020
#> SRR2105487 1 0.6483 0.32443 0.544 0.452 0.004
#> SRR2105488 2 0.6865 0.31764 0.384 0.596 0.020
#> SRR2105485 2 0.5585 0.63634 0.204 0.772 0.024
#> SRR2105486 2 0.6416 0.50477 0.304 0.676 0.020
#> SRR2105483 1 0.4399 0.37043 0.864 0.044 0.092
#> SRR2105484 1 0.4994 0.20165 0.816 0.024 0.160
#> SRR2105481 1 0.6339 0.56458 0.632 0.360 0.008
#> SRR2105482 2 0.7187 -0.13053 0.480 0.496 0.024
#> SRR2105479 1 0.5902 0.63219 0.680 0.316 0.004
#> SRR2105480 1 0.5378 0.66777 0.756 0.236 0.008
#> SRR2105477 2 0.6925 -0.05352 0.452 0.532 0.016
#> SRR2105478 1 0.6676 0.27955 0.516 0.476 0.008
#> SRR2105475 2 0.0892 0.73044 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105476 2 0.2793 0.74372 0.044 0.928 0.028
#> SRR2105473 2 0.6526 0.57340 0.260 0.704 0.036
#> SRR2105474 2 0.5956 0.58667 0.264 0.720 0.016
#> SRR2105471 1 0.7049 0.32289 0.528 0.452 0.020
#> SRR2105472 1 0.6836 0.46182 0.572 0.412 0.016
#> SRR2105469 2 0.3310 0.74752 0.064 0.908 0.028
#> SRR2105470 2 0.5455 0.67031 0.204 0.776 0.020
#> SRR2105467 2 0.6912 0.06662 0.444 0.540 0.016
#> SRR2105468 2 0.7169 0.22100 0.404 0.568 0.028
#> SRR2105465 2 0.5656 0.56268 0.284 0.712 0.004
#> SRR2105466 1 0.6483 0.34757 0.544 0.452 0.004
#> SRR2105463 1 0.6313 0.63842 0.676 0.308 0.016
#> SRR2105464 1 0.2793 0.46741 0.928 0.044 0.028
#> SRR2105461 2 0.1905 0.73690 0.016 0.956 0.028
#> SRR2105462 2 0.0424 0.73090 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105459 2 0.1267 0.73407 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105460 2 0.1411 0.72935 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105457 2 0.2939 0.74910 0.072 0.916 0.012
#> SRR2105458 2 0.2318 0.74535 0.028 0.944 0.028
#> SRR2105455 2 0.1774 0.74410 0.024 0.960 0.016
#> SRR2105456 2 0.2772 0.74290 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105453 2 0.6998 0.51717 0.292 0.664 0.044
#> SRR2105454 1 0.8037 0.36060 0.572 0.352 0.076
#> SRR2105451 2 0.0983 0.74182 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105452 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105449 2 0.7169 -0.06420 0.456 0.520 0.024
#> SRR2105450 2 0.7203 0.16417 0.416 0.556 0.028
#> SRR2105447 2 0.1267 0.73661 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105448 2 0.1950 0.74656 0.040 0.952 0.008
#> SRR2105445 2 0.0661 0.73672 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105446 2 0.1525 0.74816 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105443 2 0.1585 0.74539 0.028 0.964 0.008
#> SRR2105444 2 0.3359 0.74122 0.084 0.900 0.016
#> SRR2105441 2 0.4861 0.68836 0.180 0.808 0.012
#> SRR2105442 2 0.5845 0.51810 0.308 0.688 0.004
#> SRR2105437 1 0.2434 0.47068 0.940 0.036 0.024
#> SRR2105438 1 0.2173 0.39090 0.944 0.008 0.048
#> SRR2105435 2 0.4840 0.67387 0.168 0.816 0.016
#> SRR2105436 2 0.5639 0.62692 0.232 0.752 0.016
#> SRR2105433 1 0.6441 0.65964 0.696 0.276 0.028
#> SRR2105434 2 0.7054 -0.01712 0.456 0.524 0.020
#> SRR2105431 1 0.3896 0.44725 0.888 0.052 0.060
#> SRR2105432 1 0.2050 0.45224 0.952 0.028 0.020
#> SRR2105429 2 0.6814 0.30674 0.372 0.608 0.020
#> SRR2105430 2 0.5406 0.64028 0.224 0.764 0.012
#> SRR2105427 2 0.0747 0.72993 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105428 2 0.1999 0.74213 0.036 0.952 0.012
#> SRR2105425 2 0.1482 0.74403 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105426 2 0.4139 0.72326 0.124 0.860 0.016
#> SRR2105421 2 0.1015 0.73860 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105422 2 0.3695 0.73784 0.108 0.880 0.012
#> SRR2105423 2 0.3213 0.74037 0.060 0.912 0.028
#> SRR2105424 2 0.0592 0.73083 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105419 2 0.4326 0.71844 0.144 0.844 0.012
#> SRR2105420 2 0.1015 0.73847 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105415 1 0.5992 0.65674 0.716 0.268 0.016
#> SRR2105416 1 0.4289 0.50552 0.868 0.092 0.040
#> SRR2105417 2 0.6881 0.29465 0.388 0.592 0.020
#> SRR2105418 1 0.5339 0.44576 0.824 0.080 0.096
#> SRR2105413 2 0.1129 0.73455 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105414 2 0.0592 0.73153 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105409 2 0.6180 0.36268 0.332 0.660 0.008
#> SRR2105410 1 0.6598 0.44987 0.564 0.428 0.008
#> SRR2105411 2 0.1163 0.73221 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105412 2 0.2998 0.74175 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105407 2 0.2772 0.74779 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105408 2 0.2414 0.74613 0.040 0.940 0.020
#> SRR2105403 2 0.5899 0.59625 0.244 0.736 0.020
#> SRR2105404 2 0.6337 0.55783 0.264 0.708 0.028
#> SRR2105405 2 0.2845 0.74947 0.068 0.920 0.012
#> SRR2105406 2 0.6451 0.53077 0.292 0.684 0.024
#> SRR2105401 2 0.1031 0.73433 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105402 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105399 2 0.0747 0.73190 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105400 2 0.1647 0.72975 0.004 0.960 0.036
#> SRR2105397 2 0.6659 0.50784 0.304 0.668 0.028
#> SRR2105398 2 0.4782 0.69950 0.164 0.820 0.016
#> SRR2105395 2 0.6434 0.22261 0.380 0.612 0.008
#> SRR2105396 2 0.4645 0.69319 0.176 0.816 0.008
#> SRR2105393 2 0.2056 0.74531 0.024 0.952 0.024
#> SRR2105394 2 0.2356 0.74208 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105389 2 0.6420 0.54423 0.288 0.688 0.024
#> SRR2105390 2 0.6676 -0.06947 0.476 0.516 0.008
#> SRR2105391 2 0.6677 0.46158 0.324 0.652 0.024
#> SRR2105392 2 0.6404 0.43945 0.344 0.644 0.012
#> SRR2105385 1 0.6513 0.52864 0.592 0.400 0.008
#> SRR2105386 2 0.5480 0.54954 0.264 0.732 0.004
#> SRR2105387 2 0.1765 0.74736 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105388 2 0.5012 0.64992 0.204 0.788 0.008
#> SRR2105381 2 0.2793 0.74643 0.044 0.928 0.028
#> SRR2105382 2 0.5072 0.65575 0.196 0.792 0.012
#> SRR2105383 2 0.4551 0.71816 0.140 0.840 0.020
#> SRR2105384 2 0.5167 0.69084 0.172 0.804 0.024
#> SRR2105379 2 0.6521 0.53458 0.248 0.712 0.040
#> SRR2105380 1 0.6520 0.27189 0.508 0.488 0.004
#> SRR2105377 2 0.3987 0.73636 0.108 0.872 0.020
#> SRR2105378 2 0.7029 0.07736 0.440 0.540 0.020
#> SRR2105375 2 0.4128 0.73040 0.132 0.856 0.012
#> SRR2105376 2 0.6937 0.53947 0.272 0.680 0.048
#> SRR2105373 2 0.6823 -0.12330 0.484 0.504 0.012
#> SRR2105374 1 0.1337 0.44751 0.972 0.016 0.012
#> SRR2105371 2 0.1989 0.74952 0.048 0.948 0.004
#> SRR2105372 2 0.4873 0.70612 0.152 0.824 0.024
#> SRR2105369 2 0.3234 0.74755 0.072 0.908 0.020
#> SRR2105370 2 0.5578 0.60594 0.240 0.748 0.012
#> SRR2105367 2 0.6811 0.26538 0.404 0.580 0.016
#> SRR2105368 1 0.6906 0.54516 0.644 0.324 0.032
#> SRR2105365 1 0.6548 0.55319 0.616 0.372 0.012
#> SRR2105366 1 0.6359 0.50114 0.592 0.404 0.004
#> SRR2105363 2 0.2564 0.74713 0.036 0.936 0.028
#> SRR2105364 2 0.1015 0.73952 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105361 2 0.1905 0.73504 0.016 0.956 0.028
#> SRR2105362 2 0.2063 0.74891 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105359 2 0.6108 0.60230 0.240 0.732 0.028
#> SRR2105360 2 0.4645 0.69846 0.176 0.816 0.008
#> SRR2105355 2 0.4994 0.70421 0.160 0.816 0.024
#> SRR2105356 2 0.5455 0.64742 0.204 0.776 0.020
#> SRR2105353 2 0.6664 -0.09369 0.464 0.528 0.008
#> SRR2105354 1 0.6735 0.40776 0.564 0.424 0.012
#> SRR2105351 2 0.5982 0.41169 0.328 0.668 0.004
#> SRR2105352 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105349 2 0.3826 0.71021 0.124 0.868 0.008
#> SRR2105350 2 0.1919 0.74467 0.024 0.956 0.020
#> SRR2105345 2 0.1315 0.73863 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105346 2 0.5508 0.66091 0.188 0.784 0.028
#> SRR2105347 2 0.6553 0.23580 0.412 0.580 0.008
#> SRR2105348 2 0.6954 0.40359 0.352 0.620 0.028
#> SRR2105343 2 0.3042 0.74287 0.040 0.920 0.040
#> SRR2105344 2 0.0747 0.73304 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105341 2 0.6422 0.46460 0.324 0.660 0.016
#> SRR2105342 2 0.4861 0.68198 0.192 0.800 0.008
#> SRR2105339 2 0.5551 0.65096 0.224 0.760 0.016
#> SRR2105340 1 0.6521 0.18763 0.504 0.492 0.004
#> SRR2105335 1 0.6950 0.23133 0.508 0.476 0.016
#> SRR2105336 1 0.6451 0.47486 0.608 0.384 0.008
#> SRR2105337 1 0.6676 0.26677 0.516 0.476 0.008
#> SRR2105338 1 0.6309 0.15690 0.504 0.496 0.000
#> SRR2105331 2 0.6659 -0.13368 0.460 0.532 0.008
#> SRR2105332 1 0.6724 0.47281 0.568 0.420 0.012
#> SRR2105333 2 0.4058 0.72806 0.076 0.880 0.044
#> SRR2105334 2 0.0661 0.73413 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105329 2 0.0848 0.73752 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105330 2 0.1015 0.73984 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105327 2 0.3769 0.73256 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105328 2 0.3826 0.72175 0.124 0.868 0.008
#> SRR2105325 1 0.5366 0.66800 0.776 0.208 0.016
#> SRR2105326 1 0.4371 0.59988 0.860 0.108 0.032
#> SRR2105323 2 0.3618 0.73962 0.104 0.884 0.012
#> SRR2105324 2 0.3272 0.74165 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105319 1 0.4915 0.66698 0.804 0.184 0.012
#> SRR2105320 1 0.1774 0.45860 0.960 0.024 0.016
#> SRR2105321 1 0.6262 0.65481 0.696 0.284 0.020
#> SRR2105322 1 0.5502 0.66656 0.744 0.248 0.008
#> SRR2105317 2 0.2050 0.74067 0.020 0.952 0.028
#> SRR2105318 2 0.0592 0.73269 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105315 2 0.0237 0.73206 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105316 2 0.0237 0.73182 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105313 2 0.0848 0.73823 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105314 2 0.0424 0.73419 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105311 1 0.6339 0.57433 0.632 0.360 0.008
#> SRR2105312 1 0.5982 0.61328 0.668 0.328 0.004
#> SRR2105307 2 0.7030 0.27050 0.396 0.580 0.024
#> SRR2105308 2 0.6490 0.58746 0.256 0.708 0.036
#> SRR2105309 2 0.2152 0.74783 0.036 0.948 0.016
#> SRR2105310 2 0.2749 0.74593 0.064 0.924 0.012
#> SRR2105305 2 0.5526 0.68219 0.172 0.792 0.036
#> SRR2105306 2 0.1905 0.74228 0.016 0.956 0.028
#> SRR2105303 2 0.2527 0.74989 0.044 0.936 0.020
#> SRR2105304 3 0.1647 1.00000 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105301 2 0.5733 0.48369 0.324 0.676 0.000
#> SRR2105302 2 0.1999 0.74491 0.036 0.952 0.012
#> SRR2105299 2 0.6664 -0.05741 0.464 0.528 0.008
#> SRR2105300 2 0.3918 0.71480 0.140 0.856 0.004
#> SRR2105297 1 0.5344 0.45805 0.824 0.084 0.092
#> SRR2105298 1 0.6447 0.21534 0.744 0.060 0.196
#> SRR2105295 2 0.2564 0.74264 0.028 0.936 0.036
#> SRR2105296 2 0.5024 0.61712 0.220 0.776 0.004
#> SRR2105293 2 0.7232 0.04191 0.428 0.544 0.028
#> SRR2105294 1 0.5480 0.66667 0.732 0.264 0.004
#> SRR2105291 2 0.6404 0.42737 0.344 0.644 0.012
#> SRR2105292 1 0.6282 0.61398 0.664 0.324 0.012
#> SRR2105289 2 0.1950 0.74976 0.040 0.952 0.008
#> SRR2105290 2 0.6702 0.45889 0.328 0.648 0.024
#> SRR2105287 2 0.7163 0.44446 0.332 0.628 0.040
#> SRR2105288 1 0.6800 0.53362 0.660 0.308 0.032
#> SRR2105285 2 0.2297 0.74369 0.020 0.944 0.036
#> SRR2105286 2 0.2297 0.74508 0.036 0.944 0.020
#> SRR2105283 2 0.5053 0.68097 0.164 0.812 0.024
#> SRR2105284 2 0.5659 0.59447 0.248 0.740 0.012
#> SRR2105281 2 0.1905 0.74299 0.016 0.956 0.028
#> SRR2105282 2 0.0829 0.73491 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105259 2 0.3120 0.74590 0.080 0.908 0.012
#> SRR2105260 2 0.1182 0.73997 0.012 0.976 0.012
#> SRR2105279 2 0.1337 0.73699 0.012 0.972 0.016
#> SRR2105280 2 0.0829 0.74036 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105257 1 0.4796 0.66457 0.780 0.220 0.000
#> SRR2105258 1 0.4465 0.66124 0.820 0.176 0.004
#> SRR2105253 2 0.2866 0.74269 0.076 0.916 0.008
#> SRR2105254 2 0.1647 0.74441 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105255 2 0.5404 0.60657 0.256 0.740 0.004
#> SRR2105256 2 0.5843 0.58884 0.252 0.732 0.016
#> SRR2105251 2 0.4968 0.68110 0.188 0.800 0.012
#> SRR2105252 2 0.2384 0.75041 0.056 0.936 0.008
#> SRR2105249 2 0.1399 0.74476 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105250 2 0.6217 0.57521 0.264 0.712 0.024
#> SRR2105247 2 0.5378 0.59807 0.236 0.756 0.008
#> SRR2105248 1 0.6359 0.50142 0.592 0.404 0.004
#> SRR2105245 1 0.6577 0.44007 0.572 0.420 0.008
#> SRR2105246 2 0.5953 0.57378 0.280 0.708 0.012
#> SRR2105243 2 0.3129 0.74152 0.088 0.904 0.008
#> SRR2105244 2 0.6235 0.10495 0.436 0.564 0.000
#> SRR2105241 2 0.6204 0.14086 0.424 0.576 0.000
#> SRR2105242 1 0.6859 0.43737 0.564 0.420 0.016
#> SRR2105239 2 0.6298 0.31857 0.388 0.608 0.004
#> SRR2105240 1 0.5406 0.65480 0.764 0.224 0.012
#> SRR2105237 2 0.3237 0.73933 0.056 0.912 0.032
#> SRR2105238 2 0.0829 0.73830 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105235 2 0.0661 0.73810 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105236 2 0.3755 0.72898 0.120 0.872 0.008
#> SRR2105233 2 0.3337 0.74417 0.060 0.908 0.032
#> SRR2105234 2 0.1781 0.74420 0.020 0.960 0.020
#> SRR2105231 2 0.4413 0.67975 0.160 0.832 0.008
#> SRR2105232 2 0.5660 0.63521 0.200 0.772 0.028
#> SRR2105227 2 0.6066 0.57340 0.248 0.728 0.024
#> SRR2105228 2 0.3851 0.71616 0.136 0.860 0.004
#> SRR2105225 2 0.5618 0.59436 0.260 0.732 0.008
#> SRR2105226 2 0.6297 0.42333 0.352 0.640 0.008
#> SRR2105229 2 0.5775 0.60349 0.260 0.728 0.012
#> SRR2105230 2 0.6796 0.41596 0.344 0.632 0.024
#> SRR2105219 2 0.1015 0.73770 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105220 2 0.1525 0.73518 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105221 2 0.6313 0.49987 0.308 0.676 0.016
#> SRR2105222 1 0.6675 0.43574 0.584 0.404 0.012
#> SRR2105223 1 0.6617 0.38070 0.556 0.436 0.008
#> SRR2105224 2 0.6307 -0.13496 0.488 0.512 0.000
#> SRR2105217 1 0.5986 0.65608 0.704 0.284 0.012
#> SRR2105218 2 0.6816 -0.08392 0.472 0.516 0.012
#> SRR2105215 2 0.2229 0.75092 0.044 0.944 0.012
#> SRR2105216 2 0.0983 0.73619 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105213 1 0.6215 0.44931 0.572 0.428 0.000
#> SRR2105214 2 0.6543 0.41003 0.344 0.640 0.016
#> SRR2105211 2 0.3769 0.73834 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105212 2 0.2569 0.74532 0.032 0.936 0.032
#> SRR2105209 2 0.6769 0.28047 0.392 0.592 0.016
#> SRR2105210 1 0.7378 0.45917 0.560 0.404 0.036
#> SRR2105207 1 0.6796 0.55393 0.612 0.368 0.020
#> SRR2105208 1 0.5849 0.63211 0.756 0.216 0.028
#> SRR2105205 1 0.6520 0.27522 0.508 0.488 0.004
#> SRR2105206 1 0.6398 0.49431 0.580 0.416 0.004
#> SRR2105201 2 0.3918 0.73112 0.120 0.868 0.012
#> SRR2105202 2 0.5687 0.61876 0.224 0.756 0.020
#> SRR2105203 2 0.3618 0.73584 0.104 0.884 0.012
#> SRR2105204 2 0.1399 0.74336 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105199 2 0.1877 0.74912 0.032 0.956 0.012
#> SRR2105200 2 0.6008 0.47442 0.332 0.664 0.004
#> SRR2105197 2 0.6445 0.47977 0.308 0.672 0.020
#> SRR2105198 1 0.6763 0.34620 0.552 0.436 0.012
#> SRR2105195 1 0.6648 0.58626 0.620 0.364 0.016
#> SRR2105196 1 0.6129 0.62861 0.668 0.324 0.008
#> SRR2105193 1 0.4349 0.57110 0.852 0.128 0.020
#> SRR2105194 1 0.3337 0.49617 0.908 0.060 0.032
#> SRR2105191 2 0.7712 0.20391 0.392 0.556 0.052
#> SRR2105192 1 0.6746 0.54225 0.732 0.192 0.076
#> SRR2105189 2 0.1832 0.74630 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105190 2 0.1015 0.73815 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105187 1 0.6104 0.57958 0.648 0.348 0.004
#> SRR2105188 1 0.6955 0.18064 0.496 0.488 0.016
#> SRR2105179 1 0.6600 0.53438 0.604 0.384 0.012
#> SRR2105180 1 0.2384 0.50709 0.936 0.056 0.008
#> SRR2105183 2 0.0829 0.73638 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105184 2 0.6527 0.23931 0.404 0.588 0.008
#> SRR2105185 2 0.3083 0.75040 0.060 0.916 0.024
#> SRR2105186 2 0.6598 0.12652 0.428 0.564 0.008
#> SRR2105181 1 0.7186 0.21017 0.500 0.476 0.024
#> SRR2105182 2 0.6543 0.42548 0.344 0.640 0.016
#> SRR2105177 1 0.6416 0.65106 0.676 0.304 0.020
#> SRR2105178 1 0.5122 0.11802 0.788 0.012 0.200
#> SRR2105171 2 0.2050 0.74050 0.020 0.952 0.028
#> SRR2105172 2 0.0829 0.73949 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105175 1 0.3445 0.57179 0.896 0.088 0.016
#> SRR2105176 1 0.3415 0.37837 0.900 0.020 0.080
#> SRR2105173 2 0.5619 0.57546 0.244 0.744 0.012
#> SRR2105174 2 0.4805 0.65560 0.176 0.812 0.012
#> SRR2105169 2 0.4978 0.63299 0.216 0.780 0.004
#> SRR2105170 2 0.6825 -0.17891 0.488 0.500 0.012
#> SRR2105167 2 0.0829 0.73488 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105168 2 0.1267 0.74298 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105165 1 0.5815 0.64142 0.692 0.304 0.004
#> SRR2105166 1 0.5244 0.66678 0.756 0.240 0.004
#> SRR2105163 1 0.6275 0.58764 0.644 0.348 0.008
#> SRR2105164 1 0.5480 0.66243 0.732 0.264 0.004
#> SRR2105161 1 0.5553 0.66056 0.724 0.272 0.004
#> SRR2105162 1 0.2806 0.45763 0.928 0.040 0.032
#> SRR2105155 2 0.1170 0.73778 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105156 2 0.1170 0.74132 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105157 1 0.6654 0.38439 0.536 0.456 0.008
#> SRR2105158 1 0.5864 0.65294 0.704 0.288 0.008
#> SRR2105159 1 0.6313 0.63620 0.676 0.308 0.016
#> SRR2105160 1 0.6229 0.60393 0.652 0.340 0.008
#> SRR2105153 2 0.6330 0.18862 0.396 0.600 0.004
#> SRR2105154 1 0.5690 0.65103 0.708 0.288 0.004
#> SRR2105151 2 0.2939 0.74775 0.072 0.916 0.012
#> SRR2105152 2 0.1636 0.74350 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105149 2 0.3377 0.72858 0.092 0.896 0.012
#> SRR2105150 2 0.3183 0.74441 0.076 0.908 0.016
#> SRR2105147 2 0.8659 0.24428 0.312 0.560 0.128
#> SRR2105148 2 0.8494 0.40226 0.236 0.608 0.156
#> SRR2105143 2 0.5848 0.56739 0.268 0.720 0.012
#> SRR2105144 2 0.6108 0.60569 0.240 0.732 0.028
#> SRR2105145 1 0.4575 0.65938 0.828 0.160 0.012
#> SRR2105146 1 0.3207 0.57837 0.904 0.084 0.012
#> SRR2105141 1 0.6476 0.39811 0.548 0.448 0.004
#> SRR2105142 2 0.6359 0.11953 0.404 0.592 0.004
#> SRR2105139 2 0.1905 0.74206 0.028 0.956 0.016
#> SRR2105140 2 0.2269 0.74453 0.040 0.944 0.016
#> SRR2105137 2 0.2229 0.73500 0.012 0.944 0.044
#> SRR2105138 2 0.6062 0.35188 0.384 0.616 0.000
#> SRR2105135 2 0.0661 0.73469 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105136 2 0.1585 0.73841 0.008 0.964 0.028
#> SRR2105133 2 0.5775 0.58238 0.260 0.728 0.012
#> SRR2105134 2 0.6228 0.49332 0.316 0.672 0.012
#> SRR2105131 2 0.2066 0.74946 0.060 0.940 0.000
#> SRR2105132 1 0.7392 0.19191 0.500 0.468 0.032
#> SRR2105129 1 0.4390 0.60711 0.840 0.148 0.012
#> SRR2105130 1 0.3973 0.37596 0.880 0.032 0.088
#> SRR2105127 2 0.7141 0.34151 0.368 0.600 0.032
#> SRR2105128 2 0.6129 0.55502 0.284 0.700 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 2 0.7635 0.4299 0.300 0.516 0.172 0.012
#> SRR2105278 2 0.8366 -0.0967 0.336 0.356 0.292 0.016
#> SRR2105275 1 0.4188 0.2054 0.836 0.044 0.108 0.012
#> SRR2105276 1 0.5162 0.2766 0.768 0.092 0.136 0.004
#> SRR2105273 2 0.6613 0.4924 0.344 0.560 0.096 0.000
#> SRR2105274 2 0.6554 0.4900 0.356 0.564 0.076 0.004
#> SRR2105271 2 0.5464 0.6710 0.228 0.708 0.064 0.000
#> SRR2105272 1 0.5458 -0.0184 0.704 0.060 0.236 0.000
#> SRR2105269 2 0.1762 0.7272 0.004 0.944 0.048 0.004
#> SRR2105270 2 0.1302 0.7306 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105267 2 0.2365 0.7308 0.012 0.920 0.064 0.004
#> SRR2105268 2 0.2382 0.7379 0.004 0.912 0.080 0.004
#> SRR2105265 2 0.2675 0.7306 0.008 0.892 0.100 0.000
#> SRR2105266 2 0.3764 0.7547 0.076 0.852 0.072 0.000
#> SRR2105263 1 0.5961 0.3905 0.688 0.220 0.088 0.004
#> SRR2105264 1 0.4644 0.4346 0.748 0.228 0.024 0.000
#> SRR2105261 2 0.6026 0.6076 0.244 0.672 0.080 0.004
#> SRR2105262 2 0.4452 0.7386 0.156 0.796 0.048 0.000
#> SRR2105357 2 0.4685 0.7352 0.156 0.784 0.060 0.000
#> SRR2105358 2 0.7277 0.5124 0.284 0.556 0.152 0.008
#> SRR2105439 2 0.4688 0.7439 0.128 0.792 0.080 0.000
#> SRR2105440 2 0.4750 0.7487 0.096 0.804 0.092 0.008
#> SRR2105509 2 0.4474 0.7349 0.036 0.836 0.072 0.056
#> SRR2105510 2 0.2049 0.7356 0.012 0.940 0.036 0.012
#> SRR2105507 2 0.5597 0.5603 0.272 0.680 0.044 0.004
#> SRR2105508 2 0.5929 0.5940 0.296 0.640 0.064 0.000
#> SRR2105505 2 0.7238 0.4557 0.296 0.544 0.156 0.004
#> SRR2105506 2 0.7889 -0.1058 0.304 0.380 0.316 0.000
#> SRR2105503 2 0.5181 0.6775 0.128 0.768 0.100 0.004
#> SRR2105504 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105501 2 0.1635 0.7358 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR2105502 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105499 2 0.7196 0.2404 0.408 0.468 0.120 0.004
#> SRR2105500 2 0.6835 0.5745 0.264 0.600 0.132 0.004
#> SRR2105497 2 0.6909 -0.1399 0.452 0.464 0.072 0.012
#> SRR2105498 2 0.5812 0.5032 0.328 0.624 0.048 0.000
#> SRR2105495 2 0.1909 0.7300 0.004 0.940 0.048 0.008
#> SRR2105496 2 0.2722 0.7469 0.032 0.904 0.064 0.000
#> SRR2105493 2 0.2360 0.7451 0.020 0.924 0.052 0.004
#> SRR2105494 2 0.2892 0.7506 0.036 0.896 0.068 0.000
#> SRR2105491 1 0.3877 0.1866 0.840 0.032 0.124 0.004
#> SRR2105492 1 0.4078 0.1872 0.828 0.036 0.132 0.004
#> SRR2105489 2 0.6603 0.2548 0.372 0.548 0.076 0.004
#> SRR2105490 2 0.5918 0.6832 0.208 0.696 0.092 0.004
#> SRR2105487 1 0.7182 0.1111 0.480 0.396 0.120 0.004
#> SRR2105488 2 0.7360 0.3670 0.360 0.500 0.132 0.008
#> SRR2105485 2 0.6580 0.6261 0.220 0.640 0.136 0.004
#> SRR2105486 2 0.6892 0.5310 0.300 0.576 0.120 0.004
#> SRR2105483 1 0.6413 -0.4910 0.532 0.020 0.416 0.032
#> SRR2105484 1 0.7255 -0.5810 0.452 0.020 0.444 0.084
#> SRR2105481 1 0.6072 0.4206 0.624 0.316 0.056 0.004
#> SRR2105482 1 0.6873 -0.1294 0.464 0.444 0.088 0.004
#> SRR2105479 1 0.5250 0.4068 0.736 0.196 0.068 0.000
#> SRR2105480 1 0.3312 0.2897 0.880 0.076 0.040 0.004
#> SRR2105477 1 0.6554 0.3932 0.564 0.356 0.076 0.004
#> SRR2105478 1 0.6755 0.3240 0.536 0.380 0.076 0.008
#> SRR2105475 2 0.1302 0.7235 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105476 2 0.3001 0.7295 0.024 0.896 0.072 0.008
#> SRR2105473 2 0.6896 0.5656 0.260 0.596 0.140 0.004
#> SRR2105474 2 0.6155 0.6114 0.272 0.648 0.076 0.004
#> SRR2105471 1 0.7333 0.3299 0.544 0.296 0.152 0.008
#> SRR2105472 1 0.7148 0.3583 0.572 0.292 0.124 0.012
#> SRR2105469 2 0.4153 0.7523 0.076 0.836 0.084 0.004
#> SRR2105470 2 0.6408 0.6653 0.224 0.660 0.108 0.008
#> SRR2105467 2 0.7429 0.3026 0.360 0.464 0.176 0.000
#> SRR2105468 2 0.7673 0.3167 0.308 0.480 0.208 0.004
#> SRR2105465 2 0.6426 0.5926 0.272 0.620 0.108 0.000
#> SRR2105466 1 0.7423 0.1955 0.484 0.372 0.136 0.008
#> SRR2105463 1 0.6278 0.3464 0.652 0.228 0.120 0.000
#> SRR2105464 1 0.5607 -0.4338 0.560 0.016 0.420 0.004
#> SRR2105461 2 0.2821 0.7386 0.020 0.900 0.076 0.004
#> SRR2105462 2 0.2081 0.7315 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR2105459 2 0.2053 0.7256 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR2105460 2 0.1854 0.7260 0.000 0.940 0.048 0.012
#> SRR2105457 2 0.4332 0.7502 0.112 0.816 0.072 0.000
#> SRR2105458 2 0.3781 0.7518 0.080 0.860 0.052 0.008
#> SRR2105455 2 0.2076 0.7297 0.004 0.932 0.056 0.008
#> SRR2105456 2 0.4083 0.7569 0.072 0.840 0.084 0.004
#> SRR2105453 2 0.7046 0.5507 0.252 0.584 0.160 0.004
#> SRR2105454 3 0.8165 0.1479 0.292 0.248 0.444 0.016
#> SRR2105451 2 0.2300 0.7471 0.028 0.924 0.048 0.000
#> SRR2105452 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105449 1 0.6582 0.1125 0.512 0.416 0.068 0.004
#> SRR2105450 2 0.7092 0.1871 0.432 0.456 0.108 0.004
#> SRR2105447 2 0.1661 0.7292 0.000 0.944 0.052 0.004
#> SRR2105448 2 0.2561 0.7339 0.016 0.912 0.068 0.004
#> SRR2105445 2 0.2521 0.7477 0.024 0.912 0.064 0.000
#> SRR2105446 2 0.2943 0.7517 0.076 0.892 0.032 0.000
#> SRR2105443 2 0.3414 0.7563 0.072 0.876 0.048 0.004
#> SRR2105444 2 0.4648 0.7193 0.172 0.784 0.040 0.004
#> SRR2105441 2 0.6204 0.6866 0.188 0.688 0.116 0.008
#> SRR2105442 2 0.5939 0.6435 0.248 0.668 0.084 0.000
#> SRR2105437 1 0.5754 -0.2514 0.648 0.012 0.312 0.028
#> SRR2105438 1 0.6058 -0.3149 0.624 0.000 0.308 0.068
#> SRR2105435 2 0.5803 0.7125 0.128 0.720 0.148 0.004
#> SRR2105436 2 0.6712 0.6109 0.260 0.620 0.112 0.008
#> SRR2105433 1 0.6551 0.2645 0.668 0.172 0.148 0.012
#> SRR2105434 1 0.6824 -0.0758 0.468 0.444 0.084 0.004
#> SRR2105431 1 0.6272 -0.4578 0.512 0.028 0.444 0.016
#> SRR2105432 1 0.5658 -0.3550 0.588 0.016 0.388 0.008
#> SRR2105429 2 0.7339 0.1373 0.376 0.480 0.140 0.004
#> SRR2105430 2 0.5880 0.6716 0.216 0.700 0.076 0.008
#> SRR2105427 2 0.1545 0.7295 0.008 0.952 0.040 0.000
#> SRR2105428 2 0.2845 0.7481 0.036 0.904 0.056 0.004
#> SRR2105425 2 0.2623 0.7486 0.028 0.908 0.064 0.000
#> SRR2105426 2 0.3958 0.7438 0.112 0.836 0.052 0.000
#> SRR2105421 2 0.2546 0.7466 0.028 0.912 0.060 0.000
#> SRR2105422 2 0.4775 0.7403 0.140 0.784 0.076 0.000
#> SRR2105423 2 0.4077 0.6971 0.072 0.848 0.068 0.012
#> SRR2105424 2 0.2053 0.7348 0.004 0.924 0.072 0.000
#> SRR2105419 2 0.5232 0.7361 0.132 0.764 0.100 0.004
#> SRR2105420 2 0.2680 0.7476 0.036 0.912 0.048 0.004
#> SRR2105415 1 0.6881 0.1883 0.592 0.172 0.236 0.000
#> SRR2105416 1 0.5607 -0.5185 0.492 0.020 0.488 0.000
#> SRR2105417 2 0.7073 0.3939 0.364 0.524 0.104 0.008
#> SRR2105418 1 0.6848 -0.5165 0.484 0.044 0.444 0.028
#> SRR2105413 2 0.1575 0.7372 0.012 0.956 0.028 0.004
#> SRR2105414 2 0.1302 0.7228 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105409 2 0.6577 0.3949 0.268 0.620 0.108 0.004
#> SRR2105410 1 0.6435 0.4227 0.604 0.312 0.080 0.004
#> SRR2105411 2 0.2186 0.7341 0.012 0.932 0.048 0.008
#> SRR2105412 2 0.4426 0.7470 0.096 0.812 0.092 0.000
#> SRR2105407 2 0.4198 0.7479 0.116 0.828 0.052 0.004
#> SRR2105408 2 0.4022 0.7501 0.096 0.836 0.068 0.000
#> SRR2105403 2 0.6809 0.6181 0.240 0.632 0.112 0.016
#> SRR2105404 2 0.6723 0.5868 0.268 0.608 0.120 0.004
#> SRR2105405 2 0.4219 0.7516 0.076 0.832 0.088 0.004
#> SRR2105406 2 0.7084 0.5138 0.272 0.572 0.152 0.004
#> SRR2105401 2 0.1585 0.7257 0.004 0.952 0.040 0.004
#> SRR2105402 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105399 2 0.1489 0.7256 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR2105400 2 0.1994 0.7238 0.004 0.936 0.052 0.008
#> SRR2105397 2 0.6707 0.4800 0.340 0.580 0.060 0.020
#> SRR2105398 2 0.5321 0.6817 0.228 0.716 0.056 0.000
#> SRR2105395 2 0.6536 0.3216 0.352 0.560 0.088 0.000
#> SRR2105396 2 0.5438 0.7131 0.176 0.744 0.072 0.008
#> SRR2105393 2 0.3648 0.7454 0.032 0.856 0.108 0.004
#> SRR2105394 2 0.3427 0.7359 0.036 0.872 0.088 0.004
#> SRR2105389 2 0.6649 0.6153 0.264 0.628 0.096 0.012
#> SRR2105390 2 0.6593 0.3139 0.424 0.504 0.068 0.004
#> SRR2105391 2 0.6745 0.5917 0.264 0.608 0.124 0.004
#> SRR2105392 2 0.6315 0.5746 0.300 0.620 0.076 0.004
#> SRR2105385 1 0.6256 0.4179 0.620 0.312 0.060 0.008
#> SRR2105386 2 0.5565 0.6363 0.260 0.684 0.056 0.000
#> SRR2105387 2 0.2860 0.7522 0.048 0.904 0.044 0.004
#> SRR2105388 2 0.5631 0.6613 0.224 0.700 0.076 0.000
#> SRR2105381 2 0.3322 0.7311 0.024 0.884 0.076 0.016
#> SRR2105382 2 0.5087 0.6840 0.140 0.772 0.084 0.004
#> SRR2105383 2 0.5296 0.7325 0.108 0.760 0.128 0.004
#> SRR2105384 2 0.5594 0.6979 0.180 0.720 0.100 0.000
#> SRR2105379 2 0.5873 0.6090 0.196 0.716 0.072 0.016
#> SRR2105380 1 0.6810 0.3412 0.532 0.380 0.080 0.008
#> SRR2105377 2 0.4985 0.7354 0.148 0.776 0.072 0.004
#> SRR2105378 2 0.6869 0.2059 0.436 0.472 0.088 0.004
#> SRR2105375 2 0.5111 0.6985 0.204 0.740 0.056 0.000
#> SRR2105376 2 0.7147 0.5554 0.260 0.588 0.140 0.012
#> SRR2105373 1 0.7341 -0.0367 0.456 0.404 0.136 0.004
#> SRR2105374 1 0.4706 -0.1422 0.732 0.000 0.248 0.020
#> SRR2105371 2 0.3312 0.7550 0.072 0.876 0.052 0.000
#> SRR2105372 2 0.5562 0.7147 0.176 0.740 0.072 0.012
#> SRR2105369 2 0.4710 0.7407 0.120 0.792 0.088 0.000
#> SRR2105370 2 0.5940 0.6404 0.240 0.672 0.088 0.000
#> SRR2105367 2 0.7027 0.3370 0.380 0.508 0.108 0.004
#> SRR2105368 1 0.8055 0.1144 0.472 0.236 0.276 0.016
#> SRR2105365 1 0.6624 0.3649 0.644 0.220 0.128 0.008
#> SRR2105366 1 0.6112 0.3578 0.656 0.248 0.096 0.000
#> SRR2105363 2 0.2805 0.7351 0.012 0.888 0.100 0.000
#> SRR2105364 2 0.2342 0.7397 0.008 0.912 0.080 0.000
#> SRR2105361 2 0.2631 0.7261 0.008 0.912 0.064 0.016
#> SRR2105362 2 0.3517 0.7512 0.088 0.868 0.040 0.004
#> SRR2105359 2 0.6204 0.6289 0.244 0.660 0.092 0.004
#> SRR2105360 2 0.5180 0.7107 0.196 0.740 0.064 0.000
#> SRR2105355 2 0.5989 0.7032 0.180 0.700 0.116 0.004
#> SRR2105356 2 0.5904 0.6585 0.228 0.688 0.080 0.004
#> SRR2105353 1 0.6806 0.1806 0.492 0.420 0.084 0.004
#> SRR2105354 1 0.5969 0.1923 0.564 0.392 0.044 0.000
#> SRR2105351 2 0.6381 0.4932 0.280 0.628 0.088 0.004
#> SRR2105352 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105349 2 0.3621 0.7220 0.068 0.860 0.072 0.000
#> SRR2105350 2 0.2530 0.7339 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR2105345 2 0.1909 0.7373 0.008 0.940 0.048 0.004
#> SRR2105346 2 0.5674 0.6897 0.176 0.724 0.096 0.004
#> SRR2105347 2 0.7807 0.2884 0.348 0.488 0.140 0.024
#> SRR2105348 2 0.7960 0.2353 0.292 0.484 0.208 0.016
#> SRR2105343 2 0.3615 0.7294 0.036 0.876 0.064 0.024
#> SRR2105344 2 0.2011 0.7331 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR2105341 2 0.6818 0.5312 0.304 0.580 0.112 0.004
#> SRR2105342 2 0.5522 0.6912 0.204 0.716 0.080 0.000
#> SRR2105339 2 0.6077 0.6768 0.220 0.680 0.096 0.004
#> SRR2105340 2 0.6384 0.2638 0.440 0.496 0.064 0.000
#> SRR2105335 1 0.6525 0.3557 0.616 0.292 0.084 0.008
#> SRR2105336 1 0.7593 0.2595 0.484 0.324 0.188 0.004
#> SRR2105337 1 0.6949 0.0961 0.484 0.428 0.076 0.012
#> SRR2105338 2 0.6375 0.1455 0.472 0.476 0.044 0.008
#> SRR2105331 2 0.6824 -0.1085 0.444 0.468 0.084 0.004
#> SRR2105332 1 0.6624 0.3776 0.612 0.276 0.108 0.004
#> SRR2105333 2 0.3558 0.7210 0.052 0.880 0.044 0.024
#> SRR2105334 2 0.1209 0.7304 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR2105329 2 0.3013 0.7465 0.032 0.888 0.080 0.000
#> SRR2105330 2 0.2840 0.7524 0.044 0.900 0.056 0.000
#> SRR2105327 2 0.3329 0.7370 0.044 0.880 0.072 0.004
#> SRR2105328 2 0.3761 0.7345 0.080 0.852 0.068 0.000
#> SRR2105325 1 0.3173 0.1410 0.888 0.016 0.080 0.016
#> SRR2105326 1 0.2861 0.1092 0.892 0.004 0.092 0.012
#> SRR2105323 2 0.5134 0.7398 0.104 0.772 0.120 0.004
#> SRR2105324 2 0.4681 0.7383 0.124 0.800 0.072 0.004
#> SRR2105319 1 0.3211 0.1770 0.884 0.024 0.084 0.008
#> SRR2105320 1 0.4922 -0.2162 0.700 0.004 0.284 0.012
#> SRR2105321 1 0.4720 0.2062 0.808 0.056 0.120 0.016
#> SRR2105322 1 0.4001 0.1907 0.840 0.036 0.116 0.008
#> SRR2105317 2 0.2975 0.7451 0.032 0.900 0.060 0.008
#> SRR2105318 2 0.1305 0.7256 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105315 2 0.1824 0.7268 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR2105316 2 0.0921 0.7246 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105313 2 0.2965 0.7480 0.036 0.892 0.072 0.000
#> SRR2105314 2 0.1576 0.7315 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR2105311 1 0.5727 0.3635 0.712 0.200 0.084 0.004
#> SRR2105312 1 0.5321 0.2904 0.748 0.140 0.112 0.000
#> SRR2105307 2 0.7677 0.2737 0.336 0.464 0.196 0.004
#> SRR2105308 2 0.6484 0.6285 0.232 0.644 0.120 0.004
#> SRR2105309 2 0.4372 0.7507 0.104 0.828 0.056 0.012
#> SRR2105310 2 0.5060 0.7299 0.128 0.776 0.092 0.004
#> SRR2105305 2 0.6221 0.6913 0.188 0.692 0.108 0.012
#> SRR2105306 2 0.3168 0.7504 0.068 0.888 0.040 0.004
#> SRR2105303 2 0.2552 0.7365 0.020 0.920 0.048 0.012
#> SRR2105304 4 0.0817 1.0000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105301 2 0.5918 0.5689 0.300 0.644 0.052 0.004
#> SRR2105302 2 0.2781 0.7285 0.016 0.904 0.072 0.008
#> SRR2105299 2 0.6479 0.2570 0.428 0.508 0.060 0.004
#> SRR2105300 2 0.4144 0.7366 0.104 0.828 0.068 0.000
#> SRR2105297 1 0.7024 -0.4812 0.508 0.052 0.408 0.032
#> SRR2105298 3 0.7707 0.5155 0.372 0.032 0.488 0.108
#> SRR2105295 2 0.2874 0.7252 0.012 0.904 0.064 0.020
#> SRR2105296 2 0.5628 0.6283 0.164 0.736 0.092 0.008
#> SRR2105293 1 0.7065 0.2447 0.488 0.408 0.096 0.008
#> SRR2105294 1 0.4321 0.3799 0.812 0.144 0.040 0.004
#> SRR2105291 2 0.6873 0.5600 0.296 0.580 0.120 0.004
#> SRR2105292 1 0.6461 0.3319 0.632 0.240 0.128 0.000
#> SRR2105289 2 0.3245 0.7555 0.056 0.880 0.064 0.000
#> SRR2105290 2 0.6535 0.5436 0.312 0.588 0.100 0.000
#> SRR2105287 2 0.7608 0.4318 0.272 0.520 0.200 0.008
#> SRR2105288 1 0.7559 -0.0902 0.460 0.204 0.336 0.000
#> SRR2105285 2 0.1953 0.7421 0.012 0.940 0.044 0.004
#> SRR2105286 2 0.3241 0.7475 0.040 0.884 0.072 0.004
#> SRR2105283 2 0.5595 0.7030 0.148 0.736 0.112 0.004
#> SRR2105284 2 0.6499 0.6081 0.248 0.636 0.112 0.004
#> SRR2105281 2 0.3105 0.7347 0.012 0.868 0.120 0.000
#> SRR2105282 2 0.3219 0.7422 0.020 0.868 0.112 0.000
#> SRR2105259 2 0.4118 0.7467 0.100 0.836 0.060 0.004
#> SRR2105260 2 0.2946 0.7499 0.048 0.900 0.048 0.004
#> SRR2105279 2 0.2665 0.7301 0.008 0.900 0.088 0.004
#> SRR2105280 2 0.3612 0.7481 0.044 0.856 0.100 0.000
#> SRR2105257 1 0.6535 0.1097 0.644 0.132 0.220 0.004
#> SRR2105258 1 0.5518 0.1565 0.740 0.100 0.156 0.004
#> SRR2105253 2 0.3570 0.7194 0.048 0.860 0.092 0.000
#> SRR2105254 2 0.1970 0.7284 0.008 0.932 0.060 0.000
#> SRR2105255 2 0.5769 0.6398 0.264 0.676 0.056 0.004
#> SRR2105256 2 0.6423 0.6109 0.256 0.644 0.092 0.008
#> SRR2105251 2 0.5540 0.6806 0.148 0.740 0.108 0.004
#> SRR2105252 2 0.3621 0.7514 0.072 0.860 0.068 0.000
#> SRR2105249 2 0.2053 0.7354 0.004 0.924 0.072 0.000
#> SRR2105250 2 0.7070 0.5693 0.260 0.588 0.144 0.008
#> SRR2105247 2 0.5998 0.5582 0.200 0.684 0.116 0.000
#> SRR2105248 1 0.6784 0.4206 0.592 0.300 0.100 0.008
#> SRR2105245 1 0.6549 0.3855 0.644 0.216 0.136 0.004
#> SRR2105246 2 0.5764 0.5984 0.304 0.644 0.052 0.000
#> SRR2105243 2 0.4127 0.7454 0.124 0.824 0.052 0.000
#> SRR2105244 2 0.6120 0.3728 0.416 0.540 0.040 0.004
#> SRR2105241 2 0.6182 0.3069 0.428 0.520 0.052 0.000
#> SRR2105242 1 0.6169 0.4158 0.632 0.296 0.068 0.004
#> SRR2105239 2 0.6640 0.2807 0.416 0.508 0.072 0.004
#> SRR2105240 1 0.6624 0.0587 0.644 0.128 0.220 0.008
#> SRR2105237 2 0.2825 0.7380 0.024 0.908 0.056 0.012
#> SRR2105238 2 0.3398 0.7536 0.068 0.872 0.060 0.000
#> SRR2105235 2 0.3370 0.7510 0.048 0.872 0.080 0.000
#> SRR2105236 2 0.4956 0.7293 0.140 0.780 0.076 0.004
#> SRR2105233 2 0.3622 0.7448 0.064 0.872 0.052 0.012
#> SRR2105234 2 0.1994 0.7251 0.004 0.936 0.052 0.008
#> SRR2105231 2 0.4744 0.6830 0.080 0.808 0.100 0.012
#> SRR2105232 2 0.5613 0.6695 0.188 0.724 0.084 0.004
#> SRR2105227 2 0.5841 0.6566 0.228 0.692 0.076 0.004
#> SRR2105228 2 0.4978 0.7128 0.180 0.764 0.052 0.004
#> SRR2105225 2 0.6257 0.6236 0.260 0.648 0.088 0.004
#> SRR2105226 2 0.6136 0.4882 0.356 0.584 0.060 0.000
#> SRR2105229 2 0.6418 0.6132 0.264 0.640 0.088 0.008
#> SRR2105230 2 0.7038 0.4622 0.336 0.540 0.120 0.004
#> SRR2105219 2 0.2287 0.7342 0.012 0.924 0.060 0.004
#> SRR2105220 2 0.2342 0.7356 0.000 0.912 0.080 0.008
#> SRR2105221 2 0.6600 0.5932 0.284 0.620 0.084 0.012
#> SRR2105222 1 0.8042 0.0828 0.456 0.252 0.280 0.012
#> SRR2105223 1 0.6424 0.2388 0.560 0.372 0.064 0.004
#> SRR2105224 1 0.6003 -0.0647 0.504 0.456 0.040 0.000
#> SRR2105217 1 0.4726 0.2659 0.808 0.072 0.108 0.012
#> SRR2105218 1 0.6393 -0.0244 0.480 0.456 0.064 0.000
#> SRR2105215 2 0.3947 0.7558 0.076 0.848 0.072 0.004
#> SRR2105216 2 0.2266 0.7339 0.004 0.912 0.084 0.000
#> SRR2105213 1 0.5905 0.4327 0.636 0.304 0.060 0.000
#> SRR2105214 2 0.6743 0.4612 0.320 0.576 0.100 0.004
#> SRR2105211 2 0.5100 0.7370 0.136 0.772 0.088 0.004
#> SRR2105212 2 0.3658 0.7515 0.068 0.864 0.064 0.004
#> SRR2105209 2 0.7131 0.4172 0.352 0.520 0.124 0.004
#> SRR2105210 1 0.7552 0.3114 0.516 0.300 0.176 0.008
#> SRR2105207 1 0.5880 0.4240 0.692 0.232 0.068 0.008
#> SRR2105208 1 0.7062 0.0971 0.620 0.132 0.228 0.020
#> SRR2105205 1 0.6708 0.3871 0.576 0.324 0.096 0.004
#> SRR2105206 1 0.6621 0.4101 0.588 0.316 0.092 0.004
#> SRR2105201 2 0.5427 0.7228 0.148 0.748 0.100 0.004
#> SRR2105202 2 0.6735 0.5941 0.248 0.616 0.132 0.004
#> SRR2105203 2 0.4482 0.7210 0.088 0.816 0.092 0.004
#> SRR2105204 2 0.2412 0.7384 0.008 0.908 0.084 0.000
#> SRR2105199 2 0.4407 0.7503 0.076 0.820 0.100 0.004
#> SRR2105200 2 0.6648 0.5758 0.284 0.612 0.096 0.008
#> SRR2105197 2 0.6584 0.5164 0.336 0.568 0.096 0.000
#> SRR2105198 1 0.7636 0.2847 0.500 0.340 0.144 0.016
#> SRR2105195 1 0.5486 0.4143 0.720 0.200 0.080 0.000
#> SRR2105196 1 0.5698 0.4060 0.692 0.244 0.060 0.004
#> SRR2105193 1 0.6538 -0.3051 0.588 0.072 0.332 0.008
#> SRR2105194 1 0.5803 -0.3421 0.616 0.028 0.348 0.008
#> SRR2105191 2 0.7250 0.3388 0.396 0.504 0.068 0.032
#> SRR2105192 3 0.7456 0.4463 0.340 0.116 0.524 0.020
#> SRR2105189 2 0.2328 0.7405 0.016 0.924 0.056 0.004
#> SRR2105190 2 0.2255 0.7313 0.000 0.920 0.068 0.012
#> SRR2105187 1 0.5437 0.3503 0.748 0.144 0.104 0.004
#> SRR2105188 1 0.6338 0.3607 0.600 0.316 0.084 0.000
#> SRR2105179 1 0.6244 0.4398 0.660 0.256 0.072 0.012
#> SRR2105180 1 0.5291 -0.1561 0.700 0.032 0.264 0.004
#> SRR2105183 2 0.2874 0.7464 0.020 0.904 0.064 0.012
#> SRR2105184 2 0.6439 0.4760 0.340 0.576 0.084 0.000
#> SRR2105185 2 0.4541 0.7539 0.084 0.812 0.100 0.004
#> SRR2105186 2 0.6514 0.2840 0.408 0.516 0.076 0.000
#> SRR2105181 1 0.7003 0.2432 0.536 0.356 0.100 0.008
#> SRR2105182 2 0.6841 0.5178 0.320 0.568 0.108 0.004
#> SRR2105177 1 0.5809 0.4235 0.696 0.224 0.076 0.004
#> SRR2105178 3 0.6966 0.4596 0.444 0.004 0.456 0.096
#> SRR2105171 2 0.2803 0.7322 0.012 0.900 0.080 0.008
#> SRR2105172 2 0.3384 0.7399 0.024 0.860 0.116 0.000
#> SRR2105175 1 0.4359 0.0324 0.796 0.020 0.176 0.008
#> SRR2105176 1 0.6276 -0.5157 0.508 0.016 0.448 0.028
#> SRR2105173 2 0.4857 0.6795 0.192 0.764 0.040 0.004
#> SRR2105174 2 0.4547 0.7027 0.116 0.816 0.056 0.012
#> SRR2105169 2 0.5003 0.7071 0.148 0.768 0.084 0.000
#> SRR2105170 1 0.6719 -0.0356 0.472 0.460 0.052 0.016
#> SRR2105167 2 0.3176 0.7490 0.036 0.880 0.084 0.000
#> SRR2105168 2 0.3308 0.7456 0.036 0.872 0.092 0.000
#> SRR2105165 1 0.4939 0.4256 0.740 0.220 0.040 0.000
#> SRR2105166 1 0.3694 0.3660 0.844 0.124 0.032 0.000
#> SRR2105163 1 0.5430 0.4232 0.732 0.204 0.056 0.008
#> SRR2105164 1 0.3697 0.3310 0.852 0.100 0.048 0.000
#> SRR2105161 1 0.5119 0.3835 0.768 0.148 0.080 0.004
#> SRR2105162 1 0.5272 -0.3464 0.608 0.008 0.380 0.004
#> SRR2105155 2 0.2862 0.7376 0.012 0.900 0.076 0.012
#> SRR2105156 2 0.3286 0.7505 0.044 0.876 0.080 0.000
#> SRR2105157 1 0.6451 0.3863 0.644 0.252 0.096 0.008
#> SRR2105158 1 0.5471 0.3798 0.740 0.168 0.088 0.004
#> SRR2105159 1 0.5037 0.3564 0.776 0.136 0.084 0.004
#> SRR2105160 1 0.5537 0.3893 0.688 0.256 0.056 0.000
#> SRR2105153 2 0.6607 0.1365 0.400 0.516 0.084 0.000
#> SRR2105154 1 0.4222 0.2686 0.832 0.084 0.080 0.004
#> SRR2105151 2 0.4131 0.7497 0.064 0.836 0.096 0.004
#> SRR2105152 2 0.3716 0.7504 0.052 0.852 0.096 0.000
#> SRR2105149 2 0.3414 0.7401 0.048 0.876 0.072 0.004
#> SRR2105150 2 0.4869 0.7378 0.128 0.788 0.080 0.004
#> SRR2105147 2 0.7818 0.4332 0.288 0.548 0.048 0.116
#> SRR2105148 2 0.7443 0.5280 0.252 0.592 0.036 0.120
#> SRR2105143 2 0.6521 0.5937 0.276 0.620 0.100 0.004
#> SRR2105144 2 0.6397 0.6123 0.256 0.640 0.100 0.004
#> SRR2105145 1 0.3689 0.2074 0.860 0.048 0.088 0.004
#> SRR2105146 1 0.2899 0.1045 0.880 0.004 0.112 0.004
#> SRR2105141 1 0.6172 0.3606 0.632 0.284 0.084 0.000
#> SRR2105142 2 0.6546 0.0268 0.396 0.532 0.068 0.004
#> SRR2105139 2 0.2673 0.7288 0.008 0.904 0.080 0.008
#> SRR2105140 2 0.2915 0.7433 0.016 0.892 0.088 0.004
#> SRR2105137 2 0.2872 0.7326 0.008 0.896 0.084 0.012
#> SRR2105138 2 0.6547 0.4808 0.340 0.568 0.092 0.000
#> SRR2105135 2 0.1474 0.7295 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105136 2 0.2922 0.7344 0.008 0.884 0.104 0.004
#> SRR2105133 2 0.7011 0.5728 0.264 0.592 0.136 0.008
#> SRR2105134 2 0.7203 0.4581 0.288 0.536 0.176 0.000
#> SRR2105131 2 0.3919 0.7485 0.104 0.840 0.056 0.000
#> SRR2105132 1 0.8158 0.1084 0.384 0.364 0.240 0.012
#> SRR2105129 1 0.6598 -0.4154 0.540 0.064 0.388 0.008
#> SRR2105130 1 0.6699 -0.5531 0.480 0.024 0.456 0.040
#> SRR2105127 2 0.8026 0.1983 0.300 0.432 0.260 0.008
#> SRR2105128 2 0.6245 0.5980 0.268 0.636 0.096 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.570 0.63684 0.016 0.360 0.056 0.000 0.568
#> SRR2105278 5 0.629 0.61933 0.052 0.288 0.060 0.004 0.596
#> SRR2105275 3 0.426 0.42469 0.044 0.068 0.812 0.000 0.076
#> SRR2105276 3 0.530 0.48596 0.040 0.112 0.732 0.000 0.116
#> SRR2105273 2 0.636 0.39868 0.028 0.604 0.156 0.000 0.212
#> SRR2105274 2 0.649 0.03073 0.020 0.528 0.128 0.000 0.324
#> SRR2105271 2 0.483 0.51248 0.008 0.720 0.064 0.000 0.208
#> SRR2105272 3 0.801 -0.00300 0.264 0.100 0.400 0.000 0.236
#> SRR2105269 2 0.331 0.66504 0.028 0.872 0.044 0.004 0.052
#> SRR2105270 2 0.249 0.68040 0.008 0.900 0.020 0.000 0.072
#> SRR2105267 2 0.263 0.67903 0.016 0.900 0.028 0.000 0.056
#> SRR2105268 2 0.283 0.67531 0.012 0.864 0.004 0.000 0.120
#> SRR2105265 2 0.296 0.66950 0.036 0.864 0.000 0.000 0.100
#> SRR2105266 2 0.353 0.67435 0.040 0.852 0.028 0.000 0.080
#> SRR2105263 3 0.536 0.57537 0.052 0.244 0.676 0.000 0.028
#> SRR2105264 3 0.661 0.39526 0.044 0.304 0.548 0.000 0.104
#> SRR2105261 2 0.536 0.53954 0.036 0.712 0.176 0.000 0.076
#> SRR2105262 2 0.303 0.66223 0.004 0.868 0.040 0.000 0.088
#> SRR2105357 2 0.329 0.66265 0.012 0.852 0.028 0.000 0.108
#> SRR2105358 5 0.560 0.46030 0.008 0.448 0.052 0.000 0.492
#> SRR2105439 2 0.411 0.64304 0.020 0.800 0.040 0.000 0.140
#> SRR2105440 2 0.320 0.67327 0.008 0.844 0.016 0.000 0.132
#> SRR2105509 2 0.313 0.68560 0.028 0.884 0.048 0.008 0.032
#> SRR2105510 2 0.292 0.66956 0.024 0.888 0.040 0.000 0.048
#> SRR2105507 2 0.602 0.40268 0.032 0.656 0.204 0.004 0.104
#> SRR2105508 2 0.560 0.54537 0.020 0.704 0.144 0.008 0.124
#> SRR2105505 5 0.588 0.58022 0.020 0.408 0.056 0.000 0.516
#> SRR2105506 5 0.689 0.60288 0.120 0.304 0.052 0.000 0.524
#> SRR2105503 2 0.494 0.60473 0.036 0.752 0.160 0.004 0.048
#> SRR2105504 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.261 0.67601 0.004 0.896 0.048 0.000 0.052
#> SRR2105502 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.688 0.55875 0.028 0.388 0.144 0.000 0.440
#> SRR2105500 2 0.570 0.01441 0.020 0.556 0.048 0.000 0.376
#> SRR2105497 3 0.666 0.30278 0.044 0.392 0.476 0.000 0.088
#> SRR2105498 2 0.594 0.40947 0.032 0.640 0.236 0.000 0.092
#> SRR2105495 2 0.250 0.68053 0.012 0.908 0.020 0.004 0.056
#> SRR2105496 2 0.309 0.69292 0.024 0.868 0.016 0.000 0.092
#> SRR2105493 2 0.230 0.69361 0.012 0.916 0.012 0.004 0.056
#> SRR2105494 2 0.229 0.69360 0.012 0.904 0.004 0.000 0.080
#> SRR2105491 3 0.367 0.38315 0.040 0.056 0.848 0.000 0.056
#> SRR2105492 3 0.443 0.38994 0.088 0.068 0.800 0.000 0.044
#> SRR2105489 2 0.713 -0.01399 0.060 0.476 0.340 0.000 0.124
#> SRR2105490 2 0.547 0.49768 0.040 0.676 0.048 0.000 0.236
#> SRR2105487 5 0.743 0.56065 0.052 0.308 0.196 0.000 0.444
#> SRR2105488 5 0.596 0.59368 0.020 0.388 0.064 0.000 0.528
#> SRR2105485 2 0.511 0.20881 0.000 0.608 0.052 0.000 0.340
#> SRR2105486 2 0.557 -0.21271 0.008 0.520 0.052 0.000 0.420
#> SRR2105483 1 0.481 0.75888 0.724 0.016 0.220 0.004 0.036
#> SRR2105484 1 0.444 0.73183 0.788 0.016 0.144 0.012 0.040
#> SRR2105481 3 0.618 0.48896 0.020 0.252 0.600 0.000 0.128
#> SRR2105482 5 0.708 0.56540 0.036 0.372 0.156 0.000 0.436
#> SRR2105479 3 0.497 0.56321 0.040 0.172 0.740 0.000 0.048
#> SRR2105480 3 0.434 0.46380 0.056 0.084 0.812 0.004 0.044
#> SRR2105477 3 0.635 0.47227 0.036 0.272 0.588 0.000 0.104
#> SRR2105478 3 0.652 0.42890 0.040 0.292 0.572 0.004 0.092
#> SRR2105475 2 0.277 0.66604 0.024 0.896 0.040 0.000 0.040
#> SRR2105476 2 0.370 0.67151 0.036 0.844 0.076 0.000 0.044
#> SRR2105473 2 0.568 -0.28741 0.020 0.504 0.040 0.000 0.436
#> SRR2105474 2 0.548 0.46240 0.036 0.684 0.060 0.000 0.220
#> SRR2105471 3 0.823 -0.10849 0.096 0.292 0.348 0.004 0.260
#> SRR2105472 3 0.814 0.12342 0.120 0.284 0.380 0.000 0.216
#> SRR2105469 2 0.355 0.68082 0.016 0.844 0.028 0.004 0.108
#> SRR2105470 2 0.477 0.54403 0.008 0.720 0.056 0.000 0.216
#> SRR2105467 5 0.610 0.62880 0.020 0.304 0.096 0.000 0.580
#> SRR2105468 5 0.583 0.62443 0.016 0.392 0.060 0.000 0.532
#> SRR2105465 2 0.584 0.14672 0.016 0.580 0.060 0.004 0.340
#> SRR2105466 5 0.758 0.56831 0.064 0.328 0.188 0.000 0.420
#> SRR2105463 3 0.844 -0.09226 0.176 0.212 0.320 0.000 0.292
#> SRR2105464 1 0.568 0.77840 0.652 0.016 0.232 0.000 0.100
#> SRR2105461 2 0.283 0.67815 0.020 0.896 0.036 0.004 0.044
#> SRR2105462 2 0.278 0.67747 0.016 0.872 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105459 2 0.257 0.67479 0.016 0.908 0.028 0.004 0.044
#> SRR2105460 2 0.306 0.66596 0.028 0.888 0.044 0.008 0.032
#> SRR2105457 2 0.345 0.67270 0.016 0.848 0.036 0.000 0.100
#> SRR2105458 2 0.299 0.67981 0.012 0.888 0.028 0.012 0.060
#> SRR2105455 2 0.343 0.68456 0.028 0.868 0.052 0.008 0.044
#> SRR2105456 2 0.323 0.68149 0.016 0.864 0.036 0.000 0.084
#> SRR2105453 2 0.604 -0.14472 0.040 0.524 0.044 0.000 0.392
#> SRR2105454 5 0.717 0.19536 0.264 0.184 0.048 0.000 0.504
#> SRR2105451 2 0.224 0.69432 0.020 0.912 0.004 0.000 0.064
#> SRR2105452 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105449 2 0.789 -0.31020 0.084 0.436 0.276 0.004 0.200
#> SRR2105450 5 0.719 0.55833 0.044 0.388 0.132 0.004 0.432
#> SRR2105447 2 0.295 0.67008 0.016 0.884 0.052 0.000 0.048
#> SRR2105448 2 0.333 0.68249 0.020 0.872 0.056 0.008 0.044
#> SRR2105445 2 0.216 0.69214 0.012 0.916 0.000 0.008 0.064
#> SRR2105446 2 0.253 0.68169 0.008 0.892 0.012 0.000 0.088
#> SRR2105443 2 0.276 0.69597 0.012 0.892 0.036 0.000 0.060
#> SRR2105444 2 0.351 0.64053 0.000 0.828 0.036 0.004 0.132
#> SRR2105441 2 0.492 0.43055 0.012 0.668 0.032 0.000 0.288
#> SRR2105442 2 0.575 0.36977 0.028 0.620 0.060 0.000 0.292
#> SRR2105437 1 0.677 0.57263 0.448 0.020 0.400 0.004 0.128
#> SRR2105438 3 0.666 -0.56196 0.428 0.008 0.432 0.012 0.120
#> SRR2105435 2 0.483 0.60417 0.020 0.720 0.040 0.000 0.220
#> SRR2105436 2 0.581 0.36919 0.020 0.628 0.088 0.000 0.264
#> SRR2105433 3 0.808 0.33748 0.200 0.188 0.440 0.000 0.172
#> SRR2105434 2 0.769 -0.16762 0.072 0.472 0.220 0.004 0.232
#> SRR2105431 1 0.594 0.76203 0.640 0.024 0.224 0.000 0.112
#> SRR2105432 1 0.656 0.68448 0.508 0.024 0.348 0.000 0.120
#> SRR2105429 2 0.738 -0.10510 0.052 0.452 0.312 0.000 0.184
#> SRR2105430 2 0.559 0.55947 0.044 0.708 0.128 0.000 0.120
#> SRR2105427 2 0.294 0.67200 0.032 0.888 0.040 0.000 0.040
#> SRR2105428 2 0.233 0.69224 0.012 0.908 0.004 0.004 0.072
#> SRR2105425 2 0.384 0.68602 0.024 0.836 0.044 0.004 0.092
#> SRR2105426 2 0.320 0.68346 0.012 0.872 0.044 0.004 0.068
#> SRR2105421 2 0.275 0.68969 0.032 0.900 0.020 0.004 0.044
#> SRR2105422 2 0.341 0.67536 0.012 0.852 0.048 0.000 0.088
#> SRR2105423 2 0.403 0.66686 0.040 0.832 0.068 0.004 0.056
#> SRR2105424 2 0.233 0.67987 0.016 0.908 0.008 0.000 0.068
#> SRR2105419 2 0.412 0.65020 0.012 0.792 0.032 0.004 0.160
#> SRR2105420 2 0.217 0.68913 0.016 0.920 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105415 5 0.853 0.08300 0.232 0.192 0.276 0.000 0.300
#> SRR2105416 1 0.596 0.73059 0.660 0.024 0.124 0.004 0.188
#> SRR2105417 2 0.708 0.03149 0.052 0.532 0.180 0.000 0.236
#> SRR2105418 1 0.587 0.74067 0.692 0.044 0.132 0.004 0.128
#> SRR2105413 2 0.281 0.67123 0.016 0.896 0.044 0.004 0.040
#> SRR2105414 2 0.244 0.66943 0.020 0.912 0.032 0.000 0.036
#> SRR2105409 2 0.657 0.26304 0.036 0.572 0.280 0.004 0.108
#> SRR2105410 3 0.746 0.10578 0.048 0.312 0.428 0.000 0.212
#> SRR2105411 2 0.274 0.68708 0.020 0.896 0.016 0.004 0.064
#> SRR2105412 2 0.410 0.66366 0.036 0.792 0.016 0.000 0.156
#> SRR2105407 2 0.320 0.67832 0.028 0.872 0.036 0.000 0.064
#> SRR2105408 2 0.308 0.66459 0.012 0.868 0.028 0.000 0.092
#> SRR2105403 2 0.474 0.54862 0.008 0.724 0.056 0.000 0.212
#> SRR2105404 2 0.608 -0.03550 0.032 0.560 0.052 0.004 0.352
#> SRR2105405 2 0.407 0.62820 0.016 0.776 0.020 0.000 0.188
#> SRR2105406 5 0.572 0.50964 0.016 0.436 0.048 0.000 0.500
#> SRR2105401 2 0.291 0.66856 0.020 0.892 0.044 0.004 0.040
#> SRR2105402 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.259 0.66644 0.020 0.904 0.044 0.000 0.032
#> SRR2105400 2 0.302 0.66513 0.032 0.888 0.044 0.004 0.032
#> SRR2105397 2 0.597 0.29530 0.020 0.604 0.296 0.004 0.076
#> SRR2105398 2 0.417 0.63905 0.012 0.796 0.132 0.000 0.060
#> SRR2105395 2 0.631 0.16497 0.024 0.536 0.344 0.000 0.096
#> SRR2105396 2 0.456 0.60373 0.008 0.752 0.064 0.000 0.176
#> SRR2105393 2 0.405 0.65166 0.040 0.788 0.008 0.000 0.164
#> SRR2105394 2 0.348 0.68995 0.036 0.852 0.024 0.000 0.088
#> SRR2105389 2 0.517 0.54761 0.008 0.692 0.084 0.000 0.216
#> SRR2105390 2 0.594 0.41342 0.012 0.628 0.216 0.000 0.144
#> SRR2105391 2 0.555 0.53413 0.016 0.688 0.100 0.004 0.192
#> SRR2105392 2 0.544 0.55485 0.020 0.700 0.120 0.000 0.160
#> SRR2105385 3 0.725 0.42717 0.048 0.224 0.496 0.000 0.232
#> SRR2105386 2 0.464 0.59291 0.008 0.760 0.116 0.000 0.116
#> SRR2105387 2 0.269 0.69527 0.016 0.884 0.008 0.000 0.092
#> SRR2105388 2 0.538 0.39058 0.036 0.660 0.036 0.000 0.268
#> SRR2105381 2 0.361 0.68523 0.024 0.848 0.068 0.000 0.060
#> SRR2105382 2 0.437 0.65389 0.020 0.792 0.112 0.000 0.076
#> SRR2105383 2 0.476 0.54000 0.024 0.700 0.020 0.000 0.256
#> SRR2105384 2 0.495 0.41636 0.016 0.652 0.024 0.000 0.308
#> SRR2105379 2 0.585 0.52262 0.028 0.684 0.188 0.012 0.088
#> SRR2105380 3 0.640 0.36323 0.040 0.356 0.528 0.000 0.076
#> SRR2105377 2 0.429 0.62147 0.016 0.780 0.044 0.000 0.160
#> SRR2105378 2 0.732 -0.49852 0.056 0.412 0.128 0.004 0.400
#> SRR2105375 2 0.450 0.61547 0.012 0.772 0.076 0.000 0.140
#> SRR2105376 5 0.582 0.48109 0.024 0.436 0.044 0.000 0.496
#> SRR2105373 5 0.668 0.50133 0.024 0.268 0.168 0.000 0.540
#> SRR2105374 3 0.696 -0.27609 0.332 0.044 0.504 0.004 0.116
#> SRR2105371 2 0.284 0.69297 0.036 0.892 0.024 0.000 0.048
#> SRR2105372 2 0.405 0.65886 0.020 0.828 0.072 0.008 0.072
#> SRR2105369 2 0.401 0.66038 0.020 0.820 0.044 0.004 0.112
#> SRR2105370 2 0.508 0.43853 0.008 0.680 0.060 0.000 0.252
#> SRR2105367 2 0.657 -0.28866 0.044 0.488 0.080 0.000 0.388
#> SRR2105368 5 0.844 0.34487 0.236 0.232 0.184 0.000 0.348
#> SRR2105365 3 0.532 0.53182 0.068 0.184 0.716 0.004 0.028
#> SRR2105366 3 0.450 0.53636 0.044 0.172 0.764 0.000 0.020
#> SRR2105363 2 0.344 0.66473 0.020 0.820 0.004 0.000 0.156
#> SRR2105364 2 0.281 0.67676 0.024 0.876 0.004 0.000 0.096
#> SRR2105361 2 0.336 0.66339 0.028 0.872 0.044 0.008 0.048
#> SRR2105362 2 0.241 0.67750 0.000 0.900 0.032 0.000 0.068
#> SRR2105359 2 0.551 0.37570 0.016 0.636 0.064 0.000 0.284
#> SRR2105360 2 0.427 0.65117 0.020 0.808 0.096 0.004 0.072
#> SRR2105355 2 0.491 0.60614 0.032 0.744 0.040 0.004 0.180
#> SRR2105356 2 0.454 0.56097 0.008 0.752 0.060 0.000 0.180
#> SRR2105353 2 0.651 0.00577 0.028 0.488 0.384 0.000 0.100
#> SRR2105354 3 0.677 0.13716 0.016 0.340 0.472 0.000 0.172
#> SRR2105351 2 0.582 0.37791 0.036 0.628 0.276 0.000 0.060
#> SRR2105352 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.319 0.68480 0.008 0.864 0.080 0.000 0.048
#> SRR2105350 2 0.341 0.65047 0.028 0.820 0.000 0.000 0.152
#> SRR2105345 2 0.290 0.68655 0.020 0.872 0.008 0.000 0.100
#> SRR2105346 2 0.501 0.50085 0.032 0.704 0.032 0.000 0.232
#> SRR2105347 2 0.731 -0.27277 0.100 0.468 0.096 0.000 0.336
#> SRR2105348 2 0.734 -0.31321 0.200 0.480 0.052 0.000 0.268
#> SRR2105343 2 0.339 0.67823 0.028 0.860 0.076 0.000 0.036
#> SRR2105344 2 0.273 0.67135 0.016 0.868 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105341 2 0.573 0.32550 0.020 0.604 0.064 0.000 0.312
#> SRR2105342 2 0.421 0.62339 0.008 0.792 0.052 0.004 0.144
#> SRR2105339 2 0.467 0.63363 0.012 0.768 0.080 0.004 0.136
#> SRR2105340 2 0.679 0.11032 0.024 0.520 0.276 0.000 0.180
#> SRR2105335 3 0.720 0.20720 0.040 0.280 0.480 0.000 0.200
#> SRR2105336 5 0.812 0.37804 0.108 0.288 0.236 0.000 0.368
#> SRR2105337 2 0.670 -0.11107 0.036 0.460 0.400 0.000 0.104
#> SRR2105338 2 0.670 -0.12528 0.012 0.484 0.324 0.000 0.180
#> SRR2105331 3 0.639 0.24268 0.040 0.416 0.484 0.004 0.056
#> SRR2105332 3 0.571 0.46834 0.044 0.324 0.600 0.000 0.032
#> SRR2105333 2 0.296 0.67780 0.012 0.880 0.068 0.000 0.040
#> SRR2105334 2 0.267 0.67886 0.020 0.900 0.036 0.000 0.044
#> SRR2105329 2 0.230 0.69278 0.020 0.916 0.016 0.000 0.048
#> SRR2105330 2 0.248 0.69345 0.012 0.904 0.020 0.000 0.064
#> SRR2105327 2 0.336 0.68670 0.016 0.860 0.064 0.000 0.060
#> SRR2105328 2 0.328 0.68453 0.016 0.864 0.072 0.000 0.048
#> SRR2105325 3 0.433 0.38865 0.052 0.060 0.808 0.000 0.080
#> SRR2105326 3 0.474 0.37542 0.060 0.060 0.792 0.008 0.080
#> SRR2105323 2 0.416 0.59776 0.012 0.764 0.024 0.000 0.200
#> SRR2105324 2 0.345 0.63272 0.000 0.812 0.024 0.000 0.164
#> SRR2105319 3 0.550 0.35722 0.092 0.056 0.720 0.000 0.132
#> SRR2105320 1 0.691 0.43647 0.424 0.040 0.416 0.000 0.120
#> SRR2105321 3 0.444 0.42294 0.036 0.076 0.804 0.004 0.080
#> SRR2105322 3 0.387 0.42139 0.040 0.068 0.836 0.000 0.056
#> SRR2105317 2 0.275 0.68067 0.020 0.900 0.032 0.004 0.044
#> SRR2105318 2 0.234 0.66940 0.016 0.916 0.036 0.000 0.032
#> SRR2105315 2 0.197 0.67811 0.016 0.932 0.016 0.000 0.036
#> SRR2105316 2 0.234 0.67070 0.016 0.916 0.036 0.000 0.032
#> SRR2105313 2 0.213 0.69008 0.016 0.924 0.016 0.000 0.044
#> SRR2105314 2 0.210 0.68696 0.008 0.920 0.012 0.000 0.060
#> SRR2105311 3 0.472 0.55682 0.040 0.176 0.752 0.000 0.032
#> SRR2105312 3 0.434 0.50398 0.052 0.120 0.800 0.004 0.024
#> SRR2105307 5 0.596 0.64521 0.032 0.364 0.052 0.000 0.552
#> SRR2105308 2 0.567 -0.23068 0.020 0.516 0.040 0.000 0.424
#> SRR2105309 2 0.324 0.67035 0.012 0.864 0.028 0.004 0.092
#> SRR2105310 2 0.416 0.59642 0.016 0.772 0.024 0.000 0.188
#> SRR2105305 2 0.415 0.64481 0.012 0.804 0.040 0.008 0.136
#> SRR2105306 2 0.257 0.68142 0.016 0.908 0.028 0.004 0.044
#> SRR2105303 2 0.310 0.67714 0.008 0.876 0.052 0.004 0.060
#> SRR2105304 4 0.000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.544 0.51435 0.020 0.680 0.220 0.000 0.080
#> SRR2105302 2 0.393 0.66745 0.040 0.832 0.072 0.000 0.056
#> SRR2105299 2 0.649 0.09276 0.008 0.520 0.324 0.004 0.144
#> SRR2105300 2 0.299 0.68823 0.012 0.880 0.052 0.000 0.056
#> SRR2105297 1 0.592 0.75574 0.668 0.056 0.196 0.000 0.080
#> SRR2105298 1 0.453 0.69030 0.792 0.024 0.096 0.004 0.084
#> SRR2105295 2 0.354 0.67282 0.012 0.852 0.064 0.004 0.068
#> SRR2105296 2 0.557 0.55414 0.064 0.712 0.148 0.000 0.076
#> SRR2105293 3 0.685 0.24367 0.044 0.388 0.460 0.000 0.108
#> SRR2105294 3 0.658 0.53407 0.076 0.152 0.624 0.000 0.148
#> SRR2105291 2 0.613 0.37865 0.032 0.612 0.096 0.000 0.260
#> SRR2105292 5 0.807 0.25235 0.100 0.204 0.280 0.004 0.412
#> SRR2105289 2 0.264 0.69123 0.008 0.888 0.016 0.000 0.088
#> SRR2105290 2 0.630 -0.19752 0.036 0.508 0.056 0.004 0.396
#> SRR2105287 5 0.627 0.44841 0.044 0.444 0.052 0.000 0.460
#> SRR2105288 5 0.813 0.46629 0.236 0.224 0.132 0.000 0.408
#> SRR2105285 2 0.307 0.68007 0.016 0.876 0.040 0.000 0.068
#> SRR2105286 2 0.236 0.69260 0.000 0.892 0.012 0.000 0.096
#> SRR2105283 2 0.567 0.53865 0.036 0.688 0.100 0.000 0.176
#> SRR2105284 2 0.580 0.15324 0.024 0.604 0.052 0.004 0.316
#> SRR2105281 2 0.349 0.64563 0.016 0.796 0.000 0.000 0.188
#> SRR2105282 2 0.290 0.67701 0.028 0.864 0.000 0.000 0.108
#> SRR2105259 2 0.342 0.67397 0.016 0.852 0.040 0.000 0.092
#> SRR2105260 2 0.210 0.68825 0.004 0.916 0.012 0.000 0.068
#> SRR2105279 2 0.307 0.67111 0.016 0.864 0.008 0.004 0.108
#> SRR2105280 2 0.380 0.67188 0.040 0.812 0.008 0.000 0.140
#> SRR2105257 5 0.817 0.00915 0.164 0.152 0.320 0.000 0.364
#> SRR2105258 3 0.761 0.21519 0.160 0.112 0.496 0.000 0.232
#> SRR2105253 2 0.391 0.67937 0.044 0.840 0.060 0.004 0.052
#> SRR2105254 2 0.272 0.68482 0.020 0.900 0.024 0.004 0.052
#> SRR2105255 2 0.484 0.56178 0.020 0.728 0.048 0.000 0.204
#> SRR2105256 2 0.564 -0.12905 0.008 0.536 0.060 0.000 0.396
#> SRR2105251 2 0.579 0.51583 0.044 0.688 0.144 0.000 0.124
#> SRR2105252 2 0.332 0.69568 0.044 0.868 0.040 0.000 0.048
#> SRR2105249 2 0.351 0.66813 0.024 0.848 0.020 0.004 0.104
#> SRR2105250 2 0.557 -0.09645 0.020 0.540 0.036 0.000 0.404
#> SRR2105247 2 0.627 0.44435 0.060 0.640 0.196 0.000 0.104
#> SRR2105248 3 0.560 0.52991 0.020 0.272 0.640 0.000 0.068
#> SRR2105245 3 0.547 0.55567 0.028 0.208 0.688 0.000 0.076
#> SRR2105246 2 0.522 0.53879 0.016 0.708 0.212 0.008 0.056
#> SRR2105243 2 0.317 0.66673 0.008 0.864 0.044 0.000 0.084
#> SRR2105244 2 0.666 0.11716 0.020 0.540 0.256 0.000 0.184
#> SRR2105241 2 0.660 0.20017 0.020 0.544 0.268 0.000 0.168
#> SRR2105242 3 0.723 0.28253 0.044 0.236 0.492 0.000 0.228
#> SRR2105239 2 0.614 0.04319 0.016 0.520 0.376 0.000 0.088
#> SRR2105240 3 0.840 0.03900 0.236 0.156 0.332 0.000 0.276
#> SRR2105237 2 0.321 0.68071 0.012 0.872 0.060 0.004 0.052
#> SRR2105238 2 0.227 0.68338 0.012 0.912 0.012 0.000 0.064
#> SRR2105235 2 0.283 0.68943 0.020 0.884 0.008 0.004 0.084
#> SRR2105236 2 0.420 0.61023 0.020 0.788 0.036 0.000 0.156
#> SRR2105233 2 0.374 0.68297 0.044 0.844 0.064 0.000 0.048
#> SRR2105234 2 0.306 0.67321 0.020 0.884 0.052 0.004 0.040
#> SRR2105231 2 0.444 0.63815 0.028 0.792 0.072 0.000 0.108
#> SRR2105232 2 0.548 0.55610 0.028 0.704 0.112 0.000 0.156
#> SRR2105227 2 0.605 0.50068 0.044 0.676 0.100 0.008 0.172
#> SRR2105228 2 0.357 0.64544 0.008 0.836 0.048 0.000 0.108
#> SRR2105225 2 0.510 0.57857 0.028 0.724 0.064 0.000 0.184
#> SRR2105226 2 0.645 0.00125 0.028 0.556 0.116 0.000 0.300
#> SRR2105229 2 0.488 0.61564 0.024 0.756 0.124 0.000 0.096
#> SRR2105230 2 0.594 -0.32904 0.012 0.488 0.072 0.000 0.428
#> SRR2105219 2 0.318 0.68004 0.028 0.872 0.068 0.000 0.032
#> SRR2105220 2 0.344 0.66843 0.028 0.828 0.004 0.000 0.140
#> SRR2105221 2 0.581 0.40845 0.016 0.644 0.116 0.000 0.224
#> SRR2105222 5 0.818 0.51318 0.224 0.260 0.128 0.000 0.388
#> SRR2105223 3 0.714 0.05810 0.020 0.320 0.420 0.000 0.240
#> SRR2105224 2 0.677 0.03273 0.020 0.524 0.248 0.000 0.208
#> SRR2105217 3 0.433 0.45607 0.048 0.088 0.812 0.004 0.048
#> SRR2105218 2 0.685 -0.14125 0.020 0.448 0.368 0.000 0.164
#> SRR2105215 2 0.428 0.66818 0.032 0.800 0.032 0.004 0.132
#> SRR2105216 2 0.255 0.68252 0.020 0.896 0.008 0.000 0.076
#> SRR2105213 3 0.611 0.37304 0.024 0.336 0.560 0.000 0.080
#> SRR2105214 2 0.622 0.27122 0.032 0.572 0.312 0.000 0.084
#> SRR2105211 2 0.393 0.67701 0.024 0.824 0.052 0.000 0.100
#> SRR2105212 2 0.264 0.68310 0.008 0.884 0.012 0.000 0.096
#> SRR2105209 2 0.662 -0.21484 0.012 0.480 0.160 0.000 0.348
#> SRR2105210 5 0.846 0.29437 0.132 0.256 0.292 0.004 0.316
#> SRR2105207 3 0.680 0.50651 0.076 0.248 0.588 0.008 0.080
#> SRR2105208 3 0.848 -0.02024 0.268 0.148 0.344 0.004 0.236
#> SRR2105205 3 0.595 0.46215 0.056 0.320 0.588 0.000 0.036
#> SRR2105206 3 0.544 0.53906 0.052 0.272 0.652 0.000 0.024
#> SRR2105201 2 0.447 0.51087 0.008 0.712 0.024 0.000 0.256
#> SRR2105202 2 0.540 0.08670 0.012 0.592 0.044 0.000 0.352
#> SRR2105203 2 0.417 0.66633 0.036 0.816 0.104 0.004 0.040
#> SRR2105204 2 0.327 0.66592 0.020 0.848 0.012 0.000 0.120
#> SRR2105199 2 0.400 0.64677 0.028 0.788 0.012 0.000 0.172
#> SRR2105200 2 0.620 0.06874 0.036 0.568 0.060 0.004 0.332
#> SRR2105197 2 0.658 0.04435 0.020 0.560 0.204 0.000 0.216
#> SRR2105198 2 0.803 -0.53428 0.084 0.340 0.280 0.000 0.296
#> SRR2105195 3 0.571 0.57008 0.056 0.172 0.700 0.004 0.068
#> SRR2105196 3 0.765 0.02795 0.064 0.212 0.420 0.000 0.304
#> SRR2105193 1 0.746 0.57818 0.464 0.052 0.304 0.004 0.176
#> SRR2105194 1 0.638 0.68210 0.520 0.020 0.352 0.000 0.108
#> SRR2105191 2 0.647 0.33244 0.008 0.596 0.216 0.016 0.164
#> SRR2105192 5 0.685 -0.45559 0.404 0.056 0.076 0.004 0.460
#> SRR2105189 2 0.290 0.67576 0.020 0.888 0.044 0.000 0.048
#> SRR2105190 2 0.272 0.67457 0.012 0.892 0.028 0.000 0.068
#> SRR2105187 3 0.484 0.54871 0.024 0.152 0.752 0.000 0.072
#> SRR2105188 3 0.741 -0.01397 0.040 0.264 0.436 0.000 0.260
#> SRR2105179 3 0.648 0.48780 0.024 0.232 0.592 0.004 0.148
#> SRR2105180 3 0.759 -0.42206 0.372 0.068 0.388 0.000 0.172
#> SRR2105183 2 0.287 0.69294 0.024 0.884 0.004 0.008 0.080
#> SRR2105184 2 0.674 0.06652 0.048 0.540 0.112 0.000 0.300
#> SRR2105185 2 0.420 0.68191 0.036 0.824 0.068 0.008 0.064
#> SRR2105186 2 0.728 -0.16049 0.040 0.444 0.324 0.000 0.192
#> SRR2105181 2 0.754 -0.51221 0.036 0.336 0.300 0.000 0.328
#> SRR2105182 2 0.581 -0.38266 0.008 0.472 0.068 0.000 0.452
#> SRR2105177 3 0.714 0.47112 0.092 0.268 0.532 0.000 0.108
#> SRR2105178 1 0.423 0.71543 0.812 0.016 0.116 0.016 0.040
#> SRR2105171 2 0.351 0.68185 0.024 0.848 0.032 0.000 0.096
#> SRR2105172 2 0.351 0.66606 0.032 0.832 0.008 0.000 0.128
#> SRR2105175 3 0.640 0.15377 0.264 0.064 0.608 0.008 0.056
#> SRR2105176 1 0.438 0.75162 0.780 0.020 0.152 0.000 0.048
#> SRR2105173 2 0.429 0.64141 0.020 0.800 0.096 0.000 0.084
#> SRR2105174 2 0.492 0.58968 0.016 0.744 0.140 0.000 0.100
#> SRR2105169 2 0.457 0.63545 0.024 0.780 0.116 0.000 0.080
#> SRR2105170 2 0.744 -0.04794 0.076 0.504 0.212 0.000 0.208
#> SRR2105167 2 0.326 0.68294 0.024 0.856 0.016 0.000 0.104
#> SRR2105168 2 0.372 0.66445 0.036 0.816 0.008 0.000 0.140
#> SRR2105165 3 0.621 0.55158 0.040 0.176 0.640 0.000 0.144
#> SRR2105166 3 0.500 0.53642 0.052 0.128 0.756 0.000 0.064
#> SRR2105163 3 0.522 0.58265 0.032 0.188 0.716 0.000 0.064
#> SRR2105164 3 0.453 0.48268 0.040 0.092 0.792 0.000 0.076
#> SRR2105161 3 0.468 0.55013 0.032 0.132 0.772 0.000 0.064
#> SRR2105162 1 0.616 0.70767 0.572 0.028 0.316 0.000 0.084
#> SRR2105155 2 0.230 0.69045 0.012 0.916 0.012 0.004 0.056
#> SRR2105156 2 0.306 0.68174 0.036 0.856 0.000 0.000 0.108
#> SRR2105157 3 0.486 0.56012 0.028 0.212 0.724 0.000 0.036
#> SRR2105158 3 0.473 0.57383 0.044 0.188 0.744 0.000 0.024
#> SRR2105159 3 0.489 0.48384 0.052 0.108 0.768 0.000 0.072
#> SRR2105160 3 0.676 0.37896 0.032 0.208 0.556 0.000 0.204
#> SRR2105153 2 0.661 -0.01633 0.056 0.480 0.396 0.000 0.068
#> SRR2105154 3 0.401 0.47969 0.032 0.092 0.828 0.004 0.044
#> SRR2105151 2 0.435 0.64438 0.032 0.768 0.020 0.000 0.180
#> SRR2105152 2 0.324 0.68589 0.036 0.856 0.008 0.000 0.100
#> SRR2105149 2 0.381 0.68103 0.016 0.836 0.040 0.008 0.100
#> SRR2105150 2 0.356 0.63775 0.008 0.828 0.032 0.000 0.132
#> SRR2105147 2 0.652 0.36799 0.008 0.624 0.220 0.088 0.060
#> SRR2105148 2 0.620 0.50008 0.012 0.672 0.176 0.072 0.068
#> SRR2105143 2 0.638 0.28942 0.044 0.584 0.092 0.000 0.280
#> SRR2105144 2 0.593 -0.05381 0.036 0.548 0.044 0.000 0.372
#> SRR2105145 3 0.476 0.45928 0.064 0.088 0.780 0.000 0.068
#> SRR2105146 3 0.493 0.37089 0.092 0.060 0.768 0.000 0.080
#> SRR2105141 3 0.556 0.54391 0.028 0.256 0.656 0.000 0.060
#> SRR2105142 2 0.649 0.00943 0.040 0.500 0.380 0.000 0.080
#> SRR2105139 2 0.348 0.67449 0.028 0.848 0.024 0.000 0.100
#> SRR2105140 2 0.367 0.66479 0.020 0.812 0.012 0.000 0.156
#> SRR2105137 2 0.337 0.68638 0.036 0.864 0.004 0.020 0.076
#> SRR2105138 2 0.664 -0.37754 0.040 0.476 0.092 0.000 0.392
#> SRR2105135 2 0.267 0.67792 0.016 0.896 0.024 0.000 0.064
#> SRR2105136 2 0.325 0.67193 0.024 0.848 0.008 0.000 0.120
#> SRR2105133 2 0.548 0.23037 0.012 0.596 0.052 0.000 0.340
#> SRR2105134 5 0.580 0.56585 0.016 0.408 0.056 0.000 0.520
#> SRR2105131 2 0.307 0.67809 0.016 0.864 0.016 0.000 0.104
#> SRR2105132 5 0.622 0.61504 0.052 0.260 0.076 0.000 0.612
#> SRR2105129 1 0.784 0.52512 0.424 0.084 0.240 0.000 0.252
#> SRR2105130 1 0.474 0.73915 0.768 0.016 0.128 0.004 0.084
#> SRR2105127 5 0.604 0.63570 0.048 0.280 0.060 0.000 0.612
#> SRR2105128 2 0.612 -0.33052 0.032 0.492 0.056 0.000 0.420
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.5097 0.16346 0.008 0.188 0.020 0.000 0.688 0.096
#> SRR2105278 5 0.4797 0.08519 0.044 0.100 0.020 0.000 0.756 0.080
#> SRR2105275 3 0.4401 0.48988 0.020 0.024 0.764 0.000 0.040 0.152
#> SRR2105276 3 0.5316 0.46154 0.008 0.056 0.688 0.000 0.072 0.176
#> SRR2105273 2 0.7216 0.16241 0.020 0.480 0.152 0.000 0.248 0.100
#> SRR2105274 5 0.6639 0.28407 0.004 0.344 0.088 0.000 0.464 0.100
#> SRR2105271 2 0.5404 0.19497 0.000 0.540 0.020 0.000 0.368 0.072
#> SRR2105272 3 0.7896 -0.05221 0.300 0.032 0.332 0.000 0.228 0.108
#> SRR2105269 2 0.2940 0.62575 0.008 0.860 0.008 0.000 0.024 0.100
#> SRR2105270 2 0.3013 0.64073 0.000 0.844 0.000 0.000 0.088 0.068
#> SRR2105267 2 0.2067 0.65070 0.004 0.916 0.004 0.000 0.028 0.048
#> SRR2105268 2 0.4295 0.56907 0.000 0.728 0.000 0.000 0.112 0.160
#> SRR2105265 2 0.3176 0.62744 0.000 0.812 0.000 0.000 0.032 0.156
#> SRR2105266 2 0.4507 0.59138 0.000 0.732 0.012 0.000 0.132 0.124
#> SRR2105263 3 0.4756 0.50844 0.024 0.104 0.764 0.004 0.032 0.072
#> SRR2105264 3 0.7404 0.17094 0.056 0.144 0.524 0.004 0.184 0.088
#> SRR2105261 2 0.6994 0.26543 0.012 0.512 0.172 0.000 0.100 0.204
#> SRR2105262 2 0.4686 0.55942 0.000 0.700 0.020 0.000 0.212 0.068
#> SRR2105357 2 0.3338 0.60299 0.000 0.800 0.008 0.000 0.172 0.020
#> SRR2105358 5 0.4434 0.26499 0.004 0.208 0.016 0.000 0.724 0.048
#> SRR2105439 2 0.5202 0.45882 0.004 0.616 0.004 0.000 0.272 0.104
#> SRR2105440 2 0.4867 0.52856 0.008 0.684 0.004 0.000 0.208 0.096
#> SRR2105509 2 0.3219 0.63881 0.000 0.848 0.008 0.008 0.048 0.088
#> SRR2105510 2 0.2364 0.63635 0.004 0.892 0.000 0.000 0.032 0.072
#> SRR2105507 2 0.7267 0.07106 0.028 0.488 0.244 0.000 0.132 0.108
#> SRR2105508 2 0.6793 0.32133 0.008 0.544 0.176 0.000 0.148 0.124
#> SRR2105505 5 0.5484 0.14880 0.012 0.244 0.024 0.000 0.636 0.084
#> SRR2105506 5 0.5799 0.08785 0.116 0.140 0.016 0.000 0.664 0.064
#> SRR2105503 2 0.6715 0.39616 0.024 0.560 0.204 0.000 0.072 0.140
#> SRR2105504 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3385 0.64579 0.004 0.840 0.016 0.000 0.076 0.064
#> SRR2105502 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.6296 0.19951 0.028 0.208 0.104 0.000 0.604 0.056
#> SRR2105500 5 0.5229 0.35850 0.004 0.364 0.020 0.000 0.564 0.048
#> SRR2105497 3 0.6416 0.29018 0.024 0.236 0.580 0.000 0.072 0.088
#> SRR2105498 2 0.7396 0.09366 0.020 0.472 0.208 0.000 0.172 0.128
#> SRR2105495 2 0.2719 0.65540 0.012 0.876 0.000 0.000 0.040 0.072
#> SRR2105496 2 0.4719 0.57779 0.000 0.692 0.008 0.000 0.100 0.200
#> SRR2105493 2 0.2711 0.65015 0.000 0.872 0.008 0.000 0.084 0.036
#> SRR2105494 2 0.3749 0.63803 0.004 0.796 0.004 0.000 0.128 0.068
#> SRR2105491 3 0.4038 0.48934 0.020 0.020 0.804 0.004 0.036 0.116
#> SRR2105492 3 0.4588 0.48800 0.056 0.028 0.780 0.004 0.036 0.096
#> SRR2105489 3 0.7588 -0.17306 0.016 0.276 0.380 0.000 0.104 0.224
#> SRR2105490 5 0.6746 0.24247 0.008 0.344 0.024 0.000 0.376 0.248
#> SRR2105487 5 0.7173 -0.23441 0.044 0.152 0.136 0.000 0.544 0.124
#> SRR2105488 5 0.4692 0.27098 0.020 0.188 0.012 0.000 0.724 0.056
#> SRR2105485 5 0.5158 0.09920 0.004 0.452 0.004 0.000 0.480 0.060
#> SRR2105486 5 0.4902 0.33129 0.004 0.316 0.020 0.000 0.624 0.036
#> SRR2105483 1 0.2932 0.64991 0.840 0.000 0.132 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105484 1 0.2119 0.60499 0.912 0.000 0.060 0.004 0.008 0.016
#> SRR2105481 3 0.6659 0.35804 0.020 0.132 0.584 0.000 0.120 0.144
#> SRR2105482 5 0.7233 0.00923 0.048 0.184 0.172 0.000 0.520 0.076
#> SRR2105479 3 0.4609 0.53103 0.044 0.080 0.776 0.000 0.072 0.028
#> SRR2105480 3 0.4403 0.51992 0.084 0.032 0.788 0.000 0.068 0.028
#> SRR2105477 3 0.6209 0.29085 0.012 0.156 0.612 0.000 0.068 0.152
#> SRR2105478 3 0.5884 0.38736 0.004 0.140 0.636 0.000 0.068 0.152
#> SRR2105475 2 0.2116 0.63711 0.000 0.912 0.004 0.004 0.024 0.056
#> SRR2105476 2 0.4329 0.61620 0.012 0.780 0.060 0.000 0.032 0.116
#> SRR2105473 5 0.5814 0.36073 0.016 0.336 0.004 0.000 0.528 0.116
#> SRR2105474 2 0.6580 0.03872 0.024 0.488 0.016 0.000 0.280 0.192
#> SRR2105471 3 0.8258 -0.57882 0.048 0.160 0.332 0.000 0.212 0.248
#> SRR2105472 3 0.8503 -0.48215 0.100 0.148 0.328 0.000 0.160 0.264
#> SRR2105469 2 0.4325 0.60918 0.004 0.752 0.016 0.000 0.164 0.064
#> SRR2105470 2 0.5582 0.15809 0.008 0.520 0.020 0.000 0.388 0.064
#> SRR2105467 5 0.5568 0.04901 0.012 0.124 0.048 0.000 0.676 0.140
#> SRR2105468 5 0.5085 0.16802 0.024 0.188 0.012 0.000 0.696 0.080
#> SRR2105465 5 0.6223 0.30735 0.016 0.400 0.028 0.000 0.460 0.096
#> SRR2105466 5 0.7493 0.10508 0.064 0.228 0.136 0.000 0.488 0.084
#> SRR2105463 5 0.8426 -0.33484 0.172 0.152 0.268 0.000 0.328 0.080
#> SRR2105464 1 0.4616 0.69812 0.740 0.012 0.172 0.000 0.036 0.040
#> SRR2105461 2 0.2404 0.63641 0.000 0.884 0.000 0.000 0.036 0.080
#> SRR2105462 2 0.4117 0.60943 0.004 0.756 0.000 0.000 0.096 0.144
#> SRR2105459 2 0.1760 0.64610 0.004 0.928 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR2105460 2 0.2608 0.63277 0.004 0.888 0.004 0.004 0.036 0.064
#> SRR2105457 2 0.4598 0.58166 0.008 0.724 0.020 0.000 0.196 0.052
#> SRR2105458 2 0.3711 0.61306 0.000 0.796 0.008 0.008 0.152 0.036
#> SRR2105455 2 0.3508 0.64172 0.012 0.840 0.056 0.000 0.020 0.072
#> SRR2105456 2 0.4656 0.60879 0.004 0.732 0.016 0.000 0.128 0.120
#> SRR2105453 5 0.5892 0.36580 0.020 0.308 0.012 0.000 0.556 0.104
#> SRR2105454 5 0.6173 -0.06517 0.244 0.072 0.016 0.000 0.592 0.076
#> SRR2105451 2 0.2380 0.64978 0.000 0.892 0.004 0.000 0.068 0.036
#> SRR2105452 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105449 5 0.8370 -0.21499 0.072 0.228 0.260 0.000 0.316 0.124
#> SRR2105450 5 0.6128 0.25179 0.036 0.212 0.072 0.004 0.628 0.048
#> SRR2105447 2 0.2800 0.63901 0.008 0.880 0.012 0.000 0.040 0.060
#> SRR2105448 2 0.4041 0.64573 0.008 0.808 0.044 0.004 0.040 0.096
#> SRR2105445 2 0.3693 0.64941 0.004 0.816 0.008 0.004 0.100 0.068
#> SRR2105446 2 0.3931 0.58266 0.000 0.756 0.008 0.000 0.192 0.044
#> SRR2105443 2 0.3745 0.63749 0.000 0.808 0.024 0.000 0.108 0.060
#> SRR2105444 2 0.4983 0.44109 0.004 0.624 0.012 0.000 0.304 0.056
#> SRR2105441 5 0.5525 0.29809 0.008 0.412 0.004 0.000 0.488 0.088
#> SRR2105442 5 0.6555 0.28307 0.004 0.380 0.036 0.000 0.412 0.168
#> SRR2105437 1 0.6308 0.52035 0.444 0.000 0.348 0.004 0.016 0.188
#> SRR2105438 1 0.6422 0.52381 0.444 0.000 0.328 0.004 0.020 0.204
#> SRR2105435 2 0.6426 0.09343 0.004 0.472 0.028 0.000 0.312 0.184
#> SRR2105436 5 0.5933 0.31125 0.004 0.372 0.036 0.000 0.504 0.084
#> SRR2105433 3 0.8336 -0.07982 0.220 0.120 0.368 0.000 0.204 0.088
#> SRR2105434 5 0.8526 -0.15483 0.064 0.244 0.196 0.008 0.340 0.148
#> SRR2105431 1 0.5830 0.68483 0.636 0.004 0.184 0.000 0.068 0.108
#> SRR2105432 1 0.6373 0.63947 0.524 0.000 0.280 0.004 0.048 0.144
#> SRR2105429 3 0.7724 -0.34601 0.016 0.212 0.332 0.000 0.124 0.316
#> SRR2105430 2 0.6954 0.20569 0.004 0.500 0.156 0.000 0.120 0.220
#> SRR2105427 2 0.2213 0.64256 0.004 0.904 0.000 0.004 0.020 0.068
#> SRR2105428 2 0.3685 0.64852 0.004 0.812 0.004 0.004 0.072 0.104
#> SRR2105425 2 0.4933 0.62641 0.012 0.740 0.052 0.000 0.108 0.088
#> SRR2105426 2 0.5597 0.57481 0.004 0.668 0.056 0.004 0.172 0.096
#> SRR2105421 2 0.3052 0.65339 0.004 0.864 0.020 0.000 0.068 0.044
#> SRR2105422 2 0.4469 0.60274 0.004 0.744 0.032 0.000 0.172 0.048
#> SRR2105423 2 0.3773 0.62201 0.012 0.820 0.048 0.000 0.024 0.096
#> SRR2105424 2 0.3092 0.64093 0.000 0.836 0.000 0.000 0.060 0.104
#> SRR2105419 2 0.5147 0.55244 0.012 0.680 0.020 0.000 0.208 0.080
#> SRR2105420 2 0.3048 0.63441 0.000 0.844 0.012 0.000 0.116 0.028
#> SRR2105415 5 0.7948 -0.26813 0.264 0.128 0.200 0.000 0.372 0.036
#> SRR2105416 1 0.4740 0.60909 0.732 0.016 0.048 0.004 0.180 0.020
#> SRR2105417 5 0.7948 0.04228 0.040 0.288 0.176 0.000 0.368 0.128
#> SRR2105418 1 0.4955 0.64664 0.748 0.024 0.064 0.004 0.120 0.040
#> SRR2105413 2 0.2959 0.63534 0.008 0.864 0.004 0.000 0.052 0.072
#> SRR2105414 2 0.1655 0.64010 0.004 0.936 0.004 0.000 0.012 0.044
#> SRR2105409 2 0.6892 -0.29550 0.012 0.380 0.324 0.000 0.028 0.256
#> SRR2105410 3 0.8172 -0.39075 0.048 0.204 0.372 0.000 0.208 0.168
#> SRR2105411 2 0.3605 0.63296 0.000 0.804 0.004 0.000 0.084 0.108
#> SRR2105412 2 0.4963 0.47764 0.000 0.636 0.000 0.000 0.124 0.240
#> SRR2105407 2 0.4226 0.60836 0.000 0.772 0.040 0.000 0.132 0.056
#> SRR2105408 2 0.3870 0.59184 0.004 0.764 0.008 0.000 0.192 0.032
#> SRR2105403 2 0.5059 0.40391 0.008 0.600 0.016 0.000 0.336 0.040
#> SRR2105404 2 0.5113 -0.07221 0.004 0.476 0.008 0.000 0.464 0.048
#> SRR2105405 2 0.5390 0.47706 0.012 0.628 0.020 0.000 0.268 0.072
#> SRR2105406 5 0.4574 0.28931 0.008 0.232 0.008 0.000 0.700 0.052
#> SRR2105401 2 0.2839 0.63259 0.004 0.868 0.004 0.000 0.048 0.076
#> SRR2105402 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.1564 0.64019 0.000 0.936 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR2105400 2 0.2152 0.63250 0.004 0.904 0.000 0.000 0.024 0.068
#> SRR2105397 2 0.6096 0.14153 0.004 0.544 0.300 0.000 0.044 0.108
#> SRR2105398 2 0.5397 0.53298 0.000 0.672 0.160 0.000 0.112 0.056
#> SRR2105395 2 0.7081 -0.23103 0.008 0.392 0.372 0.000 0.116 0.112
#> SRR2105396 2 0.6087 0.29830 0.012 0.552 0.016 0.000 0.260 0.160
#> SRR2105393 2 0.5705 0.35256 0.008 0.552 0.000 0.000 0.172 0.268
#> SRR2105394 2 0.4372 0.61588 0.004 0.720 0.028 0.000 0.024 0.224
#> SRR2105389 2 0.6948 0.25042 0.004 0.492 0.120 0.000 0.244 0.140
#> SRR2105390 2 0.7222 0.02496 0.008 0.456 0.220 0.000 0.212 0.104
#> SRR2105391 2 0.6700 0.21262 0.004 0.500 0.064 0.004 0.288 0.140
#> SRR2105392 2 0.6400 0.35061 0.004 0.560 0.080 0.000 0.232 0.124
#> SRR2105385 3 0.7869 0.20641 0.068 0.124 0.452 0.000 0.208 0.148
#> SRR2105386 2 0.6127 0.43496 0.008 0.604 0.120 0.000 0.204 0.064
#> SRR2105387 2 0.5172 0.62139 0.012 0.720 0.060 0.000 0.120 0.088
#> SRR2105388 2 0.6130 -0.01562 0.008 0.480 0.008 0.000 0.332 0.172
#> SRR2105381 2 0.4310 0.62620 0.020 0.788 0.064 0.000 0.028 0.100
#> SRR2105382 2 0.4797 0.57963 0.004 0.740 0.124 0.000 0.052 0.080
#> SRR2105383 2 0.6193 -0.19017 0.004 0.420 0.008 0.000 0.376 0.192
#> SRR2105384 5 0.6260 0.29063 0.008 0.392 0.008 0.000 0.408 0.184
#> SRR2105379 2 0.5575 0.45946 0.012 0.660 0.184 0.000 0.036 0.108
#> SRR2105380 3 0.6247 0.40454 0.032 0.176 0.624 0.000 0.108 0.060
#> SRR2105377 2 0.5624 0.46984 0.008 0.600 0.020 0.000 0.272 0.100
#> SRR2105378 5 0.7278 0.18582 0.048 0.244 0.088 0.004 0.512 0.104
#> SRR2105375 2 0.6852 0.13708 0.004 0.488 0.068 0.004 0.272 0.164
#> SRR2105376 5 0.4762 0.32591 0.016 0.232 0.004 0.000 0.688 0.060
#> SRR2105373 5 0.7106 -0.22061 0.012 0.132 0.140 0.000 0.500 0.216
#> SRR2105374 3 0.6948 -0.26954 0.352 0.016 0.424 0.004 0.040 0.164
#> SRR2105371 2 0.4046 0.64580 0.004 0.804 0.064 0.000 0.060 0.068
#> SRR2105372 2 0.5397 0.56887 0.008 0.708 0.080 0.008 0.132 0.064
#> SRR2105369 2 0.4090 0.58648 0.000 0.748 0.012 0.000 0.192 0.048
#> SRR2105370 2 0.4681 0.09508 0.004 0.520 0.008 0.000 0.448 0.020
#> SRR2105367 5 0.6552 0.25695 0.016 0.344 0.032 0.000 0.468 0.140
#> SRR2105368 5 0.8469 -0.38971 0.216 0.176 0.080 0.000 0.344 0.184
#> SRR2105365 3 0.4316 0.49812 0.024 0.076 0.788 0.004 0.012 0.096
#> SRR2105366 3 0.4231 0.52280 0.032 0.072 0.804 0.004 0.020 0.068
#> SRR2105363 2 0.4944 0.53163 0.008 0.688 0.004 0.000 0.164 0.136
#> SRR2105364 2 0.4228 0.57390 0.000 0.716 0.000 0.000 0.072 0.212
#> SRR2105361 2 0.2638 0.63990 0.004 0.892 0.012 0.004 0.036 0.052
#> SRR2105362 2 0.4241 0.61429 0.004 0.764 0.032 0.000 0.160 0.040
#> SRR2105359 5 0.5934 0.30775 0.008 0.380 0.040 0.000 0.504 0.068
#> SRR2105360 2 0.5475 0.53893 0.000 0.672 0.152 0.000 0.092 0.084
#> SRR2105355 2 0.5510 0.46103 0.008 0.624 0.020 0.000 0.248 0.100
#> SRR2105356 2 0.5370 0.28358 0.004 0.556 0.028 0.000 0.364 0.048
#> SRR2105353 3 0.6753 0.00341 0.008 0.328 0.468 0.000 0.076 0.120
#> SRR2105354 3 0.7493 0.04904 0.020 0.196 0.460 0.000 0.180 0.144
#> SRR2105351 2 0.6499 0.04417 0.016 0.472 0.364 0.000 0.048 0.100
#> SRR2105352 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.4231 0.62698 0.004 0.796 0.068 0.004 0.052 0.076
#> SRR2105350 2 0.4990 0.45688 0.000 0.644 0.000 0.000 0.152 0.204
#> SRR2105345 2 0.3366 0.65218 0.004 0.824 0.000 0.000 0.092 0.080
#> SRR2105346 2 0.5914 -0.15384 0.008 0.444 0.000 0.000 0.388 0.160
#> SRR2105347 5 0.7844 0.16432 0.080 0.272 0.040 0.004 0.388 0.216
#> SRR2105348 5 0.7949 0.10722 0.204 0.280 0.020 0.000 0.328 0.168
#> SRR2105343 2 0.3870 0.62076 0.008 0.808 0.060 0.000 0.020 0.104
#> SRR2105344 2 0.3307 0.62686 0.000 0.808 0.000 0.000 0.044 0.148
#> SRR2105341 2 0.6349 -0.01174 0.004 0.444 0.040 0.000 0.388 0.124
#> SRR2105342 2 0.4712 0.51778 0.000 0.672 0.024 0.000 0.260 0.044
#> SRR2105339 2 0.6388 0.42104 0.004 0.580 0.132 0.000 0.188 0.096
#> SRR2105340 2 0.7474 -0.29802 0.008 0.384 0.300 0.000 0.180 0.128
#> SRR2105335 3 0.7676 -0.21419 0.020 0.180 0.408 0.000 0.140 0.252
#> SRR2105336 5 0.8465 -0.68371 0.112 0.128 0.152 0.000 0.328 0.280
#> SRR2105337 3 0.6849 -0.15009 0.004 0.328 0.452 0.000 0.104 0.112
#> SRR2105338 3 0.7853 -0.42700 0.032 0.260 0.336 0.000 0.276 0.096
#> SRR2105331 3 0.6180 0.27284 0.032 0.252 0.592 0.000 0.044 0.080
#> SRR2105332 3 0.5742 0.37816 0.020 0.180 0.660 0.004 0.032 0.104
#> SRR2105333 2 0.2611 0.63327 0.000 0.880 0.012 0.000 0.028 0.080
#> SRR2105334 2 0.2917 0.64712 0.004 0.868 0.012 0.000 0.040 0.076
#> SRR2105329 2 0.2790 0.63799 0.000 0.856 0.008 0.000 0.116 0.020
#> SRR2105330 2 0.3828 0.62936 0.000 0.780 0.012 0.000 0.160 0.048
#> SRR2105327 2 0.4008 0.63298 0.012 0.808 0.060 0.000 0.032 0.088
#> SRR2105328 2 0.4536 0.63282 0.008 0.772 0.072 0.000 0.068 0.080
#> SRR2105325 3 0.4916 0.44208 0.032 0.020 0.720 0.004 0.036 0.188
#> SRR2105326 3 0.5232 0.42694 0.048 0.020 0.696 0.004 0.036 0.196
#> SRR2105323 2 0.5556 0.39900 0.008 0.592 0.024 0.000 0.300 0.076
#> SRR2105324 2 0.4772 0.43547 0.000 0.624 0.004 0.000 0.308 0.064
#> SRR2105319 3 0.6316 0.39506 0.084 0.020 0.616 0.004 0.084 0.192
#> SRR2105320 1 0.6811 0.49785 0.472 0.012 0.288 0.000 0.048 0.180
#> SRR2105321 3 0.4339 0.49143 0.012 0.032 0.768 0.000 0.040 0.148
#> SRR2105322 3 0.4021 0.49487 0.016 0.020 0.804 0.004 0.040 0.116
#> SRR2105317 2 0.2074 0.64000 0.004 0.912 0.000 0.000 0.036 0.048
#> SRR2105318 2 0.1421 0.64491 0.000 0.944 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR2105315 2 0.1564 0.64787 0.000 0.936 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR2105316 2 0.1321 0.64352 0.000 0.952 0.004 0.000 0.024 0.020
#> SRR2105313 2 0.2505 0.64787 0.000 0.880 0.008 0.000 0.092 0.020
#> SRR2105314 2 0.2527 0.65045 0.000 0.884 0.004 0.000 0.048 0.064
#> SRR2105311 3 0.3995 0.53568 0.036 0.064 0.820 0.000 0.040 0.040
#> SRR2105312 3 0.2954 0.51964 0.028 0.036 0.884 0.004 0.020 0.028
#> SRR2105307 5 0.5391 0.19570 0.028 0.184 0.020 0.000 0.680 0.088
#> SRR2105308 5 0.5464 0.37452 0.016 0.308 0.004 0.000 0.584 0.088
#> SRR2105309 2 0.3497 0.60570 0.000 0.800 0.008 0.000 0.156 0.036
#> SRR2105310 2 0.5014 0.28616 0.008 0.564 0.000 0.000 0.368 0.060
#> SRR2105305 2 0.4505 0.54863 0.000 0.708 0.016 0.004 0.228 0.044
#> SRR2105306 2 0.3344 0.62856 0.008 0.844 0.020 0.000 0.092 0.036
#> SRR2105303 2 0.3417 0.64661 0.004 0.844 0.016 0.004 0.068 0.064
#> SRR2105304 4 0.0146 1.00000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.6771 0.12741 0.008 0.496 0.288 0.000 0.088 0.120
#> SRR2105302 2 0.4052 0.63389 0.008 0.796 0.048 0.000 0.032 0.116
#> SRR2105299 2 0.7439 -0.29699 0.004 0.372 0.312 0.000 0.152 0.160
#> SRR2105300 2 0.3784 0.65055 0.004 0.816 0.028 0.000 0.088 0.064
#> SRR2105297 1 0.4642 0.68571 0.760 0.020 0.124 0.000 0.064 0.032
#> SRR2105298 1 0.3445 0.55913 0.848 0.000 0.036 0.012 0.040 0.064
#> SRR2105295 2 0.3072 0.63470 0.008 0.864 0.024 0.000 0.028 0.076
#> SRR2105296 2 0.6470 0.33991 0.016 0.560 0.196 0.000 0.044 0.184
#> SRR2105293 3 0.6825 0.23281 0.020 0.228 0.540 0.000 0.116 0.096
#> SRR2105294 3 0.6454 0.40675 0.096 0.060 0.616 0.000 0.172 0.056
#> SRR2105291 2 0.7119 0.11027 0.012 0.464 0.116 0.000 0.284 0.124
#> SRR2105292 5 0.7723 -0.20174 0.132 0.100 0.188 0.004 0.496 0.080
#> SRR2105289 2 0.3626 0.62803 0.000 0.784 0.012 0.000 0.176 0.028
#> SRR2105290 5 0.5693 0.37084 0.016 0.320 0.032 0.000 0.576 0.056
#> SRR2105287 5 0.6062 0.34290 0.028 0.260 0.012 0.000 0.572 0.128
#> SRR2105288 5 0.7114 -0.07326 0.240 0.144 0.072 0.000 0.508 0.036
#> SRR2105285 2 0.3762 0.64381 0.004 0.800 0.008 0.000 0.124 0.064
#> SRR2105286 2 0.4520 0.63178 0.008 0.760 0.032 0.000 0.128 0.072
#> SRR2105283 2 0.7382 -0.05140 0.024 0.420 0.068 0.000 0.268 0.220
#> SRR2105284 2 0.5384 -0.03018 0.012 0.492 0.008 0.000 0.432 0.056
#> SRR2105281 2 0.5478 0.31231 0.000 0.568 0.000 0.000 0.236 0.196
#> SRR2105282 2 0.4114 0.58732 0.000 0.732 0.000 0.000 0.072 0.196
#> SRR2105259 2 0.5113 0.56898 0.004 0.692 0.036 0.000 0.184 0.084
#> SRR2105260 2 0.3225 0.63135 0.004 0.828 0.008 0.000 0.136 0.024
#> SRR2105279 2 0.3307 0.64700 0.004 0.836 0.004 0.008 0.032 0.116
#> SRR2105280 2 0.4632 0.51974 0.000 0.656 0.004 0.000 0.064 0.276
#> SRR2105257 5 0.8028 -0.28109 0.196 0.064 0.248 0.000 0.392 0.100
#> SRR2105258 3 0.7628 0.08113 0.204 0.036 0.432 0.000 0.236 0.092
#> SRR2105253 2 0.4532 0.62104 0.008 0.760 0.076 0.000 0.032 0.124
#> SRR2105254 2 0.1718 0.65048 0.000 0.932 0.008 0.000 0.016 0.044
#> SRR2105255 2 0.5347 0.41639 0.004 0.616 0.032 0.000 0.288 0.060
#> SRR2105256 5 0.4968 0.36735 0.000 0.328 0.016 0.000 0.604 0.052
#> SRR2105251 2 0.6954 0.21926 0.016 0.500 0.168 0.000 0.072 0.244
#> SRR2105252 2 0.5222 0.63659 0.008 0.724 0.080 0.004 0.092 0.092
#> SRR2105249 2 0.3460 0.62576 0.000 0.796 0.008 0.000 0.028 0.168
#> SRR2105250 5 0.5947 0.35759 0.020 0.320 0.008 0.000 0.536 0.116
#> SRR2105247 2 0.6272 0.18641 0.012 0.540 0.256 0.000 0.024 0.168
#> SRR2105248 3 0.4935 0.48270 0.008 0.120 0.728 0.000 0.036 0.108
#> SRR2105245 3 0.5263 0.43061 0.000 0.116 0.676 0.000 0.040 0.168
#> SRR2105246 2 0.6184 0.35261 0.012 0.592 0.236 0.000 0.084 0.076
#> SRR2105243 2 0.3961 0.60001 0.000 0.772 0.032 0.000 0.168 0.028
#> SRR2105244 2 0.7628 -0.26000 0.020 0.356 0.208 0.000 0.316 0.100
#> SRR2105241 2 0.7281 0.00876 0.012 0.448 0.240 0.000 0.204 0.096
#> SRR2105242 3 0.7626 -0.08227 0.048 0.136 0.468 0.000 0.224 0.124
#> SRR2105239 2 0.6648 -0.32840 0.000 0.412 0.368 0.000 0.056 0.164
#> SRR2105240 5 0.8194 -0.31062 0.292 0.104 0.240 0.000 0.304 0.060
#> SRR2105237 2 0.3569 0.63612 0.012 0.840 0.036 0.000 0.044 0.068
#> SRR2105238 2 0.3564 0.61182 0.004 0.796 0.004 0.000 0.160 0.036
#> SRR2105235 2 0.3605 0.63052 0.000 0.804 0.008 0.000 0.128 0.060
#> SRR2105236 2 0.5474 0.30015 0.000 0.572 0.008 0.000 0.292 0.128
#> SRR2105233 2 0.3603 0.63432 0.008 0.824 0.020 0.000 0.040 0.108
#> SRR2105234 2 0.2747 0.63192 0.004 0.876 0.008 0.000 0.036 0.076
#> SRR2105231 2 0.5388 0.47730 0.000 0.640 0.056 0.000 0.064 0.240
#> SRR2105232 2 0.7761 -0.04944 0.032 0.416 0.124 0.000 0.240 0.188
#> SRR2105227 2 0.7082 0.27993 0.028 0.524 0.104 0.004 0.240 0.100
#> SRR2105228 2 0.4088 0.57769 0.000 0.744 0.012 0.000 0.200 0.044
#> SRR2105225 2 0.5591 0.39856 0.000 0.596 0.040 0.000 0.280 0.084
#> SRR2105226 5 0.6680 0.15325 0.008 0.396 0.096 0.000 0.420 0.080
#> SRR2105229 2 0.5680 0.52452 0.000 0.656 0.120 0.000 0.132 0.092
#> SRR2105230 5 0.5475 0.31353 0.004 0.304 0.036 0.000 0.596 0.060
#> SRR2105219 2 0.3347 0.64613 0.004 0.848 0.060 0.000 0.028 0.060
#> SRR2105220 2 0.4906 0.48784 0.000 0.652 0.000 0.000 0.212 0.136
#> SRR2105221 2 0.7025 -0.14125 0.016 0.408 0.076 0.000 0.372 0.128
#> SRR2105222 5 0.7339 0.11037 0.204 0.216 0.044 0.000 0.476 0.060
#> SRR2105223 3 0.7914 -0.10429 0.020 0.188 0.368 0.000 0.212 0.212
#> SRR2105224 5 0.7755 0.01339 0.028 0.296 0.216 0.000 0.360 0.100
#> SRR2105217 3 0.4148 0.49507 0.012 0.032 0.792 0.004 0.032 0.128
#> SRR2105218 3 0.7533 -0.25547 0.008 0.184 0.416 0.000 0.168 0.224
#> SRR2105215 2 0.5988 0.39413 0.004 0.572 0.024 0.000 0.220 0.180
#> SRR2105216 2 0.3247 0.62690 0.000 0.808 0.000 0.000 0.036 0.156
#> SRR2105213 3 0.6343 0.30579 0.028 0.192 0.600 0.000 0.132 0.048
#> SRR2105214 3 0.7071 -0.17653 0.004 0.352 0.416 0.004 0.112 0.112
#> SRR2105211 2 0.5423 0.56861 0.008 0.664 0.040 0.000 0.204 0.084
#> SRR2105212 2 0.4314 0.56149 0.000 0.712 0.004 0.000 0.220 0.064
#> SRR2105209 5 0.7213 -0.10509 0.008 0.276 0.184 0.000 0.436 0.096
#> SRR2105210 5 0.7975 -0.39935 0.188 0.100 0.276 0.000 0.380 0.056
#> SRR2105207 3 0.6357 0.44080 0.060 0.112 0.640 0.000 0.116 0.072
#> SRR2105208 1 0.8633 -0.18266 0.292 0.100 0.256 0.000 0.200 0.152
#> SRR2105205 3 0.5309 0.42895 0.016 0.180 0.692 0.000 0.048 0.064
#> SRR2105206 3 0.4996 0.49110 0.028 0.132 0.740 0.004 0.028 0.068
#> SRR2105201 2 0.5470 0.04946 0.008 0.492 0.008 0.000 0.420 0.072
#> SRR2105202 5 0.5499 0.35152 0.008 0.340 0.012 0.000 0.560 0.080
#> SRR2105203 2 0.4679 0.58182 0.016 0.740 0.136 0.000 0.012 0.096
#> SRR2105204 2 0.3452 0.62313 0.000 0.792 0.008 0.000 0.024 0.176
#> SRR2105199 2 0.5364 0.36799 0.000 0.584 0.000 0.000 0.244 0.172
#> SRR2105200 2 0.6561 -0.29894 0.012 0.408 0.028 0.000 0.396 0.156
#> SRR2105197 2 0.7404 -0.15373 0.008 0.408 0.172 0.004 0.304 0.104
#> SRR2105198 6 0.8323 0.00000 0.044 0.192 0.204 0.000 0.272 0.288
#> SRR2105195 3 0.4995 0.52030 0.048 0.084 0.748 0.000 0.088 0.032
#> SRR2105196 3 0.7653 -0.28485 0.076 0.164 0.384 0.000 0.328 0.048
#> SRR2105193 1 0.6945 0.57748 0.524 0.012 0.212 0.004 0.168 0.080
#> SRR2105194 1 0.5858 0.63247 0.588 0.012 0.284 0.000 0.072 0.044
#> SRR2105191 2 0.7038 0.23880 0.004 0.524 0.128 0.008 0.180 0.156
#> SRR2105192 5 0.5906 -0.48687 0.424 0.008 0.020 0.000 0.456 0.092
#> SRR2105189 2 0.2544 0.65070 0.000 0.888 0.004 0.004 0.060 0.044
#> SRR2105190 2 0.2255 0.64419 0.000 0.892 0.004 0.000 0.016 0.088
#> SRR2105187 3 0.4689 0.49832 0.004 0.080 0.744 0.000 0.040 0.132
#> SRR2105188 3 0.7736 -0.23793 0.048 0.092 0.408 0.000 0.288 0.164
#> SRR2105179 3 0.6453 0.33878 0.020 0.124 0.608 0.000 0.136 0.112
#> SRR2105180 1 0.7337 0.39764 0.424 0.024 0.312 0.000 0.156 0.084
#> SRR2105183 2 0.4264 0.61492 0.000 0.744 0.004 0.000 0.124 0.128
#> SRR2105184 5 0.7499 0.25273 0.064 0.312 0.056 0.000 0.424 0.144
#> SRR2105185 2 0.5303 0.59552 0.012 0.712 0.136 0.004 0.052 0.084
#> SRR2105186 3 0.8059 -0.41110 0.028 0.188 0.344 0.000 0.192 0.248
#> SRR2105181 5 0.7979 -0.40860 0.012 0.220 0.228 0.000 0.284 0.256
#> SRR2105182 5 0.4977 0.29225 0.000 0.272 0.020 0.000 0.644 0.064
#> SRR2105177 3 0.7166 0.36387 0.096 0.092 0.564 0.000 0.136 0.112
#> SRR2105178 1 0.2108 0.58846 0.920 0.000 0.040 0.012 0.012 0.016
#> SRR2105171 2 0.4029 0.62771 0.016 0.796 0.012 0.000 0.112 0.064
#> SRR2105172 2 0.4762 0.52902 0.000 0.676 0.004 0.000 0.104 0.216
#> SRR2105175 3 0.5956 0.13261 0.304 0.020 0.572 0.000 0.052 0.052
#> SRR2105176 1 0.2577 0.64414 0.884 0.000 0.072 0.000 0.032 0.012
#> SRR2105173 2 0.6143 0.51259 0.012 0.632 0.132 0.000 0.116 0.108
#> SRR2105174 2 0.6491 0.43613 0.016 0.596 0.156 0.000 0.104 0.128
#> SRR2105169 2 0.6554 0.43947 0.012 0.580 0.176 0.000 0.112 0.120
#> SRR2105170 5 0.8413 -0.06793 0.060 0.260 0.188 0.000 0.308 0.184
#> SRR2105167 2 0.3945 0.61436 0.004 0.748 0.000 0.000 0.048 0.200
#> SRR2105168 2 0.4687 0.53550 0.004 0.672 0.000 0.000 0.084 0.240
#> SRR2105165 3 0.6420 0.41141 0.044 0.080 0.624 0.000 0.152 0.100
#> SRR2105166 3 0.4753 0.51721 0.044 0.060 0.768 0.000 0.088 0.040
#> SRR2105163 3 0.5173 0.50965 0.024 0.096 0.732 0.000 0.084 0.064
#> SRR2105164 3 0.4200 0.51360 0.036 0.028 0.804 0.000 0.076 0.056
#> SRR2105161 3 0.4557 0.51714 0.028 0.048 0.780 0.000 0.084 0.060
#> SRR2105162 1 0.5488 0.66633 0.652 0.020 0.240 0.004 0.056 0.028
#> SRR2105155 2 0.2760 0.65548 0.000 0.872 0.008 0.000 0.052 0.068
#> SRR2105156 2 0.4895 0.46148 0.000 0.632 0.000 0.000 0.104 0.264
#> SRR2105157 3 0.4174 0.51015 0.008 0.116 0.788 0.000 0.032 0.056
#> SRR2105158 3 0.4614 0.52999 0.036 0.072 0.784 0.004 0.040 0.064
#> SRR2105159 3 0.5255 0.50623 0.052 0.044 0.732 0.000 0.084 0.088
#> SRR2105160 3 0.7135 0.10066 0.044 0.096 0.524 0.000 0.228 0.108
#> SRR2105153 3 0.7277 0.01498 0.032 0.272 0.472 0.000 0.088 0.136
#> SRR2105154 3 0.3607 0.52374 0.032 0.036 0.844 0.000 0.052 0.036
#> SRR2105151 2 0.6091 0.19835 0.004 0.496 0.008 0.000 0.204 0.288
#> SRR2105152 2 0.4366 0.56729 0.000 0.712 0.004 0.000 0.072 0.212
#> SRR2105149 2 0.3662 0.63827 0.004 0.800 0.012 0.000 0.148 0.036
#> SRR2105150 2 0.4841 0.42527 0.004 0.620 0.008 0.000 0.320 0.048
#> SRR2105147 2 0.6837 0.21125 0.004 0.560 0.236 0.076 0.048 0.076
#> SRR2105148 2 0.6494 0.36457 0.004 0.604 0.204 0.056 0.044 0.088
#> SRR2105143 5 0.6755 0.30153 0.016 0.360 0.076 0.004 0.464 0.080
#> SRR2105144 5 0.5992 0.34363 0.012 0.336 0.008 0.000 0.508 0.136
#> SRR2105145 3 0.4828 0.49549 0.076 0.028 0.768 0.004 0.068 0.056
#> SRR2105146 3 0.5104 0.46636 0.060 0.020 0.732 0.004 0.048 0.136
#> SRR2105141 3 0.5221 0.50850 0.036 0.120 0.728 0.000 0.056 0.060
#> SRR2105142 3 0.6850 -0.02208 0.032 0.392 0.424 0.000 0.056 0.096
#> SRR2105139 2 0.3780 0.62264 0.004 0.780 0.016 0.000 0.024 0.176
#> SRR2105140 2 0.5215 0.51599 0.000 0.644 0.012 0.000 0.136 0.208
#> SRR2105137 2 0.3220 0.64881 0.000 0.840 0.004 0.012 0.032 0.112
#> SRR2105138 5 0.6559 0.33723 0.028 0.364 0.048 0.000 0.476 0.084
#> SRR2105135 2 0.2164 0.65155 0.000 0.908 0.008 0.000 0.028 0.056
#> SRR2105136 2 0.4315 0.58001 0.004 0.720 0.004 0.000 0.056 0.216
#> SRR2105133 5 0.5436 0.20921 0.004 0.408 0.016 0.000 0.508 0.064
#> SRR2105134 5 0.4966 0.32121 0.012 0.252 0.016 0.000 0.668 0.052
#> SRR2105131 2 0.3932 0.60165 0.000 0.760 0.012 0.000 0.188 0.040
#> SRR2105132 5 0.5033 0.02876 0.056 0.060 0.032 0.004 0.752 0.096
#> SRR2105129 1 0.7318 0.41214 0.480 0.064 0.156 0.000 0.252 0.048
#> SRR2105130 1 0.2469 0.64636 0.896 0.004 0.060 0.000 0.028 0.012
#> SRR2105127 5 0.5831 0.17502 0.044 0.156 0.032 0.000 0.664 0.104
#> SRR2105128 5 0.5510 0.34462 0.012 0.344 0.008 0.000 0.556 0.080
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.415 0.753 0.882 0.4340 0.584 0.584
#> 3 3 0.175 0.517 0.709 0.4785 0.707 0.525
#> 4 4 0.209 0.317 0.576 0.1437 0.914 0.774
#> 5 5 0.258 0.221 0.478 0.0743 0.892 0.689
#> 6 6 0.311 0.163 0.417 0.0454 0.870 0.569
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 2 0.2423 0.87544 0.040 0.960
#> SRR2105278 2 0.1184 0.87846 0.016 0.984
#> SRR2105275 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105276 1 0.2043 0.83668 0.968 0.032
#> SRR2105273 1 0.7528 0.74460 0.784 0.216
#> SRR2105274 2 0.6887 0.77216 0.184 0.816
#> SRR2105271 2 0.3879 0.85960 0.076 0.924
#> SRR2105272 1 0.5629 0.81574 0.868 0.132
#> SRR2105269 2 0.0672 0.87952 0.008 0.992
#> SRR2105270 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0672 0.87847 0.008 0.992
#> SRR2105266 2 0.0672 0.87942 0.008 0.992
#> SRR2105263 1 0.3584 0.83416 0.932 0.068
#> SRR2105264 1 0.8661 0.64585 0.712 0.288
#> SRR2105261 1 0.9358 0.54268 0.648 0.352
#> SRR2105262 2 0.3733 0.85747 0.072 0.928
#> SRR2105357 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105358 2 0.0938 0.87822 0.012 0.988
#> SRR2105439 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105440 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105509 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.1414 0.87860 0.020 0.980
#> SRR2105507 2 0.9881 0.20352 0.436 0.564
#> SRR2105508 1 0.6048 0.80488 0.852 0.148
#> SRR2105505 2 0.2043 0.87609 0.032 0.968
#> SRR2105506 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105503 2 0.9922 0.13483 0.448 0.552
#> SRR2105504 1 0.9896 0.34373 0.560 0.440
#> SRR2105501 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105502 1 0.9608 0.48391 0.616 0.384
#> SRR2105499 2 0.6973 0.75355 0.188 0.812
#> SRR2105500 2 0.1843 0.87639 0.028 0.972
#> SRR2105497 1 0.0938 0.83524 0.988 0.012
#> SRR2105498 2 0.9909 0.15864 0.444 0.556
#> SRR2105495 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.1414 0.87871 0.020 0.980
#> SRR2105494 2 0.0376 0.87875 0.004 0.996
#> SRR2105491 1 0.0672 0.83206 0.992 0.008
#> SRR2105492 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105489 2 0.9954 0.04475 0.460 0.540
#> SRR2105490 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105487 2 0.9933 0.15180 0.452 0.548
#> SRR2105488 2 0.1414 0.87908 0.020 0.980
#> SRR2105485 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105486 2 0.0672 0.87960 0.008 0.992
#> SRR2105483 2 0.9944 0.12273 0.456 0.544
#> SRR2105484 1 0.9866 0.32544 0.568 0.432
#> SRR2105481 1 0.1184 0.83603 0.984 0.016
#> SRR2105482 2 0.9170 0.52161 0.332 0.668
#> SRR2105479 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105480 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105477 1 0.4431 0.83512 0.908 0.092
#> SRR2105478 1 0.4298 0.83299 0.912 0.088
#> SRR2105475 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.3431 0.86154 0.064 0.936
#> SRR2105473 2 0.0672 0.87827 0.008 0.992
#> SRR2105474 2 0.2603 0.87220 0.044 0.956
#> SRR2105471 1 0.9460 0.52329 0.636 0.364
#> SRR2105472 2 0.9522 0.40490 0.372 0.628
#> SRR2105469 2 0.1633 0.87854 0.024 0.976
#> SRR2105470 2 0.2043 0.87775 0.032 0.968
#> SRR2105467 2 0.6801 0.78214 0.180 0.820
#> SRR2105468 2 0.2043 0.87775 0.032 0.968
#> SRR2105465 2 0.3114 0.86832 0.056 0.944
#> SRR2105466 2 0.9393 0.47686 0.356 0.644
#> SRR2105463 1 0.9896 0.31532 0.560 0.440
#> SRR2105464 1 0.5294 0.81738 0.880 0.120
#> SRR2105461 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105462 2 0.0376 0.87906 0.004 0.996
#> SRR2105459 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105460 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105457 2 0.2778 0.87097 0.048 0.952
#> SRR2105458 2 0.0938 0.87870 0.012 0.988
#> SRR2105455 2 0.9358 0.46777 0.352 0.648
#> SRR2105456 2 0.5408 0.81789 0.124 0.876
#> SRR2105453 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105454 2 0.0938 0.87822 0.012 0.988
#> SRR2105451 2 0.1414 0.87895 0.020 0.980
#> SRR2105452 1 0.9896 0.34373 0.560 0.440
#> SRR2105449 2 0.9661 0.36504 0.392 0.608
#> SRR2105450 2 0.5629 0.81369 0.132 0.868
#> SRR2105447 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.5059 0.83088 0.112 0.888
#> SRR2105445 2 0.2948 0.86922 0.052 0.948
#> SRR2105446 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105443 2 0.0672 0.87896 0.008 0.992
#> SRR2105444 2 0.0376 0.87895 0.004 0.996
#> SRR2105441 2 0.0938 0.87879 0.012 0.988
#> SRR2105442 2 0.3274 0.86464 0.060 0.940
#> SRR2105437 1 0.5178 0.82162 0.884 0.116
#> SRR2105438 1 0.0672 0.83323 0.992 0.008
#> SRR2105435 2 0.5408 0.82156 0.124 0.876
#> SRR2105436 2 0.4431 0.84596 0.092 0.908
#> SRR2105433 1 0.9896 0.29392 0.560 0.440
#> SRR2105434 2 0.6801 0.76964 0.180 0.820
#> SRR2105431 1 0.7950 0.73373 0.760 0.240
#> SRR2105432 1 0.4690 0.82790 0.900 0.100
#> SRR2105429 2 0.9635 0.33091 0.388 0.612
#> SRR2105430 2 0.5946 0.79793 0.144 0.856
#> SRR2105427 2 0.0672 0.87931 0.008 0.992
#> SRR2105428 2 0.2423 0.87345 0.040 0.960
#> SRR2105425 2 0.0938 0.87983 0.012 0.988
#> SRR2105426 2 0.8081 0.66443 0.248 0.752
#> SRR2105421 2 0.1414 0.87885 0.020 0.980
#> SRR2105422 2 0.9522 0.42358 0.372 0.628
#> SRR2105423 2 0.9970 0.06151 0.468 0.532
#> SRR2105424 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105419 2 0.7602 0.72602 0.220 0.780
#> SRR2105420 2 0.1843 0.87783 0.028 0.972
#> SRR2105415 2 0.9608 0.37257 0.384 0.616
#> SRR2105416 2 0.7219 0.74650 0.200 0.800
#> SRR2105417 2 0.7376 0.72897 0.208 0.792
#> SRR2105418 2 0.3431 0.86197 0.064 0.936
#> SRR2105413 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.9993 -0.01434 0.484 0.516
#> SRR2105410 1 0.9998 0.12630 0.508 0.492
#> SRR2105411 2 0.0938 0.87879 0.012 0.988
#> SRR2105412 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105407 2 0.5408 0.82801 0.124 0.876
#> SRR2105408 2 0.0672 0.87812 0.008 0.992
#> SRR2105403 2 0.0938 0.87822 0.012 0.988
#> SRR2105404 2 0.1414 0.87848 0.020 0.980
#> SRR2105405 2 0.0938 0.87884 0.012 0.988
#> SRR2105406 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105401 2 0.0672 0.87870 0.008 0.992
#> SRR2105402 1 0.9896 0.34373 0.560 0.440
#> SRR2105399 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105400 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105397 1 0.9635 0.45915 0.612 0.388
#> SRR2105398 2 0.7219 0.71962 0.200 0.800
#> SRR2105395 1 0.4161 0.83449 0.916 0.084
#> SRR2105396 2 0.0672 0.87922 0.008 0.992
#> SRR2105393 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105394 2 0.2948 0.86943 0.052 0.948
#> SRR2105389 2 0.7528 0.73329 0.216 0.784
#> SRR2105390 1 0.6801 0.78245 0.820 0.180
#> SRR2105391 2 0.6247 0.80431 0.156 0.844
#> SRR2105392 2 0.9954 0.10796 0.460 0.540
#> SRR2105385 1 0.5294 0.82011 0.880 0.120
#> SRR2105386 2 0.9491 0.42144 0.368 0.632
#> SRR2105387 2 0.1633 0.87918 0.024 0.976
#> SRR2105388 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105381 2 0.6973 0.74597 0.188 0.812
#> SRR2105382 2 0.9896 0.17755 0.440 0.560
#> SRR2105383 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105379 1 0.8016 0.71283 0.756 0.244
#> SRR2105380 1 0.1843 0.83809 0.972 0.028
#> SRR2105377 2 0.3733 0.86388 0.072 0.928
#> SRR2105378 2 0.6623 0.77670 0.172 0.828
#> SRR2105375 2 0.2236 0.87350 0.036 0.964
#> SRR2105376 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105373 1 0.8813 0.63076 0.700 0.300
#> SRR2105374 1 0.1414 0.83642 0.980 0.020
#> SRR2105371 2 0.5178 0.83114 0.116 0.884
#> SRR2105372 2 0.4939 0.83180 0.108 0.892
#> SRR2105369 2 0.3114 0.87049 0.056 0.944
#> SRR2105370 2 0.0672 0.87914 0.008 0.992
#> SRR2105367 2 0.3879 0.85983 0.076 0.924
#> SRR2105368 2 0.4298 0.85347 0.088 0.912
#> SRR2105365 1 0.1843 0.83839 0.972 0.028
#> SRR2105366 1 0.3274 0.83797 0.940 0.060
#> SRR2105363 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105364 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0938 0.87881 0.012 0.988
#> SRR2105362 2 0.1633 0.87928 0.024 0.976
#> SRR2105359 2 0.1843 0.87463 0.028 0.972
#> SRR2105360 2 0.9044 0.54441 0.320 0.680
#> SRR2105355 2 0.4690 0.84336 0.100 0.900
#> SRR2105356 2 0.3733 0.85485 0.072 0.928
#> SRR2105353 1 0.3274 0.83861 0.940 0.060
#> SRR2105354 1 0.0938 0.83464 0.988 0.012
#> SRR2105351 1 0.4562 0.83236 0.904 0.096
#> SRR2105352 1 0.9896 0.34373 0.560 0.440
#> SRR2105349 2 0.9522 0.40016 0.372 0.628
#> SRR2105350 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.1633 0.87866 0.024 0.976
#> SRR2105346 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105347 2 0.0376 0.87872 0.004 0.996
#> SRR2105348 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105343 2 0.9996 -0.06057 0.488 0.512
#> SRR2105344 2 0.0376 0.87895 0.004 0.996
#> SRR2105341 2 0.5408 0.82830 0.124 0.876
#> SRR2105342 2 0.1184 0.87879 0.016 0.984
#> SRR2105339 2 0.9393 0.45040 0.356 0.644
#> SRR2105340 1 0.5842 0.80817 0.860 0.140
#> SRR2105335 1 0.6801 0.76892 0.820 0.180
#> SRR2105336 2 0.7453 0.71762 0.212 0.788
#> SRR2105337 1 0.3431 0.83920 0.936 0.064
#> SRR2105338 1 1.0000 0.06770 0.500 0.500
#> SRR2105331 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105332 1 0.7602 0.73373 0.780 0.220
#> SRR2105333 2 0.9922 0.13091 0.448 0.552
#> SRR2105334 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105330 2 0.0376 0.87895 0.004 0.996
#> SRR2105327 2 0.6973 0.75373 0.188 0.812
#> SRR2105328 2 0.7815 0.69796 0.232 0.768
#> SRR2105325 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105326 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105323 2 0.1633 0.87820 0.024 0.976
#> SRR2105324 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105319 1 0.1184 0.83619 0.984 0.016
#> SRR2105320 1 0.7219 0.75409 0.800 0.200
#> SRR2105321 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105322 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105317 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105316 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0672 0.87827 0.008 0.992
#> SRR2105314 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105311 1 0.0000 0.83046 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105307 2 0.2236 0.87689 0.036 0.964
#> SRR2105308 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105309 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105310 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105305 2 0.2043 0.87767 0.032 0.968
#> SRR2105306 2 0.1184 0.87950 0.016 0.984
#> SRR2105303 2 0.3879 0.85872 0.076 0.924
#> SRR2105304 2 0.9922 0.09310 0.448 0.552
#> SRR2105301 1 0.9460 0.52888 0.636 0.364
#> SRR2105302 2 0.2236 0.87532 0.036 0.964
#> SRR2105299 1 0.3274 0.83704 0.940 0.060
#> SRR2105300 2 0.4022 0.85361 0.080 0.920
#> SRR2105297 2 0.8608 0.60792 0.284 0.716
#> SRR2105298 2 0.0376 0.87917 0.004 0.996
#> SRR2105295 2 0.9286 0.51006 0.344 0.656
#> SRR2105296 2 0.8081 0.66386 0.248 0.752
#> SRR2105293 1 0.3879 0.83771 0.924 0.076
#> SRR2105294 1 0.2948 0.83837 0.948 0.052
#> SRR2105291 2 0.9286 0.48264 0.344 0.656
#> SRR2105292 2 0.9996 0.00209 0.488 0.512
#> SRR2105289 2 0.0376 0.87864 0.004 0.996
#> SRR2105290 2 0.1414 0.87929 0.020 0.980
#> SRR2105287 2 0.0376 0.87864 0.004 0.996
#> SRR2105288 2 0.3584 0.86520 0.068 0.932
#> SRR2105285 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0938 0.87969 0.012 0.988
#> SRR2105283 2 0.2043 0.87728 0.032 0.968
#> SRR2105284 2 0.1414 0.87842 0.020 0.980
#> SRR2105281 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0938 0.87891 0.012 0.988
#> SRR2105259 2 0.0672 0.87914 0.008 0.992
#> SRR2105260 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105279 2 0.0376 0.87877 0.004 0.996
#> SRR2105280 2 0.0376 0.87872 0.004 0.996
#> SRR2105257 1 0.8909 0.61040 0.692 0.308
#> SRR2105258 1 0.2043 0.83890 0.968 0.032
#> SRR2105253 2 0.5629 0.81736 0.132 0.868
#> SRR2105254 2 0.4298 0.84759 0.088 0.912
#> SRR2105255 2 0.5629 0.81730 0.132 0.868
#> SRR2105256 2 0.0672 0.87879 0.008 0.992
#> SRR2105251 2 0.7883 0.67818 0.236 0.764
#> SRR2105252 2 0.5842 0.81412 0.140 0.860
#> SRR2105249 2 0.0672 0.87894 0.008 0.992
#> SRR2105250 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105247 1 0.9954 0.27640 0.540 0.460
#> SRR2105248 1 0.1843 0.83834 0.972 0.028
#> SRR2105245 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105246 1 0.6247 0.80222 0.844 0.156
#> SRR2105243 2 0.1843 0.87821 0.028 0.972
#> SRR2105244 1 1.0000 0.08748 0.504 0.496
#> SRR2105241 1 0.7815 0.72526 0.768 0.232
#> SRR2105242 1 0.4431 0.83329 0.908 0.092
#> SRR2105239 1 0.6887 0.76845 0.816 0.184
#> SRR2105240 1 0.8713 0.64926 0.708 0.292
#> SRR2105237 2 0.8144 0.67208 0.252 0.748
#> SRR2105238 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105235 2 0.0938 0.87944 0.012 0.988
#> SRR2105236 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.4690 0.83744 0.100 0.900
#> SRR2105234 2 0.3733 0.86056 0.072 0.928
#> SRR2105231 2 0.4161 0.85120 0.084 0.916
#> SRR2105232 2 0.6623 0.77808 0.172 0.828
#> SRR2105227 2 0.9963 0.06252 0.464 0.536
#> SRR2105228 2 0.1633 0.87751 0.024 0.976
#> SRR2105225 2 0.5294 0.82294 0.120 0.880
#> SRR2105226 2 0.7453 0.72060 0.212 0.788
#> SRR2105229 2 0.8443 0.62335 0.272 0.728
#> SRR2105230 2 0.5059 0.83966 0.112 0.888
#> SRR2105219 2 0.2043 0.87646 0.032 0.968
#> SRR2105220 2 0.0376 0.87758 0.004 0.996
#> SRR2105221 2 0.6247 0.79178 0.156 0.844
#> SRR2105222 2 0.1843 0.87754 0.028 0.972
#> SRR2105223 1 0.5294 0.81842 0.880 0.120
#> SRR2105224 1 0.8955 0.61216 0.688 0.312
#> SRR2105217 1 0.0672 0.83201 0.992 0.008
#> SRR2105218 2 0.9970 0.00707 0.468 0.532
#> SRR2105215 2 0.1633 0.87884 0.024 0.976
#> SRR2105216 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.4298 0.83129 0.912 0.088
#> SRR2105214 1 0.8144 0.70937 0.748 0.252
#> SRR2105211 2 0.5408 0.82733 0.124 0.876
#> SRR2105212 2 0.0376 0.87858 0.004 0.996
#> SRR2105209 2 0.9286 0.47751 0.344 0.656
#> SRR2105210 2 0.9922 0.10247 0.448 0.552
#> SRR2105207 1 0.9044 0.61119 0.680 0.320
#> SRR2105208 2 0.9248 0.47811 0.340 0.660
#> SRR2105205 1 0.0672 0.83218 0.992 0.008
#> SRR2105206 1 0.5178 0.82328 0.884 0.116
#> SRR2105201 2 0.0672 0.87827 0.008 0.992
#> SRR2105202 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105203 2 0.7056 0.73486 0.192 0.808
#> SRR2105204 2 0.0938 0.87868 0.012 0.988
#> SRR2105199 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105197 2 0.8081 0.65766 0.248 0.752
#> SRR2105198 2 0.7745 0.69462 0.228 0.772
#> SRR2105195 1 0.1414 0.83700 0.980 0.020
#> SRR2105196 1 0.8861 0.62296 0.696 0.304
#> SRR2105193 2 0.9988 0.02521 0.480 0.520
#> SRR2105194 1 0.1633 0.83733 0.976 0.024
#> SRR2105191 1 0.3431 0.83674 0.936 0.064
#> SRR2105192 2 0.1633 0.87598 0.024 0.976
#> SRR2105189 2 0.1843 0.87711 0.028 0.972
#> SRR2105190 2 0.1843 0.87649 0.028 0.972
#> SRR2105187 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105188 2 0.9996 -0.08087 0.488 0.512
#> SRR2105179 1 0.3274 0.83949 0.940 0.060
#> SRR2105180 1 0.6438 0.79384 0.836 0.164
#> SRR2105183 2 0.3584 0.86333 0.068 0.932
#> SRR2105184 2 0.6148 0.79424 0.152 0.848
#> SRR2105185 2 0.8499 0.63663 0.276 0.724
#> SRR2105186 2 0.9922 0.10996 0.448 0.552
#> SRR2105181 1 0.7056 0.77019 0.808 0.192
#> SRR2105182 2 0.4022 0.85811 0.080 0.920
#> SRR2105177 1 0.6247 0.80452 0.844 0.156
#> SRR2105178 1 0.9358 0.55375 0.648 0.352
#> SRR2105171 2 0.1843 0.87730 0.028 0.972
#> SRR2105172 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105176 1 0.5178 0.82170 0.884 0.116
#> SRR2105173 1 0.9710 0.40444 0.600 0.400
#> SRR2105174 2 0.9248 0.49429 0.340 0.660
#> SRR2105169 1 0.9996 0.10080 0.512 0.488
#> SRR2105170 2 0.4690 0.83900 0.100 0.900
#> SRR2105167 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0672 0.87883 0.008 0.992
#> SRR2105165 1 0.2778 0.83902 0.952 0.048
#> SRR2105166 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105163 1 0.0000 0.83046 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.83046 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0672 0.83323 0.992 0.008
#> SRR2105162 1 0.1414 0.83697 0.980 0.020
#> SRR2105155 2 0.3431 0.86264 0.064 0.936
#> SRR2105156 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105157 1 0.1184 0.83468 0.984 0.016
#> SRR2105158 1 0.2236 0.83755 0.964 0.036
#> SRR2105159 1 0.1184 0.83617 0.984 0.016
#> SRR2105160 1 0.7139 0.76628 0.804 0.196
#> SRR2105153 1 0.9044 0.62221 0.680 0.320
#> SRR2105154 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105151 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105149 2 0.5519 0.81786 0.128 0.872
#> SRR2105150 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105147 1 0.3733 0.83196 0.928 0.072
#> SRR2105148 1 0.6623 0.78576 0.828 0.172
#> SRR2105143 2 0.8267 0.65277 0.260 0.740
#> SRR2105144 2 0.0000 0.87820 0.000 1.000
#> SRR2105145 1 0.0672 0.83330 0.992 0.008
#> SRR2105146 1 0.0376 0.83159 0.996 0.004
#> SRR2105141 1 0.0672 0.83329 0.992 0.008
#> SRR2105142 1 0.6438 0.79091 0.836 0.164
#> SRR2105139 2 0.3274 0.86525 0.060 0.940
#> SRR2105140 2 0.0672 0.87876 0.008 0.992
#> SRR2105137 2 0.0672 0.87827 0.008 0.992
#> SRR2105138 2 0.6887 0.76274 0.184 0.816
#> SRR2105135 2 0.1843 0.87776 0.028 0.972
#> SRR2105136 2 0.1184 0.87938 0.016 0.984
#> SRR2105133 2 0.2778 0.87297 0.048 0.952
#> SRR2105134 2 0.1184 0.87879 0.016 0.984
#> SRR2105131 2 0.4690 0.84722 0.100 0.900
#> SRR2105132 2 0.4161 0.85407 0.084 0.916
#> SRR2105129 2 0.9881 0.24330 0.436 0.564
#> SRR2105130 2 0.8267 0.66172 0.260 0.740
#> SRR2105127 2 0.3584 0.86548 0.068 0.932
#> SRR2105128 2 0.0376 0.87898 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.3267 0.66581 0.884 0.116 0.000
#> SRR2105278 1 0.4121 0.66199 0.832 0.168 0.000
#> SRR2105275 3 0.2116 0.73206 0.040 0.012 0.948
#> SRR2105276 3 0.4256 0.73525 0.096 0.036 0.868
#> SRR2105273 1 0.6341 0.48358 0.716 0.032 0.252
#> SRR2105274 1 0.7712 0.64393 0.676 0.196 0.128
#> SRR2105271 2 0.6879 0.06441 0.428 0.556 0.016
#> SRR2105272 3 0.8402 0.41055 0.376 0.092 0.532
#> SRR2105269 2 0.3425 0.67203 0.112 0.884 0.004
#> SRR2105270 2 0.5465 0.59805 0.288 0.712 0.000
#> SRR2105267 2 0.3551 0.66752 0.132 0.868 0.000
#> SRR2105268 2 0.5016 0.63282 0.240 0.760 0.000
#> SRR2105265 2 0.5690 0.54808 0.288 0.708 0.004
#> SRR2105266 2 0.4887 0.62818 0.228 0.772 0.000
#> SRR2105263 3 0.4677 0.71844 0.028 0.132 0.840
#> SRR2105264 3 0.7164 0.66428 0.140 0.140 0.720
#> SRR2105261 3 0.8595 0.29550 0.100 0.404 0.496
#> SRR2105262 2 0.7533 0.32434 0.348 0.600 0.052
#> SRR2105357 2 0.5968 0.27771 0.364 0.636 0.000
#> SRR2105358 1 0.4291 0.66247 0.820 0.180 0.000
#> SRR2105439 2 0.4842 0.56732 0.224 0.776 0.000
#> SRR2105440 2 0.5216 0.62774 0.260 0.740 0.000
#> SRR2105509 2 0.2878 0.67470 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105510 2 0.6540 0.27060 0.408 0.584 0.008
#> SRR2105507 1 0.9751 0.23585 0.440 0.308 0.252
#> SRR2105508 1 0.5158 0.47294 0.764 0.004 0.232
#> SRR2105505 1 0.4452 0.66269 0.808 0.192 0.000
#> SRR2105506 1 0.4605 0.66296 0.796 0.204 0.000
#> SRR2105503 2 0.8231 0.54282 0.136 0.628 0.236
#> SRR2105504 2 0.9953 -0.02338 0.320 0.380 0.300
#> SRR2105501 2 0.4178 0.66455 0.172 0.828 0.000
#> SRR2105502 3 0.9942 0.01355 0.288 0.332 0.380
#> SRR2105499 1 0.7816 0.62680 0.668 0.200 0.132
#> SRR2105500 1 0.6416 0.40341 0.616 0.376 0.008
#> SRR2105497 3 0.3272 0.73564 0.080 0.016 0.904
#> SRR2105498 2 0.7061 0.47437 0.036 0.632 0.332
#> SRR2105495 2 0.5098 0.61164 0.248 0.752 0.000
#> SRR2105496 2 0.1860 0.66559 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105493 2 0.6410 0.20618 0.420 0.576 0.004
#> SRR2105494 2 0.5760 0.40478 0.328 0.672 0.000
#> SRR2105491 3 0.2383 0.72949 0.044 0.016 0.940
#> SRR2105492 3 0.3181 0.73874 0.024 0.064 0.912
#> SRR2105489 2 0.9621 0.04388 0.208 0.432 0.360
#> SRR2105490 2 0.2878 0.67173 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105487 1 0.6662 0.64142 0.752 0.120 0.128
#> SRR2105488 1 0.4682 0.65331 0.804 0.192 0.004
#> SRR2105485 1 0.6267 0.38911 0.548 0.452 0.000
#> SRR2105486 1 0.6448 0.58480 0.656 0.328 0.016
#> SRR2105483 2 0.6917 0.37616 0.024 0.608 0.368
#> SRR2105484 3 0.7757 0.04304 0.048 0.464 0.488
#> SRR2105481 3 0.6773 0.51333 0.340 0.024 0.636
#> SRR2105482 1 0.5961 0.65034 0.788 0.076 0.136
#> SRR2105479 3 0.1753 0.73034 0.048 0.000 0.952
#> SRR2105480 3 0.1031 0.72477 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105477 3 0.7605 0.61537 0.088 0.252 0.660
#> SRR2105478 3 0.6438 0.69989 0.100 0.136 0.764
#> SRR2105475 2 0.2356 0.67120 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105476 2 0.4281 0.67712 0.072 0.872 0.056
#> SRR2105473 2 0.5706 0.54131 0.320 0.680 0.000
#> SRR2105474 2 0.3293 0.67462 0.088 0.900 0.012
#> SRR2105471 3 0.9111 0.24972 0.144 0.384 0.472
#> SRR2105472 2 0.7543 0.52896 0.104 0.680 0.216
#> SRR2105469 1 0.3784 0.66804 0.864 0.132 0.004
#> SRR2105470 1 0.6416 0.62247 0.708 0.260 0.032
#> SRR2105467 1 0.3456 0.66340 0.904 0.060 0.036
#> SRR2105468 1 0.4178 0.66453 0.828 0.172 0.000
#> SRR2105465 2 0.6688 0.54013 0.308 0.664 0.028
#> SRR2105466 1 0.7287 0.56097 0.696 0.092 0.212
#> SRR2105463 3 0.9487 0.34437 0.260 0.244 0.496
#> SRR2105464 3 0.5932 0.69618 0.164 0.056 0.780
#> SRR2105461 2 0.4654 0.59691 0.208 0.792 0.000
#> SRR2105462 2 0.4605 0.64753 0.204 0.796 0.000
#> SRR2105459 2 0.4504 0.64065 0.196 0.804 0.000
#> SRR2105460 2 0.6302 0.13286 0.480 0.520 0.000
#> SRR2105457 1 0.6603 0.51803 0.648 0.332 0.020
#> SRR2105458 1 0.5529 0.60301 0.704 0.296 0.000
#> SRR2105455 2 0.9621 0.17746 0.360 0.432 0.208
#> SRR2105456 2 0.7213 0.57986 0.272 0.668 0.060
#> SRR2105453 2 0.4555 0.65348 0.200 0.800 0.000
#> SRR2105454 1 0.4178 0.66737 0.828 0.172 0.000
#> SRR2105451 2 0.4228 0.67079 0.148 0.844 0.008
#> SRR2105452 2 0.9953 -0.02338 0.320 0.380 0.300
#> SRR2105449 2 0.9931 0.09123 0.288 0.388 0.324
#> SRR2105450 1 0.8725 0.23335 0.476 0.416 0.108
#> SRR2105447 2 0.2537 0.67019 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105448 2 0.6510 0.65960 0.156 0.756 0.088
#> SRR2105445 1 0.7575 0.06555 0.504 0.456 0.040
#> SRR2105446 1 0.6026 0.52029 0.624 0.376 0.000
#> SRR2105443 2 0.6169 0.33191 0.360 0.636 0.004
#> SRR2105444 2 0.5835 0.39053 0.340 0.660 0.000
#> SRR2105441 1 0.6309 0.00593 0.504 0.496 0.000
#> SRR2105442 2 0.5159 0.67434 0.140 0.820 0.040
#> SRR2105437 3 0.6380 0.70255 0.164 0.076 0.760
#> SRR2105438 3 0.5551 0.66709 0.212 0.020 0.768
#> SRR2105435 2 0.7495 0.58817 0.248 0.668 0.084
#> SRR2105436 1 0.6730 0.60240 0.680 0.284 0.036
#> SRR2105433 3 0.8411 0.22823 0.088 0.404 0.508
#> SRR2105434 2 0.8714 0.52021 0.264 0.580 0.156
#> SRR2105431 3 0.9487 0.42512 0.260 0.244 0.496
#> SRR2105432 1 0.7397 -0.23820 0.484 0.032 0.484
#> SRR2105429 2 0.6758 0.54577 0.072 0.728 0.200
#> SRR2105430 2 0.5695 0.62234 0.076 0.804 0.120
#> SRR2105427 2 0.5363 0.48646 0.276 0.724 0.000
#> SRR2105428 2 0.4575 0.66565 0.160 0.828 0.012
#> SRR2105425 2 0.5020 0.66772 0.192 0.796 0.012
#> SRR2105426 2 0.8944 0.46059 0.228 0.568 0.204
#> SRR2105421 2 0.6678 0.18018 0.480 0.512 0.008
#> SRR2105422 1 0.4745 0.66105 0.852 0.080 0.068
#> SRR2105423 2 0.8817 0.41499 0.160 0.568 0.272
#> SRR2105424 2 0.5327 0.63312 0.272 0.728 0.000
#> SRR2105419 1 0.5093 0.66545 0.836 0.088 0.076
#> SRR2105420 1 0.6229 0.48017 0.652 0.340 0.008
#> SRR2105415 2 0.8939 0.31981 0.140 0.520 0.340
#> SRR2105416 1 0.6597 0.65671 0.756 0.120 0.124
#> SRR2105417 1 0.9234 0.06455 0.476 0.364 0.160
#> SRR2105418 2 0.7778 0.57667 0.264 0.644 0.092
#> SRR2105413 2 0.4121 0.66609 0.168 0.832 0.000
#> SRR2105414 2 0.3412 0.66584 0.124 0.876 0.000
#> SRR2105409 2 0.6379 0.54711 0.032 0.712 0.256
#> SRR2105410 2 0.8442 0.29314 0.100 0.548 0.352
#> SRR2105411 2 0.6629 0.49274 0.360 0.624 0.016
#> SRR2105412 2 0.3116 0.67952 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105407 1 0.6523 0.65996 0.724 0.228 0.048
#> SRR2105408 1 0.5621 0.57922 0.692 0.308 0.000
#> SRR2105403 1 0.4796 0.65001 0.780 0.220 0.000
#> SRR2105404 1 0.5502 0.65548 0.744 0.248 0.008
#> SRR2105405 1 0.4465 0.66238 0.820 0.176 0.004
#> SRR2105406 1 0.6026 0.46254 0.624 0.376 0.000
#> SRR2105401 1 0.6489 0.13116 0.540 0.456 0.004
#> SRR2105402 2 0.9953 -0.02338 0.320 0.380 0.300
#> SRR2105399 2 0.3619 0.66477 0.136 0.864 0.000
#> SRR2105400 2 0.3482 0.67329 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105397 3 0.9956 0.10920 0.312 0.308 0.380
#> SRR2105398 1 0.7794 0.45110 0.572 0.368 0.060
#> SRR2105395 3 0.6613 0.69492 0.188 0.072 0.740
#> SRR2105396 2 0.2590 0.67269 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105393 2 0.5363 0.64760 0.276 0.724 0.000
#> SRR2105394 2 0.4845 0.66580 0.104 0.844 0.052
#> SRR2105389 1 0.4602 0.67074 0.852 0.108 0.040
#> SRR2105390 3 0.8275 0.23854 0.452 0.076 0.472
#> SRR2105391 1 0.2879 0.66024 0.924 0.052 0.024
#> SRR2105392 1 0.6962 0.52418 0.724 0.092 0.184
#> SRR2105385 3 0.7181 0.24016 0.468 0.024 0.508
#> SRR2105386 1 0.9070 0.39198 0.528 0.164 0.308
#> SRR2105387 2 0.6715 0.51298 0.312 0.660 0.028
#> SRR2105388 2 0.2772 0.66837 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105381 2 0.7478 0.61012 0.192 0.692 0.116
#> SRR2105382 2 0.7828 0.37694 0.068 0.592 0.340
#> SRR2105383 2 0.4235 0.67214 0.176 0.824 0.000
#> SRR2105384 2 0.1964 0.66437 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105379 3 0.8470 0.42743 0.104 0.344 0.552
#> SRR2105380 3 0.2339 0.73578 0.048 0.012 0.940
#> SRR2105377 1 0.6738 0.32533 0.624 0.356 0.020
#> SRR2105378 2 0.9088 0.11907 0.396 0.464 0.140
#> SRR2105375 2 0.4937 0.66518 0.148 0.824 0.028
#> SRR2105376 2 0.6308 0.05449 0.492 0.508 0.000
#> SRR2105373 1 0.4802 0.56154 0.824 0.020 0.156
#> SRR2105374 3 0.5677 0.71960 0.160 0.048 0.792
#> SRR2105371 1 0.6562 0.60822 0.700 0.264 0.036
#> SRR2105372 1 0.4413 0.67418 0.832 0.160 0.008
#> SRR2105369 1 0.4654 0.65867 0.792 0.208 0.000
#> SRR2105370 1 0.6244 0.39476 0.560 0.440 0.000
#> SRR2105367 2 0.7634 0.06590 0.432 0.524 0.044
#> SRR2105368 2 0.7504 0.44578 0.312 0.628 0.060
#> SRR2105365 3 0.5360 0.67095 0.012 0.220 0.768
#> SRR2105366 3 0.3031 0.74096 0.012 0.076 0.912
#> SRR2105363 2 0.6180 0.26256 0.416 0.584 0.000
#> SRR2105364 2 0.2878 0.67398 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105361 2 0.6617 0.42154 0.388 0.600 0.012
#> SRR2105362 1 0.6445 0.52775 0.672 0.308 0.020
#> SRR2105359 1 0.6654 0.33323 0.536 0.456 0.008
#> SRR2105360 1 0.5174 0.65034 0.832 0.092 0.076
#> SRR2105355 1 0.3207 0.66255 0.904 0.084 0.012
#> SRR2105356 1 0.5845 0.62530 0.688 0.308 0.004
#> SRR2105353 3 0.6034 0.70854 0.212 0.036 0.752
#> SRR2105354 3 0.6298 0.44471 0.388 0.004 0.608
#> SRR2105351 3 0.7899 0.65082 0.144 0.192 0.664
#> SRR2105352 2 0.9953 -0.02338 0.320 0.380 0.300
#> SRR2105349 2 0.8733 0.41697 0.160 0.580 0.260
#> SRR2105350 2 0.2537 0.66816 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105345 2 0.7099 0.42100 0.384 0.588 0.028
#> SRR2105346 2 0.4974 0.65563 0.236 0.764 0.000
#> SRR2105347 2 0.3532 0.67418 0.108 0.884 0.008
#> SRR2105348 2 0.3482 0.66539 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105343 2 0.7706 0.50704 0.088 0.648 0.264
#> SRR2105344 2 0.3879 0.66795 0.152 0.848 0.000
#> SRR2105341 1 0.4249 0.66868 0.864 0.108 0.028
#> SRR2105342 1 0.5171 0.66770 0.784 0.204 0.012
#> SRR2105339 1 0.8838 0.51618 0.580 0.200 0.220
#> SRR2105340 1 0.6906 0.26430 0.644 0.032 0.324
#> SRR2105335 3 0.8703 0.52867 0.284 0.144 0.572
#> SRR2105336 1 0.8280 0.48621 0.564 0.344 0.092
#> SRR2105337 3 0.6388 0.70070 0.184 0.064 0.752
#> SRR2105338 1 0.9707 0.18621 0.424 0.224 0.352
#> SRR2105331 3 0.2918 0.74418 0.032 0.044 0.924
#> SRR2105332 3 0.6880 0.51303 0.036 0.304 0.660
#> SRR2105333 2 0.6098 0.61214 0.056 0.768 0.176
#> SRR2105334 2 0.2959 0.66907 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105329 1 0.5785 0.59717 0.668 0.332 0.000
#> SRR2105330 2 0.6451 0.13034 0.436 0.560 0.004
#> SRR2105327 2 0.7923 0.57422 0.156 0.664 0.180
#> SRR2105328 2 0.6911 0.61555 0.092 0.728 0.180
#> SRR2105325 3 0.2590 0.73201 0.072 0.004 0.924
#> SRR2105326 3 0.2301 0.73168 0.060 0.004 0.936
#> SRR2105323 1 0.3116 0.66322 0.892 0.108 0.000
#> SRR2105324 1 0.5733 0.55285 0.676 0.324 0.000
#> SRR2105319 3 0.5109 0.66968 0.212 0.008 0.780
#> SRR2105320 3 0.7091 0.63301 0.248 0.064 0.688
#> SRR2105321 3 0.2749 0.73272 0.064 0.012 0.924
#> SRR2105322 3 0.1491 0.72998 0.016 0.016 0.968
#> SRR2105317 2 0.2356 0.66894 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105318 2 0.3038 0.67337 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105315 2 0.6148 0.38097 0.356 0.640 0.004
#> SRR2105316 2 0.5291 0.58895 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105313 2 0.6140 0.31512 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105314 2 0.5497 0.60863 0.292 0.708 0.000
#> SRR2105311 3 0.1129 0.72783 0.020 0.004 0.976
#> SRR2105312 3 0.0892 0.72735 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105307 1 0.5559 0.66102 0.780 0.192 0.028
#> SRR2105308 2 0.6168 0.17488 0.412 0.588 0.000
#> SRR2105309 2 0.6307 -0.25237 0.488 0.512 0.000
#> SRR2105310 1 0.6026 0.51605 0.624 0.376 0.000
#> SRR2105305 1 0.4963 0.66558 0.792 0.200 0.008
#> SRR2105306 1 0.6451 0.30202 0.560 0.436 0.004
#> SRR2105303 2 0.6539 0.62440 0.288 0.684 0.028
#> SRR2105304 2 0.9574 0.23927 0.276 0.480 0.244
#> SRR2105301 3 0.9510 0.36836 0.264 0.244 0.492
#> SRR2105302 2 0.3846 0.66597 0.108 0.876 0.016
#> SRR2105299 3 0.7619 0.37641 0.424 0.044 0.532
#> SRR2105300 2 0.7713 0.39300 0.284 0.636 0.080
#> SRR2105297 2 0.7011 0.61843 0.092 0.720 0.188
#> SRR2105298 2 0.2486 0.67395 0.060 0.932 0.008
#> SRR2105295 2 0.9865 0.14551 0.332 0.404 0.264
#> SRR2105296 2 0.6181 0.60344 0.072 0.772 0.156
#> SRR2105293 3 0.6250 0.70950 0.104 0.120 0.776
#> SRR2105294 3 0.3425 0.72722 0.112 0.004 0.884
#> SRR2105291 1 0.4652 0.66117 0.856 0.080 0.064
#> SRR2105292 1 0.6585 0.51096 0.712 0.044 0.244
#> SRR2105289 2 0.6410 -0.05800 0.420 0.576 0.004
#> SRR2105290 1 0.5815 0.61201 0.692 0.304 0.004
#> SRR2105287 2 0.5553 0.61991 0.272 0.724 0.004
#> SRR2105288 1 0.8039 0.17618 0.508 0.428 0.064
#> SRR2105285 2 0.5678 0.51914 0.316 0.684 0.000
#> SRR2105286 2 0.3337 0.68065 0.060 0.908 0.032
#> SRR2105283 2 0.4514 0.67643 0.156 0.832 0.012
#> SRR2105284 1 0.6521 -0.00156 0.504 0.492 0.004
#> SRR2105281 2 0.2878 0.67303 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105282 2 0.4629 0.66289 0.188 0.808 0.004
#> SRR2105259 1 0.4887 0.64182 0.772 0.228 0.000
#> SRR2105260 1 0.6291 0.14281 0.532 0.468 0.000
#> SRR2105279 2 0.4121 0.66817 0.168 0.832 0.000
#> SRR2105280 2 0.2301 0.66809 0.060 0.936 0.004
#> SRR2105257 1 0.7839 0.18959 0.560 0.060 0.380
#> SRR2105258 3 0.6906 0.54606 0.324 0.032 0.644
#> SRR2105253 2 0.6510 0.60396 0.088 0.756 0.156
#> SRR2105254 2 0.6865 0.62675 0.160 0.736 0.104
#> SRR2105255 1 0.4810 0.67259 0.832 0.140 0.028
#> SRR2105256 1 0.6192 0.39588 0.580 0.420 0.000
#> SRR2105251 2 0.5737 0.63136 0.092 0.804 0.104
#> SRR2105252 2 0.7826 0.53257 0.312 0.612 0.076
#> SRR2105249 2 0.2301 0.66669 0.060 0.936 0.004
#> SRR2105250 2 0.5948 0.44397 0.360 0.640 0.000
#> SRR2105247 2 0.7778 0.45133 0.092 0.644 0.264
#> SRR2105248 3 0.4556 0.74313 0.060 0.080 0.860
#> SRR2105245 3 0.4189 0.73442 0.056 0.068 0.876
#> SRR2105246 3 0.7616 0.59275 0.292 0.072 0.636
#> SRR2105243 1 0.6495 0.32010 0.536 0.460 0.004
#> SRR2105244 1 0.9229 0.35371 0.496 0.168 0.336
#> SRR2105241 3 0.8264 0.23119 0.436 0.076 0.488
#> SRR2105242 3 0.5492 0.73317 0.080 0.104 0.816
#> SRR2105239 3 0.7954 0.62750 0.148 0.192 0.660
#> SRR2105240 3 0.7862 0.59865 0.184 0.148 0.668
#> SRR2105237 2 0.8891 0.43554 0.340 0.524 0.136
#> SRR2105238 2 0.6260 0.16168 0.448 0.552 0.000
#> SRR2105235 1 0.6307 0.03300 0.512 0.488 0.000
#> SRR2105236 2 0.3686 0.66073 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105233 2 0.6537 0.59809 0.196 0.740 0.064
#> SRR2105234 2 0.5371 0.67534 0.140 0.812 0.048
#> SRR2105231 2 0.3253 0.66912 0.052 0.912 0.036
#> SRR2105232 2 0.7316 0.62377 0.184 0.704 0.112
#> SRR2105227 1 0.8685 0.46750 0.596 0.192 0.212
#> SRR2105228 1 0.5497 0.63640 0.708 0.292 0.000
#> SRR2105225 1 0.5551 0.64517 0.768 0.212 0.020
#> SRR2105226 1 0.7300 0.55425 0.664 0.272 0.064
#> SRR2105229 1 0.7366 0.58346 0.668 0.260 0.072
#> SRR2105230 1 0.3618 0.66717 0.884 0.104 0.012
#> SRR2105219 2 0.3995 0.68060 0.116 0.868 0.016
#> SRR2105220 2 0.5929 0.54560 0.320 0.676 0.004
#> SRR2105221 2 0.8427 0.12645 0.412 0.500 0.088
#> SRR2105222 2 0.5470 0.67506 0.168 0.796 0.036
#> SRR2105223 1 0.6769 0.26252 0.652 0.028 0.320
#> SRR2105224 3 0.8195 0.18341 0.436 0.072 0.492
#> SRR2105217 3 0.3434 0.74011 0.032 0.064 0.904
#> SRR2105218 2 0.7065 0.52198 0.052 0.672 0.276
#> SRR2105215 2 0.5881 0.63940 0.256 0.728 0.016
#> SRR2105216 2 0.3116 0.66998 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105213 3 0.5497 0.71547 0.148 0.048 0.804
#> SRR2105214 3 0.7898 0.59866 0.116 0.232 0.652
#> SRR2105211 1 0.8264 0.22160 0.488 0.436 0.076
#> SRR2105212 1 0.5859 0.55429 0.656 0.344 0.000
#> SRR2105209 1 0.9058 0.46876 0.544 0.276 0.180
#> SRR2105210 2 0.9996 0.01295 0.320 0.340 0.340
#> SRR2105207 3 0.9654 0.19499 0.228 0.320 0.452
#> SRR2105208 2 0.9006 0.20950 0.288 0.544 0.168
#> SRR2105205 3 0.1905 0.73660 0.016 0.028 0.956
#> SRR2105206 3 0.4575 0.69819 0.004 0.184 0.812
#> SRR2105201 1 0.6302 -0.06342 0.520 0.480 0.000
#> SRR2105202 2 0.6095 0.37129 0.392 0.608 0.000
#> SRR2105203 2 0.6792 0.61391 0.124 0.744 0.132
#> SRR2105204 2 0.2584 0.66431 0.064 0.928 0.008
#> SRR2105199 2 0.5138 0.65253 0.252 0.748 0.000
#> SRR2105200 2 0.4755 0.67159 0.184 0.808 0.008
#> SRR2105197 1 0.7310 0.49185 0.628 0.324 0.048
#> SRR2105198 1 0.8458 0.25257 0.476 0.436 0.088
#> SRR2105195 3 0.3856 0.74042 0.072 0.040 0.888
#> SRR2105196 3 0.7932 0.28956 0.384 0.064 0.552
#> SRR2105193 2 0.8288 0.44693 0.096 0.572 0.332
#> SRR2105194 3 0.3752 0.73385 0.096 0.020 0.884
#> SRR2105191 3 0.7665 0.52632 0.340 0.060 0.600
#> SRR2105192 1 0.5465 0.59762 0.712 0.288 0.000
#> SRR2105189 2 0.4897 0.65404 0.172 0.812 0.016
#> SRR2105190 2 0.3183 0.67606 0.076 0.908 0.016
#> SRR2105187 3 0.3039 0.73608 0.036 0.044 0.920
#> SRR2105188 3 0.9602 0.04622 0.400 0.200 0.400
#> SRR2105179 3 0.6765 0.67197 0.068 0.208 0.724
#> SRR2105180 3 0.6717 0.44770 0.352 0.020 0.628
#> SRR2105183 2 0.6407 0.60446 0.272 0.700 0.028
#> SRR2105184 2 0.5764 0.65572 0.076 0.800 0.124
#> SRR2105185 2 0.9353 0.29050 0.388 0.444 0.168
#> SRR2105186 2 0.8620 0.17747 0.112 0.536 0.352
#> SRR2105181 1 0.6606 0.49630 0.716 0.048 0.236
#> SRR2105182 1 0.5688 0.67590 0.788 0.168 0.044
#> SRR2105177 3 0.9091 0.26489 0.152 0.344 0.504
#> SRR2105178 3 0.7890 0.32890 0.064 0.372 0.564
#> SRR2105171 2 0.6899 0.52166 0.364 0.612 0.024
#> SRR2105172 2 0.1964 0.66741 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105175 3 0.3267 0.74112 0.044 0.044 0.912
#> SRR2105176 3 0.4357 0.73598 0.080 0.052 0.868
#> SRR2105173 3 0.9702 0.18356 0.232 0.328 0.440
#> SRR2105174 2 0.7916 0.52630 0.100 0.636 0.264
#> SRR2105169 2 0.9088 0.12993 0.140 0.464 0.396
#> SRR2105170 2 0.6023 0.67063 0.120 0.788 0.092
#> SRR2105167 2 0.3482 0.67650 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105168 2 0.2959 0.67130 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105165 3 0.6683 0.22053 0.496 0.008 0.496
#> SRR2105166 3 0.1860 0.72965 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105163 3 0.1289 0.72758 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105164 3 0.1289 0.72823 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105161 3 0.3461 0.74016 0.076 0.024 0.900
#> SRR2105162 3 0.3031 0.73535 0.076 0.012 0.912
#> SRR2105155 2 0.6952 0.50269 0.376 0.600 0.024
#> SRR2105156 2 0.2625 0.67461 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105157 3 0.3183 0.74185 0.016 0.076 0.908
#> SRR2105158 3 0.2703 0.73638 0.016 0.056 0.928
#> SRR2105159 3 0.5119 0.71315 0.152 0.032 0.816
#> SRR2105160 1 0.8427 -0.05011 0.500 0.088 0.412
#> SRR2105153 3 0.8595 0.18632 0.100 0.404 0.496
#> SRR2105154 3 0.1877 0.73315 0.032 0.012 0.956
#> SRR2105151 2 0.2945 0.67240 0.088 0.908 0.004
#> SRR2105152 2 0.2959 0.66768 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105149 1 0.6839 0.62387 0.684 0.272 0.044
#> SRR2105150 1 0.6252 0.30330 0.556 0.444 0.000
#> SRR2105147 3 0.5603 0.71560 0.136 0.060 0.804
#> SRR2105148 3 0.9133 0.47293 0.296 0.176 0.528
#> SRR2105143 1 0.8971 0.34284 0.520 0.336 0.144
#> SRR2105144 2 0.4842 0.63566 0.224 0.776 0.000
#> SRR2105145 3 0.2636 0.74153 0.020 0.048 0.932
#> SRR2105146 3 0.1832 0.73047 0.036 0.008 0.956
#> SRR2105141 3 0.1491 0.73255 0.016 0.016 0.968
#> SRR2105142 3 0.6129 0.57142 0.016 0.284 0.700
#> SRR2105139 2 0.4708 0.66216 0.120 0.844 0.036
#> SRR2105140 2 0.3272 0.67427 0.104 0.892 0.004
#> SRR2105137 2 0.6291 0.25904 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105138 1 0.8375 0.56528 0.608 0.260 0.132
#> SRR2105135 2 0.6955 0.16642 0.488 0.496 0.016
#> SRR2105136 2 0.4059 0.67377 0.128 0.860 0.012
#> SRR2105133 1 0.4326 0.66857 0.844 0.144 0.012
#> SRR2105134 1 0.4504 0.66886 0.804 0.196 0.000
#> SRR2105131 1 0.6096 0.63489 0.704 0.280 0.016
#> SRR2105132 1 0.4063 0.67110 0.868 0.112 0.020
#> SRR2105129 1 0.9002 0.30830 0.532 0.156 0.312
#> SRR2105130 1 0.9556 0.24099 0.460 0.332 0.208
#> SRR2105127 1 0.3918 0.66711 0.868 0.120 0.012
#> SRR2105128 2 0.6291 -0.18918 0.468 0.532 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.3505 4.77e-01 0.000 0.048 0.864 0.088
#> SRR2105278 3 0.5664 4.82e-01 0.000 0.156 0.720 0.124
#> SRR2105275 1 0.3108 5.68e-01 0.872 0.000 0.016 0.112
#> SRR2105276 1 0.5427 5.05e-01 0.704 0.004 0.044 0.248
#> SRR2105273 3 0.8155 2.42e-01 0.204 0.044 0.532 0.220
#> SRR2105274 3 0.8750 2.96e-01 0.116 0.124 0.488 0.272
#> SRR2105271 2 0.8205 1.06e-02 0.020 0.416 0.356 0.208
#> SRR2105272 1 0.8673 1.37e-01 0.436 0.048 0.292 0.224
#> SRR2105269 2 0.6068 4.49e-01 0.012 0.624 0.040 0.324
#> SRR2105270 2 0.6400 5.15e-01 0.000 0.632 0.252 0.116
#> SRR2105267 2 0.5934 5.20e-01 0.004 0.688 0.084 0.224
#> SRR2105268 2 0.6198 5.14e-01 0.000 0.660 0.224 0.116
#> SRR2105265 2 0.7658 3.14e-01 0.004 0.492 0.220 0.284
#> SRR2105266 2 0.6104 5.07e-01 0.000 0.664 0.232 0.104
#> SRR2105263 1 0.6067 4.80e-01 0.704 0.124 0.008 0.164
#> SRR2105264 1 0.6949 4.83e-01 0.684 0.108 0.076 0.132
#> SRR2105261 4 0.8117 1.62e-01 0.300 0.232 0.016 0.452
#> SRR2105262 2 0.8652 2.24e-01 0.060 0.464 0.284 0.192
#> SRR2105357 2 0.7169 1.98e-01 0.000 0.528 0.312 0.160
#> SRR2105358 3 0.4297 4.85e-01 0.000 0.096 0.820 0.084
#> SRR2105439 2 0.6854 4.27e-01 0.000 0.596 0.232 0.172
#> SRR2105440 2 0.6686 4.89e-01 0.000 0.596 0.276 0.128
#> SRR2105509 2 0.5421 5.47e-01 0.000 0.724 0.076 0.200
#> SRR2105510 2 0.7850 9.05e-02 0.004 0.432 0.336 0.228
#> SRR2105507 4 0.9902 1.82e-01 0.252 0.196 0.240 0.312
#> SRR2105508 3 0.7767 1.50e-01 0.204 0.012 0.508 0.276
#> SRR2105505 3 0.4562 4.68e-01 0.000 0.056 0.792 0.152
#> SRR2105506 3 0.6472 4.31e-01 0.004 0.124 0.648 0.224
#> SRR2105503 2 0.9052 1.15e-01 0.220 0.448 0.092 0.240
#> SRR2105504 3 0.9936 -1.52e-01 0.260 0.196 0.284 0.260
#> SRR2105501 2 0.5714 5.39e-01 0.000 0.716 0.156 0.128
#> SRR2105502 1 0.9741 -1.57e-01 0.360 0.176 0.248 0.216
#> SRR2105499 3 0.9495 2.48e-01 0.148 0.212 0.408 0.232
#> SRR2105500 3 0.7331 3.46e-01 0.008 0.280 0.552 0.160
#> SRR2105497 1 0.4463 5.55e-01 0.808 0.008 0.040 0.144
#> SRR2105498 2 0.7710 1.45e-01 0.332 0.524 0.040 0.104
#> SRR2105495 2 0.7330 4.32e-01 0.004 0.552 0.244 0.200
#> SRR2105496 2 0.6121 5.22e-01 0.004 0.680 0.104 0.212
#> SRR2105493 2 0.7590 2.19e-01 0.004 0.472 0.344 0.180
#> SRR2105494 2 0.6704 3.82e-01 0.000 0.600 0.264 0.136
#> SRR2105491 1 0.3850 5.41e-01 0.804 0.004 0.004 0.188
#> SRR2105492 1 0.3224 5.60e-01 0.864 0.016 0.000 0.120
#> SRR2105489 4 0.9479 2.61e-01 0.244 0.308 0.108 0.340
#> SRR2105490 2 0.3900 5.43e-01 0.000 0.844 0.072 0.084
#> SRR2105487 3 0.7677 3.77e-01 0.076 0.088 0.592 0.244
#> SRR2105488 3 0.5201 4.81e-01 0.008 0.128 0.772 0.092
#> SRR2105485 3 0.6894 3.29e-01 0.000 0.376 0.512 0.112
#> SRR2105486 3 0.7223 4.22e-01 0.020 0.252 0.596 0.132
#> SRR2105483 1 0.8326 -1.56e-01 0.392 0.384 0.028 0.196
#> SRR2105484 1 0.7546 7.42e-02 0.504 0.348 0.016 0.132
#> SRR2105481 1 0.7762 3.90e-01 0.564 0.032 0.228 0.176
#> SRR2105482 3 0.7598 3.06e-01 0.148 0.044 0.600 0.208
#> SRR2105479 1 0.2667 5.67e-01 0.912 0.008 0.020 0.060
#> SRR2105480 1 0.0657 5.60e-01 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105477 1 0.7913 2.14e-01 0.496 0.208 0.016 0.280
#> SRR2105478 1 0.7336 4.40e-01 0.608 0.068 0.068 0.256
#> SRR2105475 2 0.4841 5.44e-01 0.000 0.780 0.080 0.140
#> SRR2105476 2 0.7085 4.35e-01 0.068 0.604 0.044 0.284
#> SRR2105473 2 0.7086 4.18e-01 0.000 0.548 0.292 0.160
#> SRR2105474 2 0.5743 5.18e-01 0.016 0.732 0.076 0.176
#> SRR2105471 4 0.8953 2.54e-01 0.220 0.296 0.068 0.416
#> SRR2105472 2 0.8081 1.06e-01 0.128 0.440 0.040 0.392
#> SRR2105469 3 0.5499 4.49e-01 0.000 0.072 0.712 0.216
#> SRR2105470 3 0.7625 2.99e-01 0.004 0.220 0.500 0.276
#> SRR2105467 3 0.3639 4.63e-01 0.012 0.028 0.864 0.096
#> SRR2105468 3 0.4986 4.77e-01 0.004 0.084 0.780 0.132
#> SRR2105465 2 0.8266 1.32e-01 0.028 0.424 0.188 0.360
#> SRR2105466 3 0.9030 1.36e-01 0.176 0.088 0.404 0.332
#> SRR2105463 1 0.9424 1.57e-02 0.412 0.132 0.236 0.220
#> SRR2105464 1 0.6607 4.95e-01 0.684 0.036 0.096 0.184
#> SRR2105461 2 0.7289 4.56e-01 0.004 0.560 0.208 0.228
#> SRR2105462 2 0.5902 5.36e-01 0.004 0.712 0.144 0.140
#> SRR2105459 2 0.5674 5.25e-01 0.000 0.720 0.148 0.132
#> SRR2105460 2 0.7343 1.14e-01 0.000 0.428 0.416 0.156
#> SRR2105457 3 0.7262 3.45e-01 0.008 0.248 0.572 0.172
#> SRR2105458 3 0.7006 4.09e-01 0.000 0.216 0.580 0.204
#> SRR2105455 4 0.9563 3.10e-01 0.144 0.244 0.224 0.388
#> SRR2105456 2 0.9211 6.65e-02 0.092 0.388 0.208 0.312
#> SRR2105453 2 0.6758 4.65e-01 0.000 0.604 0.156 0.240
#> SRR2105454 3 0.4662 4.80e-01 0.000 0.092 0.796 0.112
#> SRR2105451 2 0.7363 3.61e-01 0.012 0.504 0.120 0.364
#> SRR2105452 3 0.9936 -1.52e-01 0.260 0.196 0.284 0.260
#> SRR2105449 4 0.9929 3.39e-01 0.264 0.264 0.192 0.280
#> SRR2105450 3 0.8979 2.52e-01 0.084 0.304 0.428 0.184
#> SRR2105447 2 0.5256 5.38e-01 0.004 0.752 0.072 0.172
#> SRR2105448 2 0.7168 4.92e-01 0.048 0.644 0.112 0.196
#> SRR2105445 3 0.8581 1.10e-01 0.048 0.336 0.428 0.188
#> SRR2105446 3 0.6685 4.01e-01 0.000 0.284 0.592 0.124
#> SRR2105443 2 0.7773 1.60e-01 0.000 0.432 0.280 0.288
#> SRR2105444 2 0.6634 3.84e-01 0.000 0.592 0.292 0.116
#> SRR2105441 3 0.7810 9.31e-02 0.000 0.364 0.384 0.252
#> SRR2105442 2 0.6212 5.25e-01 0.020 0.708 0.112 0.160
#> SRR2105437 1 0.7641 3.85e-01 0.556 0.024 0.160 0.260
#> SRR2105438 1 0.6149 5.16e-01 0.688 0.004 0.132 0.176
#> SRR2105435 2 0.8545 3.24e-01 0.056 0.488 0.212 0.244
#> SRR2105436 3 0.7731 4.18e-01 0.048 0.216 0.588 0.148
#> SRR2105433 1 0.8852 -5.12e-02 0.432 0.264 0.060 0.244
#> SRR2105434 2 0.9396 -5.19e-02 0.104 0.368 0.232 0.296
#> SRR2105431 4 0.9496 2.31e-01 0.292 0.132 0.200 0.376
#> SRR2105432 1 0.8011 1.55e-01 0.448 0.012 0.320 0.220
#> SRR2105429 2 0.8077 3.06e-02 0.200 0.424 0.016 0.360
#> SRR2105430 2 0.7046 4.54e-01 0.076 0.648 0.060 0.216
#> SRR2105427 2 0.7202 4.31e-01 0.008 0.584 0.180 0.228
#> SRR2105428 2 0.6299 5.08e-01 0.004 0.676 0.160 0.160
#> SRR2105425 2 0.6624 4.67e-01 0.004 0.636 0.140 0.220
#> SRR2105426 2 0.8652 2.60e-01 0.188 0.532 0.128 0.152
#> SRR2105421 4 0.7912 -2.21e-02 0.000 0.328 0.312 0.360
#> SRR2105422 3 0.6567 3.55e-01 0.044 0.040 0.636 0.280
#> SRR2105423 4 0.8968 2.18e-01 0.208 0.336 0.068 0.388
#> SRR2105424 2 0.6860 5.07e-01 0.000 0.592 0.244 0.164
#> SRR2105419 3 0.7124 3.57e-01 0.036 0.084 0.604 0.276
#> SRR2105420 3 0.7385 3.08e-01 0.008 0.184 0.556 0.252
#> SRR2105415 2 0.9809 -1.29e-01 0.260 0.332 0.172 0.236
#> SRR2105416 3 0.7602 3.86e-01 0.128 0.080 0.628 0.164
#> SRR2105417 4 0.8883 1.53e-01 0.076 0.172 0.344 0.408
#> SRR2105418 2 0.9171 5.32e-02 0.096 0.424 0.216 0.264
#> SRR2105413 2 0.5531 5.43e-01 0.000 0.732 0.128 0.140
#> SRR2105414 2 0.5228 5.36e-01 0.000 0.756 0.124 0.120
#> SRR2105409 2 0.7586 2.56e-01 0.184 0.536 0.012 0.268
#> SRR2105410 2 0.9171 9.70e-03 0.300 0.408 0.096 0.196
#> SRR2105411 2 0.8047 1.83e-01 0.012 0.456 0.260 0.272
#> SRR2105412 2 0.5939 5.08e-01 0.000 0.668 0.084 0.248
#> SRR2105407 3 0.7868 3.90e-01 0.036 0.176 0.556 0.232
#> SRR2105408 3 0.6074 4.46e-01 0.000 0.228 0.668 0.104
#> SRR2105403 3 0.5382 4.82e-01 0.000 0.124 0.744 0.132
#> SRR2105404 3 0.5436 4.66e-01 0.000 0.092 0.732 0.176
#> SRR2105405 3 0.6616 3.28e-01 0.000 0.108 0.584 0.308
#> SRR2105406 3 0.7260 3.69e-01 0.000 0.280 0.532 0.188
#> SRR2105401 3 0.7789 1.49e-01 0.000 0.352 0.400 0.248
#> SRR2105402 3 0.9936 -1.52e-01 0.260 0.196 0.284 0.260
#> SRR2105399 2 0.5066 5.46e-01 0.000 0.768 0.120 0.112
#> SRR2105400 2 0.5000 5.50e-01 0.000 0.772 0.128 0.100
#> SRR2105397 4 0.9704 2.44e-01 0.232 0.156 0.256 0.356
#> SRR2105398 3 0.8619 2.55e-01 0.044 0.296 0.436 0.224
#> SRR2105395 1 0.8253 3.06e-01 0.532 0.072 0.132 0.264
#> SRR2105396 2 0.4462 5.45e-01 0.000 0.792 0.044 0.164
#> SRR2105393 2 0.7201 4.14e-01 0.000 0.544 0.268 0.188
#> SRR2105394 2 0.6842 4.34e-01 0.028 0.612 0.072 0.288
#> SRR2105389 3 0.6246 4.31e-01 0.056 0.048 0.708 0.188
#> SRR2105390 1 0.8542 6.06e-02 0.348 0.024 0.308 0.320
#> SRR2105391 3 0.4107 4.37e-01 0.016 0.004 0.804 0.176
#> SRR2105392 3 0.6730 3.17e-01 0.132 0.008 0.632 0.228
#> SRR2105385 1 0.7659 2.49e-01 0.508 0.016 0.324 0.152
#> SRR2105386 3 0.9096 7.54e-02 0.288 0.088 0.420 0.204
#> SRR2105387 2 0.8339 8.17e-02 0.028 0.420 0.204 0.348
#> SRR2105388 2 0.5491 5.28e-01 0.008 0.736 0.068 0.188
#> SRR2105381 2 0.8430 3.19e-01 0.088 0.520 0.128 0.264
#> SRR2105382 2 0.8975 8.23e-02 0.288 0.444 0.092 0.176
#> SRR2105383 2 0.5950 5.24e-01 0.000 0.696 0.156 0.148
#> SRR2105384 2 0.3850 5.43e-01 0.000 0.840 0.044 0.116
#> SRR2105379 1 0.8675 -6.67e-02 0.392 0.292 0.036 0.280
#> SRR2105380 1 0.4231 5.67e-01 0.824 0.024 0.016 0.136
#> SRR2105377 3 0.8309 3.05e-02 0.024 0.224 0.432 0.320
#> SRR2105378 2 0.9472 2.93e-02 0.124 0.356 0.320 0.200
#> SRR2105375 2 0.7545 4.34e-01 0.024 0.576 0.168 0.232
#> SRR2105376 3 0.7055 9.93e-02 0.000 0.396 0.480 0.124
#> SRR2105373 3 0.6332 3.76e-01 0.088 0.016 0.676 0.220
#> SRR2105374 1 0.5893 5.47e-01 0.712 0.008 0.096 0.184
#> SRR2105371 3 0.7600 2.72e-01 0.016 0.132 0.480 0.372
#> SRR2105372 3 0.6858 3.85e-01 0.004 0.124 0.588 0.284
#> SRR2105369 3 0.6224 4.71e-01 0.000 0.144 0.668 0.188
#> SRR2105370 3 0.7503 3.24e-01 0.000 0.300 0.488 0.212
#> SRR2105367 3 0.8520 6.96e-03 0.024 0.312 0.368 0.296
#> SRR2105368 2 0.9052 -4.62e-02 0.060 0.348 0.272 0.320
#> SRR2105365 1 0.5479 4.94e-01 0.740 0.180 0.008 0.072
#> SRR2105366 1 0.3614 5.74e-01 0.872 0.068 0.012 0.048
#> SRR2105363 2 0.7527 1.03e-01 0.000 0.452 0.356 0.192
#> SRR2105364 2 0.5595 5.46e-01 0.004 0.736 0.112 0.148
#> SRR2105361 2 0.7985 2.03e-01 0.004 0.404 0.272 0.320
#> SRR2105362 3 0.7813 2.77e-01 0.024 0.164 0.524 0.288
#> SRR2105359 3 0.8040 2.30e-01 0.008 0.348 0.404 0.240
#> SRR2105360 3 0.6952 3.39e-01 0.044 0.056 0.604 0.296
#> SRR2105355 3 0.6053 3.35e-01 0.008 0.052 0.640 0.300
#> SRR2105356 3 0.7742 3.79e-01 0.004 0.308 0.468 0.220
#> SRR2105353 1 0.7859 3.38e-01 0.508 0.024 0.160 0.308
#> SRR2105354 1 0.6474 2.70e-01 0.536 0.000 0.388 0.076
#> SRR2105351 1 0.8710 1.59e-01 0.424 0.108 0.104 0.364
#> SRR2105352 3 0.9936 -1.52e-01 0.260 0.196 0.284 0.260
#> SRR2105349 2 0.8951 1.16e-01 0.268 0.468 0.116 0.148
#> SRR2105350 2 0.3903 5.44e-01 0.000 0.844 0.076 0.080
#> SRR2105345 2 0.8351 2.14e-01 0.020 0.412 0.300 0.268
#> SRR2105346 2 0.6855 4.77e-01 0.000 0.600 0.200 0.200
#> SRR2105347 2 0.4666 5.33e-01 0.004 0.792 0.052 0.152
#> SRR2105348 2 0.5051 5.39e-01 0.000 0.768 0.100 0.132
#> SRR2105343 2 0.8308 8.52e-02 0.168 0.460 0.040 0.332
#> SRR2105344 2 0.5167 5.54e-01 0.000 0.760 0.132 0.108
#> SRR2105341 3 0.5080 4.75e-01 0.016 0.076 0.788 0.120
#> SRR2105342 3 0.6331 4.61e-01 0.004 0.148 0.672 0.176
#> SRR2105339 3 0.9467 6.91e-02 0.172 0.144 0.376 0.308
#> SRR2105340 3 0.7641 1.64e-01 0.292 0.016 0.528 0.164
#> SRR2105335 1 0.8773 5.06e-02 0.376 0.048 0.224 0.352
#> SRR2105336 3 0.8704 6.92e-03 0.088 0.124 0.400 0.388
#> SRR2105337 1 0.8273 3.80e-01 0.540 0.096 0.108 0.256
#> SRR2105338 3 0.9440 -1.39e-02 0.320 0.156 0.372 0.152
#> SRR2105331 1 0.5765 5.44e-01 0.748 0.064 0.036 0.152
#> SRR2105332 1 0.6687 3.01e-01 0.620 0.264 0.008 0.108
#> SRR2105333 2 0.7362 4.47e-01 0.148 0.648 0.072 0.132
#> SRR2105334 2 0.5063 5.42e-01 0.000 0.768 0.108 0.124
#> SRR2105329 3 0.7278 3.86e-01 0.000 0.284 0.528 0.188
#> SRR2105330 2 0.7182 8.69e-04 0.000 0.452 0.412 0.136
#> SRR2105327 2 0.8964 2.66e-01 0.172 0.496 0.140 0.192
#> SRR2105328 2 0.9080 2.63e-01 0.160 0.476 0.144 0.220
#> SRR2105325 1 0.3894 5.69e-01 0.844 0.000 0.068 0.088
#> SRR2105326 1 0.3970 5.65e-01 0.836 0.004 0.036 0.124
#> SRR2105323 3 0.4388 4.69e-01 0.000 0.060 0.808 0.132
#> SRR2105324 3 0.6492 4.39e-01 0.000 0.220 0.636 0.144
#> SRR2105319 1 0.6287 4.98e-01 0.676 0.004 0.176 0.144
#> SRR2105320 1 0.7741 4.11e-01 0.600 0.056 0.180 0.164
#> SRR2105321 1 0.4050 5.62e-01 0.820 0.000 0.036 0.144
#> SRR2105322 1 0.2466 5.65e-01 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR2105317 2 0.3533 5.33e-01 0.000 0.864 0.056 0.080
#> SRR2105318 2 0.4907 5.36e-01 0.000 0.764 0.060 0.176
#> SRR2105315 2 0.7309 2.37e-01 0.000 0.504 0.324 0.172
#> SRR2105316 2 0.6946 4.58e-01 0.000 0.580 0.252 0.168
#> SRR2105313 2 0.7069 2.92e-01 0.000 0.532 0.324 0.144
#> SRR2105314 2 0.7251 4.03e-01 0.000 0.536 0.272 0.192
#> SRR2105311 1 0.1635 5.66e-01 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105312 1 0.1256 5.64e-01 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR2105307 3 0.7117 3.59e-01 0.028 0.088 0.588 0.296
#> SRR2105308 2 0.7714 8.08e-02 0.000 0.448 0.292 0.260
#> SRR2105309 2 0.7538 -8.01e-02 0.000 0.428 0.384 0.188
#> SRR2105310 3 0.6834 4.27e-01 0.000 0.240 0.596 0.164
#> SRR2105305 3 0.5964 4.77e-01 0.008 0.164 0.712 0.116
#> SRR2105306 3 0.8057 1.54e-01 0.008 0.252 0.412 0.328
#> SRR2105303 2 0.8040 3.82e-01 0.028 0.516 0.244 0.212
#> SRR2105304 2 0.9870 -1.60e-01 0.240 0.328 0.236 0.196
#> SRR2105301 1 0.9506 -1.04e-01 0.356 0.116 0.236 0.292
#> SRR2105302 2 0.6367 5.02e-01 0.032 0.676 0.060 0.232
#> SRR2105299 1 0.8435 1.54e-01 0.408 0.024 0.300 0.268
#> SRR2105300 2 0.8527 3.14e-01 0.064 0.504 0.232 0.200
#> SRR2105297 2 0.8075 3.84e-01 0.180 0.588 0.104 0.128
#> SRR2105298 2 0.5396 5.44e-01 0.008 0.748 0.072 0.172
#> SRR2105295 4 0.9615 3.45e-01 0.144 0.268 0.220 0.368
#> SRR2105296 2 0.7110 2.78e-01 0.120 0.552 0.008 0.320
#> SRR2105293 1 0.8181 3.58e-01 0.552 0.104 0.096 0.248
#> SRR2105294 1 0.5126 5.36e-01 0.760 0.012 0.044 0.184
#> SRR2105291 3 0.7384 3.20e-01 0.060 0.064 0.576 0.300
#> SRR2105292 3 0.7991 2.14e-01 0.264 0.040 0.536 0.160
#> SRR2105289 2 0.7519 9.56e-02 0.000 0.496 0.256 0.248
#> SRR2105290 3 0.7081 4.47e-01 0.004 0.220 0.588 0.188
#> SRR2105287 2 0.7137 3.89e-01 0.000 0.556 0.188 0.256
#> SRR2105288 3 0.8331 1.45e-01 0.020 0.252 0.412 0.316
#> SRR2105285 2 0.7654 3.51e-01 0.004 0.496 0.272 0.228
#> SRR2105286 2 0.5644 5.49e-01 0.024 0.752 0.076 0.148
#> SRR2105283 2 0.6691 4.72e-01 0.016 0.648 0.112 0.224
#> SRR2105284 3 0.7717 -8.51e-02 0.000 0.388 0.388 0.224
#> SRR2105281 2 0.5511 5.19e-01 0.000 0.720 0.084 0.196
#> SRR2105282 2 0.5676 5.36e-01 0.000 0.720 0.136 0.144
#> SRR2105259 3 0.6231 4.26e-01 0.000 0.148 0.668 0.184
#> SRR2105260 3 0.7277 1.21e-01 0.000 0.360 0.484 0.156
#> SRR2105279 2 0.5757 5.24e-01 0.004 0.724 0.128 0.144
#> SRR2105280 2 0.4552 5.28e-01 0.000 0.784 0.044 0.172
#> SRR2105257 4 0.9064 1.01e-01 0.304 0.068 0.244 0.384
#> SRR2105258 1 0.7030 4.49e-01 0.628 0.020 0.140 0.212
#> SRR2105253 2 0.7399 3.75e-01 0.096 0.592 0.044 0.268
#> SRR2105254 2 0.7767 4.75e-01 0.100 0.620 0.148 0.132
#> SRR2105255 3 0.6275 3.87e-01 0.012 0.052 0.616 0.320
#> SRR2105256 3 0.6919 3.23e-01 0.000 0.352 0.528 0.120
#> SRR2105251 2 0.6546 3.86e-01 0.060 0.616 0.020 0.304
#> SRR2105252 2 0.8995 -7.56e-04 0.064 0.384 0.232 0.320
#> SRR2105249 2 0.5302 5.12e-01 0.004 0.720 0.044 0.232
#> SRR2105250 2 0.7037 4.11e-01 0.000 0.564 0.268 0.168
#> SRR2105247 2 0.7931 1.58e-01 0.196 0.504 0.020 0.280
#> SRR2105248 1 0.4906 5.49e-01 0.768 0.032 0.012 0.188
#> SRR2105245 1 0.5795 4.93e-01 0.668 0.032 0.016 0.284
#> SRR2105246 1 0.8565 1.38e-01 0.392 0.036 0.220 0.352
#> SRR2105243 4 0.7824 -5.32e-02 0.000 0.260 0.348 0.392
#> SRR2105244 1 0.9442 -1.13e-01 0.368 0.160 0.324 0.148
#> SRR2105241 1 0.8991 4.68e-02 0.396 0.064 0.240 0.300
#> SRR2105242 1 0.6160 5.39e-01 0.724 0.072 0.044 0.160
#> SRR2105239 1 0.8943 1.41e-01 0.436 0.120 0.124 0.320
#> SRR2105240 1 0.8338 3.38e-01 0.556 0.092 0.160 0.192
#> SRR2105237 2 0.9321 1.57e-01 0.124 0.392 0.312 0.172
#> SRR2105238 2 0.6963 1.52e-02 0.000 0.464 0.424 0.112
#> SRR2105235 2 0.7891 -8.29e-04 0.000 0.356 0.356 0.288
#> SRR2105236 2 0.5382 5.33e-01 0.000 0.744 0.132 0.124
#> SRR2105233 2 0.7971 2.90e-01 0.068 0.524 0.092 0.316
#> SRR2105234 2 0.5765 5.48e-01 0.036 0.748 0.064 0.152
#> SRR2105231 2 0.6442 4.97e-01 0.040 0.656 0.044 0.260
#> SRR2105232 2 0.7956 3.74e-01 0.040 0.540 0.156 0.264
#> SRR2105227 3 0.8932 5.92e-02 0.160 0.096 0.448 0.296
#> SRR2105228 3 0.7297 3.95e-01 0.000 0.220 0.536 0.244
#> SRR2105225 3 0.6727 3.96e-01 0.012 0.100 0.620 0.268
#> SRR2105226 3 0.7734 2.24e-01 0.016 0.148 0.468 0.368
#> SRR2105229 3 0.7719 2.55e-01 0.060 0.076 0.524 0.340
#> SRR2105230 3 0.4225 4.65e-01 0.008 0.052 0.832 0.108
#> SRR2105219 2 0.5351 5.42e-01 0.016 0.756 0.056 0.172
#> SRR2105220 3 0.7701 -1.16e-01 0.004 0.384 0.424 0.188
#> SRR2105221 2 0.8748 1.89e-01 0.056 0.448 0.248 0.248
#> SRR2105222 2 0.7003 5.23e-01 0.028 0.648 0.156 0.168
#> SRR2105223 3 0.7446 1.73e-01 0.236 0.004 0.536 0.224
#> SRR2105224 1 0.8681 2.28e-02 0.408 0.044 0.324 0.224
#> SRR2105217 1 0.5710 5.07e-01 0.704 0.060 0.008 0.228
#> SRR2105218 2 0.7719 1.87e-01 0.236 0.536 0.016 0.212
#> SRR2105215 2 0.7173 4.25e-01 0.000 0.556 0.216 0.228
#> SRR2105216 2 0.4401 5.45e-01 0.000 0.812 0.076 0.112
#> SRR2105213 1 0.7788 3.56e-01 0.568 0.052 0.120 0.260
#> SRR2105214 1 0.8356 1.92e-01 0.452 0.152 0.048 0.348
#> SRR2105211 3 0.8805 2.31e-01 0.060 0.256 0.444 0.240
#> SRR2105212 3 0.7188 3.76e-01 0.000 0.244 0.552 0.204
#> SRR2105209 3 0.9220 3.40e-02 0.076 0.260 0.336 0.328
#> SRR2105210 2 0.9884 -2.48e-01 0.272 0.284 0.268 0.176
#> SRR2105207 1 0.9526 -1.25e-01 0.388 0.220 0.136 0.256
#> SRR2105208 2 0.9553 -1.07e-01 0.232 0.376 0.260 0.132
#> SRR2105205 1 0.3344 5.76e-01 0.876 0.024 0.008 0.092
#> SRR2105206 1 0.5244 5.26e-01 0.764 0.124 0.004 0.108
#> SRR2105201 2 0.7044 1.29e-01 0.000 0.452 0.428 0.120
#> SRR2105202 2 0.7299 2.59e-01 0.000 0.512 0.312 0.176
#> SRR2105203 2 0.8379 8.05e-02 0.104 0.428 0.076 0.392
#> SRR2105204 2 0.4652 5.03e-01 0.004 0.756 0.020 0.220
#> SRR2105199 2 0.7459 3.90e-01 0.000 0.508 0.244 0.248
#> SRR2105200 2 0.7540 4.40e-01 0.012 0.548 0.192 0.248
#> SRR2105197 3 0.8324 1.07e-01 0.048 0.144 0.440 0.368
#> SRR2105198 4 0.8992 -3.63e-03 0.076 0.192 0.340 0.392
#> SRR2105195 1 0.6138 5.26e-01 0.716 0.032 0.076 0.176
#> SRR2105196 1 0.8329 1.65e-01 0.488 0.072 0.324 0.116
#> SRR2105193 2 0.8708 4.88e-05 0.304 0.432 0.052 0.212
#> SRR2105194 1 0.5086 5.51e-01 0.788 0.020 0.064 0.128
#> SRR2105191 1 0.8383 1.41e-01 0.408 0.024 0.332 0.236
#> SRR2105192 3 0.6025 4.45e-01 0.000 0.172 0.688 0.140
#> SRR2105189 2 0.7095 4.28e-01 0.008 0.600 0.204 0.188
#> SRR2105190 2 0.4640 5.51e-01 0.004 0.804 0.076 0.116
#> SRR2105187 1 0.4604 5.40e-01 0.784 0.028 0.008 0.180
#> SRR2105188 1 0.9436 -1.59e-01 0.316 0.096 0.280 0.308
#> SRR2105179 1 0.7584 3.67e-01 0.580 0.148 0.032 0.240
#> SRR2105180 1 0.7013 3.73e-01 0.604 0.016 0.264 0.116
#> SRR2105183 2 0.7870 4.02e-01 0.020 0.524 0.232 0.224
#> SRR2105184 2 0.6858 5.09e-01 0.096 0.688 0.072 0.144
#> SRR2105185 4 0.9085 2.68e-01 0.076 0.220 0.312 0.392
#> SRR2105186 2 0.8773 -8.01e-02 0.196 0.384 0.056 0.364
#> SRR2105181 3 0.7727 2.54e-01 0.184 0.040 0.584 0.192
#> SRR2105182 3 0.6566 4.66e-01 0.036 0.128 0.696 0.140
#> SRR2105177 1 0.9072 -2.05e-02 0.420 0.228 0.080 0.272
#> SRR2105178 1 0.7913 2.47e-01 0.552 0.224 0.036 0.188
#> SRR2105171 4 0.8077 4.21e-02 0.008 0.360 0.248 0.384
#> SRR2105172 2 0.3749 5.30e-01 0.000 0.840 0.032 0.128
#> SRR2105175 1 0.4937 5.58e-01 0.788 0.032 0.028 0.152
#> SRR2105176 1 0.5269 5.58e-01 0.788 0.040 0.060 0.112
#> SRR2105173 1 0.9689 -1.64e-01 0.360 0.184 0.180 0.276
#> SRR2105174 2 0.8000 2.20e-01 0.276 0.540 0.052 0.132
#> SRR2105169 1 0.9407 -2.67e-01 0.316 0.304 0.092 0.288
#> SRR2105170 2 0.7072 5.09e-01 0.084 0.676 0.108 0.132
#> SRR2105167 2 0.5839 5.23e-01 0.000 0.696 0.104 0.200
#> SRR2105168 2 0.5612 5.10e-01 0.004 0.692 0.052 0.252
#> SRR2105165 1 0.7799 2.67e-01 0.516 0.016 0.272 0.196
#> SRR2105166 1 0.2652 5.70e-01 0.912 0.004 0.028 0.056
#> SRR2105163 1 0.3421 5.69e-01 0.868 0.000 0.044 0.088
#> SRR2105164 1 0.1576 5.64e-01 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR2105161 1 0.5922 5.30e-01 0.672 0.024 0.032 0.272
#> SRR2105162 1 0.4477 5.58e-01 0.812 0.016 0.032 0.140
#> SRR2105155 3 0.7815 -1.17e-01 0.012 0.396 0.424 0.168
#> SRR2105156 2 0.5007 5.42e-01 0.000 0.760 0.068 0.172
#> SRR2105157 1 0.4292 5.70e-01 0.832 0.072 0.008 0.088
#> SRR2105158 1 0.2926 5.62e-01 0.896 0.056 0.000 0.048
#> SRR2105159 1 0.7008 4.26e-01 0.636 0.020 0.168 0.176
#> SRR2105160 3 0.8910 -1.74e-01 0.320 0.048 0.348 0.284
#> SRR2105153 1 0.9024 -9.71e-02 0.408 0.308 0.076 0.208
#> SRR2105154 1 0.2810 5.74e-01 0.896 0.008 0.008 0.088
#> SRR2105151 2 0.4561 5.40e-01 0.004 0.788 0.036 0.172
#> SRR2105152 2 0.4015 5.42e-01 0.000 0.832 0.052 0.116
#> SRR2105149 3 0.8070 3.85e-01 0.028 0.236 0.512 0.224
#> SRR2105150 3 0.7448 9.31e-02 0.000 0.400 0.428 0.172
#> SRR2105147 1 0.6814 4.39e-01 0.624 0.016 0.104 0.256
#> SRR2105148 4 0.9074 2.10e-02 0.336 0.080 0.200 0.384
#> SRR2105143 3 0.9757 -5.74e-02 0.172 0.208 0.340 0.280
#> SRR2105144 2 0.6538 4.39e-01 0.000 0.600 0.292 0.108
#> SRR2105145 1 0.3770 5.80e-01 0.852 0.040 0.004 0.104
#> SRR2105146 1 0.2466 5.71e-01 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR2105141 1 0.2040 5.69e-01 0.936 0.012 0.004 0.048
#> SRR2105142 1 0.6085 3.49e-01 0.664 0.260 0.008 0.068
#> SRR2105139 2 0.5364 4.94e-01 0.012 0.724 0.036 0.228
#> SRR2105140 2 0.6050 5.30e-01 0.012 0.708 0.104 0.176
#> SRR2105137 2 0.7589 1.31e-01 0.000 0.404 0.400 0.196
#> SRR2105138 3 0.8968 2.58e-01 0.084 0.212 0.452 0.252
#> SRR2105135 2 0.8283 -1.15e-01 0.012 0.352 0.336 0.300
#> SRR2105136 2 0.6198 4.78e-01 0.004 0.652 0.084 0.260
#> SRR2105133 3 0.3795 4.75e-01 0.004 0.060 0.856 0.080
#> SRR2105134 3 0.5042 4.87e-01 0.000 0.096 0.768 0.136
#> SRR2105131 3 0.7742 4.05e-01 0.016 0.212 0.532 0.240
#> SRR2105132 3 0.4333 4.76e-01 0.004 0.056 0.820 0.120
#> SRR2105129 4 0.8757 5.57e-02 0.208 0.056 0.308 0.428
#> SRR2105130 3 0.9635 -1.70e-01 0.224 0.136 0.324 0.316
#> SRR2105127 3 0.6214 3.06e-01 0.004 0.052 0.576 0.368
#> SRR2105128 3 0.7623 2.51e-01 0.000 0.380 0.416 0.204
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.420 0.409705 0.000 0.008 0.772 0.180 0.040
#> SRR2105278 3 0.562 0.371836 0.000 0.096 0.632 0.264 0.008
#> SRR2105275 1 0.496 0.443747 0.676 0.000 0.024 0.024 0.276
#> SRR2105276 1 0.571 0.294531 0.528 0.004 0.040 0.016 0.412
#> SRR2105273 3 0.815 0.264667 0.180 0.024 0.496 0.172 0.128
#> SRR2105274 3 0.855 0.221269 0.156 0.048 0.452 0.236 0.108
#> SRR2105271 2 0.899 -0.094558 0.032 0.296 0.268 0.268 0.136
#> SRR2105272 1 0.864 -0.064091 0.332 0.040 0.316 0.072 0.240
#> SRR2105269 2 0.734 0.339178 0.004 0.496 0.044 0.232 0.224
#> SRR2105270 2 0.718 0.295762 0.000 0.524 0.220 0.200 0.056
#> SRR2105267 2 0.700 0.391591 0.000 0.572 0.080 0.196 0.152
#> SRR2105268 2 0.714 0.322374 0.000 0.544 0.180 0.208 0.068
#> SRR2105265 2 0.810 0.135818 0.000 0.384 0.184 0.304 0.128
#> SRR2105266 2 0.694 0.298840 0.000 0.552 0.196 0.204 0.048
#> SRR2105263 1 0.587 0.477637 0.696 0.080 0.004 0.152 0.068
#> SRR2105264 1 0.662 0.478248 0.680 0.068 0.104 0.076 0.072
#> SRR2105261 5 0.853 0.247615 0.160 0.160 0.028 0.208 0.444
#> SRR2105262 2 0.917 -0.040688 0.080 0.364 0.180 0.264 0.112
#> SRR2105357 2 0.782 0.085285 0.000 0.412 0.244 0.268 0.076
#> SRR2105358 3 0.472 0.397456 0.000 0.080 0.744 0.168 0.008
#> SRR2105439 2 0.748 0.199668 0.000 0.488 0.180 0.256 0.076
#> SRR2105440 2 0.774 0.141034 0.000 0.388 0.260 0.292 0.060
#> SRR2105509 2 0.632 0.408320 0.000 0.624 0.036 0.172 0.168
#> SRR2105510 4 0.851 0.080203 0.016 0.296 0.236 0.348 0.104
#> SRR2105507 4 0.953 0.142860 0.260 0.144 0.176 0.316 0.104
#> SRR2105508 3 0.724 0.291316 0.100 0.000 0.536 0.124 0.240
#> SRR2105505 3 0.536 0.407134 0.004 0.028 0.724 0.152 0.092
#> SRR2105506 3 0.609 0.362065 0.000 0.048 0.656 0.180 0.116
#> SRR2105503 2 0.884 0.091163 0.204 0.400 0.036 0.152 0.208
#> SRR2105504 2 0.995 -0.173107 0.208 0.228 0.180 0.160 0.224
#> SRR2105501 2 0.678 0.339183 0.000 0.580 0.100 0.240 0.080
#> SRR2105502 1 0.964 -0.108940 0.332 0.192 0.148 0.128 0.200
#> SRR2105499 3 0.921 0.084126 0.160 0.132 0.364 0.264 0.080
#> SRR2105500 3 0.817 0.120879 0.012 0.228 0.428 0.240 0.092
#> SRR2105497 1 0.548 0.509132 0.736 0.016 0.056 0.052 0.140
#> SRR2105498 2 0.777 -0.032488 0.368 0.388 0.012 0.180 0.052
#> SRR2105495 2 0.791 0.246129 0.000 0.468 0.200 0.176 0.156
#> SRR2105496 2 0.663 0.334981 0.000 0.548 0.056 0.308 0.088
#> SRR2105493 2 0.837 0.122820 0.008 0.408 0.240 0.204 0.140
#> SRR2105494 2 0.750 0.255769 0.008 0.508 0.148 0.264 0.072
#> SRR2105491 1 0.419 0.425737 0.684 0.000 0.000 0.012 0.304
#> SRR2105492 1 0.392 0.493153 0.796 0.028 0.000 0.012 0.164
#> SRR2105489 5 0.964 0.180770 0.212 0.240 0.108 0.144 0.296
#> SRR2105490 2 0.496 0.414357 0.000 0.736 0.032 0.180 0.052
#> SRR2105487 3 0.844 0.241743 0.072 0.052 0.448 0.184 0.244
#> SRR2105488 3 0.550 0.400165 0.016 0.080 0.736 0.128 0.040
#> SRR2105485 3 0.743 0.127542 0.000 0.324 0.396 0.244 0.036
#> SRR2105486 3 0.714 0.273654 0.004 0.156 0.500 0.300 0.040
#> SRR2105483 1 0.852 0.052964 0.420 0.240 0.036 0.216 0.088
#> SRR2105484 1 0.694 0.332281 0.596 0.228 0.020 0.096 0.060
#> SRR2105481 1 0.792 0.285146 0.504 0.016 0.164 0.108 0.208
#> SRR2105482 3 0.743 0.291247 0.176 0.020 0.576 0.120 0.108
#> SRR2105479 1 0.430 0.524553 0.816 0.004 0.048 0.064 0.068
#> SRR2105480 1 0.112 0.514217 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105477 1 0.826 -0.008261 0.388 0.140 0.016 0.120 0.336
#> SRR2105478 1 0.712 0.253925 0.516 0.040 0.036 0.072 0.336
#> SRR2105475 2 0.543 0.383089 0.000 0.676 0.044 0.240 0.040
#> SRR2105476 2 0.729 0.357350 0.044 0.580 0.036 0.148 0.192
#> SRR2105473 2 0.794 0.144130 0.000 0.412 0.268 0.224 0.096
#> SRR2105474 2 0.630 0.401909 0.012 0.656 0.036 0.156 0.140
#> SRR2105471 5 0.872 0.220988 0.112 0.216 0.040 0.220 0.412
#> SRR2105472 5 0.789 0.049504 0.084 0.356 0.012 0.140 0.408
#> SRR2105469 3 0.645 0.351852 0.000 0.036 0.584 0.260 0.120
#> SRR2105470 3 0.830 0.163455 0.008 0.180 0.428 0.232 0.152
#> SRR2105467 3 0.507 0.414298 0.024 0.004 0.748 0.132 0.092
#> SRR2105468 3 0.556 0.392545 0.008 0.068 0.712 0.172 0.040
#> SRR2105465 4 0.854 0.110752 0.032 0.308 0.092 0.380 0.188
#> SRR2105466 3 0.914 0.124309 0.188 0.056 0.364 0.244 0.148
#> SRR2105463 1 0.917 -0.055356 0.352 0.092 0.168 0.288 0.100
#> SRR2105464 1 0.707 0.450623 0.628 0.036 0.076 0.132 0.128
#> SRR2105461 2 0.738 0.320348 0.000 0.500 0.100 0.280 0.120
#> SRR2105462 2 0.663 0.372366 0.008 0.616 0.116 0.208 0.052
#> SRR2105459 2 0.660 0.356166 0.004 0.624 0.108 0.192 0.072
#> SRR2105460 3 0.762 -0.011000 0.000 0.308 0.448 0.156 0.088
#> SRR2105457 3 0.812 0.180316 0.008 0.160 0.436 0.272 0.124
#> SRR2105458 3 0.743 0.260162 0.000 0.136 0.492 0.280 0.092
#> SRR2105455 4 0.969 0.103405 0.128 0.132 0.212 0.288 0.240
#> SRR2105456 4 0.895 0.074311 0.048 0.304 0.152 0.352 0.144
#> SRR2105453 2 0.795 0.060338 0.008 0.408 0.128 0.344 0.112
#> SRR2105454 3 0.546 0.404465 0.000 0.048 0.716 0.152 0.084
#> SRR2105451 2 0.821 0.128074 0.008 0.376 0.092 0.304 0.220
#> SRR2105452 2 0.995 -0.173107 0.208 0.228 0.180 0.160 0.224
#> SRR2105449 1 0.991 -0.264978 0.248 0.192 0.172 0.232 0.156
#> SRR2105450 3 0.932 -0.020404 0.104 0.208 0.328 0.268 0.092
#> SRR2105447 2 0.500 0.426622 0.000 0.752 0.032 0.104 0.112
#> SRR2105448 2 0.787 0.334447 0.044 0.536 0.072 0.196 0.152
#> SRR2105445 2 0.899 -0.043954 0.040 0.344 0.260 0.228 0.128
#> SRR2105446 3 0.726 0.247893 0.000 0.244 0.524 0.156 0.076
#> SRR2105443 2 0.836 0.175901 0.004 0.408 0.192 0.184 0.212
#> SRR2105444 2 0.783 0.172951 0.012 0.460 0.184 0.276 0.068
#> SRR2105441 3 0.832 -0.049858 0.004 0.288 0.348 0.248 0.112
#> SRR2105442 2 0.691 0.323964 0.052 0.600 0.056 0.244 0.048
#> SRR2105437 1 0.696 0.228224 0.480 0.032 0.056 0.040 0.392
#> SRR2105438 1 0.637 0.345255 0.560 0.000 0.084 0.040 0.316
#> SRR2105435 4 0.878 0.048903 0.052 0.328 0.136 0.364 0.120
#> SRR2105436 3 0.801 0.205627 0.068 0.164 0.504 0.224 0.040
#> SRR2105433 1 0.888 0.042170 0.388 0.172 0.060 0.276 0.104
#> SRR2105434 2 0.973 -0.062268 0.120 0.276 0.148 0.224 0.232
#> SRR2105431 5 0.929 0.282432 0.228 0.096 0.156 0.140 0.380
#> SRR2105432 3 0.857 -0.076501 0.304 0.012 0.328 0.124 0.232
#> SRR2105429 5 0.780 0.071134 0.116 0.356 0.004 0.116 0.408
#> SRR2105430 2 0.767 0.344231 0.052 0.544 0.044 0.148 0.212
#> SRR2105427 2 0.825 0.079520 0.000 0.384 0.168 0.272 0.176
#> SRR2105428 2 0.711 0.318091 0.008 0.520 0.048 0.300 0.124
#> SRR2105425 2 0.703 0.323658 0.004 0.556 0.052 0.156 0.232
#> SRR2105426 2 0.921 0.089606 0.136 0.420 0.136 0.148 0.160
#> SRR2105421 3 0.867 -0.018672 0.004 0.224 0.296 0.276 0.200
#> SRR2105422 3 0.694 0.355664 0.032 0.020 0.584 0.148 0.216
#> SRR2105423 4 0.935 -0.017565 0.116 0.252 0.076 0.284 0.272
#> SRR2105424 2 0.773 0.236052 0.000 0.408 0.152 0.344 0.096
#> SRR2105419 3 0.736 0.310314 0.024 0.032 0.532 0.228 0.184
#> SRR2105420 3 0.789 0.232351 0.008 0.120 0.496 0.188 0.188
#> SRR2105415 4 0.938 0.184267 0.260 0.244 0.084 0.300 0.112
#> SRR2105416 3 0.765 0.299234 0.144 0.044 0.556 0.196 0.060
#> SRR2105417 5 0.910 -0.039966 0.048 0.124 0.288 0.232 0.308
#> SRR2105418 2 0.940 -0.043427 0.084 0.352 0.192 0.156 0.216
#> SRR2105413 2 0.615 0.396889 0.000 0.648 0.084 0.204 0.064
#> SRR2105414 2 0.668 0.315398 0.000 0.540 0.096 0.312 0.052
#> SRR2105409 2 0.826 0.187724 0.152 0.440 0.008 0.184 0.216
#> SRR2105410 2 0.957 -0.074923 0.248 0.272 0.096 0.252 0.132
#> SRR2105411 2 0.870 -0.076462 0.016 0.320 0.188 0.320 0.156
#> SRR2105412 2 0.703 0.294066 0.000 0.532 0.096 0.284 0.088
#> SRR2105407 3 0.790 0.332210 0.036 0.084 0.532 0.168 0.180
#> SRR2105408 3 0.686 0.254524 0.000 0.196 0.536 0.236 0.032
#> SRR2105403 3 0.601 0.387482 0.000 0.096 0.672 0.168 0.064
#> SRR2105404 3 0.638 0.374235 0.000 0.068 0.636 0.184 0.112
#> SRR2105405 3 0.757 0.289870 0.000 0.092 0.496 0.208 0.204
#> SRR2105406 3 0.794 0.249985 0.000 0.188 0.464 0.188 0.160
#> SRR2105401 3 0.811 0.117851 0.008 0.208 0.444 0.232 0.108
#> SRR2105402 2 0.995 -0.173107 0.208 0.228 0.180 0.160 0.224
#> SRR2105399 2 0.654 0.336978 0.004 0.552 0.092 0.316 0.036
#> SRR2105400 2 0.620 0.408510 0.000 0.636 0.084 0.220 0.060
#> SRR2105397 5 0.819 0.365049 0.152 0.100 0.148 0.068 0.532
#> SRR2105398 3 0.885 0.061368 0.032 0.236 0.328 0.116 0.288
#> SRR2105395 1 0.879 0.238730 0.432 0.048 0.148 0.208 0.164
#> SRR2105396 2 0.603 0.415059 0.008 0.664 0.032 0.196 0.100
#> SRR2105393 2 0.788 0.265569 0.000 0.472 0.180 0.148 0.200
#> SRR2105394 2 0.746 0.335246 0.024 0.524 0.036 0.208 0.208
#> SRR2105389 3 0.659 0.382940 0.048 0.036 0.660 0.152 0.104
#> SRR2105390 5 0.818 0.161101 0.236 0.004 0.232 0.116 0.412
#> SRR2105391 3 0.462 0.392401 0.004 0.000 0.752 0.096 0.148
#> SRR2105392 3 0.746 0.206085 0.104 0.000 0.496 0.128 0.272
#> SRR2105385 1 0.831 0.228080 0.448 0.020 0.248 0.152 0.132
#> SRR2105386 3 0.939 0.053612 0.240 0.088 0.336 0.212 0.124
#> SRR2105387 2 0.904 -0.041990 0.036 0.340 0.156 0.252 0.216
#> SRR2105388 2 0.626 0.365364 0.000 0.592 0.044 0.284 0.080
#> SRR2105381 2 0.829 0.214927 0.052 0.456 0.080 0.128 0.284
#> SRR2105382 2 0.909 -0.037609 0.264 0.336 0.040 0.164 0.196
#> SRR2105383 2 0.648 0.405370 0.000 0.636 0.084 0.160 0.120
#> SRR2105384 2 0.455 0.413057 0.000 0.756 0.024 0.184 0.036
#> SRR2105379 5 0.815 0.245919 0.260 0.256 0.032 0.044 0.408
#> SRR2105380 1 0.458 0.534408 0.808 0.024 0.032 0.060 0.076
#> SRR2105377 3 0.891 -0.009007 0.020 0.180 0.328 0.244 0.228
#> SRR2105378 5 0.980 0.016600 0.116 0.236 0.228 0.176 0.244
#> SRR2105375 2 0.870 0.148316 0.040 0.412 0.120 0.256 0.172
#> SRR2105376 3 0.814 0.022969 0.000 0.272 0.368 0.252 0.108
#> SRR2105373 3 0.724 0.330619 0.092 0.012 0.584 0.148 0.164
#> SRR2105374 1 0.708 0.405858 0.564 0.020 0.068 0.080 0.268
#> SRR2105371 3 0.801 0.217550 0.004 0.092 0.420 0.216 0.268
#> SRR2105372 3 0.744 0.329206 0.000 0.076 0.504 0.208 0.212
#> SRR2105369 3 0.708 0.348637 0.000 0.116 0.560 0.224 0.100
#> SRR2105370 3 0.843 0.142437 0.000 0.196 0.344 0.268 0.192
#> SRR2105367 5 0.909 0.100014 0.028 0.236 0.244 0.192 0.300
#> SRR2105368 5 0.915 0.075866 0.036 0.220 0.244 0.184 0.316
#> SRR2105365 1 0.527 0.494411 0.744 0.116 0.004 0.044 0.092
#> SRR2105366 1 0.352 0.530514 0.864 0.032 0.008 0.048 0.048
#> SRR2105363 2 0.767 0.043219 0.000 0.360 0.228 0.356 0.056
#> SRR2105364 2 0.674 0.363866 0.000 0.572 0.076 0.260 0.092
#> SRR2105361 2 0.838 0.161812 0.000 0.368 0.184 0.232 0.216
#> SRR2105362 3 0.818 0.206341 0.012 0.116 0.452 0.220 0.200
#> SRR2105359 5 0.851 -0.062997 0.000 0.224 0.272 0.192 0.312
#> SRR2105360 3 0.728 0.280849 0.028 0.032 0.508 0.120 0.312
#> SRR2105355 3 0.649 0.330258 0.004 0.024 0.600 0.188 0.184
#> SRR2105356 3 0.828 0.253367 0.008 0.228 0.432 0.152 0.180
#> SRR2105353 1 0.759 0.270126 0.460 0.008 0.104 0.096 0.332
#> SRR2105354 1 0.686 0.177874 0.472 0.000 0.360 0.032 0.136
#> SRR2105351 5 0.863 0.073925 0.260 0.092 0.092 0.108 0.448
#> SRR2105352 2 0.995 -0.173107 0.208 0.228 0.180 0.160 0.224
#> SRR2105349 4 0.915 0.082178 0.184 0.304 0.124 0.324 0.064
#> SRR2105350 2 0.504 0.400049 0.000 0.736 0.048 0.172 0.044
#> SRR2105345 4 0.850 0.007918 0.008 0.312 0.196 0.340 0.144
#> SRR2105346 2 0.749 0.340031 0.000 0.528 0.148 0.188 0.136
#> SRR2105347 2 0.571 0.412595 0.008 0.712 0.044 0.136 0.100
#> SRR2105348 2 0.538 0.412691 0.000 0.724 0.076 0.148 0.052
#> SRR2105343 2 0.879 -0.040114 0.148 0.336 0.032 0.156 0.328
#> SRR2105344 2 0.582 0.409812 0.000 0.672 0.064 0.204 0.060
#> SRR2105341 3 0.532 0.413275 0.020 0.036 0.740 0.156 0.048
#> SRR2105342 3 0.701 0.276793 0.008 0.132 0.544 0.272 0.044
#> SRR2105339 3 0.969 0.051155 0.128 0.168 0.324 0.192 0.188
#> SRR2105340 3 0.766 0.195773 0.256 0.012 0.504 0.080 0.148
#> SRR2105335 5 0.792 0.232438 0.248 0.032 0.148 0.072 0.500
#> SRR2105336 5 0.833 0.205724 0.056 0.072 0.288 0.136 0.448
#> SRR2105337 1 0.839 0.101381 0.376 0.072 0.104 0.072 0.376
#> SRR2105338 3 0.962 -0.012218 0.252 0.152 0.304 0.184 0.108
#> SRR2105331 1 0.670 0.453069 0.640 0.100 0.016 0.076 0.168
#> SRR2105332 1 0.665 0.312856 0.592 0.240 0.008 0.036 0.124
#> SRR2105333 2 0.791 0.178053 0.148 0.472 0.024 0.284 0.072
#> SRR2105334 2 0.609 0.392723 0.000 0.640 0.076 0.228 0.056
#> SRR2105329 3 0.771 0.175912 0.000 0.204 0.416 0.308 0.072
#> SRR2105330 2 0.781 0.081351 0.008 0.448 0.280 0.196 0.068
#> SRR2105327 2 0.861 0.257405 0.084 0.464 0.108 0.236 0.108
#> SRR2105328 2 0.911 0.128832 0.136 0.384 0.076 0.256 0.148
#> SRR2105325 1 0.510 0.454541 0.688 0.000 0.052 0.016 0.244
#> SRR2105326 1 0.461 0.436875 0.676 0.000 0.020 0.008 0.296
#> SRR2105323 3 0.559 0.381395 0.000 0.036 0.692 0.184 0.088
#> SRR2105324 3 0.743 0.239554 0.000 0.236 0.512 0.160 0.092
#> SRR2105319 1 0.747 0.381272 0.552 0.012 0.160 0.088 0.188
#> SRR2105320 1 0.761 0.309736 0.512 0.012 0.164 0.072 0.240
#> SRR2105321 1 0.503 0.429209 0.632 0.000 0.012 0.028 0.328
#> SRR2105322 1 0.366 0.490402 0.784 0.000 0.000 0.020 0.196
#> SRR2105317 2 0.465 0.399418 0.000 0.760 0.020 0.160 0.060
#> SRR2105318 2 0.647 0.367500 0.000 0.620 0.052 0.184 0.144
#> SRR2105315 2 0.820 0.156717 0.008 0.424 0.248 0.208 0.112
#> SRR2105316 2 0.796 0.263070 0.000 0.460 0.196 0.188 0.156
#> SRR2105313 2 0.751 0.105548 0.000 0.440 0.276 0.232 0.052
#> SRR2105314 2 0.800 0.258009 0.000 0.444 0.236 0.160 0.160
#> SRR2105311 1 0.260 0.522118 0.896 0.000 0.020 0.012 0.072
#> SRR2105312 1 0.186 0.518566 0.928 0.000 0.004 0.008 0.060
#> SRR2105307 3 0.725 0.302738 0.012 0.048 0.516 0.292 0.132
#> SRR2105308 2 0.805 -0.023802 0.000 0.404 0.248 0.240 0.108
#> SRR2105309 2 0.799 -0.014308 0.000 0.340 0.276 0.304 0.080
#> SRR2105310 3 0.740 0.227779 0.004 0.208 0.512 0.216 0.060
#> SRR2105305 3 0.715 0.324457 0.008 0.124 0.556 0.244 0.068
#> SRR2105306 4 0.857 -0.043659 0.004 0.224 0.292 0.312 0.168
#> SRR2105303 2 0.846 0.244887 0.020 0.440 0.172 0.156 0.212
#> SRR2105304 2 0.970 -0.048457 0.176 0.324 0.152 0.144 0.204
#> SRR2105301 4 0.958 -0.123260 0.228 0.080 0.172 0.276 0.244
#> SRR2105302 2 0.738 0.366735 0.032 0.544 0.032 0.176 0.216
#> SRR2105299 1 0.849 0.050316 0.344 0.012 0.276 0.108 0.260
#> SRR2105300 2 0.881 0.152003 0.060 0.444 0.160 0.192 0.144
#> SRR2105297 2 0.820 0.132719 0.240 0.472 0.060 0.180 0.048
#> SRR2105298 2 0.657 0.363940 0.004 0.544 0.056 0.332 0.064
#> SRR2105295 5 0.956 0.050855 0.124 0.196 0.176 0.152 0.352
#> SRR2105296 2 0.817 0.086677 0.136 0.388 0.004 0.156 0.316
#> SRR2105293 1 0.840 0.129352 0.444 0.120 0.064 0.080 0.292
#> SRR2105294 1 0.600 0.498876 0.704 0.020 0.084 0.056 0.136
#> SRR2105291 3 0.797 0.269123 0.028 0.056 0.432 0.160 0.324
#> SRR2105292 3 0.810 0.187430 0.288 0.052 0.476 0.084 0.100
#> SRR2105289 2 0.821 -0.138024 0.004 0.340 0.244 0.316 0.096
#> SRR2105290 3 0.735 0.329694 0.004 0.144 0.540 0.224 0.088
#> SRR2105287 2 0.768 0.163312 0.000 0.492 0.168 0.220 0.120
#> SRR2105288 4 0.925 0.098549 0.044 0.188 0.272 0.292 0.204
#> SRR2105285 2 0.824 0.173394 0.008 0.428 0.148 0.256 0.160
#> SRR2105286 2 0.708 0.392252 0.036 0.616 0.060 0.172 0.116
#> SRR2105283 2 0.671 0.374348 0.012 0.620 0.056 0.116 0.196
#> SRR2105284 4 0.841 0.091963 0.000 0.276 0.264 0.312 0.148
#> SRR2105281 2 0.641 0.288624 0.000 0.564 0.028 0.292 0.116
#> SRR2105282 2 0.608 0.368991 0.004 0.628 0.076 0.256 0.036
#> SRR2105259 3 0.716 0.327743 0.000 0.076 0.548 0.176 0.200
#> SRR2105260 3 0.803 0.043413 0.000 0.264 0.376 0.268 0.092
#> SRR2105279 2 0.721 0.362872 0.012 0.580 0.076 0.176 0.156
#> SRR2105280 2 0.550 0.411836 0.004 0.696 0.012 0.132 0.156
#> SRR2105257 4 0.903 0.034202 0.284 0.028 0.228 0.292 0.168
#> SRR2105258 1 0.800 0.289265 0.492 0.016 0.208 0.108 0.176
#> SRR2105253 2 0.810 0.257801 0.064 0.460 0.032 0.180 0.264
#> SRR2105254 2 0.780 0.310941 0.068 0.564 0.100 0.184 0.084
#> SRR2105255 3 0.737 0.351086 0.012 0.032 0.492 0.260 0.204
#> SRR2105256 3 0.784 0.201318 0.000 0.256 0.456 0.164 0.124
#> SRR2105251 2 0.741 0.123905 0.064 0.444 0.000 0.156 0.336
#> SRR2105252 5 0.868 0.080126 0.028 0.312 0.140 0.156 0.364
#> SRR2105249 2 0.628 0.379347 0.000 0.604 0.020 0.180 0.196
#> SRR2105250 2 0.678 0.238945 0.000 0.524 0.180 0.272 0.024
#> SRR2105247 2 0.771 0.027071 0.112 0.408 0.016 0.076 0.388
#> SRR2105248 1 0.600 0.394705 0.596 0.032 0.004 0.056 0.312
#> SRR2105245 1 0.594 0.309803 0.504 0.008 0.008 0.060 0.420
#> SRR2105246 5 0.935 0.140648 0.260 0.052 0.180 0.220 0.288
#> SRR2105243 5 0.843 0.023978 0.000 0.216 0.212 0.212 0.360
#> SRR2105244 1 0.935 -0.199678 0.312 0.132 0.268 0.216 0.072
#> SRR2105241 4 0.926 0.040329 0.272 0.044 0.216 0.288 0.180
#> SRR2105242 1 0.746 0.356812 0.564 0.080 0.036 0.092 0.228
#> SRR2105239 5 0.813 0.209272 0.252 0.080 0.068 0.100 0.500
#> SRR2105240 1 0.879 0.215569 0.444 0.072 0.128 0.224 0.132
#> SRR2105237 4 0.980 0.124626 0.144 0.252 0.208 0.256 0.140
#> SRR2105238 2 0.733 -0.024088 0.000 0.368 0.360 0.244 0.028
#> SRR2105235 4 0.783 0.120488 0.000 0.252 0.280 0.396 0.072
#> SRR2105236 2 0.661 0.306514 0.012 0.600 0.080 0.256 0.052
#> SRR2105233 2 0.834 0.077204 0.036 0.400 0.072 0.172 0.320
#> SRR2105234 2 0.690 0.390625 0.036 0.624 0.060 0.196 0.084
#> SRR2105231 2 0.640 0.409471 0.016 0.632 0.024 0.128 0.200
#> SRR2105232 2 0.816 0.257483 0.060 0.488 0.084 0.104 0.264
#> SRR2105227 3 0.893 0.135465 0.120 0.060 0.388 0.160 0.272
#> SRR2105228 3 0.805 0.238990 0.004 0.216 0.460 0.152 0.168
#> SRR2105225 3 0.726 0.291807 0.000 0.056 0.504 0.252 0.188
#> SRR2105226 5 0.826 0.122585 0.016 0.120 0.288 0.152 0.424
#> SRR2105229 5 0.786 -0.000141 0.044 0.036 0.368 0.140 0.412
#> SRR2105230 3 0.533 0.406706 0.012 0.024 0.724 0.176 0.064
#> SRR2105219 2 0.726 0.343759 0.032 0.568 0.040 0.220 0.140
#> SRR2105220 2 0.824 0.057998 0.004 0.376 0.308 0.188 0.124
#> SRR2105221 2 0.894 -0.023608 0.040 0.356 0.132 0.276 0.196
#> SRR2105222 2 0.789 0.356248 0.056 0.540 0.124 0.208 0.072
#> SRR2105223 3 0.767 0.157821 0.188 0.000 0.472 0.092 0.248
#> SRR2105224 1 0.847 -0.056223 0.364 0.036 0.360 0.132 0.108
#> SRR2105217 1 0.637 0.396868 0.608 0.052 0.004 0.076 0.260
#> SRR2105218 2 0.821 0.057912 0.212 0.436 0.008 0.124 0.220
#> SRR2105215 2 0.809 0.240299 0.004 0.456 0.164 0.212 0.164
#> SRR2105216 2 0.507 0.408866 0.000 0.720 0.036 0.200 0.044
#> SRR2105213 1 0.826 0.278789 0.476 0.024 0.180 0.124 0.196
#> SRR2105214 1 0.873 -0.050081 0.340 0.176 0.028 0.132 0.324
#> SRR2105211 3 0.915 0.049639 0.060 0.168 0.340 0.288 0.144
#> SRR2105212 3 0.793 0.087295 0.000 0.224 0.392 0.296 0.088
#> SRR2105209 4 0.928 0.068490 0.040 0.236 0.240 0.276 0.208
#> SRR2105210 1 0.987 -0.273500 0.256 0.164 0.208 0.144 0.228
#> SRR2105207 1 0.968 -0.150961 0.312 0.208 0.112 0.176 0.192
#> SRR2105208 2 0.976 -0.141011 0.248 0.288 0.152 0.160 0.152
#> SRR2105205 1 0.517 0.510338 0.756 0.060 0.008 0.052 0.124
#> SRR2105206 1 0.430 0.526619 0.816 0.052 0.004 0.076 0.052
#> SRR2105201 3 0.825 -0.060563 0.000 0.320 0.340 0.200 0.140
#> SRR2105202 2 0.756 0.008556 0.000 0.440 0.244 0.260 0.056
#> SRR2105203 2 0.872 0.137062 0.064 0.372 0.068 0.188 0.308
#> SRR2105204 2 0.605 0.368885 0.008 0.616 0.008 0.116 0.252
#> SRR2105199 2 0.824 0.187418 0.000 0.408 0.192 0.208 0.192
#> SRR2105200 2 0.797 0.246589 0.008 0.468 0.124 0.252 0.148
#> SRR2105197 3 0.896 0.064430 0.040 0.116 0.328 0.280 0.236
#> SRR2105198 5 0.900 0.289222 0.080 0.168 0.180 0.140 0.432
#> SRR2105195 1 0.674 0.457686 0.668 0.084 0.052 0.108 0.088
#> SRR2105196 1 0.712 0.321597 0.564 0.028 0.180 0.204 0.024
#> SRR2105193 1 0.918 -0.175902 0.308 0.280 0.044 0.204 0.164
#> SRR2105194 1 0.509 0.516965 0.776 0.028 0.048 0.100 0.048
#> SRR2105191 5 0.853 0.144903 0.276 0.008 0.284 0.124 0.308
#> SRR2105192 3 0.724 0.344407 0.000 0.100 0.552 0.192 0.156
#> SRR2105189 2 0.770 0.085498 0.036 0.428 0.104 0.380 0.052
#> SRR2105190 2 0.573 0.397429 0.020 0.692 0.048 0.204 0.036
#> SRR2105187 1 0.501 0.431280 0.672 0.012 0.008 0.024 0.284
#> SRR2105188 5 0.932 0.284482 0.188 0.096 0.200 0.136 0.380
#> SRR2105179 1 0.857 0.041599 0.384 0.140 0.020 0.168 0.288
#> SRR2105180 1 0.669 0.445427 0.636 0.012 0.172 0.096 0.084
#> SRR2105183 2 0.800 0.139496 0.004 0.380 0.156 0.352 0.108
#> SRR2105184 2 0.765 0.363004 0.092 0.560 0.052 0.216 0.080
#> SRR2105185 5 0.917 0.091816 0.044 0.184 0.260 0.184 0.328
#> SRR2105186 5 0.820 0.238781 0.136 0.296 0.016 0.124 0.428
#> SRR2105181 3 0.843 0.048436 0.152 0.040 0.436 0.096 0.276
#> SRR2105182 3 0.711 0.346289 0.028 0.092 0.608 0.188 0.084
#> SRR2105177 1 0.933 -0.058595 0.328 0.164 0.088 0.132 0.288
#> SRR2105178 1 0.802 0.294527 0.532 0.176 0.040 0.140 0.112
#> SRR2105171 2 0.885 -0.086796 0.012 0.296 0.200 0.260 0.232
#> SRR2105172 2 0.524 0.396017 0.000 0.700 0.008 0.176 0.116
#> SRR2105175 1 0.647 0.442773 0.628 0.044 0.028 0.060 0.240
#> SRR2105176 1 0.619 0.490593 0.708 0.044 0.084 0.100 0.064
#> SRR2105173 1 0.914 -0.015942 0.376 0.104 0.148 0.272 0.100
#> SRR2105174 2 0.782 0.109416 0.280 0.492 0.028 0.128 0.072
#> SRR2105169 1 0.956 -0.142618 0.304 0.208 0.088 0.240 0.160
#> SRR2105170 2 0.784 0.316430 0.100 0.552 0.068 0.204 0.076
#> SRR2105167 2 0.674 0.393608 0.000 0.616 0.104 0.136 0.144
#> SRR2105168 2 0.645 0.401666 0.004 0.596 0.028 0.128 0.244
#> SRR2105165 1 0.783 0.229696 0.456 0.004 0.288 0.132 0.120
#> SRR2105166 1 0.316 0.527950 0.876 0.000 0.032 0.048 0.044
#> SRR2105163 1 0.445 0.524173 0.796 0.000 0.064 0.040 0.100
#> SRR2105164 1 0.289 0.521675 0.880 0.000 0.016 0.020 0.084
#> SRR2105161 1 0.690 0.442240 0.588 0.024 0.044 0.096 0.248
#> SRR2105162 1 0.562 0.518516 0.736 0.024 0.044 0.080 0.116
#> SRR2105155 3 0.831 -0.099555 0.016 0.288 0.376 0.240 0.080
#> SRR2105156 2 0.583 0.417371 0.000 0.688 0.080 0.164 0.068
#> SRR2105157 1 0.549 0.504583 0.732 0.064 0.008 0.060 0.136
#> SRR2105158 1 0.277 0.523801 0.896 0.044 0.000 0.036 0.024
#> SRR2105159 1 0.788 0.220622 0.468 0.036 0.144 0.052 0.300
#> SRR2105160 5 0.899 0.122637 0.204 0.040 0.308 0.132 0.316
#> SRR2105153 1 0.890 -0.102090 0.344 0.260 0.040 0.108 0.248
#> SRR2105154 1 0.340 0.525840 0.840 0.004 0.000 0.040 0.116
#> SRR2105151 2 0.578 0.407722 0.000 0.664 0.020 0.136 0.180
#> SRR2105152 2 0.513 0.394507 0.000 0.700 0.036 0.228 0.036
#> SRR2105149 3 0.843 0.119543 0.044 0.140 0.380 0.352 0.084
#> SRR2105150 4 0.787 -0.024660 0.000 0.268 0.308 0.356 0.068
#> SRR2105147 1 0.692 0.183556 0.460 0.020 0.032 0.080 0.408
#> SRR2105148 5 0.802 0.312594 0.196 0.052 0.144 0.080 0.528
#> SRR2105143 3 0.961 -0.115796 0.148 0.192 0.280 0.276 0.104
#> SRR2105144 2 0.725 0.274796 0.000 0.536 0.232 0.144 0.088
#> SRR2105145 1 0.425 0.533112 0.804 0.032 0.000 0.052 0.112
#> SRR2105146 1 0.311 0.513572 0.840 0.004 0.000 0.012 0.144
#> SRR2105141 1 0.179 0.524491 0.944 0.020 0.008 0.020 0.008
#> SRR2105142 1 0.571 0.416872 0.684 0.196 0.004 0.084 0.032
#> SRR2105139 2 0.667 0.377187 0.016 0.580 0.012 0.200 0.192
#> SRR2105140 2 0.664 0.363806 0.004 0.568 0.072 0.292 0.064
#> SRR2105137 2 0.820 0.064353 0.000 0.376 0.264 0.236 0.124
#> SRR2105138 3 0.936 0.111595 0.108 0.180 0.376 0.208 0.128
#> SRR2105135 3 0.879 -0.102404 0.016 0.268 0.340 0.180 0.196
#> SRR2105136 2 0.748 0.320304 0.000 0.512 0.092 0.208 0.188
#> SRR2105133 3 0.456 0.410445 0.008 0.036 0.784 0.140 0.032
#> SRR2105134 3 0.596 0.387891 0.000 0.096 0.684 0.144 0.076
#> SRR2105131 3 0.841 0.254378 0.016 0.160 0.432 0.232 0.160
#> SRR2105132 3 0.506 0.406415 0.020 0.028 0.752 0.160 0.040
#> SRR2105129 3 0.945 -0.066663 0.232 0.064 0.280 0.252 0.172
#> SRR2105130 3 0.967 -0.064767 0.212 0.092 0.276 0.232 0.188
#> SRR2105127 3 0.688 0.266129 0.012 0.032 0.560 0.264 0.132
#> SRR2105128 3 0.827 0.016265 0.000 0.268 0.352 0.252 0.128
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.592 0.239556 0.064 0.024 0.000 0.312 0.568 0.032
#> SRR2105278 5 0.672 0.129905 0.064 0.048 0.000 0.400 0.436 0.052
#> SRR2105275 3 0.468 0.288763 0.020 0.000 0.548 0.000 0.016 0.416
#> SRR2105276 6 0.509 -0.057756 0.032 0.004 0.416 0.000 0.020 0.528
#> SRR2105273 5 0.836 0.273844 0.128 0.036 0.180 0.104 0.464 0.088
#> SRR2105274 5 0.895 0.204106 0.140 0.048 0.196 0.196 0.356 0.064
#> SRR2105271 4 0.878 0.220629 0.168 0.184 0.012 0.348 0.192 0.096
#> SRR2105272 3 0.869 -0.004274 0.152 0.036 0.316 0.052 0.308 0.136
#> SRR2105269 2 0.783 0.284764 0.184 0.468 0.008 0.144 0.040 0.156
#> SRR2105270 4 0.747 0.043685 0.088 0.328 0.000 0.404 0.148 0.032
#> SRR2105267 2 0.736 0.261830 0.072 0.472 0.000 0.212 0.036 0.208
#> SRR2105268 4 0.753 -0.047507 0.112 0.368 0.000 0.376 0.100 0.044
#> SRR2105265 2 0.870 0.054524 0.236 0.304 0.000 0.172 0.172 0.116
#> SRR2105266 2 0.770 0.039377 0.108 0.412 0.004 0.316 0.116 0.044
#> SRR2105263 3 0.600 0.475595 0.100 0.096 0.688 0.064 0.016 0.036
#> SRR2105264 3 0.602 0.501252 0.088 0.048 0.700 0.068 0.064 0.032
#> SRR2105261 6 0.906 0.160515 0.208 0.152 0.184 0.088 0.036 0.332
#> SRR2105262 4 0.879 0.170162 0.124 0.288 0.060 0.356 0.084 0.088
#> SRR2105357 4 0.790 0.236159 0.092 0.288 0.000 0.404 0.140 0.076
#> SRR2105358 5 0.633 0.226259 0.060 0.056 0.000 0.308 0.544 0.032
#> SRR2105439 2 0.691 0.053403 0.084 0.460 0.004 0.360 0.044 0.048
#> SRR2105440 4 0.766 0.100729 0.092 0.256 0.000 0.440 0.164 0.048
#> SRR2105509 2 0.739 0.273504 0.108 0.496 0.000 0.212 0.040 0.144
#> SRR2105510 4 0.818 0.223195 0.132 0.208 0.012 0.440 0.140 0.068
#> SRR2105507 4 0.948 -0.126356 0.204 0.100 0.204 0.232 0.208 0.052
#> SRR2105508 5 0.700 0.344114 0.144 0.000 0.076 0.080 0.576 0.124
#> SRR2105505 5 0.643 0.291364 0.068 0.020 0.000 0.276 0.552 0.084
#> SRR2105506 5 0.663 0.313614 0.176 0.048 0.004 0.200 0.556 0.016
#> SRR2105503 1 0.918 0.131439 0.264 0.252 0.208 0.088 0.036 0.152
#> SRR2105504 2 0.997 -0.114733 0.168 0.200 0.160 0.160 0.148 0.164
#> SRR2105501 2 0.781 0.235757 0.212 0.464 0.000 0.116 0.128 0.080
#> SRR2105502 3 0.978 -0.155305 0.156 0.172 0.268 0.124 0.120 0.160
#> SRR2105499 4 0.959 0.014484 0.180 0.120 0.188 0.260 0.188 0.064
#> SRR2105500 4 0.868 0.094163 0.196 0.168 0.008 0.312 0.244 0.072
#> SRR2105497 3 0.576 0.505269 0.140 0.028 0.692 0.012 0.076 0.052
#> SRR2105498 3 0.766 -0.046903 0.140 0.312 0.404 0.112 0.004 0.028
#> SRR2105495 2 0.843 0.073727 0.100 0.360 0.000 0.240 0.152 0.148
#> SRR2105496 2 0.720 0.157322 0.116 0.408 0.008 0.372 0.016 0.080
#> SRR2105493 2 0.848 -0.010849 0.124 0.364 0.000 0.208 0.184 0.120
#> SRR2105494 2 0.702 0.058028 0.072 0.492 0.000 0.304 0.076 0.056
#> SRR2105491 3 0.425 0.291675 0.024 0.000 0.604 0.000 0.000 0.372
#> SRR2105492 3 0.421 0.445746 0.024 0.028 0.744 0.004 0.000 0.200
#> SRR2105489 6 0.981 0.021235 0.160 0.144 0.180 0.132 0.124 0.260
#> SRR2105490 2 0.600 0.278741 0.076 0.548 0.000 0.320 0.008 0.048
#> SRR2105487 5 0.867 0.186126 0.112 0.128 0.016 0.172 0.392 0.180
#> SRR2105488 5 0.733 0.179746 0.092 0.080 0.008 0.268 0.500 0.052
#> SRR2105485 4 0.783 0.223154 0.072 0.316 0.000 0.360 0.196 0.056
#> SRR2105486 4 0.799 0.098125 0.052 0.172 0.012 0.412 0.272 0.080
#> SRR2105483 3 0.810 -0.029018 0.264 0.212 0.388 0.076 0.020 0.040
#> SRR2105484 3 0.622 0.408022 0.132 0.152 0.636 0.048 0.008 0.024
#> SRR2105481 3 0.838 0.212262 0.064 0.036 0.432 0.108 0.128 0.232
#> SRR2105482 5 0.769 0.246925 0.132 0.016 0.196 0.116 0.500 0.040
#> SRR2105479 3 0.443 0.515715 0.064 0.012 0.800 0.028 0.032 0.064
#> SRR2105480 3 0.214 0.507082 0.016 0.004 0.916 0.008 0.004 0.052
#> SRR2105477 6 0.785 0.135803 0.068 0.112 0.332 0.060 0.020 0.408
#> SRR2105478 3 0.688 0.046000 0.048 0.036 0.432 0.040 0.032 0.412
#> SRR2105475 2 0.590 0.287701 0.140 0.620 0.000 0.196 0.016 0.028
#> SRR2105476 2 0.826 0.172961 0.236 0.432 0.040 0.108 0.040 0.144
#> SRR2105473 2 0.807 0.046884 0.136 0.412 0.000 0.172 0.216 0.064
#> SRR2105474 2 0.641 0.321998 0.176 0.604 0.012 0.084 0.004 0.120
#> SRR2105471 6 0.866 0.021951 0.256 0.212 0.080 0.064 0.040 0.348
#> SRR2105472 6 0.761 0.184649 0.152 0.244 0.080 0.028 0.020 0.476
#> SRR2105469 5 0.694 0.315426 0.084 0.072 0.004 0.148 0.592 0.100
#> SRR2105470 1 0.886 -0.000936 0.280 0.156 0.024 0.220 0.260 0.060
#> SRR2105467 5 0.608 0.296609 0.072 0.016 0.004 0.228 0.616 0.064
#> SRR2105468 5 0.652 0.229694 0.080 0.048 0.004 0.308 0.532 0.028
#> SRR2105465 1 0.913 0.009478 0.300 0.232 0.036 0.196 0.148 0.088
#> SRR2105466 5 0.873 0.068165 0.204 0.076 0.232 0.064 0.368 0.056
#> SRR2105463 3 0.875 0.094687 0.120 0.032 0.384 0.236 0.116 0.112
#> SRR2105464 3 0.715 0.395062 0.200 0.056 0.556 0.016 0.124 0.048
#> SRR2105461 2 0.763 0.132427 0.068 0.392 0.000 0.332 0.060 0.148
#> SRR2105462 2 0.704 0.255130 0.168 0.484 0.000 0.264 0.060 0.024
#> SRR2105459 2 0.697 0.145888 0.132 0.456 0.000 0.328 0.060 0.024
#> SRR2105460 5 0.773 -0.058384 0.120 0.260 0.000 0.176 0.412 0.032
#> SRR2105457 4 0.902 0.021150 0.184 0.148 0.020 0.284 0.260 0.104
#> SRR2105458 5 0.848 0.010030 0.148 0.172 0.000 0.276 0.316 0.088
#> SRR2105455 1 0.901 0.309205 0.364 0.172 0.096 0.068 0.220 0.080
#> SRR2105456 2 0.928 0.004645 0.224 0.276 0.056 0.220 0.148 0.076
#> SRR2105453 1 0.829 0.077112 0.348 0.328 0.012 0.120 0.116 0.076
#> SRR2105454 5 0.621 0.287261 0.112 0.032 0.000 0.208 0.608 0.040
#> SRR2105451 2 0.829 0.017210 0.316 0.328 0.004 0.096 0.080 0.176
#> SRR2105452 2 0.997 -0.114733 0.168 0.200 0.160 0.160 0.148 0.164
#> SRR2105449 1 0.867 0.265690 0.368 0.140 0.240 0.056 0.164 0.032
#> SRR2105450 4 0.949 0.112335 0.132 0.204 0.112 0.280 0.204 0.068
#> SRR2105447 2 0.611 0.342840 0.120 0.640 0.000 0.140 0.020 0.080
#> SRR2105448 2 0.837 0.101971 0.300 0.376 0.044 0.144 0.040 0.096
#> SRR2105445 4 0.900 0.072954 0.160 0.260 0.024 0.296 0.168 0.092
#> SRR2105446 4 0.797 0.091317 0.120 0.192 0.000 0.348 0.300 0.040
#> SRR2105443 2 0.855 0.119451 0.128 0.348 0.000 0.216 0.124 0.184
#> SRR2105444 2 0.754 -0.083133 0.132 0.400 0.000 0.340 0.072 0.056
#> SRR2105441 5 0.831 -0.095213 0.260 0.240 0.004 0.148 0.308 0.040
#> SRR2105442 2 0.684 0.274429 0.192 0.592 0.016 0.096 0.056 0.048
#> SRR2105437 6 0.673 -0.035354 0.028 0.020 0.396 0.036 0.068 0.452
#> SRR2105438 3 0.632 0.141839 0.024 0.020 0.448 0.016 0.064 0.428
#> SRR2105435 1 0.847 0.123878 0.352 0.316 0.036 0.124 0.120 0.052
#> SRR2105436 4 0.752 0.186208 0.056 0.104 0.060 0.504 0.252 0.024
#> SRR2105433 3 0.885 -0.138185 0.284 0.204 0.308 0.092 0.060 0.052
#> SRR2105434 1 0.957 0.264135 0.300 0.132 0.088 0.192 0.164 0.124
#> SRR2105431 1 0.976 -0.046906 0.228 0.096 0.204 0.112 0.168 0.192
#> SRR2105432 5 0.846 0.006737 0.124 0.008 0.292 0.068 0.324 0.184
#> SRR2105429 6 0.821 0.214262 0.140 0.248 0.100 0.072 0.016 0.424
#> SRR2105430 2 0.739 0.246771 0.036 0.452 0.044 0.192 0.008 0.268
#> SRR2105427 2 0.843 -0.046235 0.152 0.372 0.000 0.224 0.124 0.128
#> SRR2105428 2 0.747 0.191541 0.180 0.472 0.008 0.232 0.024 0.084
#> SRR2105425 2 0.742 0.201516 0.208 0.496 0.000 0.060 0.072 0.164
#> SRR2105426 2 0.829 0.163438 0.244 0.452 0.088 0.076 0.072 0.068
#> SRR2105421 5 0.848 -0.080574 0.280 0.164 0.004 0.124 0.336 0.092
#> SRR2105422 5 0.694 0.364194 0.116 0.016 0.032 0.116 0.596 0.124
#> SRR2105423 2 0.924 -0.119375 0.244 0.272 0.112 0.056 0.088 0.228
#> SRR2105424 4 0.805 0.047906 0.104 0.272 0.000 0.400 0.132 0.092
#> SRR2105419 5 0.732 0.268294 0.212 0.024 0.028 0.144 0.528 0.064
#> SRR2105420 5 0.802 0.249216 0.228 0.088 0.016 0.176 0.440 0.052
#> SRR2105415 1 0.935 0.087684 0.256 0.200 0.216 0.200 0.056 0.072
#> SRR2105416 5 0.821 0.276437 0.164 0.048 0.152 0.140 0.464 0.032
#> SRR2105417 1 0.860 0.133574 0.332 0.060 0.028 0.120 0.304 0.156
#> SRR2105418 1 0.918 0.251460 0.328 0.244 0.108 0.068 0.160 0.092
#> SRR2105413 2 0.712 0.202749 0.124 0.504 0.000 0.260 0.048 0.064
#> SRR2105414 4 0.658 -0.101362 0.060 0.400 0.000 0.444 0.028 0.068
#> SRR2105409 2 0.817 0.076380 0.224 0.400 0.104 0.056 0.008 0.208
#> SRR2105410 4 0.840 0.014714 0.040 0.196 0.208 0.376 0.016 0.164
#> SRR2105411 1 0.819 0.203265 0.400 0.224 0.016 0.140 0.188 0.032
#> SRR2105412 2 0.767 0.166706 0.304 0.428 0.008 0.136 0.080 0.044
#> SRR2105407 5 0.856 0.201112 0.168 0.096 0.032 0.240 0.392 0.072
#> SRR2105408 4 0.666 0.186764 0.048 0.104 0.000 0.516 0.300 0.032
#> SRR2105403 5 0.706 0.098338 0.048 0.112 0.000 0.320 0.468 0.052
#> SRR2105404 5 0.705 0.216505 0.032 0.064 0.000 0.280 0.488 0.136
#> SRR2105405 5 0.761 0.231252 0.164 0.056 0.000 0.160 0.492 0.128
#> SRR2105406 5 0.824 -0.017993 0.088 0.212 0.000 0.200 0.388 0.112
#> SRR2105401 5 0.838 -0.138858 0.164 0.176 0.008 0.300 0.308 0.044
#> SRR2105402 2 0.997 -0.114733 0.168 0.200 0.160 0.160 0.148 0.164
#> SRR2105399 2 0.612 0.225554 0.104 0.544 0.004 0.312 0.016 0.020
#> SRR2105400 2 0.651 0.232377 0.084 0.504 0.000 0.332 0.020 0.060
#> SRR2105397 6 0.792 0.300028 0.092 0.112 0.080 0.084 0.088 0.544
#> SRR2105398 6 0.882 -0.095929 0.068 0.224 0.012 0.232 0.192 0.272
#> SRR2105395 3 0.862 0.106902 0.248 0.064 0.376 0.060 0.192 0.060
#> SRR2105396 2 0.636 0.344604 0.196 0.604 0.004 0.120 0.020 0.056
#> SRR2105393 2 0.854 0.097884 0.204 0.344 0.000 0.164 0.192 0.096
#> SRR2105394 2 0.783 0.272269 0.120 0.456 0.024 0.132 0.024 0.244
#> SRR2105389 5 0.712 0.321341 0.092 0.028 0.052 0.200 0.572 0.056
#> SRR2105390 6 0.836 0.218250 0.084 0.036 0.180 0.060 0.212 0.428
#> SRR2105391 5 0.527 0.366097 0.068 0.008 0.004 0.080 0.716 0.124
#> SRR2105392 5 0.759 0.209824 0.028 0.020 0.052 0.172 0.424 0.304
#> SRR2105385 3 0.802 0.241763 0.076 0.012 0.440 0.108 0.260 0.104
#> SRR2105386 5 0.913 0.132015 0.132 0.052 0.276 0.156 0.300 0.084
#> SRR2105387 1 0.917 0.106165 0.292 0.208 0.036 0.204 0.176 0.084
#> SRR2105388 2 0.716 0.253865 0.092 0.476 0.004 0.292 0.020 0.116
#> SRR2105381 2 0.889 0.047396 0.156 0.344 0.040 0.096 0.100 0.264
#> SRR2105382 2 0.822 0.106678 0.084 0.436 0.228 0.096 0.016 0.140
#> SRR2105383 2 0.734 0.285277 0.192 0.504 0.000 0.180 0.064 0.060
#> SRR2105384 2 0.526 0.306603 0.036 0.676 0.000 0.216 0.016 0.056
#> SRR2105379 6 0.833 0.237186 0.092 0.244 0.192 0.028 0.048 0.396
#> SRR2105380 3 0.532 0.519475 0.096 0.024 0.740 0.032 0.032 0.076
#> SRR2105377 1 0.831 0.066501 0.356 0.124 0.016 0.144 0.308 0.052
#> SRR2105378 6 0.984 -0.060115 0.152 0.172 0.092 0.204 0.172 0.208
#> SRR2105375 2 0.833 0.060164 0.272 0.380 0.020 0.176 0.056 0.096
#> SRR2105376 4 0.861 0.193820 0.172 0.196 0.000 0.320 0.216 0.096
#> SRR2105373 5 0.668 0.359512 0.092 0.008 0.044 0.084 0.612 0.160
#> SRR2105374 3 0.673 0.216097 0.032 0.028 0.476 0.020 0.076 0.368
#> SRR2105371 5 0.796 0.217527 0.176 0.056 0.004 0.140 0.452 0.172
#> SRR2105372 5 0.796 0.240912 0.148 0.080 0.004 0.136 0.472 0.160
#> SRR2105369 5 0.812 0.145543 0.120 0.088 0.016 0.248 0.440 0.088
#> SRR2105370 4 0.849 0.161572 0.124 0.140 0.000 0.372 0.188 0.176
#> SRR2105367 6 0.920 -0.029153 0.144 0.196 0.024 0.156 0.180 0.300
#> SRR2105368 6 0.971 -0.084126 0.212 0.168 0.072 0.152 0.164 0.232
#> SRR2105365 3 0.533 0.492614 0.060 0.100 0.732 0.040 0.004 0.064
#> SRR2105366 3 0.317 0.512614 0.032 0.012 0.872 0.020 0.012 0.052
#> SRR2105363 4 0.805 0.086869 0.144 0.268 0.000 0.360 0.188 0.040
#> SRR2105364 2 0.721 0.296437 0.136 0.536 0.000 0.188 0.072 0.068
#> SRR2105361 6 0.867 -0.097942 0.096 0.224 0.000 0.256 0.160 0.264
#> SRR2105362 5 0.826 0.166243 0.224 0.092 0.008 0.204 0.396 0.076
#> SRR2105359 6 0.865 -0.062499 0.080 0.224 0.000 0.232 0.200 0.264
#> SRR2105360 5 0.839 0.228291 0.188 0.048 0.016 0.160 0.396 0.192
#> SRR2105355 5 0.523 0.336639 0.200 0.016 0.000 0.044 0.688 0.052
#> SRR2105356 5 0.864 0.036479 0.124 0.200 0.004 0.196 0.352 0.124
#> SRR2105353 6 0.786 0.077461 0.096 0.004 0.288 0.044 0.168 0.400
#> SRR2105354 3 0.786 0.167626 0.056 0.004 0.432 0.104 0.264 0.140
#> SRR2105351 6 0.928 0.020807 0.212 0.084 0.224 0.044 0.168 0.268
#> SRR2105352 2 0.997 -0.114733 0.168 0.200 0.160 0.160 0.148 0.164
#> SRR2105349 2 0.933 0.048767 0.168 0.308 0.160 0.216 0.080 0.068
#> SRR2105350 2 0.571 0.291239 0.092 0.620 0.000 0.244 0.012 0.032
#> SRR2105345 1 0.831 0.074645 0.364 0.276 0.004 0.152 0.132 0.072
#> SRR2105346 2 0.759 0.218102 0.248 0.444 0.000 0.176 0.092 0.040
#> SRR2105347 2 0.744 0.277996 0.200 0.520 0.016 0.120 0.028 0.116
#> SRR2105348 2 0.684 0.324049 0.200 0.544 0.000 0.168 0.052 0.036
#> SRR2105343 2 0.897 0.035389 0.164 0.376 0.160 0.068 0.056 0.176
#> SRR2105344 2 0.723 0.305212 0.188 0.484 0.000 0.232 0.044 0.052
#> SRR2105341 5 0.636 0.286379 0.048 0.008 0.020 0.312 0.544 0.068
#> SRR2105342 4 0.654 0.006757 0.056 0.088 0.004 0.472 0.368 0.012
#> SRR2105339 5 0.954 0.085837 0.212 0.080 0.108 0.124 0.272 0.204
#> SRR2105340 5 0.835 0.211517 0.076 0.020 0.200 0.088 0.416 0.200
#> SRR2105335 6 0.769 0.325535 0.048 0.028 0.180 0.060 0.180 0.504
#> SRR2105336 6 0.800 0.208179 0.032 0.084 0.044 0.184 0.184 0.472
#> SRR2105337 6 0.859 0.125487 0.052 0.088 0.288 0.076 0.116 0.380
#> SRR2105338 4 0.904 0.076137 0.056 0.104 0.216 0.368 0.144 0.112
#> SRR2105331 3 0.675 0.403547 0.184 0.060 0.584 0.016 0.020 0.136
#> SRR2105332 3 0.725 0.282496 0.144 0.204 0.532 0.032 0.012 0.076
#> SRR2105333 2 0.812 0.174422 0.140 0.444 0.132 0.204 0.008 0.072
#> SRR2105334 2 0.662 0.215311 0.084 0.480 0.008 0.360 0.016 0.052
#> SRR2105329 4 0.791 0.204503 0.116 0.152 0.000 0.428 0.240 0.064
#> SRR2105330 4 0.731 0.209715 0.036 0.332 0.004 0.416 0.168 0.044
#> SRR2105327 2 0.896 0.146128 0.116 0.352 0.124 0.260 0.052 0.096
#> SRR2105328 4 0.879 -0.066333 0.108 0.288 0.100 0.332 0.028 0.144
#> SRR2105325 3 0.435 0.381101 0.004 0.000 0.648 0.004 0.024 0.320
#> SRR2105326 3 0.447 0.350330 0.008 0.000 0.624 0.004 0.020 0.344
#> SRR2105323 5 0.676 0.295626 0.156 0.016 0.000 0.188 0.552 0.088
#> SRR2105324 4 0.792 0.047349 0.152 0.136 0.000 0.352 0.320 0.040
#> SRR2105319 3 0.793 0.199788 0.056 0.024 0.440 0.068 0.136 0.276
#> SRR2105320 3 0.734 0.157817 0.052 0.016 0.460 0.044 0.104 0.324
#> SRR2105321 3 0.543 0.292024 0.064 0.000 0.548 0.000 0.028 0.360
#> SRR2105322 3 0.389 0.444151 0.028 0.000 0.744 0.004 0.004 0.220
#> SRR2105317 2 0.528 0.326058 0.116 0.704 0.000 0.124 0.012 0.044
#> SRR2105318 2 0.757 0.230158 0.196 0.496 0.000 0.120 0.064 0.124
#> SRR2105315 2 0.792 -0.083205 0.092 0.392 0.000 0.264 0.196 0.056
#> SRR2105316 4 0.785 -0.026550 0.116 0.352 0.000 0.360 0.092 0.080
#> SRR2105313 2 0.755 0.070357 0.120 0.468 0.000 0.220 0.156 0.036
#> SRR2105314 2 0.858 -0.000770 0.132 0.304 0.000 0.272 0.180 0.112
#> SRR2105311 3 0.238 0.508167 0.040 0.000 0.896 0.000 0.008 0.056
#> SRR2105312 3 0.209 0.509780 0.024 0.016 0.920 0.004 0.000 0.036
#> SRR2105307 5 0.692 0.301359 0.232 0.032 0.012 0.168 0.528 0.028
#> SRR2105308 2 0.806 -0.161870 0.164 0.312 0.008 0.308 0.192 0.016
#> SRR2105309 4 0.723 0.265537 0.048 0.256 0.000 0.500 0.108 0.088
#> SRR2105310 4 0.779 0.119250 0.076 0.152 0.000 0.392 0.312 0.068
#> SRR2105305 4 0.723 0.050161 0.040 0.084 0.004 0.440 0.348 0.084
#> SRR2105306 5 0.869 -0.024330 0.156 0.124 0.008 0.276 0.320 0.116
#> SRR2105303 2 0.864 0.074407 0.160 0.348 0.012 0.124 0.096 0.260
#> SRR2105304 2 0.968 -0.017502 0.144 0.300 0.156 0.132 0.124 0.144
#> SRR2105301 6 0.944 0.094369 0.092 0.060 0.160 0.232 0.204 0.252
#> SRR2105302 2 0.832 0.239085 0.136 0.376 0.020 0.256 0.036 0.176
#> SRR2105299 5 0.842 -0.093537 0.100 0.024 0.228 0.040 0.312 0.296
#> SRR2105300 2 0.863 0.036865 0.112 0.404 0.048 0.240 0.068 0.128
#> SRR2105297 2 0.885 -0.075571 0.188 0.316 0.260 0.148 0.040 0.048
#> SRR2105298 2 0.791 0.285287 0.156 0.460 0.012 0.220 0.052 0.100
#> SRR2105295 1 0.891 0.269748 0.368 0.180 0.076 0.040 0.192 0.144
#> SRR2105296 2 0.841 0.019514 0.192 0.348 0.120 0.064 0.008 0.268
#> SRR2105293 3 0.902 -0.000464 0.172 0.100 0.356 0.076 0.068 0.228
#> SRR2105294 3 0.588 0.498885 0.104 0.016 0.692 0.024 0.096 0.068
#> SRR2105291 5 0.781 0.302864 0.180 0.056 0.028 0.060 0.492 0.184
#> SRR2105292 5 0.829 0.230001 0.100 0.020 0.256 0.168 0.400 0.056
#> SRR2105289 2 0.839 -0.134923 0.148 0.316 0.000 0.252 0.220 0.064
#> SRR2105290 5 0.836 0.073282 0.080 0.156 0.012 0.276 0.376 0.100
#> SRR2105287 2 0.790 0.077741 0.224 0.440 0.000 0.100 0.160 0.076
#> SRR2105288 1 0.906 0.091294 0.332 0.140 0.040 0.196 0.208 0.084
#> SRR2105285 4 0.839 0.029814 0.128 0.248 0.000 0.336 0.080 0.208
#> SRR2105286 2 0.740 0.253964 0.188 0.496 0.020 0.204 0.016 0.076
#> SRR2105283 2 0.705 0.241885 0.188 0.516 0.004 0.048 0.032 0.212
#> SRR2105284 2 0.874 -0.145428 0.188 0.280 0.008 0.268 0.180 0.076
#> SRR2105281 2 0.686 0.149263 0.264 0.524 0.000 0.088 0.028 0.096
#> SRR2105282 2 0.741 0.284366 0.208 0.504 0.012 0.172 0.072 0.032
#> SRR2105259 5 0.817 0.151122 0.124 0.076 0.000 0.232 0.396 0.172
#> SRR2105260 4 0.792 0.238128 0.104 0.152 0.000 0.448 0.212 0.084
#> SRR2105279 2 0.782 0.191120 0.248 0.448 0.004 0.128 0.056 0.116
#> SRR2105280 2 0.621 0.333849 0.172 0.612 0.000 0.112 0.008 0.096
#> SRR2105257 5 0.908 0.091769 0.184 0.048 0.228 0.108 0.336 0.096
#> SRR2105258 3 0.719 0.317196 0.112 0.020 0.488 0.016 0.292 0.072
#> SRR2105253 2 0.859 0.149250 0.156 0.368 0.048 0.144 0.032 0.252
#> SRR2105254 2 0.753 0.257264 0.100 0.528 0.072 0.216 0.028 0.056
#> SRR2105255 5 0.760 0.300861 0.116 0.020 0.012 0.180 0.476 0.196
#> SRR2105256 4 0.842 0.179232 0.068 0.240 0.000 0.284 0.272 0.136
#> SRR2105251 6 0.727 -0.045941 0.128 0.384 0.040 0.052 0.004 0.392
#> SRR2105252 6 0.854 0.066649 0.176 0.220 0.016 0.052 0.172 0.364
#> SRR2105249 2 0.682 0.220186 0.216 0.536 0.000 0.044 0.036 0.168
#> SRR2105250 2 0.739 -0.001428 0.148 0.404 0.000 0.320 0.112 0.016
#> SRR2105247 6 0.813 0.102496 0.096 0.340 0.120 0.064 0.016 0.364
#> SRR2105248 3 0.622 0.182147 0.064 0.040 0.460 0.004 0.016 0.416
#> SRR2105245 3 0.658 0.055285 0.136 0.028 0.416 0.008 0.008 0.404
#> SRR2105246 6 0.914 0.068488 0.120 0.028 0.180 0.132 0.264 0.276
#> SRR2105243 6 0.896 -0.089828 0.212 0.212 0.004 0.128 0.184 0.260
#> SRR2105244 3 0.936 -0.065831 0.164 0.120 0.304 0.224 0.132 0.056
#> SRR2105241 3 0.926 -0.020467 0.236 0.060 0.264 0.072 0.236 0.132
#> SRR2105242 3 0.742 0.277553 0.120 0.080 0.528 0.020 0.040 0.212
#> SRR2105239 6 0.835 0.250699 0.136 0.108 0.188 0.032 0.080 0.456
#> SRR2105240 3 0.865 0.160909 0.240 0.068 0.408 0.076 0.132 0.076
#> SRR2105237 4 0.966 -0.084130 0.180 0.180 0.132 0.276 0.148 0.084
#> SRR2105238 4 0.791 0.262050 0.152 0.232 0.000 0.420 0.148 0.048
#> SRR2105235 5 0.854 -0.131786 0.200 0.248 0.000 0.220 0.268 0.064
#> SRR2105236 2 0.644 0.263888 0.156 0.600 0.000 0.148 0.076 0.020
#> SRR2105233 6 0.779 0.011175 0.092 0.332 0.020 0.140 0.024 0.392
#> SRR2105234 2 0.742 0.255287 0.140 0.480 0.036 0.272 0.016 0.056
#> SRR2105231 2 0.706 0.294653 0.128 0.524 0.028 0.100 0.000 0.220
#> SRR2105232 2 0.838 0.061025 0.264 0.396 0.040 0.060 0.068 0.172
#> SRR2105227 5 0.874 0.075851 0.240 0.052 0.064 0.092 0.376 0.176
#> SRR2105228 5 0.848 0.142471 0.120 0.152 0.000 0.180 0.376 0.172
#> SRR2105225 5 0.784 0.279251 0.084 0.056 0.012 0.192 0.472 0.184
#> SRR2105226 6 0.746 0.020897 0.028 0.092 0.004 0.128 0.336 0.412
#> SRR2105229 6 0.759 0.075750 0.076 0.028 0.036 0.108 0.268 0.484
#> SRR2105230 5 0.672 0.262489 0.104 0.032 0.008 0.220 0.576 0.060
#> SRR2105219 2 0.730 0.299771 0.164 0.560 0.020 0.128 0.044 0.084
#> SRR2105220 4 0.832 0.100494 0.172 0.248 0.000 0.312 0.220 0.048
#> SRR2105221 2 0.896 -0.070675 0.276 0.300 0.032 0.176 0.080 0.136
#> SRR2105222 2 0.822 0.120202 0.136 0.396 0.060 0.304 0.064 0.040
#> SRR2105223 5 0.777 0.255489 0.092 0.004 0.156 0.072 0.480 0.196
#> SRR2105224 3 0.840 -0.027513 0.116 0.032 0.356 0.132 0.316 0.048
#> SRR2105217 3 0.693 0.250845 0.148 0.072 0.508 0.008 0.008 0.256
#> SRR2105218 2 0.820 -0.049699 0.156 0.332 0.236 0.024 0.008 0.244
#> SRR2105215 2 0.821 0.084600 0.328 0.328 0.004 0.172 0.092 0.076
#> SRR2105216 2 0.635 0.228087 0.084 0.512 0.000 0.340 0.028 0.036
#> SRR2105213 3 0.843 0.170843 0.236 0.056 0.412 0.044 0.172 0.080
#> SRR2105214 1 0.946 -0.018208 0.252 0.132 0.252 0.064 0.108 0.192
#> SRR2105211 4 0.901 0.148170 0.124 0.164 0.028 0.308 0.264 0.112
#> SRR2105212 4 0.787 0.251784 0.108 0.192 0.000 0.424 0.224 0.052
#> SRR2105209 2 0.931 -0.185332 0.196 0.228 0.020 0.164 0.212 0.180
#> SRR2105210 3 0.964 -0.240313 0.172 0.128 0.276 0.208 0.096 0.120
#> SRR2105207 3 0.931 -0.121786 0.204 0.100 0.316 0.204 0.076 0.100
#> SRR2105208 2 0.939 -0.067441 0.060 0.272 0.204 0.216 0.084 0.164
#> SRR2105205 3 0.450 0.518086 0.068 0.032 0.788 0.020 0.008 0.084
#> SRR2105206 3 0.422 0.517016 0.052 0.040 0.812 0.044 0.004 0.048
#> SRR2105201 5 0.868 -0.168225 0.144 0.216 0.000 0.236 0.292 0.112
#> SRR2105202 2 0.768 -0.133396 0.176 0.360 0.000 0.320 0.124 0.020
#> SRR2105203 2 0.905 -0.079455 0.256 0.260 0.076 0.100 0.048 0.260
#> SRR2105204 2 0.614 0.256755 0.188 0.568 0.000 0.048 0.000 0.196
#> SRR2105199 1 0.851 0.031344 0.312 0.276 0.000 0.180 0.100 0.132
#> SRR2105200 2 0.868 0.094980 0.212 0.372 0.024 0.204 0.088 0.100
#> SRR2105197 6 0.887 -0.027053 0.192 0.108 0.008 0.160 0.236 0.296
#> SRR2105198 6 0.804 0.308927 0.040 0.104 0.052 0.188 0.124 0.492
#> SRR2105195 3 0.705 0.424994 0.184 0.048 0.584 0.056 0.028 0.100
#> SRR2105196 3 0.733 0.359682 0.096 0.032 0.560 0.180 0.096 0.036
#> SRR2105193 1 0.898 0.186983 0.308 0.224 0.200 0.096 0.020 0.152
#> SRR2105194 3 0.496 0.508172 0.140 0.008 0.744 0.024 0.040 0.044
#> SRR2105191 6 0.901 0.135342 0.108 0.028 0.232 0.104 0.232 0.296
#> SRR2105192 5 0.818 0.081883 0.084 0.112 0.000 0.272 0.376 0.156
#> SRR2105189 2 0.855 0.000562 0.244 0.332 0.032 0.256 0.056 0.080
#> SRR2105190 2 0.643 0.257727 0.116 0.556 0.024 0.272 0.012 0.020
#> SRR2105187 3 0.610 0.250842 0.040 0.012 0.540 0.028 0.032 0.348
#> SRR2105188 6 0.911 0.272229 0.080 0.092 0.224 0.168 0.084 0.352
#> SRR2105179 3 0.912 -0.107151 0.172 0.160 0.272 0.100 0.028 0.268
#> SRR2105180 3 0.633 0.478260 0.080 0.008 0.660 0.084 0.104 0.064
#> SRR2105183 2 0.879 0.127497 0.180 0.316 0.004 0.224 0.148 0.128
#> SRR2105184 2 0.772 0.275090 0.072 0.492 0.084 0.244 0.020 0.088
#> SRR2105185 1 0.907 0.125836 0.292 0.092 0.032 0.128 0.212 0.244
#> SRR2105186 6 0.825 0.230081 0.096 0.232 0.092 0.096 0.032 0.452
#> SRR2105181 5 0.840 0.129962 0.104 0.020 0.096 0.104 0.368 0.308
#> SRR2105182 5 0.746 0.127984 0.044 0.068 0.032 0.364 0.428 0.064
#> SRR2105177 1 0.864 0.230949 0.364 0.160 0.268 0.028 0.088 0.092
#> SRR2105178 3 0.701 0.372480 0.172 0.128 0.580 0.016 0.048 0.056
#> SRR2105171 1 0.871 0.248881 0.380 0.204 0.016 0.120 0.160 0.120
#> SRR2105172 2 0.544 0.326311 0.112 0.696 0.000 0.100 0.008 0.084
#> SRR2105175 3 0.662 0.413271 0.132 0.044 0.600 0.016 0.028 0.180
#> SRR2105176 3 0.647 0.484118 0.144 0.024 0.648 0.060 0.048 0.076
#> SRR2105173 3 0.938 -0.172322 0.252 0.084 0.288 0.148 0.148 0.080
#> SRR2105174 2 0.786 -0.036517 0.248 0.428 0.208 0.036 0.028 0.052
#> SRR2105169 1 0.889 0.252684 0.344 0.232 0.212 0.060 0.088 0.064
#> SRR2105170 2 0.815 0.157410 0.100 0.396 0.120 0.308 0.028 0.048
#> SRR2105167 2 0.753 0.291932 0.180 0.492 0.004 0.196 0.052 0.076
#> SRR2105168 2 0.749 0.296278 0.148 0.484 0.004 0.120 0.028 0.216
#> SRR2105165 3 0.746 0.310499 0.072 0.016 0.496 0.072 0.272 0.072
#> SRR2105166 3 0.310 0.519508 0.044 0.008 0.876 0.012 0.028 0.032
#> SRR2105163 3 0.472 0.513497 0.100 0.008 0.764 0.012 0.084 0.032
#> SRR2105164 3 0.320 0.509192 0.040 0.000 0.852 0.004 0.020 0.084
#> SRR2105161 3 0.732 0.348869 0.112 0.028 0.516 0.020 0.080 0.244
#> SRR2105162 3 0.492 0.519473 0.104 0.008 0.740 0.000 0.076 0.072
#> SRR2105155 4 0.856 0.201184 0.160 0.196 0.012 0.320 0.260 0.052
#> SRR2105156 2 0.697 0.343727 0.148 0.564 0.004 0.168 0.036 0.080
#> SRR2105157 3 0.656 0.417158 0.128 0.080 0.600 0.008 0.016 0.168
#> SRR2105158 3 0.296 0.521617 0.048 0.036 0.876 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105159 3 0.788 0.270812 0.176 0.020 0.472 0.028 0.156 0.148
#> SRR2105160 5 0.868 0.005553 0.172 0.008 0.176 0.076 0.308 0.260
#> SRR2105153 3 0.910 -0.131438 0.200 0.172 0.336 0.088 0.040 0.164
#> SRR2105154 3 0.488 0.507302 0.112 0.040 0.736 0.000 0.008 0.104
#> SRR2105151 2 0.642 0.336768 0.160 0.612 0.000 0.120 0.028 0.080
#> SRR2105152 2 0.620 0.334299 0.184 0.608 0.000 0.144 0.024 0.040
#> SRR2105149 5 0.885 -0.019244 0.192 0.168 0.032 0.276 0.284 0.048
#> SRR2105150 4 0.753 0.289858 0.080 0.236 0.000 0.468 0.164 0.052
#> SRR2105147 6 0.662 0.010979 0.048 0.016 0.376 0.028 0.052 0.480
#> SRR2105148 6 0.781 0.329521 0.080 0.052 0.128 0.096 0.096 0.548
#> SRR2105143 1 0.917 0.024274 0.296 0.084 0.124 0.212 0.236 0.048
#> SRR2105144 4 0.818 0.076652 0.136 0.304 0.000 0.356 0.112 0.092
#> SRR2105145 3 0.517 0.515171 0.112 0.032 0.736 0.020 0.012 0.088
#> SRR2105146 3 0.373 0.467095 0.024 0.004 0.784 0.004 0.008 0.176
#> SRR2105141 3 0.277 0.517237 0.048 0.008 0.888 0.008 0.008 0.040
#> SRR2105142 3 0.639 0.418618 0.124 0.168 0.616 0.024 0.004 0.064
#> SRR2105139 2 0.749 0.324113 0.148 0.476 0.008 0.184 0.012 0.172
#> SRR2105140 2 0.718 0.213535 0.092 0.428 0.004 0.360 0.028 0.088
#> SRR2105137 2 0.876 -0.048153 0.156 0.288 0.004 0.256 0.196 0.100
#> SRR2105138 5 0.901 0.044390 0.172 0.184 0.052 0.208 0.332 0.052
#> SRR2105135 5 0.865 -0.114259 0.252 0.200 0.004 0.108 0.316 0.120
#> SRR2105136 2 0.792 0.155397 0.316 0.396 0.004 0.112 0.076 0.096
#> SRR2105133 5 0.663 0.251660 0.108 0.064 0.004 0.232 0.568 0.024
#> SRR2105134 5 0.721 0.108150 0.064 0.076 0.000 0.332 0.452 0.076
#> SRR2105131 5 0.882 0.002552 0.152 0.136 0.016 0.260 0.328 0.108
#> SRR2105132 5 0.650 0.304585 0.148 0.044 0.012 0.176 0.600 0.020
#> SRR2105129 5 0.816 0.067893 0.304 0.032 0.180 0.064 0.376 0.044
#> SRR2105130 5 0.903 -0.020172 0.228 0.068 0.248 0.100 0.300 0.056
#> SRR2105127 5 0.664 0.235186 0.280 0.032 0.004 0.084 0.544 0.056
#> SRR2105128 5 0.860 -0.121893 0.124 0.244 0.000 0.256 0.272 0.104
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.486 0.900 0.907 0.1461 0.959 0.959
#> 3 3 0.145 0.637 0.739 1.8932 0.545 0.525
#> 4 4 0.121 0.562 0.714 0.2150 0.938 0.881
#> 5 5 0.141 0.612 0.723 0.1805 0.890 0.782
#> 6 6 0.260 0.539 0.703 0.0979 0.962 0.910
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.6438 0.894 0.836 0.164
#> SRR2105278 1 0.6712 0.888 0.824 0.176
#> SRR2105275 1 0.9358 0.650 0.648 0.352
#> SRR2105276 1 0.8813 0.738 0.700 0.300
#> SRR2105273 1 0.6801 0.884 0.820 0.180
#> SRR2105274 1 0.6531 0.894 0.832 0.168
#> SRR2105271 1 0.5842 0.904 0.860 0.140
#> SRR2105272 1 0.5408 0.907 0.876 0.124
#> SRR2105269 1 0.0938 0.914 0.988 0.012
#> SRR2105270 1 0.1414 0.915 0.980 0.020
#> SRR2105267 1 0.1184 0.913 0.984 0.016
#> SRR2105268 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105265 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105266 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105263 1 0.0672 0.918 0.992 0.008
#> SRR2105264 1 0.0938 0.919 0.988 0.012
#> SRR2105261 1 0.8081 0.824 0.752 0.248
#> SRR2105262 1 0.7950 0.829 0.760 0.240
#> SRR2105357 1 0.6801 0.888 0.820 0.180
#> SRR2105358 1 0.6531 0.896 0.832 0.168
#> SRR2105439 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105440 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105509 1 0.3114 0.915 0.944 0.056
#> SRR2105510 1 0.2603 0.918 0.956 0.044
#> SRR2105507 1 0.6438 0.895 0.836 0.164
#> SRR2105508 1 0.6973 0.881 0.812 0.188
#> SRR2105505 1 0.5519 0.907 0.872 0.128
#> SRR2105506 1 0.4815 0.917 0.896 0.104
#> SRR2105503 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105504 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105501 1 0.1633 0.918 0.976 0.024
#> SRR2105502 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105499 1 0.6623 0.899 0.828 0.172
#> SRR2105500 1 0.6048 0.906 0.852 0.148
#> SRR2105497 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105498 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105495 1 0.1414 0.918 0.980 0.020
#> SRR2105496 1 0.1843 0.921 0.972 0.028
#> SRR2105493 1 0.1633 0.921 0.976 0.024
#> SRR2105494 1 0.2043 0.920 0.968 0.032
#> SRR2105491 1 0.1414 0.918 0.980 0.020
#> SRR2105492 1 0.1414 0.918 0.980 0.020
#> SRR2105489 1 0.0672 0.917 0.992 0.008
#> SRR2105490 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105487 1 0.5737 0.909 0.864 0.136
#> SRR2105488 1 0.5737 0.909 0.864 0.136
#> SRR2105485 1 0.6343 0.899 0.840 0.160
#> SRR2105486 1 0.6048 0.905 0.852 0.148
#> SRR2105483 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105484 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105481 1 0.6247 0.901 0.844 0.156
#> SRR2105482 1 0.4815 0.916 0.896 0.104
#> SRR2105479 1 0.6438 0.897 0.836 0.164
#> SRR2105480 1 0.5059 0.918 0.888 0.112
#> SRR2105477 1 0.1843 0.918 0.972 0.028
#> SRR2105478 1 0.1843 0.918 0.972 0.028
#> SRR2105475 1 0.2423 0.921 0.960 0.040
#> SRR2105476 1 0.2236 0.919 0.964 0.036
#> SRR2105473 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105474 1 0.1184 0.917 0.984 0.016
#> SRR2105471 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105472 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105469 1 0.6973 0.880 0.812 0.188
#> SRR2105470 1 0.6148 0.902 0.848 0.152
#> SRR2105467 1 0.5842 0.906 0.860 0.140
#> SRR2105468 1 0.5294 0.914 0.880 0.120
#> SRR2105465 1 0.4815 0.918 0.896 0.104
#> SRR2105466 1 0.4022 0.922 0.920 0.080
#> SRR2105463 1 0.3584 0.922 0.932 0.068
#> SRR2105464 1 0.3584 0.922 0.932 0.068
#> SRR2105461 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105462 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105459 1 0.1633 0.917 0.976 0.024
#> SRR2105460 1 0.0672 0.917 0.992 0.008
#> SRR2105457 1 0.6712 0.888 0.824 0.176
#> SRR2105458 1 0.6973 0.887 0.812 0.188
#> SRR2105455 1 0.5842 0.910 0.860 0.140
#> SRR2105456 1 0.6148 0.903 0.848 0.152
#> SRR2105453 1 0.5059 0.914 0.888 0.112
#> SRR2105454 1 0.5059 0.915 0.888 0.112
#> SRR2105451 1 0.2423 0.923 0.960 0.040
#> SRR2105452 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105449 1 0.4815 0.919 0.896 0.104
#> SRR2105450 1 0.4939 0.917 0.892 0.108
#> SRR2105447 1 0.2423 0.923 0.960 0.040
#> SRR2105448 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105445 1 0.5294 0.920 0.880 0.120
#> SRR2105446 1 0.4431 0.922 0.908 0.092
#> SRR2105443 1 0.6148 0.907 0.848 0.152
#> SRR2105444 1 0.4690 0.922 0.900 0.100
#> SRR2105441 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105442 1 0.0672 0.916 0.992 0.008
#> SRR2105437 1 0.7139 0.870 0.804 0.196
#> SRR2105438 1 0.7139 0.870 0.804 0.196
#> SRR2105435 1 0.5294 0.915 0.880 0.120
#> SRR2105436 1 0.6343 0.896 0.840 0.160
#> SRR2105433 1 0.4022 0.921 0.920 0.080
#> SRR2105434 1 0.3584 0.922 0.932 0.068
#> SRR2105431 1 0.4298 0.919 0.912 0.088
#> SRR2105432 1 0.4815 0.916 0.896 0.104
#> SRR2105429 1 0.5059 0.917 0.888 0.112
#> SRR2105430 1 0.4690 0.916 0.900 0.100
#> SRR2105427 1 0.1633 0.915 0.976 0.024
#> SRR2105428 1 0.2043 0.918 0.968 0.032
#> SRR2105425 1 0.2043 0.920 0.968 0.032
#> SRR2105426 1 0.1184 0.918 0.984 0.016
#> SRR2105421 1 0.7139 0.874 0.804 0.196
#> SRR2105422 1 0.7299 0.868 0.796 0.204
#> SRR2105423 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105424 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105419 1 0.6343 0.903 0.840 0.160
#> SRR2105420 1 0.5946 0.908 0.856 0.144
#> SRR2105415 1 0.4161 0.920 0.916 0.084
#> SRR2105416 1 0.3431 0.922 0.936 0.064
#> SRR2105417 1 0.4562 0.917 0.904 0.096
#> SRR2105418 1 0.3584 0.922 0.932 0.068
#> SRR2105413 1 0.2778 0.915 0.952 0.048
#> SRR2105414 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105409 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105410 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105411 1 0.1184 0.918 0.984 0.016
#> SRR2105412 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105407 1 0.7139 0.875 0.804 0.196
#> SRR2105408 1 0.7056 0.878 0.808 0.192
#> SRR2105403 1 0.6623 0.889 0.828 0.172
#> SRR2105404 1 0.6712 0.887 0.824 0.176
#> SRR2105405 1 0.5519 0.910 0.872 0.128
#> SRR2105406 1 0.4939 0.917 0.892 0.108
#> SRR2105401 1 0.4815 0.918 0.896 0.104
#> SRR2105402 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105399 1 0.7299 0.864 0.796 0.204
#> SRR2105400 1 0.7056 0.877 0.808 0.192
#> SRR2105397 1 0.8608 0.742 0.716 0.284
#> SRR2105398 1 0.8608 0.742 0.716 0.284
#> SRR2105395 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105396 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105393 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105394 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105389 1 0.8081 0.822 0.752 0.248
#> SRR2105390 1 0.7056 0.876 0.808 0.192
#> SRR2105391 1 0.7376 0.863 0.792 0.208
#> SRR2105392 1 0.7376 0.863 0.792 0.208
#> SRR2105385 1 0.5842 0.910 0.860 0.140
#> SRR2105386 1 0.6048 0.900 0.852 0.148
#> SRR2105387 1 0.5737 0.912 0.864 0.136
#> SRR2105388 1 0.6148 0.898 0.848 0.152
#> SRR2105381 1 0.4815 0.917 0.896 0.104
#> SRR2105382 1 0.3114 0.922 0.944 0.056
#> SRR2105383 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105384 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105379 1 0.2603 0.920 0.956 0.044
#> SRR2105380 1 0.2778 0.921 0.952 0.048
#> SRR2105377 1 0.0938 0.915 0.988 0.012
#> SRR2105378 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105375 1 0.5519 0.914 0.872 0.128
#> SRR2105376 1 0.4939 0.919 0.892 0.108
#> SRR2105373 1 0.7139 0.872 0.804 0.196
#> SRR2105374 1 0.7219 0.868 0.800 0.200
#> SRR2105371 1 0.7299 0.866 0.796 0.204
#> SRR2105372 1 0.7376 0.864 0.792 0.208
#> SRR2105369 1 0.6438 0.894 0.836 0.164
#> SRR2105370 1 0.6048 0.900 0.852 0.148
#> SRR2105367 1 0.4815 0.918 0.896 0.104
#> SRR2105368 1 0.5294 0.914 0.880 0.120
#> SRR2105365 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105366 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105363 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105364 1 0.1184 0.916 0.984 0.016
#> SRR2105361 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105362 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105359 1 0.6623 0.895 0.828 0.172
#> SRR2105360 1 0.6623 0.890 0.828 0.172
#> SRR2105355 1 0.6531 0.894 0.832 0.168
#> SRR2105356 1 0.6623 0.891 0.828 0.172
#> SRR2105353 1 0.9129 0.693 0.672 0.328
#> SRR2105354 1 0.7815 0.837 0.768 0.232
#> SRR2105351 1 0.1184 0.913 0.984 0.016
#> SRR2105352 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105349 1 0.2778 0.921 0.952 0.048
#> SRR2105350 1 0.1843 0.921 0.972 0.028
#> SRR2105345 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105346 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105347 1 0.0938 0.917 0.988 0.012
#> SRR2105348 1 0.0938 0.914 0.988 0.012
#> SRR2105343 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105344 1 0.0938 0.915 0.988 0.012
#> SRR2105341 1 0.7139 0.874 0.804 0.196
#> SRR2105342 1 0.7056 0.877 0.808 0.192
#> SRR2105339 1 0.6973 0.881 0.812 0.188
#> SRR2105340 1 0.7056 0.879 0.808 0.192
#> SRR2105335 1 0.5737 0.907 0.864 0.136
#> SRR2105336 1 0.5946 0.904 0.856 0.144
#> SRR2105337 1 0.5519 0.910 0.872 0.128
#> SRR2105338 1 0.6048 0.902 0.852 0.148
#> SRR2105331 1 0.1184 0.918 0.984 0.016
#> SRR2105332 1 0.0000 0.916 1.000 0.000
#> SRR2105333 1 0.2423 0.922 0.960 0.040
#> SRR2105334 1 0.3431 0.917 0.936 0.064
#> SRR2105329 1 0.3879 0.923 0.924 0.076
#> SRR2105330 1 0.3733 0.924 0.928 0.072
#> SRR2105327 1 0.0672 0.916 0.992 0.008
#> SRR2105328 1 0.1633 0.921 0.976 0.024
#> SRR2105325 1 0.9393 0.635 0.644 0.356
#> SRR2105326 1 0.9393 0.635 0.644 0.356
#> SRR2105323 1 0.6623 0.897 0.828 0.172
#> SRR2105324 1 0.6973 0.888 0.812 0.188
#> SRR2105319 1 0.6148 0.901 0.848 0.152
#> SRR2105320 1 0.6148 0.902 0.848 0.152
#> SRR2105321 1 0.9286 0.663 0.656 0.344
#> SRR2105322 1 0.9286 0.663 0.656 0.344
#> SRR2105317 1 0.2423 0.916 0.960 0.040
#> SRR2105318 1 0.1633 0.918 0.976 0.024
#> SRR2105315 1 0.3584 0.924 0.932 0.068
#> SRR2105316 1 0.2423 0.923 0.960 0.040
#> SRR2105313 1 0.1414 0.919 0.980 0.020
#> SRR2105314 1 0.1184 0.916 0.984 0.016
#> SRR2105311 1 0.9087 0.691 0.676 0.324
#> SRR2105312 1 0.9087 0.687 0.676 0.324
#> SRR2105307 1 0.5059 0.916 0.888 0.112
#> SRR2105308 1 0.4939 0.918 0.892 0.108
#> SRR2105309 1 0.7056 0.879 0.808 0.192
#> SRR2105310 1 0.6148 0.903 0.848 0.152
#> SRR2105305 1 0.7056 0.877 0.808 0.192
#> SRR2105306 1 0.6973 0.880 0.812 0.188
#> SRR2105303 1 0.0938 0.915 0.988 0.012
#> SRR2105304 2 0.1184 0.931 0.016 0.984
#> SRR2105301 1 0.2043 0.916 0.968 0.032
#> SRR2105302 1 0.2043 0.916 0.968 0.032
#> SRR2105299 1 0.6438 0.899 0.836 0.164
#> SRR2105300 1 0.4022 0.923 0.920 0.080
#> SRR2105297 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105298 1 0.0938 0.918 0.988 0.012
#> SRR2105295 1 0.2043 0.918 0.968 0.032
#> SRR2105296 1 0.1633 0.917 0.976 0.024
#> SRR2105293 1 0.7453 0.855 0.788 0.212
#> SRR2105294 1 0.6531 0.894 0.832 0.168
#> SRR2105291 1 0.4431 0.922 0.908 0.092
#> SRR2105292 1 0.4431 0.919 0.908 0.092
#> SRR2105289 1 0.6438 0.900 0.836 0.164
#> SRR2105290 1 0.5519 0.908 0.872 0.128
#> SRR2105287 1 0.4690 0.919 0.900 0.100
#> SRR2105288 1 0.3879 0.921 0.924 0.076
#> SRR2105285 1 0.3274 0.917 0.940 0.060
#> SRR2105286 1 0.3274 0.917 0.940 0.060
#> SRR2105283 1 0.3274 0.925 0.940 0.060
#> SRR2105284 1 0.2236 0.923 0.964 0.036
#> SRR2105281 1 0.1184 0.917 0.984 0.016
#> SRR2105282 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105259 1 0.7139 0.875 0.804 0.196
#> SRR2105260 1 0.6973 0.882 0.812 0.188
#> SRR2105279 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105280 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105257 1 0.4815 0.916 0.896 0.104
#> SRR2105258 1 0.4939 0.916 0.892 0.108
#> SRR2105253 1 0.2236 0.919 0.964 0.036
#> SRR2105254 1 0.1633 0.920 0.976 0.024
#> SRR2105255 1 0.6343 0.894 0.840 0.160
#> SRR2105256 1 0.6247 0.896 0.844 0.156
#> SRR2105251 1 0.0938 0.917 0.988 0.012
#> SRR2105252 1 0.0672 0.918 0.992 0.008
#> SRR2105249 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105250 1 0.1414 0.919 0.980 0.020
#> SRR2105247 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105248 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105245 1 0.7602 0.851 0.780 0.220
#> SRR2105246 1 0.7219 0.873 0.800 0.200
#> SRR2105243 1 0.6148 0.898 0.848 0.152
#> SRR2105244 1 0.6148 0.899 0.848 0.152
#> SRR2105241 1 0.5408 0.911 0.876 0.124
#> SRR2105242 1 0.5294 0.911 0.880 0.120
#> SRR2105239 1 0.7376 0.862 0.792 0.208
#> SRR2105240 1 0.5408 0.913 0.876 0.124
#> SRR2105237 1 0.3584 0.921 0.932 0.068
#> SRR2105238 1 0.2778 0.922 0.952 0.048
#> SRR2105235 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105236 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105233 1 0.2423 0.919 0.960 0.040
#> SRR2105234 1 0.2423 0.919 0.960 0.040
#> SRR2105231 1 0.0000 0.916 1.000 0.000
#> SRR2105232 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105227 1 0.6343 0.903 0.840 0.160
#> SRR2105228 1 0.5519 0.916 0.872 0.128
#> SRR2105225 1 0.5842 0.906 0.860 0.140
#> SRR2105226 1 0.5294 0.911 0.880 0.120
#> SRR2105229 1 0.7056 0.879 0.808 0.192
#> SRR2105230 1 0.6623 0.891 0.828 0.172
#> SRR2105219 1 0.1184 0.914 0.984 0.016
#> SRR2105220 1 0.1414 0.917 0.980 0.020
#> SRR2105221 1 0.2043 0.922 0.968 0.032
#> SRR2105222 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105223 1 0.6247 0.898 0.844 0.156
#> SRR2105224 1 0.6148 0.901 0.848 0.152
#> SRR2105217 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105218 1 0.0376 0.917 0.996 0.004
#> SRR2105215 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105216 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105213 1 0.7453 0.857 0.788 0.212
#> SRR2105214 1 0.7299 0.866 0.796 0.204
#> SRR2105211 1 0.6887 0.890 0.816 0.184
#> SRR2105212 1 0.6148 0.901 0.848 0.152
#> SRR2105209 1 0.5629 0.914 0.868 0.132
#> SRR2105210 1 0.4939 0.915 0.892 0.108
#> SRR2105207 1 0.4161 0.922 0.916 0.084
#> SRR2105208 1 0.4022 0.922 0.920 0.080
#> SRR2105205 1 0.1633 0.921 0.976 0.024
#> SRR2105206 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105201 1 0.1843 0.921 0.972 0.028
#> SRR2105202 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105203 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105204 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105199 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105200 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105197 1 0.7376 0.869 0.792 0.208
#> SRR2105198 1 0.7453 0.866 0.788 0.212
#> SRR2105195 1 0.5519 0.915 0.872 0.128
#> SRR2105196 1 0.4431 0.922 0.908 0.092
#> SRR2105193 1 0.4562 0.921 0.904 0.096
#> SRR2105194 1 0.3584 0.923 0.932 0.068
#> SRR2105191 1 0.7299 0.864 0.796 0.204
#> SRR2105192 1 0.4939 0.915 0.892 0.108
#> SRR2105189 1 0.2778 0.924 0.952 0.048
#> SRR2105190 1 0.2423 0.922 0.960 0.040
#> SRR2105187 1 0.4939 0.872 0.892 0.108
#> SRR2105188 1 0.3584 0.924 0.932 0.068
#> SRR2105179 1 0.5737 0.914 0.864 0.136
#> SRR2105180 1 0.4815 0.919 0.896 0.104
#> SRR2105183 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105184 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105185 1 0.2778 0.912 0.952 0.048
#> SRR2105186 1 0.1414 0.920 0.980 0.020
#> SRR2105181 1 0.6712 0.891 0.824 0.176
#> SRR2105182 1 0.6247 0.898 0.844 0.156
#> SRR2105177 1 0.3114 0.922 0.944 0.056
#> SRR2105178 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105171 1 0.0938 0.916 0.988 0.012
#> SRR2105172 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105175 1 0.3431 0.922 0.936 0.064
#> SRR2105176 1 0.4161 0.920 0.916 0.084
#> SRR2105173 1 0.1184 0.919 0.984 0.016
#> SRR2105174 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105169 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105170 1 0.0000 0.916 1.000 0.000
#> SRR2105167 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105168 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105165 1 0.6712 0.889 0.824 0.176
#> SRR2105166 1 0.6531 0.892 0.832 0.168
#> SRR2105163 1 0.9323 0.655 0.652 0.348
#> SRR2105164 1 0.9129 0.673 0.672 0.328
#> SRR2105161 1 0.4022 0.924 0.920 0.080
#> SRR2105162 1 0.4022 0.922 0.920 0.080
#> SRR2105155 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105156 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105157 1 0.0000 0.916 1.000 0.000
#> SRR2105158 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105159 1 0.5737 0.908 0.864 0.136
#> SRR2105160 1 0.4562 0.920 0.904 0.096
#> SRR2105153 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105154 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105151 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105152 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105149 1 0.6712 0.896 0.824 0.176
#> SRR2105150 1 0.6887 0.890 0.816 0.184
#> SRR2105147 2 0.7453 0.727 0.212 0.788
#> SRR2105148 2 0.7453 0.727 0.212 0.788
#> SRR2105143 1 0.4562 0.921 0.904 0.096
#> SRR2105144 1 0.3431 0.924 0.936 0.064
#> SRR2105145 1 0.5059 0.919 0.888 0.112
#> SRR2105146 1 0.4022 0.922 0.920 0.080
#> SRR2105141 1 0.0672 0.917 0.992 0.008
#> SRR2105142 1 0.0672 0.917 0.992 0.008
#> SRR2105139 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105140 1 0.0376 0.915 0.996 0.004
#> SRR2105137 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105138 1 0.0000 0.916 1.000 0.000
#> SRR2105135 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105136 1 0.0672 0.914 0.992 0.008
#> SRR2105133 1 0.6343 0.897 0.840 0.160
#> SRR2105134 1 0.6343 0.897 0.840 0.160
#> SRR2105131 1 0.3584 0.925 0.932 0.068
#> SRR2105132 1 0.2948 0.925 0.948 0.052
#> SRR2105129 1 0.3733 0.923 0.928 0.072
#> SRR2105130 1 0.2043 0.921 0.968 0.032
#> SRR2105127 1 0.4939 0.920 0.892 0.108
#> SRR2105128 1 0.3879 0.924 0.924 0.076
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.6677 0.8193 0.652 0.324 0.024
#> SRR2105278 1 0.6828 0.8163 0.656 0.312 0.032
#> SRR2105275 1 0.8399 0.6763 0.620 0.220 0.160
#> SRR2105276 1 0.8565 0.7234 0.592 0.264 0.144
#> SRR2105273 1 0.6955 0.8271 0.636 0.332 0.032
#> SRR2105274 1 0.7291 0.8319 0.604 0.356 0.040
#> SRR2105271 1 0.7069 0.7989 0.568 0.408 0.024
#> SRR2105272 1 0.6836 0.7354 0.572 0.412 0.016
#> SRR2105269 2 0.1765 0.7786 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105270 2 0.2496 0.7684 0.068 0.928 0.004
#> SRR2105267 2 0.2063 0.7779 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105268 2 0.0747 0.7758 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105265 2 0.0424 0.7735 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105266 2 0.0592 0.7758 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105263 2 0.1636 0.7801 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105264 2 0.1636 0.7799 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105261 1 0.8595 0.7217 0.496 0.404 0.100
#> SRR2105262 1 0.8375 0.7865 0.540 0.368 0.092
#> SRR2105357 1 0.6843 0.8170 0.640 0.332 0.028
#> SRR2105358 1 0.6473 0.8212 0.652 0.332 0.016
#> SRR2105439 2 0.4033 0.7178 0.136 0.856 0.008
#> SRR2105440 2 0.3349 0.7479 0.108 0.888 0.004
#> SRR2105509 2 0.4371 0.7240 0.108 0.860 0.032
#> SRR2105510 2 0.3637 0.7507 0.084 0.892 0.024
#> SRR2105507 1 0.7158 0.8287 0.596 0.372 0.032
#> SRR2105508 1 0.7600 0.8232 0.612 0.328 0.060
#> SRR2105505 1 0.7091 0.7886 0.560 0.416 0.024
#> SRR2105506 1 0.7372 0.6867 0.520 0.448 0.032
#> SRR2105503 2 0.1337 0.7802 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105504 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105501 2 0.3038 0.7563 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105502 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105499 1 0.7838 0.7312 0.488 0.460 0.052
#> SRR2105500 1 0.7585 0.7001 0.484 0.476 0.040
#> SRR2105497 2 0.2625 0.7594 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105498 2 0.1453 0.7801 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105495 2 0.3129 0.7606 0.088 0.904 0.008
#> SRR2105496 2 0.3030 0.7592 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105493 2 0.3851 0.7210 0.136 0.860 0.004
#> SRR2105494 2 0.4514 0.6933 0.156 0.832 0.012
#> SRR2105491 2 0.2550 0.7794 0.040 0.936 0.024
#> SRR2105492 2 0.2550 0.7794 0.040 0.936 0.024
#> SRR2105489 2 0.0848 0.7732 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105490 2 0.1267 0.7742 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105487 1 0.6934 0.8167 0.624 0.348 0.028
#> SRR2105488 1 0.6954 0.8151 0.620 0.352 0.028
#> SRR2105485 1 0.7013 0.8283 0.608 0.364 0.028
#> SRR2105486 1 0.7069 0.8021 0.568 0.408 0.024
#> SRR2105483 2 0.6143 0.5171 0.256 0.720 0.024
#> SRR2105484 2 0.6143 0.5176 0.256 0.720 0.024
#> SRR2105481 1 0.7223 0.7676 0.548 0.424 0.028
#> SRR2105482 1 0.7372 0.6512 0.520 0.448 0.032
#> SRR2105479 1 0.7453 0.7398 0.528 0.436 0.036
#> SRR2105480 1 0.7581 0.6220 0.496 0.464 0.040
#> SRR2105477 2 0.4068 0.7347 0.120 0.864 0.016
#> SRR2105478 2 0.3769 0.7471 0.104 0.880 0.016
#> SRR2105475 2 0.3528 0.7525 0.092 0.892 0.016
#> SRR2105476 2 0.3445 0.7556 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105473 2 0.2959 0.7589 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105474 2 0.2448 0.7713 0.076 0.924 0.000
#> SRR2105471 2 0.1877 0.7588 0.032 0.956 0.012
#> SRR2105472 2 0.1751 0.7621 0.028 0.960 0.012
#> SRR2105469 1 0.7334 0.8239 0.624 0.328 0.048
#> SRR2105470 1 0.7339 0.8179 0.572 0.392 0.036
#> SRR2105467 1 0.6629 0.8276 0.624 0.360 0.016
#> SRR2105468 1 0.7067 0.8170 0.596 0.376 0.028
#> SRR2105465 2 0.7080 -0.2551 0.412 0.564 0.024
#> SRR2105466 2 0.6587 -0.0722 0.424 0.568 0.008
#> SRR2105463 2 0.7424 0.2052 0.388 0.572 0.040
#> SRR2105464 2 0.7099 0.0746 0.384 0.588 0.028
#> SRR2105461 2 0.0424 0.7745 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105462 2 0.0592 0.7751 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105459 2 0.2446 0.7762 0.052 0.936 0.012
#> SRR2105460 2 0.1765 0.7789 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105457 1 0.6696 0.8245 0.632 0.348 0.020
#> SRR2105458 1 0.7032 0.8159 0.604 0.368 0.028
#> SRR2105455 1 0.7489 0.6742 0.496 0.468 0.036
#> SRR2105456 1 0.7735 0.7445 0.512 0.440 0.048
#> SRR2105453 1 0.7121 0.7297 0.548 0.428 0.024
#> SRR2105454 1 0.7192 0.7612 0.560 0.412 0.028
#> SRR2105451 2 0.4700 0.6528 0.180 0.812 0.008
#> SRR2105452 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105449 1 0.7293 0.6480 0.496 0.476 0.028
#> SRR2105450 1 0.7292 0.6348 0.500 0.472 0.028
#> SRR2105447 2 0.2384 0.7745 0.056 0.936 0.008
#> SRR2105448 2 0.2229 0.7794 0.044 0.944 0.012
#> SRR2105445 2 0.6627 0.0895 0.336 0.644 0.020
#> SRR2105446 2 0.6735 -0.3157 0.424 0.564 0.012
#> SRR2105443 2 0.6899 -0.0105 0.364 0.612 0.024
#> SRR2105444 2 0.5774 0.5356 0.232 0.748 0.020
#> SRR2105441 2 0.2261 0.7754 0.068 0.932 0.000
#> SRR2105442 2 0.2496 0.7757 0.068 0.928 0.004
#> SRR2105437 1 0.6335 0.7591 0.724 0.240 0.036
#> SRR2105438 1 0.6224 0.7585 0.728 0.240 0.032
#> SRR2105435 1 0.7286 0.6895 0.508 0.464 0.028
#> SRR2105436 1 0.6673 0.8287 0.636 0.344 0.020
#> SRR2105433 2 0.6824 0.1507 0.408 0.576 0.016
#> SRR2105434 2 0.7169 -0.0716 0.404 0.568 0.028
#> SRR2105431 2 0.7480 -0.2692 0.456 0.508 0.036
#> SRR2105432 2 0.7278 -0.2887 0.456 0.516 0.028
#> SRR2105429 2 0.6523 0.4884 0.228 0.724 0.048
#> SRR2105430 2 0.5466 0.6459 0.160 0.800 0.040
#> SRR2105427 2 0.2486 0.7713 0.060 0.932 0.008
#> SRR2105428 2 0.2955 0.7618 0.080 0.912 0.008
#> SRR2105425 2 0.2496 0.7777 0.068 0.928 0.004
#> SRR2105426 2 0.1289 0.7818 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105421 1 0.7368 0.8286 0.604 0.352 0.044
#> SRR2105422 1 0.7462 0.8298 0.600 0.352 0.048
#> SRR2105423 2 0.0661 0.7729 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105424 2 0.0424 0.7754 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105419 1 0.7192 0.8193 0.588 0.380 0.032
#> SRR2105420 1 0.7130 0.7656 0.544 0.432 0.024
#> SRR2105415 2 0.7601 -0.0921 0.416 0.540 0.044
#> SRR2105416 2 0.7438 -0.0312 0.392 0.568 0.040
#> SRR2105417 2 0.7069 -0.1789 0.472 0.508 0.020
#> SRR2105418 2 0.7099 0.0910 0.384 0.588 0.028
#> SRR2105413 2 0.3752 0.7449 0.096 0.884 0.020
#> SRR2105414 2 0.2743 0.7773 0.052 0.928 0.020
#> SRR2105409 2 0.1289 0.7800 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105410 2 0.2584 0.7761 0.064 0.928 0.008
#> SRR2105411 2 0.1399 0.7798 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105412 2 0.1267 0.7769 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105407 1 0.6772 0.8081 0.664 0.304 0.032
#> SRR2105408 1 0.6935 0.8130 0.652 0.312 0.036
#> SRR2105403 1 0.6772 0.8099 0.664 0.304 0.032
#> SRR2105404 1 0.6828 0.8119 0.656 0.312 0.032
#> SRR2105405 1 0.6984 0.7862 0.560 0.420 0.020
#> SRR2105406 1 0.7036 0.7176 0.536 0.444 0.020
#> SRR2105401 2 0.6203 0.5553 0.184 0.760 0.056
#> SRR2105402 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105399 2 0.7926 0.3313 0.216 0.656 0.128
#> SRR2105400 2 0.7692 0.3452 0.224 0.668 0.108
#> SRR2105397 2 0.9329 -0.3914 0.400 0.436 0.164
#> SRR2105398 2 0.9329 -0.3914 0.400 0.436 0.164
#> SRR2105395 2 0.1129 0.7792 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105396 2 0.0592 0.7762 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105393 2 0.0424 0.7716 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105394 2 0.1337 0.7770 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105389 1 0.7199 0.7773 0.676 0.260 0.064
#> SRR2105390 1 0.6772 0.8149 0.664 0.304 0.032
#> SRR2105391 1 0.7153 0.8083 0.652 0.300 0.048
#> SRR2105392 1 0.7181 0.8107 0.648 0.304 0.048
#> SRR2105385 1 0.6661 0.8052 0.588 0.400 0.012
#> SRR2105386 1 0.6811 0.7959 0.580 0.404 0.016
#> SRR2105387 1 0.7054 0.7188 0.524 0.456 0.020
#> SRR2105388 1 0.6818 0.8261 0.628 0.348 0.024
#> SRR2105381 2 0.5637 0.6270 0.172 0.788 0.040
#> SRR2105382 2 0.3752 0.7564 0.096 0.884 0.020
#> SRR2105383 2 0.1832 0.7809 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105384 2 0.1832 0.7806 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105379 2 0.3091 0.7651 0.072 0.912 0.016
#> SRR2105380 2 0.3742 0.7628 0.072 0.892 0.036
#> SRR2105377 2 0.2959 0.7614 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105378 2 0.2796 0.7584 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105375 2 0.7074 -0.5364 0.480 0.500 0.020
#> SRR2105376 2 0.7386 -0.4764 0.460 0.508 0.032
#> SRR2105373 1 0.6834 0.7809 0.692 0.260 0.048
#> SRR2105374 1 0.6067 0.7580 0.736 0.236 0.028
#> SRR2105371 1 0.7250 0.8061 0.656 0.288 0.056
#> SRR2105372 1 0.7234 0.8198 0.640 0.312 0.048
#> SRR2105369 1 0.6521 0.8234 0.644 0.340 0.016
#> SRR2105370 1 0.7311 0.8140 0.580 0.384 0.036
#> SRR2105367 2 0.7188 -0.5100 0.484 0.492 0.024
#> SRR2105368 1 0.7187 0.5476 0.496 0.480 0.024
#> SRR2105365 2 0.1781 0.7792 0.020 0.960 0.020
#> SRR2105366 2 0.1636 0.7803 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105363 2 0.2173 0.7813 0.048 0.944 0.008
#> SRR2105364 2 0.1267 0.7793 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105361 2 0.1129 0.7803 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105362 2 0.0747 0.7789 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105359 1 0.7104 0.8302 0.608 0.360 0.032
#> SRR2105360 1 0.7209 0.8251 0.604 0.360 0.036
#> SRR2105355 1 0.7760 0.8311 0.580 0.360 0.060
#> SRR2105356 1 0.7597 0.8163 0.568 0.384 0.048
#> SRR2105353 1 0.8179 0.6944 0.640 0.208 0.152
#> SRR2105354 1 0.7770 0.8006 0.628 0.292 0.080
#> SRR2105351 2 0.1315 0.7824 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105352 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105349 2 0.3722 0.7529 0.088 0.888 0.024
#> SRR2105350 2 0.1950 0.7810 0.040 0.952 0.008
#> SRR2105345 2 0.1964 0.7817 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105346 2 0.1643 0.7810 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105347 2 0.3375 0.7104 0.100 0.892 0.008
#> SRR2105348 2 0.3112 0.7119 0.096 0.900 0.004
#> SRR2105343 2 0.0237 0.7745 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105344 2 0.1129 0.7789 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105341 1 0.7039 0.8150 0.648 0.312 0.040
#> SRR2105342 1 0.7084 0.8237 0.628 0.336 0.036
#> SRR2105339 1 0.7023 0.8266 0.624 0.344 0.032
#> SRR2105340 1 0.7186 0.8293 0.624 0.336 0.040
#> SRR2105335 1 0.6769 0.8248 0.652 0.320 0.028
#> SRR2105336 1 0.6381 0.8147 0.648 0.340 0.012
#> SRR2105337 1 0.6540 0.8000 0.584 0.408 0.008
#> SRR2105338 1 0.6848 0.7735 0.568 0.416 0.016
#> SRR2105331 2 0.1453 0.7815 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105332 2 0.0661 0.7752 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105333 2 0.3528 0.7535 0.092 0.892 0.016
#> SRR2105334 2 0.3678 0.7567 0.080 0.892 0.028
#> SRR2105329 2 0.6180 0.4009 0.260 0.716 0.024
#> SRR2105330 2 0.5938 0.4552 0.248 0.732 0.020
#> SRR2105327 2 0.1832 0.7808 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105328 2 0.2651 0.7748 0.060 0.928 0.012
#> SRR2105325 1 0.8345 0.6349 0.628 0.200 0.172
#> SRR2105326 1 0.8345 0.6349 0.628 0.200 0.172
#> SRR2105323 1 0.7969 0.8028 0.540 0.396 0.064
#> SRR2105324 1 0.7809 0.8163 0.548 0.396 0.056
#> SRR2105319 1 0.6677 0.8130 0.652 0.324 0.024
#> SRR2105320 1 0.7208 0.8086 0.620 0.340 0.040
#> SRR2105321 1 0.8379 0.6631 0.624 0.208 0.168
#> SRR2105322 1 0.8379 0.6631 0.624 0.208 0.168
#> SRR2105317 2 0.3325 0.7617 0.076 0.904 0.020
#> SRR2105318 2 0.1751 0.7811 0.028 0.960 0.012
#> SRR2105315 2 0.5953 0.3286 0.280 0.708 0.012
#> SRR2105316 2 0.2955 0.7628 0.080 0.912 0.008
#> SRR2105313 2 0.2384 0.7762 0.056 0.936 0.008
#> SRR2105314 2 0.1529 0.7798 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105311 1 0.8673 0.6985 0.588 0.252 0.160
#> SRR2105312 1 0.8733 0.6911 0.580 0.260 0.160
#> SRR2105307 1 0.7476 0.6780 0.512 0.452 0.036
#> SRR2105308 2 0.7295 -0.5405 0.480 0.492 0.028
#> SRR2105309 1 0.7271 0.8262 0.608 0.352 0.040
#> SRR2105310 1 0.7192 0.7972 0.560 0.412 0.028
#> SRR2105305 1 0.7116 0.8192 0.636 0.324 0.040
#> SRR2105306 1 0.7640 0.8286 0.592 0.352 0.056
#> SRR2105303 2 0.1163 0.7789 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105304 3 0.2492 0.9097 0.048 0.016 0.936
#> SRR2105301 2 0.2998 0.7716 0.068 0.916 0.016
#> SRR2105302 2 0.3043 0.7628 0.084 0.908 0.008
#> SRR2105299 2 0.7671 -0.5714 0.464 0.492 0.044
#> SRR2105300 2 0.6487 0.3666 0.268 0.700 0.032
#> SRR2105297 2 0.5200 0.5690 0.184 0.796 0.020
#> SRR2105298 2 0.5200 0.5690 0.184 0.796 0.020
#> SRR2105295 2 0.3293 0.7567 0.088 0.900 0.012
#> SRR2105296 2 0.2680 0.7683 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105293 1 0.8117 0.7742 0.552 0.372 0.076
#> SRR2105294 1 0.7451 0.7727 0.564 0.396 0.040
#> SRR2105291 1 0.7067 0.6626 0.512 0.468 0.020
#> SRR2105292 1 0.7471 0.6051 0.516 0.448 0.036
#> SRR2105289 1 0.6849 0.8164 0.600 0.380 0.020
#> SRR2105290 1 0.7069 0.6763 0.508 0.472 0.020
#> SRR2105287 2 0.6825 -0.4955 0.488 0.500 0.012
#> SRR2105288 2 0.7030 -0.1127 0.396 0.580 0.024
#> SRR2105285 2 0.4295 0.7309 0.104 0.864 0.032
#> SRR2105286 2 0.3966 0.7491 0.100 0.876 0.024
#> SRR2105283 2 0.4453 0.6860 0.152 0.836 0.012
#> SRR2105284 2 0.4033 0.7222 0.136 0.856 0.008
#> SRR2105281 2 0.1399 0.7808 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105282 2 0.0892 0.7796 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105259 1 0.6880 0.8083 0.660 0.304 0.036
#> SRR2105260 1 0.6962 0.8150 0.648 0.316 0.036
#> SRR2105279 2 0.0983 0.7696 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105280 2 0.0983 0.7706 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105257 1 0.7262 0.7185 0.528 0.444 0.028
#> SRR2105258 1 0.7647 0.6832 0.516 0.440 0.044
#> SRR2105253 2 0.2866 0.7725 0.076 0.916 0.008
#> SRR2105254 2 0.2301 0.7790 0.060 0.936 0.004
#> SRR2105255 1 0.6994 0.8230 0.612 0.360 0.028
#> SRR2105256 1 0.7083 0.8185 0.592 0.380 0.028
#> SRR2105251 2 0.1337 0.7740 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105252 2 0.1491 0.7772 0.016 0.968 0.016
#> SRR2105249 2 0.1753 0.7810 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105250 2 0.2590 0.7755 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105247 2 0.0237 0.7743 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105248 2 0.0237 0.7728 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105245 1 0.8355 0.7628 0.508 0.408 0.084
#> SRR2105246 1 0.7995 0.6966 0.480 0.460 0.060
#> SRR2105243 1 0.6753 0.8195 0.596 0.388 0.016
#> SRR2105244 1 0.6704 0.8222 0.608 0.376 0.016
#> SRR2105241 1 0.6713 0.7792 0.572 0.416 0.012
#> SRR2105242 2 0.6955 -0.5467 0.488 0.496 0.016
#> SRR2105239 1 0.7489 0.7323 0.664 0.256 0.080
#> SRR2105240 2 0.7571 -0.4828 0.452 0.508 0.040
#> SRR2105237 2 0.5581 0.6289 0.176 0.788 0.036
#> SRR2105238 2 0.4280 0.7174 0.124 0.856 0.020
#> SRR2105235 2 0.2496 0.7709 0.068 0.928 0.004
#> SRR2105236 2 0.2590 0.7689 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105233 2 0.3550 0.7532 0.080 0.896 0.024
#> SRR2105234 2 0.3272 0.7552 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105231 2 0.1453 0.7810 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105232 2 0.0424 0.7761 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105227 1 0.7665 0.6976 0.500 0.456 0.044
#> SRR2105228 2 0.6750 0.1216 0.336 0.640 0.024
#> SRR2105225 1 0.7464 0.7993 0.560 0.400 0.040
#> SRR2105226 1 0.7138 0.6725 0.540 0.436 0.024
#> SRR2105229 1 0.7756 0.8091 0.564 0.380 0.056
#> SRR2105230 1 0.6750 0.8328 0.640 0.336 0.024
#> SRR2105219 2 0.1525 0.7775 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105220 2 0.2845 0.7720 0.068 0.920 0.012
#> SRR2105221 2 0.3784 0.7306 0.132 0.864 0.004
#> SRR2105222 2 0.3112 0.7578 0.096 0.900 0.004
#> SRR2105223 1 0.6696 0.8236 0.632 0.348 0.020
#> SRR2105224 1 0.7032 0.8221 0.604 0.368 0.028
#> SRR2105217 2 0.1337 0.7731 0.016 0.972 0.012
#> SRR2105218 2 0.1482 0.7714 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105215 2 0.1031 0.7744 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105216 2 0.0237 0.7756 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105213 1 0.8010 0.7836 0.548 0.384 0.068
#> SRR2105214 1 0.7785 0.7647 0.528 0.420 0.052
#> SRR2105211 1 0.7245 0.8264 0.596 0.368 0.036
#> SRR2105212 1 0.7337 0.7840 0.540 0.428 0.032
#> SRR2105209 1 0.7080 0.7817 0.564 0.412 0.024
#> SRR2105210 1 0.7292 0.5675 0.500 0.472 0.028
#> SRR2105207 2 0.7268 -0.4582 0.448 0.524 0.028
#> SRR2105208 2 0.7250 -0.1509 0.396 0.572 0.032
#> SRR2105205 2 0.2903 0.7781 0.048 0.924 0.028
#> SRR2105206 2 0.3502 0.7697 0.084 0.896 0.020
#> SRR2105201 2 0.4409 0.6778 0.172 0.824 0.004
#> SRR2105202 2 0.3349 0.7495 0.108 0.888 0.004
#> SRR2105203 2 0.0892 0.7791 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105204 2 0.0592 0.7735 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105199 2 0.0592 0.7704 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105200 2 0.1399 0.7727 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105197 1 0.6597 0.7899 0.696 0.268 0.036
#> SRR2105198 1 0.6621 0.7987 0.684 0.284 0.032
#> SRR2105195 2 0.7641 -0.5341 0.436 0.520 0.044
#> SRR2105196 2 0.6881 -0.1748 0.388 0.592 0.020
#> SRR2105193 2 0.7276 -0.0241 0.404 0.564 0.032
#> SRR2105194 2 0.7213 -0.1181 0.420 0.552 0.028
#> SRR2105191 1 0.6142 0.7167 0.748 0.212 0.040
#> SRR2105192 1 0.7099 0.8006 0.588 0.384 0.028
#> SRR2105189 2 0.3845 0.7273 0.116 0.872 0.012
#> SRR2105190 2 0.3272 0.7669 0.080 0.904 0.016
#> SRR2105187 2 0.6927 0.4686 0.240 0.700 0.060
#> SRR2105188 2 0.6025 0.5230 0.232 0.740 0.028
#> SRR2105179 1 0.7283 0.6944 0.512 0.460 0.028
#> SRR2105180 1 0.7581 0.6630 0.496 0.464 0.040
#> SRR2105183 2 0.0424 0.7716 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105184 2 0.1129 0.7760 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105185 2 0.3406 0.7611 0.068 0.904 0.028
#> SRR2105186 2 0.2680 0.7680 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105181 1 0.7140 0.8247 0.632 0.328 0.040
#> SRR2105182 1 0.6497 0.8266 0.648 0.336 0.016
#> SRR2105177 2 0.6601 0.4651 0.296 0.676 0.028
#> SRR2105178 2 0.6252 0.5056 0.268 0.708 0.024
#> SRR2105171 2 0.1163 0.7803 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105172 2 0.1411 0.7779 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105175 2 0.6796 0.2275 0.344 0.632 0.024
#> SRR2105176 2 0.7325 -0.0943 0.388 0.576 0.036
#> SRR2105173 2 0.0829 0.7783 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105174 2 0.0661 0.7767 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105169 2 0.0661 0.7732 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105170 2 0.1315 0.7788 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105167 2 0.1399 0.7704 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105168 2 0.1289 0.7667 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105165 1 0.7230 0.8274 0.616 0.344 0.040
#> SRR2105166 1 0.7150 0.8260 0.616 0.348 0.036
#> SRR2105163 1 0.8061 0.6476 0.652 0.192 0.156
#> SRR2105164 1 0.8448 0.6710 0.616 0.220 0.164
#> SRR2105161 2 0.6647 -0.2443 0.452 0.540 0.008
#> SRR2105162 2 0.7129 -0.1172 0.392 0.580 0.028
#> SRR2105155 2 0.1031 0.7794 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105156 2 0.0892 0.7757 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105157 2 0.0848 0.7754 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105158 2 0.0983 0.7781 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105159 1 0.7962 0.6902 0.512 0.428 0.060
#> SRR2105160 2 0.7382 -0.3924 0.456 0.512 0.032
#> SRR2105153 2 0.0661 0.7773 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105154 2 0.1129 0.7798 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105151 2 0.0424 0.7716 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105152 2 0.1163 0.7640 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105149 1 0.7661 0.6795 0.504 0.452 0.044
#> SRR2105150 1 0.7729 0.7140 0.516 0.436 0.048
#> SRR2105147 3 0.7665 0.6235 0.340 0.060 0.600
#> SRR2105148 3 0.7665 0.6235 0.340 0.060 0.600
#> SRR2105143 2 0.7036 -0.4201 0.444 0.536 0.020
#> SRR2105144 2 0.6899 0.1370 0.364 0.612 0.024
#> SRR2105145 2 0.7671 -0.1082 0.408 0.544 0.048
#> SRR2105146 2 0.7389 -0.1146 0.408 0.556 0.036
#> SRR2105141 2 0.1525 0.7815 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105142 2 0.1525 0.7816 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105139 2 0.0829 0.7753 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105140 2 0.0829 0.7717 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105137 2 0.3340 0.7478 0.120 0.880 0.000
#> SRR2105138 2 0.3607 0.7472 0.112 0.880 0.008
#> SRR2105135 2 0.0747 0.7693 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105136 2 0.0747 0.7691 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105133 1 0.6597 0.8150 0.664 0.312 0.024
#> SRR2105134 1 0.6597 0.8150 0.664 0.312 0.024
#> SRR2105131 2 0.6701 -0.2311 0.412 0.576 0.012
#> SRR2105132 2 0.7256 -0.4826 0.440 0.532 0.028
#> SRR2105129 2 0.6994 0.3068 0.360 0.612 0.028
#> SRR2105130 2 0.6143 0.5176 0.256 0.720 0.024
#> SRR2105127 1 0.7752 0.6616 0.496 0.456 0.048
#> SRR2105128 2 0.6925 -0.4190 0.452 0.532 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.7000 0.628497 0.172 0.228 0.596 0.004
#> SRR2105278 3 0.6800 0.607119 0.156 0.204 0.632 0.008
#> SRR2105275 3 0.8889 0.453430 0.160 0.180 0.508 0.152
#> SRR2105276 3 0.8949 0.486747 0.168 0.212 0.492 0.128
#> SRR2105273 3 0.6280 0.714821 0.084 0.252 0.656 0.008
#> SRR2105274 3 0.6317 0.716689 0.068 0.260 0.656 0.016
#> SRR2105271 3 0.6790 0.705771 0.076 0.324 0.584 0.016
#> SRR2105272 3 0.7299 0.620159 0.124 0.328 0.536 0.012
#> SRR2105269 2 0.1585 0.766914 0.004 0.952 0.040 0.004
#> SRR2105270 2 0.2457 0.760610 0.008 0.912 0.076 0.004
#> SRR2105267 2 0.2055 0.767595 0.008 0.936 0.048 0.008
#> SRR2105268 2 0.0657 0.759210 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105265 2 0.0336 0.756743 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0672 0.759148 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105263 2 0.2221 0.756413 0.044 0.932 0.016 0.008
#> SRR2105264 2 0.2153 0.758896 0.036 0.936 0.020 0.008
#> SRR2105261 3 0.8439 0.592783 0.088 0.356 0.456 0.100
#> SRR2105262 3 0.7888 0.666737 0.076 0.320 0.528 0.076
#> SRR2105357 3 0.6791 0.613447 0.156 0.220 0.620 0.004
#> SRR2105358 3 0.6815 0.654375 0.132 0.240 0.620 0.008
#> SRR2105439 2 0.4257 0.676087 0.048 0.812 0.140 0.000
#> SRR2105440 2 0.3707 0.704866 0.028 0.840 0.132 0.000
#> SRR2105509 2 0.4036 0.713619 0.012 0.840 0.116 0.032
#> SRR2105510 2 0.3319 0.742322 0.012 0.876 0.096 0.016
#> SRR2105507 3 0.6966 0.718772 0.092 0.292 0.596 0.020
#> SRR2105508 3 0.6683 0.706063 0.072 0.248 0.648 0.032
#> SRR2105505 3 0.6999 0.678948 0.128 0.304 0.564 0.004
#> SRR2105506 3 0.7372 0.589361 0.156 0.332 0.508 0.004
#> SRR2105503 2 0.1811 0.765139 0.028 0.948 0.020 0.004
#> SRR2105504 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105501 2 0.2922 0.745811 0.008 0.884 0.104 0.004
#> SRR2105502 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105499 3 0.7218 0.660054 0.068 0.380 0.520 0.032
#> SRR2105500 3 0.6818 0.652122 0.064 0.388 0.532 0.016
#> SRR2105497 2 0.3245 0.719462 0.028 0.872 0.100 0.000
#> SRR2105498 2 0.1575 0.762768 0.028 0.956 0.012 0.004
#> SRR2105495 2 0.3037 0.748400 0.020 0.880 0.100 0.000
#> SRR2105496 2 0.3093 0.747148 0.020 0.884 0.092 0.004
#> SRR2105493 2 0.4037 0.701580 0.056 0.832 0.112 0.000
#> SRR2105494 2 0.4406 0.678113 0.044 0.808 0.144 0.004
#> SRR2105491 2 0.3065 0.749479 0.052 0.900 0.032 0.016
#> SRR2105492 2 0.3065 0.749479 0.052 0.900 0.032 0.016
#> SRR2105489 2 0.1109 0.755817 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR2105490 2 0.1339 0.756675 0.024 0.964 0.008 0.004
#> SRR2105487 3 0.7398 0.625204 0.200 0.256 0.540 0.004
#> SRR2105488 3 0.7419 0.621946 0.200 0.260 0.536 0.004
#> SRR2105485 3 0.6974 0.719880 0.092 0.276 0.608 0.024
#> SRR2105486 3 0.7287 0.697123 0.096 0.332 0.548 0.024
#> SRR2105483 2 0.7126 -0.475941 0.420 0.464 0.112 0.004
#> SRR2105484 2 0.7090 -0.483232 0.428 0.460 0.108 0.004
#> SRR2105481 3 0.7878 0.624916 0.156 0.360 0.464 0.020
#> SRR2105482 3 0.7635 0.545649 0.176 0.324 0.492 0.008
#> SRR2105479 3 0.8127 0.601070 0.156 0.360 0.452 0.032
#> SRR2105480 3 0.8204 0.488423 0.192 0.356 0.428 0.024
#> SRR2105477 2 0.4042 0.726893 0.040 0.844 0.104 0.012
#> SRR2105478 2 0.3736 0.740059 0.032 0.860 0.096 0.012
#> SRR2105475 2 0.3200 0.745399 0.012 0.880 0.096 0.012
#> SRR2105476 2 0.3135 0.747278 0.012 0.884 0.092 0.012
#> SRR2105473 2 0.3279 0.729626 0.032 0.872 0.096 0.000
#> SRR2105474 2 0.2845 0.741609 0.028 0.896 0.076 0.000
#> SRR2105471 2 0.2287 0.722624 0.060 0.924 0.012 0.004
#> SRR2105472 2 0.2207 0.727556 0.056 0.928 0.012 0.004
#> SRR2105469 3 0.6104 0.709921 0.040 0.260 0.672 0.028
#> SRR2105470 3 0.6376 0.718081 0.056 0.304 0.624 0.016
#> SRR2105467 3 0.6745 0.675582 0.124 0.264 0.608 0.004
#> SRR2105468 3 0.6991 0.687403 0.132 0.268 0.592 0.008
#> SRR2105465 2 0.7462 -0.427561 0.152 0.452 0.392 0.004
#> SRR2105466 2 0.7686 -0.387691 0.184 0.408 0.404 0.004
#> SRR2105463 1 0.7884 0.286577 0.360 0.356 0.284 0.000
#> SRR2105464 2 0.7845 -0.418696 0.292 0.404 0.304 0.000
#> SRR2105461 2 0.0376 0.758557 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR2105462 2 0.0524 0.758846 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105459 2 0.2186 0.765193 0.008 0.932 0.048 0.012
#> SRR2105460 2 0.1807 0.765747 0.008 0.940 0.052 0.000
#> SRR2105457 3 0.6664 0.708564 0.084 0.276 0.624 0.016
#> SRR2105458 3 0.6794 0.702696 0.084 0.300 0.600 0.016
#> SRR2105455 3 0.7847 0.609223 0.112 0.348 0.500 0.040
#> SRR2105456 3 0.7507 0.673260 0.100 0.332 0.536 0.032
#> SRR2105453 3 0.7086 0.550148 0.160 0.292 0.548 0.000
#> SRR2105454 3 0.7307 0.567292 0.192 0.284 0.524 0.000
#> SRR2105451 2 0.4758 0.638081 0.064 0.780 0.156 0.000
#> SRR2105452 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105449 3 0.7590 0.563003 0.140 0.384 0.464 0.012
#> SRR2105450 3 0.7718 0.559806 0.200 0.344 0.452 0.004
#> SRR2105447 2 0.2599 0.759632 0.020 0.912 0.064 0.004
#> SRR2105448 2 0.2039 0.768450 0.016 0.940 0.036 0.008
#> SRR2105445 2 0.6526 0.156911 0.076 0.620 0.292 0.012
#> SRR2105446 2 0.6871 -0.331669 0.080 0.500 0.412 0.008
#> SRR2105443 2 0.6847 0.039917 0.072 0.580 0.328 0.020
#> SRR2105444 2 0.5590 0.530866 0.056 0.724 0.208 0.012
#> SRR2105441 2 0.2443 0.755253 0.024 0.916 0.060 0.000
#> SRR2105442 2 0.2797 0.744472 0.032 0.900 0.068 0.000
#> SRR2105437 3 0.7172 0.474248 0.240 0.144 0.600 0.016
#> SRR2105438 3 0.7118 0.479945 0.232 0.144 0.608 0.016
#> SRR2105435 3 0.7752 0.646941 0.132 0.356 0.488 0.024
#> SRR2105436 3 0.6018 0.713201 0.064 0.260 0.668 0.008
#> SRR2105433 2 0.8237 -0.576861 0.316 0.388 0.284 0.012
#> SRR2105434 2 0.7897 -0.358394 0.236 0.416 0.344 0.004
#> SRR2105431 3 0.8154 -0.045715 0.280 0.352 0.360 0.008
#> SRR2105432 2 0.7981 -0.436903 0.256 0.380 0.360 0.004
#> SRR2105429 2 0.6242 0.492987 0.056 0.704 0.196 0.044
#> SRR2105430 2 0.4851 0.649415 0.016 0.788 0.156 0.040
#> SRR2105427 2 0.2441 0.762302 0.012 0.916 0.068 0.004
#> SRR2105428 2 0.2795 0.752808 0.012 0.896 0.088 0.004
#> SRR2105425 2 0.2510 0.764667 0.012 0.916 0.064 0.008
#> SRR2105426 2 0.1488 0.768654 0.012 0.956 0.032 0.000
#> SRR2105421 3 0.6591 0.717788 0.044 0.284 0.632 0.040
#> SRR2105422 3 0.6966 0.719953 0.064 0.288 0.608 0.040
#> SRR2105423 2 0.0657 0.756277 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR2105424 2 0.0376 0.759673 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR2105419 3 0.6237 0.718932 0.044 0.300 0.636 0.020
#> SRR2105420 3 0.6625 0.676615 0.056 0.364 0.564 0.016
#> SRR2105415 2 0.8060 -0.508811 0.312 0.368 0.316 0.004
#> SRR2105416 2 0.8035 -0.424755 0.288 0.380 0.328 0.004
#> SRR2105417 2 0.7851 -0.457065 0.268 0.376 0.356 0.000
#> SRR2105418 2 0.8041 -0.330640 0.256 0.424 0.312 0.008
#> SRR2105413 2 0.3502 0.735441 0.016 0.868 0.100 0.016
#> SRR2105414 2 0.2641 0.763690 0.012 0.912 0.064 0.012
#> SRR2105409 2 0.1356 0.769012 0.008 0.960 0.032 0.000
#> SRR2105410 2 0.2674 0.762887 0.020 0.908 0.068 0.004
#> SRR2105411 2 0.1229 0.763281 0.020 0.968 0.008 0.004
#> SRR2105412 2 0.1042 0.761147 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR2105407 3 0.6893 0.668615 0.120 0.224 0.636 0.020
#> SRR2105408 3 0.6804 0.676087 0.108 0.232 0.640 0.020
#> SRR2105403 3 0.6557 0.550129 0.160 0.160 0.668 0.012
#> SRR2105404 3 0.6789 0.583290 0.160 0.184 0.644 0.012
#> SRR2105405 3 0.6409 0.708319 0.072 0.304 0.616 0.008
#> SRR2105406 3 0.6963 0.645301 0.120 0.316 0.560 0.004
#> SRR2105401 2 0.5684 0.557835 0.024 0.736 0.184 0.056
#> SRR2105402 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105399 2 0.7103 0.309700 0.020 0.620 0.216 0.144
#> SRR2105400 2 0.6990 0.332003 0.024 0.632 0.224 0.120
#> SRR2105397 2 0.9228 -0.348257 0.132 0.408 0.312 0.148
#> SRR2105398 2 0.9228 -0.348257 0.132 0.408 0.312 0.148
#> SRR2105395 2 0.1297 0.764846 0.016 0.964 0.020 0.000
#> SRR2105396 2 0.0672 0.762012 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105393 2 0.0779 0.759480 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105394 2 0.1771 0.753563 0.036 0.948 0.012 0.004
#> SRR2105389 3 0.6994 0.659531 0.084 0.212 0.652 0.052
#> SRR2105390 3 0.6252 0.697324 0.064 0.232 0.680 0.024
#> SRR2105391 3 0.6537 0.685800 0.072 0.228 0.668 0.032
#> SRR2105392 3 0.6597 0.691446 0.072 0.236 0.660 0.032
#> SRR2105385 3 0.6380 0.716886 0.064 0.300 0.624 0.012
#> SRR2105386 3 0.6245 0.699685 0.056 0.324 0.612 0.008
#> SRR2105387 3 0.6871 0.645967 0.080 0.360 0.548 0.012
#> SRR2105388 3 0.6233 0.712767 0.068 0.264 0.656 0.012
#> SRR2105381 2 0.5341 0.607592 0.032 0.756 0.180 0.032
#> SRR2105382 2 0.3504 0.748205 0.020 0.876 0.080 0.024
#> SRR2105383 2 0.1958 0.765992 0.020 0.944 0.028 0.008
#> SRR2105384 2 0.1943 0.766020 0.016 0.944 0.032 0.008
#> SRR2105379 2 0.2781 0.755743 0.008 0.904 0.072 0.016
#> SRR2105380 2 0.3571 0.744112 0.024 0.876 0.072 0.028
#> SRR2105377 2 0.3219 0.732039 0.020 0.868 0.112 0.000
#> SRR2105378 2 0.3117 0.728754 0.028 0.880 0.092 0.000
#> SRR2105375 2 0.7710 -0.552909 0.168 0.420 0.404 0.008
#> SRR2105376 3 0.7534 0.436412 0.160 0.412 0.424 0.004
#> SRR2105373 3 0.7150 0.570108 0.192 0.168 0.620 0.020
#> SRR2105374 3 0.7143 0.509792 0.224 0.152 0.608 0.016
#> SRR2105371 3 0.6660 0.683781 0.084 0.220 0.664 0.032
#> SRR2105372 3 0.6040 0.703614 0.044 0.240 0.688 0.028
#> SRR2105369 3 0.5785 0.710965 0.060 0.256 0.680 0.004
#> SRR2105370 3 0.6458 0.716451 0.084 0.280 0.628 0.008
#> SRR2105367 3 0.7867 0.383635 0.196 0.380 0.416 0.008
#> SRR2105368 3 0.7785 0.432475 0.184 0.368 0.440 0.008
#> SRR2105365 2 0.2231 0.754294 0.044 0.932 0.012 0.012
#> SRR2105366 2 0.2170 0.759696 0.036 0.936 0.016 0.012
#> SRR2105363 2 0.2207 0.767504 0.012 0.928 0.056 0.004
#> SRR2105364 2 0.1229 0.765825 0.008 0.968 0.020 0.004
#> SRR2105361 2 0.1109 0.766911 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105362 2 0.0817 0.765166 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105359 3 0.6632 0.723293 0.072 0.284 0.624 0.020
#> SRR2105360 3 0.6284 0.716246 0.052 0.300 0.632 0.016
#> SRR2105355 3 0.6822 0.724584 0.068 0.280 0.620 0.032
#> SRR2105356 3 0.6504 0.713482 0.064 0.284 0.632 0.020
#> SRR2105353 3 0.7972 0.522243 0.100 0.160 0.600 0.140
#> SRR2105354 3 0.7001 0.690736 0.056 0.236 0.640 0.068
#> SRR2105351 2 0.1543 0.768928 0.004 0.956 0.032 0.008
#> SRR2105352 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105349 2 0.3504 0.744820 0.024 0.876 0.080 0.020
#> SRR2105350 2 0.1822 0.768035 0.008 0.944 0.044 0.004
#> SRR2105345 2 0.2089 0.762892 0.020 0.932 0.048 0.000
#> SRR2105346 2 0.1888 0.764066 0.016 0.940 0.044 0.000
#> SRR2105347 2 0.4313 0.585757 0.108 0.824 0.064 0.004
#> SRR2105348 2 0.4055 0.592358 0.108 0.832 0.060 0.000
#> SRR2105343 2 0.0188 0.758701 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105344 2 0.1356 0.767582 0.008 0.960 0.032 0.000
#> SRR2105341 3 0.6379 0.694801 0.068 0.240 0.668 0.024
#> SRR2105342 3 0.5751 0.708312 0.036 0.264 0.684 0.016
#> SRR2105339 3 0.6149 0.714612 0.048 0.272 0.660 0.020
#> SRR2105340 3 0.6634 0.713332 0.064 0.260 0.644 0.032
#> SRR2105335 3 0.6852 0.644940 0.172 0.208 0.616 0.004
#> SRR2105336 3 0.6751 0.625693 0.152 0.220 0.624 0.004
#> SRR2105337 3 0.6319 0.701284 0.084 0.312 0.604 0.000
#> SRR2105338 3 0.6581 0.680257 0.076 0.328 0.588 0.008
#> SRR2105331 2 0.1489 0.769317 0.004 0.952 0.044 0.000
#> SRR2105332 2 0.0859 0.760901 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR2105333 2 0.3234 0.747559 0.020 0.884 0.084 0.012
#> SRR2105334 2 0.3266 0.745066 0.004 0.880 0.084 0.032
#> SRR2105329 2 0.5770 0.378353 0.032 0.672 0.280 0.016
#> SRR2105330 2 0.5563 0.443070 0.028 0.704 0.248 0.020
#> SRR2105327 2 0.1807 0.768358 0.008 0.940 0.052 0.000
#> SRR2105328 2 0.2561 0.763230 0.016 0.912 0.068 0.004
#> SRR2105325 3 0.8947 0.356306 0.188 0.152 0.500 0.160
#> SRR2105326 3 0.8942 0.357120 0.192 0.152 0.500 0.156
#> SRR2105323 3 0.7048 0.703067 0.056 0.316 0.584 0.044
#> SRR2105324 3 0.7301 0.717209 0.072 0.316 0.568 0.044
#> SRR2105319 3 0.7213 0.654336 0.148 0.240 0.596 0.016
#> SRR2105320 3 0.7286 0.614841 0.176 0.228 0.584 0.012
#> SRR2105321 3 0.8761 0.416424 0.168 0.156 0.524 0.152
#> SRR2105322 3 0.8761 0.416424 0.168 0.156 0.524 0.152
#> SRR2105317 2 0.3105 0.750951 0.008 0.888 0.084 0.020
#> SRR2105318 2 0.1575 0.768689 0.004 0.956 0.028 0.012
#> SRR2105315 2 0.5466 0.291993 0.040 0.668 0.292 0.000
#> SRR2105316 2 0.2658 0.754346 0.012 0.904 0.080 0.004
#> SRR2105313 2 0.2207 0.767263 0.012 0.928 0.056 0.004
#> SRR2105314 2 0.1635 0.768024 0.008 0.948 0.044 0.000
#> SRR2105311 3 0.9156 0.430322 0.192 0.200 0.468 0.140
#> SRR2105312 3 0.9191 0.393645 0.196 0.196 0.464 0.144
#> SRR2105307 3 0.7163 0.609984 0.132 0.336 0.528 0.004
#> SRR2105308 3 0.7324 0.490424 0.144 0.352 0.500 0.004
#> SRR2105309 3 0.6511 0.715998 0.060 0.280 0.636 0.024
#> SRR2105310 3 0.6691 0.701449 0.060 0.336 0.584 0.020
#> SRR2105305 3 0.6411 0.705103 0.060 0.264 0.652 0.024
#> SRR2105306 3 0.6072 0.715536 0.044 0.272 0.664 0.020
#> SRR2105303 2 0.1151 0.766803 0.008 0.968 0.024 0.000
#> SRR2105304 4 0.1284 0.888133 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR2105301 2 0.2732 0.758758 0.008 0.904 0.076 0.012
#> SRR2105302 2 0.2862 0.754737 0.012 0.900 0.076 0.012
#> SRR2105299 3 0.7520 0.490806 0.108 0.432 0.440 0.020
#> SRR2105300 2 0.6189 0.372975 0.056 0.668 0.256 0.020
#> SRR2105297 2 0.6496 -0.198237 0.356 0.568 0.072 0.004
#> SRR2105298 2 0.6482 -0.186761 0.352 0.572 0.072 0.004
#> SRR2105295 2 0.3069 0.746678 0.012 0.888 0.088 0.012
#> SRR2105296 2 0.2586 0.758711 0.012 0.912 0.068 0.008
#> SRR2105293 3 0.8626 0.613500 0.164 0.300 0.468 0.068
#> SRR2105294 3 0.7801 0.642821 0.112 0.332 0.516 0.040
#> SRR2105291 3 0.7443 0.582551 0.128 0.364 0.496 0.012
#> SRR2105292 3 0.7806 0.477904 0.228 0.316 0.452 0.004
#> SRR2105289 3 0.5918 0.719845 0.052 0.300 0.644 0.004
#> SRR2105290 3 0.7078 0.621342 0.116 0.364 0.516 0.004
#> SRR2105287 3 0.7799 0.468316 0.188 0.360 0.444 0.008
#> SRR2105288 2 0.7894 -0.386460 0.184 0.436 0.368 0.012
#> SRR2105285 2 0.3763 0.726393 0.012 0.856 0.104 0.028
#> SRR2105286 2 0.3510 0.740000 0.008 0.868 0.096 0.028
#> SRR2105283 2 0.4695 0.663113 0.076 0.800 0.120 0.004
#> SRR2105284 2 0.4141 0.707765 0.052 0.832 0.112 0.004
#> SRR2105281 2 0.1593 0.768547 0.016 0.956 0.024 0.004
#> SRR2105282 2 0.0804 0.763843 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR2105259 3 0.6841 0.666533 0.108 0.224 0.644 0.024
#> SRR2105260 3 0.6904 0.675653 0.116 0.232 0.632 0.020
#> SRR2105279 2 0.0895 0.752950 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2105280 2 0.0844 0.753488 0.012 0.980 0.004 0.004
#> SRR2105257 3 0.7526 0.564301 0.192 0.296 0.508 0.004
#> SRR2105258 3 0.7607 0.530011 0.204 0.296 0.496 0.004
#> SRR2105253 2 0.2684 0.763013 0.016 0.912 0.060 0.012
#> SRR2105254 2 0.2161 0.768206 0.016 0.932 0.048 0.004
#> SRR2105255 3 0.6103 0.713287 0.076 0.264 0.656 0.004
#> SRR2105256 3 0.6503 0.719024 0.084 0.288 0.620 0.008
#> SRR2105251 2 0.1377 0.755915 0.020 0.964 0.008 0.008
#> SRR2105252 2 0.1690 0.758093 0.032 0.952 0.008 0.008
#> SRR2105249 2 0.2021 0.767951 0.012 0.932 0.056 0.000
#> SRR2105250 2 0.2856 0.747249 0.024 0.900 0.072 0.004
#> SRR2105247 2 0.0657 0.762396 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105248 2 0.0469 0.756973 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.8415 0.641235 0.116 0.336 0.472 0.076
#> SRR2105246 3 0.8135 0.595029 0.096 0.392 0.448 0.064
#> SRR2105243 3 0.5711 0.719465 0.040 0.304 0.652 0.004
#> SRR2105244 3 0.6885 0.719259 0.092 0.296 0.596 0.016
#> SRR2105241 3 0.7008 0.681003 0.100 0.324 0.564 0.012
#> SRR2105242 3 0.7339 0.494109 0.140 0.376 0.480 0.004
#> SRR2105239 1 0.7576 -0.086652 0.448 0.068 0.436 0.048
#> SRR2105240 3 0.8109 0.423130 0.172 0.384 0.420 0.024
#> SRR2105237 2 0.5138 0.624091 0.020 0.764 0.180 0.036
#> SRR2105238 2 0.3854 0.718991 0.016 0.844 0.124 0.016
#> SRR2105235 2 0.2635 0.755800 0.016 0.908 0.072 0.004
#> SRR2105236 2 0.2635 0.749716 0.016 0.908 0.072 0.004
#> SRR2105233 2 0.3309 0.744227 0.016 0.880 0.088 0.016
#> SRR2105234 2 0.3069 0.746528 0.012 0.888 0.088 0.012
#> SRR2105231 2 0.1443 0.767396 0.008 0.960 0.028 0.004
#> SRR2105232 2 0.0336 0.759856 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105227 3 0.7426 0.616219 0.076 0.388 0.500 0.036
#> SRR2105228 2 0.6656 0.000448 0.056 0.580 0.344 0.020
#> SRR2105225 3 0.6962 0.701122 0.108 0.292 0.588 0.012
#> SRR2105226 3 0.7513 0.556255 0.152 0.312 0.524 0.012
#> SRR2105229 3 0.7534 0.693781 0.064 0.320 0.552 0.064
#> SRR2105230 3 0.6328 0.716827 0.072 0.252 0.660 0.016
#> SRR2105219 2 0.1492 0.765050 0.004 0.956 0.036 0.004
#> SRR2105220 2 0.2587 0.761348 0.004 0.908 0.076 0.012
#> SRR2105221 2 0.4059 0.705930 0.040 0.832 0.124 0.004
#> SRR2105222 2 0.3372 0.723933 0.036 0.868 0.096 0.000
#> SRR2105223 3 0.6029 0.718902 0.060 0.272 0.660 0.008
#> SRR2105224 3 0.6385 0.718177 0.076 0.288 0.628 0.008
#> SRR2105217 2 0.1675 0.749300 0.044 0.948 0.004 0.004
#> SRR2105218 2 0.1822 0.745185 0.044 0.944 0.008 0.004
#> SRR2105215 2 0.1042 0.759167 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR2105216 2 0.0469 0.761597 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105213 3 0.8062 0.652570 0.100 0.332 0.504 0.064
#> SRR2105214 3 0.8074 0.647740 0.108 0.348 0.488 0.056
#> SRR2105211 3 0.6767 0.717062 0.088 0.284 0.612 0.016
#> SRR2105212 3 0.6437 0.690480 0.052 0.360 0.576 0.012
#> SRR2105209 3 0.7442 0.669919 0.144 0.288 0.552 0.016
#> SRR2105210 3 0.7269 0.475307 0.156 0.356 0.488 0.000
#> SRR2105207 3 0.7926 0.448028 0.208 0.376 0.408 0.008
#> SRR2105208 2 0.7899 -0.423967 0.232 0.404 0.360 0.004
#> SRR2105205 2 0.2874 0.761748 0.020 0.904 0.064 0.012
#> SRR2105206 2 0.3279 0.759193 0.028 0.888 0.068 0.016
#> SRR2105201 2 0.4837 0.631771 0.056 0.780 0.160 0.004
#> SRR2105202 2 0.3616 0.715148 0.036 0.852 0.112 0.000
#> SRR2105203 2 0.0927 0.764361 0.008 0.976 0.016 0.000
#> SRR2105204 2 0.0672 0.759280 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105199 2 0.0469 0.753916 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.1816 0.750019 0.024 0.948 0.024 0.004
#> SRR2105197 3 0.7286 0.579883 0.188 0.176 0.612 0.024
#> SRR2105198 3 0.7076 0.605377 0.164 0.200 0.620 0.016
#> SRR2105195 2 0.8150 -0.597424 0.144 0.412 0.408 0.036
#> SRR2105196 2 0.7068 -0.271231 0.116 0.520 0.360 0.004
#> SRR2105193 2 0.8364 -0.423173 0.256 0.396 0.328 0.020
#> SRR2105194 2 0.8223 -0.444714 0.268 0.384 0.336 0.012
#> SRR2105191 3 0.6115 -0.226772 0.472 0.020 0.492 0.016
#> SRR2105192 3 0.7335 0.592586 0.204 0.240 0.552 0.004
#> SRR2105189 2 0.4021 0.706522 0.032 0.836 0.124 0.008
#> SRR2105190 2 0.2983 0.757013 0.016 0.896 0.076 0.012
#> SRR2105187 2 0.6960 0.431229 0.096 0.664 0.188 0.052
#> SRR2105188 2 0.6088 0.514797 0.116 0.708 0.164 0.012
#> SRR2105179 3 0.7938 0.555361 0.192 0.316 0.476 0.016
#> SRR2105180 3 0.8061 0.563457 0.168 0.364 0.444 0.024
#> SRR2105183 2 0.0336 0.754920 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1256 0.759583 0.028 0.964 0.008 0.000
#> SRR2105185 2 0.3250 0.740601 0.016 0.888 0.072 0.024
#> SRR2105186 2 0.3001 0.740002 0.036 0.896 0.064 0.004
#> SRR2105181 3 0.7040 0.641188 0.168 0.220 0.604 0.008
#> SRR2105182 3 0.6084 0.707175 0.096 0.244 0.660 0.000
#> SRR2105177 1 0.7334 0.349366 0.444 0.428 0.120 0.008
#> SRR2105178 2 0.7210 -0.511080 0.428 0.448 0.120 0.004
#> SRR2105171 2 0.1284 0.767822 0.012 0.964 0.024 0.000
#> SRR2105172 2 0.1411 0.759601 0.020 0.960 0.020 0.000
#> SRR2105175 2 0.7885 -0.360306 0.272 0.444 0.280 0.004
#> SRR2105176 2 0.7881 -0.375148 0.232 0.420 0.344 0.004
#> SRR2105173 2 0.0992 0.764316 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR2105174 2 0.0524 0.761100 0.004 0.988 0.008 0.000
#> SRR2105169 2 0.0672 0.758565 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105170 2 0.1247 0.763617 0.016 0.968 0.012 0.004
#> SRR2105167 2 0.1362 0.753690 0.020 0.964 0.012 0.004
#> SRR2105168 2 0.1388 0.750282 0.028 0.960 0.012 0.000
#> SRR2105165 3 0.7409 0.698146 0.120 0.260 0.588 0.032
#> SRR2105166 3 0.7137 0.698939 0.120 0.260 0.600 0.020
#> SRR2105163 3 0.8621 0.428890 0.152 0.160 0.540 0.148
#> SRR2105164 3 0.9011 0.397901 0.188 0.168 0.492 0.152
#> SRR2105161 2 0.7629 -0.461701 0.204 0.404 0.392 0.000
#> SRR2105162 2 0.7856 -0.392643 0.224 0.420 0.352 0.004
#> SRR2105155 2 0.1209 0.764850 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR2105156 2 0.0937 0.758925 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR2105157 2 0.0712 0.759020 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR2105158 2 0.0937 0.762629 0.012 0.976 0.012 0.000
#> SRR2105159 3 0.8332 0.546778 0.216 0.312 0.444 0.028
#> SRR2105160 2 0.7845 -0.515989 0.216 0.392 0.388 0.004
#> SRR2105153 2 0.0779 0.762290 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105154 2 0.1297 0.766001 0.020 0.964 0.016 0.000
#> SRR2105151 2 0.0657 0.758754 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105152 2 0.1151 0.747727 0.024 0.968 0.008 0.000
#> SRR2105149 3 0.7673 0.581443 0.072 0.404 0.472 0.052
#> SRR2105150 3 0.7726 0.593300 0.072 0.396 0.476 0.056
#> SRR2105147 4 0.7374 0.578347 0.128 0.032 0.240 0.600
#> SRR2105148 4 0.7374 0.578347 0.128 0.032 0.240 0.600
#> SRR2105143 3 0.6884 0.468186 0.104 0.432 0.464 0.000
#> SRR2105144 2 0.7730 -0.186613 0.172 0.488 0.328 0.012
#> SRR2105145 2 0.8565 -0.389328 0.220 0.392 0.352 0.036
#> SRR2105146 2 0.8047 -0.373643 0.212 0.408 0.368 0.012
#> SRR2105141 2 0.1488 0.768232 0.012 0.956 0.032 0.000
#> SRR2105142 2 0.1452 0.768230 0.008 0.956 0.036 0.000
#> SRR2105139 2 0.0672 0.759293 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR2105140 2 0.0657 0.755252 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105137 2 0.3638 0.718622 0.032 0.848 0.120 0.000
#> SRR2105138 2 0.4141 0.703405 0.052 0.832 0.112 0.004
#> SRR2105135 2 0.0657 0.752734 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105136 2 0.0592 0.752750 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.7176 0.606704 0.180 0.208 0.600 0.012
#> SRR2105134 3 0.7141 0.608536 0.176 0.208 0.604 0.012
#> SRR2105131 2 0.7286 -0.322705 0.132 0.476 0.388 0.004
#> SRR2105132 3 0.7335 0.501697 0.120 0.432 0.440 0.008
#> SRR2105129 2 0.8171 -0.546805 0.304 0.416 0.268 0.012
#> SRR2105130 2 0.7090 -0.483232 0.428 0.460 0.108 0.004
#> SRR2105127 3 0.7938 0.515782 0.180 0.312 0.488 0.020
#> SRR2105128 2 0.7244 -0.499179 0.100 0.448 0.440 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.5572 0.4766 0.020 0.088 0.668 0.000 0.224
#> SRR2105278 3 0.5538 0.4689 0.020 0.092 0.676 0.000 0.212
#> SRR2105275 3 0.8088 0.3485 0.044 0.084 0.508 0.144 0.220
#> SRR2105276 3 0.8311 0.4046 0.052 0.120 0.488 0.108 0.232
#> SRR2105273 3 0.5224 0.6135 0.044 0.112 0.740 0.000 0.104
#> SRR2105274 3 0.5548 0.6216 0.068 0.148 0.720 0.004 0.060
#> SRR2105271 3 0.6609 0.5799 0.080 0.208 0.624 0.008 0.080
#> SRR2105272 3 0.7750 0.4107 0.192 0.180 0.504 0.004 0.120
#> SRR2105269 2 0.1526 0.8648 0.004 0.948 0.040 0.004 0.004
#> SRR2105270 2 0.2745 0.8584 0.012 0.888 0.084 0.004 0.012
#> SRR2105267 2 0.2003 0.8669 0.004 0.928 0.052 0.008 0.008
#> SRR2105268 2 0.0727 0.8568 0.012 0.980 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105265 2 0.0324 0.8536 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105266 2 0.0740 0.8599 0.008 0.980 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105263 2 0.2782 0.8414 0.096 0.880 0.016 0.004 0.004
#> SRR2105264 2 0.2767 0.8448 0.088 0.884 0.020 0.004 0.004
#> SRR2105261 3 0.7771 0.4371 0.020 0.276 0.496 0.092 0.116
#> SRR2105262 3 0.6998 0.5507 0.008 0.228 0.580 0.072 0.112
#> SRR2105357 3 0.5829 0.4864 0.024 0.112 0.672 0.004 0.188
#> SRR2105358 3 0.5566 0.5675 0.012 0.140 0.676 0.000 0.172
#> SRR2105439 2 0.4909 0.7149 0.048 0.756 0.144 0.000 0.052
#> SRR2105440 2 0.4174 0.7758 0.044 0.804 0.124 0.000 0.028
#> SRR2105509 2 0.3837 0.8142 0.012 0.832 0.112 0.028 0.016
#> SRR2105510 2 0.3196 0.8395 0.016 0.864 0.100 0.012 0.008
#> SRR2105507 3 0.6238 0.6085 0.084 0.136 0.672 0.004 0.104
#> SRR2105508 3 0.5741 0.6182 0.040 0.140 0.712 0.012 0.096
#> SRR2105505 3 0.6958 0.5485 0.100 0.144 0.612 0.008 0.136
#> SRR2105506 3 0.7540 0.3664 0.192 0.156 0.540 0.008 0.104
#> SRR2105503 2 0.2144 0.8572 0.068 0.912 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105504 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105501 2 0.3016 0.8416 0.016 0.868 0.100 0.000 0.016
#> SRR2105502 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105499 3 0.6973 0.5473 0.056 0.260 0.572 0.016 0.096
#> SRR2105500 3 0.6776 0.5396 0.064 0.264 0.584 0.012 0.076
#> SRR2105497 2 0.3294 0.8041 0.036 0.852 0.104 0.000 0.008
#> SRR2105498 2 0.1843 0.8638 0.044 0.936 0.012 0.004 0.004
#> SRR2105495 2 0.2967 0.8477 0.012 0.868 0.104 0.000 0.016
#> SRR2105496 2 0.3114 0.8425 0.012 0.868 0.096 0.004 0.020
#> SRR2105493 2 0.4339 0.7832 0.024 0.800 0.120 0.004 0.052
#> SRR2105494 2 0.4588 0.7479 0.028 0.768 0.156 0.000 0.048
#> SRR2105491 2 0.3614 0.8213 0.108 0.840 0.036 0.012 0.004
#> SRR2105492 2 0.3614 0.8213 0.108 0.840 0.036 0.012 0.004
#> SRR2105489 2 0.1831 0.8515 0.076 0.920 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105490 2 0.1251 0.8579 0.036 0.956 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105487 3 0.7061 0.4859 0.064 0.112 0.556 0.008 0.260
#> SRR2105488 3 0.7100 0.4818 0.064 0.116 0.552 0.008 0.260
#> SRR2105485 3 0.6551 0.6140 0.068 0.152 0.644 0.008 0.128
#> SRR2105486 3 0.6951 0.5912 0.056 0.208 0.592 0.012 0.132
#> SRR2105483 1 0.3855 0.3435 0.800 0.160 0.032 0.000 0.008
#> SRR2105484 1 0.3733 0.3375 0.808 0.156 0.028 0.000 0.008
#> SRR2105481 3 0.7908 0.4619 0.128 0.212 0.492 0.008 0.160
#> SRR2105482 3 0.7572 0.2709 0.244 0.160 0.504 0.004 0.088
#> SRR2105479 3 0.8228 0.4309 0.128 0.212 0.472 0.020 0.168
#> SRR2105480 3 0.8503 0.2361 0.244 0.212 0.392 0.012 0.140
#> SRR2105477 2 0.4399 0.8049 0.040 0.800 0.116 0.004 0.040
#> SRR2105478 2 0.4370 0.8147 0.048 0.804 0.108 0.004 0.036
#> SRR2105475 2 0.3183 0.8425 0.020 0.868 0.092 0.008 0.012
#> SRR2105476 2 0.3030 0.8453 0.016 0.876 0.088 0.008 0.012
#> SRR2105473 2 0.3853 0.8096 0.044 0.832 0.092 0.000 0.032
#> SRR2105474 2 0.3288 0.8303 0.040 0.864 0.076 0.000 0.020
#> SRR2105471 2 0.2583 0.8020 0.132 0.864 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105472 2 0.2439 0.8110 0.120 0.876 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105469 3 0.5575 0.6261 0.032 0.144 0.724 0.016 0.084
#> SRR2105470 3 0.5805 0.6186 0.080 0.164 0.696 0.004 0.056
#> SRR2105467 3 0.6295 0.5453 0.064 0.112 0.644 0.000 0.180
#> SRR2105468 3 0.6289 0.5756 0.068 0.140 0.652 0.000 0.140
#> SRR2105465 3 0.7767 -0.0699 0.260 0.236 0.428 0.000 0.076
#> SRR2105466 1 0.7602 0.3228 0.364 0.240 0.348 0.000 0.048
#> SRR2105463 1 0.6874 0.4599 0.588 0.132 0.212 0.004 0.064
#> SRR2105464 1 0.7571 0.5141 0.472 0.196 0.256 0.000 0.076
#> SRR2105461 2 0.0451 0.8552 0.008 0.988 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0771 0.8582 0.020 0.976 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.1956 0.8635 0.000 0.928 0.052 0.012 0.008
#> SRR2105460 2 0.1591 0.8643 0.004 0.940 0.052 0.000 0.004
#> SRR2105457 3 0.5508 0.6080 0.008 0.184 0.684 0.004 0.120
#> SRR2105458 3 0.5893 0.5943 0.016 0.204 0.660 0.008 0.112
#> SRR2105455 3 0.7749 0.4568 0.172 0.200 0.528 0.024 0.076
#> SRR2105456 3 0.6766 0.5549 0.120 0.196 0.612 0.008 0.064
#> SRR2105453 3 0.7614 0.3031 0.188 0.108 0.532 0.008 0.164
#> SRR2105454 3 0.7523 0.3354 0.176 0.096 0.540 0.008 0.180
#> SRR2105451 2 0.4963 0.6917 0.020 0.736 0.184 0.004 0.056
#> SRR2105452 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105449 3 0.7752 0.3640 0.180 0.252 0.464 0.000 0.104
#> SRR2105450 3 0.7795 0.3643 0.240 0.196 0.460 0.000 0.104
#> SRR2105447 2 0.2666 0.8581 0.016 0.896 0.072 0.004 0.012
#> SRR2105448 2 0.2311 0.8677 0.020 0.920 0.040 0.004 0.016
#> SRR2105445 2 0.6021 0.2940 0.012 0.580 0.316 0.004 0.088
#> SRR2105446 3 0.6975 0.1674 0.044 0.424 0.424 0.004 0.104
#> SRR2105443 2 0.6793 0.1504 0.012 0.524 0.332 0.028 0.104
#> SRR2105444 2 0.5700 0.6169 0.020 0.684 0.204 0.012 0.080
#> SRR2105441 2 0.2703 0.8508 0.024 0.896 0.060 0.000 0.020
#> SRR2105442 2 0.3227 0.8356 0.040 0.868 0.072 0.000 0.020
#> SRR2105437 3 0.5938 0.2577 0.056 0.032 0.576 0.000 0.336
#> SRR2105438 3 0.5880 0.2572 0.052 0.032 0.580 0.000 0.336
#> SRR2105435 3 0.7582 0.5107 0.124 0.232 0.524 0.008 0.112
#> SRR2105436 3 0.5504 0.6258 0.032 0.144 0.716 0.004 0.104
#> SRR2105433 1 0.7117 0.5249 0.552 0.196 0.180 0.000 0.072
#> SRR2105434 1 0.7514 0.4118 0.432 0.200 0.312 0.000 0.056
#> SRR2105431 1 0.8190 0.4073 0.388 0.140 0.328 0.008 0.136
#> SRR2105432 1 0.8164 0.3977 0.388 0.160 0.316 0.004 0.132
#> SRR2105429 2 0.5971 0.5935 0.024 0.680 0.184 0.020 0.092
#> SRR2105430 2 0.4836 0.7436 0.024 0.768 0.152 0.024 0.032
#> SRR2105427 2 0.2337 0.8599 0.004 0.904 0.080 0.004 0.008
#> SRR2105428 2 0.2612 0.8510 0.004 0.892 0.084 0.004 0.016
#> SRR2105425 2 0.2588 0.8626 0.008 0.900 0.068 0.004 0.020
#> SRR2105426 2 0.1579 0.8689 0.024 0.944 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105421 3 0.5709 0.6293 0.016 0.164 0.704 0.024 0.092
#> SRR2105422 3 0.6151 0.6287 0.036 0.164 0.684 0.028 0.088
#> SRR2105423 2 0.0703 0.8557 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0486 0.8566 0.004 0.988 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105419 3 0.5841 0.6281 0.040 0.168 0.700 0.016 0.076
#> SRR2105420 3 0.6440 0.5860 0.072 0.224 0.632 0.012 0.060
#> SRR2105415 1 0.7947 0.4862 0.452 0.152 0.268 0.004 0.124
#> SRR2105416 1 0.8006 0.4599 0.432 0.164 0.284 0.004 0.116
#> SRR2105417 1 0.7686 0.4631 0.440 0.160 0.320 0.004 0.076
#> SRR2105418 1 0.7584 0.4719 0.444 0.208 0.284 0.000 0.064
#> SRR2105413 2 0.3376 0.8274 0.004 0.852 0.108 0.016 0.020
#> SRR2105414 2 0.2672 0.8620 0.012 0.900 0.064 0.012 0.012
#> SRR2105409 2 0.1739 0.8698 0.032 0.940 0.024 0.000 0.004
#> SRR2105410 2 0.3197 0.8523 0.052 0.864 0.076 0.000 0.008
#> SRR2105411 2 0.1153 0.8630 0.024 0.964 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105412 2 0.1404 0.8628 0.028 0.956 0.004 0.004 0.008
#> SRR2105407 3 0.5343 0.5917 0.008 0.124 0.704 0.004 0.160
#> SRR2105408 3 0.5311 0.5923 0.008 0.128 0.716 0.008 0.140
#> SRR2105403 3 0.5386 0.3396 0.040 0.036 0.668 0.000 0.256
#> SRR2105404 3 0.5472 0.3814 0.028 0.056 0.664 0.000 0.252
#> SRR2105405 3 0.5993 0.5955 0.088 0.164 0.676 0.000 0.072
#> SRR2105406 3 0.7023 0.4790 0.176 0.188 0.572 0.004 0.060
#> SRR2105401 2 0.5404 0.6636 0.016 0.716 0.192 0.044 0.032
#> SRR2105402 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105399 2 0.6850 0.4536 0.012 0.600 0.200 0.140 0.048
#> SRR2105400 2 0.6744 0.4820 0.016 0.616 0.208 0.108 0.052
#> SRR2105397 2 0.8420 -0.2704 0.008 0.368 0.292 0.132 0.200
#> SRR2105398 2 0.8420 -0.2704 0.008 0.368 0.292 0.132 0.200
#> SRR2105395 2 0.1646 0.8655 0.032 0.944 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105396 2 0.0693 0.8598 0.012 0.980 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0955 0.8592 0.028 0.968 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.2228 0.8473 0.076 0.908 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105389 3 0.5615 0.5826 0.008 0.100 0.712 0.032 0.148
#> SRR2105390 3 0.5728 0.6141 0.028 0.116 0.716 0.020 0.120
#> SRR2105391 3 0.5260 0.6047 0.008 0.112 0.736 0.020 0.124
#> SRR2105392 3 0.5349 0.6073 0.008 0.116 0.732 0.024 0.120
#> SRR2105385 3 0.5911 0.6149 0.064 0.180 0.676 0.000 0.080
#> SRR2105386 3 0.6070 0.5958 0.108 0.188 0.656 0.000 0.048
#> SRR2105387 3 0.7343 0.4826 0.128 0.232 0.540 0.004 0.096
#> SRR2105388 3 0.5409 0.6229 0.056 0.156 0.720 0.000 0.068
#> SRR2105381 2 0.5289 0.6986 0.020 0.732 0.176 0.032 0.040
#> SRR2105382 2 0.3584 0.8446 0.036 0.856 0.076 0.008 0.024
#> SRR2105383 2 0.2338 0.8616 0.048 0.916 0.024 0.004 0.008
#> SRR2105384 2 0.2301 0.8613 0.048 0.916 0.028 0.004 0.004
#> SRR2105379 2 0.2937 0.8555 0.020 0.888 0.068 0.012 0.012
#> SRR2105380 2 0.3973 0.8325 0.056 0.840 0.064 0.016 0.024
#> SRR2105377 2 0.3715 0.8175 0.032 0.832 0.112 0.000 0.024
#> SRR2105378 2 0.3886 0.7957 0.040 0.828 0.100 0.000 0.032
#> SRR2105375 3 0.8223 0.1846 0.180 0.288 0.396 0.004 0.132
#> SRR2105376 3 0.8211 0.1736 0.180 0.264 0.424 0.008 0.124
#> SRR2105373 3 0.5488 0.4042 0.024 0.044 0.652 0.004 0.276
#> SRR2105374 3 0.5648 0.2976 0.036 0.036 0.604 0.000 0.324
#> SRR2105371 3 0.5955 0.5942 0.028 0.104 0.692 0.020 0.156
#> SRR2105372 3 0.5261 0.6181 0.024 0.120 0.748 0.016 0.092
#> SRR2105369 3 0.4869 0.6193 0.016 0.140 0.748 0.000 0.096
#> SRR2105370 3 0.5170 0.6190 0.056 0.164 0.732 0.000 0.048
#> SRR2105367 3 0.8179 0.0345 0.248 0.244 0.384 0.000 0.124
#> SRR2105368 3 0.8188 0.0758 0.236 0.232 0.396 0.000 0.136
#> SRR2105365 2 0.2692 0.8419 0.096 0.884 0.008 0.008 0.004
#> SRR2105366 2 0.2736 0.8465 0.084 0.888 0.016 0.008 0.004
#> SRR2105363 2 0.2430 0.8676 0.020 0.912 0.052 0.004 0.012
#> SRR2105364 2 0.1347 0.8646 0.008 0.960 0.020 0.004 0.008
#> SRR2105361 2 0.1116 0.8644 0.004 0.964 0.028 0.004 0.000
#> SRR2105362 2 0.1106 0.8653 0.012 0.964 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.5617 0.6326 0.016 0.168 0.700 0.012 0.104
#> SRR2105360 3 0.5296 0.6286 0.032 0.160 0.728 0.004 0.076
#> SRR2105355 3 0.6318 0.6293 0.060 0.156 0.672 0.016 0.096
#> SRR2105356 3 0.5858 0.6080 0.084 0.164 0.692 0.004 0.056
#> SRR2105353 3 0.7028 0.4646 0.016 0.084 0.612 0.128 0.160
#> SRR2105354 3 0.6747 0.6055 0.040 0.136 0.656 0.060 0.108
#> SRR2105351 2 0.1569 0.8684 0.012 0.948 0.032 0.008 0.000
#> SRR2105352 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105349 2 0.3545 0.8421 0.032 0.856 0.084 0.012 0.016
#> SRR2105350 2 0.1717 0.8667 0.008 0.936 0.052 0.000 0.004
#> SRR2105345 2 0.2536 0.8575 0.032 0.904 0.052 0.000 0.012
#> SRR2105346 2 0.1978 0.8661 0.024 0.928 0.044 0.000 0.004
#> SRR2105347 2 0.4577 0.5773 0.244 0.716 0.028 0.000 0.012
#> SRR2105348 2 0.4439 0.5921 0.236 0.728 0.024 0.000 0.012
#> SRR2105343 2 0.0451 0.8565 0.008 0.988 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.1281 0.8658 0.012 0.956 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.5169 0.6114 0.008 0.120 0.740 0.016 0.116
#> SRR2105342 3 0.4684 0.6173 0.020 0.136 0.776 0.008 0.060
#> SRR2105339 3 0.5196 0.6245 0.020 0.164 0.736 0.012 0.068
#> SRR2105340 3 0.6183 0.6186 0.044 0.164 0.676 0.016 0.100
#> SRR2105335 3 0.6140 0.5116 0.056 0.068 0.656 0.008 0.212
#> SRR2105336 3 0.7010 0.4866 0.144 0.088 0.592 0.004 0.172
#> SRR2105337 3 0.6069 0.5822 0.100 0.200 0.652 0.000 0.048
#> SRR2105338 3 0.6578 0.5553 0.140 0.196 0.608 0.000 0.056
#> SRR2105331 2 0.2142 0.8684 0.028 0.920 0.048 0.000 0.004
#> SRR2105332 2 0.1267 0.8626 0.024 0.960 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105333 2 0.2945 0.8486 0.012 0.880 0.084 0.004 0.020
#> SRR2105334 2 0.3244 0.8421 0.012 0.868 0.088 0.016 0.016
#> SRR2105329 2 0.5335 0.4438 0.008 0.628 0.320 0.012 0.032
#> SRR2105330 2 0.5313 0.5424 0.020 0.664 0.272 0.004 0.040
#> SRR2105327 2 0.1809 0.8661 0.012 0.928 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105328 2 0.2741 0.8603 0.024 0.896 0.064 0.008 0.008
#> SRR2105325 3 0.8338 0.2335 0.068 0.064 0.468 0.144 0.256
#> SRR2105326 3 0.8370 0.2351 0.072 0.064 0.468 0.144 0.252
#> SRR2105323 3 0.6028 0.6170 0.020 0.188 0.680 0.036 0.076
#> SRR2105324 3 0.6299 0.6304 0.024 0.168 0.668 0.036 0.104
#> SRR2105319 3 0.7129 0.5051 0.116 0.112 0.580 0.004 0.188
#> SRR2105320 3 0.7288 0.4592 0.144 0.100 0.560 0.004 0.192
#> SRR2105321 3 0.7603 0.2795 0.028 0.060 0.524 0.132 0.256
#> SRR2105322 3 0.7603 0.2795 0.028 0.060 0.524 0.132 0.256
#> SRR2105317 2 0.3076 0.8480 0.008 0.876 0.084 0.016 0.016
#> SRR2105318 2 0.1603 0.8681 0.004 0.948 0.032 0.012 0.004
#> SRR2105315 2 0.5347 0.1860 0.008 0.588 0.364 0.004 0.036
#> SRR2105316 2 0.2615 0.8550 0.008 0.892 0.080 0.000 0.020
#> SRR2105313 2 0.2381 0.8665 0.012 0.912 0.060 0.008 0.008
#> SRR2105314 2 0.1630 0.8661 0.016 0.944 0.036 0.000 0.004
#> SRR2105311 3 0.8737 0.3334 0.084 0.100 0.444 0.128 0.244
#> SRR2105312 3 0.8877 0.3157 0.100 0.100 0.436 0.132 0.232
#> SRR2105307 3 0.7202 0.4142 0.196 0.136 0.568 0.004 0.096
#> SRR2105308 3 0.7414 0.2538 0.236 0.212 0.496 0.004 0.052
#> SRR2105309 3 0.5344 0.6260 0.016 0.160 0.724 0.012 0.088
#> SRR2105310 3 0.6205 0.5912 0.028 0.224 0.644 0.016 0.088
#> SRR2105305 3 0.4831 0.6171 0.004 0.136 0.756 0.012 0.092
#> SRR2105306 3 0.5252 0.6239 0.040 0.152 0.740 0.008 0.060
#> SRR2105303 2 0.1329 0.8670 0.008 0.956 0.032 0.000 0.004
#> SRR2105304 4 0.0324 0.8264 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR2105301 2 0.2666 0.8575 0.016 0.896 0.072 0.012 0.004
#> SRR2105302 2 0.3006 0.8532 0.016 0.884 0.072 0.012 0.016
#> SRR2105299 3 0.6892 0.2929 0.020 0.360 0.484 0.012 0.124
#> SRR2105300 2 0.6067 0.4318 0.028 0.616 0.280 0.008 0.068
#> SRR2105297 1 0.4121 0.3098 0.720 0.264 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105298 1 0.4146 0.3091 0.716 0.268 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105295 2 0.2963 0.8449 0.004 0.876 0.092 0.012 0.016
#> SRR2105296 2 0.2744 0.8579 0.024 0.892 0.072 0.004 0.008
#> SRR2105293 3 0.8515 0.4582 0.104 0.188 0.480 0.060 0.168
#> SRR2105294 3 0.7958 0.4894 0.112 0.216 0.516 0.028 0.128
#> SRR2105291 3 0.7528 0.3979 0.112 0.252 0.520 0.008 0.108
#> SRR2105292 3 0.7940 0.1816 0.276 0.168 0.444 0.004 0.108
#> SRR2105289 3 0.6137 0.6140 0.064 0.188 0.668 0.008 0.072
#> SRR2105290 3 0.7269 0.4529 0.200 0.208 0.524 0.000 0.068
#> SRR2105287 3 0.7684 0.2392 0.260 0.188 0.472 0.004 0.076
#> SRR2105288 3 0.7992 -0.2460 0.340 0.228 0.360 0.008 0.064
#> SRR2105285 2 0.4038 0.8097 0.016 0.824 0.112 0.024 0.024
#> SRR2105286 2 0.3403 0.8390 0.016 0.860 0.092 0.016 0.016
#> SRR2105283 2 0.4956 0.7357 0.076 0.764 0.120 0.004 0.036
#> SRR2105284 2 0.4439 0.7826 0.024 0.796 0.124 0.008 0.048
#> SRR2105281 2 0.1664 0.8687 0.020 0.948 0.020 0.004 0.008
#> SRR2105282 2 0.0727 0.8610 0.004 0.980 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105259 3 0.5305 0.5868 0.004 0.124 0.708 0.008 0.156
#> SRR2105260 3 0.5683 0.5926 0.012 0.132 0.692 0.012 0.152
#> SRR2105279 2 0.0794 0.8542 0.028 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0955 0.8566 0.028 0.968 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105257 3 0.7565 0.3197 0.196 0.104 0.536 0.008 0.156
#> SRR2105258 3 0.7755 0.2609 0.240 0.112 0.500 0.008 0.140
#> SRR2105253 2 0.2700 0.8617 0.016 0.900 0.060 0.008 0.016
#> SRR2105254 2 0.2011 0.8668 0.020 0.928 0.044 0.000 0.008
#> SRR2105255 3 0.4845 0.6216 0.020 0.144 0.752 0.000 0.084
#> SRR2105256 3 0.5605 0.6223 0.052 0.172 0.700 0.000 0.076
#> SRR2105251 2 0.1365 0.8573 0.040 0.952 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105252 2 0.1924 0.8544 0.064 0.924 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105249 2 0.2204 0.8673 0.016 0.920 0.048 0.000 0.016
#> SRR2105250 2 0.3114 0.8397 0.036 0.872 0.076 0.000 0.016
#> SRR2105247 2 0.0865 0.8630 0.024 0.972 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0510 0.8553 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.8224 0.4588 0.076 0.256 0.484 0.060 0.124
#> SRR2105246 3 0.8170 0.3921 0.076 0.296 0.456 0.044 0.128
#> SRR2105243 3 0.5216 0.6215 0.032 0.188 0.716 0.000 0.064
#> SRR2105244 3 0.6681 0.5997 0.064 0.184 0.616 0.004 0.132
#> SRR2105241 3 0.6584 0.5606 0.120 0.200 0.612 0.000 0.068
#> SRR2105242 3 0.7434 0.1992 0.252 0.200 0.484 0.000 0.064
#> SRR2105239 5 0.7023 0.5444 0.148 0.024 0.260 0.020 0.548
#> SRR2105240 3 0.8015 0.1483 0.256 0.216 0.440 0.012 0.076
#> SRR2105237 2 0.5172 0.7103 0.024 0.728 0.192 0.016 0.040
#> SRR2105238 2 0.3777 0.8137 0.012 0.820 0.140 0.008 0.020
#> SRR2105235 2 0.2786 0.8477 0.012 0.884 0.084 0.000 0.020
#> SRR2105236 2 0.2906 0.8420 0.028 0.880 0.080 0.000 0.012
#> SRR2105233 2 0.3095 0.8415 0.012 0.872 0.092 0.012 0.012
#> SRR2105234 2 0.2873 0.8433 0.008 0.880 0.092 0.012 0.008
#> SRR2105231 2 0.1661 0.8670 0.036 0.940 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0451 0.8571 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.7056 0.4697 0.048 0.276 0.552 0.016 0.108
#> SRR2105228 2 0.7294 -0.1365 0.100 0.492 0.320 0.004 0.084
#> SRR2105225 3 0.6429 0.5727 0.136 0.156 0.648 0.008 0.052
#> SRR2105226 3 0.7256 0.3548 0.244 0.156 0.532 0.004 0.064
#> SRR2105229 3 0.6704 0.5752 0.020 0.208 0.620 0.044 0.108
#> SRR2105230 3 0.5816 0.6276 0.032 0.148 0.700 0.012 0.108
#> SRR2105219 2 0.1446 0.8626 0.004 0.952 0.036 0.004 0.004
#> SRR2105220 2 0.2513 0.8610 0.012 0.900 0.076 0.008 0.004
#> SRR2105221 2 0.4467 0.7833 0.036 0.796 0.116 0.004 0.048
#> SRR2105222 2 0.4271 0.7774 0.056 0.804 0.108 0.000 0.032
#> SRR2105223 3 0.4992 0.6222 0.036 0.132 0.752 0.000 0.080
#> SRR2105224 3 0.6082 0.6193 0.076 0.168 0.668 0.000 0.088
#> SRR2105217 2 0.1638 0.8501 0.064 0.932 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.2170 0.8368 0.088 0.904 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105215 2 0.0992 0.8577 0.024 0.968 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0404 0.8581 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.8045 0.4790 0.072 0.248 0.500 0.048 0.132
#> SRR2105214 3 0.7935 0.4785 0.072 0.252 0.508 0.044 0.124
#> SRR2105211 3 0.5670 0.6144 0.016 0.128 0.692 0.008 0.156
#> SRR2105212 3 0.5625 0.5908 0.044 0.240 0.672 0.008 0.036
#> SRR2105209 3 0.7151 0.5305 0.124 0.160 0.592 0.008 0.116
#> SRR2105210 3 0.7730 0.1126 0.268 0.176 0.468 0.004 0.084
#> SRR2105207 3 0.7734 0.2275 0.304 0.184 0.428 0.000 0.084
#> SRR2105208 1 0.7704 0.3145 0.396 0.192 0.340 0.000 0.072
#> SRR2105205 2 0.3337 0.8541 0.052 0.868 0.060 0.012 0.008
#> SRR2105206 2 0.3460 0.8531 0.044 0.860 0.072 0.004 0.020
#> SRR2105201 2 0.5436 0.6403 0.056 0.712 0.172 0.000 0.060
#> SRR2105202 2 0.4274 0.7692 0.040 0.796 0.132 0.000 0.032
#> SRR2105203 2 0.1018 0.8630 0.016 0.968 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0693 0.8585 0.012 0.980 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0510 0.8522 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.1862 0.8529 0.048 0.932 0.016 0.000 0.004
#> SRR2105197 3 0.6284 0.4301 0.052 0.056 0.624 0.012 0.256
#> SRR2105198 3 0.6424 0.4644 0.040 0.088 0.632 0.016 0.224
#> SRR2105195 3 0.8089 0.3141 0.172 0.288 0.432 0.012 0.096
#> SRR2105196 2 0.7398 -0.4035 0.140 0.416 0.376 0.000 0.068
#> SRR2105193 1 0.7845 0.4247 0.416 0.204 0.304 0.004 0.072
#> SRR2105194 1 0.7685 0.4852 0.456 0.172 0.280 0.000 0.092
#> SRR2105191 5 0.4841 0.4846 0.084 0.000 0.208 0.000 0.708
#> SRR2105192 3 0.7166 0.4197 0.124 0.088 0.576 0.008 0.204
#> SRR2105189 2 0.3882 0.7950 0.036 0.812 0.140 0.004 0.008
#> SRR2105190 2 0.2789 0.8557 0.016 0.888 0.080 0.004 0.012
#> SRR2105187 2 0.7168 0.4567 0.048 0.604 0.196 0.052 0.100
#> SRR2105188 2 0.6356 0.5519 0.056 0.648 0.192 0.008 0.096
#> SRR2105179 3 0.8101 0.3743 0.172 0.184 0.472 0.008 0.164
#> SRR2105180 3 0.8009 0.3376 0.204 0.200 0.472 0.008 0.116
#> SRR2105183 2 0.0290 0.8524 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1408 0.8608 0.044 0.948 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.3585 0.8289 0.040 0.860 0.064 0.024 0.012
#> SRR2105186 2 0.3345 0.8321 0.052 0.868 0.056 0.004 0.020
#> SRR2105181 3 0.5933 0.5205 0.028 0.100 0.640 0.000 0.232
#> SRR2105182 3 0.5655 0.6179 0.044 0.124 0.712 0.004 0.116
#> SRR2105177 1 0.4865 0.3576 0.748 0.168 0.040 0.000 0.044
#> SRR2105178 1 0.3928 0.3422 0.800 0.152 0.040 0.000 0.008
#> SRR2105171 2 0.1393 0.8677 0.012 0.956 0.024 0.000 0.008
#> SRR2105172 2 0.1405 0.8626 0.020 0.956 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105175 1 0.7215 0.5271 0.504 0.220 0.228 0.000 0.048
#> SRR2105176 1 0.8052 0.3478 0.368 0.224 0.308 0.000 0.100
#> SRR2105173 2 0.1444 0.8641 0.040 0.948 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105174 2 0.0740 0.8600 0.008 0.980 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105169 2 0.1364 0.8616 0.036 0.952 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.1757 0.8642 0.048 0.936 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105167 2 0.1282 0.8577 0.044 0.952 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.1430 0.8539 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.6890 0.5871 0.080 0.136 0.632 0.020 0.132
#> SRR2105166 3 0.6790 0.5885 0.072 0.144 0.628 0.012 0.144
#> SRR2105163 3 0.7974 0.3626 0.080 0.068 0.548 0.128 0.176
#> SRR2105164 3 0.8425 0.3056 0.104 0.064 0.492 0.136 0.204
#> SRR2105161 3 0.7916 -0.1537 0.312 0.236 0.372 0.000 0.080
#> SRR2105162 1 0.7731 0.3339 0.396 0.200 0.332 0.000 0.072
#> SRR2105155 2 0.1205 0.8631 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR2105156 2 0.0912 0.8590 0.016 0.972 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.1041 0.8601 0.032 0.964 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.1364 0.8628 0.036 0.952 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105159 3 0.8026 0.3708 0.228 0.140 0.488 0.016 0.128
#> SRR2105160 3 0.8206 -0.1238 0.336 0.196 0.352 0.004 0.112
#> SRR2105153 2 0.1282 0.8628 0.044 0.952 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105154 2 0.1830 0.8647 0.052 0.932 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105151 2 0.0955 0.8597 0.028 0.968 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.1197 0.8534 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.7189 0.4056 0.040 0.312 0.520 0.024 0.104
#> SRR2105150 3 0.7056 0.4188 0.020 0.300 0.528 0.028 0.124
#> SRR2105147 4 0.6789 0.2317 0.016 0.016 0.188 0.572 0.208
#> SRR2105148 4 0.6789 0.2317 0.016 0.016 0.188 0.572 0.208
#> SRR2105143 3 0.7504 0.2945 0.180 0.276 0.472 0.000 0.072
#> SRR2105144 2 0.7867 -0.6409 0.312 0.316 0.308 0.000 0.064
#> SRR2105145 1 0.8155 0.3224 0.380 0.220 0.320 0.020 0.060
#> SRR2105146 1 0.7507 0.3489 0.408 0.200 0.340 0.000 0.052
#> SRR2105141 2 0.1644 0.8677 0.012 0.948 0.028 0.004 0.008
#> SRR2105142 2 0.1603 0.8675 0.012 0.948 0.032 0.004 0.004
#> SRR2105139 2 0.0566 0.8571 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0880 0.8581 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.3968 0.7971 0.040 0.816 0.120 0.000 0.024
#> SRR2105138 2 0.5018 0.7361 0.092 0.756 0.120 0.004 0.028
#> SRR2105135 2 0.0609 0.8525 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0609 0.8529 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.5933 0.4422 0.036 0.072 0.648 0.004 0.240
#> SRR2105134 3 0.5884 0.4422 0.032 0.072 0.648 0.004 0.244
#> SRR2105131 3 0.7482 0.1699 0.044 0.360 0.424 0.008 0.164
#> SRR2105132 3 0.7716 0.3699 0.088 0.292 0.480 0.012 0.128
#> SRR2105129 1 0.6956 0.4825 0.564 0.176 0.200 0.000 0.060
#> SRR2105130 1 0.3733 0.3375 0.808 0.156 0.028 0.000 0.008
#> SRR2105127 3 0.8050 0.2945 0.160 0.180 0.480 0.008 0.172
#> SRR2105128 3 0.7410 0.2825 0.116 0.324 0.476 0.004 0.080
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 3 0.5572 0.15043 0.016 0.036 0.576 0.000 0.332 0.040
#> SRR2105278 3 0.5631 0.16745 0.016 0.044 0.572 0.000 0.332 0.036
#> SRR2105275 3 0.7438 -0.60486 0.040 0.028 0.432 0.120 0.344 0.036
#> SRR2105276 3 0.7776 -0.49934 0.052 0.068 0.412 0.088 0.348 0.032
#> SRR2105273 3 0.5130 0.35372 0.036 0.044 0.712 0.004 0.180 0.024
#> SRR2105274 3 0.5081 0.42482 0.052 0.072 0.752 0.004 0.080 0.040
#> SRR2105271 3 0.6508 0.45274 0.076 0.120 0.632 0.004 0.116 0.052
#> SRR2105272 3 0.7470 0.30004 0.220 0.100 0.484 0.000 0.152 0.044
#> SRR2105269 2 0.1742 0.87380 0.004 0.936 0.040 0.004 0.008 0.008
#> SRR2105270 2 0.2970 0.86980 0.008 0.872 0.064 0.004 0.044 0.008
#> SRR2105267 2 0.2073 0.87567 0.004 0.920 0.048 0.008 0.016 0.004
#> SRR2105268 2 0.0912 0.86566 0.012 0.972 0.004 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105265 2 0.0551 0.86134 0.004 0.984 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105266 2 0.0924 0.86908 0.008 0.972 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105263 2 0.3571 0.83911 0.084 0.836 0.012 0.000 0.028 0.040
#> SRR2105264 2 0.3425 0.84631 0.072 0.848 0.016 0.000 0.024 0.040
#> SRR2105261 3 0.7580 0.12845 0.008 0.236 0.460 0.064 0.192 0.040
#> SRR2105262 3 0.6788 0.19843 0.004 0.188 0.544 0.052 0.192 0.020
#> SRR2105357 3 0.5914 0.20885 0.016 0.064 0.568 0.004 0.316 0.032
#> SRR2105358 3 0.5504 0.31779 0.008 0.076 0.636 0.000 0.244 0.036
#> SRR2105439 2 0.4913 0.73593 0.040 0.744 0.084 0.000 0.112 0.020
#> SRR2105440 2 0.4148 0.79428 0.040 0.792 0.068 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105509 2 0.3827 0.82629 0.000 0.812 0.108 0.028 0.044 0.008
#> SRR2105510 2 0.3358 0.85010 0.004 0.844 0.100 0.012 0.028 0.012
#> SRR2105507 3 0.6578 0.34814 0.068 0.056 0.612 0.012 0.196 0.056
#> SRR2105508 3 0.5304 0.38219 0.020 0.064 0.720 0.008 0.140 0.048
#> SRR2105505 3 0.6858 0.41850 0.112 0.076 0.576 0.000 0.180 0.056
#> SRR2105506 3 0.7478 0.25884 0.192 0.088 0.480 0.000 0.196 0.044
#> SRR2105503 2 0.2808 0.85969 0.056 0.880 0.012 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105504 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3179 0.85978 0.020 0.856 0.088 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105502 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.6609 0.43388 0.056 0.180 0.600 0.008 0.124 0.032
#> SRR2105500 3 0.6672 0.43551 0.064 0.176 0.596 0.004 0.120 0.040
#> SRR2105497 2 0.3270 0.82654 0.036 0.840 0.100 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105498 2 0.2044 0.87517 0.032 0.924 0.008 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105495 2 0.3361 0.85956 0.012 0.848 0.072 0.000 0.052 0.016
#> SRR2105496 2 0.2959 0.85704 0.008 0.864 0.072 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105493 2 0.4222 0.80377 0.012 0.784 0.052 0.000 0.124 0.028
#> SRR2105494 2 0.4456 0.78620 0.032 0.764 0.100 0.000 0.100 0.004
#> SRR2105491 2 0.4531 0.81049 0.088 0.788 0.028 0.008 0.032 0.056
#> SRR2105492 2 0.4531 0.81049 0.088 0.788 0.028 0.008 0.032 0.056
#> SRR2105489 2 0.2507 0.85751 0.072 0.884 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105490 2 0.1623 0.86928 0.032 0.940 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105487 3 0.6336 -0.07619 0.044 0.052 0.440 0.000 0.428 0.036
#> SRR2105488 3 0.6383 -0.07810 0.044 0.056 0.436 0.000 0.428 0.036
#> SRR2105485 3 0.6449 0.42836 0.056 0.088 0.604 0.000 0.200 0.052
#> SRR2105486 3 0.6587 0.43452 0.056 0.136 0.612 0.004 0.144 0.048
#> SRR2105483 1 0.2662 0.25788 0.888 0.044 0.016 0.000 0.004 0.048
#> SRR2105484 1 0.2503 0.25781 0.896 0.044 0.012 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105481 3 0.7586 0.27761 0.140 0.132 0.492 0.004 0.192 0.040
#> SRR2105482 3 0.6817 0.16244 0.260 0.084 0.512 0.000 0.132 0.012
#> SRR2105479 3 0.7834 0.17974 0.144 0.140 0.460 0.012 0.212 0.032
#> SRR2105480 3 0.7848 0.11787 0.260 0.148 0.392 0.004 0.176 0.020
#> SRR2105477 2 0.4770 0.80978 0.036 0.764 0.088 0.000 0.076 0.036
#> SRR2105478 2 0.4801 0.81680 0.040 0.764 0.092 0.000 0.060 0.044
#> SRR2105475 2 0.3361 0.85276 0.024 0.848 0.092 0.004 0.020 0.012
#> SRR2105476 2 0.3193 0.85478 0.016 0.856 0.092 0.004 0.020 0.012
#> SRR2105473 2 0.3844 0.82120 0.048 0.820 0.048 0.000 0.076 0.008
#> SRR2105474 2 0.3429 0.84000 0.040 0.848 0.056 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105471 2 0.3235 0.81012 0.128 0.820 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105472 2 0.3044 0.81954 0.116 0.836 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105469 3 0.4930 0.40428 0.016 0.068 0.748 0.008 0.124 0.036
#> SRR2105470 3 0.5582 0.43070 0.080 0.072 0.712 0.004 0.096 0.036
#> SRR2105467 3 0.6045 0.34607 0.052 0.056 0.616 0.000 0.236 0.040
#> SRR2105468 3 0.6332 0.40683 0.084 0.072 0.608 0.000 0.204 0.032
#> SRR2105465 3 0.7680 -0.12094 0.288 0.148 0.408 0.000 0.124 0.032
#> SRR2105466 1 0.7212 0.37381 0.420 0.128 0.344 0.000 0.084 0.024
#> SRR2105463 1 0.5804 0.45758 0.656 0.048 0.180 0.000 0.092 0.024
#> SRR2105464 1 0.6671 0.54900 0.544 0.096 0.236 0.000 0.112 0.012
#> SRR2105461 2 0.0696 0.86289 0.008 0.980 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105462 2 0.1109 0.86756 0.016 0.964 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105459 2 0.2042 0.87226 0.000 0.920 0.048 0.008 0.016 0.008
#> SRR2105460 2 0.1780 0.87324 0.008 0.932 0.044 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105457 3 0.5383 0.39786 0.008 0.124 0.680 0.004 0.160 0.024
#> SRR2105458 3 0.5625 0.38314 0.004 0.144 0.652 0.008 0.168 0.024
#> SRR2105455 3 0.7762 0.35414 0.172 0.124 0.512 0.020 0.120 0.052
#> SRR2105456 3 0.6966 0.43466 0.116 0.120 0.596 0.008 0.104 0.056
#> SRR2105453 3 0.7496 0.11239 0.176 0.032 0.416 0.000 0.296 0.080
#> SRR2105454 3 0.7338 0.17044 0.152 0.036 0.432 0.000 0.312 0.068
#> SRR2105451 2 0.4949 0.72795 0.016 0.720 0.152 0.000 0.092 0.020
#> SRR2105452 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.7251 0.30583 0.220 0.156 0.484 0.000 0.124 0.016
#> SRR2105450 3 0.6771 0.28049 0.272 0.112 0.500 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105447 2 0.2997 0.86887 0.020 0.872 0.068 0.000 0.020 0.020
#> SRR2105448 2 0.2553 0.87648 0.016 0.904 0.032 0.004 0.024 0.020
#> SRR2105445 2 0.6174 0.36305 0.012 0.560 0.280 0.004 0.116 0.028
#> SRR2105446 2 0.6866 -0.28015 0.028 0.388 0.384 0.000 0.176 0.024
#> SRR2105443 2 0.7110 0.20350 0.024 0.488 0.276 0.016 0.160 0.036
#> SRR2105444 2 0.5916 0.64871 0.028 0.660 0.164 0.008 0.108 0.032
#> SRR2105441 2 0.2671 0.85987 0.024 0.888 0.028 0.000 0.056 0.004
#> SRR2105442 2 0.3469 0.84282 0.044 0.848 0.052 0.000 0.044 0.012
#> SRR2105437 5 0.5526 0.47207 0.036 0.004 0.368 0.004 0.548 0.040
#> SRR2105438 5 0.5583 0.47545 0.036 0.004 0.368 0.004 0.544 0.044
#> SRR2105435 3 0.7501 0.33056 0.120 0.176 0.488 0.004 0.184 0.028
#> SRR2105436 3 0.5090 0.41553 0.020 0.084 0.716 0.000 0.152 0.028
#> SRR2105433 1 0.6605 0.46474 0.612 0.088 0.172 0.008 0.084 0.036
#> SRR2105434 1 0.7040 0.47730 0.492 0.104 0.284 0.000 0.092 0.028
#> SRR2105431 1 0.7238 0.44971 0.428 0.060 0.300 0.000 0.188 0.024
#> SRR2105432 1 0.7181 0.48392 0.444 0.072 0.272 0.004 0.200 0.008
#> SRR2105429 2 0.5948 0.65252 0.028 0.664 0.148 0.020 0.120 0.020
#> SRR2105430 2 0.5012 0.77253 0.028 0.748 0.132 0.020 0.048 0.024
#> SRR2105427 2 0.2408 0.86801 0.004 0.892 0.084 0.004 0.008 0.008
#> SRR2105428 2 0.2949 0.85906 0.004 0.868 0.084 0.004 0.028 0.012
#> SRR2105425 2 0.2852 0.87245 0.020 0.880 0.064 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105426 2 0.1680 0.87790 0.020 0.940 0.024 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105421 3 0.5274 0.39165 0.016 0.100 0.720 0.012 0.124 0.028
#> SRR2105422 3 0.5651 0.39343 0.024 0.104 0.700 0.024 0.124 0.024
#> SRR2105423 2 0.1251 0.86805 0.024 0.956 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105424 2 0.0653 0.86453 0.004 0.980 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105419 3 0.5270 0.45052 0.024 0.096 0.716 0.012 0.136 0.016
#> SRR2105420 3 0.6277 0.43880 0.064 0.152 0.644 0.008 0.100 0.032
#> SRR2105415 1 0.6853 0.50119 0.520 0.072 0.232 0.000 0.160 0.016
#> SRR2105416 1 0.6917 0.51566 0.492 0.068 0.248 0.000 0.180 0.012
#> SRR2105417 1 0.7446 0.46979 0.464 0.080 0.284 0.004 0.124 0.044
#> SRR2105418 1 0.6973 0.50229 0.512 0.104 0.264 0.000 0.092 0.028
#> SRR2105413 2 0.3662 0.83513 0.004 0.824 0.112 0.016 0.032 0.012
#> SRR2105414 2 0.2898 0.87262 0.024 0.880 0.064 0.004 0.012 0.016
#> SRR2105409 2 0.1862 0.87771 0.016 0.932 0.012 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105410 2 0.3430 0.86309 0.040 0.852 0.048 0.000 0.044 0.016
#> SRR2105411 2 0.1439 0.87328 0.012 0.952 0.008 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105412 2 0.1621 0.87325 0.028 0.944 0.004 0.004 0.012 0.008
#> SRR2105407 3 0.5099 0.32155 0.000 0.072 0.664 0.004 0.236 0.024
#> SRR2105408 3 0.5069 0.33316 0.000 0.068 0.680 0.004 0.216 0.032
#> SRR2105403 3 0.5597 0.11587 0.016 0.000 0.524 0.000 0.360 0.100
#> SRR2105404 3 0.5717 0.12536 0.012 0.008 0.544 0.000 0.332 0.104
#> SRR2105405 3 0.5755 0.45871 0.088 0.092 0.688 0.000 0.100 0.032
#> SRR2105406 3 0.6916 0.38810 0.188 0.112 0.560 0.000 0.104 0.036
#> SRR2105401 2 0.5375 0.70688 0.012 0.700 0.180 0.036 0.052 0.020
#> SRR2105402 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.6633 0.50023 0.004 0.576 0.196 0.132 0.076 0.016
#> SRR2105400 2 0.6632 0.51122 0.004 0.584 0.204 0.100 0.084 0.024
#> SRR2105397 2 0.8036 -0.22932 0.004 0.348 0.188 0.104 0.312 0.044
#> SRR2105398 2 0.8036 -0.22932 0.004 0.348 0.188 0.104 0.312 0.044
#> SRR2105395 2 0.2207 0.87410 0.032 0.916 0.028 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105396 2 0.0912 0.86975 0.012 0.972 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105393 2 0.1194 0.86849 0.032 0.956 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105394 2 0.2773 0.85327 0.068 0.876 0.008 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105389 3 0.5170 0.14329 0.012 0.028 0.684 0.016 0.228 0.032
#> SRR2105390 3 0.4906 0.27557 0.024 0.036 0.732 0.008 0.172 0.028
#> SRR2105391 3 0.4762 0.30087 0.008 0.040 0.732 0.008 0.180 0.032
#> SRR2105392 3 0.4953 0.30121 0.012 0.040 0.724 0.012 0.180 0.032
#> SRR2105385 3 0.5472 0.44465 0.048 0.100 0.708 0.000 0.108 0.036
#> SRR2105386 3 0.5455 0.46417 0.108 0.112 0.700 0.000 0.064 0.016
#> SRR2105387 3 0.6913 0.41941 0.152 0.144 0.564 0.004 0.116 0.020
#> SRR2105388 3 0.5149 0.44078 0.056 0.068 0.732 0.000 0.116 0.028
#> SRR2105381 2 0.5398 0.72087 0.016 0.704 0.168 0.020 0.064 0.028
#> SRR2105382 2 0.3653 0.85625 0.024 0.840 0.072 0.004 0.040 0.020
#> SRR2105383 2 0.2674 0.87262 0.048 0.892 0.020 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105384 2 0.2534 0.87385 0.044 0.900 0.024 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105379 2 0.2977 0.87115 0.020 0.880 0.056 0.012 0.024 0.008
#> SRR2105380 2 0.4138 0.83455 0.064 0.812 0.064 0.008 0.040 0.012
#> SRR2105377 2 0.3858 0.83240 0.032 0.820 0.064 0.000 0.072 0.012
#> SRR2105378 2 0.3853 0.80924 0.044 0.820 0.060 0.000 0.068 0.008
#> SRR2105375 3 0.8209 0.13235 0.208 0.200 0.376 0.000 0.160 0.056
#> SRR2105376 3 0.8040 0.11232 0.220 0.172 0.388 0.000 0.180 0.040
#> SRR2105373 3 0.5185 -0.28016 0.016 0.004 0.480 0.004 0.464 0.032
#> SRR2105374 5 0.5509 0.43838 0.036 0.000 0.400 0.004 0.516 0.044
#> SRR2105371 3 0.5317 0.17972 0.020 0.036 0.672 0.008 0.232 0.032
#> SRR2105372 3 0.5010 0.36257 0.020 0.056 0.744 0.004 0.120 0.056
#> SRR2105369 3 0.4637 0.43880 0.020 0.060 0.768 0.000 0.104 0.048
#> SRR2105370 3 0.4708 0.45047 0.056 0.068 0.772 0.000 0.072 0.032
#> SRR2105367 3 0.8044 -0.02678 0.280 0.152 0.348 0.000 0.184 0.036
#> SRR2105368 3 0.8079 -0.00702 0.264 0.148 0.356 0.000 0.192 0.040
#> SRR2105365 2 0.3536 0.84004 0.084 0.840 0.008 0.004 0.024 0.040
#> SRR2105366 2 0.3553 0.84399 0.072 0.844 0.012 0.004 0.028 0.040
#> SRR2105363 2 0.2663 0.87489 0.016 0.892 0.048 0.000 0.032 0.012
#> SRR2105364 2 0.1425 0.87424 0.008 0.952 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105361 2 0.1261 0.87070 0.004 0.956 0.028 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105362 2 0.1282 0.87203 0.012 0.956 0.024 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105359 3 0.5310 0.43899 0.020 0.108 0.700 0.004 0.148 0.020
#> SRR2105360 3 0.4808 0.42150 0.028 0.076 0.744 0.000 0.132 0.020
#> SRR2105355 3 0.5869 0.43097 0.032 0.076 0.684 0.012 0.144 0.052
#> SRR2105356 3 0.5519 0.45006 0.076 0.080 0.716 0.004 0.092 0.032
#> SRR2105353 3 0.6705 -0.19385 0.020 0.032 0.552 0.112 0.260 0.024
#> SRR2105354 3 0.6358 0.21847 0.032 0.056 0.632 0.060 0.196 0.024
#> SRR2105351 2 0.1584 0.87650 0.012 0.944 0.032 0.004 0.004 0.004
#> SRR2105352 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.3801 0.84998 0.020 0.832 0.080 0.008 0.036 0.024
#> SRR2105350 2 0.1847 0.87534 0.008 0.928 0.048 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105345 2 0.2872 0.86775 0.036 0.884 0.036 0.000 0.028 0.016
#> SRR2105346 2 0.2066 0.87552 0.024 0.920 0.040 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105347 2 0.5256 0.57200 0.244 0.660 0.036 0.000 0.016 0.044
#> SRR2105348 2 0.4974 0.59711 0.240 0.680 0.032 0.000 0.016 0.032
#> SRR2105343 2 0.0810 0.86621 0.004 0.976 0.008 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105344 2 0.1736 0.87543 0.020 0.936 0.032 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105341 3 0.4615 0.32264 0.012 0.044 0.752 0.004 0.156 0.032
#> SRR2105342 3 0.4420 0.41367 0.020 0.064 0.784 0.004 0.104 0.024
#> SRR2105339 3 0.4771 0.41036 0.020 0.096 0.756 0.008 0.104 0.016
#> SRR2105340 3 0.5866 0.37626 0.040 0.096 0.684 0.016 0.136 0.028
#> SRR2105335 3 0.5912 0.09262 0.056 0.024 0.544 0.000 0.344 0.032
#> SRR2105336 3 0.6874 0.23057 0.152 0.040 0.492 0.000 0.284 0.032
#> SRR2105337 3 0.5601 0.45291 0.120 0.108 0.684 0.000 0.076 0.012
#> SRR2105338 3 0.6058 0.45117 0.152 0.112 0.640 0.000 0.080 0.016
#> SRR2105331 2 0.2332 0.87798 0.020 0.908 0.048 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105332 2 0.1439 0.87145 0.016 0.952 0.012 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105333 2 0.3203 0.85580 0.008 0.856 0.088 0.004 0.028 0.016
#> SRR2105334 2 0.3186 0.85981 0.012 0.864 0.076 0.012 0.024 0.012
#> SRR2105329 2 0.5594 0.42477 0.012 0.584 0.316 0.004 0.068 0.016
#> SRR2105330 2 0.5455 0.58407 0.016 0.644 0.240 0.000 0.076 0.024
#> SRR2105327 2 0.2119 0.87575 0.016 0.912 0.060 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105328 2 0.2943 0.87099 0.032 0.876 0.060 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105325 5 0.7665 0.65400 0.068 0.020 0.352 0.116 0.404 0.040
#> SRR2105326 5 0.7742 0.65614 0.076 0.020 0.352 0.116 0.396 0.040
#> SRR2105323 3 0.5897 0.44583 0.016 0.112 0.680 0.028 0.128 0.036
#> SRR2105324 3 0.6110 0.45259 0.032 0.092 0.680 0.036 0.120 0.040
#> SRR2105319 3 0.6839 0.11843 0.124 0.056 0.480 0.004 0.320 0.016
#> SRR2105320 3 0.6984 0.10572 0.148 0.048 0.456 0.000 0.320 0.028
#> SRR2105321 5 0.6612 0.64521 0.024 0.012 0.412 0.104 0.428 0.020
#> SRR2105322 5 0.6612 0.64521 0.024 0.012 0.412 0.104 0.428 0.020
#> SRR2105317 2 0.3252 0.85604 0.004 0.856 0.084 0.016 0.028 0.012
#> SRR2105318 2 0.1836 0.87644 0.004 0.936 0.028 0.012 0.008 0.012
#> SRR2105315 2 0.5655 0.11653 0.016 0.528 0.376 0.000 0.064 0.016
#> SRR2105316 2 0.2825 0.86605 0.008 0.876 0.076 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105313 2 0.2476 0.87607 0.008 0.900 0.060 0.004 0.012 0.016
#> SRR2105314 2 0.1672 0.87477 0.012 0.940 0.028 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105311 5 0.7966 0.58723 0.064 0.056 0.340 0.092 0.404 0.044
#> SRR2105312 5 0.8155 0.57988 0.076 0.056 0.332 0.096 0.392 0.048
#> SRR2105307 3 0.7342 0.23448 0.196 0.056 0.512 0.000 0.156 0.080
#> SRR2105308 3 0.7274 0.16849 0.252 0.124 0.492 0.000 0.092 0.040
#> SRR2105309 3 0.5443 0.43213 0.020 0.104 0.708 0.008 0.124 0.036
#> SRR2105310 3 0.6128 0.44412 0.040 0.148 0.652 0.012 0.120 0.028
#> SRR2105305 3 0.4479 0.37063 0.008 0.064 0.760 0.004 0.144 0.020
#> SRR2105306 3 0.5000 0.43127 0.024 0.084 0.748 0.004 0.100 0.040
#> SRR2105303 2 0.1406 0.87514 0.008 0.952 0.020 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105304 4 0.0291 0.80374 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.2837 0.86685 0.012 0.880 0.072 0.012 0.020 0.004
#> SRR2105302 2 0.3277 0.85900 0.016 0.860 0.072 0.012 0.032 0.008
#> SRR2105299 3 0.6924 0.16142 0.012 0.332 0.404 0.004 0.220 0.028
#> SRR2105300 2 0.6050 0.47273 0.012 0.592 0.224 0.000 0.140 0.032
#> SRR2105297 1 0.4226 0.19092 0.768 0.120 0.004 0.000 0.012 0.096
#> SRR2105298 1 0.4267 0.18997 0.764 0.124 0.004 0.000 0.012 0.096
#> SRR2105295 2 0.3144 0.85155 0.000 0.852 0.096 0.008 0.032 0.012
#> SRR2105296 2 0.2912 0.86701 0.008 0.876 0.072 0.004 0.024 0.016
#> SRR2105293 3 0.8290 -0.07092 0.104 0.132 0.416 0.044 0.264 0.040
#> SRR2105294 3 0.7635 0.22079 0.100 0.160 0.504 0.012 0.180 0.044
#> SRR2105291 3 0.7635 0.31140 0.112 0.176 0.472 0.000 0.192 0.048
#> SRR2105292 3 0.7244 0.03503 0.300 0.120 0.436 0.000 0.132 0.012
#> SRR2105289 3 0.5534 0.46546 0.076 0.104 0.704 0.004 0.096 0.016
#> SRR2105290 3 0.6744 0.38561 0.212 0.116 0.556 0.000 0.096 0.020
#> SRR2105287 3 0.7604 0.09521 0.276 0.096 0.440 0.000 0.140 0.048
#> SRR2105288 1 0.7513 0.28800 0.376 0.140 0.352 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105285 2 0.4180 0.82537 0.012 0.804 0.100 0.020 0.048 0.016
#> SRR2105286 2 0.3344 0.85458 0.012 0.852 0.088 0.012 0.024 0.012
#> SRR2105283 2 0.4938 0.77285 0.072 0.752 0.072 0.000 0.080 0.024
#> SRR2105284 2 0.4320 0.80896 0.024 0.784 0.084 0.000 0.092 0.016
#> SRR2105281 2 0.1887 0.87724 0.016 0.932 0.020 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105282 2 0.1026 0.87023 0.004 0.968 0.012 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105259 3 0.5236 0.32153 0.000 0.072 0.664 0.004 0.224 0.036
#> SRR2105260 3 0.5323 0.33235 0.000 0.072 0.656 0.008 0.232 0.032
#> SRR2105279 2 0.1116 0.86607 0.028 0.960 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105280 2 0.1074 0.86747 0.028 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105257 3 0.7468 0.07017 0.184 0.024 0.436 0.000 0.260 0.096
#> SRR2105258 3 0.7623 0.03987 0.224 0.036 0.416 0.000 0.244 0.080
#> SRR2105253 2 0.2857 0.87079 0.016 0.884 0.056 0.004 0.028 0.012
#> SRR2105254 2 0.2143 0.87408 0.012 0.916 0.048 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105255 3 0.4514 0.43925 0.028 0.060 0.768 0.000 0.124 0.020
#> SRR2105256 3 0.4995 0.46459 0.056 0.092 0.736 0.000 0.104 0.012
#> SRR2105251 2 0.1931 0.86566 0.040 0.924 0.004 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105252 2 0.2738 0.85779 0.056 0.884 0.004 0.004 0.008 0.044
#> SRR2105249 2 0.2263 0.87665 0.008 0.912 0.032 0.000 0.036 0.012
#> SRR2105250 2 0.3277 0.85193 0.028 0.860 0.044 0.000 0.052 0.016
#> SRR2105247 2 0.0964 0.87123 0.016 0.968 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105248 2 0.0820 0.86610 0.016 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105245 3 0.8004 0.16897 0.076 0.204 0.444 0.044 0.208 0.024
#> SRR2105246 3 0.8116 0.22115 0.076 0.244 0.424 0.032 0.184 0.040
#> SRR2105243 3 0.4864 0.47490 0.048 0.120 0.748 0.000 0.064 0.020
#> SRR2105244 3 0.6301 0.41363 0.072 0.124 0.624 0.000 0.152 0.028
#> SRR2105241 3 0.6170 0.43259 0.136 0.092 0.648 0.000 0.088 0.036
#> SRR2105242 3 0.7265 0.05028 0.272 0.116 0.464 0.000 0.128 0.020
#> SRR2105239 6 0.7184 0.52158 0.088 0.000 0.180 0.016 0.244 0.472
#> SRR2105240 3 0.8187 -0.00361 0.260 0.116 0.408 0.012 0.144 0.060
#> SRR2105237 2 0.5438 0.72968 0.016 0.700 0.152 0.008 0.088 0.036
#> SRR2105238 2 0.4043 0.82272 0.008 0.796 0.120 0.004 0.056 0.016
#> SRR2105235 2 0.2773 0.85954 0.008 0.880 0.056 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105236 2 0.2987 0.85183 0.020 0.872 0.044 0.000 0.056 0.008
#> SRR2105233 2 0.3173 0.85118 0.008 0.856 0.092 0.008 0.028 0.008
#> SRR2105234 2 0.2984 0.85290 0.004 0.864 0.092 0.008 0.024 0.008
#> SRR2105231 2 0.2139 0.87608 0.028 0.920 0.024 0.000 0.008 0.020
#> SRR2105232 2 0.0767 0.86541 0.004 0.976 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105227 3 0.6749 0.34269 0.056 0.208 0.564 0.016 0.144 0.012
#> SRR2105228 2 0.7428 -0.25139 0.108 0.416 0.328 0.000 0.116 0.032
#> SRR2105225 3 0.6154 0.42103 0.124 0.076 0.652 0.000 0.108 0.040
#> SRR2105226 3 0.7078 0.24806 0.248 0.068 0.524 0.000 0.096 0.064
#> SRR2105229 3 0.6493 0.27290 0.020 0.156 0.608 0.032 0.160 0.024
#> SRR2105230 3 0.5725 0.37217 0.024 0.088 0.684 0.012 0.156 0.036
#> SRR2105219 2 0.1629 0.86983 0.004 0.940 0.040 0.004 0.008 0.004
#> SRR2105220 2 0.2493 0.87132 0.008 0.896 0.064 0.004 0.024 0.004
#> SRR2105221 2 0.4425 0.79885 0.040 0.780 0.060 0.000 0.104 0.016
#> SRR2105222 2 0.4364 0.78832 0.060 0.788 0.072 0.000 0.068 0.012
#> SRR2105223 3 0.4790 0.43080 0.028 0.056 0.756 0.004 0.128 0.028
#> SRR2105224 3 0.5423 0.46089 0.080 0.084 0.712 0.000 0.100 0.024
#> SRR2105217 2 0.2689 0.85787 0.060 0.884 0.012 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105218 2 0.2750 0.84360 0.080 0.868 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105215 2 0.1396 0.87021 0.024 0.952 0.008 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105216 2 0.0653 0.86533 0.000 0.980 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105213 3 0.7736 0.21154 0.060 0.196 0.476 0.032 0.204 0.032
#> SRR2105214 3 0.7863 0.19594 0.068 0.204 0.460 0.032 0.204 0.032
#> SRR2105211 3 0.5778 0.37274 0.020 0.064 0.644 0.000 0.212 0.060
#> SRR2105212 3 0.5694 0.43196 0.020 0.172 0.664 0.004 0.112 0.028
#> SRR2105209 3 0.7419 0.36593 0.116 0.080 0.532 0.004 0.184 0.084
#> SRR2105210 3 0.6879 -0.01287 0.300 0.096 0.476 0.000 0.120 0.008
#> SRR2105207 3 0.7624 -0.01836 0.320 0.080 0.408 0.004 0.148 0.040
#> SRR2105208 1 0.6842 0.42441 0.460 0.088 0.336 0.000 0.104 0.012
#> SRR2105205 2 0.3757 0.86068 0.036 0.840 0.060 0.008 0.024 0.032
#> SRR2105206 2 0.3626 0.86215 0.032 0.840 0.068 0.000 0.032 0.028
#> SRR2105201 2 0.5632 0.66064 0.044 0.688 0.116 0.000 0.120 0.032
#> SRR2105202 2 0.4359 0.78009 0.040 0.776 0.088 0.000 0.092 0.004
#> SRR2105203 2 0.1317 0.87263 0.016 0.956 0.016 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105204 2 0.0984 0.86720 0.012 0.968 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105199 2 0.0820 0.86190 0.016 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105200 2 0.2314 0.86625 0.048 0.908 0.012 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105197 3 0.6092 -0.16143 0.028 0.020 0.496 0.004 0.388 0.064
#> SRR2105198 3 0.6361 -0.09337 0.020 0.048 0.496 0.008 0.372 0.056
#> SRR2105195 3 0.7981 0.28562 0.168 0.200 0.440 0.004 0.136 0.052
#> SRR2105196 3 0.7260 0.14540 0.140 0.352 0.396 0.000 0.096 0.016
#> SRR2105193 1 0.7468 0.44491 0.464 0.092 0.292 0.008 0.104 0.040
#> SRR2105194 1 0.7284 0.50598 0.488 0.084 0.264 0.004 0.128 0.032
#> SRR2105191 6 0.4738 0.50303 0.004 0.000 0.152 0.004 0.136 0.704
#> SRR2105192 3 0.6689 0.17642 0.112 0.028 0.488 0.000 0.328 0.044
#> SRR2105189 2 0.4279 0.80955 0.020 0.784 0.120 0.000 0.052 0.024
#> SRR2105190 2 0.3005 0.86384 0.012 0.868 0.084 0.004 0.016 0.016
#> SRR2105187 2 0.7308 0.47857 0.036 0.560 0.124 0.040 0.180 0.060
#> SRR2105188 2 0.6185 0.60997 0.060 0.628 0.136 0.000 0.152 0.024
#> SRR2105179 3 0.8047 0.27222 0.176 0.112 0.464 0.004 0.132 0.112
#> SRR2105180 3 0.7903 0.27170 0.216 0.128 0.448 0.004 0.152 0.052
#> SRR2105183 2 0.0260 0.85957 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1965 0.87078 0.040 0.924 0.004 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105185 2 0.3992 0.83151 0.044 0.828 0.060 0.024 0.032 0.012
#> SRR2105186 2 0.3548 0.84260 0.064 0.844 0.048 0.004 0.032 0.008
#> SRR2105181 3 0.5722 0.15499 0.012 0.056 0.540 0.000 0.360 0.032
#> SRR2105182 3 0.5474 0.33304 0.024 0.056 0.676 0.000 0.196 0.048
#> SRR2105177 1 0.4250 0.26974 0.808 0.064 0.028 0.004 0.052 0.044
#> SRR2105178 1 0.2831 0.27518 0.880 0.048 0.024 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105171 2 0.1629 0.87615 0.012 0.944 0.020 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105172 2 0.1381 0.87230 0.020 0.952 0.004 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105175 1 0.6953 0.53415 0.548 0.116 0.224 0.004 0.072 0.036
#> SRR2105176 1 0.7045 0.43186 0.444 0.108 0.316 0.000 0.124 0.008
#> SRR2105173 2 0.2014 0.87438 0.032 0.924 0.016 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105174 2 0.0924 0.86777 0.008 0.972 0.008 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105169 2 0.1691 0.87259 0.028 0.940 0.008 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105170 2 0.2007 0.87371 0.040 0.924 0.016 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105167 2 0.1578 0.87123 0.048 0.936 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105168 2 0.1493 0.86849 0.056 0.936 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105165 3 0.6534 0.26442 0.080 0.056 0.604 0.008 0.208 0.044
#> SRR2105166 3 0.6545 0.24697 0.072 0.064 0.596 0.004 0.216 0.048
#> SRR2105163 3 0.7585 -0.54756 0.080 0.016 0.448 0.100 0.312 0.044
#> SRR2105164 3 0.7796 -0.59478 0.092 0.016 0.416 0.104 0.324 0.048
#> SRR2105161 1 0.7706 0.23743 0.344 0.156 0.336 0.000 0.144 0.020
#> SRR2105162 1 0.6823 0.44478 0.468 0.084 0.328 0.000 0.108 0.012
#> SRR2105155 2 0.1401 0.87002 0.000 0.948 0.020 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105156 2 0.1007 0.86804 0.016 0.968 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105157 2 0.1232 0.86878 0.024 0.956 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105158 2 0.1807 0.87208 0.024 0.936 0.012 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105159 3 0.7413 -0.05872 0.252 0.052 0.436 0.008 0.228 0.024
#> SRR2105160 1 0.7294 0.20574 0.388 0.100 0.364 0.000 0.128 0.020
#> SRR2105153 2 0.2002 0.86903 0.040 0.920 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105154 2 0.2420 0.86951 0.044 0.904 0.008 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105151 2 0.1457 0.87188 0.028 0.948 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105152 2 0.1398 0.86887 0.052 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105149 3 0.7192 0.24833 0.036 0.240 0.508 0.016 0.164 0.036
#> SRR2105150 3 0.7131 0.24792 0.024 0.228 0.516 0.020 0.172 0.040
#> SRR2105147 4 0.6313 0.23257 0.008 0.008 0.108 0.540 0.300 0.036
#> SRR2105148 4 0.6313 0.23257 0.008 0.008 0.108 0.540 0.300 0.036
#> SRR2105143 3 0.7745 0.21455 0.212 0.160 0.464 0.004 0.116 0.044
#> SRR2105144 1 0.7724 0.25437 0.356 0.228 0.292 0.000 0.100 0.024
#> SRR2105145 1 0.8030 0.38400 0.416 0.104 0.300 0.020 0.100 0.060
#> SRR2105146 1 0.7451 0.40374 0.428 0.080 0.336 0.004 0.104 0.048
#> SRR2105141 2 0.1931 0.87692 0.004 0.928 0.032 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105142 2 0.1931 0.87681 0.004 0.928 0.032 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105139 2 0.0798 0.86690 0.012 0.976 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105140 2 0.1194 0.87157 0.032 0.956 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105137 2 0.3885 0.81734 0.036 0.812 0.072 0.000 0.076 0.004
#> SRR2105138 2 0.5514 0.73249 0.092 0.712 0.080 0.000 0.076 0.040
#> SRR2105135 2 0.0777 0.86563 0.024 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105136 2 0.0603 0.86356 0.016 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105133 3 0.5828 -0.00721 0.024 0.032 0.500 0.004 0.408 0.032
#> SRR2105134 3 0.5763 -0.00946 0.020 0.032 0.500 0.004 0.412 0.032
#> SRR2105131 3 0.7546 0.14422 0.024 0.308 0.340 0.000 0.260 0.068
#> SRR2105132 3 0.7724 0.29994 0.088 0.208 0.432 0.000 0.224 0.048
#> SRR2105129 1 0.6330 0.42785 0.640 0.084 0.156 0.004 0.068 0.048
#> SRR2105130 1 0.2569 0.26163 0.892 0.048 0.012 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105127 3 0.8140 0.18513 0.132 0.104 0.412 0.004 0.256 0.092
#> SRR2105128 3 0.7463 0.27550 0.112 0.248 0.472 0.000 0.128 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.925 0.949 0.970 0.4958 0.499 0.499
#> 3 3 0.581 0.686 0.831 0.2882 0.819 0.649
#> 4 4 0.567 0.663 0.779 0.1195 0.856 0.633
#> 5 5 0.570 0.481 0.698 0.0642 0.931 0.770
#> 6 6 0.583 0.448 0.655 0.0462 0.910 0.667
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105276 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105269 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105270 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105267 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105268 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105265 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105266 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105263 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105264 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105261 1 0.9129 0.502 0.672 0.328
#> SRR2105262 1 0.5842 0.837 0.860 0.140
#> SRR2105357 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105358 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.3114 0.939 0.056 0.944
#> SRR2105440 2 0.2423 0.951 0.040 0.960
#> SRR2105509 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105510 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105507 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105506 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105503 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105504 2 0.4562 0.892 0.096 0.904
#> SRR2105501 2 0.2236 0.954 0.036 0.964
#> SRR2105502 2 0.2236 0.946 0.036 0.964
#> SRR2105499 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105497 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105498 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105495 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105496 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105493 2 0.1633 0.962 0.024 0.976
#> SRR2105494 2 0.1633 0.962 0.024 0.976
#> SRR2105491 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105492 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105489 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105490 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105487 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105488 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105485 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105484 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105481 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105479 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105477 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105478 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105475 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105476 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105473 2 0.3274 0.935 0.060 0.940
#> SRR2105474 2 0.3114 0.939 0.056 0.944
#> SRR2105471 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105472 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105469 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105468 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105465 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105466 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105463 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105464 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105461 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105462 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105459 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105460 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105457 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.1184 0.972 0.984 0.016
#> SRR2105455 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105456 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105453 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105454 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105451 2 0.3733 0.927 0.072 0.928
#> SRR2105452 2 0.6887 0.788 0.184 0.816
#> SRR2105449 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105450 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105447 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105448 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105445 1 0.9580 0.357 0.620 0.380
#> SRR2105446 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105443 2 0.7950 0.722 0.240 0.760
#> SRR2105444 2 0.8861 0.604 0.304 0.696
#> SRR2105441 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105442 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105437 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105434 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105431 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105432 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105429 2 0.6623 0.820 0.172 0.828
#> SRR2105430 2 0.3733 0.928 0.072 0.928
#> SRR2105427 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105428 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105425 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105426 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105421 1 0.4815 0.883 0.896 0.104
#> SRR2105422 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105423 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105424 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105419 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105416 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105417 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105418 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105413 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105414 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105409 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105410 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105411 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105412 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105407 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105403 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105406 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105401 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105402 2 0.6712 0.798 0.176 0.824
#> SRR2105399 2 0.6343 0.834 0.160 0.840
#> SRR2105400 2 0.6623 0.819 0.172 0.828
#> SRR2105397 2 0.7745 0.742 0.228 0.772
#> SRR2105398 2 0.8555 0.656 0.280 0.720
#> SRR2105395 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105396 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105393 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105394 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105389 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105388 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105381 2 0.3114 0.942 0.056 0.944
#> SRR2105382 2 0.2236 0.957 0.036 0.964
#> SRR2105383 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105384 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105379 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105380 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105377 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105378 2 0.2043 0.957 0.032 0.968
#> SRR2105375 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105376 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105373 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.1184 0.975 0.984 0.016
#> SRR2105368 1 0.0938 0.978 0.988 0.012
#> SRR2105365 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105366 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105363 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105364 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105361 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105362 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105359 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0672 0.977 0.992 0.008
#> SRR2105354 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105352 2 0.6887 0.788 0.184 0.816
#> SRR2105349 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105350 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105345 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105346 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105347 2 0.2948 0.942 0.052 0.948
#> SRR2105348 2 0.3431 0.932 0.064 0.936
#> SRR2105343 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105344 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105341 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105340 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105337 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105338 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105331 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105332 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105333 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105334 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105329 2 0.5519 0.875 0.128 0.872
#> SRR2105330 2 0.3879 0.927 0.076 0.924
#> SRR2105327 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105328 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105325 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105324 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105318 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105315 2 0.9044 0.572 0.320 0.680
#> SRR2105316 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105313 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105314 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105311 1 0.4022 0.910 0.920 0.080
#> SRR2105312 1 0.6531 0.799 0.832 0.168
#> SRR2105307 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105308 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105309 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105304 2 0.2043 0.949 0.032 0.968
#> SRR2105301 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105302 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105299 1 0.6438 0.800 0.836 0.164
#> SRR2105300 2 0.9922 0.249 0.448 0.552
#> SRR2105297 2 0.6801 0.804 0.180 0.820
#> SRR2105298 2 0.6712 0.810 0.176 0.824
#> SRR2105295 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105296 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105293 1 0.0672 0.977 0.992 0.008
#> SRR2105294 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105292 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105289 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105287 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105288 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105285 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105286 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105283 2 0.2236 0.955 0.036 0.964
#> SRR2105284 2 0.5294 0.877 0.120 0.880
#> SRR2105281 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105282 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105259 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105260 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105279 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105280 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105257 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105258 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105253 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105254 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105255 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105252 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105249 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105250 2 0.3114 0.939 0.056 0.944
#> SRR2105247 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105248 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105245 1 0.5408 0.862 0.876 0.124
#> SRR2105246 1 0.9000 0.536 0.684 0.316
#> SRR2105243 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105242 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105239 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105240 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105237 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105238 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR2105235 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105236 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105233 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105234 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105231 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105232 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105227 1 0.0938 0.975 0.988 0.012
#> SRR2105228 1 0.2043 0.962 0.968 0.032
#> SRR2105225 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0376 0.981 0.996 0.004
#> SRR2105229 1 0.4298 0.901 0.912 0.088
#> SRR2105230 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105220 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105221 2 0.1633 0.962 0.024 0.976
#> SRR2105222 2 0.3114 0.939 0.056 0.944
#> SRR2105223 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105218 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105215 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105216 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105213 1 0.4562 0.892 0.904 0.096
#> SRR2105214 1 0.6623 0.793 0.828 0.172
#> SRR2105211 1 0.0672 0.978 0.992 0.008
#> SRR2105212 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105210 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105207 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105208 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105205 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105206 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105201 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105202 2 0.2948 0.942 0.052 0.948
#> SRR2105203 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105204 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105199 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105200 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105197 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0938 0.975 0.988 0.012
#> SRR2105195 1 0.1633 0.965 0.976 0.024
#> SRR2105196 1 0.2603 0.951 0.956 0.044
#> SRR2105193 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105194 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105191 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105189 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105190 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105187 2 0.1414 0.965 0.020 0.980
#> SRR2105188 2 0.2423 0.952 0.040 0.960
#> SRR2105179 1 0.0938 0.978 0.988 0.012
#> SRR2105180 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105183 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105184 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105185 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105186 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105181 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105178 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105171 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105172 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105175 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105176 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105173 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105174 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105169 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105170 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105167 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105168 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105165 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0672 0.977 0.992 0.008
#> SRR2105164 1 0.0376 0.980 0.996 0.004
#> SRR2105161 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105162 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105155 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105156 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105157 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105158 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105159 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105153 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105154 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105151 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105152 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105149 1 0.6623 0.793 0.828 0.172
#> SRR2105150 1 0.3114 0.934 0.944 0.056
#> SRR2105147 2 0.9522 0.430 0.372 0.628
#> SRR2105148 2 0.9686 0.366 0.396 0.604
#> SRR2105143 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105144 1 0.2948 0.943 0.948 0.052
#> SRR2105145 1 0.1414 0.972 0.980 0.020
#> SRR2105146 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR2105141 2 0.1184 0.967 0.016 0.984
#> SRR2105142 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105139 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105140 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105137 2 0.3879 0.921 0.076 0.924
#> SRR2105138 2 0.6801 0.805 0.180 0.820
#> SRR2105135 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105136 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105133 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.981 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9608 0.417 0.384 0.616
#> SRR2105132 1 0.4690 0.887 0.900 0.100
#> SRR2105129 1 0.1414 0.972 0.980 0.020
#> SRR2105130 1 0.0938 0.978 0.988 0.012
#> SRR2105127 1 0.1633 0.969 0.976 0.024
#> SRR2105128 1 0.5519 0.856 0.872 0.128
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.6154 0.41018 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105278 3 0.6295 0.23723 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105275 3 0.5098 0.58918 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105276 3 0.6045 0.47670 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105273 3 0.6299 0.26009 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105274 1 0.5216 0.59271 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105271 1 0.6252 0.02999 0.556 0.000 0.444
#> SRR2105272 1 0.1643 0.77849 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105269 2 0.2066 0.89682 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105270 2 0.1860 0.90000 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105267 2 0.2165 0.89572 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105268 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0661 0.91178 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105264 2 0.0747 0.90966 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105261 3 0.3683 0.59925 0.060 0.044 0.896
#> SRR2105262 3 0.4475 0.63947 0.144 0.016 0.840
#> SRR2105357 3 0.4605 0.62561 0.204 0.000 0.796
#> SRR2105358 3 0.6062 0.45063 0.384 0.000 0.616
#> SRR2105439 2 0.3889 0.84878 0.084 0.884 0.032
#> SRR2105440 2 0.3237 0.87091 0.056 0.912 0.032
#> SRR2105509 2 0.5706 0.67088 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105510 2 0.5621 0.68556 0.000 0.692 0.308
#> SRR2105507 3 0.6235 0.37176 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105508 3 0.5882 0.52954 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105505 1 0.4702 0.64496 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105506 1 0.3941 0.70893 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105503 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.5678 0.24310 0.000 0.316 0.684
#> SRR2105501 2 0.1267 0.90925 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105502 3 0.6154 -0.06828 0.000 0.408 0.592
#> SRR2105499 3 0.6180 0.40022 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105500 3 0.6252 0.31679 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105497 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.1289 0.90850 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105496 2 0.1711 0.90090 0.008 0.960 0.032
#> SRR2105493 2 0.2414 0.89070 0.020 0.940 0.040
#> SRR2105494 2 0.2414 0.88837 0.020 0.940 0.040
#> SRR2105491 2 0.1453 0.90762 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105492 2 0.1453 0.90532 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105489 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105487 1 0.5560 0.44405 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105488 1 0.3412 0.72270 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105485 3 0.6225 0.34583 0.432 0.000 0.568
#> SRR2105486 3 0.6252 0.32325 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105483 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.5733 0.33400 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105482 1 0.0892 0.78088 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105479 1 0.6140 0.09633 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105480 1 0.3482 0.71581 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105477 2 0.1989 0.90206 0.004 0.948 0.048
#> SRR2105478 2 0.1877 0.89695 0.012 0.956 0.032
#> SRR2105475 2 0.5706 0.67139 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105476 2 0.5706 0.67247 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105473 2 0.5298 0.76844 0.164 0.804 0.032
#> SRR2105474 2 0.4799 0.80332 0.132 0.836 0.032
#> SRR2105471 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105472 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105469 3 0.5948 0.51083 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105470 1 0.6026 0.31283 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105467 1 0.6267 0.06533 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105468 1 0.5327 0.57857 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105465 1 0.3038 0.75798 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105466 1 0.0424 0.77722 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105463 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.1163 0.90797 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105462 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.4750 0.79009 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105460 2 0.4178 0.82727 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105457 3 0.3941 0.64211 0.156 0.000 0.844
#> SRR2105458 3 0.3192 0.63302 0.112 0.000 0.888
#> SRR2105455 1 0.5431 0.57062 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105456 1 0.4702 0.65932 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105453 1 0.3686 0.73258 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105454 1 0.3816 0.72572 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105451 2 0.4007 0.86465 0.036 0.880 0.084
#> SRR2105452 3 0.4887 0.42689 0.000 0.228 0.772
#> SRR2105449 1 0.2261 0.76604 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105450 1 0.1163 0.77746 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105447 2 0.5216 0.74520 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105448 2 0.2066 0.89792 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105445 3 0.3415 0.61293 0.080 0.020 0.900
#> SRR2105446 3 0.6252 0.32384 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105443 3 0.6026 0.42689 0.024 0.244 0.732
#> SRR2105444 2 0.8195 0.49976 0.232 0.632 0.136
#> SRR2105441 2 0.1711 0.89924 0.032 0.960 0.008
#> SRR2105442 2 0.1529 0.89836 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105437 1 0.6192 0.00177 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105438 1 0.6126 0.08112 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105435 3 0.6180 0.45971 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105436 3 0.6244 0.36291 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105433 1 0.0747 0.77733 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105434 1 0.0592 0.77744 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105431 1 0.0237 0.77381 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.0237 0.77381 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105429 2 0.8890 0.41194 0.140 0.532 0.328
#> SRR2105430 2 0.7023 0.59397 0.032 0.624 0.344
#> SRR2105427 2 0.2356 0.89095 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105428 2 0.2356 0.89200 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105425 2 0.0424 0.91214 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105426 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105421 3 0.3918 0.63320 0.120 0.012 0.868
#> SRR2105422 3 0.4002 0.64012 0.160 0.000 0.840
#> SRR2105423 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.6045 0.47624 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105420 3 0.6126 0.45681 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105415 1 0.0747 0.76797 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105416 1 0.0592 0.76979 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105417 1 0.0592 0.77744 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105418 1 0.0237 0.77643 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105413 2 0.5650 0.68148 0.000 0.688 0.312
#> SRR2105414 2 0.5327 0.73298 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105409 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.1182 0.90642 0.012 0.976 0.012
#> SRR2105411 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0237 0.91182 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105407 3 0.3551 0.63995 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105408 3 0.3192 0.63529 0.112 0.000 0.888
#> SRR2105403 3 0.6045 0.45851 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105404 3 0.6180 0.39300 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105405 1 0.4452 0.68605 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105406 1 0.3686 0.73668 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105401 2 0.6307 0.34062 0.000 0.512 0.488
#> SRR2105402 3 0.5254 0.37678 0.000 0.264 0.736
#> SRR2105399 3 0.5835 0.20164 0.000 0.340 0.660
#> SRR2105400 3 0.5859 0.18857 0.000 0.344 0.656
#> SRR2105397 3 0.7281 0.46899 0.148 0.140 0.712
#> SRR2105398 3 0.7058 0.49162 0.180 0.100 0.720
#> SRR2105395 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0237 0.91182 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.3752 0.64126 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105390 3 0.4842 0.62543 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105391 3 0.3752 0.64095 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105392 3 0.3879 0.64118 0.152 0.000 0.848
#> SRR2105385 3 0.6291 0.26779 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105386 3 0.6295 0.25926 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105387 1 0.3116 0.76500 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105388 1 0.3116 0.76121 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105381 2 0.5882 0.61599 0.000 0.652 0.348
#> SRR2105382 2 0.6019 0.70168 0.012 0.700 0.288
#> SRR2105383 2 0.1453 0.90653 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105384 2 0.1989 0.89364 0.048 0.948 0.004
#> SRR2105379 2 0.4504 0.80081 0.000 0.804 0.196
#> SRR2105380 2 0.4618 0.81089 0.136 0.840 0.024
#> SRR2105377 2 0.1399 0.90236 0.004 0.968 0.028
#> SRR2105378 2 0.3337 0.86853 0.060 0.908 0.032
#> SRR2105375 1 0.3030 0.76666 0.904 0.004 0.092
#> SRR2105376 1 0.1411 0.77480 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105373 3 0.6286 0.30673 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105374 1 0.6140 0.07427 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105371 3 0.5254 0.61187 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105372 3 0.5760 0.55002 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105369 3 0.6291 0.26845 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105370 1 0.6192 0.16029 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105367 1 0.2063 0.76038 0.948 0.008 0.044
#> SRR2105368 1 0.1267 0.76233 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105365 2 0.1525 0.90625 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105366 2 0.0661 0.91178 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105363 2 0.0237 0.91212 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105364 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.5968 0.50171 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105360 3 0.6168 0.41986 0.412 0.000 0.588
#> SRR2105355 3 0.5785 0.55308 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105356 1 0.5785 0.46108 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105353 3 0.4842 0.61784 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105354 3 0.6154 0.47170 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105351 2 0.1031 0.90853 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105352 3 0.5254 0.37678 0.000 0.264 0.736
#> SRR2105349 2 0.5291 0.73718 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105350 2 0.0237 0.91212 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105345 2 0.1015 0.90814 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105346 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105347 2 0.5360 0.71717 0.220 0.768 0.012
#> SRR2105348 2 0.5986 0.62525 0.284 0.704 0.012
#> SRR2105343 2 0.0892 0.90988 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105344 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.4974 0.62240 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105342 3 0.6126 0.44152 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105339 3 0.4121 0.63928 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105340 3 0.5497 0.59719 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105335 1 0.6008 0.29410 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105336 1 0.3192 0.76140 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105337 1 0.5968 0.36836 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105338 1 0.2959 0.76699 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105331 2 0.0592 0.91136 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105332 2 0.0237 0.91208 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105333 2 0.5178 0.75204 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105334 2 0.3686 0.85007 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105329 3 0.5455 0.49364 0.028 0.184 0.788
#> SRR2105330 2 0.5763 0.69196 0.008 0.716 0.276
#> SRR2105327 2 0.4974 0.76459 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105328 2 0.4887 0.77092 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105325 3 0.5905 0.49789 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105326 3 0.6008 0.48160 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105323 3 0.5254 0.58263 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105324 3 0.6168 0.37535 0.412 0.000 0.588
#> SRR2105319 1 0.5835 0.36608 0.660 0.000 0.340
#> SRR2105320 1 0.3038 0.74693 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105321 3 0.5859 0.52400 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105322 3 0.6302 0.31445 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105317 2 0.4399 0.81601 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105318 2 0.2356 0.89201 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105315 3 0.6004 0.52231 0.064 0.156 0.780
#> SRR2105316 2 0.4291 0.82058 0.000 0.820 0.180
#> SRR2105313 2 0.3619 0.85396 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105314 2 0.0424 0.91210 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105311 3 0.6143 0.52759 0.304 0.012 0.684
#> SRR2105312 3 0.6750 0.48424 0.336 0.024 0.640
#> SRR2105307 1 0.4002 0.71051 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105308 1 0.4002 0.71264 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105309 3 0.3816 0.64261 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105310 3 0.5733 0.54489 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105305 3 0.4235 0.64051 0.176 0.000 0.824
#> SRR2105306 3 0.5591 0.57384 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105303 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.6140 -0.05431 0.000 0.404 0.596
#> SRR2105301 2 0.5397 0.71289 0.000 0.720 0.280
#> SRR2105302 2 0.1529 0.90433 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105299 3 0.3644 0.63021 0.124 0.004 0.872
#> SRR2105300 3 0.4288 0.58865 0.068 0.060 0.872
#> SRR2105297 2 0.6274 0.26917 0.456 0.544 0.000
#> SRR2105298 2 0.6641 0.27564 0.448 0.544 0.008
#> SRR2105295 2 0.5465 0.71241 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105296 2 0.2796 0.87652 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105293 3 0.5988 0.50145 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105294 1 0.5706 0.37138 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105291 1 0.4062 0.71582 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105292 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.6008 0.49609 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105290 1 0.1529 0.77860 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105287 1 0.2448 0.76693 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105288 1 0.0592 0.77708 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105285 2 0.5363 0.72780 0.000 0.724 0.276
#> SRR2105286 2 0.2261 0.89393 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105283 2 0.4174 0.84419 0.092 0.872 0.036
#> SRR2105284 2 0.3472 0.86947 0.056 0.904 0.040
#> SRR2105281 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0237 0.91212 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105259 3 0.3267 0.63606 0.116 0.000 0.884
#> SRR2105260 3 0.3340 0.63744 0.120 0.000 0.880
#> SRR2105279 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.2878 0.76302 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105258 1 0.0592 0.77968 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105253 2 0.0592 0.91114 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105254 2 0.0892 0.90971 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105255 3 0.6260 0.31097 0.448 0.000 0.552
#> SRR2105256 1 0.6302 -0.06036 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105251 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0983 0.90987 0.004 0.980 0.016
#> SRR2105250 2 0.4683 0.80126 0.140 0.836 0.024
#> SRR2105247 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.7658 0.48384 0.356 0.056 0.588
#> SRR2105246 3 0.8566 0.47031 0.188 0.204 0.608
#> SRR2105243 1 0.6274 0.02522 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105244 1 0.6126 0.17286 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105241 1 0.4178 0.72030 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105242 1 0.1031 0.77913 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105239 1 0.4399 0.67325 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105240 1 0.0747 0.78079 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105237 2 0.6079 0.56686 0.000 0.612 0.388
#> SRR2105238 2 0.3267 0.87617 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105235 2 0.1170 0.91050 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105236 2 0.1170 0.90840 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105233 2 0.5591 0.69193 0.000 0.696 0.304
#> SRR2105234 2 0.5621 0.68670 0.000 0.692 0.308
#> SRR2105231 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.7004 0.37351 0.428 0.020 0.552
#> SRR2105228 1 0.4189 0.73941 0.876 0.056 0.068
#> SRR2105225 1 0.5397 0.55374 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105226 1 0.2356 0.77582 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105229 3 0.2537 0.61898 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105230 3 0.6062 0.50561 0.384 0.000 0.616
#> SRR2105219 2 0.1964 0.89911 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105220 2 0.0237 0.91232 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105221 2 0.3039 0.87686 0.044 0.920 0.036
#> SRR2105222 2 0.5826 0.72096 0.204 0.764 0.032
#> SRR2105223 3 0.6267 0.31918 0.452 0.000 0.548
#> SRR2105224 1 0.5835 0.43574 0.660 0.000 0.340
#> SRR2105217 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.6481 0.61991 0.224 0.048 0.728
#> SRR2105214 3 0.7557 0.56819 0.264 0.080 0.656
#> SRR2105211 3 0.4121 0.64225 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105212 3 0.6204 0.38650 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105209 1 0.5058 0.62011 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105210 1 0.0747 0.78064 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105207 1 0.1031 0.78029 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105208 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.4521 0.80929 0.004 0.816 0.180
#> SRR2105206 2 0.0592 0.91171 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105201 2 0.2564 0.88635 0.036 0.936 0.028
#> SRR2105202 2 0.4519 0.81956 0.116 0.852 0.032
#> SRR2105203 2 0.0237 0.91231 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105204 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0237 0.91218 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105200 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105197 3 0.5291 0.60818 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105198 3 0.5058 0.61676 0.244 0.000 0.756
#> SRR2105195 1 0.7268 -0.02017 0.524 0.028 0.448
#> SRR2105196 1 0.3530 0.72095 0.900 0.068 0.032
#> SRR2105193 1 0.0747 0.77733 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105194 1 0.0747 0.77733 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105191 3 0.6215 0.36734 0.428 0.000 0.572
#> SRR2105192 1 0.2796 0.76171 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105189 2 0.2796 0.88163 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105190 2 0.1643 0.90360 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105187 2 0.5305 0.80078 0.020 0.788 0.192
#> SRR2105188 2 0.5241 0.79341 0.132 0.820 0.048
#> SRR2105179 1 0.4293 0.71714 0.832 0.004 0.164
#> SRR2105180 1 0.1289 0.77248 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105183 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0424 0.91111 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105185 2 0.0892 0.91007 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105186 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105181 3 0.5706 0.55107 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105182 3 0.6154 0.41546 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105177 1 0.0829 0.77651 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105178 1 0.0000 0.77552 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0747 0.77733 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105176 1 0.0424 0.77722 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105173 2 0.0237 0.91228 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105174 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0747 0.90882 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.6235 -0.04045 0.564 0.000 0.436
#> SRR2105166 1 0.5948 0.22939 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105163 3 0.5835 0.51263 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105164 3 0.6062 0.46303 0.384 0.000 0.616
#> SRR2105161 1 0.1031 0.77808 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105162 1 0.0237 0.77643 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 1 0.5363 0.48268 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105160 1 0.1163 0.77746 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105153 2 0.0237 0.91229 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105154 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.0237 0.91182 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105152 2 0.0237 0.91182 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105149 3 0.3845 0.61150 0.116 0.012 0.872
#> SRR2105150 3 0.2959 0.62064 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105147 3 0.4256 0.54597 0.036 0.096 0.868
#> SRR2105148 3 0.4256 0.54597 0.036 0.096 0.868
#> SRR2105143 1 0.2537 0.77310 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105144 1 0.3045 0.72792 0.916 0.064 0.020
#> SRR2105145 1 0.2063 0.77706 0.948 0.008 0.044
#> SRR2105146 1 0.1163 0.77746 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105141 2 0.3192 0.86870 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105142 2 0.2711 0.88519 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105139 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0237 0.91182 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105137 2 0.4007 0.84613 0.084 0.880 0.036
#> SRR2105138 2 0.5982 0.69103 0.228 0.744 0.028
#> SRR2105135 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.91234 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.6140 0.44547 0.404 0.000 0.596
#> SRR2105134 1 0.6244 0.05462 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105131 2 0.8511 0.13621 0.092 0.480 0.428
#> SRR2105132 1 0.6039 0.61468 0.788 0.108 0.104
#> SRR2105129 1 0.1015 0.77554 0.980 0.012 0.008
#> SRR2105130 1 0.0475 0.77484 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105127 1 0.5167 0.68419 0.804 0.024 0.172
#> SRR2105128 1 0.5951 0.63447 0.764 0.040 0.196
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.3308 0.723604 0.036 0.000 0.872 0.092
#> SRR2105278 3 0.3652 0.720074 0.052 0.000 0.856 0.092
#> SRR2105275 3 0.6769 0.604902 0.172 0.000 0.608 0.220
#> SRR2105276 3 0.7203 0.488548 0.288 0.000 0.536 0.176
#> SRR2105273 3 0.3606 0.744221 0.132 0.000 0.844 0.024
#> SRR2105274 1 0.5503 0.083386 0.516 0.000 0.468 0.016
#> SRR2105271 3 0.5172 0.638466 0.260 0.000 0.704 0.036
#> SRR2105272 1 0.2915 0.784206 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR2105269 2 0.4872 0.296143 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR2105270 2 0.4049 0.667985 0.000 0.780 0.008 0.212
#> SRR2105267 2 0.4585 0.382946 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105268 2 0.1302 0.838819 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105265 2 0.1022 0.840114 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105266 2 0.0817 0.843661 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105263 2 0.2238 0.832849 0.004 0.920 0.004 0.072
#> SRR2105264 2 0.1837 0.828568 0.028 0.944 0.000 0.028
#> SRR2105261 4 0.5575 -0.194796 0.004 0.012 0.480 0.504
#> SRR2105262 3 0.4815 0.688967 0.028 0.004 0.752 0.216
#> SRR2105357 3 0.2988 0.726261 0.012 0.000 0.876 0.112
#> SRR2105358 3 0.3279 0.725448 0.032 0.000 0.872 0.096
#> SRR2105439 2 0.4989 0.719747 0.020 0.792 0.056 0.132
#> SRR2105440 2 0.4490 0.740054 0.012 0.820 0.056 0.112
#> SRR2105509 4 0.4936 0.672837 0.000 0.340 0.008 0.652
#> SRR2105510 4 0.5085 0.649719 0.000 0.376 0.008 0.616
#> SRR2105507 3 0.3962 0.730038 0.152 0.000 0.820 0.028
#> SRR2105508 3 0.3307 0.752727 0.104 0.000 0.868 0.028
#> SRR2105505 1 0.5982 0.286685 0.524 0.000 0.436 0.040
#> SRR2105506 1 0.4422 0.675061 0.736 0.000 0.256 0.008
#> SRR2105503 2 0.1452 0.840521 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR2105504 4 0.4858 0.579211 0.008 0.084 0.112 0.796
#> SRR2105501 2 0.3736 0.777692 0.004 0.844 0.024 0.128
#> SRR2105502 4 0.4609 0.621826 0.008 0.104 0.076 0.812
#> SRR2105499 3 0.3485 0.748588 0.116 0.000 0.856 0.028
#> SRR2105500 3 0.3984 0.743015 0.132 0.000 0.828 0.040
#> SRR2105497 2 0.0469 0.845533 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105498 2 0.1389 0.846106 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105495 2 0.3160 0.806250 0.000 0.872 0.020 0.108
#> SRR2105496 2 0.3160 0.809329 0.000 0.872 0.020 0.108
#> SRR2105493 2 0.5136 0.690749 0.004 0.752 0.056 0.188
#> SRR2105494 2 0.4696 0.735364 0.016 0.808 0.052 0.124
#> SRR2105491 2 0.4355 0.630120 0.012 0.772 0.004 0.212
#> SRR2105492 2 0.3027 0.801515 0.020 0.888 0.004 0.088
#> SRR2105489 2 0.1042 0.839429 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105490 2 0.1042 0.839707 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105487 3 0.6654 0.485425 0.296 0.000 0.588 0.116
#> SRR2105488 1 0.6811 0.085023 0.496 0.000 0.404 0.100
#> SRR2105485 3 0.3601 0.742916 0.056 0.000 0.860 0.084
#> SRR2105486 3 0.3900 0.741458 0.072 0.000 0.844 0.084
#> SRR2105483 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105484 1 0.0937 0.798289 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105481 3 0.5957 0.493160 0.364 0.000 0.588 0.048
#> SRR2105482 1 0.1677 0.800238 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR2105479 1 0.6627 -0.014640 0.504 0.000 0.412 0.084
#> SRR2105480 1 0.4149 0.706862 0.804 0.000 0.168 0.028
#> SRR2105477 2 0.4889 0.731067 0.016 0.788 0.044 0.152
#> SRR2105478 2 0.4505 0.738837 0.016 0.820 0.048 0.116
#> SRR2105475 4 0.5038 0.675020 0.000 0.336 0.012 0.652
#> SRR2105476 4 0.4897 0.676082 0.000 0.332 0.008 0.660
#> SRR2105473 2 0.5403 0.688603 0.056 0.784 0.056 0.104
#> SRR2105474 2 0.4605 0.725432 0.028 0.824 0.052 0.096
#> SRR2105471 2 0.1284 0.840128 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR2105472 2 0.1174 0.839193 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR2105469 3 0.3266 0.759747 0.084 0.000 0.876 0.040
#> SRR2105470 3 0.5024 0.443696 0.360 0.000 0.632 0.008
#> SRR2105467 3 0.4036 0.708889 0.076 0.000 0.836 0.088
#> SRR2105468 3 0.6508 0.152707 0.360 0.000 0.556 0.084
#> SRR2105465 1 0.3047 0.779915 0.872 0.000 0.116 0.012
#> SRR2105466 1 0.1151 0.800840 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105463 1 0.0927 0.799724 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105464 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105461 2 0.2868 0.775027 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105462 2 0.1389 0.837248 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105459 4 0.5060 0.585064 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR2105460 4 0.4967 0.493481 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR2105457 3 0.2706 0.759734 0.020 0.000 0.900 0.080
#> SRR2105458 3 0.2988 0.755101 0.012 0.000 0.876 0.112
#> SRR2105455 1 0.5793 0.456834 0.600 0.000 0.360 0.040
#> SRR2105456 1 0.5137 0.595262 0.680 0.000 0.296 0.024
#> SRR2105453 1 0.6229 0.582944 0.628 0.000 0.284 0.088
#> SRR2105454 1 0.6371 0.556542 0.608 0.000 0.300 0.092
#> SRR2105451 2 0.5499 0.691809 0.032 0.760 0.052 0.156
#> SRR2105452 4 0.5023 0.507813 0.008 0.056 0.164 0.772
#> SRR2105449 1 0.3161 0.754869 0.864 0.000 0.124 0.012
#> SRR2105450 1 0.1557 0.795990 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105447 4 0.5236 0.549406 0.000 0.432 0.008 0.560
#> SRR2105448 2 0.4304 0.518469 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105445 3 0.3448 0.720916 0.000 0.004 0.828 0.168
#> SRR2105446 3 0.3404 0.721266 0.032 0.000 0.864 0.104
#> SRR2105443 4 0.6357 0.486876 0.000 0.124 0.232 0.644
#> SRR2105444 2 0.8722 0.192364 0.132 0.524 0.152 0.192
#> SRR2105441 2 0.1822 0.840941 0.004 0.944 0.008 0.044
#> SRR2105442 2 0.1356 0.840147 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR2105437 3 0.6808 0.484607 0.300 0.000 0.572 0.128
#> SRR2105438 3 0.6770 0.499033 0.292 0.000 0.580 0.128
#> SRR2105435 3 0.4149 0.743696 0.152 0.000 0.812 0.036
#> SRR2105436 3 0.3441 0.756933 0.120 0.000 0.856 0.024
#> SRR2105433 1 0.1452 0.799592 0.956 0.000 0.036 0.008
#> SRR2105434 1 0.1109 0.800425 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105431 1 0.1174 0.799570 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105432 1 0.1174 0.799644 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105429 4 0.7495 0.635027 0.132 0.284 0.024 0.560
#> SRR2105430 4 0.5764 0.676926 0.032 0.320 0.008 0.640
#> SRR2105427 2 0.4262 0.620418 0.000 0.756 0.008 0.236
#> SRR2105428 2 0.4584 0.473322 0.000 0.696 0.004 0.300
#> SRR2105425 2 0.2921 0.779748 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105426 2 0.0817 0.845453 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105421 3 0.4516 0.646354 0.012 0.000 0.736 0.252
#> SRR2105422 3 0.4181 0.744754 0.052 0.000 0.820 0.128
#> SRR2105423 2 0.0524 0.844362 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105424 2 0.0188 0.843886 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105419 3 0.2450 0.759110 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR2105420 3 0.2843 0.761012 0.088 0.000 0.892 0.020
#> SRR2105415 1 0.1722 0.788249 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105416 1 0.1767 0.789739 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR2105417 1 0.0921 0.802286 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105418 1 0.0779 0.800156 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105413 4 0.4955 0.670599 0.000 0.344 0.008 0.648
#> SRR2105414 4 0.5138 0.618411 0.000 0.392 0.008 0.600
#> SRR2105409 2 0.1004 0.845429 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR2105410 2 0.1590 0.840743 0.008 0.956 0.008 0.028
#> SRR2105411 2 0.1022 0.840781 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105412 2 0.1022 0.842370 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105407 3 0.2197 0.757056 0.004 0.000 0.916 0.080
#> SRR2105408 3 0.2011 0.756182 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105403 3 0.3404 0.726501 0.032 0.000 0.864 0.104
#> SRR2105404 3 0.3497 0.724614 0.036 0.000 0.860 0.104
#> SRR2105405 1 0.4655 0.596370 0.684 0.000 0.312 0.004
#> SRR2105406 1 0.3791 0.725504 0.796 0.000 0.200 0.004
#> SRR2105401 4 0.5546 0.680408 0.000 0.292 0.044 0.664
#> SRR2105402 4 0.5145 0.543753 0.008 0.076 0.144 0.772
#> SRR2105399 4 0.5628 0.634843 0.000 0.144 0.132 0.724
#> SRR2105400 4 0.5724 0.623989 0.000 0.140 0.144 0.716
#> SRR2105397 4 0.7035 0.396507 0.116 0.052 0.168 0.664
#> SRR2105398 4 0.7027 0.316413 0.136 0.032 0.184 0.648
#> SRR2105395 2 0.0921 0.842811 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105396 2 0.1042 0.839707 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105393 2 0.0672 0.845182 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR2105394 2 0.1151 0.840249 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR2105389 3 0.2530 0.758392 0.004 0.000 0.896 0.100
#> SRR2105390 3 0.2892 0.765949 0.036 0.000 0.896 0.068
#> SRR2105391 3 0.2198 0.757937 0.008 0.000 0.920 0.072
#> SRR2105392 3 0.2101 0.759470 0.012 0.000 0.928 0.060
#> SRR2105385 3 0.3812 0.741903 0.140 0.000 0.832 0.028
#> SRR2105386 3 0.3271 0.740878 0.132 0.000 0.856 0.012
#> SRR2105387 1 0.4204 0.728446 0.788 0.000 0.192 0.020
#> SRR2105388 1 0.4434 0.699489 0.756 0.000 0.228 0.016
#> SRR2105381 4 0.6009 0.632985 0.000 0.380 0.048 0.572
#> SRR2105382 4 0.5577 0.655614 0.008 0.364 0.016 0.612
#> SRR2105383 2 0.2198 0.827782 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR2105384 2 0.2489 0.829929 0.020 0.912 0.000 0.068
#> SRR2105379 4 0.5704 0.416624 0.008 0.484 0.012 0.496
#> SRR2105380 2 0.5946 0.529031 0.136 0.708 0.004 0.152
#> SRR2105377 2 0.2699 0.805456 0.000 0.904 0.028 0.068
#> SRR2105378 2 0.3910 0.762962 0.028 0.860 0.032 0.080
#> SRR2105375 1 0.4827 0.736444 0.784 0.012 0.164 0.040
#> SRR2105376 1 0.4025 0.760723 0.832 0.004 0.128 0.036
#> SRR2105373 3 0.4458 0.725825 0.076 0.000 0.808 0.116
#> SRR2105374 3 0.6592 0.523734 0.284 0.000 0.600 0.116
#> SRR2105371 3 0.2908 0.763896 0.040 0.000 0.896 0.064
#> SRR2105372 3 0.2892 0.760805 0.068 0.000 0.896 0.036
#> SRR2105369 3 0.2859 0.748485 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR2105370 3 0.3790 0.724492 0.164 0.000 0.820 0.016
#> SRR2105367 1 0.4875 0.719606 0.792 0.008 0.128 0.072
#> SRR2105368 1 0.3069 0.766728 0.896 0.008 0.060 0.036
#> SRR2105365 2 0.4922 0.430214 0.012 0.700 0.004 0.284
#> SRR2105366 2 0.3727 0.718881 0.008 0.824 0.004 0.164
#> SRR2105363 2 0.1792 0.829788 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105364 2 0.1211 0.842433 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105361 2 0.2216 0.814447 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105362 2 0.1022 0.841364 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105359 3 0.2593 0.758882 0.080 0.000 0.904 0.016
#> SRR2105360 3 0.3876 0.750756 0.124 0.000 0.836 0.040
#> SRR2105355 3 0.3266 0.755010 0.108 0.000 0.868 0.024
#> SRR2105356 3 0.5168 -0.120068 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105353 3 0.4669 0.726845 0.052 0.000 0.780 0.168
#> SRR2105354 3 0.4037 0.753424 0.112 0.000 0.832 0.056
#> SRR2105351 2 0.3626 0.690231 0.004 0.812 0.000 0.184
#> SRR2105352 4 0.5145 0.543753 0.008 0.076 0.144 0.772
#> SRR2105349 4 0.5055 0.649610 0.000 0.368 0.008 0.624
#> SRR2105350 2 0.2281 0.810416 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105345 2 0.1822 0.841227 0.004 0.944 0.008 0.044
#> SRR2105346 2 0.1109 0.842418 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR2105347 2 0.3523 0.737776 0.112 0.856 0.000 0.032
#> SRR2105348 2 0.4927 0.478270 0.264 0.712 0.000 0.024
#> SRR2105343 2 0.2814 0.783538 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105344 2 0.0592 0.845187 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105341 3 0.2319 0.762011 0.036 0.000 0.924 0.040
#> SRR2105342 3 0.2662 0.757566 0.084 0.000 0.900 0.016
#> SRR2105339 3 0.3013 0.757016 0.032 0.000 0.888 0.080
#> SRR2105340 3 0.4764 0.734824 0.124 0.000 0.788 0.088
#> SRR2105335 3 0.5113 0.683466 0.152 0.000 0.760 0.088
#> SRR2105336 1 0.5926 0.547763 0.632 0.000 0.308 0.060
#> SRR2105337 1 0.5696 0.059054 0.496 0.000 0.480 0.024
#> SRR2105338 1 0.3659 0.767729 0.840 0.000 0.136 0.024
#> SRR2105331 2 0.2530 0.806461 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105332 2 0.1022 0.840526 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105333 4 0.5024 0.657299 0.000 0.360 0.008 0.632
#> SRR2105334 4 0.5168 0.398760 0.000 0.492 0.004 0.504
#> SRR2105329 3 0.6489 0.325551 0.000 0.080 0.548 0.372
#> SRR2105330 2 0.7346 0.141387 0.004 0.552 0.224 0.220
#> SRR2105327 4 0.5277 0.497009 0.000 0.460 0.008 0.532
#> SRR2105328 4 0.5677 0.434051 0.004 0.476 0.016 0.504
#> SRR2105325 3 0.7289 0.491634 0.268 0.000 0.532 0.200
#> SRR2105326 3 0.7102 0.500523 0.288 0.000 0.548 0.164
#> SRR2105323 3 0.2909 0.757451 0.020 0.000 0.888 0.092
#> SRR2105324 3 0.3958 0.752928 0.112 0.000 0.836 0.052
#> SRR2105319 3 0.6652 0.486948 0.316 0.000 0.576 0.108
#> SRR2105320 1 0.4010 0.729064 0.816 0.000 0.156 0.028
#> SRR2105321 3 0.6946 0.547282 0.252 0.000 0.580 0.168
#> SRR2105322 3 0.7139 0.387156 0.360 0.000 0.500 0.140
#> SRR2105317 4 0.4907 0.561290 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105318 2 0.4661 0.333491 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105315 3 0.5990 0.510659 0.000 0.072 0.644 0.284
#> SRR2105316 2 0.5183 0.027875 0.000 0.584 0.008 0.408
#> SRR2105313 2 0.4925 -0.067725 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR2105314 2 0.2149 0.821110 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105311 4 0.7886 -0.219118 0.232 0.004 0.348 0.416
#> SRR2105312 4 0.7926 -0.145857 0.256 0.004 0.316 0.424
#> SRR2105307 1 0.4328 0.679253 0.748 0.000 0.244 0.008
#> SRR2105308 1 0.4284 0.697004 0.764 0.000 0.224 0.012
#> SRR2105309 3 0.2335 0.760727 0.020 0.000 0.920 0.060
#> SRR2105310 3 0.2563 0.761319 0.072 0.000 0.908 0.020
#> SRR2105305 3 0.2385 0.761137 0.028 0.000 0.920 0.052
#> SRR2105306 3 0.2773 0.760384 0.072 0.000 0.900 0.028
#> SRR2105303 2 0.1109 0.846264 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR2105304 4 0.4599 0.624923 0.008 0.108 0.072 0.812
#> SRR2105301 4 0.5360 0.573577 0.000 0.436 0.012 0.552
#> SRR2105302 2 0.4605 0.320183 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105299 3 0.3972 0.705314 0.008 0.000 0.788 0.204
#> SRR2105300 3 0.5740 0.522997 0.004 0.032 0.620 0.344
#> SRR2105297 1 0.5846 0.298701 0.592 0.372 0.004 0.032
#> SRR2105298 1 0.5673 0.297310 0.596 0.372 0.000 0.032
#> SRR2105295 4 0.4955 0.670599 0.000 0.344 0.008 0.648
#> SRR2105296 2 0.5165 -0.004187 0.004 0.604 0.004 0.388
#> SRR2105293 3 0.7309 0.488274 0.272 0.000 0.528 0.200
#> SRR2105294 3 0.6148 0.199341 0.468 0.000 0.484 0.048
#> SRR2105291 1 0.5482 0.382151 0.608 0.000 0.368 0.024
#> SRR2105292 1 0.0779 0.800156 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105289 3 0.5288 0.642108 0.224 0.000 0.720 0.056
#> SRR2105290 1 0.2125 0.796254 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR2105287 1 0.3598 0.767920 0.848 0.000 0.124 0.028
#> SRR2105288 1 0.1677 0.802610 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR2105285 4 0.4978 0.627432 0.000 0.384 0.004 0.612
#> SRR2105286 2 0.4072 0.600944 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105283 2 0.5799 0.661385 0.088 0.756 0.040 0.116
#> SRR2105284 2 0.4937 0.722371 0.020 0.796 0.056 0.128
#> SRR2105281 2 0.1211 0.840209 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105282 2 0.1389 0.837277 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105259 3 0.2125 0.756774 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR2105260 3 0.2125 0.758452 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR2105279 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0188 0.843886 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105257 1 0.4839 0.716177 0.756 0.000 0.200 0.044
#> SRR2105258 1 0.1661 0.802383 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105253 2 0.2999 0.780305 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR2105254 2 0.2530 0.798644 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105255 3 0.2909 0.753876 0.092 0.000 0.888 0.020
#> SRR2105256 3 0.3529 0.727459 0.152 0.000 0.836 0.012
#> SRR2105251 2 0.1151 0.841797 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR2105252 2 0.1807 0.834801 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR2105249 2 0.1661 0.838541 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105250 2 0.3007 0.818092 0.028 0.900 0.012 0.060
#> SRR2105247 2 0.0592 0.841376 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105248 2 0.0927 0.841034 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR2105245 3 0.8192 0.371285 0.288 0.020 0.456 0.236
#> SRR2105246 3 0.9286 0.157685 0.152 0.132 0.384 0.332
#> SRR2105243 3 0.4391 0.617951 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR2105244 3 0.5453 0.559520 0.320 0.000 0.648 0.032
#> SRR2105241 1 0.5143 0.623465 0.708 0.000 0.256 0.036
#> SRR2105242 1 0.1211 0.801696 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105239 1 0.5491 0.547429 0.688 0.000 0.260 0.052
#> SRR2105240 1 0.1854 0.802963 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR2105237 4 0.5085 0.669063 0.000 0.304 0.020 0.676
#> SRR2105238 2 0.5393 0.568442 0.000 0.688 0.044 0.268
#> SRR2105235 2 0.2546 0.822434 0.000 0.900 0.008 0.092
#> SRR2105236 2 0.2452 0.823359 0.004 0.908 0.004 0.084
#> SRR2105233 4 0.4936 0.672837 0.000 0.340 0.008 0.652
#> SRR2105234 4 0.4973 0.667268 0.000 0.348 0.008 0.644
#> SRR2105231 2 0.0895 0.840149 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR2105232 2 0.0707 0.840245 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105227 3 0.6270 0.540155 0.292 0.012 0.636 0.060
#> SRR2105228 1 0.5739 0.702744 0.752 0.076 0.140 0.032
#> SRR2105225 1 0.5408 0.021238 0.500 0.000 0.488 0.012
#> SRR2105226 1 0.3335 0.777862 0.856 0.000 0.128 0.016
#> SRR2105229 3 0.4632 0.682215 0.012 0.004 0.740 0.244
#> SRR2105230 3 0.4532 0.728823 0.156 0.000 0.792 0.052
#> SRR2105219 2 0.4677 0.427187 0.000 0.680 0.004 0.316
#> SRR2105220 2 0.1585 0.842930 0.004 0.952 0.004 0.040
#> SRR2105221 2 0.4685 0.726863 0.024 0.816 0.052 0.108
#> SRR2105222 2 0.5326 0.679722 0.056 0.788 0.052 0.104
#> SRR2105223 3 0.3161 0.744078 0.124 0.000 0.864 0.012
#> SRR2105224 3 0.5253 0.382553 0.360 0.000 0.624 0.016
#> SRR2105217 2 0.1639 0.838567 0.008 0.952 0.004 0.036
#> SRR2105218 2 0.1042 0.839429 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105215 2 0.0469 0.844495 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105216 2 0.0921 0.841765 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105213 3 0.7519 0.540668 0.188 0.016 0.564 0.232
#> SRR2105214 3 0.8191 0.445852 0.212 0.028 0.484 0.276
#> SRR2105211 3 0.2759 0.763490 0.044 0.000 0.904 0.052
#> SRR2105212 3 0.2675 0.753706 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR2105209 1 0.6442 0.147160 0.492 0.000 0.440 0.068
#> SRR2105210 1 0.1938 0.801982 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR2105207 1 0.1854 0.799827 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR2105208 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105205 2 0.5653 -0.252872 0.004 0.532 0.016 0.448
#> SRR2105206 2 0.2859 0.820211 0.000 0.880 0.008 0.112
#> SRR2105201 2 0.4144 0.757143 0.008 0.836 0.048 0.108
#> SRR2105202 2 0.4666 0.729989 0.028 0.820 0.052 0.100
#> SRR2105203 2 0.2011 0.818443 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105204 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0336 0.846055 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105200 2 0.0927 0.841261 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR2105197 3 0.4234 0.728007 0.052 0.000 0.816 0.132
#> SRR2105198 3 0.5314 0.699756 0.084 0.000 0.740 0.176
#> SRR2105195 1 0.7108 0.115928 0.496 0.024 0.412 0.068
#> SRR2105196 1 0.4150 0.755770 0.848 0.076 0.056 0.020
#> SRR2105193 1 0.1109 0.800430 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105194 1 0.1256 0.800822 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105191 3 0.3399 0.723588 0.040 0.000 0.868 0.092
#> SRR2105192 1 0.6634 0.461069 0.564 0.000 0.336 0.100
#> SRR2105189 2 0.4697 0.490426 0.000 0.696 0.008 0.296
#> SRR2105190 2 0.3528 0.707200 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105187 2 0.6748 -0.181072 0.020 0.476 0.048 0.456
#> SRR2105188 2 0.6674 0.571446 0.104 0.700 0.060 0.136
#> SRR2105179 1 0.5291 0.519215 0.652 0.000 0.324 0.024
#> SRR2105180 1 0.3443 0.774016 0.848 0.000 0.136 0.016
#> SRR2105183 2 0.0469 0.843656 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105184 2 0.1151 0.839095 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR2105185 2 0.2839 0.791978 0.004 0.884 0.004 0.108
#> SRR2105186 2 0.1443 0.836706 0.008 0.960 0.004 0.028
#> SRR2105181 3 0.3384 0.730974 0.024 0.000 0.860 0.116
#> SRR2105182 3 0.3505 0.752150 0.048 0.000 0.864 0.088
#> SRR2105177 1 0.1256 0.800041 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105178 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105171 2 0.0657 0.844371 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR2105172 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.1151 0.800614 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105176 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105173 2 0.2197 0.838259 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR2105174 2 0.0921 0.844862 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105169 2 0.1022 0.844763 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105170 2 0.1004 0.839648 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR2105167 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.5247 0.619717 0.284 0.000 0.684 0.032
#> SRR2105166 3 0.5699 0.474099 0.380 0.000 0.588 0.032
#> SRR2105163 3 0.7518 0.449436 0.260 0.000 0.496 0.244
#> SRR2105164 3 0.7442 0.425840 0.304 0.000 0.496 0.200
#> SRR2105161 1 0.1356 0.800015 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105162 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105155 2 0.1302 0.839640 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105156 2 0.0188 0.843967 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105157 2 0.1576 0.835876 0.004 0.948 0.000 0.048
#> SRR2105158 2 0.1452 0.837123 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR2105159 1 0.5592 0.527922 0.680 0.000 0.264 0.056
#> SRR2105160 1 0.1635 0.798079 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR2105153 2 0.2860 0.795755 0.008 0.888 0.004 0.100
#> SRR2105154 2 0.1994 0.833912 0.008 0.936 0.004 0.052
#> SRR2105151 2 0.1661 0.839834 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR2105152 2 0.0000 0.843966 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.6301 0.429327 0.048 0.008 0.568 0.376
#> SRR2105150 3 0.5592 0.601772 0.044 0.000 0.656 0.300
#> SRR2105147 4 0.5220 0.313710 0.040 0.004 0.232 0.724
#> SRR2105148 4 0.5220 0.313710 0.040 0.004 0.232 0.724
#> SRR2105143 1 0.3377 0.770415 0.848 0.000 0.140 0.012
#> SRR2105144 1 0.3538 0.746895 0.868 0.096 0.024 0.012
#> SRR2105145 1 0.2585 0.796988 0.916 0.004 0.048 0.032
#> SRR2105146 1 0.1722 0.799314 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105141 4 0.5328 0.458002 0.004 0.472 0.004 0.520
#> SRR2105142 4 0.5155 0.430150 0.000 0.468 0.004 0.528
#> SRR2105139 2 0.0921 0.841291 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105140 2 0.1042 0.839707 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR2105137 2 0.4306 0.749491 0.016 0.832 0.044 0.108
#> SRR2105138 2 0.6146 0.629692 0.088 0.736 0.052 0.124
#> SRR2105135 2 0.0592 0.843903 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105136 2 0.0188 0.843734 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105133 3 0.3818 0.720212 0.048 0.000 0.844 0.108
#> SRR2105134 3 0.4426 0.703917 0.096 0.000 0.812 0.092
#> SRR2105131 3 0.7843 -0.000371 0.008 0.300 0.472 0.220
#> SRR2105132 3 0.8320 0.120416 0.352 0.056 0.460 0.132
#> SRR2105129 1 0.1624 0.798736 0.952 0.000 0.020 0.028
#> SRR2105130 1 0.1059 0.799730 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR2105127 1 0.6891 0.492443 0.568 0.008 0.324 0.100
#> SRR2105128 1 0.7578 0.522878 0.576 0.032 0.252 0.140
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.0671 0.38462 0.000 0.000 0.016 0.004 0.980
#> SRR2105278 5 0.0451 0.38383 0.000 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR2105275 3 0.5596 0.61486 0.088 0.000 0.700 0.044 0.168
#> SRR2105276 3 0.5908 0.64156 0.176 0.000 0.664 0.032 0.128
#> SRR2105273 3 0.5793 0.00783 0.076 0.000 0.460 0.004 0.460
#> SRR2105274 3 0.6771 0.26536 0.312 0.000 0.396 0.000 0.292
#> SRR2105271 3 0.6191 0.11212 0.136 0.000 0.436 0.000 0.428
#> SRR2105272 1 0.3419 0.69299 0.804 0.000 0.180 0.000 0.016
#> SRR2105269 4 0.4557 0.28508 0.000 0.476 0.008 0.516 0.000
#> SRR2105270 2 0.4986 0.34653 0.000 0.600 0.024 0.368 0.008
#> SRR2105267 4 0.4305 0.25636 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR2105268 2 0.2891 0.68541 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105265 2 0.1502 0.74381 0.000 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR2105266 2 0.0771 0.75177 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105263 2 0.4475 0.69017 0.008 0.764 0.068 0.160 0.000
#> SRR2105264 2 0.3725 0.72192 0.024 0.840 0.056 0.080 0.000
#> SRR2105261 4 0.7076 -0.43996 0.004 0.004 0.336 0.360 0.296
#> SRR2105262 5 0.6621 -0.05598 0.028 0.000 0.428 0.108 0.436
#> SRR2105357 5 0.1117 0.38313 0.000 0.000 0.020 0.016 0.964
#> SRR2105358 5 0.0798 0.38495 0.000 0.000 0.016 0.008 0.976
#> SRR2105439 2 0.5766 0.55405 0.000 0.684 0.044 0.096 0.176
#> SRR2105440 2 0.5470 0.56231 0.000 0.704 0.040 0.076 0.180
#> SRR2105509 4 0.3885 0.66111 0.000 0.268 0.008 0.724 0.000
#> SRR2105510 4 0.3913 0.62893 0.000 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR2105507 5 0.6130 0.06982 0.100 0.000 0.412 0.008 0.480
#> SRR2105508 5 0.5659 0.16668 0.060 0.000 0.404 0.008 0.528
#> SRR2105505 5 0.4703 0.16152 0.340 0.000 0.028 0.000 0.632
#> SRR2105506 1 0.3779 0.68487 0.776 0.000 0.024 0.000 0.200
#> SRR2105503 2 0.3400 0.72224 0.004 0.840 0.040 0.116 0.000
#> SRR2105504 4 0.4939 0.40122 0.000 0.020 0.236 0.704 0.040
#> SRR2105501 2 0.5830 0.56159 0.000 0.656 0.056 0.232 0.056
#> SRR2105502 4 0.4629 0.42412 0.000 0.024 0.236 0.720 0.020
#> SRR2105499 5 0.5305 0.32457 0.040 0.000 0.300 0.020 0.640
#> SRR2105500 5 0.5419 0.32263 0.060 0.000 0.296 0.012 0.632
#> SRR2105497 2 0.1544 0.74846 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105498 2 0.3126 0.74544 0.008 0.868 0.048 0.076 0.000
#> SRR2105495 2 0.5535 0.61141 0.000 0.696 0.048 0.192 0.064
#> SRR2105496 2 0.5680 0.61284 0.000 0.688 0.040 0.180 0.092
#> SRR2105493 2 0.7091 0.42124 0.000 0.548 0.064 0.204 0.184
#> SRR2105494 2 0.6848 0.46981 0.004 0.592 0.060 0.144 0.200
#> SRR2105491 2 0.5354 0.58414 0.020 0.692 0.080 0.208 0.000
#> SRR2105492 2 0.5173 0.63488 0.028 0.724 0.076 0.172 0.000
#> SRR2105489 2 0.2300 0.73312 0.000 0.908 0.052 0.040 0.000
#> SRR2105490 2 0.1310 0.74447 0.000 0.956 0.020 0.024 0.000
#> SRR2105487 5 0.6204 0.06340 0.208 0.000 0.160 0.020 0.612
#> SRR2105488 5 0.6387 0.02683 0.316 0.000 0.120 0.020 0.544
#> SRR2105485 5 0.2700 0.39076 0.024 0.000 0.088 0.004 0.884
#> SRR2105486 5 0.3241 0.38759 0.036 0.000 0.100 0.008 0.856
#> SRR2105483 1 0.0451 0.78778 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105484 1 0.0451 0.78778 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105481 3 0.6328 0.55935 0.228 0.000 0.528 0.000 0.244
#> SRR2105482 1 0.2248 0.77374 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR2105479 3 0.6090 0.57820 0.292 0.000 0.588 0.020 0.100
#> SRR2105480 1 0.4734 0.18973 0.604 0.000 0.372 0.000 0.024
#> SRR2105477 2 0.7467 0.44800 0.004 0.528 0.108 0.232 0.128
#> SRR2105478 2 0.7534 0.46861 0.016 0.556 0.096 0.180 0.152
#> SRR2105475 4 0.3906 0.66416 0.000 0.240 0.016 0.744 0.000
#> SRR2105476 4 0.3906 0.66452 0.000 0.240 0.016 0.744 0.000
#> SRR2105473 2 0.5832 0.55041 0.008 0.692 0.052 0.068 0.180
#> SRR2105474 2 0.6001 0.55253 0.004 0.680 0.068 0.076 0.172
#> SRR2105471 2 0.2228 0.73434 0.000 0.912 0.048 0.040 0.000
#> SRR2105472 2 0.2304 0.73398 0.000 0.908 0.048 0.044 0.000
#> SRR2105469 5 0.5775 0.19673 0.048 0.000 0.412 0.020 0.520
#> SRR2105470 5 0.6667 -0.12479 0.232 0.000 0.364 0.000 0.404
#> SRR2105467 5 0.1310 0.38463 0.024 0.000 0.020 0.000 0.956
#> SRR2105468 5 0.3792 0.28343 0.180 0.000 0.020 0.008 0.792
#> SRR2105465 1 0.2349 0.76702 0.900 0.000 0.012 0.004 0.084
#> SRR2105466 1 0.0451 0.78921 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105463 1 0.0451 0.78724 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105464 1 0.0324 0.78758 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105461 2 0.3242 0.63389 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105462 2 0.1732 0.74441 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105459 4 0.3895 0.62520 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR2105460 4 0.4045 0.58739 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR2105457 5 0.4972 0.31970 0.016 0.000 0.312 0.024 0.648
#> SRR2105458 5 0.5107 0.30494 0.004 0.000 0.332 0.044 0.620
#> SRR2105455 1 0.7158 -0.07350 0.452 0.000 0.304 0.028 0.216
#> SRR2105456 1 0.5966 0.37638 0.604 0.000 0.164 0.004 0.228
#> SRR2105453 5 0.5551 -0.29367 0.464 0.000 0.036 0.016 0.484
#> SRR2105454 5 0.5486 -0.24617 0.444 0.000 0.028 0.020 0.508
#> SRR2105451 2 0.7081 0.47135 0.020 0.576 0.080 0.248 0.076
#> SRR2105452 4 0.5076 0.39036 0.000 0.020 0.236 0.696 0.048
#> SRR2105449 1 0.4167 0.54893 0.724 0.000 0.252 0.000 0.024
#> SRR2105450 1 0.1557 0.77770 0.940 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR2105447 4 0.4949 0.53189 0.000 0.368 0.028 0.600 0.004
#> SRR2105448 2 0.4697 0.28769 0.000 0.592 0.020 0.388 0.000
#> SRR2105445 5 0.3800 0.32892 0.000 0.000 0.080 0.108 0.812
#> SRR2105446 5 0.1990 0.36584 0.004 0.000 0.040 0.028 0.928
#> SRR2105443 4 0.6877 0.44548 0.000 0.068 0.104 0.544 0.284
#> SRR2105444 2 0.9370 -0.04668 0.076 0.316 0.128 0.244 0.236
#> SRR2105441 2 0.3741 0.71288 0.000 0.840 0.044 0.084 0.032
#> SRR2105442 2 0.3333 0.73084 0.000 0.856 0.060 0.076 0.008
#> SRR2105437 5 0.6101 -0.06226 0.164 0.000 0.284 0.000 0.552
#> SRR2105438 5 0.6054 -0.05647 0.160 0.000 0.280 0.000 0.560
#> SRR2105435 5 0.6189 0.10172 0.096 0.000 0.360 0.016 0.528
#> SRR2105436 5 0.5219 0.27634 0.052 0.000 0.328 0.004 0.616
#> SRR2105433 1 0.0290 0.78824 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.78797 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.1648 0.78427 0.940 0.000 0.040 0.000 0.020
#> SRR2105432 1 0.1568 0.78486 0.944 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR2105429 4 0.6911 0.61655 0.064 0.244 0.096 0.584 0.012
#> SRR2105430 4 0.5719 0.64282 0.004 0.236 0.116 0.640 0.004
#> SRR2105427 2 0.4734 0.31816 0.000 0.604 0.024 0.372 0.000
#> SRR2105428 2 0.4718 0.03743 0.000 0.540 0.016 0.444 0.000
#> SRR2105425 2 0.4276 0.59345 0.000 0.716 0.028 0.256 0.000
#> SRR2105426 2 0.2570 0.75725 0.000 0.888 0.028 0.084 0.000
#> SRR2105421 5 0.6065 0.04310 0.008 0.000 0.432 0.092 0.468
#> SRR2105422 5 0.5758 0.11537 0.024 0.000 0.436 0.040 0.500
#> SRR2105423 2 0.0955 0.75230 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR2105424 2 0.0451 0.75032 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105419 5 0.4848 0.31677 0.032 0.000 0.320 0.004 0.644
#> SRR2105420 5 0.5497 0.22161 0.052 0.000 0.380 0.008 0.560
#> SRR2105415 1 0.0771 0.78352 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105416 1 0.0992 0.78198 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105417 1 0.0798 0.78985 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105418 1 0.0162 0.78775 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.4096 0.66213 0.000 0.260 0.012 0.724 0.004
#> SRR2105414 4 0.4275 0.64990 0.000 0.284 0.020 0.696 0.000
#> SRR2105409 2 0.1981 0.75733 0.000 0.920 0.016 0.064 0.000
#> SRR2105410 2 0.3568 0.71942 0.000 0.852 0.060 0.060 0.028
#> SRR2105411 2 0.1892 0.74908 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR2105412 2 0.1121 0.75064 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105407 5 0.3970 0.37045 0.000 0.000 0.236 0.020 0.744
#> SRR2105408 5 0.4000 0.37361 0.000 0.000 0.228 0.024 0.748
#> SRR2105403 5 0.1522 0.38626 0.000 0.000 0.044 0.012 0.944
#> SRR2105404 5 0.1195 0.38711 0.000 0.000 0.028 0.012 0.960
#> SRR2105405 1 0.5635 0.44932 0.636 0.000 0.120 0.004 0.240
#> SRR2105406 1 0.3197 0.72083 0.836 0.000 0.024 0.000 0.140
#> SRR2105401 4 0.4793 0.66107 0.000 0.236 0.056 0.704 0.004
#> SRR2105402 4 0.5076 0.39036 0.000 0.020 0.236 0.696 0.048
#> SRR2105399 4 0.5567 0.61732 0.000 0.128 0.112 0.712 0.048
#> SRR2105400 4 0.5726 0.61797 0.000 0.128 0.104 0.704 0.064
#> SRR2105397 4 0.7658 0.14526 0.036 0.016 0.332 0.424 0.192
#> SRR2105398 4 0.7894 0.10645 0.056 0.016 0.332 0.412 0.184
#> SRR2105395 2 0.2376 0.74097 0.000 0.904 0.044 0.052 0.000
#> SRR2105396 2 0.1981 0.74044 0.000 0.924 0.028 0.048 0.000
#> SRR2105393 2 0.1484 0.75329 0.000 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR2105394 2 0.2221 0.74161 0.000 0.912 0.036 0.052 0.000
#> SRR2105389 5 0.5094 0.09391 0.012 0.000 0.468 0.016 0.504
#> SRR2105390 5 0.4827 0.07745 0.020 0.000 0.476 0.000 0.504
#> SRR2105391 5 0.5088 0.27644 0.012 0.000 0.368 0.024 0.596
#> SRR2105392 5 0.5062 0.28440 0.016 0.000 0.356 0.020 0.608
#> SRR2105385 5 0.5884 0.15933 0.072 0.000 0.388 0.012 0.528
#> SRR2105386 5 0.5602 0.20939 0.060 0.000 0.376 0.008 0.556
#> SRR2105387 1 0.5147 0.55438 0.692 0.000 0.208 0.004 0.096
#> SRR2105388 1 0.4970 0.63255 0.712 0.000 0.140 0.000 0.148
#> SRR2105381 4 0.5326 0.60355 0.000 0.316 0.048 0.624 0.012
#> SRR2105382 4 0.5135 0.61441 0.004 0.308 0.052 0.636 0.000
#> SRR2105383 2 0.2859 0.73967 0.016 0.876 0.012 0.096 0.000
#> SRR2105384 2 0.3257 0.73688 0.024 0.856 0.016 0.104 0.000
#> SRR2105379 4 0.5565 0.45480 0.008 0.384 0.056 0.552 0.000
#> SRR2105380 2 0.6578 0.45871 0.112 0.604 0.064 0.220 0.000
#> SRR2105377 2 0.5006 0.64400 0.000 0.760 0.052 0.084 0.104
#> SRR2105378 2 0.5016 0.60931 0.000 0.752 0.048 0.064 0.136
#> SRR2105375 1 0.5359 0.62113 0.688 0.008 0.056 0.016 0.232
#> SRR2105376 1 0.4431 0.68517 0.760 0.000 0.068 0.004 0.168
#> SRR2105373 5 0.4130 0.17568 0.012 0.000 0.292 0.000 0.696
#> SRR2105374 5 0.6043 -0.05034 0.168 0.000 0.264 0.000 0.568
#> SRR2105371 5 0.4997 0.12453 0.016 0.000 0.468 0.008 0.508
#> SRR2105372 5 0.4988 0.21910 0.024 0.000 0.416 0.004 0.556
#> SRR2105369 5 0.5025 0.34198 0.044 0.000 0.288 0.008 0.660
#> SRR2105370 5 0.5421 0.30130 0.096 0.000 0.276 0.000 0.628
#> SRR2105367 1 0.5549 0.49749 0.612 0.008 0.032 0.020 0.328
#> SRR2105368 1 0.3003 0.74560 0.876 0.004 0.020 0.012 0.088
#> SRR2105365 2 0.5751 0.42565 0.020 0.616 0.072 0.292 0.000
#> SRR2105366 2 0.5466 0.53701 0.020 0.668 0.072 0.240 0.000
#> SRR2105363 2 0.3848 0.69096 0.000 0.788 0.040 0.172 0.000
#> SRR2105364 2 0.2390 0.74978 0.000 0.896 0.020 0.084 0.000
#> SRR2105361 2 0.3011 0.72097 0.000 0.844 0.016 0.140 0.000
#> SRR2105362 2 0.2574 0.73759 0.000 0.876 0.012 0.112 0.000
#> SRR2105359 5 0.5192 0.22739 0.032 0.000 0.388 0.008 0.572
#> SRR2105360 5 0.5602 0.04768 0.052 0.000 0.456 0.008 0.484
#> SRR2105355 5 0.5525 0.19051 0.060 0.000 0.392 0.004 0.544
#> SRR2105356 5 0.6820 -0.17707 0.312 0.000 0.344 0.000 0.344
#> SRR2105353 3 0.5351 0.39950 0.024 0.000 0.620 0.032 0.324
#> SRR2105354 3 0.5002 0.37079 0.044 0.000 0.612 0.000 0.344
#> SRR2105351 2 0.3885 0.53275 0.000 0.724 0.008 0.268 0.000
#> SRR2105352 4 0.5076 0.39036 0.000 0.020 0.236 0.696 0.048
#> SRR2105349 4 0.4138 0.65271 0.000 0.276 0.016 0.708 0.000
#> SRR2105350 2 0.3659 0.65004 0.000 0.768 0.012 0.220 0.000
#> SRR2105345 2 0.3316 0.72720 0.000 0.860 0.056 0.072 0.012
#> SRR2105346 2 0.1725 0.74833 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR2105347 2 0.5349 0.55787 0.160 0.728 0.048 0.060 0.004
#> SRR2105348 2 0.5670 0.38472 0.280 0.640 0.036 0.040 0.004
#> SRR2105343 2 0.3424 0.61561 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105344 2 0.1704 0.75003 0.000 0.928 0.004 0.068 0.000
#> SRR2105341 5 0.5111 0.27110 0.016 0.000 0.372 0.020 0.592
#> SRR2105342 5 0.5240 0.26549 0.032 0.000 0.368 0.012 0.588
#> SRR2105339 5 0.5560 0.10466 0.024 0.000 0.440 0.028 0.508
#> SRR2105340 3 0.5197 0.47184 0.040 0.000 0.648 0.016 0.296
#> SRR2105335 5 0.4010 0.29580 0.072 0.000 0.136 0.000 0.792
#> SRR2105336 1 0.6069 0.27118 0.448 0.000 0.120 0.000 0.432
#> SRR2105337 1 0.7135 -0.41593 0.360 0.000 0.316 0.012 0.312
#> SRR2105338 1 0.4847 0.57540 0.704 0.000 0.216 0.000 0.080
#> SRR2105331 2 0.4578 0.65005 0.000 0.724 0.048 0.224 0.004
#> SRR2105332 2 0.3901 0.72519 0.016 0.820 0.052 0.112 0.000
#> SRR2105333 4 0.3916 0.66123 0.000 0.256 0.012 0.732 0.000
#> SRR2105334 4 0.4505 0.51233 0.000 0.384 0.012 0.604 0.000
#> SRR2105329 5 0.7841 0.03338 0.000 0.076 0.216 0.348 0.360
#> SRR2105330 2 0.8135 -0.15264 0.000 0.368 0.204 0.308 0.120
#> SRR2105327 4 0.4697 0.50800 0.000 0.388 0.020 0.592 0.000
#> SRR2105328 4 0.5131 0.36214 0.000 0.420 0.040 0.540 0.000
#> SRR2105325 3 0.6109 0.63556 0.164 0.000 0.652 0.040 0.144
#> SRR2105326 3 0.6112 0.63438 0.164 0.000 0.648 0.036 0.152
#> SRR2105323 5 0.4818 0.33809 0.004 0.000 0.260 0.048 0.688
#> SRR2105324 5 0.5176 0.33288 0.040 0.000 0.312 0.012 0.636
#> SRR2105319 5 0.6225 -0.16152 0.148 0.000 0.368 0.000 0.484
#> SRR2105320 1 0.6211 0.36422 0.544 0.000 0.264 0.000 0.192
#> SRR2105321 3 0.5814 0.63875 0.140 0.000 0.672 0.028 0.160
#> SRR2105322 3 0.5678 0.63752 0.200 0.000 0.672 0.024 0.104
#> SRR2105317 4 0.3861 0.65350 0.000 0.284 0.004 0.712 0.000
#> SRR2105318 2 0.4294 -0.08168 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR2105315 5 0.7757 0.02996 0.004 0.048 0.316 0.256 0.376
#> SRR2105316 4 0.4723 0.34554 0.000 0.448 0.016 0.536 0.000
#> SRR2105313 4 0.4637 0.31247 0.000 0.452 0.012 0.536 0.000
#> SRR2105314 2 0.3671 0.60922 0.000 0.756 0.008 0.236 0.000
#> SRR2105311 3 0.7174 0.48170 0.148 0.000 0.560 0.192 0.100
#> SRR2105312 3 0.7188 0.52140 0.180 0.000 0.560 0.160 0.100
#> SRR2105307 1 0.3733 0.69329 0.804 0.000 0.032 0.004 0.160
#> SRR2105308 1 0.3396 0.71837 0.832 0.000 0.028 0.004 0.136
#> SRR2105309 5 0.4911 0.32622 0.008 0.000 0.308 0.032 0.652
#> SRR2105310 5 0.4880 0.32904 0.028 0.000 0.296 0.012 0.664
#> SRR2105305 5 0.5111 0.26986 0.016 0.000 0.372 0.020 0.592
#> SRR2105306 5 0.5211 0.22165 0.032 0.000 0.396 0.008 0.564
#> SRR2105303 2 0.2046 0.75343 0.000 0.916 0.016 0.068 0.000
#> SRR2105304 4 0.4522 0.43237 0.000 0.028 0.236 0.724 0.012
#> SRR2105301 4 0.4682 0.58533 0.000 0.356 0.024 0.620 0.000
#> SRR2105302 2 0.4574 0.15519 0.000 0.576 0.012 0.412 0.000
#> SRR2105299 5 0.3857 0.30240 0.000 0.000 0.084 0.108 0.808
#> SRR2105300 5 0.6097 0.13997 0.000 0.020 0.092 0.316 0.572
#> SRR2105297 1 0.6077 0.40973 0.604 0.296 0.052 0.044 0.004
#> SRR2105298 1 0.5969 0.41654 0.608 0.300 0.044 0.044 0.004
#> SRR2105295 4 0.4046 0.64946 0.000 0.296 0.008 0.696 0.000
#> SRR2105296 2 0.4617 -0.04426 0.000 0.552 0.012 0.436 0.000
#> SRR2105293 3 0.5965 0.64952 0.160 0.000 0.664 0.036 0.140
#> SRR2105294 3 0.6001 0.59536 0.244 0.000 0.580 0.000 0.176
#> SRR2105291 1 0.7498 -0.22377 0.416 0.008 0.336 0.032 0.208
#> SRR2105292 1 0.0771 0.79026 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105289 5 0.6651 0.01430 0.124 0.000 0.380 0.024 0.472
#> SRR2105290 1 0.2376 0.77235 0.904 0.000 0.052 0.000 0.044
#> SRR2105287 1 0.2879 0.75724 0.868 0.000 0.032 0.000 0.100
#> SRR2105288 1 0.1124 0.78855 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR2105285 4 0.4359 0.64641 0.000 0.288 0.016 0.692 0.004
#> SRR2105286 2 0.4658 0.23144 0.000 0.576 0.016 0.408 0.000
#> SRR2105283 2 0.8133 0.40647 0.104 0.540 0.068 0.140 0.148
#> SRR2105284 2 0.7330 0.47551 0.036 0.588 0.056 0.156 0.164
#> SRR2105281 2 0.2362 0.74428 0.000 0.900 0.024 0.076 0.000
#> SRR2105282 2 0.2248 0.73973 0.000 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR2105259 5 0.4169 0.36912 0.000 0.000 0.240 0.028 0.732
#> SRR2105260 5 0.4141 0.36808 0.000 0.000 0.248 0.024 0.728
#> SRR2105279 2 0.0865 0.75054 0.000 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR2105280 2 0.0566 0.74987 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105257 1 0.4419 0.58770 0.668 0.000 0.020 0.000 0.312
#> SRR2105258 1 0.2376 0.77833 0.904 0.000 0.044 0.000 0.052
#> SRR2105253 2 0.3884 0.55394 0.000 0.708 0.004 0.288 0.000
#> SRR2105254 2 0.3452 0.62672 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105255 5 0.4527 0.35870 0.040 0.000 0.260 0.000 0.700
#> SRR2105256 5 0.5057 0.35114 0.072 0.000 0.240 0.004 0.684
#> SRR2105251 2 0.2685 0.73687 0.000 0.880 0.028 0.092 0.000
#> SRR2105252 2 0.3578 0.70891 0.000 0.820 0.048 0.132 0.000
#> SRR2105249 2 0.3504 0.72128 0.000 0.844 0.044 0.100 0.012
#> SRR2105250 2 0.4270 0.69269 0.004 0.816 0.044 0.084 0.052
#> SRR2105247 2 0.1942 0.75573 0.000 0.920 0.012 0.068 0.000
#> SRR2105248 2 0.1943 0.74776 0.000 0.924 0.020 0.056 0.000
#> SRR2105245 3 0.6608 0.63211 0.136 0.020 0.648 0.052 0.144
#> SRR2105246 3 0.8437 0.40204 0.092 0.100 0.512 0.152 0.144
#> SRR2105243 5 0.6132 0.13103 0.124 0.000 0.348 0.004 0.524
#> SRR2105244 3 0.6204 0.26923 0.124 0.000 0.488 0.004 0.384
#> SRR2105241 1 0.6569 0.12009 0.528 0.000 0.308 0.020 0.144
#> SRR2105242 1 0.1386 0.78919 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR2105239 1 0.5852 -0.13876 0.476 0.000 0.444 0.008 0.072
#> SRR2105240 1 0.2228 0.78158 0.912 0.000 0.048 0.000 0.040
#> SRR2105237 4 0.5374 0.63948 0.000 0.188 0.044 0.708 0.060
#> SRR2105238 2 0.7280 0.13526 0.000 0.436 0.048 0.352 0.164
#> SRR2105235 2 0.4549 0.67895 0.000 0.784 0.040 0.124 0.052
#> SRR2105236 2 0.3783 0.70830 0.000 0.824 0.040 0.120 0.016
#> SRR2105233 4 0.3612 0.66119 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR2105234 4 0.3707 0.65536 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR2105231 2 0.2331 0.74762 0.000 0.900 0.020 0.080 0.000
#> SRR2105232 2 0.2036 0.74362 0.000 0.920 0.024 0.056 0.000
#> SRR2105227 3 0.7395 0.36417 0.208 0.008 0.464 0.032 0.288
#> SRR2105228 1 0.7308 0.22590 0.524 0.060 0.308 0.032 0.076
#> SRR2105225 3 0.6685 0.28637 0.376 0.000 0.388 0.000 0.236
#> SRR2105226 1 0.4177 0.69363 0.772 0.000 0.164 0.000 0.064
#> SRR2105229 3 0.5714 0.16581 0.004 0.000 0.512 0.072 0.412
#> SRR2105230 5 0.5597 -0.08773 0.060 0.000 0.448 0.004 0.488
#> SRR2105219 2 0.4555 -0.08205 0.000 0.520 0.008 0.472 0.000
#> SRR2105220 2 0.3639 0.66395 0.000 0.792 0.024 0.184 0.000
#> SRR2105221 2 0.6096 0.55386 0.004 0.668 0.056 0.092 0.180
#> SRR2105222 2 0.7065 0.50333 0.032 0.620 0.088 0.088 0.172
#> SRR2105223 5 0.5313 0.24125 0.048 0.000 0.376 0.004 0.572
#> SRR2105224 5 0.6670 0.01331 0.216 0.000 0.316 0.004 0.464
#> SRR2105217 2 0.3201 0.72397 0.000 0.852 0.052 0.096 0.000
#> SRR2105218 2 0.1918 0.73974 0.000 0.928 0.036 0.036 0.000
#> SRR2105215 2 0.0798 0.75295 0.000 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105216 2 0.1704 0.74760 0.000 0.928 0.004 0.068 0.000
#> SRR2105213 3 0.6803 0.49532 0.068 0.016 0.580 0.064 0.272
#> SRR2105214 3 0.7249 0.57080 0.096 0.024 0.592 0.096 0.192
#> SRR2105211 5 0.5100 0.26618 0.012 0.000 0.372 0.024 0.592
#> SRR2105212 5 0.5056 0.30897 0.040 0.000 0.336 0.004 0.620
#> SRR2105209 5 0.5812 0.04838 0.372 0.000 0.100 0.000 0.528
#> SRR2105210 1 0.1430 0.78511 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR2105207 1 0.2260 0.77589 0.908 0.000 0.064 0.000 0.028
#> SRR2105208 1 0.0451 0.78724 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105205 4 0.5653 0.33841 0.012 0.408 0.052 0.528 0.000
#> SRR2105206 2 0.5206 0.59603 0.012 0.672 0.060 0.256 0.000
#> SRR2105201 2 0.5612 0.56707 0.000 0.700 0.048 0.084 0.168
#> SRR2105202 2 0.5475 0.57063 0.004 0.716 0.044 0.068 0.168
#> SRR2105203 2 0.3491 0.60177 0.000 0.768 0.004 0.228 0.000
#> SRR2105204 2 0.0671 0.75028 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105199 2 0.1124 0.75411 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR2105200 2 0.1753 0.74329 0.000 0.936 0.032 0.032 0.000
#> SRR2105197 5 0.3388 0.26449 0.008 0.000 0.200 0.000 0.792
#> SRR2105198 5 0.4099 0.22362 0.032 0.000 0.200 0.004 0.764
#> SRR2105195 1 0.8225 -0.36653 0.380 0.020 0.300 0.064 0.236
#> SRR2105196 1 0.4324 0.70389 0.820 0.064 0.072 0.020 0.024
#> SRR2105193 1 0.1197 0.78258 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0880 0.78675 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.1124 0.37931 0.000 0.000 0.036 0.004 0.960
#> SRR2105192 5 0.5600 -0.04895 0.360 0.000 0.044 0.020 0.576
#> SRR2105189 2 0.5178 -0.09330 0.000 0.484 0.040 0.476 0.000
#> SRR2105190 2 0.4327 0.37239 0.000 0.632 0.008 0.360 0.000
#> SRR2105187 4 0.8733 0.21351 0.028 0.292 0.172 0.368 0.140
#> SRR2105188 2 0.8719 0.28455 0.048 0.444 0.188 0.136 0.184
#> SRR2105179 1 0.6409 0.08705 0.536 0.004 0.244 0.000 0.216
#> SRR2105180 1 0.3299 0.74826 0.848 0.000 0.040 0.004 0.108
#> SRR2105183 2 0.0290 0.74970 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105184 2 0.1915 0.73627 0.000 0.928 0.040 0.032 0.000
#> SRR2105185 2 0.3495 0.69705 0.000 0.816 0.032 0.152 0.000
#> SRR2105186 2 0.3924 0.71345 0.008 0.816 0.080 0.096 0.000
#> SRR2105181 5 0.1892 0.37111 0.000 0.000 0.080 0.004 0.916
#> SRR2105182 5 0.3508 0.32386 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR2105177 1 0.0290 0.78806 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0451 0.78778 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105171 2 0.2519 0.73426 0.000 0.884 0.016 0.100 0.000
#> SRR2105172 2 0.0671 0.75017 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105175 1 0.0162 0.78775 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0162 0.78775 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.3723 0.71371 0.000 0.804 0.044 0.152 0.000
#> SRR2105174 2 0.1892 0.75147 0.000 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR2105169 2 0.2569 0.74553 0.000 0.892 0.040 0.068 0.000
#> SRR2105170 2 0.2149 0.73911 0.000 0.916 0.036 0.048 0.000
#> SRR2105167 2 0.0324 0.74952 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105168 2 0.0671 0.75043 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105165 3 0.6316 0.50983 0.156 0.000 0.548 0.008 0.288
#> SRR2105166 3 0.6304 0.57891 0.216 0.000 0.556 0.004 0.224
#> SRR2105163 3 0.6113 0.63442 0.140 0.000 0.668 0.064 0.128
#> SRR2105164 3 0.6023 0.64047 0.188 0.000 0.656 0.040 0.116
#> SRR2105161 1 0.0703 0.78946 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0162 0.78775 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.2325 0.75397 0.000 0.904 0.028 0.068 0.000
#> SRR2105156 2 0.0290 0.75003 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105157 2 0.3112 0.72820 0.000 0.856 0.044 0.100 0.000
#> SRR2105158 2 0.3409 0.72163 0.000 0.836 0.052 0.112 0.000
#> SRR2105159 3 0.5166 0.36467 0.436 0.000 0.528 0.004 0.032
#> SRR2105160 1 0.1341 0.78126 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.4367 0.64127 0.000 0.748 0.060 0.192 0.000
#> SRR2105154 2 0.4036 0.68495 0.000 0.788 0.068 0.144 0.000
#> SRR2105151 2 0.2077 0.74166 0.000 0.908 0.008 0.084 0.000
#> SRR2105152 2 0.0671 0.75015 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105149 5 0.7657 -0.10663 0.048 0.000 0.276 0.312 0.364
#> SRR2105150 5 0.7225 -0.04104 0.024 0.000 0.336 0.236 0.404
#> SRR2105147 4 0.5810 0.12019 0.008 0.000 0.376 0.540 0.076
#> SRR2105148 4 0.5810 0.12019 0.008 0.000 0.376 0.540 0.076
#> SRR2105143 1 0.3053 0.75853 0.872 0.004 0.036 0.004 0.084
#> SRR2105144 1 0.2849 0.76633 0.896 0.024 0.052 0.020 0.008
#> SRR2105145 1 0.2612 0.77138 0.892 0.004 0.084 0.016 0.004
#> SRR2105146 1 0.1270 0.78154 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR2105141 4 0.5128 0.51497 0.000 0.344 0.052 0.604 0.000
#> SRR2105142 4 0.4980 0.44208 0.000 0.380 0.036 0.584 0.000
#> SRR2105139 2 0.1121 0.74911 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105140 2 0.1725 0.74136 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR2105137 2 0.5471 0.57081 0.000 0.708 0.044 0.076 0.172
#> SRR2105138 2 0.7085 0.50697 0.028 0.616 0.092 0.092 0.172
#> SRR2105135 2 0.0609 0.75057 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105136 2 0.0290 0.74945 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105133 5 0.2433 0.34967 0.012 0.000 0.056 0.024 0.908
#> SRR2105134 5 0.2673 0.34620 0.044 0.000 0.036 0.020 0.900
#> SRR2105131 5 0.7794 0.00812 0.004 0.208 0.112 0.184 0.492
#> SRR2105132 5 0.6346 0.17218 0.224 0.024 0.044 0.064 0.644
#> SRR2105129 1 0.1143 0.78842 0.968 0.004 0.008 0.008 0.012
#> SRR2105130 1 0.0324 0.78823 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105127 5 0.6442 -0.23847 0.440 0.012 0.044 0.040 0.464
#> SRR2105128 5 0.7554 -0.17781 0.380 0.028 0.048 0.108 0.436
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.3799 0.415897 0.008 0.048 0.028 0.100 0.816 0.000
#> SRR2105278 5 0.3835 0.414752 0.016 0.048 0.012 0.116 0.808 0.000
#> SRR2105275 3 0.2889 0.506354 0.032 0.032 0.884 0.020 0.032 0.000
#> SRR2105276 3 0.3485 0.507417 0.080 0.024 0.844 0.028 0.024 0.000
#> SRR2105273 3 0.4887 0.205998 0.008 0.000 0.536 0.044 0.412 0.000
#> SRR2105274 3 0.6691 0.223764 0.168 0.000 0.428 0.060 0.344 0.000
#> SRR2105271 3 0.5535 0.188395 0.056 0.000 0.508 0.036 0.400 0.000
#> SRR2105272 1 0.5089 0.597957 0.624 0.000 0.296 0.036 0.044 0.000
#> SRR2105269 2 0.4452 0.618124 0.000 0.636 0.000 0.048 0.000 0.316
#> SRR2105270 2 0.5047 0.441109 0.000 0.564 0.000 0.088 0.000 0.348
#> SRR2105267 2 0.4167 0.582929 0.000 0.612 0.000 0.020 0.000 0.368
#> SRR2105268 6 0.3349 0.480439 0.000 0.244 0.000 0.008 0.000 0.748
#> SRR2105265 6 0.1950 0.667515 0.000 0.064 0.000 0.024 0.000 0.912
#> SRR2105266 6 0.1643 0.672887 0.000 0.068 0.000 0.008 0.000 0.924
#> SRR2105263 6 0.5749 0.447062 0.016 0.216 0.008 0.156 0.000 0.604
#> SRR2105264 6 0.4660 0.596961 0.028 0.088 0.000 0.156 0.000 0.728
#> SRR2105261 3 0.6813 0.096250 0.000 0.324 0.372 0.044 0.260 0.000
#> SRR2105262 3 0.5393 0.134924 0.008 0.064 0.484 0.008 0.436 0.000
#> SRR2105357 5 0.3668 0.415109 0.004 0.048 0.020 0.112 0.816 0.000
#> SRR2105358 5 0.3674 0.418402 0.008 0.048 0.024 0.096 0.824 0.000
#> SRR2105439 6 0.6097 0.372694 0.000 0.216 0.000 0.172 0.044 0.568
#> SRR2105440 6 0.5924 0.415254 0.000 0.192 0.000 0.152 0.052 0.604
#> SRR2105509 2 0.3667 0.635144 0.000 0.740 0.008 0.012 0.000 0.240
#> SRR2105510 2 0.3714 0.644849 0.000 0.720 0.008 0.008 0.000 0.264
#> SRR2105507 3 0.5438 0.160351 0.028 0.000 0.492 0.056 0.424 0.000
#> SRR2105508 3 0.5071 0.068723 0.012 0.000 0.472 0.048 0.468 0.000
#> SRR2105505 5 0.5620 0.280396 0.220 0.008 0.028 0.112 0.632 0.000
#> SRR2105506 1 0.4364 0.703086 0.732 0.004 0.008 0.064 0.192 0.000
#> SRR2105503 6 0.4281 0.578328 0.000 0.136 0.000 0.132 0.000 0.732
#> SRR2105504 4 0.5742 0.877670 0.000 0.400 0.080 0.488 0.032 0.000
#> SRR2105501 6 0.5820 0.067255 0.000 0.380 0.004 0.116 0.012 0.488
#> SRR2105502 4 0.5520 0.864891 0.000 0.416 0.076 0.488 0.020 0.000
#> SRR2105499 5 0.4561 0.281300 0.008 0.004 0.296 0.036 0.656 0.000
#> SRR2105500 5 0.4563 0.321437 0.016 0.004 0.248 0.040 0.692 0.000
#> SRR2105497 6 0.2609 0.655886 0.000 0.096 0.000 0.036 0.000 0.868
#> SRR2105498 6 0.3652 0.658408 0.016 0.056 0.000 0.120 0.000 0.808
#> SRR2105495 6 0.5546 0.253825 0.000 0.336 0.000 0.120 0.008 0.536
#> SRR2105496 6 0.5942 0.195157 0.000 0.364 0.000 0.132 0.020 0.484
#> SRR2105493 2 0.6932 0.064420 0.000 0.408 0.004 0.196 0.060 0.332
#> SRR2105494 6 0.7130 0.139450 0.004 0.308 0.004 0.192 0.072 0.420
#> SRR2105491 6 0.6432 0.367907 0.020 0.204 0.048 0.152 0.000 0.576
#> SRR2105492 6 0.6093 0.426768 0.028 0.192 0.024 0.148 0.000 0.608
#> SRR2105489 6 0.3190 0.633450 0.000 0.044 0.000 0.136 0.000 0.820
#> SRR2105490 6 0.1633 0.675391 0.000 0.024 0.000 0.044 0.000 0.932
#> SRR2105487 5 0.7786 0.154530 0.116 0.060 0.196 0.168 0.460 0.000
#> SRR2105488 5 0.8030 0.130690 0.216 0.060 0.136 0.172 0.416 0.000
#> SRR2105485 5 0.2993 0.421784 0.012 0.008 0.064 0.048 0.868 0.000
#> SRR2105486 5 0.2768 0.422734 0.008 0.008 0.060 0.044 0.880 0.000
#> SRR2105483 1 0.0520 0.786683 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0520 0.786683 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.5131 0.479839 0.112 0.004 0.700 0.036 0.148 0.000
#> SRR2105482 1 0.4234 0.750360 0.776 0.000 0.120 0.052 0.052 0.000
#> SRR2105479 3 0.4055 0.499825 0.144 0.012 0.784 0.044 0.016 0.000
#> SRR2105480 3 0.5359 0.142236 0.432 0.012 0.500 0.036 0.020 0.000
#> SRR2105477 2 0.7105 0.118839 0.000 0.404 0.028 0.260 0.028 0.280
#> SRR2105478 2 0.7201 -0.049411 0.008 0.348 0.016 0.264 0.028 0.336
#> SRR2105475 2 0.3390 0.620672 0.000 0.780 0.008 0.012 0.000 0.200
#> SRR2105476 2 0.3390 0.620672 0.000 0.780 0.008 0.012 0.000 0.200
#> SRR2105473 6 0.6175 0.403621 0.004 0.168 0.000 0.192 0.052 0.584
#> SRR2105474 6 0.5717 0.441519 0.000 0.148 0.000 0.212 0.032 0.608
#> SRR2105471 6 0.2999 0.640969 0.000 0.040 0.000 0.124 0.000 0.836
#> SRR2105472 6 0.2887 0.643953 0.000 0.036 0.000 0.120 0.000 0.844
#> SRR2105469 3 0.5344 0.044523 0.012 0.008 0.480 0.052 0.448 0.000
#> SRR2105470 3 0.6470 0.146584 0.124 0.000 0.408 0.060 0.408 0.000
#> SRR2105467 5 0.3403 0.418983 0.012 0.024 0.032 0.088 0.844 0.000
#> SRR2105468 5 0.5412 0.335217 0.144 0.020 0.024 0.128 0.684 0.000
#> SRR2105465 1 0.3762 0.770546 0.824 0.012 0.044 0.032 0.088 0.000
#> SRR2105466 1 0.1414 0.791140 0.952 0.012 0.012 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105463 1 0.0291 0.787342 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0405 0.787043 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105461 6 0.3323 0.510723 0.000 0.240 0.000 0.008 0.000 0.752
#> SRR2105462 6 0.2357 0.644043 0.000 0.116 0.000 0.012 0.000 0.872
#> SRR2105459 2 0.3560 0.656537 0.000 0.732 0.004 0.008 0.000 0.256
#> SRR2105460 2 0.3772 0.641621 0.000 0.672 0.004 0.004 0.000 0.320
#> SRR2105457 5 0.4130 0.274882 0.000 0.008 0.312 0.016 0.664 0.000
#> SRR2105458 5 0.4412 0.273955 0.000 0.012 0.320 0.024 0.644 0.000
#> SRR2105455 1 0.7338 -0.208711 0.320 0.008 0.292 0.072 0.308 0.000
#> SRR2105456 1 0.6511 0.375749 0.512 0.004 0.132 0.064 0.288 0.000
#> SRR2105453 1 0.6788 0.186100 0.400 0.052 0.008 0.156 0.384 0.000
#> SRR2105454 5 0.6783 -0.131327 0.372 0.052 0.008 0.156 0.412 0.000
#> SRR2105451 2 0.6714 0.131386 0.012 0.428 0.016 0.168 0.012 0.364
#> SRR2105452 4 0.5832 0.881786 0.000 0.392 0.084 0.488 0.036 0.000
#> SRR2105449 1 0.5509 0.400034 0.572 0.000 0.324 0.036 0.068 0.000
#> SRR2105450 1 0.3008 0.782854 0.864 0.000 0.036 0.032 0.068 0.000
#> SRR2105447 2 0.4616 0.635773 0.000 0.640 0.008 0.028 0.008 0.316
#> SRR2105448 2 0.4651 0.275752 0.000 0.484 0.000 0.040 0.000 0.476
#> SRR2105445 5 0.5869 0.319093 0.000 0.192 0.024 0.148 0.620 0.016
#> SRR2105446 5 0.4373 0.387743 0.004 0.100 0.004 0.152 0.740 0.000
#> SRR2105443 2 0.6225 0.124588 0.004 0.648 0.072 0.132 0.112 0.032
#> SRR2105444 2 0.8486 0.248732 0.056 0.436 0.080 0.196 0.064 0.168
#> SRR2105441 6 0.4301 0.575509 0.000 0.136 0.000 0.120 0.004 0.740
#> SRR2105442 6 0.3792 0.627460 0.000 0.108 0.000 0.112 0.000 0.780
#> SRR2105437 3 0.7597 0.036407 0.100 0.048 0.380 0.116 0.356 0.000
#> SRR2105438 3 0.7568 0.033543 0.096 0.048 0.380 0.116 0.360 0.000
#> SRR2105435 5 0.5778 0.094815 0.056 0.008 0.372 0.040 0.524 0.000
#> SRR2105436 5 0.4688 0.294115 0.024 0.004 0.280 0.028 0.664 0.000
#> SRR2105433 1 0.0748 0.789444 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105434 1 0.0260 0.787136 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.1536 0.789974 0.940 0.000 0.040 0.016 0.004 0.000
#> SRR2105432 1 0.1536 0.789275 0.940 0.000 0.040 0.016 0.004 0.000
#> SRR2105429 2 0.6201 0.519242 0.048 0.640 0.072 0.044 0.008 0.188
#> SRR2105430 2 0.5420 0.571633 0.004 0.652 0.092 0.036 0.000 0.216
#> SRR2105427 2 0.4957 0.457945 0.000 0.544 0.000 0.072 0.000 0.384
#> SRR2105428 2 0.4809 0.557957 0.000 0.600 0.000 0.072 0.000 0.328
#> SRR2105425 6 0.4903 0.060218 0.000 0.380 0.000 0.068 0.000 0.552
#> SRR2105426 6 0.3626 0.654029 0.000 0.144 0.000 0.068 0.000 0.788
#> SRR2105421 3 0.5097 0.074752 0.000 0.044 0.472 0.016 0.468 0.000
#> SRR2105422 3 0.4721 0.103193 0.004 0.004 0.512 0.028 0.452 0.000
#> SRR2105423 6 0.1572 0.681679 0.000 0.028 0.000 0.036 0.000 0.936
#> SRR2105424 6 0.1418 0.678989 0.000 0.024 0.000 0.032 0.000 0.944
#> SRR2105419 5 0.4231 0.194306 0.012 0.000 0.364 0.008 0.616 0.000
#> SRR2105420 5 0.5087 0.023245 0.020 0.004 0.412 0.032 0.532 0.000
#> SRR2105415 1 0.0436 0.788609 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105416 1 0.0665 0.787723 0.980 0.000 0.004 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105417 1 0.1899 0.792675 0.928 0.004 0.032 0.028 0.008 0.000
#> SRR2105418 1 0.0146 0.787542 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.3454 0.637811 0.000 0.760 0.004 0.012 0.000 0.224
#> SRR2105414 2 0.3914 0.668474 0.000 0.720 0.008 0.008 0.008 0.256
#> SRR2105409 6 0.2937 0.670269 0.000 0.096 0.000 0.056 0.000 0.848
#> SRR2105410 6 0.4369 0.581642 0.000 0.116 0.000 0.164 0.000 0.720
#> SRR2105411 6 0.2333 0.662548 0.000 0.092 0.000 0.024 0.000 0.884
#> SRR2105412 6 0.1926 0.673435 0.000 0.068 0.000 0.020 0.000 0.912
#> SRR2105407 5 0.3902 0.367275 0.000 0.012 0.212 0.028 0.748 0.000
#> SRR2105408 5 0.3905 0.373719 0.000 0.016 0.200 0.028 0.756 0.000
#> SRR2105403 5 0.3703 0.419129 0.004 0.040 0.036 0.100 0.820 0.000
#> SRR2105404 5 0.3900 0.416879 0.008 0.044 0.032 0.108 0.808 0.000
#> SRR2105405 1 0.6269 0.462938 0.548 0.004 0.108 0.064 0.276 0.000
#> SRR2105406 1 0.4475 0.716297 0.740 0.004 0.020 0.064 0.172 0.000
#> SRR2105401 2 0.4979 0.560186 0.000 0.708 0.040 0.060 0.008 0.184
#> SRR2105402 4 0.5832 0.881786 0.000 0.392 0.084 0.488 0.036 0.000
#> SRR2105399 2 0.5900 0.220933 0.000 0.672 0.072 0.112 0.032 0.112
#> SRR2105400 2 0.5921 0.263862 0.000 0.676 0.072 0.092 0.044 0.116
#> SRR2105397 2 0.6909 -0.218289 0.036 0.428 0.376 0.116 0.044 0.000
#> SRR2105398 2 0.6913 -0.241365 0.044 0.412 0.396 0.108 0.040 0.000
#> SRR2105395 6 0.3481 0.656281 0.000 0.072 0.000 0.124 0.000 0.804
#> SRR2105396 6 0.1657 0.675464 0.000 0.016 0.000 0.056 0.000 0.928
#> SRR2105393 6 0.1720 0.679766 0.000 0.032 0.000 0.040 0.000 0.928
#> SRR2105394 6 0.2752 0.652629 0.000 0.036 0.000 0.108 0.000 0.856
#> SRR2105389 3 0.4461 0.184201 0.000 0.000 0.564 0.032 0.404 0.000
#> SRR2105390 3 0.4294 0.187693 0.000 0.000 0.552 0.020 0.428 0.000
#> SRR2105391 5 0.4379 0.127926 0.000 0.000 0.396 0.028 0.576 0.000
#> SRR2105392 5 0.4301 0.136617 0.000 0.000 0.392 0.024 0.584 0.000
#> SRR2105385 5 0.5161 0.010621 0.028 0.000 0.416 0.036 0.520 0.000
#> SRR2105386 5 0.4777 0.040982 0.008 0.000 0.416 0.036 0.540 0.000
#> SRR2105387 1 0.6131 0.512455 0.568 0.000 0.228 0.052 0.152 0.000
#> SRR2105388 1 0.6152 0.589156 0.592 0.004 0.132 0.064 0.208 0.000
#> SRR2105381 2 0.4960 0.644021 0.000 0.640 0.012 0.044 0.012 0.292
#> SRR2105382 2 0.4434 0.647532 0.000 0.684 0.008 0.048 0.000 0.260
#> SRR2105383 6 0.3114 0.648184 0.004 0.128 0.000 0.036 0.000 0.832
#> SRR2105384 6 0.3631 0.645218 0.008 0.156 0.000 0.044 0.000 0.792
#> SRR2105379 2 0.5259 0.582942 0.004 0.600 0.008 0.088 0.000 0.300
#> SRR2105380 6 0.6530 0.225132 0.092 0.256 0.000 0.128 0.000 0.524
#> SRR2105377 6 0.5222 0.474062 0.000 0.168 0.000 0.160 0.016 0.656
#> SRR2105378 6 0.5110 0.469681 0.000 0.136 0.000 0.180 0.016 0.668
#> SRR2105375 1 0.6668 0.574924 0.584 0.036 0.088 0.100 0.192 0.000
#> SRR2105376 1 0.6018 0.632657 0.648 0.024 0.072 0.096 0.160 0.000
#> SRR2105373 5 0.6000 0.008137 0.000 0.036 0.428 0.100 0.436 0.000
#> SRR2105374 3 0.7877 0.027390 0.148 0.052 0.348 0.108 0.344 0.000
#> SRR2105371 3 0.4494 0.163846 0.000 0.000 0.544 0.032 0.424 0.000
#> SRR2105372 3 0.4663 0.064100 0.004 0.000 0.492 0.032 0.472 0.000
#> SRR2105369 5 0.4086 0.320409 0.008 0.000 0.244 0.032 0.716 0.000
#> SRR2105370 5 0.4973 0.301535 0.044 0.000 0.236 0.048 0.672 0.000
#> SRR2105367 1 0.6862 0.335533 0.488 0.056 0.024 0.132 0.300 0.000
#> SRR2105368 1 0.3595 0.751108 0.840 0.032 0.008 0.072 0.044 0.004
#> SRR2105365 6 0.5932 0.265229 0.016 0.280 0.008 0.140 0.000 0.556
#> SRR2105366 6 0.5836 0.379452 0.016 0.232 0.012 0.144 0.000 0.596
#> SRR2105363 6 0.4989 0.269941 0.000 0.316 0.000 0.092 0.000 0.592
#> SRR2105364 6 0.2860 0.659320 0.000 0.100 0.000 0.048 0.000 0.852
#> SRR2105361 6 0.3933 0.492200 0.000 0.248 0.000 0.036 0.000 0.716
#> SRR2105362 6 0.3588 0.589411 0.000 0.180 0.000 0.044 0.000 0.776
#> SRR2105359 5 0.4459 0.070850 0.012 0.000 0.428 0.012 0.548 0.000
#> SRR2105360 3 0.4874 0.192059 0.016 0.000 0.544 0.032 0.408 0.000
#> SRR2105355 5 0.5068 -0.033962 0.012 0.000 0.456 0.048 0.484 0.000
#> SRR2105356 3 0.6716 0.143122 0.168 0.000 0.388 0.060 0.384 0.000
#> SRR2105353 3 0.3550 0.451275 0.000 0.008 0.780 0.024 0.188 0.000
#> SRR2105354 3 0.3300 0.476166 0.012 0.000 0.816 0.024 0.148 0.000
#> SRR2105351 6 0.4249 0.402744 0.000 0.260 0.000 0.052 0.000 0.688
#> SRR2105352 4 0.5832 0.881786 0.000 0.392 0.084 0.488 0.036 0.000
#> SRR2105349 2 0.3449 0.631880 0.000 0.780 0.008 0.016 0.000 0.196
#> SRR2105350 6 0.4552 0.156259 0.000 0.364 0.000 0.044 0.000 0.592
#> SRR2105345 6 0.4563 0.554033 0.000 0.164 0.000 0.136 0.000 0.700
#> SRR2105346 6 0.3055 0.640570 0.000 0.096 0.000 0.064 0.000 0.840
#> SRR2105347 6 0.5101 0.503631 0.140 0.056 0.000 0.100 0.000 0.704
#> SRR2105348 6 0.5541 0.325345 0.288 0.032 0.000 0.088 0.000 0.592
#> SRR2105343 6 0.4047 0.397232 0.000 0.296 0.000 0.028 0.000 0.676
#> SRR2105344 6 0.1950 0.672495 0.000 0.064 0.000 0.024 0.000 0.912
#> SRR2105341 5 0.4310 0.126406 0.000 0.000 0.396 0.024 0.580 0.000
#> SRR2105342 5 0.4586 0.102845 0.004 0.000 0.400 0.032 0.564 0.000
#> SRR2105339 3 0.4378 0.133058 0.000 0.004 0.528 0.016 0.452 0.000
#> SRR2105340 3 0.3149 0.493011 0.016 0.000 0.836 0.024 0.124 0.000
#> SRR2105335 5 0.5485 0.331001 0.032 0.020 0.132 0.132 0.684 0.000
#> SRR2105336 5 0.7391 -0.118115 0.328 0.012 0.140 0.128 0.392 0.000
#> SRR2105337 5 0.6804 -0.151843 0.252 0.000 0.336 0.044 0.368 0.000
#> SRR2105338 1 0.5931 0.501023 0.576 0.000 0.224 0.032 0.168 0.000
#> SRR2105331 6 0.5142 0.266342 0.000 0.304 0.000 0.112 0.000 0.584
#> SRR2105332 6 0.4956 0.551975 0.016 0.160 0.000 0.136 0.000 0.688
#> SRR2105333 2 0.3420 0.628010 0.000 0.776 0.008 0.012 0.000 0.204
#> SRR2105334 2 0.4029 0.642652 0.000 0.680 0.000 0.028 0.000 0.292
#> SRR2105329 2 0.6644 0.081401 0.000 0.544 0.052 0.088 0.272 0.044
#> SRR2105330 2 0.7391 0.414262 0.000 0.504 0.052 0.104 0.124 0.216
#> SRR2105327 2 0.4648 0.624585 0.000 0.636 0.004 0.044 0.004 0.312
#> SRR2105328 2 0.4833 0.591608 0.000 0.620 0.004 0.056 0.004 0.316
#> SRR2105325 3 0.3890 0.501904 0.088 0.028 0.820 0.032 0.032 0.000
#> SRR2105326 3 0.4002 0.500567 0.092 0.024 0.812 0.032 0.040 0.000
#> SRR2105323 5 0.4781 0.362501 0.004 0.028 0.216 0.052 0.700 0.000
#> SRR2105324 5 0.4252 0.297500 0.008 0.000 0.288 0.028 0.676 0.000
#> SRR2105319 3 0.6578 0.158834 0.060 0.016 0.496 0.100 0.328 0.000
#> SRR2105320 3 0.7167 -0.039864 0.320 0.004 0.400 0.092 0.184 0.000
#> SRR2105321 3 0.3169 0.509152 0.056 0.012 0.864 0.024 0.044 0.000
#> SRR2105322 3 0.3301 0.511845 0.092 0.012 0.848 0.024 0.024 0.000
#> SRR2105317 2 0.3589 0.645842 0.000 0.752 0.008 0.012 0.000 0.228
#> SRR2105318 2 0.4199 0.461183 0.000 0.544 0.004 0.008 0.000 0.444
#> SRR2105315 5 0.6896 0.070170 0.000 0.344 0.212 0.012 0.396 0.036
#> SRR2105316 2 0.4254 0.599376 0.000 0.624 0.000 0.020 0.004 0.352
#> SRR2105313 2 0.4203 0.628201 0.000 0.652 0.000 0.032 0.000 0.316
#> SRR2105314 6 0.4210 0.222817 0.000 0.336 0.000 0.028 0.000 0.636
#> SRR2105311 3 0.4303 0.482873 0.080 0.076 0.792 0.032 0.020 0.000
#> SRR2105312 3 0.4597 0.479354 0.108 0.076 0.764 0.040 0.012 0.000
#> SRR2105307 1 0.4237 0.714423 0.760 0.004 0.020 0.052 0.164 0.000
#> SRR2105308 1 0.4066 0.745151 0.792 0.012 0.020 0.052 0.124 0.000
#> SRR2105309 5 0.4165 0.274325 0.000 0.004 0.308 0.024 0.664 0.000
#> SRR2105310 5 0.4065 0.323531 0.004 0.004 0.260 0.024 0.708 0.000
#> SRR2105305 5 0.4310 0.133401 0.000 0.000 0.396 0.024 0.580 0.000
#> SRR2105306 5 0.4621 0.005028 0.008 0.000 0.448 0.024 0.520 0.000
#> SRR2105303 6 0.2618 0.674578 0.000 0.076 0.000 0.052 0.000 0.872
#> SRR2105304 4 0.5374 0.852999 0.000 0.424 0.076 0.488 0.012 0.000
#> SRR2105301 2 0.4220 0.649165 0.000 0.664 0.004 0.028 0.000 0.304
#> SRR2105302 2 0.4581 0.426749 0.000 0.516 0.000 0.036 0.000 0.448
#> SRR2105299 5 0.6454 0.276534 0.008 0.224 0.048 0.176 0.544 0.000
#> SRR2105300 2 0.6820 -0.190055 0.000 0.400 0.044 0.184 0.364 0.008
#> SRR2105297 1 0.5404 0.400296 0.624 0.024 0.000 0.108 0.000 0.244
#> SRR2105298 1 0.5361 0.419590 0.632 0.024 0.000 0.108 0.000 0.236
#> SRR2105295 2 0.3702 0.650309 0.000 0.720 0.004 0.012 0.000 0.264
#> SRR2105296 2 0.4928 0.427174 0.000 0.500 0.004 0.052 0.000 0.444
#> SRR2105293 3 0.3386 0.512611 0.068 0.036 0.852 0.024 0.020 0.000
#> SRR2105294 3 0.3871 0.516644 0.100 0.004 0.808 0.028 0.060 0.000
#> SRR2105291 3 0.8119 0.186853 0.296 0.040 0.348 0.104 0.204 0.008
#> SRR2105292 1 0.2565 0.794234 0.892 0.000 0.028 0.040 0.040 0.000
#> SRR2105289 3 0.5963 0.124144 0.084 0.000 0.456 0.044 0.416 0.000
#> SRR2105290 1 0.3844 0.764485 0.812 0.004 0.072 0.028 0.084 0.000
#> SRR2105287 1 0.4142 0.763676 0.788 0.004 0.052 0.040 0.116 0.000
#> SRR2105288 1 0.1672 0.789537 0.940 0.004 0.016 0.012 0.028 0.000
#> SRR2105285 2 0.3507 0.651966 0.000 0.752 0.004 0.012 0.000 0.232
#> SRR2105286 2 0.4381 0.400766 0.000 0.536 0.000 0.024 0.000 0.440
#> SRR2105283 6 0.7994 0.069070 0.108 0.280 0.004 0.192 0.040 0.376
#> SRR2105284 6 0.7422 0.088576 0.020 0.336 0.012 0.184 0.052 0.396
#> SRR2105281 6 0.3017 0.645403 0.000 0.108 0.000 0.052 0.000 0.840
#> SRR2105282 6 0.2747 0.652209 0.000 0.096 0.000 0.044 0.000 0.860
#> SRR2105259 5 0.3855 0.364635 0.000 0.012 0.216 0.024 0.748 0.000
#> SRR2105260 5 0.3888 0.370867 0.000 0.016 0.208 0.024 0.752 0.000
#> SRR2105279 6 0.1492 0.678850 0.000 0.036 0.000 0.024 0.000 0.940
#> SRR2105280 6 0.1418 0.680763 0.000 0.024 0.000 0.032 0.000 0.944
#> SRR2105257 1 0.6176 0.446322 0.520 0.024 0.016 0.112 0.328 0.000
#> SRR2105258 1 0.3635 0.782943 0.832 0.004 0.060 0.052 0.052 0.000
#> SRR2105253 6 0.4372 -0.133306 0.000 0.432 0.000 0.024 0.000 0.544
#> SRR2105254 6 0.4155 0.166339 0.000 0.364 0.000 0.020 0.000 0.616
#> SRR2105255 5 0.4108 0.328217 0.012 0.000 0.232 0.032 0.724 0.000
#> SRR2105256 5 0.4291 0.356106 0.028 0.000 0.176 0.048 0.748 0.000
#> SRR2105251 6 0.3790 0.610591 0.000 0.116 0.000 0.104 0.000 0.780
#> SRR2105252 6 0.4421 0.552050 0.000 0.156 0.000 0.128 0.000 0.716
#> SRR2105249 6 0.4526 0.538428 0.000 0.184 0.000 0.116 0.000 0.700
#> SRR2105250 6 0.4704 0.528052 0.000 0.160 0.000 0.140 0.004 0.696
#> SRR2105247 6 0.2389 0.679328 0.000 0.060 0.000 0.052 0.000 0.888
#> SRR2105248 6 0.2542 0.661963 0.000 0.044 0.000 0.080 0.000 0.876
#> SRR2105245 3 0.4596 0.494713 0.056 0.052 0.796 0.036 0.040 0.020
#> SRR2105246 3 0.6769 0.395598 0.032 0.084 0.640 0.064 0.096 0.084
#> SRR2105243 5 0.5469 -0.000339 0.056 0.004 0.396 0.024 0.520 0.000
#> SRR2105244 3 0.5142 0.380729 0.064 0.000 0.620 0.024 0.292 0.000
#> SRR2105241 1 0.6498 0.142848 0.440 0.000 0.316 0.032 0.212 0.000
#> SRR2105242 1 0.2763 0.794487 0.884 0.004 0.040 0.024 0.048 0.000
#> SRR2105239 3 0.6017 0.256243 0.336 0.004 0.508 0.020 0.132 0.000
#> SRR2105240 1 0.3849 0.779129 0.816 0.004 0.080 0.052 0.048 0.000
#> SRR2105237 2 0.3099 0.501302 0.000 0.848 0.012 0.044 0.000 0.096
#> SRR2105238 2 0.5742 0.417743 0.000 0.588 0.000 0.152 0.024 0.236
#> SRR2105235 6 0.4746 0.499389 0.000 0.216 0.000 0.116 0.000 0.668
#> SRR2105236 6 0.4746 0.507997 0.000 0.216 0.000 0.116 0.000 0.668
#> SRR2105233 2 0.3535 0.629589 0.000 0.760 0.008 0.012 0.000 0.220
#> SRR2105234 2 0.3616 0.632548 0.000 0.748 0.008 0.012 0.000 0.232
#> SRR2105231 6 0.2629 0.668112 0.000 0.060 0.000 0.068 0.000 0.872
#> SRR2105232 6 0.1807 0.675238 0.000 0.020 0.000 0.060 0.000 0.920
#> SRR2105227 3 0.6910 0.332385 0.108 0.028 0.528 0.060 0.268 0.008
#> SRR2105228 1 0.8253 0.080814 0.372 0.060 0.344 0.060 0.100 0.064
#> SRR2105225 3 0.7082 0.225101 0.232 0.004 0.420 0.072 0.272 0.000
#> SRR2105226 1 0.5592 0.649281 0.644 0.000 0.192 0.056 0.108 0.000
#> SRR2105229 3 0.5476 0.200266 0.004 0.036 0.536 0.044 0.380 0.000
#> SRR2105230 3 0.5442 0.066740 0.032 0.012 0.484 0.028 0.444 0.000
#> SRR2105219 2 0.4648 0.578864 0.000 0.604 0.000 0.056 0.000 0.340
#> SRR2105220 6 0.4859 0.103395 0.000 0.344 0.000 0.072 0.000 0.584
#> SRR2105221 6 0.6477 0.338118 0.000 0.220 0.000 0.216 0.052 0.512
#> SRR2105222 6 0.7074 0.342281 0.052 0.148 0.000 0.240 0.048 0.512
#> SRR2105223 5 0.4754 0.096868 0.012 0.000 0.388 0.032 0.568 0.000
#> SRR2105224 5 0.6114 0.021088 0.124 0.000 0.324 0.040 0.512 0.000
#> SRR2105217 6 0.3914 0.603436 0.000 0.104 0.000 0.128 0.000 0.768
#> SRR2105218 6 0.2843 0.646705 0.000 0.036 0.000 0.116 0.000 0.848
#> SRR2105215 6 0.1492 0.680896 0.000 0.024 0.000 0.036 0.000 0.940
#> SRR2105216 6 0.2308 0.670347 0.000 0.068 0.000 0.040 0.000 0.892
#> SRR2105213 3 0.4803 0.493962 0.036 0.028 0.764 0.032 0.124 0.016
#> SRR2105214 3 0.5341 0.486644 0.040 0.048 0.744 0.044 0.096 0.028
#> SRR2105211 5 0.4702 0.107227 0.000 0.008 0.408 0.032 0.552 0.000
#> SRR2105212 5 0.4891 0.262370 0.008 0.004 0.304 0.056 0.628 0.000
#> SRR2105209 5 0.7137 0.101986 0.284 0.016 0.116 0.116 0.468 0.000
#> SRR2105210 1 0.2483 0.792155 0.896 0.004 0.016 0.024 0.060 0.000
#> SRR2105207 1 0.3950 0.765111 0.804 0.004 0.104 0.044 0.044 0.000
#> SRR2105208 1 0.0767 0.789926 0.976 0.000 0.004 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105205 2 0.5804 0.468375 0.016 0.532 0.004 0.116 0.000 0.332
#> SRR2105206 6 0.5820 0.054541 0.012 0.360 0.004 0.120 0.000 0.504
#> SRR2105201 6 0.5916 0.406293 0.000 0.204 0.000 0.156 0.044 0.596
#> SRR2105202 6 0.5964 0.411686 0.000 0.180 0.000 0.168 0.052 0.600
#> SRR2105203 6 0.3863 0.420878 0.000 0.260 0.000 0.028 0.000 0.712
#> SRR2105204 6 0.1176 0.677478 0.000 0.024 0.000 0.020 0.000 0.956
#> SRR2105199 6 0.1682 0.679170 0.000 0.052 0.000 0.020 0.000 0.928
#> SRR2105200 6 0.1890 0.673174 0.000 0.024 0.000 0.060 0.000 0.916
#> SRR2105197 5 0.5975 0.276963 0.016 0.044 0.220 0.104 0.616 0.000
#> SRR2105198 5 0.6755 0.221408 0.028 0.068 0.232 0.124 0.548 0.000
#> SRR2105195 3 0.8139 0.186077 0.268 0.056 0.360 0.052 0.244 0.020
#> SRR2105196 1 0.5602 0.697466 0.728 0.020 0.060 0.064 0.076 0.052
#> SRR2105193 1 0.2011 0.786340 0.912 0.000 0.064 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105194 1 0.1391 0.788016 0.944 0.000 0.040 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.4560 0.399116 0.012 0.048 0.052 0.124 0.764 0.000
#> SRR2105192 5 0.7067 0.098226 0.276 0.052 0.028 0.172 0.472 0.000
#> SRR2105189 2 0.5425 0.553723 0.000 0.584 0.008 0.064 0.020 0.324
#> SRR2105190 2 0.4389 0.373640 0.000 0.512 0.004 0.016 0.000 0.468
#> SRR2105187 2 0.7569 0.268422 0.012 0.464 0.096 0.236 0.020 0.172
#> SRR2105188 6 0.8713 0.016209 0.048 0.272 0.056 0.268 0.072 0.284
#> SRR2105179 1 0.6903 0.032766 0.408 0.012 0.220 0.036 0.324 0.000
#> SRR2105180 1 0.4882 0.707543 0.728 0.008 0.056 0.052 0.156 0.000
#> SRR2105183 6 0.1225 0.679085 0.000 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952
#> SRR2105184 6 0.2176 0.667754 0.000 0.024 0.000 0.080 0.000 0.896
#> SRR2105185 6 0.4154 0.592283 0.000 0.176 0.008 0.068 0.000 0.748
#> SRR2105186 6 0.4298 0.613829 0.012 0.104 0.000 0.132 0.000 0.752
#> SRR2105181 5 0.4461 0.392597 0.000 0.056 0.080 0.100 0.764 0.000
#> SRR2105182 5 0.4305 0.367805 0.008 0.012 0.196 0.044 0.740 0.000
#> SRR2105177 1 0.0520 0.786683 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0520 0.786683 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105171 6 0.3551 0.588481 0.000 0.168 0.000 0.048 0.000 0.784
#> SRR2105172 6 0.1225 0.675996 0.000 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952
#> SRR2105175 1 0.0622 0.787938 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0520 0.786683 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105173 6 0.4614 0.523054 0.000 0.228 0.000 0.096 0.000 0.676
#> SRR2105174 6 0.2888 0.667710 0.000 0.092 0.000 0.056 0.000 0.852
#> SRR2105169 6 0.3211 0.657307 0.000 0.056 0.000 0.120 0.000 0.824
#> SRR2105170 6 0.2867 0.659793 0.000 0.040 0.000 0.112 0.000 0.848
#> SRR2105167 6 0.1261 0.677741 0.000 0.024 0.000 0.024 0.000 0.952
#> SRR2105168 6 0.1257 0.677473 0.000 0.028 0.000 0.020 0.000 0.952
#> SRR2105165 3 0.4463 0.471881 0.068 0.000 0.724 0.016 0.192 0.000
#> SRR2105166 3 0.3875 0.504521 0.092 0.000 0.780 0.004 0.124 0.000
#> SRR2105163 3 0.3560 0.511294 0.092 0.024 0.836 0.024 0.024 0.000
#> SRR2105164 3 0.3701 0.507339 0.100 0.032 0.824 0.032 0.012 0.000
#> SRR2105161 1 0.2206 0.787687 0.904 0.000 0.064 0.008 0.024 0.000
#> SRR2105162 1 0.0551 0.788632 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105155 6 0.3395 0.657587 0.000 0.132 0.000 0.060 0.000 0.808
#> SRR2105156 6 0.0935 0.675589 0.000 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964
#> SRR2105157 6 0.3701 0.623814 0.000 0.100 0.000 0.112 0.000 0.788
#> SRR2105158 6 0.4121 0.594752 0.000 0.116 0.000 0.136 0.000 0.748
#> SRR2105159 3 0.4210 0.455185 0.248 0.008 0.712 0.024 0.008 0.000
#> SRR2105160 1 0.2841 0.759099 0.848 0.000 0.128 0.012 0.012 0.000
#> SRR2105153 6 0.4915 0.472074 0.000 0.208 0.000 0.140 0.000 0.652
#> SRR2105154 6 0.4693 0.520373 0.000 0.176 0.000 0.140 0.000 0.684
#> SRR2105151 6 0.2573 0.652131 0.000 0.112 0.000 0.024 0.000 0.864
#> SRR2105152 6 0.1245 0.677329 0.000 0.032 0.000 0.016 0.000 0.952
#> SRR2105149 5 0.7264 0.064868 0.036 0.228 0.268 0.040 0.428 0.000
#> SRR2105150 5 0.6973 0.023822 0.024 0.192 0.344 0.032 0.408 0.000
#> SRR2105147 4 0.6877 0.660329 0.008 0.216 0.304 0.428 0.044 0.000
#> SRR2105148 4 0.6877 0.660329 0.008 0.216 0.304 0.428 0.044 0.000
#> SRR2105143 1 0.4475 0.763763 0.780 0.020 0.048 0.052 0.100 0.000
#> SRR2105144 1 0.3990 0.762745 0.832 0.040 0.036 0.048 0.020 0.024
#> SRR2105145 1 0.3910 0.757964 0.800 0.008 0.128 0.032 0.032 0.000
#> SRR2105146 1 0.2976 0.775417 0.860 0.000 0.088 0.024 0.028 0.000
#> SRR2105141 2 0.5105 0.545878 0.000 0.600 0.004 0.096 0.000 0.300
#> SRR2105142 2 0.4976 0.536887 0.000 0.596 0.004 0.076 0.000 0.324
#> SRR2105139 6 0.2197 0.677166 0.000 0.056 0.000 0.044 0.000 0.900
#> SRR2105140 6 0.2009 0.677804 0.000 0.024 0.000 0.068 0.000 0.908
#> SRR2105137 6 0.5837 0.415918 0.000 0.192 0.000 0.172 0.036 0.600
#> SRR2105138 6 0.6810 0.341264 0.016 0.200 0.000 0.248 0.044 0.492
#> SRR2105135 6 0.1265 0.674285 0.000 0.044 0.000 0.008 0.000 0.948
#> SRR2105136 6 0.1176 0.680790 0.000 0.020 0.000 0.024 0.000 0.956
#> SRR2105133 5 0.5498 0.354721 0.016 0.064 0.076 0.156 0.688 0.000
#> SRR2105134 5 0.5516 0.359135 0.032 0.060 0.056 0.160 0.692 0.000
#> SRR2105131 5 0.7872 -0.120868 0.004 0.300 0.032 0.128 0.384 0.152
#> SRR2105132 5 0.7130 0.244991 0.144 0.136 0.008 0.168 0.532 0.012
#> SRR2105129 1 0.1396 0.786959 0.952 0.024 0.008 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105130 1 0.0653 0.786477 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105127 5 0.7159 -0.099757 0.348 0.044 0.032 0.132 0.436 0.008
#> SRR2105128 5 0.7634 -0.099491 0.316 0.120 0.024 0.136 0.400 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.971 0.961 0.982 0.5015 0.499 0.499
#> 3 3 0.616 0.720 0.865 0.2978 0.806 0.629
#> 4 4 0.661 0.723 0.852 0.1447 0.828 0.559
#> 5 5 0.630 0.562 0.751 0.0610 0.916 0.697
#> 6 6 0.667 0.587 0.743 0.0432 0.905 0.614
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0672 0.981 0.992 0.008
#> SRR2105276 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105261 1 0.8144 0.666 0.748 0.252
#> SRR2105262 1 0.4022 0.912 0.920 0.080
#> SRR2105357 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105440 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105509 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.3879 0.910 0.076 0.924
#> SRR2105501 2 0.1633 0.959 0.024 0.976
#> SRR2105502 2 0.1414 0.962 0.020 0.980
#> SRR2105499 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105497 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105494 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105491 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105489 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105478 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105475 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR2105474 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105471 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105455 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105456 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.1633 0.958 0.024 0.976
#> SRR2105452 2 0.6887 0.783 0.184 0.816
#> SRR2105449 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105445 1 0.9460 0.421 0.636 0.364
#> SRR2105446 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105443 2 0.6801 0.789 0.180 0.820
#> SRR2105444 2 0.8608 0.620 0.284 0.716
#> SRR2105441 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.5178 0.868 0.116 0.884
#> SRR2105430 2 0.2423 0.945 0.040 0.960
#> SRR2105427 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105421 1 0.2948 0.942 0.948 0.052
#> SRR2105422 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105402 2 0.6973 0.777 0.188 0.812
#> SRR2105399 2 0.6048 0.830 0.148 0.852
#> SRR2105400 2 0.5294 0.863 0.120 0.880
#> SRR2105397 2 0.6438 0.810 0.164 0.836
#> SRR2105398 2 0.8207 0.671 0.256 0.744
#> SRR2105395 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105382 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105383 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105379 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105380 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105377 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105375 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105376 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105368 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.6887 0.783 0.184 0.816
#> SRR2105349 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105348 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105343 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.3733 0.915 0.072 0.928
#> SRR2105330 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105327 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105325 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.9170 0.514 0.332 0.668
#> SRR2105316 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.2236 0.957 0.964 0.036
#> SRR2105312 1 0.4161 0.908 0.916 0.084
#> SRR2105307 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105302 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.7056 0.763 0.808 0.192
#> SRR2105300 2 0.8955 0.562 0.312 0.688
#> SRR2105297 2 0.5059 0.872 0.112 0.888
#> SRR2105298 2 0.4022 0.907 0.080 0.920
#> SRR2105295 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105294 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105292 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105284 2 0.2778 0.938 0.048 0.952
#> SRR2105281 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105247 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.3584 0.925 0.932 0.068
#> SRR2105246 1 0.8207 0.658 0.744 0.256
#> SRR2105243 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105238 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105235 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105228 1 0.1633 0.967 0.976 0.024
#> SRR2105225 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.2603 0.949 0.956 0.044
#> SRR2105230 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105222 2 0.0376 0.974 0.004 0.996
#> SRR2105223 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.2778 0.945 0.952 0.048
#> SRR2105214 1 0.6343 0.812 0.840 0.160
#> SRR2105211 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105212 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105206 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105201 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.1184 0.965 0.016 0.984
#> SRR2105203 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.1414 0.971 0.980 0.020
#> SRR2105195 1 0.1184 0.974 0.984 0.016
#> SRR2105196 1 0.2043 0.960 0.968 0.032
#> SRR2105193 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105190 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105188 2 0.1184 0.965 0.016 0.984
#> SRR2105179 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105186 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105181 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105162 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.5629 0.850 0.868 0.132
#> SRR2105150 1 0.2423 0.953 0.960 0.040
#> SRR2105147 2 0.9732 0.345 0.404 0.596
#> SRR2105148 2 0.9815 0.299 0.420 0.580
#> SRR2105143 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR2105144 1 0.5178 0.869 0.884 0.116
#> SRR2105145 1 0.2236 0.956 0.964 0.036
#> SRR2105146 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.1843 0.955 0.028 0.972
#> SRR2105138 2 0.4562 0.890 0.096 0.904
#> SRR2105135 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.976 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9358 0.470 0.352 0.648
#> SRR2105132 1 0.5946 0.833 0.856 0.144
#> SRR2105129 1 0.2603 0.948 0.956 0.044
#> SRR2105130 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.1843 0.963 0.972 0.028
#> SRR2105128 1 0.5946 0.833 0.856 0.144
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.5497 0.55524 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105278 3 0.5988 0.43680 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105275 3 0.4062 0.64526 0.164 0.000 0.836
#> SRR2105276 3 0.5254 0.55903 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105273 3 0.5968 0.44703 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105274 1 0.5431 0.60365 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105271 1 0.6267 0.09841 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105272 1 0.0747 0.81930 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105269 2 0.0747 0.91006 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105270 2 0.0237 0.91213 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105267 2 0.0592 0.91100 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105268 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0475 0.91218 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105264 2 0.1529 0.90006 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105261 3 0.0424 0.70147 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105262 3 0.0237 0.70233 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105357 3 0.2711 0.70623 0.088 0.000 0.912
#> SRR2105358 3 0.5465 0.56045 0.288 0.000 0.712
#> SRR2105439 2 0.2625 0.86657 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105440 2 0.1860 0.88978 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105509 2 0.5291 0.71704 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105510 2 0.5254 0.72192 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105507 3 0.5835 0.48888 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105508 3 0.5098 0.61165 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105505 1 0.5291 0.61164 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105506 1 0.4346 0.71887 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105503 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.5327 0.48192 0.000 0.272 0.728
#> SRR2105501 2 0.2550 0.89085 0.024 0.936 0.040
#> SRR2105502 3 0.6204 0.05060 0.000 0.424 0.576
#> SRR2105499 3 0.5810 0.48666 0.336 0.000 0.664
#> SRR2105500 3 0.6235 0.23877 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105497 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105496 2 0.0983 0.90802 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105493 2 0.1482 0.90353 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105494 2 0.1781 0.89990 0.020 0.960 0.020
#> SRR2105491 2 0.2663 0.89364 0.024 0.932 0.044
#> SRR2105492 2 0.2492 0.89051 0.048 0.936 0.016
#> SRR2105489 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105487 1 0.5650 0.43039 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105488 1 0.2796 0.76928 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105485 3 0.6111 0.35876 0.396 0.000 0.604
#> SRR2105486 3 0.6192 0.29868 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105483 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.5733 0.39663 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105482 1 0.0424 0.82068 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105479 1 0.6079 0.24044 0.612 0.000 0.388
#> SRR2105480 1 0.1964 0.80135 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105477 2 0.0475 0.91166 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105478 2 0.1482 0.90615 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105475 2 0.5291 0.71704 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105476 2 0.5254 0.72192 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105473 2 0.4121 0.78674 0.168 0.832 0.000
#> SRR2105474 2 0.3686 0.81560 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105471 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105472 2 0.0424 0.91080 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105469 3 0.4974 0.62137 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105470 1 0.5785 0.51390 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105467 3 0.6295 0.11960 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105468 1 0.5591 0.55447 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105465 1 0.3686 0.75879 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105466 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.4346 0.80511 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105460 2 0.4605 0.78677 0.000 0.796 0.204
#> SRR2105457 3 0.0747 0.70759 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105458 3 0.0424 0.70582 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105455 1 0.5138 0.64881 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105456 1 0.4887 0.67743 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105453 1 0.3412 0.77297 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105454 1 0.3412 0.77314 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105451 2 0.6295 0.72390 0.036 0.728 0.236
#> SRR2105452 3 0.3686 0.62438 0.000 0.140 0.860
#> SRR2105449 1 0.0747 0.82009 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105450 1 0.0237 0.81964 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105447 2 0.5291 0.71815 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105448 2 0.2625 0.87964 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105445 3 0.0000 0.70279 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105446 3 0.5859 0.48518 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105443 3 0.4399 0.58340 0.000 0.188 0.812
#> SRR2105444 2 0.9484 0.20656 0.240 0.496 0.264
#> SRR2105441 2 0.1860 0.88995 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105442 2 0.1860 0.89002 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105437 1 0.6291 -0.12297 0.532 0.000 0.468
#> SRR2105438 1 0.6274 -0.09006 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105435 3 0.5431 0.61240 0.284 0.000 0.716
#> SRR2105436 3 0.5706 0.52947 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105433 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.9098 0.29229 0.148 0.492 0.360
#> SRR2105430 2 0.7301 0.59505 0.052 0.640 0.308
#> SRR2105427 2 0.3879 0.83090 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105428 2 0.2066 0.89241 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105425 2 0.1289 0.90461 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105426 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105421 3 0.0000 0.70279 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105422 3 0.0237 0.70435 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105423 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.4887 0.62504 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105420 3 0.4750 0.64235 0.216 0.000 0.784
#> SRR2105415 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0237 0.81983 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105418 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.5327 0.71243 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105414 2 0.5016 0.75048 0.000 0.760 0.240
#> SRR2105409 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.0892 0.90686 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105407 3 0.0892 0.70812 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105408 3 0.0424 0.70582 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105403 3 0.5497 0.55391 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105404 3 0.5560 0.54543 0.300 0.000 0.700
#> SRR2105405 1 0.4654 0.70308 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105406 1 0.4002 0.74743 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105401 2 0.6305 0.27091 0.000 0.516 0.484
#> SRR2105402 3 0.4504 0.57199 0.000 0.196 0.804
#> SRR2105399 3 0.5098 0.51897 0.000 0.248 0.752
#> SRR2105400 3 0.5138 0.51469 0.000 0.252 0.748
#> SRR2105397 3 0.6181 0.60079 0.156 0.072 0.772
#> SRR2105398 3 0.5384 0.61058 0.188 0.024 0.788
#> SRR2105395 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.0592 0.70677 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105390 3 0.2878 0.70169 0.096 0.000 0.904
#> SRR2105391 3 0.0747 0.70759 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105392 3 0.1031 0.70843 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105385 3 0.5926 0.45054 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105386 3 0.6008 0.41458 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105387 1 0.2165 0.81254 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105388 1 0.2796 0.79768 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105381 2 0.5905 0.58880 0.000 0.648 0.352
#> SRR2105382 2 0.5443 0.72369 0.004 0.736 0.260
#> SRR2105383 2 0.2356 0.87608 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105384 2 0.2878 0.85790 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105379 2 0.4883 0.78092 0.004 0.788 0.208
#> SRR2105380 2 0.6122 0.76392 0.152 0.776 0.072
#> SRR2105377 2 0.0892 0.90686 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105378 2 0.2878 0.85675 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105375 1 0.1529 0.81910 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105376 1 0.0892 0.82005 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105373 3 0.5905 0.48676 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105374 1 0.6235 -0.01427 0.564 0.000 0.436
#> SRR2105371 3 0.2959 0.70138 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105372 3 0.4555 0.64844 0.200 0.000 0.800
#> SRR2105369 3 0.5968 0.43035 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105370 1 0.6252 0.19094 0.556 0.000 0.444
#> SRR2105367 1 0.0237 0.81921 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105368 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.1585 0.90537 0.008 0.964 0.028
#> SRR2105366 2 0.1315 0.90804 0.008 0.972 0.020
#> SRR2105363 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.5016 0.61581 0.240 0.000 0.760
#> SRR2105360 3 0.5397 0.57092 0.280 0.000 0.720
#> SRR2105355 3 0.4452 0.65920 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105356 1 0.5560 0.58285 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105353 3 0.2356 0.69695 0.072 0.000 0.928
#> SRR2105354 3 0.5291 0.61930 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105351 2 0.1031 0.90749 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105352 3 0.4605 0.56394 0.000 0.204 0.796
#> SRR2105349 2 0.4931 0.75875 0.000 0.768 0.232
#> SRR2105350 2 0.0237 0.91223 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105345 2 0.0892 0.90688 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105346 2 0.0892 0.90683 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105347 2 0.4702 0.73130 0.212 0.788 0.000
#> SRR2105348 2 0.5529 0.59292 0.296 0.704 0.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.2959 0.70032 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105342 3 0.5327 0.57379 0.272 0.000 0.728
#> SRR2105339 3 0.0747 0.70773 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105340 3 0.2959 0.69107 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105335 1 0.5948 0.36192 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105336 1 0.1753 0.81716 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105337 1 0.5988 0.43296 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105338 1 0.2537 0.80502 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105331 2 0.1964 0.89401 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105332 2 0.0237 0.91210 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105333 2 0.4974 0.75442 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105334 2 0.3686 0.84163 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105329 3 0.2165 0.68107 0.000 0.064 0.936
#> SRR2105330 3 0.6204 0.05239 0.000 0.424 0.576
#> SRR2105327 2 0.5138 0.73757 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105328 2 0.5216 0.72919 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105325 3 0.5178 0.56345 0.256 0.000 0.744
#> SRR2105326 3 0.5254 0.55903 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105323 3 0.3816 0.68185 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105324 3 0.5926 0.44762 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105319 1 0.6008 0.28710 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105320 1 0.1643 0.81088 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105321 3 0.5098 0.57580 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105322 3 0.5988 0.42606 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105317 2 0.4062 0.82245 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105318 2 0.0747 0.91010 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105315 3 0.2945 0.66587 0.004 0.088 0.908
#> SRR2105316 2 0.4887 0.76272 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105313 2 0.2878 0.87183 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105314 2 0.0424 0.91177 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105311 3 0.5070 0.59123 0.224 0.004 0.772
#> SRR2105312 3 0.5656 0.54705 0.264 0.008 0.728
#> SRR2105307 1 0.4346 0.71892 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105308 1 0.4346 0.71948 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105309 3 0.0892 0.70812 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105310 3 0.4887 0.62477 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105305 3 0.1289 0.70874 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105306 3 0.3551 0.68804 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105303 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.6299 -0.14550 0.000 0.476 0.524
#> SRR2105301 2 0.5327 0.71211 0.000 0.728 0.272
#> SRR2105302 2 0.1860 0.89659 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105299 3 0.0424 0.70392 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105300 3 0.1647 0.69504 0.004 0.036 0.960
#> SRR2105297 1 0.6299 0.01104 0.524 0.476 0.000
#> SRR2105298 2 0.6309 0.07110 0.496 0.504 0.000
#> SRR2105295 2 0.5178 0.73159 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105296 2 0.3482 0.85044 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105293 3 0.5254 0.56873 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105294 1 0.5733 0.42493 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105291 1 0.2796 0.80141 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105292 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.5254 0.59069 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105290 1 0.1411 0.82002 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105287 1 0.2711 0.79805 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105288 1 0.0424 0.82074 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105285 2 0.5098 0.74096 0.000 0.752 0.248
#> SRR2105286 2 0.2066 0.89241 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105283 2 0.4485 0.81268 0.136 0.844 0.020
#> SRR2105284 2 0.4748 0.79790 0.144 0.832 0.024
#> SRR2105281 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.0592 0.70677 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105260 3 0.0424 0.70582 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105279 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.2537 0.80320 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105258 1 0.0747 0.82119 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105253 2 0.0424 0.91159 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105254 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 3 0.5926 0.44892 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105256 3 0.6286 0.13875 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105251 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0892 0.90678 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105250 2 0.4002 0.79578 0.160 0.840 0.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.6522 0.53944 0.272 0.032 0.696
#> SRR2105246 3 0.6100 0.63235 0.096 0.120 0.784
#> SRR2105243 1 0.6308 0.02133 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105244 1 0.6286 0.04774 0.536 0.000 0.464
#> SRR2105241 1 0.4555 0.71670 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105242 1 0.0424 0.82068 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105239 1 0.4121 0.72688 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105240 1 0.1163 0.81990 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105237 2 0.5988 0.56274 0.000 0.632 0.368
#> SRR2105238 2 0.2448 0.88688 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105235 2 0.0424 0.91085 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105236 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105233 2 0.5254 0.72192 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105234 2 0.5254 0.72192 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105231 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.6204 0.28330 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105228 1 0.1647 0.81894 0.960 0.004 0.036
#> SRR2105225 1 0.4887 0.68266 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105226 1 0.1753 0.81690 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105229 3 0.0424 0.70372 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105230 3 0.4974 0.64252 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105219 2 0.0747 0.91008 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105220 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105221 2 0.1964 0.88820 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105222 2 0.4452 0.76058 0.192 0.808 0.000
#> SRR2105223 3 0.5905 0.45457 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105224 1 0.6062 0.38942 0.616 0.000 0.384
#> SRR2105217 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.4636 0.68272 0.104 0.044 0.852
#> SRR2105214 3 0.5823 0.63338 0.144 0.064 0.792
#> SRR2105211 3 0.1163 0.70954 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105212 3 0.5327 0.58268 0.272 0.000 0.728
#> SRR2105209 1 0.5178 0.64617 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105210 1 0.0747 0.82160 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105207 1 0.0237 0.81983 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105208 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.5178 0.73166 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105206 2 0.2711 0.87632 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105201 2 0.1753 0.89246 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105202 2 0.3482 0.82745 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105203 2 0.0424 0.91159 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105204 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105197 3 0.3551 0.70015 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105198 3 0.3686 0.68954 0.140 0.000 0.860
#> SRR2105195 3 0.6825 -0.00713 0.492 0.012 0.496
#> SRR2105196 1 0.1620 0.81584 0.964 0.012 0.024
#> SRR2105193 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 3 0.5650 0.52966 0.312 0.000 0.688
#> SRR2105192 1 0.1964 0.81238 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105189 2 0.4178 0.81515 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105190 2 0.0747 0.91018 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105187 2 0.6665 0.67741 0.036 0.688 0.276
#> SRR2105188 2 0.5524 0.76276 0.164 0.796 0.040
#> SRR2105179 1 0.4796 0.69084 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105180 1 0.1753 0.81464 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105183 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105184 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105185 2 0.1031 0.90791 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105186 2 0.0424 0.91147 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105181 3 0.4452 0.65702 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105182 3 0.5397 0.57800 0.280 0.000 0.720
#> SRR2105177 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0237 0.91221 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105174 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.1289 0.90159 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105167 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.6235 0.32998 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105166 1 0.6154 0.13653 0.592 0.000 0.408
#> SRR2105163 3 0.4702 0.60761 0.212 0.000 0.788
#> SRR2105164 3 0.5291 0.54992 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105161 1 0.0592 0.81916 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105162 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 1 0.5016 0.58444 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105160 1 0.0592 0.81916 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105153 2 0.0592 0.91074 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105154 2 0.0237 0.91214 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105151 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105149 3 0.1267 0.70153 0.024 0.004 0.972
#> SRR2105150 3 0.0983 0.70244 0.016 0.004 0.980
#> SRR2105147 3 0.1905 0.69664 0.016 0.028 0.956
#> SRR2105148 3 0.1905 0.69664 0.016 0.028 0.956
#> SRR2105143 1 0.1964 0.81307 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105144 1 0.0892 0.80980 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105145 1 0.1919 0.81102 0.956 0.024 0.020
#> SRR2105146 1 0.0592 0.81916 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105141 2 0.3412 0.85328 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105142 2 0.2625 0.87918 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105139 2 0.0000 0.91240 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0747 0.90824 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105137 2 0.3116 0.84641 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105138 2 0.5327 0.64243 0.272 0.728 0.000
#> SRR2105135 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105136 2 0.0237 0.91176 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105133 3 0.5465 0.58834 0.288 0.000 0.712
#> SRR2105134 3 0.6309 0.12411 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105131 3 0.7841 0.13166 0.056 0.408 0.536
#> SRR2105132 1 0.4749 0.70044 0.844 0.116 0.040
#> SRR2105129 1 0.0592 0.81504 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.81954 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.4968 0.70790 0.800 0.012 0.188
#> SRR2105128 1 0.5633 0.67286 0.768 0.024 0.208
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105278 3 0.1484 0.82440 0.016 0.020 0.960 0.004
#> SRR2105275 3 0.5681 0.66878 0.208 0.000 0.704 0.088
#> SRR2105276 3 0.5951 0.57290 0.300 0.000 0.636 0.064
#> SRR2105273 3 0.2149 0.81240 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105274 1 0.4761 0.49633 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR2105271 3 0.4781 0.48359 0.336 0.000 0.660 0.004
#> SRR2105272 1 0.0469 0.84476 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105269 4 0.2345 0.77838 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105270 4 0.5244 0.27521 0.000 0.388 0.012 0.600
#> SRR2105267 4 0.2814 0.75437 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105268 2 0.4103 0.71855 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105265 2 0.2081 0.86604 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105266 2 0.1940 0.86940 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105263 2 0.3610 0.73269 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105264 2 0.1004 0.86522 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR2105261 4 0.4948 0.19335 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR2105262 3 0.4331 0.57041 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105357 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105358 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105439 2 0.2949 0.84560 0.000 0.888 0.024 0.088
#> SRR2105440 2 0.2596 0.85519 0.000 0.908 0.024 0.068
#> SRR2105509 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105510 4 0.0707 0.81259 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105507 3 0.3024 0.75629 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR2105508 3 0.1489 0.82812 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR2105505 1 0.4776 0.52958 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR2105506 1 0.4134 0.69372 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105503 2 0.2647 0.81886 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105504 4 0.1389 0.79954 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR2105501 2 0.6164 0.51653 0.004 0.604 0.056 0.336
#> SRR2105502 4 0.0592 0.80904 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR2105499 3 0.1722 0.82942 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR2105500 3 0.2408 0.79502 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR2105497 2 0.3105 0.83585 0.004 0.856 0.000 0.140
#> SRR2105498 2 0.0817 0.86545 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105495 2 0.4609 0.71779 0.000 0.752 0.024 0.224
#> SRR2105496 2 0.3080 0.84185 0.000 0.880 0.024 0.096
#> SRR2105493 2 0.5083 0.67322 0.000 0.716 0.036 0.248
#> SRR2105494 2 0.2224 0.85583 0.000 0.928 0.032 0.040
#> SRR2105491 2 0.4948 0.15655 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105492 2 0.4920 0.37886 0.004 0.628 0.000 0.368
#> SRR2105489 2 0.0817 0.86545 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105490 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105487 3 0.5464 0.50411 0.344 0.020 0.632 0.004
#> SRR2105488 1 0.5560 0.31851 0.608 0.020 0.368 0.004
#> SRR2105485 3 0.1732 0.82722 0.040 0.008 0.948 0.004
#> SRR2105486 3 0.2088 0.81827 0.064 0.004 0.928 0.004
#> SRR2105483 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.4830 0.46623 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR2105482 1 0.0336 0.84657 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105479 1 0.5055 0.55649 0.712 0.000 0.256 0.032
#> SRR2105480 1 0.1022 0.83879 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105477 2 0.5105 0.54508 0.000 0.696 0.028 0.276
#> SRR2105478 2 0.2282 0.84300 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR2105475 4 0.0469 0.81160 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105476 4 0.0336 0.81136 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105473 2 0.1833 0.85894 0.000 0.944 0.024 0.032
#> SRR2105474 2 0.1284 0.85284 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR2105471 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105472 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105469 3 0.1677 0.83011 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR2105470 3 0.4967 0.05612 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR2105467 3 0.2256 0.81568 0.056 0.020 0.924 0.000
#> SRR2105468 1 0.5296 0.22606 0.500 0.008 0.492 0.000
#> SRR2105465 1 0.3074 0.79038 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.4605 0.59100 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105462 2 0.2973 0.83628 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105459 4 0.0921 0.80974 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105460 4 0.0707 0.81066 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105457 3 0.0817 0.82989 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105458 3 0.0817 0.82989 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105455 1 0.4546 0.69099 0.732 0.000 0.256 0.012
#> SRR2105456 1 0.4343 0.68352 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR2105453 1 0.4542 0.73850 0.752 0.020 0.228 0.000
#> SRR2105454 1 0.4706 0.71899 0.732 0.020 0.248 0.000
#> SRR2105451 2 0.7342 -0.04559 0.024 0.448 0.084 0.444
#> SRR2105452 4 0.1940 0.78290 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR2105449 1 0.0188 0.84553 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105450 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105447 4 0.0657 0.81219 0.000 0.012 0.004 0.984
#> SRR2105448 4 0.2011 0.80168 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105445 3 0.3501 0.76007 0.000 0.020 0.848 0.132
#> SRR2105446 3 0.1229 0.82498 0.008 0.020 0.968 0.004
#> SRR2105443 4 0.3447 0.74830 0.000 0.020 0.128 0.852
#> SRR2105444 4 0.9065 0.39642 0.204 0.264 0.092 0.440
#> SRR2105441 2 0.1743 0.86499 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR2105442 2 0.0524 0.86294 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR2105437 3 0.5239 0.58477 0.300 0.020 0.676 0.004
#> SRR2105438 3 0.5239 0.58477 0.300 0.020 0.676 0.004
#> SRR2105435 3 0.3392 0.79328 0.124 0.000 0.856 0.020
#> SRR2105436 3 0.1743 0.83125 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR2105433 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0188 0.84473 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 4 0.4919 0.75221 0.112 0.080 0.012 0.796
#> SRR2105430 4 0.2505 0.80343 0.020 0.052 0.008 0.920
#> SRR2105427 4 0.3355 0.73360 0.000 0.160 0.004 0.836
#> SRR2105428 4 0.2048 0.80076 0.000 0.064 0.008 0.928
#> SRR2105425 4 0.4981 0.09984 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105426 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105421 3 0.4406 0.54815 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105422 3 0.2271 0.81471 0.008 0.000 0.916 0.076
#> SRR2105423 2 0.1557 0.87142 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105424 2 0.1389 0.87021 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105419 3 0.0937 0.83146 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR2105420 3 0.1209 0.83175 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR2105415 1 0.0336 0.84363 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105416 1 0.0188 0.84473 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105414 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105409 2 0.2216 0.86511 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105410 2 0.1182 0.85786 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR2105411 2 0.2530 0.85989 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105412 2 0.2216 0.86414 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105407 3 0.0592 0.83073 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105408 3 0.0469 0.83033 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105403 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105404 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105405 1 0.4008 0.71087 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105406 1 0.3764 0.73843 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105401 4 0.0336 0.81076 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105402 4 0.1792 0.78818 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR2105399 4 0.1792 0.78940 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR2105400 4 0.1867 0.78637 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR2105397 4 0.5955 0.66136 0.148 0.024 0.096 0.732
#> SRR2105398 4 0.6329 0.62795 0.172 0.024 0.104 0.700
#> SRR2105395 2 0.1022 0.86760 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105396 2 0.0817 0.86545 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105393 2 0.1211 0.87108 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105394 2 0.0921 0.86823 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105389 3 0.0817 0.83026 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105390 3 0.0804 0.83147 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105391 3 0.1004 0.83008 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR2105392 3 0.0895 0.83047 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR2105385 3 0.1902 0.82201 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR2105386 3 0.1557 0.82487 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR2105387 1 0.2197 0.83341 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR2105388 1 0.3528 0.76571 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105381 4 0.2021 0.81071 0.000 0.056 0.012 0.932
#> SRR2105382 4 0.1118 0.80892 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105383 2 0.2654 0.85677 0.004 0.888 0.000 0.108
#> SRR2105384 2 0.3037 0.85177 0.020 0.880 0.000 0.100
#> SRR2105379 4 0.3764 0.70928 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR2105380 4 0.6694 0.32657 0.092 0.392 0.000 0.516
#> SRR2105377 2 0.1520 0.85714 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR2105378 2 0.1520 0.85714 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR2105375 1 0.2197 0.83754 0.916 0.004 0.080 0.000
#> SRR2105376 1 0.1637 0.83889 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105373 3 0.1822 0.82673 0.044 0.008 0.944 0.004
#> SRR2105374 3 0.5191 0.59569 0.292 0.020 0.684 0.004
#> SRR2105371 3 0.0895 0.83047 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR2105372 3 0.1042 0.83134 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR2105369 3 0.1022 0.83066 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105370 3 0.3400 0.71564 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR2105367 1 0.2450 0.82391 0.912 0.016 0.072 0.000
#> SRR2105368 1 0.1182 0.83644 0.968 0.016 0.016 0.000
#> SRR2105365 4 0.4967 0.25061 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR2105366 2 0.4996 -0.02574 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105363 2 0.3444 0.80725 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105364 2 0.1118 0.86966 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105361 2 0.3873 0.76373 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105362 2 0.2281 0.86753 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105359 3 0.1042 0.83134 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR2105360 3 0.1305 0.83048 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR2105355 3 0.1807 0.82753 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR2105356 1 0.4855 0.46679 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR2105353 3 0.2919 0.81743 0.060 0.000 0.896 0.044
#> SRR2105354 3 0.2124 0.82514 0.068 0.000 0.924 0.008
#> SRR2105351 4 0.4746 0.39598 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR2105352 4 0.1867 0.78610 0.000 0.000 0.072 0.928
#> SRR2105349 4 0.0707 0.81205 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105350 2 0.4898 0.40076 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105345 2 0.2011 0.86386 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105346 2 0.1474 0.87040 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105347 2 0.0921 0.85724 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105348 2 0.1489 0.85176 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR2105343 4 0.4972 -0.00445 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR2105344 2 0.1716 0.87109 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105341 3 0.0927 0.83128 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR2105342 3 0.1004 0.83100 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR2105339 3 0.1211 0.82719 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105340 3 0.2699 0.81828 0.068 0.000 0.904 0.028
#> SRR2105335 3 0.3306 0.76695 0.156 0.004 0.840 0.000
#> SRR2105336 1 0.3710 0.76295 0.804 0.004 0.192 0.000
#> SRR2105337 1 0.4677 0.61494 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR2105338 1 0.1867 0.83621 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105331 2 0.4996 0.07632 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105332 2 0.1474 0.86321 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105333 4 0.0469 0.81160 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105334 4 0.1792 0.80543 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR2105329 4 0.5420 0.38341 0.000 0.024 0.352 0.624
#> SRR2105330 4 0.6182 0.51383 0.000 0.088 0.276 0.636
#> SRR2105327 4 0.2589 0.78869 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR2105328 4 0.2973 0.77209 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105325 3 0.5972 0.57878 0.292 0.000 0.640 0.068
#> SRR2105326 3 0.5929 0.57812 0.296 0.000 0.640 0.064
#> SRR2105323 3 0.0657 0.83007 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105324 3 0.1211 0.83029 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105319 3 0.5203 0.36153 0.416 0.008 0.576 0.000
#> SRR2105320 1 0.1792 0.82478 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105321 3 0.5721 0.60102 0.284 0.000 0.660 0.056
#> SRR2105322 3 0.5989 0.41505 0.400 0.000 0.556 0.044
#> SRR2105317 4 0.0921 0.80994 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105318 4 0.1940 0.79367 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR2105315 3 0.5229 0.29432 0.000 0.008 0.564 0.428
#> SRR2105316 4 0.0817 0.81065 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105313 4 0.2281 0.79177 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR2105314 4 0.4996 -0.06912 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105311 4 0.7827 0.06074 0.288 0.000 0.300 0.412
#> SRR2105312 4 0.7627 0.23021 0.292 0.000 0.240 0.468
#> SRR2105307 1 0.4040 0.70480 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR2105308 1 0.3942 0.71727 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR2105309 3 0.0707 0.83051 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105310 3 0.0937 0.83196 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR2105305 3 0.1042 0.83097 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR2105306 3 0.1042 0.83134 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR2105303 2 0.1792 0.87089 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105304 4 0.0592 0.80908 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR2105301 4 0.3306 0.75922 0.000 0.156 0.004 0.840
#> SRR2105302 4 0.3311 0.74422 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR2105299 3 0.3891 0.74294 0.004 0.020 0.828 0.148
#> SRR2105300 3 0.5582 0.31357 0.000 0.024 0.576 0.400
#> SRR2105297 2 0.4018 0.64886 0.224 0.772 0.000 0.004
#> SRR2105298 2 0.4655 0.51710 0.312 0.684 0.000 0.004
#> SRR2105295 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105296 4 0.3942 0.68512 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105293 3 0.7109 0.42445 0.336 0.000 0.520 0.144
#> SRR2105294 1 0.4978 0.30167 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR2105291 1 0.3266 0.78588 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105292 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.5535 0.47183 0.304 0.000 0.656 0.040
#> SRR2105290 1 0.1389 0.84279 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105287 1 0.2714 0.81873 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105288 1 0.0707 0.84695 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105285 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105286 4 0.2011 0.79470 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105283 2 0.3902 0.81143 0.060 0.864 0.028 0.048
#> SRR2105284 2 0.3322 0.83135 0.040 0.892 0.036 0.032
#> SRR2105281 2 0.2469 0.85777 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105282 2 0.2704 0.84846 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105259 3 0.0592 0.83073 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105260 3 0.0469 0.83033 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105279 2 0.1557 0.86987 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105280 2 0.1474 0.86986 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105257 1 0.3249 0.80726 0.852 0.008 0.140 0.000
#> SRR2105258 1 0.1022 0.84556 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105253 4 0.4164 0.58309 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105254 2 0.4967 0.30495 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105255 3 0.1474 0.82625 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR2105256 3 0.2647 0.78198 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR2105251 2 0.3172 0.77458 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105252 2 0.4164 0.62252 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR2105249 2 0.2530 0.85381 0.000 0.896 0.004 0.100
#> SRR2105250 2 0.1807 0.86479 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR2105247 2 0.1022 0.86772 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105248 2 0.0817 0.86693 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105245 1 0.7912 -0.05561 0.360 0.000 0.312 0.328
#> SRR2105246 4 0.7469 0.27562 0.180 0.004 0.304 0.512
#> SRR2105243 3 0.4761 0.30855 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR2105244 3 0.4500 0.55858 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR2105241 1 0.3539 0.77876 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR2105242 1 0.0469 0.84664 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105239 1 0.2647 0.80622 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR2105240 1 0.1302 0.84313 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105237 4 0.2266 0.80469 0.000 0.084 0.004 0.912
#> SRR2105238 4 0.5182 0.55760 0.000 0.288 0.028 0.684
#> SRR2105235 2 0.3647 0.80465 0.000 0.832 0.016 0.152
#> SRR2105236 2 0.3539 0.78365 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR2105233 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105234 4 0.0469 0.81141 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105231 2 0.1474 0.86882 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105232 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105227 1 0.5949 0.10159 0.484 0.004 0.484 0.028
#> SRR2105228 1 0.1863 0.84304 0.944 0.004 0.040 0.012
#> SRR2105225 1 0.4877 0.38644 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR2105226 1 0.1792 0.83713 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105229 3 0.2281 0.80567 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105230 3 0.3219 0.79076 0.112 0.000 0.868 0.020
#> SRR2105219 4 0.2408 0.77880 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105220 2 0.5119 0.22151 0.000 0.556 0.004 0.440
#> SRR2105221 2 0.1920 0.85499 0.004 0.944 0.028 0.024
#> SRR2105222 2 0.1151 0.85143 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR2105223 3 0.1557 0.82498 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR2105224 3 0.4992 -0.08964 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR2105217 2 0.2647 0.82478 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105218 2 0.0817 0.86720 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105215 2 0.1474 0.86986 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105216 2 0.1940 0.86834 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105213 3 0.7649 0.34234 0.224 0.004 0.496 0.276
#> SRR2105214 4 0.7626 -0.03004 0.204 0.000 0.384 0.412
#> SRR2105211 3 0.0921 0.82934 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105212 3 0.0895 0.83119 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR2105209 1 0.4699 0.62371 0.676 0.004 0.320 0.000
#> SRR2105210 1 0.1474 0.84228 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105207 1 0.0336 0.84518 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.4431 0.58862 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105206 4 0.4898 0.33381 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR2105201 2 0.2813 0.85043 0.000 0.896 0.024 0.080
#> SRR2105202 2 0.2443 0.85669 0.000 0.916 0.024 0.060
#> SRR2105203 2 0.5000 0.11667 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105204 2 0.1474 0.87034 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105199 2 0.2011 0.86977 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105200 2 0.0817 0.86754 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105197 3 0.1985 0.82279 0.040 0.016 0.940 0.004
#> SRR2105198 3 0.4020 0.78606 0.088 0.020 0.852 0.040
#> SRR2105195 1 0.7111 0.39423 0.544 0.008 0.332 0.116
#> SRR2105196 1 0.2076 0.81594 0.932 0.056 0.004 0.008
#> SRR2105193 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 3 0.1082 0.82491 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR2105192 1 0.5033 0.68579 0.708 0.020 0.268 0.004
#> SRR2105189 4 0.2101 0.80151 0.000 0.060 0.012 0.928
#> SRR2105190 4 0.3266 0.72338 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105187 4 0.5125 0.68185 0.008 0.248 0.024 0.720
#> SRR2105188 2 0.3416 0.81801 0.040 0.888 0.036 0.036
#> SRR2105179 1 0.4008 0.71678 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105180 1 0.2918 0.82153 0.876 0.008 0.116 0.000
#> SRR2105183 2 0.1716 0.86932 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105184 2 0.0707 0.86641 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105185 2 0.4967 0.12078 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105186 2 0.1637 0.85958 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105181 3 0.0657 0.82703 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105182 3 0.0859 0.83013 0.004 0.008 0.980 0.008
#> SRR2105177 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.3074 0.82144 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105172 2 0.1716 0.86965 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105175 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.4746 0.50882 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105174 2 0.1940 0.87024 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105169 2 0.1022 0.86802 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105170 2 0.0895 0.86511 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR2105167 2 0.1557 0.86987 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105168 2 0.1474 0.87034 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105165 3 0.3908 0.71987 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR2105166 3 0.4661 0.55187 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR2105163 3 0.6868 0.54139 0.264 0.000 0.584 0.152
#> SRR2105164 3 0.7268 0.43859 0.312 0.000 0.516 0.172
#> SRR2105161 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.2216 0.86570 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105156 2 0.1637 0.86947 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105157 2 0.3444 0.74439 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105158 2 0.2011 0.84835 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105159 1 0.3300 0.74929 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR2105160 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.4916 0.23193 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105154 2 0.4382 0.57036 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105151 2 0.2704 0.85014 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105152 2 0.1867 0.86876 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105149 3 0.5793 0.34606 0.036 0.000 0.580 0.384
#> SRR2105150 3 0.5090 0.52471 0.016 0.000 0.660 0.324
#> SRR2105147 4 0.4468 0.61483 0.016 0.000 0.232 0.752
#> SRR2105148 4 0.4468 0.61483 0.016 0.000 0.232 0.752
#> SRR2105143 1 0.2831 0.81404 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR2105144 1 0.2281 0.79423 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.1471 0.83955 0.960 0.012 0.004 0.024
#> SRR2105146 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105141 4 0.2973 0.77406 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105142 4 0.1637 0.80911 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR2105139 2 0.2081 0.86604 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105140 2 0.1022 0.86908 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105137 2 0.2111 0.85851 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR2105138 2 0.1339 0.85076 0.004 0.964 0.024 0.008
#> SRR2105135 2 0.2011 0.86675 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105136 2 0.1389 0.87045 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105133 3 0.1598 0.82524 0.020 0.020 0.956 0.004
#> SRR2105134 3 0.2521 0.81532 0.060 0.020 0.916 0.004
#> SRR2105131 3 0.7138 0.27452 0.000 0.164 0.540 0.296
#> SRR2105132 1 0.7677 0.31765 0.500 0.116 0.356 0.028
#> SRR2105129 1 0.0712 0.84541 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR2105130 1 0.0000 0.84567 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.5426 0.61101 0.656 0.024 0.316 0.004
#> SRR2105128 1 0.6519 0.65316 0.664 0.012 0.204 0.120
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.0703 0.479096 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105278 5 0.0510 0.477247 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105275 3 0.3019 0.528364 0.056 0.000 0.880 0.016 0.048
#> SRR2105276 3 0.2833 0.528392 0.120 0.000 0.864 0.012 0.004
#> SRR2105273 3 0.4717 0.252500 0.020 0.000 0.584 0.000 0.396
#> SRR2105274 3 0.6743 0.155409 0.340 0.000 0.396 0.000 0.264
#> SRR2105271 3 0.6511 0.210048 0.204 0.000 0.460 0.000 0.336
#> SRR2105272 1 0.3242 0.720605 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR2105269 4 0.1518 0.816510 0.000 0.048 0.004 0.944 0.004
#> SRR2105270 4 0.4166 0.704350 0.000 0.160 0.004 0.780 0.056
#> SRR2105267 4 0.2112 0.801485 0.000 0.084 0.004 0.908 0.004
#> SRR2105268 2 0.3983 0.526927 0.000 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR2105265 2 0.1956 0.798372 0.000 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR2105266 2 0.1638 0.804882 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR2105263 2 0.4677 0.705366 0.008 0.756 0.104 0.132 0.000
#> SRR2105264 2 0.2189 0.791346 0.012 0.904 0.084 0.000 0.000
#> SRR2105261 4 0.6691 -0.130452 0.000 0.000 0.312 0.428 0.260
#> SRR2105262 3 0.6100 0.234905 0.000 0.000 0.500 0.132 0.368
#> SRR2105357 5 0.0510 0.478074 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105358 5 0.0703 0.479096 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105439 2 0.5678 0.624315 0.000 0.624 0.016 0.076 0.284
#> SRR2105440 2 0.5372 0.633616 0.000 0.640 0.008 0.068 0.284
#> SRR2105509 4 0.0771 0.817139 0.000 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR2105510 4 0.0865 0.817743 0.000 0.024 0.004 0.972 0.000
#> SRR2105507 3 0.4917 0.215777 0.028 0.000 0.556 0.000 0.416
#> SRR2105508 3 0.4430 0.151525 0.004 0.000 0.540 0.000 0.456
#> SRR2105505 5 0.4798 0.017343 0.440 0.000 0.020 0.000 0.540
#> SRR2105506 1 0.3282 0.725992 0.804 0.000 0.008 0.000 0.188
#> SRR2105503 2 0.3242 0.770385 0.000 0.852 0.072 0.076 0.000
#> SRR2105504 4 0.1579 0.796834 0.000 0.000 0.032 0.944 0.024
#> SRR2105501 2 0.6876 0.291242 0.004 0.472 0.012 0.328 0.184
#> SRR2105502 4 0.1281 0.801948 0.000 0.000 0.032 0.956 0.012
#> SRR2105499 5 0.4642 0.337891 0.032 0.000 0.308 0.000 0.660
#> SRR2105500 5 0.5223 0.369978 0.108 0.000 0.220 0.000 0.672
#> SRR2105497 2 0.2674 0.788018 0.000 0.868 0.012 0.120 0.000
#> SRR2105498 2 0.1830 0.794169 0.008 0.924 0.068 0.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.6389 0.525569 0.000 0.556 0.008 0.204 0.232
#> SRR2105496 2 0.5823 0.617219 0.000 0.612 0.008 0.112 0.268
#> SRR2105493 2 0.7214 0.423684 0.000 0.464 0.044 0.172 0.320
#> SRR2105494 2 0.5638 0.590786 0.000 0.600 0.024 0.048 0.328
#> SRR2105491 2 0.5810 0.535534 0.008 0.632 0.136 0.224 0.000
#> SRR2105492 2 0.5207 0.650725 0.012 0.712 0.116 0.160 0.000
#> SRR2105489 2 0.1478 0.793374 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.1281 0.804079 0.000 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR2105487 5 0.5716 0.177833 0.144 0.000 0.240 0.000 0.616
#> SRR2105488 5 0.6022 0.156303 0.280 0.000 0.156 0.000 0.564
#> SRR2105485 5 0.3617 0.464534 0.044 0.000 0.128 0.004 0.824
#> SRR2105486 5 0.4020 0.449546 0.096 0.000 0.108 0.000 0.796
#> SRR2105483 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.5140 0.414583 0.284 0.000 0.652 0.004 0.060
#> SRR2105482 1 0.1732 0.812228 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR2105479 3 0.3815 0.478371 0.220 0.000 0.764 0.012 0.004
#> SRR2105480 1 0.4306 0.054974 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.8303 0.191730 0.000 0.356 0.156 0.196 0.292
#> SRR2105478 2 0.7048 0.498093 0.004 0.508 0.132 0.044 0.312
#> SRR2105475 4 0.0162 0.813777 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105476 4 0.0451 0.814279 0.000 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR2105473 2 0.5109 0.642760 0.000 0.660 0.012 0.044 0.284
#> SRR2105474 2 0.4326 0.664286 0.000 0.708 0.028 0.000 0.264
#> SRR2105471 2 0.1544 0.792445 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.1478 0.793606 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105469 3 0.4446 0.075693 0.004 0.000 0.520 0.000 0.476
#> SRR2105470 3 0.6759 0.110858 0.276 0.000 0.396 0.000 0.328
#> SRR2105467 5 0.2012 0.479585 0.020 0.000 0.060 0.000 0.920
#> SRR2105468 5 0.4638 0.273625 0.324 0.000 0.028 0.000 0.648
#> SRR2105465 1 0.2921 0.776273 0.856 0.000 0.020 0.000 0.124
#> SRR2105466 1 0.0162 0.827392 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.4135 0.536570 0.000 0.656 0.004 0.340 0.000
#> SRR2105462 2 0.2660 0.782007 0.000 0.864 0.008 0.128 0.000
#> SRR2105459 4 0.1124 0.817718 0.000 0.036 0.004 0.960 0.000
#> SRR2105460 4 0.0955 0.817710 0.000 0.028 0.004 0.968 0.000
#> SRR2105457 5 0.3932 0.307742 0.000 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105458 5 0.4201 0.322359 0.000 0.000 0.328 0.008 0.664
#> SRR2105455 1 0.5599 0.612318 0.676 0.000 0.124 0.016 0.184
#> SRR2105456 1 0.4402 0.669419 0.740 0.000 0.056 0.000 0.204
#> SRR2105453 1 0.4637 0.362403 0.536 0.000 0.012 0.000 0.452
#> SRR2105454 5 0.4552 -0.214837 0.468 0.000 0.008 0.000 0.524
#> SRR2105451 4 0.8133 0.060937 0.028 0.320 0.044 0.376 0.232
#> SRR2105452 4 0.1992 0.784810 0.000 0.000 0.032 0.924 0.044
#> SRR2105449 1 0.3895 0.658522 0.728 0.000 0.264 0.004 0.004
#> SRR2105450 1 0.0290 0.827132 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105447 4 0.1281 0.819327 0.000 0.032 0.012 0.956 0.000
#> SRR2105448 4 0.2012 0.814849 0.000 0.060 0.020 0.920 0.000
#> SRR2105445 5 0.2426 0.442724 0.000 0.000 0.036 0.064 0.900
#> SRR2105446 5 0.0290 0.473505 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105443 4 0.5637 0.515599 0.000 0.000 0.112 0.604 0.284
#> SRR2105444 5 0.8764 0.043459 0.076 0.068 0.280 0.180 0.396
#> SRR2105441 2 0.3184 0.790926 0.000 0.868 0.012 0.068 0.052
#> SRR2105442 2 0.1571 0.797737 0.000 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR2105437 5 0.6088 0.041399 0.128 0.000 0.380 0.000 0.492
#> SRR2105438 5 0.6117 0.052934 0.136 0.000 0.360 0.000 0.504
#> SRR2105435 5 0.6050 0.080258 0.104 0.000 0.404 0.004 0.488
#> SRR2105436 5 0.4717 0.344442 0.028 0.000 0.308 0.004 0.660
#> SRR2105433 1 0.0404 0.827418 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0404 0.827119 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0162 0.826994 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105429 4 0.4880 0.710749 0.036 0.040 0.156 0.760 0.008
#> SRR2105430 4 0.3354 0.749996 0.004 0.024 0.140 0.832 0.000
#> SRR2105427 4 0.2723 0.769519 0.000 0.124 0.012 0.864 0.000
#> SRR2105428 4 0.1983 0.811978 0.000 0.060 0.008 0.924 0.008
#> SRR2105425 4 0.4886 0.107106 0.000 0.448 0.024 0.528 0.000
#> SRR2105426 2 0.1124 0.801308 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR2105421 3 0.5584 0.224369 0.000 0.000 0.532 0.076 0.392
#> SRR2105422 3 0.4341 0.250524 0.000 0.000 0.592 0.004 0.404
#> SRR2105423 2 0.1484 0.806980 0.000 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR2105424 2 0.0880 0.804742 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105419 5 0.4227 0.145600 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105420 3 0.4452 0.047427 0.004 0.000 0.500 0.000 0.496
#> SRR2105415 1 0.0162 0.827247 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0162 0.827275 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.0404 0.816729 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR2105414 4 0.0000 0.814463 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105409 2 0.2630 0.804080 0.000 0.892 0.016 0.080 0.012
#> SRR2105410 2 0.3477 0.770125 0.000 0.832 0.056 0.000 0.112
#> SRR2105411 2 0.2516 0.778976 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105412 2 0.1830 0.801500 0.000 0.924 0.008 0.068 0.000
#> SRR2105407 5 0.3707 0.367582 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR2105408 5 0.3561 0.391600 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR2105403 5 0.1043 0.478554 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105404 5 0.0880 0.477523 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105405 1 0.3954 0.696237 0.772 0.000 0.036 0.000 0.192
#> SRR2105406 1 0.3163 0.746271 0.824 0.000 0.012 0.000 0.164
#> SRR2105401 4 0.0955 0.806721 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105402 4 0.1992 0.784810 0.000 0.000 0.032 0.924 0.044
#> SRR2105399 4 0.1915 0.787603 0.000 0.000 0.032 0.928 0.040
#> SRR2105400 4 0.1992 0.785883 0.000 0.000 0.032 0.924 0.044
#> SRR2105397 3 0.7798 -0.069259 0.048 0.008 0.384 0.332 0.228
#> SRR2105398 3 0.7729 -0.059020 0.056 0.004 0.392 0.340 0.208
#> SRR2105395 2 0.1764 0.796104 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR2105396 2 0.0880 0.800265 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.1300 0.806917 0.000 0.956 0.016 0.028 0.000
#> SRR2105394 2 0.1845 0.797362 0.000 0.928 0.056 0.016 0.000
#> SRR2105389 3 0.4182 0.250166 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105390 3 0.4242 0.205985 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR2105391 5 0.4305 -0.045880 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR2105392 5 0.4297 0.002869 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105385 3 0.5050 0.054313 0.024 0.000 0.496 0.004 0.476
#> SRR2105386 5 0.4655 -0.016624 0.012 0.000 0.476 0.000 0.512
#> SRR2105387 1 0.3257 0.795766 0.844 0.000 0.124 0.004 0.028
#> SRR2105388 1 0.4450 0.743280 0.760 0.000 0.108 0.000 0.132
#> SRR2105381 4 0.2913 0.805711 0.000 0.080 0.040 0.876 0.004
#> SRR2105382 4 0.2390 0.801964 0.000 0.020 0.084 0.896 0.000
#> SRR2105383 2 0.2189 0.800641 0.012 0.904 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105384 2 0.2732 0.801028 0.020 0.884 0.008 0.088 0.000
#> SRR2105379 4 0.4661 0.733409 0.012 0.156 0.076 0.756 0.000
#> SRR2105380 2 0.7485 -0.011619 0.076 0.408 0.140 0.376 0.000
#> SRR2105377 2 0.4393 0.696069 0.000 0.736 0.020 0.016 0.228
#> SRR2105378 2 0.4173 0.701421 0.000 0.748 0.012 0.016 0.224
#> SRR2105375 1 0.5072 0.694448 0.704 0.004 0.100 0.000 0.192
#> SRR2105376 1 0.4501 0.723603 0.756 0.000 0.116 0.000 0.128
#> SRR2105373 5 0.4383 0.098931 0.004 0.000 0.424 0.000 0.572
#> SRR2105374 5 0.6511 0.029006 0.204 0.000 0.336 0.000 0.460
#> SRR2105371 3 0.4367 0.222145 0.004 0.000 0.580 0.000 0.416
#> SRR2105372 3 0.4297 0.118540 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR2105369 5 0.4638 0.315645 0.028 0.000 0.324 0.000 0.648
#> SRR2105370 5 0.5896 0.304943 0.184 0.000 0.216 0.000 0.600
#> SRR2105367 1 0.4911 0.464866 0.612 0.004 0.028 0.000 0.356
#> SRR2105368 1 0.2517 0.783488 0.884 0.004 0.008 0.000 0.104
#> SRR2105365 2 0.6205 0.083268 0.008 0.472 0.108 0.412 0.000
#> SRR2105366 2 0.6020 0.347375 0.008 0.560 0.108 0.324 0.000
#> SRR2105363 2 0.3770 0.738930 0.000 0.788 0.016 0.188 0.008
#> SRR2105364 2 0.1082 0.806852 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR2105361 2 0.3759 0.724479 0.000 0.764 0.016 0.220 0.000
#> SRR2105362 2 0.2677 0.794917 0.000 0.872 0.016 0.112 0.000
#> SRR2105359 5 0.4302 -0.004417 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105360 3 0.4161 0.246607 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105355 3 0.4738 0.123293 0.016 0.000 0.520 0.000 0.464
#> SRR2105356 1 0.6673 -0.021992 0.440 0.000 0.276 0.000 0.284
#> SRR2105353 3 0.3770 0.480668 0.016 0.000 0.788 0.008 0.188
#> SRR2105354 3 0.3343 0.485518 0.016 0.000 0.812 0.000 0.172
#> SRR2105351 4 0.4830 -0.051718 0.000 0.488 0.020 0.492 0.000
#> SRR2105352 4 0.1992 0.784810 0.000 0.000 0.032 0.924 0.044
#> SRR2105349 4 0.0671 0.814461 0.000 0.004 0.016 0.980 0.000
#> SRR2105350 2 0.4632 0.272718 0.000 0.540 0.012 0.448 0.000
#> SRR2105345 2 0.2640 0.804998 0.000 0.900 0.016 0.052 0.032
#> SRR2105346 2 0.1522 0.804195 0.000 0.944 0.012 0.044 0.000
#> SRR2105347 2 0.2464 0.791899 0.048 0.904 0.044 0.004 0.000
#> SRR2105348 2 0.2694 0.777596 0.076 0.884 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105343 2 0.4410 0.326600 0.000 0.556 0.004 0.440 0.000
#> SRR2105344 2 0.1197 0.808244 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105341 5 0.4300 0.000881 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105342 5 0.4446 -0.016300 0.004 0.000 0.476 0.000 0.520
#> SRR2105339 3 0.4288 0.288937 0.000 0.000 0.612 0.004 0.384
#> SRR2105340 3 0.2621 0.511251 0.008 0.000 0.876 0.004 0.112
#> SRR2105335 5 0.5050 0.385223 0.120 0.000 0.180 0.000 0.700
#> SRR2105336 1 0.5277 0.646345 0.664 0.000 0.108 0.000 0.228
#> SRR2105337 1 0.6347 0.336546 0.544 0.000 0.196 0.004 0.256
#> SRR2105338 1 0.2946 0.807477 0.868 0.000 0.088 0.000 0.044
#> SRR2105331 2 0.5114 0.019130 0.000 0.488 0.036 0.476 0.000
#> SRR2105332 2 0.3338 0.776094 0.004 0.852 0.068 0.076 0.000
#> SRR2105333 4 0.0290 0.812814 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105334 4 0.1168 0.821106 0.000 0.032 0.008 0.960 0.000
#> SRR2105329 4 0.4980 0.384820 0.000 0.000 0.036 0.584 0.380
#> SRR2105330 4 0.6006 0.531223 0.000 0.040 0.080 0.632 0.248
#> SRR2105327 4 0.2685 0.797877 0.000 0.092 0.028 0.880 0.000
#> SRR2105328 4 0.3459 0.772609 0.000 0.116 0.052 0.832 0.000
#> SRR2105325 3 0.3361 0.523797 0.128 0.000 0.840 0.012 0.020
#> SRR2105326 3 0.3451 0.522403 0.128 0.000 0.836 0.012 0.024
#> SRR2105323 5 0.3942 0.425078 0.000 0.000 0.232 0.020 0.748
#> SRR2105324 5 0.4642 0.347666 0.032 0.000 0.308 0.000 0.660
#> SRR2105319 3 0.6033 0.286907 0.220 0.000 0.580 0.000 0.200
#> SRR2105320 1 0.4292 0.650416 0.704 0.000 0.272 0.000 0.024
#> SRR2105321 3 0.2845 0.533966 0.096 0.000 0.876 0.008 0.020
#> SRR2105322 3 0.2563 0.529937 0.120 0.000 0.872 0.008 0.000
#> SRR2105317 4 0.0671 0.817820 0.000 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR2105318 4 0.2068 0.796778 0.000 0.092 0.004 0.904 0.000
#> SRR2105315 4 0.6874 -0.303169 0.000 0.004 0.256 0.380 0.360
#> SRR2105316 4 0.1484 0.816721 0.000 0.048 0.008 0.944 0.000
#> SRR2105313 4 0.2519 0.799983 0.000 0.100 0.016 0.884 0.000
#> SRR2105314 4 0.4557 0.005965 0.000 0.476 0.008 0.516 0.000
#> SRR2105311 3 0.4541 0.481196 0.140 0.000 0.760 0.096 0.004
#> SRR2105312 3 0.4724 0.473652 0.148 0.000 0.744 0.104 0.004
#> SRR2105307 1 0.3318 0.721211 0.800 0.000 0.008 0.000 0.192
#> SRR2105308 1 0.3282 0.724834 0.804 0.000 0.008 0.000 0.188
#> SRR2105309 5 0.3949 0.301579 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105310 5 0.4088 0.349223 0.008 0.000 0.304 0.000 0.688
#> SRR2105305 5 0.4302 -0.012890 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105306 3 0.4302 0.097818 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105303 2 0.1626 0.808625 0.000 0.940 0.016 0.044 0.000
#> SRR2105304 4 0.1168 0.803928 0.000 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR2105301 4 0.3389 0.777110 0.000 0.116 0.048 0.836 0.000
#> SRR2105302 4 0.3106 0.763048 0.000 0.140 0.020 0.840 0.000
#> SRR2105299 5 0.3260 0.404500 0.004 0.000 0.084 0.056 0.856
#> SRR2105300 5 0.5170 0.247701 0.000 0.004 0.068 0.268 0.660
#> SRR2105297 2 0.5245 0.448165 0.328 0.608 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105298 2 0.5478 0.202922 0.420 0.516 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105295 4 0.1205 0.816996 0.000 0.040 0.004 0.956 0.000
#> SRR2105296 4 0.3812 0.726492 0.000 0.204 0.024 0.772 0.000
#> SRR2105293 3 0.3304 0.524615 0.128 0.000 0.840 0.028 0.004
#> SRR2105294 3 0.3438 0.509693 0.172 0.000 0.808 0.000 0.020
#> SRR2105291 1 0.5676 0.562565 0.644 0.004 0.236 0.004 0.112
#> SRR2105292 1 0.0162 0.826994 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.6685 0.195862 0.172 0.000 0.476 0.012 0.340
#> SRR2105290 1 0.1331 0.823289 0.952 0.000 0.008 0.000 0.040
#> SRR2105287 1 0.2429 0.812268 0.904 0.000 0.020 0.008 0.068
#> SRR2105288 1 0.0404 0.827532 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105285 4 0.0579 0.817220 0.000 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR2105286 4 0.0955 0.820561 0.000 0.028 0.004 0.968 0.000
#> SRR2105283 2 0.7326 0.482739 0.092 0.508 0.056 0.024 0.320
#> SRR2105284 2 0.7356 0.474765 0.056 0.492 0.060 0.044 0.348
#> SRR2105281 2 0.2361 0.792185 0.000 0.892 0.012 0.096 0.000
#> SRR2105282 2 0.2136 0.794267 0.000 0.904 0.008 0.088 0.000
#> SRR2105259 5 0.3730 0.362550 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR2105260 5 0.3534 0.394642 0.000 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR2105279 2 0.1430 0.803442 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR2105280 2 0.1568 0.807080 0.000 0.944 0.020 0.036 0.000
#> SRR2105257 1 0.3630 0.736784 0.780 0.000 0.016 0.000 0.204
#> SRR2105258 1 0.1579 0.825022 0.944 0.000 0.024 0.000 0.032
#> SRR2105253 4 0.3129 0.735893 0.000 0.156 0.008 0.832 0.004
#> SRR2105254 4 0.4446 -0.038458 0.000 0.476 0.004 0.520 0.000
#> SRR2105255 5 0.5083 0.343185 0.068 0.000 0.280 0.000 0.652
#> SRR2105256 5 0.5334 0.367425 0.148 0.000 0.180 0.000 0.672
#> SRR2105251 2 0.3075 0.774653 0.000 0.860 0.048 0.092 0.000
#> SRR2105252 2 0.4215 0.693097 0.000 0.768 0.064 0.168 0.000
#> SRR2105249 2 0.3926 0.773249 0.000 0.820 0.012 0.084 0.084
#> SRR2105250 2 0.4112 0.768248 0.008 0.816 0.012 0.060 0.104
#> SRR2105247 2 0.1012 0.806690 0.000 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR2105248 2 0.1300 0.803601 0.000 0.956 0.028 0.016 0.000
#> SRR2105245 3 0.4767 0.509820 0.116 0.012 0.784 0.052 0.036
#> SRR2105246 3 0.6719 0.388208 0.100 0.052 0.648 0.164 0.036
#> SRR2105243 5 0.6638 -0.049827 0.224 0.000 0.364 0.000 0.412
#> SRR2105244 3 0.4964 0.467614 0.096 0.000 0.700 0.000 0.204
#> SRR2105241 1 0.5143 0.679293 0.692 0.000 0.228 0.012 0.068
#> SRR2105242 1 0.0898 0.827743 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR2105239 1 0.5061 0.319219 0.528 0.000 0.444 0.008 0.020
#> SRR2105240 1 0.2171 0.817386 0.912 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR2105237 4 0.2701 0.809601 0.000 0.044 0.048 0.896 0.012
#> SRR2105238 4 0.5781 0.543927 0.000 0.096 0.008 0.600 0.296
#> SRR2105235 2 0.5157 0.705377 0.000 0.712 0.008 0.128 0.152
#> SRR2105236 2 0.3918 0.762492 0.000 0.804 0.008 0.144 0.044
#> SRR2105233 4 0.0290 0.815645 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105234 4 0.0404 0.816229 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR2105231 2 0.1893 0.803645 0.000 0.928 0.048 0.024 0.000
#> SRR2105232 2 0.0955 0.801740 0.000 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR2105227 3 0.5123 0.468816 0.160 0.000 0.696 0.000 0.144
#> SRR2105228 1 0.4324 0.671962 0.708 0.004 0.272 0.004 0.012
#> SRR2105225 1 0.6253 0.068826 0.464 0.000 0.388 0.000 0.148
#> SRR2105226 1 0.3307 0.794995 0.844 0.000 0.104 0.000 0.052
#> SRR2105229 3 0.4382 0.383422 0.000 0.000 0.688 0.024 0.288
#> SRR2105230 3 0.5059 0.103215 0.036 0.000 0.548 0.000 0.416
#> SRR2105219 4 0.1697 0.813994 0.000 0.060 0.008 0.932 0.000
#> SRR2105220 4 0.4799 0.423244 0.000 0.360 0.012 0.616 0.012
#> SRR2105221 2 0.4991 0.628015 0.004 0.656 0.024 0.012 0.304
#> SRR2105222 2 0.5386 0.633107 0.004 0.644 0.068 0.004 0.280
#> SRR2105223 5 0.4965 0.023699 0.028 0.000 0.452 0.000 0.520
#> SRR2105224 5 0.6605 0.073794 0.348 0.000 0.220 0.000 0.432
#> SRR2105217 2 0.3119 0.770538 0.000 0.860 0.072 0.068 0.000
#> SRR2105218 2 0.1197 0.797782 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.1124 0.805659 0.000 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR2105216 2 0.2172 0.797270 0.000 0.908 0.016 0.076 0.000
#> SRR2105213 3 0.5139 0.503616 0.052 0.012 0.756 0.044 0.136
#> SRR2105214 3 0.5261 0.480854 0.052 0.016 0.760 0.104 0.068
#> SRR2105211 5 0.4300 0.001811 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105212 5 0.4415 0.244439 0.008 0.000 0.388 0.000 0.604
#> SRR2105209 1 0.5341 0.432269 0.564 0.000 0.060 0.000 0.376
#> SRR2105210 1 0.1638 0.817245 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR2105207 1 0.1270 0.819966 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.4918 0.653723 0.008 0.204 0.072 0.716 0.000
#> SRR2105206 4 0.5722 0.460658 0.008 0.304 0.088 0.600 0.000
#> SRR2105201 2 0.5386 0.638660 0.000 0.644 0.008 0.072 0.276
#> SRR2105202 2 0.5215 0.645468 0.000 0.656 0.008 0.060 0.276
#> SRR2105203 2 0.4390 0.302800 0.000 0.568 0.004 0.428 0.000
#> SRR2105204 2 0.1357 0.804261 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR2105199 2 0.1430 0.804887 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR2105200 2 0.0880 0.801293 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105197 5 0.3398 0.383815 0.004 0.000 0.216 0.000 0.780
#> SRR2105198 5 0.4184 0.309944 0.024 0.000 0.232 0.004 0.740
#> SRR2105195 1 0.7760 0.141812 0.456 0.000 0.212 0.092 0.240
#> SRR2105196 1 0.3205 0.791288 0.876 0.020 0.052 0.004 0.048
#> SRR2105193 1 0.1410 0.819160 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0703 0.825276 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.1270 0.470373 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105192 5 0.4969 0.041158 0.376 0.000 0.036 0.000 0.588
#> SRR2105189 4 0.1299 0.818482 0.000 0.020 0.008 0.960 0.012
#> SRR2105190 4 0.1410 0.814889 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR2105187 4 0.8133 0.436357 0.004 0.168 0.184 0.452 0.192
#> SRR2105188 2 0.7448 0.359702 0.036 0.420 0.208 0.004 0.332
#> SRR2105179 1 0.5221 0.657735 0.696 0.000 0.128 0.004 0.172
#> SRR2105180 1 0.2971 0.777086 0.836 0.000 0.008 0.000 0.156
#> SRR2105183 2 0.1557 0.801846 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR2105184 2 0.1410 0.794379 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.5087 0.505607 0.000 0.644 0.064 0.292 0.000
#> SRR2105186 2 0.2700 0.787404 0.004 0.884 0.088 0.024 0.000
#> SRR2105181 5 0.2074 0.465163 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105182 5 0.3895 0.352892 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105177 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.3246 0.736485 0.000 0.808 0.008 0.184 0.000
#> SRR2105172 2 0.1357 0.803320 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR2105175 1 0.0162 0.826975 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0162 0.827008 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.4594 0.609930 0.000 0.680 0.036 0.284 0.000
#> SRR2105174 2 0.2017 0.803051 0.000 0.912 0.008 0.080 0.000
#> SRR2105169 2 0.1357 0.802572 0.000 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR2105170 2 0.1544 0.794635 0.000 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.1357 0.803320 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR2105168 2 0.1041 0.805177 0.000 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105165 3 0.4334 0.508937 0.092 0.000 0.768 0.000 0.140
#> SRR2105166 3 0.3863 0.528073 0.152 0.000 0.796 0.000 0.052
#> SRR2105163 3 0.3314 0.534008 0.124 0.000 0.844 0.012 0.020
#> SRR2105164 3 0.3081 0.524012 0.156 0.000 0.832 0.012 0.000
#> SRR2105161 1 0.0162 0.827071 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.2570 0.803346 0.000 0.888 0.028 0.084 0.000
#> SRR2105156 2 0.1430 0.802532 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR2105157 2 0.2719 0.783166 0.000 0.884 0.048 0.068 0.000
#> SRR2105158 2 0.2754 0.784854 0.000 0.880 0.080 0.040 0.000
#> SRR2105159 3 0.4135 0.405140 0.340 0.000 0.656 0.004 0.000
#> SRR2105160 1 0.1908 0.794732 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.5606 0.323304 0.000 0.556 0.084 0.360 0.000
#> SRR2105154 2 0.4624 0.671181 0.000 0.740 0.096 0.164 0.000
#> SRR2105151 2 0.2625 0.791570 0.000 0.876 0.016 0.108 0.000
#> SRR2105152 2 0.1357 0.804434 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR2105149 4 0.7104 -0.046867 0.032 0.000 0.172 0.432 0.364
#> SRR2105150 5 0.7070 0.029424 0.012 0.000 0.332 0.264 0.392
#> SRR2105147 4 0.5760 0.342031 0.008 0.000 0.376 0.544 0.072
#> SRR2105148 4 0.5847 0.343634 0.016 0.000 0.376 0.544 0.064
#> SRR2105143 1 0.3582 0.794810 0.840 0.008 0.072 0.000 0.080
#> SRR2105144 1 0.3406 0.786418 0.852 0.052 0.088 0.004 0.004
#> SRR2105145 1 0.2074 0.819383 0.920 0.004 0.060 0.016 0.000
#> SRR2105146 1 0.0963 0.822627 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR2105141 4 0.3464 0.772610 0.000 0.096 0.068 0.836 0.000
#> SRR2105142 4 0.1648 0.811972 0.000 0.040 0.020 0.940 0.000
#> SRR2105139 2 0.1830 0.798250 0.000 0.924 0.008 0.068 0.000
#> SRR2105140 2 0.0671 0.805179 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR2105137 2 0.5311 0.652075 0.000 0.660 0.016 0.056 0.268
#> SRR2105138 2 0.5767 0.629399 0.016 0.632 0.076 0.004 0.272
#> SRR2105135 2 0.1557 0.802461 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR2105136 2 0.0703 0.805544 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105133 5 0.2006 0.445196 0.012 0.000 0.072 0.000 0.916
#> SRR2105134 5 0.1522 0.459249 0.012 0.000 0.044 0.000 0.944
#> SRR2105131 5 0.6360 0.233577 0.000 0.128 0.044 0.208 0.620
#> SRR2105132 5 0.5997 0.279577 0.236 0.060 0.024 0.024 0.656
#> SRR2105129 1 0.0290 0.826247 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.827078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.5094 0.402719 0.556 0.024 0.008 0.000 0.412
#> SRR2105128 1 0.6389 0.459805 0.552 0.008 0.016 0.100 0.324
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.2520 0.599984 0.000 0.000 0.004 0.152 0.844 0.000
#> SRR2105278 5 0.2558 0.599590 0.000 0.000 0.004 0.156 0.840 0.000
#> SRR2105275 3 0.0767 0.695841 0.004 0.000 0.976 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105276 3 0.1124 0.702889 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105273 5 0.4936 0.331120 0.016 0.000 0.408 0.036 0.540 0.000
#> SRR2105274 5 0.6626 0.194973 0.240 0.000 0.300 0.036 0.424 0.000
#> SRR2105271 5 0.5882 0.265879 0.124 0.000 0.364 0.020 0.492 0.000
#> SRR2105272 1 0.3725 0.597798 0.676 0.000 0.316 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.1124 0.821866 0.000 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR2105270 2 0.4289 0.376776 0.000 0.612 0.000 0.360 0.000 0.028
#> SRR2105267 2 0.1950 0.805222 0.000 0.912 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR2105268 6 0.5667 0.518799 0.000 0.236 0.000 0.232 0.000 0.532
#> SRR2105265 6 0.4166 0.675557 0.000 0.028 0.000 0.324 0.000 0.648
#> SRR2105266 6 0.4348 0.702628 0.000 0.056 0.000 0.268 0.000 0.676
#> SRR2105263 6 0.2699 0.614932 0.004 0.032 0.028 0.048 0.000 0.888
#> SRR2105264 6 0.1657 0.659860 0.012 0.000 0.012 0.040 0.000 0.936
#> SRR2105261 2 0.6542 0.030243 0.000 0.436 0.300 0.032 0.232 0.000
#> SRR2105262 3 0.5833 -0.068441 0.000 0.120 0.448 0.016 0.416 0.000
#> SRR2105357 5 0.2902 0.579965 0.000 0.000 0.004 0.196 0.800 0.000
#> SRR2105358 5 0.2442 0.601698 0.000 0.000 0.004 0.144 0.852 0.000
#> SRR2105439 4 0.2815 0.696483 0.000 0.032 0.000 0.848 0.000 0.120
#> SRR2105440 4 0.2858 0.696981 0.000 0.032 0.000 0.844 0.000 0.124
#> SRR2105509 2 0.0260 0.822956 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105510 2 0.0972 0.823672 0.000 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR2105507 5 0.5136 0.331602 0.024 0.000 0.404 0.040 0.532 0.000
#> SRR2105508 5 0.4453 0.406240 0.000 0.000 0.372 0.036 0.592 0.000
#> SRR2105505 5 0.4854 0.287364 0.328 0.000 0.016 0.044 0.612 0.000
#> SRR2105506 1 0.3648 0.711380 0.776 0.000 0.012 0.024 0.188 0.000
#> SRR2105503 6 0.1575 0.673079 0.000 0.032 0.000 0.032 0.000 0.936
#> SRR2105504 2 0.1237 0.815511 0.000 0.956 0.020 0.020 0.004 0.000
#> SRR2105501 4 0.5647 0.521915 0.000 0.280 0.000 0.580 0.024 0.116
#> SRR2105502 2 0.1092 0.817207 0.000 0.960 0.020 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.2513 0.636044 0.008 0.000 0.044 0.060 0.888 0.000
#> SRR2105500 5 0.2444 0.634218 0.012 0.000 0.028 0.068 0.892 0.000
#> SRR2105497 6 0.3572 0.733958 0.000 0.032 0.000 0.204 0.000 0.764
#> SRR2105498 6 0.2362 0.678216 0.004 0.000 0.000 0.136 0.000 0.860
#> SRR2105495 4 0.3878 0.676675 0.000 0.116 0.000 0.772 0.000 0.112
#> SRR2105496 4 0.3493 0.692979 0.000 0.064 0.000 0.800 0.000 0.136
#> SRR2105493 4 0.3829 0.686845 0.000 0.072 0.012 0.792 0.000 0.124
#> SRR2105494 4 0.2551 0.704832 0.004 0.012 0.000 0.872 0.004 0.108
#> SRR2105491 6 0.3561 0.503471 0.000 0.056 0.120 0.012 0.000 0.812
#> SRR2105492 6 0.2758 0.575756 0.000 0.036 0.080 0.012 0.000 0.872
#> SRR2105489 6 0.0458 0.678092 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105490 6 0.3314 0.719115 0.000 0.004 0.000 0.256 0.000 0.740
#> SRR2105487 5 0.7354 0.035913 0.116 0.000 0.240 0.284 0.360 0.000
#> SRR2105488 5 0.7469 0.029823 0.244 0.000 0.132 0.308 0.316 0.000
#> SRR2105485 5 0.1956 0.626833 0.004 0.000 0.008 0.080 0.908 0.000
#> SRR2105486 5 0.2013 0.627286 0.008 0.000 0.008 0.076 0.908 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.4548 0.622267 0.156 0.000 0.720 0.008 0.116 0.000
#> SRR2105482 1 0.2766 0.755133 0.844 0.000 0.140 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105479 3 0.2048 0.691159 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105480 3 0.3634 0.455917 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105477 4 0.5893 0.472002 0.000 0.076 0.048 0.500 0.000 0.376
#> SRR2105478 4 0.4808 0.460636 0.000 0.008 0.036 0.512 0.000 0.444
#> SRR2105475 2 0.0146 0.821620 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105476 2 0.0260 0.821845 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105473 4 0.2833 0.700050 0.004 0.012 0.000 0.836 0.000 0.148
#> SRR2105474 4 0.3076 0.657998 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105471 6 0.0937 0.692734 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105472 6 0.1141 0.698970 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105469 5 0.4420 0.456105 0.000 0.000 0.340 0.040 0.620 0.000
#> SRR2105470 5 0.6152 0.392280 0.168 0.000 0.244 0.040 0.548 0.000
#> SRR2105467 5 0.1745 0.627146 0.000 0.000 0.012 0.068 0.920 0.000
#> SRR2105468 5 0.5079 0.453546 0.228 0.000 0.016 0.100 0.656 0.000
#> SRR2105465 1 0.2554 0.774292 0.876 0.000 0.004 0.028 0.092 0.000
#> SRR2105466 1 0.0260 0.791935 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 6 0.5455 0.521875 0.000 0.264 0.000 0.172 0.000 0.564
#> SRR2105462 6 0.4810 0.678807 0.000 0.084 0.000 0.292 0.000 0.624
#> SRR2105459 2 0.0790 0.820627 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0547 0.821687 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105457 5 0.2630 0.633046 0.000 0.000 0.064 0.064 0.872 0.000
#> SRR2105458 5 0.3161 0.630141 0.000 0.020 0.060 0.068 0.852 0.000
#> SRR2105455 1 0.6386 0.492736 0.556 0.008 0.140 0.056 0.240 0.000
#> SRR2105456 1 0.4942 0.611478 0.664 0.000 0.040 0.044 0.252 0.000
#> SRR2105453 1 0.5796 0.471592 0.552 0.000 0.012 0.180 0.256 0.000
#> SRR2105454 1 0.5998 0.343687 0.492 0.000 0.012 0.180 0.316 0.000
#> SRR2105451 4 0.4767 0.663892 0.016 0.124 0.024 0.756 0.008 0.072
#> SRR2105452 2 0.1718 0.810285 0.000 0.936 0.024 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105449 1 0.3515 0.566415 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0748 0.793062 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105447 2 0.2020 0.803318 0.000 0.896 0.008 0.096 0.000 0.000
#> SRR2105448 2 0.3516 0.755118 0.000 0.812 0.004 0.088 0.000 0.096
#> SRR2105445 5 0.5467 0.389205 0.000 0.064 0.028 0.376 0.532 0.000
#> SRR2105446 5 0.3659 0.444869 0.000 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR2105443 2 0.6321 0.404727 0.000 0.540 0.124 0.264 0.072 0.000
#> SRR2105444 4 0.6006 0.244014 0.040 0.056 0.276 0.596 0.028 0.004
#> SRR2105441 4 0.4065 0.358868 0.000 0.028 0.000 0.672 0.000 0.300
#> SRR2105442 6 0.3515 0.434514 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105437 3 0.6497 0.314579 0.060 0.000 0.508 0.168 0.264 0.000
#> SRR2105438 3 0.6595 0.294310 0.060 0.000 0.488 0.180 0.272 0.000
#> SRR2105435 5 0.4784 0.556331 0.056 0.000 0.160 0.060 0.724 0.000
#> SRR2105436 5 0.2923 0.617808 0.000 0.000 0.100 0.052 0.848 0.000
#> SRR2105433 1 0.0458 0.791852 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0146 0.791538 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0777 0.791720 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0790 0.792115 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.4476 0.714863 0.012 0.760 0.152 0.020 0.004 0.052
#> SRR2105430 2 0.3370 0.748616 0.000 0.812 0.140 0.004 0.000 0.044
#> SRR2105427 2 0.3782 0.627005 0.000 0.740 0.000 0.224 0.000 0.036
#> SRR2105428 2 0.2191 0.785717 0.000 0.876 0.000 0.120 0.000 0.004
#> SRR2105425 6 0.5713 0.166525 0.000 0.388 0.000 0.164 0.000 0.448
#> SRR2105426 6 0.2454 0.731520 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR2105421 5 0.5147 0.193062 0.000 0.048 0.456 0.016 0.480 0.000
#> SRR2105422 5 0.4602 0.208195 0.000 0.004 0.476 0.028 0.492 0.000
#> SRR2105423 6 0.3348 0.730023 0.000 0.016 0.000 0.216 0.000 0.768
#> SRR2105424 6 0.3586 0.715738 0.000 0.012 0.000 0.268 0.000 0.720
#> SRR2105419 5 0.2553 0.611695 0.000 0.000 0.144 0.008 0.848 0.000
#> SRR2105420 5 0.3840 0.514231 0.000 0.000 0.284 0.020 0.696 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0993 0.793725 0.964 0.000 0.024 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0146 0.791352 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0632 0.822126 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.820956 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105409 6 0.4524 0.485962 0.000 0.040 0.000 0.376 0.000 0.584
#> SRR2105410 6 0.3854 -0.166068 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105411 6 0.4348 0.709224 0.000 0.056 0.000 0.268 0.000 0.676
#> SRR2105412 6 0.4117 0.693607 0.000 0.032 0.000 0.296 0.000 0.672
#> SRR2105407 5 0.2058 0.634492 0.000 0.000 0.036 0.056 0.908 0.000
#> SRR2105408 5 0.1807 0.633499 0.000 0.000 0.020 0.060 0.920 0.000
#> SRR2105403 5 0.2191 0.612543 0.000 0.000 0.004 0.120 0.876 0.000
#> SRR2105404 5 0.2191 0.608898 0.000 0.000 0.004 0.120 0.876 0.000
#> SRR2105405 1 0.4941 0.594740 0.656 0.000 0.036 0.044 0.264 0.000
#> SRR2105406 1 0.3628 0.713522 0.776 0.000 0.004 0.036 0.184 0.000
#> SRR2105401 2 0.1003 0.817182 0.000 0.964 0.016 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105402 2 0.1718 0.810285 0.000 0.936 0.024 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105399 2 0.1718 0.809669 0.000 0.936 0.020 0.020 0.024 0.000
#> SRR2105400 2 0.1787 0.807569 0.000 0.932 0.016 0.020 0.032 0.000
#> SRR2105397 3 0.5771 0.405018 0.004 0.224 0.596 0.160 0.012 0.004
#> SRR2105398 3 0.5519 0.370413 0.004 0.264 0.604 0.116 0.008 0.004
#> SRR2105395 6 0.1765 0.708591 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR2105396 6 0.2969 0.721174 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105393 6 0.3141 0.732235 0.000 0.012 0.000 0.200 0.000 0.788
#> SRR2105394 6 0.1349 0.703795 0.000 0.004 0.000 0.056 0.000 0.940
#> SRR2105389 3 0.3999 -0.188253 0.000 0.000 0.500 0.004 0.496 0.000
#> SRR2105390 5 0.3823 0.302938 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR2105391 5 0.3468 0.519150 0.000 0.000 0.284 0.004 0.712 0.000
#> SRR2105392 5 0.3050 0.557610 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR2105385 5 0.4524 0.499433 0.008 0.000 0.304 0.040 0.648 0.000
#> SRR2105386 5 0.3876 0.522320 0.000 0.000 0.276 0.024 0.700 0.000
#> SRR2105387 1 0.4232 0.716703 0.744 0.000 0.188 0.020 0.048 0.000
#> SRR2105388 1 0.4901 0.686893 0.692 0.000 0.172 0.016 0.120 0.000
#> SRR2105381 2 0.3193 0.793905 0.000 0.852 0.024 0.088 0.004 0.032
#> SRR2105382 2 0.2034 0.816474 0.000 0.912 0.024 0.004 0.000 0.060
#> SRR2105383 6 0.4568 0.683558 0.008 0.044 0.000 0.300 0.000 0.648
#> SRR2105384 6 0.4984 0.670460 0.040 0.044 0.000 0.260 0.000 0.656
#> SRR2105379 2 0.5550 0.590210 0.008 0.632 0.028 0.096 0.000 0.236
#> SRR2105380 6 0.6052 0.294764 0.076 0.180 0.088 0.020 0.000 0.636
#> SRR2105377 4 0.2527 0.686392 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105378 4 0.2491 0.684106 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105375 1 0.6144 0.592786 0.608 0.000 0.172 0.080 0.136 0.004
#> SRR2105376 1 0.5552 0.633598 0.660 0.000 0.168 0.076 0.096 0.000
#> SRR2105373 3 0.5505 0.051333 0.004 0.000 0.476 0.112 0.408 0.000
#> SRR2105374 3 0.7417 0.240881 0.176 0.000 0.384 0.172 0.268 0.000
#> SRR2105371 5 0.4475 0.348772 0.000 0.000 0.412 0.032 0.556 0.000
#> SRR2105372 5 0.4206 0.434002 0.000 0.000 0.356 0.024 0.620 0.000
#> SRR2105369 5 0.1370 0.636184 0.004 0.000 0.036 0.012 0.948 0.000
#> SRR2105370 5 0.2862 0.624132 0.052 0.000 0.056 0.020 0.872 0.000
#> SRR2105367 1 0.5828 0.549682 0.628 0.000 0.064 0.156 0.152 0.000
#> SRR2105368 1 0.2545 0.767332 0.888 0.000 0.024 0.068 0.020 0.000
#> SRR2105365 6 0.3801 0.476400 0.000 0.152 0.040 0.020 0.000 0.788
#> SRR2105366 6 0.2889 0.577563 0.000 0.068 0.048 0.016 0.000 0.868
#> SRR2105363 4 0.5479 -0.047676 0.000 0.132 0.000 0.500 0.000 0.368
#> SRR2105364 6 0.3647 0.656347 0.000 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105361 6 0.5335 0.604566 0.000 0.148 0.000 0.276 0.000 0.576
#> SRR2105362 6 0.4515 0.685397 0.000 0.056 0.000 0.304 0.000 0.640
#> SRR2105359 5 0.3797 0.524715 0.000 0.000 0.292 0.016 0.692 0.000
#> SRR2105360 5 0.4337 0.211764 0.000 0.000 0.480 0.020 0.500 0.000
#> SRR2105355 5 0.4518 0.435327 0.004 0.000 0.348 0.036 0.612 0.000
#> SRR2105356 5 0.6646 0.204193 0.320 0.000 0.220 0.040 0.420 0.000
#> SRR2105353 3 0.2772 0.580225 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105354 3 0.2624 0.617693 0.004 0.000 0.844 0.004 0.148 0.000
#> SRR2105351 6 0.5202 0.504525 0.000 0.260 0.000 0.140 0.000 0.600
#> SRR2105352 2 0.1718 0.810285 0.000 0.936 0.024 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105349 2 0.0260 0.821845 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105350 2 0.6002 -0.250473 0.000 0.396 0.000 0.236 0.000 0.368
#> SRR2105345 4 0.4343 0.241264 0.000 0.028 0.000 0.592 0.000 0.380
#> SRR2105346 6 0.4318 0.491540 0.000 0.020 0.000 0.448 0.000 0.532
#> SRR2105347 6 0.4563 0.481051 0.056 0.000 0.000 0.316 0.000 0.628
#> SRR2105348 6 0.5289 0.349920 0.136 0.000 0.000 0.288 0.000 0.576
#> SRR2105343 6 0.5011 0.561037 0.000 0.264 0.000 0.116 0.000 0.620
#> SRR2105344 6 0.3470 0.721117 0.000 0.012 0.000 0.248 0.000 0.740
#> SRR2105341 5 0.3290 0.548930 0.000 0.000 0.252 0.004 0.744 0.000
#> SRR2105342 5 0.3518 0.537633 0.000 0.000 0.256 0.012 0.732 0.000
#> SRR2105339 3 0.4109 0.031473 0.000 0.000 0.576 0.012 0.412 0.000
#> SRR2105340 3 0.1531 0.678873 0.004 0.000 0.928 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105335 5 0.4962 0.528085 0.048 0.000 0.112 0.124 0.716 0.000
#> SRR2105336 1 0.6622 0.450243 0.496 0.000 0.176 0.068 0.260 0.000
#> SRR2105337 1 0.6251 0.243845 0.464 0.000 0.164 0.028 0.344 0.000
#> SRR2105338 1 0.3854 0.742225 0.780 0.000 0.160 0.016 0.044 0.000
#> SRR2105331 6 0.5947 0.136099 0.000 0.340 0.004 0.196 0.000 0.460
#> SRR2105332 6 0.2905 0.666291 0.004 0.048 0.000 0.092 0.000 0.856
#> SRR2105333 2 0.0000 0.820956 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105334 2 0.2119 0.814687 0.000 0.904 0.000 0.060 0.000 0.036
#> SRR2105329 2 0.5288 0.453629 0.000 0.596 0.000 0.164 0.240 0.000
#> SRR2105330 2 0.5747 0.372910 0.000 0.568 0.004 0.272 0.144 0.012
#> SRR2105327 2 0.2695 0.777629 0.000 0.844 0.004 0.008 0.000 0.144
#> SRR2105328 2 0.3460 0.748701 0.000 0.796 0.028 0.008 0.000 0.168
#> SRR2105325 3 0.1882 0.704159 0.060 0.000 0.920 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105326 3 0.2058 0.703260 0.072 0.000 0.908 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105323 5 0.2034 0.631077 0.000 0.004 0.024 0.060 0.912 0.000
#> SRR2105324 5 0.1780 0.638436 0.000 0.000 0.028 0.048 0.924 0.000
#> SRR2105319 3 0.5290 0.535412 0.080 0.000 0.688 0.080 0.152 0.000
#> SRR2105320 1 0.5144 0.247180 0.488 0.000 0.448 0.016 0.048 0.000
#> SRR2105321 3 0.1074 0.701302 0.028 0.000 0.960 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105322 3 0.1075 0.704007 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0146 0.821385 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105318 2 0.1867 0.803391 0.000 0.916 0.000 0.020 0.000 0.064
#> SRR2105315 5 0.5041 0.228917 0.000 0.420 0.048 0.012 0.520 0.000
#> SRR2105316 2 0.1141 0.820111 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR2105313 2 0.2685 0.795913 0.000 0.868 0.000 0.072 0.000 0.060
#> SRR2105314 6 0.5834 0.363695 0.000 0.328 0.000 0.204 0.000 0.468
#> SRR2105311 3 0.2294 0.702034 0.076 0.020 0.896 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105312 3 0.2325 0.697522 0.100 0.008 0.884 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.3452 0.722239 0.792 0.000 0.008 0.024 0.176 0.000
#> SRR2105308 1 0.3304 0.728476 0.804 0.000 0.008 0.020 0.168 0.000
#> SRR2105309 5 0.2733 0.631013 0.000 0.000 0.080 0.056 0.864 0.000
#> SRR2105310 5 0.1745 0.633712 0.000 0.000 0.020 0.056 0.924 0.000
#> SRR2105305 5 0.3050 0.556292 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR2105306 5 0.4064 0.457031 0.000 0.000 0.336 0.020 0.644 0.000
#> SRR2105303 6 0.3650 0.726102 0.000 0.012 0.000 0.280 0.000 0.708
#> SRR2105304 2 0.1092 0.817207 0.000 0.960 0.020 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3062 0.779151 0.000 0.836 0.000 0.052 0.000 0.112
#> SRR2105302 2 0.4094 0.673716 0.000 0.740 0.000 0.080 0.000 0.180
#> SRR2105299 5 0.5914 0.278896 0.000 0.064 0.056 0.432 0.448 0.000
#> SRR2105300 4 0.6459 0.093825 0.000 0.280 0.020 0.456 0.240 0.004
#> SRR2105297 1 0.5227 0.099976 0.456 0.000 0.000 0.092 0.000 0.452
#> SRR2105298 1 0.4871 0.396422 0.580 0.000 0.000 0.072 0.000 0.348
#> SRR2105295 2 0.1267 0.814896 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.4530 0.630845 0.000 0.692 0.000 0.100 0.000 0.208
#> SRR2105293 3 0.0790 0.702563 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105294 3 0.1528 0.704555 0.048 0.000 0.936 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105291 1 0.6582 0.289531 0.484 0.000 0.312 0.092 0.112 0.000
#> SRR2105292 1 0.0717 0.793056 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105289 5 0.6547 0.226865 0.136 0.012 0.376 0.036 0.440 0.000
#> SRR2105290 1 0.2095 0.791943 0.916 0.000 0.028 0.016 0.040 0.000
#> SRR2105287 1 0.2985 0.780470 0.868 0.004 0.040 0.020 0.068 0.000
#> SRR2105288 1 0.0146 0.792031 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105285 2 0.0551 0.822957 0.000 0.984 0.004 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105286 2 0.1265 0.823736 0.000 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR2105283 4 0.3753 0.669581 0.084 0.000 0.020 0.808 0.000 0.088
#> SRR2105284 4 0.3279 0.698357 0.028 0.008 0.024 0.848 0.000 0.092
#> SRR2105281 6 0.4575 0.637412 0.000 0.048 0.000 0.352 0.000 0.600
#> SRR2105282 6 0.4493 0.642758 0.000 0.044 0.000 0.344 0.000 0.612
#> SRR2105259 5 0.1921 0.634755 0.000 0.000 0.032 0.052 0.916 0.000
#> SRR2105260 5 0.1719 0.633004 0.000 0.000 0.016 0.060 0.924 0.000
#> SRR2105279 6 0.3534 0.720408 0.000 0.016 0.000 0.244 0.000 0.740
#> SRR2105280 6 0.3470 0.721139 0.000 0.012 0.000 0.248 0.000 0.740
#> SRR2105257 1 0.3998 0.741829 0.784 0.000 0.024 0.060 0.132 0.000
#> SRR2105258 1 0.2545 0.789152 0.892 0.000 0.052 0.028 0.028 0.000
#> SRR2105253 2 0.3426 0.726577 0.000 0.808 0.000 0.068 0.000 0.124
#> SRR2105254 2 0.4981 -0.110604 0.000 0.496 0.000 0.068 0.000 0.436
#> SRR2105255 5 0.1620 0.636015 0.012 0.000 0.024 0.024 0.940 0.000
#> SRR2105256 5 0.2032 0.634995 0.036 0.000 0.024 0.020 0.920 0.000
#> SRR2105251 6 0.2361 0.714105 0.000 0.028 0.000 0.088 0.000 0.884
#> SRR2105252 6 0.1700 0.667060 0.000 0.048 0.000 0.024 0.000 0.928
#> SRR2105249 4 0.4127 0.426685 0.000 0.036 0.000 0.680 0.000 0.284
#> SRR2105250 4 0.3694 0.542190 0.000 0.028 0.000 0.740 0.000 0.232
#> SRR2105247 6 0.2980 0.735312 0.000 0.012 0.000 0.180 0.000 0.808
#> SRR2105248 6 0.2191 0.726701 0.000 0.004 0.000 0.120 0.000 0.876
#> SRR2105245 3 0.1406 0.700949 0.020 0.000 0.952 0.008 0.016 0.004
#> SRR2105246 3 0.3743 0.657635 0.028 0.056 0.840 0.008 0.020 0.048
#> SRR2105243 5 0.5643 0.449040 0.160 0.000 0.220 0.020 0.600 0.000
#> SRR2105244 3 0.4917 0.342609 0.056 0.000 0.628 0.016 0.300 0.000
#> SRR2105241 1 0.5436 0.613144 0.636 0.008 0.244 0.024 0.088 0.000
#> SRR2105242 1 0.1555 0.792624 0.940 0.000 0.040 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105239 3 0.5157 0.070093 0.384 0.000 0.548 0.024 0.044 0.000
#> SRR2105240 1 0.2803 0.773847 0.856 0.000 0.116 0.012 0.016 0.000
#> SRR2105237 2 0.2301 0.803050 0.000 0.884 0.000 0.020 0.000 0.096
#> SRR2105238 4 0.4183 -0.081750 0.000 0.480 0.000 0.508 0.000 0.012
#> SRR2105235 4 0.3971 0.625453 0.000 0.068 0.000 0.748 0.000 0.184
#> SRR2105236 4 0.4813 0.514940 0.000 0.104 0.000 0.648 0.000 0.248
#> SRR2105233 2 0.0000 0.820956 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105234 2 0.0146 0.821385 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105231 6 0.2773 0.731500 0.000 0.008 0.004 0.152 0.000 0.836
#> SRR2105232 6 0.2378 0.731943 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR2105227 3 0.4858 0.534435 0.100 0.012 0.720 0.008 0.156 0.004
#> SRR2105228 1 0.4702 0.475431 0.568 0.000 0.396 0.016 0.016 0.004
#> SRR2105225 1 0.6825 0.000987 0.360 0.000 0.332 0.044 0.264 0.000
#> SRR2105226 1 0.4612 0.705768 0.724 0.000 0.184 0.036 0.056 0.000
#> SRR2105229 3 0.4684 0.460718 0.000 0.024 0.684 0.048 0.244 0.000
#> SRR2105230 5 0.4962 0.238942 0.008 0.000 0.392 0.052 0.548 0.000
#> SRR2105219 2 0.1866 0.804822 0.000 0.908 0.000 0.084 0.000 0.008
#> SRR2105220 2 0.5748 0.161567 0.000 0.492 0.000 0.316 0.000 0.192
#> SRR2105221 4 0.3074 0.683024 0.004 0.004 0.000 0.792 0.000 0.200
#> SRR2105222 4 0.3840 0.625557 0.020 0.000 0.000 0.696 0.000 0.284
#> SRR2105223 5 0.3837 0.564826 0.016 0.000 0.212 0.020 0.752 0.000
#> SRR2105224 5 0.5346 0.417019 0.272 0.000 0.096 0.020 0.612 0.000
#> SRR2105217 6 0.1149 0.674273 0.000 0.008 0.008 0.024 0.000 0.960
#> SRR2105218 6 0.1204 0.701755 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR2105215 6 0.3564 0.719225 0.000 0.012 0.000 0.264 0.000 0.724
#> SRR2105216 6 0.4101 0.687913 0.000 0.028 0.000 0.308 0.000 0.664
#> SRR2105213 3 0.2497 0.644288 0.004 0.008 0.872 0.004 0.112 0.000
#> SRR2105214 3 0.1698 0.692058 0.008 0.012 0.940 0.004 0.032 0.004
#> SRR2105211 5 0.3619 0.569038 0.000 0.000 0.232 0.024 0.744 0.000
#> SRR2105212 5 0.2887 0.625808 0.000 0.000 0.120 0.036 0.844 0.000
#> SRR2105209 1 0.6090 0.281921 0.472 0.000 0.056 0.084 0.388 0.000
#> SRR2105210 1 0.1900 0.786570 0.916 0.000 0.008 0.008 0.068 0.000
#> SRR2105207 1 0.2110 0.781310 0.900 0.000 0.084 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105208 1 0.0146 0.791132 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.4338 0.606672 0.004 0.660 0.000 0.036 0.000 0.300
#> SRR2105206 2 0.5328 0.387823 0.004 0.528 0.008 0.072 0.000 0.388
#> SRR2105201 4 0.3023 0.697838 0.000 0.044 0.000 0.836 0.000 0.120
#> SRR2105202 4 0.2858 0.694554 0.000 0.032 0.000 0.844 0.000 0.124
#> SRR2105203 6 0.5169 0.541261 0.000 0.260 0.000 0.136 0.000 0.604
#> SRR2105204 6 0.3534 0.721015 0.000 0.016 0.000 0.244 0.000 0.740
#> SRR2105199 6 0.3670 0.722513 0.000 0.024 0.000 0.240 0.000 0.736
#> SRR2105200 6 0.2994 0.722815 0.000 0.004 0.000 0.208 0.000 0.788
#> SRR2105197 5 0.5214 0.401172 0.000 0.000 0.216 0.172 0.612 0.000
#> SRR2105198 5 0.6190 0.148673 0.004 0.008 0.320 0.208 0.460 0.000
#> SRR2105195 1 0.8095 0.183011 0.428 0.080 0.188 0.068 0.224 0.012
#> SRR2105196 1 0.3847 0.714753 0.812 0.000 0.008 0.072 0.020 0.088
#> SRR2105193 1 0.1913 0.782519 0.908 0.000 0.080 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0935 0.790518 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.3453 0.587551 0.000 0.000 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR2105192 5 0.6696 -0.044216 0.360 0.000 0.048 0.196 0.396 0.000
#> SRR2105189 2 0.1989 0.817951 0.000 0.916 0.000 0.052 0.004 0.028
#> SRR2105190 2 0.1498 0.821209 0.000 0.940 0.000 0.032 0.000 0.028
#> SRR2105187 4 0.7579 0.176807 0.004 0.252 0.128 0.312 0.000 0.304
#> SRR2105188 4 0.5703 0.536379 0.036 0.000 0.096 0.576 0.000 0.292
#> SRR2105179 1 0.5492 0.589742 0.632 0.004 0.084 0.036 0.244 0.000
#> SRR2105180 1 0.3395 0.730110 0.812 0.000 0.004 0.048 0.136 0.000
#> SRR2105183 6 0.4109 0.671809 0.000 0.024 0.000 0.328 0.000 0.648
#> SRR2105184 6 0.2300 0.708041 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105185 6 0.5087 0.614325 0.000 0.100 0.072 0.116 0.000 0.712
#> SRR2105186 6 0.1341 0.660878 0.000 0.000 0.028 0.024 0.000 0.948
#> SRR2105181 5 0.4238 0.551557 0.000 0.000 0.092 0.180 0.728 0.000
#> SRR2105182 5 0.3588 0.554070 0.000 0.000 0.152 0.060 0.788 0.000
#> SRR2105177 1 0.0146 0.791352 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 6 0.4680 0.680004 0.000 0.120 0.000 0.200 0.000 0.680
#> SRR2105172 6 0.3799 0.708671 0.000 0.020 0.000 0.276 0.000 0.704
#> SRR2105175 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 6 0.4546 0.533200 0.000 0.204 0.000 0.104 0.000 0.692
#> SRR2105174 6 0.4291 0.696040 0.000 0.044 0.000 0.292 0.000 0.664
#> SRR2105169 6 0.2165 0.695917 0.000 0.008 0.000 0.108 0.000 0.884
#> SRR2105170 6 0.2442 0.694476 0.004 0.000 0.000 0.144 0.000 0.852
#> SRR2105167 6 0.3608 0.711701 0.000 0.012 0.000 0.272 0.000 0.716
#> SRR2105168 6 0.3564 0.715256 0.000 0.012 0.000 0.264 0.000 0.724
#> SRR2105165 3 0.4513 0.534019 0.072 0.000 0.712 0.012 0.204 0.000
#> SRR2105166 3 0.3808 0.644463 0.088 0.000 0.792 0.008 0.112 0.000
#> SRR2105163 3 0.1982 0.702328 0.068 0.000 0.912 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105164 3 0.1958 0.697639 0.100 0.000 0.896 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.1049 0.788317 0.960 0.000 0.032 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 6 0.4738 0.622396 0.000 0.084 0.000 0.276 0.000 0.640
#> SRR2105156 6 0.3993 0.694370 0.000 0.024 0.000 0.300 0.000 0.676
#> SRR2105157 6 0.2377 0.688839 0.000 0.024 0.008 0.076 0.000 0.892
#> SRR2105158 6 0.1624 0.665002 0.000 0.012 0.008 0.044 0.000 0.936
#> SRR2105159 3 0.2912 0.636128 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.2135 0.749296 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105153 6 0.3411 0.490164 0.000 0.160 0.024 0.012 0.000 0.804
#> SRR2105154 6 0.1857 0.627871 0.000 0.032 0.028 0.012 0.000 0.928
#> SRR2105151 6 0.4586 0.697070 0.000 0.076 0.000 0.264 0.000 0.660
#> SRR2105152 6 0.3876 0.706797 0.000 0.024 0.000 0.276 0.000 0.700
#> SRR2105149 2 0.6814 0.174294 0.028 0.476 0.096 0.064 0.336 0.000
#> SRR2105150 5 0.7017 0.196259 0.012 0.328 0.160 0.068 0.432 0.000
#> SRR2105147 3 0.4379 0.180037 0.000 0.400 0.576 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105148 3 0.4387 0.167939 0.000 0.404 0.572 0.004 0.020 0.000
#> SRR2105143 1 0.3940 0.762946 0.804 0.000 0.104 0.012 0.064 0.016
#> SRR2105144 1 0.3830 0.745975 0.808 0.000 0.084 0.032 0.000 0.076
#> SRR2105145 1 0.2786 0.767293 0.864 0.012 0.100 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.2094 0.775572 0.900 0.000 0.080 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.3670 0.654498 0.000 0.704 0.000 0.012 0.000 0.284
#> SRR2105142 2 0.2572 0.780225 0.000 0.852 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR2105139 6 0.3950 0.710877 0.000 0.028 0.000 0.276 0.000 0.696
#> SRR2105140 6 0.3265 0.713869 0.000 0.004 0.000 0.248 0.000 0.748
#> SRR2105137 4 0.2748 0.693060 0.000 0.024 0.000 0.848 0.000 0.128
#> SRR2105138 4 0.3725 0.607496 0.008 0.000 0.000 0.676 0.000 0.316
#> SRR2105135 6 0.3834 0.710420 0.000 0.024 0.000 0.268 0.000 0.708
#> SRR2105136 6 0.3629 0.712260 0.000 0.012 0.000 0.276 0.000 0.712
#> SRR2105133 5 0.4668 0.446822 0.000 0.000 0.064 0.316 0.620 0.000
#> SRR2105134 5 0.4493 0.470319 0.008 0.000 0.036 0.312 0.644 0.000
#> SRR2105131 5 0.6441 -0.070222 0.004 0.144 0.004 0.396 0.424 0.028
#> SRR2105132 5 0.7241 0.279663 0.220 0.024 0.008 0.240 0.464 0.044
#> SRR2105129 1 0.0547 0.792405 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.791038 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.5972 0.251565 0.460 0.000 0.020 0.132 0.388 0.000
#> SRR2105128 1 0.6964 0.351982 0.468 0.100 0.008 0.128 0.296 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.518 0.822 0.911 0.4964 0.501 0.501
#> 3 3 0.334 0.550 0.714 0.2653 0.959 0.920
#> 4 4 0.368 0.359 0.608 0.1215 0.760 0.509
#> 5 5 0.424 0.374 0.667 0.0669 0.880 0.620
#> 6 6 0.471 0.370 0.614 0.0545 0.923 0.707
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.1414 0.8914 0.980 0.020
#> SRR2105278 1 0.1414 0.8899 0.980 0.020
#> SRR2105275 1 0.9933 0.2543 0.548 0.452
#> SRR2105276 1 0.1414 0.8917 0.980 0.020
#> SRR2105273 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.1414 0.8912 0.980 0.020
#> SRR2105272 1 0.0672 0.8900 0.992 0.008
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.1184 0.9095 0.016 0.984
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.7056 0.7699 0.192 0.808
#> SRR2105264 2 0.6801 0.7857 0.180 0.820
#> SRR2105261 2 0.9323 0.4481 0.348 0.652
#> SRR2105262 2 0.9896 0.2028 0.440 0.560
#> SRR2105357 1 0.9996 0.0526 0.512 0.488
#> SRR2105358 1 0.1184 0.8912 0.984 0.016
#> SRR2105439 2 0.0376 0.9118 0.004 0.996
#> SRR2105440 2 0.4815 0.8593 0.104 0.896
#> SRR2105509 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.1184 0.8908 0.984 0.016
#> SRR2105505 1 0.2043 0.8891 0.968 0.032
#> SRR2105506 1 0.0376 0.8889 0.996 0.004
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.5946 0.8246 0.144 0.856
#> SRR2105502 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.3431 0.8767 0.936 0.064
#> SRR2105500 1 0.2948 0.8843 0.948 0.052
#> SRR2105497 2 0.0938 0.9104 0.012 0.988
#> SRR2105498 2 0.8555 0.6457 0.280 0.720
#> SRR2105495 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.4690 0.8659 0.100 0.900
#> SRR2105493 2 0.6531 0.7935 0.168 0.832
#> SRR2105494 2 0.5408 0.8414 0.124 0.876
#> SRR2105491 2 0.3879 0.8746 0.076 0.924
#> SRR2105492 2 0.3431 0.8889 0.064 0.936
#> SRR2105489 2 0.2043 0.9037 0.032 0.968
#> SRR2105490 2 0.5946 0.8195 0.144 0.856
#> SRR2105487 1 0.9732 0.3851 0.596 0.404
#> SRR2105488 1 0.3114 0.8823 0.944 0.056
#> SRR2105485 1 0.2778 0.8869 0.952 0.048
#> SRR2105486 1 0.1633 0.8908 0.976 0.024
#> SRR2105483 1 0.2043 0.8890 0.968 0.032
#> SRR2105484 1 0.0672 0.8894 0.992 0.008
#> SRR2105481 1 0.2948 0.8827 0.948 0.052
#> SRR2105482 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.8081 0.7119 0.752 0.248
#> SRR2105480 1 0.0672 0.8902 0.992 0.008
#> SRR2105477 2 0.6247 0.8115 0.156 0.844
#> SRR2105478 2 0.1184 0.9097 0.016 0.984
#> SRR2105475 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105476 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105473 2 0.6623 0.8017 0.172 0.828
#> SRR2105474 2 0.7602 0.7300 0.220 0.780
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.1843 0.9041 0.028 0.972
#> SRR2105469 1 0.6623 0.8048 0.828 0.172
#> SRR2105470 1 0.6531 0.8060 0.832 0.168
#> SRR2105467 1 0.1633 0.8913 0.976 0.024
#> SRR2105468 1 0.0938 0.8911 0.988 0.012
#> SRR2105465 1 0.8016 0.7063 0.756 0.244
#> SRR2105466 1 0.6712 0.7878 0.824 0.176
#> SRR2105463 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.9491 0.5016 0.632 0.368
#> SRR2105458 1 0.9710 0.4285 0.600 0.400
#> SRR2105455 1 0.3584 0.8806 0.932 0.068
#> SRR2105456 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.1414 0.8908 0.980 0.020
#> SRR2105454 1 0.2043 0.8889 0.968 0.032
#> SRR2105451 2 0.5294 0.8478 0.120 0.880
#> SRR2105452 2 0.1633 0.9060 0.024 0.976
#> SRR2105449 1 0.6148 0.8128 0.848 0.152
#> SRR2105450 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0938 0.9105 0.012 0.988
#> SRR2105448 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105445 2 0.6247 0.8124 0.156 0.844
#> SRR2105446 1 0.8327 0.6766 0.736 0.264
#> SRR2105443 2 0.5519 0.8299 0.128 0.872
#> SRR2105444 2 0.7453 0.7229 0.212 0.788
#> SRR2105441 2 0.0376 0.9119 0.004 0.996
#> SRR2105442 2 0.6438 0.8027 0.164 0.836
#> SRR2105437 1 0.0376 0.8892 0.996 0.004
#> SRR2105438 1 0.2043 0.8885 0.968 0.032
#> SRR2105435 1 0.6048 0.8277 0.852 0.148
#> SRR2105436 1 0.0376 0.8890 0.996 0.004
#> SRR2105433 1 0.0938 0.8911 0.988 0.012
#> SRR2105434 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0672 0.8903 0.992 0.008
#> SRR2105432 1 0.0672 0.8897 0.992 0.008
#> SRR2105429 2 0.7056 0.7675 0.192 0.808
#> SRR2105430 2 0.2778 0.8957 0.048 0.952
#> SRR2105427 2 0.0672 0.9113 0.008 0.992
#> SRR2105428 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0672 0.9111 0.008 0.992
#> SRR2105426 2 0.1843 0.9057 0.028 0.972
#> SRR2105421 2 0.9635 0.3306 0.388 0.612
#> SRR2105422 2 0.9833 0.2061 0.424 0.576
#> SRR2105423 2 0.0938 0.9106 0.012 0.988
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.3431 0.8821 0.936 0.064
#> SRR2105420 1 0.6048 0.8266 0.852 0.148
#> SRR2105415 1 0.0376 0.8885 0.996 0.004
#> SRR2105416 1 0.1633 0.8904 0.976 0.024
#> SRR2105417 1 0.0672 0.8904 0.992 0.008
#> SRR2105418 1 0.0938 0.8907 0.988 0.012
#> SRR2105413 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.1633 0.9057 0.024 0.976
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.4161 0.8728 0.084 0.916
#> SRR2105411 2 0.3584 0.8818 0.068 0.932
#> SRR2105412 2 0.1633 0.9063 0.024 0.976
#> SRR2105407 1 0.2948 0.8859 0.948 0.052
#> SRR2105408 1 0.8713 0.6521 0.708 0.292
#> SRR2105403 1 0.4431 0.8650 0.908 0.092
#> SRR2105404 1 0.0376 0.8889 0.996 0.004
#> SRR2105405 1 0.1414 0.8907 0.980 0.020
#> SRR2105406 1 0.4022 0.8740 0.920 0.080
#> SRR2105401 2 0.1184 0.9087 0.016 0.984
#> SRR2105402 2 0.0376 0.9120 0.004 0.996
#> SRR2105399 2 0.1633 0.9064 0.024 0.976
#> SRR2105400 2 0.2603 0.8954 0.044 0.956
#> SRR2105397 2 0.5178 0.8402 0.116 0.884
#> SRR2105398 2 0.4161 0.8691 0.084 0.916
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.4431 0.8711 0.092 0.908
#> SRR2105393 2 0.0376 0.9120 0.004 0.996
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.2948 0.8835 0.948 0.052
#> SRR2105390 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.8861 0.6266 0.696 0.304
#> SRR2105392 1 0.5946 0.8263 0.856 0.144
#> SRR2105385 1 0.1184 0.8911 0.984 0.016
#> SRR2105386 1 0.0376 0.8892 0.996 0.004
#> SRR2105387 1 0.3879 0.8734 0.924 0.076
#> SRR2105388 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.5519 0.8255 0.128 0.872
#> SRR2105382 2 0.0672 0.9115 0.008 0.992
#> SRR2105383 2 0.9044 0.5494 0.320 0.680
#> SRR2105384 2 0.9170 0.5276 0.332 0.668
#> SRR2105379 2 0.0376 0.9120 0.004 0.996
#> SRR2105380 2 0.6712 0.7828 0.176 0.824
#> SRR2105377 2 0.0672 0.9111 0.008 0.992
#> SRR2105378 2 0.1633 0.9072 0.024 0.976
#> SRR2105375 2 0.9850 0.2262 0.428 0.572
#> SRR2105376 1 0.7056 0.7732 0.808 0.192
#> SRR2105373 1 0.0938 0.8910 0.988 0.012
#> SRR2105374 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0672 0.8899 0.992 0.008
#> SRR2105372 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105369 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0376 0.8890 0.996 0.004
#> SRR2105367 1 0.8327 0.6702 0.736 0.264
#> SRR2105368 1 0.7815 0.7144 0.768 0.232
#> SRR2105365 2 0.2948 0.8900 0.052 0.948
#> SRR2105366 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0376 0.9117 0.004 0.996
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.2043 0.9016 0.032 0.968
#> SRR2105359 1 0.7745 0.7354 0.772 0.228
#> SRR2105360 1 0.2423 0.8890 0.960 0.040
#> SRR2105355 1 0.9248 0.5605 0.660 0.340
#> SRR2105356 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.8081 0.7093 0.752 0.248
#> SRR2105354 1 0.1843 0.8887 0.972 0.028
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.0938 0.9103 0.012 0.988
#> SRR2105349 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105350 2 0.0376 0.9118 0.004 0.996
#> SRR2105345 2 0.1633 0.9068 0.024 0.976
#> SRR2105346 2 0.3879 0.8760 0.076 0.924
#> SRR2105347 2 0.9427 0.4704 0.360 0.640
#> SRR2105348 2 0.9000 0.5669 0.316 0.684
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0672 0.9113 0.008 0.992
#> SRR2105341 1 0.3733 0.8757 0.928 0.072
#> SRR2105342 1 0.0672 0.8901 0.992 0.008
#> SRR2105339 1 0.4161 0.8724 0.916 0.084
#> SRR2105340 1 0.3114 0.8827 0.944 0.056
#> SRR2105335 1 0.0672 0.8898 0.992 0.008
#> SRR2105336 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0938 0.8907 0.988 0.012
#> SRR2105338 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0376 0.9119 0.004 0.996
#> SRR2105329 2 0.5519 0.8351 0.128 0.872
#> SRR2105330 2 0.6973 0.7619 0.188 0.812
#> SRR2105327 2 0.3274 0.8851 0.060 0.940
#> SRR2105328 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105325 1 0.1843 0.8907 0.972 0.028
#> SRR2105326 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105323 2 0.8499 0.5983 0.276 0.724
#> SRR2105324 1 0.7376 0.7652 0.792 0.208
#> SRR2105319 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.3274 0.8783 0.940 0.060
#> SRR2105322 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.7674 0.7235 0.224 0.776
#> SRR2105316 2 0.1843 0.9041 0.028 0.972
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.9087 0.5928 0.676 0.324
#> SRR2105312 1 0.8608 0.6645 0.716 0.284
#> SRR2105307 1 0.6531 0.8141 0.832 0.168
#> SRR2105308 1 0.2423 0.8876 0.960 0.040
#> SRR2105309 1 0.9710 0.4178 0.600 0.400
#> SRR2105310 1 0.3879 0.8740 0.924 0.076
#> SRR2105305 1 0.7602 0.7504 0.780 0.220
#> SRR2105306 1 0.2423 0.8873 0.960 0.040
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.0938 0.9105 0.012 0.988
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105299 2 0.8144 0.6751 0.252 0.748
#> SRR2105300 2 0.4690 0.8618 0.100 0.900
#> SRR2105297 2 0.9775 0.3330 0.412 0.588
#> SRR2105298 2 0.9815 0.3103 0.420 0.580
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.6712 0.8004 0.824 0.176
#> SRR2105294 1 0.0376 0.8893 0.996 0.004
#> SRR2105291 1 0.5946 0.8326 0.856 0.144
#> SRR2105292 1 0.4298 0.8630 0.912 0.088
#> SRR2105289 1 0.6887 0.7869 0.816 0.184
#> SRR2105290 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.1633 0.8912 0.976 0.024
#> SRR2105288 1 0.1633 0.8899 0.976 0.024
#> SRR2105285 2 0.0376 0.9120 0.004 0.996
#> SRR2105286 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.8608 0.6312 0.284 0.716
#> SRR2105284 2 0.7602 0.7375 0.220 0.780
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.8327 0.6909 0.736 0.264
#> SRR2105260 1 0.9775 0.3969 0.588 0.412
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0672 0.8900 0.992 0.008
#> SRR2105253 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105254 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105255 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105256 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.7883 0.7056 0.236 0.764
#> SRR2105247 2 0.3733 0.8841 0.072 0.928
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.7299 0.7631 0.796 0.204
#> SRR2105246 1 0.8813 0.6293 0.700 0.300
#> SRR2105243 1 0.0938 0.8910 0.988 0.012
#> SRR2105244 1 0.2603 0.8871 0.956 0.044
#> SRR2105241 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105242 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.1184 0.8913 0.984 0.016
#> SRR2105240 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.1184 0.9093 0.016 0.984
#> SRR2105238 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105235 2 0.0376 0.9118 0.004 0.996
#> SRR2105236 2 0.2043 0.9031 0.032 0.968
#> SRR2105233 2 0.0376 0.9115 0.004 0.996
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105227 2 0.8813 0.5729 0.300 0.700
#> SRR2105228 2 0.9710 0.3104 0.400 0.600
#> SRR2105225 1 0.1633 0.8908 0.976 0.024
#> SRR2105226 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.9732 0.4228 0.596 0.404
#> SRR2105230 1 0.6247 0.8142 0.844 0.156
#> SRR2105219 2 0.0376 0.9120 0.004 0.996
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.7056 0.7746 0.192 0.808
#> SRR2105222 2 0.8608 0.6299 0.284 0.716
#> SRR2105223 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.8081 0.7231 0.752 0.248
#> SRR2105214 1 0.9170 0.5793 0.668 0.332
#> SRR2105211 1 0.9954 0.2462 0.540 0.460
#> SRR2105212 1 0.6247 0.8183 0.844 0.156
#> SRR2105209 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.8016 0.6956 0.756 0.244
#> SRR2105208 1 0.1633 0.8901 0.976 0.024
#> SRR2105205 2 0.3274 0.8856 0.060 0.940
#> SRR2105206 2 0.5737 0.8316 0.136 0.864
#> SRR2105201 2 0.6801 0.7847 0.180 0.820
#> SRR2105202 2 0.5294 0.8442 0.120 0.880
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.6343 0.8025 0.160 0.840
#> SRR2105197 1 0.3879 0.8741 0.924 0.076
#> SRR2105198 2 1.0000 -0.0708 0.500 0.500
#> SRR2105195 1 0.9983 0.0968 0.524 0.476
#> SRR2105196 1 0.7453 0.7473 0.788 0.212
#> SRR2105193 1 0.1184 0.8911 0.984 0.016
#> SRR2105194 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.4431 0.8677 0.908 0.092
#> SRR2105192 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.7219 0.7644 0.200 0.800
#> SRR2105190 2 0.0376 0.9119 0.004 0.996
#> SRR2105187 2 0.2043 0.9035 0.032 0.968
#> SRR2105188 2 0.6623 0.8009 0.172 0.828
#> SRR2105179 1 0.2948 0.8844 0.948 0.052
#> SRR2105180 1 0.2043 0.8894 0.968 0.032
#> SRR2105183 2 0.0938 0.9099 0.012 0.988
#> SRR2105184 2 0.2603 0.8961 0.044 0.956
#> SRR2105185 2 0.0938 0.9106 0.012 0.988
#> SRR2105186 2 0.2423 0.9005 0.040 0.960
#> SRR2105181 1 0.8386 0.6818 0.732 0.268
#> SRR2105182 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.3584 0.8748 0.932 0.068
#> SRR2105178 1 0.0938 0.8903 0.988 0.012
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.5946 0.8225 0.856 0.144
#> SRR2105176 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0376 0.9118 0.004 0.996
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.9000 0.5783 0.316 0.684
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0376 0.8891 0.996 0.004
#> SRR2105166 1 0.0672 0.8900 0.992 0.008
#> SRR2105163 1 0.9944 0.2329 0.544 0.456
#> SRR2105164 1 0.4690 0.8619 0.900 0.100
#> SRR2105161 1 0.2603 0.8873 0.956 0.044
#> SRR2105162 1 0.6343 0.8022 0.840 0.160
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.9460 0.5131 0.636 0.364
#> SRR2105160 1 0.5294 0.8489 0.880 0.120
#> SRR2105153 2 0.0938 0.9102 0.012 0.988
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.1633 0.9069 0.024 0.976
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.9710 0.4355 0.600 0.400
#> SRR2105150 2 0.9815 0.2511 0.420 0.580
#> SRR2105147 2 0.8267 0.6414 0.260 0.740
#> SRR2105148 2 0.8327 0.6321 0.264 0.736
#> SRR2105143 1 0.8499 0.6734 0.724 0.276
#> SRR2105144 1 0.8267 0.6879 0.740 0.260
#> SRR2105145 1 0.4431 0.8616 0.908 0.092
#> SRR2105146 1 0.0000 0.8876 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.2948 0.8926 0.052 0.948
#> SRR2105137 2 0.7950 0.6970 0.240 0.760
#> SRR2105138 2 0.7219 0.7589 0.200 0.800
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9122 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.9000 0.6122 0.684 0.316
#> SRR2105134 1 0.0938 0.8907 0.988 0.012
#> SRR2105131 2 0.7950 0.6793 0.240 0.760
#> SRR2105132 1 0.9909 0.2325 0.556 0.444
#> SRR2105129 1 0.5629 0.8294 0.868 0.132
#> SRR2105130 1 0.4431 0.8627 0.908 0.092
#> SRR2105127 1 0.3274 0.8828 0.940 0.060
#> SRR2105128 1 0.2423 0.8858 0.960 0.040
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.6387 0.61921 0.680 0.020 0.300
#> SRR2105278 1 0.5244 0.63530 0.756 0.004 0.240
#> SRR2105275 2 0.9627 -0.44747 0.364 0.428 0.208
#> SRR2105276 1 0.5633 0.64249 0.768 0.024 0.208
#> SRR2105273 1 0.2200 0.64960 0.940 0.004 0.056
#> SRR2105274 1 0.1860 0.64488 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105271 1 0.5292 0.64616 0.764 0.008 0.228
#> SRR2105272 1 0.5497 0.60344 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105269 2 0.1289 0.73046 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105270 2 0.5291 0.73849 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105267 2 0.1753 0.74553 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105268 2 0.4702 0.76201 0.000 0.788 0.212
#> SRR2105265 2 0.4963 0.75443 0.008 0.792 0.200
#> SRR2105266 2 0.5363 0.74412 0.000 0.724 0.276
#> SRR2105263 2 0.7903 0.59848 0.068 0.576 0.356
#> SRR2105264 2 0.8822 0.47479 0.136 0.540 0.324
#> SRR2105261 2 0.7778 0.16002 0.240 0.656 0.104
#> SRR2105262 2 0.9889 -0.24503 0.296 0.408 0.296
#> SRR2105357 3 0.9698 0.37728 0.288 0.256 0.456
#> SRR2105358 1 0.6307 0.60023 0.660 0.012 0.328
#> SRR2105439 2 0.4883 0.74904 0.004 0.788 0.208
#> SRR2105440 2 0.5791 0.72679 0.048 0.784 0.168
#> SRR2105509 2 0.1289 0.72708 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105510 2 0.2356 0.73090 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105507 1 0.3116 0.64924 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105508 1 0.3607 0.64517 0.880 0.008 0.112
#> SRR2105505 1 0.6062 0.62984 0.708 0.016 0.276
#> SRR2105506 1 0.4399 0.61604 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105503 2 0.3482 0.75567 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105504 2 0.2959 0.67211 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105501 2 0.8058 0.63661 0.124 0.640 0.236
#> SRR2105502 2 0.2625 0.68250 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105499 1 0.5008 0.63231 0.804 0.016 0.180
#> SRR2105500 1 0.5167 0.64001 0.804 0.024 0.172
#> SRR2105497 2 0.4700 0.76353 0.008 0.812 0.180
#> SRR2105498 2 0.9364 0.40309 0.184 0.484 0.332
#> SRR2105495 2 0.3686 0.76045 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105496 2 0.7222 0.71448 0.072 0.684 0.244
#> SRR2105493 2 0.7357 0.67517 0.048 0.620 0.332
#> SRR2105494 2 0.7050 0.66715 0.028 0.600 0.372
#> SRR2105491 2 0.5897 0.69432 0.076 0.792 0.132
#> SRR2105492 2 0.7570 0.60261 0.044 0.552 0.404
#> SRR2105489 2 0.6297 0.71828 0.008 0.640 0.352
#> SRR2105490 2 0.7138 0.60893 0.024 0.540 0.436
#> SRR2105487 3 0.9767 0.23704 0.328 0.244 0.428
#> SRR2105488 1 0.7069 0.45925 0.568 0.024 0.408
#> SRR2105485 1 0.5726 0.61834 0.760 0.024 0.216
#> SRR2105486 1 0.4749 0.62960 0.816 0.012 0.172
#> SRR2105483 1 0.6113 0.44503 0.688 0.012 0.300
#> SRR2105484 1 0.5785 0.46182 0.696 0.004 0.300
#> SRR2105481 1 0.5295 0.65132 0.808 0.036 0.156
#> SRR2105482 1 0.4346 0.63241 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105479 1 0.8758 0.03902 0.588 0.192 0.220
#> SRR2105480 1 0.5115 0.56563 0.768 0.004 0.228
#> SRR2105477 2 0.7487 0.62109 0.040 0.552 0.408
#> SRR2105478 2 0.4963 0.74487 0.008 0.792 0.200
#> SRR2105475 2 0.3116 0.75869 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105476 2 0.3192 0.75385 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105473 2 0.8533 0.56587 0.104 0.536 0.360
#> SRR2105474 2 0.8559 0.52028 0.100 0.512 0.388
#> SRR2105471 2 0.5058 0.74839 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105472 2 0.6168 0.66583 0.000 0.588 0.412
#> SRR2105469 1 0.7605 0.51464 0.684 0.124 0.192
#> SRR2105470 1 0.5863 0.53428 0.796 0.120 0.084
#> SRR2105467 1 0.5977 0.59736 0.728 0.020 0.252
#> SRR2105468 1 0.5845 0.62628 0.688 0.004 0.308
#> SRR2105465 1 0.8957 -0.14938 0.536 0.152 0.312
#> SRR2105466 1 0.7379 0.30225 0.616 0.048 0.336
#> SRR2105463 1 0.5138 0.54947 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105464 1 0.5397 0.53294 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105461 2 0.3816 0.75925 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105462 2 0.5591 0.73778 0.000 0.696 0.304
#> SRR2105459 2 0.0592 0.72318 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105460 2 0.0892 0.72572 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105457 1 0.9725 0.00661 0.440 0.320 0.240
#> SRR2105458 1 0.9823 -0.03831 0.412 0.336 0.252
#> SRR2105455 1 0.3888 0.63568 0.888 0.048 0.064
#> SRR2105456 1 0.2066 0.64689 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105453 1 0.6333 0.50251 0.656 0.012 0.332
#> SRR2105454 1 0.6735 0.46132 0.564 0.012 0.424
#> SRR2105451 2 0.8230 0.62408 0.112 0.608 0.280
#> SRR2105452 2 0.4164 0.61404 0.008 0.848 0.144
#> SRR2105449 1 0.7163 0.43305 0.628 0.040 0.332
#> SRR2105450 1 0.3412 0.64877 0.876 0.000 0.124
#> SRR2105447 2 0.4068 0.75748 0.016 0.864 0.120
#> SRR2105448 2 0.2796 0.75212 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105445 2 0.8547 0.41395 0.104 0.532 0.364
#> SRR2105446 1 0.9015 -0.15369 0.508 0.144 0.348
#> SRR2105443 2 0.7644 0.50716 0.072 0.632 0.296
#> SRR2105444 2 0.8339 0.45519 0.168 0.628 0.204
#> SRR2105441 2 0.5365 0.75401 0.004 0.744 0.252
#> SRR2105442 2 0.7940 0.53665 0.060 0.524 0.416
#> SRR2105437 1 0.6081 0.59775 0.652 0.004 0.344
#> SRR2105438 1 0.6297 0.56853 0.640 0.008 0.352
#> SRR2105435 1 0.7713 0.51680 0.656 0.096 0.248
#> SRR2105436 1 0.3816 0.64342 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105433 1 0.1989 0.64224 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105434 1 0.4555 0.57668 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105431 1 0.5560 0.50164 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105432 1 0.5591 0.47291 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105429 2 0.8397 0.45606 0.116 0.588 0.296
#> SRR2105430 2 0.4744 0.70581 0.028 0.836 0.136
#> SRR2105427 2 0.1289 0.73219 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105428 2 0.4887 0.75334 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105425 2 0.3715 0.75788 0.004 0.868 0.128
#> SRR2105426 2 0.5763 0.74994 0.016 0.740 0.244
#> SRR2105421 2 0.8566 0.04180 0.188 0.608 0.204
#> SRR2105422 2 0.8395 -0.10193 0.328 0.568 0.104
#> SRR2105423 2 0.4700 0.74921 0.008 0.812 0.180
#> SRR2105424 2 0.4178 0.74754 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105419 1 0.6742 0.60893 0.708 0.052 0.240
#> SRR2105420 1 0.7044 0.49577 0.724 0.108 0.168
#> SRR2105415 1 0.5201 0.54398 0.760 0.004 0.236
#> SRR2105416 1 0.6205 0.44976 0.656 0.008 0.336
#> SRR2105417 1 0.6053 0.60431 0.720 0.020 0.260
#> SRR2105418 1 0.5928 0.48493 0.696 0.008 0.296
#> SRR2105413 2 0.4121 0.76072 0.000 0.832 0.168
#> SRR2105414 2 0.1453 0.72726 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105409 2 0.5785 0.72041 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105410 2 0.6798 0.66011 0.016 0.584 0.400
#> SRR2105411 2 0.6398 0.68857 0.008 0.620 0.372
#> SRR2105412 2 0.5706 0.72368 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105407 1 0.6414 0.58554 0.716 0.036 0.248
#> SRR2105408 1 0.8750 0.29789 0.580 0.164 0.256
#> SRR2105403 1 0.6810 0.54627 0.720 0.068 0.212
#> SRR2105404 1 0.4883 0.63506 0.788 0.004 0.208
#> SRR2105405 1 0.3377 0.64377 0.896 0.012 0.092
#> SRR2105406 1 0.6867 0.40440 0.636 0.028 0.336
#> SRR2105401 2 0.2400 0.72753 0.004 0.932 0.064
#> SRR2105402 2 0.4099 0.61939 0.008 0.852 0.140
#> SRR2105399 2 0.5200 0.73451 0.020 0.796 0.184
#> SRR2105400 2 0.3678 0.68219 0.028 0.892 0.080
#> SRR2105397 2 0.6111 0.55434 0.104 0.784 0.112
#> SRR2105398 2 0.5393 0.56715 0.044 0.808 0.148
#> SRR2105395 2 0.3879 0.76498 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105396 2 0.7032 0.68434 0.028 0.604 0.368
#> SRR2105393 2 0.5929 0.72817 0.004 0.676 0.320
#> SRR2105394 2 0.5216 0.74021 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105389 1 0.6521 0.58319 0.712 0.040 0.248
#> SRR2105390 1 0.4702 0.62252 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105391 1 0.9223 0.29578 0.528 0.200 0.272
#> SRR2105392 1 0.8013 0.47072 0.612 0.092 0.296
#> SRR2105385 1 0.2845 0.65063 0.920 0.012 0.068
#> SRR2105386 1 0.2959 0.65108 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105387 1 0.7295 0.46132 0.584 0.036 0.380
#> SRR2105388 1 0.3816 0.65120 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105381 2 0.5961 0.62375 0.136 0.788 0.076
#> SRR2105382 2 0.4974 0.75129 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105383 2 0.9364 0.38494 0.184 0.484 0.332
#> SRR2105384 2 0.9292 0.39383 0.176 0.492 0.332
#> SRR2105379 2 0.2096 0.74258 0.004 0.944 0.052
#> SRR2105380 2 0.6653 0.51843 0.136 0.752 0.112
#> SRR2105377 2 0.5541 0.75380 0.008 0.740 0.252
#> SRR2105378 2 0.7054 0.53186 0.020 0.524 0.456
#> SRR2105375 3 0.9673 0.37940 0.212 0.388 0.400
#> SRR2105376 3 0.7824 -0.09878 0.444 0.052 0.504
#> SRR2105373 1 0.5536 0.65046 0.752 0.012 0.236
#> SRR2105374 1 0.5363 0.59364 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105371 1 0.3644 0.64649 0.872 0.004 0.124
#> SRR2105372 1 0.4654 0.61945 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105369 1 0.4110 0.63661 0.844 0.004 0.152
#> SRR2105370 1 0.1878 0.65064 0.952 0.004 0.044
#> SRR2105367 3 0.8373 0.19710 0.388 0.088 0.524
#> SRR2105368 1 0.8533 -0.13173 0.536 0.104 0.360
#> SRR2105365 2 0.5955 0.73710 0.048 0.772 0.180
#> SRR2105366 2 0.1753 0.72995 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105363 2 0.4164 0.75414 0.008 0.848 0.144
#> SRR2105364 2 0.4796 0.75928 0.000 0.780 0.220
#> SRR2105361 2 0.1163 0.72977 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105362 2 0.3134 0.72336 0.032 0.916 0.052
#> SRR2105359 1 0.8442 0.40177 0.620 0.188 0.192
#> SRR2105360 1 0.4397 0.64503 0.856 0.028 0.116
#> SRR2105355 1 0.9778 -0.07089 0.408 0.356 0.236
#> SRR2105356 1 0.3340 0.65656 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105353 1 0.8482 0.39796 0.616 0.184 0.200
#> SRR2105354 1 0.5060 0.63413 0.816 0.028 0.156
#> SRR2105351 2 0.3340 0.75713 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105352 2 0.3918 0.62429 0.004 0.856 0.140
#> SRR2105349 2 0.1529 0.73220 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105350 2 0.5291 0.74895 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105345 2 0.6129 0.72099 0.008 0.668 0.324
#> SRR2105346 2 0.6783 0.65449 0.016 0.588 0.396
#> SRR2105347 2 0.9402 0.16520 0.172 0.416 0.412
#> SRR2105348 3 0.9252 -0.10699 0.156 0.396 0.448
#> SRR2105343 2 0.1163 0.72851 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105344 2 0.5812 0.74903 0.012 0.724 0.264
#> SRR2105341 1 0.6761 0.56868 0.700 0.048 0.252
#> SRR2105342 1 0.3573 0.64377 0.876 0.004 0.120
#> SRR2105339 1 0.6000 0.62214 0.760 0.040 0.200
#> SRR2105340 1 0.5956 0.63754 0.768 0.044 0.188
#> SRR2105335 1 0.5292 0.64172 0.764 0.008 0.228
#> SRR2105336 1 0.5621 0.57816 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105337 1 0.2280 0.64892 0.940 0.008 0.052
#> SRR2105338 1 0.2261 0.64692 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105331 2 0.3192 0.75878 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105332 2 0.4750 0.76175 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105333 2 0.3192 0.75741 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105334 2 0.3784 0.75651 0.004 0.864 0.132
#> SRR2105329 2 0.4749 0.66774 0.076 0.852 0.072
#> SRR2105330 2 0.8940 0.47917 0.200 0.568 0.232
#> SRR2105327 2 0.3694 0.72068 0.052 0.896 0.052
#> SRR2105328 2 0.4235 0.76287 0.000 0.824 0.176
#> SRR2105325 1 0.5894 0.63956 0.752 0.028 0.220
#> SRR2105326 1 0.4654 0.63592 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105323 2 0.8595 0.09893 0.216 0.604 0.180
#> SRR2105324 1 0.7695 0.51118 0.676 0.124 0.200
#> SRR2105319 1 0.5497 0.62465 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105320 1 0.6026 0.53329 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105321 1 0.4768 0.64469 0.848 0.052 0.100
#> SRR2105322 1 0.3267 0.65211 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105317 2 0.1860 0.73400 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105318 2 0.2165 0.74195 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105315 2 0.8137 0.46544 0.220 0.640 0.140
#> SRR2105316 2 0.4094 0.74094 0.028 0.872 0.100
#> SRR2105313 2 0.3551 0.75458 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105314 2 0.3267 0.75300 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105311 1 0.9523 0.04679 0.488 0.276 0.236
#> SRR2105312 1 0.8578 0.12786 0.604 0.172 0.224
#> SRR2105307 3 0.8405 -0.19451 0.456 0.084 0.460
#> SRR2105308 1 0.5681 0.56378 0.748 0.016 0.236
#> SRR2105309 1 0.9745 -0.10973 0.420 0.348 0.232
#> SRR2105310 1 0.6303 0.58020 0.720 0.032 0.248
#> SRR2105305 1 0.7975 0.40984 0.656 0.140 0.204
#> SRR2105306 1 0.5536 0.61533 0.776 0.024 0.200
#> SRR2105303 2 0.3879 0.75724 0.000 0.848 0.152
#> SRR2105304 2 0.2537 0.68572 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105301 2 0.3532 0.75399 0.008 0.884 0.108
#> SRR2105302 2 0.2878 0.75521 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105299 2 0.9192 0.34187 0.180 0.520 0.300
#> SRR2105300 2 0.7788 0.60494 0.084 0.632 0.284
#> SRR2105297 3 0.8813 0.37478 0.184 0.236 0.580
#> SRR2105298 3 0.9034 0.49860 0.244 0.200 0.556
#> SRR2105295 2 0.0892 0.71951 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105296 2 0.3551 0.76114 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105293 1 0.8693 0.32809 0.592 0.176 0.232
#> SRR2105294 1 0.4931 0.63643 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105291 1 0.6250 0.57872 0.776 0.104 0.120
#> SRR2105292 1 0.7001 0.36754 0.628 0.032 0.340
#> SRR2105289 1 0.8600 0.43950 0.604 0.184 0.212
#> SRR2105290 1 0.4002 0.62570 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105287 1 0.5763 0.54822 0.716 0.008 0.276
#> SRR2105288 1 0.4473 0.63679 0.828 0.008 0.164
#> SRR2105285 2 0.4233 0.76472 0.004 0.836 0.160
#> SRR2105286 2 0.2356 0.74345 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105283 2 0.9532 0.24245 0.244 0.488 0.268
#> SRR2105284 2 0.8435 0.58006 0.124 0.592 0.284
#> SRR2105281 2 0.3752 0.75883 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105282 2 0.5216 0.75156 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105259 1 0.8427 0.35330 0.620 0.172 0.208
#> SRR2105260 1 0.9693 -0.01920 0.456 0.292 0.252
#> SRR2105279 2 0.5785 0.70854 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105280 2 0.5363 0.73933 0.000 0.724 0.276
#> SRR2105257 1 0.4974 0.62020 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105258 1 0.5497 0.50959 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105253 2 0.5058 0.74503 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105254 2 0.4346 0.74990 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105255 1 0.4654 0.62160 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105256 1 0.4346 0.62724 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105251 2 0.5905 0.70986 0.000 0.648 0.352
#> SRR2105252 2 0.5178 0.75312 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105249 2 0.5678 0.72550 0.000 0.684 0.316
#> SRR2105250 2 0.7901 0.58093 0.060 0.540 0.400
#> SRR2105247 2 0.6935 0.72546 0.036 0.652 0.312
#> SRR2105248 2 0.5363 0.74060 0.000 0.724 0.276
#> SRR2105245 1 0.8525 0.27239 0.600 0.148 0.252
#> SRR2105246 1 0.8841 -0.07845 0.580 0.204 0.216
#> SRR2105243 1 0.3551 0.65674 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105244 1 0.4679 0.63078 0.832 0.020 0.148
#> SRR2105241 1 0.2945 0.65042 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105242 1 0.2625 0.63466 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105239 1 0.3310 0.65029 0.908 0.028 0.064
#> SRR2105240 1 0.2959 0.64353 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105237 2 0.2116 0.72510 0.012 0.948 0.040
#> SRR2105238 2 0.2537 0.74090 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105235 2 0.1529 0.73647 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105236 2 0.6307 0.70349 0.012 0.660 0.328
#> SRR2105233 2 0.1031 0.72533 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105234 2 0.0892 0.72522 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105231 2 0.4842 0.75849 0.000 0.776 0.224
#> SRR2105232 2 0.3038 0.74499 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105227 2 0.9055 -0.19794 0.252 0.552 0.196
#> SRR2105228 2 0.9514 -0.17388 0.328 0.468 0.204
#> SRR2105225 1 0.5988 0.60721 0.688 0.008 0.304
#> SRR2105226 1 0.4291 0.61735 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105229 1 0.9813 0.08152 0.428 0.304 0.268
#> SRR2105230 1 0.7157 0.55529 0.712 0.100 0.188
#> SRR2105219 2 0.1964 0.74480 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105220 2 0.4346 0.76171 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105221 2 0.8379 0.60197 0.096 0.552 0.352
#> SRR2105222 3 0.8628 -0.02888 0.116 0.340 0.544
#> SRR2105223 1 0.4235 0.63050 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105224 1 0.4062 0.63328 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105217 2 0.4887 0.75290 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105218 2 0.4702 0.75409 0.000 0.788 0.212
#> SRR2105215 2 0.4452 0.76530 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105216 2 0.5560 0.73364 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105213 1 0.9210 0.07192 0.520 0.184 0.296
#> SRR2105214 1 0.9083 0.13121 0.540 0.280 0.180
#> SRR2105211 1 0.9547 -0.05929 0.480 0.292 0.228
#> SRR2105212 1 0.7458 0.47314 0.672 0.084 0.244
#> SRR2105209 1 0.3038 0.65735 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105210 1 0.4750 0.56604 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105207 3 0.8149 0.12932 0.408 0.072 0.520
#> SRR2105208 1 0.6102 0.41142 0.672 0.008 0.320
#> SRR2105205 2 0.6245 0.73879 0.060 0.760 0.180
#> SRR2105206 2 0.7529 0.67768 0.060 0.624 0.316
#> SRR2105201 2 0.7395 0.65717 0.040 0.580 0.380
#> SRR2105202 2 0.6713 0.64236 0.012 0.572 0.416
#> SRR2105203 2 0.2537 0.74915 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105204 2 0.4178 0.76346 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105199 2 0.4062 0.76147 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105200 2 0.7490 0.63556 0.044 0.576 0.380
#> SRR2105197 1 0.7308 0.57262 0.656 0.060 0.284
#> SRR2105198 2 0.9899 -0.38655 0.280 0.400 0.320
#> SRR2105195 1 0.9982 -0.43282 0.360 0.332 0.308
#> SRR2105196 1 0.7677 0.17894 0.676 0.120 0.204
#> SRR2105193 1 0.4931 0.57746 0.784 0.004 0.212
#> SRR2105194 1 0.5098 0.53668 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105191 1 0.5875 0.62686 0.784 0.056 0.160
#> SRR2105192 1 0.5138 0.64088 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105189 2 0.7975 0.57841 0.160 0.660 0.180
#> SRR2105190 2 0.5420 0.74869 0.008 0.752 0.240
#> SRR2105187 2 0.4059 0.73678 0.012 0.860 0.128
#> SRR2105188 2 0.8685 0.43270 0.124 0.548 0.328
#> SRR2105179 1 0.3623 0.62552 0.896 0.032 0.072
#> SRR2105180 1 0.6282 0.55642 0.664 0.012 0.324
#> SRR2105183 2 0.5722 0.73189 0.004 0.704 0.292
#> SRR2105184 2 0.6510 0.66700 0.012 0.624 0.364
#> SRR2105185 2 0.1525 0.73586 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105186 2 0.6777 0.68746 0.020 0.616 0.364
#> SRR2105181 1 0.8748 0.36124 0.584 0.172 0.244
#> SRR2105182 1 0.4002 0.63574 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105177 1 0.6800 0.41084 0.660 0.032 0.308
#> SRR2105178 1 0.5760 0.43875 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105171 2 0.2625 0.74653 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105172 2 0.5397 0.73769 0.000 0.720 0.280
#> SRR2105175 1 0.7777 -0.04707 0.532 0.052 0.416
#> SRR2105176 1 0.5098 0.55450 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105173 2 0.3686 0.75764 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105174 2 0.5058 0.74827 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105169 2 0.4346 0.75978 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105170 2 0.9770 0.05275 0.232 0.400 0.368
#> SRR2105167 2 0.5760 0.72175 0.000 0.672 0.328
#> SRR2105168 2 0.5905 0.70903 0.000 0.648 0.352
#> SRR2105165 1 0.2590 0.64884 0.924 0.004 0.072
#> SRR2105166 1 0.4002 0.64541 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105163 2 0.8793 -0.40761 0.436 0.452 0.112
#> SRR2105164 1 0.5566 0.61201 0.812 0.080 0.108
#> SRR2105161 1 0.7003 0.47029 0.692 0.060 0.248
#> SRR2105162 1 0.6881 0.23109 0.592 0.020 0.388
#> SRR2105155 2 0.4796 0.75410 0.000 0.780 0.220
#> SRR2105156 2 0.5835 0.70885 0.000 0.660 0.340
#> SRR2105157 2 0.3482 0.75442 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105158 2 0.5058 0.75067 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105159 1 0.9974 -0.19794 0.360 0.300 0.340
#> SRR2105160 1 0.8134 0.37945 0.584 0.088 0.328
#> SRR2105153 2 0.2280 0.73274 0.008 0.940 0.052
#> SRR2105154 2 0.2796 0.74822 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105151 2 0.6205 0.70739 0.008 0.656 0.336
#> SRR2105152 2 0.5431 0.73525 0.000 0.716 0.284
#> SRR2105149 1 0.8985 0.09546 0.544 0.292 0.164
#> SRR2105150 2 0.9394 -0.11792 0.268 0.508 0.224
#> SRR2105147 2 0.8374 0.11414 0.144 0.616 0.240
#> SRR2105148 2 0.8493 0.08266 0.148 0.604 0.248
#> SRR2105143 1 0.9385 -0.10550 0.484 0.188 0.328
#> SRR2105144 1 0.8434 -0.09465 0.496 0.088 0.416
#> SRR2105145 1 0.4288 0.60964 0.872 0.060 0.068
#> SRR2105146 1 0.4178 0.59594 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105141 2 0.3619 0.75422 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105142 2 0.4178 0.75403 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105139 2 0.5926 0.70842 0.000 0.644 0.356
#> SRR2105140 2 0.6143 0.72406 0.012 0.684 0.304
#> SRR2105137 2 0.8283 0.53181 0.084 0.536 0.380
#> SRR2105138 2 0.8631 0.37081 0.108 0.520 0.372
#> SRR2105135 2 0.4842 0.76115 0.000 0.776 0.224
#> SRR2105136 2 0.5497 0.73048 0.000 0.708 0.292
#> SRR2105133 1 0.9457 0.21960 0.484 0.204 0.312
#> SRR2105134 1 0.6081 0.61524 0.652 0.004 0.344
#> SRR2105131 2 0.7309 0.43831 0.168 0.708 0.124
#> SRR2105132 3 0.9953 0.35768 0.344 0.288 0.368
#> SRR2105129 1 0.7642 0.40597 0.660 0.092 0.248
#> SRR2105130 1 0.6994 0.32098 0.612 0.028 0.360
#> SRR2105127 1 0.4708 0.65252 0.844 0.036 0.120
#> SRR2105128 1 0.1877 0.64532 0.956 0.012 0.032
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.524 0.3074 0.232 0.016 0.728 0.024
#> SRR2105278 3 0.416 0.4289 0.224 0.000 0.768 0.008
#> SRR2105275 4 0.925 -0.2335 0.292 0.076 0.300 0.332
#> SRR2105276 3 0.582 0.2336 0.352 0.008 0.612 0.028
#> SRR2105273 3 0.453 0.4309 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR2105274 3 0.468 0.3958 0.316 0.000 0.680 0.004
#> SRR2105271 3 0.568 0.1794 0.376 0.004 0.596 0.024
#> SRR2105272 3 0.547 -0.1613 0.440 0.000 0.544 0.016
#> SRR2105269 4 0.436 0.4780 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105270 2 0.504 0.3569 0.000 0.628 0.008 0.364
#> SRR2105267 4 0.452 0.4632 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105268 2 0.458 0.2801 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105265 2 0.441 0.3021 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105266 2 0.448 0.4429 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105263 2 0.619 0.4900 0.088 0.684 0.012 0.216
#> SRR2105264 2 0.590 0.4425 0.132 0.712 0.004 0.152
#> SRR2105261 4 0.899 0.2437 0.140 0.176 0.192 0.492
#> SRR2105262 2 0.945 0.1347 0.220 0.424 0.196 0.160
#> SRR2105357 3 0.971 -0.0019 0.184 0.288 0.348 0.180
#> SRR2105358 3 0.447 0.4823 0.124 0.020 0.820 0.036
#> SRR2105439 2 0.508 0.0501 0.004 0.576 0.000 0.420
#> SRR2105440 4 0.660 0.1332 0.040 0.440 0.020 0.500
#> SRR2105509 4 0.443 0.4847 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR2105510 4 0.461 0.4898 0.000 0.264 0.012 0.724
#> SRR2105507 3 0.340 0.5218 0.164 0.000 0.832 0.004
#> SRR2105508 3 0.467 0.5226 0.184 0.012 0.780 0.024
#> SRR2105505 3 0.623 0.1794 0.328 0.024 0.616 0.032
#> SRR2105506 1 0.508 0.4038 0.576 0.004 0.420 0.000
#> SRR2105503 4 0.498 0.2140 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR2105504 4 0.487 0.2385 0.184 0.032 0.012 0.772
#> SRR2105501 2 0.730 0.3002 0.024 0.544 0.096 0.336
#> SRR2105502 4 0.486 0.2380 0.184 0.044 0.004 0.768
#> SRR2105499 3 0.436 0.5319 0.140 0.012 0.816 0.032
#> SRR2105500 3 0.503 0.5317 0.152 0.032 0.784 0.032
#> SRR2105497 2 0.483 0.3260 0.004 0.680 0.004 0.312
#> SRR2105498 2 0.583 0.4821 0.116 0.748 0.028 0.108
#> SRR2105495 4 0.494 0.2008 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105496 2 0.674 0.4190 0.048 0.624 0.044 0.284
#> SRR2105493 2 0.562 0.4653 0.020 0.676 0.020 0.284
#> SRR2105494 2 0.570 0.4727 0.008 0.700 0.056 0.236
#> SRR2105491 4 0.674 0.2271 0.080 0.408 0.004 0.508
#> SRR2105492 2 0.528 0.5247 0.052 0.752 0.012 0.184
#> SRR2105489 2 0.340 0.5416 0.000 0.840 0.008 0.152
#> SRR2105490 2 0.259 0.4988 0.048 0.912 0.000 0.040
#> SRR2105487 1 0.739 0.3851 0.580 0.024 0.264 0.132
#> SRR2105488 1 0.708 0.4607 0.508 0.056 0.404 0.032
#> SRR2105485 3 0.427 0.5377 0.116 0.028 0.832 0.024
#> SRR2105486 3 0.329 0.5191 0.120 0.004 0.864 0.012
#> SRR2105483 1 0.450 0.6500 0.784 0.028 0.184 0.004
#> SRR2105484 1 0.439 0.6485 0.776 0.024 0.200 0.000
#> SRR2105481 3 0.612 0.3660 0.308 0.036 0.636 0.020
#> SRR2105482 1 0.498 0.3080 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR2105479 1 0.908 0.2672 0.428 0.148 0.308 0.116
#> SRR2105480 1 0.531 0.3575 0.576 0.012 0.412 0.000
#> SRR2105477 2 0.579 0.4893 0.012 0.700 0.056 0.232
#> SRR2105478 2 0.670 0.0421 0.032 0.496 0.032 0.440
#> SRR2105475 4 0.509 0.2325 0.000 0.424 0.004 0.572
#> SRR2105476 4 0.466 0.3898 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105473 2 0.581 0.4587 0.076 0.732 0.020 0.172
#> SRR2105474 2 0.426 0.5065 0.052 0.848 0.040 0.060
#> SRR2105471 2 0.513 0.3120 0.012 0.632 0.000 0.356
#> SRR2105472 2 0.284 0.5146 0.020 0.892 0.000 0.088
#> SRR2105469 3 0.680 0.3898 0.292 0.028 0.612 0.068
#> SRR2105470 3 0.643 0.4800 0.252 0.020 0.656 0.072
#> SRR2105467 3 0.542 0.4549 0.232 0.032 0.720 0.016
#> SRR2105468 3 0.502 -0.0388 0.396 0.000 0.600 0.004
#> SRR2105465 1 0.913 0.2988 0.428 0.180 0.288 0.104
#> SRR2105466 1 0.607 0.6298 0.712 0.076 0.188 0.024
#> SRR2105463 1 0.495 0.6286 0.696 0.012 0.288 0.004
#> SRR2105464 1 0.457 0.6376 0.716 0.000 0.276 0.008
#> SRR2105461 2 0.499 0.0506 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105462 2 0.404 0.5016 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105459 4 0.407 0.4882 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR2105460 4 0.464 0.4485 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105457 3 0.654 0.3258 0.040 0.048 0.648 0.264
#> SRR2105458 3 0.679 0.3048 0.028 0.076 0.628 0.268
#> SRR2105455 3 0.630 0.3964 0.324 0.028 0.616 0.032
#> SRR2105456 3 0.482 0.3687 0.344 0.000 0.652 0.004
#> SRR2105453 1 0.509 0.6242 0.672 0.012 0.312 0.004
#> SRR2105454 1 0.558 0.5686 0.612 0.016 0.364 0.008
#> SRR2105451 2 0.823 0.2200 0.100 0.476 0.072 0.352
#> SRR2105452 4 0.568 0.2224 0.184 0.024 0.056 0.736
#> SRR2105449 1 0.828 0.2561 0.416 0.136 0.400 0.048
#> SRR2105450 3 0.487 0.3555 0.304 0.000 0.684 0.012
#> SRR2105447 4 0.535 0.3655 0.000 0.388 0.016 0.596
#> SRR2105448 4 0.470 0.4140 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105445 2 0.864 0.1147 0.048 0.396 0.192 0.364
#> SRR2105446 3 0.888 0.0428 0.240 0.340 0.368 0.052
#> SRR2105443 2 0.818 0.0198 0.024 0.412 0.184 0.380
#> SRR2105444 2 0.860 0.0523 0.064 0.404 0.148 0.384
#> SRR2105441 2 0.490 0.4085 0.008 0.660 0.000 0.332
#> SRR2105442 2 0.449 0.5262 0.048 0.828 0.024 0.100
#> SRR2105437 3 0.602 -0.1041 0.400 0.016 0.564 0.020
#> SRR2105438 1 0.621 0.3077 0.484 0.024 0.476 0.016
#> SRR2105435 3 0.549 0.5052 0.128 0.040 0.772 0.060
#> SRR2105436 3 0.354 0.4992 0.164 0.000 0.828 0.008
#> SRR2105433 3 0.500 0.3032 0.392 0.004 0.604 0.000
#> SRR2105434 1 0.448 0.5772 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR2105431 1 0.375 0.6482 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR2105432 1 0.391 0.6475 0.808 0.008 0.180 0.004
#> SRR2105429 2 0.902 0.0899 0.100 0.400 0.152 0.348
#> SRR2105430 4 0.700 0.3872 0.024 0.328 0.076 0.572
#> SRR2105427 4 0.438 0.4866 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105428 4 0.570 -0.0614 0.000 0.488 0.024 0.488
#> SRR2105425 4 0.506 0.3375 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR2105426 2 0.485 0.4148 0.004 0.676 0.004 0.316
#> SRR2105421 4 0.781 0.2529 0.072 0.092 0.268 0.568
#> SRR2105422 4 0.913 0.1229 0.136 0.128 0.328 0.408
#> SRR2105423 2 0.499 0.1448 0.004 0.608 0.000 0.388
#> SRR2105424 2 0.496 0.1162 0.004 0.616 0.000 0.380
#> SRR2105419 3 0.654 0.3582 0.264 0.024 0.644 0.068
#> SRR2105420 3 0.801 0.1910 0.364 0.084 0.484 0.068
#> SRR2105415 1 0.488 0.5532 0.664 0.008 0.328 0.000
#> SRR2105416 1 0.544 0.6544 0.720 0.028 0.232 0.020
#> SRR2105417 1 0.575 0.4476 0.532 0.000 0.440 0.028
#> SRR2105418 1 0.444 0.6560 0.764 0.020 0.216 0.000
#> SRR2105413 4 0.499 0.0419 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105414 4 0.477 0.4787 0.000 0.308 0.008 0.684
#> SRR2105409 2 0.349 0.5372 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105410 2 0.387 0.5366 0.008 0.832 0.016 0.144
#> SRR2105411 2 0.310 0.5419 0.004 0.856 0.000 0.140
#> SRR2105412 2 0.394 0.4928 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105407 3 0.367 0.5303 0.056 0.016 0.872 0.056
#> SRR2105408 3 0.614 0.4544 0.084 0.052 0.736 0.128
#> SRR2105403 3 0.392 0.5224 0.072 0.020 0.860 0.048
#> SRR2105404 3 0.414 0.4298 0.208 0.000 0.780 0.012
#> SRR2105405 3 0.582 0.4304 0.320 0.020 0.640 0.020
#> SRR2105406 1 0.735 0.4226 0.560 0.100 0.312 0.028
#> SRR2105401 4 0.458 0.4901 0.004 0.272 0.004 0.720
#> SRR2105402 4 0.535 0.2262 0.184 0.020 0.044 0.752
#> SRR2105399 4 0.662 0.2647 0.008 0.324 0.080 0.588
#> SRR2105400 4 0.660 0.4570 0.024 0.244 0.080 0.652
#> SRR2105397 4 0.769 0.3665 0.104 0.208 0.080 0.608
#> SRR2105398 4 0.741 0.3595 0.036 0.220 0.136 0.608
#> SRR2105395 4 0.500 0.0838 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105396 2 0.182 0.5208 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR2105393 2 0.387 0.5018 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105394 2 0.445 0.4368 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105389 3 0.249 0.5190 0.036 0.000 0.916 0.048
#> SRR2105390 3 0.233 0.5321 0.072 0.000 0.916 0.012
#> SRR2105391 3 0.425 0.4764 0.032 0.024 0.836 0.108
#> SRR2105392 3 0.363 0.4910 0.032 0.020 0.872 0.076
#> SRR2105385 3 0.448 0.4596 0.264 0.000 0.728 0.008
#> SRR2105386 3 0.423 0.4914 0.212 0.008 0.776 0.004
#> SRR2105387 1 0.612 0.5868 0.632 0.016 0.312 0.040
#> SRR2105388 3 0.515 0.3043 0.324 0.004 0.660 0.012
#> SRR2105381 4 0.729 0.2312 0.136 0.368 0.004 0.492
#> SRR2105382 2 0.528 0.2941 0.012 0.588 0.000 0.400
#> SRR2105383 2 0.682 0.4602 0.068 0.664 0.056 0.212
#> SRR2105384 2 0.700 0.4675 0.068 0.640 0.056 0.236
#> SRR2105379 4 0.516 0.3776 0.012 0.364 0.000 0.624
#> SRR2105380 4 0.774 0.2794 0.156 0.288 0.024 0.532
#> SRR2105377 2 0.521 0.2600 0.000 0.572 0.008 0.420
#> SRR2105378 2 0.561 0.4312 0.124 0.736 0.004 0.136
#> SRR2105375 4 0.953 -0.2350 0.284 0.108 0.288 0.320
#> SRR2105376 1 0.813 0.4913 0.540 0.124 0.268 0.068
#> SRR2105373 3 0.537 0.0690 0.412 0.004 0.576 0.008
#> SRR2105374 1 0.511 0.4022 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR2105371 3 0.309 0.5307 0.128 0.000 0.864 0.008
#> SRR2105372 3 0.223 0.5343 0.064 0.004 0.924 0.008
#> SRR2105369 3 0.283 0.5263 0.120 0.000 0.876 0.004
#> SRR2105370 3 0.465 0.4134 0.312 0.000 0.684 0.004
#> SRR2105367 1 0.863 0.4023 0.476 0.204 0.260 0.060
#> SRR2105368 1 0.742 0.4396 0.584 0.248 0.144 0.024
#> SRR2105365 2 0.589 0.2546 0.036 0.600 0.004 0.360
#> SRR2105366 4 0.491 0.4717 0.012 0.312 0.000 0.676
#> SRR2105363 2 0.516 -0.0859 0.000 0.520 0.004 0.476
#> SRR2105364 2 0.505 0.2761 0.000 0.588 0.004 0.408
#> SRR2105361 4 0.452 0.4649 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105362 4 0.508 0.3228 0.004 0.420 0.000 0.576
#> SRR2105359 3 0.608 0.4936 0.180 0.020 0.712 0.088
#> SRR2105360 3 0.416 0.5319 0.168 0.008 0.808 0.016
#> SRR2105355 3 0.844 0.2023 0.184 0.056 0.500 0.260
#> SRR2105356 3 0.430 0.4805 0.240 0.000 0.752 0.008
#> SRR2105353 3 0.544 0.4862 0.112 0.008 0.756 0.124
#> SRR2105354 3 0.360 0.5223 0.148 0.000 0.836 0.016
#> SRR2105351 2 0.490 0.1238 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105352 4 0.563 0.2257 0.184 0.028 0.048 0.740
#> SRR2105349 4 0.441 0.4662 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR2105350 2 0.433 0.4796 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105345 2 0.475 0.4817 0.016 0.716 0.000 0.268
#> SRR2105346 2 0.427 0.5205 0.024 0.788 0.000 0.188
#> SRR2105347 2 0.398 0.4399 0.092 0.848 0.052 0.008
#> SRR2105348 2 0.617 0.3438 0.216 0.696 0.032 0.056
#> SRR2105343 4 0.452 0.4742 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105344 2 0.475 0.3473 0.000 0.688 0.008 0.304
#> SRR2105341 3 0.363 0.5297 0.076 0.020 0.872 0.032
#> SRR2105342 3 0.394 0.5084 0.188 0.000 0.800 0.012
#> SRR2105339 3 0.577 0.5156 0.180 0.036 0.736 0.048
#> SRR2105340 3 0.566 0.4914 0.244 0.012 0.700 0.044
#> SRR2105335 3 0.442 0.3860 0.240 0.000 0.748 0.012
#> SRR2105336 1 0.520 0.5342 0.612 0.000 0.376 0.012
#> SRR2105337 3 0.509 0.4138 0.312 0.012 0.672 0.004
#> SRR2105338 3 0.485 0.3420 0.352 0.000 0.644 0.004
#> SRR2105331 4 0.492 0.3350 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR2105332 2 0.504 0.3409 0.008 0.628 0.000 0.364
#> SRR2105333 4 0.493 0.2021 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR2105334 4 0.504 0.3530 0.004 0.404 0.000 0.592
#> SRR2105329 4 0.585 0.4708 0.020 0.212 0.056 0.712
#> SRR2105330 2 0.863 0.2580 0.108 0.508 0.128 0.256
#> SRR2105327 4 0.568 0.2823 0.024 0.452 0.000 0.524
#> SRR2105328 2 0.468 0.3189 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105325 3 0.558 0.4609 0.220 0.016 0.720 0.044
#> SRR2105326 3 0.423 0.5054 0.144 0.016 0.820 0.020
#> SRR2105323 4 0.717 0.2027 0.020 0.088 0.356 0.536
#> SRR2105324 3 0.707 0.3711 0.224 0.032 0.632 0.112
#> SRR2105319 3 0.538 -0.1940 0.452 0.000 0.536 0.012
#> SRR2105320 1 0.508 0.5665 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR2105321 3 0.586 0.4181 0.340 0.008 0.620 0.032
#> SRR2105322 3 0.484 0.3759 0.348 0.000 0.648 0.004
#> SRR2105317 4 0.451 0.4772 0.000 0.288 0.004 0.708
#> SRR2105318 4 0.452 0.4607 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105315 4 0.805 0.0535 0.012 0.312 0.232 0.444
#> SRR2105316 4 0.597 0.4228 0.000 0.304 0.064 0.632
#> SRR2105313 4 0.498 0.0948 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105314 4 0.478 0.3779 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105311 3 0.903 0.1759 0.244 0.092 0.452 0.212
#> SRR2105312 3 0.922 0.0801 0.296 0.216 0.396 0.092
#> SRR2105307 1 0.738 0.5016 0.604 0.096 0.252 0.048
#> SRR2105308 1 0.610 0.5158 0.592 0.020 0.364 0.024
#> SRR2105309 3 0.768 0.2417 0.072 0.064 0.536 0.328
#> SRR2105310 3 0.300 0.5321 0.048 0.020 0.904 0.028
#> SRR2105305 3 0.532 0.4970 0.096 0.040 0.788 0.076
#> SRR2105306 3 0.374 0.5438 0.088 0.020 0.864 0.028
#> SRR2105303 2 0.497 0.1239 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105304 4 0.451 0.2430 0.184 0.036 0.000 0.780
#> SRR2105301 4 0.555 0.2303 0.008 0.440 0.008 0.544
#> SRR2105302 4 0.473 0.3710 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105299 2 0.840 0.2385 0.036 0.464 0.216 0.284
#> SRR2105300 2 0.821 0.2058 0.032 0.456 0.172 0.340
#> SRR2105297 2 0.592 0.1221 0.404 0.564 0.020 0.012
#> SRR2105298 2 0.682 -0.1385 0.432 0.496 0.048 0.024
#> SRR2105295 4 0.404 0.4873 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105296 4 0.496 0.2637 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR2105293 3 0.819 0.0349 0.368 0.024 0.420 0.188
#> SRR2105294 3 0.535 -0.0225 0.432 0.000 0.556 0.012
#> SRR2105291 3 0.756 0.3026 0.312 0.060 0.556 0.072
#> SRR2105292 1 0.522 0.6523 0.756 0.036 0.188 0.020
#> SRR2105289 3 0.708 0.3419 0.252 0.016 0.604 0.128
#> SRR2105290 3 0.497 0.0136 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR2105287 1 0.561 0.6457 0.684 0.032 0.272 0.012
#> SRR2105288 3 0.527 0.0189 0.456 0.000 0.536 0.008
#> SRR2105285 4 0.536 0.1526 0.000 0.436 0.012 0.552
#> SRR2105286 4 0.436 0.4747 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105283 2 0.852 0.2141 0.252 0.484 0.052 0.212
#> SRR2105284 2 0.780 0.3164 0.108 0.540 0.048 0.304
#> SRR2105281 4 0.499 0.2275 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105282 2 0.376 0.4932 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105259 3 0.592 0.4754 0.116 0.032 0.744 0.108
#> SRR2105260 3 0.812 0.3073 0.128 0.084 0.568 0.220
#> SRR2105279 2 0.317 0.5331 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105280 2 0.475 0.3433 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105257 1 0.514 0.3273 0.544 0.000 0.452 0.004
#> SRR2105258 1 0.387 0.6416 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105253 2 0.476 0.3270 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105254 2 0.492 0.2303 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR2105255 3 0.245 0.5279 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR2105256 3 0.261 0.5229 0.088 0.000 0.900 0.012
#> SRR2105251 2 0.228 0.5304 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105252 2 0.470 0.3603 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105249 2 0.441 0.4538 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105250 2 0.531 0.5056 0.044 0.732 0.008 0.216
#> SRR2105247 2 0.395 0.4997 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR2105248 2 0.422 0.4655 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105245 3 0.864 0.0103 0.324 0.144 0.456 0.076
#> SRR2105246 3 0.856 0.1687 0.164 0.296 0.476 0.064
#> SRR2105243 3 0.480 0.4094 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR2105244 3 0.677 0.3205 0.364 0.072 0.552 0.012
#> SRR2105241 3 0.428 0.4569 0.224 0.000 0.764 0.012
#> SRR2105242 3 0.510 0.2050 0.428 0.004 0.568 0.000
#> SRR2105239 3 0.591 0.1970 0.432 0.004 0.536 0.028
#> SRR2105240 3 0.513 0.1425 0.448 0.004 0.548 0.000
#> SRR2105237 4 0.591 0.4791 0.016 0.264 0.044 0.676
#> SRR2105238 4 0.567 0.4560 0.000 0.300 0.048 0.652
#> SRR2105235 4 0.470 0.4539 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105236 2 0.434 0.4713 0.004 0.732 0.000 0.264
#> SRR2105233 4 0.419 0.4841 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105234 4 0.401 0.4869 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR2105231 2 0.464 0.2765 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105232 2 0.499 -0.1359 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR2105227 4 0.892 0.1352 0.328 0.160 0.088 0.424
#> SRR2105228 2 0.991 0.0330 0.204 0.312 0.244 0.240
#> SRR2105225 1 0.564 0.4179 0.544 0.004 0.436 0.016
#> SRR2105226 1 0.495 0.2895 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR2105229 3 0.627 0.3619 0.048 0.032 0.672 0.248
#> SRR2105230 3 0.407 0.5333 0.088 0.008 0.844 0.060
#> SRR2105219 4 0.441 0.4660 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR2105220 4 0.497 0.1926 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR2105221 2 0.484 0.5228 0.044 0.812 0.040 0.104
#> SRR2105222 2 0.612 0.3848 0.200 0.704 0.024 0.072
#> SRR2105223 3 0.340 0.5149 0.128 0.004 0.856 0.012
#> SRR2105224 3 0.309 0.5154 0.128 0.000 0.864 0.008
#> SRR2105217 2 0.462 0.3790 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR2105218 2 0.460 0.2721 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105215 2 0.492 0.1749 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105216 2 0.344 0.5200 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105213 3 0.925 0.0951 0.332 0.156 0.388 0.124
#> SRR2105214 3 0.772 0.3601 0.104 0.076 0.600 0.220
#> SRR2105211 3 0.746 0.3295 0.064 0.108 0.624 0.204
#> SRR2105212 3 0.668 0.4827 0.144 0.080 0.700 0.076
#> SRR2105209 3 0.532 0.3415 0.356 0.008 0.628 0.008
#> SRR2105210 1 0.416 0.6183 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105207 1 0.730 0.5485 0.628 0.112 0.212 0.048
#> SRR2105208 1 0.478 0.6506 0.776 0.044 0.176 0.004
#> SRR2105205 4 0.671 0.1362 0.052 0.440 0.016 0.492
#> SRR2105206 2 0.603 0.4477 0.048 0.652 0.012 0.288
#> SRR2105201 2 0.400 0.5406 0.028 0.840 0.012 0.120
#> SRR2105202 2 0.573 0.4976 0.028 0.700 0.028 0.244
#> SRR2105203 4 0.488 0.3523 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105204 2 0.470 0.2432 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105199 2 0.499 -0.0196 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105200 2 0.536 0.4964 0.052 0.724 0.004 0.220
#> SRR2105197 3 0.523 0.4287 0.176 0.008 0.756 0.060
#> SRR2105198 3 0.907 0.0976 0.136 0.120 0.408 0.336
#> SRR2105195 3 0.996 -0.0566 0.216 0.240 0.288 0.256
#> SRR2105196 1 0.869 0.1075 0.328 0.320 0.320 0.032
#> SRR2105193 1 0.545 0.5023 0.620 0.012 0.360 0.008
#> SRR2105194 1 0.458 0.6033 0.696 0.004 0.300 0.000
#> SRR2105191 3 0.622 0.4332 0.308 0.036 0.632 0.024
#> SRR2105192 3 0.522 -0.0890 0.424 0.000 0.568 0.008
#> SRR2105189 2 0.757 0.1304 0.056 0.472 0.060 0.412
#> SRR2105190 2 0.513 0.3112 0.008 0.604 0.000 0.388
#> SRR2105187 4 0.581 0.4449 0.024 0.300 0.020 0.656
#> SRR2105188 2 0.857 0.2514 0.200 0.488 0.060 0.252
#> SRR2105179 3 0.638 0.4220 0.288 0.068 0.632 0.012
#> SRR2105180 1 0.607 0.3970 0.508 0.028 0.456 0.008
#> SRR2105183 2 0.331 0.5245 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105184 2 0.580 0.4141 0.084 0.704 0.004 0.208
#> SRR2105185 4 0.473 0.4248 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105186 2 0.539 0.4992 0.056 0.708 0.000 0.236
#> SRR2105181 3 0.734 0.3209 0.140 0.076 0.652 0.132
#> SRR2105182 3 0.293 0.5193 0.108 0.000 0.880 0.012
#> SRR2105177 1 0.547 0.6552 0.728 0.068 0.200 0.004
#> SRR2105178 1 0.497 0.6561 0.752 0.040 0.204 0.004
#> SRR2105171 4 0.468 0.4177 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105172 2 0.468 0.3040 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105175 1 0.625 0.5817 0.696 0.132 0.160 0.012
#> SRR2105176 1 0.483 0.6145 0.680 0.004 0.312 0.004
#> SRR2105173 2 0.511 0.1852 0.004 0.560 0.000 0.436
#> SRR2105174 2 0.416 0.4706 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR2105169 2 0.483 0.2800 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105170 2 0.496 0.4169 0.136 0.792 0.052 0.020
#> SRR2105167 2 0.322 0.5280 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105168 2 0.305 0.5102 0.004 0.860 0.000 0.136
#> SRR2105165 3 0.459 0.4622 0.280 0.000 0.712 0.008
#> SRR2105166 3 0.499 0.0929 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105163 4 0.971 -0.1000 0.288 0.140 0.256 0.316
#> SRR2105164 3 0.645 0.4121 0.340 0.024 0.596 0.040
#> SRR2105161 1 0.628 0.5539 0.648 0.012 0.272 0.068
#> SRR2105162 1 0.446 0.6461 0.808 0.040 0.144 0.008
#> SRR2105155 2 0.487 0.3023 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105156 2 0.259 0.5277 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105157 2 0.478 0.1512 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105158 2 0.373 0.4780 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105159 1 0.778 0.3610 0.564 0.032 0.192 0.212
#> SRR2105160 1 0.663 0.6225 0.656 0.044 0.244 0.056
#> SRR2105153 4 0.514 0.3023 0.004 0.452 0.000 0.544
#> SRR2105154 4 0.495 0.3098 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR2105151 2 0.383 0.5265 0.000 0.792 0.004 0.204
#> SRR2105152 2 0.349 0.5051 0.004 0.824 0.000 0.172
#> SRR2105149 3 0.727 0.3931 0.096 0.056 0.632 0.216
#> SRR2105150 3 0.751 -0.2562 0.004 0.156 0.420 0.420
#> SRR2105147 4 0.686 0.1435 0.276 0.000 0.144 0.580
#> SRR2105148 4 0.691 0.1409 0.272 0.000 0.152 0.576
#> SRR2105143 1 0.890 0.3623 0.456 0.100 0.292 0.152
#> SRR2105144 1 0.810 0.4395 0.556 0.208 0.180 0.056
#> SRR2105145 3 0.690 0.2420 0.372 0.072 0.540 0.016
#> SRR2105146 1 0.499 0.1657 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR2105141 4 0.499 0.0546 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105142 2 0.497 0.1525 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105139 2 0.292 0.5347 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105140 2 0.458 0.5200 0.004 0.756 0.016 0.224
#> SRR2105137 2 0.613 0.5015 0.076 0.712 0.028 0.184
#> SRR2105138 2 0.825 0.3436 0.176 0.524 0.052 0.248
#> SRR2105135 2 0.478 0.2916 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105136 2 0.412 0.3956 0.004 0.760 0.000 0.236
#> SRR2105133 3 0.698 0.3347 0.128 0.096 0.684 0.092
#> SRR2105134 3 0.538 0.0247 0.348 0.004 0.632 0.016
#> SRR2105131 4 0.798 0.3281 0.092 0.204 0.116 0.588
#> SRR2105132 3 0.913 -0.1842 0.336 0.068 0.336 0.260
#> SRR2105129 1 0.724 0.5425 0.564 0.052 0.328 0.056
#> SRR2105130 1 0.506 0.6563 0.752 0.048 0.196 0.004
#> SRR2105127 3 0.619 0.2935 0.364 0.028 0.588 0.020
#> SRR2105128 3 0.517 0.3906 0.328 0.012 0.656 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.6170 0.3439 0.260 0.024 0.628 0.068 0.020
#> SRR2105278 3 0.5462 0.4221 0.316 0.000 0.612 0.064 0.008
#> SRR2105275 2 0.8100 -0.1606 0.268 0.360 0.308 0.032 0.032
#> SRR2105276 3 0.5799 0.2613 0.364 0.020 0.572 0.020 0.024
#> SRR2105273 3 0.4270 0.4684 0.336 0.004 0.656 0.004 0.000
#> SRR2105274 3 0.4644 0.4106 0.380 0.000 0.604 0.012 0.004
#> SRR2105271 3 0.5790 0.1863 0.412 0.012 0.528 0.032 0.016
#> SRR2105272 3 0.5320 -0.0911 0.464 0.004 0.500 0.020 0.012
#> SRR2105269 2 0.2020 0.5079 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR2105270 5 0.4302 0.2466 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR2105267 2 0.2674 0.4972 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR2105268 2 0.4451 -0.0344 0.000 0.504 0.000 0.004 0.492
#> SRR2105265 5 0.4288 0.2619 0.000 0.384 0.000 0.004 0.612
#> SRR2105266 5 0.4249 0.3163 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR2105263 5 0.5681 0.4435 0.084 0.336 0.000 0.004 0.576
#> SRR2105264 5 0.5490 0.4439 0.128 0.228 0.000 0.000 0.644
#> SRR2105261 2 0.6893 0.3258 0.112 0.632 0.168 0.040 0.048
#> SRR2105262 5 0.8716 0.0745 0.228 0.248 0.168 0.012 0.344
#> SRR2105357 3 0.9507 -0.0836 0.180 0.236 0.276 0.068 0.240
#> SRR2105358 3 0.4653 0.5296 0.136 0.008 0.776 0.064 0.016
#> SRR2105439 2 0.4403 0.0568 0.004 0.560 0.000 0.000 0.436
#> SRR2105440 2 0.4984 0.2053 0.028 0.620 0.008 0.000 0.344
#> SRR2105509 2 0.2074 0.5074 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR2105510 2 0.1697 0.5048 0.000 0.932 0.008 0.000 0.060
#> SRR2105507 3 0.3968 0.5707 0.204 0.000 0.768 0.024 0.004
#> SRR2105508 3 0.4140 0.5689 0.200 0.008 0.764 0.028 0.000
#> SRR2105505 3 0.6944 0.1185 0.416 0.036 0.452 0.076 0.020
#> SRR2105506 1 0.3934 0.4700 0.716 0.000 0.276 0.008 0.000
#> SRR2105503 2 0.4370 0.2833 0.004 0.656 0.000 0.008 0.332
#> SRR2105504 4 0.1544 0.9084 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR2105501 2 0.6268 -0.0950 0.024 0.480 0.080 0.000 0.416
#> SRR2105502 4 0.1851 0.8933 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105499 3 0.5263 0.5723 0.192 0.028 0.716 0.060 0.004
#> SRR2105500 3 0.5228 0.5660 0.216 0.024 0.712 0.024 0.024
#> SRR2105497 5 0.4630 0.2763 0.016 0.396 0.000 0.000 0.588
#> SRR2105498 5 0.5557 0.4861 0.112 0.188 0.012 0.004 0.684
#> SRR2105495 2 0.3661 0.3354 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR2105496 5 0.6586 0.2533 0.064 0.400 0.040 0.008 0.488
#> SRR2105493 5 0.4937 0.3907 0.024 0.392 0.004 0.000 0.580
#> SRR2105494 5 0.5568 0.4067 0.004 0.320 0.068 0.004 0.604
#> SRR2105491 2 0.5819 0.3621 0.080 0.628 0.004 0.016 0.272
#> SRR2105492 5 0.5028 0.5089 0.072 0.260 0.000 0.000 0.668
#> SRR2105489 5 0.3274 0.5400 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR2105490 5 0.2144 0.5192 0.020 0.068 0.000 0.000 0.912
#> SRR2105487 1 0.6085 0.3990 0.644 0.080 0.236 0.028 0.012
#> SRR2105488 1 0.5642 0.4413 0.632 0.008 0.292 0.016 0.052
#> SRR2105485 3 0.5081 0.5795 0.168 0.016 0.744 0.052 0.020
#> SRR2105486 3 0.4981 0.5601 0.180 0.004 0.732 0.072 0.012
#> SRR2105483 1 0.1117 0.6030 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR2105484 1 0.1525 0.6055 0.948 0.000 0.036 0.004 0.012
#> SRR2105481 3 0.5204 0.4438 0.300 0.016 0.652 0.012 0.020
#> SRR2105482 1 0.4299 0.3165 0.608 0.000 0.388 0.004 0.000
#> SRR2105479 1 0.7821 0.2867 0.500 0.140 0.224 0.008 0.128
#> SRR2105480 1 0.4081 0.3835 0.696 0.000 0.296 0.004 0.004
#> SRR2105477 5 0.5817 0.4262 0.008 0.288 0.080 0.008 0.616
#> SRR2105478 2 0.6227 0.1863 0.044 0.548 0.040 0.008 0.360
#> SRR2105475 2 0.3989 0.3806 0.000 0.728 0.004 0.008 0.260
#> SRR2105476 2 0.2843 0.4808 0.000 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR2105473 5 0.5187 0.4416 0.076 0.252 0.004 0.000 0.668
#> SRR2105474 5 0.3953 0.5430 0.060 0.148 0.000 0.000 0.792
#> SRR2105471 5 0.4723 0.2329 0.016 0.448 0.000 0.000 0.536
#> SRR2105472 5 0.3099 0.5191 0.028 0.124 0.000 0.000 0.848
#> SRR2105469 3 0.6233 0.4535 0.296 0.048 0.600 0.044 0.012
#> SRR2105470 3 0.4893 0.5322 0.268 0.028 0.688 0.008 0.008
#> SRR2105467 3 0.5052 0.5195 0.228 0.004 0.704 0.052 0.012
#> SRR2105468 1 0.5237 0.0979 0.488 0.000 0.468 0.044 0.000
#> SRR2105465 1 0.7688 0.3269 0.516 0.128 0.188 0.004 0.164
#> SRR2105466 1 0.3135 0.6015 0.876 0.012 0.044 0.004 0.064
#> SRR2105463 1 0.3320 0.6055 0.828 0.000 0.152 0.008 0.012
#> SRR2105464 1 0.2968 0.6118 0.864 0.000 0.112 0.012 0.012
#> SRR2105461 2 0.4138 0.1505 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105462 5 0.4101 0.4600 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR2105459 2 0.1408 0.5057 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105460 2 0.2843 0.4896 0.000 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR2105457 3 0.6042 0.3930 0.028 0.244 0.648 0.060 0.020
#> SRR2105458 3 0.6683 0.3375 0.020 0.280 0.584 0.072 0.044
#> SRR2105455 3 0.5930 0.3997 0.388 0.024 0.544 0.016 0.028
#> SRR2105456 3 0.4610 0.3517 0.432 0.000 0.556 0.012 0.000
#> SRR2105453 1 0.3412 0.5983 0.812 0.000 0.172 0.008 0.008
#> SRR2105454 1 0.4305 0.5582 0.768 0.000 0.176 0.048 0.008
#> SRR2105451 2 0.7198 -0.0219 0.100 0.476 0.084 0.000 0.340
#> SRR2105452 4 0.1626 0.9142 0.000 0.044 0.016 0.940 0.000
#> SRR2105449 1 0.7397 0.2953 0.492 0.032 0.316 0.028 0.132
#> SRR2105450 3 0.4880 0.3566 0.356 0.000 0.616 0.012 0.016
#> SRR2105447 2 0.3875 0.4358 0.000 0.756 0.012 0.004 0.228
#> SRR2105448 2 0.3039 0.4614 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105445 2 0.8231 0.0250 0.048 0.420 0.192 0.044 0.296
#> SRR2105446 5 0.8797 -0.1243 0.232 0.080 0.312 0.048 0.328
#> SRR2105443 2 0.7171 0.1819 0.016 0.508 0.184 0.020 0.272
#> SRR2105444 2 0.7062 0.1562 0.056 0.516 0.140 0.000 0.288
#> SRR2105441 5 0.4560 0.2265 0.008 0.484 0.000 0.000 0.508
#> SRR2105442 5 0.4065 0.5445 0.048 0.180 0.000 0.000 0.772
#> SRR2105437 3 0.5529 -0.0723 0.444 0.004 0.508 0.012 0.032
#> SRR2105438 1 0.5496 0.2848 0.548 0.000 0.400 0.020 0.032
#> SRR2105435 3 0.4976 0.5654 0.128 0.036 0.772 0.024 0.040
#> SRR2105436 3 0.3583 0.5579 0.168 0.000 0.808 0.016 0.008
#> SRR2105433 3 0.4304 0.2613 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.2930 0.5723 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000
#> SRR2105431 1 0.0703 0.6078 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0771 0.6057 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105429 2 0.7833 0.0951 0.080 0.460 0.180 0.008 0.272
#> SRR2105430 2 0.6032 0.4227 0.020 0.676 0.116 0.020 0.168
#> SRR2105427 2 0.2338 0.5063 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR2105428 2 0.4558 0.1974 0.000 0.652 0.024 0.000 0.324
#> SRR2105425 2 0.3861 0.4058 0.000 0.728 0.008 0.000 0.264
#> SRR2105426 5 0.4410 0.2719 0.004 0.440 0.000 0.000 0.556
#> SRR2105421 2 0.5734 0.3275 0.044 0.672 0.212 0.072 0.000
#> SRR2105422 2 0.7183 0.0593 0.124 0.476 0.352 0.016 0.032
#> SRR2105423 5 0.4307 0.0455 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR2105424 5 0.4306 0.0218 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR2105419 3 0.6764 0.3561 0.300 0.076 0.560 0.052 0.012
#> SRR2105420 1 0.6970 -0.1986 0.432 0.076 0.428 0.008 0.056
#> SRR2105415 1 0.3048 0.5640 0.820 0.000 0.176 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.2457 0.6113 0.900 0.008 0.076 0.000 0.016
#> SRR2105417 1 0.5535 0.4596 0.632 0.028 0.304 0.028 0.008
#> SRR2105418 1 0.2131 0.6140 0.920 0.000 0.056 0.008 0.016
#> SRR2105413 2 0.3932 0.1978 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105414 2 0.2989 0.5004 0.000 0.852 0.008 0.008 0.132
#> SRR2105409 5 0.3662 0.5357 0.000 0.252 0.004 0.000 0.744
#> SRR2105410 5 0.3595 0.5392 0.004 0.188 0.008 0.004 0.796
#> SRR2105411 5 0.3336 0.5486 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR2105412 5 0.4151 0.4466 0.000 0.344 0.000 0.004 0.652
#> SRR2105407 3 0.4304 0.5734 0.060 0.032 0.824 0.064 0.020
#> SRR2105408 3 0.5036 0.5470 0.056 0.072 0.784 0.060 0.028
#> SRR2105403 3 0.4185 0.5750 0.068 0.032 0.820 0.076 0.004
#> SRR2105404 3 0.5323 0.4461 0.276 0.000 0.644 0.076 0.004
#> SRR2105405 3 0.5068 0.4381 0.368 0.012 0.600 0.004 0.016
#> SRR2105406 1 0.6134 0.4227 0.596 0.024 0.300 0.008 0.072
#> SRR2105401 2 0.2162 0.5092 0.000 0.916 0.008 0.012 0.064
#> SRR2105402 4 0.1522 0.9135 0.000 0.044 0.012 0.944 0.000
#> SRR2105399 2 0.7000 0.3103 0.000 0.568 0.072 0.164 0.196
#> SRR2105400 2 0.4903 0.4712 0.004 0.772 0.044 0.108 0.072
#> SRR2105397 2 0.6003 0.4121 0.104 0.700 0.108 0.008 0.080
#> SRR2105398 2 0.5557 0.3868 0.024 0.708 0.184 0.016 0.068
#> SRR2105395 2 0.4166 0.2786 0.000 0.648 0.000 0.004 0.348
#> SRR2105396 5 0.2583 0.5375 0.000 0.132 0.004 0.000 0.864
#> SRR2105393 5 0.3913 0.4637 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR2105394 5 0.4403 0.4038 0.000 0.384 0.000 0.008 0.608
#> SRR2105389 3 0.3012 0.5622 0.040 0.004 0.880 0.068 0.008
#> SRR2105390 3 0.2568 0.5810 0.064 0.000 0.900 0.024 0.012
#> SRR2105391 3 0.3736 0.5643 0.024 0.044 0.848 0.076 0.008
#> SRR2105392 3 0.2964 0.5571 0.032 0.004 0.884 0.068 0.012
#> SRR2105385 3 0.4526 0.5059 0.300 0.000 0.672 0.028 0.000
#> SRR2105386 3 0.4397 0.5146 0.268 0.004 0.708 0.016 0.004
#> SRR2105387 1 0.4603 0.5718 0.772 0.016 0.164 0.028 0.020
#> SRR2105388 3 0.4902 0.2711 0.396 0.000 0.580 0.012 0.012
#> SRR2105381 2 0.6146 0.3379 0.132 0.608 0.012 0.004 0.244
#> SRR2105382 2 0.4688 -0.0861 0.008 0.532 0.000 0.004 0.456
#> SRR2105383 5 0.5607 0.4618 0.080 0.300 0.008 0.000 0.612
#> SRR2105384 5 0.5433 0.4940 0.032 0.308 0.024 0.004 0.632
#> SRR2105379 2 0.3282 0.4518 0.008 0.804 0.000 0.000 0.188
#> SRR2105380 2 0.5690 0.3968 0.148 0.676 0.012 0.004 0.160
#> SRR2105377 2 0.4504 -0.0601 0.000 0.564 0.008 0.000 0.428
#> SRR2105378 5 0.5379 0.4219 0.116 0.208 0.004 0.000 0.672
#> SRR2105375 2 0.8506 -0.2070 0.296 0.324 0.284 0.032 0.064
#> SRR2105376 1 0.6842 0.4546 0.608 0.048 0.196 0.016 0.132
#> SRR2105373 1 0.5255 -0.0286 0.492 0.008 0.476 0.016 0.008
#> SRR2105374 1 0.4127 0.4368 0.680 0.000 0.312 0.000 0.008
#> SRR2105371 3 0.2646 0.5846 0.124 0.000 0.868 0.004 0.004
#> SRR2105372 3 0.2511 0.5926 0.080 0.000 0.892 0.028 0.000
#> SRR2105369 3 0.3975 0.5759 0.144 0.000 0.792 0.064 0.000
#> SRR2105370 3 0.4327 0.4332 0.360 0.000 0.632 0.008 0.000
#> SRR2105367 1 0.7001 0.4538 0.584 0.048 0.168 0.012 0.188
#> SRR2105368 1 0.4766 0.4620 0.708 0.020 0.028 0.000 0.244
#> SRR2105365 2 0.5259 -0.0437 0.036 0.484 0.000 0.004 0.476
#> SRR2105366 2 0.3107 0.5029 0.016 0.852 0.000 0.008 0.124
#> SRR2105363 2 0.4114 0.1943 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105364 2 0.4645 -0.0407 0.000 0.564 0.008 0.004 0.424
#> SRR2105361 2 0.3013 0.4826 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR2105362 2 0.3676 0.4062 0.004 0.760 0.000 0.004 0.232
#> SRR2105359 3 0.5348 0.5741 0.176 0.040 0.724 0.052 0.008
#> SRR2105360 3 0.4002 0.5925 0.160 0.016 0.800 0.012 0.012
#> SRR2105355 3 0.8019 0.2257 0.196 0.260 0.452 0.076 0.016
#> SRR2105356 3 0.5171 0.5266 0.280 0.012 0.664 0.040 0.004
#> SRR2105353 3 0.3847 0.5634 0.108 0.036 0.832 0.012 0.012
#> SRR2105354 3 0.3001 0.5741 0.144 0.000 0.844 0.008 0.004
#> SRR2105351 2 0.4434 0.0449 0.000 0.536 0.000 0.004 0.460
#> SRR2105352 4 0.1626 0.9142 0.000 0.044 0.016 0.940 0.000
#> SRR2105349 2 0.2513 0.4982 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR2105350 5 0.4126 0.4345 0.000 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR2105345 5 0.4354 0.4167 0.008 0.368 0.000 0.000 0.624
#> SRR2105346 5 0.3838 0.5011 0.004 0.280 0.000 0.000 0.716
#> SRR2105347 5 0.3481 0.5054 0.100 0.056 0.004 0.000 0.840
#> SRR2105348 5 0.5111 0.3879 0.224 0.084 0.004 0.000 0.688
#> SRR2105343 2 0.2488 0.4941 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR2105344 5 0.4341 0.2790 0.000 0.404 0.004 0.000 0.592
#> SRR2105341 3 0.3325 0.5871 0.080 0.008 0.856 0.056 0.000
#> SRR2105342 3 0.4588 0.5499 0.220 0.000 0.720 0.060 0.000
#> SRR2105339 3 0.6376 0.5439 0.220 0.040 0.648 0.044 0.048
#> SRR2105340 3 0.5008 0.5406 0.236 0.024 0.708 0.012 0.020
#> SRR2105335 3 0.3962 0.4528 0.240 0.000 0.744 0.012 0.004
#> SRR2105336 1 0.4536 0.5221 0.704 0.000 0.264 0.020 0.012
#> SRR2105337 3 0.5347 0.3927 0.400 0.000 0.556 0.020 0.024
#> SRR2105338 3 0.4745 0.3325 0.424 0.000 0.560 0.004 0.012
#> SRR2105331 2 0.3561 0.4277 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR2105332 2 0.4659 -0.1323 0.012 0.500 0.000 0.000 0.488
#> SRR2105333 2 0.3885 0.3589 0.000 0.724 0.000 0.008 0.268
#> SRR2105334 2 0.3585 0.4403 0.004 0.772 0.000 0.004 0.220
#> SRR2105329 2 0.2924 0.5036 0.024 0.892 0.044 0.004 0.036
#> SRR2105330 5 0.7894 0.1380 0.104 0.352 0.128 0.008 0.408
#> SRR2105327 2 0.4421 0.4078 0.024 0.704 0.000 0.004 0.268
#> SRR2105328 5 0.4443 0.1332 0.000 0.472 0.000 0.004 0.524
#> SRR2105325 3 0.5360 0.5043 0.224 0.024 0.700 0.020 0.032
#> SRR2105326 3 0.3734 0.5459 0.128 0.000 0.824 0.020 0.028
#> SRR2105323 2 0.6890 0.2266 0.032 0.528 0.324 0.100 0.016
#> SRR2105324 3 0.7487 0.4115 0.236 0.104 0.556 0.068 0.036
#> SRR2105319 1 0.5177 0.1776 0.500 0.000 0.468 0.020 0.012
#> SRR2105320 1 0.4065 0.5427 0.760 0.000 0.212 0.020 0.008
#> SRR2105321 3 0.4804 0.4775 0.348 0.024 0.624 0.004 0.000
#> SRR2105322 3 0.4288 0.4343 0.384 0.000 0.612 0.004 0.000
#> SRR2105317 2 0.1792 0.4992 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105318 2 0.2516 0.4970 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105315 2 0.6744 0.2239 0.024 0.580 0.228 0.012 0.156
#> SRR2105316 2 0.3464 0.4920 0.000 0.836 0.068 0.000 0.096
#> SRR2105313 2 0.4029 0.2931 0.000 0.680 0.004 0.000 0.316
#> SRR2105314 2 0.3242 0.4100 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR2105311 3 0.8021 0.1870 0.240 0.232 0.444 0.016 0.068
#> SRR2105312 3 0.8277 0.0899 0.320 0.100 0.356 0.008 0.216
#> SRR2105307 1 0.6087 0.5058 0.680 0.024 0.160 0.024 0.112
#> SRR2105308 1 0.4915 0.5330 0.720 0.028 0.224 0.012 0.016
#> SRR2105309 3 0.7027 0.3001 0.052 0.316 0.536 0.072 0.024
#> SRR2105310 3 0.2825 0.5834 0.048 0.000 0.892 0.040 0.020
#> SRR2105305 3 0.3646 0.5769 0.068 0.012 0.852 0.056 0.012
#> SRR2105306 3 0.3086 0.5936 0.092 0.000 0.864 0.040 0.004
#> SRR2105303 2 0.4201 0.1041 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR2105304 4 0.1908 0.8881 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR2105301 2 0.4241 0.4023 0.004 0.708 0.004 0.008 0.276
#> SRR2105302 2 0.3421 0.4700 0.000 0.788 0.000 0.008 0.204
#> SRR2105299 5 0.7598 0.1180 0.036 0.368 0.212 0.008 0.376
#> SRR2105300 2 0.7849 -0.0489 0.036 0.392 0.196 0.024 0.352
#> SRR2105297 5 0.5155 0.1987 0.428 0.032 0.004 0.000 0.536
#> SRR2105298 5 0.5193 0.0156 0.472 0.024 0.004 0.004 0.496
#> SRR2105295 2 0.0703 0.5033 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105296 2 0.3452 0.4225 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR2105293 1 0.7412 -0.0620 0.400 0.160 0.396 0.016 0.028
#> SRR2105294 1 0.5083 0.0404 0.496 0.000 0.476 0.020 0.008
#> SRR2105291 3 0.6797 0.2913 0.360 0.068 0.504 0.004 0.064
#> SRR2105292 1 0.2522 0.6134 0.896 0.004 0.076 0.000 0.024
#> SRR2105289 3 0.6376 0.3868 0.252 0.124 0.596 0.024 0.004
#> SRR2105290 1 0.4430 0.0314 0.540 0.000 0.456 0.004 0.000
#> SRR2105287 1 0.4234 0.6055 0.788 0.004 0.160 0.028 0.020
#> SRR2105288 1 0.4976 0.1073 0.568 0.008 0.408 0.012 0.004
#> SRR2105285 2 0.4064 0.3285 0.000 0.716 0.008 0.004 0.272
#> SRR2105286 2 0.2068 0.5044 0.000 0.904 0.004 0.000 0.092
#> SRR2105283 5 0.7431 0.1346 0.272 0.316 0.032 0.000 0.380
#> SRR2105284 2 0.6857 -0.1195 0.108 0.452 0.044 0.000 0.396
#> SRR2105281 2 0.3752 0.3574 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105282 5 0.4074 0.3772 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR2105259 3 0.5227 0.5606 0.080 0.060 0.768 0.072 0.020
#> SRR2105260 3 0.7744 0.3561 0.100 0.228 0.544 0.080 0.048
#> SRR2105279 5 0.3242 0.5350 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR2105280 5 0.4440 0.2521 0.000 0.468 0.000 0.004 0.528
#> SRR2105257 1 0.4451 0.3618 0.644 0.000 0.340 0.016 0.000
#> SRR2105258 1 0.1478 0.6118 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR2105253 5 0.4561 0.1559 0.000 0.488 0.000 0.008 0.504
#> SRR2105254 2 0.4522 -0.0203 0.000 0.552 0.000 0.008 0.440
#> SRR2105255 3 0.3523 0.5862 0.120 0.000 0.832 0.044 0.004
#> SRR2105256 3 0.3056 0.5757 0.112 0.000 0.860 0.020 0.008
#> SRR2105251 5 0.2536 0.5445 0.000 0.128 0.000 0.004 0.868
#> SRR2105252 5 0.4273 0.2571 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR2105249 5 0.4227 0.3786 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR2105250 5 0.4338 0.4973 0.024 0.280 0.000 0.000 0.696
#> SRR2105247 5 0.3990 0.4724 0.000 0.308 0.004 0.000 0.688
#> SRR2105248 5 0.4060 0.4444 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR2105245 3 0.7958 0.0259 0.364 0.104 0.404 0.016 0.112
#> SRR2105246 3 0.7872 0.2193 0.144 0.080 0.480 0.020 0.276
#> SRR2105243 3 0.4717 0.3953 0.356 0.004 0.624 0.012 0.004
#> SRR2105244 3 0.6211 0.3072 0.420 0.004 0.484 0.016 0.076
#> SRR2105241 3 0.4469 0.4867 0.268 0.000 0.704 0.016 0.012
#> SRR2105242 1 0.4306 -0.1878 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.5440 -0.1745 0.500 0.032 0.456 0.004 0.008
#> SRR2105240 1 0.4410 -0.0528 0.556 0.000 0.440 0.000 0.004
#> SRR2105237 2 0.4182 0.5047 0.016 0.816 0.068 0.008 0.092
#> SRR2105238 2 0.3995 0.4812 0.000 0.788 0.060 0.000 0.152
#> SRR2105235 2 0.3003 0.4916 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR2105236 5 0.4298 0.4300 0.000 0.352 0.000 0.008 0.640
#> SRR2105233 2 0.2136 0.5044 0.000 0.904 0.000 0.008 0.088
#> SRR2105234 2 0.1331 0.5026 0.000 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR2105231 5 0.4434 0.1668 0.000 0.460 0.000 0.004 0.536
#> SRR2105232 2 0.4114 0.2497 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105227 2 0.7148 0.1925 0.348 0.484 0.076 0.004 0.088
#> SRR2105228 2 0.8890 0.0149 0.196 0.316 0.228 0.016 0.244
#> SRR2105225 1 0.4982 0.4205 0.636 0.008 0.324 0.032 0.000
#> SRR2105226 1 0.4313 0.2820 0.636 0.000 0.356 0.008 0.000
#> SRR2105229 3 0.5429 0.4370 0.044 0.184 0.720 0.020 0.032
#> SRR2105230 3 0.3134 0.5769 0.056 0.016 0.884 0.024 0.020
#> SRR2105219 2 0.2127 0.4997 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR2105220 2 0.3661 0.3460 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR2105221 5 0.4964 0.5201 0.040 0.196 0.036 0.000 0.728
#> SRR2105222 5 0.5243 0.4451 0.208 0.104 0.000 0.004 0.684
#> SRR2105223 3 0.4118 0.5512 0.188 0.000 0.772 0.032 0.008
#> SRR2105224 3 0.4160 0.5656 0.184 0.000 0.772 0.036 0.008
#> SRR2105217 5 0.4262 0.2369 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR2105218 5 0.4291 0.1304 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR2105215 2 0.4262 0.0261 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR2105216 5 0.3949 0.4913 0.000 0.300 0.000 0.004 0.696
#> SRR2105213 3 0.8713 0.1182 0.320 0.176 0.360 0.040 0.104
#> SRR2105214 3 0.6498 0.4038 0.072 0.256 0.612 0.040 0.020
#> SRR2105211 3 0.7145 0.3723 0.052 0.236 0.588 0.052 0.072
#> SRR2105212 3 0.6345 0.5177 0.176 0.092 0.664 0.020 0.048
#> SRR2105209 3 0.5437 0.3535 0.412 0.004 0.544 0.020 0.020
#> SRR2105210 1 0.2563 0.5983 0.872 0.000 0.120 0.008 0.000
#> SRR2105207 1 0.5421 0.5554 0.736 0.028 0.144 0.020 0.072
#> SRR2105208 1 0.1372 0.6054 0.956 0.000 0.024 0.004 0.016
#> SRR2105205 2 0.5496 0.2640 0.056 0.616 0.004 0.008 0.316
#> SRR2105206 5 0.5347 0.3229 0.044 0.424 0.004 0.000 0.528
#> SRR2105201 5 0.3742 0.5486 0.020 0.188 0.004 0.000 0.788
#> SRR2105202 5 0.4739 0.4757 0.016 0.320 0.012 0.000 0.652
#> SRR2105203 2 0.3910 0.3898 0.000 0.720 0.000 0.008 0.272
#> SRR2105204 5 0.4287 0.1097 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR2105199 2 0.4192 0.1254 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR2105200 5 0.4503 0.4541 0.024 0.312 0.000 0.000 0.664
#> SRR2105197 3 0.5330 0.4476 0.212 0.040 0.708 0.024 0.016
#> SRR2105198 3 0.7885 0.0540 0.120 0.380 0.408 0.036 0.056
#> SRR2105195 2 0.8862 0.0121 0.256 0.296 0.212 0.012 0.224
#> SRR2105196 1 0.7689 0.1240 0.384 0.060 0.224 0.000 0.332
#> SRR2105193 1 0.4570 0.4827 0.712 0.008 0.256 0.012 0.012
#> SRR2105194 1 0.2890 0.5878 0.836 0.000 0.160 0.004 0.000
#> SRR2105191 3 0.6597 0.4614 0.328 0.048 0.556 0.048 0.020
#> SRR2105192 1 0.5206 0.2026 0.528 0.000 0.436 0.028 0.008
#> SRR2105189 2 0.6575 0.0665 0.100 0.524 0.028 0.004 0.344
#> SRR2105190 2 0.4684 -0.0998 0.008 0.536 0.000 0.004 0.452
#> SRR2105187 2 0.3715 0.4792 0.008 0.812 0.020 0.004 0.156
#> SRR2105188 5 0.7970 0.1442 0.208 0.320 0.080 0.004 0.388
#> SRR2105179 3 0.5663 0.4428 0.332 0.016 0.592 0.000 0.060
#> SRR2105180 1 0.5042 0.4467 0.628 0.000 0.332 0.012 0.028
#> SRR2105183 5 0.3661 0.4862 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR2105184 5 0.5680 0.3723 0.092 0.284 0.000 0.008 0.616
#> SRR2105185 2 0.3210 0.4527 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR2105186 5 0.5272 0.4454 0.060 0.312 0.000 0.004 0.624
#> SRR2105181 3 0.7543 0.3421 0.188 0.112 0.576 0.040 0.084
#> SRR2105182 3 0.2956 0.5733 0.096 0.000 0.872 0.020 0.012
#> SRR2105177 1 0.3548 0.6133 0.852 0.008 0.076 0.008 0.056
#> SRR2105178 1 0.2304 0.6066 0.908 0.000 0.044 0.000 0.048
#> SRR2105171 2 0.3039 0.4372 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105172 5 0.4287 0.2012 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR2105175 1 0.4037 0.5750 0.812 0.012 0.092 0.000 0.084
#> SRR2105176 1 0.3234 0.6065 0.836 0.000 0.144 0.008 0.012
#> SRR2105173 2 0.4375 0.0495 0.004 0.576 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105174 5 0.4114 0.3790 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR2105169 2 0.4434 -0.0264 0.004 0.536 0.000 0.000 0.460
#> SRR2105170 5 0.4749 0.4636 0.172 0.088 0.004 0.000 0.736
#> SRR2105167 5 0.3534 0.5300 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR2105168 5 0.3109 0.5038 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR2105165 3 0.4029 0.4978 0.316 0.000 0.680 0.004 0.000
#> SRR2105166 1 0.4528 -0.0659 0.548 0.000 0.444 0.008 0.000
#> SRR2105163 2 0.7909 -0.0901 0.300 0.392 0.248 0.012 0.048
#> SRR2105164 3 0.5475 0.4463 0.360 0.024 0.588 0.004 0.024
#> SRR2105161 1 0.4103 0.5574 0.800 0.056 0.132 0.000 0.012
#> SRR2105162 1 0.0566 0.6047 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.4287 -0.0949 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR2105156 5 0.3003 0.5371 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR2105157 2 0.4306 0.0155 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR2105158 5 0.3837 0.4438 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR2105159 1 0.6550 0.4151 0.612 0.156 0.196 0.016 0.020
#> SRR2105160 1 0.4919 0.5827 0.768 0.044 0.140 0.016 0.032
#> SRR2105153 2 0.4039 0.4022 0.004 0.720 0.000 0.008 0.268
#> SRR2105154 2 0.3715 0.4458 0.000 0.736 0.000 0.004 0.260
#> SRR2105151 5 0.3906 0.5274 0.000 0.292 0.000 0.004 0.704
#> SRR2105152 5 0.3521 0.5077 0.000 0.232 0.000 0.004 0.764
#> SRR2105149 3 0.6010 0.4649 0.084 0.196 0.672 0.012 0.036
#> SRR2105150 2 0.5992 0.1952 0.004 0.500 0.424 0.020 0.052
#> SRR2105147 4 0.3857 0.7915 0.048 0.000 0.132 0.812 0.008
#> SRR2105148 4 0.3844 0.7787 0.040 0.000 0.144 0.808 0.008
#> SRR2105143 1 0.7991 0.3700 0.500 0.156 0.216 0.020 0.108
#> SRR2105144 1 0.6696 0.3911 0.584 0.064 0.112 0.000 0.240
#> SRR2105145 3 0.6201 0.2114 0.452 0.036 0.456 0.000 0.056
#> SRR2105146 1 0.4015 0.2458 0.652 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.3949 0.2332 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR2105142 2 0.4182 0.0695 0.000 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR2105139 5 0.3480 0.5278 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR2105140 5 0.4046 0.5061 0.000 0.296 0.008 0.000 0.696
#> SRR2105137 5 0.5342 0.4791 0.072 0.268 0.008 0.000 0.652
#> SRR2105138 5 0.6997 0.3247 0.228 0.284 0.008 0.008 0.472
#> SRR2105135 5 0.4278 0.2456 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR2105136 5 0.3913 0.3432 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR2105133 3 0.6993 0.3661 0.144 0.088 0.636 0.036 0.096
#> SRR2105134 3 0.5431 -0.0428 0.444 0.004 0.512 0.032 0.008
#> SRR2105131 2 0.5657 0.4350 0.076 0.740 0.068 0.024 0.092
#> SRR2105132 1 0.8080 0.1797 0.392 0.272 0.264 0.016 0.056
#> SRR2105129 1 0.5432 0.5524 0.712 0.056 0.184 0.004 0.044
#> SRR2105130 1 0.2344 0.6130 0.904 0.000 0.064 0.000 0.032
#> SRR2105127 3 0.5731 0.2466 0.448 0.016 0.496 0.008 0.032
#> SRR2105128 3 0.4870 0.3857 0.412 0.004 0.568 0.004 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.5368 0.35797 0.136 0.008 0.252 0.000 0.604 0.000
#> SRR2105278 5 0.5791 0.16650 0.192 0.000 0.336 0.000 0.472 0.000
#> SRR2105275 5 0.7428 0.38512 0.136 0.216 0.236 0.000 0.408 0.004
#> SRR2105276 5 0.6121 0.12399 0.168 0.016 0.392 0.000 0.424 0.000
#> SRR2105273 3 0.3592 0.57949 0.240 0.000 0.740 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105274 3 0.3695 0.56092 0.272 0.000 0.712 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105271 3 0.5642 0.31424 0.324 0.004 0.536 0.000 0.132 0.004
#> SRR2105272 3 0.5898 0.14582 0.308 0.004 0.488 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105269 2 0.2436 0.52357 0.000 0.880 0.000 0.000 0.032 0.088
#> SRR2105270 6 0.5274 0.21509 0.000 0.408 0.000 0.000 0.100 0.492
#> SRR2105267 2 0.3402 0.51981 0.000 0.820 0.000 0.008 0.052 0.120
#> SRR2105268 6 0.4762 0.04599 0.000 0.472 0.000 0.008 0.032 0.488
#> SRR2105265 6 0.4539 0.24574 0.004 0.368 0.000 0.008 0.020 0.600
#> SRR2105266 6 0.4601 0.28019 0.004 0.408 0.000 0.000 0.032 0.556
#> SRR2105263 6 0.6777 0.39008 0.080 0.284 0.004 0.008 0.116 0.508
#> SRR2105264 6 0.6209 0.43147 0.128 0.192 0.004 0.000 0.080 0.596
#> SRR2105261 2 0.6700 0.30946 0.072 0.592 0.140 0.004 0.160 0.032
#> SRR2105262 6 0.8600 0.02006 0.172 0.200 0.084 0.000 0.272 0.272
#> SRR2105357 5 0.6183 0.44659 0.052 0.112 0.100 0.000 0.656 0.080
#> SRR2105358 5 0.5176 0.27472 0.100 0.000 0.352 0.000 0.548 0.000
#> SRR2105439 2 0.5509 -0.00261 0.008 0.476 0.000 0.000 0.100 0.416
#> SRR2105440 2 0.5731 0.18399 0.012 0.548 0.008 0.000 0.108 0.324
#> SRR2105509 2 0.2527 0.52333 0.000 0.876 0.000 0.000 0.040 0.084
#> SRR2105510 2 0.2595 0.51643 0.000 0.872 0.000 0.000 0.084 0.044
#> SRR2105507 3 0.3206 0.59868 0.104 0.000 0.828 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105508 3 0.3309 0.59718 0.116 0.004 0.824 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105505 3 0.6542 0.23935 0.344 0.028 0.444 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105506 1 0.4332 0.44691 0.672 0.000 0.276 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105503 2 0.5201 0.27465 0.004 0.604 0.000 0.012 0.072 0.308
#> SRR2105504 4 0.0000 0.92285 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.6554 -0.10354 0.008 0.432 0.100 0.000 0.064 0.396
#> SRR2105502 4 0.0000 0.92285 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.4152 0.58536 0.088 0.012 0.764 0.000 0.136 0.000
#> SRR2105500 3 0.5753 0.56663 0.152 0.024 0.644 0.000 0.160 0.020
#> SRR2105497 6 0.4426 0.29857 0.008 0.356 0.000 0.004 0.016 0.616
#> SRR2105498 6 0.5707 0.46709 0.116 0.180 0.008 0.008 0.032 0.656
#> SRR2105495 2 0.4157 0.35486 0.000 0.688 0.004 0.000 0.032 0.276
#> SRR2105496 6 0.6753 0.24157 0.048 0.348 0.008 0.012 0.116 0.468
#> SRR2105493 6 0.5602 0.34767 0.012 0.336 0.000 0.000 0.116 0.536
#> SRR2105494 6 0.6477 0.29627 0.012 0.276 0.008 0.004 0.228 0.472
#> SRR2105491 2 0.6916 0.31647 0.072 0.548 0.020 0.012 0.116 0.232
#> SRR2105492 6 0.6269 0.46160 0.076 0.236 0.012 0.000 0.092 0.584
#> SRR2105489 6 0.4655 0.52793 0.016 0.192 0.008 0.000 0.064 0.720
#> SRR2105490 6 0.2649 0.50466 0.016 0.048 0.000 0.000 0.052 0.884
#> SRR2105487 5 0.5912 0.20422 0.372 0.032 0.088 0.000 0.504 0.004
#> SRR2105488 5 0.6002 0.15255 0.408 0.000 0.116 0.000 0.448 0.028
#> SRR2105485 3 0.4430 0.56860 0.064 0.012 0.732 0.000 0.188 0.004
#> SRR2105486 3 0.3813 0.58449 0.092 0.000 0.792 0.000 0.108 0.008
#> SRR2105483 1 0.0837 0.64074 0.972 0.000 0.020 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105484 1 0.1053 0.64556 0.964 0.000 0.020 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105481 3 0.5330 0.51658 0.216 0.004 0.640 0.000 0.128 0.012
#> SRR2105482 1 0.4632 0.10535 0.520 0.000 0.440 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105479 1 0.8256 0.19969 0.424 0.140 0.200 0.004 0.136 0.096
#> SRR2105480 1 0.4972 0.20499 0.568 0.000 0.352 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105477 6 0.6553 0.37811 0.036 0.224 0.004 0.012 0.184 0.540
#> SRR2105478 2 0.6421 0.19364 0.040 0.512 0.012 0.000 0.128 0.308
#> SRR2105475 2 0.4182 0.41025 0.000 0.712 0.000 0.012 0.032 0.244
#> SRR2105476 2 0.3933 0.49448 0.000 0.784 0.000 0.012 0.080 0.124
#> SRR2105473 6 0.6094 0.40477 0.096 0.232 0.000 0.000 0.088 0.584
#> SRR2105474 6 0.4783 0.52880 0.072 0.148 0.000 0.000 0.052 0.728
#> SRR2105471 6 0.5353 0.22982 0.012 0.404 0.000 0.000 0.076 0.508
#> SRR2105472 6 0.3740 0.50152 0.028 0.096 0.000 0.000 0.064 0.812
#> SRR2105469 3 0.6556 0.41086 0.232 0.024 0.500 0.004 0.232 0.008
#> SRR2105470 3 0.4075 0.59696 0.212 0.012 0.744 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105467 3 0.5787 0.41485 0.188 0.004 0.548 0.000 0.256 0.004
#> SRR2105468 3 0.5855 0.03626 0.396 0.000 0.412 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105465 1 0.7221 0.32645 0.492 0.112 0.224 0.000 0.020 0.152
#> SRR2105466 1 0.3085 0.64371 0.868 0.032 0.056 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105463 1 0.2964 0.63762 0.836 0.000 0.140 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105464 1 0.2702 0.64889 0.868 0.000 0.092 0.000 0.036 0.004
#> SRR2105461 2 0.4099 0.21262 0.000 0.612 0.000 0.000 0.016 0.372
#> SRR2105462 6 0.4621 0.45257 0.000 0.332 0.000 0.000 0.056 0.612
#> SRR2105459 2 0.1838 0.52069 0.000 0.928 0.000 0.012 0.020 0.040
#> SRR2105460 2 0.2905 0.49605 0.000 0.836 0.000 0.012 0.008 0.144
#> SRR2105457 5 0.5804 0.35324 0.020 0.124 0.328 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105458 5 0.6505 0.35341 0.004 0.200 0.312 0.000 0.456 0.028
#> SRR2105455 3 0.4970 0.55010 0.284 0.024 0.652 0.004 0.012 0.024
#> SRR2105456 3 0.4092 0.51357 0.344 0.000 0.636 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105453 1 0.3722 0.61995 0.800 0.000 0.100 0.000 0.092 0.008
#> SRR2105454 1 0.4044 0.54471 0.756 0.000 0.060 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105451 2 0.7570 -0.05077 0.084 0.316 0.016 0.000 0.308 0.276
#> SRR2105452 4 0.0146 0.92302 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105449 1 0.7850 0.18996 0.364 0.028 0.288 0.000 0.192 0.128
#> SRR2105450 3 0.4112 0.55243 0.224 0.000 0.724 0.000 0.048 0.004
#> SRR2105447 2 0.4518 0.44241 0.000 0.712 0.012 0.004 0.056 0.216
#> SRR2105448 2 0.3388 0.47898 0.000 0.792 0.000 0.000 0.036 0.172
#> SRR2105445 5 0.7239 0.08364 0.028 0.272 0.068 0.000 0.460 0.172
#> SRR2105446 5 0.8061 0.28517 0.140 0.044 0.224 0.000 0.380 0.212
#> SRR2105443 2 0.7282 0.10977 0.000 0.396 0.116 0.000 0.236 0.252
#> SRR2105444 2 0.7488 0.16539 0.048 0.472 0.124 0.000 0.104 0.252
#> SRR2105441 6 0.5197 0.24185 0.008 0.420 0.000 0.000 0.068 0.504
#> SRR2105442 6 0.4538 0.52733 0.036 0.172 0.004 0.000 0.048 0.740
#> SRR2105437 5 0.5290 0.39416 0.144 0.000 0.244 0.000 0.608 0.004
#> SRR2105438 5 0.5863 0.21946 0.284 0.000 0.236 0.000 0.480 0.000
#> SRR2105435 3 0.5975 0.19265 0.084 0.024 0.548 0.000 0.324 0.020
#> SRR2105436 3 0.3468 0.55699 0.068 0.000 0.804 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105433 3 0.3955 0.46020 0.384 0.000 0.608 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105434 1 0.3437 0.51667 0.752 0.004 0.236 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105431 1 0.1863 0.65190 0.920 0.000 0.044 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105432 1 0.1010 0.64318 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105429 5 0.7715 -0.15392 0.040 0.300 0.072 0.000 0.364 0.224
#> SRR2105430 2 0.6037 0.39824 0.008 0.640 0.072 0.004 0.148 0.128
#> SRR2105427 2 0.2918 0.52362 0.000 0.856 0.000 0.004 0.052 0.088
#> SRR2105428 2 0.5326 0.18897 0.000 0.572 0.004 0.000 0.116 0.308
#> SRR2105425 2 0.4078 0.43469 0.004 0.724 0.016 0.000 0.016 0.240
#> SRR2105426 6 0.4856 0.23479 0.008 0.432 0.000 0.000 0.040 0.520
#> SRR2105421 2 0.5536 0.28129 0.020 0.620 0.176 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105422 2 0.7063 -0.08762 0.096 0.464 0.320 0.000 0.092 0.028
#> SRR2105423 6 0.4650 0.06842 0.000 0.472 0.000 0.000 0.040 0.488
#> SRR2105424 6 0.4636 0.09322 0.000 0.432 0.000 0.004 0.032 0.532
#> SRR2105419 3 0.6815 0.26280 0.196 0.064 0.476 0.000 0.260 0.004
#> SRR2105420 3 0.7235 0.38851 0.304 0.052 0.440 0.000 0.168 0.036
#> SRR2105415 1 0.3505 0.60602 0.804 0.000 0.152 0.000 0.028 0.016
#> SRR2105416 1 0.2170 0.64889 0.912 0.008 0.056 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105417 1 0.5853 0.34172 0.552 0.020 0.312 0.000 0.108 0.008
#> SRR2105418 1 0.1692 0.64881 0.932 0.000 0.048 0.000 0.012 0.008
#> SRR2105413 2 0.4947 0.18364 0.000 0.596 0.000 0.000 0.088 0.316
#> SRR2105414 2 0.3447 0.51557 0.000 0.832 0.008 0.012 0.044 0.104
#> SRR2105409 6 0.4420 0.52575 0.000 0.192 0.004 0.000 0.088 0.716
#> SRR2105410 6 0.4766 0.52146 0.004 0.148 0.004 0.004 0.128 0.712
#> SRR2105411 6 0.4258 0.53030 0.004 0.204 0.000 0.000 0.068 0.724
#> SRR2105412 6 0.4722 0.43087 0.004 0.316 0.000 0.004 0.048 0.628
#> SRR2105407 5 0.4777 0.25775 0.024 0.012 0.400 0.000 0.560 0.004
#> SRR2105408 5 0.4847 0.20719 0.016 0.020 0.444 0.000 0.516 0.004
#> SRR2105403 3 0.4001 0.44189 0.020 0.008 0.704 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105404 3 0.5819 0.10786 0.188 0.000 0.444 0.000 0.368 0.000
#> SRR2105405 3 0.4150 0.57614 0.256 0.004 0.708 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105406 1 0.5069 0.34976 0.588 0.004 0.344 0.000 0.052 0.012
#> SRR2105401 2 0.2787 0.52103 0.000 0.872 0.000 0.012 0.072 0.044
#> SRR2105402 4 0.0146 0.92302 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105399 2 0.7481 0.21704 0.000 0.456 0.016 0.188 0.180 0.160
#> SRR2105400 2 0.5470 0.45091 0.004 0.720 0.036 0.084 0.096 0.060
#> SRR2105397 2 0.6637 0.30550 0.072 0.552 0.064 0.004 0.272 0.036
#> SRR2105398 2 0.5930 0.25941 0.004 0.552 0.108 0.000 0.304 0.032
#> SRR2105395 2 0.4187 0.30219 0.000 0.624 0.000 0.004 0.016 0.356
#> SRR2105396 6 0.2996 0.52989 0.004 0.088 0.004 0.000 0.048 0.856
#> SRR2105393 6 0.4313 0.46469 0.000 0.284 0.000 0.000 0.048 0.668
#> SRR2105394 6 0.4633 0.42217 0.000 0.324 0.000 0.012 0.036 0.628
#> SRR2105389 5 0.4234 0.14829 0.016 0.000 0.440 0.000 0.544 0.000
#> SRR2105390 3 0.3879 0.39222 0.020 0.000 0.688 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105391 3 0.4113 0.39242 0.008 0.016 0.668 0.000 0.308 0.000
#> SRR2105392 3 0.4083 0.06497 0.008 0.000 0.532 0.000 0.460 0.000
#> SRR2105385 3 0.3470 0.60301 0.200 0.000 0.772 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105386 3 0.3332 0.60699 0.144 0.000 0.808 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105387 1 0.4755 0.58065 0.724 0.016 0.168 0.004 0.084 0.004
#> SRR2105388 3 0.4827 0.48838 0.276 0.000 0.632 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105381 2 0.6074 0.38028 0.108 0.624 0.032 0.008 0.020 0.208
#> SRR2105382 2 0.5076 -0.09526 0.000 0.472 0.000 0.004 0.064 0.460
#> SRR2105383 6 0.5745 0.45084 0.044 0.280 0.012 0.000 0.064 0.600
#> SRR2105384 6 0.5515 0.46498 0.024 0.296 0.020 0.004 0.044 0.612
#> SRR2105379 2 0.3406 0.46773 0.008 0.792 0.000 0.000 0.020 0.180
#> SRR2105380 2 0.5853 0.40733 0.132 0.648 0.020 0.000 0.040 0.160
#> SRR2105377 2 0.5568 -0.09316 0.000 0.468 0.004 0.000 0.120 0.408
#> SRR2105378 6 0.6172 0.39956 0.156 0.128 0.004 0.000 0.100 0.612
#> SRR2105375 5 0.8410 0.29017 0.196 0.272 0.204 0.000 0.276 0.052
#> SRR2105376 1 0.7004 0.35837 0.532 0.036 0.144 0.000 0.216 0.072
#> SRR2105373 3 0.6236 0.18350 0.312 0.004 0.368 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105374 1 0.5662 0.13527 0.460 0.000 0.156 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105371 3 0.3732 0.55530 0.076 0.000 0.780 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105372 3 0.2887 0.56146 0.036 0.000 0.844 0.000 0.120 0.000
#> SRR2105369 3 0.3265 0.56891 0.056 0.004 0.828 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105370 3 0.3217 0.58624 0.224 0.000 0.768 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105367 1 0.7170 0.40704 0.544 0.044 0.120 0.000 0.152 0.140
#> SRR2105368 1 0.5082 0.48616 0.692 0.020 0.056 0.000 0.024 0.208
#> SRR2105365 2 0.6253 0.01047 0.044 0.456 0.008 0.008 0.068 0.416
#> SRR2105366 2 0.4115 0.50619 0.024 0.796 0.000 0.012 0.068 0.100
#> SRR2105363 2 0.4763 0.18041 0.000 0.576 0.004 0.000 0.048 0.372
#> SRR2105364 2 0.5268 -0.00493 0.000 0.516 0.008 0.004 0.064 0.408
#> SRR2105361 2 0.3551 0.50125 0.000 0.804 0.000 0.012 0.040 0.144
#> SRR2105362 2 0.4170 0.41570 0.004 0.732 0.000 0.004 0.048 0.212
#> SRR2105359 3 0.5391 0.44747 0.108 0.020 0.616 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105360 3 0.5244 0.43668 0.124 0.008 0.620 0.000 0.248 0.000
#> SRR2105355 3 0.7479 -0.26587 0.124 0.212 0.352 0.000 0.308 0.004
#> SRR2105356 3 0.5702 0.51048 0.248 0.004 0.564 0.000 0.180 0.004
#> SRR2105353 3 0.5133 0.07774 0.044 0.020 0.524 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105354 3 0.3945 0.49414 0.048 0.004 0.748 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105351 2 0.4695 0.05116 0.000 0.504 0.000 0.008 0.028 0.460
#> SRR2105352 4 0.0146 0.92302 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105349 2 0.3286 0.51659 0.000 0.832 0.000 0.012 0.044 0.112
#> SRR2105350 6 0.4640 0.41443 0.000 0.348 0.000 0.004 0.044 0.604
#> SRR2105345 6 0.4799 0.38928 0.012 0.356 0.000 0.000 0.040 0.592
#> SRR2105346 6 0.4130 0.48122 0.008 0.240 0.000 0.000 0.036 0.716
#> SRR2105347 6 0.3630 0.50634 0.072 0.036 0.012 0.004 0.036 0.840
#> SRR2105348 6 0.5207 0.36693 0.244 0.056 0.004 0.000 0.040 0.656
#> SRR2105343 2 0.3187 0.51322 0.000 0.836 0.000 0.008 0.044 0.112
#> SRR2105344 6 0.4743 0.28099 0.000 0.364 0.004 0.000 0.048 0.584
#> SRR2105341 3 0.4020 0.51292 0.024 0.004 0.716 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105342 3 0.3563 0.58846 0.108 0.000 0.800 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105339 3 0.6723 0.23873 0.136 0.028 0.488 0.000 0.312 0.036
#> SRR2105340 3 0.5430 0.40530 0.124 0.012 0.620 0.000 0.240 0.004
#> SRR2105335 3 0.5229 0.39459 0.192 0.004 0.628 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105336 1 0.5270 0.46696 0.588 0.000 0.268 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105337 3 0.4583 0.53699 0.308 0.008 0.648 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105338 3 0.3986 0.51646 0.316 0.000 0.664 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105331 2 0.3593 0.46448 0.000 0.748 0.000 0.000 0.024 0.228
#> SRR2105332 2 0.5219 -0.00407 0.016 0.512 0.000 0.000 0.056 0.416
#> SRR2105333 2 0.4181 0.38406 0.000 0.704 0.000 0.012 0.028 0.256
#> SRR2105334 2 0.4339 0.43808 0.004 0.728 0.000 0.008 0.056 0.204
#> SRR2105329 2 0.3930 0.50312 0.012 0.808 0.036 0.008 0.120 0.016
#> SRR2105330 6 0.8224 0.17756 0.084 0.280 0.140 0.012 0.088 0.396
#> SRR2105327 2 0.4731 0.41453 0.020 0.684 0.004 0.008 0.028 0.256
#> SRR2105328 6 0.4947 0.14238 0.000 0.416 0.000 0.008 0.048 0.528
#> SRR2105325 5 0.5312 0.32595 0.116 0.004 0.304 0.000 0.576 0.000
#> SRR2105326 5 0.4746 0.17101 0.048 0.000 0.444 0.000 0.508 0.000
#> SRR2105323 5 0.7024 0.30933 0.020 0.356 0.180 0.044 0.400 0.000
#> SRR2105324 3 0.7185 -0.10604 0.172 0.068 0.372 0.000 0.372 0.016
#> SRR2105319 5 0.6124 0.01622 0.328 0.000 0.316 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105320 1 0.5022 0.49227 0.640 0.000 0.156 0.000 0.204 0.000
#> SRR2105321 3 0.5675 0.45719 0.192 0.012 0.580 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105322 3 0.5413 0.48323 0.228 0.000 0.580 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105317 2 0.2488 0.51198 0.000 0.880 0.000 0.000 0.044 0.076
#> SRR2105318 2 0.2872 0.51313 0.000 0.836 0.000 0.000 0.024 0.140
#> SRR2105315 2 0.7258 0.15347 0.000 0.472 0.232 0.012 0.136 0.148
#> SRR2105316 2 0.4481 0.48154 0.000 0.752 0.032 0.000 0.124 0.092
#> SRR2105313 2 0.4498 0.32663 0.000 0.644 0.000 0.000 0.056 0.300
#> SRR2105314 2 0.4121 0.38836 0.000 0.720 0.000 0.000 0.060 0.220
#> SRR2105311 5 0.6801 0.43009 0.120 0.132 0.188 0.000 0.548 0.012
#> SRR2105312 5 0.8487 0.20552 0.224 0.092 0.240 0.000 0.320 0.124
#> SRR2105307 1 0.5658 0.55469 0.688 0.020 0.096 0.000 0.112 0.084
#> SRR2105308 1 0.4658 0.57285 0.716 0.020 0.212 0.000 0.032 0.020
#> SRR2105309 5 0.6224 0.32669 0.008 0.216 0.320 0.000 0.452 0.004
#> SRR2105310 3 0.3608 0.45352 0.012 0.000 0.716 0.000 0.272 0.000
#> SRR2105305 3 0.4521 0.20149 0.024 0.004 0.596 0.000 0.372 0.004
#> SRR2105306 3 0.2866 0.57393 0.052 0.000 0.860 0.000 0.084 0.004
#> SRR2105303 2 0.4528 0.14102 0.004 0.564 0.000 0.000 0.028 0.404
#> SRR2105304 4 0.0000 0.92285 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.4178 0.41175 0.000 0.680 0.004 0.008 0.016 0.292
#> SRR2105302 2 0.4291 0.49374 0.000 0.736 0.000 0.012 0.064 0.188
#> SRR2105299 5 0.6416 -0.12292 0.000 0.288 0.032 0.000 0.472 0.208
#> SRR2105300 5 0.7693 -0.06779 0.024 0.292 0.080 0.008 0.396 0.200
#> SRR2105297 1 0.5711 0.09431 0.492 0.024 0.016 0.000 0.052 0.416
#> SRR2105298 1 0.5047 0.17026 0.516 0.004 0.000 0.000 0.064 0.416
#> SRR2105295 2 0.1320 0.51588 0.000 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105296 2 0.4428 0.42602 0.000 0.696 0.000 0.000 0.084 0.220
#> SRR2105293 5 0.7419 0.16789 0.228 0.128 0.308 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105294 3 0.6006 0.13709 0.316 0.000 0.428 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105291 3 0.6087 0.43758 0.304 0.032 0.564 0.000 0.036 0.064
#> SRR2105292 1 0.2898 0.65462 0.868 0.000 0.056 0.000 0.060 0.016
#> SRR2105289 3 0.5179 0.52433 0.176 0.096 0.684 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105290 3 0.4325 0.21683 0.456 0.000 0.524 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105287 1 0.4123 0.59323 0.732 0.004 0.224 0.000 0.028 0.012
#> SRR2105288 1 0.4878 -0.06527 0.512 0.008 0.444 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105285 2 0.4732 0.33494 0.000 0.664 0.000 0.004 0.084 0.248
#> SRR2105286 2 0.2488 0.51978 0.000 0.880 0.000 0.000 0.044 0.076
#> SRR2105283 6 0.7950 0.18889 0.208 0.236 0.024 0.000 0.168 0.364
#> SRR2105284 2 0.7505 -0.10803 0.088 0.388 0.048 0.000 0.116 0.360
#> SRR2105281 2 0.4547 0.34512 0.000 0.656 0.000 0.000 0.068 0.276
#> SRR2105282 6 0.4424 0.35945 0.004 0.340 0.000 0.004 0.024 0.628
#> SRR2105259 5 0.5157 0.18479 0.040 0.024 0.420 0.000 0.516 0.000
#> SRR2105260 5 0.5139 0.38536 0.020 0.084 0.256 0.000 0.640 0.000
#> SRR2105279 6 0.3343 0.52714 0.000 0.176 0.000 0.004 0.024 0.796
#> SRR2105280 6 0.4905 0.24973 0.000 0.420 0.000 0.004 0.052 0.524
#> SRR2105257 1 0.5147 0.22895 0.548 0.000 0.356 0.000 0.096 0.000
#> SRR2105258 1 0.2882 0.64647 0.860 0.000 0.076 0.000 0.060 0.004
#> SRR2105253 6 0.5328 0.15856 0.000 0.420 0.000 0.012 0.072 0.496
#> SRR2105254 2 0.4765 0.01784 0.000 0.524 0.000 0.012 0.028 0.436
#> SRR2105255 3 0.3608 0.57091 0.064 0.000 0.788 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105256 3 0.2542 0.56654 0.044 0.000 0.876 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105251 6 0.3016 0.52883 0.000 0.092 0.000 0.008 0.048 0.852
#> SRR2105252 6 0.4863 0.25186 0.000 0.412 0.000 0.000 0.060 0.528
#> SRR2105249 6 0.4822 0.34159 0.004 0.400 0.000 0.000 0.048 0.548
#> SRR2105250 6 0.5219 0.47487 0.032 0.248 0.000 0.000 0.076 0.644
#> SRR2105247 6 0.4505 0.48132 0.004 0.272 0.000 0.000 0.056 0.668
#> SRR2105248 6 0.4420 0.45453 0.000 0.308 0.000 0.000 0.048 0.644
#> SRR2105245 5 0.7793 0.20330 0.188 0.068 0.308 0.000 0.376 0.060
#> SRR2105246 3 0.7242 0.14188 0.076 0.076 0.536 0.008 0.076 0.228
#> SRR2105243 3 0.4586 0.54211 0.264 0.000 0.660 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105244 3 0.6616 0.43911 0.252 0.000 0.500 0.000 0.180 0.068
#> SRR2105241 3 0.3746 0.59774 0.140 0.000 0.780 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105242 3 0.4002 0.41831 0.404 0.000 0.588 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105239 3 0.4931 0.46264 0.368 0.020 0.576 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105240 3 0.4080 0.33828 0.456 0.000 0.536 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105237 2 0.5129 0.46619 0.012 0.700 0.012 0.012 0.188 0.076
#> SRR2105238 2 0.4060 0.49002 0.000 0.764 0.004 0.000 0.120 0.112
#> SRR2105235 2 0.3037 0.50725 0.000 0.808 0.000 0.000 0.016 0.176
#> SRR2105236 6 0.5096 0.40302 0.000 0.292 0.000 0.012 0.080 0.616
#> SRR2105233 2 0.2282 0.51906 0.000 0.900 0.000 0.012 0.020 0.068
#> SRR2105234 2 0.2081 0.51908 0.000 0.916 0.000 0.012 0.036 0.036
#> SRR2105231 6 0.4620 0.19111 0.000 0.420 0.000 0.004 0.032 0.544
#> SRR2105232 2 0.4333 0.21909 0.000 0.596 0.000 0.004 0.020 0.380
#> SRR2105227 2 0.7741 0.08960 0.240 0.460 0.072 0.004 0.152 0.072
#> SRR2105228 2 0.8703 -0.04933 0.172 0.256 0.252 0.004 0.076 0.240
#> SRR2105225 1 0.6191 0.25444 0.464 0.008 0.312 0.000 0.212 0.004
#> SRR2105226 1 0.4509 -0.00266 0.532 0.000 0.436 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105229 5 0.5071 0.40227 0.016 0.068 0.300 0.000 0.616 0.000
#> SRR2105230 3 0.4135 0.10597 0.008 0.004 0.584 0.000 0.404 0.000
#> SRR2105219 2 0.2250 0.51914 0.000 0.888 0.000 0.000 0.020 0.092
#> SRR2105220 2 0.4711 0.32144 0.000 0.640 0.000 0.000 0.080 0.280
#> SRR2105221 6 0.5618 0.48774 0.036 0.148 0.024 0.000 0.116 0.676
#> SRR2105222 6 0.5938 0.40230 0.248 0.056 0.004 0.004 0.084 0.604
#> SRR2105223 3 0.2966 0.59111 0.076 0.000 0.848 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105224 3 0.3206 0.59581 0.104 0.000 0.828 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105217 6 0.5016 0.18553 0.000 0.432 0.000 0.004 0.060 0.504
#> SRR2105218 6 0.4974 0.11627 0.004 0.440 0.000 0.000 0.056 0.500
#> SRR2105215 2 0.4570 0.04795 0.000 0.528 0.000 0.000 0.036 0.436
#> SRR2105216 6 0.4222 0.49000 0.000 0.252 0.000 0.004 0.044 0.700
#> SRR2105213 3 0.8217 -0.12882 0.196 0.100 0.328 0.000 0.300 0.076
#> SRR2105214 3 0.5493 0.33172 0.028 0.180 0.668 0.004 0.112 0.008
#> SRR2105211 3 0.6941 0.04538 0.028 0.144 0.468 0.000 0.312 0.048
#> SRR2105212 3 0.5859 0.49258 0.096 0.060 0.648 0.000 0.180 0.016
#> SRR2105209 3 0.5024 0.49786 0.336 0.000 0.588 0.000 0.068 0.008
#> SRR2105210 1 0.2950 0.60610 0.828 0.000 0.148 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105207 1 0.5005 0.57611 0.728 0.012 0.096 0.000 0.124 0.040
#> SRR2105208 1 0.1065 0.64495 0.964 0.000 0.020 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105205 2 0.6278 0.23072 0.056 0.536 0.004 0.012 0.072 0.320
#> SRR2105206 6 0.5978 0.28192 0.032 0.376 0.008 0.000 0.084 0.500
#> SRR2105201 6 0.4783 0.52694 0.020 0.156 0.004 0.000 0.100 0.720
#> SRR2105202 6 0.6335 0.39729 0.060 0.288 0.004 0.000 0.116 0.532
#> SRR2105203 2 0.4444 0.38026 0.000 0.672 0.000 0.012 0.036 0.280
#> SRR2105204 6 0.4644 0.07078 0.000 0.440 0.000 0.004 0.032 0.524
#> SRR2105199 2 0.4666 0.11649 0.000 0.564 0.000 0.000 0.048 0.388
#> SRR2105200 6 0.5073 0.44541 0.028 0.284 0.000 0.000 0.056 0.632
#> SRR2105197 5 0.5449 0.37987 0.092 0.020 0.308 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105198 5 0.5549 0.47358 0.056 0.084 0.188 0.000 0.664 0.008
#> SRR2105195 5 0.8415 0.31053 0.208 0.212 0.080 0.000 0.352 0.148
#> SRR2105196 6 0.8333 -0.20579 0.288 0.064 0.224 0.000 0.128 0.296
#> SRR2105193 1 0.4653 0.34171 0.620 0.004 0.336 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105194 1 0.3081 0.57536 0.776 0.000 0.220 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105191 3 0.6513 0.44367 0.228 0.024 0.500 0.000 0.236 0.012
#> SRR2105192 1 0.5865 0.20301 0.476 0.000 0.340 0.000 0.180 0.004
#> SRR2105189 2 0.6848 0.18950 0.044 0.520 0.032 0.004 0.128 0.272
#> SRR2105190 2 0.5352 -0.08724 0.008 0.480 0.000 0.008 0.060 0.444
#> SRR2105187 2 0.5141 0.42965 0.004 0.656 0.004 0.004 0.220 0.112
#> SRR2105188 6 0.8375 0.11103 0.160 0.216 0.044 0.004 0.280 0.296
#> SRR2105179 3 0.4929 0.55995 0.252 0.012 0.672 0.000 0.020 0.044
#> SRR2105180 1 0.5110 0.39034 0.592 0.000 0.320 0.000 0.080 0.008
#> SRR2105183 6 0.3834 0.47559 0.004 0.244 0.000 0.000 0.024 0.728
#> SRR2105184 6 0.6105 0.36280 0.100 0.236 0.000 0.012 0.056 0.596
#> SRR2105185 2 0.3669 0.47035 0.000 0.760 0.000 0.004 0.028 0.208
#> SRR2105186 6 0.5851 0.42055 0.052 0.280 0.000 0.004 0.080 0.584
#> SRR2105181 5 0.6961 0.38023 0.116 0.064 0.300 0.000 0.488 0.032
#> SRR2105182 3 0.3619 0.44464 0.024 0.000 0.744 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105177 1 0.3345 0.65113 0.844 0.000 0.068 0.000 0.052 0.036
#> SRR2105178 1 0.1821 0.64321 0.928 0.000 0.040 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105171 2 0.3852 0.44242 0.004 0.764 0.000 0.000 0.052 0.180
#> SRR2105172 6 0.4957 0.22590 0.000 0.412 0.000 0.000 0.068 0.520
#> SRR2105175 1 0.4475 0.61459 0.776 0.012 0.100 0.000 0.048 0.064
#> SRR2105176 1 0.3316 0.61526 0.804 0.000 0.164 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105173 2 0.4747 0.17258 0.000 0.584 0.000 0.000 0.060 0.356
#> SRR2105174 6 0.4466 0.34261 0.004 0.352 0.000 0.000 0.032 0.612
#> SRR2105169 2 0.4908 0.05064 0.008 0.520 0.000 0.000 0.044 0.428
#> SRR2105170 6 0.5459 0.46654 0.156 0.080 0.012 0.000 0.064 0.688
#> SRR2105167 6 0.4201 0.52065 0.000 0.196 0.000 0.004 0.068 0.732
#> SRR2105168 6 0.3432 0.48674 0.000 0.148 0.000 0.000 0.052 0.800
#> SRR2105165 3 0.3776 0.60763 0.196 0.000 0.756 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105166 3 0.5597 0.34410 0.372 0.000 0.480 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105163 2 0.8017 -0.31555 0.216 0.332 0.168 0.000 0.260 0.024
#> SRR2105164 3 0.6522 0.28333 0.248 0.016 0.444 0.000 0.284 0.008
#> SRR2105161 1 0.4799 0.54797 0.724 0.064 0.176 0.000 0.020 0.016
#> SRR2105162 1 0.1478 0.64534 0.944 0.000 0.032 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105155 2 0.4456 -0.02470 0.000 0.524 0.000 0.000 0.028 0.448
#> SRR2105156 6 0.3236 0.52753 0.000 0.180 0.000 0.000 0.024 0.796
#> SRR2105157 2 0.4755 0.03338 0.000 0.492 0.000 0.000 0.048 0.460
#> SRR2105158 6 0.4270 0.44781 0.000 0.264 0.000 0.000 0.052 0.684
#> SRR2105159 1 0.6697 0.27027 0.516 0.088 0.140 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105160 1 0.5189 0.57870 0.708 0.020 0.128 0.000 0.120 0.024
#> SRR2105153 2 0.4489 0.40487 0.000 0.680 0.000 0.012 0.044 0.264
#> SRR2105154 2 0.4439 0.45027 0.000 0.692 0.000 0.004 0.064 0.240
#> SRR2105151 6 0.4616 0.52106 0.000 0.228 0.000 0.004 0.084 0.684
#> SRR2105152 6 0.3529 0.50307 0.000 0.176 0.000 0.008 0.028 0.788
#> SRR2105149 3 0.6597 0.27190 0.076 0.144 0.576 0.004 0.188 0.012
#> SRR2105150 5 0.6637 0.42085 0.012 0.296 0.228 0.000 0.444 0.020
#> SRR2105147 4 0.4151 0.74010 0.028 0.000 0.100 0.780 0.092 0.000
#> SRR2105148 4 0.4138 0.72124 0.012 0.000 0.108 0.768 0.112 0.000
#> SRR2105143 1 0.7465 0.38176 0.480 0.132 0.248 0.000 0.068 0.072
#> SRR2105144 1 0.6851 0.39457 0.572 0.060 0.124 0.000 0.060 0.184
#> SRR2105145 3 0.5705 0.43509 0.348 0.032 0.556 0.000 0.024 0.040
#> SRR2105146 1 0.4289 -0.01916 0.556 0.000 0.424 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105141 2 0.4118 0.26923 0.000 0.660 0.000 0.000 0.028 0.312
#> SRR2105142 2 0.4561 0.09454 0.000 0.568 0.000 0.000 0.040 0.392
#> SRR2105139 6 0.4203 0.51656 0.004 0.200 0.000 0.004 0.056 0.736
#> SRR2105140 6 0.4613 0.48379 0.004 0.268 0.008 0.000 0.048 0.672
#> SRR2105137 6 0.5811 0.44102 0.060 0.248 0.004 0.000 0.080 0.608
#> SRR2105138 6 0.7647 0.24413 0.284 0.240 0.008 0.008 0.096 0.364
#> SRR2105135 6 0.4620 0.33771 0.000 0.368 0.000 0.000 0.048 0.584
#> SRR2105136 6 0.4308 0.35795 0.004 0.280 0.000 0.000 0.040 0.676
#> SRR2105133 5 0.6227 0.32083 0.104 0.020 0.348 0.000 0.504 0.024
#> SRR2105134 5 0.5832 0.32786 0.292 0.000 0.196 0.000 0.508 0.004
#> SRR2105131 2 0.6230 0.42296 0.072 0.664 0.052 0.008 0.120 0.084
#> SRR2105132 5 0.7845 0.28001 0.292 0.232 0.108 0.000 0.340 0.028
#> SRR2105129 1 0.5022 0.58325 0.720 0.060 0.164 0.000 0.020 0.036
#> SRR2105130 1 0.1657 0.65101 0.936 0.000 0.040 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105127 3 0.5908 0.44187 0.340 0.012 0.540 0.000 0.076 0.032
#> SRR2105128 3 0.4344 0.53685 0.308 0.004 0.660 0.000 0.012 0.016
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.946 0.946 0.977 0.4996 0.499 0.499
#> 3 3 0.968 0.925 0.967 0.0524 0.980 0.961
#> 4 4 0.695 0.665 0.815 0.1700 0.929 0.855
#> 5 5 0.557 0.608 0.767 0.0995 0.903 0.781
#> 6 6 0.542 0.258 0.646 0.0755 0.806 0.535
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105264 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105261 1 0.5294 0.8534 0.880 0.120
#> SRR2105262 1 0.1184 0.9681 0.984 0.016
#> SRR2105357 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105358 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105440 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105509 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.7745 0.7275 0.228 0.772
#> SRR2105501 2 0.6148 0.8275 0.152 0.848
#> SRR2105502 2 0.6887 0.7897 0.184 0.816
#> SRR2105499 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105494 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105491 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105492 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105485 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105478 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105475 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105476 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105473 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105474 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.7139 0.7731 0.196 0.804
#> SRR2105452 2 0.8081 0.6961 0.248 0.752
#> SRR2105449 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.3733 0.9120 0.072 0.928
#> SRR2105448 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105445 1 0.9087 0.5027 0.676 0.324
#> SRR2105446 1 0.2043 0.9530 0.968 0.032
#> SRR2105443 2 0.9087 0.5548 0.324 0.676
#> SRR2105444 2 0.9850 0.2920 0.428 0.572
#> SRR2105441 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.7528 0.7457 0.216 0.784
#> SRR2105430 2 0.6712 0.8000 0.176 0.824
#> SRR2105427 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105421 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105422 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105414 2 0.0938 0.9635 0.012 0.988
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.4298 0.8974 0.088 0.912
#> SRR2105402 2 0.8081 0.6961 0.248 0.752
#> SRR2105399 2 0.7602 0.7396 0.220 0.780
#> SRR2105400 2 0.7376 0.7569 0.208 0.792
#> SRR2105397 1 0.9970 0.0814 0.532 0.468
#> SRR2105398 1 0.9775 0.2723 0.588 0.412
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.5842 0.8430 0.140 0.860
#> SRR2105382 2 0.5178 0.8695 0.116 0.884
#> SRR2105383 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105379 2 0.1843 0.9514 0.028 0.972
#> SRR2105380 2 0.4298 0.8991 0.088 0.912
#> SRR2105377 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105375 1 0.2043 0.9534 0.968 0.032
#> SRR2105376 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105368 1 0.1184 0.9682 0.984 0.016
#> SRR2105365 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105366 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105363 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.8081 0.6961 0.248 0.752
#> SRR2105349 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.9129 0.5456 0.328 0.672
#> SRR2105330 2 0.7815 0.7226 0.232 0.768
#> SRR2105327 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105325 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105324 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105315 1 0.9996 0.0103 0.512 0.488
#> SRR2105316 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.6531 0.8099 0.168 0.832
#> SRR2105301 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.3879 0.9059 0.924 0.076
#> SRR2105300 1 0.9795 0.2633 0.584 0.416
#> SRR2105297 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105298 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105292 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.4690 0.8868 0.100 0.900
#> SRR2105284 2 0.6973 0.7813 0.188 0.812
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105246 1 0.2423 0.9453 0.960 0.040
#> SRR2105243 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.0938 0.9635 0.012 0.988
#> SRR2105238 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105228 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105225 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105230 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105222 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105223 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105214 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105211 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105206 2 0.1414 0.9578 0.020 0.980
#> SRR2105201 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0938 0.9716 0.988 0.012
#> SRR2105195 1 0.1843 0.9571 0.972 0.028
#> SRR2105196 1 0.1414 0.9646 0.980 0.020
#> SRR2105193 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0376 0.9680 0.004 0.996
#> SRR2105190 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.1414 0.9579 0.020 0.980
#> SRR2105188 2 0.6148 0.8300 0.152 0.848
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.1633 0.9547 0.024 0.976
#> SRR2105186 2 0.0938 0.9636 0.012 0.988
#> SRR2105181 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105158 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105159 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105154 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.3584 0.9154 0.932 0.068
#> SRR2105150 1 0.2778 0.9373 0.952 0.048
#> SRR2105147 1 0.9460 0.4080 0.636 0.364
#> SRR2105148 1 0.9248 0.4673 0.660 0.340
#> SRR2105143 1 0.0376 0.9783 0.996 0.004
#> SRR2105144 1 0.3431 0.9220 0.936 0.064
#> SRR2105145 1 0.1184 0.9682 0.984 0.016
#> SRR2105146 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0672 0.9661 0.008 0.992
#> SRR2105142 2 0.0376 0.9681 0.004 0.996
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.0938 0.9626 0.012 0.988
#> SRR2105138 2 0.1414 0.9580 0.020 0.980
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9698 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9580 0.4136 0.380 0.620
#> SRR2105132 1 0.1843 0.9568 0.972 0.028
#> SRR2105129 1 0.0376 0.9782 0.996 0.004
#> SRR2105130 1 0.0000 0.9814 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0672 0.9749 0.992 0.008
#> SRR2105128 1 0.2423 0.9459 0.960 0.040
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.2165 0.939 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105278 1 0.2165 0.939 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105275 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105276 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105274 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105271 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0747 0.948 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105270 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105267 2 0.0424 0.953 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105268 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105264 2 0.0237 0.954 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105261 1 0.3499 0.875 0.900 0.072 0.028
#> SRR2105262 1 0.1170 0.960 0.976 0.008 0.016
#> SRR2105357 1 0.2356 0.934 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105358 1 0.2261 0.937 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105439 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105440 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105509 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105510 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105507 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105508 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105505 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105506 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105503 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.1774 0.997 0.016 0.024 0.960
#> SRR2105501 2 0.4808 0.683 0.188 0.804 0.008
#> SRR2105502 3 0.2152 0.987 0.016 0.036 0.948
#> SRR2105499 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105500 1 0.0892 0.961 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105497 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105496 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105493 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105494 2 0.1453 0.937 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105491 2 0.0424 0.952 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105492 2 0.0424 0.952 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105489 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105487 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105488 1 0.2066 0.940 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105485 1 0.1411 0.956 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105486 1 0.1163 0.959 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105483 1 0.1860 0.933 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105484 1 0.2066 0.926 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105481 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105480 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105478 2 0.1267 0.941 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105475 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105476 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105473 2 0.1453 0.938 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105474 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105471 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105470 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105467 1 0.1529 0.953 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105468 1 0.1163 0.959 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105465 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105463 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105464 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105461 2 0.0747 0.948 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105462 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105457 1 0.0892 0.962 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105458 1 0.1411 0.955 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105455 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105453 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105454 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105451 2 0.4811 0.746 0.148 0.828 0.024
#> SRR2105452 3 0.1774 0.997 0.016 0.024 0.960
#> SRR2105449 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0892 0.940 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105445 1 0.7002 0.460 0.672 0.280 0.048
#> SRR2105446 1 0.2982 0.918 0.920 0.024 0.056
#> SRR2105443 2 0.6715 0.422 0.312 0.660 0.028
#> SRR2105444 2 0.7069 0.224 0.408 0.568 0.024
#> SRR2105441 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105442 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105437 1 0.1753 0.945 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105438 1 0.1753 0.945 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105435 1 0.0892 0.961 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105436 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105433 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105434 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105431 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105429 2 0.4629 0.692 0.188 0.808 0.004
#> SRR2105430 2 0.2772 0.864 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105427 2 0.0592 0.951 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105428 2 0.0747 0.948 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105425 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105421 1 0.0592 0.966 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105422 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.1031 0.962 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105420 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105415 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105416 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105417 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105413 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.0592 0.951 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105411 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 1 0.1964 0.945 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105408 1 0.2261 0.937 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105403 1 0.2165 0.938 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105404 1 0.2261 0.937 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105405 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105406 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.1636 0.932 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105402 3 0.1774 0.997 0.016 0.024 0.960
#> SRR2105399 2 0.5618 0.706 0.156 0.796 0.048
#> SRR2105400 2 0.5239 0.717 0.160 0.808 0.032
#> SRR2105397 1 0.7648 0.184 0.552 0.400 0.048
#> SRR2105398 1 0.7379 0.331 0.616 0.336 0.048
#> SRR2105395 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105390 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105391 1 0.1289 0.959 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105392 1 0.1031 0.962 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105385 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105386 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105387 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.2772 0.863 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105382 2 0.1878 0.911 0.044 0.952 0.004
#> SRR2105383 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105384 2 0.0237 0.954 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105379 2 0.0592 0.948 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105380 2 0.3607 0.813 0.112 0.880 0.008
#> SRR2105377 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105378 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105375 1 0.2187 0.937 0.948 0.028 0.024
#> SRR2105376 1 0.0892 0.961 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105373 1 0.1529 0.953 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105374 1 0.1643 0.947 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105371 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105372 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105369 1 0.0892 0.963 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105370 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105367 1 0.1411 0.953 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105368 1 0.1289 0.956 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105365 2 0.0237 0.954 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105366 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105363 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105360 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105356 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105353 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105354 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105351 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105352 3 0.1774 0.997 0.016 0.024 0.960
#> SRR2105349 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105347 2 0.0592 0.951 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105348 2 0.1170 0.942 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105343 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.0892 0.963 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105342 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105339 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105340 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105335 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105336 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105337 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105329 2 0.6482 0.462 0.296 0.680 0.024
#> SRR2105330 2 0.4413 0.786 0.124 0.852 0.024
#> SRR2105327 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105328 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105325 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105326 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105323 1 0.1753 0.946 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105324 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105319 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105320 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0747 0.961 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105322 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105317 2 0.0424 0.953 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105318 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105315 2 0.7476 0.097 0.452 0.512 0.036
#> SRR2105316 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105311 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105312 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105307 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.1031 0.961 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105310 1 0.1163 0.959 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105305 1 0.0892 0.963 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105306 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105303 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.1774 0.997 0.016 0.024 0.960
#> SRR2105301 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105302 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 1 0.4194 0.860 0.876 0.064 0.060
#> SRR2105300 1 0.7634 0.121 0.524 0.432 0.044
#> SRR2105297 2 0.7889 0.346 0.288 0.624 0.088
#> SRR2105298 2 0.7944 0.326 0.296 0.616 0.088
#> SRR2105295 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105292 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105289 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105288 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105283 2 0.4811 0.745 0.148 0.828 0.024
#> SRR2105284 2 0.6105 0.546 0.252 0.724 0.024
#> SRR2105281 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 1 0.2261 0.937 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105260 1 0.2165 0.939 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105279 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 1 0.0892 0.963 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105256 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105251 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105250 2 0.1015 0.946 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105247 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105246 1 0.1129 0.951 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105243 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105244 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105238 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105235 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105236 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105233 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105234 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105228 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105225 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105226 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105229 1 0.1964 0.944 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105230 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105219 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105220 2 0.0237 0.954 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105221 2 0.1267 0.941 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105222 2 0.1267 0.941 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105223 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105224 1 0.0592 0.964 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105217 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105214 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105211 1 0.0747 0.964 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105212 1 0.0747 0.964 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105209 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105205 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105206 2 0.0592 0.947 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105201 2 0.1267 0.941 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105202 2 0.1031 0.943 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105203 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105197 1 0.2066 0.940 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105198 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105195 1 0.1031 0.950 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105196 1 0.0661 0.962 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105193 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105191 1 0.2066 0.940 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105192 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105189 2 0.0592 0.951 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105190 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105187 2 0.1620 0.934 0.012 0.964 0.024
#> SRR2105188 2 0.5756 0.633 0.208 0.764 0.028
#> SRR2105179 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105183 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.1636 0.929 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105186 2 0.0848 0.947 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105181 1 0.1964 0.941 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105182 1 0.1031 0.961 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105177 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.1031 0.956 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105171 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105176 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105166 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105163 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105164 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105162 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105160 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105153 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 1 0.3039 0.913 0.920 0.036 0.044
#> SRR2105150 1 0.1636 0.953 0.964 0.016 0.020
#> SRR2105147 1 0.6672 0.105 0.520 0.008 0.472
#> SRR2105148 1 0.6672 0.105 0.520 0.008 0.472
#> SRR2105143 1 0.0000 0.966 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105144 1 0.1525 0.938 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105145 1 0.0747 0.957 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105146 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105141 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.1919 0.925 0.020 0.956 0.024
#> SRR2105138 2 0.4551 0.767 0.132 0.844 0.024
#> SRR2105135 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.2261 0.935 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105134 1 0.2066 0.939 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105131 2 0.7039 0.392 0.312 0.648 0.040
#> SRR2105132 1 0.3263 0.905 0.912 0.040 0.048
#> SRR2105129 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105130 1 0.1031 0.956 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105127 1 0.1999 0.947 0.952 0.012 0.036
#> SRR2105128 1 0.4316 0.839 0.868 0.088 0.044
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.4933 0.8637 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR2105278 3 0.4981 0.8536 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR2105275 1 0.3356 0.6204 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105276 1 0.3569 0.6066 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR2105273 1 0.2081 0.5963 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105274 1 0.1867 0.6081 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105271 1 0.1792 0.6126 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105272 1 0.3528 0.6106 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105269 2 0.0336 0.9476 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105270 2 0.0657 0.9482 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105267 2 0.0469 0.9475 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105268 2 0.1022 0.9455 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105265 2 0.1302 0.9415 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105266 2 0.1211 0.9418 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105263 2 0.2048 0.9355 0.008 0.928 0.064 0.000
#> SRR2105264 2 0.1174 0.9456 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR2105261 1 0.6511 -0.0852 0.640 0.188 0.172 0.000
#> SRR2105262 1 0.4728 0.2226 0.752 0.032 0.216 0.000
#> SRR2105357 3 0.4933 0.8608 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR2105358 3 0.4916 0.8611 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR2105439 2 0.0779 0.9463 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105440 2 0.0779 0.9470 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105509 2 0.0707 0.9476 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105510 2 0.0707 0.9459 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105507 1 0.2408 0.5617 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105508 1 0.2814 0.5238 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105505 1 0.4382 0.0779 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105506 1 0.3610 0.4288 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105503 2 0.1209 0.9473 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR2105504 4 0.0188 0.8887 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105501 2 0.2739 0.8883 0.060 0.904 0.036 0.000
#> SRR2105502 4 0.0469 0.8805 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105499 1 0.4134 0.1522 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105500 1 0.4406 -0.0640 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR2105497 2 0.0707 0.9463 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105498 2 0.0592 0.9485 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105495 2 0.0779 0.9466 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105496 2 0.0657 0.9468 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105493 2 0.0779 0.9468 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105494 2 0.0967 0.9466 0.004 0.976 0.016 0.004
#> SRR2105491 2 0.2101 0.9280 0.012 0.928 0.060 0.000
#> SRR2105492 2 0.2207 0.9273 0.012 0.928 0.056 0.004
#> SRR2105489 2 0.0921 0.9469 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105490 2 0.1211 0.9418 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105487 3 0.4994 0.6062 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR2105488 3 0.4925 0.3457 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105485 1 0.4977 -0.6815 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR2105486 1 0.4933 -0.6361 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR2105483 1 0.4673 0.5355 0.700 0.000 0.292 0.008
#> SRR2105484 1 0.4621 0.5444 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR2105481 1 0.2814 0.6341 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105482 1 0.3074 0.6327 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105479 1 0.3528 0.6051 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105480 1 0.3764 0.5954 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105477 2 0.1339 0.9436 0.008 0.964 0.024 0.004
#> SRR2105478 2 0.1543 0.9412 0.008 0.956 0.032 0.004
#> SRR2105475 2 0.0921 0.9446 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105476 2 0.1022 0.9439 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105473 2 0.1443 0.9395 0.008 0.960 0.028 0.004
#> SRR2105474 2 0.0657 0.9467 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105471 2 0.0817 0.9476 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105472 2 0.1109 0.9477 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR2105469 1 0.3311 0.4445 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105470 1 0.2530 0.5310 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105467 3 0.4994 0.8251 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR2105468 1 0.4776 -0.3399 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR2105465 1 0.2760 0.6306 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105466 1 0.3444 0.6175 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105463 1 0.4277 0.5552 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR2105464 1 0.4277 0.5552 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR2105461 2 0.0921 0.9457 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105462 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105459 2 0.0707 0.9471 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105460 2 0.0707 0.9459 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105457 1 0.4804 -0.3996 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105458 1 0.4941 -0.6162 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR2105455 1 0.2266 0.5851 0.912 0.004 0.084 0.000
#> SRR2105456 1 0.2408 0.5853 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105453 1 0.4981 -0.6879 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR2105454 1 0.4972 -0.6830 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR2105451 2 0.3266 0.8607 0.084 0.880 0.032 0.004
#> SRR2105452 4 0.0188 0.8887 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105449 1 0.3356 0.6137 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105450 1 0.3569 0.6111 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR2105447 2 0.1733 0.9291 0.028 0.948 0.024 0.000
#> SRR2105448 2 0.0921 0.9467 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105445 1 0.7974 -0.3624 0.408 0.268 0.320 0.004
#> SRR2105446 3 0.5137 0.8480 0.452 0.004 0.544 0.000
#> SRR2105443 2 0.5626 0.5780 0.244 0.696 0.056 0.004
#> SRR2105444 2 0.6396 0.4082 0.304 0.612 0.080 0.004
#> SRR2105441 2 0.0657 0.9474 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105442 2 0.0469 0.9478 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105437 1 0.4948 0.2671 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR2105438 1 0.4989 0.1649 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR2105435 1 0.4313 0.1666 0.736 0.004 0.260 0.000
#> SRR2105436 1 0.3907 0.2603 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105433 1 0.4250 0.5578 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105434 1 0.3907 0.5930 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105431 1 0.4103 0.5792 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105432 1 0.3975 0.5874 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105429 2 0.4301 0.7827 0.120 0.816 0.064 0.000
#> SRR2105430 2 0.2546 0.8970 0.060 0.912 0.028 0.000
#> SRR2105427 2 0.0707 0.9474 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105428 2 0.0779 0.9459 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105425 2 0.0817 0.9469 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105426 2 0.0592 0.9475 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105421 1 0.3895 0.4020 0.804 0.012 0.184 0.000
#> SRR2105422 1 0.2345 0.5492 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR2105423 2 0.1389 0.9394 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105424 2 0.1211 0.9439 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105419 1 0.4103 0.2310 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105420 1 0.3688 0.3491 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105415 1 0.4008 0.5850 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105416 1 0.3873 0.5962 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105417 1 0.3123 0.6219 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105418 1 0.4304 0.5513 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105413 2 0.0921 0.9458 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105414 2 0.0921 0.9447 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105409 2 0.0592 0.9477 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105410 2 0.0524 0.9475 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105411 2 0.1389 0.9426 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105412 2 0.1211 0.9433 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105407 3 0.4972 0.8439 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR2105408 3 0.4948 0.8513 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR2105403 3 0.4907 0.8573 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105404 3 0.4961 0.8562 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR2105405 1 0.2345 0.5858 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR2105406 1 0.2530 0.6042 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105401 2 0.1593 0.9378 0.016 0.956 0.024 0.004
#> SRR2105402 4 0.0188 0.8887 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105399 2 0.5035 0.7592 0.124 0.796 0.040 0.040
#> SRR2105400 2 0.4675 0.7540 0.144 0.800 0.044 0.012
#> SRR2105397 2 0.7470 0.0837 0.332 0.496 0.168 0.004
#> SRR2105398 2 0.7566 -0.0315 0.360 0.464 0.172 0.004
#> SRR2105395 2 0.1118 0.9452 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105396 2 0.1211 0.9429 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105393 2 0.0921 0.9455 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105394 2 0.1474 0.9408 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105389 1 0.3569 0.4282 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR2105390 1 0.3123 0.5177 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105391 1 0.4804 -0.3760 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105392 1 0.4817 -0.4155 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR2105385 1 0.2589 0.5500 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105386 1 0.2868 0.5220 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR2105387 1 0.2081 0.6187 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105388 1 0.2589 0.5799 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105381 2 0.2546 0.8945 0.060 0.912 0.028 0.000
#> SRR2105382 2 0.1629 0.9349 0.024 0.952 0.024 0.000
#> SRR2105383 2 0.0469 0.9473 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105384 2 0.0657 0.9484 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105379 2 0.1256 0.9431 0.008 0.964 0.028 0.000
#> SRR2105380 2 0.2751 0.8992 0.040 0.904 0.056 0.000
#> SRR2105377 2 0.0779 0.9463 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105378 2 0.0779 0.9463 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105375 1 0.5444 0.0924 0.688 0.048 0.264 0.000
#> SRR2105376 1 0.4382 0.3344 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105373 1 0.3764 0.4215 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105374 1 0.4855 0.3416 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR2105371 1 0.2647 0.5467 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR2105372 1 0.2469 0.5595 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR2105369 1 0.4008 0.2873 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105370 1 0.3528 0.4322 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105367 1 0.5273 -0.6006 0.536 0.008 0.456 0.000
#> SRR2105368 1 0.5442 0.3140 0.672 0.040 0.288 0.000
#> SRR2105365 2 0.2255 0.9304 0.012 0.920 0.068 0.000
#> SRR2105366 2 0.2021 0.9320 0.012 0.932 0.056 0.000
#> SRR2105363 2 0.0707 0.9471 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105364 2 0.0469 0.9475 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105361 2 0.1211 0.9445 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105362 2 0.0921 0.9489 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105359 1 0.3649 0.3856 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR2105360 1 0.2530 0.5351 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105355 1 0.3311 0.4550 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105356 1 0.2589 0.5467 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105353 1 0.2149 0.6091 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR2105354 1 0.2149 0.6159 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR2105351 2 0.1022 0.9483 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105352 4 0.0188 0.8887 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105349 2 0.0921 0.9445 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105350 2 0.0817 0.9469 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105345 2 0.0188 0.9480 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105346 2 0.1118 0.9468 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105347 2 0.0657 0.9481 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105348 2 0.0336 0.9474 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105343 2 0.1474 0.9402 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105344 2 0.1118 0.9450 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105341 1 0.4164 0.1988 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105342 1 0.3649 0.3914 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR2105339 1 0.2760 0.5350 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105340 1 0.1940 0.6209 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105335 1 0.3649 0.4094 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR2105336 1 0.2760 0.5870 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105337 1 0.1474 0.6062 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105338 1 0.2011 0.6342 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105331 2 0.0592 0.9455 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105332 2 0.0921 0.9484 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105333 2 0.0817 0.9452 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105334 2 0.0921 0.9459 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105329 2 0.5144 0.6989 0.168 0.760 0.068 0.004
#> SRR2105330 2 0.2924 0.8889 0.060 0.900 0.036 0.004
#> SRR2105327 2 0.1022 0.9437 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105328 2 0.1022 0.9441 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105325 1 0.3764 0.5986 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR2105326 1 0.3726 0.5989 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR2105323 3 0.4994 0.8423 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR2105324 1 0.4500 -0.1243 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105319 1 0.2408 0.6342 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105320 1 0.3266 0.6218 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105321 1 0.3539 0.6213 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR2105322 1 0.3831 0.6021 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR2105317 2 0.0469 0.9475 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105318 2 0.0707 0.9483 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105315 2 0.7136 0.3339 0.188 0.580 0.228 0.004
#> SRR2105316 2 0.0817 0.9460 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105313 2 0.0921 0.9458 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105314 2 0.0707 0.9485 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105311 1 0.4018 0.5935 0.772 0.000 0.224 0.004
#> SRR2105312 1 0.3873 0.5954 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105307 1 0.2973 0.5798 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105308 1 0.2704 0.5995 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105309 1 0.4961 -0.6518 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR2105310 1 0.4933 -0.5954 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR2105305 1 0.4543 -0.0764 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR2105306 1 0.3123 0.4872 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105303 2 0.0592 0.9481 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105304 4 0.0188 0.8887 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105301 2 0.0921 0.9446 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105302 2 0.1022 0.9492 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105299 3 0.6148 0.7812 0.468 0.048 0.484 0.000
#> SRR2105300 2 0.7723 0.0399 0.264 0.484 0.248 0.004
#> SRR2105297 2 0.5779 0.6850 0.140 0.752 0.068 0.040
#> SRR2105298 2 0.5862 0.6737 0.140 0.748 0.068 0.044
#> SRR2105295 2 0.0817 0.9462 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105296 2 0.0707 0.9463 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105293 1 0.3311 0.6168 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105294 1 0.2921 0.6257 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105291 1 0.3400 0.4520 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105292 1 0.3172 0.6233 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR2105289 1 0.2011 0.5688 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105290 1 0.1389 0.6158 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105287 1 0.3444 0.5476 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105288 1 0.2216 0.6240 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105285 2 0.0921 0.9458 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105286 2 0.0921 0.9447 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105283 2 0.2409 0.9100 0.040 0.924 0.032 0.004
#> SRR2105284 2 0.3734 0.8367 0.096 0.856 0.044 0.004
#> SRR2105281 2 0.1389 0.9412 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105282 2 0.1118 0.9445 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105259 3 0.4955 0.8486 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR2105260 3 0.4955 0.8546 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR2105279 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105280 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105257 1 0.2760 0.5933 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105258 1 0.3024 0.6287 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105253 2 0.0592 0.9468 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105254 2 0.0336 0.9467 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105255 1 0.4193 0.1965 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105256 1 0.4103 0.2820 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105251 2 0.1118 0.9443 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105252 2 0.0921 0.9478 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105249 2 0.0524 0.9468 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105250 2 0.1114 0.9450 0.008 0.972 0.016 0.004
#> SRR2105247 2 0.0707 0.9471 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105248 2 0.1118 0.9430 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105245 1 0.2760 0.6299 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105246 1 0.4039 0.5241 0.836 0.080 0.084 0.000
#> SRR2105243 1 0.2408 0.5497 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105244 1 0.1474 0.6125 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105241 1 0.1792 0.6269 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105242 1 0.2647 0.6330 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR2105239 1 0.2737 0.6354 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR2105240 1 0.2760 0.6256 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR2105237 2 0.1109 0.9443 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105238 2 0.0895 0.9459 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105235 2 0.0779 0.9470 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105236 2 0.0592 0.9479 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105233 2 0.1004 0.9454 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105234 2 0.1022 0.9458 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105231 2 0.0921 0.9476 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105232 2 0.1118 0.9430 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105227 1 0.2142 0.6092 0.928 0.016 0.056 0.000
#> SRR2105228 1 0.3013 0.6262 0.888 0.032 0.080 0.000
#> SRR2105225 1 0.1389 0.6012 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105226 1 0.1867 0.6320 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105229 1 0.4632 -0.2186 0.688 0.004 0.308 0.000
#> SRR2105230 1 0.2921 0.5368 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105219 2 0.0592 0.9471 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR2105220 2 0.0657 0.9478 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105221 2 0.0844 0.9466 0.004 0.980 0.012 0.004
#> SRR2105222 2 0.0859 0.9465 0.008 0.980 0.008 0.004
#> SRR2105223 1 0.2704 0.5313 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105224 1 0.2704 0.5468 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105217 2 0.1389 0.9452 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105218 2 0.1211 0.9422 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105215 2 0.1389 0.9412 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105216 2 0.1302 0.9415 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105213 1 0.2408 0.6254 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105214 1 0.2466 0.6319 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105211 1 0.4406 -0.0261 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR2105212 1 0.4500 -0.1439 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR2105209 1 0.2704 0.5580 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105210 1 0.2530 0.6329 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105207 1 0.3528 0.6202 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105208 1 0.4134 0.5726 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105205 2 0.1109 0.9440 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR2105206 2 0.1356 0.9422 0.008 0.960 0.032 0.000
#> SRR2105201 2 0.0657 0.9467 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105202 2 0.0779 0.9463 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR2105203 2 0.1211 0.9441 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105204 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105199 2 0.1302 0.9425 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105200 2 0.1022 0.9466 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105197 1 0.4999 -0.7958 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR2105198 3 0.5296 0.7856 0.492 0.008 0.500 0.000
#> SRR2105195 1 0.3621 0.5783 0.860 0.068 0.072 0.000
#> SRR2105196 1 0.5033 0.5615 0.760 0.072 0.168 0.000
#> SRR2105193 1 0.4164 0.5701 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105194 1 0.4164 0.5692 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105191 3 0.4977 0.8544 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR2105192 1 0.4972 -0.6289 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR2105189 2 0.1109 0.9441 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR2105190 2 0.0707 0.9472 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105187 2 0.1575 0.9409 0.012 0.956 0.028 0.004
#> SRR2105188 2 0.4153 0.8148 0.084 0.836 0.076 0.004
#> SRR2105179 1 0.1637 0.6283 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105180 1 0.3444 0.6207 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105183 2 0.1474 0.9389 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105184 2 0.1211 0.9418 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105185 2 0.1516 0.9428 0.016 0.960 0.016 0.008
#> SRR2105186 2 0.1377 0.9457 0.008 0.964 0.020 0.008
#> SRR2105181 3 0.5000 0.8282 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR2105182 1 0.4888 -0.5487 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105177 1 0.4250 0.5578 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105178 1 0.4535 0.5399 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR2105171 2 0.0921 0.9483 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105172 2 0.1389 0.9416 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105175 1 0.4040 0.5772 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR2105176 1 0.4331 0.5474 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR2105173 2 0.1302 0.9456 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105174 2 0.1302 0.9415 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105169 2 0.1302 0.9423 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105170 2 0.0657 0.9487 0.004 0.984 0.012 0.000
#> SRR2105167 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105168 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105165 1 0.3172 0.6254 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR2105166 1 0.3486 0.6096 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105163 1 0.3486 0.6130 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105164 1 0.3688 0.6006 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR2105161 1 0.3873 0.5929 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105162 1 0.4331 0.5484 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR2105155 2 0.1118 0.9450 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105156 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105157 2 0.1302 0.9443 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR2105158 2 0.1890 0.9385 0.008 0.936 0.056 0.000
#> SRR2105159 1 0.3801 0.5927 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR2105160 1 0.3907 0.5886 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105153 2 0.1211 0.9456 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR2105154 2 0.1489 0.9448 0.004 0.952 0.044 0.000
#> SRR2105151 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105152 2 0.1474 0.9377 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR2105149 1 0.6868 -0.4866 0.544 0.120 0.336 0.000
#> SRR2105150 1 0.5873 -0.0662 0.668 0.076 0.256 0.000
#> SRR2105147 4 0.7256 -0.2598 0.444 0.016 0.092 0.448
#> SRR2105148 1 0.7091 -0.1879 0.452 0.008 0.096 0.444
#> SRR2105143 1 0.2271 0.6276 0.916 0.008 0.076 0.000
#> SRR2105144 1 0.4756 0.4810 0.784 0.144 0.072 0.000
#> SRR2105145 1 0.4436 0.5893 0.764 0.020 0.216 0.000
#> SRR2105146 1 0.4040 0.5774 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR2105141 2 0.1209 0.9448 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR2105142 2 0.1022 0.9453 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105139 2 0.1389 0.9394 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR2105140 2 0.1118 0.9444 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105137 2 0.1109 0.9432 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105138 2 0.2680 0.8957 0.048 0.912 0.036 0.004
#> SRR2105135 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105136 2 0.1557 0.9372 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR2105133 3 0.4941 0.8653 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR2105134 3 0.4985 0.8511 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR2105131 2 0.6020 0.5919 0.128 0.700 0.168 0.004
#> SRR2105132 3 0.6621 0.6764 0.408 0.084 0.508 0.000
#> SRR2105129 1 0.4538 0.5823 0.760 0.024 0.216 0.000
#> SRR2105130 1 0.4647 0.5403 0.704 0.000 0.288 0.008
#> SRR2105127 1 0.5856 -0.7452 0.504 0.032 0.464 0.000
#> SRR2105128 3 0.6817 0.6670 0.408 0.100 0.492 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.1525 0.59887 0.036 0.000 0.948 0.004 NA
#> SRR2105278 3 0.1605 0.59874 0.040 0.000 0.944 0.004 NA
#> SRR2105275 1 0.4926 0.52406 0.716 0.000 0.132 0.000 NA
#> SRR2105276 1 0.3970 0.54560 0.788 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105273 1 0.5414 0.22363 0.528 0.000 0.412 0.000 NA
#> SRR2105274 1 0.5351 0.32220 0.560 0.000 0.380 0.000 NA
#> SRR2105271 1 0.4575 0.41565 0.648 0.000 0.328 0.000 NA
#> SRR2105272 1 0.3569 0.58539 0.828 0.000 0.104 0.000 NA
#> SRR2105269 2 0.2054 0.87481 0.000 0.916 0.008 0.004 NA
#> SRR2105270 2 0.3167 0.83050 0.000 0.820 0.004 0.004 NA
#> SRR2105267 2 0.1430 0.87442 0.000 0.944 0.004 0.000 NA
#> SRR2105268 2 0.1251 0.87300 0.000 0.956 0.008 0.000 NA
#> SRR2105265 2 0.1408 0.87243 0.000 0.948 0.008 0.000 NA
#> SRR2105266 2 0.1670 0.87046 0.000 0.936 0.012 0.000 NA
#> SRR2105263 2 0.3989 0.73394 0.004 0.728 0.008 0.000 NA
#> SRR2105264 2 0.3266 0.80421 0.004 0.796 0.000 0.000 NA
#> SRR2105261 3 0.7218 0.12262 0.368 0.160 0.428 0.000 NA
#> SRR2105262 3 0.5395 0.14981 0.436 0.028 0.520 0.000 NA
#> SRR2105357 3 0.1808 0.60213 0.040 0.000 0.936 0.004 NA
#> SRR2105358 3 0.1412 0.59921 0.036 0.000 0.952 0.004 NA
#> SRR2105439 2 0.3689 0.76472 0.004 0.740 0.000 0.000 NA
#> SRR2105440 2 0.3689 0.76344 0.000 0.740 0.000 0.004 NA
#> SRR2105509 2 0.2349 0.87129 0.000 0.900 0.012 0.004 NA
#> SRR2105510 2 0.2130 0.87054 0.000 0.908 0.012 0.000 NA
#> SRR2105507 1 0.5295 0.24857 0.540 0.000 0.408 0.000 NA
#> SRR2105508 1 0.5283 0.13795 0.508 0.000 0.444 0.000 NA
#> SRR2105505 3 0.4083 0.55220 0.228 0.000 0.744 0.000 NA
#> SRR2105506 3 0.5252 0.37846 0.316 0.000 0.616 0.000 NA
#> SRR2105503 2 0.2074 0.86141 0.000 0.896 0.000 0.000 NA
#> SRR2105504 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105501 2 0.4478 0.80816 0.028 0.776 0.044 0.000 NA
#> SRR2105502 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105499 3 0.4649 0.28528 0.404 0.000 0.580 0.000 NA
#> SRR2105500 3 0.4626 0.37354 0.364 0.000 0.616 0.000 NA
#> SRR2105497 2 0.1121 0.87287 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105498 2 0.1952 0.86973 0.000 0.912 0.004 0.000 NA
#> SRR2105495 2 0.3452 0.78394 0.000 0.756 0.000 0.000 NA
#> SRR2105496 2 0.3579 0.77977 0.004 0.756 0.000 0.000 NA
#> SRR2105493 2 0.3689 0.78017 0.004 0.740 0.000 0.000 NA
#> SRR2105494 2 0.3715 0.77281 0.004 0.736 0.000 0.000 NA
#> SRR2105491 2 0.3920 0.72247 0.004 0.724 0.004 0.000 NA
#> SRR2105492 2 0.3944 0.72142 0.004 0.720 0.004 0.000 NA
#> SRR2105489 2 0.2921 0.83545 0.004 0.844 0.004 0.000 NA
#> SRR2105490 2 0.1830 0.87134 0.000 0.924 0.008 0.000 NA
#> SRR2105487 3 0.3962 0.43805 0.240 0.000 0.744 0.004 NA
#> SRR2105488 3 0.4897 0.23732 0.352 0.000 0.616 0.004 NA
#> SRR2105485 3 0.2930 0.59589 0.164 0.000 0.832 0.000 NA
#> SRR2105486 3 0.2930 0.59754 0.164 0.000 0.832 0.000 NA
#> SRR2105483 1 0.3783 0.47141 0.768 0.000 0.012 0.004 NA
#> SRR2105484 1 0.3783 0.47141 0.768 0.000 0.012 0.004 NA
#> SRR2105481 1 0.3769 0.55391 0.788 0.000 0.180 0.000 NA
#> SRR2105482 1 0.3897 0.55702 0.768 0.000 0.204 0.000 NA
#> SRR2105479 1 0.3242 0.56412 0.844 0.000 0.040 0.000 NA
#> SRR2105480 1 0.2260 0.57299 0.908 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105477 2 0.3766 0.78352 0.004 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105478 2 0.4327 0.69746 0.008 0.632 0.000 0.000 NA
#> SRR2105475 2 0.2289 0.86696 0.000 0.904 0.012 0.004 NA
#> SRR2105476 2 0.2069 0.86732 0.000 0.912 0.012 0.000 NA
#> SRR2105473 2 0.3844 0.76820 0.004 0.736 0.004 0.000 NA
#> SRR2105474 2 0.3861 0.76598 0.008 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105471 2 0.3044 0.83749 0.004 0.840 0.008 0.000 NA
#> SRR2105472 2 0.3509 0.80407 0.004 0.792 0.008 0.000 NA
#> SRR2105469 3 0.4906 0.01078 0.480 0.000 0.496 0.000 NA
#> SRR2105470 1 0.4397 0.20038 0.564 0.000 0.432 0.000 NA
#> SRR2105467 3 0.1877 0.60640 0.064 0.000 0.924 0.000 NA
#> SRR2105468 3 0.3106 0.59957 0.140 0.000 0.840 0.000 NA
#> SRR2105465 1 0.5205 0.52561 0.672 0.000 0.224 0.000 NA
#> SRR2105466 1 0.4139 0.53832 0.784 0.000 0.084 0.000 NA
#> SRR2105463 1 0.3724 0.48066 0.776 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105464 1 0.3656 0.48755 0.784 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105461 2 0.1484 0.87517 0.000 0.944 0.008 0.000 NA
#> SRR2105462 2 0.1670 0.86985 0.000 0.936 0.012 0.000 NA
#> SRR2105459 2 0.2017 0.87303 0.000 0.912 0.008 0.000 NA
#> SRR2105460 2 0.1764 0.87172 0.000 0.928 0.008 0.000 NA
#> SRR2105457 3 0.4703 0.41806 0.340 0.000 0.632 0.000 NA
#> SRR2105458 3 0.4420 0.49311 0.280 0.000 0.692 0.000 NA
#> SRR2105455 1 0.4769 0.31263 0.588 0.004 0.392 0.000 NA
#> SRR2105456 1 0.5185 0.33946 0.568 0.000 0.384 0.000 NA
#> SRR2105453 3 0.3211 0.54062 0.164 0.000 0.824 0.004 NA
#> SRR2105454 3 0.3239 0.54850 0.156 0.000 0.828 0.004 NA
#> SRR2105451 2 0.5327 0.72858 0.044 0.668 0.028 0.000 NA
#> SRR2105452 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105449 1 0.2142 0.58099 0.920 0.004 0.048 0.000 NA
#> SRR2105450 1 0.3526 0.57456 0.832 0.000 0.096 0.000 NA
#> SRR2105447 2 0.2237 0.86844 0.008 0.904 0.004 0.000 NA
#> SRR2105448 2 0.1831 0.86808 0.000 0.920 0.004 0.000 NA
#> SRR2105445 3 0.6734 0.36197 0.060 0.148 0.592 0.000 NA
#> SRR2105446 3 0.2209 0.60196 0.056 0.000 0.912 0.000 NA
#> SRR2105443 2 0.7404 0.36667 0.056 0.476 0.208 0.000 NA
#> SRR2105444 2 0.8043 0.25395 0.148 0.428 0.168 0.000 NA
#> SRR2105441 2 0.3300 0.80459 0.004 0.792 0.000 0.000 NA
#> SRR2105442 2 0.2170 0.87609 0.004 0.904 0.004 0.000 NA
#> SRR2105437 1 0.6350 0.06252 0.456 0.000 0.400 0.004 NA
#> SRR2105438 1 0.6328 0.03813 0.448 0.000 0.412 0.004 NA
#> SRR2105435 3 0.4793 0.19393 0.436 0.000 0.544 0.000 NA
#> SRR2105436 3 0.4359 0.27359 0.412 0.000 0.584 0.000 NA
#> SRR2105433 1 0.3319 0.51443 0.820 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105434 1 0.4238 0.52284 0.768 0.000 0.068 0.000 NA
#> SRR2105431 1 0.3991 0.51774 0.780 0.000 0.048 0.000 NA
#> SRR2105432 1 0.4049 0.52059 0.780 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105429 2 0.5255 0.74648 0.100 0.744 0.064 0.000 NA
#> SRR2105430 2 0.3375 0.84941 0.040 0.852 0.012 0.000 NA
#> SRR2105427 2 0.2471 0.86226 0.000 0.864 0.000 0.000 NA
#> SRR2105428 2 0.2629 0.86097 0.000 0.860 0.004 0.000 NA
#> SRR2105425 2 0.1544 0.87166 0.000 0.932 0.000 0.000 NA
#> SRR2105426 2 0.1430 0.87530 0.004 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105421 1 0.5124 -0.00198 0.488 0.004 0.480 0.000 NA
#> SRR2105422 1 0.4798 0.16744 0.540 0.000 0.440 0.000 NA
#> SRR2105423 2 0.1469 0.87180 0.000 0.948 0.016 0.000 NA
#> SRR2105424 2 0.0898 0.87282 0.000 0.972 0.008 0.000 NA
#> SRR2105419 3 0.4702 0.19848 0.432 0.000 0.552 0.000 NA
#> SRR2105420 3 0.4727 0.12792 0.452 0.000 0.532 0.000 NA
#> SRR2105415 1 0.3647 0.52737 0.816 0.000 0.052 0.000 NA
#> SRR2105416 1 0.5305 0.43194 0.672 0.000 0.132 0.000 NA
#> SRR2105417 1 0.4996 0.54451 0.708 0.000 0.164 0.000 NA
#> SRR2105418 1 0.3630 0.48357 0.780 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR2105413 2 0.1894 0.86891 0.000 0.920 0.008 0.000 NA
#> SRR2105414 2 0.2077 0.86862 0.000 0.908 0.008 0.000 NA
#> SRR2105409 2 0.1942 0.87243 0.000 0.920 0.012 0.000 NA
#> SRR2105410 2 0.3366 0.80525 0.000 0.784 0.004 0.000 NA
#> SRR2105411 2 0.1195 0.87118 0.000 0.960 0.012 0.000 NA
#> SRR2105412 2 0.1522 0.87203 0.000 0.944 0.012 0.000 NA
#> SRR2105407 3 0.1901 0.60379 0.056 0.000 0.928 0.004 NA
#> SRR2105408 3 0.1630 0.60033 0.036 0.000 0.944 0.004 NA
#> SRR2105403 3 0.1538 0.59740 0.036 0.000 0.948 0.008 NA
#> SRR2105404 3 0.1605 0.60065 0.040 0.000 0.944 0.004 NA
#> SRR2105405 1 0.5568 0.27022 0.516 0.000 0.412 0.000 NA
#> SRR2105406 1 0.5804 0.38716 0.544 0.000 0.352 0.000 NA
#> SRR2105401 2 0.2753 0.86094 0.000 0.856 0.008 0.000 NA
#> SRR2105402 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105399 2 0.5629 0.74049 0.016 0.732 0.104 0.048 NA
#> SRR2105400 2 0.5185 0.72674 0.020 0.740 0.140 0.008 NA
#> SRR2105397 2 0.8490 -0.09836 0.196 0.332 0.248 0.000 NA
#> SRR2105398 2 0.8537 -0.13272 0.228 0.320 0.224 0.000 NA
#> SRR2105395 2 0.1697 0.87310 0.000 0.932 0.008 0.000 NA
#> SRR2105396 2 0.2166 0.87163 0.004 0.912 0.012 0.000 NA
#> SRR2105393 2 0.1281 0.87341 0.000 0.956 0.012 0.000 NA
#> SRR2105394 2 0.1697 0.86963 0.000 0.932 0.008 0.000 NA
#> SRR2105389 3 0.5173 0.04616 0.460 0.000 0.500 0.000 NA
#> SRR2105390 1 0.5234 0.06236 0.496 0.000 0.460 0.000 NA
#> SRR2105391 3 0.4360 0.48738 0.300 0.000 0.680 0.000 NA
#> SRR2105392 3 0.4014 0.53625 0.256 0.000 0.728 0.000 NA
#> SRR2105385 1 0.5095 0.27076 0.560 0.000 0.400 0.000 NA
#> SRR2105386 1 0.4930 0.20096 0.548 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR2105387 1 0.4522 0.44300 0.660 0.000 0.316 0.000 NA
#> SRR2105388 1 0.5103 0.31047 0.556 0.000 0.404 0.000 NA
#> SRR2105381 2 0.3244 0.84784 0.008 0.860 0.048 0.000 NA
#> SRR2105382 2 0.2732 0.86318 0.020 0.884 0.008 0.000 NA
#> SRR2105383 2 0.0963 0.87752 0.000 0.964 0.000 0.000 NA
#> SRR2105384 2 0.1430 0.87731 0.004 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105379 2 0.1831 0.86978 0.004 0.920 0.000 0.000 NA
#> SRR2105380 2 0.3810 0.81037 0.100 0.812 0.000 0.000 NA
#> SRR2105377 2 0.3452 0.77712 0.000 0.756 0.000 0.000 NA
#> SRR2105378 2 0.3662 0.77119 0.004 0.744 0.000 0.000 NA
#> SRR2105375 1 0.6050 0.08687 0.508 0.052 0.408 0.000 NA
#> SRR2105376 1 0.4736 0.23429 0.576 0.000 0.404 0.000 NA
#> SRR2105373 3 0.5216 0.35918 0.344 0.000 0.604 0.004 NA
#> SRR2105374 1 0.5732 0.05950 0.496 0.000 0.428 0.004 NA
#> SRR2105371 1 0.5286 0.11104 0.504 0.000 0.448 0.000 NA
#> SRR2105372 1 0.5283 0.12205 0.508 0.000 0.444 0.000 NA
#> SRR2105369 3 0.4958 0.33492 0.372 0.000 0.592 0.000 NA
#> SRR2105370 3 0.4948 0.12836 0.436 0.000 0.536 0.000 NA
#> SRR2105367 3 0.5111 0.33407 0.360 0.008 0.604 0.004 NA
#> SRR2105368 1 0.5367 0.32477 0.616 0.032 0.328 0.000 NA
#> SRR2105365 2 0.4064 0.72267 0.004 0.716 0.008 0.000 NA
#> SRR2105366 2 0.3920 0.72791 0.004 0.724 0.004 0.000 NA
#> SRR2105363 2 0.1965 0.87398 0.000 0.904 0.000 0.000 NA
#> SRR2105364 2 0.1197 0.87595 0.000 0.952 0.000 0.000 NA
#> SRR2105361 2 0.1205 0.87479 0.000 0.956 0.004 0.000 NA
#> SRR2105362 2 0.1205 0.87663 0.000 0.956 0.004 0.000 NA
#> SRR2105359 3 0.4740 0.07733 0.468 0.000 0.516 0.000 NA
#> SRR2105360 1 0.4731 0.14164 0.528 0.000 0.456 0.000 NA
#> SRR2105355 1 0.5115 0.00993 0.484 0.000 0.480 0.000 NA
#> SRR2105356 1 0.5131 0.22162 0.540 0.000 0.420 0.000 NA
#> SRR2105353 1 0.5355 0.41714 0.624 0.000 0.292 0.000 NA
#> SRR2105354 1 0.5338 0.38139 0.604 0.000 0.324 0.000 NA
#> SRR2105351 2 0.1331 0.87459 0.000 0.952 0.008 0.000 NA
#> SRR2105352 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105349 2 0.2069 0.86804 0.000 0.912 0.012 0.000 NA
#> SRR2105350 2 0.0671 0.87471 0.000 0.980 0.004 0.000 NA
#> SRR2105345 2 0.2732 0.83729 0.000 0.840 0.000 0.000 NA
#> SRR2105346 2 0.1408 0.87375 0.000 0.948 0.008 0.000 NA
#> SRR2105347 2 0.3087 0.84226 0.008 0.836 0.004 0.000 NA
#> SRR2105348 2 0.3826 0.82318 0.012 0.788 0.008 0.004 NA
#> SRR2105343 2 0.1364 0.87303 0.000 0.952 0.012 0.000 NA
#> SRR2105344 2 0.1281 0.87170 0.000 0.956 0.012 0.000 NA
#> SRR2105341 3 0.5019 0.28422 0.396 0.000 0.568 0.000 NA
#> SRR2105342 3 0.4976 0.04304 0.468 0.000 0.504 0.000 NA
#> SRR2105339 1 0.5077 0.19309 0.536 0.000 0.428 0.000 NA
#> SRR2105340 1 0.4965 0.42652 0.644 0.000 0.304 0.000 NA
#> SRR2105335 3 0.5019 0.28392 0.396 0.000 0.568 0.000 NA
#> SRR2105336 3 0.5557 -0.04220 0.464 0.000 0.468 0.000 NA
#> SRR2105337 1 0.4599 0.32371 0.600 0.000 0.384 0.000 NA
#> SRR2105338 1 0.3916 0.51673 0.732 0.000 0.256 0.000 NA
#> SRR2105331 2 0.1478 0.87307 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105332 2 0.2833 0.84134 0.004 0.852 0.004 0.000 NA
#> SRR2105333 2 0.2130 0.86768 0.000 0.908 0.012 0.000 NA
#> SRR2105334 2 0.1608 0.86912 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105329 2 0.6845 0.48388 0.032 0.536 0.184 0.000 NA
#> SRR2105330 2 0.4770 0.76303 0.024 0.708 0.024 0.000 NA
#> SRR2105327 2 0.2077 0.86727 0.000 0.908 0.008 0.000 NA
#> SRR2105328 2 0.2136 0.86779 0.000 0.904 0.008 0.000 NA
#> SRR2105325 1 0.4088 0.53857 0.776 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105326 1 0.4088 0.53857 0.776 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105323 3 0.2707 0.60923 0.080 0.000 0.888 0.008 NA
#> SRR2105324 3 0.4387 0.41146 0.348 0.000 0.640 0.000 NA
#> SRR2105319 1 0.4930 0.50541 0.684 0.000 0.244 0.000 NA
#> SRR2105320 1 0.4210 0.56873 0.780 0.000 0.124 0.000 NA
#> SRR2105321 1 0.4951 0.53929 0.720 0.000 0.104 0.004 NA
#> SRR2105322 1 0.4088 0.54207 0.776 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105317 2 0.1831 0.87432 0.000 0.920 0.004 0.000 NA
#> SRR2105318 2 0.1430 0.87657 0.000 0.944 0.004 0.000 NA
#> SRR2105315 2 0.7733 0.10791 0.072 0.404 0.320 0.000 NA
#> SRR2105316 2 0.2249 0.86963 0.000 0.896 0.008 0.000 NA
#> SRR2105313 2 0.1894 0.87070 0.000 0.920 0.008 0.000 NA
#> SRR2105314 2 0.1270 0.87582 0.000 0.948 0.000 0.000 NA
#> SRR2105311 1 0.4354 0.53971 0.768 0.000 0.068 0.004 NA
#> SRR2105312 1 0.3970 0.54170 0.788 0.000 0.056 0.000 NA
#> SRR2105307 1 0.5971 0.27954 0.492 0.000 0.396 0.000 NA
#> SRR2105308 1 0.6035 0.38644 0.536 0.000 0.328 0.000 NA
#> SRR2105309 3 0.4292 0.51371 0.272 0.000 0.704 0.000 NA
#> SRR2105310 3 0.4275 0.49866 0.284 0.000 0.696 0.000 NA
#> SRR2105305 3 0.4717 0.30374 0.396 0.000 0.584 0.000 NA
#> SRR2105306 1 0.4904 0.07227 0.504 0.000 0.472 0.000 NA
#> SRR2105303 2 0.1043 0.87496 0.000 0.960 0.000 0.000 NA
#> SRR2105304 4 0.0162 0.85992 0.000 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR2105301 2 0.1894 0.86892 0.000 0.920 0.008 0.000 NA
#> SRR2105302 2 0.0880 0.87456 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105299 3 0.3368 0.58768 0.068 0.008 0.860 0.004 NA
#> SRR2105300 3 0.7731 -0.03583 0.072 0.356 0.376 0.000 NA
#> SRR2105297 2 0.7006 0.44239 0.164 0.548 0.024 0.016 NA
#> SRR2105298 2 0.6832 0.48324 0.152 0.564 0.020 0.016 NA
#> SRR2105295 2 0.1830 0.86922 0.000 0.924 0.008 0.000 NA
#> SRR2105296 2 0.1608 0.87237 0.000 0.928 0.000 0.000 NA
#> SRR2105293 1 0.4238 0.55358 0.776 0.000 0.088 0.000 NA
#> SRR2105294 1 0.3115 0.58136 0.852 0.000 0.112 0.000 NA
#> SRR2105291 1 0.4731 0.08454 0.528 0.000 0.456 0.000 NA
#> SRR2105292 1 0.3569 0.57253 0.828 0.000 0.104 0.000 NA
#> SRR2105289 1 0.4604 0.22072 0.560 0.000 0.428 0.000 NA
#> SRR2105290 1 0.4541 0.48231 0.680 0.000 0.288 0.000 NA
#> SRR2105287 1 0.5440 0.30759 0.540 0.000 0.396 0.000 NA
#> SRR2105288 1 0.5572 0.49568 0.628 0.000 0.248 0.000 NA
#> SRR2105285 2 0.1952 0.87086 0.000 0.912 0.004 0.000 NA
#> SRR2105286 2 0.1956 0.86768 0.000 0.916 0.008 0.000 NA
#> SRR2105283 2 0.5302 0.71897 0.060 0.668 0.016 0.000 NA
#> SRR2105284 2 0.5873 0.67330 0.056 0.636 0.048 0.000 NA
#> SRR2105281 2 0.1444 0.87129 0.000 0.948 0.012 0.000 NA
#> SRR2105282 2 0.1251 0.87255 0.000 0.956 0.008 0.000 NA
#> SRR2105259 3 0.1710 0.60180 0.040 0.000 0.940 0.004 NA
#> SRR2105260 3 0.1568 0.60228 0.036 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR2105279 2 0.1701 0.86944 0.000 0.936 0.016 0.000 NA
#> SRR2105280 2 0.1845 0.87007 0.000 0.928 0.016 0.000 NA
#> SRR2105257 1 0.5579 0.17005 0.508 0.000 0.420 0.000 NA
#> SRR2105258 1 0.4376 0.57507 0.764 0.000 0.144 0.000 NA
#> SRR2105253 2 0.1478 0.87309 0.000 0.936 0.000 0.000 NA
#> SRR2105254 2 0.1341 0.87547 0.000 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105255 3 0.4467 0.42821 0.344 0.000 0.640 0.000 NA
#> SRR2105256 3 0.4608 0.42330 0.336 0.000 0.640 0.000 NA
#> SRR2105251 2 0.1638 0.87132 0.000 0.932 0.004 0.000 NA
#> SRR2105252 2 0.2286 0.86033 0.000 0.888 0.004 0.000 NA
#> SRR2105249 2 0.3109 0.80943 0.000 0.800 0.000 0.000 NA
#> SRR2105250 2 0.3700 0.77910 0.008 0.752 0.000 0.000 NA
#> SRR2105247 2 0.1341 0.87303 0.000 0.944 0.000 0.000 NA
#> SRR2105248 2 0.2116 0.86765 0.004 0.912 0.008 0.000 NA
#> SRR2105245 1 0.4375 0.55995 0.768 0.004 0.156 0.000 NA
#> SRR2105246 1 0.6089 0.35222 0.584 0.068 0.312 0.000 NA
#> SRR2105243 1 0.4420 0.16574 0.548 0.000 0.448 0.000 NA
#> SRR2105244 1 0.4416 0.38491 0.632 0.000 0.356 0.000 NA
#> SRR2105241 1 0.4003 0.47787 0.704 0.000 0.288 0.000 NA
#> SRR2105242 1 0.4514 0.56178 0.740 0.000 0.188 0.000 NA
#> SRR2105239 1 0.4297 0.54681 0.756 0.008 0.200 0.000 NA
#> SRR2105240 1 0.5422 0.52510 0.656 0.000 0.212 0.000 NA
#> SRR2105237 2 0.3659 0.81591 0.000 0.768 0.012 0.000 NA
#> SRR2105238 2 0.3586 0.77992 0.000 0.736 0.000 0.000 NA
#> SRR2105235 2 0.3508 0.77260 0.000 0.748 0.000 0.000 NA
#> SRR2105236 2 0.3003 0.81820 0.000 0.812 0.000 0.000 NA
#> SRR2105233 2 0.2102 0.87019 0.000 0.916 0.012 0.004 NA
#> SRR2105234 2 0.1942 0.86856 0.000 0.920 0.012 0.000 NA
#> SRR2105231 2 0.0880 0.87399 0.000 0.968 0.000 0.000 NA
#> SRR2105232 2 0.1205 0.87374 0.000 0.956 0.004 0.000 NA
#> SRR2105227 1 0.4718 0.38686 0.636 0.016 0.340 0.000 NA
#> SRR2105228 1 0.4850 0.52104 0.728 0.056 0.200 0.000 NA
#> SRR2105225 1 0.5048 0.33061 0.580 0.000 0.380 0.000 NA
#> SRR2105226 1 0.5091 0.52641 0.672 0.000 0.244 0.000 NA
#> SRR2105229 3 0.5000 0.30465 0.388 0.000 0.576 0.000 NA
#> SRR2105230 1 0.4872 0.16779 0.540 0.000 0.436 0.000 NA
#> SRR2105219 2 0.1557 0.87715 0.000 0.940 0.008 0.000 NA
#> SRR2105220 2 0.1671 0.87286 0.000 0.924 0.000 0.000 NA
#> SRR2105221 2 0.3689 0.77342 0.004 0.740 0.000 0.000 NA
#> SRR2105222 2 0.3861 0.76629 0.008 0.728 0.000 0.000 NA
#> SRR2105223 1 0.5227 0.12975 0.508 0.000 0.448 0.000 NA
#> SRR2105224 1 0.5443 0.19709 0.504 0.000 0.436 0.000 NA
#> SRR2105217 2 0.3211 0.82697 0.004 0.824 0.008 0.000 NA
#> SRR2105218 2 0.2411 0.85679 0.000 0.884 0.008 0.000 NA
#> SRR2105215 2 0.1364 0.87196 0.000 0.952 0.012 0.000 NA
#> SRR2105216 2 0.1281 0.87183 0.000 0.956 0.012 0.000 NA
#> SRR2105213 1 0.5080 0.45358 0.656 0.004 0.284 0.000 NA
#> SRR2105214 1 0.4846 0.52602 0.720 0.012 0.212 0.000 NA
#> SRR2105211 3 0.4779 0.31862 0.388 0.000 0.588 0.000 NA
#> SRR2105212 3 0.4380 0.36107 0.376 0.000 0.616 0.000 NA
#> SRR2105209 1 0.4497 0.23354 0.568 0.000 0.424 0.000 NA
#> SRR2105210 1 0.4502 0.56236 0.744 0.000 0.180 0.000 NA
#> SRR2105207 1 0.2270 0.58233 0.904 0.000 0.076 0.000 NA
#> SRR2105208 1 0.3355 0.53005 0.832 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR2105205 2 0.2753 0.85497 0.008 0.856 0.000 0.000 NA
#> SRR2105206 2 0.2416 0.86750 0.012 0.888 0.000 0.000 NA
#> SRR2105201 2 0.3844 0.76168 0.004 0.736 0.000 0.004 NA
#> SRR2105202 2 0.3844 0.76344 0.004 0.736 0.000 0.004 NA
#> SRR2105203 2 0.1168 0.87317 0.000 0.960 0.008 0.000 NA
#> SRR2105204 2 0.1549 0.87056 0.000 0.944 0.016 0.000 NA
#> SRR2105199 2 0.1597 0.87080 0.000 0.940 0.012 0.000 NA
#> SRR2105200 2 0.1830 0.87660 0.000 0.924 0.008 0.000 NA
#> SRR2105197 3 0.2629 0.58746 0.104 0.000 0.880 0.004 NA
#> SRR2105198 3 0.3956 0.55792 0.144 0.012 0.808 0.004 NA
#> SRR2105195 1 0.5607 0.45997 0.664 0.080 0.232 0.000 NA
#> SRR2105196 1 0.4776 0.51078 0.772 0.088 0.104 0.000 NA
#> SRR2105193 1 0.3476 0.52253 0.816 0.000 0.020 0.004 NA
#> SRR2105194 1 0.3461 0.51576 0.812 0.000 0.016 0.004 NA
#> SRR2105191 3 0.1205 0.60188 0.040 0.000 0.956 0.004 NA
#> SRR2105192 3 0.3831 0.50443 0.188 0.000 0.784 0.004 NA
#> SRR2105189 2 0.2674 0.86131 0.000 0.856 0.004 0.000 NA
#> SRR2105190 2 0.1571 0.87466 0.000 0.936 0.004 0.000 NA
#> SRR2105187 2 0.4655 0.72603 0.024 0.660 0.004 0.000 NA
#> SRR2105188 2 0.6290 0.58251 0.116 0.564 0.020 0.000 NA
#> SRR2105179 1 0.4088 0.48805 0.712 0.004 0.276 0.000 NA
#> SRR2105180 1 0.3829 0.54718 0.776 0.000 0.196 0.000 NA
#> SRR2105183 2 0.1597 0.86949 0.000 0.940 0.012 0.000 NA
#> SRR2105184 2 0.1557 0.87345 0.000 0.940 0.008 0.000 NA
#> SRR2105185 2 0.2630 0.87008 0.016 0.892 0.012 0.000 NA
#> SRR2105186 2 0.2798 0.84427 0.008 0.852 0.000 0.000 NA
#> SRR2105181 3 0.2228 0.61053 0.092 0.000 0.900 0.004 NA
#> SRR2105182 3 0.2970 0.59786 0.168 0.000 0.828 0.000 NA
#> SRR2105177 1 0.3618 0.48868 0.788 0.004 0.012 0.000 NA
#> SRR2105178 1 0.3821 0.47279 0.764 0.000 0.020 0.000 NA
#> SRR2105171 2 0.1408 0.87233 0.000 0.948 0.008 0.000 NA
#> SRR2105172 2 0.1701 0.87093 0.000 0.936 0.016 0.000 NA
#> SRR2105175 1 0.2909 0.52764 0.848 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105176 1 0.3353 0.48844 0.796 0.000 0.008 0.000 NA
#> SRR2105173 2 0.1121 0.87336 0.000 0.956 0.000 0.000 NA
#> SRR2105174 2 0.1195 0.87118 0.000 0.960 0.012 0.000 NA
#> SRR2105169 2 0.1764 0.87226 0.000 0.928 0.008 0.000 NA
#> SRR2105170 2 0.2787 0.84435 0.004 0.856 0.004 0.000 NA
#> SRR2105167 2 0.1845 0.87007 0.000 0.928 0.016 0.000 NA
#> SRR2105168 2 0.1701 0.86944 0.000 0.936 0.016 0.000 NA
#> SRR2105165 1 0.4717 0.54068 0.736 0.000 0.144 0.000 NA
#> SRR2105166 1 0.3705 0.56483 0.816 0.000 0.064 0.000 NA
#> SRR2105163 1 0.4444 0.54190 0.756 0.000 0.088 0.000 NA
#> SRR2105164 1 0.3710 0.54937 0.808 0.000 0.048 0.000 NA
#> SRR2105161 1 0.2554 0.56893 0.892 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR2105162 1 0.3203 0.50907 0.820 0.000 0.012 0.000 NA
#> SRR2105155 2 0.1522 0.87250 0.000 0.944 0.012 0.000 NA
#> SRR2105156 2 0.1597 0.86949 0.000 0.940 0.012 0.000 NA
#> SRR2105157 2 0.3474 0.80221 0.004 0.796 0.008 0.000 NA
#> SRR2105158 2 0.3937 0.73824 0.004 0.736 0.008 0.000 NA
#> SRR2105159 1 0.3445 0.56244 0.824 0.000 0.036 0.000 NA
#> SRR2105160 1 0.2293 0.56040 0.900 0.000 0.016 0.000 NA
#> SRR2105153 2 0.3280 0.81191 0.004 0.808 0.004 0.000 NA
#> SRR2105154 2 0.3826 0.76312 0.004 0.752 0.008 0.000 NA
#> SRR2105151 2 0.1597 0.86949 0.000 0.940 0.012 0.000 NA
#> SRR2105152 2 0.1701 0.86944 0.000 0.936 0.016 0.000 NA
#> SRR2105149 3 0.6843 0.34173 0.292 0.108 0.540 0.000 NA
#> SRR2105150 3 0.6115 0.20143 0.416 0.056 0.496 0.000 NA
#> SRR2105147 4 0.8313 0.31190 0.204 0.028 0.200 0.464 NA
#> SRR2105148 4 0.8329 0.30967 0.200 0.028 0.200 0.464 NA
#> SRR2105143 1 0.4818 0.50696 0.688 0.004 0.260 0.000 NA
#> SRR2105144 1 0.6644 0.38188 0.620 0.172 0.096 0.000 NA
#> SRR2105145 1 0.3928 0.54835 0.800 0.008 0.040 0.000 NA
#> SRR2105146 1 0.3412 0.54746 0.820 0.000 0.028 0.000 NA
#> SRR2105141 2 0.3167 0.82665 0.004 0.820 0.004 0.000 NA
#> SRR2105142 2 0.2286 0.86519 0.004 0.888 0.000 0.000 NA
#> SRR2105139 2 0.1597 0.87112 0.000 0.940 0.012 0.000 NA
#> SRR2105140 2 0.1628 0.87092 0.000 0.936 0.008 0.000 NA
#> SRR2105137 2 0.3937 0.76654 0.004 0.736 0.008 0.000 NA
#> SRR2105138 2 0.4491 0.75088 0.024 0.708 0.008 0.000 NA
#> SRR2105135 2 0.1626 0.87072 0.000 0.940 0.016 0.000 NA
#> SRR2105136 2 0.1701 0.87204 0.000 0.936 0.016 0.000 NA
#> SRR2105133 3 0.1492 0.60137 0.040 0.000 0.948 0.004 NA
#> SRR2105134 3 0.2102 0.59696 0.068 0.000 0.916 0.004 NA
#> SRR2105131 2 0.7000 0.50944 0.052 0.544 0.172 0.000 NA
#> SRR2105132 3 0.4567 0.46926 0.128 0.096 0.768 0.004 NA
#> SRR2105129 1 0.5265 0.49046 0.716 0.032 0.072 0.000 NA
#> SRR2105130 1 0.3675 0.47435 0.772 0.000 0.008 0.004 NA
#> SRR2105127 3 0.4100 0.54716 0.148 0.052 0.792 0.000 NA
#> SRR2105128 3 0.4748 0.48029 0.120 0.112 0.756 0.000 NA
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.381 0.75861 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105278 5 0.380 0.76348 0.000 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR2105275 3 0.530 0.19650 0.088 0.000 0.612 0.000 0.280 0.020
#> SRR2105276 3 0.558 0.11858 0.112 0.000 0.576 0.000 0.292 0.020
#> SRR2105273 3 0.323 0.50895 0.088 0.000 0.828 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105274 3 0.335 0.53167 0.128 0.000 0.812 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105271 3 0.359 0.47648 0.120 0.000 0.796 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105272 3 0.549 -0.32028 0.372 0.000 0.496 0.000 0.132 0.000
#> SRR2105269 2 0.425 0.18458 0.032 0.640 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105270 2 0.261 0.17953 0.012 0.848 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105267 2 0.436 0.19498 0.024 0.608 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR2105268 2 0.390 0.25451 0.008 0.628 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR2105265 2 0.408 0.25528 0.016 0.620 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR2105266 2 0.425 0.24744 0.024 0.604 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR2105263 6 0.417 0.44199 0.012 0.212 0.000 0.000 0.044 0.732
#> SRR2105264 6 0.432 0.46968 0.012 0.264 0.008 0.000 0.020 0.696
#> SRR2105261 3 0.617 0.30409 0.052 0.096 0.656 0.000 0.076 0.120
#> SRR2105262 3 0.329 0.49279 0.036 0.012 0.852 0.000 0.080 0.020
#> SRR2105357 5 0.409 0.75843 0.004 0.004 0.440 0.000 0.552 0.000
#> SRR2105358 5 0.381 0.75861 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105439 2 0.143 0.18811 0.020 0.948 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105440 2 0.149 0.18903 0.020 0.948 0.004 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105509 2 0.452 -0.00735 0.024 0.528 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR2105510 2 0.453 -0.03826 0.024 0.508 0.000 0.000 0.004 0.464
#> SRR2105507 3 0.280 0.52827 0.064 0.000 0.860 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105508 3 0.273 0.50779 0.056 0.000 0.864 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105505 3 0.474 -0.45156 0.048 0.000 0.584 0.000 0.364 0.004
#> SRR2105506 3 0.571 -0.17158 0.172 0.000 0.528 0.000 0.296 0.004
#> SRR2105503 6 0.439 0.14848 0.004 0.472 0.000 0.000 0.016 0.508
#> SRR2105504 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.535 -0.01612 0.028 0.592 0.040 0.000 0.012 0.328
#> SRR2105502 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.259 0.44356 0.012 0.000 0.860 0.000 0.124 0.004
#> SRR2105500 3 0.346 0.39597 0.028 0.004 0.808 0.000 0.152 0.008
#> SRR2105497 2 0.408 0.09369 0.008 0.536 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR2105498 2 0.413 -0.06419 0.004 0.500 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR2105495 2 0.186 0.17372 0.004 0.904 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR2105496 2 0.211 0.16956 0.012 0.900 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR2105493 2 0.204 0.16664 0.008 0.908 0.004 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105494 2 0.144 0.18882 0.012 0.952 0.008 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105491 6 0.336 0.43244 0.008 0.128 0.000 0.000 0.044 0.820
#> SRR2105492 6 0.347 0.43338 0.012 0.136 0.000 0.000 0.040 0.812
#> SRR2105489 6 0.458 0.36912 0.012 0.372 0.000 0.000 0.024 0.592
#> SRR2105490 2 0.411 0.17155 0.012 0.576 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR2105487 5 0.580 0.53866 0.208 0.000 0.264 0.000 0.524 0.004
#> SRR2105488 5 0.577 0.36849 0.328 0.000 0.168 0.000 0.500 0.004
#> SRR2105485 3 0.458 -0.62644 0.028 0.000 0.528 0.000 0.440 0.004
#> SRR2105486 3 0.450 -0.56818 0.032 0.000 0.536 0.000 0.432 0.000
#> SRR2105483 1 0.291 0.71472 0.816 0.000 0.172 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105484 1 0.291 0.71472 0.816 0.000 0.172 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105481 3 0.496 0.25467 0.200 0.000 0.648 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105482 3 0.486 0.13795 0.304 0.000 0.612 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105479 3 0.594 -0.05857 0.208 0.000 0.528 0.000 0.252 0.012
#> SRR2105480 3 0.577 -0.34600 0.348 0.000 0.468 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105477 2 0.417 0.00471 0.012 0.708 0.004 0.000 0.020 0.256
#> SRR2105478 2 0.444 -0.07331 0.000 0.632 0.008 0.000 0.028 0.332
#> SRR2105475 6 0.454 0.06427 0.024 0.480 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR2105476 2 0.439 -0.05334 0.016 0.492 0.000 0.000 0.004 0.488
#> SRR2105473 2 0.180 0.18218 0.020 0.936 0.008 0.000 0.020 0.016
#> SRR2105474 2 0.145 0.18759 0.016 0.948 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105471 6 0.466 0.31266 0.012 0.408 0.000 0.000 0.024 0.556
#> SRR2105472 6 0.460 0.40471 0.016 0.328 0.000 0.000 0.028 0.628
#> SRR2105469 3 0.170 0.49249 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105470 3 0.226 0.54120 0.080 0.000 0.892 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105467 5 0.436 0.75720 0.016 0.000 0.436 0.000 0.544 0.004
#> SRR2105468 5 0.483 0.72178 0.044 0.000 0.456 0.000 0.496 0.004
#> SRR2105465 3 0.453 -0.40251 0.468 0.000 0.504 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105466 1 0.404 0.75270 0.632 0.000 0.352 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105463 1 0.351 0.80006 0.704 0.000 0.292 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105464 1 0.343 0.79838 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.403 0.25160 0.012 0.612 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105462 2 0.420 0.24574 0.020 0.600 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105459 2 0.446 0.00834 0.020 0.516 0.000 0.000 0.004 0.460
#> SRR2105460 2 0.438 0.01526 0.016 0.520 0.000 0.000 0.004 0.460
#> SRR2105457 3 0.323 0.32671 0.020 0.004 0.804 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105458 3 0.427 0.13989 0.024 0.020 0.732 0.000 0.216 0.008
#> SRR2105455 3 0.305 0.48940 0.156 0.004 0.824 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105456 3 0.339 0.47900 0.180 0.000 0.788 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105453 5 0.514 0.70313 0.076 0.000 0.388 0.000 0.532 0.004
#> SRR2105454 5 0.510 0.71322 0.076 0.000 0.368 0.000 0.552 0.004
#> SRR2105451 2 0.484 0.05788 0.032 0.728 0.048 0.000 0.020 0.172
#> SRR2105452 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.536 -0.32549 0.372 0.000 0.512 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105450 1 0.397 0.60613 0.544 0.000 0.452 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105447 2 0.463 -0.07317 0.024 0.492 0.008 0.000 0.000 0.476
#> SRR2105448 6 0.423 0.02278 0.008 0.480 0.000 0.000 0.004 0.508
#> SRR2105445 3 0.726 -0.32248 0.024 0.332 0.412 0.000 0.164 0.068
#> SRR2105446 5 0.528 0.73262 0.016 0.036 0.432 0.000 0.504 0.012
#> SRR2105443 2 0.669 -0.03195 0.036 0.560 0.176 0.000 0.044 0.184
#> SRR2105444 2 0.735 -0.19447 0.132 0.508 0.188 0.000 0.036 0.136
#> SRR2105441 2 0.314 0.18375 0.024 0.844 0.000 0.000 0.024 0.108
#> SRR2105442 2 0.436 0.18731 0.008 0.596 0.000 0.000 0.016 0.380
#> SRR2105437 5 0.586 0.22733 0.180 0.000 0.236 0.000 0.564 0.020
#> SRR2105438 5 0.545 0.20028 0.144 0.000 0.208 0.000 0.628 0.020
#> SRR2105435 3 0.306 0.48478 0.048 0.008 0.848 0.000 0.096 0.000
#> SRR2105436 3 0.325 0.36652 0.032 0.000 0.804 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105433 1 0.351 0.79762 0.720 0.000 0.272 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105434 1 0.395 0.77680 0.656 0.000 0.328 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105431 1 0.370 0.76874 0.660 0.000 0.336 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105432 1 0.385 0.71068 0.612 0.000 0.384 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105429 6 0.688 0.25643 0.092 0.348 0.072 0.000 0.028 0.460
#> SRR2105430 6 0.558 0.28125 0.036 0.388 0.032 0.000 0.016 0.528
#> SRR2105427 2 0.392 0.09290 0.016 0.664 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105428 2 0.370 0.10842 0.016 0.712 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR2105425 2 0.418 -0.02947 0.012 0.504 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR2105426 2 0.412 0.10506 0.012 0.568 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105421 3 0.257 0.50318 0.024 0.004 0.880 0.000 0.088 0.004
#> SRR2105422 3 0.194 0.53333 0.036 0.000 0.920 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105423 2 0.400 0.22324 0.008 0.588 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR2105424 2 0.412 0.24105 0.016 0.604 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105419 3 0.292 0.38885 0.016 0.000 0.832 0.000 0.148 0.004
#> SRR2105420 3 0.236 0.48749 0.032 0.000 0.892 0.000 0.072 0.004
#> SRR2105415 1 0.421 0.73705 0.620 0.000 0.356 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105416 1 0.453 0.74426 0.660 0.000 0.272 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105417 3 0.460 -0.47544 0.484 0.000 0.484 0.000 0.028 0.004
#> SRR2105418 1 0.313 0.78805 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.447 -0.05121 0.020 0.492 0.000 0.000 0.004 0.484
#> SRR2105414 6 0.447 0.04661 0.020 0.488 0.000 0.000 0.004 0.488
#> SRR2105409 2 0.388 0.25722 0.012 0.656 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR2105410 2 0.220 0.18150 0.004 0.884 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105411 2 0.405 0.24109 0.012 0.604 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105412 2 0.412 0.24435 0.016 0.604 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105407 5 0.424 0.73760 0.016 0.000 0.444 0.000 0.540 0.000
#> SRR2105408 5 0.410 0.75366 0.004 0.004 0.444 0.000 0.548 0.000
#> SRR2105403 5 0.380 0.75645 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105404 5 0.380 0.75645 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR2105405 3 0.385 0.47213 0.180 0.000 0.764 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105406 3 0.423 0.25930 0.292 0.000 0.672 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105401 2 0.459 -0.03406 0.016 0.584 0.004 0.000 0.012 0.384
#> SRR2105402 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105399 6 0.727 0.24795 0.028 0.324 0.096 0.072 0.016 0.464
#> SRR2105400 6 0.684 0.24319 0.032 0.328 0.124 0.008 0.028 0.480
#> SRR2105397 2 0.830 -0.37345 0.076 0.364 0.252 0.000 0.156 0.152
#> SRR2105398 2 0.854 -0.38543 0.124 0.344 0.240 0.000 0.136 0.156
#> SRR2105395 2 0.418 0.14903 0.008 0.560 0.000 0.000 0.004 0.428
#> SRR2105396 2 0.426 0.13548 0.012 0.564 0.000 0.000 0.004 0.420
#> SRR2105393 2 0.414 0.20404 0.008 0.580 0.000 0.000 0.004 0.408
#> SRR2105394 2 0.430 0.11540 0.008 0.544 0.000 0.000 0.008 0.440
#> SRR2105389 3 0.377 0.29312 0.056 0.000 0.764 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105390 3 0.373 0.34518 0.060 0.000 0.772 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105391 3 0.416 -0.09351 0.036 0.000 0.672 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105392 3 0.437 -0.35701 0.032 0.000 0.604 0.000 0.364 0.000
#> SRR2105385 3 0.232 0.54965 0.048 0.000 0.892 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105386 3 0.184 0.53010 0.028 0.000 0.920 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105387 3 0.368 0.40379 0.200 0.000 0.760 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105388 3 0.403 0.46909 0.188 0.000 0.748 0.000 0.060 0.004
#> SRR2105381 6 0.560 0.20127 0.016 0.412 0.044 0.000 0.024 0.504
#> SRR2105382 6 0.485 0.19108 0.020 0.432 0.008 0.000 0.012 0.528
#> SRR2105383 2 0.398 0.25464 0.008 0.640 0.000 0.000 0.004 0.348
#> SRR2105384 2 0.394 0.24830 0.004 0.624 0.000 0.000 0.004 0.368
#> SRR2105379 6 0.429 0.20351 0.020 0.424 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR2105380 6 0.561 0.38482 0.096 0.320 0.012 0.000 0.008 0.564
#> SRR2105377 2 0.155 0.19275 0.020 0.944 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR2105378 2 0.194 0.18303 0.020 0.928 0.004 0.000 0.020 0.028
#> SRR2105375 3 0.601 0.32794 0.208 0.036 0.612 0.000 0.128 0.016
#> SRR2105376 3 0.564 0.13559 0.308 0.000 0.532 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105373 3 0.473 -0.40350 0.052 0.000 0.556 0.000 0.392 0.000
#> SRR2105374 5 0.600 0.26470 0.220 0.000 0.252 0.000 0.516 0.012
#> SRR2105371 3 0.283 0.48074 0.052 0.000 0.856 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105372 3 0.255 0.48909 0.048 0.000 0.876 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105369 3 0.386 -0.00300 0.020 0.000 0.692 0.000 0.288 0.000
#> SRR2105370 3 0.355 0.29419 0.036 0.000 0.772 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105367 3 0.667 -0.06236 0.176 0.056 0.488 0.000 0.276 0.004
#> SRR2105368 3 0.641 -0.15230 0.336 0.064 0.492 0.000 0.104 0.004
#> SRR2105365 6 0.348 0.43716 0.008 0.140 0.000 0.000 0.044 0.808
#> SRR2105366 6 0.348 0.43556 0.008 0.140 0.000 0.000 0.044 0.808
#> SRR2105363 2 0.401 0.12844 0.008 0.632 0.000 0.000 0.004 0.356
#> SRR2105364 2 0.408 0.25226 0.012 0.636 0.000 0.000 0.004 0.348
#> SRR2105361 2 0.422 0.24586 0.016 0.612 0.000 0.000 0.004 0.368
#> SRR2105362 2 0.402 0.21829 0.004 0.592 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR2105359 3 0.215 0.46517 0.004 0.000 0.888 0.000 0.104 0.004
#> SRR2105360 3 0.133 0.53116 0.020 0.000 0.948 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105355 3 0.215 0.49802 0.028 0.000 0.900 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105356 3 0.203 0.52869 0.028 0.000 0.908 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105353 3 0.427 0.45798 0.072 0.000 0.744 0.000 0.172 0.012
#> SRR2105354 3 0.413 0.48718 0.104 0.000 0.756 0.000 0.136 0.004
#> SRR2105351 6 0.400 -0.06149 0.004 0.496 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR2105352 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105349 6 0.430 0.10821 0.012 0.460 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR2105350 2 0.399 0.24889 0.012 0.624 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR2105345 2 0.304 0.20459 0.004 0.796 0.000 0.000 0.004 0.196
#> SRR2105346 2 0.427 0.24841 0.020 0.620 0.000 0.000 0.004 0.356
#> SRR2105347 2 0.409 0.18065 0.008 0.668 0.004 0.000 0.008 0.312
#> SRR2105348 2 0.495 -0.10069 0.016 0.556 0.008 0.000 0.024 0.396
#> SRR2105343 2 0.413 0.21442 0.012 0.564 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR2105344 2 0.400 0.22048 0.008 0.588 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR2105341 3 0.328 0.35059 0.028 0.000 0.796 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105342 3 0.231 0.46668 0.016 0.000 0.880 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105339 3 0.198 0.53188 0.020 0.000 0.908 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105340 3 0.340 0.46972 0.116 0.000 0.812 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105335 3 0.483 -0.38942 0.064 0.000 0.568 0.000 0.368 0.000
#> SRR2105336 3 0.530 0.24490 0.172 0.000 0.596 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105337 3 0.260 0.47817 0.160 0.000 0.836 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105338 3 0.397 0.20179 0.296 0.000 0.680 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105331 2 0.437 0.03209 0.016 0.540 0.000 0.000 0.004 0.440
#> SRR2105332 6 0.461 0.23163 0.008 0.440 0.000 0.000 0.024 0.528
#> SRR2105333 2 0.446 -0.01950 0.020 0.508 0.000 0.000 0.004 0.468
#> SRR2105334 2 0.426 -0.00614 0.016 0.500 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR2105329 2 0.602 0.00324 0.012 0.604 0.168 0.000 0.032 0.184
#> SRR2105330 2 0.447 0.06218 0.012 0.696 0.032 0.000 0.008 0.252
#> SRR2105327 2 0.439 -0.06877 0.016 0.492 0.000 0.000 0.004 0.488
#> SRR2105328 2 0.431 -0.08535 0.012 0.492 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR2105325 3 0.599 0.09257 0.164 0.000 0.524 0.000 0.292 0.020
#> SRR2105326 3 0.596 0.10028 0.160 0.000 0.528 0.000 0.292 0.020
#> SRR2105323 3 0.516 -0.71230 0.020 0.028 0.484 0.008 0.460 0.000
#> SRR2105324 3 0.314 0.28242 0.012 0.000 0.788 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105319 3 0.519 0.34549 0.212 0.000 0.616 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105320 3 0.551 0.07894 0.312 0.000 0.548 0.000 0.136 0.004
#> SRR2105321 3 0.569 0.18288 0.136 0.000 0.576 0.000 0.268 0.020
#> SRR2105322 3 0.585 0.10373 0.152 0.000 0.552 0.000 0.276 0.020
#> SRR2105317 2 0.431 0.11876 0.024 0.580 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105318 2 0.425 0.17890 0.020 0.580 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR2105315 2 0.684 -0.04566 0.020 0.540 0.224 0.000 0.100 0.116
#> SRR2105316 2 0.413 0.01303 0.012 0.564 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR2105313 2 0.446 -0.03735 0.020 0.508 0.000 0.000 0.004 0.468
#> SRR2105314 2 0.422 0.15264 0.012 0.584 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR2105311 3 0.571 0.10586 0.128 0.000 0.564 0.000 0.288 0.020
#> SRR2105312 3 0.585 0.06831 0.144 0.000 0.544 0.000 0.292 0.020
#> SRR2105307 3 0.439 0.38207 0.232 0.000 0.700 0.000 0.064 0.004
#> SRR2105308 3 0.464 0.03924 0.368 0.000 0.588 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105309 3 0.408 -0.06767 0.020 0.008 0.688 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105310 3 0.374 0.08989 0.016 0.004 0.724 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105305 3 0.284 0.37525 0.012 0.000 0.824 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105306 3 0.191 0.50430 0.012 0.000 0.908 0.000 0.080 0.000
#> SRR2105303 2 0.403 0.25390 0.016 0.636 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105304 4 0.000 0.85062 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.453 -0.04705 0.024 0.500 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR2105302 2 0.403 0.15031 0.008 0.572 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105299 3 0.641 -0.65914 0.032 0.088 0.460 0.000 0.392 0.028
#> SRR2105300 2 0.723 -0.13652 0.020 0.492 0.224 0.000 0.144 0.120
#> SRR2105297 6 0.689 0.28287 0.192 0.328 0.028 0.000 0.024 0.428
#> SRR2105298 6 0.684 0.28601 0.176 0.344 0.028 0.000 0.024 0.428
#> SRR2105295 2 0.447 -0.03767 0.020 0.496 0.000 0.000 0.004 0.480
#> SRR2105296 6 0.387 0.02092 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR2105293 3 0.545 0.15142 0.100 0.000 0.592 0.000 0.288 0.020
#> SRR2105294 3 0.516 0.11526 0.244 0.000 0.624 0.000 0.128 0.004
#> SRR2105291 3 0.388 0.50214 0.120 0.000 0.780 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105292 1 0.399 0.51545 0.516 0.000 0.480 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105289 3 0.209 0.54660 0.068 0.000 0.904 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105290 3 0.376 0.30113 0.268 0.000 0.712 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105287 3 0.434 0.43928 0.188 0.000 0.724 0.000 0.084 0.004
#> SRR2105288 3 0.440 -0.18013 0.408 0.000 0.564 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105285 2 0.459 -0.02868 0.020 0.508 0.004 0.000 0.004 0.464
#> SRR2105286 2 0.418 0.01210 0.012 0.516 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR2105283 2 0.488 0.05145 0.072 0.740 0.040 0.000 0.016 0.132
#> SRR2105284 2 0.483 0.06739 0.060 0.752 0.064 0.000 0.016 0.108
#> SRR2105281 2 0.403 0.24948 0.012 0.612 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105282 2 0.412 0.24331 0.016 0.604 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105259 5 0.437 0.75099 0.016 0.004 0.440 0.000 0.540 0.000
#> SRR2105260 5 0.457 0.73974 0.012 0.016 0.456 0.000 0.516 0.000
#> SRR2105279 2 0.413 0.23813 0.016 0.600 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105280 2 0.421 0.22242 0.020 0.596 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105257 3 0.604 0.07355 0.292 0.000 0.460 0.000 0.244 0.004
#> SRR2105258 1 0.476 0.34540 0.484 0.000 0.468 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105253 2 0.428 0.09706 0.020 0.564 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR2105254 2 0.416 0.16009 0.016 0.588 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105255 3 0.413 -0.09604 0.032 0.000 0.668 0.000 0.300 0.000
#> SRR2105256 3 0.437 -0.24389 0.036 0.000 0.620 0.000 0.344 0.000
#> SRR2105251 2 0.450 -0.05475 0.012 0.496 0.000 0.000 0.012 0.480
#> SRR2105252 6 0.457 0.15545 0.012 0.456 0.000 0.000 0.016 0.516
#> SRR2105249 2 0.242 0.20256 0.012 0.880 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR2105250 2 0.189 0.18724 0.020 0.932 0.008 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105247 2 0.398 0.10267 0.004 0.536 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR2105248 6 0.479 0.21127 0.020 0.448 0.000 0.000 0.020 0.512
#> SRR2105245 3 0.541 0.16909 0.208 0.000 0.620 0.000 0.160 0.012
#> SRR2105246 3 0.571 0.35497 0.160 0.044 0.680 0.000 0.060 0.056
#> SRR2105243 3 0.263 0.53745 0.092 0.000 0.872 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105244 3 0.316 0.47491 0.140 0.000 0.820 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105241 3 0.400 0.29913 0.248 0.000 0.712 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105242 3 0.436 -0.27834 0.424 0.000 0.552 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105239 3 0.456 0.17489 0.272 0.004 0.664 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105240 3 0.462 -0.15850 0.392 0.000 0.564 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105237 2 0.338 0.07443 0.004 0.748 0.000 0.000 0.004 0.244
#> SRR2105238 2 0.222 0.14280 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR2105235 2 0.170 0.19079 0.016 0.936 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR2105236 2 0.339 0.19229 0.012 0.780 0.000 0.000 0.008 0.200
#> SRR2105233 2 0.460 -0.03596 0.028 0.496 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR2105234 2 0.447 -0.03270 0.020 0.496 0.000 0.000 0.004 0.480
#> SRR2105231 2 0.414 0.17356 0.012 0.560 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR2105232 2 0.428 0.17890 0.020 0.564 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR2105227 3 0.394 0.41703 0.184 0.008 0.764 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105228 3 0.566 -0.01041 0.292 0.048 0.596 0.000 0.056 0.008
#> SRR2105225 3 0.317 0.54140 0.116 0.000 0.828 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105226 3 0.465 0.31535 0.276 0.000 0.648 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105229 3 0.393 0.41517 0.048 0.012 0.788 0.000 0.144 0.008
#> SRR2105230 3 0.350 0.54504 0.080 0.000 0.804 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105219 2 0.420 0.15893 0.020 0.600 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105220 2 0.390 0.20826 0.024 0.696 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR2105221 2 0.133 0.18885 0.012 0.956 0.004 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105222 2 0.209 0.16702 0.020 0.920 0.004 0.000 0.020 0.036
#> SRR2105223 3 0.236 0.50150 0.040 0.000 0.888 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105224 3 0.279 0.52329 0.080 0.000 0.860 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105217 6 0.448 0.43496 0.012 0.320 0.000 0.000 0.028 0.640
#> SRR2105218 6 0.449 0.10807 0.016 0.480 0.000 0.000 0.008 0.496
#> SRR2105215 2 0.416 0.22236 0.016 0.588 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105216 2 0.411 0.23260 0.008 0.596 0.000 0.000 0.004 0.392
#> SRR2105213 3 0.451 0.37548 0.152 0.000 0.724 0.000 0.116 0.008
#> SRR2105214 3 0.521 0.19902 0.216 0.000 0.636 0.000 0.140 0.008
#> SRR2105211 3 0.329 0.39635 0.020 0.008 0.824 0.000 0.140 0.008
#> SRR2105212 3 0.323 0.32836 0.020 0.004 0.804 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105209 3 0.362 0.47452 0.184 0.000 0.772 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105210 3 0.433 -0.37011 0.464 0.000 0.516 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105207 3 0.531 -0.36354 0.408 0.000 0.488 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105208 1 0.386 0.75095 0.640 0.000 0.352 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105205 6 0.480 0.29969 0.020 0.400 0.000 0.000 0.024 0.556
#> SRR2105206 6 0.473 0.14095 0.028 0.468 0.004 0.000 0.004 0.496
#> SRR2105201 2 0.135 0.18996 0.020 0.952 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105202 2 0.160 0.18786 0.020 0.944 0.004 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105203 2 0.403 0.21385 0.008 0.572 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105204 2 0.415 0.22805 0.016 0.592 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105199 2 0.418 0.25113 0.020 0.608 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR2105200 2 0.418 0.20048 0.012 0.600 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR2105197 5 0.467 0.70424 0.048 0.000 0.388 0.000 0.564 0.000
#> SRR2105198 5 0.574 0.65087 0.064 0.028 0.400 0.000 0.500 0.008
#> SRR2105195 3 0.518 0.29501 0.200 0.052 0.692 0.000 0.036 0.020
#> SRR2105196 3 0.599 -0.42177 0.400 0.060 0.488 0.000 0.032 0.020
#> SRR2105193 1 0.491 0.75971 0.624 0.000 0.276 0.000 0.100 0.000
#> SRR2105194 1 0.433 0.75274 0.704 0.000 0.220 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105191 5 0.382 0.76268 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR2105192 5 0.527 0.69773 0.096 0.000 0.352 0.000 0.548 0.004
#> SRR2105189 2 0.373 0.06100 0.004 0.652 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR2105190 2 0.423 0.14176 0.020 0.588 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105187 2 0.504 -0.10248 0.008 0.544 0.016 0.000 0.028 0.404
#> SRR2105188 2 0.576 -0.02900 0.124 0.640 0.044 0.000 0.008 0.184
#> SRR2105179 3 0.416 0.18992 0.312 0.004 0.664 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105180 3 0.493 -0.41177 0.456 0.000 0.488 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105183 2 0.419 0.22848 0.020 0.604 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105184 2 0.406 0.22839 0.012 0.600 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR2105185 6 0.430 0.26662 0.004 0.420 0.008 0.000 0.004 0.564
#> SRR2105186 6 0.461 0.46141 0.012 0.292 0.008 0.000 0.028 0.660
#> SRR2105181 3 0.434 -0.70900 0.020 0.000 0.492 0.000 0.488 0.000
#> SRR2105182 3 0.446 -0.60284 0.028 0.000 0.516 0.000 0.456 0.000
#> SRR2105177 1 0.279 0.75226 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.298 0.72440 0.808 0.000 0.180 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105171 2 0.415 0.23572 0.016 0.592 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105172 2 0.421 0.25223 0.024 0.620 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR2105175 1 0.368 0.78241 0.664 0.000 0.332 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105176 1 0.331 0.79392 0.740 0.000 0.256 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105173 2 0.430 0.14976 0.008 0.544 0.000 0.000 0.008 0.440
#> SRR2105174 2 0.417 0.22449 0.016 0.584 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR2105169 2 0.455 0.07513 0.016 0.536 0.000 0.000 0.012 0.436
#> SRR2105170 6 0.422 0.16342 0.008 0.472 0.000 0.000 0.004 0.516
#> SRR2105167 2 0.419 0.23689 0.020 0.604 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105168 2 0.419 0.23612 0.020 0.604 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105165 3 0.538 0.26334 0.148 0.000 0.640 0.000 0.192 0.020
#> SRR2105166 3 0.588 0.05983 0.180 0.000 0.560 0.000 0.240 0.020
#> SRR2105163 3 0.566 0.13507 0.128 0.000 0.576 0.000 0.276 0.020
#> SRR2105164 3 0.577 0.07085 0.140 0.000 0.560 0.000 0.280 0.020
#> SRR2105161 1 0.417 0.66877 0.568 0.000 0.420 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105162 1 0.353 0.79991 0.700 0.000 0.296 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105155 2 0.411 0.25450 0.020 0.632 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105156 2 0.426 0.23962 0.024 0.600 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105157 6 0.457 0.43703 0.016 0.288 0.000 0.000 0.036 0.660
#> SRR2105158 6 0.417 0.43089 0.016 0.208 0.000 0.000 0.040 0.736
#> SRR2105159 3 0.592 -0.12965 0.280 0.000 0.532 0.000 0.172 0.016
#> SRR2105160 1 0.399 0.69151 0.592 0.000 0.400 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105153 6 0.426 0.47380 0.008 0.240 0.000 0.000 0.044 0.708
#> SRR2105154 6 0.390 0.45446 0.012 0.184 0.000 0.000 0.040 0.764
#> SRR2105151 2 0.426 0.24177 0.024 0.600 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105152 2 0.420 0.23457 0.020 0.600 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105149 3 0.590 0.19445 0.032 0.112 0.668 0.000 0.128 0.060
#> SRR2105150 3 0.500 0.42731 0.044 0.064 0.740 0.000 0.124 0.028
#> SRR2105147 4 0.761 0.35330 0.044 0.004 0.288 0.432 0.160 0.072
#> SRR2105148 4 0.759 0.35501 0.044 0.004 0.288 0.432 0.164 0.068
#> SRR2105143 3 0.491 0.02521 0.344 0.008 0.600 0.000 0.040 0.008
#> SRR2105144 1 0.630 0.47572 0.432 0.136 0.400 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105145 1 0.582 0.71886 0.556 0.008 0.312 0.000 0.104 0.020
#> SRR2105146 1 0.512 0.70537 0.576 0.000 0.320 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105141 6 0.388 0.46388 0.004 0.228 0.000 0.000 0.032 0.736
#> SRR2105142 6 0.432 0.42553 0.008 0.320 0.000 0.000 0.024 0.648
#> SRR2105139 2 0.422 0.23074 0.020 0.592 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR2105140 2 0.412 0.23687 0.016 0.604 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105137 2 0.195 0.18283 0.020 0.928 0.004 0.000 0.024 0.024
#> SRR2105138 2 0.282 0.14790 0.036 0.884 0.012 0.000 0.020 0.048
#> SRR2105135 2 0.405 0.24333 0.012 0.604 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105136 2 0.424 0.21589 0.020 0.584 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105133 5 0.414 0.76362 0.012 0.000 0.428 0.000 0.560 0.000
#> SRR2105134 5 0.403 0.76224 0.008 0.000 0.416 0.000 0.576 0.000
#> SRR2105131 2 0.603 0.03386 0.024 0.656 0.100 0.000 0.096 0.124
#> SRR2105132 5 0.620 0.63939 0.080 0.076 0.344 0.000 0.500 0.000
#> SRR2105129 1 0.451 0.76450 0.672 0.016 0.284 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105130 1 0.298 0.72145 0.808 0.000 0.180 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105127 5 0.601 0.66307 0.084 0.032 0.396 0.000 0.480 0.008
#> SRR2105128 5 0.688 0.55410 0.064 0.136 0.376 0.000 0.412 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.901 0.941 0.972 0.5005 0.500 0.500
#> 3 3 0.628 0.757 0.882 0.2519 0.876 0.755
#> 4 4 0.536 0.621 0.762 0.1038 0.874 0.698
#> 5 5 0.463 0.497 0.661 0.0786 0.939 0.821
#> 6 6 0.480 0.390 0.616 0.0512 0.931 0.787
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.1843 0.958 0.028 0.972
#> SRR2105264 2 0.3114 0.935 0.056 0.944
#> SRR2105261 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105262 1 0.0938 0.962 0.988 0.012
#> SRR2105357 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105440 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105509 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0376 0.966 0.996 0.004
#> SRR2105506 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105504 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR2105501 2 0.4690 0.889 0.100 0.900
#> SRR2105502 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105499 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105495 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105496 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.4939 0.881 0.108 0.892
#> SRR2105494 2 0.1843 0.958 0.028 0.972
#> SRR2105491 2 0.2423 0.948 0.040 0.960
#> SRR2105492 2 0.2778 0.942 0.048 0.952
#> SRR2105489 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.9209 0.516 0.664 0.336
#> SRR2105484 1 0.9323 0.488 0.652 0.348
#> SRR2105481 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105480 1 0.0376 0.966 0.996 0.004
#> SRR2105477 2 0.2043 0.955 0.032 0.968
#> SRR2105478 2 0.2948 0.938 0.052 0.948
#> SRR2105475 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105474 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.1414 0.957 0.980 0.020
#> SRR2105466 1 0.5519 0.857 0.872 0.128
#> SRR2105463 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0938 0.962 0.988 0.012
#> SRR2105461 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR2105456 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.7376 0.753 0.208 0.792
#> SRR2105452 1 0.9775 0.312 0.588 0.412
#> SRR2105449 1 0.2778 0.936 0.952 0.048
#> SRR2105450 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105448 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105445 1 0.2043 0.948 0.968 0.032
#> SRR2105446 1 0.1843 0.951 0.972 0.028
#> SRR2105443 1 0.8861 0.579 0.696 0.304
#> SRR2105444 2 0.9963 0.133 0.464 0.536
#> SRR2105441 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105437 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.4690 0.887 0.900 0.100
#> SRR2105434 1 0.2423 0.942 0.960 0.040
#> SRR2105431 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.7376 0.750 0.208 0.792
#> SRR2105430 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105427 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105426 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105421 1 0.0938 0.962 0.988 0.012
#> SRR2105422 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0938 0.961 0.988 0.012
#> SRR2105413 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105409 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.6531 0.806 0.168 0.832
#> SRR2105402 2 0.5842 0.844 0.140 0.860
#> SRR2105399 2 0.3274 0.930 0.060 0.940
#> SRR2105400 2 0.2948 0.938 0.052 0.948
#> SRR2105397 1 0.8144 0.678 0.748 0.252
#> SRR2105398 1 0.2236 0.945 0.964 0.036
#> SRR2105395 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0672 0.964 0.992 0.008
#> SRR2105388 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.5408 0.864 0.124 0.876
#> SRR2105382 2 0.1843 0.958 0.028 0.972
#> SRR2105383 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105379 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105380 2 0.6973 0.781 0.188 0.812
#> SRR2105377 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105378 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105375 1 0.3114 0.930 0.944 0.056
#> SRR2105376 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0376 0.966 0.996 0.004
#> SRR2105368 1 0.3584 0.919 0.932 0.068
#> SRR2105365 2 0.2948 0.938 0.052 0.948
#> SRR2105366 2 0.3114 0.935 0.056 0.944
#> SRR2105363 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.3879 0.918 0.076 0.924
#> SRR2105349 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105350 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR2105332 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105333 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105334 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105329 1 0.7674 0.725 0.776 0.224
#> SRR2105330 2 0.8813 0.588 0.300 0.700
#> SRR2105327 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105328 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105325 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.4161 0.903 0.916 0.084
#> SRR2105324 1 0.3114 0.929 0.944 0.056
#> SRR2105319 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105315 1 0.8499 0.639 0.724 0.276
#> SRR2105316 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105313 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105314 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0376 0.966 0.996 0.004
#> SRR2105307 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.4431 0.897 0.908 0.092
#> SRR2105309 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR2105302 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.0938 0.962 0.988 0.012
#> SRR2105300 1 0.6712 0.795 0.824 0.176
#> SRR2105297 2 0.3733 0.920 0.072 0.928
#> SRR2105298 2 0.1184 0.966 0.016 0.984
#> SRR2105295 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR2105292 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.1843 0.951 0.972 0.028
#> SRR2105285 2 0.0938 0.968 0.012 0.988
#> SRR2105286 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.4815 0.889 0.104 0.896
#> SRR2105284 2 0.8861 0.575 0.304 0.696
#> SRR2105281 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105250 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.3431 0.922 0.936 0.064
#> SRR2105246 1 0.6148 0.829 0.848 0.152
#> SRR2105243 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.6048 0.835 0.148 0.852
#> SRR2105238 2 0.2043 0.954 0.032 0.968
#> SRR2105235 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.1843 0.951 0.972 0.028
#> SRR2105228 1 0.7528 0.744 0.784 0.216
#> SRR2105225 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105230 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105222 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105223 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.1414 0.957 0.980 0.020
#> SRR2105214 1 0.6712 0.796 0.824 0.176
#> SRR2105211 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR2105209 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0672 0.964 0.992 0.008
#> SRR2105205 2 0.3879 0.916 0.076 0.924
#> SRR2105206 2 0.4815 0.887 0.104 0.896
#> SRR2105201 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105203 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0376 0.966 0.996 0.004
#> SRR2105195 1 0.6048 0.833 0.852 0.148
#> SRR2105196 1 0.4690 0.888 0.900 0.100
#> SRR2105193 1 0.3879 0.911 0.924 0.076
#> SRR2105194 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR2105190 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.7950 0.704 0.240 0.760
#> SRR2105188 2 0.9129 0.533 0.328 0.672
#> SRR2105179 1 0.1184 0.960 0.984 0.016
#> SRR2105180 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105186 2 0.0672 0.971 0.008 0.992
#> SRR2105181 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.9833 0.281 0.576 0.424
#> SRR2105178 1 0.7453 0.745 0.788 0.212
#> SRR2105171 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.2948 0.933 0.948 0.052
#> SRR2105176 1 0.2043 0.948 0.968 0.032
#> SRR2105173 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR2105155 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0938 0.969 0.012 0.988
#> SRR2105151 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105150 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105147 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105148 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105143 1 0.5178 0.870 0.884 0.116
#> SRR2105144 2 0.7139 0.767 0.196 0.804
#> SRR2105145 1 0.3733 0.915 0.928 0.072
#> SRR2105146 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0376 0.973 0.004 0.996
#> SRR2105142 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.1184 0.965 0.016 0.984
#> SRR2105138 2 0.2043 0.955 0.032 0.968
#> SRR2105135 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.974 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.968 1.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.9170 0.520 0.668 0.332
#> SRR2105132 1 0.3114 0.928 0.944 0.056
#> SRR2105129 1 0.2043 0.948 0.968 0.032
#> SRR2105130 1 0.8608 0.622 0.716 0.284
#> SRR2105127 1 0.3733 0.913 0.928 0.072
#> SRR2105128 1 0.7528 0.740 0.784 0.216
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105275 3 0.0424 0.77687 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105276 3 0.0592 0.78042 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105273 1 0.4931 0.71087 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105274 1 0.5650 0.60412 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105271 1 0.6235 0.36064 0.564 0.000 0.436
#> SRR2105272 3 0.4062 0.71254 0.164 0.000 0.836
#> SRR2105269 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105270 2 0.0892 0.92483 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.5760 0.55745 0.000 0.672 0.328
#> SRR2105264 2 0.5733 0.56242 0.000 0.676 0.324
#> SRR2105261 1 0.6629 0.50405 0.624 0.016 0.360
#> SRR2105262 1 0.2339 0.80387 0.940 0.012 0.048
#> SRR2105357 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.2796 0.87458 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105440 2 0.4702 0.73959 0.212 0.788 0.000
#> SRR2105509 2 0.0237 0.93035 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105510 2 0.0237 0.93035 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105507 3 0.6305 -0.10982 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105508 1 0.5465 0.64135 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105505 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105506 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105503 2 0.3192 0.85735 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105504 2 0.2945 0.87825 0.004 0.908 0.088
#> SRR2105501 2 0.4931 0.68008 0.232 0.768 0.000
#> SRR2105502 2 0.3816 0.82242 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105499 1 0.3116 0.79327 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105500 1 0.0661 0.80186 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105497 2 0.1289 0.91833 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105498 2 0.1411 0.91471 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105495 2 0.2711 0.87940 0.088 0.912 0.000
#> SRR2105496 2 0.1529 0.91375 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105493 2 0.5956 0.55512 0.324 0.672 0.004
#> SRR2105494 2 0.5291 0.66159 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105491 3 0.1753 0.75720 0.000 0.048 0.952
#> SRR2105492 3 0.5810 0.42400 0.000 0.336 0.664
#> SRR2105489 2 0.0747 0.92595 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105490 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105487 1 0.1163 0.79882 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105488 1 0.3816 0.73338 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105485 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.1411 0.79737 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105483 3 0.4628 0.74271 0.056 0.088 0.856
#> SRR2105484 3 0.4075 0.75592 0.048 0.072 0.880
#> SRR2105481 3 0.6291 -0.03796 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105482 1 0.5650 0.62585 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105479 3 0.0237 0.77995 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105480 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105477 2 0.4196 0.84569 0.024 0.864 0.112
#> SRR2105478 2 0.5905 0.74487 0.044 0.772 0.184
#> SRR2105475 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105473 2 0.1964 0.90328 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105474 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105471 2 0.0424 0.92917 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105472 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.2261 0.79731 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105470 1 0.4654 0.72173 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105467 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105468 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105465 1 0.7021 0.28126 0.544 0.020 0.436
#> SRR2105466 1 0.8316 0.17977 0.496 0.080 0.424
#> SRR2105463 1 0.6308 0.15299 0.508 0.000 0.492
#> SRR2105464 3 0.5948 0.35822 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105461 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105457 1 0.0237 0.80047 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105458 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.6948 0.20721 0.512 0.016 0.472
#> SRR2105456 1 0.5859 0.55750 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105453 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.6434 0.42761 0.380 0.612 0.008
#> SRR2105452 3 0.8825 0.41138 0.132 0.336 0.532
#> SRR2105449 3 0.4353 0.71769 0.156 0.008 0.836
#> SRR2105450 1 0.5431 0.65243 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105447 2 0.2711 0.87166 0.088 0.912 0.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105445 1 0.0892 0.79287 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105446 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105443 1 0.3752 0.65517 0.856 0.144 0.000
#> SRR2105444 1 0.6816 0.03412 0.516 0.472 0.012
#> SRR2105441 2 0.0592 0.92789 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105437 1 0.5621 0.51099 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105438 1 0.6168 0.25009 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105435 1 0.2165 0.80258 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105436 1 0.0592 0.80182 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105433 3 0.3213 0.76357 0.092 0.008 0.900
#> SRR2105434 3 0.6286 0.02489 0.464 0.000 0.536
#> SRR2105431 1 0.5678 0.60606 0.684 0.000 0.316
#> SRR2105432 1 0.5926 0.55532 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105429 2 0.6191 0.73309 0.140 0.776 0.084
#> SRR2105430 2 0.1163 0.92045 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105427 2 0.1031 0.92240 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105428 2 0.0237 0.93035 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105425 2 0.0424 0.92907 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105426 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105421 1 0.5763 0.64481 0.716 0.008 0.276
#> SRR2105422 1 0.5465 0.63811 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105423 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.0592 0.80132 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105420 1 0.3116 0.78914 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105415 1 0.5098 0.69465 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105416 1 0.4002 0.76649 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105417 1 0.5760 0.57322 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105418 3 0.4750 0.66008 0.216 0.000 0.784
#> SRR2105413 2 0.0747 0.92555 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105414 2 0.0747 0.92570 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 1 0.0592 0.79987 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105408 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.4002 0.75719 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105406 1 0.3918 0.76816 0.856 0.004 0.140
#> SRR2105401 2 0.5285 0.68164 0.244 0.752 0.004
#> SRR2105402 2 0.5764 0.75390 0.124 0.800 0.076
#> SRR2105399 2 0.3192 0.85369 0.112 0.888 0.000
#> SRR2105400 2 0.3619 0.83171 0.136 0.864 0.000
#> SRR2105397 1 0.9547 0.03254 0.480 0.228 0.292
#> SRR2105398 1 0.6829 0.56049 0.736 0.096 0.168
#> SRR2105395 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 1 0.2356 0.80053 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105390 1 0.1964 0.80264 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105391 1 0.0592 0.80151 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105392 1 0.0747 0.80179 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105385 1 0.6079 0.49377 0.612 0.000 0.388
#> SRR2105386 1 0.4178 0.75205 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105387 1 0.6228 0.51629 0.624 0.004 0.372
#> SRR2105388 1 0.1964 0.80248 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105381 2 0.4683 0.79458 0.140 0.836 0.024
#> SRR2105382 2 0.1964 0.90200 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105383 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105384 2 0.0424 0.92911 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105379 2 0.3340 0.85372 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105380 2 0.6308 0.08903 0.000 0.508 0.492
#> SRR2105377 2 0.1289 0.91856 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105378 2 0.0592 0.92759 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105375 1 0.4902 0.74649 0.844 0.064 0.092
#> SRR2105376 1 0.0475 0.80035 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105373 1 0.1411 0.80330 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105374 1 0.4346 0.71710 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105371 1 0.3879 0.76837 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105372 1 0.3941 0.76253 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105369 1 0.0747 0.80197 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105370 1 0.1163 0.80245 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105367 1 0.0661 0.80085 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105368 1 0.6234 0.65332 0.776 0.128 0.096
#> SRR2105365 3 0.6299 -0.04321 0.000 0.476 0.524
#> SRR2105366 3 0.5785 0.41490 0.000 0.332 0.668
#> SRR2105363 2 0.1529 0.91281 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0237 0.93041 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105359 1 0.1529 0.80221 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105360 1 0.4002 0.76612 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105355 1 0.3116 0.78400 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105356 1 0.4750 0.71307 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105353 3 0.6079 0.32723 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105354 1 0.6291 0.24239 0.532 0.000 0.468
#> SRR2105351 2 0.1031 0.92264 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105352 2 0.7158 0.39799 0.032 0.596 0.372
#> SRR2105349 2 0.2165 0.89739 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105350 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105346 2 0.0237 0.93045 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105347 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105348 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.0747 0.80254 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105342 1 0.1411 0.80253 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105339 1 0.5178 0.67669 0.744 0.000 0.256
#> SRR2105340 1 0.6180 0.38573 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105335 1 0.0592 0.80198 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105336 1 0.1643 0.80396 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105337 1 0.6274 0.29899 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105338 1 0.6126 0.46210 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105331 2 0.1647 0.91487 0.004 0.960 0.036
#> SRR2105332 2 0.1163 0.92043 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105333 2 0.0237 0.93036 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105334 2 0.0237 0.93044 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105329 1 0.3038 0.71454 0.896 0.104 0.000
#> SRR2105330 2 0.5178 0.67492 0.256 0.744 0.000
#> SRR2105327 2 0.0424 0.92933 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105328 2 0.0892 0.92377 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105325 3 0.0592 0.77607 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105326 3 0.1163 0.77446 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105323 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105319 1 0.4887 0.70257 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105320 1 0.6026 0.47606 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105321 3 0.3038 0.75452 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105322 3 0.1163 0.77982 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105317 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105315 1 0.4178 0.63003 0.828 0.172 0.000
#> SRR2105316 2 0.2066 0.89885 0.060 0.940 0.000
#> SRR2105313 2 0.0892 0.92344 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105311 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105312 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105307 1 0.3686 0.76937 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105308 1 0.7232 0.63142 0.712 0.116 0.172
#> SRR2105309 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0237 0.79974 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105305 1 0.0424 0.80075 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105306 1 0.4555 0.72832 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105303 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.2878 0.86772 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105302 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 1 0.4179 0.75283 0.876 0.052 0.072
#> SRR2105300 1 0.6016 0.46693 0.724 0.256 0.020
#> SRR2105297 2 0.3482 0.84070 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105298 2 0.1163 0.92045 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105295 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105293 3 0.0424 0.78097 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105294 3 0.3816 0.72969 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105291 1 0.4521 0.74660 0.816 0.004 0.180
#> SRR2105292 1 0.5058 0.71063 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105289 1 0.4062 0.76092 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105290 1 0.5591 0.60853 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105287 1 0.4291 0.74789 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105288 1 0.4807 0.76634 0.848 0.060 0.092
#> SRR2105285 2 0.3116 0.85636 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105283 2 0.3141 0.88501 0.068 0.912 0.020
#> SRR2105284 2 0.5948 0.48628 0.360 0.640 0.000
#> SRR2105281 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.1753 0.80322 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105258 1 0.6225 0.38097 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105253 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 1 0.0592 0.80132 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105256 1 0.0592 0.80165 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105251 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105250 2 0.1031 0.92288 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.0592 0.78146 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105246 3 0.7853 0.28098 0.384 0.060 0.556
#> SRR2105243 1 0.3267 0.78175 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105244 1 0.6192 0.41024 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105241 1 0.6252 0.33432 0.556 0.000 0.444
#> SRR2105242 1 0.5363 0.67124 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105239 3 0.6299 -0.00811 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105240 1 0.6111 0.47117 0.604 0.000 0.396
#> SRR2105237 2 0.4702 0.74090 0.212 0.788 0.000
#> SRR2105238 2 0.5810 0.54416 0.336 0.664 0.000
#> SRR2105235 2 0.0424 0.92919 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105233 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.6379 0.48462 0.624 0.008 0.368
#> SRR2105228 1 0.9743 0.08668 0.440 0.248 0.312
#> SRR2105225 1 0.3192 0.78580 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105226 1 0.5733 0.59442 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105229 1 0.2625 0.79361 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105230 1 0.2066 0.80218 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105219 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105221 2 0.2261 0.89380 0.068 0.932 0.000
#> SRR2105222 2 0.0424 0.92916 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105223 1 0.4931 0.71022 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105224 1 0.5098 0.69229 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105217 2 0.1529 0.91416 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105218 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.4291 0.70474 0.180 0.000 0.820
#> SRR2105214 3 0.2959 0.76136 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105211 1 0.1964 0.80241 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105212 1 0.0592 0.80187 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105209 1 0.2959 0.78789 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105210 1 0.5291 0.66499 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105207 3 0.6126 0.25824 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105208 3 0.7043 0.24101 0.400 0.024 0.576
#> SRR2105205 2 0.4452 0.76944 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105206 2 0.4002 0.80867 0.000 0.840 0.160
#> SRR2105201 2 0.3412 0.84487 0.124 0.876 0.000
#> SRR2105202 2 0.2796 0.87593 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105203 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105197 1 0.2165 0.78730 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105198 1 0.3610 0.76549 0.888 0.016 0.096
#> SRR2105195 3 0.6955 0.66883 0.172 0.100 0.728
#> SRR2105196 3 0.6500 0.68502 0.140 0.100 0.760
#> SRR2105193 3 0.1950 0.78129 0.040 0.008 0.952
#> SRR2105194 3 0.0237 0.77996 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105191 1 0.0747 0.79991 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105192 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.3434 0.88215 0.032 0.904 0.064
#> SRR2105190 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105187 2 0.8210 0.04683 0.072 0.468 0.460
#> SRR2105188 2 0.7036 0.67766 0.184 0.720 0.096
#> SRR2105179 3 0.6773 0.42587 0.340 0.024 0.636
#> SRR2105180 1 0.4555 0.73997 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105183 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.4887 0.69731 0.000 0.772 0.228
#> SRR2105186 2 0.5138 0.67876 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105181 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105177 3 0.3155 0.77272 0.040 0.044 0.916
#> SRR2105178 3 0.6348 0.65508 0.212 0.048 0.740
#> SRR2105171 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 3 0.0747 0.78186 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105176 3 0.1031 0.78178 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105173 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.5678 0.48831 0.316 0.000 0.684
#> SRR2105166 3 0.1031 0.78200 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105163 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105164 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105161 3 0.3896 0.74657 0.128 0.008 0.864
#> SRR2105162 3 0.3551 0.74089 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105155 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.1289 0.91912 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105159 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105160 3 0.0892 0.78208 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105153 2 0.3482 0.84374 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105154 2 0.6180 0.34748 0.000 0.584 0.416
#> SRR2105151 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 1 0.2625 0.78361 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105150 1 0.3193 0.79255 0.896 0.004 0.100
#> SRR2105147 3 0.4235 0.69520 0.176 0.000 0.824
#> SRR2105148 3 0.4178 0.69716 0.172 0.000 0.828
#> SRR2105143 1 0.8191 0.27784 0.528 0.076 0.396
#> SRR2105144 2 0.6561 0.68593 0.144 0.756 0.100
#> SRR2105145 3 0.0237 0.77889 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105146 3 0.0000 0.77839 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105141 2 0.5882 0.51703 0.000 0.652 0.348
#> SRR2105142 2 0.3412 0.84603 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105139 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.4887 0.71639 0.228 0.772 0.000
#> SRR2105138 2 0.1170 0.92442 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105135 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.93162 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.79881 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.4702 0.55577 0.788 0.212 0.000
#> SRR2105132 1 0.2200 0.76735 0.940 0.056 0.004
#> SRR2105129 1 0.7624 0.35603 0.560 0.048 0.392
#> SRR2105130 3 0.8745 0.29204 0.356 0.120 0.524
#> SRR2105127 1 0.0661 0.79895 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105128 1 0.3500 0.70761 0.880 0.116 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.0707 0.66109 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR2105278 3 0.2081 0.65624 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR2105275 4 0.2494 0.65767 0.048 0.000 0.036 0.916
#> SRR2105276 4 0.3266 0.65172 0.108 0.000 0.024 0.868
#> SRR2105273 1 0.6016 0.47543 0.544 0.000 0.412 0.044
#> SRR2105274 1 0.5090 0.60807 0.660 0.000 0.324 0.016
#> SRR2105271 1 0.6773 0.61286 0.584 0.000 0.284 0.132
#> SRR2105272 1 0.6392 0.31635 0.528 0.000 0.068 0.404
#> SRR2105269 2 0.1661 0.88101 0.052 0.944 0.004 0.000
#> SRR2105270 2 0.2704 0.82894 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR2105267 2 0.0469 0.87875 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105268 2 0.0376 0.87848 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR2105265 2 0.0524 0.87987 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105266 2 0.0469 0.87814 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.4877 0.54532 0.008 0.664 0.000 0.328
#> SRR2105264 2 0.4459 0.74850 0.032 0.780 0.000 0.188
#> SRR2105261 3 0.7838 0.12430 0.356 0.016 0.464 0.164
#> SRR2105262 3 0.5544 0.45389 0.332 0.020 0.640 0.008
#> SRR2105357 3 0.1902 0.66485 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR2105358 3 0.0592 0.66189 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2105439 2 0.5298 0.65576 0.048 0.708 0.244 0.000
#> SRR2105440 2 0.5137 0.59524 0.024 0.680 0.296 0.000
#> SRR2105509 2 0.0657 0.88097 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105510 2 0.0712 0.88169 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR2105507 1 0.5783 0.66191 0.704 0.000 0.188 0.108
#> SRR2105508 1 0.5582 0.56947 0.620 0.000 0.348 0.032
#> SRR2105505 3 0.4193 0.55561 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR2105506 3 0.4989 -0.21441 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105503 2 0.3697 0.82201 0.048 0.852 0.000 0.100
#> SRR2105504 2 0.3962 0.78934 0.028 0.820 0.000 0.152
#> SRR2105501 2 0.5565 0.64474 0.068 0.700 0.232 0.000
#> SRR2105502 2 0.4171 0.79921 0.060 0.824 0.000 0.116
#> SRR2105499 3 0.5313 0.31511 0.376 0.000 0.608 0.016
#> SRR2105500 3 0.4122 0.59766 0.236 0.004 0.760 0.000
#> SRR2105497 2 0.3726 0.74764 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.3312 0.84637 0.072 0.876 0.000 0.052
#> SRR2105495 2 0.4181 0.80320 0.052 0.820 0.128 0.000
#> SRR2105496 2 0.3598 0.82133 0.028 0.848 0.124 0.000
#> SRR2105493 2 0.6607 0.27423 0.084 0.516 0.400 0.000
#> SRR2105494 2 0.5682 0.26484 0.024 0.520 0.456 0.000
#> SRR2105491 4 0.2408 0.65005 0.036 0.044 0.000 0.920
#> SRR2105492 4 0.5599 0.43905 0.040 0.316 0.000 0.644
#> SRR2105489 2 0.2197 0.87191 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR2105490 2 0.0469 0.87891 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105487 3 0.2300 0.65797 0.064 0.000 0.920 0.016
#> SRR2105488 3 0.3616 0.63184 0.036 0.000 0.852 0.112
#> SRR2105485 3 0.2469 0.64941 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105486 3 0.3479 0.64387 0.148 0.000 0.840 0.012
#> SRR2105483 1 0.6649 0.22410 0.556 0.056 0.016 0.372
#> SRR2105484 1 0.6283 0.34321 0.604 0.032 0.024 0.340
#> SRR2105481 4 0.7712 -0.17273 0.224 0.000 0.372 0.404
#> SRR2105482 1 0.6553 0.61425 0.584 0.000 0.316 0.100
#> SRR2105479 4 0.2868 0.62416 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR2105480 4 0.3024 0.61408 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR2105477 2 0.7003 0.54116 0.020 0.628 0.132 0.220
#> SRR2105478 2 0.8000 0.31792 0.028 0.524 0.224 0.224
#> SRR2105475 2 0.0779 0.88189 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR2105476 2 0.0804 0.88127 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105473 2 0.4228 0.71594 0.008 0.760 0.232 0.000
#> SRR2105474 2 0.1452 0.88071 0.008 0.956 0.036 0.000
#> SRR2105471 2 0.2542 0.86456 0.084 0.904 0.000 0.012
#> SRR2105472 2 0.1635 0.87965 0.044 0.948 0.000 0.008
#> SRR2105469 3 0.4967 -0.05322 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR2105470 1 0.4831 0.62895 0.704 0.000 0.280 0.016
#> SRR2105467 3 0.3219 0.63363 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR2105468 3 0.3610 0.60616 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR2105465 1 0.5420 0.65615 0.724 0.008 0.220 0.048
#> SRR2105466 1 0.5845 0.64940 0.748 0.036 0.136 0.080
#> SRR2105463 1 0.6821 0.60324 0.592 0.000 0.256 0.152
#> SRR2105464 1 0.6392 0.60101 0.660 0.004 0.128 0.208
#> SRR2105461 2 0.0895 0.88256 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR2105462 2 0.0524 0.87888 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR2105459 2 0.0657 0.88022 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR2105460 2 0.0188 0.87615 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105457 3 0.3257 0.63623 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR2105458 3 0.2081 0.66250 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR2105455 1 0.4865 0.65081 0.792 0.020 0.148 0.040
#> SRR2105456 1 0.5172 0.64068 0.704 0.000 0.260 0.036
#> SRR2105453 3 0.3123 0.65433 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR2105454 3 0.2704 0.65907 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR2105451 2 0.6990 0.37111 0.124 0.560 0.312 0.004
#> SRR2105452 1 0.9099 -0.10199 0.372 0.304 0.068 0.256
#> SRR2105449 1 0.5599 0.42180 0.644 0.000 0.040 0.316
#> SRR2105450 1 0.6280 0.59828 0.584 0.000 0.344 0.072
#> SRR2105447 2 0.3840 0.82923 0.104 0.844 0.052 0.000
#> SRR2105448 2 0.0895 0.88301 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR2105445 3 0.3991 0.64688 0.172 0.020 0.808 0.000
#> SRR2105446 3 0.1792 0.66498 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR2105443 3 0.5451 0.59097 0.124 0.096 0.764 0.016
#> SRR2105444 3 0.7586 0.25317 0.164 0.304 0.520 0.012
#> SRR2105441 2 0.3090 0.86218 0.056 0.888 0.056 0.000
#> SRR2105442 2 0.1305 0.88074 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR2105437 3 0.5935 0.46911 0.080 0.000 0.664 0.256
#> SRR2105438 3 0.6000 0.31630 0.052 0.000 0.592 0.356
#> SRR2105435 3 0.4910 0.57576 0.276 0.000 0.704 0.020
#> SRR2105436 3 0.3908 0.59329 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR2105433 1 0.5861 0.46617 0.644 0.000 0.060 0.296
#> SRR2105434 1 0.5186 0.65387 0.752 0.000 0.164 0.084
#> SRR2105431 3 0.6801 -0.31167 0.448 0.000 0.456 0.096
#> SRR2105432 1 0.5966 0.57281 0.624 0.000 0.316 0.060
#> SRR2105429 2 0.8470 0.38807 0.148 0.556 0.156 0.140
#> SRR2105430 2 0.4672 0.81235 0.064 0.820 0.024 0.092
#> SRR2105427 2 0.1975 0.87520 0.016 0.936 0.048 0.000
#> SRR2105428 2 0.1398 0.87939 0.004 0.956 0.040 0.000
#> SRR2105425 2 0.2197 0.87278 0.080 0.916 0.004 0.000
#> SRR2105426 2 0.1256 0.88442 0.028 0.964 0.008 0.000
#> SRR2105421 1 0.5887 0.60367 0.616 0.004 0.340 0.040
#> SRR2105422 1 0.5384 0.59507 0.648 0.000 0.324 0.028
#> SRR2105423 2 0.1211 0.88074 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0707 0.88166 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.4830 0.12582 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR2105420 3 0.5506 -0.21200 0.472 0.000 0.512 0.016
#> SRR2105415 3 0.7031 0.24290 0.288 0.000 0.556 0.156
#> SRR2105416 3 0.6613 0.07253 0.344 0.000 0.560 0.096
#> SRR2105417 1 0.5343 0.62406 0.656 0.000 0.316 0.028
#> SRR2105418 1 0.5434 0.56861 0.728 0.000 0.084 0.188
#> SRR2105413 2 0.3256 0.85403 0.044 0.884 0.068 0.004
#> SRR2105414 2 0.2840 0.86449 0.056 0.900 0.044 0.000
#> SRR2105409 2 0.0336 0.87807 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.2115 0.87826 0.024 0.936 0.036 0.004
#> SRR2105411 2 0.1867 0.87386 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.1109 0.88134 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR2105407 3 0.3443 0.66676 0.136 0.000 0.848 0.016
#> SRR2105408 3 0.1305 0.66458 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR2105403 3 0.2704 0.65751 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR2105404 3 0.2814 0.64947 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR2105405 1 0.4605 0.57562 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105406 1 0.4804 0.56762 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105401 2 0.7152 0.42188 0.164 0.568 0.264 0.004
#> SRR2105402 2 0.6651 0.65291 0.080 0.708 0.100 0.112
#> SRR2105399 2 0.6221 0.57166 0.100 0.644 0.256 0.000
#> SRR2105400 2 0.5812 0.66360 0.064 0.696 0.232 0.008
#> SRR2105397 4 0.9311 0.18151 0.196 0.108 0.312 0.384
#> SRR2105398 3 0.6835 0.50551 0.144 0.028 0.664 0.164
#> SRR2105395 2 0.1297 0.88282 0.020 0.964 0.000 0.016
#> SRR2105396 2 0.0188 0.87615 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.1792 0.87786 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0707 0.88046 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.5195 0.51268 0.276 0.000 0.692 0.032
#> SRR2105390 3 0.4988 0.49271 0.288 0.000 0.692 0.020
#> SRR2105391 3 0.4452 0.48832 0.260 0.000 0.732 0.008
#> SRR2105392 3 0.3583 0.61806 0.180 0.000 0.816 0.004
#> SRR2105385 1 0.6238 0.63581 0.652 0.000 0.236 0.112
#> SRR2105386 1 0.5398 0.49189 0.580 0.000 0.404 0.016
#> SRR2105387 1 0.5102 0.66245 0.748 0.000 0.188 0.064
#> SRR2105388 3 0.5004 0.13499 0.392 0.004 0.604 0.000
#> SRR2105381 2 0.5512 0.71842 0.112 0.756 0.120 0.012
#> SRR2105382 2 0.2596 0.86129 0.024 0.908 0.000 0.068
#> SRR2105383 2 0.4072 0.82600 0.120 0.828 0.052 0.000
#> SRR2105384 2 0.3900 0.83186 0.072 0.844 0.084 0.000
#> SRR2105379 2 0.2670 0.86718 0.040 0.908 0.000 0.052
#> SRR2105380 2 0.6931 0.40825 0.184 0.588 0.000 0.228
#> SRR2105377 2 0.4578 0.76378 0.052 0.788 0.160 0.000
#> SRR2105378 2 0.1978 0.86902 0.004 0.928 0.068 0.000
#> SRR2105375 3 0.5883 0.50208 0.280 0.024 0.668 0.028
#> SRR2105376 3 0.3356 0.64198 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR2105373 3 0.4136 0.61684 0.196 0.000 0.788 0.016
#> SRR2105374 3 0.5033 0.60136 0.072 0.000 0.760 0.168
#> SRR2105371 1 0.6147 0.14467 0.488 0.000 0.464 0.048
#> SRR2105372 1 0.5606 0.25371 0.500 0.000 0.480 0.020
#> SRR2105369 3 0.4730 0.21658 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR2105370 3 0.4888 0.25249 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR2105367 3 0.3780 0.64303 0.148 0.016 0.832 0.004
#> SRR2105368 3 0.7668 0.29892 0.308 0.108 0.544 0.040
#> SRR2105365 2 0.5735 0.34513 0.032 0.576 0.000 0.392
#> SRR2105366 4 0.5649 0.37760 0.036 0.344 0.000 0.620
#> SRR2105363 2 0.2032 0.87878 0.036 0.936 0.028 0.000
#> SRR2105364 2 0.1406 0.88446 0.024 0.960 0.016 0.000
#> SRR2105361 2 0.0895 0.88181 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2105362 2 0.1114 0.88288 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR2105359 3 0.4356 0.45140 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR2105360 1 0.5343 0.57975 0.656 0.000 0.316 0.028
#> SRR2105355 1 0.5158 0.36448 0.524 0.000 0.472 0.004
#> SRR2105356 1 0.4950 0.56638 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR2105353 1 0.7838 0.27018 0.404 0.000 0.280 0.316
#> SRR2105354 3 0.7782 -0.14708 0.360 0.000 0.396 0.244
#> SRR2105351 2 0.1576 0.88200 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR2105352 4 0.7435 0.12973 0.068 0.424 0.040 0.468
#> SRR2105349 2 0.3387 0.85850 0.032 0.888 0.028 0.052
#> SRR2105350 2 0.2036 0.87837 0.032 0.936 0.032 0.000
#> SRR2105345 2 0.2662 0.86838 0.084 0.900 0.016 0.000
#> SRR2105346 2 0.1489 0.88258 0.044 0.952 0.004 0.000
#> SRR2105347 2 0.2255 0.87330 0.068 0.920 0.012 0.000
#> SRR2105348 2 0.2773 0.85290 0.116 0.880 0.004 0.000
#> SRR2105343 2 0.1211 0.88068 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0817 0.88196 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.4088 0.52738 0.232 0.000 0.764 0.004
#> SRR2105342 3 0.4898 0.07710 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR2105339 3 0.6060 -0.20293 0.440 0.000 0.516 0.044
#> SRR2105340 3 0.7469 -0.10439 0.340 0.000 0.472 0.188
#> SRR2105335 3 0.2271 0.66701 0.076 0.000 0.916 0.008
#> SRR2105336 3 0.3668 0.62765 0.188 0.000 0.808 0.004
#> SRR2105337 1 0.5728 0.65512 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR2105338 1 0.6461 0.64110 0.632 0.000 0.240 0.128
#> SRR2105331 2 0.2652 0.87217 0.056 0.912 0.004 0.028
#> SRR2105332 2 0.0707 0.88107 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105333 2 0.3471 0.84570 0.072 0.868 0.060 0.000
#> SRR2105334 2 0.1911 0.88001 0.020 0.944 0.032 0.004
#> SRR2105329 3 0.4356 0.61855 0.092 0.072 0.828 0.008
#> SRR2105330 2 0.6252 0.52141 0.088 0.624 0.288 0.000
#> SRR2105327 2 0.1639 0.88280 0.036 0.952 0.004 0.008
#> SRR2105328 2 0.1674 0.88209 0.012 0.952 0.004 0.032
#> SRR2105325 4 0.1733 0.65523 0.028 0.000 0.024 0.948
#> SRR2105326 4 0.2984 0.63920 0.028 0.000 0.084 0.888
#> SRR2105323 3 0.3072 0.66275 0.124 0.004 0.868 0.004
#> SRR2105324 1 0.5112 0.34862 0.560 0.004 0.436 0.000
#> SRR2105319 3 0.7188 0.41202 0.244 0.000 0.552 0.204
#> SRR2105320 3 0.6451 0.25242 0.072 0.000 0.524 0.404
#> SRR2105321 4 0.6411 0.40777 0.308 0.000 0.092 0.600
#> SRR2105322 4 0.4617 0.60422 0.204 0.000 0.032 0.764
#> SRR2105317 2 0.0895 0.88147 0.004 0.976 0.020 0.000
#> SRR2105318 2 0.0336 0.87719 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105315 3 0.6545 0.47296 0.216 0.152 0.632 0.000
#> SRR2105316 2 0.1305 0.88140 0.004 0.960 0.036 0.000
#> SRR2105313 2 0.2256 0.87422 0.020 0.924 0.056 0.000
#> SRR2105314 2 0.1109 0.88303 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR2105311 4 0.1109 0.65209 0.028 0.000 0.004 0.968
#> SRR2105312 4 0.0921 0.65223 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR2105307 1 0.4888 0.52132 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR2105308 1 0.5003 0.61587 0.676 0.016 0.308 0.000
#> SRR2105309 3 0.2976 0.66230 0.120 0.000 0.872 0.008
#> SRR2105310 3 0.2469 0.65166 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105305 3 0.4401 0.52268 0.272 0.000 0.724 0.004
#> SRR2105306 1 0.5220 0.57371 0.632 0.000 0.352 0.016
#> SRR2105303 2 0.0895 0.88120 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR2105304 2 0.1004 0.88219 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR2105301 2 0.3279 0.85328 0.088 0.880 0.008 0.024
#> SRR2105302 2 0.1004 0.88276 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR2105299 3 0.6045 0.59991 0.148 0.052 0.736 0.064
#> SRR2105300 3 0.5730 0.53738 0.072 0.124 0.760 0.044
#> SRR2105297 2 0.7227 0.57602 0.168 0.648 0.052 0.132
#> SRR2105298 2 0.5135 0.76912 0.140 0.784 0.048 0.028
#> SRR2105295 2 0.0592 0.88121 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0188 0.87609 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105293 4 0.4323 0.62550 0.204 0.000 0.020 0.776
#> SRR2105294 4 0.5929 0.22044 0.356 0.000 0.048 0.596
#> SRR2105291 1 0.5323 0.47580 0.628 0.000 0.352 0.020
#> SRR2105292 1 0.6091 0.52630 0.596 0.000 0.344 0.060
#> SRR2105289 1 0.4936 0.53345 0.652 0.000 0.340 0.008
#> SRR2105290 1 0.5560 0.57098 0.584 0.000 0.392 0.024
#> SRR2105287 1 0.6007 0.33117 0.520 0.004 0.444 0.032
#> SRR2105288 1 0.5766 0.44136 0.564 0.032 0.404 0.000
#> SRR2105285 2 0.6332 0.62298 0.088 0.676 0.220 0.016
#> SRR2105286 2 0.2565 0.87527 0.056 0.912 0.032 0.000
#> SRR2105283 2 0.6325 0.64121 0.092 0.680 0.212 0.016
#> SRR2105284 3 0.6654 -0.08015 0.048 0.460 0.476 0.016
#> SRR2105281 2 0.2500 0.87189 0.040 0.916 0.044 0.000
#> SRR2105282 2 0.0921 0.88273 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.2466 0.66106 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR2105260 3 0.1576 0.66358 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR2105279 2 0.0469 0.87904 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0469 0.87874 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105257 3 0.5130 0.44963 0.332 0.000 0.652 0.016
#> SRR2105258 1 0.6534 0.64997 0.624 0.000 0.244 0.132
#> SRR2105253 2 0.0469 0.87864 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0188 0.87609 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105255 3 0.4193 0.47802 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR2105256 3 0.4431 0.43237 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.87488 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.1576 0.88007 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR2105249 2 0.0921 0.88269 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105250 2 0.2319 0.87814 0.036 0.924 0.040 0.000
#> SRR2105247 2 0.0592 0.88099 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.1022 0.88204 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105245 4 0.4238 0.62303 0.176 0.000 0.028 0.796
#> SRR2105246 1 0.5036 0.63923 0.792 0.016 0.112 0.080
#> SRR2105243 1 0.5183 0.46525 0.584 0.000 0.408 0.008
#> SRR2105244 1 0.6656 0.61559 0.608 0.000 0.256 0.136
#> SRR2105241 1 0.5850 0.63736 0.676 0.000 0.244 0.080
#> SRR2105242 1 0.5917 0.60520 0.624 0.000 0.320 0.056
#> SRR2105239 1 0.6912 0.49170 0.592 0.000 0.192 0.216
#> SRR2105240 1 0.6098 0.66240 0.676 0.000 0.200 0.124
#> SRR2105237 2 0.6823 0.35568 0.040 0.548 0.376 0.036
#> SRR2105238 3 0.5085 0.23253 0.008 0.376 0.616 0.000
#> SRR2105235 2 0.2546 0.86817 0.028 0.912 0.060 0.000
#> SRR2105236 2 0.1356 0.88197 0.032 0.960 0.008 0.000
#> SRR2105233 2 0.2007 0.87989 0.036 0.940 0.020 0.004
#> SRR2105234 2 0.0188 0.87625 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.0336 0.87757 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.1637 0.87659 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.4579 0.62871 0.764 0.004 0.212 0.020
#> SRR2105228 1 0.5858 0.54703 0.756 0.104 0.092 0.048
#> SRR2105225 1 0.5511 0.25375 0.500 0.000 0.484 0.016
#> SRR2105226 1 0.6135 0.60254 0.608 0.000 0.324 0.068
#> SRR2105229 3 0.4937 0.61996 0.172 0.000 0.764 0.064
#> SRR2105230 3 0.3554 0.65870 0.136 0.000 0.844 0.020
#> SRR2105219 2 0.1042 0.88210 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR2105220 2 0.1545 0.88242 0.040 0.952 0.008 0.000
#> SRR2105221 2 0.5247 0.68067 0.052 0.720 0.228 0.000
#> SRR2105222 2 0.2660 0.86725 0.036 0.908 0.056 0.000
#> SRR2105223 1 0.5630 0.56616 0.608 0.000 0.360 0.032
#> SRR2105224 1 0.5423 0.61314 0.640 0.000 0.332 0.028
#> SRR2105217 2 0.2214 0.87368 0.044 0.928 0.000 0.028
#> SRR2105218 2 0.0707 0.88121 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.1637 0.88040 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0895 0.88205 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2105213 1 0.7235 0.36449 0.480 0.000 0.148 0.372
#> SRR2105214 1 0.6310 0.30214 0.540 0.004 0.052 0.404
#> SRR2105211 1 0.5353 0.41952 0.556 0.000 0.432 0.012
#> SRR2105212 3 0.5292 0.04957 0.480 0.008 0.512 0.000
#> SRR2105209 3 0.4838 0.59995 0.252 0.000 0.724 0.024
#> SRR2105210 1 0.5487 0.56305 0.580 0.000 0.400 0.020
#> SRR2105207 1 0.7149 0.50247 0.552 0.000 0.184 0.264
#> SRR2105208 3 0.9371 -0.20880 0.300 0.088 0.320 0.292
#> SRR2105205 2 0.4419 0.75101 0.016 0.792 0.012 0.180
#> SRR2105206 2 0.6046 0.68103 0.068 0.720 0.032 0.180
#> SRR2105201 2 0.5142 0.70672 0.064 0.744 0.192 0.000
#> SRR2105202 2 0.4857 0.63679 0.016 0.700 0.284 0.000
#> SRR2105203 2 0.0817 0.88262 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0188 0.87615 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.1302 0.88250 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.2131 0.87943 0.036 0.932 0.032 0.000
#> SRR2105197 3 0.2313 0.66057 0.044 0.000 0.924 0.032
#> SRR2105198 3 0.4464 0.62042 0.064 0.012 0.824 0.100
#> SRR2105195 1 0.8866 0.32604 0.448 0.068 0.236 0.248
#> SRR2105196 1 0.8649 0.32204 0.488 0.068 0.200 0.244
#> SRR2105193 1 0.4963 0.46677 0.696 0.000 0.020 0.284
#> SRR2105194 4 0.5163 -0.08139 0.480 0.000 0.004 0.516
#> SRR2105191 3 0.3539 0.65639 0.176 0.000 0.820 0.004
#> SRR2105192 3 0.1792 0.66382 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR2105189 2 0.6721 0.67659 0.088 0.696 0.148 0.068
#> SRR2105190 2 0.2131 0.87511 0.036 0.932 0.032 0.000
#> SRR2105187 4 0.7697 0.22770 0.040 0.384 0.092 0.484
#> SRR2105188 2 0.8839 0.02477 0.076 0.424 0.332 0.168
#> SRR2105179 1 0.6574 0.63293 0.652 0.008 0.208 0.132
#> SRR2105180 3 0.5063 0.60914 0.124 0.000 0.768 0.108
#> SRR2105183 2 0.1118 0.88110 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1209 0.88255 0.032 0.964 0.004 0.000
#> SRR2105185 2 0.5279 0.36447 0.400 0.588 0.000 0.012
#> SRR2105186 2 0.4428 0.79830 0.124 0.808 0.000 0.068
#> SRR2105181 3 0.1824 0.66425 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR2105182 3 0.2412 0.66938 0.084 0.000 0.908 0.008
#> SRR2105177 1 0.5593 0.43211 0.700 0.028 0.020 0.252
#> SRR2105178 1 0.8077 0.41438 0.508 0.036 0.164 0.292
#> SRR2105171 2 0.1792 0.87700 0.068 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.0188 0.87609 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.5220 0.21289 0.568 0.000 0.008 0.424
#> SRR2105176 4 0.5167 -0.07153 0.488 0.000 0.004 0.508
#> SRR2105173 2 0.3441 0.81692 0.152 0.840 0.004 0.004
#> SRR2105174 2 0.0336 0.87775 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.1004 0.88260 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR2105170 2 0.1109 0.88090 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR2105167 2 0.0707 0.88008 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0921 0.88198 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.7625 0.36633 0.432 0.000 0.208 0.360
#> SRR2105166 1 0.5778 0.18505 0.500 0.000 0.028 0.472
#> SRR2105163 4 0.3945 0.58707 0.216 0.000 0.004 0.780
#> SRR2105164 4 0.1474 0.65651 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR2105161 1 0.5893 0.54842 0.676 0.004 0.068 0.252
#> SRR2105162 1 0.6348 0.38110 0.568 0.004 0.060 0.368
#> SRR2105155 2 0.0804 0.88086 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.87488 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0336 0.87837 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.1182 0.88179 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR2105159 4 0.4539 0.54344 0.272 0.000 0.008 0.720
#> SRR2105160 4 0.5310 0.15179 0.412 0.000 0.012 0.576
#> SRR2105153 2 0.3166 0.83585 0.016 0.868 0.000 0.116
#> SRR2105154 2 0.5793 0.36586 0.036 0.580 0.000 0.384
#> SRR2105151 2 0.0895 0.88152 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR2105152 2 0.0469 0.87854 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.4829 0.61096 0.156 0.000 0.776 0.068
#> SRR2105150 3 0.4735 0.63031 0.156 0.012 0.792 0.040
#> SRR2105147 4 0.5051 0.58477 0.132 0.000 0.100 0.768
#> SRR2105148 4 0.5222 0.57776 0.132 0.000 0.112 0.756
#> SRR2105143 1 0.5706 0.62649 0.696 0.004 0.236 0.064
#> SRR2105144 1 0.6952 0.00666 0.480 0.420 0.096 0.004
#> SRR2105145 1 0.4937 0.40059 0.660 0.004 0.004 0.332
#> SRR2105146 1 0.4964 0.35694 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR2105141 2 0.5754 0.34891 0.024 0.572 0.004 0.400
#> SRR2105142 2 0.4219 0.79053 0.040 0.820 0.004 0.136
#> SRR2105139 2 0.0188 0.87627 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0779 0.88054 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105137 2 0.5213 0.67114 0.052 0.724 0.224 0.000
#> SRR2105138 2 0.2594 0.87346 0.036 0.920 0.032 0.012
#> SRR2105135 2 0.2921 0.82240 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.1302 0.88000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.2408 0.65581 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR2105134 3 0.1118 0.66183 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105131 3 0.5753 0.54569 0.124 0.148 0.724 0.004
#> SRR2105132 3 0.3938 0.64939 0.084 0.064 0.848 0.004
#> SRR2105129 1 0.4803 0.65860 0.780 0.016 0.176 0.028
#> SRR2105130 1 0.6599 0.65296 0.668 0.020 0.200 0.112
#> SRR2105127 1 0.5597 0.25615 0.516 0.020 0.464 0.000
#> SRR2105128 3 0.6621 0.15770 0.408 0.084 0.508 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.1493 0.60158 0.028 0.000 0.024 0.000 0.948
#> SRR2105278 5 0.2843 0.60828 0.076 0.000 0.048 0.000 0.876
#> SRR2105275 4 0.3651 0.63108 0.060 0.000 0.060 0.848 0.032
#> SRR2105276 4 0.4081 0.61823 0.064 0.000 0.084 0.820 0.032
#> SRR2105273 3 0.5022 0.53627 0.036 0.000 0.672 0.016 0.276
#> SRR2105274 3 0.4362 0.53266 0.036 0.000 0.748 0.008 0.208
#> SRR2105271 3 0.7752 0.30372 0.260 0.000 0.424 0.072 0.244
#> SRR2105272 3 0.7545 0.00987 0.208 0.000 0.396 0.344 0.052
#> SRR2105269 2 0.3170 0.80818 0.048 0.880 0.032 0.004 0.036
#> SRR2105270 2 0.3154 0.76144 0.012 0.836 0.004 0.000 0.148
#> SRR2105267 2 0.1605 0.80001 0.040 0.944 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105268 2 0.1041 0.79126 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105265 2 0.1525 0.79934 0.036 0.948 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105266 2 0.1502 0.79807 0.056 0.940 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.4623 0.59344 0.032 0.664 0.000 0.304 0.000
#> SRR2105264 2 0.5040 0.69359 0.080 0.716 0.012 0.192 0.000
#> SRR2105261 3 0.8112 0.13817 0.240 0.004 0.340 0.084 0.332
#> SRR2105262 5 0.6892 0.19993 0.212 0.004 0.312 0.008 0.464
#> SRR2105357 5 0.3181 0.60973 0.072 0.000 0.072 0.000 0.856
#> SRR2105358 5 0.1907 0.60542 0.044 0.000 0.028 0.000 0.928
#> SRR2105439 2 0.6389 0.50182 0.108 0.584 0.036 0.000 0.272
#> SRR2105440 2 0.5020 0.50694 0.020 0.620 0.016 0.000 0.344
#> SRR2105509 2 0.2433 0.80675 0.056 0.908 0.012 0.000 0.024
#> SRR2105510 2 0.2104 0.80533 0.044 0.924 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105507 3 0.4633 0.50134 0.060 0.000 0.784 0.048 0.108
#> SRR2105508 3 0.4690 0.53407 0.048 0.000 0.708 0.004 0.240
#> SRR2105505 5 0.6236 0.27432 0.208 0.000 0.248 0.000 0.544
#> SRR2105506 3 0.6596 0.34674 0.212 0.000 0.416 0.000 0.372
#> SRR2105503 2 0.4191 0.75602 0.088 0.796 0.008 0.108 0.000
#> SRR2105504 2 0.3554 0.79120 0.060 0.852 0.008 0.072 0.008
#> SRR2105501 2 0.7199 0.35579 0.128 0.528 0.084 0.000 0.260
#> SRR2105502 2 0.4612 0.76083 0.112 0.784 0.044 0.060 0.000
#> SRR2105499 5 0.6731 0.31445 0.280 0.000 0.228 0.008 0.484
#> SRR2105500 5 0.5481 0.50745 0.172 0.000 0.172 0.000 0.656
#> SRR2105497 2 0.4648 0.69973 0.072 0.748 0.172 0.008 0.000
#> SRR2105498 2 0.5166 0.72060 0.172 0.728 0.040 0.060 0.000
#> SRR2105495 2 0.5121 0.72387 0.080 0.736 0.032 0.000 0.152
#> SRR2105496 2 0.5465 0.68398 0.092 0.704 0.032 0.000 0.172
#> SRR2105493 2 0.7591 0.16842 0.088 0.440 0.108 0.008 0.356
#> SRR2105494 5 0.6325 -0.10192 0.100 0.432 0.016 0.000 0.452
#> SRR2105491 4 0.2701 0.60477 0.048 0.044 0.012 0.896 0.000
#> SRR2105492 4 0.3848 0.45626 0.040 0.172 0.000 0.788 0.000
#> SRR2105489 2 0.4171 0.75912 0.204 0.764 0.016 0.012 0.004
#> SRR2105490 2 0.1608 0.79963 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105487 5 0.3427 0.60974 0.064 0.000 0.048 0.028 0.860
#> SRR2105488 5 0.3894 0.60248 0.056 0.000 0.032 0.080 0.832
#> SRR2105485 5 0.4114 0.59843 0.164 0.000 0.060 0.000 0.776
#> SRR2105486 5 0.5176 0.55012 0.224 0.000 0.080 0.008 0.688
#> SRR2105483 1 0.7879 0.33030 0.352 0.024 0.316 0.284 0.024
#> SRR2105484 1 0.7303 0.29045 0.376 0.004 0.336 0.268 0.016
#> SRR2105481 4 0.7816 0.09676 0.092 0.000 0.232 0.444 0.232
#> SRR2105482 3 0.6917 0.49749 0.096 0.000 0.564 0.092 0.248
#> SRR2105479 4 0.3997 0.58765 0.116 0.000 0.076 0.804 0.004
#> SRR2105480 4 0.3425 0.61145 0.044 0.000 0.112 0.840 0.004
#> SRR2105477 2 0.8110 0.22009 0.052 0.444 0.032 0.224 0.248
#> SRR2105478 2 0.8221 0.09237 0.084 0.388 0.012 0.224 0.292
#> SRR2105475 2 0.1990 0.80490 0.068 0.920 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105476 2 0.1893 0.80508 0.048 0.928 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105473 2 0.5438 0.56087 0.060 0.628 0.012 0.000 0.300
#> SRR2105474 2 0.3961 0.77503 0.072 0.812 0.008 0.000 0.108
#> SRR2105471 2 0.5272 0.63432 0.292 0.644 0.004 0.056 0.004
#> SRR2105472 2 0.3022 0.79494 0.136 0.848 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105469 3 0.4904 0.48876 0.036 0.000 0.644 0.004 0.316
#> SRR2105470 3 0.5467 0.53169 0.116 0.000 0.672 0.008 0.204
#> SRR2105467 5 0.3848 0.55116 0.040 0.000 0.172 0.000 0.788
#> SRR2105468 5 0.4269 0.47448 0.036 0.000 0.232 0.000 0.732
#> SRR2105465 3 0.7169 0.23958 0.296 0.004 0.492 0.036 0.172
#> SRR2105466 3 0.7199 0.26158 0.280 0.032 0.548 0.044 0.096
#> SRR2105463 1 0.8155 0.24537 0.388 0.000 0.288 0.140 0.184
#> SRR2105464 3 0.7419 -0.19408 0.380 0.016 0.440 0.112 0.052
#> SRR2105461 2 0.2866 0.80360 0.100 0.872 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105462 2 0.2286 0.80230 0.108 0.888 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.2766 0.80385 0.084 0.884 0.024 0.000 0.008
#> SRR2105460 2 0.0510 0.78593 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105457 5 0.4867 0.55046 0.180 0.000 0.104 0.000 0.716
#> SRR2105458 5 0.4322 0.56458 0.144 0.000 0.088 0.000 0.768
#> SRR2105455 3 0.5051 0.34321 0.248 0.008 0.684 0.000 0.060
#> SRR2105456 3 0.5545 0.48970 0.116 0.000 0.680 0.016 0.188
#> SRR2105453 5 0.5276 0.53614 0.144 0.000 0.160 0.004 0.692
#> SRR2105454 5 0.4351 0.57209 0.100 0.000 0.132 0.000 0.768
#> SRR2105451 2 0.7207 0.33456 0.056 0.532 0.164 0.004 0.244
#> SRR2105452 3 0.8477 -0.07441 0.132 0.316 0.412 0.088 0.052
#> SRR2105449 3 0.7579 -0.14289 0.296 0.000 0.416 0.236 0.052
#> SRR2105450 3 0.7615 0.21297 0.264 0.000 0.424 0.056 0.256
#> SRR2105447 2 0.6352 0.59200 0.136 0.640 0.164 0.000 0.060
#> SRR2105448 2 0.3213 0.80510 0.060 0.872 0.052 0.004 0.012
#> SRR2105445 5 0.5043 0.53181 0.040 0.020 0.252 0.000 0.688
#> SRR2105446 5 0.3299 0.59258 0.040 0.000 0.108 0.004 0.848
#> SRR2105443 5 0.6123 0.55447 0.108 0.068 0.120 0.012 0.692
#> SRR2105444 5 0.7530 0.33769 0.120 0.172 0.140 0.012 0.556
#> SRR2105441 2 0.5167 0.66348 0.244 0.684 0.016 0.000 0.056
#> SRR2105442 2 0.3770 0.75363 0.188 0.788 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105437 5 0.5748 0.49141 0.040 0.000 0.076 0.216 0.668
#> SRR2105438 5 0.6331 0.29686 0.044 0.000 0.072 0.328 0.556
#> SRR2105435 5 0.6736 0.26300 0.324 0.000 0.172 0.016 0.488
#> SRR2105436 5 0.5892 0.47802 0.160 0.000 0.204 0.008 0.628
#> SRR2105433 1 0.7097 0.21455 0.404 0.000 0.388 0.180 0.028
#> SRR2105434 3 0.6552 0.18672 0.312 0.004 0.556 0.040 0.088
#> SRR2105431 5 0.8159 -0.37575 0.304 0.000 0.284 0.100 0.312
#> SRR2105432 3 0.7340 0.35199 0.212 0.000 0.500 0.060 0.228
#> SRR2105429 2 0.9370 -0.05759 0.224 0.352 0.088 0.132 0.204
#> SRR2105430 2 0.6924 0.54537 0.268 0.576 0.032 0.088 0.036
#> SRR2105427 2 0.3796 0.78075 0.100 0.820 0.004 0.000 0.076
#> SRR2105428 2 0.3148 0.79720 0.060 0.864 0.004 0.000 0.072
#> SRR2105425 2 0.4100 0.76969 0.148 0.792 0.052 0.000 0.008
#> SRR2105426 2 0.2775 0.80957 0.068 0.888 0.036 0.000 0.008
#> SRR2105421 3 0.5863 0.51689 0.116 0.004 0.588 0.000 0.292
#> SRR2105422 3 0.5122 0.53798 0.076 0.000 0.692 0.008 0.224
#> SRR2105423 2 0.3023 0.79901 0.112 0.860 0.024 0.004 0.000
#> SRR2105424 2 0.2284 0.80313 0.096 0.896 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105419 5 0.5857 -0.27525 0.096 0.000 0.444 0.000 0.460
#> SRR2105420 3 0.5439 0.39395 0.068 0.000 0.560 0.000 0.372
#> SRR2105415 5 0.8392 -0.19729 0.280 0.004 0.228 0.132 0.356
#> SRR2105416 5 0.7723 -0.27378 0.336 0.004 0.196 0.060 0.404
#> SRR2105417 3 0.6308 0.48527 0.140 0.004 0.608 0.020 0.228
#> SRR2105418 3 0.7338 0.03985 0.320 0.008 0.488 0.124 0.060
#> SRR2105413 2 0.5494 0.71956 0.124 0.724 0.072 0.000 0.080
#> SRR2105414 2 0.4723 0.73197 0.204 0.736 0.032 0.000 0.028
#> SRR2105409 2 0.1662 0.80481 0.056 0.936 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105410 2 0.3520 0.78870 0.080 0.840 0.004 0.000 0.076
#> SRR2105411 2 0.3915 0.75517 0.180 0.788 0.024 0.004 0.004
#> SRR2105412 2 0.3596 0.76142 0.200 0.784 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105407 5 0.4582 0.60277 0.072 0.000 0.144 0.016 0.768
#> SRR2105408 5 0.2519 0.60755 0.036 0.000 0.060 0.004 0.900
#> SRR2105403 5 0.3764 0.55890 0.040 0.000 0.148 0.004 0.808
#> SRR2105404 5 0.3646 0.55838 0.036 0.000 0.144 0.004 0.816
#> SRR2105405 3 0.4425 0.54154 0.040 0.000 0.716 0.000 0.244
#> SRR2105406 3 0.5719 0.50056 0.120 0.000 0.596 0.000 0.284
#> SRR2105401 2 0.8033 -0.04430 0.188 0.372 0.112 0.000 0.328
#> SRR2105402 2 0.6381 0.64144 0.112 0.688 0.072 0.032 0.096
#> SRR2105399 2 0.7813 -0.03204 0.236 0.364 0.068 0.000 0.332
#> SRR2105400 2 0.7190 0.23684 0.260 0.456 0.028 0.000 0.256
#> SRR2105397 4 0.9147 0.16180 0.128 0.068 0.168 0.344 0.292
#> SRR2105398 5 0.7104 0.45953 0.104 0.012 0.136 0.144 0.604
#> SRR2105395 2 0.1243 0.79767 0.028 0.960 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105396 2 0.1082 0.79379 0.028 0.964 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.3759 0.77372 0.180 0.792 0.024 0.000 0.004
#> SRR2105394 2 0.1124 0.79557 0.036 0.960 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.6350 0.15564 0.080 0.000 0.460 0.028 0.432
#> SRR2105390 5 0.6307 0.02443 0.092 0.000 0.404 0.020 0.484
#> SRR2105391 5 0.5401 -0.16583 0.056 0.000 0.452 0.000 0.492
#> SRR2105392 5 0.5255 0.32562 0.068 0.000 0.284 0.004 0.644
#> SRR2105385 3 0.6999 0.39943 0.188 0.000 0.580 0.096 0.136
#> SRR2105386 3 0.6103 0.47018 0.160 0.000 0.548 0.000 0.292
#> SRR2105387 3 0.6287 0.32752 0.256 0.000 0.596 0.028 0.120
#> SRR2105388 5 0.6819 -0.24586 0.236 0.004 0.364 0.000 0.396
#> SRR2105381 2 0.6528 0.57039 0.100 0.648 0.132 0.004 0.116
#> SRR2105382 2 0.4506 0.76816 0.096 0.792 0.036 0.076 0.000
#> SRR2105383 2 0.6452 0.31622 0.396 0.492 0.060 0.000 0.052
#> SRR2105384 2 0.6284 0.38935 0.368 0.520 0.024 0.000 0.088
#> SRR2105379 2 0.3364 0.80066 0.048 0.872 0.044 0.028 0.008
#> SRR2105380 2 0.7243 0.47636 0.136 0.580 0.088 0.184 0.012
#> SRR2105377 2 0.5767 0.64759 0.076 0.676 0.048 0.000 0.200
#> SRR2105378 2 0.3722 0.78362 0.060 0.828 0.008 0.000 0.104
#> SRR2105375 5 0.7356 -0.08319 0.372 0.016 0.164 0.024 0.424
#> SRR2105376 5 0.5327 0.50002 0.216 0.000 0.120 0.000 0.664
#> SRR2105373 5 0.5354 0.38647 0.044 0.000 0.296 0.020 0.640
#> SRR2105374 5 0.5790 0.52839 0.056 0.000 0.080 0.180 0.684
#> SRR2105371 3 0.5473 0.40161 0.080 0.000 0.620 0.004 0.296
#> SRR2105372 3 0.4735 0.48840 0.044 0.000 0.672 0.000 0.284
#> SRR2105369 5 0.5236 -0.23017 0.044 0.000 0.464 0.000 0.492
#> SRR2105370 3 0.6161 0.09721 0.132 0.000 0.444 0.000 0.424
#> SRR2105367 5 0.5678 0.52578 0.216 0.000 0.128 0.008 0.648
#> SRR2105368 1 0.8461 0.18391 0.344 0.084 0.216 0.024 0.332
#> SRR2105365 2 0.5041 0.34353 0.020 0.544 0.008 0.428 0.000
#> SRR2105366 4 0.3988 0.35400 0.016 0.252 0.000 0.732 0.000
#> SRR2105363 2 0.4366 0.77897 0.064 0.804 0.044 0.000 0.088
#> SRR2105364 2 0.3664 0.79741 0.108 0.836 0.024 0.000 0.032
#> SRR2105361 2 0.1644 0.80186 0.048 0.940 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105362 2 0.2523 0.80625 0.028 0.908 0.040 0.000 0.024
#> SRR2105359 5 0.6061 0.22625 0.212 0.000 0.212 0.000 0.576
#> SRR2105360 3 0.4608 0.54103 0.048 0.000 0.732 0.008 0.212
#> SRR2105355 3 0.4484 0.50766 0.024 0.000 0.668 0.000 0.308
#> SRR2105356 3 0.5640 0.52315 0.116 0.000 0.608 0.000 0.276
#> SRR2105353 3 0.7507 0.34340 0.104 0.000 0.508 0.156 0.232
#> SRR2105354 3 0.7184 0.34048 0.052 0.000 0.492 0.160 0.296
#> SRR2105351 2 0.2289 0.80307 0.080 0.904 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105352 2 0.7287 0.14056 0.076 0.468 0.052 0.376 0.028
#> SRR2105349 2 0.5368 0.67692 0.240 0.688 0.016 0.036 0.020
#> SRR2105350 2 0.3611 0.76669 0.208 0.780 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105345 2 0.5288 0.74421 0.132 0.736 0.060 0.000 0.072
#> SRR2105346 2 0.3624 0.79210 0.112 0.836 0.032 0.000 0.020
#> SRR2105347 2 0.5012 0.64648 0.288 0.664 0.016 0.000 0.032
#> SRR2105348 2 0.5274 0.56066 0.336 0.612 0.040 0.000 0.012
#> SRR2105343 2 0.1942 0.79949 0.068 0.920 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.1341 0.79948 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105341 5 0.4950 0.17831 0.040 0.000 0.348 0.000 0.612
#> SRR2105342 3 0.5352 0.29691 0.056 0.000 0.536 0.000 0.408
#> SRR2105339 3 0.6411 0.24702 0.148 0.000 0.440 0.004 0.408
#> SRR2105340 3 0.7698 0.33437 0.116 0.000 0.424 0.124 0.336
#> SRR2105335 5 0.2610 0.60400 0.028 0.000 0.076 0.004 0.892
#> SRR2105336 5 0.4550 0.46430 0.028 0.000 0.276 0.004 0.692
#> SRR2105337 3 0.5532 0.50741 0.132 0.000 0.708 0.036 0.124
#> SRR2105338 3 0.7717 0.08332 0.308 0.000 0.432 0.088 0.172
#> SRR2105331 2 0.4781 0.78005 0.088 0.796 0.032 0.052 0.032
#> SRR2105332 2 0.1493 0.79952 0.024 0.948 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105333 2 0.5644 0.67627 0.204 0.688 0.040 0.004 0.064
#> SRR2105334 2 0.3340 0.78765 0.156 0.824 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105329 5 0.5961 0.51365 0.180 0.104 0.048 0.000 0.668
#> SRR2105330 2 0.7842 0.22872 0.140 0.464 0.120 0.004 0.272
#> SRR2105327 2 0.3584 0.78996 0.108 0.832 0.056 0.004 0.000
#> SRR2105328 2 0.3506 0.79915 0.080 0.856 0.040 0.020 0.004
#> SRR2105325 4 0.1804 0.63134 0.012 0.000 0.024 0.940 0.024
#> SRR2105326 4 0.2437 0.62913 0.004 0.000 0.032 0.904 0.060
#> SRR2105323 5 0.4124 0.60607 0.144 0.008 0.056 0.000 0.792
#> SRR2105324 3 0.5740 0.48346 0.112 0.000 0.580 0.000 0.308
#> SRR2105319 5 0.7253 0.23145 0.068 0.000 0.352 0.124 0.456
#> SRR2105320 5 0.6302 0.05942 0.036 0.000 0.064 0.448 0.452
#> SRR2105321 3 0.7223 -0.08631 0.084 0.000 0.436 0.384 0.096
#> SRR2105322 4 0.5310 0.54729 0.032 0.000 0.268 0.664 0.036
#> SRR2105317 2 0.1525 0.80047 0.036 0.948 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105318 2 0.1638 0.80203 0.064 0.932 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105315 3 0.7545 0.02819 0.108 0.108 0.408 0.000 0.376
#> SRR2105316 2 0.2629 0.80603 0.064 0.896 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105313 2 0.3792 0.80287 0.100 0.832 0.024 0.000 0.044
#> SRR2105314 2 0.2300 0.80470 0.072 0.904 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105311 4 0.1686 0.62895 0.020 0.000 0.028 0.944 0.008
#> SRR2105312 4 0.1059 0.62077 0.008 0.000 0.020 0.968 0.004
#> SRR2105307 3 0.6416 0.42507 0.180 0.000 0.464 0.000 0.356
#> SRR2105308 3 0.6491 0.33501 0.296 0.000 0.484 0.000 0.220
#> SRR2105309 5 0.4970 0.52787 0.140 0.000 0.148 0.000 0.712
#> SRR2105310 5 0.4457 0.55903 0.124 0.000 0.116 0.000 0.760
#> SRR2105305 5 0.5811 0.20979 0.116 0.000 0.316 0.000 0.568
#> SRR2105306 3 0.4394 0.54103 0.048 0.000 0.732 0.000 0.220
#> SRR2105303 2 0.2701 0.80043 0.092 0.884 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105304 2 0.1894 0.80375 0.072 0.920 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105301 2 0.4216 0.78500 0.112 0.804 0.068 0.012 0.004
#> SRR2105302 2 0.1739 0.80479 0.032 0.940 0.024 0.000 0.004
#> SRR2105299 5 0.6561 0.54516 0.084 0.040 0.184 0.040 0.652
#> SRR2105300 5 0.6385 0.43320 0.116 0.164 0.040 0.020 0.660
#> SRR2105297 1 0.8626 0.29173 0.408 0.308 0.088 0.128 0.068
#> SRR2105298 1 0.6671 -0.05996 0.480 0.412 0.048 0.032 0.028
#> SRR2105295 2 0.1195 0.79678 0.028 0.960 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.1059 0.79470 0.020 0.968 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105293 4 0.5894 0.51634 0.068 0.000 0.300 0.604 0.028
#> SRR2105294 4 0.6672 0.16141 0.100 0.000 0.408 0.456 0.036
#> SRR2105291 3 0.5327 0.47501 0.120 0.000 0.664 0.000 0.216
#> SRR2105292 3 0.6040 0.50406 0.108 0.000 0.620 0.024 0.248
#> SRR2105289 3 0.6407 0.34048 0.296 0.000 0.500 0.000 0.204
#> SRR2105290 3 0.6598 0.36208 0.228 0.000 0.448 0.000 0.324
#> SRR2105287 1 0.7423 0.05988 0.396 0.000 0.328 0.036 0.240
#> SRR2105288 1 0.7142 0.17981 0.428 0.012 0.292 0.004 0.264
#> SRR2105285 2 0.8040 0.13762 0.264 0.420 0.096 0.004 0.216
#> SRR2105286 2 0.4644 0.72904 0.252 0.708 0.016 0.000 0.024
#> SRR2105283 2 0.7564 0.29886 0.076 0.484 0.120 0.012 0.308
#> SRR2105284 5 0.6833 0.14830 0.076 0.356 0.060 0.004 0.504
#> SRR2105281 2 0.3482 0.79670 0.168 0.812 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105282 2 0.1549 0.79955 0.040 0.944 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105259 5 0.4021 0.59901 0.076 0.000 0.108 0.008 0.808
#> SRR2105260 5 0.1981 0.60871 0.048 0.000 0.028 0.000 0.924
#> SRR2105279 2 0.1792 0.80036 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.1544 0.80230 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105257 5 0.6066 0.14392 0.084 0.000 0.364 0.016 0.536
#> SRR2105258 3 0.6712 0.45902 0.140 0.000 0.612 0.084 0.164
#> SRR2105253 2 0.1830 0.80265 0.068 0.924 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0703 0.78671 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105255 5 0.4854 0.28266 0.044 0.000 0.308 0.000 0.648
#> SRR2105256 5 0.5255 0.19412 0.052 0.000 0.388 0.000 0.560
#> SRR2105251 2 0.1638 0.80195 0.064 0.932 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105252 2 0.3087 0.78932 0.152 0.836 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105249 2 0.2574 0.80694 0.112 0.876 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105250 2 0.4503 0.77108 0.140 0.768 0.008 0.000 0.084
#> SRR2105247 2 0.1830 0.80503 0.068 0.924 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.1894 0.80322 0.072 0.920 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105245 4 0.4841 0.58023 0.040 0.000 0.200 0.732 0.028
#> SRR2105246 3 0.5397 0.42047 0.156 0.008 0.728 0.036 0.072
#> SRR2105243 3 0.5717 0.48987 0.096 0.000 0.592 0.004 0.308
#> SRR2105244 3 0.6316 0.44360 0.140 0.000 0.656 0.092 0.112
#> SRR2105241 3 0.6546 0.37882 0.236 0.004 0.604 0.048 0.108
#> SRR2105242 3 0.6836 0.45830 0.148 0.000 0.564 0.052 0.236
#> SRR2105239 3 0.7169 0.30099 0.268 0.000 0.528 0.088 0.116
#> SRR2105240 3 0.7303 0.20043 0.280 0.000 0.508 0.096 0.116
#> SRR2105237 5 0.6818 0.00337 0.084 0.404 0.024 0.020 0.468
#> SRR2105238 5 0.5215 0.30549 0.060 0.276 0.008 0.000 0.656
#> SRR2105235 2 0.4225 0.74833 0.076 0.784 0.004 0.000 0.136
#> SRR2105236 2 0.3342 0.79604 0.136 0.836 0.020 0.000 0.008
#> SRR2105233 2 0.3792 0.76422 0.180 0.792 0.020 0.000 0.008
#> SRR2105234 2 0.1197 0.79773 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.1831 0.80429 0.076 0.920 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.3403 0.78020 0.160 0.820 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105227 3 0.6073 0.43831 0.180 0.008 0.648 0.016 0.148
#> SRR2105228 3 0.6293 0.14030 0.296 0.028 0.600 0.028 0.048
#> SRR2105225 3 0.6221 0.45999 0.092 0.000 0.532 0.020 0.356
#> SRR2105226 3 0.5402 0.54606 0.068 0.000 0.696 0.032 0.204
#> SRR2105229 5 0.6176 0.50244 0.128 0.000 0.236 0.024 0.612
#> SRR2105230 5 0.4290 0.57917 0.052 0.000 0.156 0.012 0.780
#> SRR2105219 2 0.1877 0.80432 0.052 0.932 0.008 0.004 0.004
#> SRR2105220 2 0.2932 0.80034 0.112 0.864 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105221 2 0.6889 0.41677 0.144 0.532 0.044 0.000 0.280
#> SRR2105222 2 0.4830 0.73403 0.080 0.752 0.020 0.000 0.148
#> SRR2105223 3 0.4638 0.54377 0.048 0.000 0.728 0.008 0.216
#> SRR2105224 3 0.5336 0.53099 0.080 0.000 0.676 0.012 0.232
#> SRR2105217 2 0.3682 0.79194 0.096 0.832 0.008 0.064 0.000
#> SRR2105218 2 0.2445 0.80099 0.108 0.884 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105215 2 0.3773 0.77720 0.164 0.800 0.032 0.000 0.004
#> SRR2105216 2 0.1914 0.80344 0.060 0.924 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.7578 0.32078 0.124 0.000 0.476 0.284 0.116
#> SRR2105214 3 0.6373 0.26811 0.108 0.004 0.564 0.304 0.020
#> SRR2105211 3 0.5901 0.43583 0.116 0.000 0.540 0.000 0.344
#> SRR2105212 3 0.6569 0.35187 0.180 0.000 0.500 0.008 0.312
#> SRR2105209 5 0.6985 0.25192 0.332 0.000 0.184 0.024 0.460
#> SRR2105210 3 0.7085 0.29426 0.244 0.000 0.416 0.016 0.324
#> SRR2105207 3 0.8300 -0.10344 0.280 0.000 0.360 0.212 0.148
#> SRR2105208 1 0.8724 0.37856 0.376 0.024 0.136 0.256 0.208
#> SRR2105205 2 0.5764 0.63108 0.092 0.676 0.016 0.204 0.012
#> SRR2105206 2 0.7450 0.41179 0.172 0.536 0.024 0.224 0.044
#> SRR2105201 2 0.5714 0.55642 0.056 0.640 0.036 0.000 0.268
#> SRR2105202 2 0.6449 0.24978 0.128 0.472 0.012 0.000 0.388
#> SRR2105203 2 0.1704 0.80207 0.068 0.928 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.1671 0.80010 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.3242 0.78866 0.172 0.816 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.3990 0.74200 0.244 0.740 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105197 5 0.3393 0.61180 0.072 0.000 0.024 0.044 0.860
#> SRR2105198 5 0.4520 0.58968 0.136 0.004 0.024 0.052 0.784
#> SRR2105195 1 0.8296 0.40573 0.468 0.020 0.176 0.144 0.192
#> SRR2105196 1 0.8528 0.41892 0.440 0.024 0.172 0.196 0.168
#> SRR2105193 3 0.6708 0.03251 0.264 0.000 0.520 0.200 0.016
#> SRR2105194 4 0.6611 -0.00667 0.196 0.000 0.268 0.524 0.012
#> SRR2105191 5 0.5358 0.54696 0.076 0.000 0.216 0.020 0.688
#> SRR2105192 5 0.2708 0.60727 0.044 0.000 0.072 0.000 0.884
#> SRR2105189 2 0.8111 -0.01463 0.324 0.368 0.032 0.036 0.240
#> SRR2105190 2 0.4071 0.76784 0.168 0.788 0.020 0.000 0.024
#> SRR2105187 4 0.8119 0.17669 0.068 0.324 0.060 0.448 0.100
#> SRR2105188 5 0.8890 0.16772 0.076 0.224 0.120 0.148 0.432
#> SRR2105179 3 0.7464 0.04553 0.400 0.008 0.408 0.064 0.120
#> SRR2105180 5 0.6560 0.48205 0.152 0.000 0.140 0.080 0.628
#> SRR2105183 2 0.2806 0.78583 0.152 0.844 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.2517 0.79660 0.104 0.884 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105185 2 0.6741 0.01101 0.148 0.448 0.388 0.004 0.012
#> SRR2105186 2 0.5594 0.70696 0.152 0.708 0.084 0.056 0.000
#> SRR2105181 5 0.3009 0.61407 0.052 0.000 0.064 0.008 0.876
#> SRR2105182 5 0.3533 0.60579 0.056 0.000 0.104 0.004 0.836
#> SRR2105177 3 0.7320 -0.13572 0.348 0.016 0.456 0.152 0.028
#> SRR2105178 1 0.8228 0.39296 0.396 0.004 0.224 0.260 0.116
#> SRR2105171 2 0.3916 0.76416 0.188 0.780 0.028 0.004 0.000
#> SRR2105172 2 0.0703 0.78955 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105175 3 0.7298 0.06413 0.220 0.008 0.440 0.312 0.020
#> SRR2105176 4 0.6884 -0.18337 0.288 0.000 0.260 0.444 0.008
#> SRR2105173 2 0.5022 0.65108 0.272 0.676 0.040 0.008 0.004
#> SRR2105174 2 0.1557 0.80203 0.052 0.940 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.2166 0.80289 0.072 0.912 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105170 2 0.2069 0.80517 0.052 0.924 0.012 0.012 0.000
#> SRR2105167 2 0.2068 0.79827 0.092 0.904 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.1991 0.80195 0.076 0.916 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105165 3 0.7449 0.35880 0.076 0.000 0.480 0.284 0.160
#> SRR2105166 3 0.6194 0.07035 0.080 0.000 0.480 0.420 0.020
#> SRR2105163 4 0.5968 0.39396 0.060 0.000 0.328 0.580 0.032
#> SRR2105164 4 0.3450 0.63299 0.044 0.000 0.096 0.848 0.012
#> SRR2105161 3 0.7032 0.26600 0.224 0.004 0.564 0.148 0.060
#> SRR2105162 3 0.7808 -0.14969 0.280 0.000 0.340 0.320 0.060
#> SRR2105155 2 0.1243 0.79770 0.028 0.960 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105156 2 0.0510 0.78758 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.1557 0.79943 0.052 0.940 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105158 2 0.1399 0.79882 0.028 0.952 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105159 4 0.5656 0.50281 0.116 0.004 0.172 0.688 0.020
#> SRR2105160 4 0.6511 0.11330 0.224 0.000 0.200 0.560 0.016
#> SRR2105153 2 0.4275 0.75165 0.056 0.784 0.012 0.148 0.000
#> SRR2105154 2 0.5454 0.25743 0.036 0.504 0.012 0.448 0.000
#> SRR2105151 2 0.2130 0.80274 0.080 0.908 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.1478 0.79816 0.064 0.936 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105149 5 0.6695 0.44102 0.288 0.004 0.124 0.032 0.552
#> SRR2105150 5 0.6174 0.46772 0.284 0.000 0.084 0.036 0.596
#> SRR2105147 4 0.5302 0.57175 0.052 0.000 0.120 0.736 0.092
#> SRR2105148 4 0.5381 0.56476 0.048 0.000 0.124 0.728 0.100
#> SRR2105143 1 0.7426 0.13746 0.424 0.008 0.332 0.028 0.208
#> SRR2105144 1 0.7940 0.33205 0.440 0.200 0.272 0.008 0.080
#> SRR2105145 3 0.5689 0.29375 0.112 0.004 0.656 0.220 0.008
#> SRR2105146 3 0.5170 0.26600 0.052 0.000 0.628 0.316 0.004
#> SRR2105141 2 0.5856 0.18417 0.064 0.464 0.012 0.460 0.000
#> SRR2105142 2 0.5437 0.67622 0.160 0.704 0.024 0.112 0.000
#> SRR2105139 2 0.0963 0.79070 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.2339 0.80011 0.100 0.892 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105137 2 0.5548 0.62431 0.032 0.680 0.072 0.000 0.216
#> SRR2105138 2 0.5053 0.74806 0.048 0.768 0.076 0.008 0.100
#> SRR2105135 2 0.4923 0.64327 0.212 0.700 0.088 0.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.2753 0.78924 0.136 0.856 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105133 5 0.2795 0.60541 0.056 0.000 0.064 0.000 0.880
#> SRR2105134 5 0.1648 0.60529 0.020 0.000 0.040 0.000 0.940
#> SRR2105131 5 0.6744 0.46971 0.140 0.136 0.108 0.000 0.616
#> SRR2105132 5 0.3985 0.61028 0.064 0.036 0.072 0.000 0.828
#> SRR2105129 3 0.6568 0.15237 0.308 0.032 0.564 0.012 0.084
#> SRR2105130 3 0.7859 -0.08481 0.344 0.008 0.420 0.120 0.108
#> SRR2105127 3 0.7165 0.30551 0.232 0.024 0.436 0.000 0.308
#> SRR2105128 3 0.7796 0.15932 0.200 0.064 0.384 0.004 0.348
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.346 0.53864 0.016 0.000 0.120 0.000 0.820 0.044
#> SRR2105278 5 0.550 0.52942 0.116 0.000 0.096 0.000 0.676 0.112
#> SRR2105275 4 0.442 0.55392 0.020 0.000 0.056 0.784 0.044 0.096
#> SRR2105276 4 0.462 0.54380 0.052 0.000 0.040 0.780 0.068 0.060
#> SRR2105273 3 0.440 0.54265 0.008 0.000 0.740 0.008 0.176 0.068
#> SRR2105274 3 0.422 0.55500 0.036 0.000 0.792 0.016 0.108 0.048
#> SRR2105271 3 0.776 0.15154 0.340 0.000 0.372 0.072 0.148 0.068
#> SRR2105272 3 0.776 0.06302 0.232 0.000 0.352 0.304 0.048 0.064
#> SRR2105269 2 0.310 0.70184 0.076 0.864 0.020 0.000 0.016 0.024
#> SRR2105270 2 0.339 0.63718 0.028 0.796 0.000 0.000 0.172 0.004
#> SRR2105267 2 0.180 0.68603 0.028 0.932 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR2105268 2 0.213 0.69124 0.052 0.904 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105265 2 0.229 0.69920 0.060 0.904 0.008 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105266 2 0.263 0.70296 0.076 0.876 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105263 2 0.521 0.33278 0.052 0.612 0.008 0.308 0.000 0.020
#> SRR2105264 2 0.587 0.32559 0.116 0.560 0.008 0.296 0.000 0.020
#> SRR2105261 3 0.868 0.09686 0.212 0.008 0.292 0.060 0.220 0.208
#> SRR2105262 5 0.764 0.05639 0.140 0.004 0.268 0.000 0.312 0.276
#> SRR2105357 5 0.361 0.55007 0.016 0.000 0.092 0.000 0.816 0.076
#> SRR2105358 5 0.341 0.53412 0.028 0.000 0.112 0.000 0.828 0.032
#> SRR2105439 2 0.665 0.27048 0.084 0.560 0.044 0.000 0.248 0.064
#> SRR2105440 2 0.583 0.29970 0.052 0.588 0.040 0.000 0.296 0.024
#> SRR2105509 2 0.412 0.68213 0.048 0.796 0.008 0.000 0.044 0.104
#> SRR2105510 2 0.421 0.67298 0.052 0.784 0.004 0.000 0.044 0.116
#> SRR2105507 3 0.440 0.52128 0.092 0.000 0.788 0.028 0.056 0.036
#> SRR2105508 3 0.318 0.55058 0.008 0.000 0.824 0.004 0.148 0.016
#> SRR2105505 5 0.705 0.04339 0.220 0.000 0.284 0.000 0.412 0.084
#> SRR2105506 3 0.642 0.39283 0.236 0.004 0.508 0.000 0.220 0.032
#> SRR2105503 2 0.488 0.64886 0.112 0.740 0.004 0.096 0.004 0.044
#> SRR2105504 2 0.454 0.65227 0.052 0.764 0.000 0.056 0.008 0.120
#> SRR2105501 2 0.766 -0.17502 0.128 0.464 0.076 0.000 0.244 0.088
#> SRR2105502 2 0.586 0.55553 0.092 0.672 0.036 0.060 0.000 0.140
#> SRR2105499 5 0.787 -0.02338 0.224 0.000 0.204 0.008 0.300 0.264
#> SRR2105500 5 0.709 0.26913 0.224 0.000 0.160 0.000 0.464 0.152
#> SRR2105497 2 0.497 0.60945 0.104 0.720 0.132 0.004 0.000 0.040
#> SRR2105498 2 0.565 0.54185 0.196 0.656 0.012 0.080 0.000 0.056
#> SRR2105495 2 0.582 0.43872 0.056 0.648 0.048 0.000 0.208 0.040
#> SRR2105496 2 0.610 0.48079 0.124 0.636 0.020 0.004 0.168 0.048
#> SRR2105493 2 0.703 -0.08724 0.052 0.472 0.032 0.004 0.320 0.120
#> SRR2105494 5 0.647 -0.33323 0.068 0.412 0.012 0.000 0.432 0.076
#> SRR2105491 4 0.324 0.54180 0.088 0.048 0.000 0.844 0.000 0.020
#> SRR2105492 4 0.381 0.48457 0.068 0.104 0.000 0.804 0.000 0.024
#> SRR2105489 2 0.546 0.44415 0.308 0.580 0.004 0.012 0.000 0.096
#> SRR2105490 2 0.265 0.70041 0.112 0.860 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105487 5 0.472 0.55187 0.040 0.000 0.080 0.024 0.764 0.092
#> SRR2105488 5 0.475 0.55375 0.028 0.004 0.084 0.064 0.772 0.048
#> SRR2105485 5 0.640 0.46360 0.152 0.004 0.100 0.000 0.584 0.160
#> SRR2105486 5 0.688 0.38115 0.204 0.000 0.124 0.016 0.540 0.116
#> SRR2105483 1 0.721 0.35211 0.488 0.020 0.156 0.272 0.028 0.036
#> SRR2105484 1 0.656 0.35405 0.532 0.008 0.148 0.260 0.004 0.048
#> SRR2105481 4 0.784 0.04067 0.060 0.000 0.216 0.408 0.240 0.076
#> SRR2105482 3 0.627 0.52418 0.080 0.000 0.596 0.100 0.212 0.012
#> SRR2105479 4 0.427 0.50310 0.112 0.000 0.052 0.776 0.000 0.060
#> SRR2105480 4 0.335 0.55382 0.052 0.000 0.068 0.844 0.000 0.036
#> SRR2105477 2 0.784 -0.24172 0.052 0.424 0.024 0.220 0.244 0.036
#> SRR2105478 2 0.794 -0.38220 0.092 0.352 0.008 0.228 0.292 0.028
#> SRR2105475 2 0.436 0.66083 0.040 0.768 0.028 0.000 0.016 0.148
#> SRR2105476 2 0.327 0.69518 0.048 0.824 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR2105473 2 0.593 0.28907 0.084 0.580 0.012 0.000 0.284 0.040
#> SRR2105474 2 0.397 0.67369 0.076 0.788 0.000 0.000 0.116 0.020
#> SRR2105471 2 0.619 0.31252 0.332 0.532 0.000 0.040 0.024 0.072
#> SRR2105472 2 0.439 0.63657 0.220 0.716 0.004 0.008 0.000 0.052
#> SRR2105469 3 0.399 0.53364 0.016 0.000 0.756 0.000 0.192 0.036
#> SRR2105470 3 0.592 0.52348 0.104 0.000 0.640 0.004 0.148 0.104
#> SRR2105467 5 0.515 0.46253 0.036 0.000 0.224 0.000 0.664 0.076
#> SRR2105468 5 0.541 0.31378 0.092 0.000 0.320 0.000 0.572 0.016
#> SRR2105465 3 0.775 0.14199 0.316 0.004 0.412 0.056 0.112 0.100
#> SRR2105466 3 0.638 0.31515 0.240 0.020 0.604 0.044 0.036 0.056
#> SRR2105463 1 0.843 0.32088 0.384 0.000 0.196 0.156 0.144 0.120
#> SRR2105464 1 0.744 0.21401 0.436 0.008 0.340 0.084 0.056 0.076
#> SRR2105461 2 0.386 0.68151 0.144 0.788 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR2105462 2 0.291 0.69753 0.124 0.848 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105459 2 0.385 0.68141 0.052 0.804 0.012 0.000 0.012 0.120
#> SRR2105460 2 0.140 0.68116 0.024 0.952 0.004 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105457 5 0.663 0.36045 0.116 0.000 0.184 0.000 0.540 0.160
#> SRR2105458 5 0.630 0.44430 0.132 0.000 0.148 0.000 0.588 0.132
#> SRR2105455 3 0.562 0.37742 0.256 0.016 0.632 0.012 0.016 0.068
#> SRR2105456 3 0.514 0.51202 0.156 0.000 0.704 0.012 0.100 0.028
#> SRR2105453 5 0.620 0.39135 0.156 0.004 0.244 0.000 0.556 0.040
#> SRR2105454 5 0.559 0.45039 0.124 0.000 0.204 0.000 0.632 0.040
#> SRR2105451 2 0.732 -0.01003 0.048 0.520 0.100 0.004 0.220 0.108
#> SRR2105452 2 0.857 -0.47980 0.052 0.288 0.284 0.064 0.044 0.268
#> SRR2105449 1 0.762 0.22073 0.384 0.004 0.296 0.224 0.036 0.056
#> SRR2105450 1 0.826 0.12859 0.344 0.000 0.272 0.060 0.156 0.168
#> SRR2105447 2 0.706 0.20348 0.084 0.552 0.108 0.000 0.060 0.196
#> SRR2105448 2 0.499 0.64023 0.056 0.752 0.048 0.004 0.032 0.108
#> SRR2105445 5 0.594 0.44784 0.016 0.048 0.260 0.000 0.600 0.076
#> SRR2105446 5 0.466 0.51235 0.048 0.012 0.200 0.000 0.720 0.020
#> SRR2105443 5 0.670 0.40767 0.044 0.084 0.100 0.008 0.612 0.152
#> SRR2105444 5 0.768 0.10638 0.048 0.156 0.104 0.020 0.520 0.152
#> SRR2105441 2 0.577 0.40694 0.276 0.588 0.004 0.000 0.096 0.036
#> SRR2105442 2 0.363 0.64497 0.224 0.752 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105437 5 0.540 0.40076 0.000 0.000 0.036 0.244 0.632 0.088
#> SRR2105438 5 0.578 0.30951 0.004 0.000 0.040 0.336 0.548 0.072
#> SRR2105435 5 0.716 0.04030 0.304 0.000 0.100 0.000 0.392 0.204
#> SRR2105436 5 0.686 0.35294 0.072 0.000 0.164 0.016 0.520 0.228
#> SRR2105433 1 0.818 0.35660 0.408 0.012 0.196 0.164 0.036 0.184
#> SRR2105434 3 0.678 0.06362 0.388 0.008 0.452 0.036 0.060 0.056
#> SRR2105431 1 0.802 0.05686 0.372 0.004 0.244 0.056 0.248 0.076
#> SRR2105432 3 0.704 0.37530 0.208 0.000 0.512 0.020 0.176 0.084
#> SRR2105429 6 0.952 0.39318 0.188 0.188 0.052 0.120 0.200 0.252
#> SRR2105430 2 0.792 -0.45685 0.284 0.356 0.008 0.068 0.040 0.244
#> SRR2105427 2 0.506 0.64333 0.068 0.740 0.024 0.000 0.104 0.064
#> SRR2105428 2 0.439 0.64643 0.036 0.764 0.000 0.000 0.096 0.104
#> SRR2105425 2 0.502 0.64130 0.156 0.716 0.020 0.000 0.020 0.088
#> SRR2105426 2 0.404 0.69927 0.116 0.800 0.032 0.000 0.016 0.036
#> SRR2105421 3 0.547 0.54113 0.040 0.004 0.656 0.000 0.200 0.100
#> SRR2105422 3 0.413 0.55688 0.012 0.000 0.768 0.004 0.152 0.064
#> SRR2105423 2 0.292 0.69932 0.156 0.828 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105424 2 0.413 0.66132 0.160 0.756 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR2105419 3 0.621 0.24330 0.060 0.000 0.456 0.000 0.392 0.092
#> SRR2105420 3 0.508 0.48806 0.028 0.000 0.660 0.000 0.236 0.076
#> SRR2105415 1 0.888 0.26594 0.340 0.020 0.116 0.132 0.240 0.152
#> SRR2105416 1 0.809 0.32796 0.408 0.008 0.132 0.088 0.280 0.084
#> SRR2105417 3 0.610 0.49580 0.164 0.004 0.596 0.000 0.184 0.052
#> SRR2105418 3 0.775 0.01061 0.368 0.012 0.380 0.104 0.076 0.060
#> SRR2105413 2 0.625 0.36677 0.084 0.592 0.024 0.000 0.060 0.240
#> SRR2105414 2 0.638 0.32809 0.124 0.572 0.020 0.000 0.048 0.236
#> SRR2105409 2 0.307 0.70533 0.088 0.860 0.012 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105410 2 0.488 0.64962 0.128 0.744 0.012 0.004 0.076 0.036
#> SRR2105411 2 0.377 0.67618 0.192 0.768 0.020 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105412 2 0.395 0.59936 0.284 0.696 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105407 5 0.540 0.52412 0.036 0.000 0.188 0.004 0.664 0.108
#> SRR2105408 5 0.424 0.53183 0.008 0.000 0.156 0.000 0.748 0.088
#> SRR2105403 5 0.500 0.44923 0.048 0.000 0.252 0.000 0.660 0.040
#> SRR2105404 5 0.433 0.39864 0.024 0.000 0.300 0.000 0.664 0.012
#> SRR2105405 3 0.414 0.56087 0.020 0.000 0.764 0.000 0.156 0.060
#> SRR2105406 3 0.503 0.54592 0.100 0.000 0.704 0.000 0.152 0.044
#> SRR2105401 5 0.853 -0.45887 0.208 0.252 0.080 0.000 0.304 0.156
#> SRR2105402 2 0.646 0.32964 0.020 0.600 0.060 0.016 0.080 0.224
#> SRR2105399 5 0.862 -0.49885 0.228 0.224 0.072 0.000 0.248 0.228
#> SRR2105400 6 0.820 0.43618 0.208 0.260 0.028 0.000 0.228 0.276
#> SRR2105397 5 0.867 0.05610 0.060 0.040 0.088 0.252 0.352 0.208
#> SRR2105398 5 0.728 0.30130 0.040 0.008 0.072 0.140 0.520 0.220
#> SRR2105395 2 0.315 0.70284 0.076 0.860 0.012 0.016 0.000 0.036
#> SRR2105396 2 0.238 0.69789 0.068 0.892 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105393 2 0.447 0.64566 0.140 0.748 0.004 0.000 0.016 0.092
#> SRR2105394 2 0.209 0.69141 0.080 0.900 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105389 3 0.625 0.14385 0.004 0.000 0.444 0.016 0.364 0.172
#> SRR2105390 3 0.663 0.13626 0.024 0.000 0.456 0.024 0.348 0.148
#> SRR2105391 3 0.492 0.28783 0.000 0.000 0.544 0.000 0.388 0.068
#> SRR2105392 5 0.560 0.14905 0.004 0.000 0.360 0.004 0.516 0.116
#> SRR2105385 3 0.724 0.40302 0.108 0.000 0.536 0.068 0.092 0.196
#> SRR2105386 3 0.587 0.51256 0.064 0.000 0.636 0.004 0.148 0.148
#> SRR2105387 3 0.628 0.25104 0.308 0.000 0.540 0.020 0.044 0.088
#> SRR2105388 3 0.747 0.16569 0.276 0.000 0.352 0.004 0.256 0.112
#> SRR2105381 2 0.706 0.21959 0.064 0.576 0.092 0.004 0.108 0.156
#> SRR2105382 2 0.603 0.44403 0.072 0.612 0.000 0.116 0.004 0.196
#> SRR2105383 1 0.690 -0.27306 0.492 0.300 0.032 0.000 0.056 0.120
#> SRR2105384 1 0.694 -0.31388 0.464 0.296 0.008 0.000 0.080 0.152
#> SRR2105379 2 0.508 0.65906 0.072 0.760 0.044 0.048 0.012 0.064
#> SRR2105380 2 0.764 0.11288 0.108 0.508 0.084 0.204 0.008 0.088
#> SRR2105377 2 0.537 0.51625 0.064 0.676 0.012 0.000 0.200 0.048
#> SRR2105378 2 0.411 0.64551 0.060 0.772 0.000 0.000 0.144 0.024
#> SRR2105375 1 0.698 0.25335 0.456 0.008 0.104 0.004 0.328 0.100
#> SRR2105376 5 0.698 0.33482 0.216 0.004 0.088 0.004 0.500 0.188
#> SRR2105373 5 0.604 0.08024 0.032 0.000 0.432 0.024 0.456 0.056
#> SRR2105374 5 0.645 0.43245 0.012 0.000 0.152 0.208 0.568 0.060
#> SRR2105371 3 0.522 0.46178 0.004 0.000 0.644 0.004 0.176 0.172
#> SRR2105372 3 0.440 0.51711 0.004 0.000 0.728 0.004 0.184 0.080
#> SRR2105369 3 0.571 0.31793 0.072 0.000 0.528 0.000 0.360 0.040
#> SRR2105370 3 0.735 0.07629 0.116 0.000 0.340 0.000 0.320 0.224
#> SRR2105367 5 0.688 0.42772 0.220 0.024 0.104 0.004 0.552 0.096
#> SRR2105368 1 0.828 0.25750 0.404 0.056 0.156 0.028 0.268 0.088
#> SRR2105365 2 0.504 0.07475 0.052 0.512 0.004 0.428 0.000 0.004
#> SRR2105366 4 0.312 0.40218 0.020 0.176 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR2105363 2 0.594 0.58641 0.120 0.676 0.056 0.000 0.064 0.084
#> SRR2105364 2 0.413 0.68141 0.152 0.776 0.008 0.000 0.040 0.024
#> SRR2105361 2 0.257 0.69973 0.036 0.896 0.016 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105362 2 0.309 0.70279 0.044 0.872 0.032 0.000 0.016 0.036
#> SRR2105359 5 0.745 0.04312 0.156 0.004 0.280 0.000 0.392 0.168
#> SRR2105360 3 0.440 0.55903 0.060 0.000 0.764 0.004 0.136 0.036
#> SRR2105355 3 0.397 0.52111 0.008 0.000 0.740 0.000 0.216 0.036
#> SRR2105356 3 0.541 0.52738 0.132 0.000 0.680 0.000 0.116 0.072
#> SRR2105353 3 0.750 0.27009 0.008 0.000 0.396 0.120 0.244 0.232
#> SRR2105354 3 0.670 0.41714 0.012 0.000 0.556 0.144 0.192 0.096
#> SRR2105351 2 0.456 0.67262 0.136 0.740 0.016 0.004 0.000 0.104
#> SRR2105352 2 0.727 -0.11595 0.056 0.464 0.008 0.280 0.024 0.168
#> SRR2105349 2 0.737 0.18474 0.180 0.512 0.016 0.056 0.036 0.200
#> SRR2105350 2 0.563 0.42936 0.248 0.604 0.004 0.000 0.020 0.124
#> SRR2105345 2 0.548 0.59539 0.108 0.692 0.008 0.000 0.112 0.080
#> SRR2105346 2 0.417 0.68148 0.120 0.788 0.008 0.000 0.044 0.040
#> SRR2105347 2 0.534 0.23269 0.412 0.512 0.000 0.000 0.040 0.036
#> SRR2105348 1 0.458 -0.35024 0.496 0.476 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105343 2 0.221 0.70135 0.100 0.888 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105344 2 0.296 0.69464 0.068 0.848 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105341 5 0.584 -0.01412 0.016 0.000 0.388 0.000 0.472 0.124
#> SRR2105342 3 0.551 0.40220 0.028 0.000 0.600 0.000 0.276 0.096
#> SRR2105339 3 0.733 0.21250 0.096 0.000 0.380 0.004 0.276 0.244
#> SRR2105340 3 0.786 0.29212 0.040 0.000 0.424 0.144 0.220 0.172
#> SRR2105335 5 0.400 0.51320 0.004 0.000 0.148 0.008 0.776 0.064
#> SRR2105336 5 0.550 0.26042 0.048 0.000 0.364 0.004 0.548 0.036
#> SRR2105337 3 0.591 0.51420 0.096 0.000 0.668 0.032 0.068 0.136
#> SRR2105338 3 0.766 0.08578 0.324 0.000 0.408 0.072 0.116 0.080
#> SRR2105331 2 0.585 0.60849 0.124 0.700 0.044 0.068 0.036 0.028
#> SRR2105332 2 0.228 0.69767 0.028 0.908 0.004 0.048 0.000 0.012
#> SRR2105333 2 0.740 0.00673 0.168 0.504 0.036 0.000 0.140 0.152
#> SRR2105334 2 0.485 0.55175 0.132 0.660 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR2105329 5 0.642 0.34004 0.068 0.076 0.036 0.000 0.588 0.232
#> SRR2105330 2 0.826 -0.46061 0.100 0.360 0.076 0.004 0.284 0.176
#> SRR2105327 2 0.477 0.62422 0.064 0.728 0.016 0.004 0.012 0.176
#> SRR2105328 2 0.539 0.62111 0.060 0.720 0.036 0.028 0.016 0.140
#> SRR2105325 4 0.174 0.56702 0.008 0.000 0.004 0.936 0.028 0.024
#> SRR2105326 4 0.220 0.56575 0.004 0.000 0.012 0.912 0.048 0.024
#> SRR2105323 5 0.542 0.52748 0.088 0.000 0.092 0.000 0.680 0.140
#> SRR2105324 3 0.673 0.47591 0.152 0.000 0.524 0.000 0.200 0.124
#> SRR2105319 5 0.740 0.17956 0.052 0.000 0.372 0.120 0.388 0.068
#> SRR2105320 4 0.677 0.02983 0.016 0.000 0.132 0.476 0.320 0.056
#> SRR2105321 3 0.721 0.03944 0.012 0.000 0.400 0.344 0.092 0.152
#> SRR2105322 4 0.566 0.49248 0.020 0.000 0.216 0.648 0.040 0.076
#> SRR2105317 2 0.271 0.70032 0.040 0.884 0.000 0.000 0.036 0.040
#> SRR2105318 2 0.332 0.70585 0.088 0.844 0.004 0.000 0.020 0.044
#> SRR2105315 5 0.781 0.02063 0.028 0.120 0.316 0.000 0.348 0.188
#> SRR2105316 2 0.426 0.67591 0.072 0.792 0.008 0.000 0.072 0.056
#> SRR2105313 2 0.452 0.67797 0.128 0.764 0.012 0.000 0.060 0.036
#> SRR2105314 2 0.373 0.69532 0.080 0.824 0.012 0.000 0.020 0.064
#> SRR2105311 4 0.115 0.56382 0.024 0.000 0.008 0.960 0.000 0.008
#> SRR2105312 4 0.115 0.56278 0.020 0.000 0.016 0.960 0.000 0.004
#> SRR2105307 3 0.584 0.47453 0.196 0.000 0.572 0.000 0.212 0.020
#> SRR2105308 3 0.659 0.27949 0.336 0.008 0.480 0.000 0.108 0.068
#> SRR2105309 5 0.601 0.41218 0.032 0.000 0.220 0.000 0.564 0.184
#> SRR2105310 5 0.678 0.36523 0.120 0.000 0.164 0.000 0.516 0.200
#> SRR2105305 3 0.633 0.04474 0.032 0.000 0.424 0.000 0.384 0.160
#> SRR2105306 3 0.361 0.55667 0.024 0.000 0.820 0.000 0.092 0.064
#> SRR2105303 2 0.325 0.69196 0.096 0.832 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR2105304 2 0.294 0.69436 0.060 0.856 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR2105301 2 0.593 0.57473 0.140 0.664 0.056 0.008 0.016 0.116
#> SRR2105302 2 0.278 0.70337 0.064 0.876 0.004 0.000 0.008 0.048
#> SRR2105299 5 0.738 0.45830 0.092 0.036 0.164 0.048 0.568 0.092
#> SRR2105300 5 0.709 0.19778 0.076 0.164 0.064 0.024 0.592 0.080
#> SRR2105297 1 0.768 0.14493 0.512 0.180 0.020 0.156 0.076 0.056
#> SRR2105298 1 0.643 -0.10255 0.596 0.240 0.012 0.036 0.048 0.068
#> SRR2105295 2 0.217 0.69341 0.032 0.912 0.016 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105296 2 0.241 0.69520 0.060 0.896 0.004 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105293 4 0.721 0.41445 0.072 0.000 0.232 0.520 0.068 0.108
#> SRR2105294 4 0.711 0.11702 0.084 0.000 0.356 0.432 0.032 0.096
#> SRR2105291 3 0.650 0.42458 0.060 0.012 0.564 0.000 0.184 0.180
#> SRR2105292 3 0.592 0.51638 0.076 0.000 0.656 0.032 0.172 0.064
#> SRR2105289 3 0.706 0.21400 0.256 0.004 0.456 0.000 0.092 0.192
#> SRR2105290 3 0.689 0.32229 0.296 0.000 0.456 0.008 0.180 0.060
#> SRR2105287 1 0.783 0.09540 0.388 0.000 0.248 0.028 0.208 0.128
#> SRR2105288 1 0.682 0.34955 0.552 0.012 0.192 0.004 0.148 0.092
#> SRR2105285 6 0.801 0.55992 0.144 0.280 0.048 0.000 0.152 0.376
#> SRR2105286 2 0.677 -0.01100 0.268 0.460 0.008 0.000 0.040 0.224
#> SRR2105283 2 0.783 -0.15239 0.076 0.464 0.048 0.032 0.272 0.108
#> SRR2105284 5 0.678 -0.22150 0.044 0.304 0.044 0.004 0.516 0.088
#> SRR2105281 2 0.588 0.53046 0.184 0.640 0.016 0.000 0.048 0.112
#> SRR2105282 2 0.251 0.70128 0.060 0.888 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105259 5 0.473 0.52921 0.012 0.000 0.136 0.000 0.708 0.144
#> SRR2105260 5 0.430 0.54831 0.020 0.000 0.124 0.000 0.760 0.096
#> SRR2105279 2 0.298 0.70033 0.092 0.856 0.004 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105280 2 0.187 0.69195 0.064 0.916 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105257 3 0.638 0.16921 0.124 0.000 0.468 0.000 0.352 0.056
#> SRR2105258 3 0.600 0.48111 0.132 0.000 0.664 0.088 0.080 0.036
#> SRR2105253 2 0.294 0.69351 0.080 0.856 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR2105254 2 0.157 0.68132 0.032 0.936 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105255 5 0.620 0.04056 0.080 0.000 0.400 0.000 0.452 0.068
#> SRR2105256 5 0.631 0.06042 0.056 0.000 0.396 0.000 0.440 0.108
#> SRR2105251 2 0.191 0.69412 0.056 0.916 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105252 2 0.399 0.61604 0.272 0.704 0.012 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105249 2 0.379 0.69899 0.124 0.804 0.008 0.000 0.012 0.052
#> SRR2105250 2 0.483 0.63757 0.140 0.732 0.012 0.000 0.092 0.024
#> SRR2105247 2 0.296 0.70076 0.068 0.848 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105248 2 0.279 0.69704 0.088 0.864 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105245 4 0.514 0.51255 0.040 0.000 0.164 0.716 0.032 0.048
#> SRR2105246 3 0.652 0.38810 0.204 0.008 0.604 0.036 0.056 0.092
#> SRR2105243 3 0.638 0.49209 0.072 0.000 0.548 0.000 0.224 0.156
#> SRR2105244 3 0.727 0.37513 0.164 0.000 0.536 0.076 0.072 0.152
#> SRR2105241 3 0.734 0.28244 0.260 0.004 0.480 0.028 0.092 0.136
#> SRR2105242 3 0.715 0.42310 0.204 0.000 0.528 0.060 0.148 0.060
#> SRR2105239 3 0.802 0.18963 0.248 0.000 0.384 0.056 0.104 0.208
#> SRR2105240 3 0.707 0.16177 0.332 0.000 0.460 0.092 0.076 0.040
#> SRR2105237 5 0.662 -0.30792 0.044 0.372 0.012 0.020 0.476 0.076
#> SRR2105238 5 0.516 -0.08107 0.044 0.300 0.012 0.000 0.624 0.020
#> SRR2105235 2 0.490 0.58014 0.084 0.716 0.012 0.000 0.168 0.020
#> SRR2105236 2 0.481 0.64560 0.172 0.728 0.028 0.000 0.016 0.056
#> SRR2105233 2 0.539 0.52889 0.084 0.660 0.008 0.004 0.024 0.220
#> SRR2105234 2 0.220 0.69289 0.044 0.900 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105231 2 0.281 0.70123 0.092 0.864 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105232 2 0.466 0.58131 0.264 0.668 0.012 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105227 3 0.692 0.32390 0.200 0.004 0.500 0.004 0.076 0.216
#> SRR2105228 3 0.685 0.17995 0.312 0.032 0.508 0.012 0.044 0.092
#> SRR2105225 3 0.568 0.54222 0.096 0.000 0.628 0.000 0.216 0.060
#> SRR2105226 3 0.512 0.56560 0.072 0.000 0.732 0.028 0.120 0.048
#> SRR2105229 5 0.643 0.40339 0.020 0.000 0.152 0.024 0.520 0.284
#> SRR2105230 5 0.503 0.50319 0.012 0.000 0.164 0.008 0.692 0.124
#> SRR2105219 2 0.239 0.69544 0.060 0.900 0.004 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105220 2 0.397 0.67751 0.120 0.792 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR2105221 2 0.667 0.22009 0.152 0.532 0.008 0.000 0.232 0.076
#> SRR2105222 2 0.597 0.53732 0.148 0.648 0.016 0.004 0.136 0.048
#> SRR2105223 3 0.509 0.56607 0.036 0.000 0.708 0.012 0.168 0.076
#> SRR2105224 3 0.532 0.54474 0.084 0.000 0.692 0.012 0.168 0.044
#> SRR2105217 2 0.484 0.65640 0.148 0.728 0.004 0.080 0.000 0.040
#> SRR2105218 2 0.302 0.69192 0.180 0.808 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105215 2 0.464 0.64618 0.188 0.716 0.012 0.000 0.004 0.080
#> SRR2105216 2 0.232 0.69848 0.060 0.892 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105213 3 0.753 0.35423 0.108 0.004 0.480 0.260 0.080 0.068
#> SRR2105214 3 0.713 0.22737 0.144 0.004 0.488 0.264 0.016 0.084
#> SRR2105211 3 0.631 0.40006 0.068 0.000 0.504 0.012 0.348 0.068
#> SRR2105212 3 0.733 0.28474 0.108 0.004 0.408 0.000 0.248 0.232
#> SRR2105209 5 0.772 0.01557 0.324 0.000 0.144 0.016 0.340 0.176
#> SRR2105210 3 0.728 0.27294 0.292 0.000 0.404 0.004 0.192 0.108
#> SRR2105207 1 0.812 0.14141 0.348 0.000 0.288 0.196 0.108 0.060
#> SRR2105208 1 0.815 0.39049 0.440 0.028 0.088 0.244 0.144 0.056
#> SRR2105205 2 0.623 0.34898 0.092 0.604 0.004 0.212 0.008 0.080
#> SRR2105206 2 0.856 -0.42444 0.172 0.340 0.024 0.260 0.040 0.164
#> SRR2105201 2 0.625 0.34319 0.040 0.608 0.100 0.000 0.212 0.040
#> SRR2105202 2 0.662 -0.26775 0.152 0.416 0.020 0.000 0.388 0.024
#> SRR2105203 2 0.278 0.70068 0.104 0.860 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105204 2 0.273 0.69958 0.112 0.856 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105199 2 0.400 0.66224 0.220 0.736 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105200 2 0.505 0.49108 0.308 0.616 0.000 0.000 0.024 0.052
#> SRR2105197 5 0.421 0.54896 0.028 0.000 0.076 0.044 0.804 0.048
#> SRR2105198 5 0.556 0.49299 0.120 0.000 0.040 0.068 0.704 0.068
#> SRR2105195 1 0.804 0.33158 0.452 0.008 0.064 0.116 0.180 0.180
#> SRR2105196 1 0.827 0.39979 0.436 0.008 0.096 0.184 0.124 0.152
#> SRR2105193 3 0.709 0.10563 0.296 0.004 0.464 0.156 0.016 0.064
#> SRR2105194 4 0.637 0.21826 0.236 0.000 0.128 0.564 0.008 0.064
#> SRR2105191 5 0.589 0.42165 0.076 0.000 0.252 0.000 0.592 0.080
#> SRR2105192 5 0.376 0.54709 0.024 0.000 0.120 0.000 0.804 0.052
#> SRR2105189 1 0.902 -0.35150 0.284 0.176 0.044 0.048 0.212 0.236
#> SRR2105190 2 0.600 0.46677 0.180 0.628 0.016 0.000 0.048 0.128
#> SRR2105187 4 0.747 -0.28203 0.024 0.324 0.012 0.432 0.120 0.088
#> SRR2105188 5 0.841 -0.19893 0.048 0.192 0.028 0.156 0.420 0.156
#> SRR2105179 1 0.846 0.14763 0.304 0.012 0.244 0.064 0.096 0.280
#> SRR2105180 5 0.784 0.33179 0.192 0.000 0.156 0.112 0.464 0.076
#> SRR2105183 2 0.352 0.67525 0.180 0.788 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105184 2 0.349 0.68175 0.176 0.788 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105185 2 0.679 -0.02455 0.108 0.488 0.324 0.008 0.012 0.060
#> SRR2105186 2 0.701 0.45147 0.144 0.600 0.044 0.068 0.028 0.116
#> SRR2105181 5 0.412 0.55003 0.024 0.004 0.112 0.008 0.796 0.056
#> SRR2105182 5 0.490 0.50666 0.024 0.000 0.184 0.004 0.704 0.084
#> SRR2105177 1 0.752 0.16938 0.432 0.016 0.332 0.116 0.036 0.068
#> SRR2105178 1 0.690 0.39452 0.564 0.012 0.084 0.232 0.064 0.044
#> SRR2105171 2 0.495 0.61278 0.224 0.684 0.008 0.000 0.020 0.064
#> SRR2105172 2 0.217 0.69698 0.088 0.896 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105175 3 0.733 0.07980 0.236 0.008 0.400 0.280 0.004 0.072
#> SRR2105176 4 0.655 -0.05109 0.352 0.000 0.136 0.456 0.004 0.052
#> SRR2105173 2 0.607 0.34398 0.256 0.568 0.020 0.008 0.004 0.144
#> SRR2105174 2 0.163 0.69238 0.060 0.928 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105169 2 0.254 0.70094 0.104 0.872 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105170 2 0.253 0.70157 0.060 0.896 0.012 0.016 0.000 0.016
#> SRR2105167 2 0.218 0.69340 0.076 0.900 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105168 2 0.275 0.70424 0.108 0.860 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR2105165 3 0.722 0.31663 0.012 0.000 0.420 0.324 0.140 0.104
#> SRR2105166 4 0.630 0.04645 0.048 0.000 0.400 0.452 0.008 0.092
#> SRR2105163 4 0.657 0.30784 0.044 0.000 0.304 0.524 0.036 0.092
#> SRR2105164 4 0.346 0.56993 0.016 0.000 0.092 0.836 0.008 0.048
#> SRR2105161 3 0.701 0.26661 0.240 0.016 0.528 0.148 0.044 0.024
#> SRR2105162 4 0.728 -0.20166 0.328 0.008 0.260 0.352 0.040 0.012
#> SRR2105155 2 0.165 0.68704 0.040 0.936 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105156 2 0.132 0.68003 0.036 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105157 2 0.143 0.68721 0.048 0.940 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105158 2 0.300 0.70226 0.048 0.868 0.004 0.060 0.000 0.020
#> SRR2105159 4 0.551 0.46369 0.140 0.000 0.144 0.672 0.028 0.016
#> SRR2105160 4 0.588 0.30096 0.256 0.000 0.140 0.572 0.000 0.032
#> SRR2105153 2 0.544 0.45217 0.084 0.620 0.000 0.260 0.000 0.036
#> SRR2105154 4 0.495 -0.19956 0.056 0.416 0.004 0.524 0.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.263 0.69928 0.068 0.880 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105152 2 0.250 0.69830 0.108 0.872 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105149 5 0.762 0.15784 0.200 0.000 0.080 0.032 0.380 0.308
#> SRR2105150 5 0.764 0.07874 0.228 0.000 0.064 0.040 0.376 0.292
#> SRR2105147 4 0.579 0.45093 0.020 0.000 0.060 0.660 0.088 0.172
#> SRR2105148 4 0.583 0.45239 0.016 0.000 0.068 0.656 0.092 0.168
#> SRR2105143 1 0.772 0.20069 0.436 0.008 0.264 0.032 0.164 0.096
#> SRR2105144 1 0.777 0.08564 0.492 0.116 0.116 0.000 0.116 0.160
#> SRR2105145 3 0.632 0.29018 0.160 0.012 0.584 0.200 0.004 0.040
#> SRR2105146 3 0.503 0.25339 0.064 0.000 0.572 0.356 0.000 0.008
#> SRR2105141 4 0.562 -0.06535 0.076 0.308 0.004 0.580 0.000 0.032
#> SRR2105142 2 0.642 0.33279 0.132 0.584 0.004 0.160 0.000 0.120
#> SRR2105139 2 0.133 0.68409 0.020 0.948 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105140 2 0.311 0.69284 0.104 0.840 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105137 2 0.540 0.48656 0.028 0.680 0.064 0.000 0.196 0.032
#> SRR2105138 2 0.525 0.62547 0.064 0.736 0.064 0.004 0.100 0.032
#> SRR2105135 2 0.494 0.59309 0.184 0.700 0.076 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105136 2 0.269 0.70195 0.092 0.872 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105133 5 0.345 0.54396 0.024 0.000 0.088 0.000 0.832 0.056
#> SRR2105134 5 0.284 0.54023 0.004 0.000 0.116 0.000 0.852 0.028
#> SRR2105131 5 0.787 0.26632 0.076 0.124 0.156 0.000 0.464 0.180
#> SRR2105132 5 0.626 0.53347 0.088 0.044 0.132 0.004 0.652 0.080
#> SRR2105129 3 0.651 0.09198 0.380 0.020 0.472 0.004 0.072 0.052
#> SRR2105130 1 0.768 0.20942 0.400 0.008 0.336 0.140 0.064 0.052
#> SRR2105127 3 0.669 0.33224 0.244 0.008 0.484 0.000 0.224 0.040
#> SRR2105128 3 0.776 0.15337 0.240 0.052 0.396 0.000 0.244 0.068
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.987 0.988 0.0588 0.959 0.959
#> 3 3 0.196 0.454 0.759 4.4721 0.867 0.862
#> 4 4 0.187 0.463 0.726 0.4467 0.777 0.733
#> 5 5 0.194 0.438 0.685 0.1890 0.688 0.540
#> 6 6 0.248 0.563 0.699 0.1851 0.838 0.645
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105278 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105275 1 0.1843 0.981 0.972 0.028
#> SRR2105276 1 0.1843 0.977 0.972 0.028
#> SRR2105273 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105271 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105272 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105269 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105270 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105267 1 0.1414 0.985 0.980 0.020
#> SRR2105268 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105265 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105266 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105263 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105264 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105261 1 0.3274 0.952 0.940 0.060
#> SRR2105262 1 0.3274 0.952 0.940 0.060
#> SRR2105357 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105358 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105439 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105440 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105509 1 0.2778 0.964 0.952 0.048
#> SRR2105510 1 0.2236 0.974 0.964 0.036
#> SRR2105507 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105508 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105505 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105506 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105503 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105504 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105501 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105502 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105499 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105500 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105497 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105498 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105495 1 0.1184 0.988 0.984 0.016
#> SRR2105496 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105493 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105494 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105491 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105492 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105489 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105490 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105487 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105488 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105485 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105486 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105483 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105484 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105481 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105482 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105479 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105480 1 0.1184 0.988 0.984 0.016
#> SRR2105477 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105478 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105475 1 0.2603 0.967 0.956 0.044
#> SRR2105476 1 0.2603 0.967 0.956 0.044
#> SRR2105473 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105474 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105471 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105472 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105469 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105470 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105467 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105468 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105465 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105466 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105463 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105464 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105461 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105462 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105459 1 0.2043 0.977 0.968 0.032
#> SRR2105460 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105457 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105458 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105455 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105456 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105453 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105454 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105451 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105452 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105449 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105450 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105447 1 0.1633 0.981 0.976 0.024
#> SRR2105448 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105445 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105446 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105443 1 0.2236 0.975 0.964 0.036
#> SRR2105444 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105441 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105442 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105437 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105438 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105435 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105436 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105433 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105434 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105431 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105432 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105429 1 0.2423 0.970 0.960 0.040
#> SRR2105430 1 0.2423 0.970 0.960 0.040
#> SRR2105427 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105428 1 0.1184 0.988 0.984 0.016
#> SRR2105425 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105426 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105421 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105422 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105423 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105424 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105419 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105420 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105415 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105416 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105417 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105418 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105413 1 0.2236 0.974 0.964 0.036
#> SRR2105414 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105409 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105410 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105411 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105412 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105407 1 0.1633 0.983 0.976 0.024
#> SRR2105408 1 0.1414 0.985 0.980 0.020
#> SRR2105403 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105404 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105405 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105406 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105401 1 0.1184 0.988 0.984 0.016
#> SRR2105402 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105399 1 0.3584 0.946 0.932 0.068
#> SRR2105400 1 0.3584 0.946 0.932 0.068
#> SRR2105397 1 0.1843 0.981 0.972 0.028
#> SRR2105398 1 0.1633 0.981 0.976 0.024
#> SRR2105395 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105396 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105393 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105394 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105389 1 0.1184 0.985 0.984 0.016
#> SRR2105390 1 0.1414 0.983 0.980 0.020
#> SRR2105391 1 0.1414 0.983 0.980 0.020
#> SRR2105392 1 0.1414 0.983 0.980 0.020
#> SRR2105385 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105386 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105387 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105381 1 0.3114 0.957 0.944 0.056
#> SRR2105382 1 0.2043 0.975 0.968 0.032
#> SRR2105383 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105384 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105379 1 0.2236 0.973 0.964 0.036
#> SRR2105380 1 0.1633 0.981 0.976 0.024
#> SRR2105377 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105378 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105375 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105376 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105373 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105374 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105371 1 0.1414 0.983 0.980 0.020
#> SRR2105372 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105369 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105370 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105367 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105368 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105365 1 0.1633 0.982 0.976 0.024
#> SRR2105366 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105363 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105364 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105361 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105362 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105359 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105360 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105355 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105356 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105353 1 0.2236 0.970 0.964 0.036
#> SRR2105354 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105351 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105352 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105349 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105350 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105345 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105346 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105347 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105348 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105343 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105344 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105341 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105342 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105339 1 0.1633 0.980 0.976 0.024
#> SRR2105340 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105335 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105336 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105337 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105338 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105331 1 0.1633 0.981 0.976 0.024
#> SRR2105332 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105333 1 0.2236 0.974 0.964 0.036
#> SRR2105334 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105329 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105330 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105327 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105328 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105325 1 0.1843 0.977 0.972 0.028
#> SRR2105326 1 0.1843 0.977 0.972 0.028
#> SRR2105323 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105324 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105319 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105320 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105321 1 0.1184 0.985 0.984 0.016
#> SRR2105322 1 0.1184 0.985 0.984 0.016
#> SRR2105317 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105318 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105315 1 0.0938 0.990 0.988 0.012
#> SRR2105316 1 0.1414 0.984 0.980 0.020
#> SRR2105313 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105314 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105311 1 0.3584 0.944 0.932 0.068
#> SRR2105312 1 0.3584 0.944 0.932 0.068
#> SRR2105307 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105308 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105309 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105310 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105305 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105306 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105303 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105304 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105301 1 0.2603 0.967 0.956 0.044
#> SRR2105302 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105299 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105300 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105297 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105298 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105295 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105296 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105293 1 0.1414 0.985 0.980 0.020
#> SRR2105294 1 0.1414 0.985 0.980 0.020
#> SRR2105291 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105292 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105289 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105290 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105287 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105288 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105285 1 0.1843 0.979 0.972 0.028
#> SRR2105286 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105283 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105284 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105281 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105282 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105259 1 0.1633 0.983 0.976 0.024
#> SRR2105260 1 0.1633 0.983 0.976 0.024
#> SRR2105279 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105280 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105257 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105258 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105253 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105254 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105255 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105256 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105251 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105252 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105249 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105250 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105247 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105248 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105245 1 0.1414 0.984 0.980 0.020
#> SRR2105246 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105243 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105244 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105241 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105242 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105239 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105240 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105237 1 0.1843 0.979 0.972 0.028
#> SRR2105238 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105235 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105236 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105233 1 0.2603 0.967 0.956 0.044
#> SRR2105234 1 0.2603 0.967 0.956 0.044
#> SRR2105231 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105232 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105227 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105228 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105225 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105226 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105229 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105230 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105219 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105220 1 0.1414 0.987 0.980 0.020
#> SRR2105221 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105222 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105223 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105224 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105217 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105218 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105215 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105216 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105213 1 0.2043 0.976 0.968 0.032
#> SRR2105214 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105211 1 0.0938 0.987 0.988 0.012
#> SRR2105212 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105209 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105210 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105207 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105208 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105205 1 0.1843 0.979 0.972 0.028
#> SRR2105206 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105201 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105202 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105203 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105204 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105199 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105200 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105197 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105198 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105195 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105196 1 0.1414 0.987 0.980 0.020
#> SRR2105193 1 0.0000 0.989 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105191 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105192 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105189 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105190 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105187 1 0.1843 0.978 0.972 0.028
#> SRR2105188 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105179 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105180 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105183 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105184 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105185 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105186 1 0.0938 0.988 0.988 0.012
#> SRR2105181 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105182 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105177 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105178 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105171 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105172 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105175 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105176 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105173 1 0.1414 0.984 0.980 0.020
#> SRR2105174 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105169 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105170 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105167 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105168 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105165 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105166 1 0.1184 0.987 0.984 0.016
#> SRR2105163 1 0.1633 0.980 0.976 0.024
#> SRR2105164 1 0.1633 0.980 0.976 0.024
#> SRR2105161 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105162 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105155 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105156 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105157 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105158 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105159 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105160 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105153 1 0.1184 0.986 0.984 0.016
#> SRR2105154 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105151 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105152 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105149 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105150 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR2105147 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105148 2 0.0672 1.000 0.008 0.992
#> SRR2105143 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105144 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105145 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105146 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105141 1 0.1843 0.979 0.972 0.028
#> SRR2105142 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105139 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105140 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105137 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105138 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105135 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR2105136 1 0.0376 0.989 0.996 0.004
#> SRR2105133 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105134 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105131 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR2105132 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105129 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105130 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105127 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR2105128 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.6267 0.555135 0.548 0.452 0.000
#> SRR2105278 1 0.6260 0.572661 0.552 0.448 0.000
#> SRR2105275 2 0.5992 0.445008 0.268 0.716 0.016
#> SRR2105276 2 0.6027 0.426862 0.272 0.712 0.016
#> SRR2105273 2 0.5591 0.424144 0.304 0.696 0.000
#> SRR2105274 2 0.5902 0.381764 0.316 0.680 0.004
#> SRR2105271 2 0.5905 0.293303 0.352 0.648 0.000
#> SRR2105272 2 0.6111 0.045620 0.396 0.604 0.000
#> SRR2105269 2 0.1129 0.655787 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105270 2 0.1643 0.658720 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105267 2 0.1182 0.656091 0.012 0.976 0.012
#> SRR2105268 2 0.1129 0.653095 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105265 2 0.1163 0.647777 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105266 2 0.1411 0.647916 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105263 2 0.1315 0.654448 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105264 2 0.1399 0.647690 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105261 2 0.6208 0.509169 0.200 0.752 0.048
#> SRR2105262 2 0.6159 0.513913 0.196 0.756 0.048
#> SRR2105357 2 0.6291 -0.318698 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105358 2 0.6302 -0.371796 0.480 0.520 0.000
#> SRR2105439 2 0.3752 0.580910 0.144 0.856 0.000
#> SRR2105440 2 0.3482 0.604423 0.128 0.872 0.000
#> SRR2105509 2 0.3253 0.644016 0.052 0.912 0.036
#> SRR2105510 2 0.3009 0.649447 0.052 0.920 0.028
#> SRR2105507 2 0.5517 0.474402 0.268 0.728 0.004
#> SRR2105508 2 0.5443 0.481095 0.260 0.736 0.004
#> SRR2105505 2 0.6286 -0.335814 0.464 0.536 0.000
#> SRR2105506 1 0.6308 0.439287 0.508 0.492 0.000
#> SRR2105503 2 0.0848 0.653231 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105504 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105501 2 0.3129 0.651365 0.088 0.904 0.008
#> SRR2105502 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105499 2 0.5706 0.386862 0.320 0.680 0.000
#> SRR2105500 2 0.5678 0.403609 0.316 0.684 0.000
#> SRR2105497 2 0.1529 0.647554 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105498 2 0.1964 0.632232 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105495 2 0.3532 0.644401 0.108 0.884 0.008
#> SRR2105496 2 0.2682 0.647306 0.076 0.920 0.004
#> SRR2105493 2 0.3340 0.637589 0.120 0.880 0.000
#> SRR2105494 2 0.3715 0.623846 0.128 0.868 0.004
#> SRR2105491 2 0.0829 0.651882 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105492 2 0.0424 0.652992 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105489 2 0.1411 0.643384 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105490 2 0.1860 0.634894 0.052 0.948 0.000
#> SRR2105487 1 0.6286 0.569566 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105488 1 0.6286 0.570051 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105485 2 0.5785 0.360804 0.332 0.668 0.000
#> SRR2105486 2 0.5650 0.412936 0.312 0.688 0.000
#> SRR2105483 1 0.6359 0.424286 0.592 0.404 0.004
#> SRR2105484 1 0.6359 0.424286 0.592 0.404 0.004
#> SRR2105481 2 0.5988 0.218774 0.368 0.632 0.000
#> SRR2105482 2 0.6140 -0.105167 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105479 2 0.5016 0.537180 0.240 0.760 0.000
#> SRR2105480 2 0.5656 0.494679 0.264 0.728 0.008
#> SRR2105477 2 0.2680 0.652721 0.068 0.924 0.008
#> SRR2105478 2 0.3030 0.650365 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105475 2 0.3456 0.642956 0.060 0.904 0.036
#> SRR2105476 2 0.3456 0.642956 0.060 0.904 0.036
#> SRR2105473 2 0.4399 0.537898 0.188 0.812 0.000
#> SRR2105474 2 0.3941 0.582803 0.156 0.844 0.000
#> SRR2105471 2 0.2096 0.633920 0.052 0.944 0.004
#> SRR2105472 2 0.2301 0.628910 0.060 0.936 0.004
#> SRR2105469 2 0.5404 0.489953 0.256 0.740 0.004
#> SRR2105470 2 0.5517 0.471641 0.268 0.728 0.004
#> SRR2105467 2 0.6267 -0.256112 0.452 0.548 0.000
#> SRR2105468 2 0.6140 0.002666 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105465 2 0.5905 0.132545 0.352 0.648 0.000
#> SRR2105466 2 0.6026 -0.034875 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105463 1 0.6286 0.435821 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105464 2 0.6291 -0.357522 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105461 2 0.1031 0.646261 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105462 2 0.1163 0.646601 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105459 2 0.1919 0.654236 0.020 0.956 0.024
#> SRR2105460 2 0.1585 0.658538 0.028 0.964 0.008
#> SRR2105457 2 0.5785 0.421419 0.300 0.696 0.004
#> SRR2105458 2 0.5754 0.430143 0.296 0.700 0.004
#> SRR2105455 2 0.5591 0.398909 0.304 0.696 0.000
#> SRR2105456 2 0.5621 0.396894 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105453 1 0.6274 0.543173 0.544 0.456 0.000
#> SRR2105454 1 0.6225 0.561577 0.568 0.432 0.000
#> SRR2105451 2 0.3682 0.636303 0.116 0.876 0.008
#> SRR2105452 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105449 2 0.5016 0.527946 0.240 0.760 0.000
#> SRR2105450 2 0.5216 0.494724 0.260 0.740 0.000
#> SRR2105447 2 0.1636 0.655985 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105448 2 0.1182 0.658604 0.012 0.976 0.012
#> SRR2105445 2 0.5178 0.496745 0.256 0.744 0.000
#> SRR2105446 2 0.5810 0.324860 0.336 0.664 0.000
#> SRR2105443 2 0.4810 0.608018 0.140 0.832 0.028
#> SRR2105444 2 0.3573 0.634957 0.120 0.876 0.004
#> SRR2105441 2 0.2165 0.637302 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105442 2 0.2772 0.626582 0.080 0.916 0.004
#> SRR2105437 1 0.6286 0.545036 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105438 1 0.6291 0.539092 0.532 0.468 0.000
#> SRR2105435 2 0.5623 0.447631 0.280 0.716 0.004
#> SRR2105436 2 0.5621 0.405086 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105433 2 0.6140 -0.184849 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105434 2 0.6295 -0.335957 0.472 0.528 0.000
#> SRR2105431 2 0.6295 -0.384125 0.472 0.528 0.000
#> SRR2105432 2 0.6291 -0.378500 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105429 2 0.3434 0.647543 0.064 0.904 0.032
#> SRR2105430 2 0.3134 0.648142 0.052 0.916 0.032
#> SRR2105427 2 0.2173 0.659466 0.048 0.944 0.008
#> SRR2105428 2 0.1585 0.659004 0.028 0.964 0.008
#> SRR2105425 2 0.1170 0.658865 0.016 0.976 0.008
#> SRR2105426 2 0.1163 0.652313 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105421 2 0.5763 0.481023 0.244 0.740 0.016
#> SRR2105422 2 0.5843 0.472762 0.252 0.732 0.016
#> SRR2105423 2 0.1411 0.643454 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105424 2 0.1647 0.645792 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105419 2 0.5618 0.475626 0.260 0.732 0.008
#> SRR2105420 2 0.5285 0.529898 0.244 0.752 0.004
#> SRR2105415 2 0.6252 -0.312896 0.444 0.556 0.000
#> SRR2105416 2 0.6309 -0.427634 0.496 0.504 0.000
#> SRR2105417 2 0.6154 -0.212267 0.408 0.592 0.000
#> SRR2105418 2 0.6225 -0.252167 0.432 0.568 0.000
#> SRR2105413 2 0.2187 0.654154 0.028 0.948 0.024
#> SRR2105414 2 0.2056 0.656893 0.024 0.952 0.024
#> SRR2105409 2 0.1647 0.652959 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105410 2 0.2165 0.644012 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105411 2 0.1267 0.646858 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105412 2 0.1289 0.645776 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105407 2 0.6490 0.184911 0.360 0.628 0.012
#> SRR2105408 2 0.6359 0.177475 0.364 0.628 0.008
#> SRR2105403 1 0.6260 0.557018 0.552 0.448 0.000
#> SRR2105404 1 0.6252 0.561390 0.556 0.444 0.000
#> SRR2105405 2 0.5497 0.390777 0.292 0.708 0.000
#> SRR2105406 2 0.6095 -0.041043 0.392 0.608 0.000
#> SRR2105401 2 0.2774 0.655717 0.072 0.920 0.008
#> SRR2105402 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105399 2 0.5598 0.567380 0.148 0.800 0.052
#> SRR2105400 2 0.5598 0.567380 0.148 0.800 0.052
#> SRR2105397 2 0.4679 0.606189 0.148 0.832 0.020
#> SRR2105398 2 0.4615 0.606754 0.144 0.836 0.020
#> SRR2105395 2 0.1031 0.647939 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105396 2 0.1643 0.639826 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105393 2 0.1315 0.648542 0.020 0.972 0.008
#> SRR2105394 2 0.1031 0.646485 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105389 2 0.5864 0.407205 0.288 0.704 0.008
#> SRR2105390 2 0.5831 0.419533 0.284 0.708 0.008
#> SRR2105391 2 0.5831 0.417517 0.284 0.708 0.008
#> SRR2105392 2 0.5831 0.417517 0.284 0.708 0.008
#> SRR2105385 2 0.5621 0.418012 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105386 2 0.5760 0.364114 0.328 0.672 0.000
#> SRR2105387 2 0.5621 0.397968 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105388 2 0.5591 0.428687 0.304 0.696 0.000
#> SRR2105381 2 0.3780 0.638951 0.064 0.892 0.044
#> SRR2105382 2 0.2443 0.654552 0.032 0.940 0.028
#> SRR2105383 2 0.5016 0.339559 0.240 0.760 0.000
#> SRR2105384 2 0.4974 0.369915 0.236 0.764 0.000
#> SRR2105379 2 0.2176 0.656063 0.020 0.948 0.032
#> SRR2105380 2 0.1482 0.657140 0.012 0.968 0.020
#> SRR2105377 2 0.3038 0.630379 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105378 2 0.3192 0.609281 0.112 0.888 0.000
#> SRR2105375 2 0.5363 0.397104 0.276 0.724 0.000
#> SRR2105376 2 0.5882 0.103261 0.348 0.652 0.000
#> SRR2105373 1 0.6299 0.508302 0.524 0.476 0.000
#> SRR2105374 1 0.6299 0.520838 0.524 0.476 0.000
#> SRR2105371 2 0.5831 0.417517 0.284 0.708 0.008
#> SRR2105372 2 0.5690 0.425818 0.288 0.708 0.004
#> SRR2105369 2 0.5733 0.387280 0.324 0.676 0.000
#> SRR2105370 2 0.5926 0.270670 0.356 0.644 0.000
#> SRR2105367 2 0.6204 -0.244604 0.424 0.576 0.000
#> SRR2105368 2 0.6168 -0.185130 0.412 0.588 0.000
#> SRR2105365 2 0.1170 0.652212 0.008 0.976 0.016
#> SRR2105366 2 0.0237 0.651740 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105363 2 0.1031 0.656384 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105364 2 0.1031 0.655363 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105361 2 0.1267 0.647735 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105362 2 0.1267 0.647735 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105359 2 0.5291 0.485691 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105360 2 0.5431 0.470757 0.284 0.716 0.000
#> SRR2105355 2 0.5285 0.507509 0.244 0.752 0.004
#> SRR2105356 2 0.5216 0.501102 0.260 0.740 0.000
#> SRR2105353 2 0.6287 0.409643 0.272 0.704 0.024
#> SRR2105354 2 0.5623 0.431719 0.280 0.716 0.004
#> SRR2105351 2 0.0661 0.653728 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105352 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105349 2 0.1015 0.655898 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105350 2 0.0661 0.652057 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105345 2 0.2796 0.620687 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105346 2 0.2356 0.632335 0.072 0.928 0.000
#> SRR2105347 2 0.6062 -0.181618 0.384 0.616 0.000
#> SRR2105348 2 0.6126 -0.229814 0.400 0.600 0.000
#> SRR2105343 2 0.1015 0.654468 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105344 2 0.0983 0.656097 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105341 2 0.5690 0.417734 0.288 0.708 0.004
#> SRR2105342 2 0.5722 0.426048 0.292 0.704 0.004
#> SRR2105339 2 0.5848 0.443414 0.268 0.720 0.012
#> SRR2105340 2 0.5541 0.479690 0.252 0.740 0.008
#> SRR2105335 2 0.6291 -0.337064 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105336 2 0.6235 -0.196296 0.436 0.564 0.000
#> SRR2105337 2 0.5678 0.394978 0.316 0.684 0.000
#> SRR2105338 2 0.5905 0.291487 0.352 0.648 0.000
#> SRR2105331 2 0.1919 0.657523 0.024 0.956 0.020
#> SRR2105332 2 0.1482 0.659760 0.020 0.968 0.012
#> SRR2105333 2 0.2434 0.653267 0.036 0.940 0.024
#> SRR2105334 2 0.1919 0.656065 0.020 0.956 0.024
#> SRR2105329 2 0.3784 0.632660 0.132 0.864 0.004
#> SRR2105330 2 0.3983 0.632169 0.144 0.852 0.004
#> SRR2105327 2 0.1774 0.655891 0.016 0.960 0.024
#> SRR2105328 2 0.1774 0.655891 0.016 0.960 0.024
#> SRR2105325 2 0.6062 0.416414 0.276 0.708 0.016
#> SRR2105326 2 0.6062 0.416414 0.276 0.708 0.016
#> SRR2105323 2 0.5706 0.382817 0.320 0.680 0.000
#> SRR2105324 2 0.5650 0.405236 0.312 0.688 0.000
#> SRR2105319 2 0.6299 -0.381880 0.476 0.524 0.000
#> SRR2105320 2 0.6295 -0.389504 0.472 0.528 0.000
#> SRR2105321 2 0.5656 0.426080 0.284 0.712 0.004
#> SRR2105322 2 0.5656 0.426080 0.284 0.712 0.004
#> SRR2105317 2 0.2187 0.654377 0.028 0.948 0.024
#> SRR2105318 2 0.1015 0.651673 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105315 2 0.4575 0.578197 0.184 0.812 0.004
#> SRR2105316 2 0.2902 0.653444 0.064 0.920 0.016
#> SRR2105313 2 0.0424 0.652968 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105314 2 0.1015 0.655543 0.012 0.980 0.008
#> SRR2105311 2 0.6673 0.454427 0.224 0.720 0.056
#> SRR2105312 2 0.6673 0.454427 0.224 0.720 0.056
#> SRR2105307 2 0.6192 -0.191892 0.420 0.580 0.000
#> SRR2105308 2 0.6168 -0.175305 0.412 0.588 0.000
#> SRR2105309 2 0.5529 0.438689 0.296 0.704 0.000
#> SRR2105310 2 0.5815 0.412356 0.304 0.692 0.004
#> SRR2105305 2 0.5988 0.391914 0.304 0.688 0.008
#> SRR2105306 2 0.5560 0.422606 0.300 0.700 0.000
#> SRR2105303 2 0.1267 0.651602 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105304 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105301 2 0.3148 0.647138 0.048 0.916 0.036
#> SRR2105302 2 0.0475 0.654184 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105299 2 0.5024 0.545030 0.220 0.776 0.004
#> SRR2105300 2 0.5158 0.529575 0.232 0.764 0.004
#> SRR2105297 1 0.6410 0.410730 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105298 1 0.6410 0.410730 0.576 0.420 0.004
#> SRR2105295 2 0.2681 0.652329 0.040 0.932 0.028
#> SRR2105296 2 0.2056 0.656151 0.024 0.952 0.024
#> SRR2105293 2 0.5325 0.493196 0.248 0.748 0.004
#> SRR2105294 2 0.5623 0.441657 0.280 0.716 0.004
#> SRR2105291 2 0.5058 0.547956 0.244 0.756 0.000
#> SRR2105292 2 0.5988 0.070835 0.368 0.632 0.000
#> SRR2105289 2 0.4931 0.535731 0.232 0.768 0.000
#> SRR2105290 2 0.6026 0.182565 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105287 2 0.5968 0.063672 0.364 0.636 0.000
#> SRR2105288 2 0.6026 0.024987 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105285 2 0.2773 0.655511 0.048 0.928 0.024
#> SRR2105286 2 0.2443 0.656751 0.032 0.940 0.028
#> SRR2105283 2 0.4172 0.621968 0.156 0.840 0.004
#> SRR2105284 2 0.3573 0.639229 0.120 0.876 0.004
#> SRR2105281 2 0.1399 0.650776 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105282 2 0.1411 0.644267 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105259 2 0.6490 0.184911 0.360 0.628 0.012
#> SRR2105260 2 0.6427 0.232780 0.348 0.640 0.012
#> SRR2105279 2 0.1411 0.642054 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105280 2 0.1031 0.648759 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105257 2 0.6280 -0.345900 0.460 0.540 0.000
#> SRR2105258 1 0.6309 0.457569 0.504 0.496 0.000
#> SRR2105253 2 0.1647 0.659621 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105254 2 0.1163 0.658049 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105255 2 0.6140 0.033537 0.404 0.596 0.000
#> SRR2105256 2 0.5835 0.318189 0.340 0.660 0.000
#> SRR2105251 2 0.0237 0.652912 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105252 2 0.0237 0.652912 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105249 2 0.3784 0.638121 0.132 0.864 0.004
#> SRR2105250 2 0.3267 0.614695 0.116 0.884 0.000
#> SRR2105247 2 0.1129 0.649748 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105248 2 0.1163 0.645118 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105245 2 0.4755 0.570663 0.184 0.808 0.008
#> SRR2105246 2 0.5036 0.571539 0.172 0.808 0.020
#> SRR2105243 2 0.5706 0.378402 0.320 0.680 0.000
#> SRR2105244 2 0.5291 0.480134 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105241 2 0.5621 0.389779 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105242 2 0.6154 -0.042556 0.408 0.592 0.000
#> SRR2105239 2 0.5216 0.483156 0.260 0.740 0.000
#> SRR2105240 2 0.6168 -0.131473 0.412 0.588 0.000
#> SRR2105237 2 0.3886 0.635208 0.096 0.880 0.024
#> SRR2105238 2 0.3445 0.647002 0.088 0.896 0.016
#> SRR2105235 2 0.2261 0.651789 0.068 0.932 0.000
#> SRR2105236 2 0.2537 0.625766 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105233 2 0.3134 0.647538 0.052 0.916 0.032
#> SRR2105234 2 0.3134 0.647538 0.052 0.916 0.032
#> SRR2105231 2 0.1163 0.647538 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105232 2 0.0424 0.652400 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105227 2 0.4531 0.599001 0.168 0.824 0.008
#> SRR2105228 2 0.5443 0.466503 0.260 0.736 0.004
#> SRR2105225 2 0.5785 0.348121 0.332 0.668 0.000
#> SRR2105226 2 0.6026 0.147248 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105229 2 0.5728 0.450062 0.272 0.720 0.008
#> SRR2105230 2 0.5529 0.434005 0.296 0.704 0.000
#> SRR2105219 2 0.1525 0.657259 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105220 2 0.1585 0.658684 0.028 0.964 0.008
#> SRR2105221 2 0.4235 0.572523 0.176 0.824 0.000
#> SRR2105222 2 0.4002 0.586110 0.160 0.840 0.000
#> SRR2105223 2 0.5560 0.434836 0.300 0.700 0.000
#> SRR2105224 2 0.5948 0.276093 0.360 0.640 0.000
#> SRR2105217 2 0.0661 0.653067 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105218 2 0.1031 0.647863 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105215 2 0.0892 0.647918 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105216 2 0.0983 0.650921 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105213 2 0.4979 0.575192 0.168 0.812 0.020
#> SRR2105214 2 0.4861 0.560397 0.192 0.800 0.008
#> SRR2105211 2 0.5363 0.465233 0.276 0.724 0.000
#> SRR2105212 2 0.5443 0.478846 0.260 0.736 0.004
#> SRR2105209 2 0.6126 -0.004036 0.400 0.600 0.000
#> SRR2105210 2 0.6026 0.139803 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105207 2 0.6026 -0.019473 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105208 2 0.6274 -0.339544 0.456 0.544 0.000
#> SRR2105205 2 0.2636 0.658865 0.048 0.932 0.020
#> SRR2105206 2 0.2063 0.654003 0.044 0.948 0.008
#> SRR2105201 2 0.3686 0.589548 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105202 2 0.3686 0.590223 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105203 2 0.0475 0.651837 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105204 2 0.0848 0.652747 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105199 2 0.1129 0.649247 0.020 0.976 0.004
#> SRR2105200 2 0.1411 0.643291 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105197 1 0.6305 0.504578 0.516 0.484 0.000
#> SRR2105198 1 0.6518 0.498015 0.512 0.484 0.004
#> SRR2105195 2 0.5480 0.493742 0.264 0.732 0.004
#> SRR2105196 2 0.5988 0.384730 0.304 0.688 0.008
#> SRR2105193 2 0.5968 0.044339 0.364 0.636 0.000
#> SRR2105194 2 0.6215 -0.182778 0.428 0.572 0.000
#> SRR2105191 1 0.6432 0.523486 0.568 0.428 0.004
#> SRR2105192 1 0.6235 0.570403 0.564 0.436 0.000
#> SRR2105189 2 0.2866 0.658986 0.076 0.916 0.008
#> SRR2105190 2 0.1267 0.658546 0.024 0.972 0.004
#> SRR2105187 2 0.3765 0.636786 0.084 0.888 0.028
#> SRR2105188 2 0.2590 0.651297 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105179 2 0.5397 0.441918 0.280 0.720 0.000
#> SRR2105180 2 0.6079 0.000901 0.388 0.612 0.000
#> SRR2105183 2 0.1643 0.637937 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105184 2 0.1753 0.637395 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105185 2 0.0661 0.655106 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105186 2 0.0848 0.654473 0.008 0.984 0.008
#> SRR2105181 2 0.6204 -0.117468 0.424 0.576 0.000
#> SRR2105182 2 0.5835 0.280182 0.340 0.660 0.000
#> SRR2105177 1 0.6500 0.417095 0.532 0.464 0.004
#> SRR2105178 1 0.6295 0.414375 0.528 0.472 0.000
#> SRR2105171 2 0.1525 0.651834 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105172 2 0.1399 0.650992 0.028 0.968 0.004
#> SRR2105175 2 0.6373 -0.271015 0.408 0.588 0.004
#> SRR2105176 2 0.6280 -0.334149 0.460 0.540 0.000
#> SRR2105173 2 0.1636 0.653511 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105174 2 0.0592 0.651718 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105169 2 0.1031 0.647679 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105170 2 0.1411 0.643423 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105167 2 0.1163 0.649109 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105168 2 0.1411 0.642300 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105165 2 0.5465 0.441711 0.288 0.712 0.000
#> SRR2105166 2 0.5656 0.453557 0.284 0.712 0.004
#> SRR2105163 2 0.5848 0.442998 0.268 0.720 0.012
#> SRR2105164 2 0.5812 0.451600 0.264 0.724 0.012
#> SRR2105161 2 0.5948 0.119680 0.360 0.640 0.000
#> SRR2105162 2 0.6204 -0.231276 0.424 0.576 0.000
#> SRR2105155 2 0.1163 0.649020 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105156 2 0.1643 0.642243 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105157 2 0.0747 0.650881 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105158 2 0.1031 0.648237 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105159 2 0.5397 0.447619 0.280 0.720 0.000
#> SRR2105160 2 0.6026 0.050850 0.376 0.624 0.000
#> SRR2105153 2 0.1015 0.653985 0.008 0.980 0.012
#> SRR2105154 2 0.0661 0.655606 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105151 2 0.1989 0.637361 0.048 0.948 0.004
#> SRR2105152 2 0.1411 0.643564 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105149 2 0.5517 0.463627 0.268 0.728 0.004
#> SRR2105150 2 0.5517 0.463627 0.268 0.728 0.004
#> SRR2105147 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105148 3 0.0475 1.000000 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105143 2 0.5397 0.339295 0.280 0.720 0.000
#> SRR2105144 2 0.6180 -0.192961 0.416 0.584 0.000
#> SRR2105145 2 0.6008 0.030837 0.372 0.628 0.000
#> SRR2105146 2 0.5905 0.121165 0.352 0.648 0.000
#> SRR2105141 2 0.1919 0.655610 0.024 0.956 0.020
#> SRR2105142 2 0.0829 0.656480 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105139 2 0.1031 0.646373 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105140 2 0.1289 0.644539 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105137 2 0.4291 0.572760 0.180 0.820 0.000
#> SRR2105138 2 0.4178 0.553688 0.172 0.828 0.000
#> SRR2105135 2 0.1529 0.641523 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105136 2 0.1289 0.645054 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105133 1 0.6280 0.545489 0.540 0.460 0.000
#> SRR2105134 1 0.6286 0.543488 0.536 0.464 0.000
#> SRR2105131 2 0.5216 0.501683 0.260 0.740 0.000
#> SRR2105132 2 0.6154 -0.178865 0.408 0.592 0.000
#> SRR2105129 2 0.6307 -0.395488 0.488 0.512 0.000
#> SRR2105130 1 0.6302 0.407055 0.520 0.480 0.000
#> SRR2105127 2 0.6291 -0.401584 0.468 0.532 0.000
#> SRR2105128 2 0.6267 -0.322263 0.452 0.548 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.3521 0.472385 0.052 0.084 0.864 0.000
#> SRR2105278 3 0.4362 0.463540 0.088 0.096 0.816 0.000
#> SRR2105275 2 0.6249 0.431900 0.040 0.604 0.340 0.016
#> SRR2105276 2 0.6311 0.399451 0.040 0.588 0.356 0.016
#> SRR2105273 2 0.6277 0.353273 0.068 0.572 0.360 0.000
#> SRR2105274 2 0.6592 0.226427 0.084 0.524 0.392 0.000
#> SRR2105271 2 0.7146 -0.065278 0.132 0.456 0.412 0.000
#> SRR2105272 2 0.7745 -0.262888 0.236 0.412 0.352 0.000
#> SRR2105269 2 0.0927 0.694623 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR2105270 2 0.1820 0.698712 0.020 0.944 0.036 0.000
#> SRR2105267 2 0.1059 0.694147 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR2105268 2 0.1114 0.693757 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR2105265 2 0.1022 0.688440 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.1724 0.687355 0.032 0.948 0.020 0.000
#> SRR2105263 2 0.1362 0.695906 0.020 0.964 0.012 0.004
#> SRR2105264 2 0.1296 0.691754 0.028 0.964 0.004 0.004
#> SRR2105261 2 0.6288 0.549038 0.044 0.684 0.228 0.044
#> SRR2105262 2 0.6256 0.552559 0.044 0.688 0.224 0.044
#> SRR2105357 3 0.4922 0.463288 0.036 0.228 0.736 0.000
#> SRR2105358 3 0.4755 0.476487 0.040 0.200 0.760 0.000
#> SRR2105439 2 0.5222 0.553966 0.112 0.756 0.132 0.000
#> SRR2105440 2 0.4856 0.583007 0.084 0.780 0.136 0.000
#> SRR2105509 2 0.3210 0.689481 0.024 0.896 0.044 0.036
#> SRR2105510 2 0.2929 0.690121 0.028 0.908 0.040 0.024
#> SRR2105507 2 0.6179 0.429976 0.072 0.608 0.320 0.000
#> SRR2105508 2 0.5954 0.417812 0.052 0.604 0.344 0.000
#> SRR2105505 3 0.7818 -0.082805 0.324 0.268 0.408 0.000
#> SRR2105506 3 0.7559 0.012887 0.336 0.204 0.460 0.000
#> SRR2105503 2 0.0804 0.694352 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105504 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.3543 0.691018 0.032 0.868 0.092 0.008
#> SRR2105502 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105499 2 0.6479 0.158583 0.060 0.508 0.428 0.004
#> SRR2105500 2 0.6743 0.138093 0.080 0.504 0.412 0.004
#> SRR2105497 2 0.1743 0.690565 0.056 0.940 0.004 0.000
#> SRR2105498 2 0.2011 0.683623 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.4060 0.675617 0.048 0.836 0.112 0.004
#> SRR2105496 2 0.3403 0.667023 0.020 0.864 0.112 0.004
#> SRR2105493 2 0.4499 0.634272 0.048 0.792 0.160 0.000
#> SRR2105494 2 0.4199 0.645177 0.032 0.804 0.164 0.000
#> SRR2105491 2 0.0672 0.692816 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR2105492 2 0.0376 0.692533 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105489 2 0.1398 0.687379 0.040 0.956 0.004 0.000
#> SRR2105490 2 0.1902 0.681939 0.064 0.932 0.004 0.000
#> SRR2105487 3 0.4888 0.431419 0.124 0.096 0.780 0.000
#> SRR2105488 3 0.5000 0.424475 0.128 0.100 0.772 0.000
#> SRR2105485 2 0.6707 -0.001994 0.088 0.468 0.444 0.000
#> SRR2105486 2 0.6655 0.129322 0.072 0.496 0.428 0.004
#> SRR2105483 1 0.4906 0.301484 0.776 0.084 0.140 0.000
#> SRR2105484 1 0.4906 0.301484 0.776 0.084 0.140 0.000
#> SRR2105481 3 0.6817 0.219027 0.100 0.408 0.492 0.000
#> SRR2105482 3 0.7923 -0.134138 0.324 0.332 0.344 0.000
#> SRR2105479 2 0.6165 0.493028 0.072 0.640 0.284 0.004
#> SRR2105480 2 0.6922 0.381953 0.128 0.580 0.288 0.004
#> SRR2105477 2 0.3052 0.684562 0.012 0.880 0.104 0.004
#> SRR2105478 2 0.3668 0.673682 0.028 0.852 0.116 0.004
#> SRR2105475 2 0.3546 0.685462 0.028 0.880 0.060 0.032
#> SRR2105476 2 0.3546 0.685462 0.028 0.880 0.060 0.032
#> SRR2105473 2 0.5772 0.489344 0.116 0.708 0.176 0.000
#> SRR2105474 2 0.5171 0.569369 0.112 0.760 0.128 0.000
#> SRR2105471 2 0.1824 0.683748 0.060 0.936 0.004 0.000
#> SRR2105472 2 0.2048 0.679708 0.064 0.928 0.008 0.000
#> SRR2105469 2 0.5937 0.415062 0.052 0.608 0.340 0.000
#> SRR2105470 2 0.6263 0.347911 0.068 0.576 0.356 0.000
#> SRR2105467 3 0.6317 0.422660 0.116 0.240 0.644 0.000
#> SRR2105468 3 0.7640 0.184600 0.228 0.316 0.456 0.000
#> SRR2105465 2 0.7599 -0.243022 0.316 0.464 0.220 0.000
#> SRR2105466 1 0.7609 0.357678 0.404 0.396 0.200 0.000
#> SRR2105463 1 0.7198 0.426460 0.548 0.196 0.256 0.000
#> SRR2105464 1 0.7698 0.393460 0.452 0.256 0.292 0.000
#> SRR2105461 2 0.0921 0.687422 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.1211 0.688744 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.1884 0.699186 0.016 0.948 0.016 0.020
#> SRR2105460 2 0.1739 0.699142 0.016 0.952 0.024 0.008
#> SRR2105457 2 0.6298 0.188345 0.048 0.508 0.440 0.004
#> SRR2105458 2 0.6224 0.211990 0.044 0.516 0.436 0.004
#> SRR2105455 2 0.6920 0.262684 0.132 0.552 0.316 0.000
#> SRR2105456 2 0.7216 0.224593 0.180 0.536 0.284 0.000
#> SRR2105453 3 0.5835 0.196904 0.280 0.064 0.656 0.000
#> SRR2105454 3 0.5672 0.198568 0.276 0.056 0.668 0.000
#> SRR2105451 2 0.4569 0.644246 0.052 0.800 0.144 0.004
#> SRR2105452 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105449 2 0.6501 0.449061 0.104 0.628 0.264 0.004
#> SRR2105450 2 0.6956 0.299238 0.148 0.564 0.288 0.000
#> SRR2105447 2 0.1648 0.696485 0.016 0.956 0.012 0.016
#> SRR2105448 2 0.1271 0.699103 0.012 0.968 0.012 0.008
#> SRR2105445 2 0.6007 0.247784 0.044 0.548 0.408 0.000
#> SRR2105446 3 0.6008 0.062314 0.040 0.464 0.496 0.000
#> SRR2105443 2 0.5016 0.647733 0.040 0.784 0.152 0.024
#> SRR2105444 2 0.3931 0.676433 0.040 0.832 0.128 0.000
#> SRR2105441 2 0.2675 0.669549 0.044 0.908 0.048 0.000
#> SRR2105442 2 0.3323 0.653630 0.060 0.876 0.064 0.000
#> SRR2105437 3 0.3071 0.449516 0.044 0.068 0.888 0.000
#> SRR2105438 3 0.3156 0.447865 0.048 0.068 0.884 0.000
#> SRR2105435 2 0.6965 0.266882 0.116 0.552 0.328 0.004
#> SRR2105436 2 0.6568 0.171227 0.080 0.512 0.408 0.000
#> SRR2105433 1 0.7244 0.486944 0.488 0.360 0.152 0.000
#> SRR2105434 1 0.7412 0.509481 0.504 0.296 0.200 0.000
#> SRR2105431 3 0.7782 -0.209389 0.360 0.244 0.396 0.000
#> SRR2105432 1 0.7681 0.306484 0.432 0.224 0.344 0.000
#> SRR2105429 2 0.3521 0.690428 0.024 0.880 0.064 0.032
#> SRR2105430 2 0.3133 0.690274 0.036 0.900 0.036 0.028
#> SRR2105427 2 0.2297 0.699169 0.024 0.928 0.044 0.004
#> SRR2105428 2 0.1953 0.699179 0.012 0.940 0.044 0.004
#> SRR2105425 2 0.1114 0.697728 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR2105426 2 0.1488 0.695743 0.032 0.956 0.012 0.000
#> SRR2105421 2 0.6237 0.457433 0.044 0.620 0.320 0.016
#> SRR2105422 2 0.6384 0.446691 0.052 0.612 0.320 0.016
#> SRR2105423 2 0.1389 0.688644 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.1302 0.693633 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105419 2 0.6032 0.377167 0.040 0.576 0.380 0.004
#> SRR2105420 2 0.6141 0.459972 0.060 0.620 0.316 0.004
#> SRR2105415 1 0.7717 0.168851 0.388 0.224 0.388 0.000
#> SRR2105416 1 0.7550 0.251243 0.436 0.192 0.372 0.000
#> SRR2105417 1 0.7501 0.500944 0.472 0.332 0.196 0.000
#> SRR2105418 1 0.7764 0.444689 0.424 0.324 0.252 0.000
#> SRR2105413 2 0.1993 0.696278 0.016 0.944 0.016 0.024
#> SRR2105414 2 0.1884 0.696614 0.016 0.948 0.016 0.020
#> SRR2105409 2 0.1520 0.691101 0.024 0.956 0.020 0.000
#> SRR2105410 2 0.2739 0.666818 0.036 0.904 0.060 0.000
#> SRR2105411 2 0.1004 0.689619 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR2105412 2 0.1305 0.690170 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR2105407 3 0.5975 0.256013 0.028 0.400 0.564 0.008
#> SRR2105408 3 0.5833 0.279842 0.028 0.396 0.572 0.004
#> SRR2105403 3 0.4352 0.482159 0.080 0.104 0.816 0.000
#> SRR2105404 3 0.4100 0.472236 0.076 0.092 0.832 0.000
#> SRR2105405 2 0.7262 0.202200 0.208 0.540 0.252 0.000
#> SRR2105406 2 0.7729 -0.498435 0.372 0.400 0.228 0.000
#> SRR2105401 2 0.3100 0.692743 0.028 0.888 0.080 0.004
#> SRR2105402 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105399 2 0.5812 0.606313 0.044 0.740 0.168 0.048
#> SRR2105400 2 0.5812 0.606313 0.044 0.740 0.168 0.048
#> SRR2105397 2 0.5138 0.631898 0.036 0.764 0.180 0.020
#> SRR2105398 2 0.5048 0.633394 0.032 0.768 0.180 0.020
#> SRR2105395 2 0.0921 0.688777 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.1635 0.683633 0.044 0.948 0.008 0.000
#> SRR2105393 2 0.1151 0.689964 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR2105394 2 0.0921 0.688357 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105389 2 0.6257 0.272525 0.048 0.536 0.412 0.004
#> SRR2105390 2 0.6309 0.282156 0.044 0.540 0.408 0.008
#> SRR2105391 2 0.6208 0.328320 0.040 0.556 0.396 0.008
#> SRR2105392 2 0.6272 0.331180 0.044 0.556 0.392 0.008
#> SRR2105385 2 0.6286 0.288412 0.064 0.552 0.384 0.000
#> SRR2105386 2 0.6615 0.191395 0.084 0.512 0.404 0.000
#> SRR2105387 2 0.6979 0.181565 0.128 0.528 0.344 0.000
#> SRR2105388 2 0.6751 0.173330 0.096 0.508 0.396 0.000
#> SRR2105381 2 0.3818 0.680815 0.028 0.868 0.060 0.044
#> SRR2105382 2 0.2418 0.693558 0.016 0.928 0.032 0.024
#> SRR2105383 2 0.6075 0.224915 0.288 0.636 0.076 0.000
#> SRR2105384 2 0.6245 0.255802 0.268 0.636 0.096 0.000
#> SRR2105379 2 0.1843 0.694180 0.016 0.948 0.008 0.028
#> SRR2105380 2 0.1394 0.695552 0.012 0.964 0.008 0.016
#> SRR2105377 2 0.4231 0.630704 0.080 0.824 0.096 0.000
#> SRR2105378 2 0.4608 0.594862 0.096 0.800 0.104 0.000
#> SRR2105375 2 0.7489 0.079134 0.220 0.528 0.248 0.004
#> SRR2105376 2 0.7899 -0.545084 0.304 0.372 0.324 0.000
#> SRR2105373 3 0.3958 0.488332 0.052 0.112 0.836 0.000
#> SRR2105374 3 0.3301 0.459027 0.048 0.076 0.876 0.000
#> SRR2105371 2 0.6292 0.313264 0.044 0.548 0.400 0.008
#> SRR2105372 2 0.6076 0.335918 0.040 0.560 0.396 0.004
#> SRR2105369 2 0.6743 0.160299 0.096 0.512 0.392 0.000
#> SRR2105370 2 0.7314 -0.214901 0.152 0.428 0.420 0.000
#> SRR2105367 3 0.7651 -0.052954 0.320 0.228 0.452 0.000
#> SRR2105368 3 0.7683 -0.033050 0.304 0.244 0.452 0.000
#> SRR2105365 2 0.0927 0.694156 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR2105366 2 0.0336 0.691072 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105363 2 0.1284 0.696884 0.024 0.964 0.012 0.000
#> SRR2105364 2 0.1151 0.695336 0.024 0.968 0.008 0.000
#> SRR2105361 2 0.1022 0.688629 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.1209 0.691224 0.032 0.964 0.004 0.000
#> SRR2105359 2 0.6202 0.438039 0.076 0.612 0.312 0.000
#> SRR2105360 2 0.6415 0.438522 0.100 0.612 0.288 0.000
#> SRR2105355 2 0.5990 0.425490 0.056 0.608 0.336 0.000
#> SRR2105356 2 0.6519 0.370630 0.096 0.584 0.320 0.000
#> SRR2105353 2 0.6608 0.363294 0.044 0.568 0.364 0.024
#> SRR2105354 2 0.6009 0.368185 0.048 0.572 0.380 0.000
#> SRR2105351 2 0.0524 0.694050 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105352 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105349 2 0.0992 0.696637 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR2105350 2 0.0524 0.691050 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105345 2 0.3542 0.655354 0.076 0.864 0.060 0.000
#> SRR2105346 2 0.2660 0.674223 0.056 0.908 0.036 0.000
#> SRR2105347 1 0.7150 0.422924 0.480 0.384 0.136 0.000
#> SRR2105348 1 0.7070 0.444577 0.516 0.348 0.136 0.000
#> SRR2105343 2 0.0927 0.693928 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR2105344 2 0.0895 0.694775 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR2105341 2 0.5791 0.314759 0.024 0.556 0.416 0.004
#> SRR2105342 2 0.6130 0.298360 0.052 0.548 0.400 0.000
#> SRR2105339 2 0.6249 0.408844 0.044 0.596 0.348 0.012
#> SRR2105340 2 0.6248 0.413617 0.060 0.596 0.340 0.004
#> SRR2105335 3 0.6267 0.430361 0.112 0.240 0.648 0.000
#> SRR2105336 3 0.7221 0.282872 0.188 0.272 0.540 0.000
#> SRR2105337 2 0.7033 0.151963 0.128 0.508 0.364 0.000
#> SRR2105338 2 0.7328 -0.095070 0.156 0.452 0.392 0.000
#> SRR2105331 2 0.1762 0.697447 0.012 0.952 0.016 0.020
#> SRR2105332 2 0.1526 0.697243 0.016 0.960 0.012 0.012
#> SRR2105333 2 0.2329 0.694733 0.020 0.932 0.024 0.024
#> SRR2105334 2 0.1762 0.696141 0.012 0.952 0.016 0.020
#> SRR2105329 2 0.4904 0.618003 0.040 0.744 0.216 0.000
#> SRR2105330 2 0.5061 0.632410 0.048 0.752 0.196 0.004
#> SRR2105327 2 0.1640 0.695833 0.012 0.956 0.012 0.020
#> SRR2105328 2 0.1640 0.695833 0.012 0.956 0.012 0.020
#> SRR2105325 2 0.6339 0.382840 0.040 0.580 0.364 0.016
#> SRR2105326 2 0.6339 0.382840 0.040 0.580 0.364 0.016
#> SRR2105323 2 0.6214 0.015787 0.052 0.476 0.472 0.000
#> SRR2105324 2 0.6745 0.035328 0.092 0.480 0.428 0.000
#> SRR2105319 3 0.5050 0.479218 0.084 0.152 0.764 0.000
#> SRR2105320 3 0.5280 0.465630 0.096 0.156 0.748 0.000
#> SRR2105321 2 0.6083 0.381543 0.044 0.580 0.372 0.004
#> SRR2105322 2 0.6083 0.381543 0.044 0.580 0.372 0.004
#> SRR2105317 2 0.2107 0.695737 0.016 0.940 0.020 0.024
#> SRR2105318 2 0.0804 0.693034 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105315 2 0.5384 0.525784 0.028 0.676 0.292 0.004
#> SRR2105316 2 0.2982 0.695674 0.024 0.900 0.064 0.012
#> SRR2105313 2 0.0524 0.692845 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105314 2 0.0859 0.695766 0.004 0.980 0.008 0.008
#> SRR2105311 2 0.6697 0.496304 0.044 0.640 0.264 0.052
#> SRR2105312 2 0.6697 0.496304 0.044 0.640 0.264 0.052
#> SRR2105307 1 0.7665 0.418193 0.424 0.360 0.216 0.000
#> SRR2105308 1 0.7544 0.454322 0.452 0.352 0.196 0.000
#> SRR2105309 2 0.5950 0.286686 0.040 0.544 0.416 0.000
#> SRR2105310 2 0.6302 0.174935 0.048 0.504 0.444 0.004
#> SRR2105305 2 0.6333 0.263298 0.052 0.528 0.416 0.004
#> SRR2105306 2 0.6130 0.300508 0.052 0.548 0.400 0.000
#> SRR2105303 2 0.1191 0.691503 0.024 0.968 0.004 0.004
#> SRR2105304 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.3038 0.690029 0.028 0.904 0.036 0.032
#> SRR2105302 2 0.0376 0.694052 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105299 2 0.5498 0.435380 0.020 0.624 0.352 0.004
#> SRR2105300 2 0.5679 0.405659 0.020 0.608 0.364 0.008
#> SRR2105297 1 0.5102 0.298903 0.764 0.100 0.136 0.000
#> SRR2105298 1 0.5102 0.298903 0.764 0.100 0.136 0.000
#> SRR2105295 2 0.2432 0.692369 0.020 0.928 0.028 0.024
#> SRR2105296 2 0.2107 0.696103 0.020 0.940 0.016 0.024
#> SRR2105293 2 0.5866 0.486155 0.048 0.644 0.304 0.004
#> SRR2105294 2 0.6158 0.404345 0.052 0.592 0.352 0.004
#> SRR2105291 2 0.6474 0.467328 0.120 0.624 0.256 0.000
#> SRR2105292 3 0.7702 0.045184 0.224 0.360 0.416 0.000
#> SRR2105289 2 0.6494 0.455790 0.136 0.632 0.232 0.000
#> SRR2105290 2 0.7551 -0.106029 0.196 0.448 0.356 0.000
#> SRR2105287 2 0.7861 -0.479506 0.324 0.392 0.284 0.000
#> SRR2105288 2 0.7860 -0.534393 0.356 0.372 0.272 0.000
#> SRR2105285 2 0.2920 0.695674 0.032 0.908 0.040 0.020
#> SRR2105286 2 0.2437 0.696445 0.024 0.928 0.024 0.024
#> SRR2105283 2 0.5361 0.597403 0.068 0.724 0.208 0.000
#> SRR2105284 2 0.4190 0.664622 0.032 0.816 0.148 0.004
#> SRR2105281 2 0.1209 0.691819 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR2105282 2 0.1545 0.686634 0.040 0.952 0.008 0.000
#> SRR2105259 3 0.6049 0.270709 0.032 0.396 0.564 0.008
#> SRR2105260 3 0.6018 0.183764 0.028 0.420 0.544 0.008
#> SRR2105279 2 0.1211 0.687528 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0921 0.687681 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105257 3 0.7299 0.227874 0.224 0.240 0.536 0.000
#> SRR2105258 3 0.7149 0.176780 0.264 0.184 0.552 0.000
#> SRR2105253 2 0.1822 0.700335 0.008 0.944 0.044 0.004
#> SRR2105254 2 0.1247 0.698305 0.012 0.968 0.016 0.004
#> SRR2105255 3 0.6589 0.316287 0.092 0.352 0.556 0.000
#> SRR2105256 2 0.7179 -0.088543 0.136 0.456 0.408 0.000
#> SRR2105251 2 0.0188 0.692556 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105252 2 0.0188 0.692556 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105249 2 0.4898 0.640045 0.072 0.772 0.156 0.000
#> SRR2105250 2 0.4039 0.644108 0.084 0.836 0.080 0.000
#> SRR2105247 2 0.1191 0.690105 0.024 0.968 0.004 0.004
#> SRR2105248 2 0.1022 0.687759 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105245 2 0.5166 0.588622 0.044 0.736 0.216 0.004
#> SRR2105246 2 0.5593 0.584187 0.052 0.728 0.204 0.016
#> SRR2105243 2 0.7172 0.038425 0.140 0.484 0.376 0.000
#> SRR2105244 2 0.7228 0.071115 0.128 0.492 0.376 0.004
#> SRR2105241 2 0.7373 0.117903 0.192 0.508 0.300 0.000
#> SRR2105242 2 0.7850 -0.389131 0.272 0.388 0.340 0.000
#> SRR2105239 2 0.7017 0.338279 0.152 0.584 0.260 0.004
#> SRR2105240 1 0.7923 0.140421 0.340 0.324 0.336 0.000
#> SRR2105237 2 0.4208 0.676335 0.032 0.836 0.112 0.020
#> SRR2105238 2 0.3840 0.669730 0.024 0.848 0.116 0.012
#> SRR2105235 2 0.2908 0.678439 0.040 0.896 0.064 0.000
#> SRR2105236 2 0.3392 0.651048 0.072 0.872 0.056 0.000
#> SRR2105233 2 0.3218 0.688755 0.028 0.896 0.044 0.032
#> SRR2105234 2 0.3218 0.688755 0.028 0.896 0.044 0.032
#> SRR2105231 2 0.1109 0.688893 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR2105232 2 0.0469 0.692294 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105227 2 0.5883 0.555744 0.092 0.700 0.204 0.004
#> SRR2105228 2 0.7008 0.341955 0.156 0.588 0.252 0.004
#> SRR2105225 2 0.6834 0.020022 0.100 0.476 0.424 0.000
#> SRR2105226 2 0.7683 -0.318380 0.216 0.400 0.384 0.000
#> SRR2105229 2 0.5997 0.409052 0.028 0.592 0.368 0.012
#> SRR2105230 2 0.5914 0.271049 0.028 0.532 0.436 0.004
#> SRR2105219 2 0.1509 0.696881 0.020 0.960 0.012 0.008
#> SRR2105220 2 0.1739 0.699588 0.016 0.952 0.024 0.008
#> SRR2105221 2 0.5576 0.514097 0.096 0.720 0.184 0.000
#> SRR2105222 2 0.5407 0.542843 0.108 0.740 0.152 0.000
#> SRR2105223 2 0.6666 0.147964 0.088 0.508 0.404 0.000
#> SRR2105224 2 0.7279 -0.112001 0.148 0.444 0.408 0.000
#> SRR2105217 2 0.0469 0.692457 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0921 0.690372 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0817 0.687642 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0817 0.692808 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105213 2 0.5398 0.594412 0.044 0.740 0.200 0.016
#> SRR2105214 2 0.5269 0.575217 0.044 0.724 0.228 0.004
#> SRR2105211 2 0.6059 0.438167 0.052 0.616 0.328 0.004
#> SRR2105212 2 0.5915 0.326087 0.040 0.560 0.400 0.000
#> SRR2105209 3 0.7623 0.130918 0.204 0.380 0.416 0.000
#> SRR2105210 2 0.7764 -0.302152 0.240 0.404 0.356 0.000
#> SRR2105207 2 0.7710 -0.393955 0.224 0.408 0.368 0.000
#> SRR2105208 1 0.7823 0.366407 0.412 0.280 0.308 0.000
#> SRR2105205 2 0.2634 0.700129 0.032 0.920 0.028 0.020
#> SRR2105206 2 0.2297 0.695795 0.024 0.928 0.044 0.004
#> SRR2105201 2 0.5199 0.562289 0.100 0.756 0.144 0.000
#> SRR2105202 2 0.5151 0.567332 0.100 0.760 0.140 0.000
#> SRR2105203 2 0.0376 0.692268 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105204 2 0.0672 0.694212 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR2105199 2 0.1209 0.690634 0.032 0.964 0.004 0.000
#> SRR2105200 2 0.1302 0.686761 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105197 3 0.3243 0.469429 0.036 0.088 0.876 0.000
#> SRR2105198 3 0.3427 0.468592 0.036 0.088 0.872 0.004
#> SRR2105195 2 0.6596 0.431732 0.104 0.612 0.280 0.004
#> SRR2105196 2 0.7333 0.263150 0.156 0.548 0.288 0.008
#> SRR2105193 2 0.7638 -0.335367 0.332 0.448 0.220 0.000
#> SRR2105194 1 0.7841 0.303136 0.380 0.356 0.264 0.000
#> SRR2105191 3 0.3982 0.244006 0.220 0.004 0.776 0.000
#> SRR2105192 3 0.5478 0.248193 0.248 0.056 0.696 0.000
#> SRR2105189 2 0.3069 0.699553 0.036 0.896 0.060 0.008
#> SRR2105190 2 0.1697 0.699924 0.016 0.952 0.028 0.004
#> SRR2105187 2 0.3896 0.672963 0.012 0.844 0.120 0.024
#> SRR2105188 2 0.2988 0.684374 0.012 0.876 0.112 0.000
#> SRR2105179 2 0.7201 0.029588 0.148 0.496 0.356 0.000
#> SRR2105180 3 0.7732 0.057049 0.244 0.324 0.432 0.000
#> SRR2105183 2 0.1557 0.686410 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.1661 0.684795 0.052 0.944 0.004 0.000
#> SRR2105185 2 0.0524 0.693840 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105186 2 0.0712 0.693456 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR2105181 3 0.5929 0.406994 0.064 0.296 0.640 0.000
#> SRR2105182 3 0.6070 0.274125 0.048 0.404 0.548 0.000
#> SRR2105177 1 0.6245 0.440284 0.668 0.168 0.164 0.000
#> SRR2105178 1 0.6357 0.470344 0.656 0.184 0.160 0.000
#> SRR2105171 2 0.1690 0.692970 0.032 0.952 0.008 0.008
#> SRR2105172 2 0.1406 0.691723 0.024 0.960 0.016 0.000
#> SRR2105175 1 0.7398 0.465227 0.456 0.376 0.168 0.000
#> SRR2105176 1 0.7733 0.444317 0.440 0.304 0.256 0.000
#> SRR2105173 2 0.1362 0.693854 0.020 0.964 0.004 0.012
#> SRR2105174 2 0.0592 0.693427 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0921 0.687700 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.1489 0.690158 0.044 0.952 0.004 0.000
#> SRR2105167 2 0.1109 0.689224 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR2105168 2 0.1302 0.687638 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105165 2 0.6110 0.356508 0.056 0.576 0.368 0.000
#> SRR2105166 2 0.6557 0.317751 0.072 0.548 0.376 0.004
#> SRR2105163 2 0.6265 0.420072 0.040 0.600 0.344 0.016
#> SRR2105164 2 0.6214 0.437309 0.040 0.612 0.332 0.016
#> SRR2105161 2 0.7700 -0.223732 0.248 0.448 0.304 0.000
#> SRR2105162 1 0.7816 0.401339 0.412 0.316 0.272 0.000
#> SRR2105155 2 0.1356 0.687778 0.032 0.960 0.008 0.000
#> SRR2105156 2 0.1888 0.684047 0.044 0.940 0.016 0.000
#> SRR2105157 2 0.0779 0.688946 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR2105158 2 0.1004 0.687822 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR2105159 2 0.6378 0.449594 0.108 0.628 0.264 0.000
#> SRR2105160 2 0.7837 -0.397638 0.300 0.408 0.292 0.000
#> SRR2105153 2 0.0844 0.694209 0.004 0.980 0.004 0.012
#> SRR2105154 2 0.0712 0.694004 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR2105151 2 0.1824 0.684129 0.060 0.936 0.004 0.000
#> SRR2105152 2 0.1211 0.688098 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105149 2 0.5775 0.429398 0.024 0.604 0.364 0.008
#> SRR2105150 2 0.5775 0.429398 0.024 0.604 0.364 0.008
#> SRR2105147 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105148 4 0.0000 1.000000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105143 2 0.7137 0.000604 0.304 0.536 0.160 0.000
#> SRR2105144 1 0.7469 0.485686 0.472 0.340 0.188 0.000
#> SRR2105145 2 0.7527 -0.355026 0.356 0.452 0.192 0.000
#> SRR2105146 2 0.7613 -0.325167 0.340 0.448 0.212 0.000
#> SRR2105141 2 0.1640 0.695421 0.012 0.956 0.012 0.020
#> SRR2105142 2 0.0712 0.694719 0.004 0.984 0.008 0.004
#> SRR2105139 2 0.0921 0.688445 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.1305 0.687696 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR2105137 2 0.5772 0.526009 0.116 0.708 0.176 0.000
#> SRR2105138 2 0.5820 0.460263 0.100 0.696 0.204 0.000
#> SRR2105135 2 0.1576 0.686816 0.048 0.948 0.004 0.000
#> SRR2105136 2 0.1211 0.688256 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.3758 0.487446 0.048 0.104 0.848 0.000
#> SRR2105134 3 0.3840 0.486206 0.052 0.104 0.844 0.000
#> SRR2105131 2 0.6302 0.288091 0.068 0.564 0.368 0.000
#> SRR2105132 3 0.7149 0.273589 0.184 0.264 0.552 0.000
#> SRR2105129 1 0.6970 0.518135 0.576 0.256 0.168 0.000
#> SRR2105130 1 0.6473 0.476829 0.644 0.188 0.168 0.000
#> SRR2105127 3 0.7467 0.127732 0.284 0.216 0.500 0.000
#> SRR2105128 3 0.7478 0.212646 0.240 0.256 0.504 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.4774 -0.3276 0.028 0.012 0.684 0.000 0.276
#> SRR2105278 3 0.5334 -0.3170 0.076 0.012 0.672 0.000 0.240
#> SRR2105275 2 0.6823 -0.3962 0.008 0.416 0.396 0.004 0.176
#> SRR2105276 3 0.6824 0.4208 0.004 0.400 0.412 0.008 0.176
#> SRR2105273 3 0.5883 0.4851 0.024 0.368 0.552 0.000 0.056
#> SRR2105274 3 0.6029 0.4735 0.048 0.360 0.552 0.000 0.040
#> SRR2105271 3 0.6688 0.3938 0.100 0.320 0.532 0.000 0.048
#> SRR2105272 3 0.7243 0.1138 0.244 0.292 0.436 0.000 0.028
#> SRR2105269 2 0.1471 0.7906 0.004 0.952 0.020 0.000 0.024
#> SRR2105270 2 0.1787 0.7910 0.004 0.936 0.044 0.000 0.016
#> SRR2105267 2 0.0992 0.7910 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105268 2 0.0981 0.7911 0.008 0.972 0.012 0.000 0.008
#> SRR2105265 2 0.1082 0.7845 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105266 2 0.1673 0.7817 0.032 0.944 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105263 2 0.1209 0.7914 0.012 0.964 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105264 2 0.1243 0.7883 0.028 0.960 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105261 2 0.6888 0.0170 0.004 0.532 0.272 0.028 0.164
#> SRR2105262 2 0.6858 0.0259 0.004 0.536 0.272 0.028 0.160
#> SRR2105357 3 0.6390 0.1606 0.016 0.152 0.564 0.000 0.268
#> SRR2105358 3 0.6160 0.0614 0.016 0.124 0.588 0.000 0.272
#> SRR2105439 2 0.5157 0.5919 0.116 0.736 0.120 0.000 0.028
#> SRR2105440 2 0.4903 0.6182 0.080 0.760 0.124 0.000 0.036
#> SRR2105509 2 0.3576 0.7413 0.004 0.852 0.056 0.016 0.072
#> SRR2105510 2 0.3213 0.7516 0.004 0.872 0.052 0.012 0.060
#> SRR2105507 3 0.6372 0.4656 0.028 0.404 0.484 0.000 0.084
#> SRR2105508 3 0.6569 0.4656 0.032 0.408 0.464 0.000 0.096
#> SRR2105505 3 0.7388 -0.3513 0.324 0.156 0.456 0.000 0.064
#> SRR2105506 3 0.7465 -0.3438 0.316 0.132 0.464 0.000 0.088
#> SRR2105503 2 0.1121 0.7895 0.004 0.968 0.008 0.004 0.016
#> SRR2105504 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3917 0.7217 0.016 0.824 0.112 0.004 0.044
#> SRR2105502 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.5231 0.4806 0.024 0.356 0.600 0.000 0.020
#> SRR2105500 3 0.5681 0.4660 0.044 0.360 0.572 0.000 0.024
#> SRR2105497 2 0.1644 0.7851 0.048 0.940 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105498 2 0.2012 0.7760 0.060 0.920 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105495 2 0.3932 0.7266 0.032 0.820 0.116 0.000 0.032
#> SRR2105496 2 0.3376 0.7368 0.012 0.848 0.108 0.000 0.032
#> SRR2105493 2 0.4694 0.6565 0.036 0.772 0.132 0.000 0.060
#> SRR2105494 2 0.4287 0.6682 0.024 0.780 0.164 0.000 0.032
#> SRR2105491 2 0.0960 0.7861 0.008 0.972 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105492 2 0.0727 0.7855 0.004 0.980 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105489 2 0.1364 0.7835 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105490 2 0.1809 0.7773 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105487 3 0.5676 -0.3288 0.088 0.020 0.652 0.000 0.240
#> SRR2105488 3 0.5760 -0.3248 0.088 0.024 0.648 0.000 0.240
#> SRR2105485 3 0.5744 0.4527 0.056 0.324 0.596 0.000 0.024
#> SRR2105486 3 0.5575 0.4691 0.044 0.352 0.584 0.000 0.020
#> SRR2105483 1 0.1913 -0.0689 0.936 0.020 0.020 0.000 0.024
#> SRR2105484 1 0.1913 -0.0689 0.936 0.020 0.020 0.000 0.024
#> SRR2105481 3 0.6588 0.3600 0.080 0.268 0.580 0.000 0.072
#> SRR2105482 3 0.7367 -0.2405 0.340 0.220 0.404 0.000 0.036
#> SRR2105479 2 0.6858 -0.3345 0.056 0.468 0.384 0.000 0.092
#> SRR2105480 2 0.6993 -0.4764 0.104 0.424 0.416 0.000 0.056
#> SRR2105477 2 0.3233 0.7419 0.008 0.852 0.112 0.000 0.028
#> SRR2105478 2 0.3498 0.7272 0.012 0.832 0.132 0.000 0.024
#> SRR2105475 2 0.3820 0.7210 0.004 0.836 0.060 0.016 0.084
#> SRR2105476 2 0.3820 0.7210 0.004 0.836 0.060 0.016 0.084
#> SRR2105473 2 0.6023 0.4809 0.120 0.672 0.152 0.000 0.056
#> SRR2105474 2 0.5271 0.5944 0.104 0.736 0.116 0.000 0.044
#> SRR2105471 2 0.1809 0.7765 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105472 2 0.1877 0.7745 0.064 0.924 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105469 3 0.6360 0.4687 0.032 0.412 0.480 0.000 0.076
#> SRR2105470 3 0.6536 0.4760 0.052 0.384 0.496 0.000 0.068
#> SRR2105467 3 0.7018 0.0461 0.096 0.148 0.580 0.000 0.176
#> SRR2105468 3 0.7526 -0.0451 0.208 0.204 0.500 0.000 0.088
#> SRR2105465 1 0.7284 0.0847 0.356 0.324 0.300 0.000 0.020
#> SRR2105466 1 0.7135 0.4024 0.436 0.276 0.268 0.000 0.020
#> SRR2105463 1 0.6257 0.4639 0.616 0.116 0.232 0.000 0.036
#> SRR2105464 1 0.6987 0.5064 0.480 0.180 0.312 0.000 0.028
#> SRR2105461 2 0.0898 0.7830 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105462 2 0.1168 0.7851 0.032 0.960 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105459 2 0.2253 0.7851 0.012 0.924 0.020 0.008 0.036
#> SRR2105460 2 0.1851 0.7890 0.008 0.940 0.024 0.004 0.024
#> SRR2105457 3 0.5797 0.4916 0.012 0.352 0.564 0.000 0.072
#> SRR2105458 3 0.6079 0.4908 0.012 0.352 0.540 0.000 0.096
#> SRR2105455 3 0.6837 0.3875 0.140 0.372 0.460 0.000 0.028
#> SRR2105456 3 0.6966 0.3380 0.188 0.352 0.440 0.000 0.020
#> SRR2105453 3 0.6220 -0.3970 0.272 0.000 0.540 0.000 0.188
#> SRR2105454 3 0.6219 -0.4115 0.260 0.000 0.544 0.000 0.196
#> SRR2105451 2 0.4743 0.6618 0.040 0.772 0.124 0.000 0.064
#> SRR2105452 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105449 2 0.6739 -0.3967 0.084 0.464 0.400 0.000 0.052
#> SRR2105450 3 0.7137 0.3733 0.136 0.404 0.412 0.000 0.048
#> SRR2105447 2 0.1960 0.7842 0.008 0.936 0.016 0.008 0.032
#> SRR2105448 2 0.1679 0.7876 0.012 0.948 0.020 0.004 0.016
#> SRR2105445 2 0.6555 -0.0779 0.024 0.496 0.364 0.000 0.116
#> SRR2105446 3 0.6693 0.2855 0.020 0.408 0.436 0.000 0.136
#> SRR2105443 2 0.5312 0.5774 0.008 0.720 0.168 0.016 0.088
#> SRR2105444 2 0.4402 0.6636 0.020 0.780 0.148 0.000 0.052
#> SRR2105441 2 0.2728 0.7575 0.048 0.896 0.040 0.000 0.016
#> SRR2105442 2 0.3292 0.7365 0.064 0.864 0.056 0.000 0.016
#> SRR2105437 3 0.4292 -0.3487 0.024 0.000 0.704 0.000 0.272
#> SRR2105438 3 0.4315 -0.3517 0.024 0.000 0.700 0.000 0.276
#> SRR2105435 3 0.7221 0.3806 0.112 0.368 0.448 0.000 0.072
#> SRR2105436 3 0.5369 0.4696 0.044 0.344 0.600 0.000 0.012
#> SRR2105433 1 0.6321 0.5311 0.564 0.244 0.184 0.000 0.008
#> SRR2105434 1 0.6546 0.5571 0.540 0.200 0.248 0.000 0.012
#> SRR2105431 3 0.7471 -0.4190 0.368 0.152 0.412 0.000 0.068
#> SRR2105432 1 0.7361 0.4890 0.460 0.144 0.328 0.000 0.068
#> SRR2105429 2 0.4185 0.6896 0.004 0.808 0.100 0.012 0.076
#> SRR2105430 2 0.3514 0.7440 0.004 0.856 0.056 0.016 0.068
#> SRR2105427 2 0.2103 0.7816 0.004 0.920 0.056 0.000 0.020
#> SRR2105428 2 0.2217 0.7848 0.012 0.920 0.044 0.000 0.024
#> SRR2105425 2 0.1393 0.7917 0.012 0.956 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105426 2 0.1701 0.7906 0.028 0.944 0.016 0.000 0.012
#> SRR2105421 2 0.6748 -0.3391 0.004 0.440 0.384 0.008 0.164
#> SRR2105422 2 0.6858 -0.3606 0.008 0.432 0.388 0.008 0.164
#> SRR2105423 2 0.1364 0.7843 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105424 2 0.1469 0.7887 0.036 0.948 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105419 3 0.6354 0.4747 0.004 0.388 0.480 0.004 0.124
#> SRR2105420 3 0.6299 0.4368 0.036 0.436 0.464 0.000 0.064
#> SRR2105415 1 0.7628 0.4155 0.396 0.144 0.372 0.000 0.088
#> SRR2105416 1 0.6961 0.4229 0.476 0.100 0.364 0.000 0.060
#> SRR2105417 1 0.6743 0.5457 0.516 0.212 0.256 0.000 0.016
#> SRR2105418 1 0.7126 0.5216 0.464 0.216 0.292 0.000 0.028
#> SRR2105413 2 0.2631 0.7691 0.004 0.904 0.036 0.012 0.044
#> SRR2105414 2 0.2361 0.7776 0.004 0.916 0.032 0.008 0.040
#> SRR2105409 2 0.1393 0.7882 0.012 0.956 0.024 0.000 0.008
#> SRR2105410 2 0.2672 0.7580 0.024 0.896 0.064 0.000 0.016
#> SRR2105411 2 0.0798 0.7882 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105412 2 0.1483 0.7865 0.028 0.952 0.008 0.000 0.012
#> SRR2105407 3 0.6443 0.4053 0.008 0.256 0.560 0.004 0.172
#> SRR2105408 3 0.6423 0.3990 0.008 0.252 0.564 0.004 0.172
#> SRR2105403 3 0.5092 -0.3141 0.040 0.020 0.680 0.000 0.260
#> SRR2105404 3 0.4905 -0.3415 0.040 0.012 0.688 0.000 0.260
#> SRR2105405 3 0.7196 0.2827 0.220 0.376 0.380 0.000 0.024
#> SRR2105406 1 0.6997 0.3222 0.388 0.272 0.332 0.000 0.008
#> SRR2105401 2 0.3457 0.7468 0.016 0.852 0.084 0.000 0.048
#> SRR2105402 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.6255 0.3713 0.004 0.636 0.196 0.032 0.132
#> SRR2105400 2 0.6255 0.3713 0.004 0.636 0.196 0.032 0.132
#> SRR2105397 2 0.5386 0.5523 0.008 0.704 0.188 0.012 0.088
#> SRR2105398 2 0.5353 0.5618 0.008 0.708 0.184 0.012 0.088
#> SRR2105395 2 0.0898 0.7842 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105396 2 0.1682 0.7787 0.044 0.940 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105393 2 0.1467 0.7904 0.016 0.956 0.008 0.004 0.016
#> SRR2105394 2 0.0807 0.7846 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105389 3 0.6726 0.4612 0.004 0.376 0.436 0.004 0.180
#> SRR2105390 3 0.6410 0.4671 0.000 0.376 0.468 0.004 0.152
#> SRR2105391 3 0.6652 0.4605 0.004 0.372 0.452 0.004 0.168
#> SRR2105392 3 0.6690 0.4586 0.004 0.364 0.452 0.004 0.176
#> SRR2105385 3 0.5503 0.4683 0.040 0.380 0.564 0.000 0.016
#> SRR2105386 3 0.6000 0.4704 0.056 0.356 0.556 0.000 0.032
#> SRR2105387 3 0.6515 0.3868 0.124 0.348 0.508 0.000 0.020
#> SRR2105388 3 0.5510 0.4653 0.060 0.344 0.588 0.000 0.008
#> SRR2105381 2 0.4424 0.6835 0.004 0.800 0.084 0.024 0.088
#> SRR2105382 2 0.3037 0.7581 0.004 0.884 0.048 0.016 0.048
#> SRR2105383 2 0.5638 0.2675 0.328 0.600 0.048 0.000 0.024
#> SRR2105384 2 0.5955 0.2565 0.308 0.592 0.076 0.000 0.024
#> SRR2105379 2 0.2244 0.7789 0.000 0.920 0.024 0.016 0.040
#> SRR2105380 2 0.1772 0.7865 0.004 0.944 0.016 0.012 0.024
#> SRR2105377 2 0.4271 0.6847 0.056 0.808 0.096 0.000 0.040
#> SRR2105378 2 0.4488 0.6516 0.084 0.784 0.112 0.000 0.020
#> SRR2105375 2 0.7497 -0.3852 0.236 0.432 0.284 0.000 0.048
#> SRR2105376 3 0.7745 -0.3326 0.336 0.264 0.344 0.000 0.056
#> SRR2105373 3 0.4684 -0.2702 0.024 0.020 0.712 0.000 0.244
#> SRR2105374 3 0.4609 -0.3286 0.024 0.008 0.688 0.000 0.280
#> SRR2105371 3 0.6596 0.4608 0.004 0.368 0.464 0.004 0.160
#> SRR2105372 3 0.6387 0.4728 0.008 0.368 0.488 0.000 0.136
#> SRR2105369 3 0.6292 0.4431 0.072 0.360 0.532 0.000 0.036
#> SRR2105370 3 0.6958 0.3307 0.120 0.292 0.528 0.000 0.060
#> SRR2105367 3 0.8134 -0.3655 0.328 0.164 0.364 0.000 0.144
#> SRR2105368 3 0.8222 -0.3459 0.312 0.176 0.360 0.000 0.152
#> SRR2105365 2 0.1404 0.7862 0.008 0.956 0.004 0.004 0.028
#> SRR2105366 2 0.0898 0.7864 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105363 2 0.1314 0.7913 0.016 0.960 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105364 2 0.1306 0.7902 0.016 0.960 0.016 0.000 0.008
#> SRR2105361 2 0.1179 0.7878 0.016 0.964 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105362 2 0.1173 0.7865 0.020 0.964 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105359 3 0.6666 0.4525 0.052 0.420 0.452 0.000 0.076
#> SRR2105360 3 0.6775 0.4436 0.068 0.420 0.444 0.000 0.068
#> SRR2105355 3 0.6747 0.4606 0.036 0.412 0.444 0.000 0.108
#> SRR2105356 3 0.6797 0.4481 0.080 0.396 0.464 0.000 0.060
#> SRR2105353 3 0.7003 0.4441 0.004 0.380 0.432 0.020 0.164
#> SRR2105354 3 0.6437 0.4550 0.004 0.376 0.464 0.000 0.156
#> SRR2105351 2 0.1121 0.7866 0.004 0.968 0.008 0.004 0.016
#> SRR2105352 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.1439 0.7852 0.004 0.956 0.016 0.004 0.020
#> SRR2105350 2 0.0740 0.7881 0.000 0.980 0.008 0.004 0.008
#> SRR2105345 2 0.3553 0.7257 0.084 0.848 0.048 0.000 0.020
#> SRR2105346 2 0.2618 0.7630 0.052 0.900 0.036 0.000 0.012
#> SRR2105347 1 0.6358 0.3903 0.560 0.312 0.096 0.000 0.032
#> SRR2105348 1 0.6232 0.3823 0.596 0.276 0.092 0.000 0.036
#> SRR2105343 2 0.1200 0.7888 0.012 0.964 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105344 2 0.1087 0.7896 0.008 0.968 0.008 0.000 0.016
#> SRR2105341 3 0.6198 0.4842 0.008 0.364 0.524 0.004 0.100
#> SRR2105342 3 0.6186 0.4889 0.020 0.360 0.532 0.000 0.088
#> SRR2105339 2 0.6687 -0.3946 0.004 0.424 0.412 0.008 0.152
#> SRR2105340 3 0.6644 0.4253 0.016 0.412 0.432 0.000 0.140
#> SRR2105335 3 0.6686 0.0628 0.084 0.124 0.612 0.000 0.180
#> SRR2105336 3 0.7131 -0.0352 0.164 0.168 0.568 0.000 0.100
#> SRR2105337 3 0.6424 0.4032 0.112 0.356 0.512 0.000 0.020
#> SRR2105338 3 0.6865 0.3311 0.140 0.320 0.504 0.000 0.036
#> SRR2105331 2 0.1854 0.7861 0.000 0.936 0.020 0.008 0.036
#> SRR2105332 2 0.1483 0.7911 0.000 0.952 0.012 0.008 0.028
#> SRR2105333 2 0.2611 0.7725 0.004 0.904 0.028 0.012 0.052
#> SRR2105334 2 0.2171 0.7804 0.008 0.928 0.020 0.012 0.032
#> SRR2105329 2 0.5176 0.5146 0.016 0.688 0.236 0.000 0.060
#> SRR2105330 2 0.4967 0.5490 0.012 0.708 0.220 0.000 0.060
#> SRR2105327 2 0.1812 0.7835 0.004 0.940 0.012 0.008 0.036
#> SRR2105328 2 0.1812 0.7835 0.004 0.940 0.012 0.008 0.036
#> SRR2105325 3 0.6798 0.4383 0.004 0.388 0.428 0.008 0.172
#> SRR2105326 3 0.6798 0.4383 0.004 0.388 0.428 0.008 0.172
#> SRR2105323 3 0.6408 0.4615 0.028 0.352 0.524 0.000 0.096
#> SRR2105324 3 0.6571 0.4506 0.060 0.348 0.524 0.000 0.068
#> SRR2105319 3 0.5078 -0.0594 0.044 0.048 0.732 0.000 0.176
#> SRR2105320 3 0.5467 -0.0557 0.064 0.052 0.708 0.000 0.176
#> SRR2105321 3 0.6529 0.4388 0.004 0.392 0.436 0.000 0.168
#> SRR2105322 3 0.6529 0.4388 0.004 0.392 0.436 0.000 0.168
#> SRR2105317 2 0.2498 0.7764 0.004 0.912 0.032 0.016 0.036
#> SRR2105318 2 0.1362 0.7884 0.012 0.960 0.008 0.004 0.016
#> SRR2105315 2 0.5745 0.0313 0.012 0.568 0.352 0.000 0.068
#> SRR2105316 2 0.3152 0.7584 0.012 0.876 0.072 0.008 0.032
#> SRR2105313 2 0.0798 0.7876 0.008 0.976 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105314 2 0.1460 0.7886 0.008 0.956 0.012 0.004 0.020
#> SRR2105311 2 0.7250 -0.1362 0.008 0.488 0.304 0.036 0.164
#> SRR2105312 2 0.7250 -0.1362 0.008 0.488 0.304 0.036 0.164
#> SRR2105307 1 0.6801 0.4872 0.468 0.244 0.280 0.000 0.008
#> SRR2105308 1 0.6730 0.4955 0.488 0.244 0.260 0.000 0.008
#> SRR2105309 3 0.5782 0.4894 0.012 0.388 0.536 0.000 0.064
#> SRR2105310 3 0.5785 0.4907 0.012 0.348 0.568 0.000 0.072
#> SRR2105305 3 0.6138 0.4857 0.004 0.352 0.532 0.004 0.108
#> SRR2105306 3 0.6171 0.4880 0.028 0.368 0.532 0.000 0.072
#> SRR2105303 2 0.1216 0.7882 0.020 0.960 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105304 4 0.0000 0.9974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3350 0.7473 0.004 0.864 0.040 0.016 0.076
#> SRR2105302 2 0.1121 0.7875 0.004 0.968 0.016 0.004 0.008
#> SRR2105299 2 0.6118 0.2023 0.012 0.576 0.292 0.000 0.120
#> SRR2105300 2 0.6220 0.1473 0.012 0.556 0.308 0.000 0.124
#> SRR2105297 1 0.1865 -0.0888 0.936 0.024 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105298 1 0.1865 -0.0888 0.936 0.024 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105295 2 0.2681 0.7667 0.004 0.900 0.028 0.012 0.056
#> SRR2105296 2 0.2148 0.7789 0.004 0.924 0.016 0.008 0.048
#> SRR2105293 2 0.6638 -0.2806 0.012 0.472 0.356 0.000 0.160
#> SRR2105294 2 0.6772 -0.4317 0.016 0.420 0.404 0.000 0.160
#> SRR2105291 2 0.6458 -0.2326 0.104 0.500 0.372 0.000 0.024
#> SRR2105292 3 0.7617 -0.1204 0.224 0.244 0.460 0.000 0.072
#> SRR2105289 2 0.6927 -0.4277 0.132 0.444 0.388 0.000 0.036
#> SRR2105290 3 0.6686 0.2487 0.204 0.304 0.484 0.000 0.008
#> SRR2105287 3 0.7738 -0.2644 0.336 0.260 0.348 0.000 0.056
#> SRR2105288 1 0.7581 0.3244 0.380 0.264 0.312 0.000 0.044
#> SRR2105285 2 0.2945 0.7662 0.008 0.888 0.044 0.008 0.052
#> SRR2105286 2 0.2814 0.7743 0.016 0.900 0.032 0.012 0.040
#> SRR2105283 2 0.5259 0.5325 0.040 0.688 0.236 0.000 0.036
#> SRR2105284 2 0.4143 0.6754 0.016 0.784 0.168 0.000 0.032
#> SRR2105281 2 0.1074 0.7873 0.016 0.968 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105282 2 0.1618 0.7823 0.040 0.944 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105259 3 0.6394 0.4018 0.008 0.252 0.568 0.004 0.168
#> SRR2105260 3 0.6550 0.4191 0.008 0.280 0.536 0.004 0.172
#> SRR2105279 2 0.1251 0.7833 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105280 2 0.0798 0.7839 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105257 3 0.7326 -0.1981 0.220 0.136 0.536 0.000 0.108
#> SRR2105258 3 0.7000 -0.2576 0.256 0.092 0.552 0.000 0.100
#> SRR2105253 2 0.1872 0.7857 0.000 0.928 0.052 0.000 0.020
#> SRR2105254 2 0.1267 0.7914 0.004 0.960 0.024 0.000 0.012
#> SRR2105255 3 0.6484 0.2662 0.064 0.212 0.616 0.000 0.108
#> SRR2105256 3 0.6903 0.3737 0.116 0.320 0.512 0.000 0.052
#> SRR2105251 2 0.0727 0.7860 0.004 0.980 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105252 2 0.0727 0.7860 0.004 0.980 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105249 2 0.4863 0.6326 0.060 0.748 0.164 0.000 0.028
#> SRR2105250 2 0.3912 0.7049 0.084 0.824 0.076 0.000 0.016
#> SRR2105247 2 0.0798 0.7878 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105248 2 0.0912 0.7835 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105245 2 0.6239 0.0950 0.028 0.588 0.280 0.000 0.104
#> SRR2105246 2 0.6736 0.0138 0.032 0.564 0.284 0.012 0.108
#> SRR2105243 3 0.6686 0.3951 0.112 0.344 0.508 0.000 0.036
#> SRR2105244 3 0.6167 0.4147 0.100 0.336 0.548 0.000 0.016
#> SRR2105241 3 0.6945 0.2961 0.184 0.352 0.444 0.000 0.020
#> SRR2105242 3 0.7251 -0.0769 0.288 0.272 0.416 0.000 0.024
#> SRR2105239 3 0.7078 0.3326 0.144 0.400 0.416 0.000 0.040
#> SRR2105240 1 0.7797 0.3088 0.356 0.228 0.348 0.000 0.068
#> SRR2105237 2 0.4401 0.6792 0.008 0.788 0.108 0.004 0.092
#> SRR2105238 2 0.3756 0.7199 0.012 0.824 0.120 0.000 0.044
#> SRR2105235 2 0.2741 0.7629 0.032 0.892 0.064 0.000 0.012
#> SRR2105236 2 0.3423 0.7278 0.068 0.856 0.060 0.000 0.016
#> SRR2105233 2 0.3455 0.7375 0.004 0.856 0.048 0.012 0.080
#> SRR2105234 2 0.3455 0.7375 0.004 0.856 0.048 0.012 0.080
#> SRR2105231 2 0.0912 0.7851 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105232 2 0.0693 0.7867 0.008 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105227 2 0.6793 -0.0427 0.096 0.552 0.284 0.000 0.068
#> SRR2105228 2 0.6862 -0.4516 0.164 0.436 0.380 0.000 0.020
#> SRR2105225 3 0.6999 0.4463 0.072 0.316 0.512 0.000 0.100
#> SRR2105226 3 0.7301 0.1562 0.184 0.284 0.480 0.000 0.052
#> SRR2105229 3 0.6441 0.4034 0.000 0.420 0.424 0.004 0.152
#> SRR2105230 3 0.6030 0.4921 0.004 0.352 0.532 0.000 0.112
#> SRR2105219 2 0.1393 0.7920 0.008 0.956 0.012 0.000 0.024
#> SRR2105220 2 0.1911 0.7872 0.004 0.932 0.036 0.000 0.028
#> SRR2105221 2 0.5611 0.5220 0.092 0.700 0.164 0.000 0.044
#> SRR2105222 2 0.5511 0.5502 0.096 0.712 0.148 0.000 0.044
#> SRR2105223 3 0.6408 0.4486 0.064 0.348 0.536 0.000 0.052
#> SRR2105224 3 0.6588 0.3493 0.116 0.300 0.548 0.000 0.036
#> SRR2105217 2 0.0912 0.7873 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105218 2 0.0992 0.7856 0.024 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105215 2 0.0798 0.7834 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105216 2 0.0992 0.7878 0.024 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105213 2 0.6512 0.1109 0.024 0.588 0.268 0.012 0.108
#> SRR2105214 2 0.6407 0.0134 0.032 0.568 0.292 0.000 0.108
#> SRR2105211 3 0.6081 0.4265 0.012 0.440 0.464 0.000 0.084
#> SRR2105212 3 0.6156 0.4554 0.012 0.424 0.472 0.000 0.092
#> SRR2105209 3 0.7210 0.0863 0.192 0.248 0.508 0.000 0.052
#> SRR2105210 3 0.7277 0.0574 0.228 0.280 0.456 0.000 0.036
#> SRR2105207 3 0.8069 -0.0998 0.228 0.288 0.380 0.000 0.104
#> SRR2105208 1 0.7232 0.5074 0.456 0.172 0.328 0.000 0.044
#> SRR2105205 2 0.2784 0.7823 0.012 0.896 0.040 0.004 0.048
#> SRR2105206 2 0.2598 0.7711 0.008 0.904 0.044 0.004 0.040
#> SRR2105201 2 0.5237 0.5867 0.092 0.732 0.140 0.000 0.036
#> SRR2105202 2 0.5246 0.5871 0.096 0.732 0.136 0.000 0.036
#> SRR2105203 2 0.0613 0.7862 0.008 0.984 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105204 2 0.0968 0.7888 0.012 0.972 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105199 2 0.1074 0.7867 0.016 0.968 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105200 2 0.1764 0.7802 0.036 0.940 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105197 3 0.4342 -0.2624 0.016 0.012 0.724 0.000 0.248
#> SRR2105198 3 0.4407 -0.2550 0.020 0.012 0.724 0.000 0.244
#> SRR2105195 3 0.6685 0.4251 0.088 0.432 0.436 0.000 0.044
#> SRR2105196 2 0.7276 -0.4271 0.172 0.428 0.356 0.000 0.044
#> SRR2105193 1 0.7288 0.1260 0.344 0.300 0.336 0.000 0.020
#> SRR2105194 1 0.7078 0.3582 0.400 0.232 0.352 0.000 0.016
#> SRR2105191 5 0.3734 0.0000 0.036 0.000 0.168 0.000 0.796
#> SRR2105192 3 0.6083 -0.4082 0.224 0.000 0.572 0.000 0.204
#> SRR2105189 2 0.2886 0.7648 0.012 0.884 0.068 0.000 0.036
#> SRR2105190 2 0.1739 0.7856 0.004 0.940 0.032 0.000 0.024
#> SRR2105187 2 0.4280 0.6950 0.004 0.792 0.140 0.012 0.052
#> SRR2105188 2 0.3495 0.7285 0.008 0.836 0.120 0.000 0.036
#> SRR2105179 3 0.7134 0.3529 0.144 0.344 0.464 0.000 0.048
#> SRR2105180 3 0.7914 -0.1516 0.236 0.244 0.424 0.000 0.096
#> SRR2105183 2 0.1670 0.7807 0.052 0.936 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105184 2 0.1808 0.7780 0.044 0.936 0.008 0.000 0.012
#> SRR2105185 2 0.1173 0.7892 0.004 0.964 0.012 0.000 0.020
#> SRR2105186 2 0.1059 0.7874 0.008 0.968 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105181 3 0.6668 0.2284 0.036 0.204 0.576 0.000 0.184
#> SRR2105182 3 0.6104 0.3982 0.008 0.256 0.588 0.000 0.148
#> SRR2105177 1 0.4121 0.2386 0.812 0.088 0.080 0.000 0.020
#> SRR2105178 1 0.4588 0.3425 0.768 0.092 0.128 0.000 0.012
#> SRR2105171 2 0.1721 0.7900 0.020 0.944 0.016 0.000 0.020
#> SRR2105172 2 0.1405 0.7903 0.016 0.956 0.020 0.000 0.008
#> SRR2105175 1 0.6735 0.4900 0.524 0.268 0.188 0.000 0.020
#> SRR2105176 1 0.6668 0.5252 0.500 0.184 0.304 0.000 0.012
#> SRR2105173 2 0.1533 0.7876 0.016 0.952 0.004 0.004 0.024
#> SRR2105174 2 0.0981 0.7898 0.012 0.972 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105169 2 0.1059 0.7879 0.020 0.968 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105170 2 0.1630 0.7851 0.036 0.944 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105167 2 0.1082 0.7849 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105168 2 0.1364 0.7829 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105165 3 0.5849 0.4835 0.012 0.396 0.524 0.000 0.068
#> SRR2105166 3 0.6272 0.4869 0.020 0.380 0.508 0.000 0.092
#> SRR2105163 2 0.6907 -0.3914 0.008 0.416 0.396 0.008 0.172
#> SRR2105164 2 0.6881 -0.3691 0.008 0.428 0.388 0.008 0.168
#> SRR2105161 3 0.7210 0.0140 0.272 0.272 0.432 0.000 0.024
#> SRR2105162 1 0.7139 0.5059 0.456 0.212 0.304 0.000 0.028
#> SRR2105155 2 0.1393 0.7880 0.024 0.956 0.008 0.000 0.012
#> SRR2105156 2 0.1967 0.7766 0.036 0.932 0.020 0.000 0.012
#> SRR2105157 2 0.0579 0.7852 0.008 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105158 2 0.0898 0.7837 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105159 2 0.6908 -0.4471 0.076 0.440 0.412 0.000 0.072
#> SRR2105160 3 0.7466 -0.1979 0.304 0.268 0.392 0.000 0.036
#> SRR2105153 2 0.1220 0.7879 0.008 0.964 0.004 0.004 0.020
#> SRR2105154 2 0.1243 0.7877 0.004 0.960 0.008 0.000 0.028
#> SRR2105151 2 0.1809 0.7778 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105152 2 0.1251 0.7833 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105149 2 0.6343 -0.3293 0.008 0.456 0.412 0.000 0.124
#> SRR2105150 2 0.6343 -0.3293 0.008 0.456 0.412 0.000 0.124
#> SRR2105147 4 0.0162 0.9923 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105148 4 0.0162 0.9923 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105143 2 0.6916 -0.4211 0.352 0.404 0.236 0.000 0.008
#> SRR2105144 1 0.6661 0.5231 0.504 0.236 0.252 0.000 0.008
#> SRR2105145 1 0.7037 0.2246 0.372 0.316 0.304 0.000 0.008
#> SRR2105146 1 0.7138 0.1672 0.356 0.316 0.316 0.000 0.012
#> SRR2105141 2 0.1730 0.7824 0.004 0.940 0.008 0.004 0.044
#> SRR2105142 2 0.1278 0.7854 0.004 0.960 0.016 0.000 0.020
#> SRR2105139 2 0.0898 0.7853 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105140 2 0.1281 0.7826 0.032 0.956 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105137 2 0.5708 0.5185 0.112 0.688 0.164 0.000 0.036
#> SRR2105138 2 0.6004 0.4458 0.108 0.660 0.188 0.000 0.044
#> SRR2105135 2 0.1525 0.7833 0.036 0.948 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105136 2 0.1251 0.7837 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105133 3 0.5104 -0.2746 0.028 0.028 0.672 0.000 0.272
#> SRR2105134 3 0.5126 -0.2807 0.028 0.028 0.668 0.000 0.276
#> SRR2105131 2 0.6572 -0.3339 0.032 0.460 0.412 0.000 0.096
#> SRR2105132 3 0.7464 -0.0962 0.144 0.200 0.528 0.000 0.128
#> SRR2105129 1 0.5847 0.5094 0.664 0.156 0.156 0.000 0.024
#> SRR2105130 1 0.4817 0.3633 0.752 0.092 0.140 0.000 0.016
#> SRR2105127 3 0.7626 -0.2786 0.280 0.112 0.472 0.000 0.136
#> SRR2105128 3 0.7356 -0.2044 0.236 0.168 0.516 0.000 0.080
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.4008 0.28598 0.000 0.004 0.128 0.000 0.768 0.100
#> SRR2105278 5 0.4029 0.34718 0.024 0.000 0.124 0.000 0.784 0.068
#> SRR2105275 3 0.4059 0.58739 0.000 0.172 0.768 0.004 0.024 0.032
#> SRR2105276 3 0.4159 0.58544 0.004 0.156 0.776 0.008 0.020 0.036
#> SRR2105273 3 0.5654 0.57819 0.016 0.112 0.640 0.000 0.208 0.024
#> SRR2105274 3 0.6626 0.54483 0.048 0.152 0.524 0.000 0.260 0.016
#> SRR2105271 3 0.7125 0.34360 0.068 0.128 0.428 0.000 0.348 0.028
#> SRR2105272 3 0.7633 0.01606 0.240 0.132 0.356 0.000 0.264 0.008
#> SRR2105269 2 0.1693 0.85887 0.000 0.932 0.044 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105270 2 0.2127 0.85989 0.004 0.912 0.060 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105267 2 0.1074 0.85987 0.000 0.960 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105268 2 0.1218 0.86078 0.004 0.956 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105265 2 0.1167 0.85495 0.020 0.960 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105266 2 0.1509 0.84950 0.024 0.948 0.008 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105263 2 0.1647 0.86099 0.008 0.940 0.016 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105264 2 0.1938 0.86094 0.024 0.928 0.016 0.000 0.004 0.028
#> SRR2105261 3 0.5216 0.46318 0.000 0.320 0.596 0.028 0.000 0.056
#> SRR2105262 3 0.5230 0.46151 0.000 0.324 0.592 0.028 0.000 0.056
#> SRR2105357 5 0.6462 0.37583 0.000 0.092 0.240 0.000 0.540 0.128
#> SRR2105358 5 0.6101 0.36254 0.000 0.072 0.224 0.000 0.584 0.120
#> SRR2105439 2 0.5132 0.67928 0.084 0.720 0.024 0.000 0.140 0.032
#> SRR2105440 2 0.4840 0.69729 0.052 0.744 0.024 0.000 0.140 0.040
#> SRR2105509 2 0.3979 0.75959 0.000 0.772 0.160 0.016 0.000 0.052
#> SRR2105510 2 0.3758 0.78401 0.000 0.796 0.144 0.012 0.004 0.044
#> SRR2105507 3 0.5460 0.61040 0.012 0.148 0.656 0.000 0.168 0.016
#> SRR2105508 3 0.5501 0.61932 0.020 0.164 0.668 0.000 0.128 0.020
#> SRR2105505 5 0.6934 -0.02744 0.280 0.060 0.180 0.000 0.468 0.012
#> SRR2105506 5 0.6660 0.04622 0.268 0.036 0.156 0.000 0.516 0.024
#> SRR2105503 2 0.1552 0.85792 0.000 0.940 0.036 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105504 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.4708 0.70862 0.008 0.728 0.188 0.004 0.028 0.044
#> SRR2105502 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.6546 0.49935 0.020 0.172 0.452 0.000 0.340 0.016
#> SRR2105500 3 0.6687 0.45732 0.028 0.168 0.420 0.000 0.368 0.016
#> SRR2105497 2 0.1440 0.85401 0.044 0.944 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105498 2 0.1643 0.84855 0.068 0.924 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105495 2 0.4603 0.77482 0.016 0.768 0.096 0.000 0.080 0.040
#> SRR2105496 2 0.3953 0.79931 0.000 0.800 0.084 0.000 0.080 0.036
#> SRR2105493 2 0.5125 0.70836 0.016 0.720 0.092 0.000 0.132 0.040
#> SRR2105494 2 0.5073 0.71477 0.012 0.720 0.112 0.000 0.120 0.036
#> SRR2105491 2 0.1552 0.85622 0.000 0.940 0.036 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105492 2 0.1536 0.85423 0.000 0.940 0.040 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105489 2 0.1332 0.85216 0.028 0.952 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105490 2 0.1644 0.84765 0.052 0.932 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105487 5 0.5028 0.31087 0.052 0.012 0.100 0.000 0.732 0.104
#> SRR2105488 5 0.5097 0.31179 0.060 0.012 0.096 0.000 0.728 0.104
#> SRR2105485 3 0.6405 0.40840 0.036 0.140 0.424 0.000 0.396 0.004
#> SRR2105486 3 0.6535 0.47136 0.024 0.156 0.456 0.000 0.348 0.016
#> SRR2105483 1 0.1624 0.11960 0.936 0.000 0.004 0.000 0.020 0.040
#> SRR2105484 1 0.1624 0.11960 0.936 0.000 0.004 0.000 0.020 0.040
#> SRR2105481 3 0.6778 0.24847 0.060 0.100 0.456 0.000 0.360 0.024
#> SRR2105482 5 0.7450 -0.14338 0.292 0.080 0.268 0.000 0.348 0.012
#> SRR2105479 3 0.6499 0.59089 0.036 0.224 0.576 0.000 0.120 0.044
#> SRR2105480 3 0.7419 0.53927 0.096 0.208 0.476 0.000 0.188 0.032
#> SRR2105477 2 0.4202 0.78179 0.004 0.784 0.116 0.000 0.056 0.040
#> SRR2105478 2 0.4127 0.78106 0.008 0.784 0.120 0.000 0.072 0.016
#> SRR2105475 2 0.4209 0.72591 0.000 0.744 0.188 0.016 0.000 0.052
#> SRR2105476 2 0.4209 0.72591 0.000 0.744 0.188 0.016 0.000 0.052
#> SRR2105473 2 0.5796 0.57311 0.088 0.648 0.020 0.000 0.196 0.048
#> SRR2105474 2 0.5310 0.66982 0.084 0.708 0.028 0.000 0.144 0.036
#> SRR2105471 2 0.1500 0.84689 0.052 0.936 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105472 2 0.1563 0.84535 0.056 0.932 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105469 3 0.5808 0.61884 0.028 0.152 0.652 0.000 0.140 0.028
#> SRR2105470 3 0.6561 0.58449 0.052 0.156 0.576 0.000 0.188 0.028
#> SRR2105467 5 0.6237 0.41871 0.048 0.072 0.188 0.000 0.628 0.064
#> SRR2105468 5 0.7030 0.17408 0.140 0.080 0.236 0.000 0.516 0.028
#> SRR2105465 1 0.7753 0.24553 0.344 0.144 0.308 0.000 0.188 0.016
#> SRR2105466 1 0.7346 0.42065 0.428 0.116 0.260 0.000 0.188 0.008
#> SRR2105463 1 0.6083 0.39167 0.592 0.044 0.100 0.000 0.248 0.016
#> SRR2105464 1 0.6979 0.34134 0.448 0.048 0.196 0.000 0.292 0.016
#> SRR2105461 2 0.0603 0.84926 0.016 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105462 2 0.1149 0.85451 0.024 0.960 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105459 2 0.2504 0.84978 0.004 0.892 0.064 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105460 2 0.2094 0.85465 0.000 0.908 0.064 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105457 3 0.6088 0.55525 0.012 0.148 0.580 0.000 0.232 0.028
#> SRR2105458 3 0.5955 0.56699 0.016 0.144 0.596 0.000 0.224 0.020
#> SRR2105455 3 0.7217 0.44243 0.116 0.160 0.472 0.000 0.240 0.012
#> SRR2105456 3 0.7607 0.33189 0.156 0.140 0.432 0.000 0.248 0.024
#> SRR2105453 5 0.4673 0.28939 0.196 0.000 0.028 0.000 0.712 0.064
#> SRR2105454 5 0.4584 0.28895 0.184 0.000 0.028 0.000 0.724 0.064
#> SRR2105451 2 0.5151 0.71503 0.020 0.724 0.080 0.000 0.128 0.048
#> SRR2105452 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.7264 0.55319 0.072 0.248 0.476 0.000 0.172 0.032
#> SRR2105450 3 0.7713 0.42563 0.124 0.192 0.400 0.000 0.260 0.024
#> SRR2105447 2 0.2505 0.84786 0.000 0.888 0.064 0.008 0.000 0.040
#> SRR2105448 2 0.2053 0.85590 0.004 0.916 0.052 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105445 2 0.6805 0.00255 0.004 0.436 0.276 0.000 0.240 0.044
#> SRR2105446 5 0.7331 -0.06040 0.008 0.340 0.208 0.000 0.356 0.088
#> SRR2105443 2 0.5593 0.53416 0.000 0.624 0.264 0.016 0.040 0.056
#> SRR2105444 2 0.4825 0.65827 0.004 0.700 0.212 0.000 0.052 0.032
#> SRR2105441 2 0.2531 0.83161 0.036 0.900 0.012 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105442 2 0.3391 0.80442 0.048 0.852 0.020 0.000 0.060 0.020
#> SRR2105437 5 0.4668 0.18045 0.000 0.000 0.204 0.000 0.680 0.116
#> SRR2105438 5 0.4695 0.17347 0.000 0.000 0.208 0.000 0.676 0.116
#> SRR2105435 3 0.7594 0.46346 0.108 0.164 0.468 0.000 0.216 0.044
#> SRR2105436 3 0.6468 0.49520 0.028 0.156 0.484 0.000 0.320 0.012
#> SRR2105433 1 0.6605 0.49117 0.564 0.108 0.188 0.000 0.132 0.008
#> SRR2105434 1 0.6618 0.48949 0.532 0.072 0.204 0.000 0.188 0.004
#> SRR2105431 5 0.7181 -0.12084 0.320 0.028 0.224 0.000 0.392 0.036
#> SRR2105432 1 0.7220 0.24321 0.424 0.044 0.180 0.000 0.316 0.036
#> SRR2105429 2 0.4848 0.58368 0.000 0.676 0.252 0.012 0.016 0.044
#> SRR2105430 2 0.4097 0.74806 0.000 0.764 0.172 0.016 0.004 0.044
#> SRR2105427 2 0.2647 0.83820 0.000 0.876 0.088 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105428 2 0.2865 0.84682 0.008 0.872 0.080 0.000 0.012 0.028
#> SRR2105425 2 0.1844 0.86100 0.004 0.924 0.048 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105426 2 0.1663 0.86022 0.024 0.940 0.024 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105421 3 0.3518 0.59102 0.000 0.184 0.784 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105422 3 0.3734 0.59891 0.000 0.184 0.776 0.008 0.004 0.028
#> SRR2105423 2 0.1049 0.85197 0.032 0.960 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105424 2 0.1464 0.85655 0.036 0.944 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105419 3 0.5019 0.60956 0.000 0.140 0.712 0.004 0.108 0.036
#> SRR2105420 3 0.6310 0.60693 0.040 0.200 0.596 0.000 0.136 0.028
#> SRR2105415 5 0.7271 -0.09582 0.332 0.060 0.112 0.000 0.440 0.056
#> SRR2105416 1 0.6854 0.19912 0.436 0.024 0.136 0.000 0.360 0.044
#> SRR2105417 1 0.7169 0.46945 0.496 0.068 0.224 0.000 0.180 0.032
#> SRR2105418 1 0.7084 0.43423 0.448 0.072 0.232 0.000 0.240 0.008
#> SRR2105413 2 0.3252 0.80707 0.000 0.828 0.128 0.012 0.000 0.032
#> SRR2105414 2 0.2791 0.83393 0.000 0.864 0.096 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105409 2 0.1520 0.85861 0.008 0.948 0.016 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105410 2 0.2813 0.82784 0.012 0.880 0.024 0.000 0.068 0.016
#> SRR2105411 2 0.1078 0.85698 0.012 0.964 0.016 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105412 2 0.1294 0.85546 0.024 0.956 0.008 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105407 3 0.6221 0.32976 0.000 0.108 0.560 0.004 0.264 0.064
#> SRR2105408 3 0.6269 0.31056 0.000 0.108 0.556 0.004 0.264 0.068
#> SRR2105403 5 0.4348 0.30167 0.008 0.004 0.112 0.000 0.752 0.124
#> SRR2105404 5 0.4179 0.28767 0.008 0.004 0.104 0.000 0.768 0.116
#> SRR2105405 3 0.7740 0.23445 0.184 0.152 0.400 0.000 0.244 0.020
#> SRR2105406 1 0.7486 0.37594 0.384 0.116 0.280 0.000 0.212 0.008
#> SRR2105401 2 0.4045 0.78588 0.004 0.788 0.132 0.000 0.044 0.032
#> SRR2105402 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.5457 0.03532 0.000 0.484 0.432 0.032 0.000 0.052
#> SRR2105400 2 0.5454 0.05503 0.000 0.488 0.428 0.032 0.000 0.052
#> SRR2105397 2 0.5712 0.53180 0.000 0.616 0.260 0.012 0.064 0.048
#> SRR2105398 2 0.5692 0.54331 0.000 0.620 0.256 0.012 0.064 0.048
#> SRR2105395 2 0.0964 0.85395 0.016 0.968 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105396 2 0.1514 0.85041 0.036 0.944 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105393 2 0.1642 0.86032 0.012 0.944 0.024 0.004 0.004 0.012
#> SRR2105394 2 0.0520 0.85089 0.008 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105389 3 0.4486 0.54755 0.000 0.120 0.764 0.004 0.048 0.064
#> SRR2105390 3 0.4751 0.57558 0.004 0.132 0.748 0.004 0.060 0.052
#> SRR2105391 3 0.3954 0.56612 0.000 0.124 0.796 0.004 0.028 0.048
#> SRR2105392 3 0.3566 0.57309 0.000 0.120 0.820 0.004 0.032 0.024
#> SRR2105385 3 0.6707 0.54460 0.032 0.160 0.508 0.000 0.272 0.028
#> SRR2105386 3 0.6720 0.53928 0.052 0.156 0.512 0.000 0.264 0.016
#> SRR2105387 3 0.7394 0.40402 0.116 0.156 0.432 0.000 0.280 0.016
#> SRR2105388 3 0.6598 0.49560 0.044 0.148 0.496 0.000 0.300 0.012
#> SRR2105381 2 0.4886 0.58682 0.000 0.660 0.260 0.024 0.000 0.056
#> SRR2105382 2 0.3482 0.80125 0.000 0.816 0.128 0.016 0.000 0.040
#> SRR2105383 2 0.5421 0.37315 0.344 0.576 0.032 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105384 2 0.5945 0.32108 0.324 0.556 0.052 0.000 0.052 0.016
#> SRR2105379 2 0.2933 0.83226 0.000 0.860 0.092 0.016 0.000 0.032
#> SRR2105380 2 0.2341 0.85080 0.000 0.900 0.056 0.012 0.000 0.032
#> SRR2105377 2 0.3990 0.76320 0.040 0.800 0.012 0.000 0.120 0.028
#> SRR2105378 2 0.4491 0.72977 0.064 0.772 0.024 0.000 0.116 0.024
#> SRR2105375 2 0.8166 -0.56950 0.224 0.276 0.240 0.000 0.236 0.024
#> SRR2105376 1 0.7969 0.20179 0.316 0.148 0.192 0.000 0.316 0.028
#> SRR2105373 5 0.4843 0.26460 0.000 0.000 0.232 0.000 0.652 0.116
#> SRR2105374 5 0.4871 0.20031 0.000 0.000 0.224 0.000 0.652 0.124
#> SRR2105371 3 0.3792 0.56080 0.000 0.116 0.808 0.004 0.024 0.048
#> SRR2105372 3 0.4148 0.58633 0.000 0.116 0.780 0.000 0.072 0.032
#> SRR2105369 3 0.7088 0.43451 0.036 0.156 0.420 0.000 0.348 0.040
#> SRR2105370 5 0.7104 -0.21207 0.088 0.104 0.388 0.000 0.396 0.024
#> SRR2105367 5 0.7521 0.02256 0.300 0.088 0.116 0.000 0.440 0.056
#> SRR2105368 5 0.7597 0.03926 0.288 0.100 0.116 0.000 0.440 0.056
#> SRR2105365 2 0.1972 0.85098 0.000 0.916 0.056 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105366 2 0.1168 0.85580 0.000 0.956 0.028 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105363 2 0.1555 0.86045 0.012 0.940 0.040 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105364 2 0.1647 0.86045 0.016 0.940 0.032 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105361 2 0.1078 0.85648 0.012 0.964 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105362 2 0.0976 0.85383 0.016 0.968 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105359 3 0.6102 0.61836 0.036 0.164 0.624 0.000 0.148 0.028
#> SRR2105360 3 0.6413 0.60646 0.056 0.164 0.596 0.000 0.160 0.024
#> SRR2105355 3 0.5332 0.61110 0.020 0.148 0.688 0.000 0.124 0.020
#> SRR2105356 3 0.6871 0.55660 0.064 0.156 0.536 0.000 0.216 0.028
#> SRR2105353 3 0.3796 0.58008 0.000 0.144 0.800 0.020 0.016 0.020
#> SRR2105354 3 0.3025 0.57933 0.000 0.120 0.844 0.000 0.020 0.016
#> SRR2105351 2 0.1738 0.85337 0.000 0.928 0.052 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105352 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.2182 0.84550 0.000 0.900 0.076 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105350 2 0.1708 0.85804 0.000 0.932 0.040 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105345 2 0.3429 0.80671 0.072 0.844 0.008 0.000 0.052 0.024
#> SRR2105346 2 0.2427 0.83522 0.040 0.904 0.008 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105347 1 0.6580 0.20769 0.548 0.276 0.064 0.000 0.072 0.040
#> SRR2105348 1 0.6378 0.23609 0.592 0.232 0.060 0.000 0.076 0.040
#> SRR2105343 2 0.1121 0.85694 0.004 0.964 0.016 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105344 2 0.1340 0.86027 0.004 0.948 0.040 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105341 3 0.4748 0.59952 0.004 0.132 0.736 0.004 0.104 0.020
#> SRR2105342 3 0.5823 0.60743 0.012 0.144 0.624 0.000 0.192 0.028
#> SRR2105339 3 0.4224 0.60394 0.000 0.188 0.752 0.008 0.028 0.024
#> SRR2105340 3 0.4483 0.62056 0.008 0.164 0.748 0.000 0.056 0.024
#> SRR2105335 5 0.5970 0.43167 0.032 0.040 0.260 0.000 0.604 0.064
#> SRR2105336 5 0.6657 0.27515 0.116 0.068 0.240 0.000 0.552 0.024
#> SRR2105337 3 0.7267 0.37361 0.100 0.144 0.428 0.000 0.312 0.016
#> SRR2105338 3 0.7507 0.20505 0.132 0.132 0.392 0.000 0.324 0.020
#> SRR2105331 2 0.2563 0.84755 0.000 0.884 0.068 0.008 0.000 0.040
#> SRR2105332 2 0.1929 0.85882 0.000 0.924 0.048 0.008 0.004 0.016
#> SRR2105333 2 0.3194 0.81882 0.000 0.840 0.104 0.012 0.000 0.044
#> SRR2105334 2 0.2811 0.83668 0.000 0.868 0.084 0.012 0.000 0.036
#> SRR2105329 2 0.5977 0.40333 0.004 0.580 0.260 0.000 0.112 0.044
#> SRR2105330 2 0.5530 0.50754 0.004 0.624 0.244 0.000 0.100 0.028
#> SRR2105327 2 0.2361 0.84800 0.000 0.896 0.064 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105328 2 0.2361 0.84800 0.000 0.896 0.064 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105325 3 0.3824 0.58021 0.000 0.144 0.796 0.008 0.016 0.036
#> SRR2105326 3 0.3908 0.58192 0.000 0.144 0.792 0.008 0.020 0.036
#> SRR2105323 3 0.6804 0.40298 0.016 0.168 0.408 0.000 0.372 0.036
#> SRR2105324 3 0.6906 0.40883 0.040 0.152 0.416 0.000 0.368 0.024
#> SRR2105319 5 0.4850 0.41458 0.008 0.008 0.296 0.000 0.640 0.048
#> SRR2105320 5 0.5292 0.43959 0.032 0.016 0.276 0.000 0.636 0.040
#> SRR2105321 3 0.3100 0.57546 0.000 0.128 0.836 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105322 3 0.3100 0.57546 0.000 0.128 0.836 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105317 2 0.2925 0.82603 0.000 0.856 0.104 0.016 0.000 0.024
#> SRR2105318 2 0.1586 0.85817 0.004 0.940 0.040 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105315 3 0.6435 0.38943 0.004 0.400 0.420 0.000 0.136 0.040
#> SRR2105316 2 0.3544 0.81572 0.004 0.828 0.112 0.008 0.012 0.036
#> SRR2105313 2 0.0935 0.85760 0.000 0.964 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105314 2 0.1816 0.85719 0.004 0.928 0.048 0.004 0.000 0.016
#> SRR2105311 3 0.5423 0.49679 0.000 0.268 0.624 0.036 0.004 0.068
#> SRR2105312 3 0.5423 0.49679 0.000 0.268 0.624 0.036 0.004 0.068
#> SRR2105307 1 0.7186 0.45110 0.456 0.096 0.228 0.000 0.212 0.008
#> SRR2105308 1 0.7245 0.46254 0.468 0.108 0.224 0.000 0.188 0.012
#> SRR2105309 3 0.6277 0.59509 0.012 0.172 0.552 0.000 0.236 0.028
#> SRR2105310 3 0.6117 0.54436 0.012 0.144 0.572 0.000 0.244 0.028
#> SRR2105305 3 0.5452 0.61893 0.000 0.164 0.652 0.004 0.156 0.024
#> SRR2105306 3 0.5717 0.60972 0.028 0.148 0.640 0.000 0.172 0.012
#> SRR2105303 2 0.1078 0.85625 0.012 0.964 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105304 4 0.0000 0.99697 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3979 0.76481 0.000 0.772 0.160 0.016 0.000 0.052
#> SRR2105302 2 0.2011 0.85244 0.000 0.912 0.064 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105299 2 0.6400 0.21169 0.000 0.508 0.272 0.000 0.172 0.048
#> SRR2105300 2 0.6469 0.18936 0.000 0.496 0.272 0.000 0.184 0.048
#> SRR2105297 1 0.1542 0.05583 0.936 0.008 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105298 1 0.1542 0.05583 0.936 0.008 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105295 2 0.3374 0.80513 0.000 0.824 0.120 0.012 0.000 0.044
#> SRR2105296 2 0.2933 0.82782 0.000 0.856 0.096 0.008 0.000 0.040
#> SRR2105293 3 0.4705 0.58288 0.004 0.232 0.696 0.000 0.032 0.036
#> SRR2105294 3 0.4849 0.61027 0.020 0.176 0.724 0.000 0.056 0.024
#> SRR2105291 3 0.7576 0.37815 0.084 0.328 0.356 0.000 0.208 0.024
#> SRR2105292 5 0.7614 0.04716 0.192 0.100 0.296 0.000 0.388 0.024
#> SRR2105289 3 0.7394 0.53542 0.116 0.196 0.492 0.000 0.164 0.032
#> SRR2105290 3 0.7745 0.20097 0.192 0.132 0.372 0.000 0.284 0.020
#> SRR2105287 5 0.7967 -0.20771 0.284 0.096 0.268 0.000 0.312 0.040
#> SRR2105288 1 0.7499 0.26375 0.352 0.092 0.236 0.000 0.308 0.012
#> SRR2105285 2 0.3416 0.80812 0.004 0.824 0.120 0.008 0.000 0.044
#> SRR2105286 2 0.3510 0.82245 0.004 0.832 0.096 0.012 0.004 0.052
#> SRR2105283 2 0.5658 0.61005 0.024 0.660 0.132 0.000 0.160 0.024
#> SRR2105284 2 0.4989 0.70717 0.008 0.716 0.152 0.000 0.092 0.032
#> SRR2105281 2 0.0798 0.85358 0.012 0.976 0.004 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105282 2 0.1452 0.85305 0.032 0.948 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105259 3 0.6189 0.32713 0.000 0.108 0.560 0.004 0.268 0.060
#> SRR2105260 3 0.6357 0.37036 0.000 0.132 0.552 0.004 0.248 0.064
#> SRR2105279 2 0.0972 0.85059 0.028 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105280 2 0.0508 0.85042 0.012 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105257 5 0.6652 0.25228 0.160 0.044 0.232 0.000 0.540 0.024
#> SRR2105258 5 0.6476 0.25663 0.204 0.028 0.172 0.000 0.564 0.032
#> SRR2105253 2 0.2532 0.85046 0.000 0.884 0.080 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105254 2 0.1723 0.86036 0.004 0.932 0.048 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105255 5 0.6308 0.11095 0.028 0.088 0.332 0.000 0.520 0.032
#> SRR2105256 5 0.7209 -0.25840 0.072 0.132 0.376 0.000 0.392 0.028
#> SRR2105251 2 0.1340 0.85437 0.000 0.948 0.040 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105252 2 0.1410 0.85365 0.000 0.944 0.044 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105249 2 0.5168 0.71404 0.040 0.724 0.092 0.000 0.120 0.024
#> SRR2105250 2 0.3851 0.78556 0.060 0.820 0.020 0.000 0.080 0.020
#> SRR2105247 2 0.0964 0.85918 0.012 0.968 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105248 2 0.0622 0.84980 0.012 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105245 3 0.5737 0.43153 0.024 0.396 0.512 0.000 0.028 0.040
#> SRR2105246 3 0.6078 0.47919 0.028 0.344 0.544 0.012 0.028 0.044
#> SRR2105243 3 0.7232 0.33437 0.084 0.140 0.400 0.000 0.356 0.020
#> SRR2105244 3 0.7205 0.37445 0.076 0.144 0.436 0.000 0.320 0.024
#> SRR2105241 3 0.7636 0.26624 0.176 0.140 0.396 0.000 0.272 0.016
#> SRR2105242 5 0.7659 -0.20191 0.292 0.108 0.284 0.000 0.304 0.012
#> SRR2105239 3 0.7899 0.20628 0.108 0.160 0.428 0.000 0.240 0.064
#> SRR2105240 5 0.7570 -0.18384 0.332 0.088 0.216 0.000 0.344 0.020
#> SRR2105237 2 0.5134 0.63523 0.000 0.672 0.224 0.004 0.036 0.064
#> SRR2105238 2 0.4682 0.75538 0.004 0.748 0.128 0.000 0.068 0.052
#> SRR2105235 2 0.2839 0.83772 0.024 0.884 0.036 0.000 0.044 0.012
#> SRR2105236 2 0.3176 0.80807 0.052 0.860 0.008 0.000 0.060 0.020
#> SRR2105233 2 0.4057 0.74043 0.000 0.756 0.180 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105234 2 0.4057 0.74043 0.000 0.756 0.180 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105231 2 0.0984 0.85626 0.012 0.968 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105232 2 0.0891 0.85868 0.000 0.968 0.024 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105227 3 0.7120 0.38739 0.088 0.364 0.428 0.000 0.080 0.040
#> SRR2105228 3 0.7839 0.36710 0.152 0.224 0.404 0.000 0.192 0.028
#> SRR2105225 3 0.6652 0.44936 0.040 0.116 0.528 0.000 0.280 0.036
#> SRR2105226 3 0.7531 -0.03147 0.156 0.088 0.368 0.000 0.356 0.032
#> SRR2105229 3 0.4798 0.60414 0.004 0.196 0.712 0.004 0.064 0.020
#> SRR2105230 3 0.5585 0.58005 0.008 0.132 0.632 0.000 0.208 0.020
#> SRR2105219 2 0.1440 0.86180 0.004 0.948 0.032 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105220 2 0.2465 0.85398 0.004 0.892 0.072 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105221 2 0.5360 0.62615 0.064 0.688 0.020 0.000 0.184 0.044
#> SRR2105222 2 0.5429 0.64048 0.072 0.692 0.028 0.000 0.168 0.040
#> SRR2105223 3 0.6838 0.43746 0.040 0.156 0.440 0.000 0.344 0.020
#> SRR2105224 3 0.7215 0.24013 0.088 0.112 0.408 0.000 0.364 0.028
#> SRR2105217 2 0.1053 0.85650 0.004 0.964 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105218 2 0.1059 0.85507 0.016 0.964 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105215 2 0.0653 0.85071 0.012 0.980 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105216 2 0.1078 0.85517 0.016 0.964 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105213 3 0.5963 0.43237 0.020 0.388 0.512 0.012 0.024 0.044
#> SRR2105214 3 0.5669 0.46897 0.024 0.360 0.548 0.000 0.028 0.040
#> SRR2105211 3 0.5729 0.63061 0.012 0.188 0.636 0.000 0.136 0.028
#> SRR2105212 3 0.5963 0.56190 0.004 0.248 0.568 0.000 0.156 0.024
#> SRR2105209 5 0.6901 0.11182 0.136 0.068 0.348 0.000 0.436 0.012
#> SRR2105210 5 0.7678 -0.07943 0.212 0.096 0.328 0.000 0.340 0.024
#> SRR2105207 5 0.7813 0.00815 0.188 0.104 0.308 0.000 0.364 0.036
#> SRR2105208 1 0.6961 0.34828 0.436 0.040 0.216 0.000 0.292 0.016
#> SRR2105205 2 0.3167 0.83935 0.004 0.856 0.088 0.004 0.016 0.032
#> SRR2105206 2 0.3123 0.82769 0.000 0.848 0.100 0.004 0.008 0.040
#> SRR2105201 2 0.5269 0.66333 0.072 0.708 0.032 0.000 0.156 0.032
#> SRR2105202 2 0.5299 0.65847 0.072 0.704 0.028 0.000 0.160 0.036
#> SRR2105203 2 0.0951 0.85490 0.000 0.968 0.020 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105204 2 0.1396 0.85683 0.008 0.952 0.024 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105199 2 0.1026 0.85593 0.012 0.968 0.008 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105200 2 0.1434 0.84863 0.028 0.948 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105197 5 0.4764 0.22690 0.000 0.000 0.272 0.000 0.640 0.088
#> SRR2105198 5 0.4783 0.23382 0.000 0.000 0.276 0.000 0.636 0.088
#> SRR2105195 3 0.7054 0.56781 0.068 0.228 0.492 0.000 0.192 0.020
#> SRR2105196 2 0.7975 -0.57603 0.164 0.312 0.308 0.000 0.192 0.024
#> SRR2105193 3 0.7666 -0.27710 0.336 0.112 0.340 0.000 0.192 0.020
#> SRR2105194 1 0.7387 0.35975 0.392 0.068 0.296 0.000 0.224 0.020
#> SRR2105191 6 0.3470 0.00000 0.012 0.000 0.020 0.000 0.176 0.792
#> SRR2105192 5 0.4445 0.29602 0.152 0.000 0.032 0.000 0.748 0.068
#> SRR2105189 2 0.3544 0.80108 0.008 0.816 0.132 0.000 0.012 0.032
#> SRR2105190 2 0.2457 0.84406 0.000 0.880 0.084 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105187 2 0.5111 0.72345 0.000 0.720 0.140 0.012 0.072 0.056
#> SRR2105188 2 0.4544 0.75620 0.004 0.756 0.132 0.000 0.064 0.044
#> SRR2105179 5 0.7554 -0.29659 0.116 0.172 0.344 0.000 0.352 0.016
#> SRR2105180 5 0.7577 0.11105 0.204 0.120 0.184 0.000 0.460 0.032
#> SRR2105183 2 0.1367 0.84910 0.044 0.944 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105184 2 0.1628 0.85030 0.036 0.940 0.004 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105185 2 0.1895 0.85349 0.000 0.912 0.072 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105186 2 0.1391 0.85805 0.000 0.944 0.040 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105181 5 0.6097 0.31772 0.008 0.092 0.284 0.000 0.564 0.052
#> SRR2105182 3 0.6323 0.26104 0.012 0.100 0.504 0.000 0.340 0.044
#> SRR2105177 1 0.3672 0.37992 0.832 0.032 0.048 0.000 0.076 0.012
#> SRR2105178 1 0.4458 0.42446 0.772 0.028 0.068 0.000 0.116 0.016
#> SRR2105171 2 0.1785 0.86057 0.016 0.936 0.028 0.000 0.012 0.008
#> SRR2105172 2 0.1425 0.85933 0.008 0.952 0.020 0.000 0.012 0.008
#> SRR2105175 1 0.7164 0.45450 0.524 0.116 0.200 0.000 0.128 0.032
#> SRR2105176 1 0.7007 0.44118 0.468 0.072 0.220 0.000 0.232 0.008
#> SRR2105173 2 0.2145 0.85644 0.008 0.912 0.056 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105174 2 0.1585 0.85884 0.012 0.940 0.036 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105169 2 0.0748 0.85473 0.016 0.976 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105170 2 0.1440 0.85424 0.032 0.948 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105167 2 0.0806 0.85174 0.020 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105168 2 0.1074 0.85040 0.028 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105165 3 0.5482 0.61296 0.012 0.136 0.664 0.000 0.164 0.024
#> SRR2105166 3 0.5644 0.60791 0.012 0.140 0.636 0.000 0.192 0.020
#> SRR2105163 3 0.3527 0.58609 0.000 0.156 0.804 0.008 0.008 0.024
#> SRR2105164 3 0.3686 0.59020 0.000 0.172 0.788 0.008 0.012 0.020
#> SRR2105161 3 0.7544 -0.10015 0.244 0.100 0.396 0.000 0.244 0.016
#> SRR2105162 1 0.7174 0.40538 0.444 0.064 0.228 0.000 0.248 0.016
#> SRR2105155 2 0.1242 0.85519 0.012 0.960 0.008 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105156 2 0.1785 0.84469 0.028 0.936 0.008 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105157 2 0.0405 0.85335 0.004 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105158 2 0.0717 0.85228 0.016 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105159 3 0.6213 0.57484 0.056 0.168 0.628 0.000 0.116 0.032
#> SRR2105160 3 0.7515 -0.34410 0.296 0.076 0.364 0.000 0.244 0.020
#> SRR2105153 2 0.1485 0.85615 0.000 0.944 0.028 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105154 2 0.1549 0.85480 0.000 0.936 0.044 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105151 2 0.1816 0.84555 0.048 0.928 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105152 2 0.0972 0.85049 0.028 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105149 3 0.5783 0.54466 0.000 0.268 0.584 0.000 0.108 0.040
#> SRR2105150 3 0.5783 0.54466 0.000 0.268 0.584 0.000 0.108 0.040
#> SRR2105147 4 0.0146 0.99090 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105148 4 0.0146 0.99090 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105143 1 0.7925 0.13763 0.332 0.224 0.272 0.000 0.152 0.020
#> SRR2105144 1 0.6989 0.47435 0.496 0.096 0.224 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105145 1 0.7645 0.34032 0.364 0.120 0.304 0.000 0.196 0.016
#> SRR2105146 1 0.7657 0.30010 0.348 0.120 0.320 0.000 0.196 0.016
#> SRR2105141 2 0.2189 0.84905 0.000 0.904 0.060 0.004 0.000 0.032
#> SRR2105142 2 0.1867 0.84959 0.000 0.916 0.064 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105139 2 0.0767 0.85281 0.012 0.976 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105140 2 0.0993 0.84972 0.024 0.964 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105137 2 0.5720 0.60312 0.080 0.668 0.044 0.000 0.176 0.032
#> SRR2105138 2 0.5729 0.53952 0.072 0.636 0.028 0.000 0.232 0.032
#> SRR2105135 2 0.1363 0.85222 0.028 0.952 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105136 2 0.0972 0.85009 0.028 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105133 5 0.4243 0.29223 0.000 0.004 0.148 0.000 0.744 0.104
#> SRR2105134 5 0.4338 0.30801 0.004 0.004 0.148 0.000 0.744 0.100
#> SRR2105131 3 0.7290 0.21059 0.012 0.268 0.376 0.000 0.280 0.064
#> SRR2105132 5 0.6968 0.29709 0.104 0.144 0.104 0.000 0.580 0.068
#> SRR2105129 1 0.5671 0.46636 0.680 0.060 0.104 0.000 0.136 0.020
#> SRR2105130 1 0.4656 0.43298 0.756 0.028 0.080 0.000 0.120 0.016
#> SRR2105127 5 0.7130 0.20555 0.208 0.028 0.156 0.000 0.516 0.092
#> SRR2105128 5 0.7194 0.23916 0.184 0.100 0.132 0.000 0.536 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.843 0.899 0.952 0.4961 0.499 0.499
#> 3 3 0.586 0.663 0.815 0.2952 0.789 0.601
#> 4 4 0.558 0.639 0.786 0.1251 0.836 0.589
#> 5 5 0.615 0.632 0.765 0.0596 0.901 0.684
#> 6 6 0.625 0.443 0.661 0.0406 0.916 0.709
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.8207 0.6588 0.744 0.256
#> SRR2105276 1 0.6247 0.8075 0.844 0.156
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105270 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105267 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105268 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105265 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105266 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105263 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105264 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105261 2 0.7528 0.7309 0.216 0.784
#> SRR2105262 2 0.9635 0.3838 0.388 0.612
#> SRR2105357 1 0.0376 0.9504 0.996 0.004
#> SRR2105358 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.9044 0.5573 0.320 0.680
#> SRR2105440 2 0.9732 0.3486 0.404 0.596
#> SRR2105509 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105510 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105507 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105505 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105504 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105502 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.1414 0.9515 0.020 0.980
#> SRR2105498 2 0.2043 0.9439 0.032 0.968
#> SRR2105495 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105496 2 0.1633 0.9494 0.024 0.976
#> SRR2105493 2 0.2043 0.9441 0.032 0.968
#> SRR2105494 2 0.4815 0.8794 0.104 0.896
#> SRR2105491 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105492 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105489 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105490 2 0.2043 0.9437 0.032 0.968
#> SRR2105487 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.6801 0.7757 0.820 0.180
#> SRR2105480 1 0.3114 0.9133 0.944 0.056
#> SRR2105477 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105478 2 0.1633 0.9491 0.024 0.976
#> SRR2105475 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105476 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105473 1 0.9491 0.4079 0.632 0.368
#> SRR2105474 2 0.9209 0.5229 0.336 0.664
#> SRR2105471 2 0.1184 0.9537 0.016 0.984
#> SRR2105472 2 0.1414 0.9514 0.020 0.980
#> SRR2105469 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105470 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105462 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105459 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105460 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105457 1 0.1184 0.9439 0.984 0.016
#> SRR2105458 1 0.2043 0.9331 0.968 0.032
#> SRR2105455 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.4022 0.9039 0.080 0.920
#> SRR2105452 2 0.0672 0.9461 0.008 0.992
#> SRR2105449 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105448 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105445 1 0.5178 0.8532 0.884 0.116
#> SRR2105446 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105443 2 0.2236 0.9406 0.036 0.964
#> SRR2105444 2 0.3274 0.9219 0.060 0.940
#> SRR2105441 2 0.1843 0.9463 0.028 0.972
#> SRR2105442 2 0.2236 0.9409 0.036 0.964
#> SRR2105437 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0376 0.9504 0.996 0.004
#> SRR2105436 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105430 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105427 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105428 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105425 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105426 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105421 2 0.9087 0.5361 0.324 0.676
#> SRR2105422 2 0.9922 0.1999 0.448 0.552
#> SRR2105423 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105424 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105419 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105420 1 0.1633 0.9391 0.976 0.024
#> SRR2105415 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0672 0.9529 0.008 0.992
#> SRR2105414 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105409 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105410 2 0.2423 0.9380 0.040 0.960
#> SRR2105411 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105412 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105407 1 0.1414 0.9414 0.980 0.020
#> SRR2105408 1 0.1184 0.9440 0.984 0.016
#> SRR2105403 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105402 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR2105399 2 0.2043 0.9397 0.032 0.968
#> SRR2105400 2 0.1633 0.9486 0.024 0.976
#> SRR2105397 2 0.2423 0.9370 0.040 0.960
#> SRR2105398 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105395 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105396 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105393 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105394 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105389 1 0.1843 0.9359 0.972 0.028
#> SRR2105390 1 0.0672 0.9485 0.992 0.008
#> SRR2105391 1 0.1843 0.9358 0.972 0.028
#> SRR2105392 1 0.0672 0.9485 0.992 0.008
#> SRR2105385 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105382 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105383 2 0.6531 0.8104 0.168 0.832
#> SRR2105384 2 0.5178 0.8701 0.116 0.884
#> SRR2105379 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105380 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105377 2 0.2778 0.9326 0.048 0.952
#> SRR2105378 2 0.8608 0.6239 0.284 0.716
#> SRR2105375 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105376 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0938 0.9463 0.988 0.012
#> SRR2105372 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105369 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105366 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105363 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105364 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105361 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105362 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105359 1 0.2043 0.9330 0.968 0.032
#> SRR2105360 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105356 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.8813 0.5759 0.700 0.300
#> SRR2105354 1 0.0672 0.9484 0.992 0.008
#> SRR2105351 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105352 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR2105349 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105350 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105345 2 0.3584 0.9157 0.068 0.932
#> SRR2105346 2 0.2043 0.9440 0.032 0.968
#> SRR2105347 1 0.9358 0.4454 0.648 0.352
#> SRR2105348 1 0.8081 0.6555 0.752 0.248
#> SRR2105343 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105344 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105341 1 0.1184 0.9436 0.984 0.016
#> SRR2105342 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105339 1 0.7056 0.7585 0.808 0.192
#> SRR2105340 1 0.3584 0.9027 0.932 0.068
#> SRR2105335 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105332 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105333 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105334 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105329 2 0.8207 0.6737 0.256 0.744
#> SRR2105330 2 0.6148 0.8269 0.152 0.848
#> SRR2105327 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105328 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105325 1 0.3584 0.9036 0.932 0.068
#> SRR2105326 1 0.4022 0.8919 0.920 0.080
#> SRR2105323 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.3879 0.8958 0.924 0.076
#> SRR2105322 1 0.4022 0.8922 0.920 0.080
#> SRR2105317 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105318 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105315 2 0.7815 0.7129 0.232 0.768
#> SRR2105316 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105313 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105314 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105311 2 0.8443 0.6389 0.272 0.728
#> SRR2105312 2 0.8267 0.6594 0.260 0.740
#> SRR2105307 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105310 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.2423 0.9271 0.960 0.040
#> SRR2105306 1 0.0376 0.9505 0.996 0.004
#> SRR2105303 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105304 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105302 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105299 1 0.9552 0.3998 0.624 0.376
#> SRR2105300 1 0.9963 0.1235 0.536 0.464
#> SRR2105297 1 0.9170 0.4926 0.668 0.332
#> SRR2105298 1 0.8763 0.5677 0.704 0.296
#> SRR2105295 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105296 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105293 1 0.9460 0.4341 0.636 0.364
#> SRR2105294 1 0.1633 0.9384 0.976 0.024
#> SRR2105291 1 0.2043 0.9310 0.968 0.032
#> SRR2105292 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.3733 0.8996 0.928 0.072
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105286 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105283 2 0.3114 0.9261 0.056 0.944
#> SRR2105284 2 0.3879 0.9068 0.076 0.924
#> SRR2105281 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105282 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105259 1 0.1414 0.9412 0.980 0.020
#> SRR2105260 1 0.1843 0.9361 0.972 0.028
#> SRR2105279 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105280 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105254 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105255 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105252 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105249 2 0.5294 0.8658 0.120 0.880
#> SRR2105250 2 0.9988 0.1073 0.480 0.520
#> SRR2105247 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105248 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105245 2 0.8909 0.5719 0.308 0.692
#> SRR2105246 2 0.7376 0.7438 0.208 0.792
#> SRR2105243 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105238 2 0.1184 0.9537 0.016 0.984
#> SRR2105235 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105236 2 0.2423 0.9380 0.040 0.960
#> SRR2105233 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105234 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105231 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105232 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105227 1 0.5629 0.8365 0.868 0.132
#> SRR2105228 1 0.0672 0.9483 0.992 0.008
#> SRR2105225 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.8713 0.5923 0.708 0.292
#> SRR2105230 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105220 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105221 1 0.9996 0.0197 0.512 0.488
#> SRR2105222 2 0.9881 0.2547 0.436 0.564
#> SRR2105223 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105218 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105215 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105216 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105213 2 0.8608 0.6161 0.284 0.716
#> SRR2105214 2 0.8909 0.5690 0.308 0.692
#> SRR2105211 1 0.4431 0.8797 0.908 0.092
#> SRR2105212 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105206 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105201 2 0.6973 0.7818 0.188 0.812
#> SRR2105202 1 0.9993 0.0292 0.516 0.484
#> SRR2105203 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105204 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105199 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105200 2 0.2948 0.9287 0.052 0.948
#> SRR2105197 1 0.0672 0.9484 0.992 0.008
#> SRR2105198 1 0.0938 0.9462 0.988 0.012
#> SRR2105195 1 0.2423 0.9271 0.960 0.040
#> SRR2105196 1 0.0672 0.9484 0.992 0.008
#> SRR2105193 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105190 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105187 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105188 2 0.6343 0.8147 0.160 0.840
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.1633 0.9492 0.024 0.976
#> SRR2105184 2 0.1414 0.9514 0.020 0.980
#> SRR2105185 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105186 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105181 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105172 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105175 1 0.1184 0.9432 0.984 0.016
#> SRR2105176 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105174 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105169 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105170 2 0.1633 0.9489 0.024 0.976
#> SRR2105167 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105168 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105165 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.9909 0.2027 0.556 0.444
#> SRR2105164 1 0.9996 0.0378 0.512 0.488
#> SRR2105161 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105156 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105157 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105158 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105159 1 0.1843 0.9360 0.972 0.028
#> SRR2105160 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105154 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105151 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105152 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105149 2 0.9933 0.1885 0.452 0.548
#> SRR2105150 1 0.2778 0.9207 0.952 0.048
#> SRR2105147 2 0.2423 0.9252 0.040 0.960
#> SRR2105148 2 0.2423 0.9252 0.040 0.960
#> SRR2105143 1 0.4298 0.8813 0.912 0.088
#> SRR2105144 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105142 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105139 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105140 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105137 1 0.8909 0.5474 0.692 0.308
#> SRR2105138 1 0.9460 0.4201 0.636 0.364
#> SRR2105135 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105136 2 0.0938 0.9560 0.012 0.988
#> SRR2105133 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.7602 0.7157 0.780 0.220
#> SRR2105132 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105129 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
#> SRR2105128 1 0.0000 0.9523 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.5291 0.6329 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105278 1 0.2448 0.7513 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105275 3 0.2804 0.6413 0.060 0.016 0.924
#> SRR2105276 3 0.2749 0.6405 0.064 0.012 0.924
#> SRR2105273 1 0.6260 0.3847 0.552 0.000 0.448
#> SRR2105274 1 0.6140 0.4850 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105271 1 0.5733 0.6100 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105272 1 0.4062 0.7358 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105269 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105270 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105267 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0424 0.9013 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105264 2 0.0237 0.9016 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105261 3 0.4609 0.6178 0.028 0.128 0.844
#> SRR2105262 3 0.3148 0.6408 0.036 0.048 0.916
#> SRR2105357 3 0.6095 0.2011 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105358 1 0.6274 0.2943 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105439 2 0.6381 0.5230 0.340 0.648 0.012
#> SRR2105440 2 0.6566 0.4652 0.376 0.612 0.012
#> SRR2105509 2 0.6307 0.1169 0.000 0.512 0.488
#> SRR2105510 2 0.6045 0.4298 0.000 0.620 0.380
#> SRR2105507 3 0.5948 0.2762 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105508 3 0.5948 0.2820 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105505 1 0.0592 0.7578 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105506 1 0.0592 0.7578 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105503 2 0.0424 0.9013 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105504 3 0.6095 0.2047 0.000 0.392 0.608
#> SRR2105501 2 0.0747 0.8997 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105502 3 0.6154 0.1597 0.000 0.408 0.592
#> SRR2105499 1 0.6180 0.4631 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105500 1 0.5327 0.6649 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105497 2 0.0747 0.8995 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105498 2 0.1529 0.8868 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105495 2 0.0829 0.9002 0.004 0.984 0.012
#> SRR2105496 2 0.2050 0.8870 0.028 0.952 0.020
#> SRR2105493 2 0.1636 0.8901 0.016 0.964 0.020
#> SRR2105494 2 0.4289 0.8125 0.092 0.868 0.040
#> SRR2105491 2 0.2537 0.8663 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105492 2 0.2625 0.8635 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105489 2 0.0892 0.8974 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105490 2 0.1964 0.8763 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105487 1 0.1643 0.7523 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105488 1 0.1411 0.7544 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105485 1 0.6062 0.5298 0.616 0.000 0.384
#> SRR2105486 1 0.5968 0.5576 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105483 1 0.0475 0.7527 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105484 1 0.0475 0.7527 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105481 1 0.6095 0.5098 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105482 1 0.1163 0.7610 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105479 3 0.5111 0.5964 0.168 0.024 0.808
#> SRR2105480 3 0.6451 0.2068 0.384 0.008 0.608
#> SRR2105477 2 0.0892 0.9001 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105478 2 0.1636 0.8921 0.020 0.964 0.016
#> SRR2105475 3 0.6286 0.0432 0.000 0.464 0.536
#> SRR2105476 2 0.6252 0.2576 0.000 0.556 0.444
#> SRR2105473 1 0.6799 -0.0352 0.532 0.456 0.012
#> SRR2105474 2 0.6600 0.4481 0.384 0.604 0.012
#> SRR2105471 2 0.0747 0.8990 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105472 2 0.1643 0.8843 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105469 3 0.6126 0.1532 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105470 1 0.6204 0.4442 0.576 0.000 0.424
#> SRR2105467 1 0.1964 0.7587 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105468 1 0.1031 0.7568 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105465 1 0.2625 0.7560 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105466 1 0.0892 0.7584 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105463 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105464 1 0.0000 0.7531 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0424 0.9012 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105459 2 0.1753 0.8863 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105460 2 0.2165 0.8765 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105457 3 0.5656 0.4491 0.284 0.004 0.712
#> SRR2105458 3 0.4682 0.5683 0.192 0.004 0.804
#> SRR2105455 1 0.5706 0.6148 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105456 1 0.5560 0.6360 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105453 1 0.0892 0.7527 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105454 1 0.0747 0.7509 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105451 2 0.2947 0.8651 0.020 0.920 0.060
#> SRR2105452 3 0.6008 0.2548 0.000 0.372 0.628
#> SRR2105449 1 0.6386 0.4648 0.584 0.004 0.412
#> SRR2105450 1 0.5678 0.6193 0.684 0.000 0.316
#> SRR2105447 2 0.4750 0.7236 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105448 2 0.2356 0.8721 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105445 3 0.7388 0.5168 0.208 0.100 0.692
#> SRR2105446 1 0.6079 0.4690 0.612 0.000 0.388
#> SRR2105443 3 0.6386 0.2022 0.004 0.412 0.584
#> SRR2105444 2 0.4063 0.8200 0.020 0.868 0.112
#> SRR2105441 2 0.2682 0.8595 0.076 0.920 0.004
#> SRR2105442 2 0.2860 0.8528 0.084 0.912 0.004
#> SRR2105437 1 0.5905 0.4178 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105438 1 0.5948 0.4073 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105435 1 0.5968 0.5661 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105436 1 0.6045 0.5308 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105433 1 0.1031 0.7592 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105434 1 0.0747 0.7577 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105431 1 0.0424 0.7566 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105432 1 0.0592 0.7578 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105429 3 0.6286 0.0427 0.000 0.464 0.536
#> SRR2105430 3 0.6307 -0.0457 0.000 0.488 0.512
#> SRR2105427 2 0.0747 0.8992 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105428 2 0.0424 0.9016 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105425 2 0.1529 0.8899 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105426 2 0.0424 0.9013 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105421 3 0.3499 0.6357 0.028 0.072 0.900
#> SRR2105422 3 0.3009 0.6397 0.028 0.052 0.920
#> SRR2105423 2 0.0237 0.9017 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105424 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105419 3 0.5497 0.4265 0.292 0.000 0.708
#> SRR2105420 3 0.5859 0.3228 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105415 1 0.0424 0.7500 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105416 1 0.0000 0.7531 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.1163 0.7594 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105418 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105413 2 0.5948 0.4753 0.000 0.640 0.360
#> SRR2105414 2 0.5810 0.5256 0.000 0.664 0.336
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.3532 0.8275 0.108 0.884 0.008
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0424 0.9012 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105407 3 0.3851 0.6103 0.136 0.004 0.860
#> SRR2105408 3 0.3752 0.6068 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105403 1 0.5138 0.6707 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105404 1 0.2959 0.7452 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105405 1 0.5216 0.6735 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105406 1 0.3941 0.7350 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105401 2 0.3752 0.8086 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105402 3 0.6079 0.2155 0.000 0.388 0.612
#> SRR2105399 3 0.6180 0.1845 0.000 0.416 0.584
#> SRR2105400 3 0.6215 0.1503 0.000 0.428 0.572
#> SRR2105397 3 0.6008 0.3855 0.004 0.332 0.664
#> SRR2105398 3 0.5760 0.3928 0.000 0.328 0.672
#> SRR2105395 2 0.0237 0.9017 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105396 2 0.0747 0.8990 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105393 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.3112 0.6292 0.096 0.004 0.900
#> SRR2105390 3 0.3941 0.5951 0.156 0.000 0.844
#> SRR2105391 3 0.3193 0.6291 0.100 0.004 0.896
#> SRR2105392 3 0.4002 0.5941 0.160 0.000 0.840
#> SRR2105385 1 0.6126 0.4967 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105386 1 0.6225 0.4216 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105387 1 0.5397 0.6570 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105388 1 0.4452 0.7225 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105381 3 0.6280 0.0576 0.000 0.460 0.540
#> SRR2105382 2 0.6192 0.3266 0.000 0.580 0.420
#> SRR2105383 2 0.5291 0.6309 0.268 0.732 0.000
#> SRR2105384 2 0.4504 0.7316 0.196 0.804 0.000
#> SRR2105379 2 0.5216 0.6611 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105380 2 0.2878 0.8545 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105377 2 0.3607 0.8244 0.112 0.880 0.008
#> SRR2105378 2 0.6047 0.5695 0.312 0.680 0.008
#> SRR2105375 1 0.3918 0.7438 0.856 0.004 0.140
#> SRR2105376 1 0.0424 0.7566 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105373 3 0.6309 -0.1623 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105374 1 0.6045 0.3834 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105371 3 0.4121 0.5910 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105372 3 0.4931 0.5246 0.232 0.000 0.768
#> SRR2105369 1 0.5948 0.5618 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105370 1 0.5016 0.6907 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105367 1 0.0424 0.7568 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105368 1 0.0592 0.7483 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105365 2 0.3038 0.8472 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105366 2 0.0592 0.9003 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105363 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105364 2 0.0424 0.9011 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.5517 0.4752 0.268 0.004 0.728
#> SRR2105360 1 0.6286 0.3404 0.536 0.000 0.464
#> SRR2105355 3 0.5254 0.4803 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105356 1 0.6008 0.5419 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105353 3 0.2636 0.6408 0.048 0.020 0.932
#> SRR2105354 3 0.4346 0.5792 0.184 0.000 0.816
#> SRR2105351 2 0.2796 0.8576 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105352 3 0.6079 0.2155 0.000 0.388 0.612
#> SRR2105349 2 0.2878 0.8536 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105350 2 0.0592 0.9002 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105345 2 0.3983 0.7936 0.144 0.852 0.004
#> SRR2105346 2 0.1525 0.8897 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105347 1 0.5810 0.3188 0.664 0.336 0.000
#> SRR2105348 1 0.4842 0.4786 0.776 0.224 0.000
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.4842 0.5369 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105342 3 0.5835 0.3331 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105339 3 0.2749 0.6405 0.064 0.012 0.924
#> SRR2105340 3 0.3207 0.6370 0.084 0.012 0.904
#> SRR2105335 1 0.4452 0.7252 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105336 1 0.1411 0.7589 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105337 1 0.5785 0.5998 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105338 1 0.4002 0.7393 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105331 2 0.2356 0.8721 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105332 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105333 2 0.4702 0.7314 0.000 0.788 0.212
#> SRR2105334 2 0.3038 0.8475 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105329 3 0.6437 0.5755 0.048 0.220 0.732
#> SRR2105330 3 0.7056 0.3170 0.024 0.404 0.572
#> SRR2105327 2 0.5591 0.5881 0.000 0.696 0.304
#> SRR2105328 2 0.5465 0.6159 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105325 3 0.2584 0.6393 0.064 0.008 0.928
#> SRR2105326 3 0.2584 0.6393 0.064 0.008 0.928
#> SRR2105323 1 0.6260 0.4137 0.552 0.000 0.448
#> SRR2105324 1 0.5926 0.5689 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105319 1 0.5835 0.5658 0.660 0.000 0.340
#> SRR2105320 1 0.4399 0.7138 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105321 3 0.2749 0.6405 0.064 0.012 0.924
#> SRR2105322 3 0.2584 0.6396 0.064 0.008 0.928
#> SRR2105317 2 0.4178 0.7795 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105318 2 0.1031 0.8965 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105315 3 0.4677 0.6199 0.028 0.132 0.840
#> SRR2105316 2 0.3551 0.8195 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105313 2 0.1031 0.8964 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105314 2 0.0424 0.9011 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105311 3 0.2845 0.6302 0.012 0.068 0.920
#> SRR2105312 3 0.3690 0.6246 0.016 0.100 0.884
#> SRR2105307 1 0.2165 0.7594 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105308 1 0.1860 0.7593 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105309 3 0.5733 0.3689 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105310 3 0.6079 0.1855 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105305 3 0.4465 0.5887 0.176 0.004 0.820
#> SRR2105306 3 0.5650 0.3968 0.312 0.000 0.688
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.6252 0.0433 0.000 0.444 0.556
#> SRR2105301 2 0.6267 0.2357 0.000 0.548 0.452
#> SRR2105302 2 0.2261 0.8743 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105299 3 0.3832 0.6386 0.076 0.036 0.888
#> SRR2105300 3 0.5263 0.6262 0.084 0.088 0.828
#> SRR2105297 1 0.5785 0.3259 0.668 0.332 0.000
#> SRR2105298 1 0.5138 0.4390 0.748 0.252 0.000
#> SRR2105295 2 0.5178 0.6681 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105296 2 0.3816 0.8071 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105293 3 0.3045 0.6420 0.064 0.020 0.916
#> SRR2105294 3 0.5098 0.4967 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105291 1 0.7453 0.5861 0.644 0.064 0.292
#> SRR2105292 1 0.0892 0.7579 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105289 3 0.6282 0.1933 0.384 0.004 0.612
#> SRR2105290 1 0.5397 0.6563 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105287 1 0.0424 0.7566 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105288 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105285 2 0.3551 0.8218 0.000 0.868 0.132
#> SRR2105286 2 0.2448 0.8689 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105283 2 0.2269 0.8846 0.016 0.944 0.040
#> SRR2105284 2 0.3253 0.8540 0.052 0.912 0.036
#> SRR2105281 2 0.0237 0.9017 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105282 2 0.0747 0.8990 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105259 3 0.3918 0.6093 0.140 0.004 0.856
#> SRR2105260 3 0.3784 0.6135 0.132 0.004 0.864
#> SRR2105279 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105280 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105257 1 0.0592 0.7578 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105258 1 0.0592 0.7578 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105253 2 0.0747 0.8993 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105254 2 0.0475 0.9020 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105255 1 0.5926 0.5806 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105256 1 0.5706 0.6157 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105251 2 0.0592 0.9005 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105252 2 0.0592 0.9003 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105249 2 0.3459 0.8355 0.096 0.892 0.012
#> SRR2105250 2 0.6799 0.2761 0.456 0.532 0.012
#> SRR2105247 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.6646 0.5622 0.048 0.240 0.712
#> SRR2105246 3 0.7658 0.3663 0.056 0.356 0.588
#> SRR2105243 1 0.5465 0.6504 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105244 1 0.5905 0.5740 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105241 1 0.4974 0.6930 0.764 0.000 0.236
#> SRR2105242 1 0.1643 0.7612 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105239 1 0.5529 0.6413 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105240 1 0.0424 0.7566 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105237 3 0.6295 0.0193 0.000 0.472 0.528
#> SRR2105238 2 0.1129 0.8989 0.004 0.976 0.020
#> SRR2105235 2 0.0829 0.8992 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105236 2 0.2860 0.8536 0.084 0.912 0.004
#> SRR2105233 2 0.5988 0.4575 0.000 0.632 0.368
#> SRR2105234 2 0.5560 0.5944 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0237 0.9017 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105227 3 0.6665 0.4552 0.276 0.036 0.688
#> SRR2105228 1 0.6161 0.6546 0.708 0.020 0.272
#> SRR2105225 1 0.6126 0.4940 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105226 1 0.3340 0.7516 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105229 3 0.2845 0.6405 0.068 0.012 0.920
#> SRR2105230 3 0.5431 0.4347 0.284 0.000 0.716
#> SRR2105219 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105220 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105221 2 0.6763 0.3245 0.436 0.552 0.012
#> SRR2105222 2 0.6754 0.3381 0.432 0.556 0.012
#> SRR2105223 1 0.5810 0.5949 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105224 1 0.5465 0.6497 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105215 2 0.0237 0.9017 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105216 2 0.0424 0.9011 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105213 3 0.5726 0.5779 0.024 0.216 0.760
#> SRR2105214 3 0.5455 0.5931 0.028 0.184 0.788
#> SRR2105211 3 0.4575 0.5804 0.184 0.004 0.812
#> SRR2105212 3 0.6154 0.1140 0.408 0.000 0.592
#> SRR2105209 1 0.3752 0.7452 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105210 1 0.2625 0.7592 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105207 1 0.1643 0.7617 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105208 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105205 2 0.1964 0.8817 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105206 2 0.2959 0.8518 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105201 2 0.5848 0.6293 0.268 0.720 0.012
#> SRR2105202 2 0.6771 0.3184 0.440 0.548 0.012
#> SRR2105203 2 0.0747 0.8992 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.3038 0.8374 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105197 3 0.6079 0.2196 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105198 3 0.6299 0.0305 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105195 3 0.6483 -0.0370 0.452 0.004 0.544
#> SRR2105196 1 0.5298 0.7215 0.804 0.032 0.164
#> SRR2105193 1 0.2066 0.7606 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105194 1 0.1529 0.7608 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105191 1 0.4842 0.6934 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105192 1 0.1031 0.7541 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105189 2 0.1964 0.8819 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105190 2 0.0424 0.9009 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105187 2 0.3349 0.8539 0.004 0.888 0.108
#> SRR2105188 2 0.4779 0.7811 0.124 0.840 0.036
#> SRR2105179 1 0.4399 0.7237 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105180 1 0.0892 0.7527 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105183 2 0.0747 0.8991 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105184 2 0.1753 0.8816 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105185 2 0.1529 0.8897 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105186 2 0.0661 0.9019 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105181 1 0.6244 0.3705 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105182 3 0.6307 -0.1740 0.488 0.000 0.512
#> SRR2105177 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.0475 0.7527 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105171 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.2773 0.7527 0.928 0.024 0.048
#> SRR2105176 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0424 0.9011 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0424 0.9011 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105170 2 0.1753 0.8816 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105167 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105168 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105165 3 0.5968 0.2661 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105166 3 0.6026 0.2211 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105163 3 0.2903 0.6424 0.048 0.028 0.924
#> SRR2105164 3 0.2926 0.6415 0.040 0.036 0.924
#> SRR2105161 1 0.4178 0.7333 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105162 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.0424 0.9011 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105156 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105157 2 0.0237 0.9017 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105158 2 0.0424 0.9011 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105159 3 0.6095 0.1794 0.392 0.000 0.608
#> SRR2105160 1 0.3879 0.7408 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105153 2 0.0237 0.9014 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105154 2 0.0592 0.9003 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105151 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105152 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105149 3 0.3155 0.6422 0.040 0.044 0.916
#> SRR2105150 3 0.3682 0.6265 0.116 0.008 0.876
#> SRR2105147 3 0.5591 0.4030 0.000 0.304 0.696
#> SRR2105148 3 0.5591 0.4030 0.000 0.304 0.696
#> SRR2105143 1 0.5423 0.6971 0.820 0.084 0.096
#> SRR2105144 1 0.0424 0.7562 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105145 1 0.2959 0.7512 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105146 1 0.4121 0.7340 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105141 2 0.2959 0.8504 0.000 0.900 0.100
#> SRR2105142 2 0.2165 0.8764 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9017 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105137 1 0.6675 0.1421 0.584 0.404 0.012
#> SRR2105138 1 0.6799 -0.0345 0.532 0.456 0.012
#> SRR2105135 2 0.0592 0.9002 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105136 2 0.0747 0.8990 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105133 1 0.5760 0.5545 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105134 1 0.2165 0.7560 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105131 1 0.9994 -0.0759 0.344 0.316 0.340
#> SRR2105132 1 0.1289 0.7560 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105129 1 0.0424 0.7562 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105130 1 0.0237 0.7549 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105127 1 0.0747 0.7509 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105128 1 0.0592 0.7483 0.988 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.6931 0.43269 0.228 0.000 0.588 0.184
#> SRR2105278 3 0.7463 0.14789 0.364 0.000 0.456 0.180
#> SRR2105275 3 0.4391 0.54890 0.000 0.008 0.740 0.252
#> SRR2105276 3 0.4335 0.57386 0.004 0.004 0.752 0.240
#> SRR2105273 3 0.2814 0.68891 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR2105274 3 0.3764 0.62949 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR2105271 3 0.4697 0.41031 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR2105272 1 0.3486 0.71209 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105269 2 0.2011 0.79549 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105270 2 0.2011 0.79906 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105267 2 0.2081 0.79099 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105268 2 0.1637 0.79948 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105265 2 0.0804 0.81155 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105266 2 0.1677 0.80538 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR2105263 2 0.1867 0.79810 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105264 2 0.0895 0.81343 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR2105261 4 0.6188 0.55013 0.004 0.064 0.312 0.620
#> SRR2105262 3 0.5648 0.11625 0.004 0.016 0.536 0.444
#> SRR2105357 3 0.5384 0.59823 0.076 0.000 0.728 0.196
#> SRR2105358 3 0.5850 0.57535 0.116 0.000 0.700 0.184
#> SRR2105439 2 0.6784 0.58996 0.128 0.680 0.040 0.152
#> SRR2105440 2 0.7413 0.51973 0.172 0.624 0.044 0.160
#> SRR2105509 4 0.4993 0.76359 0.000 0.260 0.028 0.712
#> SRR2105510 4 0.5088 0.74017 0.000 0.288 0.024 0.688
#> SRR2105507 3 0.2859 0.70009 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR2105508 3 0.2924 0.70654 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR2105505 1 0.2623 0.76031 0.908 0.000 0.028 0.064
#> SRR2105506 1 0.2002 0.76618 0.936 0.000 0.020 0.044
#> SRR2105503 2 0.2345 0.78350 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105504 4 0.4841 0.78521 0.000 0.140 0.080 0.780
#> SRR2105501 2 0.2408 0.78883 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105502 4 0.4841 0.78521 0.000 0.140 0.080 0.780
#> SRR2105499 3 0.3448 0.66920 0.168 0.000 0.828 0.004
#> SRR2105500 3 0.4989 0.04229 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105497 2 0.1302 0.80914 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.2546 0.78027 0.092 0.900 0.000 0.008
#> SRR2105495 2 0.3160 0.79036 0.000 0.872 0.020 0.108
#> SRR2105496 2 0.3952 0.78544 0.024 0.840 0.012 0.124
#> SRR2105493 2 0.5180 0.69506 0.020 0.768 0.044 0.168
#> SRR2105494 2 0.6121 0.63675 0.044 0.704 0.044 0.208
#> SRR2105491 2 0.4790 0.28480 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105492 2 0.4746 0.32359 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105489 2 0.1807 0.80156 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR2105490 2 0.2611 0.77758 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR2105487 1 0.7432 0.15684 0.472 0.000 0.348 0.180
#> SRR2105488 1 0.7393 0.19796 0.488 0.000 0.332 0.180
#> SRR2105485 3 0.4225 0.64214 0.184 0.000 0.792 0.024
#> SRR2105486 3 0.4728 0.61379 0.216 0.000 0.752 0.032
#> SRR2105483 1 0.1059 0.77141 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR2105484 1 0.1059 0.77141 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR2105481 3 0.4098 0.64813 0.204 0.000 0.784 0.012
#> SRR2105482 1 0.2775 0.77397 0.896 0.000 0.084 0.020
#> SRR2105479 3 0.5335 0.67338 0.096 0.012 0.768 0.124
#> SRR2105480 3 0.4867 0.60187 0.232 0.000 0.736 0.032
#> SRR2105477 2 0.4285 0.75181 0.004 0.804 0.028 0.164
#> SRR2105478 2 0.5276 0.69511 0.028 0.752 0.028 0.192
#> SRR2105475 4 0.5466 0.78516 0.000 0.220 0.068 0.712
#> SRR2105476 4 0.4804 0.75033 0.000 0.276 0.016 0.708
#> SRR2105473 2 0.8400 0.16164 0.384 0.416 0.048 0.152
#> SRR2105474 2 0.7053 0.55843 0.164 0.652 0.036 0.148
#> SRR2105471 2 0.2048 0.79640 0.064 0.928 0.000 0.008
#> SRR2105472 2 0.2480 0.78275 0.088 0.904 0.000 0.008
#> SRR2105469 3 0.2984 0.71313 0.084 0.000 0.888 0.028
#> SRR2105470 3 0.3610 0.64510 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR2105467 1 0.7155 0.35022 0.540 0.000 0.292 0.168
#> SRR2105468 1 0.4956 0.68271 0.776 0.000 0.108 0.116
#> SRR2105465 1 0.3047 0.75979 0.872 0.012 0.116 0.000
#> SRR2105466 1 0.1938 0.77824 0.936 0.012 0.052 0.000
#> SRR2105463 1 0.1356 0.77893 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR2105464 1 0.1209 0.77911 0.964 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105461 2 0.0804 0.81190 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR2105462 2 0.1256 0.80891 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR2105459 2 0.4477 0.48294 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR2105460 2 0.3907 0.63712 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105457 3 0.1820 0.71879 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR2105458 3 0.2089 0.71965 0.020 0.000 0.932 0.048
#> SRR2105455 1 0.4992 0.14141 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR2105456 1 0.4925 0.28939 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR2105453 1 0.5165 0.64531 0.752 0.000 0.080 0.168
#> SRR2105454 1 0.5229 0.64102 0.748 0.000 0.084 0.168
#> SRR2105451 2 0.4779 0.75180 0.020 0.804 0.048 0.128
#> SRR2105452 4 0.5330 0.76602 0.000 0.132 0.120 0.748
#> SRR2105449 3 0.4761 0.45311 0.332 0.000 0.664 0.004
#> SRR2105450 1 0.4981 0.18226 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR2105447 4 0.5360 0.43789 0.000 0.436 0.012 0.552
#> SRR2105448 2 0.4382 0.51806 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105445 3 0.5505 0.61231 0.040 0.028 0.744 0.188
#> SRR2105446 3 0.5763 0.58387 0.096 0.000 0.700 0.204
#> SRR2105443 4 0.6279 0.76248 0.000 0.180 0.156 0.664
#> SRR2105444 2 0.6413 0.58774 0.012 0.676 0.120 0.192
#> SRR2105441 2 0.3144 0.77724 0.072 0.884 0.000 0.044
#> SRR2105442 2 0.3056 0.77932 0.072 0.888 0.000 0.040
#> SRR2105437 3 0.7295 0.30064 0.288 0.000 0.524 0.188
#> SRR2105438 3 0.7295 0.30064 0.288 0.000 0.524 0.188
#> SRR2105435 3 0.5270 0.46995 0.320 0.012 0.660 0.008
#> SRR2105436 3 0.3933 0.63558 0.200 0.000 0.792 0.008
#> SRR2105433 1 0.1970 0.77862 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR2105434 1 0.2021 0.77763 0.932 0.012 0.056 0.000
#> SRR2105431 1 0.1724 0.77717 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR2105432 1 0.1629 0.77461 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR2105429 4 0.5533 0.78601 0.000 0.220 0.072 0.708
#> SRR2105430 4 0.5598 0.78607 0.000 0.220 0.076 0.704
#> SRR2105427 2 0.2216 0.80072 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105428 2 0.2611 0.79607 0.000 0.896 0.008 0.096
#> SRR2105425 2 0.3266 0.71972 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105426 2 0.0524 0.81267 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105421 4 0.5565 0.15816 0.004 0.012 0.464 0.520
#> SRR2105422 3 0.5365 0.19905 0.004 0.008 0.576 0.412
#> SRR2105423 2 0.0937 0.81216 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR2105424 2 0.1489 0.80595 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR2105419 3 0.2142 0.71747 0.056 0.000 0.928 0.016
#> SRR2105420 3 0.2660 0.72049 0.056 0.000 0.908 0.036
#> SRR2105415 1 0.2521 0.75578 0.912 0.000 0.024 0.064
#> SRR2105416 1 0.1520 0.76997 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105417 1 0.2053 0.77679 0.924 0.004 0.072 0.000
#> SRR2105418 1 0.1661 0.78024 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR2105413 4 0.5085 0.76482 0.000 0.260 0.032 0.708
#> SRR2105414 4 0.4857 0.74379 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR2105409 2 0.1389 0.80596 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105410 2 0.4147 0.75849 0.064 0.840 0.008 0.088
#> SRR2105411 2 0.1151 0.81193 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR2105412 2 0.1489 0.80609 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR2105407 3 0.2271 0.70936 0.008 0.000 0.916 0.076
#> SRR2105408 3 0.3166 0.69068 0.016 0.000 0.868 0.116
#> SRR2105403 3 0.6550 0.51677 0.184 0.000 0.636 0.180
#> SRR2105404 3 0.7423 0.20294 0.344 0.000 0.476 0.180
#> SRR2105405 1 0.4697 0.46528 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR2105406 1 0.3975 0.65257 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105401 2 0.4139 0.72173 0.000 0.800 0.024 0.176
#> SRR2105402 4 0.5321 0.77231 0.000 0.140 0.112 0.748
#> SRR2105399 4 0.5905 0.77244 0.000 0.156 0.144 0.700
#> SRR2105400 4 0.5891 0.78399 0.000 0.168 0.132 0.700
#> SRR2105397 4 0.6373 0.63770 0.000 0.116 0.248 0.636
#> SRR2105398 4 0.5708 0.74819 0.000 0.124 0.160 0.716
#> SRR2105395 2 0.0672 0.81237 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR2105396 2 0.2048 0.79636 0.064 0.928 0.000 0.008
#> SRR2105393 2 0.1661 0.80797 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR2105394 2 0.0592 0.81089 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105389 3 0.2216 0.70097 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105390 3 0.2048 0.71574 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR2105391 3 0.2011 0.70907 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105392 3 0.1940 0.71174 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105385 3 0.3569 0.64967 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR2105386 3 0.4040 0.59082 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR2105387 1 0.4916 0.29977 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR2105388 1 0.4605 0.50534 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR2105381 4 0.5421 0.78804 0.000 0.200 0.076 0.724
#> SRR2105382 4 0.4908 0.73667 0.000 0.292 0.016 0.692
#> SRR2105383 2 0.5069 0.50373 0.320 0.664 0.000 0.016
#> SRR2105384 2 0.4594 0.56930 0.280 0.712 0.000 0.008
#> SRR2105379 4 0.4936 0.70430 0.000 0.316 0.012 0.672
#> SRR2105380 2 0.4679 0.37476 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105377 2 0.4977 0.70891 0.064 0.792 0.016 0.128
#> SRR2105378 2 0.5976 0.64935 0.104 0.736 0.028 0.132
#> SRR2105375 1 0.4453 0.64502 0.744 0.012 0.244 0.000
#> SRR2105376 1 0.1585 0.78085 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR2105373 3 0.5952 0.56988 0.124 0.000 0.692 0.184
#> SRR2105374 3 0.7042 0.39367 0.240 0.000 0.572 0.188
#> SRR2105371 3 0.1970 0.71557 0.008 0.000 0.932 0.060
#> SRR2105372 3 0.2089 0.71766 0.020 0.000 0.932 0.048
#> SRR2105369 3 0.4253 0.62238 0.208 0.000 0.776 0.016
#> SRR2105370 3 0.5686 0.30066 0.376 0.000 0.592 0.032
#> SRR2105367 1 0.3634 0.72152 0.856 0.000 0.048 0.096
#> SRR2105368 1 0.3916 0.71585 0.848 0.004 0.056 0.092
#> SRR2105365 4 0.5000 0.21925 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR2105366 2 0.3356 0.71438 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105363 2 0.0804 0.81302 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR2105364 2 0.1520 0.81339 0.024 0.956 0.000 0.020
#> SRR2105361 2 0.0469 0.81077 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105362 2 0.0592 0.81034 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105359 3 0.2675 0.71923 0.044 0.000 0.908 0.048
#> SRR2105360 3 0.4741 0.45308 0.328 0.000 0.668 0.004
#> SRR2105355 3 0.3301 0.71093 0.076 0.000 0.876 0.048
#> SRR2105356 3 0.4961 0.11086 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR2105353 3 0.4509 0.49819 0.004 0.000 0.708 0.288
#> SRR2105354 3 0.2335 0.71676 0.020 0.000 0.920 0.060
#> SRR2105351 2 0.4994 -0.15238 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105352 4 0.5321 0.77231 0.000 0.140 0.112 0.748
#> SRR2105349 2 0.4679 0.37631 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105350 2 0.2760 0.76230 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105345 2 0.2699 0.78918 0.068 0.904 0.000 0.028
#> SRR2105346 2 0.2635 0.78623 0.076 0.904 0.000 0.020
#> SRR2105347 1 0.4872 0.51747 0.728 0.244 0.000 0.028
#> SRR2105348 1 0.3158 0.69173 0.880 0.096 0.004 0.020
#> SRR2105343 2 0.2530 0.77556 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105344 2 0.1557 0.80260 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105341 3 0.1661 0.71709 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR2105342 3 0.2563 0.71365 0.072 0.000 0.908 0.020
#> SRR2105339 3 0.3945 0.60502 0.004 0.000 0.780 0.216
#> SRR2105340 3 0.2773 0.69003 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR2105335 3 0.7003 0.08138 0.424 0.000 0.460 0.116
#> SRR2105336 1 0.5326 0.64726 0.748 0.000 0.116 0.136
#> SRR2105337 3 0.4996 -0.01369 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR2105338 1 0.4343 0.62874 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR2105331 2 0.4164 0.58551 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR2105332 2 0.1940 0.79368 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105333 4 0.4643 0.65237 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR2105334 2 0.4804 0.27211 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR2105329 3 0.5855 0.50709 0.000 0.136 0.704 0.160
#> SRR2105330 3 0.6414 0.41144 0.004 0.236 0.648 0.112
#> SRR2105327 4 0.4795 0.73609 0.000 0.292 0.012 0.696
#> SRR2105328 4 0.4792 0.71266 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR2105325 3 0.4401 0.55198 0.004 0.000 0.724 0.272
#> SRR2105326 3 0.4252 0.57518 0.004 0.000 0.744 0.252
#> SRR2105323 3 0.3080 0.69598 0.096 0.000 0.880 0.024
#> SRR2105324 3 0.3751 0.63830 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR2105319 3 0.6521 0.49203 0.256 0.000 0.620 0.124
#> SRR2105320 3 0.6661 0.05281 0.456 0.000 0.460 0.084
#> SRR2105321 3 0.3668 0.63046 0.004 0.000 0.808 0.188
#> SRR2105322 3 0.4401 0.53461 0.004 0.000 0.724 0.272
#> SRR2105317 4 0.5060 0.50396 0.000 0.412 0.004 0.584
#> SRR2105318 2 0.4134 0.59037 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105315 3 0.4828 0.63481 0.004 0.084 0.792 0.120
#> SRR2105316 2 0.4193 0.58704 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105313 2 0.3356 0.71733 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105314 2 0.2408 0.77995 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105311 4 0.5105 0.58067 0.000 0.028 0.276 0.696
#> SRR2105312 4 0.5256 0.58967 0.000 0.036 0.272 0.692
#> SRR2105307 1 0.2466 0.77085 0.900 0.004 0.096 0.000
#> SRR2105308 1 0.2334 0.77225 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR2105309 3 0.1890 0.71724 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR2105310 3 0.2450 0.71429 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR2105305 3 0.2101 0.71597 0.012 0.000 0.928 0.060
#> SRR2105306 3 0.2002 0.71738 0.044 0.000 0.936 0.020
#> SRR2105303 2 0.1557 0.80117 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105304 4 0.4756 0.78632 0.000 0.144 0.072 0.784
#> SRR2105301 4 0.5143 0.76657 0.000 0.256 0.036 0.708
#> SRR2105302 2 0.4406 0.50909 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR2105299 3 0.5530 0.61674 0.032 0.024 0.724 0.220
#> SRR2105300 3 0.6111 0.59347 0.036 0.052 0.704 0.208
#> SRR2105297 1 0.3768 0.60252 0.808 0.184 0.000 0.008
#> SRR2105298 1 0.2976 0.67636 0.872 0.120 0.000 0.008
#> SRR2105295 4 0.4792 0.70786 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR2105296 4 0.4866 0.52100 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR2105293 3 0.5054 0.40055 0.004 0.008 0.660 0.328
#> SRR2105294 3 0.4215 0.69874 0.072 0.000 0.824 0.104
#> SRR2105291 3 0.6914 -0.00061 0.432 0.092 0.472 0.004
#> SRR2105292 1 0.3323 0.76377 0.876 0.000 0.060 0.064
#> SRR2105289 3 0.5498 0.51667 0.272 0.000 0.680 0.048
#> SRR2105290 1 0.4804 0.40292 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR2105287 1 0.1489 0.78113 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR2105288 1 0.1305 0.78001 0.960 0.004 0.036 0.000
#> SRR2105285 2 0.4730 0.33899 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105286 2 0.3975 0.62604 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105283 2 0.5936 0.66664 0.032 0.728 0.064 0.176
#> SRR2105284 2 0.5636 0.66816 0.032 0.736 0.040 0.192
#> SRR2105281 2 0.1182 0.81265 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR2105282 2 0.1807 0.80156 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR2105259 3 0.2124 0.71285 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR2105260 3 0.1970 0.71347 0.008 0.000 0.932 0.060
#> SRR2105279 2 0.1488 0.80866 0.032 0.956 0.000 0.012
#> SRR2105280 2 0.1452 0.80652 0.036 0.956 0.000 0.008
#> SRR2105257 1 0.3088 0.75584 0.888 0.000 0.052 0.060
#> SRR2105258 1 0.2385 0.76436 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR2105253 2 0.3024 0.75734 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105254 2 0.1716 0.80198 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105255 3 0.4800 0.62002 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR2105256 3 0.5920 0.38014 0.336 0.000 0.612 0.052
#> SRR2105251 2 0.3356 0.71455 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR2105252 2 0.3024 0.74459 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105249 2 0.3127 0.78853 0.068 0.892 0.008 0.032
#> SRR2105250 2 0.6499 0.59989 0.168 0.688 0.024 0.120
#> SRR2105247 2 0.1975 0.81192 0.016 0.936 0.000 0.048
#> SRR2105248 2 0.0895 0.81092 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2105245 4 0.7355 0.40912 0.048 0.060 0.364 0.528
#> SRR2105246 4 0.8238 0.57145 0.056 0.148 0.280 0.516
#> SRR2105243 1 0.5161 0.13579 0.520 0.000 0.476 0.004
#> SRR2105244 3 0.4624 0.43230 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR2105241 1 0.4746 0.43538 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR2105242 1 0.2593 0.76815 0.892 0.004 0.104 0.000
#> SRR2105239 1 0.5161 0.15170 0.520 0.000 0.476 0.004
#> SRR2105240 1 0.1396 0.77939 0.960 0.004 0.032 0.004
#> SRR2105237 4 0.5072 0.78103 0.000 0.208 0.052 0.740
#> SRR2105238 2 0.4365 0.73715 0.000 0.784 0.028 0.188
#> SRR2105235 2 0.2089 0.80665 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR2105236 2 0.3471 0.76776 0.072 0.868 0.000 0.060
#> SRR2105233 4 0.4857 0.74381 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR2105234 4 0.4792 0.70868 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR2105231 2 0.0469 0.81077 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105232 2 0.0469 0.81234 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105227 3 0.6805 0.58423 0.148 0.020 0.656 0.176
#> SRR2105228 1 0.5680 0.31916 0.568 0.020 0.408 0.004
#> SRR2105225 3 0.3908 0.63257 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR2105226 1 0.3498 0.73503 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR2105229 3 0.3402 0.65540 0.000 0.004 0.832 0.164
#> SRR2105230 3 0.1837 0.71994 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR2105219 2 0.2081 0.79539 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105220 2 0.1940 0.79778 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105221 2 0.8327 0.34621 0.284 0.500 0.052 0.164
#> SRR2105222 2 0.7882 0.43267 0.244 0.560 0.044 0.152
#> SRR2105223 3 0.5050 0.25225 0.408 0.000 0.588 0.004
#> SRR2105224 1 0.4996 0.11771 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR2105217 2 0.2081 0.79082 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105218 2 0.1452 0.80695 0.036 0.956 0.000 0.008
#> SRR2105215 2 0.1174 0.81135 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR2105216 2 0.1488 0.80949 0.032 0.956 0.000 0.012
#> SRR2105213 4 0.6264 0.50567 0.004 0.060 0.344 0.592
#> SRR2105214 4 0.6169 0.43459 0.004 0.048 0.376 0.572
#> SRR2105211 3 0.2670 0.71819 0.024 0.000 0.904 0.072
#> SRR2105212 3 0.2408 0.70180 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR2105209 1 0.5188 0.64445 0.716 0.000 0.240 0.044
#> SRR2105210 1 0.3554 0.75311 0.844 0.000 0.136 0.020
#> SRR2105207 1 0.3168 0.76226 0.884 0.000 0.060 0.056
#> SRR2105208 1 0.1296 0.77860 0.964 0.004 0.028 0.004
#> SRR2105205 2 0.4072 0.61475 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105206 2 0.4277 0.56327 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105201 2 0.6366 0.62473 0.112 0.708 0.032 0.148
#> SRR2105202 2 0.7819 0.44442 0.240 0.568 0.044 0.148
#> SRR2105203 2 0.3219 0.73063 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105204 2 0.1118 0.80792 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105199 2 0.0707 0.80983 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105200 2 0.2805 0.77391 0.100 0.888 0.000 0.012
#> SRR2105197 3 0.5576 0.59450 0.096 0.000 0.720 0.184
#> SRR2105198 3 0.6463 0.51077 0.160 0.000 0.644 0.196
#> SRR2105195 3 0.4706 0.57985 0.248 0.000 0.732 0.020
#> SRR2105196 1 0.4925 0.67519 0.752 0.036 0.208 0.004
#> SRR2105193 1 0.2654 0.76639 0.888 0.004 0.108 0.000
#> SRR2105194 1 0.2334 0.77388 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR2105191 3 0.6723 0.48959 0.196 0.000 0.616 0.188
#> SRR2105192 1 0.5690 0.60885 0.716 0.000 0.116 0.168
#> SRR2105189 2 0.2814 0.77209 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105190 2 0.2589 0.77529 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105187 2 0.5923 0.51534 0.008 0.620 0.036 0.336
#> SRR2105188 2 0.6302 0.62351 0.044 0.688 0.048 0.220
#> SRR2105179 1 0.5570 0.20982 0.540 0.000 0.440 0.020
#> SRR2105180 1 0.4688 0.68121 0.792 0.000 0.080 0.128
#> SRR2105183 2 0.2198 0.79224 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR2105184 2 0.2546 0.78028 0.092 0.900 0.000 0.008
#> SRR2105185 2 0.3873 0.64323 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105186 2 0.1902 0.80139 0.004 0.932 0.000 0.064
#> SRR2105181 3 0.5633 0.59721 0.100 0.000 0.716 0.184
#> SRR2105182 3 0.5096 0.62438 0.084 0.000 0.760 0.156
#> SRR2105177 1 0.1584 0.77448 0.952 0.012 0.036 0.000
#> SRR2105178 1 0.1388 0.77624 0.960 0.012 0.028 0.000
#> SRR2105171 2 0.1716 0.80246 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105172 2 0.1059 0.81368 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR2105175 1 0.2021 0.78073 0.932 0.012 0.056 0.000
#> SRR2105176 1 0.1807 0.78024 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR2105173 2 0.2281 0.78618 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105174 2 0.1022 0.80773 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105169 2 0.1677 0.80754 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR2105170 2 0.2611 0.77752 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR2105167 2 0.1722 0.80295 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR2105168 2 0.1722 0.80295 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR2105165 3 0.2861 0.70709 0.096 0.000 0.888 0.016
#> SRR2105166 3 0.2861 0.70838 0.096 0.000 0.888 0.016
#> SRR2105163 3 0.5443 0.09093 0.004 0.008 0.532 0.456
#> SRR2105164 4 0.5461 0.07672 0.004 0.008 0.480 0.508
#> SRR2105161 1 0.4155 0.66551 0.756 0.004 0.240 0.000
#> SRR2105162 1 0.1489 0.78063 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR2105155 2 0.1510 0.80992 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR2105156 2 0.1584 0.80686 0.036 0.952 0.000 0.012
#> SRR2105157 2 0.2216 0.78613 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105158 2 0.1305 0.81043 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR2105159 3 0.6139 0.54984 0.244 0.000 0.656 0.100
#> SRR2105160 1 0.3444 0.71833 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR2105153 2 0.2589 0.77220 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105154 2 0.3486 0.69958 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105151 2 0.1807 0.80188 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR2105152 2 0.1807 0.80133 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR2105149 3 0.5114 0.49403 0.004 0.020 0.696 0.280
#> SRR2105150 3 0.2805 0.71047 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR2105147 4 0.5209 0.73659 0.000 0.104 0.140 0.756
#> SRR2105148 4 0.5209 0.73659 0.000 0.104 0.140 0.756
#> SRR2105143 1 0.4667 0.68971 0.796 0.108 0.096 0.000
#> SRR2105144 1 0.1767 0.77570 0.944 0.012 0.044 0.000
#> SRR2105145 1 0.3402 0.73155 0.832 0.004 0.164 0.000
#> SRR2105146 1 0.3528 0.70816 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105141 2 0.4933 0.08343 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105142 2 0.4543 0.45256 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105139 2 0.0804 0.81250 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR2105140 2 0.1635 0.80436 0.044 0.948 0.000 0.008
#> SRR2105137 2 0.8207 0.35112 0.296 0.504 0.048 0.152
#> SRR2105138 2 0.8346 0.21441 0.364 0.436 0.044 0.156
#> SRR2105135 2 0.1890 0.79956 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR2105136 2 0.1807 0.80133 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR2105133 3 0.6423 0.53302 0.156 0.000 0.648 0.196
#> SRR2105134 1 0.7492 0.04408 0.432 0.000 0.388 0.180
#> SRR2105131 3 0.8000 0.38893 0.060 0.244 0.560 0.136
#> SRR2105132 1 0.7016 0.39542 0.572 0.000 0.252 0.176
#> SRR2105129 1 0.1584 0.77410 0.952 0.012 0.036 0.000
#> SRR2105130 1 0.1284 0.77297 0.964 0.012 0.024 0.000
#> SRR2105127 1 0.4428 0.68913 0.808 0.000 0.068 0.124
#> SRR2105128 1 0.4636 0.67376 0.792 0.000 0.068 0.140
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.4536 0.59143 0.048 0.000 0.240 0.000 0.712
#> SRR2105278 5 0.4832 0.60315 0.088 0.000 0.200 0.000 0.712
#> SRR2105275 3 0.3752 0.67632 0.000 0.000 0.804 0.148 0.048
#> SRR2105276 3 0.3615 0.68103 0.000 0.000 0.808 0.156 0.036
#> SRR2105273 3 0.1893 0.74746 0.048 0.000 0.928 0.000 0.024
#> SRR2105274 3 0.2069 0.74619 0.076 0.000 0.912 0.000 0.012
#> SRR2105271 3 0.4113 0.64939 0.232 0.000 0.740 0.000 0.028
#> SRR2105272 1 0.2953 0.77919 0.844 0.000 0.144 0.000 0.012
#> SRR2105269 2 0.3647 0.72799 0.000 0.816 0.000 0.132 0.052
#> SRR2105270 2 0.3840 0.72937 0.000 0.808 0.000 0.116 0.076
#> SRR2105267 2 0.2561 0.72823 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105268 2 0.1478 0.76883 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105265 2 0.1952 0.78575 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR2105266 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105263 2 0.2871 0.75913 0.000 0.872 0.000 0.088 0.040
#> SRR2105264 2 0.2233 0.78688 0.000 0.904 0.000 0.016 0.080
#> SRR2105261 4 0.4922 0.13431 0.000 0.020 0.424 0.552 0.004
#> SRR2105262 3 0.4339 0.52896 0.000 0.000 0.652 0.336 0.012
#> SRR2105357 5 0.4138 0.56882 0.016 0.000 0.276 0.000 0.708
#> SRR2105358 5 0.4268 0.57238 0.024 0.000 0.268 0.000 0.708
#> SRR2105439 5 0.5620 0.13055 0.036 0.388 0.000 0.024 0.552
#> SRR2105440 5 0.5565 0.25373 0.040 0.344 0.000 0.024 0.592
#> SRR2105509 4 0.3456 0.78120 0.000 0.204 0.004 0.788 0.004
#> SRR2105510 4 0.3762 0.76687 0.000 0.244 0.004 0.748 0.004
#> SRR2105507 3 0.1412 0.74940 0.036 0.000 0.952 0.004 0.008
#> SRR2105508 3 0.1408 0.74991 0.044 0.000 0.948 0.000 0.008
#> SRR2105505 1 0.2358 0.78638 0.888 0.000 0.008 0.000 0.104
#> SRR2105506 1 0.1557 0.81403 0.940 0.000 0.008 0.000 0.052
#> SRR2105503 2 0.3098 0.73071 0.000 0.836 0.000 0.148 0.016
#> SRR2105504 4 0.3048 0.66422 0.000 0.024 0.036 0.880 0.060
#> SRR2105501 2 0.4044 0.73660 0.000 0.800 0.004 0.120 0.076
#> SRR2105502 4 0.3048 0.66422 0.000 0.024 0.036 0.880 0.060
#> SRR2105499 3 0.2726 0.74021 0.064 0.000 0.884 0.000 0.052
#> SRR2105500 3 0.5066 0.45927 0.344 0.000 0.608 0.000 0.048
#> SRR2105497 2 0.2068 0.78090 0.004 0.904 0.000 0.000 0.092
#> SRR2105498 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105495 2 0.4743 0.66473 0.000 0.732 0.000 0.112 0.156
#> SRR2105496 2 0.4948 0.65172 0.000 0.708 0.000 0.108 0.184
#> SRR2105493 2 0.6239 0.11684 0.000 0.452 0.012 0.100 0.436
#> SRR2105494 5 0.5947 0.11022 0.000 0.388 0.004 0.096 0.512
#> SRR2105491 2 0.3837 0.49086 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR2105492 2 0.3661 0.55970 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR2105489 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105490 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105487 5 0.4501 0.60281 0.128 0.000 0.116 0.000 0.756
#> SRR2105488 5 0.4548 0.60055 0.128 0.000 0.120 0.000 0.752
#> SRR2105485 3 0.3970 0.70823 0.104 0.000 0.800 0.000 0.096
#> SRR2105486 3 0.4548 0.67390 0.120 0.000 0.752 0.000 0.128
#> SRR2105483 1 0.0510 0.82814 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105484 1 0.0510 0.82814 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105481 3 0.3664 0.72659 0.104 0.000 0.828 0.004 0.064
#> SRR2105482 1 0.1725 0.83141 0.936 0.000 0.044 0.000 0.020
#> SRR2105479 3 0.3819 0.73453 0.096 0.004 0.832 0.056 0.012
#> SRR2105480 3 0.3348 0.72769 0.140 0.004 0.836 0.012 0.008
#> SRR2105477 2 0.5866 0.50315 0.000 0.604 0.004 0.132 0.260
#> SRR2105478 2 0.5940 0.36350 0.000 0.544 0.004 0.104 0.348
#> SRR2105475 4 0.3523 0.77073 0.000 0.140 0.032 0.824 0.004
#> SRR2105476 4 0.3489 0.78005 0.000 0.208 0.004 0.784 0.004
#> SRR2105473 5 0.5798 0.39571 0.080 0.264 0.000 0.024 0.632
#> SRR2105474 5 0.5710 0.08694 0.040 0.400 0.000 0.024 0.536
#> SRR2105471 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105472 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105469 3 0.1597 0.74813 0.048 0.000 0.940 0.000 0.012
#> SRR2105470 3 0.2482 0.74546 0.084 0.000 0.892 0.000 0.024
#> SRR2105467 5 0.5110 0.46406 0.224 0.000 0.096 0.000 0.680
#> SRR2105468 1 0.5238 0.09358 0.484 0.000 0.044 0.000 0.472
#> SRR2105465 1 0.2179 0.81202 0.896 0.000 0.100 0.000 0.004
#> SRR2105466 1 0.0794 0.83296 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105464 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105461 2 0.1851 0.78226 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105462 2 0.2233 0.77612 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR2105459 2 0.3990 0.49563 0.000 0.688 0.000 0.308 0.004
#> SRR2105460 2 0.3700 0.61510 0.000 0.752 0.000 0.240 0.008
#> SRR2105457 3 0.1830 0.74407 0.028 0.000 0.932 0.000 0.040
#> SRR2105458 3 0.2270 0.73066 0.020 0.000 0.904 0.000 0.076
#> SRR2105455 3 0.4622 0.25127 0.440 0.000 0.548 0.000 0.012
#> SRR2105456 1 0.4528 0.13083 0.548 0.000 0.444 0.000 0.008
#> SRR2105453 5 0.4242 0.14046 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR2105454 5 0.4278 0.07034 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR2105451 2 0.6225 0.52466 0.004 0.616 0.028 0.104 0.248
#> SRR2105452 4 0.3013 0.65761 0.000 0.016 0.044 0.880 0.060
#> SRR2105449 3 0.3875 0.66380 0.228 0.004 0.756 0.000 0.012
#> SRR2105450 3 0.4517 0.26532 0.436 0.000 0.556 0.000 0.008
#> SRR2105447 4 0.4541 0.53929 0.000 0.380 0.004 0.608 0.008
#> SRR2105448 2 0.3508 0.60019 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR2105445 5 0.4665 0.54282 0.000 0.000 0.260 0.048 0.692
#> SRR2105446 5 0.3806 0.60463 0.012 0.000 0.180 0.016 0.792
#> SRR2105443 4 0.6462 0.66596 0.000 0.136 0.116 0.644 0.104
#> SRR2105444 2 0.7085 0.30546 0.000 0.488 0.052 0.136 0.324
#> SRR2105441 2 0.3370 0.74809 0.000 0.824 0.000 0.028 0.148
#> SRR2105442 2 0.3327 0.74922 0.000 0.828 0.000 0.028 0.144
#> SRR2105437 5 0.4958 0.58811 0.060 0.000 0.252 0.004 0.684
#> SRR2105438 5 0.4933 0.58951 0.060 0.000 0.248 0.004 0.688
#> SRR2105435 3 0.4379 0.67079 0.220 0.008 0.740 0.000 0.032
#> SRR2105436 3 0.3307 0.73198 0.104 0.000 0.844 0.000 0.052
#> SRR2105433 1 0.0609 0.83328 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0510 0.83340 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0609 0.82532 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105432 1 0.0703 0.82298 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105429 4 0.4666 0.76480 0.000 0.240 0.056 0.704 0.000
#> SRR2105430 4 0.4578 0.76297 0.000 0.244 0.040 0.712 0.004
#> SRR2105427 2 0.4761 0.68684 0.000 0.732 0.000 0.144 0.124
#> SRR2105428 2 0.4950 0.66479 0.000 0.724 0.004 0.152 0.120
#> SRR2105425 2 0.3048 0.70265 0.000 0.820 0.000 0.176 0.004
#> SRR2105426 2 0.2570 0.78898 0.000 0.888 0.000 0.028 0.084
#> SRR2105421 3 0.4649 0.37329 0.000 0.000 0.580 0.404 0.016
#> SRR2105422 3 0.4058 0.63303 0.000 0.000 0.740 0.236 0.024
#> SRR2105423 2 0.1851 0.78226 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105424 2 0.2193 0.78194 0.000 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR2105419 3 0.1750 0.74462 0.028 0.000 0.936 0.000 0.036
#> SRR2105420 3 0.1281 0.74900 0.032 0.000 0.956 0.000 0.012
#> SRR2105415 1 0.2074 0.77555 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR2105416 1 0.0963 0.81272 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105417 1 0.0609 0.83347 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0671 0.83323 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR2105413 4 0.3579 0.77054 0.000 0.240 0.004 0.756 0.000
#> SRR2105414 4 0.3944 0.74265 0.000 0.272 0.004 0.720 0.004
#> SRR2105409 2 0.1872 0.78191 0.000 0.928 0.000 0.052 0.020
#> SRR2105410 2 0.3988 0.70750 0.000 0.768 0.000 0.036 0.196
#> SRR2105411 2 0.1399 0.78721 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR2105412 2 0.2233 0.77612 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR2105407 3 0.2886 0.67453 0.000 0.000 0.844 0.008 0.148
#> SRR2105408 3 0.4218 0.38616 0.000 0.000 0.660 0.008 0.332
#> SRR2105403 5 0.4350 0.57783 0.028 0.000 0.268 0.000 0.704
#> SRR2105404 5 0.4763 0.60247 0.076 0.000 0.212 0.000 0.712
#> SRR2105405 1 0.4183 0.48610 0.668 0.000 0.324 0.000 0.008
#> SRR2105406 1 0.2707 0.78863 0.860 0.000 0.132 0.000 0.008
#> SRR2105401 2 0.5591 0.62480 0.000 0.692 0.028 0.168 0.112
#> SRR2105402 4 0.3034 0.66141 0.000 0.020 0.040 0.880 0.060
#> SRR2105399 4 0.3869 0.73271 0.000 0.084 0.080 0.824 0.012
#> SRR2105400 4 0.3752 0.74253 0.000 0.092 0.072 0.828 0.008
#> SRR2105397 4 0.6775 0.48393 0.000 0.052 0.204 0.580 0.164
#> SRR2105398 4 0.4549 0.67623 0.000 0.056 0.156 0.768 0.020
#> SRR2105395 2 0.2130 0.78687 0.000 0.908 0.000 0.012 0.080
#> SRR2105396 2 0.2411 0.77334 0.000 0.884 0.000 0.008 0.108
#> SRR2105393 2 0.1648 0.78344 0.000 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR2105394 2 0.1444 0.78943 0.000 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR2105389 3 0.2482 0.71472 0.000 0.000 0.892 0.024 0.084
#> SRR2105390 3 0.2248 0.71143 0.000 0.000 0.900 0.012 0.088
#> SRR2105391 3 0.1809 0.72383 0.000 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR2105392 3 0.1956 0.71774 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR2105385 3 0.2685 0.74128 0.092 0.000 0.880 0.000 0.028
#> SRR2105386 3 0.3278 0.71491 0.156 0.000 0.824 0.000 0.020
#> SRR2105387 3 0.4659 0.08361 0.488 0.000 0.500 0.000 0.012
#> SRR2105388 1 0.4270 0.50447 0.668 0.000 0.320 0.000 0.012
#> SRR2105381 4 0.3758 0.75940 0.000 0.128 0.052 0.816 0.004
#> SRR2105382 4 0.3790 0.76417 0.000 0.248 0.004 0.744 0.004
#> SRR2105383 2 0.5273 0.58517 0.192 0.696 0.004 0.004 0.104
#> SRR2105384 2 0.4755 0.65711 0.136 0.752 0.004 0.004 0.104
#> SRR2105379 4 0.3534 0.76039 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR2105380 2 0.3707 0.54534 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR2105377 2 0.4761 0.50634 0.000 0.616 0.000 0.028 0.356
#> SRR2105378 2 0.5411 0.20866 0.016 0.500 0.000 0.028 0.456
#> SRR2105375 1 0.4715 0.54286 0.684 0.024 0.280 0.000 0.012
#> SRR2105376 1 0.0807 0.83236 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105373 5 0.4532 0.53169 0.020 0.000 0.304 0.004 0.672
#> SRR2105374 5 0.4818 0.58158 0.048 0.000 0.260 0.004 0.688
#> SRR2105371 3 0.1862 0.73210 0.004 0.000 0.932 0.016 0.048
#> SRR2105372 3 0.1522 0.74156 0.012 0.000 0.944 0.000 0.044
#> SRR2105369 3 0.4444 0.68996 0.136 0.000 0.760 0.000 0.104
#> SRR2105370 3 0.6253 0.42105 0.280 0.000 0.532 0.000 0.188
#> SRR2105367 1 0.3305 0.64867 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR2105368 1 0.3890 0.59875 0.736 0.000 0.012 0.000 0.252
#> SRR2105365 4 0.4242 0.43520 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR2105366 2 0.2891 0.69586 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR2105363 2 0.3019 0.79092 0.000 0.864 0.000 0.048 0.088
#> SRR2105364 2 0.1205 0.79126 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105361 2 0.2270 0.79009 0.000 0.904 0.000 0.020 0.076
#> SRR2105362 2 0.1522 0.78993 0.000 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR2105359 3 0.1549 0.75120 0.040 0.000 0.944 0.000 0.016
#> SRR2105360 3 0.3421 0.68656 0.204 0.000 0.788 0.000 0.008
#> SRR2105355 3 0.2585 0.75439 0.048 0.000 0.904 0.024 0.024
#> SRR2105356 3 0.4165 0.52989 0.320 0.000 0.672 0.000 0.008
#> SRR2105353 3 0.4024 0.63256 0.000 0.000 0.752 0.220 0.028
#> SRR2105354 3 0.1701 0.74521 0.012 0.000 0.944 0.016 0.028
#> SRR2105351 2 0.4297 -0.09229 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR2105352 4 0.3034 0.66141 0.000 0.020 0.040 0.880 0.060
#> SRR2105349 2 0.4446 0.22012 0.000 0.592 0.000 0.400 0.008
#> SRR2105350 2 0.2886 0.71922 0.000 0.844 0.000 0.148 0.008
#> SRR2105345 2 0.3818 0.74054 0.016 0.812 0.000 0.028 0.144
#> SRR2105346 2 0.2864 0.76613 0.000 0.864 0.000 0.024 0.112
#> SRR2105347 1 0.5531 0.44661 0.680 0.168 0.000 0.012 0.140
#> SRR2105348 1 0.4011 0.64863 0.808 0.072 0.000 0.008 0.112
#> SRR2105343 2 0.2338 0.75003 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105344 2 0.1768 0.76889 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR2105341 3 0.1787 0.73911 0.016 0.000 0.936 0.004 0.044
#> SRR2105342 3 0.1579 0.74709 0.032 0.000 0.944 0.000 0.024
#> SRR2105339 3 0.3321 0.69721 0.000 0.000 0.832 0.136 0.032
#> SRR2105340 3 0.1836 0.73460 0.000 0.000 0.932 0.036 0.032
#> SRR2105335 5 0.6443 0.41610 0.212 0.000 0.256 0.004 0.528
#> SRR2105336 5 0.5401 0.12735 0.404 0.000 0.060 0.000 0.536
#> SRR2105337 3 0.4313 0.46191 0.356 0.000 0.636 0.000 0.008
#> SRR2105338 1 0.4058 0.66086 0.740 0.000 0.236 0.000 0.024
#> SRR2105331 2 0.3756 0.60759 0.000 0.744 0.000 0.248 0.008
#> SRR2105332 2 0.2583 0.73576 0.000 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR2105333 4 0.3949 0.70693 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR2105334 2 0.4510 0.08831 0.000 0.560 0.000 0.432 0.008
#> SRR2105329 3 0.6836 0.35838 0.000 0.088 0.588 0.112 0.212
#> SRR2105330 3 0.7846 0.01125 0.000 0.228 0.436 0.092 0.244
#> SRR2105327 4 0.3689 0.76028 0.000 0.256 0.004 0.740 0.000
#> SRR2105328 4 0.3790 0.74512 0.000 0.272 0.004 0.724 0.000
#> SRR2105325 3 0.3958 0.66808 0.000 0.000 0.780 0.176 0.044
#> SRR2105326 3 0.3921 0.66890 0.000 0.000 0.784 0.172 0.044
#> SRR2105323 3 0.3883 0.66672 0.036 0.000 0.780 0.000 0.184
#> SRR2105324 3 0.3971 0.70388 0.100 0.000 0.800 0.000 0.100
#> SRR2105319 5 0.5774 0.42592 0.092 0.000 0.336 0.004 0.568
#> SRR2105320 5 0.6789 0.39085 0.264 0.000 0.288 0.004 0.444
#> SRR2105321 3 0.3214 0.69811 0.000 0.000 0.844 0.120 0.036
#> SRR2105322 3 0.3732 0.67507 0.000 0.000 0.792 0.176 0.032
#> SRR2105317 4 0.3949 0.70165 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR2105318 2 0.3635 0.60327 0.000 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR2105315 3 0.5234 0.60884 0.000 0.044 0.736 0.084 0.136
#> SRR2105316 2 0.4754 0.60862 0.000 0.712 0.008 0.232 0.048
#> SRR2105313 2 0.3123 0.68784 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR2105314 2 0.2230 0.74487 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105311 4 0.4083 0.52401 0.000 0.000 0.228 0.744 0.028
#> SRR2105312 4 0.4163 0.52440 0.000 0.000 0.228 0.740 0.032
#> SRR2105307 1 0.1043 0.83139 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.1043 0.83119 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105309 3 0.1915 0.74564 0.032 0.000 0.928 0.000 0.040
#> SRR2105310 3 0.2278 0.74054 0.032 0.000 0.908 0.000 0.060
#> SRR2105305 3 0.1644 0.73750 0.008 0.000 0.940 0.004 0.048
#> SRR2105306 3 0.1364 0.74902 0.036 0.000 0.952 0.000 0.012
#> SRR2105303 2 0.1764 0.77203 0.000 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR2105304 4 0.3054 0.66605 0.000 0.028 0.032 0.880 0.060
#> SRR2105301 4 0.3719 0.78071 0.000 0.208 0.012 0.776 0.004
#> SRR2105302 2 0.3885 0.57325 0.000 0.724 0.000 0.268 0.008
#> SRR2105299 5 0.4817 0.53702 0.000 0.000 0.264 0.056 0.680
#> SRR2105300 5 0.5101 0.54037 0.000 0.008 0.256 0.060 0.676
#> SRR2105297 1 0.4473 0.58295 0.768 0.116 0.000 0.004 0.112
#> SRR2105298 1 0.4073 0.62615 0.800 0.092 0.000 0.004 0.104
#> SRR2105295 4 0.3790 0.74209 0.000 0.272 0.000 0.724 0.004
#> SRR2105296 4 0.4359 0.46525 0.000 0.412 0.000 0.584 0.004
#> SRR2105293 3 0.3812 0.67294 0.000 0.004 0.796 0.168 0.032
#> SRR2105294 3 0.3036 0.74646 0.028 0.000 0.880 0.064 0.028
#> SRR2105291 3 0.6261 0.46637 0.312 0.048 0.584 0.008 0.048
#> SRR2105292 1 0.3794 0.73524 0.800 0.000 0.048 0.000 0.152
#> SRR2105289 3 0.3611 0.68137 0.208 0.000 0.780 0.008 0.004
#> SRR2105290 1 0.4415 0.32849 0.604 0.000 0.388 0.000 0.008
#> SRR2105287 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105288 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105285 2 0.4702 0.06776 0.000 0.552 0.000 0.432 0.016
#> SRR2105286 2 0.3750 0.62687 0.000 0.756 0.000 0.232 0.012
#> SRR2105283 2 0.6252 0.21019 0.000 0.484 0.012 0.104 0.400
#> SRR2105284 2 0.6133 0.15538 0.000 0.476 0.008 0.100 0.416
#> SRR2105281 2 0.1557 0.78979 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR2105282 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105259 3 0.2753 0.68587 0.000 0.000 0.856 0.008 0.136
#> SRR2105260 3 0.2612 0.69283 0.000 0.000 0.868 0.008 0.124
#> SRR2105279 2 0.2179 0.77747 0.000 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR2105280 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105257 1 0.3565 0.74546 0.816 0.000 0.040 0.000 0.144
#> SRR2105258 1 0.2130 0.80181 0.908 0.000 0.012 0.000 0.080
#> SRR2105253 2 0.3565 0.72165 0.000 0.816 0.000 0.144 0.040
#> SRR2105254 2 0.1768 0.76497 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR2105255 3 0.5417 0.54074 0.116 0.000 0.648 0.000 0.236
#> SRR2105256 3 0.5958 0.52155 0.208 0.000 0.592 0.000 0.200
#> SRR2105251 2 0.2929 0.69285 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR2105252 2 0.2690 0.71532 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR2105249 2 0.4933 0.65849 0.016 0.700 0.004 0.032 0.248
#> SRR2105250 2 0.5777 0.47001 0.052 0.592 0.000 0.028 0.328
#> SRR2105247 2 0.1168 0.78378 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105248 2 0.2361 0.78174 0.000 0.892 0.000 0.012 0.096
#> SRR2105245 3 0.6529 0.27242 0.044 0.052 0.524 0.368 0.012
#> SRR2105246 3 0.7164 -0.11821 0.040 0.136 0.420 0.400 0.004
#> SRR2105243 3 0.4617 0.26225 0.436 0.000 0.552 0.000 0.012
#> SRR2105244 3 0.3909 0.66819 0.216 0.000 0.760 0.000 0.024
#> SRR2105241 1 0.4327 0.38427 0.632 0.000 0.360 0.000 0.008
#> SRR2105242 1 0.1628 0.82605 0.936 0.000 0.056 0.000 0.008
#> SRR2105239 3 0.4464 0.35704 0.408 0.000 0.584 0.000 0.008
#> SRR2105240 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105237 4 0.5046 0.74552 0.000 0.180 0.024 0.728 0.068
#> SRR2105238 2 0.6071 0.45137 0.000 0.568 0.004 0.140 0.288
#> SRR2105235 2 0.3909 0.70593 0.000 0.760 0.000 0.024 0.216
#> SRR2105236 2 0.4054 0.69504 0.000 0.748 0.000 0.028 0.224
#> SRR2105233 4 0.3671 0.77328 0.000 0.236 0.008 0.756 0.000
#> SRR2105234 4 0.3870 0.75526 0.000 0.260 0.004 0.732 0.004
#> SRR2105231 2 0.1701 0.79000 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR2105232 2 0.1430 0.78976 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105227 3 0.4789 0.70576 0.080 0.052 0.784 0.080 0.004
#> SRR2105228 3 0.5310 0.19412 0.448 0.020 0.516 0.004 0.012
#> SRR2105225 3 0.3134 0.73204 0.120 0.000 0.848 0.000 0.032
#> SRR2105226 1 0.2470 0.80809 0.884 0.000 0.104 0.000 0.012
#> SRR2105229 3 0.3354 0.69960 0.000 0.000 0.844 0.088 0.068
#> SRR2105230 3 0.2511 0.73045 0.028 0.000 0.892 0.000 0.080
#> SRR2105219 2 0.3242 0.74222 0.000 0.844 0.000 0.116 0.040
#> SRR2105220 2 0.3237 0.74760 0.000 0.848 0.000 0.104 0.048
#> SRR2105221 5 0.5545 0.39341 0.060 0.268 0.000 0.024 0.648
#> SRR2105222 5 0.5937 0.34978 0.080 0.292 0.000 0.024 0.604
#> SRR2105223 3 0.4464 0.56583 0.288 0.000 0.684 0.000 0.028
#> SRR2105224 3 0.4825 0.32879 0.408 0.000 0.568 0.000 0.024
#> SRR2105217 2 0.1792 0.76259 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105218 2 0.1952 0.78294 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR2105215 2 0.2068 0.78076 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR2105216 2 0.1831 0.78498 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105213 3 0.5633 0.07349 0.004 0.044 0.484 0.460 0.008
#> SRR2105214 3 0.5347 0.27926 0.000 0.040 0.556 0.396 0.008
#> SRR2105211 3 0.1904 0.74792 0.016 0.000 0.936 0.020 0.028
#> SRR2105212 3 0.2291 0.74295 0.036 0.000 0.908 0.000 0.056
#> SRR2105209 1 0.5218 0.52266 0.632 0.000 0.296 0.000 0.072
#> SRR2105210 1 0.2660 0.79283 0.864 0.000 0.128 0.000 0.008
#> SRR2105207 1 0.3309 0.76557 0.836 0.000 0.036 0.000 0.128
#> SRR2105208 1 0.0290 0.82934 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105205 2 0.4315 0.55046 0.000 0.700 0.000 0.276 0.024
#> SRR2105206 2 0.4468 0.54451 0.000 0.696 0.004 0.276 0.024
#> SRR2105201 5 0.5571 -0.10079 0.024 0.456 0.000 0.028 0.492
#> SRR2105202 5 0.5941 0.27227 0.068 0.332 0.000 0.024 0.576
#> SRR2105203 2 0.2813 0.70426 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR2105204 2 0.1310 0.78662 0.000 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR2105199 2 0.1997 0.78850 0.000 0.924 0.000 0.036 0.040
#> SRR2105200 2 0.2773 0.76778 0.000 0.868 0.000 0.020 0.112
#> SRR2105197 5 0.4642 0.51687 0.020 0.000 0.328 0.004 0.648
#> SRR2105198 5 0.4829 0.55445 0.036 0.000 0.300 0.004 0.660
#> SRR2105195 3 0.3289 0.71493 0.172 0.000 0.816 0.004 0.008
#> SRR2105196 1 0.4730 0.63136 0.712 0.028 0.244 0.004 0.012
#> SRR2105193 1 0.2249 0.81166 0.896 0.000 0.096 0.000 0.008
#> SRR2105194 1 0.1831 0.82063 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR2105191 5 0.4538 0.60034 0.044 0.000 0.228 0.004 0.724
#> SRR2105192 5 0.4733 0.29453 0.348 0.000 0.028 0.000 0.624
#> SRR2105189 2 0.4820 0.65906 0.000 0.728 0.004 0.180 0.088
#> SRR2105190 2 0.3573 0.71504 0.000 0.812 0.000 0.152 0.036
#> SRR2105187 5 0.6829 -0.00135 0.000 0.380 0.008 0.208 0.404
#> SRR2105188 5 0.5868 0.12070 0.000 0.392 0.004 0.088 0.516
#> SRR2105179 3 0.5703 0.23685 0.408 0.000 0.508 0.000 0.084
#> SRR2105180 1 0.5100 0.15872 0.516 0.000 0.036 0.000 0.448
#> SRR2105183 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105184 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105185 2 0.3039 0.68032 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105186 2 0.1430 0.77826 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105181 5 0.4625 0.50378 0.020 0.000 0.324 0.004 0.652
#> SRR2105182 5 0.4897 0.21644 0.024 0.000 0.460 0.000 0.516
#> SRR2105177 1 0.0771 0.83379 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.0404 0.82809 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105171 2 0.2046 0.77650 0.000 0.916 0.000 0.068 0.016
#> SRR2105172 2 0.2193 0.79001 0.000 0.912 0.000 0.028 0.060
#> SRR2105175 1 0.1082 0.83285 0.964 0.008 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0609 0.83347 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.2230 0.74462 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105174 2 0.1430 0.77570 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR2105169 2 0.1704 0.78693 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR2105170 2 0.2411 0.77334 0.000 0.884 0.000 0.008 0.108
#> SRR2105167 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105168 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105165 3 0.1579 0.74752 0.032 0.000 0.944 0.000 0.024
#> SRR2105166 3 0.1992 0.74421 0.032 0.000 0.924 0.000 0.044
#> SRR2105163 3 0.4306 0.52670 0.000 0.000 0.660 0.328 0.012
#> SRR2105164 3 0.4323 0.52328 0.000 0.000 0.656 0.332 0.012
#> SRR2105161 1 0.3491 0.69216 0.768 0.000 0.228 0.000 0.004
#> SRR2105162 1 0.0579 0.83138 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR2105155 2 0.2249 0.77962 0.000 0.896 0.000 0.008 0.096
#> SRR2105156 2 0.2722 0.76929 0.000 0.872 0.000 0.020 0.108
#> SRR2105157 2 0.2540 0.76719 0.000 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR2105158 2 0.1106 0.78919 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105159 3 0.4072 0.69948 0.192 0.000 0.772 0.028 0.008
#> SRR2105160 1 0.1965 0.81542 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.2561 0.72562 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105154 2 0.3074 0.67629 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR2105151 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105152 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105149 3 0.4674 0.56791 0.000 0.000 0.708 0.232 0.060
#> SRR2105150 3 0.2611 0.73032 0.016 0.000 0.896 0.016 0.072
#> SRR2105147 4 0.2983 0.64962 0.000 0.012 0.048 0.880 0.060
#> SRR2105148 4 0.2983 0.64962 0.000 0.012 0.048 0.880 0.060
#> SRR2105143 1 0.2585 0.80989 0.896 0.036 0.064 0.004 0.000
#> SRR2105144 1 0.0566 0.83319 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR2105145 1 0.2193 0.81296 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR2105146 1 0.2411 0.80523 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008
#> SRR2105141 4 0.4420 0.35825 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR2105142 2 0.4182 0.37651 0.000 0.644 0.000 0.352 0.004
#> SRR2105139 2 0.1704 0.78659 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR2105140 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105137 5 0.6223 0.28739 0.096 0.316 0.000 0.024 0.564
#> SRR2105138 5 0.5898 0.39295 0.088 0.264 0.000 0.024 0.624
#> SRR2105135 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105136 2 0.2286 0.77460 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105133 5 0.4104 0.60287 0.032 0.000 0.220 0.000 0.748
#> SRR2105134 5 0.4953 0.59737 0.124 0.000 0.164 0.000 0.712
#> SRR2105131 5 0.7875 0.28625 0.008 0.236 0.336 0.052 0.368
#> SRR2105132 5 0.4879 0.54117 0.176 0.000 0.108 0.000 0.716
#> SRR2105129 1 0.0451 0.83256 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR2105130 1 0.0324 0.83186 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105127 1 0.4138 0.36046 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105128 1 0.4210 0.28827 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.2306 0.66629 0.016 0.000 0.092 0.004 0.888 0.000
#> SRR2105278 5 0.2560 0.66779 0.036 0.000 0.092 0.000 0.872 0.000
#> SRR2105275 3 0.6104 0.61352 0.000 0.008 0.628 0.144 0.124 0.096
#> SRR2105276 3 0.5735 0.63025 0.000 0.004 0.656 0.156 0.092 0.092
#> SRR2105273 3 0.1015 0.72479 0.012 0.000 0.968 0.012 0.004 0.004
#> SRR2105274 3 0.1668 0.71642 0.060 0.000 0.928 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105271 3 0.3582 0.60704 0.192 0.000 0.776 0.008 0.024 0.000
#> SRR2105272 1 0.3753 0.63669 0.696 0.000 0.292 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105269 2 0.4089 0.31709 0.000 0.756 0.000 0.168 0.008 0.068
#> SRR2105270 2 0.5383 0.16881 0.000 0.644 0.000 0.208 0.028 0.120
#> SRR2105267 2 0.1625 0.47631 0.000 0.928 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR2105268 2 0.2416 0.46595 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR2105265 2 0.3782 0.35387 0.000 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR2105266 2 0.4057 0.32761 0.000 0.556 0.000 0.008 0.000 0.436
#> SRR2105263 2 0.3227 0.43243 0.000 0.828 0.000 0.088 0.000 0.084
#> SRR2105264 2 0.5071 0.32009 0.000 0.576 0.000 0.080 0.004 0.340
#> SRR2105261 3 0.7824 -0.00329 0.000 0.176 0.396 0.104 0.044 0.280
#> SRR2105262 3 0.6587 0.50604 0.000 0.044 0.576 0.168 0.036 0.176
#> SRR2105357 5 0.2842 0.64817 0.000 0.000 0.104 0.044 0.852 0.000
#> SRR2105358 5 0.2405 0.66071 0.004 0.000 0.100 0.016 0.880 0.000
#> SRR2105439 6 0.7585 0.35922 0.016 0.104 0.000 0.228 0.268 0.384
#> SRR2105440 6 0.7316 0.27762 0.008 0.080 0.000 0.232 0.312 0.368
#> SRR2105509 2 0.4783 -0.04669 0.000 0.520 0.000 0.024 0.016 0.440
#> SRR2105510 2 0.4446 0.02718 0.000 0.552 0.000 0.008 0.016 0.424
#> SRR2105507 3 0.1950 0.73181 0.032 0.000 0.928 0.020 0.012 0.008
#> SRR2105508 3 0.0951 0.72835 0.008 0.000 0.968 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105505 1 0.3722 0.72878 0.804 0.000 0.032 0.012 0.140 0.012
#> SRR2105506 1 0.3101 0.76064 0.856 0.000 0.020 0.012 0.096 0.016
#> SRR2105503 2 0.0777 0.47857 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105504 4 0.4293 0.80368 0.000 0.016 0.004 0.584 0.000 0.396
#> SRR2105501 2 0.4474 0.34000 0.000 0.744 0.000 0.160 0.036 0.060
#> SRR2105502 4 0.4301 0.80328 0.000 0.016 0.004 0.580 0.000 0.400
#> SRR2105499 3 0.2486 0.71533 0.040 0.000 0.896 0.040 0.024 0.000
#> SRR2105500 3 0.4677 0.41379 0.308 0.000 0.640 0.028 0.024 0.000
#> SRR2105497 2 0.3804 0.34559 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR2105498 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105495 2 0.6456 0.03611 0.000 0.540 0.000 0.236 0.084 0.140
#> SRR2105496 2 0.7088 -0.09947 0.000 0.448 0.000 0.236 0.112 0.204
#> SRR2105493 2 0.7554 -0.23489 0.000 0.352 0.000 0.240 0.236 0.172
#> SRR2105494 5 0.7562 -0.19851 0.000 0.288 0.000 0.240 0.316 0.156
#> SRR2105491 2 0.2053 0.45245 0.000 0.888 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR2105492 2 0.1908 0.45748 0.000 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR2105489 2 0.3937 0.34131 0.000 0.572 0.000 0.000 0.004 0.424
#> SRR2105490 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105487 5 0.2602 0.65617 0.052 0.000 0.040 0.020 0.888 0.000
#> SRR2105488 5 0.2793 0.65511 0.060 0.000 0.044 0.020 0.876 0.000
#> SRR2105485 3 0.3758 0.66657 0.048 0.000 0.808 0.032 0.112 0.000
#> SRR2105486 3 0.4975 0.56448 0.084 0.000 0.696 0.036 0.184 0.000
#> SRR2105483 1 0.1353 0.78990 0.952 0.000 0.000 0.024 0.012 0.012
#> SRR2105484 1 0.1448 0.78829 0.948 0.000 0.000 0.024 0.016 0.012
#> SRR2105481 3 0.4106 0.70371 0.064 0.000 0.800 0.040 0.088 0.008
#> SRR2105482 1 0.2728 0.78161 0.864 0.000 0.100 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105479 3 0.3324 0.72273 0.044 0.004 0.864 0.032 0.032 0.024
#> SRR2105480 3 0.2731 0.71850 0.068 0.000 0.884 0.020 0.016 0.012
#> SRR2105477 2 0.6694 -0.02523 0.000 0.516 0.000 0.236 0.132 0.116
#> SRR2105478 2 0.7455 -0.20373 0.000 0.388 0.000 0.236 0.200 0.176
#> SRR2105475 2 0.5374 -0.15379 0.000 0.472 0.004 0.056 0.016 0.452
#> SRR2105476 2 0.4962 -0.04297 0.000 0.520 0.000 0.036 0.016 0.428
#> SRR2105473 5 0.7565 -0.17905 0.032 0.064 0.000 0.228 0.356 0.320
#> SRR2105474 6 0.7647 0.37762 0.020 0.108 0.000 0.228 0.252 0.392
#> SRR2105471 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105472 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105469 3 0.1173 0.72666 0.016 0.000 0.960 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105470 3 0.2488 0.71385 0.076 0.000 0.888 0.016 0.020 0.000
#> SRR2105467 5 0.4574 0.61134 0.092 0.000 0.140 0.016 0.744 0.008
#> SRR2105468 5 0.5152 0.44319 0.272 0.000 0.072 0.012 0.636 0.008
#> SRR2105465 1 0.2794 0.76584 0.840 0.000 0.144 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105466 1 0.0603 0.80061 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.1078 0.79314 0.964 0.000 0.000 0.016 0.012 0.008
#> SRR2105464 1 0.1269 0.79056 0.956 0.000 0.000 0.020 0.012 0.012
#> SRR2105461 2 0.3774 0.35819 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR2105462 2 0.3823 0.33476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR2105459 2 0.2883 0.42054 0.000 0.832 0.000 0.008 0.008 0.152
#> SRR2105460 2 0.1663 0.45768 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105457 3 0.2865 0.72041 0.000 0.000 0.868 0.064 0.056 0.012
#> SRR2105458 3 0.4240 0.69018 0.000 0.000 0.772 0.092 0.108 0.028
#> SRR2105455 3 0.3955 0.37103 0.340 0.000 0.648 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105456 3 0.4195 0.08184 0.440 0.000 0.548 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105453 5 0.4029 0.47945 0.288 0.000 0.000 0.012 0.688 0.012
#> SRR2105454 5 0.4029 0.47884 0.288 0.000 0.000 0.012 0.688 0.012
#> SRR2105451 2 0.7315 -0.12533 0.000 0.436 0.004 0.244 0.148 0.168
#> SRR2105452 4 0.4293 0.80368 0.000 0.016 0.004 0.584 0.000 0.396
#> SRR2105449 3 0.3288 0.65635 0.160 0.000 0.812 0.016 0.008 0.004
#> SRR2105450 3 0.4031 0.38650 0.332 0.000 0.652 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105447 2 0.4466 0.23227 0.000 0.648 0.000 0.024 0.016 0.312
#> SRR2105448 2 0.1663 0.45780 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105445 5 0.7281 0.34571 0.000 0.048 0.116 0.252 0.496 0.088
#> SRR2105446 5 0.4606 0.57592 0.004 0.000 0.064 0.120 0.756 0.056
#> SRR2105443 2 0.7804 -0.31928 0.000 0.344 0.052 0.200 0.072 0.332
#> SRR2105444 2 0.7394 -0.13647 0.004 0.428 0.004 0.256 0.188 0.120
#> SRR2105441 6 0.5748 0.02100 0.000 0.376 0.000 0.124 0.012 0.488
#> SRR2105442 6 0.5503 -0.02628 0.000 0.396 0.000 0.092 0.012 0.500
#> SRR2105437 5 0.3196 0.65547 0.020 0.000 0.084 0.028 0.856 0.012
#> SRR2105438 5 0.3196 0.65547 0.020 0.000 0.084 0.028 0.856 0.012
#> SRR2105435 3 0.4222 0.63345 0.176 0.004 0.760 0.036 0.020 0.004
#> SRR2105436 3 0.3244 0.70109 0.080 0.000 0.848 0.036 0.036 0.000
#> SRR2105433 1 0.0858 0.79959 0.968 0.000 0.028 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0551 0.80049 0.984 0.000 0.008 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105431 1 0.1364 0.78992 0.952 0.000 0.000 0.020 0.016 0.012
#> SRR2105432 1 0.1364 0.78882 0.952 0.000 0.000 0.020 0.016 0.012
#> SRR2105429 2 0.5232 -0.04390 0.000 0.524 0.024 0.020 0.016 0.416
#> SRR2105430 2 0.5434 -0.04807 0.000 0.520 0.028 0.024 0.020 0.408
#> SRR2105427 2 0.5626 0.18728 0.000 0.632 0.000 0.212 0.052 0.104
#> SRR2105428 2 0.5788 0.12291 0.000 0.608 0.000 0.236 0.060 0.096
#> SRR2105425 2 0.1444 0.47847 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR2105426 2 0.3531 0.40023 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105421 3 0.6877 0.46742 0.000 0.040 0.552 0.140 0.064 0.204
#> SRR2105422 3 0.5654 0.62195 0.000 0.008 0.668 0.116 0.064 0.144
#> SRR2105423 2 0.3872 0.36621 0.000 0.604 0.000 0.000 0.004 0.392
#> SRR2105424 2 0.3915 0.34929 0.000 0.584 0.000 0.000 0.004 0.412
#> SRR2105419 3 0.2375 0.72865 0.000 0.000 0.896 0.068 0.020 0.016
#> SRR2105420 3 0.2014 0.73006 0.008 0.000 0.920 0.052 0.012 0.008
#> SRR2105415 1 0.2850 0.73741 0.856 0.000 0.000 0.016 0.112 0.016
#> SRR2105416 1 0.1616 0.78391 0.940 0.000 0.000 0.020 0.028 0.012
#> SRR2105417 1 0.0291 0.79898 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105418 1 0.0696 0.79997 0.980 0.000 0.004 0.008 0.004 0.004
#> SRR2105413 2 0.4205 0.04605 0.000 0.564 0.000 0.000 0.016 0.420
#> SRR2105414 2 0.4469 0.09505 0.000 0.584 0.000 0.012 0.016 0.388
#> SRR2105409 2 0.4350 0.36334 0.000 0.660 0.000 0.048 0.000 0.292
#> SRR2105410 6 0.6913 0.27029 0.000 0.292 0.000 0.208 0.072 0.428
#> SRR2105411 2 0.3464 0.41432 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR2105412 2 0.3944 0.33845 0.000 0.568 0.000 0.000 0.004 0.428
#> SRR2105407 3 0.5529 0.60266 0.000 0.000 0.636 0.112 0.212 0.040
#> SRR2105408 3 0.6164 0.21159 0.000 0.000 0.444 0.108 0.404 0.044
#> SRR2105403 5 0.2779 0.66588 0.016 0.000 0.120 0.004 0.856 0.004
#> SRR2105404 5 0.2630 0.66817 0.032 0.000 0.092 0.000 0.872 0.004
#> SRR2105405 1 0.4144 0.36085 0.580 0.000 0.408 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105406 1 0.3161 0.71849 0.776 0.000 0.216 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.5702 0.21211 0.000 0.640 0.008 0.208 0.048 0.096
#> SRR2105402 4 0.4293 0.80368 0.000 0.016 0.004 0.584 0.000 0.396
#> SRR2105399 6 0.6850 -0.38492 0.000 0.332 0.068 0.132 0.012 0.456
#> SRR2105400 6 0.6434 -0.33711 0.000 0.380 0.040 0.112 0.012 0.456
#> SRR2105397 6 0.8592 -0.30878 0.000 0.240 0.092 0.248 0.140 0.280
#> SRR2105398 6 0.7672 -0.38538 0.000 0.280 0.080 0.136 0.068 0.436
#> SRR2105395 2 0.3747 0.36604 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105396 2 0.3817 0.33799 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR2105393 2 0.3445 0.43042 0.000 0.732 0.000 0.008 0.000 0.260
#> SRR2105394 2 0.3563 0.40318 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR2105389 3 0.5140 0.66066 0.000 0.000 0.700 0.128 0.120 0.052
#> SRR2105390 3 0.5214 0.65547 0.000 0.000 0.692 0.120 0.136 0.052
#> SRR2105391 3 0.4690 0.68107 0.000 0.000 0.740 0.116 0.100 0.044
#> SRR2105392 3 0.4834 0.66690 0.000 0.000 0.724 0.108 0.128 0.040
#> SRR2105385 3 0.3323 0.69639 0.104 0.000 0.836 0.028 0.032 0.000
#> SRR2105386 3 0.2358 0.71395 0.056 0.000 0.900 0.028 0.016 0.000
#> SRR2105387 3 0.4127 0.20729 0.400 0.000 0.588 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105388 1 0.4466 0.27873 0.536 0.000 0.440 0.016 0.008 0.000
#> SRR2105381 6 0.5740 -0.29529 0.000 0.432 0.016 0.092 0.004 0.456
#> SRR2105382 2 0.4579 0.05316 0.000 0.564 0.000 0.020 0.012 0.404
#> SRR2105383 6 0.6122 -0.11172 0.196 0.396 0.000 0.004 0.004 0.400
#> SRR2105384 2 0.5752 0.16265 0.148 0.452 0.000 0.000 0.004 0.396
#> SRR2105379 2 0.4066 0.11312 0.000 0.596 0.000 0.000 0.012 0.392
#> SRR2105380 2 0.1863 0.45434 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR2105377 6 0.7152 0.40344 0.000 0.172 0.000 0.228 0.148 0.452
#> SRR2105378 6 0.7136 0.43739 0.000 0.128 0.000 0.232 0.192 0.448
#> SRR2105375 1 0.5067 0.52803 0.640 0.016 0.296 0.012 0.024 0.012
#> SRR2105376 1 0.2044 0.79516 0.924 0.000 0.020 0.016 0.032 0.008
#> SRR2105373 5 0.3336 0.63924 0.004 0.000 0.104 0.044 0.836 0.012
#> SRR2105374 5 0.3235 0.65502 0.016 0.000 0.088 0.032 0.852 0.012
#> SRR2105371 3 0.4735 0.67764 0.000 0.000 0.736 0.116 0.104 0.044
#> SRR2105372 3 0.3779 0.70578 0.000 0.000 0.812 0.080 0.076 0.032
#> SRR2105369 3 0.4625 0.62438 0.088 0.000 0.736 0.032 0.144 0.000
#> SRR2105370 3 0.5876 0.34681 0.148 0.000 0.556 0.024 0.272 0.000
#> SRR2105367 1 0.4000 0.46686 0.660 0.000 0.000 0.008 0.324 0.008
#> SRR2105368 1 0.5083 0.47838 0.628 0.000 0.028 0.020 0.304 0.020
#> SRR2105365 2 0.3244 0.34262 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR2105366 2 0.1444 0.47958 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR2105363 2 0.4436 0.40453 0.000 0.712 0.000 0.052 0.016 0.220
#> SRR2105364 2 0.3647 0.38740 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR2105361 2 0.3935 0.41679 0.000 0.688 0.000 0.016 0.004 0.292
#> SRR2105362 2 0.3499 0.41261 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105359 3 0.1874 0.73237 0.000 0.000 0.928 0.028 0.028 0.016
#> SRR2105360 3 0.2157 0.71749 0.076 0.000 0.904 0.008 0.008 0.004
#> SRR2105355 3 0.2582 0.73232 0.016 0.000 0.896 0.052 0.016 0.020
#> SRR2105356 3 0.3342 0.57017 0.228 0.000 0.760 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105353 3 0.6000 0.60837 0.000 0.004 0.632 0.148 0.100 0.116
#> SRR2105354 3 0.3953 0.70531 0.000 0.000 0.800 0.084 0.080 0.036
#> SRR2105351 2 0.2697 0.40725 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR2105352 4 0.4293 0.80368 0.000 0.016 0.004 0.584 0.000 0.396
#> SRR2105349 2 0.2562 0.41407 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR2105350 2 0.0951 0.47516 0.000 0.968 0.000 0.008 0.004 0.020
#> SRR2105345 6 0.5549 -0.06140 0.000 0.404 0.000 0.096 0.012 0.488
#> SRR2105346 2 0.4413 0.21632 0.000 0.496 0.000 0.012 0.008 0.484
#> SRR2105347 1 0.5365 0.47387 0.656 0.020 0.000 0.052 0.032 0.240
#> SRR2105348 1 0.3728 0.65559 0.800 0.004 0.000 0.032 0.020 0.144
#> SRR2105343 2 0.2730 0.46374 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105344 2 0.2814 0.46388 0.000 0.820 0.000 0.008 0.000 0.172
#> SRR2105341 3 0.4002 0.69889 0.000 0.000 0.792 0.100 0.080 0.028
#> SRR2105342 3 0.1930 0.72614 0.000 0.000 0.916 0.048 0.036 0.000
#> SRR2105339 3 0.5254 0.65351 0.000 0.000 0.692 0.148 0.076 0.084
#> SRR2105340 3 0.4632 0.68529 0.000 0.000 0.748 0.120 0.072 0.060
#> SRR2105335 5 0.5264 0.58274 0.124 0.000 0.160 0.020 0.684 0.012
#> SRR2105336 5 0.4556 0.53020 0.228 0.000 0.068 0.004 0.696 0.004
#> SRR2105337 3 0.4002 0.48689 0.284 0.000 0.692 0.016 0.008 0.000
#> SRR2105338 1 0.4231 0.48888 0.616 0.000 0.364 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105331 2 0.1845 0.46073 0.000 0.916 0.000 0.008 0.004 0.072
#> SRR2105332 2 0.1124 0.47697 0.000 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR2105333 2 0.4004 0.15917 0.000 0.620 0.000 0.000 0.012 0.368
#> SRR2105334 2 0.2964 0.38882 0.000 0.792 0.000 0.000 0.004 0.204
#> SRR2105329 4 0.8682 0.07307 0.000 0.264 0.192 0.284 0.140 0.120
#> SRR2105330 4 0.8678 -0.00587 0.000 0.272 0.168 0.288 0.140 0.132
#> SRR2105327 2 0.4502 0.05862 0.000 0.568 0.000 0.016 0.012 0.404
#> SRR2105328 2 0.4469 0.09541 0.000 0.584 0.000 0.012 0.016 0.388
#> SRR2105325 3 0.6149 0.59387 0.000 0.004 0.608 0.184 0.100 0.104
#> SRR2105326 3 0.6173 0.59434 0.000 0.004 0.608 0.176 0.108 0.104
#> SRR2105323 3 0.4342 0.58510 0.004 0.000 0.692 0.040 0.260 0.004
#> SRR2105324 3 0.4315 0.65293 0.096 0.000 0.768 0.032 0.104 0.000
#> SRR2105319 5 0.4085 0.62161 0.028 0.000 0.136 0.036 0.788 0.012
#> SRR2105320 5 0.5471 0.58134 0.076 0.000 0.208 0.036 0.664 0.016
#> SRR2105321 3 0.5531 0.64209 0.000 0.000 0.668 0.144 0.108 0.080
#> SRR2105322 3 0.5515 0.62893 0.000 0.000 0.664 0.164 0.072 0.100
#> SRR2105317 2 0.4348 0.13175 0.000 0.600 0.000 0.008 0.016 0.376
#> SRR2105318 2 0.2003 0.46093 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105315 3 0.8115 0.11291 0.000 0.224 0.400 0.196 0.096 0.084
#> SRR2105316 2 0.4686 0.32004 0.000 0.732 0.004 0.160 0.028 0.076
#> SRR2105313 2 0.0865 0.47282 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105314 2 0.0632 0.47876 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105311 6 0.7397 -0.42950 0.000 0.060 0.312 0.192 0.032 0.404
#> SRR2105312 6 0.7466 -0.41131 0.000 0.072 0.328 0.164 0.036 0.400
#> SRR2105307 1 0.1194 0.79933 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105308 1 0.0405 0.80042 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105309 3 0.2209 0.72547 0.000 0.000 0.904 0.052 0.040 0.004
#> SRR2105310 3 0.2766 0.72176 0.008 0.000 0.872 0.060 0.060 0.000
#> SRR2105305 3 0.3494 0.71071 0.000 0.000 0.828 0.072 0.080 0.020
#> SRR2105306 3 0.1396 0.72876 0.008 0.000 0.952 0.024 0.012 0.004
#> SRR2105303 2 0.2631 0.46231 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR2105304 4 0.4301 0.80328 0.000 0.016 0.004 0.580 0.000 0.400
#> SRR2105301 2 0.4446 0.02355 0.000 0.552 0.000 0.008 0.016 0.424
#> SRR2105302 2 0.2003 0.44642 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105299 5 0.7247 0.31750 0.000 0.048 0.084 0.272 0.488 0.108
#> SRR2105300 5 0.7344 0.30391 0.000 0.064 0.080 0.276 0.480 0.100
#> SRR2105297 1 0.4392 0.57019 0.728 0.008 0.000 0.032 0.020 0.212
#> SRR2105298 1 0.3876 0.63598 0.784 0.004 0.000 0.032 0.020 0.160
#> SRR2105295 2 0.4275 0.11094 0.000 0.592 0.000 0.004 0.016 0.388
#> SRR2105296 2 0.3925 0.22627 0.000 0.656 0.000 0.004 0.008 0.332
#> SRR2105293 3 0.5301 0.66326 0.004 0.008 0.712 0.124 0.060 0.092
#> SRR2105294 3 0.3945 0.71903 0.024 0.000 0.816 0.088 0.044 0.028
#> SRR2105291 3 0.6149 0.41263 0.268 0.004 0.592 0.060 0.032 0.044
#> SRR2105292 1 0.5753 0.48744 0.576 0.000 0.132 0.012 0.272 0.008
#> SRR2105289 3 0.3489 0.68399 0.132 0.000 0.820 0.020 0.008 0.020
#> SRR2105290 1 0.4080 0.26899 0.536 0.000 0.456 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.1129 0.80100 0.964 0.000 0.012 0.008 0.012 0.004
#> SRR2105288 1 0.0665 0.79725 0.980 0.000 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR2105285 2 0.3769 0.37832 0.000 0.768 0.000 0.024 0.016 0.192
#> SRR2105286 2 0.2647 0.44552 0.000 0.876 0.000 0.020 0.016 0.088
#> SRR2105283 2 0.7561 -0.21684 0.000 0.356 0.000 0.240 0.220 0.184
#> SRR2105284 2 0.7591 -0.24926 0.000 0.344 0.000 0.236 0.236 0.184
#> SRR2105281 2 0.3706 0.37739 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105282 2 0.3804 0.34482 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR2105259 3 0.5262 0.63176 0.000 0.000 0.672 0.104 0.184 0.040
#> SRR2105260 3 0.5093 0.65054 0.000 0.000 0.696 0.112 0.152 0.040
#> SRR2105279 2 0.3930 0.34473 0.000 0.576 0.000 0.000 0.004 0.420
#> SRR2105280 2 0.3804 0.34360 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR2105257 1 0.4958 0.57135 0.652 0.000 0.092 0.004 0.248 0.004
#> SRR2105258 1 0.3699 0.71670 0.796 0.000 0.036 0.012 0.152 0.004
#> SRR2105253 2 0.4179 0.34218 0.000 0.760 0.000 0.160 0.020 0.060
#> SRR2105254 2 0.2218 0.47105 0.000 0.884 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR2105255 3 0.5460 0.34127 0.076 0.000 0.576 0.028 0.320 0.000
#> SRR2105256 3 0.5826 0.38516 0.108 0.000 0.580 0.032 0.276 0.004
#> SRR2105251 2 0.1075 0.47566 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105252 2 0.1141 0.48010 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105249 6 0.7223 0.30832 0.008 0.252 0.004 0.236 0.068 0.432
#> SRR2105250 6 0.7481 0.39810 0.020 0.172 0.000 0.236 0.124 0.448
#> SRR2105247 2 0.3428 0.41681 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR2105248 2 0.3810 0.34363 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR2105245 3 0.6863 0.45021 0.024 0.116 0.596 0.076 0.024 0.164
#> SRR2105246 3 0.7192 0.27420 0.024 0.196 0.536 0.072 0.016 0.156
#> SRR2105243 3 0.4223 0.28418 0.368 0.000 0.612 0.016 0.004 0.000
#> SRR2105244 3 0.3300 0.64764 0.156 0.000 0.812 0.016 0.016 0.000
#> SRR2105241 1 0.4308 0.13679 0.516 0.000 0.468 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105242 1 0.2302 0.77577 0.872 0.000 0.120 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105239 3 0.4294 0.27943 0.388 0.000 0.592 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105240 1 0.0767 0.79927 0.976 0.000 0.000 0.004 0.012 0.008
#> SRR2105237 2 0.6353 -0.16764 0.000 0.436 0.000 0.136 0.044 0.384
#> SRR2105238 2 0.6776 -0.03643 0.000 0.504 0.000 0.236 0.148 0.112
#> SRR2105235 6 0.6548 0.25342 0.000 0.284 0.000 0.228 0.036 0.452
#> SRR2105236 6 0.6277 0.23544 0.000 0.272 0.000 0.216 0.024 0.488
#> SRR2105233 2 0.4332 0.04783 0.000 0.564 0.000 0.004 0.016 0.416
#> SRR2105234 2 0.4184 0.07308 0.000 0.576 0.000 0.000 0.016 0.408
#> SRR2105231 2 0.3531 0.40777 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105232 2 0.3756 0.39101 0.000 0.644 0.000 0.000 0.004 0.352
#> SRR2105227 3 0.4530 0.69741 0.064 0.060 0.796 0.040 0.020 0.020
#> SRR2105228 3 0.4836 0.32667 0.352 0.012 0.604 0.016 0.012 0.004
#> SRR2105225 3 0.2339 0.71853 0.072 0.000 0.896 0.012 0.020 0.000
#> SRR2105226 1 0.3121 0.73811 0.796 0.000 0.192 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105229 3 0.5815 0.64134 0.000 0.012 0.660 0.140 0.116 0.072
#> SRR2105230 3 0.4497 0.67338 0.000 0.000 0.744 0.096 0.136 0.024
#> SRR2105219 2 0.3991 0.35589 0.000 0.776 0.000 0.152 0.020 0.052
#> SRR2105220 2 0.5022 0.28172 0.000 0.692 0.000 0.168 0.028 0.112
#> SRR2105221 5 0.7440 -0.20237 0.012 0.088 0.000 0.228 0.372 0.300
#> SRR2105222 6 0.7632 0.23987 0.028 0.076 0.000 0.236 0.312 0.348
#> SRR2105223 3 0.3636 0.59723 0.196 0.000 0.772 0.016 0.016 0.000
#> SRR2105224 3 0.4323 0.29552 0.364 0.000 0.612 0.012 0.012 0.000
#> SRR2105217 2 0.2730 0.45790 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105218 2 0.3915 0.35111 0.000 0.584 0.000 0.000 0.004 0.412
#> SRR2105215 2 0.3797 0.34737 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR2105216 2 0.3695 0.37706 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105213 3 0.6726 0.37896 0.000 0.116 0.568 0.096 0.024 0.196
#> SRR2105214 3 0.6400 0.44859 0.000 0.100 0.604 0.096 0.020 0.180
#> SRR2105211 3 0.2893 0.72633 0.000 0.000 0.868 0.076 0.024 0.032
#> SRR2105212 3 0.2945 0.72603 0.012 0.000 0.868 0.064 0.052 0.004
#> SRR2105209 1 0.5081 0.43524 0.560 0.000 0.360 0.004 0.076 0.000
#> SRR2105210 1 0.3493 0.70071 0.756 0.000 0.228 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105207 1 0.4450 0.65216 0.720 0.000 0.084 0.000 0.188 0.008
#> SRR2105208 1 0.1275 0.79206 0.956 0.000 0.000 0.016 0.016 0.012
#> SRR2105205 2 0.3937 0.39397 0.000 0.792 0.000 0.080 0.020 0.108
#> SRR2105206 2 0.3837 0.39883 0.000 0.796 0.000 0.060 0.020 0.124
#> SRR2105201 6 0.7475 0.41223 0.012 0.116 0.000 0.232 0.220 0.420
#> SRR2105202 6 0.7604 0.30316 0.032 0.072 0.000 0.232 0.280 0.384
#> SRR2105203 2 0.1267 0.47840 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105204 2 0.3409 0.42061 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR2105199 2 0.3390 0.42030 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR2105200 2 0.4093 0.32076 0.000 0.552 0.000 0.004 0.004 0.440
#> SRR2105197 5 0.4214 0.60177 0.004 0.000 0.116 0.084 0.776 0.020
#> SRR2105198 5 0.3615 0.62724 0.004 0.000 0.112 0.056 0.816 0.012
#> SRR2105195 3 0.3052 0.68331 0.124 0.000 0.844 0.012 0.012 0.008
#> SRR2105196 1 0.4727 0.54655 0.636 0.008 0.316 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105193 1 0.3056 0.74528 0.804 0.000 0.184 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105194 1 0.2492 0.78534 0.876 0.000 0.100 0.020 0.000 0.004
#> SRR2105191 5 0.2730 0.66748 0.012 0.000 0.096 0.012 0.872 0.008
#> SRR2105192 5 0.3843 0.59337 0.184 0.000 0.028 0.008 0.772 0.008
#> SRR2105189 2 0.4887 0.27289 0.000 0.700 0.000 0.192 0.036 0.072
#> SRR2105190 2 0.3408 0.40168 0.000 0.828 0.000 0.112 0.024 0.036
#> SRR2105187 2 0.7238 -0.12785 0.000 0.428 0.000 0.252 0.164 0.156
#> SRR2105188 5 0.7629 -0.20067 0.000 0.240 0.000 0.232 0.332 0.196
#> SRR2105179 3 0.5184 0.34134 0.316 0.000 0.600 0.024 0.060 0.000
#> SRR2105180 5 0.6075 0.03894 0.400 0.000 0.076 0.036 0.476 0.012
#> SRR2105183 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105184 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105185 2 0.1806 0.47892 0.000 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR2105186 2 0.2996 0.44475 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR2105181 5 0.3794 0.62732 0.004 0.000 0.132 0.048 0.800 0.016
#> SRR2105182 5 0.4956 0.47099 0.004 0.000 0.256 0.088 0.648 0.004
#> SRR2105177 1 0.1520 0.80015 0.948 0.000 0.016 0.020 0.008 0.008
#> SRR2105178 1 0.1353 0.78990 0.952 0.000 0.000 0.024 0.012 0.012
#> SRR2105171 2 0.3385 0.44796 0.000 0.796 0.000 0.028 0.004 0.172
#> SRR2105172 2 0.4492 0.36298 0.000 0.620 0.000 0.036 0.004 0.340
#> SRR2105175 1 0.1210 0.80114 0.960 0.000 0.020 0.008 0.008 0.004
#> SRR2105176 1 0.1520 0.79900 0.948 0.000 0.016 0.020 0.008 0.008
#> SRR2105173 2 0.1444 0.47832 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR2105174 2 0.2003 0.47373 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105169 2 0.3717 0.37192 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105170 2 0.3823 0.33476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR2105167 2 0.3810 0.34078 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR2105168 2 0.3944 0.33861 0.000 0.568 0.000 0.000 0.004 0.428
#> SRR2105165 3 0.1780 0.73038 0.004 0.000 0.932 0.024 0.036 0.004
#> SRR2105166 3 0.3182 0.72593 0.016 0.000 0.852 0.044 0.084 0.004
#> SRR2105163 3 0.6295 0.55705 0.000 0.012 0.600 0.172 0.068 0.148
#> SRR2105164 3 0.5998 0.59415 0.000 0.012 0.632 0.168 0.060 0.128
#> SRR2105161 1 0.4211 0.54488 0.632 0.000 0.348 0.012 0.004 0.004
#> SRR2105162 1 0.0870 0.79467 0.972 0.000 0.000 0.012 0.012 0.004
#> SRR2105155 2 0.4039 0.33826 0.000 0.568 0.000 0.008 0.000 0.424
#> SRR2105156 2 0.4093 0.32044 0.000 0.552 0.000 0.004 0.004 0.440
#> SRR2105157 2 0.3244 0.44463 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR2105158 2 0.3499 0.41006 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105159 3 0.4135 0.70644 0.104 0.000 0.800 0.044 0.024 0.028
#> SRR2105160 1 0.2848 0.76033 0.828 0.000 0.160 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105153 2 0.1327 0.47948 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105154 2 0.1327 0.47779 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105151 2 0.4057 0.32906 0.000 0.556 0.000 0.008 0.000 0.436
#> SRR2105152 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105149 3 0.7061 0.53155 0.000 0.068 0.572 0.116 0.116 0.128
#> SRR2105150 3 0.4885 0.67222 0.000 0.004 0.728 0.100 0.128 0.040
#> SRR2105147 4 0.4006 0.78851 0.000 0.000 0.004 0.600 0.004 0.392
#> SRR2105148 4 0.4006 0.78851 0.000 0.000 0.004 0.600 0.004 0.392
#> SRR2105143 1 0.2827 0.78271 0.876 0.016 0.080 0.004 0.004 0.020
#> SRR2105144 1 0.0508 0.80051 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.2431 0.77110 0.860 0.000 0.132 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.3357 0.71421 0.764 0.000 0.224 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105141 2 0.3405 0.33265 0.000 0.724 0.000 0.000 0.004 0.272
#> SRR2105142 2 0.2300 0.42960 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR2105139 2 0.3747 0.36523 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR2105140 2 0.3823 0.33476 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR2105137 6 0.7891 0.31536 0.032 0.092 0.004 0.232 0.276 0.364
#> SRR2105138 5 0.7519 -0.21974 0.024 0.068 0.000 0.240 0.340 0.328
#> SRR2105135 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105136 2 0.3950 0.33548 0.000 0.564 0.000 0.000 0.004 0.432
#> SRR2105133 5 0.2157 0.66391 0.008 0.000 0.076 0.004 0.904 0.008
#> SRR2105134 5 0.2973 0.65696 0.068 0.000 0.064 0.004 0.860 0.004
#> SRR2105131 5 0.8849 -0.00868 0.004 0.192 0.144 0.260 0.272 0.128
#> SRR2105132 5 0.3931 0.63011 0.084 0.000 0.076 0.024 0.808 0.008
#> SRR2105129 1 0.0603 0.79761 0.980 0.000 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR2105130 1 0.1053 0.79424 0.964 0.000 0.000 0.020 0.004 0.012
#> SRR2105127 5 0.4566 0.00196 0.484 0.000 0.000 0.020 0.488 0.008
#> SRR2105128 1 0.4494 0.06027 0.512 0.000 0.000 0.012 0.464 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.902 0.913 0.965 0.5016 0.499 0.499
#> 3 3 0.607 0.741 0.875 0.3098 0.795 0.611
#> 4 4 0.670 0.752 0.865 0.1397 0.786 0.472
#> 5 5 0.701 0.696 0.832 0.0639 0.895 0.622
#> 6 6 0.711 0.630 0.762 0.0389 0.925 0.666
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.5842 0.82363 0.860 0.140
#> SRR2105276 1 0.2948 0.91851 0.948 0.052
#> SRR2105273 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105261 2 0.8909 0.54996 0.308 0.692
#> SRR2105262 1 0.9635 0.37782 0.612 0.388
#> SRR2105357 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.6623 0.78619 0.172 0.828
#> SRR2105440 2 0.8081 0.67066 0.248 0.752
#> SRR2105509 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105510 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105507 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105501 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105502 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105496 2 0.0376 0.96141 0.004 0.996
#> SRR2105493 2 0.0376 0.96140 0.004 0.996
#> SRR2105494 2 0.1414 0.94923 0.020 0.980
#> SRR2105491 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105489 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.4298 0.88250 0.912 0.088
#> SRR2105480 1 0.0672 0.95636 0.992 0.008
#> SRR2105477 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105478 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105475 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105476 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105473 1 0.9996 0.04343 0.512 0.488
#> SRR2105474 2 0.6531 0.79127 0.168 0.832
#> SRR2105471 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.0938 0.95591 0.012 0.988
#> SRR2105452 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105449 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105445 1 0.6438 0.79272 0.836 0.164
#> SRR2105446 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105443 2 0.1184 0.95236 0.016 0.984
#> SRR2105444 2 0.1633 0.94620 0.024 0.976
#> SRR2105441 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0376 0.96140 0.004 0.996
#> SRR2105437 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105430 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105427 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105428 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105425 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105421 2 0.9896 0.20675 0.440 0.560
#> SRR2105422 1 0.9393 0.45602 0.644 0.356
#> SRR2105423 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0376 0.95911 0.996 0.004
#> SRR2105415 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105402 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105399 2 0.0672 0.95847 0.008 0.992
#> SRR2105400 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105397 2 0.1633 0.94556 0.024 0.976
#> SRR2105398 2 0.0672 0.95845 0.008 0.992
#> SRR2105395 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105382 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105383 2 0.3879 0.89900 0.076 0.924
#> SRR2105384 2 0.2778 0.92607 0.048 0.952
#> SRR2105379 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105380 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105377 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.5629 0.83498 0.132 0.868
#> SRR2105375 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105376 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105373 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.5946 0.81771 0.856 0.144
#> SRR2105354 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105349 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.1843 0.94282 0.028 0.972
#> SRR2105346 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105347 1 1.0000 0.00602 0.504 0.496
#> SRR2105348 1 0.9427 0.42987 0.640 0.360
#> SRR2105343 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.3431 0.90628 0.936 0.064
#> SRR2105340 1 0.0376 0.95912 0.996 0.004
#> SRR2105335 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.6531 0.78929 0.168 0.832
#> SRR2105330 2 0.3114 0.91840 0.056 0.944
#> SRR2105327 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105325 1 0.1633 0.94357 0.976 0.024
#> SRR2105326 1 0.0938 0.95318 0.988 0.012
#> SRR2105323 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.1184 0.95002 0.984 0.016
#> SRR2105322 1 0.0938 0.95337 0.988 0.012
#> SRR2105317 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.8016 0.67560 0.244 0.756
#> SRR2105316 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105313 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105311 2 0.9491 0.41281 0.368 0.632
#> SRR2105312 2 0.9686 0.33961 0.396 0.604
#> SRR2105307 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0672 0.95629 0.992 0.008
#> SRR2105306 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105302 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.9866 0.24376 0.568 0.432
#> SRR2105300 2 0.9977 0.10589 0.472 0.528
#> SRR2105297 1 0.9866 0.23424 0.568 0.432
#> SRR2105298 1 0.9580 0.38055 0.620 0.380
#> SRR2105295 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.6887 0.76710 0.816 0.184
#> SRR2105294 1 0.0672 0.95625 0.992 0.008
#> SRR2105291 1 0.2603 0.92554 0.956 0.044
#> SRR2105292 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.1414 0.94683 0.980 0.020
#> SRR2105290 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105283 2 0.1184 0.95290 0.016 0.984
#> SRR2105284 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105281 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.2778 0.92613 0.048 0.952
#> SRR2105250 2 0.8955 0.55548 0.312 0.688
#> SRR2105247 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105245 2 0.9754 0.30757 0.408 0.592
#> SRR2105246 2 0.8909 0.55094 0.308 0.692
#> SRR2105243 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105238 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105235 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0376 0.96141 0.004 0.996
#> SRR2105233 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.3431 0.90805 0.936 0.064
#> SRR2105228 1 0.1184 0.94984 0.984 0.016
#> SRR2105225 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.7139 0.75046 0.804 0.196
#> SRR2105230 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.9087 0.52635 0.324 0.676
#> SRR2105222 2 0.8267 0.65038 0.260 0.740
#> SRR2105223 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105213 2 0.9552 0.39336 0.376 0.624
#> SRR2105214 2 0.9795 0.28308 0.416 0.584
#> SRR2105211 1 0.1184 0.95004 0.984 0.016
#> SRR2105212 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105206 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105201 2 0.2778 0.92527 0.048 0.952
#> SRR2105202 2 0.8386 0.63790 0.268 0.732
#> SRR2105203 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0672 0.95843 0.008 0.992
#> SRR2105197 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105195 1 0.0938 0.95328 0.988 0.012
#> SRR2105196 1 0.0938 0.95310 0.988 0.012
#> SRR2105193 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105190 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105188 2 0.4562 0.87665 0.096 0.904
#> SRR2105179 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105186 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105181 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.0672 0.95629 0.992 0.008
#> SRR2105176 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.8443 0.63020 0.728 0.272
#> SRR2105164 1 0.8555 0.61621 0.720 0.280
#> SRR2105161 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.9881 0.23223 0.564 0.436
#> SRR2105150 1 0.0672 0.95643 0.992 0.008
#> SRR2105147 2 0.3114 0.91604 0.056 0.944
#> SRR2105148 2 0.3114 0.91604 0.056 0.944
#> SRR2105143 1 0.2603 0.92553 0.956 0.044
#> SRR2105144 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105137 1 0.9977 0.09716 0.528 0.472
#> SRR2105138 1 0.9970 0.11819 0.532 0.468
#> SRR2105135 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.96422 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.8661 0.59755 0.712 0.288
#> SRR2105132 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105129 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
#> SRR2105128 1 0.0000 0.96188 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 1 0.4654 0.7118 0.792 0.000 0.208
#> SRR2105278 1 0.1643 0.8545 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105275 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105276 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105273 1 0.6244 0.2753 0.560 0.000 0.440
#> SRR2105274 1 0.5948 0.4869 0.640 0.000 0.360
#> SRR2105271 1 0.2878 0.8328 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105272 1 0.1031 0.8636 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105269 2 0.1643 0.8631 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105270 2 0.0424 0.8702 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105267 2 0.0892 0.8684 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105268 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0237 0.8706 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105264 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105261 3 0.0592 0.7963 0.000 0.012 0.988
#> SRR2105262 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105357 3 0.6008 0.4059 0.372 0.000 0.628
#> SRR2105358 1 0.6140 0.3361 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105439 2 0.5465 0.5873 0.288 0.712 0.000
#> SRR2105440 2 0.5327 0.6144 0.272 0.728 0.000
#> SRR2105509 2 0.6291 0.3199 0.000 0.532 0.468
#> SRR2105510 2 0.6140 0.4809 0.000 0.596 0.404
#> SRR2105507 3 0.5529 0.5525 0.296 0.000 0.704
#> SRR2105508 3 0.5397 0.5864 0.280 0.000 0.720
#> SRR2105505 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.1964 0.8590 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105504 3 0.5178 0.5377 0.000 0.256 0.744
#> SRR2105501 2 0.4121 0.7994 0.000 0.832 0.168
#> SRR2105502 3 0.5560 0.4418 0.000 0.300 0.700
#> SRR2105499 1 0.6026 0.4539 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105500 1 0.1529 0.8597 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105497 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105498 2 0.0237 0.8695 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105495 2 0.1399 0.8680 0.004 0.968 0.028
#> SRR2105496 2 0.1453 0.8582 0.024 0.968 0.008
#> SRR2105493 2 0.2903 0.8425 0.028 0.924 0.048
#> SRR2105494 2 0.3973 0.7999 0.088 0.880 0.032
#> SRR2105491 2 0.4178 0.7955 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105492 2 0.4121 0.7985 0.000 0.832 0.168
#> SRR2105489 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0237 0.8695 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105487 1 0.1031 0.8612 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105488 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.4887 0.7087 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105486 1 0.3619 0.8071 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105483 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.5254 0.6523 0.736 0.000 0.264
#> SRR2105482 1 0.0237 0.8670 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105479 3 0.2400 0.7888 0.064 0.004 0.932
#> SRR2105480 3 0.5873 0.5329 0.312 0.004 0.684
#> SRR2105477 2 0.2165 0.8574 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105478 2 0.1765 0.8507 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105475 3 0.5465 0.4708 0.000 0.288 0.712
#> SRR2105476 2 0.6280 0.3429 0.000 0.540 0.460
#> SRR2105473 1 0.6302 0.0277 0.520 0.480 0.000
#> SRR2105474 2 0.5650 0.5433 0.312 0.688 0.000
#> SRR2105471 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.0424 0.8680 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105469 3 0.5882 0.4582 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105470 1 0.5785 0.5534 0.668 0.000 0.332
#> SRR2105467 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0592 0.8662 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105466 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.4178 0.7964 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105460 2 0.4346 0.7865 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105457 3 0.4654 0.6789 0.208 0.000 0.792
#> SRR2105458 3 0.3267 0.7626 0.116 0.000 0.884
#> SRR2105455 1 0.3816 0.7938 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105456 1 0.3038 0.8257 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105453 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.5298 0.7598 0.032 0.804 0.164
#> SRR2105452 3 0.3686 0.7135 0.000 0.140 0.860
#> SRR2105449 1 0.5058 0.6819 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105450 1 0.2165 0.8495 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105447 2 0.5835 0.6013 0.000 0.660 0.340
#> SRR2105448 2 0.4605 0.7699 0.000 0.796 0.204
#> SRR2105445 3 0.4324 0.7695 0.112 0.028 0.860
#> SRR2105446 1 0.6008 0.4216 0.628 0.000 0.372
#> SRR2105443 3 0.3686 0.7125 0.000 0.140 0.860
#> SRR2105444 2 0.7475 0.4532 0.044 0.580 0.376
#> SRR2105441 2 0.1411 0.8546 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105442 2 0.1529 0.8520 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105437 1 0.6126 0.3149 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105438 1 0.6154 0.2910 0.592 0.000 0.408
#> SRR2105435 1 0.4178 0.7680 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105436 1 0.4887 0.7130 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105433 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 3 0.5363 0.5005 0.000 0.276 0.724
#> SRR2105430 3 0.5650 0.4183 0.000 0.312 0.688
#> SRR2105427 2 0.4504 0.7774 0.000 0.804 0.196
#> SRR2105428 2 0.3686 0.8196 0.000 0.860 0.140
#> SRR2105425 2 0.3619 0.8205 0.000 0.864 0.136
#> SRR2105426 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105421 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105422 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.4750 0.6726 0.216 0.000 0.784
#> SRR2105420 3 0.4346 0.7137 0.184 0.000 0.816
#> SRR2105415 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.6026 0.5376 0.000 0.624 0.376
#> SRR2105414 2 0.6008 0.5445 0.000 0.628 0.372
#> SRR2105409 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105410 2 0.1753 0.8470 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105407 3 0.2878 0.7737 0.096 0.000 0.904
#> SRR2105408 3 0.3340 0.7591 0.120 0.000 0.880
#> SRR2105403 1 0.3192 0.8194 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105404 1 0.2165 0.8460 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105405 1 0.1860 0.8549 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105406 1 0.1163 0.8625 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105401 3 0.6307 -0.1856 0.000 0.488 0.512
#> SRR2105402 3 0.4346 0.6569 0.000 0.184 0.816
#> SRR2105399 3 0.3816 0.7027 0.000 0.148 0.852
#> SRR2105400 3 0.4178 0.6730 0.000 0.172 0.828
#> SRR2105397 3 0.2165 0.7787 0.000 0.064 0.936
#> SRR2105398 3 0.2066 0.7804 0.000 0.060 0.940
#> SRR2105395 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.2165 0.7864 0.064 0.000 0.936
#> SRR2105390 3 0.3816 0.7374 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105391 3 0.2066 0.7875 0.060 0.000 0.940
#> SRR2105392 3 0.3551 0.7503 0.132 0.000 0.868
#> SRR2105385 1 0.5591 0.6018 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105386 1 0.6140 0.3682 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105387 1 0.1643 0.8573 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105388 1 0.0747 0.8654 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105381 3 0.5327 0.5056 0.000 0.272 0.728
#> SRR2105382 2 0.6252 0.3838 0.000 0.556 0.444
#> SRR2105383 2 0.6045 0.3820 0.380 0.620 0.000
#> SRR2105384 2 0.5835 0.4749 0.340 0.660 0.000
#> SRR2105379 2 0.5785 0.6146 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105380 2 0.5178 0.7176 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105377 2 0.2537 0.8235 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105378 2 0.4654 0.6941 0.208 0.792 0.000
#> SRR2105375 1 0.0424 0.8672 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105376 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105373 3 0.6295 0.0636 0.472 0.000 0.528
#> SRR2105374 1 0.6168 0.2824 0.588 0.000 0.412
#> SRR2105371 3 0.3752 0.7411 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105372 3 0.4002 0.7269 0.160 0.000 0.840
#> SRR2105369 1 0.4346 0.7604 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105370 1 0.2165 0.8503 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105367 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105365 2 0.4504 0.7768 0.000 0.804 0.196
#> SRR2105366 2 0.1643 0.8626 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105363 2 0.0237 0.8707 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105364 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 3 0.4654 0.6950 0.208 0.000 0.792
#> SRR2105360 1 0.6225 0.2892 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105355 3 0.4931 0.6510 0.232 0.000 0.768
#> SRR2105356 1 0.5216 0.6586 0.740 0.000 0.260
#> SRR2105353 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105354 3 0.3482 0.7536 0.128 0.000 0.872
#> SRR2105351 2 0.4399 0.7833 0.000 0.812 0.188
#> SRR2105352 3 0.4346 0.6569 0.000 0.184 0.816
#> SRR2105349 2 0.4452 0.7797 0.000 0.808 0.192
#> SRR2105350 2 0.2711 0.8451 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105345 2 0.2959 0.8083 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105346 2 0.0747 0.8645 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105347 1 0.5363 0.5560 0.724 0.276 0.000
#> SRR2105348 1 0.4555 0.6546 0.800 0.200 0.000
#> SRR2105343 2 0.1163 0.8669 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105344 2 0.1031 0.8682 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105341 3 0.3686 0.7447 0.140 0.000 0.860
#> SRR2105342 3 0.5291 0.5945 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105339 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105340 3 0.0424 0.7977 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105335 1 0.1529 0.8605 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105336 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.3816 0.7926 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105338 1 0.0237 0.8670 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105331 2 0.4346 0.7870 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105332 2 0.0592 0.8699 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105333 2 0.5497 0.6736 0.000 0.708 0.292
#> SRR2105334 2 0.5098 0.7260 0.000 0.752 0.248
#> SRR2105329 3 0.1031 0.7934 0.000 0.024 0.976
#> SRR2105330 3 0.3375 0.7724 0.008 0.100 0.892
#> SRR2105327 2 0.5926 0.5748 0.000 0.644 0.356
#> SRR2105328 2 0.5882 0.5881 0.000 0.652 0.348
#> SRR2105325 3 0.0237 0.7980 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105326 3 0.0237 0.7980 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105323 1 0.6295 0.1681 0.528 0.000 0.472
#> SRR2105324 1 0.3551 0.8082 0.868 0.000 0.132
#> SRR2105319 1 0.5497 0.5888 0.708 0.000 0.292
#> SRR2105320 1 0.3879 0.7770 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105321 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105322 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105317 2 0.5397 0.6886 0.000 0.720 0.280
#> SRR2105318 2 0.3340 0.8293 0.000 0.880 0.120
#> SRR2105315 3 0.0424 0.7978 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105316 2 0.5678 0.6422 0.000 0.684 0.316
#> SRR2105313 2 0.3116 0.8360 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105314 2 0.1753 0.8618 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105311 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105312 3 0.0424 0.7970 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105307 1 0.0592 0.8662 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105308 1 0.0592 0.8662 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105309 3 0.5058 0.6349 0.244 0.000 0.756
#> SRR2105310 3 0.5706 0.4908 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105305 3 0.2796 0.7762 0.092 0.000 0.908
#> SRR2105306 3 0.4605 0.6829 0.204 0.000 0.796
#> SRR2105303 2 0.0424 0.8702 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105304 3 0.6280 -0.0897 0.000 0.460 0.540
#> SRR2105301 2 0.6274 0.3532 0.000 0.544 0.456
#> SRR2105302 2 0.4062 0.8012 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105299 3 0.0829 0.7963 0.012 0.004 0.984
#> SRR2105300 3 0.1315 0.7943 0.020 0.008 0.972
#> SRR2105297 1 0.5397 0.5516 0.720 0.280 0.000
#> SRR2105298 1 0.4654 0.6471 0.792 0.208 0.000
#> SRR2105295 2 0.5785 0.6150 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105296 2 0.5016 0.7347 0.000 0.760 0.240
#> SRR2105293 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105294 3 0.5098 0.6279 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105291 1 0.4128 0.7994 0.856 0.012 0.132
#> SRR2105292 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.5621 0.5027 0.308 0.000 0.692
#> SRR2105290 1 0.1753 0.8560 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105287 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.5465 0.6786 0.000 0.712 0.288
#> SRR2105286 2 0.5178 0.7169 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105283 2 0.3780 0.8247 0.044 0.892 0.064
#> SRR2105284 2 0.3083 0.8288 0.060 0.916 0.024
#> SRR2105281 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.2537 0.7805 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105260 3 0.2959 0.7712 0.100 0.000 0.900
#> SRR2105279 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.3267 0.8312 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105254 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105255 1 0.3686 0.8012 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105256 1 0.2711 0.8374 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105251 2 0.2261 0.8540 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105252 2 0.1411 0.8652 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105249 2 0.3752 0.7656 0.144 0.856 0.000
#> SRR2105250 2 0.6305 0.0907 0.484 0.516 0.000
#> SRR2105247 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.3670 0.7644 0.020 0.092 0.888
#> SRR2105246 3 0.4663 0.6959 0.016 0.156 0.828
#> SRR2105243 1 0.1643 0.8585 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105244 1 0.4121 0.7767 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105241 1 0.1411 0.8609 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105242 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.3267 0.8192 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105240 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105237 3 0.5497 0.4588 0.000 0.292 0.708
#> SRR2105238 2 0.3038 0.8417 0.000 0.896 0.104
#> SRR2105235 2 0.0237 0.8695 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105236 2 0.1753 0.8471 0.048 0.952 0.000
#> SRR2105233 2 0.6111 0.4981 0.000 0.604 0.396
#> SRR2105234 2 0.5988 0.5538 0.000 0.632 0.368
#> SRR2105231 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 3 0.6917 0.4115 0.368 0.024 0.608
#> SRR2105228 1 0.2682 0.8439 0.920 0.004 0.076
#> SRR2105225 1 0.5591 0.5957 0.696 0.000 0.304
#> SRR2105226 1 0.1163 0.8635 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105229 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105230 3 0.5016 0.6345 0.240 0.000 0.760
#> SRR2105219 2 0.1031 0.8681 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105220 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105221 2 0.6079 0.3807 0.388 0.612 0.000
#> SRR2105222 2 0.5882 0.4738 0.348 0.652 0.000
#> SRR2105223 1 0.3482 0.8089 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105224 1 0.2356 0.8449 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105217 2 0.0237 0.8706 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105218 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.2774 0.7759 0.008 0.072 0.920
#> SRR2105214 3 0.2066 0.7821 0.000 0.060 0.940
#> SRR2105211 3 0.3192 0.7680 0.112 0.000 0.888
#> SRR2105212 3 0.5785 0.4621 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105209 1 0.0592 0.8666 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105210 1 0.0237 0.8670 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105207 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.4750 0.7601 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105206 2 0.5529 0.6682 0.000 0.704 0.296
#> SRR2105201 2 0.4346 0.7241 0.184 0.816 0.000
#> SRR2105202 2 0.6045 0.3992 0.380 0.620 0.000
#> SRR2105203 2 0.1163 0.8668 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105204 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.1529 0.8518 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105197 3 0.6192 0.2565 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105198 1 0.6299 0.0599 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105195 3 0.6209 0.4065 0.368 0.004 0.628
#> SRR2105196 1 0.1832 0.8555 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105193 1 0.0237 0.8670 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105194 1 0.0424 0.8667 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105191 1 0.3686 0.7944 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105192 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.5291 0.7037 0.000 0.732 0.268
#> SRR2105190 2 0.3752 0.8149 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105187 2 0.5692 0.7092 0.008 0.724 0.268
#> SRR2105188 2 0.5180 0.7313 0.156 0.812 0.032
#> SRR2105179 1 0.0747 0.8663 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105180 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0237 0.8695 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105185 2 0.3482 0.8248 0.000 0.872 0.128
#> SRR2105186 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105181 1 0.6286 0.1613 0.536 0.000 0.464
#> SRR2105182 1 0.6302 0.1235 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105177 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0237 0.8706 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105172 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.0237 0.8672 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105176 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.1753 0.8616 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105174 2 0.0592 0.8697 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105169 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0892 0.8626 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.5560 0.5336 0.300 0.000 0.700
#> SRR2105166 3 0.5905 0.4162 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105163 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105164 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105161 1 0.1529 0.8609 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0424 0.8702 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105158 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 3 0.5760 0.5098 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105160 1 0.0892 0.8649 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105153 2 0.1289 0.8660 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105154 2 0.1860 0.8602 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105151 2 0.0237 0.8695 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.0000 0.7980 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105150 3 0.1860 0.7916 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105147 3 0.2537 0.7701 0.000 0.080 0.920
#> SRR2105148 3 0.2537 0.7701 0.000 0.080 0.920
#> SRR2105143 1 0.2339 0.8398 0.940 0.048 0.012
#> SRR2105144 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.1163 0.8627 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105146 1 0.1163 0.8627 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105141 2 0.4654 0.7658 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105142 2 0.4346 0.7867 0.000 0.816 0.184
#> SRR2105139 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 1 0.6045 0.3484 0.620 0.380 0.000
#> SRR2105138 2 0.6307 0.0822 0.488 0.512 0.000
#> SRR2105135 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.8707 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 1 0.5882 0.4595 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105134 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.9413 0.1249 0.468 0.184 0.348
#> SRR2105132 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105129 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105128 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.5410 0.6797 0.192 0.080 0.728 0.000
#> SRR2105278 3 0.6611 0.1013 0.456 0.080 0.464 0.000
#> SRR2105275 3 0.2530 0.7725 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105276 3 0.1792 0.7997 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105273 3 0.2647 0.7801 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR2105274 3 0.3528 0.7295 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR2105271 1 0.3311 0.7565 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 4 0.3569 0.7140 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR2105270 2 0.4992 0.2340 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105267 4 0.3726 0.6890 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR2105268 2 0.4522 0.6500 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105265 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105266 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105263 2 0.4972 0.3094 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR2105264 2 0.2216 0.8803 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105261 4 0.4790 0.3920 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR2105262 3 0.4477 0.5233 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR2105357 3 0.3198 0.7824 0.040 0.080 0.880 0.000
#> SRR2105358 3 0.4231 0.7564 0.096 0.080 0.824 0.000
#> SRR2105439 2 0.0895 0.8364 0.004 0.976 0.020 0.000
#> SRR2105440 2 0.1297 0.8320 0.016 0.964 0.020 0.000
#> SRR2105509 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105510 4 0.0188 0.8548 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR2105507 3 0.1902 0.8070 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR2105508 3 0.1824 0.8072 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR2105505 1 0.0336 0.8874 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105503 4 0.3942 0.6710 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR2105504 4 0.1716 0.8288 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR2105501 4 0.4193 0.6135 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR2105502 4 0.1474 0.8362 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR2105499 3 0.3486 0.7360 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR2105500 1 0.2921 0.7877 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105497 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105498 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105495 2 0.4387 0.6880 0.000 0.776 0.024 0.200
#> SRR2105496 2 0.4204 0.7204 0.000 0.788 0.020 0.192
#> SRR2105493 2 0.3279 0.7981 0.000 0.872 0.032 0.096
#> SRR2105494 2 0.2958 0.8194 0.004 0.896 0.028 0.072
#> SRR2105491 4 0.0921 0.8513 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105492 4 0.0707 0.8534 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105489 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105490 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105487 1 0.5522 0.6185 0.716 0.080 0.204 0.000
#> SRR2105488 1 0.5032 0.6963 0.764 0.080 0.156 0.000
#> SRR2105485 3 0.4746 0.6015 0.304 0.008 0.688 0.000
#> SRR2105486 3 0.5212 0.3584 0.420 0.008 0.572 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.4999 -0.0989 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105479 3 0.6525 0.5251 0.116 0.000 0.612 0.272
#> SRR2105480 3 0.6182 0.5420 0.308 0.000 0.616 0.076
#> SRR2105477 4 0.5688 0.1911 0.000 0.464 0.024 0.512
#> SRR2105478 2 0.3409 0.8088 0.008 0.872 0.024 0.096
#> SRR2105475 4 0.1474 0.8363 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR2105476 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.3806 0.7181 0.156 0.824 0.020 0.000
#> SRR2105474 2 0.1174 0.8337 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR2105471 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105472 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105469 3 0.2480 0.7957 0.088 0.000 0.904 0.008
#> SRR2105470 3 0.4008 0.6823 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR2105467 1 0.4499 0.7587 0.804 0.072 0.124 0.000
#> SRR2105468 1 0.0592 0.8849 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.2589 0.8709 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105462 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105459 4 0.0921 0.8529 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105460 4 0.1022 0.8501 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105457 3 0.0804 0.8130 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR2105458 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105455 1 0.3610 0.7155 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105456 1 0.2530 0.8158 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105453 1 0.2635 0.8308 0.904 0.076 0.020 0.000
#> SRR2105454 1 0.2413 0.8406 0.916 0.064 0.020 0.000
#> SRR2105451 2 0.5522 0.6297 0.000 0.716 0.080 0.204
#> SRR2105452 4 0.2149 0.8139 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR2105449 1 0.3873 0.6769 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR2105450 1 0.1792 0.8538 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105447 4 0.0524 0.8561 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR2105448 4 0.1022 0.8513 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105445 3 0.3948 0.7770 0.016 0.096 0.852 0.036
#> SRR2105446 3 0.4753 0.7377 0.128 0.084 0.788 0.000
#> SRR2105443 4 0.4244 0.7208 0.000 0.032 0.168 0.800
#> SRR2105444 4 0.6106 0.5353 0.000 0.332 0.064 0.604
#> SRR2105441 2 0.1211 0.8694 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105442 2 0.1118 0.8677 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105437 3 0.6316 0.4821 0.324 0.080 0.596 0.000
#> SRR2105438 3 0.6261 0.5049 0.312 0.080 0.608 0.000
#> SRR2105435 1 0.4522 0.6076 0.728 0.004 0.264 0.004
#> SRR2105436 3 0.4655 0.5858 0.312 0.004 0.684 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 4 0.1716 0.8277 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR2105430 4 0.1637 0.8307 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR2105427 4 0.4483 0.5937 0.000 0.284 0.004 0.712
#> SRR2105428 4 0.4284 0.7411 0.000 0.200 0.020 0.780
#> SRR2105425 4 0.3444 0.7425 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR2105426 2 0.2868 0.8606 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105421 3 0.4585 0.4711 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR2105422 3 0.4103 0.6126 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105423 2 0.2589 0.8711 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105424 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105419 3 0.0657 0.8130 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR2105420 3 0.0804 0.8134 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105415 1 0.0804 0.8814 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105414 4 0.0336 0.8541 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105409 2 0.3266 0.8398 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105410 2 0.1798 0.8606 0.000 0.944 0.016 0.040
#> SRR2105411 2 0.3569 0.8155 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105412 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105407 3 0.0188 0.8116 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105408 3 0.0376 0.8115 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105403 3 0.5962 0.5973 0.260 0.080 0.660 0.000
#> SRR2105404 3 0.6412 0.4273 0.348 0.080 0.572 0.000
#> SRR2105405 1 0.1557 0.8624 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105406 1 0.0707 0.8817 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105401 4 0.2413 0.8372 0.000 0.064 0.020 0.916
#> SRR2105402 4 0.1940 0.8212 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR2105399 4 0.2408 0.8028 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR2105400 4 0.2216 0.8112 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR2105397 4 0.5200 0.5770 0.000 0.036 0.264 0.700
#> SRR2105398 4 0.3791 0.7050 0.000 0.004 0.200 0.796
#> SRR2105395 2 0.2081 0.8819 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105396 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105393 2 0.4040 0.7570 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105394 2 0.3172 0.8455 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105389 3 0.0707 0.8116 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105390 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105391 3 0.0707 0.8116 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105392 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105385 3 0.4134 0.6601 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR2105386 3 0.4164 0.6486 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR2105387 1 0.1474 0.8662 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105388 1 0.0469 0.8862 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105381 4 0.1637 0.8307 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR2105382 4 0.0336 0.8541 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2105383 2 0.3166 0.8117 0.116 0.868 0.000 0.016
#> SRR2105384 2 0.3598 0.8055 0.124 0.848 0.000 0.028
#> SRR2105379 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105380 4 0.0336 0.8554 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105377 2 0.0707 0.8381 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR2105378 2 0.1362 0.8450 0.004 0.964 0.020 0.012
#> SRR2105375 1 0.0657 0.8864 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105376 1 0.0188 0.8883 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105373 3 0.3088 0.7882 0.052 0.060 0.888 0.000
#> SRR2105374 3 0.5727 0.6378 0.228 0.080 0.692 0.000
#> SRR2105371 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105372 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105369 3 0.4746 0.4715 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR2105370 1 0.4608 0.5113 0.692 0.004 0.304 0.000
#> SRR2105367 1 0.1677 0.8634 0.948 0.040 0.012 0.000
#> SRR2105368 1 0.1706 0.8635 0.948 0.036 0.016 0.000
#> SRR2105365 4 0.0592 0.8545 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105366 4 0.2704 0.7970 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR2105363 2 0.4277 0.6951 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR2105364 2 0.2149 0.8816 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105361 2 0.2973 0.8552 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105362 2 0.2973 0.8563 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105359 3 0.1888 0.8120 0.044 0.000 0.940 0.016
#> SRR2105360 3 0.4040 0.6644 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR2105355 3 0.1489 0.8116 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR2105356 3 0.4996 0.1132 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR2105353 3 0.2149 0.7887 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105354 3 0.0779 0.8123 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR2105351 4 0.0921 0.8513 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105352 4 0.1940 0.8212 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR2105349 4 0.0707 0.8535 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105350 4 0.2408 0.8102 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105345 2 0.1743 0.8766 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR2105346 2 0.1940 0.8817 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105347 2 0.5623 0.2539 0.416 0.564 0.008 0.012
#> SRR2105348 1 0.4991 0.3510 0.608 0.388 0.004 0.000
#> SRR2105343 4 0.4454 0.5291 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR2105344 4 0.4996 -0.0677 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105341 3 0.0804 0.8132 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR2105342 3 0.1109 0.8119 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR2105339 3 0.1716 0.8013 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105340 3 0.1022 0.8106 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105335 1 0.4630 0.6129 0.732 0.016 0.252 0.000
#> SRR2105336 1 0.0469 0.8862 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.4624 0.4552 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105331 4 0.1022 0.8510 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105332 4 0.4522 0.4768 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105333 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105334 4 0.0592 0.8548 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105329 3 0.6228 0.3556 0.000 0.064 0.572 0.364
#> SRR2105330 3 0.5742 0.6732 0.000 0.120 0.712 0.168
#> SRR2105327 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105328 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105325 3 0.1867 0.7981 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105326 3 0.1867 0.7981 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105323 3 0.2775 0.7970 0.084 0.020 0.896 0.000
#> SRR2105324 3 0.5080 0.3626 0.420 0.004 0.576 0.000
#> SRR2105319 3 0.5284 0.4938 0.368 0.016 0.616 0.000
#> SRR2105320 1 0.4643 0.3938 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR2105321 3 0.1557 0.8045 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105322 3 0.1637 0.8030 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105317 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105318 4 0.2647 0.8034 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR2105315 3 0.4365 0.7164 0.000 0.028 0.784 0.188
#> SRR2105316 4 0.0707 0.8542 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105313 4 0.1940 0.8287 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR2105314 4 0.3688 0.6956 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR2105311 4 0.4925 0.2650 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR2105312 4 0.4866 0.3349 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR2105307 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 3 0.1004 0.8123 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR2105310 3 0.0817 0.8122 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR2105305 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105306 3 0.0804 0.8129 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR2105303 2 0.4855 0.4692 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105304 4 0.1118 0.8446 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR2105301 4 0.0469 0.8530 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR2105302 4 0.0707 0.8535 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105299 3 0.3833 0.7759 0.000 0.080 0.848 0.072
#> SRR2105300 3 0.4411 0.7492 0.000 0.080 0.812 0.108
#> SRR2105297 1 0.4972 0.1287 0.544 0.456 0.000 0.000
#> SRR2105298 1 0.4522 0.4993 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR2105295 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105296 4 0.0336 0.8550 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105293 3 0.4072 0.6137 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105294 3 0.3598 0.7745 0.124 0.000 0.848 0.028
#> SRR2105291 1 0.5621 0.5643 0.684 0.048 0.264 0.004
#> SRR2105292 1 0.0188 0.8883 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105289 3 0.6653 0.4621 0.328 0.000 0.568 0.104
#> SRR2105290 1 0.1302 0.8696 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105285 4 0.0188 0.8556 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105286 4 0.0336 0.8553 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105283 2 0.4274 0.7420 0.000 0.808 0.044 0.148
#> SRR2105284 2 0.2965 0.8116 0.000 0.892 0.036 0.072
#> SRR2105281 2 0.2408 0.8768 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105282 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105259 3 0.0336 0.8121 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105260 3 0.0469 0.8125 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105279 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105280 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105257 1 0.0188 0.8883 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 4 0.2011 0.8293 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105254 2 0.4746 0.5551 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR2105255 3 0.5298 0.4575 0.372 0.016 0.612 0.000
#> SRR2105256 1 0.5080 0.1862 0.576 0.004 0.420 0.000
#> SRR2105251 4 0.3024 0.7735 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105252 4 0.3356 0.7378 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR2105249 2 0.1271 0.8467 0.012 0.968 0.012 0.008
#> SRR2105250 2 0.1624 0.8289 0.028 0.952 0.020 0.000
#> SRR2105247 2 0.3172 0.8455 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105248 2 0.2081 0.8816 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105245 4 0.5522 0.5385 0.044 0.000 0.288 0.668
#> SRR2105246 4 0.5201 0.6485 0.044 0.004 0.220 0.732
#> SRR2105243 1 0.2530 0.8191 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105244 1 0.4898 0.2322 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR2105241 1 0.0469 0.8859 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.2921 0.7955 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105237 4 0.2335 0.8224 0.000 0.060 0.020 0.920
#> SRR2105238 4 0.5038 0.6270 0.000 0.296 0.020 0.684
#> SRR2105235 2 0.0804 0.8523 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR2105236 2 0.1151 0.8589 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR2105233 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105234 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.3024 0.8554 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105232 2 0.2760 0.8652 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105227 3 0.7645 0.2374 0.360 0.000 0.428 0.212
#> SRR2105228 1 0.1557 0.8596 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105225 3 0.3975 0.6847 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR2105226 1 0.0188 0.8884 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105229 3 0.2149 0.7899 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105230 3 0.0672 0.8129 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR2105219 4 0.4331 0.5504 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR2105220 2 0.4866 0.4769 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105221 2 0.3037 0.7746 0.100 0.880 0.020 0.000
#> SRR2105222 2 0.2174 0.8118 0.052 0.928 0.020 0.000
#> SRR2105223 1 0.4941 0.1695 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR2105224 1 0.3610 0.7159 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105217 2 0.4992 0.2524 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105218 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105215 2 0.2281 0.8793 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105216 2 0.2281 0.8792 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR2105213 4 0.4868 0.5436 0.012 0.000 0.304 0.684
#> SRR2105214 4 0.4585 0.5008 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR2105211 3 0.0927 0.8137 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR2105212 3 0.1302 0.8099 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR2105209 1 0.1022 0.8795 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0657 0.8838 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.0707 0.8550 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105206 4 0.0000 0.8555 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105201 2 0.0895 0.8364 0.004 0.976 0.020 0.000
#> SRR2105202 2 0.1174 0.8339 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR2105203 4 0.3024 0.7681 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105204 2 0.3569 0.8151 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105199 2 0.3649 0.8035 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105200 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105197 3 0.3764 0.7721 0.072 0.076 0.852 0.000
#> SRR2105198 3 0.5011 0.7175 0.160 0.076 0.764 0.000
#> SRR2105195 3 0.6574 0.3969 0.364 0.000 0.548 0.088
#> SRR2105196 1 0.1124 0.8798 0.972 0.004 0.012 0.012
#> SRR2105193 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 3 0.6316 0.4816 0.324 0.080 0.596 0.000
#> SRR2105192 1 0.2706 0.8273 0.900 0.080 0.020 0.000
#> SRR2105189 4 0.1302 0.8485 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR2105190 4 0.2011 0.8297 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR2105187 4 0.3958 0.7752 0.000 0.160 0.024 0.816
#> SRR2105188 2 0.2936 0.8196 0.036 0.908 0.024 0.032
#> SRR2105179 1 0.3142 0.8018 0.860 0.008 0.132 0.000
#> SRR2105180 1 0.1798 0.8615 0.944 0.040 0.016 0.000
#> SRR2105183 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105184 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105185 4 0.2281 0.8216 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR2105186 2 0.4522 0.6496 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR2105181 3 0.4525 0.7471 0.116 0.080 0.804 0.000
#> SRR2105182 3 0.4070 0.7596 0.132 0.044 0.824 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.4661 0.5951 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105172 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105175 1 0.0188 0.8881 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 4 0.4679 0.4026 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105174 2 0.4866 0.4575 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105169 2 0.2216 0.8803 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105170 2 0.2125 0.8817 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR2105167 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105168 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105165 3 0.1022 0.8116 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105166 3 0.1792 0.8073 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR2105163 3 0.3726 0.6764 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR2105164 3 0.4543 0.4980 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR2105161 1 0.0707 0.8834 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.2149 0.8810 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105156 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105157 4 0.4994 -0.0540 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR2105158 2 0.3528 0.8199 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105159 1 0.6332 -0.0486 0.488 0.000 0.452 0.060
#> SRR2105160 1 0.0336 0.8869 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105153 4 0.2760 0.7918 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR2105154 4 0.2081 0.8234 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR2105151 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105152 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105149 3 0.3942 0.6429 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105150 3 0.1042 0.8145 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR2105147 4 0.3024 0.7638 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR2105148 4 0.3074 0.7597 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR2105143 1 0.0817 0.8780 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105144 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.0469 0.8854 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105146 1 0.0469 0.8854 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105141 4 0.0707 0.8534 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105142 4 0.1022 0.8505 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105139 2 0.2216 0.8797 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105140 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105137 2 0.3392 0.7563 0.124 0.856 0.020 0.000
#> SRR2105138 2 0.4576 0.6106 0.232 0.748 0.020 0.000
#> SRR2105135 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105136 2 0.2011 0.8823 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105133 3 0.5122 0.7073 0.164 0.080 0.756 0.000
#> SRR2105134 1 0.5879 0.5518 0.672 0.080 0.248 0.000
#> SRR2105131 3 0.8062 0.5381 0.180 0.212 0.556 0.052
#> SRR2105132 1 0.3286 0.8143 0.876 0.080 0.044 0.000
#> SRR2105129 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.8892 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.2142 0.8501 0.928 0.056 0.016 0.000
#> SRR2105128 1 0.2142 0.8502 0.928 0.056 0.016 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.2017 0.66587 0.008 0.000 0.080 0.000 0.912
#> SRR2105278 5 0.1943 0.68000 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR2105275 3 0.2006 0.70269 0.000 0.000 0.916 0.072 0.012
#> SRR2105276 3 0.1281 0.72388 0.000 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105273 3 0.3655 0.75922 0.036 0.000 0.804 0.000 0.160
#> SRR2105274 3 0.4394 0.73902 0.100 0.000 0.764 0.000 0.136
#> SRR2105271 1 0.5993 0.36430 0.580 0.000 0.248 0.000 0.172
#> SRR2105272 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105269 4 0.3321 0.74896 0.000 0.136 0.000 0.832 0.032
#> SRR2105270 4 0.5551 0.42163 0.000 0.304 0.000 0.600 0.096
#> SRR2105267 4 0.3612 0.59986 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR2105268 2 0.3508 0.70658 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR2105265 2 0.1043 0.87695 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105266 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105263 2 0.4663 0.44701 0.000 0.604 0.000 0.376 0.020
#> SRR2105264 2 0.2011 0.86081 0.000 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR2105261 4 0.4440 0.27282 0.000 0.000 0.468 0.528 0.004
#> SRR2105262 3 0.3196 0.58778 0.000 0.000 0.804 0.192 0.004
#> SRR2105357 5 0.1851 0.66104 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR2105358 5 0.1908 0.65718 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR2105439 5 0.3913 0.58631 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR2105440 5 0.3796 0.61715 0.000 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR2105509 4 0.1430 0.80879 0.000 0.000 0.052 0.944 0.004
#> SRR2105510 4 0.1041 0.81449 0.000 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR2105507 3 0.3229 0.76657 0.032 0.000 0.840 0.000 0.128
#> SRR2105508 3 0.3099 0.76632 0.028 0.000 0.848 0.000 0.124
#> SRR2105505 1 0.0963 0.86197 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105506 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105503 4 0.3730 0.58913 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR2105504 4 0.3048 0.74632 0.000 0.000 0.176 0.820 0.004
#> SRR2105501 4 0.4029 0.68098 0.000 0.232 0.000 0.744 0.024
#> SRR2105502 4 0.2930 0.75419 0.000 0.000 0.164 0.832 0.004
#> SRR2105499 3 0.5215 0.67685 0.088 0.000 0.656 0.000 0.256
#> SRR2105500 1 0.4891 0.64159 0.716 0.000 0.172 0.000 0.112
#> SRR2105497 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105498 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105495 5 0.5819 0.57990 0.000 0.200 0.000 0.188 0.612
#> SRR2105496 5 0.5489 0.58495 0.000 0.136 0.000 0.216 0.648
#> SRR2105493 5 0.4489 0.68446 0.000 0.192 0.000 0.068 0.740
#> SRR2105494 5 0.4599 0.68631 0.000 0.156 0.000 0.100 0.744
#> SRR2105491 4 0.1478 0.80824 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR2105492 4 0.1851 0.79757 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105489 2 0.0566 0.87900 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105490 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105487 5 0.1399 0.69706 0.028 0.000 0.020 0.000 0.952
#> SRR2105488 5 0.1310 0.69920 0.024 0.000 0.020 0.000 0.956
#> SRR2105485 3 0.6192 0.53068 0.168 0.000 0.532 0.000 0.300
#> SRR2105486 3 0.6763 0.35510 0.280 0.000 0.396 0.000 0.324
#> SRR2105483 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105481 3 0.6657 0.33700 0.352 0.000 0.416 0.000 0.232
#> SRR2105482 1 0.0794 0.86685 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105479 3 0.3852 0.68348 0.072 0.000 0.828 0.084 0.016
#> SRR2105480 3 0.4221 0.70708 0.168 0.000 0.780 0.016 0.036
#> SRR2105477 5 0.4866 0.54015 0.000 0.052 0.000 0.284 0.664
#> SRR2105478 5 0.4971 0.65410 0.000 0.144 0.000 0.144 0.712
#> SRR2105475 4 0.2583 0.77332 0.000 0.000 0.132 0.864 0.004
#> SRR2105476 4 0.2068 0.79501 0.000 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105473 5 0.3861 0.63332 0.004 0.284 0.000 0.000 0.712
#> SRR2105474 5 0.3949 0.61594 0.004 0.300 0.000 0.000 0.696
#> SRR2105471 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105472 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105469 3 0.3476 0.75894 0.020 0.000 0.804 0.000 0.176
#> SRR2105470 3 0.5375 0.69434 0.136 0.000 0.664 0.000 0.200
#> SRR2105467 5 0.3760 0.60915 0.188 0.000 0.028 0.000 0.784
#> SRR2105468 1 0.3395 0.69224 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR2105465 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105464 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105461 2 0.0290 0.87886 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105462 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105459 4 0.0880 0.81984 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105460 4 0.0963 0.81597 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105457 3 0.3143 0.75266 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR2105458 3 0.2966 0.75837 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105455 1 0.2389 0.80083 0.880 0.000 0.116 0.000 0.004
#> SRR2105456 1 0.1410 0.84950 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR2105453 5 0.4150 0.29563 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR2105454 5 0.4242 0.18302 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR2105451 5 0.5695 0.67790 0.000 0.136 0.048 0.116 0.700
#> SRR2105452 4 0.3196 0.73416 0.000 0.000 0.192 0.804 0.004
#> SRR2105449 1 0.4891 0.44149 0.640 0.000 0.316 0.000 0.044
#> SRR2105450 1 0.1121 0.86009 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR2105447 4 0.0162 0.81853 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR2105448 4 0.1121 0.81465 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR2105445 5 0.0404 0.70160 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105446 5 0.0404 0.70005 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105443 4 0.4930 0.64798 0.000 0.000 0.244 0.684 0.072
#> SRR2105444 5 0.4824 0.71096 0.000 0.124 0.024 0.092 0.760
#> SRR2105441 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105442 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105437 5 0.1894 0.67438 0.008 0.000 0.072 0.000 0.920
#> SRR2105438 5 0.1894 0.67438 0.008 0.000 0.072 0.000 0.920
#> SRR2105435 1 0.5888 0.42582 0.580 0.000 0.280 0.000 0.140
#> SRR2105436 3 0.5557 0.64157 0.116 0.000 0.624 0.000 0.260
#> SRR2105433 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105432 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105429 4 0.2068 0.79473 0.000 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR2105430 4 0.1768 0.80337 0.000 0.000 0.072 0.924 0.004
#> SRR2105427 4 0.4541 0.68196 0.000 0.136 0.000 0.752 0.112
#> SRR2105428 4 0.3828 0.64220 0.000 0.008 0.008 0.764 0.220
#> SRR2105425 4 0.3366 0.68397 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR2105426 2 0.0771 0.87394 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105421 3 0.3550 0.51656 0.000 0.000 0.760 0.236 0.004
#> SRR2105422 3 0.2074 0.67508 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR2105423 2 0.0290 0.87885 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105424 2 0.0880 0.87808 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105419 3 0.2648 0.76324 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105420 3 0.3003 0.75741 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105415 1 0.1121 0.85882 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105416 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105417 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 4 0.0324 0.81828 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105414 4 0.0671 0.81774 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105409 2 0.2773 0.80758 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105410 2 0.5580 0.31284 0.000 0.576 0.000 0.088 0.336
#> SRR2105411 2 0.2230 0.84742 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.87787 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105407 3 0.3039 0.75578 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105408 3 0.3661 0.69575 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR2105403 5 0.2249 0.65491 0.008 0.000 0.096 0.000 0.896
#> SRR2105404 5 0.2077 0.66216 0.008 0.000 0.084 0.000 0.908
#> SRR2105405 1 0.0510 0.87243 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105401 4 0.4961 0.72209 0.000 0.020 0.140 0.744 0.096
#> SRR2105402 4 0.3123 0.74043 0.000 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR2105399 4 0.3160 0.73707 0.000 0.000 0.188 0.808 0.004
#> SRR2105400 4 0.3160 0.73707 0.000 0.000 0.188 0.808 0.004
#> SRR2105397 4 0.6294 0.43166 0.000 0.000 0.284 0.524 0.192
#> SRR2105398 4 0.4251 0.58248 0.000 0.000 0.316 0.672 0.012
#> SRR2105395 2 0.0794 0.87896 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105396 2 0.0451 0.87855 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105393 2 0.3109 0.76790 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105394 2 0.2230 0.84582 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105389 3 0.2230 0.76105 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105390 3 0.2648 0.76241 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105391 3 0.2605 0.76302 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105392 3 0.2966 0.75775 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105385 3 0.5874 0.62923 0.208 0.000 0.604 0.000 0.188
#> SRR2105386 3 0.4637 0.72215 0.128 0.000 0.744 0.000 0.128
#> SRR2105387 1 0.0880 0.86648 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.1041 0.86582 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR2105381 4 0.2674 0.76914 0.000 0.000 0.140 0.856 0.004
#> SRR2105382 4 0.2179 0.79066 0.000 0.000 0.100 0.896 0.004
#> SRR2105383 2 0.2389 0.77561 0.116 0.880 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105384 2 0.2719 0.74211 0.144 0.852 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105379 4 0.0566 0.81855 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105380 4 0.0794 0.81817 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR2105377 5 0.4283 0.32858 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR2105378 5 0.4283 0.33393 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR2105375 1 0.1485 0.85988 0.948 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR2105376 1 0.0510 0.87164 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105373 5 0.4238 0.08049 0.004 0.000 0.368 0.000 0.628
#> SRR2105374 5 0.2305 0.65698 0.012 0.000 0.092 0.000 0.896
#> SRR2105371 3 0.2690 0.76227 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105372 3 0.3003 0.75653 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105369 3 0.5981 0.60002 0.196 0.000 0.588 0.000 0.216
#> SRR2105370 1 0.6240 0.31884 0.544 0.000 0.244 0.000 0.212
#> SRR2105367 1 0.3932 0.51436 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105368 1 0.4151 0.47778 0.652 0.004 0.000 0.000 0.344
#> SRR2105365 4 0.0880 0.81687 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105366 4 0.4126 0.36128 0.000 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR2105363 2 0.2852 0.76128 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105364 2 0.1041 0.87904 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105361 2 0.1478 0.87069 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105362 2 0.1908 0.85932 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105359 3 0.3409 0.76403 0.024 0.000 0.816 0.000 0.160
#> SRR2105360 3 0.3353 0.68757 0.196 0.000 0.796 0.000 0.008
#> SRR2105355 3 0.1485 0.74922 0.020 0.000 0.948 0.000 0.032
#> SRR2105356 3 0.4331 0.35475 0.400 0.000 0.596 0.000 0.004
#> SRR2105353 3 0.2228 0.73667 0.000 0.000 0.912 0.040 0.048
#> SRR2105354 3 0.2561 0.76339 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105351 4 0.0963 0.81710 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105352 4 0.3123 0.74043 0.000 0.000 0.184 0.812 0.004
#> SRR2105349 4 0.0609 0.81818 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR2105350 4 0.2813 0.73313 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR2105345 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105346 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105347 1 0.4767 0.29163 0.560 0.420 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105348 1 0.3906 0.55694 0.704 0.292 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105343 2 0.3932 0.57086 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR2105344 2 0.3586 0.68855 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR2105341 3 0.2852 0.76080 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105342 3 0.3039 0.75557 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105339 3 0.0865 0.72570 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105340 3 0.1357 0.74661 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105335 1 0.6275 0.25645 0.480 0.000 0.156 0.000 0.364
#> SRR2105336 1 0.3196 0.74563 0.804 0.000 0.004 0.000 0.192
#> SRR2105337 1 0.3796 0.54199 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0566 0.87285 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105331 4 0.0963 0.81704 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105332 4 0.3966 0.47134 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR2105333 4 0.0671 0.81805 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105334 4 0.0609 0.81818 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR2105329 5 0.5559 0.17949 0.000 0.000 0.076 0.380 0.544
#> SRR2105330 5 0.4989 0.60520 0.000 0.000 0.168 0.124 0.708
#> SRR2105327 4 0.0671 0.81761 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105328 4 0.0566 0.81788 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR2105325 3 0.0955 0.72147 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105326 3 0.1082 0.72314 0.000 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR2105323 3 0.4288 0.58651 0.004 0.000 0.612 0.000 0.384
#> SRR2105324 3 0.6598 0.45508 0.260 0.000 0.464 0.000 0.276
#> SRR2105319 5 0.6781 -0.17908 0.344 0.000 0.280 0.000 0.376
#> SRR2105320 1 0.5579 0.48385 0.620 0.000 0.116 0.000 0.264
#> SRR2105321 3 0.1914 0.74738 0.000 0.000 0.924 0.016 0.060
#> SRR2105322 3 0.0898 0.72619 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR2105317 4 0.0162 0.81853 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR2105318 4 0.1851 0.79882 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR2105315 3 0.6459 0.45750 0.000 0.000 0.500 0.256 0.244
#> SRR2105316 4 0.1507 0.82004 0.000 0.012 0.024 0.952 0.012
#> SRR2105313 4 0.3143 0.69274 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR2105314 4 0.4161 0.32718 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR2105311 3 0.4350 0.09091 0.000 0.000 0.588 0.408 0.004
#> SRR2105312 3 0.4397 0.00748 0.000 0.000 0.564 0.432 0.004
#> SRR2105307 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 3 0.3366 0.73945 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105310 3 0.3274 0.74497 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105305 3 0.2929 0.75915 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105306 3 0.2852 0.76131 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR2105303 2 0.3612 0.68606 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR2105304 4 0.2233 0.78882 0.000 0.000 0.104 0.892 0.004
#> SRR2105301 4 0.1205 0.81289 0.000 0.000 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105302 4 0.0609 0.81885 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR2105299 5 0.2230 0.68589 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR2105300 5 0.1830 0.69659 0.000 0.000 0.068 0.008 0.924
#> SRR2105297 1 0.4264 0.41860 0.620 0.376 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105298 1 0.3969 0.53426 0.692 0.304 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105295 4 0.0671 0.81765 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105296 4 0.0727 0.81884 0.000 0.004 0.012 0.980 0.004
#> SRR2105293 3 0.2777 0.67043 0.000 0.000 0.864 0.120 0.016
#> SRR2105294 3 0.1569 0.72190 0.044 0.000 0.944 0.008 0.004
#> SRR2105291 1 0.5510 0.44136 0.624 0.036 0.308 0.000 0.032
#> SRR2105292 1 0.1671 0.84116 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR2105289 3 0.5104 0.53790 0.304 0.000 0.648 0.028 0.020
#> SRR2105290 1 0.0404 0.87356 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105288 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105285 4 0.0162 0.81794 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR2105286 4 0.0880 0.81687 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR2105283 5 0.4138 0.71149 0.000 0.148 0.000 0.072 0.780
#> SRR2105284 5 0.4486 0.69092 0.000 0.172 0.000 0.080 0.748
#> SRR2105281 2 0.1608 0.86770 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR2105282 2 0.0324 0.87815 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105259 3 0.3336 0.74117 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR2105260 3 0.3074 0.75416 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR2105279 2 0.0324 0.87815 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105280 2 0.0510 0.87879 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105257 1 0.1768 0.84544 0.924 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR2105258 1 0.0451 0.87397 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105253 4 0.1741 0.81094 0.000 0.040 0.000 0.936 0.024
#> SRR2105254 2 0.3752 0.64638 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105255 3 0.6234 0.51804 0.172 0.000 0.524 0.000 0.304
#> SRR2105256 1 0.6616 -0.12727 0.404 0.000 0.380 0.000 0.216
#> SRR2105251 4 0.3242 0.67758 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR2105252 4 0.4201 0.28086 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR2105249 2 0.4046 0.45516 0.008 0.696 0.000 0.000 0.296
#> SRR2105250 2 0.4560 -0.18680 0.008 0.508 0.000 0.000 0.484
#> SRR2105247 2 0.2852 0.79784 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105248 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105245 4 0.4744 0.22600 0.016 0.000 0.476 0.508 0.000
#> SRR2105246 4 0.4886 0.35503 0.012 0.004 0.420 0.560 0.004
#> SRR2105243 1 0.2915 0.79202 0.860 0.000 0.116 0.000 0.024
#> SRR2105244 3 0.5967 0.16663 0.436 0.000 0.456 0.000 0.108
#> SRR2105241 1 0.0404 0.87355 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.3925 0.71115 0.784 0.000 0.180 0.004 0.032
#> SRR2105240 1 0.0162 0.87456 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105237 4 0.2554 0.79631 0.000 0.000 0.072 0.892 0.036
#> SRR2105238 5 0.4602 0.49622 0.000 0.028 0.000 0.316 0.656
#> SRR2105235 2 0.3491 0.60854 0.000 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR2105236 2 0.1732 0.81792 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR2105233 4 0.0671 0.81765 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105234 4 0.0671 0.81765 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR2105231 2 0.1908 0.85878 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105232 2 0.1792 0.86297 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105227 3 0.5238 0.44782 0.292 0.000 0.640 0.064 0.004
#> SRR2105228 1 0.1043 0.86160 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105225 3 0.5197 0.67161 0.204 0.000 0.680 0.000 0.116
#> SRR2105226 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105229 3 0.1907 0.72559 0.000 0.000 0.928 0.044 0.028
#> SRR2105230 3 0.3305 0.74393 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105219 4 0.4180 0.65196 0.000 0.220 0.000 0.744 0.036
#> SRR2105220 4 0.5346 0.00672 0.000 0.452 0.000 0.496 0.052
#> SRR2105221 5 0.3838 0.63742 0.004 0.280 0.000 0.000 0.716
#> SRR2105222 5 0.3934 0.63976 0.008 0.276 0.000 0.000 0.716
#> SRR2105223 3 0.5818 0.16557 0.444 0.000 0.464 0.000 0.092
#> SRR2105224 1 0.4086 0.62162 0.736 0.000 0.240 0.000 0.024
#> SRR2105217 2 0.3752 0.63792 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR2105218 2 0.0794 0.87810 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105215 2 0.0880 0.87830 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105216 2 0.2074 0.85208 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR2105213 3 0.4450 -0.17952 0.000 0.000 0.508 0.488 0.004
#> SRR2105214 3 0.4443 -0.13103 0.000 0.000 0.524 0.472 0.004
#> SRR2105211 3 0.2074 0.76201 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105212 3 0.3487 0.74963 0.008 0.000 0.780 0.000 0.212
#> SRR2105209 1 0.2859 0.82198 0.876 0.000 0.056 0.000 0.068
#> SRR2105210 1 0.0324 0.87462 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105207 1 0.0963 0.86355 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105208 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 4 0.0693 0.81877 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR2105206 4 0.0854 0.81873 0.000 0.004 0.012 0.976 0.008
#> SRR2105201 5 0.3857 0.60266 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR2105202 5 0.3884 0.62864 0.004 0.288 0.000 0.000 0.708
#> SRR2105203 4 0.4219 0.25057 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR2105204 2 0.3109 0.76847 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105199 2 0.2179 0.84625 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105200 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105197 5 0.3109 0.54091 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR2105198 5 0.2648 0.63940 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR2105195 3 0.5246 0.61177 0.260 0.000 0.672 0.024 0.044
#> SRR2105196 1 0.1200 0.86425 0.964 0.000 0.016 0.008 0.012
#> SRR2105193 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.1764 0.67788 0.008 0.000 0.064 0.000 0.928
#> SRR2105192 5 0.3661 0.51312 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR2105189 4 0.1549 0.80911 0.000 0.016 0.000 0.944 0.040
#> SRR2105190 4 0.1582 0.81200 0.000 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR2105187 5 0.4647 0.42428 0.000 0.004 0.016 0.352 0.628
#> SRR2105188 5 0.4840 0.66748 0.000 0.152 0.000 0.124 0.724
#> SRR2105179 1 0.5472 0.60017 0.656 0.000 0.156 0.000 0.188
#> SRR2105180 1 0.4307 0.07028 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR2105183 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105184 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105185 4 0.3636 0.60393 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR2105186 2 0.3452 0.71499 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105181 5 0.2561 0.59394 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105182 5 0.4383 -0.15791 0.004 0.000 0.424 0.000 0.572
#> SRR2105177 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.3684 0.66336 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR2105172 2 0.2017 0.86306 0.000 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR2105175 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105173 4 0.4307 -0.06952 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR2105174 2 0.3837 0.61035 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR2105169 2 0.1544 0.86885 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105170 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105167 2 0.0451 0.87852 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105168 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105165 3 0.3039 0.75570 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105166 3 0.3462 0.75639 0.012 0.000 0.792 0.000 0.196
#> SRR2105163 3 0.2439 0.65916 0.000 0.000 0.876 0.120 0.004
#> SRR2105164 3 0.2970 0.61708 0.000 0.000 0.828 0.168 0.004
#> SRR2105161 1 0.0794 0.86754 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.1124 0.87839 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR2105156 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105157 2 0.3561 0.68970 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2105158 2 0.3003 0.78134 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2105159 3 0.4540 0.48537 0.340 0.000 0.640 0.000 0.020
#> SRR2105160 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105153 4 0.3932 0.49091 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR2105154 4 0.3452 0.63551 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR2105151 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105152 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105149 3 0.5811 0.45007 0.000 0.000 0.568 0.316 0.116
#> SRR2105150 3 0.3171 0.75991 0.000 0.000 0.816 0.008 0.176
#> SRR2105147 4 0.3838 0.63883 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR2105148 4 0.3838 0.63883 0.000 0.000 0.280 0.716 0.004
#> SRR2105143 1 0.0290 0.87258 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105144 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0162 0.87477 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105141 4 0.0671 0.81978 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR2105142 4 0.1043 0.81543 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105139 2 0.1270 0.87394 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105140 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105137 5 0.4380 0.64900 0.032 0.260 0.000 0.000 0.708
#> SRR2105138 5 0.3957 0.63648 0.008 0.280 0.000 0.000 0.712
#> SRR2105135 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105136 2 0.0162 0.87728 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105133 5 0.1043 0.69040 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105134 5 0.2067 0.69248 0.048 0.000 0.032 0.000 0.920
#> SRR2105131 5 0.2817 0.69571 0.008 0.028 0.028 0.036 0.900
#> SRR2105132 5 0.2773 0.67194 0.112 0.000 0.020 0.000 0.868
#> SRR2105129 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.87490 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.3661 0.61184 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR2105128 1 0.4201 0.33026 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.4130 0.53424 0.004 0.000 0.024 0.300 0.672 0.000
#> SRR2105278 5 0.4452 0.53480 0.016 0.000 0.028 0.292 0.664 0.000
#> SRR2105275 3 0.1434 0.67486 0.000 0.020 0.948 0.024 0.008 0.000
#> SRR2105276 3 0.0665 0.67507 0.000 0.008 0.980 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105273 3 0.4579 0.56441 0.028 0.000 0.584 0.008 0.380 0.000
#> SRR2105274 3 0.4946 0.53949 0.052 0.000 0.556 0.008 0.384 0.000
#> SRR2105271 5 0.6004 0.13487 0.352 0.000 0.184 0.008 0.456 0.000
#> SRR2105272 1 0.2196 0.78740 0.884 0.000 0.004 0.004 0.108 0.000
#> SRR2105269 2 0.3612 0.69480 0.000 0.764 0.000 0.200 0.000 0.036
#> SRR2105270 4 0.4866 0.29436 0.000 0.364 0.000 0.568 0.000 0.068
#> SRR2105267 2 0.3727 0.68840 0.000 0.748 0.000 0.036 0.000 0.216
#> SRR2105268 6 0.3671 0.71742 0.000 0.208 0.000 0.036 0.000 0.756
#> SRR2105265 6 0.0806 0.87459 0.000 0.008 0.000 0.020 0.000 0.972
#> SRR2105266 6 0.0713 0.86652 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105263 6 0.5980 0.22172 0.000 0.344 0.004 0.176 0.004 0.472
#> SRR2105264 6 0.3151 0.82128 0.000 0.040 0.004 0.112 0.004 0.840
#> SRR2105261 3 0.3937 0.11751 0.000 0.424 0.572 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105262 3 0.2531 0.61699 0.000 0.128 0.860 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105357 5 0.4072 0.55548 0.004 0.000 0.032 0.260 0.704 0.000
#> SRR2105358 5 0.3956 0.55892 0.004 0.000 0.028 0.252 0.716 0.000
#> SRR2105439 4 0.2442 0.76976 0.004 0.000 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR2105440 4 0.2442 0.76966 0.000 0.000 0.000 0.852 0.004 0.144
#> SRR2105509 2 0.0603 0.81345 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105510 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105507 3 0.4180 0.60681 0.008 0.000 0.632 0.012 0.348 0.000
#> SRR2105508 3 0.4206 0.60218 0.008 0.000 0.624 0.012 0.356 0.000
#> SRR2105505 1 0.3284 0.67203 0.784 0.000 0.000 0.020 0.196 0.000
#> SRR2105506 1 0.2730 0.69753 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105503 2 0.3911 0.65278 0.000 0.712 0.000 0.032 0.000 0.256
#> SRR2105504 2 0.2442 0.74680 0.000 0.852 0.144 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.4723 0.59794 0.000 0.680 0.000 0.140 0.000 0.180
#> SRR2105502 2 0.2362 0.75280 0.000 0.860 0.136 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.3522 0.29616 0.044 0.000 0.172 0.000 0.784 0.000
#> SRR2105500 5 0.3716 0.43084 0.248 0.000 0.012 0.008 0.732 0.000
#> SRR2105497 6 0.0547 0.87259 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105498 6 0.0547 0.86970 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105495 4 0.3073 0.75401 0.000 0.080 0.000 0.840 0.000 0.080
#> SRR2105496 4 0.3551 0.68997 0.000 0.168 0.000 0.784 0.000 0.048
#> SRR2105493 4 0.2307 0.76806 0.000 0.024 0.000 0.900 0.012 0.064
#> SRR2105494 4 0.2279 0.76462 0.000 0.048 0.000 0.900 0.004 0.048
#> SRR2105491 2 0.3311 0.77569 0.000 0.836 0.016 0.032 0.004 0.112
#> SRR2105492 2 0.3807 0.75491 0.000 0.800 0.028 0.032 0.004 0.136
#> SRR2105489 6 0.0458 0.87368 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105490 6 0.0547 0.86970 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105487 5 0.4938 0.48642 0.036 0.000 0.024 0.344 0.596 0.000
#> SRR2105488 5 0.4910 0.47999 0.052 0.000 0.012 0.336 0.600 0.000
#> SRR2105485 5 0.1478 0.52059 0.020 0.000 0.032 0.004 0.944 0.000
#> SRR2105486 5 0.1053 0.53997 0.020 0.000 0.012 0.004 0.964 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.81982 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0146 0.81935 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105481 5 0.6018 0.34042 0.176 0.000 0.260 0.024 0.540 0.000
#> SRR2105482 1 0.2491 0.73127 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105479 3 0.2959 0.65823 0.028 0.036 0.872 0.004 0.060 0.000
#> SRR2105480 3 0.3852 0.63072 0.072 0.000 0.784 0.008 0.136 0.000
#> SRR2105477 4 0.2945 0.69189 0.000 0.156 0.000 0.824 0.000 0.020
#> SRR2105478 4 0.2629 0.75163 0.000 0.068 0.000 0.872 0.000 0.060
#> SRR2105475 2 0.1588 0.79036 0.000 0.924 0.072 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105476 2 0.1152 0.80397 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105473 4 0.2794 0.76745 0.004 0.000 0.000 0.840 0.012 0.144
#> SRR2105474 4 0.2695 0.76862 0.004 0.000 0.000 0.844 0.008 0.144
#> SRR2105471 6 0.0692 0.87019 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004 0.976
#> SRR2105472 6 0.0547 0.86970 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105469 3 0.4370 0.59623 0.008 0.000 0.616 0.020 0.356 0.000
#> SRR2105470 3 0.5973 0.38645 0.120 0.000 0.436 0.024 0.420 0.000
#> SRR2105467 5 0.4380 0.54338 0.080 0.000 0.000 0.220 0.700 0.000
#> SRR2105468 5 0.4985 0.20145 0.400 0.000 0.000 0.072 0.528 0.000
#> SRR2105465 1 0.1590 0.81222 0.936 0.000 0.008 0.008 0.048 0.000
#> SRR2105466 1 0.0146 0.81984 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0363 0.81928 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105464 1 0.0363 0.81928 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105461 6 0.0508 0.87534 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000 0.984
#> SRR2105462 6 0.0547 0.87259 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105459 2 0.1616 0.81718 0.000 0.932 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR2105460 2 0.1649 0.81211 0.000 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036
#> SRR2105457 5 0.4753 -0.35463 0.000 0.000 0.456 0.048 0.496 0.000
#> SRR2105458 3 0.4936 0.36608 0.000 0.000 0.500 0.064 0.436 0.000
#> SRR2105455 1 0.4640 0.56465 0.680 0.000 0.084 0.004 0.232 0.000
#> SRR2105456 1 0.4092 0.65052 0.740 0.000 0.060 0.004 0.196 0.000
#> SRR2105453 5 0.5813 0.21895 0.384 0.000 0.000 0.184 0.432 0.000
#> SRR2105454 5 0.5693 0.20979 0.392 0.000 0.000 0.160 0.448 0.000
#> SRR2105451 4 0.3160 0.75266 0.000 0.052 0.032 0.864 0.008 0.044
#> SRR2105452 2 0.2632 0.73072 0.000 0.832 0.164 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105449 1 0.5933 0.21905 0.492 0.000 0.316 0.008 0.184 0.000
#> SRR2105450 1 0.3593 0.71182 0.788 0.000 0.044 0.004 0.164 0.000
#> SRR2105447 2 0.0914 0.81798 0.000 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR2105448 2 0.1720 0.81186 0.000 0.928 0.000 0.032 0.000 0.040
#> SRR2105445 4 0.3054 0.57563 0.000 0.000 0.036 0.828 0.136 0.000
#> SRR2105446 4 0.3695 0.40381 0.000 0.000 0.024 0.732 0.244 0.000
#> SRR2105443 2 0.5643 0.35557 0.000 0.536 0.216 0.248 0.000 0.000
#> SRR2105444 4 0.2400 0.74776 0.000 0.020 0.020 0.908 0.016 0.036
#> SRR2105441 6 0.2730 0.68460 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105442 6 0.2527 0.72140 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105437 5 0.4912 0.50467 0.016 0.000 0.048 0.328 0.608 0.000
#> SRR2105438 5 0.4977 0.50854 0.020 0.000 0.048 0.324 0.608 0.000
#> SRR2105435 5 0.4900 0.40226 0.272 0.000 0.088 0.004 0.636 0.000
#> SRR2105436 5 0.2383 0.45054 0.024 0.000 0.096 0.000 0.880 0.000
#> SRR2105433 1 0.0291 0.81972 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105434 1 0.0291 0.81972 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105431 1 0.0790 0.81564 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105432 1 0.0865 0.81347 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105429 2 0.1806 0.78997 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105430 2 0.1285 0.80486 0.000 0.944 0.052 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105427 2 0.4985 0.25084 0.000 0.528 0.000 0.400 0.000 0.072
#> SRR2105428 4 0.4091 0.07870 0.000 0.472 0.000 0.520 0.000 0.008
#> SRR2105425 2 0.4086 0.69129 0.000 0.728 0.004 0.036 0.004 0.228
#> SRR2105426 6 0.1570 0.86606 0.000 0.028 0.008 0.016 0.004 0.944
#> SRR2105421 3 0.1010 0.66773 0.000 0.036 0.960 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105422 3 0.0806 0.67448 0.000 0.020 0.972 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105423 6 0.0458 0.87371 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105424 6 0.0603 0.87403 0.000 0.004 0.000 0.016 0.000 0.980
#> SRR2105419 3 0.4159 0.56632 0.000 0.000 0.588 0.016 0.396 0.000
#> SRR2105420 3 0.4334 0.53641 0.000 0.000 0.568 0.024 0.408 0.000
#> SRR2105415 1 0.2826 0.74052 0.844 0.000 0.000 0.028 0.128 0.000
#> SRR2105416 1 0.0865 0.81372 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.81982 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.81982 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0146 0.81778 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105414 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105409 6 0.4681 0.62448 0.000 0.112 0.000 0.212 0.000 0.676
#> SRR2105410 4 0.4551 0.54290 0.000 0.048 0.000 0.608 0.000 0.344
#> SRR2105411 6 0.1700 0.85968 0.000 0.048 0.000 0.024 0.000 0.928
#> SRR2105412 6 0.0458 0.87099 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105407 5 0.5115 -0.28449 0.000 0.000 0.456 0.080 0.464 0.000
#> SRR2105408 5 0.5196 -0.14701 0.000 0.000 0.404 0.092 0.504 0.000
#> SRR2105403 5 0.3560 0.56008 0.004 0.000 0.008 0.256 0.732 0.000
#> SRR2105404 5 0.4235 0.54526 0.012 0.000 0.024 0.280 0.684 0.000
#> SRR2105405 1 0.2838 0.76755 0.852 0.000 0.028 0.004 0.116 0.000
#> SRR2105406 1 0.1732 0.80514 0.920 0.000 0.004 0.004 0.072 0.000
#> SRR2105401 2 0.4710 0.57050 0.000 0.672 0.088 0.236 0.004 0.000
#> SRR2105402 2 0.2595 0.73402 0.000 0.836 0.160 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.2558 0.73579 0.000 0.840 0.156 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105400 2 0.2558 0.73579 0.000 0.840 0.156 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105397 3 0.6486 -0.10425 0.000 0.320 0.348 0.316 0.016 0.000
#> SRR2105398 2 0.4624 0.27403 0.000 0.528 0.432 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105395 6 0.0582 0.87555 0.000 0.004 0.004 0.004 0.004 0.984
#> SRR2105396 6 0.0260 0.87334 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105393 6 0.3242 0.77985 0.000 0.148 0.000 0.032 0.004 0.816
#> SRR2105394 6 0.2000 0.85491 0.000 0.048 0.000 0.032 0.004 0.916
#> SRR2105389 3 0.3989 0.63760 0.000 0.000 0.720 0.044 0.236 0.000
#> SRR2105390 3 0.4382 0.61128 0.000 0.000 0.676 0.060 0.264 0.000
#> SRR2105391 3 0.4099 0.63329 0.000 0.000 0.708 0.048 0.244 0.000
#> SRR2105392 3 0.4652 0.58496 0.000 0.000 0.640 0.072 0.288 0.000
#> SRR2105385 5 0.5835 -0.18526 0.152 0.000 0.320 0.012 0.516 0.000
#> SRR2105386 3 0.5202 0.44111 0.076 0.000 0.472 0.004 0.448 0.000
#> SRR2105387 1 0.3371 0.70565 0.780 0.000 0.016 0.004 0.200 0.000
#> SRR2105388 1 0.3463 0.69761 0.748 0.000 0.008 0.004 0.240 0.000
#> SRR2105381 2 0.1908 0.77778 0.000 0.900 0.096 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105382 2 0.1531 0.79351 0.000 0.928 0.068 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105383 6 0.2859 0.72296 0.156 0.000 0.000 0.016 0.000 0.828
#> SRR2105384 6 0.3315 0.66336 0.200 0.000 0.000 0.020 0.000 0.780
#> SRR2105379 2 0.0551 0.81739 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105380 2 0.2831 0.80831 0.000 0.880 0.048 0.024 0.004 0.044
#> SRR2105377 4 0.2730 0.75276 0.000 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105378 4 0.3081 0.73474 0.000 0.000 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR2105375 1 0.3066 0.74024 0.836 0.000 0.012 0.012 0.136 0.004
#> SRR2105376 1 0.1644 0.79482 0.920 0.000 0.000 0.004 0.076 0.000
#> SRR2105373 5 0.5284 0.53476 0.008 0.000 0.112 0.280 0.600 0.000
#> SRR2105374 5 0.5063 0.52158 0.024 0.000 0.052 0.312 0.612 0.000
#> SRR2105371 3 0.4000 0.64289 0.000 0.000 0.724 0.048 0.228 0.000
#> SRR2105372 3 0.4150 0.61629 0.000 0.000 0.652 0.028 0.320 0.000
#> SRR2105369 5 0.2789 0.45982 0.044 0.000 0.088 0.004 0.864 0.000
#> SRR2105370 5 0.1942 0.53356 0.064 0.000 0.012 0.008 0.916 0.000
#> SRR2105367 1 0.5071 0.18474 0.540 0.000 0.000 0.084 0.376 0.000
#> SRR2105368 1 0.5000 0.30455 0.580 0.000 0.000 0.088 0.332 0.000
#> SRR2105365 2 0.2121 0.81233 0.000 0.916 0.008 0.032 0.004 0.040
#> SRR2105366 2 0.4711 0.31703 0.000 0.564 0.004 0.032 0.004 0.396
#> SRR2105363 6 0.4136 0.66409 0.000 0.192 0.000 0.076 0.000 0.732
#> SRR2105364 6 0.1092 0.87444 0.000 0.020 0.000 0.020 0.000 0.960
#> SRR2105361 6 0.2767 0.84244 0.000 0.056 0.000 0.072 0.004 0.868
#> SRR2105362 6 0.2074 0.85856 0.000 0.048 0.000 0.036 0.004 0.912
#> SRR2105359 3 0.4245 0.64919 0.008 0.000 0.716 0.048 0.228 0.000
#> SRR2105360 3 0.5551 0.53935 0.132 0.000 0.576 0.012 0.280 0.000
#> SRR2105355 3 0.3494 0.65681 0.012 0.000 0.736 0.000 0.252 0.000
#> SRR2105356 3 0.6201 0.24936 0.308 0.000 0.396 0.004 0.292 0.000
#> SRR2105353 3 0.1251 0.67694 0.000 0.008 0.956 0.024 0.012 0.000
#> SRR2105354 3 0.3139 0.67191 0.000 0.000 0.812 0.028 0.160 0.000
#> SRR2105351 2 0.2321 0.80804 0.000 0.904 0.008 0.032 0.004 0.052
#> SRR2105352 2 0.2595 0.73402 0.000 0.836 0.160 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.1418 0.81386 0.000 0.944 0.000 0.032 0.000 0.024
#> SRR2105350 2 0.2586 0.78794 0.000 0.868 0.000 0.032 0.000 0.100
#> SRR2105345 6 0.1858 0.81531 0.004 0.000 0.000 0.092 0.000 0.904
#> SRR2105346 6 0.0865 0.86246 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105347 1 0.4563 0.49183 0.656 0.000 0.000 0.056 0.004 0.284
#> SRR2105348 1 0.3183 0.70371 0.828 0.000 0.000 0.040 0.004 0.128
#> SRR2105343 6 0.3930 0.67400 0.000 0.236 0.000 0.032 0.004 0.728
#> SRR2105344 6 0.3242 0.79001 0.000 0.148 0.000 0.032 0.004 0.816
#> SRR2105341 3 0.4619 0.56064 0.000 0.000 0.600 0.052 0.348 0.000
#> SRR2105342 3 0.4199 0.55316 0.000 0.000 0.568 0.016 0.416 0.000
#> SRR2105339 3 0.0665 0.67554 0.000 0.008 0.980 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105340 3 0.1297 0.68004 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040 0.000
#> SRR2105335 5 0.4358 0.57790 0.172 0.000 0.004 0.096 0.728 0.000
#> SRR2105336 5 0.4864 0.19908 0.384 0.000 0.000 0.064 0.552 0.000
#> SRR2105337 1 0.5593 0.28393 0.524 0.000 0.140 0.004 0.332 0.000
#> SRR2105338 1 0.3360 0.67810 0.732 0.000 0.000 0.004 0.264 0.000
#> SRR2105331 2 0.1649 0.81468 0.000 0.932 0.000 0.036 0.000 0.032
#> SRR2105332 2 0.4117 0.56320 0.000 0.672 0.000 0.032 0.000 0.296
#> SRR2105333 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105334 2 0.1642 0.81524 0.000 0.936 0.004 0.032 0.000 0.028
#> SRR2105329 4 0.6178 0.39884 0.000 0.284 0.068 0.544 0.104 0.000
#> SRR2105330 4 0.4635 0.62435 0.000 0.068 0.088 0.752 0.092 0.000
#> SRR2105327 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105328 2 0.0862 0.81811 0.000 0.972 0.016 0.008 0.004 0.000
#> SRR2105325 3 0.0520 0.67428 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105326 3 0.0767 0.67449 0.000 0.008 0.976 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105323 5 0.2318 0.52591 0.000 0.000 0.044 0.064 0.892 0.000
#> SRR2105324 5 0.0870 0.53327 0.012 0.000 0.012 0.004 0.972 0.000
#> SRR2105319 5 0.5716 0.55531 0.196 0.000 0.052 0.124 0.628 0.000
#> SRR2105320 5 0.5167 0.38998 0.300 0.000 0.040 0.044 0.616 0.000
#> SRR2105321 3 0.0820 0.67671 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012 0.000
#> SRR2105322 3 0.0291 0.67524 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105317 2 0.0405 0.81842 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105318 2 0.2331 0.80192 0.000 0.888 0.000 0.032 0.000 0.080
#> SRR2105315 5 0.7706 -0.18301 0.000 0.228 0.272 0.220 0.280 0.000
#> SRR2105316 2 0.0632 0.81478 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR2105313 2 0.3176 0.74787 0.000 0.812 0.000 0.032 0.000 0.156
#> SRR2105314 2 0.4543 0.36079 0.000 0.584 0.000 0.032 0.004 0.380
#> SRR2105311 3 0.2632 0.58751 0.000 0.164 0.832 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105312 3 0.2703 0.58033 0.000 0.172 0.824 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.0603 0.81914 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105308 1 0.0405 0.81948 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105309 5 0.4199 -0.20843 0.000 0.000 0.380 0.020 0.600 0.000
#> SRR2105310 5 0.4697 -0.24186 0.000 0.000 0.404 0.048 0.548 0.000
#> SRR2105305 3 0.4508 0.59460 0.000 0.000 0.632 0.052 0.316 0.000
#> SRR2105306 3 0.4026 0.59584 0.000 0.000 0.612 0.012 0.376 0.000
#> SRR2105303 6 0.3450 0.74761 0.000 0.188 0.000 0.032 0.000 0.780
#> SRR2105304 2 0.1806 0.78562 0.000 0.908 0.088 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.0291 0.81616 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105302 2 0.1498 0.81377 0.000 0.940 0.000 0.032 0.000 0.028
#> SRR2105299 4 0.3472 0.59838 0.000 0.008 0.076 0.820 0.096 0.000
#> SRR2105300 4 0.3244 0.60060 0.000 0.004 0.064 0.832 0.100 0.000
#> SRR2105297 1 0.4106 0.49153 0.664 0.000 0.000 0.020 0.004 0.312
#> SRR2105298 1 0.3705 0.59109 0.740 0.000 0.000 0.020 0.004 0.236
#> SRR2105295 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0363 0.81791 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR2105293 3 0.0717 0.67241 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105294 3 0.0665 0.67438 0.008 0.008 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105291 1 0.6925 0.09912 0.444 0.000 0.220 0.024 0.284 0.028
#> SRR2105292 1 0.4199 0.28135 0.568 0.000 0.000 0.016 0.416 0.000
#> SRR2105289 3 0.4856 0.51601 0.188 0.004 0.692 0.008 0.108 0.000
#> SRR2105290 1 0.2636 0.77124 0.860 0.000 0.016 0.004 0.120 0.000
#> SRR2105287 1 0.1010 0.81465 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036 0.000
#> SRR2105288 1 0.0363 0.81928 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105285 2 0.0806 0.81750 0.000 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR2105286 2 0.1261 0.81648 0.000 0.952 0.000 0.024 0.000 0.024
#> SRR2105283 4 0.2566 0.76191 0.000 0.028 0.000 0.888 0.020 0.064
#> SRR2105284 4 0.2113 0.76850 0.000 0.028 0.000 0.908 0.004 0.060
#> SRR2105281 6 0.1245 0.87165 0.000 0.032 0.000 0.016 0.000 0.952
#> SRR2105282 6 0.0405 0.87449 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR2105259 5 0.5108 -0.25958 0.000 0.000 0.436 0.080 0.484 0.000
#> SRR2105260 3 0.5113 0.30697 0.000 0.000 0.472 0.080 0.448 0.000
#> SRR2105279 6 0.0260 0.87334 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105280 6 0.0000 0.87437 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.4049 0.51693 0.648 0.000 0.000 0.020 0.332 0.000
#> SRR2105258 1 0.2491 0.74800 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR2105253 2 0.2480 0.78729 0.000 0.872 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR2105254 6 0.4172 0.59712 0.000 0.280 0.000 0.040 0.000 0.680
#> SRR2105255 5 0.1059 0.53455 0.016 0.000 0.016 0.004 0.964 0.000
#> SRR2105256 5 0.1542 0.53793 0.052 0.000 0.008 0.004 0.936 0.000
#> SRR2105251 2 0.3989 0.69330 0.000 0.748 0.008 0.032 0.004 0.208
#> SRR2105252 2 0.4878 0.15315 0.000 0.512 0.008 0.032 0.004 0.444
#> SRR2105249 4 0.4090 0.50118 0.008 0.004 0.000 0.604 0.000 0.384
#> SRR2105250 4 0.3767 0.69040 0.012 0.000 0.000 0.708 0.004 0.276
#> SRR2105247 6 0.2776 0.81625 0.000 0.104 0.000 0.032 0.004 0.860
#> SRR2105248 6 0.0692 0.87019 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004 0.976
#> SRR2105245 3 0.4130 0.50901 0.024 0.220 0.736 0.008 0.012 0.000
#> SRR2105246 3 0.4440 0.40374 0.008 0.292 0.672 0.008 0.008 0.012
#> SRR2105243 5 0.4204 -0.07420 0.448 0.000 0.008 0.004 0.540 0.000
#> SRR2105244 5 0.5917 0.07791 0.244 0.000 0.252 0.004 0.500 0.000
#> SRR2105241 1 0.2009 0.79777 0.904 0.000 0.008 0.004 0.084 0.000
#> SRR2105242 1 0.1364 0.81189 0.944 0.000 0.004 0.004 0.048 0.000
#> SRR2105239 1 0.5264 0.51020 0.632 0.004 0.116 0.008 0.240 0.000
#> SRR2105240 1 0.0458 0.81929 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105237 2 0.2480 0.76541 0.000 0.872 0.024 0.104 0.000 0.000
#> SRR2105238 4 0.2581 0.71045 0.000 0.128 0.000 0.856 0.000 0.016
#> SRR2105235 4 0.3934 0.51064 0.000 0.008 0.000 0.616 0.000 0.376
#> SRR2105236 4 0.3866 0.26140 0.000 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR2105233 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105234 2 0.0146 0.81628 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105231 6 0.1644 0.86033 0.000 0.040 0.000 0.028 0.000 0.932
#> SRR2105232 6 0.2000 0.85898 0.000 0.048 0.000 0.032 0.004 0.916
#> SRR2105227 3 0.6439 0.37766 0.276 0.064 0.528 0.004 0.128 0.000
#> SRR2105228 1 0.2828 0.76938 0.864 0.000 0.072 0.004 0.060 0.000
#> SRR2105225 3 0.5910 0.36774 0.124 0.000 0.472 0.020 0.384 0.000
#> SRR2105226 1 0.2400 0.79232 0.872 0.000 0.008 0.004 0.116 0.000
#> SRR2105229 3 0.2195 0.66946 0.000 0.012 0.904 0.016 0.068 0.000
#> SRR2105230 3 0.5114 0.30252 0.000 0.000 0.468 0.080 0.452 0.000
#> SRR2105219 2 0.4890 0.59062 0.000 0.656 0.000 0.204 0.000 0.140
#> SRR2105220 2 0.5980 0.00616 0.000 0.400 0.000 0.372 0.000 0.228
#> SRR2105221 4 0.2494 0.76935 0.000 0.000 0.000 0.864 0.016 0.120
#> SRR2105222 4 0.2402 0.76971 0.000 0.000 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR2105223 5 0.4945 0.31732 0.240 0.000 0.108 0.004 0.648 0.000
#> SRR2105224 5 0.4709 -0.05979 0.444 0.000 0.036 0.004 0.516 0.000
#> SRR2105217 6 0.3590 0.74209 0.000 0.188 0.000 0.032 0.004 0.776
#> SRR2105218 6 0.0837 0.87343 0.000 0.004 0.000 0.020 0.004 0.972
#> SRR2105215 6 0.1092 0.87503 0.000 0.020 0.000 0.020 0.000 0.960
#> SRR2105216 6 0.1633 0.86087 0.000 0.044 0.000 0.024 0.000 0.932
#> SRR2105213 3 0.3295 0.56480 0.004 0.184 0.796 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105214 3 0.3023 0.57180 0.000 0.180 0.808 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105211 3 0.3819 0.63417 0.000 0.000 0.672 0.012 0.316 0.000
#> SRR2105212 5 0.4631 -0.32045 0.004 0.000 0.428 0.032 0.536 0.000
#> SRR2105209 1 0.4411 0.35355 0.576 0.000 0.012 0.012 0.400 0.000
#> SRR2105210 1 0.1957 0.78705 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105207 1 0.3608 0.56255 0.716 0.000 0.000 0.012 0.272 0.000
#> SRR2105208 1 0.0146 0.81935 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105205 2 0.1391 0.81628 0.000 0.944 0.000 0.040 0.000 0.016
#> SRR2105206 2 0.0260 0.81791 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105201 4 0.2595 0.76631 0.004 0.000 0.000 0.836 0.000 0.160
#> SRR2105202 4 0.2695 0.76867 0.004 0.000 0.000 0.844 0.008 0.144
#> SRR2105203 2 0.4533 0.37433 0.000 0.588 0.000 0.032 0.004 0.376
#> SRR2105204 6 0.2822 0.81373 0.000 0.108 0.000 0.032 0.004 0.856
#> SRR2105199 6 0.2189 0.85879 0.000 0.060 0.000 0.032 0.004 0.904
#> SRR2105200 6 0.0713 0.86715 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105197 5 0.5321 0.52191 0.008 0.000 0.116 0.280 0.596 0.000
#> SRR2105198 5 0.5517 0.44934 0.004 0.000 0.124 0.352 0.520 0.000
#> SRR2105195 3 0.5298 0.51045 0.180 0.004 0.644 0.008 0.164 0.000
#> SRR2105196 1 0.2208 0.79978 0.912 0.012 0.016 0.008 0.052 0.000
#> SRR2105193 1 0.2051 0.79314 0.896 0.000 0.004 0.004 0.096 0.000
#> SRR2105194 1 0.1674 0.80484 0.924 0.000 0.004 0.004 0.068 0.000
#> SRR2105191 5 0.4415 0.52931 0.016 0.000 0.024 0.300 0.660 0.000
#> SRR2105192 5 0.5605 0.45728 0.244 0.000 0.000 0.212 0.544 0.000
#> SRR2105189 2 0.3088 0.73107 0.000 0.808 0.000 0.172 0.000 0.020
#> SRR2105190 2 0.2019 0.80114 0.000 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR2105187 4 0.3720 0.66006 0.000 0.236 0.028 0.736 0.000 0.000
#> SRR2105188 4 0.2625 0.76216 0.000 0.056 0.000 0.872 0.000 0.072
#> SRR2105179 5 0.4414 0.38635 0.284 0.000 0.016 0.028 0.672 0.000
#> SRR2105180 5 0.5658 0.23375 0.380 0.000 0.000 0.156 0.464 0.000
#> SRR2105183 6 0.0632 0.86779 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105184 6 0.0547 0.86970 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105185 2 0.5259 0.30941 0.000 0.540 0.032 0.032 0.004 0.392
#> SRR2105186 6 0.3280 0.77678 0.000 0.152 0.004 0.032 0.000 0.812
#> SRR2105181 5 0.4226 0.55469 0.004 0.000 0.040 0.264 0.692 0.000
#> SRR2105182 5 0.3735 0.53357 0.004 0.000 0.084 0.120 0.792 0.000
#> SRR2105177 1 0.0291 0.81972 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105178 1 0.0146 0.81935 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105171 6 0.4426 0.54261 0.000 0.296 0.000 0.052 0.000 0.652
#> SRR2105172 6 0.2812 0.82895 0.000 0.048 0.000 0.096 0.000 0.856
#> SRR2105175 1 0.0291 0.81935 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105176 1 0.0146 0.81982 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105173 6 0.4535 -0.02924 0.000 0.484 0.000 0.032 0.000 0.484
#> SRR2105174 6 0.4292 0.45493 0.000 0.340 0.000 0.032 0.000 0.628
#> SRR2105169 6 0.1564 0.86325 0.000 0.040 0.000 0.024 0.000 0.936
#> SRR2105170 6 0.0458 0.87099 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105167 6 0.0260 0.87462 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105168 6 0.0547 0.86970 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105165 3 0.4309 0.62469 0.000 0.000 0.660 0.044 0.296 0.000
#> SRR2105166 3 0.4525 0.61702 0.004 0.000 0.664 0.056 0.276 0.000
#> SRR2105163 3 0.0865 0.66760 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105164 3 0.0865 0.66684 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.2476 0.79070 0.880 0.000 0.024 0.004 0.092 0.000
#> SRR2105162 1 0.0146 0.81935 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105155 6 0.0891 0.87510 0.000 0.008 0.000 0.024 0.000 0.968
#> SRR2105156 6 0.0865 0.86438 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105157 6 0.3421 0.77931 0.000 0.152 0.004 0.032 0.004 0.808
#> SRR2105158 6 0.3042 0.79700 0.000 0.128 0.004 0.032 0.000 0.836
#> SRR2105159 3 0.3952 0.61340 0.104 0.000 0.780 0.008 0.108 0.000
#> SRR2105160 1 0.0665 0.82038 0.980 0.000 0.008 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105153 2 0.4639 0.47871 0.000 0.624 0.008 0.032 0.004 0.332
#> SRR2105154 2 0.4271 0.62964 0.000 0.704 0.008 0.032 0.004 0.252
#> SRR2105151 6 0.0713 0.86630 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105152 6 0.0458 0.87099 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105149 3 0.6317 0.39493 0.000 0.288 0.528 0.076 0.108 0.000
#> SRR2105150 3 0.5206 0.49712 0.004 0.012 0.624 0.084 0.276 0.000
#> SRR2105147 2 0.3890 0.39490 0.000 0.596 0.400 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105148 2 0.3899 0.38554 0.000 0.592 0.404 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105143 1 0.0862 0.81753 0.972 0.000 0.004 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105144 1 0.0146 0.81984 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.1674 0.80486 0.924 0.000 0.004 0.004 0.068 0.000
#> SRR2105146 1 0.2196 0.78564 0.884 0.000 0.004 0.004 0.108 0.000
#> SRR2105141 2 0.1262 0.81881 0.000 0.956 0.008 0.020 0.000 0.016
#> SRR2105142 2 0.1906 0.81284 0.000 0.924 0.008 0.032 0.000 0.036
#> SRR2105139 6 0.1257 0.86753 0.000 0.020 0.000 0.028 0.000 0.952
#> SRR2105140 6 0.0632 0.86779 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105137 4 0.3621 0.75030 0.036 0.000 0.000 0.808 0.024 0.132
#> SRR2105138 4 0.2473 0.76868 0.000 0.000 0.000 0.856 0.008 0.136
#> SRR2105135 6 0.0458 0.87099 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105136 6 0.0458 0.87099 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105133 5 0.4373 0.49152 0.004 0.000 0.028 0.344 0.624 0.000
#> SRR2105134 5 0.4567 0.49818 0.032 0.000 0.012 0.324 0.632 0.000
#> SRR2105131 4 0.5326 0.04286 0.004 0.028 0.020 0.536 0.400 0.012
#> SRR2105132 5 0.5214 0.49818 0.112 0.000 0.004 0.288 0.596 0.000
#> SRR2105129 1 0.0000 0.81982 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.81982 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.5162 0.08546 0.504 0.000 0.000 0.088 0.408 0.000
#> SRR2105128 1 0.5417 -0.04498 0.464 0.000 0.000 0.116 0.420 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.489 0.797 0.898 0.4769 0.509 0.509
#> 3 3 0.425 0.525 0.748 0.2477 0.912 0.830
#> 4 4 0.378 0.536 0.710 0.1131 0.896 0.770
#> 5 5 0.416 0.417 0.645 0.1115 0.821 0.558
#> 6 6 0.487 0.439 0.675 0.0673 0.874 0.577
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.3274 0.8593 0.940 0.060
#> SRR2105278 1 0.1633 0.8597 0.976 0.024
#> SRR2105275 2 0.8207 0.6670 0.256 0.744
#> SRR2105276 2 0.9909 0.1779 0.444 0.556
#> SRR2105273 1 0.0376 0.8527 0.996 0.004
#> SRR2105274 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.6531 0.7972 0.832 0.168
#> SRR2105272 1 0.0672 0.8551 0.992 0.008
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0672 0.9082 0.008 0.992
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105261 2 0.9552 0.3896 0.376 0.624
#> SRR2105262 2 0.9608 0.3645 0.384 0.616
#> SRR2105357 2 0.9977 0.0344 0.472 0.528
#> SRR2105358 1 0.1414 0.8580 0.980 0.020
#> SRR2105439 2 0.6712 0.7755 0.176 0.824
#> SRR2105440 2 0.3584 0.8765 0.068 0.932
#> SRR2105509 2 0.2043 0.9037 0.032 0.968
#> SRR2105510 2 0.2236 0.9027 0.036 0.964
#> SRR2105507 1 0.2948 0.8582 0.948 0.052
#> SRR2105508 1 0.1843 0.8589 0.972 0.028
#> SRR2105505 1 0.0376 0.8520 0.996 0.004
#> SRR2105506 1 0.0376 0.8520 0.996 0.004
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.2948 0.8947 0.052 0.948
#> SRR2105501 2 0.4815 0.8609 0.104 0.896
#> SRR2105502 2 0.2948 0.8947 0.052 0.948
#> SRR2105499 1 0.8955 0.6285 0.688 0.312
#> SRR2105500 1 0.5946 0.8259 0.856 0.144
#> SRR2105497 2 0.1184 0.9070 0.016 0.984
#> SRR2105498 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.3114 0.8923 0.056 0.944
#> SRR2105496 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105493 2 0.3733 0.8826 0.072 0.928
#> SRR2105494 2 0.3114 0.8940 0.056 0.944
#> SRR2105491 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105489 2 0.0376 0.9083 0.004 0.996
#> SRR2105490 2 0.0938 0.9089 0.012 0.988
#> SRR2105487 1 0.9635 0.4267 0.612 0.388
#> SRR2105488 1 0.5737 0.8236 0.864 0.136
#> SRR2105485 1 0.5059 0.8429 0.888 0.112
#> SRR2105486 1 0.4022 0.8553 0.920 0.080
#> SRR2105483 1 0.4022 0.8432 0.920 0.080
#> SRR2105484 1 0.3733 0.8438 0.928 0.072
#> SRR2105481 1 0.8144 0.7075 0.748 0.252
#> SRR2105482 1 0.0672 0.8526 0.992 0.008
#> SRR2105479 2 0.9922 0.1411 0.448 0.552
#> SRR2105480 1 0.9000 0.6233 0.684 0.316
#> SRR2105477 2 0.1184 0.9087 0.016 0.984
#> SRR2105478 2 0.3584 0.8861 0.068 0.932
#> SRR2105475 2 0.2778 0.8966 0.048 0.952
#> SRR2105476 2 0.2423 0.9000 0.040 0.960
#> SRR2105473 2 0.6048 0.8052 0.148 0.852
#> SRR2105474 2 0.6623 0.7714 0.172 0.828
#> SRR2105471 2 0.1184 0.9062 0.016 0.984
#> SRR2105472 2 0.0938 0.9074 0.012 0.988
#> SRR2105469 1 0.2423 0.8596 0.960 0.040
#> SRR2105470 1 0.2948 0.8586 0.948 0.052
#> SRR2105467 1 0.1633 0.8599 0.976 0.024
#> SRR2105468 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.9686 0.4600 0.604 0.396
#> SRR2105466 1 0.6247 0.8149 0.844 0.156
#> SRR2105463 1 0.1184 0.8551 0.984 0.016
#> SRR2105464 1 0.2948 0.8578 0.948 0.052
#> SRR2105461 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.1184 0.9079 0.016 0.984
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.9850 0.3608 0.572 0.428
#> SRR2105458 1 0.9795 0.3959 0.584 0.416
#> SRR2105455 1 0.4431 0.8516 0.908 0.092
#> SRR2105456 1 0.1414 0.8583 0.980 0.020
#> SRR2105453 1 0.2236 0.8591 0.964 0.036
#> SRR2105454 1 0.0938 0.8554 0.988 0.012
#> SRR2105451 2 0.5059 0.8526 0.112 0.888
#> SRR2105452 2 0.4690 0.8601 0.100 0.900
#> SRR2105449 1 0.9286 0.5760 0.656 0.344
#> SRR2105450 1 0.3879 0.8565 0.924 0.076
#> SRR2105447 2 0.1184 0.9080 0.016 0.984
#> SRR2105448 2 0.1184 0.9085 0.016 0.984
#> SRR2105445 2 0.7602 0.7224 0.220 0.780
#> SRR2105446 2 0.9661 0.3435 0.392 0.608
#> SRR2105443 2 0.5519 0.8336 0.128 0.872
#> SRR2105444 2 0.5842 0.8229 0.140 0.860
#> SRR2105441 2 0.1184 0.9048 0.016 0.984
#> SRR2105442 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.3879 0.8537 0.924 0.076
#> SRR2105438 1 0.1184 0.8578 0.984 0.016
#> SRR2105435 2 0.9833 0.2283 0.424 0.576
#> SRR2105436 1 0.8386 0.7016 0.732 0.268
#> SRR2105433 1 0.2423 0.8597 0.960 0.040
#> SRR2105434 1 0.1843 0.8569 0.972 0.028
#> SRR2105431 1 0.1184 0.8556 0.984 0.016
#> SRR2105432 1 0.0376 0.8526 0.996 0.004
#> SRR2105429 2 0.5059 0.8505 0.112 0.888
#> SRR2105430 2 0.2423 0.9010 0.040 0.960
#> SRR2105427 2 0.2948 0.8947 0.052 0.948
#> SRR2105428 2 0.2423 0.9008 0.040 0.960
#> SRR2105425 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105426 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105421 2 1.0000 -0.0910 0.496 0.504
#> SRR2105422 2 0.9358 0.4397 0.352 0.648
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.7056 0.7874 0.808 0.192
#> SRR2105420 1 0.9552 0.4967 0.624 0.376
#> SRR2105415 1 0.3274 0.8580 0.940 0.060
#> SRR2105416 1 0.1414 0.8561 0.980 0.020
#> SRR2105417 1 0.1184 0.8566 0.984 0.016
#> SRR2105418 1 0.1184 0.8559 0.984 0.016
#> SRR2105413 2 0.1633 0.9058 0.024 0.976
#> SRR2105414 2 0.2043 0.9032 0.032 0.968
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.1184 0.9047 0.016 0.984
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.8267 0.7134 0.740 0.260
#> SRR2105408 2 0.9998 -0.0747 0.492 0.508
#> SRR2105403 1 0.1414 0.8587 0.980 0.020
#> SRR2105404 1 0.1184 0.8578 0.984 0.016
#> SRR2105405 1 0.0376 0.8520 0.996 0.004
#> SRR2105406 1 0.1633 0.8583 0.976 0.024
#> SRR2105401 2 0.3879 0.8793 0.076 0.924
#> SRR2105402 2 0.3879 0.8791 0.076 0.924
#> SRR2105399 2 0.5059 0.8494 0.112 0.888
#> SRR2105400 2 0.4690 0.8616 0.100 0.900
#> SRR2105397 2 0.5059 0.8521 0.112 0.888
#> SRR2105398 2 0.4431 0.8697 0.092 0.908
#> SRR2105395 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.1414 0.9071 0.020 0.980
#> SRR2105394 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105389 1 0.8955 0.6333 0.688 0.312
#> SRR2105390 1 0.5737 0.8254 0.864 0.136
#> SRR2105391 1 0.9661 0.4683 0.608 0.392
#> SRR2105392 1 0.6887 0.7864 0.816 0.184
#> SRR2105385 1 0.7453 0.7620 0.788 0.212
#> SRR2105386 1 0.2043 0.8600 0.968 0.032
#> SRR2105387 1 0.5408 0.8390 0.876 0.124
#> SRR2105388 1 0.4562 0.8501 0.904 0.096
#> SRR2105381 2 0.2778 0.8967 0.048 0.952
#> SRR2105382 2 0.2236 0.9023 0.036 0.964
#> SRR2105383 2 0.4690 0.8528 0.100 0.900
#> SRR2105384 2 0.2423 0.8971 0.040 0.960
#> SRR2105379 2 0.0672 0.9093 0.008 0.992
#> SRR2105380 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105377 2 0.0672 0.9092 0.008 0.992
#> SRR2105378 2 0.3114 0.8893 0.056 0.944
#> SRR2105375 1 0.9686 0.4455 0.604 0.396
#> SRR2105376 1 0.9963 0.2319 0.536 0.464
#> SRR2105373 1 0.1633 0.8600 0.976 0.024
#> SRR2105374 1 0.0376 0.8526 0.996 0.004
#> SRR2105371 1 0.5178 0.8354 0.884 0.116
#> SRR2105372 1 0.1414 0.8578 0.980 0.020
#> SRR2105369 1 0.0938 0.8562 0.988 0.012
#> SRR2105370 1 0.0376 0.8525 0.996 0.004
#> SRR2105367 1 0.3879 0.8539 0.924 0.076
#> SRR2105368 1 0.4431 0.8516 0.908 0.092
#> SRR2105365 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105363 2 0.0938 0.9090 0.012 0.988
#> SRR2105364 2 0.1414 0.9082 0.020 0.980
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105359 1 0.4022 0.8536 0.920 0.080
#> SRR2105360 1 0.0938 0.8565 0.988 0.012
#> SRR2105355 1 0.2603 0.8598 0.956 0.044
#> SRR2105356 1 0.1633 0.8583 0.976 0.024
#> SRR2105353 1 0.9933 0.2662 0.548 0.452
#> SRR2105354 1 0.8016 0.7328 0.756 0.244
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.3733 0.8821 0.072 0.928
#> SRR2105349 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0376 0.9089 0.004 0.996
#> SRR2105345 2 0.2778 0.8957 0.048 0.952
#> SRR2105346 2 0.0376 0.9085 0.004 0.996
#> SRR2105347 2 0.9552 0.3577 0.376 0.624
#> SRR2105348 2 0.8813 0.5426 0.300 0.700
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0938 0.9085 0.012 0.988
#> SRR2105341 1 0.7453 0.7676 0.788 0.212
#> SRR2105342 1 0.4939 0.8411 0.892 0.108
#> SRR2105339 1 0.9129 0.5940 0.672 0.328
#> SRR2105340 1 0.9850 0.3589 0.572 0.428
#> SRR2105335 1 0.0376 0.8529 0.996 0.004
#> SRR2105336 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.4022 0.8548 0.920 0.080
#> SRR2105338 1 0.0938 0.8561 0.988 0.012
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0672 0.9090 0.008 0.992
#> SRR2105333 2 0.0672 0.9089 0.008 0.992
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.5178 0.8487 0.116 0.884
#> SRR2105330 2 0.4562 0.8649 0.096 0.904
#> SRR2105327 2 0.2043 0.9034 0.032 0.968
#> SRR2105328 2 0.2043 0.9034 0.032 0.968
#> SRR2105325 2 0.9815 0.2629 0.420 0.580
#> SRR2105326 1 0.9732 0.4324 0.596 0.404
#> SRR2105323 1 0.7056 0.7867 0.808 0.192
#> SRR2105324 1 0.4431 0.8505 0.908 0.092
#> SRR2105319 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.6148 0.8138 0.848 0.152
#> SRR2105322 1 0.8081 0.7177 0.752 0.248
#> SRR2105317 2 0.2423 0.9014 0.040 0.960
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105315 2 0.4298 0.8720 0.088 0.912
#> SRR2105316 2 0.2948 0.8954 0.052 0.948
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105311 2 0.8713 0.5990 0.292 0.708
#> SRR2105312 2 0.8608 0.6153 0.284 0.716
#> SRR2105307 1 0.1633 0.8595 0.976 0.024
#> SRR2105308 1 0.3114 0.8553 0.944 0.056
#> SRR2105309 1 0.9954 0.2637 0.540 0.460
#> SRR2105310 1 0.8955 0.6344 0.688 0.312
#> SRR2105305 1 0.8016 0.7309 0.756 0.244
#> SRR2105306 1 0.3431 0.8571 0.936 0.064
#> SRR2105303 2 0.0938 0.9093 0.012 0.988
#> SRR2105304 2 0.1633 0.9071 0.024 0.976
#> SRR2105301 2 0.2948 0.8950 0.052 0.948
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105299 2 0.8016 0.6857 0.244 0.756
#> SRR2105300 2 0.7376 0.7407 0.208 0.792
#> SRR2105297 2 0.9608 0.3343 0.384 0.616
#> SRR2105298 1 0.9944 0.2657 0.544 0.456
#> SRR2105295 2 0.2043 0.9032 0.032 0.968
#> SRR2105296 2 0.1843 0.9057 0.028 0.972
#> SRR2105293 2 0.9963 0.0787 0.464 0.536
#> SRR2105294 1 0.8955 0.6172 0.688 0.312
#> SRR2105291 1 0.7376 0.7790 0.792 0.208
#> SRR2105292 1 0.1843 0.8604 0.972 0.028
#> SRR2105289 1 0.8813 0.6452 0.700 0.300
#> SRR2105290 1 0.3733 0.8570 0.928 0.072
#> SRR2105287 1 0.0672 0.8544 0.992 0.008
#> SRR2105288 1 0.1633 0.8563 0.976 0.024
#> SRR2105285 2 0.1414 0.9070 0.020 0.980
#> SRR2105286 2 0.1184 0.9080 0.016 0.984
#> SRR2105283 2 0.5178 0.8495 0.116 0.884
#> SRR2105284 2 0.2603 0.8995 0.044 0.956
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.9977 0.2111 0.528 0.472
#> SRR2105260 2 0.9993 -0.0357 0.484 0.516
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.1414 0.9069 0.020 0.980
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0938 0.8567 0.988 0.012
#> SRR2105256 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.3274 0.8907 0.060 0.940
#> SRR2105250 2 0.2948 0.8945 0.052 0.948
#> SRR2105247 2 0.0672 0.9093 0.008 0.992
#> SRR2105248 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105245 2 0.7376 0.7335 0.208 0.792
#> SRR2105246 2 0.7139 0.7467 0.196 0.804
#> SRR2105243 1 0.6973 0.7901 0.812 0.188
#> SRR2105244 1 0.8207 0.7183 0.744 0.256
#> SRR2105241 1 0.6048 0.8247 0.852 0.148
#> SRR2105242 1 0.0672 0.8540 0.992 0.008
#> SRR2105239 1 0.9944 0.2601 0.544 0.456
#> SRR2105240 1 0.1633 0.8579 0.976 0.024
#> SRR2105237 2 0.2778 0.8967 0.048 0.952
#> SRR2105238 2 0.0938 0.9091 0.012 0.988
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.2236 0.9016 0.036 0.964
#> SRR2105234 2 0.2043 0.9032 0.032 0.968
#> SRR2105231 2 0.0938 0.9085 0.012 0.988
#> SRR2105232 2 0.0938 0.9085 0.012 0.988
#> SRR2105227 2 0.9460 0.4260 0.364 0.636
#> SRR2105228 1 0.8144 0.7205 0.748 0.252
#> SRR2105225 1 0.0672 0.8547 0.992 0.008
#> SRR2105226 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105229 2 0.7602 0.7193 0.220 0.780
#> SRR2105230 1 0.9754 0.4174 0.592 0.408
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0938 0.9086 0.012 0.988
#> SRR2105221 2 0.5842 0.8200 0.140 0.860
#> SRR2105222 2 0.5178 0.8447 0.116 0.884
#> SRR2105223 1 0.1414 0.8586 0.980 0.020
#> SRR2105224 1 0.0672 0.8544 0.992 0.008
#> SRR2105217 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105218 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105213 2 0.7815 0.7001 0.232 0.768
#> SRR2105214 2 0.9393 0.4481 0.356 0.644
#> SRR2105211 1 0.8144 0.7270 0.748 0.252
#> SRR2105212 1 0.9710 0.4513 0.600 0.400
#> SRR2105209 1 0.1414 0.8584 0.980 0.020
#> SRR2105210 1 0.1184 0.8578 0.984 0.016
#> SRR2105207 1 0.5519 0.8329 0.872 0.128
#> SRR2105208 1 0.1184 0.8563 0.984 0.016
#> SRR2105205 2 0.1184 0.9085 0.016 0.984
#> SRR2105206 2 0.2423 0.9005 0.040 0.960
#> SRR2105201 2 0.5059 0.8384 0.112 0.888
#> SRR2105202 2 0.2778 0.8956 0.048 0.952
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105200 2 0.0376 0.9091 0.004 0.996
#> SRR2105197 1 0.7815 0.7367 0.768 0.232
#> SRR2105198 1 0.8267 0.7113 0.740 0.260
#> SRR2105195 1 0.9248 0.5791 0.660 0.340
#> SRR2105196 1 0.9732 0.4388 0.596 0.404
#> SRR2105193 1 0.1184 0.8574 0.984 0.016
#> SRR2105194 1 0.0938 0.8560 0.988 0.012
#> SRR2105191 1 0.2948 0.8596 0.948 0.052
#> SRR2105192 1 0.0000 0.8503 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.3879 0.8797 0.076 0.924
#> SRR2105190 2 0.1414 0.9076 0.020 0.980
#> SRR2105187 2 0.2948 0.8967 0.052 0.948
#> SRR2105188 2 0.2778 0.8993 0.048 0.952
#> SRR2105179 1 0.5737 0.8306 0.864 0.136
#> SRR2105180 1 0.5294 0.8390 0.880 0.120
#> SRR2105183 2 0.0376 0.9084 0.004 0.996
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.1184 0.9066 0.016 0.984
#> SRR2105186 2 0.0672 0.9079 0.008 0.992
#> SRR2105181 1 0.9983 0.1557 0.524 0.476
#> SRR2105182 1 0.6531 0.8025 0.832 0.168
#> SRR2105177 1 0.3733 0.8499 0.928 0.072
#> SRR2105178 1 0.2043 0.8533 0.968 0.032
#> SRR2105171 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105172 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105175 1 0.8555 0.6786 0.720 0.280
#> SRR2105176 1 0.4161 0.8502 0.916 0.084
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105170 2 0.0938 0.9080 0.012 0.988
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.5178 0.8394 0.884 0.116
#> SRR2105166 1 0.4690 0.8459 0.900 0.100
#> SRR2105163 2 0.8207 0.6661 0.256 0.744
#> SRR2105164 1 0.9635 0.4687 0.612 0.388
#> SRR2105161 1 0.1184 0.8577 0.984 0.016
#> SRR2105162 1 0.2423 0.8579 0.960 0.040
#> SRR2105155 2 0.0376 0.9090 0.004 0.996
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0376 0.9087 0.004 0.996
#> SRR2105159 1 0.4690 0.8470 0.900 0.100
#> SRR2105160 1 0.3879 0.8568 0.924 0.076
#> SRR2105153 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0672 0.9084 0.008 0.992
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105149 2 0.8555 0.6194 0.280 0.720
#> SRR2105150 2 0.9323 0.4665 0.348 0.652
#> SRR2105147 2 0.5408 0.8372 0.124 0.876
#> SRR2105148 2 0.5178 0.8453 0.116 0.884
#> SRR2105143 2 0.9795 0.2692 0.416 0.584
#> SRR2105144 1 0.9635 0.4685 0.612 0.388
#> SRR2105145 1 0.4022 0.8526 0.920 0.080
#> SRR2105146 1 0.0938 0.8562 0.988 0.012
#> SRR2105141 2 0.0376 0.9088 0.004 0.996
#> SRR2105142 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9082 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.8763 0.5733 0.296 0.704
#> SRR2105138 2 0.7674 0.6952 0.224 0.776
#> SRR2105135 2 0.0672 0.9092 0.008 0.992
#> SRR2105136 2 0.0938 0.9076 0.012 0.988
#> SRR2105133 1 0.9393 0.5170 0.644 0.356
#> SRR2105134 1 0.5629 0.8273 0.868 0.132
#> SRR2105131 2 0.8081 0.6766 0.248 0.752
#> SRR2105132 1 0.3584 0.8560 0.932 0.068
#> SRR2105129 1 0.3431 0.8502 0.936 0.064
#> SRR2105130 1 0.4161 0.8450 0.916 0.084
#> SRR2105127 1 0.2043 0.8598 0.968 0.032
#> SRR2105128 1 0.1184 0.8567 0.984 0.016
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.7186 0.10597 0.476 0.024 0.500
#> SRR2105278 3 0.6822 -0.25011 0.480 0.012 0.508
#> SRR2105275 2 0.8465 -0.09923 0.096 0.528 0.376
#> SRR2105276 3 0.9606 0.52249 0.212 0.340 0.448
#> SRR2105273 1 0.3686 0.46330 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105274 1 0.3879 0.45234 0.848 0.000 0.152
#> SRR2105271 1 0.8663 0.04923 0.524 0.112 0.364
#> SRR2105272 1 0.3618 0.51968 0.884 0.012 0.104
#> SRR2105269 2 0.0747 0.85005 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105270 2 0.1289 0.85337 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105267 2 0.1529 0.85413 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105268 2 0.1860 0.85267 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105265 2 0.3112 0.84332 0.004 0.900 0.096
#> SRR2105266 2 0.2711 0.84612 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105263 2 0.1411 0.85281 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105264 2 0.2356 0.85295 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105261 2 0.9613 -0.30597 0.244 0.472 0.284
#> SRR2105262 3 0.9823 0.47518 0.244 0.364 0.392
#> SRR2105357 3 0.9131 0.54046 0.168 0.312 0.520
#> SRR2105358 1 0.6954 -0.13184 0.500 0.016 0.484
#> SRR2105439 2 0.8875 0.27343 0.136 0.528 0.336
#> SRR2105440 2 0.7128 0.57063 0.052 0.664 0.284
#> SRR2105509 2 0.1163 0.84357 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105510 2 0.1453 0.84356 0.008 0.968 0.024
#> SRR2105507 1 0.5737 0.32119 0.732 0.012 0.256
#> SRR2105508 1 0.5692 0.29801 0.724 0.008 0.268
#> SRR2105505 1 0.4750 0.51338 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105506 1 0.5016 0.49438 0.760 0.000 0.240
#> SRR2105503 2 0.1163 0.85272 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105504 2 0.4409 0.73146 0.004 0.824 0.172
#> SRR2105501 2 0.2982 0.82268 0.056 0.920 0.024
#> SRR2105502 2 0.4521 0.72479 0.004 0.816 0.180
#> SRR2105499 1 0.9773 -0.45660 0.412 0.236 0.352
#> SRR2105500 1 0.7944 0.20257 0.644 0.112 0.244
#> SRR2105497 2 0.3889 0.83624 0.032 0.884 0.084
#> SRR2105498 2 0.2711 0.84517 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105495 2 0.2280 0.85000 0.008 0.940 0.052
#> SRR2105496 2 0.1163 0.85289 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105493 2 0.2636 0.83555 0.020 0.932 0.048
#> SRR2105494 2 0.3183 0.83248 0.016 0.908 0.076
#> SRR2105491 2 0.1964 0.85421 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105492 2 0.1878 0.85276 0.004 0.952 0.044
#> SRR2105489 2 0.2860 0.84601 0.004 0.912 0.084
#> SRR2105490 2 0.4602 0.79698 0.016 0.832 0.152
#> SRR2105487 3 0.8016 0.24633 0.260 0.108 0.632
#> SRR2105488 3 0.7770 0.18616 0.292 0.080 0.628
#> SRR2105485 1 0.7379 0.01760 0.584 0.040 0.376
#> SRR2105486 1 0.7057 0.27505 0.680 0.056 0.264
#> SRR2105483 1 0.6113 0.45003 0.688 0.012 0.300
#> SRR2105484 1 0.6172 0.44360 0.680 0.012 0.308
#> SRR2105481 3 0.9065 0.29913 0.364 0.144 0.492
#> SRR2105482 1 0.5926 0.45232 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105479 2 0.9857 -0.49138 0.276 0.416 0.308
#> SRR2105480 1 0.9578 -0.26900 0.480 0.272 0.248
#> SRR2105477 2 0.2356 0.85295 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105478 2 0.3528 0.82996 0.016 0.892 0.092
#> SRR2105475 2 0.1411 0.84234 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105476 2 0.1031 0.84396 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105473 2 0.8261 0.48131 0.124 0.616 0.260
#> SRR2105474 2 0.8494 0.45792 0.156 0.608 0.236
#> SRR2105471 2 0.3771 0.83467 0.012 0.876 0.112
#> SRR2105472 2 0.4139 0.82633 0.016 0.860 0.124
#> SRR2105469 1 0.4782 0.43279 0.820 0.016 0.164
#> SRR2105470 1 0.5253 0.40501 0.792 0.020 0.188
#> SRR2105467 1 0.4692 0.46548 0.820 0.012 0.168
#> SRR2105468 1 0.4399 0.53148 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105465 1 0.7665 0.00393 0.600 0.340 0.060
#> SRR2105466 1 0.5740 0.46828 0.804 0.100 0.096
#> SRR2105463 1 0.4452 0.51518 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105464 1 0.5763 0.47649 0.716 0.008 0.276
#> SRR2105461 2 0.3295 0.84190 0.008 0.896 0.096
#> SRR2105462 2 0.2537 0.84717 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105459 2 0.1031 0.84566 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105460 2 0.0424 0.84973 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105457 3 0.9914 0.51943 0.328 0.280 0.392
#> SRR2105458 3 0.9920 0.52111 0.332 0.280 0.388
#> SRR2105455 1 0.4095 0.49259 0.880 0.056 0.064
#> SRR2105456 1 0.1647 0.52044 0.960 0.004 0.036
#> SRR2105453 1 0.6416 0.41347 0.616 0.008 0.376
#> SRR2105454 1 0.6189 0.43205 0.632 0.004 0.364
#> SRR2105451 2 0.5159 0.73120 0.040 0.820 0.140
#> SRR2105452 2 0.5578 0.64645 0.012 0.748 0.240
#> SRR2105449 1 0.8962 -0.19019 0.548 0.288 0.164
#> SRR2105450 1 0.3683 0.49941 0.896 0.044 0.060
#> SRR2105447 2 0.1163 0.84784 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105448 2 0.1031 0.84619 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105445 2 0.7841 0.16046 0.064 0.576 0.360
#> SRR2105446 3 0.9587 0.50556 0.204 0.356 0.440
#> SRR2105443 2 0.5298 0.69383 0.032 0.804 0.164
#> SRR2105444 2 0.6106 0.65815 0.044 0.756 0.200
#> SRR2105441 2 0.3532 0.83753 0.008 0.884 0.108
#> SRR2105442 2 0.3267 0.83688 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105437 3 0.6723 0.25479 0.248 0.048 0.704
#> SRR2105438 3 0.6027 0.16662 0.272 0.016 0.712
#> SRR2105435 2 0.9555 -0.28863 0.224 0.476 0.300
#> SRR2105436 1 0.9485 -0.43105 0.428 0.184 0.388
#> SRR2105433 1 0.3690 0.53699 0.884 0.016 0.100
#> SRR2105434 1 0.5070 0.50318 0.772 0.004 0.224
#> SRR2105431 1 0.5529 0.47229 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105432 1 0.5291 0.48588 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105429 2 0.3765 0.79602 0.028 0.888 0.084
#> SRR2105430 2 0.1765 0.84026 0.004 0.956 0.040
#> SRR2105427 2 0.2116 0.84750 0.012 0.948 0.040
#> SRR2105428 2 0.1905 0.84115 0.016 0.956 0.028
#> SRR2105425 2 0.2165 0.85271 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105426 2 0.2356 0.84949 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105421 1 0.9746 -0.33038 0.436 0.320 0.244
#> SRR2105422 2 0.9738 -0.38771 0.264 0.448 0.288
#> SRR2105423 2 0.2625 0.84532 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105424 2 0.2261 0.85022 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105419 1 0.7814 0.15568 0.652 0.104 0.244
#> SRR2105420 1 0.9390 -0.32147 0.476 0.184 0.340
#> SRR2105415 1 0.6228 0.45141 0.672 0.012 0.316
#> SRR2105416 1 0.5588 0.47597 0.720 0.004 0.276
#> SRR2105417 1 0.2711 0.53606 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105418 1 0.5158 0.50671 0.764 0.004 0.232
#> SRR2105413 2 0.0892 0.84512 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105414 2 0.1163 0.84510 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105409 2 0.2625 0.85303 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105410 2 0.3965 0.82041 0.008 0.860 0.132
#> SRR2105411 2 0.2165 0.84960 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105412 2 0.2537 0.84603 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105407 3 0.8570 0.33984 0.428 0.096 0.476
#> SRR2105408 3 0.9563 0.54799 0.284 0.236 0.480
#> SRR2105403 1 0.5692 0.37376 0.724 0.008 0.268
#> SRR2105404 1 0.6379 0.30044 0.624 0.008 0.368
#> SRR2105405 1 0.0892 0.52504 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105406 1 0.1525 0.53187 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105401 2 0.2743 0.82571 0.020 0.928 0.052
#> SRR2105402 2 0.4931 0.69095 0.004 0.784 0.212
#> SRR2105399 2 0.3921 0.77438 0.016 0.872 0.112
#> SRR2105400 2 0.3722 0.79486 0.024 0.888 0.088
#> SRR2105397 2 0.6333 0.39378 0.012 0.656 0.332
#> SRR2105398 2 0.5864 0.50743 0.008 0.704 0.288
#> SRR2105395 2 0.2955 0.84754 0.008 0.912 0.080
#> SRR2105396 2 0.3116 0.83944 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105393 2 0.1529 0.85099 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105394 2 0.2772 0.84990 0.004 0.916 0.080
#> SRR2105389 3 0.9095 0.44231 0.376 0.144 0.480
#> SRR2105390 1 0.7187 -0.16470 0.496 0.024 0.480
#> SRR2105391 1 0.9395 -0.40504 0.432 0.172 0.396
#> SRR2105392 1 0.7534 -0.12361 0.532 0.040 0.428
#> SRR2105385 1 0.8345 0.06474 0.628 0.172 0.200
#> SRR2105386 1 0.4810 0.44773 0.832 0.028 0.140
#> SRR2105387 1 0.6325 0.41676 0.772 0.116 0.112
#> SRR2105388 1 0.6810 0.44116 0.720 0.068 0.212
#> SRR2105381 2 0.1411 0.84332 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105382 2 0.1031 0.84396 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105383 2 0.4749 0.80421 0.072 0.852 0.076
#> SRR2105384 2 0.4232 0.82759 0.044 0.872 0.084
#> SRR2105379 2 0.1399 0.84881 0.004 0.968 0.028
#> SRR2105380 2 0.1267 0.84928 0.004 0.972 0.024
#> SRR2105377 2 0.4139 0.82198 0.016 0.860 0.124
#> SRR2105378 2 0.6596 0.62922 0.040 0.704 0.256
#> SRR2105375 1 0.9287 -0.12705 0.508 0.304 0.188
#> SRR2105376 1 0.9846 -0.04770 0.420 0.276 0.304
#> SRR2105373 3 0.6813 0.09778 0.468 0.012 0.520
#> SRR2105374 3 0.6026 0.08192 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105371 1 0.7030 -0.00479 0.580 0.024 0.396
#> SRR2105372 1 0.6434 0.07572 0.612 0.008 0.380
#> SRR2105369 1 0.4531 0.44685 0.824 0.008 0.168
#> SRR2105370 1 0.3851 0.49737 0.860 0.004 0.136
#> SRR2105367 1 0.7069 0.37991 0.568 0.024 0.408
#> SRR2105368 1 0.7835 0.27611 0.492 0.052 0.456
#> SRR2105365 2 0.1289 0.85143 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105366 2 0.2096 0.85437 0.004 0.944 0.052
#> SRR2105363 2 0.2096 0.85425 0.004 0.944 0.052
#> SRR2105364 2 0.2682 0.85373 0.004 0.920 0.076
#> SRR2105361 2 0.2356 0.85007 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105362 2 0.3112 0.84358 0.004 0.900 0.096
#> SRR2105359 1 0.7339 0.07007 0.572 0.036 0.392
#> SRR2105360 1 0.5656 0.32773 0.712 0.004 0.284
#> SRR2105355 1 0.6012 0.36647 0.748 0.032 0.220
#> SRR2105356 1 0.3846 0.48897 0.876 0.016 0.108
#> SRR2105353 3 0.9745 0.47991 0.348 0.232 0.420
#> SRR2105354 1 0.8803 -0.13219 0.544 0.136 0.320
#> SRR2105351 2 0.1163 0.85104 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105352 2 0.4931 0.69149 0.004 0.784 0.212
#> SRR2105349 2 0.1289 0.84946 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105350 2 0.0747 0.85038 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105345 2 0.5656 0.78425 0.068 0.804 0.128
#> SRR2105346 2 0.3618 0.83950 0.012 0.884 0.104
#> SRR2105347 2 0.9926 -0.15662 0.328 0.388 0.284
#> SRR2105348 2 0.9887 -0.14532 0.336 0.396 0.268
#> SRR2105343 2 0.2261 0.85293 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105344 2 0.1289 0.85229 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105341 3 0.8865 0.38826 0.404 0.120 0.476
#> SRR2105342 1 0.6931 0.11657 0.640 0.032 0.328
#> SRR2105339 3 0.8581 0.28814 0.448 0.096 0.456
#> SRR2105340 3 0.9802 0.53756 0.312 0.260 0.428
#> SRR2105335 1 0.6045 0.41291 0.620 0.000 0.380
#> SRR2105336 1 0.5968 0.42994 0.636 0.000 0.364
#> SRR2105337 1 0.3267 0.50808 0.912 0.044 0.044
#> SRR2105338 1 0.2400 0.52763 0.932 0.004 0.064
#> SRR2105331 2 0.1031 0.84940 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105332 2 0.2200 0.85554 0.004 0.940 0.056
#> SRR2105333 2 0.0892 0.84749 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105334 2 0.1031 0.84869 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105329 2 0.4209 0.75500 0.020 0.860 0.120
#> SRR2105330 2 0.3528 0.78910 0.016 0.892 0.092
#> SRR2105327 2 0.1289 0.84655 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105328 2 0.1289 0.84548 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105325 3 0.9355 0.52313 0.180 0.340 0.480
#> SRR2105326 3 0.9559 0.55818 0.252 0.264 0.484
#> SRR2105323 1 0.8895 -0.30582 0.484 0.124 0.392
#> SRR2105324 1 0.6451 0.24852 0.684 0.024 0.292
#> SRR2105319 1 0.6299 0.26682 0.524 0.000 0.476
#> SRR2105320 1 0.6267 0.31353 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105321 1 0.7114 -0.00849 0.584 0.028 0.388
#> SRR2105322 1 0.7676 0.00152 0.584 0.056 0.360
#> SRR2105317 2 0.1163 0.85000 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105318 2 0.1529 0.85431 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105315 2 0.3694 0.79655 0.052 0.896 0.052
#> SRR2105316 2 0.1585 0.84304 0.008 0.964 0.028
#> SRR2105313 2 0.1411 0.85416 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105314 2 0.1031 0.84890 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105311 2 0.8891 -0.38518 0.120 0.448 0.432
#> SRR2105312 2 0.8771 -0.05301 0.132 0.544 0.324
#> SRR2105307 1 0.2947 0.53750 0.920 0.020 0.060
#> SRR2105308 1 0.3610 0.53306 0.888 0.016 0.096
#> SRR2105309 3 0.9868 0.51054 0.260 0.344 0.396
#> SRR2105310 3 0.9152 0.38405 0.424 0.144 0.432
#> SRR2105305 3 0.8464 0.31652 0.448 0.088 0.464
#> SRR2105306 1 0.6762 0.21673 0.676 0.036 0.288
#> SRR2105303 2 0.1878 0.85481 0.004 0.952 0.044
#> SRR2105304 2 0.4178 0.73535 0.000 0.828 0.172
#> SRR2105301 2 0.1163 0.84510 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105302 2 0.1289 0.85035 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105299 2 0.8515 -0.24176 0.092 0.476 0.432
#> SRR2105300 2 0.8255 -0.15693 0.076 0.496 0.428
#> SRR2105297 3 0.9917 -0.02967 0.352 0.272 0.376
#> SRR2105298 1 0.8967 0.22598 0.488 0.132 0.380
#> SRR2105295 2 0.1031 0.84396 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105296 2 0.1765 0.84994 0.004 0.956 0.040
#> SRR2105293 2 0.9568 -0.36806 0.336 0.456 0.208
#> SRR2105294 1 0.9162 -0.17540 0.536 0.268 0.196
#> SRR2105291 1 0.6208 0.28512 0.756 0.192 0.052
#> SRR2105292 1 0.6828 0.45869 0.656 0.032 0.312
#> SRR2105289 1 0.8525 0.01263 0.600 0.252 0.148
#> SRR2105290 1 0.3237 0.51878 0.912 0.032 0.056
#> SRR2105287 1 0.4931 0.51417 0.784 0.004 0.212
#> SRR2105288 1 0.5024 0.50516 0.776 0.004 0.220
#> SRR2105285 2 0.0892 0.84545 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105286 2 0.0747 0.84695 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105283 2 0.4628 0.79134 0.056 0.856 0.088
#> SRR2105284 2 0.3045 0.83716 0.020 0.916 0.064
#> SRR2105281 2 0.2066 0.85106 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105282 2 0.2711 0.84450 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105259 3 0.9574 0.55482 0.244 0.276 0.480
#> SRR2105260 3 0.9559 0.54766 0.220 0.308 0.472
#> SRR2105279 2 0.2878 0.84192 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105280 2 0.2878 0.84288 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105257 1 0.3816 0.53301 0.852 0.000 0.148
#> SRR2105258 1 0.3941 0.52799 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105253 2 0.1525 0.84961 0.004 0.964 0.032
#> SRR2105254 2 0.1289 0.85382 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105255 1 0.5815 0.33951 0.692 0.004 0.304
#> SRR2105256 1 0.4702 0.45703 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105251 2 0.1753 0.85378 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105252 2 0.1163 0.85142 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105249 2 0.3434 0.84646 0.032 0.904 0.064
#> SRR2105250 2 0.4925 0.79634 0.076 0.844 0.080
#> SRR2105247 2 0.2200 0.85424 0.004 0.940 0.056
#> SRR2105248 2 0.2860 0.84675 0.004 0.912 0.084
#> SRR2105245 2 0.5815 0.68265 0.096 0.800 0.104
#> SRR2105246 2 0.5377 0.72702 0.068 0.820 0.112
#> SRR2105243 1 0.6488 0.33946 0.756 0.160 0.084
#> SRR2105244 1 0.7966 0.07582 0.652 0.220 0.128
#> SRR2105241 1 0.4790 0.45855 0.848 0.096 0.056
#> SRR2105242 1 0.1989 0.53415 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105239 1 0.9024 -0.15548 0.448 0.420 0.132
#> SRR2105240 1 0.4842 0.50564 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105237 2 0.2400 0.82948 0.004 0.932 0.064
#> SRR2105238 2 0.1411 0.85155 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105235 2 0.2356 0.85213 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105236 2 0.3500 0.83405 0.004 0.880 0.116
#> SRR2105233 2 0.1163 0.84446 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105234 2 0.1163 0.84446 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105231 2 0.2860 0.84969 0.004 0.912 0.084
#> SRR2105232 2 0.2878 0.84650 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105227 2 0.8566 0.25431 0.204 0.608 0.188
#> SRR2105228 1 0.8513 0.08173 0.596 0.264 0.140
#> SRR2105225 1 0.4413 0.45961 0.832 0.008 0.160
#> SRR2105226 1 0.2066 0.53260 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105229 2 0.8142 -0.31433 0.068 0.468 0.464
#> SRR2105230 3 0.9817 0.54711 0.300 0.272 0.428
#> SRR2105219 2 0.0747 0.85188 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105220 2 0.1411 0.85214 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105221 2 0.7653 0.50320 0.080 0.644 0.276
#> SRR2105222 2 0.7849 0.54853 0.104 0.648 0.248
#> SRR2105223 1 0.2945 0.50148 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105224 1 0.2711 0.52476 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105217 2 0.2496 0.85132 0.004 0.928 0.068
#> SRR2105218 2 0.2772 0.84938 0.004 0.916 0.080
#> SRR2105215 2 0.2625 0.84469 0.000 0.916 0.084
#> SRR2105216 2 0.2945 0.84908 0.004 0.908 0.088
#> SRR2105213 2 0.6605 0.61296 0.096 0.752 0.152
#> SRR2105214 2 0.8321 0.31131 0.228 0.624 0.148
#> SRR2105211 1 0.9189 -0.29996 0.500 0.164 0.336
#> SRR2105212 1 0.9667 -0.34671 0.464 0.272 0.264
#> SRR2105209 1 0.3805 0.53907 0.884 0.024 0.092
#> SRR2105210 1 0.4663 0.52742 0.828 0.016 0.156
#> SRR2105207 1 0.7809 0.34450 0.548 0.056 0.396
#> SRR2105208 1 0.5815 0.47140 0.692 0.004 0.304
#> SRR2105205 2 0.1031 0.85191 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105206 2 0.1031 0.84396 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105201 2 0.7223 0.65363 0.140 0.716 0.144
#> SRR2105202 2 0.6678 0.64321 0.060 0.724 0.216
#> SRR2105203 2 0.1411 0.85266 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105204 2 0.2448 0.84981 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105199 2 0.2066 0.85376 0.000 0.940 0.060
#> SRR2105200 2 0.2680 0.85029 0.008 0.924 0.068
#> SRR2105197 3 0.8284 0.48053 0.224 0.148 0.628
#> SRR2105198 3 0.8399 0.44604 0.256 0.136 0.608
#> SRR2105195 1 0.9532 -0.25430 0.472 0.316 0.212
#> SRR2105196 1 0.9707 -0.27565 0.432 0.340 0.228
#> SRR2105193 1 0.3377 0.53623 0.896 0.012 0.092
#> SRR2105194 1 0.2339 0.53344 0.940 0.012 0.048
#> SRR2105191 1 0.7353 0.19965 0.532 0.032 0.436
#> SRR2105192 1 0.6062 0.42102 0.616 0.000 0.384
#> SRR2105189 2 0.2176 0.84393 0.020 0.948 0.032
#> SRR2105190 2 0.0661 0.84951 0.004 0.988 0.008
#> SRR2105187 2 0.4164 0.77752 0.008 0.848 0.144
#> SRR2105188 2 0.4164 0.79095 0.008 0.848 0.144
#> SRR2105179 1 0.7318 0.39329 0.668 0.068 0.264
#> SRR2105180 1 0.7970 0.39413 0.596 0.080 0.324
#> SRR2105183 2 0.4121 0.83103 0.024 0.868 0.108
#> SRR2105184 2 0.3030 0.84304 0.004 0.904 0.092
#> SRR2105185 2 0.2152 0.85240 0.016 0.948 0.036
#> SRR2105186 2 0.2280 0.85446 0.008 0.940 0.052
#> SRR2105181 3 0.9768 0.45230 0.264 0.296 0.440
#> SRR2105182 1 0.8984 -0.32853 0.440 0.128 0.432
#> SRR2105177 1 0.5884 0.48435 0.716 0.012 0.272
#> SRR2105178 1 0.5553 0.48108 0.724 0.004 0.272
#> SRR2105171 2 0.2448 0.85137 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105172 2 0.2448 0.84986 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105175 1 0.9007 0.22363 0.552 0.180 0.268
#> SRR2105176 1 0.6601 0.47561 0.676 0.028 0.296
#> SRR2105173 2 0.1411 0.85388 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105174 2 0.2356 0.85014 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105169 2 0.2796 0.84500 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105170 2 0.4033 0.82032 0.008 0.856 0.136
#> SRR2105167 2 0.2796 0.84351 0.000 0.908 0.092
#> SRR2105168 2 0.2711 0.84378 0.000 0.912 0.088
#> SRR2105165 1 0.7260 0.16145 0.636 0.048 0.316
#> SRR2105166 1 0.6379 0.27535 0.712 0.032 0.256
#> SRR2105163 2 0.7880 0.36086 0.108 0.648 0.244
#> SRR2105164 1 0.9468 -0.27077 0.488 0.212 0.300
#> SRR2105161 1 0.4865 0.53644 0.832 0.032 0.136
#> SRR2105162 1 0.5986 0.47901 0.704 0.012 0.284
#> SRR2105155 2 0.2878 0.84582 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105156 2 0.2537 0.84682 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105157 2 0.2356 0.85048 0.000 0.928 0.072
#> SRR2105158 2 0.2774 0.84962 0.008 0.920 0.072
#> SRR2105159 1 0.7337 0.26576 0.644 0.056 0.300
#> SRR2105160 1 0.7279 0.46508 0.652 0.056 0.292
#> SRR2105153 2 0.1860 0.85358 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105154 2 0.1529 0.85150 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105151 2 0.3695 0.83831 0.012 0.880 0.108
#> SRR2105152 2 0.4033 0.82259 0.008 0.856 0.136
#> SRR2105149 2 0.8925 -0.33481 0.124 0.464 0.412
#> SRR2105150 3 0.9152 0.44486 0.144 0.424 0.432
#> SRR2105147 2 0.6969 0.34809 0.024 0.596 0.380
#> SRR2105148 2 0.6777 0.39688 0.020 0.616 0.364
#> SRR2105143 2 0.8477 0.00783 0.380 0.524 0.096
#> SRR2105144 1 0.9319 0.16915 0.508 0.196 0.296
#> SRR2105145 1 0.2810 0.52859 0.928 0.036 0.036
#> SRR2105146 1 0.2096 0.52799 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105141 2 0.0747 0.84600 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105142 2 0.0892 0.84771 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105139 2 0.1753 0.85365 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105140 2 0.2878 0.84264 0.000 0.904 0.096
#> SRR2105137 2 0.9496 -0.06299 0.188 0.440 0.372
#> SRR2105138 2 0.9235 0.06208 0.156 0.460 0.384
#> SRR2105135 2 0.3690 0.83820 0.016 0.884 0.100
#> SRR2105136 2 0.3193 0.84224 0.004 0.896 0.100
#> SRR2105133 3 0.9243 0.51675 0.264 0.208 0.528
#> SRR2105134 3 0.7442 0.02277 0.368 0.044 0.588
#> SRR2105131 2 0.7726 0.46025 0.192 0.676 0.132
#> SRR2105132 3 0.7958 -0.04134 0.392 0.064 0.544
#> SRR2105129 1 0.4755 0.51636 0.808 0.008 0.184
#> SRR2105130 1 0.6252 0.46581 0.708 0.024 0.268
#> SRR2105127 1 0.6195 0.47695 0.704 0.020 0.276
#> SRR2105128 1 0.5138 0.49331 0.748 0.000 0.252
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.5110 0.42838 0.292 0.008 0.688 0.012
#> SRR2105278 3 0.4477 0.02221 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR2105275 3 0.6263 0.25414 0.024 0.428 0.528 0.020
#> SRR2105276 3 0.6422 0.51768 0.100 0.240 0.652 0.008
#> SRR2105273 1 0.4188 0.38367 0.752 0.000 0.244 0.004
#> SRR2105274 1 0.4313 0.36781 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR2105271 3 0.6363 0.08614 0.400 0.048 0.544 0.008
#> SRR2105272 1 0.4114 0.47030 0.788 0.008 0.200 0.004
#> SRR2105269 2 0.1452 0.79989 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105270 2 0.2334 0.81167 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105267 2 0.2999 0.81421 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR2105268 2 0.3052 0.81618 0.000 0.860 0.004 0.136
#> SRR2105265 2 0.4695 0.78501 0.004 0.732 0.012 0.252
#> SRR2105266 2 0.4372 0.78388 0.000 0.728 0.004 0.268
#> SRR2105263 2 0.2334 0.80696 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105264 2 0.4019 0.80492 0.000 0.792 0.012 0.196
#> SRR2105261 2 0.8464 -0.29341 0.172 0.412 0.372 0.044
#> SRR2105262 3 0.7776 0.46679 0.156 0.276 0.540 0.028
#> SRR2105357 3 0.5740 0.53148 0.060 0.204 0.720 0.016
#> SRR2105358 3 0.4844 0.42402 0.300 0.000 0.688 0.012
#> SRR2105439 2 0.8987 0.34472 0.080 0.440 0.216 0.264
#> SRR2105440 2 0.7855 0.51969 0.028 0.544 0.192 0.236
#> SRR2105509 2 0.1256 0.78221 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR2105510 2 0.1339 0.78284 0.004 0.964 0.008 0.024
#> SRR2105507 1 0.5272 0.12338 0.608 0.004 0.380 0.008
#> SRR2105508 1 0.5125 0.10090 0.604 0.000 0.388 0.008
#> SRR2105505 1 0.4567 0.53342 0.716 0.000 0.276 0.008
#> SRR2105506 1 0.4391 0.51296 0.740 0.000 0.252 0.008
#> SRR2105503 2 0.1978 0.80402 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR2105504 4 0.5134 0.91555 0.004 0.300 0.016 0.680
#> SRR2105501 2 0.3316 0.77768 0.032 0.892 0.032 0.044
#> SRR2105502 4 0.5166 0.92025 0.004 0.288 0.020 0.688
#> SRR2105499 3 0.7323 0.44725 0.308 0.160 0.528 0.004
#> SRR2105500 1 0.6534 0.08824 0.556 0.072 0.368 0.004
#> SRR2105497 2 0.4652 0.78942 0.020 0.776 0.012 0.192
#> SRR2105498 2 0.4220 0.78179 0.000 0.748 0.004 0.248
#> SRR2105495 2 0.2629 0.79847 0.004 0.912 0.024 0.060
#> SRR2105496 2 0.2179 0.80541 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR2105493 2 0.2594 0.78780 0.004 0.916 0.044 0.036
#> SRR2105494 2 0.3194 0.78546 0.004 0.888 0.052 0.056
#> SRR2105491 2 0.3172 0.81295 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR2105492 2 0.3289 0.80665 0.004 0.864 0.012 0.120
#> SRR2105489 2 0.4442 0.78534 0.004 0.752 0.008 0.236
#> SRR2105490 2 0.6129 0.71938 0.012 0.644 0.052 0.292
#> SRR2105487 3 0.4160 0.25893 0.168 0.016 0.808 0.008
#> SRR2105488 3 0.4132 0.23034 0.176 0.012 0.804 0.008
#> SRR2105485 3 0.5721 0.28598 0.428 0.020 0.548 0.004
#> SRR2105486 1 0.5985 -0.02802 0.536 0.032 0.428 0.004
#> SRR2105483 1 0.4934 0.50212 0.720 0.000 0.252 0.028
#> SRR2105484 1 0.5172 0.49429 0.704 0.000 0.260 0.036
#> SRR2105481 3 0.6435 0.34244 0.244 0.064 0.664 0.028
#> SRR2105482 1 0.5268 0.34968 0.540 0.000 0.452 0.008
#> SRR2105479 3 0.8642 0.33884 0.184 0.352 0.412 0.052
#> SRR2105480 1 0.8053 -0.26045 0.388 0.240 0.364 0.008
#> SRR2105477 2 0.3749 0.80838 0.000 0.840 0.032 0.128
#> SRR2105478 2 0.4205 0.79114 0.004 0.832 0.068 0.096
#> SRR2105475 2 0.1452 0.77910 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105476 2 0.1398 0.77862 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105473 2 0.8527 0.47989 0.084 0.520 0.160 0.236
#> SRR2105474 2 0.8569 0.50558 0.108 0.528 0.140 0.224
#> SRR2105471 2 0.5642 0.74561 0.012 0.668 0.028 0.292
#> SRR2105472 2 0.5778 0.73737 0.012 0.656 0.032 0.300
#> SRR2105469 1 0.4746 0.33586 0.712 0.008 0.276 0.004
#> SRR2105470 1 0.5090 0.28287 0.672 0.012 0.312 0.004
#> SRR2105467 1 0.4725 0.40262 0.728 0.012 0.256 0.004
#> SRR2105468 1 0.4252 0.53168 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105465 1 0.7429 0.15427 0.584 0.284 0.072 0.060
#> SRR2105466 1 0.4576 0.51029 0.824 0.088 0.068 0.020
#> SRR2105463 1 0.3810 0.53517 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR2105464 1 0.4982 0.49403 0.704 0.004 0.276 0.016
#> SRR2105461 2 0.4997 0.76054 0.004 0.688 0.012 0.296
#> SRR2105462 2 0.4220 0.77860 0.000 0.748 0.004 0.248
#> SRR2105459 2 0.1722 0.78790 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR2105460 2 0.0927 0.79158 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR2105457 3 0.7363 0.49980 0.220 0.192 0.576 0.012
#> SRR2105458 3 0.7430 0.51406 0.240 0.184 0.564 0.012
#> SRR2105455 1 0.4219 0.48486 0.820 0.040 0.136 0.004
#> SRR2105456 1 0.2611 0.51294 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR2105453 1 0.5443 0.35817 0.532 0.004 0.456 0.008
#> SRR2105454 1 0.5229 0.38983 0.564 0.000 0.428 0.008
#> SRR2105451 2 0.5086 0.69825 0.012 0.776 0.152 0.060
#> SRR2105452 4 0.5570 0.91835 0.004 0.268 0.044 0.684
#> SRR2105449 1 0.8415 -0.13090 0.468 0.244 0.252 0.036
#> SRR2105450 1 0.4033 0.48709 0.832 0.028 0.132 0.008
#> SRR2105447 2 0.1661 0.79367 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105448 2 0.1356 0.78626 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR2105445 2 0.6059 0.15945 0.016 0.544 0.420 0.020
#> SRR2105446 3 0.6915 0.50452 0.112 0.256 0.616 0.016
#> SRR2105443 2 0.4520 0.68395 0.008 0.800 0.156 0.036
#> SRR2105444 2 0.6156 0.67423 0.020 0.708 0.176 0.096
#> SRR2105441 2 0.4826 0.76850 0.000 0.716 0.020 0.264
#> SRR2105442 2 0.5010 0.76363 0.000 0.700 0.024 0.276
#> SRR2105437 3 0.2805 0.34492 0.100 0.000 0.888 0.012
#> SRR2105438 3 0.2658 0.36305 0.080 0.004 0.904 0.012
#> SRR2105435 3 0.8180 0.30533 0.184 0.380 0.412 0.024
#> SRR2105436 3 0.6854 0.46024 0.312 0.112 0.572 0.004
#> SRR2105433 1 0.3071 0.55538 0.884 0.012 0.096 0.008
#> SRR2105434 1 0.4542 0.52833 0.752 0.000 0.228 0.020
#> SRR2105431 1 0.4936 0.47998 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR2105432 1 0.4957 0.47759 0.668 0.000 0.320 0.012
#> SRR2105429 2 0.3399 0.74638 0.004 0.872 0.092 0.032
#> SRR2105430 2 0.1837 0.78103 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR2105427 2 0.2246 0.79314 0.004 0.928 0.016 0.052
#> SRR2105428 2 0.1697 0.78444 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR2105425 2 0.2918 0.81300 0.000 0.876 0.008 0.116
#> SRR2105426 2 0.3402 0.81000 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR2105421 1 0.8809 -0.25632 0.380 0.272 0.304 0.044
#> SRR2105422 2 0.8320 -0.28075 0.220 0.420 0.336 0.024
#> SRR2105423 2 0.4193 0.77452 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105424 2 0.3494 0.80732 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105419 1 0.6839 0.02137 0.552 0.088 0.352 0.008
#> SRR2105420 3 0.7760 0.35712 0.364 0.152 0.468 0.016
#> SRR2105415 1 0.5386 0.46367 0.632 0.000 0.344 0.024
#> SRR2105416 1 0.4748 0.49721 0.716 0.000 0.268 0.016
#> SRR2105417 1 0.2859 0.55404 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR2105418 1 0.4158 0.53128 0.768 0.000 0.224 0.008
#> SRR2105413 2 0.1398 0.78261 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105414 2 0.2124 0.79094 0.000 0.924 0.008 0.068
#> SRR2105409 2 0.4175 0.80650 0.000 0.784 0.016 0.200
#> SRR2105410 2 0.5473 0.76823 0.008 0.712 0.044 0.236
#> SRR2105411 2 0.3257 0.81145 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR2105412 2 0.3850 0.80127 0.004 0.804 0.004 0.188
#> SRR2105407 3 0.5568 0.46198 0.280 0.028 0.680 0.012
#> SRR2105408 3 0.6426 0.54269 0.164 0.144 0.680 0.012
#> SRR2105403 1 0.4978 0.24659 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR2105404 1 0.5576 0.09081 0.500 0.004 0.484 0.012
#> SRR2105405 1 0.2334 0.52082 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR2105406 1 0.1994 0.54061 0.936 0.004 0.052 0.008
#> SRR2105401 2 0.2486 0.78386 0.004 0.920 0.048 0.028
#> SRR2105402 4 0.5265 0.92535 0.004 0.288 0.024 0.684
#> SRR2105399 2 0.3709 0.73655 0.004 0.856 0.100 0.040
#> SRR2105400 2 0.3457 0.75203 0.008 0.876 0.076 0.040
#> SRR2105397 2 0.6163 0.27440 0.000 0.576 0.364 0.060
#> SRR2105398 2 0.5466 0.43018 0.000 0.668 0.292 0.040
#> SRR2105395 2 0.4614 0.79335 0.004 0.752 0.016 0.228
#> SRR2105396 2 0.4795 0.76759 0.000 0.696 0.012 0.292
#> SRR2105393 2 0.2928 0.80685 0.000 0.880 0.012 0.108
#> SRR2105394 2 0.4368 0.79077 0.004 0.748 0.004 0.244
#> SRR2105389 3 0.6115 0.50481 0.232 0.068 0.684 0.016
#> SRR2105390 3 0.5182 0.42898 0.304 0.008 0.676 0.012
#> SRR2105391 3 0.7237 0.46220 0.312 0.124 0.552 0.012
#> SRR2105392 3 0.5483 0.36218 0.368 0.008 0.612 0.012
#> SRR2105385 1 0.7266 -0.02839 0.520 0.144 0.332 0.004
#> SRR2105386 1 0.4920 0.38844 0.740 0.028 0.228 0.004
#> SRR2105387 1 0.5950 0.41389 0.704 0.116 0.176 0.004
#> SRR2105388 1 0.6045 0.41675 0.620 0.044 0.328 0.008
#> SRR2105381 2 0.1767 0.78141 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR2105382 2 0.1305 0.77866 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR2105383 2 0.5060 0.77735 0.052 0.756 0.004 0.188
#> SRR2105384 2 0.4734 0.78825 0.040 0.776 0.004 0.180
#> SRR2105379 2 0.2915 0.79514 0.004 0.892 0.016 0.088
#> SRR2105380 2 0.2076 0.79002 0.004 0.932 0.008 0.056
#> SRR2105377 2 0.4936 0.79182 0.004 0.768 0.052 0.176
#> SRR2105378 2 0.7678 0.55876 0.024 0.556 0.172 0.248
#> SRR2105375 1 0.8321 0.02520 0.476 0.244 0.248 0.032
#> SRR2105376 1 0.8726 0.11749 0.400 0.216 0.336 0.048
#> SRR2105373 3 0.5047 0.43181 0.264 0.012 0.712 0.012
#> SRR2105374 3 0.4319 0.35229 0.228 0.000 0.760 0.012
#> SRR2105371 3 0.5383 0.23655 0.452 0.000 0.536 0.012
#> SRR2105372 3 0.5571 0.21026 0.472 0.004 0.512 0.012
#> SRR2105369 1 0.4008 0.38364 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR2105370 1 0.3850 0.46353 0.804 0.004 0.188 0.004
#> SRR2105367 3 0.5929 -0.28917 0.448 0.004 0.520 0.028
#> SRR2105368 3 0.7006 -0.11819 0.344 0.036 0.564 0.056
#> SRR2105365 2 0.2593 0.80585 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR2105366 2 0.3545 0.81094 0.000 0.828 0.008 0.164
#> SRR2105363 2 0.2777 0.81207 0.004 0.888 0.004 0.104
#> SRR2105364 2 0.3662 0.81255 0.004 0.836 0.012 0.148
#> SRR2105361 2 0.3710 0.80534 0.000 0.804 0.004 0.192
#> SRR2105362 2 0.4755 0.77609 0.004 0.724 0.012 0.260
#> SRR2105359 3 0.6097 0.30682 0.372 0.032 0.584 0.012
#> SRR2105360 1 0.5212 0.09013 0.572 0.000 0.420 0.008
#> SRR2105355 1 0.5464 0.24655 0.656 0.020 0.316 0.008
#> SRR2105356 1 0.4049 0.44180 0.780 0.000 0.212 0.008
#> SRR2105353 3 0.7202 0.49696 0.228 0.180 0.584 0.008
#> SRR2105354 3 0.6970 0.25486 0.444 0.112 0.444 0.000
#> SRR2105351 2 0.2714 0.81016 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR2105352 4 0.5399 0.92545 0.004 0.280 0.032 0.684
#> SRR2105349 2 0.2334 0.79902 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105350 2 0.1389 0.79506 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105345 2 0.6690 0.71454 0.056 0.640 0.040 0.264
#> SRR2105346 2 0.5159 0.75449 0.008 0.680 0.012 0.300
#> SRR2105347 2 0.9745 -0.03836 0.268 0.352 0.200 0.180
#> SRR2105348 2 0.9326 -0.04999 0.328 0.372 0.188 0.112
#> SRR2105343 2 0.4011 0.80156 0.000 0.784 0.008 0.208
#> SRR2105344 2 0.3401 0.80600 0.000 0.840 0.008 0.152
#> SRR2105341 3 0.6030 0.50286 0.252 0.068 0.672 0.008
#> SRR2105342 1 0.5694 -0.12791 0.516 0.012 0.464 0.008
#> SRR2105339 3 0.6152 0.46182 0.296 0.052 0.640 0.012
#> SRR2105340 3 0.7159 0.52421 0.208 0.192 0.592 0.008
#> SRR2105335 3 0.5328 -0.26448 0.472 0.004 0.520 0.004
#> SRR2105336 1 0.4994 0.34858 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR2105337 1 0.3366 0.51347 0.872 0.028 0.096 0.004
#> SRR2105338 1 0.2859 0.52566 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR2105331 2 0.2342 0.79821 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR2105332 2 0.3400 0.81508 0.004 0.856 0.012 0.128
#> SRR2105333 2 0.1389 0.78466 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105334 2 0.1305 0.78875 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR2105329 2 0.2915 0.75150 0.004 0.892 0.088 0.016
#> SRR2105330 2 0.2706 0.76755 0.004 0.908 0.064 0.024
#> SRR2105327 2 0.2266 0.79733 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR2105328 2 0.1824 0.79057 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR2105325 3 0.6334 0.48771 0.076 0.260 0.652 0.012
#> SRR2105326 3 0.6551 0.54417 0.148 0.172 0.668 0.012
#> SRR2105323 3 0.7112 0.42106 0.352 0.092 0.540 0.016
#> SRR2105324 1 0.5573 0.06153 0.584 0.012 0.396 0.008
#> SRR2105319 3 0.4920 0.03273 0.368 0.000 0.628 0.004
#> SRR2105320 3 0.5028 -0.05327 0.400 0.000 0.596 0.004
#> SRR2105321 3 0.5543 0.25879 0.444 0.004 0.540 0.012
#> SRR2105322 1 0.5916 -0.16749 0.500 0.016 0.472 0.012
#> SRR2105317 2 0.1305 0.78751 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR2105318 2 0.2888 0.81500 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR2105315 2 0.3309 0.74539 0.016 0.880 0.088 0.016
#> SRR2105316 2 0.1452 0.78346 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105313 2 0.2654 0.81078 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR2105314 2 0.2714 0.80708 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR2105311 3 0.7391 0.33303 0.048 0.336 0.548 0.068
#> SRR2105312 2 0.7214 -0.15612 0.048 0.460 0.448 0.044
#> SRR2105307 1 0.2563 0.54832 0.916 0.012 0.060 0.012
#> SRR2105308 1 0.2731 0.55335 0.896 0.004 0.092 0.008
#> SRR2105309 3 0.7387 0.46713 0.160 0.292 0.540 0.008
#> SRR2105310 3 0.6544 0.49984 0.280 0.100 0.616 0.004
#> SRR2105305 3 0.6008 0.46883 0.284 0.048 0.656 0.012
#> SRR2105306 1 0.5444 0.00267 0.560 0.016 0.424 0.000
#> SRR2105303 2 0.3534 0.80878 0.004 0.840 0.008 0.148
#> SRR2105304 4 0.4820 0.90710 0.000 0.296 0.012 0.692
#> SRR2105301 2 0.1978 0.79334 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR2105302 2 0.1824 0.79440 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR2105299 3 0.6756 0.26269 0.024 0.392 0.536 0.048
#> SRR2105300 3 0.6379 0.20201 0.012 0.424 0.524 0.040
#> SRR2105297 1 0.9919 0.04104 0.296 0.204 0.276 0.224
#> SRR2105298 1 0.9063 0.25606 0.416 0.092 0.312 0.180
#> SRR2105295 2 0.1722 0.79212 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR2105296 2 0.3432 0.79912 0.004 0.848 0.008 0.140
#> SRR2105293 2 0.8351 -0.35011 0.260 0.408 0.312 0.020
#> SRR2105294 1 0.8032 -0.13834 0.460 0.268 0.260 0.012
#> SRR2105291 1 0.6701 0.31542 0.692 0.160 0.092 0.056
#> SRR2105292 1 0.5633 0.43932 0.596 0.016 0.380 0.008
#> SRR2105289 1 0.7656 0.08283 0.528 0.196 0.264 0.012
#> SRR2105290 1 0.3200 0.51993 0.880 0.024 0.092 0.004
#> SRR2105287 1 0.4374 0.53609 0.760 0.004 0.228 0.008
#> SRR2105288 1 0.4420 0.52989 0.748 0.000 0.240 0.012
#> SRR2105285 2 0.1209 0.78031 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105286 2 0.1256 0.78224 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR2105283 2 0.4457 0.75974 0.016 0.828 0.092 0.064
#> SRR2105284 2 0.3189 0.79075 0.004 0.888 0.048 0.060
#> SRR2105281 2 0.3400 0.80909 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR2105282 2 0.4539 0.77510 0.000 0.720 0.008 0.272
#> SRR2105259 3 0.6312 0.54191 0.124 0.176 0.688 0.012
#> SRR2105260 3 0.6528 0.53684 0.112 0.192 0.676 0.020
#> SRR2105279 2 0.4584 0.76236 0.000 0.696 0.004 0.300
#> SRR2105280 2 0.4428 0.77041 0.000 0.720 0.004 0.276
#> SRR2105257 1 0.3751 0.54873 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR2105258 1 0.3725 0.54737 0.812 0.000 0.180 0.008
#> SRR2105253 2 0.1576 0.79655 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105254 2 0.2334 0.81091 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105255 1 0.5119 0.13355 0.556 0.000 0.440 0.004
#> SRR2105256 1 0.4713 0.31595 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR2105251 2 0.3402 0.81273 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR2105252 2 0.2888 0.80717 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR2105249 2 0.4069 0.80730 0.024 0.840 0.020 0.116
#> SRR2105250 2 0.5270 0.76449 0.072 0.772 0.016 0.140
#> SRR2105247 2 0.3631 0.80726 0.004 0.824 0.004 0.168
#> SRR2105248 2 0.4600 0.78953 0.004 0.744 0.012 0.240
#> SRR2105245 2 0.5432 0.67076 0.040 0.764 0.156 0.040
#> SRR2105246 2 0.5711 0.70993 0.028 0.752 0.140 0.080
#> SRR2105243 1 0.6110 0.39712 0.708 0.128 0.152 0.012
#> SRR2105244 1 0.7150 0.12980 0.580 0.204 0.212 0.004
#> SRR2105241 1 0.4526 0.48475 0.812 0.076 0.108 0.004
#> SRR2105242 1 0.2238 0.54385 0.920 0.004 0.072 0.004
#> SRR2105239 1 0.7531 0.01713 0.460 0.404 0.120 0.016
#> SRR2105240 1 0.4452 0.52569 0.732 0.000 0.260 0.008
#> SRR2105237 2 0.2399 0.77130 0.000 0.920 0.048 0.032
#> SRR2105238 2 0.1767 0.79604 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR2105235 2 0.3946 0.80880 0.000 0.812 0.020 0.168
#> SRR2105236 2 0.5141 0.76748 0.000 0.700 0.032 0.268
#> SRR2105233 2 0.1545 0.78137 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR2105234 2 0.1452 0.78172 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105231 2 0.4360 0.78462 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR2105232 2 0.4718 0.77290 0.000 0.708 0.012 0.280
#> SRR2105227 2 0.7947 0.24962 0.128 0.536 0.288 0.048
#> SRR2105228 1 0.8045 0.21017 0.548 0.212 0.196 0.044
#> SRR2105225 1 0.4482 0.37563 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR2105226 1 0.1978 0.53653 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105229 3 0.5556 0.36831 0.012 0.356 0.620 0.012
#> SRR2105230 3 0.6830 0.53452 0.188 0.188 0.620 0.004
#> SRR2105219 2 0.1489 0.79671 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR2105220 2 0.2466 0.80842 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR2105221 2 0.8191 0.46716 0.064 0.552 0.212 0.172
#> SRR2105222 2 0.8028 0.55551 0.072 0.576 0.144 0.208
#> SRR2105223 1 0.3448 0.47782 0.828 0.004 0.168 0.000
#> SRR2105224 1 0.3391 0.51437 0.844 0.004 0.148 0.004
#> SRR2105217 2 0.4368 0.79043 0.004 0.748 0.004 0.244
#> SRR2105218 2 0.4508 0.78699 0.004 0.744 0.008 0.244
#> SRR2105215 2 0.4188 0.79194 0.000 0.752 0.004 0.244
#> SRR2105216 2 0.4462 0.78047 0.004 0.736 0.004 0.256
#> SRR2105213 2 0.5959 0.58016 0.036 0.700 0.228 0.036
#> SRR2105214 2 0.8005 0.31114 0.180 0.564 0.204 0.052
#> SRR2105211 3 0.7501 0.32055 0.400 0.128 0.460 0.012
#> SRR2105212 1 0.8276 -0.28422 0.380 0.248 0.356 0.016
#> SRR2105209 1 0.3389 0.55391 0.868 0.024 0.104 0.004
#> SRR2105210 1 0.4255 0.54476 0.784 0.008 0.200 0.008
#> SRR2105207 3 0.5899 -0.28905 0.472 0.020 0.500 0.008
#> SRR2105208 1 0.4999 0.47686 0.660 0.000 0.328 0.012
#> SRR2105205 2 0.1557 0.80010 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105206 2 0.1256 0.78677 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR2105201 2 0.7343 0.65669 0.096 0.616 0.052 0.236
#> SRR2105202 2 0.7705 0.56957 0.052 0.600 0.164 0.184
#> SRR2105203 2 0.2737 0.80552 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR2105204 2 0.4008 0.79088 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105199 2 0.2888 0.81409 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR2105200 2 0.3892 0.80033 0.004 0.800 0.004 0.192
#> SRR2105197 3 0.4287 0.48500 0.080 0.072 0.836 0.012
#> SRR2105198 3 0.5105 0.47265 0.136 0.072 0.780 0.012
#> SRR2105195 1 0.8101 -0.19682 0.408 0.284 0.300 0.008
#> SRR2105196 3 0.8930 0.22379 0.336 0.260 0.352 0.052
#> SRR2105193 1 0.3632 0.52806 0.832 0.004 0.156 0.008
#> SRR2105194 1 0.1722 0.53920 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105191 3 0.5791 0.02381 0.416 0.024 0.556 0.004
#> SRR2105192 1 0.5292 0.34798 0.512 0.000 0.480 0.008
#> SRR2105189 2 0.2335 0.79137 0.008 0.928 0.020 0.044
#> SRR2105190 2 0.1004 0.78753 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105187 2 0.4728 0.74873 0.004 0.800 0.104 0.092
#> SRR2105188 2 0.5510 0.73073 0.004 0.744 0.132 0.120
#> SRR2105179 1 0.6161 0.33343 0.592 0.044 0.356 0.008
#> SRR2105180 1 0.6606 0.39579 0.496 0.052 0.440 0.012
#> SRR2105183 2 0.5345 0.74695 0.016 0.680 0.012 0.292
#> SRR2105184 2 0.4607 0.76774 0.004 0.716 0.004 0.276
#> SRR2105185 2 0.3190 0.81100 0.008 0.880 0.016 0.096
#> SRR2105186 2 0.3300 0.81094 0.008 0.848 0.000 0.144
#> SRR2105181 3 0.7022 0.42048 0.176 0.208 0.608 0.008
#> SRR2105182 3 0.6130 0.43387 0.280 0.056 0.652 0.012
#> SRR2105177 1 0.5346 0.51700 0.692 0.004 0.272 0.032
#> SRR2105178 1 0.4546 0.51008 0.732 0.000 0.256 0.012
#> SRR2105171 2 0.3636 0.81261 0.000 0.820 0.008 0.172
#> SRR2105172 2 0.3791 0.80560 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR2105175 1 0.8198 0.31933 0.516 0.124 0.296 0.064
#> SRR2105176 1 0.5774 0.49557 0.632 0.016 0.332 0.020
#> SRR2105173 2 0.2342 0.80980 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR2105174 2 0.3257 0.80842 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR2105169 2 0.4606 0.77659 0.000 0.724 0.012 0.264
#> SRR2105170 2 0.6078 0.72507 0.016 0.640 0.040 0.304
#> SRR2105167 2 0.4313 0.77665 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR2105168 2 0.4331 0.76497 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105165 3 0.5990 0.17932 0.476 0.024 0.492 0.008
#> SRR2105166 1 0.5285 0.15524 0.632 0.012 0.352 0.004
#> SRR2105163 2 0.6891 0.28509 0.064 0.584 0.324 0.028
#> SRR2105164 1 0.8422 -0.27124 0.408 0.188 0.368 0.036
#> SRR2105161 1 0.5256 0.54128 0.748 0.028 0.200 0.024
#> SRR2105162 1 0.4744 0.50539 0.704 0.000 0.284 0.012
#> SRR2105155 2 0.4155 0.78980 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR2105156 2 0.3852 0.80052 0.000 0.808 0.012 0.180
#> SRR2105157 2 0.4212 0.79633 0.000 0.772 0.012 0.216
#> SRR2105158 2 0.4508 0.79071 0.004 0.744 0.008 0.244
#> SRR2105159 1 0.6676 -0.04802 0.508 0.040 0.428 0.024
#> SRR2105160 1 0.6281 0.44028 0.568 0.040 0.380 0.012
#> SRR2105153 2 0.3498 0.80653 0.000 0.832 0.008 0.160
#> SRR2105154 2 0.2334 0.80493 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105151 2 0.5536 0.74976 0.008 0.680 0.032 0.280
#> SRR2105152 2 0.5137 0.75014 0.000 0.680 0.024 0.296
#> SRR2105149 3 0.6359 0.34703 0.032 0.360 0.584 0.024
#> SRR2105150 3 0.6467 0.37977 0.060 0.364 0.568 0.008
#> SRR2105147 4 0.6188 0.80650 0.004 0.180 0.132 0.684
#> SRR2105148 4 0.6167 0.82773 0.004 0.188 0.124 0.684
#> SRR2105143 2 0.7873 0.15915 0.348 0.504 0.096 0.052
#> SRR2105144 1 0.7777 0.31558 0.532 0.164 0.280 0.024
#> SRR2105145 1 0.2269 0.53900 0.932 0.028 0.032 0.008
#> SRR2105146 1 0.2149 0.52940 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR2105141 2 0.1209 0.77836 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105142 2 0.1109 0.78499 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR2105139 2 0.3257 0.81001 0.000 0.844 0.004 0.152
#> SRR2105140 2 0.4420 0.77946 0.000 0.748 0.012 0.240
#> SRR2105137 2 0.9590 -0.02812 0.156 0.352 0.312 0.180
#> SRR2105138 2 0.9733 -0.03043 0.168 0.340 0.288 0.204
#> SRR2105135 2 0.4825 0.75959 0.008 0.700 0.004 0.288
#> SRR2105136 2 0.4899 0.75849 0.004 0.688 0.008 0.300
#> SRR2105133 3 0.6243 0.49757 0.132 0.124 0.716 0.028
#> SRR2105134 3 0.4533 0.18611 0.216 0.012 0.764 0.008
#> SRR2105131 2 0.6832 0.50888 0.132 0.676 0.152 0.040
#> SRR2105132 3 0.5512 0.08068 0.284 0.020 0.680 0.016
#> SRR2105129 1 0.4375 0.54356 0.788 0.000 0.180 0.032
#> SRR2105130 1 0.4468 0.51455 0.752 0.000 0.232 0.016
#> SRR2105127 1 0.5571 0.48628 0.656 0.016 0.312 0.016
#> SRR2105128 1 0.4957 0.50421 0.684 0.000 0.300 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 3 0.4617 0.49577 0.108 0.004 0.788 0.068 0.032
#> SRR2105278 3 0.5895 0.07375 0.428 0.000 0.500 0.040 0.032
#> SRR2105275 3 0.6857 0.36877 0.028 0.360 0.512 0.068 0.032
#> SRR2105276 3 0.6683 0.51765 0.056 0.196 0.640 0.072 0.036
#> SRR2105273 1 0.5220 0.26417 0.536 0.000 0.428 0.024 0.012
#> SRR2105274 1 0.5411 0.20368 0.500 0.000 0.456 0.028 0.016
#> SRR2105271 3 0.5859 0.19838 0.332 0.024 0.596 0.024 0.024
#> SRR2105272 1 0.5200 0.40640 0.580 0.004 0.384 0.012 0.020
#> SRR2105269 2 0.2516 0.60323 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105270 2 0.3586 0.50082 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR2105267 2 0.4341 0.29446 0.000 0.628 0.000 0.008 0.364
#> SRR2105268 2 0.3752 0.45490 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105265 5 0.4331 0.52373 0.000 0.400 0.004 0.000 0.596
#> SRR2105266 5 0.4227 0.51014 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR2105263 2 0.3231 0.58982 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR2105264 5 0.4698 0.18212 0.000 0.468 0.004 0.008 0.520
#> SRR2105261 3 0.8707 0.17864 0.072 0.288 0.380 0.056 0.204
#> SRR2105262 3 0.7069 0.48718 0.052 0.232 0.596 0.052 0.068
#> SRR2105357 3 0.5846 0.52697 0.036 0.124 0.724 0.068 0.048
#> SRR2105358 3 0.3412 0.50816 0.056 0.004 0.860 0.068 0.012
#> SRR2105439 5 0.5796 0.50693 0.088 0.192 0.044 0.000 0.676
#> SRR2105440 5 0.4521 0.55767 0.024 0.248 0.012 0.000 0.716
#> SRR2105509 2 0.2416 0.61248 0.000 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR2105510 2 0.1243 0.61672 0.000 0.960 0.008 0.004 0.028
#> SRR2105507 3 0.5532 0.09241 0.380 0.000 0.564 0.024 0.032
#> SRR2105508 3 0.5388 0.11503 0.384 0.000 0.568 0.020 0.028
#> SRR2105505 1 0.4351 0.58782 0.792 0.004 0.092 0.008 0.104
#> SRR2105506 1 0.3053 0.57076 0.852 0.000 0.012 0.008 0.128
#> SRR2105503 2 0.1792 0.61500 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105504 4 0.1952 0.94389 0.000 0.084 0.004 0.912 0.000
#> SRR2105501 2 0.4131 0.58899 0.008 0.788 0.028 0.008 0.168
#> SRR2105502 4 0.2068 0.93607 0.000 0.092 0.004 0.904 0.000
#> SRR2105499 3 0.6261 0.49320 0.140 0.116 0.680 0.032 0.032
#> SRR2105500 3 0.6243 0.19677 0.276 0.056 0.616 0.024 0.028
#> SRR2105497 2 0.4114 0.18196 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR2105498 2 0.4297 -0.24674 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR2105495 2 0.3297 0.61095 0.000 0.840 0.020 0.008 0.132
#> SRR2105496 2 0.3990 0.53456 0.000 0.740 0.012 0.004 0.244
#> SRR2105493 2 0.4002 0.57812 0.000 0.796 0.044 0.008 0.152
#> SRR2105494 2 0.4739 0.50554 0.000 0.724 0.056 0.008 0.212
#> SRR2105491 2 0.3534 0.48697 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR2105492 2 0.3196 0.54325 0.004 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105489 2 0.4304 -0.25931 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR2105490 5 0.4067 0.62338 0.008 0.300 0.000 0.000 0.692
#> SRR2105487 3 0.6847 0.19280 0.332 0.008 0.512 0.028 0.120
#> SRR2105488 3 0.6886 0.22713 0.292 0.004 0.532 0.036 0.136
#> SRR2105485 3 0.5222 0.41407 0.188 0.008 0.724 0.028 0.052
#> SRR2105486 3 0.5898 0.24674 0.276 0.012 0.632 0.024 0.056
#> SRR2105483 1 0.3167 0.55588 0.820 0.000 0.004 0.004 0.172
#> SRR2105484 1 0.3196 0.54788 0.804 0.000 0.000 0.004 0.192
#> SRR2105481 3 0.7034 0.33260 0.264 0.040 0.568 0.028 0.100
#> SRR2105482 1 0.5619 0.42255 0.628 0.000 0.272 0.008 0.092
#> SRR2105479 3 0.8092 0.33744 0.092 0.272 0.448 0.016 0.172
#> SRR2105480 3 0.7569 0.35921 0.228 0.208 0.504 0.024 0.036
#> SRR2105477 2 0.4416 0.45480 0.000 0.668 0.008 0.008 0.316
#> SRR2105478 2 0.5207 0.46740 0.000 0.664 0.064 0.008 0.264
#> SRR2105475 2 0.2102 0.61810 0.000 0.916 0.004 0.012 0.068
#> SRR2105476 2 0.1549 0.61810 0.000 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR2105473 5 0.6424 0.42381 0.128 0.348 0.008 0.004 0.512
#> SRR2105474 5 0.6154 0.47329 0.096 0.328 0.012 0.004 0.560
#> SRR2105471 5 0.4375 0.57607 0.004 0.364 0.004 0.000 0.628
#> SRR2105472 5 0.4066 0.59195 0.004 0.324 0.000 0.000 0.672
#> SRR2105469 1 0.5848 0.15906 0.476 0.000 0.456 0.036 0.032
#> SRR2105470 3 0.5785 -0.14973 0.456 0.004 0.484 0.032 0.024
#> SRR2105467 1 0.6064 0.26111 0.516 0.012 0.408 0.020 0.044
#> SRR2105468 1 0.4843 0.55492 0.728 0.000 0.196 0.012 0.064
#> SRR2105465 1 0.8097 0.10115 0.440 0.240 0.188 0.004 0.128
#> SRR2105466 1 0.5929 0.48162 0.672 0.072 0.200 0.004 0.052
#> SRR2105463 1 0.3736 0.58819 0.824 0.000 0.072 0.004 0.100
#> SRR2105464 1 0.3437 0.55189 0.820 0.004 0.012 0.004 0.160
#> SRR2105461 5 0.3884 0.61437 0.004 0.288 0.000 0.000 0.708
#> SRR2105462 5 0.4273 0.46719 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR2105459 2 0.1341 0.61683 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105460 2 0.1410 0.61545 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105457 3 0.5724 0.52875 0.092 0.132 0.720 0.020 0.036
#> SRR2105458 3 0.5879 0.53756 0.088 0.116 0.720 0.028 0.048
#> SRR2105455 1 0.5682 0.37673 0.600 0.032 0.336 0.020 0.012
#> SRR2105456 1 0.4938 0.41272 0.632 0.000 0.332 0.028 0.008
#> SRR2105453 1 0.5237 0.48171 0.704 0.000 0.132 0.008 0.156
#> SRR2105454 1 0.4979 0.50040 0.728 0.000 0.112 0.008 0.152
#> SRR2105451 2 0.6233 0.39913 0.004 0.604 0.152 0.012 0.228
#> SRR2105452 4 0.1571 0.95372 0.000 0.060 0.004 0.936 0.000
#> SRR2105449 3 0.8640 0.23172 0.260 0.180 0.396 0.024 0.140
#> SRR2105450 1 0.5989 0.34041 0.564 0.020 0.360 0.016 0.040
#> SRR2105447 2 0.2648 0.60300 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR2105448 2 0.0771 0.61300 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105445 2 0.6585 0.12473 0.004 0.476 0.404 0.032 0.084
#> SRR2105446 3 0.7057 0.49896 0.028 0.180 0.608 0.056 0.128
#> SRR2105443 2 0.5610 0.47568 0.004 0.708 0.152 0.036 0.100
#> SRR2105444 2 0.6735 0.34799 0.040 0.608 0.148 0.012 0.192
#> SRR2105441 5 0.4414 0.55614 0.004 0.376 0.004 0.000 0.616
#> SRR2105442 5 0.4288 0.57159 0.000 0.384 0.004 0.000 0.612
#> SRR2105437 3 0.5762 0.38449 0.252 0.000 0.648 0.056 0.044
#> SRR2105438 3 0.5724 0.39939 0.236 0.000 0.660 0.060 0.044
#> SRR2105435 3 0.7854 0.37662 0.152 0.292 0.464 0.016 0.076
#> SRR2105436 3 0.5160 0.51019 0.092 0.084 0.768 0.028 0.028
#> SRR2105433 1 0.4574 0.56924 0.748 0.008 0.184 0.000 0.060
#> SRR2105434 1 0.3916 0.58554 0.804 0.000 0.056 0.004 0.136
#> SRR2105431 1 0.3693 0.54854 0.808 0.000 0.032 0.004 0.156
#> SRR2105432 1 0.3484 0.55573 0.824 0.000 0.028 0.004 0.144
#> SRR2105429 2 0.3514 0.58677 0.000 0.848 0.088 0.016 0.048
#> SRR2105430 2 0.1908 0.61292 0.000 0.936 0.024 0.016 0.024
#> SRR2105427 2 0.2756 0.61729 0.000 0.880 0.012 0.012 0.096
#> SRR2105428 2 0.1949 0.61383 0.000 0.932 0.016 0.012 0.040
#> SRR2105425 2 0.3196 0.56078 0.000 0.804 0.004 0.000 0.192
#> SRR2105426 2 0.3607 0.48520 0.004 0.752 0.000 0.000 0.244
#> SRR2105421 3 0.8893 0.33861 0.176 0.240 0.404 0.052 0.128
#> SRR2105422 3 0.7549 0.29136 0.092 0.388 0.436 0.044 0.040
#> SRR2105423 5 0.4262 0.48205 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR2105424 2 0.3661 0.41110 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR2105419 3 0.6977 0.16407 0.340 0.076 0.520 0.032 0.032
#> SRR2105420 3 0.6598 0.45354 0.176 0.132 0.632 0.012 0.048
#> SRR2105415 1 0.4325 0.53182 0.756 0.000 0.048 0.004 0.192
#> SRR2105416 1 0.2890 0.55758 0.836 0.000 0.000 0.004 0.160
#> SRR2105417 1 0.4758 0.57218 0.744 0.000 0.160 0.008 0.088
#> SRR2105418 1 0.4205 0.58411 0.788 0.000 0.084 0.004 0.124
#> SRR2105413 2 0.1121 0.61803 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105414 2 0.3086 0.58926 0.000 0.816 0.004 0.000 0.180
#> SRR2105409 5 0.4452 0.21761 0.000 0.496 0.004 0.000 0.500
#> SRR2105410 5 0.4280 0.57387 0.004 0.312 0.008 0.000 0.676
#> SRR2105411 2 0.3816 0.41801 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR2105412 2 0.3752 0.35450 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105407 3 0.2770 0.52480 0.020 0.020 0.896 0.060 0.004
#> SRR2105408 3 0.4055 0.54353 0.016 0.092 0.824 0.060 0.008
#> SRR2105403 3 0.5712 -0.10580 0.452 0.000 0.488 0.032 0.028
#> SRR2105404 1 0.6583 0.01545 0.452 0.000 0.428 0.064 0.056
#> SRR2105405 1 0.4665 0.45128 0.668 0.000 0.304 0.016 0.012
#> SRR2105406 1 0.4597 0.48769 0.704 0.000 0.260 0.024 0.012
#> SRR2105401 2 0.3482 0.61070 0.000 0.844 0.040 0.012 0.104
#> SRR2105402 4 0.1638 0.95364 0.000 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR2105399 2 0.3485 0.57775 0.004 0.856 0.080 0.044 0.016
#> SRR2105400 2 0.4397 0.55426 0.004 0.804 0.104 0.044 0.044
#> SRR2105397 2 0.7384 0.09217 0.000 0.448 0.340 0.068 0.144
#> SRR2105398 2 0.6461 0.26122 0.000 0.592 0.264 0.064 0.080
#> SRR2105395 5 0.4434 0.36683 0.004 0.460 0.000 0.000 0.536
#> SRR2105396 5 0.4045 0.59716 0.000 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR2105393 2 0.3048 0.55625 0.000 0.820 0.004 0.000 0.176
#> SRR2105394 2 0.4397 -0.11117 0.004 0.564 0.000 0.000 0.432
#> SRR2105389 3 0.3742 0.53912 0.016 0.052 0.848 0.072 0.012
#> SRR2105390 3 0.2562 0.51254 0.032 0.000 0.900 0.060 0.008
#> SRR2105391 3 0.6125 0.50630 0.144 0.120 0.668 0.068 0.000
#> SRR2105392 3 0.4147 0.47153 0.140 0.000 0.792 0.060 0.008
#> SRR2105385 3 0.7101 0.19530 0.292 0.108 0.540 0.032 0.028
#> SRR2105386 1 0.6056 0.19947 0.488 0.012 0.440 0.028 0.032
#> SRR2105387 1 0.7210 0.35358 0.540 0.100 0.288 0.032 0.040
#> SRR2105388 1 0.6403 0.36689 0.540 0.032 0.364 0.028 0.036
#> SRR2105381 2 0.1686 0.61371 0.000 0.944 0.008 0.028 0.020
#> SRR2105382 2 0.0693 0.60915 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105383 2 0.5176 0.02265 0.048 0.572 0.000 0.000 0.380
#> SRR2105384 2 0.4623 0.33650 0.032 0.664 0.000 0.000 0.304
#> SRR2105379 2 0.3844 0.54098 0.004 0.736 0.000 0.004 0.256
#> SRR2105380 2 0.1638 0.61709 0.004 0.932 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105377 2 0.5078 -0.15009 0.020 0.508 0.008 0.000 0.464
#> SRR2105378 5 0.5177 0.52059 0.076 0.232 0.008 0.000 0.684
#> SRR2105375 1 0.7851 0.01076 0.408 0.200 0.304 0.000 0.088
#> SRR2105376 1 0.8228 0.14810 0.432 0.188 0.164 0.004 0.212
#> SRR2105373 3 0.4943 0.48367 0.144 0.004 0.756 0.068 0.028
#> SRR2105374 3 0.6036 0.37888 0.292 0.000 0.604 0.052 0.052
#> SRR2105371 3 0.5086 0.38004 0.244 0.000 0.684 0.064 0.008
#> SRR2105372 3 0.4961 0.33372 0.276 0.000 0.672 0.044 0.008
#> SRR2105369 1 0.5380 0.26092 0.532 0.000 0.424 0.028 0.016
#> SRR2105370 1 0.5057 0.39859 0.624 0.000 0.336 0.028 0.012
#> SRR2105367 1 0.6364 0.31399 0.560 0.012 0.308 0.008 0.112
#> SRR2105368 1 0.7017 0.12872 0.420 0.008 0.384 0.012 0.176
#> SRR2105365 2 0.3752 0.49059 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105366 2 0.4192 0.18231 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR2105363 2 0.2891 0.57866 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR2105364 2 0.3980 0.44236 0.000 0.708 0.008 0.000 0.284
#> SRR2105361 2 0.4331 0.15642 0.000 0.596 0.000 0.004 0.400
#> SRR2105362 5 0.4426 0.52292 0.004 0.380 0.004 0.000 0.612
#> SRR2105359 3 0.4846 0.44597 0.168 0.012 0.756 0.020 0.044
#> SRR2105360 3 0.5536 0.17640 0.336 0.004 0.604 0.020 0.036
#> SRR2105355 3 0.6161 -0.01094 0.424 0.012 0.496 0.044 0.024
#> SRR2105356 1 0.5070 0.35279 0.568 0.000 0.400 0.024 0.008
#> SRR2105353 3 0.7082 0.53043 0.124 0.164 0.616 0.064 0.032
#> SRR2105354 3 0.6806 0.41880 0.232 0.084 0.608 0.048 0.028
#> SRR2105351 2 0.4015 0.34929 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105352 4 0.1571 0.95372 0.000 0.060 0.004 0.936 0.000
#> SRR2105349 2 0.3814 0.52480 0.000 0.720 0.000 0.004 0.276
#> SRR2105350 2 0.2471 0.60217 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR2105345 5 0.5301 0.40931 0.024 0.464 0.008 0.004 0.500
#> SRR2105346 5 0.4030 0.59836 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR2105347 5 0.6726 0.31658 0.292 0.212 0.004 0.004 0.488
#> SRR2105348 5 0.6782 0.10481 0.368 0.192 0.004 0.004 0.432
#> SRR2105343 2 0.4219 -0.02656 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR2105344 2 0.4210 0.14931 0.000 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR2105341 3 0.2800 0.53917 0.020 0.040 0.900 0.032 0.008
#> SRR2105342 3 0.5274 0.26584 0.308 0.004 0.640 0.028 0.020
#> SRR2105339 3 0.5556 0.53918 0.088 0.048 0.752 0.068 0.044
#> SRR2105340 3 0.5328 0.54630 0.076 0.168 0.724 0.008 0.024
#> SRR2105335 1 0.5650 0.30342 0.580 0.004 0.356 0.016 0.044
#> SRR2105336 1 0.5456 0.44829 0.648 0.000 0.260 0.008 0.084
#> SRR2105337 1 0.5570 0.42801 0.632 0.016 0.304 0.028 0.020
#> SRR2105338 1 0.5104 0.45693 0.648 0.000 0.304 0.028 0.020
#> SRR2105331 2 0.3395 0.55007 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR2105332 2 0.4253 0.38925 0.004 0.660 0.004 0.000 0.332
#> SRR2105333 2 0.2286 0.60608 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105334 2 0.1168 0.61374 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR2105329 2 0.3237 0.59858 0.000 0.864 0.076 0.012 0.048
#> SRR2105330 2 0.2555 0.60370 0.000 0.904 0.052 0.016 0.028
#> SRR2105327 2 0.3003 0.57280 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR2105328 2 0.2230 0.61458 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR2105325 3 0.6374 0.48987 0.032 0.192 0.660 0.076 0.040
#> SRR2105326 3 0.5215 0.53935 0.024 0.112 0.760 0.076 0.028
#> SRR2105323 3 0.6548 0.46616 0.196 0.076 0.648 0.040 0.040
#> SRR2105324 3 0.5189 0.13372 0.360 0.004 0.600 0.028 0.008
#> SRR2105319 1 0.6379 0.01813 0.452 0.000 0.444 0.048 0.056
#> SRR2105320 1 0.5975 0.02316 0.472 0.000 0.452 0.036 0.040
#> SRR2105321 3 0.6106 0.40052 0.232 0.008 0.644 0.080 0.036
#> SRR2105322 3 0.6522 0.28859 0.312 0.008 0.564 0.076 0.040
#> SRR2105317 2 0.1041 0.61476 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105318 2 0.3966 0.36583 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR2105315 2 0.3264 0.58895 0.004 0.868 0.080 0.020 0.028
#> SRR2105316 2 0.2464 0.60621 0.000 0.892 0.012 0.004 0.092
#> SRR2105313 2 0.3774 0.46430 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR2105314 2 0.3990 0.42841 0.000 0.688 0.000 0.004 0.308
#> SRR2105311 3 0.8129 0.30310 0.008 0.204 0.464 0.172 0.152
#> SRR2105312 3 0.8089 0.25440 0.020 0.336 0.416 0.096 0.132
#> SRR2105307 1 0.4485 0.52025 0.732 0.000 0.224 0.008 0.036
#> SRR2105308 1 0.4764 0.56283 0.736 0.004 0.188 0.004 0.068
#> SRR2105309 3 0.6133 0.51421 0.068 0.228 0.652 0.032 0.020
#> SRR2105310 3 0.3618 0.54398 0.028 0.076 0.856 0.012 0.028
#> SRR2105305 3 0.4407 0.53416 0.064 0.036 0.820 0.056 0.024
#> SRR2105306 3 0.5272 0.17574 0.348 0.004 0.608 0.020 0.020
#> SRR2105303 2 0.4310 0.19373 0.004 0.604 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105304 4 0.1965 0.93274 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR2105301 2 0.2674 0.60200 0.000 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR2105302 2 0.3039 0.59272 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105299 3 0.7786 0.29434 0.020 0.288 0.472 0.060 0.160
#> SRR2105300 3 0.7674 0.25670 0.008 0.268 0.468 0.060 0.196
#> SRR2105297 5 0.5403 -0.01979 0.360 0.040 0.008 0.004 0.588
#> SRR2105298 1 0.5058 0.24281 0.492 0.012 0.008 0.004 0.484
#> SRR2105295 2 0.1965 0.61370 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR2105296 2 0.4238 0.29803 0.004 0.628 0.000 0.000 0.368
#> SRR2105293 2 0.8047 -0.27532 0.164 0.404 0.344 0.024 0.064
#> SRR2105294 3 0.7959 0.26350 0.264 0.248 0.424 0.028 0.036
#> SRR2105291 1 0.8044 0.19921 0.464 0.112 0.288 0.024 0.112
#> SRR2105292 1 0.6187 0.47081 0.616 0.004 0.240 0.020 0.120
#> SRR2105289 1 0.8104 -0.04011 0.376 0.168 0.368 0.028 0.060
#> SRR2105290 1 0.5346 0.42700 0.632 0.020 0.316 0.024 0.008
#> SRR2105287 1 0.3848 0.59038 0.816 0.000 0.076 0.004 0.104
#> SRR2105288 1 0.3981 0.58500 0.800 0.000 0.060 0.004 0.136
#> SRR2105285 2 0.1059 0.60961 0.000 0.968 0.004 0.008 0.020
#> SRR2105286 2 0.0451 0.60866 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105283 2 0.5817 0.42450 0.008 0.628 0.088 0.008 0.268
#> SRR2105284 2 0.4345 0.54696 0.000 0.748 0.028 0.012 0.212
#> SRR2105281 2 0.3857 0.29710 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR2105282 5 0.4171 0.55555 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR2105259 3 0.4000 0.54534 0.004 0.100 0.824 0.052 0.020
#> SRR2105260 3 0.5324 0.54238 0.004 0.132 0.740 0.064 0.060
#> SRR2105279 5 0.3684 0.60873 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR2105280 5 0.4249 0.51991 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR2105257 1 0.4206 0.57269 0.796 0.000 0.136 0.020 0.048
#> SRR2105258 1 0.3812 0.58760 0.824 0.000 0.092 0.008 0.076
#> SRR2105253 2 0.3047 0.59309 0.000 0.832 0.004 0.004 0.160
#> SRR2105254 2 0.3487 0.55781 0.000 0.780 0.000 0.008 0.212
#> SRR2105255 3 0.5123 0.05508 0.376 0.000 0.588 0.020 0.016
#> SRR2105256 3 0.5201 -0.13410 0.432 0.000 0.532 0.028 0.008
#> SRR2105251 2 0.4045 0.35723 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR2105252 2 0.3508 0.45693 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR2105249 2 0.4505 0.49109 0.012 0.748 0.024 0.008 0.208
#> SRR2105250 2 0.5420 0.22470 0.072 0.644 0.004 0.004 0.276
#> SRR2105247 2 0.4359 0.12553 0.004 0.584 0.000 0.000 0.412
#> SRR2105248 2 0.4440 -0.20361 0.004 0.528 0.000 0.000 0.468
#> SRR2105245 2 0.5684 0.44213 0.040 0.720 0.140 0.016 0.084
#> SRR2105246 2 0.6730 0.37381 0.028 0.596 0.140 0.016 0.220
#> SRR2105243 1 0.6944 0.32027 0.548 0.124 0.280 0.012 0.036
#> SRR2105244 3 0.8062 0.04577 0.364 0.188 0.372 0.032 0.044
#> SRR2105241 1 0.6253 0.38858 0.584 0.056 0.312 0.008 0.040
#> SRR2105242 1 0.4089 0.51046 0.736 0.000 0.244 0.004 0.016
#> SRR2105239 1 0.7170 0.09905 0.464 0.368 0.096 0.004 0.068
#> SRR2105240 1 0.3595 0.58315 0.828 0.000 0.048 0.004 0.120
#> SRR2105237 2 0.3348 0.61216 0.000 0.860 0.040 0.020 0.080
#> SRR2105238 2 0.3618 0.58539 0.000 0.788 0.004 0.012 0.196
#> SRR2105235 2 0.4390 0.05611 0.000 0.568 0.004 0.000 0.428
#> SRR2105236 5 0.4101 0.56962 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR2105233 2 0.1478 0.61937 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105234 2 0.1121 0.61196 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105231 5 0.4150 0.51642 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR2105232 5 0.4288 0.54819 0.000 0.384 0.004 0.000 0.612
#> SRR2105227 2 0.7534 0.16740 0.072 0.512 0.276 0.016 0.124
#> SRR2105228 1 0.8259 0.12040 0.456 0.200 0.204 0.016 0.124
#> SRR2105225 1 0.4949 0.26045 0.532 0.000 0.444 0.020 0.004
#> SRR2105226 1 0.4751 0.47984 0.688 0.000 0.272 0.028 0.012
#> SRR2105229 3 0.5421 0.45966 0.004 0.264 0.664 0.044 0.024
#> SRR2105230 3 0.5191 0.54747 0.052 0.144 0.752 0.032 0.020
#> SRR2105219 2 0.2286 0.61850 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR2105220 2 0.3452 0.52895 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR2105221 5 0.6970 0.32905 0.160 0.352 0.016 0.008 0.464
#> SRR2105222 5 0.6340 0.37741 0.112 0.356 0.016 0.000 0.516
#> SRR2105223 1 0.5189 0.37401 0.584 0.000 0.376 0.028 0.012
#> SRR2105224 1 0.5034 0.43695 0.648 0.000 0.308 0.028 0.016
#> SRR2105217 5 0.4562 0.40772 0.004 0.444 0.000 0.004 0.548
#> SRR2105218 5 0.4449 0.38105 0.004 0.484 0.000 0.000 0.512
#> SRR2105215 5 0.4307 0.37150 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR2105216 5 0.4310 0.52462 0.004 0.392 0.000 0.000 0.604
#> SRR2105213 2 0.6162 0.38027 0.012 0.656 0.192 0.028 0.112
#> SRR2105214 2 0.7961 0.16091 0.104 0.496 0.236 0.020 0.144
#> SRR2105211 3 0.7060 0.43401 0.180 0.096 0.620 0.044 0.060
#> SRR2105212 3 0.7667 0.35666 0.204 0.240 0.492 0.040 0.024
#> SRR2105209 1 0.4853 0.55185 0.736 0.008 0.192 0.008 0.056
#> SRR2105210 1 0.5386 0.57726 0.716 0.008 0.172 0.020 0.084
#> SRR2105207 1 0.5902 0.39967 0.624 0.012 0.260 0.004 0.100
#> SRR2105208 1 0.3936 0.54892 0.800 0.000 0.052 0.004 0.144
#> SRR2105205 2 0.3163 0.59939 0.000 0.824 0.000 0.012 0.164
#> SRR2105206 2 0.1116 0.61177 0.000 0.964 0.004 0.004 0.028
#> SRR2105201 5 0.5421 0.52285 0.060 0.320 0.008 0.000 0.612
#> SRR2105202 5 0.6077 0.40622 0.100 0.360 0.004 0.004 0.532
#> SRR2105203 2 0.3534 0.49397 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR2105204 2 0.4305 -0.30080 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR2105199 2 0.3607 0.49544 0.000 0.752 0.000 0.004 0.244
#> SRR2105200 2 0.3876 0.29061 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR2105197 3 0.5657 0.47334 0.152 0.040 0.724 0.056 0.028
#> SRR2105198 3 0.6153 0.48338 0.124 0.036 0.704 0.060 0.076
#> SRR2105195 3 0.7880 0.28856 0.268 0.236 0.432 0.016 0.048
#> SRR2105196 3 0.8125 0.32501 0.196 0.188 0.464 0.008 0.144
#> SRR2105193 1 0.5337 0.45446 0.636 0.000 0.304 0.024 0.036
#> SRR2105194 1 0.4440 0.49659 0.720 0.000 0.248 0.016 0.016
#> SRR2105191 1 0.6984 -0.02894 0.432 0.012 0.424 0.036 0.096
#> SRR2105192 1 0.5696 0.46371 0.668 0.000 0.176 0.016 0.140
#> SRR2105189 2 0.3455 0.60126 0.004 0.836 0.020 0.008 0.132
#> SRR2105190 2 0.2629 0.60262 0.000 0.880 0.004 0.012 0.104
#> SRR2105187 2 0.5490 0.41531 0.004 0.648 0.084 0.004 0.260
#> SRR2105188 2 0.6647 0.11352 0.016 0.528 0.128 0.008 0.320
#> SRR2105179 1 0.6869 0.17583 0.436 0.036 0.436 0.016 0.076
#> SRR2105180 1 0.6699 0.44192 0.600 0.048 0.240 0.012 0.100
#> SRR2105183 5 0.3990 0.61156 0.004 0.308 0.000 0.000 0.688
#> SRR2105184 5 0.4210 0.54766 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR2105185 2 0.3487 0.54340 0.008 0.780 0.000 0.000 0.212
#> SRR2105186 2 0.4288 0.22412 0.004 0.612 0.000 0.000 0.384
#> SRR2105181 3 0.7423 0.41223 0.228 0.136 0.552 0.060 0.024
#> SRR2105182 3 0.5628 0.46643 0.184 0.032 0.708 0.056 0.020
#> SRR2105177 1 0.4475 0.56266 0.756 0.000 0.056 0.008 0.180
#> SRR2105178 1 0.3566 0.56456 0.812 0.000 0.024 0.004 0.160
#> SRR2105171 2 0.4150 0.26291 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR2105172 2 0.4161 0.11384 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105175 1 0.7299 0.33012 0.524 0.080 0.160 0.000 0.236
#> SRR2105176 1 0.5316 0.55055 0.716 0.008 0.096 0.012 0.168
#> SRR2105173 2 0.3039 0.58026 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR2105174 2 0.3932 0.39394 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105169 5 0.4030 0.56891 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR2105170 5 0.4086 0.62104 0.012 0.284 0.000 0.000 0.704
#> SRR2105167 5 0.4088 0.59874 0.000 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR2105168 5 0.4101 0.59809 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR2105165 3 0.5065 0.34719 0.228 0.008 0.708 0.016 0.040
#> SRR2105166 3 0.5442 0.12589 0.396 0.012 0.560 0.020 0.012
#> SRR2105163 2 0.7525 0.20284 0.044 0.536 0.272 0.076 0.072
#> SRR2105164 3 0.8079 0.37616 0.212 0.132 0.508 0.032 0.116
#> SRR2105161 1 0.6006 0.55117 0.656 0.012 0.180 0.012 0.140
#> SRR2105162 1 0.3589 0.57636 0.824 0.000 0.040 0.004 0.132
#> SRR2105155 5 0.4306 0.34100 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR2105156 2 0.4161 0.11450 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR2105157 2 0.4302 -0.16087 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR2105158 5 0.4397 0.46428 0.004 0.432 0.000 0.000 0.564
#> SRR2105159 3 0.7023 0.30476 0.256 0.052 0.568 0.016 0.108
#> SRR2105160 1 0.6605 0.47347 0.608 0.020 0.212 0.020 0.140
#> SRR2105153 2 0.3895 0.32320 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR2105154 2 0.2813 0.55098 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR2105151 5 0.4183 0.61993 0.000 0.324 0.008 0.000 0.668
#> SRR2105152 5 0.3424 0.61154 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR2105149 3 0.7087 0.40352 0.012 0.248 0.564 0.060 0.116
#> SRR2105150 3 0.5807 0.46885 0.008 0.284 0.632 0.036 0.040
#> SRR2105147 4 0.1399 0.91033 0.000 0.020 0.028 0.952 0.000
#> SRR2105148 4 0.1386 0.90725 0.000 0.016 0.032 0.952 0.000
#> SRR2105143 2 0.7262 -0.08495 0.344 0.416 0.032 0.000 0.208
#> SRR2105144 1 0.6377 0.44760 0.652 0.128 0.064 0.004 0.152
#> SRR2105145 1 0.4925 0.48767 0.700 0.012 0.252 0.012 0.024
#> SRR2105146 1 0.5165 0.45418 0.644 0.000 0.304 0.016 0.036
#> SRR2105141 2 0.0162 0.60768 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105142 2 0.0880 0.61331 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105139 2 0.3857 0.26939 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR2105140 2 0.4302 -0.29220 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR2105137 5 0.7876 0.34042 0.168 0.180 0.140 0.008 0.504
#> SRR2105138 5 0.6720 0.30033 0.224 0.164 0.032 0.004 0.576
#> SRR2105135 5 0.3837 0.61882 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR2105136 5 0.3949 0.62104 0.004 0.300 0.000 0.000 0.696
#> SRR2105133 3 0.6598 0.47592 0.144 0.052 0.668 0.048 0.088
#> SRR2105134 3 0.5892 0.19518 0.360 0.000 0.556 0.020 0.064
#> SRR2105131 2 0.7524 0.23994 0.064 0.544 0.180 0.020 0.192
#> SRR2105132 3 0.7285 -0.00275 0.376 0.016 0.432 0.024 0.152
#> SRR2105129 1 0.4197 0.58826 0.776 0.000 0.076 0.000 0.148
#> SRR2105130 1 0.3609 0.57414 0.816 0.000 0.032 0.004 0.148
#> SRR2105127 1 0.4318 0.55119 0.772 0.008 0.040 0.004 0.176
#> SRR2105128 1 0.4086 0.56897 0.788 0.000 0.056 0.004 0.152
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.3576 0.57706 0.060 0.000 0.136 0.000 0.800 0.004
#> SRR2105278 5 0.4945 0.43558 0.240 0.000 0.108 0.000 0.648 0.004
#> SRR2105275 5 0.5202 0.43128 0.004 0.292 0.064 0.000 0.620 0.020
#> SRR2105276 5 0.4652 0.55279 0.004 0.092 0.184 0.008 0.712 0.000
#> SRR2105273 3 0.4012 0.57007 0.176 0.000 0.748 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105274 3 0.3469 0.59483 0.104 0.000 0.808 0.000 0.088 0.000
#> SRR2105271 5 0.5824 0.33852 0.224 0.008 0.228 0.000 0.540 0.000
#> SRR2105272 3 0.5586 0.43739 0.288 0.004 0.564 0.004 0.140 0.000
#> SRR2105269 2 0.2730 0.60381 0.000 0.836 0.012 0.000 0.000 0.152
#> SRR2105270 2 0.4109 0.44501 0.000 0.652 0.012 0.000 0.008 0.328
#> SRR2105267 2 0.4663 -0.05972 0.000 0.492 0.032 0.000 0.004 0.472
#> SRR2105268 2 0.3887 0.37416 0.000 0.632 0.008 0.000 0.000 0.360
#> SRR2105265 6 0.3221 0.58669 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR2105266 6 0.3628 0.59720 0.000 0.268 0.008 0.000 0.004 0.720
#> SRR2105263 2 0.3870 0.58827 0.008 0.752 0.024 0.004 0.000 0.212
#> SRR2105264 6 0.4821 0.25029 0.012 0.388 0.028 0.000 0.004 0.568
#> SRR2105261 5 0.8131 0.03050 0.008 0.260 0.180 0.012 0.284 0.256
#> SRR2105262 5 0.6606 0.43645 0.004 0.184 0.192 0.012 0.556 0.052
#> SRR2105357 5 0.2485 0.59710 0.008 0.016 0.064 0.000 0.896 0.016
#> SRR2105358 5 0.2877 0.58320 0.020 0.000 0.124 0.000 0.848 0.008
#> SRR2105439 6 0.6311 0.49006 0.184 0.116 0.028 0.000 0.060 0.612
#> SRR2105440 6 0.5083 0.56546 0.080 0.140 0.024 0.000 0.032 0.724
#> SRR2105509 2 0.2825 0.61518 0.000 0.844 0.008 0.012 0.000 0.136
#> SRR2105510 2 0.1749 0.62183 0.000 0.932 0.016 0.004 0.004 0.044
#> SRR2105507 3 0.2890 0.55739 0.028 0.000 0.856 0.004 0.108 0.004
#> SRR2105508 3 0.2988 0.54985 0.024 0.000 0.824 0.000 0.152 0.000
#> SRR2105505 1 0.4303 0.53120 0.712 0.000 0.236 0.000 0.032 0.020
#> SRR2105506 1 0.1788 0.66058 0.916 0.000 0.076 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105503 2 0.2218 0.61635 0.000 0.884 0.012 0.000 0.000 0.104
#> SRR2105504 4 0.0146 0.99584 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.3892 0.57231 0.000 0.740 0.048 0.000 0.000 0.212
#> SRR2105502 4 0.0146 0.99584 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105499 5 0.6101 0.24266 0.040 0.080 0.428 0.000 0.444 0.008
#> SRR2105500 5 0.6080 0.32661 0.108 0.032 0.364 0.000 0.492 0.004
#> SRR2105497 2 0.3907 0.17943 0.004 0.588 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR2105498 6 0.4062 0.32248 0.008 0.440 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR2105495 2 0.3953 0.59046 0.000 0.776 0.040 0.000 0.024 0.160
#> SRR2105496 2 0.4090 0.46255 0.000 0.652 0.004 0.000 0.016 0.328
#> SRR2105493 2 0.5289 0.52387 0.020 0.692 0.076 0.000 0.032 0.180
#> SRR2105494 2 0.5574 0.47162 0.024 0.656 0.052 0.000 0.048 0.220
#> SRR2105491 2 0.4202 0.39950 0.000 0.668 0.028 0.004 0.000 0.300
#> SRR2105492 2 0.3919 0.48217 0.000 0.740 0.028 0.004 0.004 0.224
#> SRR2105489 6 0.3955 0.30715 0.000 0.436 0.004 0.000 0.000 0.560
#> SRR2105490 6 0.3538 0.62778 0.012 0.216 0.004 0.000 0.004 0.764
#> SRR2105487 5 0.6426 0.29980 0.348 0.008 0.136 0.000 0.472 0.036
#> SRR2105488 5 0.6011 0.37286 0.296 0.008 0.124 0.000 0.548 0.024
#> SRR2105485 3 0.5219 0.20341 0.040 0.004 0.596 0.000 0.328 0.032
#> SRR2105486 5 0.6740 0.01839 0.156 0.008 0.380 0.000 0.408 0.048
#> SRR2105483 1 0.1196 0.66020 0.952 0.000 0.040 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105484 1 0.1649 0.65864 0.932 0.000 0.036 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105481 5 0.6911 0.34657 0.212 0.008 0.292 0.004 0.444 0.040
#> SRR2105482 1 0.5259 0.45564 0.600 0.000 0.160 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105479 3 0.7715 -0.18099 0.004 0.200 0.356 0.004 0.276 0.160
#> SRR2105480 3 0.6180 0.04093 0.012 0.160 0.520 0.004 0.296 0.008
#> SRR2105477 2 0.5413 0.37470 0.008 0.568 0.032 0.004 0.032 0.356
#> SRR2105478 2 0.5849 0.42853 0.012 0.600 0.084 0.000 0.040 0.264
#> SRR2105475 2 0.2679 0.62401 0.000 0.872 0.008 0.012 0.008 0.100
#> SRR2105476 2 0.1983 0.62474 0.000 0.916 0.012 0.012 0.000 0.060
#> SRR2105473 6 0.6920 0.38434 0.256 0.240 0.024 0.000 0.028 0.452
#> SRR2105474 6 0.6632 0.44765 0.144 0.236 0.032 0.000 0.040 0.548
#> SRR2105471 6 0.3853 0.57922 0.008 0.272 0.012 0.000 0.000 0.708
#> SRR2105472 6 0.3647 0.59099 0.012 0.232 0.004 0.000 0.004 0.748
#> SRR2105469 3 0.2856 0.59133 0.064 0.004 0.868 0.000 0.060 0.004
#> SRR2105470 3 0.3607 0.59450 0.096 0.004 0.812 0.000 0.084 0.004
#> SRR2105467 3 0.5412 0.47825 0.284 0.004 0.604 0.000 0.092 0.016
#> SRR2105468 1 0.4828 0.25342 0.568 0.000 0.380 0.000 0.044 0.008
#> SRR2105465 3 0.7448 0.19295 0.212 0.224 0.428 0.004 0.004 0.128
#> SRR2105466 3 0.5239 0.27987 0.356 0.056 0.568 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105463 1 0.3301 0.55947 0.772 0.000 0.216 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105464 1 0.1010 0.65946 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105461 6 0.2584 0.62142 0.000 0.144 0.004 0.000 0.004 0.848
#> SRR2105462 6 0.3647 0.49805 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR2105459 2 0.1901 0.61977 0.000 0.912 0.008 0.004 0.000 0.076
#> SRR2105460 2 0.1625 0.62016 0.000 0.928 0.012 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105457 5 0.4478 0.48253 0.008 0.028 0.308 0.004 0.652 0.000
#> SRR2105458 5 0.4831 0.56127 0.044 0.028 0.180 0.004 0.728 0.016
#> SRR2105455 3 0.4873 0.54522 0.228 0.020 0.684 0.000 0.064 0.004
#> SRR2105456 3 0.3483 0.51894 0.236 0.000 0.748 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105453 1 0.1321 0.65947 0.952 0.000 0.024 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105454 1 0.1434 0.65804 0.948 0.000 0.028 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105451 2 0.6604 0.30522 0.004 0.512 0.068 0.000 0.148 0.268
#> SRR2105452 4 0.0146 0.99584 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.6598 0.37874 0.052 0.112 0.624 0.004 0.124 0.084
#> SRR2105450 3 0.3393 0.56420 0.128 0.012 0.824 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105447 2 0.2883 0.58931 0.000 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR2105448 2 0.0993 0.61885 0.000 0.964 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105445 5 0.6390 0.06774 0.004 0.388 0.068 0.000 0.452 0.088
#> SRR2105446 5 0.6167 0.50623 0.036 0.076 0.112 0.000 0.648 0.128
#> SRR2105443 2 0.5734 0.50029 0.000 0.672 0.108 0.012 0.084 0.124
#> SRR2105444 2 0.6933 0.32977 0.028 0.548 0.100 0.004 0.096 0.224
#> SRR2105441 6 0.4251 0.58399 0.020 0.252 0.012 0.000 0.008 0.708
#> SRR2105442 6 0.4500 0.61544 0.020 0.264 0.012 0.000 0.016 0.688
#> SRR2105437 5 0.1956 0.59154 0.080 0.000 0.008 0.000 0.908 0.004
#> SRR2105438 5 0.2106 0.59300 0.064 0.000 0.032 0.000 0.904 0.000
#> SRR2105435 5 0.7762 0.28883 0.096 0.192 0.292 0.004 0.388 0.028
#> SRR2105436 5 0.5636 0.41494 0.028 0.040 0.392 0.004 0.524 0.012
#> SRR2105433 1 0.5076 0.10819 0.528 0.000 0.412 0.000 0.020 0.040
#> SRR2105434 1 0.2913 0.60931 0.812 0.000 0.180 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105431 1 0.0777 0.65883 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105432 1 0.1049 0.65944 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105429 2 0.3732 0.58386 0.000 0.816 0.092 0.000 0.044 0.048
#> SRR2105430 2 0.1434 0.62066 0.000 0.948 0.024 0.000 0.008 0.020
#> SRR2105427 2 0.3153 0.62013 0.000 0.832 0.032 0.000 0.008 0.128
#> SRR2105428 2 0.2123 0.61927 0.000 0.916 0.036 0.004 0.008 0.036
#> SRR2105425 2 0.2994 0.55578 0.000 0.788 0.004 0.000 0.000 0.208
#> SRR2105426 2 0.3489 0.44982 0.004 0.708 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR2105421 3 0.7545 0.05501 0.000 0.228 0.376 0.004 0.248 0.144
#> SRR2105422 3 0.6305 0.06724 0.004 0.332 0.452 0.004 0.200 0.008
#> SRR2105423 6 0.3852 0.57077 0.000 0.324 0.012 0.000 0.000 0.664
#> SRR2105424 2 0.3371 0.40952 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR2105419 3 0.4361 0.50590 0.020 0.036 0.760 0.004 0.168 0.012
#> SRR2105420 3 0.6218 0.23717 0.012 0.080 0.536 0.004 0.324 0.044
#> SRR2105415 1 0.1353 0.65699 0.952 0.000 0.024 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105416 1 0.0603 0.65759 0.980 0.000 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105417 1 0.4828 0.22309 0.568 0.000 0.384 0.000 0.016 0.032
#> SRR2105418 1 0.3103 0.60273 0.784 0.000 0.208 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105413 2 0.1769 0.62603 0.000 0.924 0.012 0.004 0.000 0.060
#> SRR2105414 2 0.3543 0.55446 0.004 0.740 0.004 0.004 0.000 0.248
#> SRR2105409 6 0.4792 0.33389 0.000 0.408 0.032 0.000 0.012 0.548
#> SRR2105410 6 0.4771 0.57376 0.036 0.192 0.012 0.000 0.040 0.720
#> SRR2105411 2 0.3819 0.38246 0.000 0.652 0.008 0.000 0.000 0.340
#> SRR2105412 2 0.3584 0.35190 0.000 0.688 0.004 0.000 0.000 0.308
#> SRR2105407 5 0.1643 0.58783 0.000 0.008 0.068 0.000 0.924 0.000
#> SRR2105408 5 0.1564 0.59364 0.000 0.024 0.040 0.000 0.936 0.000
#> SRR2105403 3 0.5553 0.50840 0.208 0.000 0.608 0.000 0.168 0.016
#> SRR2105404 5 0.6436 0.16632 0.308 0.000 0.232 0.000 0.436 0.024
#> SRR2105405 3 0.3670 0.47170 0.284 0.000 0.704 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105406 3 0.3725 0.43684 0.316 0.000 0.676 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105401 2 0.3478 0.62117 0.000 0.816 0.060 0.000 0.008 0.116
#> SRR2105402 4 0.0146 0.99584 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.3632 0.58686 0.000 0.836 0.024 0.044 0.076 0.020
#> SRR2105400 2 0.4451 0.57669 0.000 0.784 0.048 0.020 0.088 0.060
#> SRR2105397 5 0.6418 -0.07525 0.000 0.404 0.044 0.008 0.432 0.112
#> SRR2105398 2 0.6090 0.26461 0.000 0.544 0.056 0.008 0.316 0.076
#> SRR2105395 6 0.4335 0.50249 0.000 0.324 0.024 0.000 0.008 0.644
#> SRR2105396 6 0.3437 0.60904 0.004 0.236 0.000 0.000 0.008 0.752
#> SRR2105393 2 0.2933 0.54661 0.000 0.796 0.000 0.004 0.000 0.200
#> SRR2105394 6 0.4338 0.25660 0.000 0.484 0.020 0.000 0.000 0.496
#> SRR2105389 5 0.1956 0.58747 0.000 0.008 0.080 0.000 0.908 0.004
#> SRR2105390 5 0.2355 0.57175 0.004 0.000 0.112 0.000 0.876 0.008
#> SRR2105391 5 0.5861 0.10355 0.008 0.104 0.380 0.004 0.496 0.008
#> SRR2105392 5 0.4109 0.11620 0.004 0.000 0.392 0.000 0.596 0.008
#> SRR2105385 3 0.4978 0.43084 0.044 0.044 0.684 0.000 0.224 0.004
#> SRR2105386 3 0.2767 0.59360 0.072 0.004 0.868 0.000 0.056 0.000
#> SRR2105387 3 0.5178 0.50035 0.196 0.088 0.680 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105388 3 0.6634 0.16155 0.384 0.032 0.400 0.000 0.176 0.008
#> SRR2105381 2 0.1353 0.62026 0.000 0.952 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR2105382 2 0.0767 0.61412 0.000 0.976 0.008 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105383 2 0.5020 -0.00974 0.040 0.516 0.016 0.000 0.000 0.428
#> SRR2105384 2 0.4763 0.26993 0.040 0.604 0.012 0.000 0.000 0.344
#> SRR2105379 2 0.4122 0.49612 0.000 0.660 0.020 0.004 0.000 0.316
#> SRR2105380 2 0.2265 0.62043 0.000 0.896 0.024 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105377 6 0.5858 0.20474 0.040 0.404 0.020 0.000 0.040 0.496
#> SRR2105378 6 0.6208 0.49797 0.176 0.144 0.024 0.000 0.044 0.612
#> SRR2105375 5 0.8360 0.07654 0.304 0.172 0.152 0.004 0.312 0.056
#> SRR2105376 1 0.7982 0.26314 0.448 0.140 0.172 0.000 0.164 0.076
#> SRR2105373 5 0.3943 0.56560 0.076 0.000 0.140 0.000 0.776 0.008
#> SRR2105374 5 0.4506 0.50771 0.176 0.000 0.120 0.000 0.704 0.000
#> SRR2105371 3 0.3982 0.24451 0.004 0.000 0.536 0.000 0.460 0.000
#> SRR2105372 3 0.3922 0.43484 0.016 0.000 0.664 0.000 0.320 0.000
#> SRR2105369 3 0.4393 0.55796 0.172 0.000 0.716 0.000 0.112 0.000
#> SRR2105370 3 0.4559 0.50646 0.252 0.000 0.676 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105367 1 0.6343 0.27945 0.500 0.000 0.164 0.004 0.300 0.032
#> SRR2105368 1 0.7011 -0.00284 0.380 0.004 0.236 0.004 0.332 0.044
#> SRR2105365 2 0.4105 0.43179 0.000 0.632 0.020 0.000 0.000 0.348
#> SRR2105366 2 0.4664 -0.10007 0.000 0.484 0.032 0.000 0.004 0.480
#> SRR2105363 2 0.3200 0.57357 0.000 0.788 0.016 0.000 0.000 0.196
#> SRR2105364 2 0.3936 0.47174 0.000 0.688 0.024 0.000 0.000 0.288
#> SRR2105361 2 0.4181 -0.02829 0.000 0.512 0.012 0.000 0.000 0.476
#> SRR2105362 6 0.3596 0.60229 0.004 0.232 0.016 0.000 0.000 0.748
#> SRR2105359 5 0.5129 0.29452 0.040 0.004 0.448 0.004 0.496 0.008
#> SRR2105360 3 0.5238 0.41974 0.092 0.008 0.652 0.004 0.236 0.008
#> SRR2105355 3 0.4033 0.59331 0.088 0.012 0.776 0.000 0.124 0.000
#> SRR2105356 3 0.4382 0.52895 0.228 0.000 0.696 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105353 5 0.5844 0.37049 0.004 0.136 0.292 0.000 0.552 0.016
#> SRR2105354 3 0.5340 0.18060 0.020 0.068 0.552 0.000 0.360 0.000
#> SRR2105351 2 0.4336 -0.02067 0.000 0.504 0.020 0.000 0.000 0.476
#> SRR2105352 4 0.0146 0.99332 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105349 2 0.4076 0.47737 0.000 0.636 0.012 0.000 0.004 0.348
#> SRR2105350 2 0.2668 0.59475 0.000 0.828 0.004 0.000 0.000 0.168
#> SRR2105345 6 0.5379 0.44350 0.048 0.380 0.016 0.000 0.012 0.544
#> SRR2105346 6 0.3809 0.59811 0.012 0.264 0.008 0.000 0.000 0.716
#> SRR2105347 6 0.6928 0.18524 0.380 0.144 0.040 0.000 0.028 0.408
#> SRR2105348 1 0.5560 0.31254 0.600 0.116 0.004 0.000 0.016 0.264
#> SRR2105343 6 0.4165 0.32823 0.000 0.452 0.012 0.000 0.000 0.536
#> SRR2105344 6 0.4076 0.21318 0.000 0.452 0.008 0.000 0.000 0.540
#> SRR2105341 5 0.3066 0.58069 0.004 0.012 0.136 0.000 0.836 0.012
#> SRR2105342 3 0.3817 0.48724 0.016 0.004 0.744 0.000 0.228 0.008
#> SRR2105339 5 0.4619 0.45851 0.004 0.012 0.304 0.004 0.652 0.024
#> SRR2105340 5 0.5733 0.34544 0.008 0.100 0.384 0.004 0.500 0.004
#> SRR2105335 1 0.5828 0.01947 0.428 0.004 0.160 0.000 0.408 0.000
#> SRR2105336 1 0.4990 0.51162 0.672 0.000 0.120 0.000 0.196 0.012
#> SRR2105337 3 0.3996 0.50540 0.248 0.004 0.720 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105338 3 0.3738 0.47306 0.280 0.000 0.704 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105331 2 0.4034 0.51914 0.000 0.692 0.024 0.000 0.004 0.280
#> SRR2105332 2 0.4659 0.05110 0.000 0.504 0.032 0.000 0.004 0.460
#> SRR2105333 2 0.2845 0.59137 0.000 0.820 0.004 0.004 0.000 0.172
#> SRR2105334 2 0.1285 0.62111 0.000 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105329 2 0.3524 0.60758 0.000 0.832 0.040 0.000 0.052 0.076
#> SRR2105330 2 0.2550 0.61350 0.000 0.892 0.048 0.000 0.024 0.036
#> SRR2105327 2 0.3633 0.54825 0.000 0.732 0.012 0.004 0.000 0.252
#> SRR2105328 2 0.2872 0.61538 0.000 0.832 0.012 0.004 0.000 0.152
#> SRR2105325 5 0.3189 0.59886 0.000 0.060 0.080 0.008 0.848 0.004
#> SRR2105326 5 0.2870 0.59864 0.000 0.032 0.100 0.004 0.860 0.004
#> SRR2105323 5 0.6542 0.21171 0.044 0.072 0.352 0.000 0.492 0.040
#> SRR2105324 3 0.5246 0.41966 0.112 0.004 0.588 0.000 0.296 0.000
#> SRR2105319 5 0.5795 0.15020 0.364 0.000 0.184 0.000 0.452 0.000
#> SRR2105320 5 0.5487 0.23506 0.356 0.000 0.136 0.000 0.508 0.000
#> SRR2105321 3 0.4022 0.32287 0.000 0.004 0.628 0.000 0.360 0.008
#> SRR2105322 3 0.3905 0.46694 0.008 0.004 0.740 0.008 0.232 0.008
#> SRR2105317 2 0.1219 0.62047 0.000 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105318 2 0.3838 0.14562 0.000 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR2105315 2 0.3273 0.59319 0.000 0.848 0.068 0.000 0.052 0.032
#> SRR2105316 2 0.2704 0.59467 0.000 0.844 0.016 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105313 2 0.4226 0.43259 0.000 0.648 0.016 0.004 0.004 0.328
#> SRR2105314 2 0.4523 0.30167 0.000 0.592 0.032 0.004 0.000 0.372
#> SRR2105311 5 0.8042 0.42937 0.004 0.100 0.136 0.144 0.468 0.148
#> SRR2105312 5 0.7609 0.37828 0.000 0.196 0.204 0.044 0.460 0.096
#> SRR2105307 3 0.4184 0.26768 0.432 0.000 0.556 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105308 1 0.3828 0.06850 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 5 0.6246 0.51867 0.040 0.156 0.168 0.004 0.612 0.020
#> SRR2105310 5 0.4389 0.52469 0.000 0.036 0.288 0.000 0.668 0.008
#> SRR2105305 5 0.4240 0.46662 0.004 0.012 0.304 0.000 0.668 0.012
#> SRR2105306 3 0.4340 0.53421 0.064 0.004 0.708 0.000 0.224 0.000
#> SRR2105303 6 0.4456 0.19504 0.004 0.456 0.020 0.000 0.000 0.520
#> SRR2105304 4 0.0146 0.99584 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105301 2 0.3075 0.60797 0.000 0.840 0.016 0.012 0.004 0.128
#> SRR2105302 2 0.3674 0.54832 0.000 0.716 0.016 0.000 0.000 0.268
#> SRR2105299 5 0.5816 0.42027 0.012 0.196 0.032 0.000 0.628 0.132
#> SRR2105300 5 0.5789 0.39730 0.008 0.148 0.020 0.000 0.604 0.220
#> SRR2105297 1 0.4377 0.29944 0.608 0.008 0.004 0.000 0.012 0.368
#> SRR2105298 1 0.3799 0.42732 0.704 0.000 0.008 0.000 0.008 0.280
#> SRR2105295 2 0.2191 0.62213 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR2105296 6 0.4467 0.02353 0.000 0.480 0.020 0.004 0.000 0.496
#> SRR2105293 3 0.6813 0.01187 0.012 0.368 0.404 0.004 0.184 0.028
#> SRR2105294 3 0.5797 0.33779 0.024 0.176 0.604 0.004 0.192 0.000
#> SRR2105291 3 0.5811 0.51519 0.140 0.096 0.676 0.004 0.020 0.064
#> SRR2105292 1 0.5870 0.36816 0.540 0.000 0.280 0.000 0.164 0.016
#> SRR2105289 3 0.8228 0.15183 0.264 0.144 0.304 0.000 0.244 0.044
#> SRR2105290 3 0.3730 0.52789 0.236 0.008 0.740 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105287 1 0.3541 0.55535 0.748 0.000 0.232 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105288 1 0.2982 0.62591 0.820 0.000 0.164 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105285 2 0.0806 0.61369 0.000 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105286 2 0.0405 0.61276 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105283 2 0.6578 0.31833 0.020 0.520 0.100 0.000 0.060 0.300
#> SRR2105284 2 0.5068 0.52804 0.016 0.696 0.048 0.000 0.036 0.204
#> SRR2105281 2 0.3659 0.23017 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR2105282 6 0.3288 0.60944 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR2105259 5 0.1801 0.59379 0.000 0.016 0.056 0.000 0.924 0.004
#> SRR2105260 5 0.3680 0.59819 0.004 0.052 0.088 0.000 0.824 0.032
#> SRR2105279 6 0.2446 0.61010 0.000 0.124 0.012 0.000 0.000 0.864
#> SRR2105280 6 0.3905 0.53165 0.004 0.356 0.004 0.000 0.000 0.636
#> SRR2105257 1 0.4310 0.24066 0.580 0.000 0.396 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105258 1 0.3330 0.49637 0.716 0.000 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.3284 0.57520 0.000 0.784 0.020 0.000 0.000 0.196
#> SRR2105254 2 0.3756 0.54510 0.000 0.736 0.016 0.000 0.008 0.240
#> SRR2105255 5 0.6194 0.06808 0.252 0.000 0.304 0.000 0.436 0.008
#> SRR2105256 3 0.6072 0.31504 0.244 0.000 0.448 0.000 0.304 0.004
#> SRR2105251 2 0.4403 0.25663 0.000 0.564 0.028 0.000 0.000 0.408
#> SRR2105252 2 0.4028 0.34171 0.000 0.668 0.024 0.000 0.000 0.308
#> SRR2105249 2 0.4781 0.46079 0.024 0.688 0.040 0.000 0.008 0.240
#> SRR2105250 2 0.5786 0.20804 0.124 0.576 0.008 0.000 0.016 0.276
#> SRR2105247 6 0.3961 0.24972 0.000 0.440 0.004 0.000 0.000 0.556
#> SRR2105248 6 0.4313 0.20892 0.000 0.480 0.012 0.000 0.004 0.504
#> SRR2105245 2 0.6212 0.32957 0.024 0.608 0.236 0.008 0.076 0.048
#> SRR2105246 2 0.7226 0.15632 0.012 0.452 0.228 0.004 0.068 0.236
#> SRR2105243 3 0.6883 0.39164 0.280 0.116 0.508 0.000 0.068 0.028
#> SRR2105244 3 0.5287 0.52022 0.072 0.116 0.716 0.004 0.084 0.008
#> SRR2105241 3 0.4161 0.53859 0.188 0.040 0.752 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105242 3 0.3881 0.32260 0.396 0.000 0.600 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105239 1 0.7235 0.10872 0.408 0.348 0.156 0.000 0.052 0.036
#> SRR2105240 1 0.3294 0.62198 0.812 0.000 0.156 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105237 2 0.3948 0.61765 0.000 0.800 0.028 0.004 0.056 0.112
#> SRR2105238 2 0.3909 0.58288 0.004 0.756 0.024 0.000 0.012 0.204
#> SRR2105235 6 0.4724 0.13481 0.012 0.464 0.008 0.000 0.012 0.504
#> SRR2105236 6 0.3843 0.60230 0.016 0.232 0.004 0.000 0.008 0.740
#> SRR2105233 2 0.1644 0.62687 0.000 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR2105234 2 0.1555 0.61747 0.000 0.932 0.004 0.004 0.000 0.060
#> SRR2105231 6 0.3859 0.56926 0.000 0.288 0.020 0.000 0.000 0.692
#> SRR2105232 6 0.3855 0.59773 0.000 0.272 0.024 0.000 0.000 0.704
#> SRR2105227 2 0.7758 -0.00331 0.036 0.396 0.284 0.004 0.200 0.080
#> SRR2105228 3 0.7940 0.15919 0.216 0.212 0.424 0.004 0.060 0.084
#> SRR2105225 3 0.4800 0.56795 0.188 0.000 0.688 0.000 0.116 0.008
#> SRR2105226 3 0.4079 0.45616 0.288 0.000 0.680 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105229 5 0.3065 0.59762 0.000 0.100 0.052 0.000 0.844 0.004
#> SRR2105230 5 0.3992 0.58318 0.012 0.052 0.172 0.000 0.764 0.000
#> SRR2105219 2 0.3047 0.61749 0.000 0.832 0.012 0.004 0.008 0.144
#> SRR2105220 2 0.4315 0.49964 0.008 0.680 0.012 0.004 0.008 0.288
#> SRR2105221 6 0.7131 0.31246 0.316 0.248 0.028 0.000 0.028 0.380
#> SRR2105222 6 0.7167 0.33620 0.280 0.240 0.032 0.000 0.032 0.416
#> SRR2105223 3 0.4247 0.51971 0.240 0.000 0.700 0.000 0.060 0.000
#> SRR2105224 3 0.4330 0.48723 0.276 0.000 0.680 0.000 0.036 0.008
#> SRR2105217 6 0.3997 0.54825 0.000 0.288 0.020 0.004 0.000 0.688
#> SRR2105218 6 0.4434 0.39862 0.000 0.428 0.028 0.000 0.000 0.544
#> SRR2105215 6 0.3782 0.45938 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR2105216 6 0.3507 0.59692 0.000 0.232 0.012 0.000 0.004 0.752
#> SRR2105213 2 0.6433 0.29196 0.008 0.572 0.248 0.008 0.080 0.084
#> SRR2105214 2 0.7234 0.08602 0.008 0.388 0.376 0.008 0.096 0.124
#> SRR2105211 3 0.6530 0.22583 0.016 0.068 0.532 0.004 0.300 0.080
#> SRR2105212 3 0.5943 0.35040 0.020 0.172 0.584 0.000 0.216 0.008
#> SRR2105209 3 0.5263 0.10583 0.452 0.016 0.488 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105210 1 0.5171 0.39205 0.608 0.012 0.312 0.000 0.060 0.008
#> SRR2105207 1 0.4532 0.55356 0.712 0.008 0.068 0.000 0.208 0.004
#> SRR2105208 1 0.1367 0.66277 0.944 0.000 0.044 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105205 2 0.3870 0.57596 0.000 0.752 0.024 0.004 0.008 0.212
#> SRR2105206 2 0.0713 0.61482 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105201 6 0.5415 0.54348 0.076 0.188 0.020 0.000 0.036 0.680
#> SRR2105202 6 0.6919 0.37577 0.268 0.248 0.024 0.000 0.024 0.436
#> SRR2105203 2 0.4199 0.37278 0.000 0.640 0.020 0.004 0.000 0.336
#> SRR2105204 6 0.4101 0.45146 0.000 0.408 0.012 0.000 0.000 0.580
#> SRR2105199 2 0.3670 0.43379 0.000 0.704 0.012 0.000 0.000 0.284
#> SRR2105200 2 0.3804 0.29109 0.000 0.656 0.008 0.000 0.000 0.336
#> SRR2105197 5 0.1514 0.59580 0.036 0.004 0.012 0.000 0.944 0.004
#> SRR2105198 5 0.2507 0.60021 0.020 0.008 0.044 0.000 0.900 0.028
#> SRR2105195 3 0.7723 -0.17528 0.088 0.172 0.360 0.004 0.344 0.032
#> SRR2105196 5 0.7527 0.36486 0.080 0.116 0.300 0.004 0.448 0.052
#> SRR2105193 3 0.4013 0.47103 0.280 0.000 0.696 0.004 0.016 0.004
#> SRR2105194 3 0.3728 0.39885 0.344 0.000 0.652 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.6960 0.16646 0.296 0.012 0.196 0.000 0.444 0.052
#> SRR2105192 1 0.3205 0.63428 0.844 0.000 0.080 0.000 0.064 0.012
#> SRR2105189 2 0.3558 0.58472 0.000 0.780 0.032 0.000 0.004 0.184
#> SRR2105190 2 0.2783 0.59023 0.000 0.836 0.016 0.000 0.000 0.148
#> SRR2105187 2 0.6132 0.39083 0.008 0.588 0.060 0.004 0.084 0.256
#> SRR2105188 2 0.7235 -0.01137 0.032 0.428 0.052 0.000 0.176 0.312
#> SRR2105179 3 0.7248 -0.00765 0.272 0.024 0.340 0.004 0.332 0.028
#> SRR2105180 1 0.6469 0.31886 0.524 0.028 0.300 0.004 0.124 0.020
#> SRR2105183 6 0.3037 0.62209 0.016 0.176 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR2105184 6 0.3601 0.56974 0.004 0.312 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR2105185 2 0.3803 0.50079 0.000 0.724 0.020 0.000 0.004 0.252
#> SRR2105186 2 0.4322 0.03200 0.000 0.528 0.020 0.000 0.000 0.452
#> SRR2105181 5 0.4343 0.56873 0.100 0.024 0.116 0.000 0.760 0.000
#> SRR2105182 5 0.4332 0.54363 0.096 0.008 0.156 0.000 0.740 0.000
#> SRR2105177 1 0.4125 0.59351 0.728 0.004 0.228 0.000 0.008 0.032
#> SRR2105178 1 0.1327 0.66006 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.4444 0.28344 0.000 0.576 0.024 0.000 0.004 0.396
#> SRR2105172 2 0.4063 0.13574 0.000 0.572 0.004 0.000 0.004 0.420
#> SRR2105175 1 0.7335 0.42450 0.536 0.064 0.124 0.000 0.124 0.152
#> SRR2105176 1 0.4048 0.57712 0.728 0.000 0.236 0.004 0.020 0.012
#> SRR2105173 2 0.3507 0.56262 0.000 0.752 0.012 0.000 0.004 0.232
#> SRR2105174 2 0.3862 0.34886 0.000 0.608 0.004 0.000 0.000 0.388
#> SRR2105169 6 0.3450 0.60701 0.008 0.208 0.012 0.000 0.000 0.772
#> SRR2105170 6 0.3245 0.62509 0.016 0.184 0.004 0.000 0.000 0.796
#> SRR2105167 6 0.3050 0.63053 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR2105168 6 0.3679 0.61361 0.004 0.260 0.012 0.000 0.000 0.724
#> SRR2105165 3 0.4470 0.08685 0.012 0.008 0.568 0.004 0.408 0.000
#> SRR2105166 3 0.4928 0.53671 0.084 0.012 0.676 0.004 0.224 0.000
#> SRR2105163 2 0.6383 0.23516 0.004 0.540 0.156 0.008 0.260 0.032
#> SRR2105164 3 0.6518 0.28750 0.012 0.108 0.584 0.004 0.204 0.088
#> SRR2105161 3 0.5662 -0.04764 0.444 0.008 0.472 0.004 0.032 0.040
#> SRR2105162 1 0.3706 0.62473 0.776 0.000 0.184 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105155 6 0.4531 0.29137 0.008 0.456 0.012 0.000 0.004 0.520
#> SRR2105156 2 0.4360 0.17321 0.004 0.576 0.012 0.000 0.004 0.404
#> SRR2105157 6 0.4265 0.39064 0.000 0.384 0.016 0.000 0.004 0.596
#> SRR2105158 6 0.4044 0.53950 0.000 0.312 0.012 0.000 0.008 0.668
#> SRR2105159 3 0.6731 -0.01756 0.072 0.036 0.476 0.004 0.360 0.052
#> SRR2105160 1 0.6326 0.25840 0.476 0.020 0.364 0.004 0.124 0.012
#> SRR2105153 2 0.4474 0.04203 0.000 0.560 0.024 0.004 0.000 0.412
#> SRR2105154 2 0.3541 0.44905 0.000 0.748 0.020 0.000 0.000 0.232
#> SRR2105151 6 0.3431 0.62266 0.012 0.152 0.012 0.000 0.012 0.812
#> SRR2105152 6 0.1956 0.60384 0.008 0.080 0.004 0.000 0.000 0.908
#> SRR2105149 5 0.5493 0.51741 0.000 0.136 0.076 0.000 0.672 0.116
#> SRR2105150 5 0.5857 0.50682 0.004 0.164 0.204 0.000 0.600 0.028
#> SRR2105147 4 0.0146 0.99332 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105148 4 0.0260 0.98890 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105143 2 0.7439 -0.10982 0.332 0.340 0.084 0.000 0.012 0.232
#> SRR2105144 1 0.4910 0.57386 0.748 0.120 0.060 0.000 0.036 0.036
#> SRR2105145 3 0.3828 0.45373 0.288 0.012 0.696 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105146 3 0.4013 0.47687 0.280 0.000 0.696 0.004 0.016 0.004
#> SRR2105141 2 0.0405 0.61292 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105142 2 0.1007 0.61916 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105139 2 0.3867 0.23919 0.000 0.660 0.012 0.000 0.000 0.328
#> SRR2105140 6 0.4181 0.28703 0.012 0.476 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR2105137 6 0.7634 0.37364 0.228 0.132 0.060 0.000 0.108 0.472
#> SRR2105138 1 0.6417 -0.05259 0.456 0.096 0.024 0.000 0.032 0.392
#> SRR2105135 6 0.2848 0.62515 0.008 0.160 0.004 0.000 0.000 0.828
#> SRR2105136 6 0.2766 0.62333 0.008 0.140 0.008 0.000 0.000 0.844
#> SRR2105133 5 0.3793 0.59123 0.080 0.004 0.084 0.000 0.812 0.020
#> SRR2105134 5 0.5811 0.46371 0.252 0.004 0.136 0.004 0.588 0.016
#> SRR2105131 2 0.7271 0.26854 0.032 0.500 0.148 0.000 0.100 0.220
#> SRR2105132 1 0.6467 -0.04455 0.448 0.012 0.156 0.004 0.364 0.016
#> SRR2105129 1 0.3691 0.62591 0.780 0.000 0.168 0.000 0.004 0.048
#> SRR2105130 1 0.2263 0.65047 0.884 0.000 0.100 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105127 1 0.2420 0.65713 0.888 0.000 0.076 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105128 1 0.2556 0.66066 0.884 0.000 0.076 0.000 0.028 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.998 0.964 0.982 0.5005 0.499 0.499
#> 3 3 0.657 0.725 0.861 0.2152 0.863 0.733
#> 4 4 0.675 0.764 0.858 0.0460 0.935 0.848
#> 5 5 0.659 0.695 0.781 0.0734 0.984 0.960
#> 6 6 0.711 0.707 0.820 0.0895 0.822 0.568
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105276 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105261 1 0.7376 0.7350 0.792 0.208
#> SRR2105262 1 0.3584 0.9256 0.932 0.068
#> SRR2105357 1 0.0672 0.9849 0.992 0.008
#> SRR2105358 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105440 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105509 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105510 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105507 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.4022 0.9170 0.080 0.920
#> SRR2105501 2 0.1843 0.9603 0.028 0.972
#> SRR2105502 2 0.3431 0.9317 0.064 0.936
#> SRR2105499 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0938 0.9707 0.012 0.988
#> SRR2105498 2 0.0938 0.9704 0.012 0.988
#> SRR2105495 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105496 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105493 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105494 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105491 2 0.0938 0.9704 0.012 0.988
#> SRR2105492 2 0.1414 0.9659 0.020 0.980
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105485 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105483 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105484 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.0672 0.9849 0.992 0.008
#> SRR2105480 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105478 2 0.0938 0.9706 0.012 0.988
#> SRR2105475 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105476 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105474 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.1184 0.9686 0.016 0.984
#> SRR2105452 2 0.5842 0.8522 0.140 0.860
#> SRR2105449 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.0672 0.9713 0.008 0.992
#> SRR2105448 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105445 2 0.9580 0.4372 0.380 0.620
#> SRR2105446 1 0.6801 0.7737 0.820 0.180
#> SRR2105443 2 0.1633 0.9637 0.024 0.976
#> SRR2105444 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105441 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105436 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105431 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.3584 0.9288 0.068 0.932
#> SRR2105430 2 0.2603 0.9488 0.044 0.956
#> SRR2105427 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105428 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105425 2 0.0938 0.9701 0.012 0.988
#> SRR2105426 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105421 1 0.2043 0.9636 0.968 0.032
#> SRR2105422 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105417 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105418 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105414 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105402 2 0.4562 0.9010 0.096 0.904
#> SRR2105399 2 0.4161 0.9126 0.084 0.916
#> SRR2105400 2 0.3879 0.9196 0.076 0.924
#> SRR2105397 2 0.4161 0.9138 0.084 0.916
#> SRR2105398 2 0.3431 0.9324 0.064 0.936
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.3114 0.9384 0.056 0.944
#> SRR2105382 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105383 2 0.7674 0.7387 0.224 0.776
#> SRR2105384 2 0.8081 0.7011 0.248 0.752
#> SRR2105379 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105380 2 0.1184 0.9683 0.016 0.984
#> SRR2105377 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105378 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105375 1 0.1414 0.9748 0.980 0.020
#> SRR2105376 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105373 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.2603 0.9514 0.956 0.044
#> SRR2105365 2 0.0938 0.9706 0.012 0.988
#> SRR2105366 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105364 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.4562 0.9010 0.096 0.904
#> SRR2105349 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105346 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.4022 0.9166 0.080 0.920
#> SRR2105348 2 0.7056 0.7862 0.192 0.808
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105329 2 0.7139 0.7818 0.196 0.804
#> SRR2105330 2 0.4022 0.9168 0.080 0.920
#> SRR2105327 2 0.0672 0.9722 0.008 0.992
#> SRR2105328 2 0.0672 0.9718 0.008 0.992
#> SRR2105325 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105315 1 0.9977 0.0521 0.528 0.472
#> SRR2105316 2 0.1184 0.9683 0.016 0.984
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.4939 0.8780 0.892 0.108
#> SRR2105312 1 0.3733 0.9211 0.928 0.072
#> SRR2105307 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.2423 0.9516 0.040 0.960
#> SRR2105301 2 0.0672 0.9719 0.008 0.992
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105299 2 0.9087 0.5658 0.324 0.676
#> SRR2105300 2 0.8144 0.6985 0.252 0.748
#> SRR2105297 2 0.6531 0.8161 0.168 0.832
#> SRR2105298 2 0.7950 0.7133 0.240 0.760
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0938 0.9816 0.988 0.012
#> SRR2105294 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.2043 0.9629 0.968 0.032
#> SRR2105292 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.0672 0.9720 0.008 0.992
#> SRR2105286 2 0.0672 0.9720 0.008 0.992
#> SRR2105283 2 0.1414 0.9662 0.020 0.980
#> SRR2105284 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.2778 0.9444 0.048 0.952
#> SRR2105250 2 0.1843 0.9607 0.028 0.972
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.1414 0.9748 0.980 0.020
#> SRR2105246 1 0.2603 0.9518 0.956 0.044
#> SRR2105243 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105238 2 0.0938 0.9706 0.012 0.988
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105233 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.1633 0.9710 0.976 0.024
#> SRR2105228 1 0.1184 0.9782 0.984 0.016
#> SRR2105225 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105230 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.1184 0.9685 0.016 0.984
#> SRR2105222 2 0.0938 0.9705 0.012 0.988
#> SRR2105223 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.3274 0.9344 0.940 0.060
#> SRR2105214 1 0.1633 0.9711 0.976 0.024
#> SRR2105211 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105206 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105201 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105202 2 0.0672 0.9721 0.008 0.992
#> SRR2105203 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105197 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105195 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105196 1 0.2423 0.9554 0.960 0.040
#> SRR2105193 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105191 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0672 0.9720 0.008 0.992
#> SRR2105190 2 0.0376 0.9731 0.004 0.996
#> SRR2105187 2 0.1414 0.9658 0.020 0.980
#> SRR2105188 2 0.1633 0.9637 0.024 0.976
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.1184 0.9683 0.016 0.984
#> SRR2105186 2 0.0376 0.9730 0.004 0.996
#> SRR2105181 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105177 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105178 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.1184 0.9782 0.984 0.016
#> SRR2105176 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.1184 0.9783 0.984 0.016
#> SRR2105164 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.3879 0.9148 0.924 0.076
#> SRR2105150 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105147 2 0.8713 0.6234 0.292 0.708
#> SRR2105148 2 0.8763 0.6157 0.296 0.704
#> SRR2105143 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105144 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105145 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.3114 0.9388 0.056 0.944
#> SRR2105138 2 0.1633 0.9637 0.024 0.976
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9738 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105131 2 0.9129 0.5544 0.328 0.672
#> SRR2105132 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
#> SRR2105129 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105130 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105127 1 0.0000 0.9911 1.000 0.000
#> SRR2105128 1 0.0376 0.9881 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.5905 0.5547 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105278 3 0.5948 0.5472 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105275 1 0.5465 0.6041 0.712 0.000 0.288
#> SRR2105276 1 0.4452 0.7584 0.808 0.000 0.192
#> SRR2105273 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0592 0.8840 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105272 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.4750 0.7072 0.000 0.784 0.216
#> SRR2105270 2 0.5560 0.6039 0.000 0.700 0.300
#> SRR2105267 2 0.0424 0.8626 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105268 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.1529 0.8551 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105264 2 0.1031 0.8593 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105261 3 0.8173 0.4957 0.368 0.080 0.552
#> SRR2105262 1 0.6155 0.4756 0.664 0.008 0.328
#> SRR2105357 3 0.5785 0.5677 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105358 3 0.5905 0.5547 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105439 2 0.6180 0.4217 0.000 0.584 0.416
#> SRR2105440 2 0.6442 0.3862 0.004 0.564 0.432
#> SRR2105509 2 0.5905 0.5459 0.000 0.648 0.352
#> SRR2105510 2 0.3192 0.8148 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105507 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.1031 0.8802 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105506 1 0.0424 0.8834 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105503 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105504 3 0.3784 0.5191 0.004 0.132 0.864
#> SRR2105501 2 0.5706 0.5987 0.000 0.680 0.320
#> SRR2105502 3 0.3784 0.5191 0.004 0.132 0.864
#> SRR2105499 1 0.1753 0.8767 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105500 1 0.1529 0.8784 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105497 2 0.2063 0.8504 0.008 0.948 0.044
#> SRR2105498 2 0.2590 0.8376 0.004 0.924 0.072
#> SRR2105495 2 0.5988 0.5159 0.000 0.632 0.368
#> SRR2105496 2 0.5882 0.5469 0.000 0.652 0.348
#> SRR2105493 2 0.6235 0.3800 0.000 0.564 0.436
#> SRR2105494 2 0.6192 0.4190 0.000 0.580 0.420
#> SRR2105491 2 0.0592 0.8621 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105492 2 0.1877 0.8470 0.012 0.956 0.032
#> SRR2105489 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105487 3 0.5835 0.5636 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105488 3 0.5835 0.5636 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105485 1 0.2066 0.8705 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105486 1 0.2711 0.8540 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105483 1 0.1031 0.8745 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105484 1 0.1031 0.8745 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105481 1 0.2165 0.8708 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105482 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.3267 0.8367 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105480 1 0.2261 0.8680 0.932 0.000 0.068
#> SRR2105477 2 0.5835 0.5584 0.000 0.660 0.340
#> SRR2105478 2 0.6189 0.5175 0.004 0.632 0.364
#> SRR2105475 2 0.6079 0.4665 0.000 0.612 0.388
#> SRR2105476 2 0.3267 0.8085 0.000 0.884 0.116
#> SRR2105473 2 0.6483 0.3424 0.004 0.544 0.452
#> SRR2105474 2 0.6398 0.4117 0.004 0.580 0.416
#> SRR2105471 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.0892 0.8827 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105470 1 0.0892 0.8832 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105467 1 0.6235 0.0211 0.564 0.000 0.436
#> SRR2105468 1 0.3482 0.8109 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105465 1 0.0237 0.8828 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105466 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105463 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105464 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105461 2 0.0592 0.8612 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105462 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105460 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105457 1 0.2448 0.8667 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105458 1 0.5058 0.6925 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105455 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105453 3 0.6280 0.3572 0.460 0.000 0.540
#> SRR2105454 3 0.6111 0.5093 0.396 0.000 0.604
#> SRR2105451 2 0.6295 0.2892 0.000 0.528 0.472
#> SRR2105452 3 0.3784 0.5191 0.004 0.132 0.864
#> SRR2105449 1 0.1031 0.8820 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105450 1 0.0237 0.8841 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105447 2 0.3116 0.8170 0.000 0.892 0.108
#> SRR2105448 2 0.1529 0.8544 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105445 3 0.7642 0.5084 0.092 0.248 0.660
#> SRR2105446 3 0.6255 0.6187 0.204 0.048 0.748
#> SRR2105443 3 0.6309 -0.2326 0.000 0.500 0.500
#> SRR2105444 2 0.6489 0.3328 0.004 0.540 0.456
#> SRR2105441 2 0.3412 0.7937 0.000 0.876 0.124
#> SRR2105442 2 0.1289 0.8559 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105437 3 0.5905 0.5547 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105438 3 0.5905 0.5547 0.352 0.000 0.648
#> SRR2105435 1 0.2796 0.8436 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105436 1 0.2066 0.8712 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105433 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105434 1 0.0424 0.8811 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105431 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.6809 0.2678 0.012 0.524 0.464
#> SRR2105430 2 0.6814 0.4831 0.020 0.608 0.372
#> SRR2105427 2 0.5138 0.6812 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105428 2 0.5948 0.5311 0.000 0.640 0.360
#> SRR2105425 2 0.2537 0.8382 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105426 2 0.2261 0.8440 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105421 1 0.5733 0.5263 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105422 1 0.4702 0.7335 0.788 0.000 0.212
#> SRR2105423 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105419 1 0.2796 0.8556 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105420 1 0.3752 0.8138 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105415 1 0.3267 0.8367 0.884 0.000 0.116
#> SRR2105416 1 0.1031 0.8791 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105417 1 0.0237 0.8845 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105418 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.3816 0.7865 0.000 0.852 0.148
#> SRR2105414 2 0.1964 0.8476 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105409 2 0.1643 0.8497 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105410 2 0.5254 0.6472 0.000 0.736 0.264
#> SRR2105411 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.0424 0.8624 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105407 3 0.6079 0.5009 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105408 3 0.5948 0.5461 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105403 3 0.6126 0.4898 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105404 3 0.6026 0.5334 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105405 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.6260 0.3533 0.000 0.552 0.448
#> SRR2105402 3 0.3784 0.5191 0.004 0.132 0.864
#> SRR2105399 3 0.5948 0.2366 0.000 0.360 0.640
#> SRR2105400 3 0.6386 0.1089 0.004 0.412 0.584
#> SRR2105397 3 0.6975 0.2736 0.028 0.356 0.616
#> SRR2105398 3 0.6814 0.2200 0.020 0.372 0.608
#> SRR2105395 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105389 1 0.5058 0.6904 0.756 0.000 0.244
#> SRR2105390 1 0.4796 0.7267 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105391 1 0.4062 0.7997 0.836 0.000 0.164
#> SRR2105392 1 0.4796 0.7306 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105385 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0237 0.8841 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105387 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105381 3 0.6309 -0.1787 0.000 0.496 0.504
#> SRR2105382 2 0.4062 0.7711 0.000 0.836 0.164
#> SRR2105383 2 0.9239 0.0670 0.172 0.500 0.328
#> SRR2105384 2 0.9339 0.0561 0.188 0.496 0.316
#> SRR2105379 2 0.1643 0.8524 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105380 2 0.2384 0.8469 0.008 0.936 0.056
#> SRR2105377 2 0.5948 0.5225 0.000 0.640 0.360
#> SRR2105378 2 0.5948 0.5242 0.000 0.640 0.360
#> SRR2105375 1 0.5115 0.6960 0.768 0.004 0.228
#> SRR2105376 1 0.3619 0.8199 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105373 3 0.6305 0.2471 0.484 0.000 0.516
#> SRR2105374 3 0.6079 0.5037 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105371 1 0.3038 0.8415 0.896 0.000 0.104
#> SRR2105372 1 0.1031 0.8827 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105369 1 0.0592 0.8824 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105370 1 0.0592 0.8824 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105367 1 0.5882 0.4071 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105368 1 0.6641 -0.0205 0.544 0.008 0.448
#> SRR2105365 2 0.1753 0.8495 0.000 0.952 0.048
#> SRR2105366 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105363 2 0.1163 0.8591 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105364 2 0.0592 0.8622 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105361 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.3192 0.8412 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105360 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0237 0.8845 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105356 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.4346 0.7689 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105354 1 0.0592 0.8844 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105351 2 0.0424 0.8629 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105352 3 0.3784 0.5191 0.004 0.132 0.864
#> SRR2105349 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105350 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105345 2 0.3784 0.7949 0.004 0.864 0.132
#> SRR2105346 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105347 3 0.8515 0.0691 0.092 0.432 0.476
#> SRR2105348 3 0.9405 0.4385 0.204 0.300 0.496
#> SRR2105343 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 1 0.2959 0.8511 0.900 0.000 0.100
#> SRR2105342 1 0.1031 0.8827 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105339 1 0.4121 0.7879 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105340 1 0.2537 0.8616 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105335 1 0.4121 0.7824 0.832 0.000 0.168
#> SRR2105336 1 0.2625 0.8393 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105337 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105332 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105333 2 0.1411 0.8555 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105334 2 0.0592 0.8620 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105329 3 0.6416 0.2091 0.008 0.376 0.616
#> SRR2105330 3 0.6140 0.1123 0.000 0.404 0.596
#> SRR2105327 2 0.1411 0.8563 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105328 2 0.2096 0.8491 0.004 0.944 0.052
#> SRR2105325 1 0.4842 0.7161 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105326 1 0.4842 0.7161 0.776 0.000 0.224
#> SRR2105323 1 0.5733 0.4800 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105324 1 0.1753 0.8769 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105319 1 0.2448 0.8634 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105320 1 0.0237 0.8845 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105321 1 0.3619 0.8175 0.864 0.000 0.136
#> SRR2105322 1 0.3116 0.8419 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105317 2 0.1163 0.8587 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105318 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105315 3 0.8014 0.4882 0.104 0.268 0.628
#> SRR2105316 2 0.5098 0.6786 0.000 0.752 0.248
#> SRR2105313 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105314 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105311 1 0.6587 0.1358 0.568 0.008 0.424
#> SRR2105312 1 0.6169 0.3990 0.636 0.004 0.360
#> SRR2105307 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105309 1 0.2537 0.8642 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105310 1 0.2356 0.8683 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105305 1 0.2796 0.8583 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105306 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 3 0.4733 0.4331 0.004 0.196 0.800
#> SRR2105301 2 0.2261 0.8421 0.000 0.932 0.068
#> SRR2105302 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 3 0.7266 0.5170 0.080 0.232 0.688
#> SRR2105300 3 0.6750 0.3120 0.024 0.336 0.640
#> SRR2105297 1 0.9773 -0.3162 0.420 0.240 0.340
#> SRR2105298 1 0.9356 -0.2421 0.460 0.172 0.368
#> SRR2105295 2 0.1163 0.8585 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105296 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105293 1 0.4346 0.7676 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105294 1 0.3686 0.8155 0.860 0.000 0.140
#> SRR2105291 1 0.4915 0.7588 0.804 0.012 0.184
#> SRR2105292 1 0.2796 0.8550 0.908 0.000 0.092
#> SRR2105289 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0424 0.8844 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105288 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105285 2 0.2165 0.8439 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105286 2 0.2165 0.8433 0.000 0.936 0.064
#> SRR2105283 2 0.6495 0.3120 0.004 0.536 0.460
#> SRR2105284 2 0.6410 0.4096 0.004 0.576 0.420
#> SRR2105281 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105259 3 0.6079 0.4974 0.388 0.000 0.612
#> SRR2105260 3 0.6126 0.4734 0.400 0.000 0.600
#> SRR2105279 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105257 1 0.0424 0.8847 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105258 1 0.0237 0.8844 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105253 2 0.0747 0.8611 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105254 2 0.0237 0.8629 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105255 1 0.0892 0.8815 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105256 1 0.0592 0.8824 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105251 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105249 2 0.6675 0.4195 0.012 0.584 0.404
#> SRR2105250 2 0.6647 0.3143 0.008 0.540 0.452
#> SRR2105247 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105245 1 0.3983 0.8184 0.852 0.004 0.144
#> SRR2105246 1 0.4861 0.7730 0.808 0.012 0.180
#> SRR2105243 1 0.0592 0.8835 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105244 1 0.0892 0.8828 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105241 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0592 0.8835 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105240 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105237 2 0.6274 0.3385 0.000 0.544 0.456
#> SRR2105238 2 0.6079 0.4819 0.000 0.612 0.388
#> SRR2105235 2 0.5216 0.6609 0.000 0.740 0.260
#> SRR2105236 2 0.5058 0.6752 0.000 0.756 0.244
#> SRR2105233 2 0.1964 0.8476 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105234 2 0.1411 0.8560 0.000 0.964 0.036
#> SRR2105231 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.4409 0.7807 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105228 1 0.3752 0.8097 0.856 0.000 0.144
#> SRR2105225 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105229 3 0.6299 0.2507 0.476 0.000 0.524
#> SRR2105230 1 0.4555 0.7550 0.800 0.000 0.200
#> SRR2105219 2 0.0747 0.8619 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105220 2 0.1529 0.8541 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105221 2 0.6460 0.3706 0.004 0.556 0.440
#> SRR2105222 2 0.6451 0.3762 0.004 0.560 0.436
#> SRR2105223 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105213 1 0.4796 0.7261 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105214 1 0.4465 0.7777 0.820 0.004 0.176
#> SRR2105211 1 0.3192 0.8458 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105212 1 0.2066 0.8741 0.940 0.000 0.060
#> SRR2105209 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.1411 0.8812 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105208 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105205 2 0.0747 0.8610 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105206 2 0.1860 0.8503 0.000 0.948 0.052
#> SRR2105201 2 0.6126 0.4633 0.000 0.600 0.400
#> SRR2105202 2 0.6225 0.3983 0.000 0.568 0.432
#> SRR2105203 2 0.0592 0.8610 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105204 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105197 3 0.5948 0.5459 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105198 3 0.5810 0.5662 0.336 0.000 0.664
#> SRR2105195 1 0.2165 0.8705 0.936 0.000 0.064
#> SRR2105196 1 0.4409 0.7789 0.824 0.004 0.172
#> SRR2105193 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.0237 0.8828 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105191 3 0.5948 0.5476 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105192 3 0.6026 0.5334 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105189 2 0.5138 0.6809 0.000 0.748 0.252
#> SRR2105190 2 0.1643 0.8530 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105187 2 0.6298 0.4782 0.004 0.608 0.388
#> SRR2105188 2 0.6769 0.4384 0.016 0.592 0.392
#> SRR2105179 1 0.1753 0.8753 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105180 1 0.5678 0.4828 0.684 0.000 0.316
#> SRR2105183 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.2651 0.8396 0.012 0.928 0.060
#> SRR2105186 2 0.0892 0.8565 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105181 3 0.5968 0.5404 0.364 0.000 0.636
#> SRR2105182 1 0.5810 0.4825 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105177 1 0.0424 0.8810 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105178 1 0.0592 0.8790 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105171 2 0.0237 0.8629 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105172 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.1289 0.8804 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105176 1 0.0237 0.8828 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.0237 0.8616 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105167 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105165 1 0.1860 0.8756 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105166 1 0.2448 0.8649 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105163 1 0.5138 0.6816 0.748 0.000 0.252
#> SRR2105164 1 0.4931 0.7108 0.768 0.000 0.232
#> SRR2105161 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105156 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0424 0.8624 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105158 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105159 1 0.0424 0.8845 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105160 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.8037 0.5442 0.352 0.076 0.572
#> SRR2105150 1 0.5905 0.4342 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105147 3 0.5811 0.6006 0.092 0.108 0.800
#> SRR2105148 3 0.5815 0.6040 0.096 0.104 0.800
#> SRR2105143 1 0.1267 0.8799 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105144 1 0.0237 0.8828 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105145 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105146 1 0.0000 0.8840 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0237 0.8627 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105142 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.6309 0.2119 0.000 0.500 0.500
#> SRR2105138 2 0.7793 0.2624 0.052 0.524 0.424
#> SRR2105135 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.8630 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.5810 0.5664 0.336 0.000 0.664
#> SRR2105134 3 0.5948 0.5472 0.360 0.000 0.640
#> SRR2105131 3 0.7422 0.3171 0.048 0.344 0.608
#> SRR2105132 3 0.6045 0.5143 0.380 0.000 0.620
#> SRR2105129 1 0.0592 0.8790 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105130 1 0.0892 0.8739 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105127 1 0.5760 0.3699 0.672 0.000 0.328
#> SRR2105128 1 0.6140 0.1104 0.596 0.000 0.404
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.2281 0.7163 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR2105278 3 0.2281 0.7163 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR2105275 1 0.5191 0.6480 0.684 0.004 0.292 0.020
#> SRR2105276 1 0.3992 0.7926 0.800 0.004 0.188 0.008
#> SRR2105273 1 0.0921 0.8479 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105274 1 0.0921 0.8479 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105271 1 0.1388 0.8573 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR2105272 1 0.1151 0.8456 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105269 2 0.4499 0.7689 0.000 0.804 0.124 0.072
#> SRR2105270 2 0.5470 0.7044 0.000 0.732 0.168 0.100
#> SRR2105267 2 0.1256 0.8633 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR2105268 2 0.1256 0.8604 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR2105265 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105266 2 0.1356 0.8580 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105263 2 0.3216 0.8338 0.000 0.880 0.076 0.044
#> SRR2105264 2 0.1520 0.8567 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR2105261 1 0.8447 0.1194 0.500 0.160 0.276 0.064
#> SRR2105262 1 0.6019 0.6651 0.684 0.028 0.248 0.040
#> SRR2105357 3 0.2401 0.7102 0.092 0.004 0.904 0.000
#> SRR2105358 3 0.2216 0.7123 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR2105439 2 0.6281 0.6317 0.000 0.656 0.216 0.128
#> SRR2105440 2 0.6281 0.6319 0.000 0.656 0.216 0.128
#> SRR2105509 2 0.2844 0.8342 0.000 0.900 0.048 0.052
#> SRR2105510 2 0.1807 0.8508 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR2105507 1 0.1004 0.8507 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105508 1 0.0817 0.8483 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105505 1 0.2480 0.8212 0.904 0.000 0.088 0.008
#> SRR2105506 1 0.2142 0.8379 0.928 0.000 0.056 0.016
#> SRR2105503 2 0.1305 0.8578 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105504 4 0.3745 0.9161 0.000 0.060 0.088 0.852
#> SRR2105501 2 0.3614 0.8200 0.012 0.872 0.068 0.048
#> SRR2105502 4 0.3745 0.9161 0.000 0.060 0.088 0.852
#> SRR2105499 1 0.3172 0.8221 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR2105500 1 0.2714 0.8422 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR2105497 2 0.1798 0.8539 0.000 0.944 0.016 0.040
#> SRR2105498 2 0.1913 0.8573 0.000 0.940 0.020 0.040
#> SRR2105495 2 0.6112 0.6553 0.000 0.676 0.196 0.128
#> SRR2105496 2 0.6063 0.6585 0.000 0.680 0.196 0.124
#> SRR2105493 2 0.6457 0.6287 0.004 0.652 0.216 0.128
#> SRR2105494 2 0.6281 0.6317 0.000 0.656 0.216 0.128
#> SRR2105491 2 0.0524 0.8605 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105492 2 0.1007 0.8611 0.008 0.976 0.008 0.008
#> SRR2105489 2 0.1488 0.8554 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105490 2 0.1629 0.8585 0.000 0.952 0.024 0.024
#> SRR2105487 3 0.2530 0.7179 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR2105488 3 0.2401 0.7096 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR2105485 1 0.3528 0.7970 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105486 1 0.3907 0.7576 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105483 1 0.2224 0.8348 0.928 0.000 0.032 0.040
#> SRR2105484 1 0.2319 0.8337 0.924 0.000 0.036 0.040
#> SRR2105481 1 0.3402 0.8131 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR2105482 1 0.0672 0.8524 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105479 1 0.3591 0.8066 0.824 0.000 0.168 0.008
#> SRR2105480 1 0.3306 0.8157 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105477 2 0.6252 0.6571 0.004 0.676 0.192 0.128
#> SRR2105478 2 0.6358 0.6437 0.004 0.664 0.204 0.128
#> SRR2105475 2 0.2773 0.8361 0.000 0.900 0.028 0.072
#> SRR2105476 2 0.1398 0.8551 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105473 2 0.6549 0.6126 0.004 0.640 0.228 0.128
#> SRR2105474 2 0.6425 0.6337 0.004 0.656 0.212 0.128
#> SRR2105471 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105472 2 0.1388 0.8582 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR2105469 1 0.1474 0.8546 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR2105470 1 0.2081 0.8484 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR2105467 3 0.4594 0.6231 0.280 0.000 0.712 0.008
#> SRR2105468 1 0.5277 0.5540 0.668 0.000 0.304 0.028
#> SRR2105465 1 0.1151 0.8567 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105466 1 0.1284 0.8553 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105463 1 0.1284 0.8489 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR2105464 1 0.1356 0.8509 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105461 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105462 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105459 2 0.0469 0.8608 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105460 2 0.0376 0.8600 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105457 1 0.4103 0.7416 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR2105458 1 0.4522 0.6465 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR2105455 1 0.0895 0.8476 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105456 1 0.0921 0.8479 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105453 3 0.4675 0.6215 0.244 0.000 0.736 0.020
#> SRR2105454 3 0.4365 0.6585 0.188 0.000 0.784 0.028
#> SRR2105451 2 0.6049 0.6611 0.000 0.680 0.200 0.120
#> SRR2105452 4 0.3667 0.9159 0.000 0.056 0.088 0.856
#> SRR2105449 1 0.2773 0.8367 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR2105450 1 0.0817 0.8553 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105447 2 0.1732 0.8557 0.004 0.948 0.008 0.040
#> SRR2105448 2 0.1635 0.8549 0.000 0.948 0.008 0.044
#> SRR2105445 3 0.7427 -0.0165 0.028 0.348 0.528 0.096
#> SRR2105446 3 0.4180 0.5911 0.080 0.044 0.848 0.028
#> SRR2105443 2 0.6176 0.6619 0.004 0.680 0.200 0.116
#> SRR2105444 2 0.6310 0.6479 0.004 0.668 0.204 0.124
#> SRR2105441 2 0.4374 0.7781 0.000 0.812 0.120 0.068
#> SRR2105442 2 0.2759 0.8392 0.000 0.904 0.044 0.052
#> SRR2105437 3 0.2469 0.7213 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105438 3 0.2469 0.7213 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105435 1 0.4088 0.7670 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR2105436 1 0.3610 0.7978 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR2105433 1 0.1059 0.8497 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105434 1 0.1520 0.8439 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR2105431 1 0.1520 0.8468 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR2105432 1 0.1706 0.8478 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105429 2 0.4336 0.7874 0.008 0.828 0.100 0.064
#> SRR2105430 2 0.4058 0.8038 0.020 0.852 0.080 0.048
#> SRR2105427 2 0.4773 0.7568 0.000 0.788 0.120 0.092
#> SRR2105428 2 0.5952 0.6716 0.000 0.692 0.184 0.124
#> SRR2105425 2 0.1452 0.8573 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR2105426 2 0.1811 0.8558 0.004 0.948 0.020 0.028
#> SRR2105421 1 0.6174 0.6158 0.656 0.020 0.276 0.048
#> SRR2105422 1 0.4779 0.7594 0.756 0.004 0.212 0.028
#> SRR2105423 2 0.1356 0.8580 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105424 2 0.1356 0.8566 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105419 1 0.3907 0.7669 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR2105420 1 0.4228 0.7612 0.760 0.000 0.232 0.008
#> SRR2105415 1 0.3933 0.7906 0.792 0.000 0.200 0.008
#> SRR2105416 1 0.2271 0.8289 0.916 0.000 0.076 0.008
#> SRR2105417 1 0.1174 0.8464 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR2105418 1 0.1284 0.8446 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105413 2 0.1406 0.8585 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR2105414 2 0.1209 0.8575 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105409 2 0.2111 0.8476 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR2105410 2 0.5665 0.6894 0.000 0.716 0.176 0.108
#> SRR2105411 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105412 2 0.0804 0.8620 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR2105407 3 0.3583 0.6924 0.180 0.000 0.816 0.004
#> SRR2105408 3 0.2466 0.7152 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR2105403 3 0.2973 0.7047 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR2105404 3 0.3105 0.6975 0.140 0.000 0.856 0.004
#> SRR2105405 1 0.0895 0.8476 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105406 1 0.0895 0.8476 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105401 2 0.5002 0.7614 0.012 0.788 0.128 0.072
#> SRR2105402 4 0.3667 0.9159 0.000 0.056 0.088 0.856
#> SRR2105399 2 0.6242 0.5975 0.004 0.680 0.176 0.140
#> SRR2105400 2 0.5510 0.6930 0.004 0.744 0.132 0.120
#> SRR2105397 2 0.6801 0.6028 0.016 0.636 0.232 0.116
#> SRR2105398 2 0.6766 0.6138 0.024 0.648 0.228 0.100
#> SRR2105395 2 0.1356 0.8580 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105396 2 0.1488 0.8573 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105393 2 0.1151 0.8597 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR2105394 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105389 1 0.4836 0.6344 0.672 0.000 0.320 0.008
#> SRR2105390 1 0.4673 0.6862 0.700 0.000 0.292 0.008
#> SRR2105391 1 0.4252 0.7431 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR2105392 1 0.4483 0.7020 0.712 0.000 0.284 0.004
#> SRR2105385 1 0.0592 0.8504 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105386 1 0.0937 0.8545 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105387 1 0.0672 0.8521 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105388 1 0.0927 0.8508 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105381 2 0.4635 0.7539 0.000 0.796 0.080 0.124
#> SRR2105382 2 0.2111 0.8506 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR2105383 2 0.7360 0.4442 0.172 0.640 0.128 0.060
#> SRR2105384 2 0.7645 0.3957 0.184 0.612 0.144 0.060
#> SRR2105379 2 0.0895 0.8592 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR2105380 2 0.2099 0.8503 0.012 0.936 0.008 0.044
#> SRR2105377 2 0.6147 0.6491 0.000 0.672 0.200 0.128
#> SRR2105378 2 0.6215 0.6394 0.000 0.664 0.208 0.128
#> SRR2105375 1 0.5782 0.6634 0.704 0.068 0.220 0.008
#> SRR2105376 1 0.3961 0.8167 0.812 0.008 0.172 0.008
#> SRR2105373 3 0.4837 0.5004 0.348 0.000 0.648 0.004
#> SRR2105374 3 0.3636 0.6950 0.172 0.000 0.820 0.008
#> SRR2105371 1 0.2882 0.8502 0.892 0.000 0.084 0.024
#> SRR2105372 1 0.1406 0.8545 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR2105369 1 0.1174 0.8559 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105370 1 0.1798 0.8500 0.944 0.000 0.040 0.016
#> SRR2105367 1 0.5299 0.4482 0.600 0.004 0.388 0.008
#> SRR2105368 3 0.6837 0.1433 0.444 0.060 0.480 0.016
#> SRR2105365 2 0.0937 0.8625 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR2105366 2 0.1022 0.8587 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105363 2 0.1284 0.8591 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR2105364 2 0.0336 0.8615 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR2105361 2 0.1209 0.8584 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105362 2 0.1022 0.8575 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105359 1 0.3494 0.8083 0.824 0.000 0.172 0.004
#> SRR2105360 1 0.0657 0.8528 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105355 1 0.1151 0.8524 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105356 1 0.0921 0.8479 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105353 1 0.3751 0.7935 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR2105354 1 0.2198 0.8535 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR2105351 2 0.1151 0.8627 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR2105352 4 0.3667 0.9159 0.000 0.056 0.088 0.856
#> SRR2105349 2 0.0672 0.8606 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR2105350 2 0.0895 0.8609 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105345 2 0.3160 0.8390 0.008 0.892 0.040 0.060
#> SRR2105346 2 0.1174 0.8614 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR2105347 2 0.7962 0.3880 0.144 0.576 0.216 0.064
#> SRR2105348 2 0.8637 0.1785 0.196 0.496 0.236 0.072
#> SRR2105343 2 0.1584 0.8585 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR2105344 2 0.1109 0.8588 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105341 1 0.3306 0.8204 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105342 1 0.2466 0.8451 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR2105339 1 0.3583 0.8007 0.816 0.000 0.180 0.004
#> SRR2105340 1 0.3402 0.8101 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR2105335 1 0.4741 0.6792 0.744 0.000 0.228 0.028
#> SRR2105336 1 0.4100 0.7476 0.824 0.000 0.128 0.048
#> SRR2105337 1 0.0657 0.8530 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105338 1 0.0376 0.8525 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105331 2 0.0524 0.8609 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105332 2 0.1151 0.8618 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR2105333 2 0.0524 0.8601 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105334 2 0.0524 0.8598 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105329 2 0.8046 0.2911 0.060 0.492 0.348 0.100
#> SRR2105330 2 0.6573 0.5641 0.004 0.616 0.276 0.104
#> SRR2105327 2 0.1109 0.8584 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR2105328 2 0.1209 0.8585 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105325 1 0.4364 0.7642 0.764 0.000 0.220 0.016
#> SRR2105326 1 0.4220 0.7429 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR2105323 1 0.4994 0.1702 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR2105324 1 0.2589 0.8422 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105319 1 0.3812 0.8097 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR2105320 1 0.2385 0.8376 0.920 0.000 0.052 0.028
#> SRR2105321 1 0.3862 0.8255 0.824 0.000 0.152 0.024
#> SRR2105322 1 0.3707 0.8340 0.840 0.000 0.132 0.028
#> SRR2105317 2 0.0927 0.8620 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR2105318 2 0.0657 0.8611 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105315 2 0.8630 -0.0790 0.180 0.404 0.364 0.052
#> SRR2105316 2 0.2111 0.8477 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR2105313 2 0.0524 0.8603 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105314 2 0.0524 0.8612 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR2105311 1 0.6971 0.5431 0.620 0.016 0.236 0.128
#> SRR2105312 1 0.6400 0.6511 0.672 0.012 0.208 0.108
#> SRR2105307 1 0.1004 0.8470 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105308 1 0.1284 0.8446 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105309 1 0.3837 0.7773 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR2105310 1 0.3837 0.7774 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR2105305 1 0.3668 0.8019 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR2105306 1 0.0895 0.8562 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105303 2 0.0921 0.8588 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105304 4 0.5096 0.7821 0.000 0.156 0.084 0.760
#> SRR2105301 2 0.1489 0.8552 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR2105302 2 0.0672 0.8609 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR2105299 3 0.7275 0.0357 0.032 0.300 0.576 0.092
#> SRR2105300 3 0.7279 -0.1587 0.012 0.420 0.464 0.104
#> SRR2105297 2 0.9068 0.0230 0.260 0.448 0.192 0.100
#> SRR2105298 2 0.9207 -0.1330 0.308 0.400 0.192 0.100
#> SRR2105295 2 0.0657 0.8604 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105296 2 0.0524 0.8598 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR2105293 1 0.3992 0.7934 0.800 0.004 0.188 0.008
#> SRR2105294 1 0.3257 0.8178 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR2105291 1 0.5172 0.7395 0.740 0.032 0.216 0.012
#> SRR2105292 1 0.3479 0.8335 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR2105289 1 0.1576 0.8560 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR2105290 1 0.0895 0.8476 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105287 1 0.1356 0.8556 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105288 1 0.1256 0.8535 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105285 2 0.0927 0.8599 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR2105286 2 0.1209 0.8580 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105283 2 0.6488 0.6236 0.004 0.648 0.220 0.128
#> SRR2105284 2 0.6425 0.6337 0.004 0.656 0.212 0.128
#> SRR2105281 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105282 2 0.0376 0.8613 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR2105259 3 0.3831 0.6726 0.204 0.000 0.792 0.004
#> SRR2105260 3 0.4560 0.5880 0.296 0.000 0.700 0.004
#> SRR2105279 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105280 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105257 1 0.2214 0.8387 0.928 0.000 0.044 0.028
#> SRR2105258 1 0.1936 0.8474 0.940 0.000 0.032 0.028
#> SRR2105253 2 0.1388 0.8577 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR2105254 2 0.0804 0.8622 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR2105255 1 0.2796 0.8375 0.892 0.000 0.092 0.016
#> SRR2105256 1 0.1706 0.8510 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105251 2 0.0921 0.8597 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR2105252 2 0.1109 0.8599 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR2105249 2 0.6088 0.6669 0.004 0.688 0.196 0.112
#> SRR2105250 2 0.6696 0.5721 0.004 0.616 0.256 0.124
#> SRR2105247 2 0.1022 0.8575 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105248 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105245 1 0.4342 0.7859 0.784 0.012 0.196 0.008
#> SRR2105246 1 0.5220 0.7579 0.756 0.036 0.188 0.020
#> SRR2105243 1 0.1209 0.8563 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR2105244 1 0.1792 0.8513 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.8514 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0927 0.8485 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105239 1 0.1978 0.8532 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR2105240 1 0.1297 0.8491 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR2105237 2 0.6013 0.6674 0.000 0.684 0.196 0.120
#> SRR2105238 2 0.6392 0.6389 0.004 0.660 0.208 0.128
#> SRR2105235 2 0.5551 0.7045 0.000 0.728 0.160 0.112
#> SRR2105236 2 0.5582 0.7003 0.000 0.724 0.168 0.108
#> SRR2105233 2 0.1004 0.8590 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR2105234 2 0.0895 0.8591 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR2105231 2 0.1118 0.8574 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105232 2 0.1488 0.8575 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105227 1 0.4020 0.8090 0.820 0.008 0.156 0.016
#> SRR2105228 1 0.3217 0.8294 0.860 0.000 0.128 0.012
#> SRR2105225 1 0.0707 0.8492 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105226 1 0.1004 0.8473 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105229 1 0.5898 0.2277 0.524 0.012 0.448 0.016
#> SRR2105230 1 0.3975 0.7573 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR2105219 2 0.2919 0.8348 0.000 0.896 0.060 0.044
#> SRR2105220 2 0.1256 0.8588 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR2105221 2 0.6488 0.6235 0.004 0.648 0.220 0.128
#> SRR2105222 2 0.6457 0.6287 0.004 0.652 0.216 0.128
#> SRR2105223 1 0.0895 0.8518 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105224 1 0.0817 0.8483 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105217 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105218 2 0.1256 0.8585 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR2105215 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105216 2 0.1356 0.8575 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105213 1 0.4877 0.7716 0.768 0.020 0.192 0.020
#> SRR2105214 1 0.4619 0.7826 0.780 0.016 0.188 0.016
#> SRR2105211 1 0.4155 0.7556 0.756 0.000 0.240 0.004
#> SRR2105212 1 0.3982 0.7815 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR2105209 1 0.1489 0.8559 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR2105210 1 0.0000 0.8514 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.2053 0.8548 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR2105208 1 0.1356 0.8509 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105205 2 0.1109 0.8593 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR2105206 2 0.1356 0.8565 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR2105201 2 0.6248 0.6365 0.000 0.660 0.212 0.128
#> SRR2105202 2 0.6248 0.6365 0.000 0.660 0.212 0.128
#> SRR2105203 2 0.1022 0.8575 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105204 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105199 2 0.1004 0.8605 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR2105200 2 0.0927 0.8629 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR2105197 3 0.2647 0.7221 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR2105198 3 0.2586 0.7096 0.092 0.004 0.900 0.004
#> SRR2105195 1 0.3498 0.8138 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR2105196 1 0.4740 0.7754 0.776 0.032 0.184 0.008
#> SRR2105193 1 0.1284 0.8446 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105194 1 0.1305 0.8460 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105191 3 0.2345 0.7150 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR2105192 3 0.3718 0.6818 0.168 0.000 0.820 0.012
#> SRR2105189 2 0.2300 0.8457 0.000 0.924 0.028 0.048
#> SRR2105190 2 0.1284 0.8584 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR2105187 2 0.6460 0.6442 0.008 0.664 0.200 0.128
#> SRR2105188 2 0.6649 0.6284 0.012 0.652 0.208 0.128
#> SRR2105179 1 0.3088 0.8393 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR2105180 1 0.5372 0.2648 0.544 0.000 0.444 0.012
#> SRR2105183 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105184 2 0.1256 0.8582 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR2105185 2 0.1639 0.8572 0.004 0.952 0.008 0.036
#> SRR2105186 2 0.0779 0.8613 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR2105181 3 0.2999 0.7165 0.132 0.000 0.864 0.004
#> SRR2105182 3 0.4998 -0.0685 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR2105177 1 0.1510 0.8454 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105178 1 0.1929 0.8405 0.940 0.000 0.024 0.036
#> SRR2105171 2 0.1388 0.8619 0.000 0.960 0.028 0.012
#> SRR2105172 2 0.1488 0.8613 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105175 1 0.2660 0.8533 0.908 0.008 0.072 0.012
#> SRR2105176 1 0.1174 0.8491 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR2105173 2 0.0817 0.8606 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR2105174 2 0.1305 0.8573 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105169 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105170 2 0.0937 0.8615 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR2105167 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105168 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105165 1 0.3161 0.8350 0.864 0.000 0.124 0.012
#> SRR2105166 1 0.3306 0.8219 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR2105163 1 0.5207 0.7306 0.732 0.008 0.224 0.036
#> SRR2105164 1 0.4666 0.7732 0.768 0.004 0.200 0.028
#> SRR2105161 1 0.0672 0.8528 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105162 1 0.0657 0.8518 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105155 2 0.1820 0.8618 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR2105156 2 0.1452 0.8599 0.000 0.956 0.036 0.008
#> SRR2105157 2 0.1584 0.8586 0.000 0.952 0.036 0.012
#> SRR2105158 2 0.1305 0.8573 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR2105159 1 0.1722 0.8569 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105160 1 0.0927 0.8552 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105153 2 0.1022 0.8587 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105154 2 0.1022 0.8587 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105151 2 0.1488 0.8580 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105152 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105149 3 0.8206 0.2831 0.376 0.164 0.428 0.032
#> SRR2105150 1 0.5363 0.5016 0.612 0.004 0.372 0.012
#> SRR2105147 4 0.6156 0.8149 0.060 0.076 0.128 0.736
#> SRR2105148 4 0.6156 0.8149 0.060 0.076 0.128 0.736
#> SRR2105143 1 0.1635 0.8564 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR2105144 1 0.0672 0.8525 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105145 1 0.1151 0.8453 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105146 1 0.1209 0.8462 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR2105141 2 0.0672 0.8601 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR2105142 2 0.0469 0.8610 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105139 2 0.1209 0.8571 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR2105140 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105137 2 0.6835 0.5469 0.004 0.600 0.264 0.132
#> SRR2105138 2 0.7057 0.5566 0.016 0.604 0.256 0.124
#> SRR2105135 2 0.1488 0.8554 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR2105136 2 0.1356 0.8563 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR2105133 3 0.2546 0.7079 0.092 0.008 0.900 0.000
#> SRR2105134 3 0.2216 0.7123 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR2105131 2 0.7473 0.1921 0.024 0.460 0.420 0.096
#> SRR2105132 3 0.2469 0.7217 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR2105129 1 0.1059 0.8520 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105130 1 0.2021 0.8390 0.936 0.000 0.024 0.040
#> SRR2105127 3 0.5383 0.3113 0.452 0.000 0.536 0.012
#> SRR2105128 3 0.5420 0.5425 0.352 0.000 0.624 0.024
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.1041 0.7570 NA 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR2105278 5 0.0963 0.7604 NA 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105275 3 0.6874 0.5584 NA 0.000 0.484 0.040 0.124
#> SRR2105276 3 0.5747 0.6403 NA 0.000 0.576 0.004 0.092
#> SRR2105273 3 0.1106 0.7204 NA 0.000 0.964 0.000 0.012
#> SRR2105274 3 0.0609 0.7198 NA 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105271 3 0.1648 0.7373 NA 0.000 0.940 0.000 0.020
#> SRR2105272 3 0.1121 0.7110 NA 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.3565 0.7600 NA 0.800 0.000 0.176 0.024
#> SRR2105270 2 0.4455 0.6775 NA 0.704 0.000 0.260 0.036
#> SRR2105267 2 0.1518 0.8326 NA 0.944 0.000 0.048 0.004
#> SRR2105268 2 0.1306 0.8315 NA 0.960 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105265 2 0.1243 0.8278 NA 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105266 2 0.1673 0.8284 NA 0.944 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105263 2 0.2833 0.8079 NA 0.864 0.000 0.120 0.004
#> SRR2105264 2 0.2361 0.8183 NA 0.892 0.000 0.096 0.000
#> SRR2105261 3 0.8970 0.2504 NA 0.188 0.364 0.044 0.136
#> SRR2105262 3 0.7374 0.5469 NA 0.036 0.480 0.024 0.124
#> SRR2105357 5 0.1442 0.7538 NA 0.000 0.032 0.004 0.952
#> SRR2105358 5 0.1168 0.7569 NA 0.000 0.032 0.000 0.960
#> SRR2105439 2 0.5486 0.4818 NA 0.500 0.000 0.444 0.052
#> SRR2105440 2 0.5488 0.4759 NA 0.496 0.000 0.448 0.052
#> SRR2105509 2 0.2444 0.8194 NA 0.904 0.000 0.068 0.016
#> SRR2105510 2 0.2444 0.8191 NA 0.904 0.000 0.068 0.016
#> SRR2105507 3 0.0898 0.7265 NA 0.000 0.972 0.000 0.008
#> SRR2105508 3 0.0510 0.7240 NA 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105505 3 0.4158 0.6734 NA 0.000 0.784 0.000 0.124
#> SRR2105506 3 0.2889 0.6951 NA 0.000 0.872 0.000 0.044
#> SRR2105503 2 0.0566 0.8297 NA 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105504 4 0.5768 0.9280 NA 0.032 0.000 0.544 0.036
#> SRR2105501 2 0.3439 0.7946 NA 0.848 0.000 0.104 0.028
#> SRR2105502 4 0.5768 0.9280 NA 0.032 0.000 0.544 0.036
#> SRR2105499 3 0.5745 0.6696 NA 0.000 0.608 0.008 0.096
#> SRR2105500 3 0.4850 0.7084 NA 0.000 0.700 0.000 0.076
#> SRR2105497 2 0.1623 0.8321 NA 0.948 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105498 2 0.2444 0.8294 NA 0.912 0.000 0.036 0.024
#> SRR2105495 2 0.5148 0.5158 NA 0.528 0.000 0.432 0.040
#> SRR2105496 2 0.4880 0.6056 NA 0.616 0.000 0.348 0.036
#> SRR2105493 2 0.5344 0.4798 NA 0.500 0.000 0.448 0.052
#> SRR2105494 2 0.5344 0.4798 NA 0.500 0.000 0.448 0.052
#> SRR2105491 2 0.1179 0.8289 NA 0.964 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105492 2 0.1498 0.8288 NA 0.952 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105489 2 0.1717 0.8204 NA 0.936 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105490 2 0.1618 0.8250 NA 0.944 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105487 5 0.1205 0.7603 NA 0.000 0.040 0.000 0.956
#> SRR2105488 5 0.0963 0.7604 NA 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105485 3 0.6036 0.6454 NA 0.000 0.576 0.004 0.140
#> SRR2105486 3 0.6313 0.6081 NA 0.000 0.544 0.004 0.180
#> SRR2105483 3 0.3141 0.6306 NA 0.000 0.832 0.000 0.016
#> SRR2105484 3 0.3141 0.6306 NA 0.000 0.832 0.000 0.016
#> SRR2105481 3 0.5365 0.6788 NA 0.000 0.628 0.000 0.088
#> SRR2105482 3 0.1341 0.7318 NA 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105479 3 0.5929 0.6406 NA 0.000 0.568 0.012 0.088
#> SRR2105480 3 0.5475 0.6564 NA 0.000 0.596 0.000 0.084
#> SRR2105477 2 0.5102 0.5714 NA 0.580 0.000 0.376 0.044
#> SRR2105478 2 0.5256 0.5195 NA 0.532 0.000 0.420 0.048
#> SRR2105475 2 0.2778 0.8141 NA 0.892 0.000 0.060 0.016
#> SRR2105476 2 0.2204 0.8223 NA 0.920 0.000 0.048 0.016
#> SRR2105473 2 0.5600 0.4544 NA 0.480 0.000 0.456 0.060
#> SRR2105474 2 0.5486 0.4818 NA 0.500 0.000 0.444 0.052
#> SRR2105471 2 0.1717 0.8204 NA 0.936 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105472 2 0.1717 0.8203 NA 0.936 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105469 3 0.4270 0.7243 NA 0.000 0.748 0.000 0.048
#> SRR2105470 3 0.4138 0.7304 NA 0.000 0.776 0.000 0.064
#> SRR2105467 5 0.3437 0.7153 NA 0.000 0.120 0.000 0.832
#> SRR2105468 3 0.5721 0.0907 NA 0.000 0.492 0.000 0.424
#> SRR2105465 3 0.2286 0.7385 NA 0.000 0.888 0.000 0.004
#> SRR2105466 3 0.2127 0.7290 NA 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR2105463 3 0.2249 0.6904 NA 0.000 0.896 0.000 0.008
#> SRR2105464 3 0.2625 0.7082 NA 0.000 0.876 0.000 0.016
#> SRR2105461 2 0.1731 0.8259 NA 0.940 0.000 0.012 0.008
#> SRR2105462 2 0.1695 0.8235 NA 0.940 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105459 2 0.1200 0.8305 NA 0.964 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105460 2 0.0727 0.8300 NA 0.980 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105457 3 0.6156 0.6232 NA 0.000 0.540 0.004 0.136
#> SRR2105458 3 0.6605 0.5462 NA 0.000 0.472 0.008 0.172
#> SRR2105455 3 0.0963 0.7156 NA 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105456 3 0.1270 0.7090 NA 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR2105453 5 0.2513 0.7283 NA 0.000 0.116 0.000 0.876
#> SRR2105454 5 0.2124 0.7289 NA 0.000 0.096 0.000 0.900
#> SRR2105451 2 0.5345 0.5325 NA 0.540 0.000 0.404 0.056
#> SRR2105452 4 0.5768 0.9280 NA 0.032 0.000 0.544 0.036
#> SRR2105449 3 0.5192 0.6822 NA 0.000 0.644 0.000 0.076
#> SRR2105450 3 0.3151 0.7394 NA 0.000 0.836 0.000 0.020
#> SRR2105447 2 0.1806 0.8268 NA 0.940 0.000 0.028 0.016
#> SRR2105448 2 0.1815 0.8263 NA 0.940 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105445 2 0.7864 0.1110 NA 0.352 0.020 0.328 0.272
#> SRR2105446 5 0.3685 0.6120 NA 0.032 0.016 0.080 0.852
#> SRR2105443 2 0.5601 0.5130 NA 0.528 0.004 0.404 0.064
#> SRR2105444 2 0.5293 0.4670 NA 0.492 0.000 0.460 0.048
#> SRR2105441 2 0.4467 0.7054 NA 0.724 0.000 0.240 0.024
#> SRR2105442 2 0.3150 0.8068 NA 0.864 0.000 0.096 0.024
#> SRR2105437 5 0.1357 0.7624 NA 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR2105438 5 0.1282 0.7632 NA 0.000 0.044 0.000 0.952
#> SRR2105435 3 0.6006 0.6407 NA 0.000 0.564 0.008 0.108
#> SRR2105436 3 0.5937 0.6518 NA 0.000 0.576 0.004 0.120
#> SRR2105433 3 0.1965 0.6837 NA 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR2105434 3 0.2127 0.6770 NA 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR2105431 3 0.2574 0.6873 NA 0.000 0.876 0.000 0.012
#> SRR2105432 3 0.2464 0.7041 NA 0.000 0.888 0.000 0.016
#> SRR2105429 2 0.3385 0.7978 NA 0.856 0.000 0.084 0.044
#> SRR2105430 2 0.3585 0.7987 NA 0.856 0.012 0.076 0.040
#> SRR2105427 2 0.4206 0.6945 NA 0.708 0.000 0.272 0.020
#> SRR2105428 2 0.5000 0.5693 NA 0.576 0.000 0.388 0.036
#> SRR2105425 2 0.1588 0.8289 NA 0.948 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105426 2 0.1664 0.8316 NA 0.948 0.004 0.020 0.008
#> SRR2105421 3 0.7089 0.5656 NA 0.016 0.492 0.028 0.124
#> SRR2105422 3 0.6269 0.6182 NA 0.000 0.548 0.020 0.104
#> SRR2105423 2 0.1059 0.8273 NA 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105424 2 0.1243 0.8264 NA 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105419 3 0.5964 0.6181 NA 0.000 0.536 0.000 0.124
#> SRR2105420 3 0.5939 0.6160 NA 0.000 0.536 0.000 0.120
#> SRR2105415 3 0.5798 0.5583 NA 0.000 0.608 0.000 0.236
#> SRR2105416 3 0.4203 0.6253 NA 0.000 0.780 0.000 0.092
#> SRR2105417 3 0.2068 0.6913 NA 0.000 0.904 0.000 0.004
#> SRR2105418 3 0.2074 0.6792 NA 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR2105413 2 0.1314 0.8293 NA 0.960 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105414 2 0.1974 0.8257 NA 0.932 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105409 2 0.2295 0.8132 NA 0.900 0.000 0.088 0.008
#> SRR2105410 2 0.4594 0.6536 NA 0.680 0.000 0.284 0.036
#> SRR2105411 2 0.1059 0.8293 NA 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105412 2 0.1116 0.8280 NA 0.964 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105407 5 0.4683 0.6526 NA 0.000 0.104 0.004 0.748
#> SRR2105408 5 0.1547 0.7564 NA 0.000 0.032 0.004 0.948
#> SRR2105403 5 0.1502 0.7589 NA 0.000 0.056 0.000 0.940
#> SRR2105404 5 0.1704 0.7383 NA 0.000 0.068 0.000 0.928
#> SRR2105405 3 0.1270 0.7079 NA 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR2105406 3 0.1638 0.7025 NA 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR2105401 2 0.4831 0.7026 NA 0.712 0.004 0.236 0.036
#> SRR2105402 4 0.5768 0.9280 NA 0.032 0.000 0.544 0.036
#> SRR2105399 2 0.5202 0.7133 NA 0.756 0.004 0.076 0.068
#> SRR2105400 2 0.4804 0.7430 NA 0.788 0.008 0.064 0.060
#> SRR2105397 2 0.6115 0.4704 NA 0.496 0.012 0.412 0.076
#> SRR2105398 2 0.6035 0.4960 NA 0.516 0.008 0.392 0.080
#> SRR2105395 2 0.1369 0.8268 NA 0.956 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105396 2 0.1770 0.8225 NA 0.936 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105393 2 0.1026 0.8275 NA 0.968 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105394 2 0.1243 0.8261 NA 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105389 3 0.6497 0.5217 NA 0.000 0.472 0.000 0.208
#> SRR2105390 3 0.6333 0.5710 NA 0.000 0.516 0.000 0.196
#> SRR2105391 3 0.6144 0.5994 NA 0.000 0.520 0.000 0.148
#> SRR2105392 3 0.6576 0.5406 NA 0.000 0.480 0.004 0.196
#> SRR2105385 3 0.0794 0.7292 NA 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105386 3 0.1628 0.7382 NA 0.000 0.936 0.000 0.008
#> SRR2105387 3 0.1282 0.7330 NA 0.000 0.952 0.000 0.004
#> SRR2105388 3 0.1341 0.7311 NA 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.4017 0.7770 NA 0.828 0.000 0.052 0.052
#> SRR2105382 2 0.2087 0.8254 NA 0.928 0.000 0.032 0.020
#> SRR2105383 2 0.6746 0.5941 NA 0.668 0.060 0.072 0.116
#> SRR2105384 2 0.6749 0.5799 NA 0.668 0.064 0.068 0.116
#> SRR2105379 2 0.1306 0.8282 NA 0.960 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105380 2 0.1564 0.8279 NA 0.948 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105377 2 0.5417 0.5014 NA 0.516 0.000 0.432 0.048
#> SRR2105378 2 0.5471 0.5032 NA 0.516 0.000 0.428 0.052
#> SRR2105375 3 0.7058 0.5859 NA 0.024 0.504 0.024 0.112
#> SRR2105376 3 0.6053 0.6444 NA 0.000 0.568 0.004 0.136
#> SRR2105373 5 0.4313 0.6110 NA 0.000 0.228 0.000 0.732
#> SRR2105374 5 0.2573 0.7384 NA 0.000 0.104 0.000 0.880
#> SRR2105371 3 0.2588 0.7321 NA 0.000 0.892 0.000 0.060
#> SRR2105372 3 0.1915 0.7326 NA 0.000 0.928 0.000 0.040
#> SRR2105369 3 0.2484 0.7351 NA 0.000 0.900 0.004 0.028
#> SRR2105370 3 0.2645 0.7255 NA 0.000 0.888 0.000 0.044
#> SRR2105367 3 0.6863 0.4160 NA 0.000 0.448 0.008 0.296
#> SRR2105368 5 0.7928 0.1292 NA 0.012 0.300 0.064 0.424
#> SRR2105365 2 0.1179 0.8336 NA 0.964 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105366 2 0.1186 0.8286 NA 0.964 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105363 2 0.1638 0.8281 NA 0.932 0.000 0.064 0.000
#> SRR2105364 2 0.1267 0.8347 NA 0.960 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105361 2 0.2060 0.8317 NA 0.924 0.000 0.052 0.008
#> SRR2105362 2 0.1405 0.8317 NA 0.956 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105359 3 0.5505 0.6695 NA 0.000 0.620 0.004 0.084
#> SRR2105360 3 0.1740 0.7398 NA 0.000 0.932 0.000 0.012
#> SRR2105355 3 0.0992 0.7272 NA 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR2105356 3 0.0794 0.7175 NA 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105353 3 0.5519 0.6466 NA 0.000 0.584 0.000 0.084
#> SRR2105354 3 0.3669 0.7362 NA 0.000 0.816 0.000 0.056
#> SRR2105351 2 0.1612 0.8307 NA 0.948 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105352 4 0.5768 0.9280 NA 0.032 0.000 0.544 0.036
#> SRR2105349 2 0.0912 0.8287 NA 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105350 2 0.0960 0.8310 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105345 2 0.3491 0.8042 NA 0.844 0.000 0.108 0.028
#> SRR2105346 2 0.1673 0.8298 NA 0.944 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105347 2 0.7056 0.5673 NA 0.620 0.036 0.144 0.144
#> SRR2105348 2 0.8263 0.3781 NA 0.524 0.116 0.124 0.168
#> SRR2105343 2 0.0968 0.8302 NA 0.972 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105344 2 0.1074 0.8322 NA 0.968 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105341 3 0.5373 0.6723 NA 0.000 0.620 0.000 0.084
#> SRR2105342 3 0.4514 0.7204 NA 0.000 0.740 0.000 0.072
#> SRR2105339 3 0.5626 0.6377 NA 0.000 0.572 0.000 0.092
#> SRR2105340 3 0.5626 0.6380 NA 0.000 0.572 0.000 0.092
#> SRR2105335 3 0.4923 0.5276 NA 0.000 0.680 0.000 0.252
#> SRR2105336 3 0.4395 0.5735 NA 0.000 0.748 0.000 0.188
#> SRR2105337 3 0.1341 0.7375 NA 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105338 3 0.1043 0.7319 NA 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0960 0.8298 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105332 2 0.1195 0.8336 NA 0.960 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105333 2 0.1179 0.8281 NA 0.964 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105334 2 0.1012 0.8287 NA 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105329 2 0.7785 0.3971 NA 0.476 0.064 0.320 0.100
#> SRR2105330 2 0.6577 0.4966 NA 0.520 0.012 0.356 0.092
#> SRR2105327 2 0.1989 0.8255 NA 0.932 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105328 2 0.1989 0.8255 NA 0.932 0.000 0.032 0.016
#> SRR2105325 3 0.6237 0.6201 NA 0.000 0.544 0.016 0.108
#> SRR2105326 3 0.6386 0.5984 NA 0.000 0.520 0.016 0.120
#> SRR2105323 5 0.7010 -0.1731 NA 0.000 0.352 0.008 0.368
#> SRR2105324 3 0.4960 0.7073 NA 0.000 0.688 0.000 0.080
#> SRR2105319 3 0.4010 0.6615 NA 0.000 0.784 0.000 0.160
#> SRR2105320 3 0.2491 0.7160 NA 0.000 0.896 0.000 0.036
#> SRR2105321 3 0.4810 0.7027 NA 0.000 0.712 0.000 0.084
#> SRR2105322 3 0.4010 0.7235 NA 0.000 0.792 0.000 0.072
#> SRR2105317 2 0.1278 0.8309 NA 0.960 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105318 2 0.0798 0.8293 NA 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105315 2 0.9136 0.1674 NA 0.412 0.116 0.220 0.128
#> SRR2105316 2 0.2907 0.8072 NA 0.876 0.000 0.092 0.016
#> SRR2105313 2 0.0807 0.8289 NA 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105314 2 0.0912 0.8286 NA 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105311 3 0.7289 0.4893 NA 0.024 0.440 0.032 0.112
#> SRR2105312 3 0.7182 0.5423 NA 0.028 0.476 0.024 0.112
#> SRR2105307 3 0.1792 0.6923 NA 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR2105308 3 0.2020 0.6819 NA 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR2105309 3 0.5864 0.6364 NA 0.000 0.560 0.000 0.120
#> SRR2105310 3 0.6100 0.6322 NA 0.000 0.556 0.004 0.136
#> SRR2105305 3 0.5672 0.6514 NA 0.000 0.584 0.000 0.104
#> SRR2105306 3 0.2233 0.7418 NA 0.000 0.904 0.000 0.016
#> SRR2105303 2 0.0693 0.8290 NA 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105304 4 0.6546 0.8576 NA 0.100 0.000 0.528 0.036
#> SRR2105301 2 0.1904 0.8260 NA 0.936 0.000 0.028 0.016
#> SRR2105302 2 0.0960 0.8297 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105299 2 0.7604 0.1102 NA 0.352 0.012 0.320 0.296
#> SRR2105300 2 0.7291 0.2419 NA 0.396 0.004 0.348 0.232
#> SRR2105297 2 0.8788 0.1931 NA 0.468 0.136 0.084 0.152
#> SRR2105298 2 0.9285 -0.0981 NA 0.368 0.244 0.088 0.140
#> SRR2105295 2 0.1306 0.8282 NA 0.960 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105296 2 0.1179 0.8282 NA 0.964 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105293 3 0.5988 0.6296 NA 0.000 0.560 0.012 0.092
#> SRR2105294 3 0.5496 0.6755 NA 0.000 0.628 0.004 0.088
#> SRR2105291 3 0.6753 0.6006 NA 0.020 0.524 0.008 0.132
#> SRR2105292 3 0.5201 0.6965 NA 0.000 0.684 0.000 0.128
#> SRR2105289 3 0.3388 0.7325 NA 0.000 0.792 0.000 0.008
#> SRR2105290 3 0.0963 0.7140 NA 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105287 3 0.2079 0.7376 NA 0.000 0.916 0.000 0.020
#> SRR2105288 3 0.1981 0.7267 NA 0.000 0.920 0.000 0.016
#> SRR2105285 2 0.1869 0.8267 NA 0.936 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105286 2 0.2053 0.8241 NA 0.928 0.000 0.040 0.016
#> SRR2105283 2 0.5341 0.4859 NA 0.504 0.000 0.444 0.052
#> SRR2105284 2 0.5399 0.4759 NA 0.496 0.000 0.448 0.056
#> SRR2105281 2 0.1243 0.8261 NA 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105282 2 0.1202 0.8285 NA 0.960 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105259 5 0.4921 0.6139 NA 0.000 0.088 0.004 0.716
#> SRR2105260 5 0.6589 0.3659 NA 0.000 0.212 0.008 0.516
#> SRR2105279 2 0.1569 0.8231 NA 0.944 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105280 2 0.1843 0.8220 NA 0.932 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105257 3 0.2344 0.7147 NA 0.000 0.904 0.000 0.032
#> SRR2105258 3 0.2769 0.7034 NA 0.000 0.876 0.000 0.032
#> SRR2105253 2 0.1444 0.8317 NA 0.948 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105254 2 0.1372 0.8332 NA 0.956 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105255 3 0.3759 0.7130 NA 0.000 0.816 0.000 0.092
#> SRR2105256 3 0.2782 0.7268 NA 0.000 0.880 0.000 0.048
#> SRR2105251 2 0.1173 0.8299 NA 0.964 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105252 2 0.0960 0.8291 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105249 2 0.5254 0.5883 NA 0.592 0.008 0.360 0.040
#> SRR2105250 2 0.5624 0.4967 NA 0.512 0.000 0.420 0.064
#> SRR2105247 2 0.0960 0.8276 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105248 2 0.1412 0.8249 NA 0.952 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105245 3 0.6547 0.6155 NA 0.028 0.536 0.008 0.088
#> SRR2105246 3 0.7120 0.5803 NA 0.052 0.504 0.016 0.088
#> SRR2105243 3 0.2966 0.7395 NA 0.000 0.848 0.000 0.016
#> SRR2105244 3 0.4612 0.7080 NA 0.000 0.712 0.000 0.056
#> SRR2105241 3 0.1608 0.7397 NA 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR2105242 3 0.0963 0.7174 NA 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105239 3 0.3970 0.7228 NA 0.000 0.744 0.000 0.020
#> SRR2105240 3 0.2351 0.7068 NA 0.000 0.896 0.000 0.016
#> SRR2105237 2 0.5396 0.5204 NA 0.532 0.000 0.416 0.048
#> SRR2105238 2 0.5329 0.4992 NA 0.516 0.000 0.432 0.052
#> SRR2105235 2 0.4908 0.6007 NA 0.608 0.000 0.356 0.036
#> SRR2105236 2 0.5044 0.5991 NA 0.608 0.000 0.352 0.036
#> SRR2105233 2 0.1974 0.8252 NA 0.932 0.000 0.036 0.016
#> SRR2105234 2 0.1716 0.8272 NA 0.944 0.000 0.024 0.016
#> SRR2105231 2 0.0992 0.8276 NA 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105232 2 0.1412 0.8248 NA 0.952 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105227 3 0.6088 0.6514 NA 0.008 0.588 0.012 0.088
#> SRR2105228 3 0.5592 0.6747 NA 0.000 0.628 0.008 0.088
#> SRR2105225 3 0.0794 0.7252 NA 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105226 3 0.1697 0.7076 NA 0.000 0.932 0.000 0.008
#> SRR2105229 3 0.7486 0.4828 NA 0.008 0.436 0.044 0.168
#> SRR2105230 3 0.5834 0.6231 NA 0.000 0.544 0.000 0.108
#> SRR2105219 2 0.2358 0.8097 NA 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR2105220 2 0.1357 0.8308 NA 0.948 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105221 2 0.5546 0.4657 NA 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR2105222 2 0.5491 0.4700 NA 0.492 0.000 0.452 0.052
#> SRR2105223 3 0.1124 0.7286 NA 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR2105224 3 0.0865 0.7176 NA 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR2105217 2 0.0727 0.8285 NA 0.980 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105218 2 0.1243 0.8269 NA 0.960 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105215 2 0.1538 0.8248 NA 0.948 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105216 2 0.1153 0.8266 NA 0.964 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105213 3 0.6831 0.6003 NA 0.028 0.520 0.020 0.088
#> SRR2105214 3 0.6579 0.6098 NA 0.020 0.532 0.012 0.096
#> SRR2105211 3 0.6204 0.6037 NA 0.000 0.524 0.004 0.136
#> SRR2105212 3 0.5849 0.6625 NA 0.000 0.596 0.004 0.120
#> SRR2105209 3 0.3596 0.7325 NA 0.000 0.784 0.000 0.016
#> SRR2105210 3 0.1965 0.7402 NA 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR2105207 3 0.4489 0.7200 NA 0.000 0.740 0.000 0.068
#> SRR2105208 3 0.2573 0.7214 NA 0.000 0.880 0.000 0.016
#> SRR2105205 2 0.1525 0.8317 NA 0.948 0.000 0.036 0.004
#> SRR2105206 2 0.2204 0.8236 NA 0.920 0.000 0.048 0.016
#> SRR2105201 2 0.5582 0.4993 NA 0.512 0.000 0.428 0.052
#> SRR2105202 2 0.5491 0.4711 NA 0.492 0.000 0.452 0.052
#> SRR2105203 2 0.0960 0.8287 NA 0.972 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105204 2 0.1280 0.8270 NA 0.960 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105199 2 0.1200 0.8320 NA 0.964 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105200 2 0.1990 0.8318 NA 0.928 0.000 0.040 0.004
#> SRR2105197 5 0.1901 0.7642 NA 0.000 0.056 0.004 0.928
#> SRR2105198 5 0.2232 0.7495 NA 0.004 0.036 0.020 0.924
#> SRR2105195 3 0.5508 0.6646 NA 0.000 0.604 0.004 0.076
#> SRR2105196 3 0.6347 0.6302 NA 0.004 0.556 0.020 0.100
#> SRR2105193 3 0.1544 0.7003 NA 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105194 3 0.2439 0.6668 NA 0.000 0.876 0.000 0.004
#> SRR2105191 5 0.1124 0.7610 NA 0.000 0.036 0.000 0.960
#> SRR2105192 5 0.1831 0.7354 NA 0.000 0.076 0.000 0.920
#> SRR2105189 2 0.2957 0.8001 NA 0.860 0.000 0.120 0.008
#> SRR2105190 2 0.1970 0.8245 NA 0.924 0.000 0.060 0.004
#> SRR2105187 2 0.5298 0.5464 NA 0.556 0.004 0.396 0.044
#> SRR2105188 2 0.5483 0.4866 NA 0.504 0.004 0.440 0.052
#> SRR2105179 3 0.5304 0.6806 NA 0.000 0.628 0.000 0.080
#> SRR2105180 5 0.6462 0.0166 NA 0.000 0.356 0.000 0.456
#> SRR2105183 2 0.1695 0.8246 NA 0.940 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105184 2 0.1717 0.8209 NA 0.936 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105185 2 0.1725 0.8283 NA 0.944 0.004 0.004 0.024
#> SRR2105186 2 0.0932 0.8300 NA 0.972 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105181 5 0.2650 0.7541 NA 0.000 0.068 0.004 0.892
#> SRR2105182 5 0.6255 0.3615 NA 0.000 0.252 0.000 0.540
#> SRR2105177 3 0.2818 0.6511 NA 0.000 0.856 0.000 0.012
#> SRR2105178 3 0.3098 0.6333 NA 0.000 0.836 0.000 0.016
#> SRR2105171 2 0.1074 0.8319 NA 0.968 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105172 2 0.1673 0.8324 NA 0.944 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105175 3 0.2866 0.7375 NA 0.000 0.872 0.004 0.024
#> SRR2105176 3 0.2536 0.6882 NA 0.000 0.868 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0771 0.8291 NA 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105174 2 0.1087 0.8279 NA 0.968 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105169 2 0.1618 0.8252 NA 0.944 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105170 2 0.1518 0.8252 NA 0.944 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105167 2 0.1569 0.8228 NA 0.944 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105168 2 0.1412 0.8259 NA 0.952 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105165 3 0.4309 0.7216 NA 0.000 0.768 0.000 0.084
#> SRR2105166 3 0.4836 0.7087 NA 0.000 0.716 0.000 0.096
#> SRR2105163 3 0.6575 0.6063 NA 0.004 0.532 0.024 0.112
#> SRR2105164 3 0.6280 0.6195 NA 0.004 0.548 0.012 0.108
#> SRR2105161 3 0.1768 0.7328 NA 0.000 0.924 0.000 0.004
#> SRR2105162 3 0.1478 0.7073 NA 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR2105155 2 0.1893 0.8323 NA 0.936 0.000 0.028 0.012
#> SRR2105156 2 0.2040 0.8307 NA 0.928 0.000 0.032 0.008
#> SRR2105157 2 0.1498 0.8297 NA 0.952 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105158 2 0.1369 0.8275 NA 0.956 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105159 3 0.3615 0.7356 NA 0.000 0.808 0.000 0.036
#> SRR2105160 3 0.1544 0.7260 NA 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.1153 0.8296 NA 0.964 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105154 2 0.0992 0.8302 NA 0.968 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105151 2 0.2352 0.8296 NA 0.912 0.000 0.048 0.008
#> SRR2105152 2 0.1770 0.8236 NA 0.936 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105149 3 0.9280 0.0506 NA 0.192 0.296 0.044 0.220
#> SRR2105150 3 0.6878 0.5464 NA 0.000 0.476 0.028 0.152
#> SRR2105147 4 0.7468 0.8443 NA 0.076 0.028 0.468 0.068
#> SRR2105148 4 0.7561 0.8309 NA 0.084 0.028 0.456 0.068
#> SRR2105143 3 0.3974 0.7277 NA 0.004 0.752 0.000 0.016
#> SRR2105144 3 0.2583 0.7172 NA 0.000 0.864 0.000 0.004
#> SRR2105145 3 0.1732 0.6942 NA 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR2105146 3 0.1732 0.6946 NA 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0609 0.8296 NA 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105142 2 0.0510 0.8299 NA 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105139 2 0.1538 0.8260 NA 0.948 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105140 2 0.1618 0.8252 NA 0.944 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105137 2 0.6015 0.4515 NA 0.484 0.008 0.420 0.088
#> SRR2105138 2 0.6140 0.4191 NA 0.460 0.004 0.436 0.096
#> SRR2105135 2 0.1788 0.8193 NA 0.932 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105136 2 0.1569 0.8237 NA 0.944 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105133 5 0.1285 0.7599 NA 0.000 0.036 0.004 0.956
#> SRR2105134 5 0.0963 0.7604 NA 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR2105131 2 0.7939 0.3123 NA 0.440 0.048 0.316 0.164
#> SRR2105132 5 0.2012 0.7619 NA 0.000 0.060 0.000 0.920
#> SRR2105129 3 0.2389 0.6794 NA 0.000 0.880 0.000 0.004
#> SRR2105130 3 0.3141 0.6306 NA 0.000 0.832 0.000 0.016
#> SRR2105127 5 0.5156 0.5502 NA 0.000 0.276 0.004 0.656
#> SRR2105128 5 0.4666 0.5887 NA 0.000 0.240 0.000 0.704
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.0935 0.85142 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105278 5 0.1116 0.85346 0.008 0.000 0.028 0.000 0.960 0.004
#> SRR2105275 3 0.0806 0.64138 0.020 0.000 0.972 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105276 3 0.2146 0.63155 0.116 0.000 0.880 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105273 1 0.3360 0.74456 0.732 0.000 0.264 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105274 1 0.3126 0.74922 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.3774 0.59217 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.2941 0.74850 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.3971 0.00579 0.004 0.548 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR2105270 6 0.3636 0.59047 0.000 0.320 0.004 0.000 0.000 0.676
#> SRR2105267 2 0.1327 0.91692 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR2105268 2 0.0922 0.92924 0.004 0.968 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105265 2 0.1078 0.92670 0.016 0.964 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR2105266 2 0.1353 0.92356 0.012 0.952 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105263 2 0.2584 0.81993 0.004 0.848 0.000 0.000 0.004 0.144
#> SRR2105264 2 0.1814 0.89141 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR2105261 3 0.4189 0.45666 0.028 0.176 0.764 0.004 0.008 0.020
#> SRR2105262 3 0.1806 0.64170 0.044 0.020 0.928 0.008 0.000 0.000
#> SRR2105357 5 0.1636 0.84056 0.004 0.000 0.036 0.000 0.936 0.024
#> SRR2105358 5 0.1010 0.85097 0.004 0.000 0.036 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105439 6 0.1340 0.79788 0.000 0.040 0.008 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105440 6 0.1340 0.79788 0.000 0.040 0.008 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105509 2 0.1788 0.91971 0.028 0.928 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR2105510 2 0.1845 0.91630 0.028 0.920 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR2105507 1 0.3240 0.74712 0.752 0.000 0.244 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105508 1 0.3426 0.73193 0.720 0.000 0.276 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105505 1 0.5703 0.19536 0.428 0.000 0.412 0.000 0.160 0.000
#> SRR2105506 1 0.5178 0.39143 0.488 0.000 0.424 0.000 0.088 0.000
#> SRR2105503 2 0.0508 0.92963 0.004 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105504 4 0.0260 0.91103 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105501 2 0.2015 0.91061 0.016 0.916 0.012 0.000 0.000 0.056
#> SRR2105502 4 0.0260 0.91103 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105499 3 0.3161 0.54725 0.216 0.000 0.776 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105500 3 0.3584 0.34346 0.308 0.000 0.688 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105497 2 0.1552 0.92861 0.004 0.948 0.008 0.008 0.008 0.024
#> SRR2105498 2 0.1223 0.92707 0.000 0.960 0.004 0.012 0.008 0.016
#> SRR2105495 6 0.2320 0.80522 0.000 0.132 0.004 0.000 0.000 0.864
#> SRR2105496 6 0.3240 0.71040 0.000 0.244 0.004 0.000 0.000 0.752
#> SRR2105493 6 0.1367 0.80243 0.000 0.044 0.012 0.000 0.000 0.944
#> SRR2105494 6 0.1524 0.80644 0.000 0.060 0.008 0.000 0.000 0.932
#> SRR2105491 2 0.1109 0.92897 0.012 0.964 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR2105492 2 0.1148 0.92837 0.016 0.960 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105489 2 0.1715 0.91699 0.016 0.940 0.000 0.008 0.016 0.020
#> SRR2105490 2 0.1621 0.91919 0.016 0.944 0.000 0.008 0.012 0.020
#> SRR2105487 5 0.0972 0.85337 0.008 0.000 0.028 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105488 5 0.0972 0.85337 0.008 0.000 0.028 0.000 0.964 0.000
#> SRR2105485 3 0.4278 0.50096 0.212 0.000 0.712 0.000 0.076 0.000
#> SRR2105486 3 0.4641 0.50680 0.200 0.000 0.684 0.000 0.116 0.000
#> SRR2105483 1 0.1876 0.62406 0.916 0.000 0.072 0.004 0.004 0.004
#> SRR2105484 1 0.1931 0.61998 0.916 0.000 0.068 0.004 0.008 0.004
#> SRR2105481 3 0.2980 0.60760 0.180 0.000 0.808 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105482 1 0.3833 0.54557 0.556 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105479 3 0.2854 0.58188 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105480 3 0.2996 0.57236 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105477 6 0.2882 0.77221 0.000 0.180 0.008 0.000 0.000 0.812
#> SRR2105478 6 0.2302 0.80874 0.000 0.120 0.008 0.000 0.000 0.872
#> SRR2105475 2 0.2381 0.90807 0.028 0.908 0.016 0.012 0.000 0.036
#> SRR2105476 2 0.1565 0.92233 0.028 0.940 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105473 6 0.1453 0.79752 0.000 0.040 0.008 0.000 0.008 0.944
#> SRR2105474 6 0.1340 0.79788 0.000 0.040 0.008 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105471 2 0.1799 0.91454 0.016 0.936 0.000 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105472 2 0.1799 0.91454 0.016 0.936 0.000 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105469 3 0.3862 0.18838 0.388 0.000 0.608 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105470 3 0.3717 0.19013 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105467 5 0.3670 0.71696 0.056 0.000 0.152 0.000 0.788 0.004
#> SRR2105468 5 0.6040 0.09386 0.240 0.000 0.296 0.000 0.460 0.004
#> SRR2105465 1 0.3288 0.71430 0.724 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105466 1 0.3265 0.74378 0.748 0.000 0.248 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105463 1 0.3586 0.70272 0.712 0.000 0.280 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105464 1 0.4070 0.54975 0.568 0.000 0.424 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105461 2 0.1173 0.92508 0.016 0.960 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR2105462 2 0.1542 0.91795 0.016 0.944 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR2105459 2 0.1334 0.92641 0.020 0.948 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105460 2 0.1341 0.92442 0.024 0.948 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105457 3 0.2255 0.64345 0.080 0.000 0.892 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105458 3 0.1867 0.63443 0.036 0.000 0.924 0.000 0.036 0.004
#> SRR2105455 1 0.2854 0.74538 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105456 1 0.2793 0.74400 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105453 5 0.1716 0.83935 0.036 0.000 0.028 0.000 0.932 0.004
#> SRR2105454 5 0.1552 0.84173 0.036 0.000 0.020 0.000 0.940 0.004
#> SRR2105451 6 0.3122 0.76025 0.000 0.176 0.020 0.000 0.000 0.804
#> SRR2105452 4 0.0260 0.91103 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105449 3 0.3351 0.49140 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105450 1 0.3862 0.36539 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105447 2 0.1755 0.92000 0.028 0.932 0.008 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105448 2 0.1148 0.92751 0.020 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105445 6 0.4585 0.61139 0.000 0.012 0.104 0.000 0.164 0.720
#> SRR2105446 5 0.4071 0.54847 0.004 0.000 0.036 0.000 0.712 0.248
#> SRR2105443 6 0.2884 0.77394 0.000 0.164 0.008 0.000 0.004 0.824
#> SRR2105444 6 0.1845 0.81080 0.000 0.072 0.008 0.000 0.004 0.916
#> SRR2105441 6 0.3999 0.14733 0.000 0.496 0.000 0.000 0.004 0.500
#> SRR2105442 2 0.2673 0.85008 0.012 0.852 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR2105437 5 0.1049 0.85402 0.008 0.000 0.032 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105438 5 0.1049 0.85402 0.008 0.000 0.032 0.000 0.960 0.000
#> SRR2105435 3 0.2400 0.64470 0.116 0.000 0.872 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105436 3 0.3424 0.54061 0.204 0.000 0.772 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105433 1 0.2558 0.72015 0.840 0.000 0.156 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105434 1 0.2402 0.70477 0.856 0.000 0.140 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105431 1 0.3565 0.71439 0.716 0.000 0.276 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105432 1 0.4450 0.51174 0.528 0.000 0.448 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105429 2 0.1959 0.91619 0.024 0.924 0.020 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105430 2 0.1874 0.91651 0.028 0.928 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105427 6 0.4120 0.22859 0.004 0.468 0.004 0.000 0.000 0.524
#> SRR2105428 6 0.2595 0.78680 0.000 0.160 0.004 0.000 0.000 0.836
#> SRR2105425 2 0.1204 0.92865 0.016 0.960 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105426 2 0.1452 0.92921 0.008 0.948 0.004 0.000 0.008 0.032
#> SRR2105421 3 0.2615 0.63102 0.104 0.012 0.872 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105422 3 0.2260 0.61349 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.1294 0.92319 0.004 0.956 0.000 0.008 0.008 0.024
#> SRR2105424 2 0.1312 0.92337 0.004 0.956 0.000 0.008 0.012 0.020
#> SRR2105419 3 0.1686 0.64391 0.064 0.000 0.924 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105420 3 0.1398 0.64678 0.052 0.000 0.940 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105415 3 0.5600 0.21728 0.288 0.000 0.548 0.000 0.160 0.004
#> SRR2105416 1 0.5419 0.34514 0.468 0.000 0.428 0.000 0.100 0.004
#> SRR2105417 1 0.2738 0.73200 0.820 0.000 0.176 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105418 1 0.2278 0.69754 0.868 0.000 0.128 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105413 2 0.1498 0.92142 0.028 0.940 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105414 2 0.1644 0.91938 0.028 0.932 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105409 2 0.3411 0.65949 0.008 0.756 0.000 0.000 0.004 0.232
#> SRR2105410 6 0.3703 0.64492 0.004 0.276 0.004 0.000 0.004 0.712
#> SRR2105411 2 0.0520 0.92835 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR2105412 2 0.0982 0.92910 0.004 0.968 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR2105407 5 0.3359 0.72420 0.008 0.000 0.196 0.000 0.784 0.012
#> SRR2105408 5 0.1787 0.84297 0.004 0.000 0.068 0.000 0.920 0.008
#> SRR2105403 5 0.1511 0.85459 0.012 0.000 0.044 0.000 0.940 0.004
#> SRR2105404 5 0.1194 0.85351 0.008 0.000 0.032 0.000 0.956 0.004
#> SRR2105405 1 0.2823 0.74544 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.2793 0.74330 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105401 2 0.4092 0.43698 0.000 0.636 0.020 0.000 0.000 0.344
#> SRR2105402 4 0.0260 0.91103 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105399 2 0.4459 0.79312 0.028 0.788 0.076 0.056 0.000 0.052
#> SRR2105400 2 0.3797 0.84333 0.032 0.832 0.060 0.040 0.000 0.036
#> SRR2105397 6 0.2604 0.80715 0.000 0.076 0.036 0.000 0.008 0.880
#> SRR2105398 6 0.3562 0.75316 0.000 0.180 0.028 0.000 0.008 0.784
#> SRR2105395 2 0.1542 0.92073 0.016 0.944 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR2105396 2 0.1686 0.91965 0.016 0.940 0.000 0.004 0.016 0.024
#> SRR2105393 2 0.0653 0.93039 0.004 0.980 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105394 2 0.0622 0.92750 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105389 3 0.3551 0.53289 0.036 0.000 0.772 0.000 0.192 0.000
#> SRR2105390 3 0.3332 0.57153 0.048 0.000 0.808 0.000 0.144 0.000
#> SRR2105391 3 0.2629 0.61978 0.060 0.000 0.872 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105392 3 0.2887 0.58659 0.036 0.000 0.844 0.000 0.120 0.000
#> SRR2105385 1 0.3446 0.72042 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.3789 0.57678 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.3592 0.68466 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.3672 0.67416 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.2913 0.89109 0.024 0.880 0.016 0.052 0.000 0.028
#> SRR2105382 2 0.1565 0.92166 0.028 0.940 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR2105383 2 0.5069 0.65789 0.064 0.728 0.152 0.008 0.016 0.032
#> SRR2105384 2 0.5285 0.64718 0.084 0.716 0.140 0.008 0.016 0.036
#> SRR2105379 2 0.1485 0.92383 0.028 0.944 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105380 2 0.1405 0.92451 0.024 0.948 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105377 6 0.1267 0.80781 0.000 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR2105378 6 0.1340 0.79788 0.000 0.040 0.008 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105375 3 0.2796 0.64319 0.080 0.020 0.876 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105376 3 0.3340 0.56149 0.196 0.000 0.784 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105373 5 0.2214 0.81768 0.016 0.000 0.096 0.000 0.888 0.000
#> SRR2105374 5 0.1124 0.85383 0.008 0.000 0.036 0.000 0.956 0.000
#> SRR2105371 1 0.4086 0.44117 0.528 0.000 0.464 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105372 1 0.3923 0.64075 0.620 0.000 0.372 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105369 3 0.4584 -0.32089 0.452 0.000 0.512 0.000 0.036 0.000
#> SRR2105370 1 0.5227 0.32672 0.456 0.000 0.452 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105367 3 0.4600 0.53381 0.152 0.000 0.708 0.000 0.136 0.004
#> SRR2105368 3 0.5442 0.48083 0.084 0.000 0.660 0.000 0.192 0.064
#> SRR2105365 2 0.0862 0.92870 0.008 0.972 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105366 2 0.0748 0.92964 0.004 0.976 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105363 2 0.1728 0.92118 0.008 0.924 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR2105364 2 0.0922 0.93018 0.004 0.968 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105361 2 0.1555 0.92206 0.008 0.940 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR2105362 2 0.1251 0.92657 0.008 0.956 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105359 3 0.2933 0.59555 0.200 0.000 0.796 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105360 1 0.3930 0.55461 0.576 0.000 0.420 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105355 1 0.3528 0.71992 0.700 0.000 0.296 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105356 1 0.3163 0.74868 0.764 0.000 0.232 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105353 3 0.2362 0.62595 0.136 0.000 0.860 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105354 3 0.3899 0.10638 0.404 0.000 0.592 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105351 2 0.0912 0.92933 0.008 0.972 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR2105352 4 0.0260 0.91103 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105349 2 0.1405 0.92519 0.024 0.948 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105350 2 0.0725 0.93006 0.012 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105345 2 0.2515 0.87507 0.000 0.876 0.008 0.004 0.008 0.104
#> SRR2105346 2 0.1679 0.92216 0.012 0.936 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR2105347 2 0.6187 0.40645 0.032 0.596 0.096 0.012 0.016 0.248
#> SRR2105348 2 0.7530 0.16334 0.116 0.496 0.132 0.012 0.028 0.216
#> SRR2105343 2 0.0692 0.92961 0.004 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105344 2 0.0806 0.93103 0.008 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105341 3 0.2473 0.63910 0.136 0.000 0.856 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105342 3 0.3684 0.32025 0.332 0.000 0.664 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105339 3 0.2278 0.62404 0.128 0.000 0.868 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105340 3 0.2191 0.64162 0.120 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105335 3 0.6100 0.07351 0.268 0.000 0.444 0.000 0.284 0.004
#> SRR2105336 3 0.6212 -0.08040 0.360 0.000 0.360 0.000 0.276 0.004
#> SRR2105337 1 0.3659 0.66377 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.3979 0.52630 0.540 0.000 0.456 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105331 2 0.1313 0.92634 0.016 0.952 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR2105332 2 0.1268 0.92925 0.008 0.952 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105333 2 0.1421 0.92168 0.028 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105334 2 0.1341 0.92456 0.028 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105329 6 0.4724 0.67568 0.008 0.104 0.176 0.000 0.004 0.708
#> SRR2105330 6 0.4593 0.70159 0.000 0.180 0.112 0.000 0.004 0.704
#> SRR2105327 2 0.1644 0.91938 0.028 0.932 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105328 2 0.1852 0.92019 0.024 0.928 0.004 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105325 3 0.0858 0.63927 0.028 0.000 0.968 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105326 3 0.0951 0.63929 0.020 0.000 0.968 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105323 3 0.5087 0.36755 0.068 0.000 0.612 0.000 0.304 0.016
#> SRR2105324 3 0.3743 0.43175 0.252 0.000 0.724 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105319 3 0.5564 -0.07921 0.352 0.000 0.500 0.000 0.148 0.000
#> SRR2105320 1 0.4469 0.43774 0.504 0.000 0.468 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105321 3 0.3508 0.47746 0.292 0.000 0.704 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105322 3 0.3915 0.10410 0.412 0.000 0.584 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105317 2 0.1421 0.92291 0.028 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105318 2 0.0806 0.92885 0.008 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105315 3 0.6564 -0.35752 0.004 0.268 0.368 0.000 0.016 0.344
#> SRR2105316 2 0.2816 0.86469 0.024 0.868 0.020 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105313 2 0.1176 0.92641 0.020 0.956 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105314 2 0.0914 0.92926 0.016 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105311 3 0.3075 0.62448 0.092 0.016 0.852 0.040 0.000 0.000
#> SRR2105312 3 0.2790 0.61933 0.116 0.008 0.856 0.020 0.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.2664 0.73730 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105308 1 0.2520 0.71746 0.844 0.000 0.152 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105309 3 0.2868 0.61656 0.132 0.000 0.840 0.000 0.028 0.000
#> SRR2105310 3 0.2790 0.62235 0.132 0.000 0.844 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105305 3 0.2538 0.64862 0.124 0.000 0.860 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105306 1 0.3838 0.48949 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0260 0.92913 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105304 4 0.1700 0.85545 0.000 0.080 0.000 0.916 0.000 0.004
#> SRR2105301 2 0.1485 0.92230 0.028 0.944 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105302 2 0.1261 0.92565 0.024 0.952 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105299 6 0.4376 0.63076 0.000 0.016 0.084 0.000 0.156 0.744
#> SRR2105300 6 0.3834 0.67537 0.000 0.016 0.060 0.000 0.132 0.792
#> SRR2105297 2 0.7366 0.24697 0.224 0.520 0.120 0.016 0.032 0.088
#> SRR2105298 2 0.7649 -0.14271 0.364 0.388 0.112 0.016 0.032 0.088
#> SRR2105295 2 0.1498 0.92142 0.028 0.940 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105296 2 0.1261 0.92562 0.024 0.952 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR2105293 3 0.2278 0.62155 0.128 0.000 0.868 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105294 3 0.2912 0.57271 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105291 3 0.3502 0.63581 0.132 0.020 0.820 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105292 3 0.4172 0.35463 0.280 0.000 0.680 0.000 0.040 0.000
#> SRR2105289 3 0.3993 -0.22922 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105290 1 0.2941 0.74876 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.3979 0.52561 0.540 0.000 0.456 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105288 1 0.4063 0.60092 0.572 0.000 0.420 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105285 2 0.1565 0.92085 0.028 0.940 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105286 2 0.1421 0.92168 0.028 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105283 6 0.1829 0.80738 0.000 0.056 0.024 0.000 0.000 0.920
#> SRR2105284 6 0.1625 0.80758 0.000 0.060 0.012 0.000 0.000 0.928
#> SRR2105281 2 0.0951 0.92684 0.004 0.968 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR2105282 2 0.1251 0.92502 0.008 0.956 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105259 5 0.3827 0.65498 0.004 0.000 0.256 0.000 0.720 0.020
#> SRR2105260 3 0.4572 -0.06962 0.012 0.000 0.568 0.000 0.400 0.020
#> SRR2105279 2 0.1353 0.92127 0.012 0.952 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105280 2 0.1622 0.91881 0.016 0.940 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105257 1 0.4751 0.43730 0.500 0.000 0.452 0.000 0.048 0.000
#> SRR2105258 1 0.4475 0.53650 0.556 0.000 0.412 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105253 2 0.1391 0.92544 0.016 0.944 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105254 2 0.0622 0.92975 0.008 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105255 3 0.5706 0.05804 0.348 0.000 0.480 0.000 0.172 0.000
#> SRR2105256 1 0.5226 0.32646 0.464 0.000 0.444 0.000 0.092 0.000
#> SRR2105251 2 0.0862 0.92903 0.008 0.972 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105252 2 0.0837 0.92909 0.004 0.972 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105249 6 0.4424 0.58747 0.012 0.276 0.036 0.000 0.000 0.676
#> SRR2105250 6 0.3203 0.75952 0.004 0.160 0.024 0.000 0.000 0.812
#> SRR2105247 2 0.0820 0.92952 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR2105248 2 0.1364 0.92169 0.016 0.952 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR2105245 3 0.3761 0.57213 0.192 0.032 0.768 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105246 3 0.4531 0.49266 0.224 0.068 0.700 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105243 3 0.3862 -0.30904 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105244 3 0.3727 0.22089 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.3592 0.67965 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.3244 0.74215 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105239 3 0.3592 0.25847 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105240 1 0.4090 0.65347 0.604 0.000 0.384 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105237 6 0.2191 0.80499 0.000 0.120 0.004 0.000 0.000 0.876
#> SRR2105238 6 0.1970 0.81279 0.000 0.092 0.008 0.000 0.000 0.900
#> SRR2105235 6 0.3134 0.73354 0.004 0.208 0.000 0.000 0.004 0.784
#> SRR2105236 6 0.3244 0.73638 0.004 0.204 0.004 0.000 0.004 0.784
#> SRR2105233 2 0.1498 0.92142 0.028 0.940 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105234 2 0.1498 0.92142 0.028 0.940 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105231 2 0.0870 0.93022 0.012 0.972 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105232 2 0.1364 0.92778 0.012 0.952 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105227 3 0.3259 0.56395 0.216 0.012 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105228 3 0.3653 0.47025 0.300 0.008 0.692 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105225 1 0.3684 0.65677 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.3215 0.75162 0.756 0.000 0.240 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105229 3 0.1375 0.62220 0.004 0.008 0.952 0.000 0.028 0.008
#> SRR2105230 3 0.1333 0.64461 0.048 0.000 0.944 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105219 2 0.2772 0.77537 0.004 0.816 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR2105220 2 0.2772 0.76060 0.004 0.816 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR2105221 6 0.1370 0.79566 0.000 0.036 0.012 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105222 6 0.1340 0.79788 0.000 0.040 0.008 0.000 0.004 0.948
#> SRR2105223 1 0.3499 0.71977 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.3337 0.74716 0.736 0.000 0.260 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105217 2 0.0717 0.92910 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105218 2 0.1053 0.92601 0.004 0.964 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR2105215 2 0.1149 0.92560 0.008 0.960 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105216 2 0.1036 0.92661 0.000 0.964 0.000 0.004 0.008 0.024
#> SRR2105213 3 0.3352 0.57790 0.176 0.032 0.792 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105214 3 0.3231 0.56736 0.200 0.016 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105211 3 0.1686 0.65020 0.064 0.000 0.924 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105212 3 0.3023 0.62365 0.140 0.000 0.828 0.000 0.032 0.000
#> SRR2105209 3 0.3499 0.22072 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105210 3 0.3869 -0.43652 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105207 3 0.4326 0.28162 0.300 0.000 0.656 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105208 1 0.4127 0.46438 0.508 0.000 0.484 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105205 2 0.1564 0.92237 0.024 0.936 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105206 2 0.1642 0.92088 0.028 0.936 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105201 6 0.1701 0.81255 0.000 0.072 0.008 0.000 0.000 0.920
#> SRR2105202 6 0.1605 0.80127 0.000 0.044 0.016 0.000 0.004 0.936
#> SRR2105203 2 0.0146 0.92996 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105204 2 0.0508 0.92827 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105199 2 0.0984 0.92865 0.008 0.968 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR2105200 2 0.1483 0.92268 0.008 0.944 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR2105197 5 0.1333 0.85467 0.008 0.000 0.048 0.000 0.944 0.000
#> SRR2105198 5 0.2173 0.83236 0.004 0.000 0.064 0.000 0.904 0.028
#> SRR2105195 3 0.3050 0.56725 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105196 3 0.2794 0.64125 0.144 0.012 0.840 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105193 1 0.2762 0.74117 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105194 1 0.2048 0.69055 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 5 0.1194 0.85163 0.004 0.000 0.032 0.000 0.956 0.008
#> SRR2105192 5 0.1478 0.84456 0.032 0.000 0.020 0.000 0.944 0.004
#> SRR2105189 2 0.2398 0.88798 0.028 0.888 0.004 0.000 0.000 0.080
#> SRR2105190 2 0.1401 0.92424 0.028 0.948 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105187 6 0.2841 0.78428 0.000 0.164 0.012 0.000 0.000 0.824
#> SRR2105188 6 0.2060 0.81291 0.000 0.084 0.016 0.000 0.000 0.900
#> SRR2105179 3 0.3314 0.49937 0.224 0.000 0.764 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105180 3 0.5801 0.21722 0.160 0.000 0.464 0.000 0.372 0.004
#> SRR2105183 2 0.1686 0.91640 0.016 0.940 0.000 0.004 0.016 0.024
#> SRR2105184 2 0.1799 0.91454 0.016 0.936 0.000 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105185 2 0.1109 0.92892 0.012 0.964 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105186 2 0.0767 0.92988 0.008 0.976 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105181 5 0.1643 0.84607 0.008 0.000 0.068 0.000 0.924 0.000
#> SRR2105182 5 0.4863 0.29672 0.060 0.000 0.412 0.000 0.528 0.000
#> SRR2105177 1 0.2053 0.67215 0.888 0.000 0.108 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105178 1 0.2149 0.66180 0.888 0.000 0.104 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105171 2 0.1251 0.92903 0.012 0.956 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR2105172 2 0.1536 0.92295 0.016 0.940 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR2105175 1 0.3584 0.68929 0.688 0.004 0.308 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105176 1 0.2805 0.72168 0.812 0.000 0.184 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105173 2 0.0862 0.92962 0.004 0.972 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105174 2 0.0717 0.92757 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105169 2 0.1498 0.92128 0.012 0.948 0.000 0.004 0.012 0.024
#> SRR2105170 2 0.1799 0.91828 0.016 0.936 0.000 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105167 2 0.1686 0.91651 0.016 0.940 0.000 0.004 0.016 0.024
#> SRR2105168 2 0.1490 0.92024 0.008 0.948 0.000 0.004 0.016 0.024
#> SRR2105165 3 0.3714 0.38349 0.340 0.000 0.656 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105166 3 0.3725 0.41400 0.316 0.000 0.676 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105163 3 0.1908 0.63438 0.096 0.000 0.900 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105164 3 0.2191 0.62630 0.120 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105161 1 0.3288 0.74109 0.724 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.3448 0.73737 0.716 0.000 0.280 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105155 2 0.1523 0.92485 0.008 0.940 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105156 2 0.1332 0.92500 0.012 0.952 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR2105157 2 0.0603 0.92908 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105158 2 0.0862 0.92914 0.004 0.972 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR2105159 1 0.3993 0.32478 0.520 0.000 0.476 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105160 1 0.3101 0.74952 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0508 0.92958 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105154 2 0.0951 0.92897 0.008 0.968 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105151 2 0.2065 0.91060 0.012 0.916 0.000 0.004 0.012 0.056
#> SRR2105152 2 0.1621 0.91919 0.016 0.944 0.000 0.008 0.012 0.020
#> SRR2105149 3 0.4224 0.45705 0.000 0.144 0.772 0.004 0.032 0.048
#> SRR2105150 3 0.1036 0.63271 0.004 0.000 0.964 0.000 0.024 0.008
#> SRR2105147 4 0.3841 0.81387 0.012 0.100 0.044 0.820 0.008 0.016
#> SRR2105148 4 0.3978 0.79570 0.012 0.112 0.044 0.808 0.008 0.016
#> SRR2105143 1 0.4218 0.48750 0.584 0.012 0.400 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105144 1 0.3240 0.74698 0.752 0.000 0.244 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105145 1 0.2632 0.72540 0.832 0.000 0.164 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105146 1 0.2416 0.72307 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.1059 0.92770 0.016 0.964 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105142 2 0.1053 0.92815 0.012 0.964 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105139 2 0.1448 0.91970 0.016 0.948 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR2105140 2 0.1605 0.91958 0.012 0.940 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR2105137 6 0.2245 0.80099 0.004 0.052 0.028 0.000 0.008 0.908
#> SRR2105138 6 0.1737 0.79790 0.000 0.040 0.008 0.000 0.020 0.932
#> SRR2105135 2 0.1799 0.91454 0.016 0.936 0.000 0.008 0.016 0.024
#> SRR2105136 2 0.1592 0.91831 0.012 0.944 0.000 0.004 0.016 0.024
#> SRR2105133 5 0.1370 0.84853 0.004 0.000 0.036 0.000 0.948 0.012
#> SRR2105134 5 0.1116 0.85346 0.008 0.000 0.028 0.000 0.960 0.004
#> SRR2105131 6 0.5381 0.66285 0.000 0.096 0.136 0.000 0.084 0.684
#> SRR2105132 5 0.1511 0.85243 0.012 0.000 0.044 0.000 0.940 0.004
#> SRR2105129 1 0.2278 0.69315 0.868 0.000 0.128 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105130 1 0.2001 0.64993 0.900 0.000 0.092 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105127 5 0.5326 0.48347 0.172 0.000 0.212 0.000 0.612 0.004
#> SRR2105128 5 0.5026 0.54376 0.160 0.000 0.180 0.000 0.656 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 430 rows and 384 columns.
#> Top rows (43, 86, 129, 172, 215) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.886 0.926 0.967 0.5000 0.500 0.500
#> 3 3 0.615 0.732 0.868 0.3012 0.809 0.632
#> 4 4 0.532 0.620 0.805 0.0824 0.923 0.791
#> 5 5 0.532 0.592 0.770 0.0578 0.904 0.715
#> 6 6 0.515 0.484 0.712 0.0326 0.973 0.905
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR2105277 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105278 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105275 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105276 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105273 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105274 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105271 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105272 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105269 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105270 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105265 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105266 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105263 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105264 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105261 1 0.0376 0.9686 0.996 0.004
#> SRR2105262 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105357 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105358 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105439 2 0.1843 0.9419 0.028 0.972
#> SRR2105440 2 0.0938 0.9534 0.012 0.988
#> SRR2105509 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105510 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105507 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105508 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105505 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105506 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105503 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105504 2 0.1414 0.9479 0.020 0.980
#> SRR2105501 2 0.0938 0.9538 0.012 0.988
#> SRR2105502 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105499 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105500 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105497 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105498 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105495 2 0.3274 0.9146 0.060 0.940
#> SRR2105496 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105493 2 0.7815 0.7114 0.232 0.768
#> SRR2105494 2 0.9248 0.5115 0.340 0.660
#> SRR2105491 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105492 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105489 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105490 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105487 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105488 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105485 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105486 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105483 2 0.8661 0.6066 0.288 0.712
#> SRR2105484 2 0.8207 0.6639 0.256 0.744
#> SRR2105481 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105482 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105479 1 0.1184 0.9615 0.984 0.016
#> SRR2105480 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105477 2 0.3733 0.9048 0.072 0.928
#> SRR2105478 2 0.2236 0.9354 0.036 0.964
#> SRR2105475 2 0.4939 0.8688 0.108 0.892
#> SRR2105476 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105473 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105474 2 0.0376 0.9584 0.004 0.996
#> SRR2105471 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105472 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105469 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105470 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105467 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105468 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105465 1 0.9580 0.3952 0.620 0.380
#> SRR2105466 1 0.8608 0.6139 0.716 0.284
#> SRR2105463 1 0.1184 0.9613 0.984 0.016
#> SRR2105464 1 0.3274 0.9268 0.940 0.060
#> SRR2105461 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105462 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105457 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105458 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105455 1 0.0376 0.9687 0.996 0.004
#> SRR2105456 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105453 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105454 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105451 2 0.7528 0.7346 0.216 0.784
#> SRR2105452 1 0.4815 0.8795 0.896 0.104
#> SRR2105449 1 0.2948 0.9332 0.948 0.052
#> SRR2105450 1 0.1184 0.9613 0.984 0.016
#> SRR2105447 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105448 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105445 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105446 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105443 1 0.7219 0.7536 0.800 0.200
#> SRR2105444 1 0.9850 0.2443 0.572 0.428
#> SRR2105441 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105442 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105437 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105438 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105435 1 0.0672 0.9664 0.992 0.008
#> SRR2105436 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105433 1 0.8386 0.6438 0.732 0.268
#> SRR2105434 1 0.9087 0.5320 0.676 0.324
#> SRR2105431 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105432 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105429 2 0.8909 0.5735 0.308 0.692
#> SRR2105430 2 0.9833 0.2909 0.424 0.576
#> SRR2105427 2 0.0938 0.9537 0.012 0.988
#> SRR2105428 2 0.0672 0.9562 0.008 0.992
#> SRR2105425 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105426 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105421 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105422 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105423 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105424 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105419 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105420 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105415 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105416 1 0.0938 0.9640 0.988 0.012
#> SRR2105417 1 0.2236 0.9463 0.964 0.036
#> SRR2105418 1 0.3733 0.9158 0.928 0.072
#> SRR2105413 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105414 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105409 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105410 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105411 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105412 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105407 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105408 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105403 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105404 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105405 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105406 1 0.1184 0.9613 0.984 0.016
#> SRR2105401 2 0.9732 0.3514 0.404 0.596
#> SRR2105402 2 0.5946 0.8274 0.144 0.856
#> SRR2105399 1 0.4939 0.8767 0.892 0.108
#> SRR2105400 1 0.7950 0.6925 0.760 0.240
#> SRR2105397 1 0.3431 0.9200 0.936 0.064
#> SRR2105398 1 0.5059 0.8687 0.888 0.112
#> SRR2105395 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105396 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105394 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105389 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105390 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105391 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105392 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105385 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105386 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105387 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105388 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105381 2 0.2423 0.9322 0.040 0.960
#> SRR2105382 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105383 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105384 2 0.0672 0.9559 0.008 0.992
#> SRR2105379 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105380 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105377 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105378 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105375 1 0.0938 0.9640 0.988 0.012
#> SRR2105376 1 0.2423 0.9437 0.960 0.040
#> SRR2105373 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105374 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105371 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105372 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105369 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105370 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105367 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105368 1 0.3584 0.9197 0.932 0.068
#> SRR2105365 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105366 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105363 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105364 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105359 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105360 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105355 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105356 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105353 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105354 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105351 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105352 2 0.6712 0.7881 0.176 0.824
#> SRR2105349 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105350 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105345 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105346 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105347 2 0.0938 0.9533 0.012 0.988
#> SRR2105348 2 0.1184 0.9504 0.016 0.984
#> SRR2105343 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105341 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105342 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105339 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105340 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105335 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105336 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105337 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105338 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105331 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105332 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105329 1 0.1633 0.9548 0.976 0.024
#> SRR2105330 1 0.4815 0.8794 0.896 0.104
#> SRR2105327 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105328 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105325 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105326 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105323 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105324 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105319 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105320 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105321 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105322 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105317 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105318 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105315 1 0.1184 0.9608 0.984 0.016
#> SRR2105316 2 0.1633 0.9452 0.024 0.976
#> SRR2105313 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105314 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105311 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105312 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105307 1 0.1184 0.9612 0.984 0.016
#> SRR2105308 1 0.3431 0.9230 0.936 0.064
#> SRR2105309 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105310 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105305 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105306 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105303 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105304 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105301 2 0.0938 0.9537 0.012 0.988
#> SRR2105302 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105299 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105300 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105297 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105298 2 0.0376 0.9584 0.004 0.996
#> SRR2105295 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105293 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105294 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105291 1 0.5519 0.8539 0.872 0.128
#> SRR2105292 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105289 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105290 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105287 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105288 1 0.1184 0.9614 0.984 0.016
#> SRR2105285 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105286 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105283 2 0.7056 0.7666 0.192 0.808
#> SRR2105284 2 0.9209 0.5230 0.336 0.664
#> SRR2105281 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105282 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105259 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105260 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105279 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105280 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105257 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105258 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105253 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105254 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105255 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105256 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105251 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105252 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105249 2 0.2043 0.9386 0.032 0.968
#> SRR2105250 2 0.1633 0.9449 0.024 0.976
#> SRR2105247 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105248 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105245 1 0.6887 0.7811 0.816 0.184
#> SRR2105246 1 0.9661 0.3628 0.608 0.392
#> SRR2105243 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105244 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105241 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105242 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105239 1 0.0376 0.9687 0.996 0.004
#> SRR2105240 1 0.0938 0.9639 0.988 0.012
#> SRR2105237 1 0.9993 0.0311 0.516 0.484
#> SRR2105238 2 0.6712 0.7900 0.176 0.824
#> SRR2105235 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105236 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105233 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105234 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105231 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105232 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105227 1 0.3431 0.9235 0.936 0.064
#> SRR2105228 1 0.4022 0.9069 0.920 0.080
#> SRR2105225 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105226 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105229 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105230 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105219 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105220 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105221 2 0.4431 0.8846 0.092 0.908
#> SRR2105222 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105223 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105224 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105217 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105218 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105215 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105216 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105213 1 0.5294 0.8644 0.880 0.120
#> SRR2105214 1 0.2236 0.9465 0.964 0.036
#> SRR2105211 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105212 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105209 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105210 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105207 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105208 1 0.0938 0.9640 0.988 0.012
#> SRR2105205 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105206 2 0.1184 0.9508 0.016 0.984
#> SRR2105201 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105202 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105203 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105199 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105200 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105197 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105198 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105195 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105196 1 0.5519 0.8558 0.872 0.128
#> SRR2105193 1 0.2603 0.9400 0.956 0.044
#> SRR2105194 1 0.0672 0.9663 0.992 0.008
#> SRR2105191 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105192 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105189 2 0.0376 0.9585 0.004 0.996
#> SRR2105190 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105187 2 0.9170 0.5302 0.332 0.668
#> SRR2105188 2 0.9775 0.3258 0.412 0.588
#> SRR2105179 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105180 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105183 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105184 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105185 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105186 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105181 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105182 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105177 2 0.9866 0.2495 0.432 0.568
#> SRR2105178 1 0.6343 0.8157 0.840 0.160
#> SRR2105171 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105172 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105175 1 0.6247 0.8221 0.844 0.156
#> SRR2105176 1 0.4562 0.8910 0.904 0.096
#> SRR2105173 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105169 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105170 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105167 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105168 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105165 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105166 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105163 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105164 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105161 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105162 1 0.2236 0.9468 0.964 0.036
#> SRR2105155 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105159 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105160 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105153 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105154 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105151 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105152 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105149 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105150 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105147 1 0.0672 0.9662 0.992 0.008
#> SRR2105148 1 0.0672 0.9662 0.992 0.008
#> SRR2105143 2 0.9635 0.3876 0.388 0.612
#> SRR2105144 2 0.9393 0.4625 0.356 0.644
#> SRR2105145 1 0.3733 0.9149 0.928 0.072
#> SRR2105146 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105141 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105139 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105140 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105137 2 0.4022 0.8959 0.080 0.920
#> SRR2105138 2 0.2603 0.9290 0.044 0.956
#> SRR2105135 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105136 2 0.0000 0.9606 0.000 1.000
#> SRR2105133 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105134 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105131 1 0.5519 0.8532 0.872 0.128
#> SRR2105132 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105129 2 0.9087 0.5384 0.324 0.676
#> SRR2105130 2 0.9815 0.2923 0.420 0.580
#> SRR2105127 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
#> SRR2105128 1 0.0000 0.9710 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR2105277 3 0.0424 0.76696 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105278 3 0.0592 0.76741 0.012 0.000 0.988
#> SRR2105275 3 0.5785 0.47131 0.332 0.000 0.668
#> SRR2105276 1 0.6302 0.03618 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105273 1 0.5810 0.49435 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105274 1 0.4750 0.68837 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105271 1 0.5098 0.64285 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105272 1 0.1411 0.78758 0.964 0.000 0.036
#> SRR2105269 2 0.1647 0.91388 0.004 0.960 0.036
#> SRR2105270 2 0.0892 0.92102 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105267 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.0592 0.92470 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105266 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105263 2 0.0424 0.92517 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105264 2 0.0237 0.92479 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105261 3 0.6180 0.46297 0.332 0.008 0.660
#> SRR2105262 3 0.5158 0.64791 0.232 0.004 0.764
#> SRR2105357 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105358 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105439 2 0.5178 0.67518 0.000 0.744 0.256
#> SRR2105440 2 0.5902 0.55502 0.004 0.680 0.316
#> SRR2105509 2 0.1529 0.91272 0.000 0.960 0.040
#> SRR2105510 2 0.2537 0.88601 0.000 0.920 0.080
#> SRR2105507 1 0.3941 0.74472 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105508 1 0.4399 0.72153 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105505 1 0.5926 0.48336 0.644 0.000 0.356
#> SRR2105506 1 0.5529 0.59747 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105503 2 0.0237 0.92471 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105504 2 0.1832 0.91547 0.036 0.956 0.008
#> SRR2105501 2 0.1878 0.91439 0.044 0.952 0.004
#> SRR2105502 2 0.1765 0.91465 0.040 0.956 0.004
#> SRR2105499 3 0.5835 0.42078 0.340 0.000 0.660
#> SRR2105500 1 0.6126 0.42270 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105497 2 0.4399 0.79246 0.188 0.812 0.000
#> SRR2105498 2 0.4235 0.80964 0.176 0.824 0.000
#> SRR2105495 2 0.4784 0.75458 0.004 0.796 0.200
#> SRR2105496 2 0.1964 0.90198 0.000 0.944 0.056
#> SRR2105493 3 0.5363 0.52029 0.000 0.276 0.724
#> SRR2105494 3 0.6062 0.32011 0.000 0.384 0.616
#> SRR2105491 2 0.4654 0.76719 0.208 0.792 0.000
#> SRR2105492 2 0.4452 0.77782 0.192 0.808 0.000
#> SRR2105489 2 0.1643 0.91691 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105490 2 0.3116 0.87812 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105487 3 0.0892 0.76741 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105488 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105485 3 0.4605 0.66302 0.204 0.000 0.796
#> SRR2105486 3 0.4887 0.63386 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105483 1 0.2584 0.75486 0.928 0.064 0.008
#> SRR2105484 1 0.2703 0.76104 0.928 0.056 0.016
#> SRR2105481 1 0.6192 0.34568 0.580 0.000 0.420
#> SRR2105482 1 0.2711 0.78875 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105479 1 0.0592 0.78142 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105480 1 0.1643 0.78243 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105477 2 0.5905 0.49323 0.000 0.648 0.352
#> SRR2105478 2 0.4654 0.74805 0.000 0.792 0.208
#> SRR2105475 2 0.5247 0.71928 0.008 0.768 0.224
#> SRR2105476 2 0.1289 0.91801 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105473 2 0.5219 0.75381 0.016 0.788 0.196
#> SRR2105474 2 0.2584 0.89548 0.008 0.928 0.064
#> SRR2105471 2 0.2625 0.89580 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105472 2 0.2796 0.88950 0.092 0.908 0.000
#> SRR2105469 1 0.6302 0.16325 0.520 0.000 0.480
#> SRR2105470 1 0.5905 0.53272 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105467 3 0.1860 0.76277 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105468 3 0.4702 0.65394 0.212 0.000 0.788
#> SRR2105465 1 0.1878 0.76824 0.952 0.044 0.004
#> SRR2105466 1 0.2318 0.77995 0.944 0.028 0.028
#> SRR2105463 1 0.2384 0.78708 0.936 0.008 0.056
#> SRR2105464 1 0.2173 0.78580 0.944 0.008 0.048
#> SRR2105461 2 0.1289 0.92113 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105462 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105459 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105460 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105457 3 0.5178 0.58855 0.256 0.000 0.744
#> SRR2105458 3 0.1529 0.76523 0.040 0.000 0.960
#> SRR2105455 1 0.1529 0.78832 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105456 1 0.1031 0.78613 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105453 3 0.4605 0.64369 0.204 0.000 0.796
#> SRR2105454 3 0.4842 0.62865 0.224 0.000 0.776
#> SRR2105451 2 0.6421 0.28716 0.004 0.572 0.424
#> SRR2105452 3 0.8069 0.07115 0.460 0.064 0.476
#> SRR2105449 1 0.2152 0.78939 0.948 0.016 0.036
#> SRR2105450 1 0.0424 0.78075 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105447 2 0.1529 0.91605 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105448 2 0.2165 0.90756 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105445 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105446 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105443 3 0.1753 0.74664 0.000 0.048 0.952
#> SRR2105444 3 0.4842 0.58263 0.000 0.224 0.776
#> SRR2105441 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105442 2 0.1031 0.92332 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105437 3 0.1163 0.76590 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105438 3 0.1031 0.76664 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105435 1 0.6264 0.44140 0.616 0.004 0.380
#> SRR2105436 3 0.5098 0.60643 0.248 0.000 0.752
#> SRR2105433 1 0.2443 0.77852 0.940 0.032 0.028
#> SRR2105434 1 0.2318 0.78109 0.944 0.028 0.028
#> SRR2105431 1 0.1753 0.78691 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105432 1 0.2625 0.78193 0.916 0.000 0.084
#> SRR2105429 2 0.7872 0.55074 0.112 0.652 0.236
#> SRR2105430 2 0.8797 0.36349 0.156 0.568 0.276
#> SRR2105427 2 0.3752 0.82889 0.000 0.856 0.144
#> SRR2105428 2 0.4974 0.71026 0.000 0.764 0.236
#> SRR2105425 2 0.3686 0.84402 0.140 0.860 0.000
#> SRR2105426 2 0.1529 0.91835 0.040 0.960 0.000
#> SRR2105421 3 0.6192 0.25637 0.420 0.000 0.580
#> SRR2105422 1 0.6280 0.15632 0.540 0.000 0.460
#> SRR2105423 2 0.3412 0.86196 0.124 0.876 0.000
#> SRR2105424 2 0.2959 0.88396 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105419 3 0.3752 0.71786 0.144 0.000 0.856
#> SRR2105420 3 0.5254 0.59625 0.264 0.000 0.736
#> SRR2105415 1 0.5327 0.62545 0.728 0.000 0.272
#> SRR2105416 1 0.4465 0.72281 0.820 0.004 0.176
#> SRR2105417 1 0.1163 0.78645 0.972 0.000 0.028
#> SRR2105418 1 0.0829 0.78135 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105413 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105414 2 0.0661 0.92433 0.008 0.988 0.004
#> SRR2105409 2 0.0237 0.92489 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105410 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105411 2 0.0892 0.92404 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105412 2 0.3267 0.87079 0.116 0.884 0.000
#> SRR2105407 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105408 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105403 3 0.1753 0.76376 0.048 0.000 0.952
#> SRR2105404 3 0.0892 0.76749 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105405 1 0.1753 0.78838 0.952 0.000 0.048
#> SRR2105406 1 0.2356 0.78396 0.928 0.000 0.072
#> SRR2105401 3 0.6489 0.12025 0.004 0.456 0.540
#> SRR2105402 2 0.6254 0.74788 0.108 0.776 0.116
#> SRR2105399 3 0.2301 0.73831 0.004 0.060 0.936
#> SRR2105400 3 0.5171 0.60438 0.012 0.204 0.784
#> SRR2105397 3 0.1711 0.75995 0.032 0.008 0.960
#> SRR2105398 3 0.1751 0.76052 0.028 0.012 0.960
#> SRR2105395 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0237 0.92473 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105393 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105394 2 0.1163 0.92126 0.028 0.972 0.000
#> SRR2105389 3 0.1860 0.75972 0.052 0.000 0.948
#> SRR2105390 3 0.2261 0.76101 0.068 0.000 0.932
#> SRR2105391 3 0.1643 0.76628 0.044 0.000 0.956
#> SRR2105392 3 0.0892 0.76750 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105385 1 0.5291 0.66295 0.732 0.000 0.268
#> SRR2105386 1 0.5810 0.55876 0.664 0.000 0.336
#> SRR2105387 1 0.2400 0.78831 0.932 0.004 0.064
#> SRR2105388 1 0.4796 0.70215 0.780 0.000 0.220
#> SRR2105381 2 0.3896 0.86929 0.052 0.888 0.060
#> SRR2105382 2 0.1031 0.92129 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105383 2 0.5859 0.54998 0.344 0.656 0.000
#> SRR2105384 2 0.5905 0.53710 0.352 0.648 0.000
#> SRR2105379 2 0.1411 0.91631 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105380 2 0.5760 0.55929 0.328 0.672 0.000
#> SRR2105377 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105378 2 0.0475 0.92457 0.004 0.992 0.004
#> SRR2105375 1 0.5803 0.65221 0.736 0.016 0.248
#> SRR2105376 1 0.4353 0.73967 0.836 0.008 0.156
#> SRR2105373 3 0.0747 0.76797 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105374 3 0.0892 0.76730 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105371 3 0.5882 0.45596 0.348 0.000 0.652
#> SRR2105372 3 0.6026 0.38806 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105369 3 0.5733 0.47208 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105370 3 0.6062 0.31077 0.384 0.000 0.616
#> SRR2105367 1 0.6314 0.40830 0.604 0.004 0.392
#> SRR2105368 1 0.7181 0.31465 0.564 0.028 0.408
#> SRR2105365 2 0.2959 0.88157 0.100 0.900 0.000
#> SRR2105366 2 0.0424 0.92518 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105363 2 0.1031 0.92348 0.024 0.976 0.000
#> SRR2105364 2 0.0747 0.92478 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105361 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105362 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.5882 0.52418 0.652 0.000 0.348
#> SRR2105360 1 0.4750 0.71108 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105355 1 0.4750 0.71243 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105356 1 0.3192 0.77623 0.888 0.000 0.112
#> SRR2105353 1 0.6309 0.00305 0.504 0.000 0.496
#> SRR2105354 1 0.6154 0.36100 0.592 0.000 0.408
#> SRR2105351 2 0.1289 0.92159 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105352 2 0.6975 0.69447 0.124 0.732 0.144
#> SRR2105349 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105350 2 0.0237 0.92483 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105345 2 0.3192 0.87177 0.112 0.888 0.000
#> SRR2105346 2 0.1964 0.91047 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105347 2 0.5621 0.62222 0.308 0.692 0.000
#> SRR2105348 2 0.5859 0.55354 0.344 0.656 0.000
#> SRR2105343 2 0.2625 0.89417 0.084 0.916 0.000
#> SRR2105344 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105341 3 0.5397 0.57188 0.280 0.000 0.720
#> SRR2105342 3 0.5926 0.38443 0.356 0.000 0.644
#> SRR2105339 3 0.6291 0.13457 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105340 3 0.5733 0.51274 0.324 0.000 0.676
#> SRR2105335 3 0.4002 0.71013 0.160 0.000 0.840
#> SRR2105336 3 0.4178 0.69296 0.172 0.000 0.828
#> SRR2105337 1 0.2711 0.78510 0.912 0.000 0.088
#> SRR2105338 1 0.2537 0.78953 0.920 0.000 0.080
#> SRR2105331 2 0.1647 0.91525 0.036 0.960 0.004
#> SRR2105332 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105333 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105334 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105329 3 0.0475 0.76638 0.004 0.004 0.992
#> SRR2105330 3 0.2261 0.73478 0.000 0.068 0.932
#> SRR2105327 2 0.0892 0.92172 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105328 2 0.0237 0.92440 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105325 3 0.5760 0.47983 0.328 0.000 0.672
#> SRR2105326 3 0.4887 0.63421 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105323 3 0.3038 0.74041 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105324 3 0.5810 0.44656 0.336 0.000 0.664
#> SRR2105319 3 0.4555 0.67281 0.200 0.000 0.800
#> SRR2105320 3 0.6291 0.06238 0.468 0.000 0.532
#> SRR2105321 3 0.6309 0.03855 0.500 0.000 0.500
#> SRR2105322 1 0.6126 0.30113 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105317 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105318 2 0.0237 0.92473 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105315 3 0.1491 0.76347 0.016 0.016 0.968
#> SRR2105316 2 0.3192 0.85951 0.000 0.888 0.112
#> SRR2105313 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105314 2 0.0424 0.92501 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105311 3 0.6235 0.22645 0.436 0.000 0.564
#> SRR2105312 1 0.6180 0.26536 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105307 1 0.2096 0.78749 0.944 0.004 0.052
#> SRR2105308 1 0.2280 0.78799 0.940 0.008 0.052
#> SRR2105309 3 0.3038 0.73973 0.104 0.000 0.896
#> SRR2105310 3 0.3816 0.71094 0.148 0.000 0.852
#> SRR2105305 3 0.4452 0.67344 0.192 0.000 0.808
#> SRR2105306 1 0.6026 0.46396 0.624 0.000 0.376
#> SRR2105303 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105301 2 0.2947 0.89406 0.060 0.920 0.020
#> SRR2105302 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105299 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105300 3 0.0000 0.76510 0.000 0.000 1.000
#> SRR2105297 2 0.6295 0.23301 0.472 0.528 0.000
#> SRR2105298 1 0.6280 -0.00686 0.540 0.460 0.000
#> SRR2105295 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105296 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105293 1 0.5859 0.44639 0.656 0.000 0.344
#> SRR2105294 1 0.5529 0.54270 0.704 0.000 0.296
#> SRR2105291 1 0.9292 0.27199 0.492 0.176 0.332
#> SRR2105292 1 0.6180 0.39976 0.584 0.000 0.416
#> SRR2105289 1 0.3340 0.76759 0.880 0.000 0.120
#> SRR2105290 1 0.0592 0.78150 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105287 1 0.4399 0.73704 0.812 0.000 0.188
#> SRR2105288 1 0.3532 0.77208 0.884 0.008 0.108
#> SRR2105285 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105286 2 0.0424 0.92542 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105283 2 0.6225 0.28128 0.000 0.568 0.432
#> SRR2105284 3 0.6168 0.25068 0.000 0.412 0.588
#> SRR2105281 2 0.0424 0.92478 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105282 2 0.0747 0.92433 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105259 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105260 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105279 2 0.1411 0.91884 0.036 0.964 0.000
#> SRR2105280 2 0.0424 0.92509 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105257 1 0.6126 0.42170 0.600 0.000 0.400
#> SRR2105258 1 0.5431 0.64736 0.716 0.000 0.284
#> SRR2105253 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105254 2 0.0237 0.92471 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105255 3 0.4121 0.70130 0.168 0.000 0.832
#> SRR2105256 3 0.5810 0.43484 0.336 0.000 0.664
#> SRR2105251 2 0.0237 0.92508 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105252 2 0.0892 0.92376 0.020 0.980 0.000
#> SRR2105249 2 0.4045 0.86534 0.104 0.872 0.024
#> SRR2105250 2 0.4737 0.85118 0.084 0.852 0.064
#> SRR2105247 2 0.0237 0.92473 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105248 2 0.0424 0.92483 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105245 1 0.0829 0.78099 0.984 0.004 0.012
#> SRR2105246 1 0.0592 0.77766 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105243 1 0.5098 0.66500 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105244 1 0.4346 0.72919 0.816 0.000 0.184
#> SRR2105241 1 0.2448 0.78828 0.924 0.000 0.076
#> SRR2105242 1 0.1964 0.79048 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105239 1 0.5325 0.65253 0.748 0.004 0.248
#> SRR2105240 1 0.2682 0.78457 0.920 0.004 0.076
#> SRR2105237 3 0.4555 0.60359 0.000 0.200 0.800
#> SRR2105238 3 0.6140 0.26688 0.000 0.404 0.596
#> SRR2105235 2 0.0237 0.92427 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105236 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105233 2 0.0592 0.92323 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105234 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105231 2 0.1289 0.92048 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105232 2 0.1964 0.91108 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105227 1 0.1999 0.78931 0.952 0.012 0.036
#> SRR2105228 1 0.0892 0.78507 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105225 1 0.6140 0.34596 0.596 0.000 0.404
#> SRR2105226 1 0.3482 0.77078 0.872 0.000 0.128
#> SRR2105229 3 0.1163 0.76689 0.028 0.000 0.972
#> SRR2105230 3 0.1964 0.76315 0.056 0.000 0.944
#> SRR2105219 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105220 2 0.0892 0.92077 0.000 0.980 0.020
#> SRR2105221 2 0.6704 0.41620 0.016 0.608 0.376
#> SRR2105222 2 0.2860 0.88127 0.004 0.912 0.084
#> SRR2105223 1 0.5733 0.57597 0.676 0.000 0.324
#> SRR2105224 1 0.4750 0.70879 0.784 0.000 0.216
#> SRR2105217 2 0.0747 0.92378 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105218 2 0.3116 0.87597 0.108 0.892 0.000
#> SRR2105215 2 0.0747 0.92440 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105216 2 0.1289 0.92021 0.032 0.968 0.000
#> SRR2105213 1 0.1860 0.77800 0.948 0.000 0.052
#> SRR2105214 1 0.1964 0.77731 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105211 3 0.4887 0.63682 0.228 0.000 0.772
#> SRR2105212 3 0.4555 0.66734 0.200 0.000 0.800
#> SRR2105209 1 0.5621 0.62169 0.692 0.000 0.308
#> SRR2105210 1 0.3116 0.78020 0.892 0.000 0.108
#> SRR2105207 1 0.5098 0.65663 0.752 0.000 0.248
#> SRR2105208 1 0.2301 0.78563 0.936 0.004 0.060
#> SRR2105205 2 0.0237 0.92506 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105206 2 0.0592 0.92430 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105201 2 0.2384 0.90166 0.008 0.936 0.056
#> SRR2105202 2 0.2116 0.91137 0.012 0.948 0.040
#> SRR2105203 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.0424 0.92514 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105200 2 0.1643 0.91644 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105197 3 0.0892 0.76623 0.020 0.000 0.980
#> SRR2105198 3 0.0424 0.76697 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105195 1 0.2945 0.78200 0.908 0.004 0.088
#> SRR2105196 1 0.4897 0.74526 0.812 0.016 0.172
#> SRR2105193 1 0.1129 0.78531 0.976 0.004 0.020
#> SRR2105194 1 0.0000 0.77719 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105191 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105192 3 0.1031 0.76728 0.024 0.000 0.976
#> SRR2105189 2 0.1765 0.91213 0.004 0.956 0.040
#> SRR2105190 2 0.0237 0.92493 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105187 3 0.7828 0.38985 0.068 0.340 0.592
#> SRR2105188 3 0.6917 0.35419 0.024 0.368 0.608
#> SRR2105179 1 0.6095 0.43156 0.608 0.000 0.392
#> SRR2105180 3 0.4784 0.65116 0.200 0.004 0.796
#> SRR2105183 2 0.2066 0.90865 0.060 0.940 0.000
#> SRR2105184 2 0.1964 0.91172 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105185 2 0.5785 0.58131 0.332 0.668 0.000
#> SRR2105186 2 0.1643 0.91653 0.044 0.956 0.000
#> SRR2105181 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105182 3 0.0747 0.76797 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105177 1 0.2173 0.76727 0.944 0.048 0.008
#> SRR2105178 1 0.2173 0.78604 0.944 0.008 0.048
#> SRR2105171 2 0.0237 0.92479 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105172 2 0.0237 0.92448 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105175 1 0.0424 0.78007 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105176 1 0.1711 0.78586 0.960 0.008 0.032
#> SRR2105173 2 0.2165 0.90564 0.064 0.936 0.000
#> SRR2105174 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0237 0.92476 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105170 2 0.3038 0.88180 0.104 0.896 0.000
#> SRR2105167 2 0.0424 0.92513 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105168 2 0.2537 0.89564 0.080 0.920 0.000
#> SRR2105165 1 0.5905 0.42127 0.648 0.000 0.352
#> SRR2105166 1 0.6267 0.12673 0.548 0.000 0.452
#> SRR2105163 3 0.6244 0.22092 0.440 0.000 0.560
#> SRR2105164 1 0.6225 0.20950 0.568 0.000 0.432
#> SRR2105161 1 0.0592 0.78128 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105162 1 0.1525 0.78598 0.964 0.004 0.032
#> SRR2105155 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105156 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105158 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105159 1 0.0747 0.78234 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105160 1 0.0424 0.77930 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105153 2 0.0592 0.92424 0.012 0.988 0.000
#> SRR2105154 2 0.0237 0.92471 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105151 2 0.0237 0.92482 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105152 2 0.0747 0.92475 0.016 0.984 0.000
#> SRR2105149 3 0.0424 0.76696 0.008 0.000 0.992
#> SRR2105150 3 0.2448 0.75610 0.076 0.000 0.924
#> SRR2105147 3 0.6140 0.31103 0.404 0.000 0.596
#> SRR2105148 3 0.6026 0.38148 0.376 0.000 0.624
#> SRR2105143 1 0.1878 0.76764 0.952 0.044 0.004
#> SRR2105144 1 0.3607 0.71127 0.880 0.112 0.008
#> SRR2105145 1 0.0237 0.77874 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105146 1 0.0424 0.77964 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105141 2 0.0237 0.92433 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105142 2 0.0000 0.92389 0.000 1.000 0.000
#> SRR2105139 2 0.0237 0.92482 0.004 0.996 0.000
#> SRR2105140 2 0.0424 0.92504 0.008 0.992 0.000
#> SRR2105137 2 0.4953 0.78131 0.016 0.808 0.176
#> SRR2105138 2 0.4047 0.82219 0.004 0.848 0.148
#> SRR2105135 2 0.2878 0.88725 0.096 0.904 0.000
#> SRR2105136 2 0.1964 0.91074 0.056 0.944 0.000
#> SRR2105133 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105134 3 0.0237 0.76657 0.004 0.000 0.996
#> SRR2105131 3 0.4558 0.70057 0.044 0.100 0.856
#> SRR2105132 3 0.1289 0.76312 0.032 0.000 0.968
#> SRR2105129 1 0.2703 0.76228 0.928 0.056 0.016
#> SRR2105130 1 0.2414 0.77210 0.940 0.040 0.020
#> SRR2105127 3 0.6398 0.21261 0.416 0.004 0.580
#> SRR2105128 3 0.5810 0.43067 0.336 0.000 0.664
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR2105277 3 0.0376 0.6739 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR2105278 3 0.0469 0.6758 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR2105275 4 0.4972 0.3117 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR2105276 4 0.5219 0.5847 0.044 0.000 0.244 0.712
#> SRR2105273 4 0.7563 0.3456 0.364 0.000 0.196 0.440
#> SRR2105274 1 0.6859 0.1022 0.512 0.000 0.108 0.380
#> SRR2105271 1 0.6123 0.5008 0.676 0.000 0.132 0.192
#> SRR2105272 1 0.3217 0.6728 0.860 0.000 0.012 0.128
#> SRR2105269 2 0.2469 0.8418 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR2105270 2 0.1118 0.8773 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR2105267 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105268 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105265 2 0.1557 0.8798 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR2105266 2 0.0707 0.8817 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.0657 0.8807 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR2105264 2 0.0376 0.8810 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105261 3 0.7899 -0.1197 0.312 0.016 0.484 0.188
#> SRR2105262 3 0.5589 0.4972 0.080 0.004 0.724 0.192
#> SRR2105357 3 0.0524 0.6737 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR2105358 3 0.0376 0.6739 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR2105439 2 0.5305 0.5429 0.016 0.648 0.332 0.004
#> SRR2105440 2 0.5400 0.3023 0.008 0.560 0.428 0.004
#> SRR2105509 2 0.2060 0.8660 0.000 0.932 0.052 0.016
#> SRR2105510 2 0.3335 0.8167 0.000 0.856 0.128 0.016
#> SRR2105507 1 0.6677 0.1327 0.524 0.000 0.092 0.384
#> SRR2105508 4 0.6801 0.0821 0.448 0.000 0.096 0.456
#> SRR2105505 1 0.3428 0.6425 0.844 0.000 0.144 0.012
#> SRR2105506 1 0.3217 0.6558 0.860 0.000 0.128 0.012
#> SRR2105503 2 0.0524 0.8823 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105504 2 0.3774 0.7928 0.004 0.820 0.008 0.168
#> SRR2105501 2 0.3649 0.8397 0.044 0.872 0.068 0.016
#> SRR2105502 2 0.3946 0.7840 0.020 0.812 0.000 0.168
#> SRR2105499 3 0.7325 -0.0245 0.368 0.000 0.472 0.160
#> SRR2105500 1 0.5536 0.5472 0.724 0.000 0.180 0.096
#> SRR2105497 2 0.4252 0.7250 0.252 0.744 0.000 0.004
#> SRR2105498 2 0.4761 0.6141 0.332 0.664 0.000 0.004
#> SRR2105495 2 0.4804 0.4316 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR2105496 2 0.3324 0.8090 0.000 0.852 0.136 0.012
#> SRR2105493 3 0.4372 0.4411 0.000 0.268 0.728 0.004
#> SRR2105494 3 0.4564 0.3825 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR2105491 2 0.4508 0.7767 0.036 0.780 0.000 0.184
#> SRR2105492 2 0.4630 0.7103 0.016 0.732 0.000 0.252
#> SRR2105489 2 0.3400 0.8201 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR2105490 2 0.4454 0.6688 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR2105487 3 0.1339 0.6719 0.008 0.004 0.964 0.024
#> SRR2105488 3 0.1339 0.6714 0.008 0.004 0.964 0.024
#> SRR2105485 3 0.5314 0.5278 0.176 0.000 0.740 0.084
#> SRR2105486 3 0.5727 0.4573 0.236 0.000 0.688 0.076
#> SRR2105483 1 0.1406 0.6789 0.960 0.024 0.000 0.016
#> SRR2105484 1 0.1520 0.6780 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR2105481 1 0.7541 -0.1681 0.424 0.000 0.388 0.188
#> SRR2105482 1 0.3581 0.6803 0.852 0.000 0.032 0.116
#> SRR2105479 1 0.4632 0.5007 0.688 0.000 0.004 0.308
#> SRR2105480 1 0.5771 0.1612 0.512 0.000 0.028 0.460
#> SRR2105477 2 0.6166 0.2817 0.008 0.544 0.412 0.036
#> SRR2105478 2 0.6178 0.3623 0.016 0.564 0.392 0.028
#> SRR2105475 2 0.4171 0.7897 0.000 0.824 0.116 0.060
#> SRR2105476 2 0.1635 0.8752 0.000 0.948 0.008 0.044
#> SRR2105473 3 0.7343 -0.0378 0.100 0.432 0.452 0.016
#> SRR2105474 2 0.6119 0.5537 0.040 0.632 0.312 0.016
#> SRR2105471 2 0.3837 0.7833 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR2105472 2 0.4193 0.7300 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR2105469 1 0.7862 -0.2798 0.388 0.000 0.332 0.280
#> SRR2105470 1 0.6855 0.3572 0.600 0.000 0.200 0.200
#> SRR2105467 3 0.3292 0.6544 0.080 0.004 0.880 0.036
#> SRR2105468 3 0.5269 0.5024 0.228 0.004 0.724 0.044
#> SRR2105465 1 0.1978 0.6930 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR2105466 1 0.0895 0.6908 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105463 1 0.0844 0.6901 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR2105464 1 0.0524 0.6876 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR2105461 2 0.2408 0.8658 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.2281 0.8678 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.1082 0.8824 0.004 0.972 0.004 0.020
#> SRR2105460 2 0.0376 0.8807 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105457 3 0.6656 0.3532 0.220 0.000 0.620 0.160
#> SRR2105458 3 0.2943 0.6585 0.032 0.000 0.892 0.076
#> SRR2105455 1 0.3810 0.6364 0.804 0.000 0.008 0.188
#> SRR2105456 1 0.3610 0.6232 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR2105453 3 0.5445 0.4733 0.240 0.004 0.708 0.048
#> SRR2105454 3 0.5099 0.5340 0.200 0.004 0.748 0.048
#> SRR2105451 3 0.5827 0.1599 0.004 0.436 0.536 0.024
#> SRR2105452 4 0.7294 0.6263 0.128 0.052 0.180 0.640
#> SRR2105449 1 0.2335 0.6986 0.928 0.008 0.020 0.044
#> SRR2105450 1 0.3925 0.6455 0.808 0.000 0.016 0.176
#> SRR2105447 2 0.3123 0.8162 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR2105448 2 0.4104 0.8198 0.164 0.808 0.000 0.028
#> SRR2105445 3 0.0592 0.6735 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR2105446 3 0.0336 0.6739 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105443 3 0.2919 0.6321 0.000 0.060 0.896 0.044
#> SRR2105444 3 0.3950 0.5497 0.008 0.160 0.820 0.012
#> SRR2105441 2 0.2799 0.8617 0.108 0.884 0.000 0.008
#> SRR2105442 2 0.3401 0.8394 0.152 0.840 0.000 0.008
#> SRR2105437 3 0.0817 0.6699 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR2105438 3 0.1940 0.6505 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR2105435 1 0.4687 0.5851 0.776 0.008 0.188 0.028
#> SRR2105436 3 0.6656 0.3424 0.220 0.000 0.620 0.160
#> SRR2105433 1 0.0707 0.6903 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105434 1 0.0592 0.6902 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105431 1 0.2310 0.6788 0.920 0.004 0.008 0.068
#> SRR2105432 1 0.2124 0.6878 0.932 0.000 0.028 0.040
#> SRR2105429 2 0.6770 0.6461 0.036 0.676 0.168 0.120
#> SRR2105430 2 0.6700 0.5922 0.016 0.644 0.108 0.232
#> SRR2105427 2 0.4546 0.6712 0.000 0.732 0.256 0.012
#> SRR2105428 2 0.4866 0.3784 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR2105425 2 0.4057 0.8155 0.160 0.812 0.000 0.028
#> SRR2105426 2 0.1474 0.8815 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR2105421 4 0.7617 0.5325 0.216 0.000 0.332 0.452
#> SRR2105422 4 0.7301 0.5831 0.232 0.000 0.232 0.536
#> SRR2105423 2 0.4123 0.7712 0.220 0.772 0.000 0.008
#> SRR2105424 2 0.3649 0.8003 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR2105419 3 0.6248 0.3747 0.120 0.000 0.656 0.224
#> SRR2105420 3 0.6397 0.3490 0.164 0.000 0.652 0.184
#> SRR2105415 1 0.6776 0.3845 0.628 0.012 0.244 0.116
#> SRR2105416 1 0.1953 0.6794 0.940 0.004 0.044 0.012
#> SRR2105417 1 0.2342 0.6947 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR2105418 1 0.1118 0.6895 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR2105413 2 0.0712 0.8809 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR2105414 2 0.1398 0.8773 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR2105409 2 0.1082 0.8842 0.020 0.972 0.004 0.004
#> SRR2105410 2 0.2131 0.8781 0.032 0.932 0.036 0.000
#> SRR2105411 2 0.2868 0.8479 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR2105412 2 0.3837 0.7774 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR2105407 3 0.1022 0.6716 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105408 3 0.0336 0.6736 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105403 3 0.2214 0.6727 0.044 0.000 0.928 0.028
#> SRR2105404 3 0.1042 0.6767 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR2105405 1 0.4049 0.6173 0.780 0.000 0.008 0.212
#> SRR2105406 1 0.3945 0.6159 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR2105401 3 0.5921 0.2986 0.012 0.372 0.592 0.024
#> SRR2105402 2 0.6657 0.3732 0.020 0.564 0.052 0.364
#> SRR2105399 3 0.3732 0.6385 0.000 0.056 0.852 0.092
#> SRR2105400 3 0.5366 0.5539 0.012 0.136 0.764 0.088
#> SRR2105397 3 0.4417 0.5489 0.000 0.044 0.796 0.160
#> SRR2105398 3 0.2861 0.6314 0.000 0.016 0.888 0.096
#> SRR2105395 2 0.0592 0.8818 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105396 2 0.0921 0.8827 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR2105393 2 0.0817 0.8790 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2105394 2 0.0469 0.8823 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR2105389 3 0.4253 0.5127 0.016 0.000 0.776 0.208
#> SRR2105390 3 0.3768 0.5606 0.008 0.000 0.808 0.184
#> SRR2105391 3 0.4464 0.5323 0.024 0.000 0.768 0.208
#> SRR2105392 3 0.2542 0.6524 0.012 0.000 0.904 0.084
#> SRR2105385 1 0.6490 0.4175 0.640 0.000 0.156 0.204
#> SRR2105386 1 0.7133 0.1519 0.520 0.000 0.148 0.332
#> SRR2105387 1 0.2125 0.6902 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR2105388 1 0.6464 0.3541 0.596 0.000 0.096 0.308
#> SRR2105381 2 0.5309 0.6845 0.020 0.728 0.024 0.228
#> SRR2105382 2 0.1661 0.8763 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR2105383 1 0.4585 0.3219 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR2105384 1 0.4855 0.2852 0.644 0.352 0.000 0.004
#> SRR2105379 2 0.1557 0.8737 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105380 2 0.5090 0.7086 0.044 0.728 0.000 0.228
#> SRR2105377 2 0.3818 0.8401 0.048 0.852 0.096 0.004
#> SRR2105378 2 0.3150 0.8588 0.036 0.888 0.072 0.004
#> SRR2105375 1 0.4859 0.6194 0.800 0.020 0.128 0.052
#> SRR2105376 1 0.2837 0.6715 0.904 0.012 0.068 0.016
#> SRR2105373 3 0.0469 0.6739 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR2105374 3 0.1022 0.6680 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR2105371 4 0.6961 0.4769 0.116 0.000 0.388 0.496
#> SRR2105372 4 0.7494 0.4966 0.188 0.000 0.352 0.460
#> SRR2105369 3 0.7143 -0.0109 0.380 0.000 0.484 0.136
#> SRR2105370 3 0.6783 0.0664 0.388 0.000 0.512 0.100
#> SRR2105367 1 0.6130 0.4254 0.668 0.008 0.248 0.076
#> SRR2105368 1 0.6505 0.4506 0.672 0.040 0.228 0.060
#> SRR2105365 2 0.1388 0.8808 0.012 0.960 0.000 0.028
#> SRR2105366 2 0.1022 0.8830 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105363 2 0.1940 0.8746 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR2105364 2 0.1211 0.8832 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR2105361 2 0.0376 0.8807 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105362 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105359 1 0.7970 -0.2798 0.396 0.004 0.256 0.344
#> SRR2105360 1 0.7122 0.1077 0.516 0.000 0.144 0.340
#> SRR2105355 1 0.6857 0.0577 0.492 0.000 0.104 0.404
#> SRR2105356 1 0.6058 0.4014 0.624 0.000 0.068 0.308
#> SRR2105353 4 0.7576 0.5827 0.212 0.000 0.324 0.464
#> SRR2105354 4 0.7609 0.4508 0.312 0.000 0.224 0.464
#> SRR2105351 2 0.1938 0.8779 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR2105352 2 0.6734 0.3441 0.008 0.544 0.076 0.372
#> SRR2105349 2 0.0817 0.8824 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105350 2 0.0524 0.8807 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR2105345 2 0.3676 0.8088 0.172 0.820 0.004 0.004
#> SRR2105346 2 0.2345 0.8662 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR2105347 1 0.5773 0.1646 0.592 0.376 0.004 0.028
#> SRR2105348 1 0.5203 0.2683 0.636 0.348 0.000 0.016
#> SRR2105343 2 0.2647 0.8585 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR2105344 2 0.0469 0.8786 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105341 3 0.7352 -0.1593 0.176 0.000 0.496 0.328
#> SRR2105342 3 0.7719 -0.1914 0.284 0.000 0.448 0.268
#> SRR2105339 4 0.7063 0.5248 0.132 0.000 0.360 0.508
#> SRR2105340 3 0.6451 -0.2663 0.068 0.000 0.476 0.456
#> SRR2105335 3 0.3547 0.6335 0.064 0.000 0.864 0.072
#> SRR2105336 3 0.3037 0.6417 0.100 0.000 0.880 0.020
#> SRR2105337 1 0.5740 0.5343 0.700 0.000 0.092 0.208
#> SRR2105338 1 0.3687 0.6721 0.856 0.000 0.064 0.080
#> SRR2105331 2 0.1356 0.8806 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR2105332 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105333 2 0.0707 0.8804 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR2105334 2 0.0188 0.8780 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105329 3 0.2587 0.6608 0.004 0.012 0.908 0.076
#> SRR2105330 3 0.3873 0.6204 0.000 0.096 0.844 0.060
#> SRR2105327 2 0.1576 0.8752 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR2105328 2 0.1211 0.8774 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR2105325 4 0.5290 0.3513 0.012 0.000 0.404 0.584
#> SRR2105326 3 0.4999 -0.1556 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR2105323 3 0.3731 0.6221 0.120 0.000 0.844 0.036
#> SRR2105324 3 0.6200 0.0129 0.444 0.000 0.504 0.052
#> SRR2105319 3 0.4630 0.4448 0.016 0.000 0.732 0.252
#> SRR2105320 3 0.6708 0.0134 0.096 0.000 0.528 0.376
#> SRR2105321 4 0.5328 0.6195 0.048 0.000 0.248 0.704
#> SRR2105322 4 0.5334 0.6621 0.088 0.000 0.172 0.740
#> SRR2105317 2 0.0188 0.8780 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105318 2 0.0376 0.8805 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2105315 3 0.3932 0.6259 0.008 0.020 0.832 0.140
#> SRR2105316 2 0.4545 0.7911 0.004 0.812 0.088 0.096
#> SRR2105313 2 0.0188 0.8796 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105314 2 0.0524 0.8810 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105311 4 0.4123 0.5918 0.008 0.000 0.220 0.772
#> SRR2105312 4 0.3529 0.6096 0.012 0.000 0.152 0.836
#> SRR2105307 1 0.0895 0.6918 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105308 1 0.1211 0.6926 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR2105309 3 0.4562 0.5756 0.056 0.000 0.792 0.152
#> SRR2105310 3 0.6362 0.3937 0.168 0.000 0.656 0.176
#> SRR2105305 3 0.6944 0.2458 0.216 0.000 0.588 0.196
#> SRR2105306 1 0.7188 0.1821 0.536 0.000 0.172 0.292
#> SRR2105303 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105304 2 0.1022 0.8781 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2105301 2 0.1489 0.8785 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR2105302 2 0.0336 0.8784 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105299 3 0.0188 0.6732 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105300 3 0.0188 0.6729 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105297 1 0.4422 0.4034 0.736 0.256 0.000 0.008
#> SRR2105298 1 0.4284 0.4704 0.780 0.200 0.000 0.020
#> SRR2105295 2 0.0336 0.8784 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR2105296 2 0.0592 0.8785 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105293 4 0.4591 0.6346 0.084 0.000 0.116 0.800
#> SRR2105294 4 0.6685 0.4318 0.324 0.000 0.108 0.568
#> SRR2105291 1 0.7696 0.3905 0.600 0.052 0.192 0.156
#> SRR2105292 1 0.7220 -0.0195 0.472 0.000 0.384 0.144
#> SRR2105289 1 0.5384 0.5881 0.728 0.000 0.076 0.196
#> SRR2105290 1 0.4053 0.5948 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR2105287 1 0.2669 0.6900 0.912 0.004 0.052 0.032
#> SRR2105288 1 0.1297 0.6933 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR2105285 2 0.0779 0.8813 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR2105286 2 0.1297 0.8811 0.016 0.964 0.000 0.020
#> SRR2105283 3 0.5400 0.1858 0.008 0.428 0.560 0.004
#> SRR2105284 3 0.4605 0.3717 0.000 0.336 0.664 0.000
#> SRR2105281 2 0.2266 0.8716 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR2105282 2 0.3402 0.8307 0.164 0.832 0.000 0.004
#> SRR2105259 3 0.0336 0.6744 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2105260 3 0.0188 0.6737 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105279 2 0.3401 0.8381 0.152 0.840 0.000 0.008
#> SRR2105280 2 0.2714 0.8615 0.112 0.884 0.000 0.004
#> SRR2105257 1 0.7134 0.1156 0.532 0.000 0.312 0.156
#> SRR2105258 1 0.6663 0.3806 0.612 0.000 0.244 0.144
#> SRR2105253 2 0.0657 0.8797 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105254 2 0.0336 0.8802 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105255 3 0.4745 0.5217 0.208 0.000 0.756 0.036
#> SRR2105256 3 0.6634 0.1985 0.336 0.000 0.564 0.100
#> SRR2105251 2 0.0188 0.8800 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105252 2 0.1902 0.8790 0.064 0.932 0.000 0.004
#> SRR2105249 2 0.7062 0.6503 0.188 0.640 0.144 0.028
#> SRR2105250 2 0.6346 0.6636 0.192 0.656 0.152 0.000
#> SRR2105247 2 0.0707 0.8826 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR2105248 2 0.0188 0.8795 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105245 1 0.5028 0.3355 0.596 0.004 0.000 0.400
#> SRR2105246 1 0.2888 0.6825 0.872 0.004 0.000 0.124
#> SRR2105243 1 0.4491 0.6154 0.800 0.000 0.140 0.060
#> SRR2105244 1 0.6474 0.4128 0.624 0.000 0.120 0.256
#> SRR2105241 1 0.2282 0.6948 0.924 0.000 0.024 0.052
#> SRR2105242 1 0.3694 0.6768 0.844 0.000 0.032 0.124
#> SRR2105239 1 0.4483 0.6574 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR2105240 1 0.0895 0.6922 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105237 3 0.3878 0.5564 0.004 0.156 0.824 0.016
#> SRR2105238 3 0.4773 0.4172 0.004 0.280 0.708 0.008
#> SRR2105235 2 0.1022 0.8785 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR2105236 2 0.0927 0.8830 0.016 0.976 0.008 0.000
#> SRR2105233 2 0.1302 0.8779 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR2105234 2 0.1557 0.8729 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR2105231 2 0.2124 0.8768 0.068 0.924 0.000 0.008
#> SRR2105232 2 0.2814 0.8524 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR2105227 1 0.3300 0.6681 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR2105228 1 0.2216 0.6881 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR2105225 4 0.7875 0.4472 0.328 0.000 0.288 0.384
#> SRR2105226 1 0.6340 0.3002 0.580 0.000 0.076 0.344
#> SRR2105229 3 0.0921 0.6711 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105230 3 0.2101 0.6636 0.012 0.000 0.928 0.060
#> SRR2105219 2 0.0188 0.8793 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR2105220 2 0.0895 0.8805 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR2105221 3 0.6437 0.3325 0.036 0.316 0.616 0.032
#> SRR2105222 2 0.5990 0.4898 0.036 0.604 0.352 0.008
#> SRR2105223 1 0.6860 0.3360 0.592 0.000 0.164 0.244
#> SRR2105224 1 0.6400 0.4071 0.632 0.000 0.116 0.252
#> SRR2105217 2 0.0817 0.8826 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR2105218 2 0.3351 0.8399 0.148 0.844 0.000 0.008
#> SRR2105215 2 0.2345 0.8654 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR2105216 2 0.2469 0.8627 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR2105213 4 0.5252 0.0949 0.420 0.004 0.004 0.572
#> SRR2105214 4 0.5353 0.1004 0.432 0.000 0.012 0.556
#> SRR2105211 3 0.6576 0.3554 0.220 0.000 0.628 0.152
#> SRR2105212 3 0.6808 0.1334 0.128 0.000 0.572 0.300
#> SRR2105209 1 0.4956 0.5719 0.756 0.000 0.188 0.056
#> SRR2105210 1 0.2335 0.6926 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR2105207 1 0.7582 0.0902 0.488 0.004 0.188 0.320
#> SRR2105208 1 0.2781 0.6765 0.904 0.008 0.016 0.072
#> SRR2105205 2 0.0657 0.8797 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR2105206 2 0.0592 0.8793 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2105201 2 0.4824 0.7053 0.024 0.744 0.228 0.004
#> SRR2105202 2 0.6172 0.7085 0.156 0.688 0.152 0.004
#> SRR2105203 2 0.0895 0.8829 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR2105204 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.1406 0.8825 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR2105200 2 0.3870 0.7950 0.208 0.788 0.000 0.004
#> SRR2105197 3 0.1302 0.6637 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR2105198 3 0.0921 0.6700 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR2105195 1 0.3505 0.6882 0.864 0.000 0.048 0.088
#> SRR2105196 1 0.3773 0.6660 0.872 0.040 0.044 0.044
#> SRR2105193 1 0.3216 0.6829 0.864 0.004 0.008 0.124
#> SRR2105194 1 0.3123 0.6584 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR2105191 3 0.0779 0.6751 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR2105192 3 0.1297 0.6756 0.016 0.000 0.964 0.020
#> SRR2105189 2 0.2124 0.8614 0.000 0.924 0.068 0.008
#> SRR2105190 2 0.0469 0.8799 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR2105187 2 0.7248 -0.0254 0.004 0.440 0.432 0.124
#> SRR2105188 3 0.6176 0.1589 0.000 0.424 0.524 0.052
#> SRR2105179 1 0.6219 0.2603 0.588 0.000 0.344 0.068
#> SRR2105180 3 0.4923 0.4891 0.240 0.004 0.732 0.024
#> SRR2105183 2 0.3982 0.7815 0.220 0.776 0.000 0.004
#> SRR2105184 2 0.3942 0.7670 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR2105185 2 0.5531 0.7135 0.140 0.732 0.000 0.128
#> SRR2105186 2 0.3032 0.8526 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR2105181 3 0.0336 0.6754 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR2105182 3 0.2124 0.6647 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR2105177 1 0.1388 0.6884 0.960 0.012 0.000 0.028
#> SRR2105178 1 0.1339 0.6855 0.964 0.008 0.004 0.024
#> SRR2105171 2 0.2149 0.8708 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR2105172 2 0.1118 0.8822 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105175 1 0.3801 0.6145 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR2105176 1 0.1489 0.6901 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR2105173 2 0.4049 0.7864 0.212 0.780 0.000 0.008
#> SRR2105174 2 0.1022 0.8820 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105169 2 0.0188 0.8796 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2105170 2 0.4331 0.7023 0.288 0.712 0.000 0.000
#> SRR2105167 2 0.2281 0.8687 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.3610 0.8016 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR2105165 4 0.7026 0.6483 0.180 0.000 0.248 0.572
#> SRR2105166 4 0.6887 0.5617 0.116 0.000 0.356 0.528
#> SRR2105163 4 0.4955 0.6000 0.024 0.000 0.268 0.708
#> SRR2105164 4 0.4677 0.6447 0.048 0.000 0.176 0.776
#> SRR2105161 1 0.4608 0.5132 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR2105162 1 0.1209 0.6907 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR2105155 2 0.1388 0.8828 0.028 0.960 0.000 0.012
#> SRR2105156 2 0.0336 0.8801 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105157 2 0.0524 0.8817 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR2105158 2 0.0592 0.8823 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR2105159 4 0.5024 0.2221 0.360 0.000 0.008 0.632
#> SRR2105160 1 0.5263 0.2438 0.544 0.000 0.008 0.448
#> SRR2105153 2 0.1022 0.8834 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR2105154 2 0.0336 0.8808 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.0188 0.8780 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105152 2 0.3074 0.8371 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR2105149 3 0.2494 0.6702 0.048 0.000 0.916 0.036
#> SRR2105150 3 0.3758 0.6345 0.104 0.000 0.848 0.048
#> SRR2105147 4 0.4706 0.5354 0.020 0.000 0.248 0.732
#> SRR2105148 4 0.4776 0.5276 0.016 0.000 0.272 0.712
#> SRR2105143 1 0.1004 0.6930 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105144 1 0.1452 0.6761 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR2105145 1 0.3444 0.6483 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR2105146 1 0.4877 0.3505 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR2105141 2 0.0469 0.8799 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR2105142 2 0.0188 0.8780 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2105139 2 0.0000 0.8782 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.1118 0.8823 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.5488 0.6220 0.028 0.692 0.268 0.012
#> SRR2105138 2 0.4500 0.5805 0.000 0.684 0.316 0.000
#> SRR2105135 2 0.5085 0.5384 0.376 0.616 0.000 0.008
#> SRR2105136 2 0.3311 0.8267 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR2105133 3 0.0188 0.6725 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR2105134 3 0.1059 0.6761 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR2105131 3 0.6339 0.5062 0.176 0.048 0.708 0.068
#> SRR2105132 3 0.2089 0.6701 0.048 0.000 0.932 0.020
#> SRR2105129 1 0.0469 0.6906 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105130 1 0.0469 0.6882 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105127 1 0.5693 0.3449 0.644 0.004 0.316 0.036
#> SRR2105128 3 0.5666 0.1329 0.460 0.004 0.520 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR2105277 5 0.0671 0.6596 0.000 0.000 0.016 0.004 0.980
#> SRR2105278 5 0.0740 0.6590 0.008 0.000 0.004 0.008 0.980
#> SRR2105275 4 0.5616 0.4699 0.000 0.000 0.080 0.536 0.384
#> SRR2105276 4 0.5702 0.6150 0.000 0.000 0.192 0.628 0.180
#> SRR2105273 3 0.2830 0.6332 0.080 0.000 0.876 0.000 0.044
#> SRR2105274 3 0.3152 0.6392 0.136 0.000 0.840 0.000 0.024
#> SRR2105271 1 0.6348 0.5477 0.636 0.000 0.196 0.072 0.096
#> SRR2105272 1 0.5055 0.5986 0.708 0.000 0.208 0.072 0.012
#> SRR2105269 2 0.3538 0.7665 0.004 0.816 0.004 0.016 0.160
#> SRR2105270 2 0.1671 0.8307 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR2105267 2 0.0854 0.8445 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008
#> SRR2105268 2 0.0451 0.8398 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105265 2 0.2249 0.8370 0.096 0.896 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105266 2 0.0609 0.8435 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105263 2 0.1026 0.8452 0.000 0.968 0.004 0.024 0.004
#> SRR2105264 2 0.0579 0.8440 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105261 5 0.7440 -0.0605 0.232 0.012 0.312 0.020 0.424
#> SRR2105262 5 0.6583 -0.1027 0.064 0.000 0.428 0.056 0.452
#> SRR2105357 5 0.0854 0.6606 0.004 0.000 0.012 0.008 0.976
#> SRR2105358 5 0.0566 0.6584 0.000 0.000 0.012 0.004 0.984
#> SRR2105439 2 0.4402 0.4158 0.004 0.620 0.000 0.004 0.372
#> SRR2105440 5 0.5081 0.0421 0.020 0.472 0.000 0.008 0.500
#> SRR2105509 2 0.1997 0.8391 0.000 0.932 0.024 0.016 0.028
#> SRR2105510 2 0.2990 0.8132 0.000 0.868 0.008 0.024 0.100
#> SRR2105507 3 0.3601 0.6423 0.136 0.000 0.824 0.008 0.032
#> SRR2105508 3 0.2775 0.6309 0.100 0.000 0.876 0.004 0.020
#> SRR2105505 1 0.4160 0.6781 0.804 0.000 0.068 0.016 0.112
#> SRR2105506 1 0.4065 0.6725 0.812 0.000 0.048 0.024 0.116
#> SRR2105503 2 0.1082 0.8480 0.028 0.964 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105504 2 0.4248 0.7595 0.004 0.800 0.092 0.096 0.008
#> SRR2105501 2 0.3344 0.8249 0.048 0.872 0.052 0.012 0.016
#> SRR2105502 2 0.4643 0.7311 0.008 0.768 0.124 0.096 0.004
#> SRR2105499 1 0.7359 -0.2095 0.340 0.000 0.304 0.024 0.332
#> SRR2105500 1 0.4960 0.6259 0.740 0.000 0.144 0.016 0.100
#> SRR2105497 2 0.4410 0.6734 0.276 0.700 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105498 2 0.4297 0.3135 0.472 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105495 2 0.4546 0.1494 0.000 0.532 0.000 0.008 0.460
#> SRR2105496 2 0.3450 0.7475 0.000 0.808 0.008 0.008 0.176
#> SRR2105493 5 0.3844 0.4978 0.000 0.256 0.004 0.004 0.736
#> SRR2105494 5 0.3944 0.4851 0.000 0.272 0.004 0.004 0.720
#> SRR2105491 2 0.5303 0.6541 0.044 0.672 0.028 0.256 0.000
#> SRR2105492 2 0.4896 0.6331 0.016 0.664 0.024 0.296 0.000
#> SRR2105489 2 0.4089 0.7261 0.244 0.736 0.004 0.016 0.000
#> SRR2105490 1 0.4743 -0.1906 0.512 0.472 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105487 5 0.2467 0.6401 0.024 0.000 0.016 0.052 0.908
#> SRR2105488 5 0.1314 0.6541 0.012 0.000 0.016 0.012 0.960
#> SRR2105485 5 0.5840 0.3665 0.108 0.000 0.280 0.008 0.604
#> SRR2105486 5 0.6168 0.3532 0.264 0.000 0.120 0.020 0.596
#> SRR2105483 1 0.1377 0.7064 0.956 0.004 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105484 1 0.0579 0.7033 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR2105481 5 0.8343 -0.2694 0.312 0.000 0.192 0.164 0.332
#> SRR2105482 1 0.5617 0.5568 0.668 0.000 0.232 0.064 0.036
#> SRR2105479 1 0.6586 0.2020 0.488 0.000 0.208 0.300 0.004
#> SRR2105480 4 0.7212 -0.0882 0.316 0.000 0.308 0.360 0.016
#> SRR2105477 5 0.6491 0.3503 0.020 0.312 0.016 0.088 0.564
#> SRR2105478 5 0.6892 0.3131 0.032 0.284 0.012 0.124 0.548
#> SRR2105475 2 0.4128 0.7816 0.000 0.816 0.092 0.032 0.060
#> SRR2105476 2 0.3883 0.8015 0.000 0.832 0.076 0.028 0.064
#> SRR2105473 5 0.6409 0.4015 0.156 0.216 0.012 0.012 0.604
#> SRR2105474 5 0.6237 0.0499 0.064 0.436 0.004 0.024 0.472
#> SRR2105471 2 0.5163 0.6142 0.296 0.636 0.000 0.068 0.000
#> SRR2105472 2 0.4872 0.3785 0.436 0.540 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105469 3 0.4599 0.6319 0.088 0.000 0.760 0.008 0.144
#> SRR2105470 3 0.6024 0.5778 0.236 0.000 0.612 0.012 0.140
#> SRR2105467 5 0.3739 0.6226 0.116 0.000 0.052 0.008 0.824
#> SRR2105468 5 0.4993 0.5378 0.184 0.000 0.068 0.020 0.728
#> SRR2105465 1 0.3280 0.6683 0.812 0.000 0.176 0.012 0.000
#> SRR2105466 1 0.2835 0.7021 0.868 0.004 0.112 0.016 0.000
#> SRR2105463 1 0.1862 0.7111 0.932 0.000 0.048 0.016 0.004
#> SRR2105464 1 0.1907 0.7102 0.928 0.000 0.044 0.028 0.000
#> SRR2105461 2 0.3274 0.7709 0.220 0.780 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105462 2 0.3143 0.7793 0.204 0.796 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105459 2 0.2673 0.8433 0.032 0.908 0.016 0.028 0.016
#> SRR2105460 2 0.0290 0.8409 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105457 5 0.6915 0.3214 0.148 0.000 0.264 0.048 0.540
#> SRR2105458 5 0.4261 0.5983 0.048 0.000 0.160 0.012 0.780
#> SRR2105455 1 0.4383 0.2595 0.572 0.000 0.424 0.000 0.004
#> SRR2105456 3 0.4640 0.3467 0.400 0.000 0.584 0.016 0.000
#> SRR2105453 5 0.4923 0.4287 0.284 0.000 0.020 0.024 0.672
#> SRR2105454 5 0.4953 0.4501 0.260 0.000 0.028 0.024 0.688
#> SRR2105451 5 0.5454 0.3372 0.012 0.352 0.032 0.008 0.596
#> SRR2105452 3 0.3547 0.5045 0.008 0.016 0.852 0.092 0.032
#> SRR2105449 1 0.3497 0.6901 0.828 0.000 0.140 0.020 0.012
#> SRR2105450 1 0.4803 -0.0519 0.500 0.000 0.484 0.012 0.004
#> SRR2105447 2 0.4789 0.4464 0.004 0.608 0.368 0.020 0.000
#> SRR2105448 2 0.4948 0.6512 0.280 0.672 0.036 0.012 0.000
#> SRR2105445 5 0.0510 0.6590 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR2105446 5 0.1041 0.6602 0.000 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR2105443 5 0.2887 0.6409 0.004 0.040 0.004 0.068 0.884
#> SRR2105444 5 0.2803 0.6303 0.012 0.088 0.004 0.012 0.884
#> SRR2105441 2 0.3435 0.8070 0.156 0.820 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105442 2 0.3944 0.7558 0.224 0.756 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105437 5 0.2068 0.6321 0.000 0.000 0.004 0.092 0.904
#> SRR2105438 5 0.2930 0.5808 0.000 0.000 0.004 0.164 0.832
#> SRR2105435 1 0.4850 0.6490 0.772 0.000 0.080 0.052 0.096
#> SRR2105436 3 0.6576 0.1716 0.120 0.000 0.436 0.020 0.424
#> SRR2105433 1 0.1872 0.7146 0.928 0.000 0.052 0.020 0.000
#> SRR2105434 1 0.2358 0.6999 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR2105431 1 0.2532 0.6980 0.892 0.000 0.012 0.088 0.008
#> SRR2105432 1 0.3331 0.6951 0.864 0.000 0.024 0.068 0.044
#> SRR2105429 2 0.8053 0.3626 0.032 0.524 0.160 0.148 0.136
#> SRR2105430 2 0.7247 0.3992 0.004 0.552 0.088 0.224 0.132
#> SRR2105427 2 0.5207 0.4597 0.016 0.624 0.004 0.024 0.332
#> SRR2105428 5 0.4644 0.1308 0.000 0.460 0.000 0.012 0.528
#> SRR2105425 2 0.4000 0.7906 0.180 0.784 0.016 0.020 0.000
#> SRR2105426 2 0.2006 0.8462 0.072 0.916 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105421 3 0.3565 0.5892 0.020 0.004 0.832 0.012 0.132
#> SRR2105422 3 0.2585 0.6106 0.024 0.000 0.896 0.008 0.072
#> SRR2105423 2 0.4238 0.7370 0.228 0.740 0.004 0.028 0.000
#> SRR2105424 2 0.3715 0.7264 0.260 0.736 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105419 3 0.4565 0.4417 0.028 0.000 0.664 0.000 0.308
#> SRR2105420 3 0.5592 0.3747 0.060 0.000 0.560 0.008 0.372
#> SRR2105415 1 0.6402 0.4217 0.620 0.016 0.020 0.120 0.224
#> SRR2105416 1 0.1405 0.6970 0.956 0.000 0.008 0.020 0.016
#> SRR2105417 1 0.4929 0.6929 0.764 0.004 0.128 0.068 0.036
#> SRR2105418 1 0.2580 0.7112 0.892 0.000 0.064 0.044 0.000
#> SRR2105413 2 0.3060 0.8006 0.000 0.848 0.128 0.024 0.000
#> SRR2105414 2 0.2597 0.8209 0.000 0.884 0.092 0.024 0.000
#> SRR2105409 2 0.2277 0.8476 0.028 0.920 0.000 0.024 0.028
#> SRR2105410 2 0.3494 0.8124 0.060 0.840 0.004 0.000 0.096
#> SRR2105411 2 0.3487 0.7654 0.212 0.780 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105412 2 0.4165 0.6433 0.320 0.672 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105407 5 0.2017 0.6530 0.000 0.000 0.080 0.008 0.912
#> SRR2105408 5 0.0898 0.6570 0.000 0.000 0.020 0.008 0.972
#> SRR2105403 5 0.2362 0.6595 0.024 0.000 0.032 0.028 0.916
#> SRR2105404 5 0.1393 0.6617 0.012 0.000 0.024 0.008 0.956
#> SRR2105405 3 0.4481 0.3104 0.416 0.000 0.576 0.008 0.000
#> SRR2105406 3 0.4574 0.3303 0.412 0.000 0.576 0.012 0.000
#> SRR2105401 5 0.6044 0.2451 0.028 0.404 0.024 0.020 0.524
#> SRR2105402 2 0.6393 0.2504 0.000 0.516 0.364 0.092 0.028
#> SRR2105399 5 0.4127 0.6176 0.000 0.044 0.144 0.016 0.796
#> SRR2105400 5 0.5523 0.5811 0.032 0.096 0.116 0.020 0.736
#> SRR2105397 5 0.5333 0.3938 0.000 0.052 0.032 0.228 0.688
#> SRR2105398 5 0.3592 0.5934 0.000 0.016 0.028 0.124 0.832
#> SRR2105395 2 0.1708 0.8496 0.032 0.944 0.016 0.004 0.004
#> SRR2105396 2 0.1864 0.8478 0.068 0.924 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105393 2 0.1399 0.8394 0.000 0.952 0.028 0.020 0.000
#> SRR2105394 2 0.1026 0.8470 0.024 0.968 0.004 0.004 0.000
#> SRR2105389 5 0.4803 0.0669 0.000 0.000 0.444 0.020 0.536
#> SRR2105390 5 0.4503 0.3884 0.000 0.000 0.312 0.024 0.664
#> SRR2105391 3 0.4702 0.0857 0.004 0.000 0.512 0.008 0.476
#> SRR2105392 5 0.3895 0.4336 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR2105385 3 0.5940 0.3172 0.392 0.000 0.520 0.012 0.076
#> SRR2105386 3 0.3984 0.6450 0.140 0.000 0.804 0.012 0.044
#> SRR2105387 1 0.4044 0.5832 0.732 0.000 0.252 0.012 0.004
#> SRR2105388 3 0.3944 0.5867 0.272 0.000 0.720 0.004 0.004
#> SRR2105381 2 0.4743 0.5235 0.004 0.640 0.332 0.024 0.000
#> SRR2105382 2 0.2444 0.8323 0.004 0.908 0.056 0.028 0.004
#> SRR2105383 1 0.3928 0.5556 0.788 0.176 0.028 0.008 0.000
#> SRR2105384 1 0.3755 0.6064 0.816 0.140 0.032 0.012 0.000
#> SRR2105379 2 0.1412 0.8446 0.004 0.952 0.008 0.036 0.000
#> SRR2105380 2 0.5282 0.6788 0.020 0.716 0.148 0.116 0.000
#> SRR2105377 2 0.6041 0.5582 0.108 0.620 0.016 0.004 0.252
#> SRR2105378 2 0.3609 0.7737 0.032 0.816 0.000 0.004 0.148
#> SRR2105375 1 0.5504 0.6033 0.748 0.036 0.032 0.096 0.088
#> SRR2105376 1 0.3464 0.6814 0.868 0.016 0.020 0.040 0.056
#> SRR2105373 5 0.1168 0.6521 0.000 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR2105374 5 0.1830 0.6433 0.000 0.000 0.008 0.068 0.924
#> SRR2105371 3 0.2952 0.5826 0.008 0.000 0.868 0.020 0.104
#> SRR2105372 3 0.2731 0.6068 0.016 0.000 0.876 0.004 0.104
#> SRR2105369 3 0.6887 0.4283 0.248 0.000 0.468 0.012 0.272
#> SRR2105370 3 0.7110 0.3074 0.244 0.000 0.396 0.016 0.344
#> SRR2105367 1 0.5856 0.4332 0.660 0.012 0.016 0.088 0.224
#> SRR2105368 1 0.6070 0.4800 0.680 0.036 0.020 0.084 0.180
#> SRR2105365 2 0.1408 0.8459 0.008 0.948 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105366 2 0.1740 0.8486 0.056 0.932 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105363 2 0.2844 0.8372 0.088 0.880 0.012 0.020 0.000
#> SRR2105364 2 0.2297 0.8461 0.060 0.912 0.000 0.020 0.008
#> SRR2105361 2 0.0854 0.8460 0.008 0.976 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105362 2 0.0451 0.8409 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105359 3 0.6999 0.4547 0.152 0.000 0.576 0.084 0.188
#> SRR2105360 3 0.6160 0.5812 0.200 0.000 0.648 0.060 0.092
#> SRR2105355 3 0.2873 0.6348 0.120 0.000 0.860 0.000 0.020
#> SRR2105356 3 0.4365 0.6260 0.224 0.000 0.736 0.004 0.036
#> SRR2105353 3 0.4347 0.5583 0.028 0.000 0.756 0.016 0.200
#> SRR2105354 3 0.3471 0.6377 0.072 0.000 0.836 0.000 0.092
#> SRR2105351 2 0.1405 0.8481 0.020 0.956 0.008 0.016 0.000
#> SRR2105352 2 0.7294 0.1725 0.000 0.484 0.288 0.172 0.056
#> SRR2105349 2 0.2293 0.8422 0.084 0.900 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105350 2 0.2213 0.8506 0.048 0.920 0.004 0.024 0.004
#> SRR2105345 2 0.3783 0.7906 0.160 0.808 0.008 0.016 0.008
#> SRR2105346 2 0.2068 0.8422 0.092 0.904 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105347 1 0.4448 0.5319 0.776 0.168 0.016 0.028 0.012
#> SRR2105348 1 0.3272 0.6308 0.856 0.100 0.012 0.032 0.000
#> SRR2105343 2 0.2953 0.8207 0.144 0.844 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105344 2 0.1216 0.8400 0.000 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR2105341 3 0.4380 0.5288 0.020 0.000 0.728 0.012 0.240
#> SRR2105342 3 0.5144 0.6021 0.088 0.000 0.716 0.016 0.180
#> SRR2105339 3 0.4089 0.5662 0.024 0.000 0.780 0.016 0.180
#> SRR2105340 3 0.5273 0.4127 0.020 0.000 0.656 0.044 0.280
#> SRR2105335 5 0.3840 0.6111 0.044 0.000 0.080 0.040 0.836
#> SRR2105336 5 0.2908 0.6445 0.068 0.000 0.032 0.016 0.884
#> SRR2105337 3 0.4791 0.4579 0.360 0.000 0.616 0.008 0.016
#> SRR2105338 1 0.4866 0.5600 0.708 0.000 0.236 0.020 0.036
#> SRR2105331 2 0.1282 0.8484 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000
#> SRR2105332 2 0.0162 0.8393 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105333 2 0.1756 0.8431 0.008 0.940 0.016 0.036 0.000
#> SRR2105334 2 0.0451 0.8398 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105329 5 0.3280 0.6403 0.004 0.024 0.120 0.004 0.848
#> SRR2105330 5 0.4745 0.5848 0.000 0.124 0.108 0.012 0.756
#> SRR2105327 2 0.1907 0.8388 0.000 0.928 0.044 0.028 0.000
#> SRR2105328 2 0.1836 0.8388 0.000 0.932 0.036 0.032 0.000
#> SRR2105325 4 0.4850 0.6484 0.000 0.000 0.076 0.700 0.224
#> SRR2105326 4 0.5515 0.6310 0.000 0.000 0.112 0.628 0.260
#> SRR2105323 5 0.3969 0.6187 0.064 0.000 0.088 0.024 0.824
#> SRR2105324 1 0.7037 -0.0259 0.384 0.000 0.244 0.012 0.360
#> SRR2105319 5 0.5256 0.1422 0.004 0.000 0.048 0.356 0.592
#> SRR2105320 4 0.6180 0.4686 0.028 0.000 0.076 0.544 0.352
#> SRR2105321 3 0.4146 0.5479 0.012 0.000 0.804 0.088 0.096
#> SRR2105322 3 0.4457 0.5229 0.020 0.000 0.784 0.124 0.072
#> SRR2105317 2 0.0898 0.8424 0.008 0.972 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105318 2 0.1522 0.8496 0.044 0.944 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105315 5 0.4995 0.4485 0.000 0.020 0.316 0.020 0.644
#> SRR2105316 2 0.4032 0.7696 0.004 0.812 0.124 0.012 0.048
#> SRR2105313 2 0.0889 0.8457 0.004 0.976 0.004 0.012 0.004
#> SRR2105314 2 0.0968 0.8444 0.012 0.972 0.004 0.012 0.000
#> SRR2105311 4 0.6235 0.3069 0.004 0.000 0.412 0.460 0.124
#> SRR2105312 3 0.5847 -0.2202 0.012 0.000 0.488 0.436 0.064
#> SRR2105307 1 0.3387 0.6968 0.836 0.000 0.132 0.024 0.008
#> SRR2105308 1 0.3724 0.6359 0.776 0.000 0.204 0.020 0.000
#> SRR2105309 5 0.4524 0.3789 0.020 0.000 0.336 0.000 0.644
#> SRR2105310 5 0.6430 -0.1036 0.112 0.000 0.424 0.016 0.448
#> SRR2105305 3 0.5692 0.3893 0.064 0.000 0.572 0.012 0.352
#> SRR2105306 3 0.4221 0.6457 0.160 0.000 0.780 0.008 0.052
#> SRR2105303 2 0.0404 0.8400 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105304 2 0.1728 0.8422 0.004 0.940 0.020 0.036 0.000
#> SRR2105301 2 0.2480 0.8414 0.004 0.912 0.024 0.044 0.016
#> SRR2105302 2 0.1235 0.8449 0.004 0.964 0.004 0.016 0.012
#> SRR2105299 5 0.0898 0.6590 0.000 0.000 0.020 0.008 0.972
#> SRR2105300 5 0.1300 0.6556 0.000 0.000 0.028 0.016 0.956
#> SRR2105297 1 0.3013 0.6476 0.876 0.084 0.004 0.028 0.008
#> SRR2105298 1 0.2464 0.6621 0.908 0.048 0.012 0.032 0.000
#> SRR2105295 2 0.1082 0.8420 0.000 0.964 0.008 0.028 0.000
#> SRR2105296 2 0.0912 0.8407 0.000 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR2105293 4 0.6251 0.3025 0.032 0.000 0.400 0.500 0.068
#> SRR2105294 3 0.6562 0.3524 0.124 0.000 0.584 0.248 0.044
#> SRR2105291 3 0.6042 0.5765 0.240 0.016 0.644 0.020 0.080
#> SRR2105292 3 0.7592 0.2432 0.260 0.004 0.392 0.036 0.308
#> SRR2105289 1 0.5903 -0.1152 0.468 0.000 0.460 0.044 0.028
#> SRR2105290 3 0.4767 0.3056 0.420 0.000 0.560 0.020 0.000
#> SRR2105287 1 0.3213 0.7112 0.872 0.000 0.060 0.028 0.040
#> SRR2105288 1 0.1981 0.7118 0.920 0.000 0.064 0.016 0.000
#> SRR2105285 2 0.1996 0.8437 0.004 0.932 0.040 0.016 0.008
#> SRR2105286 2 0.1911 0.8406 0.004 0.932 0.036 0.028 0.000
#> SRR2105283 5 0.4178 0.4594 0.000 0.292 0.004 0.008 0.696
#> SRR2105284 5 0.4344 0.4950 0.004 0.256 0.012 0.008 0.720
#> SRR2105281 2 0.3628 0.7688 0.216 0.772 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105282 2 0.4184 0.6848 0.284 0.700 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105259 5 0.1251 0.6592 0.000 0.000 0.036 0.008 0.956
#> SRR2105260 5 0.1082 0.6575 0.000 0.000 0.028 0.008 0.964
#> SRR2105279 2 0.4193 0.6677 0.304 0.684 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105280 2 0.3748 0.8010 0.164 0.804 0.012 0.020 0.000
#> SRR2105257 1 0.7079 -0.0644 0.396 0.000 0.316 0.012 0.276
#> SRR2105258 1 0.7615 0.1061 0.424 0.000 0.264 0.056 0.256
#> SRR2105253 2 0.0693 0.8419 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR2105254 2 0.0613 0.8427 0.008 0.984 0.004 0.000 0.004
#> SRR2105255 5 0.5278 0.4992 0.136 0.000 0.156 0.008 0.700
#> SRR2105256 5 0.6751 0.1828 0.220 0.000 0.248 0.016 0.516
#> SRR2105251 2 0.0898 0.8468 0.020 0.972 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105252 2 0.3572 0.8247 0.064 0.840 0.008 0.088 0.000
#> SRR2105249 2 0.7467 0.1971 0.304 0.420 0.020 0.012 0.244
#> SRR2105250 2 0.6155 0.5036 0.196 0.580 0.000 0.004 0.220
#> SRR2105247 2 0.1569 0.8504 0.044 0.944 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105248 2 0.0880 0.8471 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105245 3 0.6519 0.3029 0.340 0.000 0.456 0.204 0.000
#> SRR2105246 1 0.5319 0.5800 0.676 0.000 0.212 0.108 0.004
#> SRR2105243 1 0.5592 0.2739 0.576 0.000 0.356 0.012 0.056
#> SRR2105244 3 0.4916 0.5986 0.268 0.000 0.680 0.008 0.044
#> SRR2105241 1 0.4796 0.5196 0.664 0.000 0.300 0.028 0.008
#> SRR2105242 1 0.4790 0.4335 0.628 0.000 0.344 0.004 0.024
#> SRR2105239 1 0.5672 0.4397 0.624 0.004 0.300 0.024 0.048
#> SRR2105240 1 0.2407 0.7063 0.896 0.000 0.088 0.012 0.004
#> SRR2105237 5 0.3170 0.5849 0.000 0.160 0.004 0.008 0.828
#> SRR2105238 5 0.3789 0.5373 0.000 0.212 0.000 0.020 0.768
#> SRR2105235 2 0.1830 0.8417 0.012 0.932 0.000 0.004 0.052
#> SRR2105236 2 0.1173 0.8457 0.012 0.964 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105233 2 0.2848 0.8123 0.000 0.868 0.104 0.028 0.000
#> SRR2105234 2 0.2423 0.8247 0.000 0.896 0.080 0.024 0.000
#> SRR2105231 2 0.4347 0.7890 0.136 0.780 0.008 0.076 0.000
#> SRR2105232 2 0.3606 0.8034 0.164 0.808 0.004 0.024 0.000
#> SRR2105227 3 0.5002 0.0356 0.484 0.000 0.492 0.016 0.008
#> SRR2105228 1 0.5124 0.5155 0.668 0.000 0.260 0.068 0.004
#> SRR2105225 3 0.4928 0.5943 0.072 0.000 0.748 0.028 0.152
#> SRR2105226 3 0.4268 0.6204 0.216 0.000 0.748 0.008 0.028
#> SRR2105229 5 0.1774 0.6515 0.000 0.000 0.016 0.052 0.932
#> SRR2105230 5 0.3183 0.6211 0.008 0.000 0.108 0.028 0.856
#> SRR2105219 2 0.0486 0.8402 0.004 0.988 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105220 2 0.2305 0.8222 0.000 0.896 0.000 0.012 0.092
#> SRR2105221 5 0.5228 0.5471 0.060 0.144 0.016 0.032 0.748
#> SRR2105222 5 0.5227 0.3627 0.032 0.336 0.000 0.016 0.616
#> SRR2105223 3 0.4425 0.6257 0.216 0.000 0.740 0.008 0.036
#> SRR2105224 3 0.4748 0.6271 0.208 0.000 0.732 0.024 0.036
#> SRR2105217 2 0.1990 0.8470 0.040 0.928 0.004 0.028 0.000
#> SRR2105218 2 0.3340 0.8229 0.124 0.840 0.004 0.032 0.000
#> SRR2105215 2 0.3081 0.8105 0.156 0.832 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105216 2 0.2763 0.8172 0.148 0.848 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105213 3 0.5611 0.4565 0.148 0.000 0.652 0.196 0.004
#> SRR2105214 3 0.3882 0.5931 0.168 0.000 0.788 0.044 0.000
#> SRR2105211 5 0.6531 -0.0571 0.128 0.000 0.384 0.016 0.472
#> SRR2105212 3 0.4757 0.4171 0.016 0.000 0.648 0.012 0.324
#> SRR2105209 1 0.6365 0.4546 0.592 0.000 0.204 0.020 0.184
#> SRR2105210 1 0.4510 0.6931 0.792 0.000 0.092 0.036 0.080
#> SRR2105207 4 0.7234 0.3363 0.312 0.012 0.028 0.484 0.164
#> SRR2105208 1 0.3280 0.6862 0.856 0.004 0.016 0.108 0.016
#> SRR2105205 2 0.1772 0.8470 0.016 0.944 0.004 0.012 0.024
#> SRR2105206 2 0.1668 0.8376 0.000 0.940 0.028 0.032 0.000
#> SRR2105201 2 0.4851 0.3939 0.016 0.608 0.004 0.004 0.368
#> SRR2105202 2 0.7286 -0.0286 0.196 0.404 0.012 0.016 0.372
#> SRR2105203 2 0.0865 0.8465 0.024 0.972 0.004 0.000 0.000
#> SRR2105204 2 0.0290 0.8406 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105199 2 0.1517 0.8495 0.028 0.952 0.004 0.012 0.004
#> SRR2105200 2 0.3949 0.6670 0.300 0.696 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105197 5 0.2305 0.6301 0.000 0.000 0.012 0.092 0.896
#> SRR2105198 5 0.1168 0.6528 0.000 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR2105195 1 0.5121 0.6527 0.736 0.000 0.080 0.152 0.032
#> SRR2105196 1 0.4170 0.7034 0.832 0.016 0.060 0.048 0.044
#> SRR2105193 1 0.3773 0.6820 0.800 0.000 0.164 0.032 0.004
#> SRR2105194 1 0.4674 0.5825 0.708 0.000 0.232 0.060 0.000
#> SRR2105191 5 0.1280 0.6616 0.008 0.000 0.024 0.008 0.960
#> SRR2105192 5 0.1012 0.6578 0.020 0.000 0.012 0.000 0.968
#> SRR2105189 2 0.3981 0.8024 0.008 0.832 0.060 0.020 0.080
#> SRR2105190 2 0.0740 0.8432 0.008 0.980 0.000 0.008 0.004
#> SRR2105187 5 0.6309 0.2743 0.000 0.288 0.000 0.192 0.520
#> SRR2105188 5 0.6142 0.2634 0.000 0.368 0.004 0.120 0.508
#> SRR2105179 1 0.6664 0.2072 0.520 0.000 0.072 0.064 0.344
#> SRR2105180 5 0.5094 0.5117 0.208 0.004 0.052 0.020 0.716
#> SRR2105183 2 0.4540 0.5976 0.340 0.640 0.000 0.020 0.000
#> SRR2105184 2 0.4504 0.4266 0.428 0.564 0.000 0.008 0.000
#> SRR2105185 2 0.3868 0.7849 0.056 0.824 0.104 0.016 0.000
#> SRR2105186 2 0.3211 0.8089 0.164 0.824 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105181 5 0.0854 0.6604 0.008 0.000 0.012 0.004 0.976
#> SRR2105182 5 0.3132 0.6008 0.000 0.000 0.172 0.008 0.820
#> SRR2105177 1 0.2378 0.7128 0.904 0.000 0.048 0.048 0.000
#> SRR2105178 1 0.1885 0.6997 0.932 0.004 0.020 0.044 0.000
#> SRR2105171 2 0.3606 0.7996 0.164 0.808 0.000 0.024 0.004
#> SRR2105172 2 0.2332 0.8408 0.076 0.904 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105175 1 0.5502 0.5639 0.652 0.000 0.156 0.192 0.000
#> SRR2105176 1 0.3299 0.6915 0.856 0.004 0.040 0.096 0.004
#> SRR2105173 2 0.4709 0.6079 0.324 0.648 0.004 0.024 0.000
#> SRR2105174 2 0.1357 0.8491 0.048 0.948 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105169 2 0.0671 0.8436 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105170 2 0.4590 0.4440 0.420 0.568 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105167 2 0.2074 0.8364 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105168 2 0.3395 0.7515 0.236 0.764 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105165 3 0.4904 0.5818 0.044 0.000 0.760 0.064 0.132
#> SRR2105166 3 0.5979 0.4335 0.020 0.000 0.636 0.132 0.212
#> SRR2105163 3 0.5038 0.4000 0.008 0.000 0.724 0.128 0.140
#> SRR2105164 3 0.4288 0.4589 0.008 0.000 0.776 0.160 0.056
#> SRR2105161 1 0.6273 0.2520 0.512 0.000 0.316 0.172 0.000
#> SRR2105162 1 0.2426 0.7085 0.900 0.000 0.036 0.064 0.000
#> SRR2105155 2 0.1442 0.8494 0.032 0.952 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105156 2 0.0671 0.8441 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105157 2 0.1211 0.8479 0.016 0.960 0.000 0.024 0.000
#> SRR2105158 2 0.0912 0.8460 0.016 0.972 0.000 0.012 0.000
#> SRR2105159 4 0.6418 0.2996 0.184 0.000 0.264 0.544 0.008
#> SRR2105160 4 0.5492 0.3416 0.292 0.004 0.056 0.636 0.012
#> SRR2105153 2 0.0798 0.8462 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105154 2 0.0290 0.8425 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105151 2 0.1173 0.8474 0.020 0.964 0.000 0.012 0.004
#> SRR2105152 2 0.3661 0.7056 0.276 0.724 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105149 5 0.3815 0.6295 0.060 0.000 0.088 0.020 0.832
#> SRR2105150 5 0.5455 0.4878 0.148 0.000 0.132 0.020 0.700
#> SRR2105147 4 0.4466 0.6430 0.000 0.000 0.076 0.748 0.176
#> SRR2105148 4 0.4800 0.6475 0.000 0.000 0.088 0.716 0.196
#> SRR2105143 1 0.2172 0.7108 0.908 0.000 0.076 0.016 0.000
#> SRR2105144 1 0.1830 0.7116 0.932 0.004 0.052 0.012 0.000
#> SRR2105145 1 0.5026 0.3304 0.588 0.000 0.372 0.040 0.000
#> SRR2105146 3 0.6030 0.4236 0.316 0.000 0.544 0.140 0.000
#> SRR2105141 2 0.1651 0.8465 0.008 0.944 0.012 0.036 0.000
#> SRR2105142 2 0.0451 0.8402 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR2105139 2 0.0609 0.8453 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105140 2 0.1410 0.8471 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR2105137 2 0.5499 0.6226 0.044 0.688 0.028 0.012 0.228
#> SRR2105138 2 0.4594 0.0242 0.000 0.508 0.004 0.004 0.484
#> SRR2105135 1 0.4718 -0.0680 0.540 0.444 0.000 0.016 0.000
#> SRR2105136 2 0.3231 0.7869 0.196 0.800 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105133 5 0.0451 0.6574 0.000 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR2105134 5 0.1095 0.6606 0.012 0.000 0.008 0.012 0.968
#> SRR2105131 5 0.6836 0.3600 0.248 0.048 0.100 0.016 0.588
#> SRR2105132 5 0.1670 0.6575 0.052 0.000 0.012 0.000 0.936
#> SRR2105129 1 0.2423 0.7125 0.896 0.000 0.080 0.024 0.000
#> SRR2105130 1 0.2036 0.7127 0.920 0.000 0.056 0.024 0.000
#> SRR2105127 1 0.5959 0.3570 0.608 0.008 0.048 0.032 0.304
#> SRR2105128 5 0.5759 0.2612 0.392 0.000 0.044 0.024 0.540
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR2105277 5 0.1528 0.5849 0.012 0.000 0.028 0.000 0.944 0.016
#> SRR2105278 5 0.1577 0.5870 0.008 0.000 0.016 0.000 0.940 0.036
#> SRR2105275 4 0.5309 0.3510 0.000 0.000 0.056 0.584 0.328 0.032
#> SRR2105276 4 0.5128 0.5287 0.008 0.000 0.232 0.660 0.088 0.012
#> SRR2105273 3 0.3981 0.5109 0.088 0.000 0.808 0.008 0.036 0.060
#> SRR2105274 3 0.3390 0.5077 0.140 0.000 0.816 0.000 0.016 0.028
#> SRR2105271 1 0.6615 0.3425 0.592 0.000 0.144 0.032 0.076 0.156
#> SRR2105272 1 0.5848 0.3394 0.560 0.000 0.288 0.032 0.000 0.120
#> SRR2105269 2 0.3771 0.7594 0.012 0.796 0.000 0.008 0.148 0.036
#> SRR2105270 2 0.2678 0.7921 0.000 0.860 0.000 0.004 0.116 0.020
#> SRR2105267 2 0.1622 0.8242 0.028 0.940 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR2105268 2 0.0508 0.8104 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105265 2 0.2971 0.8100 0.144 0.832 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR2105266 2 0.1082 0.8193 0.040 0.956 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2105263 2 0.1793 0.8221 0.004 0.932 0.000 0.016 0.008 0.040
#> SRR2105264 2 0.1590 0.8226 0.012 0.944 0.000 0.008 0.008 0.028
#> SRR2105261 5 0.7890 -0.3479 0.240 0.016 0.244 0.008 0.372 0.120
#> SRR2105262 5 0.6665 -0.1819 0.024 0.000 0.368 0.016 0.416 0.176
#> SRR2105357 5 0.1036 0.5861 0.000 0.000 0.008 0.004 0.964 0.024
#> SRR2105358 5 0.1245 0.5851 0.000 0.000 0.016 0.000 0.952 0.032
#> SRR2105439 2 0.4979 0.3854 0.008 0.576 0.000 0.004 0.364 0.048
#> SRR2105440 2 0.4996 0.2472 0.020 0.532 0.000 0.008 0.420 0.020
#> SRR2105509 2 0.2526 0.8167 0.000 0.896 0.020 0.004 0.052 0.028
#> SRR2105510 2 0.2723 0.7880 0.000 0.852 0.004 0.000 0.128 0.016
#> SRR2105507 3 0.4670 0.4551 0.108 0.000 0.716 0.004 0.008 0.164
#> SRR2105508 3 0.3717 0.4969 0.092 0.000 0.808 0.000 0.016 0.084
#> SRR2105505 1 0.5291 0.4517 0.696 0.000 0.096 0.000 0.104 0.104
#> SRR2105506 1 0.5526 0.4255 0.660 0.000 0.084 0.000 0.080 0.176
#> SRR2105503 2 0.1786 0.8260 0.032 0.932 0.004 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105504 2 0.4882 0.7105 0.004 0.744 0.064 0.072 0.004 0.112
#> SRR2105501 2 0.4603 0.7809 0.128 0.764 0.048 0.000 0.032 0.028
#> SRR2105502 2 0.5470 0.6417 0.004 0.680 0.100 0.068 0.000 0.148
#> SRR2105499 1 0.7680 -0.3827 0.324 0.000 0.292 0.004 0.172 0.208
#> SRR2105500 1 0.6376 0.2536 0.532 0.000 0.172 0.000 0.056 0.240
#> SRR2105497 2 0.4191 0.6804 0.284 0.684 0.004 0.004 0.000 0.024
#> SRR2105498 1 0.4756 -0.2517 0.488 0.464 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105495 2 0.5007 0.0462 0.008 0.480 0.000 0.004 0.468 0.040
#> SRR2105496 2 0.3829 0.7431 0.012 0.784 0.012 0.000 0.168 0.024
#> SRR2105493 5 0.4217 0.3938 0.000 0.296 0.000 0.008 0.672 0.024
#> SRR2105494 5 0.4288 0.3837 0.000 0.308 0.000 0.012 0.660 0.020
#> SRR2105491 2 0.5456 0.6432 0.052 0.640 0.008 0.248 0.000 0.052
#> SRR2105492 2 0.4908 0.6678 0.016 0.672 0.012 0.252 0.000 0.048
#> SRR2105489 2 0.3705 0.7608 0.224 0.748 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105490 2 0.5092 0.4238 0.428 0.512 0.000 0.008 0.004 0.048
#> SRR2105487 5 0.2645 0.5781 0.008 0.000 0.008 0.044 0.888 0.052
#> SRR2105488 5 0.2295 0.5834 0.016 0.000 0.004 0.024 0.908 0.048
#> SRR2105485 5 0.7057 -0.1102 0.144 0.000 0.212 0.008 0.500 0.136
#> SRR2105486 5 0.7019 -0.1030 0.220 0.000 0.104 0.008 0.496 0.172
#> SRR2105483 1 0.1434 0.5645 0.940 0.000 0.012 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105484 1 0.1152 0.5575 0.952 0.004 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2105481 6 0.8893 0.0000 0.216 0.000 0.156 0.160 0.224 0.244
#> SRR2105482 1 0.7096 0.1559 0.488 0.000 0.208 0.056 0.028 0.220
#> SRR2105479 1 0.7821 0.0183 0.400 0.012 0.220 0.216 0.008 0.144
#> SRR2105480 3 0.7339 -0.0291 0.284 0.000 0.320 0.308 0.004 0.084
#> SRR2105477 5 0.6400 0.3270 0.024 0.260 0.000 0.100 0.564 0.052
#> SRR2105478 5 0.6871 0.2787 0.020 0.264 0.000 0.092 0.516 0.108
#> SRR2105475 2 0.3964 0.7753 0.000 0.816 0.072 0.024 0.064 0.024
#> SRR2105476 2 0.3218 0.8150 0.000 0.864 0.040 0.020 0.052 0.024
#> SRR2105473 5 0.6114 0.3208 0.120 0.240 0.000 0.008 0.584 0.048
#> SRR2105474 5 0.5580 -0.0205 0.048 0.440 0.000 0.000 0.468 0.044
#> SRR2105471 2 0.5888 0.5405 0.312 0.560 0.000 0.064 0.004 0.060
#> SRR2105472 2 0.5415 0.3623 0.444 0.480 0.000 0.024 0.004 0.048
#> SRR2105469 3 0.6100 0.3800 0.152 0.000 0.608 0.000 0.096 0.144
#> SRR2105470 3 0.6216 0.3141 0.256 0.000 0.568 0.004 0.092 0.080
#> SRR2105467 5 0.4894 0.4667 0.060 0.000 0.104 0.004 0.736 0.096
#> SRR2105468 5 0.6874 -0.0469 0.164 0.000 0.112 0.008 0.528 0.188
#> SRR2105465 1 0.4062 0.5442 0.736 0.000 0.196 0.000 0.000 0.068
#> SRR2105466 1 0.4563 0.5281 0.700 0.000 0.136 0.000 0.000 0.164
#> SRR2105463 1 0.3728 0.5645 0.788 0.000 0.068 0.000 0.004 0.140
#> SRR2105464 1 0.2452 0.5719 0.884 0.004 0.028 0.000 0.000 0.084
#> SRR2105461 2 0.4507 0.7120 0.252 0.680 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR2105462 2 0.4023 0.7368 0.240 0.720 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR2105459 2 0.2296 0.8270 0.020 0.908 0.008 0.000 0.012 0.052
#> SRR2105460 2 0.1088 0.8151 0.024 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105457 5 0.7227 -0.1281 0.112 0.000 0.272 0.008 0.444 0.164
#> SRR2105458 5 0.6038 0.2945 0.068 0.000 0.224 0.004 0.600 0.104
#> SRR2105455 1 0.5258 0.2651 0.524 0.000 0.384 0.000 0.004 0.088
#> SRR2105456 3 0.4400 0.3012 0.376 0.000 0.592 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105453 5 0.5182 0.3512 0.200 0.000 0.020 0.008 0.676 0.096
#> SRR2105454 5 0.4559 0.4184 0.172 0.000 0.008 0.004 0.724 0.092
#> SRR2105451 5 0.5340 0.2449 0.012 0.380 0.004 0.008 0.548 0.048
#> SRR2105452 3 0.4895 0.4168 0.012 0.028 0.760 0.048 0.036 0.116
#> SRR2105449 1 0.4542 0.5579 0.736 0.004 0.124 0.004 0.004 0.128
#> SRR2105450 1 0.5502 0.1987 0.508 0.000 0.392 0.004 0.008 0.088
#> SRR2105447 2 0.5407 0.4090 0.016 0.552 0.368 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105448 2 0.5925 0.5829 0.276 0.584 0.036 0.012 0.000 0.092
#> SRR2105445 5 0.2562 0.5932 0.000 0.016 0.028 0.020 0.900 0.036
#> SRR2105446 5 0.1930 0.5891 0.000 0.000 0.028 0.012 0.924 0.036
#> SRR2105443 5 0.4121 0.5580 0.008 0.060 0.004 0.068 0.808 0.052
#> SRR2105444 5 0.4025 0.5276 0.008 0.128 0.004 0.020 0.796 0.044
#> SRR2105441 2 0.4082 0.7858 0.168 0.768 0.000 0.004 0.020 0.040
#> SRR2105442 2 0.4232 0.7660 0.188 0.744 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR2105437 5 0.3419 0.5420 0.004 0.000 0.008 0.148 0.812 0.028
#> SRR2105438 5 0.4540 0.4355 0.004 0.000 0.016 0.244 0.696 0.040
#> SRR2105435 1 0.5444 0.4362 0.688 0.000 0.068 0.008 0.088 0.148
#> SRR2105436 3 0.7229 -0.0699 0.136 0.000 0.432 0.004 0.280 0.148
#> SRR2105433 1 0.3694 0.5759 0.784 0.000 0.076 0.000 0.000 0.140
#> SRR2105434 1 0.3254 0.5694 0.816 0.000 0.136 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105431 1 0.5207 0.5192 0.716 0.000 0.044 0.108 0.016 0.116
#> SRR2105432 1 0.5029 0.5410 0.728 0.000 0.052 0.036 0.032 0.152
#> SRR2105429 2 0.8985 0.2016 0.136 0.420 0.100 0.128 0.108 0.108
#> SRR2105430 2 0.7954 0.2379 0.008 0.460 0.152 0.208 0.108 0.064
#> SRR2105427 2 0.5050 0.5918 0.008 0.664 0.008 0.012 0.256 0.052
#> SRR2105428 2 0.3804 0.2990 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR2105425 2 0.4938 0.7506 0.192 0.712 0.024 0.012 0.004 0.056
#> SRR2105426 2 0.3494 0.8074 0.156 0.804 0.004 0.008 0.000 0.028
#> SRR2105421 3 0.3771 0.4727 0.028 0.000 0.804 0.000 0.120 0.048
#> SRR2105422 3 0.2421 0.4881 0.008 0.004 0.904 0.008 0.052 0.024
#> SRR2105423 2 0.4046 0.7815 0.176 0.752 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR2105424 2 0.4145 0.7197 0.252 0.700 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105419 3 0.5653 0.1698 0.052 0.000 0.560 0.000 0.328 0.060
#> SRR2105420 3 0.6053 0.0210 0.068 0.000 0.484 0.000 0.380 0.068
#> SRR2105415 1 0.7340 -0.0353 0.520 0.016 0.020 0.152 0.196 0.096
#> SRR2105416 1 0.3312 0.5587 0.828 0.000 0.020 0.012 0.008 0.132
#> SRR2105417 1 0.5314 0.5179 0.708 0.000 0.128 0.024 0.036 0.104
#> SRR2105418 1 0.3498 0.5644 0.828 0.000 0.092 0.024 0.000 0.056
#> SRR2105413 2 0.3816 0.7809 0.004 0.800 0.096 0.008 0.000 0.092
#> SRR2105414 2 0.3561 0.7993 0.000 0.836 0.052 0.028 0.008 0.076
#> SRR2105409 2 0.2973 0.8266 0.036 0.868 0.000 0.000 0.040 0.056
#> SRR2105410 2 0.4533 0.7657 0.056 0.756 0.000 0.000 0.116 0.072
#> SRR2105411 2 0.4202 0.7534 0.208 0.732 0.000 0.004 0.004 0.052
#> SRR2105412 2 0.4981 0.6047 0.332 0.600 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR2105407 5 0.2813 0.5741 0.000 0.000 0.092 0.008 0.864 0.036
#> SRR2105408 5 0.2519 0.5845 0.000 0.000 0.044 0.016 0.892 0.048
#> SRR2105403 5 0.2950 0.5767 0.004 0.000 0.048 0.008 0.864 0.076
#> SRR2105404 5 0.2214 0.5865 0.012 0.000 0.028 0.004 0.912 0.044
#> SRR2105405 1 0.5224 0.0400 0.468 0.000 0.440 0.000 0.000 0.092
#> SRR2105406 3 0.4886 0.1038 0.432 0.000 0.508 0.000 0.000 0.060
#> SRR2105401 5 0.6299 0.1952 0.032 0.392 0.020 0.012 0.484 0.060
#> SRR2105402 2 0.6901 0.1384 0.000 0.460 0.336 0.060 0.024 0.120
#> SRR2105399 5 0.4846 0.5407 0.024 0.036 0.136 0.016 0.756 0.032
#> SRR2105400 5 0.6828 0.3949 0.044 0.140 0.088 0.016 0.612 0.100
#> SRR2105397 5 0.5620 0.3500 0.000 0.056 0.032 0.264 0.624 0.024
#> SRR2105398 5 0.4437 0.5104 0.000 0.024 0.020 0.172 0.752 0.032
#> SRR2105395 2 0.2423 0.8308 0.048 0.896 0.000 0.004 0.004 0.048
#> SRR2105396 2 0.2433 0.8252 0.084 0.888 0.000 0.004 0.004 0.020
#> SRR2105393 2 0.2452 0.8206 0.008 0.900 0.016 0.020 0.000 0.056
#> SRR2105394 2 0.1364 0.8190 0.020 0.952 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR2105389 5 0.5072 -0.0125 0.000 0.000 0.464 0.028 0.480 0.028
#> SRR2105390 5 0.4956 0.2784 0.000 0.000 0.328 0.028 0.608 0.036
#> SRR2105391 3 0.5292 -0.0314 0.004 0.000 0.492 0.008 0.432 0.064
#> SRR2105392 5 0.4452 0.3286 0.000 0.000 0.312 0.004 0.644 0.040
#> SRR2105385 3 0.6101 0.2501 0.300 0.000 0.532 0.000 0.044 0.124
#> SRR2105386 3 0.4252 0.4987 0.164 0.000 0.756 0.000 0.028 0.052
#> SRR2105387 1 0.5084 0.4338 0.612 0.000 0.264 0.000 0.000 0.124
#> SRR2105388 3 0.4865 0.4013 0.296 0.000 0.640 0.004 0.016 0.044
#> SRR2105381 2 0.6422 0.2399 0.024 0.484 0.372 0.024 0.008 0.088
#> SRR2105382 2 0.3132 0.8097 0.008 0.856 0.072 0.008 0.000 0.056
#> SRR2105383 1 0.3850 0.5084 0.804 0.076 0.016 0.004 0.000 0.100
#> SRR2105384 1 0.4180 0.5010 0.780 0.092 0.020 0.004 0.000 0.104
#> SRR2105379 2 0.2985 0.8123 0.004 0.872 0.048 0.032 0.000 0.044
#> SRR2105380 2 0.4826 0.7580 0.012 0.752 0.096 0.072 0.000 0.068
#> SRR2105377 2 0.5856 0.5466 0.092 0.600 0.000 0.004 0.252 0.052
#> SRR2105378 2 0.4222 0.7568 0.048 0.776 0.000 0.008 0.140 0.028
#> SRR2105375 1 0.6878 0.2272 0.544 0.012 0.052 0.032 0.104 0.256
#> SRR2105376 1 0.4987 0.4898 0.716 0.008 0.016 0.024 0.048 0.188
#> SRR2105373 5 0.2640 0.5830 0.004 0.000 0.032 0.040 0.892 0.032
#> SRR2105374 5 0.3220 0.5628 0.000 0.000 0.016 0.088 0.844 0.052
#> SRR2105371 3 0.2408 0.4854 0.004 0.000 0.896 0.008 0.068 0.024
#> SRR2105372 3 0.2307 0.5005 0.024 0.000 0.900 0.000 0.064 0.012
#> SRR2105369 3 0.7390 -0.1464 0.224 0.000 0.396 0.004 0.260 0.116
#> SRR2105370 3 0.7454 -0.2474 0.268 0.000 0.312 0.000 0.296 0.124
#> SRR2105367 1 0.6244 -0.0469 0.536 0.004 0.000 0.036 0.268 0.156
#> SRR2105368 1 0.6985 -0.1122 0.444 0.012 0.016 0.020 0.228 0.280
#> SRR2105365 2 0.3418 0.8111 0.020 0.840 0.004 0.068 0.000 0.068
#> SRR2105366 2 0.2851 0.8273 0.080 0.868 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR2105363 2 0.4768 0.7685 0.136 0.732 0.016 0.000 0.012 0.104
#> SRR2105364 2 0.1908 0.8279 0.056 0.916 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105361 2 0.1608 0.8216 0.020 0.944 0.000 0.008 0.008 0.020
#> SRR2105362 2 0.1109 0.8166 0.012 0.964 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR2105359 3 0.8372 -0.2482 0.168 0.008 0.396 0.064 0.168 0.196
#> SRR2105360 3 0.7174 0.1377 0.228 0.000 0.476 0.044 0.040 0.212
#> SRR2105355 3 0.3457 0.5045 0.116 0.000 0.820 0.000 0.012 0.052
#> SRR2105356 3 0.4452 0.4867 0.204 0.000 0.728 0.004 0.032 0.032
#> SRR2105353 3 0.5220 0.3779 0.020 0.000 0.704 0.048 0.172 0.056
#> SRR2105354 3 0.4399 0.5042 0.096 0.000 0.784 0.016 0.060 0.044
#> SRR2105351 2 0.2803 0.8278 0.064 0.872 0.000 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105352 2 0.7481 0.0955 0.000 0.448 0.288 0.100 0.044 0.120
#> SRR2105349 2 0.4110 0.7649 0.184 0.744 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR2105350 2 0.2344 0.8293 0.052 0.896 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR2105345 2 0.4373 0.7614 0.152 0.740 0.004 0.000 0.004 0.100
#> SRR2105346 2 0.2872 0.8116 0.152 0.832 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105347 1 0.5450 0.2956 0.644 0.192 0.004 0.004 0.012 0.144
#> SRR2105348 1 0.4142 0.4648 0.776 0.096 0.004 0.012 0.000 0.112
#> SRR2105343 2 0.4082 0.7779 0.188 0.748 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR2105344 2 0.1983 0.8193 0.012 0.924 0.008 0.012 0.000 0.044
#> SRR2105341 3 0.4762 0.3935 0.024 0.000 0.712 0.008 0.200 0.056
#> SRR2105342 3 0.5434 0.4193 0.076 0.000 0.676 0.000 0.148 0.100
#> SRR2105339 3 0.5286 0.3930 0.020 0.000 0.692 0.024 0.168 0.096
#> SRR2105340 3 0.5167 0.3182 0.020 0.000 0.676 0.028 0.228 0.048
#> SRR2105335 5 0.4949 0.4805 0.076 0.000 0.092 0.044 0.752 0.036
#> SRR2105336 5 0.3565 0.5480 0.056 0.000 0.048 0.020 0.844 0.032
#> SRR2105337 3 0.5718 0.3470 0.320 0.000 0.560 0.000 0.048 0.072
#> SRR2105338 1 0.6256 0.2826 0.552 0.000 0.276 0.008 0.052 0.112
#> SRR2105331 2 0.2100 0.8244 0.008 0.916 0.004 0.024 0.000 0.048
#> SRR2105332 2 0.0363 0.8077 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105333 2 0.1983 0.8235 0.008 0.924 0.012 0.012 0.000 0.044
#> SRR2105334 2 0.0508 0.8096 0.004 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105329 5 0.3956 0.5470 0.000 0.040 0.144 0.000 0.784 0.032
#> SRR2105330 5 0.5813 0.4194 0.000 0.176 0.116 0.000 0.632 0.076
#> SRR2105327 2 0.2115 0.8178 0.000 0.916 0.032 0.020 0.000 0.032
#> SRR2105328 2 0.2271 0.8153 0.000 0.908 0.024 0.032 0.000 0.036
#> SRR2105325 4 0.4502 0.5609 0.000 0.000 0.116 0.732 0.140 0.012
#> SRR2105326 4 0.5124 0.5247 0.000 0.000 0.128 0.664 0.192 0.016
#> SRR2105323 5 0.5372 0.3760 0.056 0.000 0.120 0.004 0.688 0.132
#> SRR2105324 5 0.7509 -0.5375 0.304 0.000 0.188 0.000 0.336 0.172
#> SRR2105319 5 0.5217 -0.0466 0.004 0.000 0.044 0.440 0.496 0.016
#> SRR2105320 4 0.6332 0.3142 0.032 0.000 0.104 0.560 0.272 0.032
#> SRR2105321 3 0.4013 0.4450 0.008 0.000 0.800 0.108 0.056 0.028
#> SRR2105322 3 0.3759 0.4362 0.016 0.000 0.808 0.132 0.020 0.024
#> SRR2105317 2 0.1007 0.8168 0.004 0.968 0.008 0.000 0.004 0.016
#> SRR2105318 2 0.1980 0.8291 0.036 0.920 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105315 5 0.5748 0.3654 0.000 0.040 0.272 0.012 0.604 0.072
#> SRR2105316 2 0.3594 0.7809 0.000 0.820 0.104 0.000 0.048 0.028
#> SRR2105313 2 0.1452 0.8249 0.008 0.948 0.004 0.008 0.000 0.032
#> SRR2105314 2 0.1810 0.8242 0.020 0.932 0.004 0.008 0.000 0.036
#> SRR2105311 4 0.6087 0.4126 0.000 0.000 0.324 0.508 0.136 0.032
#> SRR2105312 3 0.5579 -0.0340 0.004 0.000 0.560 0.340 0.064 0.032
#> SRR2105307 1 0.4827 0.5365 0.688 0.000 0.176 0.008 0.000 0.128
#> SRR2105308 1 0.4694 0.5018 0.684 0.000 0.212 0.004 0.000 0.100
#> SRR2105309 5 0.5522 0.1350 0.032 0.000 0.356 0.004 0.552 0.056
#> SRR2105310 3 0.6804 -0.0963 0.068 0.000 0.424 0.004 0.356 0.148
#> SRR2105305 3 0.6621 0.0854 0.068 0.000 0.492 0.004 0.300 0.136
#> SRR2105306 3 0.4060 0.4906 0.180 0.000 0.760 0.000 0.032 0.028
#> SRR2105303 2 0.1148 0.8182 0.016 0.960 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105304 2 0.3588 0.7868 0.004 0.828 0.020 0.040 0.004 0.104
#> SRR2105301 2 0.3661 0.8091 0.012 0.848 0.028 0.036 0.024 0.052
#> SRR2105302 2 0.1624 0.8206 0.012 0.936 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR2105299 5 0.2351 0.5891 0.000 0.000 0.036 0.028 0.904 0.032
#> SRR2105300 5 0.1966 0.5858 0.000 0.000 0.028 0.024 0.924 0.024
#> SRR2105297 1 0.3824 0.4978 0.804 0.052 0.004 0.012 0.004 0.124
#> SRR2105298 1 0.3111 0.5150 0.836 0.032 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR2105295 2 0.1413 0.8196 0.000 0.948 0.004 0.004 0.008 0.036
#> SRR2105296 2 0.0798 0.8106 0.004 0.976 0.004 0.004 0.000 0.012
#> SRR2105293 4 0.5953 0.2545 0.032 0.000 0.416 0.480 0.036 0.036
#> SRR2105294 3 0.6162 0.2941 0.068 0.000 0.596 0.252 0.036 0.048
#> SRR2105291 3 0.6994 0.1960 0.272 0.020 0.480 0.000 0.060 0.168
#> SRR2105292 3 0.8301 -0.5223 0.228 0.000 0.280 0.036 0.232 0.224
#> SRR2105289 1 0.6292 0.0869 0.460 0.000 0.392 0.012 0.036 0.100
#> SRR2105290 3 0.5122 0.1759 0.404 0.000 0.520 0.004 0.000 0.072
#> SRR2105287 1 0.4638 0.5186 0.744 0.000 0.036 0.016 0.040 0.164
#> SRR2105288 1 0.3068 0.5657 0.840 0.000 0.072 0.000 0.000 0.088
#> SRR2105285 2 0.2941 0.8189 0.020 0.872 0.056 0.000 0.004 0.048
#> SRR2105286 2 0.2495 0.8232 0.020 0.900 0.048 0.008 0.000 0.024
#> SRR2105283 5 0.4587 0.3829 0.008 0.304 0.012 0.008 0.656 0.012
#> SRR2105284 5 0.5607 0.3326 0.004 0.320 0.016 0.012 0.580 0.068
#> SRR2105281 2 0.5127 0.6689 0.252 0.640 0.004 0.008 0.000 0.096
#> SRR2105282 2 0.4623 0.6677 0.292 0.652 0.004 0.004 0.000 0.048
#> SRR2105259 5 0.1873 0.5853 0.000 0.000 0.048 0.008 0.924 0.020
#> SRR2105260 5 0.2326 0.5876 0.004 0.000 0.028 0.020 0.908 0.040
#> SRR2105279 2 0.4780 0.6016 0.336 0.612 0.000 0.008 0.004 0.040
#> SRR2105280 2 0.3293 0.8153 0.132 0.824 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR2105257 3 0.7941 -0.4757 0.284 0.000 0.312 0.016 0.184 0.204
#> SRR2105258 1 0.8337 -0.4245 0.324 0.000 0.240 0.052 0.176 0.208
#> SRR2105253 2 0.1059 0.8178 0.016 0.964 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR2105254 2 0.1686 0.8265 0.064 0.924 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR2105255 5 0.5890 0.2579 0.140 0.000 0.140 0.008 0.644 0.068
#> SRR2105256 5 0.7020 -0.2813 0.188 0.000 0.268 0.000 0.444 0.100
#> SRR2105251 2 0.1464 0.8244 0.036 0.944 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR2105252 2 0.3329 0.8207 0.052 0.844 0.000 0.072 0.000 0.032
#> SRR2105249 2 0.7078 0.2530 0.292 0.432 0.012 0.000 0.204 0.060
#> SRR2105250 2 0.6244 0.5464 0.144 0.576 0.004 0.000 0.216 0.060
#> SRR2105247 2 0.2928 0.8236 0.084 0.856 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR2105248 2 0.1053 0.8181 0.020 0.964 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR2105245 1 0.7376 0.0230 0.392 0.000 0.288 0.120 0.004 0.196
#> SRR2105246 1 0.6159 0.4399 0.600 0.004 0.188 0.072 0.000 0.136
#> SRR2105243 1 0.6359 0.2201 0.540 0.000 0.272 0.004 0.064 0.120
#> SRR2105244 3 0.6052 0.2778 0.292 0.004 0.536 0.000 0.024 0.144
#> SRR2105241 1 0.5126 0.3370 0.576 0.000 0.344 0.004 0.004 0.072
#> SRR2105242 1 0.5131 0.3480 0.576 0.000 0.356 0.004 0.016 0.048
#> SRR2105239 1 0.6862 0.1053 0.456 0.008 0.260 0.004 0.036 0.236
#> SRR2105240 1 0.3405 0.5641 0.812 0.000 0.076 0.000 0.000 0.112
#> SRR2105237 5 0.3440 0.5491 0.000 0.116 0.000 0.020 0.824 0.040
#> SRR2105238 5 0.4253 0.4711 0.000 0.204 0.008 0.016 0.740 0.032
#> SRR2105235 2 0.2195 0.8185 0.012 0.904 0.000 0.000 0.068 0.016
#> SRR2105236 2 0.1401 0.8226 0.028 0.948 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR2105233 2 0.2995 0.8044 0.000 0.860 0.092 0.008 0.008 0.032
#> SRR2105234 2 0.1889 0.8170 0.000 0.920 0.056 0.004 0.000 0.020
#> SRR2105231 2 0.4085 0.8080 0.088 0.792 0.000 0.044 0.000 0.076
#> SRR2105232 2 0.4187 0.7592 0.224 0.732 0.004 0.024 0.004 0.012
#> SRR2105227 3 0.6237 -0.0337 0.404 0.004 0.408 0.008 0.004 0.172
#> SRR2105228 1 0.5785 0.3080 0.544 0.000 0.252 0.008 0.000 0.196
#> SRR2105225 3 0.5297 0.4751 0.088 0.000 0.716 0.016 0.108 0.072
#> SRR2105226 3 0.4969 0.4472 0.228 0.000 0.680 0.004 0.028 0.060
#> SRR2105229 5 0.2772 0.5809 0.004 0.000 0.020 0.080 0.876 0.020
#> SRR2105230 5 0.4674 0.4898 0.012 0.000 0.156 0.048 0.744 0.040
#> SRR2105219 2 0.1406 0.8220 0.016 0.952 0.000 0.004 0.020 0.008
#> SRR2105220 2 0.2675 0.8196 0.004 0.880 0.004 0.000 0.052 0.060
#> SRR2105221 5 0.5634 0.4442 0.040 0.136 0.004 0.016 0.680 0.124
#> SRR2105222 5 0.5583 0.3089 0.040 0.324 0.000 0.012 0.580 0.044
#> SRR2105223 3 0.6116 0.3288 0.276 0.000 0.540 0.000 0.040 0.144
#> SRR2105224 3 0.5224 0.3989 0.280 0.000 0.620 0.004 0.012 0.084
#> SRR2105217 2 0.1511 0.8241 0.032 0.944 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR2105218 2 0.3983 0.7928 0.164 0.768 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR2105215 2 0.4292 0.7878 0.136 0.760 0.000 0.012 0.004 0.088
#> SRR2105216 2 0.3243 0.8088 0.156 0.812 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105213 3 0.6887 0.1973 0.180 0.000 0.504 0.136 0.000 0.180
#> SRR2105214 3 0.4990 0.4507 0.204 0.000 0.692 0.032 0.004 0.068
#> SRR2105211 5 0.7162 -0.3346 0.116 0.000 0.332 0.004 0.404 0.144
#> SRR2105212 3 0.5338 0.2871 0.008 0.000 0.648 0.016 0.224 0.104
#> SRR2105209 1 0.6772 0.0926 0.524 0.000 0.176 0.000 0.144 0.156
#> SRR2105210 1 0.5631 0.4820 0.676 0.000 0.100 0.016 0.056 0.152
#> SRR2105207 4 0.8090 -0.1910 0.288 0.000 0.056 0.364 0.144 0.148
#> SRR2105208 1 0.3860 0.5573 0.816 0.000 0.032 0.084 0.008 0.060
#> SRR2105205 2 0.3452 0.8205 0.068 0.848 0.008 0.004 0.048 0.024
#> SRR2105206 2 0.2067 0.8212 0.004 0.916 0.048 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105201 2 0.4905 0.3905 0.036 0.584 0.000 0.008 0.364 0.008
#> SRR2105202 2 0.7210 0.2007 0.212 0.416 0.000 0.008 0.284 0.080
#> SRR2105203 2 0.1426 0.8217 0.028 0.948 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR2105204 2 0.0717 0.8133 0.016 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR2105199 2 0.2332 0.8288 0.036 0.904 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR2105200 2 0.4753 0.6577 0.296 0.640 0.004 0.000 0.004 0.056
#> SRR2105197 5 0.3050 0.5655 0.000 0.000 0.028 0.108 0.848 0.016
#> SRR2105198 5 0.2831 0.5807 0.000 0.000 0.016 0.064 0.872 0.048
#> SRR2105195 1 0.6171 0.4376 0.628 0.000 0.076 0.092 0.024 0.180
#> SRR2105196 1 0.6132 0.4824 0.648 0.020 0.084 0.036 0.028 0.184
#> SRR2105193 1 0.5667 0.4819 0.640 0.004 0.188 0.028 0.004 0.136
#> SRR2105194 1 0.5269 0.4838 0.664 0.000 0.208 0.044 0.000 0.084
#> SRR2105191 5 0.2946 0.5700 0.004 0.000 0.016 0.016 0.856 0.108
#> SRR2105192 5 0.1768 0.5850 0.012 0.000 0.004 0.008 0.932 0.044
#> SRR2105189 2 0.5182 0.7459 0.032 0.732 0.052 0.000 0.108 0.076
#> SRR2105190 2 0.1970 0.8270 0.028 0.920 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR2105187 5 0.6331 0.2104 0.000 0.312 0.000 0.204 0.460 0.024
#> SRR2105188 5 0.6134 0.2085 0.000 0.344 0.000 0.180 0.460 0.016
#> SRR2105179 1 0.7524 -0.3400 0.420 0.000 0.072 0.036 0.276 0.196
#> SRR2105180 5 0.6220 0.2384 0.140 0.008 0.032 0.012 0.596 0.212
#> SRR2105183 2 0.4999 0.5383 0.364 0.564 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR2105184 2 0.4586 0.5235 0.400 0.564 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR2105185 2 0.5017 0.7451 0.088 0.732 0.116 0.012 0.000 0.052
#> SRR2105186 2 0.3986 0.7679 0.204 0.748 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR2105181 5 0.2745 0.5847 0.004 0.000 0.024 0.020 0.880 0.072
#> SRR2105182 5 0.4422 0.4682 0.008 0.000 0.200 0.004 0.724 0.064
#> SRR2105177 1 0.4013 0.5596 0.768 0.000 0.052 0.016 0.000 0.164
#> SRR2105178 1 0.3254 0.5405 0.804 0.000 0.008 0.016 0.000 0.172
#> SRR2105171 2 0.4542 0.7477 0.196 0.720 0.000 0.004 0.012 0.068
#> SRR2105172 2 0.3206 0.8216 0.108 0.836 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR2105175 1 0.6871 0.2623 0.484 0.000 0.148 0.116 0.000 0.252
#> SRR2105176 1 0.4226 0.5280 0.744 0.000 0.032 0.032 0.000 0.192
#> SRR2105173 2 0.5103 0.6616 0.240 0.644 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR2105174 2 0.2201 0.8290 0.076 0.896 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105169 2 0.1972 0.8281 0.056 0.916 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105170 2 0.4691 0.6235 0.332 0.616 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR2105167 2 0.1908 0.8234 0.096 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2105168 2 0.3833 0.7499 0.232 0.736 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR2105165 3 0.5394 0.4137 0.024 0.000 0.704 0.056 0.144 0.072
#> SRR2105166 3 0.5877 0.3345 0.012 0.000 0.640 0.084 0.192 0.072
#> SRR2105163 3 0.5632 0.2476 0.004 0.000 0.664 0.160 0.084 0.088
#> SRR2105164 3 0.4622 0.3188 0.012 0.000 0.716 0.212 0.020 0.040
#> SRR2105161 1 0.6688 0.1751 0.492 0.000 0.248 0.188 0.000 0.072
#> SRR2105162 1 0.3034 0.5679 0.864 0.000 0.032 0.056 0.000 0.048
#> SRR2105155 2 0.2492 0.8278 0.068 0.888 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR2105156 2 0.0748 0.8126 0.016 0.976 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR2105157 2 0.2027 0.8264 0.032 0.920 0.000 0.016 0.000 0.032
#> SRR2105158 2 0.1857 0.8222 0.028 0.928 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR2105159 4 0.7388 -0.0740 0.172 0.004 0.244 0.440 0.004 0.136
#> SRR2105160 4 0.6125 0.1526 0.244 0.000 0.068 0.596 0.016 0.076
#> SRR2105153 2 0.1257 0.8221 0.028 0.952 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR2105154 2 0.1245 0.8215 0.032 0.952 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105151 2 0.3016 0.8271 0.068 0.868 0.004 0.012 0.004 0.044
#> SRR2105152 2 0.4766 0.6733 0.276 0.656 0.000 0.008 0.004 0.056
#> SRR2105149 5 0.5248 0.4563 0.088 0.000 0.092 0.004 0.708 0.108
#> SRR2105150 5 0.7123 0.1197 0.144 0.000 0.132 0.036 0.544 0.144
#> SRR2105147 4 0.3887 0.5493 0.000 0.000 0.104 0.780 0.112 0.004
#> SRR2105148 4 0.4593 0.5628 0.000 0.000 0.136 0.728 0.120 0.016
#> SRR2105143 1 0.3795 0.5769 0.784 0.000 0.076 0.004 0.000 0.136
#> SRR2105144 1 0.2650 0.5751 0.880 0.004 0.072 0.004 0.000 0.040
#> SRR2105145 1 0.6372 0.1714 0.464 0.000 0.332 0.036 0.000 0.168
#> SRR2105146 3 0.6699 0.1820 0.336 0.000 0.452 0.096 0.000 0.116
#> SRR2105141 2 0.2827 0.8258 0.024 0.876 0.000 0.024 0.004 0.072
#> SRR2105142 2 0.1003 0.8150 0.004 0.964 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR2105139 2 0.1528 0.8256 0.048 0.936 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR2105140 2 0.1972 0.8270 0.056 0.916 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2105137 2 0.4967 0.6597 0.044 0.700 0.016 0.000 0.208 0.032
#> SRR2105138 2 0.5025 0.2838 0.016 0.548 0.000 0.000 0.392 0.044
#> SRR2105135 2 0.4851 0.3262 0.464 0.492 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR2105136 2 0.3658 0.7680 0.216 0.752 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2105133 5 0.0870 0.5843 0.000 0.000 0.004 0.012 0.972 0.012
#> SRR2105134 5 0.1605 0.5875 0.000 0.000 0.016 0.004 0.936 0.044
#> SRR2105131 5 0.7237 -0.1103 0.264 0.032 0.096 0.000 0.484 0.124
#> SRR2105132 5 0.3177 0.5651 0.044 0.000 0.016 0.012 0.860 0.068
#> SRR2105129 1 0.3880 0.5603 0.780 0.000 0.096 0.004 0.000 0.120
#> SRR2105130 1 0.2697 0.5730 0.864 0.000 0.044 0.000 0.000 0.092
#> SRR2105127 1 0.6593 -0.1295 0.508 0.004 0.036 0.008 0.272 0.172
#> SRR2105128 5 0.6244 -0.0395 0.292 0.000 0.040 0.004 0.528 0.136
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0